Генетическое разнообразие и фармакодинамическое обоснование прогноза резистентности к антимикробным препаратам нозокомиальных штаммов Acinetobacter spp. в различных регионах России и Беларуси тема диссертации и автореферата по ВАК РФ 14.03.06, кандидат медицинских наук Мартинович, Алексей Александрович

• Мартинович, Алексей Александрович
• кандидат медицинских наук
• 2010

Оглавление диссертации кандидат медицинских наук Мартинович, Алексей Александрович

СПИСОК ИСПОЛЬЗОВАННЫХ СОКРАЩЕНИЙ.

ВВЕДЕНИЕ.

ЧАСТЬ 1. ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ.

ГЛАВА 1. A CINETOBACTER SPP.

1.1. Общие представления о микроорганизме.

1.2. Клиническое значение Acinetobacter spp.:.

1.3. Методы идентификации acinetobacter spp.

ГЛАВА 2. РЕЗИСТЕНТНОСТЬ К АНТИМИКРОБНЫМ ПРЕПАРАТАМ

2.1. Механизмы антибиотикорезистентности ^с/л^гшлсгяя spp.

2.2. Активность основных антимикробных препаратов в отношении нозокомиальных штаммов Acinetobacter spp.

ЧАСТЬ 2. СОБСТВЕННЫЕ ИССЛЕДОВАНИЯ.

ГЛАВА 3. МАТЕРИАЛ И МЕТОДЫ ИССЛЕДОВАНИЯ.

3.1. клинический материал.

3.2. Фенотипическое исследование микроорганизмов.

3.3. Контроль качества при определении чувствительности.

3.4. Обработка данных и статистический анализ.

3.5. Генотипическое изучение микроорганизмов.

ГЛАВА 4. РЕЗУЛЬТАТЫ И ИХ ОБСУЖДЕНИЕ.

4.1. Значимость Acinetobacter spp. как возбудителя нозокомиальных инфекций в России.

4.1.1. Сроки проведения и география исследования.

4.1.2. Структура грамотрицательных возбудителей нозокомиальных инфекций в России и положение рода Acinetobacter.

4.2. Резистентность нозокомиальных штаммов Acinetobacter spp. к используемым антимикробным препаратам и оценка перспективных антибиотиков.

4.2.1. Динамика резистентности к используемым антибиотикам и различия в зависимости от профиля отделения.

4.2.2. Оценка резистентности нозокомиальных Acinetobacter spp. к используемым антимикробным препаратам в 2006-2008 гг.

4.2.3. Оценка активности перспективных антимикробных препаратов

4.2.4. Перекрёстная резистентность к карбапенемам.

4.3. Выявление продукции приобретённых карбапенемаз нозокомиальными штаммами Acinetobacter spp.

4.3.1. Выявление продукции приобретённых металло-бета-лактамаз

4.3.2. Разработка метода мультиплекс-ПЦР для детекции генов приобретённых ОХА-карбапенемаз у Acinetobacter spp.

4.3.3. Выявление генов приобретённых ОХА-карбапенемаз у карбапенеморезистентных штаммов Acinetobacter spp.

4.3.4. Выявление «молчащих» генов приобретённых ОХА-карбапенемаз у карбапенемочувствительных штаммов acinetobacter spp.

4.4. мультилокусное секвенирование-типирование штаммов Acinetobacter ва umannii.

4.4.1. Оптимизация протокола MJICT штаммов а. ва umannii.

4.4.2. Изучение генетического разнообразия штаммов a. baumannii, циркулирующих на территории России и Беларуси.

Введение диссертации (часть автореферата) на тему «Генетическое разнообразие и фармакодинамическое обоснование прогноза резистентности к антимикробным препаратам нозокомиальных штаммов Acinetobacter spp. в различных регионах России и Беларуси»

АКТУАЛЬНОСТЬ ТЕМЫ

Нозокомиальные инфекции являются основной инфекционной проблемой любого современного стационара [220, 266]. Их возникновение неизбежно, а частота и тяжесть с годами только растут [215]. Особенно остро вопрос нозокомиальных инфекций стоит в отделениях со значительным потреблением антибиотиков, в первую очередь это отделения реанимации и интенсивной терапии, где назначение антимикробных средств встречается до 10 раз чаще, по сравнению с отделениями других профилей, а нозокомиальная инфекция развивается у каждого пятого пациента и является основной причиной летальности [35, 221]. Ежегодно только в России отмечается порядка 2,5 млн. нозокомиальных инфекций [3], хотя официально регистрируется не более 30 тысяч [9, 10]. Для назначения своевременной, а главное, адекватной терапии каждого инфекционного заболевания врач должен знать наиболее вероятную его этиологию и спектр чувствительности предполагаемого патогена к антимикробным средствам, которые варьируют не только в зависимости от города и стационара, но и между отделениями одной больницы [24].

Возбудителями нозокомиальных инфекций могут быть различные микроорганизмы как эндогенной, так и экзогенной природы [209]. В России, по данным современных исследований, ведущей группой возбудителей нозокомиальных инфекций в ОРИТ являются грамотрицательные неферментирующие бактерии, в частности Р. aeruginosa и Acinetobacter spp. (35% и 15% соответственно) [19]. Суммарно они опережают вторую по частоте встречаемости группу энтеробактерий (34,5%), представители которой до последних лет выделялись из клинического материала при нозокомиальных инфекциях наиболее часто [14, 23]. Постепенный, но стабильный рост встречаемости ацинетобактеров в структуре нозокомиальных патогенов [68], а также высокий уровень летальности от данных инфекций (от 30 до 75%) [102, 161, 199, 279] отмечается врачами и исследователями во всём мире [39, 40, 154,213,265].

Принимая во внимание тяжесть состояния пациентов и последствия развития любой инфекции, вполне объяснимо эмпирическое назначение пациентам антибиотиков широкого профиля. Однако случаи нерационального их назначения способствуют развитию полирезистентности микрофлоры стационара [24]. Особенно быстро активизировать и приобретать различные механизмы антибиотикорезистентности способны именно представители рода Acinetobacter [157]. И действительно, различные авторы отмечают выделение резистентных к трём и более группам антибиотиков нозокомиальных ацинетобактеров в ОРИТ в 40 и более процентах случаев [6, 20]. В то время как ещё 10 лет назад данные микроорганизмы считались чувствительными к подавляющему большинству препаратов [260]. Зарубежные исследования показывают, что ситуация в мире выглядит более плачевно. Полирезистентные ацинетобактеры в ОРИТ Европы встречаются в 75 и более процентах случаев [83, 171, 242, 243], в ОРИТ США в 50 и более процентах случаев [45, 217]. Для рационального эмпирического назначения действующих на настоящий момент антимикробных препаратов, а также для предупреждения снижения их активности необходимо выявление основных механизмов резистентности и способов их распространения в популяции микроорганизмов, постоянный мониторинг активности антимикробных средств на национальном уровне. Для возможности быстрого устранения возникающих в стационарах очагов инфекции и воздействия на пути передачи возбудителя необходимы точная и достоверная видовая идентификация микроорганизмов, установление характера инфекционной вспышки, а при наличии условий и субвидовая идентификация.

ЦЕЛЬ ИССЛЕДОВАНИЯ

Изучить с помощью современных методов генетическое разнообразие, динамику резистентности к антимикробным препаратам и распространённость карбапенемаз среди нозокомиальных штаммов Acinetobacter spp., выделенных в отделениях с интенсивным потреблением антибиотиков, и разработать на этой основе рекомендации по оптимизации эмпирической и этиотропной терапии инфекций, вызванных этими микроорганизмами.

ЗАДАЧИ ИССЛЕДОВАНИЯ

1. Оценить в динамике распространенность Acinetobacter spp. в общей структуре грамотрицательных возбудителей нозокомиальных инфекций.

2. Определить с помощью современных методов чувствительность Acinetobacter spp. к используемым и перспективным антимикробным препаратам и предложить на этой основе рекомендации по эмпирической и этиотропной терапии инфекций, вызванных данным возбудителем.

3. Разработать технологию ПЦР в реальном времени для детекции приобретённых карбапенемаз молекулярного класса D у Acinetobacter spp.

4. Выявить распространённость металло-Р-лактамаз и ОХА-карбапенемаз среди клинических штаммов Acinetobacter spp., нечувствительных к карбапенемам.

5. Оптимизировать протокол мультилокусного секвенирования-типирования Acinetobacter baumannii и с его помощью изучить генетическое разнообразие карбапенемазо-продуцирующих штаммов.

НАУЧНАЯ НОВИЗНА Впервые:

1. Организована система мониторинга карбапенеморезистентных штаммов Acinetobacter spp., вызывающих нозокомиальные инфекции в стационарах 21 города 7 федеральных округов Российской Федерации и 2 городов Беларуси

2. Дана оценка in vitro активности перспективных антимикробных препаратов в отношении нозокомиальных штаммов Acinetobacter spp.

3. Разработан метод ПЦР в реальном времени для быстрого выявления генов приобретённых ОХА-карбапенемаз у Acinetobacter spp.

4. Изучена принадлежность карбапенеморезистентных штаммов Acinetobacter spp., вызывающих инфекции в стационарах России и Беларуси, к циркулирующим международным эпидемическим клонам.

