Полиморфные ДНК-маркеры в исследовании генетического разнообразия лососевых рыб тема диссертации и автореферата по ВАК РФ 03.00.15, кандидат биологических наук Сексте, Эдгар Артурович

• Сексте, Эдгар Артурович
• кандидат биологических наук
• 2008

Оглавление диссертации кандидат биологических наук Сексте, Эдгар Артурович

ВВЕДЕНИЕ.

1. ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ.

1.1. Особенности в структуре ДНК животных.

1.2. Полиморфизм повторяющихся последовательностей днк.ю

1.3. Методические особенности RAPD-PCR-анализа.

1.4. Использование полиморфных ДНК-маркеров для изучения популяций различных видов рыб.

2. МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ ИССЛЕДОВАНИЙ.

2.1. Объект исследования.

2.2. Выделение ДНК.

2.3. Расщепление ДНК рестриктазами.

2.4. Электрофорез фрагментов ДНК.

2.5. Перенос ДНК с агарозного геля на фильтр.

2.6. Прегибридизация и гибридизация ДНК.

2.7. Детекция дезоксигенина на фильтрах.

2.8. Полимеразная цепная реакция со случайными праймерами (RAPD-PCR- анализ).

2.9. Обработка результатов исследования.

3. РЕЗУЛЬТАТЫ ИССЛЕДОВАНИЙ.

3.1. Анализ полиморфизма ДНК лососевых рыб рода Salmo с помощью RAPD-PCR- анализа.

3.2. Анализ гетерогенности лососевых рыб рода Salmo с помощью ДНК-фингерпринтинга.

3.3. Анализ генетического разнообразия пород радужной форели с помощью RAPD-PCR-анализа.

3.4. Генетическая изменчивость радужной форели, определяемая методом ДНК-фингерпринтинга.

3.5. Молекуля'рно-генетический анализ пар - производителей стальноголового лосося с помощью ДНК - фингерпринтинга.

3.6. ПЦР-типирование популяций радужной форели Адлерского рыбного хозяйства.

3.7. ДНК-фингерпринтинг популяций радужной форели Адлерского рыбного хозяйства.

4. ОБСУЖДЕНИЕ РЕЗУЛЬТАТОВ.

ВЫВОДЫ.,.

ПРЕДЛОЖЕНИЯ ПРОИЗВОДСТВУ.

Введение диссертации (часть автореферата) на тему «Полиморфные ДНК-маркеры в исследовании генетического разнообразия лососевых рыб»

Актуальность темы. Поддержание оптимального уровня генетического разнообразия является одной из важнейших задач, требующих немедленного решения, поскольку снижение генетической гетерогенности приводит к ухудшению многих качественных показателей рыбы и ставит под угрозу существование генофондных популяций лосося и пород радужной форели. В

I » тоже время увеличение генетического разнообразия приводит к утрате уникальных свойств и признаков, характерных для пород и популяций лососевых рыб.

В настоящее время с внедрением в практику молекулярно-генетических методов исследования, таких как ДНК-фингерпринтинг, таксонопринт, RAPD-анализ, появилась возможность проводить генетический контроль над уровнем генетического разнообразия в генофондных популяциях, подбирать оптимальную структуру и размер популяций, осуществлять подбор пар производителей для получения эффекта гетерозиса, подбирать пары- для повышения выживаемости личинок и мальков лососевых рыб, а также осуществлять молекулярно-генетической оценку эффективности проводимой селекции, уточнять историю выведения пород и популяций лососевых рыб.

Представленная работа является частью научных исследований, проводимых лабораторией молекулярной цитогенетики ГНУ ВНИИ генетики и разведения с.-х. животных в соответствии с научной программой фундаментальных и приоритетных прикладных исследований по научному обеспечению развития агропромышленного комплекса Российской Федерации, выполненной по договору с РАСХН: 06.01.01. «Установить генетическую гетерогенность популяций сельскохозяйственных животных и разработать комплексную систему оценки наследственных качеств племенных животных на основе использования генетических маркёров и ДНК- технологий» (номер гос. регистрации 15070.7822000013.06.8.001.1).

Цель и задачи исследований. Основной целью работы является оценка генетического разнообразия пород и популяций лососевых рыб с помощью полиморфных ДНК-маркеров.

В конкретные задачи работы входило: определить перспективы применения метода RAPD-PCR для выявления различий между видами и породами лососевых рыб; провести подбор праймеров, способных выявлять повторяющиеся последовательности ДНК у лососевых рыб; обнаружить маркерные, фрагменты ДНК у отдельных пород и популяций лосося, используя молекулярный зонд (GGAT)4 провести сравнительную? оценку генетических параметров, полученных с помощью 2-х методов: RAPD-PCR-анализа и ДНК-фингерпринтинга.

Научная новизна работы. Впервые показан высокий уровень, сходства между популяциями онежского и балтийского лососей (BS=0,92 по праймеру ОРР-17). Выявлены максимальные различия между популяциями каспийского и балтийского лососей (BS=0,69 по; праймеру ОРР-17). Обнаружены маркерные фрагменты, характерные для каспийского лосося; "

Наблюдается достаточно высокий уровень сходства между породой радужной форели росталь и популяцией стальноголового лосося:

Показана высокая: отрицательная корреляция между коэффициентом: сходства и скоростью ростатодовиков; а также между коэффициентом сходства и сохранностью мальков при гетерогенном подборе в парах стальноголового лосося.

