Разработка и применение метода мультилокусного VNTR-анализа для изучения генетического разнообразия изолятов Neisseria gonorrhoeae тема диссертации и автореферата по ВАК РФ 03.01.03, кандидат биологических наук Кушнир, Анастасия Викторовна

• Кушнир, Анастасия Викторовна
• кандидат биологических наук
• 2013

Оглавление диссертации кандидат биологических наук Кушнир, Анастасия Викторовна

ОГЛАВЛЕНИЕ

Введение

1 Обзор литературы

1.1 Биология Neisseria gonorrhoeae

111 Общая характеристика N gonorrhoeae

\

112 Организация генома и факторы патогенности N gonorrhoeae

113 Инфекционный процесс, вызванный N gonorrhoeae

1.2 Устойчивость N gonorrhoeae к антибиотикам

12 1 Применение антибиотиков дія лечения гонореи

12 2 Механизмы устойчивости к антибиотикам

1.3 Молекулярная эпидемиология гонореи

13 1 Важность типирования N gonorrhoeae для эпидемиологических цепей 40 13 2 Методы типирования изочятов N gonorrhoeae на основе фенотипа 42 13 3 Методы типирования изочятов N gonorrhoeae на основе генотипа

2 Материалы и методы

2 1 Материалы

2 11 Коплекции ДНК клинических изочятов N gonorrhoeae

2 12 Реактивы

2 13 Растворы и буферы

2 14 Очигонукчеотидные праймеры

2 2 Методы

2 2 1 Поиск VNTR-чокусов

2 2 2 Мучътилокусный VNTR-аначиз

22 3 Секвенирование ДНК

2 2 4 Ора-типирование

2 2 5 NG-MAST

2 2 6 Статистический анашз данных

3 Результаты исследования

3 1 Разработка методики мультилокусного VNTR-анализа

3 11 Поиск потенциачьных VNTR-чокусов в геноме N gonorrhoeae 61 312 Тестирование VNTR-чокусов на коччекции ДНК N gonorrhoeae

3 13 Распочожение VNTR-чокусов в геноме N gonorrhoeae относитечьно кодируюгци\ посчедовательностей

3.2 Изучение генетического разнообразия изолятов N gonorrhoeae, выделенных в городе

Алматы (Казахстан)

3 2 1 Мультичокусный VNTR-анализ изолятов N gonorrhoeae

3 2 2 Ора-типирование и NG-MAST

3 2 3 Сравнение методов типирования

3 3 Изучение генетического разнообразия изолятов N gonorrhoeae, выделенных в семи

городах России

3 3 1 Мупътичокусный VNTR анапиз изолятов N gonorrhoeae

3 3 2 Кластерный анализ

3 33 Резучътаты VNTR-анализа и устойчивость к антибиотикам

3 3 4 Сравнение методов типирования на выборке из 102 изочятов

4 Обсуждение результатов

Выводы

Список сокращений и условных обозначений

Список литературы

Введение диссертации (часть автореферата) на тему «Разработка и применение метода мультилокусного VNTR-анализа для изучения генетического разнообразия изолятов Neisseria gonorrhoeae»

ВВЕДЕНИЕ

Актуальность работы

Бактерии Neisseria gonorrhoeae являются возбудителем гонореи, инфекционного заболевания человека, передаваемого половым путём. По данным ВОЗ в мире ежегодно возникает более 80 миллионов новых случаев заболевания гонореей [1]. Заболеваемость гонореей в России в 2011 году составила 38.35 случаев на 100000 населения, что превышает аналогичные показатели для Нидерландов (21.49 случаев), Венгрии (13.74 случаев), Швеции (10.09 случаев) и других стран Европейского Союза [2].

Гонорея может вызывать тяжёлые осложнения, такие как эпидидимит (воспаление придатка яичка) у мужчин и воспаление органов малого таза у женщин, которое в свою очередь, повышает риск внематочной беременности и бесплодия. Бактерии N. gonorrhoeae могут инфицировать слизистые оболочки новорожденных (гонококковая бленнорея новорожденных) при прохождении через родовые пути заражённой матери, что может привести к слепоте [3]. Важно также отметить, что гонорея ассоциирована с трансмиссией вируса иммунодефицита человека [4].

К настоящему моменту не существует вакцины против гонореи, а для лечения гонореи используют антибиотики. Своевременная идентификация заболевания и эффективное лечение антибиотиками являются основными подходами для предотвращения распространения гонореи. Однако во многих странах существуют такие проблемы, как рост заболеваемости гонореей и распространение устойчивости к антибактериальным препаратам, ранее рекомендованным для лечения гонореи (например, пенициллин, эритромицин, тетрациклин и ципрофлоксацин), а также снижение чувствительности к антибиотикам, рекомендованным недавно, таким как азитромицин и цефалоспорины третьего поколения (цефиксим и цефтриаксон) [5, 6]. Таким образом, при определённых обстоятельствах гонорея может стать неизлечимой болезнью.

Поэтому особое значение приобретают молекулярно-эпидемиологические исследования, направленные на изучение популяционной структуры гонококков. В круг задач, решаемых методами молекулярной эпидемиологии, входит определение генетического разнообразия изолятов N. gonorrhoeae в разных географических регионах, обнаружение наиболее биологически успешных вирулентных штаммов, дифференциация случаев неудачного лечения и повторного заражения, установление идентичности штаммов для решения судебно-медицинских вопросов и так далее. Основной подход молекулярной эпидемиологии - это типирование изолятов бактерий, то есть установление степени их сходства по различным признакам, на основании чего устанавливается предполагаемые филогенетические связи между изолятами.

Для типирования N. gonorrhoeae применяют как фенотипические, так и генотипические методы. Фенотипические методы основаны на определении профилей чувствительности к антибиотикам, потребности в различных питательных веществах, антигенной неоднородности белка внешней мембраны порина (РогВ), разнообразии ферментов «домашнего хозяйства». Хотя фенотипические методы и позволяют различать ауксотипы и серовары N. gonorrhoeae, с их помощью невозможно проводить дифференциацию на уровне штаммов. Существенными недостатками этих методов являются низкая дискриминирующая способность, проблемы с воспроизводимостью результатов, появление атипичных штаммов, для которых невозможно определить серовар [7].

В связи с этим, решающую роль в типировании гонококков играют молекулярно-генетические методы. Эти методы могут быть разделены на две больших группы: методы, основанные на анализе набора полос ДНК в геле после электрофореза, и методы, основанные на анализе последовательностей ДНК. К первой группе относятся такие методы, как анализ содержания плазмид, анализ полиморфизма длин рестрикционных фрагментов (Restriction Fragment Length Polymorphism, RFLP), определяемый при помощи электрофореза в пульсирующем поле (Pulsed-Field Gel Electrophoresis, PFGE), риботипирование и ора-типирование. Общими недостатками указанных методов являются трудоёмкость,

субъективная интерпретация результатов, а также сложность сравнения результатов, полученных, в разных лабораториях.

Вторая группа методов включает в себя полное или частичное секвенирование гена рогВ, мультиантигенное типирование последовательностей N. gonorrhoeae (N. gonorrhoeae Multiantigen Sequence Typing, NG-MAST) и мультилокусное типирование последовательностей (Multilocus Sequence Typing, MLST). Данные методы лишены перечисленных выше недостатков и более предпочтительны для типирования изолятов гонококков, поскольку они объективны, надёжны, воспроизводимы и обладают высокой дискриминирующей способностью [7].

В последние годы в связи с доступностью полных нуклеотидных последовательностей геномов для типирования различных микроорганизмов, в том числе N. meningitidis [8, 9], широко применяется подход, основанный на анализе варьирующих по числу тандемных повторов (Variable Number Tandem Repeat, VNTR). Метод мультилокусного VNTR-анализа (Multiple Loci VNTR Analysis, MLVA) предполагает определение количества тандемных повторов в каждом VNTR-локусе и получение для каждого изолята VNTR-профиля, состоящего из последовательности чисел. Таким образом, результаты типирования воспроизводимы и сопоставимы между лабораториями. Недавно была предложена схема MLVA для типирования изолятов N. gonorrhoeae, которая включает в себя проведение двух мультиплексных ПЦР с последующим разделением фрагментов ДНК при помощи автоматического секвенатора [10]. Данный метод требует наличия дорогостоящего оборудования для проведения капиллярного электрофореза, а также специального программного обеспечения. В этой связи актуальна разработка альтернативной схемы мультилокусного VNTR-анализа, позволяющей разделять фрагменты ДНК в полиакриламидном геле и определять число повторов без использования специальных приборов и программного обеспечения.

Цель и задачи исследования

Целью исследования является разработка метода мультилокусного VNTR-анализа для N. gonorrhoeae и применение данного метода для изучения генетического разнообразия коллекций изолятов N. gonorrhoeae, собранных в России и Казахстане.

Для достижения поставленной цели были сформулированы следующие задачи:

1) Выявить в геноме N. gonorrhoeae потенциальные VNTR-локусы in silico, разработать методику мультилокусного VNTR-анализа, оценить уровень полиморфизма выбранных VNTR-локусов на ограниченной выборке изолятов N. gonorrhoeae;

2) Провести VNTR-анализ коллекций изолятов N. gonorrhoeae, выделенных в России и Казахстане, выявить региональные особенности изолятов N. gonorrhoeae;

3) Оценить дискриминирующую способность мультилокусного VNTR-анализа и сравнить его с другими методами типирования N. gonorrhoeae;

4) Проанализировать полученные данные с целью установления возможной взаимосвязи между наличием генетических маркёров устойчивости к антибиотикам и принадлежностью изолятов к разным VNTR-типам и кластерам.

Научная новизна

В геноме N. gonorrhoeae обнаружены локусы, содержащие тандемные повторы различной длины и кратности. Разработана методика генотипирования изолятов N. gonorrhoeae, основанная на определении количества тандемных повторов в семи VNTR-локусах. Впервые проведён мультилокусный VNTR-анализ коллекций из 218 изолятов N. gonorrhoeae, собранных в России, и 48 изолятов N. gonorrhoeae, собранных в Казахстане. Коллекция изолятов N. gonorrhoeae из Казахстана впервые охарактеризована методами ора-типирования и NG-MAST. Обнаружен ряд статистически значимых ассоциаций между принадлежностью изолятов к определённым VNTR-типам и кластерам и

наличием лекарственной устойчивости, а также наличием генетических маркёров устойчивости к антибиотикам.

Теоретическая и практическая значимость Настоящая работа вносит существенный вклад в развитие молекулярной эпидемиологии гонореи, а также в понимание механизмов распространения гонококков в популяции.

Разработанный метод VNTR-анализа изолятов N. gonorrhoeae может быть полезен для изучения генетического разнообразия гонококков, циркулирующих на определённой территории, для определения наиболее вирулентных и патогенных типов N. gonorrhoeae. Кроме того, предложенный метод может быть использован как диагностический инструмент для выявления источников инфекции, для принятия решения о наличии повторного заражения либо о факте неудачного лечения, для установления идентичности или различия штаммов в судебно-медицинских целях.

В целом, молекулярно-эпидемиологические исследования N. gonorrhoeae необходимы для разработки эффективных мер контроля над распространением гонореи.

Положения, выносимые на защиту

1. Разработана методика VNTR-анализа на основе семи VNTR-локусов (VNTR264, VNTR471, VNTR947, VNTR1609, VNTR1638, VNTR2048, VNTR2168), содержащих тандемные повторы различной длины и кратности.

2. VNTR-анализ позволил выявить 101 VNTR-тип для 266 изолятов из России и Казахстана и продемонстрировал генетическую неоднородность исследованных изолятов. Показано, что наиболее генетически гетерогенны популяции гонококков из Москвы, Санкт-Петербурга, Архангельска и Алматы, а наиболее однородны - популяции из Самары и Мурманска. На основе VNTR-профилей для изолятов из России построено минимальное остовное дерево, на котором выделено шесть кластеров, содержащих 95.4 % изолятов.

3. Метод VNTR-анализа обладает высокой дискриминирующей способностью и удовлетворяет критерию HDGI > 0.95, рекомендованному Европейским

обществом клинической микробиологии и инфекционных болезней для новых методов типирования бактерий. 4. Обнаружена статистически значимая ассоциация между принадлежностью изолятов к различным VNTR-типам и кластерам и наличием лекарственной устойчивости.

