Разработка молекулярно-генетических методов для исследования β-лактамаз TEM- и SHV-типа у клинических штаммов энтеробактерий тема диссертации и автореферата по ВАК РФ 14.00.31, кандидат биологических наук Эйдельштейн, Михаил Владимирович

• Эйдельштейн, Михаил Владимирович
• кандидат биологических наук
• 2000

Оглавление диссертации кандидат биологических наук Эйдельштейн, Михаил Владимирович

СПИСОК ИСПОЛЬЗОВАННЫХ СОКРАЩЕНИЙ

Сокращения терминов

Микроорганизмы

Введение диссертации (часть автореферата) на тему «Разработка молекулярно-генетических методов для исследования β-лактамаз TEM- и SHV-типа у клинических штаммов энтеробактерий»

Актуальность темы . 6

ЦЕЛЬ ИССЛЕДОВАНИЯ . 8

ЗАДАЧИ ИССЛЕДОВАНИЯ . 8

НАУЧНАЯ НОВИЗНА . 9

ОСНОВНЫЕ ПОЛОЖЕНИЯ, ВЫНОСИМЫЕ НА ЗАЩИТУ . 10

ЧАСТЬ I. ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ . 11

Заключение диссертации по теме «Химиотерапия и антибиотики», Эйдельштейн, Михаил Владимирович

ВЫВОДЫ

1. На основе технологии одноцепочечного конформационного полиморфизма рестрикционных фрагментов ДНК (REF-SSCP) разработаны методы экспресс-анализа и дифференциации генов, кодирующих плазмидные (3-лактамазы ТЕМ- и SHV-типа, включая ферменты с широким (BSBL) и расширенным спектром ферментативной активности (ESBL), а также ингибиторорезистентные производные ТЕМ (IRT).

2. Разработанные методы использованы для анализа генетической вариабельности ТЕМ пенициллиназ у репрезентативной выборки внебольничных уропатогенных штаммов Е. соН, а также для типирования ESBL у госпитальных штаммов К. pneumoniae.

3. Гены ТЕМ р-лактамаз широкого спектра в целом отличаются достаточно высокой эволюционной консервативностью у генетически и фенотипически различных штаммов кишечной палочки. Вместе с тем, идентификация новых генов Ь/аТЕм-id и Ь/аТЕМ-70 свидетельствует о большем, чем ранее предполагалось, разнообразии нуклеотидных последовательностей, кодирующих пенициллиназы ТЕМ-типа.

4. b/aTEM1d представляет собой новый аллельный вариант гена, кодирующего пенициллиназу ТЕМ-1, в котором промотор (РЗ) и 5'-концевой участок структурной последовательности гена Ь/атЕм-1а (ТпЗ) объединены с протяженным З'-концевым фрагментом гена b/ajEM-2 (Тп7).

5. Новый фермент, ТЕМ-70, выявленный у двух штаммов Е. coli из Смоленска и Новосибирска, отличается уникальной для р-лактамаз семейства ТЕМ аминокислотной заменой Арг204~>Глн, которая обуславливает снижение его изоэлектрической точки (pi 5,2) и незначительное повышение аффинности цефоперазона (Кт 143) по сравнению с ТЕМ-1 (pi 5,4; Кт 205).

6. Исследование ESВL-продуцирующих штаммов К.pneumoniae, выделенных в Смоленской областной клинической больнице, доказывает эффективность использования разработанных методов REF-SSCP для молекулярно-эпидемиологического типирования р-лактамаз ТЕМ- и SHV-типа.

НАУЧНО-ПРАКТИЧЕСКИЕ РЕКОМЕНДАЦИИ

Результаты проведенных исследований позволяют сформулировать следующие практические рекомендации:

1. Учитывая низкую эффективность выявления резистентности, вызванной продукцией ESBL, с помощью рутинных методов определения чувствительности, а также широкое распространение штаммов энтеробактерий, обладающих данным механизмом устойчивости, необходимо внедрение в практику работы клинических бактериологических лабораторий специальных фенотипических методов выявления ESBL, в частности, метода "двойных дисков".

