Сравнительная характеристика молекулярно-генетических особенностей в медуллобластомах у взрослых и детей тема диссертации и автореферата по ВАК РФ 14.01.18, кандидат медицинских наук Рыжова, Марина Владимировна

• Рыжова, Марина Владимировна
• кандидат медицинских наук
• 2011

Оглавление диссертации кандидат медицинских наук Рыжова, Марина Владимировна

СПИСОК СОКРАЩЕНИЙ.

ВВЕДЕНИЕ.

Глава 1. МОЛЕКУЛЯРНО-ГЕНЕТИЧЕСКИЕ ОСОБЕННОСТИ В МЕДУЛЛОБЛАСТОМАХ У РАЗЛИЧНЫХ ВОЗРАСТНЫХ ГРУПП (ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ).

1.1. История развития представлений о медуллобластомах.

1.2. Патогенетические теории развития медуллобластом

1.2.1. Сигнальные пути, регулирующие развития мозжечка и медуллобластом.

1.2.2. Моделирование медуллобластомы у животных.

1.2.3. Стволовые клетки в развитии медуллобластом.

1.3. Клинико-диагностические особенности медуллобластом.

1.3.1. Этиология медуллобластом.

1.3.2. Частота встречаемости медуллобластом.

1.3.3. Клинические аспекты медуллобластом.

1.3.4. Диагностика медуллобластом.

1.3.5. Структура заболеваемости медуллобластомами.

1.3.6. Локализация медуллобластом.

1.4. Лечение медуллобластом.

1.4.1. Паллиативное лечение медуллобластом.

1.4.2. Осложнения лечения медуллобластом.

1.4.3. Контроль заболевания.

1.5. Патоморфология медуллобластом.

1.6. Генетические аберрации в медуллобластомах.

1.6.1. Изохромосома \П<\.

1.6.2. Амплификация генов.

1.6.3. Хромосома 6.

1.6.4. Маркеры благоприятного прогноза.

1.6.5. Апоптоз.

1.6.6. Маркеры неблагоприятного прогноза.

1.7. Прогрессия медуллобластом.

1.8. Клинико-морфологические различия между взрослыми и детскими медуллобластомами.

Глава 2. МАТЕРИАЛ И МЕТОДЫ ИССЛЕДОВАНИЯ.

2.1. Общая характеристика клинического материала.

2.1.1. Формирование групп для исследования.

2.1.2. Катамнестические данные.

2.2. Методы исследования.

2.2.1. Патоморфологическое исследование.

2.2.2. Иммуногистохимическое исследование.

2.2.3. Тканевые микроарреи.

2.2.4. Флуоресцентная гибридизация in situ.

2.2.5. Сравнительная геномная гибридизация.

2.2.6. Экспрессионный профайлинг.

2.3. Статистический анализ данных.

Глава 3. РЕЗУЛЬТАТЫ.

3.1. Сравнительная геномная гибридизация.

3.1.1. Цитогенетические хромосомные аберрации во взрослой скрининговой подгруппе.

3.1.2. Цитогенетические хромосомные аберрации в детской скрининговой подгруппе.

3.2. Флуоресцентная гибридизация in situ.

3.3. Экспрессионный профайлинг генов.

3.4. Статистический анализ выживаемости.

3.5. Сравнительно-сопоставительный анализ медуллобластом у взрослых и детей.

Глава 4. ОБСУЖДЕНИЕ.

Введение диссертации (часть автореферата) на тему «Сравнительная характеристика молекулярно-генетических особенностей в медуллобластомах у взрослых и детей»

Актуальность исследования

Медуллобластома (МБ) — наиболее часто встречающаяся в нейрохирургической практике высоко злокачественная опухоль головного мозга у детей, в то время как у взрослых медуллобластомы возникают относительно редко и составляют не более 4% от всех первичных опухолей головного мозга [15], [33], [164].

Медуллобластомы у детей являются относительно хорошо изученной опухолью центральной нервной системы (ЦНС), благодаря чему стало возможным разделение медуллобластом на группы риска на основании клинических и молекулярных данных [124], [172], [179]. Эти результаты исследований повлекли за собой более дифференцированный подход к лечению медуллобластом, позволяя избежать таких отдаленных осложнений, как нарушения интеллектуального развития и формирования скелета, а также эндокринных расстройств.

Имеющиеся в литературе данные, касающиеся медуллобластом у взрослых, представляют собой ретроспективные исследования большого количества опухолей, собранных за длительный период времени и трудно поддающихся анализу из-за разницы в терапевтических подходах [88], [129], [164], [194] либо представлены небольшими сериями больных, предлагающими в качестве прогностических маркеров клинические, гистологические и иммуногистохимические параметры [17], [33], [46], [90], [143], [206]. Сообщения о молекулярно-генетических нарушениях ограничены описанием единичных больных [102]. Редкость медуллобластом у взрослых и недостаток данных о биологии этих опухолей затрудняют выбор терапевтической стратегии, фактически используются «детские» протоколы лечения медуллобластом, обладающие значительной токсичностью для взрослых пациентов. Изучение генетических аберраций в медуллобластомах у взрослых, сравнение их с молекулярно-генетическим профилем детских медуллобластом, понимание путей патогенеза позволит выявить новые прогностические маркеры и оптимизировать лечение нейрохирургических больных с медуллобластомами.

Цель исследования

Выявить генетические аберрации в медуллобластомах у взрослых, сравнить нарушения в геноме медуллобластом, возникающие у взрослых и детей, выявить зависящую от возраста разницу в биологии этих опухолей и предложить основанную на молекулярных маркерах схему прогноза.

Задачи исследования

1. Подробно описать генетические особенности в медуллобластомах у взрослых нейрохирургических больных, выявленные при исследовании на уровне тотального генома с помощью методов сравнительной геномной гибридизации (array-based Comparative Genomic Hybridization array-CGH) и экспрессионного профайлинга (Gene expression profiling).

2. Определить прогностическое значение различных генетических аберраций при медуллобластомах у взрослых, исследовав их связь с общей и безрецидивной выживаемостью. Л и*

3. Сравнить частоту и прогностическое значение различных генетических аберраций в медуллобластомах у взрослых и детей.

4. Внедрить алгоритм определения прогностически важных генетических аберраций в условиях патологоанатомического отделения методом флуоресцентной гибридизации in situ (Fluorescence in situ hybridization) и определение молекулярного варианта медуллобластом методом иммуногистохимического исследования.

