Исследование ДНК-актиномициновых комплексов при низких концентрациях методами флуоресцентной спектроскопии тема диссертации и автореферата по ВАК РФ 03.00.02, кандидат физико-математических наук Ковалев, Александр Эдуардович
- Специальность ВАК РФ03.00.02
- Количество страниц 136
Оглавление диссертации кандидат физико-математических наук Ковалев, Александр Эдуардович
Принятые сокращения.
Введение.
Обзор литературы.
1.1 Историческая справка.
1.2 Общая характеристика актиномицинов.
1.3 Структура комплекса АМД - ДНК.
1.4 Специфика взаимодействия АМД с ДНК.
1.5 Энергетика взаимодействия АМД с ДНК.
1.6 Кинетика взаимодействия АМД и ДНК.
1.7 Выражение Камлета-Тафта: Линейное соотношение энергии сольватации.
1.8 Время жизни и поляризация флуоресценции. Уравнение Левшина -Перрена.
1.9 Флуориметрия в остановленном потоке (stopped flow).
1.10 Флуоресцентная корреляционная спектроскопия.
1.11 Уравнение Фредгольма первого рода.
1.12 Уравнение гетерогенной адсорбции Фрейндлиха.
Материалы и методы.
2.1 Используемые реактивы.
2.2 Регистрация спектров флуоресценции 7аАМД и его комплексов с ДНК, измерение поляризации и времени жизни флуоресценции.
2.3 Корреляционный анализ.
2.4 Флуориметрия в остановленном потоке.
2.5 Поиск оптимального алгоритма обработки КФ и их последующий анализ.
2.6 Поиск оптимальной по энергии структуры 7аАМД при помощи молекулярной динамики.
2.7 Измерения на установке ConfoCor.
2.8 Уравнение гетерогенной абсорбции Фрейндлиха.
2.9 Устранение влияния сорбции/десорбции 7аАМД на ход эксперимента.
Результаты и обсуждение.
3.1 Характеристика актиномицина и его комплексов с ДНК в тяжелой и обычной воде на основе спектральных данных.
3.2 Молекулярная динамика комплекса 7аАМД с НР1.
3.3 Анализ сольватохромного эффекта 7аАМД.
3.4 Исследование кинетики взаимодействия 7аАМД и ДНК.
3.5 Анализ корреляционных функций.
3.6 Измерение поляризации флуоресценции и ФКС на установке ConfoCor.
Рекомендованный список диссертаций по специальности «Биофизика», 03.00.02 шифр ВАК
Спектроскопическое изучение ДНК-актиномициновых комплексов2004 год, кандидат биологических наук Савинцев, Иван Витальевич
Поляризационные характеристики синхротронного излучения и развитие методов измерения затухания интенсивности и анизотропии флуоресценции молекул2007 год, кандидат физико-математических наук Демьянов, Георгий Витальевич
Исследование комплексов ДНК-золотые наночастицы методами спектроскопии поглощения и динамического рассеяния света2012 год, кандидат биологических наук Пылаев, Тимофей Евгеньевич
Повышение эффективности лазерной флуоресцентной диагностики объектов микробной природы2009 год, кандидат физико-математических наук Васильев, Евгений Николаевич
Биологические свойства и гибридизационная способность ген-направленных реагентов на основе дуплекс- и триплексобразующих олигонуклеотидов1999 год, кандидат химических наук Максименко, Андрей Викторович
Введение диссертации (часть автореферата) на тему «Исследование ДНК-актиномициновых комплексов при низких концентрациях методами флуоресцентной спектроскопии»
Актуальность
Аюгиномицины - группа антибиотиков, образуемых различными актиномицетами, обладающих антибиотическим действием против грамположительных бактерий и некоторых грибов. Антимикробные свойства актиномицина нашли применение в биохимических и микробиологических исследованиях. В медицинской практике из актиномицинов широкое применение получил только актиномицин Д, реже используется актиномицин Ц и прочие актиномицины. Поэтому главным объектом исследования данной работы является именно актиномицин Д. Актиномицин Д (АМД) успешно применяется в противоопухолевой терапии с сороковых годов прошлого столетия и по сей день. Применяют АМД самостоятельно или, чаще, в сочетании с другими лекарственными средствами (адриамицин, циклофосфан и др.) и лучевой терапией при трофобластической болезни (например, хориокарцинома матки), опухоли Вильмса и саркоме Эвинга, рабдомиосаркоме у детей, ретикулосаркоме, опухоли Юинга, злокачественных опухолях яичка, лимфогранулематозе, при комбинированной химиотерапии диссеминированной меланомы и других опухолях [J. Verweij, 1996]. Действие АМД основано на том, что он прочно связывается с ДНК, блокируя, тем самым, полимеразную активность. АМД и его производные способны блокировать обратную транскриптазу (например, вируса иммунодефицита человека), специфически связываясь с одноцепочечной ДНК, ДНК/РНК гибридами [М. Shinomiya, 1995]. Недавно обнаруженная способность актиномицина специфически связываться с ЦТГ/ЦАГ повторами [М.-Н. Нои, 2002] позволяет надеяться, что актиномицин найдет свое применение и при лечении ряда наследственных неврологических заболеваний: хорее Гентингтона, миотонической дистрофии, спиноцеребральной атаксии, миотонической атрофии спинного и продолговатого мозга. Вместе с тем, при применении препарата возможны множественные побочные эффекты: тошнота, рвота, повышение температуры тела, стоматит, кожные высыпания, алопения, лейкопения, тромбоцитопения, панцитопения. При попадании АМД под кожу развивается некроз кожи.
В настоящее время ведётся активный поиск более эффективных в терапевтических целях и менее токсичных производных актиномицинов [Е.Б. Морошкина, 2000]. Вышесказанное, в контексте роста числа онкологических заболеваний [A. Jemal, 2004], объясняет повышенный интерес к изучению физико-химических свойств и деталей механизмов действия противоопухолевых агентов.
Наиболее вероятный механизм действия АМД состоит в том, что он связывается с высокой специфичностью с уже существующими или возникающими в результате тепловых флуктуаций одноцепочечными участками ДНК, содержащими гуанин и способными образовывать шпилечные структуры, стабилизирует их в конформации шпильки. Низкая константа диссоциации АМД из комплекса с ДНК (порядка 100 нМ) и низкая скорость диссоциации комплекса (с характерным временем порядка 100 с) объясняют эффективность блокирования ДНК-матрицы для считывания полимеразами. Этот механизм объясняет также способность АМД блокировать обратную транскриптазу [R.L. Rill, 1996].
Методы исследования
Большинство современных моделей межмолекулярного взаимодействия базируются на данных рентгеноструктурного анализа и ядерного магнитного резонанса (ЯМР). С помощью ЯМР исследуются достаточно концентрированные растворы. Для проведения рентгеноструктурного анализа, как известно, исследуемое вещество должно находиться в кристаллическом состоянии. Для клинического использования производных АМД важно знать механизм их действия в физиологических (микро- и субмикромолярных) концентрациях. Изучение механизма межмолекулярных взаимодействий при низких концентрациях позволяет исключить влияние кооперативных и неспецифических эффектов. Результаты ЯМР и рентгеноструктурного анализа, тем не менее, могут быть взяты за основу для построения модели взаимодействия ДНК - противоопухолевое вещество в растворе. Необходимо отметить, что исследования в области низких концентраций могут быть сопряжены с рядом технических трудностей, таких как неспецифическая адсорбция, уменьшение соотношения сигнал/шум.