2. Использование таких методов представляется целесообразным для всех госпитальных штаммов Е. coli и К. pneumoniae, как наиболее частых продуцентов ESBL, а также для других представителей семейства Enterobacteriaceae, которые по данным предварительного тестирования проявляют пониженную чувствительность (МПК > 1 мкг/мл) к одному из цефалоспоринов III поколения.

3. Предложенные в настоящей работе методы REF-SSCP анализа генов ТЕМ и SHV р-лактамаз могут быть рекомендованы для использования в референтных лабораториях, проводящих исследования механизмов устойчивости энтеробактерий к р-лактамным антибиотикам.

4. REF-SSCP анализ может быть использован как самостоятельный подход для изучения эпидемиологии плазмидных р-лактамаз и выявления новых ферментов, а в комбинации с другими методами (ИЭФ, олиготипирование) - для точной идентификации ТЕМ- и SHV-производных.

Список литературы диссертационного исследования кандидат биологических наук Эйдельштейн, Михаил Владимирович, 2000 год

1. Козлов Р. С. Выбор антибиотиков при нозокомиальных инфекциях в отделениях интенсивной терапии на основе данных многоцентрового исследования резистентности грамотрицательных возбудителей: Автореф. дис. . канд. мед. наук. - Смоленск, 1998. - 22 с.

2. Сидоренко С. В. Механизмы антибиотикорезистентности // Антибактериальная терапия. Практическое руководство под ред. Страчунского Л. С., Белоусова Ю. Б., Козлова С. H., М.: фармединфо, 2000. 1-6 с.

3. Сидоренко С. В. Перспективы контроля распространения антибиотикорезистентности // Антибиотики и химиотерапия. 1998.- №7. С. 3-6.

4. Страчунский Л. С., Богданович Т. М. Состояние антибиотикорезистентности в России // Антибактериальная терапия. Практическое руководство под ред. Страчунского Л. С., Белоусова Ю. Б., Козлова С. H., М.: Фармединфо, 2000. 7-11 с.

5. Страчунский Л. С., Решедько Г. К., Кречикова О. И. Резистентность госпитальных штаммов К. pneumoniae в отделениях интенсивной терапии // II Российский национальный конгресс "Человек и лекарство": Тезисы. М., 1995. С. 184

6. Abraham Е. P., Chain Е. An enzyme from bacteria able to destroy penicillin // Nature. 1940. - V. 373. - P. 837.

7. Ahamed J., Kundu M. Molecular characterization of the SHV-11 p-lactamase of Shigella dysenteriae // Antimicrob. Agents Chemother.- 1999. V. 43. - P. 2081-2083.

8. Ambler R. P, Scott G. K. Partial amino acid sequence of penicillinase coded by Escherichia coli plasmid R6K 11 Proc. Natl. Acad. Sci. USA.- 1978. V. 75. - P. 3732-3736.

9. Ambler R. P. A standard numbering scheme for the class A p-lactamases // Biochem. J. 1991. - V. 276. - P. 269-272.

10. Ambler R. P. The structure of p-lactamases // Philos. Trans. R. Soc. Lond. (Biol.) 1980. - V. 289. - P. 321-331.

11. Amyes S. G. Antibiotic resistance. Resistance mediated by inhibitor-resistant and extended-spectrum TEM and SHV p-lactamases // J. Med. Microbiol. 1997. - V. 46. - P. 454-457.

12. Appleton A. Hall S. Evaluation of a novel diagnostic disc method for detection of extended-spectrum p-lactamases // 3rd European Congress of Chemotherapy: Abstracts. -Madrid, 2000. Abstr. T304.

13. ArletG., Brami G., Deere D., FlippoA., Gaillot O., Lagrange P. H., Philippon A. Molecular characterisation by PCR-restriction fragment length polymorphism of TEM p-lactamases // FEMS Microbiol. Lett.- 1995. V. 134. - P. 203-208.

14. Arlet G., Goussard S., Courvalin P., Philippon P. Sequences of the genes for the TEM-20, TEM-21, TEM-22, and TEM-29 extended-spectrum p-lactamases // Antimicrob. Agents Chemother. 1999. - V. 43.- P. 969-971.

