Молекулярная эволюция и проблемы филогенетической реконструкции истинных насекомоядных (Mammalia: Eulipotyphla)» тема диссертации и автореферата по ВАК РФ 03.02.04, доктор наук Банникова Анна Андреевна
Банникова Анна Андреевна
доктор наук
2019
- Специальность ВАК РФ03.02.04
- Количество страниц 698
Оглавление диссертации доктор наук Банникова Анна Андреевна
Оглавление
Введение
Актуальность и степень разработанности темы
Цель и задачи работы
Научная новизна
Основные положения, выносимые на защиту
Теоретическое и практическое значение
Личный вклад автора
Степень достоверности результатов
Апробация результатов
Публикации
Структура и объем работы
ГЛАВА I. Эволюция взглядов на систематику Eulipotyphla и общие проблемы современной филогенетики (обзор литературы)
1.1. Отряд истинных насекомоядных: краткая история изучения и современное состояние вопроса
1.2. Нерешенные вопросы эволюции и систематики Eulipotyphla
1.3. Общие причины неразрешенности филогенетических деревьев и несоответствия филогений, реконструированных по разным типам данных
1.4. Концепция вида и определение видовых границ
1.5. Современные молекулярные часы как необходимая часть филогенетической систематики
1.6. Конфликт молекулярной и морфологической филогенетики
ГЛАВА II. Материал и методы
2.1. Материал
2.1.1. Общие сведения о материале: источники материала, географическая 69 характеристика, размер выборок и коллекционные данные
2.1.2. Еппасе1 ёае
2.1.3. Та1р1ёае
2.1.4. Бопаёае
2.2. Экспериментальная часть: выделение ДНК, амплификация и секвенирование
2.2.1. Характеристика генетического материала и выделение ДНК
2.2.2. Исследуемые белок-кодирующие гены
2.2.3. Амплификация и секвенирование
2.2.4. Особенности экспериментальной работы с разными таксонами
2.2.4.1. Erinaceidae
2.2.4.2. Talpidae
2.2.4.3. Soricidae
2.2.5. Секвенирование транскриптома Diplomesodon pulchellum
2.2.6. Inter-SINE-PCR
2.3. Филогенетический и филогеографический анализ: методы, алгоритмы, модели
2.3.1. Филогенетический анализ
2.3.2. Делимитация видовых границ
2.3.3. Филогеографический анализ
2.4. Молекулярная оценка времен дивергенции
2.5. Особенности филогенетического анализа и молекулярного датирования в конкретных группах
2.5.1. Erinaceidae
2.5.2. Talpidae
2.5.3. Soricidae
2.5.3.1. Sorex
2.5.3.2. Neomys
2.5.3.3. Crocidura
2.6. Сравнение скорости эволюции мтДНК в разных группах Eulipotyphla
2.7. Анализ филогенетической информативности генов
2.8. Биоинформатический анализ мультилокусных данных
2.9. Филогенетический анализ результатов inter-SINE-PCR
2.10. Сокращения, приняты в диссертации
ГЛАВА III. Базальная радиация Eulipotyphla
3.1. Несоответствие морфологической и молекулярной концепции истинных насекомоядных возможные причины противоречия
3.2. Филогенетическая информативность индивидуальных генов
3.3. Проверка гипотез с помощью геномных данных
3.3.1. Анализ полных митохондриальных геномов
3.3.1.1. Филогенетическое дерево Eulipothyphla по результатам анализа полных
митохондриальных геномов
3.3.1.2. Анализ нуклеотидного состава мтДНК
3.3.2. Мультилокусный анализ кодирующих ядерных генов
3.3.2.1. Нуклеотидный состав ядерных генов Eulipotyphla
3.3.2.2. Филогенетические отношения Eulipotyphla по мультигенным данным
3.4. Молекулярные времена основных кладогенетических событий насекомоядных
по мультигенным данным
ГЛАВА IV. Erinaceomorpha Gregory,
4.1. Общая характеристика подотряда Erinacomorpha и проблемы изучения
эволюции ежовых
4.2. Нуклеотидный состав митохондриальных и ядерных генов Erinaceidae
4.3. Филогенетический анализ ядерных и митохондриальных генов ежовых.
4.3.1. Филогенетический анализ ядерных генов
4.3.2. Филогенетический анализ митохондриальных генов
4.3.3. Анализ комбинированной последовательности митохондриальных и
ядерных генов
4.3.4. Филогенетический анализ ядерных и митохондриальных данных с использованием мультилокусных методов (построение видового дерева)
4.4. Скорость нуклеотидных замен и результаты молекулярного датирования
4.5. Непостоянство нуклеотидного состава и влияние этого фактора на топологию филогенетического дерева Erinaceinae
4.6. Молекулярно-филогенетические отношения видов Erinaceinae в сравнении с морфологическими данными
4.7. Генетическое разнообразие и филогения современных Hylomyinae
4.8. Предполагаемый эволюционный сценарий Erinaceidae
4.9. Таксономическая интерпретация результатов
4.10. Новые данные о таксономическом разнообразии ежовых видового уровня 236 ГЛАВА V. Talpomorpha Bugge,
5.1. Объем семейства Talpidae и обзор общих проблем надродовой систематики
5.2. Филогенетические связи высоко специализированных групп кротовых Talpini
и Scalopini
5.3. Молекулярные времена радиации и биогеографическая история кротовых
5.4. Общее таксономическое заключение по высокоранговым группам кротовых
5.5. Новые данные о таксономическом разнообразии кротовых видового уровня
5.6. Триба Talpini: европейско-сибирская ветвь
5.6.1. Молекулярная филогения и криптическое разнообразие рода Talpa
5.6.1.1. Общая характеристика рода Talpa
5.6.1.2. Нуклеотидный состав
5.6.1.3. Анализ митохондриального гена cytb
5.6.1.4. Анализ индивидуальных ядерных локусов и комбинированной последовательности из четырех генов
5.6.1.5. Отражение филогении рода Talpa на ядерном, митохондриальном и 261 видовом деревьях
5.6.1.6. Оценка молекулярных времен рода Talpa
5.6.1.7. Генетическое определение видовых границ в роде Talpa
5.6.1.8. Новые данные о таксономическом разнообразии рода Talpa
5.6.1.9. Предполагаемый сценарий радиации Talpa
5.6.2. Филогеография Talpa europaea
5.6.2.1. Структура и пространственное распределение генетической изменчивости
5.6.2.2. Молекулярное разнообразие и историческая демография
5.6.2.3. Морфологические подвиды и генетические линии
5.7. Триба Talpini: юго-восточная ветвь
5.7.1. Проблемы систематики и филогенетики кротов Юго-Восточной Азии
5.7.2. Euroscaptor
5.7.2.1. Результаты молекулярно-генетического анализа
5.7.2.2. Определение видовых границ с использованием методов ABGD и BPP
5.7.2.3. Филогенетические взаимоотношения между видами Euroscaptor
5.7.2.4. Вклад данных по генетическому разнообразию Euroscaptor в систематику
5.7.3. Mogera
5.7.3.1. Филогенетические отношения видов рода Mogera
5.7.3.2. Видовой статусM. latouchei
5.7.3.3. Загадка видовой группы «wogura/robusta»
5.8. Сравнение молекулярной филогении с морфологическими данными, времена дивергенции родов и видов и эволюционная история трибы Talpini
5.9. Таксономическая интерпретация генетического разнообразия Talpini
ГЛАВА VI. Soricomorpha Gregory
6.1. Объем семейства и общие проблемы систематики надродового ранга
6.2. Подсемейство Soricinae G. Fischer,
6.2.1. Надродовая филогения - взаимоотношения родов и триб
6.2.2. Род $>огех- самая преуспевающая группа Бопстае
6.2.2.1. Современное состояние филогенетических исследований рода 8огех
6.2.2.2. Результаты филогенетического анализа ядерных генов
6.2.2.2.1. Подрод ОПзогвх
6.2.2.2.2. Подрод Зогех б^г
6.2.2.3. Митохондриальная филогения рода 5огех
6.2.2.3.1. Подрод $>огех б.бй"
6.2.2.3.2. Подрод Otisorex б^г
6.2.2.3.3. Генетические дистанции в роде 5огех по еуЛ
6.2.2.4. Оценка молекулярных времен
6.2.2.5. Обсуждение филогенетических взаимоотношений видов рода 5огех.
6.2.2.5.1. Otisorex: филогенетическое положение 5. hoyi
6.2.2.5.2. 8огех б^г.: соответствие результатов секвенирования ядерных генов морфологическим, митохондриальным и кариологическим данным
6.2.2.6. Гибридизация и интрогрессия в роде 5огех
6.2.2.6.1. Генетическая неоднородность 8огех satunini как возможный результат древней гибридизации и эволюция кариотипов в группе «агапеш»
6.2.2.6.1.1. Результаты анализа разных локусов генома
6.2.2.6.1.2. Вероятные объяснения несогласованности митохондриальной и
ядерной филогений
6.2.2.6.2. Эволюция ДНК и эволюция кариотипов в группе «агапеш»
6.2.2.7. Таксономическая интерпретация молекулярной филогении рода 8огех
6.2.2.8. Молекулярные времена дивергенции и исторический сценарий эволюции 384 5огех
6.2.2.9. Сравнительная филогеография широкоареальных видов 5огех б^г
6.2.2.9.1. 5огех саесиЫет
6.2.2.9.2. isodon
6.2.2.9.3. гоЪогаШ
6.2.2.9.4. daphaenodon
6.2.2.9.5. агатт
6.2.2.9.6. штиШ
6.2.2.9.7. шinutissiшus
6.2.2.9.8. tundrensis - голарктическая филогеография вида с глубокой
генетической структурой
6.2.3. Триба Neomyini Matschie, 1909 - молекулярная диверсификация полуводных землероек
6.2.3.1. Neomys
6.2.3.1.1. Объем таксона и географическое распространение
6.2.3.1.2. Филогенетический анализ молекулярных данных
6.2.3.1.3. Эволюционный сценарий и времена дивергенции
6.2.3.1.4. Таксономические и методологические выводы
6.2.3.2. Chimarrogale
6.2.3.2.1. Объем таксона и географическое распространение
6.2.3.2.2. Филогенетический анализ молекулярных данных
6.2.3.2.3. Анализ морфологических данных
6.2.3.2.4. Таксономическая ревизия Chimarrogale Вьетнама с комментариями по таксономии и биогеографии
6.2.3.3. Episoriculus и Chodsigoa
6.2.3.3.1. Episoriculus
6.2.3.3.2. Chodsigoa
6.2.3.4. 6.2.3.4. Триба Blarinellini Reumer, 1998, род Blarinella
6.2.3.4.1. Объем Blarinella s. lato и географическое распространение
6.2.3.4.2. Своеобразие экземпляров Blarinella с юга Ганьсу и севера Сычуани
6.2.3.4.3. Анализ голотипа griselda и дифилия рода Blarinella
6.2.3.4.4. Географическое распространение Blarinella s.str. и Parablarinella
6.2.3.4.5. Филогенетическое положение Blarinella и Parablarinella
6.3. Подсемейство Crocidurinae Milne-Edwards,
6.3.1. Общая характеристика и современные представления о систематике
6.3.2. Род Crocidura Wagler,
6.3.2.1. Общая характеристика и современные представления о филогении рода
6.3.2.2. Результаты молекулярно-филогенетического анализа взаимоотношений евроазиатских и афротропических ветвей Crocidura
6.3.2.3. Африканская ветвь
6.3.2.3.1. Филогенетические связи эндемичных видов Эфиопии с эндемичными белозубками Танзании
6.3.2.3.2. Филогенетические связи эндемичных видов Эфиопии с европейскими видами белозубок
6.3.2.4. Белозубки Юго-Восточной Азии
6.3.2.4.1. Современное состояние исследований белозубок ЮВ Азии
6.3.2.4.2. Результаты анализа митохондриальных генов COI и cytb
6.3.2.4.3. Результаты анализа ядерных генов
6.3.2.4.4. Таксономический статус и филогенетические связи белозубок Вьетнама и Мьянма с интерпретацией не диагностированных или не верно диагностированных сиквенсов ГенБанка
6.3.2.5. Палеарктическая группа видов «suaveolens» (малая белозубка).
6.3.5.1. Общая характеристика и современные взгляды на систематику группы
6.3.5.2. Анализ митохондриального гена cytb
6.3.5.3. Анализ ядерной ДНК
6.3.5.4. Скорость замен и молекулярные датировки основных событий
дивергенции
6.3.5.5. Филогенетические отношения, таксономический статус и исторический сценарий основных видов комплекса C. suaveolens s.lato
6.3.5.6. Филогеография и демографическая история C. suaveolens s.str
6.3.5.7. Таксономическая интерпретация генетического разнообразия C. suaveolens
s.lato
6.4. Таксономические выводы по главе Soricidae
ГЛАВА VII. Особенности молекулярной эволюции, эволюционная история и новая таксономическая система Eulipotyphla
7.1. Динамика нуклеотидного состава - основная особенность молекулярной эволюции насекомоядных
7.2. Скорость молекулярной эволюции - основная проблема филогенетической реконструкции Eulipotyphla
7.3. Другие проблемы филогенетической реконструкции
7.4. Филогения истинных насекомоядных - эволюционная история групп
7.4.1. Solenodontidae - на периферии эволюции
7.4.2. Erinaceidae - осколки древнего разнообразия и «большой взрыв»
7.4.3. Talpidae - узкий путь
7.4.4. Soricidae - рывок в молекулярной эволюции
7.4.5. Гумидность - проклятие насекомоядных
7.5. Структура вида в разных группах насекомоядных и криптическое формообразование
7.5.1. Структура вида насекомоядных и грызунов разных природных зон
7.5.2. Криптические виды - истинные и полукриптические и определение видовых
границ
7.6. Времена основных групп, ранги таксонов и система Eulipotyphla
Выводы
Список цитированной литературы
Благодарности
Публикации по теме диссертации
Рекомендованный список диссертаций по специальности «Зоология», 03.02.04 шифр ВАК
Раннепалеогеновые насекомоядные млекопитающие Азии и становление основных групп Insectivora2006 год, доктор биологических наук Лопатин, Алексей Владимирович
Филогенетические связи и систематика хвостатых амфибий семейства углозубов: Amphibia: Caudata, Hynobiidae2010 год, кандидат биологических наук Поярков, Николай Андреевич
Внутривидовая изменчивость и филогенетические отношения корюшковых рыб России2010 год, кандидат биологических наук Ковпак, Наталья Евгеньевна
Сравнительное исследование эволюционных историй букетов видов байкальских беспозвоночных2003 год, доктор биологических наук Щербаков, Дмитрий Юрьевич
Молекулярная эволюция и филогенетические отношения в двух группах рыб семейств Mugilidae и Cyprinidae2008 год, кандидат биологических наук Семина, Алиса Владимировна
Введение диссертации (часть автореферата) на тему «Молекулярная эволюция и проблемы филогенетической реконструкции истинных насекомоядных (Mammalia: Eulipotyphla)»»
ВВЕДЕНИЕ
Актуальность и степень разработанности темы
Знание филогенетических отношений между организмами - это условие продуктивности всех дальнейших эволюционных исследований, включая изучение адаптаций, видообразования и биогеографии. Поэтому реконструкция Древа Жизни составляет фундаментальную проблему биологии со времен первого «рукописного» филогенетического дерева Чарльза Дарвина и по сей день, когда филогенетика стремительно преобразуется в область математического моделирования на основе филогеномных данных. Молекулярная филогенетика млекопитающих за последние 20 лет (Stanhope et al., 1998; Waddell et al., 1999c; Murphy et al., 2001а, b; Douady et al., 2002; Nikaido et al., 2003; Nishihara et al., 2006; dos Reiz et al., 2012; Meredith et al., 2011) принесла устойчивое, в основном вполне разрешенное и продатированное молекулярное древо плацентарных, которое на уровне высокоранговых таксонов вряд ли уже будет поколеблено в своей основе. Однако осталось немало таксонов, которые все еще содержат много нерешенных вопросов. Истинные насекомоядные - это один из них.
В широком понимании (Hutterer, 2005) насекомоядные - Lipotyphla Haeckel, 1866 включают три отряда: (1) Afrosoricida Stanhope, 1998 (подотряды Tenrecomorpha Butler, 1972 и Chryzochloridea Broom, 1915), (2) Erinaceomorpha Gregory, 1910 (семейство Erinaceidae - ежовые) и (3) Soricomorpha Gregory, 1910 (семейства: Talpidae - кротовые; Soricidae - землеройковые; Solenodontidae - щелезубы). В узкой концепции (Dawson, Krishtalka, 1984; Novacek, 1986; Butler, 1988) обычно выделяют два подотряда: Erinaceomorpha и Soricomorpha. Их объём понимается по-разному: Talpidae чаще всего включаются в Soricomorpha (Gregory, 1910; Butler, 1988; Павлинов, 2003), согласно альтернативной концепции кротовые ближе к Erinaceomorpha (McDowell, 1958; McKenna, 1975). До молекулярных исследований тенреков и златокротов относили к насекомоядным, объединяя их в отдельной кладе (например, McDowell, 1958; Butler, 1988), или златокротов выделяли в самостоятельную ветвь насекомоядных (Gill, 1872; Saban, 1954; MacPhee et al., 1993), а тенреков считали близкими к щелезубам (Gregory, 1910; Butler, 1956; Van Valen, 1967). В настоящее время к истинным насекомоядным Eulipotyphla Waddell, 1999 относят только ежей, кротов, землероек и щелезубов.
Согласно кладистическому анализу морфологических признаков (Shoshani, McKenna, 1998; OLaery et al., 2013) Lipotyphla - это базальная ветвь Epitheria (плацентарные за
вычетом неполнозубых). В широком толковании они традиционно считались ключевой группой для понимания эволюции плацентарных на разных уровнях организации, и одновременно в течение десятилетий систематика насекомоядных оставалась наиболее спорной и противоречивой (MacPhee et al., 1993; Novacek, 1992). Симпсон (Simpson, 1945) удачно назвал эту группу «мусорной корзиной мелких млекопитающих». Батлер (Butler, 1972) более деликатно описал насекомоядных как «эутерий, которые не принадлежат ни к одному из более четко определенных отрядов». Другими словами, это то, что осталось не классифицированным после классификации.
Под влиянием молекулярных исследований систематика насекомоядных по сравнению с другими млекопитающими изменилась в наибольшей степени. Lipotyphla оказались полифилетическим таксоном, в котором ежи, кроты, землеройки и щелезубы (Eulipotyphla) - это базальная ветвь Laurasiatheria, а златокроты и тенреки (Afrosoricida) -часть эндемичной африканской клады Afrotheria (Murphy et al., 2001a, b; Douady et al., 2002).
Термин Eulipotyphla был введен для того, чтобы подчеркнуть дифилию Lipotyphla (Waddell et al., 1999c). Однако с точки зрения ведущих систематиков (Asher, Helgen, 2010; Аверьянов, Лопатин, 2014) в таксономической системе название Lipotyphla не следует заменять на Eulipotyphla (также как Archonta на Euarchonta и Artiodactyla на Cetartiodactyla), т.к. Eulipotyphla Waddell, 1999 - это младший синоним Lipotyphla Haeckel, 1866. Эти авторы предлагают избегать такие префиксы, если содержание клады существенно не меняется. Однако, во-первых, я не могу согласиться с тем, что содержание клады Lipotyphla существенно не изменилось, т.к. половина таксонов переместилась в другой подотряд, а, во-вторых, после разделения Insectivora на Menotyphla и Lipotyphla, было предложено отказаться от названия Insectivora. В Международном Кодексе Зоологической номенклатуры (2004) названия выше семейства не регулируются. Аргументация к стабильности номенклатуры в общем смысле разумна, но в применении к конкретной ситуации в настоящее время не валидна, так как в научной литературе с заметным перевесом уже используется название Eulipotyphla (см. scholar.google за период 2001-2019).
Наконец, я полагаю, что сохранение за истинными насекомоядными прежнего широкого названия Lipotyphla будет путать его смысловое содержания, поскольку некоторые авторы (например, Lopatin, 2006) подразумевают под ним и афросорицид. Поэтому далее в диссертации в применении к истинным насекомоядным я использую название Eulipotyphla.
Сегодня более не существует разногласий по поводу объема и монофилии истинных насекомоядных ЕиНро1урЫа (8о1епоёопйёае, Еппасе1ёае, Та1р1ёае, Бопаёае). Однако взаимоотношения этих четырех групп до сих пор остаются одним из самых «проклятых» узлов филогенетического древа млекопитающих.
Внутри себя каждая из групп истинных насекомоядных тоже содержит множество нерешенных вопросов, касающихся происхождения, филогенетических отношений и систематики. Так, до начала наших исследований отсутствовала доказательная филогенетическая гипотеза для Erinaceidae, что на фоне множества успешно разработанных молекулярно-филогенетических концепций самых разных групп млекопитающих - удивительный факт. С течением времени оказалось, что проблема заключается в особенности молекулярной эволюции ежовых - сильно сдвинутой нуклеотидной и аминокислотной композиция ДНК. Проблема филогенетической реконструкции кротовых - это большая роль морфологических параллелелизмов в эволюции подземного образа жизни, что является потенциальным источником конфликта молекулярных и морфологических филогений и искажает представления о реальном таксономическом разнообразии этой группы. В семействе землероек диагностика видов Бопстае по морфологическим признакам хорошо разработана, однако молекулярно-филогенетическая система подсемейства в целом остается недоработанной, а объем, филогенетические отношения и систематика большинства родов ожидает серьезная ревизия. Другое подсемейство, Сгоаёиппае, по-прежнему представляет собой одну из самых сложных в таксономическом отношении групп млекопитающих. Привлечение молекулярно-генетических методов к изучению филогении и систематики Сгоаёиппае в настоящее время вскрыло сложные проблемы в эволюции разнообразия этой группы, усугубленные большим числом криптических форм разного таксономического ранга.
Систематика насекомоядных в полной мере отражает проблемы современной таксономии и противоречия универсальной концепции вида. Современная систематика -это филогенетическая систематика (Павлинов, 2005). Очевидно, что решение всех поставленных выше вопросов возможно только в рамках этого подхода на основе молекулярно-генетических данных, позволяющих получить прямой филогенетический сигнал - информацию о гомологии, разнообразии, и, следовательно, об эволюционной истории организмов, которая содержится в их разнообразии. Объективная оценка филогенетических связей имеет значение не только для естественной классификации живого мира, но также для понимания механизмов и движущих факторов эволюционной истории. Любые выводы сравнительной биологии находятся в зависимости от аккуратной
оценки эволюционных связей. Хотим ли мы понять направление эволюции HOX-генов, или узнать временной порядок генных перестроек в хромосомах, или оценить степень таксон-специфичности базального метаболизма, - для всего этого необходимы знания родственных связей изучаемых организмов: "nothing in biology makes sense except in the light of evolution" (Dobzhansky, 1973).
Между тем, несмотря на усилия в области теории филогенетики и таксономии (см. обзоры: Павлинов, 2005; Павлинов, Любарский, 2011; Шаталкин, 2012; Padial et al., 2010), до сих пор справедливо замечание, сделанное еще 30 лет назад, о том, что биологи так и не разработали целостную филогенетическую систему классификации (de Queiroz, Gauthier, 1992). Предложенная в свое время научная программа Хеннига (Hennig, 1966) обрела популярность, но с его кладистической систематикой этого не случилось. Современная систематика - это смесь кладизма и классической филогенетики, признающей парафилетические таксоны. Но продвинутость современных систем состоит в очевидной тенденции отказываться от парафилии рецентных таксонов (например, система Rodentia на уровне подотрядов в 6-м томе издания Handbook of the Mammals of the World (Barthelmess, Bennett, 2016).
Наконец, открытым остается вопрос, будут ли, наконец, систематики в состоянии разработать и принять систему с объективно обоснованными таксономическими рангами? В настоящее время Линнеевские ранги по-прежнему активно используются, но уже очевидно не соответствуют задачам таксономии и не отражают современный уровень знания о филогенетических связях организмов. Их объективные характеристики отсутствуют, они мало соотносимы в разных группах, их невозможно непосредственно наложить на шкалу времени (Avise, Liu, 2011) и потому временные несоответствия пронизывают нынешние классификации. В безранговой филогенетической систематике (филокодексе) система сводится к кодексу номенклатуры видов, для которых установлены филогенетические связи (de Queiroz, Gauthier, 1990, 1992, 1994). Однако иерархическая система классификации представляется большинству систематиков более привычной и логичной и научное сообщество пока не готово отказаться от нее. Можно ли не отказываться от рангов совсем, но сделать их объективными?
Хенниг (Hennig, 1966) был первым, кто отметил, что абсолютное время эволюции могло бы быть стандартом для синхронизации таксономических рангов. Его замечание "If systematics is to be a science it must bow to the self-evident requirement that objects to which the same name is attached must be comparable in some way" остается актуальным по сей день. Однако для использования временной шкалы в классификации таксономических
рангов необходимы адекватно документированные данные о временах, которые, помимо палеонтологических и биогеографических источников, могут и должны быть взяты из результатов молекулярного датирования.
Преимущество современной филогенетической систематики заключается в том, что она использует огромные наборы данных, генерируемых мультилокусными методами молекулярно-генетического анализа. Первые попытки выяснения родственных отношений организмов по расшифрованным последовательностям ДНК были основаны на секвенировании единичных генов. Сначала большие надежды возлагали на митохондриальную ДНК (мтДНК) и анализ полных митохондриальных геномов. Однако эффект насыщения в нуклеотидной последовательности и «экранирование» филогенетического сигнала при построении филогений давно и глубоко дивергировавших таксонов обуславливают недостаточную информативность отдельных митохондриальных генов, среди которых в изучении генетической изменчивости млекопитающих наиболее популярны cyt Ь, COI, 12S и 16S. Кроме того, вследствие того, что мтДНК эволюционирует как единый локус и позволяет исследовать только матрилинеальную филогению, воспроизводимая историческая картина может быть далека от исчерпывающей и искажена, если в истории видов имели место события гибридизации и интрогрессии (например, Wu е! а1., 2005; Уапшс е! а1., 2010). Оказалось, также, что полные митохондриальные геномы могут быть источником крупных филогенетических ошибок (ЛтаБоп et а1., 2002), особенно вне тщательного подбора моделей, учитывающих значительные различия скоростей эволюции и сдвиги нуклеотидного состава в ветвях дерева (Кау1ог, Brown, 1998; Wadde11 е! а1., 1999а, Ь; К1ка1ёо е! а1., 2001; 2003), не всегда принимаемые во внимание филогенетическими программами. Тем не менее, при использовании даже единичных или немногих митохондриальных генов было получено немало информативных филогений видового и родового уровня, которые позднее в основном воспроизвелись на ядерных генах (например: 1ааго1а е! а1., 2004; Вапшкоуа е! а1., 2010Ь; Со1ап§е1о, Вапшкоуа, Кгу&иГек е! а1., 2010).
Переход к анализу консервативных ядерных локусов (экзонов белок-кодирующих генов) частично решал проблему ограничения шкалы времени, в пределах которой мог быть получен филогенетический сигнал, возникавшую в филогенетических исследованиях высоко ранговых таксонов из-за высокой скорости мутирования мтДНК. Однако практически сразу выяснилось, что использование 1-2-х ядерных генов недостаточно для получения разрешенных филогений, и магистральным направлением молекулярной
филогенетики сделался мультилокусный анализ (см. для обзора Snel et al., 2005; Degnan, Rosenberg, 2009; Springer, Gatesy, 2016).
На этом этапе использование последовательностей ДНК в систематике обострило проблему правомочности отождествления и трансляции истории разнообразия последовательностей ДНК, т.е. филогенетических деревьев генов, митотипов и аллелей — в сущностную основу систематики - филогенетические деревья видов и популяций, или видовые деревья (Avise 2000; Nichols, 2001). Полиморфизм ДНК - это не совсем прямое и далеко не полное окно в историю видов потому, что виды включают линии, состоящие из множества индивидов, которые несут множество генов. Если принять, что виды - это более высокий уровень биологической организации, чем гены, то программа систематики будет выглядеть неполной без обоснования четкого разграничения между видовыми и генными деревьями и указания на филогенетические взаимоотношения видов, гены которых мы секвенируем. Но и генные, и видовые деревья в равной мере отражают разные аспекты одного филогенетического процесса (Avise, 1994). Поэтому видовое дерево представляет для систематика и эволюциониста главный интерес, но генные деревья способствуют пониманию популяционно-демографических событий, находящихся в истоке процесса формообразования.
Только использование множества генных локусов позволило строить не генные, а «видовые деревья» (species tree). Отличие подхода видового дерева от прямого анализа комбинированной последовательности многих генов заключается в том, что минимальными операциональными единицами здесь являются не единичные особи или их небольшие группы, а популяции или группы популяций, включающие множество аллелей. Преодолеть недостатки анализа комбинированной последовательности видовому дереву позволяет то, что оно опирается на модель, включающую, уровень анцестрального полиморфизма в каждом узле (Nichols, 2001; Rannala, Yang, 2003; Degnan, Salter, 2005; Maddison, Knowles, 2006). Учитывая анцестральный полиморфизм и коалесцентные события в филогенетическом анализе, видовое дерево тем самым образует концептуальный мостик между систематикой и популяционной генетикой (Brito, Edwards, 2009).
В последние годы для решения задач филогении и популяционной генетики общепринятой практикой становится использование данных высокопроизводительного секвенирования (NGS). Это связано с постепенным исчерпанием возможностей секвенирования сотен отдельных генов по методу Сэнгера с одной стороны и накоплением материала по полным геномам — с другой. Доступный в онлайн-базах
геномных данных материал неравномерно покрывает различные систематические группы. Например, Eulipotyphla относительно общего количества видов представлены крайне слабо, при том, что круг проблем, которые решаются в этой группе молекулярными методами — огромен. Решение вопроса о взаимоотношении ветвей Eulipotyphla до последнего момента осложнялось не только отсутствием полного генома крота, но и аналогичной проблемой для ключевой ветви Soricidae - подсемейства Crocidurinae (при том, что для Soricinae такие данные имеются).
Молекулярная систематика отдельных групп Eulipotyphla одновременно с моими исследованиями разрабатывалась несколькими зарубежными авторами. Среди этих работ наиболее значимы молекулярно-филогенетическая реконструкция семейства Soricidae на уровне триб и родов (Dubey et al., 2007e; 2008c) и трибы землероек Neomyini на уровне родов и видов (He et al., 2010), а также молекулярно-филогенетические исследования Talpidae (He et al., 2014, 2017; Shinohara et al., 2014; 2015). Кроме того, ранее уже была предложена молекулярная концепция эволюции ''Insectivora'' с оценкой времен дивергенции основных клад, однако в этом исследовании отсутствовали Solenodontidae (Douady, Douzery, 2003). Надо отметить, что результаты упомянутых работах получены в основном на 4-х-8 генах, включая митохондриальные; на максимальном числе ядерных локусов (19) основана только филогения кротовых (He et al., 2017). Таким образом, в молекулярной систематике насекомоядных, как, впрочем, и в большинстве других групп млекопитающих, этап полноценного мультилокусного анализа генетических данных еще не пройден, а к массовому применению методик секвенирования нового поколения и филогенетическому анализу полногеномных данных только приступают.
Одно из последствий процесса экспансии молекулярных данных в зоологию - это дальнейшее развитие и усиление генетической концепции вида (Bateson, 1909, Dobzhansky, 1934, Muller, 1939, Nei, 1976; Masters, Spencer, 1989; Avise, Ball, 1990; Mayden, 1997; Bradley, Baker, 2001; Butlin, 2005 и др.), которой и придерживается автор диссертации. Согласно генетической концепции (ГКВ), вид - это совокупность природных популяций, которые генетически совместимы друг с другом, но изолированы от других подобных совокупностей, а видообразование есть аккумуляция генетических изменений между двумя филетическими линиями, что обеспечивает защиту и изоляцию их генофондов (Baker, Bradley, 2006). ГКВ предлагает расширенное понимание репродуктивной изолированности, операциональный критерий этой концепции состоит в количественной оценке уровня дивергенции геномов, идентификации природных гибридов и анализа потока генов между таксонами.
В настоящей работе все таксономические решения принимаются мной в рамках филогенетической систематики и генетической концепции вида. Цель и задачи работы
Цель работы: молекулярно-филогенетическая реконструкция эволюционной истории основных ветвей ЕиНро1урЫа и анализ вклада вторичных факторов (нуклеотидный состав и варьирование скоростей нуклеотидных замен) в искажение филогенетического сигнала. Задачи:
1. Реконструкция порядка ветвления основных клад ЕиНро1урЫа (Еппасе1ёае, Бопаёае, Та1р1ёае, 8о1епоёопйёае) по мультилокусным данным.
2. Анализ филогенетических связей родового и видового уровня в семействах Еппасе1ёае, Та1р1ёае и Бопаёае на основе секвенирования ядерных и митохондриальных генов.
3. Анализ нуклеотидного состава ДНК и скорости молекулярной эволюции в основных группах истинных насекомоядных и определение влияния этих факторов на результат филогенетической реконструкции.
4. Молекулярная оценка времен основных событий дивергенции ЕиНро1урЫа.
5. Филогеографический анализ структуры широкоареальных видов и разработка операционального критерия для определения видовых границ в пределах ЕиНро1урЫа.
6. Ревизия таксономической системы ЕиНро1урЫа на основе молекулярной реконструкции филогенетических отношений и времен основных событий дивергенции.
Научная новизна
Впервые базальная радиация ЕиНро1урЫа проанализирована по нескольким сотням локусов ядерной ДНК и показано, что различающиеся скорости накопления замен в разных ветвях филогенетического дерева и динамика нуклеотидного состава составляют главную особенность молекулярной эволюции и основную проблему в воссоздании эволюционной истории этой группы. Впервые композиция нуклеотидного состава митохондриальных и ядерных генов детально проанализирована в каждом семействе Eulipotyphla и подсемействах ЕппасеошогрЬа и БопашогрИа. Впервые на основе мультилокусных ядерных данных и полных митохондриальных геномов получены оценки скорости молекулярной эволюции во всех основных ветвях филогенетического дерева ЕиНро1урЫа.
Впервые на основе мультигенных данных определены филогенетические отношения внутри основных групп ЕиНро1урЫа на уровне таксонов всех рангов (семейства-подсемейства-трибы-роды-виды-подвиды) и проведена молекулярная датировка событий дивергенции. Впервые показана, что принятые в настоящее время
таксономические ранги насекомоядных не отражают истинного уровня их дивергенции при сравнении с отрядами и семействами других млекопитающих. Разработана новая таксономическая система Eu1ipotyph1a, отражающая генеалогию филетических линий и время кладогенетических событий.
Для многих видов Eu1ipotyph1a впервые получены последовательности ДНК, определены филогенетические связи и систематическое положение. По результатам работы описано три новых вида и два новых рода; открыто, но не описано три новых вида и два рода; пересмотрен ранг восьми таксонов видового и родового уровня (в 3-х случаях ранг таксонов поднят до видового; для 4-х таксонов ранги изменены на родовой уровень). На основе полученных данных проведена таксономическая ревизия родов Иеш1есЫпт, Иу1ошу$, Та1ра, Mogera, Euroscaptor, Episoriculus, Chiшarrogale, Sorex, №еошу£). Предложены гипотезы эволюционной истории Erinaceidae, Ta1pidae и Soricidae. Основные положения, выносимые на защиту
1). Разделение трех основных линий насекомоядных - Eгinaceidae, Soгicidae и Ta1pidae, представляет собой почти одновременное событие дивергенции конца мела-начала палеоцена; все группы истинных насекомоядных (Eгinaceidae, Soгicidae, Ta1pidae, So1enodontidae) по времени дивергенции соответствуют рангу отрядов/подотрядов других млекопитающих.
2). Наиболее очевидную проблему для восстановления порядка кладогенетических событий в каждой из основных клад истинных насекомоядных, а также филогенетического дерева ЕиНро!урЫа в целом составляют большая древность основных линий, отсутствие близких сестринских групп в одних случаях и высокая скорость формообразования в других, неравномерность скорости молекулярной эволюции и нуклеотидного состава и его сдвиг в ряде таксонов.
3). Возраст таксона - это важнейший критерий его ранга; в рамках конкретных групп логично использовать времена для проведения границы между разными таксономическими рангами.
4). На защиту также выносятся новая таксономическая интерпретация молекулярной филогении и реконструированные эволюционные истории изученных групп насекомоядных.
Теоретическое и практическое значение
Работа является фундаментальным научным исследованием. Результаты работы вносят вклад в создание естественной системы классификации животного мира и инвентаризацию биоразнообразия, способствуют познанию закономерностей
формирования видовой структуры и видообразования. Полученные данные по систематике, криптическому разнообразию и генетической структуре видов насекомоядных мировой фауны важны для оценки и анализа биологического разнообразия экосистем Палеарктики Неарктики, Юго-Восточной Азии и Африки и могут быть использованы для уточнения региональных таксономических списков.
Полученные сведения по филогенетике, филогеографии и систематике, были использованы при подготовке таксономических сводок по млекопитающим России (Банникова А.А., Лебедев В.С., Отряд Насекомоядные // Млекопитающие России: систематико-географический справочник / ред. И.Я. Павлинов, А.А. Лисовский -товарищество научных изданий КМК, 2012. Т.52. С. 25-72) и млекопитающим Туркменистана (Марочкина В.В., Банникова А.А., Крускоп С.В., Лебедев В.С. Таксономический обзор современной фауны млекопитающих Туркменистана // Изучение биоразнообразия Туркменистана (позвоночные животные) / ред. Сопыев О.С., Херремов Ш.Р. - Москва-Ашхабад: Мензбировское Орнитологическое общество, Среднеазиатское отделение, 2013. С. 207-242). Разработанные методики включены в методические пособия по изучению генетической изменчивости животных в природе (Белоконь М.М., Белоконь Ю.С., Банникова А.А., Политов Д.В. Молекулярно-генетические методы в изучении сообществ позвоночных животных на ЗБС. Методическое пособие - М.: ИОГен РАН, 2014. - 24 с.; Булатова Н.Ш., Павлова С.В., Банникова А.А., Наджафова Р.С., Быстракова Н.В. Практика полевой геномики: памятка по сбору проб. Методическое пособие - М.: ИПЭЭ РАН. - 2009 - 24 с.) и применялись в самостоятельных работах в течение летней полевой практики студентов Биологического факультета МГУ в 2010-2014 гг. Сведения о материале, собранном и проанализированном в процессе подготовки работы, использованы в создании информационной базы Национального банка-депозитария живых систем. Результаты диссертации используются в лекционных спецкурсах кафедры зоологии МГУ по молекулярным методам в систематике и экологии, основам Биологической систематики и филогенетики, а также в курсе по систематике и биологии млекопитающих. Личный вклад автора
Диссертационная работа является результатом многолетних исследований (1999-2019 гг.), выполненных лично автором и в рамках совместной деятельности с сотрудниками и студентами кафедры зоологии позвоночных и Зоологического музея МГУ им. М.В. Ломоносова, а также общих научно-исследовательских проектов с институтами Молекулярной Биологии им. Энгельгардта, ИПЭЭ РАН и ЗИН РАН. Автором была
определена цель, сформулированы задачи исследования, основные положения и выводы, подготовлен текст диссертации. Автор принимал участие на всех этапах исследования, включая участие в экспедиционных работах, сбор и обработку материалов, молекулярно-генетический анализ данных, интерпретацию полученных результатов и подготовку публикаций. Основная часть молекулярно-генетических исследований, филогенетический и филогеографический анализ выполнены лично автором. Содействие в расчете молекулярных датировок оказано В.С. Лебедевым. Биоинформатический анализ геномных данных выполнен И.В. Артюшиным и В.С. Лебедевым. Степень достоверности результатов
Достоверность результатов обоснована большим объемом данных, воспроизводимостью результатов, использованием современных подходов молекулярной систематики и методов молекулярно-генетического анализа, корректным применением статистических, филогенетических и биоинформатических методов, критическим анализом результатов исследования и сопоставлением их с актуальными данными литературы. Апробация результатов
Основные положения работы доложены на международных совещаниях "Териофауна России и сопредельных территорий" (Москва, 2003, 2007, 2011, 2016); на международной конференции «Биология Насекомоядных млекопитающих» (Кемерово, 1999); на международой конференции "Biology of the Soricidae II" (Powdermill Biological Station, Подермилл, 2002); на 6-м международном Совещании по цитогенетике Sorex araneus "6-th Meeting of the International Sorex araneus Cytogenetics Committee (ISACC)" (Париж, 2002); на международной конференции «Проблемы филогении, систематики и палеонтологии мелких млекопитающих» (Санкт-Петербург, 2003); на 7-м международном Совещании по цитогенетике Sorex araneus "7-th Meeting of the International Sorex araneus Cytogenetics Committee (ISACC)" (Санкт-Петербург, 2005); на 5-м международном териологическом конгрессе "V European Congress of Mammalogy" (Сиена, 2007); на международной конференции "Молекулярно-генетические основы сохранения биоразнообразия млекопитающих Голарктики" (Черноголовка, 2007); на конференциях «Современные проблемы зоо- и филогеографии млекопитающих» (Пенза, 2009) и «Целостность вида у млекопитающих» (Петергоф, 2010); на 2-й международной конференции "Advances in the biology of shrews" (Сыктывкар, 2010); на всероссийской конференции «Систематика, филогения и палеонтология мелких млекопитающих» (Санкт-Петербург, 2013); на XI Териологическом Конгрессе Италии (XI Congresso Italiano di Teriologia) (Флоренция, 2018).
Публикации
Фактические материалы и теоретические положения диссертации отражены в 89 публикациях (из них 19 статей в отечественных журналах и 20 в зарубежных изданиях из перечня WoS/Scopus/RSCI/ВАК, 9 статей в сборниках, в том числе три главы в зарубежных изданиях, 2 методических пособия, 38 тезисов устных и постерных докладов на российских и международных конференциях). Опубликованы также 45 статей по другим вопросам и группам млекопитающих, не вошедшие в материалы диссертации, и 10 статей по орнитологии и герпетологии. Структура и объем работы
Диссертационная работа изложена на 697 страницах, содержит 80 таблиц, 139 рисунков и состоит из следующих разделов: введение, обзор литературы, материалы и методы исследования, результаты и обсуждение результатов (в пяти главах), выводы, благодарности, список литературы, публикации по теме диссертации. Список литературы включает 982 источников, из которых 879 - на иностранных языках.
Похожие диссертационные работы по специальности «Зоология», 03.02.04 шифр ВАК
Молекулярно-генетические особенности внутривидовых форм обыкновенной бурозубки Sorex araneus (Mammalia)2012 год, кандидат биологических наук Григорьева, Ольга Олеговна
Молекулярно-филогенетическое исследование камбалообразных рыб (Pisces, Pleuronectiformes) дальневосточных морей России по нуклеотидным последовательностям генов цитохрома B и цитохромоксидазы 12010 год, кандидат биологических наук Шарина, Светлана Николаевна
Млекопитающие Эфиопского нагорья: пути и особенности формирования фауны горных тропиков2009 год, доктор биологических наук Лавренченко, Леонид Александрович
Анализ эволюционной изменчивости гена COI и его использование для филогении и систематики таксонов с высоким видовым разнообразием на примере комаров-звонцов подсемейства Chironominae: Chironomidae, Diptera2011 год, кандидат биологических наук Демин, Александр Геннадьевич
Эколого-эволюционные факторы организации сообществ бурозубок (insectivora, soricidae, sorex) Северной Азии2003 год, доктор биологических наук Сергеев, Владимир Евгеньевич
Заключение диссертации по теме «Зоология», Банникова Анна Андреевна
Выводы
1. Результаты работы соответствуют гипотезе почти одновременной дивергенции основных линий Eulipotyphla: Erinaceomorpha, Talpomorpha, Soricomorpha и Solenodonta. В сравнении с другими млекопитающими, ранг этих групп не ниже подотряда.
