Лекарственная устойчивость и молекулярная эпидемиология туберкулеза в четырех административных территориях Северо-Западного Федерального округа РФ тема диссертации и автореферата по ВАК РФ 14.00.26, кандидат медицинских наук Баранов, Антон Алексеевич

• Баранов, Антон Алексеевич
• кандидат медицинских наук
• 2008

Оглавление диссертации кандидат медицинских наук Баранов, Антон Алексеевич

Список сокращений

Введение

Глава 1. Обзор литературы

1.1. Особенности развития современной эпидемии^ туберкулеза

1.2. Методы по определению лекарственной чувствительности МБТ

1.3. Факторы риска развития лекарственной устойчивости МБТ

1.4 Молекулярно-генетические методы анализа для описания молекулярной эпидемиологии МБТ

Глава 2. Материалы и методы исследования'

Глава 3. Результаты определения лекарственной чувствительности МБТ и факторы риска развития МЛУ

3.1 Лекарственная чувствительность штаммов МБТ

3.2 Факторы риска1 развития МЛУ

Глава 4. Описание молекулярной эпидемиологии МБТ

4'. Г Результаты сполиготипирования

4.2'Результаты IS6110 RFLP генотипирования'

4.3 Генотип Beijing и лекарственная устойчивость

Глава 5. Обсуждение результатов исследования

5.1 Лекарственная устойчивость МБТ

5.2 Факторы риска развития лекарственной устойчивости МБТ

5.3 Молекулярная эпидемиология МБТ

Выводы

Введение диссертации (часть автореферата) на тему «Лекарственная устойчивость и молекулярная эпидемиология туберкулеза в четырех административных территориях Северо-Западного Федерального округа РФ»

Актуальность проблемы

Туберкулез - это хроническое инфекционное заболевание, которое сопутствует человечество на протяжении большей части документированной истории его развития. По некоторым оценкам, бактерия-прародитель рода Mycobacterium появилась 150 миллионов лет назад. Однако современные микобактерии туберкулеза (МБТ) появились всего лишь 15,000-20,000 лет назад [ 63 ].

В настоящее время, туберкулез является ведущей причиной смерти среди излечимых инфекционных заболеваний в. мире [144]. По оценкам Всемирной Организации Здравоохранения (ВОЗ), одна треть всего населения мира инфицирована бациллой туберкулеза [ 147].

В последние годы борьба с туберкулезной инфекцией в мировом., масштабе значительно осложнена все более широким распространением лекарственной устойчивости возбудителя туберкулеза, а также сочетанием туберкулеза с ВИЧ-инфекцией [ 146].

По степени значимости биологической угрозы для населения, в силу высокой трансмиссивности и способности к воспроизводству, лекарственно устойчивые МБТ отнесены к наивысшей категории «С» среди инфекционных агентов [31].

В Российской Федерации (РФ) недостаточная эффективность мер по борьбе с туберкулезом- во многом объясняется широким распространением лекарственно-устойчивых форм туберкулеза [26]. Распространение множественной лекарственной устойчивости (МЛУ) МБТ (устойчивость к изониазиду и рифампицину при возможной резистентности к другим противотуберкулезным препаратам) наблюдается почти во всех регионах РФ [23]. За период с 2002 года по 2006 год, в РФ • доля пациентов с множественной лекарственной устойчивостью среди всех больных туберкулезом органов дыхания с бактериовыделением возросла с 14,5% до 20,3%, причем в Северо-Западном Федеральном округе РФ в 2006 году этот показатель оказался одним из наиболее высоких среди, остальных Федеральных округов и составил 28j5% [23]. Таким образом, несмотря на то, что основные эпидемиологические показатели характеризующие уровень распространения туберкулеза в регионе остаются ниже общероссийских [8, 15], высокие уровни лекарственной устойчивости МБТ свидетельствуют о напряженной эпидемиологической! обстановке в Северо-Западном Федеральном округе РФ t

Причина появления? и быстрого распространения лекарственной-устойчивости МБТ заключается: в том, что МБТ свойственна относительно высокая? внутривидовая генетическая изменчивость, в результате которой штаммы- этого возбудителя демонстрируют различную лекарственную устойчивость и патогенные характеристики [ 10 ]. В условиях применения неадекватных схем химиотерапии, перерывах в лечении, низком качестве применяемых лекарственных препаратов! создаются* предпосылки для формирования и селекции лекарственно-устойчивых штаммов: МБТ [41,149], которые, возникнув в популяции людей, приводят к появлению случаев; заболевания туберкулезом. с первичной лекарственной; устойчивостью.

Особенности распространения различных штаммов МБТ в популяциях, исследуются стандартизованными методами тенотипирования;. большая часть которых основывается; на; полиморфизме повторяющихся последовательностей генома МБТ [91,137]. С помощью этих методов в разных регионах мира были выявлены наиболее часто встречающиеся: генотипические варианты возбудителя туберкулеза. Они были: классифицированы по генотипическим; семействам, распространенность, которых варьирует в* различных географических регионах. У некоторых генотипических семейств МБТ была выявлена связь с, наличием лекарственной устойчивости к противотуберкулезным препаратам.

