Микроэкологические основы коррекции "дисбиозной" микробиоты человека тема диссертации и автореферата по ВАК РФ 03.02.08, доктор биологических наук Соловьева, Ирина Владленовна

• Соловьева, Ирина Владленовна
• доктор биологических наук
• 2013

Оглавление диссертации доктор биологических наук Соловьева, Ирина Владленовна

ОГЛАВЛЕНИЕ

ВВЕДЕНИЕ

Глава 1. Обзор литературы. Современные аспекты синэкологии симбиотических микроорганизмов толстой кишки человека и принципы коррекции микробиоты

с помощью препаратов из штаммов-симбионтов

1.1. Видовая структура биотических сообществ

1.2. Симбиотические сообщества как объекты

биоэкологических исследований

1.3. Роль микробиоты в процессе жизнедеятельности

макроорганизма

1.4. Структурная организация микробиоценоза

пищеварительного тракта

1.5. Функции нормальной микрофлоры пищеварительного

тракта

1.6. Формирование микрофлоры у детей

1.7. Качественный и количественный состав

нормальной микрофлоры ЖКТ

1.8. Дисбиоз кишечника

1.9. Средства коррекции микрофлоры

1.10. Молекулярно-биологические методы для индикации, идентификации пробиотических микроорганизмов

и типирования промышленно-значимых штаммов

1.11. Современные принципы коррекции дисбиозов различных

биотопов организма человека

СОБСТВЕННЫЕ ИССЛЕДОВАНИЯ

Глава 2. Материалы и методы исследований

2.1. Дизайн исследования

2.2. Объем экспериментальных данных

2.3. Методы изучения видового состава и численности

симбиотических микроорганизмов

2.3.1. Классические микробиологические методы

2.3.2. Методика молекулярно-генетического анализа

2.3.3. Метод экспертных оценок

2.3.4. Клинические методы исследований, использованные

в работе для оценки эффективности пробиотиков

2.3.5. Методы статистического анализа

2.3.6. Методы ранговых распеределений

2.3.7. Методы экологического анализа

Глава 3. Синэкологический анализ симбиотичнской

микробиоты толстой кишки людей разных возрастных групп

3.1. Выбор параметров оценки состояния микробиоценоза

толстой кишки

3.2. Особенности возрастной динамики численности симбиотических микроорганизмов толстой кишки

«здоровых» людей

3.2.1. Характеристика микрофлоры просвета толстой кишки

«здоровых» детей

3.2.2. Характеристика микрофлоры просвета толстой кишки

«здоровых» взрослых

3.3. Особенности возрастной динамики численности симбиотических микроорганизмов толстой кишки

«больных» людей

3.4. Сравнение возрастной динамики численности симбиотических микроорганизмов толстой кишки

«здоровых» и «больных» людей

3.4.1. Сравнительная характеристика микрофлоры просвета

толстой кишки «здоровых» и «больных» детей

3.4.2. Сравнительная характеристика микрофлоры просвета

толстой кишки «здоровых» и «больных» взрослых

3.5. Синэкологический анализ микробиоценозов толстой кишки «здоровых» и «больных» людей разных возрастных

групп

3.5.1. Анализ ранговых распределений

3.5.2. Результаты кластеризации исходного массива данных

бактериологических исследований

3.5.3. Результаты статистического анализа с использованием

критериев Манна-Уитни и Краскала-Уоллиса

3.5.4. Анализ видового разнообразия

Глава 4. Теоретические и экспериментальные основы отбора производственных штаммов-продуцентов пробиотиков

4.1. Изучение биологических свойств штаммов-продуцентов пробиотиков

4.1.1. Определение антагонистической активности пробиотических штаммов лактобацилл

4.1.2. Изучение биосовместимости штаммов лактобацилл и бифидобактерий

4.1.3. Определение антагонистической активности лактобацилл к грибам рода Candida

4.1.4. Изучение выживаемости молочнокислых бактерий в кислой среде

4.1.5. Характеристика антибиотикорезистентности стартерных культур пробиотиков

4.2. Молекулярно-генетическая идентификация штаммов-продуцентов

4.2.1. Разработка методики индикации бактерий рода Lactobacillus и Bifidobacterium на основе ПЦР гена 16S рРНК

4.2.2. Разработка методики видовой идентификации лактобацилл с использованием гнездового варианта ПЦР

4.2.3. Изучение динамики роста лактобацилл в аксеничной и смешанной культуре

4.2.4. Разработка алгоритма контроля динамики культивирования лактобацилл в смешанной культуре методом ПЦР

Глава 5. Конструирование новых жидких пробиотиков как средств коррекции микробной экосистемы человека

5.1. Конструирование и разработка технологии производства жидкого бактериального концентрата на основе лактобацилл «LL-комплекс»

5.2. Конструирование и разработка технологии производства пробиотика в форме БАД к пище на основе лакто-и бифидобактерий «LB-комплекс»

5.3. Конструирование и разработка технологии производства жидкого бактериального концентрата на основе лакто-и бифидобактерий «LB-комплекс S»

Глава 6. Бактериологическая и клиническая эффективность

созданных жидких пробиотиков

6.1. Изучение эффективности включения синбиотика «ЬЬ-комплекс» в схемы лечения гастродуоденальной

и аллергологической патологии у детей

6.2. Изучение эффективности включения синбиотика «ЬЬ-комплекс» в программы лечения воспалительных заболеваний органов малого таза (ВЗОМТ), осложненных

кандидозом

6.3. Анализ результатов использования нового симбиотика «ЬВ-комплекс» в лечебных программах выхаживания недоношенных новорожденных в педиатрическом

стационаре

6.4. Эффективность включения пробиотиков «ЬВ-комплекс» и «ЬЬ-комплекс» в программы оздоровления беременных

женщин и детей на территории г.Н.Новгорода

6.5. Эффективность использования пробиотика «ЬВ-комплекс» в системе оздоровительно-реабилитационных мероприятий

в ДОУ

6.6. Оценка эффективности использования БАД к пище

«ЬВ-комплекс» в схемах антихеликобактерной терапии

6.7. Изучение эффективности включения симбиотика «ЬВ-комплекс Б» в алгоритм лечения туберкулезной

инфекции у детей

6.8. Изучение эффективности использования симбиотика «ЬВ-комплекс Э» в программе оздоровления студентов

старших курсов медицинского ВУЗа

Глава 7. Разработка алгоритма комплексной коррекции дисбиозной микробиоты желудочно-кишечного

и репродуктивного тракта человека

ЗАКЛЮЧЕНИЕ

ВЫВОДЫ

СПИСОК ЦИТИРОВАННОИ ЛИТЕРАТУРЫ

ПРИЛОЖЕНИЯ

жкт -пм

УПМ -СУБД -КОЕ/г -МЛПУ-ВЗОМТ-ДГКБ -ГКБ -ДОУ-

нокптд-

ПЦР-

рРНК-

БАД-

ФГБУ-НЦЭСМП

ВКПМ ФГУП

«ГосНИИ

генетика»

ВКМ ИБФМ -РАН

ГК

лактобацилл-ФБУН

ННИИЭМ им. академика И.Н Блохиной ГКНМ ФБУН МНИИЭМ имени

Габричевского

СПИСОК ОСНОВНЫХ СОКРАЩЕНИЙ

желудочно-кишечный тракт патогенные микроорганизмы

условно-патогенные (оппортунистические) микроорганизмы система управления базой данных колониеобразующая единица в грамме субстрата муниципальное лечебно-профилактическое учреждение воспалительные заболевания органов малого таза детская городская клиническая больница городская клиническая больница детское общеобразовательное учреждение Нижегородский областной клинический противотуберкулезный диспансер полимеразная цепная реакция рибосомная РНК биологически активные добавки

ФГБУ «Научный центр экспертизы средств медицинского применения»

Всероссийская коллекция промышленных микроорганизмов ФГУП «Государственный научно-исследовательский институт генетики и селекции промышленных микроорганизмов»

Всероссийская коллекция микроорганизмов ФГБУ «Институт биохимии и физиологии микроорганизмов им. Г.К. Скрябина» Российской академии наук

Государственная коллекция лактобацилл ФБУН «Нижегородский научно-исследовательский НИИ

эпидемиологии и микробиологии им. академика И.Н. Блохиной» Роспотребнадзора

Государственная коллекция микроорганизмов -представителей нормальной микрофлоры человека и животных ФБУН «Московский НИИ эпидемиологии и микробиологии имени Г.Н. Габричевского» Роспотребнадзора

Введение диссертации (часть автореферата) на тему «Микроэкологические основы коррекции "дисбиозной" микробиоты человека»

ВВЕДЕНИЕ

Актуальность работы. Изучение микробной эндоэкологии человека (микроэкологии) относится к одному из наиболее актуальных направлений прикладных и фундаментальных исследований в области экологии, биологии, и медицины. Это связано с важной ролью, которую играет микробиота в жизнедеятельности макроорганизма, а также с повсеместно наблюдаемыми изменениями экологии микроорганизмов, повлекшими нарастание удельного веса заболеваний, вызываемых т.н. микробами-оппортунистами. В связи с этим большой интерес представляет изучение видового разнообразия и структуры сообщества симбиотических микроорганизмов человека. В организме человека наибольшим видовым богатством характеризуется микробное сообщество толстой кишки. Известно, что нет ни одной функции макроорганизма, на которую прямо или косвенно не влиял бы микробиоценоз этого биотопа (Ткаченко, 2009).

Следует отметить, что, несмотря на большое количество работ, посвященных микробиоценозам кишечника, изучением качественного и количественного состава микрофлоры толстой кишки у «здоровых» людей различных возрастных групп занималось не так много исследователей, а выбранные группы «здоровых» были довольно малочисленны. Это обусловлено тем, что понятие «здоровье» не имеет четкого определения и носит, скорее, философский характер, в связи с чем затруднительно формировать группы «действительно здоровых» людей для определения «нормальных» показателей микрофлоры (Перетц, 1955; Геймберг, 1964; Гончарова, Вилыпанская, 1968; Ленцнер, 1968; Лизько, 1970; Марко, 1970; Куваева, 1976; Эпштейн-Литвак, Вилыпанская, 1977; Козлова, 1978; Наепе1, 1970). Другой аспект этой темы сводится к частным вопросам: частоте обнаружения того или иного вида микроорганизмов в микробиоте, микрофлоре определенных возрастных групп при различной патологии и т.п., обобщенных в ОСТ 91500.11.0004-2003 «Протокол ведения больных. Дисбактериоз кишечника».

В настоящее время появились новые доступные высокотехнологичные методы исследований, позволяющие более подробно изучать видовую структуру симбиотических сообществ микробиоты организма человека. Современные информационные технологии дают возможность структурировать обширные базы данных, оценивать как множество единичных признаков, так и их совокупность в многомерном пространстве показателей, проводить статистический и экологический анализ. В частности, экологический анализ успешно применен при изучении эндоэкологии симбиотических сообществ микробиоценозов миндалин человека (Бухарин и др., 2011). Однако, масштабные исследования видовой структуры симбиотических сообществ микробиоценозов толстой кишки человека до настоящего времени не проводились. Поэтому актуальным вопросом является изучение закономерностей, управляющих динамикой численности популяций микроорганизмов в составе микробиоты, ее пространственной и видовой структурой, изучение разнообразных типов межпопуляционных отношений, обеспечивающее образование сообществ, как систем с относительно стабильным видовым составом. Понимание и теоретическое осмысление экологических закономерностей функционирования симбиотической микрофлоры является необходимой предпосылкой для развития и совершенствования способов влияния на ее формирование и нормализацию с помощью различных форм пробиотиков из представителей резидентной микрофлоры. Однако, широкое распространение дисбиотических нарушений ставит на повестку дня важность разработки методов комплексной коррекции микробиоты, направленных не только на восстановление эволюционно обусловленных микробных популяций но и обеспечивающих воздействие на макроорганизм в целом.

Цель работы: на основании изучения экологических закономерностей формирования сообществ симбиотических микроорганизмов толстой кишки «здоровых» и «больных» людей разных возрастных групп, проживающих на территории крупного промышленного мегаполиса, создать новые пробиотики в форме бактериальных концентратов, восстанавливающие эволюционно обусловленную микробиоту человека.

Задачи исследования:

1. Изучить видовую структуру сообществ симбиотических микроорганизмов толстой кишки «здоровых» и «больных» людей разных возрастных групп (от периода новорожденности до старости), проживающих на территории города Нижнего Новгорода.

2. Провести выбор параметров оценки состояния микробиоценозов толстой кишки

3. Создать базу данных результатов исследования качественного и количественного состава микрофлоры толстой кишки больных и здоровых людей разных возрастных групп, и систему управления базой данных для сбора, хранения, статистической обработки и графического представления данных.

4. На основе анализа результатов структурирования базы данных произвести отбор видов микроорганизмов, перспективных в качестве стартерных культур пробиотиков.

5. Изучить биологические и молекулярно-генетические свойства микроорганизмов продуцентов пробиотиков с целью подбора производственно перспективных штаммов.

6. Сконструировать новые пробиотики для коррекции микробиоты человека и отработать технологии их производств.

7. Оценить эффективность введения новых пробиотиков в комплексы профилактических, лечебно-оздоровительных и реабилитационных мероприятий у разных возрастных групп населения с различными

нозологическими формами заболеваний, протекающих на фоне «дисбиозной» микробиоты.

8. Разработать алгоритмы комплексной коррекции микробиоты желудочно-кишечного тракта разных возрастных групп населения.

Научная новизна. Впервые создана база данных результатов бактериологических исследований качественного и количественного состава микрофлоры толстой кишки «здоровых» и «больных» людей разных возрастных групп, проживающих на территории г. Нижнего Новгорода, и система управления базой данных, позволившая провести синэкологический анализ сообществ симбиотических микроорганизмов (Свидетельство о госрегистрации № 2011614233 РФ). Доказано, что в процессе формирования микрофлоры кишечника человека участвуют как аэробные, так и анаэробные микроорганизмы, причем в равных соотношениях с первого часа жизни, процесс нарастания анаэробной компоненты (представители родов Lactobacillus, Lactococcus и Bifidobacterium) идет параллельно с ростом условно-патогенных микроорганизмов и кишечной палочки, минуя стадию «трансформации». С наибольшей частотой 92% оппортунистические микроорганизмы в значимых количествах (> 105 КОЕ/г) выделяются в группе «здоровых» детей в возрасте от одного месяца до года. Частота обнаружения УПМ в микрофлоре толстой кишки здорового человека начинает снижаться после первого года жизни и составляет 18% в возрастной группе 60 лет и старше. Доказано, что общее количество симбиотических микроорганизмов различных видов, выделяемых из толстой кишки «здоровых» людей во всех возрастных группах, на один-два порядка выше, чем у больных (р<0,05), за исключением группы 60 лет и старше.

Впервые на основе гнездовой ПЦР гена 16S рРНК разработана методика индикации и идентификации симбиотических видов бактерий родов Lactobacillus и Bifidobacterium и алгоритм контроля динамики роста стартерных культур при совместном периодическом и непрерывном культивировании (патент РФ № 2375459, 2008).

Впервые выявлен феномен симбиоза по типу мутуализма двух штаммов Ь. р1ап1ашт 8 11А-3 и Ь. fermentum 39, обуславливающий более высокую анти-микотическую активность штаммов, выращенных в совместной культуре, чем при монокультивированиии (Патент РФ №2280465, 2004).

В результате углубленного изучения биологических свойств штаммов -продуцентов впервые создан ряд гипоаллергенных жидких сим- и синбиотиков на основе гидролизатов белка: «ЬЬ-комплекс», «ЬВ-комплекс» и «ЬВ-комплекс 8» (Патент РФ №2280465, 2004; патент РФ №2192269, 2000 г), причем микробный консорциум стартерных культур подобран с учетом хромосомно опосредованной резистентности отдельных штаммов к антибиотикам 14 фармакологических групп, наиболее часто используемых в клинической практике, что делает возможным применение пробиотиков на фоне антибактериальных препаратов в комплексной терапии различных нозологических форм заболеваний.

Впервые разработан алгоритм коррекции дисбиоза желудочно-кишечного и репродуктивного трактов человека, осложняющего течение основного заболевания. Сформулированы основные направления комплекса мероприятий, направленных на коррекцию нарушений видовой структуры и восстановление численности популяции симбиотической резидентной микрофлоры (патент РФ №2193398, 2002).

