Молекулярно-генетические аспекты развития лекарственной устойчивости в условиях угрозы развития эпидемия туберкулеза в Архангельской обл. тема диссертации и автореферата по ВАК РФ 05.26.02, доктор медицинских наук Тунгусова, Ольга Сергеевна

• Тунгусова, Ольга Сергеевна
• доктор медицинских наук
• 2004

Оглавление диссертации доктор медицинских наук Тунгусова, Ольга Сергеевна

Список сокращений, принятых в диссертации

Введение

Глава! Обзор литературы

1.1. Эпидемиология туберкулеза в мировом масштабе

1.2. Эпидемиология туберкулеза в Архангельской области

1.3. Лечение туберкулеза

1.4. История развития и классификация лекарственной устойчивости

1.5. Молекулярно-генетические механизмы развития лекарственной устойчивости

1.6. Исторические и молекулярно-генетические аспекты распространения МВТ семейства W-Beijing

1.7. Лекарственная устойчивость и фитнес МВТ

Резюме

Глава П. Методология научного исследования (материалы и методы)

2.1. Материалы исследования

2.1.1. Штаммы МБТ

2.1.2. Больные туберкулезом легких

2.2. Методы исследования 66 2.2.1. Видовая идентификация штаммов

Глава III.

Глава IV.

Глава V.

2.2.2. Определение чувствительности к противотуберкулезным препаратам

2.2.3. Идентификация мутаций в гроВ гене, обусловливающих устойчивость к рифампицину

2.2.4. Определение последовательности аминокислот в ксйО гене и идентификация мутаций, обусловливающих лекарственную устойчивость к изониазиду

2.2.5. Анализ полиморфизма длин рестрикции ДНК

2.2.6. Сполиготипирование

2.2.7. Культивирование МБТ в системе МШТ для изучения характеристик роста, как показателя фитнеса

2.2.8. Статистический анализ данных

2.2.9. Используемые определения

Лекарственная устойчивость МБТ к противотуберкулезным препаратам первой линии в Архангельской области

Влияние лекарственной устойчивости МБТ на результаты лечения туберкулеза легких

4.1. Результаты лечения туберкулеза легких в Архангельской области

4.2. Результаты лечения туберкулеза легких в зависимости от чувствительности к противотуберкулезным препаратам первой линии 108 Лекарственная устойчивость МБТ к противотуберкулезным препаратам второй линии

Глава VI. Молекулярная генетика МВТ, выделенных у больных туберкулезом легких в Архангельской области

6.1. Молекулярная генетика МБТ, изолированных от больных туберкулезом в гражданском секторе области

6.2. Молекулярная генетика МБТ, изолированных от больных туберкулезом в местах лишения свободы

6.3. Сравнительный анализ молекулярно-генетических особенностей штаммов МБТ, циркулирующих среди гражданского населения и заключенных Архангельской области

6.4. Роль реинфекции в эпидемиологии туберкулеза

6.5. Моделирование механизмов развития туберкулеза легких

Глава VII. Биологическая характеристика штаммов МБТ семейства W-Beijing

7.1. Показатели роста, как индикатор фитнеса штаммов МБТ, принадлежащих к разным генотипам

7.1.1. Пилотное исследование. Разработка методологии эксперимента

7.1.2. Воспроизведение результатов

7.2. Показатели роста штаммов МБТ, не принадлежащих к семейству W-Beijing

7.3. Показатели роста штаммов МБТ, принадлежащих к семейству W-Beijing

7.4. Показатели роста парных штаммов МБТ, изолированных от одних и тех же больных в разные промежутки времени после приобретения лекарственной устойчивости к дополнительным препаратам 182 7.5. Гипотеза широкого распространения штаммов МВТ семейства \¥-Веутд, основанная на анализе фитнеса

Обсуждение результатов

Выводы

Введение диссертации (часть автореферата) на тему «Молекулярно-генетические аспекты развития лекарственной устойчивости в условиях угрозы развития эпидемия туберкулеза в Архангельской обл.»

Актуальность проблемы

Проблема искоренения инфекционных заболеваний является одной из Глобальных проблем современности и угроз здоровью [23]. Здоровье населения Российской Федерации рассматривается как компонент жизненно важных интересов личности и общества. Концепция национальной безопасности [26] - главный документ Российской Федерации по безопасности, основным элементом которого является осуществление безопасности, повышение качества и уровня жизни и обеспечение здоровья населения. Среди инфекционных заболеваний туберкулез легких представляет основную причину смертности и ведущую угрозу здоровью населения страны. В сложившихся условиях остро стоит вопрос обеспечения биологической безопасности, которая должна быть предоставлена каждому гражданину согласно Федеральному закону «О безопасности» [24].

Современный этап развития туберкулеза легких характеризуется неуклонным ростом эпидемиологических показателей и изменением биологических особенностей и структуры популяции микобактерий туберкулеза (МБТ), значительную часть которой занимают микроорганизмы, устойчивые к основным противотуберкулезным препаратам, особенно микроорганизмы с множественной лекарственной устойчивостью.

Проблема распространения лекарственно устойчивого туберкулеза является актуальной по нескольким причинам.

1. Инфицирование лекарственно устойчивыми МБТ представляет собой реальную угрозу здоровью населения и прямую угрозу развития неизлечимого заболевания [159].

2. Арсенал средств, предназначенных для лечения туберкулеза легких с множественной лекарственной устойчивостью, ограничен [9]. Проблема может быть разрешена при использовании имеющихся и разработке новых противотуберкулезных препаратов второго ряда. Известно, препараты второго ряда являются менее эффективными, имеют выраженные побочные действия и токсические эффекты и требуют больших экономических вложений [82,120, 229].

Изменения в генетическом аппарате МБТ направлены на развитие лекарственной устойчивости и появление новых генотипов возбудителя. МБТ, принадлежащие к семейству \V-Beijing, являются хорошим примером, они обладают повышенной вирулентностью и рядом других преимуществ, которые позволяют сохранить вид МБТ в условиях эффективной химиотерапии. МБТ с множественной лекарственной устойчивостью согласно классификации степени потенциальной угрозы инфекционных агентов относятся к категории С [22]. В эту категорию включены возбудители инфекционных заболеваний, обладающие высокой трансмиссией и способностью к воспроизводству. В связи с этим особую значимость приобретают вопросы биологической безопасности нации как необходимого условия устойчивого развития страны.

ЦЕЛЬ И ЗАДАЧИ ИССЛЕДОВАНИЯ

Цель исследования - изучить молекулярно-генетические аспекты развития лекарственной устойчивости у штаммов МБТ, циркулирующих в Архангельской области в условиях чрезвычайной ситуации угрозы развития эпидемии лекарственно устойчивого туберкулеза легких, и разработать мероприятия, позволяющие снизить распространение данного заболевания.

Для достижения указанной цели определены следующие задачи:

1. Провести сравнительный анализ показателей и профилей лекарственной устойчивости МБТ к противотуберкулезным препаратам первой линии в условиях чрезвычайной ситуации угрозы развития эпидемии лекарственно устойчивого туберкулеза легких.

2. Выявить и проанализировать профили лекарственной устойчивости МБТ, которые обусловливают неблагоприятные исходы туберкулеза легких и способствуют дальнейшему распространению заболевания.

3. Изучить показатели и профили лекарственной устойчивости МБТ к противотуберкулезным препаратам второй линии и предложить противотуберкулезные препараты второй линии для лечения больных туберкулезом легких с множественной лекарственной устойчивостью.

4. Провести сравнительную генетическую характеристику штаммов МБТ, циркулирующих в гражданском секторе и местах лишения свободы Архангельской области, с использованием анализа полиморфизма фрагментов длин рестрикции (от англ. RFLP - restriction fragment length polymorphism analysis) дезоксирибонуклеиновой кислоты (ДНК) и сполиготипирования.

5. Определить эпидемиологическую роль МБТ семейства W-Beijing в создании чрезвычайной ситуации угрозы развития эпидемии лекарственно устойчивого туберкулеза легких в Архангельской области.

6. Изучить и проанализировать биологические особенности возбудителя туберкулеза, являющиеся причинами широкого распространения лекарственно устойчивых штаммов МБТ, принадлежащих к семейству Веут&

ПОЛОЖЕНИЯ, ВЫНОСИМЫЕ НА ЗАЩИТУ

На протяжении последних лет в Архангельской области сохраняется чрезвычайная ситуация угрозы развития эпидемии лекарственно устойчивого туберкулеза легких. Особую биологическую угрозу представляет трансмиссия штаммов МБТ, устойчивых к противотуберкулезным препаратам первой и второй линии, что значительно затрудняет выбор адекватного режима химиотерапии и излечение данного заболевания.

Доминирование 531 ТСО—>ТТО мутации в гроВ гене и 315 АСтС—>АСС мутации в ШО гене предусматривает формирование селективных преимуществ у МБТ, обусловливающих развитие и широкое распространение туберкулеза с множественной лекарственной устойчивостью на территории области.