Научная; новизна

В работе впервые подробно изучены нарушения в опухолевом геноме взрослых нейрохирургических больных с медуллобластомами. Благодаря использованию сравнительной геномной. гибридизации array-CGH с высокой разрешающей способностью выявлены тонкие нарушения в геноме, определены критические участки поражения на уровне отдельных генов, вовлеченных в процесс развития медуллобластом у взрослых. Изучение экспрессии различных генов методом экспрессионного профайлинга позволило установить вовлеченные в патогенез медуллобластом у взрослых гены следующих сигнальных путей: Sonic Hedgehog, Wnt/Wingless и гены, контролирующие синаптогенез, нейрональную дифференцировку и рецепторы глютамата. Сравнение генетических нарушений' в медуллобластомах взрослых и< детей выявило зависящие от возраста прогностические маркеры:, амплификация CDK6, добавка 17q и потеря lOq имеют неблагоприятное прогностическое значение у взрослых больных с медуллобластомами; амплификация MYC является маркером плохого прогноза у детей; Предложена молекулярно-генетическая стратификация и внедрено определение этих маркеров иммуногистохимическим методом и флуоресцентной; гибридизацией: in situ (FISH) в практику патологоанатомического отделения Научно-исследовательского института имени академика H.H. Бурденко РАМН, что будет способствовать оптимизации лечения этих опухолей и позволит уменьшить токсичность лучевой терапии и химиотершти.

Практическая значимость

Результаты работы выявили прогностически значимые генетические маркеры у больных старше 18 лет с медуллобластомами. Определение групповой принадлежности опухоли иммуногистохимическим методом и выявление прогностически значимых генетических аберраций в медуллобластомах флуоресцентной гибридизацией in situ внедрено в практику патологоанатомического отделения Научно-исследовательского института нейрохирургии имени академика H.H. Бурденко РАМН.

Основные положения, выносимые на защиту

1. Медуллобластомы у взрослых пациентов представляют собой гетерогенную , группу опухолей, отличающихся от детских медуллобластом.

2. Экспрессионный профайлинг позволил выделить три молекулярных варианта медуллобластомы у взрослых:

- медуллобластомы с активацией генов Sonic Hedgehog сигнального пути (группа SHH)

- медуллобластомы с активацией генов Wnt/Wingless сигнального пути (группа Wnt)

- медуллобластомы с активацией генов, контролирующих синаптогенез, нейрональную дифференцировку и рецепторы глютамата (группа D)

3. В геноме взрослых медуллобластом присутствует цитогенетическая аберрация - амплификация онкогена CDK6, почти не встречающаяся в геноме детских медуллобластом.

4. Маркерами неблагоприятного прогноза у взрослых медуллобластом являются следующие принадлежащие к группе D цитогенетические аберрации: амплификация CDK6, количественные изменения на хромосоме 17 и делеция хромосомы 10q.

5. Делеция хромосомы 6q не имеет у взрослых такого благоприятного прогностического значения как у детей.

Апробация работы

Официальная апробация состоялась 23 сентября 2011 г. на расширенном совместном заседании проблемных комиссий «Биология и комплексное лечение внутримозговых опухолей» и «Детская нейрохирургия» в Научно-исследовательском институте нейрохирургии имени академика Н.Н. Бурденко РАМН.

Результаты работы были обсуждены 24 августа 2011 на семинаре отделения молекулярной генетики German Cancer Research Center in the Helmholtz Association, Heidelberg, Germany.

Публикации

По теме работы опубликовано 20 печатных работ, из них 8 в виде статей в журналах, рецензируемых ВАК и 12 в виде тезисов на профильных конференциях и конгрессах.

Структура и объем диссертации

Диссертация состоит из введения, 4 глав, заключения, выводов, практических рекомендаций и приложения. Текст изложен на 145 страницах, содержит 23 рисунка и 10 таблиц. Указатель литературы содержит ссылки на 7 отечественных и 237 зарубежных источников.

Заключение диссертации по теме «Нейрохирургия», Рыжова, Марина Владимировна

выводы

1. Современный протокол комбинированного лечения нейрохирургических больных с медуллобластомами у взрослых, включающий хирургическое удаление опухоли с последующей лучевой и химиотерапией, может быть усовершенствован путем индивидуального дифференцированного подхода, учитывающего особенности молекулярно-генетического профиля каждой конкретной опухоли.

2. Цитогенетические профили в медуллобластомах у взрослых и детей имеют существенные различия. Более чем в 1/3 (35%) взрослых медуллобластом выявляется преимущественно диплоидный сбалансированный) цитогенетический профиль, тогда как у медуллобластом детского возраста сбалансированный профиль имеет место крайне редко - в 6% случаев. В цитогенетическом профиле взрослых медуллобластом отсутствуют амплификации онкогенов MYC и MYCN, типичные для детей с медуллобластомами, где они выявляются у 15% опухолей. С другой стороны, в 9% случаев взрослых медуллобластом выявляется амплификация онкогена CDK6, которая не встречается у медуллобластом детского возраста.

3. Анализ экспрессии генов выявил различие в экспрессионном профиле медуллобластом у взрослых и детей. У взрослых медуллобластом выявляется три молекулярно-экспрессионных группы: превалирующий молекулярный вариант SHH (60%); группа D в 25% и группа Wnt 15%. Детские медуллобластомы подразделяются на четыре молекулярные группы (Wnt, SHH, С и D). При этом у детей в отличие от взрослых наблюдается приблизительно равное распределение по экспрессионным группам и присутствует группа С.

4. Молекулярными маркерами неблагоприятного прогноза для взрослых медуллобластом являются амплификация CDK6, добавка 17q и делеция хромосомы lOq, а также принадлежность к молекулярному варианту D, для которого 5-летняя общая выживаемость составляет 20%, а 5-летняя безрецидивная выживаемость —12%.

5. Делеция хромосомы lOq встречается в обеих возрастных группах с незначительной разницей по частоте (в 23% случаев у взрослых и в 30% у детей с медуллобластомами), но для медуллобластом у взрослых эта генетическая аберрация имеет неблагоприятное прогностическое значение. Делеция хромосомы 6 также встречается у детей и взрослых примерно в равном проценте случаев (15% и 17%), однако, не имеет клинической значимости для взрослых медуллобластом в отличие от детских опухолей, где эта аберрация является индикатором благоприятного прогноза.