2. Дивергенция гимнур и колючих ежей - это древнее событие начала эоцена; по
молекулярным данным разделение современных ветвей гимнур происходило в позднем эоцене, современные колючие ежи взрывообразно радиировали на границе миоцена-плиоцена. Давнее время и внушительный уровень дивергенции дают основание полагать, что ранг гимнур и колючих ежей может быть поднят до семейства.
3. Ушастая гимнура Hylomys megalotis не относится к роду Hylomys s.str., правильным является придание этой форме полного ранга нового рода Otohylomys gen. nov. и выделение его в самостоятельное подсемейство Otohylomyinae. Даурский еж согласно филогенетической систематике относится к роду Hemiechinus. Длинноиглые ежи Paraechinus безусловно являются самостоятельным родом, сестринским к Hemiechinus.
4. Время разделения двух основных подсемейств Soricomorpha - Soricinae и Crocidurinae по молекулярным данным относится к позднему эоцену и соответствует времени дивергенции семейств других млекопитающих.
5 Выделяемые в составе Soricinae четыре трибы (Anourosoricini, Neomyini, Blarinini+Blarinellini, Soricini) соответствуют рангу подсемейств. Молекулярные данные не противоречат объединению Blarinini и Blarinellini в одном подсемействе Blarininae.
6. Род Sorex - это древний компонент палеарктической фауны, переживший относительно недавний (плиоцен) взрыв формообразования. Разделение палеарктической и неарктической ветвей землероек-бурозубок (подроды Sorex s.str. и Otisorex) по молекулярным данным произошло на границе раннего-среднего миоцена, что соответствует времени и уровню дивергенции родов Soricinae.
(6а) Базальное ветвление клады Sorex s.str. (отделение S. alpinus) относится к позднему миоцену; последующие два ветвления филогенетического дерева соответствуют обособлению группы видов «cylindricauda» и S. mirabilis, после чего происходит быстрая радиация с образованием клад «caecutiens»+«minutus s.lato» , S. samniticus + «araneus» а
так же S. raddei и S. roboratus, представляющие собой самостоятельные филогенетические ветви, положение которых не разрешено;
(бб) S. cansulus входит в группу видов «caecutiens»;
(бв) группа видов «minutus s. lato» включает в себя группу «minutus s.stricto»+S. minutissimus, S. gracillimus и S. thibetanus.
7. Род Crocidura имеет относительно недавнее происхождение: по молекулярным оценкам его обособление произошло в конце позднего миоцена; время наиболее ранней диверсификации современных линий в его пределах относится к раннему плиоцену.
8. По молекулярные данным род Crocidura включает нескольких евроазитских и
африканских клад, отношения между которыми разрешены не полностью. Diplomesodon pulchellum (пегий путорак) находится внутри радиации рода Crocidura и, согласно принципам филогенетической систематики, должен относиться к этому роду. Структура филогенетических отношений групп Crocidura, степень генетического разнообразия и возраст входящих в них видов указывают на то, что центром происхождения белозубок может являться Африка или Западная Палеарктика, в то время как Юго-Восточная Азия -это мощный, но вторичный очаг разнообразия.
9. Радиация кротовых по молекулярным данным началась в раннем эоцене с
обособления Uropsilinae, что соответствует времени дивергенции семейств других млекопитающих. Другие древние линии кротовых (Talpinae, Scalopinae, Desmaninae, Condilurinae, Urotrichinae, Scaptonichinae, Neurotrichinae) могут быть отнесены к уровню подсемейств семейства Talpidae.
10. Молекулярные данные опровергают прямое родство двух высоко специализированных подземных групп - Talpinae и Scalopinae. Филогенетические взаимоотношения родов в подсемействе Scalopinae точно соответствуют морфологическим данным.
11. Эволюция подсемейства Talpinae характеризуется морфологическим консерватизмом и высокой скоростью формирования криптических видов.
12. Виды в пределах родов Eulipotyphla по молекулярным данным дивергируют начиная с конца позднего миоцена; разделение «хороших» сестринских видов датируется обычно
концом плиоцена-ранним плейстоценом; внутривидовая структура определяется событиями конца среднего-позднего плейстоцена.
13. Принятые в настоящее время таксономические ранги насекомоядных не отражают
истинного уровня их дивергенции при сравнении с семействами других млекопитающих. Предлагается новая таксономическая система Eulipotyphla, отражающая филогенетическое родство и время кладогенетических событий.
14. Динамика нуклеотидного состава и вариации скорости нуклеотидных и аминокислотных замен - наиболее очевидные особенности молекулярной эволюции насекомоядных. Первый фактор представляет проблему для филогенетической реконструкции, второй затрудняет получение оценок времен дивергенции.
Список литературы диссертационного исследования доктор наук Банникова Анна Андреевна, 2019 год
СПИСОК ЦИТИРОВАННОЙ ЛИТЕРАТУРЫ
1. Абрамов, А.В. «Насекомоядные млекопитающие Вьетнама (систематика, фауна,
зоогеография)»: автореф. дис. ... докт. биол. наук: 03.02.04 / Абрамов Алексей Владимирович. — СПб., 2017. — 48 с.
2. Аверьянов, А.О. Макросистематика плацентарных млекопитающих: современное
состояние проблемы / А.О. Аверьянов, А.В. Лопатин // Зоологический журнал. — 2014. — Т. 93. — № 7. — С. 798-798.
3. Алфимов, А.В. Тундростепные группировки насекомых и реконструкция климата
позднего плейстоцена низовий Колымы / А.В. Алфимов, Д.И. Берман, А.В. Шер // Зоологический журнал. — 2003. — T. 82. — № 2. — С. 281-300.
4. Артюшин, И.В. Молекулярная филогения кожанов (Mammalia, Chiroptera,
Eptesicus) c акцентом на исторической эволюции и таксономии видовой группы "E. serotinus" / И.В. Артюшин, С.В. Крускоп, В.С. Лебедев, А.А. Банникова // Известия Российской академии наук. Серия биологическая. — 2018. — № 5. — С. 527-536.
5. Банникова, А.А. Родственные отношения ежей подсемейства Erinaceinae
(Mammalia, Insectivora) по данным рестриктазного анализа суммарной ДНК / А.А. Банникова, В.А. Долгов, Л.В. Федорова, А.Н. Федоров, А.В. Троицкий,
A.А. Ломов, Б.М. Медников // Зоологический журнал. — 1995. — Т. 74. — № 5. — С. 95-107.
6. Банникова, А.А. К вопросу о таксономическом взаимоотношении малой и
длиннохвостой белозубок Crocidura suaveolens и C. gueldenstaedtii (Insectivora, Soricidae) / А.А. Банникова, В.Ю. Олейниченко, А.А. Ломов, В.А. Долгов // Зоологический журнал. — 2001. — Т. 80. — № 3. — С. 1-10.
7. Банникова, А.А. Опыт использования интер-ЯШЕ-ПТЦР в изучении филогенеза
млекопитающих / А.А. Банникова, В.А. Матвеев, Д.А. Крамеров // Генетика. — 2002. — Т. 38. — № 6. — С. 853-864.
8. Банникова, А.А. Полиморфизм ДНК ежей рода Erinaceus и политипичность
таксона E. concolor (Insectivora, Erinaceidae) / А.А. Банникова, Д.А. Крамеров,
B.Н. Василенко, Р.И. Дзуев, В.А. Долгов // Зоологический журнал. — 2003. — Т. 82. — № 1. — С. 1-11.
9. Банникова, А.А. Молекулярная филогенетика и современная систематика
млекопитающих / А.А. Банникова // Журнал общей биологии. — 2004. — Т. 65. — № 4. — С. 278-305.
10. Банникова, А.А. Молекулярная история землероек-белозубок Палеарктики / А.А.
Банникова, В.С. Лебедев, Д.А. Крамеров // Материалы международного совещания «Териофауна России и сопредельных территорий». — Москва. — 2007. — С. 38.
11. Банникова, А.А. Crocidura shantungensis - новый вид в фауне Монголии и Бурятии
/ А.А. Банникова, Б.И. Шефтель, В.С. Лебедев, Д.Ю. Александров, М. Мюлленберг // Доклады Академии Наук. — 2009. — Т. 424. — № 6. — С. 836839.
12. Банникова, А.А. Молекулярно-генетическая неоднородность кавказской
землеройки-бурозубки Sorex satununi (Mammalia, Lipotyphla, Soricidae) по маркерам мтДНК как вероятное последствие древней гибридизации / А.А. Банникова, В.С. Лебедев // Молекулярная биология. — 2010. — Т. 44. — № 4.
— С. 658-662.
13. Банникова, А.А. Генетическая идентификация и гибридизация обыкновенных ежей
Центральной России / А.А. Банникова, В.С. Лебедев, М.В. Рутовская, Л.А. Хляп, В.В. Рожнов // Материалы конференции «Целостность вида у млекопитающих (изолирующие барьеры и гибридизация)». — М.: Т-во научных изданий КМК, 2010. — С. 9.
14. Банникова, А.А. Отряд Насекомоядные / А.А. Банникова, В.С. Лебедев //
Млекопитающие России: систематико-географический справочник // И.Я. Павлинов, А.А. Лисовский (ред.). — М.: Т-во научных изданий КМК, 2012. — Т. 52. — С. 25-72.
15. Банникова, A.A. Генетическое разнообразие рода Chionomys (Mammalia,
Arvicolinae) и сравнительная филогеография трех видов снеговых полевок / A.A. Банникова, А.М. Сижажева, В.Г. Маликов, Ф.Н. Голенищев, Р.И. Дзуев // Генетика. — 2013. — Т. 49. — № 5. — С. 649-649.
16. Банникова, А.А. Филогенетическое положение ганьсуйского крота Scapanulus
oweni Thomas, 1912 (Mammalia, Talpidae) и взаимоотношения высокоспециализированных подземных групп кротовых / А.А. Банникова, Е.Д. Землемерова, В.С. Лебедев, Д.Ю. Александров, Ю. Фанг (Yun Fang), Б.И. Шефтель // Доклады АН. — 2015. — Т. 464. — № 2. — С. 238-238.
17. Банникова, А.А. Неожиданное генетическое разнообразие азиатских
короткохвостых землероек рода Blarinella (Mammalia, Lipotyphla, Soricidae) / А.А. Банникова, А.В. Абрамов, В.С. Лебедев, Б.И. Шефтель // Доклады АН.
— 2017. — Т. 474. — № 1. — С. 132-136.
18. Безродных, Ю.П. Новые данные о биостратиграфии и палеогеографии позднего
плейстоцена Каспия / Ю.П. Безродных, С.В. Делия, Б.Ф. Романюк, В.М. Сорокин, Т.А. Янина, Х.А Арсланов // Сборник статей VIII Всеросс. совещ. по изучению четвертичного периода «Фундаментальные проблемы квартера, итоги изучения и основные направления дальнейших исследований». — Ростов-на-Дону, 2013. — С. 56-57.
19. Белова В.А. Растительность и климат позднего кайнозоя юга Восточной Сибири /
отв. ред. Г.И. Галазий, Ю.П. Баранова. — Новосибирск: изд-во «Наука», Сибирское отделение, 1985.— 159 с.
20. Бобринский, Н.А. Определитель млекопитающих СССР / Н.А. Бобринский, Б.А.
Кузнецов, А.П. Кузякин. — M.: Гос. изд-во «Советская наука», 1944. — 440 с.
21. Бобринский, Н.А. Определитель млекопитающих СССР / Н.А. Бобринский, Б.А.
Кузнецов, А.П. Кузякин. — М: Просвещение, 1965. — 382 с.
22. Богданов, А.С. Первое генетическое свидетельство гибридизации обыкновенного и
южного ежей (Erinaceus europaeus и E. roumanicus) в Подмосковье / А.С. Богданов, А.А. Банникова, Ю.М. Пирусский, Н.А. Формозов // Известия Академии Наук. Серия Биологическая. — 2009. — № 6. — С. 760-765.
23. Величко, А.А. Устойчивость ландшафтной оболочки и ее био- и георазнообразие в
свете динамики широтной зональности / А.А. Величко // Изв. РАН. Сер. геогр. — 2002. — № 5. — С. 7-21.
24. Верещагин, Н.К. Млекопитающие Кавказа. История формирования фауны / Н.К.
Верещагин. —М.-Л.: Издательство Академии Наук СССР, 1959. — 704 стр.
25. Вирина, Е.И. Палеомагнитная характеристика типовых местонахождений
олерского фаунистического комплекса (Колымская низменность) / Е.И. Вирина, В С. Зажигин, А.В. Шер // Изв. АН СССР. Сер. геол. — 1984. — № 11. — С. 61-72.
26. Воронцов, Н.Н. Систематика кавказских лесных мышей подрода Sylvaemus
(Mammalia, Rodentia, Apodemus) / Н.Н. Воронцов, Г.Г. Боескоров, С.В. Межжерин, Е.А. Ляпунова, А.С. Кандауров // Зоологический журнал. . — 1992. — Т. 71. — С. 119-131.
27. Гептнер, В.Г. О систематическом положении Sorex mirabilis Ognev, 1937
(Mammalia, Soricidae) / В.Г. Гептнер, В.А. Долгов // Зоологический журнал. — 1967. — Т. 46. — № 9. — С. 1419-1422.
28. Графодатский, А.С. Кариотипы пяти видов землероек-белозубок фауны СССР /
A.С. Графодатский, С.И. Раджабли, А.В. Шаршов, М.В. Зайцев // Цитология.
— 1988. — Т. 30. — № 10. — С. 1247-1250.
29. Графодатский, А.С. Уровни хромосомного консерватизма в различных группах
насекомоядных млекопитающих (Mammalia, Insectivora) / А.С. Графодатский, С.И. Раджабли, М.В. Зайцев, А.А. Шаршов // Труды Зоологического института АН СССР. — 1991. — Т. 243. — С. 47-57.
30. Григорьева, О.О. Генетическая структура популяций обыкновенной бурозубки
Sorex araneus L. 1758 (Mammalia, Lipotyphla) на сплошных и фрагментированных участках ареала / О.О. Григорьева, Ю.М. Борисов, В.В. Стахеев, А.Е. Балакирев, Д.М. Кривоногов, В.Н. Орлов // Генетика. — 2015.
— Т. 51. — № 6. — С. 711-723.
31. Гричук, В.П. История флоры и растительности Русской равнины в плейстоцене /
B.П Гричук. — М.: Наука, 1989. — 183 с.
32. Гуреев, А.А. Землеройки (Soricidae) фауны мира / А.А. Гуреев — Л.: Наука, 1971.
— 253 с.
33. Гуреев, А.А. Насекомоядные (Mammalia, Insectivora). Фауна СССР,
Млекопитающие / А.А. Гуреев. — Л.: Наука, 1979. — Т. 4. — № 2. — 503 с.
34. Дзуев, Р.И. К изучению популяционной изменчивости рода Talpa Кавказа / Р.И.
Дзуев // Фауна, экология и охрана животных Северного Кавказа. — 1980. —
C. 3-15.
35. Дзуев, Р.И. Кариологические исследования кротов Кавказа / Р.И. Дзуев, В.Г.
Иванов, А.К. Темботов // Бюл. Моск. о-ва испыт. природы. Отд. биол. — 1972. — Т. 77. — № 1. — С. 33-36.
36. Докучаев, Н.Е. Биогеография и таксономическое разнообразие землероек Северо-
Восточной Азии / Н.Е. Докучаев // Докл. РАН. — 1999. — Т. 364. — № 3. — С. 420.
37. Долгов, В.А. Бурозубки Старого Света / В.А. Долгов. — М.: Изд-во МГУ, 1985. —
221 с.
38. Долгов, В.А. О строении гениталий палеарктических бурозубок (Insectivora,
Soricidae) как о систематическом признаке / В.А. Долгов, И.В. Лукьянова // Зоологический журнал. — 1966. — Т. 45. — № 12. — С. 1852-1861.
39. Долгов, В.А. Тибетская бурозубка-Sorex thibetanus Kastschenko, 1905 (Soricidae,
Mammalia) / В.А. Долгов, Р.С. Хоффманн // Зоологический журнал. — 1977.
— Т. 56. — № 10. — С. 1687-1692.
40. Зайцев, М.В. Систематический анализ таксонов подсемейства ежовых (Mammalia,
Erinaceinae) фауны СССР: автореф. дис. ... канд. биол. наук: 03.00.08 / Зайцев Михаил Вячеславович. — Л., 1982а. — 22 с.
41. Зайцев, М.В. Географическая изменчивость краниологических признаков и
некоторые вопросы систематики ежей подрода Erinaceus (Mammalia, Erinaceidae) / М.В. Зайцев // Труды Зоологического института АН СССР. — 1982б. — Т. 115. — С. 92-117.
42. Зайцев, М.В. К систематике и диагностике ежей подрода Erinaceus (Mammalia,
Erinaceidae) фауны СССР / М.В. Зайцев // Зоологический журнал. — 1984. — Т. 63. — № 5. — С. 720-729.
43. Зайцев, М.В. О номенклатуре землероек-бурозубок рода Sorex фауны СССР / М.В.
Зайцев // Зоологический журнал. — 1988. — Т. 67. — № 12. — С. 1878-1888.
44. Зайцев, М. В. Видовой состав и вопросы систематики землероек-белозубок
(Mammalia, Insectivora) фауны СССР / М.В. Зайцев // Труды Зоологического института АН СССР. — 1991. — Т. 243. — С. 3-46.
45. Зайцев, М.В. Вопросы диагностики и систематики кротов Кавказа (Investivora,
Talpidae, Talpa) / М.В. Зайцев // Зоологический журнал. — 1999. — Т. 78. — № 6. — С. 718-731.
46. Зайцев, М.В. Насекомоядные млекопитающие (Insectivora) позднего плейстоцена
Северного Кавказа (Mammalia, Soricidae) / М.В. Зайцев, В.А Осипова // Зоологический журнал. — 2004. — Т. 83. — № 7. — С. 851-868.
47. Зайцев, М.В. Млекопитающие фауны России и сопредельных территорий:
насекомоядные / М.В. Зайцев, Л.Л. Войта, Б.И. Шефтель. — СПб.: Издательство Зоологический институт РАН, 2014. — 390 c.
48. Землемерова, Е.Д. Новые данные по молекулярной систематике кротов Восточной
Азии / Е.Д. Землемерова, А.А. Банникова, А.В. Абрамов, В.С. Лебедев, В.В. Рожнов // Доклады АН. — 2013. — Т. 451. — № 6. — C. 707-710.
49. Золотарева, Е.И. Популяционно-генетическое разнообразие и гибридизация ежей
Erinaceus europaeus и E. roumanicus в Восточной Европе и Западной Сибири / Е.И. Золотарева, М.М. Белоконь, Ю.С. Белоконь, М.В. Рутовская, Л.А. Хляп, В.С. Лебедев, А.А. Банникова // Материалы международной научной конференции «Генетика популяций: прогресс и перспективы», посвященной 80-летию со дня рождения академика Ю.П. Алтухова (1936 - 2006 гг.) и 45-летию основания лаборатории популяционной генетики им. Ю.П. Алтухова. — Москва. — 2017. — С. 104.
50. Иваницкая, Е.Ю. Хромосомные наборы двух видов землероек из Таджикистана -
Sorex buchariensis Ognev, 1921 и Crocidura suaveolens Pallas, 1811 (Soricidae, Insectívora) / Е.Ю. Иваницкая, С.И. Исаков, К.В. Коробицына // Зоологический журнал. — 1977. — Т. 56. — № 12 . — С.1896-1900.
51. Иваницкая, Е.Ю. Кладистический подход в интерпретации цитогенетических
данных: анализ кариотипов бурозубок (Sorex: Insectívora) / Е.Ю. Иваницкая // Филогенетика млекопитающих: Сб. тр. Зоологического музея МГУ. — Москва, 1992. — Т. 29. —С. 201-222.
52. Иваницкая, Е.Ю. Кариотипы палеарктических землероек подрода Otisorex с
комментариями по таксономии и филогении группы "cinereus" / Е.Ю. Иваницкая, А.И. Козловский // Зоологический журнал. — 1985. — Т. 64. — № 3. — С. 950-953.
53. Иваницкая, Е.Ю. Хромосомные наборы насекомоядных млекопитающих Монголии
/ Е.Ю. Иваницкая, В.М. Малыгин // Бюллетень Моск. общ-ва испыт. природы, отд. биол. — 1985. — Т. 90. — № 2. — C. 15-23.
54. . Иваницкая, Е.Ю. Таксономический и цитогенетический анализ
трансберингийских связей землероек-бурозубок (Sorex: Insectívora) и пищух
(Ochotona: Lagomorpha): автореф. дис.....канд. биол. наук: 03.00.08 /
Иваницкая Елена Юрьевна. — Москва, 1985. — 24 с.
55. Козловский, А.И. Кариотипы и систематика некоторых популяций землероек,
обычно относимых к арктической бурозубке, Sorex arcticus (Insectivora, Soricidae) / А.И. Козловский // Зоологический журнал. — 1971. — Т. 50. — № 5. — С. 756-762.
56. Костин, Д.С. Адаптация грызунов к обитанию в высокогорье: сочетание процессов
митохондриальной интрогрессии и конвергентной молекулярной эволюции / Д.С. Костин, Л.А. Лавренченко // Доклады АН. — 2018. — Т. 483. — № 3. — С. 345-348.
57. Крамеров, Д.А. Короткие ретропозоны и их использование в филогенетических
исследованиях / Д.А. Крамеров, Н.С. Васецкий // Молекулярная биология. — 2009. — Т. 43. — № 5. — С. 795-806.
58. Кривошеев, В.Г. Современные ландшафты и распространение млекопитающих в
Северо-Восточной Азии / В.Г. Кривошеев // Биологические проблемы Севера. — 1973. — № 2. — С. 24-35.
59. Кузнецов, Г.В. Млекопитающие Вьетнама / Г.В. Кузнецов — М.: Товарищество
научных изданий КМК, 2006. — 420 с.
60. Лавренченко, Л.А. Гибридогенное видообразование у млекопитающих: иллюзия
или реальность? / Л.А. Лавренченко // Журнал общей биологии. — 2013. — Т. 74. — № 4. — С. 253-267.
61. Лавренченко, Л.А. Млекопитающие Эфиопского нагорья: пути и особенности
Формирования фауны горных тропиков: автореф. дис. ... докт. биол. наук: 03.00.08 / Лавренченко Леонид Александрович. — Москва, 2009. — 50 с.
62. Лавренченко, Л.А. Эндемичные землеройки-белозубки (Crocidura) Эфиопии:
недавняя адаптивная радиация древней группы / Л.А. Лавренченко, А.А. Банникова, В.С. Лебедев // Доклады Академии Наук. — 2009. — Т. 42. — № 5. — С. 705-708.
63. Лавренченко, Л.А. Тестирование альтернативных гипотез видообразования на
примере наземных позвоночных горных тропиков / Л.А. Лавренченко // Известия Российской академии наук. Серия биологическая. — 2011. — № 6. — С. 645-652.
64. Лопатин, А.В. Древнейшая землеройка (Soricidae, Mammalia) из среднего эоцена
Монголии / А.В. Лопатин // Палеонтол. журн. — 2002. — № 6. — С. 78-87.
65. Лопатин, А.В. Раннепалеогеновые насекомоядные млекопитающие Азии и
становление основных групп Insectivora: автореф. дис. ... докт. биол. наук: 25.00.02 / Лопатин Алексей Владимирович. — Москва, 2006. — 48 с.
66. Майр, Э. Систематика и происхождение видов с точки зрения зоолога / Э. Майр. —
М.: Гос. изд-во иностр. лит., 1947. — 502 с.
67. Матвеева, Е.И. Популяционно-генетическое разнообразие и гибридизация
обыкновенных ежей европейской части России и западной Сибири / Е.И. Матвеева, М.М. Белоконь, Ю.М. Белоконь, В.С. Лебедев, М.В. Рутовская, Л.А. Хляп, А.А. Банникова // Материалы международного совещания «Териофауна России и сопредельных территорий». — М.: Т-во научных изданий КМК, 2016. — С. 255.
68. Международный кодекс зоологической номенклатуры. Издание четвертое. Принят
Международным союзом биологических наук / пер. с анг. и фр. И.М. Кержнера, ред. пер. А.П. Андрияшев, Я.И. Старобогатов. — 2-е исправ. изд. русского перевода. — М.: Т-во на-учных изданий КМК, 2004. — 223 с.
69. Межжерин, В.А. Очерк четвертичной истории и происхождения современной
фауны землероек-бурозубок / В.А. Межжерин // Материалы по четвертичному периоду Украины. Киев. — 1965. — С. 164-174.
70. Мещерский И. Г. Анализ генетическогоразнообразия хомячка Роборовского
(Phodopus roborovskii) в северной части ареала / И.Г. Мещерский, Н.Ю. Феоктистова // Известия Российской академии наук. Серия биологическая. — 2011. — № 1. — С. 96-100.
71. Нестеренко, В.А. Насекомоядные юга Дальнего Востока и их сообщества / В.А.
Нестеренко. — Владивосток: Дальнаука, 1999. — 173 с.
72. Огнев, С.И. Материалы по систематике, морфологии и географическому
распространению землероек / С.И. Огнев // Зоологический журнал. — 1933.
— Т. 12. — № 4. — С. 8-15.
73. Огнев, С.И. Об ежах (Erinaceidae) Дальнего Востока / С.И. Огнев // Бюлл. МОИП.
Отд. биол. — 1951. — Т. 34. — № 1. — С. 8-14.
74. Орлов, В.Н. Обзор хромосомных наборов землероек рода Sorex / В.Н. Орлов, А.И.
Козловский // Вестник Московского Университета, Биология и почвоведение.
— 1971. — № 2. — С. 12-16.
75. Орлов, В.Н. Новый подвид кавказской бурозубки Sorex satunini (Mammalia) и
филогенетические связи вида по мтДНК последовательностям и хромосомным маркёрам / В.Н. Орлов, А.Е. Балакирев, Ю.М. Борисов // Поволжский экологический журнал. — 2010. — Т. 1. — С. 111-114.
76. Охотина, М.В. Дальневосточный крот и его промысел / М.В. Охотина. — М.: Изд-
во «Наука», 1966. — 135 с.
77. Павлинов, И.Я. Систематика современных млекопитающих: сборник трудов
Зоологического музея МГУ / И.Я. Павлинов. — М.: Изд. Московского Университета, 2003. — 297 с.
78. Павлинов, И.Я. Введение в современную филогенетику / И.Я. Павлинов. — М.: Т-
во науч. изданий КМК, 2005. — 341 с.
79. Павлинов, И.Я. Систематика млекопитающих СССР / И.Я. Павлинов, О.Л.
Россолимо. — М.: Изд. Московского Университета, 1987. — 253 c.
80. Павлинов, И.Я. Биологическая систематика: Эволюция идей / И.Я. Павлинов, Г.Ю.
Любарский. — М.: Т-во науч. изданий КМК, 2011. — 667 с.
81. Потапов, С.Г. Сравнительный анализ митохондриальных геномов полёвок рода
Clethrionomys в связи с адаптивной интрогрессией / С.Г. Потапов, Л.А. Лавренченко // Материалы международного совещания «Териофауна России и сопредельных территорий». — М.: Т-во научных изданий КМК, — 2016. — C.343.
82. Распопова, А.А. Филогеография и демографическая история обыкновенной
бурозубки Sorex araneus L., 1758 (Eulipotyphla, Mammalia) / А.А. Распопова,
A.А. Банникова, В.С. Лебедев // Генетика. — 2018. — Т. 54. — № 12. — С. 1426-1441.
83. Рычагов, Г.И. Хвалынский этап в истории Каспийского моря / Г.И. Рычагов //
Вестн. Моск. ун-та. Сер. 5 География. — 2014. — № 4. — С. 3-9.
84. Сатунин, К. А. Определитель млекопитающих Российской империи. Вып. 1
(Рукокрылые, насекомоядные и хищные) / К.А. Сатунин. — Тифлис, 1914.
85. Сергеев В.Е. Филогенетические отношения и их значимость в формировании
таксоценологических группировок представителей р. Sorex / В.Е. Сергеев,
B.Б. Ильяшенко // Сибирский биологический журнал. — 1991. — № 1. — С. 35-39.
86. Синицын, В.М. Древние климаты Евразии / В.М. Синицын. — Л.: Изд-во ЛГУ,
1970. — Т. 3. — 168 с.
87. Соколов В.Е. Определитель млекопитающих Монгольской Народной Республики /
В.Е. Соколов, В Н. Орлов. — М.: Наука, 1980. — 351 с.
88. Соколов, В.Е. Позвоночные Кавказа. Млекопитающие. Насекомоядные / В.Е.
Соколов, А.А. Темботов. — М.: Наука, 1989. — 547с.
89. Соколов, В.Е. Кариологическая дифференциация двух видов ежей рода Erinaceus
на территории СССР (Insectivora, Erinaceidae) / В.Е.Соколов, В.М. Анискин, И.В. Лукьянова // Зоологический журнал. — 1991. — Т. 70. — №. 7. — С. 111120.
90. Стародубайте, М. Многомерный анализ морфометрических показателей
подтверждает родовую самостоятельность сибирского крота (gen. Asioscalops Stroganov, 1941) / М. Стародубайте, М.А. Потапов // Вестник Красноярского государственного университета. — 2006. — № 6. — С. 26-30.
91. Строганов, С.У. Систематика кротовых (Talpidae) / С.У. Строганов // Труды
зоологического института АН СССР. — 1948. — Т. 8. — № 2. — С. 289-406.
92. Строганов, С.У. Звери Сибири. Насекомоядные / С.У. Строганов. — М.: АН СССР,
1957. — 268 с.
93. Темботова, Ф.А. Закономерности изменчивости и эволюции насекомоядных
млекопитающих Кавказа: автореф. дисс... докт. биол. наук: 03.00.08 / Темботова Фатимат Асланбиевна. — Нальчик, 1999. — 48 с.
94. Украинцева, В.В. Флоры позднего плейстоцена и голоцена Сибири / В.В.
Украинцева //Ботанический журнал. — 1996. — Т. 81. — № 12. — С. 37-48.
95. Хедрик, Ф. Генетика популяций / Ф. Хедрик; пер. с анг. А.А. Лушниковой и Н.В.
Петровой. — М.: Техносфера, 2003. — 592 с.
96. Шаталкин, А.И. Таксономия. Основания, принципы и правила / А.И. Шаталкин. —
М.: Т-во науч. изданий КМК, 2012. — 600 с.
97. Швецов, Ю.Г. Млекопитающие бассейна озера Байкал / Ю.Г. Швецов, М.Н.
Смирнов, Г.И. Монахов. — Новосибирск: Наука, 1984. — 257 с.
98. Шер, А.В. Возраст четвертичных отложений Яно-Колымской низменности и ее
горного обрамления / А.В. Шер // Докл. АН СССР. — 1984. — Т. 278. — № 3. — С. 708-713.
99. Шефтель, Б. И. Заметки по фауне, систематике и экологии мелких млекопитающих
юга провинции Ганьсу (Китайская Народная Республика) / Б.И. Шефтель, А.А. Банникова, Ю. Фанг, Т.Б. Демидова, Д.Ю. Александров, В.С. Лебедев, Ю.Х. Сун // Зоологический журнал. — 2017. — Т. 96. — № 2. — С. 232-248.
100. Щипанов, Н.А. Белобрюхая белозубка: поведение, пространственно-этологическая и функциональная структура популяции / Н.А. Щипанов, В.Ю. Олейниченко. — М: Наука, 1993. — 135 с.
101. Юдин, Б.С. Насекомоядные млекопитающие Сибири. (Определитель) / Б.С. Юдин. — Новосибирск: Наука, Сибирское отделение, 1971. — 172 с.
102. Юдин, Б.С. Насекомоядные млекопитающие Сибири / Б.С. Юдин. — Новосибирск: Наука, 1989. — 360 с.
103. Янина, Т.А. Эволюция природной среды Понто-Каспия в условиях глобальных изменений климата в позднем плейстоцене / Т.А. Янина // Вестн. Моск. ун-та. Сер. 5. — 2013. — Т. 5. — С. 3-17.
104. Abe, H. Classification and biology of Japanese Insectivora (Mammalia). I. Studies on variation and classification / H. Abe // Journal of the Faculty of Agriculture, Hokkaido University. — 1967. — V. 55. — P. 191-265.
105. Abe, H. Revision of the Asian moles of the genus Mogera / H. Abe // Journal of Mammalogical Society of Japan. — 1995. — V. 20. — P. 51-68.
106. Abramov, A.V. New records of the Asiatic short-tailed shrew Blarinella griselda (Soricidae) from Vietnam / A.V. Abramov, V.V. Rozhnov, A.V. Shchinov, O.V. Makarova // Mammalia. — 2007. — V. 71. — № 4. — P. 181-182.
107. Abramov, A.V. Description of a new species of Crocidura (Soricomorpha: Soricidae) from the island of Phu Quoc, Vietnam / A.V. Abramov, P.D. Jenkins, V.V. Rozhnov, A.A. Kalinin // Mammalia. — 2008a. — V. 72. — № 4. — P. 269272.
108. Abramov, A.V. Study of insectivorous mammals in North Vietnam / A.V. Abramov, A.V. Shchinov, V.V. Rozhnov // Contemporary Problems of Ecology. — 2008b. — V. 1. — № 5. — P. 593-595.
109. Abramov, A.V. Small mammals of the Dalat Plateau, southern Vietnam / A.V. Abramov, S.V. Kruskop, A.V. Shchinov // Russian Journal of Theriology. — 2010a. — V. 8. — № 2. — P. 61-73.
110. Abramov, A.V. Soricidae of Sa Pa Area (Northern Vietnam) / A.V. Abramov, A.V. Shchinov, V.V. Rozhnov // Materials of the International Conference "Advances in the biology of shrews III" — Moscow: KMK Sci Press, 2010b. — V. 5.
111. Abramov, A.V. White-toothed shrews (Mammalia, Soricomorpha, Crocidura) of coastal islands of Vietnam / A.V. Abramov, A.A. Bannikova, V.V. Rozhnov // ZooKeys. — 2012. — № 207. — P. 37-47.
112. Abramov, A.V. An annotated checklist of the insectivores (Mammalia, Lipotyphla) of Vietnam / A.V. Abramov, D.N. Can, B.T. Hai, N.T. Son // Russian Journal of Theriology. — 2013a. — V. 12. — № 2. — P. 57-70.
113. Abramov, A.V. Insectivorous mammals (Mammalia: Eulipotyphla) of the Ba Vi National Park, northern Vietnam / A.V. Abramov, A.V. Shchinov, T.Q. Tien // Proceedings of the Zoological Institute RAS. — 2013b. — V. 317. — № 3. — P. 221-225.
114. Abramov, A.V. The first record of Episoriculus umbrinus from Vietnam, with notes on the taxonomic composition of Episoriculus (Mammalia, Soricidae) / A.V. Abramov, A.A. Bannikova, D.M. Chernetskaya, V.S. Lebedev, V.V. Rozhnov // Russian Journal of Theriology. — 2017. — V. 16. — № 2. — P. 117-128.
115. Abramov, A.V. Revision of Chimarrogale (Lipotyphla: Soricidae) from Vietnam with comments on taxonomy and biogeography of Asiatic water shrews / A.V. Abramov, A.A. Bannikova, V.S. Lebedev, V.V. Rozhnov // Zootaxa. — 2017. — V. 4232. — № 2. — P. 216-230.
116. Abramson, N.I. Genetic analysis of type material of the Amur lemming resolves nomenclature issues and creates challenges for the taxonomy of true lemmings (Lemmus, Rodentia: Cricetidae) in the eastern Palearctic / N.I. Abramson, T.V. Petrova // Zoological Journal of the Linnean Society. — 2017. — V. 182. — № 2. — P. 465-477.
117. Adams, E. N. Consensus techniques and the comparison of taxonomic trees / E.N. Adams // Systematic Biology. — 1972. — V. 21. — № 4. — P. 390-397.
118. Ai, H.S. Taxonomic revision of the genus Mesechinus (Mammalia: Erinaceidae) with description of a new species / H.S. Ai, K. He, Z.Z. Chen, J.Q. Li, T. Wan, Q. Li, W.H. Nie, J.H. Wang, W.T. Su, X.L. Jiang // Zoological Research. — 2018. — V. 39. — № 5. — P. 1-13.
119. Agadjanian, A.K. Quartäre Kleinsäuger aus der Russischen Ebene / A.K. Agadjanian // Quartär. — 1977. — V.27. — P. 111-145.
120. Alfaro, M.E. Nine exceptional radiations plus high turnover explain species diversity in jawed vertebrates / M.E. Alfaro, F. Santini, C. Brock, H. Alamillo, A. Dornburg, D.L. Rabosky, G. Carnevale, L.J. Harmon // Proceedings of the National Academy of Sciences. — 2009. — V. 106. — № 32. — P. 13410-13414.
121. Allen, G.M. The Mammals of China and Mongolia, Natural History of Central Asia. Part I / G.M. Allen. — New York: American Museum of Natural History, 1938. — V. 11. — 620 p.
122. Alvarez-Valin, F. Inaccurate reconstruction of ancestral GC levels creates a "vanishing isochores" effect / F. Alvarez-Valin, O. Clay, S. Cruveiller, G. Bernardi // Molecular phylogenetics and evolution. — 2004. — V. 31. — № 2. — P. 788793.
123. Amori, G. Talpa europaea [Электронный ресурс] / G. Amori, R. Hutterer, G. Mitsain, N. Yigit, B. Krystufek, L.J. Palomo. — The IUCN Red List of Threatened Species, Version 2014.2, 2008. — Режим доступа: http://www.iucnredlist.org.
124. Andersson, A.C. Postglacial population history of the common shrew (Sorex araneus) in Fennoscandia. Molecular studies of recolonisation, sex-biased gene flow and the formation of chromosome races: PhD thesis: Genetics / Andersson Anna-Carin. — Uppsala, 2004. — 56 p.
125. Andreev, A. Paleoenvironmental changes in Northeastern Siberia during the Late Quaternary-evidence from pollen records of the Bykovsky Peninsula / A. Andreev, L. Schirrmeister, C. Siegert, A.A. Bobrov, D. Demske, M. Seiffert, H.W. Hubberten // Polarforschung. — 2002. — V. 70. — P. 13-25.
126. Anthony, H.E. Mammals collected by the Vernay-Cutting Burma expedition / H.E. Anthony // Field Museum of Natural History, Zoology Series. — 1941. — V. 27. — P.37-125.
127. Archibald, J.D. Quantitative analysis of the timing of the origin and diversification of extant placental orders / J.D. Archibald, D.H. Deutschman // Journal of Mammalian Evolution. — 2001. — V. 8.— № 2. — P. 107-124.
128. Archibald, J.D. Late Cretaceous relatives of rabbits, rodents, and other extant eutherian mammals / J.D. Archibald, A.O. Averianov, E.G. Ekdale // Nature. — 2001. — V. 414. — № 6859. — P. 62-65.
129. Arnason, U. Mammalian mitogenomic relationships and the root of the eutherian tree / U. Arnason, J.A. Adegoke, K. Bodin, E.W. Born, Y.B. Esa, A. Gullberg, M. Nilsson, R.V. Short, X. Xu, A. Janke // Proceedings of the National Academy of Sciences. — 2002. — V. 99. — № 12. — P. 8151-8156.
130. Arndt, P.F. Distinct changes of genomic biases in nucleotide substitution at the time of mammalian radiation / P.F. Arndt, D.A. Petrov, T. Hwa // Molecular biology and evolution. — 2003. — V. 20. — № 11. — P. 1887-1896.
131. Arnold, M.L. Natural hybridization as an evolutionary process / M.L. Arnold // Annual review of Ecology and Systematics. — 1992. — V. 23. — № 1. — P. 237261.
132. Asher, R.J. Locking yourself out: diversity among dentally zalambdodont therian mammals / R.J. Asher, M.R. Sanchez-Villagra // Journal of Mammalian Evolution. — 2005. — V. 12. — № 1-2. — P. 265-282.
133. Asher, R.J. A morphological basis for assessing the phylogeny of the "Tenrecoidea" (Mammalia, Lipotyphla) / R.J. Asher // Cladistics. — 1999. — V. 15. — № 3. — P. 231-252.
134. Asher, R.J. Insectivoran grade placental mammals: character evolution and fossil history / R.J. Asher // The Rise of Placental Mammals: Origin and Relationships of the Major Clades / K.D. Rose, J.D. Archibald. — Baltimore: Johns Hopkins University Press, 2005. — P. 50-70.
135. Asher, R.J. Morphology and relationships of Apternodus and other extinct, zalambdodont placental mammals / R.J. Asher, M.C. McKenna, R.J. Emry, A.R. Tabrum, D.G. Kron // Bull. Am. Mus. Nat. Hist. — 2002. — V. 217. — P. 1-117.
136. Asher, R.J. Relationships of endemic African mammals and their fossil relatives based on morphological and molecular evidence / R.J. Asher, M.J. Novacek, J.H. Geisler // Journal of Mammalian Evolution. — 2003. — V. 10. — № 1-2. — P. 131-194.
137. Asher, R.J. Nomenclature and placental mammal phylogeny / R.J. Asher, K.M. Helgen // BMC Evolutionary Biology. — 2010. — V. 10. — № 1. — P. 102.
138. Avise, J.C. Molecular markers, natural history and evolution / J.C. Avise. — New York: Chapman and Hall, 1994. — 510 p.
139. Avise, J.C. Phylogeography. The history and formation of species / J.C. Avise. — England: Harvard University Press, 2000. — 477 p.
140. Avise, J.C. Proposal for a standardized temporal scheme of biological classification for extant species / J.C. Avise, G.C. Johns // Proceedings of the National Academy of Sciences. — 1999. — V. 96. — № 13. — P. 7358-7363.
141. Avise, J.C. Time to standardize taxonomies / J.C. Avise, D. Mitchell // Systematic Biology. — 2007. — V. 56. — № 1. — P. 130-133.
142. Avise, J.C. On the temporal inconsistencies of Linnean taxonomic ranks / J.C. Avise, J.X. Liu // Biological Journal of the Linnean Society. — 2011. — V. 102. — P.707-714.
143. Baker, R.J. Speciation in mammals and the genetic species concept / R.J. Baker, R.D. Bradley // Journal of Mammalogy. — 2006. — V. 87. — № 4. — P. 643-662.
144. Bandelt, H.J. Median-joining networks for inferring intraspecific phylogenies / HJ. Bandelt, P. Forster, A. Röhl // Molecular Biology and Evolution. — 1999. — V. 16. — P. 37-48.
145. Balakirev, A.E. Revision of the genus Leopoldamys (Rodentia, Muridae) as inferred from morphological and molecular data, with a special emphasis on the species composition in continental Indochina / A.E. Balakirev, A.V. Abramov, V.V. Rozhnov // Zootaxa. — 2013. — V. 3640. — № 4. — P. 521-549.
146. Bannikova, A.A. Molecular Diversity of some Crocidura species (Insectivora, Soricidae) from Ethiopia / A.A. Bannikova, L.A. Lavrenchenko, A.A. Lomov, B.M. Mednikov // African small mammals. Orstom, coll. A travers champs / C. Denis, L. Granjon, A. Poulet (eds.). — Paris: Inst. De Recherche pour le Development, 2001. — P. 55-64.
147. Bannikova, A.A. Molecular phylogeny of Palearctic shrews inferred from RFLP and IS-PCR data / A.A. Bannikova, D.A. Kramerov // Advances in the Biology of Shrews II. Special publication of International Society of Shrew Biologists / J.F. Merritt, S. Churchfield, R. Hutterer, B. Sheftel (eds.). — 2005. — P. 87-98.
