Видовой состав госпитальных штаммов условно-патогенных микроорганизмов и их роль в развитии инфекций у новорожденных с очень низкой и экстремально низкой массой тела тема диссертации и автореферата по ВАК РФ 03.02.03, кандидат наук Любасовская, Людмила Анатольевна

• Любасовская, Людмила Анатольевна
• кандидат наук
• 2013

Оглавление диссертации кандидат наук Любасовская, Людмила Анатольевна

ВВЕДЕНИЕ

ГЛАВА 1. Современные представления о госпитальных инфекциях у новорожденных, находящихся на выхаживании в ОРИТ (обзор литературы)

1.1 Понятие о госпитальных инфекциях

1.2 Инфекции у новорожденных, классификация и особенности у детей с ОНМТиЭНМТ

1.3 Факторы вирулентности Са/УХ

1.4 Чувствительность к антибактериальным препаратам наиболее часто выделяемых госпитальных штаммов микроорганизмов к антимикробным препаратам и механизмы ее развития

1.5 Современные принципы антибиотикотерапии госпитальных инфекций у новорожденных

1.6 Микробиологический мониторинг в системе инфекционного

контроля

ГЛАВА 2. Материалы и методы исследования

2.1 Общий объем проведенных исследований

2.2 Клинический материал

2.3 Микробиологические методы

2.4 Протеомные методы

2.5 Молекулярно-генетические методы исследования штаммов СоЖ

2.6 Особенности проводимой в отделении антибактериальной терапии

2.7 Статистическая обработка полученных результатов

ГЛАВА 3. Особенности этиологической структуры инфекций новорожденных с ОНМТ и ЭНМТ

3.1 Анализ результатов микробиологических исследований у новорожденных в первые сутки жизни

3.2 Результаты микробиологического обследования слизистых ЖКТ новорожденных, находящихся на лечении в ОРИТ

3.3 Результаты микробиологического обследования очагов инфекций новорожденных, находящихся на лечении в ОРИТ

3.4 Результаты анализа микробиологического исследования аутопсийного материала новорожденных

3.5 Видовое типирование изолятов СоЛФ

ГЛАВА 4. Генетическое исследование СоМБ

4.1 Исследование факторов патогенности СоМ>

4.2 Результаты мультилокусного секвенирования Б^ер1с1егт1сИз

4.3 Результаты мультилокусного секвенирования Иаето1уасш

4.4 Изучение способности основных сиквенс-типов СоЛ/51 к длительной

персистенции

ГЛАВА 5. Изучение чувствительности основных групп УПМ и особенностей антимикробной химиотерапии у новорожденных с ОНМТ и ЭНМТ

5.1 Антибиотикотерапия у глубоконедоношенных новорожденных

5.2 Анализ чувствительности, выделенных микроорганизмов к АМП

5.3 Изучение микробиологической эффективности наиболее часто применяемых АМП в отношении этиологически значимых

микроорганизмов у новорожденных с ОНМТ и ЭНМТ

ЗАКЛЮЧЕНИЕ

ВЫВОДЫ

ПРАКТИЧЕСКИЕ РЕКОМЕНДАЦИИ

ПРИЛОЖЕНИЯ

СПИСОК ЛИТЕРАТУРЫ

СПИСОК ИСПОЛЬЗУЕМЫХ СОКРАЩЕНИЙ

ОРИТ - отделение реанимации и интенсивной терапии

ГИ - госпитальная инфекция

ВАП - вентилятор - ассоциированная пневмония

ОНМТ - очень низкая масса тела

ЭНМТ - экстремально низкая масса тела

ПКТ - прокальцитонин

АМП - антимикробные препараты

МПК - минимальная подавляющая концентрация

УПМ - условно-патогенные микроорганизмы

ПЦР - полимеразная цепная реакция

СоNS - Coagulase-Negative staphylococci (коагулазонегативные

стафилококки)

MRCoNS - Метициллин - резистентные CoNS

MS - Метициллин-чувствительные

SCCmec - staphylococcal chromosome cassette mec

MLST - Multilocus Sequence Typing

CLSI - Clinical and Laboratory Standards Institute (Институт no

клиническим лабораторным стандартам)

НЭК - некротизирующий энтероколит

грам «-» - грамотрицательные микроорганизмы

грам «+» - грамположительные микроорганизмы

ГЗТ - гиперчувствительность замедленного типа

ГНТ - гиперчувствительность немедленного типа

СТШ - синдром токсического шока

ЦВК - центральный венозный катетер

Введение диссертации (часть автореферата) на тему «Видовой состав госпитальных штаммов условно-патогенных микроорганизмов и их роль в развитии инфекций у новорожденных с очень низкой и экстремально низкой массой тела»

ВВЕДЕНИЕ.

Актуальность проблемы. Выхаживание глубоконедоношенных детей в последние годы стало приоритетным направлением деятельности отделений реанимации новорожденных. С 1 января 2012 года Россия перешла на рекомендуемую ВОЗ регистрацию детей с массой тела при рождении от 500 г с включением в государственную статистику [25]. Благодаря научно-техническому прогрессу в медицине появилась возможность выхаживать недоношенных детей, начиная с 22 недель гестации и массой тела от 500г. Однако усилия, затраченные на выхаживание таких новорожденных, могут оказаться тщетными при развитии госпитальных инфекций (ГИ), риск развития которых в этой группе пациентов чрезвычайно высок. Отсутствие сформировавшегося иммунитета и нормальной микрофлоры у столь недоношенных детей делает процесс их адаптации к вне утробному существованию проблематичным со многих точек зрения, в том числе и с микробиологических позиций. Отсутствие естественного процесса приобретения нормальной микрофлоры (от матери), а также массивная антибактериальная терапия, которую получают все маленькие пациенты, влекут за собой колонизацию и инфицирование госпитальными штаммами условно-патогенных микроорганизмов (УПМ), которые часто (у 25-30% недоношенных детей) становятся причиной развития инфекционных осложнений госпитального происхождения [28]. Такие нозологические формы, как конъюнктивиты, омфалиты, катетер-ассоциированная бактериемия, вентилятор-ассоциированная пневмония, некротизирующий энтероколит (НЭК), сепсис сопровождаются высокой летальностью. По данным Национального комитета по внутрибольничным инфекциям (NN18, США) за 2001 год поздний неонатальный сепсис встречается у 50% новорожденных с весом при рождении менее 1500г [110]. При этом увеличивается длительность пребывания в стационаре до 79 дней, а

летальность в этой группе детей возрастает до 18% (против 7% с отсутствием сепсиса), особенно если возбудитель — грам «-» микроорганизмы (36%) и грибы (32%) [133,134].

Проведение рациональной антимикробной терапии ГИ невозможно без современных знаний об этиологической структуре инфекционных заболеваний и1 антибиотикорезистентности возбудителей. В этом плане актуальным представляется регулярное слежение за изменениями видового разнообразия госпитальных штаммов микроорганизмов, циркулирующих в родовспомогательном учреждении, а также изучение их антибиотикорезистентности.

Структура ГИ, с одной стороны, конкретна для каждого стационара, что обусловлено множеством факторов, таких, как техническая оснащенность отделения, квалификация персонала, контингент больных, проводимая в стационаре антибиотикополитика и т.д. С другой стороны, общие закономерности, по которым развивается эпидемический процесс, приводят к появлению общих черт в формировании «эпидемических вариантов в популяциях госпитальных штаммов УПМ.

В современных эпидемиологических исследованиях при изучении этиологической структуры неонатальных инфекций часто используется термин «микробиологический мониторинг», под которым подразумевают плановые микробиологические обследования госпитальной среды и по клиническим показаниям — новорожденных [30]. При таком «мониторинге» получают исходные данные для ретроспективного анализа этиологической структуры уже состоявшихся ГИ и оценки эпидемиологической ситуации в отделении в целом. В современных условиях выхаживания маловесных новорожденных центр внимания переключается с госпитальной среды на пациента — слежение за этапами микробной колонизации. В режиме поп stop с двух-трех дневным интервалом проводят культуральное исследование мазков со слизистых

оболочек ЖКТ, что позволяет оперативно реагировать на ситуации патологической колонизации и предупреждать развитие ГИ как у конкретного пациента, так и неблагоприятной эпидемиологической ситуации в целом [1]. Микробиологические исследования, проводимые с диагностической целью не должны рассматриваться как микробиологический мониторинг (поскольку изучение этиологии ГИ не является профилактическим мероприятием). Цель настоящего исследования:

Выявить особенности этиологической структуры ГИ у новорожденных с очень низкой и экстремально-низкой массой тела при рождении (ОНМТ и ЭНМТ) и усовершенствовать качество микробиологического мониторинга в современных условиях перинатального Центра.

Для достижения поставленной цели были определены следующие Задачи:

1. Выявить особенности колонизации условно-патогенных микроорганизмов новорожденных с очень низкой и экстремально низкой массой тела при рождении в условиях отделения реанимации.

