Генетическая гетерогенность популяций кур, определяемая ДНК-фингерпринтингом и RAPD-анализом тема диссертации и автореферата по ВАК РФ 03.00.15, кандидат биологических наук Митрофанова, Ольга Викторовна

• Митрофанова, Ольга Викторовна
• кандидат биологических наук
• 2003

Оглавление диссертации кандидат биологических наук Митрофанова, Ольга Викторовна

0 ВВЕДЕНИЕ.

ГЛАВА 1. ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ.

1.1. Некоторые особенности структуры ДНК животных и птиц.

1.2. Полиморфные ДНК-маркеры.

1.2.1. Полиморфизм длин рестриктныъх фрагментов.

1.2.2. Мини - и микросателлиты. ДНК-фингерпринтинг.

1.2.3. Зонды, используемые в ДНК-фингерпринтинге животных и птиц.

1.2.4. ДНК-фингерпринтинг в изучении популяций.

1.3. Полимеразная цепная реакция со случайными праймерами (RAPD-PCR).

1.3.1. Методические особенности RAPD-PCR.

1.3.2. Использование RAPD-PCR для изучения популяций животных и птиц.

1.4. Другие полиморфные маркеры.

ГЛАВА 2. МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ.

2.1. Объект исследования.

4, 2.2. Выделение ДНК

2.3. ДНК-фингерпринтинг

2.3.1 Рестрикция образцов ДНК.

2.3.2. Электрофорез гидролизованных фрагментов ДНК.

2.3.3. Перенос ДНК с агарозного геля на фильтр.

2.3.4. Прегибридизация и гибридизация ДНК.

2.3.5. Детекция дезоксигенина на фильтрах.

2.4. Полимеразная цепная реакция со случайными прайм ерами.

2.5. Обработка результатов исследования.

ГЛАВА 3. РЕЗУЛЬТАТЫ ИССЛЕДОВАНИЙ.

3.1. Анализ полиморфизма ДНК у различных пород кур с помощью случайных праймеров.

3.2. Анализ геномного полиморфизма в линиях кур экспериментальной популяции Русская белоснежная с помощью случайных праймеров.

3.3. Анализ полиморфизма ДНК кур на основе использования фингерпринтинга. ф 3.4. Анализ результатов переноса амплифицированных ДНКфрагментов на фильтр.

ГЛАВА 4. ОБСУЖДЕНИЕ РЕЗУЛЬТАТОВ.

ВЫВОДЫ.

ПРЕДЛОЖЕНИЯ ПРОИЗВОДСТВУ.

Введение диссертации (часть автореферата) на тему «Генетическая гетерогенность популяций кур, определяемая ДНК-фингерпринтингом и RAPD-анализом»

Актуальность темы. Домашняя курица давно является привлекательным генетическим объектом, однако организация генома кур исследована пока недостаточно. Особенно следует отметить, что практически отсутствуют сведения о генетических особенностях малочисленных пород и экспериментальных популяций. Такая ситуация зачастую приводит к тому, что генетическое разнообразие в этих популяциях оказывается далеко не оптимальным. Слишком низкая вариабельность может вызвать повышение коэффициента инбридинга, вследствие чего возникает инбредная депрессия. Высокий уровень генетического разнообразия в популяции может привести к потере уникальных свойств или признаков, характерных для этой популяции. Селекция в таких группах птицы не дает ожидаемого эффекта. Поэтому контроль генетического разнообразия является существенным фактором в селекции.

В значительной мере решить проблему изучения генома домашней курицы позволяют методы, основанные на анализе полиморфизма ДНК. К ним, в частности, относятся полимеразная цепная реакция со случайными праймерами и мультилокусный ДНК-фингерпринтинг. Совместное использование этих методов особенно перспективно, поскольку позволяет сочетать их достоинства и сводить к минимуму недостатки.

Цель и задачи исследований. Основной целью нашей работы является оценка генетического разнообразия в породах и экспериментальных популяциях кур с помощью полиморфных ДНК-маркеров.

В конкретные задачи работы входило:

• провести подбор оптимальных праймеров, способных выявлять при помощи полимеразной цепной реакции (RAPD-PCR) различия по полиморфизму между породами и экспериментальными популяциями кур;

• определить возможность использования RAPD-PCR для обнаружения различий между линиями кур;

• выявить возможности молекулярного зонда (ГТГ)5 для обнаружения маркерных рестрикционных фрагментов ДНК у кур отдельных пород и экспериментальных популяций;

• сравнить значения основных генетических параметров, полученные с помощью RAPD-PCR и с помощью фингерпринтинга;

• определить наличие (ГТГ) - повторов в структуре ДНК-фрагментов, синтезирующихся в ходе RAPD-PCR.