ПРАКТИЧЕСКАЯ ЗНАЧИМОСТЬ РАБОТЫ

1. Организованная система мониторинга карбапенеморезистентных штаммов Acinetobacter spp. в стационарах России и Беларуси является одним из направлений работы Научно-методического центра Федерального агентства по здравоохранению и социальному развитию по мониторингу антибиотикорезистентности.

2. Полученные фармакодинамические данные по активности различных классов и групп антимикробных препаратов позволяют прогнозировать резистентность нозокомиальных штаммов Acinetobacter spp. в России и предложить рекомендации по этиотропной и эмпирической терапии инфекций, вызываемых данным родом микроорганизмов.

3. Разработанный метод ПЦР в реальном времени и оптимизация протокола мультилокусного секвенирования-типирования А. baumannii позволяет расширить возможности лабораторий центров

Госсанэпиднадзора и микробиологических лабораторий при лечебно-профилактических учреждениях по своевременному выявлению эпидемиологически опасных штаммов.

ОСНОВНЫЕ ПОЛОЖЕНИЯ, ВЫНОСИМЫЕ НА ЗАЩИТУ

1. Acinetobacter spp. является вторым по частоте неферментирующим грамотрицательным возбудителем нозокомиальных инфекций в отделениях с интенсивным потреблением антибиотиков многопрофильных стационаров России.

2. Выявленная у Acinetobacter spp. в России и Беларуси продукция приобретённых ОХА-карбапенемаз и принадлежность к новым и известным эпидемическим клональным группам является неблагоприятным прогностическим признаком распространения карбапенеморезистентности в ближайшие годы.

3. Перспективными препаратами для терапии инфекций, вызванных Acinetobacter spp., в настоящее время являются имипенем, дорипенем, меропенем и цефоперазон/сульбактам, а в будущем - колистин и полимиксин Б.

ВНЕДРЕНИЕ РЕЗУЛЬТАТОВ В ПРАКТИКУ

Практические рекомендации, разработанные в диссертации, используются в работе медико-профилактических учреждений гг. Екатеринбурга, Новосибирска, Москвы, Краснодара, Минска, Смоленска. Основные положения работы излагаются на семинарах и циклах повышения квалификации врачей и курсах усовершенствования лаборантов в НИИ антимикробной химиотерапии ГОУ ВПО «Смоленская государственная медицинская академия Федерального агенства по здравоохранению и социальному развитию», на конгрессах, конференциях и семинарах Межрегиональной ассоциации по клинической микробиологии и антимикробной химиотерапии (МАКМАХ), на практических занятиях и лекциях кафедры клинической фармакологии ГОУ ВПО «Смоленская государственная медицинская академия Федерального агенства по здравоохранению и социальному развитию».

АПРОБАЦИЯ РАБОТЫ

Результаты исследования представлены на Международном конкурсе научно-исследовательских работ по антимикробной химиотерапии, памяти члена-корреспондента РАМН, д.м.н., профессора JI.C. Страчунского (Смоленск, 2007 г.), 35-й конференции молодых ученых Смоленской государственной медицинской академии (Смоленск, 2007 г.), Научно-практическом семинаре «Бета-лактамазы: значение и методы выявления» (Смоленск, 2007 г.), Научно-практическом семинаре «Определение чувствительности к антибиотикам: практические аспекты и значение для клинической практики» (Смоленск, 2007 г.), XVIII Европейском конгрессе по клинической микробиологии и инфекционным болезням (ECCMID, Барселона, 2008 г.), III Национальном конгрессе терапевтов (Москва, 2008), курсах усовершенствования лаборантов (Смоленск, 2008, 2009 гг.), циклах повышения квалификации врачей-бактериологов (Смоленск, 2008, 2009 гг.), циклах повышения квалификации клинических фармакологов (Смоленск, 2008, 2009 гг.), XI Российском национальном конгрессе «Человек и лекарство» (Москва, 2009 г.), XIX Европейском конгрессе по клинической микробиологии и инфекционным болезням (ECCMID, Хельсинки, 2009 г.), XI Международном конгрессе МАКМАХ по антимикробной терапии (Москва, 2009 г.), 37-й конференции молодых ученых Смоленской государственной медицинской академии (Смоленск, 2009 г.), XIX Национальном конгрессе по болезням органов дыхания (Москва, 2009), 49-й междисциплинарной конференции по антимикробным препаратам и химиотерапии (ICAAC, Сан-Франциско, 2009 г.), Научно-практическом семинаре «Молекулярная бактериология: идентификация, типирование и выявление антибиотикорезистентности»

Смоленск, 2009 г.), совместном заседании сотрудников кафедр госпитальной педиатрии с курсом неонатологии ФПК и 1JLL1C, клинической фармакологии, микробиологии, поликлинической педиатрии, терапии педиатрического и стоматологического факультета, терапии ФПК и ППС, общественного здоровья и здравоохранения, травматологии и ортопедии, урологии, факультетской терапии, сотрудников НИИ антимикробной химиотерапии ГОУ ВПО «Смоленская медицинская академия Федерального агентства по здравоохранению и социальному развитию» (Смоленск, 2010 г.).

ПУБЛИКАЦИИ

По материалам диссертации опубликовано 6 научных работ, из них ВАК рецензирумемых журналах - 2, в зарубежной печати - 4, в центральной печати - 2.

ОБЪЕМ И СТРУКТУРА ДИССЕРТАЦИИ

Диссертация изложена на 144 страницах машинописного текста и состоит из введения, обзора литературы, материалов и методов исследования, результатов и обсуждения собственных исследований, заключения, выводов, практических рекомендаций, списка литературы, который включает 27 отечественных и 257 иностранных источников. Материал иллюстрирован 15 таблицами, 35 рисунками, содержит 1 приложение.

Заключение диссертации по теме «Фармакология, клиническая фармакология», Мартинович, Алексей Александрович

выводы

Acinetobacter spp. является вторым по частоте встречаемости (15%) неферментирующим грамотрицательным патогеном в отделениях с интенсивным потреблением антибиотиков в 2006-2008 гг. в России, причём, количество вызванных им инфекций в отделениях реанимации и интенсивной терапии в России за последние 12 лет увеличилось в 2,3 раза и составило 16,3%.

Наибольшую in vitro активность в отношении нозокомиальных штаммов Acinetobacter spp., выделенных в России, проявляют: колистин —» полимиксин Б —> имипенем —»• дорипенем —» цефоперазон/сульбактам —> меропенем —> нетилмицин, чувствительными к которым оказались 100% -» 99,7% -> 97,3% -> 92,7% 89,7% -» 85,5% 78,2% штаммов, соответственно.

Создание 6 новых праймеров и оптимизация состава реакционной смеси и протокола ПЦР в реальном времени позволили разработать способ выявления всех известных генов приобретённых ОХА-карбапенемаз.

Распространённость приобретённых ОХА-карбапенемаз среди карбапенеморезистентных штаммов Acinetobacter spp. в 2006-2008 гг. в России составила 18% (100% - ОХА-58), в 2008-2009 гг. - 100% (39,7% - ОХА-23; 46,5% - ОХА-40; 13,8% - ОХА-58). Распространённость ОХА-карбапенемаз в 2008-2009 гг. в Беларуси составила 94,6% (100% - ОХА-40). Металло-бета-лактамаз ни в одной из стран выявлено не было.

Для оптимизации протокола мультилокусного секвенирования-типирования штаммов A. baumannii было разработано 14 новых праймеров, оптимизированы составы реакционных смесей и протоколы ПЦР, что позволило расширить возможности практического применения данного метода в микробиологических лабораториях.

6. Среди 14 изученных штаммов выявлено 16 новых аллельных вариантов различных генов; сами штаммы отнесены к 9 новым сиквенс-типам, 7 из которых принадлежат к известным эпидемическим клональным группам. При этом три из них являются возбудителями большого числа инфекций в зарубежных странах, две — в России и Беларуси.

7. В ближайшие годы в России и Беларуси следует ожидать стремительный рост резистентности к карбапенемам среди нозокомиальных штаммов Acinetobacter spp. ввиду увеличения продуцентов приобретённых ОХА-карбапенемаз и циркуляции штаммов, имеющих эпидемические свойства.

ПРАКТИЧЕСКИЕ РЕКОМЕНДАЦИИ

Для микробиологов

1. Проводить скрининг всех клинических штаммов Acinetobacter spp. на металло-бета-лактамазы и приобретённые ОХА-карбапенемазы до определения чувствительности к антибиотикам и при выявлении любой карбапенемазы не рекомендовать терапию карбапенемами.

2. Включить разработанную технологию ПЦР в алгоритм исследований Acinetobacter spp. в микробиологических лабораториях при лечебно-профилактических учреждениях и центрах Госсанэпиднадзора.

3. Микробиологическим лабораториям при лечебно-профилактических учреждениях и центрах Госсанэпиднадзора вести учёт результатов проведённых тестов на чувствительность к антибиотикам и предоставлять врачам суммарные данные о наиболее активных за определённый период антимикробных препаратах в отношении Acinetobacter spp. в каждом конкретном стационаре.

Для клинических фармакологов

4. Рассматривать имипенем, дорипенем, меропенем и цефоперазон/сульбактам в качестве препаратов эмпирической и этиотропной терапии нозокомиальных инфекций при обнаружении или подозрении на Acinetobacter spp. во всех стационарах России.

