Мутации генов c-Kit и PDGFRA и клинико-морфологические особенности стромальных опухолей желудочно-кишечного тракта тема диссертации и автореферата по ВАК РФ 14.01.12, кандидат биологических наук Цыганова, Ирина Викторовна

• Цыганова, Ирина Викторовна
• кандидат биологических наук
• 2010

Оглавление диссертации кандидат биологических наук Цыганова, Ирина Викторовна

Введение

1. Обзор литературы

1.1. Клинико-морфологические особенности стромальных опухолей ЖКТ

1.1.1. Клиническая характеристика стромальных опухолей 10 ЖКТ

1.1.2. Морфологическая характеристика стромальных 14 опухолей ЖКТ

1.1.3. Иммуногистохимическая характеристиха 18 стромальных опухолей ЖКТ

1.1.4. Оценка риска злокачественности и прогностические 24 факторы стромальных опухолей ЖКТ

1.2. Молекулярный патогенез стромальных опухолей ЖКТ

1.2.1. Общая характеристика мутаций генов с-Кії и 33 РОСРКА

1.2.2. Первичные мутации гена c-K.it в стромальных 36 опухолях ЖКТ

1.2.3. Первичные мутации гена РОСГЯА в стромальных 41 опухолях ЖКТ

1.3. Мутации и клинико-морфологические характеристики стромальных опухолей ЖКТ

1.4. Лечение стромальных опухолей ЖКТ

2. Материалы и методы

2.1. Общая характеристика материала

2.2. Методы исследования

2.2.1. Иммуногистохимическое исследование

2.2.2. Микродиссекция парафиновых срезов стромальных 52 опухолей ЖКТ и выделение ДНК

2.2.3. Выделение геномной ДНК из операционных 53 опухолевой ткани

2.2.4. Анализ мутаций в генах с-КЫ и РОСГЯА в 53 стромальных опухолях ЖКТ

2.2.5. Разделение ПЦР-продуктов методом электрофореза в 56 агарозном геле

2.2.6. Очистка ПЦР-продуктов для секвенирования

2.2.7. Анализ результатов прямого секвенирования

2.2.8. Статистическая обработка данных

2.2.9. Список используемых растворов

3. Результаты собственных исследований

3.1. Клинико-морфологическая характеристика GIST

3.2. Иммуногистохимическая характеристика стромальных 74 опухолей ЖКТ

3.3. Мутационный статус стромальных опухолей ЖКТ

3.3.1. Мутации гена c-Kit

3.3.2. Мутации гена PDGFRA

3.3.3. Стромальные опухоли ЖКТ дикого типа

4. Сопоставление молекулярно-генетических и клинико- 101 морфологических параметров GIST

Введение диссертации (часть автореферата) на тему «Мутации генов c-Kit и PDGFRA и клинико-морфологические особенности стромальных опухолей желудочно-кишечного тракта»

Опухоли характеризуются большим спектром генетических нарушений. Среди генетических событий, приводящих к злокачественным новообразованиям, наиболее частыми и удобными для диагностики являются соматические мутации. Примером того, что мутационный анализ важен для диагностики, прогноза и терапии опухолей являются стромальные опухоли желудочно-кишечного тракта или GIST (gastrointestinal stromal tumors). Почти одновременное открытие мутаций в онкогенах, кодирующих тирозинкиназные рецепторы KIT и PDGFRa, и создание ингибиторов тирозинкиназ привели к значительным успехам в понимании биологии этих опухолей и разработке терапии на основе новых молекулярно-направленных препаратов.

Гастроинтестинальные стромальные опухоли - наиболее распространенная группа мезенхимальных опухолей желудочно-кишечного тракта (15-20 случаев на миллион жителей). Они выделены в отдельную нозологию в 2000г. на основании молекулярно-генетической особенности - активации экспрессии гена c-Kit за счет мутации. Иммуногистохимически стромальные опухоли желудочно-кишечного тракта (ЖКТ) отличаются от других сарком ЖКТ высокой экспрессией маркера CD 117, который представляет собой рецептор фактора роста стволовых клеток - тирозинкиназу KIT. GIST возникают в разных отделах желудочно-кишечного тракта из предшественников интерстициальных клеток Кахаля, регулирующих перистальтику.

Стромальные опухоли ЖКТ чрезвычайно гетерогенны по клинико-морфологическим характеристикам: локализации, размеру, гистологическому типу клеток, пролиферативной активности и уровню злокачественности. Они также различаются по типу и локализации мутации: до 80% стромальных опухолей ЖКТ имеют активирующую мутацию в одном из экзонов гена c-Kit (экзоны 9, 11, 13 и 17), 5-7% - в близкородственном гене PDGFRA (экзоны 12, 14 и 18), кодирующем а-рецептор тромбоцитарного фактора роста и 10-15% GIST содержат c-Kit и PDGFRA дикого типа. Большой интерес вызывает сравнение типа и положения мутации с локализацией, морфологическим типом клеток и степенью злокачественности GIST. Важно отметить, что определение мутации может иметь диагностическое значение, так как некоторые опухоли экспрессируют CD 117, но не являются GIST, тогда как есть стромальные опухоли ЖКТ, экспрессирующие CD 117, но не содержащие мутации c-Kit.

Основным видом лечения GIST является хирургическое удаление опухоли, однако у половины больных в течение 5 лет появляются рецидивы или метастазы. Интерес к стромальным опухолям ЖКТ возрос после того, как появились успехи в лечении их ингибиторами тирозинкиназ. Ответ GIST на молекулярно-направленную (таргетную) терапию зависит от типа мутации. Иматиниб мезилат (гливек, Novartis) -препарат первой линии лечения неоперабельных и метастатических GIST, с 2009г. рекомендован для адьювантной терапии. Наиболее чувствительны к нему опухоли с мутациями в 11 экзоне гена c-Kit, для лечения стромальных опухолей тонкой кишки с мутацией 9 экзона требуется двойная доза иматиниба, a GIST с мутацией рецептора PDGFRa (D842V) -нечувствительны к иматинибу. В случаях, когда иматиниб не эффективен, целесообразно назначение сунитиниб малата (сутент, Sugen) для больных с мутацией в 9 или 13 экзоне c-Kit либо c-Kit дикого типа, или нилотиниба (тасигна, Novartis) для GIST с мутацией в 13 или 17 экзоне c-Kit.