Научно-практическая значимость работы. В ходе выполнения работы получены новые знания о формировании симбиотической микробиоты желудочно-кишечного тракта человека, выявлены возрастные особенности качественного и количественного состава микрофлоры толстой кишки «здоровых» людей, проживающих на территории мегаполиса. Полученные данные о формировании и особенностях микрофлоры людей разных возрастных групп при различных функциональных состояниях могут быть использованы для коррекции существующих критериев оценки состояния микробиоценозов человека.

Результаты работы востребованы научными, учебными, лечебно-профилактическими учреждениями и организациями медико-биологического профиля. Полученные теоретические данные используются в учебном процессе на кафедре профилактической медицины ФПКВ ГБОУ ВПО «Нижегородской медицинской академии» Минздрава РФ в циклах усовершенствования и повышения квалификации врачей.

В результате изучения комплекса биологических и молекулярно-генетических свойств культур лакто- и бифидобактерий отобраны штаммы-продуценты пробиотиков и использованы в качестве стартерных культур во вновь разработанных жидких сим- и синбиотиках «ЬЬ-комплекс», «ЬВ-комплекс», «ЬВ-комплекс 8». Разработаны технологии, оформлены пакеты нормативно-технической документации и создано производство. Алгоритм комплексной коррекции микробиоты с включением в качестве пробиотической составляющей диетотерапии новых жидких бактериальных концентратов используется в девяти лечебно-профилактических учреждениях г. Н. Новгорода в программах лечения больных с различными нозологическими формами заболеваний, осложненных дисбиозом.

Утверждены и используются на местном уровне методические рекомендации «Совершенствование санитарно-эпидемиологического надзора в акушерско-педиатрических стационарах с целью снижения младенческой заболеваемости», 1999г. и пособие для врачей «Использование бактериальных препаратов и продуктов лечебного питания», 2000 г.

Положения, выносимые на защиту:

1. В период постнатального онтогенеза здорового человека (0-60 лет) происходят статистически значимые изменения видовой структуры микрофлоры толстой кишки, характерные для определенных возрастных групп, требующие для правильной оценки состояния микрофлоры подразделение каждой из крупных возрастных групп (0-1 год и 1год - 60 лет по ОСТ 91500.11.0004-2003) минимум на 3 подгруппы: 24 часа - 6 суток, 7 -29 суток, 1-11 месяцев и 1год - 6 лет, 7-17 лет, 18-60 лет.

2. В процессе формирования микрофлоры кишечника человека, начиная с первого часа жизни, в равных соотношениях участвуют как аэробные (E.coli, Enterococcus spp., УПМ семейств Staphylococcaceae, Enterobacteriaceae), так и анаэробные микроорганизмы (Bifidobacterium spp., Lactobacillus spp., L.lactis), минуя стадию «трансформации».

3. С наибольшей частотой оппортунистические микроорганизмы в значимых количествах (> 105 КОЕ/г) выделяются у «здоровых» детей в возрастной группе 1-11 месяцев с последующим резким снижением в возрасте от года до 17 лет, с дальнейшим сохранением стабильно невысокой частоты выделения у взрослых.

4. Численность бактерий родов Lactobacillus и Bifidobacterium, а также Е. coli, Enterococcus spp., S.epidremidis, S. aureus, Klebsiella spp., Citrobacter spp., Proteus spp., Enterobacter spp. относится к «информационно-значимым показателям», поскольку их численность статистически значимо различается у «здоровых» и «больных» людей одного возраста и между возрастными группами, что позволяет верифицировать классификационные решения по разделению пациентов на категории «здоровые» и «больные» с учетом возраста в многомерном пространстве показателей.

5. Видовая структура сообществ симбиотических микроорганизмов толстой кишки человека, представленных фиксированным набором клинически значимых культивируемых видов, может быть описана в рамках экологического анализа при помощи канонических индексов и показателей экологического разнообразия, что свидетельствует о применимости положений современной теоретической экологии к характеристике микробиоценозов макроорганизма.

6. Выявлен феномен усиления антагонистической активности по отношению к грибам вида С. albicans совместно выращенной композиции штаммов лактобацилл L.plantarum 8RA-3 и L. fermentum 39 по сравнению с их аксеничными культурами.

7. Для контроля динамики роста стартерных культур при совместном периодическом и непрерывном культивировании целесообразно использовать метод индикации и идентификации симбиотических видов бактерий рода Lactobacillus и Bifidobacterium на основе гнездовой ПЦР гена 16S рРНК.

8. Высокая эффективность дополнения базовой терапии различных нозологических форм заболеваний, осложненных дисбиозами, новыми жидкими мультиштаммовыми пробиотиками из лакто- и бифидобактерий доказывает лидирующее значение последних в обеспечении образования сообществ как систем с относительно стабильным видовым составом у людей разного возраста.

Апробация работы и публикации. Основные положения диссертации доложены на всероссийской конференции с международным участием «Пробиотики и пробиотические продукты в профилактике и лечении наиболее распространенных заболеваний человека» (г. Москва, 1999); всероссийской научно-практической конференции с международным участием «Гигиена детей и подростков на пороге третьего тысячелетия. Основные направления развития» (г. Москва, 1999); IV международном симпозиуме «Биологически активные добавки к пище: XXI век (г. Москва, 2000); международной конференции, посвященной памяти академика РАМН и АМТН И.Н.Блохиной (г. Москва, 2001); 1-м всероссийском конгрессе «Современные технологии в педиатрии и детской хирургии» (г. Москва, 2002); XI Российском национальном конгрессе «Человек и лекарство», г. Москва, 19-23 апреля, 2004г.; Международной конференция «Пробиотики, пребиотики, синбиотики и функциональные продукты питания. Современное состояние и перспективы». Форум «Новые технологии. Экология и здоровье», г. Москва, 2-4 июня, 2004.; III съезде Всероссийского общества биотехнологов России, г. Москва, 25-27.10.2005.; 6-м съезде научного общества гастроэнтерологов России, г. Москва, 1-3 февраля 2006; 4-м съезде биотехнологов России, г. Пущино. 5-7.12.2006; Международном конгрессе

«Пробиотики, пребиотики, синбиотики и функциональные продукты питания. Фундаментальные и клинические аспекты», г.Санкт-Петербург, 1518.05 2007; Международном форуме «Современные технологии на службе охраны здоровья россиян» в рамках выставки «Медицина^-», г. Нижний Новгород, 27.04.2010; круглом столе в рамках конференции, посвященной долгожителям Грузии в Сендайском университете (г.Сендай, Япония), 24.07.2010; конференции Японского общества по молочнокислым бактериям (г.Сендай, Япония), 26-27.07.2010; кафедре микробиологии университета Киорин (Токио), 28.07.2010; международной конференции «Пробиотики и здоровье», г. Ереван, Армения, 05-07.10.2010; Международная конференция «Пробиотики и бактериофаги как альтернатива антибиотиков», Тбилиси, Грузия, 29.06.-04.07.2012; Научно-практический конгресс с международным участием «Актуальные вопросы детской гастроэнтерологии», Киев, 28-29 ноября 2012; на XIV Международном медицинском форуме «Технологии профилактики - современный путь развития здравоохранения» 28-30 мая 2013 мая г. Н. Новгород.

По материалам диссертации опубликовано 53 работы, из них 28 в изданиях, рекомендованных ВАК.

Структура и объем диссертации. Диссертационная работа состоит из введения, 7 глав, заключения, выводов, списка цитированной литературы и приложения. Диссертация иллюстрирована 123 рисунками и 63 таблицами. Основной текст изложен на 396 страницах. Библиографический указатель включает 373 источника литературы (282 отечественных и 91 иностранных).

Заключение диссертации по теме «Экология (по отраслям)», Соловьева, Ирина Владленовна

выводы

1. Показано, что в процессе формирования микрофлоры кишечника человека участвуют как аэробные, так и анаэробные микроорганизмы, причем в равных соотношениях с первого часа жизни, процесс нарастания анаэробной компоненты (представители родов Lactobacillus, Lactococcus и Bifidobacterium) идет параллельно с ростом условно-патогенных микроорганизмов, E.coli и бактерий рода Enterococcus, минуя стадию «трансформации», что подтверждено результатами синэкологического анализа базы данных видового состава симбиотических микроорганизмов толстой кишки проведенного с использованием разработанной программы для ЭВМ «Автоматизированная система микробиологического мониторинга микробиоценозов желудочно-кишечного тракта (ЖКТ)».

2. Установлено, что с наибольшей частотой - в 92% случаев -оппортунистические микроорганизмы в значимых количествах (> 105 КОЕ/г) выделяются в группе «здоровых» детей в возрасте от одного месяца до года. Частота обнаружения УПМ в микрофлоре толстой кишки здорового человека начинает снижаться после первого года жизни, и составляет 18% в возрастной группе 60 лет и старше. Доказано, что суммарная численность сообществ симбиотических микроорганизмов, выделяемых из толстой кишки здоровых людей во всех возрастных группах на один - два порядка выше, чем у больных (р<0,05) за исключением группы 60 лет и старше.

3. Доказано, что все экологические законы и зависимости, свойственные другим природным биотопам и популяциям, справедливы и в отношении микробиоты человека. Кроме того, все выявленные закономерности, характерные для части микробного сообщества микрофлоры толстой кишки, представленной фиксированным набором 29 показателей, учитывающих количества различных видов микроорганизмов в одном грамме субстрата, сохраняются и развиваются также и для популяции в целом.

4. Выявлено, что количество бактерий родов Lactobacillus и Bifidobacterium, а также Е. coli, Enterococcus spp, S.epidremidis, S. aureus, Klebsiella spp., Citrobacter spp., Proteus spp., Enterobacter spp. относится к «информационно-значимым показателям», то есть их численность статистически значимо различается у здоровых и больных людей одного возраста и между возрастными группами, что позволяет верифицировать классификационные решения по разделению пациентов на категории «здоровые» и «больные» с учетом возраста в многомерном пространстве показателей.

5. Разработан ряд новых жидких препаратов - сим- и синбиотиков из пробиотических микроорганизмов родов Lactobacillus и Bifidobacterium, что обусловлено их достоверно высокой значимостью и лидирующими позициями в численности сообществ симбиотических микроорганизмов здоровых людей всех возрастных групп (р<0,001).

6. Доказана необходимость использования в составе жидких мультиштаммовых пробиотиков консорциума биосовместимых культур с выраженной хромосомно опосредованной антибиотикорезистентностью, кислотоустойчивостью и высоким уровнем антагонизма по отношению к оппортунистическим и патогенным микроорганизмам, что подтверждается эффективностью применения пробиотиков на их основе в комплексных программах оздоровления и лечения заболеваний, отягощенных дисбиозом.

7. Выявлен феномен симбиоза по типу мутуализма двух штаммов L. plantarum 8 RA-3 и L. fermentum 39, обуславливающий более высокую противокандидозную активность штаммов, выращенных при совместном культивировании, что явилось основанием для создания нового синбиотика «LL-комплекс». Выраженное антимикотическое действие этого препарата подтверждается высокой эффективностью его применения в комплексной терапии заболеваний, осложненных дисбиозом с преимущественным выделением грибов вида Candida albicans.

8. Разработана методика валидации процесса контроля динамики роста стартерных культур с использованием гнездовой ПЦР гена 16S рРНК при совместном периодическом и непрерывном культивировании симбиотических видов бактерий рода Lactobacillus и Bifidobacterium.

ЗАКЛЮЧЕНИЕ

Обобщая изложенное в предшествующих главах, необходимо отметить, что вопрос изучения видового разнообразия микроорганизмов кишечника человека и коррекции дисбиозной микробиоты сохраняет актуальность по сей день и является предметом исследования для многих ученых, как в России, так и за рубежом. Тем не менее, многие аспекты данной проблемы еще не освещены.

В представленной работе проведен глубокий анализ качественного и количественного состава микрофлоры просвета толстой кишки 3268 человек, с использованием новых доступных информационных технологий, позволяющих рассматривать как отдельные показатели, так и их совокупность в многомерном пространстве данных.

Подробно рассмотрен и проиллюстрирован процесс формирования микрофлоры просвета толстой кишки у детей с первых часов жизни, а также особенности микробиоты в различных возрастных группах.

В ходе выполнения работы были определены критерии оценки состояния «здоровья» для каждой возрастной группы. Изучен качественный и количественный состав микрофлоры просвета толстой кишки и определены 29 показателей, характеризующих видовой состав симбиотических микроорганизмов толстой кишки человека. Затем была создана база данных результатов бактериологического исследования качественного и количественного состава микрофлоры просвета толстой кишки различных возрастных групп людей, проживающих на территории г. Нижнего Новгорода, и система управления базой данных (файл-серверная реляционная СУБД), позволяющая обрабатывать и систематизировать результаты бактериологических исследований из базы данных и проводить сравнение выборок по критериям Краскела-Уоллиса, Колмогорова-Смирнова и Манна-Уитни на уровне достоверности 0,05 (р<0,05), а также строить ЗО диаграммы, в том числе ранговые распределения, с помощью которых был проведен синэкологнческий анализ видовых сообществ симбиотических микроорганизмов.

В результате проведенных исследований показано, что в процессе формирования микрофлоры кишечника человека участвуют как аэробные, так и анаэробные микроорганизмы, причем в равных соотношениях с первого часа жизни, процесс нарастания анаэробной компоненты (представители родов Lactobacillus, Lactococcus и Bifidobacterium) идет параллельно с ростом условно-патогенных микроорганизмов, E.coli и бактерий рода Enterococcus, минуя стадию «трансформации», что подтверждено результатами синэкологического анализа базы данных видового состава симбиотических микроорганизмов толстой кишки проведенного с использованием разработанной программы для ЭВМ «Автоматизированная система микробиологического мониторинга микробиоценозов желудочно-кишечного тракта (ЖКТ)».

Установлено, что в периоде постнатального онтогенеза здорового человека (0-60 лет) происходят статистически значимые изменения видовой структуры микрофлоры толстой кишки, характерные для определенных возрастных групп, требующие для правильной оценки состояния микрофлоры подразделение каждой из крупных возрастных групп (0-11 месяцев и 1год - 60 лет) минимум на 3 подгруппы: 24 часа - 6 суток, 7-29 суток, 1-11 месяцев и 1год - 6 лет, 7-17 лет, 18-60 лет.

Показано, что с наибольшей частотой - в 92% случаев -оппортунистические микроорганизмы в значимых количествах (> 105 КОЕ/г) выделяются в группе «здоровых» детей в возрасте от одного месяца до года. Частота обнаружения УПМ в микрофлоре толстой кишки здорового человека начинает снижаться после первого года жизни, и составляет 18% в возрастной группе 60 лет и старше. Доказано, что суммарная численность сообществ симбиотических микроорганизмов, выделяемых из толстой кишки здоровых людей во всех возрастных группах на один - два порядка выше, чем у больных (р<0,05) за исключением группы 60 лет и старше.

333

Построены ранговые распределения видовой структуры сообществ симбиотических микроорганизмов. Ранговые профили с сохранением порядка показателей «референс» группы для последующих групп сравнения наглядно демонстрируют перестройку сообществ симбиотических микроорганизмов толстой кишки. Использование ранговых профилей позволило выявить как выпадение и появление новых видов микроорганизмов в группах сравнения (качественный аспект) так и изменение их численностей (количественный аспект). Кластерный анализ общей матрицы данных позволил разделить большой объем данных на два крупных кластера соответствующих группам «здоровые» и «больные». Метод K-средних подтвердил результаты, полученные многомерным кластерным анализом.

Было доказано, что в период постнатального онтогенеза здорового человека (0-60 лет) происходят статистически значимые изменения видовой структуры микрофлоры толстой кишки, характерные для определенных возрастных групп, требующие для правильной оценки состояния микрофлоры подразделение каждой из крупных возрастных групп (0-1 год и 1год - 60 лет по ОСТ 91500.11.0004-2003) минимум на 3 подгруппы: 24 часа - 6 суток, 7 -29 суток, 1-11 месяцев и 1год - 6 лет, 7-17 лет, 18-60 лет.

С использованием критериев Манна-Уитни и Крускала-Уолиса в каждой возрастной группе пациентов были выявлены «информационно значимые показатели» - виды микроорганизмов, которые статистически значимо различались по численности между здоровыми и больными людьми.

