Механизмы микроэволюции вируса клещевого энцефалита тема диссертации и автореферата по ВАК РФ 03.00.06, доктор биологических наук Карганова, Галина Григорьевна

• Карганова, Галина Григорьевна
• доктор биологических наук
• 2009

Оглавление диссертации доктор биологических наук Карганова, Галина Григорьевна

Список сокращений.

Введение.

ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ.

1. Общая характеристика флавивирусов.

1.1 . Классификация флавивирусов

1.2 . Эволюция флавивирусов

1.3 . Строение вирионов

1.4 Характеристика генома и вирусных белков

1.5 . Репродукция флавивирусов в клетке

2. Патогенез клещевого энцефалита.

2.1. Характер инфекции.

2.2. Факторы, влияющие на патогенез инфекции, вызванной ВКЭ

2.3. Молекулярные детерминанты вирулентности флавивирусов

Глава 3. Основные механизмы микроэволюции РНК-содержащих арбовирусов.

3.1. Основные характеристики микроэволюции РНК-содержащих вирусов

3.2. Факторы, влияющие на приспособленность вирусной популяции 77 Собственные исследования.

МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ.

Ml. Использованные в работе вирусы.

М2. Плазмиды.

МЗ. Культуры клеток.

М4. Животные.

М5. Клещи.

Мб. Иммунные сыворотки и моноклональные антитела.

М7. Олигонуклеотиды.

М8. Титрование инфекционного вируса.

М9. Клонирование вируса методом бляшек.

М10. Титрование ВКЭ на мышах.

Mil. Опыт на клещах.

Ml2. Реакция гемагглютинации.

М13. Гистологическое исследование.

Ml4. Моделирование инфекции.

Ml5. Определение протективной активности.

Ml6. Концентрирование ВКЭ из КЖ инфицированных клеток.

Ml7. Иммуноферментный анализ (ИФА).

М18. Определение концентрации ИЛ в сыворотках крови.

Ml 9. Определение концентрации а/р интерферона (ИФН) в сыворотках крови мышей.

М20. Ракетный иммуноэлектрофорез (РИЭФ).

М21. Сорбция на гепарин сефарозе (ГС).

М22. Сорбция вируса на эритроцитах мыши.

М23. Электрофорез белков в полиакриламидном геле (ПААГ).

М24. Реакция иммунопреципитации (РИП) вирусных белков.

М25. Выделение РНК.

М26. Обратная транскрипция.

М27. Полимеразная цепная реакция (ПЦР).

М28. Аналитический электрофорез ДНК в агарозном геле.

М29. Препаративный электрофорез и выделение продуктов ПЦР из легкоплавкой агарозы.

М30. Определение нуклеотидной последовательности.

МЗ1. Анализ нуклеотидных и аминокислотных последовательностей.

М32. Метод доказательства отсутствия РНК ВКЭ в биопробах.

МЗЗ. Определение количества копий РНК ВКЭ в КЖ инфицированных клеток СПЭВ с помощью ПЦР в реальном времени.

М34. Получение препарата цитомембран.

М35. Измерение активности Na+,K+-ATOa3bi.

М36. Изучение адсорбции вирионов ВКЭ на клетках.

М37. Получение антиидиотипической сыворотки к белку Е ВКЭ.

РЕЗУЛЬТАТЫ.

Глава 1. Особенности эволюции переносимых клещами флавивирусов.

Литературные данные.

Л. 1.1. Филогенетические связи в группе переносимых клещами флавивирусов млекопитающих

Л. 1.2. Разнообразие штаммов ВКЭ

Собственные результаты.

С. 1.1. Филогенетические связи между штаммами ВКЭ по данным для полных геномов

С. 1.2. Филогенетические связи между штаммами ВКЭ по данным для фрагментов РНК, кодирующих белок Е

С.1.3. Выявление генотип- и хозяин-специфических детерминант в геноме ВКЭ

Глава 2. Изменение свойств вируса КЭ при адаптации к клещам и млекопитающим и выявление хозяин-специфических генетических детерминант.

Литературные данные.

Л.2.1. Хозяин-специфические детерминанты в геноме флавивирусов

Л.2.2. Фенотипические и генетические изменения вирусов ККЭ при адаптации к клещам и млекопитающим

Собственные результаты.

С.2.1. Общая характеристика использованных в работе вирусов

С.2.1.1 Репродукция варианта М и штамма ЭК-328 в клетках СПЭВ.

С.2.1.2. Вирулентность варианта М и штамма Эк-328 для мышей

С.2.1.3. Репродукция варианта М и штамма Эк-328 в клещах Н. marginatum 181 С.2.2. Секвенирование генома адаптированного к клещам варианта М

С.2.3 Сорбция вирионов родительского штамма ЭК-328 и варианта М на гепарин-сефарозе

С.2.4. Изучение антигенной структуры белка Е штамма ЭК-328 и варианта М

Глава 3. Взаимодействие вируса клещевого энцефалита с рецепторами на поверхности клеток.

Собственные результаты.

С.3.1 Изучение основных характеристик адсорбции вирионов ВКЭ на поверхности клеток

С.3.2. Доказательство белковой природы высокоаффинного рецептора для ВКЭ

С.3.3. Изучение природы клеточных рецепторов с помощью антиидиотипической сыворотки к белку Е

С.3.4 Изменение активности Na+, К+-АТФазы при репродукции ВКЭ в культуре клеток СПЭВ

Глава 4. Изменение патогенетических характеристик ВКЭ при адаптации к клещам и переадаптации к млекопитающим.

Литературные данные.

JI.4.1 Распространение вируса в организме млекопитающего

JI.4.2. Формирование иммунного ответа при КЭ

Собственные результаты.

С.4.1. Сравнение вирулентности для мышей штамма ЭК-328 и варианта М с использованием данных вирусологического и гистологического анализа

С.4.2. Характеристика инфекции, вызванной вариантами вируса КЭ при периферическом введении мышам

С.4.3 Сорбция вирусов на эритроцитах мыши

С.4.4 Синтез противовирусных антител в процессе вирусной инфекции

Рис. 4-5. продолжение

С.4.5 Динамика появления ключевых интерлейкинов при острой и инаппарантной формах инфекции, вызванной данными вариантами ВКЭ

С.4.7. Оценка чувствительности штамма Эк-328 и варианта М к экзогенному интерферону

С.4.8 Изучение связи тяжести заболевания с концентрацией ИЛ-2 и ИЛ-6 и содержанием антител к белкам ВКЭ в сыворотках крови людей, больных клещевым энцефалитом

С.4.9 Характеристика протективного иммунитета, индуцируемого вариантом М

Глава 5. Поведение популяции ВКЭ при смене хозяина.

Собственные результаты.

С.5.1 Получение крупнобляшечных ревертантов в культуре клеток СПЭВ 289 С.5.2 Свойства вирионов клонов, полученных из популяции варианта М в культуре клеток СПЭВ

С.5.3 Секвенирование фрагментов РНК клонов, выделенных из популяции варианта М

С.5.4 Оценка вирулентности для мышей дополнительно клонированных ревертантов

С.5.5 Сорбция ревертантов из популяции варианта М на эритроцитах мыши 300 С.5.6 Пассажи варианта М в культуре клеток СПЭВ

С.5.7. Поведение популяции варианта М при репродукции in vivo

С.5.8 Смешанная инфекция клеток СПЭВ родительским штаммом Эк-328 и вариантом М

Введение диссертации (часть автореферата) на тему «Механизмы микроэволюции вируса клещевого энцефалита»

Высокий риск инфицирования, широкое распространение и тяжесть заболевания делают клещевой энцефалит (КЭ) одной из самых актуальных природно-очаговых вирусных инфекций в России. Для заболеваемости этой инфекцией характерна цикличность, и в последнее время наблюдается ее снижение по сравнению с 1999 годом, когда в России было зарегистрировано более 10000 случаев КЭ. Несмотря на это, эпидемиологическая ситуация остается напряженной. Клещевой энцефалит распространен на территории 50 субъектов РФ. Число регистрируемых случаев в последнее время превышает 2000 в год, около трети которых протекает с остаточными осложнениями разной степени тяжести, часто приводящими к инвалидности. У 1-5% пациентов КЭ переходит в хроническую форму. Предыдущие 20 лет характеризовались повсеместным увеличением численности клещей-переносчиков вируса КЭ (ВКЭ), расширением ареала инфекции, увеличением группы риска за счет городских жителей до практически всего населения, проживающего на эндемичных территориях, а также большим числом смешанных вирусных и бактериальных переносимых клещами инфекций.

Цикличность и географическая неравномерность заболеваемости КЭ определяются многими факторами, в том числе, числом и видом клещей-переносчиков, их зараженностью ВКЭ, численностью и видами прокормителей, количеством восприимчивого населения, свойствами циркулирующего вируса и наличием в клещах возбудителей сопутствующих инфекций.

Постоянный комплексный мониторинг эпидемиологической и эпизоотологической ситуации в очагах и понимание связи эпизоотологических характеристик и заболеваемости КЭ могут дать информацию, позволяющую делать как краткосрочные прогнозы, так и разрабатывать сценарии изменения риска заболевания КЭ в зависимости от изменения климата, проведения профилактических мероприятий, антропогенного и других воздействий на биоценоз, а также предсказывать появление новых эпидемически важных вариантов этого вируса. Очевидно, что для этого необходимо изучение механизмов взаимодействия всех звеньев паразитарной системы: прокормитель -клещ - вирус.

В последнее время, благодаря усилиям нескольких научных коллективов отмечаются большие успехи в области молекулярной эпидемиологии КЭ. Установлены ареалы трех генотипов ВКЭ, получены предварительные данные, указывающие на возможную циркуляцию в природе новых генетических вариантов этого вируса. Тем не менее, полученной информации недостаточно для объяснения различных уровней заболеваемости в разных регионах России. Остаются открытыми вопросы о том, какие факторы определяют активность очагов, цикличность подъема заболеваемости, и существует ли связь между уровнем заболеваемости и вирулентностью циркулирующих вариантов ВКЭ в данном регионе.

Современные достижения в молекулярной биологии и вирусологии позволяют изучать вирусы на популяционном уровне, оценивать гетерогенность популяции и влияние этой гетерогенности на основные характеристики вируса, в том числе и патогенетические.

Настоящая работа посвящена исследованию механизмов микроэволюции ВКЭ. Популяционный подход при изучении арбовирусов, специфики поведения вирусной популяции при чередовании хозяев (членистоногие-прокормители) дает новую информацию, позволяющую объяснить зависимость вирулентности вируса и активности очагов от различных характеристик биоценоза.

ЦЕЛЬ РАБОТЫ: изучение механизмов микроэволюции популяции ВКЭ. ЗАДАЧИ РАБОТЫ:

- на основе данных филогенетического анализа оценить основные факторы, определяющие эволюцию ВКЭ;

- на модели одного штамма ВКЭ изучить геном и свойства вариантов вируса, имеющих селективные преимущества при репродукции в клещах и млекопитающих;

- исследовать начальные этапы взаимодействия ВКЭ с клетками и их роль в изменчивости этого вируса;

- описать патогенез и формирование иммунного ответа при инфекции, вызванной вариантами вируса, адаптированными к клещам и млекопитающим;

- изучить механизмы изменения генетической структуры популяции при смене хозяина.

НАУЧНАЯ НОВИЗНА

Впервые показано, что на поверхности клеток существует два типа рецепторов для ВКЭ, обеспечивающих высоко- и низкоаффинное связывание вирионов.

Впервые изучены молекулярные основы адаптации ВКЭ к клещам и млекопитающим и предложена схема, объясняющая быструю переадаптацию вируса при чередовании хозяев. Впервые показано, что адаптация ВКЭ к клещам связана с появлением в основном гликопротеине Е мутаций, приводящих к комплексному изменению его антигенной структуры и повышающих аффинность связывания вирионов с гликозаминогликанами (ГАГ) на поверхности клетки, которые служат низкоаффинным рецептором для вирионов ВКЭ.

Впервые изучены механизмы восстановления низкой аффинности связывания вирионов с ГАГ у мутантов ВКЭ с ГАГ-связывающим фенотипом. Впервые показано, что при репродукции вируса с подобным фенотипом в клетках млекопитающих могут возникать варианты ВКЭ, способные вызывать все формы инфекции (инаппарантную, острую и персистентную).

В результате проделанной работы впервые в экспериментах на мышах охарактеризована инаппарантная форма КЭ, вызванная периферическим введением адаптированного к клещам варианта ВКЭ с ГАГ-связывающим фенотипом. При данной инфекции нет виремии, не выявляется вирус и вирусная РНК в центральной нервной системе (ЦНС), не выявляются антитела (AT) к основному гликопротеину Е при синтезе в небольших количествах AT к неструктурному белку NS1 и формируется длительный протективный иммунитет.

НАУЧНО-ПРАКТИЧЕСКАЯ ЗНАЧИМОСТЬ

Настоящая работа является первым комплексным исследованием, позволяющим оценить поведение популяции переносимого клещами арбовируса при чередовании хозяев (клещ-млекопитающее). Для экспериментально полученных вариантов ВКЭ, имеющих селективное преимущество при размножении в клещах и млекопитающих, проведено сравнение геномов, свойств вирионов, характеристик репродукции в клетках, патогенетических характеристик и особенностей иммунного ответа в экспериментах на лабораторных мышах и показаны механизмы изменения структуры популяции ВКЭ при смене хозяина.

Выявлено, что адаптация ВКЭ к клещам может приводить к значительному изменению антигенной структуры белка Е. Это необходимо учитывать при разработке и применении вакцинных препаратов, а также при оценке природной изменчивости антигенной структуры ВКЭ.

Показано, что при переадаптации ВКЭ от клещей к млекопитающим в популяции вируса появляются варианты, различающиеся по патогенетическим характеристикам.

Накопленная информация показывает, что длительная циркуляция ВКЭ в клещах может приводить к селекции низковирулентных вариантов, обеспечивающих скрытую иммунизацию млекопитающих против вирулентного вируса без синтеза AT к белку Е. Полученные данные следует учитывать при создании диагностических препаратов, при прогнозировании тяжести течения и исхода заболевания, а также при изучении уровня сероконверсии у людей и прокормителей.

Приведенные данные относятся к изучению механизмов микроэволюции ВКЭ и патогенеза при разных формах КЭ с учетом гетерогенности популяции, которое является одним из приоритетных направлений фундаментальных исследований в области инфекционной патологии.

ВНЕДРЕНИЕ

Материалы исследований были использованы при составлении Санитарно-эпидемиологических правил 3.1.3.2352-07 «Профилактика клещевого вирусного энцефалита», включены в программу лекций на кафедре вирусологии биологического факультета МГУ им. М.И.Ломоносова.

Определена первая полная нуклеотидная последовательность генома представителя прибалтийской группы сибирского генотипа ВКЭ (штамм Эк-328 GenBank http://www.ncbi.nlm.nih.gov/Genbank, № DQ486861).

Разработан корректный методический подход, позволяющий контролировать отсутствие персистенции вируса в ЦНС (Вопросы вирусологии, 2006).

АПРОБАЦИЯ РАБОТЫ

Работа была апробирована на заседании межлабораторного Ученого совета ГУ ИПВЭ им. М.П.Чумакова РАМН 20 февраля 2009 года.