Научная новизна. Впервые с помощью полимеразной цепной реакции со случайными праймерами обнаружены последовательности ДНК, характерные для кур, подвергшихся селекции к пониженным температурам и неоплазмам.

Проведен сравнительный анализ генетических параметров, рассчитанных на основе ДНК-фингерпринтинга и RAPD-PCR в ряде пород и экспериментальных популяциях кур. Показан высокий уровень сходства между курами популяции Русская белоснежная и курами породы Белый леггорн (BS=0,91), а так же между курами экспериментальной популяции Русская белоснежная и курами породы Русская белая (BS=0,92).

Показано, что в ходе полимеразной цепной реакции со случайными праймерами амплифицируются нуютеотидные повторы (ГТГ)5.

Сравнительный анализ генетических параметров, рассчитанных на основе использования ДНК-фингерпринтинга и RAPD-PCR, в ряде пород и экспериментальных популяциях кур показал их полное совпадение. Отмечено существенное повышение достоверности показателей при одновременном использовании двух методов.

Теоретическая и практическая значимость работы. Показано, что в геноме кур могут быть выявлены последовательности ДНК, характерные для популяций, подвергшихся направленному отбору. Результаты исследований свидетельствуют об эффективности использования RAPD-PCR анализа для поиска маркерных нуклеотидных последовательностей для пород и отдельных популяций птиц. Совместное использование RAPD-PCR и ДНК-фингерпринтинга можно рекомендовать для контроля над генетическими процессами в популяциях малочисленных пород, а так же в популяциях, селектируемых на определенные признаки.

Апробация работы. Основные положения диссертационной работы представлены в материалах 3-ей Международной конференции "Молекулярно-генетические маркеры животных" (Киев, 1999), 2-ой Международной научной конференции "Биотехнология сельскохозяйственных животных" (Подольск, 2002), а так же докладывались и получили положительную оценку на аспирантских сессиях и отчетах лаборатории.

Положения, выносимые на защиту: возможность и степень обнаружения различий между породами и популяциями кур, выявленные с помощью RAPD-PCR; различия между линиями кур, выявленные с помощью RAPD-PCR, сопоставление основных генетических параметров, рассчитанных на основе RAPD-PCR и методом ДНК-фингерпринтинга; особенности структуры фрагментов ДНК, получаемых в ходе нолимеразной цепной реакции со случайными праймерами.

Заключение диссертации по теме «Генетика», Митрофанова, Ольга Викторовна

ВЫВОДЫ

1. При помощи RAPD-анализа у кур экспериментальной популяции Русская белоснежная (порода Русская белая), селектируемой в нескольких поколениях на резистентность к низким температурам и неоплазмам, обнаружен маркерный фрагмент ДНК размером 950 пн. Отмечена разница в частотах встречаемости ряда фрагментов ДНК у кур 10 и 16 линий этой популяции, различающихся по селекционируемым признакам. Наблюдается так же низкий коэффициент сходства между этими линиями (BS=0,86).

2. Методом ДНК-фингерпринтинга выявлен маркерный фрагмент ДНК размером 24000 пн у кур экспериментальной популяции «Аврора», селектируемой в нескольких поколениях на высокий уровень потенциальных резервов надпочечников

3. Методом RAPD-PCR показан высокий уровень сходства между курами популяции Русская белоснежная и курами породы Белый леггорн (BS=0,91), а так же между курами экспериментальной популяции Русская белоснежная и курами породы Русская белая (BS=0,92).

4. Куры Андалузской голубой породы и экспериментальной популяции "Аврора" по данным RAPD-анализа генетически наиболее удалены друг от друга (BS=0,82), несмотря на то, что обладают схожей голубой окраской оперения.

5. Наиболее высокое внутрипопуляционное генетическое разнообразие, рассчитанное по данным RAPD-анализа, установлено у кур породы Полосатый плимутрок (HR=0,122). Наименьшее геннетическое разнообразие отмечено у кур экспериментальной популяции Русская белоснежная (HR=0,050).

6. Большинство фрагментов ДНК, амплифицирующихся в ходе RAPD-PCR, содержат повторяющийся элемент (ГТГ).

7. Основные генетические параметры, рассчитанные на основе RAPD-анализа, подтверждают результаты, получаемые с помощью геномного фингерпринтинга. Поэтому особенно перспективным представляется совместное использование двух этих методов.

ПРЕДЛОЖЕНИЯ ПРОИЗВОДСТВУ

Рекомендуется использовать технологию ДНК-фингерпринтинга в сочетании с RAPD-анализом в программах по разведению и сохранению пород кур. С помощью этих методов можно следить за генетическим разнообразием в популяциях, что позволит предотвратить инбридинг.