Установлено, что количество бактерий родов Lactobacillus и

Bifidobacterium, а также Е. coli, Enterococcus spp, S.epidremidis, S. aureus,

Klebsiella spp., Citrobacter spp., Proteus spp., Enterobacter spp. относится к информационно-значимым показателям», то есть их численность статистически значимо различается у здоровых и больных людей одного возраста и между возрастными группами, что позволяет верифицировать классификационные решения по разделению пациентов на категории

334 здоровые» и «больные» с учетом возраста в многомерном пространстве показателей.

Для количественного описания видового разнообразия сообществ симбиотических микроорганизмов толстой кишки человека проведены расчеты с использованием общепринятых в экологии индексов: видового разнообразия Шеннона, доминирования Симпсона, видового богатства Маргалефа и выравненное™ Пиелу. Для подтверждения сделанных обобщений и получения статистически корректных оценок различий (t-критерий Стьюдента) в видовом разнообразии микрофлоры толстой кишки разновозрастных групп здоровых и больных людей, был применен индекс Шеннона, для которого разработаны соответствующие алгоритмы. Доказано, что все экологические законы и зависимости, свойственные другим природным биотопам и популяциям, справедливы и в отношении микробиоты человека. Кроме того, все выявленные закономерности, характерные для части микробного сообщества микрофлоры толстой кишки, представленной фиксированным набором 29 показателей, учитывающих количества различных видов микроорганизмов в одном грамме субстрата, сохраняются и развиваются также и для популяции в целом.

Доказана достоверно высокая значимость (р<0,001) и лидирующие позиции в численности сообществ симбиотических микроорганизмов здоровых людей всех возрастных групп бактерий родов Lactobacillus и Bifidobacterium, что и обосновало проведение работ по отбору пробиотических штаммов именно из этих родов микроорганизмов.

Штаммы пробиотических микроорганизмов были изучены в соответствии с МУ 2.3.2.2789-10 «Методические указания по санитарно-эпидемиологической оценке безопасности и функционального потенциала пробиотических микроорганизмов, используемых для производства пищевых продуктов».

Определены нуклеотидные последовательности фрагмента гена 16S рРНК отобранных штаммов, полученные последовательности депонированы

335 в международной базе данных GenBank/EMBL, отобран консорциум биосовместимых культур L.plantarum 8RA-3, L.fermentum 39, L. fermentum 90 TC-4, В. bifidum 1, В. bifidum 791, В. longum 379 (патент РФ № 2192269; патент РФ № 2441907) причем установлено, что выбранные штаммы обладают относительно высоким уровнем кислотоустойчивости.

Консорциум выбранных штаммов устойчив к действию антибактериальных препаратов 14 фармакологических групп, (штаммы в отдельности обладают различными уровнями чувствительности к антибиотикам, но всегда есть штамм с хромосомно опосредованной резистентностью к определенному препарату).

Выявлен феномен усиления антагонистической активности по отношению к грибам вида С. albicans совместно выращенной композиции штаммов лактобацилл L.plantarum 8RA-3 и L.fermentum 39 по сравнению с их аксеничными культурами (патент РФ № 2280465, 2004).

Создана универсальная методика индикации и точной идентификации лактобацилл и бифидобактерий на основе гнездовой мультиплексной ПЦР и системы специально подобранных олигонуклеотидных праймеров (патент РФ № 2375459, 2009).

Разработана методика валидации процесса контроля динамики роста стартерных культур на основе гнездовой ПЦР гена 16S рРНК при совместном, периодическом и непрерывном культивировании симбиотических видов бактерий рода Lactobacillus и Bifidobacterium и доказана целесообразность ее использования в производстве.

Сконструированы питательные основы, в качестве полупродукта которых использован гидролизат белка, обеспечивающие одинаково высокий выход биомассы штаммов-продуцентов родов Lactobacillus и Bifidobacterium, их жизнеспособность и активность в течение длительного времени (не менее 60 суток), а также сохранность и накопление ценных метаболитов

Полученные на предыдущем этапе исследований результаты позволили создать три новых жидких пробиотика в форме БАД к пище: «LB-комплекс»,

336

ЬЬ-комплекс» и «ЬВ-комплекс 8». Разработана промышленная технология ихпроизводства, оформлена и утверждена на Федеральном уровне технологическая документация.

В ходе выполнения данной работы был создан алгоритм комплексной коррекции дисбиозов с использованием вновь сконструированных пробиотиков (патент РФ №2193398 , 2000; № 2184558, 2000).

Опыт использования новых жидких пробиотиков в форме БАД к пище в алгоритме комплексной коррекции дисбиозов, осложняющих течение различных нозологичеких форм заболеваний, показал их выраженную эффективность в 22 ЛПУ г. Нижнего Новгорода. Улучшилось общее состояние микрофлоры пациентов, зафиксировано снижение количества и частоты выделения оппортунистических микроорганизмов, восстановление основного компонента нормальной микрофлоры - бифидо- и лактобактерий, отмечено более быстрое купирование клинических проявлений основных заболеваний по сравнению с контрольными группами, снизилось количество осложнений токсического и токсико-аллергического характера после базовой терапии. Во всех случаях отмечена хорошая переносимость новых жидких пробиотиков, полное отсутствие каких-либо побочных эффектов.

Также препараты успешно применялись в программах оздоровительно-реабилитационных мероприятий в 14 ДОУ г. Нижнего Новгорода и в программе оздоровления студентов НижГМА.

Таким образом, высокая эффективность применения алгоритма комплексной коррекции дисбиозной микробиоты с использованием вновь созданных жидких многокомпонентных пробиотиков в программах оздоровления, лечения и реабилитации пациентов подтверждает теоретические закономерности, выявленные в результате проведенного синэкологического анализа видового разнообразия симбиотических сообществ микроорганизмов просвета толстой кишки человека.

Список литературы диссертационного исследования доктор биологических наук Соловьева, Ирина Владленовна, 2013 год

СПИСОК ЦИТИРОВАННОЙ ЛИТЕРАТУРЫ

1. Авалуева, Е.Б. Кандидозный дисбиоз и адгезивные свойства Candida spp. у пациентов с воспалительными заболеваниями кишечника / Е.Б. Авалуева, М.А. Шевяков, Ю.П. Успенский, Л.Ю. Нилова, Т.Н. Жигалова, М.А. Суворова, Н.В. Матвеева //Проблемы медицинской микологии. - 2010. - Т. 12, № 1.-С. 10-14.

2. Авдеев, В.Г. Применение пробиотиков и пребиотиков в гастроэнтерологии / В. Г. Авдеев // Врач. - 2008. -№ 3. - С. 24-27.

3. Алехина, Г.Г. Пробиотики - новый подход к старым проблемам / Г.Г.Алехина, А.Н.Суворов // Успехи современного естествознания. - 2007. - № 6. - С. 36-39.

4. Алешкин, A.B. Поликомпонентые пробиотические препараты -конструирование, производство и стратегия их продвижения на Российском фармацевтическом рынке: Автореф. дис...докт. биол. наук. / A.B. Алешкин -М„ 2011, - 47 с.

5. Амерханова, A.M. Новые биопрепараты-синбиотики и их использование в неонатологии с профилактической целью / A.M. Амерханова, Л.П. Пономарева, A.C. Анкирская, O.E. Бондарь, С.А. Лисунова, С.А. Фурсова, О.Г. Жиленкова, Е.С. Зубкова, A.A. Кураленко // Вопросы детской диетологии. - 2006а. -Т. 4, № 6. - С. 66-69.

6. Амерханова, A.M. Принципы конструирования препаратов-синбиотиков и оценка их клинической эффективности / A.M. Амерханова, В.А. Алешкин, Н.М. Грачева, М.С. Петрова, О.Л. Попова, Е.С. Зубкова, О.Г. Жиленкова, A.A. Кураленко, А.И. Соловьева // Вестник Российской академии медицинских наук. - 2006b. -№ 6. - С. 38-44.

7. Амерханова, A.M. Научно-производственная разработка новых препаратов-синбиотиков: Автореф. дис... докт. биол. наук./ A.M. Амерханова - М., 2009. - 48 с.

8. Амерханова, A.M. Роль бифидофлоры в жизнеобеспечении организма ребенка и факторы, определяющие ее формирование / А.М.Амерханова, О.Л. Воронина, О.Г. Жиленкова, A.B. Алешкин, С.А. Лисунова, Е.С. Зубкова, A.A. Романова, М.Е. Субботина, М.С. Кунда // Вопросы детской диетологии. - 2010. - Т. 8, № 3. - С. 22-29.

9. Андреев, В.А. Медицинская микология / В.А. Андреев, А.В. Зачиняева, А.В. Москалев, В.Б. Сбойчаков - М.: ГЭОТАР - Медиа, 2008. - 208 с.

Ю.Аруин, Л.И. Морфологическая диагностика болезней желудка и кишечника / Л.И. Аруин, Л.Л. Капуллер, В.А. Исаков. - М.: «Триада-Х», 1998. - 496 с.

Н.Асташкина, А.П. Современные взгляды на биологическую роль бифидо- и лактобактерий /А.П. Асташкина // Вестник Воронежского государственного университета. Серия: Химия. Биология. Фармация. -2010.-№ 1.-С. 133-139.

12.Аутофлора человека в норме и патологии и ее коррекция: Респ. сб. под ред. И.Н. Блохиной, К.Я. Соколовой. - Горький: Мед. ин-т, 1988. - 144 с.

13.Афанасьев, М.С. Микробиотоп влагалища и его патогенетическая роль при уреоплазмозе и хламидиозе / М.С. Афанасьев, А.В. Караулов, В.А. Алешкин, Х.М. Галимзянов, С.С. Афанасьев, Е.А. Воропаева, Ю.В. Несвижский, Е.О. Рубальский, Е.А Егорова //Астраханский медицинский журнал.-2011.-Т. 6, № 1. - С. 139-144.

14.Ашбель, 3.3. Вопросы гигиены труда и состояния здоровья рабочих при промышленном применении ультразвука: Автореф. дисс...канд. мед. наук./ 3.3. Ашбель - Горький, 1965. - 22 с.

15.Баженов, Л.Г. Изучение антагонистического действия лактобацилл на Helicobacter pylori / Л.Г. Баженов, В.М. Бондаренко, Е.А. Лыкова // Журн. микробиол., эпидемиол. и иммунобиол. - 1997. - №3. - С.89-91.

16.Банержи, А. Медицинская статистика понятным языком: вводный курс / пер. с англ. под ред. В.П. Леонова / А. Банержи. - М.: Практическая медицина, 2007. - 287 с.

17.Баранов, А.А. Лизоцим: теория и практика. / А.А. Баранов, В.Г. Дорофейчук - НижнийНовгород: Информатик,1999. - 126 с.

18.Бельмер, С.В. Становление кишечного микробиоценоза у детей первого года жизни и пути его коррекции /С.В. Бельмер, Л.М. Карпина //Вопросы современной педиатрии. - 2010. - Т. 9, № 4. - С. 138-142.

19.Бифидобактерии и их использование в клинике, медицинской промышленности и сельском хозяйстве: Сборник науч. трудов. М.:1986. -207 с.

20.Блажевич, О. В. Культивирование клеток: Курс лекций / О. В. Блажевич -Мн.:БГУ, 2004.-78 с.

21.Блохина, И.Н. Дисбактериозы / И.Н. Блохина, В.Г. Дорофейчук - М.: Медицина. - 1979. - 175 с.

22.Блюгер, А.Ф. Клиническое значение количественного состава анаэробной и аэробной флоры микрофлоры кишечника при кишечных заболеваниях / А.Ф. Блюгер, Р.Я. Паберза, И.Н. Новицкий: Методические рекомендации -Рига, 1981.-9 с.

23.Большая советская энциклопедия. М.: Сов. Энциклопедия, 1972. - Т.9. -624 с.

24.Бондаренко, В.М. Дисбактериозы желудочно-кишечного тракта / В.М. Бондаренко., Б.В. Боев, Е.А. Лыкова // Росс. Журн. гастроэнтерол., гепатол. и колопроктол. - 1998. - №1. - С. 66-70.

25.Бондаренко В.М., Пробиотики, пребиотики и синбиотики в терапии и профилактике кишечных дисбиозов / В.М. Бондаренко, Н.М. Грачева //Фарматека. - 2003. - № 7. -С. 56-63.

26.Бондаренко, В.М. Метаболитные пробиотики: механизмы терапевтического эффекта при микроэкологических нарушениях / В.М. Бондаренко//Соп8Шит тесйсит. -2005. -Т. 7, № 6. - С. 437-443.

27.Бондаренко, В.М. Стабилизирующее действие метаболитного пробиотика Хилак форте на нормальную микрофлору кишечника / В.М. Бондаренко//Фарматека. - 2005. - № 1. - С. 36-43.

28.Бондаренко, В.М. Роль условно-патоогенных бактерий кишечника в полиорганной патологии человека / В.М. Бондаренко - М. - Тверь: ООО «Издательство «Триада», 2007. - 64 с.

29.Бондаренко, В.М. Дисбактериоз кишечника как клинико-лабораторный синдром: современное состояние проблемы / В.М. Бондаренко, Т.Н. Мацулевич - ГЭОТАР-Медиа, 2007. - 304 с.

30. Бондаренко, В.М., Клинический эффект жидких симбиотических биокомплексов, содержащих физиологически активные клетки бифидобактерий и лактобацилл / В.М. Бондаренко, Л.И. Шапошникова- М. - Тверь: ООО «Издательство «Триада», 2007. - 95 с.

31. Бондаренко, В.М. Идеи Мечникова и современная микроэкология кишечника человека / В.М. Бондаренко, В.Г. Лиходед // Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии. - 2008, № 5. - С. 23-29

32. Боровик, Т.Э. Лечебное питание при пищевой непереносимости у детей / Т.Э. Боровик, К.С. Ладодо, Н.Н. Семенова, Е.А. Рославцева, А.В. Сирота,

B.И. Круглик //Педиатрия. Журнал им. Г.Н. Сперанского. - 1997. - № 1. -

C. 20.

33.Боровик, Т.Э. Использование специализированных продуктов на основе гидролизатов белка в питании детей с пищевой непереносимостью / Т.Э. Боровик, Е.А. Рославцева, И.В. Гмошинский, Н.Н. Семенова, В.А. Скворцова, С.Г. Макарова, Е.В. Ерпулева // Аллергология. - 2001. - № 2. -С. 38-42.

34. Боровик, Т.Э. Использование белковых гидролизатов в практике педиатра / Т.Э. Боровик, В.А. Ревякина // Аллергология. - 2004. - № 2. - С. 56-58.

35.Боровик, Т.Э. Национальная стратегия вскармливания детей первого года жизни в российской федерации. Организация прикорма / Т.Э. Боровик, К.С. Ладодо, Г.В. Яцык, В.А. Скворцова, И.Я. Конь // Практика педиатра. -2008,-№9.-С. 81-87.

36.Боровик, Т.Э. Роль смесей - гидролизатов белка в прифилактике и диетотерапии пищевой аллергии у детей раннего возраста / Т.Э. Боровик, С.Г. Макарова, С.Н. Дарчия, А.В. Гамалеева // Вопросы современной педиатрии.-2010.-Т. 9,№ 1.-С. 150-156.

37.Ботина, С.Г. Реклассификация отечественных пробиотических культур бактерий рода Lactobacillus / С.Г. Ботина, К.М. Климина, Н.В. Коробан, A.M. Амерханова, В.В. Зинченко, В.Н. Даниленко // Генетика. - 2010а. - Т. 46, № 11.-С. 1306-1313.

38.Ботина, С.Г. Генетическое разнообразие бактерий рода Lactobacillus из гастроинтестинальной микробиомы людей / С.Г. Ботина, Н.В. Коробан, К.М. Климина, А.А. Глазова, Н.В. Захаревич, В.В. Зинченко, В.Н. Даниленко // Генетика. - 2010b. -Т.46, №12. - С. 1589-159.

39.Ботина, С.Г. Генетическая идентификация антагонистически активных штаммов лактобацилл, выделенных из полости рта здоровых людей / С.Г. Ботина, Ю.В. Червинец, К.М. Климина, Н.В. Коробан, В.М. Червинец, О.А. Гаврилова, Д.В. Лебедев, А.Ю. Миронов // Клиническая лабораторная диагностика. - 2010с. - №11. - С. 43-46.

40.Ботина, С.Г. Молекулярно-биологические подходы к отбору бактериальных культур при создании заквасок для биотехнологии: Автореф. дис.. .докт. биол. наук. / С.Г. Ботина. - М., 2011. - 46 с.

