Биологическая характеристика штаммов энтерококков для разработки препаратов с пробиотическими свойствами тема диссертации и автореферата по ВАК РФ 06.02.02, кандидат наук Кочкина Елена Евгеньевна

• Кочкина Елена Евгеньевна
• кандидат наук
• 2021

Оглавление диссертации кандидат наук Кочкина Елена Евгеньевна

ВВЕДЕНИЕ

I ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ

1.1 Общая характеристика бактерий рода Enterococcus

1.2 Факторы персистенции энтерококков

1.3 Бактериоциногенный потенциал энтерококков

1.4 Использование бактерий рода Enterococcus в качестве основы

биопрепаратов для птицеводства

II СОБСТВЕННЫЕ ИССЛЕДОВАНИЯ

2.1 Материалы и методы исследований

2.1.1 Методы изучения биологических свойств энтерококков

2.1.2 Полногеномное секвенирование культуры E. faecium ICIS

2.1.3 Оценка биологической активности E. faecium ICIS 96 in vivo

2.1.3.1 Определение оптимальной дозы E. faecium ICIS 96 при выращивании цыплят-бройлеров для повышения продуктивности

2.1.3.2 Методы изучения микробиоценоза толстого отдела кишечника птиц

2.1.3.3 Методы определения морфологических и биохимических показателей крови цыплят-бройлеров

2.1.3.4 Методы определения показателей функционирования адаптивного иммунитета птицы

2.1.3.4.1 Морфометрические и гистологические исследования органов иммунной системы бройлеров

2.1.3.4.2 Определение титра антител к возбудителю болезни Ньюкасла

2.1.3.5 Определение продуктивности цыплят-бройлеров

2.1.4 Статистическая обработка результатов

2.2 Персистентный потенциал бактерий рода Enterococcus

2.3 Разработка программы для отбора биотехнологически ценных культур энтерококков, выделенных от животных

2.4 Распространенность генетических детерминант бактериоциногении в популяции фекальных и клинических изолятов энтерококков

2.5 Скрининг биотехнологически ценных культур энтерококков

2.6 Анализ полного генома штамма E. faecium ICIS

2.7 Биологическая активность культуры E. faecium ICIS 96 in vivo на модели

цыплят-бройлеров

2.7.1 Определение оптимальных доз введения в рационы бройлеров

E. faecium ICIS

2.7.2 Характеристика морфологических показателей крови птиц, получавших культуру E. faecium ICIS

2.7.3 Влияние культуры E. faecium ICIS 96 на энергетический обмен в организме бройлеров

2.7.4 Оценка особенностей микробиоценоза толстой кишки цыплят-бройлеров при введении в рацион E. faecium ICIS

2.7.5 Исследование адаптивного иммунитета птицы при введении в рацион кормовой добавки на основе культуры энтерококков

2.7.6 Оценка влияния E. faecium ICIS 96 на продуктивные качества цыплят-бройлеров

ВЫВОДЫ

СПИСОК СОКРАЩЕНИЙ

БИБЛИОГРАФИЧЕСКИЙ СПИСОК

ПРИЛОЖЕНИЕ А

ПРИЛОЖЕНИЕ Б

ПРИЛОЖЕНИЕ В

ПРИЛОЖЕНИЕ Г

ПРИЛОЖЕНИЕ Д

ПРИЛОЖЕНИЕ Е

ПРИЛОЖЕНИЕ Ж

Введение диссертации (часть автореферата) на тему «Биологическая характеристика штаммов энтерококков для разработки препаратов с пробиотическими свойствами»

ВВЕДЕНИЕ

В последние годы всё больше внимания уделяется изучению биологических свойств микроорганизмов, входящих в состав нормальный микрофлоры (Karimi S. et al., 2018; Wang J. et al., 2019; Jin M. et al., 2020). В плане практического использования одними из перспективных представителей симбиотической микробиоты организма человека и животных являются энтерококки.

На протяжении десятилетий бактерии рода Enterococcus применяются в производстве традиционных ферментированных продуктов питания (El-Samragy Y.A. et al., 1988; Centeno J.A. et al., 1996; Du L. et al., 2017; Sheoran P., Ti-wari S.K., 2019; Graham K. et al., 2020). Кроме того, обладая рядом полезных функций (иммуномодулирующая (Gupta V., Garg R., 2009; Kim B. et al., 2019), противоопухолевая (Gu Y.H. et al., 2017), витаминообразующая (Divya J.B. et al., 2012; Li P. et al., 2017), детоксицирующая (Topcu A. et al., 2010)), бактериоцин-продуцирующие представители этого рода с успехом используются в качестве основы импортных пробиотических препаратов (Линекс, ЛЕК Д.Д. (Словения); Би-фиформ® АО «Ферросан» (Дания); Bio-three® ТоА (Япония); Symbioflor® 1 SymbioPharm (Германия); Bioflorin® Sanofi-aventis (Франция)) (Neuhaus K. et al., 2017; Tsukahara T. et al., 2018).

В настоящее время пробиотические препараты для животноводства на основе микроорганизмов рода Enterococcus в Российской Федерации отсутствуют. Между тем известно, что зарубежные штаммы энтерококков, входящие в состав пробиотиков, обладают низким уровнем антагонистической активности по отношению к патогенным микроорганизмам, выделенным на территории России (Зи-анбетова Л.Х., Валышева И.В., 2009), что актуализирует поиск биотехнологиче-ски ценных культур в РФ.

Принимая во внимание тот факт, что Enterococcus spp. являются потенциально-патогенными микроорганизмами, играющими важную роль в этиологии и патогенезе ряда заболеваний (Ike Y., 2017), вопрос разработки подходов к диффе-

ренциации авирулентных микроорганизмов этого рода и возбудителей инфекци-онно-воспалительных заболеваний следует считать актуальным.

Несмотря на то, что в настоящее время подробно охарактеризован вирулентный потенциал энтерококков, выделенных от животных (Пошвина Д.В. и др., 2014; Oliveira M. et al., 2016; Ben Said L. et al., 2017), дифференциация микроорганизмов по факторам патогенности не представляется возможной, поскольку, по мнению ряда исследователей, вирулентность не является результатом наличия только конкретных детерминант патогенности, а представляет собой более сложный процесс (Franz C.M. et al., 2011).

Альтернативным подходом к решению вышеобозначенной проблемы может явиться оценка способности микроорганизмов к инактивации компонентов эф-фекторных механизмов иммунитета, которая, по мнению Ю.А. Брудастова и Д.Г. Дерябина (1994) является комплексом маркеров, информативных при диагностике патогенной микрофлоры. Однако до настоящего времени персистентный потенциал энтерококков, выделенных от животных, изучен недостаточно (Пошвина Д.В. и др., 2015).

Учитывая вышеизложенное, цель исследования - охарактеризовать биологические свойства клинических и фекальных культур Enterococcus spp., выделенных от животных; отобрать культуру энтерококков для разработки пробиотиче-ского биопрепарата и оценить её биологическую активность in vivo.

Для достижения поставленной цели были определены и решены следующие задачи:

1. Оценить пенетрантность и выраженность факторов персистенции (АИгА в отношении sIgA, АЦА в отношении ФНО-а, ИЛ-10) у микроорганизмов рода Enterococcus, выделенных от животных, с учётом их видовой и клинической значимости.

2. Определить информативные свойства для построения математической модели дифференциации этиологически значимых штаммов Enterococcus spp. от представителей мутуалистической микробиоты.

3. Отобрать авирулентный штамм из числа симбиотических бактериоцин-продуцирующих энтерококков, перспективный для создания биопрепарата про-биотической направленности, и охарактеризовать его фенотипические свойства и генетическую структуру.

4. Изучить биологические эффекты перспективной культуры энтерококков in vivo.

Область исследования. Исследование проведено в рамках специальности 06.02.02 Ветеринарная микробиология, вирусология, эпизоотология, микология с микотоксикологией и иммунология, паспорта специальности ВАК РФ (биологические науки).

Научная новизна исследований. Впервые изучена способность энтерококков, выделенных от здоровых животных и с инфекционно-воспалительными заболеваниями, изменять в условиях in vitro концентрацию цитокинов (ФНО-а, ИЛ-10) и секреторного IgA. Установлено, что этиологически значимые штаммы Enterococcus spp. обладают более высоким потенциалом к инактивации интерлей-кина-10 и секреторного IgA, чем кишечные изоляты. Выявлены значимые перси-стентные свойства, характеризующие авирулентные культуры энтерококков.

Разработан алгоритм отбора штаммов энтерококков, пригодных для создания безопасных бактериальных препаратов (свидетельство о государственной регистрации программ для ЭВМ № 2019664545).

Впервые проведено полногеномное секвенирование и аннотация генома штамма Enterococcus faecium ICIS 96, обладающего антагонистической активностью. Отсутствие у культуры генетических детерминант вирулентности делает штамм перспективным для использования в качестве основы биопрепаратов про-биотической направленности (решение о выдаче патента РФ на изобретение по заявке № 2019144113 от 15.10.2020 (приложение А)).

Впервые в условиях in vivo на модели цыплят-бройлеров продемонстрированы биологические эффекты культуры E. faecium ICIS 96. Установлено, что при введении в рацион цыплят-бройлеров штамм энтерококка нормализует микро-

биоценоз кишечного биотопа, благотворно влияет на физиолого-биохимический и иммунный статусы, существенно повышая сохранность поголовья и продуктивные качества птицы.

Теоретическая и практическая значимость работы. Полученные результаты расширяют представление о роли факторов персистенции в дифференциации культур на симбиотическую и вирулентную микрофлору и являются основой для разработки новых практических решений, позволяющих проводить скрининг био-технологически ценных культур энтерококков.

Научная значимость исследования определяется получением новых знаний о способности энтерококков, выделенных от животных в норме и при патологии, инактивировать цитокины макроорганизма (ФНО-а, ИЛ-10) и секреторный IgA.

Практическое значение работы подтверждено разработкой способа «Скрининг биотехнологически ценных культур энтерококков для создания безопасных бактериальных препаратов» (свидетельство о государственной регистрации программ для ЭВМ № 2019664545).

Перспективный для практического использования штамм E. faecium ICIS 96 депонирован в Ведомственной коллекции полезных микроорганизмов сельскохозяйственного назначения ОСХН РАН (г. Пушкин, г. Санкт-Петербург) (приложение Б); геномная последовательность штамма депонирована в базе данных NCBI BioProject (геномный проект ID:PRJNA224116).

