Клинико-эпидемиологические проявления парвовирусной инфекции и состояние гуморального иммунитета среди различных групп населения тема диссертации и автореферата по ВАК РФ 14.02.02, кандидат наук Никишов Олег Николаевич
- Специальность ВАК РФ14.02.02
- Количество страниц 162
Оглавление диссертации кандидат наук Никишов Олег Николаевич
ВВЕДЕНИЕ
Глава 1. СОВРЕМЕННЫЕ ПРЕДСТАВЛЕНИЯ ОБ ЭТИОЛОГИИ И ЭПИДЕМИОЛОГИИ ПАРВОВИРУСНОЙ ИНФЕКЦИИ (обзор литературы)
1.1. Этиология и патогенез парвовирусной инфекции
1.2. Клинико-эпидемиологическая характеристика парвовирусной инфекции
1.3. Механизм развития эпидемического процесса и структура нозологических форм парвовирусной инфекции
1.4. Группы риска среди людей по возникновению парвовирусной инфекции
1.5. Методы диагностики парвовирусной инфекции
1.6. Возможности эпидемиологического мониторинга и профилактики парвовирусной инфекции
ГЛАВА 2. МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ ИССЛЕДОВАНИЯ
2.1. Материалы исследования
2.2. Методы исследования
ГЛАВА 3. КЛИНИКО-ЭПИДЕМИОЛОГИЧЕСКИЕ ПРОЯВЛЕНИЯ ПАРВОВИРУСНОЙ ИНФЕКЦИИ
3.1. Особенности заболеваемости инфекциями с экзантемными проявлениями лиц из организованных коллективов и пациентов инфекционного стационара
3.2. Показатели распространенности маркеров специфического гуморального иммунитета у пациентов с экзантемными проявлениями инфекционного процесса
3.3. Характеристика и структура клинико-лабораторных проявлений при парвовирусной инфекции
ГЛАВА 4. ОПРЕДЕЛЕНИЕ ЛАБОРАТОРНЫХ МАРКЕРОВ 85 ПАРВОВИРУСНОЙ ИНФЕКЦИИ В РАЗНЫХ ГРУППАХ НАСЕЛЕНИЯ
4.1. Показатели гуморального иммунитета против парвовирусной инфекции
4.1.1. Организованные коллективы
4.1.2. Женщины репродуктивного возраста
4.2. Выявление лабораторных маркеров парвовирусной инфекции у доноров крови
4.2.1. Показатели гуморального иммунитета и частота детекции ДНК парвовируса В19 у серопозитивных доноров
4.2.2. Определение вирусной нагрузки в ДНК-положительных образцах плазмы
4.2.3. Молекулярно-генетическая характеристика изолятов парвовируса В19, выделенных из плазмы доноров
ГЛАВА 5. ОРГАНИЗАЦИЯ И ПРОВЕДЕНИЕ ЭПИДЕМИОЛОГИЧЕСКОГО МОНИТОРИНГА ЗА ПАРВОВИРУСНОЙ ИНФЕКЦИЕЙ
5.1. Разработка рабочего определения вероятного (подозрительного) случая парвовирусной инфекции
5.2. Организация и проведение эпидемиологического мониторинга
5.3. Алгоритмы клинико-лабораторного обследования на парвовирусную инфекцию
5.4. Обоснование приоритетных направлений профилактики парвовирусной инфекции
ЗАКЛЮЧЕНИЕ
ВЫВОДЫ
ПРАКТИЧЕСКИЕ РЕКОМЕНДАЦИИ
ПЕРСПЕКТИВЫ ДАЛЬНЕЙШЕЙ РАЗРАБОТКИ ТЕМЫ ИССЛЕДОВАНИЯ
СПИСОК СОКРАЩЕНИЙ И УСЛОВНЫХ ОБОЗНАЧЕНИЙ
СПИСОК ЛИТЕРАТУРЫ
ПРИЛОЖЕНИЯ
ВВЕДЕНИЕ
Рекомендованный список диссертаций по специальности «Эпидемиология», 14.02.02 шифр ВАК
Лабораторные маркеры парвовирусной инфекции и молекулярно-генетическая характеристика изолятов парвовируса В19 в отдельных географических регионах2021 год, кандидат наук Хамитова Ирина Викторовна
Значение лабораторной диагностики краснушной и парвовирусной инфекций в период элиминации краснухи2013 год, кандидат биологических наук Антипова, Анастасия Юрьевна
Биохимические и молекулярно-генетические исследования парвовируса В19 при оценке безопасности препаратов альбумина и иммуноглобулина2013 год, кандидат биологических наук Филатова, Екатерина Викторовна
Эпидемиологический мониторинг сезонных воздушно-капельных инфекций в организованных воинских коллективах2023 год, кандидат наук Артебякин Сергей Владимирович
Значение индикации ДНК парвовируса В19 в обеспечении инфекционной безопасности плазмы для фракционирования2015 год, кандидат наук Попцов, Александр Леонидович
Введение диссертации (часть автореферата) на тему «Клинико-эпидемиологические проявления парвовирусной инфекции и состояние гуморального иммунитета среди различных групп населения»
Актуальность темы исследования
Парвовирусная инфекция (ПВИ) представляет собой одну из относительно новых проблем, которая входит в приоритетную область научных исследований вирусологии и инфектологии [Anderson L. et. al, 1986, Blumel J. et al., 2005]. Кроме детей разных возрастов, она может быть актуальна и для других социально значимых контингентов населения, прежде всего, здоровых лиц из числа доноров крови и женщин, планирующих беременность [Gustafsson I. et. al., 2010, Лаврентьева И.Н. и соавт., 2013, Климович Н.В., 2017]. Но ее распространенность на популяционном уровне среди разных групп людей изучена недостаточно. Кроме этого, в эпидемических в чагах кори, краснухи, «детских» и других вирусных инфекций требуется проведение дифференциальной диагностики. Показано, что возбудитель этого инфекционного заболевания обладает тератогенным действием и способен быстро распространяться среди людей, что определяет его эпидемиологическую значимость [Смеликов Я.А., 2011].
Важным параметром, характеризующим иммунорезистентность к ПВИ, является состояние специфического гуморального иммунитета [Васильев В.В. и соавт., 2011, Лаврентьева И.Н. с соавт., 2015, Ермолович М.А. и соавт., 2016]. Однако, как показывают данные литературы, распространенность ее лабораторных маркеров среди социально значимых контингентов людей практически не исследовалась. В целом, описание клинико-эпидемиологических проявлений ПВИ в доступных источниках представлено разрозненно, а отсутствие официального учета случаев заболевания не позволяет в полной мере оценить масштаб ее распространенности.
Необходимо отметить, что особую актуальность ПВИ представляет для беременных женщин и пациентов гематологического профиля, вследствие тератогенного действия и негативного влияния на кроветворение [Жданов В.М. и соавт., 1982, Лаврентьева И.Н. и соавт., 2013, Попцов А.Л. и соавт., 2014].
Решающее значение в раннем активном выявлении случаев заболевания имеют лабораторные исследования, позволяющие выявить специфические маркеры этой инфекции среди разных групп населения [Белан Ю.Б. с соавт., 2014, Лаврентьева И.Н. с соавт., 2016].
Таким образом, требуется проведение комплексного научно-практического исследования, направленного на изучение заболеваемости, и показателей специфического противовирусного гуморального иммунитета в сопоставлении с клинико-эпидемиологическими проявлениями ПВИ среди разных групп населения, объединенных определенными социальными условиями, способными обеспечить реализацию передачи возбудителя.
Степень разработанности темы исследования
Исследования, проведенные в нашей стране [Тихонова Н.Т., 2004., Антипова А.Ю., 2011, Медведева В.В., 2013] и за рубежом [Enders M., 2007, Nicolay N., 2009] свидетельствуют о том, что у 70-80 % взрослых людей имеются специфические IgG-антитела к парвовирусу В19 (PV В19) в сыворотке крови, что свидетельствует о перенесенной ПВИ. В то же время, исследования, выполненные в Европе, показывают, что от 15 % до 45 % женщин детородного возраста не имеют специфического приобретенного иммунитета [De Jong E.P., 2006, 2011, Lassen J., 2012, Watt A.P., 2013]. По результатам немногочисленных исследований, проведенных в нашей стране, от 33 % до 56 % обследованных женщин были восприимчивы к парвовирусу В19. При этом наибольшая доля неиммунных женщин находятся в возрастной группе 18-25 лет [Васильев В.В.,2011, Лаврентьева И.Н., 2013]. Заболевание актуально для такого социально значимого контингента людей, как доноры крови и ее компонентов. По данным отдельных научных исследований отечественных исследователей [Филатова Е.В., 2010, Элижбаева М.А., 2011, Попцов А.Л., 2015] и зарубежных авторов [Candotti D., 2004, Kleinman S. H., 2009, Ke L., 2011, Marano G., 2014] от 0,5 % до 2,0 % обследованных доноров имели в крови парвовирус В19 с концентрацией, потенциально опасной для инфицирования реципиентов при
трансфузии крови и её компонентов. Показано, что при вирусной нагрузке равной или превышающей 105 копий ДНК PV В19/мл 50 % реципиентов могут инфицироваться парвовирусом В19 [Bailey J.M., 2006, Попцов А.Л., 2015].
Сходство клинических проявлений различных инфекций (ветряная оспа, краснуха и другие) и неинфекционных заболеваний (токсикодермия, аллергические реакции) требует проведения исследований по установлению возможной роли парвовируса В19 как этиологического агента заболевания, протекающего с экзантемой [Антипова А.Ю., 2011, Pedranti M.S, 2012, Ермолович М.А., 2016, Климович Н.В., 2017]. Необходимо отметить, что данные об изучении распространенности маркеров специфического гуморального иммунитета на популяционном уровне в научной литературе отсутствуют, что затрудняет полноценную и качественную оценку эпидемиологических проявлений, прежде всего, среди социально значимых контингентов людей.
Цель исследования: выявить особенности клинико-эпидемиологических проявлений парвовирусной инфекции с оценкой распространенности ее лабораторных маркеров среди социально значимых групп населения.
Задачи исследования:
1. Изучить заболеваемость при экзантемных проявлениях инфекционного процесса в организованных коллективах лиц, обучающихся в военной образовательной организации.
2. Выявить лабораторные маркеры и ведущие неспецифические клинико-лабораторные признаки парвовирусной инфекции у пациентов инфекционного стационара при наличии синдрома экзантемы.
3. Оценить распространенность лабораторных маркеров парвовирусной инфекции среди социально значимых групп населения (организованные коллективы, доноры крови, беременные женщины).
4. Определить вирусную нагрузку парвовируса В19 в ДНК-положительных образцах в плазме крови доноров.
5. Охарактеризовать геноварианты парвовируса В19, циркулирующие в
организованных коллективах, среди доноров крови.