Результаты лечения туберкулеза легких в Архангельской области не достигли должного уровня в связи с большим числом случаев прерванного лечения и распространением лекарственно устойчивых МБТ. Исход заболевания не зависит от принадлежности штамма МБТ, которым инфицирован больной, к семейству \\МЗеуп^. Исход заболевания в первую очередь зависит от чувствительности штамма МБТ к противотуберкулезным препаратам.

В Архангельской области основной причиной туберкулеза легких являются штаммы МБТ, принадлежащие к семейству АУ-Веуц^. Принадлежность МБТ к семейству \У-Веуи^ достоверно коррелирует с наличием устойчивости к противотуберкулезным препаратам первой линии. Появление лекарственной устойчивости МБТ к дополнительным препаратам на фоне адекватного и регулярного лечения может быть обусловлено реинфекцией новым лекарственно устойчивым штаммом МБТ.

Рост штаммов МБТ в условиях in vitro характеризуется фенотипическим и генотипическим полиморфизмом. У лекарственно устойчивых штаммов МБТ обычных генотипов происходит замедление роста по сравнению с лекарственно чувствительными штаммами МБТ. Часть лекарственно устойчивых штаммов МБТ семейства W-Beijing характеризуется замедлением роста, у другой части МБТ данного генотипа не отмечено изменения роста после приобретения лекарственной устойчивости. Селективные преимущества МБТ семейства W-Beijing обусловлены особенностями их роста и доминированием 531 TCG—>TTG мутации в гроВ гене.

КОНЦЕПЦИЯ РАБОТЫ

Сохранение здоровья населения является приоритетом обеспечения биологической безопасности страны. Среди инфекционных заболеваний туберкулез легких представляет реальную угрозу здоровью населения и занимает ведущее положение в структуре их смертности.

Основное направление работы связано с определением молекулярно-генетических механизмов развития и распространения лекарственно устойчивого туберкулеза легких в зависимости от биологических особенностей возбудителя в условиях чрезвычайной ситуации природного характера.

Ежегодный рост показателей лекарственной устойчивости, распространение МБТ, принадлежащих к семейству W-Beijing, в структуре популяции возбудителя туберкулеза создают условия для трансмиссии лекарственно устойчивых штаммов МБТ, инфицирования восприимчивого населения и развития у него заболевания, излечение которого является сложной задачей. Множественная лекарственная устойчивость, низкая эффективность химиотерапии и широкое распространение резистентности к противотуберкулезным препаратам второго ряда делают туберкулез легких неизлечимым заболеванием.

Для устранения бактериологической угрозы, отрицательного воздействия на жизнедеятельность и здоровье населения необходимо своевременное выявление, прогнозирование развития лекарственной устойчивости и проведение комплекса лечебно-профилактических мероприятий с соблюдением законодательства по национальной безопасности. Основным методом устранения биологической опасности в создавшихся условиях является своевременная и качественная диагностика туберкулеза с применением молекулярно-генетических методов и лечение больных в соответствии с индивидуальными профилями лекарственной чувствительности к противотуберкулезным препаратам.

НАУЧНАЯ НОВИЗНА ИССЛЕДОВАНИЯ

Проведен мониторинг показателей лекарственной устойчивости к противотуберкулезным препаратам первой линии в течение 1995-2002 годов и сделан сравнительный анализ индивидуальных профилей лекарственной чувствительности МБТ, выделенных от больных туберкулезом легких в Архангельской области.

Подтверждена роль мутаций в гроВ гене при развитии лекарственной устойчивости к рифампицину, которые служат маркером множественной лекарственной устойчивости. Впервые идентифицированы мутации в ксйО гене, обусловливающие развитие лекарственной устойчивости МБТ к изониазиду при туберкулезе легких в Архангельской области, которые могут служить дополнительным маркером множественной лекарственной устойчивости.

Впервые представлены и проанализированы результаты лечения туберкулеза легких в зависимости от профиля лекарственной устойчивости и принадлежности к семейству W-Beijing.

Впервые изучена лекарственная устойчивость к противотуберкулезным препаратам второй линии и предложены препараты, которые возможно использовать для химиотерапии больных туберкулезом легких с множественной лекарственной устойчивостью.

Проведена сравнительная генетическая характеристика штаммов МВТ, вызывающих туберкулез легких в Архангельской области. Впервые идентифицировано распространение МВТ, принадлежащих к семействам Т, Haarlem и LAM, и установлена эпидемиологическая роль МБТ семейства W-Beijing в развитии чрезвычайной ситуации угрозы эпидемии лекарственно устойчивого туберкулеза легких на территории Архангельской области. Доказано, что высокий показатель кластерности МБТ семейства W-Beijing является косвенным показателем повышения фитнеса МБТ данного генотипа и обусловливает селективные преимущества при распространении лекарственно устойчивого туберкулеза легких.

Впервые определена роль реинфекции новым лекарственно устойчивым штаммом МБТ на фоне проводимого лечения, которая может объяснить появление лекарственной устойчивости к дополнительным противотуберкулезным препаратам на фоне адекватной и регулярной химиотерапии.

Впервые изучены биологические особенности и фитнес штаммов МБТ, обладающих разными профилями лекарственной устойчивости и принадлежащих к разным генотипам. В частности, установлены профили лекарственной устойчивости и виды мутаций в гроВ гене, обусловливающие селективные превосходства МБТ семейства W-Beijing по сравнению с МБТ других генотипов и способствующие широкому распространению и диссеминации МБТ с множественной лекарственной устойчивостью у новых случаев.

НАУЧНО-ПРАКТИЧЕСКАЯ ЗНАЧИМОСТЬ РАБОТЫ. ВНЕДРЕНИЕ РЕЗУЛЬТАТОВ В ПРАКТИКУ

Изучены распространение лекарственно устойчивого туберкулеза легких в Архангельской области и исходы заболевания в зависимости от индивидуального профиля лекарственной чувствительности штамма МВТ и его принадлежности к определенному генотипу. Установлены индивидуальные профили лекарственной устойчивости, затрудняющие лечение туберкулеза легких и приводящие к неблагоприятным исходам (летальный исход и безуспешное лечение).

Установлены точечные мутации в кагЭ и гроВ генах МВТ, позволяющие разработать и внедрить экспресс методы определения множественной лекарственной устойчивости, основанные на полимеразной цепной реакции (ПЦР).

Выявление активной трансмиссии штаммов МВТ семейства \V-Beijing и роли реинфекции новым штаммом МВТ на фоне проводимого адекватного регулярного лечения позволяет предложить и внедрить эпидемиологические мероприятия в противотуберкулезных медицинских учреждениях, а именно разграничение потоков инфекционно опасных больных и изоляцию больных, выделяющих штаммы МВТ с множественной лекарственной устойчивостью.

Изучение особенностей показателей роста лекарственно устойчивых штаммов МВТ семейства \V-Beijing, как характеристики фитнеса, позволило расширить знания в области биологических особенностей возбудителя и сформулировать гипотезу широкого распространения штаммов МВТ семейства \V-Beijing.

Основные положения диссертации и вытекающие из них рекомендации в настоящее время используются в педагогической работе на кафедре фтизиопульмонологии Северного государственного медицинского университета (акт внедрения 2004 год), в практической работе Архангельского областного противотуберкулезного диспансера (АОПД) (акт внедрения 2001 год, 2004 год) и Мурманского областного противотуберкулезного диспансера (акт внедрения 2004 год). Бактериологический мониторинг лекарственной устойчивости при туберкулезе легких проводится с 1995 года, за эти годы созданы коллекция штаммов МВТ и компьютерная база данных, состоящая из профилей чувствительности к противотуберкулезным препаратам и индивидуальных рисунков хромосомной ДНК МБТ, циркулирующих в Архангельской области. Созданная база данных используется для проведения научных исследований в рамках молекулярной эпидемиологии и молекулярной генетики, а также для анализа качества практической работы бактериологической службы Архангельской области.

Ежегодно проводится определение лекарственной чувствительности к противотуберкулезным препаратам первого ряда радиометрическим методом ВАСТЕС и определение вида мутаций в гроВ гене методом ШЖ)-1лРа Ш£ ТВ у больных с новыми случаями заболевания. При выявлении множественной лекарственной устойчивости проводится исследование на чувствительность к противотуберкулезным препаратам второго ряда, результаты которого учитываются при выборе противотуберкулезных препаратов и назначении режима химиотерапии. Диссертационное исследование выполнено в рамках региональной научно-технической программы «Здоровье населения Европейского Севера», имеет номер гос. регистрации ГР 01200316208.

