Механизмы антибиотикорезистентности и молекулярная эпидемиология нозокомиальных штаммов Salmonella enterica серовар Typhimurium тема диссертации и автореферата по ВАК РФ 03.02.03, кандидат биологических наук Козырева, Варвара Константиновна
- Специальность ВАК РФ03.02.03
- Количество страниц 117
Оглавление диссертации кандидат биологических наук Козырева, Варвара Константиновна
СПИСОК ИСПОЛЬЗОВАННЫХ СОКРАЩЕНИЙ.
ВВЕДЕНИЕ.
ЧАСТЬ I. ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ.
Глава 1. Номенклатура рода Salmonella.
Глава 2. Клиническое значение нетифоидных сероваров S. enterica и эпидемиология сальмонеллеза.
Глава 3. Применение антибиотиков для терапии инфекций, вызванных нетифоидными сероварами S. enterica.
Глава 4. Антибиотикорезистентность у сальмонелл.
Глава 5. Особенности эволюции генома сальмонелл и выбор методов исследования молекулярной эпидемиологии сальмонеллезов.
ЧАСТЬ И. СОБСТВЕННЫЕ ИССЛЕДОВАНИЯ.
Глава 6. Материалы и методы исследования.
Глава 7. Результаты исследования.
Глава 8. Обсуждение.
ВЫВОДЫ.
Рекомендованный список диссертаций по специальности «Микробиология», 03.02.03 шифр ВАК
Молекулярно-генетический мониторинг в системе санитарно-эпидемиологического надзора за нозокомиальным сальмонеллезом2004 год, кандидат медицинских наук Лапа, Светлана Эдуардовна
Плазмидные характеристики различных сероваров сальмонелл и их применение в системе микробиологического мониторинга при сальмонеллезе2004 год, кандидат биологических наук Ковальчук, Наталья Ивановна
Генетическое разнообразие и фармакодинамическое обоснование прогноза резистентности к антимикробным препаратам нозокомиальных штаммов Acinetobacter spp. в различных регионах России и Беларуси2010 год, кандидат медицинских наук Мартинович, Алексей Александрович
Микробиолого-клинические параллели при сальмонеллезной инфекции2003 год, кандидат медицинских наук Раков, Алексей Владимирович
Клинико-эпидемиологические особенности и вопросы этиотропной терапии сальмонеллеза enteritidis у детей2010 год, кандидат медицинских наук Гурьева, Ольга Васильевна
Введение диссертации (часть автореферата) на тему «Механизмы антибиотикорезистентности и молекулярная эпидемиология нозокомиальных штаммов Salmonella enterica серовар Typhimurium»
Сальмонеллез является актуальной проблемой здравоохранения для всех стран без исключения: это миллионы случаев заражения и тысячи смертей в год по всему миру [206]. Клиническое проявление инфекции, вызванной нетифоидными сальмонеллами вида S. enterica подвид I, может сильно варьировать: от бессимптомного носительства и нетяжелой диареи, не требующей антимикробной терапии, до тяжелой инвазивной инфекции, такой, как бактериемия, менингит или остеомиелит, когда назначение антимикробных препаратов является необходимым. Большая часть таких осложнений приходится на долю нозокомиальных инфекций. Штаммы сальмонелл, распространяющиеся в госпитальной среде, как правило, отличаются от внебольничных изолятов множественной лекарственной устойчивостью (полирезистентностью) [3, 5].
На фоне глобального роста резистентности S. Typhimurium к ампициллину, ко-тримоксазолу, хлорамфениколу, тетрациклину, сульфаниламидам и ряду других антимикробных препаратов [83, 85, 181, 204] особенно большую тревогу вызывает появление и распространение полирезистентных штаммов, устойчивых также к цефалоспоринам III поколения (цефотаксиму, цефтриак-сону) и фторхинолонам - препаратам выбора для лечения инвазивных сальмо-неллезов [52, 71].
Проблема нозокомиального сальмонеллеза в России обозначилась в 70-е годы XX века, пик заболеваемости пришелся на 1992 г. При этом, более чем в
80% случаев нозокомиальная форма сальмонеллеза вызвана штаммами серо-типа Typhimurium [4, 5, 113, 115]. В 1999 г. в России было зарегистрировано 32 вспышки нозокомиального сальмонеллеза, в которые в общей сложности было вовлечено 472 человека [5]. До недавнего времени было несколько сообщений о распространении резистентных к цефалоспоринам S. Typhimurium в России и Беларуси. Крупные вспышки нозокомиального сальмонеллеза, вызванного полирезистентными штаммами были зарегистрированы в 1994-2003 гг. в Москве, Санкт-Петербурге, Смоленской, Минской, Гомельской, Гродненской и Витебской областях Эйдельштейном и соавт. [89]. В Гомельской области выделение цефотаксиморезистентных штаммов, продуцирующих (3-лактамазы расширенного спектра действия (БЛРС) СТХ-М-5, отмечалось позднее в 2007 г и было зафиксировано Тапальским и соавт. [180]. Помимо этого, CTX-M-5-продуцирующие штаммы S. Typhimurium выделялись в Греции, Венгрии, Латвии и США [70, 182, 207].
Клональное распространение полирезистентных штаммов S. Typhimurium в разных странах и регионах мира широко описано в литературе [71, 194, 204], однако, популяционная структура и эпидемиология нозокомиального сальмонеллеза, вызванного штаммами с множественной резистентностью, в России и соседних странах мало изучена.
ЦЕЛЬ ИССЛЕДОВАНИЯ
Определить особенности молекулярной эпидемиологии и механизмы антибиотикорезистентности цефотаксимоустойчивых нозокомиальных штаммов 5. ТурЫтипит, выделявшихся в ходе спорадических вспышек в стационарах на территории России, Беларуси и Казахстана с 1996 по 2009 гг.
ЗАДАЧИ ИССЛЕДОВАНИЯ
1. Оценить генетические связи между цефотаксиморезистентными нозо-комиальными штаммами ТурЫтипит, выделенными на территории Российской Федерации и сопредельных государств, с помощью методов молеку-лярно-генетического типирования (мультилокусного секвенирования-типирования (МЬБТ), мультилокусного анализа тандемных повторов (МЬУА) и пульс-электрофореза макрорестрикционных фрагментов геномной ДНК (РЕвЕ)).
2. Выявить генетические детерминанты, ответственные за формирование резистентности штаммов 5. ТурЫтипит к (3-лактамам и хинолонам.
3. Определить локализацию генов приобретенных (3-лактамаз и их связь с мобильными генетическими элементами.
4. Исследовать штаммы 5. ТурЫтипит на наличие фенотипа гиперму-табельности и оценить частоту возникновения мутаций резистентности к хинолонам.
