Изучение алеллофонда пород Gallus Gallus с использованием микросателлитов тема диссертации и автореферата по ВАК РФ 03.02.07, кандидат биологических наук Волкова, Валерия Владимировна

• Волкова, Валерия Владимировна
• кандидат биологических наук
• 2012

Оглавление диссертации кандидат биологических наук Волкова, Валерия Владимировна

СПИСОК СОКРАЩЕНИЙ

ВВЕДЕНИЕ

1. ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ

1.1. Общая характеристика состояния птицеводства в России

1.2. Современные направления в селекции кур

1.3. Современное состояние генофонда домашних кур

1.4. Микросателлитные маркеры и их свойства

1.5. Использование микросателлитных меркеров для поиска 33 С)ТЬ у кур

1.6. Использование микросателлитных маркеров для 37 генетической характеристики пород и популяций кур

1.7. Краткое заключение по обзору литературы

2. МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ ИССЛЕДОВАНИЙ

2.1. Животные

2.2. Реактивы и оборудование

2.2.1.' Реактивы и расходные материалы

2.2.2. Оборудование

2.3. Банк проб и ДНК

2.4. Методы исследований

2.4.1. Исследование функциональных характеристик и 48 потребительских свойств тест-системы

2.4.1.1. Функциональные характеристики

2.4.1.2. Потребительские свойства

2.4.2. Создание генетических паспортов пород

3. РЕЗУЛЬТАТЫ ИССЛЕДОВАНИЙ

3.1. Характеристика системы сохранения и рационального использования пород кур генофондного стада

3.2. Разработка мультиплексной тест-системы анализа восьми 55 микросателлитов кур

3.2.1. Выбор локусов и теоретическое моделирование системы 55 генетического анализа кур на основе МС

3.2.2. Экспериментальная апробация системы анализа МС кур

3.3. Оценка функциональных характеристик и 61 потребительских свойств разработанной тест-системы

3.3.1. Функциональные характеристики

3.3.2. Потребительские свойства

3.4. Характеристика генетической структуры изучаемых пород 69 кур по восьми микросателлитным локусам

3.5. Оценка генетической консолидированности и определение 73 степени генетического сходства российских пород кур по микросателлитным локусам при создании паспортов кур

12-ти пород

4. ВЫВОДЫ

5. ПРАКТИЧЕСКИЕ ПРЕДЛОЖЕНИЯ

Введение диссертации (часть автореферата) на тему «Изучение алеллофонда пород Gallus Gallus с использованием микросателлитов»

Актуальность темы. Важную роль в продовольственной безопасности страны играет птицеводство, обеспечивающее 40% животного белка в рационе россиян [Фисинин В.И., 2008].

По данным ФАО [2010], от 70 до 90 % пород разных видов домашней птицы, внесенных во Всемирный перечень разнообразия домашних животных (WWL-DAD) близки к вымиранию или статус их неизвестен. Из 1273 пород кур лишь 321 находится вне состояния риска, 40 отнесены к исчезнувшим, судьба 493 не известна, остальные находятся на разных стадиях риска. Наиболее интенсивно этот процесс идет в странах Европы и Северной Америки.

Местные породы кур, созданные народной селекцией, являются ценнейшими генетическими ресурсами [Сахацкгш Н. И.,1990; Горбачева Н., 1993; Столповский Ю.А., 2006]. Изучение местных пород, объективная оценка генофонда малочисленных пород и замкнутых популяций кур, являющихся источником племенного материала российской перспективной селекции и резервом для создания новых форм и новых кроссов птицы, является актуальной задачей для современной генетики и селекции [Моисеева И.Г., 1999, 2009]. При создании отечественных конкурентоспособных кроссов используются генофондные коллекции редких и исчезающих пород птицы, а также новый генетический материал ведущих фирм. В России собраны и сохраняются самые крупные мировые генофондные стада кур, насчитывающие 76 пород [Фисинин В.И., 2010]. Всестороннее изучение генофонда пород кур, их генетической изменчивости и дифференциации необходимо для решения задач создания высокопродуктивной птицы.

В связи с этим, возникает необходимость в разработке и использовании для паспортизации животных и птицы высокопроизводительных систем ДНК анализа. В решении данной проблемы с высокой степенью надежности могут быть использованы микросателлитные маркеры, позволяющие получать молекулярно-генетическую информацию для детальной характеристики видов и пород животных [Зиновьева Н.А., 2003, 2011; Букаров Н.Г., 2010; Марзанов Н.С., 2004, 2011/, в том числе и птицы [Фисинин В.И., 2011; Новгородова И.П., 2011, 2012] в рамках генетической паспортизации пород и линий кур.

Цель работы и задачи исследования. Целью работы явилось изучение аллелофонда пород кур с использованием разработанной универсальной системы анализа микросателлитов.