148. Bannikova, A.A. Phylogeny and systematics of the Crocidura suaveolens species group: corroboration and controversy between nuclear and mitochondrial DNA markers / A.A. Bannikova, V.S. Lebedev, D.A. Kramerov, M.V. Zaitsev // Mammalia. — 2006. — V. 70. — № 2. — P. 106-119.
149. Bannikova, A.A. Mitochondrial and nuclear DNA variability of the east european and siberian chromosome races of the common shrew Sorex araneus / A.A.
Bannikova, N.S. Bulatova, V.S. Lebedev, D.A. Kramerov // Russian journal of theriology. — 2007. — V. 6. — № 2. — P. 159-160.
150. Bannikova, A.A. Molecular diversity and basal radiation of spiny hedgehogs / A.A. Bannikova, V.S. Lebedev // Collection of materials of International conference. "Molecular genetic bases of conservation of biodiversity of Holarctic mammals".
— Moscow: KMK Sci Press, 2007. — P. 23-30.
151. Bannikova, A.A. Genetic heterogenity of the Caucasian shrew Sorex satunini (Mammalia, Lipotyphla, Soricidae) inferred from the mtDNA markers as a potential consequence of ancient hybridization / A.A. Bannikova, V.S. Lebedev // Molecular biology. — 2010. — V. 44. — № 4. — P. 658-662.
152. Bannikova, A.A. Holarctic phylogeography of the tundra shrew (Sorex tundrensis) based on mitochondrial genes / A.A. Bannikova, E.N. Dokuchaev, E.V. Yudina, A.V. Bobretzov, B.I. Sheftel, V. Ilyashenko, V.S. Lebedev // Biological Journal of the Linnean Society. — 2010a. — V. 101. — № 3. — P. 721-746.
153. Bannikova, A.A. Molecular phylogeny and evolution of the Asian lineage of vole genus Microtus (Arvicolinae, Rodentia) inferred from mitochondrial cytb sequence / A.A. Bannikova, V.S. Lebedev, A.A. Lissovsky, V. Matrosova, N.I. Abramson, E.V. Obolenskaya, A.S. Tesakov // Biological Journal of the Linnean Society. — 2010b. — V. 99. — P. 595-613.
154. Bannikova, A.A. Mitochondrial diversity of the white-toothed shrews (Mammalia, Eulipotyphla, Crocidura) in Vietnam / A.A. Bannikova, A.V Abramov, A.V.Borisenko, V.S. Lebedev, V.V. Rozhnov // Zootaxa. — 2011. — V. 2812. — P. 1-20.
155. Bannikova, A.A. Contrasting evolutionary history of hedgehogs and gymnures (Mammalia: Erinaceomorpha) as inferred from a multigene study / A.A. Bannikova, V.S. Lebedev, A.V. Abramov, V.V. Rozhnov // Biological Journal of the Linnean Society. — 2014. — V. 112. — № 3. - P. 499-519.
156. Bannikova, A.A. An underground burst of diversity — a new look at the phylogeny and taxonomy of the genus Talpa Linnaeus, 1758 (Mammalia: Talpidae) as revealed by nuclear and mitochondrial genes / A.A. Bannikova, E.D. Zemlemerova, P. Colangelo, M. Sözen, M. Sevindik, A.A. Kidov, R.I. Dzuev, B. Krystufek, V.S. Lebedev // Zoological Journal of the Linnean Society. — 2015. — V. 175. — № 4.
— P. 930-948.
157. Bannikova, A.A. Evolutionary history of the genus Sorex (Soricidae, Eulipotyphla) as inferred from multigene data / A.A. Bannikova, D. Chernetskaya, A. Raspopova,
D. Alexandrov, Y. Fang, N. Dokuchaev, B. Sheftel, V. Lebedev // Zoologica Scripta. — 2018a. — V. 47. — № 5. — P. 518-538.
158. Bannikova, A. Genetic evidence for several cryptic species within the Scarturus elater species complex (Rodentia: Dipodoidea): when cryptic species are really cryptic / A. Bannikova, V. Lebedev, A. Dubrovskaya, E. Solovyeva, V. Moskalenko, B. Krystufek, R. Hutterer, E. Bykova, B. Zhumabekova, K. Rogovin, G. Shenbrot // Biological Journal of the Linnean Society. — 2018b. — V. 126. — № 1. — P. 16-39.
159. Bannikova, A. Haste makes waste, or who are you, Griselda? A new genus of the Asiatic short-tailed shrews (Mammalia, Eulipotyphla, Soricidae) / A. Bannikova, P. Jenkins, E. Solovyeva, S. Pavlova, S. Simanovsky, B. Sheftel, V. Lebedev, Y. Fang, L. Dalen, A. Abramov // Zookeys. — 2019 (in press).
160. Barnosky, A.D. A skeleton of Mesoscalops (Mammalia, Insectivora) from the Miocene Deep River Formation, Montana, and a review of the proscalopid moles: evolutionary, functional and stratigraphic relationships / A.D. Barnosky // Journal of Vertebrate Paleontology. — 1981. — V. 1. — № 3-4. — P. 285-339.
161. Barthelmess, E. L., K. R. Bennett. Handbook of the Mammals of the World: Lagomorphs and Rodents I / D.E. Wilson, T. E. Lacher, R. A. Mittermeier (eds.).
— Barcelona: Lynx Edicions, 2016. — V. 6. — 987 p.
162. Barton, N.H. Evolutionary biology: how did the human species form? / N.H. Barton // Current Biology. — 2006. — № 16. — P. R647-R650.
163. Basset, P. Genetic and karyotypic structure in the shrews of the Sorex araneus group: are they independent? / P. Basset, G. Yannic, J. Hausser // Molecular ecology. — 2006. — V. 15. — № 6. — P. 1577-1587.
164. Bateson, W. Heredity and variation in modern lights / W. Bateson // Darwin and modern science / A.C. Seward (eds.). — United Kingdom, Cambridge: Cambridge University Press, 1909. — P. 85-101.
165. Baum, B.R. Combining trees as a way of combining data sets for phylogenetic inference, and the desirability of combining gene trees / B.R. Baum // Tax on. — 1992. — V. 41. — № 1. — P. 3-10.
166. Beerli, P. Maximum likelihood estimation of a migration matrix and effective population sizes in n subpopulations by using a coalescent approach / P. Beerli, J. Felsenstein // Proceedings of the National Academy of Sciences. — 2001. — V. 98.
— № 8. — P. 4563-4568.
167. Belle, E. The decline of isochores in mammals: An assessment of the GC content variation along the mammalian phylogeny / E. Belle, L. Duret, N. Galtier, A. Eyre-Walker // . — Journal of Molecular Evolution — 2004. — V. 58. — P. 653-660.
168. Bell, M.A. Hybridization, transgressive segregation, genetic covariation, and adaptive radiation / M.A. Bell, M.P. Travis // Trends in ecology & evolution. — 2005. — V. 20. — № 7. — P. 358-361.
169. Ben Faleh, A.R. Phylogeography of the Greater Egyptian jerboa Jaculus orientalis (Rodentia: Dipodidae) in Mediterranean North Africa / A.R. Ben Faleh, L. Granjon, C. Tatard, Z. Boratynski, K. Said, J.F. Cosson // Journal of Zoology. — 2012a. — V. 286. — № 3 — P. 208-220.
170. Ben Faleh, A. Phylogeography of two cryptic species of African desert jerboas (Dipodidae: Jaculus) / A. Ben Faleh, L. Granjon, C. Tatard, Z. Boratynski, J.F. Cosson, K. Said // Biological Journal of the Linnean Society. — 2012b. — V. 107.
— № 1. — P. 27-38.
171. Benton, M.J. Dating the tree of life / M.J. Benton, F.J. Ayala // Science. — 2003.
— V. 300. — № 5626. — P. 1698-1700.
172. Benton, M.J. Calibrating and constraining molecular clocks / M.J. Benton, P.C.J. Donoghue, R.J. Asher // The Timetree of Life / S.B. Hedges, S. Kumar (eds.). — New York: Oxford University Press, 2009. — P. 35-86.
173. Berg, B. Litter decomposition and organic matter turnover in northern forest soils / B. Berg // Forest ecology and Management. — 2000. — V. 133. — № 1-2. — P. 13-22.
174. Berman, D. I. Intraspecific genetic differentiation of the Siberian newt (Salamandrella keyserlingii, Amphibia, Caudata) and the cryptic species S. schrenckii from southeastern Russia / D.I. Berman, M.V. Derenko, B.A. Malyarchuk, T. Grzybowski, A.P. Kryukov, D. Miscicka-Sliwka // Entomological Review. — 2005. — V. 85. — P. 240-253.
175. Bickford, D. Cryptic species as a window on diversity and conservation / D. Bickford, D.J. Lohman, N.S. Sodhi, P.K.L. Ng, R. Meier, K. Winker, K.K. Ingram, I. Das // Trends in Ecology & Evolution. — 2007. — V. 22 — P. 148-155.
176. Bilton, D.T. Mediterranean Europe as an area of endemism for small mammals rather than a source for northwards postglacial colonization / D.T. Bilton, P.M. Mirol, S. Mascheretti, K. Fredga, J. Zima, J.B. Searle // Proceedings of the Royal Society of London B: Biological Sciences. — 1998. — V. 265. — № 1402. — P. 1219-1226.
177. Biltueva, L.S. Comparative chromosome analysis in three Sorex species: S. raddei, S. minutus and S. caecutiens / L.S. Biltueva, P.L. Perelman, A.V. Polyakov, J. Zima, E. Dannelid, P.M. Borodin, A.S. Grafodatsky // Evolution in the Sorex araneus group: Cytogenetic and molecular aspects, Acta Theriologica / J.B. Searle & J. M. Wojcik (eds.). — 2000. — V. 45. — Suppl. 1. — P. 119-213.
178. Biltueva, L. Karyotype evolution of Eulipotyphla (Insectivora): the genome homology of seven Sorex species revealed by comparative chromosome painting and banding data / L. Biltueva, N. Vorobieva, P. Perelman, V. Trifonov, V. Volobouev, V. Panov, V. Ilyashenko, S. Onischenko, P. O'Brien, F. Yang, M. Ferguson-Smith, A. Graphodatsky // Cytogenetic and genome research. — 2011. — V. 135. — № 1. — P. 51-64.
179. Biltueva, L. Chromosome evolution in Eulipotyphla / L. Biltueva, N. Vorobieva // Cytogenetic and genome research. — 2012. — V. 137. — № 2-4. — P. 154-164.
180. Bininda-Emonds, O.R.P. The delayed rise of present-day mammals / O.R.P. Bininda-Emonds, M. Cardillo, K.E. Jones, R.D. E. MacPhee, R.M.D. Beck, R. Grenyer, S.A. Price, R. A.Vos, J.L. Gittleman, A. Purvis // Nature. — 2007. — V. 446. — № 7135. — P. 507-512.
181. Bolfîkovâ, B. Microevolution of sympatry: Landscape genetics of hedgehogs Erinaceus europaeus and E. roumanicus in Central Europe / B. Bolfîkovâ, P. Hulva // Heredity. — 2012. — V. 108 — № 3. — P. 248-255.
182. Bolikhovskaya, N.S. Spatial and temporal regularities in the evolution of vegetation and climate of North Eurasia in the Neopleistocene / N.S. Bolikhovskaya // Archaeology, Ethnology and Anthropology of Eurasia. — 2007. — V. 32. — № 1.
- P. 2-28.
183. Borisenko, A.V. DNA barcoding in surveys of small mammal communities: A field study in Suriname / A.V. Borisenko, B.K. Lim, N.V. Ivanova, R.H. Hanner, P.D.N. Hebert // Molecular Ecology Resources. — 2008. — V. 8. — P. 471-479.
184. Borisenko, A.V. The front-end logistics of DNA barcoding: challenges and prospects / A.V. Borisenko, J.E. Sones, P.D.N. Hebert // Molecular Ecology Resources. — 2009. — V. 9. — P. 27-34.
185. Borodulina, O.R. Short interspersed elements (SINEs) from insectivores. Two classes of mammalian SINEs distinguished by A-rich tail structure / O.R. Borodulina, D.A. Kramerov // Mammalian Genome. — 2001. — V. 12. — № 10.
— P. 779-786.
186. Brace, S. Evolutionary history of the Nesophontidae, the last unplaced recent mammal family / S. Brace, J.A. Thomas, L. Dalen, J. Burger, R.D.E. MacPhee, I. Barnes, S.T.Turvey // Mol. Biol. Evol. — 2016. — V. 33. — P. 3095-3103.
187. Bradley, B.D. A test of the genetic species concept: cytochrome-b sequences and mammals / B.D. Bradley, R.J. Baker // Journal of Mammalogy. — 2001. — V. 82.
— № 4. — P. 960-973.
188. Brambell, F.W.R. Reproduction in the common shrew Sorex araneus Linnaeus / F.W.R. Brambell // Philosophical Transactions of the Royal Society of London. Ser. B. Biological Sciences. — 1935. — V. 225. — P. 1-62.
189. Brandon-Jones, D. The Asian Colobinae (Mammalia: Cercopithecidae) as indicators of quaternary climatic change / D. Brandon-Jones // Biological Journal of the Linnean Society. — 1996. — V. 59. — № 3. — P. 327-350.
190. Brandli, L. Evolutionary history of the greater white-toothed shrew (Crocidura russula) inferred from analysis of mtDNA, Y, and X chromosome markers / L. Brandli, L.-J. L. Handley, P.Vogel, N. Perrin // Molecular Phylogenetics and Evolution. — 2005. — V. 37. — № 3. — P. 832-844.
191. Brito, P.H. Multilocus phylogeography and phylogenetics using sequence-based markers / P.H. Brito, S.V. Edwards // Genetica. — 2009. — V. 135. — № 3. - P. 439-455.
192. Bromham, L. Testing the Cambrian explosion hypothesis by using a molecular dating technique / L. Bromham, A. Rambaut, R. Fortey, A. Cooper, D. Penny // Proceedings of the National Academy of Sciences. — 1998. — V. 95. — № 21. — P. 12386-12389.
193. Bromham, L. Growing up with dinosaurs: molecular dates and the mammalian radiation / L. Bromham, M.J. Phillips, D. Penny // Trends in ecology & evolution.
— 1999. — V. 14. — № 3. — P. 113-118.
194. Bromham, L. The power of relative rates tests depends on the data / L. Bromham, D. Penny, A. Rambaut, M.D. Hendy // Journal of Molecular Evolution. — 2000. — V. 50. — № 3. — P. 296-301.
195. Bromham, L. The modern molecular clock / L. Bromham, D. Penny // Nature Reviews Genetics. — 2003. — V. 4. — № 3. — P. 216-224.
196. Brown, R.P. Rate variation and estimation of divergence times using strict and relaxed clocks / R.P. Brown, Z. Yang // BMC Evolutionary Biology. — 2011. — V. 11. — № 271. — P. 1-12.
197. Brown, J. FQC Dashboard: integrates FastQC results into a web-based, interactive, and extensible FASTQ quality control tool / J. Brown, M. Pirrung, L.A. McCue // Bioinformatics. - 2017. — V. 33. — № 19. — P. 3137-3139.
198. Brunet, A.K. Evidence of introgression between masked shrews (Sorex cinereus), and prairie shrews (S. haydeni), in Minnesota / A.K. Brunet, R.M. Zink, K.M. Kramer, R.C. Blackwell-Rago, S.L. Farrell, T.V. Line, E.C. Birney // The American midland naturalist. — 2002. — V. 147. — № 1. — P. 116-122.
199. Bryant, D. A classification of consensus methods for phylogenetics / D. Bryant // BioConsensus / M. Janowitz (eds.). — American Mathematical Society, 2003. — P. 163-183.
200. Bugge, J. The Cephalic Arterial System in Insectivores, Primates, Rodents and Lagomorphs, with Special Reference to the Systematic Classification / J. Bugge // Cells Tissues Organs. — 1974. — V. 87. — Suppl. 62. — P. 21-31.
201. Burgin, C.J. Species accounts of Soricidae / C.J. Burgin, K. He, R. Haslauer, B.I. Sheftel, P.D. Jenkins, M. Ruedi, S. Hintsche, M. Motokawa, A. Hincley, R. Hutterer // Handbook of the Mammals of the World. Insectivores, Sloths and Colugos / D.E. Wilson, R.A. Mittermeier. — Barcelona: Lynx Editions, 2018. — V. 8. — P. 395-551.
202. Butler, P.M. On the evolution of the skull and teeth in the Erinaceidae, with special reference to fossil material in the British Museum / P.M. Butler // Proceedings of the Zoological Society of London. — 1948. — V. 118. — № 2. — P. 446-500.
203. Butler, P.M. The skull of Ictops and the classification of the Insectivora / P.M. Butler // Proceedings of the Zoological Society of London. — 1956. — V. 126. — № 3. — P. 453-481.
204. Butler, P.M. The problem of insectivore classification / P.M. Butler // Studies in Vertebrate Evolution / K.A. Joysey, T.S.N.-Y. Kemp (eds.). — Winchester: Winchester Press, 1972. — P. 253-265.
205. Butler, P.M. Phylogeny of the Insectivores / P.M. Butler // The phylogeny and classification of the tetrapods / M.J. Benton (Ed.). — Oxford: Clarendon Press, 1988. — V. 2. — P. 117-141.
206. Butler, P.M. Fossil history of shrews in Africa / P.M. Butler // Evolution of shrews / J.M. Wojcik, M. Wolsan (eds.). — Bialowieza: Mammal Research Institute, Polish Academy of Sciences, 1998. — P. 121-132.
207. Butlin, R.K. Recombination and speciation / R.K. Butlin // Molecular Ecology. — 2005. — V. 14. — № 9. — P. 2621-2635.
208. Cabrera, A. XXXII.—Three new Spanish insectivores / A. Cabrera // Journal of Natural History. — 1907. — V. 20. — № 117. — P. 212-215.
209. Cabrera, A. Genera Mammalium, Insectivora Galeopithecia / A. Cabrera. — Madrid: Museo Nacional de Ciencias Naturales, 1925. — 232 p.
210. Camargo, A. Species delimitation with ABC and other coalescent-based methods: a test of accuracy with simulations and an empirical example with lizards of the Liolaemus darwinii complex (Squamata: Liolaemidae) / A. Camargo, M. Morando, L.J. Avila, J.W. Sites Jr // Evolution: International Journal of Organic Evolution. — 2012. — V. 66. — № 9. — P. 2834-2849.
211. Camargo, A. Species Delimitation: A Decade after the Renaissance / A. Camargo, J.J. Sites // InTech. — 2013. — P. 225-247.
212. Campbell, B. The shoulder anatomy of the moles. A study in phylogeny and adaptation / B. Campbell // American Journal of Anatomy. — 1939. — V. 64. — № 1. — P. 1-39.
213. Can, D.N. Checklist of wild mammal species of Vietnam / D.N. Can, H. Endo, N.T. Son, T. Oshida, L.X. Canh, D.H. Phuong, D.P. Lunde, S.-I. Kawada, A. Hayashida, M. Sasaki. — Hanoi: Institute of Ecology and Biological Resources, 2008. — 400p.
214. Capanna, E. Caryotype et morphologie crânienne de Talpa romana Thomas de terra typica / E. Capanna // Mammalia. — 1981. — V. 45. — P. 71-82.
215. Carstens, B.C. How to fail at species delimitation / B.C. Carstens, T.A. Pelletier, N.M. Reid, J.D. Satler // Molecular ecology. — 2013. — V. 22. — № 17. — P. 4369-4383.
216. Castién, E. The diet of Neomys fodiens in the Spanish Western Pyrenees / E. Castién // Folia Zoologica . — 1995. — V. 44. — P. 297-303.
217. Castiglia, R. Mitochondrial DNA reveals different phylogeographic structures in the water shrews Neomys anomalus and N. fodiens (Insectivora: Soricidae) in Europe / R. Castiglia, F. Annesi, G. Aloise, G. Amori // Journal of Zoological Systematics and Evolutionary Research. — 2007. — V. 45. — № 3. — P. 255-262.
218. Castiglia, R. The evolutionary history of a mammal species with a highly fragmented range: the phylogeography of the European snow vole / R. Castiglia, F. Annesi, B. Krystufek, M.G. Filippucci, G. Amori // Journal of zoology. — 2009. — V. 279. — № 3. — P. 243-250.
219. Castoe, T.A. Evidence for an ancient adaptive episode of convergent molecular evolution / T.A. Castoe, A.J. de Koning, H.M. Kim, W. Gu, BP. Noonan, G.
Naylor, Z.J. Jiang, C. L. Parkinson, D.D. Pollock // Proceedings of the National Academy of Sciences. — 2009. — V. 106. — №. 22. — P. 8986-8991.
220. Catzeflis, P.F. Comparaison biochimique des Musaraignes du genre Sorex en Europe occidentale (Soricidae, Mammalia) / F. Catzeflis, J.-D. Graf, J. Hausser, P. Vogel // Journal of Zoological Systematics and Evolutionary Research. — 1982. — V. 20. — P. 223-233.
221. Catzeflis, F. Unexpected findings on the taxsonomic status of East Mediterranean Crocidura russula auct. (Mammalia, Insectivora) / F. Catzeflis, T. Maddalena, S. Hellwing, P. Vogel // Z. Saugetierk. — 1985. — V. 50. — № 4. — P. 185-201.
222. Cerling, T.E. Global vegetation change through the Miocene/Pliocene boundary / T.E. Cerling, J.M. Harris, B.J. MacFadden, M.G. Leakey, J. Quade, V. Eisenmann, J R. Ehleringer // Nature. — 1997. — V. 389. — № 6647. — P. 153-158.
223. Chemenda, A. I. New results from physical modelling of arc-continent collision in Taiwan: evolutionary model / A.I. Chemenda, R.K. Yang, J.F. Stephan, E.A. Konstantinovskaya, G.M. Ivanov // Tectonophysics. — 2001. — V. 333. — № 1.
— P. 159-178.
224. Chen, S.D. Molecular phylogeny of asiatic short-tailed shrews, genus Blarinella Thomas, 1911 (Mammalia: Soricomorpha: Soricidae) and its taxonomic implications / S. Chen, S. Liu, Y. Liu, K. He, W. Chen, X. Zhang, Z. Fan, F. Tu, X. Jia, B. Yue // Zootaxa. — 2012. — V. 3250. — № 1. — P. 43-53.
225. Chen, S. Molecular phylogenetics and phylogeographic structure of Sorex bedfordiae based on mitochondrial and nuclear DNA sequences / S. Chen, Z. Sun, K. He, X. Jiang, Y. Liu, N. P. Koju, X. Zhang, F. Tu, Z. Fan, S. Liu, B. Yue // Molecular phylogenetics and evolution. — 2015. — V. 84. — P. 245-253.
226. Churakov, G. Mosaic retroposon insertion patterns in placental mammals / G. Churakov, J.O. Kriegs, R. Baertsch, A. Zemann, Ju. Brosius, Ju. Schmitz // Genome Research. — 2009. — V. 19. — № 5. — P. 868-875.
227. Churchfield, S. The natural history of shrews / S. Churchfield. — London: Christopher Helm Press, 1990. — 178 p.
228. Churchfield, S. Diets and coexistence in Neomys and Sorex shrews in Bialowieza forest, eastern Poland / S. Churchfield, L. Rychlik // Journal of Zoology. — 2006.
— V. 269. — №. 3. — P. 381-390.
229. Churchfield, S. First results on the feeding ecology of the Transcaucasian water shrew Neomys teres (Soricomorpha: Soricidae) from Armenia / S. Churchfield, L.
Rychlik, E. Yavrouyan, K. Turlejski // Canadian Journal of Zoology. — 2006. — V. 84. — №. 12. — P. 1853-1858.
230. Clement, M. TCS: a computer program to estimate gene genealogies / M. Clement, D. Posada, K.A. Crandall // Molecular ecology. — 2000. — V. 9. — № 10. — P. 1657-1659.
231. Colangelo, P. Molecular systematics and evolutionary biogeography of the genus Talpa (Soricomorpha: Talpidae) / P. Colangelo, A.A. Bannikova, B. Krystufek, V. Lebedev, F. Annesi, A. Loy, E. Capanna // Molecular Phylogenetics and Evolution. — 2010. — V. 55. — № 2. — P. 372-380.
232. Corbet, G.B. The mammals of the Palaearctic region: A taxonomic review / G.B. Corbet. — London: British Museum (Natural History), 1978. — 314 p.
233. Corbet, G. B. The family Erinaceidae: a synthesis of its taxonomy, phylogeny, ecology and zoogeography / G.B. Corbet // Mammal review. — 1988. — V. 18. — № 3. — P. 117-172.
234. Corbet, G.B. The mammals of the Indomalayan region: a systematic review / G.B. Corbet, J E. Hill. — Oxford: Oxford University Press, 1992. — 496 p.
235. Corti, M. Multivariate analysis of osteometric traits in Italian moles (genus Talpa) / M. Corti, A. Loy, M.L. Azzaroli, E. Capanna // Zeitschrift für Säugetierkunde. — 1985. — V. 50. — №. 1. — P. 12-17.
236. Corti, M. Morphometric divergence in southern European moles (Insectivora, Talpidae) / M. Corti, A. Loy // Italian Journal of Zoology. — 1987. — V. 54. — №. 2. — P. 187-191.
237. Curletti, G. Notes on metatarsal morphology in the genus Agrilus and proposed redefinition of its subgenera in afrotropical region (Coleoptera, Buprestidae) / G. Curletti // Bolletino della Società entomologica italiana. — 1998. — V. 130. — № 2. — P. 125-134.
238. Cuvier, G. Tableau élémentaire de lhistoire naturelle des animaux / G. Cuvier. — Paris, Baudouin, 1798. — 710 p.
239. Cuvier, G. Le r gne animal distribu d'apr s son organisation. Pour servir de base l'histoire naturelle des animaux et d'introduction l'anatomie compare / G. Cuvier. — Paris, 1817.
240. Cosson, J.-F. Phylogeographical footprints of the Strait of Gibraltar and Quaternary climatic fluctuations in the western Mediterranean: a case study with the greater white-toothed shrew, Crocidura russula (Mammalia: Soricidae) / J.-F. Cosson, R.
Hutterer, R. Libois, M. Sara, P. Taberlet, P. Vogel // Molecular Ecology. — 2005. — V. 14. — № 4. — P. 1151-1162.
241. Crowcroft, P. On the life span of the common shrew (Sorex araneus L.) / P. Crowcroft // Proc. zool. Soc. Lond. — 1956. — V. 127. — P. 285-292.
242. Crumpton, N. The holes of moles: osteological correlates of the trigeminal nerve in Talpidae / N. Crumpton, R.S. Thompson // Journal of Mammalian Evolution. — 2013. — V. 20. — №. 3. — P. 213-225.
243. Csilléry, K. Approximate Bayesian computation (ABC) in practice / K. Csillèry, M. Blum, O. Gaggiotti, O. François // Trends in ecology & evolution. — 2010. — V. 25. — № 7. — P. 410-418.
244. Dahlmann, T. Die Kleinsäuger der unter-pliozänen Fundstelle Wölfersheim-in der Wetterau (Mammalia: Lipotyphla, Chiroptera, Rodentia) / T. Dahlmann // Courier Forschungsinstitut Senckenberg. — 2001. — V. 227. — P. 1-129.
245. Dannelid, E. The genus Sorex (Mammalia, Soricidae) - distribution and evolutionary aspects of Eurasian species / E. Dannelid // Mammal Review. — 1991. — V. 21. — № 1. — P. 1-20.
246. Dannelid, E. Chromosome polymorphism in Sorex alpinus (Mammalia, Soricidae) in the western Alps and the Swiss Jura / E. Dannelid // Zeitschrift für Säugetierkunde. — 1994a. — V. 59. — № 3. — P. 161-168.
247. Dannelid, E. The karyotype of Sorex samniticus and its relation to that of S. araneus and three other species of Sorex (Mammalia, Soricidae) / E. Dannelid // Folia Zoologica. — 1994b. — V. 43. — № 1. — P. 71-88.
248. Dannelid, E. Dental adaptations in shrews / E. Dannelid // Evolution shrews / J. M.Wojcik, M. Wolsan (eds.). — Bialowieza: Mammal Research Institute, Polish Academy of Sciences, Bialostockie Zaklady Graficzne, 1998. — P. 157-174.
249. Davis, P.H. Distribution patterns in Anatolia with particular reference to endemism / P.H. Davis // Plant life of south west Asia / P.H. Davis, P.C. Harper, I.C. Hedge (eds.). — Edinburgh: Royal Botanic Garden, 1971. — P. 15-27.
250. Dawson, M.R. Bering down: Miocene dispersals of land mammals between North America and Europe / M.R. Dawson // The Miocene land mammals of Europe / G.E. Rössner, K. Heissig (eds.). — München: Verlag Dr. Friedrich Pfeil, 1999. — P. 473-483.
251. Dawson, M.R. Fossil history of the families of recent mammals / M.R. Dawson, L. Krishtalka // Orders and Families of Recent Mammals of the World / S. Anderson, J.K. Jones (eds.). — New York: Wiley, 1984. — P. 11-57.
252. De Giuli, C. Endemism and bio-chronological reconstructions: the Gargano case history / C. De Giuli, F. Masini, D. Torre, V. Boddi // Bollettino della Società Paleontologica Italiana. — 1987. — V. 25. — № 3. — P. 267-276.
253. De Jong, W.W. Molecules remodel the mammalian tree / W.W. De Jong // Trends in ecology & evolution. — 1998. — V. 13. — № 7. — P. 270-275.
254. De Queiroz, K. A unified concept of species and its consequences for the future of taxonomy / K. de Queiroz // Proceedings of the California Academy of Sciences. — 2005. — V. 56. — P. 195-215.
255. De Queiroz, K. Species concepts and species delimitation / K. de Queiroz // Systematic biology. — 2007. — V. 56. — № 6. — P. 879-886.
256. De Queiroz, K. Phylogeny as a central principle in taxonomy: phylogenetic definitions of taxon names Systematic zoology / K. de Queiroz, J. Gauthier // Systematic zoology. — 1990. — V. 39. — № 4. — P. 307-322.
257. De Queiroz K. Phylogenetic taxonomy / K. de Queiroz, J. Gauthier // Annual review of ecology and of Ecology and Systematics. — 1992. — V. 23. — P. 449480.
258. De Queiroz K. Toward a phylogenetic system of biological nomenclature / K. de Queiroz, J. Gauthier // Trends in Ecology & Evolution. — 1994. — V. 9. — № 1. — P. 27-31.
259. Degnan, J.H. Gene tree distributions under the coalescent process / J.H. Degnan, L A. Salter // Evolution. — 2005. — V. 59. — № 1. — P. 24-37.
260. Degnan, J.H. Gene tree discordance, phylogenetic inference and the multispecies coalescent / J.H. Degnan, N.A. Rosenberg // Trends in ecology & evolution. — 2009. — V. 24. — № 6. — P. 332-340.
261. Demboski, J.R. Phylogeography of the dusky shrew, Sorex monticolus (Insectivora, Soricidae): insight into deep and shallow history in northwestern North America / J.R. Demboski, J.A. Cook // Molecular Ecology. — 2001. — V. 10. — № 5. — P. 1227-1240.
262. Demboski, J.R. Phylogenetic diversification within the Sorex cinereus group (Soricidae) / J.R. Demboski, J.A. Cook // Journal of Mammalogy. — 2003. — V. 84. — № 1. — P. 144-158.
263. Demos, T.C. Local endemism and within-island diversification of shrews illustrate the importance of speciation in building Sundaland mammal diversity / T.C. Demos, A.S. Achmadi, T.C. Giarla, H. Handika, K.C. Rowe, J.A. Esselstyn // Molecular ecology. — 2016. — V. 25. — № 20. — P. 5158-5173.
264. Demuth, J.P. The evolution of mammalian gene families / J.P. Demuth, T. De Bie, J.E. Stajich, N. Cristianini, M.W. Hahn // PloS one. — 2006. — V. 1. — № 1. — P. e85.
265. Depéret, C. Recherches sur la succession des Faunes de Vertébrés miocènes de la vallée du Rhone / C. Depéret // Arch. Mus. Hist. Natur. Lyon. — 1887. — V. 4. — P. 45-313.
266. Derouiche, L. Genetic evidence supporting the taxonomic separation of the Arabian and Northwest African subspecies of the desert hedgehog (Paraechinus aethiopicus) / L. Derouichea, P. Vercammenb, R. Bouhadada, C. Fernandes // Gene. — 2017. — V. 620. — P. 54-65.
267. Dettman, D.L. Uplift-driven climate change at 12 Ma: a long 518O record from the NE margin of the Tibetan plateau / D.L. Dettman, X. Fang, C.N. Garzione, J. Li // Earth and Planetary Science Letters. — 2003. — V. 214. — №. 1-2. — P. 267-277.
268. Diersing, V.E. Systematics and evolution of the pygmy shrews (subgenus Microsorex) of North America / V.E. Diersing // Journal of Mammalogy. — 1980. — V. 61. — № 1. — P. 76-101.
269. Dobin, A. STAR: ultrafast universal RNA-seq aligner / A. Dobin, C.A. Davis, F. Schlesinger, J. Drenkow, C. Zalesk, S. Jha, P. Batu, M. Chaisson, T.R. Gingeras // Bioinformatics. — 2013. — V. 29. — № 1. — P. 15-21.
270. Doby, J. A Systematic Review of the Soricimorph Eulipotyphla (Soricidae: Mammalia) from the Gray Fossil Site (Hemphillian), Tennessee / J. Doby // Electronic Theses and Dissertations. — 2015. — Paper 2526.
271. Dobzhansky, T. Genetics and the origin of species / T. Dobzhansky. — New York: Columbia University Press, 1937 — 364 p.
272. Dobzhansky, T. Studies on hybrid sterility. I. Spermatogenesis in pure and hybrid Drosophila pseudoobscura hybrids / T. Dobzhansky // Proceedings of the National Academy of Sciences. — 1934. —V. 19. — P. 397-403.
273. Dokuchaev, N.E. "Rule of six" for the forming of multispecies communities in shrews Sorex / N.E. Dokuchaev // Abstracts of 9th International mammalogical Congress "Roles of Mammalogy on coexistence of wild mammals and human". — Hokkaido, Sapporo, 2005. — P. 69-70.
274. Dos Reis, M. Phylogenomic datasets provide both precision and accuracy in estimating the timescale of placental mammal phylogeny / M. Dos Reis, J. Inoue, M. Hasegawa, R.J. Asher, P.C. Donoghue, Z. Yang // Proceedings of the Royal Society B: Biological Sciences. — 2012. — V. 279. — № 1742. — P. 3491-3500.
275. Dos Reis, M. Uncertainty in the Timing of Origin of Animals and the Limits of Precision in Molecular Timescales / M. Dos Reis, Y. Thawornwattana, K. Angelis, M.J. Telford, P.C.J. Donoghue, Z. Yang // Current Biology. — 2015. — V. 25. — P. 2939-2950.
276. Douady, C.J. Molecular phylogenetic evidence confirming the Eulipotyphla concept and in support of hedgehogs as the sister group to shrews / C.J. Douady, P.I. Chatelier, O. Madsen, W.W. De Jong, F. Catzeflis, M.S. Springer, M.J. Stanhope // Molecular phylogenetics and evolution. — 2002. — V. 25. — № 1. — P. 200-209.
277. Douady, C. Molecular estimation of eulipotyphlan divergence times and the evolution of "Insectivora" / C. Douady, E. Douzery // Molecular phylogenetics and evolution. — 2003. — V. 28. — № 2. — P. 285-296.
278. Doukas, C.S. Greece / C.S. Doukas // The Fossil Record of the Eurasian Neogene Insectivores (Erinaceomorpha, Soricomorpha, Mammalia), Part I. Scripta Geologica Special Issue / L.W. van den Hoek Ostende, C.S. Doukas, J.W.F. Reumer (eds.). — 2005. — V. 5. — P. 99-112.
279. Doukas, C.C. The Vertebrate Locality Maramena (Macedonia, Greece) at the Turolian-Ruscinian Boundary (Neogene) / C.C. Doukas, L.W. van den Hoek Ostende, C.D. Theocharopoulos, J.W. Reumer // Münchner Geowissenschaftliche Abhandlungen. — 1995. — V. 28. — P. 43-64.
280. Douzery, E.J.P. OrthoMaM v8: a database of orthologous exons and coding sequences for comparative genomics in mammals / E.J.P. Douzery, C. Scornavacca, J. Romiguier, K. Belkhir, N. Galtier, F. Delsuc, V. Ranwez // Molecular biology and evolution. — 2014. — V. 31. — № 7. — P. 1923-1928.
281. Drummond, A.J. Bayesian coalescent inference of past population dynamics from molecular sequences / A.J. Drummond, A. Rambaut, B. Shapiro, O.G. Pybus // Molecular biology and evolution. — 2005. — V. 22. — №. 5. — P. 1185-1192.
282. Drummond, A.J. Relaxed phylogenetics and dating with confidence / A.J. Drummond, S.Y. Ho, M.J. Phillips, A. Rambaut // PLoS biology. — 2006. — V. 4. — № 5. — P. e88.
283. Drummond, A.J. Bayesian phylogenetics with BEAUti and the BEAST 1.7 / A.J. Drummond, M.A. Suchard, D. Xie, A. Rambaut // Molecular biology and evolution. — 2012. — V. 29. — № 8. — P. 1969-1973.
284. Dubey, S. Pliocene and Pleistocene diversification and multiple refugia in a Eurasian shrew (Crocidura suaveolens group) / S. Dubey, M. Zaitsev, J.-F. Cosson,
A. Abdukadier, P. Vogel // Molecular Phylogenetics and Evolution. — 2006. — V. 38. — № 3. — P. 635-647.
285. Dubey, S. Use of phylogeny to resolve the taxonomy of the widespread and highly polymorphic African giant shrews (Crocidura olivieri group, Crocidurinae, Mammalia) / S. Dubey, M. Antonin, C. Denys, P. Vogel // Zoology. — 2007a. — V. 110. — № 1. — P. 48-57.
286. Dubey, S. Mediterranean populations of the lesser white-toothed shrew (Crocidura suaveolens group): an unexpected puzzle of Pleistocene survivors and prehistoric introductions / S. Dubey, J-F. Cosson, E. Magnanou, V. Vohralik, P. Benda, D. Frynta, R. Hutterer, V. Vogel, P.Vogel // Molecular Ecology. — 2007b. — V. 16. — № 16. — P. 3438-3452.
287. Dubey, S. Molecular evidence of Pleistocene bidirectional faunal exchange between Europe and the Near East: the case of the bicoloured shrew (Crocidura leucodon, Soricidae) / S. Dubey, J.F. Cosson, V. Vohralik, B. Krystufek, E. Diker, P. Vogel // Journal of evolutionary biology. — 2007c. — V. 20. — № 5. — P. 1799-1808.
288. Dubey, S. Cytogenetic and molecular relationships between Zarudny's rock shrew (Crocidura zarudnyi; Mammalia: Soricomorpha) and Eurasian taxa / S. Dubey, P. Novâ, P. Vogel, V. Vohralik //Journal of mammalogy. - 2007d. - V. 88. - №. 3. -P. 706-711.
289. Dubey, S. Molecular phylogenetics of shrews (Mammalia: Soricidae) reveal timing of transcontinental colonizations / S. Dubey, N. Salamin, S.D. Ohdachi, P. Barrière, P. Vogel // Molecular phylogenetics and evolution. — 2007e. — V. 44. — № 1. — P. 126-137.
290. Dubey, S. Secondary contact zones and hybridizations: the case of the lesser white-toothed shrew (Crocidura suaveolens group, Soricidae) / S. Dubey, E. Diker, C. Kurtonur, P. Vogel // Biological Journal of the Linnean Society. — 2008a. — V. 95. — P. 557-565.
291. Dubey, S. Molecular phylogenetics reveals Messinian, Pliocene, and Pleistocene colonizations of islands by North African shrews / S. Dubey, K. Koyasu, R. Parapanov, M. Ribi, R. Hutterer, P. Vogel // Molecular Phylogenetics and Evolution. — 2008b. — V. 47. — № 2. — P. 877-882.
292. Dubey, S. Biogeographic origin and radiation of the Old World crocidurine shrews (Mammalia: Soricidae) inferred from mitochondrial and nuclear genes / S. Dubey,
N. Salamin, M. Ruedi, P. Barrire, M. Colyn, P. Vogel // Molecular Phylogenetics and Evolution. — 2008c. — V. 48. — № 3. — P. 953-963.
293. Dubey, S. False phylogenies on wood mice due to cryptic cytochrome-b pseudogene / S. Dubey, J. Michaux, H. Brunner, R. Hutterer, P. Vogel // Molecular Phylogenetics and Evolution. — 2009. — V. 50. — № 3. — P. 633-641.
294. Dueser, R.D. Microhabitats in a forest-floor small mammal fauna / R.D. Dueser, H.H. Shugart Jr // Ecology. — 1978. — V. 59. — № 1. — P. 89-98.
295. Dupanloup, I. A simulated annealing approach to define the genetic structure of populations / I. Dupanloup, S. Schneider, L. Excoffier // Molecular ecology. — 2002. — V. 11. — № 12. — P. 2571-2581.
296. Duret, L. Vanishing GC-rich isochores in mammalian genomes / L. Duret, M. Semon, G. Piganeau, D. Mouchiroud, N. Galtier // Genetics. — 2002. — V. 162. — № 4. — P. 1837-1847.
297. Eames, J.C. New species of barwing Actinodura (Passeriformes: Sylviinae: Timaliini) from the western highlands of Vietnam / J.C. Eames, L.T. Trai, N. Cu, R. Eve // Ibis. — 1999. — V. 141. — № 1. — P. 1-10.
298. Earl, D A. STRUCTURE HARVESTER: a website and program for visualizing STRUCTURE output and implementing the Evanno method / D.A. Earl, B.M. von Holdt // Conservation genetics resources. — 2012. — V. 4. — № 2. — P. 359-361.
299. Easteal, S. The Mammalian Molecular Clock / S. Easteal, C. Collet, D.Betty. — New York, R.G. Landes, 1995.
300. Ebersberger, I. Mapping human genetic ancestry / I. Ebersberger, P. Galgoczy, S. Taudien, S. Taenzer, M. Platzer, A. von Haeseler // Molecular biology and evolution. — 2007. — V. 24. — № 10. — P. 2266-2276.
301. Edwards, S.V. Is a new and general theory of molecular systematics emerging? / S.V. Edwards // Evolution: International Journal of Organic Evolution. — 2009. — V. 63. — № 1. — P. 1-19.
302. Ellerman, J.R. Checklist of Palearctic and Indian mammals 1758 to 1946 / J.R. Ellerman, T.C. Morrison-Scott. — London: Brit. Mus. Nat. Hist, 1951. — 810 p.
303. Emerling, C.A. Spectral shifts of mammalian ultraviolet-sensitive pigments (short wavelength-sensitive opsin 1) are associated with eye length and photic niche evolution / C.A. Emerling, H.T. Huynh, M.A. Nguyen, R.W. Meredith, M.S. Springer // Proceedings of the Royal Society B: Biological Sciences. — 2015. — V. 282. — № 1819. — P. 20151817.
304. Emerson, G.L. Phylogenetic relationships of the order Insectivora based on complete 12S rRNA sequences from mitochondria / G.L. Emerson, C.W. Kilpatrick, B E. McNiff, J. Ottenwalder, M.W. Allard // Cladistics. — 1999. — V. 15. — № 3.
— P. 221-230.
305. Engesser, B. Odontological and craniological comparisions of the recent hedgehog Neotetracus with Hylomys and Neohylomys / B. Engesser, J. Jiang // Vertebrata Palasiatica. — 2011. — V. 49. — № 4. — P. 406-422.
306. Esselstyn, J.A. The role of repeated sea-level fluctuations in the generation of shrew (Soricidae: Crocidura) diversity in the Philippine Archipelago / J.A. Esselstyn, R.M. Brown // Molecular Phylogenetics and Evolution. — 2009. — V. 53. — №. 1. — P. 171-181.
