Микробиологические и молекулярно-генетические аспекты диагностики внебольничных пневмоний пневмококковой этиологии у лиц молодого возраста тема диссертации и автореферата по ВАК РФ 03.02.03, кандидат наук Скрыль, Сергей Владимирович

• Скрыль, Сергей Владимирович
• кандидат наук
• 2013

Оглавление диссертации кандидат наук Скрыль, Сергей Владимирович

ОГЛАВЛЕНИЕ

ВВЕДЕНИЕ 8

1 ГЛАВА I. ЛИТЕРАТУРНЫЙ ОБЗОР. 17

МИКРОБИОЛОГИЧЕСКИЕ АСПЕКТЫ ЭТИОЛОГИИ ВНЕБОЛЬНИЧНЫХ ПНЕВМОКОККОВЫХ ПНЕВМОНИЙ У ЛИЦ МОЛОДОГО ВОЗРАСТА

1.1 Эпидемиология внебольничных пневмоний у лиц молодого 17 возраста

1.2. Этиология внебольничных пневмоний лиц молодого 22 возраста: современное состояние проблемы.

1.3. Современные представления о микробном пейзаже при 24 внебольничных пневмониях

1.3.1 Streptococcus pneumoniae 24

1.3.2. Haemophilus influenzae 27

1.3.3. Moraxella catarrhalis 2 7

1.3.4. Стрептококковая инфекция 28

1.3.5 Другие микроорганизмы 28

2. Устойчивость к антимикробным химиопрепаратам 29 пневмококков: характерные особенности

3. Результаты изучения носительства штаммов S.pneumoniae у 35 лиц молодого возраста.

3.1. Факторы риска по носителъству S.pneumoniae 3 5

4. Современные методы микробиологического контроля за 38 распространением штаммов S.pneumoniae

5. Микробиологический мониторинг за пневмококковыми 41 пневмониями

5.1. Способы оценки риска распространения эпидемического 42 геноварианта пневмококка и система микробиологического мониторинга

5.1.1 Значение серотипирования штаммов Б.рпеитотае: 43

5.1.2. Генетические методы микробиологического мониторинга 436 пневмококковых пневмоний

6. Молекулярно-микробиологические исследования 48 внебольничных пневмоний пневмококковой этиологии

при планировании противоэпидемических мероприятий

2. ГЛАВА II. НАПРАВЛЕНИЯ, КОНТИНГЕНТ, 53

МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ ИССЛЕДОВАНИЯ

2.1 Направления исследований 53

2.2 Контингент исследования 59

2.3 Материал для исследования 60

2.3.1 Клинический лабораторный материал 60

2.3.2 Тест-культуры (эталонные штаммы) 61

2.4 Методы исследования 62 2.4.1 Выделение, идентификация и дальнейшее изучение 63

биологических свойств культур

2.5 Изучение факторов патогенности 64

2.5.1 Оценка нейраминидазной активности 64

2.5.2 Изучение фибринокиназной активности 65

2.5.3 Изучение гиалуронидазной активности 65

2.5.4 Изучение адгезивной активности 66

2.6 Молекулярно- биологические исследования по 67 исследованию вирулентности

2.6.1 Подготовка клинических образцов для исследования 68

2.6.2 Выделение ДНК микроорганизмов из исследуемых образцов 68

2.6.3 Идентификация штаммов пневмококка полимеразной 69 цепной реакцией.

2.7. Определение чувствительности к антибиотикам 71

2.7.1 Диско-диффузионный метод 72

2.7.2 Изучение устойчивости к антибактериальным 72 химиопрепаратам методом серийных разведений

2.7.3 Молекулярно-генетическая оценка детерминант 73 устойчивости к антибактериальным химиопрепаратам методом ПНР

2.8. Серотипирование штаммов 75

2.9. Мультилокусное сиквенстипирование МЬБТ 16

3. Статистическая обработка 77

3.1. Статистическая обработка цифровых показателей 77

3.1.1 Средняя арифметическая (взвешенная) и ошибка средней 78 арифметической

3.1.2 Достоверность (Т) различий между двумя средними 78 величинами

3.1.3 Корреляционный анализ 79

3 ГЛАВА III. ЭПИДЕМИОЛОГИЧЕСКИЕ ОСОБЕННОСТИ 80 И АНАЛИЗ МИКРОБИОЛОГИЧЕСКОЙ СТРУКТРЫ ВНЕБОЛЬНИЧНЫХ ПНЕВМОНИЙ У ЛИЦ МОЛОДОГО ВОЗРАСТА

3.1 Эпидемиологический анализ заболеваемости 80

внебольничными пневмониями лиц молодого возраста

3.2. Этиология внебольничных пневмоний у лиц молодого 89 возраста. Роль штаммов пневмококка в развитии внебольничных пневмоний

3.3 Результаты изучения носительства основных возбудителей 92 внебольничных пневмоний в закрытых коллективах

4. ГЛАВА IV. МИКРОБИОЛОГИЧЕСКИЕ СВОЙСТВА 100 ШТАММОВ S.PNEUMONIAE, ВЫДЕЛЕННЫХ У ЛИЦ МОЛОДОГО ВОЗРАСТА. РЕЗУЛЬТАТЫ ИССЛЕДОВАНИЯ ПАТОГЕННОСТИ.

4.1 Факторы патогенности S.pneumoniae 101

4.1.1 Исследование адгезивной способность штаммов 101 S.pneumoniae

4.1.2 Исследование фибринокиназной активности штаммов 103 пневмококка

4.1.3 Исследование нейраминидазной активности 105

4.1.4. Гиалуронидазная активность 107

4.1.5 Генотиповая характеристика штаммов S.pneumoniae, 108

выделенных у пациентов молодого возраста

5. РЕЗУЛЬТАТЫ ИССЛЕДОВАНИЯ УСТОЙЧИВОСТИ 118 К АНТИБАКТЕРИАЛЬНЫМ ПРЕПАРАТАМ У ЛИЦ МОЛОДОГО ВОЗРАСТА

5.1. Результаты исследования резистентности 118

к антибактериальным химиопрепаратам штаммов S.pneumoniae, выделенных у пациентов внебольничными пневмониями, бронхитами и у носителей

5.2 Изучение полирезистентности в штаммах, выделенных от 124 больных внебольничными пневмониями и от носителей

6. ГЛАВА VI. РЕЗУЛЬТАТЫ МОЛЕКУЛЯРНО- 129 ГЕНЕТИЧЕСКОГО МОНИТОРИНГА ШТАММОВ БШЕиМОМАЕ, ВЫДЕЛЕННЫХ У ЛИЦ МОЛОДОГО ВОЗРАСТА, МЕТОДОМ МУЛЬТИЛОКУСНОГО СИКВЕНСТИПИРОВАНИЯ

7 ЗАКЛЮЧЕНИЕ 139

8 ВЫВОДЫ 147

9 РЕКОМЕНДАЦИИ ДЛЯ ВНЕДРЕНИЯ 148 В МЕДИЦИНСКУЮ НАУКУ И ПРАКТИЧЕСКОЕ ЗДРАВООХРАНЕНИЕ

10 СПИСОК ЛИТЕРАТУРЫ 149

Введение диссертации (часть автореферата) на тему «Микробиологические и молекулярно-генетические аспекты диагностики внебольничных пневмоний пневмококковой этиологии у лиц молодого возраста»

Актуальность: Несмотря на достижения в диагностике и постоянной разработке новых схем антибактериальной терапии, внебольничная пневмония продолжает оставаться одной из наиболее актуальных проблем современной медицины. По данным Федерального медико-биологического агентства России (2013 год), при заболеваемости пределах 25-44%о в старших возрастных группах (> 65 лет), заболеваемость лиц молодого возраста таюке является значимой проблемой и составляет 11,6-16%о. Учитывая социальную и экономическую активность такой демографической группы населения как лица молодого возраста, проблема лечения внебольничных пневмоний представляется более, чем актуальной. Особую актуальность эта проблема приобретает в регионах Дальневосточного Федерального округа, где заболеваемость органов дыхательных путей особенно высока по сравнению с центральными регионами Российской Федерации и превышает общероссийский более, чем на 30% [12,15]. Во многом это связано с микробиологическими особенностями этиологического спектра возбудителей внебольничной пневмонии, определяющих ее различия [1,2]. При этом, пневмококковые внебольничные пневмонии занимают фактически лидирующее место среди внебольничных пневмоний другой этиологии и составляют по мнению российских [16-23] и зарубежных специалистов [134,145] практически 30% в этиологической структуре. Особенную значимость проблеме внебольничных пневмоний пневмококковой этиологии придает тот факт, что при достаточно длительной истории изучения Streptococcus pneumoniae как микроорганизма, микробиологическое подтверждение получают всего 3% всех пневмоний бактериальной природы ( согласно МУ 3.1.2.3047-13 «Эпидемиологический надзор за внебольничными пневмониями», 10.01.2013). К объективным причинам данного явления можно отнести и сложность выделения такого прихотливого возбудителя в чистой культуре как пневмококк, распространенность носительства среди населения, особенно из закрытых коллективов, а также зачастую недооценке значимости клинической