6. Использование цитогенетических и экспрессионных молекулярных маркеров может способствовать оптимизации лечения медуллобластом у взрослых пациентов. Так, опухоли с экспрессией прогностически неблагоприятных маркеров могут быть включены в протокол с максимально интенсивным лечением или патогенетически обоснованной таргетной терапией. Кроме того, большая группа взрослых медуллобластом с экспрессией генов Sonic Hedgehog может быть включена в лечебный протокол с использованием ингибиторов SHH таких как GDC-0449 и ATO.

ПРАКТИЧЕСКИЕ РЕКОМЕНДАЦИИ

Алгоритм исследования медуллобластомы условиях в патологоанатомического отделения

1. Рутинное окрашивание препаратов гематоксилином и эозином.

2. Иммуногистохимическое исследование с антителами SFRP1, P-catenin, NPR3 и KCNA1 для определения молекулярного варианта.

3. Проведение флуоресцентной гибридизации in situ FISH со следующими пробами «Vysis»

• Centromere 8pll-qll probe (spectrum green)/8q24/MYC probe (spectrum orange)

• Centromere 2pl 1-ql 1 probe (spectrum orange)/2p24/MYCN probe (spectrum green)

• 17pl3.3/LISl (spectrum orange)/17q21/RARA (spectrum green)/6q23/MYB spectrum aqua)

• 9q34/ABL (spectrum orange)/22qll/BCR (spectrum green)/9q34/ABL spectrum aqua)

•Centromere lOpl 1.1-ql 1.1 probe (spectrum green)/10q23/PTEN probe (spectrum orange)

106

Список литературы диссертационного исследования кандидат медицинских наук Рыжова, Марина Владимировна, 2011 год

1. Коршунов А.Г., Сычева Р.В., Горелышев С.К., Озеров С.С., Голанов А.В. Аномалии хромосомы 17 в медуллобластомах и их прогностическое значение. Вопросы Нейрохирургии, 2007

2. Мацко Д.Е., Коршунов А.Г. Атлас опухолей центральной нервной системы (гистологическое строение) С-Пб.-1998-200с

3. Озеров С.С. Клиническая и гистобиологическая характеристика медуллобластом. Дисс. канд. мед. наук. М., 1999

4. Смирнов Л.И. Гистогенез, гистология и топография опухолей мозга. М. Медгиз-1951-476с

5. Смирнов Л.И. Опухоли головного и спинного мозга. М. Медгиз-1962-240с

6. Хоминский Б.С. Гистологическая диагностика опухолей центральной нервной системы. М., 1969

7. Abacioglu U., Uzel О., Sengoz M., Turkan S., and Ober A. Medulloblastoma in adults: treatment results and prognostic factors. Int. J. Radiation Oncology Biol. Phys. 54,3:855-860, 2002

8. Adesina A.M. Molecular heterogeneity in medulloblastoma with implications for differing tumor biology. J Child Neurol 14:411-417, 1999

9. Adesina A.M., Dunn S.T., Moore W.E. and Nalbantoglu J. Expression of p27kipl and p53 in medulloblastoma: relationship with cell proliferation and survival. Pathology Research and Practice 196:243-250, 2000

10. Albertson D.G. and Pinkel D. Genomic microarrays in human genetic disease and cancer. Human Molecular Genetics, 12,2:145-152, 2003

11. Albright A.L., Wisoff J.H., Zeltzer P.M., Boyett J.M., Rorke L.B., Stanley P. Effects of medulloblastoma resection on outcome in children: a report from the Children's Cancer Group. Neurosurgery 38 (2):265-271, 1996

12. Aldosari N., Bigner S.H., Burger P.C., Becker L., Kepner J.L., Friedman H.S., McLendon R.E. MYCC and MYCN oncogene amplification in medulloblastoma. Arch Pathol Lab Med 126:540-544, 2002

13. Aldosari N., Rasheed B.K.A., McLendon R.E., Friedman H.S., Bigner D.D., Bigner S.H. Characterization of chromosome 17 abnormalities in medulloblastomas. Acta Neuropathol 99:345-351, 2000

14. Altaba A.R., Sanchez P. and Dahmane N. Gli and Hedgehog in cancer: tumours, embryos and stem cells. Nature Review/Cancer 2:361-372, 2002

15. Ang C., Hauerstock D., Guiot M.-C., Kasymjanova G., Roberge D., Kavan P. and Muanza T. Characteristics and outcomes of medulloblastoma in adults. Pediatr Blood Cancer 51: 603-607, 2008

16. Bailey P., Cushing H. Medulloblastoma cerebelli: a common type of midcerebellar glioma of childhood. Arch Neurol Psychiatry 14:192-223, 1925

17. Bar E.E., Chaudhry A., Farah M.H., and Eberhart C.G. Hedgehog signaling promotes medulloblastoma survival via Bc/II. The American Journal of Pathology 170:347-355, 2007

18. Baryawno N., Sveinbjornsson B., Kogner P., and Johnsen J.I. Medulloblastoma a disease with disorganized developmental signaling cascades. Cell Cycle 9,13:2548-2554, 2010

19. Bodey B., Bodey B. Jr., Siegel S.E. and Kaiser H.E. Fas (APO-1, CD95) receptor expression and new option for immunotherapy in childhood medulloblastomas. Anticancer Research 19:3293-3314,1999

20. Bont J.M. de, Packer R.J., Michiels E.M., Boer M.L. den, and Pieters R. Biological background of pediatric medulloblastoma and ependymoma: a review from a translational research perspective. Neuro-Oncology 10:10401060,2008

21. Boon K. Eberhart C.G., and Riggins GJ. Genomic amplification of Orthodenticle Homologue 2 in medulloblastomas. Cancer Res 65 (3):703-707, 2005

22. Boon K., Edwards J., Siu I-M., Olschner D., Eberhart C.G., Marra M.A., Strausberg R.L. and Riggins G. Comparison of medulloblastoma and normal neural transcriptomes identifies a restricted set of activated genes. Oncogene 22:7687-7694, 2003

23. Bouffet E. Medulloblastoma in infants: the critical issues of the dilemma. Current Oncology 17(3):2-3, 2010

24. Brandes A.A., Franceschi E., Tosoni A., Blatt V., Ermani M. Long-term results of a prospective study on the treatment of medulloblastoma in adults Cancer 110:2035-2041, 2007

