Топография и функция остатков цистеина в ДНК-зависимой РНК-полимеразе Е.coli тема диссертации и автореферата по ВАК РФ 02.00.10, кандидат химических наук Селюченко, Ольга Александровна

• Селюченко, Ольга Александровна
• кандидат химических наук
• 1985

Оглавление диссертации кандидат химических наук Селюченко, Ольга Александровна

ВВЕДЕНИЕ.

I. ЖШЕСКМ МОДИФИКАЦИЯ РШ{-П0Ш«РАЗЫ е. coli И ЕЕ

ИСПОЛЬЗОВАНИЕ В ИЗУЧЕНИИ ПРОЦЕССА ТРАНСКРИПЦИИ.

1.1. РНК-полимера,за, - ключевой фермент процесса транскрипции

1.1.1. Связывалие с матрицей

1.1.2. Инициация синтеза РНК .II

1.1.3. Элонгация цепи РНК.

1.1.4. Терминация транскрипции.

1.2. Роль sh -групп РНК-полимеразы в процессе транскрипции

1.3. Химическая модификация ряда функционально важных аминокислотных остатков РНК-полимеразы

1.3.1. Модификация остатков лизина, как подход к изучению каталитического центра фермента

1.3.2. Роль остатков аргинина и гистидина. в

РНК-полимеразе.

2. РЕЗУЛЬТАТЫ И ИХ ОБСУЖДЕНИЕ.

3. ЭКСПЕРИШТШЫ1АЯ ЧАСТЬ.

3.1 Материалы.

3.2 Выделение и характеристика субъединиц РНК-полимеразы

3.3. Определение аминокислотной последовательности пептидов.

3.4. Химическая модификация РНК-полимеразы.

4. ВЫВОДЫ.

Введение диссертации (часть автореферата) на тему «Топография и функция остатков цистеина в ДНК-зависимой РНК-полимеразе Е.coli»

Одним из основных процессов переда,чи генетической информа,ции является процесс транскрипции, глубокое изучеш^е которого позволяет решить многие ваяшейшие проблемы биологии, например, такие, как индивидуальное развитие, клеточная дифференцировка,, взаимоотношение с внешней средой, а так}ке откроет широкие перспективы в борьбе со многшли инфекционными и наследственными за,болевания1да.Во многих ла.бораториях в нашей стране и за, рубелюм проводятся исследования ДЕ-Ж-зависимой РШ(-полимеразы и процесса транскрипции в целом. В настоящее врекш охарактеризована каждая стадия транскрипции, выяснена структура сигнальных з^астков нушгеиновых кислот, используемых ,для регуляции транскрипции, получена обширная информация о свойствах фермента,, а, таш^е определена, первичная струЕ т^ура всех субъединиц РБК-полимеразы Е . coli . О.днако, сам механизм синтеза РНК остается невыясненным. В частности, практически ничего не известно о том, какие аминокислотные остатки РНКполимеразы участвуют в каталитическом процессе, какие - взанмо-, действуют с субстратам'!, матрицей и Р1Ж-продуктом, т.е. какова, структура, активных центров фермента. Знание первичной структуры фермента открывает широкие перспективы ,дяя более детального изучения механизма функционироБа,ния ДШ{-за.висимой РНК-полимеразы Escherichia coli . _ 4 На,стоящая работа является частью структурно-функциональных исследований ДНК-зависимой РНК-полимеразы Е , coli.В задачу работы входило изучение роли остатков цистеина РНК-полимера,зы Б , coli на разлхтаных этапах процесса •транскрипции, локализация функционально важных остатков цистеина, цринима]ющих участие в образовании активных центров фермента, а также выяснение пространственной топографии остатков цистеина РНК-полимеразы Е. coli, Автор выража,ет благодарность акад. Ю.А. Овчинникову,д.х.н.В.М. Липкину и к.х.н. О.Ю. Чертову за постоянный интерес к этой ра.боте и помощь при ее выполнении. - 5

Заключение диссертации по теме «Биоорганическая химия», Селюченко, Ольга Александровна