микробиологической диагностики в целом, что приводит к отсутствию информации о заболеваемости и не позволяет оценивать эпидемиологическую ситуацию по внебольничным пневмониям в целом. Действительно, не систематизированы, а, зачастую, и отсутствуют данные об антибиотикорезистентности штаммов пневмокококков с учетом региональных особенностей, что наиболее актуально для ДВФО региона. Не изучены и микробиологические свойства штаммов, определяющих циркуляцию вирулентных штаммов, с учетом фактора колонизации дыхательных путей несколькими изолятами пневмококка, в том числе и штаммами нескольких различных серотипов. Последствия интересующего явления ощутимы прежде всего для таких наиболее уязвимых в эпидемиологическом плане групп как закрытые коллективы, члены которых наиболее часто подвержены распространению инфекционных заболеваний с аэрозольным механизмом передачи. Основными проблемами, наиболее значимыми в практическом здравоохранении и требующими научно-практической доработки, в отношении пневмококковой инфекции являются организация слежения и контроля за распространением антибиотикорезистентных изолятов, а также молекулярно-эпидемиологический мониторинг выделяемых штаммов, основанный на генотипировании, так как именно он позволит получить упорядоченную информацию о распространении того или иного изолята, что позволит сравнивать полученную информацию о характере выявляемых штаммов Б.рпеитотае, и соответственно, планировать профилактические мероприятия в отношении внебольничных пневмоний пневмококковой этиологии. Все вышесказанное обозначает актуальность проблемы, определяет необходимость дальнейшего совершенствования методов клинической микробиологической диагностики, а также микробиологического мониторинга с применением генетического маркирования штаммов для решения задач эпидемиологического надзора за внебольничными пневмониями, и обосновывает цель, проведенного нами исследования.

ЦЕЛЬ: изучить микробиологические свойства штаммов пневмококка, выделенных у лиц молодого возраста из закрытых коллективов с внебольничными пневмониями, с применением молекулярно-генетических методов с целью проведения микробиологического мониторинга и планирования мероприятий эпидемиологического надзора..

ЗАДАЧИ:

1) Определить роль штаммов Б.рпеитотае в этиологической структуре внебольничных пневмоний у лиц молодого возраста, а также выявить особенности факторов вирулентности штаммов пневмококка, выделенных у лиц молодого возраста в закрытых коллективах при внебольничных пневмониях и у носителей.

2) Изучить особенности эпидемического процесса по внебольничным пневмониям пневмококковой этиологии у лиц молодого возраста с учетом региональных особенностей в ДВФО регионе на примере субъекта (г. Петропавловск-Камчатский).

3) Оценить антибиотикорезистентность штаммов пневмококка, выделенных среди лиц молодого возраста при внебольничных пневмониях и от носителей, а также с учетом распространения основных генетических детерминант.

4) Провести молекулярно-генетический мониторинг выделенных штаммов с применением методики мультилокусного сиквенстипирования в ДВФО регионе на примере субъекта (г. Петропавловск-Камчатский) для клональной характеристики циркулирующих при внебольничных пневмониях штаммов Б.рпеитотае.

НАУЧНАЯ НОВИЗНА И ТЕОРЕТИЧЕСКАЯ ЗНАЧИМОСТЬ РАБОТЫ

1. Впервые комплексно оценена эпидемиологическая ситуация по заболеваемости внебольничными пневмониями пневмококковой этиологии у лиц молодого возраста из закрытых коллективов с учетом региональных особенностей ДВФО региона на примере г.Петропавловска-Камчатского.

2. Оценена роль фактора пребывания в закрытом коллективе для развития внебольничных пневмоний пневмококковой этиологии у лиц молодого возраста.

3. Изучены особенности популяционной структуры штаммов пневмококка, вызвавших различные формы пневмококковых инфекций у лиц молодого возраста из закрытых коллективов, идентифицирован клон, циркулирующий в популяции пневмококков, выделенных при внебольничных пневмониях у лиц молодого возраста.

4. Выявлены микробиологические и молекулярно-генетические особенности факторов вирулентности штаммов пневмококка, приводящие к формированию высокопатогенных штаммов S.pneumoniae, оценена консервативность генов таких факторов вирулентности как ply и lytA.

5. Охарактеризовано состояние чувствительности к антибактериальным химиопрепаратам штаммов S.pneumoniae, выделенных у пациентов молодого возраста с внебольничными пневмониями.

6. Определены генотипические особенности формирования антибиотикорезистентности штаммов пневмококка, вызвавших внебольничные пневмонии у лиц молодого возраста.

7. Учитывая генотипические механизмы формирования устойчивости к антибактериальным химиопрепаратам штаммов пневмококка у лиц молодого возраста, предложены рекомендации по коррекции регионального стандарта лечения внебольничных пневмоний пневмококковой этиологии.

ПРАКТИЧЕСКАЯ ЗНАЧИМОСТЬ

1. Данные о распространении эпидемиологической ситуации по внебольничным пневмониям пневмококковой этиологии позволили получить представление об эпидемической ситуации по заболеваемости внебольничными пневмониями у лиц молодого возраста в регионах ДВФО.

2. Охарактеризована эпидемиологическая ситуация по заболеваемости внебольничными пневмониями среди лиц молодого возраста, показан фактор влияния закрытого коллектива на формирование заболеваемости пневмококковыми пневмониями у лиц молодого возраста.

3. Характеристика микробиологических особенностей, а также выявленные различия в штаммах, выделенных при внебольничных пневмониях и от носителей, позволили оценить динамику формирования эпидемического варианта в закрытом коллективе среди лиц молодого возраста

4. Изучение микробиологических свойств штаммов Б.рпеитотае., позволило выявить такие особенности вирулентности как увеличение экспрессии факторов адгезии и инвазии, что будет обусловливать возможность формирования госпитальных изолятов.

5. Проведенное изучение антибиотикорезистентности выделенных штаммов пневмококка позволило получить представление об эффективности общепринятой и проводимой антибиотикотерапии, а также, учитывая механизм формирования устойчивости к антибактериальным средствам, определить возможность коррекции фармакологического списка препаратов для лечения пневмококковых инфекций у лиц молодого возраста.

6. Изучив популяционную структуру возбудителей внебольничных пневмоний, а также выделив видовой, серотиповой состав штаммов пневмококка стало возможным планировать противоэпидемические мероприятия в отношении внебольничных пневмоний пневмококковой этиологии у лиц молодого возраста в закрытых коллективах.

ВНЕДРЕНИЯ

По материалам диссертации выпущены методические рекомендации «Молекулярно-диагностические аспекты идентификации S.pneumoniae, С.pneumoniae. M.pneumoniae», информационные письма «Об эпидемиологических аспектах диагностики возбудителей внебольничных типичных и атипичных пневмоний», «О микробиологических аспектах диагностики возбудителей астипичных пневмоний» подготовлена информационная справка «О заболеваемости и диагностике внебольничных пневмоний у лиц молодого возраста».Результаты исследования использованы в создании формуляров антибиотикотерапии пульмонологического отделения Главного Госпиталя ТОФ и его филиалов, организации мероприятий эпидемиологического надзора в частях и учреждениях ТОФ.Материалы диссертации используются в учебном процессе при подготовке врачей на кафедре эпидемиологии Владивостокского государственного медицинского университета, на кафедре микробиологии Академии экологии, морской биологии и биотехнологии (АЭМББТ), на кафедре общей экологии ДВФУ.