Таким образом, определение мутации в генах c-Kit и PDGFRA необходимо для определения индивидуальной чувствительности пациента к терапии таргетными препаратами. Особый интерес представляет сопоставление данных молекулярно-генетического анализа с клинико-морфологическими характеристиками GIST для определения прогностической значимости мутаций рецепторов. В России подобные исследования не проводились.

Цель исследования

Целью работы является анализ мутаций генов c-Kit и PDGFRA в стромальных опухолях желудочно-кишечного тракта и сопоставление генетических и клинико-морфологических данных для оптимизации условий выбора препарата таргетной терапии и определения прогностической значимости мутаций. Задачи исследования

1. Создать банк образцов стромальных опухолей ЖКТ (парафиновые блоки, свежезамороженные операционные биопсии).

2. Исследовать клинико-морфологические и иммуногистохимические характеристики стромальных опухолей ЖКТ.

3. Провести анализ мутаций 9, 11, 13 и 17 экзонов гена c-Kit.

4. Провести анализ мутаций 12, 14 и 18 экзонов гена PDGFRA.

5. Сопоставить молекулярно-генетические данные (тип и частота мутаций) стромальных опухолей ЖКТ с клинико-морфологическими характеристиками для определения индивидуальной чувствительности к таргетной терапии.

6. На основании анализа молекулярно-генетических данных и клинико-морфологических характеристик оценить диагностическую и прогностическую значимость мутационного статуса стромальных опухолей ЖКТ.

Новизна темы

Впервые получены данные о частоте мутаций генов c-Kit и PDGFRA у российских больных стромальными опухолями ЖКТ. Выявлены особенности: высокая частота GIST c-Kit дикого типа, с мутациями

PDGFRA, низкая частота точечных замен в 11 экзоне c-Kit, редки мутации D842V в 18 экзоне PDGFRA. Обнаружены новые (в 11 и 13 экзонах c-Kit), и редкие мутации (в 10 интроне - 11 экзоне c-Kit, в 17 экзоне c-Kit). При сопоставлении результатов молекулярно-генетического анализа с клинико-морфологическими данными показано, что существует корреляция в типе и частоте мутации с особенностями морфологии, иммуногистохимической характеристикой опухоли и клиническим течением заболевания.

Впервые в России проведена оценка выживаемости больных GIST в зависимости от степени злокачественности опухоли, от локализации опухоли и типа мутации до применения таргетной терапии иматинибом. Впервые проведен анализ вторичных мутаций, вызванных терапией иматинибом. Получены убедительные данные, что тип и локализация мутации могут быть важным параметром для определения индивидуальной чувствительности к таргетной терапии, а также для прогноза стромальных опухолей ЖКТ.

Научно-практическая значимость исследования

Результаты анализа мутаций генов c-Kit и PDGFRA были использованы при дифференциальной диагностике мезенхимальных опухолей ЖКТ. Оценена прогностическая значимость различных клинико-морфологических и имуногистохимических параметров GIST.

Впервые в России на основе молекулярно-генетического анализа мутаций и сопоставлении их с клинико-морфологическими данными показана связь клинических и генетических параметров с прогнозом заболевания GIST. Изучена прогностическая значимость мутаций до применения тирозинкиназных ингибиторов. Полученные результаты были использованы при назначении больным GIST препаратов молекулярно-направленной терапии в РОНЦ им. Н.Н.Блохина РАМН и других клиниках.

Заключение диссертации по теме «Онкология», Цыганова, Ирина Викторовна

Выводы

1. Выявлены клинико-морфологические особенности стромальных опухолей ЖКТ в России: преобладание стромальных опухолей у женщин, высокая частота опухолей с эпителиоидным и смешанным типом клеточного строения. Выживаемость больных стромальными опухолями ЖКТ зависит от локализации (р=0,016), размера опухоли (р=0,0013) и степени злокачественности по системе FNCLCC (р=0,0015).

2. Впервые в России проведен анализ мутаций в ДНК из 120 стромальных опухолей ЖКТ: мутации гена c-Kit выявлены в 83,3% GIST, гена PDGFRA - в 9,2% GIST, в 6,7% стромальных опухолей ЖКТ мутации генов c-Kit и PDGFRA не обнаружены.

3. Наиболее часто в стромальных опухолях различной локализации встречаются мутации в 11 экзоне гена c-Kit (68,3%), мутации 9 экзона выявлены в 14,9% опухолей, преимущественно тонкой кишки, мутации в 13 и 17 экзонах гена c-Kit - в трех опухолях желудка.

4. Мутации 11 экзона гена c-Kit представлены делециями (41,7%), 50/120) и точечными заменами на 5'-конце (12,5%, 15/120). В отдельную группу выделены стромальные опухоли ЖКТ с делециями в центральной части 11 экзона c-Kit (7,5%, 9/120), которые отличаются высокой злокачественностью и низким уровнем экспрессии маркера CD 117. Дупликации на 3'-конце 11 экзона ЖКТ (7,5%, 9/120) впервые обнаружены не только в стромальных опухолях желудка у женщин пожилого возраста, но и у мужчин.

5. Мутации гена PDGFRA (делеции и точечные замены) обнаружены исключительно в 18 экзоне в 9,2% (11/120), преимущественно в стромальных опухолях желудка с эпителиоидным типом клеточного строения, обращает внимание низкий процент замен D842V (2,5%, 3/120).

6. Выявлены ранее неописанные (точечные замены в 11, 13 экзонах с-КИ и 18 экзоне РОСРЯЛ), а также редкие мутации (делеция интрона 10 -экзона 11 гена c-K.it, дупликация 9 экзона c-K.it в стромальной опухоли желудка и другие).

7. Оценка выживаемости больных стромальными опухолями ЖКТ до терапии иматинибом показала наиболее высокую выживаемость у больных с мутациями гена РЭОГРА. Среди больных с мутациями гена с-К'й наилучшая выживаемость у больных с дупликациями и точечными заменами 11 экзона, тогда как делеции 11 экзона и мутации 9 экзона гена с-КИ коррелируют с плохим прогнозом.