В; связи с вышеизложенным,, актуальным является проведение бактериологического мониторинга путем детального изучения лекарственной устойчивости и молекулярной эпидемиологии МБТ в четырех административных территориях Северо-Западного Федерального округа РФ.

Цель исследования

Изучение лекарственной устойчивости и доминирующих генотипов штаммов МБТ, циркулирующих в четырех административных территориях Северо-Западного Федерального округа РФ, для оптимизации бактериологического мониторинга противотуберкулезных мероприятий.

Задачи исследования:

1. Провести анализ показателей и профилей лекарственной устойчивости МБТ к противотуберкулезным препаратам первого и второго ряда у впервые выявленных больных легочным туберкулезом в четырех административных территориях Северо-Западного Федерального округа РФ.

2. Оценить динамику уровней лекарственной устойчивости МБТ к противотуберкулезным препаратам первого» ряда у больных с новыми случаями заболевания легочным туберкулезом в Архангельской области по сравнению с данными эпидемиологического исследования 1998-1999 гг.

3. Определить роль МБТ генотипа Beijing в поддержании эпидемии лекарственно-устойчивого туберкулеза легких в четырех административных территориях Северо-Западного Федерального округа РФ.

4. Оценить генетическую схожесть штаммов МБТ, циркулирующих в исследуемых регионах.

Научная новизна

Впервые в четырех административных территориях Северо-Западного Федерального округа РФ изучена распространенность лекарственной устойчивости циркулирующих штаммов МБТ к противотуберкулезным препаратам первого и второго ряда с использованием полуавтоматического радиометрического метода ВАСТЕС 460s

В'Мурманской, Архангельской^ областях, Республиках Карелия и Коми впервые представлена молекулярная эпидемиология* туберкулеза на выборке штаммов МБТ, выделенных от последовательно диагностированных впервые выявленных больных легочным туберкулезом-, с использованием современных методов молекулярной^ биологии. Установлены особенности генотипических семейств МБТ, выделенных от впервые выявленных больных туберкулезом из четырех административных территорий СевероЗападного Федерального округа РФ, которые являются основой современной' эпидемии туберкулеза.

Практическая значимость работы

Показатели и профили лекарственной устойчивости МБТ к противотуберкулезным* препаратам первого и второго ряда в четырех административных территориях Северо-Западного Федерального округа-РФ1 способствуют выбору наиболее эффективных схем химиотерапии^ туберкулеза.

Результаты исследования молекулярной эпидемиологии туберкулеза в четырех административных территориях Северо-Западного Федерального округа РФ позволяют оптимизировать превентивные меры, направленные на разрыв эпидемиологической цепочки передачи инфекции.

Основные положения, выносимые на- защиту:

1. Широкое распространение лекарственной устойчивости, среди новых случаев заболевания туберкулезом в четырех административных территориях Северо-Западного Федерального округа РФ создает угрозу развития эпидемии лекарственно-устойчивого туберкулеза.

2. В Архангельской области сложилась напряженная эпидемическая ситуация, обусловленная нарастанием уровня МЛУ среди новых случаев заболевания туберкулезом легких.

3. Генотип Beijing МБТ является наиболее распространенным среди новых случаев заболевания туберкулезом в четырех административных территориях Северо-Западного Федерального округа РФ. Для штаммов МБТ, принадлежащих к генотипу Beijing, характерны повышенные уровни МЛУ и лекарственной устойчивости к этионамиду, а также высокая ^трансмиссия в исследуемой популяции.

4. Штаммы МБТ с одинаковыми генетическими рисунками выявляются» из разных административных территорий Северо-Западного Федерального округа РФ.

Реализация результатов работы

Результаты исследования используются; в практической работе ГУЗ "Областной клинический противотуберкулезный* диспансер" (Архангельск), ГУЗ "Мурманский областной противотуберкулезный диспансер" (Мурманск), ГУ РК "Республиканский противотуберкулезный' диспансер" (Сыктывкар), а также при проведении курсов последипломного обучения на кафедре фтизиопульмонологии Северного государственного медицинского университета.

Проведен внешний контроль качества определения лекарственной чувствительности МБТ лабораториями противотуберкулезных диспансеров Архангельской, Мурманской областей, Республик Карелия и Коми к противотуберкулезным препаратам первого и второго ряда- в Норвежском институте общественного здоровья (НИОЗ) (Осло).

Апробация работы

Материалы диссертации доложены на 17-ом Европейском конгрессе по клинической микробиологии и инфекционным заболеваниям и 25-ом

Международном конгрессе по химиотерапии (Мюнхен, 2007), на заседании секции международного общественного здоровья при медицинском факультете Университета г. Осло (Осло, 2007), на всероссийской конференции с международным участием "Надзор инфекционных заболеваний в Баренц-регионе" (Архангельск, 2007); на образовательном курсе "Современные методы в микобактериологии" (Лондон, 2008).

По теме диссертации опубликовано 6 печатных работ, в том числе 3 - в ведущих рецензируемых научных изданиях.

Структура и объем диссертации

Заключение диссертации по теме «Фтизиатрия», Баранов, Антон Алексеевич

Выводы:

1. Широкое распространение лекарственной устойчивости, в особенности МЛУ, которая выявлена у 30,7% штаммов МБТ, циркулирующих в четырех административных территориях Северо-Западного Федерального округа РФ, создает угрозу развития лекарственно-устойчивой эпидемии туберкулеза.

