Роль посттрансляционных модификаций клеточных белков в регуляции репликации и транскрипции у микроорганизмов тема диссертации и автореферата по ВАК РФ 03.00.07, кандидат биологических наук Лёзина, Лариса Евгеньевна

• Лёзина, Лариса Евгеньевна
• кандидат биологических наук
• 2004

Оглавление диссертации кандидат биологических наук Лёзина, Лариса Евгеньевна

ВВЕДЕНИЕ.

1. ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ.

1.1. Вирус Эпстайна-Барр: молекулярные механизмы регуляции вирусной репликации и роль клеточных факторов.

1.2. Теломеры, как аналоги нонамеров вирусного генома, и факторы, связывающиеся с теломерными повторами.

1.3. Регуляция инициации транскрипции на уровне формирования прединициационного транскрипционного комплекса

1.3.1. Образование и свойства прединициационного транскрипционного комплекса у дрожжей.

1.3.2. Роль фактора TFIIA в регуляции транскрипции.

1.4. Регуляция жизнедеятельности вирусов и клеток на уровне посттрансляционных модификаций белков.

1.4.1. Роль поли-АДФ-рибозилирования белков в жизни клетки.

1.4.2. Фосфорилирование и его роль в регуляции транскрипции.

2. МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ.

3. РЕЗУЛЬТАТЫ.

3.1. Идентификация теломерных белков, ассоциированных с DS-элементом через взаимодействие с EBNA1.

3.2. Ассоциация теломерных факторов с oriP в латентно инфицированной клеточной линии лимфомы Бёркитта.

3.3. Кооперативное связывание TRF2 и EBNA1 с DS элементом.

3.4. Влияние белков, связывающихся с нонамерными последовательностями, на опР-зависимую репликацию ДНК.

3.5. Функции нонамеров в поддержании стабильности вирусного генома.

3.6. Влияние поли-АДФ-рибозных модификаций на функцию поддержания стабильности вирусного генома.

3.7. Значение взаимодействия между TFIIA и ТВР для роста и жизнеспособности дрожжей.

3.8. Нарушение клеточного цикла у дрожжей, мутантных по TFIIA.

3.9. Роль взаимодействия между TFIIA и ТВР в выборе промотора in vivo.

3.10. Активатор- и промотор- зависимые дефекты у дрожжей, мутантых по TFIIA.

3.11. In vivo фосфорилирование Toal субъединицы TFIIA комплекса.

3.12. Стимуляция образования TFIIA-TBP-ДНК комплекса в результате фосфорилирования Toal.

3.13. Значение фосфорилирования Toal для поддержания индуцибельной транскрипции группы промоторов in vivo.

3.14. Влияние фосфорилирования Toal на жизнеспособность дрожжей.

4. ОБСУЖДЕНИЕ РЕЗУЛЬТАТОВ.

ВЫВОДЫ.

Введение диссертации (часть автореферата) на тему «Роль посттрансляционных модификаций клеточных белков в регуляции репликации и транскрипции у микроорганизмов»

Актуальность темы. Любой живой организм, на каком бы уровне организации он не находился, представляет собой открытую систему. Он постоянно находится под воздействием внешних факторов, и потому должен обладать способностью быстро и адекватно реагировать на изменения, происходящие во внешней среде. Жизненный цикл любого организма включает в себя пролиферацию, сопровождающуюся циклическими изменениями, происходящими во всем организме, и, если речь идет о многоклеточных организмах, дифференциацию, сопровождающуюся изменениями, происходящими на определенной фазе развития организма. Все эти процессы требуют от организма присутствия четких регуляторных механизмов, способных модулировать его функции и поддерживающих его в стабильном состоянии. Из числа таких регуляторных механизмов, особое значение принадлежит посттрансляционным модификациям.

Посттрансляционные модификации играют большую роль в регуляции тонких процессов жизнедеятельности. Способность быстро модифицировать функциональный белок, добавляя или снимая с его поверхности физиологически активные группы с помощью специфических ферментов, тем самым меняя заряд на его поверхности, конформацию и другие физико-химические свойства, позволяет использовать эти модификации в качестве «переключателя» во многих клеточных процессах. К таким посттрансляционным модификациям относятся фосфорилирование, ацетилирование, гликозилирование и другие.

Фосфорилирование представляет собой наиболее общий и важный механизм быстрой и обратимой регуляции белковых функций. Исследования животных клеток выявили, что примерно одна треть всех клеточных белков ковалентно модифицирована фосфорилированием. Фосфорилирование белков и последующее их дефосфорилирование действуют совместно в , сигнальных путях и вызывают быстрые изменения в ответ на воздействия гормонов, факторов роста и нейротрансмиттеров. Большинство факторов роста [Heldin, 1995] и цитокининов [Ihle et al., 1994] стимулируют фосфорилирование во время связывания со своими рецепторами. Индуцированное фосфорилирование в свою очередь активирует цитоплазматические протеинкиназы [Marshall, 1995]. Дополнительно, клеточный цикл у всех эукариот в обеих G1/S и G2/M переходных фазах регулируется циклин-зависимыми протеинкиназами [Doree and Galas, 1994]. Фосфорилированием также контролируется дифференциация и развитие клеток, а в определенных случаях и метаболизм.

По сравнению с ацетилированим и фосфорилированием, гликозилирование является более узко направленной модификацией, необходимой для поддержания структурной целостности белков. Поли-АДФ-рибозилирование является одним из определяющих процессов, регулирующих жизнь клетки. Он представляет собой посттрансляционную ' модификацию ядерных белков, как немедленный ответ клетки на разрушение ДНК, вызванное ионизирующей радиацией, окислением и мутагенами [Ате et al., 2000]. Кроме того, поли-АДФ-рибозилирование играет существенную роль в регуляции процессов экспрессии генов и некоторых аспектов репликации ДНК [D'Amours et al., 1999; Dantzer et al., 1999; Kraus and Lis, 2003].

Одновременно вопросы, касающиеся таких фундаментальных процессов регуляции живых организмов, как наследование генетической информации и ее реализация, находятся на переднем крае современной биологии. Такие процессы, как репликация и транскрипция ДНК, являются наиболее важными, благодаря которым реализуется программа развития всех живых организаций, от индивидуальных организмов до целых популяций.

В связи с вышеизложенным определяется актуальность исследования роли различных посттрансляционных модификаций в регуляции жизненноважных функций находящихся на различных уровнях организации микроорганизмов, таких как репликация и транскрипция.

Цель и задачи исследований. Целью настоящей работы являлось изучение функций белков, принимающих участие в инициации транскрипции дрожжей и репликации вируса Эпстайна-Барр, а также механизмов их регуляции на уровне посттрансляционных модификаций.

В соответствии с заданной целью были поставлены следующие задачи.

1. Выделить и охарактеризовать белки, входящие в состав комплекса, связанного с сайтом инициации репликации oriP вируса Эпстайна-Барр.

2. Определить потенциальный вклад активности отдельных белков в регуляцию инициации репликации и поддержания стабильности генома вируса Эпстайна-Барр.

3. Установить функциональную активность основного транскрипционного фактора дрожжей TFIIA в зависимости от выбранного промотора in vivo.

