Свойства 4/1-подобных белков растений - возможных факторов внутри- и межклеточного транспорта тема диссертации и автореферата по ВАК РФ 03.00.03, кандидат биологических наук Минина, Елена Андреевна

• Минина, Елена Андреевна
• кандидат биологических наук
• 2007

Оглавление диссертации кандидат биологических наук Минина, Елена Андреевна

СПИСОК СОКРАЩЕНИЙ

ВВЕДЕНИЕ

ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ

1. Внутриклеточный транспорт

1.1 Экзоцитоз

1.2 Эндоциоз

1.3 Регуляция внутриклеточного транспорта

1.4 Внутриклеточный транспорт к плазмодесмам.

2. Межклеточный транспорт

2.1 Типы плазмодесм

2.2 Структура плазмодесм

2.3 Транспорт через плазмодесмы

2.3.1 Заякоривание около ПД

2.3.2 Транслокация через плазмодесмы

2.3.3 Высвобождение из плазмодесмы в соседней клетке

2.4 Регуляция межклеточного транспорта.

2.4.1. Предельная пропускная способность плазмодесм.

2.4.2 Роль цитоскелета в регуляции межклеточного 45 транспорта

2.4.3 Роль посттранскрипционных модификаций в регуляции 46 транспорта белков

2.5 Специфичность транспорта макромолекул в растениях и 48 его регуляция

3. Белок 4/1 АгаЫйорьк /АаИапа. 50 МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ 51 РЕЗУЛЬТАТЫ

1 Поиск гомологов белка 4/1 АгаЫс1ор$1$ 1каИапа т $Шсо

2 Иммунодетекция белка 4/1 АгаЫс1ор$1$ 1каИапа и его 74 гомологов.

3 Клонирование кДНК гомологов белка 4/1 из растений 76 ШсоИапа ЬепШат1апа и ШсоНапа шЬасит методом

ЛАСЕ-РСЯ

4 Клонирование полных копий генов гомологов белка 4/1 78 из растений ШсоНапа ЬеШкат1апа и ШсоИапа /аЬасит

5 Изучение внутриклеточной локализации белка 4/1 82 5.1 Внутриклеточная локализация белка 4/1, слитого с вРР.

5.2. Ко-локализация белка 4/1 с маркером ЭПР.

5.3. Ко-локалзация белка 4/1 с актиновыми филаментами.

5.4. Ко-локализация белка 4/1 с маркером аппарата Гольджи.

5.5. Мутационное картирование участков белка 4/1, ответственных за его внутриклеточную локализацию.

6. Поиск белков-партнеров белка 4/1 с помощью дрожжевой двугибридной системы

ОБСУЖДЕНИЕ РЕЗУЛЬТАТОВ

ВЫВОДЫ

Введение диссертации (часть автореферата) на тему «Свойства 4/1-подобных белков растений - возможных факторов внутри- и межклеточного транспорта»

Изучение молекулярных механизмов внутриклеточного и межклеточного транспорта в растениях является одним из наиболее актуальных направлений молекулярной биологии растений.

Функционирование любого многоклеточного организма предполагает наличие тесного контакта между отдельными клетками. В растениях клетки соединены между собой специализированными межклеточными контактами -плазмодесмами (ПД), которые представляют собой поры, пронизывающие клеточные стенки соседних клеток. Через плазмодесмы осуществляется транспорт питательных веществ, гормонов, при участии этих межклеточных контактов происходит распространение сигналов дифференцировки, посттранскрипционпого умолкания генов, апоптоза (Lucas et al.,1993). Известно также, что через плазмодесмы происходит распространение вирусной инфекции из первично зараженной клетки (Atabekov and Dorokhov, 1984).

Необходимой стадией, предваряющей межклеточный транспорт, является доставка транспортируемых частиц на периферию клеток к плазмодесмам. (Ding et äl., 1998; Lazarowitz and Beachy, 1999). Несмотря на общие черты в организации транспортных систем, механизм внутриклеточного транспорта растительных и животных клеток имеет ряд существенных отличий. На данный момент, выявлены некоторые пути регуляции внутриклеточного транспорта растений, показана роль в этом процессе цитоскелета и эндомембранных структур, но для полного понимания функционирования системы требуются дальнейшие исследования.

Удобной моделью для изучения молекулярных механизмов межклеточного и внутриклеточного транспорта в растениях являются транспортные белки вирусов растений (ТБ). Транспортные белки обеспечивают перемещение генома вируса внутри клетки, перенос его в соседние клетки и распространение вирусной инфекции по всему организму растения (Atabekov and Dorokhov, 1984). Известно, что ТБ вирусов растений используют систему транспорта клеток хозяина (Lucas et al, 1995; Carrington et al., 1996; Ghoshroy et al., 1997). Большое разнообразие транспортных белков делает их удобными моделями для изучения молекулярных механизмов внутриклеточного и межклеточного транспорта растений (Mushegian et al.,1993; Lazarowitz and Beachy, 1999).

Белок 4/1 A. thaliana был обнаружен как фактор, способный взаимодействовать с транспортным белком вируса бронзовости томата, что позволило предположить его участие в процессе внутри- и межклеточного транспорта в растениях. Данная работа посвящена изучению свойств белка 4/1 и его гомологов из других растений.

ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ

В 1879 году Eduard Tangle впервые показал, что стенки соседних клеток в растениях пронизаны тонкими тяжами цитоплазмы, объединяющими клетки в более сложную структуру, симпласт. В дальнейшем, эти контакты были названы плазмодесмами (ПД), было показано, что они являются специфичным для растений видом межклеточных контактов (Сагг, 1976).

Простая плазмодесма представляет собой заполненный цитоплазмой канал, пронизывающий стенки соседних клеток. Изнутри канал выстлан плазмалеммой, в его центре располагается десмотрубочка, образованная спрессованной мембраной эндоплазматического ретикулума двух соседних клеток (Robarás et al, 1990). Десмотрубочка соединена с плазмалеммой канала белковыми "мостиками", разделяющими полость плазмодесмы на 10-20 микроканальцев диаметром 1,5-3,0 нм (Ding et al., 1992). Предполагается, что транспорт идет по микроканальцам (Radford et al, 1998) и внутри десмотрубочки (Grabski et al, 1993; Gamalei et al, 1994).

Долгое время считалось, что плазмодесмы служат для транспортировки питательных веществ и гормонов. Затем результаты опытов по изучению механизмов распространения вирусной инфекции по растению показали, что с участием плазмодесм происходит также и транспорт макромолекул: белков и нуклеиновых кислот. Дальнейшее изучение межклеточного транспорта в растениях позволило выявить ряд белков растений, способных самостоятельно перемещаться из клетки в клетку, и также транспортировать собственную мРНК.

На данный момент установлено, что плазмодесмы играют важную роль в росте и развитии растений (Lucas et al, 1993). В ходе деления и дифференцировки клеток меристемы происходит формирование плазмодесм в результате неполного цитокинеза, тем самым обеспечивается непрерывность цитоплазмы и эндомембранных структур между дочерними клетками во всей новообразующейся ткани растения (Mezitt and Lucas, 1996). Таким образом, на ранних стадиях развития растение представляет собой симпласт клеток, соединенных плазмодесмами; в процессе развития, часть плазмодесм отмирает или модифицируется и симпласт разделяется на "домены" (Esau and Thorsch, 1985). Считается, что внутри каждого такого симпластного домена метаболизм и функционирование клеток синхронизировано (Goodwin, 1983).

Различают два основных типа транспорта у растений: локальный (транспорт между соседними клетками) и системный (транспорт по проводящей системе). И в том и в другом процессе задействованы специализированные контакты - плазмодесмы. основное отличие механизмов локального транспорта от системного заключается в том, что перемещение из клетки в клетку при локальном транспорте представляет собой активный процесс, требующий участия ассоциированных с плазмодесмами белков и затраты энергии (Wolf et al, 1989; Maule, 199l;Deom et al., 1990), тогда как циркуляцию по проводящей системе принято считать пассивным процессом (Leisner et al, 199За,b).

Локальный транспорт можно в свою очередь подразделить на два основных этапа: внутриклеточный транспорт на периферию клетки и собственно межклеточный транспорт.

