Разработка и применение молекулярно-генетических методов для идентификации микобактерий - возбудителей заболеваний человека тема диссертации и автореферата по ВАК РФ 03.00.07, доктор биологических наук Вишневская, Елена Борисовна

• Вишневская, Елена Борисовна
• доктор биологических наук
• 2000

Оглавление диссертации доктор биологических наук Вишневская, Елена Борисовна

ВВЕДЕНИЕ.

ГЛАВА 1. ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ.

1.1. Род микобактерий.

1.2. Молекулярно-генегические методы исследования микобактерий.

1.3. Идентификация вакцинного штамма M.bovis BCG.

1.4. L-формы микобактерий.

1.5. Плазмиды микобактерий.

ГЛАВА 2. МАТЕРИАЛ И МЕТОДЫ ИССЛЕДОВАНИЯ.

2Л. Исследование L-форм микобактерий.

2.2. Выделение ДНК из образцов патологического материала для полимеразной цепной реакции.

2.3. Полимеразная цепная реакция.

2.4. Лигазная цепная реакция.

2.5. Методы выделения плазмид нетуберкулезных микобактерий.

ГЛАВА 3. ПРИМЕНЕНИЕ МОЛЕКУЛЯРНО-ГЕНЕТИЧЕС-КИХ МЕТОДОВ ДЛЯ ИДЕНТИФИКАЦИИ МИКОБАКТЕРИЙ В БИОЛОГИЧЕСКИХ ОБРАЗЦАХ.

3.1 .Разработка схемы выявления микобактерий в клинических образцах методом ПЦР.

3.2. Идентификация М. bovis BCG в клинических образцах методом ПЦР.

3.3. Эффективность применения амплификационных методов для выявления М. tuberculosis.

ГЛАВА 4. ИЗУЧЕНИЕ L-ФОРМ M.tuberculosis С ПРИМЕНЕНИЕМ ПОЛИМЕРАЗНОЙ ЦЕПНОЙ РЕАКЦИИ.

4.1. Верификация принадлежности L-форм к M.tuberculosis complex.

4.2. Видовая идентификация L-форм, принадлежащих к M.tuberculosis complex, и их генетические особенности.

ГЛАВА 5. ИЗУЧЕНИЕ ПЛАЗМИДНОГО ПРОФИЛЯ МИКО-БАКТЕРИЙ - ВОЗБУДИТЕЛЕЙ МИКОБАКТЕРИ-ОЗОВ У ЖИТЕЛЕЙ СЕВЕРО-ЗАПАДНОГО РЕГИОНА РОССИЙСКОЙ ФЕДЕРАЦИИ.

ОБСУЖДЕНИЕ РЕЗУЛЬТАТОВ.

ВЫВОДЫ.

Введение диссертации (часть автореферата) на тему «Разработка и применение молекулярно-генетических методов для идентификации микобактерий - возбудителей заболеваний человека»

Актуальность проблемы.

В 90-е годы во всем мире отмечен рост заболеваемости туберкулезом, который по уровню смертности занимает одно из первых мест среди инфекционных заболеваний (Baiter, 1999). Даже в тех странах, в которых в течение последних пятидесяти лет наблюдали постоянное снижение числа вновь заболевших, сегодня говорят об угрозе новой эпидемии туберкулеза. Раннее выявление и диагностика туберкулеза являются актуальной задачей в борьбе с этим заболеванием. Известно, что при вовремя и правильно назначенном лечении с помощью современных методов химиотерапии возможно излечение до 98% больных (Fox, 1981). Существует предположение, что даже в развитых странах до 5% больных туберкулезом остаются невыявленными и не получают своевременной противотуберкулезной терапии, что приводит к увеличению смертности от туберкулеза (Saltini, Ivanyi, 1995).

Основным критерием при постановке диагноза туберкулез остается выделение возбудителя - Mycobacterium tuberculosis. В то же время, на ранних стадиях заболевания культура микобактерий выделяется не более чем у 20% больных. На более поздних стадиях туберкулеза легких бактериологическое подтверждение туберкулеза получают в 50 - 90% случаев. При туберкулезе внелегочных локализаций эти цифры значительно ниже - 20 - 50% (Вишневский Б.И., Качанова Н.К., 2000). Наиболее широко распространенные методы культурального исследования на плотных питательных средах занимают месяцы. Современные варианты выделения возбудителя туберкулеза с применением жидких сред, автоматизированные системы ВАСТЕС, MGIT и другие позволяют сократить срок исследования до недель. Наиболее быстрым методом выявления микобактерий является бактериоскопия, но она не дает возможности дифференцировать M.tuberculosis от нетуберкулезных микобактерий. Кроме того, далеко не все образцы клинического материала содержат достаточное для обнаружения с помощью микроскопии количество микобактериальных клеток. Таким образом, разработка методов быстрого и специфичного выявления M.tuberculosis является актуальной задачей лабораторной диагностики туберкулеза.

С конца 80-х годов широкое распространение получают молекулярные методы диагностики инфекционных заболеваний, основанные на выявлении специфической ДНК или РЕПС возбудителя. Одним из наиболее развитых методов молекулярной диагностики является полимеразная цепная реакция. Этот метод, одним из первых представленный Saiki et al. в 1985 г., позволяет с высокой степенью чувствительности и специфичности выявлять даже несколько копий ДНК возбудителя, присутствующих в биологическом материале, что дает возможность применять его непосредственно при исследовании клинических образцов. Метод ПЦР по праву относится к экспресс-методам диагностики, так как результат анализа может быть получен в течение одного дня.

Метод полимеразной цепной реакции (ПЦР) для выявления M.tuberculosis непосредственно в клинических образцах применяется уже довольно давно, при этом чувствительность различных ПЦР-диагностикумов варьирует в широких пределах. Особую важность этот метод приобретает в случаях внелегочного туберкулеза, при котором стандартные методы бактериологического исследования часто оказываются неэффективными. В то же время, при работе с олигобациллярными образцами появляется и ряд новых проблем (Tan, Ng, 1997). Данные различных зарубежных исследователей об эффективности ПЦР при внелегочном туберкулезе весьма разноречивы

Tortoli et al., 1997; Saltini, 1998).

Пути повышения эффективности ПЦР ряд исследователей усматривает в совершенствовании методов экстракции ДНК возбудителя из клинического материала (Lisby, 1999; Veloso, 2000). Для наиболее успешного проведения ПЦР целесообразно применять комплексные методики, включающие глубокий лизис образца и тщательную очистку ДНК (Saltini е.а., 1998), однако подобные методики оказываются слишком сложными и многостадийными. Поиск оптимальных путей подготовки образца для анализа амплификационными методами является актуальной задачей молекулярной диагностики.

В структуре детского туберкулеза в России значительное место занимают заболевания, вызванные вакцинным штаммом BCG. Стандартные методы идентификации M.bovis BCG трудоемки и не всегда точны; более того, диагностика таких заболеваний затруднена из-за низкой высеваемости возбудителя (Коваленко К.Н., 2000). В этом случае чувствительные и специфичные методы молекулярной диагностики также могут оказаться очень полезными.

Одной из первоочередных задач бактериологической диагностики туберкулеза является повышение эффективности выделения культур микобактерий и их быстрая видовая идентификация. Известно, что помимо типичных клеточных форм, микобактерии могут присутствовать в макроорганизме в виде измененных вариантов, L-форм (Дорожкова И.Р. и др., 1980; Коваленко И.В., 1989). Однако, хотя методы выделения L-форм микобактерий из биологических образцов разработаны уже более двух десятилетий назад, вопрос точной видовой идентификации выделенных L-форм до сих пор остается не решенным окончательно. В мировой литературе существуют противоположные взгляды на проблему L-форм, ряд исследователей ставит под сомнение само существование такого рода измененных микроорганизмов, в то время как другие считают фазу L-трансформации естественной фазой жизненного цикла [224]. Для разрешения этой проблемы целесообразно применение молекулярно-генетических методов, позволяющих проводить идентификацию выделенных L-форм на уровне генома.

В последние десятилетия обострилась проблема заболеваний, вызываемых нетуберкулезными микобактериями - микобактериозов (Оттен Т.Ф., 1994), особенно у ВИЧ-инфицированных и больных СПИДом. Для прогнозирования течения заболевания и назначения адекватного лечения необходимо знать основные биологические свойства возбудителя. Особенности биохимических свойств микроорганизмов во многих случаях определяются наличием плазмид, несущих гены, ответственные за синтез биологически активных веществ. Многие исследователи сообщали о плазмидах у нетуберкулезных микобактерий (Meissner, Falkinham, 1986; Crawford, Bates, 1986), но четкой взаимосвязи между наличием плазмид и биологическими свойствами установлено не было. До сих пор нет работ, посвященных прямому исследованию плазмидного профиля у различных видов микобактерий, вегетирующих на территории Российской Федерации. Вопрос о наличии плазмид у микобактерий туберкулезного комплекса также остается открытым (Cole, Telenti, 1995).Таким образом, несмотря на пристальное внимание ученых к проблеме плазмид у микобактерий, этот предмет все еще требует изучения.

Все вышеперечисленные проблемы, встающие перед исследователями микобактерий - возбудителей заболеваний человека, определяют цели и задачи работы.