Теоретическая и практическая значимость работы. Теоретическая значимость состоит в разработке молекулярно-генетических подходов для выявления особенностей породообразовательных процессов у лососевых рыб.

Полученные результаты свидетельствуют об эффективности использования RAPD-PCR анализа для обнаружения маркерных последовательностей ДНК у генофондных популяций лосося и пород радужной форели.

Использованные методы позволяют с большой эффективностью подбирать пары стальноголового лосося для дальнейшего получения товарной рыбы.

Апробация работы. Основные положения диссертационной работы представлены на аспирантских сессиях, отчетах лаборатории молекулярной цитогенетики и в материалах межрегиональной научной конференции аспирантов и студентов СПбГАУ, посвященной 100-летию университета. Отдельные положения работы представлены в материалах международной научной конференции ГНУ ВНИИГРЖ «Современные методы генетики и селекции в животноводстве», Санкт-Петербург, 26-28 июня 2007 и в журнале «Доклады РАСХН».

Основные положения, выносимые на защиту: наличие маркерных последовательностей, характерных для отдельных популяций рыб, выявляемых с помощью RAPD-PCR-анализа и ДНК-фингерпринтинга использование зонда (GGAT)4 для типирования популяций лосося;

- сравнительная оценка основных генетических параметров, полученных методом RAPD-PCRh ДНК-фингерпринти и гом.

1. ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ

Заключение диссертации по теме «Генетика», Сексте, Эдгар Артурович

выводы

1. Проведенный анализ RAPD-спектров выявил маркерные фрагменты размером 950 п.н., 670 п.н. и 300 п.н., специфичные для каспийского лосося.

2. Методом ДНК-фингерпринтинга показана значительная разница в частотах встречаемости ряда фрагментов ДНК между онежским, балтийским и каспийским лососем.

3. В результате RAPD-анализа наблюдается высокое генетическое сходство между популяциями онежского и балтийского лосося (BS=0,93 по праймеру ОРР-17), а так же - между породой росталь и стальноголовым лососем (BS=0,96.по праймеру ОРС-05, по праймеру UBC-744- 0,95 и по суммарной матрице - 0,91).

4. По данным RAPD-анализа, максимальные различия были получены между популяциями каспийского и балтийского лосося (BS=0,69 по праймеру ОРР-17). , ,

5. Самый высокий уровень гетерозиготности отмечен в популяции каспийского лосося (Н=0,62). Самый низкий уровень генетического разнообразия выявлен в популяции онежского лосося (Н=0,40) при использовании ДНК-фингерпринтинга.

6. В ходе RAPD- анализа выяснилось, что популяции янтарной форели Адлерского рыбного хозяйства по основным генетическим параметрам слабо различаются, что вероятно связано с жестким отбором в этих популяциях.

7. В результате анализа пар производителей стальноголового лосося выявлена отрицательная корреляция между сохранностью их мальков и коэффициентом сходства (BS) при гетерогенном подборе.

8. ДНК-фингерпринтинг, в целом, подтверждает основные выводы, полученные с использованием RAPD-анализа.

ПРЕДЛОЖЕНИЯ ПРОИЗВОДСТВУ

Данные по полиморфным ДНК-маркерам рекомендуется использовать при разведении пород радужной форели и в программах по сохранению генофондных популяций онежского, балтийского и каспийского лосося.

Список литературы диссертационного исследования кандидат биологических наук Сексте, Эдгар Артурович, 2008 год

1. Адаричев В.А., Корохов Н.П., Остапчук Я.В., Дымшиц Г.М., Маркель А.Л. Характеристика линий крыс с нормотензивным и гипертензивным статусом методом геномного фингерпринтинга // Генетика.-1996.-Т.32.-С.1669-1672

2. Алтухов, Ю.П., Сальменкова, Е.А., Омельченко, В.Т. Популяционная генетика лососевых рыб./ Ю.П.Алтухов; Е.А. Сальменкова, В.Т.Омельченко М.: Наука, 1997г.

3. Балдеску Н.Г., Гинскэ и др. Первичное исследование вещественныхiдоказательств и оценка их пригодности для биологической идентификационной экспертизы методом геномной "дактилоскопии" // Суд. мед. эксп.-1990.-Т.4-С.12 ^

4. Банникова, А.А., Матвеев, В.А., Крамеров, Д.А. Опыт использования интер-8ГЫЕ-ПЦР в изучении филогенеза млекопитающих. / А.А.Банникова, В.А.Матвеев, Д.А.Крамеров //Генетика. М.: Наука,-2002.-№6-Т.38.-С.853. .864.