25. Brandes A.A., Franceschi E., Tosoni A., Reni M., Gatta G., Vecht C., Kortmann R.D. Adult neuroectodermal tumors of posterior fossa (medulloblastoma) and of supratentorial sites (stPNET). Critical Reviews in Oncology/Hematology 71:165-179, 2009

26. Brandes A. A., Paris M.K. Review of the prognostic factors in medulloblastoma of children and adults. Critical Reviews in Oncology/ Hematology 50: 121-128, 2004

27. Briggs K.J., Eberhart C.G., and Watkins D.N. Just say no to ATOH: How HIC1 methylation might predispose medulloblastoma to lineage addiction. Cancer Res. 68, 21:8654-8656, 2008

28. Bruggers C.S., Tai K-F., Murdock T., Sivak L., Le K., Perkins S.L., Coffin C.M., and Carroll W.L. Expression of the c-Myc protein in childhood medulloblastoma. Journal of Pediatric Hematology/Oncology 20,1:18-25, 1998

29. Castellino R.C., Bortoli M. De, Lu X., Moon S-H., Nguyen T-A., Shepard M.A., Rao P.H., Donehower L.A., Kim J.Y.H. Medulloblastomas overexpess the p53-inacrivating oncogene WTP1/PPM1D. J Neurooncol, 86(3): 245-256, 2008

30. Chan A.W., Tarbell N.J., Black P. Mcl., Louis D.N., Frosch M.P., Ancukiewicz M., Chapman P., Loeffler J.S. Adult medulloblastoma: prognostic factors and patterns of relapse. Neurosurjery 47,3:625-632, 2000

31. Cleveland W. J Am Stat Assoc 74:829-836, 1979

32. Cleveland W: Am Stat 35:54, 1981

33. Cong F., Zhang J., Pao W., Zhou P and Varmus H. A protein knockdown strategy to study the function of p-catenin in tumorigenesis. BMC Molecular Biology 4:10, 2003

34. Corcoran A., Maestro R.F. Del. Testing the "Go or Grow" hypothesis in human medulloblastoma cell lines in two and three dimentions. Neurosurgery 53:174-183,2003

35. Crawford J.R., MacDonald T.J., Packer R. Medulloblastoma in childhood: new biological advances. Lancet Neurol6:1073-1085, 2007

36. Curran E. K., Le G. M., Sainani K. L., Propp J. M., Fisher P. G.

37. Do children and adults differ in survival from medulloblastoma? A study from the SEER registry. JNeurooncol, 95:81-85, 2009

38. Curran E. K., Sainani K. L., Le G. M., Propp J. M., and Fisher P. G. Gender affects survival for medulloblastoma only in older children and adults: a study from the surveillance epidemiology and end results registry. Pediatr Blood Cancer 52:60-64, 2009

39. Cvekl A. Jr., Zavadil J., Birshtein B.K., Grotzer M.A., Cvekl A. Analysis of transcripts from 17pl3.3 in medulloblastoma suggests ROX/MNT as a potential tumour suppressor gene. European Journal of Cancer 40:2525-2532, 2004

40. Dahlback H-S. S., Brandal P., Gorunova L., Widing E., Meling T.R., Krossness B.K., and Heim S. Genomic aberrations in pediatric gliomas and embryonal tumors. Genes, Chromosomes & Cancer DPI: 10.1002/gcc.20898, 2011

41. Dahmen R.P., Koch A., Denkhaus D., Tonn J.C., Sorensen N., Berthold F., Birchmeier W., Wistler O.D., and Pietsch T. Deletion of AXIN1, a component of the WNT/wingless pathway, in sporadic medulloblastomas. Cancer Research 61:7039-7043, 2001

42. Duman-Scheel M., Weng L, Xin S. and Du W. Hedgehog regulates cell growth and proliferation by inducing Cyclin D and Cyclin E. Nature 417:299304,2002

43. Duplan S.M., Theoret Y., and Kenigsberg R.L. Antitumor activity of fibroblast growth factors (FGFs) for medulloblastoma may correlate with FGF receptor expression and tumor variant. Clinical Cancer Research 8:246-257, 2002

44. Eberhart C.G. In search of the medulloblast: neuronal stem cells and embryonal brain tumor. Neurosurgery Clinics of North America 18:59-69, 2007

45. Eberhart C.G. Molecular diagnosis in embrional brain tumors. Brain Pathology 21:96-101,2011

46. Eberhart C.G., Burger P.C. Anaplasia and grading in medulloblastomas. Brain Pathol 13:376-385, 2003

47. Eberhart C.G, Chaudhry A., Daniel R.W., Khaki L., Shah K.V. and Gravitt P. Increased p53 immunopositivity in anaplastic medulloblastoma and supratentorial PNET is not caused by JC virus. BMC Cancer 5:19 DQI:10.1186/1471-2407-5-19, 2005

48. Eberhart C.G, Cohen K.J, Tihan T, Goldthwaite P.T, and Burger P.C. Medulloblastomas with systemic metastases: evaluation of tumor histopathology and clinical behavior in 23 patients. Journal of Pediatric Hematology/Oncology 25,3:198-203, 2003

49. Eberhart C.G, Kratz J, Schuster A, Goldthwaite P, Cohen K, Perlman E.J, and Burger P.C. Comparative genomic hybridization detects an increased number of chromosomal alterations in large cell/anaplastic medulloblastomas. Brain Pathol 12:36-44, 2002

50. Eberhart C.G., Tihan T., and Burger P.C. Nuclear localization and mutation of P-catenin in medulloblastomas. Journal of Neuropathology and Experimental Neurology 59 (4): 333-337,2000

51. Ellison D.W. Childhood medulloblastoma: novel approaches to the classification of a heterogeneous disease. Acta Neuropathol, 120(3): 305-16, 2010

52. Fari X. and Eberhart C.G. Medulloblastoma stem cells. Jornal of Clinical Oncology 26,17:2821-2827, 2008

53. Fan X., Matsui W., Khaki L., Stearns D., Chun J., Li Y-M., and Eberhart C.G. Notch pathway inhibition depletes stem-like cells and blocks engraftment in embryonal brain tumors. Cancer Research 66,15:7445-7452,2005

54. Fernandez-Teijeiro A., Betensky R., Sturla L.M., Kim J. Y. H., Tamayo P., and Pomeroy S.L. Combining gene expression profiles and clinical parameters for risk stratification in medulloblastomas. J Clin Oncol 22:994-998, 2004

