Цитогенетическая и молекулярная организация B-хромосом хищных семейства Canidae тема диссертации и автореферата по ВАК РФ 03.00.15, кандидат биологических наук Юдкин, Дмитрий Владимирович

• Юдкин, Дмитрий Владимирович
• кандидат биологических наук
• 2006

Оглавление диссертации кандидат биологических наук Юдкин, Дмитрий Владимирович

СПИСОК СОКРАЩЕНИЙ.

ВВЕДЕНИЕ.

ГЛАВА 1. ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ.

1.1. В-хромосомы.

1.1.1. Происхождение и эволюция В-хромосом.

Ф 1.1.1.1. Происхомедение В-хромосом.

1.1.1.2. «Храповик Мюллера» в эволюции В-хромосом.

1.1.2. В-хромосомы млекопитающих.

1.1.3. В-хромосомы млекопитающих из отряда хищных.

1.1.4. Молекулярный состав В-хромосом.

1.1.4.1 Рибосомная ДНК.

1.1.4.2 Транспозоны.

1.1.4.3. Теломерные повторы.

1.1.4.4. Другие виды повторенной ДНК.

1.2. Структура и функции гена C-KIT.

1.2.1. Структура, экспрессия и локализация гена C-KIT.

1.2.2. Структура тирозин-киназного рецептора Kit.

1.2.3. Kit лиганд.

1.2.4. Сигнальные пути, активируемые рецептором Kit.

1.2.5. Мутации гена C-KIT.

1.2.6. Амплификация гена C-KIT.

1.3. Кариотипические и филогенетические характеристики некоторых

• представителей семейства Canidae.

1.3.1. Кариотипические взаимоотношения в семействе Canidae.

1.3.2. Филогенетические отношения в семействе Canidae.

1.3.3. Геном собаки как один из базовых геномов в современных исследованиях.

ГЛАВА 2. МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ.

2.1. МАТЕРИАЛЫ.

2.2. МЕТОДЫ.

2.2.1. Реамплификация библиотек в DOP-ПЦР.

2.2.2. Мечение зондов в DOP-ПЦР.

2.2.3. Полимеразная цепная реакция.

2.2.4. Мечение ВАС в реакции NICK-трансляции.

2.2.5. Получение Cot10 ДНК лисицы.

2.2.6. Получение препаратов метафазных хромосом.

2.2.7. Дифференциальная окраска хромосом.

2.2.8. Флуоресцентная in situ гибридизация.

2.2.9. Fiber-FISH.

2.2.10. Саузерн-блот гибридизация.

2.2.11. Дот-блот гибридизация интрона гена C-KIT с геномной ДНК разных видов.

ГЛАВА 3. РЕЗУЛЬТАТЫ И ОБСУЖДЕНИЕ.

3.1. Локализация гена C-KIT на В-хромосомах различных видов.

3.1.1. Локализация C-KIT на хромосомах лисицы.

3.1.2. Локализация C-KIT на хромосомах енотовидной собаки.

3.1.3. Локализация C-KIT на хромосомах собаки и песца.

3.1.4. Оценка дозы гена C-KIT.

3.2. Анализ структуры гена C-KIT, локализованного в В-хромосомах.

3.2.1. Анализ геномных блотов.

3.2.2. Определение экзон-интронной структуры гена C-KIT, локализованного в В-хромосомах.

3.3. Определение размера аутосомного фрагмента, встроенного в В-хромосому

3.3.1. Локализация генов, окружающих C-KIT, на хромосомах Canidae.

3.3.2. Скрининг B-хромосомных библиотек с помощью ПЦР.

3.4. Локализация различных видов повторов на В-хромосомах.

3.4.1. Локализация генов рибосомных РНК.

3.4.2. Локализация LINE.

3.4.3. Локализация Bsp-повтора.

Введение диссертации (часть автореферата) на тему «Цитогенетическая и молекулярная организация B-хромосом хищных семейства Canidae»

Актуальность проблемы. Существует гипотеза, что быстрые темпы кариотипической эволюции часто сопровождаются появлением добавочных или В-хромосом, которые характеризуются необязательностью для жизнеспособности организма. Число добавочных хромосом может варьировать как на внутри- так и на межиндивидуальном уровне. К настоящему времени сверхчисленные хромосомы тщательно исследованы с помощью цитогенетических методов. Сейчас добавочные хромосомы активно изучают с помощью молекулярных методов.

До последнего времени в В-хромосомах млекопитающих не было обнаружено уникальных генов. Необязательность добавочных элементов в кариотипе и варьирование их числа наводили на мысль об их функциональной инертности. При сравнительном картировании геномов собаки (Canis familiaris) и лисицы (Vulpes vulpes) с помощью ВАС-клонов не было получено ни одного сигнала на добавочных хромосомах лисицы (Switonski et al., 2004).

Ф Работы по изучению добавочных хромосом и доместикации лисиц были начаты в Институте Цитологии и Генетики СО РАН академиком Д.К. Беляевым с коллегами (Беляев и др., 1974). В Лаборатории цитогенетики человека и животных ИЦиГ СО РАН проводятся работы по сравнительному картированию геномов собаки и лисицы, в рамках совместного проекта с Институтом Ветеринарии Корнельского университета (Нью-Йорк, США). В ходе этих работ, один из ВАС-клонов, содержащий последовательности онкогена C-KIT собаки, кроме сигналов на аутосомах, дал дополнительные сигналы на В-хромосомах лисицы (В.Р. Беклемишева, Н.В. Воробьева, личное сообщение). Этот ген кодирует трансмембранную рецепторную тирозин-киназу, которая играет очень важную роль при дифференцировке и пролиферации гемопоэтических клеток, меланобластов и ранних половых клеток (Ashman, 1999). Известно, что мутации в гене C-KIT, а также изменение его копийности в геноме (например, дупликации)

Ф приводят к тяжелым для организма последствиям (нарушениям пигментации, различным видам рака). Район, гомологичный гену C-KIT, был обнаружен в средней части генома провируса саркомы кошек Харди-Зукермана 4, и назван, соответственно, v-kit. (Besmer et al., 1986; Marklund et al., 1998; Ashman, 1999; Heinrich et al., 2002a)

Поскольку В-хромосомы считаются генетически инертными элементами -возникает вопрос, почему такой важный ген, копийность которого является критической для нормального функционирования организма, локализован в добавочных хромосомах, число которых варьирует. Еще одна проблема - это происхождение В-хромосомной копии гена. Источником дополнительной копии С-KIT может быть аутосома (непроцессированный ген или копия тРНК) или геном провируса.

