Катионные α-спиральные олигопептиды - носители ДНК тема диссертации и автореферата по ВАК РФ 02.00.06, кандидат химических наук Гурьянов, Иван Алексеевич
- Специальность ВАК РФ02.00.06
- Количество страниц 126
Оглавление диссертации кандидат химических наук Гурьянов, Иван Алексеевич
Список используемых в тексте сокращений и терминов.
1 ВВЕДЕНИЕ.
2 ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ.
2.1 Молекулярная структура белков и олигопептидов.
2.1.1 Взаимодействие амфипатических олигопептидов с мембранами.
2.2 Проникновение невирусных векторов в клетку.
2.2.1 Комплексообразование и компактизация ДНК.
2.2.2 Связывание с поверхностью клетки. г^ 2.2.3 Транспорт в ядро клетки.
2.3 Носители ДНК в генной терапии.
2.3.1 Использование катионных липидов в качестве носителей ДНК.
2.3.2 Катионные полимеры как носители ДНК.
2.3.3 Использование катионных олигопептидов как носителей ДНК.
3 ОБСУЖДЕНИЕ РЕЗУЛЬТАТОВ.
3.1 Синтез пептидов.
3.1.1 Синтез пептидов РР, РР1 и РР4.
3.1.2 Синтез пептидов N2 и
3.1.3 Синтез пептидов N4 и ЯЖ.
3.2 Изучение вторичной структуры пептидов методом кругового дихроизма.
3.3 Исследование структуры и размеров комплексов синтезированных пептидов с ДНК методом электронной микроскопии.
3.4 Исследование комплексообразования и защиты ДНК от нуклеазного расщепления методом гель-электрофореза.
3.5 Исследование гемолитической активности пептидов.
3.6 Исследование эндосомолитических свойств пептидов
FP1 и FP4.
3.7 Взаимодействие пептидов с аденилатциклазной системой клетки.
4 ЭКСПЕРИМЕНТАЛЬНАЯ ЧАСТЬ.
14 4.1 Материалы.
4.2 Оборудование.
4.3 Методы.
4.3.1 Синтез пептидов FP, FP1, FP4, JTS-1, N2, RN2, N4, RN4.
4.3.2 Спектроскопия кругового дихроизма.
4.3.3 Электронная микроскопия комплексов пептид- ДНК.
4.3.4 Получение комплексов пептид-ДНК и изучение их устойчивости к ферментативному расщеплению методом гель-ретардации (DNase I protection assay).
4.3.5 Определение гемолитической активности.
4.3.6 Оценка эффективности трансфекции комплексами пептид pCMV-nlsLacZ.
4.3.7 Изучение влияния пептидов на аденилатциклазную систему.
5 ВЫВОДЫ.
Рекомендованный список диссертаций по специальности «Высокомолекулярные соединения», 02.00.06 шифр ВАК
Катионные пептиды как средство переноса ДНК в клетки млекопитающих2005 год, кандидат биологических наук Игнатович, Ирина Анатольевна
Синтез и изучение свойств положительно заряженных гидрофобных производных циклических и ациклических полиолов2000 год, кандидат химических наук Маслов, Михаил Александрович
Синтез нейтральных неогликолипидов для создания модульных систем доставки нуклеиновых кислот2013 год, кандидат химических наук Иванова, Екатерина Алексеевна
Перенос генов в клетки млекопитающих с помощью молекулярных конъюгатов: разработка носителей и оптимизация генетических конструкций2012 год, кандидат биологических наук Ефремов, Александр Михайлович
Биологические свойства и гибридизационная способность ген-направленных реагентов на основе дуплекс- и триплексобразующих олигонуклеотидов1999 год, кандидат химических наук Максименко, Андрей Викторович
Введение диссертации (часть автореферата) на тему «Катионные α-спиральные олигопептиды - носители ДНК»
Актуальность работы. В последнее время высокомолекулярные соединения получают все большее распространение в новых биомедицинских технологиях, в частности, в генной терапии, целью которой является коррекция нарушений функционирования генома при помощи двух основных подходов: 1) замены дефектного участка генома нормальным и 2) введения в организм функционально активных генов, продуцирующих необходимые белки или гормоны, либо олигодезоксирибонукпеотидов, регулирующих функциональную активность целевых генов [1-2]. Наиболее распространенным в современной генотерапии способом введения в клетки и ткани терапевтических генов является использование рекомбинантных вирусных векторов, которые обеспечивают высокую эффективность трансфекции, то есть проникновения чужеродного гена. Однако у вирусных векторов есть ряд недостатков. Очень часто они вызывают иммунный ответ, вследствие чего проведение повторных курсов лечения затруднено. Такие векторы также могут встраиваться в геном, что может привести к повреждению других генов. Размер ДНК, которая может быть включена в состав вирусных векторов, ограничен. Кроме того, стоимость их довольно высока и может достигать в настоящее время 200-500 тысяч долларов [3]. Сообщение о смерти одного из пациентов при введении рекомбинантного аденовирусного вектора [4] существенно затормозило все клинические испытания с использованием вирусных векторов и привлекло внимание к поиску новых методов доставки ДНК в клетки и применению невирусных систем, моделирующих отдельные этапы проникновения в клетку вирусов, в том числе полностью синтетических векторов для систематической доставки генов.