Результаты исследования функциональной активности культуры E. faecium ICIS 96 in vitro и in vivo открывают перспективы для её использования в составе биопрепаратов пробиотической направленности для нужд птицеводства.

Связь работы с плановыми исследованиями и научными программами. Представленные данные - составная часть темы открытого плана НИР ФГБОУ ВО Оренбургский ГАУ: «Роль факторов персистенции условно-патогенных микроорганизмов в инфекционном процессе» (№ государственной регистрации АА-АА-А17-117092740002-9).

Исследования были проведены при поддержке гранта Молодежного форума Приволжского федерального округа «аВолга» (2019); гранта молодежного научно-инновационного конкурса «УМНИК-2019»; гранта Правительства Оренбургской области для финансирования инновационных проектов научных коллективов в 2019 г. (№ 29).

Апробация работы. Результаты научных исследований доложены и обсуждены на:

- IX Российской научной конференции с международным участием «Перси-стенция и симбиоз микроорганизмов» (стендовый доклад) (г. Оренбург, 2018);

- ежегодной межвузовской научно-практической конференций «Студенты и аспиранты в науке» (г. Оренбург, 2018);

- международной научной конференции студентов, аспирантов и молодых ученых «Знания молодых для развития ветеринарной медицины и АПК страны» (г. Санкт-Петербург, 2019) и удостоены диплома I степени (приложение В);

- национальной научно-практической конференции с международным участием «Достижения и перспективы развития биологической и ветеринарной науки» (г. Оренбург, 2019);

- выставке научно-технического творчества молодых ученых Оренбургской области в рамках Всероссийской научно-практической конференции «Молодые ученые и специалисты - науке и практике страны» (г. Оренбург, 2019);

- заочном и очном этапах XVII Всероссийского конкурса молодежных авторских проектов и проектов в сфере образования, направленных на социально-экономическое развитие российских территорий, «Моя страна - моя Россия» (г. Оренбург, 2020) и отмечены дипломом I степени (приложение Г);

- выставке научно-технического творчества «Оренбуржье - ТЕРриторИЯ-ТехНО» (г. Оренбург, 2020).

Итоги проведённых исследований доложены на расширенном заседании кафедры микробиологии и заразных болезней ФГБОУ ВО Оренбургский ГАУ (протокол № 5 от 19 октября 2020 года).

Публикации. Основные научные результаты опубликованы в 8 печатных работах, из них 2 статьи в международных журналах, индексируемых в базах данных Scopus и Web of Science; 2 - в изданиях, рекомендованных ВАК при Министерстве науки и высшего образования РФ, получено решение о выдаче патента РФ на изобретение, свидетельство о государственной регистрации программы для ЭВМ.

Фрагменты работы были представлены на областном конкурсе научно-исследовательских работ и отмечены премией Губернатора Оренбургской области для талантливой молодежи (2019).

Материалы диссертации были представлены на II и III этапах Всероссийского конкурса на лучшую научную работу среди студентов, аспирантов и молодых учёных высших учебных заведений Министерства сельского хозяйства РФ (г. Киров, 2020; г. Краснодар, 2020) и отмечены дипломами I степени (приложения Д, Е).

Научные положения, выносимые на защиту.

1. Способность энтерококков изменять в условиях in vitro концентрацию цитокинов (ФНО-а, ИЛ-10) и секреторного IgA варьирует в зависимости от их эковариантной принадлежности.

2. Предложен новый методический подход для отбора авирулентных культур энтерококков с целью включения в состав биопрепаратов, основанный на оценке распространённости и выраженности антицитокиновой активности в отношении ФНО-а и ИЛ-10.

3. Штамм E. faecium ICIS 96 положительно влияет на физиолого-биохимический и иммунный статусы цыплят-бройлеров, что определяет возможность его использования в качестве компонента пробиотической кормовой добавки для птицеводства.

Объем и структура диссертации. Работа изложена на 143 страницах компьютерной верстки, содержит 8 таблиц и 23 рисунка. Диссертация состоит из общей характеристики работы, обзора литературы, материалов и методов исследо-

вания, результатов исследований и их обсуждения, выводов, практических предложений, библиографического списка, который включает 213 наименований, в том числе 148 работ иностранных авторов.

I ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ 1.1 Общая характеристика бактерий рода Enterococcus

Бактерии рода Enterococcus представляют собой повсеместно распространенную в окружающей среде (вода, почва, растения, пищевые продукты) группу молочнокислых микроорганизмов. В то же время энтерококки являются частью нормальной микрофлоры желудочно-кишечного тракта самых разнообразных животных, насекомых, рыб и человека (Ramos S. et al., 2020).

С момента открытия таксономическое положение энтерококков вызывало много споров. Впервые энтерококки были обнаружены и описаны в конце 1880-х годов несколькими исследователями. T. Escherich описал Enterococcus faecalis еще в 1886 г., назвав микроорганизм в то время «Micrococcus ovalis», а в 1899 -E. faecium (Kendall A.I., Haner R.C., 1924). M.E. Thiercelin (1899), изучая грампо-ложительные диплококки, выделенные из кишечника, для их обозначения использовал термин «enterococcus». В 1906 году F.W. Andrewes и T.J. ^rder выделили энтерококки от пациента с эндокардитом и, основываясь на расположении клеток в мазке в виде коротких или длинных цепочек, отнесли их к роду Streptococcus. Согласно серологической классификации R.C. Lancefield (1933) энтерококки были отнесены к стрептококкам группы D, поскольку они агглютинировались сывороткой группы D. Наиболее распространенной была классификация, предложенная J.M. Sherman (1937), в соответствии с которой род Streptococcus разделялся на 4 группы: «вириданс» (зеленящие), «пиогенные» (гноеродные) стрептококки, «молочные» стрептококки и «энтерококки». На протяжении почти 100 лет энтерококки относились к роду Streptococcus. Лишь в 1984 году они были отнесены в отдельный род Enterococcus на основании результатов гибридизации ДНК-ДНК, ДНК-рРНК, проведенной K.H. Schleifer и R. Kilpper-Balz, а еще спустя два года род Enterococcus был добавлен в справочник Берджи по бактериологической систематике. В 2001 году энтерококки были включены в состав семейства

Enterococcaceae (Ших Е.В. и др., 2019; Garcia-Solache M., Rice L.B., 2019; Sel-leck E.M et al., 2019).

Анализ последовательностей 16S рРНК свидетельствует о том, что энтерококки более тесно связаны с родами Vagococcus, Tetragenococcus, Carnobacterium, чем с родами Streptococcus и Lactococcus (Facklam R.R. et al., 2002).

Однако в современной научной литературе до сих пор можно встретить термин «фекальные стрептококки» (S. faecalis и S. faecium) как отголоски устаревшей таксономической классификации.

В настоящее время род Enterococcus включает более 55 видов (Jin D. et al., 2017; McLaughlin R.W. et al., 2017).

Энтерококки - это грамположительные микроорганизмы овоидной формы, располагающиеся одиночно, парами, короткими цепочками и небольшими скоплениями. Для энтерококков характерен полиморфизм, что проявляется образованием круглых или слегка вытянутых вдоль оси клеток (Бухарин О.В., Валы-шев А.В., 2012).

Бактерии рода Enterococcus не образуют спор и капсул. Некоторые штаммы обладают подвижностью за счет наличия единичных жгутиков. Энтерококки являются мезофильными микроорганизмами, температурный оптимум составляет 35-37°С. Способны расти в широком диапазоне рН (3,0-12,0) и температур (10-45°С), устойчивы к высушиванию, ионизирующему излучению, осмотическому и окислительному стрессам, высокой концентрации тяжелых металлов. Выдерживают нагревание до 60°С в течение 30 мин. Большинство штаммов энтерококков растут в присутствии 40% желчных солей, 6,5% хлорида натрия (NaCl), а также в молоке, содержащем 0,1% метиленового синего, гидролизуют эскулин (Raza T. et al., 2018).

По типу дыхания энтерококки являются факультативными анаэробами. По типу питания - хемоорганотрофы. Энтерококки осуществляют метаболизм бродильного типа, сбраживают углеводы с образованием молочной кислоты, но не

газа. Каталазоотрицательные, но некоторые штаммы проявляют псевдокаталаз-ную активность.

Энтерококки продуцируют ряд биологически активных соединений, таких как бактериоцины, органические кислоты, активированные метаболиты кислорода, многоатомные спирты (полиолы), ферменты, экзополисахариды. Продукция этих соединений является отражением конкурентного обитания бактерий в условиях многокомпонентных микробиомов и обеспечивает устойчивую колонизацию биотопов хозяина (Валышев А.В., 2014; Bintsis Т., 2018).

Поскольку энтерококки являются комменсальными микроорганизмами желудочно-кишечного тракта животных и человека, постоянно выделяются во внешнюю среду, где не размножаются и не изменяют своих свойств, а также обладают устойчивостью к неблагоприятным условиям, их используют в качестве индикаторов фекального загрязнения (FIB - fecal indicator bacteria) во всем мире (Staley C. et al., 2014).

На протяжении десятилетий бактерии рода Enterococcus применяются в производстве традиционных ферментированных продуктов питания. Обладая рядом технологических черт (подкисление за счет образование молочной кислоты, липолитическая, протеолитическая активность, метаболизм углеводов и производство летучих соединений) микроорганизмы этого рода с успехом используются в качестве стартера или вспомогательных культур при производстве молочных и/или ферментированных продуктов питания. Считается, что они во многом определяют органолептические характеристики этих продуктов (Foulquié Moreno M.R. et al., 2006; M'hir S. et al., 2012). По мнению D.M. Amaral et al. (2017), такой эффект связан с их липолитической активностью, утилизацией цитрата и выработкой ароматических летучих соединений.

Кроме того, бактериоцинпродуцирующие представители этого рода, обладающие антагонистической активностью в отношении широкого спектра патогенных и условно-патогенных микроорганизмов, применяются в качестве консервантов пищевых продуктов, а также в составе пробиотических препаратов, кото-

рые используются для улучшения здоровья человека и животных и оказывают благоприятное воздействие на организм за счёт ряда биологических функций (противоопухолевая, детоксицирующая, иммуномодулирующая, витаминообра-зующая) (Ермоленко Е.И., 2009; Golob M. et al., 2019).

Между тем, до настоящего времени род Enterococcus еще не получил статус GRAS (Generally Regarded As Safe - общепризнанный как безопасный). Это обусловлено тем, что при определенных условиях некоторые представители рода En-terococcus могут выступать в роли этиологического фактора инфекционно-воспалительных заболеваний человека, животных и птиц, поскольку обладают факторами патогенности и персистенции.