55. Fisher P.G., Burger P.C. and Eberhart C.G. Biologic risk stratification of medulloblastoma: the real time is now. Journal of Clinical Oncology 22 (6):971-974,2004

56. Fruhwald M.C. and Plass C. Metastatic medulloblastoma — therapeutic success through molecular target identification? The Pharmacogenomics Journal 2:710, 2002

57. Gan D-D., Reiss K., Carrill T., Valle L. Del., Croul S., Giordano A., Fishman P. and Khalili K. Involvement of Wnt signaling pathway in murine medulloblastoma induced by human neurotropic JC virus. Oncogene 20:48644870,2001

58. Gessi M., Muehlen A. zur, Lauriola L., Gardiman M.P., Giangaspero F. and Pietsch T. TP53, b-catenin and c-myc/ N-myc status in embryonal tumours with ependymoblastic rosettes. Neuropathology and Applied Neurobiology 37:406-413,2011

59. Giangaspero F., Perilongo G., Fondelli M.P., Brisigotti M., Carollo C., Burnelli R., Burger P.C., and Garre M.L. Medulloblastoma with extensive nodularity: a variant with favorable prognosis. J Neurosurg 91:971-977, 1999

60. Giangaspero F., Wellek S., Masuoka J., Gessi M., Kleihues P., Ohgaki H. Stratification of medulloblastoma on the basis of histopathological grading. Acta Neuropathol 112:5-12,2006

61. Gilbertson RJ. Medulloblastoma: signaling a change in treatment. The Lancet Oncology 5:209-218, 2004

62. Gilbertson R.J. & Clifford S.C. PDGFRB is overexpressed in metastatic medulloblastoma. Nature Genetics 35,3:197-198, 2003

63. Gilbertson R.J. and Gajjar A. Molecular biology of medulloblastoma: will it ever make a difference to clinical management? Journal of Neuro-Oncology 75:273-278, 2005

64. Giordana T. M., Agostino C. D', Polio B., Silvani A., Ferracini R., Paiolo A., Ghiglione P. and Chio A. Anaplasia is rare and does not influence prognosis in adult medulloblastoma. J. Neuropathol Exp Neurol, 64, 10: 869-874, 2005

65. Giordana M.T., Cavalla P., Dutto A., Borsotti L., Chio A. and Schiffer D. Is medulloblastoma the same tumor in children and adults? Journal of Neuro-Oncology 35:169-176, 1997

66. Giordana M. T., Duo D., Gasverde S., Trevisan E., Boghi A., Morra I., Pradotto L., Mauro A. and Chio A. MDM2 overexpression is associated with short survival in adult with medullodlastoma. Neuro-Oncology 4: 115-122, 2002

67. Giordana M.T., Migheli A. and Pavanelli E. Isochromosome 17q is a constant finding in medulloblastoma. An interphase cytogenetic study on tissue sections. Neuropathology and Applied Neurobiology 24:233-238, 1998

68. Graf E., Schmoor C., Sauerbrei W. and Schumaher M. Assessment and comparison of prognostic classification schemes for survival data. Statistics in Medicine 18:2529-2545, 1999

69. Haas T.G.K.J. de, Kool M. Clinicopathological features of medulloblastoma: an overview with an emphasis on molecular biology. Clinical Neuropathology 26 (3): 93-110, 2007

70. Hambardzumyan D., Becher O.J. and Holland E.C. Cancer stem cells and survival pathways. Cell Cycle 7,10:1371-1378, 2008

71. Haslam R.H.A., Lamborn K.R., Becker L.E., and Israel M.A. Tumor cell apoptosis present at diagnosis may predict treatment outcome for patients with medulloblastoma. Journal of Pediatric Hematology/Oncology 20,6:520-527, 1998

72. Hernan R., Fasheh R., Calabrese C., Frank A.J., Maclean K.H., Allard D., Barraclough R., and Gilbertson R.J. ERBB2 up-redulates S100A4 and severalother prometastatic genes in medulloblastoma. Cancer Research 63:140-148, 2003

73. Holland H, Koschny R, Krupp W, Meixensberger J, Bauer M, Schober R, Kirsten H, Ganten T.M, Ahnert P. Cytogenetic and molecular biological characterization of an adult medulloblastoma. Cancer Genetics and Cytogenetics 178:104-113, 2007

74. Horbinski C, Miller C.R, Perry A. Gone FISHing: clinical lessons learned in brain tumor molecular diagnostics over the last decade. Brain Pathology 21:57-73, 2011

75. Howng S-L., Wu C-H, Cheng T-S, Sy W-D, Lin P-C.K, Wang C, Hong Y-R. Differential expression of Wnt genes, P-catenin and E-cadherin in human brain tumors. Cancer Letters 183:95-101, 2002

76. Huang H, Mahler-Araujo B.M, Sankila A, Chimelli L, Yonekawa Y, Kleihues P, and Ohgaki H. APC mutation in sporadic medulloblastomas. The American Journal of Pathology 156:433-437, 2000

77. Hubbard J.L, Scheithauer B.W, Kispert D.B, Carpenter S.M, Wick M.R, and Laws E.R. Jr. Adult cerebellar medulloblastomas: the pathological, radiographic, and clinical disease spectrum. J Neurosurg 70:536544, 1989

78. Inazawa J., Inoue J. and Imoto I. Comparative genomic hybridization (CGH)-arrays pave the way for identification of novel cancer-related genes. Cancer Sci 95 (7):559-563, 2004

79. Kagawa N., Maruno M., Suzuki T., Hashiba T., Hashimoto' N., Tzumoto S., Yoshimine T. Detection of genetic and chromosomal aberrations in medulloblastomas and primitive neuroectodermal tumors with DNA microarrays. Brain Tumor Pathol 23:41-47, 2006

80. Katsetos C., Valle L. Del, Legido A., Chadarevian J-P. de, Perentes E., Mork S.J. On the neuronal/neuroblastic nature of medulloblastomas: a tribute to Pio del Rio Hortega and Moises Polak. Acta NeuropathoL105:l-13,2003

81. Kasuga C., Nakahara Y., Ueda S., Hwakins C., Taylor M.D., Smith' C.A., and Rutka J.T. Expression of MAGE and GAGE genes in medulloblastoma and modulation of resistance to chemotherapy. J Neurosurg Pediatrics 1:305-313,2008