4. Выявить роль посттрансляционных модификаций транскрипционного фактора TFIIA в формировании прединициационного комплекса на различных типах промоторов.

5. Подтвердить значение различных типов посттрансляционных модификаций белков - поли-АДФ-рибозилирования и фосфорилирования - в регуляции жизненноважных функций микроорганизмов.

Научная новизна. Используя новую методику биохимического выделения ДНК-связывающих белков, впервые выделена и идентифицирована группа клеточных белков, специфически взаимодействующих с сайтом инициации репликации oriP вируса Эпстайна-Барр in vitro и in vivo. Этими белками оказались теломерные белки, участвующие в регуляции длины теломер. Показано влияние выделенных > белков на функции репликации и поддержания стабильности вирусного генома. Отмечено, что эти функции регулируются различными механизмами двух типов: пассивным, за счет белок-белковых взаимодействий, и энзиматически активным за счет посттрансляционных модификаций.

Установлено, что поли-АДФ-рибозилированне регулирует стабильность вирусного генома, модифицируя белки комплекса, связанного с oriP.

Впервые показана in vivo необходимость образования стабильного комплекса между транскрипционными факторами TFIIA и ТВР (TATA Binding Protein) и промоторной ДНК для нормального роста и жизнеспособности дрожжей Saccharomyces cerevisiae. Показано, что стабильное взаимодействие между TFIIA и ТВР является лимитирующим фактором для экспрессии некоторых, но не всех, генов класса II (регулируемых РНК-полимеразой II). Особенно важны такие взаимодействия для экспрессии генов, содержащих индуцибельные промоторы, а также для генов, специфически регулируемых на определенных фазах клеточного цикла. Все это позволило подтвердить функцию TFILA, как транскрипционного фактора, зависимого от структуры корового промотора, и необходимого для инициации транскрипции определенной группы генов in vivo. Впервые получены данные о фосфорилировании TFIIA in vivo в дрожжах. Показано, что фосфорилирование TFIIA стимулирует его комплексообразование с ТВР и промоторной ДНК, что является необходимым условием для поддержания максимального уровня транскрипции с некоторых промоторов in vivo.

Вышеуказанные научные факты и наблюдения позволили выявить общие закономерности функционирования живых систем разного уровня организации, а также механизмов регуляции их наиболее важных процессов жизнедеятельности. В результате проведенных исследований на защиту выносятся следующие научные положения, отражающие новизну проделанной работы.

Основные защищаемые положения диссертации:

I. Клеточные белки, связывающиеся с сайтом инициации репликации oriP вируса Эпстайна-Барр, принимают участие в регуляции функций репликации и поддержания стабильности вирусного генома, в том числе используя посттрансляционный механизм поли-АДФ-рибозилирования белков для снижения активности исследуемых функций.

2. Основной транскрипционный фактор TFIIA регулирует формирование прединициационного транскрипционного комплекса in vivo на промоторах определенной группы генов в дрожжах Saccharomyces cerevisiae, выполняя в определенных случаях зависимую от его фосфорилирования функцию ко-активатора.

3. Посттрансляционные модификации белков, на примере поли-АДФ-рибозилирования и фосфорилирования, представляют универсальный механизм регуляции жизненноважных функций микроорганизмов, обладающих различными уровнями организации.

Практическая значимость работы. Вирусом Эпстайна-Барр инфицировано более 90% человечества. Хотя он в большинстве случаев устанавливает "молчащую" латентную инфекцию, он также ассоциирован с некоторыми раковыми заболеваниями. Результаты работ по изучению регуляции процессов жизнедеятельности вируса Эпстайна-Барр способствуют выявлению механизма участия вируса в этих заболеваниях. Определение путей регуляции, в частности репликации вирусной ДНК и поддержания стабильности его генома, и нахождение способов модуляции этих процессов дает возможность использовать эти знания в медицинских целях, в разработке фармакологических препаратов. К тому же есть основание предполагать, что некоторые другие вирусы могут обладать похожим механизмом регуляции репликации.

Дрожжи, в частности Saccharomyces cerevisiae (пекарские дрожжи), широко применяются в производстве, поэтому базисные исследования транскрипции их белков могут быть использованы в дальнейшем в разработке новых технологий, новой продукции, а также в усовершенствовании производственных процессов.

Связь работы с базовыми научными программами. Работа в течение 1994 - 2004 гг. проводится в соответствии с планом НИР Казанского государственного университета (№ госрегистрации 01910049994). Исследование в рамках тематики работы были поддержанными грантами NIH(GM 12345-01 и GM 5 4687-02, США) и грантами Leukemia S ociety о f America (США) и American Cancer Society (США).

Место выполнения работы. Работа выполнена на кафедре микробиологии Казанского государственного университета под руководством д.б.н. О.Н. Ильинской и в отделе молекулярной генетики Института анатомии и биологии Уистара (Wistar Institute, г. Филадельфия, США) под руководством д.б.н. П.М. Либермана.

Апробация работы. Материалы диссертации доложены и обсуждены на итоговых конференциях кафедры микробиологии КГУ, на IV научной конференции молодых ученых, аспирантов и студентов «Материалы и технологии XXI века» (Казань, 2004), на отчетных научно-практических конференциях молодых ученых института анатомии и биологии Уистера (Филадельфия, США, 1998, 1999, 2000, 2001).

Публикации. Основной материал диссертационной работы нашел отражение в 6 печатных работах. Из них 4 научные работы опубликованы в центральной зарубежной и 1 — в российской печати, 1 — в сборнике тезисов докладов российской конференции.

Благодарности. Автор выражает искреннюю благодарность сотрудникам института Уистера (США), в сотрудничестве с которыми возникла идея этой работы, Д. Озеру, С.П. Солоу, 3. Дэнд, Ч.-Д. Чен, С. Штивелбанд, а также сотрудникам кафедры микробиологии Казанского государственного университета за теплую рабочую атмосферу Автор выражает благодарность профессору Н.А. Барлеву за критические замечания по структуре и содержанию диссертационного материала. Автор особо благодарит своих научных руководителей профессора О.И. Ильинскую и профессора П.М. Либермана.

1. ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ

Заключение диссертации по теме «Микробиология», Лёзина, Лариса Евгеньевна

ВЫВОДЫ:

1. Выделенные нами белки клеток человека, взаимодействующие с DS элементом сайта инициации репликации oriP вируса Эпстайна-Барр, являются факторами, регулирующими длину теломер. Их взаимодействие с oriP строго зависит от ключевого вирусного белка EBNA1. Клеточный белок TRF2 непосредственно связывается с наномерными сайтами DS элемента в присутствии EBNA1, кооперативно усиливая способность последнего к комплексообразованию.

2. Показано, что клеточные белки, в том числе поли(АДФ-рибозо)полимеразы, являются частью системы регуляции репликации и поддержания стабильности генома вируса Эпстайна-Барр. Нами установлено наличие как пассивного, так и энзиматически активного механизма этой регуляции, к которому относится поли-АДФ-рмбозилирование белков репликационного комплекса.