Физические методы введения в клетку чужеродного гена (электропорация, бомбардировка микрочастицами с нанесенной на них ДНК и т.д.) не могут широко использоваться из-за низкой выживаемости клеток и невысокой эффективности - только в отдельных клетках, подвергнутых обработке, введенная ДНК оказывается способной к экспрессии, то есть к считыванию гена и синтезу соответствующего белка. Непосредственная инъекция в ядро хоть и является более эффективной [5], не может быть применена в условиях in vivo. Более перспективными являются искусственные макромолекулярные системы, состоящие из синтетических катионных носителей и ДНК. Идеальная система для невирусной доставки ДНК должна:
1) быть структурно хорошо охарактеризованной, нетоксичной, биодеградируемой системой, которая защищает ДНК от действия нуклеаз, t
2) обеспечивать доставку ДНК к определенным типам клеток, то есть иметь лиганд для связывания со специфическими рецепторами на поверхности плазматической мембраны данного типа клеток,
3) способствовать быстрому pH-зависимому освобождению комплекса из эндосом (клеточных образований, куда попадают из внешней среды крупные частицы и высокомолекулярные соединения) и транспорту ДНК в ядро клетки.
При использовании пептидных носителей ДНК многообещающим является синтез многофункциональных пептидов (в том числе с дендримерной структурой), которые позволяют выполнять несколько вышеупомянутых функций одновременно.
Целью данной работы являлся синтез новых олигомерных соединений, как потенциальных носителей ДНК, на основе катионных олигопептидов с теоретически рассчитанной структурой, в. том числе модифицированных гидрофобными остатками каприновой (декановой) кислоты, что позволяет как усилить их взаимодействие с внешней поверхностью клеточной мембраны, так и способствовать освобождению из эндосом их комплексов с ДНК, а также синтез носителей на основе фрагмента пептидной последовательности вируса иммунодефицита человека HIV-1 Tat (48-60), по литературным данным обладающего способностью проникать через мембраны клетки и накапливаться в ядре. Звездообразная структура носителей с наличием нескольких таких фрагментов, а также введение лигандов для связывания с рецепторами на поверхности клетки может усилить эти свойства и способствовать более эффективной защите ДНК от ферментативного расщепления и целевой доставке в ядро клетки. Диссертация предусматривала изучение конформационных характеристик синтезированных носителей и изменения структуры ДНК при взаимодействии ДНК-пептид с помощью метода кругового дихроизма. Образование комплексов носитель-ДНК и защита нуклеиновой кислоты от действия гидролитических ферментов также были изучены с помощью гель-электрофореза. Большое внимание в диссертации уделено исследованию способности синтезированных пептидов нарушать целостность биологических мембран (эритроцитарных и эндосомальных) и влиянию на протекание биохимических реакций в клетке на примере аденилатциклазной системы, что обычно упускается из внимания при создании и исследовании носителя.
Научная новизна работы заключалась в теоретическом поиске наиболее оптимальных структур ДНК-связывающих пептидов и синтезе новых катионных олигопептидов, гидрофильно-гидрофобный баланс которых варьировался от сильно гидрофобного пептида со структурой, способствующей формированию амфипатической а-спирали, до гидрофильных димеров и звездообразных тетрамеров на основе фрагмента 48-60 белка вируса иммунодефицита человека. Изучение свойств синтезированных соединений показало зависимость содержания а-спиральной конформации в структуре пептидов и увеличение размеров их комплекса с ДНК от гидрофобности пептида. Кроме того, было обнаружено, что переход от линейной структуры пептида к звездообразной, а также введение лиганда 01ЮВ8 резко меняет структуру пептида и его комплекса с
ДНК. Впервые было рассмотрено влияние катионных олигопептидов -носителей ДНК — на протекание биохимических процессов в клетке на примере аденилатциклазной системы и был обнаружен рост базальной активности аденилатциклазы с увеличением гидрофобности пептидов, что можно объяснить усилением их взаимодействия с мембраной клетки. Эти данные подтверждаются также ростом гемолитической активности более гидрофобных пептидов и ярко выраженной способностью амфипатического олигопептида к проникновению через эндосомальную мембрану и их следует принимать во внимание при создании поликатионных носителей ДНК и других биологически активных веществ.
Эти результаты составляют основу выносимых на защиту диссертации положений.
Практическая значимость работы: в результате проведенной работы был синтезирован ряд новых катионных олигопептидов, потенциальных носителей ДНК, и изучены их свойства. Поиск новых компактизующих пептидов, модификация их лигандами, позволяющими осуществлять направленный транспорт к определенным типам клеток и транспорт ДНК в их ядра, а также поиск эндосомолитических компактизующих пептидов, которые могут существенно повысить эффективность проникновения чужеродной ДНК в клетку и достигнуть уровня вирусных носителей, избавившись от присущих им недостатков, является одной из главных задач генной терапии. Исследование механизмов проникновения невирусных векторов в клетку, взаимодействия их с клеточными структурами и влияния на биохимические реакции, протекающие в клетке в их присутствии, позволяет определить направление этого поиска. Поэтому проведенная работа является значимой как с научной, так и с практической точки зрения.