41. Бочков, И.А. Состояние микрофлоры толстой кишки у детей раннего возраста (по материалам амбулаторных исследований) / И.А. Бочков, Л.П. Юрко, Н.М. Юдицкая // Инфекционные болезни. - 2004. - Т. 2, № 3. - С. 83-85.

42.Брилене, Т.А. Влияние половых гормонов на цитадгезию лактобацилл влагалища / Т.А. Брилене // Аутофлора человека в норме и патологии и ее коррекция. - Горький: ГМИ им. С.М. Кирова, 1988. - С. 59-64.

43.Булатова, Е.М. Пробиотки: клинические и диетологические аспекты применения / Е.М. Булатова, Н.М. Богданова, Е.А. Лобанова, Т.В. Габрусская //Педиатрия. Журнал им. Г.Н. Сперанского. - 2010. - Т. 89, № 3. -С. 84-91.

44.Бухарин, О.В. Межбактериальные взаимодействия / О.В. Бухарин, Б.Я. Усвяцова, Л.М. Хуснутдинова // ЖМЭИ. - 2003. - №4. - С. 3- 8.

45.Бухарин, О.В. Прогнозирование состояния микросимбиоценоза с помощью математического моделирования межмикробных взаимодействий / О.В. Бухарин, Б.Я. Усвяцов, Ю.А. Хлопко, A.M. Осипова // Экология человека. -2011. -№10. - С.59-64

46.Варичев, А.Н. Статитстический анализ видового состава сообществ симбиотических микроорганизмов биопленки толстого кишечника здоровых и больных людей различных возрастных групп / А.Н. Варичев, Д.Б. Гелашвили, И.В. Соловьева //Вестник Нижегородского университета им. Н.И. Лобачевского. - 2010. - № 2. - С. 383-387.

47.Вахитов, Т.Я. Динамика и функции экзометаболитов в процессе роста периодической культуры Escherichia coli М-17 / Т.Я. Вахитов, E.H. Момот, Ю.Н. Толпаров // ЖМЭИ. - 2005. - №1. - С. 16-21.

48.Вахитов, Т. Я. Регуляторные функции экзометаболитов бактерий / Т. Я. Вахитов, Л. Н. Петров // Микробиология. - 2006. -Т. 75, N 4. - С. 483-488.

49.Вельтищев, Ю.Е. Объективные показатели нормального развития и стстояния здоровья ребенка (нормативы детского возраста) / Ю.Е. Вельтищев, В.П. Ветров. - М.: 2000. - 96 с.

50. Воробьева, О.Н. Микробиологический мониторинг возбудителей внутрибольничных инфекций в отделении экстренной хирургии / О.Н. Воробьева, Л.И. Денисенко, Т.Н. Штанова, Л.М. Соседова // Бюллетень Восточно-Сибирского научного центра СО РАМН. - 2009. - № 4. - С. 6167.

51.Воробьев, A.A. Дисбактериозы - актуальные проблемы медицины / A.A. Воробьев, H.A. Абрамов, В.М. Бондаренко // Вестн. Росс. АМН. - 1997. -№ 3. - С. 4-7.

52.Воробьев, A.A. Микроэкологические нарушения при клинической патологии и их коррекция бифидосодержащими пробиотиками / A.A. Воробьев, В.М. Бондаренко, Е.А. Лыкова // Вестн. РАМН. - 2004. - №2. -С. 13-17.

53.Воронина, О.Л. Анализ видового разнообразия бифидофлоры и влияние синбиотика «Бифидум-мульти-1» на становление и развитие бифидобактерий у детей раннего возраста / О.Л. Воронина, М.С. Кунда, М.Е. Субботина, О.Г. Жиленкова, A.M. Амерханова, С.С. Афанасьев, В.А. Алешкин // Вопросы детской диетологии. - 2008. - Т. 6, № 5. - С. 59-64.

54. Воронина, О.Л. Мультилокусное секвенирование - информативный подоход молекулярной экологии / О.Л. Воронина, М.С. Кунда, В.Г. Лунин, А.Л. Гинцбург //Вестник Московского университета. Серия 16: Биология. -2010,-№4.-С. 7-10.

55.Галлямова, Ю.А. Атопический дерматит и дисбактериоз / Ю.А. Галлямова //Лечащий врач. - 2010. - № 10. - С. 14-17.

56.Геймберг, В.Г. Состав нормальной кишечной микрофлоры и влияние на нее некоторых антибактериальных препаратов/ в кн.: Вопросы гигиены питания/ В.Г. Геймберг, С.Я. Михлин, Л.И. Петрушина - М., 1964. - С. 90109.

57.Гелашвили, Д.Б. Эколого-экономический анализ экотоксикологической опасности промышленных предприятий города Н. Новгорода / Д.Б. Гелашвили, В.А. Басуров, Н.И. Ефимова (Зазнобина) // Экологический ежемесячник. - 2001. - №7(82). - С.22-25.

58.Гелашвили, Д.Б. Структурная организация и фрактальная природа макрозообентоса малых городских водоемов/ Д.Б. Гелашвили, Д.А.

Пухнаревич, Д.И. Иудин// Поволжский экологический журнал. - 2007. -№1. - С.1-15.

59.Гелашвили, Д.Б. Мультифрактальный анализ видовой структуры сообществ мелких млекопитающих Волго-Уральского палеоценоза / Д.Б. Гелашвили, А.И. Дмитриев, Д.И, Иудин, Г.С. Розенберг, JI.A. Солнцев //Докл. РАН. - 2008а. - Т. 421. - № 4. - С.562 - 566.

60. Гелашвили, Д.Б. Мультифрактальный анализ видовой структуры сообществ мелких млекопитающих Нижегородского Поволжья / Д.Б. Гелашвили, Д.И, Иудин, А.И. Дмитриев, В.Н. Якимов, Г.С. Розенберг, JI.A. Солнцев // Экология. - 2008b. - №6. - С.456-461.

61.Гелашвили, Д.Б. Видовая структура сообществ симбиотических микроорганизмов биопленки толстой кишки здоровых и больных детей разных возрастных групп / Д.Б. Гелашвили, А.Н. Варичев, И.В. Соловьева, J1.A. Солнцев // Экология человека. - 2011. - №6 - С. 55-60.

62.Гланц, С. Медико-биологическая статистика / С. Гланц. - М.: Практика, 1998.-459 с.

63.Глушанова, H.A. Биологические свойства лактобацилл / H.A. Глушанова // Бюллетень сибирской медицины. - 2003. - № 4. - с. 50-58.

64. Глушанова, H.A. Экспериментальное обоснование новых подходов к коррекции микробиоценоза кишечника: Автореф. дис. ... докт. мед. наук. /

H.A. Глушанова - Москва, 2005. - 56 с.

65.Глушанова, H.A. О биологической и антагонистической активности «сухого» и «жидкого» пробиотика «Наринэ»/ H.A. Глушанова, А.И. Блинов //Бюллетень Восточно-Сибирского научного центра СО РАМН. 2005. - №

I.-С. 148-153.

66.Глушкова, O.A. Роль биоценоза кишечника беременной женщины во внутриутробном инфицировании плода и пути его коррекции: Дис... канд. мед. наук. / O.A. Глушкова - Н. Новгород, 2000. - 202 с.

67.Глушкова, O.A. Взаимосвязь внутриутробного обсеменения новорожденных с дисбиотическим состоянием микрофлоры матери. / O.A. Глушкова, Е.Б. Талаева, Т.П. Колпакова // Актуальные проблемы абдоминальной патологии у детей: Материалы конференции. - М., 1995. -С. 31.

68.Головач, Т.Н. Опыт совместного культивирования лактобацилл / Т.Н. Головач // Микробиологический журнал. - 2004. - №6. - С.23-25.

69.Голосова, Т.В. Диагностика дисбактериоза кишечника и его коррекция биологическими препаратами у взрослых больных острыми лейкозами / Т.В. Голосова, Т.В. Толкачева: Методические рекомендации. - М., 1984. -16с.

70.Голошва, Е.В. Микроэкологические нарущения в составе нормальной микрофлоры кишечника у людей с лекарственным дисбактериозом / Е.В. Голошва // Известия высших учебных заведений. Северо-Кавказский регион. Серия: Естественные науки. - 2003. - № 2. - С. 87-89.

71.Гончар, Н.В Пробиотики в неонатологии / Н.В. Гончар //Бюллетень Федерального Центра сердца, крови и эндокринологии им. В.А. Алмазова. -2010,-№6.-С. 16.

72.Гончарова, Г.И. Бифидофлора человека, ее защитная роль в организме и обоснование сфер применения препарата бифидумбактерина: Автореф. дисс...д-ра. биол. наук. -М.,1982. - 38с.

73.Гончарова, Г.И. Частота обнаружения В. bifidum в испражнениях взрослых людей / Г.И. Гончарова, Ф.Л. Вилыианская //ЖМЭИ. - 1968. - №7 - С.55-59.

74.Горелов, A.B. Пробиотики: механизмы действия и эффективность при инфекциях желудочно-кишечного тракта / A.B. Горелов, Д.В. Усенко // Эпидемиология и инфекционные болезни. - 2006. - №4. - С.53 - 56.

75.Горская, Е.М. Адгезия микробов к эпителиальным клеткам кишечника // Антибиотики и микроэкология человека и животных / Е.М. Горская - М., 1998.-С. 79-82.

76. Грачева, Н.М. Комплексное применение препарата «Хилак форте» и антибиотиков и их действие на микрофлору кишечника / Н.М. Грачева, A.A. Аваков, А.Ф. Гаврилов // Новые лекарственные препараты: экспресс-информ. -2006. - Вып. 1. - С. 15-23.

77.Грачева, Н.М. Применение бактерийных биологических препаратов в практике лечения больных кишечными инфекциями. Диагностика и лечение дисбактериоза кишечника / Н.М. Грачева, Г.И. Гончарова: Методические рекомендации - М., 1986. - 24 с.

78.Грачева, Н.М. Дисбактериоз кишечника у взрослых / Н.М. Грачева, О.С. Партии, И.Т. Щербаков //Инфекционные болезни. - 2003. -Т. 1, № 1. - С. 34-38.

79.Гриневич, В.Б. Пребиотики как основа микробиоценоз-ориентированной терапии / В.Б. Гриневич, С.М. Захаренко, Е.И. Сас //Лечащий врач. - 2008. -№ 10.-С. 47-50.

80.Гришель, А.И. Пробиотики и их роль в современной медицине / А.И. Гришель, Е.П. Кишкурно // Вестник фармации. - 2009. - № 1(43). - С. 9093.

81.Гусейнова, H.A. Особенности микробиоценоза кишечника новорожденных, рожденных с помощью кесарева сечения: клиническая, микробиологическая, иммунологическая эффективность пробиотикотерапии, применяемой при кишечной дисфункции / H.A. Гусейнова // Врач-аспирант. - 2010. - Т. 43, № 6. - С. 203-207.

82.Дармов, И.В. Молекулярно-генетические характеристики штаммов лактобацилл, входящих в препарат «Билакт» / И.В. Дармов, И.В. Маракулин, С.Н. Янов, A.A. Воробьев, И.Н. Садовой, И.В. Парамонов, A.B. Ельшин, И.В. Рассанова // Материалы международной научно-практической конференции «Пробиотические микроорганизмы современное состояние вопроса и перспективы использования. - М., 2002. -С. 23.

83.Диагностика и биокоррекция нарушений антиинфекционного гомеостаза в системе «мать-дитя». - книга для практического врача. / под ред. проф. Ефимова Е.И., Соколовой К .Я. - Н. Новгород, НГМА, 2004. - 376 с.

84.Дисбиоз кишечника. Руководство по диагностике и лечению. / Под редакцией проф. Ткаченко Е.И., проф. Суворова А.Н. - СПб.: Спецлит, 2007. - 238с.

85.Дисбиоз кишечника. Руководство по диагностике и лечению. - 2-е изд., испр. и доп. / под ред. Е.И. Ткаченко, А.Н. Суворова. - СПб.: ИнформМед, 2009. - 276 с.

86.Домарадский, И.В. Противоречивая микроэкология / И.В. Домарадский, Т.Х. Хохоев, O.A. Кондракова // Росс. Химический журнал. - 2002. - Т.46, №3. - С.80-89.

87.Донецкая, Э.Г.А. Клиническая микробиология: Руководство для специалистов клинической лабораторной диагностики / Э.Г.А. Донецкая -М.: ГЭОТАР-Медиа, 2011. - 480с

88.Доронин, А.Ф. Функциональное питание / А.Ф. Доронин, Б.А. Шендеров -М.: Гранть, 2002.-296 с.

89.Егорова, Е.В. Грибковые и некоторые паразитарные заболевания женских половых органов - 2-е изд., перераб. и доп. / Е.В. Егорова, О.Б. Минскер -М.: Медицина, 1988. - 224 с.

90.Животовский, JI.A. Показатель внутрипопуляционного разнообразия / JI.A. Животовский // Журн.общ.биол. - 1980. - Т. 41, №6. - С 829-836.

91.Жиленкова, О.Г. Селекция производственно-перспективных штаммов бифидобактерий, выделенных от детей: Автореф. дис...канд. биол. наук. / О.Г. Жиленкова - М., 2011. - 30 с.

92.3авгородняя, Е.Ф. Количественно-качественный состав нормальной микрофлоры толстого отдела кишечника / Е.Ф. Завгородняя, //Дальневосточный журнал инфекционной патологии. - 2009. - № 14. - С. 140-145.

93.Захарова, И.Н. Современные пробиотики для коррекции микробиоценоза кишечника у детей / И.Н. Захарова, J1.H. Мазанкова, Ю.А. Дмитриева // Вопросы современной педиатрии. - 2009. - Т. 08, № 02 - С. 109-113.

94.3еленова, Е.Г. Микрофлора полости рта: норма и патология: Учебное пособие. / Е.Г. Зеленова, М.И. Заславская, Е.В. Салина, С.П. Рассанов. Нижний Новгород: Издательство НГМА, 2004. - 158 с.

95.Зорина, В.В. Модуляция клеток иммунной системы лактобактериями / В.В. Зорина, Т.Н. Николаева, В.М. Бондаренко // Журн. Микробиол., эпидемиол. и иммунобиол. - 2004. -№6. - С. 57-60.

96.Иванов, Д.В. Чувствительность к антибиотикам Pseudomonas aeruginosa, выделенным при внутрибольничных инфекциях / Д.В. Иванов // Эпидемиология и инфекционные болезни. - 2006. - № 5. - С. 32-36.

97.Ивашкин, В.Т. Местный иммунитет и микробиоценоз при заболеваниях кишечника / В.Т. Ивашкин, H.JI. Денисов // Российский журнал гастроэнтерологии, гепатологии, колопроктологии. - 2009. - Т. 19, № 6. -С. 11-16.

98. Ильин, B.K. Культуральные свойства бифидобактерий, лактобацилл и пекарских дрожжей под влиянием УФ-облучения воды, входящей в состав питательных сред / В.К. Ильин, С.С. Есиев, JI.B. Ракитская и др. // Сельскохозяйственная биология. - 2004. - № 2. - С. 98-10

99. Инструкция по микробиологическому контролю производства на предприятиях молочной промышленности, утвержденная Главным государственным санитарным врачом СССР от 28.04.87 г.

100. Инструкция по приготовлению молочного бифидумбактерина на молочных кухнях, М., 1987.- Юс.

101. Инструкция по приготовлению кисломолочного бифилакта на молочных кухнях, М., 1987.- Юс.

102. Исаков, В.А. Азитромицин (Сумамед) - новый компонент антихеликобактерной терапии / В.А. Исаков, JI.B. Кудрявцева // Клиническая фармакология и терапия. - 2000. - т.9, №1. - С.22-24.

103. Иудин, Д. И. Мультифрактальный анализ структуры биотических сообществ / Д.И. Иудин, Д.Б. Гелашвили, Г.С. Розенберг // Докл. РАН. -2003. - Т. 389, № 2. - С. 279-282.

104. Иудин, Д.И. Методология принципа самоподобия в исследовании видовой структуры биотических сообществ: Автореферат дисс... док. биол. наук. / Д.И. Иудин - Тольятти, 2006. - 40 с.

105. Казин, Э. М. Основы индивидуального здоровья человека: Введение в общую и прикладную валеологию: Учеб. пособие для высш. учеб. заведений. / Э. М. Казин, Н. Г. Блинова, Н. А. Литвинова - М.: Гуманит. изд. центр ВЛАДОС, 2000. - 192с.