4.1.Наиболее распространённый в России VNTR-тип 16 и близкие к нему VNTR-типы 17 и 21 ассоциированы с наличием множественной устойчивости к антибиотикам.

4.2.Принадлежность изолятов к кластеру А ассоциирована с устойчивостью к ципрофлоксацину и тетрациклину, а также наличием мутаций в генах реп А, ропА, rpsJ, mtrR, gyrA, и parC.

4.3.Принадлежность изолятов к кластеру D ассоциирована с устойчивостью к пенициллину и наличием мутаций в генах ропА и rpsJ и с наличием плазмидного гена Ьіа^м-і).

4.4.Принадлежность изолятов к кластерам В, С и Е ассоциирована с чувствительностью к ципрофлоксацину и отсутствием мутаций в генах ропА, rpsJ, gyrA и par С.

Апробация результатов

По материалам диссертации опубликовано 4 статьи в журналах, входящих в Перечень ведущих рецензируемых научных изданий и журналов, рекомендуемых Высшей аттестационной комиссией для публикации основных научных результатов диссертаций:

1) Кушнир, А. В., Муминов, Т. А., Баев, А. И., Храпов, Е. А., Филипенко, М. JI. Использование метода VNTR-типирования для оценки генетического разнообразия изолятов Neisseria gonorrhoeae II Молекулярная генетика, микробиология и вирусология. - 2011. - №1. - С. 24-29.

2) Кушнир, А. В., Ильина, Е. Н., Малахова, М. В., Припутневич, Т. В., Филипенко, М. JI. VNTR-типирование изолятов Neisseria gonorrhoeae

в России // Вестник НГУ. Серия: биология, клиническая медицина. -2012. - №5. - С 11-18.

3) Kushnir, А. V., Muminov, Т. A., Bayev, A. I., Khrapov, Е. A., Filipenko, M. L. Molecular characterization of Neisseria gonorrhoeae isolates in Almaty, Kazakhstan, by VNTR analysis, Opa-typing and NG-MAST // Infection, Genetics and Evolution : journal of molecular epidemiology and evolutionary genetics in infectious diseases. - 2012. - Vol. 12. - P. 570576.

4) Kushnir, A. V., Ilina, E. N., Malakhova, M. V., Priputnevich, T. V., Filipenko, M. L. Multiple-Locus Variable Number Tandem Repeat Analysis of Neisseria gonorrhoeae Isolates in Russia // Infection, Genetics and Evolution : journal of molecular epidemiology and evolutionary genetics in infectious diseases. - 2013. - Vol. 14 - P. 8-14.

Результаты исследования были представлены на научных конференциях.

Вклад автора

Основные результаты получены лично автором. Сбор коллекции изолятов N. gonorrhoeae в городе Алматы проведён Научно-исследовательским кожно-венерологическим институтом республики Казахстан. Сбор коллекции изолятов N. gonorrhoeae в различных регионах России и определение чувствительности к антибиотикам проведено Государственным научным центром дерматовенерологии и косметологии.

Поиск тандемных повторов в геноме N. gonorrhoeae, VNTR-анализ изолятов N. gonorrhoeae, ора-типирование и типирование методом NG-MAST, подготовка образцов к секвенированию, а также статистический анализ полученных результатов были проведены лично автором.

Структура и объём работы

Диссертация состоит из введения, обзора литературы, описания использованных материалов и методов, изложения и обсуждения собственных экспериментальных данных, выводов и списка литературы (248 наименований). Работа изложена на 129 страницах и содержит 16 таблиц и 13 рисунков.

Автор выражает искреннюю благодарность всем коллегам по работе, и персонально к.б.н. Дымовой Майе Александровне, д.б.н. Тикуновой Нине Викторовне за внимательное прочтение рукописи диссертации и полезные замечания, д.б.н., доценту Ильиной Елене Николаевне за сотрудничество и помощь в написании статьей, к.б.н. Филипенко Максиму Леонидовичу за научное руководство работой.

Заключение диссертации по теме «Молекулярная биология», Кушнир, Анастасия Викторовна

ВЫВОДЫ

1. Разработана методика VNTR-анализа на основе семи VNTR-локусов (VNTR264, VNTR471, VNTR947, VNTR1609, VNTR1638, VNTR2048, VNTR2168), содержащих тандемные повторы различной длины и кратности.

2. VNTR-анализ позволил выявить 101 VNTR-тип для 266 изолятов из России и Казахстана и продемонстрировал генетическую неоднородность исследованных изолятов. Показано, что наиболее генетически гетерогенны популяции гонококков из Москвы, Санкт-Петербурга, Архангельска и Алматы, а наиболее однородны - популяции из Самары и Мурманска. На основе VNTR-профилей для изолятов из России построено минимальное остовное дерево, на котором выделено шесть кластеров, содержащих 95.4 % изолятов.

3. Метод VNTR-анализа обладает высокой дискриминирующей способностью и удовлетворяет критерию HDGI > 0.95, рекомендованному Европейским обществом клинической микробиологии и инфекционных болезней для новых методов типирования бактерий.

4. Обнаружена статистически значимая ассоциация между принадлежностью изолятов к различным VNTR-типам и кластерам и наличием лекарственной устойчивости.

4.1.Наиболее распространённый в России VNTR-тип 16 и близкие к нему VNTR-типы 17 и 21 ассоциированы с наличием множественной устойчивости к антибиотикам.

4.2.Принадлежность изолятов к кластеру А ассоциирована с устойчивостью к ципрофлоксацину и тетрациклину, а также наличием мутаций в генах репА, ропА, rpsJ, mtrR, gyrA, и parC.

4.3.Принадлежность изолятов к кластеру D ассоциирована с устойчивостью к пенициллину и наличием мутаций в генах ропА и rpsJ и с наличием плазмидного гена bla(jEM.i).

4.4.Принадлежность к кластерам В, С и Е ассоциирована с чувствительностью к ципрофлоксацину и отсутствием мутаций в генах ропА, rpsJ, gyrA и par С.

СПИСОК СОКРАЩЕНИЙ И УСЛОВНЫХ ОБОЗНАЧЕНИЙ

МЛУ - множественная лекарственная устойчивость

ПААГ - полиакриламидный гель

ПЦР - полимеразная цепная реакция

ТАЕ - трис-ацетатный буфер

ТБЕ - трис-боратный буфер

Трис - трис(гидроксиметил)аминометан

ЭДТА - этилендиамин тетрауксусная кислота

ТЕМЕД - N, N, N', N'-тетраметилэтилендиамин

ABC-транспортёры (ATP-binding cassette transporters) - АТФ связывающие кассетные транспортёры

AR (Adjusted Rand index) - скорректированный коэффициент Рэнда CI (Confidence Interval) - доверительный интервал

HGDI (Hunter-Gaston Discriminatory Index) - индекс дискриминации Хантера-Гастона

MLEE (Multilocus Enzyme Electrophoresis) - мультилокусный электрофорез ферментов

MLST (Multilocus Sequence Typing) - мультилокусное типирование последовательностей ДНК

MLVA (Multiple Loci VNTR Analysis) - мультилокусный VNTR-анализ NG-MAST (N. gonorrhoeae Multiantigen Sequence Typing) - мультиантигенное типирование последовательностей ДНК N. gonorrhoeae

PFGE (Pulsed-Field Gel Electrophoresis) - электрофорез в пульсирующем поле RFLP (Restriction Fragment Length Polymorphism) - полиморфизм длин рестрикционных фрагментов ST (Sequence Type) - тип последовательности

VNTR (Variable Number Tandem Repeat) - варьирующие по числу тандемные повторы

Список литературы диссертационного исследования кандидат биологических наук Кушнир, Анастасия Викторовна, 2013 год

СПИСОК ЛИТЕРАТУРЫ

1. World Health Organization. Prevalence and incidence of selected sexually transmitted infections / World Health Organization. - Geneva: WHO Press, 2011. - 36

P-

2. World Health Organization. Sexually transmitted infections (STI). Gonorrhoea -Incidence rate (per 100,000 population) [Electronic resource] / World Health Organization. - 2012. - http://data.euro.who.int/cisid/.

3. Holmes, К. K., Sparling, P. F., Walter, E. S., Piot, P., Wasserheit, J. N., Corey, L., Cohen, M. S., and Watts, D. H. Sexually transmitted diseases, 4th ed. / Holmes, К. K., Sparling, P. F., Walter, E. S., Piot, P., Wasserheit, J. N., Corey, L., Cohen, M. S., and Watts, D. H. - New York: McGraw-Hill, 2008. - 2166 p.

4. Galvin, S. R., and Cohen, M. S. The role of sexually transmitted diseases in HIV transmission // Nature reviews. Microbiology. - 2004. - Vol. 2. - N. 1. - P. 33-42.

5. Deguchi, Т., Nakane, K., Yasuda, M., and Maeda, S. Emergence and spread of drug resistant Neisseria gonorrhoeae II The Journal of urology. - 2010. - Vol. 184. - N. 3. -P. 851-8; quiz 1235.

6. Unemo, M., and Shafer, W. M. Antibiotic resistance in Neisseria gonorrhoeae: origin, evolution, and lessons learned for the future // Annals of the New York Academy of Sciences. - 2011. - Vol. 1230.-P. E19-28.

7. Unemo, M., and Dillon, J.-A. R. Review and international recommendation of methods for typing Neisseria gonorrhoeae isolates and their implications for improved knowledge of gonococcal epidemiology, treatment, and biology // Clinical microbiology reviews. - 2011. - Vol. 24. - N. 3. - P. 447^158.

8. Schouls, L. Multiple-locus variable-number tandem repeat analysis of Neisseria meningitidis yields groupings similar to those obtained by multilocus sequence typing // Journal of clinical microbiology. - 2006. - Vol. 44. - N. 4. - P. 1509-1518.

9. Liao, J. C., Li, С. C., and Chiou, C. S. Use of a multilocus variable-number tandem repeat analysis method for molecular subtyping and phylogenetic analysis of Neisseria meningitidis isolates // BMC Microbiology. - 2006. - Vol. 6. - P. 44.

10. Heymans, R., Schouls, L. M., Van der Heide, H. G. J., Van der Loeff, M. F. S., and Bruisten, S. M. Multiple-locus variable-number tandem repeat analysis of Neisseria gonorrhoeae II Journal of clinical microbiology. - 2011. - Vol. 49. - N. 1. - P. 354363.

11. Criss, A. K., and Seifert, H. S. A bacterial siren song: intimate interactions between Neisseria and neutrophils // Nature reviews. Microbiology. - 2012. - Vol. 10. - N. 3. -P. 178-90.

12. Marri, P. R., Paniscus, M., Weyand, N. J., Rendón, M. a, Calton, C. M., Hernández, D. R., Higashi, D. L., Sodergren, E., Weinstock, G. M., Rounsley, S. D., and So, M. Genome sequencing reveals widespread virulence gene exchange among human Neisseria species // PloS one. - 2010. - Vol. 5. -N. 7. - P. el 1835.

13. Liu, S. V, Saunders, N. J., Jeffries, A., and Rest, R. F. Genome analysis and strain comparison of correia repeats and correia repeat-enclosed elements in pathogenic Neisseria II Journal of bacteriology. - 2002. - Vol. 184. -N. 22. -P. 6163-73.

14. Snyder, L. A. S., McGowan, S., Rogers, M., Duro, E., O'Farrell, E., and Saunders, N. J. The repertoire of minimal mobile elements in the Neisseria species and evidence that these are involved in horizontal gene transfer in other bacteria // Molecular biology and evolution. -2007. - Vol. 24. -N. 12. - P. 2802-15.

15. Korch, C., Hagblom, P., Ohman, H., Goransson, M., and Normark, S. Cryptic plasmid of Neisseria gonorrhoeae: complete nucleotide sequence and genetic organization //Journal of bacteriology. - 1985. - Vol. 163. -N. 2. - P. 430-8.

16. Elwell, L. P., Roberts, M., Mayer, L. W., and Falkow, S. Plasmid-mediated beta-lactamase production in Neisseria gonorrhoeae II Antimicrobial agents and chemotherapy. - 1977. - Vol. 11. -N. 3. - P. 528-33.