5. Барышева Е.В., Просняк М.И., Власов М.С. и др. Использование ДНК фага М13 для анализа межиндивидуального полиморфизма ДНК человека на примере изучения популяции г. Краснодара // Генетика.-1989.-Т.25.-С.2079-2081

6. Блисковский В.В. Тандемные повторы ДНК в геноме позвоночных: структура, возможные механизмы образования и эволюции // Мол. биол.-1992.-Т.26.-С.965-982

7. Булат, С.А., Мироненко, Н.В. Идентификация грибов и анализ их генетической изменчивости методом полимеразной цепной реакции (ПЦР) с геноспецифичными и неспецифичными праймерами. / С.А.Булат, Н.В.Мироненко //Генетика. М.: Наука,-1996.-Т.32.-С.165.183.

8. Ю.Владыченская Н.С., Мирошниченко Г.П. Развитие представлений о чередовании полинуклеотидных последовательностей в геномах эукариотов//Успехи современной биологии.-1983.-Т.96.-С.196-210

9. Генетика, селекция и племенное дело в аквакультуре России.- М.: ФГНУ «Росинформагротех», 2005.- 428с.

10. Гинатулин А.А. Структура, организация и ' эволюция генома позвоночных.-М.:Наука, 1984.-294 с.

11. Глазко В.И., Дунин И:М., Глазко Г.В., Калашникова JI.A. Введение в ДНК-технологии.- М: ФГНУ Росинформагротех, 2001.-436с.

12. Глазко,В .И., Зеленая, Л.Б. Дифференциация домашней лошади и лошади Пржевальского по различным последовательностям ДНК. / В.И. Глазко, Л.Б.Зеленая //Генетика. -М:: Наука,-1998.-Ж7.- Т.34.-С.996.999.

13. Глик, В., Пастернак, Дж. Молекулярная биотехнология: Принципы и применение./ В.Глик, Дж Пастернак М.: Мир, 2002 г.

14. Демидова И.А., Сурин B.JL, Менделеева Л.П., ' Савченко В.Г. Амплификация гипервариабельных участков генома для установления типа гемопоэза у больных гемобластозами после аллогенной трансплантации костного мозга // Генетика.-1997.-Т.ЗЗ.-С.546-549

15. Деренко, М.В., Малярчук, Б.А. Однопраймерный вариант ПЦР-амплификации участков главной некодирующей области митохондриальной ДНК человека. / М.В.Деренко, Б.А.Малярчук // Генетика. М.: Наука-1994.-№ 11.- Т.ЗО.-С.1535. 1537.

16. Долматова, И.Ю., Саитбаталов, Т.Ф., Гареев, Ф.Т. RAPD анализ генетического полиморфизма уток. Межпородные различия. / И.Ю.Долматова, Т.Ф. Саитбаталов, Ф.Т.Гареев // Генетика. - М.: Наука,-2000.-№5,- Т.36.-С.682. .687.

17. Дорофеева, Е.А. Систематика и история расселения европейских лососей рода Salmo./ Е.А.Дорофеева // Вопросы ихтиологии. М.: Наука,-1998.-№4.- Т.38.-С.437.447.

18. Иванов П.Л. Молекулярно-генетическая- индивидуализация человека // авт.док.дисс.-М.-1995.-57 с.

19. Иванов П.Л., Вербовая Л.В., Гуртовая С.В. Применение геномной "дактилоскопии" для диагностики монозиготности близнецов // Суд. мед. эксп.-1991.-Т.1-С.32-33

20. Иванов П.Л., Гуртовая С.В., Вербовая Л.В. и др. Геномная "дактилоскопия" в экспертизе спорного отцовства и определении биологического родства//Суд. мед. эксп.-1990>Т.2.-С.36-38

21. Иванов П.Л., Гуртовая С.В., Плаксин В.О. и др. Геномная "дактилоскопия" с использованием в качестве зонда бактериофага М13 (экспертиза вещественных доказательств и идентификация личности) // Суд. мед. эксп.-1989.-Т.4.-С.39-42

22. Игнатов,- А.Н., Кугуники, Я., Супрунова, Т.П. и др. RAPD-маркеры, сцепленные с локусом устойчивости к расе 4 возбудителя сосудистогобактериоза у Brassika rapa L. / А.Н.Игнатов // Генетика.-2000.-Т.36.f . \1. С.357.360.

23. Конарев, А.В. Использование молекулярных маркеров в работе' с генетическими ресурсами растений. / А.В.Конарев // С.-х. биология М., - 1998. - Т.5.-С.3.24.

24. Кривенко А.А., Филипенко M.JL, Адаричев 1В.А. и др. Анализ косегрегации полиморфных ДНК-маркеров с величиной артериального давления у крыс гипертензивной линии НИСАГ // Генетика.-1999.-Т.З5.-С. 164-169

25. Куликова, И.В., Челомина, Г.Н., Журавлёв, Ю.Н. RAPD-PCR анализ генетического разнообразия маньчжурского фазана. / И.В. Куликова, Г.Н. Челомина, Ю.Н.Журавлёв // Генетика. М.: Наука,-2002.-№6.-Т.38.-С.836.841.

26. Ларкин, Д.М., Кузнецов, С.Б., Астахова, Н.В., Жданова, Н.С. Использование ПЦР маркеров для картирования хромосомы 12 свиньи. / Д.М.Ларкин с соавт. // Генетика. М.: Наука,-2001.-№3.- Т.37.-С.358.364.

27. Маниатис Т., Фрич Э., Сэмбрук Дж. Молекулярное клонирование":' М :Мир, 1984. 480 с.