Диссертация состоит из 6 разделов: введения, обзора литературы, касающейся данной проблемы, обсуждения результатов проведенной работы, экспериментальной части, выводов и списка литературы, который включает 137 наименований.
Работа выполнена как часть исследований, проводящихся в ИВС РАН по теме "Гидрофильные синтетические и природные полимеры, биологически активные соединения и материалы на их основе". и
2 ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ
Похожие диссертационные работы по специальности «Высокомолекулярные соединения», 02.00.06 шифр ВАК
Линейные и разветвленные поли- и олигопептиды на основе лизинга как средства доставки генных конструкций в клетки млекопитающих2009 год, кандидат биологических наук Егорова, Анна Алексеевна
Синтез и свойства химерных мембрано-активных пептидов на основе грамицидина А2008 год, кандидат химических наук Стоилова, Татьяна Борисовна
Носители противоопухолевых препаратов на основе синтетических полипептидов2009 год, доктор химических наук Буров, Сергей Владимирович
Особенности экспрессии гена аполипопротеина A-l человека после его переноса в организм млекопитающего2004 год, кандидат биологических наук Акифьев, Борис Николаевич
Изучение анти-ВИЧ активности новых комплексных мембранотропных соединений2004 год, кандидат биологических наук Тимофеев, Денис Игоревич
Заключение диссертации по теме «Высокомолекулярные соединения», Гурьянов, Иван Алексеевич
5 ВЫВОДЫ
1. С учетом литературных данных и теоретических расчетов, синтезирован ряд новых катионных олигопептидов, носителей ДНК, гидрофильно-гидрофобный баланс которых варьировался от сильно гидрофобного пептида (FP4) со структурой, способствующей формированию амфипатической ос-спирали, до гидрофильных димеров и тетрамеров звездообразной структуры на основе фрагмента 48-60 белка Tat вируса иммунодефицита человека.
2. Синтез димерной и тетрамерной форм фрагмента 48-60 белка Tat вируса иммунодефицита человека был проведен по оригинальной методике, позволившей получить эти пептиды с высокой степенью чистоты.
3. При изучении с помощью гель-электрофореза (метод ретардации) комплексов пептидов с ДНК было показано, что все синтезированные пептиды способны как к связыванию и компактизации ДНК, так и к ее эффективной защите от ферментативного гидролиза.
4. Изучение вторичной структуры синтезированных пептидов методом кругового дихроизма показало увеличение а-спиральности при возрастании их гидрофобности. Переход от димерной к тетрамерной форме пептидов, фрагментов белка вируса иммунодефицита человека, а также введение лиганда GRGDS по данным кругового дихроизма резко меняет структуру пептида и его комплекса с ДНК.
5. С помощью метода электронной микроскопии было показано, что увеличение гидрофобности пептидов приводит к увеличению размеров комплекса пептида с ДНК.
6. Показано, что более гидрофобные пептиды обладают способностью разрушать биологические мембраны.
7. Впервые на примере аденилатциклазной системы было рассмотрено влияние катионных олигопептидов - носителей ДНК - на протекание биохимических процессов в клетке. Был обнаружен рост базальной активности аденилатциклазы с увеличением гидрофобности пептидов. В то же время гидрофильные катионные пептиды аденилатцитклазную систему не активируют. Эти данные следует принимать во внимание при создании новых поликатионных носителей ДНК и других биологически активных веществ.
