Современная структура кишечного микробиоценоза у детского населения Иркутской области тема диссертации и автореферата по ВАК РФ 03.02.03, кандидат биологических наук Ракова, Елена Борисовна

• Ракова, Елена Борисовна
• кандидат биологических наук
• 2010

Оглавление диссертации кандидат биологических наук Ракова, Елена Борисовна

ВВЕДЕНИЕ.4

ГЛАВА I. ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ

1.1 .Современные представления о формировании микробиоценозов человека.14

1.1.1 .Экосистемные симбиотические взаимодействия.14

1.1.2.Микробиота толстого кишечника.18

1.1.3. Кишечные дисбиозы и экологический прессинг.26

1.2. Колонизационная резистентность - ключевая функция индигенных микроорганизмов.41

1.3.Бифидобактерии: молекулярный подход и геносистематика.52

1.4. Современные методы коррекции дисбиотических нарушений.56

ГЛАВА 2. МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ ИССЛЕДОВАНИЙ.68

2.1. Объекты исследований.69

2.2. Методы исследований.70

2.3. Эколого-гигиеническая характеристика изучаемых территорий

Восточной Сибири.78

ГЛАВА 3. ХАРАКТЕРИСТИКА ИНТЕСТИНАЛЬНЫХ МИКРОБИОЦЕНОЗОВ У ДЕТЕЙ ДОШКОЛЬНОГО И ШКОЛЬНОГО ВОЗРАСТА, ПРОЖИВАЮЩИХ НА ТЕРРИТОРИИ ИРКУТСКОЙ ОБЛАСТИ.97

3.1. Анализ состояния здоровья детей в гг. Иркутск, Ангарск, Шелехов.97

3.2. Особенности интестинальных микробиоценозов у детей Иркутска.102

3.3. Особенности интестинальных микробиоценозов у детей Ангарска. 106

3.4. Характеристика микробной экологии кишечного биоценоза у детей г. Шелехова.115

3.5. Сравнительная характеристика интестинальных микробиоценозов у детей, проживающих в промышленных городах Иркутской области.120

3.6. Региональные ориентиры количественного содержания основных аутохтонных микроорганизмов в кишечной микробиоте детей Иркутской области.122

3.7. Характер дисбиотических нарушений у детей с клиническими проявлениями кишечного дисбиоза.124

3.8 Изменение биологического профиля и биохимическая внутрипопуляционная гетерогенность Е.соИ у лиц с манифестными формами дисбиоза кишечника.129

3.9. Динамика структуры кишечных дисбиозов детей, рожденных в разные годы.134

ГЛАВА 4. НЕКОТОРЫЕ БИОЛОГИЧЕСКИЕ ХАРАКТЕРИСТИКИ ПОПУЛЯЦИЙ БИФИДОБАКТЕРИЙ У НАСЕЛЕНИЯ ИРКУТСКОЙ

ОБЛАСТИ.139

4.1. Изучение антагонистических свойств аутоштаммов бифидобактерий, изолированных от детей с дисбиозами толстого кишечника.139

ГЛАВА 5. ИЗУЧЕНИЕ ВИДОВОЙ АРХИТЕКТОНИКИ БИФИДОБАКТЕРИЙ НА ОСНОВЕ МОЛЕКУЛЯРНО-ГЕНЕТИЧЕСКОГО ПОДХОДА.145

ГЛАВА 6. ОБСУЖДЕНИЕ РЕЗУЛЬТАТОВ.156

ВЫВОДЫ.163

Введение диссертации (часть автореферата) на тему «Современная структура кишечного микробиоценоза у детского населения Иркутской области»

Демоэкологическая Г политика, содействующая охране и улучшению здоровья населения, невозможна без / понимания закономерностей функционирования нормальных биоценозов человека и животных.

Микробная колонизация представляет собой, одно из явлению природы, которое изучается как биологией,.так и медициной. CS позиции экологии данное' явление можно рассматривать как процесс расселения микроорганизмов на различных объектах, в том числе, на коже, слизистых оболочках, на раневой поверхности, что сопровождается их размножением до определенного предела. Колонизация приводит к формированию комплексных сообществ различных популяций микроорганизмов'в определенных биотопах - как в окружающей среде, так и в организме животных и человека. В результате указанных событий формируются экосистемы, обнаруживается определенная иерархия среди микробных популяций [Бочков И.А., Овчарова Н.М., 1991; Бондаренко В.М., 1998; Воробьев A.A. и соавт., 2001; Шендеров Б.А., 1998]. Ни-один метаболический процесс, ни одна физиологическаяг функция в организме не протекает без прямого или опосредованного участия симбионтной микробиоты [Шендеров Б.А., 2007]. •

Биоценозы состоят из совокупности популяций автохтонных, аллохтонных и заносных из внешней среды видов; между которыми; существуют определенные количественные и качественные соотношения. В результате внешних и внутренних воздействий состав популяций постоянно меняется. При длительном влиянии дестабилизирующих факторов или кратковременном воздействии агента большой повреждающей силы, происходит нарушение механизмов стабилизации, и, как следствие этого, новый состав? микроорганизмов формирует дисбиоз [Долгушина И.И. и соавт., 1998; Крамарь Л.В., 2001; Домарадский И. В., 2002].

Социальное значение микроэкологических исследований значительно возрастает в эпоху научно-технических преобразований, характеризующихся усилением взаимодействия общества и природы. Нормальная микрофлора находится в прямой зависимости от факторов окружающей среды, является первичной мишенью приложения любого попадающего в организм соединения и первой вовлекается в трансформацию естественных и чужеродных субстанций, в том числе ксенобиотиков и. экотоксикантов. Это способствует росту дисбиозов биотопов человека, приводит к изменению физиологических, биохимических и иммунологических показателей, накоплению и селекции атипичных штаммов, формированию в организме новых микробных сообществ (патоценозов) и, в конечном итоге, способствует возникновению патологических состояний [Шендеров Б.А., Манвелова М.А., 1997].

Возрастающее экологическое неблагополучие окружающей среды уже привело к тому, что некоторые эволюционно сложившиеся биоценозы почвы и водоемов' безвозвратно утеряны. Нарушение же естественных микробиоценозов человека может привести к непредсказуемым последствиям для его здоровья и жизни. В условиях длительного воздействия негативных факторов на биологическую систему «макроорганизм-микробиота» отношения между членами этой системы изменяются. К особым экологическим факторам следует отнести широко применяемые в практике здравоохранения антибиотики и другие противомикробные препараты. Особенность этого экологического феномена для микроорганизмов заключается в том, что этот процесс трудно было приостановить [Бароян О.В., 1972]. Кроме того, в результате широкого применения вакцинных, фаговых препаратов в какой-то степени изменена иммунологическая структура населения, и циркуляция некоторых микроорганизмов происходит в необычных для них условиях. Поэтому правомерно будет говорить о существовании и такого экологического фактора, как обитание микроорганизма в необычных для него условиях [Покровский В.И. и соавт., 1994].

Варианты тактического разнообразия в системе «макроорганизм -микробиота» являются отражением высоких адаптационных возможностей участников этой биологической системы, изучение которой- остается одним из актуальнейших-направлений современной медицины и биологии.

Следует подчеркнуть важное обстоятельство - отношения макроорганизма с микроорганизмами, заселяющими свои экологические ниши, складываются по-разному. Так, отношения с бифидобактериями, доминантой кишечного микробиоценоза (около 90% всех бактерий кишечника), подобны отношениям целого со своей частью — макроорганизмом. Не случайно, в научной литературе имеет место приравнивания сложнейшей экологической системы «нормобиоценоз кишечника» к «своеобразному экстракорпоральному органу человека» [Дорофеев А.Э. и соавт., 1997; Крылов В.П. и соавт., 1998]. В кишечнике человека'обитает около 100 триллионов бактерий. Живые бактерии составляют 30% фекальных масс. У здорового человека имеется стабильное равновесие в доминировании полезных микроорганизмов. Интестинальная микробиота - это комплексное микробное сообщество, коллективный геном которого, микробном, кодирует функции, которые оказывают воздействие на физиологию человека [Тиггош Р, 2008; МаэаЫга Найоп, 2009].

Иммунологические взаимоотношения- в системе «макроорганизм микробиота» нередко выходят за границы нормы. Это проявляется наличием измененной реактивности к представителям нормальной микробиоты хозяина. В регуляции микробиоценоза важную роль играют иммунные реакции, в т.ч. содержание ^А в слизистых секретах кишечника [Пинегин Б.В. и соавт., 1984; Лыкова Е.А.и соавт., 1996].