28. Медников, Б.М., Шубина, Е.А., Мельникова, М.Н., Саввантова, К.А. Проблема родового статуса тихоокеанских лососей и форелей (геносистематический анализ). / Б.М.Медников с соавт. // Вопросы ихтиологии. М.: Наука,-1999.-№1.- Т.39.-С.14.21.

29. Рыбчин, В1Н. Основы генетической инженерии. / В.Н.Рыбчин // СПб, из-во СПбГТУ, 1999 г. 522 с.

30. Рысков А.П., Джинчарадзе А.Г., Просняк М.И. и др. Геномная "дактилоскопия" организмов различных таксономических групп:использование в. качестве гибридизационной пробы ДНК фага М13 // Генетика.-1988а.-Т.24.-С.227-23 8

31. Рысков А.П., Токарская О.Н., Вербовая Л.В. Геномная "дактилоскопия" микроорганизмов: использование в качестве гибридизационного зонда ДНК фага Ml3 // Генетика;-19886.-Т.24.-С. 1310-1313

32. Рябинина, Н.Л., Гречко, В.В., Даревский, И.С. Полиморфизм ДНК популяций ящериц семейства Lacertidae, определяемый методом RAPD / Н.Л.Рябинина, В.В.Гречко, И.С.Даревский // Генетика.-1998.-Т.34.-С. 1661. 1667.

33. Сайки, Р., Тилинстен, У., Эрлих, Г. Анализ генома. / Р.Сайки, У.Гилинстен, Г. М.Эрлих //Мир,-1990.-248с.

34. Семенова, С.К., Илларионова, Н.А., Васильев, В.А. и др., Филенко, А.Л., Васильев, В.А. и др. Использование полиморфных маркеров ДНК для дифференциации пород кур различного происхождения. / С.К.Семенова с соавт. // Генетика.-1996.- №6. Т.32.-С.795.803.

35. Семенова, С.К., Романова, Е.А., Бенедиктов; Рысков, А.П. Анализ генетической изменчивости печеночного сосальщика Fasciola hapatica с помощью ПЦР со случайными праймерами. / С.К.Семенова // Генетика.-1995.- №2. С.273.275.

36. Сидоренко, А.П., Березовская, О.П., Созинов, А.А. Оценка генетического полиморфизма в популяции колорадского жука по RAPD-маркерам. / А.П.Сидоренко, О.П.Березовская, А.А. Созинов // Генетика.-2000.-Т.36.-С.651. .656.

37. Симоненко В.Н. Микросателлитные последовательности (TG)n-rana генома крупного рогатого скота: Автореф. дисс.канд. биол. наук.-Боровск, 2001.-26с.

38. Спиридонова, JI.H., Челомина, Г.Н., Крюков, А.П. Генетическое разнообразие черной и болыпеюповой ворон по данным RAPD-PCR анализа. / Л.Н.Спиридонова, Г.Н.Челомина, А.П.Крюков // Генетика.-2003.- №6.- Т.39.-С.1516.1526.

39. Терлецкий В.П. Молекулярно-генетические методы анализа» генетической изменчивости в популяциях животных // Международный Аграрный Журнал.- 1998.-Т.4.-С.38-40

40. Токарская О.Н., Зуев.А.В., Сорокин Ф.Г. и др. Геномная дактилоскопия журавлей: новый подход для генотипирования видов // Генетика.-1990.-Т.26.-С.599-606 },

41. Уфыркина О.В., Васильев В.А., Крюков А.П., Рысков А.П. Геномная дактилоскопия ворон: изучение генетической структуры популяций гибридной зоны // Генетика.-1995.-Т.7.-С.883-888

42. Челомина- Г.Н., Павленко М.В., Картавцева И.В., Боескоров Г.Г., Ляпунова Е.А., Воронцов Н.Н. Генетическая дифференциация* лесных мышей Кавказа: сравнение изозимной, хромосомной и молекулярной дивергенции // Генетика.-1998.-Т.34.-С.213-225

43. Шагинян, И.А., Гинцбург, A.JI. ПЦР генетическое типирование патогенных микроорганизмов. / И.А.Шагинян, А.Л.Гинцбург // Генетика.-1995.- №5.- Т.31.-С.600-610.

44. АН S., Mailer C.R., Epplen J.T. DNA fingerprinting by oligonucleotide probes specific for simple repeats // Human Genetics.-1986.-V.74.-P. 239243

45. Araneda, C.M., Neira, R., Iturra, P. Identification of DNA polymorphic markers associated to muscle coloration in COHO SALMON (Oncorhynchuskisatch) / Araneda, C.M. et al. // Plant., Animal & Microbe Genomes. i

46. Cnference Aquaculture. 2002.

47. Avvedimento V.E. Sequence organization of porcine DNA // Nucl.Acids Res.-1976.- V.3.-P.2491-2505

48. Bagley, M.J., Anderson, S.L., May, B. Choice of methodology for assessing genetic impacts of environmental stressors: polymorphism and reproducibility of RAPD and AFLP fingerprints. / M.J.Bagley et al. // Ecotoxicology. 2002.-vol.10. №4 - p.239-244.