17. Anderson, B., Albritton, W. L., Biddle, J., and Johnson, S. R. Common beta-lactamase-specifying plasmid in Haemophilus ducreyi and Neisseria gonorrhoeae II Antimicrobial agents and chemotherapy. - 1984. - Vol. 25. - N. 2. - P. 296-7.

I 8. Pachulec, E., and Van der Does, C. Conjugative plasmids of Neisseria gonorrhoeae

II PloS one. - 2010. - Vol. 5. - N. 4. - P. e9962.

19. Pearce, W. A., and Buchanan, T. M. Attachment role of gonococcal pili. Optimum conditions and quantitation of adherence of isolated pili to human cells in vitro // The Journal of clinical investigation. - 1978. - Vol. 61. -N. 4. - P. 931-43.

20. Swanson, J., Robbins, K., Barrera, O., Corwin, D., Boslego, J., Ciak, J., Blake, M., and Koomey, J. M. Gonococcal pilin variants in experimental gonorrhea // The Journal of experimental medicine. - 1987. - Vol. 165.-N. 5.-P. 1344-57.

21. Seifert, H. S., Wright, C. J., Jerse, A. E., Cohen, M. S., and Cannon, J. G. Multiple gonococcal pilin antigenic variants are produced during experimental human infections // The Journal of clinical investigation. - 1994. - Vol. 93. -N. 6. - P. 2744-9.

22. Meyer, T. F., Billyard, E., Haas, R., Storzbach, S., and So, M. Pilus genes of Neisseria gonorrheae: chromosomal organization and DNA sequence // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. - 1984. - Vol. 81. -N. 19.-P. 6110-4.

23. Hagblom, P., Segal, E., Billyard, E., and So, M. Intragenic recombination leads to pilus antigenic variation in Neisseria gonorrhoeae II Nature. - 1985. - Vol. 315. - N. 6015.-P. 156-8.

24. Haas, R., and Meyer, T. F. The repertoire of silent pilus genes in Neisseria gonorrhoeae: evidence for gene conversion // Cell. - 1986. - Vol. 44. - N. 1. - P. 107— 15.

25. Segal, E., Hagblom, P., Seifert, H. S., and So, M. Antigenic variation of gonococcal pilus involves assembly of separated silent gene segments // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. - 1986. - Vol. 83. - N. 7. - P. 2177-81.

26. Kallstrom, H., Islam, M. S., Berggren, P. O., Jonsson, a B., and Kallstrom, H. Cell signaling by the type IV pili of pathogenic Neisseria II The Journal of biological chemistry. - 1998.-Vol. 273.-N. 34.-P. 21777-82.

27. Ayala, B. P., Vasquez, B., Clary, S., Tainer, J. A., Rodland, K., and So, M. The pilus-induced Ca2+ flux triggers lysosome exocytosis and increases the amount of Lampl accessible to Neisseria IgAl protease // Cellular microbiology. - 2001. - Vol. 3. -N. 4.-P. 265-275.

28. Chen, C., Tobiason, D. M., Thomas, C. E., Shafer, W. M., Seifert, H. S., and Sparling, P. F. A mutant form of the Neisseria gonorrhoeae pilus secretin protein PilQ allows increased entry of heme and antimicrobial compounds // Journal of bacteriology. -2004.-Vol. 186.-N. 3.-P. 730-9.

29. Rudel, T., Scheurerpflug, I., and Meyer, T. F. Neisseria PilC protein identified as type-4 pilus tip-located adhesin //Nature. - 1995. - Vol. 373. -N. 6512. - P. 357-9.

30. Scheuerpflug, I., Rudel, T., Ryll, R., Pandit, J., and Meyer, T. F. Roles of PilC and PilE proteins in pilus-mediated adherence of Neisseria gonorrhoeae and Neisseria meningitidis to human erythrocytes and endothelial and epithelial cells // Infection and immunity. - 1999.-Vol. 67.-N. 2.-P. 834-43.

31. Merz, a J., So, M., and Sheetz, M. P. Pilus retraction powers bacterial twitching motility // Nature. - 2000. - Vol. 407. - N. 6800. - P. 98-102.

32. Howie, H. L., Glogauer, M., and So, M. The N. gonorrhoeae type IV pilus stimulates mechanosensitive pathways and cytoprotection through a pilT-dependent mechanism // PLoS biology. - 2005. - Vol. 3. -N. 4. - P. elOO.

33. Dietrich, M., Bartfeld, S., Munke, R., Lange, C., Ogilvie, L. A., Friedrich, A., and Meyer, T. F. Activation of NF-kB by Neisseria gonorrhoeae is associated with microcolony formation and type IV pilus retraction // Cellular microbiology. — 2011. — Vol. 13.-N. 8.-P. 1168-82.

34. Swanson, J. Colony opacity and protein II compositions of gonococci // Infection and immunity. - 1982.-Vol. 37. -N. l.-P. 359-68.

35. Black, W. J., Schwalbe, R. S., Nachamkin, I., and Cannon, J. G. Characterization of Neisseria gonorrhoeae protein II phase variation by use of monoclonal antibodies // Infection and immunity. - 1984. - Vol. 45. -N. 2. - P. 453-7.

36. Stern, A., Brown, M., Nickel, P., and Meyer, T. F. Opacity genes in Neisseria gonorrhoeae: control of phase and antigenic variation 11 Cell. - 1986. - Vol. 47. - N. 1. -P. 61-71.

37. Connell, T. D., Black, W. J., Kawula, T. H., Barritt, D. S., Dempsey, J. A., Kverneland, K., Stephenson, A., Schepart, B. S., Murphy, G. L., and Cannon, J. G. Recombination among protein II genes of Neisseria gonorrhoeae generates new coding

sequences and increases structural variability in the protein II family // Molecular microbiology. - 1988. - Vol. 2. - N. 2. - P. 227-36.

38. Bhat, K. S., Gibbs, C. P., Barrera, O., Morrison, S. G., Jahnig, F., Stern, A., Kupsch, E. M., Meyer, T. F., and Swanson, J. The opacity proteins of Neisseria gonorrhoeae strain MSI 1 are encoded by a family of 11 complete genes // Molecular microbiology. -1991.-Vol. 5. - N. 8.-P. 1889-901.

39. Bilek, N., Ison, C. a, and Spratt, B. G. Relative contributions of recombination and mutation to the diversification of the opa gene repertoire of Neisseria gonorrhoeae II Journal of bacteriology. -2009. -Vol. 191. -N. 6. -P. 1878-90.

40. Jerse, A. E., Cohen, M. S., Drown, P. M., Whicker, L. G., Isbey, S. F., Seifert, H. S., and Cannon, J. G. Multiple gonococcal opacity proteins are expressed during experimental urethral infection in the male // The Journal of experimental medicine. -1994.-Vol. 179.-N. 3.-P. 911-20.

41. Fischer, S. H., and Rest, R. F. Gonococci possessing only certain P.II outer membrane proteins interact with human neutrophils // Infection and immunity. - 1988. -Vol. 56.-N. 6.-P. 1574-9.

42. Hauck, C. "Small" talk: Opa proteins as mediators of Afe/sser/a-host-cell communication // Current Opinion in Microbiology. - 2003. - Vol. 6. - N. 1. - P. 4349.

43. Sadarangani, M. Opa proteins and CEACAMs: pathways of immune engagement for pathogenic Neisseria II FEMS microbiology reviews. - 2011. - Vol. 35. - P. 498514.

44. Chen, T., Belland, R. J., Wilson, J., and Swanson, J. Adherence of pilus- Opa+ gonococci to epithelial cells in vitro involves heparan sulfate // The Journal of experimental medicine. - 1995. - Vol. 182. - N. 2. - P. 511-7.

45. Freissler, E., Meyer auf der Heyde, A., David, G., Meyer, T. F., and Dehio, C. Syndecan-1 and syndecan-4 can mediate the invasion of OpaHSPG-expressing Neisseria gonorrhoeae into epithelial cells // Cellular microbiology. - 2000. - Vol. 2. -N. l.-P. 69-82.

46. Wang, J., Gray-Owen, S. D., Knorre, A., Meyer, T. F., and Dehio, C. Opa binding to cellular CD66 receptors mediates the transcellular traversal of Neisseria gonorrhoeae across polarized T84 epithelial cell monolayers // Molecular microbiology. - 1998. -Vol. 30.-N. 3.-P. 657-71.

47. Chen, T., and Gotschlich, E. C. CGMla antigen of neutrophils, a receptor of gonococcal opacity proteins // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. - 1996. - Vol. 93.-N. 25.-P. 14851-6.

48. McCaw, S. E., Schneider, J., Liao, E. H., Zimmermann, W., and Gray-Owen, S. D. Immunoreceptor tyrosine-based activation motif phosphorylation during engulfment of Neisseria gonorrhoeae by the neutrophil-restricted CEACAM3 (CD66d) receptor // Molecular microbiology. - 2003. - Vol. 49. - N. 3. - P. 623-37.

49. Sarantis, H., and Gray-Owen, S. D. The specific innate immune receptor CEACAM3 triggers neutrophil bactericidal activities via a Syk kinase-dependent pathway // Cellular microbiology. - 2007. - Vol. 9. - N. 9. - P. 2167-80.

50. Boulton, I. C., and Gray-Owen, S. D. Neisserial binding to CEACAM1 arrests the activation and proliferation of CD4+ T lymphocytes // Nature immunology. - 2002. -Vol. 3. - N. 3.-P. 229-36.

51. Pantelic, M., Kim, Y.-J., Bolland, S., Chen, I., Shively, J., and Chen, T. Neisseria gonorrhoeae kills carcinoembryonic antigen-related cellular adhesion molecule 1 (CD66a)-expressing human B cells and inhibits antibody production // Infection and immunity.-2005.-Vol. 73.-N. 7.-P. 4171-9.

52. Blake, M. S., and Gotschlich, E. C. Purification and partial characterization of the major outer membrane protein of Neisseria gonorrhoeae II Infection and immunity. -1982.-Vol. 36.-N. 1.-P. 277-83.

53. Carbonetti, N. H., Simnad, V. I., Seifert, H. S., So, M., and Sparling, P. F. Genetics of protein I of Neisseria gonorrhoeae: construction of hybrid porins // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. - 1988. - Vol. 85. -N. 18.-P. 6841-5.

54. Rudel, T., Schmid, A., Benz, R., Kolb, H. A., Lang, F., and Meyer, T. F. Modulation of Neisseria porin (PorB) by cytosolic ATP/GTP of target cells: parallels

between pathogen accommodation and mitochondrial endosymbiosis // Cell. - 1996. -Vol. 85.-N.3.-P. 391-402.

55. Müller, A., Günther, D., Düx, F., Naumann, M., Meyer, T. F., and Rudel, T. Neisserial porin (PorB) causes rapid calcium influx in target cells and induces apoptosis by the activation of cysteine proteases // The EMBO journal. - 1999. - Vol. 18. - N. 2. -P. 339-52.

56. Müller, A., Günther, D., Brinkmann, V., Hurwitz, R., Meyer, T. F., and Rudel, T. Targeting of the pro-apoptotic VDAC-like porin (PorB) of Neisseria gonorrhoeae to mitochondria of infected cells // The EMBO journal. - 2000. - Vol. 19. - N. 20. - P. 5332-43.

57. Ayala, P., Vasquez, B., Wetzler, L., and So, M. Neisseria gonorrhoeae porin Pl.B induces endosome exocytosis and a redistribution of Lampl to the plasma membrane // Infection and immunity. - 2002. - Vol. 70. - N. 11. - P. 5965-71.

58. Binnicker, M. J., Williams, R. D., and Apicella, M. A. Infection of human urethral epithelium with Neisseria gonorrhoeae elicits an upregulation of host anti-apoptotic factors and protects cells from staurosporine-induced apoptosis // Cellular microbiology. - 2003. - Vol. 5. - N. 8. - P. 549-60.

59. Binnicker, M. J., Williams, R. D., and Apicella, M. A. Gonococcal porin IB activates NF-kappaB in human urethral epithelium and increases the expression of host antiapoptotic factors // Infection and immunity. - 2004. - Vol. 72. - N. 11. - P. 640817.