1. Изучена, химическая модифшшция SH -групп Д[Ж-зависимой РШ^-полтлеразы алкилирующими и ртутьсодер}кащ1Ши соединениями.Показано, что иодуксусная кислота и иодадетамид не влияют на.активность фермента, а Ы-этилмалеимид и ртутьсодержащие соеди нения ингибируют синтез РШ{.2. Установлено, что остаиш цистеина РНК-полимеразы играют ваш1ую роль в процессе взаитлодействия фермента с промоторсодер жащими участками на, ДНК-матрице, а таклсе на ста,дии элонгации.Ползгчены да.нные, свидетельствующие об участии SH-групп фермен та в процессе расплетания двухцепочечной ДШ{.3. Показало, что функционально вашшми остатками цистеина в РНК-полимеразе являются остаток 764 В-субъединицы, а таюке остатки 70 и ( или ) 72 &'-субъе,диницы.4. Выяснена топография остатков цистеина в РНК-полимеразе.На поверхности молекулы фермента располагается 8 остатков цис теина: в <>1-субъединице остаток 269, в ^ -субъединице - 559 и 636, в /'-субъединице - 88, 517 и 888 и в С-субъединице - оста.-

ток 291. Остатки цистеина 269 в обеих Я--субъединицах а та1ше оста.Т1Ш 269 и 176 внутри каждой «с-субъединицы простра.нственно сближены.

Список литературы диссертационного исследования кандидат химических наук Селюченко, Ольга Александровна, 1985 год

1. Ovchinnikov Yu.A., Lipkin V.M,, Modjanov N.N^, Chertov 0,Yu.,Srairnov Yu.V. Primary structure of <^ -subunit of DNA-dependent RHA polymerase from Escherichia coli.- FEBS Letters, 1977, V. 76, и 1, p. 108-111,

2. Travers A«A., Burgess R.R. Cyclic re-use of the RNA polymerase Sigma factor,- Hature, 1969i v. 222, p. 537-540. 3. Ghamberlin M,J, Interection of R17A polymerase with the DHAtemplate, - In: RNA polymerase ( Losick R,, Ghamberlin M, eds ) Gold Spring Harbor, Шг Gold Spring Harbor Lab., 1976, p. 159-191.

4. Ghamberlin M.J. RITA polymerase - an overview, - In: RHA polymerase ( Losick R,, Ghamberlin M, eds ) Gold Spring Harbor, ЮГ: Gold Spring Harbor Lab,, 1976, p. 17-67.

5. Gilbert W. Starting and stopping for the RETA polymerase.In: RITA polymerase ( Losick R,, Ghamberlin Ш, eds ), Gold Spring Harbor Lab,, 1976, p, 193-205.

6. Rosenberg M,, Court D. Regulatory sequences involving in thepromotion and termination of Шк transcription. - Ann, Rev, Genet,, 1979, v. 13, p. 319-353.

7. Ghamberlin M,J. The selectivity of transcription, - Ann, Rev.Biochem., 1974, v, 43, p. 721-775.

8. Mangel W,P,, Ghamberlin ",J. Studies of ribonucleic acid chaininitiation by Escherichia coli RHA polymerase boimd to T7 deoxyribonucleic acid chain initiation. - J. Biol. Chem,, 1974, V. 249, N 10, p. 2995-3001,

9. Kosaganov Yu.N», Zarudnaja M.J., Lasurkin Yu.S., Franc-Kamenetski M.D., Beabelashvilly R.S., Savochina L.P. - Local unwinding of ША during RNA synthesis in vitro.- Nature New Biol., 1971, V. 231, IT 16, p. 212-214.

10. Sausiera J.-M., Wang J.С Angular alteration of the DITA byE. coli RHA polymerase. - Uature New Biol., 1972, v. 239, H 93, p. 167-170. - 92 -•

11. Siebejilist W,, Simpson R.B,, Gilbert W. E. coli RITA polymepase interacts homologously with, the different promoters. Cell, 1980, V. 20, N 2, p. 269-281.