5. Исключить из протоколов терапии нозокомиальных инфекций, вызванных Acinetobacter spp., незащищённые пенициллины и незащищённые цефалоспорины III поколения, а в ожоговых отделениях и отделениях хирургической инфекции - также гентамицин и пиперациллин/тазобактам.

6. Обратиться с ходатайством в Федеральную службу по надзору в сфере здравоохранения и социального развития о внедрении на фармацевтический рынок России парентеральных форм полимиксина Б и колистина ввиду их высокой активности в отношении полирезистентных Acinetobacter spp.

Список литературы диссертационного исследования кандидат медицинских наук Мартинович, Алексей Александрович, 2010 год

1. Акимкин В.Г. Система профилактики внутрибольничных инфекций в России. Служба госпитальных эпидемиологов: итоги и перспективы развития. // Эпидемиология и инфекционные болезни. 2005. - Т.1 - С. 4-8.

2. База данных Университета Оксфорда (Великобритания) о различных микроорганизмах, созданная на основе результатов секвенирования-типирования. Информация доступна по адресу: http://pubMJICT.org/

3. База данных Университета Пастера (Франция) о различных микроорганизмах, созданная на основе результатов секвенирования-типирования. Информация доступна по адресу: http://www.pastem-.fr/recherche/genopole/PF8/MJICT/

4. Белоцерковский БЗ, Гельфанд ЕБ, Попов ТВ, Карабак ВИ, Краснов ВГ. Проблемные госпитальные микроорганизмы. Acinetobacter spp. — возбудитель или свидетель? // Инфекции в хирургии. 2008. - Т. 1. - №6.

5. Государственный доклад. О санитарно-эпидемиологической обстановке в Российской Федерации в 2007 году. // Москва. Федеральный центр гигиены и эпидемиологии Роспотребнадзора. - 2008. - С. 257-261.

6. Государственный доклад. О санитарно-эпидемиологической обстановке в Российской Федерации в 2008 году. // Москва. Федеральный центр гигиены и эпидемиологии Роспотребнадзора. - 2009. - С. 302-309.

7. Зубков МН. Неферментирующие бактерии. Acinetobacter spp.: таксономия и классификация, характеристика, клиническое значение, идентификация, антибиотикорезистентность. // Инфекции и антимикробная терапия. 2003. -Т. 5.-№2.

8. Ильина ЕН, Говорун ВМ. Масс-спектрометрия нуклеиновых кислот в молекулярной медицине. // Биоорганическая химия. 2009. - Т. 35. - №2. - С. 149-164.

9. Козлов PC, Стецюк ОУ, Андреева ИВ. Современные тенденции антибиотикорезистентности возбудителей нозокомиальных инфекций в ОРИТ России: что нас ждет дальше? // Журнал Интенсивная терапия. 2007. -Т. 4.

10. Лапин А. Автоматизация микробиологических исследований. Информация доступна по адресу: http://praktic.ru/articles/id~l 3/

11. Поиск мишеней для праймеров в описанных геномах живых существ. Функция доступна по адресу: http://VAVw.ncbi.nlm.nih. gov/tool s/primer-blast

12. Приказ №535: «Об унификации микробиологических (бактериологических) методов исследования, применяемых в клинико-диагностическихлабораториях лечебно-профилактических учреждений». // Москва. -Министерство здравоохранения СССР. 22 апреля 1985 г.

13. Рафальский ВВ, Страчунский JIC, Кречикова ОИ и др. Резистентность возбудителей амбулаторных инфекций мочевыводящих путей по данным многоцентровых микробиологических исследований UTTAP-I и UTIAP-П // Урология. 2004. - №2. - С. 13-17.

14. Решедько ГК, Рябкова EJI, Кречикова ОИ, с соавт. Антибиотикорезистентность грамотрицательных возбудителей нозокомиальных в отделениях реанимации и интенсивной терапии России. // Клин Микробиол Антимикроб Химиотер. 2008. - Vol. 10 - №2. - С. 163-180.

15. Сидоренко СВ. Будущее клинической микробиологии как лабораторной службы. Информация доступна по адресу: http://nature.web.ru/db/msg.html?mid=l 180836&s=l 11400330

16. Степанюк ВВ., Смирнова ГФ., Клюшникова ТМ., Канюк НИ., Панченко ЛП., Ногина ТМ. и Прима ВИ. Новый вид рода Acinetobacter Acinetobacter thermotoleranticus sp. nov. //Микробиология. - 1992. - Т. 61. - С. 347-356.

17. Страчунский JIC и др. Рекомендации по оптимизации антимикробной терапии нозокомиальных инфекций, вызванных грамотрицательными бактериями в отделениях реанимации и интенсивной терапии. // Смоленск. -изд. Боргес. 2002.

18. Страчунский JIC, Белоусов ЮБ, Козлов СН. Практическое руководство по антиинфекционной химиотерапии. 3-е издание. // Смоленск. МАКМАХ.2007. С. 32-56.

19. Техника проведения электрофореза. Информация доступна по адресу: http://www.hopldnsmedicine.org7beic/services/methods.html

20. Федосов ЕА. Методические указания. Часть 1 // Смоленск. изд. «Универсум». - 2005. - С. 93-95.

21. Фокин АА, Рачина СА, Козлов СН. Исследования использования лекарственных средств: методология проведения и перспективы практического применения в России. // Клин фармакол тер. 2009. - Т. 18. -№1. - С. 1-7.

22. Характеристика масс-спектрометров. Информация доступна по адресу: http://www.genomeweb.conyprote^ collaborations-gains-distributor-regulator

23. Шагинян ИА. Роль и место молекулярно-генетических методов в эпидемиологическом анализе внутрибольничных инфекций. // Клин Микробиол Антимикроб Химеотер. 2000. - Т. 9. - №3. - С. 211-218.

24. Шевченко ОВ, Эйделынтейн MB, Степанова МН. Металло- |3 -лактамазы: значение и методы выявления у грамотрицательных неферментирующих бактерий. // Клин Микробиол Антимикроб Химеотер. 2007. - Т. 2. - №3. - С. 82-95.

25. Яковлев СВ. Время для переоценки места карбапенемов при нозокомиальных инфекциях. // РМЖ. 2006. - Т. 7. - №14.

26. Abstract 133. Abstracts of 24th International Conference on Pharmacoepidemiology & Therapeutic Risk Management. // Pharmacoepidemiol Drug Saf. 2008 Aug. - Vol. 17. - Suppl. 1. - P. S1-S294

27. Aizal-Shah M, Liveimore DM. Worldwide emergence of carbapenem-resistant ■ Acinetobacter spp. // J Antimicrob Chemother. 1998. - Vol. 41. - P. 576-577.

28. Alberti C, Brun-Buisson C, Burchardi H. et al. Epidemiology of sepsis and infection in ICU patients from an international multicentre cohort study. // Intensive Care Med. 2002. - Vol. 28 - P. 108-121.

29. Albini S, Brodard I, Jaussi A et al. Real-time multiplex PCR assays for reliable detection of Clostridium perfringens toxin genes in animal isolates. // Vet Microbiol. 2008 Feb 5. - Vol. 127. - №1-2. - P. 179-185.

30. Allen KD, Green HT. Hospital outbreak of multi-resistant Acinetobacter anitratus: an airborne mode of spread. // J Hosp Infect. -1987. Vol. 9. - P. 110-119.

31. Alon RN and Gutnick DL. Esterase from the oil-degrading Acinetobacter Iwoffii RAG-1: sequence analysis and over-expression in Escherichia coli. II FEMS Microbiol Lett. 1993. - Vol. 112. - P. 275-280.

32. Ayan M, Durmaz R, Aktas E, Durmaz B. Bacteriological, clinical, and epidemiological characteristics of hospital acquired Acinetobacter baumannii infection in ateaching hospital. // J Hosp Infect. 2003. - Vol. 54. - P. 39-45.

33. Aygun G, Demirkirian O, Utku T et al. Environmental contamination during a carbapenem-resistant Acinetobacter baumannii outbreak in an intensive care unit. // J Hosp Infect. 2002. - Vol. 52. - P. 259-262.

34. Baker JC, Rumley RE, and Eckdahl TT. Random amplified polymorphic DNA PCR in the microbiology teaching laboratory. // BAMBED. 2002. - Vol. 30. - №. 6.-P. 394-397.

35. Bartuai SG, Seifert H, Hippler С et al. Development of a multilocus sequence typing scheme for characterization of clinical isolates of Acinetobacter baumannii. IIJ Clin Microbiol. 2005 Sep. - Vol. 43. - №9. - P. 4382-4390.

36. Baumann P, Doudoroff M, and Stanier RY. A study of the Moraxella group. П. Oxidase-negative species (genus Acinetobacter). // J Bacteriol. 1968. - Vol. 95. -P. 1520-1541.

37. Baumann P. Isolation of Acinetobacter from soil and water. I IJ Bacteriol. 1968. -Vol. 96.-P. 39-42.

38. Beavers SF, Blossom DB, Wiemken TL et al. Comparison of risk factors for recovery of Acinetobacter baumannii during outbreaks at two Kentucky hospitals, 2006.// Public Health Rep. 2009 Nov-Dec. - Vol. 124. - №6. - P. 868-874.