В-хромосомы млекопитающих еще интересны потому, что их частота встречаемости в этом классе минимальна среди всех групп организмов, несущих добавочные элементы, что вероятно, связано с низкой толерантностью млекопитающих к лишней ДНК. Тем не менее, у млекопитающих существует большое разнообразие систем добавочных элементов. Все это делает данный класс очень удобным объектом для исследования В-хромосом, как в плане анализа их структуры и молекулярного состава, так и в плане выяснения их функций.

Цели и задачи исследования. Целью данной работы является исследование структуры и возможных функций добавочных хромосом Canidae.

В связи с этим были поставлены следующие задачи:

1. Локализовать ген C-KIT на метафазных хромосомах видов семейства Canidae, содержащих В-хромосомы, а так же на метафазных хромосомах близкородственных видов, не содержащих добавочные элементы.

2. Исследовать структуру В-хромосомной копии гена C-KIT и сравнить ее со структурой этого же гена, локализованного в аутосомах.

3. Провести исследование добавочных элементов на предмет присутствия в них других последовательностей, окружающих ген C-KIT, в аутосоме.

4. Проанализировать распределение повторенных последовательностей в В-хромосомах.

Научная новизна и практическая ценность. Впервые в добавочных хромосомах млекопитающих был локализован уникальный ген C-KIT, псевдоген Rpl23a и часть гена KDR. Проанализирована структура В-хромосомной копии гена C-KIT. Впервые определено, что добавочные хромосомы представителей Canidae содержат протяженный фрагмент гомологичный фрагменту Cfa13. Гены C-KIT, PDGFRA и KDR впервые локализованы на хромосомах собаки, лисицы, песца и двух подвидов енотовидной собаки. Впервые предположено единое аутосомное происхождение В-хромосом лисицы и енотовидной собаки.

Апробация работы. Результаты исследования были доложены на следующих конференциях:

Международное рабочее совещание «Происхождение и эволюция биосферы» (Новосибирск, 26-29 июня 2005 г.);

XV Всероссийское совещание "Структура и функции клеточного ядра" (Санкт-Петербург, 18-20 октября 2005 г.);

Отчетная сессия Института Цитологии и Генетики (2005 г.);

Конференция «Современные проблемы генетики, радиобиологии, радиоэкологии и эволюции» им. Н.В.Тимофеева-Ресовского (Ереван, Армения, 812 сентября 2005 года), где работа получила приз «Генетического Общества Америки»;

2-ой Конгресс Международного Цитогенетического Общества (Университет Кента, Великобритания, 25-29 июня 2006г.)

Вклад автора. Автором выполнены все работы по локализациям с помощью FISH, а также скрининг В-хромосомных библиотек с помощью ПЦР. Саузерн-блот гибридизация и секвенирование проведены совместно с А.В. Кукековой (Корнельский университет, Нью-Йорк, США).

Структура и объем диссертации. Работа состоит из введения, обзора литературы, описания материалов и методов, результатов и обсуждения, заключения, выводов и списка цитируемой литературы, содержащего 195 ссылок. Диссертация изложена на 110 страницах машинописного текста, содержит 5 таблиц и 19 рисунков.

Заключение диссертации по теме «Генетика», Юдкин, Дмитрий Владимирович

Выводы

1. С помощью FISH ген C-KIT впервые локализован на всех В-хромосомах лисицы, китайской и японской енотовидных собак. Показано, что число копий гена у лисицы и енотовидной собаки положительно коррелирует с числом добавочных хромосом.

2. Показано, что В-хромосомы лисицы содержат полноразмерную копию гена C-KIT. Секвенирование 10 экзонов гена выявило сохранение экзон/интронных границ и высокую консервативность В-хромосомной копии (найдено две замены, отличающие ее от гена собаки).

3. Ген C-KIT впервые локализован на хромосомах лисицы в районе 2р12, песца в районе 11р13, собаки в районе 13q22-23, японской енотовидной собаки в районе 2qcen и китайской енотовидной собаки в районе 6qprox. Все места локализации этого гена на аутосомах, по данным сравнительного пэйнтинга, являются гомологичными. Гены KDR и PDGFRA впервые локализованы на хромосомах лисицы в районе 2р12, китайской енотовидной собаки в районе 6qprox и японской енотовидной собаки в районе 2qcen.

4. Определены размеры В-хромосомных фрагментов, гомологичных аутосомам. Аутосомный фрагмент в В-хромосомах лисицы составляет минимум 480 т.п.н. и включает ген C-KIT, псевдоген Rpl23a и большой межгенный участок с 5' и 3' концов от C-KIT. Аутосомный фрагмент в В-хромосомах енотовидной собаки составляет минимум 490 т.п.н. и включает ген C-KIT, псевдоген Rpl23a, часть гена KDR и большой межгенный участок с 5' конца от гена C-KIT.

5. Исследовано распределение различных видов повторов в В-хромосомах лисицы и енотовидной собаки. Показано, что после дивергенции этих видов 12,5 млн. лет назад в их добавочных хромосомах сохранилась высококонсервативная аутосомная вставка, в то время как по составу повторенных последовательностей добавочные элементы этих видов сильно отличаются. Более того, два подвида енотовидной собаки, китайская и японская, отличаются между собой по локализациям в В-хромосомах генов рРНК.