Материалы диссертации представлены на заседании Ученого совета ГУ ИПВЭ им. М.П.Чумакова РАМН (2007), на научной конференции, посвященной 90-летию со дня рождения М.П.Чумакова (Москва, 1999), на региональных научно-практических конференциях (Якутск, 2007; Красноярск, 2008; Пермь, 2008), на Всесоюзных и Всероссийских научно-практических конференциях (Иркутск, 1990; Алма-Ата, 1991; Ярославль, 1992; Ижевск, 1998; Новосибирск, 2002; Пермь, 2003; Самара, 2004; Красноярск, 2005), на Международных конференциях по арбовирусам и арбовирусным инфекциям (Москва, 1989), по проблемам инфекций в клинической медицине (Санкт-Петербург, 2002), по ликвидации и элиминации инфекционных болезней (Санкт-Петербург, 2003), по возникающим болезням и выживанию (IMED Вена-Австрия, 2007), на VIII и X Международных конгрессах по вирусологии (Берлин-Германия, 1990; Иерусалим-Израиль, 1996), на III Совместном совещании европейского общества борьбы с вирусными заболеваниями и европейской группы по быстрой вирусной диагностике (Страсбург-Франция, 1991), на V Интернациональном симпозиуме по (+)РНК содержащим вирусам (Флорида, 1998), на IV Конгрессе Европейского общества по инфекционным болезням (ESEI Лиссабон-Португалия, 2007); на VIII Всероссийском съезде эпидемиологов, микробиологов и паразитологов (Москва, 2002), на IV Всероссийском съезде общества паразитологов (Санкт-Петербург, 2008); на расширенных пленумах проблемных комиссий по клещевым и другим вирусным энцефалитам (Москва, 2003) и арбовирусам (Астрахань, 2006), на Бюро Отделения профилактической медицины РАМН (Москва, 2008).

ПУБЛИКАЦИИ

По результатам работы опубликовано 14 статей в реферируемых научных журналах, из них 3 за рубежом, 1 монография и 10 статей в научных сборниках.

ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ

Заключение диссертации по теме «Вирусология», Карганова, Галина Григорьевна

выводы

1. Адаптация штамма Эк-328 вируса клещевого энцефалита к клещам Hyalomma marginatum marginatum сопровождается набором несинонимических замен в геноме: нуклеотидными заменами в 5'-НТО, аминокислотными заменами в сигнальной последовательности белка ргМ, в области белков Е, NS2a, NS4a. Замены в белке Е Glu J22—»Gly и Thr426—>Пе определяют основные свойства адаптированного к клещам варианта М, отличающие его от адаптированного к мышам родительского штамма Эк-328.

2. ВКЭ имеет два типа рецепторов на поверхности клеток млекопитающих: высокоаффинный и низкоаффинный. Адаптация ВКЭ к клещам связана с появлением мутаций в белке Е, повышающих аффинность связывания вирионов с гликозаминогликанами на поверхности клетки, которые служат низкоаффинным рецептором для этого вируса.

3. При репродукции в клетках млекопитающих вариант ВКЭ с ГАГ-связывающим фенотипом восстанавливает способность к низкоаффинному связыванию с ГАГ клеток за счет появления обратных и компенсирующих замен. Свойства ревертантов зависят от характера и расположения компенсирующих замен в белке Е.

4. Получена модель инаппарантной формы КЭ при периферическом заражении лабораторных мышей адаптированным к клещам вариантом М, которая характеризуется формированием длительного протективного иммунитета без выраженного синтеза антител к основному вирусному гликопротеину Е. Особенности инаппарантной инфекции определяются быстрым удалением вируса из кровотока за счет повышенной сорбции вирионов на эритроцитах, ранней активации неспецифического иммунитета, а также активацией Thl-лимфоцитов.

5. На экспериментальной модели показано, что ВКЭ может существовать в виде гетерогенной популяции, содержащей варианты, обладающие селективным преимуществом при репродукции либо в клещах, либо в млекопитающих. Переадаптация к млекопитающим адаптированного к клещам вируса происходит за счет изменения соотношения этих вариантов в популяции, а также за счет появления новых мутантов с более высокой приспособленностью к репродукции в данной системе.

6. Скорость изменения генетической структуры популяции ВКЭ и разнообразие мутантов определяется характеристикой хозяина и наличием эффекта "бутылочного горлышка".

СПИСОК РАБОТ, ОПУБЛИКОВАННЫХ ПО ТЕМЕ ДИССЕРТАЦИИ

Научные статьи, опубликованные в рецензируемых научных журналах

1. Тимофеев А.В., Карганова Г.Г., Мальдов Д.Г., Лашкевич В.А., Эльберт Л.Б. Обнаружение возможного рецептора для вируса клещевого энцефалита с помощью антиидиотипических антител //ДАН СССР. — 1990.-т. 315(1).-С. 226-228.

2. Дживанян Т.Н., Карганова Г.Г., Соболев С.Г., Королев М.Б., Каштанова Г.М., Чупринская М.В., Лашкевич В.А. Свойства частиц, формирующихся при воспроизведении острой инфекции адаптированного к клещам H.plumbeum вируса клещевого энцефалита //Вопр. вирусол. - 1991. - № 4. С.297-300.

3. Погодина В.В., Бочкова Н.Г., Дживанян Т.Н., Левина Л.С., Карганова Г.Г., Рясова Р.А., Сергеева В.А., Лашкевич В.А. Явление антигенной дефектности у циркулирующих в природе штаммов вируса клещевого энцефалита и его возможная связь с серонегативными формами заболевания //Вопр. вирусол. - 1992. - №2. - С. 103-107.

4. Maldov D.G., Karganova G.G., Timofeev A.V. Tick-borne encephalitis virus interaction with the target cells //Arch. Virology. - 1992. - V.127. - P. 321-325.

5. Васильев B.B., Злобин В.И., Дживанян Т.Н., Карганова Г.Г., Верхозина М.М., Воронко И.В., Гусарова Н.А., Лашкевич В.А. Изучение электрофоретической подвижности вирусспецифических белков штаммов вируса клещевого энцефалита, выделенных в различных регионах СНГ //Вопр. вирусол. - 1993. - №1. - С. 11-16.

6. Дрокин Д.А., Злобин В.И., Карганова Г.Г., Вихорева Т.В., Якименко В.В., Дживанян Т.И., Лашкевич В.А. Изменение геномов штаммов вируса клещевого энцефалита в результате пассажей на мышах //Вопр. вирусол. - 1994. - №1. - С. 160-162.

7. Мальдов Д.Г, Гмыль Л.В, Карганова Г.Г. Изменение активности Na+,K+-ATOa3bi при репродукции вируса клещевого энцефалита в культуре клеток СПЭВ //Вопр. Вирусол. - 1997. - №1. - С. 23-26.

8. Timofeev A.V, Ozherelkov S.G, Pronin A.V, Deeva A.V, Karganova G.G, Elbert L.B, Stephenson J.R. Immunological basis for protection in a murine model of tick-bome encephalitis by a recombinant adenovirus carrying the gene encoding the NS1 non-structural protein //J. Gen. Virol.-1998.-V. 79.-P. 689-695.

9. Тимофеев A.B, Кондратьева Я.Ю, Карганова Г.Г, Стефенсон Дж. Протективная активность бактериальной плазмиды, несущей ген неструктурного белка NS1 вируса клещевого энцефалита //Вопр. Вирусол. - 2001. - № 1. с. 22-24.

10. Тимофеев А.В, Кондратьева Я.Ю, Орловский В.Г, Локтев В.Б, Карганова Г.Г. Изучение корреляции тяжести течения заболевания клещевым энцефалитом и концентрацией интерлейкинов 2 и 6 в сыворотках больных клещевым энцефалитом //Терапевтический архив. - 2002. - № 6. - С. 22-23.

11. Романова Л.Ю, Козловская Л.И, Шевцова А.С, Карганова Г.Г. Метод доказательства отсутствия РНК вируса клещевого энцефалита в биопробах //Вопр. вирусол. - 2006. - №1. - С. 38-41.

12. Романова Л.Ю, Гмыль Л.В, Локтев В.Б, Протопова Е.В, Дживанян Т.И, Лашкевич В.А, Карганова Г.Г. Изменение антигенной структуры поверхностного гликопротеина Е вируса клещевого энцефалита при его адаптации к клещам и млекопитающим //Вопр. Вирусол. - 2006. -№6.-С. 31-34.

13. Romanova L.I, Gmyl А.Р, Dzhivanian T.I, Bakhmutov D.V, Lukashev A.N, Gmyl L.V, Rumyantsev A.A, Burenkova L.A, Lashkevich V.A,

Karganova G.G. Microevolution of Tick-Borne Encephalitis virus (TBEV) in course of host alternation //Virology. - 2007. - V. 362(1). - P. 75-84.

14. Лашкевич B.A., Карганова Г.Г. Современные аспекты профилактики клещевого энцефалита//Вопр. вирусол. - 2007. - №5. - С. 31-32.

Монография

15.Timofeev A.V., Karganova G.G. Tick-borne encephalitis vaccine: from past to future. - Москва, 2003.

Научные статьи, материалы, опубликованные в сборниках:

16. Карганова Г.Г., Дживанян Т.И., Бочкова Н.Г., Вертинский Б.В., Лубкина М.О., Погодина В.В., Лашкевич В.А. Циркуляция в Калининградской области штаммов вируса клещевого энцефалита со сниженной антигенной активностью //«Эпидемиология, клиника и профилактика вирусных инфекций». - Екатеринбург, 1992. — С. 136-140.

17.Карганова Г.Г., Дживанян Т.П., Терешкина Н.В., Гмыль Л.В., Антыкова Л.П., Лашкевич В.А. Изменение патогенетических и иммуногенных характеристик вируса клещевого энцефалита при его адаптации к клещам и млекопитающим //"Актуальные проблемы природноочаговых инфекций". Сборник материалов II республиканской научно-практической конференции, посвященной 75-летию инфекционной службы Удмуртии. - Ижевск, 1998. - С. 167-169.

18. Карганова Г.Г. Emerging потенциал переносимых клещами флавивирусов млекопитающих. //«Эпидемиологическая обстановка и стратегия борьбы с клещевым энцефалитом на современном этапе". Материалы расширенного пленума проблемной комиссии "Клещевой и другие вирусные энцефалиты" РАМН. - Москва, 2003. - С. 16-17.

19. Кондратьева Я.Ю., Локтев В.Б., Орловский В.Г., Куржуков Г.П., Тимофеев А.В., Карганова Г.Г. Обнаружение антител к белкам Е, NS1,

NS3 и NS5 вируса клещевого энцефалита в сыворотках крови больных КЭ. //«Актуальные проблемы эпидемиологии и профилактики инфекционных болезней". Материалы Всероссийской научно-практической конференции. - Самара, 2004. - Т. 2. - С. 219-221.

20. Романова Л.Ю., Бахмутов Д.В., Дживанян Т.И., Гмыль Л.В., Румянцев А.А., Лукашев А.Н., Гмыль А.П., Карганова Г.Г. Молекулярные основы изменения фенотипических характеристик вируса клещевого энцефалита при его адаптации к клещам и млекопитающим //"Актуальные проблемы эпидемиологии и профилактики инфекционных болезней". Материалы Всероссийской научно-практической конференции. - Самара, 2004.- Т. 2. - С. 225-229.

21. Карганова Г.Г., Гмыль А.П., Романова Л.Ю., Гмыль Л.В. Особенности эволюции переносимых клещами арбовирусов. //Материалы расширенного пленума проблемной комиссии «Арбовирусы» и научно-практической конференции «Арбовирусы и арбовирусные инфекции».- Астрахань, 2006. - С. 30-35.

22. Романова Л.Ю., Козловская Л.И., Рогова Ю.В., Дживанян Т.И., Гмыль А.П., Карганова Г.Г. Стабильность популяции адаптированного к клещам варианта вируса клещевого энцефалита с повышенной сорбцией на клеточных гликозаминогликанах при пассажах в культуре клеток СПЭВ. //«Медицинская вирусология». Труды ИПВЭ им. М.П.Чумакова РАМН. - Москва, 2007. - Т. 24. - С. 73-79.

23. Шевцова А.С., Рогова Ю.В., Романова Л.Ю., Кондратьева Я.Ю., Карганова Г.Г. Различия в характере взаимодействия с интерфероновой системой клетки, выявленные у двух близкородственных вариантов вируса клещевого энцефалита. //«Медицинская вирусология». Труды ИПВЭ им. М.П.Чумакова РАМН. - Москва, 2007. - Т. 24. - С. 89-96.

24. Романова Л.Ю., Козловская Л.И., Карганова Г.Г. Взаимодействие вирионов с клеточными гепарансульфат гликозаминогликанами и нейроинвазивность вируса клещевого энцефалита. //«Медицинская вирусология». Труды ИПВЭ им. М.П.Чумакова РАМН. - Москва, 2007. - Т. 24. - С. 273-279.

25. Карганова Г.Г. Клещ как фактор микроэволюции вируса клещевого энцефалита. //«Паразитология в XXI веке - проблемы, методы, решения». Материалы IV Всероссийского съезда паразитологического общества при РАН. - С.-Петербург, 2008. - Т. 2. - С. 23-27.

БЛАГОДАРНОСТИ

Выражаю глубокую благодарность дирекции ГУ ИПВЭ им. М.П. Чумакова РАМН в лице академика РАМН С.Г. Дроздова и профессора М.И. Михайлова за предоставленную возможность выполнения данной работы. Я искренне признательна своему научному консультанту академику РАМН В.А. Дашкевичу за неоценимые научные рекомендации и постоянную поддержку во всех начинаниях. Данная работа является продолжением исследований, которые были начаты в Институте научными сотрудниками Т.И.Дживанян и С.П.Чунихиным. Я очень благодарна вед.н.с. Т.И.Дживанян за помощь в выборе этого направления в научной работе. Большую теоретическую и практическую помощь при проведении данных исследований оказали к.б.н. А.П.Гмыль, д.м.н. А.В.Тимофеев и к.б.н. Д.Г.Мальдов, Л.Ю.Романова. Также благодарю бывших и настоящих сотрудников ИПВЭ им. М.П. Чумакова РАМН [Д.В.

Бахмутова|, к.б.н. Л.А. Буренкову, к.б.н. Л.В. Гмыль, Л.И. Козловскую, к.м.н. Я.Ю. Кондратьеву, д.м.н. А.Н Лукашева, д.б.н. В.Н.Ляпустина, Ю.В. Рогову, к.б.н. А.А.Румянцева, к.м.н. Н.В. Терешкину, А.С.Шевцову, за помощь и участие в настоящей работе. Я благодарна официальным рецензентам д.б.н. А.С.Гамбарян и к.б.н. М.Ф.Воровичу за внимательное прочтение работы и ценные замечания. Большую помощь при проведении исследований оказали старшие лаборанты лаборатории молекулярной биологии вирусов Г.М. Каштанова и А.А. Медведкова. Я благодарна всем соавторам моих работ, не упомянутых выше, за помощь в проведении данных исследований.

Список литературы диссертационного исследования доктор биологических наук Карганова, Галина Григорьевна, 2009 год

1. Авакян А.А., Левкович Е.Н., Бусник М.М. Изучение морфологии нервных клеток, пораженных вирусами клещевого энцефалита и сходных с ними заболеваний //Вопр. Вирусол. 1960. - № 3. - С. 208216.