Список литературы диссертационного исследования кандидат биологических наук Цыганова, Ирина Викторовна, 2010 год

1. Анурова, O.A. Морфологическая характеристика стромальных опухолей желудочно-кишечного тракта / O.A. Анурова, П.В. Снигур, H.A. Филиппова, Сельчук В.Ю. // Арх. Пат. 2006. Т. 1, №68. С. 10-13.

2. Казанцева, И.А. Морфологические особенности GIST / И.А. Казанцева // Современная онкология: журнал кафедры онкологии РМАПО для непрерывного последипломного образования. 2007. -Т. 9, № экстравыпуск, С. 50-78.

3. Кравцов, В.Г. Клинико-морфологическая характеристика, вопросы гистогенеза и проблема определения прогноза гастроинтестинальных стромальных опухолей / В.Г. Кравцов, О.В. Зайратьянц // Архив патологии. 2007. - Т. 69, №5 - С.54-61.

4. Никулин, М.П. Гастроинтестинальные стромальные опухоли (GIST). Эпидемиология, диагностика, современные подходы в лечении / М.П. Никулин, И.С. Стилиди // Современная онкология. -2007. Т. 9, № экстравыпуск, С. 3-49.

5. Снигур, П.В. Клинико-морфологические особенности стромальных опухолей желудочно-кишечного тракта / П.В. Снигур, О.А. Анурова, Н.Н. Петровичев, В.Ю. Сельчук // Вопросы онкологии. 2003. - Т. 49, №6.-С. 705-710.

6. Ando, N. The diagnosis of GI stromal tumors with EUS-guided fine needle aspiration with immunohistochemical analysis / N. Ando, H. Goto, Y. Niwa, Y. et al. // Gastrointest Endosc. 2002. - Vol.55 - P. 37-43.

7. Antonescu, C.R. Acquired resistance to imatinib in gastrointestinal stromal tumor occurs through secondary gene mutation / C.R. Antonescu, P. Besmer, T. Guo, R.P. DeMatteo et al. // Clin Cancer Res. 2005. -Vol. 11, №11 - P. 4182-4190.

8. Antonescu, C.R. Gene expression in gastrointestinal stromal tumors is distinguished by KIT genotype and anatomic site / C.R. Antonescu, Viale A., L. Sarran, S.J. Tschernyavsky et al. // Clin Cancer Res. 2004. - Vol. 10, №10 - P. 3282-3290.

9. Besmer, P. A new acute transforming feline retrovirus and relationship of its oncogene v-kit with the protein kinase gene family / P.

10. Besmer, J.E. Murphy, P.C. George, F.H. Qiu et al. // Nature. 1986. -Vol. 320, №6061. -P.415-421.

11. Blume-Jensen, P. Activation of the human c-kit product by ligand-induced dimerization mediates circular actin reorganization and chemotaxis. P.Blume-Jensen, L. Claesson-Welsh, A. Siegbahn, K.M. Zsebo et al. // EMBOJ.-1991.-Vol. 10, №13.-P. 4121-4128.

12. Burkert, J. Side populations of gastrointestinal cancers are not enriched in stem cells / J. Burkert, W.R. Otto, N.A. Wright // J Pathol. -2008. Vol. 214, №5. - P. 564-573.

13. Catena, F. Gastrointestinal stromal tumors: experience of an emergency surgery department / Catena F., Pasqualini E., Campione O. // Dig Surg. 2000. - Vol. 17, №5. P.503-507.

14. Sciot, R. GIST under imatinib therapy / Sciot R., Debiec-Rychter M. // Semin Diagn Pathol. 2006. - Vol. 23, №2. - P.84-90.

15. Chabot, B. The proto-oncogene c-kit encoding a transmembrane tyrosine kinase receptor maps to the mouse W locus / B. Chabot D.A.Stephenson, V.M.Chapman, P.Besmer, A.Bernstein // Nature. -1988. Vol.335, №6185. - P.88-89.

16. Chan, P.M. Autoinhibition of the kit receptor tyrosine kinase by the cytosolic juxtamembrane region / P.M. Chan, S. Ilangumaran, J. La Rose, Chakrabartty A., Rottapel R. // Mol Cell Biol. 2003. - Vol. 23, №9. -P.3067-3078.

17. Chen, L.L. A missense mutation in KIT kinase domain 1 correlates with imatinib resistance in gastrointestinal stromal tumors / L.L.Chen,

18. J.C. Trent, E.F.Wu, G.N. Fuller et al. // Cancer Res. 2004.- Vol.64, №17. -P.5913-5919.

19. Cho, S. Deletion of the KIT gene is associated with liver metastasis and poor prognosis in patients with gastrointestinal stromal tumor in the stomach / S.Cho, Y.Kitadai, S.Yoshida, S.Tanaka et al. // Int J Oncol. -2006. Vol. 28, №6. - P.1361-1367.

20. Cho, S. Genetic and pathologic characteristics of gastrointestinal stromal tumors in extragastric lesions / S.Cho, Y.Kitadai, S.Yoshida, S.Tanaka et al. // Int J Mol Med. 2006. - Vol.18, №6. - P. 1067-1071.

21. Chompret, A. PDGFRA germline mutation in a family with multiple cases of gastrointestinal stromal tumor / A.Chompret, C.Kannengiesser, M.Barrois, P.Terrier et al. // Gastroenterology. -2004. -Vol.126, №1.-P.318-321.

22. Connolly, E.M. Gastrointestinal stromal tumours / E.M.Connolly, E.Gaffney, J.V. Reynolds // Br J Surg. 2003. - Vol.90, №10.- P.1178-1186.

23. Corless, C.L. Molecular pathobiology of gastrointestinal stromal sarcomas / C.L.Corless, M.C. Heinrich // Annu Rev Pathol. 2008. -Vol.3. -P.557-586.

24. Corless, C.L. PDGFRA mutations in gastrointestinal stromal tumors: frequency, spectrum and in vitro sensitivity to imatinib. A.Schroeder, D.Griffith, A.Town et al. // J Clin Oncol. 2005. - Vol.23, №23. - P.5357-5364.

25. Corless, C.L. Biology of gastrointestinal stromal tumors / C.L.Corless, J.A.Fletcher, M.C.Heinrich // J Clin Oncol. 2004,- Vol.22, №18. - P.3813-3825.

