Микробиологический мониторинг пищевых продуктов в системе эпидемиологического надзора за сальмонеллезами тема диссертации и автореферата по ВАК РФ 14.00.30, кандидат медицинских наук Родькина, Лариса Анатольевна

• Родькина, Лариса Анатольевна
• кандидат медицинских наук
• 2007

Оглавление диссертации кандидат медицинских наук Родькина, Лариса Анатольевна

ВВЕДЕНИЕ4

ГЛАВА I. ЭВОЛЮЦИЯ ИНФЕКЦИОННЫХ БОЛЕЗНЕЙ В РОССИИ В XX ВЕКЕ. СОВРЕМЕННЫЕ ПРЕДСТАВЛЕНИЯ ОБ ИНФЕКЦИОННОЙ ПАТОЛОГИИ И ОСНОВНЫХ НАПРАВЛЕНИЯХ СОВЕРШЕНСТВОВАНИЯ СТРАТЕГИИ ЕЁ ПРОФИЛАКТИКИ11

ГЛАВА 2. МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ ИССЛЕДОВАНИЯ

2.1. МЕТОДЫ ИССЛЕДОВАНИЯ29

2.2. МАТЕРИАЛЫ ИССЛЕДОВАНИЯ34

ГЛАВА 3. ЭПИДЕМИОЛОГИЧЕСКИЕ АСПЕКТЫ ОСТРЫХ КИШЕЧНЫХ ИНФЕКЦИЙ В ОМСКОЙ ОБЛАСТИ

3.1. АНАЛИЗ ЗАБОЛЕВАЕМОСТИ ОСТРЫМИ КИШЕЧНЫМИ ИНФЕКЦИЯМИ

НА ТЕРРИТОРИИ ОМСКОЙ ОБЛАСТИ ЗА 1994-2005гг.36

3.2. ИССЛЕДОВАНИЯ АНТИСЕПТИЧЕСКИХ СВОЙСТВ КОМПОНЕНТОВ САПРОПЕЛЯ НА ВОЗБУДИТЕЛЯХ ОСТРЫХ КИШЕЧНЫХ ИНФЕКЦИЙ42

ГЛАВА 4. МИКРОБИОЛОГИЧЕСКИЙ АНАЛИЗ КАЧЕСТВА И БЕЗОПАСНОСТИ ПИЩЕВЫХ ПРОДУКТОВ И ПРОДОВОЛЬСТВЕННОГО СЫРЬЯ ЗА 1994-2005 ГОДЫ В ОМСКОЙ ОБЛАСТИ.45-48^

ГЛАВА 5. ОЦЕНКА КАЧЕСТВА ПИЩЕВЫХ ПРОДУКТОВ И ПРОДОВОЛЬСТВЕННОГО СЫРЬЯ ПО СОДЕРЖАНИЮ ОСТАТОЧНОГО КОЛИЧЕСТВА АНТИБИОТИКОВ ЗА 1994-2005гг. В ОМСКОЙ ОБЛАСТИ.49

ГЛАВА 6. ВЫЯВЛЕНИЕ ПАТОГЕННОЙ МИКРОФЛОРЫ В ПИЩЕВЫХ ПРОДУКТАХ И ПРОДОВОЛЬСТВЕННОМ СЫРЬЕ НА ТЕРРИТОРИИ ОМСКОЙ

ОБЛАСТИ В 1994-2005 гг.55

ГЛАВА 7. АНАЛИЗ ЗАВИСИМОСТИ ЗАБОЛЕВАЕМОСТИ ОСТРЫМИ КИШЕЧНЫМИ ИНФЕКЦИЯМИ И САЛЬМОНЕЛЛЁЗАМИ ОТ МИКРОБИОЛОГИЧЕСКОГО ЗАГРЯЗНЕНИЯ РАЗЛИЧНЫХ ГРУПП ПИЩЕВЫХ ПРОДУКТОВ.63

ГЛАВА 8. РОЛЬ МИКРОБИОЛОГИЧЕСКОГО МОНИТОРИНГА В

ЭПИДЕМИОЛОГИЧЕСКОМ НАДЗОРЕ ЗА ОСТРЫМИ КИШЕЧНЫМИ ИНФЕКЦИЯМИ И САЛЬМОНЕЛЛЁЗАМИ.70

Введение диссертации (часть автореферата) на тему «Микробиологический мониторинг пищевых продуктов в системе эпидемиологического надзора за сальмонеллезами»

Федеральный Закон «О качестве и безопасности пищевых продуктов» №29 от 02.01.2000г., Постановление Правительства Российской Федерации №60 от 02.02.2006г. «Об' утверждении Положения о проведении социально -гигиенического мониторинга», МР МЗ РФ №2001/83 «По проведению социально-гигиенического мониторинга» от 25.05.2001г., Приказ Роспотребнадзора №367 от 17.11.2006г. «Порядок проведения социально — гигиенического мониторинга, представления данных и обмена ими между федеральными органами исполнительной власти, учреждениями и другими организациями, участвующими в проведении социально - гигиенического мониторинга», определяют приоритетные направления государственной политики в области обеспечения качества и безопасности продуктов питания [4]. Вследствие наибольшей эпидемиологической значимости основное внимание уделяется исследованиям пищевых продуктов на соответствие нормативным документам (НД) по микробиологическим показателям безопасности. Качественный состав и биологические характеристики микрофлоры пищевых продуктов- могут оказывать существенное влияние на эпидемическую ситуацию по острым кишечным инфекциям (ОКИ) [2].

Наиболее адекватной моделью, при которой прослеживается связь между качеством пищевых продуктов и заболеваемостью ОКИ, являются сальмонеллезы. Они распространены настолько широко, что в настоящее время ставят вопрос лишь о снижении уровня заболеваемости и ограничении распространения возбудителя среди основных источников этой инфекции [71]. В настоящее время Salmonella enteritidis (Salmonella enterica subsp. enterica серовар enteritidis), занимает ведущее значение в этиологии сальмонеллезов в России. Рост заболеваемости обусловлен активацией эпизоотического процесса на предприятиях промышленного птицеводства, продукция которых преимущественно и используется в пищу населением [63], а в последние годы также продукция, вырабатываемая на предприятиях общественного питания индивидуальной собственности.

В условиях повсеместного распространения сальмонеллёзов особую озабоченность вызывает отсутствие эффективных методов предупреждения болезни, нужны новые критерии для диагностики и прогнозирования эпидемиологической ситуации. Помимо некоторых преимуществ, которые свойственны бактериологическому методу (простота, достаточная оперативность), он имеет ряд недостатков, связанных с тем, что основан на регистрации фенотипических признаков [85].

В последние годы для внутривидового типирования сальмонелл широко применяют молекулярно-генетические методы, прежде всего плазмидный анализ. Он позволяет дифференцировать сальмонеллы на плазмидные варианты, определять источники и факторы передачи возбудителей, устанавливать или исключать связь между отдельными случаями заболеваний, отличать привозные случаи заболеваний от местных [87]. Микробиологический мониторинг служит информационной базой современной эпидемиологии и позволяет влиять на эффективность эпидемиологического надзора. Кроме того установлено, что появление новых плазмидоваров Б. е^егШсНэ может приводить к существенным изменениям показателей заболеваемости [88].

Цель исследования •

Совершенствование системы эпидемиологического надзора за сальмонеллезами на основе микробиологического мониторинга пищевых продуктов и оценки значимости различных плазмидоваров сальмонелл в эпидемическом процессе.

Задачи исследования

Проанализировать заболеваемость сальмонеллёзами в отдельных возрастных группах населения Омской области за 1994-2005гг.

2.Провести комплексный анализ результатов испытаний пищевых продуктов в Омской области за период 1994-2005гг. по микробиологическим показателям и наличию остаточного количества антибиотиков.

3.Выделить значимые в заболеваемости ОКИ группы пищевых продуктов и проанализировать изменения микробиологических показателей их безопасности. -^Проанализировать эффективность выделения патогенной микрофлоры при проведении планового надзора, пополнить базу эпидемиологического надзора информацией об особенностях ОКИ установленной этиологии, вызванными употреблением пищевых продуктов, коитаминированных патогенной микрофлорой.

5.Принять участие в системе централизованного молекулярно-генетического мониторинга за возбудителями сальмонеллеза для изучения плазмидной характеристики популяции сальмонелл в Омской области и оценить эпидемиологическую значимость плазмидоваров .5. еп(егШсИя в заболеваемости населения.

6. Сформировать базу данных по выделению патогенной микрофлоры из продуктов питания, предметов окружающей среды и клинического материала в «Центре гигиены и эпидемиологии в Омской области» и обосновать основные направления профилактики сальмонеллезов в Омской области.