АПРОБАЦИЯ РАБОТЫ

Материалы диссертации доложены и обсуждены: на Осенней конференции микробиологов, г. Осло, Норвегия, 13-14 сентября 2001 г.; третьей международной встрече Борьба с инфекционными заболеваниями в странах Балтийского моря и Баренцевом регионе, г. Архангельск, Россия, 2427 сентября 2001 г.; 32 Всемирном конгрессе Международного союза по борьбе с туберкулезом и заболеваниями легких, г. Париж, Франция, 1-4 ноября 2001 г.; Форуме инфекционистов, г. Осло, Норвегия, 16-17 ноября

2001 г.; Первой международной научной конференции института международного здоровья, университета Осло, г. Осло, Норвегия, 2-3 мая

2002 г.; Дневном семинаре института общей врачебной практики, г. Осло, Норвегия, 23 октября 2002 г.; Ежегодной научной конференции Норвежского института общественного здоровья, г. Осло, Норвегия, 5-6 декабря 2002 г.; Научной конференции по туберкулезу, Норвежского института общественного здоровья, г. Осло, Норвегия, 12-13 декабря 2002 г.; Второй международной научной конференции института международного здоровья, университет Осло, г. Осло, Норвегия, 15-16 мая 2003 г.; Российском съезде фтизиатров, г. Москва, 3-5 июня 2003 г.; XVII Всемирном конгрессе по астме и V съезде иммунологов и аллергологов СНГ, г. Санкт-Петербург, 5-11 июля

2003 г.; Скандинавской встрече по туберкулезу, г. Осло, Норвегия, 10 октября 2003 г.; 20 съезде Скандинавского общества антимикробной терапии, г. Оденса, Дания, 24-26 октября 2003 г.; Ежегодной научной конференции Норвежского института общественного здоровья, г. Осло, Норвегия, 4-5 декабря 2003 г.

ПУБЛИКАЦИИ

Результаты и основные положения диссертации опубликованы в 23 печатных работах.

СТРУКТУРА И ОБЪЕМ ДИССЕРТАЦИИ

Диссертационная работа изложена на 229 енстраницах машинописи и состоит из введения, обзора литературы, содержит материалы и методы собственных исследований, их результаты и обсуждение, выводы, практические рекомендации и список литературы. Текст диссертационной работы иллюстрирован 15 рисунками и 40 таблицами. Указатель литературы

Заключение диссертации по теме «Безопасность в чрезвычайных ситуациях (по отраслям наук)», Тунгусова, Ольга Сергеевна

ВЫВОДЫ

1. На протяжении последних лет (с 1995 по 2002 год) в Архангельской области сохраняется чрезвычайная ситуация угрозы развития эпидемии лекарственно устойчивого туберкулеза легких. Высокие показатели лекарственной устойчивости у новых случаев заболевания свидетельствуют о циркуляции и трансмиссии лекарственно устойчивых штаммов МБТ, что создает реальную угрозу здоровью населения.

2. Среди исследованных штаммов МБТ первичная множественная лекарственная устойчивость в гражданском секторе и системе заключения составила 13,5% и 34,0% соответственно. Лекарственная устойчивость к изониазиду и рифампицину обусловлена генетическим полиморфизмом в \zatG и гроВ генах.

3. Лечение лекарственно чувствительного туберкулеза легких приводит к благоприятным исходам заболевания при условии назначения стандартного режима химиотерапии и регулярного приема больными противотуберкулезных препаратов. Устойчивость МБТ к двум (изониазид и рифампицин) и более противотуберкулезным препаратам часто приводит к безуспешному лечению и летальному исходу, увеличению продолжительности бактериовыделения и распространению инфекции среди населения Архангельской области.

4. Широкое распространение лекарственной устойчивости к противотуберкулезным препаратам второй линии (этионамид 92,2%, капреомицин 42,9% и канамицин 41,6%) способствует развитию чрезвычайной ситуации угрозы развития эпидемии лекарственно устойчивого туберкулеза легких в Архангельской области. Устойчивость к противотуберкулезным препаратам второй линии вызвана циркуляцией таких штаммов МБТ на территории области и их активной трансмиссией среди населения гражданского сектора и системы заключения.

5. Изучение молекулярной генетики МВТ в Архангельской области позволило идентифицировать МВТ семейства \V-Beijing, распространение которых в гражданском секторе и системе заключения составило 44,5% и 76,3% соответственно. Уровень трансмиссии туберкулеза в системе заключения в несколько раз превышает таковой в гражданском секторе области.

6. В области наблюдается активная трансмиссия лекарственно устойчивых штаммов МВТ, принадлежащих к семейству \У-Веушд, связанная с повышением фитнеса МВТ данного генотипа. Принадлежность штамма МВТ к семейству \У-Веуп^ не оказывает существенного влияния на результат лечения туберкулеза. Неблагоприятные исходы лечения при инфицировании штаммом МВТ семейства \У-Веушд вызваны, прежде всего, широким распространением лекарственной устойчивости у данного семейства МВТ.

7. Селективные преимущества \^-Веуищ штаммов среди других генотипов МВТ обусловлены особенностями их фитнеса, доминированием 531 ТСО—»ТТО мутации в гроВ гене, возможными компенсаторными мутациями, восстанавливающими снижение фитнеса вследствие развития лекарственной устойчивости. Все это объясняет широкое распространение и диссеминацию МВТ семейства Ш-Веу^, а так же возникновение чрезвычайной ситуации угрозы развития эпидемии лекарственно устойчивого туберкулеза легких в Архангельской области.

ПРАКТИЧЕСКИЕ РЕКОМЕНДАЦИИ

1. Необходимо продолжать проводить ежегодный мониторинг показателей лекарственной устойчивости к противотуберкулезным препаратам, развивать бактериологическую лабораторию в АОПД, внедрять методы качественного определения лекарственной устойчивости МБТ (ВАСТЕС, МШТ, ТВАкЛ и другие) к противотуберкулезным препаратам первой и второй линии, используя разработанные критерии лекарственной устойчивости и проводить внутренний и внешний контроль качества определения лекарственной устойчивости.

2. Идентифицированные точечные мутации в гроВ и ка(С генах, служащие маркерами множественной лекарственной устойчивости, позволяют разработать и внедрить экспресс методы определения лекарственной устойчивости к рифампицину и изониазиду. Эти методы должны быть основаны на амплификации гроВ и ка(С генов с помощью ПЦР, они обеспечат качественную и быструю диагностику множественной лекарственной устойчивости и позволят проводить неотложные мероприятия по устранению чрезвычайной ситуации развития угрозы эпидемии лекарственно устойчивого туберкулеза легких.

3. Внедрить сполиготипирование, экспресс метод генотипирования, основанный на ПЦР, позволяющий выявлять больных, инфицированных штаммами МБТ семейства \V-Beijing, которые обладают повышенной способностью к развитию лекарственной устойчивости к противотуберкулезным препаратам и играют важную роль в создании чрезвычайной ситуации развития угрозы эпидемии лекарственно устойчивого туберкулеза легких.

4. Для предупреждения распространения штаммов МБТ внедрить специализированную программу лечения больных с множественной лекарственной устойчивостью.

5. Изучить лекарственную чувствительность к новым альтернативным противотуберкулезным препаратам при использовании автоматизированных методов исследования (ВАСТЕС, М01Т, ТВА1е11 и др.). Разработать и внедрить индивидуализированные схемы лечения туберкулеза легких с множественной лекарственной устойчивостью.

6. Для предупреждения реинфекции больных другим штаммом МБТ, обладающим лекарственной устойчивостью, особенно множественной лекарственной устойчивостью, необходимо усилить проводимые противоэпидемические мероприятия в противотуберкулезных медицинских учреждениях.

7. Продолжить изучение биологических особенностей возбудителя туберкулеза, особенно штаммов МБТ семейства \¥-Веут§, и их роль в возрождении туберкулеза в Архангельской области, распространении лекарственной устойчивости и создании чрезвычайной ситуации развития угрозы эпидемии лекарственно устойчивого туберкулеза легких.

Список литературы диссертационного исследования доктор медицинских наук Тунгусова, Ольга Сергеевна, 2004 год

1. Анализ результатов лечения туберкулеза в Архангельской области за 1999 год /А.О. Марьяндышев, Н.И. Низовцева, Т.В. Тоичкина, Е.И. Никишова //Борьба с инфекционными заболеваниями в странах Баренц региона. -2001.-С. 33-35.

2. Биологические свойства лабораторных штаммов и клинических изолятов микобактерий с множественной устойчивостью к противотуберкулезным препаратам /А.А. Корнеев, В.И. Голышевская, Э.В. Севастьянова и др. //Проблемы туберкулеза 1999. - № 2. - С. 44-47.

3. Вирулентность микобактерий туберкулеза /Б.И. Вишневский, О.В. Нарвская, С.Н. Васильева и др. //Проблемы туберкулеза. 2002. - № 10. -С. 33-36.

4. ВИЧ инфекция в Северо-западном федеральном округе в 2001 году: Информационный бюллетень /СПб.: Бостон-спектр, 2002. 28 с.

5. Вишневский Б.И. Лекарственная устойчивость микобактерий туберкулеза на северо-западе России /Б.И. Вишневский, Е.Б. Вишневская //Проблемы туберкулеза. 2003. - № 5. - С. 42-45.