49. Bardakci, F., Skibinski, D.O. Application of the RAPD technique in tilapia fish: species' and subspecies identification. / F.Bardakci, ■D.O.Skibinski // Heredity, 1994. .- vol.73. №2 - p. 117-123.

50. Becerril, C., Acevedo, H., Ferrero, M., Sanz, F., Castano, A. DNA fingerprint comparison of rainbow trout and RTG-2 cell line using random amplified polymorphic DNA. / G.Becerril et al. // Ecotoxicology. 2001.- vol.10. №2 -p.115-124.

51. Bell G;, Selby M., Rutter J. The highly polymorphic region near the human insulin is composed of simple tandemly repeating sequences //Nature.-1982.-V.295.-P.31-35

52. Bernardi G. The human genome: organization and evolutionary history // Annu.Rev.Genetics.-1995 .-V.29.-P.445-476

53. Bernardi G., Olofsson В., Filipski J., Zerial M., Salinas J. The mosaic'-'genome of warm-blooded vertebrates // Science.-1985.-V.228.-P.953-958

54. Bettink S., Wullich В., Christmann A., Zwergel Т., Zang K.D., Unteregger G. Genetic heterogeneity of prostatic carcinoma-derived cell lines as emphasized by DNA fingerprinting // Electrophoresis.-1992.-V. 13.-P. 644-646

55. Bielawski, J.P., Pumo, P.E. Randomly amplified polymorphic DNA (RAPD) analisis of Atlantic Coast striped bass. / J.P. Bielawski, P.E.Pumo // Heredity, 1997.- vol.78. №1 -p.32-40.

56. Blackburn E.H. Telomerases // Annu.Rev.Biochem.-1992.-V.61.-P.l 13-129

57. Blanchelot A. Genetic relatedness in honeybees as established by DNA fingerprinting//J. of Heredity.-1991.-V.82.-P.391-396

58. Borowsky, R.L., Vidthayanon, С. Nucleotide diversity in population of balitorid-cave fishes from Thailand. / R.L.Borowsky et al. // Mol.Ecol;, 2001.-vol. 10. № 12 - p.2799-2805.

59. Borowsky, R.L., Wilkens, H. Mapping a cave fish genome: polygenic systems and regressive evolution./ R.L.Borowsky et al. // Heredity, 2002,-vol.93. № 1 - p. 19-21.

60. Breen M., Downs P. et al. Intrageneric amplification of horse microsatellite markers with emphasis on the Przewalski's horse (E. Przewalskii) Anim. Genet.-1994:-V.25 .-P:401-405

61. Britten R:J. and Kohne DIE. Repeated sequences in DNA //. Science.-1968.-V. 161.-P.529-540 '

62. Caetano-Anolles, G., Bassam, B.J:, Gresshoff,. P.M. DNA amplification fingerprinting using very short arbitrary oligonucleotide primers./ G.Gaetano-. Anolles et al. // Bio Technology.-1991.-V.9.-P.553-557.

63. Gallejas, 0., Ochandb;; M;Di Phylogenetic . relabionhips among VSpanish? Barbus species (Pisces, Gypriniodae) shown by RAPD markers / C.Callejas et al. // Heredity, -2002.- vol.89. №1• - p.36-43.

64. Carlson, J.E., Tulsieram, L.K., Glaubitz, J.C. et al. Segregation of random amplified DNA markers in F1 progeny of conifers./ J.E.Carlson et al. // Theor. Appl. Genetics.-1991 .-V.83 .-P. 194-200.

65. Chong, E.K., Tan;S:G. et al. Idetification and characterization of Malaysian river catfish, Mystus nemurus (C&V): RAPD and AFLP analysis. / L.K.Chong et al. II Biochem. Genet- 2000; - V.38- №3, 4.-P.63-76.

66. Cohen J.E. DNA fingerprinting for forensic identification: potential effects on data integration of subpopulation heterogeneity and band number variability // Am. J. Human Genet.-1990.-V.46.-P.358-368

67. Davidson E.H. and Britten R.J. Organization, transcription and regulation in animal genome // Quart.Rev.Biol.-1973.-V.48.-P.565-61390; Davidson E.H. Comparative aspects of DNA organization in Metazoa // Chromosoma.-1975 .-V.51 .-P.253-259

68. Dinesh, K.R., Lim, T.M., Chua, K.L. et al. RAPD analisis: an efficient method of DNA fingeфrinting in fishes./ K.R.Dinesh et al.// J.Zoology. —1993. vol. 10. - №5 - p.849-854.

