Выделение и идентификация нетуберкулезных микобактерий у пациентов фтизиатрических учреждений тема диссертации и автореферата по ВАК РФ 03.02.03, доктор биологических наук Макарова, Марина Витальевна

• Макарова, Марина Витальевна
• доктор биологических наук
• 2010

Оглавление диссертации доктор биологических наук Макарова, Марина Витальевна

ВВЕДЕНИЕ.

ГЛАВА 1. ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ: НЕТУБЕРКУЛЕЗНЫЕ МИ-КОБАКТЕРИИ.

1.1. Классификация, обнаружение в окружающей среде, заражение человека и животных, эпидемиология.

1.2. Патогенность нетуберкулезных микобактерий, пути заражения, роль макроорганизма, виды патологии, вызываемой HTM.

1.3. Выделение, идентификация микобактерий, диагностика микобактериозов.

1.4. Лечение, лекарственная чувствительность.

ГЛАВА 2. МАТЕРИАЛ И МЕТОДЫ.

2.1. Выделение и идентификация микобактерий микробиологическими методами.

2.1.1. Выделение микобактерий.

2.1.2. Первичная идентификация микобактерий кулъту-ралъными методами.

2.1.3. Биохимические методы идентификации, микобактерий

2.2. Высокоэффективная жидкостная хромотография (ВЭЖХ) для видовой идентификации микобактерий-.

2.3. Молекулярно-генетические методы идентификации1 микобактерий

2.3.1. Определение видовой принадлежности микобактерий методом гибридизации на. олигонуклеотидном. микрочипе «IMS».

2.3.2. Определение вида нетуберкулезных микобактерий с помощью оценки полиморфизма длин рестрикци-онных фрагментов (ПДРФ).

2.4. Определение лекарственной чувствительности нетуберкулезных микобактерий.

2.5. Статистическая обработка результатов.

ГЛАВА 3. ВЫДЕЛЕНИЕ НЕТУБЕРКУЛЕЗНЫХ МИКОБАКТЕРИЙ И ИХ. ИДЕНТИФИКАЦИЯ МИКРОБИОЛОГИЧЕСКИМИ МЕТОДАМИ.

3.1. Выделение HTM на разных питательных средах.

3.2. Идентификация видов, HTM, выделенных в Централизованной микробиологической лаборатории МНПЦБТ.

3.3. Микробиологические характеристики отдельных видов нету беркулезных микобактерий.

ГЛАВА 4. ИДЕНТИФИКАЦИЯ МИКОБАКТЕРИЙ МЕТОДОМ ВЫСОКОЭФФЕКТИВНОЙ ЖИДКОСТНОЙ ХРОМАТОГРАФИИ

ГЛАВА 5. ИДЕНТИФИКАЦИЯ МИКОБАКТЕРИЙ МОЛЕКУ-ЛЯРНО-ГЕНЕТИЧЕСКИМИ МЕТОДАМИ.

5.1. Разработка и испытание биологического микрочипа (биочипа) для идентификации HTM.

5.2. Видовая идентификация микобактерий с помощью определения полиморфизма длин рестрикционных фрагментов (ПДРФ) гена hsp

5.3. Сравнительные данные использования «БИОЧИП IMS» и других.методов идентификации HTM.

ГЛАВА 6. ЧАСТОТА ОБНАРУЖЕНИЯ РАЗНЫХ ВИДОВ НЕТУБЕРКУЛЕЗНЫХ МИКОБАКТЕРИЙ В ГОРОДЕ МОСКВЕ И ИХ ЧУВСТВИТЕЛЬНОСТЬ К АНТИБАКТЕРИАЛЬНЫМ ПРЕПАРАТАМ

6.1. «Спектр HTM» в городе Москве. ¡

6.2. Изучение чувствительности нетуберкулезных микобактерий к антибактериальным препаратам.

Введение диссертации (часть автореферата) на тему «Выделение и идентификация нетуберкулезных микобактерий у пациентов фтизиатрических учреждений»

Актуальность проблемы

Нетуберкулезные микобактерии - это микроорганизмы, про которые в начале второй половины XX века хорошо знали микробиологи, а в некоторых странах и клиницисты (вызываемую ими патологию называют микобактериозами). Но затем эта проблема была в значительной степени забыта и вновь приобрела актуальность с распространением ВИЧ-инфекции, поскольку у ВИЧ-инфицированных (особенно на стадии СПИД) часто развиваются микобактериозы, которые в большом числе случаев приводят к летальному исходу [Katoch V., 2004; Khatter S., 2008].

В настоящее время род Mycobacterium включает более 100 видов, й их число продолжает увеличиваться [Euzeby J., 2003; Katoch V., 2004]. Из них наиболее распространены; M tuberculosis и M. leprae, вызывающие у людей хорошо известные заболевания. Несколько видов микобак-терий входят в так называемый М. tuberculosis complex: M. tuberculosis; M. bovis, M. africanum, M. microti, M. canetti, M. caprae, M. pinnipedii. Остальные широко распространены в окружающей среде как сапрофиты, однако в некоторых случаях они могут быть этиологическими факторами тяжелой (вплоть до смертельной) патологии, чаще у людей, имеющих нарушения иммунитета различной природы [Модель JI.M., 1958; Зыков М.П., 1984; Лазовская А.Л., 1991; Оттен Т.Ф., 1994, 1999; Новожилова И.А., 2004; Wolinsky Е., 1979, 1992; Tellis С., Putnam J., 1980; Grange J., Yaters M., 1986; Wallace R. et al., 1990, 1997; Olivier К., 1998; Dawson D.3 2000; Euzeby J., 2003; Heifets L., 2004; Jarzembowski J., Young M., 2008].

He входящие в M. tuberculosis complex микобактерии долгие годы называли микобактериями окружающей среды (enviromental mycobacteria), возбудителями микобактериозов, атипичными микобактериями. Однако, в последние десятилетия большинство микробиологов использует термин «нетуберкулезные микобактерии» (HTM) [Wallace R. et al., 1990, 1997; Dawson D., 2000; Katoch V., Kumar M., 2001; Heifets L.,

2004].

Значительный вклад в изучение нетуберкулезных микобактерий и вызываемой ими патологии внесли отечественные исследователи, работавшие в 50-70 годы XX века: JIM. Модель, М.М. Дыхно, Н.М. Макаре-вич, Н.М. Рудой, Я.А. Благодарный, Т.Б. Яблокова, Т.Б. Ильина, P.O. Драбкина, Ю.К. Вейсфейлер и др. Затем, в течение многих лет исследования в этой области продолжались лишь в некоторых регионах России, в первую очередь, в Санкт-Петербурге [Оттен Т.Ф., Васильев A.B.,

2005].

За это время ситуациям мире резко изменилась, число больных микобактериозами, во многих странах возросло в десятки раз. Это-явилось следствием-увеличения числа лиц с серьезными нарушениями иммунитета" (в первую очередь ВИЧ-инфицированных) [Marras Т., Daley С., 2002; Cole Т. et al., 2005], а также применения новых чувствительных и специфичных методов' выделения и идентификации микобактерий (культивирование в автоматизированных системах с использованием жидких питательных сред, молекулярно-генетические методы и высокоэффективная жидкостная* хроматография - ВЭЖХ), которые позволили существенно ускорить диагностику микобактериозов и повысить ее эффективность [Butler W., Guthertz L., 2001; Fukushima M. et al., 2003; Heifets L., 2004; Shin J. et al., 2009].

Заболевания, вызываемые разными видами HTM, характеризуются сходной с туберкулезом клинико-рентгенологической картиной, но требуют применения схем лечения, отличных от химиотерапии туберкулеза, из-за высокой их резистентности к противотуберкулезным препаратам [Оттен Т.Ф., Васильев A.B., 2005; Cole T.et al., 2005]. Перед мико-бактериологическими лабораториями стоят важные задачи по раннему выявлению и идентификации микобактерий туберкулезного комплекса (МБТ) и нетуберкулезных микобактерий. Это необходимо для своевременного проведения мероприятий по предотвращению распространения инфекции и назначения адекватной терапии.

В зарубежной литературе по данной проблеме в последние годы опубликовано много работ, исследования по изучению HTM и микобак-териозов прогрессируют стремительно [Wallace R. et al., 1990, 1997; Ка-toch V., 2004; Heifets L., 2004; Jarzembowski J., Young M., 2008].

К сожалению, в нашей стране понимание того, насколько важна эта проблема, еще не достигнуто, в абсолютном большинстве регионов отсутствуют также методические возможности, которые позволили бы реально идентифицировать вид нетуберкулезных микобактерий, установить диагноз микобактериоза и назначить своевременное лечение.

Кроме того, в России микобактериозы не считаются самостоятельными заболеваниями, несмотря на то, что они включены в Международную классификацию болезней. В связи с такой ситуацией, врачи не знают особенностей течения и лечения этой патологии, нет специальных курсов обучения, не используются современные методы диагностики микобактериозов. Сегодня даже не ясно, в каких учреждениях следует лечить таких больных. Часто пациенты, страдающие микобактериозами, находятся в одних палатах с больными туберкулезом и могут инфицироваться от них, а возможно и заражать их.

Все вышеизложенное определяет актуальность и необходимость разработки комплекса методов выделения и идентификации HTM с применением всех имеющихся в настоящее время технических возможностей.

Цель исследования

Создание оптимального комплекса выделения и идентификации нетуберкулезных микобактерий (HTM) с использованием разработанных и модифицированных методов, и на этой основе изучение видового состава выделенных HTM и их чувствительности к антибактериальным препаратам.

Задачи исследования

1. Изучить эффективность использования наиболее широко применяющихся в мировой практике питательных сред: плотной яичной Левенштейна-Йенсена, плотной агаровой Миддлбрука 7Н11 и модифицированной жидкой Миддлбрука 7Н9 (в автоматизированной системе ВАСТЕС MGIT 960) для выделения HTM.

2. Провести сравнительный анализ результатов применения для видовой идентификации микобактерий методов высокоэффективной жидкостной хроматографии (ВЭЖХ), оценки полиморфизма длин рестV рикционных фрагментов (ПДРФ) и микробиологических методов.

3. Разработать для видовой идентификации HTM новый молеку-лярно-генетический метод - биологические микрочипы, сопоставить эффективность его использования с результатами, полученными микробиологическими'методами, ПДРФ и ВЭЖХ.

4. На основании результатов сравнительных исследований эффективности различных методов выделения и идентификации HTM разработать оптимальный диагностический комплекс (алгоритм), с его помощью охарактеризовать видовой спектр штаммов HTM, циркулирующих в городе Москве.

5. Проанализировать частоту повторного обнаружения у больных одного и того же вида HTM, как критерия (при наличии клинико-рентгенологических признаков заболевания) развития микобактериоза.

6. Выявить особенности чувствительности к противотуберкулезным и другим антибактериальным препаратам HTM, выделенных из диагностического материала, поступившего в Централизованную микробиологическую лабораторию МНПЦБТ из противотуберкулезных учреждений города Москвы.

Научная новизна исследования

В результате сравнительного изучения эффективности выделения HTM с помощью модифицированной жидкой питательной среды Миддлбрука 7Н9 (в автоматизированной-системе BAGTEC MGIT 960) и плотных — агаровой (Миддлбрука 7Н11) и яичной (Левенштейна-Йенсена) питательных сред, установлено, что наибольшее число мико-. бактерий из клинического материала удается выделить при использовании жидкой питательной среды Миддлбрука 7Н9. При этом срок детекции роста микобактерий в 1,9 раз короче, чем на плотной яичной и в 1,5 раза, чем-.на плотной агаровой среде. Поскольку на плотных питательных средах дополнительно удается; получить до: 10% изолятов, оптимальным для i выделения:- HTM является' комплексное: применение жидкой и одной из плотных (агаровой или яичной) питательных сред.

Выявлено (при.; субкультивировании, на чашках с агаровой средой Миддлбрука 7Н11), что клинические изоляты, выделенные как в жидкой, так и на плотных питательных средах,, могут содержать несколько видов микобактерий.

Впервые для идентификации видов HTM разработан и применен метод биологических микрочипов: поэтапно испытаны несколько модификаций биочипов с последовательным увеличением количества им-мобилизированных в лунках с гелем специфических ол игону к л еотидов. В итоге полученный «БИОЧИП IMS» позволяет идентифицировать 9 видов HTM: М. avium, М. intracellulars; М scrofulaceum, М. kansasii, М. gordonae, М. xenopi, М. marinum, M.fortuitum, М chelonae и дифференцировать их от М. tiiberculosis complex.