Список литературы диссертационного исследования кандидат биологических наук Митрофанова, Ольга Викторовна, 2003 год

1. Айала Ф., Кайгер Дж. Современная генетика.-М :Мир, 1988.-335с.

2. Алтухов Ю.П. Внутривидовое генетическое разнообразие: мониторинг и принципы сохранения // Генетика.-1995.-Т.31.-С.1333-1357

3. Алтухов Ю.П., Корочкин Л.И., Рычков Ю.Г. Наследственное биохимическое разнообразие в процессах эволюции и индивидуального развития // Генетика.-1996.-Т.32.-С. 1450-1473

4. Алтухов Ю.П., Сальменкова Е.А. Полиморфизм ДНК в популяционной генетике // Генетика.-2002.-Т.38.-С.

5. Банникова А.А., Матвеев В.А. Крамеров Д.А. Опыт использования HHTep-SINE-ПЦР в изучении филогенеза млекопитающих. II Генетика,-2002.-Т.38.-С. 853-864.

6. Босак Н.П., Колесник О.В., Смарагдов М.Г., Смирнов А.Ф. Использование полиморфных минисателлитных и RAPD-маркеров у кур // Селекционно-генетические методы повышения продуктивности сельхозживотных: Сб. науч. тр. / ВНИИГРЖ.-С-Пб.,-1999.-С.243-246.

7. Булат С.А., Мироненко Н.В. Идентификация грибов и анализ их генетической изменчивости методом полимеразной цепной реакции (ПЦР) с геноспецифичными и неспецифичными праймерами // Генетика.-1996.-Т.32.-С.165-183.

8. Васильев В.А., Стекленев Е.П., Морозова Е.В., Семенова С.К. ДНК-фингерпринтинг представителей отдельных видов, межродовых и межвидовых гибридов родов Bos и Bison подсемейства Bovinae // Генетика. -2002.-Т.4.-С.515-520.

9. Гинатулин А. А. Структура, организация и эволюция генома позвоночных.-М. .Наука, 1984.-294 с.

10. Ю.Глазко В.И., Дунин И.М., Глазко Г.В., Калашникова JI.A. Введение в ДНК-технологии,- М: ФГНУ Росинформагротех, 2001.-436с.

11. Глазко В.И. Проблемы использования ДНК-технологий у животных // С.-х. биология. -1998а.-№4.-С.33-42.

12. Глазко В.И., Зеленая Л.Б. Дифференциация домашней лошади и лошади Пржевальского по различным последовательностям ДНК // Генетика.-1998в.-Т.34.-С.996-999.

13. Горбачева Н. Сохранить генофонд кур // Птицеводство.-1991 .-Т.11 -С.6-8

14. Горбачева Н. Породы кур и их содержание в приусадебном хозяйстве.-М: Изд-во «Искусство и мода», 1993.-143с.

15. Гречко В.В. Молекулярные маркеры ДНК в изучении филогении и систематики // Генетика.-2002.-Т.38.-С.1013-1033.

16. Далмацио С., Каммарата М., Каррильо Д. и др. Молекулярные характеристики вариабельной тандемно повторяющейся последовательности, выявленной в ходе RAPD-анализа островной иприбрежной популяции Posidonia oceanica // Генетика.-2002.-Т.38,-С.820-827.

17. П.Дементьева Н.В. Оценка полиморфизма минисателлитных ДНК у коров, кур и осетровых рыб: Автореф. дис.канд. биол. наук.-СПб-Пушкин, 1996.-14с.

18. Дмитриев В.Б. Гормональный фактор в микроэволюционном процессе и селекции животных// С.-х. биология.-2001.-Т.2.-С.18-30

19. Дмитриев В.Б., Чуркина И.В., Смирнов А.Ф., Николаева Е.К. Дестабилизирующий эффект отбора кур по функциональным резервам надпочечников. // Генетика.-2001.-Т.37.-С.517-523.

20. Долматова И.Ю., Саитбаталов Т.Ф., Гареев Ф.Т. RAPD-анализ генетического полиморфизма уток. Межпородные различия // Генетика.-2000.-Т.36.-С.682-687.

21. Долматова И.Ю., Саитбаталов Т.Ф., Гареев Ф.Т. RAPD-анализ генетического полиморфизма уток. Межлинейные различия пекинской породы // Генетика.-2000.-Т.36.-С.805-812.