6. Разработать рабочее определение вероятного (подозрительного) случая парвовирусной инфекции.
7. Обосновать направления совершенствования эпидемиологического мониторинга за парвовирусной приоритетные направления ее профилактики.
Научная новизна исследования
Научно обосновано выделение социально значимых групп населения по эпидемиологической значимости парвовирусной инфекции, в которые, кроме детей, входят лица из организованных коллективов, доноры крови и ее компонентов, беременные женщины и пациенты инфекционного профиля с наличием экзантемы.
Доказано, что для организованных коллективов военнослужащих-курсантов характерно распространение сезонной экзантемной заболеваемости, в структуре которой весомую долю имеют инфекционные заболевания (преимущественно с вирусным поражением кожи и слизистых оболочек) и болезни органов дыхания по типу острых респираторных инфекций (с атипичным течением). При этом значительную часть среди них составляет манифестная форма ПВИ, что подтверждается обнаружением у таких пациентов ее лабораторных маркеров.
Установлено, что диагностика манифестной формы ПВИ базируется на активном выявлении полиморфного синдрома экзантемы, сопровождающегося выраженностью ведущих неспецифических клинических проявлений (синдром общеинфекционной интоксикации, лихорадка) и лабораторными сдвигами (лейкопения, лимфоцитоз, ферментемия), но с обязательной этиологической верификацией диагноза. Бессимптомная форма заболевания обнаруживается только при лабораторном скрининге в наиболее значимых социальных группах (доноры, беременные женщины), а также в организованных коллективах лиц, которые являются потенциальными донорами.
Выявлена неоднородность распространения маркеров специфического противовирусного иммунитета, представленная зависимостью частоты их выявления от гендерных показателей, группы крови, принадлежности людей к определенным социальным контингентам населения, что позволяет определить конкретные группы риска по возникновению ПВИ.
Выделены два изолята парвовируса В19 (MG779500 RUS15.15 и MG779501 RUS15.15.2), депонированные в международной базе данных Genbank. Секвенированные нуклеотидные последовательности изолятов отнесены к генотипу 1А, подгруппе 1А2 и имеют мутационные аминокислотные замены по сравнению с референсным изолятом PVB19 в участке, кодируемым геном VP1 (VP1u). Филогенетический анализ показал сходство нуклеотидных последовательностей выделенных изолятов с другими загруженными в коллекцию Genbank последовательностями из России, Франции, Германии, Японии, что подтверждает активную циркуляцию парвовируса в странах Евразийского континента.
Установлено, что часть образцов плазмы обследованных доноров крови содержали ДНК парвовируса В19 в концентрации, создающей опасность гемоконтактной передачи возбудителя реципиентам при гемотрансфузиях.
Показано, что для оценки проявлений ПВИ требуются направленный эпидемиологический мониторинг с использованием рабочего определения вероятного (подозрительного) случая этого заболевания и алгоритмы клинико-лабораторного обследования для каждой социально значимой группы людей, которые необходимы для обоснования выполнения приоритетных мер профилактики.
Теоретическая и практическая значимость работы
Установлены эпидемиологические особенности ПВИ, заключающиеся в распространенности, сезонном характере и формах проявлений (манифестная, бессимптомная) среди разных групп населения, что демонстрирует ее
значимость и позволяет обосновать необходимость проведения направленных вирусологических исследований.
Представлены ведущие клинико-эпидемиологические и лабораторные признаки, позволяющие заподозрить возникновение ПВИ и качественно осуществить дифференциальную диагностику.
Выявлена возможность контаминации образцов плазмы крови доноров ДНК парвовируса В19 в концентрации, создающей опасность гемоконтактной передачи возбудителя при гемотрансфузиях.
Показана генетическая однородность нуклеотидных последовательностей секвенированной области изолятов парвовируса В19, выделенных из плазмы крови военнослужащих-курсантов, что доказывает наличие циркуляции вируса в организованных коллективах военнослужащих.
Выявлена неоднородность распространения маркеров ПВИ среди разных социально значимых групп населения, что показывает необходимость выполнения приоритетных мер, направленных на предупреждение гемоконтактного и вертикального механизмов передачи возбудителя, а также предупреждение его распространения в организованных коллективах военнослужащих-курсантов. Разработано и обосновано определение рабочего вероятного (подозрительного) случая ПВИ и алгоритмы ее клинико-лабораторной диагностики, что позволяет осуществлять направленный эпидемиологический мониторинг.
Методология и методы исследования
Методологической основой выполнения работы явились разработка научной гипотезы о распространенности и особенностях ПВИ среди контингентов взрослых лиц с помощью последовательных методов эпидемиологического анализа с использованием вирусологических методов исследования. Дизайн исследования включал разработку семи задач, три из которых предполагали использование вирусологических методов исследования. На первом этапе, с учетом данных литературы, были определены основные
социально значимые контингента взрослых лиц - доноры крови и беременные женщины, на втором этапе было сделано предположение о том, что ПВИ актуальна и для других групп - организованных коллективов военнослужащих-курсантов и пациентов с экзантемными проявлениями инфекционного процесса. Детальная оценка экзантемной заболеваемости, распространенности маркеров парвовирусной инфекции во всех группах на последующих этапах работы позволили не только подтвердить выдвинутую научную гипотезу, но и разработать специфические элементы направленного эпидемиологического мониторинга (рабочее определение вероятного (подозрительного) случая, алгоритмы клинико-лабораторной диагностики), молекулярно-генетического и филогенетического анализа, определить приоритетные меры профилактики. Сравнение полученных данных с результатами, опубликованными в научной литературе, показало их новизну и научно-практическую значимость. Все этапы работы были обеспечены применением адекватной статистической обработки данных.
Положения, выносимые на защиту
1. Для организованных коллективов военнослужащих характерно формирование заболеваемости, связанной с экзантемными проявлениями инфекционного процесса. Выявление лабораторных маркеров парвовирусной инфекции при синдромосходных инфекционных заболеваниях и болезнях органов дыхания, занимающих ведущее место в ее структуре, подтверждает ее распространенность и социально-эпидемиологическую значимость.
2. Оценка состояния гуморального иммунитета в социально значимых группах населения является приоритетным направлением в эпидемиологическом мониторинге за парвовирусной инфекцией. Скрининг образцов плазмы доноров крови на количественное определение ДНК парвовируса В19 необходим для повышения безопасности переливания крови и ее компонентов.
3. Нуклеотидные последовательности изолятов парвовируса В19,
выделенных из плазмы крови военнослужащих-курсантов, отнесены к генотипу 1А2 и характеризуются генетической идентичностью, что подтверждает наличие циркуляции вируса в организованных коллективах. Указанные изоляты по результатам филогенетического анализа наиболее сходны с изолятами из других регионов России, Западной Европы и Японии.
4. Использование разработанного рабочего определения вероятного (подозрительного) случая парвовирусной инфекции позволяет повысить эффективность эпидемиологической и клинико-лабораторной диагностики, а также определить лиц, нуждающихся в лабораторном обследовании для выявления ее маркеров.
Степень достоверности и апробация результатов
Достоверность полученных результатов определяется значительным объёмом выполненных исследований и применением комплекса современных методов сбора и обработки первичной информации, формированием пула репрезентативных выборок и созданием информационного массива данных, а также использованием современных эпидемиологических, молекулярно-генетических и иммунологических, методов. Обоснованность научных положений, выводов и рекомендаций обеспечены детальным анализом собранного материала и применением адекватных методов математико-статистической обработки данных, значениями критериев проверки статистических гипотез. Исследуемые выборки формировались из потенциальных социально значимых по экзантемным инфекциям контингентов населения: лиц из организованных коллективов (военнослужащих-курсантов), периодически являющихся донорами крови, доноров крови, беременных женщин, а также пациентов инфекционного профиля, имеющих экзантемные проявления инфекционного процесса. Полученные результаты собственных исследований (данные вирусологического исследования 1002 проб сывороток крови, клинико-лабораторные данные 69 пациентов инфекционного стационара) и изученная учетно-отчетная документация о заболеваемости
военнослужащих (65 годовых и ежемесячных отчётов о работе медицинской службы ФГБВОУ ВО «Военно-медицинской академии имени С.М. Кирова» Минобороны России, 2186 медицинских книжек военнослужащих, 756 историй болезни, сведения из книги учета больных в амбулатории) позволили установить клинико-эпидемиологические особенности парвовирусной инфекции и изучить состояние гуморального иммунитета среди различных групп населения.
По теме диссертационной работы опубликовано 19 научных работ, из них
5 статей в журналах, входящих в перечень рецензируемых научных изданий, определенных ВАК при Минобрнауки России, в которых должны быть опубликованы основные научные результаты диссертаций на соискание учёной степени кандидата наук.
Материалы исследования были доложены и получили положительную оценку на заседании отделения Всероссийского научно-практического общества эпидемиологов, микробиологов и паразитологов в Санкт-Петербурге и Ленинградской области (г. Санкт-Петербург, 17 марта 2015 г.); Международном научном форуме «Многопрофильная клиника XXI века. Экстремальная медицина» (г. Санкт-Петербург, 9-11 апреля 2015 г.); XV Всероссийском научном форуме с международным участием имени академика В.И. Иоффе «Дни иммунологии в Санкт-Петербурге» (г. Санкт-Петербург, 1-4 июня 2015 г.); на круглом столе МО РФ «Перспективные технологии в системе обеспечения санитарно-эпидемиологического благополучия войск» (г. Москва,
6 октября 2015 г.); VII Научно-практической конференции молодых учёных и специалистов Роспотребнадзора (г. Санкт-Петербург, 8-10 декабря 2015 г.); Всероссийской научно-практической конференции «Здоровье медицинского персонала и обеспечение эпидемиологической безопасности медицинской деятельности» (г. Омск, 21-23 апреля 2016 г.); Всероссийской научной конференции с международным участием «Новые технологии в диагностике, лечении и профилактике: ИСМП, инфекции и паразитозы» (г. Тюмень, 12-14 апреля 2018 г.); Международной конференции «Молекулярные основы
эпидемиологии, диагностики, профилактики и лечения актуальных инфекций», посвященной 110-летию ФБУН «Санкт-Петербургский научно-исследовательский институт эпидемиологии и микробиологии имени Пастера» Роспотребнадзора (г. Санкт-Петербург, 4-6 декабря 2018 г.).
