Совершенствование лабораторной диагностики урогенитального хламидиоза тема диссертации и автореферата по ВАК РФ 03.02.03, кандидат биологических наук Гречишникова, Ольга Геннадьевна

• Гречишникова, Ольга Геннадьевна
• кандидат биологических наук
• 2013

Оглавление диссертации кандидат биологических наук Гречишникова, Ольга Геннадьевна

Оглавление

Список сокращений

Введение

Глава 1. Обзор литературы

1.1. Лабораторная диагностика урогенитального хламидиоза

1.1.2.Методы обнаружения и дифференциации Chlamydia trachomatis

1.1.3. Особенности верификации Chlamydia trachomatis при урогенитальном

хламидиозе

1.2. Типирование хламидий

1.3.Устойчивость Chlamydia trachomatis к антибиотикам

Глава 2. Материалы и методы исследований

2.1. Материалы исследования

2.1.2. Образцы клинического материала

2.1.3. Штаммы микроорганизмов

2.1.4. Культуры клеток

2.1.5. Используемые питательные среды и буферы

2.2. Лабораторные методы исследования

2.2.1. Цитологический метод

2.2.2. Серологический метод

2.2.3. Культуральный метод

2.2.4. Молекулярно-генетические методы

2.3. Программное обеспечение в молекулярно-генетическом исследовании хламидий

2.4. Статистическая обработка полученных данных

Глава 3. Результаты собственных исследований

3.1. Сравнительная характеристика информативности методов верификации Chlamydia trachomatis в зависимости от характера течения инфекционного про-

3.2. Разработка ПЦР-системы для одновременного выявления и видовой дифференциации ДНК Chlamydophyla pneumoniae и Chlamydia trachomatis, а так же ПЦР-системы для верификации штаммов Chlamydia trachomatis, выделенных от человека, с наличием, либо отсутствием участка нуклеотидной последовательности ДНК криптической плазмиды

3.3.Разработка способа молекулярно-генетического типирования методом ПЦР и анализ наличия генетических детерминант антибиотикорезистентности штаммов Chlamydia trachomatis

3.4. Оптимизация проведения диагностики хламидиоза культуральным методом

3.5. Оптимизация алгоритма лабораторной диагностики хламидиоза

Глава 4. Обсуждение полученных результатов

Выводы

Практические рекомендации

Список литературы

Список сокращений

AT антитело

ВЗОМТ воспалительные заболевания органов малого таза

ДНК дезоксирибонуклеиновая кислота

ИФА иммуноферментный анализ

КМ культуральный метод

ЛПС (LPS) липополисахарид

ЛЦР лигазная цепная реакция

МАНК метод амплификации нуклеиновых кислот

МОМР (major outer membrane protein) основной белок наружной мембраны

НИФ реакция непрямой иммунофлуоресценции

ПДРФ полиморфизм длины рестрикционных фрагментов

ПИФ реакция прямой иммунофлуоресценции

ПЦР полимеразная цепная реакция

РИГА реакция непрямой гемагглютинации

РНК рибонуклеиновая кислота

рРНК рибосомальная РНК

тРНК транспортная РНК

РТ ретикулярное тельце

УГТ урогенитальный тракт

УГХ урогенитальный хламидиоз

ФИТЦ флуоресцинизотиоцианат

ЭТ элементарное тельце

Ig иммуноглобулин

NASBA Nucleic Acid Sequence-Based Amplificaition

Введение диссертации (часть автореферата) на тему «Совершенствование лабораторной диагностики урогенитального хламидиоза»

Введение

На сегодняшний день инфекционные заболевания урогенитального тракта, вызываемые видом Chlamydia trachomatis, являются одной из серьезных проблем здравоохранения, вследствие своего широкого распространения и доказанным риском тяжелых клинических осложнений при отсутствии своевременного лечения [2,5,9,11,56,59,76,77,80,81,83,89,95,97,105,110,111,127,130,133, 150,154,156] .

В диагностике урогенитального хламидиоза значительная роль отводится лабораторным исследованиям, так как от точности поставленного этиологического диагноза зависит успех лечения инфекции [1,3,10,13,14,18,28,45,58,60,94]. В настоящее время существует большое количество лабораторных тестов с различной чувствительностью и специфичностью, что создает предпосылки для разночтений при интерпретации результатов, а, следовательно, и в постановке диагноза [5,45,79].

Выделение хламидий в культуре клеток длительное время являлось «золотым стандартом», с которым сравнивали новые методы диагностики, не связанные с выявлением жизнеспособности микроорганизма. Однако культураль-ное исследование - это сложная и требующая достаточного времени процедура, для которой нет стандартизированных подходов. Информативность метода во многом зависит от условий забора и транспортировки клинического материала, качества клеточных линий и питательных сред, вариантов детекции хламидий, исправности оборудования и других факторов [101]. Поэтому в последние годы для диагностики хламидиоза широко применяются молекулярные методы, в основе которых лежат амплификационные технологии. В отличие от культураль-ного метода исследования, они не требуют специальных условий транспортировки клинического материала для сохранения жизнедеятельности возбудителя и обладают высокой специфичностью, чувствительностью и быстротой выполнения. Однако использование ряда коммерческих тест-систем, основной мишенью которых, при выявлении Ch. trachomatis, является участок нуклеотидной

последовательности видоспецифической криптической плазмиды, выявлена до-

5

статочно серьезная проблема. В случае мутации в ДНК-мишени или появлении бесплазмидных вариантов хламидий, возможны серьезные диагностические ошибки, ведущие к искажению результатов, а, в ряде случаев, к неверной постановке диагноза, как это произошло при появлении «шведского варианта» Ch.trachomatis [86,140,173].

Наряду с урогенитальными хламидиозами, вызываемыми Ch. trachomatis, широко распространены респираторные хламидиозы, к числу которых относят острые респираторные заболевания и пневмонии, возникающие в результате заражения как Ch. trachomatis, так и Chlamydophila pneumoniae [44]. Создание универсальной ПЦР-системы для выявления и видовой дифференциации ДНК хламидий как из урогенитального тракта (Ch.trachomatis), так и верхних дыхательных путей (Сh. trachomatis или Chi.pneumoniae) представляет собой актуальную задачу для практического здравоохранения.

Сообщения последних лет свидетельствуют о возникновении проблемы резистентности хламидий к антибиотикам [11,21,52,67]. Определение чувствительности к лекарственным препаратам культуральным методом сопряжено с трудностями стандартизации процедуры и интерпретации результатов [71]. Поэтому исследования отечественных и зарубежных ученых направлены на разработку методических подходов оценки наличия в ДНК микроорганизмов генетических детерминант, определяющих устойчивость к антибиотикам [96,100,102,129,138,145,167,171].

Среди Сh.trachomatis выделяют 19 генотипов, которые отличаются распространенностью в популяции, клеточным тропизмом, вирулентностью и им-муногенностью [19,31,41,59,70,72,73,82,115,116,128]. Типирование хламидий не имеет значения для постановки клинического диагноза, но является важной частью в эпидемиологическом исследовании, в изучении клинических проявлений, ответа на лечение, а также в создании вакцины [148,149,151,152]. В связи с тем, что эталонный метод генотипирования, основанный на секвенировании гена ompl, кодирующего основной белок наружной мембраны хламидий, сопряжен с рядом трудностей и не доступен для рутинных исследований, актуальным

6

представляется вопрос о нахождении альтернативных путей типирования Ch. trachomatis.

Таким образом, трудности дифференциальной диагностики урогениталь-ного хламидиоза, а также недостаточная информативность традиционно используемых методов подтверждают актуальность проблемы, в связи с чем возрастает роль научных исследований, направленных на совершенствование диагностики заболевания.

Цель работы

Совершенствование диагностики урогенитального хламидиоза на основе сравнительного анализа диагностической значимости прямых методов детекции хламидий, их модификации и предложения алгоритма применения.