12. Hsleh. T.S., Wang J.O. Phyaicochemical studies on interactionsbetween DUA and Ш1А polymerase. Ultraviolet absorption measurements. - Nucl. Acid. Res., 1978, v. 5, N 9, p. 3337-3345,

13. Reisbig R.R., Woody A.-U.M., Woody R.V/. Spectroscopic analysisof the interection of E. coli DlTA-dependent RNA polymerase with Ш7 ША and synthetic polynucleotides.- J. Biol. Cham., 1979, V. 254, П 22, p. 11208-11217.

14. Hawley D.K., McClure W.R. In vitro comparison of initiationproperties of bacteriophage Л, wild type Pj^ and X3 mutant promoters. - Proc. Uatl. Acad. Sci. USA, 1980, v. 77, IT 11, p. 6381-6385.

15. Stender W. Conformational changes of Escherichia coli RITApolymerase on binding of templates.- №BS Letters, 1979, v. 103, IT 1, p. 57-60.

16. Scherer G.E.F,, Walkinshaw M.D., Arnott S. A computer aidedoligonucleotide analises provides a model sequence for RITApolymerase-promoter recognition in E, coli. - Nucl. Acid Res., 1978, V. 5, H 10, p. 3759-3773.

17. Хесин P. Б., Аста,5фОва О.Б., Шемякин М.Ф., Камзолова, Г., Шняков В.Ф. Изменение свойств РНК-полимеразы при соединении с ДШС и налале синтеза РШ{.- Молек. биология, 1967, т. I, М , с. 736-753.

18. Hincle В,0», CJhamberlin M.J., Studies of the binding of Escherichia coli МГА polymerase to DM. II Kinetics of the binding reaction. - J. Molec. Biol., 1972, v. 70, Я 2, p. 187-195.

19. Uierman W.C., Ghamberlin M.J. Studies of RITA chain initiation by Eschericha coli RHA polymerase bound to T7 ША. Direct analysis of the kinetics and extent of RNA chain initiation at T7 promoter A^. - J. Biol. Chera., 1979, v. 254, К 16, p. 7921-7926.

20. Hincle D., Mangel W., Ghamberlin M. Studies of the bindingof Escherichia coli RUA polymerase to DKA. IV The effect of rifampicin oh binding and on RNA chain initiation. - J. Mol, Biol., 1972, V. 70, N 2, p. 209-222.

21. Никифоров Б.Г., Зоргаф Ю.Н. Регуляция активности генов у бактерий.- 06: Итоги науки и техники, Молек. биология, 1977, т. 13, ВИНИТИ.

22. Stender W. Sequence - specific interaction of tf-subunit ofE, coli RUA polymerase with DHA. - Nucl. Acid. Res., 1980, V. 8, и 15, p. 3459-3466.

23. Kudo T., Doi R.H, Free 6' factor of Escherichia coli RITA polymerase can bind to DM. - J. Biol. Ghem., 1981, v. 256, H 19, P. 9778-9781.

24. Chenchick A., Beabelashvilli R., Mirsa-'bekov A. Topographyof interaction of Escherichia coli R M polymerase subunits - 94 v/ith lac UV5 promoter, - PEB3 Letters, 1981, v, 128, U 1, p. 46-50.

25. Simpson R,B. The molecular topography of RHA polymerase promoter interaction. - Cell, 1979, v. 18, N 2, p. 277-285.

26. Hillel Z., Wu C.-W, Photochemical cross-linking studies onthe interaction of Escherichia coli RITA polymerase with 17 DNA. - Biochemistry, 1978, v.17, N 15, p. 2954-2961.

27. Park G.S., Hillel Z., Wu O.-W. DHA strand specifity in promoter recognition by RITA polymerase. - Nucl. Acid Res., 1980, V. 8, H 23, p. 5895-5912.

28. Maitra U., Hurwitz J, The role of RNA synthesis. IX Nucleoside triphosphate termini in RNA polymerase products. - Proc. Nat. Acad. Sci. USA, 1965, v. 54, N 3, p. 815-824.