При сравнительном изучении эффективности видовой идентифит кации микобактерий с помощью разработанных биочипов, методов .ПДРФ и ВЭЖХ. на большом объеме клинического материала показано, что все эти методы дают сопоставимые результаты с данными микробиологических исследований (не зависящие от того в жидкой или на плотных питательных средах выделены культуры микобактерий), но в значительно более короткие сроки. Дополнительным преимуществом биочипов является автоматизированный учет результатов с помощью программного обеспечения и возможность идентификации микобактерий непосредственно в клиническом материале.

Впервые разработан и обоснован оптимальный комплекс методов (алгоритм) выделения и идентификации HTM, который включает: культивирование биологического материала на двух питательных средах -плотной и жидкой, и идентификацию полученной культуры микобактерий методами ВЭЖХ и/или ПДРФ, либо биологических микрочипов (использование последнего - предпочтительнее).

Впервые с помощью разработанного алгоритма охарактеризован видовой состав HTM, выделенных от больных туберкулезом и лиц с подозрением на туберкулез в городе Москве. С наибольшей частотой среди медленнорастущих HTM из,клинического материала выделяли MAC, М. xenopi и М. kansasii а быстрорастущих - М. fortuitum. Клинические изоляты HTM отличались-высоким уровнем устойчивости как к основным, так и к большинству резервных противотуберкулезных препаратов и чувствительностью к таким- фторхинолонам, как ципрофлоксацин и моксифлоксацин.

Впервые создана коллекция клинических изолятов (548 штаммов) нетуберкулезных микобактерий (относящихся к 14 видам), идентифицированных с помощью микробиологических, молекулярно-генетических методов и ВЭЖХ.

Практическая значимость работы и внедрение результатов в практику

Предложено для эффективного выделения HTM из биологического материала производить его посев на 2 питательные среды: жидкую Миддбрука 7Н9 (в автоматизированной системе ВАСТЕС MGIT 960) и одну из плотных (агаровую или яичную). Субкультивирование на чашках с агаровой средой Миддлбрука 7Н11, выделенных в жидкой и на плотной яичной питательных средах культур, позволяет обнаружить несколько видов микобактерий и изучить их культур ально-морфологические свойства.

Высокая степень совпадения результатов, идентификации микобактерий методом, ВЭЖХ с данными микробиологических исследований, а также возможность идентификации большего числа видов, по сравнению с традиционными микробиологическими методами, определяет целесообразность применения этого метода в бактериологических референс-лабораториях. Важное практическое значение имеет сокращение времени такого исследования до 24-х часов, вместо 3-4-х недель при использовании микробиологических методов.

Результаты видовой идентификации культур HTM с помощью мо-лекулярно-генетических методов (ПДРФ и биологических микрочипов) аналогичным образом? в большинстве случаев' совпадают с данными микробиологических исследований, при- существенном сокращении времени их получения. В связи-с этим, указанные методы' могут быть использованы в лабораторной практике. Преимуществом применения* биочипов является простота метода, возможность.идентификации микобактерий- непосредственно^ В' клиническом, материале* и автоматизированный учет результатов.

При неоднократном обнаружении в материале, полученном от больного, одного* и того же вида HTM, при отсутствии М. tuberculosis и наличии клинико-рентгенологических проявлений заболевания, лечащим врачам в диагностическом ряду следует рассматривать микобакте-риоз.

При проведении химиотерапии микобактериозов следует учитывать, что HTM в большинстве случаев устойчивы к основным и резервным противотуберкулезным препаратам и чувствительны к таким фтор-хинолонам, как ципрофлоксацин и моксифлоксацин.

Создана коллекция, состоящая из 548 клинических изолятов нетуберкулезных микобактерий (относящихся к 14 видам), идентифицированных с помощью микробиологических, молекулярно-генетических методов и ВЭЖХ, которая может быть использована в качестве контрольной при разработке и испытании новых диагностических тест-систем.

Результаты настоящей работы внедрены в практическую деятельность Централизованной микробиологической лаборатории Московского научно-практического центра борьбы с туберкулезом (МНПЦБТ), обслуживающей Центр и противотуберкулезные диспансеры города Моек-, вы. Они вошли в курс лекций и практических занятий на кафедре фти-зиопульмонологии РМАПО Федерального агентства по здравоохранению и социальному развитию.

На основании результатов проведенных исследований составлены и изданы методические рекомендации:

• «Определение вида микобактерий комплексов MAIS и Mycobacterium tuberculosis методом рестрикционного анализа», утвержденные Департаментом здравоохранения города Москвы 07.02.2007;

• «Идентификация микобактерий методом высокоэффективной жидкостной хроматографии», утвержденные Департаментом- здравоохранения города Москвы 21.05.2009;

• «Выделение и идентификация нетуберкулезных микобактерий микробиологическими методами», утвержденные Департаментом здравоохранения города Москвы 21.05.2009г.

Основные положения, выносимые на защиту

1. Использование модифицированной жидкой питательной среды Миддлбрука 7Н9 (в автоматизированной системе ВАСТЕС MGIT 960) в сочетании с одной из плотных (агаровой или яичной) питательных сред является оптимальным для выделения HTM из клинического материала.

2. Разработанный, путем поэтапного анализа различных модификаций с увеличением количества специфических олигонуклеотидов, им-мобилизированных в лунках с гелем, метод биологических микрочипов (БИОЧИП «IMS») является достоверным, простым и быстрым методом идентификации микобактерий видов: М. avium, М. intracellulars, М. scrofiilaceum, М. kansasii, М. gordonae, М. xeriopi, М. marinum, М. fortui-tum, М. chelonae и дифференциации их от М. tuberculosis complex.

3. Анализ сравнительного изучения эффективности видовой идентификации микобактерий с помощью биочипов, оценки ПДРФ, ВЭЖХ и микробиологических методов, показал, что все они дают сопоставимые результаты. При этом ВЭЖХ и молекулярно-генетические тесты характеризуются более высокой специфичностью и скоростью получения результатов, а преимуществом биочипов также является автоматизированный учет с помощью программного обеспечения и возможность идентификации микобактерий непосредственно в клиническом материале.

4. Разработан алгоритм выделения и идентификации HTM, применение которого в лабораторной практике позволит улучшить диагностику микобактериозов. Он включает: культивирование биологического материала на двух питательных средах (жидкой и плотной); идентификацию выделенной культуры микобактерий методом ВЭЖХ и/или одним из молекулярно-генетических методов (ПДРФ и БИОЧИП-IMS); субкультивирование на чашках с агаровой средой 7Н11 для обнаружения смешанных культур микобактерий и проведения (в случаях необходимости) идентификации вида микробиологическими методами.

5. При использовании предложенного алгоритма выделения и идентификации HTM охарактеризован их видовой состав в городе Москве: с наибольшей частотой из медленнорастущих HTM в клиническом материале обнаружены MAC, М. kansasii и М. xenopi, а из быстрорастущих - М. fortuitum. Неоднократное обнаружение в диагностическом материале, полученном от больного, одного и того же вида HTM (при отсутствии М. tuberculosis и наличии соответствующей клинико-рентгенологической симптоматики) дает основание для рассмотрения в диагностическом ряду микобактериоза.

6. HTM, выделенные от больных туберкулезом и лиц с подозрением на туберкулез в городе Москве, отличаются высоким уровнем устойчивости как к основным, так и резервным противотуберкулезным препаратам, и в большинстве случаев чувствительны к таким фторхинолонам, как ципрофлоксацин и моксифлоксацин.

Апробация работы

Материалы диссертации представлены на научных форумах^ всероссийского и международного уровней, включая научно-практические; конференции и заседания Ученого* совета МНПЦБТ, 8-й Российский) съезд фтизиатров. (Москва, 2007 г.), Всероссийскую научно-практическую конференцию «Актуальные вопросы лечения туберкулеза различных локализаций» (Санкт-Петербург, 2008 г.),. 4-й конгресс ЕвроАзиатского респираторного обществами 5-й Международный конгресс; пульмонологов. Центральной Азии (Ташкент, 2008 г.), 7-ю и. 8-ю Московские Ассамблеи«Здоровьс Столицы» в.2008. г. и 2009 г., Европейские респираторнью конгрессы«(Берлин!2008¿г.,'Венш 2009> г.); 5-й. конгресс Международного противотуберкулезного союза (Дубровник 2009 г.).

Публикации !

По теме, диссертации опубликовано- 28 работ, в том числе одна книга, 9 статей в изданиях, рекомендованных ВАК Минобразования РФ.

Структура и объем-диссертации

Заключение диссертации по теме «Микробиология», Макарова, Марина Витальевна

ВЫВОДЫ

1. Установлено, что нетуберкулезные микобактерии в последние годы с возрастающей частотой обнаруживаются в клиническом материале, полученном от больных туберкулезом и лиц с подозрением на туберкулез. В результате культурального исследования 163766 образцов такого материала, поступившего из противотуберкулезных учреждений, города Москвы за период с января 2006 по ноябрь 2009гг., было получено 13784 изолятов микобактерий, из них к HTM отнесены - 720 (5,2 %) культуры. При этом если в 2006 г. выделено 88 (2,5%), в 2007 г. - 90 (2,7%), то в 2008 г. - 278 (7,5%) и за 10 месяцев 2009 года - 264 (8,0%) изолятов HTM (от общего числа выделенных микобактерий).

2. Наибольшее число HTM из клинического материала удается выделить при использовании модифицированной жидкой среды Мидд-лбрука 7Н9 в автоматизированной системе ВАСТЕС MGIT 960 (85,4%), в сравнении с агаровой средой Миддлбрука 7Н11 (73,2%) и яичной средой Левенштейна-Иенсена (65,9%). При этом срок детекции роста микобактерий при использовании жидкой питательной среды - 19,8±5,2 дней, что в 1,9 раз короче, чем на плотной яичной (37,2±4,5 дней) и в 1,5 раза, чем на плотной агаровой среде (30,5±3,9 дней).

3. Для видовой идентификации HTM разработан метод биологических микрочипов (БИОЧИП IMS), на основе поэтапного испытания различных вариантов биочипов с увеличением количества иммобилизиро-ванных в лунках с гелем специфических олигонуклеотидов (увеличение числа идентифицируемых HTM). БИОЧИП «IMS» позволяет идентифицировать 9 видов HTM: М. avium, М. intracellalare, М. scrofulaceum, М. kansasii, М. gordonae, М. xenopi, М. marinum, М. fortuitum, М. chelonae и дифференцировать их от М. tuberculosis complex.

4. Использованные для видовой идентификации микобактерий методы - микробиологические, биочипы, ПДРФ, ВЭЖХ дают сопоставимые результаты. При этом ВЭЖХ и молекулярно-генетические методы характеризуются более высокой специфичностью и скоростью получения результатов, а преимуществом биочипов также является автоматизированный учет с помощью программного обеспечения.

5. Разработан оптимальный комплекс методов (алгоритм) выделения и идентификации HTM, который включает выделение микобактерий с помощью культивирования биологического материала на двух питательных средах (жидкой и плотной) и применение ВЭЖХ и/или одного из молекулярно-генетических методов (ПДРФ, биочип - последний предпочтительнее) для определения вида выделенной культуры.

6. Охарактеризован видовой состав HTM, выделенных от больных туберкулезом и лиц с подозрением на туберкулез, в городе Москве. Установлено, что с наибольшей частотой среди медленнорастущих HTM из клинического материала выделяются MAC (33,6%), М. xenopi (13,2%) и М. kansasii (12,7%), а быстрорастущих - М. fortuitum (28,5%). Неоднократное обнаружение в материале, полученном от больного, одного и того же вида HTM, при отсутствии М. tuberculosis и наличии соответствующей клинико-рентгенологической симптоматики, дает основание для рассмотрения лечащим врачом в диагностическом ряду микобакте-риоза.

7. Установлено, что большинство клинических изолятов HTM, выделенных от больных туберкулезом и лиц с подозрением на туберкулез в городе Москве отличается высоким уровнем устойчивости как к основным, так и к большинству резервных противотуберкулезных препаратов и чувствительностью к таким фторхинолонам, как ципрофлокса-цин и моксифлоксацин.

8. Поскольку материал для исследования поступал в Централизованную микробиологическую лабораторию МНПЦБТ из противотуберкулезных диспансеров, в которых состоят на учете больные туберкулезом и лица из групп риска развития туберкулеза из двух третей населения города, данные видовой идентификации HTM и определения их чувствительности к антибактериальным препаратам отражают ситуацию в целом в городе Москве.