Для достижения поставленной цели были сформулированы следующие задачи:

1. Дать характеристику системы сохранения и рационального использования пород кур генофондного стада;

2. Разработать мультиплексную тест-систему анализа восьми микросателлитов кур;

3. Оценить функциональные характеристики и потребительские свойства разработанной тест-системы;

4. Дать характеристику генетической структуры изучаемых пород кур по восьми микросателлитным локусам;

5. Выполнить оценку генетической консолидированности и определить степень генетического сходства российских пород кур по микросателлитным локусам при создании паспортов кур 12-ти пород.

Научная новизна. Впервые в России разработана мультиплексная тест-система микросателлитного анализа. С использованием созданной тест-системы определена степень генетической близости и дана характеристика аллелофонда 12 пород кур, в том числе 11 пород генофондного стада, в сравнении с породой леггорн.

Научная и практическая значимость. Предложена автоматическая система мультиплексного микросателлитного анализа кур для установления генетических различий между породами и кроссами кур. Дана характеристика аллелофонда 12 пород кур генофондного стада различного направления продуктивности.

Апробация работы. Результаты исследований были доложены и обсуждены:

1. На конференции «Современные достижения и проблемы биотехнологии сельскохозяйственных животных: роль нанотехнологий в реализации приоритетных задач биотехнологии», БиоТехЖ-2008. Дубровицы. 23-24 октября 2008.

2. На конференции «Научные основы повышения продуктивности сельскохозяйственных животных», Краснодар. - 2009.

3. На 8-й международной научной конференции «Современные достижения и проблемы генетики и биотехнологии сельскохозйственных животных», Био-ТехЖ-2009. - Дубровицы. - 2009.

4. На конференции «Ориентированные фундаментальные исследования и их реализация в АПК России», Сергиев Посад. 28-30 октября 2009.

5. На международной научной молодежной конференции-школе «Биотехнологии в сельском хозяйстве: современные достижения и проблемы биотехнологии сельскохозяйственных животных», БиоТехЖ-2012. -Дубровицы. Май 2012.

6. На научных конференциях Центра биотехнологии и молекулярной диагностики животных ГНУ ВИЖ Россельхозакадемии в период с 2009-2012.

Основные положения, выносимые на защиту.

1. Разработана тест-система анализа восьми микросателлитов Gallus Gallus, которая характеризуется высокой производительностью (8 локусов), информативностью (не менее 4 аллелей в локусе), точностью подтверждения происхождения по обоим родителям (PIX) - 99,60%, точность подтверждения происхождения по одному родителю (Р2Х) - 96,08%, вероятность исключения родителей (РЗХ) - 99,99%.

2. Созданы ДНК-паспорта 12 пород кур, в т.ч. 11 пород кур генофондного стада по восьми микросателлитным локусам.

3. Подтверждена гипотеза о наличии породоспецифических аллелей, свойственных замкнутым популяциям кур.

4. Установлены филогенетические связи между изучаемыми породами кур, обусловленные общностью их исторического происхождения.

Публикации результатов исследований. Всего за время написания диссертационной работы опубликовано 13 статей, из них по теме диссертационной работы 6 статей, из них 2 в рецензируемом журнале, рекомендованном ВАК РФ («Проблемы биологии продуктивных животных», 2011, №1; «Достижения науки и техники АПК», 2011, № 10).

Структура и объем работы. Диссертация написана на 118 страницах, состоит из следующих разделов: введение, обзор литературы, материалы и методы исследований, результаты и обсуждение, выводы, практические предложения, список литературы. Диссертационная работа содержит 25 таблиц и 23 рисунков. Список литературы включает 153 источника, в том числе 114 источников на иностранном языке.

Заключение диссертации по теме «Генетика», Волкова, Валерия Владимировна

4. ВЫВОДЫ

1. Дана характеристика системы сохранения и рационального использования пород кур генофондного стада с учетом генетических особенностей и направления продуктивности пород.

2. Разработана универсальная тест-система генетического анализа пород кур включающая 8 микросателлитных маркеров. Среднее число аллелей на локус составило 6,47 и колебалось от 4,08 в локусе MCW0111 до 11,50 в локусе MCW0123. В 11 из 12 пород число информативных аллелей было выше 3,50 на МС, что говорит об информативности созданной панели.

3. Оценены функциональные характеристики и потребительские свойства разработанной тест-системы. Точность идентификации пород кур (PI) с использованием тест-системы из 8 микросателлитов составила 5,01*10'7, точность подтверждения происхождения по обоим родителям (Р1Х) - 99,60%, точность подтверждения происхождения по одному родителю (Р2Х) - 96,08%, вероятность исключения родителей (РЗХ) - 99,99%. Вероятность совпадения генотипа не превышает 1 случая на 20000 особей.