АПРОБАЦИЯ

Материалы научно-исследовательской работы изложены на: постоянно действующих семинарах «Актуальные вопросы госпитальной эпидемиологии» (2008 год), на заседании Приморского отделения Всероссийского общества эпидемиологов, микробиологов и паразитологов, на 10-й Тихоокеанской международной научно-практической конференции студентов и молодых ученых с международным участием «Актуальные проблемы экспериментальной, профилактической и клинической медицины» (апрель, Владивосток, 2010 г), на VI-ой Международной конференции «Молекулярная медицина и биобезопасность» (Москва, 2009), на

конференции «Лабораторная медицина в свете концепции развития здравоохранения России до 2020 года» (28-30 сентября, Москва 2009 года), на III международной конференции по инфекционным заболеваниям DITAN (Пекин, июль 2009), на IV международной конференции по инфекционным заболеваниям DIT AN (Пекин, 2010), на Всероссийской научной конференции «Проблемы современной эпидемиологии. Перспективные средства и методы лабораторной диагностики и профилактики актуальных инфекций» (Санкт-Петербург, Военно-медицинская академия, 2009), на Всероссийской научной школе для молодежи «Перспективы развития инноваций в биологии» (ноябрь, 2009,ДВГУ, Владивосток), на V-ой научно-практической конференции «Инфекционная патология в Приморском крае» (19-20 мая 2010 года, Владивосток), на 11-й Тихоокеанской международной научно-практической конференции студентов и молодых ученых с международным участием «Актуальные проблемы экспериментальной, профилактической и клинической медицины» (апрель, Владивосток, 2010), на Международном симпозиуме по изучению пневмококков и пневмококковых инфекций (ISPPD 7, Tel-Aviv, Israel, 2010), на Европейском Респираторном Конгрессе (сентябрь, 2010, Барселона), на Третьем Съезде военных врачей медико-профилактического профиля Вооруженных сил РФ «Достижения науки и практики в обеспечении санитарно-эпидемиологического благополучия ВС РФ» (декабрь, 2010), на первом Евроазиатском конгрессе «Инфекционные болезни: проблемы, достижения и перспективы» (декабрь, 2010, Санкт-Петербург), в работе 16 Азиатско-Тихоокеанского международного симпозиума по изучению проблем респирологии (Манила, Филиппины, февраль, 2011).

ПУБЛИКАЦИИ

По материалам диссертации опубликовано 14 печатных работ (в журналах, рекомендованных ВАК - 2 статьи), из них в центральной печати 12, в зарубежной печати 3.

ОБЪЕМ И СТРУКТУРА ДИССЕРТАЦИИ

Работа изложена на 171 странице машинописного текста и состоит из введения, обзора литературы, главы материалы и методы исследования, 4 глав собственных исследований, заключения, выводов, практических рекомендаций, списка литературы. Диссертация иллюстрирована 43 таблицами, 86 рисунками, 10 схемами. Список литературы содержит 168 источников, из них 90 принадлежит отечественным, 78 зарубежным авторам. Номер государственной регистрации 01.20.03.02174. Исследование одобрено Этическим комитетом ВГМУ (протокол №1 от 26.03.2012).

ПОЛОЖЕНИЯ, ВЫНОСИМЫЕ НА ЗАЩИТУ

1. Внебольничные пневмонии пневмококковой этиологии являются актуальной проблемой у лиц молодого возраста из закрытых коллективов на примере г.Петропавловска-Камчатского. Заболеваемость внебольничными пневмониями пневмококковой этиологии составляет в структуре инфекций нижних дыхательных путей 26%.

2. В этиологической структуре внебольничных пневмоний пневмококковой этиологии З.рпеитотае составляет по данным бактериологического исследования 41,3% в монокультуре и до 55% в ассоциациях с различными микроорганизмами.

3. Отмечается явление полирезистентности, связанное со снижением чувствительности к пенициллину отмечаемое, прежде всего в отношении штаммов, нечувствительных к макролидам. При изучении генетических детерминант резистентности отмечается преобладание таких генов как те/Е и егтВ, являющихся маркерами устойчивости к макролидам.

4. Анализ клонального родства выделенных штаммов пневмококка методом мультилокусного сиквенстипирования показал, что среди штаммов пневмококка, вызвавших внебольничную пневмонию,

преобладает штамм 8рат23Г, а среди носителей штамм Яб, что говорит о возможности импорта изучаемых геновариантов в популяцию лиц молодого возраста из закрытых коллективов г. Петропавловска-Камчатского.

Заключение диссертации по теме «Микробиология», Скрыль, Сергей Владимирович

выводы

1) Ведущим возбудителем в этиологии внебольничных пневмоний у лиц молодого возраста является Streptococcus pneumoniae, который выделяется в качестве клинически значимого возбудителя как в монокультуре (41,3%), так и в ассоциациях (55%).

2) В Дальневосточном регионе наблюдается высокий уровень заболеваемости внебольничными пневмониями среди лиц молодого возраста. Заболеваемость внебольничными пневмониями пневмококковой этиологии составляет 26% у лиц молодого возраста.

3) Мониторинг антибиотикорезистентности штаммов пневмококка выявил высокий уровень чувствительности к бета-лактамам, цефалоспоринам, хлорамфениколу, клиндамицину и фторхинолонам нового поколения; отсутствие ванкомицинрезистентных штаммов; высокий уровень устойчивости к тетрациклину. Такая же тенденция выявлена и в популяции пневмококков, выделенных от здоровых носителей, свидетельствуя об единых процессах формирования устойчивости к антибактериальным химиопрепаратам.

4) Выявлено увеличение количества поли- и перекрестнорезистентных штаммов, маркером которых были егт гены, а также высокие темпы формирования устойчивости к макролидам, опосредованное теf генами (М-фенотипом).

5) Молекулярно-генетический мониторинг с применением мультилокусного сиквенстипирования позволил идентифицровать штаммы пневмококка клона Spain23F, наиболее частые в популяции штаммов, вызвавших внебольничную пневмонию у лиц молодого возраста, характеризующиеся полирезистентностью и повышенной активностью факторов патогенности, что свидетельствует о формировании эпидемического геноварианта.

РЕКОМЕНДАЦИИ ДЛЯ ВНЕДРЕНИЯ В МЕДИЦИНСКУЮ НАУКУ И ЗДРАВООХРАНЕНИЕ

1. Необходимо организовать микробиологический мониторинг за штаммами пневмококка, выделенными при инфекциях нижних дыхательных путей, у лиц молодого возраста с применением метода мультилокусного сиквенстипирования с целью возможностей использования полученной информации для организации эпидемиологического надзора.

2. Учитывая характер формирования устойчивости к антибактериальным химиопрепаратам, в проводимой терапии необходимо использовать бета-лактамы.

3. Для молекулярно-генетической идентификации штаммов пневмококка необходимо использовать сочетание праймеров к гену ply и гену lytA.

4. Необходимо организовывать мониторинг штаммов пневмококка с применением метода мультилокусного сиквенстипирования для организации и своевременного выявления завозных штаммов и организации надзорных мероприятий.

5. Поскольку большинство множественно-устойчивых штаммов S. pneumoniae, циркулирующих на территории России, относятся к «вакцинным», антипневмококковую вакцинацию следует рассматривать как действенный и перспективный путь сдерживания распространения антибактериальной резистентности среди этих бактерий.

Список литературы диссертационного исследования кандидат наук Скрыль, Сергей Владимирович, 2013 год

СПИСОК ЛИТЕРАТУРЫ

1. Авдеев, С.Н.. Тяжелая внебольничная пневмония/С.Н.Авдеев// Рус.мед.журн.: РМЖ — 2001. — Т.9, № 5. — С.177-182.

2. Активность ряда ферментов анаболического ряда у штаммов Streptococcus pneumoniae, содержащих плазмиды устойчивости к антибиотикам/ С.Р.Козицкая, Гаврилюк В.Г., Голодок Л.П. и соавт.// Микробиологический журнал— 1997.—Т.59,№1.—С.37-41.

3. Анализ чувствительности возбудителей внебольничных пневмоний к азитромицину/ С.Д. Митрохин, О.Н. Зайцева, Т.Д. Константинова,

B.Е. Ноников, Е.В. Никушкин, М.И.Крючков.// Антибиотики и химиотерапия — 1999. — Т.43,№4 — С.40-42.

4. Антимикробная резистентность Streptococcus pneumoniae в России: результаты проспективного многоцентрового исследования (фаза А проекта ПеГАС-1)/Р.С. Козлов, О.И.Кречикова, О.В. Сивая, Л.И. Ахметова, Л.А. Вишнякова, Е.Н Гугцидзе и др. // Клиническая микробиология и антимикробная химиотерапия .— 2002.— Т.З, № 4.—

C. 267—277.

5. Бачинская, E.H. Возбудители внебольничных пневмоний на пороге нового тысячелетия /Е.Н.Бачинская// Антибиотики и химиотерапия. — 2000. —Т.45,№11.— С.21-28.