106. Камалова, A.A. Эндотоксемия и дисбактериоз кишечника у детей с желчнокаменной болезнью / A.A. Камалова, О.Д. Зинкевич, Г.А. Хуснуллина, H.A. Сафина // Российский педиатрический журнал. - 2010. -№ 5. - С. 26-29.

107. Карзанова, М.Е. Определение видовой принадлежности штаммов бифидобактерий на основе секвенирования фрагментов генов 16SpPHK интрансальдолазы / М.Е. Карзанова, О.Л. Воронина, В.Г. Лунин, О.Г. Жиленкова, A.M. Амерханова // Доклады Российской академии сельскохозяйственных наук. - 2006. - № 5. - С. 9-12.

108. Кафарская, Л.И. Особенности микробной колонизации кишечника новорожденных и недоношенных детей в отделениях реанимации и интенсивной терапии / Л.И. Кафарская, Н.Н. Володин, Б.А. Ефимов, С.С. Афанасьев, А.Н. Шкопоров // Вестник Российской академии медицинских наук. - 2006а. - № 1.- С. 10-14.

109. Кафарская, Л.И. Особенности становления микрофлоры у детей раннего возраста / Л.И. Кафарская, Б.А. Ефимов, Е.А. Постникова, Е.Е. Донских // Детские инфекции. - 2006b. - Т. 5, № 1. - С. 6-11.

110. Кешишян, Е.С. Микробиоценоз кишечника у детей раннего возраста: факторы, влияющие на его становление, роль видов вскармливания / Е.С. Кешишян, Е.К. Бердникова // Российский вестник перинатологии и педиатрии. - 2009. - Т. 54, № 5. - С. 20-24.

111. Климова, Е.В. Пробиотики, пребиотики и синбиотики. Общие и избранные разделы проблемы / Е.В. Климова // Экологическая безопасность в АПК. Реферативный журнал. - 2009. - № 2. - С. 587-587.

112. Клинические аспекты диагностики и лечения дисбиоза кишечника в общетерапевтической практике. Учебно-методическое пособие. - СПб., 2003. - 36 с.

113. Клиническая лабораторная аналитика. Том IV. Частные аналитические технологии в клинической лаборатории \ под. ред. Меньшикова В.В. - М.: Агат-Мед, 2003.-816 с.

114. Коваленко, Н.К. Использование ПЦР для идентификации представителей родов Lactobacillus и Streptococcus / Н.К. Коваленко, Л.Н. Бурьяновский, B.C. Подгорский // Микробиологический журнал. - 2000. - № 62 (6). - С. 7-14.

115. Козлова, Д.И. Состояние кишечного микробиоценоза и течение Н. pylori-ассоциированного гастрита в условиях эрадикационной и симбиотической терапии: Автореф. дис....канд. мед. наук./ Д.И. Козлова. - СПб, 2004. - 21 с.

116. Козлова, Э.П. Микрофлора кишечника новорожденных детей в норме и патологии и восстановление ее бифидумбактерином: автореф. дис... канд. мед. наук. / Э.П. Козлова - М.,1978. - 23 с.

117. Кокорева, С.П. Влияние экологических факторов на состояние микробиоценоза кишечника у детей / С.П. Кокорева, Н.П. Куприна, С.А. Шишлова // Системный анализ и управление в биомедицинских системах. - 2008. - Т. 7, № 3. - С. 654-657.

118. Комбарова, С.Ю. Молекулярно-генетические методы дифференциации промышленных штаммов бифидобактерий и лактобацилл / С.Ю. Комбарова, Т.С. Погосьян, О.Ю. Борисова // Сборник материалов конференции «Пробиотические микроорганизмы - современное состояние вопроса и перспективы использования» - М., 2002. - С. 21.

119. Конев, Ю.В. Дисбиоз в пожилом и старческом возрасте / Ю.В. Конев, Л.Б. Лазебник, Л.Г. Каган, М.Ю. Яковлев // Клин, геронтология. - 2001. - № 9. -с. 7-12.

120. Кононов, A.B. Гистобактериоскопический и бактериологический методы исследования колонобиоптатов и характеристика пристеночной микрофлоры как показатель биоценоза толстой кишки / A.B. Кононов, О.Н. Миронова /Пособие для врачей. - 2005. - С. 12-23.

121. Конь, И. Я. Пребиотики в детском питании / И. Я. Конь // Вопросы детской диетологии. - 2006. - Т. 4, № 3. - С. 35-40.

122. Конькова, Н.К. Пути усовершенствования питательных сред, используемых в технологии производства медицинских и ветеринарных пробиотиков: Автореф. дисс... канд. биол. наук./ Н.К. Конькова - Нижний Новгород, 2002. -21с.

123. Коровина, H.A. Профилактика и коррекция нарушений микробиоценза кишечника у детей раннего возраста /H.A. Коровина, З.Н. Вихирева. - М., 1995.-32 с.

124. Коршунов, В.М. Коррекция микрофлоры кишечника при химиотерапевтических дисбактериозах с помощью аутоштаммов бифидобактерий и лактобактерий / В.М. Коршунов, H.A. Синицина, Г.А. Гинодман, Б.В. Пинегин // ЖМЭИ,- 1985. - №9. - С. 20-25.

125. Коршунов, В.М. Коррекция дисбиотических нарушений ваиальной микрофлоры с помощью препарата из высокоадгезивных лактобактерий / В.М. Коршунов, Л.И. Кафарская, H.H. Володин, Н.П. Тарабрина // ЖМЭИ,- 1990,-№7.-С. 17-19.

126. Коршунов, В.М. Рациональные подходы к проблеме коррекции микрофлоры кишечника / В.М. Коршунов, В.В. Смеянов, Б.А. Ефимов // Вест. РАМН. - 1996. - №2. - С. 60-65.

127. Коршунов, В.М. Микроэкология влагалища. Коррекция микрофлоры при вагинальных дисбактериозах. / В.М. Коршунов, В.В. Володин, Б.А. Ефимов - М.: ВУНМЦ МЗ РФ, 1999. - 80 с.

128. Коршунов, В.М. Изучение бифидофлоры влагалища у женщин репродуктивного возраста / В.М. Коршунов, З.А. Гудиева, Б.А. Ефимов // Журн. микробиол., эпидемиол. и иммунобиол - 1999. -№4. - С. 74-78.

129. Коршунов, В.М. Дисбактериозы кишечника / В.М. Коршунов, В.В. Володин, Б.А. Ефимов // Детская больница. - 2000. - №1. - С. 66-74.

130. Крамарь, B.C. Микроэкология человека, коррекция дисбактериоза / B.C. Крамарь, Т.Н. Савченко, В.О. Крамарь, J1.B. Михайлова, Д.С. Добреньков, A.B. Панченко, K.M. Прокопенко // Вестник Волгоградского государственного медицинского университета. - 2010. - № 4. - С. 73-75.

131. Красноголовец, В.Н. Дисбактериоз кишечника и его клиническое значение./ В.Н. Красноголовец - М.: Медицина, 1979. - 192 с.

132. Красноголовец, В.Н. Дисбактериоз кишечника. / В.Н. Красноголовец -М.: Медицина, 1989. - 208 с.

133. Кругликов, В.Д. Отбор штаммов лактобацилл, обладающим выраженным антагонистическим действием на холерные вибрионы / В.Д. Кругликов, Т.Ф. Богданова // Актуальные вопросы микробиологии, лабораторной диагностики и профилактики холеры: Тез. Всесоюзн. науч. конф. -Ростов-на-Дону. - 1988. - С. 21-23.

134. Куваева, И. Б. Микроэкология и иммуноглобулины пищеварительных секретов и копрофильтратов человека в норме и при патологии / И. Б. Куваева, Т.Я. Темкина, М.А. Виноградова // Вестник АМН СССР. - 1975. -№12. - С.70-77.

135. Куваева, И.Б. Обмен веществ организма и кишечная микрофлора. / И.Б. Куваева - М.: Медицина, 1976. - 248с.

136. Куваева, И. Б. Микроэкологические и иммунные нарушения у детей. / И. Б. Куваева, К.С. Ладо до - М.: Медицина, 1991. - 240 с.

137. Кушугулова, А.Р. Методы генотипического анализа лактобацилл / А.Р. Кушугулова, М.Л. Филипенко, Ж.Т. Бекболатова // Материалы Международной конференции «Пробиотики, пребиотики, синбиотики и функциональные продукты питания. Современное состояние и перспективы» - М., 2004. - С. 27.

138. Лазарева, Т.С. Желудочно-кишечный тракт, микрофлора и иммунитет / Т.С. Лазарева, Ф.Ф. Жвания // Педиатрическая фармакология. - 2009. - Т. 6, № 1.-С. 46-50.

139. Лашевский, B.B. Дизайн праймеров для ДНК лактобактерий / В.В. Лашевский, Н.К. Коваленко // Микробиологический журнал. - 2003. - № 65 (З).-С. 46-53.

140. Лебедева, О.В. Формирование микроэкологии толстой кишки у здоровых новорожденных в условиях европейского севера / О.В. Лебедева, Т.А. Бажукова // Медицинский академический журнал. - 2007. - Т. 7., № 4. - С. 93-100.

141. Лебедева, М.Н. Руководство к практическим занятиям по медицинской микробиологии. / М.Н. Лебедева - М.: Медицина, 1973 - 312с.

142. Лебедева, О.В. Характер микробиоценоза влагалища и кишечника беременных женщин в условиях Европейского севера / О.В. Лебедева, A.A. Абрамов, Н.В. Павловский, Т.А. Бажукова // Тезисы Всероссийской конференции с международным участием «Пробиотики и пробиотические продукты в профилактике и лечении наиболее распространенных заболеваний человека. 21-22 апреля. - М., 1999. - С. 28-29.

143. Леванова, Л.А. Становление микрофлоры кишечника у детей первого года жизни. / Л.А. Леванова, В.А. Алешкин, A.A. Воробьев //Журн. микробиол. - 2001. - №4. - С.47-50.

144. Леванова, Г.Ф. Использование методов изучения хромосомной и плазмидной ДНК для оценки производственно-перспективных штаммов молочно-кислых бактерий, нормализующих микрофлору кишечника / Г.Ф. Леванова, С.Ю. Кашников, Д.М. Трошкина// Регуляция биологических систем: межвузовский тематический сборник научных трудов под ред. И.Н. Блохиной; ГГУ. - Горький, 1990. - 80 с.

145. Леванова, Г.Ф. Фенотаксономия и геносистематика лактобацилл/ Г.Ф. Леванова, Е.И. Ефимов/ под ред. д.б.н. Григорьевой Г.И. - Н. Новгород: Изд. Ю.А. Николаев, 2009. - 248 с.

146. Левич, А.П. Структура экологических сообществ / А.П. Левич. - М.: Изд-во МГУ, 1980.

147. Левич, А.П. Математические аспекты вариационного моделирования в экологии сообществ / А.П. Левич, В. Л. Алексеев, В.А.Никулин // Математическое моделирование. - 1994. - Т. 6, №5. - С. 55-71.

148. Левич, А.П. Феноменология, применение и происхождение ранговых распределений в биоценозах и экологии как источник идей для тех-ноценозов и экономики / А.П. Левич // Общая и прикладная ценология. -2007.-№5.-С. 14-19.

149. Левин, А.П. Поиск целевых показателей качеств для биоиндикаторов экологического состояния и факторов окружающей среды (на примере водных объектов реки Дон) / А.П. Левич, Е.А. Забурдаева, В.Н. Максимов, Н.Г. Булгаков, C.B. Мамихин // Водные ресурсы. - 2009. -Т.36, №6. - С. 730-742.

150. Ледник М.П. Микробная экосистема человека. / Ледник М.П. // Материалы Международной научно-практической конференции «Здоровье: человек и технологии». - Киев, 2010. - с. 25.

151.Ленцнер, A.A. Об антагонистической активности различных видов лактобацилл по отношению к энтеропатогенной кишечной палочке серологического типа ОтВ4 / A.A. Ленцнер, Э.Т. Таллмейстер, М.А. Тоом, М.Э. Микельсаар, М.Н. Воронина // Материалы V научн. конф. Таллинского ИЭМиГ. - Таллин, 1964. - С. 8-9.

152. Ленцнер, A.A. О количественном составе микрофлоры кала здоровых взрослых при обычном питании / A.A. Ленцнер, М.Э. Микельсаар, М.Н. Воронина / В кн.: Материалы XVI научн. сессии института питания АМН СССР.-М., 1966. - Т.2. - С. 153-154.

153. Ленцнер, A.A. О видовом составе лактобацилл кала пожилых людей / A.A. Ленцнер, М.Э. Микельсаар/ В кн.: Сб. докладов научн. конф. -Таллин, 1968. - С.29-31.

154. Лизько, H.H. Изменение состава нормальной кишечной микрофлоры при различных рационах питания и в условиях длительного пребывания человека в герметически замкнутом объеме: автореф. дис... канд. мед. наук / H.H. Лизько. - М., 1970. - 25 с.

155. Лихачева, А.Ю. Совершенствование видовой идентификации лактобацилл с использованием микрокультуральных тест-систем и данных о строении геном / А.Ю. Лихачева, К.Я. Соколова, Г.Ф. Леванова // Журн. микробиол. - 1995. - № 5. - С. 45-48.

156. Лыкина, Е.В. Влияние анамнестических факторов риска на состояние кишечного микробиоценоза детей первого полугодия жизни / Е.В. Лыкина, А.Ю. Миронов, К.А. Осман, М.Л. Корнеев // Курский научно-практический вестник Человек и его здоровье. - 2006. - № 4. - С. 45-51.

157. Маев, И.В. Пробиотики и пребиотики в клинической практике / И.В. Маев, A.A. Самсонов, И.Н. Никушкина, Н.Ю. Ивашкина, Е.Ю. Плотникова // Фарматека. - 2011. - № 5. - С. 33-41.

158. Маевская, M.B. Пробиотики и пробиотические продукты в практике врача-гастроэнетролога / М.В. Маевская // Фарматека. - 2010. - № 2. - С. 72-77.

159. Мазанкова, JI.H. Пробиотики. Характеристика препаратов и выбор в педиатрической практике / JI.H. Мазанкова, Е.А. Лыкова //Детские инфекции. - 2004. - № 1. - С. 18-23.

160. Макаров, В.В. Основы здорового образа жизни и профилактика болезней / В.В. Макаров - М: Академия, 2001. - 320 с.

161. Макарова, С.Г. Использование продуктов на основе гидролизата молочного белка при пищевой аллергии у детей раннего возраста / С.Г. Макарова, Т.Э. Боровик, С.Н. Шихов, Л.В. Шумилина, И.М. Гусева, А.П. Чеканникова // Лечащий врач. - 2008. - № 1. - С. 23-29.

162. Максимов, В.Н. Концепция выявления стрессовых состояний водных экосистем методом ранговых распределений и экологически допустимые уровни загрязняющих веществ для водоемов р. Элиста / В.Н. Максимов, Л.В. Джабруева, Н.Г. Булгаков, А.Т. Терехин // Водные ресурсы. - 1997. -т. 24(1).-С. 79-85.

163. Малкоч, A.B. Пребиотики и их роль в формировании кишечной микрофлоры / A.B. Малкоч, C.B. Бельмер //Педиатрия. Журнал им. Г.Н. Сперанского. - 2009. - Т. 87, № 4. - С. 111-114.

164. Маргалеф, Р. Облик биосферы / Р. Маргалеф. - М.: Наука, 1992. - 254 с.

165. Маргелис, Л. Роль симбиоза в эволюции клетки / Л. Маргелис. - М.: Мир, 1983.-352 с.

166. Марко, О.П. Кишечная микрофлора при неспецифическом язвенном колите / О.П. Марко // Применение колибактерина для профилактики и лечения кишечных заболеваний и технология его производства: сб.научн. тр.-М. 1967.

167. Марко, О.П. О составе микрофлоры кишечника здоровых людей / О.П. Марко. - Лабораторное дело. -1970. - №6. - С.365

168. Методы бактериологического исследования условно-патогенных микроорганизмов в клинической микробиологии: методические рекомендации. - М.: Минздрав. - 1991.

169. Методические указания по санитарно-эпидемиологической оценке безопасности и функционального потенциала пробиотических микроорганизмов, используемых для производства пищевых продуктов:

методические указания № 2.3.2.2789-10 - М.: Роспотребнадзор. -2010. -71 с.

