Молекулярно-генетическая характеристика и таксономическое положение вирусов Бханджа и Кисмайо, представителей антигенного комплекса Бханджа: семейство Bunyaviridae тема диссертации и автореферата по ВАК РФ 03.01.03, кандидат биологических наук Климентов, Александр Сергеевич

• Климентов, Александр Сергеевич
• кандидат биологических наук
• 2013

Оглавление диссертации кандидат биологических наук Климентов, Александр Сергеевич

1. ВВЕДЕНИЕ.

Актуальность проблемы.

Цели и задачи исследования.

Научная новизна и практическая значимость.

2. ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ.

2.1 Общая характеристика семейства Випуамтйае.

2.1.1 История и классификация.

2.1.2 Особенности морфологии и строения.

2.1.3 Стратегия кодирования генома.

2.2 Характеристика вирусов антигенной группы Бханджа.

2.2.1 История изучения.

2.2.2 Экология.

2.2.3 Физико-химическая характеристика.

2.2.4 Биологические свойства.

3. МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ.

3.1 Вирусы.

3.2 Бактериальный штамм.

3.3 Клещевые суспензии.

3.4 Олигонуклеотиды.

3.5 Частичная очистка вирусов Бханджа и Кисмайо.

3.6 Иммуноферментный анализ (ИФА).

3.7 Электрофорез белков в полиакриламидном геле.

3.8 Вестерн-блот.

3.9 Выделение тотальной РНК.

3.10 Обратная транскрипция.

3.11 Достройка комплементарной цепи.

3.12 Полимеразная цепная реакция (ПЦР).

3.13 Электорофорез в агарозном геле.

3.14 Клонирование ДНК.

3.15 Секвенирование ДНК.

3.16 Компьютерный анализ последовательностей и филогенетический анализ

4. РЕЗУЛЬТАТЫ.

4.1 Очистка вирусов Бханджа и Кисмайо в градиенте сахарозы и определение вируссодержащих фракций.

4.2 Определение нуклеотидных последовательностей геномов вирусов Бханджа и Кисмайо.

4.3 Определение таксономического положения вирусов Бханджа и Кисмайо

4.4 Разработка ОТ-ПЦР тест-системы для детекции вирусов Бханджа и Кисмайо.

4.5 Определение специфичности праймеров.

4.6 Апробация созданной тест-системы на полевом материале.

4.7 Филогенетический анализ последовательностей.

5. ОБСУЖДЕНИЕ.

6. ВЫВОДЫ.

7. СПИСОК СОКРАЩЕНИЙ.

8. БЛАГОДАРНОСТИ.

Введение диссертации (часть автореферата) на тему «Молекулярно-генетическая характеристика и таксономическое положение вирусов Бханджа и Кисмайо, представителей антигенного комплекса Бханджа: семейство Bunyaviridae»

Семейство Bunyaviridae - самое многочисленное среди РНК-геномных вирусов, оно насчитывает более 350 представителей, объединенных в 5 родов. Большинство буньявирусов принадлежит к экологической группе арбовирусов, передающихся через укусы кровососущих членистоногих: комаров, москитов, мокрецов и клещей [126].

К семейству Bunyaviridae относятся многие вирусы, вызывающие заболевания человека, в их числе: энцефалиты Ла Кросс и Калифорнийский, лихорадки долины Рифт и Крымская-Конго и другие [48, 131].

За последние несколько лет были открыты еще несколько буньявирусов, патогенных для человека и домашних животных. В 2009 г. в Китае была выявлена тяжелая лихорадка с синдромом тромбоцитопении (SFTS), этиологически связанная с новым флебовирусом, переносимым клещами [144, 145]. В том же году в США из крови больных со сходными симптомами был выделен вирус, названный Heartland, родственный вирусу SFTS [95]. В Германии в 2011г. был обнаружен ортобуньявирус, названный Schmallenberg, вызывающий крупные эпизоотии среди крупного рогатого скота, коз и овец. Заболевание характеризуется лихорадкой, снижением продукции молока, а также гибелью новорожденных животных [62].

Несмотря на выраженное значение буньявирусов и вызываемых ими инфекций в патологии человека и животных, данные по молекулярно-генетической характеристике и таксономии многих из них весьма ограничены или отсутствуют. Это в полной мере относится к вирусу Бханджа, вызывающему острые лихорадочные заболевания человека [1, 31, 114]. Описан случай тяжелого менингоэцефалита при естественном заражении вирусом Бханджа через укус клеща [138].

Прототипный штамм вируса Бханджа IG690 был изолирован в 1954 г. из клещей Haemaphysalis intermedia, собранных с козы в Индии [127]. Впоследствии циркуляция вируса Бханджа была установлена во многих странах Африки, Азии и Европы [67, 68]. Вирус Бханджа, наряду с африканскими вирусами Кисмайо (Сомали) и Форекария (Гвинея), на основании перекрестных связей, выявленных в реакции связывания комплемента (РСК) и реакции торможения гемагглютинации (РТГА), объединены в антигенную группу Бханджа [5, 27, 41]. На основании данных электронной микроскопии вирус Бханджа был включен в состав семейства Bunyaviridae, в категорию буньяподобных вирусов [99]. Для вирусов Бханджа, Кисмайо и Форекария не установлено антигенных связей с другими представителями семейства Bunyaviridae, их таксономическое положение не определено. Вся доступная в литературе информация о вирусе Бханджа представляет собой либо сообщения о выделении вируса или обнаружении специфических антител, либо данные по экспериментальному заражению животных. Информация о вирусах Форекария и Кисмайо еще более ограничена. К началу выполнения данной работы какие-либо данные молекулярно-генетических исследований вирусов группы Бханджа отсутствовали, что определяет актуальность диссертационной работы.