6. Белобородов, В.Б. Антибактериальная терапия инвазивной пневмококковой инфекции и проблема резистентности пневмококков./В.Б. Белобородов//Инфекции и антимикробная терапия.— 2000.—Т.6,№2.— С. 168—172.

7. Белобородова, Н.В. Антибиотики гликопептиды: клиническое значение/Н.В.Белобородова//Рус.мед.журн.: РМЖ.-—-Т.6, №13. — С.832-835.

8. Белоусов, Ю.Б. Применение фторхинолонов в лечении внебольничных и внутрибольничных пневмоний/ Ю.Б. Белоусов, Ж.А. Галеева, О.В. Ефременкова//Пульмонология.— 1999.—№1.-С.13-17.

9. Богданов, М.Б. Микробиологическая оценка антибактериальных препаратов, используемых для эмпирической терапии внебольничных инфекций нижних дыхательных путей/М.Б.Богданов, Т.В. Черненькая// Антибиотики и химиотерапия.— 2000. — Т.45, №10.— С.15-19.

Ю.Богомолова, М.Б. Этиологическая структура бактериальных менингитов в Новосибирске в 1986-1988 гг/ М.Б. Богомолова//Менингококковая инфекция и гнойные менингиты:Тез.докл.Всесоюзн.конф.—М.,1990—Т.1—С.28-30.

П.Бондарева, Н.В. Пневмококковый менингит: заболеваемость и клинические формы/ Н.В. Бондарева, А.А.Астапов// Менингококковая инфекция и гнойные менингиты: Тез.докл. Всесоюзн.конф.— Архангельск, 1986.—с. 145-147.

12.Брико, Н. И., Филатов H. Н., Лыткина И. Н. и соавт. «Профилактика стрептококковой (группы А) инфекции», Санитарные правила (СП)./Н.И. Брико, H.H. Филатов, И.Н. Лыткина // М.: Экоплан,1998 .— 15 с.

13.Брико, H.H. Лабораторная диагностика стрептококковых инфекций. Пособие для врачей и научных работников./ Н.И.Брико, A.C. Ещина, Л.А. Ряпис//М.: Хризостом,2000.— 64 с.

14.Брико, Н.И.. Состояние и перспективы лабораторной диагностики стрептококковой инфекции в России/ Н.И. Брико// Клиническая лабораторная диагностика.— 2000.—№8.—С.12-15.

15.Буданов, C.B. Азитромицин (сумамед)-основные свойства и

особенности применения в терапии внебольничной пневмонии/С.В.

150

Буданов // Антибиотики и химиотерапия.— 2000.— Т.45,№10.— С.28-38.

16.Бухарин, О.В. Механизмы персистенции бактерий — патогенов/О.В. Бухарин // Вестник РАМН — 2000—Т.2,№4—С.43-49.

17.Вишнякова, JI.A. Адгезия Streptococcus pneumoniae на эксплантантах трахеи мышей и ее ингибирование углеводными препаратами/ JI.A. Вишнякова, Ю.В. Резцова // Журн микробиологии, эпидемиологии и иммуннобиологии.— 1999.—Т.2., №3—С.26-28

18.Вишнякова, Л.А.Нейраминидаза различных штаммов Streptococcus pneumoniae!JI.A. Вишнякова, Н.Е.Резцова //Журн. Микробиол.— 1990.—№2.—С. 108-109.

19.Вишнякова, Л.А.Некоторые вопросы эпидемиологии пневмококковой инфекции./ Л.А.Вишнякова, М.Е.Фаустова, Т.С.Сологуб//Журнал микробиологии—1988.—№8.—С.64-68.

20.Внебольничная пневмония у взрослых: практические рекомендации по диагностике, лечению и профилактике/А.Г.Чучалин, А.И. Синопальников, С.В. Яковлев и соавт. //Клиническая микробиология и антимикробная химиотерапия. — 2003.— №3.— С. 198-224.

21.Внебольничная пневмония у взрослых: практические рекомендации по диагностике, лечению и профилактике: пособие для врачей/ А.Г. Чучалин, А.И. Синопальников, С.В. Яковлев и соавт. — Смоленск, 2003.—54 с.

22.Выделение, идентификация и определение чувствительности к антибиотикам Streptococcus pneumoniae! О Ж. Кречикова, P.C. Козлов, Т.М. Богданович, О.У. Стецюк, М.М. Суворов и др.// Клиническая

микробиология и антимикробная химиотерапия.— 2000.—Т. 2,№1.— С.88-98.

23.Гучев, И.А.Антибиотикопрофилактика вспышек внебольничной пневмонии в гомогенной популяции/ И.А. Гучев, О.И. Клочков//Качественная клиническая практика.—2003.—№1.— С.24-29.

24.Гучев, И.А.Пневмонии в военных коллективах/ И.А. Гучев, А.И. Синопальников //Рус. мед. журн: РМЖ. — 2001.— Т.3,№1.— С.25-28

25. Дворецкий, Л.И. Ошибки антибактериальной терапии инфекций дыхательных путей в амбулаторной практике/ Л.И. Дворецкий, С.В.Яковлев// Инфекции и антимикробная терапия.— 2001.—Т. 3, №1—С. 12-17.

26.Дмитриева, Т.Б. Здоровье населения и национальная безопасность/ Т.Б. Дмитриева// Рос. мед. вест .—2007. — №.5.—С.5-14

27. Досуточная летальность в стационаре при внебольничной пневмонии./А.Л. Верткин, A.B. Наумов, Е.И.Вовк и соавт./ЯСпиническая микробиология и антимикробная химиотерапия.— 2003. — Т.5, №4. —С.380-388.

28.Евдощенко, Е.А.Острый средний отит и его осложнения/ Е.А.Евдощенко//Журнал ушных, носовых и горловых болезней. — 1983.—№6. —С.7-14.

29.Езепчук, Ю.В. Роль нейраминидазы в функции бактериальных токсинов/ Ю.В. Езепчук//Молекулярная генетика. — 1983.—№3. — С.21-23.

30.Жданова, Л.Г.К 100-летию открытия пневмококка/ Л.Г.Жданова//Журнал микробиологии. ■— 1981. — №12.—С.3-5.

31.Зубков, М.Н.Микробиологические аспекты диагностики пневмоний/ М.Н. Зубков, E.H. Гугуцидзе// Пульмонология.— 1997.—Т.1., № 3— С.41-45.

32.К вопросу о профилактике острых респираторных вирусных инфекций и пневмоний в войсках /В.И. Сибилев, В.А. Хоженко, В.И.Рыжиков и др. //Военно-медицинский журнал.— 1999.—№ 2.—С. 18-22.

33.Карбон, К. Значение новых макролидов при лечении внебольничных инфекций дыхательных путей: обзор экспериментальных и клинических данных/ К. Карбон, М.Д. Пул // Клиническая микробиология и антимикробная химиотерапия.— 2000.—Т.1., №2— С.47-59.

34.Карпов, О.И. Комплаенс антибиотикотерапии инфекций дыхательных путей/ О.И. Карпов// Антибиотики и химиотерапия. — 1999.— Т.44,№8 — С.37-44.

35.Кинг, Т. Е. Внебольничная пневмония/Т.Е. Кинг // Международный журнал медицинской практики.— 1999.—Т.11,№3—С.34-36.

36.Клясова, Г.А. Практические рекомендации по антибактериальной терапии инфекций у пациентов с нейтропенией. (По материалам рекомендаций Американского общества инфекционных болезней) /Г.А. Клясова//Клиническая микробиолоигя и антимикробная химиотерапия. — 2003. — Т.5, №1.—С.47-73.

37.Козлов, М.Я. Острые отиты у детей и их осложнения/М.Я.Козлов.— JI. Медицина, 1986.—232 с.

38.Козлов, P.C. Пневмококки: прошлое, настоящее и будущее/ P.C. Козлов.- Смоленск: Смоленская государственная медицинская академия, 2005.—128с.

39.Козлов, Р. С. Современные возможности специфической профилактики пневмококковых инфекций /P.C. Козлов// Клиническая микробиология и антимикробная химиотерапия.— 2002.— Т.4,№ 1.— С. 61-69.

40.Красильников, И. А. Заболеваемость инфекциями дыхательных путей в Санкт-Петербурге и Северо-Западном округе./И.А. Красильников.-СПб.: ТИТ «Комета», 2000.— 120 с.