Флуоресцентные методы обладают гораздо большей чувствительностью и позволяют проводить исследования в диапазоне микро- и даже наномолярных концентраций исследуемого вещества. У АМД имеется флуоресцирующее аминопроизводное - 7-аминоактиномицин Д (7аАМД) с идентичным биологическим действием [Y.-C. Chiao, 1979]. Оно и являлось основным объектом настоящего исследования. Для изучения взаимодействия 7аАМД с ДНК нами использовались стационарная флуорометрия и флуорометрия в остановленном потоке, флуоресцентная корреляционная спектроскопия; производились измерения времени жизни и поляризации флуоресценции; исследовался сольватохромный эффект.
Как относительно малоизвестный необходимо в нескольких словах представить метод флуоресцентной корреляционной спектроскопии (ФКС), позволяющий характеризовать очень малые количества флуорофора. Метод ФКС позволяет в объёме порядка 10"15 литра одновременно измерять: абсолютную концентрацию флуоресцирующих частиц (в наномолярном диапазоне), степень их связанности (например, с ДНК) и характеризовать микроокружение флуоресцирующих частиц (по изменению эффективности флуоресценции). Область применимости данного метода, кроме возможности непосредственного изучения флуоресцирующих веществ, включает в себя возможность исследовать флуоресцирующие аналоги исследуемых соединений, вещества, способные связывать флуоресцирующие вещества, исследовать конкурентные взаимоотношения исследуемых и флуоресцирующих веществ. С помощью корреляционной спектроскопии имеется возможность зарегистрировать лишь существенные изменения объёма флуоресцирующих частиц - на порядок, что далеко не всегда бывает достаточно для изучения процессов комплексообразования.
Цель и объекты исследования
Несмотря на огромное количество публикаций, многие вопросы относительно АМД до сих пор остаются без ответа, существуют в литературе и некоторые противоречия. Так до сих пор не была выполнена оценка роли воды и водородных связей при образовании комплекса между АМД и ДНК, несмотря на попытки использования АМД в фотодинамической терапии не были охарактеризованы его электронно-возбужденное состояние и его фотохимическая активность. До сих пор не известна конфигурация комплекса АМД*ДНК в растворе, существуют противоречивые объяснения механизмов образования и диссоциации комплексов, не были исследованы процессы конкурентного замещения АМД в комплексе АМД*ДНК, не оценивалась неспецифическая адсорбция, являющаяся причиной цитотоксичности, не были должным образом охарактеризованы системы адресной доставки АМД к ДНК клетки, не ясно чем объясняется красный сдвиг спектра поглощения 7аАМД при взаимодействии с ДНК.
В связи с вышеизложенным, цель настоящего исследования - дальнейшее изучение физико-химических свойств взаимодействия 7аАМД и АМД с ДНК при низких концентрациях флуоресцентными методами.
В опытах использовались АМД, флуоресцирующий 7аАМД, различные виды природной ДНК, фрагментированная ультразвуком ДНК тимуса телёнка, одноцепочечный шпилечный олигонуклеотид - НР1.
Задачи исследования
Для достижения сформулированной выше цели предполагалось решить следующие задачи:
- Охарактеризовать энергетику взаимодействия 7аАМД с ДНК при низких концентрациях, оценить вклады водородного связывания в энергию взаимодействия феноксазинового цикла 7аАМД с ДНК и определить степень участия воды в формировании комплекса.
- Определить энергетически наиболее выгодную конфигурацию 7аАМД и НР1 в образуемом ими комплексе.
- Попытаться установить механизмы, определяющие кинетику ассоциации/диссоциации 7аАМД с ДНК.
- Исследовать электронно-возбужденное состояние 7аАМД в комплексе с ДНК, его фотохимическую активность, ввиду важности этой информации для фотодинамической терапии.
- Найти молекулярные причины "красного" сдвига максимума спектра поглощения 7аАМД при его взаимодействии с ДНК.
- Охарактеризовать шпилечный олигонуклеотид и мицеллу как модели средств адресной доставки АМД, представляющие интерес в терапевтических целях.
Кроме того, необходимо было решить ряд методических задач:
- Совместить ФКС измерения с измерениями поляризации флуоресценции для обеспечения на порядок более высокой чувствительности ФКС к размеру флуоресцирующих частиц.
- Выполнить поиск и адаптацию алгоритма, позволяющего оценивать молекулярные параметры в эксперименте ФКС в присутствии фоновой флуоресценции для флуорофоров с низким квантовым выходом.
- Исследовать свойства неспецифической адсорбции 7аАМД, найти условия, позволяющие устранить влияние этой адсорбции в ходе эксперимента.
Полученные экспериментальные данные определяют выбор адекватных молекулярных моделей взаимодействия ДНК - противоопухолевое вещество в растворе, представляют ценную информацию для разработки лекарственных препаратов нового поколения.
Обзор литературы
Похожие диссертационные работы по специальности «Биофизика», 03.00.02 шифр ВАК
Фотофизические процессы в растворах бифлуорофорных органических молекул2007 год, кандидат физико-математических наук Гостева, Оксана Юрьевна
Летальный фактор из Bacillus anthracis: субстратная специфичность и механизм действия2009 год, кандидат биологических наук Захарова, Мария Юрьевна
Фотоника биополимеров, мембран и модельных систем: Пути трансформации энергии фотовозбуждения1996 год, доктор биологических наук Векшин, Николай Лазаревич
Разработка подходов к направленному воздействию на нуклеиновые кислоты с помощью тандемных систем производных олигонуклеотидов1999 год, кандидат биологических наук Гайдамаков, Сергей Алексеевич
Метод конфокальной микроспектроскопии и реконструкции спектральных изображений в исследованиях биологически активных соединений2006 год, доктор биологических наук Феофанов, Алексей Валерьевич
Заключение диссертации по теме «Биофизика», Ковалев, Александр Эдуардович
Выводы
1. Определена энергетика интеркаляционного взаимодействия хромофорной части 7аАМД с ДНК, вычленен энтропийный вклад, вклад водородного связывания. Показано, что способность акцептировать водород при образовании водородной связи у феноксазина 7аАМД выражена слабо и при комплексообразовании с ДНК не задействована. Основное электронное состояние 7аАМД стабилизируется водородным связыванием по акцепторному типу и дестабилизируется водородным связыванием по донорному типу. В электронно-возбужденном состоянии, стабилизируемом любыми взаимодействиями с молекулами окружения, у 7аАМД появляется и реализуется способность к водородному связыванию по акцепторному типу. Переноса протона при этом не происходит.