15. Arlet G., Philippon A. Construction by polymerase chain reaction and use of intragenic DNA probes for three main types of transferable p-lactamases (TEM, SHV, CARB) // FEMS Microbiol. Lett. 1991.- V. 15. P. 19-25.

16. ArletG., Rouveau M., Bengoufa D., Nicolas M. H., Philippon A. Noveltransferable extended-spectrum ß-lactamase (SHV-6) from Klebsiella pneumoniae conferring selective resistance to ceftazidime // FEMS Microbiol. Lett. 1991. - V. 65. - P. 57-62.

17. Arlet G., Rouveau M., Philippon A. Substitution of alanine for aspartate at position 179 in the SHV-6 extended-spectrum ß-lactamase // FEMS Microbiol. Lett. 1997. - V. 152. - P. 163-167.

18. Arstila T., Jacoby G. A., Huovinen P. Evëaluation of five different methods to prepare bacterial extracts for the identification of ß-lactamases by isoelectric focusing // J. Antimicrob. Chemother. 1993. - V. 32.- P. 809-816.

19. Barthélémy M., Peduzzi J., Labia R. Complete amino acid sequence of p453-plasmid-mediated PIT-2 ß-lactamase (SHV-1) // Biochem. J.- 1988. V. 251. - P. 73-79.

20. Barthélémy M., Peduzzi J., Yaghlane H. B., Labia R. Single amino acid substitution between SHV-1 ß-lactamase and cefotaxime-hydrolyzing SHV-2 enzyme // FEBS Lett. 1988. - V. 231. - P. 217-220.

21. Bauernfeind A., Horl G. Novel R-factor borne ß-lactamase of Escherichia coli conferring resistance to cephalosporins // Infection. 1987.- V. 15.- P. 257-259.

22. Bedenic B., Zagar Z. Extended-spectrum ß-lactamases in clinical isolates of Klebsiella pneumoniae from Zagreb, Croatia // J. Chemother. 1998.- V. 10. P. 449-459.

23. Belaaouaj A., Lapoumeroulie C., Canica M. M., Vedel G., Nevot P., Krishnamoorthy R., Paul G. Nucleotide sequences of the genes coding for the TEM-like ß-lactamases IRT-1 and IRT-2 (formerly called TRI-1 and

24. TRI-2) // FEMS Microbiol. Lett. 1994. - V. 120. - P. 75-80.

25. Ben Redjeb, Fournier S. J., Mabilat C., Ben Hassen A., Philippon A. Two novel transferable extended-spectrum p-lactamases from Klebsiella pneumoniae in Tunisia I I FEMS Microbiol. Lett. 1990.- V. 67. - P. 3338.

26. Billot-Klein D., Gutmann L., Collatz E. Nucleotide sequence of the SHV-5 p-lactamase gene of a Klebsiella pneumoniae plasmid 11 Antimicrob. Agents Chemother. 1990. - V. 34. - P. 2439-2441.

27. Bolmstrom A., Nordstrom U., Kolar D. Etest for fingerprinting of bacteria producing p-lactamases // 19th International Congress of Chemotherapy: Abstracts. Montreal, 1995. Abstr. P4226.

28. Bonnet R., De Champs C., Sirot D., Chanal C., Labia R., Sirot J. Diversity of TEM mutants in Proteus mirabilis 11 Antimicrob. Agents Chemother.- 1999. V. 43. - P. 2671-2677.

29. Bonomo R. A., Rice L. B. Inhibitor resistant class A beta-lactamases // Frontiers Bioscience. 1999. - V. 4. - P. 34-41.

30. Bradford P. A., Jacobus N. V., Bhachech N., Bush K. TEM-28 from an

31. Escherichia coli clinical isolate is a member of the His-164 family of TEM-1 extended-spectrum p-lactamases // Antimicrob. Agents Chemother. 1996. - V. 40. - P. 260-262.

32. Bradfordford P. A. Automated thermal cycling is superior to traditional methods for nucleotide sequencing of blasnv genes // Antimicrob. Agents Chemother. 1999. - V. 43. - P. 2960-2963.