Задачи исследования

1. Оценить информативность лабораторных методов диагностики урогенитального хламидиоза в зависимости от характера течения инфекционного процесса.

2. Разработать ПЦР-систему для одновременного выявления и видовой дифференциации ДНК Chi.pneumoniae и Ch.trachomatis, а также ПЦР-систему для верификации штаммов Ch.trachomatis, выделенных от человека, с наличием, либо отсутствием участка нуклеотидной последовательности ДНК криптической плазмиды.

3. Разработать способ генотипирования штаммов Ch.trachomatis методом ПЦР.

4. Установить наличие генетических детерминант антибиотикорезистентно-сти штаммов хламидий методом ПЦР.

5. Подобрать оптимальные условия культивирования Ch.trachomatis и определить набор методических приёмов для детекции хламидий в культуре клеток.

6. Дать оценку диагностической значимости лабораторных методов выявления Ch. trachomatis, с учетом их модификаций, и предложить алгоритм прямой детекции хламидий в клиническом материале.

Научная новизна исследований

Полученные в ходе диссертационной работы данные расширяют представление о методах диагностики урогенитального хламидиоза.

Дана оценка степени информативности различных методов лабораторной диагностики УГХ, в зависимости от характера течения инфекционного процесса. Установлено, что наиболее сильная корреляционная связь прослеживается при клинически выраженной форме инфекции - с положительными результатами ПНР и ИФА, средняя - с положительными результатами культурального и цитологического исследования. При бессимптомном процессе выявляется сильная корреляционная связь - с положительными результатами ИФА, средняя - с ПЦР, слабая корреляция - с сочетанием положительных результатов культурального и цитологического исследований.

Впервые разработанный способ видовой ПЦР-детекции хламидий позволяет одновременно выявлять в биологической пробе ДНК Ch.trachomatis и Chi.pneumoniae, а способ ПЦР-верификации участка нуклеотидной последовательности ДНК криптической плазмиды - фенотипические особенности возбудителя, выделенного от человека.

Впервые показана возможность молекулярно-генетического типирования штаммов Ch. trachomatis, выделенных от человека, методом ПЦР, что обеспечивает повышение информативности и упрощает исследование, по сравнению с существующими способами генотипирования.

Практическая значимость

Результаты проведенных исследований позволяют оптимизировать алгоритм прямой детекции хламидий в биологическом материале и свидетельствуют о необходимости комплексного лабораторного обследования, с использова-

нием модифицированных методов выявления хламидий с целью повышения их диагностической ценности для постановки диагноза.

Применение разработанной ПЦР-системы для видовой дифференциации хламидий, выделенных от человека, позволяет одновременно выявлять в биологической пробе ДНК Chi.pneumoniae и Ch.trachomatis.

Применение разработанной ПЦР-системы для верификации участка нук-леотидной последовательности ДНК криптической плазмиды Ch. trachomatis позволяет свести к минимуму наличие ложноотрицательных результатов при диагностике возбудителя.

Разработанный способ молекулярно-генетического типирования штаммов Ch. trachomatis, выделенных от человека, методом ПЦР позволяет в короткие сроки установить генотип возбудителя. Метод применим в стандартных лабораториях, оснащенных ПЦР-оборудованием, и адаптирован для рутинных исследований при хламидиозе.

Внедрение результатов работы

В результате выполненной работы получены три Патента РФ на изобретение: «Способ диагностики хламидийной инфекции человека или обезьян и набор для его осуществления» № 2385946 (зарегистрирован 10.04.2010); «Способ прогнозирования манифестной или стертой формы хламидийной инфекции человека или обезьян и набор для его осуществления» № 2385945 (зарегистрирован 10.04.2010); «Способ генотипирования Chlamydia trachomatis» № 2443782 (зарегистрирован 27.02.12).

Результаты исследований и разработок внедрены в научно-исследовательскую работу лаборатории клинической микробиологии и биотехнологии ФБУН МНИИЭМ им. Г.Н. Габричевского.

После проведения в 2013году лабораторных испытаний планируется коммерческий выпуск тест-систем на основе разработанных методов для видовой дифференциации хламидий, обнаружения штаммов Ch.trachomatis с наличием, либо отсутствием участка нуклеотидной последовательности ДНК

криптической плазмиды, а так же генетического типирования штаммов с целью дальнейшего использования в практике здравоохранения.

Основные положения, выносимые на защиту

1. Установлена положительная взаимозависимость между обнаружением хламидий или их маркеров в клиническом материале и характером течения инфекционного процесса.

2. Впервые разработанные ПЦР-системы для диагностики хламидийной инфекции у людей позволяют одновременного выявлять в биологической пробе ДНК Chi.pneumoniae и Ch. trachomatis, а также верифицировать штаммы Ch.trachomatis с наличием, либо отсутствием участка нуклеотидной последовательности ДНК криптической плазмиды.

3. Разработанный метод генетического типирования штаммов Ch.trachomatis, основанный на ПЦР-амплификации специфического участка гена ompl, позволяет производить внутривидовую дифференциацию хламидий в стандартных лабораториях, оснащенных ПЦР-оборудованием.

4. Использование комплекса модифицированных методов прямой верификации хламидий повышает информативность лабораторной диагностики хламидийной инфекции.

Заключение диссертации по теме «Микробиология», Гречишникова, Ольга Геннадьевна

Выводы

1.При сравнительной характеристике информативности общепринятых методов верификации Ch.trachomatis применение корреляционного анализа позволило установить тесную взаимосвязь между обнаружением хламидий или их маркеров и характером течения инфекционного процесса.

2.Впервые разработанные ПЦР-системы для диагностики хламидийной инфекции позволяют одновременно выявлять ДНК Ch.trachomatis и Chi.pneumoniae, а также верифицировать штаммы вида Ch.trachomatis с наличием, либо отсутствием участка нуклеотидной последовательности ДНК криптической плазми-ды.

3.Впервые разработанный метод генетического типирования штаммов Ch.trachomatis методом ПЦР позволяет в короткие сроки производить внутривидовую дифференциацию клинических изолятов и музейных штаммов хламидий для определения принадлежности к тому или иному генотипу.

4. Установлено, что с помощью оригинальных праймеров методом ПЦР у штаммов Ch.trachomatis выявляются гены устойчивости к тетрациклинам и макролидам. Дальнейшая работа над расширением возможностей метода может привести к созданию на его основе простого и надежного инструмента для определения антибиотикорезистентности штаммов хламидий.

5. Оптимизация условий культивирования и предложенный комплекс детекции хламидий в культуре клеток сводят к минимуму наличие ложноположительных и ложноотрицательных результатов, тем самым, повышая диагностическую ценность культурального метода исследования на хламидиоз.

6. Проведённая оценка диагностической значимости общепринятых методов лабораторной диагностики хламидиоза с учетом их модификации позволила предложить алгоритм прямой детекции хламидий в клиническом материале.

Практические рекомендации

Для диагностики хламидийной инфекции целесообразно использование нескольких взаимодополняющих тестов с учетом характера течения инфекционного процесса.

Предложенные модифицированные культуральный и молекулярно-генетические методы, включённые в алгоритм прямой детекции хламидий в клиническом материале, позволяют провести выявление и дать объективную оценку генотипических и фенотипических свойств возбудителя.

Список литературы диссертационного исследования кандидат биологических наук Гречишникова, Ольга Геннадьевна, 2013 год

Список литературы

1. Адаскевич В.П. Заболевания, передаваемые половым путем: 2-е изд., пе-рераб. и доп. - Витебск. - 1997. - 31 Ос.

2. Адаскевич В.П. Инфекции, передаваемые половым путем: руководство для врачей. - М.: Мед. кн.; Н.Новгород: НГМА. - 2004. - 414 с.

3. Аковбян В.А. Урогенитальная хламидийная инфекция: 25 лет спустя// Журнал для практических врачей. -2004.- Т. 6, №2.- с.52-57.