39. Bergogne-Berezin E. and Towner, KJ. Acinetobacter spp. as nosocomial pathogens: microbiological, clinical, and epidemiological features. // Clin Microbiol Rev. 1996. - Vol. 9. - №2. - P. 148-165.

40. Bernard PS, Wittwer CT. Real-time PCR technology for cancer diagnostics. // Clin Chem. 2002 Aug. - Vol. 48. - №8. - P. 1178-1185.

41. Bifulco JM, Shirey JJ, and Bissonnette GK. Detection of Acinetobacter spp. in Rural Drinking Water Supplies. // Appl Environ Microbiol. 1989. - Vol. 55. -№9.-P. 2214-2219.

42. Blondeau JM. Expanded activity and utility of the new fluoroquinolones: a review. // Clin Ther. -1999. Vol. 21. - P. 3-40.

43. Bouvet PJ, and Jeanjean S. Delineation of new proteolytic genomic species in the genus Acinetobacter. //Res Microbiol. 1989. - Vol. 140. - P. 291-299.

44. Braun G, Vidotto MC. Evaluation of adherence, hemagglutination, and presence of genes codifying for virulence factors of Acinetobacter baumannii causing urinai-y tract infection. // Mem Inst Oswaldo Cruz. 2004. - Vol. 99. - P. 839-844.

45. Breuil C, Kushner DJ. Lipase and esterase formation by psychrophilic artel mesophilic Acinetobacter species. // Can J Microbiol. 1975 Apr. - Vol. 21.-P. 423-433.

46. Breuil C, Novitsky TJ, Kushner DJ. Characteristics of a facultatively psychrophilic Acinetobacter species isolated from river sediment. // Can J Microbiol. 1975 Dec. - Vol. 21. - №12. - P. 2103-2108.

47. Brisou J and Prevot AR. Etudes de systematique bacterienne. X. Revision des especes reunies dans le genre Achromobacter. II Ann Inst Pasteur (Paris). 1954 Jun. - Vol. 86. - №6. - P. 722-728.

48. Brisou J. Contribution a l'etude des Pseudomonadaceae. Precisions taxonomiques sur le gems Acinetobacter. II Ann Inst Pasteur. 1957. - Vol. 93. - P. 397-404.

49. Buxton AE, Anderson RL, Werdegard D, and Atlas E. Nosocomial respiratory tract infection and colonization with Acinetobacter calcoaceticus: epidemiologic characteristics. II Am J Med. 1978. - Vol. 65. - P. 507-513.

50. Caetano-Anolles G, Bassam BJ, Gresshoff PM. DNA amplification fingerprinting using veiy short arbitrary oligonucleotide primers. // Biotechnology (NY). 1991 Jun. - Vol. 9. - №6. - P. 553-557.

51. Calero O, Hortiguela R, Albo C, de Pedro-Cuesta J, Calero M. Allelic discrimination of genetic human prion diseases by real-time PCR genotyping. // Prion. 2009 Jul. - Vol. 3. - №. - P. 146-150.

52. Carr EL, Giirtler V, Seviour RJ. Variation of 16S-23S rRNA intergenic spacer regions (ISRs) in Acinetobacter baylyi (strain B2) isolated from activated sludge. I I Syst Appl Microbiol. 2004 Aug. - Vol. 27. - №4. - P. 478-491.

53. Carr EL., Kampfer P., Patel BK., Gurtler V., and Seviour RJ. Seven novel species of Acinetobacter isolated from activated sludge. // Int J Syst Evol Microbiol. -2003.-Vol. 53.-P. 953-963.

54. Cefai C, Richards J, Gould FK, and McPeake P. An outbreak of Acinetobacter respiratory tract infection resulting from incomplete disinfection of ventilatory equipment. //J Hosp Infect. 1990. - Vol. 15. - P. 177-182.

55. Chastre J. Infections due to Acinetobacter baumannii in the ICU. // Semin Respir Crit Care Med. 2003 Feb. - Vol. 24 - №1. - p. 69-78.

56. Cheesman SJ, de Roode JC, Read AF, Carter R. Real-time quantitative PCR for analysis of genetically mixed infections of malaria parasites: technique validation and applications. // Mol Biochem Parasitol. 2003 Oct. - Vol. 131. - №2. - P. 8391.

57. Chen CH, Young TG, Huang CC. Predictive biomarkers for drug-resistant Acinetobacter baumannii isolates with 6/ятем-ъ AmpC-type bla and integrase 1 genotypes. // J Microbiol Immunol Infect. 2006 Oct. - Vol. 39. - №5. - P. 372379.

58. Choi CH, Lee EY, Lee YC et al. Outer membrane protein 38 of Acinetobacter baumannii localizes to the mitochondria and induces apoptosis of epithelial cells. // Cell Microbiol. 2005. - Vol. 7. - P. 1127-1138.

59. Christensen EA, Gerner-Smidt P, and Kristensen H. Radiation resistance of clinical Acinetobacter spp. A need for concern? // J Hosp Infect. 1991. - Vol. 18. -P.85-92.

60. Chu YW, Afcal-Shah M, Houang ET et al. IMP-4, a novel metallo-|3-lactamase from nosocomial Acinetobacter spp. collected in Hong Kong between 1994 and 1998. //Antimicrob Agents Chemother. 2001. - Vol. 45. - P. 710-714.

61. Clark RB. Imipenem resistance among Acinetobacter baumannii: association with reduced expression of a 33-36 kDa outer membrane protein. // J Antimicrob Chemother. -1996. Vol. 38. - P. 245-251.

62. Comaglia G, Riccio ML, Mazzariol A et al. Appearance of IMP-1 metallo-b-lactamase in Europe. //Lancet. -1999. Vol. 353. - P. 899-900.

63. Crombach WHJ, Dijkshoorn L, van Noort-Klaassen M et al. Control of an epidemic spread of multi-resistant Acinetobacter calcoaceticus in a hospital. // Intensive Care Med. 1989. - Vol. 15. - P. 166-170.

64. Cruz P, Buttner MP. Development and evaluation of a real-time quantitative PCR assay for Aspergillus flavus. II Mycologia. 2008 Sep-Oct. - Vol. 100. - №5. - p. 683-690.

65. Cunha BA, Klimek JJ, Gracewski J, McLaughlin JC, and Quintiliani R. A common source outbreak of Acinetobacter pulmonary infections traced to Wright respirometers. // Postgrad Med J. 1980. - Vol. 56. - P. 169-172.

66. Currie B. Real-time PCR testing for CDI improves outcomes and reduces costs. // MLO Med Lab Obs. 2009 Oct. - Vol. 41. - №10. - P. 18-20.

67. Das I, Lambert P, Hill D, Noy M, Bion J, Elliott T. Carbapenem-resistant Acinetobacter and role of curtains in an outbreak in intensive care units. // J Hosp Infect. 2002 Feb. - Vol. 50. - №2. - P. 110-114.

68. De Bord GG. Organisms invalidating the diagnosis of gonorrhea by the smear method. // J Bacteriol. -1939. Vol. 38. - P. 119.

69. De Vegas EZ, Nieves B, Araque M, Velasco E, Ruiz J, Vila J. Outbreak of Infection With Acinetobacter Strain RUH 1139 in an Intensive Care Unit. I I Infect Control Hosp Epidemiol. 2006. - Vol. 27. - P. 397-403.

70. Dealler S. Nosocomial outbreak of multi-resistant Acinetobacter sp. on an intensive care unit: possible association with ventilation equipment // J Hosp Infect. 1998 Feb. - Vol. 38. - №2. - P. 147-148.

71. Devaud M, Kayser FH, Bachi B. Transposon-mediated multiple antibiotic resistance in Acinetobacter strains. // Antimicrob Agents Chemother. 1982 Aug. -Vol.22.-№2.-P. 323-329.

72. Di Cello F, Pepi M., Baldi F, and Fani R. Molecular characterization of an n-alkane-degrading bacterial community and identification of a new species, Acinetobacter venetianus. II Res Microbiol. 1997. - Vol. 148. - P. 237-249.

73. Dijkshoorn L, Aucken H, Gerner-Smidt P et al. Comparison of outbreak and nonoutbreak Acinetobacter baumannii strains by genotypic and phenotypic methods. //J Clin Microbiol. -1996. Vol. 34. - P. 1519-1525.

74. Dmitriev A, Hu YY, Shen AD, Suvorov A, Yang YH. Chromosomal analysis of group В Streptococcal clinical strains; bac gene-positive strains are genetically homogenous. // FEMS Microbiol Lett. 2002 Feb. - Vol. 208. - №1. - P. 93-98.

75. Donlan RM, and Costerton JW. Biofilms: survival mechanisms of clinically relevant microorganisms. // Clin Microbiol Rev. 2002. - Vol. 15. - P. 167-193.

76. Drlica K, Zhao X. DNA gyrase, topoisomerase IV, and the 4-quinolones. // Mcrobiol Mol Biol Rev. 1997. - Vol. 61. - P. 377-392.