Известно, что вирулентные штаммы энтерококков способны стать причиной таких инфекционно-воспалительных заболеваний животных как мастит (Rozanska H. et al., 2019; Gao X. et al., 2019), эндометрит, диарея, гастроэнтерит, раневые инфекции, бактериемии (сепсис), инфекции мочевыводящих путей (Пал-ковский О.Л. и др., 2015; Sharon Goh H.M. et al., 2017).

По данным A. Wozniak-Biel et al. (2019) энтерококки вызывают эндокардит, асцит и артрит у кур, печеночные гранулемы у индеек, остеомиелит, а также легочную гипертензию у бройлеров. В работе A. Jung et al. (2018) описаны случаи летального исхода при остеомиелите цыплят-бройлеров.

Помимо широкого спектра факторов патогенности (Banerjee T., Anupurba S., 2015), Enterococcus spp. обладают природной устойчивостью к некоторым антибактериальным препаратам (цефалоспоринам, ß-лактамам, фторхинолонам) (Torres C. et al., 2018; Gagetti P. et al., 2019), что затрудняет терапию больных с инфекционно-воспалительными заболеваниями энтерококковой этиологии.

Таким образом, несмотря на существенный биотехнологический потенциал Enterococcus spp., вопрос о безопасности практического использования микроорганизмов этого рода является дискуссионным и достаточно широко освещен в литературе последних лет. Однако, до настоящего времени критерии дифференциации этиологически значимых культур энтерококков, выделенных из организма

животных, от представителей нормальной микрофлоры не всегда ясны. По мнению О.В. Бухарина с соавт. (2011) в роли информативных биомаркёров, позволяющих дифференцировать вирулентные культуры микроорганизмов от симбио-тических изолятов, могут выступать факторы персистенции, характеристике которых посвящен следующий раздел литературного обзора.

1.2 Факторы персистенции энтерококков

Бактерии рода ЕМегососсш, являясь условно-патогенными микроорганизмами, способны длительно переживать неблагоприятные условия в организме хозяина (персистенция). Это возможно благодаря эволюционно сложившимся механизмам: «экранированию» клеточной стенки бактерий, образованию Ь-форм, секреции факторов, инактивирующих защитные силы макроорганизма (Бухарин О.В., 1999).

«Экранирование» клеточной стенки энтерококков реализуется за счет продукции капсульных полисахаридов, что способствует «уклонению» от иммунных сил макроорганизма. В работе Ь.К Thurlow е1 а1. (2009) показано, что Е. faecalis серотипов С и Э обладают капсульными полисахаридами. Б.М. МсВпёе е1 а1. (2007) обнаружено, что наиболее вирулентные представители вида Е. faecalis относятся к серотипу С.

Еще одним механизмом, способствующим развитию энтерококковой перси-стирующей инфекции, является образование форм микроорганизмов с отсутствием (дефектом) клеточной стенки (Ь-формы). Несмотря на то, что Ь-формы бактерий могут играть важную роль в хронических или рецидивирующих инфекциях, клеточные механизмы, вовлеченные в переход в состояние L-формы и из него, все еще плохо изучены.

Еще в 1970 году ученым из США удалось получить L-формы Е. faecium Б24 путем посева обычных клеток на питательную среду, содержащую 20 ед/мг пенициллина. Кроме того, было определено, что воздействие на клетки энтерококков

лизоцима в сочетании с сахарозой не только сопровождается утратой клеточной стенки, но и способствует увеличению количества образовавшихся L-форм в 1000 раз (King J.R., Gooder H., 1970).

При сравнении роста и адгезии обычных клеток и L-форм штаммов E. faecium J. Jass et al. (1994) было установлено, что L-формы в жидкой культуре характеризовались медленным ростом, по сравнению с родительским штаммом, что сопровождалось удлинением лаг-фазы и медленными удельными скоростями роста. Несмотря на то, что L-формы E. faecium адгезировались к поверхности из каучука, плотность популяции была в 10-100 раз меньше, чем у родительских клеток.

По данным Y. Kawai et al. (2019), активное образование L-форм отмечается при культивировании штаммов E. faecium в планшетах с сукцинатом, а также в планшетах с глюкозой в сочетании с ß-лактамным антибиотиком пенициллином G и лизоцимом.

Еще одним механизмом персистенции бактерий рода Enterococcus является устойчивость к факторам врожденного иммунитета. Установлено, что энтерококки, выделенные из организма человека, способны инактивировать лизоцим, антимикробные белки и пептиды, гистоноподобные белки, образовывать биопленки, взаимодействовать с системой комплемента (Бухарин О.В., 2000).

Лизоцим является важным и широко распространенным антибактериальным ферментом защитной системы макроорганизма, который разрушает клеточные стенки бактерий путем гидролиза пептидогликана. E. faecalis является одной из немногих бактерий, которые почти полностью устойчивы к лизоциму. A. Benachour et al. (2012) считают, что это связано с О-ацетилированием пепти-догликана, которое ингибирует ферментативную активность лизоцима, а также D-аланилированием тейхоевых кислот, которое сдерживает связывание лизоцима с бактериальной клеточной стенкой.

В результате анализа полногеномной последовательности штамма E. faecalis V583 было выявлено два гена - EF0783 и EF1843, которые могут кодировать ус-

тойчивость к лизоциму. Белковые продукты этих генетических детерминант имеют значительную гомологию с О-ацетилтрансферазой пептидогликана S. aureus (OatA) и N-ацетилглюкозаминдеацетилазой S. pneumoniae (PgdA) (Hebert L. et al., 2007).

В работе Д.В. Пошвиной с соавторами (2015) антилизоцимная активность (АЛА) обнаружена у 100% культур рода Enterococcus, выделенных при инфекци-онно-воспалительных заболеваниях животных. Авторы отмечают, что уровень выраженности АЛА зависит от видовой принадлежности изолятов и биотопа выделения. Наиболее высокие значения АЛА были зафиксированы у культур E. du-rans, Е. casseliflavus и E. avium, низкие - у штаммов вида Е. flavescens. Кроме того, максимальный уровень признака был обнаружен у культур энтерококков, изолированных их экскрета молочных желез.

Интересен тот факт, что энтерококки способны не только инактивировать лизоцим, но и продуцировать его. Так, в исследовании O. Ben Brai'ek et al. (2019) из креветок Penaeus vannamei изолировали штамм Enterococcus lactis Q1, который способен синтезировать лизоцим, что делает его перспективным кандидатом для включения в состав пробиотиков или использования в качестве биоконсерванта пищевых продуктов.

Установлен высокий уровень распространенности и выраженности антилак-тоферриновой (АЛфА), антигемоглобиновой (АНЬА) активностей, а также комбинация данных свойств у этиологически значимых изолятов E. faecalis и E. faecium по сравнению с фекальными культурами, выделенными от человека (Сычева М.В., Карташова О.Л., 2015).

По данным Н.В. Бугеро, Н.И. Потатуркиной-Нестеровой (2012), при сокуль-тивировании простейших Blastocystis hominis и культур E. faecalis происходит увеличение выраженности факторов персистенции (АЛА, АГА, АЛфА) последних, что, вероятно, связано с реализацией межмикробных взаимодействий бактериями.

Установлено, что энтерококки способны деградировать другие антимикробные белки и пептиды. Так, S.Y. Park et al. (2007) обнаружили в супернатан-те штамма E. faecalis желатиназу (GelE) и сериновую протеазу (SprE). В попытке выяснить механизмы их вирулентности, GelE и SprE вводили в гемолимфу восковой моли G. mellonella и оценивали влияние на состояние иммунной системы насекомых. В результате было установлено, что GelE деградировала индуцибельный антимикробный пептид (цекропин), выполняющий важную роль в защите хозяина на начальных этапах инфекционного процесса. В свою очередь SprE не оказывала влияния на иммунную систему насекомого.

Известно, что большинство бактерий в окружающей среде, как правило, существует не в виде планктонных культур, а в форме биопленок. Биопленка представляет собой структурированное сообщество микроорганизмов (бактерий, грибов, простейших), прикрепленное к биогенной или абиогенной поверхности (Петрова Н.В., 2015; Бахир В.М. и др., 2016). В биопленках бактерии располагаются плотно друг к другу и заключены в матрикс, продуцируемый ими внеклеточный полимерный материал, который защищает микроорганизмы от агрессивного воздействия окружающей среды (ультрафиолетовые лучи, изменение pH, осмотический шок, высыхание, воздействие антибиотиков), а также от действия факторов врожденного иммунитета макроорганизма (макрофаги, цитокины, белки системы комплемента, лизоцим) (Глушанова Н.А. и др., 2015; Хапцев З.Ю. и др., 2020; Flemming H.-C., Wingender J., 2010).

Список литературы диссертационного исследования кандидат наук Кочкина Елена Евгеньевна, 2021 год

БИБЛИОГРАФИЧЕСКИЙ СПИСОК

1. Автандилов, Г.Г. Медицинская морфометрия / Г.Г. Автандилов. - Москва: Медицина, 1990. - 384с.

2. Акимченков, Н.А. Быстрый метод полихромного статуса гистологического препарата / Н. А. Акимченков // Архив анатомии, гистологии и эмбриологии. - 1973. - Т. 64. - № 6. - С. 117-118.

3. Антибактериальная терапия инфекционного эндокардита, вызванного Enterococcus faecalis / Е.В. Ших, Т.Е. Морозова, В.Н. Дроздов и др. // Рациональная фармакотерапия в кардиологии. - 2019. - №15 (4). - С. 586-592.

4. Антипептидная активность пробиотических штаммов бифидо- и лак-тобактерий / Н.Б. Перунова, Е.В. Иванова, И.Н. Чайникова и др. // Гастроэнтерология Санкт-Петербурга. - 2017. - № 1. - С. 98-99.

5. Антицитокиновая активность микроорганизмов / О.В. Бухарин, Н.Б. Перунова, И.Н. Чайникова и др. // Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии. - 2011. - № 4. - С. 56-61.

6. Ашмарин, И.П. Статистические методы в микробиологических исследованиях / И.П. Ашмарин, А.А. Воробьев. - Л.: Гос. изд-во мед. лит, 1962. - 180 с.

7. Биопленки микроорганизмов и их значение в ветеринарии и медицине / З.Ю. Хапцев, В.А. Агольцов, Р.В. Радионов и др. // Научная жизнь. - 2020. -Т. 15. - № 1 (101). - С. 105-120.