2. Определить этиологию инфекций у новорожденных с очень низкой и экстремально низкой массой тела на основании результатов микробиологического исследования патологического материала из очагов инфекций.

3. С помощью масс-спектрометрического анализа определить видовую принадлежность коагуазонегативных стафилококков (СоА^Х), циркулирующих в отделении реанимации новорожденных. Используя молекулярно-генетические методы, изучить сиквенс-типы и факторы вирулентности СоЫБ.

4. Сопоставить данные чувствительности к антимикробным

препаратам этиологически значимых условно-патогенных микроорганизмов in vitro с данными микробиологической эффективности в процессе этиотропной терапии новорожденных.

5. Определить влияние антимикробной терапии на колонизацию госпитальными штаммами УПМ новорожденных с ОНМТ и ЭНМТ.

Научная новизна работы:

■Изучены особенности колонизации и инфицирования госпитальными штаммами УПМ новорожденных с ОНМТ и ЭНМТ в условиях перинатального Центра.

■Получена комплексная микробиологическая и молекулярно-генетическая характеристика госпитальных штаммов CoNS и показана роль штаммов с определенным генетическим профилем в развитии инфекционного процесса у новорожденных.

■Показана роль антимикробной терапии в формировании микроценоза слизистых оболочек ЖКТ у новорожденных с ОНМТ и ЭНМТ, а также ее влияние на этиологическую структуру ГИ у пациентов этих групп.

Практическая значимость:

На основании проведенного комплексного клинического и молекулярно-генетического анализа даны рекомендации по оптимизации микробиологического мониторинга и эмпирической терапии инфекций у новорожденных с ОНМТ и ЭНМТ при рождении. Основные положения, выносимые на защиту:

1. Метициллин-резистентные коагулазонегативные стафилокококки (MRCoNS), полирезистентные штаммы энтеробактерий {Enterobacter cloacae) и дрожжевые грибы видов Candida non-albicans играют ведущую роль в этиологической структуре госпитальных инфекций у новорожденных с ОНМТ и ЭНМТ.

2. Staphylococcus epidermidis и Staphylococcus haemolyticus преобладают в

видовой структуре среди CoNS. Каждый из этих видов принадлежит к ограниченному числу сиквенс-типов. Они являются близкородственными, относятся к единому клональному комплексу. Основное их свойство - способность к длительной циркуляции в стационаре.

3. Распространение MRCoNS, несущих ген тесА и увеличение доли дрожжевых грибов Candida non-albicans, устойчивых к флюконазолу, в значительной мере является результатом селективного давления антимикробных препаратов (АМП). Внедрение результатов исследования в практику здравоохранения:

Усовершенствованный алгоритм микробиологического мониторинга в ОРИТ новорожденных используется в практической работе Отдела микробиологии и клинической фармакологии ФГБУ «НЦАГиП им. В.И.Кулакова» МЗ РФ; рекомендации по оптимизации антимикробной терапии у новорожденных с ОНМТ и ЭНМТ внедрены в работу Отдела неонатологии Центра. Материалы диссертации используются в лекционном материале при обучении на курсах повышения квалификации врачей, обучении клинических ординаторов и аспирантов, на семинарах и конференциях, проводимых в ФГБУ «НЦАГиП им. В.И.Кулакова» МЗ РФ. Апробация работы:

Основные положения диссертации доложены и обсуждены на:

• XIV международном конгрессе МАКМАХ по антимикробной терапии, Москва, май 2012г.

• Ученом совете ФГБУ «Научный центр акушерства, гинекологии и перинатологии имени академика В.И.Кулакова» Минздрава РФ, Москва, ноябрь 2012г.

• V Научно - образовательном конгрессе «Анестезия и реанимация в акушерстве и неонатологии», Москва, ноябрь 2012г.

• III международной научно-практической конференции «Постгеномные методы анализа в биологии, лабораторной и клинической медицине», Казань, ноябрь 2012г.

• 22nd European Congress of Clinical Microbiology and Infectious Diseases, London, United Kingdom, март-апрель 2012.

• 13th Asia-Pacific Congress of Clinical Microbiology and Infection October 25-28, 2012 Beijing, China.

• XV международном конгрессе MAKMAX по антимикробной терапии, Москва, май 2013г.

Обсуждение диссертационной работы состоялось на межклинической конференции сотрудников ФГБУ «НЦАГиП им. В.И.Кулакова» МЗ РФ (01.03.2013), заседании апробационной комиссии (06.05.2013) ФГБУ «НЦАГиП им. В.И.Кулакова» МЗ РФ.

Публикации: По теме диссертации опубликовано 12 научных работ, в том числе 5 статей в рецензируемых научных журналах, определенных ВАК РФ и 2 публикации в зарубежных изданиях. Структура и объем диссертации:

Диссертационная работа состоит из введения 5 глав, включающих обзор литературы, собственные исследования и их результаты, заключения, выводы, практические рекомендации, список литературы. Работа изложена на 143 страницах машинописного текста, иллюстрирована 22 таблицами, 16 рисунками и 3 фотографиями.

Указатель литературы состоит из 34 отечественных и 114 зарубежных источников.

ГЛАВА 1. Современные представления о госпитальных инфекциях у новорожденных, находящихся на лечении в ОРИТ новорожденных (обзор литературы).

1.1 Понятие о госпитальных инфекциях.

Согласно определению ВОЗ госпитальные инфекции - это любые клинически выраженные заболевания микробного происхождения, поражающие больного в результате его госпитализации или посещения лечебного учреждения с целью лечения, а также больничный персонал в силу осуществления им деятельности, независимо от того, проявляются или не проявляются симптомы этого заболевания во время нахождения данных лиц в стационаре.

ГИ обычно возникают через 48 часов или более после поступления больного в лечебное учреждение, при условии отсутствия клинических проявлений этих инфекций в момент обращения [34]. Несмотря на проводимые противоэпидемические мероприятия, частота возникновения, летальность и стоимость терапии ГИ остается высокой. В большей степени это связано с ростом и распространением штаммов микроорганизмов, резистентных к АМП. Это является серьёзным фактором, влияющим как на клинический исход, так и приводящим к значительному увеличению затрат на лечение инфекций [95]. Более 90% всех ГИ имеет бактериальное происхождение, а вирусные, грибковые возбудители и простейшие встречаются значительно реже [33].

Особенностью ГИ является то, что они могут быть вызваны не только облигатными патогенами (например, М. tuberculosis), но и УПМ, обладающими небольшим набором факторов вирулентности (S.maltophilia, Acinetobacter spp., S.epidermidis и др.), особенно подвержены пациенты с иммунодефицитными состояниями различного происхождения и больные, имеющие тяжелую патологию. Наиболее частыми возбудителями ГИ

являются микроорганизмы, широко распространенные в окружающей среде, устойчивые ко многим внешним факторам и быстро приобретающие резистентность к антибактериальным препаратам. По сравнению с "классическими" возбудителями нозокомиальных инфекций (S.aureus, P.aeruginosa, E.coli, Klebsiella spp.), этиологическое значение других групп УПМ со значительно более низким патогенным потенциалом в последние годы значительно возросло [33]. Наиболее подверженный ГИ контингент больных — больные онкогематологическими заболеваниями, ожоговые больные, пациенты отделений реанимации и интенсивной терапии (ОРИТ), а так же новорожденные.

Наиболее частыми проявлениями ГИ являются пневмония и сепсис. У пациентов, требующих проведения искусственной вентиляции легких (ИВЛ) вероятность возникновения пневмонии возрастает в 6-21 раз [4]. Госпитальная пневмония занимает первое место среди причин смерти от ГИ, составляя в общей их структуре около 15%, а частота их оценивается от 5 до 10 случаев на 1000 госпитализаций [18]. Наиболее частыми возбудителями госпитальных пневмоний у взрослых среди грам «+» микроорганизмов являются - S.aureus (особую опасность среди которых представляют метициллинрезистентные штаммы), Streptococcus pneumoniae, среди грам «-» микроорганизмов, неферментирующие грам «-» бактерии и энтеробактерии [4,5,18]. Стафилококковые пневмонии отличаются тяжелым течением и высокой легальностью [18].

Сепсис также является основной причиной смерти в ОРИТ некоронарного профиля и занимает при этом 11 -е место среди всех причин смертности населения. По данным эпидемиологических исследований, законченных в 2003 году в Европе и Австралии, частота сепсиса в индустриальных странах составляет 50-100 случаев на 100 тыс. населения [29]. При ГИ первичный очаг чаще отмечается в легких (68%), реже — в брюшной полости (22%) [27]. В 63,2% случаев сепсис является

осложнением ГИ [29].

По данным зарубежной литературы - роль грам «+» и грам «-» бактерий в развитии госпитального сепсиса сопоставима, тоща как в нашей стране по результатам некоторых исследований частота грам «+» и грам «-» сепсиса приблизительно равна, хотя авторы отмечают увеличение роли грам «+» бактерий (/Streptococcus spp., Staphylococcus и Enterococcus spp.) за счет CoNS, в особенности S.epidermidis [12,27,29]. В популяции различных видов стафилококков наблюдается неуклонное увеличение частоты выделения метициллинрезистентных штаммов (MRSA, MRCoNS). Энтерококки часто служат причинными микроорганизмами в развитии широкого ГИ: первичная бактериемия, инфекции мочевыводящих путей, эндокардит, инфекции кожи и мягких тканей, перитонит [27].