77. Du Preez JC, Toerien DF, and Lategan PM. Growth Parameters of Acinetobacter calcoaceticus on Acetate and Ethanol. // European J Appl Microbiol Biotechnol. -1981.-Vol. 13.-P. 45-53

78. Ecker JA, Massire C, Hall ТА. Identification of Acinetobacter species and genotyping of Acinetobacter baumannii by multilocus PCR and mass spectrometry. // J Clin Microbiol.- 2006 Aug. Vol. 44. - №8. - P. 2921-2932.

79. Enright MC, Spratt BG. Multilocus sequence typing. // Trends Microbiol. 1999 Dec. - Vol. 7. - №12. - P. 482-487.

80. Eribo BE and Jay JM. Incidence of Acinetobacter spp. and other gram-negative, oxidase-negative bacteria in fresh and spoiled ground beef. // Appl Environ Microbiol. 1985. - Vol. 49. - №1. - P. 256-257.

81. Espy MJ, Uhl JR, Sloan LM et al. Real-time PCR in clinical microbiology: applications for routine laboratory testing. // Clin Microbiol Rev. 2006 Jan. - Vol. 19. -№1. - P. 165-256.

82. Euzeby JP. List of bacterial names with standing in nomenclature: a folder available on the internet. // bit J Syst Bacterid. 1997. - Vol. 47. - P. 590-592.

83. F. Perez, AM. Hujer, KM. Hujer et al. Global challenge of multidrug-resistant Acinetobacter baumannii. // Antimicrob Agents Chemother. 2007. - Vol. 51. -№10.-P. 3471-3484.

84. Fagon JY, Chastre J, Hance AJ et al. Nosocomial pneumonia in ventilated patients: a cohort study evaluating attributable mortality and hospital stay. // Am J Med. -1993.-Vol. 94.-P. 281-288

85. Fournier РЕ, Vallenet D, Barbe V et al. Comparative genomics of multidrug resistance in Acinetobacter baumannii. II PLoS Genet. 2006. - Vol. 2. - e7.

86. Fu W, Demei Z, Shi W et al. The susceptibility of non-fermentative Gram-negative bacilli to cefperazone and sulbactam compared with other antibacterial agents. // Int J Antimicrob Agents. 2003. - Vol. 22. - №4. - P. 444-448.

87. Gallego L. and Towner K. J. Carriage of class 1 integrons and antibiotic resistance in clinical isolates of Acinetobacter baumannii from northern Spain. // J.Med.Microbiol. 2001. - Vol. 50. - P. 71-77.

88. Gehrlein M, Leying H, Cullmann W, Wendt S, Opferkuch W. Imipenem resistance in Acinetobacter baumanii is due to altered penicillin-binding proteins. // Chemotherapy. 1991. - Vol. 37. - №6. - P. 405-412.

89. Gennari M, and Lombardi P. Comparative characterization of Acinetobacter strains isolated from different foods and clinical sources. // Zentralbl Bakteriol. -1993. Vol. 279. - P. 553-564.

90. Gerischer U. Acinetobacter molecular microbiology. I I Caister Academic Pr. -2008.

91. Gerner-Smidt P, Tjernberg I, Ursing J. Reliability of phenotypic tests for identification of Acinetobacter species. // J Clin Microbiol. 1991. - Vol. 29. - P.и277.282.

92. Gerner-Smidt P. and Frederiksen W. Acinetobacter in Denmark: I. Taxonomy, antibiotic susceptibility, and pathogenicity of 112 clinical strains. // APMIS. -1993.-Vol. 101.-P. 815-825.

93. Gerner-Smidt P. and Tjernberg I. Acinetobacter in Denmark: П. Molecular studies of the Acinetobacter calcoaceticus-Acinetobacter baumannii complex. // APMIS. -1993.-Vol. 101.-P. 826-832.

94. Gerner-Smidt P. Endemic occurrence of Acinetobacter calcoaceticus biovar anitratus in an intensive care unit. // J Hosp Infect. 1987. - Vol. 10. - P. 265-272.

95. Gerner-Smidt P. Frequency of plasmids in strains of Acinetobacter calcoaceticus. /IJ Hosp Infect. 1989. - Vol. 14. - P. 23-28.

96. Gibson UE, Heid CA, Williams PM. A novel method for real time quantitative RT-PCR. // Genome Res. 1996 Oct. - Vol. 6. - №10. - P. 995-1001.

97. Gilardi GL. Glucose nonfermenting gram-negative bacteria in clinical microbiology. // N.Y. CRC Press, Inc. 1978.

98. Glew RH, Moellering RC, and Kunz LJ. Infections with Acinetobacter calcoaceticus (Herellea vaginicola): clinical and laboratory studies. // Medicine (Baltimore). -1977 Mar. Vol. 56. - №2. - P. 79-97.

99. Goldstein FW, Labigne-Roussel A, Gerbaud G, Carlier C, Collatz E, Courvalin P. Transferable plasmid-mediated antibiotic resistance in Acinetobacter. II Plasmid. -1983.-Vol. 10.-P. 138-147.

100. Gonzalez CJ., Santos JA., Garcia-Lopez ML., and Otero A. Psychrobacters and related bacteria in freshwater fish. // J Food Prot. 2000. - Vol. 63. - P. 315-321.

101. Gonzalez-Rodriguez MN., Sanz JJ., Santos JA., Otero A., and Garcia-Lopez ML. Numbers and types of microorganisms in vacuum-packed cold-smoked freshwater fish at the retail level.//Int J Food Microbiol. -2002. Vol. 77. -P. 161-168.

102. Gulati A, Vyas P, Rahi P, Kasana RC. Plant growth-promoting and rhizosphere-competent Acinetobacter rhizosphaerae strain ВШВ 723 from the cold deserts of the Himalayas. // Cuir Microbiol. 2009 Apr. - Vol. 58. - №4. - P. 371-377

103. Hall RM, Collis CM. Mobile gene cassettes and integrons: capture and spread of genes by site-specific recombination. // Mol Microbiol. 1995 Feb. - Vol. 15. -№4.-P. 593-600.

104. Harrington BJ. Letter to the editors. // Clin Microbiol Newslett. 1997. - Vol. 19. -P. 191.

105. Heid CA, Stevens J, Livak KJ, Williams PM. Real time quantitative PCR. // Genome Res. -1996 Oct. Vol. 6. - №10. - P. 986-994.

106. Henriksen SD. Moraxella, Acinetobacter, and the Mimeae. II Bacteriol Rev. -1973.-Vol. 37.-P. 522-561.

107. Heritier C, Poirel L, Fournier PE, Claverie JM, Raoult D, and Nordmann P. Characterization of the naturally occurring oxacillinase of Acinetobacter baumannii. // Antimicrob Agents Chemother. 2005. - Vol. 49. - P. 4174-4179.

108. Hinton A Jr, Cason JA, and Ingram KD. Tracking spoilage bacteria in commercial poultry processing and refrigerated storage of poultry carcasses. // Int J Food Microbiol. 2004. - Vol. 91. - P. 155-165.

109. Huang LY, Chen TL, Lu PL et al. Dissemination of multidrug-resistant, class 1 integron-canying Acinetobacter baumannii isolates in Taiwan. // Clin Microbiol Infect. 2008 Nov. - Vol. 14. - №11. - P. 1010-1019.

110. Hugh R. Classical methods for isolation and identification of glucose nonfermenting Gram-negative rods. // 1978. P. 2. - In Gilardi GL. Glucose nonfermenting gram-negative bacteria in clinical microbiology. // CRC Press Inc. -Boca Raton. - Florida.

111. Hujer KM, Hamza NS, Hujer AM et al. Identification of a new allelic variant of the Acinetobacter baumannii cephalosporinase, ADC-7 p-lactamase: defining a unique family of class С enzymes. // Antimicrob Agents Chemother. 2005. - Vol. 49.-P. 2941-2948.

112. Huovinen P, Sundstrom L, Swedberg G, Skold O. Trimethoprim and sulfonamide resistance. // Antimicrob Agents Chemother. 1995. - Vol. 39. - P. 279-289.

113. Hwa WE, Subramaniam G, Navaratnam P, et al. Detection and characterization of class 1 integrons among carbapenem-resistant isolates of Acinetobacter spp. in Malaysia. // J Microbiol Immunol Infect. 2009 Feb. - Vol. 42. - №1. - P. 54-62.

114. Ikonomidis A, Ntokou E, Maniatis AN, Tsakris A, Pournaras S. Hidden VIM-1 metallo-beta-lactamase phenotypes among Acinetobacter baumannii clinical isolates. //J Clin Microbiol. 2008 Jan. - Vol. 46. - №1. - P. 346-349.

115. Jensen NE, Aarestrup FM. Epidemiological aspects of group В Streptococci of bovine and human origin. // Epidemiol Infect. 1996 Dec. - Vol. 117. - №3. - P. 417-422.

116. Jolley KA, Chan MS, Maiden MC. MJICTdbNet distributed multi-locus sequence typing (МЛСТ) databases. //BMC Bioinformatics. - 2004 Jul 1. - Vol. 5. -P. 86.

117. Juni E. Bergey's manual of systematic bacteriology. // Baltimore: Willam& Willcins Co. -1984/ 9th ed. P. 303-307.

118. Juni E. Genetics and physiology of Acinetobacter. II Annu Rev Microbiol. 1978. -Vol. 32.-P. 349-371.

119. Kappstein I, Grundmann H, Hauer T, Niemeyer C. Aerators as a reservoir of Acinetobacter junii: an outbreak of bacteraemia in paediatric oncology patients. // J Hosp Infect. 2000 Jan. - Vol. 44. - №1. - P. 27-30.