4. По 12 породам процент полиморфных локусов в среднем составил 98,96±1,04%, с диапазоном от 87,50% в голошейной до 100% во всех остальных 11 породах. В шести из 12 исследованных пород выявлен дефицит гетерозигот, при этом наибольшее значение показателя отмечено в породе белый леггорн - 11,4%. Установлено достоверное отклонение от генетического равновесия в 11 из 12 пород кур, за исключением первомайской, что указывает на инбридированность популяций кур генофондного стада.

5. Выявлено 14 приватных аллелей, принадлежащих 6 микросателлитам с частотой встречаемости от 1,70% до 25,00%. В трех породах кур выявлено три аллеля с частотой более 5% - ленинградская белая аллель 274 локуса LEI0094, загорская лососевая аллель 187 локуса MCW0067 и русская белая аллель 195 локуса MCW0104. Подтверждена гипотеза о наличии породоспецифических аллелей, свойственных замкнутым популяциям кур.

6. Установлены филогенетические связи между изучаемыми породами

102 кур, обусловленные общностью их исторического происхождения. Единый центральный кластер формируют породы, созданные на основе породы белый леггорн и его производных. Дальше всех отстоит голошейная, образующая самостоятельную ветвь.

7. Показана высокая генетическая консолидированность изучаемых пород кур. Вероятность идентификации породной принадлежности особи на основании анализа 8 микросателлитов в зависимости от породы варьировала от 88,89 до 100% и в среднем составила 97,08%.

5. ПРАКТИЧЕСКИЕ ПРЕДЛОЖЕНИЯ

1. Лабораториям молекулярно-генетической экспертизы для контроля состояния генофонда кур, оценки генетического разнообразия и породной принадлежности птиц, разводимых в замкнутых популяциях, рекомендуем использовать разработанную тест-систему анализа 8 микросателлитов: МС\¥0111, МС\¥0067, ЬЕ10094, МС\У0123, МС\¥0081, МСУ/0069, МС\¥0104 и МС'МО^З.

2. Отбор и комплектование генофондных стад рекомендуем проводить с учетом данных по молекулярно-генетической паспортизации пород кур.

Список литературы диссертационного исследования кандидат биологических наук Волкова, Валерия Владимировна, 2012 год

1. Алтухов, Ю.П. Полиморфизм ДНК в популяционной генетике / Ю.П. Алтухов, Е.А. Салменкова // Генетика. 2002. - Т. 98. - № 9. - С. 11731195.

2. Боголюбекий, С.И. Селекция сельскохозяйственной птицы: Учеб. пособие для студентов вузов по спец. "Зоотехния" / С.И. Боголюбекий // М.: Агропромиздат. 1991. 285 с.

3. Букаров, Н.Г. Оценка быков-производителей по генетическим маркерам групп крови / Н.Г. Букаров, А.И. Хрунова, A.A. Новиков, Н.С. Мишина, Д.Ю. Политкин // Зоотехния. 2010. -№ 11. - С. 2-3.

4. Вейр, Б. Анализ генетических данных / Б. Вейр // М.: Мир. 1995. -400 с.

5. Генофонды сельскохозяйственных животных: Генетические ресурсы животноводства России / отв. ред. И.А. Захаров. М.: Наука. 2006. -462 с.

6. Горбачева, Н. Породы кур / Н. Горбачева // М.: Искусство и мода. 1993.- 143 с.

7. Дарвин, Ч. Изменение животных и растений в домашнем состоянии / Ч. Дарвин // М., Л. 1941. 619 с.

8. Егорова, A.B. Методы и приемы племенной работы по повышению эффективности использования мясистых кур: Дисс. доктора сельскохозяйственных наук / Егорова Анна Васильева. Сергиев Посад, 1999 -306 с.

9. Елизаров, Е. Использование маркерного гена К в работе с мясными курами / Е. Елизаров // Животноводство России. 2002. - № 11.-е. 13-14.

10. Зиновьева, H.A. Методические рекомендации по использованию метода полимеразной цепной реакции в животноводстве / H.A. Зиновьева, А.П. Попов, Л.К. Эрнст, Н.С. Марзанов, В.В. Бочкарев, Н.И. Стрекозов, Г. Брем // Дубровицы: ВИЖ. 1998.

11. Зиновьева, H.A. Применение днк-диагностики для анализа генов-кандидатов локусов количественных признаков сельскохозяйственных животных / H.A. Зиновьева, Е.А. Гладырь, Д.А. Фролкин // Животноводство России.-2003.-Т. 1.-С. 218 .

12. Зиновьева, H.A. Фундаментальные и прикладные аспекты применения микросателлитов в животноводстве / H.A. Зиновьева, Е.И. Сизарева, Е.А. Гладырь, K.M. Шавырина // Зоотехния. 2010.