Некоторые отечественные авторы отмечают; что частота грам «+» инфекций в ОРИТ в нашей стране значительно ниже по сравнению с другими странами. Это касается в основном 5!aureus, S.epidermidis, Enterococcus spp., S.pneumoniae. Хотя частота выделения MRSA в России сравнима с данными США и Канады [27]. Лидирующие позиции в РФ занимают энтеробактерии и неферментирующие грам «-» бактерии: они являлись возбудителями инфекций в 63,7% всех случаев или в 72,7% - среди бактериальных ГИ. Распространённость инфекций, связанных с грам «+» бактериями, в общей этиологической структуре была почти в три раза ниже - 23,9% [27].

В исследовании РИОРИТа среди грам «-» бактерий в качестве возбудителей лидирующие позиции занимали представители семейства Enterobacteriaceae - 52,7%, а также неферментирующие грам «-» бактерии - Pseudomonas aeruginosa - 29,9% и Acinetobacter spp. - 15,7%. В свою очередь, в семействе Enterobacteriaceae главную роль играли Klebsiella pneumoniae - 34% и Esherichia coli - 28,9%. Повышение их значимости в развитии тяжелых инфекций связано с длительной ИВЛ и увеличением частоты применения в клинической практике цефалоспоринов III

поколения и гентамицина [29].

Грибы в качестве возбудителей ГИ, по различным данным, встречаются от 9 до 20% случаев, со значительным преобладанием Candida albicans [27].

В неонаталогии до 1960-х годов этиологическими факторами большинства эпидемий ГИ был S. aureus, а в 60-х и 70-х годах — грам негативные бактерии. В дальнейшем основными возбудителями ГИ у новорожденных стали вновь грам «+» кокки, особенно S. aureus, а с конца 90-х лидирующее положение занимают CoNS [63,69,108].

В детских ОРИТ, где на лечении находятся дети старше 1 месяца, а также в хирургических детских отделениях лидирующие позиции занимают полирезистентные грам негативные микроорганизмы (Escherichia coli, Klebsiella spp., Pseudomonas spp.) [21].

1.2 Инфекции у новорожденных, классификация и особенности у детей с ОНМТ и ЭНМТ.

Для плода и новорожденного характерно относительное иммунодефицитное состояние, сопровождающееся повышенной (по сравнению с детьми старшего возраста и взрослыми) восприимчивостью к инфекции, т. е. у плода и новорожденного снижена функциональная способность всех важных компонентов иммунной системы. Инфицирование может происходить антенатально, интранатально и постнатально. При антенатальном инфицировании (вертикальный путь передачи) инфекция может иметь как восходящий, так и трансплацентарный механизм проникновения [2,12]. При этом инфекция будет носить внутриутробный характер и такому типу инфекций присущ определенный круг возбудителей (из них основные бактериальные агенты -Streptococcus agalactiae — бета-гемолитический стрептококк группы В, E.coli, Listeria monocytogenes. Streptococcus agalactiae и E.coli являются

основными возбудителями оппортунистических инфекций влагалища, приводящих к восходящему инфицированию околоплодных вод [2,12,37,129,148]. У 42-72% детей, родившихся естественным путем (т. е. без кесарева сечения) обнаруживается колонизация микробами матери, при этом только у 1-2% из них развивается инфекционное заболевание [42]. Возбудители внутриутробных инфекций - как правило «дикие» штаммы, т.е имеют небольшое количество маркеров антибиотикорезистентности [2,37,129].

В клинической практике не всегда удается быстро определить природу инфекции, а наличие признаков инфекционного процесса требует от врача принятия решения о выборе схемы антимикробной терапии, то есть гораздо раньше, чем заканчивается постановка точного диагноза. В этом плане актуальным представляется классификация инфекций в зависимости от сроков манифестации клинических симптомов. Условной гранью для разделения госпитальных и врожденных инфекций во всем мире является срок в 72 часа после рождения. Исходя из этого инфекции у новорожденных делятся на ранние (манифестируют раньше 72 часов) и поздние постнатальные (манифестируют позже 72 часов) [23,54,56]. Такое деление условно, но на начальном этапе оно помогает определить тактику эмпирической терапии.

По результатам самого большого анализа заболеваемости новорожденных с ОНМТ и ЭНМТ за 14 - ти летний период (1997 — 2010гг.), причиной ранних постнатальных инфекций чаще всего являются грам «-» микроорганизмы, а поздних — грам «+» и дрожжевые грибы. Особый интерес вызывает то, что заболеваемость ранним и поздним неонатальным сепсисом мало изменилась за этот 14-летний период. При этом общая смертность новорожденных с ОНМТ и ЭНМТ при положительном посеве крови, выше, чем у новорожденных этих групп с отрицательными гемокультурами [83,145].

Ранние постнатальные инфекции проявляются в первые 72 часа жизни новорожденного. Смертность от раннего неонатального сепсиса выше, чем от позднего [148]. Как правило, эти инфекции имеют внутриутробное происхождение или заражение происходит интранатально — в обоих случаях чаще всего источником является мать, хотя бывает, что и в эти сроки манифестируют ГИ [2,12]. Подтверждением внутриутробного происхождения инфекции может служить выделение одинакового штамма из заднего свода влагалища или цервикального канала матери и из очагов инфекции у новорожденного [2].

Если женщина не подвергалась воздействию инвазивных процедур в условиях стационара или не имеет тяжелой сопутствующей соматической патологии, трансплантированных органов и т.д, то наиболее частыми бактериальными возбудителями ранних неонатальных инфекций являются Streptococcus agalactiae и E.coli [23,37,129,148]. Это связано и с тем, что эти микроорганизмы часто встречаются при неспецифических (аэробных) вагинитах, когда инфекция носит восходящий характер.

В последние годы наблюдается снижение частоты ранних постнатальных инфекций вообще и ассоциированных с Streptococcus agalactiae в частности [129,139]. Причиной этому служит активное применение ампициллина в качестве профилактики Streptococcus agalactiae - ассоциированных инфекций. Но у этой положительной тенденции есть и отрицательная сторона: нарастает частота инфекций, вызванных E.coli, устойчивой к ампициллину [37,129]. Однако это, случаи инфекций, вызванных штаммами E.coli, устойчивыми к амокициллину/клавуланату, встречаются редко [139]. У 10 - 30% беременных Streptococcus agalactiae колонизирует влагалище или перианальную область, но лишь у 1-2% развивается инфекция плода [42,76].

Одним из наиболее опасных возбудителей внутриутробных инфекций является Listeria monocytogenes, для которой характерен как

трансплацентарный, так и восходящий пути передачи. Этот возбудитель у новорожденных вызывает менингит и сепсис [33]. Причем даже адекватная антибиотикотерапия не всегда предотвращает фатальные исходы [50].

Вульво-вагинальный кандидоз у женщин также является фактором риска развития внутриутробной инфекции у новорожденного, хотя у доношенных детей генерализации процесса, как правило, не происходит в силу низкой вирулентности этих микроорганизмов. Новорожденные с ОНМТ и ЭНМТ - группа пациентов особого риска по реализации грибковой инфекции [99]. Внутриутробные грибковые инфекции чаще всего ассоциированы с Candida albicans, а госпитальные — с non-albicans видами [3,55,58,84, 97,99,126,128,148].

Поздние постнатальные инфекции проявляются позднее 72 часов жизни. Возбудители этих инфекций, как правило, госпитальные штаммы [54]. На современном этапе наибольшую этиологическую роль в ОРИТ новорожденных играют метициллин-резистентные коагулазонегативные стафилококки (MRCoNS), дрожжевые грибы рода Candida [30,38,54, 55,107,116,129,139,148]. Резервуаром госпитальных штаммов являются больные новорожденные, персонал и окружающая среда [143].

Частота ГИ у новорожденных в разных странах варьирует от 5до 10%, а у недоношенных новорожденных 25-30% [12,28]. В нашей стране официально регистрируемая заболеваемость новорожденных внутрибольничными (связанными с акшерским стационаром) гнойно-септическими инфекциями значительно ниже истиной, что обусловлено неполным выявлением заболевших в акушерском стационаре и дефектами в системе учета заболевших (после выписки из родильного дома) [30]. На первом месте по зарубежным данным стоят инфекции кровотока и пневмонии [124], а в нашей стране ведущими нозологическими формами ГИ являются поражение кожи (везикулопустулез, пузырчатка, пиодермия), глаз (конъюнктивит, дакриоцистит) и омфалит [14,16,30].

Пневмония, ассоциированная с искусственной вентиляцией легких (ВАП), по данным зарубежных авторов, является ведущей нозологической формой ГИ в ОРИТ новорожденных [41]. НЭК у глубоконедоношенных новорожденных в некоторых случаях имеет также госпитальное происхождение [60].