Список литературы диссертационного исследования кандидат химических наук Гурьянов, Иван Алексеевич, 2004 год
1. Агат Kh., Aubertin А.-М., Roche А.-С., Monsigny М., Mayer R. Synthesis and antiviral activity of peptide-oligonucleotide conjugates prepared by using ^-(bromoacetyOpeptides. Bioconjugate Chem. 1995. V. 6. P. 573-577
2. Zauner W., Ogris M., Wagner E. Polylysine-based transfection systems utilizing receptor-mediated delivery. Adv. Drug Delivery Rev. 1998. V. 30. P. 97-113
3. Богданенко E. В., Свиридов Ю. В., Московцев А. А., Жданов Р. И. Невирусный перенос генов in vivo в генной терапии. Вопросы медицинской химии. 2000. Т. 46. С. 226-245
4. Smaglik P. Gene therapy death may delay new trials. The Scientist. 1999. V. 13. P. 9-14
5. Capecchi M. R. High efficiency transformation by direct microinjektion of DNA into mammalian cells. Cell. 1980. V. 22. P. 479-483
6. Кнорре Д., Г., Мызина С. Д. Биологическая химия. Москва. "Высшая школа". 1998
7. Никифорович Г. В., Галактионов С. Г., Чипенс Г. И. Конформациипептидных биорегуляторов. Москва. "Медицина". 1983
8. Терентьев А.П., Потапов В.М. Основы стереохимии. Москва. "Химия". 1964
9. Кочетков Н.К., Торгов И.В., Ботвиник М.М. Химия природных соединений. Москва. Издательство Академии Наук СССР. 1961
10. Hruby V., Udenfriend S., Meienhofer J. The peptides. Analysis, synthesis, biology. V.7. London. Academic press, Inc. 1985
11. Xiong H., Buckwalter B. L., Shieh H. M., Hecht M. N. Periodicity of polar and nonpolar amino acids is the major determinant of secondary structure in self-assembling oligomeric peptides. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 1995. V. 92. P. 6349-6353
12. L-P. Liu, Sh.-Ch. Li, N. K. Goto, and Ch. M. Deber. Threshold hydrophobicity dictates helical conformations of peptides in membrane environments. Biopolimers. 1996. V. 39. P. 465-470
13. Honda S., Morii H., Uedaira H. Design of membrane protein consisting of a metal binding loop and a transmembrane helix. Proc. 23th EPS. 1994. P. 447
14. Tripet B., Zhou N., Sonnichsen F., Hodges R. S. Hybritein 1: A de novo designed protein displaying cooperative interactions between a metal-ion binding loop and a helix-helix dimerization motif. Proc. 23th EPS, 1994, P. 79
15. Renold P., Tsang K. Y., Shimizu L., Kemp D. S. For short alanine-lysine peptides the helical propensities of lysine residues (s values) are strongly temperature dependent. J. Am. Chem. Soc. 1996. V. 118. P. 12234-12235
16. Yumoto N., Murase S., Petukhov M. G., Yamamoto H., Tatsu Y., Taguchi T., Yoshikawa S. Effect of the N-terminal modification on the stability of cx-helix in the C-terminal fragment of neuropeptide Y. Proc. 23th EPS, 1994. P. 555
17. Marqusee S., Baldwin R. L. Helix stabilisation by Glu".Lis+ salt bridges in short peptides of de novo design. Proc. Natl. Acad. Sci. USA 1987. V. 84. P. 8898-8902
18. Holtz J. S., Holtz J. H., Chi Z., Asher S. A. Ultraviolet raman examination ofthe environmental dependence of bombolitin I and bombolitin III secondary structure. Biophys. J. 1999. V. 76. №6. P. 3227-323
19. Ruan F., Chen Y., Hopkins P. B. Metal ion enhanced helicity in synthetic peptides containing unnatural, metal-ligating residues. J. Am. Chem. Soc. 1990. V. 112. P. 9403-9404
20. Ghadiri M. R., Feraholz A. K. Peptide architecture. Design of stable a-helical metallopeptides via a novel exchange-inert Ru3+ complex. J. Am. Chem. Soc. 1990. V. 112. P. 9633-9635 J. Am. Chem. Soc. 1990. V. 112. P. 9403-9404
21. Vogel H., Dhanapal B., Pawlak M., Meseth U., Eggleston., Mutter M. Membrane channel forming properties of melittin-TASP. Proc. 23th EPS, 1994, P. 449
22. Coraut I., Buttner K., Dasseux J-L., Dufourcq J. The amphipatic alpha- helix concept. Application to the de novo design of ideally amphipatic Leu, Lys peptides with hemolytic activity higher than the melittin. FEBS Letters. 1994. V. 349. P. 29-33
23. Niidome T., Anzai Sh., Sonoda J., Tokunaga Y., Nakahara M., Hatakeyama T., Ayoagi H. Effect of amino acid substitution in amphiphilic alpha- helical peptides on peptide-phospholipid membrane interaction. J. Pep. Sci. 1999. V. 5. P. 298-305
24. Ohmori N., Niidome T., Hatakeyama T., Mihara H., Aoyagi H. Interaction of alpha- helical peptides with phospholipid membrane: effects of chain length and hydrophobicity of peptides. J. Peptide Res. 1998. V. 51. P. 103-109
25. Blondelle S. E., Takahashi E., Houghten R. A., Perez-Paya E. Design of conformationally defined combinatorial libraries. Proc. 23th EPS, 1994, P. 85
26. Krause E., Rothemund S., Dathe M., Beyermann M., Mark-Kross L. J., Ennis M., Bienert M. Influence of amphipaticity and helicity on the peptide-induced mast cell activation. Proc. 23th EPS, 1994. P. 387
27. R. Epand, Y. Shai, J. Segrest, and G. M. Anantharamaian. Mechanisms for the modulation of membrane bilayer properties by amphipatic helical peptides. Biopolimers. 1995. V. 37. P. 319-338
28. Epand R., Shai Y., Segrest J., Anantharamaian G. M. Mechanisms for the modulation of membrane bilayer properties by amphipatic helical peptides. Biopolimers. 1995. V. 37. P. 319-338
29. Nir S., Nieva J. L. Interacton of peptides with liposomes: pore formation and fusion. Progress in lipid research. 2000. V. 39. P. 181-206