В последние годы интерес к симбионтной микробиоте кишечника человека необыкновенно возрос. Дисбиоз кишечника со всеми заболеваниями, сопровождающими его, с его последствиями, связанными с нарушением функции интестинальной иммунной системы, привлекает пристальное внимание врачей во всем мире. Распространенность дисбиозов необычно велика. Но, несмотря на многочисленность исследований по изучению кишечных дисбиозов взрослых и особенно детей, обилие практических рекомендаций по коррекции кишечного микробного гомеостаза, профилактике и.т.п., проблема остается актуальной поскольку даже тенденции к их сокращению не наблюдается.,

Актуальность данной проблемы определяется и тем, что климатогеографические и эколого-гигиенические условия обитания человека, возраст, характер питания и др. вызывают изменения в иммунореактивности организма, что отражается на его микробиоценозе, придавая особенности нормальной микробиоте кишечника. В свою очередь, состав и биологические свойства микробиоты определяют состояние здоровья человека, что доказывается ее изменениями при различных заболеваниях [Миронов А.Ю. 2001 и др.; Bjorksten et al.,2001; Sekirov I., Finlay B.B., 2009; Morowitz M.J. et al., 2010]. При этом нарушения в составе кишечной микробиоты наступают задолго до клинических симптомов и поэтому могут быть предвестниками определенного патологического процесса [Воробьев А.А. и соавт., 1995; Schulenburg Н. et al., 2009]. В связи с этим возникает необходимость в разработке критериев оценки микроорганизмов кишечника и определении нормы для населения различных территорий.

Не менее важной проблемой является ухудшение экологической обстановки, связанное с урбанизацией. В условиях экологического неблагополучия иммунодефицитные состояния наблюдаются практически у всего населения, проживающего в данных регионах. При этом выраженность иммуносупрессивного эффекта зависит от продолжительности и интенсивности воздействия экологически вредных факторов на организм человека [Хаитов P.M. и соавт., 1995; Скачков М.В., 2001; и др.]. Изменения в иммунной системе проявляются в формировании первичных и вторичных иммунодефицитов, аллергии, аутоиммунных и онкологических заболеваний, а также дисбиозов, которые проявляются, прежде всего, в угнетении бифидобактерий и лактобацилл, обладающих иммуностимулирующей активностью и увеличением количества условно - патогенных бактерий, особенности биологических свойств которых определяются регионом их распространенности [Бондаренко-В.М., 2002; и др.].

В процессе постоянного взаимодействия макро- и микроорганизмов формируется уникальная система, находящаяся в состоянии динамического равновесия. При, этом постоянство микробиоценоза, микробиологический фенотип, присущий каждому человеку, является показателем иммунологической реактивности организма и одним из факторов естественного иммунитета [Гребнев А.Л., Мягкова А.Н., 1994; Пинегин Б.В. и соавт., 1984; Лыкова Е.А. с соавт, 1996]. Разгадку многих механизмов, лежащих в основе формирования дисбиозов, может дать всестороннее изучение всех сочленов данных сообществ, которые как объект экологии, представляют собой сложные многофакторные явления. Человек является не только средой обитания для микроорганизмов, но и непосредственным сочленом формирующихся биоценозов. Поэтому так важно иметь полное представление о поведении всех сочленов этого сообщества.

Так, практика показала, что коррекция препаратами пробиотиков, содержащих бифидобактерии и лактобациллы, часто не приводит к устойчивому улучшению состояния и дальнейшей нормализации микробиоценоза кишечника. И через 1-2 месяца после прекращения биокоррекции состояние дисбиоза кишечника возвращается. Считается, что эта коррекция не сопровождается заселением слизистых поверхностей кишечника штаммами лечебных препаратов. Они только, восполняя недостаточную антагонистическую и другие функции аутоштаммов, дают возможность размножиться и заселиться своей, аутохтонной микрофлоре. В тех случаях, когда не происходит восстановления нормобиоценоза кишечника с помощью препаратов-пробиотиков, создается впечатление, что организм как бы постоянно «отторгает» от себя нужную микрофлору.

Таким образом, поскольку механизмы процесса нарушения микробиоценоза изучены недостаточно, представляется важным дальнейшее изучение особенностей микробиоты кишечника,

Учитывая малую вероятность полного оздоровления окружающей среды в ближайшее время, формирование и поддержание оптимальных микробиоценозов и их коррекция при дисбиозах являются важными задачами как в отношении сохранения здоровья отдельных людей, так и человеческой популяции в целом [Глушанова Н.А. и соавт., 2007; Lampe J.W., 2008; Preidis G.A., Versalovic J., 2009; Saulnier D.M.A. et al., 2009]. Это делает необходимым дальнейшее расширение и углубление исследований в области микробной экологии, направленных на выяснение закономерностей саморегуляции биоценозов, определения их роли в поддержании гомеостаза и в возникновении многих заболеваний [Векслер И.Г., 1985; Костюкова Н.Н., 1999; Крамарь Л.В., 2001; Finegold S.M., et al, 1983; Gialdroni-Grassai G., 1985; Van der Waaij D., 1996; Hamilton-Miller J.M.T.,1997; Домарадский И.В. и соавт., 2002; Versalovic J.,2006; Шендеров Б.А., 2007; Costello E.K. et al., 2009; Turnbaugh P.J., 2009; Hattori M., 2009; The NIH Human Microbiome Project, 2009].

ЦЕЛЬ ИССЛЕДОВАНИЯ

На основе изучения особенностей региональной архитектоники кишечного микробиоценоза определить основные основные варианты интестинальных микроценотипов и видовой рейтинг бифидобактерий у детей Иркутской области

Задачи исследования:

• Изучить региональные особенности микробного пейзажа кишечной микробиоты у здоровых детей Иркутской области в условиях существующей техногенной нагрузки.

Проанализировать динамику микроэкологических нарушений у детей с клиническими проявлениями кишечного дисбиоза.

Определить спектр геновидового разнообразия рода Bifidobacterium в кишечнике детей и взрослых, проживающих в зоне техногенного загрязнения, а также выявить доминирующие виды бифидобактерий.

Исследовать антагонистическую активность региональных штаммов популяции бифидобактерий.

Научная новизна:

Впервые определены качественные и количественные характеристики микробного пейзажа основных групп резидентных микроорганизмов в кишечной микробиоте детей, проживающих в городах Иркутской области, выявлены характерные отличительные особенности микробиоценозов, связанные с местом проживания.

Впервые установлено, что многолетняя динамика структуры кишечных дисбиозов у детей имеет выраженную тенденцию сокращения тяжёлых форм на фоне отсутствия эубиотических состояний.

Впервые показана, оригинальная видовая архитектоника региональных штаммов бифидобактерий с преобладанием B.longum и их низкая антагонистическая активность.

Показана информативность метода МГНК и его перспективность для видовой идентификации бифидобактерий.

Впервые предложен универсальный алгоритм для популяционной оценки микроархитектоники интестинальной микробиоты по отношению к общефизиологическим нормам и региональным ориентирам.

Практическая значимость работы:

Результаты натурных и экспериментальных исследований легли в основу полученного патента: База данных Микроэкологический пейзаж биоценозов человека у населения Иркутской области [текст]: Per. номер св. 2009620535 (06.11.2009); патентообладатель НЦ ПЗСРЧ СО РАМН, ГОУПДО «Иркутский ГИУВ Федерального агентства по здравоохранению и социальному развитию»; опубл. 20.03.2010, Бюл.№ 1(70) -750 Кб.

Разработаны, опубликованы и внедрены методические рекомендации для врачей, научных работников, преподавателей: «Региональные особенности микробной экологии у детей Иркутской области» // Пособие для врачей. Иркутск: РИО ИГИУВа, 2009.-36 с./Рец. д.м.н., проф. Киборт Р.В., к.м.н. Ленок Г.В.

Характеристика основных вариантов интестинальных микробиоценозов и региональные показатели количественного содержания основных групп индигенных микроорганизмов в кишечнике детей, проживающих в городах Иркутской области, используются в учебном процессе на кафедре эпидемиологии ГОУ ДПО ИГИУВ Росздрава, кафедре общей гигиены ГОУ ВПО ИГМУ Росздрава, кафедре физико-химической биологии ГОУ ВПО ИГУ, а также в работе врачей-бактериологов МУЗ ГКБ № 9 г. Иркутска.

ПОЛОЖЕНИЯ, ВЫНОСИМЫЕ НА ЗАЩИТУ

1. Микроэкологическая структура кишечных биоценозов здоровых детей

Иркутской области имеет региональные особенности, характеризующиеся снижением количества доминирующих симбионтных микроорганизмов (бифидобактерий, лактобактерий, нормальной кишечной палочки), высокой частотой индикации атипичных эшерихий (слабоферментативные, лактозонегативные и гемолитические варианты), увеличивающейся с возрастом. У детей изученных городов сложились оригинальные варианты микробиоценозов, различающиеся как по архитектонике, так и по выделению «индикаторных» штаммом УПМ.