29. Goldthwait D.A., Anthony D.D., Wu C.-W. Studies with RNA polymerase.- In: RNA polymerase and transcription ( Silvestry 1. eds ), Narth-Holland P.O., Amsterdam-London, 1969, p.1027.

30. Krakow J.S., Rhodes G., Jovin T.M. RNA polymerase: catalyticmechanisms and inhibitors. - In: RNA polymerase ( LOsick R,, Ohamberlin M. eds ) Gold Spring Harbor, ITY, Cold Spring Harbor Lab, 1976, p. 127-157.

31. Zillig Y/., Palm P., Heil A. Function and reasembly of subunit of DNA dependent RNA polymerase,- In: RITA polymerase ( Losick R., Chamberlin M. eds ) Cold Spring Harbor, NY, Cold Spring Harbor Lab., 1976, p. 101-125.

32. Свердлов Е.Д., Царев А., Модянов Н.Н., Липкин В.М., ГрачевМ.А., Зайчиков Е.Ф., Плетнев А.Г. Фотоаффинная модификадия РШ{-полшлеразы Е. coIiB тралскрищионном комплексе аналога,ми субстратов.- Биооргал. химия, 1978, т. 4, Ю, с.1278-1280. - 95

33. Mincley E.G., Bribnov D, Transcription of the early regionof bacteriophage T7: selective with dinucleotides»- J. Molec. Biol», 1973, V. 77, N 2, p. 255-277.

34. Gilbert W., Maizels И"., Maxam A. Sequences of controlingregion of the lactose operon.- Cold Spring Harbor Symp. Quant. Biol., 1974, V. 38, p. 845-853.

35. Jonston D.E., McClure Y/.R. Abortive initiation of in vitroRNA synthesis on bacteriophage DNA. In: RNA polymerase ( Losick R., Ghamberlin M., eds ), Cold Spring Harbor, NY: Gold Spring Harbor Lab., 1976, p. 413-428.

36. Cech C.L., bichy J., McClure W.R. Characterisation of promoter containing DNA fragments based on the abortive initiation reaction of Escherichia coli RNA polymerase.- J. Biol. Chem., - 96 1980, V. 255, If 5, p. 1763-1766.

37. Hansen U.M,, JIcGliire W.R. A noncycling activity assay for the(f subunit of Escherichia coli R M polymerase.- J. Biol. Ohera,, 1979, V. 254, N 13, p. 5713-5717.

38. McClure V/.R., Gech G.L., Johnston D.E. A steady state assayfor the ША polymerase initiation reaction.- J. Biol. Ohem., 1978, V. 253, H 24, p. 8941-8948.

39. Smagovicz W.I., Sheit K.H. Steady state kinetic studies on initiation of RNA synthesis on T7 D M in the presence of rifampicin.- Studia biophysica, 1978, v, 67, p. 39-40.

40. JKTixon J,, Spoore (D., Evans J., Kimball A. A affinity labelingof Escherichia coli В deoxyribonucleic acid dependent ribonucleic acid polymerase.- Biochemistry, v. 11, 1972, N 24» p. 5470-4572.

41. Grachev М.А., Zaychikov Е.Р, Photo-modification studies ofthe contacts of the 5«-terminus RNA with subunits of RUA-polymerase.- PEBS Letters, 1981, v. 130, N 1, p. 23-26, 42. Свердлов Е.Д., Царев A. Субъединицы РЖ-полимеразы Е. coli,контакифующие с 5'-концом Р Ж на, разных стадиях транскрищии,Биоорган. химия, 1980, т. 6, 11>. 7, с. IIII-III3.

43. Roberts J. Termination factor for ША synthesis.- Hature,1969, V. 224, N5225. p. 1168-1174.

44. Neff P.H., Ohamberlin M.iJ. Termination of transcription byEscherichia coli RUA polymerase in vitro is affected by ribonucleoside triphosphate base analogs.- J. Biol. Chem., 1978, V. 253, H 7, p. 2455-2460.