Удобной моделью для изучения механизмов доставки макромолекул на периферию клеток и их перемещения через плазмодесмы являются вирусы растений. Вирусы растений попадают в клетки хозяина через механические повреждения клеточной стенки. Из первично инфицированной клетки происходит распространение вирусной инфекции в близлежащие клетки, пока вирус не достигнет элементов проводящей системы, по которой происходит распространение вируса по всему организму растения. Перемещение вируса из клетки в клетку и его системный транспорт происходит в виде транспортной частицы. На данный момент считается, что геном вируса транспортируется в составе рибонуклеопротеинового комплекса (РНП). В ходе эволюции фитовирусы выработали пути активного использования системы внутри- и межклеточного транспорта растений. Геном вирусов растений кодирует специфические транспортные белки (ТБ), необходимые для распространение вирусной инфекции из первично зараженной клетки.

Относительная примитивность геномов вирусов растений облегчает задачу идентификации их ТБ и последующего изучения свойств этих белков.

Разнообразие транспортных белков вирусов растений очень велико. Известны однокомпонентные и многокомпонентные транспортные системы вирусов, когда при транспорте необходим только один ТБ или несколько, соответственно. К первым относится транспортная система вируса табачной мозаики (ВТМ), перемещение которого происходит при участии белка ЗОК (Deom et al., 1987), а также системы других вирусов, кодирующих ЗОК-подобные белки, например, представителей родов Bromovirus, Cucumovirus, Tombusvirus, Tobamovirus, Tobravirus, Umbravirus, Begomovirus, Comovirus, Nepovirus, Tospovirus и др. (Koonin et al., 1991; Melcher, 1990, 1993; Mushegian and Koonin, 1993; Mushegian, 1994).

К многокомпонентным транспортным системам, относятся системы вирусов, представителей родов Potexvirus, Carlavirus, Allexivirus, Foveavirus, Hordeivirus, Benyvirus, Pomovirus, Pecluvirus, геном которых содержит тройной блок генов (ТБГ). ТБГ содержит гены с перекрывающимися рамками считывания, кодирующими 3 белка, необходимыми для транспорта соответствующего вируса (Morozov et al., 1989, Solovyev et al., 1996).

Транспорт вирусного генома в составе РНП может сопровождаться разрушением структуры ПД, такой вид транспорта характерен вирусов, принадлежащих к группам Comovirus, Nepovirus, Caulimovirus, Tospovirus, Alfamovirus, Bromovirus ( van Lent ei. al., 1990; Wieczoreck and Sanfacon, 1993; Storms et. al., 1995; Kasteel et. al., 1997; Zheng et. al., 1997); или же обратимыми изменениями структуры ПД, этот способ используют вирусы групп Tobamovirus, Tobravirus, Diantovirus, Hordeivirus и др. (Dawson et. al., 1988; Saito et. al., 1990; Xiong et. al., 1993; Hamilton and Baulcombe, 1989; Petty and Jackson, 1989). Большое разнообразие ТБ позволяет использовать их для многостороннего исследования механизмов транспорта в растениях.

Общим свойством всех транспортных белков вирусов растений является то, что они способны рекруитизировать транспортную систему клеток растений. Так например, предполагается, что ТБ взаимодействуют с рецепторами плазмодесм, используя таким образом систему межклеточного транспорта растений для переноса своего генетического материала (Lucas et al.,1995). Взаимодействие вирусного белка с хозяйскими факторами предполагает наличие между ними некого сродства, уровень этого сродства может варьировать для различных комбинаций вируса и хозяина; тем самым определяется специфичность вируса по отношению к растению и чувствительность растения к данной вирусной инфекции (Morozov et al.,1997).

Ранее считалось, что только вирусы растений имеют белки, способные взаимодействовать с плазмодесмами и обеспечивать транспорт других белков и нуклеиновых кислот между клетками. Именно поэтому, рекомбинантные транспортные белки вирусов в основном использовались для изучения межклеточного транспорта в растениях (Ding et. al., 1992). Позднее было установлено, что транспорт в растении может идти и в отсутствии вирусной инфекции, и вирусы используют универсальный механизм. Основываясь на этих данных, была выдвинута гипотеза о том, что вирусные ТБ изначально имеют растительное происхождение и были "захвачены" вирусным геномом для обеспечения транспортных функций (Mezitt and Lucas, J996).

Заключение диссертации по теме «Молекулярная биология», Минина, Елена Андреевна

выводы.

1. Анализ доступных баз нуклеотидных последовательностей позволил обнаружить ряд гомологов ранее открытого белка 4/1 АгаЫс1ор$1$ ЛаНапа. Определены общие черты в структуре генов белков 4/1, найдены консервативные районы последовательностей белков 4/1.

2. Получены поликлональные и моноклоналные антитела к 4/1 белку и обнаружены его экспрессия и накопление в мембрано-ассоциированных фракциях клеток у растений семейства пасленовых, включая табак и картофель.

3. Впервые клонированы кДНК и хромосомные гены 4/1 белка табака.

4. Была показана внутриклеточная локализация белка 4/1, сшитого с флуоресцирующими белками-маркерами, в составе структур везикулярного типа, образованных мембранами ЭПР и ассоциированных с плазмодесмами.

5. Выявлена полярная локализация белка 4/1 в разных типах клеток растения и способность его транспортироваться по клетке с использованием актинового цитоскелета.

6. Доказана способность белка транспортироваться через плазмодесмы.

7. С помощью дрожжевой двугибридной системы были выявлены потенциальные белки-партнеры, взаимодействующие с белком 4/1 АгаЫс1орз15 МаИапа и его гомологами из табака.

Список литературы диссертационного исследования кандидат биологических наук Минина, Елена Андреевна, 2007 год

1. Allan, B. B„ Moyer, B. D. and Balch, W. E. (2000). Rabl recruitment of pi 15 into a cis-SNARE complex: programming budding COPII vesicles for fusion. Science 289,444-8.

2. Alvarez, C., Garcia-Mata, R., Hauri, H. P. and Sztul, E. (2001). The pll5-interactive proteins GM130 and giantin participate in endoplasmic reticulum-Golgi traffic. J Biol Chem 276,2693-700.

3. Andreeva, A. V., Kutuzov, M. A., Evans, D. E. and Hawes, C. R. (1998). Proteins involved in membrane transport between the ER and the Golgi apparatus: 21 putative plant homologues revealed by dbEST searching. Cell Biol Int 22,145-60.

4. Andreeva, A. V., Zheng, H., Saint-Jore, C. M., Kutuzov, M. A., Evans, D. E. and Hawes, C. R. (2000). Organization of transport from endoplasmic reticulum to Golgi in higher plants. Biochem Soc Trans 28,505-12.

5. Aniento, F. and Robinson, D. G. (2005). Testing for endocytosis in plants. Protoplasma 226,3-11

6. Antonny, B., Gounon, P., Schekman, R. and Orci, L. (2003). Self-assembly of minimal COPII cages. EMBO Rep 4, 419-24.

7. Atabekov, J. G. and Dorokhov Yu, L. (1984). Plant virus-specific transport function and resistance of plants to viruses. Adv Virus Res 29,313-64.

8. Balachandran S., Xiang Y., Shobert C., Thompson G.A., Lucas W.J. (1997) Phloem sap proteins from Cucurbita maxima and Ricinus communis have capacity to traffic cell to cell through plasmodesmata. Proc. Natl. Acad. Sci. USA 94: 14150-14155

9. Baluska F, Samaj J, Napier R,VolkmannD (1999)Maize calreticulin localizes preferentially to plasmodesmata in root apex. Plant J 19: 48M88

10. Baluska, F., Cvrckova, F., Kendrick-Jones, J. and Volkmann, D. (2001). Sink plasmodesmata as gateways for phloem unloading. Myosin VIII and calreticulin as molecular determinants of sink strength? Plant Physiol 126,39-46.

11. Baluska, F., Samaj, J., Hlavacka, A., Kendrick-Jones, J. and Volkmann, D. (2004). Actin-dependent fluid-phase endocytosis in inner cortex cells of maize root apices. J Exp Bot 55,463-73.