2. Многолетняя динамика структуры дисбиотических изменений в кишечной микробиоте детей с клиническими проявлениями дисбиоза (диспептический синдром, аллергические реакции) характеризуется значительным сокращением, вплоть до отсутствия, как глубоких изменений кишечного микробиоценоза (IV степени дисбиотических нарушений), так и отсутствием эубиотических состояний.

3. Видовая архитектоника бифидобактерий у жителей гг. Иркутска и Ангарска имеет оригинальную региональную структуру с преобладанием ВЛоп^ит Популяции региональных ауто штаммов бифидобактерий характеризуются резко выраженным снижением антагонистической активности по отношению к условно-патогенным микроорганизмам, способствуя усилению их персистентного потенциала и формированию патобиоценозов.

Апробация работы

Основные положения работы представлены и доложены на конференциях:

• Международном конгрессе по пробиотикам (Санкт-Петербург, 2007 г.).

• Юбилейной международной конференции НИИЭМ, (Иркутск, 2007г.).

• Всероссийской научно-практической конференции «Здоровье семьи -здоровый ребёнок», посвященной 20- летию Института педиатрии НЦ ПЗС РЧ СО РАМН (Иркутск, 2009 г.).

• Научно-практической конференции для практических врачей (Иркутск, 2009 г).

• 6-й Объединенной научной сессии и 2-го Международного конгресса по пробиотикам (Санкт-Петербург, 2009 г).

• 8-й научно-практической конференции молодых ученых «Актуальные вопросы охраны здоровья населения регионов Сибири» (Красноярск, 2010 г.).

Работа обсуждена на заседаниях Ученого совета и совещаниях сотрудников Института эпидемиологии и микробиологии Научного Центра проблем здоровья семьи и репродукции человека СО РАМН.

Результаты исследований использованы и внедрены в практическую и научно-исследовательскую работу специалистов здравоохранения: врачей-бактериологов, микробиологов.

Полученные новые данные используются в учебном процессе кафедры эпидемиологии» ГОУ ДПО ИГИУВ Росздрава, кафедры общей гигиены ГОУ ВПО ИГМУ Росздрава., кафедры физико-химической биологии ГОУ ВПО ИГУ, а также в работе врачей-бактериологов МУЗ ГКБ № 9, г. Иркутск. Акты внедрения приложены к диссертации.

Публикации

По теме диссертации опубликовано 16 научных работ, из них 5 в изданиях, рекомендованных ВАК Минобразования и науки РФ для публикаций материалов диссертационных работ, материалы исследований защищены 1 патентом РФ, разработано и внедрено в практику здравоохранения 1 методическое пособие для практических врачей.

Объем и структура диссертации Диссертация состоит из введения, обзора литературы, 4 глав собственных исследований и обсуждения результатов, выводов. Работа изложена на 192 страницах машинописного текста, иллюстрирована 29 таблицами, 30 рисунками, 2 фотографиями. Библиографический указатель включает 131 наименование отечественных и 105 зарубежных источников литературы. Лабораторные и клинические исследования проведены непосредственно автором настоящей работы на базе лабораторий и клиники института

Заключение диссертации по теме «Микробиология», Ракова, Елена Борисовна

ВЫВОДЫ

1. Микроэкологическая структура кишечных биоценозов здоровых детей Иркутской области характеризуется высокой частотой- диссоциации нормальных эшерихий, увеличивающейся с возрастом (28,0±8,9%- у дошкольников и 100%- у школьников г. Ангарска; р<0,05 ), и наличием в зависимости от топодема проживания сложившихся вариантов интестинальных микробиоценозов с индикацией условно-патогенных микроорганизмов, названных нами «индикаторными».

2. Региональные ориентиры основных групп резидентных микроорганизмов в кишечной микробиоте детей характеризуются снижением их титров относительно общефизиологических показателей (ОСТ, 2003), данных по другим крупным промышленным городам России (С-Петербург, Москва, Кемерово) и смещением диапазона количественных показателей плотности популяций бифидобактерий в среднем до 5-7 lg КОЕ/г, лактобацилл - до 5 lg КОЕ/г, нормальных эшерихий- до 5-6 lg КОЕ/г.

3. У детей школьного возраста г. Ангарска- 'значительно чаще, чем у дошкольников (р<0,05), регистрируется микроэкологический дисбаланс, проявляющийся снижением концентрации бифидобактерий и лактобацилл, увеличением частоты индикации атипичных и снижением плотности нормальных эшерихий, высокой частотой регистрации патогенных грибов рода Candida (16,1 ±6,7%) в диагностических титрах (5 lg КОЕ/г), что свидетельствует о снижении колонизационной резистентности.

4. Многолетняя динамика структуры дисбиозов кишечника у детей с диспептическим синдромом и аллергическими реакциями (1997 - 2007 гг.)< характеризуется значительным снижением выраженности микроэкологических сдвигов к концу периода наблюдения (р<0,05), что проявляется в снижении оценочной степени дисбиоза, независимо от возраста, в сокращении, вплоть до отсутствия, глубоких изменений (IV степень дисбиоза) и отсутствии эубиотических состояний.

5. Зарегистрирован высокий удельный вес аутоштаммов региональной популяции бифидобактерий с низкой антагонистической активностью (71,4±3,2%) к представителям транзиторных оппортунистических микроорганизмов, что способствует снижению колонизационной резистентности.

6. Видовая архитектоника бифидобактерий у жителей гг. Иркутска и Ангарска имеет оригинальную региональную структуру с доминированием B.longum и выявляемостыо B.adolescentis среди «здоровых» детей обоих городов, что может свидетельствовать о микроэкологических сдвигах в кишечном биотопе детей в сторону дисбиоза.

7. Применение алгоритма комплексного микробиологического обследования организма/популяции позволяет выявлять тенденции микроэкологических отклонений, соотнесенных к физиологичным/региональным нормативам.

ПРАКТИЧЕСКИЕ РЕКОМЕНДАЦИИ

Результаты проведенных исследований могут быть рекомендованы для внедрения в следующих направлениях:

1. Создание диагностических тест- систем на основе МГНК для видовой идентификации бифидобактерий, в т. ч. и Кар1ё-диагностикумов и биочипов для клинических лабораторий.

2. Применение базы данных по региональной популяционной характеристике индигенной микроорганизмов в . лабораториях практических органов здравоохранения для более адекватных рекомендаций при дисбиотических нарушениях кишечного биоценоза у детей.

3. В производстве при конструировании пробиотических консорциумов микроорганизмов, адаптированных для функционального питания жителей региона.

Список литературы диссертационного исследования кандидат биологических наук Ракова, Елена Борисовна, 2010 год

1. Александрович Н.Ж., Пирогова З.И. Нарушения микробного пейзажа человека и пути их коррекции // Клин, питание.— 2005 — № 2.— С. 4360.

2. Аминова А.И., Бурдина Е.С., Уланова Т.В. Особенности диагностики дисбактериоза у детей, проживающих в условиях экологического неблагополучия // Известия самарского научного центра РАН. — 2009. —Т.1, №1(5). — С. 835-838.

3. Ардатская М.Д., Минушкин О.Н. Дисбактериоз кишечника: эволюция взглядов. Современные принципы диагностики и фармакологической коррекции // Consilium medicum. Приложение. Гастроэнтерология. — 2006-№2-С. 4-18.

4. Бабин В.Н., Домарадский И.В., Дубинин А.В., Кондракова О.А. Биохимические и молекулярные аспекты симбиоза человека и его микрофлоры // Российск. хим. журн. — 1994.— № 38. — С. 66-78.

5. Барановский А.Ю., Кондрашина З.А. Дисбактериоз и дисбиоз кишечника. СПб: Питер, 2000. — 224 с.

6. Белобородова Н.В., Белобородов С.М. Метаболиты анаэробных бактерий (летучие жирные кислоты) и реактивность макроорганизма // Антибиотики и химиотер. — 2000. — №2 — С. 28-35.

7. Бельмер С.В., Малкоч А. В. Дисбактериоз кишечника и роль пробиотиков в его коррекции // Лечащий Врач. — 2006. — №6. — С. 18-23.

8. Бельмер С.В. Применение пробиотиков для профилактики и лечения нарушений микрофлоры кишечника: учебно-методическое пособие — М., 2005.-24 с

9. Битюкова В.Р. Экологическая цена промышленного роста в России (1998-2003) // ЭКиП: Экология и промышленность России. —2005. — N3.-C.4-9.