2. Авакян А.А., Альтштейн А.Д. Изучение острой и хронической инфекции, вызываемой вирусом клещевого энцефалита в культуре ткани. Сообщение 3. О возможном механизме хронической инфекции // Вопр. Вирусол. 1964. - №5. - С. 575-580.

3. Алексеев А.И., Чунихин С.П. Способ изготовления стеклянных микроигл для инъецирования клещей и других мелких членистоногих //Мед. паразитол. и паразит. Болезни. 1987. - №6. - С. 69-70.

4. Анджапаридзе О.Г., Степанова Л.Г. Изучение изменчивости вируса клещевого энцефалита. Сообщение 3. Выделение из вирусных популяций клонов со сниженной нейропатогенностью //Вопр. Вирусол.-1967. № 5. -С. 604-607.

5. Анджапаридзе О.Г., Степанова Л.Г., Розина Э.Э. Изучение изменчивости вируса клещевого энцефалита. Сообщение 4. Патогенные свойства некоторых штаммов вирусов группы клещевого энцефалита и их вариантов //Вопр. Вирусол. 1967. - № 6. - С. 691697.

6. Анджапаридзе О.Г., Степанова Л.Г. Изучение изменчивости вируса клещевого энцефалита. Сообщение 5. Генетическая характеристика штаммов с разной вирулентностью //Вопр. Вирусол. 1969. - № 6 - С. 687-691.

7. Бабабянц А.А., Манахова Л.С., Карганова Г.Г., Порховатый С.Я., Кондратенко И.В., Хахалин Л.Н. Интерфероновая реакциялейкоцитов у больных с первичными иммунодефицитами //Вопр. Вирусол. 1985. - № 6. - С. 714-717.

8. Баннова Г.Г., Сарманова Е.С., Караванов А.С., Бычкова М.В., Пиванова Г.П., Флеер Г.П. Изучение биологических свойств штаммов вируса клещевого энцефалита, выделенных в разных частях его ареала //Вопр. Вирусол.- 1982.- № 1. С. 41-44.

9. Баркова Э.А., Иерусалимский А.П. Динамика накопления вируснейтрализующих антител у больных с различными клиническими формами клещевого энцефалита //Вопр. Вирусол. -1963. № 2. - С. 189-193.

10. Бахвалова В.Н., Караванов А.С., Матвеев Л.Э., Матвеева В.А., Морозова О.В. Исследование с помощью моноклональных антител антигенов Е и NS1 штаммов вируса клещевого энцефалита Западной Сибири //Вопр. Вирусол. 2001. - №6. - С. 33-36.

11. Бахвалова В.И., Морозова О.В., Морозов И. Свойство популяции вируса клещевого энцефалита, циркулировавшего в 1980-2006 гг. на территории Новосибирской области //Бюллетень СО РАМН. 2007.- т. 126. - С. 41-48.

12. Бедарева Т.Ю., Попонникова Т.В., Доблер Г., Хуферт Ф., Галиева Г.Ю., Вахрамеева Т.Н. Особенности цитокинового статуса при клещевых нейроинфекциях у детей //Медицина в Кузбассе. — 2008. -№5.-С. 13-18.

13. Богачек М.В., Протопопова Е.В., Терновой В.А., Качко А.В., Иванова А.В., Иванисенко В.А., Локтев В.Б. Иммунохимические свойства рекомбинантных полипептидов, моделирующих домены I и II белка Е вируса Западного Нила //Мол. биол. 2005. - №5. - С. 813822.

14. Богачек М.В., Протопопова Е.В., Терновой В.А., Качко А.В., Иванова А.В., Ивасенко В.А., Шалов А., Локтев В.Б. Иммунохимические свойства белка РгМ и С-концевого фрагмента белка М вируса Западного Нила //Мол. биол. 2007. - т.41. - С. 8-17.

15. Борисевич В.Г., Леонова Г.Н. Инфекционный процесс при стертой и инаппарантной формах клещевого энцефалита //"Клещевой энцефалит (к 65-летию открытия)".- Владивосток, 2002. С. 48-59.

16. Бычкова М.В., Сарманова Е.С., Мартсон М.А., Коваленко В.Н. Изучение вирусемии и динамики формирования иммунитета при клинически выраженных и инаппарантных формах клещевого энцефалита. 1964.

17. Варгин В.В., Семенов Б.Ф. Изменение активности естественных киллеров у мышей разных линий на фоне острой и бессимптомной флавивирусной инфекции //Acta virol.- 1986. № 30. - С. 303-308.

18. Волкова Л.И., Образцова Р.Г. Клиническая картина острого клещевого энцефалита на Среднем Урале //"Клещевой энцефалит (к 65-летию открытия)». Владивосток, 2002. - С. 88-98.

19. Воробьева М.С. Современное состояние вакцинопрофилактики клещевого энцефалита //"Клещевой энцефалит (к 65-летию открытия)». Владивосток, 2002. С. 166-169.

20. Ворович М.Ф., Тимофеев А.В., Мальдов Д.Г., Эльберт Л.Б. Функциональная роль третичной структуры поверхностного антигена вируса клещевого энцефалита полипептида Е //Доклады АН СССР.-1988. - Т. 301. - № 3. - С. 728-730.

21. Вотяков В.И., Злобин В.И., Мишаева Н.П. Клещевые энцефалиты Евразии. Вопросы экологии, молеклуярной эпидемиологии, нозологии, эволюции. Новосибирск, 2002.

22. Гильманова Г.Х., Лапшина Т.Н., Ливанова И.А. Об инфицировании вирусом клещевого энцефалита через молоко коров //Вопр. Вирусол. -1964. -№ 1.-С. 47-49.

23. Гмыль Л.В., Карганова Г.Г., Смирнова С.Е., Лашкевич В.А. Вирусспецифические белки вируса Крымской-Конго геморрагической лихорадки //Вопр. вирусол. 2001. - № 3. - С. 16-21.

24. Григорьева Л.В., Чигиринский А.Е., Воробьева М.С., Ладыженская И.П., Кан Г.А., Расщепкина М.Н. Методические рекомендации по морфологической оценке нейровирулентности вирусов комплекса клещевого энцефалита. Москва, 1985.

25. Грицун Т.С, Ляпустин В.Н, Карганова Г.Г, Лашкевич В.А. Невирнонный («растворимый») антиген вируса клещевого энцефалита//Вопр. Вирусол. 1988. - № 2. - С. 217-227.

26. Грицун Т.С, Ляпустин В.Н, Шаталов А.Г, Лашкевич В.А. Множественные формы белка NS 1 как основного компонента невирионного («растворимого») антигена вируса клещевого энцефалита //Вопр. вирусол. 1990. - № 6. - С. 471-474.

27. Готовцева Е.П, Серов И.В, Учакин П.Н, Шестакова С.В, Суркина И.Д, Ершов Ф.И. Нарушение продукции лимфоцитами человека интерлейкина-2 и у-интерферона при стрессе и некоторые механизмы их взаимодействия //Вопр. Вирусол. 1990. - №5. - С. 435-437.

28. Гуляева С.Е, Квон Ю.В, Кирилюк И.И. Коваленко Л.С, Николина Л.В. Клиника клещевого энцефалита в Приморском Крае //"Клещевой Энцефалит (к 65-летию открытия)». Владивосток, 2002. С. 39-47.

29. Дживанян Т.И, Чупринская М.В, Лашкевич В.А. О факторах, влияющих на появление ДС-признака вирусов комплекса клещевого энцефалита//Вопр. вирусол. 1973. - № 1. - С. 86-91.

30. Дживанян Т.И, Чунихин С.П, Чупринская М.В, Лашкевич В.А. Изменчивость вируса клещевого энцефалита по ДС-признаку при пассажах через клещей и позвоночных животных //«Экология вирусов». Материалы IX симпозиума. Душанбе, 1975. С. 22-24.

31. Дживанян Т.И, Чунихин С.П, Лисак В.М, Каштанова Г.М, Королев М.Б. Иммунохимические характеристики антигенов варианта вирусаклещевого энцефалита, адаптированного к клещам Hyalomma plumbeum //Вопр. вирусол. 1986. - №1. - С. 92-96.

32. Дживанян Т.И., Королев М.Б., Лисак В.М., Карганова Г.Г., Каштанова Г.Г., Чупринская М.Ф., Лашкевич В.А. Действие туникамицина на инфекционность и белковый синтез вируса клещевого энцефалита //Вопр. Вирусол. 1987. - №6. - С. 690-696.

33. Дживанян Т.И., Карганова Г.Г., Кондратьева Я.Ю., Лашкевич В.А. Изменение антигенной специфичности вируса клещевого энцефалита при смене хозяев //«Актуальные проблемы вирусологии». Материалы конференции. Москва, 1999. - С. 23.

34. Ерман Б.А., Дроздова Л.И., Зайцева Л.Н., Тулакина Л.Г. Патологическая анатомия современного клещевого энцефалита на Урале. Екатеринбург, 1999.

35. Злобин В.И., Дрокин Д.А., Мансуров П.Г., Калмин О.Б., Якименко В.В. Типирование штаммов вируса клещевого энцефалита по растворимому антигену //Вопр. Вирусол. 1991. - №1. - С. 24-27.

36. Злобин В.И., Борисов В.А., Верхозина М.М., Малов И.В., Холмогорова Г.Н. Клещевой энцефалит в Восточной Сибири. Иркутск, 2002.

37. Злобин В.И., Беликов С.И., Джиоев Ю.П., Демина Т.В., Козлова И.В. Молекулярная эпидемиология клещевого энцефалита. Иркутск, 2003.

38. Злобин В.И. Клещевой энцефалит в Российской Федерации: современное состояние проблемы и стратегия профилактики //Вопр. вирусол. 2005. - №3. - С. 26-32.

39. Злобин В.И., Верхозина М.М., Демина Т.В., Джиоев Ю.П., Адельшин Р.В., Козлова И.В., Беликов С.И., Хаснатинов М.А., Данчинова Г.А., Исаева Е.И., Гришечкин А.Е. Молекулярная эпидемиология клещевого энцефалита //Вопр. Вирусол. 2007. - № 6. -С. 4-13.

40. Иерусалимский А.П. Клещевой энцефалит. Новосибирск, 2001.

41. Ильенко В.И., Покровская О.А. Особенности течения экспериментальной инфекции у обезьян, зараженных вирусами клещевого, двухволнового и шотландского энцефалитов //Acta Virol. -1960.-С. 75-81.

42. Ильенко В.И., Платонов В.Г., Смородинцев А.А. Биологические варианты вируса клещевого энцефалита, выделенные в различных очагах заболеваний //Вопр. Вирусол. 1974. - № 4. - С. 414-418.

43. Канн Г.А., Воробьева М.С., Шаламберидзе Т.Д., Блоха В.В. Экспериментальное изучение иммунологической реактивности инбредных мышей с различной чувствительностью к вирусу клещевого энцефалита //Вопр. Вирусол. 1986. - № 1. - С. 107-110.

44. Карганова Г.Г. Зависимые от хозяина варианты вируса клещевого энцефалита и особенности их репродукции в клетках млекопитающих. Диссертация на соискание ученой степени кандидата биологических наук по специальности вирусология. Москва, 1991.

45. Карганова Г.Г. Emerging потенциал переносимых клещами флавивирусов млекопитающих //«Эпидемиологическая обстановка и стратегия борьбы с клещевым энцефалитом на современном этапе".

46. Материалы расширенного пленума проблемной комиссии "Клещевой и другие вирусные энцефалиты" РАМН.- Москва, 2003.- С. 16-17.

47. Карганова Г.Г, Припузова Н.С, Терешкина Н.В, Гмыль Л.В, Дживанян Т.И, Румянцев А.А, Лашкевич В.А. Оценка остаточной нейровирулентности химеры флавиврусов Лангат и денге-4 при интрацеребральном заражении обезьян //Вопр. Вирусол. 2005. - №1. -С. 27-31.

48. Карганова Г.Г. Клещ как фактор микроэволюции вируса клещевого энцефалита. //«Паразитология в XXI веке — проблемы, методы, решения». Материалы IV Всероссийского съезда паразитологического общества при РАН. С.-Петербург, 2008. - Т. 2. - С. 23-27.

49. Кашкин К.П. Цитокины иммунной системы: Основные свойства и иммунобиологическая активность //Клиническая лабораторная диагностика. 1998. - № 11. - С. 21-32.

50. Кветкова Э.А, Переходова С.К, Дуринова Л.П, Соколова Т.Ф. Функции Т и В - систем иммунитета при клещевом энцефалите

51. Этиология, эпидемиология и меры профилактики клещевого энцефалита на Дальнем Востоке". Хабаровск, 1978. - С. 42-43.

52. Кветкова Э.А., Семенов Б.Ф., Переходова С.К., Соколова Т.Ф. Количественная характеристика Т- и В- популяции лимфоцитов у больных клещевым энцефалитом //"Вопросы иммунитета и диагностики природноочаговых болезней». Ленинград, 1978. - С. 36-41.

53. Кветкова Э.А., Переходова С.К. Развитие клеточного иммунитета при экспериментальном клещевом энцефалите //Вопр. Вирусол. -1981.-№1.-С. 67-71.

54. Кветкова Э.А., Шматко В.Г. Феномен вторичной иммунологической недостаточности и его значение в патогенезе острого клещевого энцефалита //Журн. невропатол. и психиатрии. 1982. - т. 82. - № 2. -С. 220-224.

55. Кветкова Э.А. Диагностическое и прогностическое значение иммуноглобулинов класса М при клещевом энцефалите //«Арбовирусы». Таллин, 1984. - С. 100-101.

56. Кветкова Э.А., Илюшенко Л.П., Шматко В.Г., Кротова Р.А. Иммунологические критерии прогноза течения и выздоровления при клещевом энцефалите //"Природнор-очаговые болезни человека». -Омск, 1986.-С. 56-62.

57. Кимура М. Молекулярная эволюция: теория нейтральности. М., 1985.

58. Козлов О.Ю., Минаков С.Д., Хованова A.M., Чукреев Е.Ф. О роли макрофагов в патогенезе экспериментальной инфекции, вызванной вирусом клещевого энцефалита //ЖМЭИ. 1974. - № 8. - С. 20-24.

59. Козловская Л.И., Рудской В.И. Разработка и применение математической модели для описания сорбции вирионов вируса клещевого жэнцефалита на клеточных рецепторах //2Медицинскаявирусология»ю ТрудыИПВЭ им. М.П.Чумакова РАМН. 2006. - т. XXIII.-С. 82-89.

60. Конев В.П., Кветкова Э.А. Морфогенез экспериментального клещевого энцефалита //«Природно-очаговые болезни человека (вопросы эпидемиологии и прфилактики)». Омск, 1981. - С. 71-79.

61. Конькова А.Б., Ратникова Л.И. Медико-биологические эффекты нитроксид-молекулы в патогенезе клещевого менингоэнцефалита //Эпидемиол. и инфекцуионные болезни. 2004. - №3. - С. 25-28.

62. Коротков Ю.С., Никитин А.Я., Антонова A.M. Роль климатических факторов в многолетней динамике заболеваемости населения города Иркутска клещевым энцефалитом //Бюлл. Восточно-сибирского НЦ СО РАМН. 2007. - № 3 (55). - С. 121-125.