120. Kaufinann R. Matrix-assisted laser desorption ionization (MALDI) mass spectrometry: a novel analytical tool in molecular biology and biotechnology. // J Biotechnol. -1995 Jul 31. Vol. 41. №2-3. - P. 155-175.

121. Kilic A, Li H, Mellmann A, Basustaoglu AC et al. Acinetobacter septicus sp. nov. association with a nosocomial outbreak of bacteremia in a neonatal intensive care unit. // J Clin Microbiol. 2008 Mar. - Vol. 46. - №3. - P. 902-908.

122. Kuah BG, Kumarasinghe G, Doran J, Chang HR. Antimicrobial susceptibilities of clinical isolates оf Acinetobacter baumannii from Singapore. // Antimicrob Agents Chemother. -1994. Vol. 38. - P. 2502-2503.

123. Kuti JL, Nightingale CH, Nicolau DP. Optimizing pharmacodynamic target attainment using the MYSTIC antibiogram: data collected in North America in 2002. // Antimicrob Agents Chemother. 2004 Jul. - Vol. 48. - №7. - P. 24642470.

124. Lacroix SJ and Cabelli VJ. Membrane Filter Method for Enumeration of Acinetobacter calcoaceticus from Environmental Waters. // Appl Environ Microbiol. 1982. - Vol. 43. - №1. - P. 90-96.

125. Landman D, Quale JM, Mayorga D, Adedeji A, Vangala K, Ravishankar J, et al.

126. Citywide clonal outbreak of multiresistant Acinetobacter baumannii and

127. Pseudomonas aeruginosa in Brooklyn, NY, the preantibiotic era has returned. // Arch Intern Med. -2002. Vol. 162. -P. 1515-1520.

128. Levin PD, Shatz O, Sviri S, Moriah D, Or-Barbash A, Sprung CL, Moses AE, Block C. Contamination of portable radiograph equipment with resistant bacteria in the ICU. // Chest. 2009 Aug. - Vol. 136. - Ш. - P. 426-432.

129. Lim YM, Shin KS, Kim J. Distinct antimicrobial resistance patterns and antimicrobial resistance-harboring genes according to genomic species of' Acinetobacter isolates. // J Clin Microbiol. 2007 Mar. - Vol. 45. - №3. - P. 902905

130. Limansky AS, Mussi MA, and Viale AM. Loss of a 29-kilodalton outer membrane protein in Acinetobacter baumannii is associated with imipenem resistance. // J Clin Microbiol. 2002. - Vol. 40. - P. 4776-4778.

131. Livermore DM, Woodford N. Carbapenemases: a problem in waiting? // Curr Opin Microbiol. 2000 Oct. - Vol. 3. - №5. - P. 489-495.

132. Lizaso D, Aguilera CK, Correa M et al. Nosocomial bloodstream infections caused by gram-negative bacilli: epidemiology and risk factors for mortality. // Rev Chilena Infectol. 2008 Oct. - Vol. 25. - №5. - P. 368-373.

133. Loehfelm TW, Luke NR, and Campagnari AA. Identification and Characterization of an Acinetobacter baumannii Biofilm-Associated Protein. // J Bacteriol. 2008. -Vol. 190.-P. 1036-1044.

134. Maglio D, Kuti JL, Nicolau DP. Simulation of antibiotic pharmacodynamic exposure for the empiric treatment of nosocomial bloodstream infections: a report from the OPTAMA program. // Clin Ther. 2005 Jul. - Vol. 27. - №7. - P. 10321042.

135. Magnet S, Courvalin P, Lambert T. Resistance-nodulation-cell division-type efflux pump involved in aminoglycoside resistance in Acinetobacter baumannii strain BM4454. // Antimicrob Agents Chemother. 2001. - Vol. 45. - P. 3375-3380.

136. Mah MW, Memish ZA, Cunningham G, Bannatyne RM. Outbreak of Acinetobacter baumannii in an intensive care unit associated with tracheostomy. // Am J Infect Control. 2001 Oct. - Vol. 29. - №5. - P. 284-288.

137. Maiden MC, Bygraves JA, Feil E et al. Multilocus sequence typing: a portable approach to the identification of clones within populations of pathogenic microorganisms. // Proc Natl Acad Sci USA.- 1998 Mar 17. Vol. 95. - №6. - P. 3140-3145.

138. Мак Ж, Kim MJ, Pham J, Tapsall J, White PA. Antibiotic resistance determinants in nosocomial strains of multidrug-resistant Acinetobacter baumannii. II J Antimicrob Chemother. 2009 Jan. - Vol. 63. - №1. - P. 47-54.

139. Maltezou HC. Metallo-beta-lactamases in Gram-negative bacteria: introducing the era of pan-resistance? // Int J Antimicrob Agents. 2009 May. - Vol. 33. - №5. - P. 405.-el-7.

140. Marchand I, Damier-Piolle L, Courvalin P, and Lambert T. Expression of the RND-Type efflux pump AdeABC in Acinetobacter baumannii is regulated by the AdeRS two-component system. // Antimicrob Agents Chemother. 2004. - Vol. 48.-№9.-P. 3298-3304.

141. Marque S, Poirel L, Heritier С et al. Regional occurrence of plasmid mediated carbapenem-hydrolyzing oxacillinase OXA-58 in Acinetobacter spp. in Europe. // J Clin Microbiol. 2005. - Vol. 43. - P. 4885-4888.

142. Masterton RG, Kuti JL, Turner PJ, Nicolau DP. The OPTAMA programme: utilizing MYSTIC (2002) to predict critical pharmacodynamic target attainment against nosocomial pathogens in Europe. // J Antimicrob Chemother. 2005. - Vol. 55. -№1.- P. 71-77.

143. McEldowney S. and Fletcher M. The effect of temperature and relative humidity on the survival of bacteria attached to dry solid surfaces. // Lett Appl Microbiol. -1988.-Vol. 7.-P. 83-86.

144. Melman А. МЛСТ&8Е8Т. // 47th ICAAC. 2007. - Workshop 47-08.

145. Mendes RE, Spanu T, Deshpande L et al. Clonal dissemination of two clusters of Acinetobacter baumannii producing OXA-23 or OXA-58 in Rome, Italy. I I Clin Microbiol Infect. 2009 Jun. - Vol. 15. - №6. - P. 588-592.

146. Menezes BF, de Oliveira Camargo FA, Океке ВС, and Frankenberger WT, Jr. Diversity of biosurfactant producing microorganisms isolated from soils contaminated with diesel oil. // Microbiol Res. 2005. - Vol. 160. - P. 249-255.

147. Merkier AK, and Centron D. Ь/аохл-51-type beta-lactamase genes are ubiquitous and vary within a strain in Acinetobacter baumannii. II bit J Antimicrob Agents. -2006.-Vol. 28.-P. 110-113.

148. Mittman A, Huard C, et al. Comparison of BD Phoenix to Vitek 2, MicroScan MICroSTREP, and Etest for antimicrobial susceptibility testing of Streptococcus pneumoniae. I/ J Clin Microbiol. 2009. Nov. - Vol. 47. - №11. - P. 3557-3561.

149. Moubareck C, Bremont S, Conroy MC, Courvalin P, Lambert T. GES-11, a novel integron-associated GES variant in Acinetobacter baumannii. II Antimicrob Agents Chemother. 2009 Aug. - Vol. 53. - №8. - P. 3579-3581.

150. Murray BE, Moellering RC. Evidence of plasmid-mediated production of aminoglycoside-modifying enzymes not previously described in Acinetobacter. II Antimicrob Agents Chemother. -1980. Vol. 17. - P. 30-36.

151. Musa EK, Desai N, Casewell MW. The survival of Acinetobacter calcoaceticus inoculated on fingertips and on formica. // J Hosp Infect. 1990. - Vol. 15. - P. 219227.

152. Naas T, and Nordmann P. OXA-type beta-lactamases. // Curr Pharm Des. 1999 Nov. - Vol. 5. - №11. - p. 865-879.

153. Nemec A, De Baere T, Tjernberg I et al. Acinetobacter ursingii sp. nov. and Acinetobacter schindleri sp. nov., isolated from human clinical specimens. // Int J SystEvol Microbiol. 2001 Sep. - Vol. 51. - №5. p. 1891-1899.

154. Nemec A, Dijkshoorn L, Cleenwerck I et al. Acinetobacter parvus sp. nov., a small-colony-forming species isolated from human clinical specimens. // Int J Syst Evol Microbiol. 2003. - Vol. 53. - P. 1563-1567.

155. Nemec A, Dijkshoorn L, Jezek P. Recognition of two novel phenons of the genus Acinetobacter among non-glucose-acidifying isolates from human specimens. // J Clin Microbiol. 2000 Nov. - Vol. 38. - №11. - P. 3937-3941.

156. Neuwirth C, Siebor E, Duez JM et al. Imipenem resistance in clinical isolates of Proteus mirabilis associated with alterations in penicillin-binding proteins. // J Antimicrob Chemother. 1995 Aug. - Vol. 36. - №2. - P. 335-342.