ПРАКТИЧЕСКИЕ РЕКОМЕНДАЦИИ

1. Для эффективного выделения HTM из биологического материала рекомендуется его посев на две питательные среды: жидкую (Мидцб-рука 7Н9 в автоматизированной системе ВАСТЕС MGIT 960) и одну из плотных (агаровую или яичную).

2. Для обнаружения смешанных культур микобактерий, получения чистой культуры и изучения культурально-морфологических свойств рекомендуется культуры HTM, выделенные в жидкой и/или на плотной питательных средах, субкультивировать на чашках с агаровой средой 7Н11.

3. Культурально-морфологические и биохимические свойства разных штаммов одного и того же вида микобактерий вариабельны, что может приводить к неправильной их идентификации. При наличии в лаборатории более точных методов (например, молекулярно-генетических и ВЭЖХ), использование микробиологических тестов целесообразно лишь в отдельных (спорных) случаях. 4. Поскольку при использовании ВЭЖХ имеет место высокая степень совпадения результатов определения вида микобактерий с данными микробиологических исследований, этот метод может быть рекомендован для их определения в бактериологических референс-лабораториях, тем более что идентификация вида микробиологическими методами занимает до 3-4-х недель, тогда как применение ВЭЖХ сокращает ее время до 24 часов.

5. Результаты видовой идентификации культур нетуберкулезных микобактерий с помощью молекулярно-генетических методов - ПДРФ и биологических микрочипов, также как и ВЭЖХ, в большинстве случаев совпадают с данными микробиологических исследований, в связи с этим и быстрым получением результатов, данные методы также могут быть рекомендованы для практического использования. При этом преимуществом применения биочипов является простота метода и автоматизированный учет результатов с помощью программного обеспечения.

6. При неоднократном обнаружении у больного одного и того же вида HTM (в сочетании с клинико-рентгенологическими проявлениями заболевания) в диагностическом ряду рекомендуется рассматривать ми-кобактериоз.

7. При проведении химиотерапии микобактериозов следует учитывать то, что HTM, как правило, устойчивы к основным и большинству резервных противотуберкулезных препаратов и чувствительны к фторхинолонам (ципрофлоксацину и моксифлоксацину).

Список литературы диссертационного исследования доктор биологических наук Макарова, Марина Витальевна, 2010 год

1. Авербах М.М. (ред.) Иммунология и иммунопатология туберкулеза. М. Медицина. -1980.-318С.

2. Авербах М.М., Мороз A.M., Апт A.C. и др. Иммуногенетика инфекционных заболеваний. — М.: Медицина. 1985. - 253 С.

3. Александрова А.Е., Васильев A.B., Лозовская М.Э. Новые подходы к лечению микобактериозов легких/ЛТробл. туб. 1991. - №4. - с. 15-17.

4. Апт A.C. Генетические аспекты выявления группы риска по туберкулезу // Пробл. туб. 2001. - № 6. - с. 67-79.

5. Васильев A.B., Оттен Т.Ф. К вопросу о тактике ведения больных микобактериозом легких // Пробл. туб. 1991. - № 4. - с. 13-15.

6. Вейсфейлер Ю.К. Биология и изменчивость микобактерий туберкулеза и атипичные микобактерии. Экспериментальные и теоретические исследования. Будапешт.: Академия наук Венгрии. 1975. - 334 С.

7. Вишневский Б.И., Иванова Л.Л., Колечко Н.Г. и др. клиническое значение микобактерий туберкулеза с различными биологическими свойствами // Пробл, туб. 1991. - № 1.-е. 51-54.

8. Воробьев A.A., Бадукшанова Н.М., Дорожкова И.Р. и др. Идентификация микобактерий методом газожидкостной хроматогра-фии//Пробл. туб. 1991. -№ 7. - с. 46-50.

9. Драбкина P.O., Гельфер П.И., Клименко М. Т. Значение «атипичных» микобактерий при поражении почек // Пробл. туб. 1977. - № 10. -с. 80-81.

10. Дыхно М.М. Сравнительное изучение и методы дифференциации туберкулезных микобактерий, атипичных штаммов и кислотоустойчивых сапрофитов. Дисс. док.мед.наук. М. - 1963

11. Зыков М.П. Советская микобактериология на современном эта-пе//Сов. Мед. 1984. - № 1. - с. 64-68.

12. Ильина Т.Е., Вишневский Б.И., Войтова Д.И. и др. Микобакте-риозы легких в 1965-1980 гг. (по материалам ЛНИИТ) // 6-я конф. фтизиатров и пульмонологов Латвии: Тез. докл. Рига, 1981.-е. 120-121.

13. Калинина O.A. Гуморальный иммунитет при заражении и иммунизации микобактериями комплекса Mycobacterium avium-intracellularae-scrofulaceum (MAIS). Автореф. дисс. канд.мед.наук. -M.- 1992.-19 С.

14. Корзюков Ю.А. Болезни аквариумных рыб. М.:Колос. 1979.174 С.

15. Кочетков Б.И., Девятова А.И. Эффективность комплексной терапии микобактериозов легких в зависимости от видовой принадлежности возбудителя//Тер. арх. 1987. - № 7. - с. 80-82.

16. Краснова М.А., Макарова М.В., Скотникова О.И., Мороз A.M. Идентификация микобактерий комплекса «MAIS» и М. tuberculosis методом полиморфизма длин рестрикционных фрагментов гена hsp65// БЭБиМ. 2006. - №8.- с. 188-191.

17. Лазовская А.Л. Нерешенные проблемы микобактериозов// Пробл. туб. -1991.-№4.- с. 18-19.

18. Литвинов В.И., Гергерт В.Я., Мороз A.M. и др. Иммунология туберкулеза: современное состояние проблемы// Вестник РАМН. — 1999. №7.-с. 8-11.

19. Литвинов В.И., Макарова М.В., Краснова М.А. Нетуберкулезные микобактерии. М.: МНПЦБТ.-2008.- 256 С.

20. Макаревич Н.М. Атипичные микобактерии: методы идентификации, источники выделения, значение в клинике. Дисс. док.мед.наук. -М. 1973.

21. Макаревич Н.М. Чувствительность атипичных микобактерий к различным противотуберкулезным препаратам//Сб. научн. тр. т. 20. -М.: ЦНИИТ. - 1976. - с. 148-150.

22. Макаревич Н.М., Рудой Н.М., Ильина Т.Б. и др. Распространение нетуберкулезных микобактерий в отдельных регионах Советского Союза и их роль в заболевании человека//Сб. научн. тр. Фрунзе.: Киргиз. НИИ. - 1985. - с. 73-79.

23. Модель JT.M. Биология туберкулезных микобактерий и иммунология туберкулеза. М: Медгиз. - 1958. - 314 С.

24. Найманов А.Х. Аллергологическая диагностика микобактери-альных инфекций крупного рогатого скота//Автореф. дисс.д-ра ветеринарных наук. М. - 1993. - 29 С.

25. Новожилова И.А. Микобактериозы: прошлое, настоящее и будущее //Пробл.туб. и болезней легких. 2004. - № 9. - с. 3-9.

26. Оттен Т.Ф. Чувствительность некоторых видов нетуберкулезных микобактерий к антибиотикам и химиопрепаратам широкого спектра действия//Проблемы и перспективы развития бактериологии во фтизиатрии.-М.- 1988.-с. 87-91.

27. Оттен Т.Ф. Особенности бактериологической диагностики и этиотропной терапии микобактериоза легких: Автореф. дис. д-ра мед. наук.-СПб. 1994.-41 С.

28. Оттен Т. Ф. Микобактериоз легких: клинико-бактериологические критерии диагностики // БЦЖ. 1999. - № 3. - с. 17-19.

29. Оттен Т.Ф., Васильев A.B. Микобактериоз. СПб.: Мед. пресса.-2005.-224 С.

30. Оттен Т.Ф., Макроусов И.В., Нарвская О.В. и др. Возможности и перспективы бактериологической диагностики микобактериоза// Пробл.туб. и болезней легких. 2004. - № 5. - с. 32-35.

31. Покровский В.И., Гордиенко С.П., Литвинов В.И. Иммунология бактериальных инфекций. Руководство для врачей. М. - 1993. -306 С.

32. Покровский В.И., Адамбеков Д.А.Литвинов В.И. Иммунология бактериальных инфекций. Руководство для врачей. Москва-Бишкек. -1994.-c.145.

33. Финкель Е.А., Михайлова Л.В., Соколова М.А. и др. Некоторые бактериологические аспекты изучения нетуберкулезных микобакте-рий//4-й съезд фтизиатров Казахстана: Тез. докл. Алма-Ата. - 1992. - с. 126-127.

34. Ablordey A., Kotlowski R., Swings J. et al. PCR amplification with primers based on IS2404 and GC-rich repeated sequence reveals polymorphism in Mycobacterium ulcerans // J. Clin. Microbiol. 2005. - v. 43. - p. 448-451.

35. Adekambi Т., Revnaud-Gaubert M., Greub G. et al. Amoebal co-culture of "Mycobacterium massiliense" sp. nov. from the sputum of a patient with hemoptoic pneumonia // J. Clin. Microbiol. 2004. - v. 42. - p. 54935501.

36. Adle-Biassette H., Huerre M., Breton G. et al. Non-tuberculous mycobacterial diseases // Ann. Pathol. 2003. - v. 23. - p. 216-235.

37. Ahkee S., Srinath L., Huang A. et al. Clinical significance of my-cobacterium other than tuberculosis isolated from respiratory specimens at a university hospital // J. Ky. Med. Assoc. 1995. - v. 93. - p. 53-55.

38. Ahrens P., Giese S., Klausen J. et al. Two markers, IS901-IS902 and p40 identified by PCR and by using monoclonal antibodies in Mycobacterium avium strains // J. Clin. Microbiol. 1995. - v. 33. - p. 1049-1053.

39. Aldabagh В., Tomecki K. Cutaneous nontuberculous mycobacterial infections // Dermatol. Nurs.- 2009.-v.21(4).-p.l79-182.

40. AI Jarad N., Demertzis P., Jones D. et al. Comparison of characteristics of patients and treatment outcome for pulmonary non-tuberculous mycobacterial infection and pulmonary tuberculosis // Thorax. 1996. - v. 51.— p. 137-139.

41. Al-Mahruqi S, van-Ingen J, Al-Busaidy S, et al.Clinical relevance of nontuberculous Mycobacteria, Oman. // Emerg. Infect. Dis.- 2009. -v.15(2)- p.292-294.

42. Alvarado-Esquivel C., García-Corral N., Carrero-Dominguez D. et al. Molecular analysis of Mycobacterium isolater from extrapulmonary specimens obtained from patients in Mexico. // BMC. Clin. Pathol.- 2009.-v.9-p.l

43. Amfah G., Bonsu F., Tetteh C. et al. Buruli ulcer in Ghana: results of a national case search // Emerg. Infect. Dis. 2002. - v. 8. - p. 176-170.

44. Andréjak C., Thomsen V., Johansen I. et al. Nontuberculous Pulmonary Mycobacteriosis in Denmark: Incidence and Prognostic Factors // Am. J. Respir. Crit. Care Med.- 2010.- v. 181(5).-p.514-521.

45. Appelberg R., Castro A., Pedrosa J. et al. Role of gamma interferon and tumor necrosis factor alpha during T-cell-independent and -dependent phases of Mycobacterium avium infection // Infect. Immun. — 1994. v. 62. -p. 3962-3971.

46. Arend S, van Soolingen D, Ottenhoff T. Diagnosis and treatment of lung infection with nontuberculous mycobacteria.// Curr Opin Pulm Med. -2009- v.l5(3)-p.201-208.

47. Armstrong K., James R., Dawson D. et al. Mycobacterium haemo-philum causing perihilar or cervical lymphadenitis in healthy children // J. Pe-diatr. 1992. - v. 121.-p. 202-205.

48. Bailey W. Treatment of atypical mycobacterial disease // Chest. -1983. -v. 84. -№ 5. P. 625-628.

49. Balcewicz-Sablinska MK, Gan H, Remold HG. Interleukin 10 produced by macrophages inoculated with Mycobacterium avium attenuates mycobacteria-induced apoptosis by reduction of TNF-alpha activity. // J. Infect. Dis. 1999.- v.l80(4)-p. 1230-1237.

50. Ballarino G., Olivier K., Claypool R., et al. Pulmonary nontubercu-lous mycobacterial infections: Antibiotic treatment and associated costs // Respir. Med.- 2009.-v.l03(10).-p.l448-1455.