41. Лечение бактериальных пневмоний в дневных стационарах/ И.Ф. Литова, O.E. Попова, С.Л.Жаравина, C.B. Морозова, В.Л. Архиповский // Экология человека.— 2000.—№1.—С.13-14.

42.Лобзин, Ю.В. Руководство по инфекционным болезням/ Ю.В. Лобзин, А.П. Казанцев — СПб.: ТИТ «Комета», 1996.—720 с.

43.Лызлова, Л.В. Растворимый фибронектин: биологические функции и роль в системе «паразит-хозяин»/ Л.В. Лызлова, К.Б. Грабовская, A.A. Тотолян//Журн. Микробиол.—1990.—№9.—С. 112-120.

44.Маркова, А.И. Пневмококковый менингит/А.И. Маркова/Юстрые менингиты: сб. научн. трудов НИИЭМ им. Н.Ф. Гамалеи АМН СССР.

— М., 1982.—Т.150.—С.13-15.

45.Никонова, Е.В. Клинико-диагностические аспекты пневмоний/ Е.В. Никонова, А.Л. Черняев, А.Г. Чучалин// Пульмонология. — 1997.

— №1.—С.60-63

46.Новиков, Ю.К. Диагностика и лечение внебольничных пневмоний/ Ю.К. Ноников// Рус.мед.журн.: РМЖ,— 2001.—Т.З., №1.—С.11-16.

47.Ноников, В.Е. Тактика антибактериальной химиотерапии пневмоний/В,Е.Ноников//Рус.мед.журн.: РМЖ.. — 1997. — Т.5,№24. — С.1570-1578.

48.06 унификации микробиологических (бактериологических) методов

исследования, применяемых в клинико-диагностических лабораториях

154

лечебно- профилактических учреждений. Приказ МЗ СССР № 535 от 22 апреля 1985 г.

49.0бгольц, A.A. Механизмы персистирования бактерий/ А.А.Обгольц//Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммуннобиологии: ЖМЭИ— 1992.—№.4.—С.70-72.

50.Пилотное исследование длительной профилактики азитромицином острых бактериальных инфекций дыхательных путей у военнослужащих / А.И. Синопальников, Ю.А. Первов, М.Б. Богданов, A.JI. Раков // Клиническая микробиология и антимикробная химиотерапия.— 2000.—Т.2, №1.—С.31-37.

51 .Покровский В.И., Прозоровский C.B., Малеев В.В., Тартаковский И.С. Этиологическая диагностика и этиотропная терапия острых пневмоний/В.И.Покровский, С.В.Прозоровский, В.В. Малеев, И.С. Тартаковский. — М: Медицина, 1995.—140 с.

52.Покровский, В.И. Медицинская микробиология/В.И. Покровский, O.K. Поздеев. — М.: ГЭОТАР МЕДИЦИНА, 1999.—1200 е.: ил.

53.Правила и техника получения проб клинического материала для исследования в лаборатории клинической микробиологии: метод, указания.— М: Главное управление здравоохранения Администрации Московской области, 1997.—350 с.

54. Практические рекомендации по рациональной антибиотикотерапии в амбулаторной практике/С.В. Сидоренко, И.П. Фомина, B.C. Шухов и соавт.// Клин фармакол тер.— 1999.—Т. 9,№2.—С.10-11.

55.Равид, Сарит. Адгезивные молекулы и их роль в воспалительном процессе/ Сарит Равид, Алекс Эциони// Международный медицинский журнал.— 2000.—№1.—С.942-946.

56.Разработка программы эмпирической антибактериальной терапии внебольничной пневмонии /М.П. Суворова, C.B. Яковлев, Т.В. Шахова, Л.И. Дворецкий // Антибиотики и химиотерапия. —1998.—Т.43, №7.—С.31-35.

57.Ред.: Антибиотики в амбулаторной практике: некоторые проблемы / Редакционная статья// Клиническая фармакология и терапия.— 2000.—Т.9,№2.—С.3-5.

58.Ред.: Роль аминопенициллинов в лечении внебольничных инфекций /Редакционная статья// Клиническая фармакология и терапия.— 1999.—Т.8,№2.-С.8.

59.Ред: обзор: при диагностике внебольничных пневмоний точность результатов клинического обследования невелика/Редакционная статья: А.Г.Чучалин и др.// Пульмонология.— 1999.— №.1.—с. 43-47

60.Сидоренко C.B. Резистентность микроорганизмов и антибактериальная терапия / C.B. Сидоренко//Рус мед журн.: РМЖ.— 1999.—Т. 6, № 11.—С.717-725.

61.Сидоренко, C.B. Оценка антибиотикорезистентности микроорганизмов и ее клиническая интерпретация/ C.B. Сидоренко // Антибиотики. Современные принципы рациональной антибиотикотерапии: сб материалов науч-практич конф, 8-9 июня 1999 года.— Владивосток: ООО «ИРА Комсомолка ДВ»,1999.—С.47-48.

62.Сидоренко, C.B. Перспективы контроля распространения антибиотикорезистентности /C.B. Сидоренко // Антибиотики и химиотерапия.—1998.—Т.43, №7.—С.3-5.

63.Сидоренко, C.B. Фторхинолоны: спектр активности и клиническое

значение/ C.B. Сидоренко// Антибиотики. Современные принципы

рациональной антибиотикотерапии: сб материалов науч-практ конф,

156

8-9 июня 1999 года. — Владивосток: ООО «ИРА Комсомолка ДВ», 1999.—С.44-47.

64.Сидоренко,C.B. Происхождение, эволюция и клиническое значение антибиотикорезистентности/С.В. Сидоренко// Антибиотики и химиотерапия.— 1999.—Т.44,№12.—С. 19-21.

65.Синопальников, А.И. Внебольнично приобретенная пневмония: этиологический диагноз/ А.И. Синопальников, И.С. Тартаковский, М.Б. Миронов//Антибиотики и химиотерапия.— 1997.—Т.42, №10.— С.38-42.

66. Синопальников, А.И. Новые рекомендации по ведению взрослых пациентов с внебольничной пневмонией/ А.И. Синопальников, JI.C. Страчунский // Клиническая микробиология и антимикробная химиотерапия.— 2001.— Т.З, №1 .—С. 18-21.

67.Синопальников, А.И. Роль и место макролидов в лечении внебольничной пневмонии / А.И. Синопальников, О.В. Фесенко // Клиническая медицина .—1997, №6.—С. 12-19.

68.Синопальников, А. И. Макролиды: современная концепция применения/ А.И. Синопальников, И.А. Гучев // Рус. мед. журн.: РМЖ—2003.—№ 11.—С. 88—93.

69. Страчунский, JI.C., Козлов С.Н. Макролиды в современной клинической практике/JI.С. Страчунский, С.Н. Козлов.— Смоленск: Русич,1998.—302 с.

70.Страчунский, Л.С. Пенициллины/ Л.С. Страчунский // Антибиотики. Современные принципы рациональной антибиотикотерапии: сб материалов науч-практ конф, 8-9 июня 1999 года. — Владивосток: ООО «ИРА Комсомолка ДВ»,1999.—С.8-27.

71.Страчунский, Л.С. Проблемы и перспективы антибактериальной терапии/ Л.С. Страчунский //Антибиотики. Современные принципы рациональной антибиотикотерапии: сб материалов науч-практ конф, 8-9 июня 1999 года. - Владивосток: ООО «ИРА Комсомолка ДВ», 1999.—С.2-8.

72.Страчунский, Л.С. Проблемы и перспективы антибактериальной терапии/ Л.С. Страчунский// Российские медицинские вести.— 1998.—№.1.—С.23-39.

73.Страчунский, Л.С. Состояние антибиотикорезистентности в России/ Л.С. Страунский// Клиническая фармакология и терапия.— 2000.— Т. 9,№2.—С.6-9.

74.Страчунский, Л.С. Цефалоспорины/ Л.С. Страчунский // Антибиотики. Современные принципы рациональной антибиотикотерапии: сб материалов науч-практ конф, 8-9 июня 1999 года. — Владивосток: ООО «ИРА Комсомолка ДВ»,1999.—С.27-44.

75. Страчунский, Л.С. Эмпирическая антибактериальная терапия внебольничных пневмоний (обзор зарубежной литературы)/ Л.С. Страчунский // Терапевтический архив.— 2001.—№.3.—С.68-73.