12. Barlowe, C. (2003). Molecular recognition of cargo by the COPII complex: a most accommodating coat. Cell 114,395-7.

13. Bednarek, S. Y. and Falbel, T. G. (2002). Membrane trafficking during plant cytokinesis. Traffic 3,621-9.

14. Ben-Tekaya, H., Miura, K., Pepperkok, R. and Hauri, H. P. (2005). Live imaging of bidirectional traffic from the ERGIC. J Cell Sci 118, 357-67.

15. Bi, X., Corpina, R. A. and Goldberg, J. (2002). Structure of the Sec23/24-Sarl pre-budding complex of the COPII vesicle coat. Nature 419, 2717.

16. Bielli, P., Casavola, E. C., Biroccio, A., Urbani, A. and Ragnini

17. Wilson, A. (2006). GTP drives myosin light chain 1 interaction with the class V107myosin Myo2 IQ motifs via a Sec2 RabGEF-mediated pathway. Mol Microbiol 59,1576-90.

18. Blackman L.M., Harper J.D.I, and Overall R.L. (1999) Localization of a. centrin-like protein to higher plant plasmodesmata. Eur J Cell. Biol 78:297-304

19. Blackman L.M. and Overall R.L. (2001) Structure and function of plasmodesmata. Aust. J. Plant Physiol. 28:709-727.

20. Boehm, M., Aguilar, R. C. and Bonifacino, J. S. (2001). Functional and physical interactions of the adaptor protein complex AP-4 with ADP-ribosylation factors (ARFs). Embo J 20, 6265-76.

21. Boevink P. and Oparka K.J.(2005) Virus-Host Interactions during Movement Processes. Plant Physiol, 138:1815-1821.

22. Boevink, P., Oparka, K., Santa-Cruz, S., Martin, B., Betteridge, A., Hawes, C. (1998). Stacks on tracks: the plant Golgi apparatus traffics on an actin/ER network. Plant J, 15,441-447.

23. Boevink, P., Martin, B., Oparka, K., Santa-Cruz, S., Hawes, C. (1999). Transport of virally expressed green fuorescent protein through the secretory pathway in tobacco leaves is inhibited by cold shock and brefeldin A. Planta, 208,392-400.

24. Bolte, S., Talbot, C., Boutte, Y., Catrice, O., Read, N. D. and Satiat-Jeunemaitre, B. (2004). FM-dyes as experimental probes for dissecting vesicle trafficking in living plant cells. J Microsc 214,159-73.

25. Bonifacino JS, Lippincott-Schwartz J (2003) Coat proteins: shaping membranetransport. Nat Rev Genet 4:409-414

26. Brandizzi, F., Frangne, N., Marc-Martin, S., Hawes, C., Neuhaus, J. M. and Paris, N. (2002a). The destination for single-pass membrane proteins is influenced markedly by the length of the hydrophobic domain. Plant Cell 14, 1077-92.

27. Brandizzi, F., Irons, S. L., Johansen, J., Kotzer, A. and Neumann, U. (2004). GFP is the way to glow: bioimaging of the plant endomembrane system. J Microsc 214,138-58.

28. Brummell,D.A., Lashbrook,C.C. and Bennett,A.B. (1994) Plant endo-l,4-b-D-glucanases. Structure, properties and physiological function.In Himmel,M.E., Baker,J.O. and Overend,R.P. (eds), EnzymaticConversion of Biomass for Fuels Production.: 100-129.

29. Cantrill L.C., Overall R.L., Goodwin P.B.(1999) Cell-to-cell communication via plant endomembranes. Cell Biol Int 23:653-661.

30. Carr, D.J. (1976) Historical perspectives on plasmodesmata. In Intercellular Communication in Plants: Studies on Plasmodesmata (Gunning, B.E.S. and Robards, A.W. eds), pp. 291-295, Springer-Verlag

31. Carrington J.C, Kasschau K.D., Mahajan S.K., and Schaad M.C. (1996) Cell-to-cell and long-distance transport of viruses in plants. Plant Cell 8: 1669-1681.

32. Caumont, A. S., Galas, M. C., Vitale, N., Aunis, D. and Bader, M. F. (1998). Regulated exocytosis in chromaffin cells. Translocation of ARF6stimulates a plasma membrane-associated phospholipase D. J Biol Chem 273, 1373-9.

33. Chen, Y. A. and Scheller, R. H. (2001). SNARE-mediated membrane fusion. Nat Rev Mol Cell Biol 2,98-106.

34. Chen, X., Goodwin, S.M., Boroff, V.L., Liu, X. and Jenks, M.A. (2003) Cloning and characterization of the WAX2 gene of Arabidopsis involved in cuticle membrane and wax production. Plant Cell, 15:1170-1185.

35. Chen MH, Tian GW, Gafni Y, Citovsky V (2005) Effects of calreticulin on viral cell-to-cell movement. Plant Physiol doi/10.1104/pp.l05.064386

36. Cheong, Y.H., Chang, H.S., Gupta, R., Wang, X., Zhu, T. and Luan, S. (2002) Transcriptional Profiling Reveals Novel Interactions between Wounding, Pathogen, Abiotic Stress, and Hormonal Responses in Arabidopsis. Plant Physiol., 129:661-677.

37. Cilia, M.L., Jackson, D., 2004. Plasmodesmata form and function. Curr. Opin. Cell Biol. 16, 500-506.

38. Citovsky V, Mclean BG, Zupan JR, Zambryski P (1993) Phosphoiylation of tobacco mosaic virus cell-to-cell movement protein by a developmentally regulated plant cell wall-associated protein kinase. Genes Dev 7:904-910

39. Cleland, R.E., Fujiwara, T., Lucas, W.J., 1994. Plasmodesmal-mediated cell-tocell transport in wheat roots is modulated by anaerobic stress. Protoplasma 178, 81-85.

40. Clary, D. O. and Rothman, J. E. (1990). Purification of three related peripheral membrane proteins needed for vesicular transport. J Biol Chem 265,10109-17.

41. Cook, M.E., Graham, L.E., Botha, C.E.J., Lavin, C.A. (1997). Comparativeultrastructure of plasmodesmata of Chara and selectedbryophytes: toward an elucidation of the evolutionary origin ofplant plasmodesmata. American Journal of Botany. 84: 1169-1178.

42. Coppolino MG, Woodside MJ, Demaurex N, Grinstein S, StArnaud R, Dedhar S (1997) Calreticulin is essential for integrin-mediated calcium signalling and cell adhesion. Nature 386: 843-847

43. Dawson W.O., Bubrick P., and Grantham G.L. (1988) Modifications of the tobacco mosaic virus coat protein gene affecting replication movement and symptomatology. Phytopathology 78: 783-789.

44. Denecke, J., Botterman, J. and Deblaere, R. (1990). Protein secretion in plant cells can occur via a default pathway. Plant Cell 2,51-9.

45. Denecke J, Carlsson LE, Vidal S, Hoglund AS, Ek B, van Zeijl MJ, Sinjorgo KMC, Palva ET (1995) The tobacco homolog of mammalian calreticulin is present in protein complexes in vivo. Plant Cell 7: 391-406

46. Deom, C.M., Oliver, M.J., Beachy, R.N., 1987. The 30-kilodalton gene product of tobacco mosaic virus potentiates virus movement. Science 237, 389-394.

47. Deom C.M., Schubert K.R.,Wolf S., Holt C.A., Lucas W.J., and Beachy R.N.(1990) Molecular characterization and biological function of the movement protein of tobacco mosaic virus in transgenic plants. Proc.Natl.Acad.Sci.USA87: 3284-3288.

48. Derrick PM, Barker H, Oparka KJ (1992) Increase in plasmodesmatal permeability during cell-to-cell spread of tobacco rattle virus from individually inoculated cells. Plant Cell 4:1405-1412

49. Ding B. (1998) Intercellular protein trafficking through plasmodesmata. Plant Molecular Biology 38:79-310.

50. Ding, B., Turgeon, R., Parthasarathy, M.V. (1991). Routine cryofixation of plant tissue by propane jet freezing for freeze substitution. J Electron Microsc Tech, 19,107-17.