6. Генетическое маркирование полирезистентных штаммов Mycobacterium tuberculosis, выделенных на Северо-Западе России /О.В. Нарвская, И.В. Мокроусов, Т.Ф. Оттен, В.И. Вишневский //Проблемы туберкулеза. 1999. - № 3. - С. 39-41.

7. Диагностика, клиника и тактика лечения остропрогрессирующих форм туберкулеза легких в современных эпидемиологических условиях /А.Г. Хоменко, В.Ю. Мишин, В.И. Чуканов и др. //Проблемы туберкулеза. -1999.-№ 1. С. 22-27.

8. Ильина Т.Я. Резистентность микобактерий туберкулеза у впервые выявленных больных туберкулезом и при рецидивах заболевания /Т.Я. Ильина, А.А. Жангиреев, О.А. Сидоренко //Проблемы туберкулеза. -2003.-№5.-С. 19-21.

9. Кибрик Б.С. Некоторые особенности лекарственной резистентности микобактерий туберкулеза у больных с остропрогрессирующими деструктивными формами туберкулеза легких /Б.С. Кибрик, О.Г. Челнонова //Проблемы туберкулеза. 2003. - №8. - С. 3-5.

10. Ю.Левашев Ю.Н. Состояние и перспективы борьбы с туберкулезом на северо-западе России /Ю.Н. Левашев //Проблемы туберкулеза. 2003. - № 10.-С. 3-9.

11. Н.Лялина Е.Л. Туберкулез легких у лиц, бывших в заключении /Е.Л. Лялина, Н.А. Рогожина, В.Н. Гурьянов //Проблемы туберкулеза. 2003. - № 4. - С. 44-45.

12. Марьяндышев А.О. Лечение больных туберкулезом. Программа краткосрочной химиотерапии больных туберкулезом /А.О. Марьяндышев, Н.И. Низовцева, В.И. Дитятев. Архангельск: Северный государственный медицинский университет, 2001. - 26 с.

13. Министерство Российской Федерации по делам гражданской обороны, чрезвычайным ситуациям и ликвидации последствий стихийных бедствий. Защита населения и территорий в чрезвычайных ситуациях /Под ред. М.И. Фалеева. Калуга: ГУП «Облиздат». 2001. - 480 с.

14. Мишин В. Ю., Макиева В. Г., Поспелов JI. Е. и др. //Материалы Юбилейной сессии ЦНИИТ РАМН. М., 2001. - С. 56-57.

15. Молекулярная характеристика клинических мультирезистентных штаммов микобактерии туберкулеза, изолированных в России /Е.В. Генерозов, Т.А. Акопян, В.М. Говорун и др. //Молекулярная генетика микробиология вирусология 2000. - № 1. - С. 11-17.

16. Молекулярная эпидемиология туберкулеза /О.В. Нарвская, И.В. Мокроусов, Е.В. Лимещенко и др. //Большой целевой журнал о туберкулезе. 2000. - № 78. - С. 4-6.

17. Молекулярно-генетическая характеристика штаммов Mycobacterium tuberculosis, выделенных от больных, оперированных по поводу туберкулеза легких /О.В. Нарвская, Б.И. Вишневский, A.B. Елькин и др. //Проблемы туберкулеза 2002. - № 3. - С. 50-53.

18. Особенности клинической картины и лечения туберкулеза у ВИЧ-инфицированных больных /О.И. Аухтун, B.C. Голанов, Н.Г. Березин, E.H. Кирбятьева//Проблемы туберкулеза. 2002. - № 11. - С. 21-23.

19. Пальцев М.А. Биологическое оружие проблема национальной безопасности России /М.А. Пальцев //Национальная безопасность. - 2002. -№1-2.

20. Политология. Курс лекций. /ОмГПУ. Омск., 1995.

21. Правительство Российской Федерации Закон «О безопасности» /Закон Правительства Российской Федерации. 5 марта 1992. - № 2446-1.

22. Правительство Российской Федерации. О реализации Федерального закона «О предупреждении распространения туберкулеза в Российской

23. Федерации». Постановление Правительства Российской Федерации № 892 от 25.12.2001.

24. Президент Российской Федерации Концепция национальной безопасности /Указ Президента Российской Федерации. -17 декабря 1997. № 1300.

25. Пунга В.В. Туберкулез в России /В.В. Пунга, Л.П. Капков //Проблемы туберкулеза. 1999. № 1. - С. 14-16.

26. Рудой Н.М. Лекарственная устойчивость микобактерий туберкулеза /Н.М. Рудой. М.: Медицина, 1969. - 255 с.

27. Теория вероятностей и математическая статистика: Учебн. пособ. //Под ред. В.А. Колемаева.- М.: Высш. шк., 1991.- 400с.

28. Туберкулез легких, вызванный Mycobacterium tuberculosis различных генотипов /Н.В. Сапожникова, Л.А. Скворцова, М.В.Павлова и др. //Проблемы туберкулеза. 2003. - № 10. - С. 13-15.

29. Ускоренная культуральная диагностика туберкулеза с использованием автоматизированных систем ВАСТЕС MGIT 960 и МВ/ВАСТ /О.А. Иртуганова, Н.С. Смирнова, А.М. Мороз, В.И. Литвинов //Проблемы туберкулеза 2002. - № 1. - С. 58-62.

30. Характеристика циркулирующих на северо-западе России штаммов Mycobacterium tuberculosis с использованием сполиготипирования /О.В.

31. Нарвская, И.В. Мокроусов, Е.В. Лимищенко и др. //Проблемы туберкулеза. 2002. - № 4. - С. 44-48.

32. A marked difference in pathogenesis and immune response induced by different Mycobacterium tuberculosis genotypes /В. Lopez, D. Aguilar, H. Orozco et al. //Clin. Exp. Immunol. 2003. - № 133. - P. 30-37.

33. A multi-institutional outbreak of highly drug-resistant tuberculosis. Epidemiology and clinical outcomes /T.R. Frieden, L.F. Sherman, K.L. Maw et al. //JAMA. 1996. - № 276. - P. 1229-35.

34. A new evolutionary scenario for the Mycobacterium tuberculosis complex /R. Brosch, S.V. Gordon, M. Marmiesse et al. //PNAS. 2002. - № 99. - P. 36843689.

35. Albino J.A. Multidrug-resistant tuberculosis /J.A. Albino, L.B. Reichman //Current. Opin. Infect. Dis. 1997. - № 10. - P. 116-122.

36. Amikacin in the treatment of pulmonary tuberculosis /B.W. Allen, D. Mitchison, Y.C. Chan et al. //Tubercle. 1983. - № 64. - P. 111-118.

37. Andersson D.I. The biological cost of antibiotic resistance /D.I. Andersson, B.R. Levin //Current. Opin. Microbiol. 1999. - № 2. - P. 489-493.

38. Anti-tuberculosis drug resistance in community and prison patients, Orel oblast, Russian Federation /Р. Spradling, E. Nemtsova, T. Aptekar et al. /Ant. J. Tuberc. Lung. Dis. 2002. - № 6. - P. 757-762.

39. Anti-tuberculosis drug resistance in the world. Report No. 2. Prevalence and trends. /The WHO/IUATLD Global project on anti-tuberculosis drug resistance surveillance. 2000. - 253 p.

40. Bifani P.J. Global dissemination of the Mycobacterium tuberculosis W-Beijing family strains /P.J. Bifani, B. Mathema, N.E. Kurepina //Trends. Microbiol. -2002. -№ 10.-P. 45-52.

41. Billington O.J. Physiological cost of rifampin resistance induced in vitro in Mycobacterium tuberculosis /O.J. Billington, T.D. McHugh, S.H. Gillespie //Antimicrobial. Agents. Chemother. 1999. - № 43. - P. 1866-1869.

42. Blower S.M. Problems and solutions for the Stop TB partnership //S.M. Blower, C.L. Daley //The Lancet Infect. Dis. 2002. - № 2. - P. 374-376.

43. Blower S.M. Understanding, predicting and controlling the emergence of drug-resistant tuberculosis: a theoretical framework /S.M. Blower, J.L. Gerberding //J. Mol. Med. 1998. - № 76. - P. 624-636.

44. Brooks G.F. Medical microbiology /G.F. Brooks, J.S. Butel, S.A. Morse. -McGraw-Hill: Medical Books, 2001. 176 p.

45. Cantwell M.F. Tuberculosis in sub-Saharan Africa: A regional assessment of the impact of the human immunodeficiency virus and National Tuberculosis Control Program quality /M.F. Cantwell, N.J. Binkin //Tubercle. Lung. Disease. 1996.-№77.-P. 220-225.

46. CDC. Acquired multidrug-resistant tuberculosis Buenaventura, Colombia //MMWR. Morb. Mortal. Wkly. Rep. - 1998. - № 47. - P. 759-761.