60. Edwards, J. L., Brown, E. J., Ault, K. A., and Apicella, M. A. The role of complement receptor 3 (CR3) in Neisseria gonorrhoeae infection of human cervical epithelia // Cellular microbiology. - 2001. - Vol. 3. - N. 9. - P. 611-22.

61. Edwards, J. L., Brown, E. J., Uk-nham, S., Cannon, J. G., Blake, M. S., and Apicella, M. A. A co-operative interaction between Neisseria gonorrhoeae and complement receptor 3 mediates infection of primary cervical epithelial cells // Cellular microbiology. - 2002. - Vol. 4. -N. 9. - P. 571-84.

62. Ram, S., McQuillen, D. P., Gulati, S., Elkins, C., Pangburn, M. K., and Rice, P. A. Binding of complement factor H to loop 5 of porin protein 1 A: a molecular mechanism

of serum resistance of nonsialylated Neisseria gonorrhoeae II The Journal of experimental medicine. - 1998.-Vol. 188.-N. 4.-P. 671-80.

63. Ram, S., Cullinane, M., Blom, A. M., Gulati, S., McQuillen, D. P., Monks, B. G., O'Connell, C., Boden, R., Elkins, C., Pangburn, M. K., Dahlback, B., and Rice, P. A. Binding of C4b-binding protein to porin: a molecular mechanism of serum resistance of Neisseria gonorrhoeae II The Journal of experimental medicine. - 2001. - Vol. 193. -N. 3.-P. 281-95.

64. Blake, M. S., and Swanson, J. Studies on gonococcus infection. XVI. Purification of Neisseria gonorrhoeae immunoglobulin A1 protease // Infection and immunity. - 1978. -Vol. 22.-N. 2.-P. 350-8.

65. Hauck, C. R., and Meyer, T. F. The lysosomal/phagosomal membrane protein h-lamp-1 is a target of the IgAl protease of Neisseria gonorrhoeae II FEBS letters. -1997.-Vol. 405.-N. l.-P. 86-90.

66. Ayala, P., Lin, L., Hopper, S., Fukuda, M., and So, M. Infection of epithelial cells by pathogenic neisseriae reduces the levels of multiple lysosomal constituents // Infection and immunity. - 1998. - Vol. 66. -N. 10. - P. 5001-7.

67. Johannsen, D. B., Johnston, D. M., Koymen, H. O., Cohen, M. S., and Cannon, J. G. A Neisseria gonorrhoeae immunoglobulin A1 protease mutant is infectious in the human challenge model of urethral infection // Infection and immunity. - 1999. - Vol.

67.-N. 6.-P. 3009-13.

68. Griffiss, J. M., Schneider, H., Mandrell, R. E., Yamasaki, R., Jarvis, G. A., Kim, J. J., Gibson, B. W., Hamadeh, R., and Apicella, M. A. Lipooligosaccharides: the principal glycolipids of the neisserial outer membrane // Reviews of infectious diseases. - 1988.-Vol. 10 Suppl 2.-P. S287-95.

69. Gotschlich, E. C. Genetic locus for the biosynthesis of the variable portion of Neisseria gonorrhoeae lipooligosaccharide // The Journal of experimental medicine. -1994.-Vol. 180.-N. 6.-P. 2181-90.

70. Makepeace, B. L., Watt, P. J., Heckels, J. E., and Christodoulides, M. Interactions of Neisseria gonorrhoeae with mature human macrophage opacity proteins influence

production of proinflammatory cytokines // Infection and immunity. - 2001. - Vol. 69. -N. 3.-P. 1909-13.

71. Harvey, H. A., Jennings, M. P., Campbell, C. A., Williams, R., and Apicella, M. A. Receptor-mediated endocytosis of Neisseria gonorrhoeae into primary human urethral epithelial cells: the role of the asialoglycoprotein receptor // Molecular microbiology. -2001.-Vol. 42.-N. 3. - P. 659-72.

72. Wu, H., and Jerse, A. E. Alpha-2,3-sialyltransferase enhances Neisseria gonorrhoeae survival during experimental murine genital tract infection // Infection and immunity. - 2006. - Vol. 74. - N. 7. - P. 4094-103.

73. Smith, H., Parsons, N. J., and Cole, J. a. Sialylation of neisserial lipopolysaccharide: a major influence on pathogenicity // Microbial pathogenesis. - 1995. - Vol. 19. - N. 6. -P. 365-77.

74. Anderson, J. E., Hobbs, M. M., Biswas, G. D., and Sparling, P. F. Opposing selective forces for expression of the gonococcal lactoferrin receptor // Molecular microbiology.-2003.-Vol. 48.-N. 5.-P. 1325-37.

75. Anderson, J. E., Leone, P. A., Miller, W. C., Chen, C., Hobbs, M. M., and Sparling, P. F. Selection for expression of the gonococcal hemoglobin receptor during menses // The Journal of infectious diseases. - 2001. - Vol. 184.-N. 12.-P. 1621-3.

76. Merz, A., and So, M. Interactions of pathogenic neisseriae with epithelial cell membranes // Annual review of cell and developmental biology. - 2000. - Vol. 16. - P. 423-457.

77. Apicella, M. A., Ketterer, M., Lee, F. K., Zhou, D., Rice, P. A., and Blake, M. S. The pathogenesis of gonococcal urethritis in men: confocal and immunoelectron microscopic analysis of urethral exudates from men infected with Neisseria gonorrhoeae II The Journal of infectious diseases. - 1996. - Vol. 173. - N. 3. - P. 63646.

78. Edwards, J. L., and Apicella, M. A. The molecular mechanisms used by Neisseria gonorrhoeae to initiate infection differ between men and women // Clinical microbiology reviews. - 2004. - Vol. 17. - N. 4. - P. 965-81, table of contents.

79. Massari, P., Henneke, P., Ho, Y., Latz, E., Golenbock, D. Т., and Wetzler, L. M. Cutting edge: Immune stimulation by neisserial porins is toll-like receptor 2 and MyD88 dependent // Journal of immunology (Baltimore, Md.: 1950). - 2002. - Vol. 168. -N. 4.-P. 1533-7.

80. Fisette, P. L., Ram, S., Andersen, J. M., Guo, W., and Ingalls, R. R. The Lip lipoprotein from Neisseria gonorrhoeae stimulates cytokine release and NF-kappaB activation in epithelial cells in a Toll-like receptor 2-dependent manner // The Journal of biological chemistry. - 2003. - Vol. 278. - N. 47. - P. 46252-60.

81. Kaparakis, M., Turnbull, L., Carneiro, L., Firth, S., Coleman, H. A., Parkington, H. C., Le Bourhis, L., Karrar, A., Viala, J., Мак, J., Hutton, M. L., Davies, J. K., Crack, P. J., Hertzog, P. J., Philpott, D. J., Girardin, S. E., Whitchurch, С. В., and Ferrero, R. L. Bacterial membrane vesicles deliver peptidoglycan to NODI in epithelial cells // Cellular microbiology.-2010.-Vol. 12.-N. 3.-P. 372-85.

82. Ramsey, К. H., Schneider, H., Cross, A. S., Boslego, J. W., Hoover, D. L., Staley, T. L., Kuschner, R. A., and Deal, C. D. Inflammatory cytokines produced in response to experimental human gonorrhea // The Journal of infectious diseases. - 1995. - Vol. 172. -N. 1. - P. 186-91.

83. Hedges, S. R., Sibley, D. A., Mayo, M. S., Hook, E. W., and Russell, M. W. Cytokine and antibody responses in women infected with Neisseria gonorrhoeae: effects of concomitant infections // The Journal of infectious diseases. - 1998. - Vol. 178.-N. 3,-P. 742-51.

84. Lee, W. L., Harrison, R. E., and Grinstein, S. Phagocytosis by neutrophils // Microbes and infection / Institut Pasteur. - 2003. - Vol. 5.-N. 14.-P. 1299-306.

85. Farzadegan, H., and Roth, I. L. Scanning electron microscopy and freeze-etching of gonorrhoeal urethral exudate // The British journal of venereal diseases. - 1975. - Vol. 51.-N. 2.-P. 83-91.

86. Casey, S. G., Shafer, W. M., and Spitznagel, J. K. Neisseria gonorrhoeae survive intraleukocytic oxygen-independent antimicrobial capacities of anaerobic and aerobic granulocytes in the presence of pyocin lethal for extracellular gonococci // Infection and immunity. - 1986.-Vol. 52.-N. 2.-P. 384-9.

87. Veale, D. R., Goldner, M., Penn, C. W., Ward, J., and Smith, H. The intracellular survival and growth of gonococci in human phagocytes // Journal of general microbiology. - 1979. -Vol. 113.-N. 2.-P. 383-93.

88. Simons, M. P., Nauseef, W. M., Griffith, T. S., and Apicella, M. A. Neisseria gonorrhoeae delays the onset of apoptosis in polymorphonuclear leukocytes // Cellular microbiology. - 2006. - Vol. 8. - N. 11. - P. 1780-90.

89. Roos, D., Van Brüggen, R., and Meischl, C. Oxidative killing of microbes by neutrophils // Microbes and infection / Institut Pasteur. - 2003. - Vol. 5. - N. 14. - P. 1307-15.

90. Fang, F. C. Antimicrobial reactive oxygen and nitrogen species: concepts and controversies // Nature reviews. Microbiology. - 2004. - Vol. 2. - N. 10. - P. 820-32.

91. Seib, K. L., Wu, H.-J., Kidd, S. P., Apicella, M. A., Jennings, M. P., and McEwan, A. G. Defenses against oxidative stress in Neisseria gonorrhoeae: a system tailored for a challenging environment // Microbiology and molecular biology reviews : MMBR. -2006.-Vol. 70.-N. 2.-P. 344-61.

92. Stohl, E. A., and Seifert, H. S. Neisseria gonorrhoeae DNA recombination and repair enzymes protect against oxidative damage caused by hydrogen peroxide // Journal of bacteriology.- 2006. -Vol. 188.-N. 21. - P. 7645-51.

93. LeCuyer, B. E., Criss, A. K., and Seifert, H. S. Genetic characterization of the nucleotide excision repair system of Neisseria gonorrhoeae II Journal of bacteriology. -2010.-Vol. 192.-N. 3.-P. 665-73.

94. Stohl, E. A., Criss, A. K., and Seifert, H. S. The transcriptome response of Neisseria gonorrhoeae to hydrogen peroxide reveals genes with previously uncharacterized roles in oxidative damage protection // Molecular microbiology. - 2005. - Vol. 58. - N. 2. -P. 520-32.

95. Lorenzen, D. R., Günther, D., Pandit, J., Rudel, T., Brandt, E., and Meyer, T. F. Neisseria gonorrhoeae porin modifies the oxidative burst of human professional phagocytes // Infection and immunity. - 2000. - Vol. 68. -N. 11. - P. 6215-22.

96. Kinchen, J. M., and Ravichandran, K. S. Phagosome maturation: going through the acid test // Nature reviews. Molecular cell biology. - 2008. - Vol. 9. - N. 10. - P. 78195.

97. Levy, O. Antimicrobial proteins and peptides: anti-infective molecules of mammalian leukocytes // Journal of leukocyte biology. - 2004. - Vol. 76. - N. 5. - P. 909-25.

98. Shafer, W. M., Qu, X., Waring, A. J., and Lehrer, R. I. Modulation of Neisseria gonorrhoeae susceptibility to vertebrate antibacterial peptides due to a member of the resistance/nodulation/division efflux pump family // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. - 1998. - Vol. 95. - N. 4. - P. 1829-33.

99. Lee, E. H., and Shafer, W. M. The farAB-encoded efflux pump mediates resistance of gonococci to long-chained antibacterial fatty acids // Molecular microbiology. -1999.-Vol. 33,-N. 4.-P. 839-45.

100. Tapsall, J. W., Ndowa, F., Lewis, D. a, and Unemo, M. Meeting the public health challenge of multidrug- and extensively drug-resistant Neisseria gonorrhoeae II Expert review of anti-infective therapy. - 2009. - Vol. 7. -N. 7. - P. 821-34.

101. Ashford, W. A., Golash, R. G., and Hemming, V. G. Penicillinase-producing Neisseria gonorrhoeae II Lancet. - 1976. - Vol. 2. - N. 7987. - P. 657-8.