10. Бойков С.С. Мороз А.Ф., Бабаева Е.Е. Ассоциации грибов Candida albicans с некоторыми условно-патогенными микроорганизмами при дисбиозе кишечника у пациентов различных возрастных групп // Журнал микробиологии. — 2005. — N 2. С.— 65-69.

11. Бондаренко В.М. «Острова» патогенности бактерий // Журн. микробиол. 2001. — № 4. — С. 67-74.

12. Бондаренко В.М., Воробьев A.A. Дисбиозы и препараты с пробиотической функцией // Журн. микробиол. — 2004. — №1. — С. 84 -92.

13. Бондаренко В.М., Грачева Н.М. Дисбиотические состояния и лечебные мероприятия при них // Вестн. РАМН. — 2005. — № 12. — С. 23-29.

14. Бондаренко В.М. Поликомпонентные пробиотики: механизм действия и терапевтический эффект при дисбиозах кишечника // Фарматека.— 2005.—№20,—С. 46-54.

15. Бондаренко В.М., Грачева Н.М., Мацулевич Т.В. Дисбактериозы кишечника у взрослых. — М.: КМК Scientific Press, 2003.— 24 с.

16. Бондаренко В.М., Королюк A.M. Пробиотическая микробиология: современное состояние и проблемы // Журн. «Клиническое питание».— 2007. — №1-2,— С. А24-25.

17. Бухарин О.В., Валышев A.B., Перунова Н.Б. Бактериально-грибковые ассоциации кишечника в условии колонизации дрожжеподобными грибами рода Candida // Журнал микробиологии. — 2002. — N 5. — С. 45-48.

18. Быков A.A., Неверова O.A. Моделирование загрязнения атмосферы и экологическое зонирование территории г. Кемерово // Инженерная экология.— 2002.— N 6.— С. 25-32.

19. Вахитов Т.Я., Петров JT.H., Бондаренко В.М. Стимулятор роста микроорганизмов «Полифлор» и препарат для лечения желудочно-кишечного тракта// Патент России №2291192. 2007. Бюлл. №1.

20. Векслер И.Г. Сравнительная оценка влияния некоторых биологически активных полисахаридов на иммунную систему организма /под ред. Чипенса Г.И. и др. // Химия и биология иммуномодуляторов. Рига: Зинатне, 1985.— С. 167-187.

21. Воеводин Д.А., Розанова Г.Н., Стенина М.А. Роль дисбактериоза в формировании хронической неинфекционной патологии у детей // Журн. Микробиол, —2001.— № 6. — С. 88-93.

22. Володин H.H., Ефимов Б.А., Пикина А.П. Микробиологическая диагностика дисбактериозов кишечника: пособие для врачей и студентов. — Москва: МЗ РФ, 1997.— 24с.

23. Воробьев A.A., Бондаренко В.М., Лыкова Е.А. Микроэкологические нарушения при клинической патологии и их коррекция бифидосодержащими пробиотиками // Вестн. РАМН. — 2004. — №2.—С. 13-17.

24. Воробьёв A.A., Иноземцева Л.О., Буданова Е.В. Изменения микробиоценоза толстой кишки у больных различными заболеваниями // Вест. РАМН. — 1995. — №5.— С. 59 64.

25. Воробьев A.A. Дисбактериозы у детей : учеб. пособие для врачей и студентов. — М., 1998.— 175 с.

26. Гайдышев И.В. Анализ и обработка данных: специальный справочник.— С-Петербург, СПб: Питер. — 2001.— С. 22-45.

27. ГОСТ РИСО 5725 2 - 2002. Точность (правильность и рецизионность) методов и результатов измерений. М: Госстандарт России, 2002. — 15с.

28. Государственный доклад о санитарно-эпидемиологической обстановке в Иркутской области в 2008 г. / Иркутск, 2009. — 255с.

29. Государственный доклад о состоянии окружающей природной среды Иркутской области в 1996 году (1997-2000 гг.) / Иркутск, 1998-2000.

30. Грачева Н.М., Бондаренко В.М. Пробиогические препарты в терапии и профилактике дисбактериоза кишечника // Инфекц. болезни. — 2004. — Т.2, №2. —С. 53-58.

31. Григорьев В.А., Огородников И.А. Проблемы экологизации городов в мире, России, Сибири: аналит. обзор // Экология. — №63. — 2001. — 151 с.

32. Гриневич В.Б., Успенский Ю.П., Добрынин В.М. Клинические' аспекты диагностики и лечения дисбиоза кишечника в общетерапевтической практике: учебно-методическое пособие. — СПб.—2003.— 134 с.

33. Гриневич В.Б., Захаренко С.М., Осипов Г.А. Принципы коррекции дисбиозов кишечника// Лечащий врач. — 2008. — №6. — С. 10-14.

34. Гришина И.А., Долина А.М., Яковлев В.П. Влияние антибиотиков на адгезию микроорганизмов // Антибиотики и химиотерапия. — 1990. — Т. 35, №3. — С. 50-52.

35. Даутов Ф.Ф., Яруллин А.Х., Гончаров Ю.Н. Заболеваемость детей, проживающих в районах с разным уровнем загрязнения атмосферного воздуха // Гигиена и санитария. — 1998. —№11.— С. 3-5.

36. Диагностика, профилактика и лечение дисбактериозов кишечника: метод, рекомендации / МЗ СССР №10-11/4-М., 1991. — 15 с.

37. Дисбиоз кишечника. Руководство по диагностике и лечению / под ред. Е.И.Ткаченко, А.Н.Суворова. — СПб.: СпецЛит., 2007. — 238с.

38. Дисбиоз кишечника. Руководство по диагностике и лечению / под ред. Е.И. Ткаченко, А.Н. Суворова. — 2-изд. — СПб.: ИнформМед, 2009.— 276 с.

39. Домарадский И.В., Хохоев Т.Х., Кондракова O.A. Противоречивая микроэкология // Российский химический журнал. —2002. — № 46(3). — С. 80-89

40. Дубинин A.B., Бабин В.Н., Раевский П.М. Трофические и регуля горные связи макроорганизма и микрофлоры // Клиническая медицина. — 1991. — № 7 — С. 24 28.

41. Егоров Н.С. Основы учения об антибиотиках: учебник. — 6-е изд., перераб. и доп. — М.: Изд-во МГУ; Наука, 2004. —503 с.

42. Езепчук Ю.В. Патогенность как функция биомолекул. — М., 1985.— 287 с.

43. Запруднов A.M. Мазанкова J1.H. Микробная флора кишечника и пробиотики: методическое пособие. — М., 2001. — 32 с.

44. Захарченко М.П., Гриневич В.Б., Добрынин В.М. Проблемы диагностики дисбиоза под влиянием факторов окружающей среды // Журн. Гигиена и санитария. — 2003. — № 5. — С. 74-76.

45. Иванова Ю.Д. Эколого-информационные технологии: анализ пространственной информации с помощью канонических корреляций (Электронный экологический атлас г. Красноярска) // Инженерная экология. — 2004 .— N 2. — С. 35-40.

46. Ивашкин В.Т., Лапина Т.Л. Пробиотики. Рациональная фармакотерапия заболеваний органов пищеварения / под ред. В.Т. Ивашкина. — М.: Литтерра, 2003. — С. 132-137.

47. Иноземцева Л.О., Леверьева М.И., Ахременко Я.А. Микробный статус человека в условиях Крайнего Севера, как показатель здоровья индивидуума // Лабораторное дело и профилактика: Науч.-практ. изд., Якутск. — 2000. — С. 92-93.

48. Йоргенсен Дж.Х. Микробиологический справочник для клиницистов.1. М: Мир, 2006.— 242 с.

49. Казначеев В.П. Очерки теории и практики экологии человека.—М.,1983.-260 с.

50. Калмыкова А.И. Пробиотики: Терапия и профилактика заболеваний. Укрепление здоровья. — Новосибирск, 2001. — 208 с.

51. Карпунина Т.Н., Горовиц, Э.С., Чиненкова А.Н., Повышение терапевтического действия пробиотиков // Журн. микробиол. — 1998.2. —С. 104- 107.

52. Квасников Е.И., Нестеренко O.A. Молочнокислые бактерии и пути их использования.— М.: Наука, 1975. — С. 392.

53. Корниенко Е.А. Актуальные вопросы коррекции кишечноймикрофлоры у детей — Москва: ГОУ ВУНМЦ МЗ и CP РФ, 2006.С48.

54. Королюк А.М. От простокваши Мечникова к современным пробиотическим продуктам функционального питания // Вестник РАМН. — 2008. —- №3. — С. 146-151.