51. Banks J., Jenkins P., Smith A. Pulmonary infections in Mycobacterium malmoense a review of treatment and response // Tubercle. — 1985. -v. 66.-p. 197-203.

52. Begg D., O'brien R., Mackintosh C. et al. Experimental infection model for Johne's disease in sheep // Infect. Immun. — 2005. — v. 73. p. 5603-5611.

53. Behr M., Falkinham J. Molecular epidemiology of nontuberculous mycobacteria // Future Microbiol.- 2009,- v.4.-p. 1009-1020.

54. Benator D., Gordin F. Nontuberculous mycobacteria in patients with human immunodeficiency virus infection // Semin. Respir. Infect. — 1996.-v. 11.-p. 285-300.

55. Bennett S., Peterson D., Johnson D. et al. Bronchoscopy-associated Mycobacterium xenopi pseudoinfections // Am. J. Respir. Crit. Care Med. -1994.-v. 150.-p. 245-250.

56. Beran V., Matlova L., Dvorska L. et al. Distribution of mycobacteria in clinically healthy ornamental fish and their aquarium environment // J. Fish Dis. 2006. - v. 29. - p. 383-393.

57. Biçmen C, Coçkun M, Gündüz A, et al. Identification of atypical mycobacteria isolated from clinical specimens by line probe assay (LIPA) // Mikrobiyol Bui. 2007.- v.41(4)-p.503-510.

58. Biehle J., Cavalieric S., Saubolle M. et al. Evaluation of E test for susceptibility testing of rapidly growing mycobacteria // J. Clin. Microbiol. — 1995.-v. 33.-p. 1760-1764.

59. Biet F., Boschiroli M., Thorel M. et al. Zoonotic aspects of Mycobacterium bovis and Mycobacterium avium-intracellulare complex (MAC) // Vet. Res. 2005. - v. 36. - p. 411-436.

60. Black W., Berk S. Cooling towers a potential environmental source of slow-growing mycobacterial species // AIHA J. - 2003. - v. 64. -p. 238-242.

61. Blackwood K., Cheng H., Gunton J. et al., Evaluation of recA sequences for identification of Mycobacterium species // J. Clin. Microbiol. -2000.-v. 38.-p. 2846-2852.

62. Blyth C., Best E., Jones C. et al. Nontuberculous mycobacterial infection in children: a prospective national study // Pediatr Infect Dis J.- 2009.-v.28(9).-p.801-805.

63. Boddinghaus B., Rogall T., Flohr T. et al. Detection and identification of mycobacteria by amplification of rRNA // J. Clin. Microbiol. 1990. -v. 28.-p. 1751-1759.

64. Bodle EE, Cunningham JA, Della-Latta P, et al. Epidemiology of nontuberculous mycobacteria in patients without HIV infection, New York City // Emerg Infect Dis.- 2008. v. 14(3) - p.390-6.

65. Böttcher J., Gangl A. Mycobacterium avium ssp. Paratuberculosis -combined serological testing and classification of individual animals and herds // J. Vet. Med. B. Infect. Dis. Vet. Public Health. 2004. - v. 51. - p. 443-448.

66. Böttger E. Mycobacterium genavense: an emerging pathogen // Eur. J. Clin. Microbiol. Infect. Dis. 1994. - v. 13. - p. 932-936.

67. British Thoracic Society. Management of opportunistic mycobacterial infections: Joint Tuberculosis Committee guidelines 1999 // Thorax. -2000.-v. 55.-p. 210-218.

68. Brooker W., Aufderheide A. Genitourinary tract infection due to atypical mycobacteria // J. urol. 1980. - v. 124. - № 2. - P. 242-244.

69. Broussard G, Ennis D. Mycobacterium marinum produces long-term chronic infections in medaka: a new animal model for studying human tuberculosis // Comp Biochem Physiol C Toxicol Pharmacol. 2007 -v.145(1)-p.45-54.

70. Brown-Elliot B., Wallace R., Onyi G. et al. Activities of four mac-rolides, including clarithromycin, against Mycobacterium fortuitum, Mycobacterium chelonae, and M. chelonae-like organisms // Antimicrob. Agents Chemother. 1992. - v. 36. - p. 180-184.

71. Brown-Elliott B., Wallace P. Clinical and taxonomic status of pathogenic non-pigmented or late-pigmented rapidly growing mycibacteria // Clin. Microbiol. Rev. -2002. v. 15. - p. 716-746.

72. Bruijnesteijn van Coppenraet L., Kuijper E., Lindeboom J. et al. Mycobacterium haemophilum and lymphadenitis in children // Emerg. Infect. Dis.-2005.-v. 11.-p. 62-68.

73. Buijtels P., van-der-Sande M., de-Graaff C., et al., Nontuberculous mycobacteria, Zambia.Emerg // Infect Dis.- 2009. v. 15(2) - p.242-9.

74. Butler W., Guthertz L. Mycolic acid analysis by high-performance liquid chromatography for identification of Mycobacterium species // Clin. Microbiol. Rev.- 2001 v. 14(4) - p.704-26.

75. Butler W., Jost K., Kilburn J. et al. Identification of Mycobacteria by High-Performance Liquid Chromatography//J. Clin. Microbiol. -1991.-v. 29(1 l).-p.2468-2472.

76. Butler W., Kilburn J. Identification of major slowly growing pathogenic mycobacteria and Mycobacterium gordonae by high-performance liquidchromatography of their mycolic acids //J Clin. Microbiol.-1988.- v.26(l). -p.50-53.

77. Cage G. Direct identification of Mycobacterium species in BAC-TEC 7H12B medium by high-performance liquid chromatography // J. Clin. Microbiol. 1994.-v.32(2).-p.521-524.

78. Casal M., Casal M. Preliminary multicenter supveillance of atypical mycobacteria in some European countries // Clinical Mycobacteriology. -1998.-p. 77-81.

79. Cassidy P., Hedberg K., Saulson A. et al. Nontuberculous mycobacterial disease prevalence and risk factors: a changing epidemiology // Clin. Infect. Dis. -2009.-v. 49(12).-p.l24-129.

80. Castro C., Puerto G., Garcia L. et al. Molecular identification of non-tuberculous mycobacteria // Biomedica. 2007. - v. 27. - p. 439-446.

81. Caugant D., Sandven P. Mycobacteria other than tuberculosis isolated from patients in Norway 1995-1998 // Int. J. Tuberc. Lung Dis. 1999. -v. 3, № 9. - Suppl. - p. 187-188.

82. Chakrabarti A., Sharma M., Dubey M. Isolation rates of different mycobacterial species from Chandigarh (north India) // Indian J. Med. Res. -1990.-v. 91.-p. 111-114.

83. Chemlal K., Huys G., Laval F. et al. Characterization of an unusual Mycobacterium: a possible missing link between Mycobacterium marinum and Mycobacterium ulcerans // J. Clin. Microbiol. 2002. - v. 40. - p. 23702380.

84. Claydon E., Coker R., Harris J. Mycobacterium malmoense infection in HIV positive patients // J. Infect. Dis. 1991. - v. 164. - p. 432-433.

85. Cloud J., Neal H., Rosenberry R. et al. Identification of mycobacte-rium ssp. by using a commercial 16S ribosomal DNA sequencing kit and additional sequencing libraries // J. Clin. Microbiol. 2002. - v. 40. - p. 400406.

86. Cole T., Kewman D., Boninger M. Development of medical rehabilitation research in 20th-century America//Am J Phys Med Rehabil. 2005. -v. 84(12).-p.940-54.

87. Collins C., Grange J., Yates M. Mycobacteria in water // J. Appl. Bacteriol.- 1984,-v. 57.-p. 193-211.

88. Couto I., Machado D., Viveiros M.,et al. Identification of nontuber-culous mycobacteria in clinical samples using molecular methods: a 3-year study // Clin. Microbiol. Infect.- 2009. Epub ahead of print.

89. Crow H., King C., Smith E. et al. A limited clinical, pathologic, and epidemiologic study of patients with pulmonary lesions associated with atypical acid-fast bacilli in the sputum // Am. Rev. of Tuberc. 1957. - v. 75. - p. 199-222.

90. Cummins C. Ornithine in mucopeptide of Gram-positive cell walls // Nature. 1965. - v. 206. - p. 1272.

91. Cvetnic Z., Spicic S., Benic M. et al. Mycobacterial infection of pigs in Croatia //Acta. Vet. Hung. 2007. - v. 55. - p. 1-9.

92. Da Costa Cruz J. Mycobacterium fortuitum un novo bacilo acido-resistente patogenico para o homen // Acta. Med. 1938. - v. 1. - p. 298-301.

93. Daley C. Nontuberculous mycobacterial disease in transplant recipients: early diagnosis and treatment // Curr Opin Organ Transplant.- 2009.-v.l4(6).-p.619-624.

94. Daniel T., Illner J., Boom W.N. Immunology of Tuberculosis. In.: Tuberculosis. International Approach. L.Reichman, E.Heishfield, eds. Marcel Dekker. New York. - 2000. - p. 187-214.

95. Davidson P. The diagnosis and management of disease caused by M. avium complex, M. kansasii, and other mycobacteria // Clin, chest. Med. -1989.-v. 10. №3. - p. 431-443.

96. Dawson D. Mycobacterial terminology // J. Clin. Microbiol. -2000.-v. 38.-p. 3913.

97. Debrunner M., Salfînger M., Brandli O. et al. Epidemiology and clinical significance of nontuberculous mycobacteria in patients negative for human immunodeficiency virus in Switzerland // Clin. Infect. Dis. 1992. — v. 15.-p. 330-345.

98. Del Beccaro MA, Mendelman PM, Nolan C. Diagnostic usefulness of mycobacterial skin test antigens in childhood lymphadenitis // Pedi-atr. Infect. Dis. J. 1989 - v.8(4)-p.206-10.

99. De March Ayuela P. Infections caused by environmental mycobacteria in Spain // Med. Clin. (Bare). 2000. - v. 114. - p. 318-319.

100. Deutz A., Spergser J., Wagner P. et al. Mycobacterium avium subsp. paratuberculosis in wild animal species and cattle in Styria/Austria // Berl. Munch. Tierarztl. Wochenschr. 2005. - v. 118. - p. 314-320.

101. Di Lonardo M., Isola N., Ambrogg M. et al. Mycobacteria in HIV infected patients in Buenos Aires // Tuber. Lung Dis. 1995. - v. 76. -p. 185-189.

102. Ding L., Lai C., Lee L. et al. Abdominal nontuberculous mycobacterial infection in a university hospital in Taiwan from 1997 to 2003 // J. Formos. Med. Assoc. 2006. - v. 105. - p. 370-376.

103. Dorman S., Subramanian A. AST Infectious Diseases Community of Practice.Nontuberculous mycobacteria in solid organ transplant recipients // Am. J. Transplant.- 2009.-v.9.- p.63-69.

104. Drancourt M. Out-of-water: emerging, nontuberculous mycobacteria// Clin. Microbiol. Infect. 2009.-v.l5(10).-p.887.

105. Dunne A., Kim-Berger H., Zimmermann S. et al. Atypical mycobacterial tuberculosis a diagnostic and therapeutic dilemma? Case reports and review of the literature // Otolaryngol. Pol. - 2003. - v. 57. - p. 17-23.

106. Duvall C. Studies in atypical forms of tubercle bacilli isolated directly from the human tissues in cases of primary cervical adenitis // J. Exp. Med. 1984. - v. 9. - p. 403-429.

107. Eda S., Elliott B., Scott M. et al. New method of serological testing for Mycobacterium avium subsp. paratuberculosis (Johne's disease) by flow cytometry // Foodborne Pathol. Dis. 2005. - v. 2. - p. 250-262.

108. Eddyani M., Ofori-Adjei D., Teugels G. et al. Potential role for fish in trans mission of Mycobacterium ulcerans disease (Buruli ulcer): an environmental study // Appl. Environ. Microbiol. 2004. - v. 70. - p. 56795681.

109. El Amin N., Hanson H., Pettersson B. et al. Identification of nontuberculous mycobacteria: 16S rRNA gene sequence analysis vs. conventional methods // Scand. J. Infect. Dis. 2000. - v. 32. - p. 47-50.

110. Ellner J., Goldberger M., Parenti D. M.avium infection and AIDS: A therapeutic dilemma in rapid evolution // J. Infect. Dis. 1992. - v. 165.-p. 577-580.

111. Elston D. Nontuberculous mycobacterial skin infections: recognition and management // Am. J. Clin. Dermatol. 2009.-v.l0(5).- p.281-285.