Реализация результатов исследования
Результаты диссертационного исследования внедрены в практическую деятельность специалистов филиала № 14 ФГКУ «442 военный клинический госпиталь» Минобороны России (акт о внедрении от 08.02.2018 г.), ФГКУ «985 Центр государственного санитарно-эпидемиологического надзора» Минобороны России (акт о внедрении от 28.02.2018 г.) и в образовательный процесс на кафедре (общей и военной эпидемиологии) ФГБВОУ ВО «Военно-медицинская академия имени С.М. Кирова» Министерства обороны Российской Федерации при подготовке практического занятия «Механизм развития эпидемического процесса при парвовирусной инфекции» для слушателей ординатуры, лекции «Эпидемиология и профилактика парвовирусной инфекции» для адъюнктов и аспирантов по направлению подготовки «Медико-профилактическое дело» (акт внедрения от 26.03.2018 г.).
Материалы диссертации реализованы при подготовке электронного учебника «Эпидемиология. Военная эпидемиология» для врачей медико-профилактического профиля (2016 г.), а также при разработке раздела методических рекомендаций «Медицинское обеспечение Высших военно-учебных заведений» (2016 г.).
Результаты, полученные в ходе выполнения работы, использованы в научно-исследовательской работе третьей категории «Исследование клинико-эпидемиологических проявлений и распространённости лабораторных маркеров парвовирусной инфекции» (№ VMA03.03.04.1516/0134 от 1 июня 2016 года, шифр «Вымпел»), выполненной в соответствии с планом научно-исследовательских работ ФГБВОУ ВО «Военно-медицинская академия имени С.М. Кирова» Минобороны России. На основе полученных результатов
разработан проект методических рекомендаций «Диагностика, лечение и профилактика парвовирусной инфекции в Вооружённых Силах Российской Федерации» (2016 г.) (Авторы: Никишов О.Н., Антипова А.Ю., Лаврентьева И.Н., Кузин А.А.).
В Международном банке данных GenBank депонировано две нуклеотидных последовательности парвовируса В19 (МG 779500, 779501) (2015 г.).
Организация и проведение диссертационного исследования одобрены независимым Этическим комитетом при ФГБВОУ ВО «Военно-медицинская академия имени С.М. Кирова» МО РФ (протокол № 192 от 18 июля 2017 г.).
Диссертация апробирована на межкафедральном заседании (протокол № 1 от 18 января 2019 г.), заседании проблемной комиссии № 3 при ВМедА им. С.М. Кирова Минобороны России (протокол № 127 от 8 февраля 2019 г.) и заседании научной проблемной комиссии «Эпидемиология и профилактика инфекционных и неинфекционных заболеваний» ФГБОУ ВО СЗГМУ им. И.И. Мечникова Минздрава России (протокол № 2 от 18.02.2019 г).
Личное участие автора
Автором лично были определены цель и задачи работы, разработаны методология и этапы научного исследования, выполнен сбор, систематизация, логическое построение работы и анализ научных результатов. Автор самостоятельно сформировал информационно-аналитические базы данных с их последующей статистической обработкой, сформулировал научные положения, выносимые на защиту, выводы и практические рекомендации. Сбор материала проводился лично диссертантом. Автором осуществлен поиск и анализ медицинской документации, содержащей сведения о случаях экзантемных проявлений у пациентов. Совместно с сотрудниками Центра крови и тканей, клиники акушерства и гинекологии, медицинской службы ВМА им. С.М. Кирова и ГБУЗ «Инфекционная больница № 30 им. С.П. Боткина» автор проводил отбор проб сыворотки крови у обследуемых лиц.
Автор проводил исследование состояния гуморального иммунитета, определение лабораторных маркеров парвовирусной инфекции. В совместных публикациях автору принадлежат сведения, касающиеся описания клинико-эпидемиологических проявлений ПВИ, обзорные данные, полученные результаты, раскрывающие распространенность маркеров специфического гуморального иммунитета среди различных групп населения.
Объем и структура диссертации
Диссертация изложена на 162 страницах машинописного текста на русском языке, состоит из введения, обзора литературы, описания материалов и методов исследования, собственных результатов (три главы), заключения, выводов, практических рекомендаций, перспектив дальнейшей разработки темы исследования, списка сокращений и условных обозначений, списка цитируемой литературы и приложений. Работа иллюстрирована 26 таблицами и 23 рисунками. Список литературы состоит из 146 литературного библиографического источника (50 отечественных и 96 зарубежных авторов).
ГЛАВА 1. СОВРЕМЕННЫЕ ПРЕДСТАВЛЕНИЯ ОБ ЭТИОЛОГИИ И ЭПИДЕМИОЛОГИИ ПАРВОВИРУСНОЙ ИНФЕКЦИИ (обзор литературы)
1.1. Этиология и патогенез парвовирусной инфекции
Возбудителем парвовирусной инфекции (ПВИ) является парвовирус человека В19 (PV B19) (лат. parvo - мелкий), который впервые обнаружили британский вирусолог Y. Cossart et al. (1974-1975 гг.) при лабораторном обследовании образца плазмы крови здорового донора на наличие HBsAg (рисунок 1) [113]. Название возбудителя (парвовирус В19) исследователи связали с номером лунки планшета, содержащей образец сыворотки крови, из которого он был выделен.
Рисунок 1 - Вирусные частицы В19У в образце сыворотки крови
человека[51]
Патогномоничным клиническим проявлением ПВИ является инфекционная эритема, описанная еще в XVIII веке английским врачом К 'ИНап задолго до установления ее этиологии [17]. Однако только в 1899
году немецкий врач Sticker выделил ее в самостоятельную нозологическую форму, а в 1905 году Cheinisse ввел в классификацию инфекционную эритему и определил ее как «пятую болезнь» в числе шести классических экзантем [21, 17]. Необходимо отметить, что клинические проявления ПВИ имеют сходные признаки с корью и краснухой, что затрудняет ее своевременное распознавание и требует проведения дифференциальной диагностики с применением лабораторных методов, необходимых для верификации диагноза и установления этиологии заболевания [21].
Патогенное действие вируса было установлено лишь в 1981 году, когда исследователи обнаружили взаимосвязь между инфицированием детей с плоско-клеточной анемией и развитием у них в ряде случаев апластического криза [104]. В 1983 году была подтверждена этиологическая роль парвовируса В19 в возникновении инфекционной эритемы [85]. Уже в 1984 году появились сообщения о развитии водянки плода на фоне внутриутробного инфицирования парвовирусом В19, что заканчивалось преждевременным прерыванием беременности и его гибелью [19, 26]. Эти научные факты свидетельствуют о расширении эпидемиологической значимости ПВИ и позволяют выделить группы риска среди людей, наиболее подверженных развитию осложнений при ее инфицировании. В связи с появлением в современных условиях специфической лабораторной диагностики расширилась и география регистрации случаев парвовирусной В19 инфекции. В частности, она этиологически подтверждена на территориях стран Юго-Восточной Азии, в США, Европе, России, а также странах в СНГ [4, 10].
Необходимо отметить, что таксономическое положение парвовируса В19 несколько раз пересматривалось и хронологию этих изменений с 1991 г. по настоящее время можно представить следующим образом (таблица 1). Официально PV В19 был отнесён к семейству парвовирусов в 1985 году [138]. В 2013 году, на съезде вирусологов в г. Эдинбурге (Шотландия), его назвали Primate Erithroparvovirus 1 и отнесли к семейству Parvoviridae, подсемейству
РагУ0У1гтав, роду ЕгуМгврагуву^ж и в дальнейшем его таксономия и название не пересматривались [138] (таблица 1).
Таблица 1 - Таксономическое положение парвовируса человека В19 (РV В19)
Год Источник Семейство-подсемейство-род-вид
1991 ICTV 5th Report Parvoviridae - ... - Parvovirus - B19 virus
1993 Plenary session vote 10 August 1993 in Glasgov Parvoviridae - Parvovirinae - Erythrovirus-B19 virus
2005 ICTV 8th Report Parvoviridae - Parvovirinae- Erythrovirus-Human parvovirus B19
2013 EC 45, Edinburgh, July 2013; Email ratification 2014 Parvoviridae - Parvovirinae-Erythroparvovirus -Primate erythroparvovirus 1
Установлено, что структуру возбудителя формирует безоболочечный капсид из 60 капсомеров, который составляет 60-80 % массы вириона [29]. Его образуют структурные белки: VP1 (4-5 %), необходимый для перемещения капсида в ядро клетки, и VP2 (95 %), обеспечивающий сборку вирионов [29, 87, 97]. Кроме этого, белок VP2 индуцирует образование аутоантител против коллагена, кератина, кардиолипина и фосфолипидов, что имеет значение в патогенезе артритов и артралгий, связанных с ПВИ [130]. Внутри капсида находится единственная линейная ДНК с сайтами репликации [132, 143]. Четыре открытые рамки считывания кодируют неструктурный белок NS1, структурные белки VP1 и VP2, и белки с неизвестной функцией. Отмечено, что
Похожие диссертационные работы по специальности «Эпидемиология», 14.02.02 шифр ВАК
Особенности клинико-эпидемиологических проявлений и диагностики стрептококковой инфекции в организованных воинских коллективах2020 год, кандидат наук Жарков Денис Александрович
Эпидемиология и профилактика аэрозольных антропонозов в организованных коллективах на фоне пандемии новой коронавирусной инфекции2024 год, кандидат наук Горенчук Алексей Николаевич
Совершенствование системы эпидемиологического надзора и профилактики пиодермий в организованных воинских коллективах2014 год, кандидат наук Марьин, Герман Геннадьевич
Эпидемиологические и иммунологические аспекты токсоплазмоза в группах высокого риска2007 год, кандидат медицинских наук Калитин, Александр Владимирович
Особенности формирования у взрослых гуморального иммунитета к вирусу Varizella zoster2013 год, кандидат медицинских наук Казанова, Александра Сергеевна
Список литературы диссертационного исследования кандидат наук Никишов Олег Николаевич, 2019 год
СПИСОК ЛИТЕРАТУРЫ
1. Алгоритм диагностики парвовирусной В19 инфекции: Инструкция по применению. Утверждена первым заместителем Министра здравоохранения Республики Беларусь 20.12.2011 г. (регистрационный № 124 - 1211). - Режим доступа: Шрв://уапёех.ги/8еагсМг=10898&сНё=2163430&1ех1 (дата обращения 13.10.2018 г.).
2. Алимбарова, Л.М. Парвовирусы (Ра^оупМае) // Медицинская вирусология: руководство под ред. Д.К. Львова. - М.: Медицинское информационное агентство, 2008. - С. 276 - 284.
3. Ананьева, Л.П. Инфекция, вызванная парвовирусом В19 / Л.П. Ананьева // Научно-практическая ревматология. - 2002. - № 4. - С. 32 - 35.
4. Антипова, А.Ю. Значение лабораторной диагностики краснушной и парвовирусной инфекций в период элиминации краснухи: автореф. дис. ... канд. биол. наук: 03.02.02 / Антипова Анастасия Юрьевна - СПб., 2013. - 23 с.
5. Белан, Ю.Б. Парвовирусная В19 инфекция / Ю.Б. Белан, М. В. Старикович // Лечащий врач. - 2014. - № 11. - С. 41 - 44.