Поздний неонатальный сепсис (более 72 часов после рождения) встречается у 50% новорожденных с весом при рождении менее 1500г. [110,132] При этом увеличивается длительность пребывания в стационаре до 79 дней, а летальность в группе детей с ОНМТ возрастает до 18% (против 7% с отсутствием сепсиса), особенно если возбудитель — грам «-» микроорганизмы (36%) и грибы (32%) [133,134].

По данным зарубежных авторов, 21% новорожденных с ОНМТ, проживших более трех дней, имеют один или более эпизодов бактериемии, причем у этих новорожденных вероятность заразиться внутрибольничной инфекцией кровотока больше, чем у доношенных детей. Глубоконедоношенные новорожденные чаще подвергаются воздействию инвазивных процедур (в частности — катетеризация центральных вен, инфузии липидных растворов), которые являются дополнительным фактором риска и создают предпосылки для развития катетер-ассоциированных инфекций [70,132,133,134].

V.Q.Hemming и сотрудники, обобщили данные о 904 новорожденных, установили, что частота внутрибольничных инфекций среди пациентов ОРИТ новорожденных составила 15,3% (бактериемии — 1%, пневмонии — 29,3%, инфекции мочевыводящих путей — 4,5%, менингиты — 4%). Эти показатели были существенно выше у младенцев, вес которых при рождении был ниже 1500г [81]. Goldman и сотрудники, изучавшие вопрос о ГИ в ОРИТ новорожденных, отметили повышенный риск инфицирования детей с низким весом при рождении, с незаращением Баталова протока, а также у детей, подвергшихся хирургическим вмешательствам и

множественным инвазивным инструментальным процедурам [73].

Таким образом, основными факторами риска развития ГИ у новорожденных являются: низкий вес при рождении (менее 1500г), малый гестационный возраст (менее 32 нед), применение внутрисосудистых катетеров (венозных, артериальных), проведение искусственной вентиляции легких, использование антибиотиков, кортикостероидов [54,73,81,107,132]. Дополнительным фактором передачи ГИ может являться как зондовое энтеральное, так и парентеральное питание (внутривенные инфузии растворов липидов) [68,70,107,132,138]. Частота возникновения инфекций обратно пропорциональна весу ребенка при рождении и его гестационному возрасту. К осложнениям недоношенности, увеличивающим риск возникновения позднего неонатального сепсиса, относятся открытый артериальный проток, бронхолегочную дисплазию и НЭК [133,134].

Тяжесть состояния и массивная антибиотикотерапия в ОРИТ определяют формирование микрофлоры, сильно отличающейся от присущей в норме тому или иному биотопу [8]. Ранее, в 90-е годы большое внимание уделялось грам «-» микрофлоре, а также энтерококкам.

CoNS довольно часто обнаруживали при изучении колонизации слизистых оболочек, однако их роль как потенциальных возбудителей ГИ, недооценивалась. Эти микроорганизмы первыми заселяют кожу и слизистые новорожденного. На 2-3 сутки они формируют микробиоценоз кожи новорожденного в ассоциации с грам «-» палочками (главным образом лактозоположительными негемолитическими эшерихиями). Есть указания на то, что у детей с ранней неонатальной дезадаптацией чаще обнаруживаются CoNS с увеличенным патогенным потенциалом (антибиотикорезистентность и гемолитические свойства), чаще встречаются дрожжевые грибы рода Candida и потенциально патогенные энтеробактерии (клебсиеллы, протей, гемолитические лактозонегативные

Список литературы диссертационного исследования кандидат наук Любасовская, Людмила Анатольевна, 2013 год

СПИСОК ЛИЕРАТУРЫ:

1. Анкирская A.C. Микробиологический мониторинг в системе профилактики внутрибольничных инфекций в отделениях реанимации и интенсивной терапии новорожденных. / А.С.Анкирская, Т.Г.Миронова // Тезисы докладов научно-практической конференции с международным участием «Роль клинической микробиологии в профилактике внутрибольничных инфекций» - М., 26-27 октября,2004. - С.-8-10

2. Анкирская АС. Условно-патогенные микроорганизмы — возбудители внутриутробной инфекции плода и новорожденного: автореферат дис. ... д-ра мед. наук:03.00.07 / А.С Анкирская - М.: 1985.-42с.

3. Антонов А.Г. Профилактика и лечение микозов у глубоконедоношенных детей в условиях ОРИТ / А.ГАнтонов, О.А.Бабак, А.А.Рудакова, Н.А.Приходько, М.А.Мумрикова, О.В.Ионов, Д.Н.Дегтярев, И.В.Никитина, А.С.Анкирская, Т.В.Припутневич // Материалы IV Всероссийского образовательного конгресса. - М., 22-25 ноября 2011. - с.126-128

4. Белобородов В.Б. Нозоюмиальная пневмония, связанная с искусственной вентиляции легких, и проблема лечения резистентной грамположительной флоры / В.Б. Белобородов // Инфекции и антимикробная химиотерапия- 2004.- Т.06.-№4.- с.114-120

5. Белобородов В.Б., AB. Дехнич, P.C. Козлов, Г.К. Решедью, C.B. Сидоренко. Нозоюмиальная пневмония у взрослых: российские национальные рекомендации / ред. АГ.Чучалин, Б.Р.Гельфанд-Ярослааль:Ярославский печатный двор,- 2009.-90с.

6. Белобородова Н.В. Карбапенемы в педиатрии / Н.В. Белобородова // Антибиотики и химиотерапия. - 2001.- Т. 46.-№12.-с.8-16

7. Белобородова Н.В. Новые тенденции в антимикробной терапии тяжелых гнойно-воспалительных заболеваний у детей и значение антибиотиков группы карбопенемов / Н.В.Белобородова // Российский вестник перинатологии и педиатрии.- 2002.- №2.- с. 56-60

8. Белобородова Н.В. Особенности микрофлоры зева у детей в отделениях интенсивной терапии / Н.В.Белобородова, Т.Ю.Вострикова // Антибиотики и антимикробная химиотерапия.- 1998.- №8.- с. 16-22

9. Белоусов Ю.Б. Общая и частная клиническая фармакокинетика / Ю.Б.Белоусов, К.Г.Гуревич - М.: ИИА Ремедиум, 2006.- 807с.

10. Благонравова А.С. Эпидемиологические и микробиологические аспеюы госпитальных гнойно-септических инфекций новорожденных, обусловленных шагулазоотрицагельными стафилококками / АСЕлагонравова, О.Н.Воробьева, О.В.Ковалишена, И.Г. Алексеева, Н.Ю. Иванова, И.Ю. Широкова, Н.В. Саперкин // Медицинский альманах.-2009 - № 2.- с.72-75

П.Брудастов Ю.А. Свойства E.coli как факторы транслокации из кишечника во внутренние органы / Ю.А.Брудастов, В.А.Гриценко, О.С.Журлов, А.Н.Брудастов // Вестник ОГУ. Приложение Биология и медицина.- 2005.-№5,- с.9-14

12. Венцел РП. Внурибольничные инфекции /ред..-М.: Медицина, 1990 - 656с.

1 З.Воронина O.JI. Разработка схемы мультилокусного секвенирования Staphylococcus haemolyticus и ее применение для молекулярно-эпидемиологического анализа штаммов, выделенных в стационарах Российской Федерации в 2009-2010гг / О.Л.Воронина, М.С.Кунда, О.А.Дмитренко, В.Г.Лунин, А.Л.Гинцбург// Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунологии.- 2011.- №5.- С. 62-67

14.Вялкова А. А. Клинико-микробиологическая характеристика новорожденных с патологией дыхательной системы / А.А.Вялкова, Т.В.Бирюкова, В.А.Гриценко, Т.В.Космович, Е.В.Васильева // Вестник ОГУ. Приложение Биология и медицина 2005.- №5.- с. 15-18

15.Вялкова А.А. Перинатальная инфекционно-воспалительная птология у новорожденных Оренбурга: региональные особенности эпидемиологии, нозологии и микробиологии / А.А.Вялкова, Т.В.Бирюкова, О.В.Бухарин,

В.А.Гриценко, И.Н.Воропаева, Т.В.Космович. // Тихоокеанский медицинский журнал.-2005.- №3.- с.80-83

16.Гриценко В. А. Клинико-анамнестическая и микробиологическая характеристика новорожденных с разным характером ранней неонатальной адаптации / В.А.Гриценко, А.А.Вялкова, Е.В.Азарова // Курский научно-практический вестник "Человек и его здоровье".-2009.-№3.- с. 38-46

17.Гучев И.А. Современные препараты в лечении инфекций, вызванных оксациллинустойчивыми стафилококками и энтерококками / И.А.Гучев // Consilium medicum.-2005.-TOM 07.-№ 2.