30. T. Niidome, M. Wakamatsu, A. Wada, T. Hirayama, and H. Aoyagi. Required structure of cationic peptide for oligonucleotide- binding and -delivering into cells. J. Pep. Sci. 2000. V. 6. P. 271-279
31. Ряднова И. Ю. Интерполимерные комплексы нуклеиновых кислот с белками. Диссертация на соискание ученой степени кандидата химических наук. С-Петербург. 1999
32. Smith L. С., Duguid J., Manpreed S. W., Logan M. J., Tung Ch.-H., Edwards V., Sparrow J. T. Synthetic peptide-based DNA complexes for nonviral gene delivery. Adv. Drug Delivery Rev. 1998. V. 30. P. 115-131
33. De Smedt S. C., Demeester J., Hennink W. E. Cationic Polymer Based Gene Delivery Systems. Pharm. Res. 2000. V. 17. P. 113-126
34. Porschke D., Ronnenberg J. The reaction of aromatic peptides with double helical DNA. Quantitative characterization of a two step reaction scheme. Biophys. Chem. 1981. V.13. P. 283-290
35. Porschke D. Dynamics of DNA condensation. Biochemistry. 1984. V. 23. P. 4821-4828
36. Yaroslavov A. A., Sukhishvili S. A., Obolsky O. L., Yaroslavova E. G., Kabanov A. V., Kabanov V. A. DNA affinity to biological membranes is enhanced due to complexation with hydrophobized polycation. FEBS lett. 1996. V. 384. P. 177-180
37. Wagner E., Zenke M., Cotten M., Beug H., Birnstiel M. L. Transferrin-polycation conjugates as carriers for DNA uptake into cells. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 1990. V. 87. P. 3410-3414
38. Mervin J. R., Noell G. S., Thomas W. L. Targeted delivery of DNA using YEE(GalNAcAH)3 a synthetic glycopeptide ligand for the asialoglycoprotein receptor. Bioconjug. Chem. 1994. V. 5. P. 612-620
39. Niidome T., Urakawa M., Sato H., Takahara Y., Anai T., Hatakeyama T., Wada A., Hirayama T., Ayoagi H. Gene transfer into hepatoma cells mediated by galactose-modified alpha-helical peptides. Biomaterials. 2000. V.21.P. 1811-1819
40. Feero W. G., Li S., Rosenblatt J. D. Selection and use of ligands for receptor-mediated gene delivery to myogenic cells. Gene Therapy. 1997. V. 4. P. 664674
41. Wagner E., Zenke M. Transferrin-polycation conjugates as carriers for DNA uptake into cells. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 1990. V. 87. P. 3410-3414
42. Gottschalk S., Cristiano R. G., Smith L. S., Woo S. L. Folate receptor mediated DNA delivery into tumor cells: potosomal disruption results in enhanced gene expression. Gene Therapy. 1994. V. 1 P. 185-191
43. Schneider H., Huse K., Birkenmeier G., Otto A., Scholz G. H., Gene transferimediated by a2-macroglobulin. Nucleic Acids Res. 1996. V. 24. P. 3873-3874
44. Huckett В., Ariatti M., Hawtrey A. O., Evidence for targeted gene transfer by receptor-mediated endocytosis. Stable expression following insulin-directed entry of NEO into HepG2 cells. Biochem. Pharm. 1990. V. 40. P. 253-263
45. Rosenkranz A. A., Yachmenev S. V., Jans D. A. Serebryakova N. V., Murav'ev V. I., Peters R., Sobolev A. S. Receptor- mediated endocytosis and nuclear transport of a transfecting DNA construct Exp. Cell Res. 1992. V. 199. P. 323-329
46. Trubetskoy V. S., Torchilin V. P., Kennel S. J., Huang L., Use of N-terminal modified poly(L-lysine)-antibody conjugate as a carrier for targeted gene delivery in mouse lung endothelial cells. Bioconjug. Chem. 1992. V. 3. P. 323-327
47. Геннис P. Биомембраны. Молекулярная структура и функции. Москва. "Мир". 1997
48. Wang K., Guan T., Cheresh D. A., Nemerow G. R. Regulation of adenovirus membrane penetration by the cytoplasmic tail of integrin £5. J. Virology.2000. V. 74. P. 2731-2739
49. Nemerov G., Steward Ph. Role of av integrins in adenovirus cell entry and gene delivery. Microbiol. Molecular Biol. Rev. 1999. V. 63. P. 725-734
50. Scott E. S., Wiseman J. W., Evans M. J., Colledge W. H. Enhanced gene delivery to human airway epithelial cells using an integrin- targeting lipoplex. J. Gene Medicine. 2001. V. 3. P. 125-134
51. Jenkins R. G., Herrik S. E., Meng Q.-H., Kinnon C., Laurent G. J., McAnulty R. J., and Hart S. L. An integrin- targeted non-viral vector for pulmonary gene therapy. Gene therapy. 2000. V.7. P. 393-400
52. Subramanian A., Ranganathan P., Diamond S. L. Nuclear targeting peptide scaffolds for lipofection of nondividing mammalian cells. Nature Biotechnology. 1999. V. 17. P. 873- 877
53. Cartier R., Reszka R. Utilisation of synthetic peptides containing nuclear localization signals for nonviral gene transfer systems. Gene Therapy. 2002. V.9. P. 157-167
54. Pouton C. W. Nuclear import of polypeptides, polynucleotides and supramolecular complexes. Adv. Drug Delivery Rev. 1998. V. 34. P. 51-64
55. Reed M. W., Fraga D., Schwartz D. E., Scholler J., Hinrichsen R. D. Synthesis and evaluation of nuclear targeting peptide- antisense oligodeoxynucleotide conjugates. Bioconjugate Chem. 1995. V. 6. P. 101-108
56. Gariepy J., Kawamura K. Vectorial delivery of macromolecules into cells using peptide- based vehicles. Trends in Biotechnology. 2001. V. 19. P. 21-28
57. Chan C.-K., Senden T., Jans D. A. Supramolecular structure and nuclear targeting efficiency determine the enhancement of transfection by modified polylysines. Gene Therapy. 2000. V. 7. P. 1690-1697
58. Singh D., Kiarash R., Kawamura K., LaCasse E. C., Gariepy J. Penetrationand intracellular routing of nucleus-directed peptide-based shuttles (loligomers) in eukaiyotic cells. Biochemistry. 1998. V. 37. P. 5798-5809