ЦЕЛЬ ИССЛЕДОВАНИЯ:

Целью настоящего исследования явилась разработка и использование молекулярно-генетических методов для идентификации возбудителей туберкулеза и микобактериозов в клиническом материале.

Задачи работы:

1. Оценить эффективность амплификационных методов выявления микобактерий в нереспираторных клинических образцах и идентифицировать M.bovis BCG непосредственно в биологическом материале.

2. Разработать схему применения молекулярно-генетических методов в диагностике туберкулеза и микобактериозов.

3. Идентифицировать L-формы микобактерий с помощью полимеразной цепной реакции.

4. Определить плазмидный профиль микобактерий и установить взаимосвязь наличия плазмид с биологическими свойствами штаммов.

Научная новизна:

1. Разработан дифференцированный подход для выявления микобактерий в различных типах клинических образцов методом ПЦР.

2. Разработана схема применения молекулярно-генетических методов в диагностике заболеваний, вызываемых микобактериями.

3. Предложен экспресс-метод определения M.bovis BCG в клинических образцах.

4. С помощью молекулярно-генетических методов доказана микобактериальная природа L-форм, выделяемых из клинических образцов при туберкулезе, и определены особенности структуры ДНК микобактериальных L-форм. 5. Охарактеризован плазмидный профиль микобактерий, выделенных от больных, проживющих в Северо-Западном регионе Российской Федерации и установлена связь между частотой выделения плазмид и жизнеспособностью микобактерий.

Практическая значимость исследования:

По теме диссертации:

- направлена заявка на изобретение «Способ бактериологической диагностики туберкулеза», получена приоритетная справка № 2000103371 от 10.02.2000 г.

- опубликовано 22 работы, 2 находятся в печати.

- утверждены Минздравом России Методические рекомендации "Методы выделения ДНК для диагностики внелегочного туберкулеза путем полимеразной цепной реакции" (№ 99/154, 1999 г.).

- представлены на утверждение в Минздрав России Методические рекомендации: "Повышение эффективности этиологической диагностики внелегочного туберкулеза".

Основные положения диссертации, выносимые на защиту.

1. Эффективность применения полимеразной цепной реакции для выявления M.tuberculosis в биологических образцах от больных внелегочным туберкулезом, которая достигнута за счет дифференцированного подхода к выделению ДНК из различных типов проб, превосходит эффективность стандартных бактериологических методов (микроскопии и посева) в 2 - 20 раз.

Предложенная схема применения молекулярно-генетических тестов позволяет проводить ускоренную идентификацию и исследование биологических свойств микобактерий различных видов.

2. L-формы, выделяемые из биологических образцов от больных внелегочным туберкулезом и идентифицированные методом полимеразной цепной реакции в 85% случаев принадлежат к М.tuberculosis и к M.bovis BCG, при этом ДНК культур L-форм не всегда содержит инсерционный элемент IS 6110.

3. Нетуберкулезные микобактерии - возбудители микобактериозов, выделяемые от больных, проживающих в Северо-Западном регионе РФ, содержат плазмиды: М.avium - 28% штаммов, M.chelonae -37,5% и M.fortuitum - 49%. Наличие плазмид взаимосвязано с биологической активностью микобактерий.

Апробация работы.

Материалы диссертации доложены на:

СПб научном обществе микробиологов (1997, 1998, 1999, 2000), Европейском ежегодном семинаре микобактериологов (Париж, 1996), русско-финском совещании по проблеме инфекционных заболеваний (Турку, 1997, Хельсинки, 1998, СПб, 1999), русско-финском семинаре по проблемам туберкулеза (СПб, 1998, 1999), Научно-практической конференции СПбНИИФ (1997, 1998), Всероссийском съезде микробиологов и эпидемиологов (Москва, 1998), пленуме Межведомственного научного совета РАМН и МЗ РФ по туберкулезу и гранулематозным заболеваниям легких (Москва, 1998), Всероссийской научно-практической конференции "ПЦР-диагностика инфекционных заболеваний" (СПб, 1998),

Заключение диссертации по теме «Микробиология», Вишневская, Елена Борисовна

ВЫВОДЫ

1. Использование современных молекулярно-генетических методов позволило повысить эффективность выявления микобактерий туберкулезного комплекса в биологических образцах при внелегочном туберкулезе в 2 - 20 раз по сравнению со стандартными бактериологическими методами.

2. Показана высокая чувствительность и специфичность методов полимеразной цепной реакции и лигазной цепной реакции для выявления М. tuberculosis из внелегочного материала.

3. Предложен метод идентификации вакцинного штамма M.bovis BCG методом полимеразной цепной реакции непосредственно в клинических образцах.

4. С помощью молекулярно-генетических методов установлено, что 85% L-форм, изолируемых из клинического материала, полученного от больных внелегочным туберкулезом, относятся к представителям микобактерий туберкулезного комплекса (М tuberculosis и М. bovis BCG).

5. Выявлено, что генетическая структура L-форм М. tuberculosis отличается от генетической структуры клеточных форм.

6. Анализ плазмидного спектра основных видов нетуберкулезных микобактерий - возбудителей микобактериозов у жителей СевероЗападного региона России показал, что наиболее часто плазмиды встречаются у M.fortuitum (48,4%), реже всего - у M.avium (30,2%), M.chelonae занимают промежуточную позицию (40%). Для M.fortuitum характерно наличие двух-трех плазмид в штамме, в то время как большинство штаммов M.avium несут одну плазмиду. У штаммов М. tuberculosis плазмид не обнаружено.

ПРАКТИЧЕСКИЕ РЕКОМЕНДАЦИИ:

Для быстрой и надежной видовой идентификации L-форм микобактерий и повышения эффективности бактериологической диагностики туберкулеза целесообразно применять метод полимеразной цепной реакции с видоспецифичными для M.tuberculosis и M.bovis BCG праймерами.

Для выделения ДНК из патологического материала и снижения ингибирования ПЦР клиническими образцами целесообразно применять модифицированные методы, сочетающие глубокий лизис и тщательную очистку генного материла. Применение модифицированных методов позволяет позволяют повысить эффективность выявления микобактерий туберкулеза методом ПЦР:

- Для анализа биологических жидкостей и мягких тканей -в случае очистки гель-фильтрацией - на 35%; для варианта с применением сорбента-на 18%;

- Для анализа костей, суставов и плотных тканей - на 25 - 30%.

При выявлении M.tuberculosis методом ПЦР следует учитывать зависимость эффективности ПЦР от типа клинического образца. Рекомендуемый для исследования материал:

- При гинекологическом туберкулезе - ткань эндометрия или биоптаты маточных труб;

- При туберкулезе костей у детей - фрагменты костей;

- При туберкулезе костей у взрослых - гной, некротические массы;

- При туберкулезе суставов - параллельное исследование синовиальной жидкости и синовиальной оболочки.

Список литературы диссертационного исследования доктор биологических наук Вишневская, Елена Борисовна, 2000 год

1. Альварес Фигероа М.В., Лепеха Л.Н., Никоненко Б.В. и др.// Выявление Mycobacterium tuberculosis в крови методом ПЦР (экспериментальная модель)//'Тенодиагностика в современной медицине". - М., 2000. - С. 277 - 279.

2. Беллендир Э.Н. Патогенез внелегочных локализаций туберкулеза// Внелегочный туберкулез. Руководство для врачей/ ред. А.В.Васильев: СПб, 2000-С. 38-49.

3. Бухарин О.В., Усвяцов Б.Я., Голанов B.C. и др. способ прогнозирования течения туберкулезного процесса в легких. Патент RU 2121302 // РЖ "Туберкулез". 1999. - №1. - С. 21-23.

4. Вишневский Б.И., Оттен Т.Ф. Актуальные вопросы современной микобактериологии//Новые технологии в диагностике и лечении туберкулеза различных органов и систем СПб, 1998.- т.1.- С.21 - 23.

5. Вишневский Б.И., Качанова Н.К. Микробиологические методы исследования// Внелегочный туберкулез. Руководство для врачей/ ред. А.В.Васильев: СПб, 2000 С. 114 - 123.

6. Гамалея Н.Ф. Гетероморфизм бактерий под влиянием солей лития//

7. Врач. 1894.-Т. 15.-С. 541.

8. Голышевская В.И., Корнеев А.А., Черноусова JI.H. Биологическая характеристика M.tuberculosis и трудности микробиологической диагностики туберкулеза// Пробл.Туб. 1995. - №2. - С. 30 - 32.

9. Голышевская В.И., Корнеев А. А., Черноусова JI.H. Микробиологическая диагностика туберкулеза// Вестн.Рос.Акад.наук.1995.-№7.-С. 16-18.

10. Голышевская В.И., Корнеев А. А., Черноусова Л.Н. Новые микробиологические методы в диагностике туберкулеза// Пробл.Туб.1996,- №6. -С. 22-25.

11. Голышевская В.И., Черноусова Л.Н., Шишкина Е.Ф. и др. Применение ПЦР для диагностики туберкулеза легких// "Полимеразная цепная реакция в диагностике и контроле лечения инфекционных заболеваний". М., 1998. - С. 93 - 94.

12. Демкин В.В., Скотникова О.И., Николаева Н.П. и др. Эффективность выявления микобактерий туберкулезного комплекса тест-системой, основанной на использовании принципа нестед ПЦР// "Генодиагностика в современной медицине". М., 2000. - С. 268 - 271.