8. Болотников И.А. Гематология птиц / И.А. Болотников, Ю.В. Соловьев. - Л.: Наука, 1980. - 116 с.

9. Ботина, С.Г. Видовая идентификация и генетическая паспортизация молочнокислых бактерий методами молекулярно-генетического типирования / С.Г. Ботина // Молочная промышленность. - 2008. - №3. - С. 50-52.

10. Ботина, С.Г. Идентификация промышленных штаммов молочнокислых бактерий методами молекулярно-генетического типирования / С.Г. Ботина,

Ю.Д. Цыганков, В.В. Суходолец // Генетика. - 2006. - Т. 42. - № 12. - С. 16211635.

11. Брудастов, Ю.А. Биологическое значение антикомплементарной активности бактерий / Ю.А. Брудастов, Д.Г. Дерябин // Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии. - 1994. - № S. - С. 28-31.

12. Бугеро, Н.В. Изменение факторов персистенции энтерококков при со-культивировании с простейшими Blastocystis hominis / Н.В. Бугеро, Н.И. Потатур-кина-Нестерова // Вестник новых медицинских технологий. - 2012. - Т. 19. -№ 2. - С. 73-74.

13. Бухарин, О.В. Биология и экология энтерококков / О.В. Бухарин, А.В. Валышев. - Екатеринбург: УрО РАН, 2012. - 227 с.

14. Бухарин, О.В. Механизмы устойчивости энтерококков к антимикробным белкам и пептидам / О.В. Бухарин, А.В. Валышев // Журнал микробиологии, иммунологии и эпидемиологии. - 2012. - № 5. - С. 89-94.

15. Бухарин, О.В. Персистенция патогенных бактерий / О.В. Бухарин. -М.: Медицина, 1999. - 367 с.

16. Бухарин, О.В. Персистенция патогенных бактерий: теория и практика / О.В. Бухарин // Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунологии. -2000. - № 4. - С. 4-7.

17. Бухарин, О.В. Способ определения антииммуноглобулиновой активности микроорганизмов / О.В. Бухарин, И.Н. Чайникова, А.В. Валышев // Патент РФ № 2236465. от 20.09.2004 г. Бюл. № 26.

18. Валышев, А.В. Антимикробные соединения энтерококков / А.В. Валышев // Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунологии. -2014. - № 5. - С. 119-126.

19. Видовая характеристика и факторы персистенции энтерококков, выделенных от животных в норме и при патологии / Д.В. Пошвина, Н.Е. Щепитова, М.В. Сычёва и др. // Ветеринария. - 2015. - № 6. - С. 26-29.

20. Влияние нового комбинированного синбиотического препарата на микробиоценоз кишечника цыплят-бройлеров / Е.С. Красникова, В.В. Ситников, О.Н. Фомичева и др. // Известия Саратовского университета. Новая серия. Серия: Химия. Биология. Экология. - 2012. - Т. 12. - № 2. - С. 82-86.

21. Глушанова, Н.А. Бактериальные биопленки в инфекционной патологии человека / Н.А. Глушанова, А.И. Блинов, Н.Б. Алексеева // Медицина в Кузбассе. - 2015. - № 2. - С. 30-35.

22. Ермоленко, Е.И. Бактериоцины энтерококков: проблемы и перспективы использования (обзор литературы) / Е.И. Ермоленко // Вестник Санкт-Петербургского университета медицины. - 2009. - №3. - С. 78-93.

23. Ермоленко, Е.И. Иммуномодулирующее действие пробиотических бактерий при заболеваниях желудочно-кишечного тракта / Е.И. Ермоленко // Вестник Санкт-Петербургского университета. Медицина. - 2014. - № 4. - С. 5-18.

24. Зианбетова, Л.Х. Антимикробная активность энтерококков, выделенных из различных источников / Л.Х. Зианбетова И.В. Валышева // Вестник РГМУ. - 2009. - № 3. - С. 28.

25. Зобнина, Н.Л. Изучение адсорбции пировиноградной кислоты как участника глюконеогенеза / Н.Л. Зобнина, П.И. Цапок // Материалы XV Всероссийской научно-практической конференции с международным участием «Биодиагностика состояния природных и природно-техногенных систем». - ФГБОУ ВО «Вятский государственный университет», ФГБУН Институт биологии Коми научного центра Уральского отделения Российской академии наук. - 2017. - С. 297300.

26. Зубарева, Н.А. Местный иммунитет гнойных ран / Н.А. Зубарева, А.В. Ренжин, К.В. Шмагель // Медицинская иммунология. - 2010. - Т. 12. -№12. - С. 393-398.

27. Каблинова, Т.В. Оценка антагонистической активности микроорганизмов как фактора вирулентности респираторной микрофлоры / Т.В. Каблинова,

М.П. Калипарова, Е.П. Крайнова // Научная сессия Пермского государственного медицинского университета имени академика Е.А. Вагнера. - 2015. - С. 28-31.

28. Каштальян, О.А. Цитокины как универсальная система регуляции / О.А. Каштальян, Л.Ю. Ушакова // Медицинские новости. - 2017. - № 9. - С. 3-7.

29. Климов, А.Н. Обмен липидов и липопротеидов и его нарушения /

A.Н. Климов, Н.Г. Никуличева. - СПб.: Питер Ком, 1999. - 512 с.

30. Кнорре, Д.Г. Биологическая химия / Д.Г. Кнорре. - М.: Наука, 2002. -

479 с.

31. Комаров, А.В. Анатомическое вскрытие и изучение особенностей строения тела домашних птиц / А.В. Комаров. - Елгава: Латв. СХА, 1981. - 19 с.

32. Кононенко, С.И. Эффективный способ повышения продуктивности / С.И. Кононенко // Политематический сетевой электронный научный журнал Кубанского государственного аграрного университета. - 2016. - № 98. - С. 1-28.

33. Кормовая добавка для профилактики бактерионосительства микроорганизмов рода Salmonella у сельскохозяйственной птицы и способ ее применения / В.Ю. Коптев, М.А. Леонова, И.С. Онищенко и др. // Патент на изобретение RU 2694256 C2, 11.07.2019. Заявка № 2017142475 от 05.12.2017.

34. Кудлай, Д.Г. Бактериоциногения / Д.Г. Кудлай, В.Г. Лиходед. -М.: Медицина, 1966. - 203 с.

35. Куликов, Л.В. Практикум по птицеводству: учебное пособие / Л.В. Куликов. - М.: Колос, 2002. - 125 с.

36. Манько, В.М. Ветеринарная иммунология. Фундаментальные основы /

B.М. Манько, Д.А. Девришов. - М: Издательство «Агровет», 2011. - 752 с.

37. Методика проведения научных и производственных исследований по кормлению сельскохозяйственной птицы / Ш.А. Имангулов, И.А. Егоров, Т.М. Околелова и др. - Сергиев Посад, 2004. - 34 с.

38. Микробные биопленки: механизмы образования и взаимодействия с окружающей средой, новые подходы к разрушению биопленок / В.М. Бахир,

Л.Г. Ипатова, О.А. Суворов и др. // В сборнике: Пища. Экология. Качество. Труды XIII международной научно-практической конференции. - 2016. - С. 125-130.

39. Минушкин, О.Н. Методика определения микробиоценоза кишечника / О.Н. Минушкин // Академия. - 1999. - № 2. - С. 17.

40. Миронова, А.В. Факторы вирулентности энтерококков / А.В. Миронова // Международный журнал прикладных и фундаментальных исследований. -2015. - № 4-1. - С. 67-70.

41. Михайлова, Е.А. Антииммуноглобулиновая активность бактерий и ее диагностическая ценность / Е.А. Михайлова, А.П. Луда, М.И. Бигеев // В сборнике: Персистенция бактерий. - 1990. - С. 107-114.

42. Мордвинов, В.А. Цитокины: Биологические свойства и регуляция экспрессии гена интерлейкина-5 человека / В.А. Мордвинов, Д.П. Фурман // Информационный вестник ВОГиС. - 2009. - Т. 13. - № 1. - С. 53-67.

43. Мясное птицеводство в регионах России: современное состояние и перспективы инновационного развития / В.И. Фисинин, В.С. Буяров, А.В. Буяров и др. // Аграрная наука. - 2018. - № 2. - С. 30-38.

44. Николаева, И.В. Содержание секреторного ^А в грудном молоке у женщин в норме и патологии / И.В. Николаева // Практическая медицина. -2011. - № 1(51). - С. 150-152.

45. Новикова, М.В. Влияние адаптогенов на основе пробиотиков на производственные показатели кур / М.В. Новикова, И.А. Лебедева // Вопросы нормативно-правового регулирования в ветеринарии. - 2017. - № 3. - С. 128-129.

46. Осипова, Е.А. Секреторный иммуноглобулин А у женщин с хроническими воспалительными заболеваниями урогенитального тракта / Е.А. Осипова, Г.С. Суржикова // Мать и дитя в Кузбассе. - 2012. - № 4(51). - С. 54-57.

47. Палковский, О.Л. Проблемы терапии нозокомиальной энтерококковой инфекции (обзор литературы) / О.Л. Палковский, Л.А. Алексеева, И.С. Шиманов // Проблемы здоровья и экологии. - 2015. - №4(46). - С. 4-8.

48. Петрова, Н.В. Биопленки: этапы формирования, свойства и клинические последствия / Н.В. Петрова // Клиническая патофизиология. - 2015. - № 3. -С. 9-16.

49. Плешакова, В.И. Микробиоценоз желудочно-кишечного тракта у индеек / В.И. Плешакова, Н.А. Лещёва, Л.М. Гелярная // Птицеводство. -2017. -№ 7. - С. 37-40.

50. Пошвина, Д.В. Образование биоплёнок клиническими изолятами энтерококков / Д.В. Пошвина // Известия Оренбургского государственного аграрного университета. - 2015. - №1 (51). - С. 75-76.

51. Пошвина, Д.В. Распространение генетических детерминант вирулентности среди клинических изолятов энтерококков, выделенных от животных / Д.В. Пошвина, М.В. Сычева // Сборник трудов VIII Всероссийской научно-практической конференции с международным участием «Молекулярная диагностика 2014». - 2014. - Т.2. - С. 464-465.

52. Разработка пробиотического препарата для животных с использованием ассоциации Bacillus subtilis и Enterococcus faecium / Н.А. Ушакова, Е.В. Котенкова, А.А. Козлова и др. // Успехи современной биологии. - Т. 131. -№ 1. - 2011. - С. 95-101.