170. Мечников, И. И. Этюды оптимизма / И. И. Мечников - М.: Наука, 1964. -128 с.

171. Мечников, И.И. О д1этическомъ значенш «кислаго молока» проф. Мечникова. Клиничесюя наблюдешя изъ СПБ. Морского Госпиталя, доктора мед. Г. А. Макарова. / И.И. Мечников: С.-Петербургъ. Издаше К. JI. Риккера. Невскш пр., 14. - 1907.

172. Микельсаар, М.Э. О количественном составе микрофлоры кала здоровых взрослых при обычном питании/ М.Э. Микельсаар, М.Н. Воронина / В кн.: Материалы XVI научн. сессии института питания АМН СССР. - М., 1966, Т.2.- С. 153-154.

173. Миловидова, О.В. Иммунопрофилактика гнойно-воспалительных инфекций у недоношенных детей: Автореф. дис....канд. мед. наук. / О.В. Миловидова - М., 1994. - 25 с.

174. Митрохин, С.Д. Метаболиты нормальной микрофлоры человека в экспресс-диагностике и контроле лечения дисбиоза толстой кишки: Автореф. дис. ...д-ра мед. наук./ С.Д. Митрохин - М., 1998. - 37 с.

175. Митрохин, С.Д. Сравнительные биохимические показатели кишечных микробиоценозов у обычных и безмикробных крыс / С.Д. Митрохин, A.A. Иванов, Б.А. Шендеров // Медицинские аспекты микробной экологии: Сб. науч. тр. МНИИЭМ им. Г.Н. Габричевского/ под ред. Б.А. Шендерова. -М.: 1991.-С. 52-62.

176. Могильный, Н.П. Все о молоке / Н.П.Могильный, Л.А.Трушкина -изд-во "Экономика", М., 1989. - 80 с.

177. Молохова, Е.И. Разработки отечественных метаболических пробиотиков и их стандартизация / Е.И. Молохова, Ю.В. Сорокина // Сибирский медицинский журнал (г. Томск). - 2011. - Т. 26, № 1-1. - С. 29-33.

178. Молохова, Е.И. Лекарственные препараты на основе метаболитов микроорганизмов и фрагментов клеток / Е.И. Молохова, Ю.В. Сорокина, A.B. Казьянин // Фармация. - 2010. - № 6. - С. 52-55.

179. Мусаева, З.М. Микробиоценоз влагалища и его коррекция / З.М. Мусаева // Проблемы женского здоровья. - 2008. - Т. 3, № 3. - С. 43-53.

180. Мэгарран, Э. Экологическое разнообразие и его измерение. Пер. с англ. / Э. Мэгарран. -М.: Мир, 1992. - 184 с.

181. Несчисляев, В.А. Микробиологические и технологические аспекты получения, контроля и конструирования препаратов: дисс.... докт. мед. наук./ В.А. Несчисляев - Пермь, 2005. -277с.

182. Несчисляев, В.А. Пробиотики: сравнительная характеристика моно- и поликомнонентных препаратов / В.А. Несчисляев, Я.В. Долгих, Е.В. Орлова, К.А. Лыско, Е.М. Валиева // Сибирский медицинский журнал. -2011. - Т. 26, № 2-2. - С. 68-70.

183. Несчисляев, В.А. К вопросу разработки пробиотических препаратов из культуральной жидкости лактобактерий / В.А. Несчисляев , Е.И. Молохова, Л.П. Чистохина // Клиническое питание. - 2007. - № 1-2. - С. А-55.

184. Нетребенко, О. К. Питание грудного ребенка и кишечная микрофлора / О. К. Нетребенко // Педиатрия. - 2005а. - № 3. - С. 57-61.

185. Нетребенко, О. К. Развитие и укрепление иммунитета в первый, решающий год жизни, раздел «Эволюция кишечной микрофлоры». Информация только для медицинских работников / О. К. Нетребенко. -2005b.

186. Никитенко, Н. И. Роль транслокации бактерий в патогенезе хирургической инфекции / Н. И. Никитенко, В.В. Захаров, A.B. Бородин // Хирургия. - 2001. - № 2. - С. 63-66.

187. Николаева, И.В. Кишечная микрофлора у здоровых детей раннего возраста / И.В. Николаева, В.А. Анохин, И.А. Айнутдинова // Российский вестник перинатологии и педиатрии. - 2009. - Т. 54, № 2. - С. 30-33.

188. Одум, Ю. Экология / Ю. Одум. - М.: Мир, 1986. - Т.2. - 376 с.

189. Олескин, А.В Экологически важные свойства популяций микроорганизмов. / A.B. Олескин // Соросовский образовательный журнал.-2001.-т. 7, №8.-С. 7-12.

190. Олескин, A.B. Колониальная организация и межклеточная коммуникация у микроорганизмов. / A.B. Олескин, И.В. Ботвинко, Е.А. Цавкелова // Микробиология. - 2000. - Т. 69, № 3. - С. 309-327.

191. Олескин, A.B. Биосоциальность одноклеточных (на материале исследования прокариот). / A.B. Олескин // Журнал общей биологии. 2009. - Т. 70, № 3. - С. 225-238.

192. Онищенко, Г.Г. Особенности санитарно-эпидемиологического благополучия детей и подростков в Российской Федерации. / Г.Г.Онищенко // Материалы Всероссийской научно-практической

конференции с международным участием «Гигиена детей и подростков на пороге третьего тысячелетия. Основные направления развития». - М. -1999.-С.5.

193. Определение чувствительности микроорганизмов к антибактериальным препаратам: методические указания № 4.2.1890-04. - М.: Федеральный центр Госсанэпиднадзора Минздрава России. - 2004. - 91 с.

194. Организация определения лекарственной чувствительности микобактерий туберкулеза: инструкция по применению. - Минск: МЗ республики Беларусь. - 2007. - 9 с.

195. Орлов А.И. Экспертные оценки. Учебное пособие. - М.: 2002. - 31 с.

196. ОСТ 91500.11.0004-2003. Протокол ведения больных. Дисбактериоз кишечника. Утвержден приказом МЗ РФ №231 от 09.06.2003. - М.: изд-во Госстандартов, 2003. - 173 с.

197. Падейская, E.H. Препараты группы 5-нитроимидазола для лечения анаэробных и протозойных инфекций / E.H. Падейская // Инфекции и антимикробная терапия. - 2000. - Т.2, №4. - С. 240.

198. Панчишина, М.В. Дисбактериозы кишечника. / М.В. Панчишина, С.Ф. Олейник - Киев: Здоров'я, 1977. - 190 с.

199. Пат. №2193398 Россия, МПК 7 А 61 К 31/00, 35/00, 35/74, А 61 Р 1/00, Способ лечения дисбактериозов / И.В. Соловьева, К.Я. Соколова, В.А. Княжев (Россия). № 2000107271/14 заявлено 24.03.2000, опубл. 27.11.2002, Бюл. №33. С.18.

200. Пат. № 2122868 Россия, МПК А61М31/00, А61КЗЗ/06, Способ энтеросорбции / Н.И. Богомолов, Н.И. Кулиш, H.H. Богомолова (Россия). №7111429/14, заявлено 08.07.1997, опубл. 10.12.1998.

201. Пат. № 2095072 Россия, МПК А61К35/74, Способ лечения неспецифической инфекционной патологии урогениталий у женщин / А.Е. Щербинов, A.B. Казаков, Г.В. Телякова (Россия). № 93012461/14, заявлено 01.04.1993, опубл. 10.11.1997.

202. Пат. № 2113806 Россия, МПК A23L1/30, A23L1/304, A23L1/305, A23L1/076, А61К35/78, А61К35/64, Пищевая биологически активная добавка / И.Д. Фадеева (Россия). № 97101811/13, заявлено 05.02.1997, опубл. 27.06.1998.

203. Пат. № 2280465 Россия, МПК А61К 35/74 А23С 9/12 C12N 1/20 C12R 1/225 C12R 1/25, Способ приготовления пробиотика / И.В. Соловьева, К.Я. Соколова, Е.И. Ефимов, Т.П. Иванова, А.Г.Точилина, И.В. Белова

(Россия). № 2004131097/13 заявлено 25.10.2004, опубл. 27.07.2006, Бюл. №19. С. 8.

204. Пат. № 2184558 Россия, МПК 7 А 61 К 35/74, А 61 Р 1/04, Способ лечения язвенной болезни двенадцати перстной кишки / М.Г. Яковлев, В.Б. Кузин, В.В. Дугина, П.П. Потехин, К.Я. Соколова, И.В. Соловьева (Россия). №2000121246/14 заявлено 07.08.2000, опубл. 10.07.2002, Бюл. №19. С. 6.

205. Пат № 2375459 Россия, МПК C12Q 1/68, С12Р 19/34. Способ индикации бактерий рода Lactobacillus / Новикова Н.А., Точилина А.Г., Соловьева И.В. (Россия). № 2008113591, заявлено 07.04.2008, опубл. 10.12.2009, Бюл. 34. С.6.

206. Пат № 2192269 Россия, МПК С2 7А61 К 35/74, А 23 С 9/127, С12 N 1/20//(С12 N1/20, С 12 R 1:07, 1:225, 1:25 Способ приготовления лечебно-профилактического препарата на основе живых штаммов микроорганизмов «LB-комплекс» / Соловьева И.В, Соколова К.Я. (Россия). № 20001175/13, заявлено 03.07.2000, опубл. 10.11.2002, Бюл. 31, с. 2

207. Перетц, Л.Г. Значение нормальной микрофлоры для организма человека. / Л.Г. Перетц. - М.: Медгиз. - 1955. - 250 с.

208. Перковец, М.В. Инулин и олигофруктоза - пребиотики с давних времен до наших дней / М.В. Перковец // Пищевая промышленность. - 2007. - № 4.-С. 56-58.

209. Песенко, Ю.А. Принципы и методы количественного анализа в фаунистических исследованиях / Ю.А. Песенко. - М.: Наука, 1982. - 288 с.

210. Петровская В.Г, Марко О.П. Микрофлора человека в норме и патологии. / В.Г. Петровская, О.П. Марко. - М.: Медицина, 1976. - 612 с.

211. Пианка, Э. Эволюционная экология / Э. Пианка. - М.: Мир, 1981. - 400 с.

212. Пивоваров, Ю.П. Санитарно-значимые микроорганизмы (таксономическая характеристика и дифференциации) / Ю.П. Пивоваров, В.В. Королик - М.: Изд-во ИКАР, 2000. - 268 с.

213.Пинегин, В.В. Дисбактериозы кишечника / В.В. Пинегин, В.Н. Мальцев, В.М. Коршунов -М.: Медицина, 1984., 144 с.

214. Плахтий, Л.Я. Антибиотикорезистентность штаммов бифидобактерий, выделенных из генитального тракта женщин репродуктивного возраста /

Л.Я. Плахтий, З.А. Уртаева, Л.В. Цаллагова, Е.И. Рындина // Жур. Клин.

361

микробиологии и антимикробной химиотерапии. - 2002. -Т.4, Прил. 1. -С.35.

215. Подопригора, Г.И. Медицинская гнотобиология / Г.И. Подопригора. -Медицинское информационная агентство, 2003. - 272 с.

216. Поздеев, O.K. Энтеробактерии: руководство для врачей / O.K. Поздеев, Р.В. Федоров. - М.: ГЭОТАР-Медиа, 2007. - 720 с.

217. Попова-Борзашка, С. Определение антагонистической активности лактобактерий Солко (Lactobacillus acidophilus Ldt 11/83) при использовании гнотобиологической технологии / С. Попова-Борзашка, В.М. Коршунов, Н.П. Тарабрина, Б. Боссарт // ЖМЭИ. - 1990. - №9. - С. 3-6.

218. Поспелова, В.В. Биопрепараты, нормализующие микрофлору кишечника: итоги двадцатилетних исследований по проблеме /В.В. Поспелова, Н.Г. Рахимова, Г.И. Ханина, М.П. Халенова // Антибиотики и колонизационная резистентность; под ред. Б.А. Шендерова. - М., 1990. -Вып.Х1Х. - С. 172-181.

219. Приказ Минздрава СССР №535 «Об унификации микробиологиченских (бактериологических) методов исследования, применяемых в клнико-диагностических лабораториях лечебно-профилактических учреждений», 22.04.1985

220. Проворов, Н.А. Метаболическая интеграция организмов в системах симбиоза / Н.А. Проворов, Е.А. Долгих // Журн. общ. биологии. - 2006 - Т. 67, №6.-С. 403-422.

221. Пузаченко, Ю.Г. Семантические аспекты биоразнообразия / Ю.Г. Пузаченко, А.Ю. Пузаченко // Журн. общ. биол. - 1996. - Т. 57, № 1. - С. 143.

222. Реброва, Р.Н. Грибы рода Candida при заболеваниях негрибковой этиологии / Р.Н. Реброва. - 2-е изд., перераб. и доп. - М.: Медицина, 1989. -128 с.

223. Римарчук, Г.В. Энтеросорбция в терапевтических программах различных заболеваний у детей / Г.В. Римарчук, Н.И. Урсова, Л,А. Щеплягина // Альманах клинической медицины. - 1999. - № 2. - С. 283-292.

224. Руководство по инфекционному контролю в стационаре / под ред. В.Венцеля, Т. Бревера, Ж.-П. Бутцлера; пер с англ. - Смоленск: МАКМАХ, 2003.-272 с.

225. Рыбальченко, O.B. Атлас ультраструктуры микробиоты кишечника человека. / О.В. Рыбальченко, В.М. Бондаренко, В.П. Добрица. - СПб. ИИЦ BMA, 2008.- 112 с.

226. Рыбальченко, О.В. Образование биопленок симбионтными представителями микробиоты кишечника как форма существования бактерий / О.В. Рыбальченко, В.М. Бондаренко // Вестник Санкт-Петербургского университета. - 2013. - Серия 11, № 1. - С. 179-186.

227. Рябиченко, Е.В. Кишечно-мозговые взаимоотношения в норме и патологии/ Е.В. Рябиченко, В.М. Бондаренко // Верхневолжский медицинский журнал. - 2013. - Т. 11, № 1. - С. 34-39.

228. Рысс, Е.С. Фармакотерапия язвенной болезни / Е.С. Рысс, Э.Э. Звартау. -СПб., М.: «Невский Диалект» - «Издательство БИНОМ», 1998. - 253 с.

229. Савинов, А.Б. Биосистемалогия (системные основы теории эволюции и экологии). Учебное пособие / А.Б. Савинов. - Н.Новгород: Изд-во ННГУ, 2006. - 205 с.

230. Самойлов, В.А. Молочные продукты пробиотической направленности / В. А. Самойлов, П.Г. Нестеренко, O.A. Суюнчев // Молочная промышленность. - 2007. - № 7. - С. 45-46.

231. Самсонова, С.А. Методы ПЦР-идентификации и классификации пробиотических микроорганизмов / С.А. Самсонова, В.В. Самсонов, Н.Б. Бавыкина // Сборник материалов конференции «Пробиотические микроорганизмы - современное состояние вопроса и перспективы использования». - М., 2002. - С. 20.

232. Санитарно-эпидемиологическая оценка обоснования сроков годности и условий хранения пищевых продуктов: методические указания № 4.2.1847-04. - М.: Федеральный центр Госсанэпиднадзора Минздрава России, 2004. - 19 с.

233. Сергиенко, В.И. Математическая статистика в клинических исследованиях / В.И. Сергиенко, И.Б. Бондарева. - 2-е изд., перераб. и доп. - М.: ГЭОТАР-Медиа, 2006. - 304 с.

234. Симонова, Е.В. Роль нормальной микрофлоры в поддержании здоровья человека / Е.В. Симонова, O.A. Пономарева// Сибирский медицинский журнал. - 2008. - №8. - С. 20 -25.

235. Сире, У. Ваш малыш от рождения до двух лет / У. Сире, М. Сире - М.: Эксмо, 2011.-912 с.

236. Скирда, Г.И. Сезонные изменения кишечной микрофлоры здоровых детей / Г.И. Скирда. - Педиатрия. - 1971. - №11. - с. 16-20.

237. Соколова, К.Я. Изучение микробиоценозов кишечника детей, больных острой дизентерией, с использованием ЭЦВМ: Автореф. дис...канд. мед. наук. / К.Я. Соколова. - Москва, 1972. - 18 с.