Список литературы диссертационного исследования кандидат биологических наук Юдкин, Дмитрий Владимирович, 2006 год

1. Беляев Д.К., Волобуев В.Т., Раджабли С.И., Трут Л.Н. Полиморфизм и мозаицизм по добавочным хромосомам у серебристо-черных лисиц. // Генетика. 1974. Т. 10. С. 58-67.

2. Боескоров Г.Г., Картавцева И.В., Загороднюк И.В., Белянин А.Н., Ляпунова Е.А. Ядрышкообразующие районы и В-хромосомы лесных мышей (Mammalia, Rodentia, Apodemus). II Генетика. 1995. Т. 31. С. 185-192.

3. Борисов Ю.М., Кораблев В.П., Картавцева И.В., Ляпунова Е.А., Воронцов Н.Н. Добавочные хромосомы крысовидного хомячка и его систематические положение. //Тез. докл. 2жВсесоюзной териологической конференции. М.: Наука, 1978. С. 13-14.

4. Гилева Е.А. В-хромосомы, необычное наследование половых хромосом и соотношение по полу у Dicrostonyx torquatus Pall. (1779). II Докл. Акад. Наук СССР. 1973. Т. 213. С. 952-955.

5. Гилева Е.А. Противоположные примеры хромосомной эволюции в двух родах леммнгов, Lemmus и Dicrostonyx (Mammalia, Rodentia). // Генетика. 1983. Т. 60. С. 173-179.

6. Графодатский А.С., Раджабли С.И. Хромосомы сельскохозяйственных и лабораторных млекопитающих. Новосибирск.: Наука, 1988.128 с.

7. Иванов С.В., Потапов В.А., Сосновцев С.В., Ромащенко А.Г. Организация

8. Вэр-повторов в геноме лисицы. // Генетика. 1989. Т. 25(5). С. 809-818.

9. Картавцева И.В. Описание В-хромосом в кариотипе полевой мыши Apodemus agrarius. II Цитол. Генет. 1994. Т. 28. С. 96-97.

10. Ковальская Ю.М. В-хромосомы и ХО-самцы узкочерепных полевок Microtus/Stenocranius/gregalis из северной Монголии. // Доклады 7-ой всесоюзной конференции 1. Нальчик, Свердловск, 1988. С. 73-74.

11. Краль Б. Характеристика хромосом некоторых мышевидных грызунов (Muridae) азиатской части СССР. // Зоологические листы. 1971. Т. 20. С. 331-347.

12. Павлинов И.Я. Систематика современных млекопитающих. М.: Изд-во МГУ, 2003. 297 с.

13. Потапов В.А., Иванов С.В., Графодатский А.С., Кудряшова Н.В., Ромащенко А.Г. Сравнительный анализ свойств высокоповторенной ДНК лисицы и песца (Carnivora, Canidae). II Генетика. 1987. Т. 23. С. 1104-1112.

14. Раджабли С.И., Исаенко В.П., Волобуев В.Г. Исследование природы и роли добавочных хромосом серебристо-черных лисиц. Поведение в мейозе. // Генетика. 1978. Т. 14. С. 439-443.

15. Соколов В.Е. Систематика млекопитающих (китообразные, хищные, .). М.: Высш. школа, 1979. 528 с.

16. Соколов В.Е. Приходько В.И. Таксономия кабарги (Artiodactyla, Mammalia). // Изв. Акад. наук. 1998. С. 37-46.

17. Чернявский Ф.Б., Козловский А.И. Видовой статус и история копытных леммингов (Dicrostonyx, Rodentia) острова Врангеля. // Зоол. Журнал. 1980. Т. LIX (2). С. 266-273.

18. Aguilera M., Perez-Zapata A. Karyotyping of Holochilus venezuelae (Rodentia, Cricetidae). //Acta Cient Venez. 1989. V. 40(3). P. 198-207.

19. Allander S.V., Nupponen N.N., Ringner M., Hostetter G., Maher G.W., Goldberger N., Chen Y., Carpten J., Eikahloun A.G, Meltzer P.S. Gastrointestinal stromal tumors with KIT mutations exhibit a remarkably homogeneous gene expression

20. Ф profile. // Cancer Research. 2001. V. 61. P. 8624-8628.

21. Alvarez Y., Coll M.D., Bastida P., Ortega J.J., Caballin M.R. AML1 amplification in a child with acute lymphoblastic leukemia. // Cancer Genet. Cytogenet. 2003. V. 140(1). P. 58-61.

22. Andrades-Miranda J., Oliveira L.F.B., Zanchin N.I.T., Mattevi M.S: Chromosomal description of the rodent genera Oecomys and Nectomys from Brazil. // Acta Ther. 2001. V. 46. P. 269-278.

23. Andre C., Martin E., Cornu F., Hu W.X., Wang X.P., Galibert F. Genomic organization of the human c-kit gene: evolution of the receptor tyrosine kinase subclassщ III. // Oncogene. 1992. V.7 (4). P. 685-691.

24. Arber D.A., Tamayo R., Weiss L.M. Paraffin section detection of the c-kit gene product (CD117) in human tissues: Value in the diagnosis of mast cell disorders. // Hum. Pathol. 1998. V. 29. P. 498-504.

25. Ashman L.K. The biology of stem cell factor and its receptor C-kit. // The International Journal of Biochemistry & Cell Biology. 1999. V. 31. P. 1037-1051.

26. Azzalin C.M., Nergadze S.G., Guilotto E.: Human intrachromosomal telomeric-like repeats: sequence organization and mechanisms of origin. // Chromosoma. 2001. V.110. P. 75-82.

27. Bardeleben C., Moore R.L., Wayne R.K. A molecular phylogeny of the Canidae based on six nuclear loci. // Molecular Phylogenetics and Evolution. 2005. V. 37. P.815.831.