13. Зиновьева, H.A. Генетическая экспертиза сельскохозяйственных животных: применение тест-систем на основе микросателлитов / H.A. Зиновьева, Е.А. Гладырь // Достижения науки и техники АПК. 2011. - № 9. -С. 19-20.

14. Информационно-правовой портал BestPravo электронный ресурс. Режим доступа: http://bestpravo.ru/rossijskoje/do-postanovlenija/w9p/page-7.htm.

15. Кочиш, И.И. Селекция в птицеводстве / И.И. Кочиш // М.: Колос. 1992.-272 с.

16. Куликов, J1.B. История и методология зоотехнической науки / Л.В. Куликов // М.: РУДН. 2001.- 146 с.

17. Марзанов, Н.С. Др. микросателлиты и их использование для оценки генетического разнообразия животных / Н.С. Марзанов, М.Ю. Озеров, М.Г. Насибов // Сельскохозяйственная биология. 2004. - № 2. - С. 104.

18. Марзанов, Н.С. Генетическое маркирование, сохранение биоразнообразия и проблемы разведения животных / Н.С .Марзанов, Д.А. Девришов, С.Н. Марзанова, Е.А. Комкова, М.Ю. Озеров, Ю. Кантанен // Сельскохозяйственная биология. -2011.-№2.-С.З-14.

19. Меркурьева, Е.К. Генетика с основами биометрии / Е.К. Меркурьева, Г.Н. Шангин-Березовский // М.: Колос. 1983 400 с.

20. Моисеева, И.Г. Принципы построения классификаций пород кур / И.Г. Моисеева // С.-х.биология. Сер.биология животных. 1999. - № 6. - С. 2332.

21. Моисеева, И.Г. Эволюция, генетическая изменчивость юрловской голосистой породы кур. Системный анализ форм изменчивости / И.Г.

22. Моисеева, М.Н. Романов, A.B. Александров, A.A. Никифоров,

23. A.А.Севастьянова // Изв.Тимирязев.с.-х.акад. 2009. - № 3. - С. 132-147.

24. Новгородова, И.П. Изучение информативности микросателлитов кур G. Gallus для характеристики аллелофонда индеек М. Gallopavo / И.П. Новгородова, В.В. Волкова, Е.И. Гладырь, М.И. Селионова, Е.И. Растоваров,

25. B.И. Фисинин, H.A. Зиновьева // Достижения науки и техники АПК. 2011. -№ 10.-С. 66-67.

26. ОАО ППЗ «Свердловский» электронный ресурс. Режим доступа: http.V/www.rodonit.org/O

27. Породы кур. Разведение кур в приусадебном хозяйстве электронный ресурс. Режим доступа: http://porodakur.ru/.

28. Приказ Минсельхоза РФ № 402 от 19 октября 2006 года.

29. Приказ Минсельхоза РФ № 135 от 23 апреля 2010 года: Целевая программа ведомства «Развитие птицеводства в РФ на 2010-2012 годы и на период 2013-2020 года».

30. Ройтер, Я.С. Племенная работа в птицеводстве / Я.С. Ройтер, A.B. Егорова, Е.С. Устинова // Сергиев Посад: ГНУ ВНИТИП. 2011. 255 с.

31. Сахацкий, Н.И. Популяционно-генетические аспекты сохранения генофонда кур / Н.И. Сахацкий, А.П. Подстрешный // Птицеводство. 1990. -Т. 43.-С. 9-13.

32. Серебровский, A.C. К составлению плана хромосом домашней курицы / A.C. Серебровский, С.Г. Петров // Журнал экспериментальной биологии. 1930. - Т. 6. - Вып. 3. - С. 157-180.

33. Столповский, Ю.А. Консервация генетических ресурсов сельскохозяйственных животных: проблемы и принципы решения / Ю.А. Столповский // М. 1997.

34. Столповский, Ю.А. Генофонды отечественных пород национальное богатство России / Ю.А. Столповский, И.А. Захаров // М.: Рос. акад. наук. Ин-т общей генетики им. Н.И. Вавилова РАН. Прогр. Президиума РАН "Биоразнообразие и динамика генофондов". 2007. 48 с.

35. Тоцький, В.М. Генетика: Пщручник / В.М. Тоцький // Одесса: Астропринт. 2002. 172 с.

36. ФГУП «Генофонд» Россельхозакадемии электронный ресурс. -Режим доступа: http://genofund.narod.ru/history.htm.

37. Фисинин, В.И. Стратегия эффективного развития отрасли и научных исследований по птицеводству / В.И. Фисинин // Вестник Российской академии сельскохозяйственных наук. 2002. - № 1. - 56 с.