307. Esselstyn, J.A. Do geological or climatic processes drive speciation in dynamic archipelagos? The tempo and mode of diversification in Southeast Asian shrews / J.A. Esselstyn, R.M. Timm, R.M. Brown // Evolution: International Journal of Organic Evolution. — 2009. — V. 63. — № 10. — P. 2595-2610.
308. Esselstyn, J.A. New species of shrew (Soricidae: Crocidura) from Sibuyan Island, Philippines / J.A. Esselstyn, S.M. Goodman // Journal of Mammalogy. — 2010. — V. 91. — № 6. — P. 1467-1472.
309. Esselstyn, J.A. Integrating phylogenetic and taxonomic evidence illuminates complex biogeographic patterns along Huxley's modification of Wallace's Line / J.A. Esselstyn, C.H. Oliveros, R.G. Moyle, AT. Peterson, J.A. McGuire, R.M. Brown // Journal of Biogeography. — 2010. — V. 37. — № 11. — P. 2054-2066.
310. Esselstyn, J.A. Carving out turf in a biodiversity hotspot: multiple, previously unrecognized shrew species co-occur on Java Island, Indonesia / J.A. Esselstyn, A.S. Achmadi, C D. Siler, B.J. Evans // Molecular ecology. — 2013. — V. 22. — № 19. — P. 4972-4987.
311. Esselstyn, J.A. A new species of shrew (Soricomorpha: Crocidura) from West Java, Indonesia / J.A. Esselstyn, A.S. Achmadi // Journal of Mammalogy. — 2014.
— V. 95. — № 2. — P. 216-224.
312. Esselstyn, J.A. A hog-nosed shrew rat (Rodentia: Muridae) from Sulawesi Island, Indonesia / J.A. Esselstyn, A.S. Achmadi, H. Handika, K.C. Rowe // Journal of Mammalogy. — 2015. — V. 96. — № 5. — P. 895-907.
313. Evanno, G. Detecting the number of clusters of individuals using the software STRUCTURE: a simulation study / G. Evanno, S. Regnaut, J. Goudet // Molecular ecology. — 2005. — V. 14. — № 8. — P. 2611-2620.
314. Excoffier, L. Analysis of molecular variance inferred from metric distances among DNA haplotypes: application to human mitochondrial DNA restriction data / L. Excoffier, P.E. Smouse, J.M. Quattro // Genetics. — 1992. — V. 131. — № 2. — P. 479-491.
315. Eyre-Walker, A. The evolution of isochores / A. Eyre-Walker, L.D. Hurst // Nature Reviews Genetics. — 2001. — V. 2. — № 7. — P. 549-555.
316. Farris, J.S. Testing significance of incongruence / J.S. Farris, M. Källersjö, A.G. Kluge, C. Bult, // Cladistics. — 1995. — V. 10. — № 3. — P. 315-319.
317. Fedorov, V.B. Comparative phylogeography and demographic history of the wood lemming (Myopus schisticolor): implications for late Quaternary history of the taiga species in Eurasia / V.B. Fedorov, A.V. Goropashnaya, G.G. Boeskorov, J.A. Cook // Molecular Ecology. — 2008. — V. 17. — №. 2. — P. 598-610.
318. Feldhamer, G.A. Mammalogy: adaptation, diversity, and ecology / L.C. Drickamer,
5.H. Vessey, J.F. Merritt. — New York: McGraw-Hill, 1999. — 576 p.
319. Felsenstein, J. Evolutionary trees from DNA sequences: a maximum likelihood approach / J. Felsenstein // Journal of molecular evolution. — 1981. — V. 17. — №
6. — P. 368-376.
320. Felsenstein, J. Inferring phylogenies / J. Felsenstein. — Sunderland, MA : Sinauer associates, 2004.
321. Feng, Y.-J. Phylogenomics reveals rapid, simultaneous diversification of three major clades of Gondwanan frogs at the Cretaceous-Paleogene boundary / Y.-J. Feng, D C. Blackburn, D. Liang, D.M. Hillis, D.B. Wake, D C. Cannatella, P. Zhang // Proceedings of the National Academy of Sciences. — 2017. — V. 114. — № 29. — P. E5864-E5870.
322. Feuda, R. Tracing the evolutionary history of the mole, Talpa europaea, through mitochondrial DNA phylogeography and species distribution modelling / R. Feuda, A.A. Bannikova, E.D. Zemlemerova, M. Di Febbraro, A. Loy, R. Hutterer, G. Aloise, A.E. Zykov, F. Annesi, P. Colangelo // Biological Journal of the Linnean Society. — 2015. — V. 114. — № 3. — P. 495-512.
323. Filippucci, M.G. Allozyme variation and divergence in Erinaceidae (Mammalia, Insectivora) / M.G. Filippucci, S. Simson // Israel Journal of Zoology. — 1996. — V. 42. — № 4. — P. 335-345.
324. Filippucci, M.G. Allozyme variation and systematics of European moles of the genus Talpa (Mammalia, Insectivora) / M.G., Filippucci, G. Nascetti, E. Capanna, L. Bullini // Journal of Mammalogy. — 1987. — V. 68. — № 3. — P. 487-499.
325. Findley, J.S. Speciation of the wandering shrew / J.S. Findley // University of Kansas Natural History Museum Miscellaneous Publication. — 1955. — V. 9. — P. 1-68.
326. Fitch, W.M. Distinguishing homologous from analogous proteins / W.M. Fitch // Systematic zoology. — 1970. — V. 19. — № 2. — P. 99-113.
327. Fitch, W.M. Construction of phylogenetic trees / W.M. Fitch, E. Margoliash // Science, New Series. — 1967. — V. 155. — № 3760. — P. 279-284.
328. Fitzpatrick, B.M. Rates of evolution of hybrid inviability in birds and mammals / B.M. Fitzpatrick // Evolution. — 2004. — V. 58. — № 8. — P. 1865-1870.
329. Fjeldsa, J. Diversification of tanagers, a species rich bird group, from lowlands to montane regions of South America / J. Fjeldsa, C. Rahbek // Integrative and comparative biology. — 2006. — V. 46. — № 1. — P. 72-81.
330. Foley, N.M. Mammal madness: is the mammal tree of life not yet resolved? / N.M. Foley, M.S. Springer, E.C. Teeling // Philosophical Transactions of the Royal Society B: Biological Sciences. — 2016. — V. 371. — № 1699. — P. 20150140.
331. Fontanillas, P. Nonshivering thermogenesis capacity associated to mitochondrial DNA haplotypes and gender in the greater white-toothed shrew, Crocidura russula / P. Fontanillas, A. Depraz, M.S. Giorgi, N. Perrin // Molecular Ecology. — 2005. — V. 14. — № 2. — P. 661-670.
332. Fortelius, M. Fossil mammals resolve regional patterns of Eurasian climate change over 20 million years / M. Fortelius, J. Eronen, J. Jernvall, L. Liu, D. Pushkina, J. Rinne, A. Tesakov, I. Vislobokova, Z. Zhang and, L. Zhou // Evolutionary Ecology Research. — 2002. — V. 4. — № 7. — P. 1005-1016.
333. Fortelius, M. Continental-scale hypsodonty patterns, climatic palaeobiogeography, and dispersal of Eurasian Neogene large mammal herbivores / M. Fortelius, J.T. Eronen, L. Liu, D. Pushkina, A. Tesakov, I.A. Vislobokova, Z. Zhang // Distribution and Migration of Tertiary Mammals in Eurasia. A volume in honour of Hans de Bruijn / J.W.F. Reumer, W. Wessels (eds.). — 2003. — V. 10. —P. 1-11.
334. Fortelius, M. Late Miocene and Pliocene large land mammals and climatic changes in Eurasia / M. Fortelius, J. Eronen, L. Liu, D. Pushkina, A. Tesakov, I. Vislobokova, Z. Zhang // Palaeogeography, Palaeoclimatology, Palaeoecology. — 2006. — V. 238. — № 1. — P. 219-227.
335. Fortelius, M. Neogene of the Old World Database of Fossil Mammals (NOW). [Электронный ресурс]: University of Helsinki, 2008. — Режим доступа: http://www.helsinki.fi/science/now/.
336. Foster, P.G. Compositional bias may affect both DNA-based and protein-based phylogenetic reconstructions / P.G. Foster, D.A. Hickey // Journal of molecular evolution. — 1999. — V. 48. — № 3. — P. 284-290.
337. Francis, C.M. A field guide to the mammals of Thailand and South-East Asia: Thailand, Peninsular Malaysia, Singapore, Myanmar, Laos, Vietnam, Cambodia / C.M. Francis. — Asia Books Company, Limited, 2008.
338. Francis, C.M. The role of DNA barcodes in understanding and conservation of mammal diversity in Southeast Asia / C.M. Francis, A.V. Borisenko, N.V. Ivanova, J.L. Eger, B.K. Lim, J.L. Eger, B.K. Lim, A.Guillen-Serven, S.V. Kruskop, I. Mackie, P.D.N. Hebert // PloS one. — 2010. — V. 5. — № 9. — P. e12575.
339. Fredga, K. Colonization history of the pygmy shrew, Sorex minutus, in Britain and Scandinavia revealed by genetic markers / K. Fredga, D. Bilton, J.B. Searle // Abstracts of Oral and Poster papers, 2nd European Congress of Mammalogy. — England, Southampton, 1995.
340. Frenzel, B. The Pleistocene vegetation of northern Eurasia / B. Frenzel // Science.
— 1968. — V. 161. — P. 637-649.
341. Frenzel, B. Atlas of paleoclimates and paleoenvironments of the Northern Hemisphere (Late Pleistocene-Holocene) / B. Frenzel, M. Pecsi, A.A. Velichko. — Budapest-Stuttgart, 1992.
342. Frost, D.R. Phylogenetic relationships of hedgehogs and gymnures (Mammalia: Insectivora; Erinaceidae) / D.R. Frost, W.C. Wozencraft, R.S. Hoffmann, // Smithsonian Contribution to Zoology. — 1991. — V. 518. — P. 1-69.
343. Fu, Y.X. Statistical tests of neutrality of mutations against population growth, hitchhiking and background selection / Y.X. Fu // Genetics. — 1997. — V. 147. — № 2. — P. 915-925.
344. Fuchs, J. Mitochondrial phylogeographic structure of the white-browed piculet (Sasia ochracea): cryptic genetic differentiation and endemism in Indochina / J. Fuchs, P.G.P. Ericson, E. Pasquet // Journal of Biogeography. — 2008. — V. 35.
— № 3. — P. 565-575.
345. Fujita, M.K. Coalescent-based species delimitation in an integrative taxonomy / M.K. Fujita, A.D. Leache, F.T. Burbrink, J.A. Mcguire, C.C. Moritz // Trends in ecology & evolution. — 2012. — V. 27. — № 9. — P. 480-488.
346. Fumagalli, L. Phylogenetic structures of the Holarctic Sorex araneus group and its relationships with S. samniticus, as inferred from mtDNA sequences / L. Fumagalli,
J. Hausser, P. Taberlet, L. Gielly, D.T. Stewart // Hereditas. — 1996. — V. 125. — P. 191-199.
347. Fumagalli, L. Molecular Phylogeny and Evolution of Sorex Shrews (Soricidae: Insectivora) Inferred from Mitochondrial DNA Sequence Data / L. Fumagalli, P. Taberlet, D.T. Stewart, L. Gielly, J. Hausser, P. Vogel. // Molecular phylogenetics and evolution. — 1999. — V. 11. — № 2. — P. 222-235.
348. Furió, M. Evolutionary history of the African soricid Myosorex (Insectivora, Mammalia) out of Africa / M. Furió, A. Santos-Cubedo , J. Agustí, R. Minwer-Barakat // Journal of Vertebrate Paleontology. — 2007. — V. 27. — №. 4. — P. 1018-1032.
349. Furió, M. Predictable structure of Miocene insectivore (Lipotyphla) faunas in Western Europe along a latitudinal gradient / M. Furió, I. Casanovas-Vilar, L.W. van den Hoek Ostende // Palaeogeography, Palaeoclimatology, Palaeoecology. — 2011. — V. 304. — № 3-4. — P. 219-229.
350. Gadagkar, S.R. Inferring species phylogenies from multiple genes: concatenated sequence tree versus consensus gene tree / S.R. Gadagkar, M.S. Rosenberg, S. Kumar // Journal of Experimental Zoology Part B: Molecular and Developmental Evolution. — 2005. — V. 304. — № 1. — P. 64-74.
351. Galtier, N. Evolution of isochores in mammals: A human-like ancestral pattern / N. Galtier, D. Mouchiroud // Genetics. — 1998. — V. 150. — P. 1577-1584.
352. García-Moreno, J. Chronology and mode of speciation in the Andean avifauna / J. García-Moreno, J. Fjeldsá // Bonn. Zool. Monogr. — 2000. — V. 46. — P. 25-46.
353. Garcia-Perea, R. Sorex granarius / R. Garcia-Perea, J. Ventura, M.J. Lopez-Fuster, J. Gisbert // Mammalian Species. — 1997. — V. 554. — P. 1±4.
354. Gatesy, J. Corroboration among data sets in simultaneous analysis: hidden support for phylogenetic relationships among higher level artiodactyl taxa / J. Gatesy, P. O'Grady, R.H. Baker // Cladistics. — 1999. — V. 15. — № 3. — P. 271-313.
355. Geisler, J. H. Humeri of Oligoscalops (Proscalopidae, Mammalia) from the Oligocene of Mongolia / J.H. Geisler // Bulletin of the American Museum of Natural History. — 2004. — V. 15. — №. 3. — P. 166-177.
356. Gosálbez, J. Insectívors i Rosegadors de Catalunya. Metodologia d'estudi i catáleg faunístic / J. Gosálbez. — Barcelona: Ketres Editora, 1987. — 241 p.
357. George, S.B. Evolution and biogeography of soricine shrews / S.B. George // Systematic Zoology. — 1986. — V.35. — №. 2. — P. 153-162.
358. George, S.B. Systematics, historical biogeography, and evolution of the genus Sorex / S.B. George // Journal of Mammalogy. — 1988. — V. 69. — №. 3. — P. 443-461.
359. George, S.B. Albumin evolution in the Soricinae and its implications for the phylogenetic history of the Soricidae / S.B. George, V.M. Sarich // Advances in the Biology of Shrews. Special Publication No. 18 / J.F. Merritt, G.L. Kirkland, R.K. Rose (eds.). — Pittsburgh: Carnegie Museum of Natural History, 1994. — P. 289293.
360. Giarla, T.C. The Challenges of Resolving a Rapid, Recent Radiation: Empirical and Simulated Phylogenomics of Philippine Shrews / T.C. Giarla, J.A. Esselstyn // Systematic Biology . — 2015. — V. 64. — № 5. — P. 727-740.
361. Gilbert, N. Evolutionary inventions and continuity of CORE-SINEs in mammals / N. Gilbert, D. Labuda // Journal of molecular biology. — 2000. — V. 298. — № 3. — P. 365-377.
362. Gill, T.N. Arrangment of the families of mammals with analytical tables / T.N. Gill // Smithsonian Miscellaneous Collections. — 1872. — V. 11. — P. 1-98.
363. Gill, T.N. Insectivora / T.N. Gill // The Standard Natural History, Vol. 5 / J. S. Kingsley (ed.). — Boston: S.E. Cassino & Co., 1885. — pp. 134-158.
364. Gillespie, J.H. The causes of molecular evolution / J.H. Gillespie. — UK: Oxford University Press, 1991.
365. Giterman, R.E. The main development stages of the vegetation of North Asia in Anthropogen / R.E. Giterman, L.V. Golubeva, E.D. Zaklinskaya, E.V. Koreneva, O.V. Matveeva, L.A. Skiba // Transactions of Geological Institute of Academy of Sciences of the USSR. — Moscow: Nauka, 1968. — T. 177. — 271 p.
366. Gogolevsky, K.P. Bov-B-mobilized SINEs in vertebrate genomes / K.P. Gogolevsky, N.S. Vassetzky, D A. Kramerov // Gene. — 2008. — V. 407. — № 12. — P. 75-85.
367. González, G. Soil fauna and plant litter decomposition in tropical and subalpine forests / G. González, T.R. Seastedt // Ecology. — 2001. — V. 82. — № 4. — P. 955-964.
368. González-Sampériz, P. Glacial and Lateglacial vegetation in northeastern Spain: new data and a review / P. González-Sampériz, B.L. Valero-Garces, J.S. Carrión, J.L. Peña-Monné, J.M. García-Ruiz, C. Martí-Bono // Quaternary International. — 2005. — V. 140. — P. 4-20.
369. Gornung, E. Comparative cytogenetics of moles (Eulipotyphla, Talpidae): chromosomal differences in Talpa romana and T. europaea / E. Gornung, M. Volleth, E. Capanna, R. Castiglia // Cytogenetic and genome research. — 2008. — V. 121. — №. 3-4. — P. 249-254.
370. Gorog, A.J. Vicariance or dispersal? Historical biogeography of three Sunda shelf murine rodents (Maxomys surifer, Leopoldamys sabanus and Maxomys whiteheadi) / A.J. Gorog, M.H. Sinaga, M.D. Engstrom // Biological Journal of the Linnean Society. — 2004. — V. 81. — № 1. — P. 91-109.
371. Gould, G.C. Hedgehog phylogeny (Mammalia, Erinaceidae) - the reciprocal illumination of the quick and the dead / G.C. Gould // American Museum Novitates. — 1995. — V. 3131. — 45 p.
372. Gould, G.C. The phylogenetic resolving power of discrete dental morphology among extant hedgehogs and the implications for their fossil record / G.C. Gould // American Museum Novitates. — 2001. — V. 3340. — 52 p.
373. Gowri-Shankar, V. A reversible jump method for Bayesian phylogenetic inference with a nonhomogeneous substitution model / V. Gowri-Shankar, M. Rattray // Molecular Biology and Evolution. — 2007. — V. 24. — № 6. — P. 1286-1299.
374. Graf, J.D. Confirmation du status spécifique de Sorex samniticus Altobello, 1926 (Mammalia, Insectivora) / J.-D. Graf, J. Hausser, A. Farina, P. Vogel // Bonner Zoologische Beiträge. — 1979. — V. 30. — № 1. — P. 14-21.
375. Granjon, L. Reevaluation of the taxonomic status of North African gerbils usually referred to as Gerbillus pyramidum (Gerbillinae, Rodentia): chromosomal and biometrical data / L. Granjon, A. Bonnet, W. Hamdine, V. Volobouev // Zeitschrift fur Saugetierkunde. — 1999. — V. 64. — №. 5. — P. 298-307.
376. Gregory, W.K. The orders of mammals / W.K. Gregory // Bulletin of the American Museum of Natural History. — 1910. — V. 37. — P. 1-524.
377. Grenyer, R. A composite species-level phylogeny of the 'Insectivora' (Mammalia: Order Lipotyphla Haeckel, 1866) / R. Grenyer, A. Purvis //Journal of Zoology. — 2003. — V. 260. — №. 3. — P. 245-257.
378. Gronau, I. Bayesian inference of ancient human demography from individual genome sequences / I. Gronau, M.J. Hubisz, B. Gulko, C.G. Danko, A. Siepel // Nature genetics. — 2011. — V. 43. — № 10. — P. 1031-1034.
379. Guillerme, T. Assessment of available anatomical characters for linking living mammals to fossil taxa in phylogenetic analyses / T. Guillerme, N. Cooper // Biology letters. — 2016. — V. 12. — № 5. — P. 20151003.
380. Gunnel, G.F. Insectivorous mammals / G.F. Gunnel, J.I. Bloch // Evolution of Tertiary Mammals of North America / C.M. Janis, G.F. Gunnell, M.D. Uhen (eds.).
— Cambridge University Press, 2007. — V. 2. — P. 49-62.
381. Hackett, S.J. A phylogenomic study of birds reveals their evolutionary history / S.J. Hackett, R.T. Kimball, S. Reddy, R.C.K. Bowie, EL. Braun, M.J. Braun, J.L. Chojnowski, W.A. Cox, K.L. Han, J. Harshman, C.J. Huddleston, B.D. Marks, K.J. Miglia, W.S. Moore, F.H. Sheldon, D.W. Steadman, C.C. Witt, T. Yuri // Science.
— 2008. — V. 320. — № 5884. — P. 1763-1768.
382. Haeckel, E. Systematische Einleitung in die allgemeine Entwicklungsgeschichte / E. Haeckel // Generelle Morphologie der Organismen. — Berlin: Georg reimer, 1866. — V. 2. — P. XVII-CLX.
383. Haffer, J. Alternative models of vertebrate speciation in Amazonia: an overview / J. Haffer // Biodiversity & Conservation. — 1997. — V. 6. — № 3. — P. 451-476.
384. Hall, T.A. BioEdit: a user-friendly biological sequence alignment editor and analysis program for Windows 95/98/NT / T.A. Hall // Nucleic acids symposium series. — 1999. — V. 41. — № 41. — P. 95-98.
385. Halliday, T.J.D. Resolving the relationships of Paleocene placental mammals / T.J.D. Halliday, P. Upchurch, A. Goswami // Biological Reviews. — 2017. — V. 92. — № 1. — P. 521-550.
386. Hallström, B.M. Mammalian evolution may not be strictly bifurcating / B.M. Hallström, A. Janke //Molecular biology and evolution. — 2010. — V. 27. — №. 12. — P. 2804-2816.
387. Hallström, B.M. A Genomic Approach to Examine the Complex Evolution of Laurasiatherian / B.M. Hallström, A. Schneider, S. Zoller, A. Janke // PLoS One.
— 2011. — V. 6. — №. 12. — P. e28199.
388. Hallström, B.M. Resolution among major placental mammal interordinal relationships with genome data imply that speciation influenced their earliest radiations / B.M. Hallström, A. Janke // BMC evolutionary biology. — 2008. — V. 8. — № 1. — P. 162.
389. Han, W. Tibet forcing of mid-Pleistocene synchronous enhancement of East Asian winter and summer monsoons revealed by Chinese loess record / W. Han, X. Fang, A. Berger // Quaternary Research. — 2012. — V. 78. — № 2. — P. 174-184.
390. Handbook of the Mammals of the World. / D.E. Wilson, R.A. Mittermeier, T.E. Lacher, (eds.). — Barcelona: Lynx Edicions, 2009-2018. — V. 1-9.
391. Hans, J. Comparative study of decomposition rates of organic matter in temperate and tropical regions / J. Hans, S.P. Gessel, F.T. Bingham // Soil Science. — 1949. — V. 68. — № 6. — P. 419-432.
392. Haq, B.U. Chronology of fluctuating sea levels since the Triassic / B.U. Haq, J.A.N. Hardenbol, P.R. Vail // Science. — 1987. — V. 235. — №. 4793. — P. 1156-1167.
393. Harada M. Re-evaluation of the status of Chodsigoa sodalis Thomas, 1913 (Mammalia: Insectivora: Soricidae) / M. Harada // Zoological Studies. — 1997. — V. 36. — №. 1. — P. 42-47.
394. Harmon, L. Geiger: Analysis of evolutionary diversification Version: 2.0.3. [Электронный ресурс] / L. Harmon, J. Weir, C. Brock, R. Glor, W. Challenger, G. Hunt, R. FitzJohn, M. Pennell, G. Slater, J. Brown, J. Uyeda, J. Eastman. — 2014. — Distributed by the author at < http://www.webpages.uidaho.edu/ca.lukeh/software.html. http://doi:10.1093/bioinformatics/btu181>.
395. Harris, A.H. Fossil history of shrews in North America / A.H. Harris // Evolution of Shrews, Special publication of the International Society of Shrew Biologists / J.M. Wojcik, M. Wolsan (eds.). — New-York, 1998. — V. 1. — P. 121-132.
396. Harrison, J.L. An introduction to mammals of Singapore and Malaya / J.L. Harrison. — Second ed. — Singapore: Malayan Nature Society, 1974. — 340 p.
397. Hasegawa, M. Ribosomal RNA trees misleading? / M. Hasegawa, T. Hashimoto // Nature. - 1993. — V. 361. — № 6407. — P. 23.
398. Hassanin, A. The 'evolutionary signal'of homoplasy in proteincoding gene sequences and its consequences for a priori weighting in phylogeny / A. Hassanin, G. Lecointre, S. Tillier // Comptes Rendus de l'Académie des Sciences-Series III-Scie nces de la Vie. — 1998. — V. 321. — № 7. — P. 611-620.
399. Hausser, J. Relationships between chromosome races and species of Sorex of the araneus group in the western Alps / J. Hausser, F. Bosshard, P. Taberlet, J. Wojcik // Mémoires de la Société vaudoise des Sciences naturelles. — 1991. — V. 19. — P. 79-95.
400. He, K. A multi-locus phylogeny of Nectogalini shrews and influences of the paleoclimate on speciation and evolution / K. He, Y.J. Li, M.C. Brandley, L.K. Lin, Y.X. Wang, Y.P. Zhang, X.L. Jiang // Molecular Phylogenetics and Evolution. — 2010. — V. 56. — № 2. — P. 734-746.
401. He, K. An estimation of Erinaceidae phylogeny: a combined analysis approach / K. He, J.-H. Chen, G.C. Gould, N. Yamaguchi, H.-S. Ai, Y.-X. Wang, Y.-P. Zhang, X.-L. Jiang // PLoS One. — 2012. — V. 7. — № 6. — P. e39304.
402. He, K. Multilocus phylogeny of talpine moles (Talpini, Talpidae, Eulipotyphla) and its implications for systematics / K. He, A. Shinohara, X.L. Jiang, K.L. Campbell // Molecular phylogenetics and evolution. — 2014. — V. 70. — P. 513-521.
403. He, K. Talpid mole phylogeny unites shrew moles and illuminates overlooked cryptic species diversity / K. He, A. Shinohara, K.M. Helgen, M.S. Springer, X.-L. Jiang, K.L. Campbell // Molecular biology and evolution. — 2017. — V. 34. — № 1. — P. 78-87.
404. He, K. A new genus of Asiatic short-tailed shrew (Soricidae, Eulipotyphla) based on molecular and morphological comparisons / K. He, X. Chen, P. Chen, S.-W. He, F. Chen, X.-L. Jiang, K.L. Campbell // Zoological research. — 2018. — V. 39. — № 5. — P. 321-334.
405. Head, M.J. The Early-Middle Pleistocene transition: characterization and proposed guide for the defining boundary/ M.J. Head, B. Pillans, S.A. Farquhar // Episodes. — 2008. — V. 31. — №. 2. — P. 255.
406. Heaney, L.R. Systematics and distribution of shrews of the genus Crocidura (Mammalia: Insectivora) in Vietnam / L.R. Heaney, R.M. Timm // Proceedings of the Biological Society, Washington. — 1983. —V. 96. — P. 115-120.
407. Heaney, L. R. Small mammal diversity along elevational gradients in the Philippines: an assessment of patterns and hypotheses / L. Heaney // Global ecology and Biogeography. — 2001. — V. 10. — № 1. — P. 15-39.
408. Heath, T.A. The fossilized birth-death process for coherent calibration of divergence-time estimates / T.A. Heath, J.P. Huelsenbeck, T. Stadler // Proceedings of the National Academy of Sciences. — 2014. — V. 111. — № 29. — P. E2957-E2966.
409. Hebert, P.D.N. Biological identifications through DNA barcodes / P.D.N. Hebert, A. Cywinska, S.L. Ball, J.R. Waard // Proceedings of the Royal Society of London. Series B: Biological Sciences. — 2003. — V. 270. — №. 1512. — P. 313-321.
410. Hedges, S.B. Caribbean biogeography: molecular evidence for dispersal in West Indian terrestrial vertebrates / S.B. Hedges, C.A. Hass, L.R. Maxson // Proceedings of the National Academy of Sciences. — 1992. — V. 89. — № 5. — P. 1909-1913.
411. Hedges, S.B. Precision of molecular time estimates / S.B. Hedges, S. Kumar // TRENDS in Genetics. — 2004. — V. 20. — №. 5. — P. 242-247.
412. Hedges, S.B. Genomic clocks and evolutionary timescales / S.B. Hedges, S. Kumar // TRENDS in Genetics. — 2003. — V. 19. — № 4. — P. 200-206.
413. Hedges, S.B. Discovering the timetree of life / S.B. Hedges, S. Kumar // Timetrees of life / B. Hedges, X. Kumar (eds.). — Oxford: Oxford University Press, 2009. — P. 3-18.
414. Heled, J. Bayesian inference of species trees from multilocus data / J. Heled, A.J. Drummond // Molecular biology and evolution. — 2010. — V. 27. — № 3. — P. 570-580.
415. Hellborg, L. Y chromosome conserved anchored tagged sequences (YCATS) for the analysis of mammalian male-specific DNA / L. Hellborg, H. Ellegren // Molecular ecology. — 2003. — V. 12. — № 1. — P. 283-291.
416. Hellborg, L. Y chromosome conserved anchored tagged sequences (YCATS) for the analysis of mammalian male-specific DNA / L. Hellborg, H. Ellegren // Molecular ecology. — 2003. — V. 12. — № 1. — P. 283-291.
417. Hendy, M.D. A framework for the quantitative study of evolutionary trees / M.D. Hendy, D. Penny // Systematic zoology. — 1989. — V. 38. — №. 4. — P. 297-309.
418. Henn, B.M. Characterizing the time dependency of human mitochondrial DNA mutation rate estimates / B.M. Henn, C.R. Gignoux, M.W. Feldman, L. Joanna, J.L. Mountain // Molecular Biology and Evolution. — 2008. — V. 26. — № 1. — P. 217-230.
419. Hennig, W. Phylogenetic systematic / W. Hennig. — Urbana: University of Illinois Press, 1966. — 284 p.
420. Hewitt, G.M. Some genetic consequences of ice ages, and their role in divergence and speciation / G.M. Hewitt // Biological journal of the Linnean Society. — 1996. — V. 58. — № 3. — P. 247-276.
421. Hewitt, G.M. Post-glacial re-colonization of European biota / G.M. Hewitt // Biological journal of the Linnaean Society. — 1999. — V. 68. — P. 87-112.
422. Hewitt, G. The genetic legacy of the Quaternary ice ages / G. Hewitt // Nature. — 2000. — V. 405. — P. 907-913.
423. Hewitt, G.M. Inferring glacial refugia and historical migrations with molecular phylogenies / G.M. Hewitt, K.M. Ibrahim // Integrating ecology and evolution in a spatial context. BES symposium volume / J. Silvertown J. Antonovics (eds.). — Oxford: Blackwells, 2001. — P. 271-294.
424. Hewitt, G.M. Genetic consequences of climatic oscillations in the Quaternary / G.M. Hewitt // Philosophical Transactions of the Royal Society of London. Series B: Biological Sciences. — 2004. — V. 359. — №. 1442. — P. 183-195.
425. Hey, J. Isolation with migration models for more than two populations / J. Hey // Molecular biology and evolution. — 2009. — V. 27. — №. 4. — P. 905-920.
426. Hey, J. Integration within the Felsenstein equation for improved Markov chain Monte Carlo methods in population genetics / J. Hey, R. Nielsen // Proceedings of the National Academy of Sciences. — 2007. — V. 104. — № 8. — P. 2785-2790.
427. Hillis, D M. SINEs of the perfect character / D M. Hillis // Proceedings of the National Academy of Sciences. — 1999. — V. 96. — № 18. — P. 9979-9981.
428. Himes, C.M. Influence of montane isolation and refugia on population structure of Sorex palustris in western North America / C.M. Himes, G.J. Kenagy // Journal of Mammalogy. — 2010. — V. 91. — № 4. — P. 1000-1010.
429. Ho, S.Y.W. An examination of phylogenetic models of substitution rate variation among lineages / S.Y.W. Ho // Biology letters. — 2009. — V. 5. — № 3. — P. 421-424.
430. Ho, S.Y.W. Time dependency of molecular rate estimates and systematic overestimation of recent divergence times / S.Y.W. Ho, M.J. Phillips, A. Cooper,
A.J. Drummond // Molecular biology and evolution. — 2005. — V. 22. — № 7. — P. 1561-1568.
431. Ho, S.Y.W. Evidence for time dependency of molecular rate estimates / S.Y.W. Ho,
B. Shapiro, M.J. Phillips, A. Cooper, A.J. Drummond // Systematic biology. — 2007. — V. 56. — № 3. — P. 515-522.
432. Ho, S.Y.W. Accounting for calibration uncertainty in phylogenetic estimation of evolutionary divergence times / S.Y.W. Ho, M.J. Phillips // Systematic Biology. — 2009. — V. 58. — № 3. — P. 367-380.
433. Ho, S.Y.W. Biogeographic calibrations for the molecular clock / S.Y.W. Ho, K.J. Tong, C.S.P. Foster, A.M. Ritchie, N. Lo, M.D. Crisp // Biology Letters. — 2015.
— V. 11. — № 9. — P. 20150194.
434. Hodgson, B.H. Classified catalogue of mammals of Nepal, corrected to end of 1840, first printed in 1832 / B.H. Hodgson // Calcutta Journal of Natural History.
— 1841. — V. 2. — № 6. — P. 212-221.
435. Hoffmann, R.S. A review of the genus Soriculus (Mammalia: Insectivora) / R.S. Hoffmann // Journal of the Bombay Natural History Society. — 1986. — V. 82. — № 3. — P. 459-481.
436. Hoffmann, R.S. A review of the systematics and distribution of Chinese red-toothed shrews (Mammalia: Soricinae) / R.S. Hoffmann // Acta Theriologica Sinica. — 1987. — V. 7. — P. 100-139.
437. Hoffmann, R.S. Noteworthy shrews and voles from the Xizang-Qingjai plateau / R.S. Hoffmann // Contributions in Mammalogy: A memorial volume honoring Dr. J. Knox / Jr. Jones eds.) — Museum of Texas Tech University, 1996. — P. 155168.
438. Hoffmann, R.S. Order Erinaceomorpha, Order Soricomorpha / R.S. Hoffmann, D. Lunde // A Guide to the Mammals of China / A.T. Smith, Y. Xie (eds.). — Princeton: Princeton University Press, 2008. — P. 292-327.
439. Hofreiter, M. The future of ancient DNA: Technical advances and conceptual shifts / M. Hofreiter, J.L. Paijmans, H. Goodchild, C.F. Speller, A. Barlow, G.G. Fortes, J.A. Thomas, A. Ludwig, M.J. Collins // BioEssays. — 2015. — V. 37. — № 3. — P. 284-293.
440. Hooker, J.J. Skeletal adaptations and phylogeny of the oldest mole Eotalpa (Talpidae, Lipotyphla, Mammalia) from the UK Eocene: the beginning of fossoriality in moles / J.J. Hooker // Palaeontology. — 2016. — V. 59. — № 2. — P. 195-216.
441. Hope, A.G. High-latitude diversification within Eurasian least shrews and Alaska tiny shrews (Soricidae) / A.G. Hope, E.Waltari, N.E. Dokuchaev, S. Abramov, T. Dupal, A. Tsvetkova, H. Henttonen, S.O. MacDonald, J.A. Cook // Journal of Mammalogy. — 2010. — V. 91. — № 5. — P. 1041-1057.
442. Hope, A.G. A climate for speciation: rapid spatial diversification within the Sorex cinereus complex of shrews / A.G. Hope, K.A. Speer, J.R. Demboski, S.L. Talbot, J.A. Cook // Molecular Phylogenetics and Evolution. — 2012. — V. 64. — № 3. — P. 671-684.
443. Hopkins, D.M. The Bering Land Bridge / D.M. Hopkins. — Stanford: Stanford University Press, 1967.
444. Hopkins, D.M. Introduction: The concept of Beringia / D.M. Hopkins // American Beginnings: The Prehistory and Palaeoecology of Beringia / F.H. West (eds.). — Chicago: University of Chicago Press, 1996. — P. xvii-xxi.
445. Huelsenbeck, J.P. A compound Poisson process for relaxing the molecular clock / J.P. Huelsenbeck, B. Larget, D. Swofford // Genetics. — 2000. — V. 154. — № 4. — P. 1879-1892.
446. Huelsenbeck, J.P. Inference of population structure under a Dirichlet process model / J.P. Huelsenbeck, P. Andolfatto // Genetics. — 2007. — V. 175. — P. 1787-1802.
447. Huelsenbeck, J.P. Structurama: Bayesian inference of population structure / J.P. Huelsenbeck, P. Andolfatto, E.T. Huelsenbeck // Evolutionary Bioinformatics. — 2011. — P. 55-59.
448. Hugueney, M. Early Miocene soricids (Insectivora, Mammalia) from Limagne (Central France): new systematic comparisons, updated biostratigraphic data and evolutionary implications / M. Hugueney, O. Maridet // Geobios. — 2011. — V. 44. — № 2-3. — P. 225-236.
449. Hutchison J.H. Fossil Talpidae (Insectivora, Mammalia) from the later Tertiary of Oregon / J.H. Hutchison // Bulletin of the Museum of Natural History of the University of Oregon. — 1968. — V. 11. — P. 1-117.
450. Hutterer, R. Anatomical adaptations of shrews / R. Hutterer // Mammal review. — 1985. — V. 15. — P. 43-55.
451. Hutterer, R. Temporal and geographical variation of shrews of the Sicilian-Maltese archipelago since the Pleistocene / R. Hutterer // Vie Milieu. — 1990. — V. 40. — P. 213-217.
452. Hutterer, R. Order Insectivora / R. Hutterer // Mammal Species of the World: a Taxonomic and Geographic Reference / ed. D.E. Wilson, D.M. Reeder. — 2rd ed.
— Washington: Smithsonian Institution Press, 1993. — P. 69-130.
453. Hutterer, R. A new myosoricine shrew from the Congo Basin referable to the forgotten genus Congosorex (Mammalia: Soricidae) / R. Hutterer, P. Barriere, and M. Colyn. // Bulletin de l'Institut royal desSciences naturelles de Belgique, Biologie. — 2001. — V. 71. — P. 7-16.
454. Hutterer, R. Order Erinaceomorpha, Order Soricomorpha / R. Hutterer // Mammal Species of the World. A taxonomic and geographic reference / ed. D.E. Wilson, D.M. Reeder. — 3rd ed. — Baltimore: The Johns Hopkins University Press, 2005.
— P. 212-311.
455. Hutterer, R. The shrews of the eastern Canary Islands: a new species (Mammalia: Soricidae) / R. Hutterer, L.F. Lopez-Jurado, P. Vogel // Journal of Natural History.
— 1987a. — V. 21. — № 6. — P. 1347-1357.
456. Hutterer, R. A checklist of the shrews of Rwanda and biogeographical considerations on African Soricidae / R. Hutterer, E. Van der Straeten, W.N. Verheyen // Bonn Zoologishe Beitrage. — 1987b. — V. 38. — P. 155-172.
457. Hutterer, R. A new genus and species of shrew (Mammalia: Soricidae) from Palawan Island, Philippines / R. Hutterer, D.S. Balete, T.C. Giarla, L.R. Heaney, J.A. Esselstyn // Journal of Mammalogy. — 2018. — V. 99. — № 3. — P. 518-536.
458. Huxley, T.H. On the application of the laws of evolution to the arrangement of the Vertebrata and more particularly of the Mammalia / T.H. Huxley // Proceedings of the Zoological Society of London. — 1880. — V. 43. — P. 649-662.
459. Huynh, D.H. Checklist of Mammals in Vietnam / D.H. Huynh, D.V. Tien, C.V. Sung, P.T. Anh, H.M. Khien. — Hanoi: Publishing House "Science and Technics", 1994. — 168 p.
460. Igea, J. Novel intron markers to study the phylogeny of closely related mammalian species / J. Igea, J. Juste, J. Castresana // BMC evolutionary biology. — 2010. — V. 10. — № 1. — P. 369.
461. Igea, J. Multilocus species trees and species delimitation in a temporal context: application to the water shrews of the genus Neomys / J. Igea, P. Aymerich, A.A. Bannikova, J. Gosalbez, J. Castresana // BMC evolutionary biology. — 2015. — V. 15. — № 1. — P. 209.
462. Imaizumi, Y. A natural history of mammals of the world. Insectivora & Dermoptera / Y. Imaizumi, H. Obara. — Tokyo: Shin Shichoyo Sha Inc., 1966 (in Japanese). — 365 p.
463. Imaizumi, Y. The handbook of Japanese land mammals / Y. Imaizumi. — Tokyo: Shin-Shichoa-Sha, 1970. — 350 p.
464. Innes, D.G.L. Life histories of the Soricidae: a review / D.G.L. Innes // Advances in the Biology of Shrews. Special Publication No. 18 / J.F. Merritt, G.L. Kirkland, R.K. Rose (eds.). — Pittsburgh: Carnegie Museum of Natural History, 1994. — P. 111-129.
465. International Human Genome Sequencing Consortium. Initial sequencing and analysis of the human genome // Nature. — 2001. — V. 409. — № 6822. — P. 860-921.
466. Iturralde-Vinent, M.A. Meso-Cenozoic Caribbean paleogeography: implications for the historical biogeography of the region / M.A. Iturralde-Vinent // Int. Geol. Rev. — 2006. — V. 48. — P. 791-827.
467. Ivanova, N.V. An inexpensive, automation-friendly protocol for recovering high-quality DNA / N.V. Ivanova, J.R. deWaard, P.D.N. Hebert // Molecular ecology notes. — 2006. — V. 6. — №. 4. — P. 998-1002.
468. Ivanova, N.V. CCDB Protocols, Sequencing / N.V. Ivanova, C.M. Grainger // Appl. Biosyst. — 2007. — V. 1. — P. 3-5.
469. Ivanova, N.V. Universal primer cocktails for fish DNA barcoding / N.V. Ivanova, T S. Zemlak, RH. Hanner, P.D.N. Hebert // Molecular Ecology Notes. — 2007. — V. 7. — № 4. — P. 544-548.
470. Ivarson, K.C. Decomposition of forest litters. 1. Production of ammonia and nitrate nitrogen, changes in microbial population, and rate of decomposition / K.C. Ivarson, F.J. Sowden // Plant and Soil. — 1959. — V. 11. — № 3. — P. 237-248.
471. Iwasa, M.A. Local differentiation of Clethrionomys rutilus in northeastern Asia inferred from mitochondrial gene sequences / M.A. Iwasa, I.V. Kartavtseva, A.K. Dobrotvorsky, V.V. Panov, H. Suzuki // Mammalian Biology. — 2002. — V. 67. — № 3. — P. 157-166.
472. Iwasa, M.A. Intraspecific Differentiation in the Lesser Japanese Mole in Eastern Honshu, Japan, Indicated by Nuclear and Mitochondrial Gene Analyses / M.A. Iwasa, C. Kawakubo, K. Tsuchiya, H. Suzuki // Zoological Science. — 2006. — V. 23. — № 11. — P. 955-961.
473. Iwasa, M.A. Phylogeography of the root vole Microtus oeconomus in Russian Far East: a special reference to comparison between Holarctic and Palaearctic voles / M.A. Iwasa, V.A. Kostenko, L.V. Frisman, I.V. Kartavtseva // Mammal study. — 2009. — V. 34. — № 3. — P. 123-130.
474. Jaarola, M. 2004. Molecular phylogeny of the speciose vole genus Microtus (Arvicolinae, Rodentia) inferred from mitochondrial DNA sequences / M. Jaarola, N. Martínková, Í. Gündüz, C. Brunhoff, J. Zima, A. Nadachowski, G. Amori, N.S. Bulatova, B. Chondropoulos, S. Fraguedakis-Tsolis, J. González-Esteban, M.J. López-Fuster, A.S. Kandaurov, H. Kefelioglu, M. da Luz Mathias, I. Villate, J.B. Searle // Molecular Phylogenetics and evolution. — 2004. — V. 33. — №. 3. — P. 647-663.