53. Рылова Н.В. Влияние L-карнитина на уровень пировиноградной и молочной кислот в слюне детей с муковисцидозом / Н.В. Рылова, О.В. Кондратьева // Казанский медицинский журнал. - 2011. - Т. 92. - № 3. - С. 382-384.

54. Рыскина, Е.А. Полифункциональность пирувата / Е.А. Рыскина // Вопросы биологической, медицинской и фармацевтической химии. - 2014. - № 10. -С. 42-46.

55. Середа, Т.И. Характеристика углеводного обмена в организме кур-несушек кросса «Ломан белый» / Т.И. Середа, М.А. Дерхо // Известия Оренбургского государственного аграрного университета. - 2011. - № 3(31). - С. 334-337.

56. Симбиоз и его роль в инфекции / О.В. Бухарин, Е.С. Лобакова, Н.Б. Перунова и др. - Екатеринбург: УрО РАН, 2011. - 300 с.

57. Симбирцев, А.С. Цитокины: классификация и биологические функции / А.С. Симбирцев // Цитокины и воспаление. - 2004. - Т. 3. - № 2. - С. 16-22.

58. Сычева, М.В. Биологические свойства энтерококков различного происхождения / М.В. Сычева, О.Л. Карташова // Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии. - 2015. - № 4. - С. 17-21.

59. Сычева, М.В. Дифференциация клинически значимых штаммов энтерококков от представителей нормальной микрофлоры животных с использованием математических моделей / М.В. Сычева // Известия Оренбургского государственного аграрного университета. - 2016. - № 1(57). - С. 56-58.

60. Тараканов, Б.В. Микрофлора кишечника, иммунный статус и продуктивность цыплят-бройлеров при включении в рацион пробиотика микроцикола / Б.В. Тараканов, Т.А. Николичева, А.И. Манухина // Сельскохозяйственная биология. - 2007. - Т. 42. - № 2. - С. 87-94.

61. Технологические приемы повышения продуктивности и потребительских свойств мяса бройлеров, выращиваемых в техногенной зоне РСО-Алания / В.Х. Темираев, Р.Б. Темираев, Л.А. Витюк, А.А. Баева. - Владикавказ: Издательство ФГБОУ ВО «Горский государственный аграрный университет», 2016. -208 с.

62. Тлецерук, И.Р. Организация рационального кормления животных / И.Р. Тлецерук, С.И. Кононенко, С.В. Булавцева // Известия Горского государственного аграрного университета. - 2012. - Т. 49. - № 4(4). - С. 92-96.

63. Чарыев, А.Б. Эффективность использования пробиотика сублилис при выращивании бройлеров / А.Б. Чарыев, Р.Р. Гадиев // Известия Оренбургского государственного аграрного университета. - 2014. - № 6 (50). - С. 139- 141.

64. Червинец, Ю.В. Симбиотические взаимоотношения лактобацилл и микроорганизмов желудочно-кишечного тракта: дис. ... д-ра мед. наук: 03.02.03 / Червинец Юлия Вячеславовна. - М., 2012. - 263 с.

65. Щепитова, Н.Е. Биопленкообразование энтерококками кишечной микрофлоры животных / Н.Е. Щепитова // Известия Оренбургского государственного аграрного университета. - 2015. - № 1(51). - С. 77-79.

66. A comparison of the effects of antibiotics, probiotics, synbiotics and pre-biotics on the performance and carcass characteristics of broilers / V. Tayeri, A. Seidavi, L. Asadpour et al. // Veterinary Research Communications. - 2018. -No. 42(3).

67. A Novel High-Molecular-Mass Bacteriocin Produced by Enterococcus fae-cium: Biochemical Features and Mode of Action / A.S. Vasilchenko, A.V. Vasilchenko, A.V. Valyshev et al. // Probiotics Antimicrobial Proteins. - 2018. - No. 10(3). - Р. 427434.

68. A Review of Combination Antimicrobial Therapy for Enterococcus faeca-lis Bloodstream Infections and Infective Endocarditis / M. Beganovic, M.K. Luther, L.B. Rice et al. // Clinical Infectious Diseases. - 2018. - No. 67(2). - Р. 303-309.

69. A Review of Enterococcus Cecorum Infection in Poultry / A. Jung, L.R. Chen, M.M. Suyemoto et al. // Avian Diseases. - 2018. - No. 62(3). - Р. 261-271.

70. A thymus candidate in lampreys / B. Bajoghli, P. Guo, N. Aghaallaei et al. // Nature. - 2011. - No. 3. - P. 90-94.

71. Ahmed, M.O. Vancomycin-Resistant Enterococci: A Review of Antimicrobial Resistance Mechanisms and Perspectives of Human and Animal Health / M.O. Ahmed, K.E. Baptiste // Microbial Drug Resistance. - 2018. - No. 24(5). -Р. 590-606.

72. Andrewes, F.M. A study of the streptococci pathogenic for man / F.M. An-drewes, T.J. Horder // Lancet. - 1906. - No. 2. - P. 708-713.

73. Antagonistic effect of isolated probiotic bacteria from natural sources against intestinal Escherichia coli pathotypes / S. Karimi, E. Rashidian, M. Birjandi et al. // Electronic Physician. - 2018. - No. 10(3). - P. 6534-6539.

74. Antimicrobial activity of Enterococcus faecium L50, a strain producing en-terocins L50 (L50A and L50B), P and Q, against beer-spoilage lactic acid bacteria in broth, wort (hopped and unhopped), and alcoholic and non-alcoholic lager beers / A. Basanta, J. Sánchez, B. Gómez-Sala et al. // International Journal of Food Microbiology. - 2008. - No. 125(3). - P. 293-307.

75. Antimicrobial Resistance and Biofilm Formation in Enterococcus Spp. Isolated From Humans and Turkeys in Poland / A. Wozniak-Biel, G. Bugla-Ploskonska, J. Burdzy et al. // Microbial Drug Resistance. - 2019. - No. 25(2). - P. 277-286.

76. Antimicrobial Resistance and Virulence Genes in Enterococcus faecium and Enterococcus faecalis from Humans and Retail Red Mea / M. Golob, M. Pate, D. Kusar et al. // Biomed Research International. - 2019. - No 11. -doi: 10.1155/2019/2815279.

77. Antimicrobial Resistance in Enterococcus spp. of animal origin / C. Torres, C.A. Alonso, L. Ruiz-Ripa et al. // Microbiology Spectrum. - 2018. - No. 6(4). - P. 141.

78. Arias, C.A. The rice of the Enterococcus: beyond vancomycin resistance / C.A. Arias, B.E. Murray // Nature reviews. Microbiology. - 2012. - No. 10(4). -P. 266-278.

79. Assessment of biofilm formation by faecal strains of Enterococcus hirae from different species of animals / E. Bino, A. Lauková, A. Kandricáková et al. // Polish Journal of Veterinary Sciences. - 2018. - No. 21(4). - P. 747-754.

80. Bacteriocins from lactic acid bacteria and their applications in meat and meat products / W. Woraprayote, Y. Malila, S. Sorapukdee et al. // Meat Science. -2016. - No. 120. - P. 118-132.

81. Bacteriocins of lactic acid bacteria: extending the family / P. Alvarez-Sieiro, M. Montalban-Lopez, D. Mu et al. // Applied Microbiology and Biotechnology. - 2016. - No. 100(7). - P. 2939-2951.

82. Banerjee, T. Prevalence of Virulence Factors and Drug Resistance in Clinical Isolates of Enterococci: A Study from North India / T. Banerjee, S. Anupurba // Journal of Pathogens. - 2015. - No. 2015. - P. 692612.

83. Bintsis, T. Lactic acid bacteria as starter cultures: An update in their metabolism and genetics / T. Bintsis // AIMS Microbiology. - 2018. - No. 4(4). - P. 665684.

84. Biochemical and genetic characterization of enterocin P, a novel secdepen-dent bacteriocin from Enterococcus faecium P13 with a broad antimicrobial spectrum / L.M. Cintas, P. Casaus, L.S. Havarstein et al. // Applied and Environmental Microbiology. - 1997. - No. 63. - P. 4321-4330.

85. Biofilm formation capacity and presence of virulence factors among commensal Enterococcus spp. from wild birds / D. St^pien-Pysniak, T. Hauschild, U. Kosikowska et al. // Scientific Reports. - 2019. - No. 9(1). - P. 11204.

86. Bio-guided Purification and Mass Spectrometry Characterisation Exploring the Lysozyme-like Protein from Enterococcus lactis Q1, an Unusual Marine Bacterial Strain / O. Ben Braiek, S. Smaoui, Y. Fleury et al. // Biotechnology and Applied Bi o-chemistry. - 2019. - No. 188(1). - P. 43-53.

87. Bolger, A.M. Trimmomatic: a flexible trimmer for Illumina sequence data / A.M. Bolger, M. Lohse, B. Usadel // Bioinformatics. - 2014. - No. 30(15). - P. 21142120.

88. Braiek, O.B. Enterococci: Between Emerging Pathogens and Potential Pro-biotics / O. Ben Braiek, S. Smaoui // Biomed Res Int. - 2019. -doi.org/10.1155/2019/593 8210.

89. Cell-cell communication in sourdough lactic acid bacteria: a proteomic study in Lactobacillus sanfranciscensis CB1 / R.D. Cagno, M. De Angelis, A. Limitone et al. // Proteomics. - 2007. - No. 7(14). - P. 2430-2446.

90. Centeno, J.A. Main microbial flora present as natural starters in Cebreiro raw cow's-milk cheese (northwest Spain) / J.A. Centeno, S. Menéndez, J.L. Rodríguez-Otero // International Journal of Food Microbiology. - 1996. - No. 33(2-3). - P. 307313.

91. Changes in intestinal microflora in digestive tract diseases during pregnancy / M. Jin, D. Li, R. Ji et al. // Archives of Gynecology and Obstetrics. - 2020. -No. 301(1). - P. 243-249.

92. Characterization and partial purification of a broad spectrum antibiotic AS-48 produced by Streptococcus faecalis / A. Gálvez, M. Maqueda, E. Valdivia et al. // Canadian Journal of Microbiology. - 1986. - No. 32(10). - P. 765-771.

93. Characterization of Enterococcus durans 152 bacteriocins and their inhibition of Listeria monocytogenes in ham / L. Du, F. Liu, P. Zhao et al. // Food microbiology. - 2017. - No. 68. - P. 97-103.

94. Characterization of the bacteriocin produced by Enterococcus italicus ONU547 isolated from Thai fermented cabbage / A. Merlich, M. Galkin, Y. Choiset et al. // Folia Microbiologica. - 2019. - No. 64(4). - P. 535-545.