4. Алехин Е.К. Как действуют антибиотики. // Соровский образовательный журнал. -2000. -Т.6. -№ 4. -с. 19-23.

5. Аликберов Ш.А. Сравнительное изучение эффективности методов иммунодиагностики урогенитального хламидиоза // Автореф. дис. канд. мед. наук - Саратов - 2007.

6. Антибактериальная терапия. Практическое руководство / Под ред. Л.С.Страчунского, Ю.Б. Белоусова, С.Н. Козлова. - М.: Полимаг. - 2000. - 192 с.

7. Ашмарин И.П., Воробьёв A.A. Статистические методы в микробиологических исследованиях. - Л. - 1962.

8. Байракова А.Л., Алешкин В.А., Воропаева Е.А. и др. Способ диагностики хронического урогенитального хламидиоза. Патент RU 2327995, 2008.06.27.

9. Битти В.Л., Моррисон Р.П., Бирн Д.И. Персистенция хламидий: от клеточных культур до патогенеза хламидийной инфекции // ЗППП. - 1996. -№ 6.-С. 3-18.

Ю.Богуш П.Г., Скрипкин Ю.К. Диагностика микоуреаплазмозов и хламидийной инфекции в условиях Московского кожновенерологического клинического диспансера // Клиническая дерматология и венерология. -2005. -№ З.-С. 1-5.

П.Васильев М.М. Хламидийная инфекция. Проблема антибиотикорези-стентности // Вестник дерматологии и венерологии. - 2003. - №3. - С. 1822.

12.Воробьев A.A., Кривошеин Ю.С. Основы микробиологии, вирусологии и иммунологии. - М:Академия- 2002. - 224с.

13.Гасанова Т.А. Хламидийная инфекция и репродуктивная функция // Вестник дерматологии и венерологии. - 2001. - №1. - С. 11-16.

14-Герасимова Н.М. Новая классификация хламидий и ее значение для практики//ИППП. - 2001. - № 1.-С. 14-18.

15.Глазкова JI.K., Акилов O.E. Практические аспекты персистирующей хла-мидийной инфекции // ИППП. - 1999. - № 4. - С. 29 - 34.

16. Гланц С. Медико-биологическая статистика. Пер. с анг.-М., Практика.-1998.-459с.

17.Глик Б., Пастернак Д. Молекулярная биотехнология. Принципы и применение. Пер. с англ. - М.: Мир.- 2002.

18. Гомберг М.А., Поздняков О.Л., Соловьев A.M. Урогенитальная хламидийная инфекция: лечить или не лечить? // Consilium medicum.-2006.-T. 8, №4.-С. 21-25.

19. Гранитов В.М. Хламидиозы.-М.: Медицинская книга, Н.Новгород: Издательство НГМА.-2000. - 192с.

20. Гринхальд Т. Основы доказательной медицины: пер. с англ. / под ред. И.Н. Денисова, К.И. Сайткулова. - 3-е изд. - М.: ГЭОТАР-Медиа, 2008,-228с.

21. Гучев И.А. Хламидийные инфекции. Возможности антибактериальной терапии. // Инфекции и антимикробная терапия. - 2005. - Т.11. - № 3. -С.1-10.

22. Диагностика хламидийной, микоплазменных и герпесвирусных инфекций методом полимеразной цепной реакции //Методические рекомендации Московского НИИ педиатрии и детской хирургии МЗМП РФ и Фе-

дерального детского научно-практического центра противорадиационной защиты.-М.- 1995.

23. Дмитриев Г.А. Лабораторная диагностика бактериальных урогениталь-ных инфекций. - М.: Медицинская книга, Н.Новгород: Издательство НГМА.-2003. - 336с.

24. Дмитриев Г.А., Киселев В.И., Орлова O.E. и др. Лабораторная диагностика урогенитального хламидиоза. Пособие для врачей. - М. - 1999. -19с.

25. Дмитриев Г.А., Глазко И.И. Диагностика инфекций, передаваемых половым путем.- М.: «Издательство БИНОМ».- 2007. - 320с.

26. Европейские стандарты диагностики и лечения заболеваний, передаваемых половым путем. Под ред. К.Рэдклиф. - М.:Медицинская литература. -2006.-272 е.: ил.

27. Зимин А.Л. Разработка метода специфической детекции и видовой дифференциации возбудителей хламидиозов на основе структурного полиморфизма гена отр2. - Автореф. дис. канд. биол. наук. - М. -2003. - 28с.

28. Зоерман В.М. Усовершенствование лабораторной диагностики урогени-тальной хламидийной инфекции. - Автореф. дис. канд. мед. наук. - Пермь. - 2007. - 25 с.

29. Интерфероновый статус, препараты интерферона в лечении и профилактике инфекционных заболеваний и реабилитация больных / Под ред. С. С. Афанасьева, Г. Г. Онищенко, В. А. Алешкина, Л. В. Феклисовой, М. С. Афанасьева, А. В. Алешкина. - М. : Триада-Х.-2005. - 767 с.

30. Коваленко Е.В., Новицкая С.А., Назарова И.Н. Особенности иммунного статуса больных хламидиозом // II Всеросс. Науч.-практ. конф. «Полиме-разная цепная реакция в диагностике и контроле лечения инфекционных заболеваний» 20-22 января 1998 г., Москва,- М.-1998.- С. 20-21.

31. Козлова В.И., Пухнер А.Ф. Вирусные, хламидийные и микоплазменные заболевания гениталий // Руководство для врачей, издание 6-е, обновленное и дополненное.-М.:Триада-Х.-2003. - 439с.

81

32. Колкова H.H., Мартынова В.Р. К вопросам диагностики хламидийных инфекций //Клиническая лабораторная диагностика.-1998.-№ 2.-С. 20-21.

33. Костюк С.А. Лабораторно-диагностические показатели оценки вида возбудителей и устойчивости к антибиотикам при урогенитальных инфекциях методом полимеразной цепной реакции: Автореф. дис. канд. мед. наук: 14.00.46 - БелМАПО. - Минск, 2004. - 24 с.

34. Коэн K.P. Патогенез воспалительных заболеваний органов малого таза хламидийной этиологии. // ИППП. - 1999. - №6. - С.4-7.

35. Ксенз И.Н., Почерняев К.Ф., Курман А.Ф. Способ определения ДНК возбудителей хламидийных инфекций в мультиплексной полимеразной цепной реакции. Патент UA 11834 U, 16.01.2006.

36. Куляш Г.Ю. Персистирующая урогенитальная инфекция: возможности и нерешенные вопросы лабораторной и клинической диагностики //ИППП,-2003.-№ З.-С. 3-8.

37. Кудрявцева Л.В., Мисюрина О.Ю., Генерозов Э.В. и др. Клиника, диагностика и лечение хламидийной инфекции (пособие для врачей).-М,-2001.- 62с.

38. Лобзин Ю.В., Лященко Ю.И., Позняк А.Л.. Хламидийные инфекции. Руководство для врачей,- СПб.: ООО «Издательство Фолиант».-2003. -399с.

39. Мавров И.И. Состояние проблемы заболеваний, передающихся половым путем. // Журн. дерматологии и венерологии. - 2002. - № 3, Т. 17. - С. 310.

40. Мавров Г.И., Чинов Г.П. Лечение хламидиоза (подходы к антибактериальной терапии) // Вересень. - 2005. - №3. - С. 82-91.

41.Мартынова В.Р., Колкова Н.И., Шаткин A.A. Хламидии и хламидиозы: клиника, биология и диагностика. // Росс. мед. вестник. - 1997. - № 3. - С. 49-55.

42. Мазепа В. Н., Шипулин Г. А., Бруснигина Н. Ф., Черневская О. М. Способ выявления наиболее значимых возбудителей негонококковых уроге-

82

нитальных инфекций (Chlamydia trachomatis, Mycoplasma hominis, Ureaplasma urealyticum, Cytomegalovirus, Herpes symplex Vi) у детей с использованием метода ПЦР. Патент RU 2271003 С2, 27.02.2006.