112. Esteban J., Fernandez Roblas R., Ortiz A. et al. Pseudo-outbreak of Mycobacterium gordonae: usefulness of randomly amplified polymorphic DNA analysis to assess the clonality of the isolates // Clin. Microbiol. Infect. -2006. v. 12.-p. 677-679.

113. Esther C., Henry M., Molina P. et al. Nontuberculous mycobacterial infection in young children with cystic fibrosis // Pediatr. Pulmonol. -2005.-v. 40.-p. 39-44.

114. Esther C. Jr, Esserman D., Gilligan P.et al. Chronic Mycobacterium abscessus infection and lung function decline in cystic fibrosis // J. Cyst. Fibros.- 2010.-v.9(2).-p. 117-123.

115. Euzeby J. List of bacterial names with standing in nomenclature — Genus Mycobacterium. 2003. — p. 12.

116. Fabry W., Schmid E., Ansorg R. Comparison of the E test and proportional dilution methods for susceptibility testing of Mycobacterium kansasii // Chemotherapy. 1995. - v. 41. - p. 247-252.

117. Falkinham J. Epidemiology of infection by nontuberculous mycobacteria // Clin. Microbiol. Rev. 1996. - v. 9. - p. 177-215.

118. Falkinham J. Nontuberculous mycobacteria in the environment // Clin. Chest Med.-2002.-v. 23.-p. 529-551.

119. Falkinham J. Mycobacterial aerosols ánd respiratory disease // Emerg. Infect. Dis. 2003. - v. 9. - p. 763-767.

120. Falkinham J. Surrounded by mycobacteria: nontuberculous mycobacteria in the human environment // J. Appl. Microbiol.- 2009.-v. 107(2).-p.356-367.

121. Fan M., Hadjiliadis D. Incidence and management of mycobacterial infection in solid organ transplant recipients // Curr. Infect. Dis. Rep.-2009.-v.ll(3).-p.216-222.

122. Feldman R., Hershfield E. Mycobacterial skin infection by an unidentified species. A report of 29 patients // Ann. Intern. Med. 1974. - v. 80.-p. 445-452.

123. Field S., Cowie R. Lung disease due to the more common nontuberculous mycobacteria // Chest. 2006. - v. 129. - p. 1653-1672.

124. Froman S, Lechtman M, Scammon L, et al. Mycobacteriophage lysates as serologic antigens // Am. Rev. Respir. Dis. 1961-v.83-p,.901-2.

125. Fukushima M., Kakinuma K., Hayashi H. et al. Detection and identification of Mycobacterium species isolates by DNA microarray // J. Clin. Microbiol.- 2003.- v.41(6).-p.2605-2615

126. Gauthier D., Vogelbein W., Ottinger C. Ultrastructure of Mycobacterium marinum granuloma in striped bass Morone saxatilis // Dis. Aquat. Organ. 2004. - v. 62. - p. 121-132.

127. Gay J., De Young D., Roberts G. In vitro activities of norfloxacin and ciprofloxacin against Mycobacterium tuberculosis, M. avium complex, M. chelonei, M. fortuitum, and M. kansasii // Antimicrob. Agents Chemother. 1984. - v. 26. - p. 94-96.

128. Ghadiali A., Strother M., Naser S. et al. Mycobacterium avium subsp. paratuberculosis strains isolated from Crohn's disease patients and animal species exhibit similar polymorphic locus patterns // J. Clin. Microbiol. 2004. - v. 42. - p. 5345-5348.

129. Giron RM, Maiz L, Barrio I, et al. Nontuberculous mycobacterial infection in patients with cystic fibrosis: a multicenter prevalence study // Arch Bronconeumol.- 2008 -v.44(12)-p.679-84.

130. Glassroth J. Pulmonary disease due to nontuberculous mycobacteria // Chest.- 2008.- v. 133(l).-p.243-251.

131. Good R., Snider D. Isolation of nontuberculous mycobacteria in the United States, 1980 // J. Infect. Dis. 1982. - v. 146. - p. 829-833.

132. Goslee S, Wolin sky E. Water as a source of potentially pathogenic mycobacteria // Am. Rev. Respir. Dis. 1976- v.l 13(3)-p.287-92.

133. Grange J. Infection and disease due to the environmental mycobacteria // Trans. R. Soc. Trop. Med. Hyg. 1987. - v. 81. - p. 179-182.

134. Grange J., Yates M. Infections caused by opportunist mycobacteria: a review // J. R. Soc. Med. 1986. - v. 79. - p. 226-229.

135. Grange J., Yates M., Pozniak A. Bacteriologically confirmed nontuberculous mycobacterial lymphadenitis in southeast England: a recent increase in the number of cases // Arch. Dis. Child. 1995. - v. 72. - p. 516517.

136. Grant I. Mycobacterium paratuberculosis and milk // Acta. Vet. Scand. 2003. - v. 44. - p. 261-266.

137. Griffith D. Nontuberculous mycobacteria // Curr. Opin. Pulm. Med. 1997. - v. 3. - p. 139-145.

138. Griffith D. Nontuberculous mycobacterial lung disease // Curr. Opin. Infect. Dis.- 2010. Epub ahead of print.

139. Griffith D., Girard W., Wallace R. Clinical features of pulmonary disease caused by rapidly growing mycobacteria: an analysis of 154 patients // Am. Rev. Respir. Dis. 1993. - v. 147. - p. 1271-1278.

140. Grifftth D., Brown B., Giard W. et al. Adverse events association with high dose rifabutin and macrolide containing regimens for the treatment of M. avium lung disease // Clin. Infect. Dis. 1995. - v. 21. - p. 594-598.

141. Grubek-Jaworska H, Walkiewicz R, Safianowska A, et al. Nontuberculous mycobacterial infections among patients suspected of pulmonary tuberculosis // Eur. J. Clin. Microbiol. Infect. Dis.- 2009 v.28(7)p.739-744.

142. Guerrero C., Bernasconi C., Burki D. et al. A novel insertion element from Mycobacterium avium, IS 1245, is a specific target for analysis of strain relatedness// J. Clin. Microbiol. 1995. - v. 33. - p. 304-307.

143. Guthertz L., Damsker B., Bottome E. et al. Mycobacterium avium and Mycobacterium intracellulare infections in patients with and without AIDS//J. Infect. Dis. 1989. - v. 160.-p. 1037-1041.

144. Guthertz L., Lim S., Jang Y. et al. Curvilinear-gradient highperformance liquid chromatography for identification of mycobacteria // J. Clin. Microbiol. -1993.-v.3 l(7).-p. 1876-1881.

145. Haider A., Schliep T., Zeana C. Nontuberculous mycobacterium disease with pleural empyema in a patient with advanced AIDS // Am. J. Med. Sei.- 2009.-v.338(5).-p.418-420.

146. Han X., De I., Jacobson K. Rapidly growing mycobacteria: clinical and microbiologic studies of 115 cases // Am. J. Clin. Pathol. 2007. -v. 128.-p. 612-621.

147. Hänsch H., Smith D., Mielke M. et al. Mechanisms of granuloma formation in murine Mycobacterium avium infection: the contribution of CD4+ T cells // Int. Immunol. 1996. - v. 8. - p. 1299-1310.

148. Harris N., Barletta R. Mycobacterium avium subsp. paratubercu-losis in Veterinary Medicine // Clin. Microbiol. Rev. 2001. - v. 14. - p. 489-512.

149. Hartman T., Swensen S., Williams D. Mycobacterium avium-intracellulare complex: evaluation with CT // Radiology. 1993. - v. 187. -p. 23-26.

150. Hartmann P., Plum G. Immunological defense mechanisms in tuberculosis and MAC-infection // Diagn. Microbiol. Infect. Dis. 1999. - v. 34.-p. 147-152.

151. Hautmann G., Lotti T. Atypical mycobacterial infections of the skin // Dermatol. Clin. 1994. - v. 12. - p. 657-668.

152. Haverkort F. National atypical mycobacteria survey, 2000 // Commun. Dis. Intell. -2003. v. 27. - p. 180-189.

153. Hawkins C., Gold W., Whimbey E. et al. M. avium complex infections in patient with acquired immunodeficiency syndrome // Ann. Intern. Med.- 1986.-v. 105.-p. 184-188.

154. Heifets L. Synergistic effect of rifampin, streptomycin, ethionamide, and ethambutol on Mycobacterium intracellulare // Am. Rev. Respir. Dis. 1982. - v. 125. - p. 43-48.

155. Heifets L. MIC as a quantitative measurement of the susceptibility of Mycobacterium avium strains to seven antituberculosis drugs // Anti-microb. Agents Chemother. 1988. - v. 32. - p. 1131-1136.

156. Heifets L. (ed.) Clinical Mycobacteriology // WB Saunders, Philadelphia. 1996. - 639 P.

157. Heifets L. Mycobacterial infections caused by nontuberculous mycobacteria // Semin. in Respir. Crit. Care Med. 2004. - v. 25 (3). - p. 283-295

158. Henry M., Inamdar L., O'Riordain D. et al. Nontuberculous mycobacteria in non-HIV patients: epidemiology, treatment and response // Eur. Respir. J. 2004. - v. 23. - p. 741-746.

159. Herbst L., Costa S., Weiss L. et al. Granulomatous skin lesions in moray eels caused by a novel Mycobacterium species related to Mycobacterium triplex // Infect. Immun. 2001. - v. 69. - p. 4639-4646.

160. Hernandez-Divers S., Shearer D. Pulmonary mycobacteriosis caused by Mycobacterium haemophilum and M. marinum in a royal python // J. Am. Vet. Med. Assoc. 2002. - v. 220. - p. 1661-1663.

161. Hettick J., Kashon M., Simpson J. et al. Proteomic profiling of intact mycobacteria by matrix-assisted laser desorption/ionization time-offlight mass spectrometry // Anal. Chem. 2004. - v. 76. - p. 5769-5776.

162. Ho T., Rommelaere M., Coche E. et al. Nontuberculous mycobacterial pulmonary infection in renal transplant recipients // Transpl. Infect. Dis.- 2009.-v. 19. Epub ahead of print.

163. Hoy J., Rolston K., Hopfer R. et al. Mycobacterium fortuitum bacteremia in patients with cancer and long-term venous catheters // Am. J. Med.- 1987.-v. 83.-p. 213-217

164. Hoffman P., Fräser D., Robicsek F. et al. Two outbreaks of sternal wound infections due to organisms of the Mycobacterium fortuitum complex//J. Infect. Dis. 1981. - v. 143. - p. 533-542.

165. Holland S. Nontuberculous mycobacteria // Am. J. Med. Sei. -2001.-v. 321.-p. 49-55.

166. Hoover D., Graham N., Bacellar H. et al. An epidemiologic analysis of Mycobacterium avium complex disease in homosexual men infected with human immunodeficiency virus type 1 // Clin. Infect. Dis. 1995. -v. 20.-p. 1250-1258.

167. Horsburgh C. M.avium complex infection in the acquired immunodeficiency syndrome //N. Engl. J. Med. 1991. - v. 324. - p. 1332-1338.

168. Horsburgh C. Epidemiology of disease caused by nontuberculous mycobacteria // Semin. Respir. Infect. 1996. - v. 11. - p. 244-251.

169. Horsburgh C., Mason U., Farhi D. et al. Disseminated infection with Mycobacterium avium-intracellulare // Medicine. (Baltimor) 1985. - v. 64.-p. 36-48

170. Horsburgh C., Selik R. The epidemiology of disseminated non-tuberculous mycobacterial infection in the Acquired Immunodeficiency Syndrome (AIDS) // Am. Rev. Respir. Dis. 1989. - v. 139. - p. 4-7.

171. Hosker H., Lam C., Ng T. et al. The prevalence and clinical significance of pulmonary infection due to non-tuberculous mycobacteria in Hong-Kong // Respir. Med. 1995. - v. 89. - p. 3-8.

172. Hoy J., Rolston K., Hopfer R. et al. Mycobacterium fortuitum bacteremia in patients with cancer and long-term venous catheters // Am. J. Med.- 1987.-v. 83.-p. 213-217.

173. Huang C, Tsai Y, Shu C, et al.Clinical significance of isolation of nontuberculous mycobacteria in pulmonary tuberculosis patients // Respir. Med. -2009.-v.l03(10).-p. 1484-1491.

174. Huebner R., Schein M., Cauthen G., et al. Usefulness of skin testing with mycobacterial antigens in children with cervical lymphadenopa-thy //Pediatr. Infect. Dis. J. 1992. -v.ll(6)-p.450-6.

