Регуляторные районы контролируемых глюкокортикоидами генов: Экспериментальное и теоретическое исследование тема диссертации и автореферата по ВАК РФ 03.00.15, доктор биологических наук Меркулова, Татьяна Ивановна

• Меркулова, Татьяна Ивановна
• доктор биологических наук
• 2002

Оглавление диссертации доктор биологических наук Меркулова, Татьяна Ивановна

1. ВВЕДЕНИЕ

2. ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ

2.1. Гены, регулируемые глюкокортикоидами.

2.2. Структурно-функциональная организация рецептора глюкокортикоидов

2.2.1. Гормон-связывающий домен

2.2.2. ДНК- связывающий домен

2.2.3. Районы ГР, ответственные за трансактиваторную функцию

2.3. Цитоплазматический мультибелковый комплекс, активация и переход в клеточное ядро

2.4. Элементы глюкокортикоидной регуляции (GREs) и связанные с ними способы позитивного и негативного контроля транскрипции генов глюкокортикоидными гормонами.

2.4.1. Позитивные элементы глюкокортикоидной регуляции -"Классические" GREs

2.4.2. Негативные элементы глюкокортикоидной регуляции nGREs)

2.4.3. Композиционные элементы, обеспечивающие негативную глюкокортикоидную регуляцию.

2.4.4. Опосредованные элементы негативной глюкокортикоидной регуляции

2.4.5. Позитивные элементы задержанного первичного ответа на глюкокортикоидные гормоны.

2.5. Регуляторные зоны контролируемых глюкокортикоидами генов. Единицы глюкокортикоидной регуляции (GRUs).

2.6. Возможные механизмы регуляции транскрипции глюкокортикоидами

2.7. Взаимодействие рецептора глюкокортикоидов с ДНК, упакованной в нуклеосомы: влияние на специфичность связывания и инициация ремоделирования хроматина.

2.8. Механизмы, обеспечивающие специфичность регуляции экспрессии генов стероидными гормонами.

Введение диссертации (часть автореферата) на тему «Регуляторные районы контролируемых глюкокортикоидами генов: Экспериментальное и теоретическое исследование»

Актуальность проблемы.

Исследование механизмов регуляции экспрессии генов эукариот является одной из важнейших задач молекулярной биологии. Согласно современным представлениям, основные события, определяющие интенсивность экспрессии генов, происходят на транскрипционном уровне. Ведущую роль в этих событиях играют регуляторные белки -факторы транскрипции, опознающие определенные последовательности ДНК - регуляторные элементы, которые формируют регуляторную часть гена [Latchman D.S., 1995; Wingender Е. et al., 2000; Kolchanov N.A. et al., 2000]. Таким образом, набор регуляторных элементов гена программирует его судьбу в процессе индивидуального развития, определяет тканеспецифичность экспрессии, а также способность отвечать на различные сигналы внешней и внутренней среды. В связи с этим исключительно важное значение имеют исследования, направленные на выявление и изучение отдельных регуляторных элементов в различных генах, идентификацию регуляторных районов генов, выяснение принципов организации всей регуляторной зоны гена, а также изучение механизмов, обеспечивающих реализацию информации, заложенной в последовательностях ДНК этой зоны.

Рецептор глюкокортикоидных гормонов (ГР) является лиганд-зависимым фактором транскрипции: после связывания с гормоном и перехода в ядро клетки он осуществляет позитивную или негативную регуляцию различных генов посредством присоединения к опознаваемым им участкам ДНК в регуляторных районах генов и в результате белок-белковых взаимодействий с другими факторами транскрипции [Reichardt Н.М. & Schutz G., 1998]. Изучение молекулярных механизмов глюкокортикоидной регуляции представляет особый интерес в связи с исключительным многообразием контролируемых глюкокортикоидами биохимических и физиологических процессов в организме, что находит отражение в существовании большого числа регулируемых глюкокортикоидами генов. Регуляторные районы этих генов являются хорошей моделью как для изучения механизмов координированной регуляции генов под действием какого-либо сигнала, так и механизмов, обеспечивающих индивидуальные особенности экспрессии отдельных генов (тканеспецифичность, временную зависимость, активацию или репрессию в ответ на сигнал и т.д.).

Центральным для понимания механизмов координированной регуляции групп генов и не решенным до сих пор вопросом является вопрос о том, каким образом факторы транскрипции осуществляют избирательное распознавание контролируемых ими генов в составе геномных последовательностей ДНК. Сравнение регуляторных элементов, опознаваемых одним и тем же белком, как правило, обнаруживает в них лишь небольшое относительно консервативное ядро длиной 4-10 п.н., явно недостаточное для успешного распознавания [Latchman D.S., 1995; Bucher P., 1999]. Для элементов глюкокортикоидной регуляции (GREs) таким ядром являются последовательности, гомологичные консенсусу GNACANNNTGTTCT [Beato М. et al., 1989], причем значительная часть GREs обладает весьма слабым сходством с консенсусной последовательностью. В связи с этим представляется очевидным, что для решения вопроса о распознавании рецепторным белком контролируемых им генов необходимы новые подходы к изучению организации GREs. Одним из таких подходов может быть выяснение роли неконсервативного нуклеотидного окружения гомологичного консенсусу GRE участка в формировании опознаваемой рецепторным белком структуры сайта его связывания.

Изучение структуры сайтов связывания регуляторных белков -факторов транскрипции является также необходимой предпосылкой для разработки компьютерных методов распознавания таких сайтов в последовательностях ДНК. Особая актуальность развития подобных методов обусловлена достигнутыми в последние годы успехами в определении нуклеотидных последовательностей большого числа различных генов, а также целых геномов. Огромные массивы прочитанных последовательностей ДНК ставят задачу их функциональной аннотации, в частности, выявления регуляторных районов генов, необходимой компонентой которого является идентификация отдельных регуляторных элементов. Однако, в связи с чрезвычайной сложностью регуляторного кода ДНК разработка таких методов является серьезной проблемой и получение новых экспериментальных данных об организации регуляторных элементов должно помочь в ее решении.

Концептуальное значение для понимания организации регуляторной части гена и механизмов регуляции транскрипции имеет вопрос о локализации регуляторных элементов. К моменту начала наших исследований безусловно доминирующим было представление о том, что регуляторные элементы гена находятся в его 5'-фланкирующей области. Однако, постепенно накапливающиеся данные об обнаружении отдельных регуляторных элементов, также как и комплексных регуляторных единиц (энхансеров, сайленсеров), в интронах и 3'-фланкирующих областях генах ставят задачу более углубленного исследования регуляторных возможностей этих районов как с помощью экспериментальных подходов, так и с привлечением компьютерных методов поиска регуляторных элементов. В настоящее время актуальность подобных исследований резко возрастает в связи появлением многочисленных сведений о сопряженных с различными клиническими проявлениями единичных нуклеотидных заменах (SNPs), расположенных в интронных последовательностях. Во многих случаях такие SNPs не поддаются интерпретации в качестве мутаций, повреждающих сайты сплайсинга, и логично предполагать, что они могут затрагивать находящиеся в интронах регуляторные элементы. Идентификация регуляторных SNPs в интронах имеет большое значение не только для медицинской генетики, но и для формирования более полного представления о регуляторной части гена.

Специфичность глюкокортикоидной регуляции отдельных генов осуществляется, главным образом, за счет взаимодействия рецептора глюкокортикоидов с другими транскрипционными факторами, сайты связывания которых находятся вблизи GREs в регуляторных районах генов. Идентификации таких факторов и изучению механизмов их взаимодействия с рецептором посвящено большое число работ. Однако, практически не исследованными остаются механизмы, посредством которых различные внешние воздействия, в частности химические канцерогены, могут избирательным образом влиять на глюкокортикоидную регуляцию определенных генов. Представляется весьма вероятной вовлеченность в эти процессы транскрипционных факторов, наряду с ГР участвующих в глюкокортикоидной регуляции этих генов, и выяснение таких механизмов представляет большой интерес. Целью работы было изучение структуры, локализации и функционирования элементов глюкокортикоидной регуляции в контролируемых глюкокортикоидами генах, создание эффективного метода поиска таких элементов в последовательностях ДНК, исследование организации регуляторных районов глюкокортикоид-регулируемых генов и выяснение механизмов ген-специфического нарушения гормональной регуляции. Конкретные задачи работы включали:

1. Выявление неизвестных ранее мест связывания рецептора глюкокортикоидов в контролируемых этими гормонами генах с помощью экспериментальных методов

2. Изучение первичной структуры сайта связывания глюкокортикоидного рецептора: выяснение влияния неконсервативного нуклеотидного окружения участка, гомологичного консенсусу GRE, на эффективность взаимодействия сайта с рецепторным белком и на глюкокортикоидную индукцию.

3. Разработку нового компьютерного метода поиска потенциальных GREs в последовательностях ДНК, его экспериментальную проверку и применение для анализа распределения этих элементов в нуклеотидных последовательностях контролируемых глюкокортикоидами генов.

4. Поиск участков специфического связывания рецептора глюкокортикоидов в структурной части гена триптофаноксигеназы (TD02) и функциональную интерпретацию связанных с психическими расстройствами единичных нуклеотидных замен (SNPs), расположенных в этом потенциально регуляторном районе.

5. Выяснение механизма ген-специфического антиглюкокортикоидного действия гепатоканцерогенов

6. Создание компьютерной базы данных, посвященной описанию структурно-функциональной организации регулируемых глюкокортикоидами генов и использование собранных в ней материалов для анализа структуры GREs, выяснения принципов организации содержащих GREs регуляторных районов и планирования экспериментов по изучению механизмов глюкокортикоидной регуляции.

Основные положения, выносимые на защиту.

1. Рецептор глюкокортикоидов с высокой эффективностью опознает специфические сайты его связывания в составе протяженных (десятки т.п.н.) фрагментов ДНК, что, очевидно, играет определяющую роль в распознавании этим белком контролируемых им генов. Для опознавания глюкокортикоидным рецептором участков его связывания на ДНК важны как консервативные элементы гомологичной консенсусу GRE последовательности (GNACANNNTGTTCT), так и их вариабельное ближайшее окружение. Особенности первичной структуры ДНК в окружении участка гомологии с консенсусом оказывают существенное влияние на связывание рецепторного белка. Учет вариабельного окружения гомологичных консенсусу GRE районов существенно повышает эффективность методов выявления потенциальных сайтов связывания рецептора глюкокортикоидов в последовательностях ДНК.

2. Регуляторная часть контролируемых глюкокортикоидами генов не ограничена их 5'-фланкирующей областью. Плотность выявленных с помощью разработанного нами метода потенциальных сайтов связывания рецептора глюкокортикоидов в нуклеотидных последовательностях интронов и З'-фланкирующих районов этих генов сравнима с плотностью таких сайтов в последовательностях 5'-фланкирующих районов и почти на порядок превосходит плотность потенциальных сайтов связывания рецептора в последовательностях ДНК, не имеющих отношения к глюкокортикоидной регуляции. Потенциальные сайты связывания рецептора глюкокортикоидов в первом интроне гена хорионического соматомамотропина человека и 3'-фланкирующем районе гена металлотионеина I мыши являются функциональными GREs. Район 4-6 го интронов гена TD02 крысы взаимодействует с рецептором глюкокортикоидов эффективнее, чем 5'-фланкирующая область этого гена. Расположенные в том же районе гена TD02 человека единичные нуклеотидные замены (SNP), ассоциированные с рядом психических нарушений, повреждают сайт связывания фактора транскрипции YY1 и приводят к формированию сайтов связывания для других транскрипционных факторов.

3. Ген-специфическое модулирующее действие внешних агентов на глюкокортикоидную регуляцию может быть опосредовано через их влияние на активность факторов транскрипции, сайты связывания которых наряду с GREs входят в состав регуляторных районов контролируемых глюкокортикоидами генов. Ингибирующий эффект гепатоканцерогенов на глюкокортикоидную индукцию тирозинаминотрансферазы (ТАТ) в печени реализуется за счет снижения ДНК-связывающей активности фактора транскрипции HNF3. Угнетение активности HNF3 вовлечено также в механизм опухолеиндуцируещего действия гепатоканцерогенов. Научная новизна. Впервые обнаружены участки специфического связывания рецептора глюкокортикоидов в 5'- фланкирующей области гена цитохрома CYP2B2 крысы, 5' и 3' - фланкирующих районах гена металлотионеина I мыши, первом интроне гена хорионического соматомамотропина человека и районе 4-6 го интронов гена триптофаноксигеназы крысы. Показано, что сайты связывания ГР в 5'(от -252 до -209 п.н.) и 3'(от +1011 до +1054 п.н.) - фланкирующих районах гена металлотионеина I мыши и первом интроне (от +60 до +103 п.н.) гена хорионического соматомамотропина человека способны функционировать в качестве элементов глюкокортикоидной регуляции при присоединении их к гетерологичному промотору.

Впервые показано существенное влияние первичной структуры ДНК в окружении гомологичного консенсусу GRE участка в сайтах связывания глюкокортикоидного рецептора на эффективность взаимодействия с рецепторным белком. На основании сформированного представления о сайте связывания глюкокортикоидного рецептора как о сочетании относительно консервативного "ядра" (описываемого консенсус-последовательностью) и существенно менее консервативного, хотя и неслучайного "окружения" построен оригинальный и высокоэффективный метод выявления потенциальных сайтов связывания рецептора глюкокортикоидов в последовательностях ДНК. С помощью разработанного метода впервые удалось разделить выборки нуклеотидных последовательностей генов, находящихся под контролем заданного транскрипционного фактора, и последовательностей, не имеющих отношения к регуляции этим фактором.