43.Маликова М.В. Проблема хламидиозов в современных условиях // Инфекционные болезни. Тернополь. - 1998. - № 2. - С. 35-39.

44. Малкова Е.М., Гавалов С.М., Гришаева О.Н. Хламидийная инфекция у новорожденных детей. - Кольцово. - 2003. - 48с.

45.Марданлы С.Г., Куляш Г.Ю. Проблемы достоверности и объективной оценки результатов лабораторной диагностики гонореи, трихомониаза и урогенитального хламидиоза. Учебно-методическое пособие. // ЗАО «Эко лаб», ГУЗ «Саратов. Обл. кожно- венеролог, диспансер». - Электрогорск.-2007.-71 с.

46. Метельская В.А., Алешкин В.А., Зверев В.В. и др. Современные методы лабораторной диагностики хламидиозов //Журн. микробиол.-2008.-№ 4.-С. 111-117.

47. Метод выделения хламидий в культуре клеток McCoy. Определение чувствительности хламидий к противомикробным препаратам: метод, рекомендации / МЗ РБ, разраб. ГУНИИЭМ.; Л.П. Титов и др. - Минск, 1998. -15 с.

48. Могилевец Т.Л. Клинико-иммунологическая характеристика урогени-тальной хламидийной инфекции у женщин. - Автореф. дис. канд. мед. наук. - Санкт-Петербург. - 2002. - 23 с.

49. Молочков, В.А. Урогенитальный хламидиоз.-М.: Бином.- 2006.-208с.

50. Мортон P.C. Урогенитальная инфекция: переоценка данных и гипотезы //ИППП. - 2000. - № 2. - С. 4-15.

51. Мусина Е. А., Шипицына Е. В., Савичева А. М., и др. Значение хламидийной инфекции в развитии заболеваний репродуктивной системы // Журнал акушерства и женских болезней. - 2006. - № 5. С. 32-33.

52. Николаева, Н.В. Резистентность к терапии урогенитального хламидиоза:

механизмы устойчивости к антибактериальным препаратам: Автореф.

83

дис. канд. мед. наук: 14.00.11; Центр, научн.-исслед. кож.-вен. институт. -М, 2004.-22 с.

53. Нурушева С.М. Урогенитальная хламидийная инфекция у женщин (кли-нико-экспериментальные лабораторные исследования).- Автореф. дис. докт. мед. наук.-М. - 1996. - 39с.

54. Петри А., Сэбин К. Наглядная медицинская статистика; пер. с англ. под ред. В.П.Леонова. - 2-е изд., перераб. и доп. - М.: ГЭОТАР - Медиа, 2009. - 168с.: ил.

55. Павлович С.А. Микробиология с иммунологией и вирусологией. Учебн. пособие для Мед. ВУЗов. Изд. 2.-Минск: Высш. Школа.-2008. - 799с.

56. Полещук H.H., Капитулец H.H., Рубаник Л.В. и др. Особенности обнаружения и механизмы персистенции возбудителя Chlamydia trachomatis. // Медицинские новости. - 2003. - №3. - С.65-71.

57. Плютто A.M. Выявление хламидийной инфекции по косвенным цитологическим признакам // Клиническая лабораторная диагностика. - 1998.-№ 8.-С. 19-21.

58. Рищук С.В., Костюченко Д.Ф. Способ диагностики манифестной и латентной форм хронического урогенитального хламидиоза у мужчин. Патент RU 2222018 С1, 06.06.2002.

59. Рубаник Л.В. Лабораторная диагностика хламидийно-герпетической и трихомонадной урогенитальной инфекции у людей с материалами экспериментальных исследований по разработке лечебной моновакцины на основе авторского штамма Chlamydia trachomatis. // Автореф. дис. канд. биол. наук. - Минск. - 2007. - 24 с.

60.Савичева A.M. Этиологическая диагностика и терапия репродуктивно значимых инфекций //Трудный пациент - № 1- 2007- С. 21-28.

61. Савичева A.M., Башмакова М.А. Урогенитальный хламидиоз у женщин и его последствия. Под ред. Э.К.Айламазяна - Н.Новгород.: Издательство НГМА, 1998.- 182с.: ил.

62. Савичева A.M., Башмакова M.А., Кошелева H.Г. и др. Хламидийная инфекция в акушерстве и гинекологи (Диагностика, клиника, лечение): Методическое пособие. - СПб.: ООО "Издательство H-JI", - 2002. - 48с.

63. Савичева A.M., Соколовский Е.В., Домейка М. Краткое руководство по микроскопической диагностике инфекций, передаваемых половым путем." СПб.: Фолиант.- 2004. - 128с.

64. Семенов В.М. Клинико-эпидемиологическая характеристика хламидио-зов // Рос. мед. журн. - 2000. - № 1. - С. 48-52.

65. Серов В.Н., Краснопольский В.И., Делекторский В.В.,Афанасьев С.С., Денисов Д.А. и другие. Хламидиоз. Клиника, диагностика, лечение (методические рекомендации) МЗРФ, РААиГ, МОнИИАиГ, ЦКВНИИ.-М,-1999.-22 с.

66. Сидоренко М.Г. Статистика: учебное пособие. - М.: Форум. - 2007. -160с.

67. Скрипкина Ю.К., Кубанова A.A., Аковбян В.А., и др. Проблема диагностики и лечения урогенитального хламидиоза в России // Антибиотики и химиотерапия. - 1996. - Т. 41, № 2. - С. 5-8.

68. Хрянин A.A., Решетников О.В., Лебедев C.B. и др. Распространенность хламидийной инфекции и особенности сексуального поведения студентов.-1-ый Сибирский конгресс акушеров-гинекологов и дерматовенерологов. Материалы конгресса.-Новосибирск.-2006.-С. 86.

69.Чеботарев В.В. Урогенитальная хламидийная инфекция: современные взгляды на диагностику, патогенез, клинику и лечение (часть 1) // М. -Врачебное сословие. - №3 - 2006 - С. 24-28.

70. Шаткин A.A., Мавров И.И. Урогенитальные хламидиозы / Киев: Здо-ров'е, 1983.-200 с.

71. Шипицына Е.В., Савичева A.M., Хуснутдинова Т.А. и др. Устойчивость Chlamydia trachomatis к антибиотикам in vitro: методологические аспекты и клиническое значение. // Клин микробиол антимикроб химиотер. -2004. -Т.6.-№1. -С.54-64.

72. Эйдельштейн И. А. Фундаментальные изменения в классификации хла-мидии и родственных им микроорганизмов, порядка Chlamydiales // Клин, микробиол. и антимикроб, химиотер. - 1999. - Т. 1, № 1. - С. 5 - 11.

73. Эйдельштейн И.А., Эйдельштейн М.В., Нарезкина А.Д. Способ дифференциальной диагностики представителей семейства Chlamydiaceae. Патент RU 2245369 Cl, 05.05.2003.

74. Юнкеров В.И., Григорьев С.Г. Математико-статистическая обработка данных медицинских исследований, 2-е изд., доп.-СПб.: ВМедА.-2005. -292с.

75. Якубович А.И., Корепанов А.Р. Урогенитальный хламидиоз. - Иркутск: Полиграфический Центр «РИЭЛ», 2007. - 108 с.

76. Andersen P. Pathogenesis of lower respiratori tract infections due Chlamydia, Mycoplasma, Legionella and viruses // Thorax. - 1998. - Vol. 53, N 4. - P. 302-307. .

77.Anttila T. Chlamydial antibodies and risk of prostate cancer. // Cancer Epidemiology, biomarkers and prevention. - 2005. - Vol. 14, № 2. - P. 385-389.

78. Anttila T., Saikku P., Koskela P. et al. Serotypes of Chlamydia trachomatis and risk for development of cervical squamous cell carcinoma //JAMA.-2001 .Vol. 285, N. l.-P. 47-51.