3. Выявлено, что основной транскрипционный фактор TFIIA, в зависимости от структуры корового промотора, может функционировать как ко-активатор. При этом взаимодействие между TFIIA и ТВР является определяющим фактором в регуляции инициации транскрипции in vivo определенных генов в дрожжах Saccharomyces cerevisiae.

4. Впервые показано, что TFIIA фосфорилируется in vivo в дрожжах. Эта модификация TFIIA важна как для формирования прединициационного транскрипционного комплекса так и для поддержания максимального уровня транскрипции некоторых индуцибильных генов.

5. На примере микроорганизмов, находящихся на разных уровнях развития — вирусов и дрожжей — нами подтверждена универсальность посттрансляционных модификаций белков, в частности, поли-АДФ-рибозилирования и фосфорилирования, как механизма регуляции важнейших функций живых существ.

Список литературы диссертационного исследования кандидат биологических наук Лёзина, Лариса Евгеньевна, 2004 год

1. Кузнецова Н.Н. Методы генной инженерии / Н.Н.Кузнецова, В.Г.Винтер. - М.:Биоинформсервис, 1997. — 256 с.

2. Михайлов B.C. ДНК-полимеразы эукариот // Мол. биол. 1999. - Т.ЗЗ, N4. - С. 567-580.

3. Рубцов П.М. Альтернативные промоторы и процессинг РНК в экспрессии эукариотического генома // Мол. биол. 2000. - Т.34, N4. — С. 626-634.

4. Сингер М. Гены и геномы / М.Сингер, П.Берг. М.:Мир, 1998. - 2т.

5. Журавлева Г.А. Геном дрожжей и первые шаги в постгеномную эру / Г.А.Журавлева, Л.Н.Миронова, С.Г.Инге-Вечтомов // Мол. биол. 2000. -Т.34,N4.-С. 560-571.

6. Adams A. Replication of latent Epstein-Вагг virus genomes in Raji cells // J. Virol. 1987.-61. - P. 1743-1746.

7. Aiyar A. The plasmid replicon of EBV consists of multiple cis-acting elements that facilitate DNA synthesis by the cell and a viral maintenance element / A.Aiyar, C.Tyree, B.Sugden // EMBO J. 1998. - 17. - P. 63946403.

8. Akoulitchev S. Requirement for TFIIH kinase activity in transcription by RNA polymerase II / S.Akoulitchev, T.P.Makela, R.A.Weinberg, D.Reinberg // Nature. 1995. - 377. - P. 557-560

9. Aimer A. Removal of positioned nucleosomes from the yeast PH05 promoter upon PH05 induction releases additional upstream activating DNA elements /

10. A.Almer, H.Rudolph, A.Hinnen, W.Horz // EMBO J. 1986. - 5. - P. 26892696.

11. Althaus F.R. ADP-ribosylation of Proteins. Enzymology and Biological Significance / F.R.Althaus, C.Richter // Berlin, Heidelberg, New York: Springer, 1987.-P. 1-232.

12. Alvarez-Gonzalez R. Regulatory mechanisms of poly(ADP-ribose) polymerase / R.Alvarez-Gonzalez, T.A.Watkins, P.K.Gill, J.L.Reed H.Mendoza-Alvarez // Mol. Cell. Biochem. 1999. - 193. - P. 19-22.

13. Amon A. Mechanisms that help the yeast с ell с ycle clock tick: G2cyclins transcriptionally activate G2 cyclins and repress G1 cyclins / A.Amon, M. Tyers, B.Futcher, K.Nasmyth // Cell. 1993. - 74. - P. 993-1007.

14. Apone L.M. Yeast TAFII90 is required for cell cycle progression through G2/M but not for general transcription activation / L.M.Apone, C.-M.A. Virbasius, J.C.Reece, M.R.Green // Genes Dev. 1996. - 10. - P. 2368-2380.

15. Auble D.T. Motl, a global repressor of RNA polymerase II transcription, inhibits TBP binding to DNA by an ATP-dependent mechanism / D.T.Auble, K.E.Hansen, C.G.Mueller, W.S.Lane, J.Thorner, S.Hahn // Genes Dev.- 1994. -8.-P. 1920-1934.

16. Ausubel F.M. Current Protocols in Molecular Biology / F.M.Ausubel, RBrent, R.E.Kingston, D.D.Moore, J.G.Seidman, J.A.Smith, K.Struhl (eds.), // New York: Greene and Wiley-Interscience, 1997.

17. Blackburn E.H. Switching and signaling at the telomere // Cell. 2001. - 106. -P. 661-673.

18. Bochkarev A. Crystal structure of the DNA-binding domain of the Epstein-Barr virus origin-binding protein EBNA 1 / A.Bochkarev, J.A.Barwell, R.A.Pfuetzner, W.Jr.Furey, A.M.Edwards, L.Frappier // Cell. 1995. -83. -P. 39-46.

19. Bochkarev A. Crystal structure of the DNA-binding domain of the Epstein-Barr virus origin-binding protein, EBNAl, bound to DNA / A.Bochkarev, J.A.Barwell, RA.Pfiietzner, E.Bochkareva, L.Frappier, A.M.Edwards // Cell. -1996.-84, 5.-P. 791-800.

20. Bogan J. A. Initiation of eukaryotic DNA replication: conservative or liberal? / J.A.Bogan, D.A.Natale, M.L.Depamphilis // J. Cell. Physiol. 2000. - 184. -P. 139-150.

21. Broccoli D. Human telomeres contain two distinct Myb-related proteins, TRF1 and TRF2 / D.Broccoli, A.Smogorzewska, L.Chong, T.de Lange // Nat. Genet. 1997. - 17. - P. 231-235.

22. Broccoli D. Telomerase activity in normal and malignant hematopoietic cells / D.Broccoli, J.W.Young, T.de Lange // Proc Natl Acad Sci USA. 1995. - 92. -P. 9082-9086.

23. Bryant G.O. Radical mutations reveal TATA-box binding protein surfaces required for activated transcription in vivo / G.O.Bryant, L.S.Martel, S.K.Burley, A.J.Berk // Genes Dev. 1996. - 10. - P. 2491-2504.

24. Buratowski S. Five intermediate complexes in transcription initiation by RNA polymerase II / S.Buratowski, S.Hahn, L.Guarente, P.A.Sharp // Cell. 1989. -56.-P. 549-561.

25. Burke T.W. Drosophila TFIID binds to a conserved downstream basal promoter element that is present in many TATA-box-deficient promoters / T.W. Burke, J.T.Kadonaga // Genes Dev. 1996. - 10. - P. 711-724.

26. Burley S.K. Biochemistry and structural biology of transcription f actor IID (TFIID) / S.K.Burley, R.G.Roeder // Annu. Rev. Biochem. 1996. - 65. - P. 769-799.

27. Butler A.J. Poly(ADP-ribose) polymerase binds with transcription enhancer factor 1 to MCAT1 elements to regulate muscle-specific transcription / A.J.Butler, C.P.Ordahl // Mol. Cell. Biol. 1999. - 19. - P. 296-306.