102. Phillips, I. Beta-lactamase-producing, penicillin-resistant gonococcus // Lancet. -1976. - Vol. 2. - N. 7987. - P. 656-7.

103. Yokoi, S., Deguchi, T., Ozawa, T., Yasuda, M., Ito, S., Kubota, Y., Tamaki, M., and Maeda, S. Threat to cefixime treatment for gonorrhea // Emerging infectious diseases.-2007.-Vol. 13.-N. 8.-P. 1275-7.

104. Ohnishi, M., Saika, T., Hoshina, S., Iwasaku, K., Nakayama, S., Watanabe, H., and Kitawaki, J. Ceftriaxone-resistant Neisseria gonorrhoeae, Japan // Emerging infectious diseases.-2011.-Vol. 17.-N. l.-P. 148-9.

105. Alergant, C. D. Streptomycin resistant gonorrhoea // The British journal of venereal diseases. - 1958. - Vol. 34. - N. 1. - P. 36-7.

106. Boslego, J. W., Tramont, E. C., Takafuji, E. T., Diniega, B. M., Mitchell, B. S., Small, J. W., Khan, W. N., and Stein, D. C. Effect of spectinomycin use on the prevalence of spectinomycin-resistant and of penicillinase-producing Neisseria gonorrhoeae II The New England journal of medicine. - 1987. - Vol. 317. - N. 5. - P. 272-8.

107. Maier, T. W., Beilstein, H. R., and Zubrzycki, L. Multiple antibiotic resistance in Neisseria gonorrhoeae II Antimicrobial agents and chemotherapy. - 1974. - Vol. 6. -N. l.-P. 22-8.

108. Young, H., Moyes, A., and McMillan, A. Azithromycin and erythromycin resistant Neisseria gonorrhoeae following treatment with azithromycin // International journal of STD & AIDS. - 1997. - Vol. 8. - N. 5. - P. 299-302.

109. Morse, S. A., Johnson, S. R., Biddle, J. W., and Roberts, M. C. High-level tetracycline resistance in Neisseria gonorrhoeae is result of acquisition of streptococcal tetM determinant // Antimicrobial agents and chemotherapy. - 1986. - Vol. 30. - N. 5. - P. 664-70.

110. Belland, R. J., Morrison, S. G., Ison, C., and Huang, W. M. Neisseria gonorrhoeae acquires mutations in analogous regions of gyrA and parC in fluoroquinolone-resistant isolates //Molecular microbiology. - 1994. - Vol. 14. -N. 2. - P. 371-80.

111. Van Slyke, C. J., Arnold, R. C., and Buchholtz, M. Penicillin Therapy in Sulfonamide-Resistant Gonorrhea in Men // American journal of public health and the nation's health. - 1943. - Vol. 33. - N. 12. - P. 1392-4.

112. Kojima, M., Masuda, K., Yada, Y., Hayase, Y., Muratani, T., and Matsumoto, T. Single-dose treatment of male patients with gonococcal urethritis using 2g spectinomycin: microbiological and clinical evaluations // International journal of antimicrobial agents. - 2008. - Vol. 32. - N. 1. - P. 50-^.

113. Handsfield, H. H., Dalu, Z. A., Martin, D. H., Douglas, J. M., McCarty, J. M., and Schlossberg, D. Multicenter trial of single-dose azithromycin vs. ceftriaxone in the treatment of uncomplicated gonorrhea. Azithromycin Gonorrhea Study Group // Sexually transmitted diseases. - Vol. 21. -N. 2. - P. 107-11.

114. Lundbàck, D., Fredlund, H., Berglund, T., Wretlind, B., and Unemo, M. Molecular epidemiology of Neisseria gonorrhoeae- identification of the first presumed Swedish transmission chain of an azithromycin-resistant strain // APMIS : acta pathologica, microbiologica, et immunologica Scandinavica. - 2006. - Vol. 114. - N. 1. - P. 67-71.

115. Unemo, M., Golparian, D., Syversen, G., Vestrheim, D. F., and Moi, H. Two cases of verified clinical failures using internationally recommended first-line cefixime for gonorrhoea treatment, Norway, 2010 // Euro surveillance: bulletin européen sur les maladies transmissibles = European communicable disease bulletin. - 2010. - Vol. 15. -N. 47.

116. Unemo, M., and Nicholas, R. a. Emergence of multidrug-resistant, extensively drug-resistant and untreatable gonorrhea // Future microbiology. - 2012. - Vol. 7. - P. 1401-22.

117. Ohnishi, M., Golparian, D., Shimuta, K., Saika, T., Hoshina, S., Iwasaku, K., Nakayama, S., Kitawaki, J., and Unemo, M. Is Neisseria gonorrhoeae initiating a future era of untreatable gonorrhea?: detailed characterization of the first strain with high-level resistance to ceftriaxone // Antimicrobial agents and chemotherapy. - 2011. - Vol. 55. -N. 7.-P. 3538-45.

118. Unemo, M., Golparian, D., Nicholas, R., Ohnishi, M., Gallay, A., and Sednaoui, P. High-level cefixime- and ceftriaxone-resistant Neisseria gonorrhoeae in France: novel penA mosaic allele in a successful international clone causes treatment failure // Antimicrobial agents and chemotherapy. - 2012. - Vol. 56. - N. 3. - P. 1273-80.

119. Cámara, J., Serra, J., Ayats, J., Bastida, T., Carnicer-Pont, D., Andreu, A., and Ardanuy, C. Molecular characterization of two high-level ceftriaxone-resistant Neisseria gonorrhoeae isolates detected in Catalonia, Spain // The Journal of antimicrobial chemotherapy. - 2012. - Vol. 67.-N. 8.-P. 1858-60.

120. Galarza, P. G., Abad, R., Canigia, L. F., Buscemi, L., Pagano, I., Oviedo, C., and Vázquez, J. A. New mutation in 23S rRNA gene associated with high level of azithromycin resistance in Neisseria gonorrhoeae II Antimicrobial agents and chemotherapy.-2010.-Vol. 54.-N. 4.-P. 1652-3.

121. Chisholm, S. A., Dave, J., and Ison, C. A. High-level azithromycin resistance occurs in Neisseria gonorrhoeae as a result of a single point mutation in the 23 S rRNA genes // Antimicrobial agents and chemotherapy. - 2010. - Vol. 54. - N. 9. - P. 3812-6.

122. Dowell, D., and Kirkcaldy, R. D. Effectiveness of gentamicin for gonorrhoea treatment: systematic review and meta-analysis // Sexually transmitted infections. -2012.-Vol. 88.-N. 8.-P. 589-94.

123. Golparian, D., Fernandes, P., Ohnishi, M., Jensen, J. S., and Unemo, M. In vitro activity of the new fluoroketolide solithromycin (CEM-101) against a large collection of clinical Neisseria gonorrhoeae isolates and international reference strains, including those with high-level antimicrobial resistance: potential treatment op // Antimicrobial agents and chemotherapy. - 2012. - Vol. 56. - N. 5. - P. 2739-42.

124. Unemo, M., Golparian, D., Limnios, A., Whiley, D., Ohnishi, M., Lahra, M. M., and Tapsall, J. W. In vitro activity of ertapenem versus ceftriaxone against Neisseria gonorrhoeae isolates with highly diverse ceftriaxone MIC values and effects of ceftriaxone resistance determinants: ertapenem for treatment of gonorrhea? // Antimicrobial agents and chemotherapy. - 2012. - Vol. 56. -N. 7. - P. 3603-9.

125. Patel, A. L., Chaudhry, U., Sachdev, D., Sachdeva, P. N., Bala, M., and Saluja, D. An insight into the drug resistance profile & mechanism of drug resistance in Neisseria gonorrhoeae II The Indian journal of medical research. - 2011. - Vol. 134. - N. 4. - P. 419-31.

126. Dowson, C. G., Jephcott, A. E., Gough, K. R., and Spratt, B. G. Penicillin-binding protein 2 genes of non-beta-lactamase-producing, penicillin-resistant strains of Neisseria gonorrhoeae II Molecular microbiology. - 1989. - Vol. 3. -N. 1. - P. 35-41.

127. Spratt, B. G., Bowler, L. D., Zhang, Q. Y., Zhou, J., and Smith, J. M. Role of interspecies transfer of chromosomal genes in the evolution of penicillin resistance in pathogenic and commensal Neisseria species,// Journal of molecular evolution. - 1992. -Vol. 34.-N. 2.-P. 115-25.

128. Hagman, K. E., Pan, W., Spratt, B. G., Balthazar, J. T., Judd, R. C., and Shafer, W. M. Resistance of Neisseria gonorrhoeae to antimicrobial hydrophobic agents is

modulated by the mtrRCDE efflux system // Microbiology. - 1995. - Vol. 141 (Pt 3). -P. 611-22.

129. Veal, W. L., Nicholas, R. A., and Shafer, W. M. Overexpression of the MtrC-MtrD-MtrE efflux pump due to an mtrR mutation is required for chromosomally mediated penicillin resistance in Neisseria gonorrhoeae II Journal of bacteriology. -2002.-Vol. 184. -N. 20.-P. 5619-24.

130. Olesky, M., Hobbs, M., and Nicholas, R. A. Identification and analysis of amino acid mutations in porin IB that mediate intermediate-level resistance to penicillin and tetracycline in Neisseria gonorrhoeae II Antimicrobial agents and chemotherapy. -2002.-Vol. 46.-N. 9.-P. 2811-20.

131. Olesky, M., Zhao, S., Rosenberg, R. L., and Nicholas, R. A. Porin-mediated antibiotic resistance in Neisseria gonorrhoeae: ion, solute, and antibiotic permeation through PIB proteins with penB mutations // Journal of bacteriology. - 2006. - Vol. 188.-N. 7.-P. 2300-8.

132. Ropp, P. A., Hu, M., Olesky, M., and Nicholas, R. A. Mutations in ponA, the gene encoding penicillin-binding protein 1, and a novel locus, penC, are required for highlevel chromosomally mediated penicillin resistance in Neisseria gonorrhoeae II Antimicrobial agents and chemotherapy. - 2002. - Vol. 46. -N. 3. - P. 769-77.

133. Zhao, S., Tobiason, D. M., Hu, M., Seifert, H. S., and Nicholas, R. A. The penC mutation conferring antibiotic resistance in Neisseria gonorrhoeae arises from a mutation in the PilQ secretin that interferes with multimer stability // Molecular microbiology.-2005.-Vol. 57.-N. 5.-P. 1238-51.

134. Hu, M., Nandi, S., Davies, C., and Nicholas, R. A. High-level chromosomally mediated tetracycline resistance in Neisseria gonorrhoeae results from a point mutation in the rpsJ gene encoding ribosomal protein S10 in combination with the mtrR and penB resistance determinants // Antimicrobial agents and chemotherapy. - 2005. - Vol. 49.-N. 10.-P. 4327-34.

135. Donhofer, A., Franckenberg, S., Wickles, S., Berninghausen, O., Beckmann, R., and Wilson, D. N. Structural basis for TetM-mediated tetracycline resistance //

Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. -2012.-Vol. 109.-N. 42.-P. 16900-5.

136. Galimand, M., Gerbaud, G., and Courvalin, P. Spectinomycin resistance in Neisseria spp. due to mutations in 16S rRNA // Antimicrobial agents and chemotherapy. - 2000. - Vol. 44.-N. 5.-P. 1365-6.

137. Unemo, M., Golparian, D., Skogen, V., Olsen, A. O., Moi, H., Syversen, G., and Hjelmevoll, S. O. Neisseria gonorrhoeae strain with high-level resistance to spectinomycin due to a novel resistance mechanism (mutated ribosomal protein S5) verified in Norway // Antimicrobial agents and chemotherapy. - 2012. -N. November.

138. Deguchi, T., Yasuda, M., Nakano, M., Ozeki, S., Ezaki, T., Saito, I., and Kawada, Y. Quinolone-resistant Neisseria gonorrhoeae: correlation of alterations in the GyrA subunit of DNA gyrase and the ParC subunit of topoisomerase IV with antimicrobial susceptibility profiles // Antimicrobial agents and chemotherapy. - 1996. - Vol. 40. -N. 4.-P. 1020-3.