Научная новизна

1. На основе анализа многолетних данных заболеваемости и результатов исследования пищевых продуктов показана зависимость заболеваемости ОКИ от степени микробиологического загрязнения пищевых продуктов.

2. Впервые изучена клоиальная структура популяции возбудителей сальмонеллёзов в Омской области, механизмы их реализации в эпидемическом процессе и выделены основные подходы для профилактики ОКИ пищевой этиологии.

3. На основе изучения структурной организации популяций S. enteritidis и других сальмонелл в Омской области впервые выявлена их плазмидная гетерогенность. Определены основные, в том числе доминирующие плазмидовары S. enteritidis. Показано, что популяции свойственна относительная стабильность её плазмидоварной структуры, определяемая доминирующими плазмидоварами микроба, и изменчивость, определяемая наличием редко выявляемых плазмидоваров S. enteritidis. Показано, что плазмидовар 38:1,4 MDa играет ведущую роль в заболеваемости всех возрастных групп населения.

4. Установлено, что S. dublin, S. montevideo, S. brandenburg, S. agama, S. derby, которые были выделены из пищевых продуктов, предметов окружающей среды и от больных, вероятнее всего относятся к завозной части микрофлоры, так как не были выделены на местных предприятиях промышленного птицеводства.

5. Установлено, что одной из причин снижения заболеваемости населения сальмонеллезом тифимуриум явилось уменьшение активности эпизоотического процесса этой инфекции среди сельскохозяйственных птиц (кур) и ограничение эпидемиологической роли птицепродуктов.

6. По данным корреляционно-регрессионного анализа заболеваемости сальмонеллезом и динамики микробиологических показателей качества ochobhéix групп пищевых продуктов за период с 1994 по 2005 годы проведён расчёт прогноза заболеваемости и количества неудовлетворительных проб на 20062007гг. Основными продуктами «риска», связанными с формированием заболеваемости сальмонеллезом, являются: мясо птицы и продукты птицеводства, а в последние годы кулинарные изделия, продукция общественного питания, мясо и мясные продукты.

Практическая значимость

- проведен комплексный анализ результатов испытаний пищевых продуктов по микробиологическим показателям в Омской области за период 1994-2005гг.,

- выделены наиболее значимые в заболеваемости ОКИ группы пищевых продуктов, показана зависимость уровня заболеваемости ОКИ от степени микробиологического загрязнения пищевых продуктов,

- проанализирована вероятность выделения патогенной микрофлоры при проведении планового надзора и по эпидемиологическим показаниям,

- сформирована база данных по выделению патогенной микрофлоры из продуктов питания, предметов окружающей среды и клинического материала,

- на основе плазмидного анализа проведено внутривидовое типирование штаммов З.еЫегШсИБ, которое используется для централизованного микробиологического мониторинга за возбудителями сальмонеллеза. Результаты мониторинга публикуются в «Ежемесячном информационном бюллетене о штаммах сальмонелл в Уральском, Сибирском и Дальневосточном1 федеральных округах Российской Федерации».

- предложена система централизованного микробиологического мониторинга за инфекционной патологией,

- для оптимизации информационного обеспечения микробиологического мониторинга в системе эпидемиологического надзора за инфекционной патологией разработаны методические рекомендации МР 4.2.005-07 «Методические основы обеспечения микробиологического мониторинга' возбудителей инфекционной патологии»,

- сформулированы основные направления профилактики сальмонеллезов в Омской области, вызванного местной и завозной частями популяции З.егйегШсЦБ.

Основные положения, выносимые на защиту:

1. По данным бактериологических исследований в Омской области наиболее контаминированной сальмонеллами продукцией, реализуемой населению, является мясо птицы, продукты птицеводства, а начиная с 2003г. мясные полуфабрикаты, изготовленные на предприятиях общественного питания индивидуальной формы собственности. Обследование объектов с целью планового надзора является эффективным методом контроля выявления патогенной микрофлоры из пищевых продуктов.

2. В условиях внедрения новых технологических приёмов и режимов производства, а так же повышения ответственности изготовителя за качество выпускаемой продукции выявлена общая тенденция улучшения качества пищевых продуктов по микробиологическим показателям безопасности.

3. Популяция З.еЫегШсИз в Омской области гетерогенна по спектру выявляемых плазмид. Основным источником сальмонеллёзной инфекции, вызванной основными плазмидоварами Б.еМегШсИя, является птица, выращиваемая на местных предприятиях промышленного птицеводства, а начиная с 2003г. мясные полуфабрикаты, изготовленные на предприятиях общественного питания индивидуальной формы собственности.

Апробация работы

Материалы диссертации представлены и обсуждены на:

- V межрегиональной научно - практической конференции с международным участием (Омск 2004г.).

- VI межрегиональной научно практической конференции, посвященной 110-летию со дня рождения организатора медико-профилактического факультета ОГМА, основателя Омской научной школы гигиенистов Л.М.Маслова (Омск,2006г.).

- 6-й межрегиональной научно практической конференции посвященной 85-летию СибНИВИ-ВНИИБТЖ (Омск,2007г.).

10

Публикации

По материалам диссертации опубликовано 7 научных работ, в том числе

1 журнальная публикация, рекомендованная ВАК перечня 2007 года,

1 публикация в центральной и 5 работ в региональной печати. Опубликованы методические рекомендации МР 4.2.005-07 «Методические основы обеспечения микробиологического мониторинга возбудителей инфекционной патологии». Принято участие в подготовке информационно-методического пособия «Сапропели Омского Прииртышья. Итоги пилотного исследования медико-фармацевтической группы «ВТК Сапропель»».

Структура и объём диссертации

Диссертация состоит из введения, обзора литературы, 6 глав собственных исследований, выводов, заключения, списка литературы и приложения. Работа представлена на 111 страницах текста, включает 10 таблиц и 22 рисунка. Указатель литературы содержит 89 отечественных и 31 иностранных источников. Приложение изложено на 13 страницах.

Заключение диссертации по теме «Эпидемиология», Родькина, Лариса Анатольевна

ВЫВОДЫ:

1. Произошли изменения в возрастной структуре заболеваемости сальмонеллёзами в сторону увеличения удельного веса детей от 3-6 лет с 5,9% в 1994г. до 11% в 2005г. и детей до 14 лет с 17,4 до 40%.

2. Выявлена общая тенденция улучшения качества пищевых продуктов по микробиологическим показателям в условиях внедрением новых технологических приёмов, режимов производства для пролонгирования сроков годности, а так же повышения ответственности изготовителя за качество и безопасность продукции.

3.Корреляционно-регрессионный анализ заболеваемости сальмонеллезами и динамики микробиологических показателей качества основных групп пищевых продуктов показал, что основными продуктами «риска», связанными с формированием заболеваемости, являются: мясо птицы и продукты птицеводства, а в последние годы кулинарные изделия, продукция общественного питания, мясо и мясные продукты.

4. Обследование объектов с целью планового надзора является эффективным методом выявления патогенной микрофлоры из пищевых продуктов и предметов окружающей среды.

5.Изученным штаммам Э.егЛегШсЦз в Омской области свойственна гетерогенность по плазмидной характеристике, которая проявляется наличием основных, а среди них - доминирующих в патологии человека плазмидоваров. Относительная стабильность плазмидоварной структуры изученных штаммов определяется наличием доминирующих плазмидоваров:38 МЕ)а, 38:1,4 МБа, 38:2,3 МЕ)а. Изменчивость изученных штаммов определяется наличием редко выявляемых плазмидоваров 8. еЫегШсИх: 38:4,4Мс1а - 38:4,4:2,2Мс1а — 80:3,2 Мс1а. б.Плазмидный анализ, дополненный данными серотипирования и антибиотикочувствительности, является эффективным методом внутривидового типирования 8.еп1егШ(Нз и может быть рекомендован для осуществления микробиологического мониторинга за сальмонеллезами.

7.Основным фактором передачи сальмонеллёзной инфекции является продукция предприятий промышленного птицеводства, а начиная с 2003 года и продукция предприятий общественного питания индивидуальной собственности.

8.Основным направлением профилактики сальмонеллёзов в Омской области до 2003г. являлось снижение инфицированности птицы и продуктов птицеводства на местных птицефабриках. В настоящее время профилактика инфекции включает и снижение инфицированности продукции предприятий общественного питания индивидуальной собственности.

Заключение.

Одним из основных направлений государственной политики в Российской Федерации является охрана здоровья населения как важнейшего фактора национальной безопасности. И в этом особое значение имеет борьба с инфекционными заболеваниями.

Федеральный Закон «О качестве и безопасности пищевых продуктов» №29 от 02.01.2000г., Постановление Правительства Российской Федерации №60 от 02.02.2006г. «Об утверждении Положения о проведении социально) -гигиенического мониторинга», МР МЗ РФ №2001/83 «По проведению социально-гигиенического мониторинга» от 25:05.200Гг., Приказ Роспотребнадзора-№367 от 17.11.2006г. определяют приоритетные направления государственной политики в области обеспечения качества и безопасности продуктов питания.