28. Caelles C. M-phase-specific phosphorylation of the POU transcription factor ^ GHF-1 by a cell cycle-regulated protein kinase inhibits DNA binding /

29. C.Caelles, H.Hennemann, M.Karin // Mol. Cell, Biol. 1995. - 15. - P. 66946701.

30. Carey M. A mechanism for synergistic activation of a mammalian gene by GAL4 derivatives / M.Carey, Y.S.Lin, M.R.Green, M.Ptashne // Nature. -1990.-345.-P. 361-364.

31. Cervellera M.N. Poly(ADP-ribose) polymerase is a B-MYB coactivator / M.N.Cervellera, A.Sala // J. Biol. Chem. 2000. - 275. - P. 10692-10696.

32. Chatterjee S. Connecting a promoter-bound protein to TBP bypasses the need for a transcriptional activation domain / S.Chatteijee, K.Struhl // Nature. -1995.-374.-P. 820-822.

33. Chaudhuri B. Human DNA replication initiation factors, ORC and MCM, associate with oriP of Epstein-Barr virus / B.Chaudhuri, H.Xu, I.Todorov, A.Dutta, J.L.Yates // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 2001. - 98. - P. 1008510089.И

34. Chen Y. Identification of the C-terminal activator domain in yeast heat shock factor: independent control of transient and sustained transcriptional activity / Y.Chen, N.A.Barlev, O.Westergaard, B.KJakobsen // EMBO J. 1993. - 12. -P. 5007-5018.

35. Chi T. A general mechanism for transcriptional synergy by eukaryotic activators / T.Chi, P.Lieberman, K.Ellwood, M.Carey // Nature. 1995. -377.-P. 254-257.

36. Choy B. Eukaryotic activators function during multiple steps of preinitiation complex assembly / B.Choy, M.R.Green // Nature. 1993. - 366. - P. 531536.

37. Cisek L.J. Phosphorylation of RNA polymerase by the murine homologue ofthe cell-cycle control protein cdc2 / L.J.Cisek, J.L.Corden // Nature. 1989. -339.-P. 679-684.

38. Conaway R.C. General initiation factors for RNA polymerase П / R.C.Conaway, J.W.Conaway // Annu. Rev. Biochem. 1993. - 62. - P. 161190.

39. Cook B.D. Role for the related poly(ADP-ribose) polymerases tankyrase 1and 2 at human telomeres / B.D.Cook, J.N.Dynek, W.Chang, G.Shostak, S.Smith // Mol. Cell. Biol. 2002. - 22. - P. 332-342.

40. Dahmann C. S-phase-promoting cyclin-dependent kinases prevent re-replication by inhibiting the transition of replication origins to a pretreplicative state / C.Dahmann, J.F.Diffley, K.A.Nasmyth // Curr. Biol. 1995. -5.-P. 1257-1269.

41. Dahmus M.E. Reversible phosphorylation of the C-terminal domain of RNA polymerase II // J. Biol. Chem. 1996. - 271. - P. 19009-19012.

42. D'Amours D. Poly(ADP-ribosyl)ation reactions in the regulation of nuclear functions / D.D'Amours, S.Desnoyers, I.D'Silva, G.G.Poirier // Biochem. J. -1999.-342.-P. 249-268.

43. Dantzer F. Involvement of poly(ADP-ribose) polymerase in base excision repair / F.Dantzer, V.Schreiber, C.Niedergang, C.Trucco, E.Flatter, G.De La Rubia, J.Oliver, V.Rolli, J.MeAnissier-de Murcia, G.de Murcia // Biochimie. -1999.-81.-P. 69-75.

44. Deng Z. Telomeric Proteins Regulate Episomal Maintenance of Epstein-Barr Virus Origin of Plasmid Replication / Z.Deng, L.Lezina, C-J.Chen, S.Shtivelband, W.So, P.M.Lieberman // Molecular Cell. 2002. - Vol. 9. - P. 493-503.

45. Dhar S.K. Replication from oriP of Epstein-Barr virus requires human ORC and is inhibited by geminin / S.K.Dhar, K.Yoshida, Y.Machida, P.Khaira, B.Chaudhuri, J.A.Wohlschlegel, M.Leffak, J.Yates, A.Dutta // Cell. 2001. -106.-P. 287-296.

46. Dignam J.D. Accurate transcription initiation by RNA polymerase II in a soluble extract from isolated mammalian nuclei / J.D.Dignam, R.M.Lebovitz, R.G.Roeder // Nucleic Acids Res. 1983. - 11. - P. 1475-1489.

47. Dikstein R. TAFII250 is a bipartite protein kinase that phosphorylates the base transcription factor RAP74 / R.Dikstein, S.Ruppert, R.Tjian // Cell. -1996.-84.-P. 781-790.

48. Doree M. The cyclin-dependent protein kinases and the control of cell division / M.Doree, S.Galas // FASEBJ. 1994. - 85. - P. 1114-1121.

49. Espejel S. Mammalian Ku86 mediates chromosomal fusions and apoptosis caused by critically short telomeres / S.Espejel, S.Franco, S.Rodriguez

50. Perales, S.D.Bouffler, J.C.Cigudosa, M.A.Blasco // EMBO J. 2002. - 21. -P. 2207-2219.

51. Frappier L. Overproduction, purification, and characterization of EBNA1, the origin binding protein of Epstein-Barr virus / L.Frappier, M.J.O'Donnell // Biol. Chem. 1991. - 266. - P. 7819-7826.

52. Gahn T.A. The Epstein-Barr virus origin of plasmid replication, oriP, contains both the initiation and termination sites of DNA replication / T.A.Gahn, C.L.Schildkraut // Cell. 1989. - 58, 3. - P. 527-535.

53. Galande S. Poly (ADP-ribose) polymerase and Ku autoantigen form a complex and synergistically bind to matrix attachment sequences / S.Galande, T.Kohwi-Shigematsu // J. Biol. Chem. 1999. - 274. - P. 20521-20528.

54. Ge H. The high mobility group protein HMG1 can reversibly inhibit class II gene transcription by interaction with the TATAbinding protein / H.Ge, R.G.Roeder // J. Biol. Chem. 1994. - 269. - P. 17136-17140.

55. Geiger J.H. The crystal structure of the yeast TFIIA/TBP/DNA complex / J.H.Geiger, S.Hahn, S.Lee, P.B.Sigler // Science. 1996. - 272. - P. 830-836.

56. Griesenbeck J. Protein-protein interaction of the human poly(ADPribosyl) transferase depends on the functional state of the enzyme / J.Griesenbeck, S.L.Oei, P.Mayer-Kuckuk, M.Ziegler, G.Buchlow, M.Schweiger // Biochemistry. 1997. - 36. - P. 7297-7304.

57. Griffith J.D. Mammalian telomeres end in a large duplex loop / J.D.Griffith, L.Comeau, S.Rosenfield, R.M.Staansel, A.Bianchi, H.Moss, T.de Lange // Cell. 1999. - 97. - P. 503-514.

58. Halle J.-P. Gene expression: increasing evidence for a transcriptosome / J.P.Halle, M.Meisterernst // Trends Genet. 1996. - 12. - P. 161-163.

59. Hammerschmidt W. Identification and characterization of orilyt, a lytic origin of DNA replicationof Epstein-Barr virus / W.Hammerschmidt, B.Sugden // Cell. 1988. - 55. - P. 427-433.