238. Соколова, К.Я! Методика оценки состояния микрофлоры толстой кишки с использованием ЭВМ. / К.Я. Соколова, И.В. Шутова, A.C. Коровенков // ЖМЭИ - 1998. - № 11.-с. 11-16.

239. Соколова, К.Я. Дисбактериозы: Теория и практика / К.Я. Соколова, И.В. Соловьева - Н. Новгород. - 1999. - 199 с.

240. Соловьева, И.В. Характеристика микрофлоры влагалища женщин в норме и патологии: дисс.. канд. мед. наук. / И.В. Соловьева. - Горький, 1987. -145 с.

241. Соловьева, И.В. Применение полимеразной цепной реакции для изучения динамики развития популяции лактобацилл (L.plantarum и L.fermentum) / И.В. Соловьева, А.Г. Точилина, H.A. Новикова, И.В. Белова, И.С. Горлова, Т.П. Иванова, В.А. Жирнов // Биотехнология. - 2011. -№4. -С.82-87.

242. Тамим, А.Й. Йогурт и другие кисломолочные продукты / А.Й. Тамим, Р.К. Робинсон, пер с англ. под науч ред. JI.A. Забодаловой - СПб.: Профессия, 2003. - 664 с.

243. Тарасова, Н.Б. Сравнительное изучение лактобактерий и E.coli Mi7 в целях разработки нового препарата - лактобактерина: дис. ... канд. мед. наук / Тарасова Н.Б. - Горький, 1969. - 245 с.

244. Тинцбург, A.JI. «Quorum sensing» или социальное поведение бактерий / АЛ. Тинцбург, Т.С. Ильина, Ю.М. Романова // ЖМЭИ. - 2003. - №5. -С.86-93

245. Ткаченко, Е.И. Питание, эндоэкология человека, здоровье, болезни. Современный взгляд на проблему их взаимосвязи / Е.И. Ткаченко // Терапевтический архив. - 2004. - №2. - С. 67-71.

246. Ткаченко, Е.И. Питание, микаробиоцноз и интеллект человека / Е.И. Ткаченко, Ю.П. Успенский. - СПб.: СпецЛит, 2006. - 590 с.

247. Точилина, А.Г. Биохимическая и молекулярно-Огенетическая идентификация бактерий рода Lactobacillus: Дис. ... канд. биол. наук / А.Г. Точилина. - Нижний Новгород, 2009. - 147 с.

248. Точилина, O.A. Коррекция дисбактериоза у детей раннего возраста с помощью жидких синбиотиков, содержащих, содержащих бифидо- и лактобактерии / O.A. Точилина, И.А. Частоедова, Ю.А. Поярков // Казанский медицинский журнал. - 2011. - Т. 92, № 4. - С. 557-562.

249. Тюрин, М.В. К механизму антагонистической активности лактобацилл / М.В. Тюрин, Б.А. Шендеров, Н.Г. Рахимова // Журн. микробиол., эпидемиол. и иммунобиол. - 1989. - №2. - С. 3-8.

250. Уголев, A.M. Теория адекватного питания и трофология/ A.M. Уголев. -СПб.: Наука, 1991.-270 с.

251. Урсова, Н.И Основные физиологические функции интестинальной микрофлоры и формирование мйкробиоценоза у детей / Н.И. Урсова // Вопросы практической педиатрии. - 2006. - Т. 1, № 1. - С. 51-57.

252. Усенко, Д.В. Пробиотики и пробиотические продукты / Д.В. Усенко // Вопросы детской диетологии. - 2006. - Т. 4, № 6. - С. 36-43.

253. Фалова, O.E. Микробиоценоз кишечника как микроэкологическая система организма / O.E. Фалова, Н.С. Глебова, Ю.Ю. Красноперова, Н.И. Потатуркина-Нестерова // Современные наукоемкие технологии. 2005. -№ 4. - С. 98-98.

254. Фармакопейная статья ФС 0054-00. Лактобактерии сухой. Утверждена 01.11.2000.

255. Феклисова, Л.В. Лактосодержащие отечественные пробиотики / Л.В. Феклисова // Кремлевская медицина. Клинический вестник. - 2007. - № 4. -С. 48-50.

256. Феклисова, Л.В. Отечественные бифидосодержащие пробиотики а педиатрической практике / Л.В. Феклисова, Т.В. Мацулевич // Альманах клинической медицины. - 2002. - № 5. - С. 296-300.

257. Феклисова, Л.В. Возможности применения синбиотиков для снижения заболеваемости часто болеющих детей, посещающих дошкольные учреждения / Л.В. Феклисова, A.M. Амерханова, О.Г. Жиленкова, Е.Р. Мескина, Е.А. Воропаева, Л.В. Пожалостина, Е.С. Зубкова, A.A. Кураленко, К.Д. Моисеева //Вопросы практической педиатрии. - 2007. -Т. 2, №6.-С. 53-59.

258. Филиппова, И.Е. Формирование микробиоценоза кишечника у новорожденных детей раннего неотнатального периода / И.Е. Филиппова // Медицина в Кузбассе. - 2006. - № 4. - С. 26-32.

259. Цибулевский, А.Ю. Микроэкология человека (Часть I). / А.Ю. Цибулевский, A.B. Соколов // Успехи современного естествознания. -2008а.-№7. - С. 17-21.

260. Цибулевский, А.Ю. Микроэкология человека (Часть II). / А.Ю. Цибулевский, A.B. Соколов // Успехи современного естествознания. -2008b. -. №7. - С. 22-26.

261.Чахава, О.В. Микробиологические и иммунологические основы гнотобиологии / О.В. Чахава, Е.М. Горская, С.З. Рубан. - М.: Медицина, 1982. - 200 с.

262. Червинец, Ю.В. Бактериоциногенные высокоантагонистические штаммы лактобацилл / Ю.В. Червинец, В.М. Бондаренко, H.A. Шабанова, A.M. Самоукина, В.М. Червинец // Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии. - 2006. - № 7. - С. 78-82.

263. Червинец, В.М. Формирование биопленок антагонистическими штаммами лактобацилл полости рта / В.М. Червинец, Ю.В. Червинец, A.M. Самоукина, Е.С. Михайлова, O.A. Гаврилова // Стоматология. -2012.-Т. 91, № 1.-С. 16-19

264. Червинец, Ю.В. Нарушения микробиоты желудочно-кишечного тракта здоровых лиц / Ю.В.Червинец, Е.А.Беляева, В.М.Червинец и др. // Международный журнал прикладных и фундаментальных исследований. -2013.-№3.-с. 55-58.

265.Чернин, В.В. Дисбактериоз мукозной микрофлоры эзофагогастродуоденальной зоны / В.В. Чернин, В.М. Бондаренко, В.М. Червинец, С.Н. Базлов. - М.: ООО «Медицинское информационное агентство», 2011. - 144 с.

266. Шабалов, Н. П. Неонатология / Н. П. Шабалов— М. : Медпресс-ин- форм, 2004. - С. 128-129.

267. Шагинян, И.А. Роль и место молекулярно-генетических методов в эпидемиологическом анализе внутрибольничных инфекций / И.А. Шагинян // КМАХ. - 2000. - т.2, №3 - С. 82-95.

268. Шапошникова, Л.И. Микробиотиа человека как основной физиологический орган / Л.И. Шапошникова // Успехи современного естествознания. - 2006. - № 9. - С. 80-82.

269. Шевелева, С.А. Пробиотики, пребиотики и пробиотические продукты. Современное состояние вопроса / С.А. Шевелева / Вопросы питания. -№2. - 1999. - С.32-39.

270. Шевяков, М.А. Candida species в кишечнике. Клинические аспекты / М.А. Шевяков, Е.Б. Авалуева, Н.В. Барышникова // Проблемы медицинской микологии. - 2007. - Т. 9, № 4. - С. 4-11.

271. Шендеров, Б.А. Колонизационная резистентность крыс, родившихся от животных с экспериментальным дисбактериозом / Б.А. Шендеров, Р.Г. Ануфриева, С.М. Навашин // Антибиотики и медицинская биотехнология.

- 1986.-№6. -С. 440-445.

272. Шендеров, Б.А. Медицинская микробная экология и функциональное питание. Том I: Микрофлора человека и животных и ее функции / Б.А. Шендеров - М.: Издательство ГРАНТЪ, 1998а. - 288 с.

273. Шендеров, Б.А. Медицинская микробная экология и функциональное питание. Том II: Социально-экологические и клинические последствия дисбаланса микробной экологии человека и животных. / Б.А. Шендеров -М.: Издательство ГРАНТЪ, 1998b. - 416 с.

274. Шендеров, Б.А. Нормальная микрофлора и ее роль в поддержании здоровья человека / Б.А. Шендеров // Рос. Журн. Гастроэнтерол., гепатол., колопроктол. - 1998с. - Т. 7, № 1. - С. 61-65.

275. Шендеров, Б.А. Медицинская микробная экология и функциональное питание. Том III: Пробиотики и функциональное питание. / Б.А. Шендеров - М.: Издательство ГРАНТЪ, 2001. - 288 с.

276. Шкарин, В.В. Термины и определения в эпидемиологии: словарь / В.В. Шкарин, A.C. Благонравова. - Н. Новгород: Издательство НГМА, 2010. -300 с.

277. Шкопоров, А.Н. Бифидобактерии: традиционный взгляд и современные генетические исследования / А.Н. Шкопоров, Б.А. Ефимов, H.H. Володин, Л.И. Кафарская // Вопросы практической педиатрии. - 2007. - Т. 2, № 5. -С. 76-79.

278. Щербаков, П.Л. Микроэкология кишечника у детей и ее нарушения./ П.Л. Щербаков, A.A. Нижевич, В.В. Логиновская, М.Ю. Щербакова, Л.В. Кудрявцева, С.Д. Митрохин, Н.М. Нуртдинова, P.A. Очилова //Фарматека.

- 2007. - № 14.-с. 28-34.

279. Экология человека и профилактическая медицина. Мегатезаурус -большой словарь-справочник. - Москва-Воронеж, 2001. - 487 с.

280. Эпштейн-Литвак, Р.В. К характеристике дисбактериоза кишечника / Р.В. Эпштейн-Литвак, Ф.Л. Вилыианская // Материалы III съезда эпидемиологов, микробиологов, инфекционистов АзССР. - Баку, 1967. -С.81-82.

281. Эпштейн-Литвак, Р.В. Бактериологическая диагностика дисбактериоза кишечника. / Р.В. Эпштейн-Литвак, Ф.Л. Вилыианская // Метод, рекомендации. - М., 1977. - 22 с.

282. Янковский, Д.С. Перспективы использования пропионовокислых бактерий в составе пробиотиков / Д.С. Янковский, В.В. Бережной, Г.С. Дымент // Соврем, педиатрия. - 2004. - № 1(2). - С. 111-118.

283. Ahlroos, Т. Quantitative strain-specific detection of Lactobacillus rhamnosus GG in human faecal samples by real-time PCR / T. Ahlroos, S. Tynkkynen // J Appl Microbiol. - 2009. - Vol.106, №2. - P.506-14.

284. Andrew, J. In Vitro Biofilm Models: An Overview / J.Andrew, I. McBain // Advances in Applied Microbiology. - 2009. - Vol. 69. - P. 100-126.

285. Bary de, A. Die Erscheinung der Symbioses / A. de Bary. - Trubker: Strassburg, 1879.-235 p.

286. Brinques, G.B. Optimization of probiotic and lactic acid production by Lactobacillus plantarum in submerged bioreactor systems / G.B. Brinques , M. do Carmo Peralba , M.A. Ayub // J Ind Microbiol Biotechnol. - 2010. - V.37 (2).-P. 205-12.

287. Chaitov, L. Probiotics. Thorsons Publishing Group/ L.Chaitov, N. Trenev. -Northamptonshire, England, 1990.

288. Castellarin, M. Fusobacterium nucleatum infection is prevalent in human colorectal carcinoma / M. Castellarin, R.L. Warren, J.D. Freeman, L. Dreolini, M. Krzywinski, J. Strauss, R. Barnes, P. Watson, E. Allen-Vercoe, R.A. Moore, RA. Holt // Genome Res. 2011 Oct 18.

289. Chagnaud, P. Rapid PCR-based procedure to identify lactic acid bacteria application to six common Lactobacillus species / P. Chagnaud // J of Microbiol Meth. - 2001. - Vol.44. - P. 139-148.

290. Collado, M.C. Assessment of the bacterial diversity of breast milk of healthy women by quantitative real-time PCR / M. C. Collado, S. Delgado, A. Maldonado, J.M. Rodriguez // Lett Appl Microbiol. - 2009. - Vol.48, №5. - P. 523-8.

291. Collins, M.D. Probiotics, prebiotics, and synbiotics: approaches for modulating the microbial ecology of the gut / M.D.Collins, G.R.Gibson //Am J Clin Nutr. -1999. - Vol. 69. - P.1052S-7S.

292. Costerton, J.W. Bacterial biofilms: a common cause of persistent infections / J.W. Costerton, P.S. Stewart, E.P. Greenberg // Science. - 1999. - №284. -P.1318-1322

293. Cusick, S. M. Use of a Single, Triplicate Arbitrarily Primed-PCR Procedure for Molecular Fingerprinting of Lactic Acid Bacteria / S.M. Cusick, D.J. O'Sullivan // Appl Environ Microbiol. - 2000. - Vol. 66, №5. - P. 2227-2231.

294. Dach, S.K. Acidophilus: The Friendly Bacteria / S.K. Dach // In: Total Health. - 1995.-Apr.: 27

295. De Backer, E. Quantitative determination by real-time PCR of four vaginal Lactobacillus species, Gardnerella vaginalis and Atopobium vaginae indicates an inverse relationship between L. gasseri and L. iners/ E. De Backer , R. Verhelst , H. Verstraelen , M.A. Alqumber , J.P. Burton, J.R. Tagg , M. Temmerman , M. Vaneechoutte // BMC Microbiol. - 2007. -Vol. 7, №115. -1-13.

296. Douglas, A.E. Symbiotic interactions / A.E. Douglas. - Oxford, New York, Toronto: Oxford Univer. Press, 1994. - 148 p.

297. Edwards, C. A. Intestinal flora during the first months of life new perspectives / C. A. Edwards, A. M. Parret // Br. J. Nutr. - 2002. - Vol. 88 (11). - P. 11-18.

298. Emami, C. N. Role of the Host Defense System and Intestinal Microbial Flora in the Pathogenesis of Necrotizing Enterocolitis / C.N. Emami, M. Petrosyan, S. Giuliani, M. Williams, C. Hunter, N.V. Prasadarao, H. R. Ford. // Surgical infections. -Vol. 10. -2009. - P. 407- 417.

299. Fanaro, S. Intestinal microflora in early infancy: composition and develop-ment / S. Fanaro, R. Chierici, P. Guerrini, V. Vigi // Acta Paediat. -2003. -Vol. 91 (441).-P. 48-55.

300. Fisher, H.M. Genetic regulation of nitrogen fixation in rhizobia / H.M. Fisher // Microbiol. Review. - 1994. - V.58. - P. 352-386.

301. Gibson, G.R. Dietary modulation of the human colonic microbiota: Introducing the concept of prebiotics. / G.R. Gibson, M.B. Roberfroid // J Nutr. - 1995. -Vol. 125.-P. 1401-1412.

302. Gissen, A.S. Off Probiotics, Prebiotics & Synbiotics Iss VRPs Inc. Vit Res Prod Newsletters, Sept, 1995, USA.

303. Graham, D. Choosing the best anti-Helicobacter pylori therapy: effect of antimicrobial resistance / D. Graham, W.A. de Boer, G.N.J. Tytgat // Am. J. Gastroenterol. - 1996. - Vol. 91. - P.1072-1076.

304. Haenel, H. Zur Mikroekologie des Duenndarmes und des oberen Colon beim Menschen nach Untersuchungen an punktiertem Material / H. Haenel, A. von Lutzki, G.Feldheim - "Med. Welt", 1961. - Vol. 12. - P. 370.

305. Haenel, H. Human normal and abnormal gastrointestinal flora / H. Haenel //Am. J. Clin. Nutr. - 1970. - v.23, N 11. - p. 1433-1439.

306. Hammes,W.P. The genus of Lactobacillus and Carnobacterium / The Procaryotes / W.P. Hammes, C.A. Hertel, H.G. Balows, G.Truper, M. Dworkin, W. Harder, K.-H. Schleifer, Vol.4, Edition 2. - 1992, SpringerVerlag, New-York.