2. Была показана возможность встраивания 7аАМД в большую бороздку НР1. Установлено, что НР1 в комплексе с 7аАМД принимает форму Б-ДНК. Окружение хромофорной части 7аАМД в ДНК, по сравнению с водным окружением, характеризуется в два раза более сильной способностью акцептировать водородные связи, благодаря кислородам фосфатных групп, и слабой способностью водородные связи предоставлять. ДНК в значительной мере экранирует 7аАМД от взаимодействия с молекулами воды.
3. Адсорбция 7аАМД на ДНК контролируется ионными и полярными взаимодействиями. Образование комплекса характеризуется константой ассоциации в 2*104 М-1 с1. За процессом ассоциации следует конформационная подстройка 7аАМД и ДНК с характерным временем в 40 с. Процесс десорбции 7аАМД контролируется, в основном, гидрофобными взаимодействиями. Высокоспецифичными центрами связывания (константа диссоциации 78 нМ) являются одноцепочечные последовательности способные образовывать шпиличные (крестообразные) структуры. Наблюдается практически безбарьерное замещение 7аАМД на АМД в комплексе с НР1.
4. При взаимодействии с ДНК растет эффективность флуоресценции 7аАМД, уменьшается доля затушенных молекул флуорофора, но происходит уменьшение фотостабильности последнего. В водном растворе 7аАМД имеет два отличных по фотостабильности состояния. На природной ДНК, в отличие от олигонуклеотида НР1, имеются центры связывания 7аАМД, в которых его флуоресценция существенно затушена. Вероятность обратимых переходов 7аАМД в нефлуоресцирующее состояние на природной ДНК выше, чем на НР1 на 26%. 7аАМД менее фотостабилен в обработанной ультразвуком по сравнению с нативной ДНК.
5. Были решены следующие методические задачи: Выбран и адаптирован алгоритм оптимальный для обработки результатов ФКС для флуорофоров с низким квантовым выходом. Дополнение ФКС поляризационными измерениями позволило в десять раз поднять чувствительность ФКС к изменению объема флуоресцирующих частиц. Установлено, что уравнения адсорбции на гетерогенную поверхность Фрейндлиха адекватно описывает адсорбцию 7аАМД на стекло со следующими параметрами: к = 3350, а -0,255. Найдены условия, обеспечивающие постоянство низкой концентрации 7аАМД в ходе эксперимента.
6. В качестве модельных систем адресной доставки АМД к ДНК предлагается использовать олигонуклеотид НР1 и мицеллы тритона Х-100. Гидрофобное окружение 7аАМД в мицелле или в НР1, позволяющее достичь высоких концентраций 7аАМД в растворе, не препятствует взаимодействию 7аАМД с ДНК, но исключает неспецифическое взаимодействие 7аАМД Процесс ресорбции 7аАМД с НР1 на ДНК протекает в две стадии: в начале происходит адсорбция комплекса 7аАМД*НР1 на ДНК, затем самопроизвольная диссоциация 7аАМД из комплекса с НР1 и формирование комплекса с ДНК. Фотохимическая активность 7аАМД при связывании с ДНК заметно увеличивается, что обуславливает возможность использования 7аАМД в фото динамической терапии. В мицеллах тритона Х-100 фотоустойчивость 7аАМД значительно повышается.
Список опубликованных работ по теме диссертации
1. А.Э. Ковалев, А.А. Яковенко, H.JI. Векшин Исследование взаимодействия 7-аминоактиномицина с ДНК методом флуоресцентной корреляционной спектроскопии. / Биофизика 2004, т. 49, N 6, с. 1030-7.
2. A. Agafonov, Е. Gritsenko, К. Belosludtsev, A. Kovalev, О. Gateau-Roesch, N.-E.L. Saris, G.D. Mironova A permeability transition in liposomes induced by the formation of Ca2+/palmitic acid complexes. / Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Biomembranes 2003, V. 1609, Issue 2, p. 153-160.
3. A.B. Агафонов, E.H. Гриценко, K.H. Белослудцев, А.Э. Ковалев, Г.Д. Миронова Связывание кальция с анионами пальмитиновой кислоты в мембране липосом приводит к формированию липидных пор. / Труды конференции "От современной фундаментальной биологии к новым наукоемким технологиям", г. Пущино, 11-14 ноября 2002 г., с. 43.
4. Ю.В. Шаталин, А.Э. Ковалев, И.В. Савинцев, H.JI. Векшин Комплексы актиномицинов с олигонуклеотидами и ДНК. / Труды конференции "От современной фундаментальной биологии к новым наукоемким технологиям", г. Пущино, 11-14 ноября 2002 г., с. 146.
5. A. Kovalev FCS Measurements of low fluorescent dye in nanomolar concentrations. / Theses of the "Euroanalysis-12" Dortmund, Germany. 8-13 September 2002, p. 231.
6. А. Ковалев Системный подход в флуоресцентной спектроскопии. / Тезисы 6- ой Пущинской конференции молодых ученых. Пущино, 20-24 мая 2002, с. 257.
7. А.Э. Ковалёв, Ю.В. Шаталин Выбор оптимального алгоритма для обработки данных флуоресцентной корреляционной спектроскопии (ФКС). / Тезисы IX международной конференции Математика. Компьютер. Образование, г. Дубна, 28 января - 2 февраля 2002.
8. А.Э. Ковалев Выбор оптимального алгоритма для обработки данных флуоресцентной корреляционной спектроскопии (ФКС). / Труды IX международной конференции. Компьютер. Образование, г. Дубна, 28 января - 2 февраля 2002, вып. 9, ч. 2, с. 674.
9. И.В. Савинцев, А.Э. Ковалев, H.JI. Векшин Механизм формирования ДНК-актиномициновых комплексов. / Сборник тезисов 5-ой конференции молодых ученых г. Пущино "Биология - наука 21 века". Пущино, 16-20 апреля 2001, с. 48.
10. N. Vekshin, I. Savintsev, A. Kovalev, R. Yelemessov, and R.M. Wadkins Solvatochromism of the Excitation and Emission Spectra of 7-Aminoactinomycin D: Implications for Drug Recognition of DNA Secondary Structures./ The Journal of Physical Chemistry B, 2001, V. 105, N. 35, p. 84618467.
11. N. Vekshin, I. Savintsev, A. Kovalev, E. Smirnov, R. Yelemessov, D.E. Graves, and R.M. Wadkins Forces stabilizing the complex formed between 7-aminoactinomycin D and a DNA hairpin: Solvatochromism and NMR studies./ Biophys. J. (Annual Meeting Abstracts) 2001, p. 487a.