55. Коршунов В.М., Ефимов Б.А., Пикина А.П. Характеристика биологических препаратов и пищевых добавок для функциональногопитания и коррекции микрофлоры кишечника // Журн. микробиол.2000. —№3,—С. 86-91.

56. Косенко И.М., Пирогова З.И. Обоснование алгоритма коррекциикишечной микрофлоры у детей: методическое пособие для врачей.1. СПб., 2008. —24 с.

57. Костюкова H.H. Уроки дифтерии // Журн. микробиол.— 1999. —№ 21. С. 92 -96.

58. Крамарь Л.В. Микробная экология кишечника людей, проживающих в условиях техногенного воздействия крупного промышленного города: Автореф. дис. докт. мед. наук. — Москва, 2001. — 44 с.

59. Красноголовец В.Н. Дисбактериоз кишечника.— 2-е изд. — М.: Медицина, 1989. —208 с.

60. Куваева И.Б., Ладо до К.С. Микроэкологические и иммунные нарушения у детей. — М., 1991. — 240 с.

61. Кулачёв А.П. Компьютерный контроль процессов и анализ сигналов.

62. М: Информатика и компьютеры, 1999. — 300 с.

63. Леванова Л.А. Микроэкология кишечника жителей Западной Сибири, коррекция дисбиотических состояний: автореф. дис. докт. мед. наук.1. Москва, 2003.— 48 с.

64. Лещенко Я.А. Научные основы совершенствования мониторинга здоровья населения промышленного города как средства эколого-гигиенической оценки качества окружающей среды и условийжизнедеятельности: автореф. дис. докт. мед. наук. — Иркутск, 1997.44 с.

65. Лыкова Е.А., Бондаренко В.М., Сидоренко C.B. Сочетанная антибактериальная терапия хеликобактерассоциированных заболеваний у детей // Журн. микробиол. — 1999. — № 2.С. 76-81.

66. Малов В.А., Гюлазян Н.М. Микробиоценоз желудочно-кишечноготракта: современное состояние проблемы // Лечащий врач.2007. —6.— С. 10-14.

67. Маянский А.Н. Дисбактериоз: иллюзии и реальность // Клиническая микробиология и антимикробная химиотерапия. — 2000.Т.2, № 2.1. С. 61-64.

68. Мехтиев С.Н., Гриневич В.Б., Захаренко С.М. Дисбактериоз кишечника. Вопросы и ответы: учебно-методическое пособие. — М., 2006.— 63 с.

69. Мечников И.И. Молочные микробы и польза, приносимая ими здоровью (Ягурт). — СПб. — 1911. — 155с.

70. Минушкин О.Н., Минаев В.И., Митрохин С.Д. Комплексная диагностика, лечение и профилактика дисбактериоза (дисбиоза) кишечника в клинике внутренних болезней: методические рекомендации / под ред. В.И. Минаева. — М.: МЦ УД ПРФ, 1997. — 20 с.

71. Минушкин О.Н., Елизаветина Г. А., Ар датская М.Д. Лечение функциональных расстройств кишечника и желчевыводящей системы, протекающих с абдоминальными болями и метеоризмом // Клин, фармакол. и тер. — 2002.— № (1). — С. 1-4.

72. Миронов А.Ю. Архитектоника микробной экологии человека в норме и при некоторых патологических состояниях: автореф. дисс. докт. мед. наук. — Москва, 2002. — 44 с.

73. Михайлов И.Б., Корниенко Е.А., Дисбиоз кишечника у детей и взрослых (про- и пребиотики): методическое пособие для врачей. — СПб. — 2007.

74. Мюллер П. Таблицы по математической статистике. — М.: «Финансы и статистика», 1982 — С. 191 200.

75. Николаева Т.Н., Зорина В.В., Бондаренко В.М. Иммуностимулирующая и антиканцерогенная активность нормальной лактофлоры кишечника // Эксперим. клин, гастроэнтерол. — 2004. — №4.—С. 39-43.

76. Новик Г.И., Астапович Н.И., Самарцев A.A. Исследование биохимических особенностей бифидобактерий на поздних стадияхразвития популяций // Микробиология. — 2001.— Т. 70, №4. — С. 495-502.

77. Новиков В.Н. Экология. Урбанизация. Жизнь: учеб. пособие — М., 2002. —327 с.

78. О дум Ю. Экология. — М.: Мир, 1986. — Т. 1-2.

79. Олескин А.В., Ботвинко И.В. и др. Микробная эндокринология и биополитика // Вестн. Моск. Ун-та. Сер. Биология. — 1998. — № 4. — С. 3-10.

80. Определитель бактерий Берджи / Пер. с англ. М.: 1997. - Т. 1.; Bergy' s Mannual of Systematic Bacteriology / Ed. N.A. King. Baltimore: London, 1984.-9 ed. Vol. l.-P. 141- 199; P. 353 -373; P. 591 -599.

81. Осипов Г.А. Хромато-масс-спектрометрическое исследование микроорганизмов и их сообществ. Автореф. дис. докт. биол. наук. — Москва, 1995.— 62 с.

82. Отраслевой Стандарт «Протокол ведения больных. Дисбактериоз кишечника» / ОСТ 91500.11.0004-2003.Приказ МЗ РФ №231 от 09.06.2003. —70 с.

83. Парфенов А. И. Кишечный дисбактериоз // Лечащий Врач. —2001. — №5-6. — С. 20-25.

84. Парфенов А.И. Микробная флора кишечника и дисбактериоз // Русск. Мед. журн.— 1998, — Т.6, №18. — С. 1170-1 173.

85. Пененко В.В., Белан Б.Д., Харитонов А.Ю. Экологические проблемы городов Сибири: междисциплинарный проект СО РАН // География и природные ресурсы. — 2004. —Спец. выпуск. — С. 140-143.

86. Петровская В.Г., Бондаренко В.М. Адгезины энтеротоксигенных кишечных палочек: роль в патогенезе диарей и генетический контроль // Журн. микробиол. — 1990. — №5. — С. 110 116.

87. Петухов В.А., Стернина JI.A., Травкин А.Е. Нарушения функций печени и дисбиоз при липидном дистресс-синдроме Савельева:современный взгляд на проблему // Consilium Medicum. — 2004 — Т. 06, № 6. — С. 406-412.

88. Пивкнн В.М., Чнндяева J1.H. Экологическая инфраструктура сибирского города: (На примере Новосиб. агломерации) / под ред. В.М.Пивкина. — Новосибирск: Сибпринт, 2005. — 194 с.

89. Пинегин Б.В., Мальцев В.Н., Коршунов В.М. Дисбактериозы кишечника. — М., 1984. — 144 с.

90. Подволоцкая А.Б. Функциональная характеристика аутомикрофлоры кожи детей младшего школьного возраста в условиях техногенного загрязнения среды: автореф. дисс. канд. биол. наук.— Владивосток, 2000. —31 с.

91. Попкова С.М., Кичигина Е.Л. Иммуноэкологическая концепция развития кишечных дисбактериозов // Журн. инфекционной патологии. —Иркутск, — 1999. —№2-3. —С. 13- 15.

92. Попкова С.М., Лещук С.И., Немченко У.М. Микробная экология человека в промышленных городах Восточной Сибири // Бюлл. ВСНЦ СО РАМН. — 2004. — Т. 3, № 1. —С. 143-146.

93. Приказ Минздрава РФ от 30 декабря 2003 г. N 621 "О комплексной оценке состояния здоровья детей".

94. НИ Римарчук Г.В., Щеплягина Л.А., Кругпова И.В. Нарушение микрофлоры кишечника у детей (клиническое значение, диагностика, факторы риска, новые технологии в лечении): лекция для врачей.1. М., 2007.

95. Сабирова З.Ф. Влияние загрязнения атмосферного воздх^.1. В т-чнефтепереработки, нефтехимии, химии на смертности ^Эегионах

96. Гигиена и санитария. — 1999. — №5. — С. 15-19. ^^Ления //

97. Савилов Е.Д., Колесников С.И., Красовский Г.Н ^^техногенное загрязнение-Новосибирск: Наука, 1996 Нс£>екция иl90c

98. Савченков М.Ф., Лемешевская Е.П. Медико-экологиче1. J-c ^ ена территории Сибири // Сибирский медицинский жур^ Р'облемы1. N2. —С. 34-37. "" 1995. —

99. Савченков М.Ф. Состояние здоровья населения г. Иркл^ техногенным загрязнением окружающей среды.— Ир^ связи с 75с. >"*СК' 1991.