22. Захаров Е.В. Доказательство естественной гибридизации двух видов парусников методом RAPD-PCR // Генетика.-2001.-Т.37.-С.475-484.23.3авертяев Б.П. Краткий словарь селекционно-генетических терминов в животноводстве.-М.: Россельхозиздат, 1983.-108 с.

23. Иванов П.Л., Гуртовая С.В., Плаксин В.О. и др. Геномная "дактилоскопия" с использованием в качестве зонда бактериофага М13экспертиза вещественных доказательств и идентификация личности) // Суд. мед. эксп.-1989.-Т.4.-С.39-42

24. Игнатов А.Н., Кугуники Я., Супрунова Т.П. и др. RAPD-маркеры, сцепленные с локусом устойчивости к расе 4 возбудителя сосудистого бактериоза у Brassika rapa L // Генетика.-2000.-Т.36.-С.357-360.

25. Инге-Вечтомов С.Г. Генетика с основами селекции.-М.: Высшая школа, 1989.-591 с.

26. Колесник О.В., Смарагдов М.Г., Босак Н.П., Николаева Е.К., Дмитриев В.Б., Смирнов А.Ф. Использование RAPD-маркеров для оценки дивергенции геномов у кур при разнонаправленной селекции // Сборник научных трудов ВНИИГРЖ.-2001.-С.173-176

27. Конарев А.В. Использование молекулярныъх маркеров в работе с генетическими ресурсами растений // С.-х. биология.-1998.-Т.5.-С.3-24.

28. Костюченко М.В., Удина ИМ.Г., Зайцев A.M., Храброва J1.A. и др. Днк-технологии для оценки генетического разнообразия пород лошадей отечественной селекции// С.-х. биология.2001.-№6.-С.29-34.

29. Кочиева Е.З., Рыжова Н.Н.,Храпалова И.А., Пухалъский В.А. Использование метода RAPD-анализа в определении генетического полиморфизма и филогенетических связей у представителей рода Lycopersicon (Tourn.) Mill. // Генетика.-2002.-Т.38.-С. 1298-1303.

30. Кривенко А.А., Филипенко M.J1., Адаричев В.А. и др. Анализ косегрегации полиморфных ДНК-маркеров с величиной артериальногодавления у крыс гипертензивной линии НИСАГ // Генетика.-1999.-Т.35.-С.164-169.

31. Куликова И.В., Челомина Г.Н., Журавлев Ю.Н. RAPD-PCR анализ генетического разнообразия маньчжурского фазаана // Генетика.-2002,- ^ Т.38.-С.836-841.

32. Мартиросян И.А., Рысков А.П., Петросян В.Г., Аракелян М.С. и др. Изменчивость мини- и микросателлитных маркеров ДНК в популяциях партеногенетической скальной ящерицы Darevskia rostombekovi. // Генетика.-2002.-Т.38.-С. 828-835.

33. Мартиросян И.А., Кан Н.Г., Петросян В.Г., Малышева Д.Н. и др. Фингерпринтный анализ выриабельности мини- и микросателлитных повторов ДНК у партеногенетических ящериц Darevskia armeniakai. // Генетика.-2003.-Т. 39.-С.215-222.

34. Митрофанова О.В., Босак Н.П., Николаева Е.К., Дмитриев В.Б. RAPD-анализ генетического разнообразия у кур.// "2-ая Международная научная конференция биотехнологии сельскохозяйственных животных", ВИЖ, 19-20 ноября 2002-С.151-152.

35. Мельникова М.Н., Гречко В.В., Медников Б.М. Исследование полиморфизма и дивергенции геномной ДНК на видовом и популяционном уровнях (на примере ДНК пород домашних овец и диких баранов) // Генетика.-1995.-Т.31.-С.1180-1131.

36. Моисеева И.Г., Банникова JI.B., Алтухов Ю.П. Состояние птицеводства в России: генетический мониторинг // Междунар. С.-х. журн.-1993.-Т.5-6.-С.66-69

37. Моисеева И.Г. Генетические ресурсы куроводства в России Птицеводство.-1995.-Т. 5.-С. 12-15

38. Моисеева И.Г. и Лисичкина М.Г. Происхождение и эволюция домашних кур // Природа.-1996.-Т.5.-С.88-96

39. Моисеева И.Г., Лисичкина М.Г., Никифоров А.А. История куроводства в России // Природа.-1997а.-Т. 1 .-С.71 -80

40. Моисеева И.Г. и Лисичкина М.Г. Домашние куры: мифология, традиции, обычаи, народное творчество // Друг.-1997в.-Т. 1 -С.22-25

41. Морозова Е.В., Рысков А.П., Семенова С.К. RAPD-изменчивость двух видов трематод из популяции крупного рогатого скота. // Генетика,-2002.-Т.38.-С.1155-1162.