33. BretL., Chaibi E. B., Chanal-Claris C., Sirot D., Labia R., Si rot J. Inhibitor-resistant TEM (IRT) p-lactamases with different substitutions at position 244 // Antimicrob. Agents Chemother. 1997. -V. 41.- P. 2547-2549.

34. BretL., Chanal C., Sirot D., Labia R., Sirot J. Characterization of an inhibitor-resistant enzyme IRT-2 derived from TEM-2 p-lactamase produced by Proteus mirabilis strains // J. Antimicrob. Chemother.- 1996. V. 38. - P. 183-191.

35. Bush K. Characterisation of p-lactamases // Antimicrob. Agents Chemother. 1989. - V. 33. - P. 259-263.

36. Bush K. The evolution of p-lactamases // Antibiotic Resistance: Origins,

37. Evolution, Selection and Spread / John Willey& Sons, 1997. P. 152163, 163-169.

38. Bush K., Jacoby G. Nomenclature of TEM p-lactamases // J. Antimicrob. Chemother. 1997. - V. 39. - P. 1-3.

39. Bush K., Jacoby G., Medeiros. A functional classification scheme for p-lactamases and its correlation with molecular structure // Antimicrob. Agents Chemother. 1995. - V. 39. - P. 1211-1233.

40. Canica M. M., Barthelemy M., Gilly L., Labia R., Krishnamoorthy R., Paul G. Properties of IRT-14 (TEM-45), a newly characterized mutant of TEM-type p-lactamases // Antimicrob. Agents Chemother. 1997.- V. 41. P. 374-378

41. Canica M. M., Lu C. Y., Krishnamoorthy R., Paul G. C. Molecular diversity and evolution of t>/aTem genes encoding p-lactamases resistant to clavulanic acid in clinical E. coli // J. Mol. Evol. 1997. - V. 44. - P. 5765.

42. Carter G. I., Towner K. J., Slack R. C. Detection of TEM p-lactamase genes by non-isotopic spot hybridisation // Eur. J. Clin. Microbiol.- 1987. V. 6. - P. 406-409.

43. Chaibi E. B., Sirot D., Paul G., Labia R. Inhibitor-resistant TEM p-lactamases: phenotypic, genetic and biochemical characteristics // J. Antimicrob. Chemother. 1999. - V. 43. - P. 447-458.

44. Chanal C. M., Poupart M-C., Sirot D., Labia R., Sirot J., Cluzel R. Nucleotide sequences of CAZ-2, CAZ-6, and CAZ-7 p-lactamase genes // Antimicrob. Agents Chemother. 1992. - V. 36. - P. 1817-1820.

45. Chanal C., Sirot D., Malaure H., Poupart M.-C., Sirot J. Sequences of

46. CAZ-3 and CTX-2 extended-spectrum p-lactamase genes // Antimicrob. Agents Chemother. 1994. - V. 38. - P. 2452-2453.

47. Chaves J., Coira A., Segura C., Reig R. Identification and location of the SHV-1 gene in Klebsiella pneumoniae strains // Chemother. 1995.- V. 7. P. 49-51.

48. Chen S.-T., Clowes R. S. Variation between the nucleotide sequences of 7771, Tn2, and Tn3 and expression of p-lactamase in Pseudomonas aeruginosa and Escherichia coli // J. Bacteriol. 1987. - V. 169.- P. 913-916.

49. Cockerill III F. R. Genetic methods for assessing antimicrobial resistance //Antimicrob. Agents Chemother. 1999. - V. 43. - P. 199-212.

50. Collatz E., Labia R., Gutmann L. Molecular evolution of ubiquitous p-lactamases towards extended-spectrum enzymes active against newer p-lactam antibiotics // Mol. Microbiol. 1990. - V. 4. - P. 1615-1620.

51. Cooksey R. C., Clark N. C., Thornsberry C. A gene probe for TEM type p-lactamases // Antimicrob. Agents Chemother. 1985. - V. 28.- P. 154-156.

52. Cormican M. G., Marshall S. A., Jones R. N. Detection of extended-spectrum p-lactamase (ESBL)-producing strains by the Etest ESBL screen //J. Clin. Microbiol. 1996. - V. 34. - P. 1880-1884.