6. Белов, А.Б. Эпидемиология и профилактика ветряной оспы в воинских коллективах / А.Б. Белов, П.И. Огарков, Е.В. Ланцов // Военно-медицинский журнал. - 2017. - Т. 338, № 2. - С. 37 - 44.
7. Боткина, А.С. / Вирусные экзантемы в практике педиатра / А.С. Боткина // Практика педиатра. - 2016. - № 3. - С. 54.
8. Выявление случаев парвовирусной инфекции в системе эпидемиологического надзора за экзантемными заболеваниями / И.Н. Лаврентьева, А.Ю. Антипова, М.А. Бичурина [и др.] // Инфекция и иммунитет. - 2016. - Т. 6, № 3. - С. 219 - 224.
9. Генотипирование изолятов паврвовируса В19, циркулирующих в Северо-Западном округе Российской Федерации / И.Н. Лаврентьева, А.Ю. Антипова, А.Н. Семенов [и др.] // Микробиология. - 2013. - № 6. - С. 36 - 43.
10. Долгих, Т.И. Современные возможности лабораторной диагностики инфекционных заболеваний (методы, алгоритмы, интерпретация результатов): пособие для врачей / Т.И Долгих. - Омск: Омская государственная медицинская академия, 2005. - 40 с.
11. Ермолович, М.А. Эпидемический процесс острой парвовирусной инфекции в республике Беларусь. // М.А. Ермолович, А.М. Дронина, Е.О. Самойлович // Эпидемиология и инфекционные болезни. - 2016. - № 5. -С. 13 - 20.
12. Клинико-лабораторная характеристика парвовирусной инфекции В19 / О. Н. Никишов, О.В. Мальцев, А.А. Кузин [и др.] // Лечение и профилактика. -2016. - Т. 7, № 4 (24). - С. 18 - 25.
13. Клинико-эпидемиологическая характеристика парвовирусной В19 инфекции в современных условиях: автореф. дис. ... канд. мед. наук: 14.01.09 / Климович Наталья Владимировна. - Минск., 2017. - 23 с.
14. Клинико-эпидемиологические аспекты В19 парвовирусной инфекции при беременности / Н. П. Бондаренко, В.П. Лакатош, В.В. Белая [и др.] // Здоровье женщины. - 2015. - № 6. - С. 89 - 93.
15. Клинико-эпидемиологические особенности и профилактика парвовирусной инфекции / О.Н. Никишов, А.А. Кузин, А.Ю. Антипова [и др.] // Военно-медицинский журнал. - 2016. - Т. 337, № 8. - С. 45 - 50.
16. Клинико-эпидемиологические особенности регистрации парвовирусной инфекции в Донецком регионе / В.В. Медведева, Н.П. Скородумова, Н.П. Кучеренко [и др.] // Медико-сощальш проблему шм'1. - 2013. - Т. 18, № 2. -С. 98 - 101.
17. Кожные проявления парвовирусной инфекции [Электронный ресурс] / Н.Г.Макарова,И.Г.Сергееваhttp://www.dermatology.ru/publications/derm.ross.2013 11/30094. (Дата обращения: 08.01.2017).
18. Кравченко, С.К. Диагностика В19 парвовирусной инфекции у больных с анемиями / С.К. Кравченко, К.Е. Браун, С. Грин // Проблемы гематологии. -1996. - № 2. - С. 30 - 34.
19. Лаврентьева, И.Н. Парвовирус В19 человека: характеристика возбудителя, распространение и диагностика обусловленной им инфекции. / И.Н. Лаврентьева, А.Ю. Антипова // Инфекция и иммунитет. 2013. - Т. 3, № 4. -С. 311 - 322.
20. Ливада, А.И. Парвовирусная В19 инфекция [Электронный ресурс Педиатр онлайн.] / А.И. Левада // М, 2012. - Режим доступа: кйр://03опНпе. сom/news/pediatr/1-0-12 (дата обращения: 10.05.2016).
21. Лушнова, И.В. Парвовирусная В19 инфекция / И.В Лушнова // Педиатр. 2010. - Т. 1, № 2. - С. 115 - 118.
22. Макаров, О.В. / Инфекции в акушерстве и гинекологии / О.В. Макаров, В.А. Алешкин, Т.Н. Савченко. - М.: МЕДпресс-информ, 2007. - С. 360 - 357.
23. Международная классификация болезней (МКБ 10). Режим доступа Шрв://уапёех.га/8еагсЬ/?1г=10898&сНё=2163430&1ех1 (дата обращения 24.03.16).
24. Молекулярная диагностика парвовируса В19 у беременных. / О.В. Пиксасова, В.А. Гнетецкая, Э.А. Домонова [и др.] // Генодиагностика инфекционных болезней: VI Всероссийская научно-практическая конференция с международным участием, 28-30 ноября 2007 года: материалы конференции. - М., 2007. - Т. III, раздел 17. - С. 339 - 343.
25. Мультиплексная диагностика вирусов гепатитов В, С и парвовируса В19 у больных, получающих множественные трансфузии / А.В. Судариков, О.А. Глинщикова, Т.В. Макарик [и др.] // Гематология и трансфузиология. - 2008. -№ 4. - С. 54 - 56.
26. Неиммунная водянка плода: диагностика и тактика / Г.А. Шипулин, М.Э. Белковская, О.Л. Мальмберг [и др.] // Акушерство и гинекология. - 2009. -№ 2. - С. 37 - 40.
27. Новое в трансфузиологии [Электронный ресурс] / Е.Б. Жибурт, О.В Баранова, П.В. Рейзман [и др.] XXVIII Конгресс Международного общества переливания крови. Режим доступа: http://www.transfusion.ru/doc/2004-09-03-1.html (дата обращения: 25.02.2015).
28. Об утверждении технического регламента о требованиях безопасности крови, её продуктов, кровезамещающих растворов и технических средств, используемых в трансфузионно-инфузионной терапии (с изменениями от 12 октября 2010 г.): постановление Правительства РФ от 26 января 2010 г. № 29 (ред. от 04.09.2010 г.) // Собрание законодательства РФ - 2010. - № 5. - (ст. 536). - С. 31.
29. Общая и частная вирусология // Руководство под ред В.М. Жданов, С.А. Гайдамовича. - М.: Медицина, 1982. - Т. 2. - 1016 с.
30. Определение маркеров парвовируса В19 в образцах крови доноров / Е.В. Филатова, Н.А. Новикова, Н.В. Зубкова [и др.] // Микробиология, эпидемиология и иммунология. - 2010. - № 5. - С. 67 - 70.
31. Парвовирус В19 человека: характеристика, возбудителя и диагностика обусловленной им инфекции / А.Ю. Антипова, О.Н. Никишов, И.В. Хамитова [и др.] // Инфекция и иммунитет. - 2015. - Т. 5, № 2. - С. 171 -174.
32. Парвовирусная (B19V) инфекция у беременных и детей раннего возраста / В.В. Васильев, Е.А. Мурина, С.В. Сидоренко [и др.] // Журнал инфектологии. - 2011. - Т. 3, № 4. - С. 26 - 33.
33. Парвовирусная инфекция - современная проблема в эпидемиологии и клинической медицине / О. Н. Никишов А.А. Кузин, А.Ю. Антипова [и др.] // Эпидемиология и вакцинопрофилактика. - 2015. - Т. 14, № 4 (83). - С. 29 -35.
34. Парвовирусная инфекция. Значимость и возможность специфической профилактики / А.Ю. Антипова, И.В. Хамитова, О.Н. Никишов [и др.] // Медицинская иммунология. - 2015. - Т. 17, № 5. - С. 153.
35. Парциальная красноклеточная аплазия костного мозга у реципиента почечного трансплантата / Б.Т. Джумабаева, Л.С. Бирюкова, И.Б. Капланская [и др.] // Вестник трансплантологии и искусственных органов. -2011. - Т.12, № 2. - С. 83 - 86.
36. Попцов, А.Л. Верификация методики выявления и количественного определения ДНК парвовируса В19 методом ПЦР в плазме для фракционирования / А.Л. Попцов, И.В. Парамонов, Н.Ю. Фетищева // Вестник службы крови России. - 2014. - № 1. - С. 48 - 53.
37. Попцов, А.Л. Значение индикации ДНК парвовируса В19 в обеспечении инфекционной безопасности плазмы для фракционирования: автореф. дис. ... канд. мед. наук: 14.01.21 / Попцов Александр Леонидович - Киров, 2015. - 21 с.
38. Распространение парвовирусной инфекции в Северо-Западном федеральном округе России / А.Ю Антипова, И.Н Лаврентьева, М.А Бичурина [и др.] // Журнал инфектологии. - 2011. - Т. 3, № 4. - С.44 - 48.
39. Ретроспективный эпидемиологический анализ и прогнозирование заболеваемости личного состава Вооруженных Сил Российской Федерации / П.И Мельниченко, П.И Огарков, О.В. Курьянович [и др.]: методические указания. - М: Воениздат, 2006. - 143 с.
40. Сафиуллина, А.А. Оценка воспалительных изменений миокарда с помощью магнитно-резонансной томографии с контрастированием в сопоставлении с результатами эндомиокардиальной биопсии у больных с дилатационной кардиомиопатией: автореф. дис. ... канд. мед. наук: 14.01.05 / Сафиуллина Альфия Ахатовна - Москва, 2014. - 23 с.
41. Семериков, В.В. Предпосылки и условия элиминации краснухи в России / В.В. Семериков, И.Н. Лаврентьева // Инфекция и иммунитет. - 2012. - Т. 2, № 1 - 2: Итоги и перспективы обеспечения эпидемиологического благополучия населения Российской Федерации: материалы X съезда Всероссийского научно-практического общества эпидемиологов,
микробиологов и паразитологов (г. Москва, 12-13 апреля 2012 г.). - С. 519 -520.
42. Смеликов, Я.А. Парвовирусная (В19) инфекция у детей на современном этапе (обзор) / Я.А. Смеликов // Вестник КГМА им. И.К. Ахунбаева. - 2011. - № 4 (11). - С. 20 - 24.
43. Тихонова, Н.Т. Оценка распространения парвовирусной инфекции в Москве: / информационное письмо Комитета здравоохранения г. Москвы. // Н.Т. Тихонова, А.Г. Герасимова, Т.Н. Москалева - М., 2004. - № 11. - 12 с.
44. Ушакова, Р.С. Способ лечения парвовирусной инфекции В19 у детей раннего возраста: патент на изобретение № 2487708. Бюллетень № 20 от 20.07.2013. www.freepatent.ru (дата обращения 30.10.2014).