63. Ларина Г.И., Левкович Е.Н. Изучение функциональной активности макрофагальных элементов перитонеального экссудата животных в процессе инфицирования вирусами комплекса клещевого энцефалита // Вопр. Вирусол. 1980. - № 4. - С. 457-460.

64. Ларина Г.И., Левкович Е.Н. Взаимосвязь генотипа животного и штаммовых особенностей вируса с течением экспериментального клещевого энцефалита //Вопр. Вирусол. 1983. - № 3.- С. 345-348.

65. Лашкевич В.А., Карганова Г.Г. Современные аспекты профилактики клещевого энцефалита //Вопр. вирусол. 2007. - №5 - С. 31-32.

66. Левина Л.С., Погодина В.В. Персистенция вируса клещевого энцефалита в вакцинированном организме //Вопр. Вирусол. 1988. -№ 4. - С. 485-490.

67. Левкович Е.Н., Сарманова Е.С., Погодина В.В., Николаева Г.Н. Изучение особенности гуморального иммунитета у больных клещевым энцефалитом людей //Вопросы медицинской вирусологии. 1960. -№ 6. -С. 28-33.

68. Левкович Е.Н., Погодина В.В., Засухина Г.Д., Карпович Л.Г. Вирусы комплекса клещевого энцефалита. — Ленинград, 1967.

69. Лезина М.Н., Воробьева М.С. Изучение штаммов вируса клещевого энцефалита, выделенных из различных эндемических очагов инфекции //"Этиология, эпидемиология и меры профилактики клещевого энцефалита на Дальнем Востоке". Хабаровск, 1978. - С. 61-64.

70. Леонова Г.Н., Мураткина С.М., Кругляк С.П. Изучение вирулентности штаммов вируса клещевого энцефалита, изолированных на юге советского Дальнего Востока //Вопр. Вирусол. 1990.-№5.- С. 399-401.

71. Леонова Г.Н., Исачкова Л.М., Кругляк С.П., Майстровская О.С., Фисенко А.Ю. Патогенетические критерии оценки вирулентности штаммов вируса клещевого энцефалита, изолированных на юге Дальнего Востока //Вопр. Вирусол. 1995. - № 4. - С. 165-169.

72. Леонова Г.Н., Майстровская О.С. Вирусемия у больных клещевым энцефалитом и у лиц с присасыванием иксодовых клещей //Вопр. вирусол. 1996. - №5. - С. 224-228.

73. Леонова Г.Н., Майстровская О.С., Борисевич В.Б. Антигенемия у людей, инфицированных вирусом клещевого энцефалита //Вопр. Вирусол. 1996а. - № 6. - С. 260-263.

74. Леонова Г.Н. Клещевой энцефалит в Приморском крае. Вирусологические и эколого-эпидемиологические аспекты. Владивосток, 1997.

75. Леонова Г.Н., Беликов С.И., Борисевич В.Б., Кожемяко В.В. Новые перспективы в изучении клещевого энцефалита //Тихоокеанский мед. журн. 2001. - т. 7. - № 2. - С. 17-22.

76. Леонова Г.Н. Этапы изучения клещевого энцефалита в Приморском крае //"Клещевой энцефалит (к 65-летию открытия)". Владивосток, 2002. - С. 5-14.

77. Леонова Г.Н., Павленко Е.В., Крылова Н.В. Вакцинопрофилактика клещевого энцефалита. Владивосток, 2006.

78. Лисак В.М., Королев М.Б., Дживанян Т.Н., Карганова Г.Г., Лашкевич В.А. Электронно-микроскопическое изучение инфицированной вирусом клещевого энцефалита клеточной культуры при воздействии туникамицина //Вопр. Вирусол. 1987. -№6.-С. 696-701.

79. Локтев В.Б., Терновой В.А., Нетесов С.В. Молеклуряно-генетическая характеристика вируса клещевого энцефалита //Вопр. Вирусол. 2007. -№ 5. - С. 10-16.

80. ЮЗ.Ляпустин В.Н., Лисак В.М., Грицун Т.С., Королев М.Б., Лашкевич В.А. Иммунохимический и электронномикроскопический анализ высокомолекулярных структур вируса клещевого энцефалита //Вопр. вирусол. 1985. - №4. - С. 419-426.

81. Ляпустин, В.Н., Лашкевич В.А., Мустафина А.Н., Решетников И.А., Чунихин С.П. Зависимость синтеза вирионных структур вирусаклещевого энцефалита от вида клеточных культур //Вопр. Вирусол. 1987.-№6.-С. 701-709.

82. Ляпустин В.Н, Чунихин С.П, Решетников И.Н, Лашкевич В.А. Изменения синтеза вирионного антигена вируса клещевого энцефалита после пассирования через иксодовых клещей и мелких млекопитающих //Вопр. вирусол. 1987. - № 4. - С. 451-456.

83. Ляпустин В.Н, Карганова Г.Г, Мустафина А.Н, Грицун Т.С, Лашкевич В.А. Выявление вирусспецифических белков вируса клещевого энцефалита с помощью иммуносорбции //Вопр. Вирусол.1988.-№4.-С. 448-452.

84. Ляпустин В.Н, Ливанова Г.П, Караванов А.С, Лашкевич В.А. Сопоставление протективных свойств препаратов вирионного иневирионного («растворимого») антигенов вируса клещевогоэнцефалита //Вопр. Вирусол. 1991. - № 6. - С. 496-500.

85. Майер В. Изучение вирулентности вируса клещевого энцефалита. 1. Экспериментально полученная линия вируса клещевого энцефалита с измененной патогенностью для молодых мышей и ее иммуногенность //Acta virol. 1963. - № 7. - С. 421-429.

86. Майер В. Изучение вирулентности вируса клещевого энцефалита. 2. Патогенетические свойства двух вариантов одного вирусного штамма //Acta virol. 1964. - № 8. - С. 14-21.

87. Майер В. Изучение вирулентности вируса клещевого энцефалита. 4. Термочувствительность вирионов и их отношение к другим генетическим маркерам //Acta virol. 1965. - № 9. - С. 397.

88. Майер В, Сабо А. Изучение вирулентности вируса клещевого энцефалита. 5. Действие мочевины на термолабильные и термостабильные вирусные варианты //Acta virol. 1966. - № 10. - С. 486.

89. Майер В., Гаждосова Е., Славик И. Изучение клеточного иммунитета к вирусу клещевого энцефалита in vitro: исследование на реконвалесцентах и лицах с субклиническими формами инфекции //Acta virol. 1976. - № 20. - С. 395-401.

90. Малиновская В.В., Волегова Г.М., Устинова О.Ю. Система интерферона при остром клещевом энцефалите и влияние на динамику клинико-лабораторных показателей различных методов интерферонотерапии //Вопр. Вирусол. 1995. - № 5. - С. 234-238.

91. Малкова Д., Франкова В. Роль лимфатической системы в развитии клещевого энцефалита у мышей //Acta virol. 1959. - т. 3. - С. 210214.

92. Малкова Д. Роль лимфатической системы при экспериментальном заражении клещевым энцефалитом. 1. Вирус клещевого энцефалита в лимфе и крови экспериментально зараженных баранов //Acta virol.1960.-т. 4.-С. 233-240.

93. Малкова Д. Участие лимфатической и кровеносной систем в дессиминации вируса клещевого энцефалита в органы экспериментально зараженных мышей //Acta virol. 1960а. — т. 4. - С. 290-295.

94. Малкова Д., Рала Ф., Сидак 3. Изменения в составе элементов белой крови, в региональных лимфатических узлах и селезенке мышей, зараженных вирусом клещевого энцефалита //Acta virol.1961.-т. 5.-С. 101-111.

95. Малкова Д. Влияние рентгеновского облучения на проникновение вируса клещевого энцефалита через региональные лимфатические узлы //Acta virol. 1962. - т. 6. - С. 475-476.

96. Малкова Д., Сметана, А. Роль лимфатической системы при прямом введении вируса клещевого энцефалита в кровь чувствительных белых мышей //Acta virol. 1966. - т. 10. - С. 471-474.

97. Мальдов Д.Г., Гмыль Л.В., Карганова Г.Г. Изменение активности Na, К -АТФазы при репродукции вируса клещевого энцефалита в культуре клеток СПЭВ //Вопр. вирусол. 1997. - №4. - С. 23-26.

98. Маниатис Т., Фрич Э., Сэмбрук Дж. Методы генетической инженерии. Молекулярное клонирование. М., 1984.

99. Овчинникова Э.А., Карпович Л.Г., Левкович Е.Н. Изучение терморезистентности штаммов вирусов комплекса клещевого энцефалита, обладающих различной нейровирулентностью для лабораторных животных //Вопр. Вирусол. 1967. - № 5. - С. 607-611.

100. Ожерелков С.В., Хозинский В.В., Семенов Б.Ф. Исследование иммунологических механизмов действия температурных и эмоциональных стресс-факторов при экспериментальных флавивирусных инфекциях //ЖМЭИ. 1986. - № 12. - С. 95-99.

101. Остерман Л.А. Исследование белков и нуклеиновых кислот. Электрофорез и ультрацентрифугирование. М., 1981.

102. Павленко Е.В., Леонова Г.Н., Яковлев А.А., Борисова О.Н. Анализ заболеваемости клещевым энцефалитом в Приморском Крае запериод с 1990 по 2000 годы //"Клещевой энцефалит (к 65-летию открытия)". Владивосток, 2002. С. 15-25.

103. Панов А.Г. Клещевой энцефалит. Ленинград, 1956.

104. Панов А.Г., Ильенко В.И. Команденко Н.И. Некоторые патогенетические механизмы прогредиентных форм клещевого энцефалита //Журнал невропатол. и психиатрии им. С.С. Корсакова.-1977.-т. 77. -№2. С. 161-166.

105. Пиванова Г.П., Баннова Г.Г., Бычкова М.В., Караванов А.С. Иммуногенная и гемагглютинирующая активность штаммов вируса клещевого энцефалита, выделенных от больных в разных частях нозоареала//Вопр. вирусол. 1990. - № 3. - С. 49-51.

106. Плетнев А.Г., Ямщиков В.Ф., Блинов В.М. Нуклеотидная последовательность генома и полная аминокислотная последовательность полипротеина вируса клещевого энцефалита //Биоорг. Химия. 1989. - т. 15. - № 11. - С. 1504-1522.

107. Погодина В.В., Магазаник С.С. Изучение процесса скрытой иммунизации при клещевом энцефалите клинико-вирусологическими методами //Тезисы и авторефераты докладов 6 научной сессии ИПВЭ АМН СССР. Москва, 1961. - С. 247-248.

108. Погодина В.В., Хань-Ши-Цзе. Изучение корреляций между патогенностыо вирусов группы клещевого энцефалита для животных и особенностями размножения в организме //Вопр. Вирусол. 1964. -№ 6. - С. 682-690.

109. Погодина В.В., Бочкова Н.Г., Корешкова Г.В. Свойства штаммов серотипа Айна/1448 вируса клещевого энцефалита //Вопр. вирусол., -1981.-№6.-С. 741-745.

110. Погодина В.В., Ларина Г.И., Фролова М.П., Бочкова Н.Г. Варианты иммунного ответа хомяков на вирус клещевого энцефалита //Вопр. Вирусол. 1984. - № 6. - С. 708-715.

111. Погодина В.В., Фролова М.П., Ерман Б.А. Хронический клещевой энцефалит. Новосибирск, 1986.

112. Погодина В.В., Бочкова Н.Г., Левина Л.С., Фролова Т.В., Трухина А.Г., Фролова М.П., Маленко Г.В. Комплексная характеристика сибирского подтипа вируса клещевого энцефалита //"Клещевой энцефалит (к 65-летию открытия)". Владивосток, 2002. - С. 72-87.

113. Погодина В.В. Мониторинг популяций вируса клещевого энцефалита и этиологической структуры заболеваемости за 60-летний период//Вопр. вирусол. 2005. - № 3. - С. 7-13.

114. Протопопова Е.И., Хусаинова А.Д., Коновалова С.Н., Локтев В.Б. Получение и характеризация антиидиотипических антител, несущих на своей поверхности гемагглютинирующие паратопы вируса клещевого энцефалита //Вопр. вирусол. 1996. - № 2. - С. 50-53.

115. Протопопова Е.В., Коновалова С.Н., Локтев В.Б. Выделение клеточного рецетора для вируса клещевого энцефалита при помощи антиидиотипических антител //Вопр. вирусол. 1997. - № 6. - С. 264268.

116. Романенко В.В., Есюнина М.С., Килячина А.С. Опыт реализации программы массовой иммунизации населения против клещевого энцефалита в Свердловской области //Вопр. Вирусол. 2007.- № 6. — С. 22-25.

117. Романова Л.Ю, Козловская Л.И, Шевцова А.С, Карганова Г.Г. Метод доказательства отсутствия РНК вируса клещевого энцефалита в биопробах //Вопр. вирусол. 2006. - №1. - С. 38-41.

118. Северцев А.С. Основы теории эволюции. М, 1987.

119. Семенов Б.Ф., Варгин В.В., Хозинский В.В. Иммунопатологические реакции, воспроизводимые с арбовирусами //Вестник АМН СССР,. -1974.-№ 11.-С. 38-40.

120. Скулачев, В. П. Биоэнергетика. Мембранные преобразователи энергии, Москва, 1989.

121. Соколова Е.Д., Камалов И.И., Коновалова Г.В. Характеристика нейровирулентности, стабильности и иммуногенности ослабленных вариантов вируса Лангат Тр-21 //Вопр. Вирусол. 1994. - №5. - С. 220-223.

122. Сомова-Исачкова Л.М., Фролова М.П., Леонова Г.Н., Погодина

123. B.В., Фисенко А.Ю. Сравнительная патогистология клещевых энцефалитов в Приморском Крае //«Клещевой энцефалит (к 65-летию открытия)». Владивосток, 2002. - С. 26-38.

124. Степанова Л.Г., Шухмина Н.Р., Анджапаридзе О.Г. Изучение изменчивости вируса клещевого энцефалита. Сообщение 6. Некоторые вопросы иммуногенеза при вакцинации мышей аттенуированным штаммом И-40 Д //Вопр. Вирусол. 1970. - № 4.1. C. 405-408.

125. Сысолятин В.А., Селюта И.А., Караванов А.С. Особенности иммунного ответа у больных клещевым энцефалитом //«Современные проблемы эпидемиологии, диагностики и профилактики клещевого энцефалита». Иркутск, 1990. - С. 125-126.

126. Тимофеев А.В., Карганова Г.Г., Мальдов Д.Г., Лашкевич В.А., Эльберт Л.Б. Обнаружение возможного рецептора для вируса клещевого энцефалита с помощью антиидиотипических антител //ДАН СССР. 1990. - т. 315(1). - С. 226-228.

127. Тимофеев А.В., Ожерелков С.В., Кондратьева Я.Ю., Терешкина

128. Тимофеев, А., Я. Кондратьева, Г. Карганова. Протективная активность бактериальной плазмиды, несущей ген неструктурного белка NS1 вируса клещевого энцефалита //Вопр. Вирусол. 2001.- №1.-С. 22-24.

129. Топчий М.К., Корнюшенко Н.П. Руководство к практическим занятиям по вирусологии. Киев, 1967.