Вследствие наибольшей эпидемиологической значимости основное внимание уделяют исследованиям, пищевых продуктов на соответствие нормативным документам (НД) по микробиологическим показателям безопасности. Качественный состав и биологические характеристики микрофлоры пищевых продуктов могут оказывать существенное влияние на эпидемическую ситуацию по острым кишечным инфекциям (ОКИ).

Наиболее адекватной моделью, при которой прослеживается связь между качеством пищевых продуктов и заболеваемостью ОКИ; являются сальмонеллезы. Они распространены настолько широко, что сохраняет актуальность вопрос; о снижении уровня, заболеваемости и ограничении распространения возбудителя среди основных источников этой; инфекции. В настоящее upmn Salmonella enteritidis (Salmonella enterica subsp. enterica серовар enteritidis), занимает ведущее значение в этиологии сальмонеллезов в России. Рост заболеваемости обусловлен активацией эпизоотического процесса на предприятиях промышленного птицеводства, продукция которых преимущественно и используется в пищу населением.

В условиях повсеместного распространения сальмонеллезов необходимы новые критерии для диагностики и прогнозирования эпидемиологической ситуации. В последние годы для внутривидового типирования сальмонелл применяют методы молекулярной биологии, прежде всего плазмидный анализ. Он позволяет дифференцировать сальмонеллы на плазмидные варианты, определять источники и факторы передачи возбудителей, отличать привозные и местные случаи заболеваний. Микробиологический мониторинг служит информационной базой современной эпидемиологии и позволяет влиять на эффективность эпидемиологического надзора.

В период проведения реорганизационных мероприятий в санитарно-эпидемиологической службе важно предусмотреть ряд организационных моментов в системе управления инфекционной заболеваемостью на территории крупных промышленных городов.

Выполняя диагностические функции в системе управления инфекционной патологией, эпидемиологический надзор с современными подходами к организации противоэпидемических мероприятий, требует от лабораторной службы оперативной, достоверной, унифицированной и грамотной информации о циркуляции возбудителей инфекционных заболеваний на контролируемых территориях.

Одно из направлений реализации этих задач является создание автоматизированных информационных систем в лечебно-профилактических учреждениях (АИС ЛПУ), учреждениях Роспотребнадзора (АИС ИЛЦ), других ведомствах и предприятиях, и обеспечение их информационного взаимодействия.

Принцип автоматического учета и ведения баз данных, реестров является основополагающим в системе социально-гигиенического мониторинга, так же как и использование материалов различных ведомств, осуществляющих сопредельные функции.

Существующая система учёта и отчётности микропейзажа возбудителей инфекционной патологии в микробиологических лабораториях города показала, что имеющиеся сведения о высеваемости циркулирующих штаммов микроорганизмов, как из биоматериалов, так и из объектов окружающей среды, не в полной мере используются в эпидемиологическом анализе. Данные о высеваемых возбудителях специфических и неспецифических инфекций из клинико-диагностических лабораторий ЛПУ, лабораторий санитарно-эпидемиологической службы в комплексе не обобщаются и не анализируются. Учёт и отчётность проводится в пределах отдельно взятых министерств и ведомств. Это принижает значимость и эффективность использования диагностической функции лабораторных исследований в плане управления инфекционной заболеваемостью населения.

Система эпидемиологического надзора за циркулирующими популяциями микроорганизмов, вызывающими инфекционные заболевания состоит из трех взаимосвязанных подсистем: информационной, диагностической и управлен ческой.

Информационная подсистема при проведении микробиологического' мониторинга ориентирована на сбор данных из микробиологических лабораторий (МЛ) о свойствах циркулирующих возбудителей: принадлежности их к семейству, роду, виду, вирулентности и патогенности, типичности штаммов, резистентности к антибиотикам, бактериофагам, дезинфектантам, температурному фактору, их токсигенность, адгезивная и цитотаксическая активность, плазмидные характеристики, риботипирование и др.

Целью диагностической подсистемы является постановка эпидемиологического диагноза и прогнозирование эпидемической обстановки: определение ведущего типа эпидемического процесса, путей и факторов передачи возбудителя, выявление причин и условий (факторов риска) эпидемического процесса.

Управленческая подсистема предполагает разработку плана мероприятий по борьбе с возбудителями инфекционной патологии, методическую подготовку исполнителей и контроль за проведением санитарно-гигиенических, противоэпидемических и ветеринарно-санитарных мероприятий.

Для обеспечения функционирования АИС ММ в едином информационном пространстве предлагается использовать модульный принцип на базе программных средств «Эпидбак» (разработанного в ЦГСЭН в ЦАО г. Омска в 2002 году для микробиологического мониторинга возбудителей инфекционной патологии, выделяемых из биологических материалов), и программного средства «Испытательный лабораторный центр» (разработанного в ЦГСЭН в Омской области в 20031 году в том числе и для микробиологического мониторинга микрофлоры окружающей среды). Каждый модуль программ должен быть адаптирован в зависимости от порядка автоматизации рабочего места программного средства (АРМ ПС) и его применения.

Микробиологические лаборатории обеспечивают в первую очередь информационную подсистему системы эпидемиологического надзора. Можно выделить три основных потока информации:

- мониторинг возбудителей инфекционных патологий, выделенных от больных, переболевших, бактерионосителей, лиц, бывших в контакте с больными или обследуемых с профилактической целью

- мониторинг микрофлоры окружающей среды (вода питьевая, источников водоснабжения, сточная и др.; пищевые продукты и продовольственное сырье; почва, объекты окружающей среды лечебно-профилактических учреждений)

- мониторинг возбудителей, выделенных от животных, птиц и т.д.

Таким образом необходима разработка региональной модели микробиологического мониторинга возбудителей инфекционной патологии на основе классической схемы эпидемиологического надзора с применением единой автоматизированной информационной системы для обработки баз данных различных ведомств в рамках ведения социально-гигиенического мониторинга.

Становление системы микробиологического мониторинга на региональном уровне предполагает ряд организационно-правовых этапов:

1. Создание Центра микробиологического мониторинга (ЦММ) на базе Управления Роспотребнадзора субъекта РФ.

2. Подготовка Указа Губернатора по организации социально-гигиенического мониторинга (с привлечением всех необходимых ведомств, в том числе по организации микробиологического мониторинга), либо более узко и конкретизировано по профилактике инфекционной заболеваемости.

3. Либо подготовка соглашений или совместных приказов с каждым ведомством, предприятием и т.д. по передаче информации о результатах лабораторных исследований.

4. Проведение паспортизации всех лабораторий по ведомственной принадлежности, формам собственности, номенклатуре исследований, кадровому потенциалу.

5. Разработка стандартного программного средства для всех участников мониторинга.

6. Техническое оснащение микробиологических лабораторий.

7. Внедрение программных модулей всем участникам мониторинга.

8. Отработка передачи данных.

9. Сбор и анализ информации в ЦММ.

В структуре АИС ММ заложены разделы: унифицированные справочники, формы ввода первичной информации (журнал результатов исследований, протоколы испытаний либо «скрининговые» таблицы), аналитический блок, выходная информация в виде учетно-отчетных и аналитических таблиц.

Разработаны унифицированные скрининговые учётно-отчётные и аналитические формы, обеспечивающие концентрацию сведений о циркулирующей микрофлоре на центральном программном модуле.

Микробиологическими лабораториями 1-уровня заполняется либо персонифицированная база данных по результатам лабораторных исследований с возможностью их дальнейшей аналитической обработки и получению выходных форм, либо утвержденные скрининговые шаблоны для передачи на следующий уровень.

Эпидемиологи и другие специалисты II уровня в пределах своего учреждения связаны с базой данных лаборатории в локальной сети и осуществляют обработку информации в ежедневном режиме.

Передача данных на III уровень в ЦММ осуществляется ежемесячно, а при чрезвычайных ситуациях в ежедневном режиме в виде экспортных файлов за отчетный период.

Администратором АИС ММ осуществляется прием и импорт экспортных файлов или скрининговых шаблонов, ведение единой базы данных, администрирование системы, обеспечение информационной безопасности, техническое обучение специалистов всех уровней.

Специалисты аналитического профиля ЦММ, используя полную базу данных ММ и дополняя ее данными по заболеваемости и результатам надзорных функций, разрабатывают мероприятия по снижению инфекционной заболеваемости.

Автоматизированная система микробиологического мониторинга представляет собой многофункциональную и гибкую систему за счёт возможностей программы дополнять, актуализировать её справочники и выходные отчётные формы, изменять её модули в разных порядках. Это определяет перспективность АИС ММ.