82. Katoh M. WNT/PCP signaling-pathway and human cancer (review). Oncology Reports 14:1583-1588, 2005

83. Kaur J. and Sanial S.N. Association of PI3-kinase and Wnt signaling in non-steroidal anti-inflammatory drug-induced apoptosis in experimental colon cancer. American Journal of Biomedical Sciences l(4):395-405, 2009

84. Kenney A.M., Cole M.D. and Rowitch D.H. Nmyc upregulation by Sonic Hedgehog Signaling promotes proliferation in developing cerebellar granule neuron precusors. Development 130:15-28, 2003

85. Khalil E.B. Treatment results of adults and children with medulloblastoma NCI, Cairo University experience. Journal of the Egyptian Nat. Cancer Inst. 20(2): 175-186, 2008

86. Kim J.Y.H., Koralnik I.J., LeFave M., Segal R.A., Pfister L-A. and Pomeroy S.L. Medulloblastomas and primitive neuroectodermal tumors rarely contain polyomavirus DNA sequences. Neuro-Oncology 4/3(165-170):1522-8517,2002

87. Koch A., Hrychyk A., Hartmann W., Waha A., Mikeska T., Waha A., Schuller U., Sorensent N., Berthold F., Goodyer C.C., Wiestler O.D. Birchmeier W., Behrens J. and Pietsch T. Mutations of the Wnt antagonist

88. AXIN2 (Conductin) result in TCF-dependent transcription in medulloblastomas. Int. J. Cancer 121:284-291, 2007

89. Koch A., Tonnt J., Kraus J.A., Sorensent N., Albrecht S., Wiestier O.D. and Pietsch T. Molecular analysis of the lissencephaly gene 1 (LIS-1) in medulloblastomas. Neuropathology and Applied Neurobiology 22:233-242, 1996

90. Korn E.L. Censoring distributions as a measure of follow-up in survival analysis. Statistics in Medicine 5:255-260, 1986

91. Korshunov A., Benner A., Remke M., Lichter P., Deimling A. von, Pfister S. Accumulation of genomic aberrations during clinical progression of medulloblastoma. Acta Neuropathol, 116 (4): 383-390, 2008

92. Kortmann R-D., Kühl J., Timmermann B., Mittler U., Urban C., Budach V., Richter E., Willich N., Flentje M., Berthold F., Slave I., Wollf J.,

93. Lai R. Survival of patients with adult medulloblastoma. A population-based study. Cancer, 112, 7:1568-1574, 2008

94. Lamont J.M., Mcmanamy C.S., Pearson A.D., Clifford S.C., and Ellison D.W. Combined histopathological and molecular cytogenetic stratification of medulloblastoma patients. Clinical Cancer Research 10:54825493, 2004

95. Lee Y. and McKinnon PJ. DNA ligase IV suppresses medulloblastoma formation. Cancer Research 62:6395-6399, 2002

96. Lee Y., Miller H.L., Jensen P., Hernan R., Connelly M., Wetmore C., Zindy F., Roussel M.F., Curran T., Gilbertson R.C., and McKinnon P.J. A molecular fingerprint for medulloblastoma. Cancer Research 63:5428-5437, 2003

97. Leonard J.R., Cai D.X., Rivet D.J., Kaufinan B.A., Park T.C., Levi B.K., Perry A. Large cell/anaplastic medulloblastomas and medullomyoblastomas; clinicopathological and genetic features. JNeurosurg 95:82-88, 2001

98. Lescop S., Lellouch-Tubiana A., Vassal G. and Basnard-Guerin C. Molecular genetic studies of chromosome 11 and chromosome 22q DNA sequences in pediatric medulloblastomas. Journal of Neuro-Oncology 44:119127, 1999

99. Li X-N., Shu Q., Su J.M., Adesina A.M., Wong K.K., Perlaky L., Antalffyt B.A., Blaney S.M. and Lau C.C. Differential expression of survivin splice isoforms in medulloblastomas. Neuropathology and Applied Neurobiology 33:67-76, 2007

100. Lindsey J.C., Anderton J.A., Lusher M.E, and Clifford S.C. Epigenetic events in medulloblastoma development. Neurosurg Focus 19, 5:1-13, 2005

101. Liu J., Li J-W., Gang Y., Guo L., Li H. Expression of leukemia-inhibitory factor as an autocrinal growth factor in human meduloblastomas. J Cancer Res Clin Oncol 125:475-480

102. Lo K.C., Ma C., Bundy B.N., Pomeroy S.L., Eberhart C.G., and Cowell J.K. Gain of lq is a potential univariate negative prognostic marker for to survival in medulloblastoma. Clin Cancer Res 13 (23):7022-7028, 2007

103. Lo K.C., Rossi M.R., Eberhart C.G., Cowell J.K. Genome wide copy number abnormalities in pediatric medulloblastomas as assessed by array comparative genome hybridization. Brain Pathol, 17(3):282-96,2007

104. Malheiros S. M. F., Franco C. M. R., Stavale J. N., Santos A. J., Borges L. R. R., Pelaez M. P., Ferraz F. A. P. and Gabbai A. A. Medulloblastoma in adult: a series from Brazil. Journal of Neuro-Oncology 60: 247-253, 2002

105. Marcotullio L. Di, Ferretti E, Smaele E. De, Argenti B, Mincione C, Zazzeroni F, Gallo R, Masuelli L, Napolitano M, Maroder M, Modesti A,1. I/pTp»1 1

106. Giangaspero F, Screpanti I, Alesse E, and Guilino A. REN is a suppressor of Hedgehog signaling and is deleted in human medulloblastoma. PNAS 101,29:10833-10838, 2004

107. McLendon R.E, Friedman H.S, Kun L.E. & Bigner S.H. Diagnostic markers in pediatric medulloblastoma: a Pediatric Oncology Group Study. Histopathology 34:154-162, 1999

108. Min H.S., Lee Y.J., Park K., Cho B-K., Park S-H. Medulloblastoma: histopathologic and molecular markers of anaplasia and biologic behavior. Acta Neuropathol 112:13-20, 2006

109. Miralbell R., Tolnay M., Bieri S., Probst A., Sappino A-P., Berchtold W., Pepper M.S. and Pizzolato G. Pediatric medulloblastoma: prognostic value of p53, bcl-2, Mib-1, and microvessel density. Journal of Neuro-Oncology 45: 103-110, 1999