175. Igari H., Kikuchi N., Kawashima T. et al. The isolation of non-tuberculous mycobacteria and the pulmonary infections of nontuberculous mycobacteria in the general hospital // Kekkaku. 1994. - v. 69. - p. 483490.

176. Ingram C., Tanner D., Durack D. et al. Disseminated infection with rapidly growing mycobacteria // Clin. Infect. Dis. 1993. - v. 16. - p. 463-471.

177. Isaac-Renton J., Allen E., Chao C. et al. Isolation and geographic distribution of Mycobacterium other than M. tuberculosis in British Columbia, 1972-1981 // Can. Med. Assoc. J. 1985. - v. 133. - p. 573-576.

178. Iseman M. Mycobacterium avium complex and the normal host: the other side of the coin // Engl. J. Med. 1989. - v. 321. - p. 896-898.

179. Iseman M., Buschman D., Ackerson L. Pectus excavatum and scoliosis thoracic anomalies associated with pulmonary disease caused by M. avium complex // Am. Rev. Respir. Dis. 1991. - v. 144. - p. 914-916.

180. Iseman M., Marras T. The importance of nontuberculous mycobacterial lung disease // Am. J. Respir. Crit. Care. Med.- 2008.-v. 178(10).-p.999-1000.

181. Jacobson M., Hopewell P., Yajco D. et al. Natural history of disseminated Mycobacterium avium complex infection in AIDS // J. infect. Dis. -1991. v. 164. - № 5. - p. 994-998.

182. Jarzembowski J., Young M. Nontuberculous mycobacterial infections// Arch Pathol Lab Med. 2008. - v. 132(8). - p. 1333-41.

183. Jeong Y., Lee K., Koh W. et al. Nontuberculous mycobacterial pulmonary infection in immunocompetent patients: comparison of thin-section CT and histopathologic findings // Radiology. 2004. - v. 231. - p. 880-886.

184. Jesudason M., Gladstone P. Non tuberculous mycobacteria isolated from clinical specimens at a tertiary care hospital in South India // Indian J. Med. Microbiol. 2005. - v. 23. - p. 172-175.

185. Jun H., Jeon K., Um S., et al. Nontuberculous mycobacteria isolated during the treatment of pulmonary tuberculosis / /Respir. Med.- 2009.-v.l03(12).-p. 1936-1940.

186. Kalita JB, Rahman H, Baruah KC. Delayed post-operative wound infections due to non-tuberculous Mycobacterium // Indian J. Med. Res. 2005 -v.l22(6)-p.535-9.

187. Kasai H., Ezaki T., Harayama S. Differentiation of phylogeneti-cally related slowly growing mycobacteria by their gyrB sequences//.!. Clin. Microbiol. 2000. - v. 38. - p. 301-308.

188. Katoch V. Mechanisms of drug resistance in mycobacteria. In: Sygnal R L, Sood O P eds. Drug resistance: mechanisme and mangment. Proc 4 th. Annual Ranbaxy Science Foundation symposium. New Delhi. 1997. -p. 41-46.

189. Katoch V. Infections due to non-tuberculous mycobacteria (NTM) // Indian J. Med. Res. 2004. - v. 120. - p. 290-304.

190. Katoch V. Kumar M. Atipical mycobacterial infections. In: Sharma SK eds.: Tuberculosis Ist ed. New Delhi Jaypece Bradhers Medical Publishers (P) Ltd. -2001. p. 439-451.

191. Kaufmann S.Y. Is the development of a new tuberculosis vaccine possible? Nature Med. 2000. - v. 6. - p. 955-960.

192. Kawahara S., Nagare H. Nontuberculous mycobacteriosis; the present status and in the future. The view of development of new drugs against tuberculous mycobacterial infections // Kekkaku. 1998. - v. 73. - p. 77-82.

193. Kawata N., Kawahara S., Tada A. et al. Antimycobacterial susceptibility against nontuberculous mycobacteria using brothmic NTM // Kekkaku. 2006. - v. 81.-p. 329-335.

194. Kent M., Whipps C., Matthews J. et al. Mycobacterium in ze-brafish (Danio rerio) research facilities // Comp. Biochem. Physiol. C. Toxicol. Pharmacol. 2004. - v. 138. - p. 383-390.

195. Kessler A., Kourtis A. Mycobacterium abscessus as a cause of pacemaker infection // Med. Sei. Monit. 2004. - v. 10. - p. 60-62.

196. Khatter S., Singh U., Arora J. et al. Mycobacterial infections in human immuno-deficiency virus seropositive patients: role of nontuberculous mycobacteria// Indian J Tuberc. 2008. - v. 55(1). - p.28-33.

197. Kiehn T., White M., Pursell K. et al. A cluster of four cases of Mycobacterium haemophilum infection // Eur. J. Clin. Microbiol. Infect. Dis. 1993.-v. 12.-p. 114-118.

198. Kiehn T., White M. Mycobacterium haemophilum: an emerging pathogen // Eur. J. Clin. Microbiol. Infect. Dis. 1994. - v. 13. - p. 925-931.

199. Kiehn T., Cynamon M., Inderlied C. et al. Antimycobacterial susceptibility testing for Mycobacterium tuberculosis: tentative standards // National Committee for Clinical Laboratory Standards document M24-T, December. 1995. - v. 15.-p. 1-31.

200. Kim B-J., Lee S-H., Lyu M-A. et al. Identification of mycobacterial species by comparative sequence analysis of the RNA polymerase gene// J. Clin. Microbiol. 1999. - v. 37. - p. 1714-1720.

201. Kim H., Mun H., Kim H. et al. Differentiation of Mycobacterial species by hsp65 duplex PCR followed by duplex-PCR-based restriction analysis and direct sequencing // J. Clin. Microbiol. 2006. - v. 44. - p. 3855-3862.

202. Kobashi Y, Mouri K, Miyashita N, et al. Clinical usefulness of QuantiFERON TB-2G test for the early diagnosis of pulmonary Mycobacterium kansasii disease // Jpn. J. Infect. Dis. 2009 - v.62(3) - p.239-241.

203. Koh W., Kwon O., Lee K. Nontuberculous mycobacterial pulmonary diseases in immunocompetent patients // Korean J. Radiol. 2002. — v. 3. — p. 145-157.

204. Kurashima A. Radiographic findings of pulmonary nontuberculous mycobacteriosis other than Mycobacterium avium complex // Kekkaku -2009.-v.84(8).-p.577-583.

205. Kuritsky J., Bullen M., Broome C. et al. Sternal wound infections and endocarditis due to organisms of the Mycobacterium fortuitum complex: a potential environmental source // Ann. Intern. Med. 1983. - v. 98.-p. 938-939.

206. Kuze F., Kurasawa T., Bando K. et al. In vitro and in vivo susceptibility of atypical mycobacteria to various drugs // Rev. Infect. Dis. — 1981.-v. 3.-P- 885-897.

207. Kwapinski J. Antigenic structure of the actinomycetales. XI. spectra of serological activities of the plasm antigens // Zentralb. Bacteriol. -1966.-v. 200.-p. 380-390.

208. Kwapinski J., Snyder M. Antigenic structure and serological relationships of Mycobacterium, Actinomyces, Streptococcus, and Diplococcus //J. Bacteriol. 1961.-v. 82.-p. 632-639.

209. La Bombardi V., Katariwala R., Pipia G. The identification of mycobacteria from solid media and directly from VersaTREK Myco bottles using the Sherlock Mycobacteria Identification HPLC system // Clin. Microbiol. Infect.- 2006.-v.l2(5).-p.478-481.

210. Lai C., Tan C., Chou C. et al. Increasing incidence of nontuberculous mycobacteria, Taiwan, 2000-2008 // Emerg. Infect. Dis.- 2010.-v.l6(2).-p.294-296.

211. Lai K., Stottmeier K., Sherman I. et al. Mycobacterial cervical lymphadenopathy // J.A.M.A. 1984. - v. 251. - p. 1286-1288.

212. Laussucq S., Baltch A., Smith R. et al. Nosocomial Mycobacterium fortuitum colonization from a contaminated ice machine // Am. Rev. Respir. Dis.- 1988.-v. 138.-p. 891-894.

213. Lebrun L., Weill F., Lafendi L. et al. Use of the INNO-LIPA-MYCOBATERIA assay (version 2) for identification of Mycobacterium avium intracellulare scrofulaceum complex isolates // J. Clin. Microbiol. -2005. v. 43. - p. 2567-2574.

214. Leite C., da Silva Rocha A., de Andrade Leite S. et al. A comparison of mycolic acid analysis for nontuberculous mycobacteria identification by thin-layer chromatography and molecular methods // Microbiol. Immunol. 2005. - v. 49. - p. 571-578.

215. Lerner C., Safdar A., Coppel S. Mycobacterium haemophilum infection in AIDS // Infect. Dis. Clin. Prac. 1995. - v. 4. - p. 233-236.

216. Leung K., Yip C., Cheung W. et al. Development of a simple and low- cost real-time PCR method for the identification of commonly encountered mycobacteria in a high throughput laboratory // J. Appl. Microbiol.- 2009.-v.l07(5).-p. 1433-1439.

217. Lewis A., Lasche E., Armstrong A. et al. A clinical study of the chronic lung disease due to nonphotochromogenic acid-fast bacilli // Ann. Intern. Med. 1960. - v. 53. - p. 273-285.

218. Leysen D., Haemers A., Pattyn S. Mycobacteria and the new quinolones // Antimicrob. Agents Chemother. 1989. - v. 33. - p. 1-5.

219. Li Z., Kang X., Yang Y. Detection and identification of the DNA between Mycobacterium tuberulosis and Mycobacterium nontubercu-losis by triplex polymerase chain reaction technique // Zhonghua Jie He He HuXi Za Zhi. 1998. - v. 21.-p. 547-551.

220. Lillis J., Ansdell V., Ruben K. Sequelae of World War II: an outbreak of chronic cutaneous nontuberculous mycobacterial infection among Satowanese islanders// Clin. Infect. Dis. 2009. - v.48(l 1) - p.1541-1546.

221. Linares M., Pelaez M., Casal M. Application of high-perfomance liquid crtromatography for identification of atypical mycobacteria // Clinical Mycobacteriology. 1998. - p. 185-188.

222. Linares M., Pelaez M., Casal M. Isolation of atypical mycobacteria from mycobacteria reference center in Spain // Int. J. Tuberc. Lung Dis. -1999. -v.3.-№9. -p. 181-182.

223. Liu Z., Cai X., Zhu P. et al. Study on species identification of Mycobacteria by gas chromatography analysis of whole-cell fatty acid // Zhonghua Jie He He Hu Xi Za Zhi. 2005. - v. 28. - p. 403-406.

224. Lovodic-Sivcev B., Vukelic A. Changes in the kidneys in patients with successire findings of Mycobacterium xenopi and Mycobacteriumfortuitum in urine: report of 16 cases // Med. Pregl. 1999. - v. 52. - № 9-10. -p. 334-342.

225. Lu D., Heeren B., Dunne W. Comparison of the Automated Mycobacteria Growth Indicator Tube System (BACTEC 960/MGIT) with Lowenstein-Jensen medium for recovery of mycobacteria from clinical specimens //Am. J. Clin. Pathol. -2002.- v.ll8(4).-p.542-545.

226. McSwiggan D., Collins C. The isolation of M. kansasii and M. xenopi from water systems // Tubercle. 1974. — v. 55. — p. 291-297.

227. Mahaisavariya P., Chaiprasert A., Khemngern S. et al. Nontu-berculous mycobacterial skin infections: clinical and bacteriological studies // J. Med. Assoc. Thai. 2003. - v. 86. - p. 52-60.

228. Maloney S., Welbel S., Daves B. et al. Mycobacterium absces-sus pseudoinfection traced to an automated endoscope washer: utility of epidemiologic and laboratory investigations // J. Infect. Dis. 1994. - v. 169. -p. 1166-1169.

229. Marras T., Daley C. Epidemiology of human pulmonary infection with nontuberculous mycobacteria // Clin. Chest Med. 2002. - v. 23. -p. 553-567.

230. Marras T., Daley C. A systematic review of the clinical significance of pulmonary Mycobacterium kansasii isolates in HIV infection // J. Acquir. Immune Defic. Syndr. 2004. - v. 36. - p. 883-889

231. Marsollier L., Andre J., Frigui W. et al. Early trafficking events of Mycobacterium ulcerans within Naucoris cimicoides // Cell Microbiol. -2007.-v. 9.-p. 347-355.