475. Jackman, S.D. ABySS 2.0: resource-efficient assembly of large genomes using a Bloom filter / S.D. Jackman, B P. Vandervalk, H. Mohamadi, J. Chu, S. Yeo, S.A. Hammond, G. Jahesh, H. Khan, L. Coombe, R.L Warren, I. Birol // Genome research. — 2017. — V. 27. — № 5. — P. 768-777.
476. Jackson, H.H.T. A taxonomic review of the American long-tailed shrews / H.H.T. Jackson // North American Fauna. — 1928. — V. 51. — P. 1-238.
477. Jameson, E.W. The Soricidae of Taiwan / E.W. Jameson, G.S. Jones // Proceedings of the Biological Society of Washington. — 1977. — V. 90. — P.459-482.
478. Jansson, R. The fate of clades in a world of recurrent climatic change: Milankovitch oscillations and evolution / R. Jansson, M. Dynesius // Annual review of ecology and Systematics. — 2002. — V. 33. — P. 741-777.
479. Jarvis, E.D. Whole-genome analyses resolve early branches in the tree of life of modern birds / E.D. Jarvis, S. Mirarab, A.J. Aberer, B. Li, P. Houde, C. Li, S. Y.W. Ho, B.C. Faircloth, B.Nabholz, J.T. Howard, A. Suh, C.C. Weber, RR. da Fonseca, J. Li, F. Zhang, H. Li, L. Zhou, N. Narula, L. Liu, G. Ganapathy, B. Boussau, Md.S. Bayzid, V. Zavidovych, S. Subramanian, T. Gabaldon, S. Capella-Gutierrez, J. Huerta-Cepas, B. Rekepalli, K. Munch, M. Schierup, B. Lindow, W. C. Warren, D. Ray, RE. Green, M.W. Bruford, X. Zhan, A. Dixon, S. Li, N. Li, Y. Huang, E.P. Derryberry, M. Frost Bertelsen, F.H. Sheldon, R.T. Brumfield, C.V. Mello, P.V. Lovell, M. Wirthlin, MP. Cruz Schneider, F. Prosdocimi, J.A. Samaniego, A.M. Vargas Velazquez, A. Alfaro-Nunez, P.F. Campos, B. Petersen, T. Sicheritz-Ponten, A. Pas, T. Bailey, P. Scofield, M. Bunce, D.M. Lambert, Q. Zhou, P. Perelman, A. C. Driskell, B. Shapiro, Z. Xiong, Y. Zeng, S. Liu, Z. Li, B. Liu, K. Wu, J. Xiao, X. Yinqi, Q. Zheng, Y. Zhang, H. Yang, J. Wang, L. Smeds, F.E. Rheindt, M. Braun, J. Fjeldsa, L. Orlando, F.K. Barker, K.A. Jonsson, W. Johnson, K.-P. Koepfli, S. O'Brien, D. Haussler, O.A. Ryder, C. Rahbek, E. Willerslev, G.R. Graves, T.C. Glenn, J. McCormack, D. Burt, H.Ellegren, P. Alström, S.V. Edwards, A. Stamatakis, D.P. Mindell, J.Cracraft, E.L. Braun, T. Warnow, W. Jun, M.T.P. Gilbert, and G. Zhang // Science. — 2014. — V. 346. — № 6215. — P. 1320-1331.
480. Jeanmaire-Besancon, F. Sexual maturity of Crocidura russula (Insectivora: Soricidae) / F. Jeanmaire-Besancon // Acta Theriologica. — 1988. — V. 33. — № 35. — P. 477-485.
481. Jenkins, P.D. Variation in Eurasian shrews of the genus Crocidura (Insectivora: Soricidae) / P.D. Jenkins // Bulletin of the British Museum (Natural History), Zoology. — 1976. — V. 30. — P. 271-309.
482. Jenkins, P.D. A discussion of the Malayan and Indonesian shrews of the genus Crocidura (Insectivora: Soricidae) / P.D. Jenkins // Zoologische Mededelingen. — 1982. — V. 56. — №. 21. — P. 267-279.
483. .Jenkins, P.D. Another variation on the gymnure theme: description of a new species of Hylomys (Lipotyphla, Erinaceidae, Galericinae) / P.D. Jenkins, M.F. Robinson // Bulletin of the Natural History Museum: Zoology Series. — 2002. — V. 68. — № 1. — P. 1-11.
484. Jenkins, P.D. Description of two new species of white-toothed shrews belonging to the genus Crocidura (Soricomorpha: Soricidae) from Ngoc Linh Mountain, Vietnam / P.D. Jenkins, A.V. Abramov, V.V. Rozhnov, O.V. Makarova // Zootaxa.
— 2007. — V. 1589. — P. 57-68.
485. Jenkins, P.D. Descriptions of new species of Crocidura (Soricomorpha: Soricidae) from mainland Southeast Asia, with synopses of previously described species and remarks on biogeography / P.D. Jenkins, D.P. Lunde, C.B. Moncrieff // Bulletin of the American Museum of Natural History. — 2009. — V. 2009. — №. 331. — P. 356-405.
486. Jenkins, P.D. A new species of Crocidura (Soricomorpha: Soricidae) from southern Vietnam and north-eastern Cambodia / P.D. Jenkins, A.V. Abramov, V.V. Rozhnov, A. Olsson // Zootaxa. — 2010. — V. 2345. —P. 60-68.
487. Jenkins, P.D. Bones and genes: resolution problems in three Vietnamese species of Crocidura (Mammalia, Soricomorpha, Soricidae) and the description of an additional new species / P.D. Jenkins, A.V. Abramov, A.A. Bannikova, V.V. Rozhnov // ZooKeys. — 2013. — №. 313. — С. 61-79.
488. Jennings, W.B. Speciational history of Australian grass finches (Poephila) inferred from thirty gene trees / W.B. Jennings, S.V. Edwards // Evolution. — 2005. — V. 59. — № 9. — P. 2033-2047.
489. Jiang, X.-L. A revision of the white-toothed shrews (Crocidura) of southern China / X.-L. Jiang, R.S. Hoffmann // Journal of Mammology. — 2001. — V. 82. — № 4.
— P. 1059-1079.
490. Jiang, X.L. A review of the systematics and distribution of Asiatic short-tailed shrews, genus Blarinella (Mammalia: Soricidae) / X.L. Jiang, Y.X. Wang, R.S. Hoffmann // Mammalian Biology. — 2003. — V. 68. — № 4. — P. 193-204.
491. Jimenez, R. Karyotype and chromosome banding in the mole (Talpa occidentalis) from the south-east of the Iberian Peninsula. Implications on its taxonomic position / R. Jimenez, M. Burgos, R. Diaz De La Guardia // Caryologia. — 1984. — V. 37.
— № 3. — P. 253-258.
492. Jobb, G. TREEFINDER version of October 2008 [Электронный ресурс] / G. Jobb.
— Munich, Germany. — 2008. — Distributed by the author at < http://www.treefinder.de>.
493. Jombart, T. adegenet: a R package for the multivariate analysis of genetic markers / T. Jombart // Bioinformatics. — 2008. — V. 24. — № 11. — P. 1403-1405.
494. Jones, J.K. Review of the insectivores of Korea / J.K. Jones, D.H. Johnson // Univ. of Kansas Publ., Mus. Nat. Hist. — 1960. — V. 9. — P. 549-578.
495. Jones, G.S. Chimarrogale from Taiwan / G.S. Jones, R.E. Mumford // Journal of Mammalogy. — 1971. — V. 52. — P. 228-232.
496. Junge, J.A. Relationships within the Holarctic Sorex arcticus-Sorex tundrensis species complex / J.A. Junge, R.S. Hoffmann, R.W. DeBry // Acta Theriologica.
— 1983. — V. 28. — P. 339-350.
497. Jurka, J. Ubiquitous mammalian-wide interspersed repeats (MIRs) are molecular fossils from the mesozoic era / J. Jurka, E. Zietkiewicz, D. Labuda // Nucleic Acids Research. — 1995. — V. 23. — № 1. — P. 170-175.
498. Kamei, R.G. Discovery of a new family of amphibians from northeast India with ancient links to Africa / R.G. Kamei, D.S. Mauro, D.J. Gower, I. Van Bocxlaer, E. Sherratt, A. Thomas, S. Babu, F. Bossuyt, M. Wilkinso, S.D. Biju // Proceedings of the Royal Society B: Biological Sciences. — 2012. — V. 279. — № 1737. — P. 2396-2401.
499. Kawada, S. Morphological Review of the Japanese Mountain Mole (Eulipotyphla, Talpidae) with the Proposal of a New Genus / S. Kawada // Mammal Study. — 2016. — V. 41 — № 4. — P. 191-205.
500. Kawada, S.I. Karyosystematic analysis of Japanese talpine moles in the genera Euroscaptor and Mogera (Insectivora, Talpidae) / S.I. Kawada, M. Harada, Y. Obara, S. Kobayashi, K. Koyasu, S.I. Oda // Zoological Science. — 2001. — V. 18.
— № 7. — P. 1003-1010.
501. Kawada, S.I. Karyological note on the short-faced mole, Scaptochirus moschatus (Insectivora, Talpidae) / S.I. Kawada, M. Harada, K. Koyasu, S.I. Oda // Mammal Study. — 2002. — V. 27. — № 1. — P. 91-94.
502. Kawada, S.I. The mole of Peninsular Malaysia: notes on its identification and ecology / S.I. Kawada, A. Shinohara, M. Yasuda, S.I. Oda, L.B. Liat // Mammal Study. — 2003. — V. 28. — № 1. — P. 73-77.
503. Kawada, S. The historical notes and taxonomic problems of East Asian moles, Euroscaptor, Parascaptor and Scaptochirus, of continental Asia (Insectivora, Talpidae) / S. Kawada //Mammal Study. — 2005. — V. 30. — № Supplement. — P. S5-S11.
504. Kawada, S.I. Revision of the mole genus Mogera (Mammalia: Lipotyphla: Talpidae) from Taiwan / S.I. Kawada, A. Shinohara, S. Kobayashi, M. Harada, S.I.
Oda, L.K. Lin // Systematics and Biodiversity. — 2007. — V. 5. — № 2. — P. 223-240.
505. Kawada, S. Karyological diversity of talpids from Vietnam (Insectivora, Talpidae) / S. Kawada, N.T. Son, D.N. Can // Checklist of Wild Mammal Species of Vietnam.
— 2008a. — P. 384-389.
506. Kawada, S. Redescription of the Malaysian mole as to be a true species, Euroscaptor malayana (Insectivora, Talpidae) / S. Kawada, M. Yasuda, A. Shinohara, B.L. Lim //Memoirs of the National Museum of Nature and Science. — 2008b. — V. 45. — P. 65-74.
507. Kawada, S. Moles (Insectivora, Talpidae, Talpinae) of Vietnam / S. Kawada, N.T. Son, D.N. Can // Bulletin of the National Museum of Nature and Science. — 2009.
— V. 35. — № 2. — P. 89-101.
508. Kawada, S. A new species of mole of the genus Euroscaptor (Soricomorpha, Talpidae) from northern Vietnam / S. Kawada, N.T. Son, D.N. Can // Journal of Mammalogy. — 2012. — V. 93. — № 3. — P. 839-850.
509. Kimura, M. Evolutionary rate at the molecular level / M. Kimura // Nature. — 1968. — V. 217. — № 5129. — P. 624-626.
510. Kimura, M. A simple method for estimating evolutionary rates of base substitutions through comparative studies of nucleotide sequences / M. Kimura // Journal of molecular evolution. — 1980. — V. 16. — № 2. — P. 111-120.
511. Kimura, M. The neutral theory of molecular evolution / M. Kimura. — Cambridge: Cambridge University Press, 1983.
512. Kimura, M. On the rate of molecular evolution / M. Kimura, T. Ohta // Journal of Molecular Evolution. — 1971. — V. 1. — № 1. — P. 1-17.
513. Kirihara, T. Spatial and temporal aspects of occurrence of Mogera species in the Japanese islands inferred from mitochondrial and nuclear gene sequences / T. Kirihara, A. Shinohara, K. Tsuchiya, M. Harada, A.P. Kryukov, H. Suzuki // Zoological science. — 2013. — V. 30. — № 4. — P. 267-281.
514. Kishino, H. Performance of a divergence time estimation method under a probabilistic model of rate evolution / H. Kishino, J.L. Thorne, W.J. Bruno // Molecular biology and evolution. - 2001. — V. 18. — № 3. — P. 352-361.
515. Kitamura, A. History of the inflow of the warm Tsushima Current into the Sea of Japan between 3.5 and 0.8 Ma / A. Kitamura, K. Kimoto // Palaeogeography, Palaeoclimatology, Palaeoecology. — 2006. — V. 236. — №. 3-4. — P. 355-366.
516. Klietmann, J. A gap in digging: the Talpidae of Petersbuch 28 (Germany, Early Miocene) / J. Klietmann, D. Nagel, M. Rummel, L.W. van den Hoek Ostende // Paläontologische Zeitschrift. — 2015. — V. 89. — №. 3. — P. 563-592.
517. Knowles, L.L. Delimiting species without monophyletic gene trees / L.L. Knowles, B.C. Carstens // Systematic biology. — 2007. — V. 56. — № 6. — P. 887-895.
518. Kocher, T.D. Base substitution in fish mitochondrial DNA: patterns and rates / T.D. Kocher, K.L. Carleton // Molecular systematics of fishes / T.D. Kocher, C.A. Stepein (eds.). — California: Academic Press, 1997. — P. 1-24.
519. Koh, H. S. Lack of genetic divergence between Mogera wogura coreana from Korea and M. w. robusta from northeastern China and adjacent Russia (Soricomorpha: Mammalia), reexamined from 12S rRNA and cytochrome b sequences / H.S. Koh, K.H. Jang, ED. Han, J.E. Jo, S.K. Jeong, E.J. Ham, J.H. Lee, K S. Kim, S T. In, G.H. Kweon // Animal Cells and Systems. — 2012. — V. 16. — № 5. — P. 408-414.
520. Kohli, B.A. Multilocus systematics and non-punctuated evolution of Holarctic Myodini (Rodentia: Arvicolinae) / B.A. Kohli, K.A. Speer, C. W. Kilpatrick, N. Batsaikhan, c, D. Damdinbaza, J. A. Cook // Molecular Phylogenetics and Evolution. — 2014. — V. 76. — P. 18-29.
521. Kohli, B.A. Phylogeography of a Holarctic rodent (Myodes rutilus): testing high-latitude biogeographical hypotheses and the dynamics of range shifts / B.A. Kohli, V.B. Fedorov, E. Waltari, J.A. Cook // Journal of Biogeography. — 2015. — V. 42. — № 2. — P. 377-389.
522. Kolesnikov, B. P. Vegetation. Southern part of the Far East / B.P. Kolesnikov. — Moscow: Nauka, 1969. — 206 p.
523. Kopylova, E. SortMeRNA: fast and accurate filtering of ribosomal RNAs in metatranscriptomic data / E. Kopylova, L. Noe, H. Touzet // Bioinformatics. — 2012. — V. 28. — № 24. — P. 3211-3217.
524. Kordis, D. Unusual horizontal transfer of a long interspersed nuclear element between distant vertebrate classes / D. Kordis, F. Gubensek // Proceedings of the National Academy of Sciences. — 1998. — V. 95. — № 18. — P. 10704-10709.
525. Kratochvil, J. Karyotypes and phylogenetic relationships of certain species of the genus Talpa (Talpidae, Insectivora) / J. Kratochvil, B. Kral // Zoologeskii Listy. — 1972. — V. 21. — P. 199-208.
526. Kretteck, A. Sequence analysis of the complete mitochondrial DNA molecule of the Hedgehog, Erinaceus europaeus, and the phylogenetic position of the
Lipotyphla / A. Kretteck, A. Gullberg, U. Arnason // Journal of Molecular Evolution. — 1995. — V. 41. — P. 952-957.
527. Kretzoi, M. Drepanosorex--neu definiert / M. Kretzoi // Vertebrata Hungarica. — 1965. — V. 7. — №. 1-2. — P. 117-129.
528. Kriegs, J.O. Evolutionary history of 7SL RNA-derived SINEs in Supraprimates / J.O. Kriegs, G. Churakov, J. Jurka, J. Brosius, J. Schmitz // Trends in Genetics. —
2007. — V. 23. — №. 4. — P. 158-161.
529. Kriegs, J.O. Retroposed elements as archives for the evolutionary history of placental mammals / J.O. Kriegs, G. Churakov, M. Kiefmann, U. Jordan, J. Brosius, J. Schmitz // PLoS biology. — 2006. — V. 4. — № 4. — P. e91.
530. Kruskop, S.V. A new species of tube-nosed bat Murina (Vespertilionidae, Chiroptera) from Vietnam / S.V. Kruskop, J.L. Eger // Acta Chiropterologica. —
2008. — V. 10. — №. 2. — P. 213-220.
531. Krystufek, B. The taxonomy of blind moles (Talpa caeca and T. stankovici, Insectivora, Mammalia) from south-eastern Europe / B. Krystufek // Bonn. zool. Beitr. — 1994. — V. 45. — P. 1-16.
532. Krystufek, B. Cranial variability in the eastern hedgehog Erinaceus concolor (Mammalia: Insectivora) / B. Krystufek // Journal of Zoology. — 2002. — V. 258.
— P. 365-373.
533. Krystufek, B. Evolutionary biogeography of water shrews (Neomys spp.) in the western Palaearctic Region / B. Krystufek, A. Davison, H.I. Griffiths // Canadian Journal of Zoology. — 2000. — V. 78. — P. 1616-1625.
534. Krystufek, B. Mammals of Turkey and Cyprus: introduction, checklist, Insectivora / B. Krystufek, V. Vohralik. — Koper: Zgodovinsko drustvo za juzno Primorsko, 2001. — 140 p.
535. Krystufek, B. The Caucasian mole Talpa caucasica-a new mammal for Iran / B. Krystufek, P.Benda // Mammalian Biology-Zeitschrift für Säugetierkunde. — 2002.
— V. 67. — №. 2. — P. 113-116.
536. Krystufek, B. News from the Balkan refugium: Thrace has an endemic mole species (Mammalia: Talpidae) / B. Krystufek, N. Nedyalkov, J.J. Astrin, R. Hutterer // Bonn zoological Bulletin. — 2018. — V. 67. — № 1. — P. 41-57.
537. Kubatko, L.S. Inconsistency of Phylogenetic Estimates from Concatenated Data under Coalescence / L.S. Kubatko, J.H. Degnan //Systematic Biology. — 2007. — V. 56. — №. 1. — P. 17-24.
538. Kubatko, L.S. STEM: species tree estimation using maximum likelihood for gene trees under coalescence / L.S. Kubatko, B.C. Carstens, L.L. Knowles // Bioinformatics. — 2009. — V. 25. — № 7. — P. 971-973.
539. Kudla, G. High guanine and cytosine content increases mRNA levels in mammalian cells / G. Kudla, L. Lipinski, F. Caffin, A. Helwak, M. Zylicz // PLoS biology. — 2006. — V. 4. — № 6. — P. e180.
540. Kuhner, M.K. Maximum likelihood estimation of population growth rates based on the coalescent / M.K. Kuhner, J. Yamato, J. Felsenstein // Genetics. — 1998. — V. 149. — № 1. — P. 429-434.
541. Kumar, S. Molecular clocks: four decades of evolution / S. Kumar // Nature Reviews Genetics. — 2005. — V. 6. — № 8. — P. 654-662.
542. Kumar, S. A molecular timescale for vertebrate evolution / S. Kumar, S.B. Hedges // Nature. — 1998. — V. 392. — № 6679. — P. 917-920.
543. Kumar, S. Disparity index: a simple statistic to measure and test the homogeneity of substitution patterns between molecular sequences / S. Kumar, S.R. Gadagkar // Genetics. — 2001. — V. 158. — № 3. — P. 1321-1327.
544. Lanfear, R. PartitionFinder: combined selection of partitioning schemes and substitution models for phylogenetic analyses / R. Lanfear, B. Calcott, S.Y. Ho, S. Guindon // Molecular biology and evolution. — 2012. — V. 29. — № 6. — P. 1695-1701.
545. Lara, M.C. Diversification of small mammals in the Atlantic forest of Brazil: testing the alternatives / M.C. Lara, L. Geise, C.J. Schneider // UC Publ. Zool. — 2005. — V. 133. — P. 311-334.
546. Lavrenchenko, L.A. The genetic diversity of small mammals of the Bale Mountains, Ethiopia / L.A. Lavrenchenko, A.N. Milishnikov, V.M. Aniskin., A.A. Warshavsky, W. Gebrekidan // Ethiopian Journal of Science. — 1997. — V. 20. — P. 213-233.
547. Lavrenchenko, L.A. Morphometric and genetic study of Ethiopian Lophuromys flavopunctatus Thomas, 1888 species complex with description of three new 70-chromosomal species (Muridae, Rodentia) / L.A. Lavrenchenko, W.N. Verheyen, E. Verheyen, J. Hulselmans, H. Leirs // Bulletin de l'Insitut Royal des Sciences Naturelles de Belgique, Biologie. — 2007. — V. 77. — P. 77-117.
548. Lavrenchenko, L.A. Diversity of shrews in Ethiopia, with the description of two new species of Crocidura (Mammalia: Lipotyphla: Soricidae) / L.A. Lavrenchenko, L.L. Voyta, R. Hutterer // Zootaxa. — 2016. — V. 4196. — № 1. — P. 038-060.
549. Leaché, A.D. Species delimitation using genome-wide SNP data / A.D. Leaché, M.K. Fujita, V.N. Minin, R.R. Bouckaert // Systematic biology. — 2014. — V. 63.
— № 4. — P. 534-542.
550. Lebedev, V.S. Molecular phylogeny of the genus Alticola (Cricetidae,Rodentia) as inferred from the sequence of the cytochrome b gene / V.S. Lebedev, A.A. Bannikova, A.S. Tesakov, N.I. Abramson // Zoologica Scripta. — 2007. — V. 36.
— № 6. — P. 547-563.
551. Lebedev, V.S. Molecular phylogeny and systematics of Dipodoidea: a test of morphology-based hypotheses / V.S. Lebedev, A.A. Bannikova, M. Pages, J. Pisano, J R. Michaux, G.I. Shenbrot // Zoologica Scripta. — 2013. — V. 42. — №. 3. — P. 231-249.
552. Lebedev, V.S. Molecular phylogenetics and taxonomy of dwarf hamsters Cricetulus Milne-Edwards, 1867 (Cricetidae, Rodentia): description of a new genus and reinstatement of another. V.S. Lebedev, A.A. Bannikova, K. Neumann, M.V. Ushakova, N.V. Ivanova, A.V. Surov // Zootaxa. — 2018. — V. 4387. — № 2. — P. 331-349.
553. Lebedev, V.S. Phylogeny and evolutionary history of birch mice Sicista Griffith, 1827 (Sminthidae, Rodentia): implications from a multigene study / V.S. Lebedev, M.Yu. Rusin, E.D. Zemlemerova, V.A. Matrosova, A.A. Bannikova, Y.M. Kovalskaya, A.S. Tesakov // Journal of Zoological Systematics and Evolutionary Research. — 2019. — V. 57. — P. 695-709.
554. Leche, W. Uber die SaËugethiergattung Galeopithecus / W. Leche // Kongl.Svenska Vetens-Acad. Handl. — 1885. — V. 21. — P. 1-92.
555. Lepage, T. Continuous and tractable models for the variation of evolutionary rates / T. Lepage, S. Lawi, P. Tupper, D. Bryant //Mathematical biosciences. — 2006. — V. 199. — №. 2. — P. 216-233.
556. Lepage, T. A general comparison of relaxed molecular clock models / T. Lepage, D. Bryant, H. Philippe, N. Lartillot // Molecular biology and evolution. — 2007. — V. 24. — № 12. — P. 2669-2680.
557. Lewis, P.O. A likelihood approach to estimating phylogeny from discrete morphological character data / P.O. Lewis // Systematic biology. — 2001. — V. 50.
— № 6. — P. 913-925.
558. Lewontin, R.C. Hybridization as a source of variation for adaptation to new environments / R.C. Lewontin, L.C. Birch // Evolution. — 1966. — V. 20. — № 3.
— P. 315-336.
559. Li, M.K. Evolution of the isochore structure in the scale of chromosome: insight from the mutation bias and fixation bias / M.K. Li, L. Gu, S.S. Chen, J.Q. Dai, S.H.Tao // Journal of evolutionary biology. — 2008. — V. 21. — № 1. — P. 173182.
560. Li, W.H. So, what about the molecular clock hypothesis? / W.H. Li // Current opinion in genetics & development. — 1993. — V. 3. — № 6. — P. 896-901.
561. Li, S. Molecular Phylogeny and Biogeography of Petaurista Inferred from the Cytochrome b Gene, with Implications for the Taxonomic Status of P. caniceps, P. marica and P. sybilla / S. Li, K. He, F.H. Yu, Q.S. Yang // PloS one. — 2013. — V. 8. — №. 7. — P. e70461.
562. Li, W. Cd-hit: a fast program for clustering and comparing large sets of protein or nucleotide sequences / W. Li, A. Godzik // Bioinformatics. — 2006. — V. 22. — № 13. — P. 1658-1659.
563. Librado, P. DnaSP v5: a software for comprehensive analysis of DNA polymorphism data / P. Librado, J. Rozas // Bioinformatics. — 2009. — V. 25. — № 11. — P. 1451-1452.
564. Ligabue-Braun, R. Venomous mammals: a review / R. Ligabue-Braun, H. Verli, C.R. Carlini // Toxicon. — 2012. — V. 59. — № 7-8. — P. 680-695.
565. Lillegraven, J.A. Evolutionary relationships of middle Eocene and younger species of Centetodon (Mammalia: Insectivora: Geolabididae), with a description of the dentition of Ankylodon (Adapisoricidae) / J.A. Lillegraven, M.C. McKenna, L. Krishtalka // Universily of Wyoming Publication. — 1981. —V. 45. — P. 1-115.
566. Lim, H.C. Multilocus analysis of the evolutionary dynamics of rainforest bird populations in Southeast Asia / H.C. Lim, F.H. Sheldon // Molecular Ecology. — 2011. — V. 20. — № 16. — P. 3414-3438.
567. Lin, Y.-H. Four new mitochondrial genomes and the increased stability of evolutionary trees of mammals from improved taxon sampling / Y.-H. Lin, P.A. McLenachan, A.R. Gore, M.J. Phillips, R. Ota, M.D. Hendy, D. Penny // Molecular Biology and Evolution. — 2002. — V. 19. — № 12. — P. 2060-2070.
568. Linnaeus, K. Systema nature per regna tria nature, secundum classes, ordines, genera, species, cum characteribus, differentiis, synonymis, locis. Editio decima, reformata / K. Linnaeus. — 10th ed. — Holmis [Stockholm]: impensis direct. Laurentii Salvii. 1758. — 824 p.
569. Link, W. Genetic Diversity in European Mediterranean Faba Bean Germ Plasm Revealed by RAPD Markers / W. Link, C. Dixkens, M. Singh, M.M.A.E. Schwall,
A.E. Melchinger // Theoretical and Applied Genetics. — 1995. — V. 90. — №. 1.
— P. 27-32.
570. Liu, L. Estimating species trees using multiple-allele DNA sequence data / L. Liu, D.K. Pearl, R.T. Brumfield, S.V. Edwards // Evolution: International Journal of Organic Evolution. — 2008. — V. 62. — № 8. — P. 2080-2091.
571. Liu, Y. Convergent sequence evolution between echolocating bats and dolphins / Y. Liu, J.A. Cotton, B. Shen, X. Han, S.J. Rossiter, S. Zhang // Current Biology. — 2010. — V. 20. — №. 2. — P. R53-R54.
572. Liu, X. Molecular phylogeny and taxonomy of wood mice (genus Apodemus Kaup, 1829) based on complete mtDNA cytochrome b sequences, with emphasis on Chinese species / X. Liu, F. Wei, M. Li, X. Jiang, Z. Feng, J. Hud // Molecular Phylogenetics and Evolution. — 2004. — V. 33. — № 1. — P. 1-15.
573. Liu, Y. A new species of Uropsilus (Talpidae: Uropsilinae) from Sichuan China / Y. Liu, S.Y. Liu, Z.Y. Sun, P. Guo, Z.X. Fan, R.W. Murphy // Acta Theriol Sin. — 2013. — V. 33. — № 2. — P.113.
574. Lohse, K. Can mtDNA barcodes be used to delimit species? A response to Pons et al. (2006) / K. Lohse //Systematic Biology. — 2009. — V. 58. — №. 4. — P. 439442.
575. Lopatin, A.V. Early Paleogene insectivore mammals of Asia and establishment of the major groups of Insectivora / A.V. Lopatin // Paleontological Journal. — 2006.
— V. 40. — № 3. — P. S205-S405.
576. Lopez-Giraldez, F. PhyDesign: an online application for profiling phylogenetic informativeness / F. Lopez-Giraldez, J.P. Townsend // BMC Evolutionary Biology.
— 2011. — V. 11. — № 1. — P. 152.
577. Loy, A. A parapatric contact area between two species of moles (genus Talpa): character displacement investigated through the geometric morphometric of skull / A. Loy, E. Capanna // Acta Zoologica Academiae Scientiarum Hungaricae. — 1998. — V.44. — P. 151-164.
578. Loy, A. Genetic and morphometric evidence of introgression between two species of moles (Insectivora: Talpa europaea and Talpa romana) in central Italy / A. Loy, M. Capula, A. Palombi, E. Capanna // Journal of Zoology. — 2001. — V. 254. — № 2. — P. 229-238.
579. Loy, A. Distribution of Talpa europea (Mammalia, Insectivora, Talpidae) in Europe: A biogeographic hypothesis based on morphometric data / A. Loy, M. Corti // Italian Journal of Zoology. — 1996. — V. 63. — № 3. — P. 277-284.
580. Lukacova, L. G-banded karyotype of the Alpine shrew, Sorex alpinus (Mammalia, Soicidae), from the Sumava Mts / L. Lukacova, E. Dannelid, J. Hausser, M. Macholan, J. Zima // Folia Zoologica (Czech Republic). — 1996a. — V. 45. — P. 223-226.
581. Lukacova, L. Karyotypic variation in Sorex tundrensis (Soricidae, Insectivora) / L. Lukacova, J. Zima, V.T. Volobouev // Hereditas. — 1996b. — V. 125. — P. 233238.
582. Lunde, D.P. A survey of small mammals from Mt. Tay Con Linh II, Vietnam, with the description of a new species of Chodsigoa (Insectivora: Soricidae) / D.P. Lunde, G.G. Musser, N.T. Son // Mammal Study. — 2003. — V. 28. — № 1. — P. 31-46.
583. Lunde, D.P. Description of a new species of Crocidura (Soricomorpha: Soricidae, Crocidurinae) from Ke Go Nature Reserve, Vietnam / D.P. Lunde, G.G. Musser, T. Ziegler // Mammal Study. — 2004. — V. 29. — №. 1. — P. 27-36.
584. Lv, X. Continental refugium in the Mongolian plateau during quaternary glacial oscillations: phylogeography and niche modelling of the endemic desert hamster, Phodopus roborovskii / X. Lv, L. Xia, D. Ge, Z. Wen, Y. Qu, L. Lu // PloS one. — 2016. — V. 11. — № 2. — P. e0148182.
585. McDonald, J. Adaptive protein evolutionat the Adh locus in Drosophila / J. McDonald, M. Kreitman // Nature. — 1991. — V. 351. — №. 6328. — P. 652.
586. MacDonald, G.M. Holocene treeline history and climate change across northern Eurasia / G.M. MacDonald, A.A. Velichko, C.V. Kremenetski, O.K. Borisova // Quaternary Research. — 2000. — V. 53. — № 3. — P. 302-311.
587. MacFadden, B.J. Rafting mammals or drifting islands? Biogeography of the Greater Antillean insectivores Nesophontes and Solenodon / B.J. MacFadden // Journal of Biogeography. — 1980. — V. 7. — P. 11-22.
588. Macholan, M. Chromosomal and allozyme characterization of the Caucasian shrew, Sorex satunini, from North-East Turkey / M. Macholan // Hereditas. — 1996. — V. 125. — P. 225-231.
589. Macholan, M. Karyological and allozyme survey of the common shrew, Sorex araneus, from Macedonia / M. Macholan, M.G. Filippucci, J. Zima, B. Krystufek, S. Simson //Journal of Zoological Systematics and Evolutionary Research. — 1994. — T. 32. — № 2. — P. 129-136.
590. Mackiewicz, P. Evolutionary history and phylogeographic relationships of shrews from Sorex araneus group / P. Mackiewicz, M. Moska, H. Wierzbicki, P. Gagat, D. Mackiewicz // PloS one. — 2017. — V. 12. — № 6. — P. e0179760.
591. MacPhee, R.D.E. Definition and relationships of Lipotyphla / R.D.E. MacPhee, M.J. Novacek // Mammal phylogeny: placentals / F.S. Szalay, M.J. Novacek, M.C. McKenna, N.-Y. Springer-Verlag (eds.). — 1993. — P. 13-31.
592. MacPhee, R.D.E. "Last occurrence" of the Antillean insectivoran Nesophontes: new radiometric dates and their interpretation / R.D.E. MacPhee, C. Flemming, D P. Lunde // American Museum novitates. — 1999. — V. 3261. — P. 1-20.
593. Maddalena, T. Systematics and biogeography of Afrotropical and Palaearctic shrews of the genus Crocidura (Insectivora: Soricidae): an electrophoretic approach / T. Maddalena // Vertebrates in the Tropics. — 1990. — P. 297-308.
594. Maddalena, T. Biochemical systematics of the endemic African genus Myosorex Gray, 1838 (Mammalia: Soricidae) / T. Maddalena, G. Bronner Israel // Journal of Ecology and Evolution. — 1992. — V. 38. — № 3-4. — P. 245-252.
595. Maddalena, T. Chromosomal evolution in the genus Crocidura (Insectivora: Soricidae) / T. Maddalena, M. Ruedi // Carnegie Mus. Nat. Hist. Spec. Publ. — 1994. — V. 18. — P. 335-344.
596. Maddison, W.P. Gene trees in species trees / W.P. Maddison // Systematic biology. — 1997. — V. 46. — № 3. — P. 523-536.
597. Maddison, W.P. Inferring phylogeny despite incomplete lineage sorting / W.P. Maddison, L.L. Knowles // Systematic biology. — 2006. — V. 55. — № 1. — P. 21-30.
598. Madsen, O. Parallel adaptive radiations in two major clades of placental mammals / O. Madsen, M. Scally, C.J. Douady, D.J. Kao, R.W. DeBry, R. Adkins, H.M. Amrina, M.J. Stanhope, W W. De Jong, M.S. Springer // Nature. — 2001. — V. 409. — P. 610-614.
599. Mahmoudi, A. Mitochondrial sequences retrieve an ancient lineage of Bicolored shrew in the Hyrcanian refugium / A. Mahmoudi, J. Darvish, R.Siahsarvie, S. Dubey, B. Krystufek // Mammalian Biology. — 2019. — V. 95. — P. 160-163.
600. Malinsky, M. Genomic islands of speciation separate cichlid ecomorphs in an East African crater lake / M. Malinsky, R.J. Challis, A.M. Tyers, S. Schiffels, Y. Terai, B.P. Ngatunga, E.A. Miska, R. Durbin, M.J. Genner, G.F Turner // Science. — 2015. — V. 350. — № 6267. — P. 1493-1498.
601. Mallet, J. Hybridization as an invasion of the genome / J. Mallet // Trends in ecology & evolution. — 2005. — V. 20. — № 5. — P. 229-237.
602. Mallet, J. Hybrid speciation / J. Mallet // Nature. — 2007. — V. 446. — №. 7133. — P. 279-283.
603. Mantel, N. The detection of disease clustering and a generalized regression approach / N. Mantel // Cancer Res. — 1967. — V. 27. — № 2. — Part 1. — P. 209-220.
604. Martin, Y. Molecular phylogeny of European muroid rodents based on complete cytochrome b sequences / Y. Martin, G. Gerlach, C. Schlotterer, A. Meyer // Molecular phylogenetics and evolution. — 2000. — V. 16. — №. 1. — P. 37-47.
605. Marshall, C.R. Confidence intervals on stratigraphic ranges / C.R. Marshall // Paleobiology 1990. — V. 16. — № 1. — P. 1-10.
606. Marshall, C.R. A simple method for bracketing absolute divergence times on molecular phylogenies using multiple fossil calibration points / C.R. Marshall // The American Naturalist. - 2008. — V. 171. — № 6. — P. 726-742.
607. Mascheretti, S. How did pygmy shrews colonize Ireland? Clues from a phylogenetic analysis of mitochondrial cytochrome b sequences / S. Mascheretti, M.B. Rogatcheva, I. Gunduz, K. Fredga, J.B. Searle // Proceedings of the Royal Society of London B: Biological Sciences. — 2003. — V. 270. — № 1524. — P. 1593-1599.
608. Mason, M.J. Evolution of the middle ear apparatus in talpid moles / M.J. Mason // Journal of Morphology. — 2006. — V. 267. — №. 6. — P. 678-695.
609. Masters, J.C. Why we need a new genetic species concept / J.C. Masters, H.G. Spencer // Systematic Zoology. — 1989. — V. 38. — № 3. — P. 270-279.
610. Matthew, W.D. The Carnivora and Insectivora of the Bridger bassin, Middle Eocene / W.D. Matthew // Mem. Amer. Mus. Nat. Hist. — 1909. — V. 115. — P. 113-214.
611. Mayden, R.L. A hierarchy of species concepts: the denouement in the saga of the species problem / R.L. Mayden // Species: the units of biodiversity / M.F. Claridge, H.A. Dawah, M.R. Wilson (eds.). — United Kingdom, London: Chapman & Hall, 1997. — P. 381-424.
612. Mayr, E. The biogeographic evidence supporting the Pleistocene forest refuge hypothesis / E. Mayr, R.J. O'Hara // Evolution. — 1986. — V. 40. — P. 55-67.
613. McCormack, J.E. Applications of next-generation sequencing to phylogeography and phylogenetics / J.E. McCormack, S.M. Hird, A.J. Zellmer, B.C. Carstens, R.T.
Brumfield // Molecular phylogenetics and evolution. — 2013. — V. 66. — № 2. — P. 526-538.
614. McDevitt, A.D. Genetic variation in Irish pygmy shrews Sorex minutus (Soricomorpha: Soricidae): implications for colonization history / A.D. McDevitt, R.V. Rambau, J. O'Brien, CD. McDevitt, T.J. Hayden, J.B. Searle // Biological journal of the Linnean Society. — 2009. — V. 97. — № 4. — P. 918-927.
615. McDevitt, A.D. Postglacial recolonization of continental Europe by the pygmy shrew (Sorex minutus) inferred from mitochondrial and Y chromosomal DNA sequences / A.D. McDevitt, G. Yannic, R.V. Rambau, T.J. Hayden, J.B. Searle // Relict Species - Phylogeography and Conservation Biology / J.C. Habel, T. Assmann (eds.). — Berlin, Heidelberg: Springer-Verlag, 2010. — P. 217-236.
616. McDevitt, A.D. Colonization of Ireland: revisiting 'the pygmy shrew syndrome' using mitochondrial, Y chromosomal and microsatellite markers / A.D. McDevitt, R. Vega, R.V. Rambau, G. Yannic, J.S. Herman, T.J. Hayden, J.B. Searle // Heredity. — 2011. — V. 107. — №. 6. — P. 548.
617. McDowell, S B. The Greater Antillean insectivores / S.B. McDowell // Bulletin of the American Museum of Natural History. — 1958. — V. 115. — P. 115-214.
618. McKenna, M.C. Toward a phylogenetic classification of the Mammalia / M.C. McKenna // Phylogeny of the primates - a multidisciplinary approach / W.P. Luckett, F.S. Szalay (eds.). — New York: Plenum Press, 1975. — P. 21-46.
619. McKenna, M.C. Classification of mammals above the species level / M.C.McKenna, S.K. Bell. — New York: Columbia University Press, 1997. — 631 p.
620. Meschersky, I.G. Evidence of a complex phylogeographic structure in the Indomalayan pencil-tailed tree mouse Chiropodomys gliroides (Rodentia: Muridae) in eastern Indochina / I.G. Meschersky, A.V. Abramov, V.S. Lebedev, A.N. Chichkina, V.V. Rozhnov // Biochemical Systematics and Ecology. — 2016. — V. 65. — P. 147-157.
621. Meegaskumbura, S. Crocidura hikmiya, a new shrew (Mammalia: Soricomorpha: Soricidae) from Sri Lanka / S. Meegaskumbura, M. Meegaskumbura, R. Pethiyagoda, K. Manamendra-Arachchi, C.J. Schneider // Zootaxa. — 2007. — V. 1665. — № 1. — P. 19-30.
622. Meegaskumbura, S. Phylogenetic relationships of the endemic Sri Lankan shrew genera: Solisorex and Feroculus / S. Meegaskumbura, M. Meegaskumbura, C.J.
Schneider // Ceylon Journal of Science (Bio. Sci.). — 2014. — V. 43. — № 2. — P. 65-71.
623. Meester J. A systematic revision of the shrew genus Crocidura in Southern Africa / J. Meester // Transvaal Museum Memoirs. — 1963. — V. 13. — № 1. — P. 1-127.
624. Mein, P. Les mammifères du gisement miocène inférieur de Li Mae Long, Thaïlande: systématique, biostratigraphie et paléoenvironnement / P. Mein, L. Ginsbur // Geodiversitas. - 1997. — V. 19. — № 4. — P. 783-844.
625. Mein, P. Sur l'âge relatif des différents dépôts karstiques miocènes de La Grive-Saint-Alban (Isère) / P. Mein, L. Ginsburg // Publications du musée des Confluences. — 2002. — V. 5. — №. 2. — P. 7-47.
626. Meier, J.I. Ancient hybridization fuels rapid cichlid fish adaptive radiations / J.I. Meier, D.A. Marques, S. Mwaiko, C.E. Wagner, L. Excoffier, O. Seehausen // Nature communications. — 2017. — V. 8. — P. 14363.
627. Melo-Ferreira, J. Invasion from the cold past: extensive introgression of mountain hare (Lepus timidus) mitochondrial DNA into three other hare species in northern Iberia / J. Melo-Ferreira, P. Boursot, F. Suchentrunk, N. Ferrand, P.C. Alves // Molecular Ecology. — 2005. — V. 14. — P. 2459-2464.
628. Meredith, R.W. Impacts of the Cretaceous Terrestrial Revolution and KPg extinction on mammal diversification / R.W. Meredith, J.E. Janecka, J. Gatesy, O.A. Ryder, C.A. Fisher, E.C. Teeling, A.Goodbla, E. Eizirik, T.L.L. Simäo, T. Stadler, D.L. Rabosky, R.L. Honeycutt, J.J. Flynn, C.M. Ingram, C. Steiner, T.L. Williams, T.J. Robinson, A. Burk-Herrick, M. Westerman, N.A. Ayoub, M.S. Springer, W.J. Murphy, // Science. — 2011. —V. 334. — P. 521-524.
629. Meyer, A. Shortcomings of the cytochrome b gene as a molecular marker / A. Meyer // Trends in Ecology & Evolution. — 1994. — V. 9. — №. 8. — P. 278-280.
630. Meylan, A. La formule chromosomique de Sorex minutus L. (Mammalia, Insectivora) / A. Meylan // Experientia. — 1965. — V. 21. — P. 1-4.
631. Meylan, A. Donnèe nouvelles sur les chromosomes des Insectivores europeèns (mamm.) / A. Meylan // Revue Suisse de Zoologie. — 1966. — V. 73. — P. 548558.
632. Meylan, A. Position cytotaxonomique de quelques musaraignes du genre Crocidura au Tessin (Mammalia, Insectivora) / A. Meylan, J. Hausser // Revue Suisse de Zoologie. — 1974. —V. 81. — P. 701-710.