47. CDC. Epidemiologic notes and reports nosocomial transmission of multidrug-resistant tuberculosis among HIV-infected persons Florida and New York //MMWR. Morb. Mortal. Wkly. Rep. -1991. - № 40. - P. 585-591.

48. CDC. Epidemiologic notes and reports nosocomial transmission of multidrug-resistant tuberculosis to health-care workers and HIV-infected patients in an urban hospital Florida //MMWR. Morb. Mortal. Wkly. Rep. - 1990. - № 39. -P. 718-722.

49. CDC. Evaluation of a directly observed therapy short-course strategy for treating tuberculosis in Orel oblast, Russian Federation, 1999-2000 //Morb. Mortal. Wkly. Rep. 2001. - № 50. - P. 204-206.

50. CDC. Outbreak of multidrug-resistant tuberculosis Texas, California, and Pennsylvania //MMWR. Morb. Mortal. Wkly. Rep. - 1990. - № 39. - P. 369372.

51. CDC. Screening for tuberculosis and tuberculosis infection in high risk populations //MMWR Morb. Mortal. Wkly. Rep. 1995. - № 44. - P. 3-17.

52. CDC. Tuberculosis treatment interruptions in Ivanovo oblast, Russian Federation, 1999 //Morb. Mortal. Wkly. Rep. 2001. - № 50. - P. 201-204.

53. CDC. WHO/IUATLD Global project on anti-tuberculosis drug resistance surveillance //TB Notes. 1997. - № 4. - P. 15-18.

54. Characterization of the katG and inhA genes of isoniazid-resistant clinical isolates of Mycobacterium tuberculosis /D.A. Rouse, Z. Li, G.H. Bai, S.L. Morris //Antimicrobial. Agents. Chemother. 1995. - № 39. - P. 2472-2477.

55. Characterization of Mycobacterium tuberculosis isolates from patients in Houston, Texas, by spoligotyping /H. Soini, X.I. Pan, A. Amin et al. //J. Clin. Microbiol. 2000. 38. - P. 669-676.

56. Characterization of rpoB mutations in rifampin-resistant Mycobacterium tuberculosis isolates from the Middle East IS. Ahmad, G.F. Araj, P.K. Akbar et al. //Diagnostic. Microbiol. Infect. Dis. 2000. - № 38. - P. 227-232.

57. Characterization of rpsL and rrs mutations in streptomycin-resistant Mycobacterium tuberculosis isolates from diverse geographic localities /S. Sreevatsan, X. Pan, K.E. Stockbauer et al. //Antimicrob. Agents. Chemother. -1996.-№40.-P. 1024-1026.

58. Characterization of streptomycin resistance mechanisms among Mycobacterium tuberculosis isolates from patients in New York City /R.C. Cooksey, G.P. Morlock, A. McQueen et al. //Antimicrob. Agents. Chemother. 1996. - № 40. -P. 1186-1188.

59. Clinical microbiology procedures handbook /Isenberg, Henry D. ed. American Society for Microbiology Washington: D.C., 1992.

60. Cohen T. The effect of drug resistance on the fitness of Mycobacterium tuberculosis /T. Cohen, B. Sommers, M. Murray //Lancet Infect. Dis. 2003. -№ 3. - P. 13-21.

61. Cole S.T. Drug resistance in Mycobacterium tuberculosis /S.T. Cole, A. Telenti //Eur. Respir. J. 1995. - № 20. - P. 701-713.

62. Cole S.T. Mycobacterium tuberculosis drug-resistance mechanisms /S.T. Cole //Trends. Microbiol. 1994. - № 2. - P. 411-414.

63. Comparison of a radiometric method (BACTEC) and conventional culture media for recovery of mycobacteria from smear-negative specimens /M.A. Morgan, C.D. Horstmeier, D.R. de Young, G.D. Roberts //J. Clin. Microbiol. -1983.18.-P. 384-388.

64. Compensatory aphC gene expression in isoniazid-resistant Mycobacterium tuberculosis /D.R. Sherman, K. Mdluli, M.J. Hickey et al. //Science. 1996. - P. 272-p. 1641-1643.

65. Correlation of molecular resistance mechanisms and phenotypic resistance levels in streptomycin-resistant Mycobacterium tuberculosis /A. Meier, P.

66. Sander, K-J. Schaper et al. //Antimicrob. Agents. Chemother. 1996. - № 40. -P. 2452-2454.

67. Crofton S.J. Clinical tuberculosis /S.J. Crofton, N. Hörne, F. Miller. London: Macmillan, 1999. - P. 222.

68. Cross-resistance in M. tuberculosis to kanamycin, capreomycin, and viomycin /J.K. McClatchy, W. Kanes, P.T. Davidson, T.S. Moulding //Tubercle. 1977. -№58.-P. 29-34.

69. Decentralization of the DOTS programme within a Russian penitentiary system /A. Slavuckij, V. Sizaire, L. Lobera et al. //Europ. J. Publ. Health. 2002. - № 12. - P. 94-98.

70. Detection of rifampicin-resistance mutations in Mycobacterium tuberculosis /A. Telenti, P. Imboden, F. Marchesi et al. //Lancet. 1993. - № 341. - P. 647-650.

71. Detection of rifampin resistance among isolates of Mycobacterium tuberculosis from Mozambique /D.A. Caugant, P. Sandven, J. Eng et al. //Microbial Drug Resist. 1995. -№ 1. - P. 321-326.

72. Dhandayuthapani S. Interactions of OxyR with the promoter region of the oxyR and ahpC genes from Mycobacterium leprae and Mycobacterium tuberculosis IS. Dhandayuthapani, M. Mudd, V. Deretic //J. Bacteriol. 1997. - № 179. - P. 2401-2409.

73. Douglass J. A ribosomal gene mutation in streptomycin-resistant Mycobacterium tuberculosis isolates /J. Douglass, L.M. Steyn //J. Infect. Dis. -1993.-№ 167.-P. 1505-1506.

74. Drobniewski F.A. The rapid diagnosis and rifampicin resistance in Mycobacterium tuberculosis a molecular story /F.A. Drobniewski, S.M. Wilson//J. Med. Microbiol. - 1998. - № 47. - P. 189-196.

75. Drug-resistant strains of Mycobacterium tuberculosis exhibit a range of virulence for mice /D.J. Ordway, M.G. Sonnenberg, S.A. Donahue et al. //Infect. Immun. 1995. - № 63. - P. 741-743.

76. Drug-resistant strains of Mycobacterium tuberculosis isolated in Russia /V.N. Stepashina, E.A. Panfertsev, O.V. Korobova et al. IIInt. J. Tuberc. Lung. Dis. -1999. -№3.- P. 149-152.

77. Drug-resistant tuberculosis in prisons in Azerbaijan: case study /R. Coninx, G.E. Pfyffer, C. Mathieu et al. //BMJ. 1998. - № 316. - P. 1423-1425.

78. Dunlap N.E. The use of RFLP as a tool for tuberculosis control: utility or futility? /N.E. Dunlap //Int. J. Tuberc. Lung. Dis. 2000. - № 4. - P. S134-S138.

79. Enhanced capacity of a widespread strain of Mycobacterium tuberculosis to grow in human macrophages /M. Zhang, J. Gong, Z. Yang et al. //J. Infect. Dis. 1999.-№ 179.-P. 1213-1217.

80. Epidemiological evidence of the spread of a Mycobacterium tuberculosis strain of the Beijing genotype on Gran Canaria Island /J.A. Caminero, M.J. Pena, M.I. Campos-Herrero et al. II Am. Respir. Crit. Care. Med. 2001. - № 164. - P. 1165-1170.

81. Ethambutol inhibition of glucose methabolism in mycobacteria: a possible target of the drug IG. Silve, P. Valero-Guillen, A. Quemard et al. //Antimicrobial. Agents. Chemotherapy. 1993. - № 37. - P. 1536-1538.

82. Exogenous re-infection as a cause of recurrent tuberculosis in a low-incidence area /A.S. Boer, M.W. Borgdorff, E. Vynnycky et al. //Int. J. Tuberc. Lung. Dis. -2003,-№7.-P. 145-152.

83. Expression of katG in Mycobacterium tuberculosis is associated with its growth and persistence in mice and guinea pigs /Z. Li, C. Kelley, F. Collins, D. Rouse //J. Infect. Dis. 1998. - № 177. - P. 1030-1035.

84. Fischer B. Epidemiology of mycobacterial resistance (especially Mycobacterium tuberculosis) /B. Fischer //Chemother. 1999. - № 45. - P. 109120.

85. Genetic alterations in streptomycin-resistant Mycobacterium tuberculosis: mapping of mutations conferring resistance /A. Meier, P. Kirschne, F-C. Bange et al. //Antimicrob. Agents. Chemother. 1994. - № 38. - P. 228-233.

86. Gillespie S.H. Evolution of drug resistance in Mycobacterium tuberculosis: clinical and molecular perspective /S.H. Gillespie //Antimicrobial. Agents. Chemother. 2002. - № 46. - P. 267-274.