2. В Архангельской области в 2004-2006 гг. отмечается абсолютное увеличение уровня МЛУ среди новых случаев заболевания туберкулезом легких на 27,9%, по сравнению с данными эпидемиологического исследования проведенного в 1998-1999 гг., что свидетельствует о напряженной эпидемиологической ситуации в регионе.

3. Наиболее часто встречающимся генотипом МБТ в четырех административных территориях Северо-Западного Федерального округа РФ является генотип Beijing, который обнаруживается почти в половине (47,1%) новых случаев заболевания легочным туберкулезом. Штаммы МБТ генотипа Beijing обладают самым высоким уровнем кластерности среди остальных генотипов МБТ, что свидетельствует об их активной передаче в популяции.

4. Генотип Beijing статистически значимо ассоциирован с МЛУ и лекарственной устойчивостью к этионамиду, по сравнению с другими наиболее распространенными генотипическими семействами МБТ - Т и Haarlem.

5. В состав 4 из 10 RFLP кластеров входят штаммы МБТ, выделенные от больных из разных административных территорий Северо-Западного Федерального округа РФ.

Практические рекомендации

1. Для сокращения сроков выявления больных с лекарственно-устойчивыми формами туберкулеза целесообразно использовать методы, основанные на ПНР и ВАСТЕС 960 MGIT, в работе бактериологических лабораторий противотуберкулезных диспансеров, что обеспечит своевременное назначение адекватной химиотерапии на стационарном этапе лечения.

2. С целью повышения эффективности определения источников передачи инфекции необходимо проводить исследование генотипов МБТ, что позволит уменьшить риск распространения лекарственно-устойчивых штаммов возбудителя туберкулеза.

3. Внешний контроль качества бактериологического мониторинга лекарственной устойчивости и исследований молекулярной эпидемиологии штаммов МБТ, циркулирующих в Северо-Западном Федеральном округе РФ, рекомендуется выполнять с помощью ВАСТЕС и молекулярно-генетических методов на базе референс-лабораторий ведущих учреждений противотуберкулезной службы России.

Список литературы диссертационного исследования кандидат медицинских наук Баранов, Антон Алексеевич, 2008 год

1. Алексеева Г.И. Мониторинг лекарственной устойчивости микобактерий туберкулеза в Республике Саха (Якутия) / Г.И. Алексеева, А.Ф. Кравченко // Проблемы туберкулеза и болезней легких. 2007. - № 7. - С. 30-33.

2. Андреевская С.Н. Влияние генотипа М. tuberculosis на выживаемость мышей при экспериментальном туберкулезе / С.Н. Андреевская, Л.Н. Черноусова, Т.Г. Смирнова и др. // Проблемы туберкулеза и болезней легких. 2007. - № 7. - С. 45-50.

3. Балабанова Я.М. Преобладание штаммов Mycobacterium tuberculosis семейства Beijing и факторы риска их трансмиссии в Самарской области / Я.М. Балабанова, В.В. Николаевский, М. Радди и др. // Проблемы туберкулеза и болезней легких. 2006. - № 2. - С. 31-37.

4. Вишневский Б.И. Лекарственная устойчивость микобактерий туберкулеза на Северо-Западе России / Б.И. Вишневский, Е.Б. Вишневская // Проблемы туберкулеза и болезней легких. 2003. - № 5. - С. 42-45.

5. Ворожцова М.П. Раннее выявление и профилактика туберкулеза у ВИЧ-инфицированных / М.П. Ворожцова, А.К. Иванов, Н.А. Турсунова и др. // Проблемы туберкулеза и болезней легких. 2005. - № 10. - С. 45-46.

6. Гвоздевский, Н. А. Геномный полиморфизм российской популяции Mycobacterium tuberculosis: Автореф. дис. канд. медиц. наук. Москва, 2005. - 24 с.

7. Ерохин В.В. Особенности выявления, клинических проявлений и лечения туберкулеза у ВИЧ-инфицированных /В.В. Ерохин, З.Х.

8. Корнилова, Л.П. Алексеева // Проблемы туберкулеза и болезней легких. 2005. - № 10. - С. 20-28.

9. Карачунский М.А. Молекулярная эпидемиология туберкулеза / М.А. Карачунский, JI.H. Черноусова // Проблемы туберкулеза и болезней легких. 2007. - № 4. - С. 3-7.

10. Левашев Ю.Н. Клиническое значение штаммов Mycobacterium tuberculosis различных генотипов, циркулирующих на Северо-Западе России / Ю.Н. Левашев, О.В. Нарвская, А.В. Елькин и др. // Медицинский академический журнал. 2004. - Т. 4. - № 1. - С. 56-61.

11. Левашев Ю.Н. Туберкулез в Северо-Западном Федеральном округе (2000-2004 гг.) / Ю.Н. Левашев, А.В. Шеремет, А.Н. Гришко // Проблемы туберкулеза и болезней легких. 2005. - № 11. - С. 3-6;

12. Мавзютов А.Р. Ингибиторы полимеразной цепной реакции / А.Р. Мавзютов, В.М. Бондаренко, А.Т. Латкин // Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунологии. 2003. - № 3. - С. 93-98.