95. Chen, H. Bacteriocins and their food applications / H. Chen, D.G. Hoover // Comprehensive Reviews in Food Science and Food Safety. - 2003. - No. 2. - P. 82-100.

96. Competitive interactions in Escherichia coli populations: the role of bacte-riocins / H. Majeed, O. Gillor, B. Kerr et al. // The ISME Journal. - 2011. - No. 5(1). -P. 71-81.

97. Cotter P.D. Bacteriocins: developing innate immunity for food / P.D. Cotter, C. Hill, R.P. Ross // Nature Rev Microbiol. - 2005. - No. 3. - P. 777-788.

98. Cox C.R. Enterococcal cytolysin: a novel two component peptide system that serves as a bacterial defense against eukaryotic and prokaryotic cells / C.R. Cox, P.S. Coburn, M.S. Gilmore // Current Protein & Peptide Science. - 2005. - No. 6(1). -P. 77-84.

99. Crucial role for central carbon metabolism in the bacterial L-form switch and killing by ß-lactam antibiotics / Y. Kawai, R. Mercier, K. Mickiewicz et al. // Nature Microbiology. - 2019. - No. 4(10). - P. 1716-1726.

100. Detoxification of aflatoxin B1 and patulin by Enterococcus faecium strains / A. Topcu, T. Bulat, R. Wishah et al. // International Journal of Food Microbiology. - 2010. - No. 139(3). - P. 202-205.

101. Diversity of enterococcal bacteriocins and their grouping in a new classification scheme / C.M. Franz, M.J. Van Belkum, W.H. Holzapfel et al. // FEMS Microbiology Reviews. - 2007. - No. 31(3). - P. 293-310.

102. Divya, J.B. Newly isolated lactic acid bacteria with probiotic features for potential application in food industry / J.B. Divya, K.K. Varsha, K.M. Nampoothiri // Biotechnology and Applied Biochemistry. - 2012. - No. 167(5). - P. 1314-1324.

103. Dündar, H. Bacteriocinogenic Potential of Enterococcus faecium Isolated from Wine / H. Dündar // Probiotics and Antimicrobial Proteins. - 2016. - No. 8(3). -P. 150-160.

104. Easy and rapid purification of highly active nisin / A. Abts, A. Mavaro, J. Stindt et al. // International Journal of Peptides. - 2011. - No. 2011. - P. 1-9.

105. Effect of dietary supplementation with a probiotic (Enterococcusfaecium) on production performance, excreta microflora, ammonia emission, and nutrient utilization in ISA brown laying hens / J.W. Park, J.S. Jeong, S.I. Lee et al. // Poultry Science. - 2016. - No. 12. - P. 2829-2835.

106. Effects of a probiotic, Enterococcus faecium, on growth performance, intestinal morphology, immune response, and cecal microflora in broiler chickens chal-

lenged with Escherichia coli K88 / G.T. Cao, X.F. Zeng, A.G. Chen et al. // Poultry Science. - 2013. - No. 92(11). - P. 2949-2955.

107. Effects of Clostridium butyricum and Enterococcus faecium on growth performance, lipid metabolism, and cecal microbiota of broiler chickens / X. Zhao, Y. Guo, S. Guo et al. // Applied Microbiology and Biotechnology. - 2013. - No. 97. - P. 64776488.

108. Effects of dietary supplementation of microencapsulated Enterococcusfae-calis and the extract of Camellia oleifera seed on laying performance, egg quality, serum biochemical parameters, and cecal microflora diversity in laying hens / D. Song, Y.W. Wang, Z.X. Lu et al. // Poultry Science. - 2019. - No. 7. - P. 2880-2887.

109. Effects of Enterococcus faecium M 74 strain on selected blood and production parameters of laying hens / M. Capcarova, L. Chmelnicna, A. Kolesarova et al. // British Poultry Science. - 2010. - No 51(5). - P. 614-620.

110. Effects of microencapsulated Enterococcus faecalis CG1.0007 on growth performance, antioxidation activity, and intestinal microbiota in broiler chickens / W. Han, X.L. Zhang, D.W. Wang et al. // Journal of Animal Science. - 2013. -No. 91(9). - P. 4374-4382.

111. Efficient Inactivation of Multi-Antibiotics Resistant Nosocomial Entero-cocci by Purified Hiracin Bacteriocin / M. Hassan, D.A. Brede, D.B. Diep et al. // Advanced Pharmaceutical Bulletin. - 2015. - No. 5(3). - P. 393-401.

112. Egg Production in Poultry Farming Is Improved by Probiotic Bacteria / J.M. Peralta-Sanchez, A.M. Martin-Platero, M. Martinez-Bueno et al. // Frontiers in Microbiology. - 2019. - No. 10. - P. 1042.

113. Enterococcal isolates from bovine subclinical and clinical mastitis: Antimicrobial resistance and integron-gene cassette distribution / X. Gao, C. Fan, Z. Zhang et al. // Microbial Pathogenesis. - 2019. - No. 129. - P. 82-87.

114. Enterococci as probiotics and their implications in food safety / C.M. Franz, M. Huch, H. Abriouel et al. // International Journal of Food Microbiology. - 2011. - No. 151(2). - P. 125-140.

115. Enterococci, from Harmless Bacteria to a Pathogen / S. Ramos, V. Silva, M. de L.E. Dapkevicius et al. // Microorganisms. - 2020. - No. 8(8). - P. 1118.

116. Enterococcus crotali sp. nov., isolated from faecal material of a timber rattlesnake / R.W. McLaughlin, P.L. Shewmaker, A.M. Whitney et al. // International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology. - 2017. - No. 67 (6). - P. 19841989.

117. Enterococcus faecalis constitutes an unusual bacterial model in lysozyme resistance / L. Hébert, P. Courtin, R. Torelli et al. // Infection and Immunity. - 2007. -No. 75(11). - P. 5390-5398.

118. Enterococcus faecalis bacteriocin EntV inhibits hyphal morphogenesis, biofilm formation, and virulence of Candida albicans / C.E. Graham, M.R. Cruz, D.A. Garsin et al. // Proceedings of the National Academy of Sciences USA. -2017. - No. 114(17). - P. 4507-4512.

119. Enterococcus faecium and Enterococcus durans isolated from cheese: Survival in the presence of medications under simulated gastrointestinal conditions and adhesion properties / D.M.F. Amaral, L.F. Silva, S.N. Casarotti et al. // American Dairy Science Association. - 2017. - No. 2. - P. 933-949.

120. Enterococcus faecium NCIMB 10415 Supplementation Improves the Meat Quality and Antioxidant Capacity of Muscle of Broilers / L. Yu, Z. Peng, L. Dong et al. // Journal of Animal Physiology and Animal Nutrition. - 2019. - No. 103(4). -P. 1099-1106.

121. Enterococcus faecium secreted antigen A generates muropeptides to enhance host immunity and limit bacterial pathogenesis / B. Kim, Y.C. Wang, C.W. Hespen et al. // eLife. - 2019. - No. 8.

122. Enterococcus faecium SF68 as a model for efficacy and safety evaluation of pharmaceutical probiotics / W. Holzapfel, A. Arini, M. Aeschbacher et al. // Beneficial Microbes. - 2018. - No. 9(3). - P. 375-388.

123. Enterococcus faecium SF68 enhances the immune response to Giardia intestinalis in mice / J. Benyacoub, P.F. Pérez, F. Rochat et al. // Journal of Nutrition. -2005. - No. 135(5). - P. 1171-1176.

124. Enterococcus wangshanyuanii sp. nov., isolated from faeces of yaks (Bos grunniens) / D. Jin, J. Yang, S. Lu et al. // International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology. - 2017. - No. 67 (12). - P. 5216-5221.

125. Environmental and Animal-Associated Enterococci / C. Staley, G.M. Dunny, M.J. Sadowsky // Advances in Applied Microbiology. - 2014. - No. 87. -P. 147-186.

126. Evaluation of the efficacy of a probiotic containing Lactobacillus, Bifido-bacterium, Enterococcus and Pediococcus strain in promoting broiler perfomance and modulating cecal microflora composition and metabolic activites / K.C. Mountzouris, P. Tsistsikos, E. Kalamara et al. // Poultry Science. - 2007. - Vol. 86. - P. 309-317.

127. Expression in eukaryotic cells and purification of synthetic gene encoding enterocin P: a bacteriocin with broad antimicrobial spectrum / A. Tanhaeian, M.S. Damavandi, D. Mansury et al. // AMB Express. - 2019. - No. 9. - P. 6.

128. Extracellular gelatinase of Enterococcus faecalis destroys a defense system in insect hemolymph and human serum / S.Y. Park, K.M. Kim, J.H. Lee et al. // Infection and Immunity. - 2007. - No. 75(4). - P. 1861-1869.

129. Facklam, R.R. Enterococcus / R.R. Facklam, M.G. Carvalho, L.M. Teixeira // Washington, DC: ASM Press, 2002. - 54 p.

130. Fijan, S. Microorganisms with Claimed Probiotic Properties: An Overview of Recent Literature / S.Fijan, B.L. Hollenbeck, L.B. Rice // International Journal of Environmental Research and Public Health. - 2014. - No. 11(5). - P. 4745-4767.

131. Fisher, K. The ecology, epidemiology and virulence of Enterococcus / K. Fisher, C. Phillips // Microbiology. - 2009. - No. 155. - P. 1749-1757.

132. Flemming, H.-C. The biofilm matrix / H.-C. Flemming, J. Wingender / Nature Reviews Microbiology. - 2010. - No. 8(9). - P. 623-633.

133. Garcia-Solache M. The Enterococcus: a Model of Adaptability to its Environment / M. Garcia-Solache, L.B. Rice // Clinical Microbiology Reviews. - 2019. -No. 32(2). - P. 1-28.

134. Genetic Diversity among Enterococcus faecalis / S.M. McBride, V.A. Fischetti, D.J. LeBlanc et al. // PLoS One. - 2007. - No. 2(7). - P. e582.

135. Genetic identification of the bacteriocins produced by Enterococcus fae-cium IT62 and evidence that bacteriocin 32 is identical to enterocin IT / E. Izquierdo, Y. Cai, E. Marchioni et al. // Antimicrobial Agents and Chemotherapy. - 2009. -No. 53(5). - P. 1907-1911.

136. Ghrairi, T. Enhanced bactericidal effect of enterocin A in combination with thyme essential oils against L. monocytogenes and E. coli O157:H7 / T. Ghrairi, K. Hani // Journal of Food Science and Technology. - 2015. - No. 52(4). - P. 21482156.