59. Ritter W, Plank C, Lausier J, Rudolph C, Zink D, Reinhardt D, Rosenecker J.
60. A novel transfecting peptide comprising a tetrameric nuclear localization sequence. J. Mol. Med. 2003. V. 81. P. 708-717
61. LimaM. C., Simoes S., Pires P., GasparR., Slepushkin V., Duzgunes N. Genedelivery mediated by cationic liposomes: from biophysical aspects to enhancement of transfection. Mol. Membr. Biol. 1999. V. 16. №1. P. 103109
62. Radler J. O., Koltover I., Salditt T., Safinya C. R. Structure of DNA-cationic liposome complexes: DNA intercalation in multilamellar membranes in distinct interhelical packing regimes. Science. 1997. V. 275. P. 810-814
63. Faneca H., Simoes S., Pedroso de Lima M.C. Evaluation of lipid-based reagents to mediate intracellular gene delivery. Biochim. Biophys. Acta. 2002. V. 1567. P. 23-33
64. Simoes S., Slepushkin V., Pires P. Mechanisms of gene transfer mediated by lipoplexes associated with targeting ligands or pH-sensitive peptides. Gene Therapy. 1999. V. 6. P. 1798-1807
65. Zelphati O., Uyechi L. S., Barron L. G., Szoka Jr F. C. Effect of serum components on the physico-chemical properties of cationiclipid/oligonucleotide complexes and on their interactions with cells. Bioch. Bioph. Acta. 1998. V. 1390. P. 119-133
66. Kabanov A. V., Kabanov V. A. DNA complexes with polycations for the delivery of genetic material into cells. Bioconjug. Chem. 1995. V. 6. P. 7-20
67. Zauner W., Ogris M., Wagner E. Polylysine-based transfection systems utilizing receptor-mediated delivery. Adv. Drug Del. Rev. 1998. V. 30. P. 97113
68. Wagner E., Cotten M., Foisner R., Bimstiel M. L. Transferrin-polycation-DNA complexes: the effect of polycations on the structure of the complex andI
69. DNA delivery to cells. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 1991. V. 88. P. 4255^259
70. Remy J. S., Abdallah B., Zanta M. A., Boussif O., Behr J. P., Demeneix B. Gene transfer with lipospermines and polyethyleneimines. Adv. Drug Deliv. Rev. 1998. V. 30. P. 85-95
71. Haensler J. Szoka F. C. J. Polyamidoamine cascade polymers mediate efficient transfection of cells in culture. Bioconjug. Chem. 1993. V. 4. P. 372379
72. Ohsaki M., Okuda T., Wada A., Hirayama T., Niidome T., Aoyagi H. In vitro gene transfection using dendritic poly(l-lysine). Bioconjug. Chem. 2002. V. 13. P. 510-517
73. Maruyama A., Ishihara T., Kim J. S., Kim S. W., Akaike T. Nanoparticle DNAcarrier with poly(L-lysine) grafted polysaccharide copolymer and poly(D,L-lactic acid). Bioconjug. Chem. 1997. V. 8. P. 735-742
74. Midoux P., Monsigny M. Efficient gene transfer by histidilated polylisine/ pDNA complexes. Bioconjug. Chem. 1999. V. 10. P. 406-411
75. Gottschalk S., Sparrow J. T., Hauer J. A novel DNA-peptide complex for efficient gene transfer and expression in mammalian cells. Gene Therapy. 1996. V. 3. P. 448-457
76. Choi J. S., Lee E. J., Choi Y. H. Polyethylene glycol)-block-poly(l-lysine) dendrimer: novel linear polymer/dendrimer block copolymer forming a spherical water-soluble polyionic complex with DNA. Bioconjug. Chem. 1999. V. 10. P. 62-65
77. Huddle T., Rayner SA., Comer RM. Activated polyamidoamine dendrimers, a non-viral vector for gene transfer to the corneal endothelium. Gene Therapy. 1999. V. 6. P. 939-943
78. Richardson S., Ferruti P., Duncan R. Poly(amidoamine)s as potential endosomolytic polymers: evaluation in vitro and body distribution in normal and tumour-bearing animals. J. Drug Target. 1999.