18. Дворецкий Л.И. Госпитальные стафилококковые пневмонии / Л.ИДворецкий, В.В.Каминский, С.ВЛковлев. // Consilium medicum -2001. -№4

19.Калиновская И.И. Фармакоэпидемиология неонатальных инфекций в условиях стационара / И.И.Калиновская, И.Г.Солдатова , Л.Л.Панкратьева // Материалы XI научно-практической конференции «Внутрибольничные инфекции в стационарах различного профиля, профилактика, лечение осложнений,- Москва.- 4-5 апреля 2013,- с.35-36

20.Клиническая лабораторная аналитика. Том IV. Частные аналитические технологии в клинической микробиологии / ред. В.В.Меньшикова - М.: Агат-Мед, 2003,- 816с.

21. Крапивина И.В. Микробиологический мониторинг в оптимизации антибактериальной терапии внутрибольничных инфекций в отделениях реанимации и интенсивной терапии и отделениях хирургического профиля / И.В.Крапивина, А.Ю.Миронов // Курский научно-практический вестник «Человек и его здоровье». - 2009.- № 1. - С. 81-87

22.Любимова A.B. Микробиологический мониториг в отделениях реанимации новорожденных / А.В.Любимова, Л.П.Зуева, А.М.Пулин, Н.В.Сатосова.// Эпидемиология и вакцинопрофилактика.-2011.- №5.-с.25-

23. Пагосян К.С. Эпидемиология виутрибольничных инфекций в отделениях реанимации и интенсивной терапии новорожденных / К.С Пагосян, А.ДАмбарцумян, К.ЭАрупонова // Медицинский вестник Эребуни.- 2008.- 2.(34), с. 55-60

24.Приказ Минздрава СССР от 28.12.1989 № 691 «О профилактике виутрибольничных инфекций в акушерских стационарах»

25.Приказ Министерства здравоохранения и социального развития РФ от 27 декабря 2011 г. №1687н «О медицинских критериях рождения, форме документа о рождении и порядке ее выдачи»

26.Приходько H.A. Профилактика и лечение грибковых инфекций у новорожденных в условиях отделения реанимации и интенсивной терапии: клинические рекомендации / Н.А.Приходько, Д.С.Крючко, О.В.Ионов, С.Д.Мирохин, А.Г.Антонов, Т.В.Припутневич, Е.Н.Балашова, И.В.Никитина, Д.Н.Дегтярев -М.:ФГБУ НЦ АГиП МЗ РФ, 2012.-19с.

27. Руцнов В.А Инфекции в ОРИТ России: результаты национального многоцентрового исследования. / ВАРуднов, Д В.Вельский, А.В.Дехнич // Клиническая микробиология и антимикробная химиотерапия.-2011 .-том 13.-№ 4.-С.294-303

28.Рюмина И.И. Современные принципы выхаживания новорожденных и санитарно-противоэпидемический режим / И.И.Рюмина // Материалы XI научно-практической конференции «Внутрибольничные инфекции в стационарах различного профиля, профилактика, лечение осложнений.-Москва.- 4-5 апреля 2013,- с.68-69

29.Савельев B.C. Сепсис в начале XXI века: практическое руководство / В.С.Савельев, Б.С.Гельфанд // М.:Литтерра. - 2006.-176с.

30.Сергевнин В.И. Пути совершенствования микробиолоического мониторинга в системе эпидемического надзора за внутрибольничными гнойно-септическими инфекциями / В.И.Сергевнин, Н.И.Маркович, Н.С.Авдеева // Казанский медицинский журнал.- 2008.- том 89.-№5.-

с.725-728

31. Сидоренко С.В. Клиническое значение атибиотикорезистентносга грамположигельных микроорганизмов / С.В.Сидореню // Инфекции и антимикробная химиотерапия - 2003.- том 5 - № 2.-С.З-15

32.Сидоренко С.В. Проблема устойчивости стафилококков к бета-лактамам и гликопептидам: от теории к практике / Сидоренко С.В. // Анналы антимикробной химиотерапии.-2009.- Том 1.№1 - с. 41-50

33.Страчунекий JI.C. Практическое руководство по антиинфекционной химиотерапии / под ред. Л.С.Страчунский, Ю.Б.Белоусов, С.Н.Козлов-Смоленск: МАКМАХ, 2007.- 464 с.

34. Строганов В.П. Особенности эпидемиологии и микробиологии госпитальных инфекций / В.П.Строганов // Инфекции и антимикробная химиотсрапия.-2000.- том 02.-№3,с.96-98

35.Aaron SD, Ferris W, Ramotar К, Vandemheen К, Chan F, Saginur R. Single and combination antibiotic susceptibilities of planktonic, adherent, and biofilm-grown Pseudomonas aeruginosa isolates cultured from puta of adults with cystic fibrosis // Journal of Clinical Microbiology. 2002 November;40( 11 ):4172-9

36.Aideen I. McKevitt, Gordean L. Bjornson, Christof A. Mauracher, David W. Scheifele. Amino-acid Sequence of a delta-like toxin from Staphylococcus epidermidis // Infection and immunity. 1987 September; p.2268-73

37.Andreu A, Ortega E, Planes AM, Salcedo S. Evolution of perinatal Escherichia coli disease in the era of group В Streptococcus prophylaxis // Med Clin (Bare). 2001 November 3;117(14):521-4

38. Ankirskaya A.S., Ershova T.U., Mironova T.G Coagulaso-negative staphylococci, cause neonatal pneumonia in intensive care // 3-rd International Conference of the Hospital Infection Society // London, 4-7 September 1994. Book abstr., №5, post 140, p.60.

39.Anne JM. Loonen, Arjan R. Jansz, Jeandery NB. Bergland, Marion

Valkenburg, Petra FG. Wolffs, Adriaan JC. van den Brule.Comparative Study Using Phenotypic, Genotypic, and Proteomics Methods for Identification of Coagulase-Negative Staphylococci // Journal of Clinical Microbiology. 2012 January;50(4): 1437-9

40.Antonia Camerer, Anke Kohlenberg, Danuta Stefanik, Harald Seifert. Evaluation of Quantitative Antibiotic Susceptibility Testing by Vitek 2 as a Routine Method To Predict Strain Relatedness of Coagulase-Negative Staphylococci Isolated from Blood Cultures // Journal of Clinical Microbiology. 2011 September; 49(9):3355-7

41.Badr MA, Ali YF, Albanna EA, Beshir MR, Amr GE. Ventilator associated pneumonia in critically-ill neonates admitted to neonatal intensive care unit, zagazig university hospitals // Iran Journal Pediatrics. 2011 December^ 1(4):418-24

42.Baker CJ, Barret FF. Transmission of group B streptococci among parturient women and their neonates // Journal Pediatrics. 1973 December; 83(6):919-25

43.Bansal S, Jain A, Agarwal J, Malik GK. Significance of coagulase negative staphylococci in neonates with late onset septicemia // Indian Journal of Pathology and Microbiology. 2004 October; 47(4):586-8

44.Barbara Lucignano, Stefania Ranno, Oliver Liesenfeld, Beatrice Pizzorno, Lorenza Putignani, Paola Bernaschi and Donato Menichell. Multiplex PCR Allows Rapid and Accurate Diagnosis of Bloodstream Infections in Newborns and Children with Suspected Sepsis // Journal of Clinical Microbiology. 2011 June; 49(6):2252-8

45.Blakey JL, Lubitz L, Campbell NT, Gillam GL, Bishop RF, Barnes GL. Enteric colonization in sporadic neonatal necrotizing enterocolitis // Journal of Pediatric Gastroenterology and Nutrition. 1985 August; 4(4):591-5

46.Boo NY, Cheah IG. Risk factors associated with necrotising enterocolitis in very low birth weight infants in Malaysian neonatal intensive care units // Singapore Medical Journal. 2012 December; 53(12):826-31

47.Bruinsma N, Stobberingh EE, Herpers MJ, Vies JS, Weber BJ, Gavilanes DA. Subcutaneous ventricular catheter reservoir and ventriculoperitoneal drain-related infections in preterm infants and young children // Clinical Microbiology and Infection. 2000 April; 6(4):202- 6

48.Burnie JR, Naderi-Nasab M. Loudon KW, Matthews RC. An epidemiological study of blood culture isolates of coagulase-negative staphylococci demonstrating hospital-acquired infection // Journal of Clinical Microbiology. 1997 July; 35(7): 1746-50

49.Caiazza NC, O'Toole GA. Alpha-toxin is required for biofilm formation by Staphylococcus aureus //Journal of Bacteriology. 2003; 185(10): 3214-7

50.Cekmez F, Tayman C, Saglam C, Cetinkaya M, Bedir O, Gnal A, Tun T, Sarici SU. Well-known butfor rare pathogen in neonates: Listeria monocytogenes. // European Revew for Medical Pharmacological Sciences. 2012 October; 16 Suppl 4:58-61

51.Cerca N, Martins S, Cerca F, Jefferson KK, Pier GB, Oliveira R, Azeredo J. Comparative assessment of antibiotic susceptibility of coagulasenegative staphylococci in biofilm versus planktonic culture as assessed by bacterial enumeration or rapid XTT colorimetry. // Journal Antimicrobial Chemotherapy. 2005 August; 56(2):331-6