633. Meylan, A. The karyotype of the North American Sorex tundrensis (Mammalia, Insectivora) / A. Meylan, J. Hausser // Proceedings of the ISACCs Second
International Meeting. Mémoires de la Société Vaudoise des Sciences Naturelles.
— 1991. — V. 19. — P. 125-129.
634. Mezhzherin, V.A. The red-toothed shrews (Sorex, Insectivora, Mammalia) from the Pleistocene deposits of USSR. Nauka, Novosibirsk. Teriology 1: 117-129. 1972.
635. Michaux, J. New fossil from Fuerteventura, Canary Islands: evidence for a pleistoceneage of endemic rodents and shrews / J. Michaux, R. Hutterer, N. Lopez-Martinez // C.R. Acad. Sci. Paris. — 1991. — V. 312. — P. 801-806.
636. Miller, K.G. Evidence for Oligocene-Middle Miocene abyssal circulation changes in the western North Atlantic / K.G. Miller, R.G. Fairbanks // Nature. — 1983. — V. 306. — №. 5940. — P. 250.
637. Milne-Edwards, A. Note sur quelques Mammifères du Tibet oriental / A. Milne-Edwards // Comptes rendus des séances de l'Académie des Sciences. — 1870. — V. 70. — P. 341-342.
638. Milne-Edwards, A. Memoire sur la faune mammalogique du Tibet oriental et principalement de la Principaute de Moupin / A. Milne-Edwards // Recherches pour servir a l'histoire naturelle des mammiferes / H. Milne-Edwards. — Paris: Libraire de l'Academie de Medecine, 1872. — P. 231-304.
639. Miralles A., New metrics for comparison of taxonomies reveal striking discrepancies among species delimitation methods in Madascincus lizards / A. Miralles, M. Vences // PLoS One. — 2013. — T. 8. — №. 7. — P. e68242.
640. Mishmar, D. Natural selection shaped regional mtDNA variation in humans / D. Mishmar, E. Ruiz-Pesinia, P. Golikb, V. Macaulay, A.G. Clark, S. Hosseini, M. Brandon, K. Easley, E. Chen, M.D. Brown, R.I. Sukernik, A. Olckers, D C. Wallace // Proceedings of the National Academy of Sciences. — 2003. — V. 100.
— № 1. — P. 171-176.
641. Mivart, S.G. Notes on the osteology of the Insectivora / S.G. Mivart // J. Anat. Physiol. 1868. — V. 2. — P. 117-154.
642. Miyamoto, M.M. Molecular systematics: Perfect SINEs of evolutionary history? / M M. Miyamoto // Current Biology. — 1999. — V. 9. — № 21. — P. R816-R819.
643. Miyamoto, M.M. Biomolecular systematics of eutherian mammals: phylogenetic patterns and classification / M.M. Miyamoto, M. Goodman // Systematic Biology.
— 1986. — V. 35. — № 2. — P. 230-240.
644. Moore, B.R. Increasing data transparency and estimating phylogenetic uncertainty in supertrees: approaches using nonparametric bootstrapping / B.R. Moore, S.A.
Smith, M.J. Donoghue // Systematic Biology. — 2006. — V. 55. — № 4. — P. 662-676.
645. Molnar, P. Mantle dynamics, uplift of the Tibetan Plateau, and the Indian monsoon / P. Molnar, P. England, J. Martinod // Reviews of Geophysics. — 1993. — V. 31. — №. 4. — P. 357-396.
646. Morgan, K. Comparative phylogeoa Jenkinsaphy reveals a shared impact of pleistocene environmental change in shaping genetic diversity within nine Anopheles mosquito species across the Indo-Burma biodiversity hotspot / K. Morgan, S.M. O'Loughlin, B. Chen, Y.M. Linton, D. Thongwat, P. Somboon, M Y. Fong, R. Butlin, R. Verity, A. Prakash, P.T. Htun, T. Hlaing, S. Nambanya, D. Socheat, T.H. Dinh, C. Walton // Molecular Ecology. — 2011. — V. 20. — № 21. — P. 4533-4549.
647. Mori, T. On three new mammals from Manchuria / T. Mori // Annot Zool. Japonensis. — 1927. — P. 107-109.
648. Moribe, J. Karyological Notes on the Southern Short-tailed Shrew, Blarinella wardi (Mammalia, Soricidae) / J. Moribe, S. Li, Y.X. Wang, S. Kobayashi, S.I. Oda // Cytologia. — 2007. — V. 72. — № 3. — P. 323-327.
649. Moribe, J. Sorex bedfordiae has the Smallest Diploid Chromosome Number of the XY Group in the Genus Sorex (Mammalia, Soricidae) / J. Moribe, S. Li, Y. Wang, S. Kobayashi, S. Oda // Cytologia. — 2009. — V. 74. — № 1. — P. 95-99.
650. Mossel, E. Incomplete lineage sorting: consistent phylogeny estimation from multiple loci / E. Mossel, S. Roch // IEEE/ACM Transactions on Computational Biology and Bioinformatics (TCBB). — 2010. — V. 7. — № 1. — P. 166-171.
651. Motokawa, M. Phylogenetic relationships among East Asian species of Crocidura (Mammalia, Insectivora) inferred from mitochondrial cytochrome b gene sequences / M. Motokawa, H. Suzuki, M. Harada, L.K. Lin, K. Koyasu, S.I. Oda // Zoological Science. — 2000. — V. 17. — № 4. — P. 497-504.
652. Motokawa, M. Chromosomal polymorphism in the gray shrew Crocidura attenuata (Mammalia: Insectivora) / M. Motokawa, M. Harada, Y. Wu, L.K. Lin, H. Suzuki //Zoological science. — 2001. — V. 18. — №. 8. — P. 1153-1160.
653. Motokawa, M. Taxonomic status of Soriculus baileyi (Insectivora, Soricidae) / M. Motokawa, L.K. Lin // Mammal Study. — 2005. — V. 30. — № 2. - P. 117-124.
654. Motokawa, M. Diversification of the white-toothed shrews of the genus Crocidura (Insectivora: Soricidae) in East and Southeast Asia / M. Motokawa, H.T. Yu, M. Harada // Mammal Study. — 2005. — V. 30. — P. S53-S64.
655. Motokawa, M. Taxonomic study of the water shrews Chimarrogale himalayica and C. platycephala / M. Motokawa, M. Harada, L. Apin, S. Yasuma, S.L. Yuan, L.K. Lin // Acta theriologica. — 2006. — V. 51. — №. 2. — P. 215-223.
656. Motokawa, M. Karyotypes of three shrew species (Soriculus nigrescens, Episoriculus caudatus and Episoriculus sacratus) from Nepal / M. Motokawa, M. Harada, K. Mekada, K.C. Shrestha // Integrative zoology. — 2008. — V. 3. — № 3. — P. 180-185.
657. Motokawa, M. Karyotypes of six soricomorph species from Emei Shan, Sichuan Province, China / M. Motokawa, Y. Wu, M. Harada // Zoological science. — 2009.
— V. 26. — P. 791-797.
658. Mottaz, C. Préliminaires à nos "études de micromammalogie": Description du Neomys milleri, sp. nova / C. Mottaz // Mem Soc Zool France. — 1907. — V. 20.
— P. 20-32.
659. Mouchaty, S.K. The phylogenetic position of the Talpidae within Eutheria based on analysis of complete mitochondrial sequences / S.K. Mouchaty, A. Gullberg, A. Janke, U. Arnason, // Molecular Biology and Evolution. — 2000. — V. 17. — № 1.
— P. 60-67.
660. Muller, H.J. Reversibility in evolution considered from the standpoint of genetics / H.J. Muller // Biological Reviews. — 1939. — V. 14. — № 3. — P. 261-280.
661. Mulungu, S.L. Diversity and distribution of rodent and shrew species associated with variations in altitude on Mount Kilimanjaro, Tanzania / S.L., Mulungu, R.H. Makundi, A.W. Massawe, R.S. Machang'u, N.E. Mbije // Mammalia. — 2008. — V. 72. — P. 178-185.
662. Murphy, W.J. Mammalian phylogenomics comes of age / W.J. Murphy, P.A. Pevzner, S.J. O'Brien // TRENDS in Genetics. — 2004. — V. 20. — №. 12. — P. 631-639.
663. Murphy, W.J. Molecular phylogenetics and the origins of placental mammals / W.J. Murphy, E. Eizirik, W.E. Johnson, Ya P. Zhang, O A. Ryder, S.J. O'Brien // Nature. — 2001a. — V. 409. — № 6820. — P. 614-617.
664. Murphy, W.J. Resolution of the early placental mammal radiation using Bayesian phylogenetics / W.J. Murphy, E. Eizirik, S.J. O'Brien, O. Madsen, M. Scally, C.J. Douady, E. Teeling, O.A. Ryder, M.J. Stanhope, W W. de Jong, M.S. Springer // Science. — 2001b. — V. 294. — № 5550. — P. 2348-2351.
665. Nachman, M.W. Estimate of the mutation rate per nucleotide in humans / M.W. Nachman, S.L. Crowell // Genetics. — 2000. — V. 156. — № 1. — P. 297-304.
666. Nadachowski, A. The taxonomic status of Schelkovnikov's Pine Vole Microtus schelkovnikovi (Rodentia, Mammalia) / A. Nadachowski // Acta Zoologica Cracoviensia-Series A: Vertebrata. — 2007. — V. 50. — №. 1-2. — P. 67-72.
667. Naderi, G. Mitochondrial evidence uncovers a refugium for the fat dormouse (Glis glis Linnaeus, 1766) in Hyrcanian forests of northern Iran / G. Naderi, M. Kaboli, T. Koren, M. Karami, M. Zupan, H.R. Rezaei, B. Krystufek // Mammalian Biology-Zeitschrift für Säugetierkunde. — 2014. — V. 79. — №. 3. — P. 202-207.
668. Natarajan, A. Karyotype and heterochromatin pattern of the Algerian hedgehog / A. Natarajan, A. Gropp // Chromosoma (Berl.). — 1972. — V. 35. — P. 143-152.
669. Naylor, G.J.P. Amphioxus mitochondrial DNA, chordate phylogeny, and the limits of inference based on comparisons of sequences / G.J.P. Naylor, W.M. Brown // Systematic Biology. - 1998. — V. 47. — № 1. — P. 61-76.
670. Nazarenko, A.A. Ornithofaunistic exchange between the Southern and Northern Eurasia on the eastern periphery of the continent: The Last Glacial-Interglacial Cycle / A.A. Nazarenko // Zhurnal Obshchei Biologii. — 1990. — V. 51. — №. 1.
— P. 89-106.
671. Nazarov, R.A. Taxonomy of naked-toes geckos Cyrtodactylus irregularis complex of south Vietnam and description of a new species from Chu Yang Sin National Park (Krong Bong District, Dac Lac Province, Vietnam) / R.A. Nazarov, N.L. Orlov, N.N. Sang, T.C. Ho // Russian Journal of Herpetology. — 2008. — V. 15.
— №. 2. — P. 141-156.
672. Ndiaye, A. Evolutionary systematics and biogeography of the arid habitat-adapted rodent genus Gerbillus (Rodentia, Muridae): a mostly Plio-Pleistocene African history / A. Ndiaye, P. Chevret, G. Dobigny, L. Granjon // Journal of Zoological Systematics and Evolutionary Research. — 2016. — V. 54. — №. 4. — P. 299317.
673. Nei, M. Mathematical models of speciation and genetic distance / M. Nei // Population genetics and ecology / S. Karlin, E. Nevo (eds.). — New York: Academic Press, 1976. — P. 723-765.
674. Nei, M. Molecular evolutionary genetics / M. Nei. — New York: Columbia University Press, 1987.
675. Neronov, V.M. Chorological structure of the range and genetic variation of the midday Gerbil (Meriones meridianus) / V.M. Neronov, N.I. Abramson, A.A. Warshavsky, T.Y. Karimova, L.A. Khlyap // Doklady Biological Sciences. — MAIK Nauka/Interperiodica, 2009. — V. 425. — №. 1. — P. 135-137.
676. Nevo, E. Adaptive convergence and divergence of subterranean mammals / E. Nevo // Annual review of ecology and systematics. — 1979. — V. 10. — № 1. — P. 269-308.
677. Ngo, V.T. Descriptions of two new species of Cyrtodactylus Gray, 1827 (Squamata: Gekkonidae) endemic to southern Vietnam / V.T. Ngo, A.M. Bauer // Zootaxa. — 2008. — V. 1715. — №. 1. — P. 27-42.
678. Ngo, V.T. A new species of Gekko Laurenti, 1768 (Squamata, Gekkonidae) from Dong Nai Province, Southeastern Vietnam / V.T. Ngo, A.M. Bauer, P.L.Jr. Wood, J.L. Grismer //Zootaxa. — 2009. — V. 2238. — №. 1. — P. 33-42.
679. Nguyen, L.T. IQ-TREE: a fast and effective stochastic algorithm for estimating maximum-likelihood phylogenies / L.-T. Nguyen, H.A. Schmidt, A. von Haeseler, B.Q. Minh // Molecular biology and evolution. — 2015. — V. 32. — № 1. — P. 268-274.
680. Nichols, R. Gene trees and species trees are not the same / R. Nichols // Trends in Ecology & Evolution. — 2001. — V. 16. — №. 7. — P. 358-364.
681. Niethammer, J. Talpa caeca Savi, 1822 — Blindmaulwurf / J. Niethammer // Handbuch der Säugetiere Europas / J. Niethammer, F. Krapp (eds.). — Wiesbaden: AULA Verlag, 1990. — V. 3. — P. 145-156.
682. Nikaido, M. Maximum likelihood analysis of the complete mitochondrial genomes of eutherians and a reevaluation of the phylogeny of bats and insectivores / M. Nikaido, K. Kawai, Y. Cao, M. Harada, S. Tomita, N. Okada, M. Hasegawa // Journal of Molecular Evolution. — 2001. — V. 53. — № 4-5. — P. 508-516.
683. Nikaido, M. The phylogenetic relationships of insectivores with special reference to the lesser hedgehog tenrec as inferred from the complete sequence of their mitochondrial genome / M. Nikaido, Y. Cao, N. Okada, M. Hasegawa // Genes & genetic systems. — 2003. — V. 78. — № 1. — P. 107-112.
684. Nikolaev, S. Early history of mammals is elucidated with the ENCODE multiple species sequencing data / S.Nikolaev, J.I. Montoya-Burgos, E.H. Margulies, J. Rougemont, B. Nyffeler, S.E. Antonarakis // PLoS genetics. — 2007. — V. 3. — № 1. — P. e2.
685. Nichols, R. Gene trees and species trees are not the same / R. Nichols // Trends in Ecology & Evolution. — 2001. — V. 16. — № 7. — P. 358-364.
686. Nicolas, V. Talpa aquitania nov. sp. (Talpidae, Soricomorpha) a new mole species from southwest France and north Spain / V. Nicolas, J. Martinez-Vargas, J.P. Hugot
// Bulletin de l'Académie Vétérinaire de France. — 2016. — V. 168. — P. 329334.
687. Nicolas, V. Molecular data and ecological niche modelling reveal the evolutionary history of the common and Iberian moles (Talpidae) in Europe / V. Nicolas, J. Martinez-Vargas, J. P. Hugot // Zoologica Scripta. — 2017a. — V. 46. — №. 1. — P. 12-26.
688. Nicolas, V. Talpa aquitania sp. nov. (Talpidae, Soricomorpha), a new mole species from SW France and N Spain / V. Nicolas, J. Martinez-Vargas, J. P. Hugot // Mammalia. — 2017b. — V. 81. — №. 6. — P. 641-642.
689. Nicolas, V. Multilocus phylogeny of the Crocidura poensis species complex (Mammalia, Eulipotyphla): Influences of the palaeoclimate on its diversification and evolution / V. Nicolas, F. Jacquet, R. Hutterer, A. Konecny, S.K. Kouassi, L. Durnez, A. Lalis, M. Colyn, C. Denys // Journal of Biogeography. — 2019. — V. 46. — № 5. — P. 871-883.
690. Nishihara, H. Retroposon analysis and recent geological data suggest near-simultaneous divergence of the three superorders of mammals / H. Nishihara, S. Maruyama, N. Okada // Proceedings of the National Academy of Sciences. — 2009. — V. 106. — №. 13. — P. 5235-5240.
691. Nishihara, H. A retroposon analysis of Afrotherian phylogeny / H. Nishihara, Y. Satta, M. Nikaido, J.G. Thewissen, M.J. Stanhope, N. Okada // Molecular biology and evolution. — 2005. — V. 22. — № 9. — P. 1823-1833.
692. Nishihara, H. Pegasoferae, an unexpected mammalian clade revealed by tracking ancient retroposon insertions / H. Nishihara, M. Hasegawa, N. Okada // Proceedings of the National Academy of Sciences. — 2006. — V. 103. — № 26. — P. 9929-9934.
693. Nor, S.M. Elevational diversity patterns of small mammals on Mount Kinabalu, Sabah, Malaysia / S.M. Nor // Global Ecology and Biogeography. — 2001. — V. 10. — №. 1. — P. 41-62.
694. Nosil, P. Speciation with gene flow could be common / P. Nosil // Molecular ecology. — 2008. — V. 17. — № 9. — P. 2103-2106.
695. Novacek, M.J. A review of Paleocene and Eocene Leptictidae (Eutheria: Mammalia) from North America / M.J Novacek // Paleobios. — 1977. — V. 24. — P. 1-42.
696. Novacek, M.J. The skull of leptictid insectivorans and the higher-level classification ofeutherian mammals / M.J. Novacek // Bulletin of the American Museum of Natural History. — 1986. — V. 183. — P. 1-112.
697. Novacek, M.J. Mammalian phytogeny: shaking the tree / M.J. Novacek // Nature. — 1992. — V. 356. — P. 121-125.
698. Novacek, M.J. On the classification of the Early Tertiary Erinaceomorpha (Insectivora, Mammalia) / M.J. Novacek, T.M. Bown, D. Schankler // USGS Staff -Published Research. — 1985. — P. 1-22.
699. Nowak, R.M. Walker's Mammals of the World / R.M. Nowak. — Johns Hopkins University Press, 1999.
700. Obolenskaya, E.V. Diversity of Palaearctic chipmunks (Tamias, Sciuridae) / E.V. Obolenskaya, M.Y. Lee, N.E. Dokuchaev, T. Oshida, M.S. Lee, H. Lee, A.A. Lissovsky, // Mammalia. — 2009. — V. 73. — № 4. — P. 281-298.
701. Ohdachi, S. Phylogeny of Eurasian soricine shrews (Insectivora, Mammalia) inferred from the mitochondrial cytochrome b gene sequences / S. Ohdachi, R. Masuda, H. Abe, J. Adachi, N.E. Dokuchaev, V. Haukisalmi, M.C. Yoshida // Zoological science. — 1997a. — V. 14. — № 3. — P. 527-532.
702. Ohdachi, S. Biogeographical history of northeastern Asiatic soricine shrews (Insectivora, Mammalia) / S. Ohdachi, R. Masuda, H. Abe, N.E. Dokuchaev // Researches on Population Ecology. — 1997b. — V. 39. — № 2. — P. 157-162.
703. Ohdachi, S. Intraspecific phylogeny and geographical variation of six species of northeastern Asiatic Sorex shrews based on the mitochondrial cytochrome b sequences / S. Ohdachi, N.E. Dokuchaev, M. Hasegawa, R. Masuda // Molecular Ecology. — 2001. — V. 10. — № 9. — P. 2199-2213.
704. Ohdachi, S.D. Molecular phylogenetics of Crocidura shrews (Insectivora) in east and central Asia / S.D. Ohdachi, M.A. Iwasa, V.A. Nesterenko, H. Abe, R. Masuda, W. Haberl // Journal of Mammalogy. — 2004. — V. 85. — № 3. — P. 396-403.
705. Ohdachi, S.D. Molecular phylogenetics of soricid shrews (Mammalia) based on mitochondrial cytochrome b gene sequences: with special reference to the Soricinae / S.D. Ohdachi, M. Hasegawa, M.A. Iwasa, P. Vogel, T. Oshida, L.-K. Lin, H. Abe // Journal of Zoology. — 2006. — V. 270. — № 1. — P. 177-191.
706. Ohdachi, S.D. The wild mammals of Japan / S.D. Ohdachi, Y. Ishibashi, M.A. Iwasa, T. Saitoh. — Kyoto: Shoukadoh Book Sellers, Quarto, laminated boards, 2009. — 544 p.
707. Ohdachi, S.D. Intraspecific phylogeny and nucleotide diversity of the least shrews, the Sorex minutissimus-S. yukonicus complex, based on nucleotide sequences of the Mitochondrial Cytochrome b Gene and the Control Region / S.D. Ohdachi, K. Yoshizawa, I. Hanski, K. Kawai, N.E. Dokuchaev, B.I. Sheftel, A.V. Abramov, I. Moroldoev, A. Kawahara // Mammal Study. — 2012. — V. 37. — № 4. — P. 281297.
708. Ohshima, K. The late-Quaternary sea-level change of the Japanese Islands / K. Ohshima // Journal of Geography (Chigaku Zasshi). — 1991. — V. 100. — №. 6. — P. 967-975. (In Japanese).
709. Ohta, T. Near-neutrality in evolution of genes and gene regulation / T. Ohta // Proceedings of the National Academy of Sciences. — 2002. — V. 99. — № 25. — P. 16134-16137.
710. O'Leary, M.A. The placental mammal ancestor and the post-K-Pg radiation of placentals / M.A. O'Leary, J.I. Bloch, J.J. Flynn,T.J. Gaudin, A. Giallombardo, N.P. Giannini, S.L. Goldberg, BP. Kraatz, Z.-X. Luo, J. Meng, X. Ni, M.J. Novacek, F A. Perini, Z.S. Randall, G.W. Rougier, E. J. Sargis, M.T. Silcox, N.B. Simmons, M. Spaulding, P.M. Velazco, M. Weksler, J R. Wible, A.L. Cirranello // Science. — 2013. — V. 339. — № 6120. — P. 662-667.
711. O'Neill, M.B. Mitochondrial DNA variation in water shrews (Sorexpalustris, Sorex bendirii) from western North America: implications for taxonomy and phylogeography / M.B. O'Neill, D.W. Nagorsen, R.J. Baker // Canadian journal of zoology. — 2005. — V. 83. — № 11. — P. 1469-1475.
712. Orlov, N.L. A New Species of the Genus Vibrissaphora Liu, 1945 (Anura: Megophryidae) from Mount Ngoc Linh (Kon Tum Province) and Analysis of the Extent of Species Overlap in the Fauna of Amphibians and Reptiles of the NorthWest of Vietnam and Central Highland / N.L. Orlov // Russian Journal of Herpetology. — 2005. — V. 12. — № 1. — P. 17-38.
713. Orlov, N.L. A new species of the genus Calamaria (Squamata: Ophidia: Colubridae) from the Central Highlands (Ngoc Linh Nature Reserve, Ngoc Linh Mountain, Kon Tum Province), Vietnam / N.L. Orlov // Russian Journal of Herpetology. — 2009. — V. 16. — № 2. — P. 146-154.
714. Oshida, T. Phylogeography of the Russian flying squirrel (Pteromys volans): implication of refugia theory in arboreal small mammal of Eurasia / T. Oshida, A. Abramov, H. Yanagawa, R. Masuda // Molecular Ecology. — 2005. — V. 14. — № 4. — P. 1191-1196.
715. Ottenwalder, J.A. Systematics and biogeography of the West Indian genus Solenodon / J.A. Ottenwalder // Biogeography of the West Indies: patterns and perspectives / C.A. Woods, F.E. Sergile (eds.). — Florida: CRC Press, 2001. — P. 253-259.
716. Padial, J.M. The integrative future of taxonomy / J.M. Padial, A. Miralles, I. De la Riva, M. Vences // Frontiers in zoology. — 2010. — V. 7. — № 1. — P. 16.
717. Patou, M.L. Phylogenetic relationships of the Asian palm civets (Hemigalinae & Paradoxurinae, Viverridae, Carnivora) / M.-L. Patou, R. Debruyne, A.P. Jennings, A. Zubaid, J.J. Rovie-Ryan, G. Veron //.Molecular Phylogenetics and Evolution. — 2008. — V. 47. — № 3. — P. 883-892.
718. Patou, M.L. Evolutionary history of the Paradoxurus palm civets-a new model for Asian biogeography / M.L. Patou, A. Wilting, P. Gaubert, J.A. Esselstyn, C. Cruaud, A.P. Jennings, J. Fickel, G. Veron // Journal of Biogeography. — 2010. — V. 37. — № 11. — P. 2077-2097.
719. Pauperio, J. Cryptic speciation in the field vole: a multilocus approach confirms three highly divergent lineages in Eurasia / J. Pauperio, J.S. Herman, J. Melo-Ferreira, M. Jaarola, P.C. Alves, J.B. Searle // Molecular Ecology. — 2012. — V. 21. — №. 24. — P. 6015-6032.
720. Pavlova, S. A distinct chromosome race of the common shrew (Sorex araneus Linnaeus, 1758) within the Arctic Circle in European Russia / S. Pavlova // Comparative Cytogenetics. — 2010. — V. 4. — № 1. — P. 73-78.
721. Peshev, D.T. Comparative study of hedgehogs of genus Erinaceus (Insectivora, Mammalia) in the Near East and Bulgaria / D.T. Peshev, K.A. Hussein // Acta Zoologica Bulgarica. — 1990. — V. 38. — P. 12-15.
722. Peters, W.C.H. Über die Säugethiergattung Solenodon / W.C.H. Peters // Abhandl. Akad. Wissensch. Berlin. — 1864. — P. 1-22.
723. Petrova, T.V. Phylogeography of the narrow-headed vole Lasiopodomys (Stenocranius) gregalis (Cricetidae, Rodentia) inferred from mitochondrial cytochrome b sequences: an echo of Pleistocene prosperity / T.V. Petrova, E.S. Zakharov, R.Samiya, N.I. Abramson // Journal of Zoological Systematics and Evolutionary Research. — 2014. — V. 53. — № 2. — P. 97-108.
724. Petrova, T.V. Cryptic speciation in the narrow-headed vole Lasiopodomys (Stenocranius) gregalis (Rodentia: Cricetidae) / T.V. Petrova, A.S. Tesakov, Y.M. Kowalskaya, N.I. Abramson // Zoologica Scripta. — 2016. — V. 45. — № 6. — P. 618-629.
725. Phillips, M.J. Geomolecular dating and the origin of placental mammals / M.J. Phillips // Systematic biology. — 2016. — V. 65. — № 3. — P. 546-557.
726. Phillips, M.J. Genome-scale phylogeny and the detection of systematic biases / M.J. Phillips, F. Delsuc, D. Penny // Molecular biology and evolution. — 2004. — V. 21. — № 7. — P. 1455-1458.
727. Pisano, J. Out of Himalaya: the impact of past Asian environmental changes on the evolutionary and biogeographical history of Dipodoidea (Rodentia) / J. Pisano, F.L. Condamine, V. Lebedev, A. Bannikova, J.-P. Quere, G.I. Shenbrot, M. Pages, J.R. Michaux // Journal of Biogeography. — 2015. — V. 42. — № 5. — P. 856-870.
728. Poe, S. Taxon sampling revisited / S. Poe, D.L. Swofford // Nature. — 1999. — V. 398. — P. 299-300.
729. Pons, J. Sequence-based species delimitation for the DNA taxonomy of undescribed insects / J. Pons, T.G. Barraclough, J. Gomez-Zurita, A. Cardoso, D.P. Duran, S. Hazell, S. Kamoun, W.D. Sumlin, A.P. Vogler // Systematic biology. — 2006. — V. 55. — № 4. — P. 595-609.
730. Popov, V.V. Late Pliocene Erinaceidae and Talpidae (Mammalia: Insectivora) from Varshets (North Bulgaria) / V.V. Popov // Acta zoologica cracoviensia. — 2004. — V. 47. V № 1-2. — P. 61-80.
731. Posada, D. Modeltest: testing the model of DNA substitution / D. Posada, K.A. Crandall // Bioinformatics. — 1998. — V. 14. — № 9. — P. 817-818.
732. Prieto, J. The Middle Miocene insectivores from Saamsonhaza 3 (Hungary, Nograd County): Biostratigraphical and palaeoenvironmental notes near to the Middle Miocene Cooling / J. Prieto, L.W. Van Den Hoek Ostende, J. Hir // Bulletin of Geosciences. — 2012. — V. 87. — № 2. — P. 227-240.
733. Prieto, J. Primitive Anourosoricini and Allosoricinae from the Miocene of Germany / J. Prieto, J.A. van Dam // Geobios. — 2016. — V. 45. — № 6. — P. 581-589.
734. Pritchard, J.K. Inference of population structure using multilocus genotype data / J.K. Pritchard, M. Stephens, P. Donnelly // Genetics. — 2000. — V. 155. — № 2. — P. 945-959.
735. Pucek, Z. Sexual maturation and variability of the reproductive system in young shrews (Sorex L.) in the first calendar year of life / Z. Pucek // Acta theriologica. — 1960. — V. 3. — № 12. — P. 269-296.
736. Puillandre, N. Automatic Barcode Gap Discovery for primary species delimitation / N. Puillandre, A. Lambert, S. Brouillet, G. Achaz // Molecular ecology. — 2012. — V. 21. — № 8. — P. 1864-1877.
737. Qiang, X.K. Magnetostratigraphic record of the Late Miocene onset of the East Asian monsoon, and Pliocene uplift of northern Tibet / X.K. Qiang, Z.X. Li, C.M.A. Powell, H.B. Zheng // Earth and Planetary Science Letters. — 2001. — V. 187. — № 1-2. — P. 83-93.
738. Qiu, Z.D. China / Z.D. Qiu, G. Storch // The fossil record of the Eurasian Neogene Insectivores (Erinaceomorpha, Soricomorpha, Mammalia), I. Scripta Geologica Special Issue / H. Ostende, L.W. van den, C.S. Doukas, J.W.F. Reumer (eds.). — Leiden, 2005. — V. 5. — P. 37-50.
739. Quast, C. The SILVA ribosomal RNA gene database project: improved data processing and web-based tools / C. Quast, E. Pruesse, P. Yilmaz, J. Gerken, T. Schweer, P. Yarza, J. Peplies, F.O. Glöckner // Nucleic acids research. — 2012. — V. 41. — № D1. — P. D590-D596.
740. Quérouil, S. Phylogeny and evolution of African shrews (Mammalia: Soricidae) inferred from 16s rRNA sequences / S. Querouil, R. Hutterer, P. Barriere, M. Colyn, J.C. Kerbis, E. Verheyen // Molecular phylogenetics and evolution. — 2001. — V. 20. — № 2. — P. 185-195.
741. Quérouil, S. A molecular insight into the systematics of African Crocidura (Crocidurinae, Soricidae) using 16s rRNA sequences / S. Quérouil, P. Barrière, M. Colyn, R. Hutterer, A. Dudu, M. Dillen, E. Verheyen // Advances in the Biology of Shrews II. Special publication of International Society of Shrew Biologists / J.F. Merritt, S. Churchfield, R. Hutterer, B. Sheftel (eds.). — 2005. — P. 99-113.
742. Ragan, M.A. Phylogenetic inference based on matrix representation of trees / M.A. Ragan // Molecular phylogenetics and evolution. — 1992. — V. 1. — № 1. — P. 53-58.
743. Rambaut, A. Tracer version 1.4. [Электронный ресурс] / A. Rambaut, A. Drummond. — 2007. — Режим доступа: http://evolve.zoo.ox.ac.uk/software.html.
744. Rannala, B. Inferring speciation times under an episodic molecular clock / B. Rannala, Z. Yang // Systematic Biology. — 2007. — V. 56. — P. 453-466.
745. Rannala, B. Identifiability of parameters in MCMC Bayesian inference of phylogeny / B. Rannala // Systematic Biology. — 2002. — V. 51. — № 5. — P. 754-760.
746. Rannala, B. Bayes estimation of species divergence times and ancestral population sizes using DNA sequences from multiple loci / B. Rannala, Z. Yang // Genetics. — 2003. — V. 164. — № 4. — P. 1645-1656.
747. Ranwez, V. OrthoMaM: a database of orthologous genomic markers for placental mammal phylogenetics / V. Ranwez, F. Delsuc, S. Ranwez, K. Belkhir, M. Tilak, E. J. P. Douzery // BMC evolutionary biology. — 2007. — V. 7. — № 1. — P. 241.
748. Ranwez, V. MACSE: Multiple Alignment of Coding SEquences Accounting for Frameshifts and Stop Codons / V. Ranwez, S. Harispe, F. Delsuc, E.J.P. Douzery // PLoS ONE. — 2011. — V. 6. — № 9. — P. e22594.
749. Ratkiewicz, M. The evolutionary history of the two karyotypic groups of the common shrew, Sorex araneus, in Poland / M. Ratkiewicz, S. Fedyk, A. Bonaszek // Heredity. — 2002. — V. 88. — № 4. — P. 235-242.
750. Rausch, V.R. Karyopypic characteristics of Sorex tundrensis Merriam (Mammalia: Soricidae), a nearctic species of the S. araneus-group / V.R. Rausch, R.L. Rausch // Proceedings of the Biological Society of Washington. — 1993. — V. 106. — № 2.
— P. 410-416.
751. Reid, N.M. Phylogenetic estimation error can decrease the accuracy of species delimitation: a Bayesian implementation of the general mixed Yule-coalescent model / N.M. Reid, B.C. Carstens // BMC evolutionary biology. — 2012. — V. 12.
— № 1. — P. 196.
752. Repenning, C.A. Subfamilies and genera of the Soricidae / C.A. Repenning // Geological Survey Professional Paper. — 1967. — V. 565. — P. 1-74.
753. Reumer, J.W.F. Ruscinian and early Pleistocene Soricidae (Insectivora, Mammalia) from Tegel en (The Netherlands) and Hungary / J.W.F. Reumer // Scripta Geologica, 1984. — V. 73. — P. 1-173.
754. Reumer, J.W.F. Redefinition of the Soricidae and the Heterosoricidae (Insectivora, Mammalia), with the description of the Crocidosoricinae, a new subfamily of Soricidae / J.W.F. Reumer // Revue de Paléobiologie. — 1987. — V. 6. — P. 189192.
755. Reumer, J.W.F. Speciation and evolution in the Soricidae (Mammalia: Insectivora) in relation with the paleoclimate / J.W.F. Reumer // Revue Suisse De Zoologie. — 1989. — V. 96. — P. 81-90.
756. Reumer, J.W.F. Phylogeny and distribution of the Crocidosoricinae (Mammalia, Soricidae) / J.W.F. Reumer // Advances in the Biology of Shrews. Special Publication No. 18 / J.F. Merritt, GL. Kirkland, R.K. Rose (eds.). — Pittsburgh: Carnegie Museum of Natural History, 1994. — P. 345-356.
757. Reumer, J.W.F. The effect of paleoclimate on the evolution of the Soricidae (Mammalia, Insectivora) / J.W.F. Reumer // Paleoclimate and Evolution with
Emphasis on Human Origins / E.S. Vrba, G.H. Denton, T.C. Partridge, L.H. Burckle (eds.). — New Haven and London: Yale University Press, 1995. — P. 135-147.
758. Reumer, J.W.F. Classification of the fossil and recent shrews / J.W.F. Reumer // Evolution of shrews / J.M. Wojcik, M. Wolsan (eds.). — Bialowieza: Mammal Research Institute, Polish Academy of Sciences, 1998. — P. 5-22.
759. Rich, T.H.V. Brachyerix, a Miocene Hedgehog from Western North America, with a Description of the Tympanic Region of Paraechinus and Podogymnura / T.H.V. Rich, P.V. Rich // American Museum novitates. — 1971. — V. 2477. — P. 1-59.
760. Rich, T.H.V. Origin and history of the Erinaceidae and Brachyericinae (Mammalia, Insectivora) in North America / T.H.V. Rich // Bull. of the American Museum of Natural History. — 1981. — V. 171. — P. 1-116.
761. Robbins, C.B. Morphometrics and distinctness of the hedgehog genera (Insectivora: Erinaceidae) / C.B. Robbins, H.W. Setzer // Proceedings of the Biological Society of Washington. — 1985. — V. 98. — № 1. — P. 112-120.
762. Robertson, G. De novo assembly and analysis of RNA-seq data / G. Robertson, J. Schein, R. Chiu, R. Corbett, M. Fiel, S.D. Jackman, K. Mungall, S. Lee, H.M. Okada, J.Q. Qian, M. Griffith, A. Raymond, N. Thiessen, T. Cezard, Y.S. Butterfield, R. Newsome, S.K. Chan, R. She, R. Varhol, B. Kamoh, A.-L. Prabhu, A. Tam, Y. Zhao, R.A. Moore, M. Hirst, M.A. Marra, S.J.M. Jones, P A. Hoodless, I. Birol // Nature methods. — 2010. — V. 7. — № 11. — P. 909-912.
763. Robinson, M. Sensitivity of the relative-rate test to taxonomic sampling / M. Robinson, M. Gouy, C. Gautier, D. Mouchiroud // Molecular biology and evolution. — 1998. — V. 15. — № 9. — P. 1091-1098.
764. Roca, A.L. Mesozoic origin for West Indian insectivores / A.L. Roca, G.K. Bar-Gal, E. Eizirik, K M. Helgen, R. Maria, M.S. Springer, S.J. O'Brien, W.J. Murphy // Nature. — 2004. — V. 429. — № 6992. — P. 649-651.
765. Rodriguez-Trelles, F. A methodological bias toward overestimation of molecular evolutionary time scales / F. Rodriguez-Trelles, R. Tarrio, F.J. Ayala // Proceedings of the National Academy of Sciences. — 2002. — V. 99. — № 12. — P. 81128115.
766. Rofes, J. First evidence of the Soricidae (Mammalia) Asoriculus gibberodon (Petenyi, 1864) in the Pleistocene of north Iberia / J. Rofes, G. Cuenca-Bescos // Rivista Italiana di Paleontologia e Stratigrafia. — 2006. — V. 112. — № 2. — P. 301-315
767. Rohlf, F.J. Morphometric analysis of old world Talpidae (Mammalia, Insectivora) using partial-warp scores / F.J. Rohlf, A. Loy, M. Corti // Systematic biology. — 1996. — V. 45. — № 3. — P. 344-362.
768. Romiguier, J. Contrasting GC-content dynamics across 33 mammalian genomes: relationship with life-history traits and chromosome sizes / J. Romiguier, V. Ranwez, E.J.P. Douzery, N. Galtier // Genome research. — 2011. — V. 20. — № 8. — P. 1001-1009.
769. Romiguier, J. Genomic evidence for large, long-lived ancestors to placental mammals / J. Romiguier, V. Ranwez, E.J.P. Douzery, N. Galtier // Molecular Biology and Evolution. — 2012. — V. 30. — № 1. — P. 5-13.
770. Ronquist, F. MrBayes 3: Bayesian phylogenetic inference under mixed models / F. Ronquist, J.P. Huelsenbeck // Bioinformatics. — 2003. — V. 19. — № 12. — P. 1572-1574.
771. Ropiquet, A. Super TRI: a new approach based on branch support analyses of multiple independent data sets for assessing reliability of phylogenetic inferences / A. Ropiquet, B. Li, A. Hassanin // Comptes Rendus Biologies. — 2009. — V. 332.
— № 9. — P. 832-847.
772. Rose, K.D. Postcranial skeleton of Eocene Leptictidae (Mammalia), and its implications for behavior and relationships / K.D. Rose // Journal of Vertebrate Paleontology. — 1999. — V. 19. — P. 355-372.
773. Rosenberg, M.S. Incomplete taxon sampling is not a problem for phylogenetic inference / M.S. Rosenberg, S. Kumar // Proceedings of the National Academy of Sciences. — 2001. — V. 98. — № 19. — P. 10751-10756.
774. Roux, G.H. The cranial development of certain Ethiopian "insectivores" and its bearing on the mutual affinities of the group / G.H. Roux // Acta Zoologica. — 1947. — V. 28. — № 2-3. — P. 165-397.
775. Rowley, J.J.L. A new tree frog of the genus Rhacophorus (Anura: Rhacophoridae) from southern Vietnam / J.J.L. Rowley, T.L. Thi, D. Tran, T.A. Dao, B.L. Stuart, H.D. Huy // Zootaxa. — 2010. — V. 2727. — № 1. — P. 45-55.
776. Roy, M.S. Recent diversification in African greenbuls (Pycnonotidae: Andropadus) supports a montane speciation model / M.S. Roy // Proceedings of the Royal Society of London. Series B: Biological Sciences. — 1997. — V. 264. — № 1386.
— P. 1337-1344.
777. Ruedi, M. Taxonomic revision of shrews of the genus Crocidura from the Sunda Shelf and Sulawesi with description of two new species (Mammalia: Soricidae) /
M. Ruedi // Zoological Journal of the Linnean Society. — 1995. — V. 115. — №. 3. — P. 211-265.
778. Ruedi, M. Phylogenetic evolution and biogeography of southeast Asian shrews (genus Crocidura: Soricidae) / M. Ruedi // Biological Journal of the Linnean Society. — 1996. — V. 58. — № 2. — P. 197-219.
779. Ruedi, M. Protein evolution in shrews / M. Ruedi // Evolution of shrews / J.M. Wojcik, M. Wolsan (eds.). — Bialowieza: Mammal Research Inst., Polish Academy of Sciences, 1998. — P. 269-294.
780. Ruedi, M. Taxonomic status of Hylomys parvus and Hylomys suillus (Insectivora: Erinaceidae): biochemical and morphological analyses / M. Ruedi, M. Chapuisat, D. Iskandar // Journal of Mammalogy. — 1994. — V. 75. — № 4. — P. 965-978.
781. Ruedi, M. Genetic structure of Gymnures (genus Hylomys; Erinaceidae) on continental islands of Southeast Asia: historical effects of fragmentation / M. Ruedi, L. Fumagalli // Journal of Zoological Systematics and Evolutionary Research. — 1996. — V. 34. — № 3. — P. 153-162.
782. Russell, D.E. The Paleogene of Asia: Mammals and Stratigraphy / D.E. Russell, R. J. Zhai // // Memoires du Museum National d'histoire Naturelle, Ser. C, Sciences de la Terre. — 1987. — V. 52. — P. 1-488.
783. Rzebik-Kowalska, B. Soricidae (mammalia, insectivora) from the plio-pleistocene and middle quaternary of Morocco and Algeria / B. Rzebik-Kowalska // Folia quaternaria. — 1988. — V. 57. — P. 51-90.
784. Rzebik-Kowalska, B. Fossil history of shrews in Europe / B. Rzebik-Kowalska // Evolution of shrews / J.M. Wojcik, M. Wolsan (eds.). — Bialowieza: Mammal Research Inst., Polish Academy of Sciences, 1998. — P. 23-92.
785. Rzebik-Kowalska B. Distribution of shrews (Insectivora, Mammalia) in time and space / B. Rzebik-Kowalska // Deinsea. — 2003. — V. 10. — №. 1. — P. 499-508.
786. Rzebik-Kowalska, B. New data on Soricomorpha (Lipotyphla, Mammalia) from the Pliocene and Pleistocene of Transbaikalia and Irkutsk Region (Russia) / B. Rzebik-Kowalska // Acta Zoologica Cracoviensia-Series A: Vertebrata. — 2007. — V. 50. — № 1-2. — P. 15-48.
787. Rzebik-Kowalska, B. Insectivores (Soricomorpha, Mammalia) from the Pliocene and Pleistocene of Transbaikalia and Irkutsk region (Russia) / B. Rzebik-Kowalska // Quaternary International. — 2008. — V. 179. — №. 1. — P. 96-100.
788. Saban, R. Phylogénie des insectivores / R. Saban // Bulletin du Muséum National dHistoire Naturelle. — 1954. — V. 26. — P. 419-432.