157. Nevers P, Saedler H, Transposable genetic elements as agents of gene instability and chromosomal rearrangements. //Nature. 1977 Jul 14. - Vol. 268. - №5616. -P. 109-115.

158. Nishimura N., Takeshi I., and Iizuka H. Acinetobacter radioresistens sp. nov., Isolated from Cotton and Soil. // Int J Syst Bacterid. 1988. - Vol. 38. - P. 209-211

159. Nordmann P, and Guibert M. Extended-spectrum (3-lactamases in Pseudomonas aeruginosa. IIJ Antimicrob Chemother. 1998. - Vol. 42. - P. 128-131.

160. Nordmann P, and Poirel L. Emerging carbapenemases in Gram-negative aerobes. // Clin Microbiol Infect. 2002 Jun. - Vol. 8. - №6. - P. 321-331.

161. Oste C. Polymerase chain reaction. // Biotechniques. 1988 Feb. - Vol. 6. - № 2. -P. 162-167.

162. Pagel JE, and Seyfiied PL. Numerical taxonomy of aquatic Acinetobacter isolates. // J Gen Microbiol. 1976. - Vol. 95. - P. 220-232.

163. Pardesi KR, Yavankar SP, Chopade BA. Plasmid distribution and antimicrobial susceptibility patterns of Acinetobacter genospecies from healthy skin of a tribal population in western India. // Indian J Med Res. 2007. - Vol. 125. - P. 79-88.

164. Paton RH, Miles RS, Hood J, Amyes SGB. ARI-1: p-lactamase-mediated imipenem resistance in Acinetobacter baumannii. II Int J Antimicrob Agents. -1993.-Vol. 2.-P. 81-88.

165. Patwardhan RB, Dhakephalkar PK, Niphadkar KB, Chopade BA. A study on nosocomial pathogens in ICU with special reference to multiresistant Acinetobacter baumannii harbouring multiple plasmids. // Indian J Med Res. -2008 Aug. Vol. 128. №2. - P. 178-187.

166. Perez F, Hujer AM, Hujer KM, Decker BK, Rather PN, Bonomo RA. Global challenge of multidrug-resistant Acinetobacter baumannii. II Antimicrob Agents Chemother. 2007 Oct. - Vol. 51. - №10. - P. 3471-3484.

167. Pessione E and Giunta C. Acinetobacter radioresistens metabolizing aromatic compounds. 2. Biochemical and microbiological characterization of the strain. // Microbios. -1997. Vol. 89. - №359. - P. 105-117.

168. Piddock LJ. Mechanisms of resistance to fluoroquinolones: state-of-the-art 19921994. // Drugs. 1995. - Vol. 49. - Suppl. 2. - P. 29-35.

169. Poirel L, Karim A, Mercat A et al. Extended-spectrum beta-lactamase-producing strain of Acinetobacter baumannii isolated from a patient in France. // J Antimicrob Chemother. 1999 Jan. - Vol. 43. - №1. - P. 157-158.

170. Poirel L, Menuteau O, Agoli N, Cattoen C, Nordmann P. Outbreak of extended-spectrum beta-lactamase VEB-1-producing isolates of Acinetobacter baumannii in a French hospital. // J Clin Microbiol. 2003. - Vol. 41. - P. 3542-3547.

171. Poirel L, Nordmann P. Carbapenem resistance in Acinetobacter baumannii: mechanisms and epidemiology. // Clin Microbiol Infect. 2006 Sep. - Vol. 12. -№9.-P. 826-836.

172. Poon LL, Chan KH, Smith GJ et al. Molecular detection of a novel human influenza (H1N1) of pandemic potential by conventional and real-time quantitative RT-PCR assays. // Clin Chem. 2009 Aug. - Vol. 55. - №8. - P. 1555-1558.

173. Prashanth К and Badrinath S. Simplified phenotypic tests for identification of Acinetobacter spp. and their antimicrobial susceptibility status. // J. Med. Microbiol. 2000. - Vol. 49. - P. 773-778.

174. Preston G.A., Larson E.L., Stamm W.E. Effect of private isolation rooms on patient care practices: colonization and infection in an intensive care unit. // Amer J Med. 1981. - Vol. 70. - P. 641-645.

175. Quale J, Bratu S, Landman D, Heddurshetti R. Molecular epidemiology and mechanisms of carbapenem resistance in Acinetobacter baumannii endemic in New York City. // Clin Infect Dis. 2003 Jul. - Vol. 37. - №2. - P. 214-220.

176. Rahal JJ, Urban C, Segal-Maurer S. Nosocomial antibiotic resistance in multiple gram-negative species: experience at one hospital with squeezing the resistance balloon at multiple sites. // Clin Infect Dis. 2002. - Vol. 34. - P. 499-503.

177. Ramaswamy M, McDonald C, Smith M, Thomas D, Maxwell S, Tenant-Flowers M, Geretti AM. Diagnosis of genital herpes by real time PCR in routine clinical practice. // Sex Transm Infect. 2004 Oct. - Vol. 80. - №5. - P. 406-410.

178. Rello J, Ollendorf DA, Oster G, et al. Epidemiology and outcomes of ventilator-associated pneumonia in a large US database. // Chest. 2002 Dec. - Vol.122 - №6 -P. 2115-2121.

179. Retailliau HF, Hightower AW, Dixon RE, Allen JR. Acinetobacter calcoaceticus: a nosocomial pathogen with an unusual pattern. // J Infect Dis. 1979. - Vol. 139. -P. 371-375.

180. Rhomberg PR, Jones RN. Summary trends for the Meropenem Yearly Susceptibility Test Information Collection Program: a 10-year experience in the United States (1999-2008). // Diagn Microbiol Infect Dis. 2009 Dec. - Vol. 65. -№4.-P. 414-426.

181. Ribera A, Roca I, Ruiz J, Gibert I, Vila J. Partial characterization of a transposon containing the tet(A) determinant in a clinical isolate of Acinetobacter baumannii. IIJ Antimicrob Chemother. 2003 Sep. - Vol. 52. -№3.-P. 477-480.

182. Ribera A, Ruiz J, Jiminez de Anta MT, Vila J. Effect of an efflux pump inhibitor on the MIC of nalidixic acid for Acinetobacter baumannii and Stenotrophomonas maltophilia clinical isolates. // J Antimicrob Chemother. 2002. - Vol. 49. - P. 697698.

183. Richards MJ, Edwards JR, Culver DH, Gaynes RP. Nosocomial infections in medical intensive care units in the United States. National Nosocomial Infections Surveillance System. // Crit Care Med. 1999. - Vol. 27 - №5 - P. 887-892.

184. Roder BL, Nielson SL, Mangussen P, et al. Antibiotic usage in an intensive care unit in a Danish university hospital. // J Antimicrob Chemother. 1993. - Vol. 32 -P. 633-642.

185. Rollo F, Salvi R, Amici A, Anconetani A. Polymerase chain reaction fingerprints. // Nucleic Acids Res. 1987 Nov 11. - Vol. 15. - №21. - P. 9094.

186. Ron EZ, and Rosenberg E. Natural roles of biosurfactants. // Environ Microbiol. -2001.-Vol.3.-P. 229-236.

187. Rosenthal S and Tager IB. Prevalence of Gram-negative rods in the normal pharyngeal flora. // Ann Intern Med. 1975. - Vol. 83. - P. 355-357.

188. Rosenthal SL. Sources of Pseudomonas and Acinetobacter species found in human culture materials. // Am J Clin Pathol. 1974. - Vol. 62. - P. 807-811.

189. Ruzin A, Keeney D, Bradford PA. AdeABC multidrug efflux pump is associated with decreased susceptibility to tigecycline in Acinetobacter calcoaceticus

190. Acinetobacter baumannii complex. // J Antimicrob Chemother. 2007. - Vol. 59. -P. 1001-1004.

191. Sakala RM, Hayashidani H, Kato Y et al. Change in the composition of the microflora on vacuum-packaged beef during chiller storage. // Int J Food Microbiol. 2002. - Vol. 74. - P. 87-99.

192. Sato K, Nakae T. Outer membrane permeability of Acinetobacter calcoaceticus and its implication in antibiotic resistance. // J Antimicrob Chemother. -1991 Jul. -Vol. 28.-№1.-P. 35-45.

193. Schaub IG, and Hauber FD. A biochemical and serological study of a group of identical unidentifiable gram-negative bacilli in human sources. // J Bacteriol. -1948.-Vol. 56.-P. 379-385.

194. Segal H, Jacobson RK, Garny S, Bamford CM, Elisha BG. Extended -10 promoter in IS Aba-1 upstream of 6/яоха-23 from Acinetobacter baumannii. // Antimicrob Agents Chemother. 2007 Aug. - Vol. 51. - №8. - P. 3040-3041.

195. Segal H, Thomas R, Gay EB. Characterization of class 1 integron resistance gene cassettes and the identification of a novel IS-like element in Acinetobacter baumannii. //Plasmid. 2003. - Vol. 49. - P. 169-178.

196. Seifert H, Dijkshoorn L, Gerner-Smidt P et al. Distribution of Acinetobacter species on human skin: comparison of phenotypic and genotypic identification methods. // J Clin Microbiol. 1997 Nov. - Vol. 35. -№11.- 2819-2825.