232. Martin-Casabona N., Bahrmand A., Bennedsen J. et al. Non-tuberculous mycobacteria: patterns of isolation. A multicountry retrospective survey // Int. J. Tuberc. Lung. Dis. 2004. - v. 8. - p. 1186-1193.

233. Matos E., Santana M., de Santana M. et al. Nontuberculosis mycobacteria at a multiresistant tuberculosis reference center in Bahia: clinical epidemiological aspects // Braz. J. Infect. Dis. 2004. - v. 8. - p. 296-304.

234. Mattila J., Katila M., Vornanen M. Slowly growing mycobacteria and chronic skin disorders // Clin. Infect. Dis. 1996. - v. 23. - p. 10431048.

235. Meissner G., Anz W. Sources of Mycobacterium avium-complex infection resulting in human disease // Am. Rev. Respir. Dis. 1977. -v. 116.-p. 1057-1064.

236. Miguez-Burbano M., Flores M., Ashkin D. et al. Non-tuberculous mycobacteria disease as a cause of hospitalization in HIV-infected subjects // Int. J. Infect. Dis. 2006. - v. 10. - p. 47-55.

237. Mishina D., Katsel P., Brown S. et al. On the etiology of Crohn disease // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 1996. - v. 93. - p. 9816-9820.

238. Mohamed A., Kuyper D., Iwen P. et al. Computational approach involving use of the internal transcribed spacer 1 region for identification of Mycobacterium species//J. Clin. Microbiol. 2005. - v. 43. - p. 3811-3817.

239. Mondragón-Barreto M., Vázquez-Chacón C., Barrón-Rivero C. et al. Comparison among three methods for mycobacteria identification // Salud Publica Méx.- 2000.-v.42(6).-p.484-489.

240. Morris AJ Relier LB. Reliability of formation in BACTEC media for presumptive idtntification of mycobacteria // J. Clin. Microbiol.- 1993.

241. Munjal S., Tripathi B., Paliwal O. Progressive immunopa-thological changes during early stage of experimental infection of goats with Mycobacterium avium subspecies paratuberculosis // Vet. Pathol. 2005. — v. 42.-p. 427-436.

242. Nalan P., Patel A. The epidemiology of human nontuberculous myco-bacterial disease in Queens land: 1985 to 1994 // Aust. and N. Z. J. Med. 1997. - v. 27. - № 2. - p. 216.

243. Narang R, Narang P, Mendiratta DK.Isolation and identification of nontuberculous mycobacteria from water and soil in central India // Indian. J. Med. Microbiol.- 2009 v.27(3) - p.247-250.

244. Nightingale S., Byrd L., Southern P. et al. Incidence of M. avium-intracellulare complex bacteremia in human immunodeficiency viruspositive patients // J. Infect. Dis. 1992. - v. 165. - p. 1082-1085.

245. Nightingale S., Cameron D., Gordin F. et al. Two controlled trials of rifabutin prophylaxis against Mycobacterium avium complex infections in AIDS // N. Engl. J. Med. 1993. - v. 329. - p. 828-833.

246. Nolt D., Michaels M., Wald E. Intrathoracic disease from nontuberculous mycobacteria in children: two cases and a review of the literature //Pediatrics.-2003.-v. 112.-p. 434.

247. O'Brien D., Currie B., Krause V. Nontuberculous mycobacte-rium disease in Northern Australia: a case series and review of the literature // Clin. Infect. Dis. 2000. - v. 31. - p. 958-968.

248. O'Brien R. The epidemiology of nontuberculous mycobacterial disease // Clin. Chest Med. 1989. - v. 10. - p. 407-418.

249. Olivier K. Nontuberculous mycobacterial pulmonary disease // Curr. Opin. Pulm. Med. 1998. - v. 4. - p. 148-153

250. Oliveira M., Fraga A., Torrado E. et al. Infection with Mycobacterium ulcerans induces persistent inflammatory responses in mice // Infect. Immun. 2005. - v. 73.-p. 6299-6310.

251. Ordway D., Henao-Tamayo M., Smith E. et al. Animal model of Mycobacterium abscessus lung infection // J. Leukoc. Biol. 2008. - v.

252. Ostroff S., Hutwagner L., Collin S. Mycobacterial species and drug resistance patterns reported by state laboratories 1992 // 93rd American

253. Society for Microbiology General Meeting, May 16, 1993. Atlanta, GA. -v. 9.-p. 170.

254. Park H., Jang H., Song E. et al. Detection and genotyping of Mycobacterium species from clinical isolates and specimens by oligonucleotide array // J. Clin. Microbiol. 2005. - v. 43. - p. 1782-1788.

255. Park H, Suh G, Chung M, et al. Comparison of clinical and radiographic characteristics between nodular bronchiectatic form of nontuber-culous //J. Korean Med Sei.- 2009. -v.24(3)-p.427-32.

256. Parti R., Srivastava S., Gachhui R. et al. Murine infection model for Mycobacterium fortuitum // Microbes Infect. 2005. — v.l.- p. 349-355.

257. Pate M., Jencic V., Zolnir-Dovc M. et al. Detection of mycobacteria in aquarium fish in Slovenia by culture and molecular methods // Dis. Aquat. Organ. 2005. - v. 64. - p. 29-35.

258. Patel J., Leonard D., Pan X. et al. Sequence-based identification of Mycobacterium species using the MicroSeq 500 16S rDNA bacterial identification system // J. Clin. Microbiol. 2000. - v. 38. - p. 246-251.

259. Patz E., Swenson S., Erasmus J. Pulmonary manifestation of nontuberculous mycobacteria // Radiol. Clin. North Am. 1995. - v. 33. - p. 719-729.

260. Piersimoni C., Scarparo C. Extrapulmonary infections associated with nontuberculous mycobacteria in immunocompetent persons // Emerg. Infect. Dis. -2009.-v.l5(9).-p.l351-1358.

261. Pinner M. Atypical acid fast microorganisms // Am. Rev. Tu-berc. 1935. - v. 32. - p. 424-445.

262. Pizzi R, Miller J.Amputation of a Mycobacterium marinum-infected hindlimb in an African bullfrog (Pyxicephalus adspersus). // Vet Ree.- 2005 v. 156(23) - p.747-8.

263. Polverosi R., Guarise A., Balestro E. et al. High-resolution CT of nontuberculous mycobacteria pulmonary infection in immunocompetent, non-HIV-positive patients // Radiol Med.- 2009,-v. 14. Epub ahead of print.

264. Portaeis F. Epidemiology of mycobacterial diseases // Clin. Dermatol. 1995. - v. 297. - p. 207-222.

265. Prearo M, Zanoni RG, Campo Dall'Orto B, Pavoletti E, et al. Mycobacterioses: emerging pathologies in aquarium fish // Vet Res Commun. 2004 Suppl v.315-317.

266. Primack S., Logan P., Hartman T. et al. Pulmonary tuberculosis and Mycobacterium avium-intracellulare: a comparison of CT findings // Radiology. 1995. - v. 194.-p. 413-417.

267. Primm T., Lucero C., Falkinham J. Health impact of environmental mycobacteria // Clin. Microbiol. Rev. 2004. - v. 17. - p. 98-106.

268. Prince D., Peterson D., Steiner R. et al. Infection with Mycobacterium avium complex in patients without predisposing conditions // N. Engl. J. Med. 1989. - v. 321. - p. 863-868.

269. Razonable R. Nontuberculous mycobacterial infections after transplantation: a diversity of pathogens and clinical syndromes // Transpl. Infect. Dis.- 2009.-v.l l(3).-p.191-194.

270. Reddy V., Luna-Herrera J., Gangadharam P. Pathobiological significance of colony morphology in Mycobacterium avium complex // Mi-crob. Pathog.- 1996.-v. 21.-p. 97-109.

271. Reuss A., Wiese-Posselt M., Weimann B. et al. Incidence rate of nontuberculous mycobacterial disease in immunocompetent children: a prospective nationwide surveillance study in germany // Pediatr. Infect. Dis. J.-2009 v.28(7)- p.642-644.

272. Richardson E., Samson D, Banaei N. Rapid Identification of Mycobacterium tuberculosis and nontuberculous mycobacteria by multiplex, real-time PCR// J. Clin. Microbiol.- 2009 v.47(5) - p.1497-1502.

273. Richter E., Wessling J., Lügering N. et al. Mycobacterium avium subsp. paratuberculosis infection in a patient with HIV, Germany // Emerg. Infect. Dis. 2002. - v. 8. - p. 729-731.

274. Roque S., Nobrega S., Appelberg R. et al. IL-10 underlies distinct susceptibility of BALB/c and C57BL/6 mice to Mycobacterium avium infection and influences efficacy of antibiotic therapy // J. Immunol. 2007. -v. 178.-p. 8028-8035.

275. Rosezweig D. Pulmonary mycobacterial infections due to Mycobacterium intracellulare-avium complex: clinical features and course in 100 consecutive cases // Chest. 1979. - v. 75. - p. 115-119.

276. Roth A., Fischer M., Hamid M. et al. Differentiation of phy-logenetically related slowly growing mycobacteria based on 16S-23S rRNA gene internal transcribed spacer sequence // J. Clin. Microbiol. 1998. - v. 36.-p. 139-147.

277. Roux A., Catherinot E., Ripoll F. et al. Jean-Louis Herrmann for the OMA Group.Multicenter study of prevalence of nontuberculous mycobacteria in patients with cystic fibrosis in France // J. Clin. Microbiol. -2009.-v.47(12).-p.4124-4128

278. Rushton S., Goodfellow M., O'Donnell A. et al. The epidemiology of atypical mycobacterial diseases in northern England: a space-time clustering and generalized linear modelling approach // Epidemiol. Infect. -2007.-v. 135.-p. 765-774.

279. Sakatani M. Nontuberculous mycobacteriosis: the present status of epidemiology and clinical studies // Kekkaku. 1999. - v. 74. - № 4. - p. 377-384.

280. Sakatani M. The non-tuberculous mycobacteriosis // Kekkaku. -2005.-v. 80.-p. 25-30.

281. Sakatani M., Nakajima Y. Treatment of non-tuberculous pulmonary mycobacteriosis // Kekkaku. 2006. - v. 81. - p. 35-50.

282. Sampaio J., Artiles N., Pereira R. et al. Mycobacterium simiae infection in a patient with acquired immunodeficiency syndrome // Braz. J. Infect. Dis.-2001.-v. 5.-p. 352-355.

283. Samra Z., Kaufman L., Pitlik S. et al. Emergence of Mycobacterium simiae in respiratory specimens // Scand. J. Infect. Dis. 2005. - v. 37. -p. 838-841.

284. Sarmentó de Castro R., Vasconcelos O., Horta A. et al. Atypical mycobacteria infections // Acta. Med. Port. 1999. - v. 12. - p. 371-379.

285. Scarparo C., Piccoli P., Rigon A. et al. Direct identification from MB/BacT alert 3D bottles: comparative evaluation of two commercial probe assays //J. Clin. Microbiol. 2001. - v. 39. - p. 3222-3227.

286. Schaad U., Votteler T., McCracken H. et al. Management of atypical mycobacterial lymphadenitis in childhood: a review based on 380 cases // J. Pediatr. 1979. - v. 95. - p. 356-360.

287. Schroder K., Kazda J., Muller K. et al. Isolation of Mycobacterium simiae from the environment // Zentralbl. Bakteriol. 1992. - v. 277. -p. 561-564.

288. Schulze-Robbecke R. Mycobacteria in the environment // Immun. Infect. 1993. - v. 21. - p. 126-131.

289. Shafer R., Sierra M. Mycobacterium xenopi, Mycobacterium fortuitum, Mycobacterium kansasii, and other non-tuberculous mycobacteria in an area of endemicity for AIDS // Clin. Infect. Dis. 1992. - v. 15. - p. 161-162.

290. Sherer R., Sable R., Sonnenberg M. et al. Disseminated infection with Mycobacterium kansasii in the Acquired Immunodeficiency Syndrome // Ann. Intern. Med. 1986. - v. 105. - p. 710-712.

291. Shin J., Lee H., Cho E., et al. Targeting the rpoB gene using nested PCR-restriction fragment length polymorphism for identification ofnontuberculous mycobacteria in hospital tap water // J. Microbiol.- 2008 -v.46(6)-p.608-614.

292. Siddiqi S.H., Laszlo A, Buthler W. R. et el. Bacteriological investigation of unusual mycobacteria isolated from immuno-compromised patients // Diagn. Microbiol. Infect. DIS. 1993.- v. 6.-p. 321-323

293. Singh S., Gopinath K., Shahdad S. et al. Nontuberculous mycobacterial infections in Indian AIDS patients detected by a novel set of ESAT-6 polymerase chain reaction primers // Jpn. J. Infect. Dis. 2007. - v. 60. - p. 14-18.