130. Усебаева Г.К., Карпович Л.Г., Левкович Е.Н. Особенности патогенеза инфекции у мышей, вызванной вирулентными и аттенуированными вариантами вирусов клещевого энцефалита и лангат //Вопр. Вирусол. 1970. - № 4. - С. 482-488.

131. Фокина Г.И., Погодина В.В., Маленко Г.В. Приматы как лабораторная модель вирусной персистенции и хронического течения вирусных энцефалитов //Вестник АМН СССР. 1986. - № 3. - С. 6368.

132. Фролова Т.В., Погодина В.В., Ларина Г.И. Активирующий эффект циклофосфана на поздних этапах персистенции вируса клещевого энцефалита//Вопр. вирусол. 1982. - № 5. - С. 578-585.

133. Хаитов P.M., Игнатьева Г.А., Сидорович И.Г. Иммунология. М., 2000.

134. Хаитов P.M., Пинегин Б.В. Современные представления о защите организма от инфекции //Иммунология. 2000. - № 1. - С. 61-64.

135. Хань-Ши-Цзе, Погодина В.В. Применение метода флуоресцирующих антител для изучения инфекции, вызванной вирусом восточного клещевого энцефалита у мышей, хомяков и поросят //Acta Virol. 1964. - т. 8. - С. 22-29.

136. Хозинский В.В., Семенов Б.В. 1980. Защитное и повреждающее действие цитотоксических Т-лимфоцитов при экспериментальном клещевом энцефалите. ЖМЭИ, № 4, стр. 56-59.

137. Хозинский В.В., Семенов Б.В. Неспецифические Т-супрессоры при экспериментальном клещевом энцефалите //Acta Virol. 1981. - № 25.- С. 277-282.

138. Черницына Л.О., Коненков В.И., Иерусалимский А.П., Прокофьев В.Ф. Неоднородная последовательная процедура анализа генетических маркеров в разработке методов индивидуального прогноза исхода клещевого энцефалита //Иммунология. 1991. - № 6.- С. 56-59.

139. Черницына Л.О., Коненков В.И.,Илюшенко Л.П., Прокофьев В.Ф. Ассоциированность аллельных вариантов генов HLA-комплекса класса 1 с интенсивностью гуморального иммунного ответа к антигенам вируса клещевого энцефалита в процессе заболевания. 1994.

140. Чумаков М.П., Рубин С.Г., Линев М.Б. Три антигенных типа вируса клещевого энцефалита, их хависимость от основных видов клещей-переносчиков и географическое распространение //Вопросы Медицинской Вирусологии. М., 1975. - С. 371-372.

141. Чунихин С.П., Куренков В.Б., Дживанян Т. И., Рыльцева Е.В. Изучение особенностей трансфазовой и трансмиссивной передачи штаммов вируса клещевого энцефалита с разной степенью патогенности для мышей //Мед. паразитол. 1979. - № 2. - С. 61-65.

142. Чунихин С.П., Леонова Г.Н. Экология и географическое распространение арбовирусов. М., 1985.

143. Чунихин С.П., Решетников И.Н., Ляпустин В.Н. Изменчивость вируса клещевого энцефалита при пассировании через иксодовых клещей и мелких млекопитающих //Мед. паразитол. и паразит. Болезни. 1986. - № 6. - С. 58-61.

144. Шаповал А.Н. Клещевой энцефаломиелит. Ленинград, 1980.

145. Ярилин, А.А. Система цитокинов и принципы ее функционирования в норме и патологии //Иммунология. 1997. - № 5. - С. 7-13.

146. Aaskov J., Buzacott К., Field Е., Lowry К., Berlioz-Arthaud A., Holmes E. Multiple recombinant dengue type 1 viruses in an isolate from a dengue patient //J. Gen. Virol. 2007. - v. 88. - P. 3334-3340.

147. Albrecht P. Pathogenesis of experimental infection with tick-borne encephalitis virus //"Biology of virus of tick-borne encephalitis complex". -Praha, 1962. P. 247-257.

148. Allison S.L., Schalish J., Stiasny K., Mandl C.W., Kunz C., Heinz F.X. Oligomeric rearrangement of tick-borne encephalitis virus envelope proteins included by an acidic pH //J. Virol. 1995. - v. 69. - P. 695-700.

149. Allison S.L, Stiasny K, Stadler K, Mandl C.W, Heinz F.X. Mapping of functional elements in the stem-anchor region of tick-borne encephalitis virus envelope protein E //J. Virol. 1999. - v. 73. - P. 5605-5612.

150. Allison, S.L, Schalich J, Stiasny, K, Mandl, C.W, Heinz, F.X. Mutational evidence for an internal fusion peptide in flavivirus envelope protein E //J. Virol. 2001. - v. 75. - P. 4268-4275.

151. Altamirano A, Fons M, Russel J, Cragoe E.J.Jr, Albrecht T. Human cytomegalovirus infection increases the number of ouabain-binding sites in human fibroblasts // . 1994. - V. 199. - P. 151-154.

152. Anderson R, King A.D, Innis B.L. Correlation of E protein binding with cell susceptibility to dengue 4 virus infection //J.Gen.Virol. 1992. -V. 73. - P. 2155-2159.

153. Arias A, Ruiz-Jarabo C, Escarmis C, Domingo E. Fitness increase of memory genomes in a viral quasispecies //J. Mol. Biol. 2004. - V. 339. -P. 405-12.

154. Atrasheuskaya A.V, Fredeking T.M, Ignatyev G.M. Chenges in immune parameters and their correction in human cases of tick-borne encephalitis //Clin. Exp. Immunol. 2003. - V/ 131. - P. 148-154.

155. Avery P.R, Hoover A. Gamma interferon/interleukin 10 balanse in tissue lymphocytes correlates with down modulation of mucosal feline immunodeficiency virus infection // J. Virol. 2004. - V. 78(8) - P. 40114019.

156. Baillie G.J, Kolokotronis S.O, Waltari E, Maffei J.G, Kramer L.D, Perkins S.L. Phylogenetic and evolutionary analyses of St. Louis encephalitis virus genomes //Mol. Phylogenet. Evol. 2008. - V. 47(2). -P. 717-28.

157. Bernard K.A, Klimstra W.B, Johnston R.E. Mutations in the E2 glycoprotein of Venezuelan equine encephalitis virus confer heparansulfate interaction, low morbidity, and rapin clearance from blood of mice //Virology. 2000. - V. 276. - P. 93-103.

158. Bernfield M., Gotte M., Park P.W., Reizes O., Fitzgerald M. L., Lincecum J., Zako M. Functions of cell surface heparan sulfate proteoglycans //Annu. Rev. Biochem. 1999. - V. 68. - P. 729-777.

159. Bhardwaj S., Holbrook M., Shope R.E., Barrett A.D., Watowich S.J. Biophysical characterization and vector-specific antagonist activity of domain III of the tick-borne flavivirus envelope protein //J. Virol. 2001. -V. 75. - P. 4002-^1007.

160. Biebricher C., Eigen M. What is a quasispecies //Quasisspecies: concept and implications for virology /Е. Domingi (ed.). 2006. - V. 299. - P. 131.

161. Billoir F., Chesse R., Tolou H., Micco P., Gould E.A., Lamballerie X. Phylogeny of the genus Flavivirus using complete coding sequences of arthropod-borne viruses and viruses with no known vector //J. Gen.Virol. -2000.-V. 81.-P. 781-790.

162. Binder G., Griffin D. Interferon-y-mediated site specific clearance of alphavirus from CNS neurons //Science. 2001. - V. 293 - P. 303-306.

163. Blok J., Mc William M., Butler H.C. Comparison of a dengue-2 virus and its candidate vaccine derivative: sequence relationships with the flaviviruses and other viruses //Virology. 1992. - V. 187.- P. 573-590.

164. Bressanelli S., Stiasny K., Allison S. L., Stura E.A., Duquerroy S., Lescar J., Heinz F.X., Rey F.A. Structure of a flavivirus envelope glycoprotein in its low-pH-induced membrane fusion conformation //EMBO J. 2004. - V. 23. - P. 728-738.

165. Bukowski J.F., Kurane I., Lai C.-J., Bray M., Falgout В., Ennis F.A. Dengue virus-specific cross-reactive CD8+ humen cytotoxic T cells //J. Virol. 1989. -V. 63. - P. 5086-5091.

166. Burke D.S., Monaht T.P. Flaviviruses // Fields virology / Knipe D.M., Howley P.M. et al. (eds.). 4-th ed. Philadelphia, 2001. - P. 1042-1150.

167. Butenko A.M., Karganova G.G. Crimean-Congo hemorrhagic fever in Russia and other countries of the former soviet union //Crimean-Congo Hemorrhagic fever /О. Ergonul, C.A. Whitehouse (eds.). Springer, 2007. -P. 99-114.

168. Byrnes A.P., Griffin, D.E. Large-plaque mutants of Sindbis virus show reduced binding to heparan sulfate, heightened viremia, and slower clearence from the circulation //J. Virol. 2000. - V. 74. - P. 644-651.

169. Cahour A., Pletnev A., Vazeille-Falcoz V., Rosen L., Lai C-J. Growth-restricted Dengue virus mutants containing deletions in the 5' noncoding region of the RNA genome //Virology. 1995. - V. 207. - P. 68-76.

170. Calisher, Gould E. Taxonomy of the virus family Flaviviridae //Adv. Virus Res. 2003. - V. 59. - P. 1-19.

171. Casati, S., Gern L., Piffaretti J. Diversity of the population of Tick-borne encephalitis virus infecting Ixodes ricinus ticks in an endemic area of central Switzerland (Canton Bern) //J. Gen. Virol. 2006. - V. 87. - P. 2235-41.

172. Cecilia D., Gould E.A. Nucleotide changes responsible for loss of neuroinvasiveness in Japanese encephalitis virus neutralization-resistant mutants //Virology. 1991. - V. 181. - P. 70-77.

173. Chao L. Fitness of RNA virus decreased by Muller's ratchet //Nature. -1990.-V. 348-P. 454-455.

174. Chen W.-J., Wu H.-R., Chiou S.-S. E/NS1 modifications of Dengue 2 virus after serial passages in mammalian and/or mosquito cells //Intervirology. 2003. - V. 46 - P. 289-295.

175. Chu J. J. H., Ng M. L. Infectious entry of West Nile virus occurs through a clathrin-mediated endocytic pathway //J. Virol. 2004. - V. 78. -P. 10543-10555.

176. Chua J.J.E., Ng M.M.L., Chow V.T.K. The non-structural 3 (NS3) protein of dengue virus type 2 interacts with human nuclear receptor binding protein and is associated with alterations in membrane structure //Virus Res. 2004. - V. 102 - P. 151-163.

177. Chunikhin S.P., Dzhivanyan T.I. Ecological markers of arboviruses //Arctic and Tropical Arboviruses /Ed. E. Kurstak. New York, 1979. - p. 297-302.

178. Church J., Ghosh S., Roufogalis В., Villalobo A. Endogenous hyperphosphorylation in plasa membrane from an ascites hepatocarcinoma cell line //Biochem. Cell Biol. 1988. - V. 66. - P. 1-12.

179. Clarke D.K., Casals J. Techniques for hemagglutination and hemagglutination-inhibition with arthropod-borne viruses //Am. J. Trop. Med. Hygiene. 1958. - V. 7. - P. 561-573.

180. Clarke D.K. Antigenic analysis of certain group В arthropodborne viruses by antibody absorption //J. Exp. Med. 1960. -V. 111.- P. 2132.

181. Clarke D. Studies on antigenic relationships among yhe viruses of the group В tick-borne complex //Bull. World Health Organ. 1964. - V. 31. -P. 45-56.

182. Clarke D.K., Duarte E.A, Elena S.F., Moya A., Domingo E., Holland J. The red queen reigns in the kingdom of RNA viruses //Proc. Nath. Acad. Sci. USF. 1994. - V. 91. - P. 4821-4824.

183. Cooper L., Scott T. Differential evolution of eastern equine encephalitis virus populations in response to host cell type //Genetics. 2001. - V. 157. -P. 1403-1412.

184. Crabtree M., Sang R., Stollar V., Dunster L., Miller B. Genetic and phenotypic characterization of the newly described insect flavivirus, Kamiti River virus //Arch Virol. 2003. - V. 148. - P. 1095-1118.

185. Domingo E., Sabo D., Taniguchi Т., Welssmann C. Nucleotide Sequence Heterogeneity of an RNA Phage Population //Cell. 1988. - V. 13. - P. 739-744.

186. Domingo E., Escarmis C., Sevilla N., Moya A., Elena S.F., Quer J. Novella I.S., Holland JJ. Basic concepts in RNA virus evolution //Faseb J. 1996. -V. 10. - P. 859-864.

187. Domingo E., Holland J.J. RNA virus mutations and fitness for survival //Annu. Rev. Micribiol. 1997. - V. 51 - P. 151-178.

188. Domingo E. Quasispecies theory in virology //J. Virol. 2002. - V. 76. -P. 463-465.

189. Drake J.W., Holland J.J. Mutation rates among RNA viruses //Proc. Nath. Acad. Sci. USA. 1999. - V. 96. - P. 13910-13913.

190. Ecker M., Allison S.L., Meixner Т., Heinz F.X. Sequence analysis and genetic classification of tick- borne encephalitis viruses from Europe and Asia//J. of Gen. Virol. 1999.-V. 80. - P. 179-185.

191. Eigen M. On the nature of virus qusispecies. Trends Microbiol., v. 4, p. 216-218.

192. Elshuber S., Allison S., Heinz F., Mandl C. Cleavage of protein prM is necessary for infection of BHK-21 cells by tick-borne encephalitis virus //J. Gen. Virol.-2003.-V. 84.-P. 183-191.

193. De Filippis V.R., Villarreal L.P. Virus evolution //"Fields Virology" /Eds. Knipe D.M., Howley P.M. et al. Lippincott Williams&WilkinsrPhiladelphia, 2001. P. 353-371.

194. Fischl W, Elshuber S., Schrauf S, Mandl C. Changing the protease specificity for activation of a flavivirus, tick-borne encephalitis virus //J. Virol. 2008. - V. 82. - P. 8272-8282.

195. Flamand M, Megret F, Mathieu M, Lepault J, Rey F, Deubel V. Dengue virus type 1 nonstructural glycoprotein NS1 is secreted from mammalian cells as a soluble hexamer in a glycosylation-dependent fashion //J. Virol. 1999. - V. 73. - P. 6104-6110.

196. Fritz R, Stiasny K, Heinz F.X. Identification of specific histidines as pH sensors in flavivirus membrane fusion //J. Cell Biol. 2008. - V. 183. - P. 353-361.

197. Gao G.G, Hussain M.H, Reid H.W, Gould E.A. Identification of naturally occurring monoclonal antibody escape variants of louping ill virus //J. Gen. Virol. 1994. - V. 75. - P. 609-614.

198. Gao C.F, Zanotto P.M., Holmes E.C, Reid H.W, Gould E.A. Molecular variation, evolution and geographical distribution of louping ill virus //Acta Virol. 1997. - V. 41(5). - P. 259-268.