60. Hampsey M. Molecular genetics of the RNA polymerase II general transcriptional machinery // Microbiol. Mol. Biol. Rev. 1998. - 62. - P. 465503.

61. Harley C.B. Telomeres shorten during ageing of human fibroblasts /

62. C.B.Harley, A.B.Futcher, C.W.Greider // Nature. 1990. - 345. - P. 458^60.

63. Harris A. Random association of Epstein-Barr virus genomes with host cell metaphase chromosomes in Burkitt's lymphoma-derived cell lines / A.Harris, B.D.Young, B.E.Griffin // J. Virol. 1985. - 56. - P. 328-332.

64. Harrison S. Sequence requirements of the Epstein-Barr virus latent origin of DNA replication / S.Harrison, K.Fisenne, J.Hearing // J. Virol. 1994. - 68, 3.-P. 1913-1925.

65. Hartl P. Mitotic repression of transcription in vitro / P.Hartl, J.Gottesfeld,

66. D.J.Forbes // J. Cell Biol. 1993. - 120. - P. 613-624.

67. Hassa P.O. The functional role of poly(ADP-ribose)polymerase 1 as novel coactivator of NF- B in inflammatory disorders / P.O.Hassa, M.O.Hottiger // Cell. Mol. Life Sci. 2002. - 59. - P. 1534-1553.

68. Heldin C.-H. Dimerization of cell surface receptors in signal transduction // Cell. 1995. - 80. - P. 213-223.

69. Hershkovitz M. Metaphase chromosome analysis by ligation-mediated PCR: heritable chromatin structure and a comparison of active and inactive X chromosomes / M.Hershkovitz, A.D.Riggs // Proc Natl Acad Sci USA. — 1995.-92.-P. 2379-2383.

70. Hirai K. Epstein-Barr virus genome in infected cells and cancer / K.Hirai, T.Yamamoto, T.Hironaka, T.Arai, H.Takeuchi, R.Kobayashi, I.Hoio, T.Oishi // Epstein-Barr virus and human cancer. Japan Scientific Press, 1998. - P. 29-39.

71. Hirai К. Replication and licensing of the EBV oriP minichromosome / K.Hirai, M.Shirakata // Epstein-Barr Virus and Human Cancer (K. Takada, ed.). Heidelberg: Springer, 2001. - P. 13-33.

72. Hoffinann A. A histone octamer-like structure within TFIID / A.Hoffmann, C.M.Chiang, T.Oelgeschlager, X.Xie, S.K.Burley, Y.Nakatani, R.G.Roeder // Nature. 1996. - 380. - P. 356-359.

73. Holstege F.C.P. Opening of an RNA polymerase II promoter occurs in two distinct steps and requires the basal transcription factors ПЕ and IIH /

74. F.C.P.Holstege, P.C.van der Vliet, H.Th.M.Timmers // EMBO J. 1996. - 15. -P. 1666-1677.

75. Hsieh D.J. Constitutive binding of EBNA1 protein to the Epstein-Barr virus replication origin, oriP, with distortion of DNA structure during latent infection / DJ.Hsieh, S.M.Camiolo, J.L.Yates // EMBO J. 1993. - 12, 13.1. P. 4933-4944. (Dec 15)

76. Hsu H.L. Ku is associated with the telomere in mammals / H.L.Hsu, D.Gilley, E.H.Blackburn, D.J.Chen // Proc. Natl. Acad. Sci. 1999. - 96. - P. 1245412458.

77. Huletsky A. The effect of poly(ADP-ribosyl)ation on native and HI-depleted chromatin. A role of poly(ADP-ribosyl)ation on core nucleosome structure / A.Huletsky, G.de Murcia, S.Muller, M.Hengartner, L.Menard, D.Lamarre,

78. G.G.Poirier // J. Biol. Chem. 1989. - 264. - P. 8878-8886.

79. Hunter T. The regulation of transcription by phosphorylation / T.Hunter, M.Karin // Cell. 1992. - 70. - P. 375-387.

80. Ihle J.N. Signalling by the cytok- ine receptor superfamily: JAKS and STATS / J.N.Ihle, B.A.Witthuhn, F.W.Quelle, K.Yamamoto,

81. W.E.Thierfelder, B.Kreider, O.Silvennoinen // Trends Biochem. Sci. -1994. -19.-P. 222-227.

82. Imbalzano A.N. Transcription factor (TF) IIB and TFIIA can independently increase the affinity of the TATA-binding protein for DNA / A.N.Imbalzano, K.S.Zaret, R.E.Kingston // J. Biol. Chem. 1994. - 269. - P. 8280-8286.

83. Imhof A. Acetylation of general transcription factors by histone acetyltransferases / A.Imhof, X.J.Yang, V.V.Ogryzko, Y.Nakatani, A.P.Wolffe, H.Ge // Curr. Biol. 1997. - 7. - P. 689-692.

84. Iyer V. Mechanism of differential utilization of the his3 TR and TC TATA elements / V.Iyer, K.Struhl / Mol. Cell. Biol. 1995. - 15. - P. 7059-7066.

85. Iyer V. Absolute mRNA levels and transcriptional initiation rates in Saccharomyces cerevisiae / V.Iyer, K.Struhl // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. -1996.-93.-P. 5208-5212.

86. Jackson S.P. Regulating transcription factor activity by phosphorylation // Trends Cell Biol. 1992. - 2. - P. 104-108.

87. Jankelevich S. A nuclear matrix attachment region organizes the Epstein-Barr viral plasmid in Raji cells into a single DNA domain / S.Jankelevich, J.L.Kolman, J.W.Bodnarand, G.Miller // EMBO J. 1992. - 11. - P. 11651176.

88. Jiang Y. A three-step pathway of transcription initiation leading to promoter ^ clearance at an activation RNA polymerase II promoter / YJiang, M.Yan,

89. J.D.Gralla // Mol. Cell. Biol. 1996. - 16. - P. 1614-1621.

90. Kadonaga J.T. Assembly and disassembly of the Drosophila RNA polymerase II complex during transcription // J. Biol. Chem. 1990. - 265. - P. 26242631.

91. Kang J.J. Analysis of the yeast transcription factor TFIIA: distinct functional regions and a polymerase Il-specific role in basal and activated transcription / J.J.Kang, D.T.Auble, J.A.Ranish, S.Hahn // Mol. Cell. Biol. 1995. - 15. - P. 1234-1243.

92. Karlseder J. p53- and ATM-dependent apoptosis induced by telomeres lacking TRF2 / J.Karlseder, D.Broccoli, Y.Dai, S.Hardy, T.de Lange // Science. 1999. - 283. - P. 1321-1325.

93. Karlseder J. Senescence induced by altered telomere state, not telomere loss / J.Karlseder, A.Smogorzewska, T.de Lange // Science. 2002. - 295. - P. 2446-2449.

94. Kass-Eisler A. Recombination in telomere-length maintenance / A.Kass-Eisler, C.W.Greider // Trends Biochem Sci. 2000. - 25. - P. 200-204.

95. Kaufmann J. Direct recognition of initiator elements by a component of the transcription factor IID complex / J.Kaufmann, S.T.Smale // Genes Dev. -1994.-8.-P. 821-829.