НОВИЗНА ИССЛЕДОВАНИЯ
В представленной работе впервые:
1. установлена клональность цефотаксиморезистентных нозокомиаль-ных штаммов Salmonella enterica серовар Typhimurium, выделяемых на территории России, Беларуси и Казахстана, с использованием современных методов молекулярной эпидемиологии;
2. выявлены механизмы и распространение резистентности к ß-лактамам и хинолонам у штаммов, вызвавших вспышки нозокомиального сальмонеллеза в России, Беларуси и Казахстане;
3. охарактеризованы неизвестные ранее неавтоконъюгативные СТХ-М-5-кодирующие плазмиды, специфичные для описанной клональной группы S. Typhimurium.
4. показана гипермутабельность штаммов S. Typhimurium, циркулирующих в больничной среде на территории России и сопредельных государств.
ОСНОВНЫЕ ПОЛОЖЕНИЯ, ВЫНОСИМЫЕ НА ЗАЩИТУ
1. Вспышки нозокомиального сальмонеллеза на территории России, Беларуси и Казахстана с 1996 по 2009 гг. были вызваны клонально родственными цефотаксиморезистентными штаммами S. Typhimurium.
2. Резистентность к цефалоспоринам III-IV поколений у нозокомиальных штаммов S. Typhimurium обусловлена продукцией ß-лактамазы расширенного спектра действия СТХ-М-5, ген которой находится в сцеплении с мобильным элементом ISEcpl на небольшой неконъюгативной, но мобилизируемой плаз-ми де.
3. Механизмом устойчивости нозокомиальных штаммов S. Typhimurium к хинолонам является возникновение мутаций области, определяющей устойчивость к хинолонам (QRDR), гена субъединицы А ДНК-гиразы (gyrA).
4. Независимое приобретение мутаций резистентности к хинолонам разными членами описанной клональной группы является следствием гипермута-бельности изолятов.
ВНЕДРЕНИЕ РЕЗУЛЬТАТОВ РАБОТЫ В ПРАКТИКУ
Результаты исследования внедрены в практику работы микробиологической лаборатории Федерального бюджетного учреждения здравоохранения "Центр гигиены и эпидемиологии в Смоленской области" (г. Смоленск) в форме информационного письма «Рекомендации по эпидемиологическому типированию и определению чувствительности к цефалоспоринам III-IV поколений и хинолонам нозокомиальных штаммов Salmonella enterica серовар Typhimurium», утвержденного в 2011 году. Выпущенное в 2012 году на основании результатов работы информационное письмо «О внедрении новых методических подходов в практику определения антибиотикочувствительности и эпидемического типирования возбудителей нозокомиального сальмонелле-за Salmonella enterica серовар Typhimurium» явилось основой для внедрения соответствующих практических рекомендации в работу лабораторий антибио-тикорезистентности и клинической бактериологии НИИ антимикробной химиотерапии ГБОУ ВПО СГМА Минздравсоцразвития России. Также результаты работы внедрены в учебный процесс кафедры микробиологии ГБОУ ВПО СГМА Минздравсоцразвития России и используются в программах циклов повышения квалификации врачей-бактериологов и семинарах для практических врачей, проводимых в НИИ антимикробной химиотерапии ГБОУ ВПО СГМА Минздравсоцразвития России.
АПРОБАЦИЯ РАБОТЫ И НАУЧНЫЕ ПУБЛИКАЦИИ
Полученные автором результаты были представлены и обсуждены на 18-ом Европейском конгрессе по клинической микробиологии и инфекционным заболеваниям (Барселона, 2008); Заседаниях проблемной комиссии по иммунологии, иммуноморфологии и иммунопатофизиологии ГБОУ ВПО «Смоленская государственная медицинская академия» Министерства здравоохранения и социального развития Российской Федерации (Смоленск, 2008, 2012); XV Российском национальном конгрессе «Человек и лекарство» (Москва, 2008); X Международном конгрессе по антимикробной химиотерапии (Москва, 2008); Международной конференции, посвященной памяти члена-корреспондента РАМН, профессора Л.С. Страчунского «Антимикробная терапия: сегодня и завтра» (Смоленск, 2008); Конференции региональной академии антибактериальной терапии (Новосибирск, 2008); XVI Российском национальном конгрессе «Человек и лекарство» (Москва, 2009); XI Международном конгрессе МАКМАК/ЕБСМГО по антимикробной терапии (Москва, 2009); Республиканской конференции «Современные принципы рациональной антибиотикотера-пии» (Якутск, 2009); XIV Конгрессе педиатров России с международным участием «Актуальные проблему педиатрии» (Москва, 2010); XVII Российском национальном конгрессе «Человек и лекарство» (Москва, 2010); Межрегиональной научно-практической конференции «Современная антибиотикотера-пия в клинической практике» (Саратов, 2010); XII Международном конгрессе MAKMAX/ESCMID по антимикробной терапии (Москва, 2010); Региональной конференции «Современные подходы к лечению сепсиса» (Минск, 2010); III Ежегодном Всероссийском Конгрессе по инфекционным болезням (Москва,
2011); XIX Российском национальном конгрессе «Человек и лекарство» (Москва, 2012); I Республиканской научно-практической конференции «Проблемы антибиотикорезистентности в многопрофильном стационаре» (Якутск, 2012); Конференции «Безопасность и эффективность антимикробной терапии: уроки доказательной медицины» (Санкт-Петербург, 2012); Международной научно-практической конференции «Молекулярно-генетические методы исследования в медицине и биологии» (Караганда, 2012); 52-ой Междисциплинарной конференции по антимикробным препаратам и химиотерапии (Сан-Франциско,
2012); на совместном заседании сотрудников кафедр микробиологии, инфекционных болезней с эпидемиологией, инфекционных болезней у детей, поликлинической педиатрии, факультетской терапии, ЦНИЛ и НИИАХ ГБОУ ВПО «Смоленская государственная медицинская академия» Министерства здравоохранения и социального развития Российской Федерации (Смоленск, 2012).
По материалам диссертации опубликовано 9 научных работ: 4- в зарубежной и 5- в отечественной печати (из них 2 работы опубликовано в рецензируемых ВАК журналах).
ЧАСТЬ I. ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ
Похожие диссертационные работы по специальности «Микробиология», 03.02.03 шифр ВАК
Эпидемиологические особенности и профилактика нозокомиального сальмонеллеза в отделениях хирургического профиля2004 год, кандидат медицинских наук Трунилина, Раиса Александровна
Мутационная изменчивость CTX-M β-лактамаз и формирование устойчивости к цефтазидиму у клинических и лабораторных штаммов Escherichia coli2011 год, кандидат биологических наук Степанова, Марина Николаевна
Эколого-эпидемиологические особенности госпитальных инфекций и многоуровневая система эпидемиологического надзора2009 год, доктор медицинских наук Ковалишена, Ольга Васильевна
Разработка средств и совершенствование методов лечения и профилактики сальмонеллеза птиц2012 год, доктор биологических наук Пименов, Николай Васильевич
Оптимизация антибиотикотерапии нозокомиальных инфекций, вызванных Klebesiella pneumoniae, в стационарах России2006 год, кандидат медицинских наук Рябкова, Елена Леонидовна
Заключение диссертации по теме «Микробиология», Козырева, Варвара Константиновна
ВЫВОДЫ
1. По данным молекулярно-генетического типирования методами мультило-кусного секвенирования-типирования (MLST), мультилокусного анализа тан-демных повторов (MLVA) и пульс-электрофореза макрорестрикционных фрагментов геномной ДНК (PFGE) цефотаксиморезистентные штаммы Salmonella Typhimurium, вызвавшие вспышки сальмонеллеза в стационарах на территории России, Беларуси и Казахстана с 1996 по 2009 гг., принадлежат к одной клональной группе.