Заключение
В данной работе для анализа межмолекулярного взаимодействия использовались различные флуоресцентные методы, работающие при исключающих кооперативные эффекты, эффекты неспецифического связывания физиологически-низких концентрациях антибиотика. 7-аминоактиномицин Д (7аАМД) обладает высоким сродством к одноцепочечным участкам ДНК способным образовывать шпилечные структуры. В процессе комплексообразования с ДНК АМД в первую очередь связывается с ними, но на природной ДНК концентрация таких центов мала. Поэтому АМД связывается с менее специфическими центрами, число которых во много раз больше. Энергия взаимодействия 7аАМД с усредненным центром на природной ДНК на -2,7 кКал/моль ниже энергии взаимодействия с наиболее специфичным центром. Связываясь с двухцепочечными участками, АМД вызывает медленные конформационные изменения в ДНК. Было показано, что в основном электронном состоянии аминогруппа феноксазинового цикла 7аАМД образует водородную связь с фосфатной группой ДНК. Это взаимодействие и определяет красный сдвиг в спектре возбуждения 7аАМД при его переходе из водного окружения в ДНК. В электронно-возбужденном состоянии карбонильный кислород хинола либо 012 образуют водородную связь. В комплексе с ДНК 7аАМД существенно экранирован от молекул воды. Актиномицин Д (АМД) способен, связываясь со шпилечным олигонуклеотидом, конкурентно вытеснять 7аАМД из комплекса, при этом энергетический барьер такой замены очень мал. Был обнаружен эффект сорбции комплекса 7аАМД*НР1 на ДНК и последующей ресорбции 7аАМД из комплекса с НР1 на ДНК. То есть НР1 способен выполнять функцию адресной доставки актиномицинов.
На примере 7-аминоакгиномицина Д была продемонстрирована возможность расширить рамки метода флуоресцентной корреляционной спектроскопии для измерений с использованием слабо флуоресцирующих поверхностно-активных флуорофоров. Результаты ФКС на первый взгляд выглядят необычно. Так, в отличие от стационарной флуориметрии, в ФКС наблюдается ослабление общей флуоресценции (но не квантового выхода)
7аАМД при связывании с ДНК. Нельзя сказать, что данные ФКС противоречат данным, полученным с помощью стандартной флуоресцентной спектроскопии. От части, различия результатов обусловлены фотохимической активностью 7аАМД и использованием гораздо большей плотности возбуждающего света в микроспектрофлуориметре ConfoCor по сравнению со стандартным спектрофлуориметром. В случае стандартной спектрофлуориметрии регистрируется флуоресценция от всех молекул 7аАМД. В случае ФКС - в основном от фотостабильной фракции (возможно, изоформы) 7аАМД.
Использование наномолярных концентраций 7аАМД в эксперименте осложняется высокой адсорбция 7аАМД на стенки измерительной ячейки. Но вклады, соответствующие сорбции красителя, могут быть исключены из уравнений, описывающих изучаемую систему, если данные ФКС дополнить измерениями поляризации флуоресценции.
Удалось показать, что 7аАМД на ДНК находится в двух состояниях: фотостабильном (меньшая часть, с вероятной локализацией красителя в пурин-пиримидиновом стэкинговом окружении) и в фотохимически-активном (большая часть), когда 7аАМД локализован в шпилечных (крестообразных) структурах и разрывах ДНК. 7аАМД связывается с ДНК прочнее, чем АМД. Уточнена константа димеризации АМД. Фотохимическая активность связанного 7аАМД возрастает в ряду: мицеллы тритона Х-100 - водный раствор - димеры с АМД - комплекс с ДНК.
Фотохимическая активность 7аАМД заметно возрастает, после того как он связывается с ДНК, что позволяет использовать его в фотодинамической терапии. Наиболее фотохимически активным оказалось состояние во фрагментированной тимусной ДНК, наименее фоточувствительным - в плазмиде pGEM3Zf(+). Фотодеструкция 7аАМД имеет как минимум два характерных времени. В мицеллах тритона Х-100 7аАМД наиболее фотостабилен. Мицеллы и шпилечные олигонуклеотиды не позволяют актиномицину адсорбироваться неспецифически, но, при этом, не затрудняют взаимодействие со специфическими центрами связывания. В случае олигонуклеотида НР1 происходит быстрая адсорбция комплекса 7аАМД*НР1 на ДНК, затем медленная, в течение минуты, диссоциация 7аАМД из комплекса с быстрым локальным связыванием на ДНК. В случае мицеллы тритона Х-100 ДНК проникает в мицеллу и уже в гидрофобном окружении происходит взаимодействие 7аАМД с ДНК.
Список литературы диссертационного исследования кандидат физико-математических наук Ковалев, Александр Эдуардович, 2005 год
1. К.В. Балдин, О.Ф. Быстрое, М.М. Соколов Эконометрика. ЮНИТИ 2004, 254 с.
2. H.JI. Векшин Фотоника биологических систем. Пущино, ОНТИ НЦБИ АН СССР, 1988,164 с.
3. Дж. Лакович Основы флуоресцентной спектроскопии. Пер с англ. М., Мир, 1986.
4. Л.В. Левшин, A.M. Салецкий Оптические методы исследования молекулярных систем. Ч. 1. Молекулярная спектроскопия. М.: Изд-во МГУ, 1994. 320 с.
5. В.А. Морозов, Н.Л. Гольдман Численный алгоритм решения интегральных уравнений Фредгольма I рода методом поточечной невязки. В сб.: Методы и алгоритмы в численном анализе. М.: Изд-во МГУ, 1981, стр. 28-43.
6. Е.Б. Морошкина, Е.А. Кузьменко (Квачадзе), М.А. Кривцова, Е.Н. Глибин. Взаимодействие ДНК с амидами актиноцина. / Молекулярная биология 2000, Т. 34, N 3, с. 448-455.
7. Л. К. Мусалимова, Е. Г. Давыдова Клеточные оболочки дрожжей -сорбенты ионов тяжелых металлов. / Материалы XXXVII международной научной студенческой конференции. Новосибирск 1999.
8. А.И. Олемский, А.Я. Флат Использование концепции фрактала в физике конденсированной среды. / УФН 1993, Т. 163, N. 12, с. 1-50.
9. С.Л. Ощепков, О.В. Дубовик Оптимизированный итерационный метод для численного решения интегрального уравнения первого рода в положительно определенных значениях. / Физика атмосферы и океана, 1994.
10. И.В. Савинцев, А.Э. Ковалев, Н.Л. Векшин Механизм формирования ДНК-актиномициновых комплексов. / Сборник тезисов V конференции молодых ученых г. Пущино "Биология наука 21 века", Пущино 16-20 апреля 2001 г, с. 48.
11. А.Н. Тихонов О регуляризации некорректно поставленных задач. ДАН СССР 1963, т. 153, N 1.
12. В.В. Фролкис Старение и увеличение длительности жизни. Л. 1988, 237 с.
13. М.Н. Abraham / Journal of Chemical Society, Perkin Trans. 1972, V. 2, p. 1343.
14. S.R. Aragon, R. Pecora Fluorerescence correlation spectroscopy as a probe of molecular dynamics. /J. Chem. Phys. 1976, V. 64, p. 1791-1803.
15. A. Aretxaga, S. Romero, M. Sarra, T. Vicent Adsorption step in biological degradation of textile dye. / Biotechnol. Prog. 2001, V. 17, N. 4, pp. 664-8.
16. E.M. Arnett, L. Joris, E. Mitchell, T.S.S. Murty, T.M. Gorrie, and P.v.R. Schleyer / Journal of the American Chemical Society 1970, V. 92, p. 2364.