45. ФБУН ЦНИИ Эпидемиологии Роспотребнадзора. Инструкция по применению набора реагентов для выявления и количественного определения ДНК Parvovirus B19 в клиническом материале методом полимеразной цепной реакции (ПЦР) с гибридизационно-флуоресцентной детекцией «АмплиСенсParvovirus B19-FL» [Текст] / ФБУН ЦНИИ Эпидемиологии Роспотребнадзора // Москва: ФБУН ЦНИИ Эпидемиологии Роспотребнадзора, 2013. - 27 с.
46. Хегер, П.Г. Детская дерматология: учебник / П.Г. Хегер. пер. с нем. - под общ. ред. С.В. Панфиловой. - М.: БИНОМ, Лаборатория знаний, 2013. - 648 с.
47. Чистенко, Г.Н. Парвовирусная инфекция / Г.Н. Чистенко, А.М. Дронина, М.И. Бандацкая // Мир медицины. - 2015. - № 2. - С. 4-6.
48. Элижбаева, М.А. Парвовирус В19 у доноров крови и больных гематологического стационара: автореф. дис. ... канд. биол. наук: 14.01.21 / Элижбаева Медина Абубакаровна - М., 2011. - 23 с.
49. Эпидемиологическая характеристика парвовирусной инфекции у детей с гематологическими заболеваниями / Н.В. Климович, В.А. Матвеев, О.Н.
Романова [и др.] // Охрана материнства и детства. - 2011. - № 1. - С. 42 -46.
50. Юнкеров, В.И. Математико-статистическая обработка данных медицинских исследований: учебное пособие / В.И. Юнкеров, С.Г. Григорьев. - СПб.: ВМедА, 2002. - 266 с.
51. Advances in human B19 erytrovirus biology / A. Servant-Delmas, J.J. Lefrere, F. Morinet [et al.] // J. Virol. - 2010. - Vol. 84. - P. 9658 - 9665.
52. Amand, St. Indentification and сharacterization of a family of 11-kDa proteins encoded by hyman parvovirus B19 / St. Amand, J. Astell, C.R. Astell // Virology.
- 1993. - Vol. 192. Р. 121 - 131.
53. Atypical manifestations of congenital parvovirus B19 infection / I. Savarese, M. P. De Carolis, S. Costa [et al.] // Eur. J. Pediatr. - 2008. - Vol. 167, N 12. -Р. 1463 - 1466.
54. Bailey, J.M. Parvovirus B19 presenting with severe sepsis in a previously healthy 25-year-old female / J.M. Bailey // J. Am. Board Fam. Med. - 2006. -Vol. 19, N 3. - Р. 317 - 319.
55. Bamba, M. Human parvovirus B19. / М. Bamba // Nihon Rinsho. - 2010 Jun. -68 Suppl 6:350 - 3.
56. Baylis, S.A. Standardization of nucleic acid amplification technique (NAT)-based assays for different genotypes of parvovirus B19: a meeting summary / S.A. Baylis // Vox Sanguinis. - 2008. - Vol. 94. - Р.74 - 80.
57. Bernuau, J. Parvovirus B19 infection and ful-minant hepatitis / J. Bernuau, F. Durand, D.Valla // Lancet. - 1999. - Vol. 353, № 9154. - P. 754 - 755.
58. Biologikal and immunological relations among Human Parvovirus B19 genotypes 1 to 3 / A. Ekman, K. Hokynar, L. Kakkola [et al.] // J. of Virol. - 2007.
- Vol. 81, № 13. - Р.6927 - 6935.
59. Broliden, K. Clinical aspects of parvovirus B19 infection / K. Broliden, T. Tolfvenstam, O. Norbeck // J. Intern. Med. - 2006. - Vol. 260. - Р. 285 - 304.
60. Centres for Disease Control. Current trends risks associated with human Parvovirus B19 infection. MMWR Morb Mortal WKLY Rep. - 1989. - Vol. 38, № 6. - P. 81 - 88, P. 93 - 97. URL: htt//www.cdc.gov/mmwr/preview/mmwrhtm/ 00001348.htm.
61. Characterization of erythrovirus B19 genomes isolated in liver tissues from patients with fulminant hepatitis and biliary atresia who underwent liver transplantation. / K. Abe, T. Kiuchi, K. Tanaka [et al.] // Int. J. Med. Sci. - 2007. -Vol. 4, № 2. - P. 105-109.
62. Characterization of Parvovirus B19 genotypes 2 in KU812Ep6 cells / J. Blumel, A.M. Eis-Hubinger, F. Stuhler [et al.] // J.Virol. - 2005. - Vol. 79, № 22. - P. 4197 - 14206.
63. Clinical and Epidemiological Aspects of Human Parvovirus B19 Infection in an Urban Area in Brazil (Niteroi City Area, State of Rio de Janeiro, Brazil) / S. Oliveira, L.A.B. Camacho, A.C. de Mederios Pereira [et al.] // Mem. Inst. Oswaldo Cruz. - 2002. - Vol. 97, N 7. - P. 965 - 970.
64. Cloing of a human parvovirus by molecular screening of respiratory tract samples / N. Allander, M.T. Tammi, M. Eriksson [et al.] // Proc. Natl Acad. Sci. USA. - 2005; Vol. 102. - P. 12891 - 12896.
65. Corcoran, A. Advances in the biology, diagnosis and host-pathogen interactionsof parvovirus B19 / A. Corcoran A., S. Doyle // J. Med. Microbiol. -2004. - Vol. 53. - P. 459 - 475.
66. Crane, J. Parvovirus B19 infection in pregnancy / J. Crane, W. Mundle, I. Boucoiran // J. Obstet Gynaecol Can. - 2014. - Vol. 36, № 12. - P. 1107 - 1116.
67. Cunha, B.A Parvovirus B19 with ascarlatiniform/rubelliform rash and small joint arthritis mimicking rubella in an adult / B.A. Cunha, J. Chandrankunnel // Travel Med Infect Dis. - 2012. - Vol. 10, № 4 - P. 208.
68. Detection of antibodies and antigens of human parvovirus B19 by enzume-linked immunosorbent assay / L.J. Anderson, C. Tsou, R.A. Parker [et al.] // J. Clin. Microbiol. - 1986. - Vol. 24. - P. 522 - 526.
69. Detection of PARV4, genotypes 1 and 2, in healthy and pathological clinical specimens / S. Botto, M. Bergallo, F. Sidoti [et al.] // New Microbiol. - 2009. -Vol. 32. - P.189 - 192.
70. Detection of parvovirus B19, cytomegalovirus and enterovirus infections in cases of intrauterine fetal death / K. Broliden, K. Petersson, O. Norbeck [et al.] // J. Perinat. Med. - 2004. - V. 32, № 6. - Р. 516 - 521.
71. Enders, M. Current epidemiological aspects of human parvovirus B19 infection during pregnancy and childhood in the western part of Germany / M. Enders, A. Weidner, G. Enders // Epidemiol. Infect - 2007. - Vol. 135. - Р. 563 - 569.
72. Etiology of community-acquired pneumonia in 254 hospitalized children / Т Juven, J. Mertsola, M. Waris [et al.] // Pediatr Infect Dis J. - 2000. - Vol. 19. Р. 293 - 298.
73. Evolution of Parvovirus B19 infection in children with malignant or hematological disorders / I. Gustafsson, T. Caldensjo, A. Lindblom [et al.] // Clin. Infect. Dis. - 2010. - Vol. 50, № 10. - Р. 1426 - 1427.
74. Ex Vivo-generated CD36+ erythroid progenitors are highly permissive to Human Parvovirus B19 replication / S. Wong N Zhi C Fillipone [et al.] // J. Virol. - 2008. - Vol. 82, N 5. - Р. 2470 - 2476.
75. Fain, O. Parvovirus B19 infection in an adult / О. Fain, С. Landon, J. Stirnemann. Rev Prat. - 2009. - Vol. 9, № 10. - Р. 1344.
76. Fetal morbidity and mortality after acute human parvovirus B19 infection in pregnancy: prospective evaluation of 1018 cases / М. Enders, А. Weidner, I. Zoellner [et al] // Prenat. Diagn. - 2004. - Vol. 24 - Р. 513 - 518.
77. Food and Drug Administration, U.S. Departament of Health and Human Services Guidance for Indastry. Nucleic acid testing to reduce the possible risk of human parvovirus B19 transmission by plasma-derived products [Электронный ресурс]. / FDA: U.S. Departament of Health and Human Services // Режим доступа: http://www.fda.gov/BiologicsBloodVaccines/GuidanceComplianceRegulatoryInfo rmati on/Guidances/default.html (Access Date: 15.10.2017).
78. Frequency of measles, rubella, dengue and erythema infectiosum among suspected cases of measles and rubella in the State of Pernambuco between 2001 and 2004 / M.J. Oliveira, M.T. Cordeiro, F.M. Costa [et al.] // Rev. Soc. Bras. Med. Trop. - 2008. - Vol. 41, N 4. - P. 338 - 44.
79. Generation of a parvovirus B19 vaccine / S. Chandramouli, A. Medina-Selby, D. Coit [et al.] // Vaccine. - 2013. - Vol. 31. - P. 3872 - 3878.
80. Genetic variants of Human Parvovirus B19 in South Africa: cocirculation of three genotypes and identification of a novel subtype of genotype 1 / C. Corcoran, D. Hardie. J. Yeats [et al.] // J. Clin. Microbiol. - 2010. - Vol. 48, N 1. - P. 137 -142.
81. High prevalence of viral genomes and multiple viral infections in the myocardium of adults with "idiopathic" left ventricular dysfunction / U. Kühl, M. Pauschinger, M. Noutsias [et al.] // Circulation. - 2005; Vol. 111, № 7. - 887 -893.
82. Hubschen J.M. Phylogenetic analysis of human parvovirus b19 sequences from eleven different countries confirms the predominance of genotype 1 and suggests the spread of genotype 3b / J.M. Hubschen [et al.] // J. Clin. Microbiol. - 2009. -Vol. 47, № 11. - P. 3735 - 3738.
83. Human Parvovirus B19 and blood product safety: a tale of twenty years of improvements. / G. Marano, S. Vaglio, S. Pupella [et al.] // Blood Transfus. -2014. - Vol. 13. - P. 184 - 196.
84. Human parvovirus B19 experimental infection in human fibroblasts and endothelial cells cultures / K. Zakrzewska, R. Corvito, G.A. Gentilomi [et al.] // Virus Res. - 2005. - Vol. 114. - P. 1 - 5.
85. Human parvovirus, the cause of erithema infectiosum (fifth disease) / M.J. Anderson, S.E. Jones, S.P. Fisher-Hoch [et al] // Lancet. - 1983. - Vol. 321. -P. 1378.
86. Identification and genetic diversity of two human parvovirus B19 genotype 3 subtypes / A. Parsyan, C. Szmaragd, J.-P. Allain [et al.] // J. Gen. Virol. - 2007. -Vol. 88. - P. 42881.