53. D'Agata E., Venkataraman L., DeGirolami P., Weigel L., Samore M., Tenover F. The molecular and clinical epidemiology of enterobacteriaceae-producing extended-spectrum p-lactamase in a tertiary care hospital // J. Infect. 1998. - V. 36. - P. 279-285.

54. Datta N, Kontomichalou P. Penicillinase synthesis controlled by infectious R factors in Enterobacteriaceae // Nature (London) 1965. - V. 208.- P. 239-241.

55. Davies J. E. Origins, acquisition and dissemination of antibiotic resistance determinants // Antibiotic Resistance: Origins, Evolution, Selection and Spread / John Willey& Sons, 1997. P. 152-163, 163-169.

56. Du Bois S. K., Marriott M. S., Amyes S. G. TEM- and SHV-derived extended-spectrum p-lactamases: relationship between selection, structure and function // J. Antimicrob. Chemother. 1995. - V. 35.- P. 7-22.

57. Fleming P. C., Goldner M., Glass D. G. Observations on the nature, distribution, and significance of cephalosporinase // Lancet. 1963. -V. I. - P. 1399-1401.

58. Garbarg-Chenon A., Godard V, Labia R., Nicolas J.-C. Nucleotide sequence of SHV-2 ß-lactamase gene // Antimicrob. Agents Chemother.- 1990. V. 34. - P. 1444-1446.

59. Goussard S., Courvalin P. Sequences of the genes blaT-1B and blaT-2 // Gene. 1991. - V. 102.- P. 71-73.

60. Goussard S., Courvalin P. Updated sequence information for TEM (3-lactamase genes // Antimicrob. Agents Chemother. 1999.- V. 43.- P. 367-370.

61. Gutmann L., Ferre B., Goldstein F. W., Rizk N., Pinto-Schuster E., Acar J. F., Collatz E. SHV-5, a novel SHV-type p-lactamase that hydrolyzes broad-spectrum cephalosporins and monobactams // Antimicrob. Agents Chemother. 1989. - V. 33. - P. 951-956.

62. Haeggman S., Lefdahl S., Burman L. G. An allelic variant of the chromosomal gene for class A p-lactamase K2, specific for Klebsiella pneumoniae, is the ancestor of SHV-1 // Antimicrob. Agents Chemother.- 1997. V. 41. - P. 2705-2709.

63. Heritage J., Hawkey P. M., Todd N., Lewis I. J. Transposition of the gene encoding a TEM-12 extended-spectrum p-lactamase // Antimicrob. Agents Chemother. 1992. - V. 36. - P. 1981-1986.

64. Heritage J., M'Zali F. H., Gascoyne-Binzi D., Hawkey P. M. Evolution and spread of SHV extended-spectrum p-lactamases in gram-negative bacteria // J. Antimicrob. Chemother. 1999. - V. 44. - P. 309-318.

65. Hibbert-Rogers L. C., Heritage J., Todd N., Hawkey P. M. Convergent evolution of TEM-26, a p-lactamase with extended-spectrum activity // J. Antimicrob. Chemother. 1994. - V. 33. - P. 707-720.

66. Hujer K. M., Hujer A. M., Bonomo R. A. Site-saturation mutagenesis of the 238 position in the SHV-1 beta-lactamase // 39th Interscience Conference on Antimicrobial Agents and Chemotherapy: Abstracts. San Francisco, 1999. Abstr. 2051.

67. HuletskyA., Couture F., Levesque R. C. Nucleotide sequence and phylogeny of SHV-2 p-lactamase // Antimicrob. Agents Chemother.- 1990. V. 34. - P. 1725-1732.

68. Huovinen S. Rapid isoelectric focusing of plasmid-mediated beta-lactamases with Pharmacia PhastSystem // Antimicrob. Agents Chemother. 1988. - V. 32. - P. 1730-1732.

69. Huovinen S., Huovinen P., Jacoby G. A. Detection of plasmid-mediated p-lactamases with DNA probes // Antimicrob. Agents Chemother. 1988. - V. 32. - P. 175-179.

70. IEF and electrophoretic titration curve analysis. PhastSystem separation technique file No. 100. Uppsala: Pharmacia Biotech., 1993. - 4 P.