2. Резистентность нозокомиальных штаммов S. Typhimurium к цефалоспори-нам III-IV поколения и азтреонаму обусловлена наличием у них генетических детерминант, кодирующих ß-лактамазы расширенного спектра действия СТХ-М-5, тогда как устойчивость к ингибиторозащищенным пенициллинам связана с генами ß-лактамаз ОХА-1 типа.
3. Ген приобретенной ß-лактамазы СТХ-М-5 связан с инсерционным элементом ISEcpl и находится в составе ранее не описанных сходных между собой неавтоконъюгативных плазмид, которые способны к мобилизации другими конъюгативными плазмидами.
4. Резистентность к хинолонам во всех случаях является результатом единичных аминокислотных замен в области, определяющей устойчивость к хинолонам (QRDR), А-субъединицы ДНК-гиразы (Asn-87, Phe-83, Gly-87, Tyr-87)
5. Штаммы Salmonella Typhimurium описанной клональной группы являются гипермутабельными и характеризуются высокой частотой возникновения спонтанных мутаций резистентности к налидиксовой кислоте (~1 х Ю"5), что способствует независимому приобретению устойчивости к хинолонам.
ПРАКТИЧЕСКИЕ РЕКОМЕНДАЦИИ
1. В связи с широким распространением ß-лактамаз расширенного спектра действия, необходимо проводить регулярное определение чувствительности штаммов Salmonella Typhimurium, выделяемых в стационарах, к цефалоспори-нам III поколения.
2. Для адекватной оценки чувствительности штаммов сальмонелл к ципрофлок-сацину рекомендуется использовать обновленные критерии Института клинических и лабораторных стандартов (CLSI) 2012 г. (ципрофлоксацин «чувствительный» < 0,06 мг/л; «нечувствительный»>0,06 мг/л). Дополнительное определение чувствительности к налидиксовой кислоте является наиболее надежным способом выявления устойчивости к фторхинолонам, связанной с мутациями в хромосомном гене gyrA ДНК-гиразы.
3. Для изучения региональной и национальной эпидемиологии сальмонеллеза оптимальным является метод мультилокусного анализа тандемных повторов (MLVA), а для целей глобальной эпидемиологии- сочетание метода MLVA и мультилокусного секвенирования-типирования (MLST).
4. Выявленная нами гипермутабельность нозокомиального клона Salmonella Typhimurium способствует приобретению мутаций резистентности к ципроф-локсацину, в связи с чем назначение фторхинолонов в стационарах должно быть ограничено случаями инвазивного сальмонеллеза у взрослых при невозможности использования цефалоспоринов III поколения по причине резистентности возбудителя к ним или аллергических реакций у пациента.
5. Скрининговый тест с диском налидиксовой кислоты для выявления фенотипа гипермутабельности может явиться полезным инструментом для рутинного предсказания повышенной вероятности приобретения вторичной резистентности к фторхинолонам штаммами Salmonella Typhimurium и связанной с этим клинической неэффективности применения ципрофлоксацина для терапии ин-вазивной сальмонеллезной инфекции.
Список литературы диссертационного исследования кандидат биологических наук Козырева, Варвара Константиновна, 2012 год
1. О санитарно-эпидемиологической обстановке в Российской Федерации в 2010 году: Государственный доклад Электронный ресурс. М.: Федеральный центр гигиены и эпидемиологии Роспотребнадзора, 2011. URL: http://rospotrebnadzor.ru/.
2. О санитарно-эпидемиологической обстановке в Российской Федерации в 2007 году: Государственный доклад Электронный ресурс. М.: Федеральный центр гигиены и эпидемиологии Роспотребнадзора, 2008. URL: http://rospotrebnadzor.ru/.
3. Акимкин, В.Г. Нозокомиальный сальмонеллез как самостоятельная нозологическая форма инфекционной патологии человека // Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии. 1998. - № 4. - С. 106-110.
4. Акимкин, В.Г. Современные клинико-эпидемические аспекты нозокомиального сальмонеллеза // Медицинский алфавит. Эпидемиология и санитария. 2010. - № 3. - С. 4-9.
5. Акимкин, В.Г., Покровский, В.И. Нозокомиальный сальмонеллез взрослых. М.: Издательство РАМН, 2002. - С. 35-72.
6. Ахметова, Л.И., Розанова, С.М. Чувствительность к антимикробным препаратам штаммов шигелл и сальмонелл, выделенных в Екатеринбурге // КМАХ. 2000. - Т. 2, № 3. - С. 58-62.
7. Беляева, Т.В., Кожухова, Е.А., Кафтырева, Л.А. Чувствительность к антимикробным препаратам возбудителей, выделенных при остромшигеллезе и сальмонеллезе // Казанский медицинский журнал. 2009. -№ 3. - С. 395-399.
8. Бродов, Л.Е., Ющук, Н.Д., Малеев, В.В. Диагностика и лечение острых кишечных инфекций // Эпидемиология и инфекционные болезни. 1997.- № 4. С. 4-6.
9. Голубев, А.О., Милютина, Л.Н. Современные данные об особенностях иммунного ответа при сальмонеллезах // Инфекционные болезни. 2010.- Т. 8, № 2. С. 62-67.
10. Горелов, A.B., Малеев, В.В., Милютина, Л.Н., и др. Эмпирическая антибиотикотерапия острых кишечных инфекций у детей // Антибиотики и химиотерапия. 2001. - № 10. - С. 19-24.
11. Дворецкая, С.А. Особенности современного течения сальмонеллезной инфекции у детей раннего возраста в зависимости от типа возбудителя // Педиатрия. 1994. - № 5. - С. 98-99.
12. Дмитраченко, Т.И., Семенов, В.М. Резистентность S.typhimurium к антибактериальным препаратам // Клиническая микробиология и антимикробная химиотерапия. 2001. - № 3. - С. 12.
13. Егорова, С.А., Кожухова, Е.А., Кафтырева, Л.А., и др. Клинико-микробиологическая характеристика сальмонеллеза и шигеллеза в Санкт-Петербурге // Medline.ru. 2006. - Т. 7, № 1. - С. 531-540.
14. Егорова, С.А., Макарова, М.А., Забровская, A.B., и др. Многообразие механизмов антибиотикорезистентности сальмонелл // Инфекция и иммунитет. 2011. - Т. 1, № 4. - С. 303-310.
15. Захарова, И.Н., Андрюхина, E.H., Дмитриева, Ю.А. Инфекционные и неинфекционные диареи у детей: алгоритм диагностики и лечения // Вопросы практической педиатрии. 2009. - Т. 4, № 6. - С. 40-46.