79. Ohmori N., Niidome T., Kiyota T., Lee S., Sugihara G., Wada A., Hirayama
80. T., Aoyagi H. Importance of hydrophobic region in amphipatic structures of alpha-helical peptides for their gene transfer-ability into cells. Biochem. Biophys. Res. Commun. 1998. V. 245. №1. P. 259-265
81. Forminaya J., Gasset M., Garcia R., Roncal F., Albar J. P., Bernad A. An optimized amphiphilic cationic peptide as an afficient non-viral gene delivery vector. J. Gene Medicine. 2000. V. 2. P. 455-464
82. Niidome T., Takaji K., Urakawa M., Ohmori N., and Wada A. Chain length of cationic a-helical peptide sufficient for gene delivery into cells. Bioconjug. Chem. 1999. V. 10. P. 773-780
83. Niidome T., Urakava M., Takaji K. et. al. Influence of lipophilic groups in cationic a-helical peptides on their abilities to bind with DNA and deliver genes into cells. J. Peptide Res. 1999. V. 54. P. 361-367
84. Morris M. C., Chaloin L., Heitz F., Divita G. Translocating peptides and proteins and their use for gene delivery. Current Opinion in Biotechnology. 2000. V. 11. P. 461-466
85. Rittner K., Benavente A., Bombard-Sorlet A., Heitz F., Divita G., Brasseur R., Jacobs E. New basic membrane-destabilizing peptides for plasmid-based gene delivery in vitro and in vivo. Molecular Therapy. 2002. V. 5. P. 104-114
86. Vaysse L., Arveiler B. Transfection using synthetic peptides: comparison of three DNA-compacting peptides and effect of centrifugation. Bioch. Bioph. Acta. 2000. V. 1474. P. 244-250
87. Gottschalk S., Sparrow J. T., Hauer J., Mims M. P., Leland F. E., Woo S. L. C., Smith L. C. A novel DNA-peptide complex for efficient gene transfer and expression in mammalian cells. Gene Therapy. 1996. V.3. P. 448-457
88. Vaysse L., Burgelin I., Merlio J. P., Arveiler B. Improved transfection usingepithelial cell line-selected ligands and fusogenic peptides. Biochim.
89. Biophys. Acta. 2000. V. 1475. P. 369-376
90. Sheldon K., Liu D., Ferguson J., Gariepy J. Loligomers: Design of de novo peptide-based intracellular vehicles. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 1995. V. 92. P. 2056-2060
91. Okuda Т., Sigiyama A., Niidome Т., Ayoagi H. Characters of dendritic poly(l-lysine) analogues with the terminal lysines replaced with arginines and histidines as gene carriers in vitro. Biomaterials. 2004. V. 25. P.537-544
92. Rodryguez-Hernandez J., Gatti М., Klok Н-А. Highly branched poly(l-lysine). Biomacromolecules. 2003. V. 4. P. 249-258
93. Lee H. J., Pardrige W. M. Pharmacokinetics and delivery of Tat and Tatprotein conjugates to tissues in vivo. Bioconjugate Chem. 2001. V. 12. P. 995-999
94. Torchilin V., Rammohan R., Weissig V., Levchenko T. Tat peptide on the surface of liposomes affords their efficient intracellular delivery even at low temperature and in presence of metabolic inhibitors. PNAS. 2001. V. 98. №15. P. 8786-8791
95. Rudolph C., Plank C., Lausier J., Schillinger U., Muller R., Rosenecker J. Oligomers of the arginine-rich motif of the HIV-1 Tat protein are capable of transferring plasmid DNA into cells. J. Biol. Chem. 2003. V. 128. №13. P. 11411-11418
96. Perutz M. F., Johnson Т., Suzuki M., Finch J. Glutamine repeats as polar zippers: their possible role in inherited neurodegenerative deseases. Proc. Natl. Acad Sci. USA. 1994. V. 91. P. 5355-5358
97. Кузнецова Л.А., Плеснева С.А. Влияние биогенных аминов и полипептидных гормонов на активность протеинкиназы "А" и аденилатциклазы в мышцах моллюска Anodonta cygnea. Ж. эволюц. биохим. физиол. 2001. Т. 37. №5. С. 395-400
98. Strader C.D., Fong T.M., Tota M.R., Underwood D., Dixon R.A.F. Structure and function of G protein-coupled receptors Annu. Rev. Biochem. 1994. V. 63. P. 101-132
99. Wess J. G protein-coupled receptors: molecular mechanisms involved in receptor activation and selectivity of G protein recognition FASEB J. 1997. V. 11. P. 346-354
100. Flawia M.M., Torres H.N. Adenylate cyclase activity in Neurospora crassa. III. Modulation by glucagon and insulin. J. Biol. Chem. 1973. V. 248. P. 4517-4520