Впервые получены данные, позволяющие рассматривать единичные нуклеотидные замены (SNP), расположенные в интроне гена, в качестве потенциально регуляторных. Показано, что нуклеотидные замены G->A в позиции 663 п.н. и G->T в позиции 666 п.н. интрона 6 гена TD02 человека, ассоциированные с рядом психических расстройств, приводят к разрушению сайта связывания транскрипционного фактора YY1 и образованию сайтов связывания для других факторов транскрипции.

Раскрыт механизм ингибирующего влияния гепатоканцерогенов на глюкокортикоидную индукцию ТАТ в печени. Впервые установлено, что данный эффект реализуется посредством угнетения ДНК-связывающей активности HNF3 белков, сайты связывания которых играют существенную роль в функционировании глюкокортикоид-зависимых энхансеров гена ТАТ.

Научно-теоретическое и практическое значение. Полученные в работе результаты способствуют дальнейшему развитию представлений о структурно-функциональной организации генов и механизмах регуляции транскрипции. Они также имеют значение для разработки эффективных методов анализа последовательностей ДНК геномов эукариот.

Обнаружение потенциальной регуляторной зоны в районе 4-6 интронов гена TD02 оказалось принципиально важным для изучения этого гена, как одного из главных объектов генетики психических расстройств. Наши данные послужили основанием для секвенирования соответствующего района гена TD02 человека в Медицинском центре

Дуарте, Калифорния и способствовали выявлению в его шестом интроне SNPs, связанных с такими нарушениями, как синдром Туретта, синдром гиперактивности у детей и наркотическая зависимость [Comings D.E. et al., 1996]. Проведенная нами функциональная интерпретация этих SNPs, как мутаций, изменяющих спектр взаимодействующих с районом факторов транскрипции, указывает на необходимость расширения исследований регуляторных возможностей SNPs, локализованных в интронах. Такие исследования послужат развитию представлений о механизмах наследственной предрасположенности к различным мультифакториальным патологиям и тем самым будут способствовать разработке методов их прогноза и лечения. Созданная на основании проведенной работы компьютерная система rSNPGuide для выявления и изучения потенциально регуляторных SNPs позволяет существенно повысить эффективность подобных исследований.

Выяснение механизма антиглюкокортикоидного действия гепатоканцерогенов в печени, осуществляемого через снижение активности печень-специфичного фактора транскрипции HNF3, является серьезным вкладом в понимание механизмов тканеспецифического и видоспецифического действия канцерогенных соединений. Эти знания могут быть использованы как для развития теории химического канцерогенеза, так и для последующей разработки средств его профилактики.

Собранная база данных о регуляторных районах контролируемых глюкокорткоидами генов (GR-TRRD) является ценным источником сведений о структурно-функциональной организации этих генов для широкого круга пользователей. Материалы GR-TRRD могут быть использованы в научно-исследовательской работе для анализа регуляторных областей генов и планирования экспериментов. База доступна по адресу: http://wwwmgs.bionet.nsc.ru/mgs/papers/merkulova/gluc/.

Развиваемые в работе теоретические представления о механизмах регуляции экспрессии генов глюкокортикоидными гормонами, структурно-функциональной организации контролируемых глюкокортикоидами генов, наличии регуляторных SNPs в интронах генов и молекулярных механизмах химического канцерогенеза могут найти практическую реализацию в учебных процессах биологических и медицинских учебных заведений.

Апробация работы. Основные положения диссертации докладывались на V Всесоюзном Биохимическом Съезде (Москва, 1985), IX Всесоюзном симпозиуме «Структура и функции клеточного ядра» (Черноголовка, 1987), VI Советско-итальянском симпозиуме "Macromolecules in functioning cell" (Ленинград, 1989), Всесоюзной конференции "Макромолекулы клетки" (Пущино, 1989), 20-th Meeting of FEBS (Будапешт, 1990), Всесоюзном симпозиуме "Биохимия рецепторных систем" (Таллинн, 1990), 1-й и 2-й Всесоюзных конференциях "Геном человека" (Переславль-Залесский 1990,1991), Франко-российском симпозиуме "Regulation of Gene Expression" (Новосибирск, 1995), II Съезде Биохимического общества РАН (Пущино, 1997), 3-м Съезде физиологов Сибири и Дальнего Востока (Новосибирск, 1997), Международной конференции "Genetic and Developmental Psychoneuroendocrinology (Новосибирск, 1999), XIII Всероссийском симпозиуме «Структура и функции клеточного ядра» (Санкт-Петербург, 2000), 1-й и 2-й Международных конференциях "Bioinformatics of Genome Regulation and Structure" (Новосибирск 1998, 2000).

Публикации. По теме работы опубликовано 27 статей в отечественной и зарубежной печати.

Структура и объем работы. Диссертация включает введение, обзор литературы, 6 глав результатов исследования, обсуждение результатов, заключение, выводы и список литературы. Работа изложена на 271

Заключение диссертации по теме «Генетика», Меркулова, Татьяна Ивановна

ВЫВОДЫ

1. Разработана оригинальная процедура очистки рецептора глюкокортикоидов, позволяющая с высокой воспроизводимостью получать очищенный более чем в 5000 раз препарат полноразмерного рецепторного белка с молекулярным весом 94 кДа. С использованием полученного препарата показано, что рецептор глюкокортикоидов успешно распознает специфические сайты его связывания в составе протяженных (достигающих нескольких тысяч или десятков тысяч пар нуклеотидов) фрагментов ДНК.

2. Установлено, что для эффективного связывания рецептора глюкокортикоидов с опознаваемыми им участками ДНК важно как гомологичное консенсусу GNACANNNTGTTCT консервативное ядро такого участка, так и его вариабельное нуклеотидное окружение. Уникальность первичной структуры "окружения" задается индивидуальными особенностями организации регуляторного района, в котором расположен конкретный сайт связывания рецептора.

3. На основании полученных экспериментальных данных о важной роли вариабельного окружения консенсуса в формировании структуры сайта разработан новый метод выявления потенциальных сайтов связывания рецептора глюкокортикоидов в последовательностях ДНК. С помощью разработанного метода впервые разделены выборки глюкокортикоид-регулируемых и нерегулируемых генов по плотности потенциальных сайтов связывания рецептора, которая составила 1,2 на 1 т.п.н. для регулируемых глюкокортикоидами генов и 0,12 на 1 т.п.н. для последовательностей, не имеющих отношения к глюкокортикоидной регуляции. Впервые показана высокая насыщенность потенциальными сайтами связывания рецептора глюкокортикоидов не только 5'фланкирующей районов (2 на 1 т.п.н.) контролируемых глюкокортикоидами генов, но также их интронов (0,9 на 1 т.п.н.) и 3' -фланкирующих районов (1,8 на 1 т.п.н).

4. Получены экспериментальные доказательства существования предсказанных с помощью разработанного метода сайтов связывания рецептора глюкокортикоидов в 5'- фланкирующей области гена цитохрома CYP2B2 крысы, 5' и 3' - фланкирующих районах гена металлотионеина I мыши и первом интроне гена хорионического соматомамотропина человека. Показано, что сайты связывания рецептора в 5' (от -252 до -209 п.н.) и 3' (от +1011 до +1054 п.н.) -фланкирующих районах гена металлотионеина I мыши и первом интроне (от +60 до +103 п.н.) гена хорионического соматомамотропина человека способны функционировать как элементы глюкокортикоидной регуляции (GREs) при присоединении их к гетерологичному промотору. На примере этих сайтов показано влияние окружения гомологичного консенсусу ядра сайта на глюкортикоидную индукцию.

5. Обнаружен участок специфического связывания рецептора глюкокортикоидов в районе 4-6 го интронов TD02 крысы, обладающий большим сродством к рецептору, чем 5'-фланкирующая область этого гена, что свидетельствует о его возможной регуляторной роли. Установлено, что находящиеся в том же районе гена TD02 человека единичные нуклеотидные замены (SNP), ассоциированные с рядом психических нарушений, повреждают сайт связывания фактора транскрипции YY1 и приводят к формированию сайтов связывания для других транскрипционных факторов.

6. Сформирована база данных транскрипционных регуляторных районов регулируемых глюкокортикоидами генов - GR-TRRD, содержащая описание регуляторных районов 53 генов и 131 GREs. В результате анализа нуклеотидных последовательностей выборки 84 GREs из

228 позитивно регулируемых глюкокортикоидами генов внесены уточнения в общепринятую консенсусную последовательность. Впервые выведена статистически значимая консенсусная последовательность для GREs из негативно регулируемых генов (nGREs). На основании сравнительного изучения структуры GREs и nGREs показана несостоятельность принятой в настоящее время гипотезы об универсальном механизме негативной глюкокортикоидной регуляции, постулирующей необходимость и достаточность связывании ГР в виде мономера для блокирования транскрипции.

7. На основании анализа описанных в GR-TRRD регуляторных районов генов, кодирующих ряд адаптивных ферментов печени, выявлен транскрипционный фактор, вовлеченный в механизм ген-специфического антиглюкокортикоидного действия химических гепатоканцерогенов. Установлено, что этот эффект реализуется через снижение ДНК-связывающую активности печень-специфичного фактора транскрипции HNF3. Показана связь ингибирующего влияния гепатоканцерогенов на активность HNF3 и последующим развитием опухолей.

6. ЗАКЛЮЧЕНИЕ.

На современном этапе развития молекулярной генетики одной из важнейших проблем является идентификация регуляторных районов генов и выяснение закономерностей их структурно-функциональной организации. Результаты проведенных нами комплексных исследований регуляторных районов контролируемых глюкокортикоидами генов с использованием органичного сочетания экспериментальных подходов и методов теоретического анализа позволили внести существенный вклад в развитие системы представлений о регуляторной части гена и выявить некоторые новые закономерности как в принципах организации, локализации и функционирования ее простейшей структурной единицы -регуляторного элемента (на примере элементов глюкокортикоидной регуляции), так и в организации более сложно устроенных регуляторных районов гена, состоящих из многих регуляторных элементов.

Одним из отправных моментов в формировании системы представлений об организации регуляторной части генов является, как мы считаем, представление об иерархическом делении связывающихся с ДНК факторов транскрипции на две группы: в первую входят факторы, способные самостоятельно находить регуляторные районы контролируемых этими белками генов (т.е. с высокой эффективностью распознавать соответствующие регуляторные элементы), ко второй относятся факторы, привлекаемые к регуляторным районам факторами первой группы. Согласно нашим и литературным данным рецептор глюкокортикоидов (ГР) принадлежит к первой группе транскрипционных факторов. Результаты наших исследований с использованием полученного нами высокоочищенного (в 5000 раз) препарата ГР показывают, что этот белок хорошо распознает специфические сайты его связывания в составе протяженных (десятки т.п.н.) фрагментов ДНК. Подобные результаты, хотя и с использованием фрагментов ДНК меньшей длины (т.п.н.), были получены рядом других авторов [Payvar F. et al., 1981; Cato A. et al, 1984; Renkawitz R. et al., 1984]. Следовательно, сайты связывания ГР являются адекватной моделью для выяснения закономерностей организации регуляторных элементов, обеспечивающих распознавание генов, контролируемых соответствующим фактором. Из экспериментальных данных о высокой избирательности связывания ГР следует также очень важный вывод о принципиальной возможности создания эффективного компьютерного метода поиска сайтов связывания этого белка в последовательностях ДНК.

В опознавании фактором транскрипции соответствующих регуляторных элементов важную роль играет сходство их первичной структуры, описываемое консенсусной последовательностью элемента. Для элементов глюкокортикоидной регуляции (GRE) характерен достаточно выраженный консенсус. Общепринятый его вариант G45G65T5oA55C75A55nnnT8oG95T9oT65CiooT85 (подстрочные индексы обозначают частоты встречаемости указанных нуклеотидов в процентах) был выведен в 1989г. на основании сравнения нуклеотидных последовательностей первых 25 экспериментально выявленных сайтов связывания ГР [Beato М. et al., 1989]. Анализ втрое большей выборки таких сайтов позволил нам внести ряд уточнений в консенсусную последовательность, которая несколько потеряла в консервативности и приобрела вид A5onG51nA43C55A5onnnT81G9oT86T68C9iT58: Тем не менее, по сравнению с консенсусными последовательностями многих других регуляторных элементов [Bucher Р., 1999] консенсус GREs обладает относительной "жесткостью", а также довольно большой протяженностью, что, несомненно, служит условием успешного распознавания своих сайтов рецепторным белком.

Однако, как показывают результаты проведенного нами исследования, это условие является недостаточным. Использование различных вариантов консенсуса для идентификации уже известных и поиска новых сайтов связывания ГР в нуклеотидных последовательностях приводит к высокому уровню либо недопредсказаний, либо перепредсказаний и не позволяет отличать последовательности ДНК регулируемых глюкортикоидами генов от последовательностей, не имеющих отношения к глюкокортикоидной регуляции, в то время как экспериментальные данные показывают, что белок-рецептор успешно дискриминирует такие последовательности.