Цели и задачи исследования

Цели работы заключались в определении таксономического положения вирусов Бханджа и Кисмайо, и создании ОТ-ПЦР тест-системы, позволяющей детектировать и идентифицировать эти вирусы в полевых и клинических материалах.

Для достижения этих целей были поставлены следующие задачи:

• Определить нуклеотидные последовательности геномов штамма Ю690 вируса Бханджа и штамма ЯЪ91 вируса Кисмайо.

• На основании сравнения аминокислотных последовательностей белков, кодируемых геномами вирусов Бханджа и Кисмайо с соответствующими белками других буньявирусов выявить их филогенетическое положение.

• Сконструировать олигонуклеотидные праймеры, специфически амплифицирующие участок генома вирусов Бханджа и Кисмайо.

• Провести апробацию созданной пары праймеров на полевом материале.

Научная новизна и практическая значимость

1. Впервые определены полногеномные нуклеотидные последовательности прототипного штамма Ю690 вируса Бханджа и штамма Ш191 вируса Кисмайо. На основании множественного выравнивания выведенных аминокислотных последовательностей вирусов Бханджа и Кисмайо с последовательностями представителей семейства Випу№тс1ае и филогенетического анализа впервые установлена принадлежность этих вирусов к роду РЫеЪочггш. Последовательности сегментов генома вируса Бханджа были депонированы в ОепВапк с кодами доступа КС521440-КС521442.

2. Создана ОТ-ПЦР тест-система, позволяющая амплифицировать фрагмент Ь сегмента генома флебовирусов длиной 507 нуклеотидов (по последовательности полимеразы вируса лихорадки долины Рифт (МСО14397)). Продемонстрирована специфичность разработанной тест-системы с использованием различных арбовирусов.

3. Созданная ОТ-ПЦР тест-система была апробирована на полевом материале, собранном в различных регионах европейской части РФ. В результате проведенной работы в клещах Ixodes persulcatus, Dermacentor reticulatus и Hyalomma scupense обнаружены фрагменты РНК-полимеразы пяти новых представителей рода Phlebovirus.

Апробация работы

Основные результаты работы были представлены на IV Ежегодном Всероссийском конгрессе по инфекционным болезням (г. Москва, 26-28 марта 2012 г.), X съезде Всероссийского научно-практического общества эпидемиологов, микробиологов и паразитологов «Итоги и перспективы обеспечения эпидемиологического благополучия населения Российской Федерации (г. Москва, 12-13 апреля 2012 г.), конференции совета молодых ученых ИПВЭ им. М.П. Чумакова РАМН (Московская область 27 апреля 2012 г.), XII международном симпозиуме по болезням, переносимым клещами, IJSTD XII (Германия, г. Веймар, 20-23 марта 2013 г.).

Публикации

По результатам диссертации опубликована 1 статья в научном журнале «Эпидемиология и Инфекционные болезни» 2012 г., №4, с. 4-8; 2 - в сборниках материалов конференций и 2 тезисных сообщения.

Заключение диссертации по теме «Молекулярная биология», Климентов, Александр Сергеевич

6. ВЫВОДЫ

1. Впервые определены полногеномные нуклеотидные последовательности прототипного штамма IG690 вируса Бханджа и штамма Rh91 вируса Кисмайо. Длина L, М и S сегментов генома вируса Бхаджа составляет 6333, 3304 и 1807 нуклеотидов соответственно, вируса Кисмайо -6344, 3323 и 1879 нуклеотидов соответственно.

2. На основании множественного выравнивания и филогенетического анализа установлено, что исследуемые вирусы являются новыми представителями рода Phlebovirus. Их ближайшими родственниками (хотя весьма дальними) являются вирус тяжелой лихорадки с синдромом тромбоцитопении (SFTSV) и вирус Heartland (HRTV). Белок, кодируемый L сегментом генома вирусов Бханджа и Кисмайо, имеет 52% гомологии с полимеразой SFTSV и HRTV. Гомология белка, кодируемого М сегментом генома вирусов Бханджа и Кисмайо, и предшественника поверхностных гликопротеинов SFTSV и HRTV достигает 35%. Гомология нуклеокапсидного белка вирусов Бханджа и Кисмайо с N белком SFTSV и HRTV составляет 53%. Гомология аминокислотных последовательностей полимеразы вирусов Бханджа и Кисмайо достигает 85%, предшественника гликопротеинов - 60%, нуклеокапсидного белка - 75%.

3. Создана универсальная ОТ-ПЦР тест-система, позволяющая детектировать участок L сегмента генома флебовирусов в экспериментальных и полевых материалах. Продемонстрирована специфичность (способность выявлять только целевую РНК) созданной тест-системы с использованием различных арбовирусов.

4. При помощи созданной тест-системы в клещах Ixodes persulcatus, Dermacentor reticulatus и Hyalomma scupense, собранных в Республике Карелия и Ставропольском крае, детектированы пять РНК-изолятов вирусов - кандидатов для включения в род Phlebovirus. У четырех из них выявлено родство с вирусами группы Уукуииеми, один продемонстрировал наиболее высокое сходство с вирусами группы москитных лихорадок.