Целью выше перечисленных задач является совершенствование системы эпидемиологического надзора, а целью настоящей работы совершенствование системы эпидемиологического надзора за сальмонеллёзами на основе микробиологического мониторинга пищевых продуктов и оценки значимости различных плазмидоваров сальмонелл в эпидемическом процессе.

Для выполнения поставленной цели впервые по материалам изучения на примере Омской области, на основе анализа многолетних данных заболеваемости и результатов исследования пищевых продуктов показана зависимость заболеваемости ОКИ от степени микробного загрязнения пищевых продуктов. По данным корреляционно-регрессионного анализа заболеваемости сальмонеллезами и динамики микробиологических показателей качества основных групп пищевых продуктов за период 1994-2005гг. проведен расчет прогноза заболеваемости и количества неудовлетворительных проб на 2007-2008гг. Основными продуктами риска», связанными с формированием заболеваемости сальмонеллезами, являются: мясо птицы и продукты птицеводства, а в последние годы - кулинарные изделия, продукция общественного питания, мясо и мясные продукты.

Впервые изучена клональная структура популяции возбудителей сальмонеллезов в Омской области, механизмы их реализации в эпидемическом процессе и выделены основные подходы для профилактики сальмонеллёзов пищевой этиологии. На основе изучения-структурной организации популяций S. enteritidis и других сальмонелл в Омской области впервые выявлена их плазмидная гетерогенность. Показано, что популяции свойственна относительная стабильность ее плазмидоварной структуры, определяемая доминирующими плазмидоварами микроба, и изменчивость, определяемая наличием редко выявляемых плазмидоваров S. enteritidis. Показано, что плазмидовар 38:1,4 MDa играет ведущую роль в заболеваемости всех возрастных групп населения.

Установлено, что S. dublin, S. montevideo, S. brandenburg, S. agama, S. derby, которые были выделены из пищевых продуктов, предметов окружающей среды и от больных, вероятнее всего относятся к завозной части микрофлоры, так*'как не были выделены на местных предприятиях промышленного птицеводства.

Установлено, что одной из причин снижения заболеваемости населения сальмонеллезом, вызванным S.typhimnrium, явилось уменьшение активности эпизоотического процесса среди птиц (кур) и ограничение эпидемиологической роли птицепродуктов.

В результате проделанной работы проведен комплексный анализ результатов испытаний пищевых продуктов по микробиологическим показателям в Омской области за период 1994-2005гг.; выделены наиболее значимые в заболеваемости ОКИ группы пищевых продуктов, показана зависимость уровня заболеваемости ОКИ от степени микробиологического загрязнения пищевых продуктов; проанализирована вероятность выделения патогенной микрофлоры при проведении планового надзора и по эпидемиологическим показаниям; сформирована база данных по выделению патогенной микрофлоры из продуктов питания, предметов окружающей среды и клинического материала; на основе плазмидного анализа проведено внутривидовое типирование штаммов Б.еЫегШсИз, которое используется для централизованного микробиологического мониторинга за возбудителями сальмонеллеза. Результаты мониторинга публикуют в «Ежемесячном информационном бюллетене о штаммах сальмонелл в Уральском, Сибирском и Дальневосточном федеральных округах Российской Федерации»; для оптимизации информационного обеспечения микробиологического мониторинга в системе эпидемиологического надзора за инфекционной патологией разработаны методические рекомендации МР4.2.005-07 «Методические основы обеспечения микробиологического мониторинга возбудителей инфекционной патологии»; сформулированы основные направления профилактики сальмонеллезов в Омской области, вызванного местной и завозной частями популяции 8.еп1егШсЦз.

В ходе работы были вынесены следующие положения:

- по данным бактериологических исследований в Омской области наиболее контамииированной сальмонеллами продукцией, реализуемой населению, является мясо птицы, продукты птицеводства, а начиная с 2003г. - мясные полуфабрикаты, изготовленные на предприятиях общественного питания индивидуальной' формы собственности. Обследование объектов с, целью планового надзора является эффективным методом контроля выявления патогенной микрофлоры из пищевых продуктов.

- в условиях внедрения новых технологических приёмов и режимов производства, а так же повышения ответственности» изготовителя за качество продукции отмечается тенденция улучшения качества пищевых продуктов по микробиологическим показателям безопасности.

- популяция еЫегШсИБ в Омской области гетерогенна по спектру выявляемых плазмид. Основным источником инфекции, вызванной основными плазмидоварами Б.еШегШсИз, является птица, выращиваемая на местных предприятиях промышленного птицеводства, а начиная с 2002г. - мясные полуфабрикаты, изготовленные на предприятиях общественного питания индивидуальной формы собственности.

Анализ заболеваемости острыми кишечными инфекциями показал, что за последние 12 лет наблюдается стабильная тенденция снижение заболеваемости: сальмонеллезами - с 59 случаев на 100 тыс. населения в 1994г. до 19 случаев в 2005г., дизентерией - со 102 на 100 тыс. в 1994г. до 56 случаев в 2005г., гастроэнтероколитами неустановленной этиологии - с 273 на 100 тыс. в 1994г. до 206 случаев на 100 тыс. в 2005г. (рис.1). Аналогичная тенденция снижения заболеваемости сальмонеллёзами наблюдается по РФ с 69 случаев на 100 тыс. населения в 1994г. до 26 случаев в 2004г. Стабильная тенденция роста заболеваемости зарегистрирована по гастроэптероколитам установленной этиологии с 97 случаев на 100 тыс. в 1994г. до 159 случаев на 100 тыс. в 2005г.

Анализ заболеваемости населения сальмонеллёзами по районам области показал, что наиболее стабильные высокие показатели заболеваемости зарегистрированы в Большереченском районе: 145,1 в 1995г., 135,1 в 1998г., 172,9 в 1999г., 247,3 в 2000г., 144,0 в 2001г. Эпизодически высокие показатели заболеваемости зарегистрированы: в Большеуковском районе (200,0 в 1995г., 114,0 в 1996г.), в Седельниковском районе (144,9 в1995г., 123,2 в 1998г.), в Усть-Ишимском районе (308,4 в 1994г., 232,2 в 1995г.).

В возрастной структуре сальмонеллезов регистрируется увеличение удельного веса детей до 14 лет и от 3 до 6 лет. Если в 1994 г. на долю детей до 14 лет приходилось 17,4%, детей от 3 до 6 лет 5,9% от общего количества случаев по области, то в 2005 г. на долю детей до 14 лет приходится 40%, а от 3 до 6 лет -11%. Одновременно регистрируется уменьшение удельного веса от общего числа случаев детей до года, от 16,1% в 1994г. до 8,3% в 2005г.

В этиологической структуре сальмонелл превалируют возбудители группы Д (85,9% в 1994 г., 68,3% в 1996 г., 91,4% в 2000 г., 88,5% в 2005 г. На группу В приходилось 2,5% в 1994 году, 14,3% в 1996 году, 6,2% в 2003 году, 7,2% в 2005 году. На группу С в структуре заболеваемости сальмонеллезами приходилось 2,4% в 1994 году, 8,4% в 1996 году, не регистрировалась заболеваемость сальмонеллезами группы С в 2002 году, в 2005 году она составила 1,5% .

Ежегодно в области регистрируется вспышечная заболеваемость ОКИ. Наибольшее число пострадавших - 602 человека (12 вспышек), зарегистрировано в 2005г., в том числе 464 детей в возрасте до 14 лет. В возрастной структуре основную группу пострадавших составляют дети до 14 лет, их удельный вес колеблется от 16,9% в 1999г. до 85,3%) в 2006г.

Данные эпидемиологического расследования очагов ОКИ с 1996г. по 2006г. показали, что в области превалирует контактно-бытовой путь передачи возбудителя, на его долю за 11 лет в среднем приходится 48,6%) (от 10,3% в 2005г. до 92,9% в 1999г). Удельный вес пищевого пути передачи составил 25,7% (от 2,5% в 2006г. до 48,5% в 2001г.). На долю водного пути передачи возбудителя^ в среднем приходится 25,4% (от 5,4% в 1996г. до 84,2% в 2005г.).

Мероприятия по профилактике кишечных инфекций должны быть направлены на совершенствование системы эпидемиологического надзора. При этом особое внимание необходимо уделять контролю за обеспечением населения доброкачественной- питьевой водой, продуктами питания, своевременным проведением противоэпидемических мероприятий в очагах.

Микробиологический анализ качества и безопасности пищевых продуктов показал, что объемы лабораторных испытаний пищевых продуктов* находились примерно на одном уровне и составили от 22 до 28 тысяч проб в год. Средний показатель нестандартных проб за отчетный период составил 6,3% (по РФ -7,25%>). Отмечается общая тенденция к снижению удельного веса проб, не отвечающим требованиям нормативов по микробиологическим показателям.