17. N. Asaad, M.J. den Otter, J.B. Engberts Aqueous solutions that model the cytosol: studies on polarity, chemical reactivity and enzyme kinetics. / Org. Biomol. Chem. 2004, V. 2(9), pp. 1404-12.
18. H.W. Atkin, and W.R. Gilkerson / The Journal of the American Chemical Society 1973, V. 95, p. 8551.
19. H.E. Auer, B.E. Pawlowski-Konopnicki, T.R. Krugh The absorption spectrum of actinomycin D. Evidence for three transitions in the visible band. / FEBS Letters 1977, V. 73, N2, pp. 167-170.
20. H.E. Auer, B.E. Pawlowski-Konopnicki, Y.-C.C. Chiao, T.R. Krugh Resolution of electronic absorption bands and nucleotide binding process in actinomycin D. / Biopolymers 1978, V. 17, pp. 1891-1911.
21. S.A. Bailey, D.E. Graves, R. Rill, and G. Marsch Influence of DNA base sequence on the binding energetics of actinomycin D./ Biochemistry 1993, V. 32, pp. 5881-7.
22. J. Basu, N. Padhy, A. Mookerjee An insight into the structure of DNA through melting studies. / Indian J. Biochem. Biophys. 1990, V. 27, N 4, pp. 202-8.
23. A.S. Benight, F.J. Gallo, T.M. Paner, K.D. Bishop, F.D. Faldasz, and M.J. Lane Advances in Biophysical Chemistry. JAI Press Inc., Greenwich, CT 1995, V. 5, pp 1-55.
24. K.M. Berland, P.T.C. So, E. Gratton Two-photon fluorescence correlation spectroscopy: Method and application to the intracellular environment. / Biophys. J. 1995, V. 68, pp. 694-701.
25. R. Bittman, L. Blau Stopped-flow kinetic studies of actinomycin binding to DNAs./ Biochemistry 1975, V. 14, p. 2138-2145.
26. G. Bonnet, O. Krichevsky, A. Libchaber Kinetics of conformational fluctuations in DNA hairpin-loops. / Proc Nad Acad Sci U S A 1998 Jul 21, V. 95, N 15, pp. 8602-6
27. H. Brakhage On ill-posed problems and the method of conjugate gradients in H.W. Engel & C.W. Groetsch (Eds.) Inverse and ill-posed problems, Academic Press, Boston, 1987.
28. L.G. Brooker, G.H. Keyes, D.W. Heseltine / J. Am. Chem. Soc. 1951, V. 73, pp. 5350-6.
29. L.G.S. Brooker, A.C. Craig, D.W. Heseltine, P.W. Jenkins, and L.L. Lincoln / The Journal of the American Chemical Society 1965, V. 87, p. 2443.
30. D.R. Brown, M. Kurz, D.R. Kearns, and V.L. Hsu Formation of multiple complexes between actinomycin D and a DNA hairpin: Structural characterization by multinuclear NMR. / Biochemistry 1994, V. 33, pp. 651-664.
31. S. Brownstein / Can. J. Chem. 1960, V. 38, p. 1590.
32. C. Brown, R. Shafer Kinetic studies of actinomycin D binding to mono-, oligo-, and polynucleotides. / Biochemistry 1987, V. 26, pp. 277-282.
33. J. Burgess / Spectrochimica acta Part A 1970, V. 26, p. 1957.
34. S.T. Burns, A.A. Agbodjan, M.G. Khaledi Characterization of solvation properties of lipid bilayer membranes in liposome electrokinetic chromotography. / J. Chromotogr. A 2002, V. 973, pp. 167-76.
35. P. Bustamante, A. Martin, M.A. Gonzalez-Guisandez Partial solubility parameters and solvatochromic parameters for predecting the solubility of single and multiple drugs in individual solvents. / J. Pharm. Sci. 1993, V. 82, N 6, pp. 635-40.
36. M.T. Chahine Determination of the temperature profile in an atmosphere from its outgoing radiance. / JOSA 1968, V. 58, No. 12, pp 1634-7.
37. J.B. Chaires, N. Dattagupta, D.M. Crothers Self-associacion of daunomycin./ Biochemistry 1982, V. 21, N 17, pp.3927-32.
38. K. Chattopadhyay, S. Saffarian, E.L. Elson, C. Frieden Measuring unfolding of proteins in the presence of denaturant using in fluorescence correlation spectroscopy. / Biophys. J. 2005, V. 88, N 2, pp. 1413-22.
39. F.-M. Chen, C.M. Jones, and Q.L. Johnson Dissociation kinetics of actinomycin D from oligonucleotides with hairpin motifs. / Biochemistry 1993, V. 32, p. 5554-9.
40. F.-M. Chen, F. Sha, K-H. Chin, and S.-H. Chou Binding of actinomycin D to single-stranded DNA of sequence motif d(TGTCTnG) and d(TGTnGTCT)./ Biophys. J. 2003, V. 84, pp 432-9.
41. F.-M. Chen, F. Sha, K-H. Chin, and S.-H. The nature of actinomycin D binding to d(AACCAXYG) sequence motif./ Nuc. Acid Res. 2004, V. 32, No 1, pp 271277.
42. S.C. Cheung, G. Medoff, D. Schlessinger, G.S. Kobayashi Response of yeast and mycelial phase of Histoplasma capsulatum to amorphotericin В and actinomycin D. / Antimicrob. Agents Chemother. 1975, V. 8, No. 4, pp. 498-503.
43. Y.-C. Chiao, K.G. Rao, J.W. Hook, T.R. Krugh, S.K. Sengupta 7-Amino-actinomycin D complexes with deoxynucleotides as models for binding of the drug to DNA. / Biopolymers 1979, V. 18, No. 7, pp. 1749-62.
44. L. Chinsky, P.Y. Turpin Ultraviolet resonance Raman study of DNA and of its interaction with actinomycin D. / Nucleic Acid Res. 1978, V. 5, N 8, pp. 296977.
45. A. Delon, Y. Usson, J. Derouard, T. Biben, C. Souchier Photobleaching, mobility, and compartmentalization: interference in fluorescence correlation spectroscopy. / J. Fluoresc. 2004, V. 14, N. 3, pp. 255-67.
46. K. Dimroth, C. Reichardt, T. Seipmann, and F. Bohlmann / Justus Liebigs Ann. Chem. 1963, V. 661, p. 1.
47. E.L. Elson, D. Madge Fluorescence correlation spectroscopy. I. Conceptual basis and theory. / Biopolymers 1974, V. 13, pp. 1-27.
48. A. Ehrenberg, R. Rigler Rotational Brownian-motion and fluorescence intensity fluctuations. / Chem. Phys. 1974, V. 4, pp. 390-401.
49. G.R. Famini, D. Aguiar, M.A. Payne, R. Rodriquez, L.Y. Wilson Using the theoretical linear solvation energy relationship to correlate and predict nasal pungency threshold. / J. Mol. Graph. Model 2002, V. 20,4, p.277-80.