294. Smith D., Hansch H., Bancroft G. et al. T cell independent mechanisms of granuloma formation in M. avium infection: role of TNFa and IFNy//Immunology. 1997. - v. 92. - p. 413-419.

295. Somoskovi A, Mester J, Hale Y, Parsons L, Salfinger M. Laboratory diagnosis of nontuberculous mycobacteria // Clin. Chest. Med.- 2002.-v. 23(3).-p.585-597.

296. Sorlozano A., Soria I., Roman J. et al. Comparative evaluation of three culture methods for the isolation of mycobacteria from clinical samples //J. Microbiol. Biotechnol.- 2009.- v.l9(10).-pl259-1264.

297. Stager C., Libonati J., Siddiqi S. et al. Role of solid media when used in conjunction with the BACTEC system for mycobacterial isolation and identification// J. Clin. Microbiol.- 1991.-v.29(l).-p.l54-157.

298. Starke J. Mycobacterial infections // Handb. Clin. Neurol. -2010.-v.96.-p.l59-177.

299. Stavri H., Branaru-Gheorghiu M., Moldovan O. et al. Rapid immunochromatographic serum assay of nontuberculous mycobacterial infections // Roum. Arch. Microbiol. Immunol. 2005. - v. 64. - p. 42-49.

300. Steadham J. High-catalase strains of M. kansasii isolated from water in Texas // J. Clin. Microbiol. 1980. - v. 11. - p. 496-498.

301. Steadham J., Stall S., Simmank J. Use of the BACTEC system for drug susceptibility testing of Mycobacterium tuberculosis, M. kansasii, and M. avium complex // Diagn. Microbiol. Infect. 1985. - v. 3. - p. 33-40.

302. Stracher A., Sepkowitz K. Atypical mycobacterial infections in HIV disease // AIDS Reader. 1995. - p. 14-25.

303. Swaim L., Connolly L., Volkman H. et al. Mycobacterium marinum infection of adult zebrafish causes caseating granulomatous tuberculosis and is moderated by adaptive immunity // Infect. Immun. 2006. - v. 74.-p. 6108-6117.

304. Swenson J., Wallace R., Silcox V. et al. Antimicrobial susceptibility testing of 5 subgroups of Mycobacterium fortuitum and Mycobacterium chelonae // Antimicrob. Agents Chemother. 1985. - v. 28. - p. 807-811.

305. Szabo I. Mycobacterium chelonei endemy after heart surgery with fatal consequences // Am. Rev. Respir. 1980. - v. 121. - p. 607-611.

306. Tabarsi P, Baghaei P, Farnia P, et al. Nontuberculous mycobacteria among patients who are suspected for multidrug-resistant tuberculosis-need for earlier identification of nontuberculosis mycobacteria // Am. J. Med.-2009.-v.337(3)-p. 182-184.

307. Tanaka H., Yamada Y., Ito E. Differential diagnosis of pulmonary mycobacterial infection; radiological findings mimicking tuberculous ornontuberculous mycobacterial pneumonia // Kekkaku.- 2009.-v.84(8).-p.585-590.

308. Tanaka I., Anno I., Leite S. et al. Comparison of a multiplex-PCR assay with mycolic acids analysis and conventional methods for the identification of mycobacteria //Microbiol. Immunol.- 2003.-v.47(5).-p.307-312.

309. Tellis C., Putnam J. Pulmonary disease caused by Nontubercu-losis mycobacteria // Med. Clin. North Am. 1980. - v. 64. - p. 433-446.

310. Thibert L., Lapierre S. Routine application of high-performance liquid chromatography for identification of mycobacteria / /J. Clin. Microbiol.- 1993 .-v.31 (7).-p. 1759-1763.

311. Thorel M., Huchzermeyer H., Michel A. Mycobacterium avium and Mycobacterium intracellulare infection in mammals // Rev. Sci. Tech. -2001.-v. 20.-p. 204-218.

312. Timpl A., Runyon E. The relationship of atypical acid-fast bacteria to human disease: a preliminary report // J. Lab. Clin. Med. 1954. — v. 44.-p. 202-209.

313. Tomioka H. Bacteriology of mycobacteria: taxonomic and morphological characteristics // Nippon. Rinsho. 1998. - v. 56. - p. 3001-3007.

314. Torkko P., Suomalainen S., Iivanainen E. et al. Characterization of Mycobacterium bohemicum isolated from humam, veterinary, and environmental sources // J. Clin. Microbiol. 2001. - v. 39. - p. 207-211.

315. Tortoli E. Impact of genotypic studies on mycobacterial taxonomy: the new mycobacteria of the 1990s // Clin. Microbiol. Rev. 2003. - v. 16.-p. 319-354.

316. Tortoli E. Clinical manifestations of nontuberculous mycobacteria infections // Clin. Microbiol. Infect. 2009.-v.l5(10).-p.906-910.

317. Tortoli E., Bartolom A., Burrinic et al. Identification of nontuberculous mycobacteria: conventional tests versus HPLC of micolic acids: a four year experience // Clinical Mycobacteriology. 1998. - p. 189-191.

318. Tortoli E., Nanetti A., Piersimoni C. et al. Performance assessment of new multiplex probe assay for identification of mycobacteria // J. Clin. Microbiol.-2001.-v. 39.-p. 1079-1084.

319. Tortoli E., Bartolom A., Böttger E. et al. Burden of unidentifiable mycobacteria in a reference laboratory // J. Clin. Microbiol. 2001. - v. 39. -p. 4058-4065.

320. Tortoli E., Rogasi P., Fantoni E. et al. Tuberculosis-like infection, due to a novel mycobacterium, mimicking MDR-TB // Clin Microbiol Infect.- 2009.- v. 14. Epub ahead of print.

321. Torvinen E., Suomalainen S., Lehtola M. et al. Mycobacteria in water and loose deposits of drinking water distribution systems in Finland // Appl. Environ. Microbiol. 2004. - v. 70. - p. 1973.

322. Tremblay V, Ayad T, Lapointe A, et al. Nontuberculous mycobacterial cervicofacial adenitis in children: epidemiologic study // J. Otolaryngol. Head Neck Surg.- 2008- v.37(5) p.616-22.

323. Trott K., Stacy B., Lifland B. et al. Characterization of a Mycobacterium ulcerans-like infection in a colony of African tropical clawed frogs (Xenopus tropicalis) // Comp. Med. 2004. - v. 54. - p. 309-317.

324. Tsai H., Kunin C., Lee S. et al. Fish gambler's tenosynovitis caused by Mycobacterium marinum: environmental investigation of a fishing pond in Southern Taiwan // Diagn. Microbiol. Infect. Dis. 2007. - v. 59. - p. 227-230.

325. Tsukamura M., Kita N, Shimoide H. et al. Studies on the epidemiology of nontuberculous mycobacteriosis in Japan // Amer. Rev. resp. Dis. 1988. -v. 137. - № 6. - p. 1280-1284.

326. Wagner D., Young L. Nontuberculous mycobacterial infections: a clinical review // Infection. 2004. - v. 32. - p. 257-270.

327. Wallace R., Jones D., Wiss K. Sulfonamide activity against Mycobacterium fortuitum and Mycobacterium chelonae // Rev. infect. Dis. -1981. v. 3. - p. 898-904.

328. Wallace R., Swenson J., Silcox V. et al. Spectrum of disease due to rapidly growing mycobacteria // Rev. Infect. Dis. 1983. - v. 5. - p. 657679.

329. Wallace R., Nash D., Tsukamura M. et al. Human disease due to Mycobacterium smegmatis // J. Infect. Dis. 1988. — v. 158. - p. 52-59.

330. Wallace R.} Musser J., Hull S. et al. Diversity and sources of rapidly growing mycobacteria associated with infections following cardiac surgery // J. Infect. Dis. 1989. - v. 159. - p. 708-716.

331. Wallace R., O'Brien R., Glassroth J. et al. Diagnosis and treatment of disease caused by nontuberculous mycobacteria (ATS statement) // Amer. Rev. resp. Dis. 1990. - v. 142. - p. 940-953.

332. Wallace R., Glassroth J., Griffith D. et al. Diagnosis and treatment of disease caused by nontuberculous mycobacteria (American Thoracic Society Statement) // Am. J. Respir. Crit. Care Med. 1997. - v. 156. - p. 125.

333. Wallace R., Brown-Elliott B., Ward S. et al. Activities of line-zolid against rapidly growing mycobacteria // Antimicrob. Agents Chemother. 2001. - v. 45.-p. 764-767.

334. Wayne L., Sramek H. Agents of newly recognized or infrequently encountered mycobacterial diseases // Clin. Microbiol. Rev. 1992. -v. 5.-p. 1-25.

335. Weitzman I., Osadezyl D., Corrado N. et al. Mycobacteriumthermoresistibile: a new pathogen for humans // J. Clin. Microbiol. 1981. — v. 14. p. 593-595.

336. Wenger J., Spika J., Smithwick R. et al. Outbreak of Mycobacterium chelonae infection associated with use of jet injectors // J.A.M.A. -1990.-v. 264.-p. 373-376.

337. Whipps C., Dougan S., Kent M. Mycobacterium haemophilum infections of zebrafish (Danio rerio) in research facilities // FEMS Microbiol. Lett. 2007. - v. 270. - p. 21-26.

338. Williams M., Yakrus M., Arduino M. et al. Structural analysis of biofilm formation by rapidly and slowly growing nontuberculous mycobacteria // Appl. Environ. Microbiol. -2009. v.75(7) - p.2091-8.

339. Winter S., Bernard E., Gold J. et al. Humoral response to disseminated infections by Mycobacteria avium-intracellulare in the acquired immunodeficiency syndrome and haity cell leukemia // J. Infect. Dis. 1985. -v. 151.-p. 523-527.

340. Wolinsky E. Nontuberculous mycobacteria and associated disease // Am. Rev. Respir. Dis. 1979. - v. 119. - p. 107-159.

341. Wolinsky E. Mycobacterial diseases other than tuberculosis // Clin. Infect. Dis. 1992. - v. 15. - p. 1-12.

342. Wolinsky E. Mycobacterial lymphadenitis in children: a prospective study of 105 nontuberculous cases with long-term follow-up // Clin. Infect. Dis. 1995. - v. 20. - p. 954-963.

343. Wolinsky E., Rynearson T. Mycobacteria in soil and their relation to disease-associated strains // Am. Rev. Respir. Dis. 1968. — v. 97. — p. 1032-1037.

344. Woodley C., Kilburn J. In vitro susceptibility of Mycobacterium avium complex and Mycobacterium tuberculosis strains to a spiro-piperidyl rifamycin // Am. Rev. Respir. Dis. 1982. - v. 126. - p. 586-587.

345. Woods G., Washington J. Mycobacteria other than Mycobacterium tuberculosis: review of microbiologic and clinical aspects // Rev. infect. Dis. -1987,-v. 9.-p. 275-294.

346. Woods G. The mycobacteriology laboratory and new diagnostic techniques // Infect. Dis. Clin. North Am. 2002 -v. 16(l)-p. 127-44.

347. Yano T., Okuda S., Kato K. et al. Mycobacterium kansasii osteomyelitis in a patient with AIDS on highly active antiretroviral therapy // Intern. Med. 2004. - v. 43. - p. 1084-1086.

348. Yates M., Paznik A., Uttley H. et al. Isolation of environment mycobacreria from clinical specimens in South-East England: 1973-1993 // Int. J. Tuberc. Lung Dis. 1997. - v. 1. - № 1. - p. 75-80.

349. Yeager H., Raleigh J. Pulmonary disease due to Mycobacterium intracellular // Am. Rev. Respir. Dis. 1973. - v. 108. - p. 547-552.

350. Zaugg M., Salfmter M., Opravil M. et al. Extrapulmonary and disseminated infections due to Mycobacterium malmoense: case report and review // Clin. Infect. 1993. - v. 16. - p. 540-549.

351. Zhang O., Kennon R., Koza M. et al. Pseudoepidemic due to a unique strain of Mycobacterium szulgai: genotypic, phenotypic, and epidemiological analysis // J. Clin. Microbiol. 2002. - v. 40. - p. 1134-1139.

352. Zenone T., Boibieux A., Tigaud S. et al. Non-tuberculous mycobacterial tenosynovitis: a review // Scand. J. Infect. Dis. 1999. - v. 31. -p. 221-228.