13. Маркелов Ю.М. Лекарственно-устойчивый туберкулез в Республике Карелия (2000-2005 гг.) / Ю.М. Маркелов, И.А. Дородная // Проблемы туберкулеза и болезней легких. 2007. - № 8. - С. 8-10.

14. Марьяндышев А.О. Лечение больных туберкулезом. Программа краткосрочной химиотерапии больных туберкулезом./ А.О. Марьяндышев, Н.И. Низовцева, В.И. Дитятев Архангельск: Северный государственный медицинский университет. - 2001. - 26 с.

15. Матракшин А.Г. Генотипическая характеристика штаммов Mycobacterium tuberculosis из Республики Тыва / А.Г. Матракшин, Е.Н. Месько, Н.К. Белякова и др. // Проблемы туберкулеза и болезней легких. 2004. - № 3. - С. 37-40.

16. Министерство Здравоохранения и Социального развития Российской Федерации Приказ Министерства здравоохранения Российской Федерации от 21.03.2003 г. № 109 «О совершенствовании противотуберкулезных мероприятий в Российской Федерации» М. -347 с.

17. Мишин В.Ю. Лекарственно-устойчивый туберкулез легких: клиника, диагностика и лечение / В.Ю. Мишин // Consilium Medicum: журнал доказательной медицины для практикующих врачей. 2002. - Т. 4. - № 12. - С. 645-650.

18. Мишин В.Ю. Диагностика и химиотерапия туберкулеза органов дыхания / В.Ю. Мишин, С.Е. Борисов, В.А. Аксенова и др. // Проблемы туберкулеза и болезней легких. 2005. - № 3. - С. 47-64.

19. Мишин В.Ю. Эффективность лечения туберкулеза легких, вызванного микобактериями с множественной лекарственной устойчивостью / В.Ю. Мишин, В.И. Чуканов, И.А. Васильева // Проблемы туберкулеза и болезней легких. 2002. - № 12. - С. 18-23.

20. Нарвская О. В. Геномный полиморфизм Mycobacterium tuberculosis и его значение в эпидемическом процессе: Автореф. дис. докт. медиц. наук. Санкт-Петербург, 2003. - 35 с.

21. Нарвская О.В. Молекулярная эпидемиология туберкулеза / О.В. Нарвская, И.В. Мокроусов, Е.В. Лимещенко и др. // Большой целевой журнал о туберкулезе. 2000. - № 7-8. - С. 4-6.

22. Пальцев М.А. Биологическое оружие проблема национальной безопасности России / М.А. Пальцев // Национальная безопасность. -2002. - № 1-2.

23. Пунга В.В. Влияние заболеваемости туберкулезом на показатели здоровья спецконтингента уголовно-исполнительной системы /В.В.

24. Пунга, Ю.А. Павлов, М.А. Щудрова и др. // Проблемы туберкулеза и болезней легких. 2005. - № 5. - С. 3-8.

25. Сазыкин B.JI. Комплексная оценка эпидемической ситуации по туберкулезу в России / B.JI. Сазыкин, И.М. Сон // Проблемы туберкулеза и болезней легких. 2006. - № 10. - С. 65-69.

26. Самойлова А. Г. Организация лечения туберкулеза с множественной лекарственной устойчивостью микобактерий в условиях угрозы развития эпидемии в Архангельской области: Автореф. дис. канд. медиц. наук. Архангельск, 2005. - 20 с.

27. Самойлова А.Г. Лекарственная устойчивость микобактерий туберкулеза актуальная проблема фтизиатрии / А.Г. Самойлова, А.О. Марьяндышев // Проблемы туберкулеза и болезней легких. - 2005. - № 7.- С. 3-9.

28. Скворцова Л.А. Туберкулез сегодня: особенности возбудителя, клиника и лечение / Л.А. Скворцова, М.В. Павлова, Н.В. Сапожникова и др. // Проблемы туберкулеза и болезней легких. 2005. - № 11. - С. 69.

29. Скотникова О.И. Молекулярно-биологические методы во фтизиатрии / О.И. Скотникова // Проблемы туберкулеза и болезней легких. 2005. -№ 8. - С. 5-10.

30. Сон И.М. Функционирование системы мониторинга туберкулеза в Москве / И.М. Сон, А.Ф. Мейснер, С.А. Ростовцев и др. // Проблемы туберкулеза и болезней легких. 2005. - № 8. - С. 14-18.

31. Томашевский А.Ф. Особенности эпидемической ситуации по туберкулезу на Крайнем Севере / А.Ф. Томашевский // Проблемы туберкулеза и болезней легких. 2005. - № 7. - С. 9-13.

32. Тунгусова О. С. Молекулярная эпидемология микобактерий и факторы риска развития лекарственной устойчивости при туберкулезе легких в Архангельской области: Автореф. дис. канд. медиц. наук. -Архангельск, 2001. 19 с.

33. Тунгусова О.С. Молекулярные механизмы формирования лекарственной устойчивости у микобактерии туберкулеза / О.С. Тунгусова, А.О. Марьяндышев // Проблемы туберкулеза и болезней легких. 2001. - № 6. - С. 48-49.