13. Дорожкова И.Р., Земскова З.С. Формы персистирования микобактерий туберкулеза в организме практически здоровых в отношении туберкулеза людей // Журн.микробиол. 1973. - №1. - С. 115-119.

14. Дорожкова И.Р., Волк А.В. Фазы морфогенеза L-форм микобактерий туберкулеза, полученных под влиянием различных антибиотиков и туберкулостатических препаратов// Журн.микробиол. 1973. - №11. - С. 12-18.

15. Дорожкова И.Р., Кочемасова З.Н., Дыхно М.М. Выделение L-форм микобактерий туберкулеза из патологического материала. Методические рекомендации МЗ СССР. М.,1984. - 19 с.

16. Дорожкова И.Р., Карачунский М.А., Абдуллаев Э.Т. и др. Выявление L-форм МБТ как прогностический критерий рецидивов и обострений туберкулеза у больных с большими остаточными изменениями в легких//Пробл. туб. 1989. - № 3. - С. 14 - 17.

17. Иртуганова О.А., Лобашова Г.П., Мороз A.M., Литвинов В.И. Автоматизированные системы выявления роста M.tuberculosis ВАСТЕС MGIT 960 и МВ/ВАСТ: сравнительный анализ// Тез.доклТУ съезда науч.-мед. ассоциации фтизиатров. Йошкар-Ола, 1999. - № 903.

18. Карачунский М.А., Дорожкова И.Р., Балта Ю.Е. Динамика выделения L-форм микобактерий при лечении больных с впервые выявленным деструктивным туберкулезом легких //Пробл.туб,- 1978. №3.- С. 66-69.

19. Карачунский М.А., Дорожкова И.Р., Гаджиев Г.С. и др. Особенности клиники туберкулеза периферических лимфоузлов при выделении L-форм МБТ//Пробл.туб. 1983. - № 11. - С.32-35.

20. Кац Л.Н., Волк А.В., Константинова Н.Д. Ультраструктура L-форм. Сообщение 1. Микобактерии туберкулеза.//Журн.микробиол. 1974. - № 4. - С. 73 - 77.

21. Кноринг Б.Е. Применение иммунолюминесцентного метода для идентификации микобактерий туберкулеза и выявления специфических антител: Автореф.дис. .канд.мед.наук. Л., 1970. - 22с.

22. Коваленко И.В. L-формы микобактерий туберкулеза: клиническое значение и выявление. М.: Наука и техника, 1989. - 104 с.

23. Коваленко И.В. Антигенность и серологическая активностьмикобактерий, полученных экспериментальным путем// L-формы микобактерий туберкулеза/ ред. Коровкин B.C.: Наука и техника, М., 1989. 104 с.

24. Коваленко И.В. Определение L-форм методом посева и иммунофлюоресценции в патологическом материале у больных активным туберкулезом легких// L-формы микобактерий туберкулеза/ ред. Коровкин B.C. : Наука и техника, М., 1989. 104 с.

25. Коваленко К.Н. Туберкулез костей и суставов у детей// Внелегочный туберкулез. Руководство для врачей/ ред. А.В.Васильев. СПб, 2000 -С. 253-275.

26. Кожухарь Г.Н., Аникин В.Н., Жук Н.А. и др. Способ обнаружения микобактерий туберкулеза.//РЖ "Туберкулез". 1999. - № 3.- с. 9-11.

27. Корнеев А.А., Пузанов В.А., Гришина Т.Д., Черноусова JI.H. S и R формы M.tuberculosis как проблема получения клонированных и фенотипически компетентных штаммов// Пробл.Туб. 1996. - №2. - С. 36-40.

28. Кочемасова З.Н., Дыхно М.М., Кассирская Н.Г. и др.//Биологические свойства ревертантов, полученных из L-форм микобактерий туберкулеза // Пробл.туб. 1969. - №2. - С. 65 - 68.

29. Кочемасова З.Н., Дыхно М.М., Дорожкова И.Р., Кассирская Н.Г., Баканова Д.Я. L-формы микобактерий туберкулеза. М.: Медицина, 1980.- 175 с.

30. Круду В.Н. Характеристика микобактериальной популяции и ее рольв реактивации процесса у лиц с остаточными туберкулезными изменениями в легких. Автореф.дис. .канд.мед.наук. М., 1990. - 22с.

31. Кузнецов П.В. Способ диагностики туберкулеза почек. Патент RU 2121145//РЖ "Туберкулез". 1999. -№1. - С. 19-20.

32. Куличенко А.Н., Завалев В.И., Майоров Н.В. и др. Сравнительное использование различных схем анализа при ПЦР-диагностике туберкулеза// Тез.докл-IV съезда науч.-мед. ассоциации фтизиатров. -Йошкар-Ола, 1999. № 791. - С. 213.

33. Лазовская Л.Л., Пинчук Л.М. Факторы патогенности микобактерий туберкулеза //Пробл.туб. 1988. - № 8. - С. 72 - 76.

34. Леви Д.Т., Аксенова В.А., Закирова Н.Р., Александрова Н.В. Вакцинация BCG: характеристика препаратов и причина поствакцинальных осложнений. Пробл.туб. - 1999. - № 4. - С.4-7.

35. Оттен Т.Ф. Особенности бактериологической диагностики и этиотропной терапии микобактериозов легких.: Дисс. . д.м.н. СПб., 1994.-240с.

36. Прозоровский С.В. Проблема патогенности L-форм бактерий имикоплазм (сравнительный анализ): Дисс. .д.м.н. М.,1970- 416с.

37. Руководство по микробиологическим методам./ред. Биргер М.О.: М., "Медицина", 1982.-80 с.

38. Терешин И.М., Белоусова И.И. // Действие биологически активных веществ на устойчивость к антибиотикам // Химиотерапия инфекций и лекарственная устойчивость патогенных микроорганизмов: сб.науч.тр. М., 1973. С.28 - 30.

39. Терешин И.М. Преодоление лекарственной устойчивости возбудителей инфекционных заболеваний JL: Медицина, 1977.-182с .

40. Тимаков В.Д., Каган Г.Я. Биология L-форм бактерий. М.: Медгиз, 1961.-235 с.

41. Тимаков В.Д., Каган Г.Я. L-формы бактерий и семейство Mycoplasmataceae в патологии. М.: Медицина, 1973. - 392 с.

42. Тимаков В.Д. Роль L-форм бактерий и микоплазм в этиологии и патогенезе некоторых острых и хронических заболеваний// Вестн.АМН СССР. 1976. - №5. - С. 3-10.

43. Федерольф А.К. Влияние хлористого лития на бактерии// Врач. -1895.-Т. 16.-С. 1084.

44. Хоменко А.Г. Динамика бацилловыделения и критерии абациллирования у больных туберкулезом легких// Тез. докл. 8-го Всес.съезда фтизиатров. -М., 1973. С.159 - 160.

45. Черноусова JI.H., Ларионова Е.Е., Севастьянов Э.В. и др. Обнаружение M.tuberculosis в мокроте больных с ограниченными формами туберкулеза легких методом ПЦР// "Туберкулез сегодня -проблемы и перспективы". М., 2000. - С. 89 - 90.

46. Черноусова Л.Н., Ларионова Е.Е., Севастьянов Э.В. и др. Повышение эффективности диагностики абациллярного туберкулеза при сочетании ПЦР-анализа с культуральным посевом// "Генодиагностика в современной медицине" М.,2000. - С. 290-291.

47. Черноусова JI.H., Николаева Г.М., Смирнова Т.Г. и др. Определение содержания ДНК микобактерий в диагностическом материале от больных туберкулезом легких в процессе химиотерапии// "Генодиагностика в современной медицине". М., 2000. - С. 291 - 292.

48. Шмелев Н.А., Дорожкова И.Р., Земскова З.С. Персистирование возбудителя туберкулеза в организме в виде L-форм и их повреждающее действие // Вестник Акад.мед.наук. 1976. - № 5. - С. 29-37.

49. АЬе С., Hirano К., Wada М. Evaluation of the Mycobacteria Growth Indicator Tube system using an oxygen sensitive fluorescent sensor for rapid detection of mycobacteria// Clin. Mycobacter. 1998. - P. 175 - 180.

50. Afghani B. Rapid differentiation of Mycobacterium tuberculosis and Mycobacterium bovis using glycerol susceptibility and quantitative polymerase chain reaction. //J. Investig. Med. 1998. - Vol. 46. - No. 2. - P. 73-75.

51. Aka N., Vural E.Z. Evaluation of patients with active pulmonary tuberculosis for genital involvement//J.Obstet.Gynaecol.Res. 1997. - Vol. 23.-No. 2.-P. 337-340.

52. Alberghina M, Nicoletti G. Genetic determinants of aminoglycoside resistance in strains of Mycobacterium tuberculosis II Chemotherapy. 1973. -Vol. 19. - No.l. - P. 148- 160.

53. Alexander-Jackson E. Tuberculous mycobacteria spheroplasts// Ann.N.Y.Acad.Sci. 1945. -Vol.7. - No.l. - P.81.

54. Aljada I.S., Crane J.K., Corriere N., Wagle D.G. Mycobacterium bovis BCG causing vertebral osteomyelitis (Pott's disease) following intravesical BCG therapy.// J.Clin.Microbiol. 1999. - Vol.37. - No.6. -P.2106-2108.