100. Сидоренко А.В. Новик Г.И., Акимов В.Н. Испольч«-^ геносистематики в классификации и идентификации г— Методов Bijidobacterium 11 Микробиология. — 2008. — Т. 77 >Г«з Р°Да

101. Сираева А.С. Состояние колонизационной резистентт^ ^'^93-302. кишки в динамике лечения больных хроническим ^ ТИ т°лстой дис. канд. мед. наук. — Уфа, 2008. — 138 с. Креатиюм :

102. Совершенствование методов диагностики дисбакт^1. РИозакишечника // Информационное письмо. СПб. —■ 200? °лстого15с.

103. Тармакова С.С. Структурно-функциональные повп^кишечника и их коррекция фитобактерР1 Печени,бифидосодержащими средствами: автореф. дисс п нЫМи и

104. Улан-Удэ, 1999. — 40 с. * HOJ1• наук.

105. Терновская J1.H., Гапон М.Н. Особенности микробу1. Цецоза ткишки людей с дисфункциональными расстройств °лстойтракта // Журн. микробиол. —2009 .— № 3. — С. 89-9? ЛИаРного

106. Тетиор А.H. Экологическая инфраструктура и среда жизни // Рос. экол. федер. информ. агентство. — М.: РЭФИА, 2002. — 421 с.

107. Труфакин В.А., Трунова JT.A. Иммунологические механизмы формирования экологически обусловленной патологии // Вестн. РАМН.— 1997. —№7,—С. 15-18.

108. Усенко Д.В., Горелов A.B., Шабалина C.B. Применение пробиотического продукта в диетотерапии детей с измененной аллергической реактивностью // Лечащий врач. — 2006. — №4. — С. 91-92.

109. Хавина Л.А. Экологическая ситуация в городе Шелехове (Иркутская обл.) // География и природные ресурсы .-— 2001. —- N 3. —-С. 136139.

110. Хавкин А.И. Эволюция представлений о роли кишечной микрофлоры. URL: http://www.disbak.ru/php/content.php?group=442 (дата обращения: 02.10.2009).

111. Хергет Х.Ф., Летцель X., Петров Р.О. Комплексная терапия дисбиозов // Эпидемиол. и инфекц. болезни. — 1997. — №6. — С. 51-55.

112. Циммерман Я.С. О сущности понятия «дисбактериоз (дисбиоз) кишечника» и правомерности использования этого термина // Росс.журн.гастроэнтерол.,гепатол.,колопроктол. — 2000. — №1. — С. 81-84.

113. Шевяков М.А. Антибиотик-ассоциированная диарея и кандидоз кишечника: возможности лечения и профилактики // Антибиотики и химиотерапия. — 2004. — Т. 49, №10. — С. 26-29.

114. Шевяков М.А., Архипова Е.И., Александров И.В. Дисбиоз кишечника (клиническое значение и коррекция): учебное пособие. — Великий Новгород, 2007.

115. Шендеров Б.А. Медицинская микробная экология: некоторые итоги и перспективы исследований // Вестник РАМН. — 2005. — №12. -— С.13-17.

116. Шендеров Б.А. Медицинская микробная экология и функциональное питание. — М.: Грант, 1998, —Т. 1. —286 е., —Т. 2.— 412 с.

117. Шостакович-Корецкая Л.Р., Кривуша Е.Л., Чергинец A.B. Тактический подход к коррекции дисбиоза кишечника у детей пробиотическими препаратами. Опыт применения препарата Линекс // Укр. мед. журн.1999.— № 2. — С. 6-14.

118. Щербаков П.Л., Цветков П.М., Нечаева Л.В. Профилактика диареи связанной с приемом антибиотиков у детей // Вопросы современной педиатрии. — 2004. — Т. 3, № 2. — С. 55-58.

119. Экологическое картографирование Сибири / под ред. В.В. Воробьева.

120. Новосибирск: Рос. акад. наук. Сиб. отд-ние. Ин-т географии, 1996.279 с.

121. Экологические проблемы урбанизированных территорий /А.Н. Антипов, Е.В. Полюшкин и др. / под ред. А.Н. Антипова. — Иркутск: ИГ СО РАН, 1998.-198 с.

122. Экология Сибири / под ред. В.В.Захаренкова. — Новокузнецк: КузГПА, 2004. — 97 с.

123. Эткина Э.И. Состояние здоровья детей дошкольного возраста в районах атмосферного загрязнения выбросами переработки нефти: автореф. дис. канд. мед. наук. — Москва, 1992.— 21 с.

124. Яковенко Э.П. Дисбактериоз кишечника // Лечеб. дело. —2004.— № 3.—С. 3-8.

125. Adams M.R., Hall С. J. Growth inhibition of food-borne pathogen by lactic and acetic acids and their mixtures // Int. J. Fud. Sci. Technol. — 1988. — Vol. 23. —P. 292.

126. Albright J.F. Airborne pollutants and the immune system // Otolaryngology-Head and Neck Surgery. — 1996. — Vol. 114, № 2. — P. 232-238.

127. Axselsson L.T., Chung T.C., Dobrogosz W. et al. Production of a broad spectrum antimicrobial substance by Lactobacillus rcuten // Microb. Ecolog. Health Dis. — 1989. — Vol. 2. — P. 131-136.

128. Apperloo-Renkema H.Z., Van der Waaij B.D., Van der Waaij. D. Role of competition for substrate in bacterial antagonism in the gut // Infect. Immun. — 1982. — Vol. 38, №3. — P. 887-892.

129. Baird-Parker A.C., Silliker J. Organic acids // Microbial Ecology of Foods: Academic Press, New York. —1980. — P. 126-135.

130. Bern C., Martines J. et al. The magnitude of the global problem of diarrheal disease // Vale J.Biol.Med. — 1988. — Vol. 51.— P. 505-512.

131. Barman Melissa, Unold David, Shifley Kathleen et al. Enteric Salmonellosis Disrupts the Microbial Ecology of the Murine Gastrointestinal Tract // Infect. Immun. — 2008. — Vol. 76. — P. 907-915.

132. Besselink M.G., van Santvoort H.C., Buskens E. et al. Probiotic prophylaxis in predicted severe acute pancreatitis: a randomised, double-blind, placebo-controlled trial // J. Pancreas. — 2008. — Vol. 9, №3. — P. 362-364.

133. Besselink Marc G.H., Hjalmar C.van Santvoort, Geert J.M.G. et al. Gooszen and For the Dutch Acute Pancreatitis Study Group // Langenbeck's Archives of Surgery. — 2009. — Vol. 394, № 1. — P. 191-192.

134. Biavati B., Sgorbati V. The Genus Bifidobacterium // The Procariotes. A Handbook on the biology of bacteria: ecophysiology, isolation, identification, application Ed. Balows A. New York: Springer-Verlag, 1992. —Vol. 1. —P. 816-833.

135. Braat H., de Jong E.C., van den Brande J.M. et al. Dichotomy between Lactobacillus rhamnosus and Klebsiella pneumoniae on cell dendritic phenotype and function // J. Mol. Med. — 2004. — Vol. 82, № 3. — P. 197-205.

136. Charteris W.P., Kelly P.M., Morelli L. et al. Antibiotic suscebility of potentially probiotic Bifidobacterium isolates from the human gastrointestinal tract // Letters in Applied Microbiol. — 1998. — Vol. 26, №5. —P. 333 337.

137. Clinical Ecology, American College Physicians // Ann.Intem.med. — 1989. — Vol. Ill, №2, —P. 168-178.

138. Collado et al. Imbalances in faecal and duodenal Bifidobacterium species composition in active and non-active coeliac disease // BMC Microbiol. — 2008. — Vol. 8. —P. 232.

139. Cummings J.H., Antoine J.M., Azpiroz F. et al. PASSCLAIM—gut health and immunity // Eur. J. Nutr. — 2004. — Vol. 43, № 2. — P. 118-173.

140. Differential cytokine production in clonal macrophage and T cell lines cultured with bifidobacteria // J. Dairy Sc. — 1997. — Vol. 80. — P. 27132720.

141. De Roos N.M., Katan M.B. Effects of probiotic bacteria on diarrhea, lipid metabolism, and carcinogenesis: a review of papers published between 1988 and 1998 // American J. of Clinical Nutrition. — 2000. — Vol. 71. — P. 405 -411.

142. Determination of colonization resistance of the digestive tract by biotyping of Enterobacteriaceae // Epidemiology and Infection: Cambridge University Press, 1990.—Vol. 105. — P.355-361.

143. Devillard E., Mcintosh F.M., Paillard D. Differences between human subjects in the composition of the faecal bacterial community and faecal metabolism of linoleic acid // Microbiology. — 2009. — Vol. 155. — P. 513-520.

144. Dubuis Ch., Haas D. Cross-Species GacA-ControUed Induction of Antibiosis in Pseudomonads // Appl. Environ. Microbiol.— 2007. —• Vol. 73, №21. —P. 650-654.