52.Ceri H, Olson ME, Stremick C, Read RR, Morck D, Buret A. The Calgary Biofilm Device: new technology for rapid determination of antibiotic susceptibilities of bacterial biofilms // Journal of Clinical Microbiology. 1999 June; 37(6): 1771-6

53.Cheung GY, Otto M. Understanding the significance of Staphylococcus epidermidis bacteremia in babies and children // Current Opinion in Infectious

Disease. 2010 June; 23(3):208-16

54. Clark R, Powers R, While R, Bloom B, Sanchez P, Benjamin DK Jr. Nosocomial Infection in the NICU: A Medical Complication or Unavoidable Problem // Journal of Perinatology. 2004 June; 24(6): 382 -8

55.Clark TA, Slavinski SA, Morgan J, Lott T, Arthington-Skaggs BA, Brandt ME, Webb RM,. Currier M, Flowers RH, Fridkin SK, Hajjeh RA. Epidemiologic and molecular characterization of an outbreak of Candida parapsilosis bloodstream infections in a community hospital // Journal of Clinical

-Microbiology. 2004 October; 42(10):4468-72

56. Craft A., Finer N. Nosocomial coagulase negative staphylococcal (CoNS) catheter-related sepsis in preterm infants: definition, diagnosis, prophylaxis, and prevention. // Journal. Perinatology. 2001 Aprril-May, 26(3): 186-92

57.Craft AP, Finer NN., Barrington KJ. Vancomicin for prophylaxis against psepsis in preterm neonatates(CochraneReview)//Cochrane Database Syst Rev. 2000;(2):CD001971.

58. Da Silva Ruiz L, Montelli AC, Sugizaki MD, Gon^alves Da Silva E, Matuura De Batista GC, Moreira D, Rodrigues Paula C. Outbreak of iimgemia caused by Candida parapsilosis in a neonatal intensive care unit: Molecular investigation through microsatellite analysis // Rev Iberoam Micol. 2013 April-June; 30(2):112-5

59.Dario Garcia de Viedma, Pablo Martin Rabadan, Marisol Diaz, Emilia Cercenado, Emilio Bouza. Heterogeneous Antimicrobal Resistance Patterns in Polyclonal Populations of Coagulase-Negative Staphylococci Isolated from Catheters // Journal of Clinical microbiology. 2000 April; 38(4):1359-63

60.David W. Scheifele, Gordean L. Bjornson. Delta-like toxin produced by CoNS is associated with neonatal necrotizing enterocolitis // Infection and immunity. 1987 September; 55(9):2268-73

61.Deville JG, Adler S, Azimi PH, Jantausch BA, Morfin MR, Beltran S, Edge-Padbury B, Naberhuis-Stehouwer S, Bruss JB. Linezolid versus vancomycin in the treatment of known or suspected resistant gram-positive infections in

neonates // Pediatric Infectious Disease Journal. 2003 September. 22(9 suppl):Sl 58-63

62.Dinges M, Orwin P. Schlievert PM. Exotoxins of Staphylococcus aureus // Clinical Microbiology Reviews. 2000 January; 13(1): 16-34

63.Donowitz LG, Haley CE, Gregory WW, Wenzel RP Neonatal intensive care unit bacteremia: emergence of gram-positive bacteria as major pathogens.// American Journal of Infectio Control. 1987 August; 15(4): 141-7

64.Eggink BH, Rowen JL. Primary osteomyelitis and suppurative arthritis caused by coagulase-negative staphylococci in a preterm neonate // Pediatric Infectious Disease Journal. 2003 June; 22(6):572-3

65.Emma Gabriel, Brigit Lucey, Aidan Coffey, Jim M.CTMahony Characterization of coagulase negative Staphylococcus clinical isolates a hospital in southern Ireland // Special Issue: Abstracts of the 22 European Congress of Clinical Microbiology and Infectious Diseases, London, 31 March-3April 2012.-P.1548

66.Emmi Sarvikivi, Outi Lyytikainen, David R. Soli, Claude Pujol, Michael A. Pfaller, Malcolm Richardson, Pirkko Koukila-Kahkola, Paivi Luukkainen, and Harri Saxen. Emergence of Fluconazole Resistance in a Candida parapsilosis Strain That Caused Infections in a Neonatal Intensive Care Unit // Journal of Clinical Microbiology. 2005 June; 43(6): 2729-35

67.Ferraris L, Butel MJ, Campeotto F, Vodovar M, Roze JC, Aires J. Clostridia in premature neonates' gut: incidence, antibiotic susceptibility, and perinatal determinants influencing colonization // Public Library of Science One. 2012;7(l):e30594.

68.Fleer A, Hemels MA, Paauw A, Krediet TG. Reduced expression of PBP-2Aby neonatal mecA-positive coagulase-negative staphylococci blood isolates: (3-lactams are useful first-line agents for the treatment of neonatal CoNS sepsis, restricting the use of vancomycin // Journal of Antimicrobial Chemotherapy.

2012 July;67(7): 1616-8.

69.Fleer A, Sanders RC, Visser MR. Bijlmer RP, Gerards LJ, Kraaijeveld CA, Verhoef J. Septicemia due to coagulase negative stphylococci in a neonatal intensive care unit:clinical and bacteriologic features and contaminated parenteral fluids are a source of sepsis // Pediatric Infectious Disease. 1983 November-December; 2(6): 426-31

70.Freeman J, Goldmann DA, Smith NE, Sidebottom DG, Epstein MF, Platt R. Association of intravenous lipid emulsion and coagulase-negative staphylococcal bacteremia in neonatal intensive care units // New Englend Journal of Medicine. 1990 August 2; 323(5):301-8

71.G. D. I. de Silva, M. Kantzanou, A. Justice, R. C. Massey, A. R. Wilkinson, N. P. J. Day, and S. J. Peacock. The ica Operon and Biofilm Production in Coagulase-Negative Staphylococci Associated with Carriage and Disease in a Neonatal Intensive Care Unit // Journal of Clinical Microbiology. 2002 February; 40(2): 382-8

72.Gerke C, Kraft A, Sussmuth R, Schweitzer O, Götz F. Characterization of the N-acetylglucosaminyltransferase activity involved in the biosynthesis of the Staphylococcus epidermidis polysaccharide intercellular adhesin // Journal of Biologycal Chemistry. 1998 July; 17; 273(29): 18586-93

73.Goldmann D.A., Durbin W.A., Freeman J. Nosocomial infections in a neonatal intensive care unit // Journal of Infectious Diseases. 1981; 144, 449-59

74.Gruskay J, Harris MC, Costarino AT, Polin RA, Baumgart S. Neonatal Staphylococcus epidermidis meningitis with unremarkable CSF examination results //American Journal of Diseases Children. 1989 May; 143(5):580-2

75.Guilbert J, Meau-Petit V, de Labriolle-Vaylet C, Vu-Thien H, Renolleau S. Coagulase-negative staphylococcal osteomyelitis in preterm infants: a proposal for a diagnostic procedure // Archives of Pediatrics. 2010 October; 17(10): 1473-6

76.Hadji-Petrusheva Meloska I, Curcic Trajkovska B, Jaglikovski B, Hadji-Petrusheva Jankijevikj A. Susceptibility of vaginal group B Streptococcus isolates to penicillin and erythromycin // Special Issue: Abstracts of the 22 European Congress of Clinical Microbiology and Infectious Diseases, London, 31 March-3April 2012.-P.1004

77.Hall AD, Vidaillac C, Rose WE, Rybak MJ. High-dose daptomycin vs vancomycin, alone or combined with clarithromycin or rifampin against methicillin-resistant St.epidermidis in an in vitro pharmacokinetic/pharmacodynamic model of bacterial biofilm // Special Issue: Abstracts of the 22nd European Congress of Clinical Microbiology and Infectious Diseases, London, 31 March-3 April 2012, P. 1603

78.Haque NZ, Zuniga LC, Peyrani P, Reyes K, Lamerato L, Moore CL, Patel S, Allen M, Peterson E, Wiemken T, Cano E, Mangino JE, Kett DH, Ramirez JA, Zervos MJ. Relationship of vancomycin minimum inhibitory concentration to mortality in patients with methicillin-resistant Staphylococcus aureus hospital-acquired, ventilator-associated, or health-care-associated pneumonia // Chest. 2010 December; 138(6):1356-62

79.Heilmann C, Schweitzer O, Gerke C, Vanittanakom N, Mack D. Molecular basis of intercellular adhesion in the biofilm-forming Staphylococcus epidermidis // Molecular Microbiology. 1996 June;20(5): 1083-91

80.Hemels MA, van den Hoogen A, Verboon-Maciolek MA, Fleer A, Krediet TG. A Seven-Year Survey of Management of Coagulase-Negative Staphylococcal Sepsis in the Neonatal Intensive Care Unit: Vancomycin May Not Be Necessary as Empiric Therapy //Neonatology. 2011;100: (2):180-5