16. Иванов, A.C. Современные представления об антибиотикорезистентности и антибактериальной терапии сальмонеллезов // Клиническая микробиология и антимикробная химиотерапия. 2009. - Т. 11, № 4. - С. 305-326.
17. Кафтырева, JI.A., Егорова, С.А., Кожухова, Е.А., и др. Резистентность энтеробактерий к антимикробным препаратам выбора при лечении острых кишечных инфекций // Казанский медицинский журнал. 2009. -Т. 90, № 5. - С. 699-704.
18. Кафтырева, JI.A., Кожухова, Е.А. Течение острой кишечной инфекции, вызванной S. Enteritidis, у взрослых и характеристика циркулирующих в Санкт-Петербурге штаммов // Вестник Санкт-Петербургского университета. 2009. - Т. 11, № 3. - С. 94-102.
19. Козлов, P.C. Нозокомиальные инфекции: эпидемиология, патогенез, профилактика, контроль // Клиническая микробиология и антимикробная химиотерапия. 2000. - Т. 2, № 1. - С. 16-30.
20. Козлова, Н.С., Гладин, Д.П., Липатова, Л.А. Антибиотикорезистентность сальмонелл, выделенных в Санкт-Петербурге и Ленинградской области в 1992-2000 гг. // Клиническая микробиология и антимикробная химиотерапия. 2001. - № 3. - С. 20.
21. Лобзин, Ю.В. Опыт применения офлоксацина для лечения острых кишеных инфекций // Антибиотики и химиотерапия. 1996. - Т. 41, № 9.- С. 96-98.
22. Милютина, Л.Н., Горелов, A.B. Сальмонеллезы у детей // Детский доктор. 1999. - № 3. - С. 10-12.
23. Милютина, Л.Н., Рожнова, С.Ш., Цешковский, И.С. Клинические аспекты лекарственной резистентности сальмонелл // Эпидемиология и инфекционные болезни. 1998. - № 1. - С. 33-37.
24. Милютина, Л.Н., Рожнова, С.Ш., Цешковский, И.С. Лекарственная резистентность сальмонелл и ее значение в клиническом сальмонеллезе у детей // Эпидемиол. и инфекц. болезни. 1997. - № 4. - С. 37.
25. Минсбург, Ц.Я. Сальмонеллез тифимуриум / Под ред. В.И. Покровского.- Кишинев: «Штиинца», 1984. 161 с.
26. Новокшонов, A.A., Мазанкова, JI.H., Соколова, H.B. Патогенетическое обоснование оптимальной терапии острых кишечных инфекций у детей // Детские инфекции. 2002. - № 1. - С. 32-38.
27. Пак, С.Г., Хохлова, Т.О., Далина, A.M. Адгезивные свойства сальмонелл в динамике инфекционного процесса // Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии. 1989. - № 11. - С. 33-36.
28. Покровский, В.И., Килессо, В. А., Ющук, Н.Д. Сальмонеллезы: этиология, эпидемиология, клиника, профилактика. Ташкент: «Медицина», 1989. - 344 с.
29. Покровский, В.И., Рише, X., Килессо, В.А. Распространение устойчивости к антибиотикам у штаммов S. typhimurium, выделенных при разных эпидемических ситуациях // Журн. микробиол. 1982. - № 12. - С. 60-65.
30. Постовит, В.А., Иванов, К.Н. Особенности клинического течения сальмонеллеза у больных пожилого и старческого возраста // Врач. дело. 1982.-№3.-С. 111-114.
31. Раков, A.B., Шубин, Ф.Н., Иванис, В.А. Сравнительная характеристика сальмонеллеза, вызванного различными плазмидоварами Salmonellaenteritidis H Эпидемиология и инфекционные болезни. 2001. - № 5. - С. 50-54.
32. Рожнова, С.Ш. Микробиологический мониторинг в системе эпидемиологического надзора за сальмонеллезами: Автореф. дис. д-ра мед. наук: 14.00.30 / ЦНИИ эпидемиологии МЗ РФ. М., 1993. - 57 с.
33. Рожнова, С.Ш. Сальмонеллезы: проблемы и решения // Эпидемиология и инфекционные болезни. 1999. - № 2. - С. 39-41.
34. Рожнова, С.Ш., Кафтырева, JI.A. Значение плазмид в эволюции возбудителей и эпидемического процесса внутрибольничных сальмонеллезов // Эпидемиол. и инфекц. болезни. 2000. - № 5. - С. 2527.
35. Салихов, В.М. Случай острого сальмонеллезного менингита у ребенка 5 месяцев // Педиатрия. 2002. - № 6. - С. 105-106.
36. Сидоренко, C.B. Ципрофлоксацин в лечении кишечных инфекций бактериальной природы // Антибиотики и химиотерапия. 1997. - Т. 42, № 6. - С. 26-33.
37. Сидоренко, C.B., Тишков, В.И. Молекулярные основы резистентности к антибиотикам // Успехи биологической химии. 2004. - Т. 44. - С. 263306.
38. Солодовников, Ю.П., Лыткина, И.Н., Филатов, И.И. Сальмонеллезы в Москве: эпидемиологическая характеристика и задачи профилактики // Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии. 1996. - № 4. - С. 46-49.
39. Степанова, М.Н. Мутационная изменчивость СТХ-М b-лактамаз и формирование устойчивости к цефтазидиму у клинических и лабораторных штаммов Escherichia coli: Автореф. дис. канд. биол. наук: 03.02.03/ СГМА. Смоленск: СГМА, 2011. - 119с.
40. Улуханова, Л.У., Идармачев, A.M., Саидов, М.З., и др. Современные клинические особенности течения сальмонеллеза Salm. Typhimurium у детей // Педиатрия. 2008. - Т. 87, № 5. - С. 150-151.
41. Хахарева, Т.П., Белова, Т.Н., Шевлягина, Т.П. Биологическая характеристика сальмонелл тифимуриум различного происхождения // Острые кишечные инфекции. 1982. - Т. 6. - С. 76-80.
42. Эйделыптейн, М.В. ß-лактамазы аэробных грамотрицательных бактерий: характеристика, основные принципы классификации, современные методы выявления и типирования // Клиническая микробиология и антимикробная химиотерапия. 2001. - Т. 3, № 3. - С. 223-242.
43. Эйделыптейн, М.В. Выявление ß-лактамаз расширенного спектра у грамотрицательных бактерий с помощью фенотипических методов. Методические рекомендации // Клиническая микробиология и антимикробная химиотерапия. 2001. - Т. 3, № 2. - С. 183-189.
44. Ющук, Н.Д. Сальмонеллез // Российский медицинский журнал. 1996. -№ 3. - С. 19-23.
45. National prevalence survey of hospital acquired infections: definitions. A preliminary report of the Steering Group of the Second National Prevalence Survey // J Hosp Infect. 1993. - Vol. 24, Issue 1. - P. 69-76.