38. Фисинин, В.И. Птицеводство стран мира в конце XX века / В.И. Фисинин, С.А. Данкверт, A.M. Холманов, О.Ю. Осадчая // М. 2005. 344 с.

39. Фисинин, В.И. Перспективы развития отечественного птицеводства / В.И. Фисинин // Животноводство России. 2008. - № 4. - С. 24.

40. Фисинин, В.И. Научное обеспечение развития животноводства России / В.И. Фисинин, В.В. Калашников, В.А. Багиров // Современные проблемы диагностики, лечения и профилактики инфекционных болезней животных и птиц. 2010. - в. 3. - С. 5-11.

41. Фисинин, В.И. Анализ генетической структуры пород домашних кур с использованием микросателлитных маркеров / В.И. Фисинин, Е.А. Гладырь, В.В. Волкова, А.А. Севастьянова, Н.А. Зиновьева // Проблемы биологии продуктивных животных. 2011. - № 1. - С. 68-72.

42. Эйснер, Ф.Ф. Проблемы сохранения и рационального использования генофонда сельскохозяйственных животных / Ф.Ф. Эйснер // Науч.-техн. бюл. ВНИИРГЖ. 1983. - Вып. 63. - С. 6-10.

43. Эрнст, JI.K. Биологические проблемы животноводства в XXI веке / Л.К. Эрнст, Н.А. Зиновьева // М.: РАСХН. 2008. 508 с.

44. Allikmets R., Kashuba V.I., Huebner К., LaForgia S., Kisselev L.L., Klein G., Dean M., Zabarovsky E.R. // Chromosome Research. 1996. - V. 4. - № 1.-P.33.

45. Avise, J.C. Molecular markers, natural history and evolution / J.C. Avise // Chapman and HALL: An International Thomson Publishing Company. 1994.- 122 p.

46. Ball, A.O. Population genetic analysis of white shrimp, Litopenaeus setiferus, using microsatellite genetic markers / A.O. Ball, R.W. Chapman // Mol. Ecol. 2003. - 12. - P. 2319-2330.

47. Beamount, M. Microsatellites in conservation genetics. In:

48. Microsatellites Application and evolution. / M. Beamount, M. Bruford // Oxford University Press. - 1999. - P. 165-180.

49. Bodo, I. Principles in use of live animals / I. Bodo // Animal genetic resources: Strategies for improved use and conservation. Rome: FAO/UNEP. -1987.-P. 191-198.

50. Bodo, I. Methods and experiences with in situ preservation of farm animals: Manuscript of the Department of Animal Husbandry University of Veterinary Science /1. Bodo // Budapest. 1989. 29 p.

51. Brookfield, J.F.Y. A simple new method for estimating null allele frequency from heterozygote deficiency / J.F.Y. Brookfield // Mol. Ecol. 1996. - 5. -P. 453-455.

52. Bodzsar, N. Genetic diversity of Hungarian indigenous chicken breeds based on microsatellite markers / N. Bodzsar, H. Eding, T. Revay, A. Hidas, S. Weigend // Anim Genet. 2009. - Aug. 40(4). - 516-23.

53. Callen, D.F. Incidence and origin of "null" alleles in the (AC)n microsatellite markers / D.F. Callen, A.D. Thompson, Y. Shen, H.A. Phillips, R.I. Richards, J.C. Mulley, G.R. Sutherland // Am. J. Hum. Genet. 1993. - 52. - P. 922927.

54. Chakraborty, R. Apparent heterozygote deficiencies observed in DNA typing data and their implications in forensic applications / R. Chakraborty, M. De Andrade, S.P. Daiger, B. Budowle //Ann. Hum. Genet. 1992. - 56. - P. 45-57.

55. Cheng, H.H. Development of a genetic map of the chicken with markers of high utility / H.H. Cheng, I. Levin, R.L. Vallejo, H. Khatib, J.B. Dodgson, L.B. Crittenden, J. Hillel II Poult. Sei. 1995. -№ 74. - P. 1855-1874.

56. Crawford, A.M. An autosomal genetic linkage map of the sheep genome / A.M. Crawford, K.G. A.J. Dodds, Ede, C.A. Pierson, G.W. Montgomery, H.G. Garmonsway, A.E. Beattie, K. Davies, J.F. Maddox, S.W. Kappes // Genetics. -1995.- 140.-P. 703-724.

57. Day, E.J. Future research needs focus on new, old problems / E.J. Day // Feedstuffs. 1990. - July 23. - P. 12-15.

58. De La Rua, P. Genetic structure and distinctness of Apis mellifera L. populations from the Canary Islands / P. De La Rua, J. Galian, J. Serrano, R.F.A. Moritz // Mol. Ecol. 2001. - 10. - P. 1733-1742.