199. Gaunt M.W, Sail A.A, de Lamballerie X, Falconar A.K.I, Dzhivanian Т. I, Gould E. A. Phylogenetic relationships of flaviviruses correlate with their epidemiology, disease association and biogeography //J. Gen. Virol. -2001.-V. 82.-P. 1867-1876.

200. Gilbert L., Jones L.D., Hudson P.J., Gould E.A., Reid H.W. Role of small mammals in the persistence of Louping-ill virus: field survey and tick co-feeding studies //Med. Vet. Entomol. 2000. - V. 14(3). - P. 277282.

201. Gojobori Т., Moriyama E.N., Kimura M. Molecular clock of virol evolution, and neutral theory //Proc. Nath. Acad. Sci. USA. 1990. - V. 87. - P. 10015-10018.

202. Golovljova I., Vene S., Sjolander K.B., Vasilenko V., Plyusnin A., Lundkvist A. Characterization of tick-borne encephalitis virus from Estonia //J. Med. Virol. 2004. - V. 74. - P. 580-588.

203. Gould E.A., Zanotto P.M.A., Holmes E.C. The genetic evolution of flaviviruses //"Factors in the Emergence of Arbovirus Diseases" /Eds. Saluzzo J.F., Dodet B. Elsevier:Paris, 1997. - P. 51-62.

204. Gould E.A., de Lamballerie X., de Zanotto P.M., Holmes E.C. Origins, evolution, and vector/host coadaptations within the genus flavivirus //Adv. Virus Res. 2003. - V. 59. - P. 277-314.

205. Goto A., Hayasaka D., Yoshii K., Mizutani Т., Kariwa H., Takashima I. A. BHK-21 cell culture-adapted tick-borne encephalitis virus mutant is attenuated for neuroinvasiveness //Vaccine. 2003. - V. 21. - P. 4043— 4051.

206. Green S., Kurane I., Pincus S., Paoletti E., Ennis F.A. Recognition of dengue virus NSl-NS2a proteins by human CD4+ cytotoxic T lymphocyte clones //Virology. 1997. - V. 234(2). - P. 383-386.

207. Griffin D.E. Immune responses to RNA-virus infections of the CNS //Immunology. 2003. -V. 3. - P. 493-501.

208. Gritsun T.S., Holmes E.C., Gould E.A. Analysis of flavivirus envelope proteins reveals variable domains that reflect their antigenicity and may determine their pathogenesis //Virus Res. 1995. -V. 35. - P. 307-321.

209. Gritsun T.S., Desai A., Gould E.A. The degree of attenuation of tick-borne encephalitis virus depends on the cumulative effects of point mutations //J. Gen. Virol. 2001. - V. 82. - P. 1667-1675.

210. Gritsun T.S., Lashkevich V.A., Gould E.A. Tick-borne encephalitis //Antiviral research. 2003a. -V. 57. - P. 129-146.

211. Haglund M., Gunther G. Tick-borne encephalitis — pathogenesis, clinical course and long-term follow-up //Vaccine. 2003. - V. 21. - Suppl. 1. - S. 11-18.

212. Hahn C.S., Dalrymple J.M., Strauss F. Comparison of the virulent Asibi strain of yellow fever virus with the 17D vaccine strain derived from it //Proc. Nath. Acad. Sci. USA. 1987. - V. 84. - P. 2019-2023.

213. Hase Т., Summers P.L., Eckeles K.H., Putnak J.P. Morphogenesis of flaviviruses //Virally infected cells /Ed. Herris. Plenum:N.Y., 1989. - P. 275-308.

214. Hasegawa H., Yoshida M., Shiosaka Т., Fujita S., Kobayashi Y. Mutations in the envelope protein of Japanese encephalitis viruses affect entry into cultured cells and virulence in mice //Virology. 1992. - V. 191.-P. 158-165.

215. Haysaka D., Suzuki Y., Kariwa H., Gojobori Т., Takashima I. Phylogenetic and virulence analysis of tick-borne encephalitis viruses from Japan and Far-eastern Russia //J. Gen. Virol. 1999. - V. 80. - P. 3127-3135.

216. Heinz F.X., Berger R., Tuma W., Kunz C. A topological and functional model of epitopes on the structural glycoprotein of tick-borne encephalitisvirus defined by monoclonal antibodies //Virology. 1983. - V. 126. - P. 526-537.

217. Heinz F.X. Epitope mapping of flavivirus glicoproteins //Adv.Virus Res. 1986.-V. 31.-P. 103-168.

218. Heinz F.X., Allison S.L., Stiasny K., Schalich J., Holzmann H., Mandl C., Kunz C. Recombinant and virion-derived soluble and particulate immunogenes for vaccination against tick-borne encephalitis //Vaccines. -1995.-V. 13. P. 1636-1642.

219. Heinz F.X., Allison S.L. Structures and mechanisms in flavivirus fusion //Adv. Virus Res. 2000a. - V. 55. - H. 231-269.

220. Heinz F.X., Allison S.L. Flavivirus structure and membrane fusion //Adv. Virus Res. 2003. - V. 59. - P. 63-97.

221. Holbrook M.R., Ni H., Shope R.E., Barrett A.D.T. Amino acid substitution(s) in the stem-anchor region of Langat virus envelope protein attenuates mouse neurovirulence //Virology. 2001. - V. 286. - P. 54-61.

222. Holland J.J., Torre J.C., Steinhauer D.A. RNA virus populations as quasispecies //Curr. Top. Microbiol. Immunol. 1992. - V. 176. - P. 1-16.

223. Holland J.J. Evolving virus plaques //Proc. Nath. Acad. Sci. USA. -1996.-V. 93.-P. 545-546.

224. Holmes, E. С., M. Worobey, and A. Rambaut. 1999. Phylogenetic evidence for recombination in dengue virus. . Mol Biol Evol 16:405-409.

225. Holmes E.C., Moya A. Is the Quasispecies Concept Relevant to RNA Viruses? //J. Virol. 2002. - V. 76. - P. 460-462.

226. Holzmann H., Mandl C., Guirakhoo F., Heinz F.X., Kunz C. Characterization of antigenic variants of of tick-borne encephalitis virus selected with neutralizing monoclonal antibodies //J. Gen. Virol. 1989. -V. 70.-P. 219-222.

227. Holzmann H., Heinz F.X., Mandl C., Guirakhoo F., Kunz C. A single amino acid substitution in envelope protein of tick-borne encephalitis virus leads to attenuation in mouse model //J. Virol. 1990. - V. 64. - P. 51565159.

228. Holzmann H., Vorobyova M.S., Ladyzhenskaya I.P., Ferenczi E., Kundi M., Kunz C., Heinz F.X. Molecular epidemiology of tick-borne encephalitis virus: cross-protection between European and Far Eastern subtypes //Vaccine. 1992. - V. 10. - p. 345-349.

229. Holzmann H., Stiasny K., Ecker M., Kunz C., Heinz F.X. Characterization of monoclonal antibody-escape mutants of tick-borne encephalitis virus with reduced neuroinvasiveness in mice //J. Gen. Virol. 1997.-V. 78. -P. 31-37.

230. Hoshino K., Isawa H., Tsuda Y., Yano K., Sasaki Т., Yuda M., Takasaki Т., Kobayashi M., Sawabe K. Genetic characterization of a new insect flavivirus isolated from Culex pipiens mosquito in Japan //Virology. -2007. V. 359. - P. 405-414.

231. Jacobs S.C, Wilkinson G.W.G, Stephenson J.R. High level expression of TBEV NS1 protein by using an adenovirus-based vector: protection elicited in murine model //J. Virol. 1992. -V. 66. - P. 2086-2095.

232. Jenkins G, Worobey M, Wolk C.H, Holmes E.C. Evidence for the non-quasispecies evolution of RNA viruses //Mol. Biol. Evol. 2001. - V. 18. -P. 987-994.

233. Jenkins G.M, Rambaut A, Pybus O.G, Holmes E.C. 2002. Rates of molecular evolution in RNA viruses: a quantitative phylogenetic analysis //J. Mol. Evol. V. 54. - P. 156-165.

234. Jiang W.R, Lowe A, Higgis S, Reid H, Gould E.A. Single amino acid codon changes detected in louping ill virus antibody-resistant mutants with reduced neurovirulence //J. Gen. Virol. 1993. - V. 74. - P. 931-935.

235. Johnsos P.A., Rosner M.R. Characterization of murine-specific leukemia virus receptor from L cells //J. Virol. 1986. - V. 58. - P. 900-908.

236. Jones C.T., Ma L., Burgner J.W., Groesch T.D., Post C.B., Kuhn R.J. Flavivirus capsid is a dimeric alpha-helical protein //J. Virol. 2003. - V. 77.-P. 7143-7149.

237. Jones M., Davidson A., Hibbert L., Gruenwald P., Schlaak J., Ball S., Foster G., Jacobs M. Dengue virus inhibits alpha interferon signaling by reducing STAT2 expression //J. Virol. 2005. - V. 79. - P. 5414-5420.

238. Kawano H., Rostapshov V., Rosen L., Ching-Jun Lai. Genetic determinants of Dengue type 4 virus neurovirulence for mice //J. Virol. -1993.-V. 67. P. 6567-6575.

239. Khan A., Pichler J., Rosemann A., Blaas D. Human rhinovirus type 54 infection via heparan sulfate is less efficient and strictly dependent of low endosomal pH //J. Virol. 2007. - V. 81. - P. 4625-4632.

240. Khromykh A.A., Varnavski A.N., Sedlak P.L., Westaway E.G. Coupling between replication and packaging of flavivirus RNA: evidence derivedfrom the use of DNA-based full-length cDNA clones of Kunjin virus //J. Virol. 2001a. - V. 75. - P. 4633-4640.

241. Kiermayr S., Kofler R.M., Mandl C.W., Messner P., Heinz F.X. Isolation of capsid protein dimers from the tick-borne encephalitis flavivirus and in vitro assembly of capsid-like particles //J. Virol. 2004. - V. 78. - P. 80788084.

242. Kim S.-Y., Yun S.-M., Han M.G., Lee I.Y., Lee N.Y., Jeong Y.E., Lee B.C., Ju Y.R. Isolation of Tick-Borne viruses from wild rodents, South Korea //Vector-Borne Zoonitic Dis. 2008. - V. 8(1). - P. 7-13.

243. Kjellen L., Lindahl U. Proteoglycans: structures and interactions //Annu. Rev. Biochem. 1991. -V. 60. - P. 443-475.

244. Klimstra W.B., Ryman K.D., Johnston R.E. Adaptation of Sindbis virus to BHK cells selects for use of heparan sulfate as an attachment receptor //J. Virol. 1998. - V. 72. - P. 7357-7366.

245. Kofler R.M., Leitner A., O'Riordain G., Heinz F.X., Mandl C.W. Spontaneous mutations restore the viability of tick-borne encephalitis virus mutants with large deletions in protein С //J. Virol. 2003. - V. 77. -p. 443-451.

246. Kopecky J., Gruhoffer L., Kovar V., Jindrak L., Vokurkova D. A putative host cell receptor for tick-borne encephalitis virus identified by anty-idiotypic antibodies and virus affinoblotting //Intervirology. 1999. -V. 42.-P. 9-16.

247. Krah D.L., Choppin P.W. Mice immunized with measles virus develop antibodies to a cell surface of Vero cells //J. Virol. 1988. - V. 62. - P. 1565-1572.

248. Kreil T.R., Eibl M.M. Viral infection of macrophages profoundly alters requirements for induction of nitric oxide synthesis //Virology. 1995. -V. 212. - P. 174-178.

249. Kreil T.R., Eibl M.M. Nitric oxide and viral infection: no antiviral activity against a Flavivirus in vitro, and evidence for contribution to pathogenesis in experimental infection in vivo //Virology. 1996. - V. 219.-P. 304-306.

250. Kroschewski H., Allison S.L., Heinz F.X., Mandl C.W. Role of heparan sulfate for attachment and entry of tick-borne encephalitis virus //Virology. 2003. - V. 308. - P. 92-100.

251. Kummerer B.M., Rice C.M. Mutations in the yellow fever virus nonstructural protein NS2A selectively block production of infectious particles //J. Virol. 2002. - V. 76(10). - P. 4773-4784.

252. Kuno G., Chang G., Tsuchiya K., Karabatsos N., Cropp C. Phylogeny of the genus Flavivirus //J. Virol. 1998. - V. 72. - P. 73-83.

253. Kuno G., Chang G.J. Biological transmission of arboviruses: reexamination of and new insights into components, mechanisms, and unique traits as well as their evolutionary trends //Clin. Microbiol. Rev. -2005. -V. 18(4). P. 608-637.

254. Кигапе I., Brinton M.A., Samson A.L., Ennis F.A. Dengue virus-specific, human CD4+ CD8- cytotoxic T-cell clones: multiple patterns of virus cross-reactivity recognized by NS3-specific T-cell clones //J. Virol. -1991.-V. 65(4).-P. 1823-1828.

255. Labuda M., Austin J.A., Zuffova E., Kozuch O., Fuchsberger N., Lysy J., Nuttals P.A. Importance of lokalized skin infection in TBEV transmission //Virology. 1996. -V. 219. - P. 357-366.

256. Laemmli V.K. Clevage of structural proteins during the assembly of the head of bacteriophage T4 //Nature. 1970. - V. 227. - P. 680-685.

257. Lamballerie X. de, Crochu S., Billoir F., Neyts J., Micco P. de, Holmes E.C., Gould E.A. Genome sequence analysis of Tamana bat virus and its relationship with the genus Flavivirus //3 Gen Virol. 2002. - V. 83 - P. 2443-2454.

258. Lane Т.Е., Hardison J.L., Walsh K.B. Functional diversity of chemokines and chemokine receptors in response to viral infection of the central nervous system //Curr. Top. Microbiol. Immunol. — 2006. — V. 303.-P. 1-27.

259. Lee J.M., Crooks A.J., Stephenson J.R. The synthesis and maturation of a non-structural extracellular antigen from tick-bome encephalitis virus and its relationship to the intracellular NS1 protein //J.Gen. Virol. 1989. -V. 70. - P. 335-343.

260. Lee E., Weir R.C., Dalgarno L. Changes in the Dengue major envelope protein on passaging and their localization on the three-dimensional structure of the protein //Virology. 1997. -V. 232. - P. 281-290.

261. Lee E., Lobigs M. Substitution at the putative receptor-binding site of an encephalitic flavivirus alter virlence and host cell tropism and reveal a role for glycosaminoglycans in entry //J. Virol. 2000. - V. 74. - P. 8867-8875.

262. Lee E., Lobigs M. Mechanism of virulence attenuation of glycosaminoglycan-binding variants of Japanese encephalitis virus and Murray Valley encephalitis virus //J.Virol. 2002. - V. 76. - P. 4901-4911.

263. Lee E., Hall R.A., Lobigs M. Common E protein determinants for attenuation of glycosaminoglycan-binding variants of Japanese encephalitis and West Nile viruses //J. Virol. 2004. - V. 78. - P. 82718280.

264. Levine В., Hardwick J.M., Trapp B.D., Crawford Т.О., Bollinger R.C., Griffin D.E. Antibody-mediated clearance of alphavirus infection from neurons //Science. 1991. - V. 254 - P. 856-860.