28. Battaglia E. Cytogenetics of В chromosomes. // Caryologia. 1964. V. 17. P. 245299.

29. Baverstock P.R., Wats C.H.S., Hogarth J.T: Heterochromatin variation in Australian rodent Uromys caudimaculatus. //Chromosoma. 1976. V. 59. P. 397-403.

30. Baverstock P.R., Wats C.H.S., Hogarth J.T: Chromosome evolution in Australian rodents. I. The Pseudomyinae, the Hydromyinae and Uromys/Melomys group. // Chromosoma. 1977. V. 61. P. 9-125.

31. Beghini A., Cairoli R., Morra E., Larizza L. In Vivo differentiation of mast cells from acute myeloid leukemia blasts carrying a novel activating ligand-independent c-kit mutation. // BCMD. 1998. V. 24(12). P. 262-270.

32. Beghini A., Magnani I., Ripamonti C.B., Larizza L. Amplification of a novel c-Kit activating mutation Asn822-Lys in the Kasumi-1 cell line: a t(8,21)-Kit mutant model for acute myeloid leukemia. //The Hematology Journal. 2002. V. 3. P. 157-163.

33. Belcheva R.G., Topashka-Ancheva M.N., Atanassov N. Karyological studies of five species of mammals from Bulgarian fauna. // Comptes rendus de I'Academie bulgare des Sciences. 1988. V. 42. P. 125-128.

34. Belyaev D.K., Ruvinsky A.O., Trut L.N. Inherited activation-inactivation of the star gene in the foxes. //The Journal of Heredity. 1981. V. 72. P. 267-274.

35. Bhatnagar V.S. Microchromosomes in the somatic cells of Vulpes bengalensis Shaw. // Chromosome Info Service. 1973. V. 15. P. 32.

36. Bhatnagar V.S., Srivastava M.D.L. Somatic chromosomes of four common bats of Allahabad. // Cytologia. 1974. V. 39. P. 327-334.

37. Bininda-Emonds O.R.P., Gittleman J.L., Purvis A. Building large trees by combing phylogenetic information: a complete phylogeny of the extant Carnivora (Mammalia). // Biol. Rev. 1999. V. 74. P. 143-175.

38. Blanks G.A., Shellhammer S.H. Chromosome polymorphism in California populations of harvest mice. // J Mamm. 1968. V. 49. P. 726-731.

39. Blume-Jensen P., Jiang G., Hyman R., Lee K.-F., O'Gorman S., Hunter T. Kit/stem cell factor receptor-induced activation of phosphatidylinositol З'-kinase is essential for male fertility. // Nature Genetics. 2000. V. 24(2). P. 157-162.

40. Borin L.A., Martin-Santos I.C. Study on karyotype and occurrence of В chromosomes in two endemic species of the genus Pimelodus (Siluriformes, Pimelodidae) from the river Iguacu. // Hereditas. 2004. V. 140. P. 201-209.

41. Broudy VC, Smith FO, Lin N, et al: Blasts from patients with acute myelogenous leukemia express functional receptors for stem cell factor. // Blood 1992. V. 80. P. 6067.

42. Cabrera J., Bakkali M., Bugrov A., Warchalowska-Sliwa E., Lopez-Leon M.D., Perfectii F., Camacho J.P.M. Multiregional origin of В chromosomes in the grasshopper Eyprepocnemis plorans. II Chromosoma. 2003. V. 112. P. 207-211.

43. Camacho J.P.M., Sharbel T.F., Beukboom L.W. B-chromosome evolution. // Phil. Trans. R. Soc. Lond. B. 2000. V. 355. P. 163-178.f

44. Canonico В., Felici C., Papa S. CD117. //J Biol Regul Homeost Agents. 2001. V. 15. P. 90-94.

45. Cavagna P., Stone G., Stanyon R. Black rat (Rattus rattus) genomic variability characterized by chromosome painting. // Mammalian Genome. 2002. V. 13. P. 157163.

46. Chabot В., Stephenson D.A., Chapman V.M., Besmer P., Bernstein A. The proto-oncogene c-kit encoding a transmembrane tyrosine kinase receptor maps to the mouse W locus. // Nature. 1988. V. 335. P. 88-89.

47. Chiarelly A.B. The chromosomes of the Canidae. In: Fox MW. The wild Canids. New York: Van Nostrand Reinhold. 1975. P. 40-53.

48. Civitelli M.V., Consentino P., Capanna E. Inter- and intra-individual chromosome variability in Thamnomys (Grammomys) gazellae (Rodentia, Muridae) B-chromosomes and structural heteromorphisms. // Genetica. 1989. V. 79. P. 93-105.

49. Dobigny G., Ozouf-Costaz C., Waters P.D., Bonillo C., Coutanceau J.P., Volobuev V. LINE-1 amplification accompanies explosive genome repatterning in rodents. // Chromosome Research. 2004. V. 12. P. 787-793.

50. Donald T.M., Houben A., Leach C.R., Timmis J.N. Ribosomal RNA genes specific to the В chromosomes in Brachycome dichromosomatica are not transcribed in leaf tissue. //Genome. 1997. V. 40. P. 674-681.

51. Eickbush D.G., Eickbush Т.Н., Werren J.H. Molecular characterization of repetitive DNA sequences from а В chromosome. // Chromosoma. 1992. V. 101. P. 575-583.

52. Fagundes V., Camacho J.P.M., Yonenaga-Yassuda Y. Are the dot-like chromosomes in Trinomys iheringi (Rodentia, Echimyidae) В chromosomes? // Cytogenet Genome Res. 2004. V. 106. P. 159-164.

53. Fidlerova H., Senger G., Kost M., Sanseau P., Sheer D. Two simple procedures for releasing chromatin from routinely fixed cells for fluorescence in situ hybridization. // Cytogenetics and Cell Genetics. 1994. V. 65. P. 203-205.

54. Fletcher J.A. Role of KIT and Platelet-Derived Growth Factor Receptors as oncoproteins. //Seminars in Oncology. 2004. V. 31(2). P. 4-11.