110. Monje M., Beachy P.A., and Fisher P.G. Hedgehog, Flies, Wnts and MYCs: the time has come for many things in medulloblastoma. Journal of Clinical Oncology 29(11):1395-1398, 2011

111. Nicholson J., Wickramasinghe C., Ross F., Crolla J., Ellison D. Imbalances of chromosome 17 in medulloblastomas determined by comparative genomic hybridization and fluorescence in situ hybridization. J Clin Pathol: Mol Pathol 53:313-319, 2000

112. Northcott P.A., Hielscher T., Dubuc A., Mack S., Shih D., Remke M., Al-Halabi H., Albrecht S., Jabado N., Eberhart C.G., Grajkowska W., Weiss W.A., Clifford S.C., Bouffet E., Rutka J.T., Korshunov A., Pfister S.,

113. Taylor M.D. Pediatric and adult sonic hedgehod medulloblastomas are clinically and moleculary distinct. Acta Neuropathol, DPI: 10.1007/s00401-011-0846-7, 2011

114. Pnguru P., Karslioglu Y., Pzcan A. and Celik E. Anti-apoptotic and growth-promoting markers in adult medulloblastomas. Clinical Neuropathology 29(6):384-389, 2010

115. Padovani L., Andre N., Carrie C., Muracciole X. Childhood and adult medulloblastoma; What difference? Cancer/Radiotherapie 13:530-535, 2009

116. Park P.C., Taylor M.D., Mainprize T.G., Becker L.E., Ho M., Dura W.T., Squire J., and Rutka J.T. Transcriptional profiling of medulloblastoma in children. J Neurosurg 99:534-541, 2003

117. Pelc K., Vincent S., Ruchoux M-M., Kiss R., Pochet R., Sariban E., Decaestecker C., Heizmann C.W. Calbindin-D28k a marker of reccurence for medulloblastoma. Cancer 95, 2:410-419, 2002

118. Peringa J., Fung K-M., Muragaki Y. and Trojanowski J.O. The cellular and molecular biology of medulloblastoma. Current Opinion in Neurology 8:437-440,1995

119. Pfister S., Hartmann C., and Korshunov A. Histology and molecular pathology of pediatric brain tumors. J Child Neurol, 24(11): 1375-86, 2009

120. Pfister S.M., Korshunov A., Kool M., Hasselblatt M., Eberhart C., Taylor M. Molecular diagnosis of CNS embryonal tumors. Acta Neuropathol, 120(5):553-66, 2010

121. Piccirillo S.G.M., Binda E., Fiocco R., Vescovi A.L., Shah K. Brain cancer stem cells. J Mol Med 87:1087-1095, 2009

122. Pizer B., Clifford S. Medulloblastoma: new insights into biology and treatment. Arch Dis Child Educ Pract Ed 93:137-144, 2008

123. Pizer B.L., Clifford S. C. The potential impact of tumour biology on improved clinical practice for medulloblastoma: progress towards biologically driven clinical trials. British Journal of Neurosurgery 23 (4): 364-375, 2009

124. Poelen J., Bernsen H.J.J.A. and Prick M.J.J. Metastatic medulloblastoma in an adult; treatment with temozolomide. Case report. Acta Neurol. Belg. 107:51-54, 2007

125. Polkinghorn W., Tarbell N. Medulloblastoma: tumorigenesis, current clinical paradigm, and efforts to improve risk stratification. Nat Clin Pract Gncol. 4:295-304, 2007

126. Pomeroy S.L., Cho Y-J. Molecular fingerprints of medulloblastoma and their application to clinical practice. Future Pncol. 7 (3):327-329, 2011

127. Przkora R., Meyer-Puttlitz B., Schmitt O., Berthold F., Nothen M., Krauss J., Tonn J.C., Deimling A. von, Wiestler O.D., Pietsch T. Analysis of the TSC2 gene in human medulloblastoma. Acta Neuropathol 102:380-384, 2001

128. Pui C-H., Gajjar A., Kane J.R., Qaddoumi I.A. and Pappo A.S. Challenging issues in pediatric oncology. Nature Reviews Clinical Oncology; DPI: 10.1038/nrclinonc.2011.95

129. Ramachandran C., Khatib Z., Escalon E., Fonseca H.B., Jhabvala P., Medina L.S., Souza B. D', Ragheb J., Morrison G., Melnick S J. Molecular studies in pediatric medulloblastomas. Brain Tumor Pathol 19:15-22, 2002

130. Ray A., Ho M., Ma J., Parkers R.K., Mainprize T.G., Ueda S., McLaughlin J., Bouffet E., Rutka J.T., and Hawkins C.E. A clinicobiological model predicting survival in medulloblastoma. Clinical Cancer Research 10:7613-7620, 2004

131. Reddy A.T. and Packer RJ. Medulloblastoma. Current opinion in Neurology 12:681-685, 1999

132. Rickert C.H, Paulus W. Comparative genomic hybridization in Central and Peripheral Nervous System tumors of childhood and adolescence. Journal of Neuropathology and Experimental Neurology 63 (5):399-417, 2004

133. Riffaud L, Saikali S, Leray E, Hamlat A, Haegelen C, Vauleon E, and Lesimple T. Survival and prognostic factors in a series of adult with medulloblastomas. J Neurosurg 111:478-487, 2009

134. Rochkind S, Blatt I, Saden M, Goldhammer Y. Extracranial metastases of medulloblastoma in adults: literature review. Journal of Neurology, Neurosurgery, and Psychiatry 54:80-86, 1991

135. Rodriguez F. J, Eberhart C, O'Neill B. P, Slezak J, Burger P.C., Goldthwaite P, Wu W, Giannini C. Histopathologic grading of adult medulloblastomas. Cancer 109(12):2557-2565, 2007

136. Rodriguez F.J, Scheithauer B.W. Anaplastic medulloblastoma with granular cell change. Acta Neuropathol, 113(1): 95-99, DPI: 10.1007/S00401-006-0121-5. 2006

137. Rossi A, Caracciolo V, Russo G, Reiss K, and Giordano A. Medulloblastoma: from molecular pathology to therapy. Clin Cancer Res 14(4):971-976, 2008

138. Rossi M.R., Conroy J., McQuaid D., Nowak N.J., Rutka J.T., and Cowell J.K. Array CGH analysis of pediatric medulloblastomas. Genes, Chromosomes & Cancer 45:290-303,2006