307. Harmsen, H.J.M. Comparison of viable cell counts and fluorescence in situ hybridization using specific rRNA-based probes for the quantification of human fecal bacteria / H.J.M. Harmsen, G.R. Gibson, P. Elfferich, G.C. Raangs, A.C.M. Wildeboer-Veloo, A. Argaiz, M.B. Roberfroid, G.W. Welling // FEMS. Microbiol. Letts. -2000. - Vol.183. - P. 125-129.

308. Holzapfel, W.H. Taxonomy and important features of probiotic microorganisms in food and nutrition / W.H. Holzapfel, P. Haberer, R. Geisen // Am.J. Clin. Nutr. - 2001. - Vol. 73. - P. 365S-373S.

309. Hopkins, M.J. Changes in predominant bacterial populations in human faeces with age and with Clostridium difficile infection. / M.J. Hopkins, G.T. Macfarlane // J. Med. Microbiol. — Vol. 51 (2002). -p. 448^154

310. Indrio, F. Effects of probiotic and prebiotic on gastrointestinal motility in newborns / F. Indrio, .Riezzo, F. Raimondi // J Physiol Pharmacol - 2009. -V.60 (6).-P. 27-31.

311.Janson, S. Measures of ecological association / S. Janson, J. Vegelius // Oecologia. - 1981. - V. 49. - P. 371-376.

312. Karapetsas, A. Rapid detection and identification of probiotic Lactobacillus casei ATCC 393 by multiplex PCR / A. Karapetsas, E. Vavoulidis, A Galanis, R. Sandaltzopoulos , Kourkoutas Y.//J Mol Microbiol Biotechnol. - 2010. -Vol.18, №3,-P. 156-61.

313. Kennedy, M.J. Mechanism association of Candida albicans with intestinal mucosa / M.J. Kennedy, P.A. Volz, C.A. Edwards, R.L. Yancey // J.Med. Microbiol. - 1987. - Vol.24. - P.333-341.

314. Kleerebezem, M. Quorum sensing control of lantibiotic production; nisin and subtilin autoregulate their own biosynthesis / M. Kleerebezem // Peptides. -2004. -Vol. 25(9). - P. 1405-1414.

315. Kollenbrander, P. E. Communication among oral bacteria /Kollenbrander P., E., Andersen R.N., Blehert D.S. // Microbiology and molecular biology rew. -2002. - Vol. 66, №3. - P. 486-505.

316. Kramer, M. Quantification of live and dead probiotic bacteria in lyophilised product by real-time PCR and by flow cytometry / M. Kramer, N. Obermajer, I. Rogelj, V. Kmetec // Appl Microbiol Biotechnol. - 2009. - Vol.84, №6. -P.l 137-47.

317. Kwon, H.S. Rapid identification of probiotic Lactobacillus species by multiplex PCR using species-specific primers based on the region extending from 16S rRNA through 23S rRNA / H.S. Kwon, E.H. Yang, S.W. Yeon // FEMS Microbiology Letters. - 2004. - Vol.239, Is.2. - P. 267-275.

318. Lactic acid bacteria and bifidobacteria. / Edited by K. Sonomoto, A. Yokoto. Caister Academic Press, Norfolk, UK. - 2011. - 285 p.

319. Lactobacillus, molecular biology. From genomics to probiotics./ Edited by A. Ljungh, T. Wanstrom. Caister Academic Press, Norfolk, UK. - 2009. - 205 p.

320. Le Chevallier, M.W. Inactiwation of biofilm bacteria / M.W. Le Chevallier, D. Cawthen, R.G. Lee // Appl. Environm. Microbiol. - 1998. - Vol. 54, №10. -P.68-80.

321. Lewis, D.H. Microorganisms and plants: the evolution of parasitisms and mutualism / D.H. Lewis // Evolution of microbial world (Proc. 24th Sym p. Soc. General Microbiol). - Cambridge: Univ. Press, 1974. - P. 367-392.

322. Liu, C. Antibiotic resistance of probiotic strains of lactic acid bacteria isolated from marketed foods and drugs / C. Liu, Z.Y. Zhang, K. Dong, J.P. Yuan, X.K. Guo //Biomed Environ Sci. -2009. - Vol.22, №5. - P.401-12.

323. Lopez, I. Design and Evaluation of PCR Primers for Analysis of Bacterial Populations in Wine by Denaturing Gradient Gel Electrophoresis /1. Lopez, F. Ruiz-Larrea, L. Cocolin, E. Orr, T. Phister, M. Marshall, J. VanderGheynst, D.A.Mills // Appl Environ Microbiol. - 2003. - Vol. 69, №11.- P. 6801-6807.

324. Marcovitch, H. Does Fusobacterium varium cause ulcerative colitis? / H. Marcovitch // BMJ: British Medical Journal. - 2003. - T. 326, № 7388. - C. 521.

325. Mackie, R.I. Developmental microbial ecology of the neonatal gastrointestinal tract / R.I. Mackie, A. Sghir, H.R. Gaskins // Am J Clin Nutr. - 1999. -Vol. 69. -P.1035S^15S.

326. Margalef, R. Human impact on transportation and diversity in ecosystems. How far is extrapolation valid/ R. Margalef // Proc. 1st Int. Congr. of ecology. Structure, functioning and management of ecosystems. The Hage, Sept. 8 - 14, 1974. Centre for Agricultural publishing and documentation: Wageningen, Netherlands, 1975. - P. 237-241.

327. Martin, R. Human milk is a source of lactic acid bacteria for the infant gut / R. Martin // FEMS Microbiol Ecol. - 2008. - Vol.66 (3). - P. 630-636.

328. Martin, R. Probiotic potentialof 3 Lactobacilli strains iso lated from breast milk / R. Martin, M. Olivares, M. L. Marin // J. Hum. Lact. — 2005. - Vol. 21. - P. 8-17

329. Martin, R. The commensal microflora of human milk new perspectives for food bacteriotherapy and probiotics / R. Martin // Trends Food Sci. Tech. - 2004. -Vol. 15.-P. 17-21.

330. Muller, M.R.A. Multiplex PCR for the detection of Lactobacillus ponis and two related species in a sourdough fermentation / M.R.A. Muller, M.A. Ehrmann, R.F. Vogel // Appl. Environ Microbiol. - 2000. -Vol.66, №5. - P. 2113-2116.

331.Naveh, Z. Ecological and cultural landscape restoration and cultural evolution towards a post-industrial symbiosis between human society and nature / Z. Naveh // Restoration Ecology. - 1998. - V. 6, № 2. - P. 135-143.

332.0'Sullivan, D.J. Methods for Analysis of the Intestinal Microflora / D.J. O'Sullivan // Curr. Issues Intest. Microbiol. -2000. - Vol. 1, №2. - P. 39-50.

333. Ohkusa, T. Fusobacterium varium / T. Ohkusa, N. Sato, T. Ogihara, K. Morita, M. Ogawa, Okayasu I. // Journal of Gastroenterology and Hepatology. - 2002. -T. 17, № 8.-C. 849-853.

334. Orrhagt, K. Factors controlling the bacterial colonization of the intestine in breastfed infants / K. Orrhagt, C. E. Nord // Acta Paediatr Suppl. - 1999. -Vol. 88 (4-30). - P. 47-57.

335. Ouoba, L.I. Genotypic diversity of lactic acid bacteria isolated from African traditional alkaline-fermented foods / L.I. Ouoba, C.A. Nyanga-Koumou, C. Parkouda, H.Sawadogo, S.C. Kobawila, S. Keleke, B. Diawara, D. Louembe, J.P. Sutherland // J Appl Microbiol. - 2010. -Vol. 108, №6. - P.2019-29.

336. Ouwehand, A. From new strain to health claim / A. Ouwehand // Gastroenterology of St. Petersburg. - 2009, №4. - c. A19.

337. Pielou, E. C. The measurement of diversity in different types of biological collections / E.C. Pielou // J. Theor. Biol. - 1966. - V. 13. - P. 131-144.

338. Polzin, K.M. Copy number and location of insertion sequences ISS1 and IS981 in lactococci and several other lactic acid bacteria / K.M. Polzin, D.Romero, M. Shimizu-Kadota, T.R. Klaenhammer, L.L. McKay // J. Dairy Sci. - 1993. -Vol. 76:-P. 1243-1252.

339. Pond, F.R. R-body producing bacteria / F.R. Pond, I. Gibson, J. Lalucat // Microb. Rev. - 1989. - V. 53, № 1. - P. 25-67.

340. Quevedo, B. Phylogenetic group- and species-specific oligonucleotide probes for single-cell detection of lactic acid bacteria in oral biofilms / B. Quevedo, E. Giertsen, V. Zijnge, H. Luthi-Schaller, B. Guggenheim, T. Thurnheer, R. Gmtir //BMC Microbiology.-2011.-Vol. 11, №14.-P. 1-12.

341.Requena, T. Identification, detection and enumeration of human Bifidobacteriun species by PCR targeting the transaldolase gen / T. Requena, J. Burton, T. Matsuki // Appl. Environ Microbiol. -2002. -Vol.68, №5. - P. 2420-2427.

342. Romling, U. Physical genome analysis of bacteria / U. Romling, D. Grothues, T. Heuer, B. Tummler // Electrophoresis. - 1992. - Voll3. - P. 626-631.

343. Roy, D. Molecular differentation of Bifidobacterium species with amplified ribosomal DNA restriction analysis and alignment of short regions of the ldh gene / D. Roy, S. Sirois // FEMS Microbiol Lett. - 2000. - Vol. 191- P. 17 -24.

344. Sager, P.E. Species diversity in lacustrine phytoplankton. I. The components of the index of diversity from Shannon's formula / P.E. Sager, A.D. Hasler // Amer. Natur. - 1969. - V. 103, № 929. - P. 51-59.

345. Schiffrin, E.J. Immunomodulation of human blood cells following the ingestion of lactic acid bacteria / EJ. Schiffrin, F. Rochat, H. Linc-Amster // J. Dairy Sci. - 1995. - Vol. 78. - P. 491-497.

346. Schiffrin, E.J. Interactions between the microbiota and the intestinal mucosa / E.J. Schiffrin, S. Blum // Eu J Clin Nutr. -2002. - Vol. 56. - P. S60-S64.

347. Shannon, C.E. A mathematical theory of communication / C.E. Shannon // Bell System Technical Journal. - 1948. - V. 27. - P. 379-423.

348. Simpson, E.H. Measurement of diversity / E.H. Simpson // Nature. - 1949. - V. 163.-688 p.

349. Song, Y. Rapid identification of 11 human intestinal Lactobacillus species by multiplex PCR assays using group- and species- specific praimers deraived from the 16S-23S rRNA intergenic spacer region and its flanking 23S rRNA /

Y. Song, N. Kato, C. Liu // FEMS Microbiol Lett. - 2000. - Vol. 187. - P. 167173.

350. Southwood, T.R.E. Ecological methods / T.R.E. Southwood. - London: Chapman and Hall, 1978. - 524 p.

351. Spiegel, J.E. Safety and Benefits of Fructooligosaccharides as Food Ingredients / J.E. Spiegel, R. Rose, P. Karabell// Food Technology. - 1994, Jan. - P. 85-89

352. Stene, L.C. Relation between oc currence of type 1 diabetes and asthma / L. C. Stene, P. Nafstad // Lancet. - 2001. - Vol. 357. - P. 607-608.

353. Tani, K. Development of a direct in situ PCR method for detection of specific bacteria in natural environments / K. Tani, K. Kurokawa, M. Nasu // Appl. Environ. Microbiol. - 1998. - Vol.64. - P. 1536-1540.

354. Teale, C.J. Antimicrobial resistance and the food chain / C.J. Teale //J. Appl. Microbiol. - 2002. - Vol. 92. - P. 85.

355. Tilsava-Timisjarvi, A. Development of oligonucleotide praimers froml6S-23S rRNA intergenic sequences for identifying different dairy and probiotic lactic acid bacteria by PCR / A. Tilsava-Timisjarvi, T. Alatossava // Int. J. Food Microbiol. - 1997. - Vol. 35. - P.49 -56.

356. Toole, G.A. Biofilm formation as microbial development / G.A. Toole, H.B. Kaplan, R. Kolter // Annu. Rev. Microbiol. - 2000. - №54. - P.49-79.

357. Thompson, J.P. Product Total Flora. Support Questions and Answers / J.P. Thompson // Iss. Interchange Inc. - 1997.

358. Torriani, S. Differentation of Lactobacillus plantarum, L. pentosus, and L. paraplantarum by recA Gene sequence analysis and multiplex PCR assay with recA gene derived praimers / S. Torriani, G.E. Felis, F. Dellaglio // Appl. Environ Microbiol. - 2001. - Vol.67, №8. - P. 3450-3454.

359. Torriani, S. Use of PCR-based methods for rapid differentiation of Lactobacillus delbrueckii subsp. bulgaricus and Lactobacillus delbrueckii subsp. Lactis / S. Torriani, G. Zapparoli, F. Dellaglio // Appl. Environ Microbiol. - 1999. - Vol.65, №10. - P. 4351-4356.

360. Torriani, S. Plasmid DNA and antibiotic susceptibility in lactobacillus strains from human vagina / S. Torriani, U. Sotilli, A. Giorgi, M.Vescovo, F. Dellaglio // Microbiol, alim. nutr. - 1988. - Vol.6, N1. - P. 63-68.

361. Tynkkynen, S. Comparison of Ribotyping, Randomly Amplified Polymorphic DNA Analysis, and Pulsed-Field Gel Electrophoresis in Typing of Lactobacillus rhamnosus and L. casei srains / S. Tynkkynen, R. Satokari, M.

Saarela, M. Mattila-Sandholm, M. Saxelin // Appl. Environ Microbiol. - 1999. - Vol. 65, №9. - P. 3908-3914.

362. Vandenplas, Y. Helicobacter pylori infection / Y. Vandenplas // Clin Microbiol Infect. - 1999.-Vol.5.-P. 1-11.

363. Ventura, M. Analysis, characterization, and loci of the tuf genes in Lactobacillus and Bifidobacteriun species and their direct application for species identification / M. Ventura, C. Canchaya, V. Meylan // Appl. Environ Microbiol. - 2003. - Vol.69, №11. - P. 6908-6922.

364. Walter, J. Detection and identification of gastrointestinal Lactobacillus species by using denaturating gradient gel electrophoresis and species-specific per primers / J. Walter, G.W. Tannock, A. Tilsava-Timisjarvi // Appl. Environ Microbiol. - 2000. - Vol.67, №8. - P. 297-303.

365. Ward, L.J. Differentiation of Lactobacillus casei, Lactobacillus paracasei and Lactobacillus rhamnosus by polymerase chain reaction / L.J. Ward, M.J. Timmins // Lett Appl Microbiol. - 1999. - Vol.29. - P. 90-92.

366. Williams, C.L. Helicobacter pylori: bacteriology and laboratory diagnosis / C.L. Williams // J Infect. - 1997. - Vol. 34. - P. 1-5.

367. Whittaker, R.H. Communities and ecosystems / R.H. Whittaker - N.Y.; L.: Macmillan, 1970. - 162 p.

368. Whittaker, R.H. Evolution end measurement of species divercity / R.H. Whittaker // Taxon. - 1972. - V.21, № 2/3 - P. 213-251.

369. Yakimov, V. Multifractal diversity-area relationship at small scales in dune slack plant communities / V. Yakimov, B. Bossuyt, D. Iudin, D. Gelashviliy // Oikos. - 2008. - V. 117. - P. 33 - 39.

370. Yu, Z. Dynamics of bacterial community in solid-state fermented feed revealed by 16S rRNA / Z. Yu, B. Dong, W. Lu // Lett Appl Microbiol. - 2009. -Vol.49, №2.-P. 166-72.

371. Yun, J.W. Fructooligosaccharides - Occurence, Preparation and Applications / J.W. Yun // Enzyme a Microbiol. Technol. -1996. - Vol. 19. - P. 107 -117.

372. Zhong, W. Differentiation of lactobacillus species by molecular typing / W. Zhong, R. Millsap, H. Bialkowska-Hobrzanska // Appl. Environ Microbiol. -1998. - Vol.64, №7. -P. 2418-2423.

373. Zoetendal, E.G. DNA isolation protocols affect the detection limit of PCR approaches of bacteria in samples from the human gastrointestinal tract / E.G. Zoetendal, K. Ben-Amor, A.D. Akkermans // Syst Appl Microbiol. - 2001. -Vol. 24, №3. - P.405-410.