51. Ding B, Haudenshield JS, Hull RJ, Wolf S, Beachy RN, Lucas WJ (1992) Secondary plasmodesmata are specific sites of localization of the tobacco mosaic virus movement protein in transgenic tobacco plants.Plant Cell 4: 915-928

52. Ping B., Kwon M.O., and Warnberg L. (1996) Evidence that actin filaments are involved in controlling the permeability of plasmodesmata in tobacco mesophyll. Plant J.10: 157-164 .

53. Ding, X.S., Carter, S.A., Deom, C.M., Nelson, R.S. (1998). Tobamovirus and potyvirus accumulation in minor veins of inoculated leaves from representatives of the Solanaceae and Fabaceae. Plant Physiol, 116, 125136.

54. Edeling, M. A., Smith, C. and Owen, D. (2006). Life of a clathrin coat: insights from clathrin and AP structures. Nat Rev Mol Cell Biol 7, 32-44.

55. Ehlers, K., and Kollmann, R. (2001). Primary and secondary plasmodesmata: Structure, origin, and functioning. Protoplasma 216:1-30.

56. Ehlers K, Schultz M, Kollmann R (1996) Subcellular localization of ubiquitin in plant protoplasts and the function of ubiquitin in selective degradation of outer-wall plasmodesmata in regenerating protoplasts. Planta 199: 139-151.

57. Esau K.,Thorsch J. (1985) Sieve plate pores and plasmodesmata , the communication channels of the symplast: ultrastructural aspects and developmental relations. Am J.Bot. 72:1641-1653 .

58. Eulgem, T., Rushton, P.J., Schmelzer, E., Hahlbrock, K., and Somssich, I.E. (1999). Early nuclear events in plant defence signaling:Rapid gene activation by WRKY transcription factors. EMBO J. 18:4689-4699.

59. Fridborg, I., Grainger, J., Page, A., Coleman, M., Findlay, K., Angelí, S. (2003). TIP, a novel host factor linking callóse degradation with the cell-to-cell movement of Potato virus X. Mol Plant Microbe Interact, 16, 132140.

60. Fulnecek J. K. Y. Lim A. R. Leitch A. Kovarik R. Matyasek (2002) Evolution and structure of 5S rDNA loci in allotetraploid Nicotiana tabacum and its putative parental species. Heredity 88: 19-25

61. Gamalei, Y.V. (1989). Structure and function of leaf minor veins intrees and herbs. Trees, 3: 96-110.

62. Gamalei Y.V., Van Bel A.,J.,E., Pakhomova M.V., and Sjutkina A. (1994) Effects of temperature on the conformation of the endoplasmatic reticulum and on starch accumulation in leaves with the symplastic minor-vein configuration. Planta 194:443-453

63. Ghoshroy S., Lartley R., Sheng J.,Citovsky V. (1997) Transport of proteins and nucleic acids through plasmodesmata. Annu.Rev.Plant. Physiol. Plant.Mol.Biol. 48:27-50

64. Gilliland, L.U., Pawloski, L.C., Kandasamy, M.K. and Meagher, R.B. 2003. Arabidopsis actin gene ACT7 plays an essential role in germination and root growth. The Plant Journal 33 (2), 319-328.

65. Gillingham, A. K. and Munro, S. (2003). Long coiled-coil proteins and membrane traffic. Biochim Biophys Acta 1641, 71-85.

66. Gillingham, A. K., Tong, A. H., Boone, C. and Munro, S. (2004). The GTPase Arflp and the ER to Golgi cargo receptor Ervl4p cooperate to recruit the golgin Rud3p to the cis-Golgi. J Cell Biol 167,281-92.

67. Glushka JN, Terrell M, York WS, O'Neill MA, Gucwa A, Darvill AG, Albersheim P, Prestegard JH (2003) Primary structure of the 2-O-methyl-alpha-L-fucose-containing side chain of the pectic polysaccharide, rhamnogalacturonan II. Carbohydr Res 338:341-352

68. Goodwin P.B. (1983) Molecular size limit for movement in the symplast of the Elodea leaf. Planta 157:124-130.

69. Gorbalenya, A. E., Koonin, E.V. (1993). Helicases. Amino acid sequence comparisons and beyond. Curr. Opin. Struct. Biol., 3,419-429.

70. Goodwin P.B. (1983) Molecular size limit for movement in the symplast of the Elodea leaf. Planta 157:124-130.

71. Grabski, S., de Feijter, A.W., Schindler, M. (1993). Endoplasmic reticulum forms a dynamic continuum for lipid diffusion between contiguous soybean root cells. Plant Cell, 5,25-38.

72. Guan Y. and Nothnagel E.A.(2004) Binding of Arabinogalactan Proteins by Yariv Phenylglycoside Triggers Wound-Like Responses in Arabidopsis Cell Cultures. Plant Physiol. 135:1346-1366,

73. Gunning, B. E. S. and Overall R. L., 1983: Plasmodesmata and cell-, to-cell transport in plants. Bioscience 33,260—265

74. Hake, S. and Char, B.R. (1997) Cell-Cell Interactions during Plant. Development, Genes Devel.,vol. 11,1087-1097.

75. Hadlington, J. L. and Denecke, J. (2000). Sorting of soluble proteins in the secretory pathway of plants. Curr Opin Plant Biol 3,461-8.

76. Hamilton, W.D.O., and Baulcombe, D.C. (1989). Infectious RNA produced by in vitro transcription of a full-length tobacco rattle virus RNA-1 cDNA. Gen. Virol. 70,963-968.

77. Hanton, S. L., Bortolotti, L. E., Renna, L., Stefano, G. and Brandizzi, F. (2005). Crossing the divide-transport between the endoplasmic reticulum and Golgi apparatus in plants. Traffic 6, 267-77.

78. Haupt S., Cowan G.H., Ziegler A., Roberts A.G., Oparka K.J., Torrance L (2005) Two plant-viral movement proteins traffic in the endocytic recycling pathway. Plant Cell 17:164-181

79. Hawes, C. and Satiat-Jeunemaitre, B. (2005). The plant Golgi apparatus—going with the flow. Biochim Biophys Acta 1744, 93-107.

80. Hawes, C. (2005). Cell biology of the plant Golgi apparatus. New Phytologist 165,29-44.

81. Haywood, V., Kragler, F., Lucas, W.J., 2002. Plasmodesmata: pathways for protein and ribonucleoprotein signaling. Plant Cell 14, S303-S325.

82. Heinlein, M., Epel, B.L., Padgett, H.S., Beachy, R.N., 1995. Interaction oftobamovirus movement proteins with the plant cytoskeleton. Science 270,1983-1985

83. Helariutta, Y., Fukaki, H., Wysocka-Diller, J., Nakajima, K., Jung, J., Sena, G., Hauser, M.T., and Benfey, P.N. (2000). The SHORT-ROOT gene controls radial patterning of the Arabidopsis root through radial signaling. Cell 101,555-567.

84. Henrissat,B., Claeyssens,M., Tomme,P., Lemesle,L. and Mornon,J.-P.(1989) Cellulase families revealed by hydrophobic cluster analysis.Gene, 81: 83-95.

85. Hirst, J., Miller, S. E., Taylor, M. J., von Mollard, G. F. and Robinson, M. S. (2004). EpsinR is an adaptor for the SNARE protein Vtilb. Mol Biol Cell 15,5593-602.

86. Hohl, I., Robinson, D. G., Chrispeels, M. J. and Hinz, G. (1996). Transport of storage proteins to the vacuole is mediated by vesicles without a clathrin coat. J Cell Sci 109 ( Pt 10), 2539-50.

87. Hong, W. (2005). SNAREs and traffic. Biochim Biophys Acta 1744,120-44.

88. Huang Z, Andrianov VM, Han Y, Howell SH (2001) Identification of Arabidopsis proteins that interact with the cauliflower mosaic virus (CaMV) movement protein. Plant Mol Biol 47: 663-675

89. Itaya A., Hickman H., Bao Y., Nelson R.,and Ding B. (1997)Cell-to-cell trafficking of cucumber mosaic virus movement protein: GFP fusion produced by biolistic gene bombardment in tobacco. Plant J. 12: 1223-1230

90. Itaya A., Woo Y.M., Masuta C., Bao Y., NelsonR.S., and Ding B.(1998) Developmental Regulation of Intercellular Protein Trafficking through Plasmodesmata in Tobacco Leaf Epidermis Plant Physiol. 118: 373-385.