69. Ellegren H., Chowdhary В., Johansson M. et al. A primary linkage map of the porcine genome reveals a low rate of genetic recombination // Genetics.1994.-V.137.-P. 1089

70. Epplen C., Epplen J.T. Expression of (cac)n/(gtg)n simple repetitive sequences, in: mRNA of human lymphocytes // Hum.Genetics:-1994;-V.93.-,1. P.35-41

71. Ezzel G. Panel of DNA flngeфrints in court cases // Science News.-1992.-V.141.-P.261

72. Fobes, S., Knudsen, K., Allendorf, F. Genetic variation in DNA COHO SALMON from1 the lower Columbia: river. / S.Fobes et al. // Benneville Power Administration; 1993;- p; 1-29: •

73. Foo, C.L., Dinesh, K.R. et al. Inheritance of RAPD markers in the guppy fish: Poecilia reticulata. / G.L. Foo et al:.// Zoolog.Sci. 1995. - vol.12. - №5 -p.535-541.98;Galan G.A. Evolution» of the repetitive and non-repetitive DNA // In:

74. Gilbert D.A., Lehman N., O'Brien S.J., Wayne R.K. Genetic fingerprinting reflects population differentiation in the California Channel Island fox // Nature.-1990a.-V.344.-P.764-767

75. Gilbert D.A., Parker C., Pusey A.E., Stephens J.C., O'Brien S.J. Analytical DNA fingerprinting in lions: parentage, genetic diversity, and kinship // J. Hered.-1991.-V.82.-P.378-386

76. Grimaldi M.C. and Crouau-Roy B. Microsatellite allelic homoplasy due to variable flanking sequences // J. Mol. Evol.-1997.-V.44.-P.336-340

77. Grobet L., Charlier C., Hancet R. DNA fingerprints and leukochimerism in bovine dizygotic twins // Ann. Med. Vet.-1991.-V.135.-P.353-359 ;

78. Grobet L., Charlier C., Schwers A., Hancet R. Detection of freemartinism by means of DNA fingerprints and a bovine Y-specific probe // Ann. Med. Vet.— 1992.-V.136.-P.41-49

79. Hatanaka, Т., Galetti, P.M. RAPD markers indicate the occurrence of structured populations in a migratory freshwater, fish species./ T.Hat'anaka et al. // Genet.Mol.biol. -2003. vol.26. - №l.p.l4

80. Healy P.J., Dennis J.A., Nickols P.J., Reichmann K.G. Hemeropoetic chimerism: a complication in heterozygote detection tests for inherited defects in cattle //Anim. Genet.-1994.-V.25.-P.l-6,

81. Hedenskog M., Sjogren M., Cederberg H., Rannug U. Induction of germline-length mutations at the minisatellitesPC-l1 and PC-2 in male mice exposed to polychlorinated biphenyls and diesel exhaust emissions // Environ. Mol. Mutagen.-1997.-V.30.-P.254-259

82. Hohenhorst J., Strazinger C. Use of microsatellites for parentage control in pigs // Anim. Genet.-1994.-V.25.-P.25

83. Holland C.A. Sequence complexity of nuclear and messenger RNA in Hela cells // J.Mol.Biol.-1980.-V.138.-P.755-778

84. Inoue M. et al. Isolation of polymorphic microsatellite loci from Japanese black cattle and their application to individual identification // Anim. Genet.-1994.-V.25.-P: 144

85. Iturra P., Lam N, Vergara N., Medrano J.E Characterization of sex chromosomes in rainbow trout and coho salmon using fluorescence in sity hybridization (FISH)// Genetica -2001 .vol.11 l.-p.l25-131.

86. Jeffreys A.J., Bois P., Buard J., Collick A., Dubrova Y. et al. Spontaneous and5 induced minisatellite instability // Electrophoresis.-1997.-V.18.-P.1501-1511

87. Jeffreys A.J., Royle N.J., Wilson V., Wong Z. Spontaneous mutation-rates to new length alleles at random-repetitive hypervariable loci in human* DNA // Nature.-1988.-V.332.-P.278-281s

88. Jeffreys A.J., Wilson* V., Kelly R. Mouse DNA fingerprints analysis of chromosome localization and germ-line stability of hypervariable loci in recombinant inbred strains // Nucl.Acid Res.-1987.-V.15.-P.2823-2836

89. Jeffreys A.J., Wilson V., Thein S.L. Hypervariable minisatellite region in human DNA // Nature.-1985a.-V.314.-P.67-73

90. Jeffreys A.J., Wilson V., Thein S.L. Individual-specific "fingerprints" of human DNA // Nature.-1985b.-V.316.-P.76-78

91. Jin L., Chakraborty R. Estimation of genetic distance and coefficient of gene diversity from single-probe multilocus DNA fingerprinting data // Mol. Biol. Evol.-1994.-V. 11 .-P. 120-127

92. Johnson, S.L., Midson, C.N., Ballinger, E.W. et al. Identification of RAPD primers that reveal extensive polymorphisms between laboratory strains of zebrafish. / S.L.Johnson et al. // Genomics. 1994.-V.19.- №5. - P.152-156.

93. Joshi A.R., Sinha S., Dil-Afroz, Sulaiman I.M., Banerji A.K., Hasnain S.E. Alterations in brain tumor DNA detected by a fingerprinting probe // Indian J. Biochem. Biophys.-1996.-V.33.-P.455-457

94. Jug Т., Dove., J. Pohar and A.Snoj RAPD analysis as a tool for discriminating marble trout from hybrids(marble trout x brown trout) in the zones of hybridization //Animal Breeding and Genetics .2004.-vol. 121 .-№ 3-p.156-162

95. Kashi Y.,,Lipkin E., Darvasi A., Nave A., Gruenbaum Y., Beckmann J. S., Soller M. Parentage identification in the bovine using DNA fingerprints // Dairy Sci.-1990.-V.73.-P.3306-3311

96. Kashi Y., Nave A., Gruenbaum Y., Soller M., Beckmann J.S. A minisatellite from bovine which produces highly polymorphic DNA fingerprinting patterns in mammals and chickens // Anim. Genet.-1992.-V.23 .-P.570 ij

97. Kovacs, В., Egedi, S., Bartfai, R., Orban, L. Male-specific DNA markers from African catfish (Clarias garie pinus). / B.Kovacs et al. //. Genetica. — 2000.-V.110.-№3. P.267-276.