45. Rosenberg M., Court D., Shimatake H., Brady 0., Wulff D.b.The relationship between f\inction and Ш А sequence in an intercistronic regulatory region in phage Л. .- Hature, 1978, V. 272, IT 5652, p. 414-423.

46. Stauffer G.V,, Zurawski G., Yanofsky G. Single base pair alteration in the E. coli trp operon leader region that reliave transcription at the trp attenuator.- Proc. ITatl. Acad. Sci. USA, 1978, V. 75, N 10 , p. 4833-4837.

47. Adhya S., Gottesman M, Control of transcription termination.Ann. Rev. Biochem., 1978, v. 47, p. 967-996.

48. Parnham P.J., Piatt T. A model for transcription suggested- 98 by studies on the trp attenuator in vitro using base analogs.Cell, 1980, V. 20, N 3, p. 739-748,

49. Parnham P,J., Piatt T. Rho-independent termination: dyad sirnimetry in DNA causes RHA polymerase to pause during transcription in vitro.- ITucl. Acids Res., 1981, v. 9, И" 4, P. 563-577.

50. Das A., Merril С , Adhya S. Interaction of RUA polymerase andrho in transcription termination: coupled ATPase,- Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 1978, v. 75, N 10, p. 4828-4832.

51. Guarente L. Restoration of termination by RNA polymerase mutations is rho allele-specific- J. Molec. Biol., v. 129, N 2, p. 295-304.

52. Darlix J.-L. The fimctions of rho in T7-DM transcription invitro.- Eur. J. Biochem., 1973, v. 35, H 3, p. 517-526.

53. Lowery-Goldhammer 0., Richardson J.P. An RNA-dependent nucleoside triphosphate phosphohydrolase ( ATPase ) associated with rho termination factor.- Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 1974, v. 71, N 5, p. 2003-2007.

54. Howard B.H., de Crombrugghe B. ATPase activity required fortermination of transcriptiooi by the Escherichia coli protein factor p .- J. Biol. Ghem., 1976, v. 251, N 8, p. 2520-2524.

55. Richardson J.P., Conoway R. Ribonucleic acid release activityof transcription termination protein D is dependent on the hydrolysis of nucleoside triphosphates.- Biochemistry, 1980, V. 19, N 18, p. 4293-4299.

56. Parker D.J., Allison W.S, The mechanism of inactivation ofglyceralfehyde-3-pho3phat degydrogenase by tetrationate, oiodosobenzoate and iodide mono chloride,- J. Biol. Ghem,, 1969, V. 244, N 1, p. 180-187.

57. Dooman S., Stanway G. Identification of the reactive sylfhydryl group of mitochondrial aspartate aminotransferase from pig heart.- PEBS Letters, v. 69, N 1, p. 261, 1976. - 100

58. Nisimoto Y,, Shibata Y. Location of function SH-groups inNADPH-cytochrome P-450 reductase from rabbit liver microsomes, • Biochem, Biophys. Acta, 1981, v. 662, N 2, p. 291.

59. Wittinghfer A., Leberman R. Elongation factor T from Bacillusstearothermophillus and Escherichia coli.- Europ. J. Biochem., 1976, V. 62, N 2, p. 373-382.

60. Hicholson B.H,, King A.M.Q. 3Jhiol function ternary structureof RNA polymerase.- Europ. J. Biochem., 1973,v. 37, N 3, p. 575-584.

61. Chamberlin M., Berg P. Deoxyribonucleic acid-directed synthesis of ribonucleic acid by an enzyme from Escherichia coli.Proc. Fatl. Acad. Sci. USA, 1962, v. 48, Я 1, p. 81-94.

62. Ishihama A., Hurwitz J. The role of deoxyribonucleic acid inribonucleic acid synthesis. XVII multiple active sites of Escherichia coli ribonucleic acid polymerase,- J. Biol. Chem., 1969, V, 244, Ж 24, p. 6680-6689.