26. Corless, C.L. KIT gene deletions at the intron 10-exon 11 boundary in GI stromal tumors / C.L.Corless, L.McGreevey, A.Town, A.Schroeder // J Mol Diagn. 2004. - Vol.6, №4.- P.366-370.

27. Corless, C.L. KIT mutations are common in incidental gastrointestinal stromal tumors one centimeter or less in size / C.L.Corless, L.McGreevey, A.Haley, A.Town, M.C.Heinrich // Am J Pathol. -2002. Vol.160, №5. - P. 1567-1572.

28. Crosier, P.S. Expression of isoforms of the human receptor tyrosine kinase c-kit in leukemic cell lines and acute myeloid leukemia. P.S.Crosier, S.T.Ricciardi, L.R.Hall, M.R. Vitas et al. Blood. 1993. -Vol.82, №4.-P.l 151-1158.

29. Debiec-Rychter, M. KIT mutations and dose selection for imatinib in patients with advanced gastrointestinal stromal tumours / Debiec-Rychter M., Sciot R., Le Cesne A., Schlemmer M. et al. // Eur J Cancer. -2006. Vol.42, №8. - P. 1093-1103.

30. DeMatteo, R.P. Two Hundred Gastrointestinal stromal tumors. Recurrence Patterns and Prognostic Factors for Survival Annals of Surgery / R.P.DeMatteo, J.J.Lewis, D.Leung, S.S. Mudan et al. // Ann Surg. 2000. - Vol.231, №1. -P.51-58.

31. Di Vizio, D. Skp2 expression is associated with high risk and elevated КІ67 expression in gastrointestinal stromal tumours / D.Di Vizio, F.Demichelis, S.Simonetti, G.Pettinato et al. // BMC Cancer. -2008. №8. -P.134.

32. Duensing, A. Mechanisms of oncogenic KIT signal transduction in primary gastrointestinal stromal tumors (GISTs) / A.Duensing, F.Medeiros, B.McConarty, N.E Joseph et al. // Oncogene. -2004.- Vol.23, №22.- P. 3999-4006.

33. Emile, J.F. Clinicopathologic, phenotypic, and genotypic characteristics of gastrointestinal mesenchymal tumors / Emile J.F., Theou N., Tabone S., Cortez A. et al. // Clin Gastroenterol Hepatol. -2004,- Vol.2, №7. P. 597-605.

34. Emory, T.S. Prognosis of gastrointestinal smooth-muscle (stromal) tumors: dependence on anatomic site / T.S.Emory, L.H.Sobin, L.Lukes, D.H.Lee, T.J.O'Leary // Am J Surg Pathol. -1999.- Vol.23, №1.- P.82-87.

35. Ernst, S.I. KIT mutation portends poor prognosis in gastrointestinal stromal/smooth muscle tumors / S.I.Ernst, A.E.Hubbs, R.M.Przygodzki, T.S. Emory et al. // Lab Invest. -1998.- Vol.78, №12. P. 1633-1636.

36. Espinosa, I. A novel monoclonal antibody against DOG1 is a sensitive and specific marker for gastrointestinal stromal tumors / I.Espinosa, C.H.Lee, M.K.Kim, B.T. Rouse et al. // Am J Surg Pathol. -2008. Vol.32, №2. - P.210-218.

37. Evans, H.L. Smooth muscle tumors of the gastrointestinal tract. A study of 56 cases followed for a minimum of 10 years / H.L. Evans Cancer. -1985. Vol.56, №9. -P.2242-2250.

38. Fletcher, J.A. Role of KIT and platelet-derived growth factor receptors as oncoproteins / J.A. Fletcher // Semin Oncol. -2004.- Vol.31, №2. P.4-11.

39. Fletcher, C.D. Diagnosis of gastrointestinal stromal tumors: A consensus approach / C.D.Fletcher, J.J.Berman, C.L.Corless, F.Gorstein et al. // Hum Pathol. 2002. - Vol.33, №5. - P.459-465.

40. Fong, Y. Lymph node metastasis from soft tissue sarcoma in adults. Analysis of data from a prospective database of 1772 sarcoma patients / Y.Fong, D.G.Coit, J.M.Woodruff, M.F.Brennan // Ann Surg. 1993.-Vol.217, №1. - P.72-77.

41. Foster, R. Molecular basis of the constitutive activity and STI571 resistance of Asp816Val mutant KIT receptor tyrosine kinase / R.Foster,

42. R.Griffith, P.Ferrao, L.Ashman // J Mol Graph Model. 2004. - Vol.23, №2. -P.139-152.

43. Gari, M. c-kit proto-oncogene exon 8 in-frame deletion plus insertion mutations in acute myeloid leukaemia / M.Gari, A.Goodeve, G.Wilson, P.Winship et al. // Br J Haematol. 1999.- Vol.105, №4. - P. 894-900.

44. Giebel, L.B. Organization and nucleotide sequence of the human KIT (mast/stem cell growth factor receptor) proto-oncogene / L.B.Giebel, K.M.Strunk, S.A.Holmes, R.A. Spritz // Oncogene. 1992. - Vol.7, №11. -P.2207-2217.

45. Graham, J. Imatinib in the management of multiple gastrointestinal stromal tumors associated with a germline KIT K642E mutation / J.Graham, M.Debiec-Rychter, C.L.Corless, R.Reid et al. // Arch Pathol Lab Med. 2007. - Vol.131, №9. -P. 1393-1396.

46. Haller, F. Site-dependent differential KIT and PDGFRA expression in gastric and intestinal gastrointestinal stromal tumors / F.Haller, N. Happel, H.J.Schulten, A. von Heydebreck et al. // Mod Pathol. 2007. -Vol.20, №10.-P.l 103-1 111.

47. Hartmann, K. Novel germline mutation of KIT associated with familial gastrointestinal stromal tumors and mastocytosis / K.Hartmann, E. Wardelmann, Y.Ma, S.Merkelbach-Bruse et al. // Gastroenterology.-2005.-Vol.129, №3. P.1042-1046.

48. Hasegawa, T. Gastrointestinal stromal tumor: consistent CD117 immunostaining for diagnosis, and prognostic classification based ontumor size and MIB-1 grade / T.Hasegawa, Y. Matsuno, T.Shimoda, S. Hirohashi // Hum Pathol.- 2002,-Vol. 33, №6. P.669-676.