55. Almenoff P.L., Johnson A., Lesser M., Mattman L.H. Growth of acid fast L- forms from the blood of patients with sarcoidosis. // Thorax. 1996. -Vol. 51.-No. 5.- P. 530-533.

56. Amicosante M., Richeldi L., Trenti G. et al. Inactivation of polymerase inhibitors for Mycobacterium tuberculosis DNA amplification in sputum by using capture resin// J. Clin. Microbiol. 1995. - Vol. 33. - No. 3. - P. 629 -630.

57. Ausina V., Barrio J., Luquin M. et al. Mycobacterium xenopi infections in the Acquired Immunodeficiency Syndrome// Ann.Intern.Med. 1988. - Vol. 109.-No. 5.- P. 927-928.

58. Bachrach G., Colston M.J., Bercovier H. e.a. A new single-copy mycobacterial plasmid, pMFl, from Mycobacterium fortuitum which is compatible with the pAL5000 replicon // Microbiology. 2000. - Vol. 146. -No. 2. - P. 297-303.

59. Badak F.Z., Kiska D.L., Seetterquist S. et al. Comparison of Mycobacteria Growth Indicator Tube with BACTEC 460 for detection and recovery of mycobacteria from clinical specimens // J. Clin.Microbiol. 1996. - Vol. 34. -No. 11.-P. 2236-2239.

60. Balazs D., Cojocaru R., Damian M. Molecular characterization of Mycobacterium bovis BCG: Romanian sub-strain.// Int. J. Tuberc. Lung Dis. 1999. - Vol. 3. - No. 6. - P. 542-545.

61. В alter M. AIDS now World's fourth biggest killer//Science. 1999. - No. 3. - P.1101 - 1102.

62. Barany F. Genetic disease detection and DNA amplification using cloned thermostable ligase// Proc.Nat.Acad.Sci. 1991. - Vol. 88. - No. 2. - P. 189

63. Barnes P.F. Rapid diagnostic tests for tuberculosis: progress but no gold standard//Am.J.Resp.Crit.Care Med. 1997.-Vol. 155.-No. 5.-P. 173-179.

64. Beggs M.L., Crawford J.T., Eisenach K.D. Isolation and sequencing of the replication region of Mycobacterium avium plasmid pLR7// J. Bacterid.- 1998.-Vol. 177.- No. 17,- P. 4836-4840.

65. Beggs M.L., Eisenach K.D., Cave M.D. Mapping of IS6110 insertion sites in two epidemic strains of Mycobacterium tuberculosis// J.Clin.Microbiol. — 2000. Vol. 38. - No. 8. - P. 2923 - 2928.

66. Birkenmayer L., Armstrong A.S. Preliminary evaluation of the ligase chain reaction for specific detection of Neisseria gonorrhoeae/! J.Clin.Microb. 1992. - Vol. 30. - No. 15. - P. 3089 - 3094.

67. Boddinghaus В., Flohr Т., Rogall T. et al. Identification of mycobacteria by amplification of rRNA// J.Clin.Microbiol. 1990. - Vol. 28. - No. 8. - P. 1751 - 1759.

68. Boddinghaus В., Rogall Т., Flohr T. et al. Detection and identification of mycobacteria by amplification and hybridization of rRNA// J.Clin.Microbiol. -1991.-Vol. 29.-No. l.-P. 171-175.

69. Boom R., Sol C.J.A., Salimans M.M.H. Rapid and simple method for purification of nucleic acid// J.Clin.Microb. 1990. - Vol. 28. - No. 2. - P. 495-503.

70. Brosman S.A. Bacillus Calmette-Guerin immunotherapy// Urol. Clin. North.Am. 1992. - No. 3. - P. 557-564.

71. Buddie B.M., Parlane N.A., Keen D.L. Differentiation between Mycobacterium bovis BCG-vaccinated and M. bovis-infected cattle by using recombinant mycobacterial antigens.// Clin. Diagn. Lab. Immunol. 1999. -Vol. 6. - No.l.-P. 1-5.

72. Butler W.R., Jost K.S., Kilburn J.O. Identification of mycobacteria by high-performance liquid chromatography // J. Clin.Microbiol. 1991. - Vol.29. No. 13. - P. 2468-2472.

73. Butler W.R., O'Connor S.P., Yakrus M.A. Cross-reactivity of genetic probe for detection of Mycobacterium tuberculosis with newly described species Mycobacterium celatum/l J. Clin.Microbiol. 1994. — Vol. 32. - No. 3.-P. 536-538.

74. Caldarelli-Stefano R., Yazo L., Bonetto S. et al. Use of magnetic beads for tissue DNA extraction and IS6110 Mycobacterium tuberculosis PCR// Mol. Pathol. 1999.-Vol. 52.-No. 3.-P. 158- 160.

75. Calmette A., Guerin G., Negre L., Boquet A. Premunition des nouveaux-nes contre la tuberculose par le vaccin BCG, 1921-1926// Ann. Inst. Pasteur (Paris). 1926. - Vol.40. - P. 89 - 133.

76. Cattaneo C., Smillie D.M., Gelsthorpe K. et al. A simple method for extracting DNA from old skeletal material// Forensic.Sci.Int. 1995. - Vol. 74. - No. 3. - P. 167-174.

77. Charache, P. Atypical bacterial forms in human disease// Microbial protoplasts, spheroplasts and L-forms/ ed. L. B. Guze: TheWilliams & Wilkins Co., Baltimore, 1968. P. 484-494.

78. Cheab F.F., Kan Y.W. Detection of specific DNA sequences by fluorescence amplification: a color complementation assay// Proc.Nat.Acad.Sci. 1989. - Vol. 86. - No. 17. - P. 9178 - 9182.

79. Chen C.M., Yuen K.Y., Chan K.S. et al. Single-tube nested PCR in the diagnosis of tuberculosis// J. Clin. Pathol. 1996. - Vol. 49. - No. 2. - P. 290-294.

80. Christel L.A., Petersen K., McMillan W. et al. Rapid, automated nucleic acid probe assays using silicon microstructures for nucleic acidconcentration// J.Biomech.Eng. 1999. - Vol. 121. - No. 1. - P.22 - 27.

81. Clarrige III J.E., Shawar B.M., Shinnick T.M., Pilkaytis B.B. Large-scale use of polymerase chain reaction for detection of in a routine mycobacteriology laboratory// J.Clin.Microbiol. 1993. - Vol. 31. - No. 7. -P. 2049-2056.

82. Cole S.T., Telenti A. Drug resistance in Mycobacterium tuberculosis!1 Eur.Resp.J. 1995. - Vol. 8, Suppl. 20. - P. 701 - 713.

83. Coombs N.J., Gough A.C., Primrose J.N. Optimization of DNA and RNA extraction from archival formalin-fixed tissue//Nucl.Acids Res. 1999. - Vol. 27.-No. 16.-P. 12.

84. Crawford J.T., Bates J.H. Isolation of plasmids from mycobacteria // Infect. Immun. 1979,- Vol. 24.-No. 3. - P. 979-981.

85. Crawford J.T., Cave M.D., Bates J.H. Characterization of plasmids from strains of Mycobacterium avium-intracellulare II Rev. Infect. Dis. 1981. -Vol. 3.-No. 5. - P. 949-952.

86. Crawford J.T., Bates J.H. Analysis of plasmids in Mycobacterium avium-intracellulare isolates from persons with acquired immunodeficiency syndrome//Am.Rev.Respir.Dis. 1986. - Vol. 143. - No. 4. - P. 659 - 661.

87. Crawford J.T., Falkinham J.O. Plasmids of the Mycobacterium avium complex//Molecular biology of the mycobacteria/ Ed. J.McFadden: London, 1990.-P. 97-119.

88. Dailloux M., Laurain C. Value of nucleic acid amplification methods Amplicor (Roche) and Amplified MTD (Gen-Probe) for the rapid diagnosis of tuberculosis// Ann.Biol.Clin.Paris. 1996. - Vol. 54. - P. 297 - 301.

89. Dale J.W. Mobile genetic elements in mycobacteria // Europ.Resp.J. -1995. Vol. 8, Suppl. 20. - P. 633 - 648.

90. D'Amato R.F., Isemberg H.D., Hochshtein L et al. Evaluation of the Roshe Septi-Check AFB system for the recovery of mycobacteria // J. Clin.Microbiol. 1991. - Vol. 29. - No. 15. - P. 2906 - 2908.

91. Dar L., Sharma S.K., Bhanu N.V. et al. Diagnosis of pulmonary tuberculosis by polymerase chain reaction for MPB 64 gene: an evaluation in a blind study// Indian J.Chest Dis.Allied Sci. 1998. - Vol. 40. - No. 1. - P. 5-16.

92. David H.L. Bacteriology of mycobacterioses. Washington, 1976. - P. 94 - 109.

93. Del Portillo P., Murillo L.A., Patarroyo M.A. Amplification of a species-specific DNA fragment of Mycobacterium tuberculosis and its possible use in diagnosis// J.Clin.Microbiol. 1991. - Vol. 29. - No. 8. - P. 2163-2168.

94. Dienes, L. L type variant forms in cultures of various bacteria//Proc. Soc. Exp. Biol. Med. 1939. - Vol. 42. - P. 773-778.