55. Fleishman R.A., Saltman D.L., Stastny V., Zneimer S. Deletion of the c-kit protooncogen in the human developmental defect piebald trait. // Proc. Nat. Acad. Sci. 1991. V. 88. P. 10885-10889.

56. Franks Т.К., Houben A., Leach C.R., Timmis J.N. The molecular organization of а В chromosome tandem repeat sequence from Brachycome dichromosomatica. // Chromosoma. 1996. V. 105. P. 223-230.

57. Freitas T.R.O., Mattevi M.S., Oliveira L.F.B., Souza M.J., Yonenaga-Yassuda Y., Salzano F.M: Chromosome relationship in three representatives of the genus Holochilus (Rodentia, Cricetidae) from Brazil. // Genetica. 1983. V. 61. P. 13-20.

58. Funkhouser W.K., Kaiser-Rogers K. Review: significance of, and optimal screening for, HER-2 gene amplification and protein overexpression in breast carcinoma. II Ann. Clin. Lab. Sci. 2001. V. 31(4). P. 349-358.

59. Gadi I.K., Sharma Т., Raman R. Supernumerary chromosomes in Bandicota indica nemorivaga and a female individual with XX/X0 mosaicism. // Genetica. 1982. V. 58. P. 103-108.

60. Giebel L.B., Spritz R.A. Mutation of the KIT (mast/stem cell growth factor receptor) protooncogene in human piebaldism. // Proc. Nat. Acad. Sci. 1991. V. 88. P. 8696-8699.

61. Graves J.A.M. The origin and function of the mammalian Y chromosome and Y-borne genes-and evolving understanding. // BioEssays. 1995. V. 17. P. 311-321.

62. Green D.M. Muller's Ratchet and the evolution of supernumerary chromosomes. // Genome. 1990. V. 33 P. 818-824.

63. Green D.M. Structure and evolution of В chromosomes in amphibians. // Cytogenet Genome Res. 2004. V. 106. P. 235-242.

64. Gropp A., Marshall J., Flatz GM Olbrich M., Manyanondha K., Santadust A: Chromosomen polymorphismus durch uberzahlige Autosomen. Beobachtungen an der Hausratte (R. rattus). IIZ Saugetierk. 1970. V. 35. P. 363.

65. Gropp A., Marshall J., Markvong A. Chromosomal findings in the spiny mice of Thailand (genus Mus) and occurrence of a complex intraspecific variation in M. shortridgei. IIZ Saugetierk. 1973. V. 38. P. 159-168.

66. Guevara Ladron de R.G., Diaz de la Guardia R. Frequency of chromosome polymorphism for pericentric inversions and B-chromosomes in Spanish populations of Rattus rattus frugivorus. И Genetica. 1981. V. 57. P. 99-103.

67. Han Y., Liu X., Benny U., Corby Kistler H., VanEtten H.D. Genes determining pathogenicity to pea are clustered on a supernumerary chromosome in the fungal plant pathogen Nectria haematococca. II The Plant Journal. 2001. V. 25(3). P. 305-314.

68. Hayata J. Chromosomal polymorphism caused by supernumerary chromosomes in field mouse, Apodemus giliacus. II Chromosoma. 1973. V. 42. P. 403-414.

69. Hayman D.L., Martin P.G. Supernumerary chromosomes in the marsupial Schoinobates volans (Ker). //Aust J biol Sci. 1965. V. 18. P. 1081-1082.

70. Hayman D.L., Martin P.G., Waller P.F. Parallel mosaicism of supernumerary chromosomes and sex chromosomes in Echymipera kalabu (Marsupialia). // Chromosoma. 1969. V. 27. P. 371-380.

71. Haymann D.L: Chromosome number: constancy and variation. // Stonehouse B, Gilmore D (eds): The Biology of Marsupials (University Park Press, Baltimore). 1977.

72. Heinrich M.C., Rubin B.P., Longley B.J., Fletcher J.A. Biology and genetic aspects of gastrointestinal stromal tumors:KIT activation and cytogenetic alterations. // Human Pathology. 2002a. V. 33(5). P. 484-495.

73. Heinrich M.C., Blanke C.D., Druker B.J., Corless C.L. Inhibition of KIT tyrosine kinase activity: a novel molecular approach to the treatment of KIT-positive malignancies. // Journal of Clinical Oncology. 2002b. V. 20 (6). P. 1692-1703.

74. Hines S.J., Organ С., Kornstein M.J., Krystal G.W. Coexpression of the c-kit and stem cell factor genes in breast carcinomas. // Cell Growth Differ. 1995. V. 6. P. 769779.

75. Hodgson J.G., Chin K., Collins C., Gray J.W. Genome amplification of chromosome 20 in breast cancer. // Breast Cancer Res. Treat. 2003. V. 78(3). P. 337345.

76. Hongyo Т., Li Т., Syaifudin M., Baskar R., Ikeda H., Kanakura Y., Aozasa K., Nomura T. Specific c-kit mutations in sinonasal natural кШегЯ-сеП lymphoma in China and Japan. // Cancer Res. 2000. V. 60. P. 2345-2347.

77. Hsu T.C., Benirschke K. An Atlas of mammalian Chromosomes. Springer-Verlag. New York. 1967-1971. V. 106.

78. Hunter T. Tyrosine phosphorylation in signaling and disease. II Keio J Med. 2002. V. 51(2). P. 61-71.

79. Ijdo J.W., Baldini A., Ward D.C., Reeders S.T., Wells R.A.: Origin of human chromosome 2: an ancestral telomere-telomere fusion. // Proc Natl Acad Sci USA. 1991. V. 88. P. 9051-9055.

80. Ishihara K., Hirano T. Molecular basis of the cell specificity of cytokine action. // Biochimica et Biophysica Acta. 2002. V. 1592. P. 281-296.