49. Hasegawa, T. Validity and reproducibility of histologic diagnosis and grading for adult soft-tissue sarcomas / S.Yamamoto, T.Nojima, T. Hirose et al. // Hum Pathol. 2002. - Vol.33, №1. - P.l 11-115.

50. Heinrich, M.C. Kinase mutations and imatinib response in patients with metastatic gastrointestinal stromal tumor / M.C.Heinrich, C.L.Corless, G.D.Demetri, C.D. Blanke // J Clin Oncol. 2003. - Vol.21, №23. - P.4342-4349.

51. Heinrich, M.C. PDGFRA activating mutations in gastrointestinal stromal tumors / M.C.Heinrich, C.L. Corless, A.Duensing, L. McGreevey // Science.- 2003.-Vol. 299, №5607. -P.708-710.

52. Herawi, M. GISTs on prostate needle biopsy: a clinicipathologic study of 8 cases / M.Herawi, E.A.Montogomery, J.I. Epstein // Am.J. Surg. Pathol. -2006.- Vol.30. P.1389-1395.

53. Hirota, S. Gain-of-function mutations of platelet-derived growth factor receptor alpha gene in gastrointestinal stromal tumors / S.Hirota, A.Ohashi, T.Nishida, K.Isozaki et al. // Gastroenterology.-2003.-Vol.125, №3 P.660-667.

54. Hirota, S. Familial gastrointestinal stromal tumors associated with dysphagia and novel type germline mutation of KIT gene / S. Hirota T.Nishida, K.Isozaki, M.Taniguchi et al. // Gastroenterology. 2002. -Vol.122, №5-P. 1493-1499.

55. Hirota, S. Gain-of-function mutation at the extracellular domain of KIT in gastrointestinal stromal tumours / S. Hirota, T.Nishida, K.Isozaki, M.Taniguchi et al. //J Pathol. 2001. -Vol.193, №4 - P.505-510.

56. Hirota, S. Gain-of-function mutations of c-kit in human gastrointestinal stromal tumors / S.Hirota, K.Isozaki, Y.Moriyama, K.Hashimoto et al. // Science. 1998. -Vol.279, №5350 - P.577-580.

57. Hongyo, T. Specific c-kit mutations in sinonasal natural killer/T-cell lymphoma in China and Japan / T.Hongyo, T.Li, M.Syaifudin, R.Baskar et al. // Cancer Res. 2000. -Vol.60, №9 -P.2345-2347.

58. Hopkins, T.G. Sunitinib in the management of gastrointestinal stromal tumours (GISTs) / T.G.Hopkins, M.Marples, D.Stark // Eur J Surg Oncol.- 2008. -Vol.34, №8 -P.844-850.

59. Hostein, I. Detection of a new mutation in KIT exon 9 in a gastrointestinal stromal tumor / I.Hostein, M.Longy, B.Gastaldello, Geneste G et al. // Int J Cancer. 2006. -Vol.118, №8 -P.2089-2091.

60. Hou, Y.Y.C-kit gene mutation in human gastrointestinal stromal tumors / Y.Y.Hou, Y.S.Tan, M.H.Sun, Y.K. Wei // World J Gastroenterol. 2004. -Vol.10, №9. - P. 1310-1314.

61. Huang, E.J. Differential expression and processing of two cell associated forms of the kit-ligand: KL-1 and KL-2 / E.J. Huang, K.H.Nocka, J.Buck, P.Besmer // Mol Biol Cell. 1992. - Vol.3, №3. -P.349-362.

62. Huizinga, J.D. Gastrointestinal peristalsis: joint action of enteric nerves, smooth muscle, and interstitial cells of Cajal / J.D. Huizinga // Microsc Res Tech. -1999. Vol.47, №4. - P. 239-247.

63. Irusta, P.M. Definition of an inhibitory juxtamembrane WW-like domain in the platelet-derived growth factor beta receptor / P.M. Irusta, Y.Luo, O.Bakht, C.C. Lai et al. // J Biol Chem. 2002. - Vol.277, №41io -P.38627-3834.

64. Irusta, P.M. A single amino acid substitution in a WW-like domain of diverse members of the PDGF receptor subfamily of tyrosine kinases causes constitutive receptor activation / P.M. Irusta, D. DiMaio // EMBO J. -1998. Vol.17, №23. - P.6912-6923.

65. Isozaki, K. Disturbed intestinal movement, bile reflux to the stomach, and deficiency of c-kit-expressing cells in Ws/Ws mutant rats / K.Isozaki, S.Hirota, A. Nakama, J. Miyagawa et al. // Gastroenterology. -1995. Vol.109. - P.456-464.

66. Joensuu, H. Second line therapies for the treatment of gastrointestinal stromal tumor / H. Joensuu // Curr Opin Oncol. -2007. -Vol.19, №4. -P.353-358.

67. Joensuu, H. Tyrosine kinase inhibitor imatinib (STI571) as an anticancer agent for solid tumours / H.Joensuu, S. Dimitrijevic // Ann Med. -2001. Vol.33, №7. - P. 451-455.

68. Joensuu, H. Effect of the tyrosine kinase inhibitor STI571 in a patient with a metastatic gastrointestinal stromal tumor / H.Joensuu, P.J.Roberts, M.Sarlomo-Rikala, L.C. Andersson et al. // N Engl J Med. -2001. Vol.344, №14. - P.1052-1056.

69. Kawanowa, K. High incidence of microscopic gastrointestinal stromal tumors in the stomach / K.Kawanowa, Y.Sakuma, S.Sakurai, T.Hishima et al. // Hum Pathol. 2006. - Vol.37, №12k> - P.1527-1535.

70. Kemmer, K. KIT mutations are common in testicular seminomas / K.Kemmer, C.L.Corless, J.A.Fletcher, L.McGreevey et al. // Am J Pathol. 2004. - Vol.164, №1. - P.305-313.

71. Kikuchi, H. Immunohistochemical and genetic features of gastric and metastatic liver gastrointestinal stromal tumors: sequential analyses / H.Kikuchi, K.Yamashita, T.Kawabata, M. Yamamoto et al. // Cancer Sci.- 2006. Vol.97, №2. P - 127-132.

72. Kim, T.W. Prognostic significance of c-kit mutation in localized gastrointestinal stromal tumors / T.W.Kim, H.Lee, Y.K.Kang, M.S. Choe et al. // Clin Cancer Res. 2004. - Vol. 10, №9. -P.3076-3081.