95. Dienes, L., H. J. Weinberger, and S. Madoff. The transformation oftyphoid bacilli into L forms under various conditions.// J. Bacteriol. 1950. - Vol. 59. - No. 3. - P. 755-764.

96. Dienes, L., S. Madoff, and S. Bullivant. Study of L-forms as seen in thin sections with the electron microscope// Current research on group A Streptococcus/ ed. R. Caravano: Excerpta Medi. Foundation, Amsterdam,1966. P. 342.

97. Dienes, L. Morphology and reproductive processes of bacteria withdefective cell wall// Microbial protoplasts, sphero-plastsand L-forms/ ed. L. B. Guze: The Williams & Wilkins Co., Baltimore., 1968. P. 74.

98. Dienes, L. Permanent alterations of the L-forms of Proteus andSalmonella under various conditions//J.Bacteriol. 1970. - Vol. 104. - P. 1369-1377.

99. Dienes, L. Nomenclature of bacterial L-form and cell wall-defective bacteria// J. Infect. Dis. 1973. - Vol. 127. - No. 3. - P. 476-477.

100. Domingue, G. J., and J. U. Schlegel. The possible role of microbialL-forms in pyelonephritis.// J. Urol. 1970. - Vol. 104. - No. 4. - P. 790-798.

101. Domingue, G. J. Filterable, cell-associated cell wall-deficient bacteriain renal diseases. Addison-Wesley PublishingCo., Reading Mass., 1982. - P. 121 - 138.

102. Domingue, G. J. Cell wall-deficient bacteria: basic principles and clinical significance. Reading Mass., 1982. - 264p.

103. Domingue G.J., Woody H.B. Bacterial Persistence and Expression of Disease// Clin. Microb. Rev. 1997. - Vol. 10. - No. 2. - P. 320-344.

104. Eing B.R., Becker A., Sohns A., Ringelmann R. Comparison of Roshe Cobas Amplicor Mycobacterium tuberculosis assay with in-house PCR and culture for detection of M.tuberculosis 11 J.Clin.Microbiol. 1998. - Vol. 36. -No. 7.-P. 2023-2029.

105. Erardi F.X., Failla M.L., Falkinham J.O. // Plasmid-encoded copperresistance and precipitation by Mycobacterium scrofulaceum // Appl. Environ. Microbiol.- 1987.-Vol. 53. No. 8.- P. 1951-1954.

106. Erlich H.A., Gelfand D., Sninsky J J. Recent advances in the polymerase chain reaction// Science-1991. Vol. 252. - No. 10. - P. 1643 -1651.

107. Faerman M., Jankauskas R. Paleopathological and molecular evidence of human bone tuberculosis in Iron Age Lithuania//Anthropol.Anz. 2000. -Vol. 58,-No. 1.- P. 57-62.

108. Falkinham J.O., Crawford J.T. Plasmids// Tuberculosis: pathogenesis, protection and control/ Ed. Bloom B.R.: London, SU Press, 1990. p. 97 -119.

109. Figueroa D.R., Martinez V.I., Villagrana Z.R. Tuberculosis of the female reproductive tract: effect of function// Int.J.Fertil.Menopausal Stud. -1996. Vol. 41. - No. 3. - P. 430 - 436.

110. Folgueira L., Delgado R., Palenque E. Detection of Mycobacterium tuberculosis DNA in clinical samples by using a simple lysis method andpolymerase chain reaction// J.Clin.Microbiol. 1993. - Vol. 31. - No. 5. - P. 1019-1021.

111. Forbes B.A., Hicks K.E.S. Direct detection of Mycobacterium tuberculosis in respiratory specimens in a clinical laboratory by polymerase chain reaction // J. Clin. Microbiol- 1993.- Vol. 31.- No. 5. P. 1688 -1694.

112. Fox W. Whither short-course chemotherapy?//Br.J.Dis.Chest. — 1981. — Vol. 75. No. 2. - P. 331 - 357.

113. Franzblau S.G., Takeda Т., Nakamura M. Mycobacterial plasmids: screening and possible relationship to antibiotic resistance in Mycobacterium avium/ Mycobacterium intracellulare II Microb.Immun. 1986. - V. 30. -No. 5.- P. 903 -907.

114. Frothingham R., Wilson K.H. Sequence-based differentiation of strains in the Mycobacterium avium complex// J.Bacteriol. 1993. - Vol. 175. - No. 13. - P. 2818-2825.

115. Frothingham R., Wilson K.H. Molecular phylogeny of the Mycobacterium avium complex demonstrates clinically meaningful divisions// J.InfectDis. 1994.-Vol. 169.- No. 2. - P.305-312.

116. Frothingham R. Differentiation of strains in Mycobacterium tuberculosis complex by DNA sequence polymorphisms, including rapid identification of M. bovis BCG// J.Clin.Microbiol. 1995. - Vol. 33. - No.3. -P.840 - 844.

117. Gangadharam P.R., Perumal V.K., Crawford J.T., Bates J.H. Association of plasmids and virulence of Mycobacterium avium complex // Am. Rev. Respir. Dis. 1988. - Vol. 137. - No. 1. - P. 212-214.

118. Garcia-Quintanilla A., Garcia L., Tudo G. et al. Single-tube balanced heminested PCR for detecting Mycobacterium tuberculosis in smear-negative samples// J. Clin. Microbiol. 2000. - Vol. 38. - No. 3. - P. 1166-1169.

119. Garvin D.F., Mattman L.H. Immunofluorescent identification of mycobacterial variants//Bact.Proc. 1967 - Vol.67. - No. l.-P. 101-104.

120. Gavigan J.A., Ainsa J.A., Perez E. e.a. Isolation by genetic labeling of a new mycobacterial plasmid, pJAZ38, from Mycobacterium fortuitum. II J. Bacteriol. 1997. - Vol. 179. - No. 13. - P. 4115-4122.

121. Ginesu F., Pirina P., Sechi L.A. et al. Microbiological diagnosis of tuberculosis: a comparison of old and new methods// J.Chemother. 1998. -Vol. 10. - No. 4. - P. 295 - 300.

122. Good R.C., Snider D.E. Isolation of nontuberculous mycobacteria in the United States, 1980// J. Infect. Dis. 1982. - Vol.146. - No. 6. - P.829 -833.

123. Haeseleer F. Structural instability of recombinant plasmids in mycobacteria//Res. Microbiol. 1994. - Vol. 145.-No. 9. - P. 683 - 687.

124. Hance A.J., Grandcharnp В., Levy-Frebault V. et al. Detection and identification of mycobacteria by amplification of mycobacterial DNA// Mol.Microbiol. 1989. - Vol. 3. - No.5. -P. 843 - 849.

125. Hance A.J., Levy-Frebault V., Grandcharnp В., et al. Detection and identification of mycobacterium species by DNA amplification// Mol.Microb. 1990.-Vol. 4.-No. l.-P. 83-87.

126. Hawley R.J., Mann N., Imaeda T. Ultrastructure of Nocardia-like variants of Mycobacterium smegmatis and chemical composition of the basal cell wall layer// Canad. J. Microbiol. 1977. - Vol. 23. - No. 12. - P. 1723

127. Hellyer T.J., Brown I.N., Dale J.W. e.a. Plasmid analysis of Mycobacterium avium/intracellulare isolated in the United Kingdom // J.Med.Microb. 1991. - Vol. 34. - No. 1. - P. 225-231.

128. Hellyer T.J., DesJardin L.E., Teixeira L. et al. Detection of viable Mycobacterium tuberculosis by reverse transcriptase-strand displacement amplification of mRNA// J.Clin.Microbiol. 1999. - Vol. 37. - No. 3. -P.518 - 523.

129. Hijmans, W., and H. A. L. Clasener. A survey of the L-forms of bacteria// Mycoplasma and the L-forms of bacteria./ ed. S. Madoff: New York., 1971.-P. 37-47.

130. Hijmans W.,. vanBoven C.P.A, Clasener H.A.L. Fundamentalbiology of the L-phase of bacteria// The myco-plasmatales and the L-phase of bacteria./ ed. L. Hayflick: Appleton-Century-Crofts: NewYork., 1969. P. 67 -75.

131. Horsburgh С.J., Selik R.M. The epidemiology of disseminated nontuberculous mycobacterial infection in the Acquired Immunodeficiency Syndrome (AIDS)//Am.Rev.Resp.Dis. 1989. - Vol. 139.-No.l.- P. 4-7.

132. Hull S.I., Wallace R.J., Bobey DJ. e.a. Presence of aminoglycoside acetyltransferase and plasmids in Mycobacterium fortuitum/l Amer.Rev.Resp.Dis. 1984. -Vol. 129.-No.2. - P. 614-618.

133. Ikonomopoulous J.A., Gorgoulis V.G., Zacharatos P.V. et al. Multiplex PCR assay for the detection of mycobacterial DNA sequences directly from sputum// In Vivo. 1998. - Vol. 12. - No. 5. - P. 547 - 552.

134. Iovannisci D.M., Winn-Deen E.S. Ligation amplification and fluorescence detection of Mycobacterium tuberculosis DNA// Mol.Cell.Probes. 1993. - No. 7. - P. 35 -43.