7. СПИСОК СОКРАЩЕНИЙ ак - аминокислота

БОЕ - бляшкообразующая единица

ВКЭ - вирус клещевого энцефалита

ДМСО - диметилсульфоксид

ДНК - дезоксирибонуклеиновая кислота дцРНК - двухцепочечная РНК

ИАЖ - иммунная асцитная жидкость

ИФА - иммуноферментный анализ кДНК - комплементарная ДНК кДа - килодальтон кРНК - комплементарная РНК

КРС - крупный рогатый скот

ЛД50 - доза, вызывающая гибель 50% животных мРНК - матричная РНК н.б.м. - новорожденные белые мыши нт - нуклеотид

НТО - нетранслируемая область оцРНК(-) - одноцепочечная РНК отрицательной полярности оцРНК(+) - одноцепочечная РНК положительной полярности

ОТ - обратная транскрипция

ОРС - открытая рамка считывания

ПААГ - полиакриламидный гель

ПВДФ - поливинилденфторид пн - пара нуклеотидов

ПСА - персульфат аммония

ПЦР - полимеразная цепная реакция

РН - реакция нейтрализации

РНК - рибонуклеиновая кислота

РНП - рибонуклеопротеин

РСК - реакция связывания комплемента

РТГА - реакция торможения гемагглютинации

ЦПД - цитопатическое действие

ЭПР - эндоплазматический ретикулум dNTP - дезоксинуклеозид-5'-трифосфаты

DTT - дитиотриит (dithiothreitol)

ICTV - Международный комитет по таксономии вирусов (International

Committee on Taxonomy of Viruses)

PBS - фосфатный буфер (phosphate buffered saline)

SDS - додецилсульфат натрия (sodium dodecyl sulfate)

SISPA -неспецифичная амплификация с одного рендомизированного праймера (sequence independent single primer amplification)

TBE - трис-боратный буфер

ТАЕ - трис-ацетатный буфер

TMED - тетраметилэтилендиамин (tetramethylethylenediamine)

8. БЛАГОДАРНОСТИ

Я выражаю искреннюю благодарность д.б.н. профессору A.M. Бутенко и к.б.н. А.П. Гмылю за научное руководство, неизменную поддержку и участие в подготовке диссертации. Я глубоко признателен д.б.н. Г.Г. Каргановой за помощь и внимание к настоящей работе.

Благодарю сотрудников лаборатории биологии и индикации арбовирусов НИИ вирусологии, к.б.н. В.Ф. Ларичева и к.б.н. Н.В. Хуторецкую за активное сотрудничество при проведении исследований.

Хочу поблагодарить сотрудников ИПВЭ им. М.П. Чумакова РАМН к.б.н. Гмыль Л.В., к.б.н. Козловскую Л.И., к.б.н. Исаеву О.В., Белову O.A., Холодилова И.С., Простову М.А., к.б.н. Романову Л.Ю. и сотрудника Института биологии Карельского центра РАН к.б.н. Бугмырина C.B. за непосредственную помощь и участие в данной работе.

Также хочу поблагодарить всех сотрудников лаборатории биологии и индикации арбовирусов НИИ вирусологии и лабораторий биохимии и биологии арбовирусов ИПВЭ им. М.П. Чумакова за создание дружественной и рабочей атмосферы.

Выражаю глубокую благодарность дирекции НИИ вирусологии им. Д.И. Ивановского в лице академика РАМН Д.К. Львова и дирекции ИПВЭ им. М.П. Чумакова РАМН в лице профессора М.И. Михайлова за предоставленную возможность выполнения данной работы.

Я благодарен официальным оппонентам д.б.н., к.м.н. Борисевичу C.B. и д.б.н. Забережному А.Д., а также рецензентам д.б.н. Исаевой Е.И. и к.б.н. Сергееву О.В. за внимательное прочтение работы и ценные замечания.

Я благодарен всем соавторам моих работ, не упомянутых выше, за помощь в проведении исследований.

Список литературы диссертационного исследования кандидат биологических наук Климентов, Александр Сергеевич, 2013 год

1. Бутенко A.M. Обнаружение некоторых арбовирусов в Сомали / Тезисы докладов Советско-французского симпозиума по медицинской вирусологии (вирусы в окружающей среде, бешенство, арбовирусы), Москва. -М, 1980.-С. 1.

2. Бутенко A.M. Изучение циркуляции арбовирусов в Гвинейской Республике // Медицинская паразитология и паразитарные болезни. 1996. -№2. - С. 40-44.

3. Бутенко A.M., Громашевский В.Л., Львов Д.К. и др. Вирус Кисмайо представитель антигенной группы Бханджа // Вопр. Вирусол. - 1979. - том 24-С. 661-665.

4. Варгина С.Г., Кучук Л.А. Карась Ф.Р. Летучие мыши как экологическая группа арбовирусов // Вирусы и вирусные инфекции человека. -М., 1981.-С. 94.

5. Виноград И.А., Красовская И.А., Сидорова Г.А. и др. Выделение аробовируса Бханджа из клещей Boophilus decoloratus в Камеруне // Вопр. вирусол. 1975. -№1. - С. 63-67.

6. Гмыль J1.B. Молекулярно-биологическая характеристика вируса Крымской-Конго геморрагической лихорадки: дисс. . канд. биол. наук: 03.00.06. — М., 2003.