87. Global distribution of Mycobacterium tuberculosis spoligotypes /1. Filliol, J.R. Driscol, D. van Soolingen et al. //Emerg. Infect. Dis. 2002. - № 8. - P. 13471349.

88. Herr E.B.Jr. Chemical and physical characterization of capreomycin /E.B.Jr. Herr, M.O. Redstone //Ann. N. Y. Acad. Sei. 1996. - № 135. - P. 940-946.

89. Hirano K. Mutations in the rpoB gene of rifampin-resistant Mycobacterium tuberculosis strains isolated mostly in Asian countries and their rapid detection by Line Probe Assay /K. Hirano, C. Abe, M. Takahashi //J Clin Microbiol.1999.-№37.-P. 2663-2666.

90. Historic and recent events contribute to the disease dynamics of Beijing-like Mycobacteriun tuberculosis isolates in a high incidence region /M. Richardson,

91. W.P. van Lilt, G.D. van der Spuy et al. //Int. J. Tuberc. Lung. Dis. 2002. - №6.-P. 1001-1011.

92. Hoel T. Radiometric and conventional drug susceptibility testing of Mycobacterium tuberculosis IT. Hoel, J. Eng //APMIS. 1991. - № 99. - P. 977-980.

93. Honore N. Streptomycin resistance in mycobacteria /N. Honore, S.T. Cole //Antimicrob. Agents. Chemother. 1994. - № 38. - P. 238-242.

94. Huang C.H. Non- radoactive probe for the rapid identification of Mycobacterium avium complex from clinical specimens /C.H. Huang, D.L. Jungking //Mol. Cell. Probes. 1991. - № 5. - P. 277-280.

95. Identification of a W variant outbreak of Mycobacterium tuberculosis via population-based molecular epidemiology /P.J. Bifani, B. Mathema, Z. Liu et al. //JAMA. 1999. - № 282. - P. 2321-2327.

96. In vitro and in vivo laboratory studies on the antituberculosis activity of capreomycin /W.B. Sutton, R.S. Gordee, W.E. Wick, L.V. Standfield //Ann. N. Y. Acad. Sci. -1966. № 135. - P. 947-959.

97. Inadequacy of the current WHO re-treatment regimen in a central Siberian prison: treatment failure and MDR-TB /M.E. Kimerling, H. Kluge, N. Verzhnina et al. //Int. J. Tuberc. Lung. Dis. 1999. - № 3. - P. 451-453.

98. Inderlied C.B. Antimicrobial susceptibility testing: present practices and future trends /C.B. Inderlied //Eur. J. Clin. Microbiol. Infect. Dis. 1994. - № 13.-P. 980-993.

99. Inderlied C.B. Manual of clinical microbiology /C.B. Inderlied, P.R. Murray, E.J. Baron et al. Washington: American Society for Microbiology, 1999.-P. 1601-1623.

100. Influence of anti-tuberculosis drug resistance on the treatment outcome of pulmonary tuberculosis patients receiving DOTS in Riyadh, Saudi Arabia /R.

101. Inhibition of a Mycobacterium tuberculosis ß-ketoacyl ACP synthase by isoniazid IK. Mdluli, R.A. Slayden, Y. Zhu et al. //Science. 1998. - № 280. -P. 1607-1610.

102. Interpreting DNA fingerprint clusters of Mycobacterium tuberculosis /J.R. Glynn, J. Bauer, A.S. de Boer et al. IIInt. J. Tuberc. Lung. Dis. 1999. - № 3. -P. 1055-1060.

103. Investigation and control of a large outbreak of multi-drug resistant tuberculosis at a central Lisbon hospital /M.M. Hannan, H. Peres, F. Maltez et al. //J. Hosp. Infect. 2001. - № 47. - P. 91-97.

104. IS6/70-RFLP and spoligotyping of Mycobacterium tuberculosis isolates in Iran IM. Doroudchi, K. Kremer, E.A. Basiri et al. //Scand. J. Infect. Dis. 2000. - № 32. - P. 663-668.

105. Jacobs R. F. Multiple-drug resistant tuberculosis /R.F. Jacobs //Clin. Infect. Dis. 1994. -№19. -P. 1-10.

106. Kimerling M.E. The Russian equation: an evolving paradigm in tuberculosis control /M.E. Kimerling //Int. J. Tuberc. Lung. Dis. 2000. - № 4. - P. S160-S167.

107. Laing R.O. Tuberculosis drug issues: prices, fixed-dose combination products and second-line drugs /R.O. Laing, K.M. McGoldrick //Int. J. Tuberc. Lung. Dis. 2000. - № 4. - P. S194-S207.

108. Lefford M.J. The ethionamide sensitivity of British pretreatment strains of Mycobacterium tuberculosis /M.J. Lefford //Tubercle. Lond. 1966. - № 47. -P. 198-206.

109. Manual of clinic microbiology /G.D. Roberts, E.W. Koneman, Y.K. Kim et al. Washington: American Society of Microbiology, D.C., Mycobacterium, 1991.-304-339 p.

110. Marttila H.J. Molecular genetics of drug-resistant Mycobacterium tuberculosis /H.J. Marttila. Turku: Turun Yliopisto, 1999. 200 p.

111. McClure W.R. On the mechanism of rifampicin inhibition of RNA synthesis /W.R. McClure, C.I. Cech //J. Biol. Chem. 1978. - № 253. - P. 8949-8956.

112. Medical and social analysis of prisoners with tuberculosis in a Russian prison colony: an observation study /F. Drobniewski, Y. Balabanova, M. Ruddy et al. //Clin. Infect. Dis. 2003. - № 36. - P. 234-235.

113. Medical Research Council. Streptomycin treatment of pulmonary tuberculosis /Medical Research Council //BMJ.- 1948. № 2. - P. 769-782.

114. Middlebrook G. Automatable radiometric detection of growth of Mycobacterium tuberculosis in selective media /G. Middlebrook, Z. Reggiardo, W.D. Tigerit //Am. Rev. Respir. Dis. 1977. - № 115. - P. 1066-1069.

115. Middlebrook G. Some observations on the pathogenicity of isoniazid resistant variants of tubercle bacilli /G. Middlebrook, M.L. Cohn //Science. -1953. -№118. -P. 297-299.

116. Migliori G.B. Problems to control TB in Eastern Europe and consequences in low incidence countries /G.B. Migliori, R. Centis //Monaldi. Arch. Chest. Dis. 2002. - № 57. - P. 285-290.

117. Missense mutations in the catalase-peroxidase gene, katG, are associated with isoniazid resistance in Mycobacterium tuberculosis /B. Heym, P.M. Alzari, N. Honore, S.T. Cole //Mol. Microbiol. 1995. - № 15. - P. 235-245.

118. Mitchell A. Y. DNA fingerprinting: RFLP analysis /A.Y. Mitchell //Molecular mycobacteriology. New York, 1999. - P. 131-151.

119. Mitchison D. The segregation of streptomycin resistant variants of Mycobacterium tuberculosis into groups with characteristic resistance /D. Mitchison //J. Gen. Microbiol. -1951. № 5. - P. 596-604.

120. Mitchison D.A. How drug resistance emergence as a result of poor compliance during short course chemotherapy for tuberculosis /D.A. Mitchison //Int. J. Tuberc. Lung. Dis. 1998. - № 2. - P. 10-15.

121. Molecular epidemiology of Mycobacterium tuberculosis in Norway /U. Dahle, P. Sandven, E. Heldal, D.A. Caugant //J. Clin. Microbiol. 2001. - № 39.-P. 1802-1807.

122. Molecular epidemiology of tuberculosis in Cuba outside of Havana /R. Diaz, K. Kremer, P.E. de Haas et al. //Int. J. Tuberc. Lung. Dis. 1998. - № 2. - P. 743-750.

123. Molecular evidence for independent occurrence of IS6110 insertions at the same sites of the genome of Mycobacterium tuberculosis in different clinical isolates /Z. Fang, D.T. Kenna, C. Doig et al. //J. Bacteriol. 2001. - № 183 - P. 5279-5284.

124. Morlock G.P. Characterization of spontaneous, in vitro-selected, rifampin-resistant mutants of Mycobacterium tuberculosis strain H37Rv /G.P. Morlock, B.B. Plikaytis, J.T. Crawford //Antimicrobial. Agents. Chemother. 2000. - № 44.-P. 3298-3301.

125. Multidrug-resistant tuberculosis in prison inmates, Azerbaijan /G.E. Pfyffer, A. Strassle, T. van Gorkum et al. //Emerg. Infect. Dis. 2001. - № 7. - P. 855861.

126. Multiple drug-resistant Mycobacterium tuberculosis: evidence for changing fitness following passage through human hosts /S.H. Gillespie, O.J. Billington, A. Breathnach, T.D. McHugh //Microb. Drug. Resist. 2002. - № 8. - P. 273279.