42. Никифоров А.А., Моисеева И.Г., Захаров И.А. Место русских пород кур в разнообразии пород Евразии // Генетика.-1998.-Т.34.-С.850-851

43. Петросян В.Г., Токарская О.Н., Кашенцева Т.А., Корочкина Л.И. и др. Оценка подразделенности популяций на основе данных ДНК-фингерпринтинга и модифицированной Fgt-статистики Райта. // Генетика.-2003.-Т.39.-С.229-235.

44. Петухов В.Л., Эрнст Л.К., Гудилин И.И. и др. Генетические основы селекции животных.-М.:Агропромиздат, 1989.-273с.

45. Потапов С.Г., Токарская О.Н., Семенова С.К., Данилкин А.А., Марков Г.Г., Рысков А.П. Диагностические возможности мультилокусных маркеров ДНК в систематике диких копытных животных (Artiodactyla) // Генетика.-1997.-Т.33.-С.961-966

46. Рысков А.П. Мультилокусный ДНК-фингерпринтинг в генетико-популяционных исследованиях биоразнообразия // Молекулярная биология. 1999.-Т.ЗЗ.-С.997-1011.

47. Рудых И.А., Гречко В.В., Чобану Д.Г. и др. Вариабельность сайтов рестрикции сателлитной ДНК как молекулярная основа метода таксонопринта (на примере скальной ящерицы Кавказа) // Генетика. -2002.-Т.38.-С.1110-1114.

48. Рябинина H.JI., Гречко В.В., Даревский И.С. Полиморфизм ДНК популяций ящериц семейства Lacertidae, определяемый методом RAPD // Генетика.-1998.-Т.34.-С. 1661-1667.

49. Сайки А. Анализ генома. М.; Мир. 1992.

50. Сахарова С.А. Совершенствование методов сохранения генофонда малочисленных пород кур в условиях коллекционария „ Канд. дисс., СПб-Пушкин.-1992.-124с.

51. Семёнова С.К., Филенко А.Л., Васильев В. А., Просняк М.И., Севастьянов А.А., Рысков А.П. Использование полиморфных маркеров ДНК для идентификации пород кур различного происхождения П Генетика.-1996.-Т.32.-С.795-803.

52. Семенова С.К., Илларионова Н.А., Васильев В.А. и др. Генетический анализ и оценка генетического разнообразия восточноевропейских пород борзых собак (Canis familiaris L.) по данным RAPD-маркирования генома // Генетика.-2002а.-Т.38.-С.842-852.

53. Семенова С.К., Моисеева И.Г., Васильев В.А. и др. Генетический полиморфизм русских, европейских и азиатских пород кур, выявляемыйс помощью ДНК и белковых маркеров // Генетика.-2002в.-Т.38.-С.1304-1308.

54. Серебровский А.С. Генетика кур.

55. Сиволап Ю.М., Календарь Р.Н., Чеботарь С.В. Исследование генетического полиморфизма злаковых растений при помощи ПЦР с произвольными праймерами // Цитология и генетика.-1994.-Т.28.-С.54-61.

56. Сидоренко А.П., Березовская О.П., Созинов А.А. Оценка генетического полиморфизма в популяции колорадского жука по RAPD-маркерам // Генетика.-2000.-Т.36.-С.651-656.

57. Соколова А.Н. Генетико-селекционные методы создания популяции кур с повышенной устойчивостью к неоплазмам: Автореф. дис.докт. с.-х. наук.-СПб-Пушкин, 1999.-56с.

58. Сулимова Г.Е., Удина И.Г., Шайхаев Г.О., Захаров И.А. Полиморфизм ДНК в гене BoLA-DRB3 у крупного рогатого скота в связи с устойчивостью и чувствительностью к лейкозу // Генетика.-1995.-Т.31 .-С.1294-1299

59. Сулимова Г.Е. ДНК-маркеры в оценке молочной продуктивности и резистентности крупного рогатого скота // Материалы III Международной конференции «Актуальные проблемы биологии в животноводстве».-Боровск.-2000.-С.29

60. Суходолец Популяционные волны как условие для повышения экологической устойчивости организмов в процессе вертикальной эволюции // Генетика.-2002.-Т.38.-С.881-893.

61. Терлецкий В.П. Молекулярно-генетические методы анализа генетической изменчивости в популяциях животных // Международный Аграрный Журнал,- 1998.-Т.4.-С.38-40.