7. Громашевский B.JL, Скворцова Т.М., Никифоров Л.П. и др. Изоляция некоторых арбовирусов на территории Туркмении и Азербайджана // Экология вирусов. 1975. том 3. - С.91-93.

8. Зайцев H.A., Бутенко A.M., Успенская И.Г. Серологические данные о циркуляции вир Бханджа в Молдавии // Здравоохранение. 1978. С. 1.

9. Закарян В.А., Громашевский В.Л., Чубкова А.И. и др. Изоляция вируса Бханджа в Армянской ССР из клещей Dermacentor marginatus И Экология вирусов. 1974. - том 2. - С. 82-83.

10. Карась Ф.Р., Варгина С.Г., Осипова Н.З. и др. Выделение вируса Бханджа из клещей Hyalomma plumbeum в юго-западном климатическом районе Киргизии // Экология вирусов. 1974. - том 2. - С. 124-6.

11. Семашко И.В., Матевосян К.С., Пиванова Г.П. и др. Изоляция вируса Бханджа из клещей Dermacentor marginatus собранных с овец в районе озера Севан // Медицинская вирусология. 1973. - №21. - С. 160-16.

12. Семашко И.В., Чумаков М.П., Цыакин Л.Б. и др. Изучение1. Р m „ „ cz —патогенности вируса иханджа для ягня i при разных способах заражения. Экология вирусов. 1976. - С. 184-186.

13. Alberdi М.Р., Dalby M.J., Rodriguez-Andres J. et al. Detection and identification of putative bacterial endosymbionts and endogenous viruses in tick cell lines // Ticks Tick-borne Dis. 2012. - Vol. 3, №3. - P. 137-146.

14. Altamura L.A., Bertolotti-Ciarlet A., Teigler J. et al. Identification of a novel C-terminal cleavage of Crimean-Congo hemorrhagic fever virus PreGn thatleads to generation of an NSm protein // J. Virol. 2007. - Vol. 81, №12. - P. 6632-42.

15. Anagnostou V., Pardalos G., Athanasiou-Metaxa M. et al. A Novel phlebovirus in Febrile Child, Greece // Emerg. Infect. Dis. 2011. - Vol. 17, №5. -P. 940-1.

16. Andersson A.M., Melin L., Persson R. et al. Processing and membrane topology of the spike proteins G1 and G2 of Uukuniemi virus // J. Virol. 1997. -Vol. 71, №1.-P. 218-25.

17. Baker T.S., Olson N.H., Fuller S.D. Adding the third dimension to virus life cycles: Three-dimensional reconstruction of icosahedral viruses from cryo-electron micrographs // Microbiol. Mol. Biol. Rev. 1999. - Vol. 63. - P. 862922.

18. Balducci M., Verani P., Lopes M. C. et al. Experimental pathogenicity of Bhanja virus for white mice and Macaca mulatto monkeys // Acta Virol. 1970. -Vol. 14, №3.-P. 237-43.

19. Barr J.N., Wertz G.W. Role of the conserved nucleotide mismatch within 3'- and 5'-terminal regions of Bunyamwera virus in signaling transcription // J. Virol. 2005. - Vol. 79, №6. - P. 3586-94.

20. Battisti A. J., Chu Y.K., Chipman P.R. et al. Structural studies of Hantaan virus//! Virol. 2011.-Vol. 85, №2.-P. 835-41.

21. Baumann D., Pusterla N., Péter O. et al. Fever after a tick bite: clinical manifestations and diagnosis of acute tick bite-associated infections in northeastern Switzerland // Dtsch. Med. Wochenschr. 2003. - Vol. 128, №19. - P. 1042-7.

22. Bishop D.H., Gould E.A., Akashi H., et al. The complete sequence and coding content of Snowshoe hare bunyavirus small (S) viral RNA species // Nucleic. Acids. Res. 1982. - Vol. 10. - P. 3703-3713.

23. Bouloy M., Janzen C., Vialat P. et al. Genetic evidence for an interferon-antagonistic function of Rift Valley fever virus nonstructural protein NSs // J. Virol. 2001. - Vol. 75, №3. - P. 1371-7.

24. Butenko A.M., Minja T., Mujomba E. et al. Distribution of CHF-Congo virus and some other tick-borne viruses in East Africa. // Arthropod-borne virus information exchange. 1977. -№33. - P. 112-121, 129-132.

25. Calisher C.H., Goodpasture H.C. Human Infection with Bhanja virus // Am. J. Trop. Med. Hyg. 1975. - Vol. 24, №6. - P. 1040-1042.

26. Calisher C.H., Monath T.P., Karabatsos N. et al. Arbovirus subtyping: applications to epidemiologic studies, availability of reagents and testing services // Am. J. Epidemiol. 1981. - Vol. 114, №5. - P. 619-31.

27. Cash P. Polypeptide synthesis of Dugbe virus, a member of the Nairovirus genus of the Bunyaviridae II J. Gen. Virol. 1985. - Vol. 66(Pt 1). - P. 141-8.

28. Charrel R.N., Izri A., de Lamballerie X. et al. Toscana virus RNA in Sergentomyia minuta flies // Emerg. Infect. Dis. 2006. - Vol. 12. - P. 1299-1300.