В связи с этим мы выдвинули гипотезу о том, что для эффективного распознавания регуляторных элементов транскрипционными факторами наряду с относительно консервативной частью элемента, гомологичной консенсусной последовательности, важно вариабельное нуклеотидное окружение этой консервативной части. На примере элементов глюкокортикоидной регуляции нами были получены убедительные доказательства справедливости выдвинутой гипотезы. Во- первых, в экспериментах по изучению связывания ГР с рядом синтезированных двуцепочечных олигонуклеотидов (длиной 43-59п.н.), содержащих консенсусную последовательность GRE в различном нуклеотидном окружении, было показано существенное влияние изменений в "окружении" консенсуса на эффективность связывания. Во-вторых, только с учетом последовательностей, фланкирующих гомологичные консенсусу участки, при создании обучающей выборки сайтов связывания ГР нам удалось построить метод поиска потенциальных сайтов связывания этого белка, способный (подобно самому рецептору) дискриминировать последовательности ДНК контролируемых глюкортикоидами генов и последовательности, не имеющие отношения к глюкокортикоидной регуляции. Значимость окружения гомологичного консенсусу GRE участка была продемонстрирована также в экспериментах по трансфекции при изучении способности изолированных природных GREs, содержащих совершенную копию консенсуса, (GREs из интрона I гена hCS и 5'-области гена тМТГ) обеспечивать гормональную индукцию репортерного гена CAT, которая существенно различалась для этих двух элементов.

Совокупность всех полученных нами результатов позволяет рассматривать структуру сайта связывания ГР как сочетание его достаточно консервативного ядра, гомологичного консенсусной последовательности GRE, и неслучайного, хотя и не содержащего видимых признаков консервативности, ближайшего нуклеотидного окружения этой последовательности. При этом вариабельное окружение должно, очевидно, содержать тот или иной набор факультативных характеристик, которые в сочетании с консервативным ядром сайта формирует оптимальную для распознавания рецептором локальную конформацию ДНК. Такая сложная организация сайтов связывания ГР, с одной стороны, обеспечивает высокую точность их распознавания белком-рецептором в составе протяженных участков ДНК, т.е. фактически лежит в основе распознавания рецептором контролируемых глюкокортикоидами генов в геномных последовательностях. С другой стороны, подобная организация допускает возможность нахождения самых разнообразных регуляторных элементов в непосредственной близости от ядра сайта связывания ГР, что создает широкий спектр вариантов организации регуляторных районов для обеспечения индивидуальных особенностей глюкокортикоидной регуляции различных генов (таких, например, как тканеспецифичность, позитивный или негативный характер ответа на гормональный сигнал, модулирующие действие других внешних сигналов и т.д.).

Для сбора и систематизации информации о структурно-функциональной организации регуляторных районов контролируемых глюкокортикоидами генов нами была сформирована база данных GR-TRRD (Glucocorticoid-Regulated Genes TRRD). Эта база является составной частью созданной в лаборатории теоретической генетики ИЦиГ СО РАН базы данных TRRD (Transcription Regulatory Regions Database) [Кель А.Э. и др., 1997; Kolchanov N.A. et al., 1999; Kolchanov N.A. et al., 2000] и в настоящее время содержит описание 53 регулируемых глюкокортикоидами генов. Анализ собранных в базе данных показывает высокую степень сложности строения регуляторных районов контролируемых глюкокортикоидами генов и наличие уникальных особенностей в организации каждого района. Наиболее представленной в базе формой объединения регуляторных элементов, содержащих GREs и обеспечивающих глюкокортикоидную регуляцию генов, являются GRUs - единицы глюкокортикоидной регуляции. Как правило, GRU содержит один или несколько сайтов связывания ГР и ряд сайтов связывания других ТФ, которые обеспечивают различные аспекты глюкокортикоидной регуляции конкретных генов. Обеспечивающие сходные функции GRUs характеризуются близким или даже идентичным составом регуляторных элементов, однако, количество элементов каждого типа и расположение различных элементов внутри GRUs строго индивидуально (Рис. 31). Такая организация регуляторных районов позволяет понять причины "неуловимости" для принятых в настоящее время методов анализа нуклеотидных последовательностей факультативных характеристик окружения гомологичного консенсусу ядра сайта связывания ГР, важных для связывания этого белка. Выявление таких характеристик, очевидно, станет возможным с появлением новых методов анализа последовательностей ДНК.

Кроме того, в рамках GR-TRRD нами собрана самая большая на сегодняшний день выборка экспериментально выявленных GREs (131 элемент). В результате анализа этой выборки нами были не только внесены существенные уточнения в общепринятую консенсусную последовательность GREs из позитивно регулируемых глюкокортикоидами генов, но также впервые выведена статистически значимая консенсусная последовательность для GREs из негативно регулируемых генов (nGREs).

Детальное изучение структуры "позитивных" и "негативных" GREs позволило нам прийти к заключению о неверности принятой в настоящее время гипотезы [Lefstin J.A. & Yamamoto K.R., 1998], согласно которой связывание ГР в виде мономера с его сайтами на ДНК или с другими транскрипционными факторами является универсальным механизмом репрессии транскрипции под действием глюкокортикоидов.

Одной из главных целей создания GR-TRRD являлось последующее использование сконцентрированных в ней данных для выбора оптимальной стратегии проведения экспериментальных исследований различных аспектов глюкокортикоидной регуляции. В рамках данной работы это было реализовано при планировании экспериментов по выяснению механизма ген-специфического антиглюкокортикоидного действия химических гепатоканцерогенов. Сравнение структурно-функциональной организации описанных в GR-TRRD GRUs гена ТАТ, глюкокортикоидная индукция которого снижается под действием канцерогенов, и генов РЕРСК и ASPART, на индукцию которых эти вещества не действуют, позволило предположить, что данный эффект может быть осуществлен посредством влияния канцерогенов на регуляторные белки - члены HNF3, Ets и GMEB семейств факторов транскрипции. Эксперименты по изучению влияния гепатоканцерогенов на ДНК-связывающую активность этих белков с использованием различных моделей химического гепатоканцерогенеза показали, что представители одного из этих семейств, а именно HNF3 факторы, действительно вовлечены в механизм как антиглюкокортикоидного, так и опухолеиндуцирующего действия канцерогенов.

Таким образом, благодаря использованию GR-TRRD нам удалось не только выяснить нераскрытый до сих пор механизм давно известного явления - антиглюкокортикоидного эффекта гепатоканцерогенов, но и впервые получить данные о тесно сопряженном с опухолеиндуцирующей активностью химических канцерогенов негативном влиянии этих соединений на тканеспецифичный, имеющий непосредственное отношение к дифференцировке транскрипционный фактор. Результаты этой работы поддерживают концепцию, связывающую неопластический процесс с нарушениями не структуры, а функции генома, и имеют принципиальное значение для понимания механизмов, лежащих в основе канцерогенного процесса.

Одним из важнейших в системе представлений об организации регуляторной части генов является вопрос о локализации регуляторных элементов в различных их районах. На момент начала наших исследований в этой сфере господствующим было представление о том, что регуляторной является 5'- фланкирующая область гена. Это определило направленность работ по выявлению различных регуляторных элементов, включая GREs, которые фактически оказались сосредоточенными на изучении 5'- фланкирующая областей различных генов. Однако, полученные нами результаты как теоретического анализа нуклеотидных последовательностей контролируемых глюкокортикоидами генов, так и поиска GREs и других регуляторных элементов с помощью экспериментальных подходов показывают, что помимо 5'-фланкирующей области регуляторная часть этих генов включает и другие районы. Прежде всего, с помощью разработанного нами метода поиска потенциальных сайтов связывания ГР было показано, что частота встречаемости таких сайтов в нуклеотидных последовательностях интронов и 3'-фланкирующих районов регулируемых глюкокортикоидами генов составляет 0,9-1,8 на 1 т.п.н., что сравнимо с частотой встречаемости потенциальных сайтов связывания ГР в 5'-фланкирующих районах (2 на 1 т.п.н.). Для предсказанных с помощью разработанного метода сайтов в первом интроне гена хорионического соматомамотропина человека и 3'-фланкирующей районе гена металлотионеина I их способность специфически связывать ГР и функционировать в качестве GREs была подтверждена экспериментально. Был обнаружен также участок специфического связывания ГР в район 4-6 го интронов гена TD02 крысы, который взаимодействовал с рецептором более эффективно, чем 5'-фланкирующая область данного гена. Кроме того, в интроне 6 гена TD02 человека был найден сайт связывания транскрипционного фактора YY1, нарушение которого в результате встречающихся в популяции человека единичных нуклеотидных замен (SNP), ассоциировано с рядом психических расстройств.

Полученные нами результаты вместе с постоянно возрастающим объемом литературных данных об обнаружении как отдельных регуляторных элементов, так и протяженных регуляторных районов (энхансеров, сайленсеров) в интронах и 3'-фланкирующих районах генов [Bucher Р., 1999; Carey М. & Smale S.T., 2000] указывают на необходимость интенсификации работ по изучению этих районов для углубления знаний об организации регуляторной части гена и механизмах регуляции транскрипции. Развитие данного направления исследований представляется весьма перспективным еще и потому, что оно с большой вероятностью может привести к открытию новых, важных для регуляции экспрессии генов функций регуляторных элементов, расположенных ниже старта транскрипции. Этими функциями, могут оказаться, например, взаимодействие связанных с такими элементами ТФ с белками ядерного матрикса, что может обеспечить необходимую для эффективной экспрессии гена его наднуклеосомную укладку в составе хроматина, или участие ТФ, связывающихся с расположенными в интронах элементами, в механизме дестабилизации нуклеосом, облегчающем продвижение РНК-полимеразы II в ходе элонгации транскрипции и т.п.

В целом, полученные нами данные способствуют лучшему пониманию механизмов глюкортикоидной регуляции. Они показывают сложность структуры GREs, которая наряду с консервативной, гомологичной консенсусу частью, включает ее неслучайное, но высоковариабельное нуклеотидное окружение. Такая организация GREs обусловлена уникальными чертами строения регуляторных районов различных генов. С одной стороны, она обеспечивает высокую избирательность распознавания этих элементов рецепторным белком на фоне большого числа похожих на консенсус последовательностей и таким образом вносит существенный вклад в механизмы координированной глюкокортикоидной регуляции групп генов, а с другой - дает возможность для реализации индивидуальных особенностей регуляции экспрессии отдельных генов, находящихся под контролем глюкокортикоидных гормонов. Комплексное строение содержащих GREs регуляторных районов обеспечивает также возможности модуляции величины глюкокортикоидного ответа за счет влияния различных факторов на взаимодействующие с рецептором регуляторные белки. Полученные нами результаты свидетельствуют также о большом регуляторном потенциале интронов и 3'- фланкирующих районов контролируемых глюкокортикоидами генов и вовлеченности этих районов в процессы регуляции транскрипции глюкокортикоидными гормонами. Применявшееся в ходе всех проводимых нами исследований взаимодополняющее сочетание экспериментальных и теоретических методов продемонстрировало хорошую результативность и представляется весьма перспективным подходом к изучению регуляторных элементов и регуляторных районов генов.

Автор выражает глубокую благодарность В.М. Меркулову, без которого не была бы начата и выполнена данная работа, С.Ю.Плисову, Г.В. Васильеву, И.А. Селедцову за многолетнее плодотворное сотрудничество и большое удовольствие, которое доставляла совместная с

225 ними работа, С.Ю. Плисову также за помощь лаборатории регуляции экспрессии генов, которую он неизменно оказывал после отъезда за рубеж, В.И. Каледину за предоставление прекрасно подготовленной экспериментальной модели для изучения механизмов антиглюкокортикоидного действия гепатоканцерогенов, плодотворное сотрудничество в данной области и интересные дискуссии, К.Ю. Кропачеву за вклад в исследование механизмов антиглюкокортикоидного действия гепатоканцерогенов, В.Ф. Кобзеву за синтез олигонуклеотидов, обеспечивший возможность продолжать экспериментальные исследования даже в самые тяжелые времена, Н.А. Колчанову за полезные дискуссии и постоянную помощь в организации компьютерной части исследования, а также всем сотрудникам ИЦиГ и студентам НГУ, принимавшим то или иное участие в выполнении или обеспечении условий выполнения данного исследования.

Список литературы диссертационного исследования доктор биологических наук Меркулова, Татьяна Ивановна, 2002 год

1. Александров Н.Н., Каламбет Ю.А. // Компьютерный анализ генетических текстов. / Под ред. Франк-Каменецкого М.Д. Москва. Наука. 1990. С. 113-153.

2. Георгиев Г.П. "О структуре единиц транскрипции в клетках эукариот". // Успехи биологической химии. 1973. Т. С.3-46.

3. Гловер Д. Клонирование ДНК. Методы. М. Мир. 1988.

4. Каледин, В.И., Алексеева Г.В., Волкова А.И. "О канцерогенности о-аминоазотолуола для кишечника мышей". // Бюллетень эксп. биол. и мед. 1978 Т. 10. С. 476-477.

5. Каледин В.И., Глазко Т.Т., Захарова Н.П. "Нарушение индукции тирозинаминотрансферазы дексаметазоном в печени мышей, получавших о-аминоазотолуол "// Докл. АН СССР. 1979. Т.224. С. 233237.

6. Каледин В.И., Захарова Н.П. // Исследования по индукции и метастазированию злокачественных опухолей у экспериментальных животных. / Под ред. Грунтенко Е.В. Новосибирск: ИцИГ. 1984. С. 146— 185.

7. Каледин В.И., Багинская Н.В. "Влияние диэтилнитрозамина на индукцию гидрокортизоном активности тирозинаминотрансферазы в печени крыс линии Спрейг-Доули и мышей линии ДД". //Эксперим. Онкология. 1993.Т.15. С.17-20.