46. Aarestrup, F.M., Wiuff, C., Molbak, K., et al. Is it time to change fluoroquinolone breakpoints for Salmonella spp.? // Antimicrob Agents Chemother. 2003. - Vol. 47, Issue 2. - P. 827-829.
47. Anil, M., Helvaci, M., Ozkalay, N., et al. Salmonella typhimurium outbreak in a neonatal unit in Turkey // Indian J Pediatr. 2009. - Vol. 76, Issue 6. - P. 629-633.
48. Arlet, G., Barrett, T.J., Butaye, P., et al. Salmonella resistant to extended-spectrum cephalosporins: prevalence and epidemiology // Microbes Infect. -2006. Vol. 8, Issue 7. - P. 1945-1954.
49. Baucheron, S., Tyler, S., Boyd, D., et al. AcrAB-TolC directs efflux-mediated multidrug resistance in Salmonella enterica serovar typhimurium DTI04 // Antimicrob Agents Chemother. 2004. - Vol. 48, Issue 10. - P. 3729-3735.
50. Bauernfeind, A., Casellas, J.M., Goldberg, M., et al. A new plasmidic cefotaximase from patients infected with Salmonella typhimurium II Infection. 1992. - Vol. 20, Issue 3. - P. 158-163.
51. Bell, R.L., Gonzalez-Escalona, N., Stones, R., et al. Phylogenetic evaluation of the 'Typhimurium' complex of Salmonella strains using a seven-gene multilocus sequence analysis // Infect Genet Evol. 2011. - Vol. 11, Issue 1. - P. 83-91.
52. Beltran, P., Plock, S.A., Smith, N.H., et al. Reference collection of strains of the Salmonella typhimurium complex from natural populations // J Gen Microbiol. 1991. - Vol. 137, Issue 3. - P. 601-606.
53. Blazquez, J. Hypermutation as a factor contributing to the acquisition of antimicrobial resistance // Clin Infect Dis. 2003. - Vol. 37, Issue 9. - P. 1201-1209.
54. Bonnet, R. Growing group of extended-spectrum beta-lactamases: the CTX-M enzymes // Antimicrob Agents Chemother. 2004. - Vol. 48, Issue 1. - P. 1-14.
55. Boonmar, S., Bangtrakulnonth, A., Pornruangwong, S., et al. Significant increase in antibiotic resistance of Salmonella isolates from human beings andchicken meat in Thailand // Vet Microbiol. 1998. - Vol. 62, Issue 1. - P. 7380.
56. Bouchrif, B., Paglietti, B., Murgia, M., et al. Prevalence and antibiotic-resistance of Salmonella isolated from food in Morocco // J Infect Dev Ctries. 2009. - Vol. 3, Issue 1. - P. 35-40.
57. Boyd, D., Cloeckaert, A., Chaslus-Dancla, E., et al. Characterization of variant Salmonella genomic island 1 multidrug resistance regions from serovars Typhimurium DTI04 and Agona // Antimicrob Agents Chemother. -2002. Vol. 46, Issue 6. - P. 1714-1722.
58. Bradford, P.A. Extended-spectrum beta-lactamases in the 21st century: characterization, epidemiology, and detection of this important resistance threat // Clin Microbiol Rev. 2001. - Vol. 14, Issue 4. - P. 933-951, table of contents.
59. Bradford, P.A., Yang, Y., Sahm, D., et al. CTX-M-5, a novel cefotaxime-hydrolyzing beta-lactamase from an outbreak of Salmonella typhimurium in Latvia II Antimicrob Agents Chemother. 1998. - Vol. 42, Issue 8. - P. 19801984.
60. Butaye, P., Michael, G.B., Schwarz, S., et al. The clonal spread of multidrug-resistant non-typhi Salmonella serotypes // Microbes Infect. 2006. - Vol. 8, Issue 7.-P. 1891-1897.
61. Chiu, C.H., Wu, T.L., Su, L.H., et al. The emergence in Taiwan of fluoroquinolone resistance in Salmonella enterica serotype choleraesuis // N Engl J Med. 2002. - Vol. 346, Issue 6. - P. 413-419.
62. Chopra, I., O'Neill, A. J., Miller, K. The role of mutators in the emergence of antibiotic-resistant bacteria // Drug Resist Updat. 2003. - Vol. 6, Issue 3. - P. 137-145.
63. Cloeckaert, A., Chaslus-Dancla, E. Mechanisms of quinolone resistance in Salmonella//Vet Res. 2001. - Vol. 32, Issue 3-4. - P. 291-300.
64. Cloeckaert, A., Schwarz, S. Molecular characterization, spread and evolution of multidrug resistance in Salmonella enterica Typhimurium DTI04 // Vet Res. 2001. - Vol. 32, Issue 3-4. - P. 301-310.
65. CLSI. Performance standards for antimicrobial susceptibility testing. -Wayne, PA, USA: Clinical and Laboratory Standards Institute, 2012. 184p.
66. Cohen, J.I., Bartlett, J.A., Corey, G.R. Extra-intestinal manifestations of salmonella infections // Medicine (Baltimore). 1987. - Vol. 66, Issue 5. - P. 349-388.
67. Didelot, X., Bowden, R., Street, T., et al. Recombination and population structure in Salmonella enterica II PLoS Genet. 2011. - Vol. 7, Issue 7. - P. el002191.
68. Dierikx, C., van Essen-Zandbergen, A., Veldman, K., et al. Increased detection of extended spectrum beta-lactamase producing Salmonella enterica and Escherichia coli isolates from poultry // Vet Microbiol. 2010. - Vol. 145, Issue 3-4. - P. 273-278.
69. Doublet, B., Lailler, R., Meunier, D., et al. Variant Salmonella genomic island 1 antibiotic resistance gene cluster in Salmonella enterica serovar Albany // Emerg Infect Dis. 2003. - Vol. 9, Issue 5. - P. 585-591.
70. Drahovska, H., Mikasova, E., Szemes, Т., et al. Variability in occurrence of multiple prophage genes in Salmonella Typhimurium strains isolated in Slovak Republic // FEMS Microbiol Lett. 2007. - Vol. 270, Issue 2. - P. 237244.
71. Edwards, R.A., Olsen, G.J., Maloy, S.R. Comparative genomics of closely related salmonellae // Trends Microbiol. 2002. - Vol. 10, Issue 2. - P. 94-99.
72. EUCAST. Breakpoint tables for interpretation of MICs and zone diameters Электронный ресурс. European Committee on Antimicrobial Susceptibility Testing, 2012. URL: www.eucast.org.
73. Foley, S.L., Lynne, A.M. Food animal-associated Salmonella challenges: pathogenicity and antimicrobial resistance // J Anim Sei. 2008. - Vol. 86, Issue 14 Suppl. - P. E173-187.
74. Galan, J.C., Tato, M., Baquero, M.R., et al. Fosfomycin and rifampin disk diffusion tests for detection of Escherichia coli mutator strains // J Clin Microbiol. 2004. - Vol. 42, Issue 9. - P. 4310-4312.