59. Diehl, S.R. Automated genotyping of human DNA polymorphisms / S.R. Diehl, J. Ziegle, G.A. Buck, T.R. Reynolds, J.L. Weber //Amer. J. Hum. Genet. 1990.-V. 47.-P. A177.

60. Du, Z.Q. Genetic diversity in Tibetan chicken / Z.Q. Du, L.J. Qu, X.Y. Li, X.X. Hu, Y.H. Huang, N. Li, N. Yang // Yi Chuan 2004. - Mar. - 26(2). - 16771.

61. Ede, A.J. Mutations in the sequence flanking the microsatellite at the Kap8 locus prevent the amplification of some alleles / A.J. Ede, A.M. Crawford // Anim. Genet. 1995. - 26. - P. 43-44.

62. Edwards, A. DNA typing and genetic mapping with trimeric and tetrameric tandem repeats / A. Edwards, A. Civitello, H.A. Hammond, C.T. Caskey // American Journal of Human Genetics. 1991. - 49. - P. 746-756.

63. FAO. Food and Agriculture Organization. 2004.

64. Fumihito, A. Monophyletic origin and unique dispersal patterns of domestic fowls / A. Fumihito, T. Miyake, M. Takada, R. Shingu, T. Endo, T.

65. Gojobori, N. Kondo, S. Ohno // Proceedings of the National Academy of Sciences USA. 1996. - 93(13). - P. 6792-6795.

66. Gibbs, M. Chicken microsatellite markers isolated from libraries enriched for simple tandem repeats / M. Gibbs, D.A. Dawson, C. McCamley, A.F. Wardle, J.A.L. Armour, T. Burke //Anim. Genet. 1997. -№ 28. - P. 401-417.

67. Goldstein, D.B. Launching Microsatellites: A review of mutation processes and methods of phylogenetic inference / D.B. Goldstein, D.D. Pollock // J. Hered. 1997. - 88. - P. 335-342.

68. Gueye, E.F. Village egg and fowl meat production in Africa // World's Poultry Science Journa. 1998. - 54. - P. 73-86.

69. Guichoux, E. Current trends in microsatellite genotyping / E. Guichoux, L. Lagache, S. Wagner, P. Chaumeil, P. Leger, O. Lepais, C. Lepoittevin, T. Malausa, E. Revardel, F. Salin, R.J. Petit // Molecular Ecology Resources. 2011. - 11. -P. 591-611.

70. Hammond, E.L. Microsatellite analysis of genetic diversity in wild and farmed Emus (Dromaius novaehollandiae) / E.L. Hammond, A.J. Lymbery, G.B. Martin, D. Groth, J.D. Wetherall II J. Hered. 2002. - 93. - P. 376-380.

71. Hassen, H. Study on the genetic diversity of native chickens in northwest Ethiopia using microsatellite markers / H. Hassen, F.W.C. Neser, A. de Kock, E van Marle-Koster //Afr. J. Biotech. 2009. - 8. - P. 1347-1353.

72. Hillel, J. DNA fingerprints in poultry / J. Hillel, Y. Plotsky, A. Haberfeld, U. Lavi, A. Cahaner, A.J. Jeffreys // Anim. Genet. 1989. - № 20. - P. 145-155.

73. Hillen, J. Biodiversity of 52 chicken populations assessed by microsatellite typing of DNA pools / J. Hillen, A.M. Groenen Martien, M. Tixier

74. Holm, L.E. Elucidation of the molecular basis of a null allele in a rainbow trout microsatellite / L.E. Holm, V. Loeschcke, C. Bendixen // Mar. Biotechnol.-2001.-3.-P. 555-560.

75. IS AG. The Internet Security Advisors Group. 2004. - www.isag.com.

76. Jamieson, A. Comparisons of three probability formulae for parentage exclusion / A. Jamieson, S.C.S. Taylor // Animal Genetics. 1997. - 28. - P. 397400.

77. Jaszczak, K. Chromosome abnormalities in early embryos from chicken divergently selected for embryo skeletal deformations / K. Jaszczak, W. Pryszcz, J. Jaszczak, G. Ziêba // Proc. Poult. Genet. Symp. 1999. - 6-8 October. -Mariensee/Germany. - 122 p.

78. Jaszczak, K. A new reference family (Green-legged Partrigenous x Rhode Island Red) for mapping QTLs in laying hens / K. Jaszczak, B. Wardêcka, R. Olszewski, G. Ziêba, M. Pierzcha£a // Anim. Sci. Pap. Rep. 2001. - № 19. - P. 131-139.

79. Jones, A.G. The molecular basis of a microsatellite null allele from the white sands pupfish / A.G. Jones, C.A. Stockwell, D. Walker, J.C. Avise // J. Hered. 1998.-89.-P. 339- 342.