8. Ю.Каледин В.И., Гуляева Л.Ф., Ильницкая С.И., Попова Н.А., Булычева Т.Е. "За нарушение глюкокортикоидной индукции тирозинаминотрансферазы в печени ответственны активированные метаболиты гепатоканцерогенов". // Доклады РАН.1997. Т. 357. С. 126129.

9. П.Кель А.Э., Колчанов Н.А., Кель О.В., Ромащенко А.Г., Ананько Е.А., Игнатьева Е.В., Меркулова Т.И., и др. "TRRD база данных регуляторных районов транскрипции эукариот" // Молекулярная биология 1997. Т.31. С. 626-636.

10. Кель О.В., Кель А.Э. Межгенные взаимоотношения в регуляции клеточного цикла. Ключевая роль транскрипционных факторов E2F. // Мол. Биол. 1997. Т. 31. С. 656-670.

11. Кель О.В., Кель А.Э., Ромащенко А.Г., Колчанов Н.А. Композиционные регуляторные элементы: классификация и описание в базе данных Compel // Молекулярная биология, 1997, т.31, с.601-615.

12. Колмен А.// Транскрипция и трансляция. Методы. Под. ред. Хейнса Б. и Хиггинса С. М.: Мир, 1987. С.80.

13. Маниатис Т., Фрич Э., Сэмбрук Дж. Молекулярное клонирование, М. Мир. 1984.

14. Меркулова Т.И., Меркулов В.М., Митина P.JI. "Механизмы глюкокортикоидной регуляции и регуляторные зоны генов, контролируемых глюкокортикоидами: описание в базе данных TRRD" // Молекулярная биология 1997. Т.31, С.714-725.

15. Миллер, Дж. и Миллер Э. Успехи в изучении рака 1955 Т 1. С. 7-71.

16. Позднякова Л.Д., Дашкевич B.C., Каледин В.И., Мертвецов Н.Н. "Влияние 3'-метил-4-диметиламиноазобензола и его неканцерогенного аналога на глюкокортикоидную индукцию тирозинаминотрансферазы в печени крыс". // Доклады АН. 1995. Т.340. С. 119-122.

17. Пузырев В.П., Степанов В.А. Патологическая анатомия генома человека. Новосибирск: Наука. 1997.

18. Розен В.Б., Смирнов А.Н. "Рецепторы и стероидные гормоны". // Издательство Московского университета. 1981.

19. Селедцов И.А., Соловьев В.В., Меркулова Т.И. "Новые элементы в структуре сайтов связывания глюкокортикоид-рецепторного комплекса в составе гормон-регулируемых генов".// Молекулярная биология. 1990. Т.24. С. 716-728.

20. Студитский В.М. "Транскрипция хроматина" //Молекулярная биология.2001. Т. 35. С. 235-237.

21. Сьякесте Н.И., Сьякесте Т.Г. "Факторы транскрипции и ядерный матрикс"//Молекулярная биология. 2001. Т. 35. С. 739-749.

22. Хефтман Э. "Биохимия стероидов."//Москва. Мир. 1972.

23. Adler A.J., Danielsen М., Robins D.M. "Androgen-specific gene activation via glucocorticoid response element is determined by interaction with nonreceptor factors". // Proc. Natl. Acad. Sci. USA 1992. V. 89. P. 1166011663.

24. Akerblom I.E, Slater E.P, Beato M, Baxter J.D, Mellon PL "Negative regulation by glucocorticoids through interference with a cAMP responsive enhancer". // Science 1988. V. 241(4863) P. 350-353.

25. Alberts В., Herrick G. "DNA-cellulose chromatography".// Methods Ensymol. 1971. V.21. PartC. P. 198-217.

26. Almlof Т., Wright A.P., Gustafsson J.A. "Role of acidic and phosphorylated residues in gene activation by the glucocorticoid receptor". // J. Biol. Chem. 1995. V.270P. 17535-17540.

27. Almlof Т., Gustafsson J.A., Wright A.P. "Role of hydrophobic amino acid clusters in the transactivation activity of the human glucocorticoid receptor". // Mol. Cell. Biol. 1997. V.17 P.934-945.

28. Almlof Т., Wallberg A.E., Gustafsson J.A., Wright A.P. "Role of important hydrophobic amino acids in the interaction between the glucocorticoidreceptor tau 1-core activation domain and target factors" .// Biochemistry 1998. V. 37. P. 9586-9594.

29. Alroy I., Freedman L.P. "DNA binding analysis of glucocorticoid receptor specificity mutants". // Nucleic Acids Res. 1992. V.20 P. 1045-1052.

30. Ammendola R., Gounari F., Piaggio G. et al. "Transcription of the promoter of the rat NF-1 gene depends on the integrity of an Spl recognition site". // Mol. Cell. Biol. 1990. V.10. P.387-390.

31. Anderson R.A., Raina P.N., Milholland R.J. // Oncologia. 1966. 20. P. 153166.

32. Andrews G.K."Regulation of metallothinein gene expression."// Prog, in Food and Nutr. Sci. 1990. V. 14. P. 193-258.

33. Argentin S., Sun Y.L., Lihrmann I., Schmidt T.J., Drouin J., Nemer M. "Distal cis-acting promoter sequences mediate glucocorticoid stimulation of cardiac atrial natriuretic factor gene transcription. // J. Biol. Chem. 1991. V. 266. P. 23315-23322.

34. Balbin M. and Lopez-Otin C. "Hormonal regulation of human pepsinogen С gene in breast cancer cells". //J.Biol.Chem. 1996. V. 271. P. 15175-15181.

35. Bartsch D., Ghirardi M., Skehel et al. "Aplysia CREB2 represses long-term facilitation relief of repression, converts transient facilitation into long-term functional and structural changes". // Cell. 1995. V. 8. P. 979-992.

36. Baxter J.D. Tomkins G.M. "Specific cytoplasmic glucocorticoid receptor in hepatoma tissue culture cells."// Proc. Natl. Acad. Sci. 1971. V. 68. P. 932937.

37. Beato M., Chalepakis G, Schauer M., Slater E.P. "DNA regulatory elements for steroid hormones".// J. Steroid Biochem. 1989. V. 32. P.737-748.

38. Beato M., Eisfeld K. "Transcription factors access to chromatin". // Nucl. Acids Res. 1997. V. 25. P. 3559-3563.

39. Becker P., Renkawitz R., Schutz G. "Tissue-specific DNasel hypersensitive site in the 5'-flanking sequences of the tryptophan oxygenase and tyrosineaminotransferase genes". // EMBO J. 1984. V. 3. P. 2015-2020.

40. Becker P.B., Gloss В., Schmid W., Strahle U., Schutz G. "In vivo protein-DNA interactions in a glucocorticoid response element require the presence of the hormone". // Nature 1986. V.324. P. 686-688.

41. Berg O.G., von Hippel P.H. "Selection of DNA binding sites by regulatory proteins: Statistical-mechanical theory and applications to operators and promoters". // J. Mol. Biol. 1987. V. 193. P. 723-750.

42. Bianci M., Meng C., Ivashkiv L. B. "Inhibition of IL-2-induced Jak-Stat signaling by glucocorticoids." // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 2000.V. 97. P. 9573-9578.

43. Blomquist P., Li Q., Wrange O. "The affinity of nuclear factor 1 for its DNA state is drastically reduced by nucleosome organization irrespective of its rotational or translational position". //J. Biol. Chem.1996. V.271. P.153-159.

44. Bocquel M. T, Kumar V, Strieker C, Chambon P, Gronemeyer H. "The contribution of the N- and C-terminal regions of steroid receptors to activation of transcription is both receptor and cell-specific". // Nucleic Acids Res. 1989. V. 17 P. 2581-2595

45. Bodwell J.E., Orti E., Coull J.M., Pappin D.J., Smith L.I., Swift F. "Identification of phosphorylated sites in the mouse glucocorticoid receptor". //J. Biol. Chem. 1991. V. 266. P. 7549-7555.

46. Bredford M. // Anal. Biochem. 1976. V.72. P. 248-254.

47. Bresnick E.H., Dalman F.C., Sanchez E.R., Pratt W.B. Evidence that the 90-kDa heat shock protein is necessary for the steroid binding conformation of the L cell glucocorticoid receptor". // J. Biol. Chem. 1989. V. 264. P.4992-4997.

48. Brookes A.J., Lehvaslaino H., Siegfried M., Boehm J.G., Yuan Y.P., Sarkar C.M., Bork Р/, Ortigao F. HGBASE: a database of SNPs and other variations in and around human genes. // Nucleic Acids Res. 2000. V. 28. P. 352-355.

49. Boshart M., Kluppel M.,Schmidt A. et al."Reporter constructs with lowbackground activity utilizing the CAT gene."// Gene. 1992. V.110. P. 129130.

50. Bruggemeier U., Rogge L., Winnacker E.-L., Beato M. "Nuclear factor I acts as a transcription factor on the MMTV promoter but competes with steroid hormone receptors for DNA binding". // EMBO J. 1990. V.9. P.2233-2239.

51. Bucher P. Regulatory elements and expression profiles. // Curr. Opin. Srtuct. Biol. 1999. V. 9. P. 400-407.

52. Bushmeyer S., Park K., Atchison M. "Caracterization of functional domains within the multifanctional transcription factor YY1". // J. Biol. Chem. 1995. V. 270. P. 30213-30220.

53. Burnstein K.L., Jewell C.M., Cidlowski J.A. "Human glucocorticoid receptor cDNA contains sequences sufficient for receptor down-regulation". // J. Biol. Chem. 1990. V. 265. P. 7284-7291.

54. Cake M.H. "Induction of tyrosine aminotransferase in utero by anti-insulin agents". // Biochem. J. 1986. V. 238. P. 927-929.

55. Calladin C.R. "Mechanisms of sequence-dependent stacking of bases in B-DNA". // J. Mol. Biol. 1982. V. 161. P. 343-352.

56. Camper S.A., Yao Y.A., Rottman F.M. "Hormonal regulation of the bovine prolactin promoter in rat pituitary tumor cells".// J.Biol.Chem. 1985.V. 260. P. 12246-12251.

57. Carey M., Smale S.T. Transcriptional regulation in eukaryotes. Cold Spring Harbor, New York: Cold Spring Harbor Laboratory Press; 2000

58. Castren M, Trapp T, Berninger B, Castren E, Holsboer F. "Transcriptional induction of rat mineralocorticoid receptor gene in neurones by corticosteroids". // Mol. Endocrinol. 1995. V. 14. P. 285-293.

59. Cereghini S. "Liver-enriched transcription factors and hepatocyte differentiation". // FASEB J. 1996. V.10 P. 267-282.

60. Chattopadhyay N., Kher R., Godbole M. "Inexpensive SDS/phenol method for RNA extraction from tissues". //Biotechniques. 1993. V. 15. P. 24-26.

61. Cheung J., Smith D.F. "Molecular shaperone interactions with steroid receptors: an update." // Mol. Endocrinol. 2000. V. 14. P. 939-946.

62. Claessens F., Alen P., Devos A., Peeters В., Verhoeven G., Rombauts W. "The androgen-specific probasin response element 2 interacts differentially with androgen and glucocorticoid receptors". // J. Biol. Chem. 1996. V. 271. P. 19013-19016.

63. Clouston W.M., Lyons I.G., Richards R.I. "Tissue-specific and hormonal regulation of angiotensinogen minigenes in transgenic mice".// EMBO J. 1989. V. 8. P. 3337-3343.

64. Cochet M. Chang A.C.Y., Cohen S.N. "Characterization of structural gene and putative 5'-regulatory sequence of human proopiomelanocortin". // Nature 1982. V. 297. P.335-339.

65. Comings D.E. "Blood serotonin and triptophan in Tourette sindrome". // Amer.J.Med.Genetics. 1990. V.36. P.418-430.

66. Comings D.E., Muhleman D., Dietz G.W., Donlon T. "Humman TO loceted to 4q31 possible implication for alkoholism and ohter behevioral disorders."// Genomics. 1991. V.9. P.301-308.

67. Comings DE, Muhleman D, Dietz G, Sherman M, Forest GL. "Sequence of human tryptophan 2,3-dioxygenase (TD02): presence of a glucocorticoid response-like element composed of a GTT repeat and an intronic CCCCT repeat". // Genomics 1995.V. 29.P. 390-396.

68. Comings D.E.,Gade R., Muhleman D., Chue C."Exon and intron variants in the humman TO gene: potentional association with Tourette sindrome, substans abuse and other disorders."// Pharmacogenetics. 1996. V.6. P.307-318.

69. Compton M.M., Cidlovski J.A. "Identification of glucocoprticoid induced nuclease in thymocytes". // J.Biol.Chem. 1987. V. 262. P. 8288-8292.

70. Cordingley M.G., Riegel A.T., Hager G.L. "Steroid-dependent interaction of transcription factors with the inducible promoter of mouse mammary tumor virus in vivo". // Cell 1987. V. 48. P. 261-270.

71. Cornett L.E., Hiller F.C., Jacobi S.E., Cao W., McGraw D.W. "Identification of a glucocorticoid response element in the rat beta2-adrenergic receptor gene". //Mol.Pharmacol. 1998. V. 54. P. 1016-1023.

72. Costa R.H., Grayson D.R., Darnell J.E. "Multiple hepatocyte-enriched nuclear factors function in the regulation of transthyretin and a-antitrypsingenes". // Mol. Cell. Biol. 1989. V. 9. P. 1415-1425.

73. Cote C.J., Gafel R.F. "Dexamethasone differently affects the level of calcitonin and calcitonin gene regulated mRNA in a medullary carcinoma cell line". //J.Biol.Chem. 1986. V. 262. P. 15524-15528.