75. Gay, K., Robicsek, A., Strahilevitz, J., et al. Plasmid-mediated quinolone resistance in non-Typhi serotypes of Salmonella enterica II Clin Infect Dis. -2006. Vol. 43, Issue 3. - P. 297-304.
76. Gilbert, G.L. Using MLVA to type strains of Salmonella Typhimurium in New South Wales //NSW Public Health Bull. 2008. - Vol. 19, Issue 1-2. -P. 29-31.
77. Giraud, A., Radman, M., Matic, I., et al. The rise and fall of mutator bacteria // Curr Opin Microbiol. 2001. - Vol. 4, Issue 5. - P. 582-585.
78. Gniadkowski, M. Evolution and epidemiology of extended-spectrum beta-lactamases (ESBLs) and ESBL-producing microorganisms // Clin Microbiol Infect. 2001. - Vol. 7, Issue 11. - P. 597-608.
79. Gunell, M., Webber, M.A., Kotilainen, P., et al. Mechanisms of resistance in nontyphoidal Salmonella enterica strains exhibiting a nonclassical quinolone resistance phenotype // Antimicrob Agents Chemother. 2009. - Vol. 53, Issue 9. - P. 3832-3836.
80. Hall, L.M., Henderson-Begg, S.K. Hypermutable bacteria isolated from humans- a critical analysis // Microbiology. 2006. - Vol. 152, Issue Pt 9. - P. 2505-2514.
81. Heisig, P. High-level fluoroquinolone resistance in a Salmonella Typhimurium isolate due to alterations in both gyrA and gyrB genes // J Antimicrob Chemother. 1993. - Vol. 32, Issue 3. - P. 367-377.
82. Herikstad, H., Hayes, P., Mokhtar, M., et al. Emerging quinolone-resistant Salmonella in the United States // Emerg Infect Dis. 1997. - Vol. 3, Issue 3. -P. 371-372.
83. Heyndrickx, M., Pasmans, F., Ducatelle, R., et al. Recent changes in Salmonella nomenclature: the need for clarification // Vet J. 2005. - Vol. 170, Issue 3.-P. 275-277.
84. Hopkins, K.L., Batchelor, M.J., Liebana, E., et al. Characterisation of CTX-M and AmpC genes in human isolates of Escherichia coli identified between 1995 and 2003 in England and Wales // Int J Antimicrob Agents. 2006. -Vol. 28, Issue 3.-P. 180-192.
85. Hopkins, K.L., Peters, T.M., de Pinna, E., et al. Standardisation of multilocus variable-number tandem-repeat analysis (MLVA) for subtyping of Salmonella enterica serovar Enteritidis // Euro Surveill. 2011. - Vol. 16, Issue 32.
86. Horst, J.P., Wu, T.H., Marinus, M.G. Escherichia coli mutator genes // Trends Microbiol. 1999. - Vol. 7, Issue 1. - P. 29-36.
87. Kam, K.M. Serotype epidemiology and patterns of antibiotic susceptibilities of salmonellae isolated in Hong Kong 1983-93 // Chin Med J (Engl). 1996. -Vol. 109, Issue4.-P. 276-281.
88. Keddy, K.H., Dwarika, S., Crowther, P., et al. Genotypic and demographic characterization of invasive isolates of Salmonella Typhimurium in HIV co-infected patients in South Africa // J Infect Dev Ctries. 2009. - Vol. 3, Issue 8.-P. 585-592.
89. Kholodii, G., Yurieva, O., Mindlin, S., et al. Tn5044, a novel Tni family transposon coding for temperature-sensitive mercury resistance // Res Microbiol. 2000. - Vol. 151, Issue 4. - P. 291-302.
90. Kidgell, C., Reichard, U., Wain, J., et al. Salmonella Typhi, the causative agent of typhoid fever, is approximately 50,000 years old // Infect Genet Evol. 2002. - Vol. 2, Issue 1. - P. 39-45.
91. Kobryn, K., Chaconas, G. The circle is broken: telomere resolution in linear replicons // Curr Opin Microbiol. 2001. - Vol. 4, Issue 5. - P. 558-564.
92. Koskiniemi, S., Hughes, D., Andersson, D.I. Effect of translesion DNA polymerases, endonucleases and RpoS on mutation rates in Salmonella typhimurium // Genetics. 2010. - Vol. 185, Issue 3. - P. 783-795.
93. Krauland, M.G., Marsh, J.W., Paterson, D.L., et al. Integron-mediated multidrug resistance in a global collection of nontyphoidal Salmonella enterica isolates // Emerg Infect Dis. 2009. - Vol. 15, Issue 3. - P. 388-396.
94. Lan, R., Reeves, P.R., Octavia, S. Population structure, origins and evolution of major Salmonella enterica clones // Infect Genet Evol. 2009. - Vol. 9, Issue 5.-P. 996-1005.
95. Lartigue, M.F., Poirel, L., Nordmann, P. Diversity of genetic environment of ¿>fo(CTX-M) genes // FEMS Microbiol Lett. 2004. - Vol. 234, Issue 2. - P. 201-207.
96. LeClerc, J.E., Li, В., Payne, W.L., et al. High mutation frequencies among Escherichia coli and Salmonella pathogens // Science. 1996. - Vol. 274, Issue 5290. - P. 1208-1211.
97. Leclercq, R., Canton, R., Brown, D.F., et al. EUCAST expert rules in antimicrobial susceptibility testing // Clin Microbiol Infect. 2011. - doi: 10.111 l/j.1469-0691.2011.03703.x.
98. Lindstedt, B.A. Genotyping of selected bacterial enteropathogens in Norway // Int J Med Microbiol. 2011. - Vol. 301, Issue 8. - P. 648-653.
99. Litrup, E., Torpdahl, M., Malorny, В., et al. DNA microarray analysis of Salmonella serotype Typhimurium strains causing different symptoms of disease // BMC Microbiol. 2010. - Vol. 10. - P. 96.
100. Liu, W.B., Liu, В., Zhu, X.N., et al. Diversity of Salmonella isolates using serotyping and multilocus sequence typing // Food Microbiol. 2011. - Vol. 28, Issue 6. - P. 1182-1189.
101. Livermore, D.M. beta-Lactamases in laboratory and clinical resistance // Clin Microbiol Rev. 1995. - Vol. 8, Issue 4. - P. 557-584.
102. Llanes, C., Kirchgesner, V., Plesiat, P. Propagation of TEM- and PSE-type beta-lactamases among amoxicillin-resistant Salmonella spp. isolated in France // Antimicrob Agents Chemother. 1999. - Vol. 43, Issue 10. - P. 2430-2436.
103. Mammeri, H., Nazic, H., Naas, T., et al. AmpC beta-lactamase in an Escherichia coli clinical isolate confers resistance to expanded-spectrum cephalosporins // Antimicrob Agents Chemother. 2004. - Vol. 48, Issue 10. -P. 4050-4053.