137. Gillor, O. Persistence of colicinogenic Escherichia coli in the mouse gastrointestinal tract / O.Gillor, I. Giladi, M.A. Riley // BMC Microbiology. - 2009. -No. 9. - P. 165.

138. Gobbetti, M. Cell-cell communication in food related bacteria / M. Gobbet-ti, M. De Angelis, R.D. Cagno // International Journal of Food Microbiology. - 2007. -No. 120(1-2). - P. 34-45.

139. Graham, K. Safety, beneficial and technological properties of enterococci for use in functional food applications - a review / K. Graham, H. Stack, R. Rea // Critical Reviews in Food Science and Nutrition. - 2020. - No. 10. - P. 1-26.

140. Growth and adhesion of Enterococcus faecium L-forms / J. Jass, L.E. Phillips, E.J. Allan et al. // FEMS Microbiology Letters. - 1994. - No. 115 (2-3). -P. 157-162.

141. Gupta, V. Probiotics / V. Gupta, R. Garg // Indian Journal of Medical Microbiology. - 2009. - No. 27(3). - P. 202-209.

142. Host Responses to Biofilm / C. Watters, D. Fleming, D. Bishop et al. // Progress in Molecular Biology and Translational Science. - 2016. - No. 142. - P.193-239.

143. Ike, Y. Pathogenicity of Enterococci / Y. Ike // Nihon saikingaku zasshi. Japanese journal of bacteriology. - 2017. - No. 72(2). - P. 189-211.

144. In vitro synergism and anti-biofilm activity of ampicillin, gentamicin, cef-taroline and ceftriaxone against Enterococcus faecalis / L. Thieme, M. Klinger-Strobel, A. Hartung et al. // Journal of Antimicrobial Chemotherapy. - 2018. - No. 73(6). - P. 1553-1561.

145. Inoue, T. Bac 32, a Novel Bacteriocin Widely Disseminated among Clinical Isolates of Enterococcus faecium / T. Inoue, H. Tomita, Y. Ike // Antimicrobial Agents and Chemotherapy. - 2006. - No. 50(4). - P. 1202-1212.

146. Isolation and biochemical characterization of enterocins produced by enterococci from different sources / M.R. Foulquie Moreno, R. Callewaert, B. Devreese et al. // Journal of Applied Microbiology. - 2003. - No. 94. - P. 214-229.

147. Isolation and characterization of enterocin W, a novel two-peptide lantibi-otic produced by Enterococcus faecalis NKR-4-1 / N. Sawa, P. Wilaipun, S. Kinoshita et al. // Applied and Environmental Microbiology. - 2012. - No. 78(3). - P. 900-903.

148. Isolation, characterization, and assessment of lactic acid bacteria toward their selection as poultry probiotics / R.C. Reuben, P.C. Roy, I.K Jahid et al. // BMC Microbiology. - 2019. - No. 19. - P. 253-273.

149. Kendall, A.I. Micrococcus Ovalis: LXX. Studies in Bacterial Metabolism / A.I. Kendall, R.C. Haner // The Journal of Infectious Diseases. - 1924. - No. 1. -Vol. 35. - P. 67-76.

150. King, J.R. Induction of Enterococcal L-Forms by the Action of Lysozyme / J.R. King, H. Gooder // Journal of Bacteriology. - 1970. - No. 103(3). - P. 686-691.

151. Klaenhammer T.R. Bacteriocins of lactic acid bacteria / T.R. Klaenham-mer // Biochimie. - 1988. - No. 70(3). - P. 337-349.

152. Krulwich, T.A. Molecular aspects of bacterial pH sensing and homeostasis / T.A. Krulwich, G. Sachs, E. Padan // Nature Reviews Microbiology. - 2011. -No. 9(5). - P. 330-343.

153. Lactobacillus cultures on growth performance, abdominal fat deposition, serum lipids and weight of organs of broiler chickens / R. Kalavathy, N. Abdullah, S. Jalaludin et al. // British Poultry Science. - 2003. - No. 44(1). - P. 139-144.

154. Lancefield, R.C. A serological differentiation of human and other groups of hemolytic streptococci / R.C. Lancefield // J.Exp. Med. - 1933. - Vol. 57. - No. 4. -P. 571-595.

155. Laukova A. Antagonistic effect of enterocin CCM 4231 from Enterococcus faecium on "bryndza", a traditional Slovak dairy product from sheep milk / A. Laukova, S. Czikkova // Microbiological Research. - 2001. - No. 156(1). - P. 31-34.

156. Madej, J.P. M. Effect of in ovo delivered prebiotics and synbiotics on lym-phoid-organs' morphology in chickens / J.P. Madej, T. Stefaniak, M. Bednarczyk // Poultry Science. - 2015. - No. 94(6). - P. 1209-1219.

157. Model systems for the study of Enterococcal colonization and infection / H.M. Sharon Goh, M.H. Adeline Yong, K.K. Long Chong et al. // Virulence. - 2017. -No. 8(8). - P. 1525-1562.

158. Modulation of vaccine re-sponse by concomitant probiotic administration / C. Maidens, C. Childs, A. Przemska et al. // British Journal of Clinical Pharmacology. -2013. - No. 75(3). - P. 663-670.

159. Mokoena, M.P. Lactic Acid Bacteria and Their Bacteriocins: Classification, Biosynthesis and Applications against Uropathogens: A Mini-Review / M.P. Mokoena // Molecules. - 2017. - No. 22(8). - P. 1255.

160. Novel vitamin B12-producing Enterococcus spp. and preliminary in vitro evaluation of probiotic potentials / P. Li, Q. Gu, Y. Wang et al. // Applied Microbiology and Biotechnology. - 2017. - No. 101(15). - P. 6155-6164.

161. Occurrence of Enterococci in Mastitic Cow's Milk and their Antimicrobial Resistance / H. Rózanska, A. Lewtak-Pilat, M. Kubajka et al. // Journal of Veterinary Research. - 2019. - No. 63(1). - P. 93-97.

162. Oldak, A. Bacteriocins from lactic acid bacteria as an alternative to antibiotics / A. Oldak, D. Zielinska // Postepy Hig Med Dosw (Online). - 2017. - No. 71(0). -P. 328-338.

163. Ooi, L.G. Cholesterol-lowering effects of probiotics and prebiotics: a review of in vivo and in vitro findings / L.G. Ooi, M.T. Liong // International Journal of Molecular Sciences. - 2010. - No. 11. - P. 2499-2522.

164. Oscáriz, J.C. Classification and mode of action of membrane-active bacteriocins produced by gram-positive bacteria / J.C. Oscáriz, A.G. Pisabarro // International Microbiology. - 2001. - No. 4(1). - P. 13-19.

165. Pediocin-like bacteriocins: new perspectives on mechanism of action and immunity / N.S. Ríos Colombo, M.C. Chalón, S.A. Navarro et al. // Current Genetics. -2018. - No. 64(2). - P. 345-351.

166. Pharmaceutical Production of Anti-tumor and Immune-potentiating Enterococcus faecalis-2001 P-glucans: Enhanced Activity of Macrophage and Lymphocytes in Tumor-implanted Mice / Y.H. Gu, H. Choi, T. Yamashita et al. // Current Pharmaceutical Biotechnology. - 2017. - No. 18(8). - P. 653-661.

167. Potential Evaluation and Health Fostering Intrinsic Traits of Novel Probiotic Strain Enterococcus durans F3 Isolated from the Gut of Fresh Water Fish Catla catla

/ E. Alshammari, M. Patel, M. Sachidanandan et al. // Food Science of Animal Resources. - 2019. - No. 39(5). - P. 844-861.

168. Pretreatment with Probiotic Enterococcus faecium NCIMB 11181 Ameliorates Necrotic Enteritis-Induced Intestinal Barrier Injury in Broiler Chickens / Y. Wu, W. Zhen, Y. Geng et al. // Scientific Reports. - 2019. - No. 9(1). - P. 10256.

169. Probiotic and Safety Properties Screening of Enterococcus faecalis from Healthy Chinese Infants / J. Wang, R. Da, X. Tuo et al. // Probiotics and Antimicrobial Proteins. - 2019. doi.org/10.1007/s12602-019-09625-7.

170. Probiotic Enterococcus faecalis Symbioflor® down regulates virulence genes of EHEC in vitro and decrease pathogenicity in a Caenorhabditis elegans model / K. Neuhaus, M.C. Lamparter, B. Zölch et al. // Archives of Microbiology. - 2017. -No. 199(2). - P. 203-213.

171. Probiotic properties and adsorption of Enterococcus faecalis PSCT3-7 to vermiculite / J. Kim, E.G. Awji, S. Park et al. // The Journal of Veterinary Science. -2017. - No. 18(1). - P. 95-99.

172. Probiotic Properties of Enterococcus Isolated From Artisanal Dairy Products / Y. Nami, R.V. Bakhshayesh, M.A. Hejazi et al. // Frontiers in Microbiology. -2019. - No. 10. - P. 30-43.

173. Probiotic Species in the Modulation of Gut Microbiota: An Overview / M.A.K. Azad, M. Sarker, J. Yin et al. // Biomed Research International. - 2018. -No. 2. - P. 1-8.

174. Probiotic supplementation improves reproductive performance of unvacci-nated farmed sows infected with porcine epidemic diarrhea virus / T. Tsukahara, T. Inatomi, K. Otomaru et al. // Animal Science Journal. - 2018. - No. 89(8). - P. 11441151.

175. Production of class II bacteriocins by lactic acid bacteria; an example of biological warfare and communication / V.G. Eijsink, L. Axelsson, D.B. Diep et al. // Antonie Van Leeuwenhoek. - 2002. -No. 81 (1-4). - P. 639-654.

176. Properties of Labneh-Like Product Manufactured Using Enterococcus Starter Cultures as Novel Dairy Fermentation Bacteria / Y.A. El-Samragy, E.O. Fayed, A.A. Aly et al. // Journal of Food Protection. - 1988. - No. 51(5). - P. 386-390.

177. Proteomic Study of Enterococcus Durans LAB18S Growing on Prebiotic Oligosaccharides / C.B. Comerlato, A.C. Ritter, K.N. Miyamoto et al. // PLoS ONE. -2020. - No. 89. - P. 103-119.

178. Purification and Characterization of Bacteriocin Produced by a Strain of Enterococcus faecalis TG2 / Q. Xi, J. Wang, R. Du et al. // Biotechnology and Applied Biochemistry. - 2018. - No. 184(4). - P. 1106-1119.