62. Токарская О.Н., Зуев А.В., Сорокин Ф.Г. и др. Геномная дактилоскопия журавлей: новый подход для генотипирования видов // Генетика,-1990,-Т.26.-С.599-606

63. Тыщенко В.И. Анализ генетического разнообразия в породах и экспериментальных популяциях кур методом ДНК-фингерпринтинга. Дис.канд. биол. наук. Санкт-Петербург.-2002.

64. Тыщенко В.И., Дементьева Н.В., Терлецкий В.П. и др. Оценка генетического разнообразия кур на основе геномной дактилоскопии // С.-х. биология.-2002.-№6.-С.43-47.

65. Удина И.Г., Туркова С.О., Костюченко М.В., Лебедева JI.A., Сулимова Г.Е. Полиморфизм гена пролактина (микросателлиты, ПЦР-ПДРФ) у крупного рогатого скота // Генетика.-2001.-Т.37.-С.511-516

66. Фёдоров А.Н., Гречко В.В., Слобянюк СЛ., Фёдорова JI.B., Тимохина Г.И. Таксономический анализ повторяющихся последовательностей ДНК // Мол. Биол.-1992.-Т.26.-С.464-469

67. Челомина Г.Н., Спиридонова JI.H., Козыренко М.М. и др. Использование ПП-ПЦР анализа клеточной ДНК для оценки генетического полиморфизма и подвидовой диагностики дальневосточного леопарда. // Генетика.-1999.-Т.35.-С.681-687.

68. Чуркина И.В. Полиморфизм ТГ-обогащенной микросателлитной ДНК домашней курицы (Gallus domesticus): Диссертация.канд. биол. наук, СПб-Пушкин, 1999а.-137с.

69. Шаброва Е.В., Тарская Л.А., Микулич А.И., Аболмасов Н И. и др. Дифференциация близкородственных и отдаленных популяций человека на основе данных мультилокусного ДНК-фингерпринтинга. // Генетика.-2003.-Т.39.-С.236-243.

70. Щинов М.Ю. и Букаров Н.Г. Молекулярно-генетические аспекты выявления QTL маркеров на 6 хромосоме крупного рогатого скота // Материалы III Международной конференции «Актуальные проблемы биологии в животноводстве».-Боровск.-2000.-С.29

71. Эрнст Л.К., Дмитриев Н.Г., Паронян И.А. и др. Генетические ресурсы сельскохозяйственных животных в России и сопредельных странах.-СПб.: ФАО/ЮНЕП и РАСХН, 1994.-472

72. Botstein D., White R.L., Skolnick M. et al. Construkction off genetic map m using restriction fragment polymorphism // Am. J. Hum. Genet.-1980.-V.32,-P.314-331.

73. Bruford M.W., Burke T. Hypervariable DNA markers and their applications in the chicken// In: DNA fingerprinting approaches and applications.-Basel, 1991,-Birkhouser Verlag.- P.230-240

74. Bednarczyk M., Siwek M., Vazanowski A., Czekalski P. DNA polymorphism in various goose by RAPD-PCR // Theor. Appl. Genetics.-2002.-V.5.-P.234-237.

75. Carlson J.E., Tulsieram L.K., Glaubitz J.C. et al. Segregation of random amplified DNA markers in F1 progeny of conifers // Theor. Appl. Genetics. -1991.-V.83.-P. 194-200.

76. Cepica S., Wolf J., Hojny J., Vackova I., Schroffel J Jr. Relations between genetic distance of parental pig breeds and heterozygosity of their F1 crosses measured by genetic markers // Anim. Genet.-1995.-V.26.-P. 135-140

77. Caetano-Anolles G., Bassam B.J., Gresshoff P.M. DNA amplification fingerprinting using very short arbitrary oligonucleotide primers // Bio Technology.-199 l.-V.9.-P. 553-557.

78. Ellegren H., Chowdhary В., Johansson M. et al. A primary linkage map of the porcine genome reveals a low rate of genetic recombination // Genetics.-1994.-V.137.-P.1089

79. Fang D.Q., Roose M.L. Identification of closely related citrus cultivars with inter-simple sequense repeats markers // Theor. Appl. Genet.-1997.-V.95,-P.408-417.

80. Gavora J.S., Fairfull R.W., Benkel B.F. DNA fingerprints as predictors of heterosis //Proceedings 42nd National breeders Rountable, St.Louis.-1993,-P.62-76

81. Gavora J.S., Fairfull R.W., Benkel B.F., Cantwell W.J., Chambers J.R. Prediction of heterosis from DNA fingerprints in chickens // Genetics.-1996,-V. 144.-P.777-784

82. Gillet E.M. GSED Genetic Structures from Electroforesis Date. User's Manual. Version 1.0, Gottingen, 1994. 49 p.

83. Gregorius H.-R. A diversity-independent measure of evenness // Amer. Natur.-1990.-V.136.-P.701-711.

84. Goldstein D.B., Linares A.R., Cavelli-Sforsa L.L. An evaluation of genetic distanses for use with mikrosatellite loci // Genetics.-1995.-V.139.-P.463-471.