104. Martinez-Martinez, L., Eliecer Cano, M., Manuel Rodriguez-Martinez, J., et al. Plasmid-mediated quinolone resistance // Expert Rev Anti Infect Ther. -2008. Vol. 6, Issue 5. - P. 685-711.
105. Martinez-Martinez, L., Pascual, A., Jacoby, G.A. Quinolone resistance from a transferable plasmid // Lancet. 1998. - Vol. 351, Issue 9105. - P. 797-799.
106. McQuiston, J.R., Parrenas, R., Ortiz-Rivera, M., et al. Sequencing and comparative analysis of flagellin genes fliC,fljB, and flpA from Salmonella // J Clin Microbiol. 2004. - Vol. 42, Issue 5. - P. 1923-1932.
107. Medalla, F., Sjolund-Karlsson, M., Shin, S., et al. Ciprofloxacin-resistant Salmonella enterica Serotype Typhi, United States, 1999-2008 // Emerg Infect Dis. 2011. - Vol. 17, Issue 6. - P. 1095-1098.
108. Miriagou, V., Tzouvelekis, L.S., Rossiter, S., et al. Imipenem resistance in a Salmonella clinical strain due to plasmid-mediated class A carbapenemase KPC-2 // Antimicrob Agents Chemother. 2003. - Vol. 47, Issue 4. - P. 12971300.
109. Mmolawa, P.T., Willmore, R., Thomas, C.J., et al. Temperate phages in Salmonella enterica serovar Typhimurium: implications for epidemiology // Int J Med Microbiol. 2002. - Vol. 291, Issue 8. - P. 633-644.
110. Modrich, P., Lahue, R. Mismatch repair in replication fidelity, genetic recombination, and cancer biology // Annu Rev Biochem. 1996. - Vol. 65. -P. 101-133.
111. Naas, T., Lezzar, A., Bentchouala, C., et al. Multidrug-resistant Salmonella enterica serotype Senftenberg isolates producing CTX-M beta-lactamases from Constantine, Algeria // J Antimicrob Chemother. 2005. - Vol. 56, Issue 2. - P. 439-440.
112. Nakaya, H., Yasuhara, A., Yoshimura, K., et al. Life-threatening infantile diarrhea from fluoroquinolone-resistant Salmonella enterica Typhimurium with mutations in both gyrA and parC II Emerg Infect Dis. 2003. - Vol. 9, Issue 2. - P. 255-257.
113. Nelson, J.D., Kusmiesz, H., Jackson, L.H., et al. Treatment of Salmonella gastroenteritis with ampicillin, amoxicillin, or placebo // Pediatrics. 1980. -Vol. 65, Issue 6.-P. 1125-1130.
114. Nelson, K., Selander, R.K. Intergeneric transfer and recombination of the 6-phosphogluconate dehydrogenase gene (gnd) in enteric bacteria // Proc Natl Acad Sci USA.- 1994. Vol. 91, Issue 21. - P. 10227-10231.
115. Nishino, K., Latifi, T., Groisman, E.A. Virulence and drug resistance roles of multidrug efflux systems of Salmonella enterica serovar Typhimurium // Mol Microbiol. 2006. - Vol. 59, Issue 1. - P. 126-141.
116. Noda, T., Murakami, K., Asai, T., et al. Multi-locus sequence typing of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Enteritidis strains in Japan between 1973 and 2004 // Acta Vet Scand. 2011. - Vol. 53.- P. 38.
117. Nuesch-Inderbinen, M.T., Kayser, F.H., Hachler, H. Survey and molecular genetics of SHV beta-lactamases in Enterobacteriaceae in Switzerland: two novel enzymes, SHV-11 and SHV-12 // Antimicrob Agents Chemother. -1997. Vol. 41, Issue 5. - P. 943-949.
118. O'Brien, S.J., de Valk, H. Salmonella "old" organism, continued challenges ! //Euro Surveill. - 2003. - Vol. 8, Issue 2. - P. 29-31.
119. Ochman, H., Lawrence, J.G., Groisman, E.A. Lateral gene transfer and the nature of bacterial innovation // Nature. 2000. - Vol. 405, Issue 6784. - P. 299-304.
120. Olsen, S.J., DeBess, E.E., McGivern, T.E., et al. A nosocomial outbreak of fluoroquinolone-resistant salmonella infection // N Engl J Med. 2001. - Vol. 344, Issue 21.-P. 1572-1579.
121. Orlen, H., Hughes, D. Weak mutators can drive the evolution of fluoroquinolone resistance in Escherichia coli II Antimicrob Agents Chemother. 2006. - Vol. 50, Issue 10. - P. 3454-3456.
122. Orman, B.E., Pineiro, S.A., Arduino, S., et al. Evolution of multiresistance in nontyphoid salmonella serovars from 1984 to 1998 in Argentina // Antimicrob Agents Chemother. 2002. - Vol. 46, Issue 12. - P. 3963-3970.
123. Pang, S., Octavia, S., Reeves, P.R., et al. Genetic Relationships of Phage Types and Single Nucleotide Polymorphism Typing of Salmonella enterica Serovar Typhimurium // J Clin Microbiol. 2012. - Vol. 50, Issue 3. - P. 727734.
124. Prabha Adhikari, M.R., Baliga, S. Ciprofloxacin-resistant typhoid with incomplete response to cefotaxime // J Assoc Physicians India. 2002. - Vol. 50. - P. 428-429.
125. Ramisse, V., Houssu, P., Hernandez, E., et al. Variable number of tandem repeats in Salmonella enterica subsp. enterica for typing purposes // J Clin Microbiol. 2004. - Vol. 42, Issue 12. - P. 5722-5730.
126. Robicsek, A., Strahilevitz, J., Jacoby, G.A., et al. Fluoroquinolone-modifying enzyme: a new adaptation of a common aminoglycoside acetyltransferase // Nat Med. 2006. - Vol. 12, Issue 1. - P. 83-88.
127. Robins-Browne, R.M., Rowe, B., Ramsaroop, R., et al. A hospital outbreak of multiresistant Salmonella Typhimurium belonging to phage type 193 // J Infect Dis. 1983. - Vol. 147, Issue 2. - P. 210-216.
128. Rossi, A., Lopardo, H., Woloj, M., et al. Non-typhoid Salmonella spp. resistant to cefotaxime // J Antimicrob Chemother. 1995. - Vol. 36, Issue 4. -P. 697-702.
129. Savard, P., Gopinath, R., Zhu, W., et al. First NDM-positive Salmonella sp. strain identified in the United States // Antimicrob Agents Chemother. 2011. - Vol. 55, Issue 12. - P. 5957-5958.
130. Strahilevitz, J., Jacoby, G.A., Hooper, D.C., et al. Plasmid-mediated quinolone resistance: a multifaceted threat // Clin Microbiol Rev. 2009. -Vol. 22, Issue 4. - P. 664-689.