76. Структура и чувствительность к антибиотикам возбудителей внебольничных инфекционных заболеваний бактериальной природы у детей/ Т.А. Самсыгина, Т.А. Дудина, М.А. Корнюшин, и др. // Антибиотики и химиотерапия.— 2000.—Т. 45.-—№3.—С.15-19.

77.Туркутюков, В.Б. Антибиотики. Роль микробиологических

исследований в рационализации антимикробной химиотерапии/

В.Б. Туркутюков// Современные принципы рациональной

антибиотикотерапии. Антибиотики. Современные принципы

рациональной антибиотикотерапии: сб материалов науч-практ конф,

158

8-9 июня 1999 года. — Владивосток: ООО «ИРА Комсомолка ДВ», 1999.—С.65-78.

78.Христолюбова, E.H. Анализ пневмоний больных, умерших на дому/ E.H. Христолюбова, Л.И. Волкова// Клиническая медицина.— 2001.— Т. 79,№7.—С.46-49.

79.Цыганкова, О.И. Бактериальные гемолизины и их связь с вирулентностью/ О.И. Цыганкова. — Ставрополь: Медицина, 1998.— 50 с.

80. Черненькая, Т.В. Современные проблемы и задачи микробиологической лаборатории многопрофильной больницы/ Т.В. Черненькая, М.Б. Богданов// Клиническая лабораторная диагностика .—2000.—№2.—С.33-36.

81.Шагинян, И.А. Генетические маркеры в эпидемиологии бактериальных инфекций/ И.А. Шагинян, М.Ю.Першина// Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии.—1997.—№4.—С.54-59.

82.Шагинян, И.А. Геномный полиморфизм возбудителей бактериальных инфекций/ И.А. Шагинян, А.Л. Гинцбург// Молекулярная генетика.— 1991.—№12.—С.3-9.

83.Щерба, Ю.В. Инфекционные и неинфекционные поражения системы органов дыхания при употреблении наркотических средств и психотропных веществ/Ю.В. Щерба //Журн. инфекц. патологии. — 2004.— Т.З, №4. — С. 117-121.

84.Щерба, Ю.В.Пневмония как осложнение гриппа в периоды сезонных подъемов 2000-2001 гг/Ю.В. Щерба, Л.В. Волощук, И.В. Гончарова. — Проблема инфекции в клинической медицине: науч конф и VIII съезд Итало-Российского общества по инфекционным болезням, 5-6 декабря 2002 г., Санкт-Петербург. — СПб., 2002. — С. 424-425.

85.Юшон, Жерар. Внебольничные пневмонии/ Жерар Юшон// Пульмонология. — 1997. — №1.—С.56-60.

86.Яковлев, А.А. Теоретические и прикладные аспекты морской эпидемиологии: автореф.дис....докт.мед.наук/ Яковлев Анатолий Александрович. —Владивосток, 1996.—24 с.

87.Яковлев, С. В. Антибактериальная терапия тяжелой пневмонии/С.В. Яковлев// Антибиотики и химиотерапия.— 2000.— Т.45, №6—С.40-43.

88.Яковлев, С. В. Клиническая химиотерапия бактериальных инфекций/С.В. Яковлев. — М.:Медицина,1996. — 119 с.

89.Яковлев, С.В. Микробиологические и фармакологические факторы, определяющие клинический эффект антибиотикотерапии/ С.В. Яковлев // Антибиотики и химиотерапия.— 1999.—Т.44, №5.—С.3-5.

90.Яковлев, С.В. Клиническая фармакология цефалоспоринов 4 поколения/ С.В. Яковлев// Рус.мед.журн.:РМЖ.— 1999.—Т.6., №22— С.1449-1456.

91. Adam HJ, Hoban DJ. Association between fluoroquinolone usage and a dramatic rise in ciprofloxacin-resistant Streptococcus pneumoniae in Canada, 1997-2006./ HJ Adam, DJ Hobau//Int J Antimicrob Agents. — 2009, Jul. — Vol.34, Suppl .l-P.82-85.

92.Augustovski FA, Garcia Marti S. Childhood pneumococcal disease burden in Argentina. / FA,Augustovski, S Garcia Marti //Rev Panam Salud Publica. — 2009., Vol.25.-P.423-430.

93.Barichello T, Silva GZ, Batista AL. Early antibiotic administration prevents cognitive impairment induced by meningitis in rats. /Т. Barichello, GZ Silva, AL Batista //Neurosci Lett.- 2009, Vol.465-P.71-73.

94.Borgmann S, Jakobiak T.Prescriptions of broad-spectrum antibiotics to outpatients do not match increased prevalence and antibiotic resistance of respiratory pathogens in Bavaria. /S.Borgmann, TJakobiak // Pol J Microbiol.- 2009,Vol.58-P. 105-110.

95.Campos LC, Carvalho Mda G. Prevalence of Streptococcus pneumoniae serotype 6C among invasive and carriage isolates in metropolitan Salvador, Brazil, from 1996 to 2007. / LC Campos, M da Carvalho/ZDiagn Microbiol Infect Dis. -2009, Vol.65-P.112-115.

96.Complete genome sequence of a virulent isolate of Streptococcus pneumoniae/ H.Tettelin, K.E.Nelson, I.T. Paulsen et al.//Science.—2001/—■ Vol,293.—P.498-506.

97. Confirmation of Nontypeable Streptococcus pneumoniae-VikQ Organisms Isolated from Outbreaks of Epidemic Conjunctivitis as Streptococcus pneumoniae. /Maria Gloria S. Carvalho, Arnold G. Steigerwalt et al.//J. Clin. Microbiol. —2003.—Vol.41.—P.4415-4417.

98.Cordonnier C, Labopin M, Chesnel V; Infectious Diseases Working Party of the European Group for Blood and Marrow Transplantation.Randomized study of early versus late immunization with pneumococcal conjugate vaccine after allogeneic stem cell transplantation. / C, Cordonnier, M, Labopin, V.Chesnel //Clin Infect Dis.- 2009, Vol.48-P.1392-1401.

99.Dagan R. Pneumococcal conjugate vaccines probe studies: the solution points to the problem. / R.Dagan//Adv Exp Med Biol.- 2009, Vol.634-P.69-77.

100. De la Pedrosa EG, Baquero F. High clonal diversity in erythromycin-resistant Streptococcus pneumoniae invasive isolates in Madrid, Spain (2000-07). / EG, de la Pedrosa, F.Baquero //J Antimicrob Chemother.-2009,Vol.64-P.l 165-1169.

101. Domingo P, Suarez-Lozano I, Torres F; VACH Cohort Study Group.Bacterial meningitis in HIV-1-infected patients in the era of highly active antiretroviral therapy/ P.Domingo, I. Suarez-Lozano,F.Torres//. J Acquir Immune Defic Syndr.- 2009, Vol.5l-P.582-587.

102. Dortet L, Ploy MC; ORP lie de France Ouest.Emergence of Streptococcus pneumoniae of serotype 19A in France: molecular capsular serotyping, antimicrobial susceptibilities, and epidemiology. / L,Doret, MC Ploy //Diagn Microbiol Infect Dis.- 2009, Vol.65-P.49-57.

103. Du Plessis, M. Rapid detection of penicicllin resistant Streptococcus pneumoniae in cerebrospinal fluidit with the seminested-PCR strategy. /M. Du Plessis, A.M. Smith, K.J. Klugman // J.Clin. Microbiol.—1998.— Vol.46.—P.453-456.

104. Dunbar, John. Phylogenetic Specificity and Reproducibility and New Method for Analysis of Terminal Restriction Fragment Profiles of 16S rRNA Genes from Bacterial Communities/John Dunbahr, Lawrence O. Ticknor//Appl. Envir. Microbiol.—Jan 2001,—Vol.67.—P. 190 - 197.

105. El Sayed Zaki M, Raafat D.Study of human metapneumovirus-associated lower respiratory tract infections in Egyptian adults. / M Zaki, El Said, D.Raafat//Microbiol Immunol.- 2009,Vol.53.-P.603-608.

106. Enright, M.C.A multilocus sequence typing scheme for Streptococcus pneumoniae identification of clones association with serious invasive disease/M.C.Enright, B.G. Spratt// Microbiology. —1998.—Vol.144.— P.5049-5060.

107. Epidemiology of invasive Streptococcus pneumoniae infections in Metropolitan Santiago, Chile, a newly industrializing country/M.M. Levine, R.Lagos, O.S. Levine et al. //Pediatr.Infect.Dis.J—1998.—Vol.17.—P.287-293.