87. Identification of an immunodominant peptide in the parvovirus B19 VP1 unique region able to elicit a long-lasting immune response in humans / E. Zuffi, E. Manaresi, G. Gallinella [et al.] // Viral Immunol. - 2001. - Vol. 14, N 2. - P. 151 - 158.
88. Immediate and long term outcome of human parvovirus B19 infection in pregnancy / E. Miller, C. Fairley, B.J. Cohen. [et al.] // Br. J. Obstet Gynaecol. -1998. - Vol. 105. - P. 174 - 178.
89. Indentification and characterization of persistent human erythrovirus infection in blood donor samples / D. Candotti, N. Etiz, A. Parsyan [et al.] // J. Virol. - 2004. - Vol. 78. - P. 12169 - 12178.
90. Infection and immunity for human parvovirus B19 in patients with febrile exanthema / M.S. Pedranti, P. Barbero, C.Wolff [et al.] // Epidemiol Infect. -2012. - Vol. 140, N 3. - P. 454 - 461.
91. Infection by parvovirus B19 during pregnancy: a review / R. Levy, A. Weissman G. Blomberg [et al.] // Obstet Gynecol Surv. - 1997. - Vol. 52. - P. 254 - 259.
92. Intrauterine parvovirus infection associated with hydrops fetalis / T. Brown, A. Anand, L.D. Ritchie [et al.] // Lancet. - 1984. - Vol. 2. - P. 1033 - 1034.
93. Jordan, J.A. Globoside expression within the human placenta / J.A. Jordan, J.A. DeLoia // Placenta - 1999. - Vol. 20. - P. 103 - 108.
94. Ku80 autoantigen as a cellular coreceptor for human parvovirus B19 infection / Y. Munakata, T. Saito-Ito, K. Kumura-Ishii [et al.] // Blood. - 2005. - Vol. 106, N 10. - P. 3449 - 3456.
95. Molecular mechanism underlying B19 virus inactivation and comparison to other parvoviruses / B. Mani, M Gerber, P. Lieby [et al.] // Transfusion. - 2007. - Vol. 47. - P. 1765 - 1774.
96. Molecular characterization of the newly identified human parvovirus 4 in the family Parvoviridae / S. Lou, B. Xu, Q. Xuang [et al.] // J. Virology. - 2012, Vol. 422. - P. 59 - 69.
97. Neutralizing linear epitopes of B19 parvovirus cluster in the VP1 unique and VP1-VP2 junction regions / T. Saikawa, S. Fnderson, M. Momoeda [et al.] // J. Virol. - 1993. - Vol. 67. - P. 3004 - 3009.
98. New DNA viruses identified in patiens with acute viral infection syndrome / M. S. Jones. A. Kapoor, V. Lukashov [et al.] // J. Virol. 2005. - Vol. 79. - P. 8230 -8236.
99. Nicolay, N. Clinical and epidemiological aspects of parvovirus B19 infections in Ireland, January 1996 - June 2008 / N. Nicolay, S. Cotter // Eurosur veillance. 2009. - Vol. 14. P. 1 - 5.
100. Nonstructural protein of parvoviruses B19 and minute virus of mice controls transcription / C. Doerig, B Hirt, J.-P. Antonietti [et al.] // J. Virol. - 1990. - Vol. 64. - P. 387 - 396.
101. Observational study of effect of intrauterine transfusion on outcome of fetal hydrops after parvovirus B19 infection / C. Fairley, J. Smoleniec, O. Caul [et al.] // Lancet 1995. - Vol. 346. - P. 1335.
102. Occupational risk of human cytomegalovirus and parvovirus B19 infection in female day care personnel in the Netherlands; a study based on seroprevalence / F.F. Stelma, A. Smismans, V.J. Goossens [et al.] // Eur. J. Clin. Microbiol. Infect. Dis. - 2009. - Vol. 28. - P. 393 - 397.
103. Occupational risk of human parvovirus B19 infection forschool and day-care personnel during an outbreak of erythema infectiosum / S.M. Gillespie, M.L. Carrter, S. Asch [et al.] // J. Am. Med. Assoc. - 1990. - Vol. 263, № 15. - P. 2061 - 2065.
104. Outbreak of aplastic crises in sickle cell anaemia associated with parvovirus-like agent / G.R. Serjeant, J.M. Topley, K. Mason // Lancet ii. - 1981. - P. 595 -597.
105. Ozawa, K. Characterization of capsid and noncapcid proteins of B19 parvovirus propagated in human erythroid bone marrow cell cultures / K. Ozawa, N. Young // J. Virol. - 1987. - Vol. 61. - P. 2627 - 2630.
106. Ozawa, K. Replication of the B19 parvovirus in human bone marrow cell cultures / K. Ozawa, G. Kurtzman, N.S. Young // Science. - 1986. - Vol. 233. - P. 883 - 886.
107. Parvovirus B19 / S. Neal, M.D. Young, E. Kevin [et al.] // The New England Journal of Medicine. - 2004, N 350.
108. Parvovirus B19 during pregnancy a review / E. Giorgio, M.A De Oronzo, I. Iozza // J. Of Prenatal Medicicne. - 2010. - Vol. 4, № 4. - P. 63 - 66.
109. Parvovirus B19 in pregnancy: possible consequences of vertical transmission / C. Puccetti, M. Contoli, F. Bonvicini [et al.] // Prenatal Diagnosis 2012. - Vol. 32. - P. 897 - 902.
110. Parvovirus B19 infection in pregnancy / E.P. De Jong, T.R. de Haan, A.S. Kroes [et al.] // J. Clin. Virol. - 2006. - Vol. 36. - P.1 - 7.
111. Parvovirus B19 infection in the European countries: seroepidemiology, force of infection, and maternal risk of infection / J. Mossong, N. Hens, V. Friederichs [et al.] // Epidemiol. Infect. - 2008. - Vol. 136, N 8. - P. 1059 - 1068.
112. Parvovirus B19 Infection in the First Trimester of Pregnancy and Risk of Fetal Loss: A Population-based Case-Control Study / J. Lassen, A. K. V. Jensen, P. Bager [et al.] // Am J. Epidemiol. - 2012. - Vol. 176, № 9. - P. 803 - 807.
113. Parvovirus-like particles in human sera / Y. Cossart, A. Field, B. Cant [et al.] // Lanset. - 1975. - Vol. 1. - P.137 - 142.
114. PCR-based diagnosis of Enterovirus and Parvovirus B19 in paraffin-embedded heart tissue of children with suspected sudden infant death syndrome / A. Baasner, R. Dettmeyer, M. Graebe [et al.] // Lab. Invest. - 2003. - Vol. 83. -P.1451 - 1455.
115. Persistent B19 infection in immunocompetent individuals: implications for transfusion safety / J.J. Lefrere, A. Servant-Delmas, D. Candotti // Blood. - 2005. - Vol. 106, № 8. - P. 2890 - 2895.
116. Placental endothelial cells can be productively infected by Parvovirus B19 / G. Pasquinelli, F. Bonvicini, L. Foroni [et al.] // J. of Clinical Virology - 2009. -Vol. 44. - P. 33 - 38.
117. Porter, H.J. B19 parvovirus infection of myocardial cells / H.J. Porter, A.M. Quantrill, K.A. Fleming // Lancet. 1988. - Vol. 1. - P. 535 - 536.
118. Prevalence and quantitation of parvovirus B19 DNA levels in blood donors with a sensitive polymerase chain reaction screening assay / S. Kleinman, S Glynn, T. Lee [et al.] // Transfusion. - 2007. - 47. - Vol. 1756 - 1764.
119. Resistance to Parvovirus B19 infection due to lack of virusreceptor (erythrocyte P-antigen) / K. Brown, J.R. Hibbs, G. Gallinella [et al.] // N. Engl. J. Med. - 1994. - Vol. 330, № 17. - P. 1192 - 1196.
120. Risk factors for parvovirus B19 infection in pregnancy / A.K. Valeur-Jensen, C.B. Pedersen, T. Westergaard [et al.] // JAMA. - 1999. - Vol. 281, N 12. - P. 1099 - 1105.
121. Risk of infection following exposures to human parvovirus B19 / L.J. Anderson, S.M. Gillespie, T.J. Torok [et al.] // Behring Inst. Mitt. - 1990. -Vol. 85. - P. 60 - 63.
122. Sachan, D. / Erythema infectiosum rash // Indian Pediatr. - 2011. - Vol. 48, N 4. - P. 338.
123. Safety and immunogenicity of a candidate Parvovirus B19 vaccine / D.I. Bernstein, H. Sahly, W.A. Keitel [et al.] // Vaccine. - 2011. - Vol. 29, № 43. - P. 7357-7363.
124. Schulert, G. S. Polymicrogyria and congenital Parvovirus B19 infection/ G.S. Schulert, W.F. Walsh, J.H. Weitkamp // Am J. Perinatol Rep. 2011. - Vol. 1. - P. 105 - 110.
125. Schwarz, T.F. Detection of parvovirus B19 in fetal autopsies / T.F., Schwarz, A. Nerlich, P. Hillemanns // Arch. Gynecol. Obstet. - 1993. - Vol. 253, N 4. - P. 207 - 213.
126. Self-assembled B19 parvovirus capsids, produced in a baculovirus system, are antigenically and immunogenically similar to native virions / S. Kajigaya, H. Fujii, A. Field [et al.] // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. - 1991. - Vol. 88. - P. 4646 -4650.
127. Seroprevalence of parvovirus B19 among pregnant women in Tripoli, Libya / E. Elnifro, A. K. Nisha, M. Almabsoot [et al.] // J. Infect. Dev. Ctries. - 2009. -Vol. 3. - P. 218 - 220.
128. Seroprevalence of parvovirus B19 infection in daycareeducators / N.L. Gilbert, T.W. Gyorcus, C. Beliveau [et al.] // Epidemiol. Infect. - 2005. - Vol. 133. - P. 299 - 304.
129. Shelly, D.A. Parvovirus B19 VLP Vaccine Manufacturing. / Shelly D.A., Van Cleave V. // GEN magazine articles. - 2009. - Vol. 29, N 16.
130. Söderlund, M. Epitope type-specific IgG responses to capsid proteins VP1 and VP2 of human parvovirus B19 / M. Söderlund, C.S. Brown, W.J. Spaan [et al.] // J. Infect. Dis. - 1995b. - Vol. 172. - P. 1431 - 1436.
131. Stela, F.F. Occupational risk of human cytomegalovirus and parvovirus B19 infection in female day care personnel in the Netherlands; a study based on seroprevalence / F.F. Stelma [et al.] // Eur. J. Clin Microbiol. Infect. Dis. - 2009. -Vol. 28. - P. 393-397.