127. Murray M. Molecular epidemiology of tuberculosis: achievements and challenges to current knowledge /М. Murray, E. Nardell //Bull. World. Health. Org. 2002. - № 80. - P. 477-482.

128. Musser J.M. Antimicriobial agent resistance in Mycobacteria: molecular genetic insights /J.M. Musser //Clin. Microbiol. Rev. 1995. - № 8. - P. 496514.

129. Mutation to rifampin resistance at the begining of the RNA polymerase p subunit gene in Escherichia coli /N.A. Lisitsyn, E.D. Sverdlov, E.P. Moiseyeva et al. //Mol. Gen. Genet. 1984. - № 196. - P. 173-174.

130. Mutations in the rpoB and katG genes leading to drug resistance in Mycobacterium tuberculosis in Latvia /Т. Tracevska, I. Jansone, L. Broka et al. 113. Clin. Microbiol. 2002. - № 40. - P. 3789-3792.

131. Mycobacterium tuberculosis Beijing genotype emerging in Vietnam /D.D. Anh., M.W. Borgdorff, L.N. Van et al. //Emerg. Infect. Dis. 2000. - № 6. - P. 302-305.

132. Mycobacterium tuberculosis Beijing genotype strains associated with febrile response to treatment /R. Van Crevel, R.H.H. Nelwan, W. de Lenne et al. //Emerg. Infect. Dis. 2001. - № 7. - P. 880-883.

133. Mycobacterium tuberculosis drug resistance in a suburban community in southern Mexico /M.L. Garcia-Garcia, M.E. Jimenez-Corona, A. Ponce de Leon et al. Hint J. Tuberc. Lung. Dis. 2000. - № 4. p. S168-170.

134. Nachega J.B. Tuberculosis drug resistance: a global threat /J.B. Nachega, R.E.Chaisson //Clin. Infect. Dis. 2003. - № 36. - P. S24-S30.

135. Niemann S. IS 6110 fingerprinting of drug-resistant Mycobacterium tuberculosis strains isolated in Germany during 1995 /S. Niemann, S. Rusch-Gerdes, E. Richter //J. Clin. Microbiol. 1997. - № 35. - P. 3015-3020.

136. Normark B. H. Evolution and spread of antibiotic resistance /B.H. Normark, S. Normark //J. Internal. Med. 2002. - № 252. - P. 91-106.

137. Origin and interstate spread of a New York City multidrug-resistant Mycobacterium tuberculosis clone family /P.J. Bifani, B.B. Plikaytis, V. Kapur et al. //JAMA. 1996. - № 275. - P. 452-457.

138. Outcomes of patients with multidrug-resistant pulmonary tuberculosis treated with ofloxacin/levofloxacin-containing regimens /W.W. Yew, C.K. Chan, C.H. Chau et al. //Chest. 2000. - № 117. - P. 744-751.

139. Pablos-Mendez A.R. The relationship between delayed or incomplete treatment and all cause mortality in patients with tuberculosis /A.R. Pablos-Mendez, T.F. Sterling, T.R. Frieden //JAMA. 1996. - № 276. - P. 1223-1228.

140. PCR-based methodology for detecting multidrug-resistant strains of Mycobacterium tuberculosis Beijing family circulating in Russia /1. Mokrousov, T. Otten, A. Vyazovaya et al. IIEur. J. Clin. Microbiol. Infect. Dis. 2003. - № 22. - P. 342-348.

141. Peloquin C.A. Therapeutic drug monitoring in the treatment of tuberculosis /C.A. Peloquin//Curr. Opin. 2002. - № 62. - P. 2169-2183.

142. Perelman M. I. Tuberculosis in Russia /M.I. Perelman //Int. J. Tuberc. Lung. Dis. 2000. - №. 4. - P. 1097-1103.

143. Pfaller M. A. Application of new technology to the detection, identification, and antimicrobial susceptibility testing of Mycobacteria /M.A. Pfaller //Am. J. Clin. Pathol. 1994. - № 101. - P. 329-337.

144. Phylogenetic reconstruction within Mycobacterium tuberculosis Beijing genotype in northwestern Russia /1. Mokrousov, O. Narvskaya, T. Otten et al. //Res. Microbiol. 2002. - № 153. - P. 629-637.

145. Pio A. Tuberculosis handbook I A. Pio, P. Chaulet. Geneva: World Health Organisation, 1998. - 222 p.

146. Portaels F. Addressing multi-drug resistant tuberculosis in penitentiary hospitals and in the general population of the former Soviet Union IF. Portaels, L. Rigouts, I. Bastian //Int. J. Tuberc. Lung. Dis. 1999. - № 3. - P. 582-588.

147. Predominance of a single genotype of Mycobacterium tuberculosis in countries of East Asia ID. Van Soolingen, L. Qian, P.E.W. de Haas et al. //J. Clin. Microbiol. 1995. - № 33. - P. 3234-3238.

148. Primary structure of Escherichia coli RNA polymerase. Nucleotide substitution in the p subunit gene of the rifampicin resistant rpoB255 mutant /Y.A. Ovchinnikov, G.S. Monastyrskaya, V.V.Gubanov et al. //Mol. Gen. Genet. -1981. № 184. - P. 536-538.

149. Pyle M. M. Relative numbers of resistant tubercle bacilli in sputa of patients before and during treatment with streptomycin /M.M. Pyle //Proc. Staff. Meet. Mayo. Clin. 1947. - № 22. - P. 465-473.

150. Ramaswamy S. M. Molecular genetic basis of antimicrobial agent resistance in Mycobacterium tuberculosis: 1998 update IS. Ramaswamy, J.M.Musser //Tubercle. Lung. Dis. 1998. - № 79. - P. 3-29.

151. Rapid detection of rifampin-resistant Mycobacterium tuberculosis by sequencing and Line probe assay /H.J. Marttila., H. Soini, B.I. Vyshnevskiy et al. //Scand. J. Infect. Dis. 1998. - № 30. - P. 129-132.

152. Rapid identification of a point mutation of the Mycobacterium tuberculosis catalase-peroxidase (katG) gene associated with isoniazid resistance /F.R. Cockerill, J.R. Uhl, Z. Temesgen et al. IIJ. Infect. Dis. 1995. - № 171. - P. 240-245.

153. Rattan A. Multidrug-resistant Mycobacterium tuberculosis: molecular perspectives I A. Rattan, A. Kalia, N. Ahmad //Emerg. Infect. Dis. 1998. - № 4. - P. 195-209.

154. Raviglione M.C. The TB epidemic from 1992 to 2002 /M.C. Raviglione //Tuberculosis. 2003. - № 83. - P. 4-14.

155. Reichman L.B. How to ensure the continued resurgence of tuberculosis /L.B. Reichman //Lancet. 1996. - № 8995. - P. 175-177.

156. Reichman L.B. Timebomb. The global epidemic of multi-drug-resistant tuberculosis /L.B. Reichman, J.H. Tanne. New York: McGraw-Hill, 2001. -127-138 p.

157. Restriction fragment analysis of cromosomal DNA defines different strains of Mycobacterium tuberculosis /S.A. Shoemaker, J.H. Fisher, W.D. Jones, C.H. Scoggin //Am. Rev. Resp. Dis. 1986. - № 134. - P. 210-213.

158. Restriction fragment length polymorphism study of Mycobacterium tuberculosis in Thailand using IS6110 as probe /P. Palittapongarnpim, P. Luangsook, S. Tansuphaswadikul et al. //Int. J. Tuberc. Lung. Dis. 1997. - № l.-P. 370-376.

159. Retreatment tuberculosis cases. Factors associated with drug resistance and adverse outcomes /A.L. Kritski, L.S.R. de Jesus, M.K. Andrade et al. //Chest. -1997.-№ 111.-P. 1162-1167.

160. Retrospective analysis of the Beijing family of Mycobacterium tuberculosis in preserved lung tissues /L. Qian, J.D.A. van Embden, A.G.M. van der Zanden et al. //J. Clin. Microbiol. 1999. - № 37. - P. 471-474.

161. RFLP patterns and risk factors for recent tuberculosis transmission among hospitalized tuberculosis patients in Rio de Janeiro, Brazil /F.C. Fandinho, A.L.

162. Kritski, C. Hofer et al. //Trans. R. Soc. Trop. Med. Hyg. 2000. - № 94. - P. 271-275.

163. Rifampin- and multidrug-resistant tuberculosis in Russian civilians and prison inmates: dominance of the Beijing strain family /F. Drobniewski, Y. Balabanova, M. Ruddy et al. //Emerg. Infect. Dis. 2002. - № 8. - P. 13201326.

164. Riska P. F. Molecular determinants of drug resistance in Mycobacterium tuberculosis /P.F. Riska, W.R. Jacobs, D. Alland //Int. J. Tuberc. Lung. Dis. -2000.-№ 4. P. S4-S10.

165. Salyers A.A. Bacterial pathogenesis. A molecular approach /A.A. Salyers, D.D. Whitt. Washington: ASM Press D.C., 2002.