74. Dahlman-Wright K., Wright A., Gustafsson J.A., Carlstedt-Duke J. "Interaction of the glucocorticoid receptor DNA-binding domain with DNA as a dimer is mediated by a short segment of five amino acids". // J Biol. Chem. 1991. V. 266. P. 3107-3112.

75. Dahlman-Wright K., Wright A.P., Gustafsson J.A. "Determinants of high-affinity DNA binding by the glucocorticoid receptor: evaluation of receptor domains outside the DNA-binding domain". // Biochemistry 1992. V. 31. P. 9040-9044.

76. Dahlman-Wright K., Grandien K., Nilsson S., Gustafsson J.A., Carlstedt-Duke J. "Protein-protein interactions between the DNA-binding domains of nuclear receptors: influence on DNA-binding". // J. Steroid Biochem. Mol. Biol. 1993.V.45. P. 239-250.

77. Danesch U., Closs В., Schmid W., Schutz G., Schule R., Rencawitz R."Glucocorticoid induction of rat tryptophan oxigenase gene is mediated by two wide separated glucocorticoid responsive elements."// EMBO J. 1987. V.6. P.625-630.

78. Danielian P.S., White R., Lees J.A., Parker M.G. "Identification of a conserved region required for hormone dependent transcriptional activation by steroid hormone receptors". // EMBO J. 1992.V. 11. P. 1025-1033.

79. Danielsen M., Northrop J.P., Ringold G.M. "The mouse glucocorticoid receptor: mapping of functional domains by cloning, sequencing and expression of wild-type and mutant receptor proteins".// EMBO J. 1986 V. 5. P.2513-2522.

80. Danielsen M., Hinck L., Ringold G.M. "Two amino acids within the knuckle of the first zinc finger specify DNA response element activation by the glucocorticoid receptor". // Cell 1989. V. 57. P. 1131-1138.

81. Danielsen M. "Properties of the hormone binding domain of the glucocorticoid receptor". // Glucocorticoid receptor structure / Gametchu B. New-York, Berlin, Heidelberg: Springer-Verlag, 1995. P. 57-74.

82. Davidson E., Jacobs H.T., Britten R.G. "Very short repeats and coordinate induction of genes". //Nature 1983. V. 301. P.468-470.

83. Dean D.M., Jones P., Sanders M.M. "Regulation of the chicken ovalbumin gene estrogen and corticocterone requires a novel element binds a labile protein, Chrip-I". //Mol.Cell.Biol. 1996. V. 16. P. 2015-2024.

84. Dean D.M., Sanders M.M. "Ten years after: reclassification of steroid-responsive genes" // Mol. Endocrinol. 1996. V. 10. P. 1489-1495.

85. Diamond D.J., Goodman H.M. "Regulation of growth hormone mesenger RNA synthesis by dexamethasone and thriiod thironin". // J. Mol.Biol. 1985.V. 181. P. 41-62.

86. Diamond,M.I., Miner,J.N., Yoshinaga,S.K. and Yamamoto,K.R. "Transcription factors interactions: Selectors of positive or negative regulation from single DNA element". // Science. 1990. V. 249. P. 12661272.

87. Di Lorenzo D., Williams P., Ringold G. Identification of two distinct nuclear factors with DNA-binding activity within glucocorticoid regulatory region of the rat a-l-acid-glycoprotein // Biochem. Biophys. Res. Comm. 1991. V.176. P. 1326-1332.

88. Drouin J., Sun Y.L., Tremblay S., Lavender P., Schmidt T.J., de Lean A., Nemer M. "Homodimer formation is rate-limiting for high affinity DNA binding by glucocorticoid receptor". // Mol. Endocrinol. 1992. V. 6. P. 12991309.

89. Drouin J., Sun Y.L., Chamberland M., Gauthier Y., De Lean A., Nemer M., Schmidt T. J. "Novel glucocorticoid receptor complex with DNA element of the hormone repressed POMC gene". // EMBO J. 1993. V.7. P.3389-3395.

90. Eisfeld К., Candau R., Truss M., Beato M. Binding of NF1 to the MMTV promoter in nucleosomes: influence of rotational phasing, translational position and histone HI. //Nucl. Acids Res. 1997. V. 25. P. 3733-3742.

91. Encio I.J., Detera-Wadleigh S.D. "The genomic structure of the human glucocorticoid receptor". // J. Biol. Chem. 1991. V. 266. P.7182-7188.

92. Eriksson M.A., Nilsson L. "Structural and dynamic effects of point mutations in the recognition helix of the glucocorticoid receptor DNA-binding domain'.// Protein Eng. 1998. V. 11. P. 589-600.

93. Espinas M.L., Roux J., Ghysdal J., Pictet R., Grange T. "Participation of Ets transcriptional factors in glucocorticoid response of the rat tyrosine aminotransferase gene". // Mol. Cell. Biol. 1994. V. 14. P. 4116-4125.

94. Evans L., Best J., Moore G., Cox J. "Zimelidine: a serotonin uptake blocker in the treatment of phobic anxiety."// Progr. Neuropsych. Biol.Psychiatry. 1980. V.4. P.75-79.

95. Evans R.M. "The steroid and thyroid hormone receptor superfamily". // Science 1988. V. 240. P.889-895.

96. Falkner C.K., Rushmore Т.Н., Linder M.W., and Prough R.A. "Negative regulation of the rat glutathione S-transferase A2 gene by glucocorticoids involves a canonical glucocorticoid consensus sequence". // Mol. Pharmacol. 1998. V. 53. P. 1016-1026.

97. Firestone G.L., Payvar F., Yamamoto K. "Glucocorticoid regulation of protein processing and compartmentalization". // Nature 1984. V. 300. P. 221-225.

98. Fragozo G., John S., Roberts M.S., Hager G.L. Nucleosome positioning on the MMTV LTR results from the frequency-based occupancy of multiple frames.//Genes. Dev. 1995. Y.9. P. 1933-1947.

99. Freedman L.P., Luisi B.F., Korszun Z.R., Basavappa R., Sigler P.B., Yamamoto K.R. "The function and structure of the metal coordination sites within the gluco-corticoid receptor DNA binding domain". // Nature 1988. V. 334 P.543-546.

100. Freedman L.P., Yoshigava S.K., Yanderbilt J.N., Yamamoto K.R. "In vitro transcription enhancement by purified glucocorticoid receptor".// Science. 1989. V. 245. P. 298-301.

101. Freedman L.P. Steroid receptors zinc fingers. // Endocrine Rev. 1992. V. 13. P. 129-145.

102. Ford J., McEvan IJ., Wright A.P.H., Gustafsson J-A. "Involvment of the transcription factor IID protein complex in gene activation by the N-terminal domain of the glucocorticoid receptor in vitro".// Mol. Endocrinol. 1997. V.l 1. P.1467-1475.

103. Fujii K. "Induction of tumors in transplacental or neonatal mice administered 3'-methyl-4-dimethylaminoazobenzene or 4-aminoazobenzene". //Cancer Lett. 1983.Y. 17. P. 321-325.

104. Funder J.W., Pearce P.Т., Smith R., Smith A.I. "Mineralocorticoid action: target tissue specificity is enzyme, not receptor, mediated". // Science 1988. V. 242. P.583-585.

105. Gadson P., McCoy J. "Differential expression of tyrosine aminotransferase by glucocorticoids and insulin". // Biochem. Biophys. Acta 1993. V. 1173. P. 22-31.

106. Gametchu B, Harrison R.W. "Characterization of a monoclonal antibody to the rat liver glucocorticoid receptor".//Endocrinology 1984. V.114. P.274-279.

107. Gloger S., Grinnaus L., Birmacher R.'Treatment of spontaneous panic attacks with clomipramine."// Am. J. Psychiatry. 1981. V. 138. P. 12151217.

108. Godowski P.J., Rusconi S., Miesfeld R., Yamamoto K.R. "Glucocorticoid receptor mutants that are constitutive activators of transcriptional enhancement". //Nature. 1987. V. 325. P.365-368.

109. Gorman C.M., Moffat L.F., Howard B.H. "Recombinant genomes which express chloramphenicol acetyltransferase in mammalian cells".// Mol. Cell. Biol. 1982. V. 2. P.1044-1061.

110. Gorski К., Carnero M., Schibler U. "Tissue-specific in vitro transcription from the mouse albumin promoter".// Cell. 1986. V. 47. P. 767-776.

111. Gotoh Т., Chowdhury S., Takiguchi M., Mori M. "The glucocorticoid-responsive gene cascade. Activation of the rat arginase gene through induction of C/EBP beta". //J. Biol. Chem. 1997. V. 272. P. 3694-3698.

112. Govindan M.V., Gronemeyer H. "Characterisation of the rat liver glucocorticoid receptor purified by DNA-cellulose and ligand affinity chromatography".// J. Biol.Chem. 1984. V. 259. P. 12915-12924.

113. Granner D.K., Hargrove J.L. "Regulation of the synthesis of tyrosine aminotransferase: the relationship to mRNA TAT". // Mol. Cell. Biochem. 1983. V.53-54. P.l 13-128.

114. Greengard O. "The developmental formation of enzymes in rat liver". //Biochemical action of hormones Academic Press, New-York, London. (Ed. Litwack G.) V. 1 P. 53-87.

115. Gualberto A., LePage D., Pons G. Mader S.L., Park K., Atchison M.L., Walsh K. "Functional antagonism between YY1 and the serum response factor". // Mol.Cell.Biol. 1992. V.12. P.209-4214.

116. Guo В., Odgren P.R., van Wijnen A.J., Last Т., Nickerson J., Penman S., Lian J., Stein G. "The nuclear matrix protein NMP-1 is the transcription factor YY1" // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 1995. V. 92 P. 10526-10530.

117. Guo D.-F., Uno S., Inagami T. "Steroid hormones upregulate rat angiotensin II type 1A receptor gene: role of glucocorticoid responsive elements in rat angiotensin II type 1A promoter". // J.Ster.Boichem.Mol.Biol. 1995.V. 53. P. 69-73.

118. Hall R.K., Yamasaki Т., Kucera Т., Waltner-Law M., O'Brian R., Granner D.K "Regulation of phosphoenolpyruvate carboxykinase and insulin-like growth factor binding protein 1 gene expression by insulin."// J.Biol.Chem. 2000. V. 275. P.30169-30175.

119. Hanausen-Walaszek M., Shumm D.E., Webb Т.Е. "The repression and derepression of hepatic tyrosine aminotransferase by carcinogenes". // Chem.-Biol. Interactions 1976. V. 12. P. 391-401.

120. Hapgood J.P., von Holt C. "Steroid affinity purification of the rat liver glucocorticoid hormone receptor". // J. Steroid. Biochem. 1987. V.28. P. 769-777.

121. Harrison R.W., Lippman S.S., Hendry W.J., Chien M.C. Isolation of genomic sublibrary enriched for glucocorticoid regulated genes. // DNA Cell Biol. 1990. V. 9. P. 95-102.

122. Hashimoto S., Schmid W., Schutz G. "Transcriptional activation of the rat liver tyrosine aminotransferase gene by cAMP". // Proc. Natl. Acad. Sci. USA 1984. V.81 P. 6637-6641.

123. Hautanena A., Lankinen L., Kupari M., Janne O.A., Adlercreutz H., Nikkila H., White P.C. "Associations between aldosterone synthase gene polymorphism and the adrenocortical function in males". // J. Intern. Med. 1998. V.244. P. 11-18.

124. Heck S., Kullmann M., Gast A., Ponta H., Rahmsdorf H.J., Herrlich P., Cato A.C. "A distinct modulating domain in glucocorticoid receptor monomers in the repression of activity of the transcription factor AP-1". // EMBO J. 1994. V. 13. P.4087-4095.

125. Heery D.M., Kalkhoven E., Hoare S., Parker M.G. " A signature motif of transcriptional co-activators mediates binding to nuclear receptors"// Nature.1997. V. 387. P. 733-736.

126. Henriksson A., Almlof Т., Ford J., McEwan I.J., Gustafsson J.A., Wright A.P. "Role of the Ada adaptor complex in gene activation by the glucocorticoid receptor". // Mol. Cell. Biol. 1997. V. 17 P.3065-3073.

127. Hienrich P.C., Castell J.V., Andus T."Interleukin-6 and acute phase response." // Biochem. J.1990. Vol. 265. P.621-536.

128. Hierholzer K., Buhler H. "Metabolism of cortical steroid hormones and their general mode of action". // Comprehensive human physiology. / Greger R., Windhorst U. Berlin, Heidelberg: Springer-Verlag, 1996. P. 79-93.

129. Hirt H., Kimelman J., Birnboum M.J., Chen E.Y., Seeburg P.H., Eberhart N.L., Barta A.'The human growth hormone gene locus: structure, evolution, and allelic variants."//DNA. 1987. V.6. P. 59-70.

130. Hittelman A.B., Burakov D., Iniguez-Lluhi J.A., Freedman L.P., Garabedian M.J. "Differential regulation of glucocorticoid receptor transcriptional activation via AF-1 associated proteins". // EMBO J. 1999. V.19. P.5380-5388.

131. Hoeck W., Groner B. "Hormone-dependent phosphorylation of the glucocorticoid receptor occurs mainly in the amino-terminal transactivation domain'. // J. Biol. Chem. 1990. V. 265. P. 5403-5408.