789. Salzburger, W. The performance of phylogenetic algorithms in estimating haplotype genealogies with migration / W. Salzburger, G.B. Ewing, A. Von Haeseler // Molecular ecology. — 2011. — V. 20. — № 9. — P. 1952-1963.
790. Sambrook, J. Molecular cloning: a laboratory manual / J. Sambrook, E.F. Fritsch, T. Maniatis. — NY: Cold Spring Harbor Lab. Press., 1989.
791. Sanchez-Villagra, M. A comprehensive morphological analysis of talpid moles (Mammalia) phylogenetic relationships / M. Sanchez-Villagra, I. Horovitz, M. Motokawa // Cladistics. — 2006. — V. 22. — № 1. — P. 59-88.
792. Sanderson, M.J. A nonparametric approach to estimating divergence times in the absence of rate constancy / M.J. Sanderson // J. Mol. Evol. — 1997. — V. 14. — P. 1218-1231.
793. Sanderson, M.J. r8s: inferring absolute rates of molecular evolution and divergence times in the absence of a molecular clock / M.J. Sanderson // Bioinformatics. — 2003. — V. 19. — № 2. — P. 301-302.
794. Sanger, F. Species differences in insulins / F. Sanger // Nature. — 1949. — V. 164.
— P. 529.
795. Sansalone, G. Influence of evolutionary allometry on rates of morphological evolution and disparity in strictly subterranean moles (Talpinae, Talpidae, Lipotyphla, Mammalia) / G. Sansalone, P. Colangelo, T. Kotsakis, A. Loy, R. Castiglia, A. Bannikova, E. Zemlemerova, P. Piras // Journal of Mammalian Evolution. — 2018. — V. 25. — № 1. — P. 1-14.
796. Santucci, F. Mitochondrial DNA phylogeography of European hedgehogs / F. Santucci, B.C. Emerson, G.M. Hewitt // Molecular Ecology. — 1998. — V. 7. — № 9. — P. 1163-1172.
797. Sato, J.J. Molecular phylogeny of arctoids (Mammalia: Carnivora) with emphasis on Molecular phylogeny of arctoids (Mammalia: Carnivora) with emphasis on phylogenetic and taxonomic positions of the ferret-badgers and skunks / J.J. Sato, T. Hosoda, M. Wolsan, H.Suzuki // Zoological science. — 2004. — V. 21. — № 1.
— P. 111-118.
798. Sato, J.J. Molecular phylogenetic analysis of nuclear genes suggests a Cenozoic over-water dispersal origin for the Cuban solenodon / J.J. Sato, S.D. Ohdachi, L.M. Echenique-Diaz, R. Borroto-Paez, G. Begue-Quiala, J.L. Delgado-Labanino, J. Gamez-Diez, J. Alvarez-Lemus, S.T. Nguyen, N. Yamaguchi, M. Kita // Scientific reports. — 2016. — V. 6. — P. 31173.
799. Satunin, K.A. Über neue und wenig bekannte Igel. / K.A. Satunin // Bullet. Scient. de TAcademie Imper. de St.-Petersbourg. — 1906. — V. XI. — P. 173-185.
800. Savage, D.E. Mammalian Paloefaunas of theWorld / D.E. Savage, D.E. Russell. — Boston: Addison-Wesley, Reading, MA, 1983.
801. Scally, A. Revising the human mutation rate: implications for understanding human evolution / A. Scally, R. Durbin // Nature Reviews Genetics. — 2012. — V. 13. — № 10. — P. 745-753.
802. Schettino, A. Breakup of Pangaea and plate kinematics of the central Atlantic and Atlas regions / A. Schettino, E. Turco // Geophysical Journal International. — 2009. — V. 178. — № 2. — P. 1078-1097.
803. Schneider, S. Arlequin: A Software for Population Genetics Data Analysis, Version 2.000 / S. Schneider, D. Roessli, L. Excoffier // Genetics and Biometry Laboratory. Department of Anthropology, University of Geneva, Geneva, 2000.
804. Schneider, A. Support patterns from different outgroups provide a strong phylogenetic signal / A. Schneider, G.M. Cannarozzi // Molecular biology and evolution. — 2009. — V. 26. — № 6. — P. 1259-1272.
805. Schwenk, K. Introduction. Extent, processes and evolutionary impact of interspecific hybridization in animals / K. Schwenk, N. Brede, B. Streit // Philosophical Transactions of the Royal Society B: Biological Sciences. — 2008. — V. 363. — № 1505. — P. 2805-2811.
806. Schwermann, A.H. Extraordinarily preserved talpids (Mammalia, Lipotyphla) and the evolution of fossoriality / A.H. Schwermann, R.S. Thompson // Journal of Vertebrate Paleontology. — 2015. — V. 35. — №. 4. — P. e934828.
807. Searle, J.B. Evidence for a widespread karyotypic race of hedgehog (Erinaceus europaeus) in Britain / J.B. Searle, Erskine I. // Journal of Zoology. — 1985. — V. 206.— № 2. — P. 276-278.
808. Searle, J.B. Chromosomal evolution: the case of Sorex araneus / J.B. Searle, J.M. Wojcik // Evolution of Shrews / J.Wojcik, M.Wolsan (eds.). — Bialowieza: Mammal Research Inst., Polish Academy of Sciences, 1998. — P. 219-262.
809. Searle, J.B. The Celtic fringe of Britain: insights from small mammal phylogeography / J.B. Searle, P. Kotlik, R.V. Rambau, S. Markova, J.S. Herman, A.D. McDevitt // Proceedings of the Royal Society of London B: Biological Sciences. — 2009. — V. 276. — № 1677. — P. 4287-4294.
810. Seddon, J.M. DNA footprints of European hedgehogs, Erinaceus europaeus and E. concolor: Pleistocene refugia, postglacial expansion and colonization routes / J.M.
Seddon, F. Santucci, N. Reeve, GM. Hewitt // Molecular Ecology. — 2001. — V. 10. — № 9. — P. 2187-2198.
811. Seddon, J.M. Caucasus Mountains divide postulated postglacial colonization routes in the white-breasted hedgehog, Erinaceus concolor / J.M. Seddon, F. Santucci, N. Reeve, G.M. Hewitt // Journal of Evolutionary Biology. — 2002. — V. 15. — № 3. — P. 463-467.
812. Seehausen, O. Hybridization and adaptive radiation / O. Seehausen // Trends in ecology & evolution. — 2004. — V. 19. — № 4. — P. 198-207.
813. Seiffert, E.R. The oldest and youngest records of afrosoricid placentals from the Fayum Depression of northern Egypt / E.R. Seiffert // Acta Palaeontologica Polonica. — 2010. — V. 55. — P. 599-616.
814. Seiffert, E.R. Widanelfarasia, a diminutive placental from the late Eocene of Egypt / E.R. Seiffert, E.L. Simons // Proceedings of the National Academy of Sciences USA. — 2000. — V. 97. — P. 2646-2651.
815. Seiffert, E.R. New remains of Eocene and Oligocene Afrosoricida (Afrotheria) from Egypt, with implications for theorigin(s) of afrosoricid zalambdodonty / E.R. Seiffert, E.L. Simons, T. Ryan, T.M. Bown, Y. Attia // Journal of Vertebrate Paleontology. — 2007. — V. 27. — P. 963-972.
816. Shafer, A.B.A. Phylogenetic relationships among Nearctic shrews of the genus Sorex (Insectivora, Soricidae) inferred from combined cytochrome b and inter-SINE fingerprint data using Bayesian analysis / A.B.A. Shafer, D.T. Stewart // Molecular Phylogenetics and Evolution. — 2007. — V. 44. — № 1. — P. 192-203.
817. Sharman, G.B. Chromosomes of the common shrew / G.B. Sharman // Nature. — 1956. — V. 177. — № 4516. — P. 941-942.
818. Shakryl, A.K. Landscape-forming oaks of the Tertiary floras of Colchis / A.K. Shakryl // Palaeovegetational development in Europe and regions relevant to its palaeofloristic evolution / J. Kovar-Eder (ed.). — Proceedings of the Pan-European Palaeobotanical Conference, Vienna: Museum of Natural History, 1991. — P. 228230.
819. Sheftel, B.I. Spatial distribution of nine species of shrews in the central Siberian taiga / B.I. Sheftel // Advances in the biology of shrews / J.F. Merritt, G.L. Kirkland, R.K. Rose (eds.). —Pittsburgh: Carnegie Museum of Natural History, 1994. — P. 45-55.
820. Sheftel, B.I. Why genetic similar forms fall in good morphological differentiation
species sometimes? / B.I. Sheftel, A.A. Bannikova, D.Y. Alexandrov, V.S. Lebedev
668
// Abstracts of third international conference "Advances in the biology of shrews III". — Syktyvkar, Komi Republic. — 2010. — C. 56-57.
821. Shenbrot, G.I. Spatial ecology of desert rodent communities / G.I. Shenbrot, B.R. Krasnov, K.A. Rogovin. — Berlin: Springer, 1999. — 292 p.
822. Shenbrot, G. A new recent genus and species of three-toed jerboas (Rodentia: Dipodinae) from China: A living fossil? / G. Shenbrot, A. Bannikova, P. Giraudoux, J.-P. Quere, F. Raoul, V. Lebedev // Journal of Zoological Systematics and Evolutionary Research. — 2017. — V. 55. — № 4. — P. 356-368.
823. Sher, A. Pleistocene mammals and stratigraphy of the far northeast USSR and North America / A. Sher // International Geological Review. — 1974. — V. 16. — P.1-284.
824. Shinohara, A. Molecular phylogenetic relationships of moles, shrew moles, and desmans from the new and old worlds / A. Shinohara, K.L. Campbell, H. Suzuki // Molecular Phylogenetics and Evolution. — 2003. — V. 27. — № 2. — P. 247-258.
825. Shinohara, A. Phylogenetic position of the Malaysian mole, Euroscaptor micrura (Mammalia: Eulipotyphla), inferred from three gene sequences / A. Shinohara, S.I. Kawada, M. Yasuda, L B. Liat // Mammal Study. — 2004a. — V. 29. — № 2. — P. 185-189.
826. Shinohara, A. Evolution and biogeography of talpid moles from continental East Asia and the Japanese Islands inferred from mitochondrial and nuclear gene sequences / A. Shinohara, H. Suzuki, K. Tsuchiya, Y.P. Zhang, J. Luo, X.L. Jiang, Y.-X. Wang, K.L. Campbell // Zoological science. — 2004b. — V. 21. — № 12. — P. 1177-1185.
827. Shinohara, A. Phylogenetic relationships of the short-faced mole, Scaptochirus moschatus (Mammalia: Eulipotyphla), among Eurasian fossorial moles, as inferred from mitochondrial and nuclear gene sequences / A. Shinohara, S.I. Kawada, M. Harada, K. Koyasu, S.I. Oda, H. Suzuki // Mammal study. — 2008. — V. 33. — № 2. — P. 77-82.
828. Shinohara, A. Molecular phylogeny of East and Southeast Asian fossorial moles (Lipotyphla, Talpidae) / A. Shinohara, S.I. Kawada, N.T. Son, C. Koshimoto, H. Endo, D.N. Can, H. Suzuki // Journal of Mammalogy. — 2014. — V. 95. — № 3. — P. 455-466.
829. Shinohara, A. Molecular phylogenetic relationships and intra-species diversities of
three Euroscaptor spp. (Talpidae: Lipotyphla: Mammalia) from Vietnam / Akio
Shinohara, Shin-ichiro Kawada, Nguyen Truong Son, Dang Ngoc Can, Shinsuke H.
669
Sakamoto, Chihiro Koshimoto1 // Raffles bulletin of zoology. — 2015. — V. 63.
— P.366-375.
830. Shoshani, J. Higher taxonomic relationships among extant mammals based on morphology, with selected comparisons of results from molecular data / J. Shoshani, M.C. McKenna // Molecular phylogenetics and evolution. — 1998. — V. 9. — № 3. — P. 572-584.
831. Sibuet, J.C. How was Taiwan created? / J.C. Sibuet, S.K. Hsu // Tectonophysics. — 2004. — V. 379. — № 1. — P. 159-181.
832. Sigé, B. Les mammifères insectivores des nouvelles collectiones de Sossis et sites associés (Éocène supérieur, Espagne) / B. Sigé // Geobios. — 1997. — V. 30. — №. 1. — P. 91-113.
833. Simpson, G.G. The principles of classification and a classification of mammals / G.G. Simpson // Bull. Amer. Museum Nat. History. — 1945. — V. 85. — P. 1-350.
834. Simpson, J.T. ABySS: a parallel assembler for short read sequence data / J.T. Simpson, K. Wong, S.D. Jackman, J.E. Schein, S.J.M. Jones, I. Birol // Genome research. — 2009. — V. 19. — № 6. — P. 1117-1123.
835. Sipe, T.W. Phylogeography of masked (Sorex cinereus) and smoky shrews (Sorex fumeus) in the southern Appalachians / T.W. Sipe, R.A. Browne // Journal of Mammalogy. — 2004. — V. 85. — № 5. — P. 875-885.
836. Sites Jr, J.W. Delimiting species: a Renaissance issue in systematic biology / J.W. Sites Jr, J.C. Marshall // Trends in Ecology & Evolution. — 2003. — V. 18. — № 9. — P. 462-470.
837. Smit, A.F.A. MIRs are classic, tRNA-derived SINEs that amplified before the mammalian radiation / A.F.A. Smit, A.D. Riggs // Nucleic acids research. — 1995.
— V. 23. — № 1. — P. 98-102.
838. Smith, A.T. A guide to the mammals of China / A.T. Smith, Y. Xie. — Princeton University Press, 2008. — 544 p.
839. Smith, A.B. Dating the time of origin of major clades: molecular clocks and the fossil record / A.B. Smith, K.J. Peterson // Annual Review of Earth and Planetary Sciences. — 2002. — V. 30. — № 1. — P. 65-88.
840. Snel, B. Genome trees and the nature of genome evolution / B. Snel, M.A. Huynen, B E. Dutilh // Annual Review of Microbiology. — 2005. — V. 59. — P. 191-209.
841. Song, Y. Late Neogene rock magnetic record of climatic variation from Chinese eolian sediments related to uplift of the Tibetan Plateau / Y. Song, X. Fang, M.
Torii, N. Ishikawa, J. Li, Z. An // Journal of Asian Earth Sciences. — 2007. —V. 30. — № 2. — P. 324-332.
842. Sözen, M. Karyological and some morphological peculiarities along with a new distribution locality for Talpa davidiana (Mammalia: Soricomorpha) in Turkey / M. Sözen, F. Matur, F. £olak, S. Irmak // Turkish Journal of Zoology. — 2012. — V. 36. — № 6. — P. 806-813.
843. Spitzenberger, F. Gattung Neomys Kaup, 1829 / F. Spitzenberger // Handbuch der Säugetiere Europas: Insektenfresser, Herrentiere / J. Niethammer, F. Krapp. — Wiesbaden: Aula-Verlag, 1990a. — P. 313-374.
844. Spitzenberger F. Sorex alpinus Schinz, 1837 - Alpenspitzmaus / F. Spitzenberger // Handbuch der Säugetiere Europas. Bd. 3/1 Insektenfresser, Herrentiere / J. Niethammer, F. Krapp (eds.). — Wiesbaden: Aula Verlag, 1990b. — P. 295-312.
845. Springer, M.S. Technical comment on "the placental mammal ancestor and the post-KPg radiation of placentals" / M.S. Springer, R.W. Meredith, E. Teeling, W.J. Murphy // Science. — 2013. — V. 341. — №. 6146. — P. 613-613.
846. Springer, M.S. Mammalian evolution and biomedicine: new views from phylogeny / M.S. Springer, W.J. Murphy // Biological Reviews. — 2007. — V. 82. — № 3. — P. 375-392.
847. Springer, M.S. The gene tree delusion / M.S. Springer, J. Gatesy // Molecular phylogenetics and evolution. — 2016. — V. 94. — P. 1-33.
848. Springer, M.S. Waking the undead: Implications of a soft explosive model for the timing of placental mammal diversification / M.S. Springer, C.A. Emerling, R.W. Meredith, J.E. Janecka, E. Eizirik, W.J. Murphy // Molecular phylogenetics and evolution. — 2017. — V. 106. — P. 86-102.
849. Springer, M.S. Appropriate fossil calibrations and tree constraints uphold the Mesozoic divergence of solenodons from other extant mammals / M.S. Springer, J.W. Murphy, A.L. Roca // Molecular phylogenetics and evolution. — 2018. — V. 121. — P. 158-165.
850. Stamatakis, A. RAxML version 8: a tool for phylogenetic analysis and post-analysis of large phylogenies / A. Stamatakis // Bioinformatics. — 2014. — V. 30. — №. 9. — P. 1312-1313.
851. Stanhope, M.J. Molecular evidence for multiple origins of Insectivora and for a new order of endemic African insectivore mammals / M.J. Stanhope, V.G. Waddell, O. Madsen, W. De Jong, SB. Hedges, G.C. Cleven, D. Kao, M.S.
Springer // Proceedings of the National Academy of Sciences. — 1998. — V. 95.
— № 17. — P. 9967-9972.
852. Stanley, W.T. Phylogeny, phylogeography and geographical variation in the Crocidura monax (Soricidae) species complex from the montane islands of Tanzania, with descriptions of three new species: Systematics of Crocidura monax species complex from the montane islands of Tanzania, with descriptions of three new species / W.T. Stanley, R. Hutterer, T.C. Giarla, J.A. Esselstyn // Zoological Journal of the Linnean Society. — 2015. — V. 174. — №. 1. — P. 185-215.
853. Starcova, M. Phylogeography of the Alpine shrew, Sorex alpinus (Soricidae, Mammalia) / M. Starcova, V. Vohralik, B. Krystufek, B.C. Bolfikova, P. Hulva // Folia Zoologica. — 2016. — V. 65. — № 2. — P. 107-117.
854. Steel, M. Maximum likelihood supertrees / M. Steel, A. Rodrigo // Systematic biology. — 2008. — V. 57. — № 2. — P. 243-250.
855. Steiner, C.C. The genetic basis of phenotypic convergence in beach mice: similar pigment patterns but different genes / C.C. Steiner, H. Rompler, L.M. Boettger, T. Schoneberg, H.E. Hoekstra, // Molecular Biology and Evolution. — 2009. — V. 26.
— № 1. — P. 35-45.
856. Stephens, M. A new statistical method for haplotype reconstruction from population data / M. Stephens, N.J. Smith, P. Donnelly // The American Journal of Human Genetics. — 2001. — V. 68. — № 4. — P. 978-989.
857. Stephens, M. A comparison of bayesian methods for haplotype reconstruction from population genotype data / M. Stephens, P. Donnelly // The American Journal of Human Genetics. — 2003. — V. 73. — № 5. — P. 1162-1169.
858. Steppan, S.J. Muroid rodent phylogenetics: 900-species tree reveals increasing diversification rates / S.J. Steppan, J.J. Schenk., // PLoS One. — 2017. — V. 12. — №. 8. — P. e0183070.
859. Stewart, D.T. Evolution of mtDNA D-loop sequences and their use in phylogenetic studies of shrews in the subgenus Otisorex (Sorex: Soricidae: Insectivora) / D.T. Stewart, A.J. Baker // Molecular Phylogenetics and Evolution. — 1994. — V. 3. — № 1. — P. 38-46.
860. Stewart, D.T. A phylogeny of some taxa of masked shrews (Sorex cinereus) based on mitochondrial-DNA, D-loop sequences / D.T. Stewart, A.J. Baker // Journal of Mammalogy. — 1997. — V. 78. — № 2. — P. 361-376.
861. Stewart, J.R. Refugia revisited: individualistic responses of species in space and time / J.R. Stewart, A.M. Lister, I. Barnes, L. Dalen // Proc. R. Soc. Lond. B. — 2010. — V. 277. — P. 661-671.
862. Storch, G. Insectivores (Mammalia: Erinaceidae, Soricidae, Talpidae) from the Lufeng hominoid locality, Late Miocene of China / G. Storch, S. Qiu // Geobios. — 1991. — V. 24. — № 5. — P. 601-621.
863. Storch, G. Fossil history of shrews in Asia / G. Storch, Z.H. Qiu, V.S. Zazhigin // Evolution of Shrews / J.M. Wojcik, M. Wolsan (eds.). — Bialowieza: Mammal Research Inst., Polish Academy of Sciences, 1998. — P. 93-117.
864. Strauss, D. Classical confidence intervals and Bayesian probability estimates for ends of local taxon ranges / D. Strauss, P.M. Sadler // Mathematical Geology. — 1989. — V. 21. — № 4. — P. 411-427.
865. Stuart, B.L. The Leptobrachium (Anura: Megophryidae) of the Langbian Plateau, southern Vietnam, with description of a new species / B.L. Stuart, J.J. Rowley, D.T.A. Tran, D.T.T. Le, H.D. Hoang // Zootaxa. — 2011. — V. 2804. — №. 1. — P. 25-40.
866. Suh, A. The dynamics of incomplete lineage sorting across the ancient adaptive radiation of neoavian birds / A. Suh, L. Smeds, H. Ellegren // PLoS biology. — 2015. — V. 13. — №. 8. — P. e1002224.
867. Sullivan, J. Are guinea pigs rodents? The importance of adequate models in molecular phylogenetics / J. Sullivan, D. Swofford //Journal of Mammalian Evolution. — 1997. — V. 4. — №. 2. — P. 77-86.
868. Sukumaran, J. Multispecies coalescent delimits structure, not species / J. Sukumaran, L.L. Knowles // Proceedings of the National Academy of Sciences. — 2017. — V. 114. — №. 7. — P. 1607-1612.
869. Svendsen J. I. et al. Late Quaternary ice sheet history of northern Eurasia / Svendsen, J. I., Alexanderson, H., Astakhov, V. I., Demidov, I., Dowdeswell, J. A., Funder, S., V. Gataullin, M. Henriksen, C. Hjort, M. Houmark-Nielsen, H. W Hubberten, O. Ingolfsson, M. Jakobsson, K. H Kj^r, E. Larsen, H. Lokrantz, J. P. Lunkka, A. Lysa, L. Polyak, M. Saarnisto, C. Siegert, M. J Siegert, R. F Spielhagen, H.W. Hubberten // Quaternary Science Reviews. — 2004. — V. 23. - № 11-13. — P. 1229-1271.
870. Swofford, D. L. PAUP*. Phylogenetic analysis using parsimony (*and other methods) / D. L. Swofford. — Massachusetts, Sunderland: Sinauer Associates, 2003. — v. 4.0b10.
871. Symonds, M.R.E. Phylogeny and life histories of the 'Insectívora': controversies and consequences / M.R.E. Symonds // Biological Reviews. — 2005. — V. 80. — №. 1. — P. 93-128.
872. Taberlet, P. Chromosomal versus mitochondrial DNA evolution: tracking the evolutionary history of the southwestern European populations of the Sorex araneus group (Mammalia, Insectivora) / P. Taberlet, L. Fumagalli, J. Hausser // Evolution. — 1994. — V. 48. — № 3. — P. 623-636.
873. Taberlet, P. Biodiversity at the intraspecific level: the comparative phylogeographic approach / P. Taberlet // Journal of Biotechnology. — 1998. — V. 64. — №. 1. — P. 91-100.
874. Tabuce, R. Afrotherian mammals: a review of current data / R. Tabuce, R.J. Asher, T. Lehmann // Mammalia. — 2008. — V. 72. — P. 2-14.
875. Tajima, F. The effect of change in population size on DNA polymorphism / F. Tajima // Genetics. — 1989. — V. 123. — № 3. — P. 597-601.
876. Tajima, F. Simple methods for testing the molecular evolutionary clock hypothesis / F. Tajima // Genetics. — 1993. — V. 135. — № 2. — P. 599-607.
877. Takezaki, N. Phylogenetic test of the molecular clock and linearized trees / N. Takezaki, A. Rzhetsky, M. Nei // Molecular biology and evolution. — 1995. — V. 12. — № 5. — P. 823-833.
878. Tamura, K. MEGA4: molecular evolutionary genetics analysis (MEGA) software version 4.0 / K. Tamura, J. Dudley, M. Nei, S. Kumar // Molecular biology and evolution. — 2007. — V. 24. — № 8. — P. 1596-1599.
879. Tarasov, P.E. A pollen-based biome reconstruction over the last 3.562 million years in the Far East Russian Arctic-new insights into climate-vegetation relationships at the regional scale / P.E. Tarasov, A.A. Andreev, P.M. Anderson, A.V. Lozhkin, C. Leipe, E. Haltia, N.R. Nowaczyk, V. Wennrich, J. Brigham-Grette, M. Melles // Climate of the Past. — 2013. — V. 9. — № 6. — P. 2759-2775.
880. Taylor, J.R.E. Evolution of energetic strategies in shrews / J.R.E. Taylor // Evolution of shrews / J.M. Wójcik, M. Wolsan (eds.). — Bialowieza: Mammal Research Institute, Polish Academy of Sciences, 1998. — P. 309-346.
881. Teeling, E.C. Molecular evidence regarding the origin of echolocation and flight in bats / E.C. Teeling, M. Scally, D.J. Kao, ML. Romagnoli, M.S. Springer, M.J. Stanhope // Nature. — 2000. — V. 403. — № 6766. — P. 188-192.
882. Thaw, S. Phylogeography / S. Thaw, T. White, A. Bannikova, J. Searle // Shrews, Chromosomes and Speciation (Cambridge Studies in Morphology and Molecules:
New Paradigms in Evolutionary Bio) / J. Searle, P. Polly, J. Zima (eds.). — Cambridge: Cambridge University Press, 2019. — P. 112-133.
883. Thomas, O. On a collection of small mammals from the Tsin-ling Mountains, Central China, presented by Mr. G. Fenwick Owen to the National Museum / O. Thomas // Journal of Natural History. — 1912. — V. 10. — №. 58. — P. 395-403.
884. Thomas, O. The Delacour exploration of French Indo-China—Mammals / O. Thomas // Proceedings of the Zoological Society of London. — Oxford, UK: Blackwell Publishing Ltd, 1927. — V. 97. — №. 1. — P. 41-58.
885. Thomas, O. On a new genus and species of shrew, and some new Muridae from the East-Indian Archipelago / O. Thomas // Annals and Magazine of Natural History.
— 1921. — V. 7. — №. 39. — P. 243-249.
886. Thorne, J. L. Estimating the rate of evolution of the rate of molecular evolution / J.L. Thorne, H. Kishino, I.S. Painter // Molecular biology and evolution. — 1998.
— V. 15. — № 12. — P. 1647-1657.
887. Todorovic, M. Characteristics of the karyotype of the populations of the genus Talpa from Macedonia and Montenegro / M. Todorovic, B. Soldatovic, Z. Dunderski // Arhiv Bioloskih Nauka. — 1972. — V. 24. — P. 131-139
888. Townsend, J.P. Profiling phylogenetic informativeness / J.P. Townsend // Systematic Biology. — 2007. — V. 56. — № 2. — P. 222-231.
889. Tryfonopoulos, G.A. New data on the distribution and genetic structure of Greek moles of the genus Talpa (Mammalia, Talpidae) / G.A. Tryfonopoulos, E.G. Thanou, S.E. Fraguedakis-Tsolis, B.P. Chondropoulos // Journal of Zoological Systematics and Evolutionary Research. — 2010. — V. 48. — № 2. — P. 188-193.
890. Tseng, S.P. Influence of gene flow on divergence dating-implications for the speciation history of Takydromus grass lizards / S.-P. Tseng, S.-H. Li, C.-H. Hsieh, H.-Y. Wang, S.-M. Lin // Molecular ecology. — 2014. — V. 23. — № 19. — P. 4770-4784.
891. Tsuchiya, K. Molecular phylogeny of East Asian moles inferred from the sequence variation of the mitochondrial cytochrome b gene / K. Tsuchiya, H. Suzuki, A. Shinohara, M. Harada, S. Wakana, M. Sakaizumi, S.-H. Han, L.-K. Lin, A. Kryukov // Genes & Genetic Systems. — 2000. — V. 75. — № 1. — P. 17-24.
892. Twyford, A.D. Next-generation hybridization and introgression / A.D. Twyford, R.A. Ennos // Heredity. — 2012. — V. 108. — № 3. — P. 179-189.
893. Van Cleef-Roders, J. Dental morphology of Talpa europaea and Talpa occidentalis (Mammalia: Insectivora) with a discussion of fossil Talpa in the Pleistocene of
Europe / J.T. van Cleef-Roders, L.W. van Den Hoek Ostende // Zoologische Mededelingen. — 2001. — V. 75. — P. 51-68.
894. Van Dam, J.A. The systematic position of Anourosoricini (Soricidae, Mammalia): paleontological and molecular evidence / J.A. van Dam // Journal of Vertebrate Paleontology. — 2010. — V. 30. — № 4. — P. 1221-1228.
895. Van de Lagemaat, L.N. Genomic deletions and precise removal of transposable elements mediated by short identical DNA segments in primates / L.N. van de Lagemaat, L. Gagnier, P. Medstrand, D.L. Mager // Genome research. — 2005. — V. 15. — № 9. — P. 1243-1249.
896. Van de Peer, Y. TREECON: a software package for the construction and drawing of evolutionary trees / Y. van de Peer, R. de Wachter // Computer Applications in the Biosciences. — 1993. — V. 9. — № 2. — P. 177-182.
897. Van den Hoek Ostende, L.W. A revised generic classification of the Galericini (Insectivora, Mammalia) with some remarks on their palaeobiogeography and phylogeny. [Une revision des genres des Galericini (Insectivora, Mammalia) avec quelques observations sur leur paleobiogeographie et phylogenie] / L.W. van den Hoek Ostende // Geobios. — 2001a. — V. 34. — №. 6. — P. 681-695.
898. Van den Hoek Ostende, L.W. Insectivore faunas from the Lower Miocene of Anatolia—Part 5: Talpidae / L.W. Van den Hoek Ostende // Scripta Geologica. — 2001b. — V. 122. — P. 1-45.
899. Van den Hoek Ostende, L.W. Insectivore faunas from the Lower Miocene of Anatolia—Part 8: stratigraphy, palaeoecology, palaeobiogeography / L.W. van den Hoek Ostende // Scripta Geologica. — 2001c. — V. 122. — P. 101-122.
900. Van den Hoek Ostende, L.W. Spain / L.W. Hoek Ostende Van den, M. Furio // The fossil record of the Eurasian Neogene insectivores (Erinaceomorpha, Soricomorpha, Mammalia), Part. I. / ed. L.W. Hoek Ostende Van den, C.S. Doukas, J.W.F. Reumer. — Scripta Geologica. — 2005. — Special Issue 5. — P. 149-284.
901. Van den Hoek Ostende, L.W. Erinaceidae and Talpidae (Erinaceomorpha, Soricomorpha, Mammalia) from the Lower Miocene of Merkur-Nord (Czech Republic, MN 3) / L.W. van den Hoek Ostende, O. Fejfar // Beiträge zur Paläontologie. — 2006. — V. 30. — P. 175-203.
902. Van Peenen, P.F.D. A collection of mammals from Con Son Island, Vietnam / P.F.D. Van Peenen, M.L. Cunningham, J.F. Duncan // Journal of Mammalogy. — 1970. — V. 51. — №. 2. — P. 419-424.
903. Van Valen, L. New Paleocene insectivores and insectivore classification / L. van Valen // Bulletin of the American Museum of Natural History. — 1967. — V. 135. — P. 217-284.
904. Van Zyll de Jong, C.G. Handbook of Canadian mammals. Marsupials and insectivores / C.G. van Zyll de Jong. — Ottawa: National Museum of Natural Sciences, 1983. — V. 1. — 210 p.
905. Vaughan, T.A. Mammalogy / T.A. Vaughan, J.M. Ryan, N.J. Czaplewski. — Orlando (Florida): Saunders College Publishers, 2000. — 4th edition.
906. Vega, R. Northern glacial refugia for the pygmy shrew Sorex minutus in Europe revealed by phylogeographic analyses and species distribution modelling / R. Vega, C. Fl0jgaard, A. Lira-Noriega, Y. Nakazawa, J.-C. Svenning, J.B. Searle // Ecography. — 2010. — V. 33. — № 2. — P. 260-271.
907. Velichko, A.A. Late Pleistocene glaciation of the arctic shelf, and the reconstruction of Eurasian ice sheets / A.A. Velichko, L.L. Isayeva, V.M. Makeyev, G.G. Matishov, M.A. Faustova // Late Quaternary Environments of the Soviet Union / A.A. Velichko, H.E. Wright, C.W. Barnosky (eds.). — Minneapolis: University of Minnesota Press, 1984. — P. 35-41.
908. Velichko, A.A. Climate and vegetation dynamics in the tundra and forest zone during the Late Glacial and Holocene / A.A. Velichko, A.A. Andreev, V.A. Klimanov // Quaternary International. —1997. — V. 41. — P. 71-96.
909. Vogel, P. The biology of reproduction and post-natal development of Crocidura suaveolens Pallas, 1811 under laboratory conditions / P. Vogel // Acta Universitais Carolinae-Biolofica. — 1972. — V. 70. — P. 207-292.
910. Vogel, P. Metabolic levels and biological strategies of shrews / P. Vogel // Comparative Physiology: Primitive Mammals / K. Schmidt-Nielsen, L. Bolis, C. R. Taylor (eds.). — Cambridge: Cambridge University Press, 1980. — P. 170-180.
911. Vogel, P. Der Karyotyp der Kretaspitzmaus, Crocidura zimmermanni Wettstein, 1953 (Mammalia, Insectivora) / P. Vogel // Bonn. zool. 1986. —. Beitr. 37. — P. 35-38.
912. Vogel, P. Taxonomical and biogeographical problems in Mediterranean shrews of the genus Crocidura (Mammalia, Insectivora) with reference to a new karyotype from Sicily (Italy) / P. Vogel // Bulletin de la Société Vaudoise des Sciences Naturelles. — 1988. — V. 79. — № 1. — P. 39-48.
913. Vogel, P. A contribution to the taxonomy and ecology of shrews (Crocidura zimmermanni and C. suaveolens) from Crete and Turkey / P. Vogel, T. Maddalena, F. Catzeflis // Acta Theriologica. — 1986. — V. 31. — № 39. — P. 537-545.
914. Vogel, P. Cytotaxonomy of shrews of the genus Crocidura from Mediterranean islands / P. Vogel, T. Maddalena, P.J. Schembri // Rev. Ecol. (Vie Milieu). — 1990.
— V. 40. — P. 124-129.
915. Vogel, P. Taxonomic status and origin of the shrews (Soricidae) from the Canary Islands inferred from a mtDNA comparison with the European Crocidura species / P. Vogel, J.F. Cosson, L.F.L. Jurado // Molecular Phylogenetics and Evolution. — 2003. — V. 27. — № 2. — P. 271-282.
916. Volobouev, V.T. Chromosomal evolution and phylogenetic relationships of the Sorex araneus-arcticus species group / V.T. Volobouev, B. Dutrillaux // Memoires de la Société vaudoise des sciences naturelles. — 1991. — V. 19. — P. 131-139.
917. Waddell, P.J. Assessing the Cretaceous superordinal divergence times within birds and placental mammals by using whole mitochondrial protein sequences and an extended statistical framework / P.J. Waddell, Y. Cao, M. Hasegawa, D.P. Mindell // Systematic Biology. — 1999a. — V. 48. — № 1. — P. 119-137.
918. Waddell, P.J. Using novel phylogenetic methods to evaluate mammalian mtDNA, including amino acid-invariant sites-LogDet plus site stripping, to detect internal conflicts in the data, with special reference to the positions of hedgehog, armadillo, and elephant / P.J. Waddell, Y. Cao, J. Hauf, M. Hasegawa // Systematic Biology.
— 1999b. — V. 48. — № 1. — P. 31-53.
919. Waddell, P.J. Towards resolving the interordinal relationships of placental mammals / P.J. Waddell, N. Okada, M. Hasegawa // Systematic Biology. — 1999c.
— V. 48. — № 1. — P. 1-5.
920. Wagner, J.A. Die saugethiere in abbildungen nach der natur / J.A. Wagner. — Weiger, Leipzig, 1855.
921. Wan, T. Climate niche conservatism and complex topography illuminate the cryptic diversification of Asian shrew-like moles / T. Wan, K. He, W. Jin, S-Y Liu, Z-Z. Chen, B. Zhang, R. W. Murphy, X-L. Jiang // Journal of Biogeography. — 2018.
— 00:1-15. https://doi.org/10.1111/jbi.13401.
922. Wan, T. Multilocus phylogeny and cryptic diversity in Asian shrew-like moles (Uropsilus, Talpidae): Implications for taxonomy and conservation / Wan, T., He, K., Jiang, X. L. // BMC Evolutionary Biology. — 2013. — 13:232. https://doi.org/10.1186/1471-2148-13-232
923. Wang, Y.X. A complete checklist of mammal species and subspecies in China: a taxonomic and geographic reference / Y.X. Wang. — Beijing: China Forestly Publishing House, 2003. — 394 p.
924. Wang, X. Amphicticeps and Amphicynodon (Arctoidea, Carnivora) from Hsanda Gol Formation, Central Mongolia and phylogeny of basal arctoids with comments on zoogeography / X. Wang, M.C. McKenna, D. Dashzeveg // American Museum Novitates. — 2005. —.V. 3483. — P. 1-57.
925. Waters, P.D. Evolutionary history of LINE-1 in the major clades of placental mammals / P.D. Waters, G. Dobigny, P.J. Waddell, T.J. Robinson // — PloS one.
— 2007. — 2(1): e158. https://doi.org/10.1371/journal.pone.0000158
926. Weir, J.T. Divergent timing and patterns of species accumulation in lowland and highland neotropical birds / J.T. Weir // Evolution. — 2006. — V. 60. — № 4. — P. 842-855.
927. Welch, J.J. Molecular dating when rates vary / J.J. Welch, L. Bromham // TRENDS in Ecology and Evolution. — 2006. — V. 20. — № 6. — P. 320-327.
928. Wetterich, S. Palaeoenvironmental dynamics inferred from late Quaternary permafrost deposits on Kurungnakh Island, Lena Delta, northeast Siberia, Russia / S.Wetterich, S. Kuzmina, A.A. Andreev, F. Kienast, H. Meyer, L. Schirrmeister, T. Kuznetsova, M. Sierralta // Quaternary Science Reviews. — 2008. — V. 27. — № 15-16. — P. 1523-1540.
929. Whidden, H.P. Comparative myology of moles and the phylogeny of the Talpidae (Mammalia, Lipotyphla) / H.P. Whidden // American Museum Novitates. — 2000.
— V. 3294. — P. 1-53.
930. Whidden, H.P. The origin of the Greater Antillean insectivorans / H.P. Whidden, R.J. Asher // Biogeography of the West Indies: patterns and perspectives / C.A. Woods, F.E. Sergile (eds.). — Florida: CRC Press, 2001. — P. 237-252.
931. White, T.A. The colonization of Scottish islands by the common shrew, Sorex araneus (Eulipotyphla: Soricidae) / T.A. White, J.B. Searle // Biological Journal of the Linnean Society. — 2008. — V. 94. — № 4. — P. 797-808.
932. Wolsan, M. A list of living species of shrews / M. Wolsan, R. Hutterer // Evolution of Shrews / J.M. Wojcik, M. Wolsan (eds.). — Bialowieza: Mammal Research Inst., Polish Academy of Sciences, 1998. — P. 423-448.
933. Wojcik, J.M. Evolution of the common shrew Sorex araneus / J.M. Wojcik, M. Ratkiewicz, J.B. Searle // Acta Theriologica. — 2002. — V. 47. — № 1. — P. 139167.
934. Wojcik, J.M. The list of the chromosome races of the common shrew Sorex araneus / J.M. Wojcik, P.M. Borodin, S. Fedyk, J. Fredga, J. Hausser, A. Mishta, V.N. Orlov, J.B. Searle, V. Volobouev, J. Zima // Mammalia. — 2003. — V. 68. — № 2. — P. 169-178.
935. Woodruff, D.S. Neogene marine transgressions, palaeogeography and biogeographic transitions on the Thai-Malay Peninsula / D.S. Woodruff // Journal of Biogeography. — 2003. — V. 30. — № 4 — P. 551-567
936. Wu, C.I. Evidence for higher rates of nucleotide substitution in rodents than in man / C.I. Wu, W.H. Li // Proceedings of the National Academy of Sciences. — 1985.
— V. 82. — № 6. — P. 1741-1745.
937. Wu, C. Molecular phylogenetics and biogeography of Lepus in Eastern Asia based on mitochondrial DNA sequences / C. Wu, J. Wu, T.D. Bunch, Q. Li, Y. Wang, Y.P. Zhang // Molecular Phylogenetics and Evolution. — 2005. — V. 37. — №. 1.
— P. 45-61.
938. Yeh, F.C. POPGENE 32-version 1.31. Population genetics software [Электронный ресурс] / F.C. Yeh, R.C. Yang, T. Boyle. — 1999. — http://www.ualberta.ca/wfyeh/fyeh/.
939. Yang, D.Y. Technical note: improved DNA extraction from ancient bones using silica-based spin columns / D.Y. Yang, B. Eng, J.S. Waye, J.C. Dudar, S.R. Saunders // American journal of physical anthropology. — 1998. — V. 105. — № 4. — P. 539543.
940. Yang, Z. Among-site rate variation and its impact on phylogenetic analyses / Z. Yang // Trends Ecol. Evol. — 1996. — V. 11. — № 9. — P. 367-372.
941. Yang, Z. PAML 4: a program package for phylogenetic analysis by maximum likelihood / Z. Yang // Molecular Biology and Evolution. — 2007. — V. 24. — P. 1586-1591.
942. Yang, Z. Bayesian species delimitation using multilocus sequence data / Z. Yang, B. Rannala //Proceedings of the National Academy of Sciences. — 2010. — V. 107. — №. 20. — P. 9264-9269.
943. Yang, Z. Bayesian estimation of species divergence times under a molecular clock using multiple fossil calibrations with soft bounds / Z. Yang, B. Rannala // Molecular biology and evolution. — 2006. — V. 23. — № 1. — P. 212-226.
944. Yannic G., Basset P., Hausser J. A new perspective on the evolutionary history of western European Sorex araneus group revealed by paternal and maternal
molecular markers / G. Yannic, P. Basset, J. Hausser // Molecular phylogenetics and evolution. — 2008a. — V. 47. — № 1. — P. 237-250.
945. Yannic, G. A hybrid zone with coincident clines for autosomal and sex-specific markers in the Sorex araneus group / G. Yannic, P. Basset, J. Hausser // Journal of evolutionary biology. — 2008b. — V. 21. — № 3. — P. 658-667.
946. Yannic, G. Chromosomal rearrangements and gene flow over time in an interspecific hybrid zone of the Sorex araneus group / G. Yannic, P. Basset, J. Hausser // Heredity. — 2009. — V. 102. — №. 6. — P. 616.
947. Yannic, G. Additional data for nuclear DNA give new insights into the phylogenetic position of Sorex granarius within the Sorex araneus group / G. Yannic, S. Dubey, J. Hausser, P. Basset // Molecular phylogenetics and evolution.
— 2010. — V. 57. — № 3. — P. 1062-1071.
948. Yannic, G. Systematics of snow voles (Chionomys, Arvicolinae) revisited / G. Yannic, R. Burri, V.G. Malikov, P. Vogel // Molecular Phylogenetics and Evolution. — 2012. — V. 62. — P. 806-815.
949. Yates, T.L. Insectivores, elephant shrews, tree shrews, and dermopterans / T.L. Yates // Orders and families of recent mammals of the world / S. Anderson, J.K. Jones (eds.). — New York: John Wiley and Sons, 1984. — P. 117-144.