96. Kim Т.К. Effects of activation-defective TBP mutations on transcription initiation in yeast / T.K.Kim, S.Hashimoto, R.J.3rd Kelleher, P.M.Flanagan, R.D.Kornberg, M.Horikoshi, R.G.Roeder // Nature. 1994. - 369. - P. 252255.

97. Kim H. NAD glycohydrolases: a possible function in calcium homeostasis / H.Kim, E.L.Jacobson, M.KJacobson // Mol Cell Biochem. 1994. - 138. - P. 237-243.

98. Kim N.W. Specific association of human telomerase activity with immortal cells and cancer / N.W.Kim, M.A.Piatyszek, K.R.Prowse, C.B.Harley, M.D.West, P.L.Ho, G.M.Coviello, W.E.Wright, S.L.Weinrich, J.W.Shay // Science. 1994. - 266. - P. 2011-2015.

99. Kingston R.E. Repression and activation by multiprotein complexes that alter chromatin structure / R.E.Kingston, C.A.Bunker, A.N.Imbalzano // Genes Dev. 1996. - 10. - P. 905-920.

100. Kirov N. The mechanism of repression by DSP1 (dorsal switch protein) involves interference with preinitiation complex formation / N.Kirov, P.Lieberman, C.Rushlow // EMBO J. 1995. - 15. - P. 7079-7087.

101. Kitajima S. Regulation of the human general transcription initiation factor TFIIF by phosphorylation / S.Kitajima, T.Chibazakura, M.Yonaha, Y.Yasukochi // J. Biol. Chem. 1994. - 269. - P. 29970-29977.

102. Koleske A.J. The RNA polymerase II holoenzyme and its implications for gene regulation / A.J.Koleske, R.A.Young // Trends Biochem. Sci. 1995. -20.-P. 113-116.

103. Koons M.D. The replicator of the Epstein-Barr virus latent cycle origin of DNA replication, oriP, is composed of multiple functional elements / M.D.Koons, S.V.Scoy, J.Hearing // J. Virol. 2001. - 75. - P. 10582-10592.

104. Kraus W.L. PARP goes transcription / W.L.Kraus, J.Lis // Cell. 2003. - 113. -P. 677-683.

105. Kuranda M.J. Chitinase is required for cell separation during growth of Saccharomyces cerevisiae / M.J.Kuranda, P.W.Robbins // J. Biol. Chem. -1991.-266.-P. 19758-19767.

106. Lee H.W. Essential role of mouse telomerase in highly proliferative organs / H.W.Lee, M.A.Blasco, G.J.Gottlieb, J.W.Horner, C.W.Greider, R.A.DePinho // Nature. 1998. - 392. - P. 569-574.

107. Lee D.K. TFIIA induces conformational changes in TFIID via interactions with the basic repeat / D.K.Lee, J.DeJong, S.Hashimoto, M.Horikoshi, R.G.Roeder et al. // Mol. Cell. Biol. 1992. - 12. - P. 5189-5196.

108. Lee M.A. Genetic evidence that EBNA-1 is needed for efficient, stable latent infection by Epstein-Barr virus / M.A.Lee, M.E.Diamond, J.L.Yates // J. Virol. 1999. - 73. - P. 2974-2982.

109. Lei M. Initiating DNA synthesis: from recruiting to activating the MCM complex / M.Lei, B.K.Tye // J. Cell Sci. 2001. - 114. - P. 1447-1454.

110. Leuther K.K. Two-dimensional crystallography of TFIIB- and IIE-RNA polymerase II complexes: implications for start site selection and initiation complex formation / K.K.Leuther, D.A.Bushnell, R.D.Kornberg // Cell. -1996.-85.-P. 773-779.

111. Li X.Y. Distinct classes of yeast promoters revealed by differential TAF recruitment / X.Y.Li, S.RJBhaumik, M.RGreen // Science. 2000. - 288. - P. 1242-1244.

112. Li B. Identification of human Rapl: Implications for telomere evolution / B.Li, S.Oestreich, T.de Lange // Cell. 2000. - 101. - P. 471-483.

113. Lieberman P.M. A mechanism for TAFs in transcriptional activation: activation domain enhancement of TFIID-TFIIA—promoter DNA complex formation / P.M.Lieberman, AJ.Berk // Genes Dev. 1994. - 8. - P. 9951006.

114. Lindahl T. Quality control by DNA repair / T.Lindahl, RD.Wood // Science. -1999.-286.-P. 897-1905.

115. Lingner J. Reverse transcriptase motifs in the catalytic subunit of telomerase / J.Lingner, T.RHughes, A.Shevchenko, M.Mann, V.Lundblad, T.R.Cech // Science. 1997. - 276. - P. 561-567.

116. Little R.D. Initiation of latent DNA replication in the Epstein-Barr virus genome can occur at sites other than the genetically defined origin / RD.Little, C.L.Schildkraut // Mol Cell Biol. 1995. - 15,5. - P. 2893-2903.

117. Luscher B. Mitosis-specific phosphorylation of the nuclear oncoproteins Мус and Myb / B.Luscher, RN.Eisenman // J. Cell Biol. 1992. - 118. - P. 775784.Г141

118. Ma D. Separation of the transcriptional coactivator and antirepression functions of transcription factor IIA / D.Ma, I.Olave, A.Merino, D.Reinberg // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 1996. - 93. - P. 6583-6588.

119. Marshall C.J. Specificity of receptor tyrosine kinase signalling: Transient versus sustained extracellular signal-regulated kinase activation // Cell. -1995.-80.-P. 179-185.

120. Martinez-Balbas M.A. Displacement of sequence-specific transcription factors from mitotic chromatin / M.A.Martinez-Balbas, A.Dey, S.K.Rabindran, K.Ozato, C.Wu // Cell. 1995. - 83. - P. 29-38.

121. Mathis G. Release of core DNA from nucleosomal core particles following (ADP-ribose)n-modification in vitro / G.Mathis, F.R.Althaus // Biochem. Biophys. Res. Commun. 1987. - 143. - P. 1049-1054.

122. Matsui T. Multiple factors required for accurate initiation of transcription by purified RNA polymerase II / T.Matsui, J.Segall, P.A.Weil, R.G.Roeder // J. Biol. Chem. 1980. - 255. - P. 11992-11996.

123. Maxon M.E. Transcription factor HE binds preferentially to RNA polymerase Ila and recruits TFIIH: a model for promoter clearance / M.E.Maxon, J.A.Goodrich, R.Tjian // Genes Dev. 1994. - 8. - P. 515-524.

124. Meyer R. Negative regulation of alkylation-induced sister-chromatid exchange by poly(ADP-ribose)polymerase-1 activity / R.Meyer, M.Muller, S.Beneke, J.H.KuEpper, A.BuErkle // Int J Cancer. 2000. - 88. - P. 351355.

125. Middleton T. EBNAl can link the enhancer element to the initiator element of the Epstein-Barr vims plasmid origin of DNA replication / T.Middleton, B.Sugden // J. Virol. 1992. - 66. - P. 489-495. /

126. Mitsiou D.J. TAC, a TBP-sans-TAFs complex containing the unprocessed TFIIA alphabeta precursor and the TFIIA gamma, subunit / D.J.Mitsiou, H.G.Stunnenberg et al. // Mol. Cell. 2000. - 6. - P. 527-537.