91. Jackson, D., 2002. Double labeling of KNOTTED 1 mRNA and protein reveals multiple potential sites of protein trafficking in the shoot apex. Plant Physiol. 129,1423- 1429.

92. Jackson, D., Hake, S., 1997. Morphogenesis on the move: cell-to-cell trafficking of plant regulatory proteins. Curr. Opin. Genet. Dev. 7,495-500.

93. Jauh, G. Y., Phillips, T. E. and Rogers, J. C. (1999). Tonoplast intrinsic protein isoforms as markers for vacuolar functions. Plant Cell 11, 186782.

94. Jahn, R., Lang, T. and Sudhof, T. C. (2003). Membrane fusion. Cell 112,519-33.

95. Jia, J.H., Tong, C., Wang, B., Luo, L.P., Jiang, J., 2004. Hedgehog signalling activity of Smoothened requires phosphorylation by protein kinase A and casein kinase I. Nature 432,1045- 1050.

96. Jiang, R., Gao, B., Prasad, K., Greene, L. E. and Eisenberg, E. (2000). Hsc70 chaperones clathrin and primes it to interact with vesicle membranes. J Biol Chem 275, 8439-47.

97. Jones, M.G.K. (1976). The origin and development of plasmodesmata. In Intercellular Communication in Plants: Studies on Plasmodesmatapp. Springer-Verlag, Berlin, Germany, 81-105.

98. Kalinina, N.A., Fedorkin, O.N., Samuilova, O.V., Maiss, E., Korpela, T., Morozov, S.Yu., Atabekov, J.G. (1996). Expression and biochemical analysis of recombinant potato virus X 25K movement protein. FEBS Lett, 397,75-78.

99. Karasev A.V, Kashinab A.S, Gelfandb V.I. and DoljaV.V.(1992) HSP70-related 65 kDa protein of beet yellows closterovirus is a microtubule-binding protein. FEBS 304: 12-14.

100. Karpova, O.V., Ivanov, K.I., Rodionova, N.P., Dorokhov, Y.L., Atabekov, J.G., 1997. Nontranslatability and dissimilar behavior in plants and protoplasts of viral RNA and movement protein complexes formed in vitro. Virology 230,11-21.

101. Karpova, O.V., Rodionova, N.P., Ivanov, K.I., Kozlovsky, S.V., Dorokhov, Y.L., Atabekov, J.G., 1999. Phosphorylation of tobacco mosaic virus movement protein abolishes its translation repressing ability. Virology 261, 2024.

102. Kasteel J. W., Goldbach R. W. and van Lent J. W. M.(1997) Isolation and characterization of tubular structures of cowpea mosaic virus. J. of Gen.Vir. (1997), 78,3167-3170

103. Kim JY, Rim Y, Wang L, Jackson D (2005) A novel cell-to-cell trafficking assay indicates that the KNOX homeodomain is necessary and sufficient for intercellular protein and mRNA trafficking. Genes Dev 19: 788— 793

104. Kim, J.Y., Yuan, Z., Jackson, D., 2003. Developmental regulation and significance of KNOX protein trafficking in Arabidopsis. Development 130, 4351-4362.

105. Kim JY, Yuan ZA, Cilia M, Khalfan-Jagani Z, Jackson D (2002) Intercellular trafficking of a KNOTTED 1 green fluorescent protein fusion in the leaf and shoot meristem of Arabidopsis. Proc Natl Acad Sei USA 99: 4103^108

106. Kim, S-J., Kim, M-R, Bedgar, D.L., Moinuddin, S.G.A., Cardenas, C.L., Davin, L.B., Kang,C. and Lewis, N.G. (2003b) Functional reclassification of the putative cinnamyl. alcohol dehydrogenase multigene family in Arabidopsis. PNAS. 101 (6): 1455-1460

107. Kirchhausen, T. (2002). Clathrin adaptors really adapt. Cell 109,413.6.

108. Kollmann, R., and Glockmann, C. (1985). Studies on graft unions.I. Plasmodesmata between cells of plants belonging to different unrelated taxa. Protoplasma 124,224-235.

109. Kollmann, R., and Glockmann, C. (1991). Studies on graft unions.III. On the mechanism of secondary formation of plasmodesmata at the graft interface. Protoplasma 165, 71-85,

110. Koonin, E. V. and Dolja, V. V. (1993). Evolution and taxonomy of positive-strand RNA viruses: implications of comparative analysis of amino acid sequences. Crit Rev Biochem Mol Biol 28,375-430.

111. Kost B, Spielhofer P, Chua N-H (1998) A GFP-mouse talin fusion protein labels plant actin filaments in vivo and visualizes the actin cytoskeleton in growing pollen tubes. Plant J. 1998 Nov;16(3):393-401.

112. Kotlizky G., Shurtz S., Yahalom A., Malik Z., Traub O., and Epel B.L.(1992)An improved procedure for the isolation of plasmodesmata embedded in clean maize cell walls. Plant J. 2:623-630.

113. Kragler F, Curin M, Trutnyeva K, Gansch A, Waigmann E (2003) MPB2C, a microtubule-associated plant protein binds to and interferes with cellto-cell transport of tobacco mosaic virus movement protein. PlantPhysiol 132:1870-1883

114. Kragler, F., Monzer, J., Shash, K., Xoconostle-Ca'zares, B., Lucas, W.J., (1998). Cell-to-cell transport of proteins: requirement for unfolding and characterization of binding to a putative plasmodesmal receptor. Plant J. 15, 367-381.

115. Kragler, F., Monzer, J., Xoconostle-Ca'zares, B., Lucas, W.J., 2000. Peptide antagonists of the plasmodesmal macromolecular trafficking pathway. EMBO J. 19,2856- 2868.

116. Laemmli, U. K. (1970). Cleavage of structural proteins during the assembly of the head of bacteriophage T4. Nature 227,680-5.

117. Lazarowitz S.G., Beachy R.N. (1999) Viral movement proteins as probes for intracellular and intercellular trafficking in plants. Plant Cell 11: 535548

118. Lederkremer, G. Z., Cheng, Y., Petre, B. M., Vogan, E., Springer, S., Schekman, R., Walz, T. and Kirchhausen, T. (2001). Structure of the Sec23p/24p and Secl3p/31p complexes of COPII. Proc Natl Acad Sei U S A 98, 10704-9.

119. Lee, J.Y., Yoo, B.C., Rojas, M.R., Gomez-Ospina, N., Staehelin, L.A., Lucas, W.J., 2003. Selective trafficking of non-cell-autonomous proteins mediated by NtNCAPPl. Science 299,392-396.

120. Lee, J.Y. and Lucas, W.J.(2001). Phosphorylation of viral movement proteins— Regulation of cell-to-cell trafficking. Trends Microbiol. 9, 5-8.

121. Lee, Y. R. and Liu, B. (2004). Cytoskeletal motors in Arabidopsis. Sixty-one kinesins and seventeen myosins. Plant Physiol 136,387783.

122. Leisner, S.M., Howell, S.H. (1993 a). Long distance movement of viruses in plants. Trends Microbiol., 1:314-317.

123. Leisner, S.M., Turgeon, R., Howell, S.H. (1993 b). Effects of host plant development on the long-distance movement of cauliflower mosaic virus in Arabidopsis. Plant Cell, 5: 191-202.

124. Li, B. and Fields, S. (1993) Identification of mutations in p53 that affect its binding to SV40 T antigen by using the yeast two-hybrid system. FASEB J. 7:957-963.

125. Loh, E. and Hong, W. (2004). The binary interacting network of the conserved oligomeric Golgi tethering complex. J Biol Chem 279,24640-8.

126. Lucas, W.J. and Lee, J.-Y. (2004) Cell-to-cell communication in plants: plasmodesmata as a supracellular control network. Nat. Rev. Mol. Cell Biol. 5:712-726.

127. Lucas WJ, Bouchepillon S, Jackson DP, Nguyen L, Baker L, Ding B, Hake S (1995) Selective trafficking of KNOTTED 1 homeodomain protein and its messenger-RNA through pl^sfjjodesmata. Science 270:1980-1983

128. Lucas, W.J., Ding, B., van Der SchoQt, Q„ JP93. PJasmqcje^^ and the supracellular nature of plants. New Phytol. 125,435-476.