81. Hemming VQ, Overall JC, Britt MR. Nosocomial infections in a newborn intensive care unit: resalts of forty-one months of surveillance // New Englland Journal Medicine 1976 June 10; 294 (24): 1310-6

82.Hernandez L, Diaz de Tuestra J, Sanchez J, Cisterna R. Prevence of urinary

tract infections in neonatates // Special Issue: Abstracts of the 20 European Congress of Clinical Microbiology and Infectious Diseases, Vienna, 10-13 April 2010, R.2381

83.Hornik CP, Fort P, Clark RH, Watt K, Benjamin DK Jr, Smith PB, Manzoni P, Jacqz-Aigrain E, Kaguelidou F, Cohen-Wolkowiez M. Early and late onset sepsis in very-low-birth-weight infants from a large group of neonatal intensive care units. // Early Human Development. 2012 May; 88 Suppl 2:S69-74

84.Huang, YC, Lin TY,Leu HS, Peng HL, Wu JH, Chang HY. Outbreak of Candida parapsilosis fungemia in neonatal intensive care units: clinical implications and genotyping analysis // Infection. 1999 March-April; 27(2):97-102

85.Isaacs D. A ten year multicentre study of coagulase negative staphylococcal infections in Australasian neonatal units // Archives of Disease in Childhood. 2003 March; 88(2):F89-93

86. Jacqz-Aigrain E, Zhao W, Sharland M, van den Anker JN. Use of antibacterial agents in the neonate: 50 years of experience with vancomycin administration // Seminars in Fetal Neonatal Medicine. 2013 February; 18(1 ):28-34

87.John L. Pace. Biofilms, infection, and antimicrobial therapy. / Edited by John L. Pace, Mark Rupp, Roger GFinch. USA: Published by CRC Press Taylor & Francis Group,2006; 520p.

88.Johnson-Robbins LA, el-Mohandes AE, Simmens SJ, Keiser JF. Staphylococcus epidermidis sepsis in the intensive care nursery: a characterization of risk associations in infants < 1,000 g // Biology of the Neonate. 1996; 69:249-56

89.Kaplan SL, Deville JG, Yogev R, Morfin MR, Wu E, Adler S, Edge-Padbury B, Naberhuis-Stehouwer S, Bruss JB. Linezolid versus vancomycin for treatment of resistant Gram-positive infections in children // Pediatric Infectious Diseases Journal. 2003 August; 22(8):677-86

90.Karlowicz MG, Furigay PJ, Croitoru DP, Buescher ES. Central venous catheter removal versus in situ treatment in neonates with coagulase-negative staphylococcal bacteremia // Pediatric Infectious Diseases Journal. 2002 January; 21(l):22-7

91.Karlowicz MG. Candidal renal and urinary tract infection in neonates. Seminars Perinatol. 2003; 27 (5), p. 393-400.

92.Kaufman D, Boyle R, Hazen KC, Patrie JT, Robinson M,. Donowitz LG. Fluconazole prophylaxis against fungal colonization and infection in preterm infants // New Englland Journal Medicine. 2001 December; 345(23): 1660-6

93.Kimberly J. Center, Annette C. Reboli, Robin Hubler, Gail L. Rodgers, Sarah S. Long. Decreased Vancomycin Susceptibility of Coagulase-Negative Staphylococci in a Neonatal Intensive Care Unit: Evidence of Spread of Staphylococcus warneri //Journal of Clinical Microbiology. 2003 October; 41:10 4660-5

94.Lepainteur M, Decousser JW, Royer G, Romaim O. Phenotypic and genotypic characterization of coagulase negative Staphylococcus bacteremic isolates from infected very low birht neonatates: antibiotic and antiseptic subseptibility, biofilm prodaction and clonalityposter // Special Issue: Abstracts of the 22nd European Congress of Clinical Microbiology and Infectious Diseases, London, 31 March-3 April 2012, P. 1153

95. Levy S. B., Marshal B. Antibacterial resistance world-wide: causes, challenges and responses //Nature Medical. 2004 December, 10 (12 Suppl): S122-9

96.Li M, Wang X, Gao Q, Lu Y. Molecular characterization of Staphylococcus epidermidis strains isolated from a teaching hospital in Shanghai // China Journal of Medical Microbiology. 2009 April; 58 (Pt 4):456-61

97.Lupetti A, Tavanti A,Davini P, Ghelardi E, Corsini V, Merusi I, Boldrini A, Campa M, Senesi S. Horizontal transmission of Candida parapsilosis

candidemia in a neonatal intensive care unit // Journal of Clinical Microbiology. 2002 July; (7) 40:2363-9

98.Madhusoodanan J, Seo KS, Remortel B, Park JY, Hwang SY, Fox LK,Park YH, Deobald CF, Wang D, Liu S, Daugherty SC, Gill AL, Bohach GA, Gill SR. An Enterotoxin -Bearing Pathogenicity Island in Staphylococcus epidermidis // Journal of Bacteriology. 2011 April; 193(8): 1854-62

99.Makhoul I.R., Sujov P., Smolkin T., Lusky A., Reichman B. Epidemiological, clinical, and microbiological characteristics of late-onset sepsis among very low birth weight infants in Israel: a national survey // Pediatrics. 2002 January; 109(1): 34-9

100. Malachowa N, DeLeo FR. Mobile genetic elements of Staphylococcus aureus // Cellular and Molecular Life Sciences,. 2010 September; 67(18):3057-71

101. Manzoni P, Arisio R, Mostert M, Leonessa M, Farina D, Latino MA, Gomirato G. Prophylactic fluconazole is effective in preventing fungal colonization and fungal systemic infections in preterm neonates: a singlecenter, 6-year, retrospective cohort study // Pediatrics. 2006 January; 117(1 ):e22-32.

102. Marin M, de la Rose M, Cornejo I. Enterotoxigenicity of Staphylococcus strains isolated from Spanish dry-cured hams // Applied and Environmental Microbiology. 1992 March; 58(3): 1067-9

103. McDevitt D, Nanavaty T, House-Pompeo K, Bell E, Turner N, Mclntire L, Foster T, Hook M. Characterization of the interaction between the Staphylococcus aureus clumping factor (ClfA) and fibrinogen // European Journal of Biochemistry. 1997 July; 247(l):416-24

104. Mendes R.E, Deshpande L.M, Costello A.J, Farrell D.J. Molecular epidemiology of Staphylococcus epidermidis clinical isolates from U.S. Hospitals // Antimicrobial Agents and Chemotherapy. 2012 September;56

(9):4656-61

105. Menzies BE. The role of fibroneetin binding proteins in the pathogenesis of Staphylococcus aureus infections // Current Opinion in Infectious Diseases. 2003 June.l6(3):225-9

106. Miragaia M, Thomas JC, Couto I, Enright MC, de Lencastre H. Inferring a Population Structure for Staphylococcus epidermidis from Multilocus Sequence Typing Data // Journal of bacteriology. 2007 March; 189(6):2540-52

107. Mohan P. Venkatesh, Placencia Frank, Leonard E. Weisman. Coagulase-Negative Staphylococcal Infections in the Neonate and Child: An Update // Seminars of Pediatrics Infectious Diseases. 2006 July; 17(3): 120-7

108. Munson DP, Thompson TR, Johnson DE.Rhame FS, VanDrunen N, Ferrieri P. Coagulase-negative stphylococci septicemia: experence in a newborn intensive care unit // Journal Pediatrics. 1982 October; 101 (4): 602-5

109. Nahed A1 Laham, Holger Rohde, Gunnar Sander, Andreas Fischer, Muzaffar Hussain, Christine Heilmann, Dietrich Mack, Richard Proctor, Georg Peters, Karsten Becker and Christof von Eiff. Augmented Expression of Polysaccharide Intercellular Adhesin in a Defined Staphylococcus epidermidis Mutant with the Small-Colony-Variant Phenotype // Journal of Bacteriology. 2007 June; 189(2):4494-501

110. National Nosocomial Infections Surveillance (NNIS) System Report, Data Summary from January 1992-June 2001 // American Journal of Infection Control. 2001;29:404-21

111. Ni Eidhin D, Perkins S, Francois P, Vaudaux P, Hook M, Foster TJ. Clumping factor B (ClfB), a new surface-located fibrinogen-binding adhesin of Staphylococcus aureus // Molecular Microbiology. 1998 October; 30(2):245-57

112. Otto M. Molecular basis of Staphylococcus epidermidis infections // Seminars Immunopathology. 2012 March; 34(2): 201-14

113. Otto M. Staphylococcal biofilms // Curr Top Microbiol Immunol. 2008;

322:207-28.