79. Bachmaier K., Penninger J.M. Chlamydia and antigenic mimicry. // Microbiol. Immunol.-2005.-Vol. 296.-P. 153-163.

80. Balin B.J., Gérard H.C., Arking E. J. et al. Identification and localization of Chlamydia pneumoniae in the Alzheimer's brain // Medical Microbiology and Immunology.- 1998.-Vol. 187, N. l.-P. 23-42.

81. Bandea C.I., Kubota K., Brown T.M., et al. Typing of Chlamydia trachomatis strains from urine samples by amplification and sequencing the major outer membrane protein gene (ompl) // Sexually Transmitted Infections. - 2001. -Vol. 77, N. 6.-P. 419^422.

82. Batteiger B.E. Species-, serogroup- and serovar-specific epitopes are juxtaposed in variable sequence region 4 of the major outer membrane proteins of

86

some chlamydia trachomatis serovars. // Infect. Immun. - 1996. - Vol. 64, № 7.-P. 2839 -2841.

83. Binet R, Maurelli T.A. Frequency of spontaneous mutations that confer antibiotic resistance in Chlamydia spp.// Antimicrobial agents and chemotherapy. -2005. - Vol. 49, N. 7. - P. 2865-2873.

84. Birkelund S. and Stephens R.S. Construction of physical and genetic maps of Chlamydia trachomatis serovar L2 by pulsed-field gel electrophoresis // Journal of bacteriology. - 1992. - Vol. 174, N. 9. - P. 2742-2747.

85. Birtles R. J., Rowbotham T. J., Storey C., et al. Chlamydia-like obligate parasite of free-living amoebae // Lancet. - 1997. - Vol. 349, Issue 9056. - P. 891964.

86. Björn Herrmann, Anna Torner, Nicola Low, Markus Klint, Anders Nilsson, Inga Velicko, Thomas Söderblom, Anders Blaxhult Emerg. Emergence and Spread of Chlamydia trachomatis Variant, Sweden // Infect Dis. 2008 September; 14(9): 1462-1465

87. Bodetti T.J., and Timms P. Detection of Chlamydia pneumoniae DNA and antigen in the circulating mononuclear cell fractions of Humans and Koalas // Infect. Immun.- 2000. - Vol. 68, N. 5. - P. 2744-2747.

88. Brenciani A., Bacciaglia A., Vecchi M., et al. Genetic Elements Carrying erm{B) in Streptococcus pyogenes and Association with tet(M) Tetracycline Resistance Gene // Antimicrobial Agents and Chemotherapy.-2007. - Vol. 51, N. 4.-P. 1209 - 1216.

89. Burton M.J., Holland M.J., Jeffries D. et al. Conjunctival chlamydial 16S ribo-somal RNA expression in trachoma: is chlamydial metabolic activity required for disease to develop? // Clinical Infectious Diseases. - 2006. - Vol. 42, N. 4. -P. 463-470.

90. Bush R.M. and Everett K.D.E. Molecular evolution of the Chlamydiaceae // Int. J. of Systematic and Evolutionary Microbiology. - 2001,- Vol. 51. - P. 203-220.

91. Carlson J.H., Whitmire W.M., Crane D.D., Wicke L., Virtaneva K. The Chlamydia trachomatis Plasmid Is a Transcriptional Regulator of Chromosomal Genes and a Virulence Factor // Infect. Immun.-2008.-Vol. 76, N. 6.-P. 22732283.

92. Carlson J.H., Porcella S.F., McClarty G., and Caldwell H.D. Comparative genomic analysis of Chlamydia trachomatis oculotropic and genitotropic strains //Infect. Immun. -2005,- Vol. 73, N. 10. - P. 6407-6418.

93. Chernesky M.A., Jang D., Lee H.H. et al. Diagnosis of Chlamydia trachomatis infections in men and women by testing first-void urine by ligase chain reaction // J. Clin. Microbiol. -1994. - Vol. 32, N. 11. - P. 2682-2685.

94. Clarebout G. Real-time multiplex detection of three bacterial species responsible for sexually-transmitted diseases. Patent WO 2007/137650 Al, 06.12.2007.

95. Crook T., Bannister B. Acute transverse myelitis associated with Chlamydia pneumoniae infection // J. Infection. - 1992. - Vol. 2. - P. 63-65.

96. Comanducci M., Ricci S., Cevenini R., Ratti G. Diversity of the Chlamydia trachomatis common plasmid in biovars with different pathogenicity // Plas-mid.-1990.- N 23.-P. 149-154.

97. Corsaro D., Greub G. Pathogenic Potential of Novel Chlamydiae and Diagnostic Approaches to Infections Due to These Obligate Intracellular Bacteria //C. Microbiology REVIEWS. - 2006. - Vol. 19, N. 2. - P. 283-297.

98. Cross N.A., Kellock D.J., Kinghorn G.R. et al. Antimicrobial susceptibility testing of Chlamydia trachomatis using a reverse transcriptase PCR-based method. // Antimicrobial Agents and Chemotherapy. - 1999. - Vol. 43, N. 9. -P. 2311-2313.

99. Cunningham M. Compositions, methods and kits for determining the presence of Chlamydophila pneumoniae in a test sample. Patent WO 2006/133385 A2, 14.12.2006.

100. Dabiri H., Rezadehbashi M., Badami N., et al. Detection of Chlamydia pneumoniae in Atherosclerotic Plaques of Patients in Tehran, Iran // Jpn. J. Infect. Dis. - 2009. - Vol. 62, N. 3. - P. 195-197.

88

101.Domeika M. Chlamydia trachomatis infections in eastern Europe: legal aspects, epidemiology, diagnosis and treatment // Sex. Transm. Inf. - 2002. -Vol. 78.-P. 115-119.

102. Dugan J., Rockey D.D., Jones L., Andersen A.A. Tetracycline Resistance in Chlamydia suis Mediated by Genomic Islands Inserted into the Chlamydial wv-Like Gene // Antimicrobial Agents and Chemotherapy. - 2004. - Vol. 48, N. 10.-P. 3989 - 3995.

103. Eckert L.O., Suchland R.J., Hawes S.E. Quantitative Chlamydia trachomatis cultures: correlation of Chlamydial inclusion-forming units with serovar, age, sex, and race. // J. of Infect. Dis. - 2000. - Vol. 182 № 2. - P. 540-544.

104. Edet E.E. The prevalence of Chlamydial trachomatis infection among gynaecological patients // Br. J. Clin. Pract. - 1993. - Vol. 47, N 1. - P. 21-22.

105. Ellis R.W. Infection and coronary heart disease // J. Med. Microbiol. -1997.-Vol. 46.-P. 535-539.

106. Elnifro E.M., Cooper R. J., Klapper P.E., et al. Multiplex polymerase chain reaction for diagnosis of Viral and Chlamydial Keratoconjunctivitis // IOVS. -2000. - Vol. 41, N. 7.-P. 1818-1822.

107. Essig A., Rudolphi A., Heinemann M., et al. A Model of Genital Chlamydia trachomatis Infection Using Human Xenografts in Severe Combined Immuno-deficienc Mice // Infect. Immun. - 1996. - Vol. 64, N. 6. - P. 2300-2307.

108. Everett K. D., Bush R. M., Andersen A. A. Emended description of the order Chlamydiales, proposal of Parachlamydiaceae fam. nov. and Simkaniaceae fam. nov., each containing one monotypic genus, revised taxonomy of the family Chlamydiaceae, including a new genus and five new species, and standards for the identification of organisms // Int. J. Syst. Bacteriol. - 1999. - Vol. 49, P 2.-P. 415-440.

109. Everett K. D., Bush R. M., Andersen A. A. Phylogenetic analysis of the cod-iny gene support the new Chlamydia taxonomy // 4 - 5th European Chlamydia Congress "Chlamydia 2000". Abstract book. - Helsinki. - 2000. - P.5.