29. Charrel R.N., Izri A., Temmam S., et al. Cocirculation of 2 genotypes of Toscana virus, southeastern France // Emerg. Infect. Dis. 2007. - Vol. 13. - P. 465-468.

30. Charrel R.N., Moureau G., Temmam S. et al. Massilia virus, a novel phlebovirus (Bunyaviridae) isolated from sandflies in the Mediterranean // Vector Borne Zoonotic Dis. 2009. - Vol. 9, №5. - P. 519-30.

31. Collao X., Palacios G., de Ory F. et al. Granada virus: a natural phlebovirus reassortant of the sandfly fever Naples serocomplex with low seroprevalence in humans // Am. J. Trop. Med. Hyg. 2010. - Vol. 83, №4. - P. 760-5.

32. Darwish M., Hoogstraal H. Arboviruses infecting humans and lower animals in Egypt: a review of thirty years of research // The journal of the Egyptian public health association. 1981. - Vol. 56, №1-2. - P. 34-6.

33. Delarue M., Poch O., Tordo N. et al. An attempt to unify the structure of polymerases// Prot. Eng. 1990. - Vol. 3. - P. 461-7.

34. Digoutte J.P., Heme G. // Institut Pasteur Dakar Annual Report. 1985. -P. 111.

35. Diicher M., Aives M.J., Finkeisen D. et al. Genetic characterization of Bhanja virus and Palma virus, two tick-borne phleboviruses // Virus Genes. -2012. Vol. 45, №2. - P. 311-5.

36. Djikeng A., Halpin R, Kuzmickas R., et al. Viral genome sequencing by random priming methods // BMC Genomics. 2008 9:5.

37. Eifan S.A. and Elliott R.M. Mutational analysis of the Bunyamwera orthobunyavirus nucleocapsid protein gene // J. Virol. 2009. - Vol. 83. - P. 11307-17.

38. Endres M.J., Jacoby D.R., Janssen R.S. et al. The large viral RNA segment of California serogroup bunyaviruses encodes the large viral protein // J. Gen. Virol. 1989. - Vol. 70 (Pt 1). - P. 223-8.

39. Elliott R.M. Identification of nonstructural proteins encoded by viruses of the Bunyamwera serogroup (family Bunyaviridae) II Virology. 1985. - Vol. 143. -P. 119-26.

40. Elliott R.M. Nucleotide sequence analysis of the large (L) genomic RNA segment of Bunyamwera virus, the prototype of the family Bunyaviridae II Virology. 1989. - Vol. 173, №2. - P. 426-36.

41. Elliott R.M. Molecular biology of the Bunyaviridae II J. Gen. Virol. -1990.-Vol. 71.-P. 501-522.

42. Elliott R.M., Weber F. Bunyaviruses and the type I interferon system // Viruses. 2009. - Vol. 1,№3.-P. 1003-21.

43. Fazakerley J.K., Gonzalez-Scarano F., Strickler J. et al. Organization of the middle RNA segment of Snowshoe hare bunyavirus // Virology. 1988. - Vol. 167, №2.-P. 422-32.

44. Fazakerley J.K., Ross A.M. Computer analysis suggests a role for signal sequences in processing polyproteins of enveloped RNA viruses and as a mechanism of viral fusion // Virus Genes. 1989. - Vol. 2, №3. - P. 223-39.

45. Filipe A.R., Alves M.J., Karabatsos N. et al. Palma virus, a new Bunyaviridae isolated from ticks in Portugal // Intervirology. 1994. - Vol. 37. -P. 348-351.

46. Fontana J., Lopez-Montero N., Elliott R.M. et al. The unique architecture of Bunyamwera virus factories around the Golgi complex // Cell Microbiol. -2008. Vol. 10. - P. 2012-2028.

47. Habjan M., Pichlmair A., Elliott R.M. et al. NSs protein of Rift Valley fever virus induces the specific degradation of the double-stranded RNA-dependent protein kinase // J. Virol. 2009. - Vol. 83, №9. - P. 4365-75.

48. Hewlett M.J., Pettersson R.F. and Baltimore D. Circular forms of Uukuniemi virion RNA: an electron microscopic study // J. Virol. 1977. Vol. 21, №3. - P. 1085.

49. Hill C.A., Wikel S.K. The Ixodes scapularis genome project: an opportunity for advancing tick research. Trends Parasitol. 2005. Vol. 21, №4.rv 1 n ^r. 1D1-J.

50. Hoffmann B., Scheuch M., Hoper D. et al. Novel orthobunyavirus in cattle, Europe, 2011 // Emerging Infect. Dis. 2012. - Vol. 18. - P. 469-472.

51. Horling J. and Lundkvist A. Single amino acid substitutions in Puumala virus envelope glycoproteins G1 and G2 eliminate important neutralization epitopes // Virus Res. 1997. - Vol. 48. - P. 89-100.

52. Hubalek Z. Modulation of Bhanja virus infection in mice // Zentralbl. Bakteriol. Mikrobiol. Hyg. A. 1986. - Vol. 262, №3. - P. 417-24.

53. Hubalek Z. Some physical and chemical properties of Bhanja virus // Acta virologica. 1986. - Vol. 30. - P. 440-442.

54. Hubalek Z. Experimental pathogenicity of Bhanja virus // Zentralbl. Bakteriol. Mikrobiol. Hyg. A. 1987. - Vol. 266, №1-2. - P. 284-91.