34. Тунгусова О.С. Влияние лекарственной устойчивости возбудителя на результаты лечения туберкулеза легких в Архангельской области / О.С. Тунгусова, Н.И. Низовцева, Т.В. Тоичкина и др. // Проблемы туберкулеза и болезней легких. 2005. - № 9. - С. 38-43.

35. Revised international definitions in tuberculosis control // Int. J. Tuberc. Lung Dis. 2001. - Vol. 5. - № 3. - P. 213-215.

36. Primary multidrug-resistant tuberculosis—Ivanovo Oblast, Russia, 1999 // MMWR Morb. Mortal. Wkly. Rep. 1999. - Vol. 48. - № 30. - P. 661-664.

37. Spoligotyping kit manual. Isogen Life Science, 2005.

38. Abate G. Susceptibility of multidrug-resistant strains of Mycobacterium tuberculosis to amoxycillin in combination with clavulanic acid and ethambutol / G. Abate, H. Miorner // J. Antimicrob. Chemother. 1998. -Vol. 42. - № 6. - P. 735-740.

39. Abebe F. The emergence of Beijing family genotypes of Mycobacterium tuberculosis and low-level protection by bacille Calmette-Guerin (BCG) vaccines: is there a link? / F. Abebe, G. Bjune // Clin. Exp. Immunol. 2006. - Vol. 145. - № 3. - P. 389-397.

40. Aerts A. Tuberculosis and tuberculosis control in European prisons / A. Aerts, B. Hauer, M. Wanlin et al. // Int. J. Tuberc. Lung Dis. 2006. - Vol. 10.-№ 11.-P. 1215-1223.

41. Banerjee A. inhA, gene encoding a target for isoniazid and ethionamide in Mycobacterium tuberculosis / A. Banerjee, E. Dubnau, A. Quemard et al. // Science. 1994. - Vol. 263. - № 5144. - P. 227-230.

42. Bifani P.J. Origin and interstate spread of a New York City multidrug-resistant Mycobacterium tuberculosis clone family / P.J. Bifani, B.B. Plikaytis, V. Kapur et al. // JAMA. 1996. - Vol. 275. - № 6. - P. 452-457.

43. Brewer T.F. Long time due: reducing tuberculosis mortality in the 21 st century / T.F. Brewer, S.J. Heymann // Arch. Med. Res. 2005. - Vol. 36. -№6.-P. 617-621.

44. Brosch R. A new evolutionary scenario for the Mycobacterium tuberculosis complex / R. Brosch, S.V. Gordon, M. Marmiesse et al. // Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2002. - Vol. 99. - № 6. - P. 3684-3689.

45. Che D. Epidemiology of tuberculosis in Ile-de-France in 2001 / D. Che, J. Cailhol, C. Campese et al. // Rev. Mai Respir. 2004. - Vol. 21. - № 2 Pt 1. -P. 272-278.

46. Cole S.T. Deciphering the biology of Mycobacterium tuberculosis from the complete genome sequence / S.T. Cole, R. Brosch, J. Parkhill et al. // Nature. 1998. - Vol. 393. - № 6685. - P. 537-544.

47. Coninx R. First-line tuberculosis therapy and drug-resistant Mycobacterium tuberculosis in prisons / R. Coninx, C. Mathieu, M. Debacker et al. // Lancet. 1999. - Vol. 353. - № 9157. - P. 969-973.

48. Dahle U.R. Continued low rates of transmission of Mycobacterium tuberculosis in Norway / U.R. Dahle, P. Sandven, E. Heldal et al. // J. Clin. Microbiol. 2003. - Vol. 41. - № 7. - P. 2968-2973.

49. Daniel T.M. The impact of tuberculosis on civilization / T.M. Daniel // Infect. Dis. Clin. North Am. 2004. - Vol. 18. - № 1. - P. 157-165.

50. Daniel T.M. The history of tuberculosis / T.M. Daniel // Respir. Med. -2006. Vol. 100. - № 11. - p. 1862-1870.

51. Decludt B. Epidemiology of tuberculosis / B. Decludt // Rev. Prat. 2002. -Vol. 52. - № 19. - P. 2106-2110.

52. Dhandayuthapani S. Interactions of OxyR with the promoter region of the oxyR and ahpC genes from Mycobacterium leprae and Mycobacterium tuberculosis / S. Dhandayuthapani, M. Mudd, V. Deretic // J. Bacteriol. -1997. Vol. 179. - №. - P. 2401-2409.

53. European Concerted Action on New Generation Genetic Markers and Techniques for the Epidemiology and Control of Tuberculosis Beijing/W genotype Mycobacterium tuberculosis and drug resistance / European

54. Concerted Action on New Generation Genetic Markers and Techniques for the Epidemiology and Control of Tuberculosis // Emerg. Infect. Dis. 2006. -Vol. 12.-№5.-P. 736-743.

55. Faggiano F. Tuberculosis incidence in Turin, Italy, 1973-1999 / F. Faggiano, F.D. Vigna-Taglianti, E. Versino et al. // Int. J. Tuberc. Lung Dis. 2004. -Vol. 8.-№2.-P. 171-179.