132. Structure and mapping of the DNA of human parvovirus B19 / J. Mori, P. Beattie, D.W. Melton [et al.] // J. Gen. Virol - 1987. - Vol. 68. P. 2797 - 2806.
133. The age-specific prevalence of human parvovirus immunity in Victoria, Australia compared with other parts of the world / H.A. Kelly, D. Siebert, R. Hammond [et al.] // Epidemiol. Infect. - 2000. - Vol. 124. - P. 449 - 457.
134. The burden of parvovirus B19 infection in women of childbearing age in England and Wales / A.J. Vyse, N.J. Andrews, L.M. Hesketh // Epidemiol. Infect. - 2007. - Vol. 135, N 8. - P. 1354 - 1362.
135. The lack of routine surveillance of Parvovirus B19 infection in pregnancy prevents an accurate understanding of this regular cause of fetal loss and the risks posed by occupational exposure / A. P. Watt, M. Brown, M. Pathiraja [et al.] // J. of Medical Microbiology. - 2013. - Vol. 62. - Р. 86 - 92.
136. The prevalence of human parvovirus B19 DNA and antibodies in blood donors from four Chinese blood centers / L. Ke, M. He, C. Li; [et al.] // Transfusion. - 2011. - Vol. 51. - P.1909 - 1918.
137. URL.https: //www.cirlab.ru/library/3/455 (дата обращения 27.06.2018).
138. Virus Taxonomi: 2014 Release. EC 46, Montreal Canada, July 2014, http//www. Ictvonline.org/virus Taxonomi. asp.- (дата обращения15.05.2015).
139. Weigel-Kelley, K.A. Alpha5beta1 integrin as a cellular coreceptor for human parvovirus B19: requirement of functional activation of beta1 integrin for viral entry / K.A. Weigel-Kelley, M.C. Yoder, A. Srivastava // Blood. - 2003. -Vol. 102. - P. 3927 - 3933.
140. Weigel-Kelley, K.A. Recombinant human parvovirus B19 vectors: erythrocyte P antigen is necessary but not sufficient for successful transduction of human hematopoietic cells / K.A. Weigel-Kelley, M.C. Yoder, A.J. Srivastava // Virol. 2001. - Vol. 75, N 9. - P. 4110 - 4116.
141. Wong, A. Seroprevalence of Cytomegalovirus, Toxoplasma and parvovirus in pregnancy / A. Wong, K.H. Tan, C.S. Tee // Signapore Med. J. - 2000. - Vol. 1, N 4. - P. 151 - 155.
142. Yermalovich, M.A. / Human parvovirus B19 surveillance in patients with rash and fever from Belarus / M.A. Yermalovich, J.M. Hubschen, G.V. Semeiko // J. Med. Virol. - 2012. - Vol. 84, N 6. - P. 973 - 978.
143. Young, N.S. Brown Mechanisms of disease: Parvovirus B19 / N.S. Young, K.E. Brown // Engl. J. Med. - 2004. - Vol. 350, N 6. - Р. 586 - 597.
144. A linked donor-recipient study to evaluate parvovirus B19 transmission by blood component transfusion / S. Kleinman, S. Glynn, T. Lee [et al.] // Blood. -2009. - Vol. 114, № 17. - P. 3509 - 3511.
145. B19 virus genome diversit: epidemiological and clinical correlations / G. Gallinella, S. Venturoli, E.J. Manaresi [et al.] // Clin. Virol. - 2003, № 28. - P. 1 -13.
146. Parvovirus B19 infection in fetal deaths / A. Riipinen, E. Vaisanen, M. Nuutila [et al.] // CID - 2008, N. 47. - P. 1519 - 1525.
Приложение А (справочное, информационное)
Документы
о внедрении результатов диссертационной работы
полко]
Акт
о внедрении результатов научных исследований
Настоящий акт составлен о том, что результаты диссертационной работы на соискание учёной степени кандидата медицинских наук преподавателя кафедры (общей и военной эпидемиологии) ФГБВОУ ВО ВМедА имени С.М. Кирова МО РФ Никишова Олега Николаевича «Клинико-эпидемиологические проявления парвовирусной инфекции и состояние гуморального иммунитета среди различных групп населения» внедрены в практическую деятельность специалистов эпидемиологического отдела ФКГУ «985 ЦГСЭН» Минобороны России.
Внедрение результатов диссертационной работы Никишова О.Н. показало свою эффективность при проведении эпидемиологического обследования и ликвидации очагов парвовирусной инфекции в военно-медицинских организациях, воинских частях и учреждениях Западного военного округа.
Начальник эпидемиологического отдела
ФКГУ «985 ЦГСЭН» Минобороны России /\
майор медицинской службы
А. Горенчук
УТВЕРЖДАЮ
МИНИСТЕРСТВО ОБОРОНЫ РОССИЙСКОЙ ФЕДЕРАЦИИ (МИНОБОРОНЫ РОССИИ)
Федеральное государственное
казенное учреждение «442 поенный клинический
госпиталь» Минобороны России филиал М' 14
шооороны В. Токарев
188827 а. Каменка, Выборгский р-н. Ленинградская облаем. Тел/факс: 8 (81378) 99-068
Акт
о внедрении результатов научных исследований
Настоящий акт составлен о том, что результаты диссертационной работы на соискание учёной степени кандидата медицинских наук преподавателя кафедры (общей и военной эпидемиологии) ФГБВОУ ВО ВМедА имени С М. Кирова МО РФ Никишова Олега Николаевича на тему: «Клинико-эпидемиологические проявления парвовирусной инфекции и состояние гуморального иммунитета среди различных групп населения» внедрены в практическую деятельность специалистов филиала № 14 ФКГУ «442 ВКГ» Минобороны РФ (г. Санкт-Петербург).
Результаты диссертационного исследования используются медицинскими специалистами учреждения в целях совершенствования ранней диагностики парвовирусной инфекции и организации санитарно-противоэпидемических (профилактических) мероприятий. Разработанный алгоритм обследования социально значимых контингентов населения позволит предупредить распространение парвовирусной инфекции. В связи с этим внедрение результатов диссертационной работы Никишова О Н. является своевременным и актуальным.
Председатель врачебной комиссии: Заместитель начальника филиала № 14 ФКГУ «442 военный клинический госпиталь»
Минобороны РФ по медицинской части
Члены комиссии:
Начальник терапевтического отделения Заведующая приемным отделением Ординатор хирургического отделения
у?
УТВЕРЖДАЮ Заместитель начальника ФГБВОУ ВО «Военно-медицинская академия имени С.М. Кирова» МО РФ по учебной и научной работе Заслуженный врач РФ доктор медицинских нау
сор
[. Котив
АКТ ВНЕДРЕНИЯ
в учебный процесс кафедры (общей и военной эпидемиологии) федерального государственного бюджетного образовательного учреждения высшего образования «Военно-медицинская академия имени С.М. Кирова» Министерства обороны Российской Федерации результатов научной работы по материалам кандидатской диссертации на тему «Клинико-эпидемиологические проявления парвовирусной инфекции и состояние гуморального иммунитета среди различных групп населения» преподавателя кафедры (общей и военной эпидемиологии) Никишова Олега
Николаевича.
Мы, нижеподписавшиеся, комиссия в составе: председателя, начальника кафедры (общей и военной эпидемиологии), Заслуженного врача РФ kVh. Аминева P.M.; начальника учебной части кафедры (общей и военной эпидемиологии), к.м.н. Шипицина К.С.; профессора кафедры (общей и военной эпидемиологии), д.м.н., профессора Жоголева С.Д.
Удостоверяем, что результаты диссертационного исследования на тему «Клинико-эпидемиологические проявления парвовирусной инфекции и состояние гуморального иммунитета среди различных групп населения» преподавателя кафедры (общей и военной эпидемиологии) Никишова О.Н.
внедрены в практическое занятие «Эпидемиология и профилактика антропонозов с аэрозольным механизмом передачи» для слушателей магистратуры, лекцию «Эпидемиология и профилактика парвовирусной инфекции» для слушателей магистратуры, адъюнктов и аспирантов по направлению подготовки: меди ко-профилактическое дело, направленность программы: эпидемиология (14.02.02) и одобрены на заседании кафедры (общей и военной эпидемиологии), протокол № 7 от 20 марта 2018.
Начальник кафедры
(общей и военной эпидемиологии)
к.м.н.,
Начальник учебной части кафедры (общей и военной эпидемиологии) к.м.н.
Р.М. Аминев
К.С. Шипицин
Профессор кафедры
(общей и военной эпидемиологии)
д.м.н., профессор
С.Д. Жоголев
(подпись)
locus Bl9v_sankt-petersburg.RU5_15.2015_1855 bp dna linear
vrl10-jan-2018
DEFINITION [Primate erythroparvovirus 1 isolate
Bl9v/sankt-petersburg.RUS/15.2015/1] non-structural protein NSl (N51), partial cds, minor capsid protein unique region (VPlu), partial cds.
Bl9v_sankt-petersburg.rus_15.2015_1
accession version keywords source organism
primate erythroparvovirus 1 Primate erythroparvovirus 1
Viruses; ssDNA viruses; Parvoviridae; Parvovirinae; Erythroparvovirus. REFERENCE 1 (bases 1 to 855)
AUTHORS Nikishov,0.N., Antipova,A.Y., Lavrentieva,l.N. and Kuzin,A.A. title Bl9v/sankt-petersburg.rus/15.2015/1 journal unpublished REFERENCE 2 (bases 1 to 855) authors Nikishov.o.n., Anti pova,a.y., Lavrentieva,i.n. and Kuzin.a.a. title Direct Submission
journal Submitted (1q-jan-2018) laboratory of experimental virology, st.-Petersburg Pasteur institute, street Mira, 14, saint-Petersburg, saint-Petersburg 197101, Russia iomment Bankit comment: total # of SEQS:1.