110. Falck G., Heyman L., Gnarpe J. et al. Chlamydia pneumonia (TWAR): a common agent in acute bronchitis // Scand. J. Infect. Dis. - 1994. - Vol. 26, N. 2.-P. 179-187.

111. Falck G., Engstrand I., Gnarpe J., Gnarpe H. Association of Chlamydia ^ pneumoniae with otitis media in children // Scand. J. Infect. Dis. - 1998. - Vol.

30, N. 4.-P. 377-380.

112. Farencena A., Comanducci M. Characterization of A New Isolate of Chlamydia trachomatis Which Lacks the Common Plasmid and Has Properties of Biovar trachoma // Infect. Immun.-1997,-Vol. 65, N. 7.-P. 2965-2969.

113. Fryer R.H., Schwobe E.P., Woods M.L., Rodgers G.M. Chlamydia species infect human vascular endothelial cells and induce procoagulant activity // J. Investig. Med. - 1997.-Vol. 45, N. 4.-P. 168-174.

114. Gao X, Chen X.-S., Yin Y.-P. et al. Distribution Study of Chlamydia trachomatis serovars among high-risk women in China performed using PCR-restriction fragment length polymorphism genotyping. // J. Clin. Microb. -2007. - Vol. 45, N. 4. - P. 1185-1189.

115. Gaydos C. A., Palmer L., Quinn T. C., et al. Phylogenetic relationship of Chlamydia pneumoniae to Chlamydia psittaci and Chlamydia trachomatis as determined by analysis of 16S ribosomal DNA sequences // Int. J. Syst. Bacte-riol. - 1993. - Vol. 43, N. 3. - P. 610 - 612.

116. Geisler W., Suchland R.J., Whittington W. et al. The relationship of serovar to clinical manifestations of urogenital Chlamydia trachomatis infection. // Sex. Trans. Dis. - 2003. - Vol.30, № 2. - P. 160-165.

117. Ginevra C., Barranger C., Ros A., et al. Development and evaluation of Chlamylege, a new commercial test allowing simultaneous detection and identification of Legionella, Chlamydophila pneumoniae, and Mycoplasma pneumoniae in clinical respiratory specimens by multiplex PCR // J. Clin. Microb. -2005. - Vol. 43, N. 7. - P. 3247-3254.

118. Grayston J. T., Kuo C.-C., Campbell L. A., and Wang S. Chlamydia pneumoniae sp. nov. for Chlamydia sp. strain TWAR // Int. J. Syst. Bacteriol. -1989. - Vol. 39, N. 2. - P. 88 - 90.

119. Gullsby K., Storm M., and Bondeson K. Simultaneous Detection of Chla-mydophila pneumoniae and Mycoplasma pneumoniae by Use of Molecular Beacons in a Duplex Real-Time PCR // J. Clin. Microb. - 2008. - Vol. 46, N. 2.-P. 727-731.

120.Hackstadt T., Scidmore-Carlson M.A., Shaw E.I., and Fischer E.R. The Chlamydia trachomatis IncA protein is required for homotypic vesicle fusion // Cellular Microbiology. - 1999. - Vol. 1, N. 2. - P. 119-130.

121. Hahn D.L., Dodge R.W. and Golubjatnikov R. Association of Chlamydia pneumoniae (strain TWAR) infection with wheezing, asthmatic bronchitis, and adult-onset asthma // JAMA. - 1991. - Vol. 266, N. 2. - P.225-230.

122. Hartley J. C., Kaye S., Stevenson S., Bennett J. et al. PCR Detection and Molecular Identification of Chlamydiaceae Species // Clin. Microbiol. - 2001. -Vol. 39, N9. - P. 3072-3079.

123. Heick E. Skriver. Chlamydia pneumoniae - associated ADEM (acute disseminated encephalomyelitis) // European Journal of Neurology. - 2000. - Vol. 7. -P. 435-438.

124. Hogan R. J., Mathews S. A., Mukhopadhyay S. Chlamydial persistence: beyond the Biphasic Paradigm // Infect. Immun. - 2004. - Vol. 72, N. 4. - P. 1843-1855.

125. Hsu M.-C., Tsai P.-Y., Chen K.-T. et al. Genotyping Chlamydia trachomatis from clinical specimens in Taiwan. // J. Med. Microb. - 2006.- №55,- P. 301308.

126. Hyldig-Nielsen J.J., Godskesen M.A. PNA probes for detection of Neisseria gonorrhoeae and Chlamydia trachomatis. Patent US 6,169,169 Bl, 02.01.2001.

127. Inman R.D., Chiu B. Synoviocyte-packaged chlamydia trachomatis induces a chronic aseptic arthritis // J. Clin. Invest. - 1998. - Vol. 102, N. 10. - P. 17761782.

128. Javal H., Stephen H., Alexander S., et al. Development of Real-Time PCR assays for genotyping of Chlamydia trachomatis. II J. Clin. Microb. - 2007. -Vol. 45, N. 8.-P. 2649-2653.

129. Jones R.B., Van der Pol, Martin D.H., et al. Partial characterization of Chlamydia trachomatis isolates resistant to multiple antibiotics. // J. Infect. Dis. -1990.-Vol. 162.-P. 1309-1315.

130.Kanauchi M., Kawano T., Dohi K. Association of Chlamydia pneumoniae infection with diabetic nephropathy // Diabetes. Res. Clin. Pract. - 2000. - Vol. 47, N. 1. - P. 45-8.

131 .Karunakaran K.P., Noguchi Y., Read T.D., et al. Molecular analysis of the multiple GroEL proteins of Chlamydiae // Journal of Bacteriology. - 2003. -Vol. 185, N. 6. - P. 1958-1966.

132.Klint M., Fuxelius H.-H., Goldkuhl R.R., et al. High-Resolution Genotyping of Chlamydia trachomatis Strains by Multilocus Sequence Analysis // J. Clin. Microb. - 2007. - Vol. 45, N. 5. - P. 1410-1414.

133.Koskela P., Anttila T., Bjorge T. et al. Chlamydia trachomatis infection as a risk factor for invasive cervical cancer //Int. J. Cancer.-2000.-Vol. 85, N. l.-P. 35-39.

134.Kuo C.-C., Jackson L.A., Campbell L.A., and Grayston J.T. Chlamydia pneumoniae (TWAR) // Clinical Microbiology Reviews. - 1995. - Vol. 8, N. 4. - P. 451-461.

135.Lampe M.F. Nucleotide sequence of the variable domains within the major outer membrane protein gene from serovariants of Chlamydia trachomatis.// Infect. Immun.- 1993,-Vol. 61.- P. 213-219.

136.Lampe M.F., Wilson C.B., Bevan M.J., Stambach M.N. Gamma interferon production by cytotoxic T lymphocytes is required for resolution of Chlamyd-

ia trachomatis infection // Infect. Immun. - 1998. -Vol. 66, N. 11.- P. 54575461.

137.Lee H.H. et al. Diagnosis of Chlamydia trachomatis genitourinary infection in women by ligase chain reaction assay of urine // Lancet. -1995. -Vol. 345. -P. 213-216.

138.Lefevre J.C., Lepargneur J.P. Comparative in vitro susceptibility of a tetracy-cline-resistant Chlamydia trachomatis strain isolated in Toulouse (France).// Sexually Transmitted Diseases - 1998. - Vol. 25. - P. 350-352.

139.Levett P.N., Brandt K., Olenius K., et al. Evaluation of Three Automated Nucleic Acid Amplification Systems for Detection of Chlamydia trachomatis and Neisseria gonorrhoeae in First-Void Urine Specimens // J. Clin. Microb.-2008. - Vol. 46, N. 6. - P. 2109-2111.

140.Lysen M., Osterlund A., Rubin C.-J., et al. Characterization of ompA genotypes by sequence analysis of DNA from all detected cases of Chlamydia trachomatis infections during 1 year of contact tracing in a Swedish County // J. Clin. Microb.- 2004. - Vol. 42, N. 4. - P. 1641-1647.