56. Faustini A. Risk factors for multidrug resistant tuberculosis in Europe: a systematic review / A. Faustini, A.J. Hall, C.A. Perucci // Thorax. 2006. -Vol. 61.- №2. -P. 158-163.

57. Filliol I. Global distribution of Mycobacterium tuberculosis spoligotypes /1. Filliol, J.R. Driscoll, D. Van Soolingen et al. // Emerg. Infect. Dis. 2002. -Vol. 8.-№ 11.-P. 1347-1349.

58. Filliol I. Detection of a previously unamplified spacer within the DR locus of Mycobacterium tuberculosis: epidemiological implications /1. Filliol, C. Sola, N. Rastogi // J. Clin. Microbiol. 2000. - Vol. 38. - № 3. - P. 12311234.

59. Gandhi N.R. Extensively drug-resistant tuberculosis as a cause of death in patients infected with tuberculosis and HIV in rural South Africa / N.R.

60. Gandhi, A. Moll, A.W. Sturm et al. // Lancet. 2006. - Vol. 368. - № 9547. -P. 1575-1580.

61. Garcia di Viedma Rapid detection of resistance in Mycobacterium tuberculosis: a review discussing molecular approaches / Garcia di Viedma // Clin. Microbiol. Infect. 2003. - Vol. 9. - № 5. - P. 349-359.

62. Griffith M.E. Stability of antimycobacterial drugs in susceptibility testing / M.E. Griffith, H.L. Bodily // Antimicrob. Agents Chemother. 1992. - Vol. 36. -№ 11. - P. 2398-2402.

63. Gutierrez M.C. Ancient origin and gene mosaicism of the progenitor of Mycobacterium tuberculosis / M.C. Gutierrez, S. Brisse, R. Brosch et al. // PLoS. Pathog. 2005. - Vol. 1. - № 1. - P. e5.

64. Hermans P.W. Insertion element IS986 from Mycobacterium tuberculosis: a useful tool for diagnosis and epidemiology of tuberculosis / P.W. Hermans, D. Van Soolingen, J.W. Dale et al. // J. Clin. Microbiol. 1990. - Vol. 28. -№9.-P. 2051-2058.

65. Hoel T. Radiometric and conventional drug susceptibility testing of Mycobacterium tuberculosis / T. Hoel, J. Eng // APMIS. 1991. - Vol. 99. -№ 11. - P. 977-980.

66. Houston H.R. Development of a culturally sensitive educational intervention program to reduce the high incidence of tuberculosis among foreign-born Vietnamese I H.R. Houston, N. Harada, T. Makinodan // Ethn. Health. -2002. Vol. 7. - № 4. - P. 255-265.

67. Huerga Aramburu H. Comparative study of infectious diseases in immigrant children from various countries / H. Huerga Aramburu, R. Lopez-Velez // An. Pediatr. (Bare. ). 2004. - Vol. 60. - № l. - P. 16-21.

68. Kiers A. Use of DNA fingerprinting in international source case finding during a large outbreak of tuberculosis in The Netherlands / A. Kiers, A.P. Drost, D. Van Soolingen et al. // Int. J. Tuberc. Lung Dis. 1997. - Vol. 1. -№ 3.- P. 239-245.

69. Kimerling M.E. The risk of MDR-TB and polyresistant tuberculosis among the civilian population of Tomsk city, Siberia, 1999 / M.E. Kimerling, A. Slavuckij, S. Chavers et al. // Int. J. Tuberc. Lung Dis. 2003. - Vol. 7. - № 9. - P. 866-872.

70. Kremer K. Discriminatory power and reproducibility of novel DNA typing methods for Mycobacterium tuberculosis complex strains / K. Kremer, C. Arnold, A. Cataldi et al. // J. Clin. Microbiol. 2005. - Vol. 43. - № 11. - p. 5628-5638.

71. Kremer K. Definition of the Beijing/W lineage of Mycobacterium tuberculosis on the basis of genetic markers / K. Kremer, J.R. Glynn, T. Lillebaek et al. // J. Clin. Microbiol. 2004. - Vol. 42. - № 9. - P. 4040-4049.

72. Legrand E. Use of spoligotyping to study the evolution of the direct repeat locus by IS6110 transposition in Mycobacterium tuberculosis / E. Legrand, I. Filliol, C. Sola et al. // J. Clin. Microbiol. 2001. - Vol. 39. - № 4. - P. 1595-1599.

73. Lopez B. A marked difference in pathogenesis and immune response induced by different Mycobacterium tuberculosis genotypes / B. Lopez, D. Aguilar, H. Orozco et al. // Clin. Exp. Immunol. 2003. - Vol. 133. - № 1. -P. 30-37.

74. McAdam R. A. Characterization of a Mycobacterium tuberculosis insertion sequence belonging to the IS3 family / R.A. McAdam, P. W. Hermans, D. Van Soolingen et al. // Mol. Microbiol. 1990. - Vol. 4. - № 9. - P. 16071613.

75. McGrath J.W. Social networks of disease spread in the lower Illinois valley: a simulation approach / J.W. McGrath // Am. J. Phys. Anthropol. 1988. -Vol. 77. - № 4. - P. 483-496.