71. Jacoby G. A. Genetics of extended-spectrum beta-lactamases // Eur. J. Clin. Microbiol. Infect. Dis. 1994. - V. 13. - Suppl. 1. - P. 2-11.

72. Jacoby G. A., Medeiros A. A. More extended-spectrum p-lactamases // Antimicrob. Agents Chemother. 1991. - V. 35. - P. 1697-1704.

73. Jacoby G. A., Sutton L. Properties of plasmids responsible for production of extended-spectrum (3-lactamases // Antimicrob. Agents Chemother.- 1991. V. 35. - P. 164-169.

74. Kim J., Kwon Y. Development of ligase chain reaction (LCR)-PCR method for discriminatory detection of genes coding for SHV variants // 39th Interscience Conference on Antimicrobial Agents and Chemotherapy: Abstracts. San Francisco, 1999. Abstr. 2051

75. Kim J., Kwon Y., Pai H., Kim J. W., Cho D. T. Survey of Klebsiella pneumoniae strains producing extended-spectrum p-lactamases: prevalence of SHV-12 and SHV-2a in Korea // J. Clin. Microbiol. 1998.- V. 36. P. 1446-1449.

76. Kliebe C., Nies B. A., Meyer J. F., Tolxdorff-Neutzling R. M., Wiedemann B. Evolution of plasmid-coded resistance to broad-spectrum cephalosporins // Antimicrob. Agents Chemother. 1985. - V. 28.- P.302-307.

77. Knothe H., Shah P., KremeryV., Antal M., Mitsuhashi S. Transferable resistance to cefotaxime, cefoxitin, cefamandole and cefuroxime in clinical isolates of Klebsiella pneumoniae and Serratia marcescens // Infection. 1983. - V. 11. - P. 315-317.

78. Knox J. R. Extended-spectrum and inhibitor-resistant TEM-type p-lactamases: mutations, specificity , and three-dimensional structure // Antimicrob. Agents Chemother. 1995. - V. 39. - P. 2593-2601.

79. Kuzin A. P., Nukaga M., Nukaga Y., Hujer A. M., Bonomo R. A., Knox J. R. Structure of the SHV-1 p-lactamase // Biochemistry. 1999.- V. 4. P. 5720-5727.

80. Labia R., Chaibi E. B., Sirot D., Chanal-Claris C., Stapleton P., Shannon K., French G. Inhibitor-resistant TEM p-lactamases: revision of the TEM-41 sequence // Antimicrob. Agents Chemother. 1998. - V. 42.- P. 2771.

81. Lee K-Y., Hopkins J. D., Synanen M. Direct involvement of IS26 in an antibiotic resistance operon // J. Bacteriol. 1990. - V. 172. - P. 32293236.

82. LemozyJ., Sirot D., Chanal C., HucC., Labia R., Dabernat H., Sirot J. First characterization of inhibitor-resistant TEM (IRT) p-lactamases in Klebsiella pneumoniae strains // Antimicrob. Agents Chemother. 1995.- V. 39. P. 2580-2582.

83. Liu P. Y., Gur D., Hall L. M., Livermore D. M. Survey of the prevalence of p-lactamases amongst 1000 gram-negative bacilli isolated consecutively at the Royal London Hospital // J. Antimicrob. Chemother. 1992.- V. 30. P. 429-447.

84. Liu Q., Feng J., Sommer S. S. Bi-directional dideoxy fingerprinting (Bi-ddF): a rapid method for quantitative detection of mutation in genomic regions of 300-600 bp. // Hum. Mol. Gen. 1996. - V. 5.- P. 107-114.

85. Liu Q., Sommer S. S. Restriction endonuclease fingerprinting (REF): as sensitive method for screening mutations in long contiguous segments of DNA. // Biotechniques 1995. - V. 18. - P. 470-477.

86. Livermore D. M. ß-lactamases in laboratory and clinical resistance // Clin. Microb. Reviews. 1995. - V. 8. - P. 557-584.

87. Livermore D. M. Mechanisms of resistance to ß-lactam antibiotics // Scand. J. Infect. Dis. 1991. - Suppl. 78. - P. 7-16.