135. Isenberg H.D., D'Amato R.F., Heifets L. et al. Collaborative feasibility study of a biphasic system (Roshe Septi-Check AFB) for rapid detection and isolation of mycobacteria // J. Clin.Microbiol. 1991. - Vol. 29. - No. 9. - P. 1719-1722.

136. Jatana S.K., Nair M.N., Lahiri K.K., Sarin N.P. Polymerase chain reaction in the diagnosis of tuberculosis// Indian Pediatr. 2000. - Vol. 37. -No. 4.-P. 375-382.

137. Jensen A.J., Bennedsen J., Rosdahl V.T. Plasmid profiles of Mycobacterium avium/intraceUulare isolated from patients with AIDS or cervical lymphadenitis and from environmental samples // Scand.J.Infect.Dis. 1989.-Vol. 21.- No.3. - P. 645-649.

138. Jonas V., Alden M.J., Curry Ji et al. Detection and identification of Mycobacterium tuberculosis directly from sputum sediments by amplification ofrRNA//J.Clin.Microbiol.- 1993.-Vol. 31.-No. 10.-P. 2410-2416.

139. Jonas V., Curry Ji. Detection and identification of Mycobacterium tuberculosis from respiratory tract specimens by amplification of rRNA// J.Clin.Microbiol. 1993. -Vol. 31. - No. 13.-P. 2684-2689.

140. Jones W.D., David H.L. Preliminary observations on the occurence of a streptomycin R-factor in Mycobacterium Smegmatis ATCC 607 // Tubercle.- 1972. Vol. 53. - No. 1.- P. 35-42.

141. Katila M.L., Katila P., Erkinjuntti-Pekkanen R. Accelerated detection and identification of mycobacteria with MGIT 960 and COBAS AMPLICOR systems// J.Clin.Microbiol. 2000. - Vol. 38. - No. 3. - P. 960 - 964.

142. Kearns A.M., Magee J.G., Gennery A. et al. Rapid identification of Mycobacterium bovis BCG by the detection of the RD1 deletion using a multiplex PCR technique// Int. J. Tuberc. Lung Dis. 1999. - Vol. 3. - No.7.- P.635-638.

143. Kieser T. Factors affecting the isolation of cccDNA from Streptococcuslividans //VXs&mid. 1984. - Vol. 12. - No. 1. - P. 19 - 36.

144. Klemen H., Bogiatzis A., Ghalibafian M., Popper H.H. Multiplex polymerase chain reaction for rapid detection of atypical mycobacteria and Mycobacterium tuberculosis complex// Diagn.Mol.Pathol. 1998. - Vol. 7. -No. 6.-P.310-316.

145. Klieneberger E. The natural occurrence of pleuropneumonia-likeorganisms in apparent symbiosis with Streptobacillus moniliformis and otherbacteria// J. Pathol. Bacteriol. 1935. - Vol. 40. - No. 1. - P. 93-105.

146. Kocagoz Т., Yilmaz E., Ozkara S. et al. Detection of in sputum samples by polymerase chain reaction using a simplified procedure// J.Clin.Microbiol. 1993. - Vol. 31. - No. 6. - P. 1435 - 1438.

147. Koga H., Shigeru H., Kazunori T. et al. Clinical evaluation of the reagent for detection of Mycobacterium tuberculosis complex DNA by ligase chain reaction (LCR)// J.Jap.Assoc.Infect.Diseases. 1997. - Vol. 71. - No. 12.-P. 1246- 1251.

148. Kolattukudu P.E., Fernandes N.D., Azad A.K. et al. Biochemistry and molecular gentics of cell-wall lipid biosynthesis in mycobacteria// Mol. Microbiol. 1997. - Vol. 24. - No. 1. - P. 263 - 270.

149. Kolk A.H.J., Schuitema A.R., Kuijper S. et al. Detection of Mycobacterium tuberculosis in clinical samples by using polymerase chain reaction and a non-radioactive detection system// J.Clin.Microbiol. 1992. -Vol. 30. - No. 10. - P. 2567 - 2575.

150. Kolk A.H., Kox L.F., van Leeuwen J. et al. Clinical utility of the polymerase chain reaction in the diagnosis of extrapulmonary tuberculosis// Eur.Resp.J.- 1998.-Vol. 11. No. 6.-P. 1222-1226.

151. Kues U., Stahl U. Replication of plasmids in gram-negative bacteria // Microbiol. Rev. 1989. -Vol. 53. - No 2. - P. 491-516.

152. Kwiatkowska S., Marczak J., Zieba M., Nowak D. Clinical utility of a commercial ligase chain reaction kit for the diagnosis of smear-negativepulmonary tuberculosis// Int.J.Tuberc.Lung Dis. 1999. - Vol. 3. - No. 5. -P. 421 -425.

153. Labidi A., Daugnet C., Goh K.S. et al. Plasmid profiles of M.fortuitum complex isolates//Curr. Microb. 1984. - Vol. 11.- No.2. - P. 235 - 240.

154. Labidi A., Mardis E., Roe B.A. et al. Cloning and DNA sequence of the Mycobacterium fortuitum var fortuitum plasmid pAL5000 // Plasmid. -1992.-Vol. 27. No.l.-P. 130-140.

155. Lamm D.L.,van der Meijden A.,Morales A. et al. Incidence and treatment of complications of Bacillus Calmette-Guerin intravescical therapy in superficial bladder cancer// J.Urol. 1992. - Vol. 147. - No.3. - P. 596 -600.

156. Landegren U., Kaiser R., Caskey C.T., Hood L. DNA diagnostic: molecular techniques and automation// Science. 1988. - Vol. 242. - No. 1. -P. 229 - 237.

157. Le Т.К., Bach K.H., Ho M.L. et al. Molecular fingerprinting of Mycobacterium tuberculosis strains isolated in Vietnam using IS6110 as probe// Tuberc. Lung Dis. 2000. - Vol. 80. -No. 2. -P. 75 - 83.

158. Lebrun L., Espinasse F., Poveda J.D.et al. Evaluation of nonradioactive DNA probes for identification of mycobacteria// J. Clin.Microbiol. 1992. - Vol. 30. - No. 13. - P. 2476 - 2478.

159. Leckie G., Alcalde X., Black W. et al. Clinical performance of the LCx Mycobacterium tuberculosis assay in a multicenter study// Clin. Mycobacter. 1998.-P. 131 - 140.

160. Lefevre P., Braibant M., Content J. Characterization of a Mycobacterium bovis BCG insertion sequence related to the IS21 family// FEMS Microbiol. Lett 1999. - Vol. 178. - No. 2. - P. 211-217.

161. Li G.L. Induction of the L forms of M. tuberculosis in vivo guinea pigs// Chung Hua Chieh Ho Ho Hu Hsi Tsa Chih 1990. Vol.13. - No. 6. -P.351-354.

162. Li H., Gyllensten U.B., Cui X. et al. Amplification and analysis of DNA sequences in single human sperm and diploid cells// Nature. 1988. -Vol. 335. -No.3. - P. 414 - 417.

163. Li J.Y., Lo S.T., Ng C.S. Molecular detection of Mycobacterium tuberculosis in tissues showing granulomatous inflammation without demonstrable acid-fast bacilli// Diagn.Mol.Pathol. 2000. - Vol. 9. - No. 2. -P. 67-74.

164. Linares M.J., Pelaez M.J., Casal M. Application of high-performance liquid chromatography for identification of atypical mycobacteria// Clin. Mycobacter. 1998. - P. 185 - 187.

165. Lisby G. Application of nucleic acid amplification in clinical microbiology// Mol.Biotechnol. 1999. - Vol. 12. - No. 1. - P. 75 - 99.

166. Lotte A., Wasz-Hockert O., Poisson N. et al. BCG complications: estimates for the risk among vaccinated subjects and statistical analysis of their main characteristics//Adv.Tuberc.Res. 1984. - Vol. 21. - No.l. - P. 107- 193.

167. Lotte A., Wasz-Hockert O., Poisson N. Second IUATLD study on complications induced by intradermal BCG-vaccination//Bull.Int.Union Tuberc.- 1988.-Vol. 63. No.l. - P.47-59.

168. Lugosi L. Theoretical and methodological aspects of BCG vaccine from the discovery of Calmette and Guerin to molecular biology//Tubercle Lung Dis. 1992. - Vol. 73. - No.l. - P. 252-261.

169. Madiraju M.V., Qin M.H., Rajagopalan M. Development of simple and efficient protocol for isolation of plasmids from mycobacteria using zirconia beads//Lett.Appl. Microbiol.- 2000.- Vol. 30. No. 1. - P.38 - 41.

170. Madoff, S., M. E. Burke, and L. Dienes. Induction and identificationof L-forms of bacteria.//Ann.N.Y.Acad. Sci. 1967. - Vol. 143. - No. 4. - P. 755-759.

171. Madoff, S. The bacterial L-forms. Marcel Dekker, Inc., NewYork,. 1986. - 116p.

172. Madyavan H.N., Therese K.L., Gunisha P. et al. Polymerase chain reaction for detection of Mycobacterium tuberculosis in epiretinal membrane in Eale's disease// Invest. Ophtalmol. Vis. Sci. 2000. - Vol. 41. - No.3. -P.822 - 855.