179. Purification, characterization and mode of action of enterocin, a novel bacteriocin produced by Enterococcus faecium TJUQ1 / X. Qiao, R. Du, Y. Wang et al. // International Journal of Biological Macromolecules. - 2020. - No. 144. - P. 151-159.

180. Reduction of Salmonella in gnotobiotic Japanese quails caused by the enterocin A-producing EK13 strain of Enterococcus faecium / A. Lauková, P. Guba, R. Nemcová et al. // Veterinary Research Communications. - 2003. - No. 27(4). -P. 275-280.

181. Resistance to ß-lactams in enterococci / P. Gagetti, L. Bonofiglio, G. García Gabarrot et al. // Revista Argentina de Microbiología. - 2019. - No. 51(2). - P. 179-183.

182. Review - Lactic acid bacteria in traditional fermented Asian foods / M. Azam, M. Mohsin, H. Ijaz et al. // Pakistan Journal of Pharmaceutical Sciences. -2017. - No. 30(5). - P. 1803-1814.

183. Riley, M.A. Bacteriocin diversity: ecological and evolutionary perspectives / M.A. Riley, J.E. Wertz // Biochimie. - 2002. - No. 84(5-6). - P. 357-364.

184. Safety, potential biotechnological and probiotic properties of bacteriocino-genic Enterococcus lactis strains isolated from raw shrimps / O. Ben Braïek, S. Morandi, P. Cremonesi et al. // Microbial Pathogenesis. - 2018. - No. 117. - P. 109117.

185. Schleifer, K.H. Transfer of Streptococcus faecalis and Streptococcus fae-cium to the Genus Enterococcus nom. rev. as Enterococcus faecalis comb. nov. and En-terococcus faecium comb. nov. / K.H. Schleifer, R. Kilpper-Balz // International journal of systematic bacteriology. - 1984. - No. 1. - Vol. 34. - P. 31-34.

186. Screening of the Enterocin-Encoding Genes and Their Genetic Determinism in the Bacteriocinogenic Enterococcus faecium GHB21 / M. Merzoug, K. Mosbahi, D.Walker et al. // Probiotics and Antimicrobial Proteins. - 2019. - No. 11(1). - P. 325331.

187. Selleck, E.M. Pathogenicity of Enterococci / E.M. Selleck, D.V. Tyne, M.S. Gilmore // Microbiology spectrum. - 2019. - No. 7(4). - doi: 10.1128/microbiolspec.GPP3-0053-2018.

188. Sheoran, P. Anti-staphylococcal activity of bacteriocins of food isolates Enterococcus hirae LD3 and Lactobacillus plantarum LD4 in pasteurized milk / P. Sheoran, S.K. Tiwari // 3 Biotech. - 2019. - No. 9(1). - P. 8.

189. Sherman, J.M. The streptococci / J.M. Sherman // Bacteriol Rev. - 1937. -No. 1(1). - P. 3-97.

190. Genetics of bacteriocin production in lactic acid bacteria / M. Skaugen, L.M. Cintas, I.F. Nes et al. // Springer US. - 2003. - P. 225-260.

191. Slawinska, A. Effects of synbiotics injected in ovo on regulation of immune-related gene expression in adult chickens / A. Slawinska, M. Siwek, M. Bednarc-zyk // American Journal of Veterinary Research. - 2014. - No. 75. - P. 997-1003.

192. SPAdes: a new genome assembly algorithm and its applications to single-cell sequencing / A. Bankevich, S. Nurk, D. Antipov et al. // Journal of Computational Biology. - 2012. - No. 19(5). - P. 455-477.

193. Species distribution, antibiotic resistance and virulence traits in canine and feline enterococci in Tunisia / L. Ben Said, R. Dziri, N. Sassi et al. // Acta Veterinaria Hungarica. - 2017. - No. 65(2). - P. 173-184.

194. Stanley, D. Microbiota of the chicken gastrointestinal tract: influence on health, productivity and disease / D. Stanley, R.J. Hughes, R.J Moore // Appl. Microbiol. Biotechnol. - 2014. - No. 98. - P. 4301-4309.

195. Stewart, P.S. Antibiotic resistance of bacteria in biofilms / P.S. Stewart, J.W. Costerton // Lancet. - 2001. - No. 358(9276). - P.135-138.

196. Strompfova, V. Enterococci from Piglets - Probiotic Properties and Responsiveness to Natural Antibacterial Substances / V. Strompfova, A. Laukova // Folia Microbiol. - 2009. - Vol. 54. - No. 6. - P. 538-544.

197. Systematic review: human gut dysbiosis induced by non-antibiotic prescription medications / Q.L. Bastard, G.A. Al-Ghalith, M. Grégoire et al. // Alimentary Pharmacology & Therapeutics. - 2018. - No. 47(3). - P. 332-345.

198. Technological, functional and safety aspects of enterococci in fermented vegetable products: a mini-review / S. M'hir, F. Minervini, R. Di Cagno et al. // Annals of Microbiology. - 2012. - No. 62. - P. 469-481.

199. The Genus Enterococcus: Between Probiotic Potential and Safety Concerns - An Update / H. Hanchi, W. Mottawea, K. Sebei et al. // Frontiers in Microbiology. - 2018. - No. 9. - P. 1791.

200. The impact of dietary supplementation of different feed additives on performances of broiler breeders characterized by different egg-laying rate / S. Zhao, K. Zhang, X. Ding et al. // Poultry Science. - 2019. - No. 11. - P. 6091-6099.

201. The lysozyme-induced peptidoglycan N-acetylglucosamine deacetylase PgdA (EF1843) is required for Enterococcus faecalis virulence / A. Benachour, R. Lad-jouzi, A. Le Jeune et al. // Journal of Bacteriology. - 2012. - No. 194(22). - P. 60666073.

202. The Role and Application of Enterococci in Food and Health / M.R. Foulquié Moreno, P. Sarantinopoulos, E. Tsakalidou et al. // International Journal of Food Microbiology. - 2006. - No. 106(1). - P. 1-24.

203. Thiercelin, M.E. Sur un diplocoque saprophyte de l'intestin susceptible de devenir pathogène / M.E. Thiercelin // Séances Société Biologie. - 1899. - No. 5. -P. 269-271.

204. Thurlow, L.R. Capsular Polysaccharide Production in Enterococcus faeca-lis and Contribution of CpsF to Capsule Serospecificity / L.R. Thurlow, V.C. Thomas, L.E. Hancock // Journal of Bacteriology. - 2009. - No. 191(20). - P. 6203-6210.

205. Tyne, D.V. Friend Turned Foe: Evolution of Enterococcal Virulence and Antibiotic Resistance / D.V. Tyne, M.S. Gilmore // Annual Review of Microbiology. -2014. - No. 68. - P. 337-356.

206. Tyne, D.V. Structure, Function, and Biology of the Enterococcus faecalis Cytolysin / D.V. Tyne, M.J. Martin, M.S. Gilmore // Toxins. - 2013. - No. 5(5). -P. 895-911.

207. Urinary tract infections: epidemiology, mechanisms of infection and treatment options / A.L. Flores-Mireles, J.N. Walker, M. Caparon et al. // Nature Reviews Microbiology. - 2015. - No. 13(5). - P. 269-284.

208. Vancomycin resistant Enterococci: A brief review / T. Raza, S.R. Ullah, K. Mehmood et al. // JPMA. - 2018. - No. 5. - P. 768-772.

209. Virulence traits and antibiotic resistance among enterococci isolated from dogs with periodontal disease / M. Oliveira, M. Tavares, D. Gomes et al. // Comparative Immunology, Microbiology and Infectious Diseases. - 2016. - No. 46. - P. 27-31.

210. Zhang, Z.F. Effects of probiotic supplementation in different energy and nutrient density diets on performance, egg quality, excreta microflora, excreta noxious gas emission, and serum cholesterol concentrations in laying hens / Z.F Zhang, I.H. Kim // Journal of Animal Science. - 2013. - No. 10. - P. 4781-4787.

211. Zheng, S. Diversified transporters and pathways for bacteriocin secretion in gram-positive bacteria / S. Zheng, K. Sonomoto // Applied Microbiology and Biotechnology. - 2018. - No. 102(10). - P. 4243-4253.

212. Zielinska, D. Food-Origin Lactic Acid Bacteria May Exhibit Probiotic Properties: Review / D. Zielinska, D. Kolozyn-Krajewska // BioMed Research International. - 2018. - No. 2018. - P. 1-15.

213. Zimmermann, P. The influence of probiotics on vaccine responses - A systematic review / P. Zimmermann, N. Curtis // Vaccine. - 2018. - No. 4. - Vol. 36(2). -P. 207-213.

Russian Collection of Agricultural Microorganisms

министерство науки и высшего образования российской федерации Федеральное государственное бюджетное научное учреждение «Всероссийский научно-исследовательский институт сельскохозяйственной микробиологии» __(фгбнувниисхм)

196608 Санкт-Петербург. Пушкин, шоссе Подбельского. 3 Телефон [phone] -<Ю

Выдано в ФГБОУ ВО «Оренбургский государственный аграрный университет»

СПРАВКА

о депонировании культуры микроорганизмов в Ведомственной коллекции полезных микроорганизмов сельскохозяйственного назначения

(RCAM)

1 .Депозитор: Федеральное государственное бюджетное образовательное учреждение высшего образования «Оренбургский государственный аграрный университет» (ФГБОУ ВО Оренбургский ГАУ), 460014 г. Оренбург, ул. Челюскинцев, д. 18.

2.Авторы: Сычева М.В., Карташова О.Л., Кочкина Е.Е.

3.Штамм Enterococciis faecium ICIS 96 проявляет антагонистическую активность в отношении культур escherichia coli, ванкомицин-резистентных штаммов Enierococcus faecal is, бактерий рода Listeria. Депонирован как практически-ценный

4. Штамм Enterococcus faecium ICIS 96 депонирован 13 сентября 2019 г. под регистрационным номером RCAMÖ5I60.

5.Адрес коллекции: 196608, Санкт-Петербург, Пушкин, шоссе Подбельского, д. 3, ФГБНУ ВНИИСХМ: тел. [phone], факс[phone]. e-mail: v.safronovafiÄrambler.ru. сайт: http: • www.arnain.ru

Директор ФГБНУ ВНИИСХМ, д.б.н. Заведующая RCAM, к.б.н

H.A. Проворов В.И.Сафронова

о

ПРИЛОЖЕНИЕ Д