145. Eckburg P.B., Bik E.M., Bernstein C.N. et al. Diversity of the human intestinal microbial flora // Scince. — 2005. — Vol. 308. — P. 1635-1638.

146. Estelle Devillard., Freda M. Mcintosh et al. Metabolism of Linoleic Acid by Human Gut Bacteria: Different Routes for Biosynthesis of Conjugated Linoleic Acid // J.Bacteriol. — 2007. — Vol. 189. — P. 2566-2570.

147. Ewaschuk J.B., Diaz H., Meddings L. et al. Secreted bioactive factors from Bifidobacterium infantis enhance epithelial cell barrier function // Am. J. Physiol. Gastrointest. Liver Physiol. — 2008. — Vol. 295. — P. 10251034.

148. Faber S.M. Are probiotics useful in irritable bowel syndrome? // J. Clin. Gastroenterol. — 2003. — Vol. 37, № 1. — P. 93-94.

149. McCracken V.J., Gaskins HR., Tannoek G.W. Probiotics and the immune system. Probiotics a critical review // Horizon Scientific Press, 1999. — P. 85-111.

150. Rousseaux C., Thuru X., Gelot A. et al. Lactobacillus acidophilus modulates intestinal pain and induces opioid and cannabinoid receptors // Nat. Med.—2007. —Vol. 13, — P. 35-7.

151. Zhao H.Y., Wang H.J., Lu Z. Intestinal microflora in patients with liver cirrhosis // Chin. J. Dig. Dis. — 2004. — Vol. 5, №2. — P. 64-70.

152. Finegold S.M., Mathisen C.E., George W.L. (ed. D.S.Mentges) Human intestinal microflora in health and disease // N.Y.: Acad. Press., 1983.—P. 355-446.

153. Gialdroni-Grassai G. Bacterial products as immunodulating agents // Int. Arch. Allergy and Appl. Immunol. 1985. — Vol. 76, № 1. — P. 119127.

154. Hamady M., Knight R. Microbial community profiling for human microbiome projects: Tools, techniques, and challenges // Genome Res. — 2009. —Vol. 19. —P. 1141-1152.

155. Hamilton-Miller J.M.T. Living in the post-antibiotic era: could the use of probiotics an effective strategy? // Microbiol, and infection. — 1997. — Vol. 3, № 1. —P.234-237.

156. Hancock R.E.W., Falla T.J. Antimicrobial peptides: broad-spectrum antibiotics from nature // Clin. Microbiol. Inf. — 1996, № 1. — P. 226-229.

157. Hansen-Wester I., Hensel M. Salmonella pathogenicity islands encoding type III secretion systems // Microb. Infect. — 2001. — Vol. 3. — P. 549590.

158. Hentschel U., Hacker J. Pathogenicity islands: the tip of the iceberg // Microb. Infect. — 2001. — Vol. 3. — P. 545-8.

159. Herget H.F., Herget. H. Das intestinale Immunsystem und seine Stimulation durch Symbioselenkung // Aufl.-Pascoe. — 1996. — 512 p.

160. Hermie J.M., Harmsen, Gerwin C. Raangs et al. Extensive Set of 16S rRNA-Based Probes for Detection of Bacteria in Human Feces // Appl. Envir. Microbiol. — 2002. — Vol. 68 — P. 2982-2990.

161. Holdeman L.V., Moore W.E.C. // Anaerobe. Laboratory manual. Blacksburg; Virginia, Polytechnic Institute and State University. — 1972.

162. Jihyun F. Kim., Haeyoung Jeong et al. Genome Sequence of the Probiotic Bacterium Bifidobacterium animalis subsp. lactis ADO 11 // Journal of Bacteriology. — 2009. — Vol. 191, № 6. — P. 1995.

163. Joseph F. Petrosino, Sarah- Highlander, Ruth Ann Luna, Richard A. Gibbsand, J. Versalovic. Metagenomic Pyrosequencing and Microbial Identification // Clinical Chemistry. — 2009. — Vol. 55. — P. 856-866.

164. Klein G., Pack A., Bonaparte C., Reuter G. Taxomony and physiology of probiotic acid bacteria // Int. J. Food Microbiol. — 1998, № 41. — P. 103125.

165. Klijn A. Mercenier A. Arigoni F. Lessons from the genomes of bifidobacteria // FEMS Microbiol. Rev. — 2005. — Vol. 29, № 3. — P. 491-509.

166. Kovatcheva-Datchary P. et al. Tools for the tract: understanding the functionality of the gastrointestinal tract // Therapeutic Advances in Gastroenterolog. — 2009. — № 2. — P. 9-22.

167. LaFleur Michael D., Qingguo Qi. et al. Patients with Long-Term Oral Carriage Harbor High-Persister Mutants of Candida albicans //Antimicrobial Agents and Chemotherapy. — 2010. — Vol. 54, № 1. — P. 39-44.

168. Lammers K.M., Brigidi P., Vitali B. et al. Immunomodulatory effects of probiotic bacteria DNA: IL—1 and IL-10 response in human peripheral blood mononuclear cells // FEMS Immunol. Med. Microbiol. — 2003. — Vol. 22, № 38(2). — P. 165-720.

169. Leahy S.C., Higgins D.G, Fitzgerald G.F., van Sinderen D. Getting better with bifidobacteria // J. Appl. Microbiol. — 2005. — № 98. — P. 1303 -1315.

170. Leser T.D., M0lbak L. Better living through microbial action: the benefits of the mammalian gastrointestinal microbiota on the host // Environ. Microbiol. — 2009. — Vol. 11, №9. — P. 2194-206.

171. Mara D.D., Oragui J. Sorbitol-fermenting bifidobacteria as specific indicators of human faecal pollution // J. Appl. Bacteriol. — 1983. — Vol. 55, № 2. — P. 79-82.

172. Marin M., Murtha J., Ustunol Z., Ventura Marco, Reniero Roberto, Zink Ralf. Specific Identification and Targeted Characterization of

173. Bifidobacterium lactis from Different Environmental Isolates by a Combined Multiplex-PCR Approach //Appl. Environ. Microbiol. — 2001. — Vol. 67, № 6. — P. 2760-2765.

174. Martinez I., Wallace G., Zhang C., Legge R. et al. Diet-Induced Metabolic Improvements in a Hamster Model of Hypercholesterolemia Are Strongly Linked to Alterations of the Gut Microbiota // Appl. Envir. Microbiol. — 2009. — Vol.75. — P. 4175-4184.

175. Masahira Hattori, Todd D. Taylor. The Human Intestinal Microbiome: A New Frontier of Human Biology // DNA Research. — 2009. Vol. 16, № 1. —P.l-12.

176. Matsuki T., Watanabe K., Fujimoto J. et al. Use of 16S rRNA gene-targeted group-specific primers for real-time PCR analysis of predominant bacteria in human feces // Appl. Environ. Microbiol. — 2004. — Vol. 70, №12. — P. 7220-8.

177. Matsuki T., Watanabe K., Tanaka R. Genus-and species-specific PCR primers for the detection and identification of bifidobacteria // Curr. Issues Intest. Microbiol. — 2003. — Vol. 4. — P. 61-69.

178. McCartney A.L., Wenzhi W., Tannock G.W. Molecular analysis of the composition of the bifidobarterial and lactobacillus microflora of humans // Appl. Environ. Microbiol. — 1996. — Vol. 62. — P. 4608-4613.

179. Miettinen M., Lehtonen A., Julkunen I., Matikainen S. Lactobacilli and Streptococci activate NF-kappa B and STAT signaling pathways in human macrophages // J. Immunol. — 2000. — Vol. 164, № 7. — P. 3733^0.

180. Misra A., Kuila R. Antimicrobial substances from Bifidobacterium bifidum. // Indian J. Dairy Sc. — 1995. — Vol. 48. — P 612-614.

181. Morowitz M.J., Poroyko V., Caplan M. et al. Redefining the Role of Intestinal Microbes in the Pathogenesis of Necrotizing Enterocolitis // Pediatrics. — 2010. — Vol. 125. — P. 777-785.

182. Nebra Y., Bonjoch X., Blanch Anicet R. Use of Bifidobacterium dentium as an Indicator of the Origin of Fecal Water Pollution // Appl Environ Microbiol. — 2003. — Vol. 69, №5 — P. 2651-2656.

183. Perez P.F., Minnaard, Y., Disalvo E.A. Surface properties of bifidobacterial strains of human origin // Applied and Environmental Microbiology. — 1998 — Vol. 64. — P. 21 26.