98. Lynch M. Analysis of population genetic structure by DNA fingerprinting // In: "DNA fingerprinting: approaches and applications".-Basel,11 1991.-Birkhauser Verlag.-P. 113-126

99. Manning J.E. Interspersion-of repetitive and non-repetitive DNA sequences in the Drosophila melenogaster genome'// Cell.-1975.-V.4.-P. 141-155

100. Mather, P.B. Overview offish genetics, research at Queensland university of technology. / P.B.Mather // Aquaculture ICLARM Conf. Proc. 04. 2001. -p.133-139.

101. Matsumura Y., Tarin D. DNA fingerprinting survey of various human tumors and their metastases // Cancer Res.-1992.-V.52.-P:2174-2179

102. Mathur P.K., Ponsuksili S., Groen A.F., Horst P. Estimation of genetic variability within and between populations using DNA fingerprints // Proceedings 5th World Congress on Genetics Applied to Livestock Production.-Guelph.-1994.-P.528-531

103. McGowan, С. And Davidson, W.S. The RAPD technique fails to detect a male-specific genetic marker in Atlantic salmon. / C.McGowan, W.S. Davidson//J. Fish biology.- 1998. V.53.-№5. - P.1134-1136.

104. Meyer E. Microsatellite polymorphisms reveal phylogenetic relationships in primates // J.Mol.Evol.-1995.-V.41 .-P. 10-14

105. Mohideen, M.A., Moore, J.L., Cheng, K.C., Centromere-linked microsatellite markers for linkage groups 3, 4, 6, 7, 13 and 20 zebrafish (Danio rerio). / M.A.Mohideen et al. // Genomics. 2000.-V.67.- №1. -P. 102-106.

106. Moran C. Microsatellite repeats in pig (Sus domestica) and chicken (Gallus domesticus) // J.of Heredity.-1993.-V.84.-P.274-280

107. Moyzis R.K. An alternative view of mammalian DNA sequence organization. 1. Repetitive sequence interspersion in Syrian hamster <DNA: a model system // J.Mol.Biol.-1981 .-V. 153 .-P.841 -870

108. Naish, K.A., Warren, M. et al. Multilocus DNA fingerprinting and RAPD reveal similar genetic relationships petween strains of Oreochromis niloticus (Piscesi Cichlidae) / K.A.Naish et al. // Mol.Ecol., 1995.- vol.4. №2 - p.271-274.

109. Nakamura Y., Leppert M., O'Connel P. Variable number of tandem repeat (VNTR) markers for human gene mapping // Science.-1987.-V.135.-P.1616-1622

110. Nakamura K., Ozaki A., Akutsu Т., Iwai K., Sakamoto Т., Yoshizaki G., Okamoto N. Genetic mapping of the dominant albino locus in rainbow trout (Oncorhynchus mykiss) // Mol Genet Genomics.- 2001.- V.265.- №1.- P.687-693

111. Novikov L.V., Kalinovsky V.P., I-Ienson K.P. Method of DNA fingerprinting for determination of structural peculiarities of human genomic DNA// In: Biotechnology.-St.-Petersburg, 1994.-P.83-84

112. Numberg P., Marczinek К., Thiel G., hampe J. Parallel genome analysis by one- and two-dimentional DNA fingerprinting in human gliomas // Electrophoresis.-1995 .-V. 16.-P. 1715-1725

113. Ohtsuka, M., Makino, S. Et al. Construction of a linkage map of the medaka (Oryzias latipes) and mapping of the Da mutant locus defective in dorsoventral patterming. / M.Ohtsuka et al.-// Genome Res. 1999.- vol.9; -№1 - p. 1277-1287.

114. Okada N., Hamada M., Ogiwara I., Ohshima K. SINEs and1; LINHs share common 3' sequences: a review//Gene.- 1997.-V.205.-P.229-243

115. Parkin Di The use of genetic fingerprinting in the study of animal population // J. Zoology.-1989.-V.217.-P.351-353

116. Rogstad, S.H., Pelican S. GELSTATS: a computer program for population genetics analysis using VNTR multilocus probe data // BioTechniques.-1996.-V.-21.-P. 1128-1131

117. Schneider-Stock R., Gunther Т., Roessner A., Epplen J.T. Somatic DNA alterations in breast carcinomas, of different lymph-node status by DNA fingerprint analeses // Cancer Genet. Cytogenet.-1998.-V. 103.-P. 149-154

118. Schwai'ger P.M., Gomolka M., Geldermann H., Zischler H., Buitcamp Ji, Epplen JIT., Ammer PI. Oligonucleotide fingerprinting to individualize ungulates //Apph Theor. Electrophor.-1992.-V.2.-P.193-200