55. Hubalek Z. Geographic distribushion of Bhanja virus // Folia parasitol. -1987. Vol. 34, №1. - P. 77-86.

56. Hubalek Z. Biogeography of Tick-Borne Bhanja virus (Bunyaviridae) in Europe // Interdiscip. Perspect. Infect. Dis. 2009. - Vol. 2009, id372691.

57. Hubalek Z. and Halouzka J. Numerical comparative serology of the Bhanja antigenic group (Bunyaviridae) II Archives of Virology. 1985. - Vol. 84, №3-4.-P. 175-80.

58. Hubalek Z. and Rodl P. Experimental infection of rabbit with Bhanja virus // Folia Parasitol. 1981. - №28. - P. 93-96.

59. Huiskonen J.T., Hepojoki J., Laurinmaki P. et al. Electron cryotomography of Tula hantavirus suggests a unique assembly paradigm for enveloped viruses // J. Virol. 2010. - Vol. 84, №10. - P. 4889-97.

60. Huiskonen J.T., Overby A.K., Weber F. et al. Electron cryo-microscopy and single-particle averaging of Rift Valley fever virus: evidence for Gn-Gc glycoprotein heterodimers // J. Virol. 2009. - Vol. 83, №8. - P. 3762-9.

61. Ihara T., Akashi H., Bishop D.H. Novel coding strategy (ambisense genomic RNA) revealed by sequence analyses of Punta Toro phlebovirus S RNA // Virology. 1984. - Vol. 136, №2. - P. 293-306.

62. International catalogue of Arboviruses, Bhanja virus http://wwwn.cdc.gov/arbocat/catalog-listing. asp?VirasID=64&SI=l.

63. International catalogue of Arboviruses, Forecariah virus, http://wwwn.cdc.gov/arbocat/catalog-listing.asp?VirusID=l 50&SI=1.

64. International catalogue of Arboviruses, Kismayo virus, http://wwwn.cdc.gov/arbocat/catalog-listing.asp?VirusID=240&SI=l.

65. Kakach L.T., Wasmoen T.L., Collett M.S. Rift Valley fever virus M segment: use of recombinant vaccinia viruses to study phlebovirus gene expression // J. Virol. 1988. - Vol. 62, №3. - P. 826-33.

66. Karabatsos B. Susceptibility of baby-hamster-kidney cell line (BHK-21) to infection with arboviruses // Amer. J. trop. med. Hyg. 1967. - Vol. 16. - P. 99105.

67. Kaukinen P., Koistinen V., Vapalahti O. et al. Interaction between molecules of hantavirus nucleocapsid protein // J. Gen. Virol. 2001. - Vol. 82 (Pt 8).-P. 1845-53.

68. Kormelink R., Storms M., Van Lent J. et al. Expression and subcellular location of the NSm protein of Tomato spotted wilt virus (TSWV), a putative viral movement protein // Virology. 1994. - Vol. 200. - P. 56-65.

69. Kumar S., Tamura K. and Nei M. MEGA: Molecular Evolutionary Genetics Analysis software for microcomputers // Computer Applications in Biosciences. 1994. - Vol. 10, №2. - P. 189-191.

70. Le May N., Dubaele S., Proietti de Santis L. et al. TFIIH transcription factor, a target for the Rift Valley hemorrhagic fever virus // Cell. 2004. - Vol. 116.-P. 541-550.

71. Le May N., Gauliard N., Billecocq A. et al. The N terminus of Rift Valley fever virus nucleoprotein is essential for dimerization // J. Virol. 2005. -Vol. 79, №18.-P. 11974-80.

72. Le May N., Mansuroglu Z., Leger P. et al. A SAP30 complex inhibits IFN-b expression in Rift Valley fever virus infected cells // PLoS Pathog. 2008. -Vol. 4, №1. - el3 doi: 10.1371/journal.ppat.0040013.

73. Lober C., Anheier B., Lindow S. et al. The Hantaan virus glycoprotein precursor is cleaved at the conserved pentapeptide WAASA // Virology. 2001. -Vol. 289, №2.-P. 224-9.

74. Lopes M.C., Ronda C., Verani P. et al. Growth of Bhanja virus in tissue culture // Acta Virol. 1970. - Vol. 14, №3. - P. 244-8.

75. Lotric-Furlan S., Petrovec M., Avsic-Zupanc T. et al. Prospective assessment of the etiology of acute febrile illness after a tick bite in Slovenia // Clin. Infect. Dis. 2001. - Vol. 33, №4. - P. 503-10.

76. Marklewitzl M., Handrick S., Grasse W. et al. Gouleako virus isolated from West African mosquitoes constitutes a proposed novel genus in the family Bunyaviridae 11 J. Virol. 2011. - Vol. 85, №17. - P. 9227-9234.

77. Marriott A.C. and Nuttall P.A. Comparison of the S RNA segments and nucleoprotein sequences of Crimean-Congo hemorrhagic fever, Hazara, and Dugbe viruses // Virology. 1992. - Vol. 189, №2. - P. 795-9.

78. Marriott A.C., Nuttall P.A. Large RNA segment of Dugbe nairovirus encodes the putative RNA polymerase // J. Gen. Virol. 1996. - Vol. 77 (Pt 8). -P. 1775-80.

79. Martin M.L., Lindsey-Regnery H., Sasso D.R. et al. Distinction between Bunyaviridae genera by surface structure and comparison with Hantaan virus using negative stain electron microscopy // Arch. Virol. 1985. - Vol. 86. - P. 17-28.