80. Julian, R.J. Rapid growth problems: ascites and skeletal deformities in broilers / R.J. Julian // Poult. Sci. 1998. - № 77. p. 1773-1780.

81. Koorey, D.J. Allele non-amplification: a source of confusion in linkage studies employing microsatellite polymorphisms / D.J. Koorey, G.A. Bishop, G.W. McCaughan // Hum. Mol. Genet. 1993. - 2. - P. 289-291.

82. Koskivainio, H. Suomalainen maatiaiskana; rotukana vai sekarotuinen? / H. Koskivainio // Report (in Finnish). The Agricultural College of Peltosalmi. Peltosalmi. Finland. 1993.

83. Kuhnlein, U. DNA fingerprinting: a tool for determining genetic distances between strains of poultry / U. Kuhnlein, D. Dawe, D. Zadworny, J.S. Gavora // Theor. Appl. Genet. 1989. - №77. - P. 669-672.

84. Lehmann, T. An evaluation of evolutionary constraints on microsateilite loci using null alleles / T. Lehmann, W.A. Hawley, F.H. Collins // Genetics. 1996,- 144. -P. 1155-1163.

85. Lessios, H.A. Testing electrophoretic data for agreement with Hardy

86. Weinberg expectations / H.A. Lessios // Mar. Biol. 1992. - 112. - P. 517-523.

87. Lin, H.J. Plasma free hydroxyproline, growth, and sexual maturity in the scoliotic chicken / H.J. Lin, R.S. Benson, R.S. Riggins, R.B. Rucker, U.K. Abbott//Proc. Soc. Exp. Biol. Med. 1980. -№ 165. - P. 345-348.

88. Liu, G.Q. Analysis of genetic diversity of yangzhou chicken by microsatellite markers / G.Q. Liu, X.P. Jiang, J.Y. Wang, Z.Y. Wang, G.Y. Liu, Y.J. Mao // Int. J. Poult. Sci. 2008. - 7. - P. 1237-1241.

89. McCarrey, J.R. Genetics of scoliosis in chickens / McCarrey J.R., Abbot U.K., Benson D.R., Riggins R.S. //J. Hered. 1981. - № 72. - P. 6-10.

90. Mercer, J.T. Estimation of genetic parameters for skeletal defects in broiler chickens / J.T. Mercer, W.G. Hill // Heredity. 1984. - № 53. - P. 193-203.

91. Morris, M.P. National survey of leg problems / M.P. Morris // Broiler Ind. 1993. - May. - P. 20-24.

92. Msoffe, P.L.M. Genetic structure among the local chicken ecotypes of Tanzania based on microsatellite DNA typing / P.L.M. Msoffe, M.M.A. Mtambo,

93. U.M. Minga, H.R. Juul-Madsen, P.S. Gwakisa // African Journal of Biotechnology.1131 i f' I 'i>, \ 1 S VAy^ . »M H1 >„. . ' 'it" I ( , ' o <\ ft* ' '' I '>t' *- 2005. August. - Vol .4(8). - P. 768-771.

94. Nasiri, M.T.B. Study on polymorphism of Isfahan native chickens population using microsatellite markers. / M.T.B. Nasiri, F. Shokri, S. Esmaeil Khanian, S. Tavakoli // Int. J. Poult. Sci. 2007. - 6. - P. 835-837.

95. Nei, M. Accuracy of estimated phylogenetic trees from molecular data / M. Nei, F. Tajima, Y. Tateno // J. Mol. Evol. 1983. - 19. - P. 153-170.

96. Oldenbroek, J.K. Introduction. In: Genebanks and Conservation of Farm Animal Genetic Resource / J.K. Oldenbroek // DLO. Institute for Animal Science. Lelystad. the Netherlands. - 1999. - P. 1-9.

97. Paetkau, D. Genetic assignment methods for the direct, real-time estimation of migration rate: a simulation based exploration of accuracy and power/ D. Paetkau, R. Slade, M. Burdens, A. Estoup // Molecular Ecology. 2004. - 13. -P. 55-65.

98. Patent WO 2009/046724 A2. Polymorphisms of mbl // JUUL

99. MADSEN, Helle Risdahl (DK/DK); Karetmagervej 40, DK-8900 Randers (DK). SKJODT, Karsten (DK/DK); Kastanievej 59, DK-Odense M 5230 (DK). -61/068,565.-30.09.2008.

100. Peakall, R. Mark-recapture by genetic tagging reveals restricted movements by bush rats, Rattus fuscipes, in a fragmented landscape / R. Peakall, D. Ebert, R. Cunningham, D.B. Lindenmayer // Journal of Zoology. 2006. - 268. - P. 207-216.