132. Horikoshi N., Tashiro F., Tanaka N., Ueno,Y. "Modulation of hormonal induction of tyrosine aminotransferase and glucocorticoid receptor by aflotoxin B. and sterigmatocstiin in Reuber hepatoma cells". // Cancer Res. 1988. V.48.P. 5188-5192.

133. Hollenberg S.M., Giguere V., Segui P., Evans R.M. "Colocalization of DNA-binding and transcriptional activation functions in the human glucocorticoid receptor". // Cell. 1987.V. 49. P. 39-46.

134. Hollenberg S.M., Evans R.M. Multiple and cooperative trans-activation domains of the human glucocorticoid receptor. // Cell. 1988. V.55. P.899-906.

135. Hong H., Kohli K., Trivedi A., Jonson D.L., Stallcup M.R. "GRIP1, a novel mouse protein that serves as transcriptional coactivator for the hormone binding domain of steroid receptors". // Proc. Natl Acad. Sci. USA. 1996. V. 93. P.4948-4952.

136. Hong H., Kohli K., Garabedian M.J., Stallcup M.R. "GRIP1, a transcriptional coactivator for the AF-2 transactivation domain of steroid, thyroid, retinoid, and vitamin D receptors". // Mol. Cell. Biol. 1997. V. 17. P. 2735-2744.

137. Horwitz K.B., Jackson T.A., Bain D.L., Richer J.K., Takimoto G.S., Tung L. "Nuclear receptor coactivators and compressors". // Mol. Endocrinol. 1996. V. 10. P. 1167-1177.

138. Hutchison K.A., Dittmar K.D., Czar M.J., Pratt W.B. "Proof that hsp70 is required for assembly of the glucocorticoid receptor into a heterocomplex with hsp90". // J. Biol. Chem. 1994. V.269 P.5043-5049.

139. Hyde-DeRuyshcher R. P., Jennings E., Shenk T. "DNA binding sites for the transcriptional activator/repressor YY1" // Nucleic Acids Res. 1995. V.23.No.21 P.4457-4465.

140. Imai E., Stromstedt P.E., Quinn P.G., Carlstedt-Duke J., Gustafsson J.A., Granner D.K. "Characterization of a complex glucocorticoid response unit in the phospho-enolpyruvate carboxykinase gene". // Mol. Cell. Biol. 1990. V. 10. P. 4712-4719.

141. Imai E., Miner J.N., Mitchell J.A., Granner D.K. "Glucocorticoid receptor-cAMP response element-binding protein interaction and the response of phosphoenolpyruvate carboxykinase gene to glucocorticoids."// J.Biol.Chem. 1993. V. 268. P. 5353-5356.

142. Imbalzano A.N., Kwon H., Green M.R., Kingston R.E. Facilitated binding of TATA-binding protein to nucleosomal DNA.// Nature 1994. V. 370. P.481-485.

143. Imhof A., Yang X.-J., Ogryzko V.V., Nakatani Y., Wolffe A.P., Ge H. "Acetylation of general transcription factors by histone acetyltransferases". // Curr. Biol. 1997. V.7. P. 689-692.

144. Jacq X., Brou C., Lutz Y., Davidson I., Chambon P."Human TAFII30 is present in a distinct TFIID complex and is requered for transcription activation by the estrogen receptor".// Cell. 1994. V.79. P. 107-117.

145. Jantzen H.M., Strahle U., Gloss В., Stewart F., Schmid W., Boshart M., Miksicek R.,Schutz G. "Cooperativity glucocorticoid responsve element located far upstream of tyrosine aminotransferase gene".// Cell. 1987. V. 49. P.29-38.

146. Jonat C., Rahmsdorf H.J., Park K.-K. et al. Antitumor promotion and antiinflammation: Down-Modulation of AP-1 (Fos/Jun) activity byglucocorticoid hormone // Cell. 1990. V.62. P. 1189-1204.

147. Kadonaga J. T. "Eukariotic transcription: An interlaced network of transcription factors and chromatin remodelling machines." // Cell. 1998. V. 92. P. 307-313.

148. Kaestner K.H., Hiemisch H., Luckow В., Schutz G. "The HNF-3 gene family of transcription factors in mice: gene structure, cDNA sequence, and mRNA distribution". // Genomics 1994. V. 20. P. 377-385.

149. Karin M., Haslinger H., Holtgreve H. "Characterisation of DNA sequences through which cadmium and glucocorticoid hormones induce human metallothionein IIA gene.'7/Nature. 1984. V. 308. P. 513-519.

150. Karin M "New twists in gene regulation by glucocorticoid receptor: is DNA binding dispensable?" // Cell 1998. V. 93. P.487-490.

151. Kaspa R.T., Burc R.D., Shaul Y., Snafritz D.A. "Hepatit В virus DNA contain a glucocorticoid responsive element". // Proc. Natl. Acad. Sci. USA 1986. V.83. P. 5899-5903.

152. Kaye W.H., Evers M.N., Wiess S.R."Differenses in brut serotonergic metabolism between nonbulimic and bulimic patients with anorexia nervosa."//Am. J. Psychiatry. 1984. V. 141. P. 1598-1601.

153. Kel-Margoulis O.V., Romashchenko A.G., Kolchanov N.A., Wingender E., Kel A.E. "COMPEL: a database on composite regulatory elementsproviding combinatorial transcriptional regulation". // Nucleic Acids Res. 2000. V. 28 P. 311-315.

154. Kim Y., Geiger J.H, Hahn S., Segler P.B. Crystal structure of a yeast TBP/TATA-box complex. //Nature 1993. V. 365. P.512-520.

155. King W.J., Greene G.L. "Monoclonal antibodies localize oestrogen receptor in the nuclei of target cells". // Nature 1984. V. 307 P.745-747.

156. Ко L.J., Cereghini S., Raymondjen M., Carranca A.G. et al. "Factors involved in control of tissue-specific expression of albumin gene" // Cell. 1987. V. 50. P.627-638.

157. Kouzarides Т. "Acetylation: a regulatory modification to rival phosphorylation". // EMBO J. 2000. V.19. P. 1176-1179.

158. Krawczak M., Ball E.V., Fenton I., Stenson P.D., Abeysinghe S., Thomas N., Cooper D.N. "Human gene mutation database a biomedical information and research resource". // Human mutation 2000. V. 15. P. 4551.

159. Kroger H., Grener B. "Influence of carcinogenous N-nitroso-morpholine on induction of tryptophan-oxygenase and tyrosine-2-oxoglutarate-transaminase in rat liver". // Hoppe-Seyler's Z. Physiol. Chem. 1965. V. 342. P. 148-156.

160. Kumarev V.P., Kobzev V.F., Kuznedelov K.D., Sredin Yu.G. "Super-rapid synthesis of oligodeoxyribonucleotides on micro-scale". // Nucl. Acid Res. Symposium Series. 1991. V.24. P. 234.

161. Lai E., Prezioso V.R., Smith E. et al. "HNF-3A, a hepatocyte-enriched transcription factor of novel structure is regulated transcriptionally". // Genes and Dev. 1990. V.4. P. 1427-1438.

162. Lai E., Prezioso V.R., Tao W., Chen W.C. Darnell J.E. "Hepatocyte nuclear factor-3A belongs to a gene family in mammals that is homologous to the Drosophila homeotic gene fork head". // Genes and Dev., 1991. V.5. P.416-427.

163. Lanz R.B., McKenna N.J., Onate S.A., Albrecht U., Wong J., Tsai S.Y., Tsai M.J., O'Malley B.W. 'A steroid receptor coactivator, SRA, functions as an RNA and is present in an SRC-1 complex". // Cell 1999. V. 97. P. 17-27.

164. Latchman D.S. Eucaryotic transcription factors. London: Academic press;

165. Laudet V., Hanni С., Coll J., Catzefols F., Stehelin D. "Evolution of nuclear receptor superfamily".//EMBO J. 1992. V. 11. P. 1003-1013.

166. Leach K.L., Dahmer M.K., Hammond N.D., Sando J.J., Pratt W.B. "Molybdate inhibition of glucocorticoid receptor transformation".//!. Biol. Chem. 1979. V.254. P. 11884-11890.

167. LeClerc S., Palaniswami R., Xie B.X., Govindan M.V. "Molecular cloning and characterization of a factor that binds the human glucocorticoid receptor gene and represses its expression". // J. Biol. Chem. 1991. V. 266 P. 17333-17340.

168. Lefstin J.A., Yamamoto K.R. "Allosteric effects of DNA on transcriptional regulators". //Nature 1998. V. 392(6679) P.885-888.

169. Lewin B. "Chromatin and gene expression: Constant questions, but changing answers". // Cell 1994. V. 79. P. 397-406.

170. Li Q., Wrange О Accessibility of a glucocorticoid response element in a nucleosome depends on its rotational position.// Mol. Cell. Biol. 1995. V.l5. P.4375-4384.

171. Lin В., Morris D.W., Chou J.Y. "Hepatocyte nuclear factor 1 alpha is an accessory factor required for activation of glucose-6-phosphatase gene transcription". // DNA Cell Biol. 1998.V.17.P.967-974.

172. Logsdon C.D., Perot K.J., and McDonald A.R. "Mechanism of glucocorticoid-induced increase in pancreatic amylase gene transciption ".// J.Biol.Chem. 1987. V. 262 P. 15765-15769.

173. Lowe C.R., Pearson J. S "Affinity chromatography on immobilized dyes".// Methods Ensymol. 1984. V.104. Part C. P. 97-113.

174. Lowry O.H., Rosebrauch N.Y., Farr A.L., Randall R.J. "Protein measurment with Folin phenol reagent."// J. Biol.Chem. 1951. V. 193. P.265-275.

175. Lucas P.C., Granner D.K. "Hormone response domains in gene transcription". // Annu. Rev. Biochem. 1992. V. 61. P.l 131-1173.

176. Luisi B.F., Xu W.X., Otwinowski Z., Freedman L.P., Yamamoto K.R., Sigler P.B. "Crystallographic analysis of the interaction of the glucocorticoid receptor with DNA". // Nature 1991.V. 352. P. 497-505.

177. Ma H., Hong H., Huang S.M., Irvine R.A., Webb P., Kushner P.J., Coetzee G.A., Stallcup M.R. "Multiple signal input and output domains of the 160-kilodalton nuclear receptor coactivator proteins". // Mol.Cell.Biol. 1999. V.19. P.6164-6173.

178. Malkoski S.P., Dorin R.I. "Composite glucocorticoid regulation at a functionally defined negative glucocorticoid response element of the human corticotropin-releasing hormone gene". // Mol. Endocrinol. 1999. V. 13. P. 1629-1644.

179. Mangelsdorf D.J., Thummel C., Beato M., Herrlich P., Schutz G., Umesono K., Blumberg В., Kastner P., Mark M., Chambon P., Evans R. M. The nuclear receptor superfamily: the second decade.// Cell. 1995. V. 83. P.835-839.

180. Maroder M., Farina A.R., Vacca A., Felli M.P., Meco D., Screpanti I., Frati L. Gulino A. "Cell-specific bifunctional role of Jun oncogene family members on glucocorticoid receptor-dependent transcription". // Mol.Endocrinol. 1993. V.7. P. 570-584.

181. Matsuno F., Chowdhury S., Gotoh Т., Iwase K, Matsuzuki H., Takatsuki K., Mori M., Takiguchi M. "Induction of the C/EBP beta gene by dexamethasone and glucagon in primary-cultured rat hepatocytes".// J.Biochem. 1996. V. 119. P. 524-532.

182. Maxam A.N., Gilbert W. "Sequencing end-labeled DNA with base-specific chemical cleavages". // Methods Enzymol. 1980. V. 65. P. 499-560.

183. Merkulov V.M., Merkulova T.I. "Nucleotide sequence of a fragment of the rat tryptophan oxygenase gene showing high affinity to glucocorticoid receptor in vitro". // Biochim. Biophys. Acta 1992. V.l 132. P.100-102.

184. McFarlan S.C., Zhang Q., Miksicek R.J., Lange A.J. "Characterization of an intronic hormone response element of rat liver/skeletal muscle 6-phosphofructo-2-kinase/fructose-2,6-bisphosphatase gene". // Mol. Cell. Endocrinol. 1997. V. 129. P 219-227.

185. Miesfeld R., Godowski P.J., Maler B.A., Yamamoto K.R. "Glucocorticoid receptor mutants that define a small region sufficient for enhancer activation". // Science 1987. V. 236. P.423-427.

186. Miksicek R., Heber A., Schmid W. "Glucocorticoid responsiveness of the transcriptional enhancer of Moloney murine sarcoma virus". // Cell 1986. V. 46. P. 283-290.

187. Miksicek R., Borgmeyer U., Nowock J. "Interaction of the TGGCA-binding protein with upstream sequences is required for efficient transcription of mouse mammary tumor virus". // EMBO J. 1987. V. 6. P. 1355-1360.

188. Miller M.S., Buzard G.S., McDowell A.E. "In vivo inhibition of glucocorticoid-inducible gene expression by dimethylnitrosamine in rat liver".//Biochem.Pharmacol. 1993. V. 45. P. 1465-1470.

189. Miner J.N., Yamamoto K.R. "The basic region of AP-1 specifies glucocorticoid receptor activity at a composite response element". // Genes Dev. 1992. V.6. P. 2491-2501.

190. Mitchell J.A., Noisin E., Hall R.K., O'Brien R., Imai E., Granner D.K. "Integration of multiple signals through a complex glucocorticoid response unit in the phosphoenolpyruvate carboxykinase gene". // Mol. Endocrinol. 1994. V. 8. P. 565-594.