127. Miyamoto Т. Inhibition of nuclear receptor signalling by poly(ADP-ribose) polymerase / T.Miyamoto, T.Kakizawa, K.Hashizume // Mol. Cell. Biol. -1999.-19.-P. 2644-2649.

128. Nie J. Interaction of Oct-1 and automodification domain of poly(ADP-ribose) synthetase / J.Nie, S.Sakamoto, D.Song, Z.Qu, K.Ota, T.Taniguchi // FEBS Lett. 1998. - 424. - P. 27-32.

129. Nikolov D.B. Crystal structure of a TFIIB-TBP-TATA-element ternary complex / D.B.Nikolov, H.Chen, E.D.Halay, A.A.Usheva, K.Hisatake, D.K.Lee, R.G.Roeder, S.K.Burley // Nature. 1995. - 377. - P. 119-128.

130. Nikolov D.B. RNA polymerase II transcription initiation: a structural view / D.B.Nikolov, S.K.Burley // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 1997. - 94. - P. 1522.

131. Niller H.H. Nucleoprotein complexes and DNA 5'-ends at oriP of Epstein-Barr vims / H.H.Niller, G.Glaser, R.Knuchel, H.Wolf// J Biol Chem. -1995.-270, 21.-P. 12864-12868.

132. O'Brien T. Functional analysis of the human TAFII250 N-terminal kinase domain / T.O'Brien, R.Tjian // Mol. Cell. 1998. - 1. - P. 905-911.

133. Oei S.L. Regulation of RNA Polymerase II-dependent transcription by poly(ADP-ribosyl)ation of transcription factors / S.L.Oei, J.Griesenbeck, M.Schweiger, M.Ziegler // J Biol Chem. 1998. - 273. - P. 31644-31647.

134. Oelgeschlager T. T opology and г eorganization о f a human Т FIID-promoter complex / T.Oelgeschlager, C.-M.Chiang, R.G.Roeder // Nature. 1996. -382. - 735-738.

135. Ozer J. Transcription factor IIA mutations show activator-specific defects and reveal a IIA function distinct from stimulation of TBP-DNA binding / J.Ozer, A.H.Bolden, P.M.Lieberman // J. Biol. Chem. 1996. - 271. - P. Ill 8211190.

136. Ozer J. Molecular cloning of the small (gamma) subunit of human TFIIA reveals functions critical for activated transcription / J.Ozer, P.A.Moore, A.H.Bolden, A.Lee, C.A.Rosen, P.M.Lieberman // Genes Dev. 1994. - 8. -P. 2324-2335.

137. Ozer J. A testis-specific transcription factor IIA (TFILAtau) stimulates TATA-binding protein-DNA binding and transcription activation / J.Ozer, P.Moore, P.M.Lieberman // J. Biol. Chem. 2000. - 275. - P. 122-128.

138. Plaza S. Involvement of poly (ADP-ribose)-polymerase in the Pax-6 gene regulation in neuroretina / S.Plaza, M.Aumercier, M.Bailly, C.Dozier, S.Saule // Oncogene. 1999. - 18. - P. 1041-1051.

139. Poirier G.G. Poly(ADP-ribosyl)ation of polynucleosomes causes relaxation of chromatin structure / G.G.Poirier, G.de Murcia, J.Jongstra-Bilen, C.Niedergang, P .Mandel // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 1 982. - 79. - P. 3423-3427.

140. Ranish J.A. Isolation of two genes that encode subunits of the yeast transcription factor IIA / J.A.Ranish, W.S. Lane, S.Hahn // Science. 1992. -255.-P. 1127-1129.

141. Realini C.A. Histone shuttling by poly(ADP-ribosylation) / C.A.Realini, F.R.Althaus // J. Biol. Chem. 1992. - 267. - P. 18858-18865.

142. Roeder R.G. The complexities of eukaryotic transcription initiation: ^ regulation of preinitiation complex assembly // Trends Biochem. Sci. 1991.-16.-P. 402-408.

143. Roeder R.G. The role of general i nitiation factors in transcription b у RNA polymerase II // Trends Biochem. 1996. - 21. - P. 327-335.

144. Rose M. Construction and use of gene fusions to lacZ (beta-galactosidase) that are expressed in yeast / M.Rose, D.Botstein // Methods Enzymol. 1983. -101.-P. 167-180.

145. Rose M. Methods in yeast genetics / M.Rose, R.Winston, P.Hieter. Cold Spring Harbor, N.Y.: Cold Spring Harbor Laboratory Press, 1990. - 348p.

146. Rudolph K.L. Longevity, stress response, and cancer in aging telomerase-deficient mice / K.L.Rudolph, S.Chang, H.W.Lee, M.Blasco, G.J.Gottlieb, C.Greider, R.A.DePinho // Cell. 1999. - 96. - P. 701-712.

147. Ruscetti T. Stimulation of the DNA-dependent protein kinase by poly(ADP-ribose) polymerase / T.Ruscetti, B.E.Lehnert, J.Halbrook, H.Le Trong,

148. M.F.Hoekstra, D.J.Chen, S.R.Peterson //J Biol Chem. 1998. -273.- P. 14461-14446.

149. Sakurai H. Two alternative pathways of transcription initiation in the yeast negative regulatory g ene GAL80 / H.Sakurai, T.Ohishi, T.Fukasawa // Mol. Cell. Biol. 1994. - 14. - 6819-6828.

150. Segil N. Mitotic phosphorylation of the Oct-1 homeodomain and regulation of Oct-1 DNA binding activity / N.Segil, S.B.Roberts, N.Heintz // Science. -1991.-254.-P. 1814-1816.

151. Segil N. Mitotic regulation of TFIID: inhibition of activator-dependent transcription and changes in subcellular localization / N.Segil, M.Guermah, A.Hoffmann, R.G.Roeder, N.Heintz // Genes Dev. 1996. - 10. - P. 23892400.

152. Shirakata M. Identification of minimal oriP of Epstein-Barr virus required for DNA replication / M.Shirakata, K.Hirai // J Biochem (Tokyo). 1998. - 123, l.-P. 175-181.

153. Shirakata M. Requirement of replication licensing for the dyad symmetry element-dependent replication of the Epstein-Barr virus oriP minichromosome / M.Shirakata, K.I.Imadome, K.Hirai // Virology. 1999. - 263. - P. 42-54.

154. Shire К. EBP2, a human protein that interacts with sequences of the Epstein-Barr virus nuclear antigen 1 important for plasmid maintenance f K.Shire,

155. D.F.Ceccarelli, T.M.Avolio-Hunter, L.Frappier // J. Virol. 1999. - 73. - P. 2587-2595.

156. Sikorski R.S. A system of shuttle vectors and yeast host strains designed for efficient manipulation of DNA in Saccharomyces cerevisiae / R.S.Sikorski, P.Hieter // Genetics. 1989. - 122. - P. 19-27.

157. Smith S. Tankyrase, a poly(ADP-ribose) polymerase at human telomeres / S.Smith, I.Giriat, A.Schmitt, T.de Lange // Science. 1998. - 282. - P. 14841487.