139. Roussel M.F. New concepts in organ site research on medulloblastoma: genetics and genomics. Future Oncol. 6(8):1229-1231, 2010

140. Rubin J.B. and Rowitch D.H. Medulloblastoma: a problem of developmental biology. Cancer Cell 7-8,2002

141. Rudin C.M., Hann C.L., Laterra J., Yauch R.L., Callahan C.A., Fu L., Holcomb T., Stinson J., Gould S.E., Coleman B., LoRuss P.M., Hoff D.D. Von, Sauvage F.J. de, and A. Low J.A. Treatment of medulloblastoma with

142. Hedgehog Pathway Inhibitor GDC-0449. The New England Journal of

143. Medicine 361:1173-1178, 2009

144. Russo C.,, Pellarin M., Tingby O., Bollen A.W., Lamborn K.R., Mohapatra G., Collins V.P., Feuerstein B.G. Comparative genomic hybridization in patients with supratentorial and infratentorial primitive neuroectodermal tumors. Cancer 86:331-339, 1999

145. Rutkowski S., Hoff K. von, Emser A., Zwiener I., Pietsch T., Figarella-Branger D., Giangaspero F., Ellison D.W. Garre M-L., Biassoni V.,

146. Grundy R.G., Finlay J.L., Dhall G., Raquin M-A., and Grill J. Survival and prognostic factors of early chilshood medulloblastoma: an international meta-analysis. J Clin Oncol 28 DPI: 10.1200/JCQ.2010.30.2299, 2010

147. Sarkar C., Deb P., Sharma M.C. Medulloblastomas: new direction in risk stratification. Neurology India 54:16-23, 2006

148. Schubert T.E.P., and Cervos-Navarro J. The histopathologycal and clinical relevance of apoptotic cell death in medulloblastomas. Journal of Neuropathology and Experimental Neurology 57(1):10-15, 1998

149. Scott D.K., Straughton D., Cole M., Bailey S., Ellison D.W., Clifford S.C. Identification and analysis of tumor suppressor loci at chromosome 10q23.3-10q25.3 in medulloblastoma. Cell Cycle 5 (20):2381-2389, 2006

150. Segal R.A., Goumnerova L.C., Kwon Y.K., Stiles C.D., and Pomeroy S.L. Expression of the neurotrophin receptor TrkC is linked to a favorable outcome in medulloblastoma. Medical Sciences 91:12867-12871, 1994

151. Shimato S., Natsume A., Takeuchi H., Fujii M., Ito M., Ito S., Park I.H., Bang J.H., Kim S.U. and Yoshida J. Human neural stem cells target and deliver therapeutic gene to experimental leptomeningeal medulloblastoma. Gene Therapy 14(15):1132-42, 2007

152. Siu I-M., Lai A., Blankenship J.R., Aldosari N., and Riggins G.J. C-MYC promoter activation in medulloblastoma. Cancer Research 63:47734776, 2003

153. Smaele E. De., Marcotullio L. Di., Ferretti E., Screpanti I., Alesse E., Guilino A. Chromosome 17p deletion in human medulloblastoma. A missing checkpoint in the Hedgehog pathway. Cell Cycle 3, 10:111-114, 2004

154. Sommer A., Waha A., Tonn J., Sorensen N., Hurlin P.J., Eisenman R.N., Luscher B. and Pietsch T. Analysis of the max-binbing protein MNT in human medulloblastomas. Int. J. Cancer 82:810-816, 1999

155. Stearns D., Chaudhry A., Abel T.W., Burger P.C., Dang C.V., and Eberhart C.G. C-MYC overexpression causes anaplasia in medulloblastoma. Cancer Res 66, 2:673-681, 2006

156. Sure U., Bertalanffy H., Isenmann St., Brandner S., Berghorn W.J., Seeger W., and Aguzzi A. Secondary manifestation of medulloblastoma: metastases and local reccurences in 66 patients. Acta Neurochirurgica 136:117126, 1995

157. Tabori U., Baskin B., Shago M., Alon N., Taylor M.D., Ray P.N., Bouffet E., Malkin D., and Hawkins C. Universal poor survival in children with medulloblastoma hardoring somatic TP53 mutations. J Clin Oncol 28, DPI: 10.1200/JCQ.2009.23.5952, 2010

158. Taylor M.D., Mainprize T.G., Rutka J.T. Molecular insight into medulloblastoma and central nervous system primitive neuroectodermal tumor biology from hereditary syndromes: a review. Neurosurgery 47(4):888-901, 2000

159. Tibiletti M.G. Interphase FISH as a new tool in tumor pathology. Cytogenetic and Genome Research 118:229-236, 2007

160. Tibshirani R., Hastie T., Narasimhan B., and Chu G. Diagnosis of multiple cancer types by shrunken centroids of gene expression PNAS 99(10): 6567- 6572, 2002

161. Toftgard R. Hedgehod signaling in cancer. CMLS Cellular and Molecular Life Sciences 57:1720-1731, 2000

162. Tong W-M., Ohgaki H., Huang H., Granier C., Kleihues P., and Wang Z-Q. Null mutation of DNA strand break-binding molecule poly (ADP-ribose) polymerase causes medulloblastomas in p53 mice. American Journal of Pathology 162, 1:343-352, 2003

163. Uziel T., Zindy F., Sherr C.J., Roussel M.F. The CDK ingibitor pl8Ink4c is a tumor suppessor in medulloblastoma. Cell Cycle 5 (4):363-365, 2006

164. Wu X, Northcott P.A, Croul S. and Taylor M.D. Mouse models of medulloblastoma. Chinese Journal of Cancer 30(7):442-448, 2011

165. Yasue M, Tomita T, Engelhard H, Gonsales-Crussi F, McLone D.G, and Bauer K.D. Prognostic importance of DNA ploidy in medulloblastoma of childhood. J.Neurosurg 70:385-391, 1989

166. Yin X-L, Pang J C-S. and Ng H-K. Identification of a region of homozygous deletion on 8p22-23.1 in medulloblastoma. Oncogene 21:14611468, 2002

167. Zurawel R.H, Allen C, Chiappa S, Cato W, Biegel J, Cogen P, Sauvage F. de, and Raffel C. Analysis of PTCH/SMO/SHH pathway genes in medulloblastoma. Genes, Chromosomes & Cancer 27:44-51, 2000