##as sembly-Data-start##
Sequencing Technology :: Sanger dideoxy sequencing ##Assembly-Data-END## EATURES Location/Qualifiers
source 1..855
/organism="primate erythroparvovirus 1" /mol_type="genomic dna"
/isolate="B19V/Sankt-Petersburg.RUS/15.2015/1" /isolation_source="man, 18 years old" /host="Homo sapiens" /bio_material='donor blood" /db_xr ef="taxon:1511900" /country="Russia" /collection_date="2015-04-07" gene <1..471
/gene="NSl" CDS <1..471
/gene="NSl" /codon_start=l
/product="non-structural protein 1"
/transiation="SSEELSESSFFNLITPGAWNTETPR5STPIPGTSSGESFVGSPV S5EWAASWEEAFYTPLADQFRELLVGVDYVWDGVRGLPVCCVQHINNSGGGLGLCPH CINVGAWYNGWKFREFTPDLVRCSCHVGASNPFSVLTCKKCAYLSGLQSFVDYE" gene 464.. >855
/gene="vpl" CDS 464..>855
/gene="vpl" /codon_start=l
/product="minor capsid protein 1 unique region" /translati On="MSKESGKWWESDDKFAKAVYQQFVEFYEKLTGTDLELIQILKDH YNISLDNPLENPSSLFDLVARIKNNLKNSPDLYSHHFQSHGQL5DHPHALSS5N5HAE PRGENAVLSSEDLHKPGQVSVQLPGTNYV1' BASE COUNT 240 a 174 C 193 g 248 t ORIGIN
1 agctctgaag aactcagtga aagcagcttt tttaacctca tcaccccagg cgcctggaac 61 actgaaaccc cgcgctctag tacgcccatc cccgggacca gttcaggaga atcatttgtc 121 ggaagcccag tttcctccga agttgtagct gcatcgtggg aagaagcctt ctacacacct 181 ttggcagacc agtttcgtga actgttagtt ggggttgatt atgtgtggga cggtgtaagg 241 ggtttacctg tgtgttgtgt gcagcatatt aacaatagtg ggggaggctt gggactttgt 301 ccccattgca ttaatgtagg ggcttggtat aatggatgga aatttcgaga atttacccca 361 gatttggtgc ggtgtagctg ccatgtggga gcttctaatc ccttttctgt gctaacctgc 421 aaaaaatgtg cttacctgtc tggattgcaa agctttgtag attatgagta aagaaagtgg 481 caaatggtgg gaaagtgatg ataaatttgc taaagctgtg tatcagcagt ttgtggaatt 541 ttatgaaaag cttactggaa cagacttaga gcttattcaa atattaaaag atcattacaa 601 tatttcttta gataatcccc tagaaaaccc atcctctctg tttgacttag ttgctcgtat
Рисунок 21 - Нуклеотидная последовательность парвовируса В19, депонированная в Международном банке данных GenBank (2015 г., № MG 779500)
(LOCUS Bl9v_Sankt-Petersburg.RUS_15.2015_2889 bp DNA linear
VRLll-JAN-2018
definition [primate erythroparvovirus 1 isolate
B19V/Sankt-Peterburg.RUS/15.2015/2] non-structural protein N51 (N51), partial cds, minor capsid protein unique region (VPlu), partial cds.
ACCESSION Bl9v_Sankt-Petersburg.RUS_15.2015_2
VERSION
KEYWORDS
source primate erythroparvovirus 1 organism Primate erythroparvovirus 1
Viruses; ssDNA viruses; Parvoviridae; Parvovirinae; Erythroparvovirus. REFERENCE 1 (bases 1 to 889) authors Nikishov.o.N., Antipova.A.Y., Khamitova.i.v., ostankova.Y. v. ,
Lavrentieva.i.N. and Kuzin.A. a. title Bl9v/sankt-peterburg.rus/15.2015/2 journal unpublished REFERENCE 2 (bases 1 to 889) authors Nikishov.o.N., Antipova.a.y., Khamitova.i. v. , ostankova.Y.v..
Lavrentieva.i.N. and Kuzin.A.A. title Direct Submission
journal submitted (II-jan-2018) laboratory of experimental virology, st.-Petersburg Pasteur institute, street Mira, 14, Saint-Petersburg, Saint-Petersburg 197101, Russia comment Bankit comment: total # of seqs:1.
##Assembly-Data-START##
Sequencing Technology :: Sanger dideoxy sequencing ##Assembly-Data-END## features Locati on/Qualifi ers
source 1..889
/organism="Primate erythroparvovirus 1" /mol_type="genomic DNA"
/isolate="Bl9v/Sankt-Peterburg. RUS/15.2015/2" /host="Homo sapiens" /bio_material='donor blood" /db_xr ef="taxon:1511900" /country="Russia" /col1ecti on_date="2015-04-07" /note="18 years old man" gene <1..502
/gene="NSl" CDS <1..502
/gene="NSl" /codon_start=2
/product="non-structural protein 1"
/translati on="TDT5I5S5GGESSEEL5ESSFFNLITPGAWNTETPR5STPIPGT SSGESFVGSPVSSEWAASWEEAFYTPLADQFRELLVGVDYVWDGVRGLPVCCVQHIN NSGGGLGLCPHCINVGAWYNGWKFREFTPDLVRCSCHVGASNPFSVLTCKKCAYLSGL QSFVDYE'' gene 498..>889
/gene="vpl" CDS 498..>889
/gene="VPl" /codon_start=l
/product="minor capsid protein 1 unique region" /translation="MSKESGKWWESDDKFAKAVYQQFVEFYEKLTGTDLELIQILKDH YNISLDNPLENPSSLFDLVARIKNNLKNSPDLYSHHFQSHGQLSDHPHALSSSNSHAE P RGE NAVL S S E DL H KPGQVSVQL PGTNYV BASE COUNT 251 a 182 C 203 g 253 t ORIGIN
1 cacagacacc agtatcagca gcagtggtgg tgaaagctct gaagaactca gtgaaagcag 61 cttttttaac ctcatcaccc caggcgcctg gaacactgaa accccgcgct ctagtacgcc 121 catccccggg accagttcag gagaatcatt tgtcggaagc ccagtttcct ccgaagttgt 181 agctgcatcg tgggaagaag ccttctacac acctttggca gaccagtttc gtgaactgtt 241 agttggggtt gattatgtgt gggacggtgt aaggggttta cctgtgtgtt gtgtgcagca 301 tattaacaat agtgggggag gcttgggact ttgtccccat tgcattaatg taggggcttg 361 gtataatgga tggaaatttc gagaatttac cccagatttg gtgcggtgta gctgccatgt 421 gggagcttct aatccctttt ctgtgctaac ctgcaaaaaa tgtgcttacc tgtctggatt
Рисунок 22 - Нуклеотидная последовательность парвовируса В19, депонированная в Международном банке данных GenBank (2015 г., № MG 779501)
® Download v Graphics
Sequence ID: Query_19083 Length: 889 Number of Matches: 1
Range 1: 35 to 889 Graphics
Score
1580 bits(85S)
Expect 0.0
Identities
855/855(100%)
Gaps
0/855(0%)
Strand Plus/Plus
>MG779500 1 >MG779501 35 >MG779500 61 >MG779501 95 >MG779500 1 21 >MG779501 155 >MG779500 181 >MG779501 215 »MG779500 241 >MG779501 275 >MG779500 301 >MG779501 3 3 5 >MG779500 361 >MG779501 3 9 5 >MG779500 421 >MG779501 455 >MG779500 481 >MG779501 5 1 5 >MG779500 541 >MG779501 575 >MG779500 601 >MG779501 635 >MG779500 661 >MG779501 695 >MG779500 721 >MG779501 755 >MG779500 781 >MG779501 8 1 5 >MG779500 841 >MG779501 8 7 5
agctctgaagaactcagtgaaagcagcttttttaacctcatcaccccaggcgcctggaac 60 I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I agcxctgaagaactcagtgaaagcagcttttttaacctcatcaccccaggcgcctggaac 94
actgaaaccccgcgctctagtacgcccatccccgggaccagttcaggagaatcatttgtc 12 0 I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I i I I I I I I I I I I I I I 1 I I I I I I I I I I I I I I I actgaaaccccgcgctctagtacgcccatccccgggaccagttcaggagaatcatttgtc 154
ggaagcccagtttcctccgaagttgtagctgcatcgtgggaagaagccttctacacacct 180 I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I i I I I I I I I I I I I ggaagcccagtttcctccgaagttgtagctgcatcgtgggaagaagccttctacacacct 214
ttggcagaccagtttcgtgaactgttagttggggttgattatgtgtgggacggtgtaagg 240 I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I III I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I ttggcagaccagtttcgtgäactgttagttggggttgattatgtgtgggacggtgtaagg 274
ggtttacctgtgtgttgtgtgcagcatattaacäatagtgggggaggcttgggactttgt 300 I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I ggtttacctgtgtgttgtgtgcagcatattaacaatagtgggggaggctxgggacxtxgt 334
ccccattgcattaatgtaggggcttggtataatggatggaaatttcgagaatttacccca 360 I I I I I I I I I I I I I I II I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I II I I I I I I I I I ccccattgcattaatgtaggggcttggtataatggatggaaatttcgagaatttacccca 394
gatttggtgcggtgtagctgccatgtgggagcttctaatcccttttctgtgctaacctgc 420 llllllllllllllllllllllllllllllllllllllllllllllllllllllllllll gatttggtgcggtgtagctgccatgtgggagcttctaatcccttttctgtgctaacctgc 454
aaäääätgtgcttäcctgtctggattgcaaagctttgtagättätgagtaäagääägtgg 480 I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I III I III II I I III III I II I I I I I I I I I I I I I aaaaaatgtgcttacctgtctggattgcaaagctttgtagattatgagtaaagaaagtgg 514
caaatggtgggaaagtgatgataaatttgctaaagctgtgtatcagcagtttgtggaatt 540 llllllllllllllllllllllllllllllllllllllllllllllllllllllllllll caaatggtgggaaagtgatgataaatttgctaaagctgtgtatcagcagtttgtggaatt 574
ttatgaaaagcttactggaacagacttagagcttattcaaatattaäaagatcattacaa 600 I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I ttatgaaaagcttactggaacagacttagagcttattcaaatattaaaagatcattacaa 634
tatttctttagataätcccctagääääcccatcctctctgtttgacttagttgctcgtat 660 I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I tatttctttagataatcccctagaaaacccatcctctctgtttgacttagttgctcgtat 694
taaaaataaccttaaaaactctccagacttatatagtcatcattttcaaagtcatggaca 720 I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I t aaaaat aacctt aaaaact ctccagacttatatagt catcatttt caaagt cat ggaca 754
gttatctgaccacccccatgccttatcatccagtaacagxcatgcagaacctagaggaga 780 I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I gttatctgaccacccccatgccttatcatccagtaacagxcatgcagaacctagaggaga 814
aaat gcagt attat ct agi gaagacttacacaagcct gggcaagttagcgtacaactacc 840 I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I aaatgcagtattatctagtgaagacttacacaagcct gggcaagttagcgtacaactacc 874
cggtactaactatgt 855 I I I I I I I I I I I I I I I cggtactaactatgt 889
Рисунок 23 - Идентичность нуклеотидных последовательностей изолятов MG 779500 RUS 15.15 и MG 779501 RUS 15.15.2 ф в фрагменте генома парвовируса В19, кодирующего вариабельную область белка VP1 (VP1u).3
Обратите внимание, представленные выше научные тексты размещены для ознакомления и получены посредством распознавания оригинальных текстов диссертаций (OCR). В связи с чем, в них могут содержаться ошибки, связанные с несовершенством алгоритмов распознавания. В PDF файлах диссертаций и авторефератов, которые мы доставляем, подобных ошибок нет.