129. Lucas, W. J. 1993 Process of virus systemic infection studied using microinjection procedures. In: Genetic Engineering, Molecular Biology and Tissue

130. Lupas, A. (1997). Predicting coiled-coil regions in proteins. Curr Opin Struct Biol 7,388-93.

131. Lupas, A., Van Dyke, M., and Stock, J. (1991) Predicting Coled Coils from Protein Sequences, Science 252:1162-1164.

132. Macia, E., Luton, F., Partisani, M., Cherfils, J., Chardin, P. and Franco, M. (2004). The GDP-bound form of Arf6 is located at the plasma membrane. J Cell Sci 117,2389-98.

133. Matsushita, Y., Hanazawa, K., Yoshioka, K., Oguchi, T., Kawakami, S., Watanabe, Y., Nishiguchi, M., Nyunoya, H.( 2000). In vitro phosphorylation of the movement protein of tomato mosaic tobamovirus by a cellular kinase. J. Gen. Virol. 81,2095-2102.

134. Matsushita, Y., Ohshima, M., Yoshioka, K., Nishiguchi, M., Nyunoya, H. (2003). The catalytic subunit of protein kinase CK2 phosphorylates in vitro the movement protein of Tomato mosaic virus. J. Gen. Virol. 84, 497505.

135. Maule, A.J. (1991). Virus movement in infected plants. Cri. Rev. Plant Sci., 9:457-473.

136. McDowell, J. M., An, Y.-Q., McKinney, E. C., Huang, S., and Meagher, R. B. (1996). T The arabidopsis ACT7 actin gene is expressed in rapidly developing tissues and responds to several external stimuli. Plant physiol. 111(3): 699-712.

137. Mclean BG, Zupan J, Zambryski PC (1995) Tobacco mosaic virus movement protein

138. McMahon HT, Mills IG. COP and clathrin-coated vesicle budding: different pathways, common approaches. Current Opinion in Cell Biology 2004; 16(4): 379-391.

139. Meckel, T., Hurst, A. C., Thiel, G. and Homann, U. (2004). Endocytosis against high turgor: intact guard cells of Vicia faba constitutively endocytose fluorescently labelled plasma membrane and GFP-tagged K-channel KAT1. Plant J 39, 182-93.

140. Melcher, U. (1990). Similarities between putative transport proteins of plant viruses. J. of Gen. Virology 71,1009-1018.

141. Melcher, U. (1993). HIV-1 proteinase as structural model of intercellular transport proteins of plant viruses. J. of Theoretical Biology 162, 6174.

142. Memon, A. R. (2004). The role of ADP-ribosylation factor and SARI in vesicular trafficking in plants. Biochim Biophys Acta 1664, 9-30.

143. Mernaugh R. and Mernaugh G., (1995) Methods for the production of mouse monoclonal antibodies. In "Molecular methods in plant pathology", ed by Rudra P.Singh and UmaN. Singh,"LEWIS Publisher", 343-358.

144. Mezitt, L.A., Lucas, W.J. (1996). Plasmodesmal cell-to-cell transport of proteins and nucleic acids. Plant Mol Biol, 32,251-273.

145. Minic Z, Rihouey C, Do CT, Lerouge P, Jouanin L (2004) Purification and characterization of enzymes exhibiting beta-D-xylosidase activities in stem tissues of Arabidopsis. Plant Physiol,2004,135(2):78-867.

146. Morozov, S., Dolja, V. V. and Atabekov, J. G. (1989). Probable reassortment of genomic elements among elongated RNA-containing plant viruses. J Mol Evol 29, 52-62.

147. Movafeghi, A., Happel, N., Pimpl, P., Tai, G. H. and Robinson, D. G. (1999). Arabidopsis Sec21p and Sec23p homologs. Probable coat proteins of plant COP-coated vesicles. Plant Physiol 119,1437-46.

148. Mushegian, A. R. (1994). The putative movement domain encoded by nepovirus RNA-2 is conserved in all sequenced nepoviruses. Archives of Virology 135,437-441.

149. Mushegian, A. R. and Koonin, E. V. (1993). Cell-to-cell movement of plant viruses. Insights from amino acid sequence comparisons of movement proteins and from analogies with cellular transport systems. Archives of Virology 133,239-257.

150. Nakajima, K., Sena, G., Nawy, T., and Benfey, P.N. (2001). Intercellular movement of the putative transcription factor SHR in root patterning. Nature 413,307-311.

151. Nakano T, Suzuki K, Fujimura T, Shinshi H: Genome-wide analysis of the ERF gene family in Arabidopsis and rice. Plant Physiol. 140(2):411-432.

152. Nebenfuhr, A. (2002). Vesicle traffic in the endomembrane system: a tale of COPs, Rabs and SNAREs. Cuit Opin Plant Biol 5, 507-12.

153. Nebenfuhr, A., Gallagher, L. A., Dunahay, T. G., Frohlick, J. A., Mazurkiewicz, A. M., Meehl, J. B. and Staehelin, L. A. (1999). Stop-and-go movements of plant Golgi stacks are mediated by the acto-myosin system. Plant Physiol 121,1127-42.

154. Nebenfiihr, A. and Staehelin, L. A. (2001). Mobile factories: Golgi dynamics in plant cells. Trends Plant Sci 6, 160-7.

155. Neumann, U., Brandizzi, F. and Hawes, C. (2003). Protein transport in plant cells: in and out of the Golgi. Ann Bot (Lond) 92,167-80.

156. Nickel, W., Brugger, B. and Wieland, F. T. (2002). Vesicular transport: the core machinery of COPI recruitment and budding. J Cell Sci 115, 3235-40.

157. Nicol, F., His, I., Jauneau, A., Vernhettes, S., Canut, H., Hofte, H. (1998) A plasma membrane-bound putative endo-l,4-b-Dglucanase is required for normal wall assembly and cell elongation in Arabidopsis. EMBO 17 (19):5563—5576.

158. Nufer, O., Guldbrandsen, S., Degen, M., Kappeler, F., Paccaud, J. P., Tani, K. and Hauri, H. P. (2002). Role of cytoplasmic C-terminal amino acids of membrane proteins in ER export. J Cell Sci 115, 619-28.

159. Okamuro J.K., Caster B., Villarroel R., van Montagu M., Jofuku K.D. (1997). The AP2 domain of APETALA2 defines a large new family of DNA binding proteins in Arabidopsis. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 94:70767081.

160. Oparka KJ (2004) Getting the message across: How do plant cells exchange macromolecular complexes? Trends Plant Sci 9:33^11

161. Overall R.L. and Blackman L.M.( 1998) Immunolocalization ofthe cytoskeleton to plasmodesmata of Chara corallina. Plant J. 14:733-741.127

162. Overall R.L. and Blackman L.M. (1996) A model of the macromolecular structure of plasmodesmata. Trends Plant Sei 1: 307-311

163. Paleotti, O., Macia, E., Luton, F., Klein, S., Partisani, M., Chardin, P., Kirchhausen, T. and Franco, M. (2005). The small G-protein Arf6GTP recruits the AP-2 adaptor complex to membranes. J Biol Chem 280, 21661-6.

164. Paris, N. and Neuhaus, J. M. (2002). BP-80 as a vacuolar sorting receptor. Plant Mol Biol 50,903-14.

165. Paris, N., Stanley, C. M., Jones, R. L. and Rogers, J. C. (1996). Plant cells contain two functionally distinct vacuolar compartments. Cell 85, 563-72.

166. Peremyslov VV, Hagiwara Y, Dolja VV (1999) HSP70 homolog functions in cell-to-cell movement of a plant virus. Proc Natl Acad Sei USA 96:14771-14776

167. Petty, I.T.D., Jackson, A.O. (1990). Mutational analysis of barleystripe mosaic virus RNAß. Virology, 179: 712-71

168. Pilon M, Schekman R (1999) Protein translocation: how Hsp70 pulls it off.Cell 97: 679-682

169. Pimpl, P., Movafeghi, A., Coughlan, S., Denecke, J., Hillmer, S. and Robinson, D. G. (2000). In situ localization and in vitro induction of plant COPI-coated vesicles. Plant Cell 12,2219-36.