В результате анализа качества пищевых продуктов по содержанию остаточного количества антибиотиков установлено, что удельный вес проб, превышающих остаточное количество антибиотиков колеблется от 9,6% в 1994г., 1,5% в 2001г. до 36,9% в 2004 и 29,1% в 2005г. Основная доля (69%) испытуемых проб приходится на молоко и молочные продукты. Удельный вес проб молочных продуктов, превышающих остаточное количество антибиотиков, в среднем за 1994-2005гг. составил 13,8%). На долю антибиотиков тетрациклиновой группы приходится 85% (137проб), на долю пенициллина 12,5% (20 проб), на долю стрептомицина 2,5% (4 пробы).

Частота обнаружения повышенного содержания остаточных количеств антибиотиков в мясе, включая мясо птицы, в среднем составила 9,9%, от 4% в 1997г. до 22% в 2004г. Наиболее массивными загрязнителями, как и в молочных продуктах, являются антибиотики тетрациклиновой группы, на их долю приходится 90,9% (50 проб), на долю пенициллина приходится 5,4% (3 пробы), на долю стрептомицина - 3,6% (2 пробы). Данная ситуация может влиять на эффективность выделения патогенной микрофлоры, в том числе сальмонелл при микробиологическом мониторинге.

По результатам выявления патогенной микрофлоры в пищевых продуктах на базе, бактериологической лаборатории ЦГСЭН в Омской, области был подготовлен «Реестр патогенной микрофлоры, выделенной из пищевых продуктов и объектов окружающей среды». Он содержит базу данных с 1993г., постоянно пополняется информационными материалами по выделенным штаммам- микроорганизмов, и используется при проведении- мониторинга за циркуляцией патогенной микрофлоры в пищевых продуктах при проведении планового надзора, производственного контроля и по эпидемиологическим показаниям.

Наибольший процент выделения патогенных микроорганизмов из сырой продукции приходится на долю субпродуктов, яичного порошка, мяса птицы, фарша куриного. Одновременно необходимо отметить, что за анализируемый период отсутствует высеваемость сальмонелл из содержимого- яйца сырого, доставляемого на исследование в областную ветеринарную лабораторию с птицефабрик, которое прошло предварительную обработку газовой формалиновой смесью перед поступлением в розничную торговую сеть.

Потенциально опасными объектами, допускающими выпуск продукции, содержащей патогенную микрофлору, были предприятия промышленного птицеводства, предприятия мясоперерабатывающей отрасли, а в последние годы предприятия общественного питания индивидуальной собственности.

Из 227 штаммов сальмонелл, выделенных лабораториями ЦГиЭ 76,7%(174к-ры) приходится на долю обследования объектов с целью планового надзора, и 22,7%(53 к-ры) на долю обследования по эпидемиологическим показаниям. Из чего следует, что обследование объектов с целью планового надзора является эффективным методом контроля- выявления патогенной микрофлоры из пищевых продуктов: Начиная с 2003г. патогенная микрофлора выделялась только из мясных полуфабрикатов, изготовленных на1 предприятиях общественного питания индивидуальной; формы собственности.

Таким образом; основным* направлением профилактики сальмонеллёзов в Омской области- до 2003г. являлось снижение инфицированное™, птицы на местных предприятиях птицеперерабатывающей отрасли. В настоящее время профилактика, инфекции включает и снижение инфицированное™ продукции, выпускаемой' предприятиями общественного питания индивидуальной < собственности.

Проанализирована инфекционная: заболеваемость населения^ ОКИ ш сальмонеллезами на территории Омской* области, микробная обсемененность продуктов питания по величине процента проб не соответствующих требованиям гигиенических нормативов по микробиологическим показателям за период 1994-2005г.г. по данным отчетных статистических форм.

Наличие положительной' корреляции сильной степени выраженности по удельному весу нестандартных проб основных групп пищевых продуктов: и заболеваемостью ОКИ было обнаружено по следующим группам ■ продуктов -молоко^ кондитерские и кулинарные изделия; детское питание, и напитки (г - от 0,62 до 0,89), соответственно коэффициент детерминации^ составлял от 38;5% до 79,3% соответственно;

При анализе связи удельного веса нестандартных проб (выделение сальмонелл) с заболеваемостью сальмонеллезами наличие положительной корреляции сильной степени выраженности было обнаружено по следующим группам продуктов - мясо птицы и продукты птицеводства, мясо и мясные продукты, кулинарные изделия (г - от 0,02 до 0,54), коэффициент детерминации составляет от 17,8% до 29,5% соответственно.

При сопоставлении удельного веса нестандартных проб пищевых продуктов и заболеваемости сальмонеллезами по районам Омской области за 1994-2005гг. наличие положительной корреляции сильной степени выраженности было обнаружено в Большереченском районе (г = 0,26), Усть-Ишимском районе (г = 0,78), Большеуковском районе (г = 0,62). В Омском районе коэффициент корреляции составил г = -0,28, хотя удельный вес случаев заболевания сальмонеллезами по району в среднем за 1994-2005 гг. от общего числа случаев по районам области составил 11,7%, что отчасти можно объяснить реализацией продукции предприятий пищевой промышленности населению г. Омска.

Рассматривая роль микробиологического мониторинга, который является одним из направлений эпидемиологического надзора и представляет собой систематический сбор и анализ информации о циркулирующих штаммах, вызывающих инфекционную патологию человека, для изучения их эпидемиологически значимых биологических свойств и проведения! своевременных противоэпидемических мероприятий, направленных на снижение или ликвидацию инфекций был представлен алгоритм микробиологических исследований по разделу «острые кишечные инфекции и сальмонеллёзы». Основные методы, используемые в лабораторной диагностике ОКИ и сальмонеллёзов: микробиологический, иммунологический и молекулярно-генетический. Молекулярно-генетический метод используется^ для внутривидового типирования сальмонелл, среди которых наиболее распространенным является плазмидный анализ, выполняемый по методике Kado C.I.,Liu S.T. 1981. Этот метод оценки геномного полиморфизма микроорганизмов, позволяет проводить анализ структуры популяции возбудителей на территориальной еденице, выделенных из пищевых продуктов, предметов окружающей среды, от больных и контактных, и путей реализации гетерогенной популяции микроба в эпидемическом процессе.

Кроме того установлено, что появление новых плазмидоваров S. enteritidis может приводить к существенным изменениям показателей заболеваемости.

С этой целью было изучено 97 штаммов сальмонелл, по результатам исследований был проведен первоначальный анализ плазмидных вариантов популяции сальмонелл на территории Омской области, выделенных из пищевых продуктов, предметов окружающей среды, от больных и контактных.

По источнику выделения штаммы распределились следующим образом: 68 штаммов изолировано от больных и лиц, контактировавших с больными, .10 - из пищевых продуктов, 11 штаммов из внутренних органов погибших животных (крупный рогатый скот) и 8 штаммов - из объектов внешней среды.

На, долю Я. еЫегШсИъ из всех изученных культур, приходится 79 штаммов (81,4%), причем 34 штамма (43,0%)-имеют плазмидовар 38:1,4Мёа. Кроме того, наиболее часто выявляемыми были штаммы плазмидоваров: 38Мс1а- всего выделено 30 штаммов или 37,9% и 38:2,ЗМс1а- выделено 9 штаммов-или 11,4%. Еденичные штаммы имели следующий набор плазмид: 38:4,4Мс1а-3 штамма, 38:4,4:2,2Мс1а -2 штамма, 80:3,2Мс1а -Г штамм. Плазмида с молекулярной-массой 38Мёа является плазмидой вирулентности, специфичной для серовара- 8. еЫегШсИъ.

Источником выделения доминирующего плазмидовара являются- больные; лица, контактировавшие с больными, объекты внешней среды, продукты и внутренние органы крупного рогатого скота при падеже. Штаммы- остальных сероваров и плазмидоваров сальмонелл наиболее часто выделяли из внутренних органов крупного рогатого скота при падеже и воды. Отчасти- объяснение данным особенностям популяции получено в процессе изучения- плазмидной характеристики штаммов 8. еЫегШсИз, выделенных из продукции местных птицефабрик. Оказалось, что штаммы плазмидоваров микроба, играющие основную роль в этиологии инфекции, циркулируют среди птицы местных предприятий промышленного птицеводства и вместе с их продукцией попадают населению. Следовательно, можно утверждать, что причина заболеваемости населения с доминирующими плазмидоварами 8. еЫегШсИз состояла в циркуляции возбудителя на местных предприятиях промышленного птицеводства

Штаммы 8.с1иЬНп, изолированные от телят в ЗАО «Знамя» Марьяновского района, относятся к плазмидовару 50Мс1а. Данная плазмида является серотипоспецифической плазмидой вирулентности ЗЛиЬИп. Учитывая однотипность плазмидной характеристики штаммов, изолированных в 2005г. и I кв. 2007г., можно полагать о наличии среди животных ЗАО «Знамя» хронического эпизоотического сальмонеллёзного процесса, вызванного БЛиЬНп плазмидовара 50Мс1а.