114. Ozkan H, Pasaoglu G, Olgac N, Yuce A, Gulay Z. Stenotrophomonas maltophilia pneumonia in a premature infant // Turkish Journal of Pediatrics 1999 April-June; 41(2): 283-6

115. Pagano PJ, Buchanan LV, Dailey CF, Haas JV, Van Enk RA, Gibson JK: Effects of linezolid on staphylococcal adherence versus time of treatment // International Journal of Antimicrobial Agents. 2004 March; 23(3):226-34

116. Pammi M, Holland L, Butler G, Gacser A, Bliss JM. Candida parapsilosis is a Significant Neonatal Pathogen: A Systematic Review and Meta-Analysis // Pediatrics Infections Diseases Journal. 2013 January; 32(5):206-16

117. Patti JM, Jonsson H, Guss B, Switalski LM, Wiberg K, Lindberg M, Hook M. Molecular characterization and expression of a gene encoding a Staphylococcus aureus collagen adhesin // Journal of Biological Chemistry. 1992 March; 267(7):4766-72

118. Performance Standards for Antimicrobial Susceptibility Testing; Eighteenth Informational Supplement // CLSI Document M100-S18. - 2008.

119. Piette A, Verschraegen G., Role of coagulase-negative staphylococci in human disease // Veterinary Microbiology. 2009 February; 134 (1-2): 45-54

120. Plata K, Rosato A, Wegrzyn G. Staphylococcus aureus as an infectious agent: overview of biochemistry and molecular genetics of its pathogenicity // ActaBiochim. Pol., 2009; 56(4), 594-612

121. Polin RA. Management of neonates with suspected or proven early-onset bacterial sepsis // Pediatrics. 2012 May;129(5):1006-15

122. Pollock I, Mulhall A, de Louvois J. Ceftazidime in the treatment of neonatal infection // Journal of Hospital Infection. 1985 June;6(2): 158-65

123. Qu Y, Daley AJ, Istivan TS, Garland SM, Deighton MA. Antibiotic susceptibility of coagulase-negative staphylococci isolated from very low birth

weight babies: comprehensive comparisons of bacteria at different stages of biofilm formation //Annals of Clinical Microbiology and Antimicrobials. 2010 May 27; 9:16

124. Save the children. State of the World's Newborn. Save the Children, Washington DC; 200 1h

125. Savey A, Fleurette J, Salle BL. An analysis of the microbial flora of premature neonates // Journal of Hospital Infection. 1992 August; 21(4):275-89

126. Saxen H,Virtanen M, Carlson P, Hoppu K, Pohjavuori M, Vaara M, Vuopio-Varkila J, Peltola H. Neonatal Candida parapsilosis outbreak with a high case fatality rate // Pediatrics Infection Diseases Journal. 1995 September; 14(9):776-81

127. SE Reef, Lasker BA, Butcher DS,McNeil MM, Pruitt R, Keyserling H, Jarvis WR. Nonperinatal nosocomial transmission of Candida albicans in a neonatal intensive care unit: prospective study // Journal of Clinical Microbiology 1998 May; 36(5);1255-9

128. Shama A, Patole SK, Whitehall JS. Intravenous rifampicin in neonates with persistent staphylococcal bacteraemia // Acta Paediatrica. 2002; 91(6):670-3

129. Shane AL, Stoll BJ. Recent Developments and Current Issues in the Epidemiology, Diagnosis, and Management of Bacterial and Fungal Neonatal Sepsis //American Journal of Perinatology. 2013 February; 30(2); 131-41.

130. Sherertz RJ, Gledhill KS, Hampton KD, Pfaller MA, Givner LB, Abramson JS, Dillard RG. Outbreak of Candida bloodstream infections associated with retrograde medication administration in a neonatal intensive care unit // Journal Pediatrics. 1992 March;120(3):455-61

131. Sidebottom D G, Freeman J, Piatt R, Epstein MF, Goldmann DA. Fifteen-year experience with bloodstream isolates of coagulase-negative staphylococci in neonatal intensive care // Journal of Clinical Microbiology. 1988

April;26(4):713-8

132. Sohn AH, Garrett DO, Sinkowitz-Cochran RL, Grohskopf LA, Levine GL, Stover BH, Siegel JD, Jarvis WR. Prevalence of nosocomial infections in neonatal intensive care unit patients: results from the first national point-prevalence survey // Journal Pediatrics. 2001 December; 139(6):821-7

133. Stoll BJ, Hansen N. Infections in VLBW infants: studies from the NICHD Neonatal Research Network. // Seminars in Perinatology. 2003 August; 27(4):293-301

134. Stoll BJ., Hansen N, Fanaroff AA, Wright LL, Carlo WA, Ehrenkranz RA, Lemons JA, Donovan EF, Stark AR, Tyson JE, Oh W, Bauer CR, Korones SB, Shankaran S, Laptook AR, Stevenson DK, Papile LA, Poole WK.. Late-onset sepsis in very low birth weight neonates: the experience of the NICHD Neonatal Research Network // Pediatrics. 2002August; 110(2Pt 1): 285-91

135. Tan TQ, Mason EO Jr, Ou CN, Kaplan SL. Use of intravenous rifampin in neonates with persistent staphylococcal bacteremia // Antimicrobial Agents Chemotherapy. 1993 November; 37(11):2401-6

136. Tannette G Krediet, Ellen M. Mascini, Ellen van Rooij et all. Molecular Epidemiology of Coagulase-Negative Staphylococci Causing Sepsis in a Neonatal Intensive Care Unit over an 11-Year Period//Journal ofClinical Microbiology. 2004 March; 42(3): 992-5

137. Thomas DF, Fernie DS, Bayston R, Spitz L.Clostridial toxins in neonatal necrotising enterocolitis // Archives of Disease in Childhood. 1984 March; 59(3):270-2

138. Tresoldi AT, Padoveze MC, Trabasso P, Veiga JF, Marba ST, von Nowakonski A, Branchini ML. Enterobacter cloacae sepsis outbreak in a newborn unit caused by contaminated total parenteral nutrition solution // American Journalal of Infection Control. 2000 Jun; 28 (3): 258-61

139. van den Hoogen A, Gerards LJ, Verboon-Maciolek MA, Fleer A, Krediet TG. Long-term trends in the epidemiology of neonatal sepsis and antibiotic susceptibility of causative agents // Neonatology. 2010; 97(l):22-8

140. van der Lugt NM, Steggerda SJ, Walther FJ. Use of rifampin in persistent coagulase negative staphylococcal bacteremia in neonates // BMC Pediatrics. 2010 November; 19;10:84.

141. Vazquez JA, Boikov D, Boikov SG, Dajani AS. Use of electrophoretic karyotyping in the evaluation of Candida infections in a neonatal intensive-care unit // Infection Control and Hospital Epidemiology. 1997 January; 18(l):32-7

142. Vermont CL,. Hartwig NG, Fleer A, P de Man, Verbrugh H, J. van den Anker, R. de Groot, A. van Belkum. Persistence of clones of coagulase-negative staphylococci among premature neonates in neonatal intensive care units: two-center study of bacterial genotyping and patient risk factors // Journal of Clinical Microbiology. 1998 September; 36(9):2485-90

143. Vishal Hira, Marcel Sluijter, Goessens WH, Ott A, de Groot R, Hermans PW, Komelisse RE. Coagulase-Negative Staphylococcal Skin Carriage among Neonatal Intensive Care Unit Personnel: from Population to Infection. // Journal of Clinical Microbiology. 2010 November, 48(11)3876-81

144. Vuong C, Kocianova S, Voyich J, Yao Y, Fischer E, DeLeo F, Otto M. A crucial role for exopolysaccharide modification in bacterial biofilm formation, immune evasion, and virulence // Journal Biological Chemistry. 2004 March; 279(52): 54881-6

145. Waggoner-Fountain, LA, Walker MW, Hollis RJ, Pfaller MA, Ferguson II JE, Wenzel RP, Donowitz LG. Vertical and horizontal transmission of unique Candida species to premature newborns // Clinical Infectious Diseases. 1996 May; 22(5):803-8

146. Wil C. Van Der Zwet, Yvette J. Debets-Ossenkopp, Erik Reinders, Maria Kapi, Paul H. M. Savelkoul, Ruurd M. Van Elburg, Keiichi Hiramatsu, Vandenbroucke-Grauls CM. Nosocomial Spread of a Staphylococcus capitis Strain with Heteroresistance to Vancomycin in a Neonatal Intensive Care Unit // Journal of Clinical Microbiology. 2002 July; 40(7): 2520-5

147. Wojkowska-Mach J, Chmielarczyk A, Borszewska-Kornacka M, Domanska J, Gadzinowski J, Gulczynska E, Nowiczewski M, Helwich E, Kordek A, Pawlik D, Jursa-Kulesza J, Giedrys-Kalemba S, Szczapa J, Heczko PB. Enterobacteriaceae Infections of Very Low Birth Weight Infants in Polish Neonatal Intensive Care Units: Resistance and Cross-transmission // Pediatric Infectious Disease Journal. June 2013; 32(6):594-8

148. Wu JH, Chen CY, Tsao PN, Hsieh WS, Chou HC. Neonatal sepsis: a 6-year analysis in a neonatal care unit in Taiwan // Pediatrics and Neonatology. 2009 June; 50(3):88-95