81. Jamilena M., Garrido-Ramos M., Ruiz Rejon M., Ruiz Rejon C., Parker J.S. Characterisation of repeated sequences from microdissected B-chromosomes of Crepis capillaris. II Chromosoma. 1995. V. 104. P. 113-120.

82. Jeng Y.M., Lin C.Y., Hsu H.C. Expression of the c-kit protein is associated with certain subtypes of salivary gland carcinoma. // Cancer Lett. 2000. V. 154. P. 107-111.

83. Judd S.R., Cross S.P. Chromosomal variation in Microtus longicaudus (Merriam). II Murrelet. 1980. V. 61. P. 2-5.

84. Jones N., Houben А. В chromosomes in plants: escapees from the A chromosome genome? //TRENDS in Plant Science. 2003. V. 8. P. 417-423.

85. Keyl H.G., Hagele K. B-chromosomes in Chironomus. II Chromosoma. 1971. V. 35(4). P. 403-417.

86. Kirkness E.F., Bafna V., Halpern A.L., Levy S., Remington K., Rusch D.B., Delcher A.L., Pop M., Wang W., Fraser C.M., Venter J.C. The dog genome: survey sequencing and comparative analysis. II Science. 2003. V. 301. P. 1898-1903.

87. Krishna R.S., Aswathanarnyana N.V. Supernumerary (B-) chromosomes in the indian long-tailed mouse, Vandeleuria oleracea (Bennett) and the indian bush rat, Golunda ellioti (Gray). II Eur. J. Cell Biol. 1980. V. 22(1). P. 109.

88. Larizza L., Magnani I., Beghini A. The Kasumi-1 cell line: a t(8;21)-kit mutant model for acute myeloid leukemia. // Leukemia & Lymphoma. 2005. V. 46(2). P. 247255.

89. Leach C.R., Houben A., Field В., Pistrick K., Demidov D., Timmis J.N. Molecular evidence for transcription of genes on а В chromosome in Crepis capillaris. II Genetics. 2005. V. 171. P. 269-278.

90. Lindblad-Toh K., Wade C.M., Mikkelsen T.S. et al. Genome sequence, comparative analisys and haplotype structure of the domestic dog. // Nature. 2005. V. 438(8). P. 803-819.

91. Linnekin D. Early signaling pathways activated by c-Kit in hematopoietic cells. // The International Journal of Biochemistry & Cell Biology. 1999. V. 31. P. 1053-1074.

92. Lobato L., Cantos G., Araujo В., Bianchi N.O., Merani S. Cytogenetics of the South American akodont rodents (Cricetidae) X. Akodon mollis: a species with XY females and В chromosomes. // Genetica. 1982. V. 57. P. 199-205.

93. Lopez-Leon M.D., Neves N., Schwarzacher Т., Heslop-Harrison J.S., Hewitt G.M., Camacho J.P. Possible origin of а В chromosome deduced from its DNA composition using double FISH technique. // Chromosome Res. 1994. V. 2(2). P. 8792.

94. Loveland K.L., Schlatt S. Stem cell factor and c-kit in the mammalian testis: ф lessons originating from Mother Nature's gene knockouts. // Journal of Endocrinology.1997. V. 153. P. 337-344.

95. Lux M.L., Rubin B.P., Biase T.L., Chen C.J., Maclure Т., Demetri G., Xiao S., Singer S., Fletcher C.D., Fletcher J.A. KIT extracellular and kinase domain mutations in gastrointestinal stromal tumors. //Am. J. Pathol. 2000. V. 156. P. 791-795.

96. Lyon M.F. LINE-1 elements and X chromosome inactivation: A function for "junk" DNA? IIPNAS. 2000. V. 97. P. 6248-6249.

97. Maddalena T. 1990. Ph.D. Dissertation.University Lausanne. Lausanne. (Цитировано no Ruedi et al., 1990)

98. McAllister B.F., Werren J.H. Hybrid origin of а В chromosome (PSR) in the parasitic wasp Nasonia vitripennis. //Chromosoma. 1997. V. 106(4). P. 243-253.

99. Metallinos D., Rine J. Exclusion of EDNRB and KIT as the basis for white > spotting in Border Collies. // Genome Biology. 2000. V. 1(2).

100. Meylan A., Hausser J. Position citotaxonomique de quelques museragines du genere Crocidura au Tessisn (Mammalia: Insectivora). Origine du dessin dentarie "Apodemus" (Rodentia, Mammalia). IICR Acad. Sci. Paris. 1974. V. 264. P. 711.

101. Miettinen M., Sarlomo-Rikala M., Lasota J. KIT expression in angiosarcomas and fetal endothelial cells: Lack of mutations of exon 11 and exon 17 of C-kit. // Mod. Pathol. 2000. V. 13. P. 536-541.

102. Moore J.W., Elder R.L. Chromosome of the fox. // J. Hered. 1965. V. 56. P. 142143.

103. Munugalavadla V., Kapur R. Role of c-Kit and erythropoietin receptor in erythropoiesis. // Crit. Rev. Oncol. Hematol. 2005. V. 54(1). P. 63-75.

104. Myers P., Carleton M.D. The species Oryzomys (Oligoryzomys) in Paraguay and the identity of Azara's "Rat sixime ou Rat Tarse Noir". II Publ. Mus. Univ. Mich. 1981. V. 161. P. 1-141.

105. Myllykangas S., Knuutila S. Manifestation, mechanisms and mysteries of gene amplifications. // Cancer Letters. 2006. V. 232. P. 79-89.П

106. Nachman M.W. Geographic patterns of chromosomal variation in South American marsh rats, Holochilus brasiliensis and H. vulpinus. II Cytogenet. Cell Genet. 1992. V. 61. P. 10-17.

107. Nash W.G. Menninger J.C., Wienberg J., Padilla-Nash H.M., O'Brien S.J. The pattern of phylogenomic evolution of the Canidae. // Cytogenet. Cell Genet. 2001. V. 95. P. 210-224.