139. Tanaka, M., Sakuma, S., Takahashi^ K., Nagahuzi, T., Saika, T., Kobayashi, I., and Kumazawa, J. Analysis of quinolone resistance mechanisms in Neisseria gonorrhoeae isolates in vitro // Sexually transmitted infections. - 1998. - Vol. 74. - N. 1. - P. 59-62.

140. Shafer, W. M., Veal, W. L., Lee, E. H., Zarantonelli, L., Balthazar, J. T., and Rouquette, C. Genetic organization and regulation of antimicrobial efflux systems possessed by Neisseria gonorrhoeae and Neisseria meningitidis II Journal of molecular microbiology and biotechnology. - 2001. - Vol. 3. - N. 2. - P. 219-24.

141. Ng, L.-K., Martin, I., Liu, G., and Bryden, L. Mutation in 23S rRNA associated with macrolide resistance in Neisseria gonorrhoeae II Antimicrobial agents and chemotherapy. - 2002. - Vol. 46. - N. 9. - P. 3020-5.

142. Hunter, P. R., and Gaston, M. A. Numerical index of the discriminatory ability of typing systems: an application of Simpson's index of diversity // Journal of clinical microbiology. - 1988. - Vol. 26. - N. 11. - P. 2465-2466.

143. Carifo, K., and Catlin, B. W. Neisseria gonorrhoeae auxotyping: differentiation of clinical isolates based on growth responses on chemically defined media // Applied microbiology. - 1973. - Vol. 26. - N. 3. - P. 223-30.

144. Dillon, J. A., and Carballo, M. Molecular epidemiology and novel combinations of auxotype, serovar, and plasmid content in tetracycline-resistant Neisseria gonorrhoeae isolated in Canada // Canadian journal of microbiology. - 1990. - Vol. 36. - N. 1. - P. 64-7.

145. Ng, L. K., Carballo, M., and Dillon, J. A. Differentiation of Neisseria gonorrhoeae isolates requiring proline, citrulline, and uracil by plasmid content, serotyping, and pulsed-field gel electrophoresis // Journal of clinical microbiology. - 1995. - Vol. 33. -N. 4.-P. 1039-41.

146. Dillon, J. R., and Pauze, M. Relationship between plasmid content and auxotype in Neisseria gonorrhoeae isolates // Infection and immunity. - 1981. - Vol. 33. - N. 2. -P. 625-8.

147. Knapp, J. S., Tam, M. R., Nowinski, R. C., Holmes, K. K., and Sandstrom, E. G. Serological classification of Neisseria gonorrhoeae with use of monoclonal antibodies to gonococcal outer membrane protein I // The Journal of infectious diseases. - 1984. -Vol. 150.-N. 1,-P. 44-8.

148. Tam, M. R., Buchanan, T. M., Sandstrom, E. G., Holmes, K. K., Knapp, J. S., Siadak, A. W., and Nowinski, R. C. Serological classification of Neisseria gonorrhoeae with monoclonal antibodies // Infection and immunity. - 1982. - Vol. 36. - N. 3. - P. 1042-53.

149. Cooke, S. J., De la Paz, H., La Poh, C., Ison, C. A., and Heckels, J. E. Variation within serovars of Neisseria gonorrhoeae detected by structural analysis of outermembrane protein PIB and by pulsed-field gel electrophoresis // Microbiology. - 1997. -Vol. 143 (Pt 4). - P. 1415-1422.

150. Cooke, S. J., Jolley, K., Ison, C. A., Young, H., and Heckels, J. E. Naturally occurring isolates of Neisseria gonorrhoeae, which display anomalous serovar properties, express PIA/PIB hybrid porins, deletions in PIB or novel PIA molecules // FEMS microbiology letters. - 1998. - Vol. 162.-N. l.-P. 75-82.

151. Hobbs, M. M., Alcorn, T. M., Davis, R. H., Fischer, W., Thomas, J. C., Martin, I., Ison, C., Sparling, P. F., and Cohen, M. S. Molecular typing of Neisseria gonorrhoeae

causing repeated infections: evolution of porin during passage within a community // The Journal of infectious diseases. - 1999. - Vol. 179. -N. 2. - P. 371-381.

152. Li, H., and Dillon, J. A. Utility of ribotyping, restriction endonuclease analysis and pulsed-field gel electrophoresis to discriminate between isolates of Neisseria gonorrhoeae of serovar IA-2 which require arginine, hypoxanthine or uracil for growth // Journal of medical microbiology. - 1995. - Vol. 43. -N. 3. - P. 208-215.

153. Ng, L. K., and Dillon, J. R. Typing by serovar, antibiogram, plasmid content, riboprobing, and isoenzyme typing to determine whether Neisseria gonorrhoeae isolates requiring proline, citrulline, and uracil for growth are clonal // Journal of clinical microbiology. - 1993. - Vol. 31. -N. 6. - P. 1555-61.

1 54. Poh, C. L., and Lau, Q. C. Subtyping of Neisseria gonorrhoeae auxotype-serovar groups by pulsed-field gel electrophoresis // Journal of medical microbiology. - 1993. -Vol. 38.-N. 5.-P. 366-370.

155. Poh, C. L., Lau, Q. C., and Chow, V. T. Differentiation of Neisseria gonorrhoeae IB-3 and IB-7 serovars by direct sequencing of protein IB gene and pulsed-field gel electrophoresis // Journal of medical microbiology. - 1995. - Vol. 43. - N. 3. - P. 201 — 7.

156. Unemo, M., Oleen, P., Albert, J., and Fredlund, H. Comparison of serologic and genetic porB-based typing of Neisseria gonorrhoeae: consequences for future characterization // Journal of clinical microbiology. - 2003. - Vol. 41. - N. 9. - P.

4141-4147.

157. Unemo, M., Berglund, T., OlcEn, P., and Fredlund, H. Pulsed-field gel electrophoresis as an epidemiologic tool for Neisseria gonorrhoeae: identification of clusters within serovars // Sexually transmitted diseases. - 2002. - P. 25-31.

158. De la Fuente, L., and Vázquez, J. A. Multilocus enzyme analysis of African type penicillinase-producing Neisseria gonorrhoeae (PPNG) strains isolated in Spain // Sexually transmitted diseases. - 1991. - Vol. 18.-N. 3.-P. 150-2.

159. Poh, C. L., Ocampo, J. C., and Loh, G. K. Genetic relationships among Neisseria gonorrhoeae serovars analysed by multilocus enzyme electrophoresis // Epidemiology and infection. - 1992. - Vol. 108. - N. 1. - P. 31-8.

160. O'Rourke, M., and Spratt, B. G. Further evidence for the non-clonal population structure of Neisseria gonorrhoeae: extensive genetic diversity within isolates of the same electrophoretic type // Microbiology. - 1994. - Vol. 140 (Pt 6). - N. 1 994. - P. 1285-1290.

161. Gutjahr, T. S., O'Rourke, M., Ison, C. A., and Spratt, B. G. Arginine-, hypoxanthine-, uracil-requiring isolates of Neisseria gonorrhoeae are a clonal lineage within a non-clonal population 11 Microbiology. - 1997. - Vol. 143 (Pt 2). -N. 143. - P. 633-640.

162. Gascoyne-Binzi, D. M., Heritage, J., and Hawkey, P. M. Nucleotide sequences of the tet(M) genes from the American and Dutch type tetracycline resistance plasmids of Neisseria gonorrhoeae 11 The Journal of antimicrobial chemotherapy. - 1993. - Vol. 32. -N. 5.-P. 667-76.

163. Pagotto, F., Aman, A. T., Ng, L. K., Yeung, K. H., Brett, M., and Dillon, J. A. Sequence analysis of the family of penicillinase-producing plasmids of Neisseria gonorrhoeae II Plasmid. - 2000. - Vol. 43. - N. 1. - P. 24-34.

164. Falk, E. S., Bjorvatn, B., Danielsson, D., Kristiansen, B. E., Melby, K., and S0rensen, B. Restriction endonuclease fingerprinting of chromosomal DNA of Neisseria gonorrhoeae II Acta pathologica, microbiologica, et immunologica Scandinavica. Section B, Microbiology. - 1984. - Vol. 92. -N. 5. - P. 271-8.

165. Xia, M., Whittington, W. L., Holmes, K. K., Plummer, F. A., and Roberts, M. C. Pulsed-field gel electrophoresis for genomic analysis of Neisseria gonorrhoeae II The Journal of infectious diseases. - 1995.-Vol. 171.-N. 2.-P. 455-8.

166. Van Looveren, M., Ison, C. a, Ieven, M., Vandamme, P., Martin, I. M., Vermeulen, K., Renton, A., and Goossens, H. Evaluation of the discriminatory power of typing methods for Neisseria gonorrhoeae II Journal of clinical microbiology. - 1999. - Vol. 37.-N. 7. - P. 2183-2188.

167. Hamett, N., Brown, S., Riley, G., Terro, R., Krishnan, C., Pauze, M., and Yeung, K. H. Analysis of Neisseria gonorrhoeae in Ontario, Canada, with decreased susceptibility to quinolones by pulsed-field gel electrophoresis, auxotyping, serotyping

and plasmid content // Journal of medical microbiology. - 1997. - Vol. 46. - N. 5. - P. 383-90.

168. Lee, K., Chong, Y., Erdenechemeg, L., Soon Song, K., and Hun Shin, K. Incidence, epidemiology and evolution of reduced susceptibility to ciprofloxacin in Neisseria gonorrhoeae in Korea // Clinical microbiology and infection : the official publication of the European Society of Clinical Microbiology and Infectious Diseases. -1998. - Vol. 4. - N. 11. - P. 627-633.

169. Ng, L.-K., Sawatzky, P., Martin, I. E., and Booth, S. Characterization of ciprofloxacin resistance in Neisseria gonorrhoeae isolates in Canada // Sexually transmitted diseases. - 2002. - Vol. 29. - N. 12. - P. 780-8.

170. Sosa, J., Ramirez-Arcos, S., Ruben, M., Li, H., Llanes, R., Llop, A., and Dillon, J.-A. R. High percentages of resistance to tetracycline and penicillin and reduced susceptibility to azithromycin characterize the majority of strain types of Neisseria gonorrhoeae isolates in Cuba, 1995-1998 // Sexually transmitted diseases. - 2003. -Vol. 30.-N. 5.-P. 443-8.

171. Su, X., and Lind, I. Molecular basis of high-level ciprofloxacin resistance in Neisseria gonorrhoeae strains isolated in Denmark from 1995 to 1998 // Antimicrobial agents and chemotherapy. - 2001.-Vol. 45.-N. l.-P. 117-23.

172. Su, X., Hutapea, N., Tapsall, J. W., and Lind, I. Plasmid-mediated resistance of Neisseria gonorrhoeae strains isolated from female sex workers in North Sumatra, Indonesia, 1996 // Sexually transmitted diseases. - 2003. - Vol. 30. -N. 2. - P. 178-82.

173. Unemo, M., Sjostrand, A., Akhras, M., Gharizadeh, B., Lindback, E., Pourmand, N., Wretlind, B., and Fredlund, H. Molecular characterization of Neisseria gonorrhoeae identifies transmission and resistance of one ciprofloxacin-resistant strain // APMIS : acta pathologica, microbiologica, et immunologica Scandinavica. - 2007. - Vol. 115.-N. 3.-P. 231-41.

174. Yong, D., Kim, T. S., Choi, J. R., Yum, J. H., Lee, K., Chong, Y., Oh, H.-B., Shultz, T., and Tapsall, J. W. Epidemiological characteristics and molecular basis of fluoroquinolone-resistant Neisseria gonorrhoeae strains isolated in Korea and nearby

countries // The Journal of antimicrobial chemotherapy. - 2004. - Vol. 54. - N. 2. - P. 451-5.

175. Starnino, S., Suligoi, B., Regine, V., Bilek, N., Stefanelli, P., Dal Conte, I., Flanchino, B., Fianchino, B., Delmonte, S., Robbiano, F., D'Antuono, a, Mirone, E., Matteelli, a, De Francesco, M. a, Cusini, M., Scioccati, L., Di Carlo, a, Prignano, G., and Salfa, M. C. Phenotypic and genotypic characterization of Neisseria gonorrhoeae in parts of Italy: detection of a multiresistant cluster circulating in a heterosexual network // Clinical microbiology and infection : the official publication of the European Society of Clinical Microbiology and Infectious Diseases. - 2008. - Vol. 14. -N. 10. - P. 94954.