76. Mdluli К. Inhibition of a Mycobacterium tuberculosis -ketoacyl ACP synthase by isoniazid / K. Mdluli, R.A. Slayden, Y. Zhu et al. // Science. -1998. Vol. 280. - № 5369. - P. 1607-1610.

77. Meier A. Genetic alterations in streptomycin-resistant Mycobacterium tuberculosis: mapping of mutations conferring resistance / A. Meier, P. Kirschner, F.-C. Bange et al. // Antimicrob. Agents Chemother. 1994. -Vol. 38.-№2.- P. 228-233.

78. Mokrousov I. Allele-specific rpoB PCR assays for detection of rifampin-resistant Mycobacterium tuberculosis in sputum smears /1. Mokrousov, T. Otten, B. Vyshnevskiy et al. // Antimicrob. Agents Chemother. 2003. -Vol. 47. -№7. -P. 2231-2235.

79. Muhumuza J. Introduction of an in-house PCR for routine identification of M. tuberculosis in a low-income country / J. Muhumuza, B.B. Asiimwe, S. Kayes et al. // Int. J. Tuberc. Lung Dis. 2006. - Vol. 10. - № 11. - P. 12621267.

80. Okeke I.N. Antimicrobial resistance in developing countries. Part I: recent trends and current status / I.N. Okeke, R. Laxminarayan, Z.A. Bhutta et al. // Lancet Infect. Dis. 2005. - Vol. 5. - № 8. - P. 481-493.

81. Perelman M.I. Tuberculosis in Russia / M.I. Perelman // Int. J. Tuberc. Lung Dis. 2000. - Vol. 4. - № 12. - P. 1097-1103.

82. Rifes G. Immigration and tuberculosis. Five year experience / G. Rifes, M. Villar // Rev. Port. Pneumol. 2003. - Vol. 9. - № 3. - P. 195-204.

83. Rothschild B.M. Mycobacterium tuberculosis complex DNA from an extinct bison dated 17,000 years before the present / B.M. Rothschild, L.D. Martin, G. Lev et al. // Clin. Infect. Dis. 2001. - Vol. 33. - № 3. - P. 305-311.

84. Ruddy M. Rates of drug resistance and risk factor analysis in civilian and prison patients with tuberculosis in Samara Region, Russia / M. Ruddy, Y. Balabanova, C. Graham et al. // Thorax. 2005. - Vol. 60. - № 2. - P. 130135.

85. Salo W.L. Identification of Mycobacterium tuberculosis DNA in a pre-Columbian Peruvian mummy / W.L. Salo, A.C. Aufderheide, J. Buikstra et al. //Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 1994. - Vol. 91. - № 6. - P. 2091-2094.

86. Samaan G. Tuberculosis notifications in Australia, 2002 / G. Samaan, P. Roche, J. Spencer et al. // Commun. Dis. Intell. 2003. - Vol. 27. - № 4. - P. 449-458.

87. Scorpio A. Mutations inpncA, a gene encoding pyrazinamidase/nicotinamidase, cause resistance to the antituberculous drug pyrazinamide in tubercle bacillus / A. Scorpio, Y. Zhang // Nat. Med. -1996. Vol. 2. - № 6. - P. 662-667.

88. Sebek M. DNA fingerprinting and contact investigation / M. Sebek // Int. J. Tuberc. Lung Dis. 2000. - Vol. 4. - № 2 Suppl 1. - P. S45-S48.

89. Sherman D.R. Compensatory aphC gene expression in isoniazid-resistant Mycobacterium tuberculosis / D.R. Sherman, K. Mdluli, M.J. Hickey et al. // Science. 1996. - Vol. 272. - № 5268. - P. 1641-1643.

90. Siddiqi S.H. ВАСТЕС 460TB System. Product and procedure manual, revision / S.H. Siddiqi. D. Sparks, MD, USA: Becton Dickinson Microbiology Systems. - 1995.

91. Sipan C. Screening Latino adolescents for latent tuberculosis infection (LTBI) / C. Sipan, E. Blumberg, M. Hovell et al. // Public Health Rep. -2003. Vol. 118. - № 5. - P. 425-433.

92. Small P.M. The epidemiology of tuberculosis in San Francisco. A population-based study using conventional and molecular methods / P.M. Small, P.C. Hopewell, S.P. Singh et al. // N. Engl. J. Med. 1994. - Vol. 330.-№24.-P. 1703-1709.

93. Sonnenberg P. HIV-1 and recurrence, relapse, and reinfection of tuberculosis after cure: a cohort study in South African mineworkers / P. Sonnenberg, J. Murray, J.R. Glynn et al. // Lancet. 2001. - Vol. 358. - № 9294.-P. 1687-1693.

94. Tayles N. Leprosy and tuberculosis in Iron Age Southeast Asia? / N. Tayles, H.R. Buckley // Am. J. Phys. Anthropol. 2004. - Vol. 125. - № 3. - P. 239256.

95. Telenti A. Detection of rifampicin-resistance mutations in Mycobacterium tuberculosis / A. Telenti, P. Imboden, F. Marchesi et al. // Lancet. 1993. -Vol. 341. - № 8846. - P. 647-650.