50. Z. Foldes-Papp, U. Demel, G.P. Tilz Ultrasensitive detection and identification of fluorescent molecules by FCS: Impact for immunobiology. / Proc Natl Acad Sci U S A 2001 Sep 25, V. 98, N 20, pp. 11509-14.
51. F.W. Fowler, A.R. Katritzky, and R.J.D. Rutherford / J. Chem. Soc. В 1971, V. 160, p. 460.
52. С.A. Frederick, G.J. Quigley, M.K. Teng, M. Coll, G.A. Van der Marel, J.H. Van Boom, A. Rich, A.H. Wang Molecular structure of an A-DNA decamer d(ACCGGCCGGT). / Eur J Biochem. 1989, V. 181, N 2, pp. 295-307.
53. H. Freundlich Colloid and Capillary Chemistry. Methuen. London. 1926.
54. X.C. Fu, Y.W. Dai Prediction of percutaneous drug permeability using modified theoretical linear solvation energy relationship. / Zhejiang Da Xue Xue Bao Yi Xue Ban 2003, V. 32, N 4, pp. 352-5.
55. E.F. Gale, E. Cunliffe, P.E. Reynolds, M.H. Richmond, M.J. Waring The molecular basis of antibiotic action. / John Wiley and Sons, London, 1981.
56. J.E. Gill, M.M. Jotz, S.G. Young, E.J. Modest and S.K. Sengupta 7-Amino-actinomycin D as a cytochemical probe. I. Spectral properties. / J Histochem. Cytochem. 1975, V. 23, N 11, pp. 793-9.
57. T. Gramstad, and J. Sandstrom / Spectrochim. Acta Part A 1969, V. 25, p. 31.
58. A. Gomez-Hens, M.P. Aguilar-Caballos Stopped-flow fluorescence polarization immunoassay. / Comb. Chem. High Throughput. Screen. 2003, V. 6, N. 3, pp. 177-82.
59. J. Goodisman, R. Rehfuss, B. Wang, J.C. Dabrowiak Site-specific binding constants for actinomycin D on DNA determined from footprinting studies./ Biochemistry 1992, V. 31, pp. 1046-58.
60. D. Gurka, R.W. Taft, L. Joris, and P.v.R. Schleyer / The Journal of the American Chemical Society 1967, V. 89, p. 5957.
61. D. Gurka and R.W. Taft / The Journal of the American Chemical Society 1969, V. 91, p. 4794.
62. R. Hahin, A. Kondratiev ED50 AP block predictions for phenyl substituted n-alkanols / J. Membr. Biol. 2001, V. 180, p. 137-145.
63. P.C. Hansen The truncated SVD as a method for regularization. / ВГГ 1987, V. 27, pp. 543-553.
64. R.J. Hanson A numerical method for solving Fredholm integral equations of the first kind using singular values. / SIAM J. Numer. Anal. 1971, V. 8, N 3, pp. 616-22.
65. Y. Hashimoto, M. Sugawara, T. Masuko, H. Hojo Antitumor effect of actinomycin D entrapped in liposomes bearing subunits of tumor-specificmonoclonal immunoglobulin M antiody. / Cancer Res. 1983, V. 43, N 11, pp. 5328-34.
66. U. Haupts, S. Maiti, P. Schwille, W.W. Webb Dynamics of fluorescence fluctuations in green fluorescent protein observed by fluorescence correlation spectroscopy. Proc Nad Acad Sci U S A 1998 Nov 10, V. 95, N 23, pp. 13573-8.
67. J.H. Hildebrand, R.L. Scott The solubility of nonelectrolytes. 3rd ed.; Dover Publ.: NY, 1964.
68. J.C. Horng, S.M. Tracz, KJ. Lumb, D.P. Raleigh Slow folding of a three-helix protein via a compact intermediate. / Biochemistry 2005, V. 44, N 2, pp. 627-34.
69. M.-H. Hou, H. Robinson, Y.-G. Gao and A.H.-J. Wang Crystal structure of actinomycin D bound to the CTG triplet repeat sequences linked to neurological deseases. / Nucl. Acid Res. 2002, V. 30, N 22, pp. 4910-7.
70. Z. Huang, N.L. Thompson Imaging fluorescence correlation spectroscopy: nonuniform IgE distributions on planar membranes. / Biophys. J. 1996, V. 70, pp. 2001-2007.
71. R.D. Icenogle, E.L. Elson Fluorescence correlation spectroscopy and photobleaching recovery of multiple binding reactions. I. Theory and FCS measurements. Biopolymers 1983, V. 22, pp. 1919-1948.
72. T.N. Inada, K. Kikuchi, Y. Takahashi, H. Ikeda, T. Miyashi A comparative study on electron-transfer fluorescence quenching by aliphatic and aromatic amines. / J. Photochem. Photobiol. A. 2000, V. 137, pp. 93-97.
73. Y. Ishihama, N. Asakawa Characterization of lipophilicity scales using vectors from solvation energy descriptors. / J. Pharm. Sci. 1999, V. 88, pp. 1305-12.
74. E.A. Jares-Erijman , Е.А., R. Klement, R. Machinek, R.M. Wadkins, L.A. Marky, B.I. Kankia and T.M. Jovin Binding of actinomycin D to single-stranded DNA. / Nucleosides and Nucleotides 1997, V. 16, pp. 661-7.
75. S. Kamitory and F. Takusagawa Crystal structure of the 2:1 complex between d(GAAGCTTC) and the anticancer drug actinomycin D. / J. Mol. Biol. 1992, V. 225, N 2, pp. 445-56.
76. S. Kamitory and F. Takusagawa Multiple binding models of anticancer drug actinomycin D: X-ray, molecular modeling, and spectroscopic studies of d(GAAGCTTC)-actinomycin D complexes and its host DNA. / J. Am. Chem. Soc. 1994, V. 116, pp. 4154-65.
77. M.J. Kamlet, R.W. Taft The solvatochromic comparison method. I. The уЗ-scale of solvent hydrogen-bond acceptor (HBA) basicities./ Journal of the American Chemical Society 1976, V. 98, N 2, pp. 377-387.
78. M.J. Kamlet, J.L. Abboud, and R.W. Taft The solvatochromic comparison method. 6. The n* scale of solvent polarities./ Journal of the American Chemical Society 1977, V. 99, N 18, p. 6027-6038.
79. P. Kask, R. Piksarv, U. Mets Fluorescence correlation spectroscopy in the nanosecond time range: photon antibunching in tdye fluorescence. Eur. Biophys. J. 1985, V. 12, pp. 163-6.
80. A.R. Katritzky, T. Tamm, Y. Wang, M. Karelson A unified treatment of solvent properties./ J. of Chemical Information and Computer Sciencies 1999, V. 39, N 4, pp. 692-8.
81. M.M. Khan, T.J. Lindell Actinomycin D binds with highest affinity to nonribosomal DNA. / J. Biol. Chem. 1980 Apr., V. 25, pp. 3581-3584.