108. Neitzel H. Chromosome evolution of Cervidae: Karyotypic and molecular aspects. //Cytogenetics. Berlin, Heidelberg: Springer, 1987. P. 90-112.

109. Nergadze S.G., Rocchi M., Azzalin C.M., Mondello C., Guilotto E.: Insertion of telomeric repeats at intrachromosomal break sites during primate evolution. // Genome Research. 2004. V. 14(9). P. 1704-10.

110. Nie W., Wang J., Perelman P., Graphodatsky A.S., Yang F. Comparative chromosome painting defines the karyotypic relationships among the domestic dog, Chinese raccoon dog and Japanese raccoon dog. // Chromosome Research. 2003. V. 11. P. 735-740.

111. Nocka K., Tan J.C., Chiu E., Chu T.Y., Ray P., Traktman P., Besmer P. Molecular bases of dominant negative and loss of function mutations at the murine c-/crt/white spotting locus: W37, W, W41 and W. II The EMBO Journal. 1990. V. 9(6). P. 1805-1813.

112. Palestis B.G., Trivers R., Burt A., Jones R.N. The distribution of В chromosomes across species. // Cytogenet Genome Res. 2004. V. 106. P. 151-158.

113. Patton J.L. A complex system of chromosomal variation in the pocket mouse, PerognathusЬа/Уеу/Merriam. //Chromosoma. 1972. V. 36. P. 241-255.

114. Patton J.L., Sherwood S.W. Genome evolution in pocket gophers (Genus Thomomys) I. Heterochromatin variation and speciation potential. // Chromosoma. 1982. V. 85. P. 149-162.

115. Peppers J.A., Wiggins L.E., Baker R.J. Nature of В chromosomes in the harvest mouse Reithrodontomys megalotis by fluorescence in situ hybridization (FISH). // Chromosome Research. 1997. V. 5. P. 475-479.

116. Pinto A., Gloghini A., Gattei V., Aldinucci D., Zagonel V., Carbone A. Expression of the c-kit receptor in human lymphomas is restricted to Hodgkin's disease and CD30+ anaplastic large cell lymphomas. // Blood. 1994. V. 83. P. 785-792.

117. Rao K.S., Aswathanrayana N.V., Prakash K.S. Supernumerary (B) chromosomes in Indian bush rat Golunda ellioti (Gray). IIMCN. 1979. V. 20. P. 79.

118. Raudsepp Т., Kijas J., Godard S., Guerin G., Andersson L., Chowdhary B.P. Comparison of horse chromosome 3 with donkey and human chromosomes by cross-species painting and heterologous FISH mapping. // Mammalian Genome. 1999. V. 10. P. 277-282.

119. Reilly J.T. Class III receptor tyrosine kinases: role in leukaemogenesis. // British Journal of Haematology. 2002. V. 116. P. 744-757.

120. Reilly J.T. Receptor tyrosine kinases in normal and malignant haematopoiesis. // Blood Reviews. 2003. V. 17. P. 241-248.

121. Reinsch N., Thomsen H., Xu N., Brink M., Looft C., Kalm E., Brockmann G.A., Grupe S., Kuhn C., Schwerin M., Leyhe В., Hiendleder S., Erhardt G., Medjugorac I.,

122. Russ I., Forster M., Reents R., Averdunk G. A QTL for the degree of spotting in cattle shows synteny with the KIT locus on chromosome 6. // J. Hered. 1999. V.90(6). P. 629634.

123. Rice W.R. Degeneration of nonrecombining chromosome. // Science. 1994. V. 263. P. 230-232.

124. Robins L.W. "Southwest. Natur." 1981. V. 26: P. 201-202 (цитировано no http://www.bionet.nsc.ru/chromosomes)

125. R6nnstrand L. Signal transduction via the stem cell factor receptor/c-Kit. // Cell. Mol. Life Sci. 2004. V. 61. P. 2535-2548.

126. Rousset D., Agnes F., Lachaume P., Andre C., Galibert F.Molecular evolution of the genes encoding receptor tyrosine kinase with immunoglobulinlike domains. // J. Mol. Evol. 1995. V. 41(4). P.421-429.

127. Ruedi M., Maddalena Т., Yong H., Vogel P. The Crocidura fuliginosa species complex (Mammalia; Insectivora) in peninsular Malaysia: biological, kariological and genetical evidence. // Biochem Sistematics and Ecology. 1990. V. 18. N. 7/8. P. 573581.

128. Sbalqueiro I.J., Mattevi M.S., Oliveira L.F.B., Solano M.J.V. В chromosome system in populations of Oryzomys flavescens (Rodentia, Cricetidae) from southern Brazil. //Acta ther. 1991. V. 36. P. 193-199.

129. Schartl M., Nanda I., Schluppl., Wilde В., Epplen J.T., Schmidt M., Parzefall J. Incorporation of subgenomic amounts of DNA as compensation for mutational load in a gynogeneticfish. // Nature. 1995. V. 373. P. 68-71.

130. Shepherd P.R., Withers D.J., Siddle K. Phosphoinositide 3-kinase : the key switch mechanism in insulin signalling. // Biochem. J. 1998. V. 333. P. 471-490.

131. Silva M.J.J., Yonenaga-Yassuda Y. В chromosomes in Brazilian rodents. // Cytogenet Genome Res. 2004. V. 106. P. 257-263.

132. Soldatovic В., Savic. I., Seth P., Reichstein H., Tolksdorf M. Comparative karyological study of the genus Apodemus. II Acta Vet. (Beograd). 1975. V. 25. P. 110.

133. Switonski M., Szczrbal I., Nowacka J. The dog genome map and its use in mammalian comparative genomics. //J. Appl. Genet. 2004. V. 45(2). P. 195-214.

134. Szczerbal I., Switonski M. В chromosomes of the Chinese raccoon dog (iNyctereutes procyonoides procyonoides Gray) contain inactive NOR-like sequences. // Caryologia. 2003. V. 56. P. 213-216.