Главная особенность штаммов редко выявляемых сероваров и плазмидоваров состоит в том, что они не имеют существенной значимости в формировании заболеваемости населения. Так, из 68 штаммов выделенных от больных и контактных только 2 штамма (2,9%) приходится на другие серовары. Возрастная структура изученных штаммов представлена следующим образом, дети от 0-6 лет составляют 12,5%, на долю детей до 14 лет приходится 41,3%; 46,2% изученных штаммов выделено от взрослых.

Представленные данные показали, что в Омской области циркулирует гетерогенная по плазмидным характеристикам еШегШсИя. Основными свойствами этой популяции является ее стабильность, обусловленная наличием доминирующих плазмидоваров микроба, маркированных плазмидами: 38М(1а — 38:1,4Мёа - 38:2,ЗМёа., и изменчивость, определяемая наличием, редко выявляемых плазмидоваров Б. еЫегШйгз: 38:4,4Мёа - 38:4,4:2,2Мёа- 80:3,2 М(1а.

Учитывая, что по биотипу и антибиотикорезистентности исследованные штаммы представляют собой, за небольшим исключением, однородную, группу, плазмидный анализ можно считать- эффективным методом внутривидового типирования микроба.

В настоящем исследовании представлен только первый опыт такого мониторинга, но его результаты показали целесообразность и перспективность слежения за движением возбудителя на изучаемой территории, а централизация микробиологического мониторинга позволяет следить за движением возбудителя на территории Азиатской части России.

Список литературы диссертационного исследования кандидат медицинских наук Родькина, Лариса Анатольевна, 2007 год

1. Акимкин В.Г. Нозокомиальный сальмонеллез у взрослых / В.Г.Акимкин, В .И.Покровский //М. Изд-во РАМН, 2002.- 130с.

2. Батурлина С.Н. Информационное обеспечение и эпидемиологические аспекты микробиологического мониторинга на основе компьютерных технологий / С.Н. Батурлина // автореф. дис. . кан. мед. наук.- Омск, 2004.- С. 3-20.

3. Беляев E.H. Деятельность госсанэпидслужбы в период экономических реформ в России / Е.Н:Беляев, Н.В.Зайцева, В.Л.Гончаренко // Эпидемиология и инфекционные болезни,-М., 1999.-№3.-С.4-9.

4. Березина Л.А., Вашукова С.С. и др. Возбудители острых кишечных заболеваний / Л.А.Березина // пособие для бактериологов.- С-Петербург., 1995.-С.3-17.

5. Бондаренко В.М. Изменение функциональной активности фагоцитов в зависимости от наличия у бактерий плазмиды pR50 / В.М.Бондаренко, Е.В.Рябиченко, Н.Л.Мальшакова // Журн. микр.- 2003.- № 3,- С. 3-7.

6. Борисов Л.Б. Медицинская микробиология, вирусология, иммунология /Л.Б.Борисов// М., ООО «Медицинское информационное агентство», 2001.-С.396.

7. Болдырева H.H. Особенности эпидемиологии кишечных инфекций в Ковровском районе Владимирской области / Н.Н.Болдырева // Журн. микр.-2002.- № 1.-С. 105-107.

8. Воротыпцева Н.В. Клинические особенности пищевой вспышки сальмонеллеза у детей / Н.В.Воротынцева, А.В.Горелова // Эпидемиология и инфекционные болезни,- 2003.- № 5.- С. 51-54.

9. Далматов В.В. Применение методов математической статистики при проведении эпидемиологического анализа / ВВ.Далматов, Р.Н.Готвальд, В.Л.Стасенко // Пособие для студентов, интернов, ординаторов, практических врачей. Омск.- 2002.- С.3-4.

10. Далматов В.В. Методические рекомендации по применению методов математической статистики при проведении эпидемиологического анализа / В.В.Далматов, Р.Н.Готвальд, В.Л.Стасенко // Омск, 1998.- С.8-10.

11. Далматов В.В. Социально- гигиенический мониторинг и эпидемиологический надзор в системе управления здоровьем населения /

12. B.В.Далматов, В.Л.Стасенко, Т.М.Обухова // Материалы 1Умежрегион. науч.-практ. конф. с международным участием, посвященной 60-летию кафедры эпидемиологии и 80-летию кафедры микробиологии ОмГМА.- Омск, 2003.1. C.102-111.

13. Далматов В.В. Методология формирования умений системного анализа у студентов в процессе преподавания эпидемиологии / В'.В. Далматов, В.Л.Стасенко, Ю.В.Ерофеев, Д.В.Турчанинов // Омский научный вестник,2006,- №3(37).- С. 222-227.

14. Дмитриева Г.М. О вспышке сальмонеллёза у работников птицефабрики в Красноярском крае / Г.М.Дмитриева, Е.В.Карева и др./ Материалы IX съезда всероссийского науч.-практ. общества эпидемиологов, микробиологов и паразитологов.- М., 2007.- С.144-145.

15. Информационный сборник статистических и аналитических материалов. 1999 2004 г.г. - М., 2005. - С 25-28.

16. Кальницкая О.И. Подбор микробиологической тест-системы для обнаружения антибиотиков в продуктах животного происхождения: метод, рекомендации / О.И.Кальницкая; Российская академия сельскохозяйственных наук,- М., 2006,- 8с.

17. Карцев В.В. Санитарная микробиология пищевых продуктов: руководство для врачей / В.В.Карцев, Л.В.Белова, В.П. Иванов. С-Петербург: Мед. книга, 2000.-236с.

18. Килессо В.А. Факторы резистентности и вирулентности возбудителей разных бактериальных инфекций и их клинико-эпидемиологическое значение / В.А.Килессо // Сборник научных трудов.- М.,1988.- С. 5-8.

19. Килессо В.А., Черкасский Б.Л., Рожнова С.Ш. Госпитальный сальмонеллез. Эпидемический процесс как социально-экологическая система / В.А.Килессо, Б.Л.Черкасский, С.Ш.Рожнова//М., 1986.- С. 51-56.

20. Кузнецова H.A. Молекулярная эпидемиология сальмонеллеза, вызванного Salmonella enteritidis, в Приморском крае / Н.А.Кузнецова-// автореф. дис. . кан'мед. наук.- Владивосток., 2006.- С. 7-11.

21. Кузнецова- H.A. Внутригодовая динамика сальмонеллёза, вызванного гетерогенной популяцией Salmonella enteritidis / Н.А.Кузнецова, Ф.Н.Шубин, A.B.Раков и др. // Журн. микр., 2006.- № 3.- С. 32-36.

22. Ковальчук Н.И. Плазмидные характеристики различных сероваров сальмонелл и их применение в системе микробиологического мониторинга при сальмонеллезе / Н.И.Ковальчук // автореф. дис. . кан. мед. наук.-Владивосток., 2004.- С. 3-15.

23. Красиков А.П. Мониторинг эпизоотологической обстановки по инфекционным болезням птиц в Западно-Сибирском регионе и Алтайскомкрае / А.П.Красиков, Н.В:Рудаков, В.Г.Крыцын и др. // Сборник научных, трудов

24. Лопотко- М.З. Состав, свойства, ресурсы^ озёрных санропелей и; научные основы их комплексного освоения / М.З Лопотко // автореф: дис. д-ра техн. наук.-Минск., 1984.-С. 3-34.

25. Мамонтова Л.М., Кондратьева А.М., Марков; A.B. и: др. Принципы, организации микробиологического мониторинга // Бюллетень ВСРЩ СО РАМП № 4 (18). Иркутск, 2001 С.50-55. ■.; ■.'.

26. Нафеев A.A. Оптимизация эпидемиологического надзора с; применением современных технологий / А.А.Нафеев?/ Материалы IX съезда всероссийского i науч.-практ. общества эпидемиологов, микробиологов; и паразитологов.- М:, 2007.- С.24-25.

27. Онищенко Г.Г. Эпидемиологическая обстановка в Российской-Федерации;и основные направления деятельности по ее стабилизации / Г.Г. Онищенко // Материалы VIII Всероссийского съезда эпидемиологов, микробиологов и паразитологов. М., 2002.-С.27-29.

28. Онищенко Г.Г. Заболеваемость инфекциями, управляемыми средствами специфической профилактики в Российской Федерации и задачи по ее снижению и ликвидации / Г.Г.Онищенко // Журн. микроб., 2003.- №2.-С. 16-28.