63. Krakow J.S.-On the role of sulfhydryl groups in the structureand function of the Azotobacter vinelandii RNA polymerase,Biochemistry, 1975, v. 14, N 20, p. 4522-4527.

64. Brather S.G., Kronman M.J. Reaction of the thiol groups of- lOI E. coli Ш А polymerase with 7-chloro-4-nitrobenzo-2-oxa-1,3diasole.- Biochem. Biophys. Res. Commun,, 1977, v. 79, H 1, p. 203-209.

65. Sumegi J., Sannar T,, Pihe A. Involvement of highly reactivesulfhydryl groups in the action of RNA polymerase from E, coli.- FBBS Letters, 1971, v, 16, Ж 2, p. 125-127.

66. Harding J.D., Beychok S. Sulfhydryl reactivity of B, coli ШАdependent RHA polymerase,- Biochem. Biophys. Res. Oomraun,, 1973, V. 51, N 3, p. 711-717.

67. Yarhrough L.R., Wu O.-W, Role of sulfhydryl residues of Escherichia coli ribonucleic acid polymerase in template recognition and specific initiation.- J. Biol. Chem., 1974, v. 249, N 13, p. 4079-4085.

68. Smith D.A., Martinez A.M., Ratliff R.L. The role of sulfhydryl groups in the binding of RUA polymerase to synthetic polydesoxynucleotides.- J. Molec. Biol., 1971, v. 60, U 2, p. 395-400.

69. Ishihama A. Subunit of ribonucleic acid polymerase in functionand structure. I. Reversible dissociation of Escherichia coli ribonucleic acid polymerase.- Biochemistry, 1972, v. 11, N 7, p. 1250-1258.

70. King A.M.Q., Nicholson B.H, Thiol groups of ribonucleic acidpolymerase.- Biochem. J., 1972, v. 128, N 3, p. 90P.

71. Daroczy A., Damjanovich S. On the reactivity of DNA-dependentRNA polymerase,- Abstr. Comm. 9th Meet. Fed. Eur, Biochem. Soc., Budapest, 1974, p. 177.

72. Zillig ¥/., Palm P., Heil A. Function and reassembly of subunits of DNA-dependent RUA polymerase.- In; RlIA polymerase - 102 ( Losick R., Ohamberlin M. eda ) Cold Spring Harbor, HY: Gold Spring Harbor Lab., 1976, p. 159-191.

73. Wu P.Y,-H., Yarbrough L.R., Wu G.-W. Conformational transitionof Escherichia coli RNA polymerase induced by the interaction of (Г subunit with core enzyme,- Biochemistry, 1976, v. 15, N 15, p. 3254-3258.

74. Narayanan G.S., Krakow J.S, Chemical modification of sigmasubunit of the B. coli RlIA polymerase.- lucl. Acids Res., 1983, V. 11, N 9, p. 2701-2716.

75. Камзолова, Г. Модификация РШ^-полимеразы Escherichia coliфлуоресцеБбимеркуриацетатом. - Молек. биол., 1982, т. 16, .й 2, с. 434-439.

76. Маркович Д.С, Умрихина Н.В., Волькенштеин М.В. Исследованиеспецифического связывания "репортеров" ( ртутных производных флуорескам1гаа ) лактатдегидрогеназой.- Молек. биол., I97I, т. 5, Ж , с. 51-57.

77. Miller J.А,, Serio G.F,, Bear J.L., Howard R.A,, Kimball A.P«Affinity labeling of a cysteinekt or near the catalytic center of Escherichia coli in DIJA-dependent RITA polymerase,Biochem. Biophys. Acta, 1980, v. 612, H 1, p. 286-294.

78. Armstrong V.W,, Sternbach H,, Eckstein F. Affinity labelingof Escherichia coli ША-dependent RliA polymerase with 5-formil-1-( d/ -D-ribofuranosyl ) iiracil 5'-triphosphate,- Biochemistry, 1976, V, 15, N10, p, 2086-2091.