191. Moore D.D., Marks A.R., Buckley D.I., Kapler G., Payvar F., Goodman H.M. "The first intron of the human growth hormone gene contains a binding site for glucocorticoid receptor". // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 1985. V. 82. P.699-702.

192. Morin В., Woodcock G.R., Nichols L.A., Holland L.J.

193. Heterodimerization between the glucocorticoid receptor and unrelated DNA-binding protein Xenopus glucocorticoid receptor accessory factor". // Mol. Endocrinol. 2001. V. 15. P.458-466.

194. Moudgil V.K., Lombardo G., Eessalu Т., Eliezer N. "Hormone dependency of transformation of rat liver glucocorticoid receptor in vitro: effects of heat, salt, and nucleotides". // J. Biochem. (Tokyo) 1986. V. 99 P.1005-1016.

195. Muchardt C., Yaniv M. "A human homologue of Sacharomyces cerevizia SNF2/SWI2 and Drosophila bhm genes potentiates transcriptional activation by the glucocorticoid receptor".// EMBO J. 1993. V.12. P.4279-4290.

196. Mulvihill E.R. LePennec J.P., Chambon P. "Chicken oviduct progesteron receptor: location of specific regions of high affinity binding of cloned DNA fragments of hormone responsive genes". // Cell 1982. V. 28. P. 621-632.

197. Nakamura, Т., Mura, Т., Saito, K. Ohsawa, Т., Akiyoshi, H., Sato, K. "Adenovirus-transferred HNF-3y conserves some liver functions in primary cultured hepatocytes of adult rats". // Biochem. Biophys. Res. Commun. 1998. V. 253 P. 352-357.

198. Nawa K. "Glucocorticoid-dependent expression of the albumin gene in adult rat hepatocytes". //J.Biol.Chem. 1986. V. 261 P. 16883-16888.

199. Nechushtan H, Benvenisty N, Brandeis R, Reshef L "Glucocorticoids control phosphoenolpyruvate carboxykinase gene expression in a tissue specific manner".// Nucleic Acids Res. 1987. V. 15. P. 6405-6417.

200. Nitsch D., Schutz G. "The distal enhancer implicated in the developmental regulation of the tyrosine aminotransferase gene is bound by liver-specificand ubiquitous factors". // Mol. Cell. Biol. 1993. V. 13. P. 4494-4504.

201. Nordeen S.K., Suh B.J., Kuhnel В., Hutchinson C.A. "Structural determinants of a glucocorticoid receptor recognition element". // Mol. Endocrinol. 1990. V. 4. P. 1866-1873.

202. O'Brien R., Lucas P.C., Forest C.D., Magnuson M.A., Granner D.K. "Identification of the sequence of the PEPCK gene that mediates a negative effect of insulin on transcription."// Science. 1990. V. 249. P. 533-537.

203. Ogryzko V.V., Schiltz R.I., Russanova V., Howard B.H., Nakatani Y. "The transcriptional coactivators рЗОО and СВР are histone acetyltransferases". // Cell 1996. V. 87. P. 953-959.

204. Okret S., Wikstrom A.C., Gustafsson J.A. "Molybdate-stabilized glucocorticoid receptor: evidence for a receptor heteromer". // Biochemistry 1985. V. 24 P.6581-6586.

205. Oshima H., Simons S.S. "Sequence-selective interactions of transcription factor elements with tandem glucocorticoid-responsive elements at physiological steroid concentrations". // J. Biol. Chem. 1993. V. 268. P. 26858-26865.

206. Oshima H., Szapary D., Simons S.S. "The factor binding to the glucocorticoid modulatory element of the tyrosine aminotransferase gene is a novel and ubiquites heteromeric complex". // J.Biol.Chem. 1995. V. 270, P. 21893-21901.

207. Palmiter R.D., Sandgren E.P., Koeller D.M., Brinster R.L." Distal regulatory elements from the mouse metallothionein locus stimulate gene expression in transgenic mice". // Mol. Cell. Biol. 1993. V. 13. P. 52665275.

208. Pasin M.J., Kadonaga J.T. " SWI2 / SNF2 and related proteins: ATP-driven motors that disrupt protein-DNA interactions? "// Cell. 1997. V.88. P. 737-740.

209. Pearce D., Yamamoto K.R. "Mineralocorticoid and glucocorticoid receptor activities distingvished by nonreceptor factors at a composite response element". // Science 1993. V. 259. P. 1161-1165.

210. Perier R.C., Praz V., Junier Т., Bonnard C., Bucher P. "The eukaryotic promoter database (EPD)". // Nucleic Acids Res. 2000. V. 28. P.302-303.

211. Perlmann T. Glucocorticoid receptor-DNA binding specificity is increased by the organization of DNA in nucleosomes. // Proc. Natl. Acad. Sci. USA 1992. V. 89. P. 3884-3888.

212. Perlmann Т., Evans R.M. "Nuclear receptors in Sicily: all in the famiglia".

213. Cell. 1997. V. 90. P. 391-397.

214. Perlmann Т., Wrange O. Specific glucocorticoid receptor binding to DNA reconstituted in nucleosome.// EMBO J. 1988 V. 3. P. 2015-2020.

215. Petty K.J., Krimkevich Y.I., Thomas D. "A TATA binding protein associated factor functions as a coactivator for thyroid hormone receptors".// Mol. Endocrinol. 1996. V.10. P. 1632-1645.

216. Picard D, Yamamoto KR. "Two signals mediate hormone-dependent nuclear localization of the glucocorticoid receptor". // EMBO J. 1987. V. 6 P. 3333-3340.

217. Pina В., Bruggemeier U., Beato M. "Nucleosome positioning modulates accessibility of regulatory proteins to the mouse mammary tumor vims promoter. //Cell. 1990. V.60. P.719-731.

218. Plisov, S. Y., Merkulova, Т. I., and Seledtsov, I. A.: "Glucocorticoid receptor binding site at 5'-flanking region of a rat cytochrome CYP 2B2 gene predicted with a novel computer method". // Biochim. Biophys. Acta 1991. V. 1095: P. 114-116.

219. Ponomarenko M.P., Ponomarenko J.V., Frolov A.F., Podkolodnaya O.A., Vorobyev D.G., Kolchanov N.A., Overton G.C. "Oligonucleotide frequency matrices addressed to recognizing functional DNA sites". // Bioinformatics.1999. V. 15. P. 644-653.

220. Ponta H., Cato A.C.B., Herrlich P. "Interference of pathway specific transcription factors". // Biochim.Biophys.Acta 1992. V.l 129. P. 255-261.

221. Pratt W.B. "Transformation of glucocorticoid and progesterone receptors to the DNA-binding state". // J. Cell. Biochem. 1987. V.35. P.51-68.

222. Pratt W.B. "The role of heat shock proteins in regulating the function, folding, and trafficking of the glucocorticoid receptor". // J. Biol. Chem. 1993. V.268. P.21455-21458.

223. Pratt W.B., Toft D.O. "Steroid receptor interactions with heat shock protein and immunophilin chaperones".// Endocr. Rev. 1997. V.l8. P.306-360.

224. Press M.F., Greene G.L. "Localization of progesterone receptor with monoclonal antibodies to the human progestin receptor". // Endocrinology 1988. V.122 P.1165-1175.

225. Ptashne M. "Gene regulation by proteins acting nearby and at a distance". //Nature 1986. V. 322. P. 697-701.

226. Raju V.S., McCoubrey W.K., Mains M.D. "Regulation of heme oxygenase 2 in neonatal rat brain: characterization of a functional glucocorticoid response element". // Biochim. Biophys. Acta 1997. V. 1351: P. 89-104.

227. Rangarayan P.N., Rovishankar H., Pandamanaban G.'Tsolation of a cytochrome-450e gene variant and characterisation of its 5'-flanking sequence."// Biochim. Biophys. Res. Commun. 1987. V. 144. P. 258-263.

228. Ray A., LaForge K.S., Sehgal P.B. "On the mechanism for efficient repression of the interleukin-6 promoter by glucocorticoids: enhancer, TATAbox, and RNA start site (Inr motif) occlusion ". // Mol. Cell. Biol. 1990. V.10. P. 5736-5746.

229. Reichardt H.M., Schutz G. "Glucocorticoid signalling—multiple variations of a common theme". // Mol. Cell. Endocrinol. 1998. V. 146. P. 1-6.

230. Reichardt H.M., Kaestner K.H., Tuckermann J., Kretz O., Wessely O., Bock R., Gass P., Schmid W., Herrlich P., Angel P., Schutz G. "DNA binding of the glucocorticoid receptor is not essential for survival". // Cell 1998. V. 93. P. 531-541.

231. Renkawitz R., Schutz G., von der Ahe D., Beato M. "Sequence in the promoter region of the chicken lysozyme gene required for steroid regulation and receptor binding". // Cell 1984. V. 37. P. 503-510.

232. Rexin M., Busch W., Segnitz В., Gehring U. "Structure of the glucocorticoid receptor in intact cells in the absence of hormone". // J. Biol. Chem. 1992. V. 267. P. 9619-9621.

233. Rhodes C., Yamada Y."Characterization of glucocorticoid responsive element and identification of an AT-rich element that regulate the link protein gene. // Nucleic Acids Res. 1995. V. 23. P. 2305-2313.

234. Riggs D., Susuki Y. "Lac-repressor operator interaction".// J Mol. Biol. 1970. V. 48. P. 67-83.

235. Rigaud G., Roux J., Pictet R., Grange T. "In vivo footprinting of rat TAT gene: dynamic interplay between the glucocorticoid receptor and a liver-specific factor" // Cell. 1991. V.67. P. 977-986.

236. Robyr D., Wolffe A.P., Wahli W. "Nuclear hormone receptor coregulators in action: diversity of steroid tasks" // Mol. Endocrinol. 2000. V.14. P.329-347.

237. Roeder R. "The role of general initiation factors in transcription by RNA polymerase II". // Trends Biochem. 1996. V. P.21. 327-335.

238. Roesler W.J., Graham J.G., Kolen K., Klemm D.J., McFie P.J. "The cAMP response element binding protein synergizes with other transcriptionfactors to mediate cAMP responsiveness." // J. Biol. Chem. 1995. V. 270. P. 8225-8232.

239. Rouiller D.G., McKeon C., Taylor S.I., Gorgen P. "Hormonal regulation of insulin receptor gene expression. Hydrocortisone and insulin act by different mechanisms'. //J.Biol.Chem. 1988. V. 263. P. 13185-13190.

240. Roux J., Pictet R., GrangeT. "Hepatocyte nuclear factor 3 determines the amplitude of the glucocorticoid response of the rat tyrosine aminotransferase gene". // DNA and Cell Biol, 1995. V. 14. P. 385-396.

241. Ryan W.A., Franza B.R., Gilman M.L. "Two distinct cellular phosphoproteins bind to the c-fos serum response element". // EMBO J. 1989. V.8. P.1785-1792.

242. Sakai D.D., Helms S., Carlstedt-Duke J., Gustafsson J.A., Rottman F.M., Yamamoto K.R. "Hormone-mediated repression: a negative glucocorticoid response element from the bovine prolactin gene". // Genes Dev. 1988. V. 2. P. 1144-1154.

243. Sassi H., Fromont-Racine M., Grange Т., Pictet R. "Tissue specificity of a glucocorticoid-dependent enhancer in transgenic mice". // Proc. Natl. Acad. Sci. USA 1995.V. 92. P. 7197-7201.

244. Savory J.G., Hsu В., Laquian I.R., Giffin W., Reich Т., Hache R.J., Lefebvre Y.A. "Discrimination between NL1- and NL2-mediated nuclear localization of the glucocorticoid receptor". // Mol. Cell. Biol. 1999. V.l 9. P. 1025-1037.

245. Scatchard G. "The attractions for proteins for small proteins and iones". // Proc. Natl. Acad. Sci. 1949. V. 51. P. 660-672.

246. Scheidereit C. Beato M. Contacts between receptor and DNA double helix within a glucocorticoid regulatory element of mouse mammary tumor. // Proc. Natn. Acad. Sci. USA. 1984.V. 81. P. 3029-3034.

247. Scheier В., Foletti A., Stark G., Aoyama A., Dobbeling U., Rusconi S., Klemenz R. "Glucocorticoids regulate the expression of stressprotein alpha

248. В crystallin". // Mol. Cell. Endocrinol. 1996 V. 123. P. 187-198.

249. Scheller A., Hughes E., Golden K.L., Robins D.M. "Multiple receptor domains interact to permit, or restrict, androgen-specific gene activation". // J. Biol. Chem. 1998. V.73. P. 24216-24222.

250. Schmid W., Scherer G., Dabtsch H., Patric M., Schutz G."Isolation and characterisation of the rat tryptophan oxigenase gene". // EMBO J. 1982. V.l. P.1287-1293.

251. Schug J., Overton G.C. "TESS: Transcription element search software on the WWW". // Technical report CBIL-TR-1997-1001-vO.O, of the Computational Biology and Informatics Laboratory, School of Medicine, University of Pensilvania. 1997.

252. Schuster C., Chasserot-Golaz S., Beck G. "Activation of Epstein-Barr virus promoters by a growth-factor and a glucocorticoid". // FEBS Lett. 1991. V.284. P. 82-86.

253. Schuster C., Chasserot-Golas S., Urier G., Beck G., Sergeant A."Evidence for the functional glucocorticoid responsive element in the Epstein-Barr virus genome'7/Mol. Endocrinol. 1991. V. 5, P. 267-272.