141.Mahony J.B., Luinstra K.E., Sellors J.W., Chernesky M.A. Comparison of Plasmid - and Chromosome-Based Polymerase Chain Reaction Assays for Detecting Chlamydia trachomatis Nucleic Acids // J. Clin. Microb.-1993.-Vol. 31, N. 7.-P. 1753-1758.

142.Mahony J. B., Kathy E. Luinstra, John W. Sellors, and Max A. Chernesky, Comparison of Plasmid - and Chromosome-Based Polymerase Chain Reaction Assays for Detecting Chlamydia trachomatis Nucleic Acids// J. Clin. Microb. -1993, Vol. 31, N. 7, p. 1753-1758.

143.Mahony J.B., Luinstra K.E., Sellors J.W. et al. Confirmatory polymerase chain reaction testing for Chlamydia trachomatis in first-void urine from asymptomatic and symptomatic men // J. Clin. Microbiol. - 1992. - Vol. 30, N. 9. - P. 2241-2245.

144.Martin D.H., Koutsky L., Eschenbach D.A., et al. Prematurity and perinatal mortality in pregnancies complicated by maternal Chlamydia trachomatis infections//JAMA-1982.-Vol. 247, N. 11.-P. 1585-1588.

145. Misyurina O.Y., Chipitsyna E.V., Finashutina Y.P., et al. Mutations in a 23S rRNA gene of Chlamydia trachomatis associated with resistance to macro-lides. // Antimicrobial Agents and Chemotherapy. - 2004. - Vol. 48, N. 4. - P. 1347-1349.

146.Moazed T.C., Grayston J.T., and Campbell L.A. A rabbit model of Chlamyd-ophila pneumonia infection, abstr. B-214, p. 66. In Abstracts of the 94th General Meeting of the American Society for Microbiology 1994. American Society for Microbiology, Washington, D.C.

147.Molano M., Chris J. L. M., Meijer S.A. et al. Combination of PCR targeting the VD2 of ompl and reverse line blot analysis for typing of urogenital Chlamydia trachomatis serovars in cervical scrape specimens //J. Clin. Microbiol.-2004.-Vol. 42, N. 7.-P. 2935-2939.

148.Morre S.A., Ossewaarde J.M., Lan J. et al. Serotyping and genotyping of genital Chlamydia trachomatis isolates reveal variants of serovars Ba, G, and J as confirmed by ompl nucleotide sequence analysis //J. Clin. Microbiol.-1998,-Vol. 36, N. 2.-P. 345-351.

149.Morre S.A., Rozendaal L., van Valkengoed I.G. et al. Urogenital Chlamydia trachomatis serovars in men and women with a symptomatic or asymptomatic infection: an association with clinical manifestations? //J. Clin. Microbiol.-2000.-Vol. 38, N. 6.-P. 2292-2296.

150.Muhlestein J.B. Bacterial infections and atherosclerosis // J. Investig. Med. -1998. - Vol. 46, N. 8. - P. 396-402.

151.Newhall W.J., Terho P., Wilde III C.E., et al. Serovar determination of Chlamydia trachomatis isolates by using type-specific monoclonal antibodies. // J. Clin. Microb. - 1986. - Vol. 23, N. 2. - P. 333-338.

152. Ngandjio A., Clerc M., Fonkoua M.C. et al. Screening of volunteer students in Yaounde (Cameroon, Central Africa) for Chlamydia trachomatis infection

and genotyping of isolated C. trachomatis strains //J. Clin. Microbiol.-2003.-Vol. 41, N. 9.-P. 4404-4407.

153. Ngandjio A., Clerc M., Fonkoua M.C. et al. Restriction endonuclease patterns of the ompl gene of reference Chlamydia trachomatis strains and characterization of isolates from Cameroonian students //J. Med. Microbiol.-2004.-Vol. 53, N. l.-P. 47-50.

154. Norton R., Schepetiuk S., Kok T. Chlamydia pneumoniae with endocarditis // Lancet. - 1995.-Vol. 345, N 8961. - P. 1376-1377.

155. Ossewaarde J. M., Rieffe M., Rozenberg - Arska M. et al. Development and clinical evaluation of a polymerase chain reaction test for detection of Chlamydia trachomatis // J. Clin. Microb. - 1992. - Vol. 30, N. 8. - P. 2122-2128.

156. Paavonen, J. Chlamydia trachomatis and cancer. // Sex. Transm. Inf. - 2001. -Vol. 77 - P. 154-156.

157.Pal S., Hui W., Peterson E.M., de la Maza L.M. Factors influencing the induction of infertility in a mouse model of Chlamydia trachomatis ascending genital tract infection // J. Med. Microbiol. - 1998. - Vol. 47, N. 7. - P. 599-605.

158. Pannekoek Y., Spaargaren J., Ankie A.J. et al. Interrelationship between Polymorphisms of incA, Fusogenic Properties of Chlamydia trachomatis Strains, and Clinical Manifestations in Patients in The Netherlands // J. Clin. Microb.-2005.-Vol. 43, № 5.-P. 2441-2443.

159. Pannekoek Y., Arie van der Endi, Eijk P.P., et al. Normal IncA Expression and Fusogenicity of Inclusions in Chlamydia trachomatis Isolates with the incA I47T Mutation // Infection and Immunity. - 2001. - Vol. 69, N.7. - P. 4654-4656.

160.Pedersen L.N., Kjaer H.O., Moller J. K. et al. High-resolution genotyping of Chlamydia trachomatis from recurrent urogenital infections // J. Clin. Micro-biol.-2000.-Vol. 38, N. 8.-P. 3068-3071.

161.Peterson E.M., Markoff B.A., Schuchter J., de la Maza L.M. The 7, 5 kb plas-mid present in Chlamydia trachomatis is not essential for the growth of this microorganism//Plasmid.-1990.-N. 23.-P. 144-148.

162.Pickett M.A., Everson J.S., Pead P.J., Clarke I.N. The plasmids of Chlamydia trachomatis and Chlamydophila pneumoniae (N16): accurate determination of copy number and the paradoxical effect of plasmid-curing agents // Microbiology. - 2005. -N. 151. - P. 893-903.

163.Poppert S., Essig A., Marre R., et al. Detection and Differentiation of Chla-mydiae by Fluorescence In Situ Hybridization // Applied and environmental microbiology. - 2002. - Vol. 68, N. 8. - P. 4081-4089.

164.Read T. D., Brunham R. C., Shen C., at all. Genome sequences of Chlamydia trachomatis MoPn and Chlamydia pneumoniae AR39 // Nucleic. Acids. Res. -2000. - Vol. 28, N. 6. - 1397-1406.

165.Rodriguez P., Vekris A., Barbeyrac B., et al. Typing of Chlamydia trachomatis by restriction endonuclease analysis of the amplified major outer membrane protein gene // J. Clin. Microb. - 1991. - Vol. 29, N. 6. - P. 1132-1136.

166.Ryan G., Abdella T.N., McNeeley S.G., et al. Chlamydia trachomatis infection in pregnancy and effect of treatment on pregnancy outcome // Am. J . Obstet. Gynecol. - 1990. - Vol. 162. - P. 34-39.

167.Samra Z. In vitro susceptibility of recent clinical isolates of Chlamydia trachomatis to macrolides and tetracyclines. // Diagnostic Microbiology and Infectious Disease. - 2001. - Vol. 39 - P. 177-179.

168.Schifer H.G. Enteropathogenitat von Chlamydien // Dtsch. Med. Wochenschr. - 1994,- Bd. 119, N 117. - S. 1637-1638.

169.Scidmore-Carlson M.A., Shaw E.I., Dooley C.A., et al. Identification and characterization of a Chlamydia trachomatis early operon encoding four novel inclusion membrane proteins // Molecular Microbiology. - 1999. - Vol. 33, N. 4.-P. 753-765.

170.Schachter J., Stamm W.E., Qiunn T.C., et al. Ligase chain reastion to detect Chlamydia trachomatis infection of the cervix // J. Clin. Microbiol. - 1994. -Vol. 32, N. 10. - P. 2540-2543.