79. Venegas A., Martial J,, Velenzuela P. Active site-directedinhibition of E. coli DUA-dependent RNA polymerase by pyridoxal-5'-phosphate,- Biochem. Biophys. Res. Gommun., 1973, V. 55, H 4, p. 1053-1059.

80. Slepneva I,A. .«Detection of nucleoside triphosphate bindingsites of two types in Escherichia coli RITA polymerase by affinity labeling.- Molec. Biol. Report, 1980, v. 6, К 1, p. 31-34.

81. Slepneva I.A., Zakhareva 1Т.У., Backer J.M. Kinetic evidence ":"for multiple binding sites of nucleoside triphosphates in Escherichia coli RHA polymerase,- EBBS Letters, 1978, v. 87, N 2, p. 273-276,

82. Свердаов Е.Д., Царев A., Модянов Н.Н., МШШЕ В.М., Грачев- 104 М.А., Зайчиков Е.Ф., Плетнев А.Г. Фотоафинная модафикация РШ^-полимеразы Е. соЯ в транскрищионном комплексе аналогами субстратов,- Биоорган, химия, 1978, т. 4, Ш Ч , с. 1378-I28I.

83. Nakaya K», Horinishi H., Shibata K, States of amino acid residues in protein. XIII. Monochlortrifluoroquinone as a new reagent for discrimination of amino groups.- J. Biochem., 1967, V. 61, H 3, p. 337-341.

84. Hunter M.J., Ludwig M.L, The reaction of imidoester withprotein and related small molecules.- J. Amer, CJhem.Soc, 1962, V. 84, N 18, p. 3491-3504.

85. Macoff A.J., Malcolm D.B. Identification of a class of lysines withing the non-specific DHA-binding site of RUA polymerase core enzyme from Escherichia coli.- Егхгор. J. Biochem., 1980, V. 106, Ж 1, p. 313-320.

86. Narayanan G.S,, Krakow J.S. Effect of lysine modificationon the activity of the 0' subunit of Escherichia coli RNA polymerase.- Biochemistry, 1982, v. 21, Ж 24, p. 6103-6111.

87. Armstrong '/."., Sternbach H., Eckstein P. Modi£icationof an essential arginine in Escherichia coli ША-dependent RUA polymerase.- EEBS Letters, 1976, v. 70, H I , p. 48-50. - 105

88. Takanashl К, The reaction of phenylglyoxal with arginine residues in proteins.- J. Biol. Ghem,, 1968, v. 243, N 23, p. 6171-6179.

89. Melchor W.B., Fahrney Jr. and D, Ethoxyformylation of reaction of ethoxyformic anhydride with ot'-chymotrypsin, pepsin and pancreatic ribonuclease at pH 4.- Biochemistry, 1970, V. 9, N 2, p. 251-258.

90. Розовская Т. A. Бибилашвили Р.Ш., Модификация РНК-полимеразыEscherichia coli диэтилпирокарбонатом.- Молек. биология, 1979, т. 13, № 2, с. 388-401.

91. Розовская Т.А., Бибилашвили Р.Ш., Зарудная М.И., КосагаловЮ.Н. Модификация РНК-полимеразы Escherichia coli диэтилпирокарбонатом. II Связывание и дестабилизация двойной спирали ДШС- Молек. биология, I98I, т. 15, J^ I, с. 79-85.

92. Гралев М.А., Мустаев А. А. РНК-полрмераза: простой метод локализация активного центра.- У1 Всесоюзный симпозиум " Химия белков и пептидов ", Тезисы докладов, Рига, 1983, с. 183-184.

93. Хесин Р. Б., Шемякин М.Ф., Горленко S.M., Богданова, Л., Афа.насьева. Т.Г. РШ^-полимераза в клетках Escherichia coli зараженных фагом Т2.- Биохимия, 1962, т. 27, В 6, с. I092-II05

94. Geiduschek E.P., Snyder L., Golvill A.J,, Sarnat M. Selectivesynthesis of (D-event bacteriophage early messenger in vitro.J. Molec. Biol., 1966, v. 19, N 2, p. 54I-547,

95. Cohen S.H., Maitra U., Hurwitz J. Role of D M in RNA synthesis XI. Selective transcription of 7U D M segments in vitro by R M polymerase of Escherichia coli.- J. molec. Biol.,1967, V. 26, N 1, p. 19-38.