170. Porte B., Oertel-Buchheit P., Granger-Schnarr M., Schnarr M. (1997). Fos Leucine Zipper Variants with Increased Association Capacity. Nucleic Acids Res. 25(15): 3026-3033.

171. Pratelli, R., Sutter, J. U. and Blatt, M. R. (2004). A new catch in the SNARE. Trends Plant Sei 9,187-95.

172. Pruyne DW, Schott DH, Bretscher A (1998) Tropomyosin-containing actin cables direct the Myo2p-dependent polarized delivery of secretory vesicles in budding yeast. J Cell Biol 143: 1931-1945

173. Qi, Y., Pelissier, T., Itaya, A., Hunt, E., Wassenegger, M. and Ding, B. (2004). Direct role of a viroid RNA motif in mediating directional RNA trafficking across a specific cellular boundary. Plant Cell.16(7): 1741 1752

174. Radford J.,E., and White R.,G. (1998) Localization of myosin -like protein to plasmodesmata. Plant J. 14(6): 743-50

175. Raemdonck, D. van, Pesquet E., Cloquet S., Beeckman H., Boeijan W., Goffner D., El Jaziri M., and Baucher M.(2005). Molecular changes associated with the setting up of secondary growth in aspen. J. of Experimental Botany. 56(418): 2211-2227.

176. Raes, J., Rohde, A., Holst-Christensen, J., Van de Peer, Y. and Boeijan, W. (2003) Genome-wide characterization of the lignification toolbox in Arabidopsis. Plant Physiol. 133:1051-1071

177. Reichel C, Mas P, Beachy RN (1999) The role of the ER and cytoskeleton in plant viral trafficking. Trends Plant Sei 4:458^62

178. Rein, U., Andag, U., Duden, R., Schmitt, H. D. and Spang, A. (2002). ARF-GAP-mediated interaction between the ER-Golgi v-SNAREs and the COPI coat. J Cell Biol 157,395-404.

179. Ridley BL, O'Neill MA, Mohnen D (2001) Pectins: structure, biosynthesis, and oligogalacturonide related signaling. Phytochemistry 57: 929967

180. Rinne, P.L.H., Kaikuranta, P.M., van der Schoot, C. (2001). Theshoot apical meristem restores its symplastic organisation duringchilling-induced release from dormancy. Plant J., 26,249-264.

181. Robards M.R., Lucas W.J. (1990) Plasmodesmata. Annu Rev. Plant. Physiol. Plant Mol. Biol 41: 368-419.

182. Roberts, A.G., and K.J. Oparka. 2003. Plasmodesmata and the control of symplastic transport.Plant Cell Environ. 26:103-124.

183. Roberts K. (2001) How the Cell Wall Acquired a Cellular Context. Plant Physiology, January 2001, Vol. 125, pp. 127-130.

184. Roberts A. G. and Oparka K. J. (2003) Plasmodesmata and the control of symplastic transport. Plant, Cell and Environment 26:103-124.

185. Roberts, A.G., Santa-Cruz, S., Roberts, I.M., Prior, D.A.M., Turgeon,.R., Oparka, K.J. (1997). Phloemunloading in sink leaves ofNicotiana benthamiana: comparison of a fluorescent solute withafluorescent virus. Plant Cell, 9:1381-1396.

186. Robinson, D. G., Hinz, G. and Holstein, S. E. (1998). The molecular characterization of transport vesicles. Plant Mol Biol 38,49-76.

187. Roth, M. G. (1999). Inheriting the Golgi. Cell 99, 559-62.

188. Ruiz-Medrano, R., Xoconostle-Càzares, B., and Lucas, W.J. (1999). Phloem long-distance transport of CmNACP mRNA: Implications for supracellular regulation in plants. Development 126,4405-4419.

189. Runions J, Brach T, Ku"hner S, Hawes C (2005) Photoactivation of GFP for quantification of protein dynamics within the endoplasmic reticulum membrane. J Exp Bot 57:43-50

190. Rushton, P.J., Macdonald, H., Huttly, A.K., Lazarus, C.M., and Hooley, R. (1995). Members of a new family of DNA-binding proteins bind to a conserved cis-element in the promoters of a-Amy2 genes. Plant Mol. Biol. 29, 691-70

191. Rushton, P.J., Torres, J.T., Parniske, M., Wernert, P., Hahlbrock, K., and Somssich, I.E. (1996). Interaction of elicitor-induced DNA-binding proteinswith elicitor response elements in the promoters of parsley PR1 genes. EMBOJ. 15, 5690-5700.

192. Russinova, E., Borst, J. W., Kwaaitaal, M., Cano-Delgado, A., Yin, Y., Chory, J. and de Vries, S. C. (2004). Heterodimerization and endocytosis of Arabidopsis brassinosteroid receptors BRI1 and AtSERK3 (BAK1). Plant Cell 16, 3216-29.

193. Sacher, M., Barrowman, J., Wang, W., Horecka, J., Zhang, Y., Pypaert, M. and Ferro-Novick, S. (2001). TRAPP I implicated in the specificity of tethering in ER-to-Golgi transport. Mol Cell 7,433-42.

194. Saito, T., Yamana, K., Okada, Y. (1990). Long-distance movement and viral assembly of tobacco mosaic virus mutants. Virology. 176: 329-336.

195. Sambrook, J., Fritsch, E.F., Maniatis, T. (1989). Molecular Cloning. A Laboratory Manual. 2nd edn. Cold Spring Harbor, NY, Cold Spring Harbor Laboratory.

196. Sanderfoot, A. A., Assaad, F. F. and Raikhel, N. V. (2000). The Arabidopsis genome. An abundance of soluble N-ethylmaleimide-sensitive factor adaptor protein receptors. Plant Physiol 124,1558-69.

197. Sanderfoot, A. A., Kovaleva, V., Bassham, D. C. and Raikhel, N. V. (2001). Interactions between syntaxins identify at least five SNARE complexes within the Golgi/prevacuolar system of the Arabidopsis cell. Mol Biol Cell 12, 3733-43.

198. Sapperstein, S. K., Walter, D. M., Grosvenor, A. R., Heuser, J. E. and Waters, M. G. (1995). pi 15 is a general vesicular transport factor related to the yeast endoplasmic reticulum to Golgi transport factor Usolp. Proc Natl Acad Sci U S A 92,522-6.

199. Schott D, Ho J, Pruyne D, Bretscher A (1999) The COOH-terminal domain of Myo2p, a yeast myosin V, has a direct role in secretory vesicle targeting. J Cell Biol 147: 791-808

200. Serafini, T., Orci, L., Amherdt, M., Brunner, M., Kahn, R. A. and Rothman, J. E. (1991a). ADP-ribosylation factor is a subunit of the coat of Golgi-derived COP-coated vesicles: a novel role for a GTP-binding protein. Cell 67,239-53.

201. Shorter, J. and Warren, G. (2002). Golgi architecture and inheritance. Annu Rev Cell Dev Biol 18, 379-420.

202. Sibout R, Eudes A, Mouille G, Pollet B, Lapierre C, Jouanin L and Seguin A (2005): CINNAMYL ALCOHOL DEHYDROGENASE-C and -D are the primary genes involved in lignin biosynthesis in the floral stem of Arabidopsis. The Plant Cell. 17:2059-2076.

203. Sollner, T., Whiteheart, S. W., Brunner, M., Erdjument-Bromage, H., Geromanos, S., Tempst, P. and Rothman, J. E. (1993). SNAP receptors implicated in vesicle targeting and fusion. Nature 362,318-24.

204. Solovyev, A. G., Stroganova, T. A., Zamyatnin, A. A., Jr., Fedorkin, O. N., Schiemann, J. and Morozov, S. Y. (2000). Subcellular sorting of small membrane-associated triple gene block proteins: TGBp3-assisted targeting ofTGBp2. Virology 269,113-27.

205. Storms, M.M., Kormelink, R., Peters, D., van Lent, J.W., Goldbach, R.W. (1995). The nonstructural NSm protein of tomato spotted wilt virus induces tubular structures in plant and insect cells. Virology, 214: 485-493.