29. Об инфекционной заболеваемости в Республике Казахстан в 2006г Электронный ресурс. — 2006. Режим доступа http://www.nomad.su/?a=3-200702120429.

30. О сапропелях Электронный ресурс.- 2001.- Режим доступа: http//www.eco-sapropel.ru/rus/sapropel .html.

31. Панацея от всех болезней лечебная грязь Сапропель Электронный ресурс.- 2005.- Режим доступа: http//faberlic.rosdon.ru/sapropel.html.

32. Покровский В.И. Роль эпидемиологической науки и практики в охране здоровья населения страны / В.И.Покровский // Журн. микроб.- 2003.- № 5.-С.34-40.

33. Покровский В.И. Эволюция инфекционных болезней в России в XX веке / В.И. Покровский, Г.Г.Онищенко, Б.Л.Черкасский // МЕДИЦИНА. М., 2003.- С. 18-25.

34. Покровский В.И. Инфекционные болезни в конце XX века и санитарно-эпидемиологическое благополучие в России в XXI веке / В.И.Покровский, Г.Г.Онищенко, Б.Л.Черкасский // Журн. микроб., 2002.№3.- С. 16-23.

35. Покровский В.И. Современные представления об инфекционной патологии и основных направлениях совершенствования стратегии ее профилактики / В.И.Покровский, Г.Г.Онищенко, Б.Л.Черкасский // Вестник РАМН.- 2000.-С.З-7.

36. Покровский В.И., Поздеев В.К. Медицинская микробиология / В.И.Покровский, О.К.Поздеев //ГЭОТАР МЕДИЦИНА. М., 1999.- С. 363-378.

37. Покровский В.И. Руководство по зоонозам / В.И.Покровский //МЕДИЦИНА. М., 1983.- С.- 260.

38. Раков A.B. Сравнительная характеристика сальмонеллеза, вызванного различными плазмидоварами S. enteritidis / А.В.Раков, Ф.Н.Шубин, В.А.Иванис и др. // Журн. микр.- 2001,- №5.- С. 50-54.

39. Раков A.B. Микробиолого-клинические параллели при сальмонеллёзной инфекции / А.В.Раков // автореф. дис. . кан. мед. наук.- Владивосток, 2003.- С. 3-22.

40. Раков A.B. Сравнительный анализ штаммов S. enteritidis, выделенных от больных системной сальмонеллёзной инфекцией / А.В.Раков, Ф.Н.Шубин, Н.А.Кузнецова и др. // Журн. микр,- 2006.- № 3.- С. 36-39.

41. Раков A.B. Эпидемиологические особенности сальмонеллёза, вызванного Salmonella enteritidis /А.В.Раков, Ф.Н.Шубин, Н.А.Кузнецова/ Материалы IX съезда всероссийского науч.-практ. общества эпидемиологов, микробиологов и паразитологов.- М., 2007.- С. 185.

42. Руководство к лабораторным занятиям по медицинской микробиологии, вирусологии, иммунологии под. ред. Л.Б.Борисова // М,- 1993.- 215с.

43. Рудакова Р.И., Кортев А.И. Сальмонеллез в Западной Сибири / Р.И.Рудакова, А.И.Кортев // Омск., 1976.- С.86-92.

44. Рожнова С.Ш. Значение плазмид в эволюции возбудителей и*-эпидемиологического процесса внутриболышчных сальмонеллезов / С.Ш.Рожнова, Л.А.Кофтырева // Журн. эпидемиология и инфекционные болезни.-2000.- №5. -С.25-27.

45. Рожнова С.Ш. Сальмонеллезы, проблемы и решения / С.Ш.Рожнова // Журн. эпидемиология и инфекционные болезни.- 1999.- №2. С.39-41.

46. Рожнова С.Ш. Роль лабораторной диагностики и микробиологического мониторинга в профилактике «госпитальных» сальмонеллезов / С.Ш.Рожнова, М.А.Головина, О.А.Христюхина // Эпидемиология и вакцинопрофилактика.-2005.-№3.-С. 42-44.

47. РИА Новости, отравление в Якутии Электронный ресурс. 2007. - Режим доступа: http://www.urbc.rujdigest.asp?da==93912.

48. Савицкая К.И. Мониторинг возбудителей острых кишечных инфекций в регионе Московской области / К.И.Савицкая, А.Ю.Миронов, Ю.Б.Аваш и др. // Журн. микроб., 2002.- № 6.- С. 10-13.

49. Солодевников Ю.П. Эпидемиологические вспышки кишечных инфекций -индикатор общей и сезонной активности эпидемиологического процесса / Ю.П.Солодевников, А.Г.Тибекин, Л.Л.Черкасова и др. // Журн. микроб., 2004.-№3.- С.112-116.

50. Солодников Ю.П. Распространение сальмонеллезов в Москве и пути их профилактики / Ю.П.Солодников, А.Т.Тибекин, Л.В.Черкасова и др. // Журн. микр. 2004.- № 5.- С. 36-39.

51. Солодников Ю.П. Вспышка сальмонеллёзной инфекции в детском саду / Ю.П.Солодников, А.Т.Тибекин, М.В.Ермоленко и др. // Журн. микр.- 2005.- № 3.- С. 121-122.

52. Сергевнин В.И. Современные тенденции в эпидемиологии сальмонеллезной инфекции и научно-методические основы эпизоотолого-эпидемиологического надзора / В.И.Сергевнин // автореф. дис. . док. мед. наук.- Пермь., 1995.- С. 334.

53. Сергевнин В.И. Серологический мониторинг при сальмонеллезах / В.И.Серневнин // инструктивно-методическое письмо.- Пермь., 1993.- С.4-8.

54. Сергевнин В.И., Коза Н.М. и др. Оперативная оценка эпизоотического состояния промышленных птицекомплексов по сальмонеллезной инфекции. / В!И.Сергевнин // Региональные методические рекомендации.- Пермь., 1992.- С. 3-11.

55. Сергевнин В.И., Шарипова И.С. и др. Меры профилактики заражений сальмонеллезной инфекцией через куриные яйца и яйцесодержащие продукты / В.И Сергевнин // Информационно-инструктивное письмо.- Пермь., 1994.- С.З-11.

56. Сергевнин В.И., Коза Н.М. и др. Эпизоотолого-эпидемиоллогический надзор за сальмонеллезной инфекцией / В.И.Сергевнин // Межрегиональные методические рекомендации.- Пермь-Челябинск., 1993.- С. 3-17.

57. Сергевнин В.И. Экспериментальная оценка выживаемости Salmonella enteritidis в майонезе и яичном порошке / В.И.Сергевнин, Е.В.Сармометов,

58. Л.С.Смирнова и др./ Материалы IX съезда всероссийского науч.-практ. общества эпидемиологов, микробиологов и паразитологов.- М., 2007.е.34-35.

59. Федеральный закон « О санитарно-эпидемиологическом благополучии населения». №52-ФЗ от 30 марта 1999г.

60. Филатов Н:Н. Пути совершенствования эпидемиологического надзора на основе разработки и внедрениям системы социально-гигиенического мониторинга / Н;Н.Филатов // автореф. дис. . док. мед. наук.- М., 1999.- С.46-47.

61. Филатов Н.Н'. Информационное обеспечение эпидемиологического; надзора / Н.Н.Филатов, В.М.Глиненко, М.В.Ефимов / Материалы IX съезда' всероссийского науч.-практ. общества эпидемиологов,- микробиологов ш паразитологов.- М., 2007,- С.34-35.

62. Чайникова И.Н. Влияние плазмиды рК50, контролирзгющей протеазн}гю активность бактерий на экспериментальную сальмонеллёзную инфекцию / И.Н. Чайникова // Жури, микр.- 2006.- № 1.- С. 6-9.

63. Черкасский Б.Л; Инфекционные и паразитарные болезни человека / Б.Л.Черкасский // Справочник эпидемиолога. М., 1994.- С. 216-2201

64. Черкасский БЛ. Система эпидемиологического1 надзора и системы социально-гигиенического мониторинга / Б.Л.Черкасский // Эпидемиология и инфекционные болезни.- 1999.-С. 10-14.

65. Черкасский Б.Л: Эпидемиологический надзор за зоонозами / Б.Л.Черкасский // Алма-Ата.-1988.-С.196.

66. Черкасский Б;Л., Рожнова С.Ш. Современная эволюция сальмонелл. Пищевые зоонозы / Б.Л. Черкасский, С.Ш.Рожнова // Материалы международного симпозиума м., 1994.- С.34-35.

67. Черкасский Б.Л., Рожнова С.Ш., Христюхина О.А., Соловьева Н.К. Современные особенности эпидемического процесса сальмонеллезов в СССР / Б.Л.Черкасский, С.Ш.Рожнова и др. // Журн. микроб. 1991.- №1.- С.31-36.