96. Камзолова. Г., Мадяков В.Ф., йюелев Н.А., Шешкин М.Ф.,Аста.урова. О.Б., Хесин Р.Б. Образование комплексов РНК-полимеразы с ДНК.- Молек. биология, 1969, т. 3, А^ I, с. 74-87.

97. Walter G., Zillig W., Palm P., Puchs E. Initiation of DMdependent RNA synthesis and effect of heparin on R M polymerase.- Eur op. J. Biochem., ,19167, v.3, N 2, p. 194-201»

98. Anthony D., Zeszotek E., Goldthwait D.A. Initiation by theDM-dependent R M polymerase,- Proc. Hatl. Acad. Sci. USA, - 107 1966, V. 56, IT 3, p. 1026-1033.

99. Siebenlist U, R M polymerase unwinds an 11 base pair segmentof a phage T? promoter.- Nature, 1979, v. 279, N 5714, p.651-652.

100. Bannister В., Kagan P. The synthesis of nucleoside and nucleotide analogs derived from uridine.- J. Amer. Chem. Soc., i960, V. 82, H 13, p. 3363-3368.

101. Khesin R.B., Shemyakin M.F., Gorlenco Zh.M,, Mindlin S.Z.,1.yna T.S, Studies on the RNA polymerase in Escherichia coli К 12 using the mutation affecting its activity.- J. Molec. Biol., 1969, V. 42, N 3, p. 401-414.

102. Steele J.G.H., Jr., Nielsen T.B. Evalution of cross-linkedpolypeptides in SDS gel electrophoresis.- Anal. Biochem,, 1978, V. 84, N 1, p. 218-224.

103. Chou P.Y., Pasman G.D. Prediction of protein conformation.Biochemistry, 1974, v. 13, H 2, p. 222-245.

104. Goff C.G, Chemical structure of a modification of the Escherichia coli ribonucleic acid polymerase Я polypeptides induced by bacteriophage T4 infection.- J. Biol. Chem., 1974, V. 249, H 19, p. 6181-6190.

105. Лишшн B.M., М0ДЯНОВ H.IL, Чертов ОАО,, Кочергинская A.,Ниютфоров В.Г., Лебедев А.Н. Модификация остатков тирозина, в ДНК-зависимой РЖ-полимеразе в. coli .- Биооргал. химия, 1979, т. :.5, iFi 6, с. 929-936.

106. Messineo L., Mussarra E. A sensitive spectrophotometric method for the determination of free or boirnd tryptophan,Int. J. Biochem., 1972, v. 3, N 3 , p. 700-704.

107. Edelhoch,,Spectroscopic determination of tryptophan aлd tyrosine in protein,- Biochemistry, I967, v. 6, Ж j , p, 1948-1954,

108. Беленький Б.Г., Ганкина Э.С, Нестеров В.В. Экспрессный метод ультралувствительный метод идентификации Н-концевых - 109 аминокислот в белках и пептидах с помощью тонкослойной хроматографии.- Докл АН СССР, 1967, т. 172, & I, с. 91-93.

109. Briel G,, Neyhoff V. Microanalysis of amino acids and theirdetermination in biological material using dansyl chloride.Норрег-Зеу1егЛ Z, Physiol. Ghem,, 1972, v. 353, N 4 , p.540-553.

110. Chang J.Y., Greaser E.H., Bentley K.lf. 4-H,N-diraethylaminoazobenzene-4'-isothiocyanate, a new chromophoric reagent for protein sequense analysis.- Biochem, J,, 1976, v. 153» N 3, p. 607-611.

111. Edman P., BeggJ. A protein sequenator.- Europ. J. Biochera.,1967, V. 1, N 1, p. 80-91.