173. Magdalena J., Supply P., Locht C. Specific Differentiation between Mycobacterium bovis BCG and Virulent Strains of the Mycobacterium tuberculosis Complex// J.Clin.Microb. 1998. - Vol. 36. - No. 9. - P. 24712476.

174. Mahairas G.G., Sabo P.J., Hickey MJ. e.a. Molecular analysis of genetic differences between Mycobacterium bovis BCG and virulent M.bovis //J.Bacteriol. 1996. - Vol. 178. - No. 6. - P. 1274 - 1282.

175. Manual of Clinical Microbiology 8th ed./Ed. by Murray P.R., Baron E.J., Pfaller M.A. et al.: Washingtone, 1998. 1243p.

176. Marchetti G., Gori A., Catozzi L. et al. Evaluation of PCR in detection of Mycobacterium tuberculosis from formaline-fixed, paraffin-embedded tissues: comparison of four amplification assays// J.Clin.Microbiol. 1998. -Vol. 36.-No. 6.-P. 1512-1517.

177. Marttila H., Soini H., Huovinen P., Viljanen M. katG mutations in isoniazid-resistant Mycobacterium tuberculosis isolates recovered from Finnish patients//Antimicr.Agents Chem. 1996. - Vol.40. - No.9. - P.2187-2189.

178. Marttila H. Molecular genetics of drug-resistant Mycobacterium tuberculosis. Turku, 1999 - 79 p.

179. Mattman L.H. L-forms isolated from infections In: Microbialprotoplasts, spheroplasts and L-forms. / Ed. by L.B.Guze: Baltimore, 1968. -P. 472-483.

180. Mattman, L. H. Cell wall-deficient forms// Stealth pathogens, 2nd ed. -CRC Press, Inc., Boca Raton, Fla., 1993. P. 285.

181. Mattman, L. H. Leprosy// Stealth pathogens, 2nd ed. CRC Press, Inc., Boca Raton, Fla., 1993. - P. 197.

182. Mattman, L. H. Mycobacterium tuberculosis and atypicals// Stealth pathogens, 2nd ed. CRC Press, Inc., Boca Raton, Fla., 1993. - P. 175.

183. Mattman, L. H. Sarcordosis.// Stealth pathogens, 2nd ed. CRC Press, Inc., Boca Raton, Fla., 1993. - P. 187.

184. McGee, Z. A., R. G. Whittler, H. Gooder, and P. Charache. Wall-defective microbial variants: terminology and experimental design// J. Infect. Dis. 1971.-Vol. 123.-No. 2.-P. 433-438.

185. Meissner P.S., Falkinham J.O. Plasmid-encoded mercuric reductase in Mycobacterium scrofulaceum И J. Bacteriol. 1984. - Vol. 157. - No.2. - P. 669-672.

186. Mira-Guttierez J., Paredes-Salido F., Sasian-Matias P. et al. Value of a gas chromatography to identify some rapidly growing mycobacterial species// Clin. Mycobacter. 1998. - P. 193 - 198.

187. Miyazaky Y., Koga H., Kohno S., Kaku M. Nested polymerase chain reaction for detection of Mycobacterium tuberculosis in clinical samples// J.Clin.Microbiol. 1993. - Vol. 31. - No. 8. - P. 2228 - 2232.

188. Mizuguchi Y., Fukunaga M., Taniguchi H. Plasmid deoxyribonucleic acid and translucent-to-opaque variation in Mycobacterium intracellular 103 //J.Bacteriol. 1981. -Vol. 146,- No. 3. - P. 656 - 659.

189. Moore D.F., Curry J.I. Detection and identification of Mycobacterium tuberculosis directly from sputum sediments by ligase chain reaction// J.Clin.Microbiol. 1998. - Vol. 36. - No. 4. - P. 1028 - 1031.

190. Mordarska H., Mordarski M., Goodfellow M. Chemotaxonomic characters and classification of some nocardioform bacteria// J.Gen.Microbiol. 1972. - Vol.71. -P.77- 86.

191. Morris A.J., Reller L.B. Reliability of cord formation in BACTEC media for presumptive identification of mycobacteria// J. Clin.Microbiol. -1993.-Vol. 31.-No. 12.-P. 2533 -2534.

192. Morris S.L., Rouse D.A., Malik A. e.a. Characterisation of plasmids extracted from AIDS—associated Mycobacterium avium isolates // Tubercle. -1990. Vol. 71. - No. 3. - P. 181-185.

193. Much's granules revisited. Leading article.// Tubercle. 1987. - V.68. -No. 2. - P.241 -242.

194. Nightingale S.D.,Byrd L.T., Southern P.M. et al. Incidence of Mycobacterium avium-intracellulare complex in human immunodefeciency virus-positive patiennts//J.Inf.Dis. -1992.-Vol.165. No. 6.- P. 1082-1085.

195. Niyaz Ahmed A.S., Khan J.R., Ganai N.A. et al. DNA amplification assay for rapid detection of bovine tubercle bacilli in semen.// Anim. Reprod. Sci.-1999.-Vol. 31,- No. 1-2.-P. 15-21.

196. Nolte F.S., Metchock В., McGowan J.E. et al. Direct detection of Mycobacterium tuberculosis in sputum by polymerase chain reaction and DNA hybridization// J.Clin.Microbiol. 1993. - Vol. 31. - No. 8. - P. 1777 -1782.

197. Nolte F.S., Metchock B. Mycobacterium// Manual of Clinical

198. Microbiology, 6th ecL/Ed. by Murray P.R., Baron E.J., Pfaller M.A. et al: Washingtone, 1995. P.400 - 437.

199. Oosthuizen A.P., Wessels P.H., Hefer J.N. Tuberculosis of the female genital tract in patients attending an infertility clinic//S.Afr.Med.J. 1990. -Vol. 77. - No. 11. - P. 562 - 564.

200. Pai S.R., Actor J.K., Sepulveda E. et al. Identification of viable and non-viable Mycobacterium tuberculosis in mouse organs by directed RT-PCR for antigen 85B mRNA// Microb.Pathol. 2000. - Vol. 28. - No. 6. - P. 335 -342.

201. Pestel-Caron, M., Graff, G., Berthelot, G.,e.a.// Molecular Analysis of Mycobacterium avium Isolates by Using Pulsed-Field Gel Electrophoresis and PCR.// J. Clin. Microbiol. 1999. - Vol. 37.- No. 10.- P. 2450 - 2455.

202. Pethel M.L., Falkinham J.O. Plasmid-influenced changes in Mycobacterium avium catalase activity // Infect. Immun. 1989. - Vol. 57. -No. 6. - P. 1714- 1718.

203. Picardeau M., Vincent V. Characterization of large linear plasmids in mycobacteria // J. Bacteriol. 1997 - Vol. 179. - No. 8 .- P. 2753 - 2756.

204. Picardeau M., Vincent V. Mycobacterial linear plasmids have an invertron-like structure related to other linear replicons in actinomycetes// Microbiology. 1998. - Vol. 144. - No. 7. - P. 1981 - 1988.

205. Picardeau M., Le Dantec C., Vincent V. Analysis of the internal replication region of a mycobacterial linear plasmid // Microbiology. 2000. -Vol. 146,- No. 2.- P. 305 - 313.

206. Piepkorn M.W., Reichenbach D.D. Infective endocarditisassociated with cell-wall deficient bacteria. Electron microscopic findings in four cases//

207. Hum. Pathol. 1978.-Vol. 19.-No.l.-P. 163-173.

208. Plikaytis B.B., Eisenach K.D., Crawford J.T., Shinnick T.M. Differentiation of Mycobacterium tuberculosis and Mycobacterium bovis BCG by a polymerase chain reaction assay. //Mol .Cell. Probes. 1991. -Vol. 5. - No.3. - P. 215-219.

209. Portillo-Gomez L., Morris S.L., Panduro A. Rapid and efficient detection of extra-pulmonary Mycobacterium tuberculosis by PCR analysis// Int.J.Tuberc.Lung dis. 2000. - Vol. 4. - No. 4. - P. 361 - 370.

210. Pozzi G., Meloni M., Iona E. e.a. rpoB mutations in multidrug-resistant strains of Mycobacterium tuberculosis isolated in Italy // J.Clin.Microb. 1999. - Vol. 37. - No. 7. - P. 1197-1199.

211. Ranes M.G.,. Rauzier J., Lagranderie M., e.a. Functional analysis of pAL5000, a plasmid from Mycobacterium fortuitum: construction of a "mini" mycobacterium-Escherichia coli shuttle vector // J. Bacteriol. 1990. -Vol. 172. - No.ll.- P. 2793 -2797.

212. Rauzier J., Moniz-Pereira J, Gicquel-Sanzey B. Complete nucleotide sequence of hAL5000, a plasmid from M.fortuitum // Gene. 1988. - Vol. 71. - No. 2. - P. 315-321.

213. Richter С., Kox L.F., Van-Leeuwen J.V. et al. PCR detection of mycobacteraemia in tanzanian patients with extrapulmonary tuberculosis// Eur.J.Clin.Microb.Infect.Dis. 1996. - Vol. 15. -No. 10. - P. 813 - 817.

214. Roberts G.D., Koneman E.W., Kim Y.K. Mycobacterium//Manual of clinical microbiology/ Ed. Balows A., Hausler W.T., Herrmann K.L. et al.: NY, 1991.-P. 304-309.