254. Schwerk C., Klotzbucher M., Sachs M., Ulber V., Klein-Hitpass L. "Identification of transactivation function in the progesterone receptor that interacts with TAFII110 subunit of the TFIID complex".// J Biol. Chem.1995. V. 270. P. 21331-21338.

255. Scott D.K., Mitchell J.A., Granner D.K. "The orphan receptor COUP-TF bind to a third glucocorticoid accessory factor element within phosphoenolpyruvate carboxykinase gene promoter."// J.Biol.Chem. 1996a. V. 271. P.31909-31914.

256. Scott D.K., Mitchell J.A., Granner D.K. "Identification and characterization of the second retinoic acid response element in phosphoenolpyruvate carboxykinase gene promoter."// J.Biol.Chem. 1996b. V. 271. P.6260-62644.

257. Searle P.F., Davidson B.L., Stuart G.V., Wilkie T.M., Norstedt G., Palmiter R.D. "Regulation, linkage and sequence of mMTI and II genes".//Mol. Cell. Biol. 1984. V. 4. P. 1221-1230.

258. Seledsov I.A., Solovyev V.V., Merkulova T.I. "New elements of glucocorticoid receptor binding sites of hormone-regulated genes."// Biochim. Biophys. Acta. 1991. V.1089. P.367-376.

259. Severne Y., Wieland S., Schaffner W., Rusconi S. "Metal binding 'finger' structures in the glucocorticoid receptor defined by site-directed mutagenesis". //EMBO J. 1988. V. 7. P.2503-2508.

260. Shapiro D.G., Sharp P.A, Wahli W.W., Keller M.J. "A high-efficiency HeLa cell nuclear transcription extract".// DNA. 1988. V.7. P.47-55.

261. Shim E.Y., Woodcock C., Zaret K.S. "Nucleosome positioning by the winged helix transcription factor HNF3". // Genes Dev. 1998. V. 12 P.5-10.

262. Sienna N., Larson D.E., Sells B.H. "Dexamethasone stimulates ribosomal protein L32 gene transcription in rat myoblasts".// Mol. Cell. Endocrinol. 2000 V. 167. P. 127-137.

263. Slater E.P., Rabenau О., Karin M., Baxter J.D., Beato M. "Glucocorticoid receptor binding and activation of a heterologous promoter by the first intron of human growth hormone gene". // Mol.Cell. Biol. 1985. V.5. P.2984-2992.

264. Slater E.P, Hesse H., Muller J.M., Beato M. "Glucocorticoid receptor binding site in the mouse alpha-amylase 2 gene mediates response to the hormone". // Mol. Endocrinol. 1993. V. 7. P. 907-914.

265. Smith C.L., Htun H., Wolford R.G., Hager G.L. "Differential activity of proge-sterone and glucocorticoid receptors on mouse mammary tumor virus templates differing in chromatin structure". // J. Biol. Chem. 1997 V. 272 P.14227-14235.

266. Solovyev V.V., Zharkikh A.A., Kolchanov N.A.'The template RNAs can have compact secondary structure formerd by long duable helices with partial violation with complementary".// FEBS Lett. 1984. v.165. P.72-78.

267. Song C.-Z., Tian X., Gelehrter T. "Glucocorticoid receptor inhibits transforming growth factor-P signaling by directly targeting the transcription activation function of Smad3." //Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 1999.V. 96. P. 11776-11781.

268. Soudeyns H., Geleziunas R., Shyamala G., Hiscott J., Wainberg M. A. "Identification of novel glucocorticoid response element within the genome of the human immunodeficiency virus type 1". // Virology 1993 V. 194. P. 758-768.

269. Spencer Т.Е., Jenster G., Burcin M.M., Allis C.D., Zhou J., Mizzen C.A., McKenna N.J., Onate S.A., Tsai S.Y., Tsai M.J., O'Malley B.W. "Steroid receptor coactivator-1 is a histone acetyltransferase". // Nature. 1997. V. 389 P. 194-198.

270. Stoecklin E., Wissler M., Moriggl R., Groner B. "Specific DNA binding of Stat5, but not glucocorticoid receptor, is requered for their functional cooperation in the regulation of gene transcription."// Mol.Cell.Biol. 1997. V.17. P.6708-6716.

271. Strahle U., Schmid W., Schutz G. "Sinergistic action of the glucocorticoid receptor with transcription factors".// EMBO J. 1988. V.7. P.3389-3395.

272. Strahle U., Boshart M., Klock G., Stewart F., Schutz G. "Glucocorticoid-and progesterone-specific effects are determined by differential expression of the respective hormone receptors". // Nature 1989. V. 339. P.629-632.

273. Stormo G.D., Shneider T.D., Gold L.G., Ehrenfeucht A. "Use of the "Perceptron" algorithm to distinguish translational initiation sites in E. coli". //Nucleic Acids Res. 1982. V. 10. P. 2997-3011.

274. Stuart G.W. Searle P.F., Chen H.Y. et al. "A 12-base pairs DNA motif repeated several times in metallothionein gene promoter confers metal regulation to a heterologous gene". // Proc. Natl. Acad. Sci. USA 1984. V.81. P.7818-7322.

275. Subramaniam N., Cairns W., Okret S. "Studies on the mechanism of glucocorticoid-mediated repression from a negative glucocorticoid response element from the bovine prolactin gene". // DNA Cell. Biol. 1997. V. 16. P. 153-163.

276. Subramaniam N., Treuter E., Okret S. Receptor interacting protein RIP 140 inhibits both positive and negative gene regulation by glucocorticoids.// J Biol. Chem. 1999. V. 274. P. 18121-18127.

277. Takeshita A., Yen P.M., Migiti S., Gardona G.R., Liu Y., Chin W.W. "Molecular cloning and properties of full-length thyroid hormone receptorcoactivator". // Endocrinology. 1996. V. 137. P. 3594-3597.

278. Torchia J., Glass C., Rosenfeld M.G. "Co-activators and co-repressors in the integration of transcriptional responses"// Curr. Opin. Cell. Biol. 1998. V. 10. P. 373-383.

279. Treisman R. "The serum response element". // TIBS. 1992. V. 17. P.423-426.

280. Truss M., Chalepakis G., Beato M. Contacts between steroid hormone receptors and thymins in DNA: an interference method. // Proc. Natl. Acad. Sci.1990. V. 87. P. 7180-7184.

281. Truss M., Beato M. "Steroid hormone receptors: interaction with deoxyribo-nucleic acids and transcription factors".// Endocrine Rev. 1993. V.14. P. 459-478.

282. Truss M., Bartsch J., Schelbert A., Hache R.J., Beato M. 'Hormone induces binding of receptors and transcription factors to a rearranged nucleosome on the MMTV promoter in vivo". // EMBO J. 1995. V. 14. P. 1737-1751.

283. Tsuchima Y., Hallor M., Hayashiodo K. "Sequence analysis of the putative regulatory region of rat a2-macroglobulin gene". // Gene. 1987 V. 5/ P/73-80.

284. Uskerand D,S., Yamamoto K.R. "Early events in the stimulation of mouse mammary tumor virus RNA synthesis by glucocorticoids". // J. Biol. Chem. 1983. V. 259. P. 7416-7420.

285. Urnov F.D., Wolffe A.P. A necessary good: Nuclear hormone receptors and their chromatin templates. // Mol. Endocrinol. 2001. V. 15. P. 1-16.

286. Vachner J., Tilghman S.M. "Dominant negative regulation of the mouse a-fetoprotein in adult liver". // Science 1990. V. 250. P. 1732-1735.

287. Vedeckis W.V. "Subunit dissociation as a possible mechanism of glucocorticoid receptor activation". // Biochemistry 1983. V.22. P. 19831989.

288. Wade P.A., Pruss D., Wolffe A.P. "Histone acetylation: Chromatin in action". // Trends Biochem. Sci. 1997. V. 22. P. 128-132.

289. Wallberg A.E., Neely K.E., Gustaffson J.A., Wright A.P., Grant P.A. "Histone acetyltransferase complexes can mediate transcriptional activation by the major glucocorticoid receptor activation domain." // Mol. Cell. Biol. 1999. V. 19. P 5952-5959.

290. Wallrath L.L., Lu Q., Granok H., Elgin S.C. Architectural variations of inducible eukaryotic promoters: preset and remodelling chromatin structures. // Bioessays 1994 V.l6. P. 165-170.

291. Walsh M., Leleiko N.S., Kennet M., Sterling J. "Regulation of types I,II and III procollagens mRNA synthesis in glucocorticoid regulated intestinal development". //J. Biol. Chem. 1987. V. 262. P. 10814-10818.

292. Wang J-C., Stromstedt P-E., Sugiyama Т., Granner D.K. "The phosphoenolpyruvate carboxykinase gene glucocorticoid response unit: Identification of the functional domains of accessory factors HNF3(3(

293. Hepatic nuclear factor-3P) and HNF4 and the necessity of proper alingment of their cognate binding sites". // Mol. Endocrinol. 1999. V. 13. P. 604-617.

294. Webster NJ, Green S, Jin JR, Chambon P. "The hormone-binding domains of the estrogen and glucocorticoid receptors contain an inducible transcription activation function". // Cell 1988. V. 54 P. 199-207.

295. Webster M.K., Goya L., Ge Y., Maiyar A.C., and Firestone G.L. "Characterization of sgk, a novel member of the serine/treonine protein kinase gene".// Mol.Cell.Biol. 1993 V. 13. P. 2031-2040.

296. Webster J.C., Jewell C.M., Bodwell J.E., Munck A., Sar M., Cidlowski J.A. "Mouse glucocorticoid receptor phosphorilation status influences multiple functions of the receptor protein."// J. Biol. Chem. 1997. V. 272. P. 9287-9293.

297. Welte Т., Philipp S., Cairns C., Gustafsson J-A and Doppler W. "Glucocorticoid receptor binding sites in the promoter region of milk protein genes".//J. Ster. Boichem. Mol.Biol. 1993 V. 47. P. 75-81.

298. Westphal H.M., Beato M. "The activated glucocorticoid receptor from rat liver. Purification and physical characterisation".// Eur.J. Biochem. 1980. V. 106. P. 395-403.

299. Whitmarsh A. J., Davis R.J. "Regulation of transcription factor function by phosphorylation". // Cell. Mol. Life Sci. 2000. V. 57. P. 1172-1183.

300. Willmann Т., Beato M. "Steroid-free glucocorticoid receptor binds specifically to mouse mammary tumour virus DNA".// Nature 1986. V.324. P.688-691.

301. Wilson C.J., Chao D.M., Imbalsano A.N., Schnitzler G.R., Kingston R.E., Young R.A." RNA polymerase II holoenzyme contains SWI / SNF regulators involved in chromatin remodelling."// Cell. 1996. V.84. P. 235244.

302. Wingender E., Chen X., Hehl R., Karas H., Liebich I., Matys V., Meinhardt Т., Prub M., Reuter I., Schacherer F. "TRANSFAC: an integratedsystem for gene expression regulation". // Nucleic Acids Res. 2000. V. 28. P. 316-319.

303. Witselt J.A., Pilot Т., Clark J.C. "Induction of surfactant protein in fetal lung". // J. Biol. Chem. 1987. V. 262. P. 5256-5261.

304. Wolffe A.P. Nucleosome positioning and modification: chromatin structures that potentiate transcription. // Trends Biochem. Sci. 1994 V.19. P. 240-244.

305. Wrange O., Carlstedt-Duke J., Gustaffson J.-A."Purification of the glucocorticoid receptor from rat liver cytosol". // J. Biol.Chem. 1979. V. 254. P.9284-9290.

306. Wrange O., Okret S., Radojcic M., Carlstedt-Duke J., Gustaffson J.-A."Characterisation of the purified activated glucocorticoid receptor from rat liver cytosol." // J. Biol.Chem. 1984. V. 259. P.4531-4534.

307. Yamamoto K.R, Alberts B.M. "On the specificity of the binding of the estradiol receptor protein to the DNA'. // J. Biol. Chem. 1974. V.249. P.7076-7087.

308. Yamamoto M., Ко L.J., Leonard M.V. et al. "Activity and tissue-specific expression of the transcription factor NF-E1 multigenic family" // Genes and Dev. 1990. V.4. P. 1650-1662.

309. Yeoch G.C.T. "The effect of 3 -methyl-4-dimethylaminoazobenzene on foetal rat hepatocytes in culture".// Eur. J. Cancer Clin. Oncol. 1981 V. 17. P. 743-752.

310. Zaret K.S., Yamamoto K.R. Reversible and persistent changes in chromatin structure accompany activation of a glucocorticoid-dependent enhancer element. // Cell. 1984. V. 38. P. 29-38.

311. Zavel L., Reinberg D. "Common themes in assembly and function of eukariotic transcription complexes".// Annu. Rev. Biochem. 1995. V. 64. P.533-561.

312. Zhou Z., Corden J.L., Brown T.R. "Identification and characterization of a novel androgen response element composed of a direct repeat". // J. Biol. Chem. 1997. V.272. P.8227-8235.

313. Zilliacus J., Carlstedt-Duke J., Gustafsson J.A., Wright A.P. "Evolution of distinct DNA-binding specificities within the nuclear receptor family of transcription factors". // Proc. Natl. Acad. Sci. USA 1994.V. 91.P.4175-4179.

314. Zilliacus J., Wright A.P., Norinder U., Gustafsson J.A., Carlstedt-Duke J. "Determinants for DNA-binding site recognition by the glucocorticoid receptor". // J. Biol. Chem. 1992.V. 267. P. 24941-24947.