197. Seifert H, Schulze A, Baginski R, and Pulverer G. Plasmid DNA fingerprinting of Acinetobacter species other than Acinetobacter baumannii. И J Clin Microbiol. -1994.-Vol. 32.-P. 82-86.

198. Shabtai Y and Gutnick DL. Tolerance of Acinetobacter calcoaceticus RAG-1 to the cationic surfactant cetyltrimethylammonium bromide: role of the bioemulsifier emulsan. //Appl.Environ.Microbiol. 1985. - Vol. 49. - P. 192-197.

199. Sherertz RJ, and Sullivan ML. An outbreak of infections with Acinetobacter calcoaceticus in burn patients: contamination of patients' mattresses. // J Infect Dis. 1985.-Vol. 151.-P. 252-258.

200. Siau H, Yuen KY, Ho PL, Luk WK, Wong SS, Woo PC, Lee RA, Hui WT. Identification of Acinetobacters on blood agar in presence of d-glucose by unique browning effect. // J Clin Microbiol. 1998 May. - Vol. 36. - №5. - P. 1404-1407

201. Smith PW, and Massanari M. Room humidifiers as the source of Acinetobacter infections. //JAMA. 1977. - Vol. 237. - P. 795-797

202. Smolyakov R, Borer A, Riesenberg K. et al. Nosocomial multi-drug resistant Acinetobacter baumannii bloodstream infection: risk factors and outcome with ampicillin-sulbactam treatment. // J Hosp Infect. 2003. - Vol. 54. - №1. - P. 32-38.

203. Smolyakov R, Schlaeffer F, Alkan M et al. Ampicillin-sulbactam treatment for nosocomial multiresistant Acinetobacter baumanii bacteremia. // Intersci Conf Antimicrob Agents Chemother. 2001. - Vol. 41. - Abstract no. K-l 188.

204. Somerville DA, and Noble WC. A note on the gram-negative bacilli of human skin. // Eur J Clin Biol Res. 1970. - Vol. 40. - P. 669-670.

205. Taplin D, Rebell G, and Zaias N. The human skin as a source of Mima-Herellea infections. //JAMA. 1963. - Vol. 186. - P. 952-954.

206. Tjernberg I, and Ursing J. Clinical strains of Acinetobacter classified by DNA-DNA hybridization. //APMIS. 1989. - Vol. 97. - P. 595-605.

207. Tognim MC, Gales AC, Penteado AP et al. Dissemination of IMP-1 metallo-beta-lactamase-producing Acinetobacter species in a Brazilian teaching hospital. // Infect Control Hosp Epidemiol. 2006 Jul. - Vol. 27. - №7. - P. 742-747.

208. Tomaras AP, Dorsey CW, Edelmann RE, Actis LA. Attachment to and biofilm formation on abiotic surfaces by Acinetobacter baumannii: involvement of a novelchaperone-usher pili assembly system. // Microbiology. 2003. - Vol. 149. - P. 3473-3484.

209. Towner KJ, Bergogne-Berezin E, and Fewson CA. Acinetobacter: portrait of a genus. // In Towner KJ, Bergogne-Berezin E, and Fewson CA. The biology of Acinetobacter. I I New York Plenum Publishing Corp. - 1991. - P. 1 -24.

210. Towner KJ. The genus Acenitobacter. II The Prokaryotes. 1991. - Vol. 6. - P. 746-758.

211. Traub WH, and Spohr M. Antimicrobial drug susceptibility of clinical isolates of Acinetobacter species (A. baumannii, A. haemolyticus, genospecies 3, and genospecies 6). // Antimicrob Agents Chemother. 1989. - Vol. 33. - P. 16171619.

212. Tsakris A, Ikonomidis A, Pournaras S, Tzouvelekis LS, Sofianou D, Legakis NJ, Maniatis AN. VIM-1 metallo-beta-lactamase in Acinetobacter baumannii. II Emerg Infect Dis. 2006 Jun. - Vol. 12. - №6. - P. 981-983.

213. Turner PJ, Greenhalgh JM. The activity of meropenem and comparators against Acinetobacter strains isolated from European hospitals, 1997-2000. // Clin Microbiol Infect 2003. - Vol. 9. - P. 563-567.

214. Turner PJ. Meropenem activity against European isolates: report on the MYSTIC (Meropenem Yearly Susceptibility Test Information Collection) 2006 results. // Diagn Microbiol Infect Dis. 2008 Feb. - Vol. 60. - №2. - P. 185-192.

215. Turton JF, Ward ME, Woodford N et al. The role of ISAbal in expression of OXA carbapenemase genes in Acinetobacter baumannii. IIFEMS Microbiol Lett. 2006 May. - Vol. 258. - №1. - P. 72-77.

216. Uraz G, Citak S. The isolation of Pseudomonas and other Gram(-) psychrotrophic bacteria in raw milks. I IJ Basic Microbiol. -1998. Vol. 38. - P. 129-134.

217. Vila J, Ribera A, Marco F et al. Activity of clinafloxacin, compared with six other quinolones, against Acinetobacter baumannii clinical isolates. // J Antimicrob Chemother. 2002. - Vol. 49. - P. 471-477.

218. Vila J, Ruiz J, Goni P, Jimenez De Anta MT. Quinoloneresistance mutations in the topoisomerase IV parC gene of Acinetobacter baumannii. II J Antimicrob Chemother. -1997. Vol. 39. - P. 757-762.

219. Vila J, Ruiz J, Goni P, Marcos A, Jimenez De Anta MT. Mutation in the gyrA gene of quinolone-resistant clinical isolates of Acinetobacter baumannii. II Antimicrob Agents Chemother. 1995. Vol. 39. - P. 1201-1203.

220. Villegas MV, Hartstein Al. Acinetobacter outbreaks, 1977-2000. // Infect Control Hosp Epidemiol. 2003. - Vol. 24. - P. 284-295.

221. Vitek2 характеристики прибора. Информация доступна по адресу: http://216.62.91.163/industrv/cosmetic/vitek2compact/vitek2info.htm

222. Vos Р, Hogers R, Bleeker M, Reijans M, van de Lee T, Homes M, Frijters A, Pot J, Peleman J, Kuiper M, et al. AFLP: a new technique for DNA fingerprinting. // Nucleic Acids Res. 1995 Nov 11. - Vol. 23. - №21. - P. 4407-4414.

223. Walsh TR. Clinically significant carbapenemases: an update. // Curr Opin Infect Dis. 2008 Aug. - Vol. 21. - №4. - P. 367-371.

224. Walther-Rasmussen J, Hedby N. OXA-type carbapenemases. // J Antimicrob Chemother. 2006 Mar. - Vol. 57. - №3. - P. 373-383.

225. Washington CW, Allen S et al. Koneman's Color Atlas and Textbook of Diagnostic Microbiology. Sixth edition. // Lippincott Williams & Wilkins. 2006. P. 354.

226. Weaver RE, Actis LA. Identification of Acinetobacter species. I IJ Clin Microbiol. 1994 Jul. - Vol. 32. - №7. - P. 1833

227. Webster C, Towner KJ, Humphreys H. Survival of Acinetobacter on three clinically related inanimate surfaces. // Infect Control Hosp Epidemiol. 2000. -Vol. 21.-P. 246.

228. Weernink A, Severin WPJ, Tjernberg I, and Dijkshoorn L. Pillows, an unexpected source of Acinetobacter. IIJ Hosp Infect. 1995. - Vol. 29. - P. 189-199.

229. Welsh J, McClelland M. Fingerprinting genomes using PCR with arbitrary primers. //Nucleic Acids Res. 1990 Dec. - Vol. 18. - Ш4. - P. 7213-7218.

230. Weyant RS, Moss CW et al. Identification of unusual pathogenic gram-negative Aerobic and facultatively anaerobic bacteria. Ed.2. // Baltimore. Williams and Wilkins. -1996.

231. Wieczorek P, Sacha P, Hauschild T et al. Multidrug resistant Acinetobacter baumannii the role of AdeABC (RND family) efflux pump in resistance to antibiotics. //Folia Histochem Cytobiol. - 2008. - Vol. 46. - №3. - P. 257-267.

232. Williams JG, Kubelik AR, Livak KJ, Rafalski JA, Tingey SV. DNA polymorphisms amplified by arbitrary primers are useful as genetic markers. // Nucleic Acids Res.- 1990 Nov.-Vol. 18.-№.22.-P. 6531-6535.

233. Woodford N, Ellington MJ, Coelho JM et al. Multiplex PCR for genes encoding prevalent OXA carbapenemases m Acinetobacter spp. // Int J Antimicrob Agents. -2006.-Vol. 27.-P. 351-353.

234. Wu WZ, Feng YC, Wang JL. Characteristics of 4-chlorophenol degradation by a soil bacterium Acinetobacter sp. // Huan Jing Ke Xue. 2008 Nov. - Vol. 29. -№11.-P. 3185-3188.

235. Yoon JH, Kim IG, Oh TK. Acinetobacter marinus sp. nov. and Acinetobacter seohaemis sp. nov., isolated from sea water of the Yellow Sea in Korea. // J Microbiol Biotechnol. 2007 Nov. - Vol. 17. - №11. - P. 1743-1750.