82. M. Kinjo, G. Nishimura, T. Koyama, Mets, R. Rigler Single-molecule analysis of restriction DNA fragments using fluorescence correlation spectroscopy. Anal Biochem 1998 Jul 1, V. 260, N 2, pp. 166-72.
83. J. Klingler, T. Friedrich Site-specific interaction of thrombin and inhibitors observed by fluorescence correlation spectroscopy. Biophys. J. 1997, V. 73, pp. 2195-2200.
84. I.A. Koppel and V.A. Palm / Reakt. sposobn. org. soed. 1969, V. 4, p. 504.
85. I.A. Koppel and V.A. Palm "Advances in Linear Free Energy Realtionships", N.B. Chapman and J. Shorter, Ed., Plenum Press, London, Chapter 5,1972.
86. E.M. Kosower / The Journal of the American Chemical Society 1958, V. 80, p. 3253.
87. E.M. Kosower An introduction to physical organic chemistry. John Wiley & Sons, 1968.
88. T. Krai, M. Hof, M. Langner The effect of spermine on plasmid condensation and dye release observed by fluorescence correlation spectroscopy. / Biol. Chem. 2002, V. 383, N2, pp. 331-5.
89. H. Kurahashi, H. Inagaki, K. Yamada, T. Ohye, M. Taniguchi, B.S. Emanuel, and T. Toda Cruciform DNA structure underlies the etiology for palindrome-mediated human chromosomal translocations. / J. Biol. Chem. 2004, V. 279, N 34, pp. 35377-83.
90. A.F. Lagalante, A.Abdulagatov, and T.J. Bruno Kamlet-Taft thermosolvatochromic parameters of hydrofluoroethers and hydrofluoroether azeotropic mixtures. / J. Chem. Eng. Data 2002, V. 47, pp. 47-51.
91. W.R. Laws, L. Brand Analysis of two-state excited-state reactions. The fluorescence decay of 2-naphthol. / J. Phys. Chem. 1979, V. 83, pp. 795-802.
92. C.L. Lawson, R.J. Hanson Solving Least Squares Problems. / SIAM Press 1995, ISBN 0-89871-356-0.
93. C.-H. Lee, H. Mizusaa, T. Kakefuda Unwinding of double-stranded DNA helix by dehydration. / PNAS USA 1981, V. 78, N 5, pp. 2838-42.
94. J. Li, J.J. Masso, S. Rendon Quantitative evaluation of adhesive properties and drug-adhesive interactios for transdermal drug delivery formulations using linear solvation energy relationships. / J. Control Release 2002, V. 82, N 1, pp. 1-16.
95. W. Liu, H.M. Vu, D.R. Kearns 1H NMR studies of a 17-mer DNA duplex. / BBA 2002, V. 1574, N 1, pp. 93-9.
96. Y. Marcus, M.J. Kamlet, and R.W. Taft Linear solvation energy relationships. Standard molar Gibbs free energies and Enthalpies of transfer of ions from water into nonaqueous solvents./ J. Phys. Chem. 1988, V. 92, pp. 3613-3622.
97. L.A. Marky, J.G. Snyder, D.P. Remeta, K.J.J. Breslauer / Biomolec. Struct. Dyn. 1983, V. 1, pp. 487-507.
98. J. Meienhofer, E. Atherton Structure-activity relationship among the semisynthetic antibiotics. D. Perlman Ed., Academic Press Inc., NY 1977, pp. 427-529.
99. T. Meyer, H. Schindler Particle counting by fluorescence correlation spectroscopy. /Biophys. J. 1988, V. 54, pp. 983-993.
100. B. Mishra, K.I. Priyadarsini, M.K. Bhide, R.M. Kadam, H. Mohan Reactions of superoxide radicals with curcumin: probable mechanisms by optical spectroscopy and EPR. / Free Radic. Res. 2004, V. 38, N 4, pp. 355-62.
101. J.N. Murrell The theory of electronic spectra of organic molecules. Methuen, London, 1963, pp. 242 ff.
102. J.R. Neto, M.F. Colombo Water regulation of actinomycin-D binding to DNA: The interplay among drug affinity, DNA long-range conformation, and hydration. / Biopolymers 2000, V. 53, pp. 46-59.
103. C.G. Pack, G. Nishimura, M. Tamura, K. Aoki, H. Taguchi, M. Yoshida, M. Kinjo Analysis of interaction between chaperonin GroEL and its substrate usingfluorescence correlation spectroscopy. Cytometry 1999 Jul 1, V. 36, N 3, pp. 247-53.
104. J.X. Pan, Y. Liu, S.P. Zhang. T.C. Tu, S.D. Yao, N.Y. Lin, Photodynamic action of actinomycin D: an EPR spin trapping study. / Biochim Biophys. Acta 2001, V. 1527, N 1-2, pp. 1-3.
105. D. Papahadjopoulos, G. Post, W.J. Vail, and J.L. Biedler Use of lipid vesicles as carriers to introduce Actinomycin D into resistant tumor cells. / Cancer Res. 1976, V. 36, pp. 2988-2994.
106. T.M. Penning, Y. Jin, V.V. Heredia, M. Lewis Structure-function relationships in 3alpha-hydroxysteroid dehydrogenases: a comparison of the rat and human isoforms. / J. Steroid Biochem. Mol. Biol. 2003, V. 85, N 2-5, p. 247-55.
107. P. Perez, A. Toro-Labbe, R. Contreras Solvent effects on electrophilicity. / J. Am. Chem. Soc. 2001, V. 123, pp. 5527-31.
108. M. Pitschke, R. Prior, M. Haupt, D. Riesner Detection of single amyloid beta-protein aggregates in the cerebrospinal fluid of Alzheimer's patients by fluorescence correlation spectroscopy Nat Med 1998 Jul 4, V. 7, pp. 832-4.
109. P.K. Ponnuswamy, R.F. McGuire, and H.A. Scheraga Refinement of the molecular structure of actinomycin D by energy minimization. / Intntl. J. Peptide and Protein Research 1973, V. 5, pp. 73-84.
110. L.A. Pothan, Y. Zimmermann, S. Thomas, S. Spange Determination of polarity parameters of chemically modified cellulose fibers by means of the solvatochromic technique. / Journal of Polymer Science, Part В 2000, V. 38, pp 2546-53.
111. S.W. Provencher / Comput. Phys. Commun. 1982, V. 27, pp. 213-27,229-42.
112. W. Qiquan, L. Weiping Correlation of imazapyr adsorption and desorption with soil properties. / Soil Science 1999, V. 164, N 6, pp. 411-16.
113. F. Quadrifoglio, A. Ciana, V. Crescenzi Letter: On the interaction between actinomycin D and DNA./ Biopolymers 1976, V. 15, N 3, pp. 595-7.
114. G.J. Quigley, A.H-J. Wang, G. Ughetto, G.A. van der Marel, J.H. Boom, A. Rich Molecular structure of an anticancer drug-DNA complex: Daunomycin plus d(CpGpTpApCpG). / PNAS USA 1980, V. 77, pp.7204-8.