68. Черкасский Б.Л. Сальмонеллезы. Методические рекомендации / Б.Л.Черкасский // М., 1995.- С.3-25.

69. Черкасский Б.Л. Болезни животных, опасные для человека /Б.Л.Черкасский // М., 1997.-С. 2-37.

70. Черкасский Б.Л. Соловьева Н.К. Фролочкина Т.И. Сравнительная характеристика эпидемиологии сальмонеллезов / Б.Л.Черкасский, Н.К.Соловьева, Т.И.Фролочкина // Здравоохранение Р.Ф. 1992.- №10.- С.15-16.

71. Черкасский Б.Л. Вопросы эпидемиологии некоторых зоонозов. / Б.Л.Черкасский //Научный обзор. М., 1975.- С. 14-28.

72. Шагинян И.А. Молекулярная эпидемиология: предмет, цель и задачи новой науки / И.А.Шагинян, И.В.Тарасевич/ Материалы IX съезда всероссийского науч.-практ. общества эпидемиологов, микробиологов и паразитологов.- М., 2007.-С.41-42.

73. Шубин Ф.Н. Микробиологический мониторинг за Э. е^егШсИэ в Приморском крае. Фенотипическая и плазмидная характеристика возбудителя /Ф.Н.Шубин, Н.И.Ковальчук, Н.А.Кузнецова и др // Эпидемиология и инфекционные болезни.- 2002,- №1.- С. 36-39.

74. Шубин Ф.Н. Микробиологический мониторинг за З.еЩегШсНБ в Приморском крае. Характеристика заболеваемости, вызванной различными плазмидоварами микроба во Владивостоке /Ф.Н.Шубин, Н.А.Кузнецова,

75. Н.И.Ковальчук и др.// Эпидемиология и инфекционные болезни.-2002.- №1.- С.40-43.

76. Application of molecular methods to a nosocomial outbreak of Salmonella enteritidis phage type 4. / Rushdy AA, Wall R, Seng C, Wall PG, Stuart JM, Ridley AM, Threlfall EJ, Ward LR.// J Hosp Infect.-1997 Jun- Vol. 36, №2. P. 123-131.

77. Barth S. Virulence plasmids of Salmonella enterica—incidence and properties / S. Barth, R. Bauerfeind // Berl. Munch. Tierarztl. Wochenschr. 2005. - Vol. 118, № 1-2.-P. 8-23.

78. Conversion of Salmonella enteritidis phage type 4 to phage type 7 involves loss of lipopolysaccharide with concomitant loss of virulence. / Chart H, Row B, Threlfall EJ, Ward LR. // FEMS Microbiol Lett.- 1989 Jul- Vol.51, №1. P. 37-40.

79. Characterization of multiple-antimicrobial-resistant salmonella serovars isolated from retail meats / S. Chen et al. // Appl. Environ. Microbiol. 2004. - Vol. 70,* № l.-P. 1-7.

80. Characterization of Salmonella ser. enteritidis phage type 34 isolated from food poisoning outbreaks in Tokyo by epidemiological makers / Kusunoki J, et al. // Kansenshogaku Zasshi. 1996. - Vol. 70, № 7. - P. 702-709.

81. Dissemination amongst humans and food products of animal origin of a Salmonella typhimurium clone expressing an integron-borne OXA-30 beta-lactamase / P. Antunes et al. //J. Antimicrob. Chemother. 2004. - Vol. 54, № 2. - P. 429434.

82. Expression of a new porin 'OmpE' by strains of Salmonella. / Chart H, Frost J.A, Rowe B. // FEMS Microbiol Lett. -1993 May Vol.109, №3. P. 185-187.

83. Epidemiological application of differentiating multiresistant Salmonella typhimurium DTI04 by plasmid profile / E.J. Threlfall et al. // Commun. Dis. Rep. CDR Rev. 1996. - Vol. 6, № 11. P. R155-R159.

84. Genetic relationships among strains of Salmonella enteritidis in a national epidemic in Switzerland. / Stanley J, Burnens AP, Threlfall EJ, Chowdry N, Goldsworthy M // Epidemiol Infect. -1992 Apr- Vol.108, №2.- P. 213-220.

85. Isolation, molecular characterization and antimicrobial resistance patterns of Salmonella and Escherichia coli isolates from meat-based fast food in Lebanon / S. Harakeh et al. // Sci. Total Environ. 2005. - Vol. 341, № 1-3. - P. 33-44.

86. Identification of contemporary plasmid virulence genes in ancestral isolates of Salmonella enteritidis and Salmonella typhimurium. / Jones CS, Osborne DJ. // FEMS Microbiol Lett. -1991 May- Vol.64, № 1. P. 7-11.

87. Jelesic Z. Analysis of the plasmid profile of various Salmonella serotypes / Z. Jelesic, M. Kulauzov, G. Kozoderovic // Med. Pregl. 2000. - Vol. 53, № 11-12. -P. 564-567.

88. Molecular analyses of Salmonella enterica isolates from fish feed factories and fish feed ingredients / L.L. Nesse et al. // Appl. Environ. Microbiol. 2003. - Vol. 69, №2.-P. 1075-1081.

89. Molecular characterization of plasmids in Salmonella enteritidis phage types. / Brown DJ, Threlfall EJ, Hampton MP, Rowe B // Epidemiol Infect.-1993 Apr-Vol.l 10, №2. P.209-216.

90. Molecular epidemiology of antibiotic resistance of Salmonella enteritidis during a 7-year period in Greece / P.T. Tassios et al. // J. Clin. Microbiol. 1997. - Vol. 35, №6.-P. 1316-1321.

91. Outer membrane characteristics of Salmonella enteritidis phage type 4 growing in chickens. / Chart H, Conway D, Rowe B. // Epidemiol Infect. -1993 Dec- Vol.111, №3. P.449-454.

92. Plasmid profiles and resistance to antimicrobial agents among Salmonella enteritidis isolates from human beings and poultry in the midwestern United States / U.S. Nair et al. // J. Am. Vet. Med. Assoc. 1995. - Vol. 206, № 9. - P. 13391344.

93. Plasmid analysis of Australian strains of Salmonella enteritidis. / Mills L, Woolcock JB, Cox JM. // Lett Appl Microbiol. -1995 Feb- Vol. 20, №2. P.85-88.

94. Phage restriction and the presence of small plasmids in Salmonella enteritidis. / Gado I, Laszlo VG, Nagy B, Milch H, Drin I, A wad-Masalmeh M, Horvath J.// Zentralbl Bakteriol.-1998 May- Vol.287, №4. P.509-519.

95. Benson, D.J. Piatt //Epidemiol: Infect. 1995. - Vol. 144, № 1.- P. 25-40.

96. Subdivision'of Salmonella enteritidis PT 4 by pulsed-field gel electrophoresis: potential for epidemiological surveillance. / Powell NG, Threlfall' EJ, Chart If, Rowe B-//FEMS Microbiol Lett.-1994 Jun- Vol.l l 9, №2. P: 193-198:

97. Someya A. Antimicrobial susceptibilities of Salmonella isolates, obtainedi from layer chicken houses on a commercial egg-producing farm in Japan, 1997 to 2002 / AvSomeya, K. Otsuki, T; Murase // J. Food Prot. 2005. - Vol. 68, № 10. - P. 20302034.

98. Seyfarth A.M. Antimicrobial resistance in Salmonella enterica subsp. enterica serovar typhimurium from humans and production animals / A.M. Seyfarth, PLC. Wegener, N. Frimodt-Moller // J. Antimicrob. Chemother. 1997. - Vol. 40, № 1. -P. 67-75.

99. Tsen H.Y. Analysis; of Salmonella enteritidis strains isolated from food-poisoning cases in Taiwan by pulsed field gel electrophoresis, plasmid profile andphage typing / H.Y. Tsen, J.S. Lin.// J. Appl. Microbiol. 2001. - Vol. 9.1, № 1. - P.72.79.

100. The effect of environmental pH on the physiology and surface structures of Salmonella serotype enteritidis phage type 4. / McDermid AS, McKee AS, Dowsctt AB, Marsh PD.// J Med Microbiol. -1996 Dec- Vol. 45, №6. PC 452-458.

101. Use of plasmid profile typing for surveillance of Salmonella enteritidis phage type 4 from humans, poultry and eggs. / Threlfall EJ, Hampton MD, Chart H, Rowe B.// Epidemiol Infect. -1994 Feb- Vol.112, №1. P. 25-31.

102. Virulence of Salmonella enteritidis phage type 4 is related to the possession of a 38 MDa plasmid. / Chart H, Threlfall EJ, Rowe B. // FEMS Microbiol Lett. 1989 Apr- Vol. 49, №2. -P. 299-303.