96. Thierry D. IS6110, an IS-like element of Mycobacterium tuberculosis complex / D. Thierry, M.D. Cave, K.D. Eisenach et al. // Nucleic Acids Res. 1990. - Vol. 18.-№ l.-P. 188.

97. Toungoussova O.S. Epidemic of tuberculosis in the former Soviet Union: social and biological reasons / O.S. Toungoussova, G. Bjune, D.A. Caugant // Tuberculosis. (Edinb. ). 2006. - Vol. 86. - № 1. - P. 1-10.

98. Toungoussova O.S. Impact of drug resistance on fitness of Mycobacterium tuberculosis strains of the W-Beijing genotype / O.S. Toungoussova, D.A. Caugant, P. Sandven et al. // FEMS Immunol. Med. Microbiol. 2004. -Vol. 42.-№3.-P. 281-290.

99. Toungoussova, O. Determination of risk factors for the development of tuberculosis with drug-resistant strains of Mycobacterium tuberculosis in the

100. Arkhangelsk oblas, Russia / O. Toungoussova. Oslo, Norway, Department of General Practice and Community Medicine, The Faculty of Medicine, University of Oslo. - 2001. - P. 1-108.

101. Van Deutekom H. Clustered tuberculosis cases: do they represent recent transmission and can they be detected earlier? / H. Van Deutekom, S.P. Hoijng, P.E. de Haas et al. // Am. J. Respir. Crit Care Med. 2004. - Vol. 169.-№7.-P. 806-810.

102. Van Embden J.D. Strain identification of Mycobacterium tuberculosis by DNA fingerprinting: recommendations for a standardized methodology / J.D. Van Embden, M.D. Cave, J.T. Crawford et al. // J. Clin. Microbiol. -1993. Vol. 31. - № 2. - P. 406-409.

103. Van Rie A. Exogenous reinfection as a cause of recurrent tuberculosis after curative treatment / A. Van Rie, R. Warren, M. Richardson et al. // N. Engl. J. Med. 1999. - Vol. 341. - № 16. - P. 1174-1179.

104. Van Soolingen D. Molecular epidemiology of tuberculosis and other mycobacterial infections: main methodologies and achievements / D. Van Soolingen // J. Intern. Med. 2001. - Vol. 249. - № 1. - P. 1-26.

105. Van Soolingen D. Molecular epidemiology of tuberculosis in the Netherlands: a nationwide study from 1993 through 1997 / D. Van Soolingen, M.W. Borgdorff, P.E. de Haas et al. // J. Infect. Dis. 1999. -Vol. 180.-№3.-P. 726-736.

106. Van Soolingen D. Predominance of a single genotype of Mycobacterium tuberculosis in countries of east Asia / D. Van Soolingen, L. Qian, P.E. de Haas et al. //J. Clin. Microbiol. 1995. - Vol. 33. - № 12. - P. 3234-3238.

107. Van Soolingen D. Molecular epidemiology of tuberculosis and other mycobacterial infections: main methodologies and achievements / D. Van Soolingen // J. Intern. Med. 2001. - Vol. 249. - № 1. - P. 1-26.

108. Verver S. Proportion of tuberculosis transmission that takes place in households in a high-incidence area / S. Verver, R.M. Warren, Z. Munch et al. // Lancet. 2004. - Vol. 363. - № 9404. - P. 212-214.

109. Victor T.C. Molecular characteristics and global spread of Mycobacterium tuberculosis with a western cape F11 genotype / T.C. Victor, P.E. de Haas, A.M. Jordaan et al. // J. Clin. Microbiol. 2004. - Vol. 42. - № 2. - P. 769772.

110. WHO. The use of restriction fragment length polymorphism (RFLP) analysis for epidemiological studies of tuberculosis in developing countries. Report of a WHO review and planning meeting. 7-8 December 1994. -Geneva, WHO. 1995. - P. 1-18.

111. WHO. The world health report 2004: changing history. Geneva, World Health Organization. - 2004.

112. WHO. Report of the meeting of the WHO Global Task Force on XDR-TB. Geneva, Switzerland 9-10 October 2006. Geneva, World Health Organization. - 2006. - P. 1-24.

113. WHO. Global tuberculosis control: surveillance, planning, financing: WHO report 2007. Geneva, World Health Organization. - 2007.

114. WHO. Tuberculosis fact sheet №104. Geneva, World Health Organization. - 2007.

115. WHO/IUATLD. Anti-tuberculosis drug resistance in the world: third global report. Geneva, World Health Organization. - 2004 - P. 1-299.

116. WHO/IUATLD Guidelines for surveillance of drug resistance in tuberculosis / WHO/IUATLD // Int. J. Tuberc. Lung Dis. 1998. - № 2. - P. 72-79.

117. Zhang Y. The magic bullets and tuberculosis drug targets / Y. Zhang // Annu. Rev. Pharmacol. Toxicol. 2005. - Vol. 45. - P. 529-564.

118. Zhang Y. The catalase-peroxidase gene and isoniazid resistance of Mycobacterium tuberculosis / Y. Zhang, B. Heym, B. Allen et al. // Nature. -1992. Vol. 358. - № 6387. - P. 591-593.