101. Galperin M.Y., Nikolskaya A.N., Koonin E.V. Novel domains of the prokaryotic two-component signal transduction systems. FEMS Microbiol Lett. 2001. V. 203. P. 11-21
102. Paveto C., Mallo G., Egidy G., Galvagno M.A., Passeron S. Activation of the cAMP cascade by steroidogenic hormones and glucagon in the pathogenic fungus Candida albicans. Cell Biol Int. Rep. 1991. V. 15. P. 169-178
103. Simon M.I., Strathmann M.P., Gautam N. Diversity of G proteins in signal transduction. Science. 1991. V. 252. P. 802-808
104. Inoue H., Yoshioka T. Purification of a regulatory subunit of type II cAMP-dependent protein kinase from Drosophila heads Biochem. Biophys. Res. Commun. 1997. V. 235. P. 692-696
105. Kariya K., Saito K., Iwata H. Adrenergic mechanism in Tetrahymena. III. cAMP and cell proliferation. Jap. J. Pharmacol. 1974. V. 24. P. 129-134
106. Перцева М.Н., Шпаков А.О., Плеснева С.А. Современные достижения в изучении сигнальных механизмов действия инсулина и родственных ему пептидов. Ж. эволюц. биохим. физиол. 1996. Т. 32. №3. С. 318-340
107. Шпаков А.О. Молекулярные детерминанты рецепторов и ГТФ-связывающих белков, определяющие специфичность взаимодействий между ними. Журн. эволюц. биохим. физиол. 1996. Т. 32. №4. С. 488-511
108. Перцева М.Н., Шпаков А.О. Консервативность инсулиновой сигнальной системы в эволюции беспозвоночных и позвоночных животных. Журн. эволюц. биохшл. физиол. 2002. Т. 38. №5. С. 430-441
109. Brzostowski J.A., Kimmel A.R. Signaling at zero G: G-protein-independent functions for 7-TM receptors Trends Biochem. Sci. 2001. V. 26. P. 291-297
110. Gudermann Т., Kalkbrenner F., Schultz G. Diversity and selectivity of receptor-G protein interaction.Annu. Rev. Pharmacol. Toxicol. 1996. V. 36. P. 429-460
111. Bourret R.B., Borkovich K.A., Simon M.J. Signal transduction pathways involving protein phosphorylation in prokaryotes. Ann. Rev. Biochem. 1991. V. 60. P. 401-441
112. Janetopoulos C., Jin Т., Devreotes P. Receptor-mediated activation of heterotrimeric G-proteins in living cells. Science. 2001. V. 291. P. 24082411
113. Srinivasan J., Gundersen R.E., Hadwiger J.A. Activated G subunits can inhibit multiple signal transduction pathways during Dictyostelium development. Dev. Biol. 1999. V. 215. P. 443-452
114. Шпаков А.О., Перцева М.Н. Структурно-функциональная характеристика ГТФ-связывающих белков беспозвоночных животных Журн. эволюц. биохим. физиол. 1993. Т. 29. №5-6. С. 635-653
115. Шпаков А.О., Перцева М.Н. Структурно-функциональная характеристика Ру-субъединиц G-белков и молекулярные механизмы их сопряжения с другими компонентами систем сигнальной трансдукции Журн. эволюц. биохим. физиол. 1997. Т. 33. №6. С. 669688
116. Shpakov А.О. Molecular basis of the functional coupling of receptors to GTP-binding proteins. Membr. and Cell Biol. 1996. V. 9. P. 467-488
117. Wess J. Molecular basis of receptor/G protein-coupling selectivity Pharmacol. Ther. 1998. V. 80. P. 231-264
118. Гершкович А. А., Кибирев В. К. Синтез пептидов. Реагенты и методы. Киев. "Наукова думка". 1987
119. Додсон Р., Эллиот Д., Эллиот У., Джонс К. Справочник биохимика. Москва. "Мир". 1991
120. Kamber В., Hartmann A., Riniker К., Rink В., Sieber P., Rittel W. Helv. Chem. Acta. 1980. V. 63. P. 899-914
121. Маниатис E., Фрич Э., Сэмбрук Дж. Молекулярное клонирование. Методы генетической инженерии. Москва, "Мир", 1984
122. Kidwai A.M., Radcliffe A.M., Lee E.V., Daniel E.E. Isolation and properties of skeletal muscle membrane. Biochim. Biophys. Acta. 1973. V. 289. P. 593607
123. Salomon Y., Londos C., Rodbell M.A. Highly sensitive adenylate cyclase assay. Anal. Biochem. 1974. V. 58. P. 541-548
Обратите внимание, представленные выше научные тексты размещены для ознакомления и получены посредством распознавания оригинальных текстов диссертаций (OCR). В связи с чем, в них могут содержаться ошибки, связанные с несовершенством алгоритмов распознавания. В PDF файлах диссертаций и авторефератов, которые мы доставляем, подобных ошибок нет.