119. Sertadaki A. and Lindsay S; CAC the neglected repeat // BioEssays.-1996.-V.18.-P.237-242

120. Sharma D., AppaRao K.B.C., Singh R.V. and Totey S.M. Genetic diversity among chicken breeds estimated through randomly amplified polymorphic

121. DNA./ D.Sharma et al.//Animal Biotechnology.-2001.-vol.l2.-№ 2. p.lll-120

122. Shriver M.D. Origins and evolution of VNTR loci: the apolipoprotein B3' VNTR// Ph.D Thesis.-1993.-University of Texas.-Houston

123. Singer M.F. SINEs and LINEs: highly repeated short and long interspersed sequences in mammalian genomes // Cell.-1982.-V.28.-P.433-434

124. Smiht G.R. and Stearley R.F. The classification and scientific names of rainbow and cutthroad trout // Fisheries.-1989.-V.14.-P.4-10.

125. Streit, В., Stadler, Т., Schwenk, K. Et al. Natural hybridization in freshwater animals Ecological implications and molecular approaches. / B.Streit et al. // Natur wissenschaften; 1994. V.81.- №2. -P.65-73.

126. Sultmann, H., Mayer, W.E. et al. Phylogenetic analysis of cichlid fishes using nuclear DNA markers. / H. Sultmann et al. // Mol.Biol.Evol. 1995. -V.12.- №6. -P. 1033-1047.

127. Supowit S.C. and Rosen J.M. Gene* expression in normal and neoplastic mammary tissue // Biochemistry.-1980.-V. 19.-3452-3460

128. Tegelstrom H. and von Essen L. DNA fingerprinting of captive breeding pairs of lesser white-fronted geese (Anser erythropus) with unknown pedigrees //Biochem. Genet.-1996.-V.34.-P.287-296

129. Terletski V.P., Tycshenko V.U., Dementieva N.V., Belash D.E., Terentieva E.G., Golod V.M. Molecular genetic analisis of population parameters inselected breeds of Salmon // Vortragstagungder DGfZ/undder GfT am 17/18, September 2003 in Gottingen, D 25.

130. Thomsen P.D. and Miller J.R. Pig genome analysis: differential distribution of SINE and LINE sequences is less pronounced than in the human and mouse genomes // Mamm.genome.-1996.-V.7.-P.42-46

131. Trommelen G.J.M., Den Daas J., Vijg J., Vitterlinden A. DNA profiling of cattle using micro-and minisatellite core probes // Animal Genetics.-1993 a.-V.23.-P.23 5-241

132. Vergara N., Iturra P. and Aguirre R. Multilocus DNA-fingerprinting using oligonucleotide probes (GATA)4 and (GGAT)4 in rainbow trout (Oncorhynchus mykiss). /Genetics &Molecular Biology.- 1998-V.21.- №2.-P.45- 48

133. Viard F., Franck P., Dubois M.P., Estoup A., Jarne P. Variation of microsatellite size homoplasy across electrromorphs, loci, and populations in three invertebrate species //'J.Mol.Evol:-1998.-V.47.-P.42-51 •

134. Welsh J. and McCleland G.M. Fingerprinting genomes using PCR with arbitrary primers // Nucl. Acids Res.-1990.-V.18.-P.7213-7218

135. Williams J.G.K., Kubelik A.R., Livak K.J., Rafalski J.A., Tingey S:V. DNA polymorphisms amplified by arbitrary primers are useful as genetic markers // Nucl. Acid Res.-1990.-V.18.-P.6531-6535

136. Wong A.K., Yee H:A., van de Sande J.H., Rattner J.B. Distribution of CT-rich tracts is conserved in vertebrate chromosomes // Chromosoma.-1990.-V.99.- P.344-351

137. Wyman A. and White J. Hypervariable regions in the genomes contain tandem repeats of short DNA sequences // Proc.Nat.Acad.Sci.USA.-1980.-V.77.-P.6754.

138. Ye X., Zhu J., Velleman S.G., Bacon W.L., Nestor K.E. Measurement of genetic variation within and between Japanese quail lines using DNA fingerprinting // Poult. Sci.-1998b.-V.77.-P.1755-1758

139. Ye X., Zhu J., Velleman S.G., Nestor K.E. Genetic diversity of commercial turkey primary breeding lines as estimated by DNA fingerprinting // Poult. Sci.-1998a.-V.77.-P.802-807

140. Yoon, J.M., Kim, G.W. Randomly amplified polymorphic DNA polymerase chain reaction analisis of two different populations of cultured Korean catfish silurus asotus./ J.M.Yoon, G.W.Kim // J. Bioscience. 2001. V.26.- №6. -P.641-647.

141. Zhang X., McDaniel G.R. and Giambrone J.J. Random amplified polymorphic DNA comparison among broiler lines selected for incidence of tibial dyschondroplasia./ X.Zhang et aI.//Poultry science.-1995.-vol.74.-p.1253-1258.

142. Zhu J., Nestor K.E., Moritsu Y. Relationship between band sharing levels of DNA fingerprints and inbreeding coefficients and estimation, of true inbreeding in turkey lines // Poult. Sci.-1996.-V.75.-P.25-28