184. Rolfe R.D. The role of probiotic cultures in the control of gastrointestinal health // J. of Nutrition. — 2000. — Vol. 130, № 2S. — P. 396- 402.

185. Roy D., Berger J.L., Reuter G. Characterization ofdairyrelated Bifidobacterium spp. based on their beta-galactosidase electrophoretic patterns // Int. J. Food Microbiol. — 1994. — Vol. 23. — P. 55-70.

186. Ruth E. Ley, Hamady Micah et al. Evolution of Mammals and Their Gut Microbes//Science. — 2008. — Vol. 320, №. 5883, —P. 1647- 1651.

187. Sakata S., Kitahara M., Sakamoto M. et al., Unification of Bifidobacterium infantis and Bifidobacterium suis as Bifidobacterium longum // Int. J. Syst. Evol. Microbiol. — 2002. — Vol. 52. — P. 1945 1951.

188. Savage D.C., Zink R. Overview of the association of microbes with epithelial surfaces // Microecol. Therapy. — 1984. — Vol. 14. — P. 167171.

189. Schmidt G. Basis features of the stress response in the three species of bifidobacteria: B. longum, B. adolescentis and B. Breve // International J. of Food Microbiol. — 2000. — Vol. 54. —P. 41 -45.

190. Seaton A., MacNee W., Donaldson K. Particulate air pollution and accute health effects // Lancet. — 1995.—Vol. 345, № 2.—P. 176-178.

191. Sekirov. I., Finlay B.B. The role of the intestinal microbiota in enteric infection // J. Physiol. — 2009. — Vol. 587. — P. 4159-4167.

192. Sepp E., Voor Т., Julge K., et al. Does the composition if intestinal microbiota depend on the year of birth? // Журн. «Клиническое питание».—2007. -№1-2:—С. All.

193. Servin A.L. Antagonistic activities of lactobacilli and bifidobacteria against microbial pathogens // FEMS Microbiol. Rev. — 2004. — Vol. 28,-№4. — P. 405-40.

194. Sharma R., Young C., Mshvildadze M. et al. Intestinal Microbiota: Does It Play a Role in Diseases of the Neonate? // NeoReviews. — 2009. — № 10. — P. 166-179.

195. Shenderov B.A. Modern condition and prospective host microecology investigation // Журн. «Клиническое питание». — 2007. — №1-2. — С. А12.

196. Silva М., Jacobus N.V., Deneke С., Gorbach S.L. Antimicrobial substance from a human Lactobacillus strains // Antimicrob. Agents Chemother. — 1987, —Vol. 31. —P. 1231-1233.

197. Simpson P.J., Ross R.P., Fitzgerald .G.F., Santon C. Bifidobacterium psychroaerophilum sp. nov. and Aeriscardovia aeriphilla gen. nov., sp. nov., isolaited from porsine ceacum // Int. J. Syst. Evol. Microbiol. — 2004. — Vol. 54.—P. 401 -406.

198. Stach J.E.M., Maldonado L.A., Ward A.C. et al. New primers for the class Actinobacteria; application to marine and terrestrial environments // Environ. Microbiol. — 2003. — Vol. 5. — P. 828-841.

199. Stackebrandt E., Rainey F.A., Ward-Rainey N.L. Proposal for a new hierarchic classification system, Actinobacteria classis nov. // Int. J. Syst. Bacteriol. — 1997. —№ 47. P. 479-491.

200. Steen G. Stahlhut, Chattopadhyay Sujay et al. Population Variability of the FimH Type 1 Fimbrial Adhesin in Klebsiella pneumoniae // Journal of Bacteriology. — 2009. — Vol. 191.—№.6. —P. 1941-1950.

201. T. de Sablet., Chassard C.et al. Human Microbiota-Secreted Factors Inhibit Shiga Toxin Synthesis by Enterohemorrhagic Escherichia coli 0157:H7 // Infect. Immun. — 2009. — Vol. 77. — P. 783-790.

202. Takahashi Т., Nakagawa E., Nara T. et al. Effect of orally ingested Bifidobacterium longum on the mucosal IgA response to mice dietary antigens // Biosci Biotechnol Biochem. — 1998. —№62. — P. 10-15.

203. Takahiro Matsuki et al. Quantitative PCR with 16S rRNA-Gene-Targeted Species-Specific Primers for Analysis of Human Intestinal Bifidobacteria // Appl Environ Microbiol. —2004. —Vol. 70, №1. — P. 167-173.

204. Tannock G.W. Probiotics: A critical ' review. — URL: http://www.horisonpress.com/hsp/pro.html. (Дата обращения: 01.09.2009).

205. Turck D., Bernet J.P., Marx J. et al. Incidence and risk factors of oral antibiotic-associated diarrhea in outpatient pediatric population // J. Pediatr. Gastroenterol. Nutr. — 2003. — Vol. 37, № 1. — P. 22-26.

206. Turroni F., Ribbera A., Foroni E. Human gut microbiota and bifidobacteria: from composition to functionality //Antonie Van Leeuwenhoek. — 2008. — Vol. 94, №1 — P. 35-50.

207. Turroni F., Marchesi J.R., Foroni E. et al. Microbiomic analysis of the bifidobacterial population in the human distal gut // ISME J. — 2009. — Vol 3, №6 —P. 745-51.

208. Ueli von Ah, Mozzetti Valeria, Lacroix Christophe. Classification of a moderately oxygen-tolerant isolate from baby faeces as Bifidobacterium thermophihim // BMC Microbiol. — 2007. — Vol. 7. — P. 79.

209. Van der Waaij D. The immunoregulation of the intestinal flora: experimental investigation on the development and the composition of the microflora in normal and thymusless mice // Microecol. Therapy. — 1984. — Vol. 14. —P. 197-201.

210. Veckman V., Miettinen M., Matikainen S. et al. Lactobacilli and streptococci induce inflammatory chemokine production in human macrophages that stimulates Thl cell chemotaxis // J. Leukoc. Biol. — 2003. — Vol. 74, № 3. — P. 395-402.

211. Ventura M., Meylan V., Zink R. Identification and traicing of Bifidobacterium srecies by use of enterobacterial repetitive intergenic consensus sequences // Appl.and Enviromental microbiology. — 2003. — Vol. 69, № 7. — P. 4296-4301.

212. Versalovic J., Relman D. How bacterial communities expand functional repertoires? // PLOS Biology. — 2006. — № 4 — P. 2193-2195.

213. Virmeet V., Singh, Phillip P. Toskes. Small bowel Bacterial Owergrowth: Presentation? Diagnosis, and treatment // Current Gastroenterology Reports. — 2003. —P. 365-372.

214. Yasui H., Nagaoka N., Mike A. et al. Detection of Bifidobacterium strains that induce large quantities of IgA // Microbiol. Ecol. in Health Dis. — 1992. —Vol. —P. 155-162.

215. Yasui H., Ohwaki M. Enhancement of immune response in Peyer's patch cells cultured with Bifidobacterium breve // J Dairy Sei. — 1991. — Vol.74. —P. 1187-1195.

216. Yeung P.S.M., Sanders M.E., Kitts C.L. et al. Species-specific identification of commercial probiotic strains // J. Dairy Sei. — 2002. — № 85. — P. 1039-1051.

217. Yildirim Z., Johnson M. Characterization and antimicrobial spectrum of Bifidocin B a bacteriocin produced by Bifidobacterium bifidum NCFB 1454//J. Food Prot. — 1998. —Vol. 61. —P. 47-51.

218. Zoetendal E.G., Rajilic-Stojanovic M., de Vos W.M. High-throughput diversity and functionality analysis of the gastrointestinal tract microbiota // Gut. —2008,—№57. —P. 1605-1615.

219. Zoetendal E.G., Cheng B., Koike S., Mackie R.L. Molecular microbial ecology of the gastrointestinal tract from phytogeny to function // Curr. Issues Intest. Microbiol. — 2004. — № 5. — P. 31 -45.

220. Список основных сокращенийа.а. антагонистическая активность

221. ААД антибиотик-ассоциированная диарея

222. АБ антибактериальные препараты

223. БПТ Байкальская природная территория

224. ЖКТ желудочно-кишечный тракт

225. ЗЗР зона задержки роста микроорганизмов

226. ИЗА индекс загрязнения атмосферы

227. КОЕ колониеобразующие единицы

228. КР колонизационная резистентность

229. МГНК метод гибридизации нуклеиновых кислот

230. НКП нормальная кишечная палочка

231. ПДК предельно допустимая концентрация

232. ПДКмр максимально разовая концентрация

233. УПМ условно-патогенные микроорганизмы

234. ЭПК энтеропатогенная кишечная палочка1. Н1 индекс опасности1. НО коэффициент опасности