176. Morris, S. R., Moore, D. F., Hannah, P. B., Wang, S. a, Wolfe, J., Trees, D. L., Bolan, G., and Bauer, H. M. Strain typing and antimicrobial resistance of fluoroquinolone-resistant Neisseria gonorrhoeae causing a California infection outbreak // Journal of clinical microbiology. - 2009. - Vol. 47. - N. 9. - P. 2944-9.

1 77. DeMattia, A., Kornblum, J. S., Hoffman-Rosenfeld, J., Trees, D. L., Tumpey, A. J., and Laraque, D. The use of combination subtyping in the forensic evaluation of a three-year-old girl with gonorrhea // The Pediatric infectious disease journal. - 2006. -Vol. 25.-N. 5.-P. 461-3.

178. Khaki, P., Bhalla, P., Fayaz, A. M., Moradi Bidhendi, S., Esmailzadeh, M., and Sharma, P. Molecular Typing of Neisseria gonorrhoeae Isolates by Opa-Typing and Ribotyping in New Delhi, India // International journal of microbiology. - 2009. - Vol. 2009.-P. 934823.

179. Gurtler, V., and Stanisich, V. A. New approaches to typing and identification of bacteria using the 16S-23S rDNA spacer region // Microbiology. - 1996. - Vol. 142 (Pt 1).-P. 3-16.

180. O'Rourke, M., Ison, C. A., Renton, A. M., and Spratt, B. G. Opa-typing: a highresolution tool for studying the epidemiology of gonorrhoea // Molecular microbiology. - 1995. - Vol. 17. - N. 5. - P. 865-875.

181. Viscidi, R. P., Demma, J. C., Gu, J., and Zenilman, J. Comparison of sequencing of the por gene and typing of the opa gene for discrimination of Neisseria gonorrhoeae

strains from sexual contacts // Journal of clinical microbiology. - 2000. - Vol. 38. - N. 12.-P. 4430-8.

182. Morris, a K., Palmer, H. M., and Young, H. Opa-typing can identify epidemiologically distinct subgroups within Neisseria gonorrhoeae multi-antigen sequence type (NG-MAST) clusters // Epidemiology and infection. - 2008. - Vol. 136. -N.3.-P. 417-20.

183. Bilek, N., Martin, I. M., Bell, G., Kinghorn, G. R., Ison, C. a, and Spratt, B. G. Concordance between Neisseria gonorrhoeae genotypes recovered from known sexual contacts // Journal of clinical microbiology. - 2007. - Vol. 45. - N. 11. - P. 3564-7.

184. Fjeldsoe-Nielsen, H., Unemo, M., Fredlund, H., Hjorth, S. V, Berthelsen, L. M., Palmer, H. M., and Friis-Moller, a. Phenotypic and genotypic characterization of prolyliminopeptidase-negative Neisseria gonorrhoeae isolates in Denmark // European journal of clinical microbiology & infectious diseases : official publication of the European Society of Clinical Microbiology. - 2005. - Vol. 24. -N. 4. - P. 280-3.

185. Chen, Q., Yin, Y.-P., Dai, X.-Q., Yu, Y.-H., Wang, H.-C., Zhu, B.-Y., Gao, X., and Chen, X.-S. Opa typing of Neisseria gonorrhoeae strains isolated from patients attending sexually transmitted disease clinics in China // Sexually transmitted diseases.

- 2007. - Vol. 34.-N. 12. - P. 967-73.

1 86. Martin, I. M. C., Ghani, A., Bell, G., Kinghorn, G., and Ison, C. A. Persistence of two genotypes of Neisseria gonorrhoeae during transmission // Journal of clinical microbiology.-2003.-Vol. 41.-N. 12.-P. 5609-14.

187. Howie, F., Young, H., and McMillan, a. The diversity of the opa gene in gonococcal isolates from men who have sex with men // Sexually transmitted infections.

- 2004. - Vol. 80. - N. 4. - P. 286-8.

188. Palmer, H. M., Leeming, J. P., and Turner, A. Investigation of an outbreak of ciprofloxacin-resistant Neisseria gonorrhoeae using a simplified opa-typing method // Epidemiology and infection. -2001Vol. 126. -N. 2.-P. 219-24.

189. Kolader, M.-E. E., Dukers, N. H. T. M., Van der Bij, A. K., Dierdorp, M., Fennema, J. S. a, Coutinho, R. a, and Bruisten, S. M. Molecular epidemiology of Neisseria gonorrhoeae in Amsterdam, The Netherlands, shows distinct heterosexual

and homosexual networks // Journal of clinical microbiology. - 2006. - Vol. 44. -N. 8. - P. 2689-2697.

190. Moodley, P., and Martin, I. Typing of Neisseria gonorrhoeae reveals rapid reinfection in rural South Africa // Journal of clinical microbiology. - 2002. - Vol. 40. -N. 12.-P. 4567-4570.

191. Heymans, R., Golparian, D., Bruisten, S. M., Schouls, L. M., and Unemo, M. Evaluation of Neisseria gonorrhoeae multiple-locus variable-number tandem-repeat analysis, N. gonorrhoeae Multiantigen sequence typing, and full-length porB gene sequence analysis for molecular epidemiological typing // Journal of clinical microbiology.-2012.-Vol. 50.-N. l.-P. 180-183.

192. Heymans, R., Bruisten, S. M., Golparian, D., Unemo, M., De Vries, H. J. C., and Van Dam, A. P. Clonally related Neisseria gonorrhoeae isolates with decreased susceptibility to the extended-spectrum cephalosporin cefotaxime in Amsterdam, the Netherlands // Antimicrobial agents and chemotherapy. - 2012. - Vol. 56. - N. 3. - P. 1516-1522.

193. Butt, N. J., Virji, M., Vayreda, F., Lambden, P. R., and Heckels, J. E. Gonococcal outer-membrane protein PIB: comparative sequence analysis and localization of epitopes which are recognized by type-specific and cross-reacting monoclonal antibodies // Journal of general microbiology. - 1990. - Vol. 136. - N. 11. - P. 216572.

194. Fudyk, T. C., Maclean, I. W., Simonsen, J. N., Njagi, E. N., Kimani, J., Brunham, R. C., and Plummer, F. A. Genetic diversity and mosaicism at the por locus of Neisseria gonorrhoeae II Journal of bacteriology. - 1999. - Vol. 181. -N. 18. - P. 5591-9. .

195. Garvin, L. E., Bash, M. C., Keys, C., Warner, D. M., Ram, S., Shafer, W. M., and Jerse, A. E. Phenotypic and genotypic analyses of Neisseria gonorrhoeae isolates that express frequently recovered PorB PIA variable region types suggest that certain PI a porin sequences confer a selective advantage for urogenital tract infection // Infection and immunity. - 2008. - Vol. 76. - N. 8. - P. 3700-9.

196. Ilina, E. N., Oparina, N. Y., Shitikov, E. A., Borovskaya, A. D., and Govorun, V. M. Molecular surveillance of clinical Neisseria gonorrhoeae isolates in Russia // Journal of clinical microbiology. - 2010. - Vol. 48. -N. 10. - P. 3681-3689.

197. Liao, M., Bell, K„ Gu, W.-M., Yang, Y., Eng, N. F., Fu, W„ Wu, L., Zhang, C.-G., Chen, Y., Jolly, A. M., and Dillon, J.-A. R. Clusters of circulating Neisseria gonorrhoeae strains and association with antimicrobial resistance in Shanghai // The Journal of antimicrobial chemotherapy. - 2008. - Vol. 61. - N. 3. - P. 478-87.

198. Liao, M., Helgeson, S., Gu, W.-M., Yang, Y., Jolly, A. M., and Dillon, J.-A. R. Comparison of Neisseria gonorrhoeae multiantigen sequence typing and porB sequence analysis for identification of clusters of N. gonorrhoeae isolates // Journal of clinical microbiology. - 2009. - Vol. 47. - N. 2. - P. 489-91.

199. Unemo, M., Vorobieva, V., Firsova, N., Ababkova, T., Leniv, I., Haldorsen, B. C., Fredlund, H., and Skogen, V. Neisseria gonorrhoeae population in Arkhangelsk, Russia: phenotypic and genotypic heterogeneity // Clinical microbiology and infection : the official publication of the European Society of Clinical Microbiology and Infectious Diseases. - 2007. - Vol. 13. - N. 9. - P. 873-878.

200. Unemo, M., Olcen, P., and Berglund, T. Molecular epidemiology of Neisseria gonorrhoeae: sequence analysis of the porB gene confirms presence of two circulating strains//Journal of clinical microbiology. - 2002. - Vol. 40. -N. 10. - P. 3741-3749.

201. Olsen, B., Hadad, R., Fredlund, H., and Unemo, M. The Neisseria gonorrhoeae population in Sweden during 2005-phenotypes, genotypes and antibiotic resistance // APMIS : acta pathologica, microbiologica, et immunologica Scandinavica. - 2008. -Vol. 116.-N. 3.-P. 181-9.

202. Golparian, D., Hellmark, B., Fredlund, H., and Unemo, M. Emergence, spread and characteristics of Neisseria gonorrhoeae isolates with in vitro decreased susceptibility and resistance to extended-spectrum cephalosporins in Sweden // Sexually transmitted infections.-2010,-Vol. 86.-N. 6.-P. 454-60.

203. Unemo, M., Sjostrand, A., and Akhras, M. Molecular characterization of Neisseria gonorrhoeae identifies transmission and resistance of one ciprofloxacin-resistant strain

// APMIS : acta pathologica, microbiologica, et immunologica Scandinavica. - 2007. -Vol. 115.-N. 3.-P. 231-241.

204. Pérez-Losada, M., Viscidi, R. P., Demma, J. C., Zenilman, J., and Crandall, K. A. Population genetics of Neisseria gonorrhoeae in a high-prevalence community using a hypervariable outer membrane porB and 13 slowly evolving housekeeping genes // Molecular biology and evolution. - 2005. - Vol. 22. - N. 9. - P. 1887-902.

205. Posada, D., Crandall, K. A., Nguyen, M., Demma, J. C., and Viscidi, R. P. Population genetics of the porB gene oí Neisseria gonorrhoeae: different dynamics in different homology groups // Molecular biology and evolution. - 2000. - Vol. 17. - N. 3.-P. 423-36.

206. Tazi, L., Pérez-Losada, M., Gu, W., Yang, Y., Xue, L., Crandall, K. A., and Viscidi, R. P. Population dynamics of Neisseria gonorrhoeae in Shanghai, China: a comparative study // BMC infectious diseases. - 2010. - Vol. 10. - P. 13.

207. Pérez-Losada, M., Crandall, K. A., Bash, M. C., Dan, M., Zenilman, J., and Viscidi, R. P. Distinguishing importation from diversification of quinolone-resistant Neisseria gonorrhoeae by molecular evolutionary analysis // BMC evolutionary biology. - 2007. - Vol. 7. - P. 84.

208. Unemo, M., and Olcén, P. Molecular typing of Neisseria gonorrhoeae isolates by pyrosequencing of highly polymorphic segments of the porB gene // Journal of clinical microbiology. - 2004. - Vol. 42. - N. 7. - P. 2926-2934.

209. Bash, M., Zhu, P., and Gulati, S. por Variable-region typing by DNA probe hybridization is broadly applicable to epidemiologic studies of Neisseria gonorrhoeae II Journal of clinical microbiology. - 2005. - Vol. 43. -N. 4. - P. 1522-1530.

210. Ling, A. E., Bash, M. C., Lynn, F., Lister, N. A., Zhu, P., Garland, S. M., Fairley, C. K., and Tabrizi, S. N. Evaluation of PorB variable region typing of Neisseria gonorrhoeae using PCR-ELISA in samples collected from men who have sex with men // Journal of clinical laboratory analysis. - 2007. - Vol. 21. -N. 4. - P. 237-43.

211. Lynn, F., Hobbs, M. M., Zenilman, J. M., Behets, F. M. T. F., Van Damme, K., Rasamindrakotroka, A., and Bash, M. C. Genetic typing of the porin protein of Neisseria gonorrhoeae from clinical noncultured samples for strain characterization and

identification of mixed gonococcal infections // Journal of clinical microbiology. -2005. - Vol. 43. -N. 1. -P. 368-75.