206. Sudhof, T. C. (2004). The synaptic vesicle cycle. Annu Rev Neurosci 27, 509-47.

207. Surpin, M. and Raikhel, N. (2004). Traffic jams affect plant development and signal transduction. Nat Rev Mol Cell Biol 5,100-9.

208. Suvorova, E. S., Duden, R. and Lupashin, V. V. (2002). The Sec34/Sec35p complex, a Yptlp effector required for retrograde intra-Golgi trafficking, interacts with Golgi SNAREs and COPI vesicle coat proteins. J Cell Biol 157, 631-43.

209. Sztul, E. and Lupashin, V. (2006). Role of tethering factors in secretory membrane traffic. Am J Physiol Cell Physiol 290, CI 1-26.

210. Terry B.R and Robards A.B.(1987) Hydrodynamic radius alone governs the mobility of molecules trough plasmodesmata. Planta 172: 145-157 .

211. Tilney, L.G., Cooke, T.J., Connelly, P.S., Tilney, M.S. (1991). The structure of plasmodesmata as revealed by plasmolysis, detergent extraction, and protease digestion. J Cell Biol, 112, 739-747.

212. Trutnyeva K, Bachmaier R, Waigmann E (2005) Mimicking carboxyterminal phosphorylation differentially effects subcellular distribution and cell-to-cell movement of tobacco mosaic virus movement protein. Virology 332: 563-577

213. Tucker E.B. (1982)TransIocation in the staminal hairs of Setcreasea purpurea. I. Study of ultrastructure and cell-to-cell passage of molecular probes. Protoplasma 113:193-201.

214. Ueda, T. and Nakano, A. (2002). Vesicular traffic: an integral part of plant life. Curr Opin Plant Biol 5, 513-7.

215. Ueda, T., Ueraura, T., Sato, M. H. and Nakano, A. (2004). Functional differentiation of endosoraes in Arabidopsis cells. Plant J 40,783-9.

216. Uemura, T., Ueda, T., Ohniwa, R. L., Nakano, A., Takeyasu, K. and Sato, M. H. (2004). Systematic analysis of SNARE molecules in Arabidopsis: dissection of the post-Golgi network in plant cells. Cell Struct Funct 29,49-65.

217. Ungermann, C. and Langosch, D. (2005). Functions of SNAREs in intracellular membrane fusion and lipid bilayer mixing. J Cell Sci 118, 381928.

218. Van Lent J., Wellink J., and Goldbach R. (1990) Evidence for the involvement of the 58K and 48K proteins in the intercellular movement of cowpea mosaic virus. J.Gen. Virol. 71:219-223.

219. Wada T, Tachibana T, Shimura Y and Okada K (1997) Epidermal cell differentiation in Arabidopsis determined by a myb homolog, CPC. Science, 277,1113-1116.

220. Waigmann E, Chen MH, Bachmaier R, Ghoshroy S, Citovsky V (2000) Regulation of plasmodesmal transport by phosphorylation of tobacco mosaic virus cell-to-cell movement protein. EMBO J 19:4875-4884

221. Waigmann, E., Turner, A., Peart, J., Roberts, K., Zambryski, P. (1997). Ultrastructural analysis of leaf trichome plasmodesmata reveals major differences from mesophyll plasmodesmata. Planta. 203: 75-84.

222. Waigmann, E., Zambryski, P., 1995. Tobacco mosaic virus movement protein-mediated protein transport between trichrome cells. Plant Celli, im-im.

223. Wang, Z., Yang, P., Fan, B., and Chen, Z. 1998. An oligo selection procedure for identification of sequence-specific DNA-binding activities associated with plant defense. Plant J. 16:515-522.

224. Ward T.H., Polishchuk R.S., Caplan S., Hirschberg K. and Lippincottschwartz J. (2001) Maintenance of Golgi structure and function depends on the integrity of ER export. J. Cell Biol., 155:, 557-570.

225. Waters, M. G., Clary, D. O. and Rothman, J. E. (1992). A novel 115-kD peripheral membrane protein is required for intercisternal transport in the Golgi stack. J Cell Biol 118,1015-26.

226. Wieczorek A and Sanfacon H. (1993) Characterization and subcellular location of Tomato Ringspot nepovirus putative movement protein . Virology, ,194:734-742.

227. Wickner, W. and Haas, A. (2000). Yeast homotypic vacuole fusion: a window on organelle trafficking mechanisms. Annu Rev Biochem 69, 247-75.

228. Willats WG, McCartney L, Mackie W, Knox JP (2001) Pectin: cell biology and prospects for functional analysis. Plant Mol Biol 47: 9-27

229. White, R.G., Badelt, K., Overall, R.L., Vesk, M. (1994). Actin associated with plasmodesmata. Protoplasma, 180, 169-184.

230. Wolf, S., Deom, C.M., Beachy, R.N., Lucas, W.J. (1989). Movement protein of tobacco mosaic virus modifies plasmodesmatal size exclusion limit. Science, 426:377-379.

231. Wolf S, Deom CM, Beachy R, Lucas WJ (1991) Plasmodesmatal function is probed using transgenic tobacco plants that express a virus movement protein. Plant Cell 3: 593-604

232. Xiong, Z., Kim, K.H., Giesman-Cookmeyer, D., Lommel, S.A. (1993). The roles of the red necrotic mosaic virus capsid and cell-to-cell movement proteins in systemic infection. Virology, 192,27-32.

233. Xu, R.M., Carmel, G., Sweet, R.M., Kuret, J., Cheng, X., 1995. Crystal structure of casein kinase-1, a phosphate-directed protein kinase. EMBO J. 14,1015-1023.

234. Yamakawa, H., Seog, D. H., Yoda, K., Yamasaki, M. and Wakabayashi, T. (1996). Usol protein is a dimer with two globular heads and a long coiled-coil tail. J Struct Biol 116,356-65.

235. Yahalom, A., Lando, R., Katz, A., Epel, B.L., 1998. A calcium-dependent protein kinase is associated with maize mesocotyl plasmodesmata. J. Plant Physiol. 153, 354-362.

236. Yahalom A., Warmbrodt R.D., Laird D.W., Traub O., Revel J.P., Willecke K, Epel B.L.(1991). Maize mesocotyl plasmodesmata proteins cross-react with connexin gap junction protein antibodies. Plant Cell 3:407-417.

237. Yang, P., Wang, Z., Fan, B., Chen, C. and Chen, Z. (1999) A pathogen- and salicylic acid-induced WRKY DNA-binding activity recognizes the elicitor response element of the tobacco class I chitinase gene promoter. Plant Cell 13: 1779-1790

238. Yoo, B.C., Kragler, F., Varkonyi-Gasic, E., Haywood, V., Archer-Evans, S., Lee, Y.M., Lough, T.J., Lucas, W.J., 2004. A systemic small RNA signaling system in plants. Plant Cell 16,1979-2000.

239. Youn B , Camacho R, Moinuddin SG, Lee C , Davin LB, Lewis NG , Kang C ( 2006 ). Ciystal structures and catalytic mechanism of the Arabidopsis cinnamyl alcohol dehydrogenases AtCAD5 and AtCAD4 . Org. Biomol. Chem.,4: 1687- 1697.

240. Zambiyski, P., and K. Crawford. 2000. Plasmodesmata: gatekeepers for cell-to-cell transport of developmental signals in plants. Annu. Rev. Cell Dev. Biol. 16: 393^121.

241. Zheng H.„ Wang G.„ and Zhang L., (1997) Alfalfa Mosaic Virus Movement Protein induces yubules in plant protoplasts. MPMI 10 (No. 8): pp. 1010-1014

242. Zerial, M. and McBride, H. (2001). Rab proteins as membrane organizers. Nat Rev Mol Cell Biol 2,107-17.

243. Zhao, L., Helms, J. В., Brugger, В., Harter, C., Martoglio, В., Graf, R., Brunner, J. and Wieland, F. T. (1997). Direct and GTP-dependent interaction of ADP ribosylation factor 1 with coatomer subunit beta. Proc Natl Acad Sci U S A 94,4418-23.

244. Zhao, L., Helms, J. В., Brunner, J. and Wieland, F. T. (1999). GTP-dependent binding of ADP-ribosylation factor to coatomer in close proximity to the binding site for dilysine retrieval motifs and p23. J Biol Chem 274,14198-203.