85. Howlet R. DNA forensics and the FBI (news) //Nature.-1989.-V.341.-P.182-183.

86. Haberfeld A., Dunnington E.A., Siegel P.B., Hillel J. Heterosis and DNA fingerprinting in chickens II Poultry Science.- 1996.-V.75.-P.951 -953

87. Jeffreys A.J., Wilson V., Thein S.L. Hypervariable minisatellite region in human DNA // Nature.-1985a.-V.314.-P.67-73

88. Jeffreys A.J., Wilson V., Thein S.L. Individual-specific "fingerprints" of human DNA // Nature.-1985b.-V.316.-P.76-78

89. Jin L., Chakraborty R. Estimation of genetic distance and coefficient of gene diversity from single-probe multilocus DNA fingerprinting data // Mol. Biol. Evol.-1994.-V. 11.-P. 120-127

90. Jones C.J., Edwards K.J., Castiglione S. et al. Reproducibility testing of RAPD, AFLP and SSR markers in plants by a network of European laboratories // Mol. Breeding.-1997

91. Kashi Y., Lipkin E., Darvasi A., Nave A., Gruenbaum Y., Beckmann J. S., Soller M. Parentage identification in the bovine using DNA fingerprints // Dairy Sci.-1990.-V.73.-P.3306-3311

92. Khandka D.K., Tuna M., Tal M., Nejidat A., Golan-Goldhirsh A. Variability in the pattern of random amplified polymorphic DNA // Electrophoresis.-1997.-V.18.-P.2852-2856

93. Kuhnlein U., Dawe Y., Zadvorny D., Gavora J.S. DNA fingerprinting: a tool for determining genetic distances between strains of poultry // Theor. Appl. Genet.-1989.-V.77.-P.669-672

94. Kuhnlein U., Zadvorny D., Gavora J.S. Faithful identification of markers associated with quantitative trait loci in chickens by DNA fingerprinting // In: DNA fingerprinting approaches and applications.-Basel, 1991,-Birkhouser Verlag.- P.274-282

95. Lagoda P. J. L, Seitz G., Epplen L.T. et al. Increased detectability of somatic chenges in the DNA from homan tumors after probing with "synthetic" and genome-derived hypervariable multilocus probes // Human Genetics.-1989.-V.84.-P. 35-40.

96. Levin I., Crittenden L.B., Dodgson J.B. Mapping DNA polymorphisms using PCR primers derived from the sequence of an avian CRI element // J.Heredity.-1994b.-V.85.-P.73-78.

97. Lynch M., Milligan B.G. Analysis of population structure with RAPD markers //Mol. Ecjl.-1994.-V.3.-P.91-99.

98. Lynch M. Analysis of population genetic structure by DNA fingerprinting // In: "DNA fingerprinting: approaches and applications"-Basel, 1991-Birkhauser Verlag.-P. 113-126

99. Mathur P.K., Ponsuksili S., Groen A.F., Horst P. Estimation of genetic variability within and between populations using DNA fingerprints !! Proceedings 5th World Congress on Genetics Applied to Livestock Production.-Guelph.-l 994.-P.528-531

100. Meng A., Gong G., Chen D., Zhang H., Qi S., Tang H., Gao Z. DNA fingerprint variability within and among parental lines and its correlation with performance of F-l laying hens // Theor. Appl. Genetics.-1996.-V.92,-P.769-776

101. Nakamura Y., Leppert M., O'Connel P. Variable number of tandem repeat (VNTR) markers for human gene mapping // Science.-1987.-V.135,-P.1616-1622

102. Okada N., Hamada M., Ogiwara I., Ohshima K. SINEs and LINEs share common 3' sequences: a review // Gene.- 1997.-V.205.-P.229-243

103. Plotsky Y., Kaiser M. G., Lamont S.J. Genetic characterization of highly inbred chicken lines by two DNA methods: DNA fingerprinting and polymerase chain reaction using arbitrary primers //

104. Ponsuksili S., Wimmers K., Horst. Evaluation of variation within and between different chicken lines by DNA fingerprinting // Journal of heredity.-1998.-V.89.-P. 17-23.