80. McMullan L.K., Folk S.M., Kelly A.J. et al. A new phleboviras associated with severe febrile illness in Missouri // N. Engl. J. Med. 2012. - Vol. 367, №9.-P. 834-41.

81. Mir M.A., Panganiban A.T. The hantavirus nucleocapsid protein recognizes specific features of the viral RNA panhandle and is altered in conformation upon RNA binding // J. Virol. 2005. - Vol. 79, №3. - P. 1824-35.

82. Mohamed M., McLees A. and Elliott R. M. Viruses in the Anopheles A, Anopheles B and Tete serogroups in the Orthobunyavirus genus (family Bunyaviridae) do not encode an NSs protein // J. Virol. 2009. - Vol. 83, №15. -P. 7612-8.

83. Muller R., Poch O., Delarue M. et al. Rift Valley fever virus L segment: correction of the sequence and possible functional role of newly identified regions conserved in RNA-dependent polymerases // J. Gen. Virol. 1994. - Vol. 75. - P. 1345-52.

84. Murphy F.A., Harrison A.K. and Whitfield S.G. Bunyaviridae: morphologic and morphogenetic similarities of Bunyamwera serologic supergroup viruses and several other arthropod-borne viruses // Intervirology. 1973. - №1. -P. 297-316.

85. Pagel Van Zee J., Geraci N.S., Guerrero F.D. et al. Tick genomics: the Ixodes genome project and beyond // Int. J. Parasitol. 2007. - Vol. 37, №12. P. 1297-305.

86. Palacios G., Savji N., Travassos da Rosa A. et al. Characterization of the Uukuniemi virus group (Phlebovirus: Bunyaviridae): evidence for seven distinct species // J. Virol. 2013. - Vol. 87, №6. - P. 3187-95.

87. Pavlov P., Rosicky B. and Hubalek Z. Isolation of Bhanja virus from ticks of the genus Haemapysalis in southeast Bulgaria and presence of antibodies in pastured sheep // Folia parasitol. 1978. - №25. - P. 67-73.

88. Pavlov P., Rosicky B., Hubalek Z. et al. Bhanja virus antibodies in sheep from Bulgaria // Folia Parasitol. 1978. - Vol. 25, №1. - P. 67-73.

89. Pepin M., Bouloy M., Bird B.H. et al. Rift Valley fever virus {Bunyaviridae: Phlebovirus): an update on pathogenesis, molecular epidemiology, vectors, diagnostics and prevention // Vet. Res. 2010. - Vol. 41, №6. - P. 61.

90. Pesonen M., Kuismanen E. and Pettersson R.F. Monosaccharide sequence of protein-bound glycans of Uukuniemi virus // J. Virol. 1982. - Vol. 41, №2.-P. 390-400.

91. Petersen T.N., Brunak S., von Heijne G. et al. SignalP 4.0: discriminating signal peptides from transmembrane regions // Nat. Methods. 2011. - Vol. 8, №10.-P. 785-6.

92. Poch O., Sauvaget I., Delarue M. et al. Identification of four onserved motifs among the RNA-dependent polymerase encoding elements // EMBO J. -1989. Vol. 8. - P. 3867-3874.

93. Punda V., Beus I., Calisher C. H., et al. Laboratory infections with Bhanja virus. Arboviruses in the Mediterrnean Countries // Zbl. Bakt., suppl. 9. -1980.-P. 273-275.

94. Raju R. and Kolakofsky D. Translational requirement of La Crosse virus S-mRNA synthesis: in vivo studies // J Virol. 1987. - Vol. 61, №1. - P. 96-103.

95. Raju R., Kolakofsky D. Unusual transcripts in La Crosse virus-infected cells and the site for nucleocapsid assembly // J. Virol. 1987. - Vol. 61, №3. P. 667-72.

96. Raju R. and Kolakofsky D. The ends of La Crosse virus genome and antigenome RNAs within nucleocapsids are base paired // J. Virol. 1989. - Vol. 63, №1.- P. 122-8.

97. Salanueva I.J., Novoa R.R., Cabezas P. et al. Polymorphism and structural maturation of Bunyamwera virus in Golgi and post-Golgi compartments //J. Virol.-2003.-Vol. 77.-P. 1368-1381.

98. Sanchez A.J., Vincent M.J., Erickson B.R. et al. Crimean-Congo hemorrhagic fever virus glycoprotein precursor is cleaved by Furin-like and SKI-1 proteases to generate a novel 38-kilodalton glycoprotein // J. Virol. 2006. - Vol. 80, №1,-P. 514-25.

99. Sanchez A.J., Vincent M.J. and Nicho! S.T. Characterization of the glycoproteins of Crimean-Congo hemorrhagic fever virus // J. Virol. 2002. - Vol. 76, №14.-P. 7263-75.

100. Sánchez-Seco M.P., Echevarría J.M., Hernández L. et al. Detection and identification of Toscana and other phleboviruses by RT-Nested-PCR assays with degenerated primers // J. Med. Virol. 2003. - Vol. 71. - P. 140-149.

101. Schmaljohn C.S. Nucleotide sequence of the L genome segment of Hantaan virus // Nucleic Acids Res. 1990. - Vol. 18, №22. - P. 6728.