158. Smogorzewska A. Different telomere signaling pathways in human and mouse cells / A.Smogorzewska, T.de Lange // EMBO J. 2002. - 21. — P. 4338-4348.

159. Soldatenkov V.A. Transcriptional repression by binding of poly(ADP-ribose) polymerase to promoter sequences / V.A.Soldatenkov, S.Chasovskikh, V.N.Potaman, I.Trofimova, M.E.Smulson, A.Dritschilo // J. Biol. Chem. -2002.-277.-P. 665-670.

160. Solomon M.J. Mapping protein-DNA interactions in vivo with formaldehyde: evidence that histone H4 is retained on a highly transcribed gene / M.J.Solomon, P.L.Larsen, A.Varshavsky // Cell. 1988. - 53, 6. - P. 937947.

161. Song K. Interaction of human Ku70 with TRF2 / K.Song, D Jung, Y.Jung, S.G.Lee, I.Lee // FEBS Lett. 2000. - 481. - P. 81-85.

162. Srinivas S.K. Spontaneous loss of viral episomes accompanying Epstein-Barr virus reactivation in a Burkitt's lymphoma cell line / S.K.Srinivas, J.T.Sample, J.W.Sixbey // J. Infect. Dis. 1998. - 177. - P. 1705-1709.

163. Stansel R.M. T loop, assembly in vitro involves binding of TRF2 near the 30 telomeric overhang / R.M.Stansel, T.de Lange, J.D.Griffith // EMBO J. -2001.-20.-P. 5532-5540.

164. Stargell L.A. The TBP-TFIIA interaction in response to acidic activators in vivo / L.A.Stargell, K.Struhl // Science. 1995. - 269. - P. 75-78.

165. Strahl-Bolsinger S. Grunstein MSIR2 and SIR4 interactions differ in core and extended telomeric heterochromatin in yeast / S.Strahl-Bolsinger, A.Hecht, K.Luo // Genes Dev. 1997. - 11, 1. - P. 83-93.

166. Struhl K. Yeast transcriptional regulatory mechanisms // Annu. Rev. Genet. -1995.-29.-P. 651-674.

167. Sugden B. Molecular mechanisms of maintenance and disruption of virus latency / B.Sugden, E.R.Leight // Epstein-Barr Virus and Human Cancer.(K. . Takada, ed.) Heidelberg: Springer, 2001. - P. 3-11.

168. Sugden B. A vector that replicates as a plasmid and can be efficiently selected in B-lymphocytes transformed by Epstein-Barr virus / B.Sugden, K.Marsh, J.Yates // Mol. Cell. Biol. 1985. - 5. - P. 410-413.

169. Sun X. Reconstitution of human TFIIA activity from recombinantpolypeptides: a role in TFIID-mediated transcription / X.Sun, D.Ma, M.Sheldon, K.Yeung, D.Reinberg // Genes Dev. 1994. - 8. - P. 2336-2348.

170. Tan S. Crystal structure of a yeast TFIIA/TBP/DNA complex / S.Tan, Y.Hunziker, D.F.Sargent, T.J.Richmond // Nature. 1996. - 381. - P. 127134.

171. Tupler R. Expressing the human genome / RTupler, G.Perini, M.RGreen // Nature. 2001. - 409. - P. 832-833.

172. Upadhyaya A.B. Identification of a general transcription factor TFIIA alpha/beta homolog selectively expressed in testis / A.B.Upadhyaya, S.H.Lee, J.DeJong // J. Biol. Chem. 1999. - 274. - P. 18040-18048.

173. Usheva A. Specific interaction between the nonphosphorylated form of RNA polymerase II and the TATA-binding protein / A.Usheva, E.Maldonado,

174. A.Goldring, H.Lu, C.Houbavi, D.Reinberg, Y.Aloni // Cell. 1992. - 69. - P. 871-881.

175. Van Dyke M.W. Physical analysis of transcription preinitiation complex assembly on a class II gene promoter / M.W.Van Dyke, R.G.Roeder, M.Sawadogo // Science. 1988. - 241. - P. 1335-1338.

176. B.van Steensel, A.Smogorzewska, T.de Lange // Cell. 1998. - 92. - P. 401413.

177. Walker S.S. Yeast TAFII145 required for transcription of Gl/S cyclin genes and regulated by the cellular growth state / S.S.Walker, W.-C.Shen, J.C.Reese, L.M.Apone, M.R.Green // Cell. 1997. - 90. - P. 607-614.

178. Wang Y. P32/TAP, a cellular protein that interacts with EBNA-1 of Epstein

179. Wesierska-Gadek J. ADP-ribosylation of wild-typep53 in vitro: binding of p53 protein to specific p53 consensus sequence prevents its modification /

180. J.Wesierska-Gadek, G.Schmid, C.Cerni // Biochem Biophys Res Commun. -1996.-224.-P. 96-102.

181. Yates J.L. Stable replication of plasmids derived from Epstein-Barr virus in various mammalian cells / J.L.Yates, N.Warren, B.Sugden // Nature. 1985. — 313.-P. 812-815.

182. Yates J.L. Epstein-Barr virus-derived plasmidsteplicatr only onceper cell cycle and are not amplifiedafter entryinto cells / J.I.Yates, N.Guan // J. Virol. -1991.-65.-P. 423-431.

183. Yates J.L. The minimal replicator of Epstein-Barr virus oriP / J.L.Yates, S.M.Camiolo, J.M.Bashaw // J. Virol. 2000. - 74. - P. 4512^1522.

184. Yokomori K. Drosophila TFIIA directs cooperative DNA binding with TBP and mediates transcriptional activation / K.Yokomori, M.P.Zeidler, J.L.Chen, C.P.Verrijzer, M.Mlodzik, R.Tjian // Genes Dev. 1994. - 8. - P. 2313-2323.

185. Zawel L. Initiation of transcription by RNA polymerase II: a multi-step process / L.Zawel, D.Reinberg // Prog. Nucleic Acids Res. Mol. Biol. 1993. -44.-P. 67-108.

186. Zawel L. Common themes in assembly and function of eukaryotic transcription complexes / L.Zawel, D.Reinberg // Annu. Rev. Biochem. -1995.-64.-P. 533-561.

187. Zawel L. Recycling of the general transcription factors during RNA polymerase II transcription / L.Zawel, K.P.Kumar, D.Reinberg // Genes Dev. -1995.-9.-P. 1479-1490.

188. Zhou X.Z. The Pin2/TRF1 interacting protein PinXl is a potent telomerase inhibitor / X.Z.Zhou, K.P.Lu // Cell. 2001. - 107. - P. 347-359.

189. Zhu X.D. Cell cycle-regulated association of Rad50/MRE11/NBS1 with TRF2 and human telomeres / X.D.Zhu, B.Kuster, M.Mann, J.H.Petrini, T.de Lange // Nat. Genet. 2000. - 25. - P. 347-352.

190. Ziegler M. A cellular survival switch: poly(ADP-ribozyl)ation stimulates DNA repair and silences transcription / M.Ziegler, S.L.Oei // BioEssays. -2001.-23.-P. 543-548.