950. Yates, T.L. Speciation and evolution in the family Talpidae (Mammalia: Insectivora) / T.L. Yates, D.W. Moore // Evolution of subterranean mammals at the organismal and molecular levels / E. Nevo, O.A. Reig (eds.). — New York: Alan R. Liss, 1990. — P. 1-22.
951. Ye, J. Cross-species chromosome painting unveils cytogenetic signatures for the Eulipotyphla and evidence for the polyphyly of Insectivora / J. Ye, L. Biltueva, L. Huang, W. Nie, J. Wang, M. Jing, W. Su, N. Vorobieva, X. Jiang, A. Graphodatsky, F. Yang // Chromosome Research. — 2006. — V. 14. — № 2. — P. 151-159.
952. Yokohata, Y. A brief review of the biology on moles in Japan / Y. Yokohata // Mammal Study. — 2005. — V. 30. — № sp1. — P. 25-30.
953. Young, N.D. GapCoder automates the use of indel characters in phylogenetic analysis / N.D. Young, J. Healy // BMC bioinformatics. — 2003. — V. 4. — № 1.
— P. 6.
954. Yoshikawa, S. Land bridge formation and proboscidean immigration into the Japanese islands during the Quaternary / S. Yoshikawa, Y. Kawamura, H. Taruno //Journal of Geosciences, Osaka City University. — 2007. — V. 50. — P. 1-6.
955. Yoshiyuki, M. Notes on Thai mammals 1. Talpidae (Insectivora) / M. Yoshiyuki // Bulletin of the National Science Museum (Tokyo).(A). — 1988. — V. 14. — P. 215-222.
956. Yokoyama, R. Convergent evolution of the red-and green-like visual pigment genes in fish, Astyanaxfasciatus, and human / R. Yokoyama, S. Yokoyama // Proceedings of the National Academy of Sciences. — 1990. — V. 87. — № 23. — P. 93159318.
957. Yuan, S.L. A mitochondrial phylogeny and biogeographical scenario for Asiatic water shrews of the genus Chimarrogale: implications for taxonomy and low-latitude migration routes / S.L. Yuan, X.L. Jiang, Z.J. Li, K. He, M. Harada, T. Oshida, L.K. Lin // PloS one. — 2013. — V. 8. — № 10. — P. e77156.
958. Zachos, J. Trends, rhythms, and aberrations in global climate 65 Ma to present / J. Zachos, M. Pagani, L. Sloan, E. Thomas, K. Billups // Science. — 2001. — V. 292.
— № 5517. — P. 686-693.
959. Zachos, J.C. An early Cenozoic perspective on greenhouse warming and carbon-cycle dynamics / J.C. Zachos, G.R. Dickens, R.E. Zeebe // Nature. — 2008. — V. 451. — №. 7176. — P. 279.
960. Zaitsev, M.V. Late Anthropogene Insectivora from the South Urals with a special reference to diagnostics of red-toothed shrews of the genus Sorex / M.V. Zaitsev // Quaternary Paleozoology in the Northern Hemisphere / J.J. Saunders, B.W. Styles, G.F. Baryshnikov (eds.). — Illinois State Museum Scientific Papers, Springfield, 1998. — P. 145-158.
961. Zaitsev, M.V. Pleistocene Soricidae (Lipotyphla, Insectivora, Mammalia) from Treugolnaya Cave, Northern Caucasus, Russia / M.V. Zaitsev, G.F. Baryshnikov // Acta zoologica cracoviensia. — 2002. — V. 45. — № 2. — P. 283-305.
962. Zaitsev, M.V. Taxonomy of Middle and Late Pleistocen shrews from the Northern Caucasus / M.V. Zaitsev, V. Osipova // Advances in the Biology of Shrews II. Special publication of International Society of Shrew Biologists / J.F. Merritt, S. Churchfield, R. Hutterer, B. Sheftel (eds.). — 2005. — P. 49-62.
963. Zazhigin, V.S. A new middle Miocene crocidosoricine shrew from the Mongolian Shargain Gobi Desert / V.S. Zazhigin, L.L. Voyta // Acta Palaeontologica Polonica.
— 2018. — V. 63. — № 1. — P. 171-187.
964. Zemlemerova, E.D. Secrets of the underground Vietnam: an underestimated species diversity of Asian moles (Lipotyphla: Talpidae: Euroscaptor) / E.D. Zemlemerova,
A.A. Bannikova, V.S. Lebedev, V.V. Rozhnov, A.V. Abramov // Proceedings of the Zoological Institute RAS. — 2016. — V. 320. — № 2. — P. 193-220.
965. Zemlemerova, E. Genetic and morphologic diversity of the moles (Talpomorpha, Talpidae, Mogera) from the continental Far East / E.D. Zemlemerova, A.V. Abramov, A.P. Kryukov, V.S. Lebedev, Mi-Sook Min, Seo-Jin Lee, A.A. Bannikova // Journal of Zoological Systematics and Evolutionary Research. — 2019. — V. 57. — P. 662-678.
966. Zhang, J. Parallel functional changes in the digestive RNases of ruminants and colobines by divergent amino acid substitutions / J. Zhang // Molecular biology and evolution. — 2003. — V. 20. — № 8. — P. 1310-1317.
967. Zhang, P. Higher-level salamander relationships and divergence dates inferred from complete mitochondrial genomes / P. Zhang, D.B. Wake // Molecular Phylogenetics and Evolution. — 2009. — V. 53. — № 2. — P. 492-508.
968. Zhang, C. Evaluation of a Bayesian coalescent method of species delimitation / C. Zhang, D.-X. Zhang, T. Zhu, Z. Yang // Systematic biology. — 2011. — V. 60. — № 6. — P. 747-761.
969. Zhao, W. High-latitude vegetation and climate changes during the Mid-Pleistocene Transition inferred from a palynological record from Lake El'gygytgyn, NE Russian Arctic / W. Zhao, P.E. Tarasov, A.V. Lozhkin, P.M. Anderson, A.A. Andreev, J.A. Korzun, M. Melles, E. Y. Nedorubova, V. Wennrich // Boreas. — 2018. — V. 47. — № 1. — P. 137-149.
970. Zhu, L. Sequencing and analysis of the complete mitochondrial genome of the Ussuri shrew (Sorex mirabilis) from China / L. Zhu, T. Xin-Min, J. Zhi-Min, D. Ming, Z. Jun-Sheng, D. Jian-Yu // Mitochondrial DNA Part B. — 2017. — V. 2. — № 2. — P. 645-647.
971. Ziegler, R. Odontologische und osteologische Untersuchungen ah Galerix exilis (Blainville) (Mammalia, Erinaceidae) aus den mioz~inen Ablagerugen vom Steinberg und Goldberg und Nordlinger Ries Süddeutschlands / R. Ziegler. Unpublished doctoral thesis. — University of Mtmich, 1983. — P. 1-224.
972. Ziegler, R. Heterosoricidae und Soricidae (Insecivora, Mammalia) aus dem Oberoligozän und Untermiozän Süddeutschlands / R. Ziegler // Stuttgarter Beiträge zur Naturkunde. — 1989. — Serie B. — V. 154 — P. 1-73
973. Ziegler, R. Didelphidae, Erinaeeidae, Metacodontidae und Dimylidae (Mammalia) aus dem Oberoligozan und Untermiozfin Süddeutschlands / R. Ziegler // Stuttgarter
Beiträge zur Naturkunde: Reihe B (Geologie und: Paläontologie). — 1990. — V. 158. — P. 1-99.
974. Ziegler, R. Marsupialia und Insectivora (Mammalia) aus den oberoligoznen Spaltenfullungen 8 und Herrlingen 9 bei Ulm (Baden-Wurttenberg) / R. Ziegler // Senckenbergiana lethaea. — 1998. — V. 77. — №. 1-2. — P. 101-143.
975. Ziegler, R. Moles (Talpidae) from the Middle Miocene of South Germany / R. Ziegler // Acta Palaeontologica Polonica. — 2003. — V. 48. — № 4. — P. 617648.
976. Ziegler, R. Miocene Insectivores from Austria and Germany—an overview / R. Ziegler // Beiträge zur Paläontologie. — 2006. — V. 30. — P. 481-494.
977. Ziegler, R. Moles (Talpidae, Mammalia) from Early Oligocene karstic fissure fillings in South Germany / R. Ziegler // Geobios. — 2012. — V. 45. — P. 501513.
978. Ziegler, R. Oligozäne Säugetierfaunen aus den Spaltenfüllungen von Lautern, Herrlingen und Ehrenstein bei Ulmm (Baden-Württemberg) / R. Ziegler, E.P.J. Heizmann, E.P.J. Heizmann // Stuttgarter Beiträge zur Naturkunde: Serie B/Geologie und: Paläontologie. - 1991. — V. 171. — P. 1-26.
979. Ziegler, R. Germany / R. Ziegler, T. Dahlmann, J.W.F. Reumer, G. Storch // The Fossil Record of the Eurasian Neogene Insectivores (Erinaceomorpha, Soricomorpha, Mammalia), Part I. Scripta Geologica Special Issue / L.W. van den Hoek Ostende, C.S. Doukas, J.W.F. Reumer (eds.). — 2005. — V. 5. — P. 61-98.
980. Ziegler, R. Oligocene-Miocene Vertebrates from the Valley of Lakes (Central Mongolia): Morphology, phylogenetic and stratigraphic implications / R. Ziegler, T. Dahlmann, G. Storch // Ann. Naturhist. Mus. Wien. — 2007. — V. 108A. — P. 53-64.
981. Zima, J. Karyotypic and biochemical status of certain marginal populations of Sorex araneus / J. Zima, M. Macholän, M.G. Filippucci, A. Reitter, M. Andreas, M. Lipa, B. Krystufek // Folia Zoologica. — 1994. — V. 43. — Suppl. 1. — P. 43-51.
982. Zima, J. Chromosomal evolution in shrews / J. Zima, L. Lukäcovä, M. Macholän // Evolution of Shrews / J.M. Wojcik, M. Wolsan (eds.). — Bialowieza: Mammal Research Inst., Polish Academy of Sciences, 1998. — P. 175-218.
983. Zuckerkandl, E. Molecular disease, evolution and genic heterogeneity / E. Zuckerkandl, L. Pauling // Horizons in biochemistry / M. Kasha, B. Pullman (eds.). — New York: Academic Press, 1962. — P. 189-225.
Благодарности
Работа выполнялась на кафедре зоологии позвоночных МГУ им. М.В. Ломоносова и в лаборатории Эволюции эукариотических геномов Института Молекулярной Биологии РАН им. М.В. Энгельгардта. Считаю своим приятным долгом выразить глубокую благодарность руководителям этих подразделений, Л.П. Корзуну и Д.А. Крамерову, а также В.В. Гречко, за постоянное внимание к моей работе и поддержку. Мой главный соавтор, самый жесткий критик и научный консультант, В.С. Лебедев, помогал мне на всех этапах исследования и в реализации всех моих проектов; без его участия эта работа не могла бы быть выполнена. Хочу отдельно поблагодарить И.В. Артюшина, который подвиг меня на привлечение в работу геномных данных и выполнил всю работу по сборке транскриптома. Выполнение работы было бы невозможно также и без участия А.В. Абрамова и Л.А. Лавренченко, собравших и передавших мне для анализа пробы насекомоядных из Вьетнама и Эфиопии. Я благодарна А.В. Сурову и руководству Совместной Российско-Монгольской экспедиции за возможность сбора материала в Монголии. Огромную помощь в сборе материала мне оказали Б.И. Шефтель, Н.Е. Докучаев, А.А. Лисовский, В.М. Коршунов, В.Ю. Олейниченко, Н.Ш. Булатова, А. Калинин, М. Касаткин, Е. Крысанов, Ю.М. Ковальская, А. Щинов, а также зарубежные коллеги Борис Кристуфек (Boris Krystufek), Паоло Коланжело (P. Colangelo), Жозе Кастрезана (Joze Castrezana), Франсуа Кацефлис (F. Catzeflis), Франческа Сантуцци (F. Santucci), Антонио Санчес (A. Sánchez), Кевин Кэмпбэлл (K.L. Campbell), Ян Зима (J. Zima), Петер Фогель (P. Vogel), Мустафа Созен (M. Sözen), за что я выражаю им искреннюю признательность. В сборе и генетической обработке материала принимали участие сотрудники, студенты и аспиранты кафедры зоологии позвоночных Биологического факультета МГУ: Е.Д. Землемерова, Д.М. Чернецкая, Е.И. Золотарева, Е.В. Юдина, А.А. Распопова, В.О. Бурская, С.А. Косушкин; техническую помощь в подготовке диссертации оказали Е.Д. Землемерова и А.А. Лисенкова, и я искренне признательна им за творческое сотрудничество. Благодарю моих друзей, оказывающих мне моральную поддержку и моих родных, обеспечивших мне условия для подготовки диссертации.
В диссертацию вошли результаты исследований, выполненных в рамках проектов Российского фонда фундаментальных исследований (гранты 00-04-49301а, 05-04-49240a, 08-04-00029а, 11-04-00020a, 14-04-00034а, 17-04-00065а, 15-29-02771_офи_м, 17-54-53085_ГФЕН_а,) и Российского научного фонда (14-50-00029).
Публикации по теме диссертации Статьи в журналах из перечня WоS/Scopus/RSCI
1. Банникова, А.А. К вопросу о таксономическом взаимоотношении малой и длиннохвостой белозубок Crocidura suaveolens и C. gueldenstaedtii (Insectivora, Soricidae) / А.А. Банникова, В.Ю. Олейниченко, А.А. Ломов, В.А. Долгов // Зоологический журнал. — 2001. — Т. 80. — № 3. — С. 1-10.
2. Олейниченко, В.Ю. Поведение и некоторые особенности использования пространства кавказской бурозубки (Sorex satunini) / В.Ю. Олейниченко, В.А. Долгов, А.А. Банникова, А.В. Купцов // Зоологический журнал. — 2002. — Т. 81. — № 6. — C. 734-744.
3. Банникова, А.А. Опыт использования интер-SINF-ni ЦР в изучении филогенеза млекопитающих / А.А. Банникова, В.А. Матвеев, Д.А. Крамеров // Генетика. — 2002. — Т. 38. — № 6. — С. 853-864.
4. Банникова, А.А. Полиморфизм ДНК ежей рода Erinaceus и политипичность таксона E. concolor (Insectivora, Erinaceidae) / А.А. Банникова, Д.А. Крамеров, В.Н. Василенко, Р.И. Дзуев, В.А. Долгов // Зоологический журнал. — 2003. — Т. 82. — № 1. — С. 1-11.
5. Bannikova, A.A. DNA Polymorphism of Sorex araneus and its relationships with associated species as derived from Inter-SINE-PCR / A.A. Bannikova, N.S. Bulatova, E.Y. Krysanov, D A. Kramerov // Mammalia. — 2003. — V. 38. — № 2. — P. 263-274.
6. Банникова, А.А. Молекулярная филогенетика и современная систематика млекопитающих / А.А. Банникова // Журнал общей биологии. — 2004. — Т. 65. — № 4. — С. 278-305.
7. Bannikova, A.A. Phylogenetic relationships between Afrotropical and Palaearctic Crocidura species inferred from Inter-SINE-PCR / A.A. Bannikova, L.A. Lavrenchenko, D.A. Kramerov // Biochemical Systematics and Ecology. — 2005. — V. 33. — № 1. — P. 45-59.
8. Bannikova, A.A. Phylogeny and systematics of the Crocidura suaveolens species group: corroboration and controversy between nuclear and mitochondrial DNA markers / АА. Bannikova, V.S. Lebedev, D A. Kramerov, M.V. Zaitsev // Mammalia. — 2006. — V. 70. — № 2. — P. 106-119.
9. Банникова, А.А. Молекулярная изменчивость обыкновенной бурозубки Sorex araneus L. Европейской России и Сибири по данным о полиморфизме длин участков ДНК, фланкируемых короткими диспергированными повторами (Inter-SINE-PCR), и взаимоотношения хромосомных рас "Москва" и "Селигер"/ А.А. Банникова, Н.Ш. Булатова, Д.А. Крамеров // Генетика. — 2006. — Т. 42. — № 6. — С. 1-11.
10. Банникова, А.А. Crocidura shantungensis - новый вид в фауне Монголии и Бурятии / А.А. Банникова, Б.И. Шефтель, В.С. Лебедев, Д.Ю. Александров, М. Мюлленберг // Доклады АН. — 2009. — Т. 424. — № 6. — С. 836-839.
11. Лавренченко, Л.А. Эндемичные землеройки-белозубки (Crocidura) Эфиопии: недавняя адаптивная радиация древней группы / Л.А. Лавренченко, А.А. Банникова, В.С. Лебедев // Доклады АН. — 2009. — Т. 42. — № 5. — С. 705-708.
12. Богданов, А.С. Первое генетическое свидетельство гибридизации обыкновенного и южного ежей (Erinaceus europaeus и E. roumanicus) в Подмосковье / А.С. Богданов, А.А. Банникова, Ю.М. Пирусский, Н.А. Формозов // Известия Академии Наук. Серия Биологическая. — 2009. — № 6. — С. 760-765.
13. Colangelo, P. Molecular systematics and evolutionary biogeography of the genus Talpa (Soricomorpha: Talpidae) / P. Colangelo, A.A. Bannikova, B. Krystufek, V. Lebedev, F. Annesi, A. Loy, E. Capanna // Molecular Phylogenetics and Evolution. — 2010. — V. 55. — № 2. — P. 372-380.
14. Банникова, А. А. Молекулярно-генетическая неоднородность кавказской землеройки-бурозубки Sorex satunini (Mammalia, Lipotyphla, Soricidae) по маркерам мтДНК как вероятное последствие древней гибридизации / А.А. Банникова, В.С. Лебедев // Молекулярная биология. — 2010. — Т. 44. — № 4. — С. 658-662.
15. Bannikova, A.A. Holarctic phylogeography of the tundra shrew (Sorex tundrensis) based on mitochondrial genes / A.A. Bannikova, E.N. Dokuchaev, E.V. Yudina, A.V. Bobretzov, B.I. Sheftel, V. Ilyashenko, V.S. Lebedev // Biological Journal of the Linnean Society. — 2010. — V. 101. — № 3. — P. 721-746.
16. Bannikova, A.A. Mitochondrial diversity of the white-toothed shrews (Mammalia, Eulipotyphla, Crocidura) in Vietnam / A.A. Bannikova, A.V Abramov, A.V.Borisenko, V.S. Lebedev, V.V. Rozhnov // Zootaxa. — 2011. — V. 2812. — P. 1-20.
17. Abramov, A.V. White-toothed shrews (Mammalia, Soricomorpha, Crocidura) of coastal islands of Vietnam / A.V. Abramov, A.A. Bannikova, V.V. Rozhnov // ZooKeys. — 2012. — № 207. — P. 37-47.
18. Jenkins, P.D. Bones and genes: resolution problems in three Vietnamese species of Crocidura (Mammalia, Soricomorpha, Soricidae) and the description of an additional new species / P.D. Jenkins, A.V. Abramov, A.A. Bannikova, V.V. Rozhnov // ZooKeys. — 2013. — №. 313. — С. 61-79.
19. Землемерова, Е.Д. Новые данные по молекулярной систематике кротов Восточной Азии / Е.Д. Землемерова, А.А. Банникова, А.В. Абрамов, В.С. Лебедев, В.В. Рожнов // Доклады АН. — 2013. — Т. 451. — № 6. — C. 707-710.
20. Bannikova, A.A. Contrasting evolutionary history of hedgehogs and gymnures (Mammalia: Erinaceomorpha) as inferred from a multigene study / A.A. Bannikova, V.S. Lebedev, А^. Abramov, V.V. Rozhnov // Biological Journal of the Linnean Society. — 2014. — V. 112. — № 3. - P. 499-519.
21. Feuda, R. Tracing the evolutionary history of the mole, Talpa europaea, through mitochondrial DNA phylogeography and species distribution modeling / R. Feuda, A.A. Bannikova, E.D. Zemlemerova, M.Di Febbraro, A. Loy, R. Hutterer, G. Aloise, A.E. Zykov, F. Annesi, P. Colangelo // Biological Journal of the Linnean Society. — 2015. — V. 114. — № 3. — P. 495-512.
22. Igea, J. Multilocus species trees and species delimitation in a temporal context: application to the water shrews of the genus Neomys / J. Igea, P. Aymerich, A.A. Bannikova, J. Gosalbez, J. Castresana // BMC evolutionary biology. — 2015. — V. 15. — № 1. — P. 209.
23. Bannikova, A.A. An underground burst of diversity — a new look at the phylogeny and taxonomy of the genus Talpa Linnaeus, 1758 (Mammalia: Talpidae) as revealed by nuclear and mitochondrial genes / A.A. Bannikova, E.D. Zemlemerova, P. Colangelo, M. Sözen, M. Sevindik, A.A. Kidov, R.I. Dzuev, B. Krystufek, V.S. Lebedev // Zoological Journal of the Linnean Society. — 2015. — V. 175. — № 4. — P. 930-948
24. Банникова, А.А. Филогенетическое положение ганьсуйского крота Scapanulus oweni Thomas, 1912 (Mammalia, Talpidae) и взаимоотношения высокоспециализированных подземных групп кротовых / А.А. Банникова, Е.Д. Землемерова, В.С. Лебедев, Д.Ю.
Александров, Ю. Фанг (Yun Fang), Б.И. Шефтель // Доклады АН. — 2015. — Т. 464. — № 2. — С. 238-238.
25. Zemlemerova, E.D. Secrets of the underground Vietnam: an underestimated species diversity of Asian moles (Lipotyphla: Talpidae: Euroscaptor) / E.D. Zemlemerova, A.A. Bannikova, V.S. Lebedev, V.V. Rozhnov, A.V. Abramov // Proceedings of the Zoological Institute RAS.
— 2016. — V. 320. — № 2. — P. 193-220.
26. Шефтель, Б. И. Заметки по фауне, систематике и экологии мелких млекопитающих юга провинции Ганьсу (Китайская Народная Республика) / Б.И. Шефтель, А.А. Банникова, Ю. Фанг, Т.Б. Демидова, Д.Ю. Александров, В.С. Лебедев, Ю.Х. Сун // Зоологический журнал. — 2017. — Т. 96. — № 2. — С. 232-248.
27. Abramov, A.V. Revision of Chimarrogale (Lipotyphla: Soricidae) from Vietnam with comments on taxonomy and biogeography of Asiatic water shrews / A.V. Abramov, A.A. Bannikova, V.S. Lebedev, V.V. Rozhnov // Zootaxa. — 2017. — V. 4232. — № 2. — P. 216-230.
28. Банникова, А.А. Неожиданное генетическое разнообразие азиатских короткохвостых землероек рода Blarinella (Mammalia, Lipotyphla, Soricidae) / А.А. Банникова, А.В. Абрамов, В.С. Лебедев, Б.И. Шефтель // Доклады АН. — 2017. — Т. 474. — № 1. — С. 132-136.
29. Abramov, A.V. The first record of Episoriculus umbrinus from Vietnam, with notes on the taxonomic composition of Episoriculus (Mammalia, Soricidae) / A.V. Abramov, A.A. Bannikova, D.M. Chernetskaya, V.S. Lebedev, V.V. Rozhnov // Russian Journal of Theriology. — 2017. — V. 16. — № 2. — P. 117-128.
30. Bannikova, A.A. Evolutionary history of the genus Sorex (Soricidae, Eulipotyphla) as inferred from multigene data / A.A. Bannikova, D. Chernetskaya, A. Raspopova, D. Alexandrov, Y. Fang, N. Dokuchaev, B. Sheftel, V. Lebedev // Zoologica Scripta. — 2018.
— V. 47. — № 5. — P. 518-538.
31. Распопова, А.А. Филогеография и демографическая история обыкновенной бурозубки Sorex araneus L., 1758 (Eulipotyphla, Mammalia) / А.А. Распопова, А.А. Банникова, В.С. Лебедев // Генетика. — 2018. — Т.54. — № 12. — С. 1426-1441.
32. Abramov, A.V. A broadly distributed species instead of an insular endemic? A new find of the poorly known Hainan gymnure (Mammalia, Lipotyphla) / A.V. Abramov, A.A. Bannikova, V.S. Lebedev, V.V. Rozhnov // ZooKeys. — 2018. — №. 795. — С. 77-81.
33. Sansalone, G. Influence of evolutionary allometry on rates of morphological evolution and disparity in strictly subterranean moles (Talpinae, Talpidae, Lipotyphla, Mammalia) / G. Sansalone, P. Colangelo, T. Kotsakis, A. Loy, R. Castiglia, A. Bannikova, E. Zemlemerova, P. Piras // Journal of Mammalian Evolution. — 2018. — V. 25. — № 1. — P. 1-14.
34. Zemlemerova, E. Genetic and morphologic diversity of the moles (Talpomorpha, Talpidae, Mogera) from the continental Far East / E.D. Zemlemerova, A.V. Abramov, A.P. Kryukov, V.S. Lebedev, M.-S. Min, S.-J. Lee, A.A. Bannikova // Journal of Zoological Systematics and Evolutionary Research. —2019. — V. 57. — P. 662-678.
Статьи в журналах из перечня ВАК
1. Долгов, В.А. Насекомоядные и грызуны (Mammalia, Insectivora, Rodentia) долины р. Пенжины / В.А. Долгов, А.А. Банникова // Вестн. Моск. Ун-та, сер. 16, Биология. — 1998. — № 1. — С. 32-37.
2. Bannikova, A.A. Mitochondrial and nuclear DNA variability of the east european and siberian chromosome races of the common shrew Sorex araneus / A.A. Bannikova, N.S. Bulatova, V.S. Lebedev, D.A. Kramerov // Russian journal of theriology. — 2007. — V.6. — № 2. — P. 159-160.
3. Шефтель, Б.И. Затерянный мир Лианхуашаня / Б.И. Шефтель, А.А. Махров, В.В. Бобров, В.С. Артамонова, Д.Ю. Александров, Е.А. Коблик, А.А. Банникова // Природа. — 2013. — № 7. — C. 57-65.
4. Коблик, Е.А. Тибет: последняя пастораль Земли / Е.А. Коблик, А.А. Банникова, А.А. Махров, Б.И. Шефтель, В.В. Бобров, В.С. Артамонова, Д.Ю. Александров // Природа. — 2014. — № 5. — С. 79-88.
Статьи в сборниках, монографиях и журналах, не входящих в перечень WоS/Scopus/RSCI/ВАК
1. Банникова, А.А. Молекулярная и цитогенетическая дифференциация обыкновенных ежей Кавказа (Mammalia, Erinaceinae) / А.А. Банникова, В.Н. Василенко, Р.И. Дзуев,
В.А. Долгов // Вестник Кабардино-Балкарского Государственного Университета, сер. Биол. науки. — 2000. — № 4. — C. 42-52.
2. Bannikova, А.А. Molecular Diversity of some Crocidura species (Insectivora, Soricidae) from Ethiopia / А.А. Bannikova, L.A. Lavrenchenko, A.A. Lomov, B.M. Mednikov // African small mammals. Orstom, coll. A travers champs / C. Denis, L. Granjon, A. Poulet (eds.). — Paris: Inst. De Recherche pour le Development, 2001. — P. 55-64.
3. Bannikova, A.A. Molecular phylogeny of Palearctic shrews inferred from RFLP and IS-PCR data / A.A. Bannikova, D.A. Kramerov // Advances in the Biology of Shrews II. Special publication of International Society of Shrew Biologists / J.F. Merritt, S. Churchfield, R. Hutterer, B. Sheftel (eds.). — 2005. — P. 87-98.
4. Bannikova, A.A. Molecular diversity and basal radiation of spiny hedgehogs / A.A. Bannikova, V.S. Lebedev // Collection of materials of International conference. "Molecular genetic bases of conservation of biodiversity of Holarctic mammals". — M.: KMK, 2007. — P. 23-30.
5. Распопова, А.А. Особенности строения и изменчивости левого домена D-петли обыкновенной бурозубки (Sorex araneus L.) / А.А. Распопова, А.А. Банникова, Н.А. Шипанов // Материалы международной конференции «Молекулярно-генетические основы сохранения биоразнообразия млекопитающих Голарктики». — М.: ИПЭЭ РАН, 2007. — С. 221-227.
6. Банникова, А.А. Отряд Насекомоядные / А.А. Банникова, В.С. Лебедев // Млекопитающие России: систематико-географический справочник // И.Я. Павлинов,
A.А. Лисовский (ред.). — М.: Т-во научных изданий КМК, 2012. — Т. 52. — С. 25-72.
7. Марочкина, В.В. Таксономический обзор современной фауны млекопитающих Туркменистана / В.В. Марочкина, А.А. Банникова, С.В. Крускоп, В.С. Лебедев // Изучение биоразнообразия Туркменистана (позвоночные животные) / О.С. Сопыева, Ш.Р. Херремова (ред.). — Москва-Ашхабад: Мензбировское Орнитологическое общество, Среднеазиатское отделение, 2013. — С. 207-242.
8. Хляп, Л.А. К изучению разнообразия млекопитающих (Mammalia) заповедника «Утриш» / Л.А. Хляп, В.М. Малыгин, А.А. Банникова, А.С. Богданов, И.В. Артюшин,
B.Г. Петросян // Охрана биоты в государственном природном заповеднике «Утриш». Научные труды. — 2015. — Т. 3. — C. 311-320.
9. Thaw, S. Phylogeography / S. Thaw, T. White, A. Bannikova, J. Searle // Shrews, Chromosomes and Speciation (Cambridge Studies in Morphology and Molecules: New Paradigms in Evolutionary Bio) / J. Searle, P. Polly, J. Zima (eds.). — Cambridge: Cambridge University Press, 2019. — P. 112-133.
Методические пособия
1. Булатова, Н.Ш. Практика полевой геномики: памятка по сбору проб / Н.Ш. Булатова, С.В. Павлова, А.А. Банникова, Р.С. Наджафова, Н.В. Быстракова // Методическое пособие. — М.: Т-во научных изданий КМК, 2009. — 24 с.
2. Белоконь, М.М. Молекулярно-генетические методы в изучении сообществ позвоночных животных на ЗБС / М.М. Белоконь, Ю.С. Белоконь, А.А. Банникова, Д.В. Политов // Методическое пособие. — 2014. — 69 с.
Материалы международных и всероссийских совещаний и конференций:
1. Bannikova, A.A. Molecular phylogeny of Palearctic shrews inferred from RFLP and IS-PCR data / A.A. Bannikova, D.A. Kramerov // Abstracts of 2nd «Biology of the Soricidae II». — 2002. — P. 2.
2. Bannikova, A.A. DNA Polymorphism of Sorex araneus and its relationships with associated species as derived from Inter-SINE-PCR / A.A.Bannikova, N.S. Bulatova, E.Y. Krysanov, D.A. Kramerov // Abstracts of 6-th Meeting of the International Sorex araneus Cytogenetics Committee (ISACC). — Paris. — 2003. — P. 13-14.
3. Bannikova, A.A. Phylogenetic relationships among Ethiopian Crocidura species inferred from Inter-SINE-PCR data and as compared with Palearctic shrews / A.A. Bannikova, L.A. Lavrenchenko, D.A. Kramerov // Abstracts of 9th African Small Mammals symposium. — Tanzania. — 2003. — P. 17.
4. Банникова, А.А. Вклад эволюционной геномики в филогенетику и таксономию млекопитающих: обзор последних исследований / А.А. Банникова // Материалы Международного совещания «Териофауна России и сопредельных территорий». — Москва. — 2003. — С. 30-31.
5. Банникова, А.А. Молекулярная филогения землероек-белозубок Палеарктики / А.А. Банникова, Л.А. Лавренченко, Д.А. Крамеров // Материалы международной
конференции «Проблемы филогении, систематики и палеонтологии мелких млекопитающих». — Санкт-Петербург. — 2003. — C. 35-39.
6. Bannikova, A. Mitochondrial and nuclear DNA variability of the East European and Siberian chromosome races of the common shrew Sorex araneus. Evolution in the Sorex araneus group: cytogenetic and molecular aspects / A. Bannikova, V. Lebedev, N. Bulatova, D. Kramerov // Abstracts of 7-th Meeting of the International Sorex araneus Cytogenetics Committee (ISACC). — St.-Petersburg. — 2005. — P. 14-15.
7. Банникова, А.А. Молекулярная история землероек-белозубок Палеарктики / А.А. Банникова, В.С. Лебедев, Д.А. Крамеров // Материалы международного совещания «Териофауна России и сопредельных территорий». — Москва. — 2007. — С. 38.
8. Банникова, А.А. Молекулярная филогения ежей подсемейства Erinaceinae Fischer, 1814 по данным секвенирования ядерных и митохондриальных генов. Биология насекомоядных млекопитающих / А.А. Банникова, В.С. Лебедев // Материалы III Всероссийской научной конференции по биологии насекомоядных млекопитающих. — Новосибирск. — 2007. — C. 12-13.
9. Bannikova, A.A. Molecular phylogeny of Erinaceinae Fischer, 1814 of the world as inferred from multigene sequencing / A.A. Bannikova, V.S. Lebedev // Abstracts of V European Congress of Mammalogy. — Siena, Italy. — 2007. — P. 192.
10. Суров, А.В. Филогеография мелких млекопитающих Монголии / А.В. Суров, В.С. Лебедев, И.А. Тихонов, П.Л. Богомолов, Н.Ю. Феоктистова, И.Г. Мещерский, А.А. Банникова // Материалы Российско-Монгольского симпозиума «Глобальные и региональные особенности трансформации экосистем Байкальского региона». — Улан-Батор. — 2008. — C. 134-136.
11. Банникова, A.A. Голарктическая история тундряной бурозубки (Sorex tundrensis) / A.A. Банникова, Е.В. Юдина, В.С. Лебедев, А.В. Бобрецов, Е.Н. Докучаев // Материалы конференции «Современные проблемы зоо- и филогеографии млекопитающих». — Пенза. — 2009. — С. 13.
12. Шефтель, Б.И. Распространение, экология и родственные связи палеарктических землероек / Б.И. Шефтель, А.А. Банникова, В.С. Лебедев, Д.Ю. Александров // Материалы конференции «Современные проблемы зоо- и филогеографии млекопитающих». — Пенза. — 2009. — С. 113.
13. Bannikova, A.A. Phylogeography of the Palaearctic red-toothed shrews / A.A. Bannikova, V.S. Lebedev, Yu.N. Dokuchaev, Yu.V. Yudina, V.O. Burskya, A.V. Bobretzov,
B.I. Sheftel // Abstracts of third international conference "Advances in the biology of shrews III". — Syktyvkar, Komi Republic. — 2010. — C. 8.
14. Bannikova, А.А. Genetic diversity of the white-toothed shrews of the genus Crocidura in Vietnam as revealed by the mitochondrial genes / А.А. Bannikova, А^. Abramov, А^. Borisenko, V.S. Lebedev, V.V. Rozhnov // Abstracts of third international conference "Advances in the biology of shrews III". — Syktyvkar, Komi Republic. — 2010. — C. 7.
15. Sheftel, B.I. Why genetic similar forms fall in good morphological differentiation species sometimes? / B.I. Sheftel, A.A. Bannikova, D.Y. Alexandrov, V.S. Lebedev // Abstracts of third international conference "Advances in the biology of shrews III". — Syktyvkar, Komi Republic. — 2010. — C. 56-57.
16. Лебедев, В.С. Фауна млекопитающих Монголии: новое за последние 30 лет / В.С. Лебедев, А.А. Банникова, А.В. Суров // Материалы международной конференции "Экологические последствия биосферных процессов в экотонной зоне южной Сибири и Центральной Азии". — Улан-Батор, Монголия. — 2010. — Т. 2. — C. 217-223.
17. Банникова, А.А. Генетическая неоднородность кавказской землеройки-бурозубки Sorex satunini Ognev, 1922 как возможный результат древней гибридизации / А.А. Банникова, В.С. Лебедев' // Материалы конференции «Целостность вида у млекопитающих (изолирующие барьеры и гибридизация)». — М.: Т-во научных изданий КМК. — Петергоф. — 2010. — С. 8.
18. Банникова, А.А. Генетическая идентификация и гибридизация обыкновенных ежей Центральной России / А.А. Банникова, В.С. Лебедев, М.В. Рутовская, Л.А. Хляп, В.В. Рожнов // Материалы конференции «Целостность вида у млекопитающих (изолирующие барьеры и гибридизация)». — М.: Т-во научных изданий КМК, 2010. — Петергоф. — С. 9.
19. Альбов, С.А. О находках гибридных особей млекопитающих в Приокско-Террасном заповеднике / С.А. Альбов, А.А. Банникова, Е.Ю. Звычайная, Л.А. Хляп // Материалы конференции «Целостность вида у млекопитающих. Изолирующие барьеры и гибридизация». — М.: Т-во научных изданий КМК. — Петергоф. — 2010. —
C. 4.
20. Распопова, А.А. Изменчивость гена цитохрома b в популяциях хромосомных рас обыкновенной бурозубки (Sorex araneus) / А.А. Распопова, А.А. Банникова, С.В. Павлова, Н.А. Щипанов // Материалы конференции «Целостность вида у млекопитающих. Изолирующие барьеры и гибридизация». — Петергоф. — 2010. — С. 71.
21. Банникова, А.А. Молекулярные, морфологические и цитогенетические филогении: проблема соответствия / А.А. Банникова // Материалы международного совещания «Териофауна России и сопредельных территорий». — Москва. — 2011. — C. 39.
22. Банникова, А.А. Новый род гимнур (Erinaceidae, Galericinae) - мультигенное обоснование / А.А. Банникова, В.С. Лебедев, А.В. Абрамов, В.В. Рожнов // Материалы международного совещания «Териофауна России и сопредельных территорий». — Москва. — 2011. — C. 40.
23. Землемерова, Е.Д. Молекулярная филогения рода Talpa Linnaeus, 1758 и генетическое разнообразие кротов Кавказа / Е.Д. Землемерова, А.А. Банникова, В.С. Лебедев, А.А. Кидов, Р.И. Дзуев // Материалы международной научной конференции «Биологическое разнообразие и проблемы охраны фауны Кавказа». Ереван, Армения.
— 2011. — C. 152-155.
24. Землемерова, Е.Д. Филогеография кротов рода Talpa (Linnaeus, 1758) / Е.Д. Землемерова, А.А. Банникова, А. Зыков, В.С. Лебедев // Материалы конференции «Молекулярно-генетические подходы в таксономии и экологии». — Ростов-на-Дону. — 2013. — С. 41.
25. Zemlemerova, E.D. New data on molecular systematics of the East Asian moles / E.D. Zemlemerova, A.A. Bannikova, A.V. Abramov, V.V. Rozhnov, V.S. Lebedev // Abstracts of MAPEEG-2013: Modern Achievements in Population, Evolutionary and Ecological Genetics.
— Vladivostok. — 2013. — С. 75.
26. Банникова, А.А. Молекулярно-генетические аспекты структуры видов и распознавание видовых границ / А.А. Банникова // Материалы научной конференции «Структура вида у млекопитающих». М.: Т-во научных изданий КМК. — 2015. — С. 12.
27. Распопова, А.А. Послеледниковая экспансия обыкновенной бурозубки (Sorex araneus L., 1758) / А.А. Распопова, А.А. Банникова, В.С. Лебедев // Материалы
научной конференции «Структура вида у млекопитающих». М.: Т-во научных изданий КМК. — 2015. — С. 70.
28. Землемерова, Е.Д. Криптическое разнообразие кротов Вьетнама (Lipotyphla, Talpidae, Euroscaptor) / Е.Д. Землемерова, А.А. Банникова, В.С. Лебедев, А.В. Абрамов, В.В. Рожнов // Материалы научной конференции «Структура вида у млекопитающих». М.: Т-во научных изданий КМК. — 2015. — С. 33.
29. Абрамов, А.В. Молекулярная филогения азиатских водяных землероек (Lipotyphla, Soricidae, Chimarrogale s.lato) / А.В. Абрамов, А.А. Банникова, В.С. Лебедев, Е.Д. Землемерова, В.В. Рожнов // Материалы научной конференции «Структура вида у млекопитающих». М.: Т-во научных изданий КМК. — 2015. — С. 5.
30. Шефтель, Б.И. Генетическая и морфологическая дифференциация насекомоядных млекопитающих восточной Палеарктики / Б.И. Шефтель, А.А. Банникова, В.С. Лебедев // Материалы научной конференции «Структура вида у млекопитающих». М.: Т-во научных изданий КМК. — 2015. — С. 89.
31. Банникова, А.А. Молекулярная история и проблемы филогенетической реконструкции истинных насекомоядных / А.А. Банникова, В.С. Лебедев // Материалы международного совещания «Териофауна России и сопредельных территорий». — М.: Т-во научных изданий КМК. — 2016. — С. 32.
32. Землемерова, Е.Д. Молекулярная филогения и филогеография кротов трибы Talpini (Mammalia: Talpidae) / Е.Д. Землемерова, А.А. Банникова, А.В. Абрамов, В.С. Лебедев // Материалы международного совещания «Териофауна России и сопредельных территорий». — М.: Т-во научных изданий КМК. — 2016. — С. 137.
33. Матвеева, Е.И. Популяционно-генетическое разнообразие и гибридизация обыкновенных ежей европейской части России и западной Сибири / Е.И. Матвеева, М.М. Белоконь, Ю.М. Белоконь, В.С. Лебедев, М.В. Рутовская, Л.А. Хляп, А.А. Банникова // Материалы международного совещания «Териофауна России и сопредельных территорий». — М.: Т-во научных изданий КМК. — 2016. — С. 255.
34. Банникова, А.А. Эмпирическое исследование видовых границ у мелких млекопитающих / А.А. Банникова // Материалы международной научной конференции «Генетика популяций: прогресс и перспективы», посвященной 80-летию со дня рождения академика Ю.П. Алтухова (1936 - 2006 гг.) и 45-летию основания
лаборатории популяционной генетики им. Ю.П. Алтухова. — Москва. — 2017. — С. 17.
35. Золотарева, Е.И. Популяционно-генетическое разнообразие и гибридизация ежей Erinaceus europaeus и E. roumanicus в Восточной Европе и Западной Сибири / Е.И. Золотарева, М.М. Белоконь, Ю.С. Белоконь, М.В. Рутовская, Л.А. Хляп, В.С. Лебедев, А.А. Банникова // Материалы международной научной конференции «Генетика популяций: прогресс и перспективы», посвященной 80-летию со дня рождения академика Ю.П. Алтухова (1936 - 2006 гг.) и 45-летию основания лаборатории популяционной генетики им. Ю.П. Алтухова. — Москва. — 2017. — С. 104.
36. Распопова, А.А. Филогеографическая структура обыкновенной бурозубки (Sorex araneus L., 1758) в восточной части ареала / А.А. Распопова, С.В. Павлова, А.А. Банникова, В.С. Лебедев // Материалы III международной конференции «Современные проблемы биологической эволюции». — М.: ГДМ. — 2017. — С. 568569.
37. Землемерова, Е.Д. Генетическая изменчивость и таксономический статус могер Дальнего Востока и Корейского полуострова / Е.Д. Землемерова, А.В. Абрамов, А.П. Крюков, В.С. Лебедев, А.А. Банникова // Материалы III международной конференции «Современные проблемы биологической эволюции». — М.: ГДМ. — 2017. — С. 131133.
38. Bannikova, A.A. Molecular evolution of Eulipotyphla: unresolved problems of phylogenetic reconstruction / A.A. Bannikova // XI Congresso Italiano di Teriologia Hystrix, It. J. Mamm. 29 (Supplement) Associazione Teriologica Italiana - 2018. — P. 5.
Обратите внимание, представленные выше научные тексты размещены для ознакомления и получены посредством распознавания оригинальных текстов диссертаций (OCR). В связи с чем, в них могут содержаться ошибки, связанные с несовершенством алгоритмов распознавания. В PDF файлах диссертаций и авторефератов, которые мы доставляем, подобных ошибок нет.