115. J. Ren, T.C. Jenkins, and J.B. Chaires Energetics of DNA intercalation reactions. / Biochem. 2000, V. 39, pp. 8439-47.
116. D. Rentzeperis, D.W. Kupke, L.A. Marky Volume changes correlate with entropies and enthalpies in formation of nucleic acid homoduplexes: differential hydration of A and В conformations./ Biopolymers 1993, V. 33, N 1, pp. 117-25.
117. R. Rigler, J. Widengren, U. Mets Interactions and kinetics of single molecules as observed by fluorescence correlation spectroscopy. In Fluorescence Spectroscopy. O.S. Wolfbeis, editor. Springer-Verlag, Berlin/Heidelberg/New York, 1992, pp. 13-24.
118. R.L. Rill and K.H. Hecker Sequence-specific actinomycin D binding to single-stranded DNA inhibits HIV reverse transcriptase and other polymerases. / Biochemistry 1996, V. 35, pp. 3525-3533.
119. W. Sanger Principles of nucleic acid structure. Springer-Verlag 1984, pp. 368-84.
120. M. Shinomiya, W. Chu, R.G. Carlson, R.F. Weaver, F. Takusagawa Structural, physical, and biological characteristics of RNA*DNA binding agent N8-actinomycin D. / Biochemistry 1995, V. 34, pp. 8481-91.
121. C. Ray Smith & W.T. Grandy, Jr. (Eds.) Maximum-entropy and Bayesian methods in inverse problems. Reidel, Boston, 1985.
122. G. Smulevich, L. Angeloni and M.P, Marzocchi Raman excitation profiles of actinomycin D. / Biochem. Biophys. Acta 1980, V. 610, pp. 384-91.
123. H.M. Sobell, S.C. Jain, T.D. Sacore, C.E. Nordman / Nature, New Biol. 1971, V. 231, pp. 200-5.
124. H.M. Sobell, S.C. Jain Stereochemistry of actinomycin binding to DNA П. Detailed molecular model of actinomycin-DNA complex and it's implication. / J. Mol. Biol. 1972, V. 68, pp. 21-34.
125. J.S. Sobel, A.M. Albrecht, H. Riehm, J.L. Biedler Hybridization of actinomycin D- and amethopterin- resistant Chinese hamster cells in vitro. / Cancer Res. 1971, V. 31, N 3, pp. 297-307.
126. S. Spange, R. Sens, Y. Zimmermann, A. Seifert, I. Roth, S. Anders, and K. Hofmann A solvatochromic dye for probing significantly the dipolarity/polarizability of HBD (hydrogen bond donationg) environments. / New J. Chem. 2003, V. 27, pp. 520-4.
127. R.W. Taft, D. Gurka, L. Joris, P.v.P. Schleyer, J.W. Rakshys / Journal of the American Chemical Society 1969, V. 91, p. 4801.
128. R.W. Taft, M.J. Kamlet The solvatochromic comparison method. 2. The ar-scale of solvent hydrogen-bond donor (HBA) acidities./ Journal of the American Chemical Society 1976, V. 98, N 10, pp. 2886-2894.
129. J.C. Tai, W.S. Craig, B.P. Gaber On the electronic spectrum of actinomycin D. / J. Am. Chem. Soc. 1976, V. 98, N 25, pp. 7925-7.
130. N.L. Thompson Fluorescence correlation spectroscopy. In Topics in Fluorescence Spectroscopy, V. 1: Techniques. J.R. Lakowicz, editor. Plenum Press, New York. 1991, pp. 337-78.
131. S. Twomey Comparison of constrained linear inverse and an interactive nonlinear algorithm applied to the indirect estimation of particle size distribution. /J. Comput. Phys. 1975, V. 18, N 2, pp. 188-200.
132. J. Verweij, J.H.M. Schellens, T.L. Loo, H.M. Pinedo / Cancer Chemotherapy and Biotherapy / Eds B.A.Chabner, D.L. Longo. Philadelphia: Lippincott-Raven Publishers 1996, pp. 395-407.
133. N.L. Vekshin Photonics of Biopolymers. Moscow State University Press, M., 1999.
134. R.M. Wadkins, T.M. Jovin Actinomycin D and 7-aminoactinomycin D binding to single-strand DNA. / Biochemistry 1991, V. 30, N 39, pp. 9469-78.
135. R.M. Wadkins, E.A. Jares-Erijman, R. Klement, A. Ruediger, T.M. Jovin / J. Mol. Biol. 1996, V. 262, pp. 53-68.
136. R. M. Wadkins, C. Tunng, P. M. Vallone, A. S. Benight. The role of the loop in binding of an actinomycin D analog to hairpins formed by single-stranded DNA./ Archives of Biochemistry and Biophysics 2000, V. 384, pp. 199-203.
137. J. Widengren, R. Rigler, U. Mets Triplet-state monitoring by fluorescence correlation spectroscopy. / J. Fluorescence 1994, V. 4, pp. 255-258.
138. J. Widengren Fluorescence correlation spectroscopy, photophysical aspects and applications. Ph.D. thesis. Karolinska Institute, Stockholm, Sweden, 1996, 66 p.
139. J. Widengren, R. Rigler Fluorescence correlation spectroscopy as a tool to investigate chemical reactions in solutions and on cell surfaces. Cell Mol Biol (Noisy-le-grand) 1998 Jul, V. 44, N 5, pp. 857-79.
140. L.Y. Wilson Using theoretical descriptors in quantitative structure-activity relationships: Some toxicological indices. / J. Med. Chem. 1991, V. 34, N 5, pp. 1668-74.
141. H. Winter, K. Korn, R. Rigler Direct gene expression analysis. / Curr. Pharm. Biotechnol. 2004, V. 5, N 2, pp. 191-7.
142. J. Wyman, S.J. Gill Binding and linkage: Functional chemistry of biological macromolecules. Univ. Science Books, Mill Valley, CA, 1981.
143. L.E. Xodo, G. Manzini, F. Quadrifoglio, N. Yathindra, G.A. van der Marel, J.H. van Boom A facile duplex-hairpin interconversion through a cruciform intermediate in a linear DNA fragment. / J. Mol. Biol. 1989, V. 205, N 4, pp. 777781.
144. C. Ybert, F. Nadal, R. Salome, F. Argoul, L. Bourdieu Electrically induced microflows probed by fluorescence correlation spectroscopy. / Eur. Phys. J. E Soft Matter, in press 2005.
145. R.L. Yu, G.R. Hu, Y.H. Zhao Comperative study of four QSAR models of aromatic compounds to aquatic organisms. / J. Environ. Sci. (China) 2002, V. 14, pp. 552-7.
146. M. Zander, U. Breymann, H. Dreeskamp, E. Koch / Z. Nuturforsch. A 1977, V. 32A, pp. 1561-3.
Обратите внимание, представленные выше научные тексты размещены для ознакомления и получены посредством распознавания оригинальных текстов диссертаций (OCR). В связи с чем, в них могут содержаться ошибки, связанные с несовершенством алгоритмов распознавания. В PDF файлах диссертаций и авторефератов, которые мы доставляем, подобных ошибок нет.