73. Lam, M.M. Extragastrointestinal stromal tumors presenting as vulvovaginal/rectovaginal septal masses: a diagnostic pitfall / M.M.Lam, C.L.Corless, J.R.Goldblum, M.C. Heinrich et al. // Int. J. Ginecol. Pathol.- 2006. Vol.25. - P.288-292.

74. Lasota, J. Clinical significance of oncogenic KIT and PDGFRA mutations in gastrointestinal stromal tumours / J.Lasota, M.Miettinen // Histopathology. 2008. - Vol.53, №3. - P.245-266.

75. Lasota, J. KIT exon 11 deletion-inversions represent complex mutations in gastrointestinal stromal tumors / J.Lasota, M.Miettinen // Cancer Genet Cytogenet. 2007. - Vol.175, №1. - P.69-72.

76. Lasota, J. KIT and PDGFRA mutations in gastrointestinal stromal tumors (GISTs) / J.Lasota, M.Miettinen // Semin Diagn Pathol. 2006. -Vol.23, №2.-P.91-102.

77. Lasota, J. A great majority of GISTs with PDGFRA mutations represent gastric tumors of low or no malignant potential / J.Lasota, A.Dansonka-Mieszkowska, L.H.Sobin, M.Miettinen // Lab Invest. 2004. -Vol.84, №7.-P.874-883.

78. Lasota, J. GISTs with PDGFRA exon 14 mutations represent subset of clinically favorable gastric tumors with epithelioid morphology / J.Lasota, J.Stachura, M.Miettinen // Lab Invest. 2006. - Vol.86, №1. -P.94-100.

79. Lasota, J. Mutations in exons 9 and 13 of KIT gene are rare events in gastrointestinal stromal tumors. A study of 200 cases / J.Lasota, A.Wozniak, M.Sarlomo-Rikala, J.Rys et al. // Am J Pathol. 2000. -Vol.157, №4.-P.1091-1095.

80. Lee, H.E. Characteristics of KIT-negative gastrointestinal stromal tumours and diagnostic utility of protein kinase C theta immunostaining / H.E. Lee, M.A.Kim, H.S.Lee, B.L.Lee, W.H. Kim // J Clin Pathol. -2008. Vol.61, №6. - P.722-729.

81. Lee, J.R. Gastrointestinal autonomic nerve tumor: immunohistochemical and molecular identity with gastrointestinal stromaltumor / J.R.Lee, V.Joshi, J.W.Griffm, J.Lasota, M.Miettinen // Am J Surg Pathol. -2001. Vol.25, №8. -P.979-987.

82. Lev, S. Interspecies molecular chimeras of kit help define the binding site of the stem cell factor / S.Lev, J.Blechman, S.Nishikawa,

83. D.Givol, Y.Yarden // Mol Cell Biol. 1993. - Vol.13, №4. - P.2224-2234.

84. Liu, H. Structural basis for stem cell factor-KIT signaling and activation of class III receptor tyrosine kinases. H.Liu, X.Chen, P.J. Focia, X.He // EMBO J. 2007. - Vol.26, №3. - P.891-901.

85. Longley, B.J. Classes of c-KIT activating mutations: proposed mechanisms of action and implications for disease classification and therapy / B.J.Longley, M.J.Reguera, Y.Ma // Leuk Res. 2001. - Vol.25, №7.-P. 571-576.

86. Longley, B.J. Somatic c-KIT activating mutation in urticaria pigmentosa and aggressive mastocytosis: establishment of clonality in a human mast cell neoplasm / B.J.Longley, L.Tyrrell, S.Z.Lu, Y.S.Ma et al. // Nat Genet. 1996. - Vol.12, №3. - P.312-314.

87. Lux, M.L. KIT extracellular and kinase domain mutations in gastrointestinal stromal tumors / M.L.Lux, B.P.Rubin, T.L.Biase, C.J. Chen et al. // Am J Pathol. 2000. - Vol.156, №3. - P.791-795.

88. Ma, Y. Inhibition of spontaneous receptor phosphorylation by residues in a putative alpha-helix in the KIT intracellular juxtamembrane region / Y.Ma, M.E.Cunningham, X.Wang, I.Ghosh et al. // J Biol Chem. 1999. - Vol.274, №19. - P. 13399-13402.

89. Maeda H. Requirement of c-kit for development of intestinal pacemaker system / H.Maeda, A.Yamagata, S.Nishikawa, K.Yoshinaga et al. // Development. 1992. - Vol.116, №2. - P.369-375.

90. Maniatis, T. Molecular cloning a laboratory manual / T.Maniatis,

91. E.E.Fritsh, J.Sambrook. Cold Spring Harbor Labaratory, 1982. - 480 c.

92. Mazur, M.T. Gastric stromal tumors: Reappraisal of histogenesis / M.T. Mazur, H.B. Clark // Am J Surg Pathol. 1983. - №7. - P.507-519.

93. Medeiros, F. KIT-negative gastrointestinal stromal tumors: proof of concept and therapeutic implications / F.Medeiros, C.L.Corless, A.Duensing, J.L.Hornick et al. // Am J Surg Pathol. 2004. - Vol.28, №7.-P. - 889-894.

94. Miettinen, M. Gastrointestinal stromal tumors: pathology and prognosis at different sites / M.Miettinen, J.Lasota // Semin Diagn Pathol. 2006. - Vol.23, №2. - P.70-83.

95. Miettinen, M. Evaluation of malignancy and prognosis of gastrointestinal stromal tumors: a review / M.Miettinen, W.El-Rifai, H.L.Sobin, J.Lasota // Hum Pathol. 2002. - Vol.33, №5. - P.478-483.

96. Miettinen, M. Pathology and diagnostic criteria of gastrointestinal stromal tumors (GISTs): a review / M.Miettinen, M.Majidi, J.Lasota // Eur J Cancer. 2002. - Vol.38, №5. - P.39-51.

97. Miettinen, M. Gastrointestinal stromal tumors-definition, clinical, histological, immunohistochemical, and molecular genetic features and differential diagnosis / M.Miettinen, J.Lasota // Virchows Arch. 2001. -Vol.438, №1.-P.1-12.