265. Lieberman A.P., Pitha P.M., Shin H.S., Shin M.L. Production of tumor necrosis factor and other cytokines by astrocytes stimulated withlipopolysaccharide or a neurotropic virus //Proc. Natl. Acad. Sci. USA. -1989.-V. 86.-P. 6348-6352.

266. Lin C, Amberg S.M, Chambers T.J, Rice C.M. Cleavage at a novel site in the NS4A region by the yellow fever virus NS2B-3 proteinase is a prerequest for processing at the downstream 4A/4B signalase site //J. Virol. 1993. - V. 67. - P. 2327-2335.

267. Lin Yi.L, Chen L.K, Liao C.L. A highly attenuated strain of Japanese encephalitis virus induces a protective immune response in mice //J. Virol. 1998.-V. 72. - P. 191-200.

268. Lindenbach B.D, Rice C.M. Genetic interaction of flavivirus nonstructural proteins NS1 and NS4A as a determinant of replicase function //J. Virol. 1999. - V. 73. - P. 4611-4621.

269. Lindenbach B.D, Rice C.M. Flaviviridae: The Viruses and Their Replication //"Fields Virology" /Eds. Knipe D.M, Howley P.M. et al. -Lippincott Williams&Wilkins:Philadelphia, 2001. P. 991-1043.

270. Lindenbach B.D, Rice C.M. Molecular biology of flaviviruses //Adv. Virus Res. 2003. - V. 59. - P. 23-60.

271. Lindsley M.D, Rodriguez M. Characterization of the inflamatory response in the central nervous system of mice susceptible or resistant to demyelination by Theiler's virus //J. Immunol. 1989. - V. 142 - P. 26772682.

272. Liou V.L, Hsu C.Y. Japanese encephalitis virus is transported across the cerebral blood vessels by endocytosis in mouse brain //Cell Tissue Res. -1998.- V. 293-P. 389-394.

273. Lobigs M., Arthur C.E., Mullbacher A., Blanden R.V. The Flavivirus nonstructural protein NS3 is a dominant sourse of citotoxic T cell peptide dominants //Virology. 1994. - V. 202. - P. 195-201.

274. Lobigs M., Mullbacher A.,Wang Y., Pavy M., Lee E. Role of type I and II interferon responses in recovery from infection with an encephalitic flavivirus //J. Gen. Virol. 2003. - V. 84. - P. 567-572.

275. Lobigs M., Lee E. Inefficient signalase cleavage promotes efficient nucleocapsid incorporation into budding flavivirus membranes //J. Virol. -2004.-V. 78.-P. 178-186.

276. Lorenz I.C., Allison S.L., Heinz F.X., Helenius A. Folding and dimerization of tick-borne encephalitis virus envelope proteins prM and E in the endoplasmic reticulum //J. Virol. 2002. - V. 76. - P. 5480-5491.--------r------- -----r„. . . . . 367

277. Lukashev A.N. Role of recombination in evolution of enteroviruses //Rev. Med. Virol. 2005. - V. 15. - P. 157-67.

278. Lyon M., Deakin J.A., Gallagher. Liver heparan sulfate structure. A novel molecular design //J. Biol. Chem. 1994. - V. 269. - P. 1120811215.

279. Ma L., Jones C.T., Groesch T.D., Kunh R.J., Post C.B. Solution structure of dengue virus capsid protein reveals another fold //Proc. Nath. Acad. Sci. USA. 2004. - V. 101. - P. 3414-3419.

280. Mackenzie J.M., Jones M.K., Young P.R. Immunolocalization of the dengue virus nonstructural glycoprotein NS 1 suggests a role in viral RNA replication //Virology. 1996. - V. 220. - P. 232-240.

281. Mackenzie J.M., Khromykh A.A., Jones M.K., Westaway E.G. Subcellular localization and some biochemical properties of the flavivirus Kunjin nonstructural proteins NS2A and NS4A //Virology. 1998. - V. 245.-P. 203-215.

282. Major L., Linn M., Slade R., Schroder W., Hyatt A., Gardner J., Cowley J., Suhrbier A. Ticks associated with macquarie island penguins carry arboviruses from four genera //PLoS ONE 4. Epub 2009. - e4375.

283. Maldov D.G., Karganova G.G., Timofeev A.V. Tick-borne encephalitis virus interaction with the target cells //Arch. Virol. 1992. - V. 127 - P. 321-325.

284. Mandl C.W., Heinz F.X., Kunz C. Sequence of the structural proteins of the tick-borne encephalitis virus (Western subtype) and comparative analysis with other flaviviruses //Virology. 1988. -V. 166. - P. 197-205.

285. Mandl C.W., Guirakhoo F., Holzmann H., Heinz F.X., Kunz C. Antigenic strucrure of the flavivirus envelope protein E at the molecular level, using tick-borne encephalitis virus as a model //J. Virol. 1989. - V. 63 - P. 564-571.

286. Mandl C.W., Heinz F.X., Stockl E., Kunz C. Genome sequence of tick-borne encephalitis virus (Western subtype) and comparative analysis of nonstructural proteins with other flaviviruses //Virology. 1989. - V. 173. -P. 291-301.

287. Mandl C.W., Kunz C., Heinz F.X. Presence of poly(A) in a flavivirus: significant differences between the 3" noncoding regions of the genomic RNAs of tick-borne encephalitis virus strains //J.Virol. 1991. - V. 65. -P. 4070-4077.

288. Mandl C.W., Holzmann H., Kunz C., Heinz F.X. Complete genomic sequence of Powassan virus: evaluation of genetic elements in tick-borne versus mosquito-borne flaviviruses //Virology. 1993. - V. 194. - P. 173184.

289. Mandl C.W., Holzmann H., Meixner Т., Rauscher S., Stadler P.F., Allison S.L., Heinz F.X. Spontaneous and engineered deletion in 3' NCR of TBE: construction of highly attenuated mutants of a Flavivirus //J.Gen. Virol.- 1998.-V. 72 -P. 2132-2140.

290. Mandl C.W., Allison S.L., Holzmann H., Meixner Т., Heinz F.X. Attenuation of tick-borne encephalitis virus by structure-based site-specific mutagenesis of a putative Flavivirus receptor binding site // J. Virol. 2000. - V. 74. - P. 9601-9609.

291. Mandl C.W. Steps of the tick-borne encephalitis virus replication cycle that affect neuropathogenesis //Virus Res. 2005. - V. 111 - P. 161-174.

292. Marin M.S., Zanotto P.M.De A., Gritsun T.S., Gould E.A. Phylogeny of TYU, SRE, and CFA virus: different evolutionary rates in the genus Flavivirus //Virology. 1995. - V. 206. - P. 1133-1139.

293. Markoff L., Falgout В., Chang A. Conserved internal hydrophobic domain mediates the stable membrane integration of the dengue virus capsid protein //Virology. 1997. - V. 233. - P. 105-117.

294. Markoff L. 5'- and З'-noncoding regions in flavivirus RNA //Adv. Virus Res. 2003. - V. 59 - P. 177-228.

295. Martinez-Barragan J.J., del Angel R.M. Identification of a putative coreceptor on Vero cells that participates in dengue 4 virus infection //J. Virol. -2001.-V. 75(17). -P. 7818-7827.

296. McArtur M.A., Suderman M.T., Mutebi J.P., Xiao S.Y., Barrett D.T. Molecular characterization of a hamster viscerotropic strain of yellow fever virus //J. Virol. 2003. - V. 77. - P. 1462-1468.

297. McMinn P.C., Dalgarno L., Weir R.C. A comparison of the spread of Murray Valley encephalitis viruses of high or low neuroinvasiveness in the tissues of Swiss mice after peripheral inoculation //Viroljgy. 1996. — V. 220.-P. 414-423.

298. McMinn P.C., Weir R.C., Dalgarno L. A mouse-attenuated envelope protein variant of Murray Valley encephalitis virus with altered fusion activity //J. Gen. Virol. 1996a. - V. 77 - P. 2085-2088.

299. McMinn P.C. The molecular basis of virulence of the encephalitogenic flaviviruses //J. Gen.Virol. 1997. - V. 78. - P. 2711-2722.

300. Mecham R.P. Receptors for laminin on mammalian cells //FASEB J. -1991.-V. 5.-P. 2538-2546.

301. Mims C.A. Aspects of the pathogenesis of virus diseases //Bacteriolog. Reviews. 1964. - V. 28( 1). - P. 3 0-71.

302. Miralles R., Moya A., Elena S.F. Effect of population patchiness and migration rates on the adaptation and divergence of vesicular stomatitis virus quasispecies populations //J. Gen. Virol. 1999. - V. 80. - P. 20512059.

303. Miralles R., Moya A., Elena S.F. Diminishing returns of population size in the rate of RNA virus adaptation //J. Virol. 2000. - V. 74. - P. 35663571.

304. Modis Y., Ogata S., Clements D., Harrison S.C. A ligand-binding pocket in the dengue virus envelope glycoprotein //Proc. Nath. Acad. Sci. USA. -2003. V. 100. - P. 6986-6991.

305. Modis Y, Ogata S, Clements D, Harrison S.C. Structure of the dengue virus envelope protein after membrane fusion //Nature. 2004. - V. 427. -P. 313-319.

306. Modis Y, Ogata S, Clements D, Harrison S.C. Variable surface epitopes in the crystal structure of Dengue virus type 3 envelope glycoprotein //J. Virol. 2005. - V. 79. - P. 1223-1231.

307. Monath T.P, Heinz F.X. Flaviviruses //"Fields Virology" /Eds. Fields B.N, Knipe D.M, Howley P.M. et al. Lippincott-Raven Publishers Philadelphia, 1996. - P. 961-1034.

308. Morales-Betoulle M. E, Pineda M. L. M, Sosa S. M, Panella N, Lopez M.R, Cordon-Rosales C, Komar N, Powers A, Johnson B.W. Culex Flavivirus Isolates from Mosquitoes in Guatemala //J. Med. Entomol. -2008.-V. 45.- P. 1187-1190.

309. Moya A, Elena S.F, Bracho A, Miralles R, Barrio E. The evolution of RNA viruses: A population genetics view //Proc. Nath. Acad. Sci. USA. -2000. V. 97. - P. 6967-6973.

310. Moya A, Holmes E.C, Gonzalez-Candelas F. The population genetics and evolutionary epidemiology of RNA viruses //Nat. Rev. Microbiol. -2004. V. 2 - P. 279-288.

311. Mukhopadhyay S, Kim B.-S, Chipman P.R, Rossmann M.G, Kuhn R.J. Structure of West Nile virus //Science. 2003. - V. 302. - P. 248.

312. Munoz-Jordan J.L, Sanchez-Burgos G.G, Laurent-Rolle M, Garcia-Sastre A. Inhibition of interferon signaling by dengue virus //Proc. Nath. Acad. Sci. USA. 2003. - V. 100 - P. 14333-14338.

313. Murray J.M., Aaskov J.G., Wright P.J. Processing of the dengue virus type 2 proteins prM and C-prM //J. Gen. Virol. 1993. - V. 74. - P. 175180.

314. Muszbek L., Szabo Т., Fesus L. A high sensitive method for the measurement of ATPase activity //Anal. Biochemistry. 1977. - V. 77. -P. 286-288.

315. Muylaert I.R., Chambers T.J., Galler R., Rice C.M. Mutagenesis of the N-linked glycosylation sites of the yellow fever virus NS1 protein: Effects on virus replication and mouse neurovirulence //Viroljgy. 1996. — V. 222.-P. 159-168.

316. Muylaert I.R., Galler R., Rice C.M. Genetic analysis of yellow fever virus NS1 protein: identification of a temperature-sensitive mutation which blocks RNA accumulation //J. Virol. 1997. -V. 71. - P. 291-298.

317. Nawa M., Takasaki Т., Yamada K.-I., Kurane I., Akatsuka T. Interference in Japanese encephalitis virus infection of Vero cells by a cationic amphiphilic drug, chloropromazine //J. Gen. Virol. 2003. - V. 84. - P. 1737-1741.

318. Neumann H., Schmidt H., Wihharm E., Behrens L., Wekerle H. Interferon у gene expression in sensory neurons: evidence for autocrine gene regulation //J. Exp. Med. 1997. -V. 186. - P. 2023-2031.

319. Ni H., Chang G.-J.J., Xie H., Trent D.W., Barrett A.D.T. Molecular basis of attenuation of neurovirulence of wild-type Japanese encephalitis virus strain SA14 //J. Gen. Virol. 1995. -V. 76. - P. 409-413.

320. Niedrig M., Klockmann U., Lang W., Roeder J., Burk S., Modrou S., Pauli G. Monoclonal antibodies directed against tick-borne encephalitis virus with neutralizing activity in vivo //Acta Virol. 1994. — V. 38. - P. 141-149.

321. Nisbet D., Lee K., van den Hurk A., Johansen C., Kuno G., Chang G., Mackenzie J., Ritchie S., Hall R. Identification of new flaviviruses in the Kokobera virus complex //J. Gen. Virol. 2005. - V. 86. - P. 121-124.

322. Nitayaphan S., Grant J.A., Chang G.J. Nucleotide sequense of the virulent SA-14 strain of Japanese encephalitis virus and its attenuated vaccine derivative, SA-14-14-2 //Virology. 1990. - V. 177. - P. 541-552.

323. Novella I.S, Elena S.F., Moya A., Domingo E., Holland J.J. Size of genetic bottlenecks leading to virus fitness loss is determined by mean initial population fitness //J. Virol. 1995. - V. 69 - P. 2869-2872.

324. Novella I.S., Duarte E.A., Elena S.F., Moya A., Domingo E., Holland J.J. Exponential increases of RNA virus fitness during large population transmissions //Proc. Nath. Acad. Sci. USA. 1995b. - V. 92. - P. 58415844.

325. Novella I.S., Quer J., Holland J.J. Exponential fitness gains of RNA virus populations are limited by bottleneck effects //J. Virol. 1999. - V. 73.-P. 1668-1671.

326. Novella I.S., Hershey C.L., Escannis C., Domingo E., Holland J.J. Lack of evolutionary stasis during alternating replication of an arbovirus in insect and mammalian cells //J. Mol. Biol. 1999a - V. 287. - P. 459-465.

327. Nowak Т., Wengler G. Analysis of the disulfides present in the membrane proteins of the West Nile flavivirus //Virology. 1987. - V. 156.-P. 127-137.

328. Nuttall P. A., Labuda M. Dynamics of infection in tick vectors and at the tick-host interface //Adv. Virus Res. 2003. - V. 60. - P. 233-272.

329. Parrish C.R., Woo W.S., Wright P.J. Expression of the NS1 gene of dengue virus type 2 using vaccina virus. Dimerisation of the NS1 glycoprotein //Arch.Virol. 1991. - V. 117.- P. 279-286.

330. Patkar C., Kuhn R. Yellow Fever virus NS3 plays an essential role in virus assembly independent of its known enzymatic functions //J. Virol. -2008.-V. 82.-P. 3342-52.

331. Pletnev A.G., Yamshchikov V.F., Blinov V.M. Tick-borne encephalitis virus genome. The nucleotide sequence coding for virion structural proteins //FEBS Lett. 1986. -V. 200. - P. 317-321.

332. Pletnev A.G., Yamshchikov V.F., Blinov V.M. Nucleotide sequence of the genome and complete amino acid sequence of the polyprotein of tick-borne encephalitis virus //Viroljgy. 1990. - V. 174. - P. 250-263.