212. McKnew, D. L., Lynn, F., Zenilman, J. M., and Bash, M. C. Porin variation among clinical isolates of Neisseria gonorrhoeae over a 10-year period, as determined by Por variable region typing // The Journal of infectious diseases. - 2003. - Vol. 187. -N. 8. -P. 1213-22.

213. Thompson, D. K., Deal, C. D., Ison, C. A., Zenilman, J. M., and Bash, M. C. A typing system for Neisseria gonorrhoeae based on biotinylated oligonucleotide probes to PIB gene variable regions // The Journal of infectious diseases. - 2000. - Vol. 181. -N. 5.-P. 1652-60.

214. Martin, I. M., Ison, C. A., Aanensen, D. M., Fenton, K. A., and Spratt, B. G. Rapid sequence-based identification of gonococcal transmission clusters in a large metropolitan area // The Journal of infectious diseases. - 2004. - Vol. 189. - N. 8. - P. 1497-1505.

215. Abu-Rajab, K., Palmer, H. M., Scoular, a, Church, S., Connell, J., Hart, G., and Winter, a J. To what extent does Neisseria gonorrhoeae multiantigen sequence typing of gonococcal isolates support information derived from patient interviews? // International journal of STD & AIDS. - 2009. - Vol. 20. -N. 6. - P. 414-7.

216. Palmer, H. M., Young, H., Martin, I. M. C., Ison, C. a, and Spratt, B. G. The epidemiology of ciprofloxacin resistant isolates of Neisseria gonorrhoeae in Scotland 2002: a comparison of phenotypic and genotypic analysis // Sexually transmitted infections.-2005.-Vol. 81.-N. 5.-P. 403-7.

217. Mavroidi, A., Tzelepi, E., Siatravani, E., Godoy, D., Miriagou, V., and Spratt, B. G. Analysis of emergence of quinolone-resistant gonococci in Greece by combined use of Neisseria gonorrhoeae multiantigen sequence typing and multilocus sequence typing //Journal of clinical microbiology. - 2011. - Vol. 49. -N. 4. - P. 1196-201.

218. Lindberg, R., Fredlund, H., Nicholas, R., and Unemo, M. Neisseria gonorrhoeae isolates with reduced susceptibility to cefixime and ceftriaxone: association with genetic polymorphisms in pen A, mtrR, porBlb, and ponA // Antimicrobial agents and chemotherapy.-2007.-Vol. 51.-N. 6. -P. 2117-22.

219. Glazkova, S., Golparian, D., Titov, L., Pankratova, N., Suhabokava, N., Shimanskaya, I., Domeika, M., and Unemo, M. Antimicrobial susceptibility/resistance and molecular epidemiological characteristics of Neisseria gonorrhoeae in 2009 in Belarus // APMIS : acta pathologica, microbiologica, et immunologica Scandinavica. -2011.-Vol. 119. -N. 8.-P. 537-42.

220. Ota, K. V, Fisman, D. N., Tamari, I. E., Smieja, M., Ng, L.-K., Jones, K. E., Diprima, A., and Richardson, S. E. Incidence and treatment outcomes of pharyngeal Neisseria gonorrhoeae and Chlamydia trachomatis infections in men who have sex with men: a 13-year retrospective cohort study // Clinical infectious diseases: an official publication of the Infectious Diseases Society of America. - 2009. - Vol. 48. - N. 9. -P. 1237-43.

221. Tapsall, J., Read, P., Carmody, C., Bourne, C., Ray, S., Limnios, A., Sloots, T., and Whiley, D. Two cases of failed ceftriaxone treatment in pharyngeal gonorrhoea verified by molecular microbiological methods // Journal of medical microbiology. -2009. - Vol. 58. - N. Pt 5. - P. 683-7.

222. Martin, I. M. C., Foreman, E., Hall, V., Nesbitt, A., Forster, G., and Ison, C. a. Non-cultural detection and molecular genotyping of Neisseria gonorrhoeae from a piece of clothing // Journal of medical microbiology. - 2007. - Vol. 56. - N. Pt 4. - P. 487-90.

223. Palmer, H. M., Young, H., Graham, C., and Dave, J. Prediction of antibiotic resistance using Neisseria gonorrhoeae multi-antigen sequence typing // Sexually transmitted infections. - 2008. - Vol. 84. - N. 4. - P. 280-4.

224. Maiden, M. C., Bygraves, J. A., Feil, E., Morelli, G., Russell, J. E., Urwin, R., Zhang, Q., Zhou, J., Zurth, K., Caugant, D. A., Feavers, I. M., Achtman, M., and Spratt, B. G. Multilocus sequence typing: a portable approach to the identification of clones within populations of pathogenic microorganisms // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. - 1998. - Vol. 95. - N. 6. - P. 3140-5.

225. Urwin, R., and Maiden, M. C. J. Multi-locus sequence typing: a tool for global epidemiology // Trends in microbiology. - 2003. - Vol. 11. - N. 10. - P. 479-87.

226. Bennett, J. S., Jolley, K. a, Sparling, P. F., Saunders, N. J., Hart, C. A., Feavers, I. M., and Maiden, M. C. J. Species status of Neisseria gonorrhoeae: evolutionary and epidemiological inferences from multilocus sequence typing // BMC biology. - 2007. -Vol. 5.-P. 35.

227. Viscidi, R. P., and Demma, J. C. Genetic diversity of Neisseria gonorrhoeae housekeeping genes // Journal of clinical microbiology. - 2003. - Vol. 41. - N. 1. - P. 197-204.

228. Ohnishi, M., Watanabe, Y., Ono, E., Takahashi, C., Oya, H., Kuroki, T., Shimuta, K., Okazaki, N., Nakayama, S., and Watanabe, H. Spread of a chromosomal cefixime-resistant penA gene among different Neisseria gonorrhoeae lineages // Antimicrobial agents and chemotherapy. - 2010. - Vol. 54. -N. 3. - P. 1060-7.

229. Camarena, J. J., Nogueira, J. M., Dasi, M. A., Moreno, F., Garcia, R., Ledesma, E., Llorca, J., and Hernandez, J. DNA amplification fingerprinting for subtyping Neisseria gonorrhoeae strains // Sexually transmitted diseases. - 1995. - Vol. 22. - N. 2. - P. 128-36.

230. Palmer, H., and Arnold, C. Genotyping Neisseria gonorrhoeaeUs'mg Fluorescent Amplified Fragment Length Polymorphism Analysis // Journal of clinical microbiology. - 2001. - Vol. 39. - N. 6. - P. 2325-2329.

231. Poh, C. L., Ramachandran, V., and Tapsall, J. W. Genetic diversity of Neisseria gonorrhoeae IB-2 and IB-6 isolates revealed by whole-cell repetitive element sequence-based PCR // Journal of clinical microbiology. - 1996. - Vol. 34. - N. 2. - P. 292-5.

232. Trees, D. L., Schultz, a J., and Knapp, J. S. Use of the neisserial lipoprotein (Lip) for subtyping Neisseria gonorrhoeae II Journal of clinical microbiology. - 2000. - Vol. 38.-N. 8.-P. 2914-2916.

233. Trees, D. L., Sirivongrangson, P., Schultz, A. J., Buatiang, A., Neal, S. W., Knapp, J. S., and Kilmarx, P. H. Multiclonal increase in ciprofloxacin-resistant Neisseria gonorrhoeae, Thailand, 1998-1999 // Sexually transmitted diseases. - 2002. - Vol. 29. -N. 1 l.-P. 668-73.

234. Johnson, S. R., Sandul, A. L., Parekh, M., Wang, S. A., Knapp, J. S., and Trees, D. L. Mutations causing in vitro resistance to azithromycin in Neisseria gonorrhoeae II International journal of antimicrobial agents. - 2003. - Vol. 21. -N. 5. - P. 414-9.

235. Dunning Hotopp, J. C., Grifantini, R., Kumar, N., Tzeng, Y. L., Fouts, D., Frigimelica, E., Draghi, M., Giuliani, M. M., Rappuoli, R., Stephens, D. S., Grandi, G., and Tettelin, H. Comparative genomics of Neisseria meningitidis', core genome, islands of horizontal transfer and pathogen-specific genes // Microbiology. - 2006. - Vol. 152. -N. Pt 12.-P. 3733-49.

236. Snyder, L. A. S., and Saunders, N. J. The majority of genes in the pathogenic Neisseria species are present in non-pathogenic Neisseria lactamica, including those designated as "virulence genes" 11 BMC genomics. - 2006. - Vol. 7. - P. 128.

237. Stabler, R. A., Marsden, G. L., Witney, A. A., Li, Y., Bentley, S. D., Tang, C. M., and Hinds, J. Identification of pathogen-specific genes through microarray analysis of pathogenic and commensal Neisseria species // Microbiology. - 2005. - Vol. 151. - N. Pt 9. - P. 2907-22.

238. Boom, R., Sol, C. J., Salimans, M. M., Jansen, C. L., Wertheim-van Dillen, P. M., and Van der Noordaa, J. Rapid and simple method for purification of nucleic acids // Journal of clinical microbiology. - 1990. - Vol. 28. -N. 3. - P. 495-503.

239. Ilina, E. N., Vereshchagin, V. A., Borovskaya, A. D., Malakhova, M. V, Sidorenko, S. V, Al-Khafaji, N. C., Kubanova, A. A., and Govorun, V. M. Relation between genetic markers of drug resistance and susceptibility profile of clinical Neisseria gonorrhoeae strains // Antimicrobial agents and chemotherapy. - 2008. - Vol. 52.-N. 6.-P. 2175-2182.

240. Benson, G. Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences // Nucleic Acids Res. - 1999. - Vol. 27. - N. 2. - P. 573-580.

241. Larkin, M. A., Blackshields, G., Brown, N. P., Chenna, R., McGettigan, P. A., McWilliam, H., Valentin, F., Wallace, I. M., Wilm, A., Lopez, R., Thompson, J. D., Gibson, T. J., and Higgins, D. G. Clustal W and Clustal X version 2.0 // Bioinformatics. -2007.-Vol. 23.-N. 21.-P. 2947-2948.

242. Francisco, A. P., Bugalho, M., Ramirez, M., and Carrico, J. A. Global optimal eBURST analysis of multilocus typing data using a graphie matroid approach // BMC Bioinformatics. - 2009. - Vol. 10. - P. 152.

243. Tamura, K., Peterson, D., Peterson, N., Stecher, G., Nei, M., and Kumar, S. MEGA5: molecular evolutionary genetics analysis using maximum likelihood, evolutionary distance, and maximum parsimony methods // Molecular biology and evolution. - 2011. - Vol. 28. - N. 10. - P. 2731-9.

244. Carrico, J. A., Silva-Costa, C., Melo-Cristino, J., Pinto, F. R., De Lencastre, H., Almeida, J. S., and Ramirez, M. Illustration of a common framework for relating multiple typing methods by application to macrolide-resistant Streptococcus pyogenes // Journal of clinical microbiology. - 2006. - Vol. 44. - N. 7. - P. 2524-2532.

245. Davidson, A. L., and Chen, J. ATP-binding cassette transporters in bacteria // Annual review of biochemistry. - 2004. - Vol. 73. - P. 241-68.

246. Adamczyk-Poplawska, M., Kondrzycka, A., Urbanek, K., and Piekarowicz, A. Tetra-amino-acid tandem repeats are involved in HsdS complementation in type IC restriction-modification systems // Microbiology. - 2003. - Vol. 149. - N. Pt 11. - P. 3311-3319.

247. Van Belkum, A., Tassios, P. T., Dijkshoorn, L., Haeggman, S., Cookson, B., Fry, N. K., Fussing, V., Green, J., Feil, E., Gerner-Smidt, P., Brisse, S., and Struelens, M. Guidelines for the validation and application of typing methods for use in bacterial epidemiology // Clinical microbiology and infection : the official publication of the European Society of Clinical Microbiology and Infectious Diseases. - 2007. - Vol. 13 Suppl 3.-P. 1-46.

248. European Centre for Disease Prevention and Control. EpiNorth Project. Epidemiological data. Gonorrhoea [Electronic resource] / European Centre for Disease Prevention and Control. - 2012. - http://www.epinorth.org.