171.Somani J., Bhullar V.B., Workowski K.A. et al. Multiple drug-resistant Chlamydia trachomatis associated with clinical treatment failure // J. Infect. Dis. -2000. - Vol. 181, N. 4. - P. 1421 - 1427.

172.Sriprakash K.S., Macavoy E.S. Characterization and sequence of a plasmid from the trachoma biovar of Chlamydia trachomatis // Plasmid. - 1987. - N. 18. - P. 205-214.

173. Stary A., Strauss R., Crucittui T., et al. Results of a Europe-wide investigation to assess the presence of a new variant of Chlamydia trachomatis. II Eurosur-veillance.- 2007,- Vol. 12. № 10.

174.Stephens, R.S. Chlamydia. Intracellular Biology // Pathogenesis and Immunity. Washington: ASM Press. - 1999. - 32IP.

175.Stephens R.S., Lammel C.J. Chlamydia outer membrane protein discovery using genomics. // Current opinion in microbiology. - 2001. - Vol. 4. - P. 16-20.

176.Stothard D.R., Williams J.A. Identification of a Chlamydia trachomatis Serovar E Urogenital Isolate Which Lacks the Cryptic Plasmid // Infection and Immunity.-1998,-Vol. 66, N. 12.-P. 6010-6013.

177.Suchland R.J., Rockey D.D., Weeks S.K. et al. Development of Secondary Inclusions in Cells Infected by Chlamydia trachomatis // Infect. Immun.-2005.-Vol. 73, № 7.-P. 3954-3962.

178.Suchland R.J., Rockey D.D., Bannantine J.P., Stamm W.E. Isolates of Chlamydia trachomatis Lack IncA, a Protein Localized to the Inclusion Membrane // Infect. Immun.-2000.-Vol. 68, N. l.-P. 360 - 367.

179.Suchland R.J., Stamm W.E. Simplified microtiter cell culture method for rapid immunotyping of Chlamydia trachomatis // J. Clin. Microbiol.-1991-Vol. 29, N. 7.-P. 1333-1338.

180.Sweet R. L., Landers D.V., Walker C., et al. Chlamydia trachomatis infection and pregnancy outcome // Am. J. Obstet. Gynecol. -1987. - Vol. 156. - P. 824-833.

181 .Sziller I., Babula O., Ujhazy A. et al. Chlamydia trachomatis infection, Fallopian tube damage and a mannose-binding lectin codon 54 gene polymorphism //Human Reproduction. -2007. - Vol. 22, N.7.- P. 1861-1865.

182.Thomas N.S., Lusher M., Storey C.C. and Clarke I.N. Plasmid diversity in Chlamydia H Microbiology. - 1997. - Vol. 143. - P. 1847-1854.

183.Thomson N.R., Holden M.T., Carder C., at all. Chlamydia trachomatis: Genome sequence analysis of lymphogranuloma venereum isolates // Genome Res. -2008. - Vol. 18, N. l.-P. 161-171.

184.Timms P. Novel diagnostic agents of chronic or persistent Chlamydial diseases and uses thereof. Patent WO 02/14516 A1, 21.02.2002.

185.Trama J., Mordechai E., Adelson M.E. Methods and compositions for detecting serotypes of Chlamydia trachomatis capable of causing lymphogranuloma venereum. . Patent US2007269810 (Al), 22.11.2007.

186. Verbeke P., Welter-Stahl L., Ying S., et al. Recruitment of BAD by the Chlamydia trachomatis vacuole correlates with host-cell survival. // PLoS Pathogens. - 2006. - Vol. 2., Iss.5. - P. 0408-0417.

187. Ward M.E. The immunobiology and immunopathology of Chlamydial infections // Acta path microhiol. Immunol scand. - 1995. - Vol. 103. - P. 769-796.

188.Yong D., Paul N. Micro direct inoculation method for the isolation and identification of Chlamydia trachomatis. II J. Clin. Microb. - 1986. - Vol. 23, N. 3. -P. 536-538.

189.Yuan Y., Zhang Y.X., Watkins N.G., Caldwell H.D. Nucleotide and deduced amino acid sequences for the four variable domains of the major outer membrane proteins of the 15 Chlamydia trachomatis serovars //Infect. Immun.-1989.-Vol. 57, N. 4.-P. 1040-1049.

190.Zelin J. M., Robinson A. J., Ridgway G. L., et al. Chlamydial urethritis in heterosexual men attending a genitourinary medicine clinic: prevalence, symptoms condom usage and partner change // Int. J. STD AIDS. - 1995. - Vol. 6. -P. 27-30.

191.Zhongyu Li, Ding Chen, Youmin Zhong, et al. The Chlamydial Plasmid-Encoded Protein pgp3 Is Secreted into the Cytosol of Chlamydia-Infected Cells // Infection and Immunity.-2008.-Vol. 76, N. 8,- P. 3415-3428.

Патенты РФ на изобретение

1. Пат. № 2385945 Российская Федерация МПК С 12 Q 1/68. Способ прогнозирования манифестной или стертой формы хламидийной инфекции человека или обезьян и набор для его осуществления / В.В. Слободенюк, В.А. Алешкин, С.С.Афанасьев, Б.А. Лапин, Е.А. Воропаева, В.А. Баннов, О.М. Кострова, A.B. Караулов, Э.К. Джикидзе, Н.В. Воложанцев, И.А. Дятлов, Э.А. Светоч, О.Г. Гречишникова, В.А. Метельская, А.Л. Байракова, М.С. Афанасьев, Е.А. Егорова, О.В. Рубальский, Д.С. Афанасьев, Е.О. Рубальский, Ю.Н. Урбан, А.Н. Кура-кова; заявитель и патентообладатель ФГУН МНИИЭМ им. Г.Н. Габричевского Роспотребнадзора.-№ 2008151548/13; заявл. 26.12.2008; зарег. во ФГУП «Роспатент» 10.04.2010.

2. Пат. № 2385946 Российская Федерация МПК С 12 Q 1/68. Способ диагностики хламидийной инфекции человека или обезьян и набор для его осуществления / В.В. Слободенюк, В.А. Алешкин, С.С.Афанасьев, Б.А. Лапин, Е.А. Воропаева, В.А. Баннов, О.М. Кострова, A.B. Караулов, Э.К. Джикидзе, Н.В. Воложанцев, И.А. Дятлов, Э.А. Светоч, О.Г. Гречишникова, В.А. Метельская, А.Л. Байракова, М.С. Афанасьев, Е.А. Егорова, О.В. Рубальский, Д.С. Афанасьев, Е.О. Рубальский, Ю.Н. Урбан, А.Н. Куракова; заявитель и патентообладатель ФГУН МНИИЭМ им. Г.Н. Габричевского Роспотребнадзора.-№ 2008151550/13; заявл. 26.12.2008; зарег. во ФГУП «Роспатент» 10.04.2010.

3.Пат. № 2443782 Российская Федерация МПК С 12 Q 1/68. Способ генотипи-рования Chlamydia trachomatis / В.В. Слободенюк, В.А. Алешкин, С.С.Афанасьев, Б.А. Лапин, Х.М. Галимзянов, Е.А. Воропаева, Ю.В. Несвижский, A.B. Алешкин, О.М. Кострова, A.B. Караулов, О.В. Рубальский, Э.К.

99

Джикидзе, И.А. Дятлов, Э.А. Светоч, О.Г. Гречишникова, В.А. Метельская, А.Л. Байракова, М.С. Афанасьев, Е.А. Егорова, Д.С. Афанасьев, Ю.Н. Урбан, Е.О. Рубальский; заявитель и патентообладатель ФГУН МНИИЭМ им. Г.Н. Габричевского Роспотребнадзора.-№ 2010132294/13; заявл. 03.08.2010; зарег. во ФГУП «Роспатент» 27.02.2012.