215. Rodriguez-Barradas M.C., Clarridge J., Darouiche R. Disseminated Mycobacterium fortuitum disease in an AIDS patient// Am.J.Med. 1992. -Vol.93. - No.3. - P. 473-474.

216. Rook G.A.W., Stanford J. L. Slow bacterial infections or autoimmunity// Immunol. Today 1992. - Vol.13. - No.l. - 160-164.

217. Saiki R.K., Scharf S., Faloona F.et al. Enzymatic amplification of (3-globin genomic sequences and restriction site analysis for diagnosis of sickle cell anemia// Science. 1985. - Vol. 230. - P. 1350 - 1354.

218. Saiki R.K., Walsh P.S., Levenson C.H., Erlich H.A. Genetic analysis of amplified DNA with sequence-specific oligonucleotide probes// Proc.Nat.Acad.Sci. 1989. - Vol. 86. - P. 6230 - 6234.

219. Salch A.F., Weyer В., Bruns U. Comparison of ВАСТЕС MGIT 960 with ВАСТЕС 460 and solid media for detection of mycobacteria in clinical specimens in clinical laboratory// Clin.Microb.and Infect. 1999. - Vol.5, Suppl.3. -P.95.

220. Salian NV, Rish JA, Eisenach VD, Cave MD, Bates JH. Polymerase chain reaction to detect Mycobacterium tuberculosis in histology specimens// Amer.J.Resp.Crit.Care Med. -1998. Vol. 158. - No. 5. - P. 1150 - 1155.

221. Saltini C., Ivanyi J. Bridging research to medicine//Europ.Resp.J. -1995.-Vol.8, Suppl. 20.-P. 615-616.

222. Saltini C. Direct amplification of Mycobacterium tuberculosis deoxyribonucleic acid in paucibacillary tuberculosis//Eur.Respir.J. 1998. -Vol. 11. -No. 6.-P. 1215 - 1217.

223. Sambrook J., Fritsch E.F., Maniatis T. Molecular cloning: a laboratory manual. NY, 1989. - 264p.

224. Schroder G. Multicentre evaluation of the new Abbott LCx MTB assay// Clin. Mycobacter. 1998. - P. 141 - 148.

225. Sewell D.L., Rashad A.L., Rourke W.J. et al. Comparison of the Septi-Check AFB and BACTEC systems and conventional culture for recovery of mycobacteria// J. Clin.Microbiol. 1993. - Vol. 31. - No. 13. - P. 2689 -2691.

226. Sherman I., Harrington N., Rothrock A., George H. Use of a cut-off range in identifying Mycobacteria by the Gen-Probe rapid diagnostic system// J.Clin.Microbiol. 1989. - Vol.27. - No. 2. - P. 241 - 244.

227. Shinnik T.M., Good R.C. Mycobacterial taxonomy// Eur.J.Cli.Microb. Infect.Dis.- 1994.-Vol. 13.- No.3. P.884-901.

228. Siddiqi S.H., Libonati J.P., Middlebrook G. Evaluation of a rapid radiometric method for drug susceptibility testing of Mycobacterium tuberculosis //J.Clin.Microbiol. 1981. - Vol.13. -No.4. -P. 908 - 912.

229. Sjobring U., Mecklenburg M., Andersen A.B., Miorner H. Polymerase chain reaction for detection of Mycobacterium tuberculosis// J.Clin.Microbiol. 1990. - Vol. 28. - No. 7. - P. 2200 - 2204.

230. Small L.C., Ramakrishnan L., Falkow S. Remodeling schemesof intracellular pathogens.//Science.-1994,-Vol. 263. -No.2. P.637-639.

231. Soini H., Bottger E.C., Viljanen M.K. Identification of mycobacteria by

232. PCR-based sequence determination of the 32-kilodalton protein gene//J.Clin.Microbiol. 1994. - Vol. 32. - No. 12. - P. 2944 - 2947.

233. Soini H. Detection and identification of mycobacteria by PCR and sequencing of the 32-kDa protein gene. Turku, 1996. - 61 p.

234. Stager C.E., Libonati J.P., Siddiqi S.H. et al. Role of solid media when using in conjunction with the BACTEC system for mycobacterial isolation and identification // J. Clin.Microbiol. 1991. - Vol. 29. - No. 1. - P. 154 -157.

235. Stolt P., Stoker N.G. Functional definition of regions necessary for replication and incompatibility in the Mycobacterium fortuitum plasmid pAL5000 // Microbiology. 1996. - Vol. 142. - No. 10. - P. 2795 - 2802.

236. Su W.J., Tsou A.P., Yang M.H. et al. Clinical experience in using polymerase chain reaction for rapid diagnosis of pulmonary tuberculosis// Chung Hua I Hsueh Tsa Chin (Taipei). 2000. - Vol. 63. - No. 7. - P. 521 -526.

237. Suffys P.N., Ivens de Araujo M.E., Degrave N.M. et al. The changing face of the epidemiology of tuberculosis due to molecular strain typing a review// Memorial Inst.Oswaldo Gruz. - 1997. - Vol. 92. - No. 3. - P. 297 -316.

238. Suffys P., Palomino J.C., Cardoso Leao S. et al. Evaluation of the polymerase chain reaction for the detection of Mycobacterium tuberculosis I J Int.J.Tuberc.Lung Dis. 2000. - Vol. 4. -No.2.-P. 179- 183.

239. Talbot E.A., Williams D.L., Frothingham R. PCR identification of Mycobacterium bovis BCG//J.Clin.Micr. 1997. - Vol. 35. - No.3. - P. 566569.

240. Tan M.F., Ng W.C., Chan S.H. Comparative usefulness of PCR in the detection of Mycobacterium tuberculosis in different clinical specimens//J.Med.Microbiol. 1997. - V. 46. - No. 1. - P. 164 - 169.

241. Thibert L., Lapierre S. Routine application of high-performance liquid chromatography for identification of mycobacteria // J. Clin.Microbiol. -1993. Vol. 31. - No. 9. - P. 1759- 1763.

242. Thierry D.A., Brisson-Noel A., Vincent-Levy-Frebault S. et al. Characterization of a Mycobacterium tuberculosis insertion sequence, IS 6110, and its application in diagnosis// J.Clin.Microb. 1990. - Vol. 28. -No. 12.-P. 2668-2673.

243. Udou Т., Ogawa M., Mizuguchi Y. Spheroplast formation of Mycobacterium smegmatis and morphological aspects of their reversion to the bacillary form.//J. Bacteriol. 1982. - Vol. 151. - No. 2. - P. 1035 - 1039.

244. Vachee A., Savage G., Blanckaert C. et al. Diagnosis of osteo-articular tuberculosis by Gen-Probe Amplified Mycobacterium tuberculosis Direct Test (AMTD)//Clin.Mycobacter. Cordoba, 1998. - P. 165 - 170.

245. Vaquero M., Guttierrez J., Casal M. Comparison of ligase chain reaction and polymerase chain reaction methods for the detection of Mycobacterium tuberculosis!/Clin. Mycobacter. Cordoba, 1998. - P. 171 -174.

246. Veloso I., Lopes M., Salas C., Moreira E.//A comparison of three DNA extractive procedures with leptospira for polymerase chain reaction analysis// Mem.Inst.Oswaldo Cruz. 2000. - Vol. 95. - No. 3. - P. 339 - 343.

247. Vordermeier H.M., Cockle P.C., Whelan A. Development of diagnostic reagents to differentiate between Mycobacterium bovis BCG vaccination and M. bovis infection in cattle//Clin. Diagn. Lab. Immunol. -1999. Vol. 6. - No. 5. - P. 675-682.

248. Wahlberg J., Lundeberg J., Hultman Т., Uhlen M. General colorimetric method for DNA diagnostics allowing direct solid-phase genomic sequencing of the positive samples// Proc.Nat.Acad.Sci. 1990. - Vol. 87. - P. 6569 -6573.

249. Wayne L.G. Microbiology of tubercle bacilli//Am.Rev.Resp.Dis. -1982. Vol. 125 (Suppl.). - P. 31-41.

250. Wayne L.G., Kubica G.P. The mycobacteria// Bergey's manual of systematic bacteriology, vol.2/ Ed. P.H.A.Sneath: Baltimore, 1986. P. 14351457.

251. Wilson K.H., Blitchington R.B., Green R.C. Amplification of bacterial 16S ribosomal DNA with polymerase chain reaction// J.Clin.Microbiol. -1990.-Vol. 28.-No. 10.-P. 1942- 1946.

252. Wilson S.M., McNerney R., Nye P.M. et al. Progress toward a simplified polymerase chain reaction and its application to diagnosis of tuberculosis// J.Clin.Microbiol.- 1993. Vol.31. -No.3.- P. 776 - 782.

253. Yagupsky P.V., Kaminski D.A., Palmer K.M., Nolte F.S. Cord formation in BACTEC 7H12 medium for rapid, presumptive identification of Mycobacterium tuberculosis complex 1990. Vol. 28. - No. 7. - P. 1451 -1453.

254. Yuen K.Y., Chan K.S., Chan C.M. et al. Use of a PCR in routine diagnosis of treated and untreated pulmonary tuberculosis// J.Clin.Pathol. -1993. Vol. 46. - No. 3. - P. 318 - 322.