131. Struelens, M.J., Rost, F., Deplano, A., et al. Pseudomonas aeruginosa and Enterobacteriaceae bacteremia after biliary endoscopy: an outbreak investigation using DNA macrorestriction analysis // Am J Med. 1993. -Vol. 95, Issue 5. - P. 489-498.
132. Su, L.H., Chiu, C.H. Salmonella: clinical importance and evolution of nomenclature // Chang Gung Med J. 2007. - Vol. 30, Issue 3. - P. 210-219.
133. Summers, A.O. Generally overlooked fundamentals of bacterial genetics and ecology // Clin Infect Dis. 2002. - Vol. 34, Suppl. 3. - P. 85-92.
134. Sun, Y., Zeng, Z., Chen, S., et al. High prevalence of bla(CTX-M) extended-spectrum beta-lactamase genes in Escherichia coli isolates from pets and emergence of CTX-M-64 in China // Clin Microbiol Infect. 2010. - Vol. 16, Issue 9. - P. 1475-1481.
135. Swaminathan, B., Barrett, T.J., Hunter, S.B., et al. PulseNet: the molecular subtyping network for foodborne bacterial disease surveillance, United States // Emerg Infect Dis. 2001. - Vol. 7, Issue 3. - P. 382-389.
136. Tamang, M.D., Nam, H.M., Kim, A., et al. Prevalence and mechanisms of quinolone resistance among selected nontyphoid Salmonella isolated from food animals and humans in Korea // Foodborne Pathog Dis. 2011. - Vol. 8, Issue 11. - P. 1199-1206.
137. Tapalski, D., Hendriksen, R.S., Hasman, H., et al. Molecular characterisation of multidrug-resistant Salmonella enterica serovar Typhimurium isolates from Gomel region, Belarus // Clin Microbiol Infect. 2007. - Vol. 13, Issue 10. -P. 1030-1033.
138. Tassios, P.T., Gazouli, M., Tzelepi, E., et al. Spread of a Salmonella Typhimurium clone resistant to expanded-spectrum cephalosporins in three European countries // J Clin Microbiol. 1999. - Vol. 37, Issue 11. - P. 37743777.
139. Tenover, F.C., Arbeit, R.D., Goering, R.V., et al. Interpreting chromosomal DNA restriction patterns produced by pulsed-field gel electrophoresis: criteria for bacterial strain typing // J Clin Microbiol. 1995. - Vol. 33, Issue 9. - P. 2233-2239.
140. Threlfall, E.J. Antimicrobial drug resistance in Salmonella: problems and perspectives in food- and water-borne infections // FEMS Microbiol Rev. -2002. Vol. 26, Issue 2. - P. 141-148.
141. Threlfall, E.J., Skinner, J.A., Graham, A., et al. Resistance to ceftriaxone and cefotaxime in non-typhoidal Salmonella enterica in England and Wales, 199899 // J Antimicrob Chemother. 2000. - Vol. 46, Issue 5. - P. 860-862.
142. Tindall, B.J., Grimont, P.A., Garrity, G.M., et al. Nomenclature and taxonomy of the genus Salmonella // Int J Syst Evol Microbiol. 2005. - Vol. 55, Issue Pt 1. - P. 521-524.
143. Torpdahl, M., Sorensen, G., Ethelberg, S., et al. A regional outbreak of S. Typhimurium in Denmark and identification of the source using MLVA typing // Euro Surveill. 2006. - Vol. 11, Issue 5. - P. 134-136.
144. Turner, A.K., Nair, S., Wain, J. The acquisition of full fluoroquinolone resistance in Salmonella Typhi by accumulation of point mutations in the topoisomerase targets // J Antimicrob Chemother. 2006. - Vol. 58, Issue 4. -P. 733-740.
145. Velge, P., Cloeckaert, A., Barrow, P. Emergence of Salmonella epidemics: the problems related to Salmonella enterica serotype Enteritidis and multiple antibiotic resistance in other major serotypes // Vet Res. 2005. - Vol. 36, Issue 3. - P. 267-288.
146. Wasyl, D., Sandvang, D., Skov, M.N., et al. Epidemiological characteristics of Salmonella Typhimurium isolated from animals and feed in Poland // Epidemiol Infect. 2006. - Vol. 134, Issue 1. - P. 179-185.
147. Weigel, L.M., Steward, C.D., Tenover, F.C. gyrA mutations associated with fluoroquinolone resistance in eight species of Enterobacteriaceae II Antimicrob Agents Chemother. 1998. - Vol. 42, Issue 10. - P. 2661-2667.
148. Whichard, J.M., Gay, K., Stevenson, J.E., et al. Human Salmonella and concurrent decreased susceptibility to quinolones and extended-spectrum cephalosporins // Emerg Infect Dis. 2007. - Vol. 13, Issue 11. - P. 16811688.
149. Yan, J.J., Chiou, C.S., Lauderdale, T.L., et al. Cephalosporin and ciprofloxacin resistance in Salmonella, Taiwan // Emerg Infect Dis. 2005. -Vol. 11, Issue 6. - P. 947-950.
150. Yan, J.J., Ko, W.C., Chiu, C.H., et al. Emergence of ceftriaxone-resistant Salmonella isolates and rapid spread of plasmid-encoded CMY-2-like cephalosporinase, Taiwan // Emerg Infect Dis. 2003. - Vol. 9, Issue 3. - P. 323-328.
151. Yang, B., Zheng, J., Brown, E.W., et al. Characterisation of antimicrobial resistance-associated integrons and mismatch repair gene mutations in Salmonella serotypes // Int J Antimicrob Agents. 2009. - Vol. 33, Issue 2. -P. 120-124.
152. Yates, C., Amyes, S. Extended-spectrum beta-lactamases in non-typhoidal Salmonella spp. isolated in the UK are now a reality: why the late arrival? // J Antimicrob Chemother. 2005. - Vol. 56, Issue 2. - P. 262-264.
153. Yates, C.M., Brown, D.J., Edwards, G.F., et al. Detection of TEM-52 in Salmonella enterica. serovar Enteritidis isolated in Scotland // J Antimicrob Chemother. 2004. - Vol. 53, Issue 2. - P. 407-408.
154. Yu, F., Chen, Q., Yu, X., et al. High prevalence of extended-spectrum beta lactamases among Salmonella enterica Typhimurium isolates from pediatric patients with diarrhea in China // PLoS One. 2011. - Vol. 6, Issue 3. - P. el6801.
155. WMabilat, C., Goussard, S. PCR detection and identification of genes for extended-spectrum b-lactamases // Diagnostic molecular microbiology: principles and applications. 1993. - P. 553-562.
156. WHO. Drug-resistant salmonella. Fact sheet №139 Электронный ресурс. -2005. URL: http://www.who.int/mediacentre/factsheets/fsl39/en/.
Обратите внимание, представленные выше научные тексты размещены для ознакомления и получены посредством распознавания оригинальных текстов диссертаций (OCR). В связи с чем, в них могут содержаться ошибки, связанные с несовершенством алгоритмов распознавания. В PDF файлах диссертаций и авторефератов, которые мы доставляем, подобных ошибок нет.