101. Pemberton, J.M. Nonamplifying alleles at microsatellite loci: a caution for parentage and population studies / J.M. Pemberton, J. Slate, D.R. Bancroft, J.A. Barrett // Mol. Ecol. 1995. - 4. - P. 249-252.

102. Pritchard, J.K. Inference of population structure using multilocus genotype data / J.K. Pritchard, M. Stephens, P. Donnelly // Genetics 2000. - 155. -P. 945-959.

103. Pryszcz, W. Zrealizowana odziedziczalnooeas embrionalnych wad odcinka piersiowego kregoslupa (Realised heritability of embryo defects of the thoracic region of the vertebral column) / W. Pryszcz // Zesz. Nauk. Przegl. Hod. -1996,.-№24.-P. 39-47.

104. Pryszcz, W. Scoliotic changes in adult birds from families selected for low and high frequency of embryonal scoliosis / W. Pryszcz // Zivocisna Vyroba. -19962.-№ 11.-P. 527-528.

105. Pryszcz, W. Chromosome aberrations in chicken embryos from families with developmental abnormalities of spine / W. Pryszcz, K. Jaszczak, J. Jaszczak, A. Brzek // Ann. Univ. Mariae Curie-Sklodowska, Lublin-Polonia. 1999. - № 33. - P. 259-263.

106. Qu, L.J. Conservation efficiency of local chicken breeds in different farms as revealed by microsatellite markers / L.J. Qu, G.Q. Wu, X.Y. Li // Yi Chuan Xue Bao. 2004. - Jun. 31(6). - 591-5.

107. Rajkumar, U. Genomic heterogeneity of chicken populations of India / U. Rajkumar, B.R. Gupta, A.R. Reddy // Asian-Aust. J. Anim. Sci. 2008. - 21. - P. 1710-1720.

108. Riggings, R. Scoliosis in chicken / R. Riggings, U. Abbott, C. Ashmore, R. Rucker, J.R. McCarrey // J. Bone Jt. Surg. 1977. - № 59. - P. 10201026.

109. Ruyter-Spira, C.P. Bulked Segregant Analysis Using Microsatellites: Mapping of the Dominant White Locus in the Chicken / C.P. Ruyter-Spira, Gu Zhi Liang, J.J. Van Der Poel, M.A.M. Groenen // Poultry Science. 1997. - № 76. - P. 386-391.

110. Schloetterer, C. Opinion: The evolution of molecular markers just a matterof fashion? / C. Schloetterer // Nature Rev. Genet. - 2004. - 5. - P. 63-69.

111. Siegel, P.B. Jungle fowl-domestic fowl relationships: a use of DNA fingerprinting / P.B. Siegel, A. Haberfeld, T.K. Mukherjee, L.C. Stallard, H.L. Marks, N.B. Anthony, E.A. Dunnington // World's Poult. Sci. J. 1992. - № 48. - P. 147-155.

112. Smith, E.J. Use of randomly amplified polymorphic DNA markers for the genetic analysis of relatedness and diversity in chickens and turkeys / E.J. Smith, C.P. Jones, J. Bartlett, K.E. Nestor // Poultry Sci. 1996. - № 75. - P. 579-584.

113. Somes, R.G. International registry of poultry genetic stocks / R.G. Somes // Storrs Agr. Exp. Stat. Bull. Conn. 1988. - P. 47-98.

114. Somes, R.G. Mutations and major variants of muscles and skeleton in chickens // In: Poultry Breeding and Genetics (R.D. Crawford). 1990. - Elsevier: 209-237.

115. Sullivan, T.W. Skeletal problems in poultry: estimated annual cost and descriptions / T.W. Sullivan // Poult. Sci. 1994. - № 73. - P. 869-882.

116. Tadano, R. Microsatellite marker analysis for the genetic relationships among Japanese long-tailed chicken breeds / R. Tadano, M. Sekino, M. Nishibori, M. Tsudzuki // Poult Sci. 2007. - Mar. 86(3). - 460-9.

117. Tadano, R. Assessing genetic diversity and population structure for commercial chicken lines based on forty microsatellite analyses / R. Tadano, M. Nishibori, N. Nagasaka, M. Tsudzuki // Poult Sci. 2007. - Nov. 86(11). - 2301-8.

118. Tatsuda, K. Genetic mapping of the QTL affecting body weight in chickens using a F2 family / K. Tatsuda, K. Fujinaka // Br. Poult. Sci. 2001. - 42. -P. 333-337.

119. Taylor, L. Kyphoscoliosis in a long-term selection experiment with chickens/L. Taylor //Avian Dis. 1971.- № 15.-P. 367-390.

120. Tuiskula-Haavisto, M. Genome-wide significant QTL for egg quality and production in egg-layers / M. Tuiskula-Haavisto, M. Honkatukia, J. Vilkki, D.J.n >