102. Schmaljohn C.S. and Dalrymple J.M. Analysis of Hantaan virus RNA: evidence for a new genus of Bunyaviridae // Virology. 1983. - Vol. 131, №2. -P. 482-91.

103. Schmaljohn C.S., Hasty S.E., Rasmussen L. et al. Hantaan virus replication: effects of monensin, tunicamycin and endoglycosidases on the structural glycoproteins // J. Gen. Virol. 1986. - Vol. 67 (Pt 4). - P. 707-17.

104. Schmaljohn C.S., Jennings G.B., Hay J. et al. Coding strategy of the S genome of Hantaan virus // Virology. 1986. - Vol. 155, №2. - P. 633-43.

105. Schmaljohn C.S. and Nichol S.T. Bunyaviridae: the viruses and their replication / "Fields virology" (Lippincott Williams & Wilkins, Philadelphia), 5th Ed. 2007. Vol. 2. pp 1741-1789.

106. Shah K.V. and Work T.H. Bhanja virus is a new arbovirus from ticks Haemaphysalis intermedia II Indian J. of Med. Res. 1969. - Vol. 57, №5. - P. 793-798.

107. Sherman M.B., Freiberg A.N., Holbrook M.R. et al. Single-particle cryo-electron microscopy of Rift Valley fever virus // Virology. 2009. - Vol. 387, №1. -P.ll-5.

108. Shi X., Kohl A., Leonard V.H. et al. Requirement of the N-terminal region of orthobunyavirus nonstructural protein NSm for virus assembly and morphogenesis // J. Virol. 2006. - Vol. 80, №16. - P. 8089-8099.

109. Shi X., Kohl A., Li P. et al. Role of the cytoplasmic tail domains of Bunyamwera orthobunyavirus glycoproteins Gn and Gc in virus assembly and morphogenesis // J. Virol. 2007. - Vol. 81, №18. - P. 10151-10160.

110. Soldan S.S. and Gonzalez-Scarano F. Emerging infectious diseases: The Bunyaviridae II J. Neurovirol. 2005. - Vol. 11. - P. 412-423.

111. Soldan S.S., Plassmeyer M.L., Matukonis M.K. et al. La Crosse virus nonstructural protein NSs counteracts the effects of short interfering RNA // J. Virol. 2005. - Vol. 79, №1. - P. 234-44.

112. Struthers J.K., Swanepoel R., Shepherd S.P. Protein synthesis in Rift Valley fever virus-infected cells // Virology. 1984. - Vol. 134, №1. - P. 118-24.

113. Subramaniam S., Bartesaghi A., Liu J. et al. Electron tomography of viruses // Curr. Opin. Struct. Biol. 2007. - Vol. 17. - P. 596-602.

114. Takeda A., Sugiyama K., Nagano H. et al. Identification of a novel RNA silencing suppressor, NSs protein of Tomato spotted wilt virus // FEBS Lett. -2002. Vol. 532, №1-2. - P. 75-9.

115. Ungureanu A., Popovici V., Catana§ F. et al. Isolation of Bhanja virus in Romania // Arch. Roum. Pathol. Exp. Microbiol. 1990. - Vol. 49, №2. - P. 13945.

116. Verani P., Balducci M., Lopes M.C. Isolation of Bhanja virus from Haemaphysalis ticks in Italy // Am. J. Trop. Med. Hyg. 1970. - Vol. 19, №1. - P. 103-5.

117. Vesenjak-Hirjan J., Calisher C. H., Beus I. et al. First natural clinical human Bhanja vims infection // Arboviruses in the Mediterrnean Countries, Zbl. Bakt, suppl. 9. 1980. - P. 297-301.

118. Vesenjak-Hirjan J., Calisher C.H., Brudnjak Z. et al. Isolation of Bhanja virus from ticks in Yugoslavia // Am. J. Trop. Med. Hyg. 1977. - Vol. 26, №5 (Pt 1).-P. 1003-8.

119. Weidmann M., Sanchez-Seco M.P., Sail A.A. et al. Rapid detection of important human pathogenic phleboviruses // J. Clin. Virol. 2008. - Vol. 41, №2.n no 4"» — i . uo-tz,.

120. Wickens M.P. and Dahlberg J.E. RNA-protein interactions // Cell. -1987. Vol. 51, №3. - P. 339-42.

121. Won S., Ikegami T., Peters C.J. et al. NSm protein of Rift Valley fever virus suppresses virus-induced apoptosis // J. Virol. 2007. - Vol. 81, №24. - P. 13335-45.

122. Xiong Y. and Eickbush T.H. Origin and evolution of retroelements based upon their reverse transcriptase sequences // EMBO J. 1990. - Vol. 9. - P. 33533362.

123. Yu X.J., Liang M.F., Zhang S.Y. et al. Fever with thrombocytopenia associated with a novel bunyavirus in China // N. Engl. J. Med. 2011. - Vol. 364, №16.-P. 1523-32.

124. Zhang Y.Z., He Y.W., Dai Y.A. et al. Hemorrhagic fever caused by a novel bunyavirus in China: pathogenesis and correlates of fatal outcome // Clin. Infect. Dis. 2012. - Vol. 54, №4. - P. 527-33.

125. Zhioua E., Moureau G., Chelbi I. et al. Punique virus, a novel phlebovirus, related to sandfly fever Naples virus, isolated from sandflies collected in Tunisia // J. Gen. Virol. 2010. - Vol. 91 (Pt 5). P. 1275-83.