108. Ergin A, Eser OK, Sener B, Has9elik G.Value of demonstration of pneumococcal surface antigen A and autolysin genes for the identification of Streptococcus pneumoniae clinical isolates. / A/Ergin, OK Eser, B.Sener, G.Hascelik//Mikrobiyol Bui.- 2009, Vol.43-P.ll-17.

109. Ferré P, Daoud P, Zemouri N. Emergence of invasive nonvaccine pneumococcal serotypes: 2 cases involving 19A and 10A serotypes . / P. Ferre, P. Daoud, N, Zemouri//Ar]ch Pediatr.- 2009, Vol.16- P.1350-1352.

110. Ganeshram P, Goundan PN, Jeyachandran V, Arthur P.Five factors contributing to severe rhabdomyolysis in a 21 yr old IV drug abuser: a case report./ P.Gabeshram, PN Goundan, V. Jeyachabdrab//Cases J.- 2009, Vol. 7.-P.6479.

111. Greenberg D.The shifting dynamics of pneumococcal invasive disease after the introduction of the pneumococcal 7-valent conjugated vaccine: toward the new pneumococcal conjugated vaccines./D.Greenberg // Clin Infect Dis.- 2009, Vol.49.-P.213-215.

112. Grijalva CG.Recognising pneumonia burden through prevention./ CG GrijalvaWVaccine.- 2009, Vol.27, Suppl .3-P.6-8.

113. Ho PL, Cheng VC, Chow KHDecreasing prevalence of levofloxacin-resistant Streptococcus pneumoniae in Hong Kong, 2001 to 2007. ./ PL Ho, VC Cheng, KH ChowWJ Antimicrob Chemother.- 2009, Vol.63-P.836-838.

114. Horizontal gene transfere and the evolution of resistant and virulence determinants in Streptococcus/C.G. Dowson, V. Barcus, S. King, P. Cockerill etal. //J.Appl. Bacteriol. Symp. Ser—1997.—Vol. 26.—P.42-51.

115. Horstetter, M.K. Serotypic variations among pneumococci in deposition and degradation of covalently bound C3: implications for phagocytosis and antibody production/ M.K. Horstetter//J.Infect. Dis.— 1986.—Vol. 153.—P.682-693.

116. Huang SH, Jong A. Evolving role of laminin receptors in microbial pathogenesis and therapeutics of CNS infection./ SH Huang, A JongWFuture Microbiol.- 2009, Vol.4.-P.959-962.

117. Ianelli, F.Allelic variation in the highly polymorphic locus pspC of Streptococcus pneumoniae! F. Ianelli, M.R. Oggioni, G. Pozzi // Gene.— 2002.— Vol.284.—P.63-71.

118. Identification of an efflux pump gene, pmrA, associated with fluoroquinolone resistance in Streptococcus pneumoniae/MJ.Gill, N.P. Brenwaald. R. Wise et al. //Antimicrob.Agents Chemother.—1999.— Vol,43.—P.187-189.

119. Identification of multiply clones of extended-spectrum cephalosporin-resistant Streptococcus pneumoniae isolates in the United States/ L.K.Mc Dougal, J.K.Rasheed, J.W. Biddle et al. //Antimicrob. Agents Chemother.— 1995.—Vol.39.—P.2282-2288.

120. Imöhl M, Reinert RR, van der Linden M. Adult invasive pneumococcal disease between 2003 and 2006 in North-Rhine Westphalia, Germany: serotype distribution before recommendation for general pneumococcal conjugate vaccination for children <2 years of age./ M. Imohl, RR Reinert, M. van der Linden//Clin Microbiol Infect.- 2009, Vol.l5.-P.1008-1012.

121. Influence of Patient Age on Streptococcus pneumoniae Serotypes Causing Invasive Disease./ Jaime Inostroza, Ana Maria Vinet, Gloria Retamal et al. // Clin. Diagn. Lab. Immunol. —2001.—Vol. 8.—P. 556559.

122. Intercontinental spread of a multiresistant clone of serotype 23F Streptococcus pneumoniaefR.Munoz, T.J.Coeffy, M. Daniels et al.//J.Infect.Dis.—1997.—Vol.175.—P.839-846.

123. Invasive pneumococcal infections: a clinical and microbiological analysis of 53 patients in Taiwan/C-Y.Lee, C-H.Chiu, Y-C. Huang et al. //Clinical Microbiology and Infection — 2003.— Vol.9, Issue 7.— P.614-618.

124. Jain M, Thomson AH.Palivizumab, pneumococcal and influenza vaccination in cystic fibrosis./ M. Jain, AH Thomson//J R Soc Med.- 2009, Vol.102, Suppl l-P.:23-28.

125. Khan A, Coughtrey H, Leroi MJ.Streptococcus pneumoniae: uncommon cause of fatal neonatal sepsis./ A. Khan, H. Coughtrey, MJ Leroi//J Paediatr Child Health.- 2009,Vol.45-P.686-687.

126. Kimura M.The 23-valent pneumococcal polysaccharide vaccination in patients with severe motor and intellectual disabilities/ M. Kimura//]No To Hattatsu.- 2009, Vol.41-P.229-230.

127. Kitaoka K, Takasaki K, Kumagami H.Oxygen consumption by bacteria: a possible cause of negative middle ear pressure in ears with otitis media./ K. Kitaoka, K. Takasaki, H. Kungami//Acta Otolaryngol Suppl. 2009, Vol.562.-P.63-66.

128. Knoll MD, Mo'isi JC, Muhib FB; PneumoADIP-Sponsored Surveillance Investigators. Standardizing surveillance of pneumococcal disease./ MD Knoll, JC Moisi, FB Muhib//Clin Infect Dis.- 2009, Vol.48-P.37-48.

129. Kontou P, Kuti JL, Nicolau DP.Validation of the Infectious Diseases Society of America/American Thoracic Society criteria to predict severe community-acquired pneumonia caused by Streptococcus pneumoniae./ P.Kontou, JL Kuti, DP Nicolau//Am J Emerg Med.- 2009, Vol.27-P.968-974.

130. Kubak BM, Gregson AL.Use of hearts transplanted from donors with severe sepsis and infectious deaths./ BM Kubak, AL Gregson//J Heart Lung Transplant.- 2009, Vol.28-P.260-265.

131. Leibovitz E.Complicated otitis media and its implications./ E.Leibovitz//Vaccine.- 2008, Vol.26, Suppl 7.-P.16-19.

132. Lemoyne S, Van Leemput J, Smet D.Pelvic inflammatory disease due to Streptococcus pneumoniae: a usual pathogen at an unusual place./ S. Lemonyne, J Van Leemput, D Smet//Acta Clin Belg.- 2008, Vol.63-P.398-401.

133. Levison ME, Levison JH.Pharmacokinetics and pharmacodynamics of antibacterial agents./ ME Levison, JH Levison/Anfect Dis Clin North Am.-2009, Vol.23-P.791-815.

134. Lynch JP 3rd, Zhanel GG.Streptococcus pneumoniae: epidemiology, risk factors, and strategies for prevention. Semin Respir Crit Care Med. 2009 Apr;30(2): 189-209.

135. Madsen RG, Ladefoged K, Clemmesen C.Endocarditis in Greenland with special reference to endocarditis caused by Streptococcus pneumoniae.! RG Madsen, K. Ladefoged//Int J Circumpolar Health.- 2009, Vol.68-P.347-353.

136. Marimon JM, Ercibengoa M, Alonso M.Clonal structure and 21-year evolution of Streptococcus pneumoniae serotype 1 isolates in northern Spain./ JM marimon, M. Alonso//Clin Microbiol Infect.-2009, Vol. 15-P. 875-877.

137. Meerveld-Eggink A, van der Velden AM.Antibody response to polysaccharide conjugate vaccines after nonmyeloablative allogeneic stem cell transplantation./A, Meerveld-Eggink, AM, van der Velden //Biol Blood Marrow Transplant.- 2009, Vol. 15.-P. 1523-1530.

138. Moscoso M, Garcia E, Lopez R. Pneumococcal biofilms./M. Morosco, E.Garcia, R.Lopez //Int Microbiol.- 2009, Vol.l2.-P.77-85.

139. Mureithi MW, Finn A, Ota MO.T cell memory response to pneumococcal protein antigens in an area of high pneumococcal carriage and disease./MW, Mureithi, A Finn, MO Ota //J Infect Dis.- 2009, Vol.200.-P.783-793.