135. Tang В., Mano H., Yi Т., Ihle J.N. Tec kinase associates with c-kit and is tyrosine phosphorylated and activated following stem cell factor binding // Molecular and Cellular Biology. 1994. V. 14. P. 8432-8437.

136. Tanic N., Vujosevic M., Dedovic-Tanic N., Dimitrijevic B. Differential gene expression in yellow-necked mice Apodemus flavicollis (Rodentia, Mammalia) with and without В chromosomes. // Chromosoma. 2005. V. 113. P. 418-427.

137. Tian Q., Frierson H.F., Jr., Krystal G.W., Moskaluk C.A. Activating c-kit gene mutations in human germ cell tumors. //American Journal of Pathology. 1999. V. 154.1. Щ P. 1643-1647.

138. Щ 167.Vandenbark G.R., de Castro C.M., Taylor H., Dew-Knight S., Kaufman R.E.

139. Cloning and structural analysis of the human c-kit gene. // Oncogene. 1992. V. 7(7). P. 1259-1266.

140. Vassart M., Guedant A., Vie J.C., Keravec J., Seguela A., Volobuev V.T. Chromosomes of Alouatta senicuius (Platyrrhini, Primates) From French Guiana. //The Journal of Heredity. 1996. V. 87(4). P. 331-334.

141. Volleth M. Comparative analysis of the banded karyotypes of the European Nyctalus species (Vespertilionidae, Chiroptera). // Prague Studies in Mammology. Prague. Charles University Press, 1992. P. 221-226.

142. Volobujev V.T., Sicard В., Aniskin V.M., Gautun J.J., Granjon L. Robertsonian polymorphism, В chromosomes variation and sex chromosomes heteromorphism in theш African water rat Dasymys (Rodentia, Muridae). II Chrom. Res. 2000. V. 8. P. 689-697.

143. Vujosevic M., Blagoevic J. В chromosomes in populations of mammals. // Cytogenet Genome Res. 2004. V. 106. P. 247-256.

144. Vujosevic M., Zivkovic S. Numerical chromosome polymorphism in Apodemus flavicollis and A. sylvaticus (Mammalia: Rodentia) caused by supernumerary chromosomes. //ActaVet. (Beograd). 1987. V. 37. P. 81-92.

145. Wahrman J, Gourevitz P. The chromosome biology of the 2n = 38 black rat, Rattus rattus. И Chromosomes Today. New York and Jerusalem. Israel Universities Press, 1973. V. 4. P. 433^34.

146. Wang J., Zhao X., Deng Y., Qi H., Liu Y., Zhang Z., Koh H., Shan X. Karyotypes and В chromosome of greater long-tailed hamster (Cricetulus triton). II Acta Ther. Sinica. 1999. V. 19. P. 197-211.

147. Ward O.G. Chromosomes studies in Japanese raccoon dogs: X chromosomes, supernumeraries, and heteromorphism. // Mammal. Chrom. Newsletter. 1984. V. 25. P. 34.

148. Ward O.G., Wurster-Hill D.H., Ratty F.J., Song Y. Comparative cytogenetics of Chinese and Japanese raccoon dogs, Nyctereutes procyonoides. II Cytogenet. Cell Genet. 1987. V. 45. P. 177-186.

149. Wayne R.K., Van Valkenburgh В., O'Brien S.J. Molecular distance and divergence time in Carnivores and Primates. // Mol. Biol. Evol. 1991. V. 8(3). P. 297319.

150. Wayne R.K., Ostrander E.A. Origin, genetic diversity, and genome structure of the domestic dog. // BioEssays. 1999. V. 21. P. 247-257.

151. Wayne R.K., Ostrander E.A. Out of the dog house: the emergence of the canine genome. // Heredity. 2004. V. 92. P. 273-274.

152. Wilson D.E., Reeder D.M. Mammal Species of the world: A Taxonomic and Geographic Reference. 2nd Ed. Washington and London.: Smithsonian Institutions, 1993.

153. Wurster D.H., Benirschke K. Comparative cytogenetic studies in the order Carnivora. //Chromosoma. 1968. V. 24(3). P. 336-382.

154. Yonenaga-Yassuda Y., de Souza M.J., Kasahara S., L'Abbate M., Chu H.T. Supernumerary system in Proechimys ihen'ngi iheringi (Rodentia, Echimydae), from the state of Sao Paulo, Brazil. // Caryologia. 1985. V. 38. P. 179-194.

155. Yonenaga-Yassuda Y., do Prado C.R., Mello D.A. Supernumerary chromosomes in Holochilus brasiliensis and comparative cytogenetic analysis with Nectomys squamipes (Cricetidae, Rodentia). II Rev. Brasil. Genet. 1987. V. X(2). P. 209-220.

156. Yong H.S., Dhaliwal S.S. Supernumerary (B-) chromosomes in the Malayan house rat, Rattus rattus diardii (Rodentia, Muridae). // Chromosoma. 1972. V. 36. P. 256-262.

157. Yunis E.J., Torres de Caballero O.M., Ramirez C., Ramirez Z.E. Chromosomal variations in the primate Alouatta seniculus seniculus. II Folia Primatol. 1976. V. 25. P.215-224.

158. Ziegler C.G., Lamatsch D.K., Steinlein C., Engel W., Schartl M., Schmid M. The giant В chromosome of the cyprinid fish Alburnus alburnus harbours a retrotransposon-derived repetitive DNA sequence. // Chromosome Research. 2003. V. 11. P. 23-25.

159. Zima J., Macholan M. В chromosomes in the wood mice (genus Apodemus). // Acta ther. (Suppl 3). 1995. P. 75-86.

160. Zimmerman E.G. Karyology, systematics and chromosomal evolution in the rodent genus Sigmodon. II Michigan State Univ. Publ. Mus: Biol. Ser. 1970. V. 4. P. 385-394.