98. Miettinen, M. Immunohistochemical spectrum of GISTs at different sites and their differential diagnosis with a reference to CD117 / M.Miettinen, H.Leslie Sobin, M.Sarlomo-Rikala // Mod Pathol. 2000. -Vol.13, №10.-P.l 134-1142.

99. Miettinen, M. Gastrointestinal stromal tumors: recent advances in understanding of their biology / M.Miettinen, M.Sarlomo-Rikala, J.Lasota //Hum Pathol. 1999.-Vol.30, №10.-P. 1213-1220.

100. Min, K.W. Small intestinal stromal tumors with skeinoid fibers. Clinicopathological, immunohistochemical, and ultrastructural investigations / K.W.Min // Am J Surg Pathol. 1992. - Vol.16, №2. -P.145-155.

101. Mol, C.D. Structural basis for the autoinhibition and STI-571 inhibition of c-Kit tyrosine kinase / C.D.Mol, D.R.Dougan, T.R.Schneider, R.J. Skene et al. // J Biol Chem. 2004. - Vol.279, №30. -P.31655-31663.

102. Mol, C.D. Structure of a c-kit product complex reveals the basis for kinase transactivation / Mol C.D., Lim K.B., Sridhar V., Zou H. et al. // J Biol Chem. 2003. - Vol.278, №34. -P.31461-31464.

103. Nakagomi, N. Juxtamembrane-type c-kit gene mutation found in aggressive systemic mastocytosis induces imatinib-resistant constitutive KIT activation / N.Nakagomi, S.Hirota // Lab Invest. 2007. - Vol.87, №4. -P.365-371.

104. Nakahara, M. A novel gain-of-function mutation of c-kit gene in gastrointestinal stromal tumors / M.Nakahara, K.Isozaki, S.Hirota,

105. J.Miyagawa et al. // Gastroenterology. 1998. - Vol.115, №5. - P. 10901195.

106. Nakajima, T. Interstitial cells of Cajal do not harbor c-kit or PDGFRA gene mutations in patients with sporadic gastrointestinal stromal tumors / T.Nakajima, S.Miwa, T.Ando, H.Fujinami et al. // J Gastroenterol. 2009. - Vol.44, №5. - P.426-431.

107. Nakatani, H. STI571 (Glivec) inhibits the interaction between c-KIT and heat shock protein 90 of the gastrointestinal stromal tumor cell line, GIST-T1 / H.Nakatani, M.Kobayashi, T.Jin, T.Taguchi et al. / Cancer Sci. -2005. Vol.96, №2. -P.l 16-119.

108. Nishida, T. Biological and clinical review of stromal tumors in the gastrointestinal tract / T.Nishida, S.Hirota // Histol Histopathol. 2000. -Vol.15, №4.-P.1293-1301.

109. O'Riain, C. Gastrointestinal stromal tumors: insights from a new familial GIST kindred with unusual genetic and pathologic features / C.O'Riain, C.L.Corless, M.C.Heinrich, D.Keegan et al. // Am J Surg Pathol. 2005. - Vol.29, №12. - P. 1680-1683.

110. Pawson, T. Regulation and targets of receptor tyrosine kinases / Pawson T. // Eur J Cancer. 2002. - Vol.38, №5. - P.3-10.

111. Penzel, R. The location of KIT and PDGFRA gene mutations in gastrointestinal stromal tumours is site and phenotype associated / R.Penzel, S.Aulmann, M.Moock, M.Schwarzbach et al. // J Clin Pathol. -2005. Vol.58, №6. - P. 634-639.

112. Pidhorecky, I. Gastrointestinal stromal tumors: current diagnosis, biologic behavior, and management / I.Pidhorecky, R.T.Cheney, W.G.Kraybill, J.F. Gibbs // Ann Surg Oncol. 2000. - Vol.7, №9. -P.705-712.

113. Pierie, J.P. The effect of surgery and grade on outcome of gastrointestinal stromal tumors / J.P.Pierie, U.Choudry, A.Muzikansky, B.Y. Yeap et al. // Arch Surg. 2001. - Vol.136, №4. - P.383-389.

114. Przygodzki, R.M. Primary mediastinal seminomas: evidence of single and multiple KIT mutations / R.M.Przygodzki, A.E.Hubbs, F.Q.Zhao, T.J. O'Leary // Lab Invest. 2002. - Vol.82, №10. - P. 13691375.

115. Reith, A.D.Signal transduction by normal isoforms and W mutant variants of the Kit receptor tyrosine kinase / A.D.Reith, C.Ellis, S.D.Lyman, D.M. Anderson et al. // EMBO J. 1991. - Vol.10, №9. -P.2451-2459.

116. Roberts, W.M. Tandem linkage of human CSF-1 receptor (c-fms) and PDGF receptor genes / W.M.Roberts, A.T.Look, M.F.Roussel, C.J. // Sherr Cell. 1988. - Vol.55, №4. - P.655-661.

117. Rönnstrand, L. Signal transduction via the stem cell factor receptor/c-Kit / Rönnstrand L. // Cell Mol Life Sei. 2004. - Vol.61, №19. - P.2535-2548.

118. Rubin, B.P. Gastrointestinal stromal tumour / B.P.Rubin, M.C.Heinrich, C.L. Corless//Lancet.-2007.-Vol.369.-P.1731-1741.

119. Rubin, B.P. Gastrointestinal stromal tumours: an update / B.P.Rubin // Histopathology. 2006. - Vol.48, №1. - P.83-96.

120. Rubin, B.P. KIT activation is a ubiquitous feature of gastrointestinal stromal tumors / B.P.Rubin, S.Singer, C.Tsao, A.Duensing et al. // Cancer Res. 2001. - Vol.61, №22. - P.8118-8121.

121. Sakurai, S. Mutations in c-kit gene exons 9 and 13 in gastrointestinal stromal tumors among Japanese / S.Sakurai, S.Oguni, M.Hironaka, M. Fukayama et al. // Jpn J Cancer Res.- 2001. Vol.92, №5. -P.494-498.

122. Sakurai, S. C-kit gene abnormalities in gastrointestinal stromal tumors (tumors of interstitial cells of Cajal / S.Sakurai, T.Fukasawa, J.M.Chong, A.Tanaka, M.Fukayama // Jpn J Cancer Res. 1999. -Vol.90, №12.-P.1321-1328.