166. Scorpio A. Mutations in pncA, a gene encoding pyrazinamidase/nicotinamidase, cause resistance to the antituberculous drug pyrazinamide in tubercle bacillus /A. Scorpio, Y. Zhang //Nature. Med. 1996. - № 2. - P. 662-667.

167. Seventy percent of the M. tuberculosis isolates in Hong Kong represent the Beijing genotype /M.Y. Chan M. Y., M. Borgdorff M., C.W. Yip et al. //Epidemiol. Infect. 2001. - № 127. - P. 169-171.

168. Siddiqi S.H. BACTEC 460TB System. Product and procedure manual, revision /S.H. Siddiqi. D. Sparks, MD, USA.: Becton Dickinson Microbiology Systems, 1995.

169. Simultaneous detection and strain differentiation of Mycobacterium tuberculosis for diagnosis and epidemiology /J. Kamerbeek, L. Schouls, A. Kolk et al. //J. Clin. Microbiol. 1997. - № 35. - P. 907-914.

170. Single nucleotide polymorphisms in genes associated with isoniazid resistance in Mycobacterium tuberculosis /S.V. Ramaswamy, R. Reich, S.J. Dou et al. //Antimicrobial. Agents. Chemother. 2003. - № 47. - P. 1241-1250.

171. Snider D. E. The global threat of drug-resistant tuberculosis /D.E. Snider, K.G. Castro //N. Engl. J. Med. 1998. - № 338. - P. 1689-1690.

172. Spacer oligonucleotide typing of bacteria of the Mycobacterium tuberculosis complex: recommendations for standardised nomenclature /J.W. Dale, D. Brittain, A.A. Cataldi et al. //Int. J. Tuberc. Lung. Dis. 2001. - № 5. - P. 216219.

173. Spoligotype database of Mycobacterium tuberculosis: biogeographic distribution of shared types and epidemiologic and phylogenetic perspectives /C. Sola, I. Filliol, M.C.Gutierrez et al. //Emerg. Infect. Dis. 2001. - № 7. - P. 390-396.

174. Spread of drug-resistant pulmonary tuberculosis in Estonia /A. Kruuner, S.E. Hoffner, H. Sillastu et al. //J. Clin. Microbiol. 2001. - № 39. - P. 3339-3345.

175. Spread of strain W, a highly drug-resistant strain of Mycobacterium tuberculosis, across the United states /T.B. Agerton, S.E. Valway, R.J. Blinkhora et al. //Clin. Infect. Dis. 1999. - № 29. - P. 85-92.

176. Standard short-course chemotherapy for drug-resistant tuberculosis treatment outcomes in 6 countries /M.A. Espinal, S.J. Kim, P.G. Suarez et al. //JAMA. 2000. - № 283. - P. 2537-2545.

177. Starke J. R. Drug-resistance in tuberculosis: mechanisms and prevention /J.R. Starke //Pediatric. Pulmonology. 1997. - № 16. - P. 154-156.

178. Stern V. Problems in prisons worldwide, with a particular focus on Russia /V. Stern //Annals. New. York. Academy, of Science. 2001. - № 953. - P. 113119.

179. Stop TB working group on DOTS-Plus for MDR-TB. A prioritised research agenda for DOTS-Plus for multidrug-resistant tuberculosis (MDR-TB) /Stop TB working group on DOTS-Plus for MDR-TB //Int. J. Tuberc. Lung. Dis. -2003.-№7. -P. 410-414.

180. Strain identification of Mycobacterium tuberculosis by DNA fingerprinting: Recommendations for a standardized methodology /J.D.A. Van Embden, M.D. Cave, J. Crawford et al. //J. Clin. Microbiol. 1993. - № 31. - P. 406-409.

181. Survey of drug-resistant tuberculosis in northwestern Russia from 1984 through 1994 /M.K. Viljanen, B.I. Vyshnevskiy, T.F. Otten et al. //Eur. J. Clin. Microbiol. Infect. Dis. 1998. - № 17. - P. 177-183.

182. Takayama K. Inhibition of synthesis of arabinogalactan by ethambutol in Mycobacterium smegmatis IK. Takayama, J.O. Kilburn //Antimicrobial. Agents. Chemotherapy. 1989. - № 33. - P. 1493-1499.

183. The catalase-peroxidase gene and isoniazid resistance of Mycobacterium tuberculosis IY. Zhang, B. Heym, B. Allen et al. //Nature. 1992. - № 358. - P. 591-593.

184. The molecular basis of antibiotic action /E.F. Gale, E. Cundliffe, P.E. Reynolds et al. New York: John Wiley & Sons, 1981.

185. The nature and consequence of genetic variability within Mycobacterium tuberculosis M. Kato-Maeda, P.J. Bifani, B.N. Kreiswirth, P.M. Small //J. Clin. Investig. 2001. - № 107. - P. 533-537.

186. The rpsL gene and streptomycin resistance in single and multiple drug-resistant strains of Mycobacterium tuberculosis /J. Nair, D.A. Rouse, G-H. Bai, S.L. Morris //Mol. Microbiol. 1993. - № 10. - P. 521-527.

187. Treatment outcome of relapse and defaulter pulmonary tuberculosis patients IT. Sevim, G. Atac, G. Gungor et al. //Int. J. Tuberc. Lung. Dis. 2002. - № 6. -P. 320-325.

188. Tsukamura M. Cross-resistance relationships among the aminoglucoside antibiotics in Mycobacterium tuberculosis HA. Tsukamura, S. Mizuno //J. Gen. Microbiol. 1975. - № 88. - P. 269-274.

189. Tuberculosis control and molecular epidemiology in a South African gold-mining community /P. Godfrey-Faussett, P. Sonnenberg, S.C. Shearer et al. //Lancet. 2000. - № 356. - P. 1066-1071.

190. Tuberculosis guide for low-income countries /D.A. Enarson, H.L. Rieder, T. Arnadottir, A. Trebucq. Paris: International Union Against Tuberculosis and Lung Diseases, 1996. - P. 65.

191. Use of Molecular techniques to distinguish between treatment failure and exogenous reinfection with Mycobacterium tuberculosis /A. Kruuner, L. Pehme, S. Ghebremichael et al. //Clin. Infect. Dis. 2002. - № 35. - P. 146-155.

192. Van Soolingen D. Molecular epidemiology of tuberculosis and other mycobacterial infections: main methodologies and achievements /D. Van Soolingen //J. Intern. Med. 2001. - № 249. - P. 1-26.

193. Vennesland K. The demonstration of naturally occurring streptomycin resistant variants in the human strain of tubercle bacillus H-37RV /K. Vennesland, R.H. Ebert, R.G. Bloch //Science. 1947. - № 106. - P. 476-477.

194. Werngren J. Drug-susceptible Mycobacterium tuberculosis Beijing genotype does not develop mutation-conferred resistance to rifampin at an elevated rate /J. Werngren, S.E. Hoffner //J. Clin. Microbiol. 2003. - № 41. - P. 1520-1524.

195. WHO Geneva/IUATLD Paris. Guidelines for surveillance of drug resistance in tuberculosis /WHO Geneva/IUATLD Paris //Int. J. Tuberc. Lung. Dis. -1998.-№2.-P. 72-89.

196. World Bank. Investing in health: world development report 1993 / World Bank. New York.: Oxford University Press, 1993.

197. World Health Organization, Communicable Diseases Programme. Global tuberculosis control /World Health Organization. Geneva: World Health Organization, 2002. - 275 p.

198. World Health Organization. Report on TB epidemic. Global TB programme /World Health Organization. Geneva: World Health Organization, 1997.

199. World Health Organization. TB, a global emergency /World Health Organization. Geneva: World Health Organization, 1994.

200. World Health Organization. TB: groups at risk, WHO report on the tuberculosis epidemic/ World Health Organization. Geneva: World Health Organization, 1996.

201. World Health Organization. Treatment' of tuberculosis (rev 3). WHO/CDS/TB/2003.313. /World Health Organization. Geneva: WHO, 2003.

202. World Health Organization. Treatment of tuberculosis: guidelines for national programmes /World Health Organization. Geneva: World Health Organization, 2003.

203. World Health Organization. Tuberculosis. /World Health Organization. -Geneva: World Health Organization, 2003, fact sheet №4.

204. World Health Organization. Tuberculosis. Geneva: World Health Organization, 2000, fact sheet №104.

205. World Health Organization. WHO global report on tuberculosis /World Health Organization. Geneva.: WHO, 1996.

206. Worldwide occurrence of Beijing/W strains of Mycobacterium tuberculosis: a systematic review /J.R. Glynn, J. Whiteley, P.J. Bifani et al. //Emerg. Infect. Dis. 2002. - № 8. - P. 843-849.

207. Yerokhin V. V. Tuberculosis in Russia and the problem of multiple drug resistance /V.V. Yerokhin, V.V. Punga, L.N. Rybka //Annals. New. York. Academy, of Science. 2001. - № 953. - P. 133-137.