105. Rogstad S.H., Pelican S. GELSTATS: a computer program for population genetics analysis using VNTR multilocus probe data // BioTechniques.-1996.-V.-21.-P.1128-1131

106. Sharma D., Appa Rao K.B., Singh R.V., Totey S.M. Genetic diversity among chicken breeds estimated through randomly amplified polymorphic DNA// Anim. Biotechnol.-2001.-V.2.-P.l 11-120

107. Singh R.V., Sharma D. Within- and betweenstrain genetic variability in White Leghorn population detected through RAPD markers // Br Poult. Sci-V.43.-P.33-37.

108. Smith E.J., Jones C.P., Bartlett J., Nestor K.E. Use of randomly amplified polymorfic DNA markers for the genetic analysis of relatednes and diversity in chickens and turkeys // Poult. Sci.-1996.-V.75.-P.579-584

109. Sreekumar G.P., Smyth J.R.Jr., Ponce de Leon F.A. Molecular characterization of the Smyth chicken sublines and their parental controls by RFLP and DNA fingerprint analysis // Poult.Sci.-2000.-V.l .-P. 1-5

110. Stephens J.C., Gilbert D.A., Yuhki N., O'Brien S.J. Estimation of heterozygosity for single-probe multilocus DNA fingerprints // Mol. Biol. Evol.-1992.-V.9.-P.729-743

111. Tautz D. Hypervariability of simple sequense as a general sourse for polymorfic DNA markers // Nucl. Acids Res.-1989.-V.17.-P.6463-6471.

112. Washio K., Misawa S., Ueda S. Probe walking: development of novel probes for DNA fingerprinting // Hum. Genet.-1989.-V.83.-P.223-226.

113. Wei R., Dentine M.R., Bitgood JJ. Random ampliefied polymorphic DNA markers in crosses between inbred lines of Rhode Island red and White Leghorn chikens // Anim. Genet.-1997.-V.28.-P.291-294.

114. Wells R.A., Wonke В., Thein S.L/ Prediction of consanguinity using human DNA fingerprints // J. of Mtd. Genet.-1988.-V.25.-P.660-662.

115. Welsh J. and McCleland G.M. Fingerprinting genomes using PCR with arbitrary primers // Nucl. Acids Res.-1990.-V.18.-P.7213-7218

116. Williams J.G.K., Kubelik A.R., Livak K.J., Rafalski J.A., Tingey S.V. DNA polymorphisms amplified by arbitrary primers are useful as genetic markers //Nucl. AcidRes.-1990.-V.18.-P.6531-6535

117. Wu K.-S., Jones R., Danneberger L. et al. Detection of microsatellite polymorphism without cloning // Nukl. Acids Res.-1994.-V.22.-P.3257-3258.

118. Yeh F.C., Yang R.-C., Boyle T. PORGENE. Quick User Guide.version 1.0.,1997.1-27.

119. Ye X., Zhu J., Velleman S.G., Nestor K.E. Genetic diversity of commercial turkey primary breeding lines as estimated by DNA fingerprinting // Poult. Sci.-1998a.-V.77.-P.802-807

120. Ye X., Zhu J., Velleman S.G., Bacon W.L., Nestor K.E. Measurement of genetic variation within and between Japanese quail lines using DNA fingerprinting // Poult. Sci.-1998b.-V.77.-P.1755-1758

121. Zhu J., Nestor K.E., Moritsu Y. Relationship between band sharing levels of DNA fingerprints and inbreeding coefficients and estimation of true inbreeding in turkey lines // Poult. Sci.-1996.-V.75.-P.25-28

122. Zhivotovsky L. A., Feldman M.W. Microsatellite variability and genetic distance//Proc. Natl. Acad. Sci.-1995.-V.92.-P.l 1549-11552.

123. Zhang X., McDaniel G.R., Gismbrone J.J. Random amplified polymorphic DNA comparisons among broiler lines selekted for incidense of tibial dyschondroplasia // Poul. Sci.-1995.-V.74.-P.1253-1258

124. Zhang X., Leung F.C., Chan D.K., Chen Y., Wu C. Comparative analysis of allosyme, random amplified polymorphic DNA and microsatellite polymorphism on Chinese native chickens // Poult. Sci.-2002a.~V.81,-P.1093-1098.

125. Zhang X., Leung F.C., Chan D.K.,Yang G, Wu C. Genetic diversity of Chinese native chicken breeds based on protein polymorphism, random amplified polymorphic DNA and microsatellite polymorphism // Poult. Sci.-2002a.-V.81.-P. 1463-1472.

126. Zietkiewicz E., Rafalski A., Labuda D. Genome fingerprinting by simple sequence repeat (SSR)-anchored polymerase chain reaction amplification // Genetics.-1994.-V.20.-P. 176-183.