123. Sarlomo-Rikala, M. CD117: a sensitive marker for gastrointestinal stromal tumors that is more specific than CD34 / M.Sarlomo-Rikala,

124. A.J.Kovatich, A.Barusevicius, M.Miettinen // Mod Pathol. 1998. -Vol.11, №8.-P.728-734.

125. Sciot, R. GIST under imatinib therapy / R.Sciot, M.Debiec-Rychter // Semin Diagn Pathol. 2006. - Vol.23, №2. - P. 84-90.

126. Shao, Z. Expression of c-kit receptor on the hemopoietic stem/precursor cells of aplastic anemia patients / Z.Shao, G.Chen, H. Zhang Zhonghua // Xue Ye Xue Za Zhi. 1999. - Vol.20, №10. - P.532-534.

127. Singer, S. Prognostic value of KIT mutation type, mitotic activity, and histologic subtype in gastrointestinal stromal tumors / S.Singer,

128. B.P.Rubin, M.L.Lux, C.J. Chen et al. // J Clin Oncol. 2002. - Vol.20, №18. -P.3898-3905.

129. Sircar, K. Interstitial cells of Cajal as precursors of gastrointestinal stromal tumors / K.Sircar, B.R.Hewlett, J.D.Huizinga, K.Chorneyko et al. // Am J Surg Pathol. 1999. - Vol.23, №4. - P.377-389.

130. Steigen, S.E. Mutations in gastrointestinal stromal tumors—a population-based study from Northern Norway / S.E.Steigen, T.J.Eide, B.Wasag, J.Lasota, M.Miettinen // APMIS. 2007. - Vol.115, №4. -P.289-298.

131. Stenman, G. Human PDGFA receptor gene maps to the same region on chromosome 4 as the KIT oncogene / G.Stenman, A.Eriksson, L.Claesson-Welsh // Genes Chromosomes Cancer. 1989. - Vol.1, №2. -P.155-158.

132. Subramanian, S. Gastrointestinal stromal tumors (GISTs) with KIT and PDGFRA mutations have distinct gene expression profiles / S.Subramanian, R.B.West, C.L.Corless, W. Ou et al. // Oncogene. 2004.- Vol.23, №47. P. 7780-7790.

133. Suehara, Y. Pfetin as a prognostic biomarker of gastrointestinal stromal tumors revealed by proteomics / Y.Suehara, T.Kondo, K.Seki, T.Shibata et al. // Clin Cancer Res. 2008. - Vol.14, №6. - P. 1707-1717.

134. Taniguchi, M. Effect of c-kit mutation on prognosis of gastrointestinal stromal tumors / M.Taniguchi, T.Nishida, S.Hirota, K.Isozaki et al. // Cancer Res. 1999. - Vol.59, №17. - P.4297-4300.

135. Tarn, C. Analysis of KIT mutations in sporadic and familial gastrointestinal stromal tumors: therapeutic implications through protein modeling / C.Tarn, E.Merkel, A.A.Canutescu, W.Shen et al. // Clin Cancer Res. 2005. - Vol.11, №10. - P. 3668-3677.

136. Tian, Q. Activating c-kit gene mutations in human germ cell tumors. Q.Tian, H.F. Jr.Frierson, G.W.Krystal, C.A. // Moskaluk Am J Pathol. 1999. - Vol.154, №6. - P. 1643-1647.

137. Toquet, C. Elevated (> or = 10%) MIB-1 proliferative index correlates with poor outcome in gastric stromal tumor patients: a study of 35 cases / C.Toquet, J.C.Le Néel, L.Guillou, K.Renaudin et al. // Dig Dis Sci. 2002. - Vol.47, №10. - P.2247-2253.

138. Tuveson, D.A. STI571 inactivation of the gastrointestinal stromal tumor c-KIT oncoprotein: biological and clinical implications / D.A.Tuveson, N.A.Willis, T.Jacks, J.D.Griffin et al. // Oncogene. 2001.- Vol.20, №36. P.5054-5058.

139. Vandenbark, G.R. Cloning and structural analysis of the human c-kit gene / G.R.Vandenbark, C.M.deCastro, H.Taylor, S.Dew-Knight, R.E. Kaufman // Oncogene. 1992. - Vol.7, №7. - P.1259-1266.

140. Wang, L. Cellular origin of gastrointestinal stromal tumors: a study of 27 cases / L.Wang, H.Vargas, S.W.French // Arch Pathol Lab Med. -2000. Vol.124, №10. -P.1471-1475.

141. Wardelmann, E. c-kit mutations in gastrointestinal stromal tumors occur preferentially in the spindle rather than in the epithelioid cell variant / E.Wardelmann, I.Neidt, E.Bierhoff, N.Speidel et al. // Mod Pathol. -2002. Vol.15, №2. - P. 125-136.

142. Weiss, S.W., Goldblum J.R. Soft tissue sarcomas Mosby. Inc. Fourth edition 2001.

143. Williams, D.E. Identification of a ligand for the c-kit protooncogene / D.E.Williams, J.Eisenman, A.Baird, C.Rauch et al. // Cell. -1990.-Vol.63, №1.-P.167-174.

144. Wu, T.J. Surgical treatment and prognostic analysis for gastrointestinal stromal tumors (GISTs) of the small intestine: before theera of imatinib mesylate / T.J.Wu, L.Y.Lee, C.N.Yeh, P.Y.Wu et al. // BMC Gastroenterol. 2006. - Vol.24, №6. - P.29.

145. Xie, X.Y. Gastrointestinal stromal tumors: update / X.Y.Xie, N. Carter, P.E.Darwin, C.B.Drachenberg // Arkh Patol. 2004. - Vol.66, №2. - P.36-40.

146. Yarden, Y. Human proto-oncogene c-kit: a new cell surface receptor tyrosine kinase for an unidentified ligand / Y.Yarden, W.J.Kuang, T.Yang-Feng, L. Coussens et al. // EMBO J. 1987. - Vol.6, №11. -P.3341-3351.

147. Zsebo, K.M. Stem cell factor is encoded at the SI locus of the mouse and is the ligand for the c-kit tyrosine kinase receptor / K.M.Zsebo, D.A.Williams, E.N.Geissler, V.C. Broudy et al. // Cell. 1990. - Vol.63, №1. - P.213-224.