140. Nakae H, Shimazu T, Miyauchi H.Does splenic preservation treatment (embolization, splenorrhaphy, and partial splenectomy) improve immunologic function and long-term prognosis after splenic injury?/ H Nakae, T Shimazu, H Miyauchi //J Trauma.- 2009, Vol.67-P.557-563

141. Nakamura T, Shimizu C, Hirakawa K, Inui S.Antibacterial activity of quinolones against various clinically isolated strains and evaluation of efficacy based on the pharmacokinetics/pharmacodynamics theory]/ //Jpn J Antibiot.- 2009, Vol.62.-P. 194-202.

142. Ndiaye AG, Boye CS, Hounkponou E.Antimicrobial susceptibility of select respiratory tract pathogens in Dakar, Senegal. /AG Ndiaye, CS Boye, E. Houkponou//J Infect Dev Ctries.- 2009, Vol.22.-P.660-666.

143. Niki Y, Kohno S, Watanabe A, Aoki N. Analysis on the sensitivity to beta-lactam antibiotics of respiratory-infectious isolates on the second survey on the sensitivity of isolates conducted by the japanese society of chemotherapy in 2007—concerning the aspect of PK/PD break points]/ Y Niki, S Kohno, A Watanabe, N Aoki //Jpn J Antibiot.- 2009, Vol. 62-P.203-213.

144. O'Brien KL, Wolfson LJ, Watt JP; Hib and Pneumococcal Global Burden of Disease Study Team. Burden of disease caused by Streptococcus pneumoniae in children younger than 5 years: global estimates./KL O Rtien, LJ Wolfson, JP Watt//Lancet.- 2009, Vol.374.- P.893-902. Review.

145. Patel SN, Pillai DR, Pong-Porter S.In vitro activity of ceftaroline, ceftobiprole and cethromycin against clinical isolates of Streptococcus pneumoniae collected from across Canada between 2003 and 2008./SN patel, DR Pillai, S Pong-Porter//J Antimicrob Chemother.-2009, Vol.64.-P.659-660.

146. Picazo JJ.Management of antibiotic-resistant Streptococcus pneumoniae infections and the use of pneumococcal conjugate vaccines./ J J Picazo //Clin Microbiol Infect.- 2009, Vol.15, Suppl 3.-P.4-6. Review.

147. Pollard AJ, Perrett KP, Beverley PC.Maintaining protection against invasive bacteria with protein-polysaccharide conjugate vaccines./ AJ Pollard, KP Perett, PC Beverley //Nat Rev Immunol.- 2009, Vol.9.-P.213-220.

148. Proksch JW, Granvil CP, Siou-Mermet R.Ocular pharmacokinetics of besifloxacin following topical administration to rabbits, monkeys, and humans./JW Proksch, CP Granvil, R Sion Mermet //J Ocul Pharmacol Ther.-2009,Vol.25.-P.335-44.

149. Prymula R, Schuerman L.lO-valent pneumococcal nontypeable Haemophilus influenzae PD conjugate vaccine: Synflorix.Expert Rev /R.Prymula, L. Schuerman //Vaccines.- 2009, V0I.8.-P. 1479-1500.

150. Ramakrishnan M, Ulland AJ. Sequelae due to bacterial meningitis among African children: a systematic literature review./M. Ramakrishnan, AJ Ulland//BMC Med. -2009, Vol.l4;7-P.47.

151. Rhomberg PR, Jones RN.Summary trends for the Meropenem Yearly Susceptibility Test Information Collection Program: a 10-year experience in the United States (1999-2008)./PR Rhomberg, RN Jones //Diagn Microbiol Infect Dis.- 2009, Vol.65-P.414-426.

152. Rodrigues F, Nunes S, Sá-Leao R.Streptococcus pneumoniae nasopharyngeal carriage in children attending day-care centers in the central region of Portugal, in the era of 7-valent pneumococcal conjugate vaccine./F.Rodrigues, S Nunes, R Sao-Leao //Microb Drug Resist.- 2009, Vol.15.- P.269-277.

153. Rudan I, Campbell H. The deadly toll of S pneumoniae and H influenzae type b./I. Rudan, H. Campbell //Lancet.- 2009, Vol.l2-P.854-856.

154. Samson SI, Mégard Y.Overview of vaccination policies for the elderly in Western European countries./SI, Samson, Y Megard //Aging Clin Exp Res.- 2009, Vol.21- P.210-215.

155. Schubert-Unkmeir A, Slanina H, Frosch M.Mammalian cell transcriptome in response to meningitis-causing pathogens./A. Schubert-Unkmeir, H Slanina, M. Frosh //Expert Rev Mol Diagn.- 2009, Vol.9.-P.833-842.

156. Siira L, Rantala M, Jalava J, Hakanen AJ.Temporal trends of antimicrobial resistance and clonality of invasive Streptococcus pneumoniae isolates in Finland, 2002 to 2006. /L.Siira, M.Rantala, AJ Hakanen //Antimicrob Agents Chemother.- 2009, Vol.53.- P.2066-2073.

157. Snedecor SJ, Strutton DR, Ciuryla V.Transmission-dynamic model to capture the indirect effects of infant vaccination with Prevnar (7-valent pneumococcal conjugate vaccine (PCV7)) in older populations./ SJ Snedecor, DR Strutton, V Ciuryla//Vaccine.- 2009, Vol.23.-P.4694-4703.

158. Sullivan DC, Flowers H, Nanayakkara NP.Antibacterial activity of synthetic fire ant venom: the solenopsins and isosolenopsins./DC Sullivan, H.Flowers, NP Nanayakkara //Am J Med Sei.- 2009,Vol.338.- P.287-291.

159. Takahashi T, Morozumi M, Chiba N.Co-infection with respiratory syncytial virus subgroup a and Streptococcus pneumoniae detected by a comprehensive real-time polymerase chain reaction assay in an elderly patient with community-acquired pneumonia./T. Takahashi, M. Moruzumi, N Chiba //J Am Geriatr Soc.- 2009, Vol.57-P.1711-1713.

160. Traore Y, Tameklo TA, Njanpop-Lafourcade BM. Incidence, seasonality, age distribution, and mortality of pneumococcal meningitis in Burkina Faso and Togo./Y Traore, TA Tameklo, BM Njanpop-Lafourcade //Clin Infect Dis.- 2009, Vol.48, Suppl 2-P.181-189.

161. Utine GE, Oz?elik U, Kiper N, Dogru D,.Pediatric pleural effusions: etiological evaluation in 492 patients over 29 years./GE Utine, U Oz9elik, N. Kiper, D Dogru //Turk J Pediatr.- 2009, Vol.51-P.214-219.

162. Vainio A, Lyytikäinen O, Sihvonen R,.An outbreak of pneumonia associated with S. pneumoniae at a military training facility in Finland in 2006./A Vainio, O Lyytikäinen, R Sihvonen//APMIS.- 2009, Vol. 117-P.488-491.

163. van der Poll T, Opal SM.Pathogenesis, treatment, and prevention of pneumococcal pneumonia./T van der Poll, SM Opal //Lancet.- 2009, Vol.31-P. 1543-56.

164. Venuta A, Bertolani P.Streptococcus Pneumoniae infection and hemolytic uremic syndrome./A Venuta, P. Bertolani // Nefrologia.- 2009, Vol.29.- P.496-497.

165. Weng L, Biswas I, Morrison DA.A self-deleting Cre-lox-ermAM cassette, Cheshire, for marker-less gene deletion in Streptococcus pneumoniae./L Weng, I Biswas, DA Morrison //J Microbiol Methods.- 2009, Vol.79.- P.353-357.

166. Zartler ER, Porambo RJ,.Identification of 3-O-acetylglycerol, a novel structural element in bacterial polysaccharides./ER Zartlett, RJ Porambo //Carbohydr Res.- 2009, Vol.14- P.2586-2590.

167. Zegans ME, Sanchez PA, Likosky DS,.Clinical features, outcomes, and costs of a conjunctivitis outbreak caused by the ST448 strain of Streptococcus pneumoniae./ ME Zegans, PA Sanchez, DS Likosky//Cornea.- 2009, Vol.28.-P.503-509.

168. Zhang J, Xu JF, Liu YB.Population pharmacokinetics of oral levofloxacin 500 mg once-daily dosage in community-acquired lower respiratory tract infections: results of a prospective multicenter study in China./J Zhang, JF Xu, YB Liu//J Infect Chemother.- 2009, Vol. 15.-P.293-300.