333. Pletnev A.G., Bray C.J., Lai C.J. Chimeric of tick-borne encephalitis and dengue type 4 viruses: effects of mutations on neurovirulence in mice //J. Virol. 1993. - V. 67. - P. 4956-4963.

334. Pletnev A.G., Men R. Attenuation of the Langat tick-borne flavivirus by chimerization with mosquito-borne flavivirus dengue type 4 //Proc. Nath. Acad. Sci. USA. 1998. - V. 95. - P. 1746-1751.

335. Pletnev A.G., Karganova G.G., Dzhivanyan T.I., Lashkevich V.A., Bray M. Chimeric Langat/Dengue viruses protect mice from heterologouschallenge with the highly virulent strains of tick-borne encephalitis virus //Virology. 2000. - V. 274. - P. 26-31.

336. Protopopova E.V., Sorokin A.V., Konovalova S.N. Human laminin-binding protein as cell receptor for the tick-borne encephalitis virus //Zenr. bl. Bacteriol. 1999. - V. 289. - P. 632-638.

337. Proutsky V., Gould E.A., Holmes E.C. Secondary structure of the 3'untranslated region of flaviviruses: similarities and difference //Nucl. Acids Res. 1997. - V. 25. - P. 1194-1202.

338. Rauscher S., Flamm C.W., Mandl C.W., Heinz F.X., Stadler P.F. Secondary structure of the З'-noncoding region of flavivirus genomes: comparative analysis of base pairing probabilities //RNA. 1997. — V. 3. — P. 779-791.

339. Rey O., Rossi J., Lopez R., Iapalucci-Espinoza S.J., Franze-Rernandez M.T. Tacaribe virus infection may induce inhibition of the activity of the host cell Ca2+ and Na+/K+ pumps //J. Gen. Virol. 1988. - V. 69. - P. 951-954.

340. Rey F.A., Heinz F.X., Mandl C.W., Kunz C., Harrison S.C. The envelope glycoprotein from tick-borne encephalitis virus at 2A resolution //Nature. -1995. V. 375. - P. 292-297.

341. Rice C.M. Flaviviridae: the viruses and their replication //"Fields Virology" /Eds. Fields B.N., Knipe D.M., Howley P.M. et al. Lippincott-Raven Publishers:Philadelphia. - 1996. - P. 931-959.

342. Roehrig J.T. Antigenic structure of flavivirus proteins //Adv. Virus Res. 2003. — V. 59. - P. 141-175.

343. Rostland K.S., Esko J.D. Microbial adherence to and invasion through proteoglycans //Infect. Immun. 1997. - V. 65. - P. 1-8.

344. Rothman A.L., Kurane I., Lai C.-J., Bray M., Falgout В., Men R., Ennis F.A. Dengue virus protein recognition by virus-specific murine CD8+ cytotoxoc lymphocytes //J. Virol., 1993. - V. 67. - P. 801-806.

345. Rubin S.G., Chumakov M.P. New data on the antigenic types of tick-borne encephalitis virus //Arboviruses in the Mediterranean Countreies / Ed. by J. Veseniak-Hirjan. Fisher:Stuttgart, New York, 1980. - P. 231236.

346. Ruiz-Jabaro C.M. Arias A. Baranowski E., Escarmis C., Domingo E. Memory in viral quasispecies //J. Virol. 2000. - V. 74. - P. 3543-3547.

347. Ruiz-Jarabo C., Arias A., Molina-Paris C., Briones C., Baranowski E., Escarmis C., Domingo E. Duration and fitness dependence of quasispecies memory //J. Mol. Biol. 2002. -V. 315. - P. 285-296.

348. Ruoslahti E. Integrins //J. Clin. Invest. 1991. - V. 87(1). - P. 1-5.

349. Ryan M.D., Monaghan S., Flint M. Virus-encoded proteinases of the Flaviviridae //J.Gen. Virol. 1998. - V. 79. - P. 947-959.

350. Ryman K.D., Xie H., Neil Ledger Т., Campbell G.A., Barrett A.D.T. Antigenic variants of Yellow Fever virus with an altered neurovirulence phenotype in mice //Virology. 1997. - V. 230. - P. 376-380.

351. Ryman K.D., Neil Ledger Т., Campbell G.A., Watowich S.J., Barrett A.D.T. Mutation in 17D-204 vaccine substrain-specific envelope protein epitope alters the pathogenesis of Yellow Fever virus in mice //Virology. -1998.-V. 244. P. 59-65.

352. Sambrook J., Fritsch E.R., Maniatis T. Molecular cloning Laboratory manuals. CSH Laboratory Press:USA. - 1989.

353. Sanches I.J., Ruiz B.H. A single nucleotide change in the E protein of dengue virus 2 Mexican strain affects neuruvirulence in mice //J. Gen. Virol. 1996.-V. 77.-P. 2541-2545.

354. Scatchard G. The interaction of proteins for small molecules and ions //Ann .NY Acad. Sci. 1949. - V. 51. - P. 660-672.

355. Schlegel R., Willingham M.C., Pastan I.H. Saturable binding sites for vesicular stomatitis virus on the surfage of Vero cells //J. Virol. 1982. — V. 43.-P. 871-875.

356. Schlesinger J.J., Brandiss M.W., Cropp C.B., Monath T.P. Protection against yellow fever in monkeys by immunization with yellow fever nonstructural protein 1 //Virology. 1986. -V. 60. - P. 1153-1155.

357. Spector T. Refinement of the coomassie blue method of protein quantitation. A simple and linear spectrophotometric assay for less than or equal to 0.5 to 50 microgram of protein //Analyt. Biochem. 1978. - V. 86.-P. 142-146.

358. Sprent J. T and В memory cells //Cell.- 1994. V. 76. - P. 315-322.

359. Sprent J, Surh C.D. Cytokines and T cell homeostasis //Immunol. Lett. -2003. V. 85(2). - P. 145-149.

360. Standler K, Allison S.L, Schalish J, Heinz F.X. Proteolitic activation of tick-borne encephalitis virus by furin //J.Gen. Virol. 1997. — V. 71. - P. 8475-8481.

361. Stephenson J.R, Crooks A.J, Lee J.M. The synthesis of immunogenic polypeptides encoded by tick-borne encephalitis virus //J.Gen. Virol. -1987.-V. 68. P. 1307-1316.

362. Stiasny K, Allison S.L, Marchler-Bauer A, Kunz C, Heinz F.X. Structural requirement for low-pH-induced rearragements in the envelope glycoprotein of tick-bome encephalitis virus //J. Virol. 1996. — V. 70. - P. 8142-8147.

363. Stiasny K, Allison S.L, Schalich J, Heinz F.X. Membrane interactions of the tick-borne encephalitis virus fusion protein E at low pH //J. Virol. -2002. V. 76. - P. 3784-3790.

364. Stiasny К, C. Kossl C, Heinz F.X. Involvement of lipids in different steps of the flavivirus fusion mechanism //J. Virol. 2003. - V. 77. - P. 7856-7862.

365. Stiasny К., Kossl С., Heinz F.X. Differences in the postfusion conformations of full-lenth and truncated class II fusion protein E of tick-borne encephalitis virus //J. Virol. 2005. - V. 79 - P. 6511-6515.

366. Stocks C.E., Lobigs M. Signal peptidase cleavage at the Flavivirus CprM junction: dependence on the viral NS2B-3 protease for efficient processing requires determinants in C, the signal peptide, and prM //J. Virol., 1998. V. 72. - P. 2141-2149.

367. Stollar V, Thomas V. An agent in the Aedes aegypti cell line (Peleg) wich causes fusion of Aedes albopictus cells //Virology. 1975. - V. 64. — P. 367-377.

368. Takashima I., Morita K., Chiba M., Hashimoto N. A case of tick-borne encephalitis in Japan and isolation of the virus //J. Clin. Microbiol. 1997. -V. 35.-P. 1843-1947.

369. Takeda Т., Ito Т., Chiba M., Takahashi K., Niioka Т., Takashima I. Isolation of tick-borne encephalitis virus from Ixodes ovatus (Acari: Ixodidae) in Japan //J. Med. Entomol. 1998. - V. 35(3). - P 227-231.

370. Thepparit C., Smith D.R. Serotype-specific entry of dengue virus into liver cells: identification of the 37 kilodalton/67-kilodalton high-affinity laminin receptor as a dengue virus serotype 1 receptor //J. Virol. 2004. — V. 78(22).-P. 12647-12656.

371. Thurner C., Witwer C., Hofacker I. L., Stadler P. F. Conserved RNA-secondary structures in Flaviviridae genomes //J. Gen. Virol. 2004. - V. 85.-P. 1113-1124.

372. Turner P.E., Elena S.F. Cost of host radiation in RNA virus //Genetics. -2000. -V. 15. P. 1465-1470.

373. Twiddy S., Holmes E. The extent of homologous recombination in members of the genus Flavivirus //J. Gen. Virol. 2003. - V. 84. - P. 429440.

374. Uchil P., Satchidanandam V. Architecture of the flaviviral replication complex //J. Biol. Chem. 2003. - V. 278. - P. 24388-24398.

375. Ulug Т., Garry R.F., Waite M.R.F., Bose H.R. Alterations in monovalent cftion transport in Sindbis virus-infected chich cells // Virology. 1984. -V. 132.-P. 118-130.

376. Ulug, E., Garry R., Bose H. The role of monovalent cation transport in Sindbis virus maturation and release //Virology. 1989. - V. 172(1). - P. 42-50.

377. Ulug E.T., Garry R.F., Bose H.RJr. Inhibition of Na+K+ATPase activity in membranes of Sindbis virus-infected chick cells //Virology.- 1996. V. 216(2).-P. 299-308.

378. Van der Poll Т., Jansen J., Levi M. 1994. Regulation of interleukin 10 release by tumor necrosis factor in humans and chimpanzees //J. Exp. Med. V. 180.-P. 1985-1988.

379. Venugopal K., Reid H.W., Gould E.A. Tick-borne flavivirus NS1 gene: identification of conserved peptides and antigenic analysis of recombinant louping ill virus NS1 protein //Virus Res. 1993. - V. 31. - P. 245-254.

380. Vignuzzi M., Stone J.K., Arnold J.J., Cameron C.E., Andino R. Quasispecies diversity determines patogenesis through cooperative interactions in a viral population //Nature. 2006. - V. 439. - P. 344-348.

381. Volkova T.D., Vorovitch M.F., Ivanov V.T., Timofeev A.V., Volpina O.M. A monoclonal antibody that recognizes the predicted tick borne encephalitis virus E protein fusion sequence blocks fusion //Arch. Virol. -1999.-V. 144.-P. 1035-1039.

382. Vorovitch M.F., Timofeev A.V., Atanadze S.N., Tugizov S.M., Kushch A.A., Elbert L.B. pH- dependent fusion of tick-borne encephalitis virus with artificial membranes //Arch. Virol. 1991. -V. 118. - P. 133-138.

383. Wallner G., Mandl C.W., Kunz C., Heinz F.X. The flavivirus Зл-noncoding region: extensive size heterogeneity independent ofevolutionary relationshipsamong strains of tick-borne encephalitis virus //Virology. 1995.-V. 213. - P. 169-178.

384. Wallner G., Mandl C.W., Ecker M. Characterization and complete genome sequences of high- and low-virulence variants of tick-borne encephalitis vims //J. Gen. Virol. 1996. - V. 77. - P. 1035-1042.

385. Weaver S.C., Rico-Hesse R., Scott T.W. Genetic diversity and slow rates of evolution in New World Alphaviruses //Curr. Top. Microbiol. Immunol. 1992.-V. 176.-P. 99-115.

386. Weaver S.C., Brault A.C. Kang W., Holland J.J. Genetic and fitness changes accompanying adaptation of an arbovirus to vertebrate and invertabrate cells //J. Virol. 1999. - V. 73 - P. 4316-4326.

387. Westaway E.G., Mackenzie J.M., Kenney M.T. Ultrastructure of Kunjin virus-infected cells: Colocalization of NS1 and NS3 with double-stranded RNA, and of NS2B with NS3, in virus-induced membrane structures //J. Virol. 1997 - V. 71. - P. 6650-6661.

388. Westaway E.G., Mackenzie J M., Khromykh A.A. Kunjin RNA replication and applications of Kunjin replicons //Adv. Virus Res. 2003. -v. 59.-P. 99-140.

389. Whitton J.L., Oldstone M.B.A. The immune response to viruses //Fields Virology /Ed. D.M. Knipe, P.M. Howley et al. Lippicott Williams& Wilkins:Philadelphia, 2001. - P. 285-320.

390. Winkler G., Randolph V.B., Cleaves G.R., Ryan Т.Е., Stollar V. Evidence that the mature form of the flavivirus nonstructural protein NS1 is a dimmer //Virology. 1988. -V. 162. - P. 187-196.

391. Winkler G., Maxwell S.E., Ruemmler C., Stollar V. Newly synthesized dengue-2 virus nonstructural protein NS1 is a soluble protein but becomes partially hydrophobic and membrane-associated after dimerization //Virology. 1989. -V. 171. - P. 302-305.

392. Woolhouse M.E.J., Louise Т.Н., Haydon D.T. Population biology of multihost pathogens //Science. 2001. - V. 292. - P. 1109-1112.

393. Worobey M., Rambaut A., Holmes E.C. Widespread intra-serotypic recombination in natural populations of dengue virus //Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 1999. V. 96. - P. 7352-7357.

394. Wu J., Bera A., Kuhn R., Smith J. Structure of the Flavivirus helicase: implications for catalytic activity, protein interactions, and proteolytic processing//J. Virol. 2005. -V. 79. - P. 10268-10277.

395. Xie H., Ryman K.D., Campbell G.A., Barrett A.D. Mutation in NS5 protein attenuates mouse neurovirulence of yellow fever 17D vaccine virus //J. Gen. Virol. 1998. - V. 79. - P. 1895-1899.

396. Xu Т., Sampath A., Chao A., Wen D., Nanao M., Chene P., Vasudevan S., Lescar J. Structure of the Dengue virus helicase/nucleoside triphosphatase catalytic domain at a resolution of 2.4 A//J Virol. 2005.79:10278-88.

397. Yap Т., Xu Т., Chen Y., Malet H., Egloff M., Canard В., Vasudevan S., Lescar J. Crystal structure of the dengue virus RNA-dependent RNA polymerase catalytic domain at 1.85-angstrom resolution //J. Virol. -2007.-V. 81.-P. 4753-4765.

398. Zanotto P.M.A, Gao G.F, Gritsun T, Marin M.S, Jiang W.R, Venugopal K, Reid H.W, Gould E.A. An Arbovirus cline across the Nothern Hemisphere //Virology. 1995. - V. 210. - P. 152-159.

399. Zanotto P.M.A, Gould E.A, Gao G.F, Harvey P.H, Holmes E.C. Population dynamics of flaviviruses revealed by molecular phylogenies //Proc. Nath. Acad. Sci. USA. 1996. - V. 93. - P. 548-553.

400. Zhang Y, Corver J, Chipman P.R, Zhang W, Pletnev S.V, Sedlak D, Baker T.S, Strauss J.H, Kuhn RJ, Rossmann M.G. Structures of immature flavivirus particles //EMBO J. 2003. - V. 22 - P. 2604-2613.