88. Livermore D. M., Williams J. D. ß-lactams: mode of action and mechanisms of bacterial resistance // Antibiotics in laboratory medicine. / Ed. Lorian V. Baltimore: Williams & Wilkins, 1991. P. 503-578.

89. Mabilat C., Courvalin P. Development of "oligotyping" for characterization and molecular epidemiology of TEM ß-lactamases in members of the family Enterobacteriaceae // Antimicrob. Agents Chemother. 1990. - V. 34. - P. 2210-2216.

90. Mabilat C., Goussard S. PCR detection and identification of genes for extended-spectrum ß-lactamases // Diagnostic Molecular Microbiology. Principles and Aplications / Ed. Persing D., Smith T. Washington: ASM, 1993, P. 553-559.

91. Mabilat C., Goussard S., SougakoffW., Spencer R. C., Courvalin P. Direct sequencing of the amplified structural gene and promoter for the extended-broad-spectrum ß-lactamase TEM-9 (RHH-1) of Klebsiella pneumoniae // Plasmid. 1990. - V. 23. - P. 27-34.

92. Marchandin H., Carriere C., Sirot D., Pierre H. J., Darbas H. TEM-24 produced by four different species of Enterobacteriaceae, including Providencia rettgeri, in a single patient // Antimicrob. Agents Chemother.- 1999. V. 43. - P. 2069-2073.

93. Marchese A., ArletG., Schito G. C., Lagrange P. H., Philippon A. Detection of SHV-5 extended-spectrum ß-lactamase in Klebsiella pneumoniae strains isolated in Italy I I Eur. J. Clin. Microbiol. Infect. Dis.- 1996. V. 15. - P. 245-248.

94. Matagne A., Lamotte-Brasseur J., Frere J. M. Catalytic properties of class A p-lactamases: efficiency and diversity // Biochem. J. 1998.- V. 1. P. 581-598.

95. Mathew A., Harris A. M., Marshall M. J., Ross G. W. The use of analytical isoelectric focusing for detection and identification of beta-lactamases // J. Gen. Microbiol. 1975. - V. 88. - P. 169-178.

96. Matthew M., Hedges R. W. Analytical isoelectric focusing of R factor determined p-lactamases: correlation with plasmid compatibility // J. Bacteriol. 1976. - V. 125. - P. 713-718.

97. Medeiros A. A. Evolution and dissemination of p-lactamases Accelerated by genaration of p-lactam antibiotics // Clin. Infect. Dis. . 1997. - V. 24.- Suppl. 1. P. 2488-93.

98. Medeiros A. A., Cohenford M., Jacoby G. A Five novel plasmid-determined p-lactamases // Antimicrob. Agents Chemother. 1985.- V. 27. P. 715-719.

99. MercierJ., Levesque R. C. Cloning of SHV-2, OHIO-1, and OXA-6 p-lactamases and cloning and sequencing of SHV-1 p-lactamase // Antimicrob. Agents Chemother. 1990. - V. 34. -P. 1577-1583.

100. Mitsuhashi S., Inoue M. Mechanisms of resistance to beta-lactam antibiotics // Beta-lactam antibiotics / Ed. Mitsuhashi S. New York: Springer-Verlag, 1981. P. 41-56.

101. Mugnier P., Dubrous P., Casin I., Arlet G., Collatz E. A TEM-derived extended-spectrum p-lactamase in Pseudomonas aeruginosa // Antimicrob. Agents Chemother. 1996. - V. 40. - P. 2488-93.

102. M'Zali F. H., Chanawong A., Kerr K. G., Birkenhead D., Hawkey P. M.

103. Detection of extended-spectrum p-lactamases in members of the family Enterobacteriaceae: comparison of the MAST DD test, the double disc and the Etest ESBL // J. Antimicrob. Chemother. 2000. - V. 45.- P.881-885.

104. Neuwirth C., Labia R., Siebor E., PechinotA., Madec S., Chaibi E. B., Kazmierczak A. Characterization of TEM-56, a novel p-lactamase produced by a Klebsiella pneumoniae clinical isolate // Antimicrob. Agents Chemother. 2000. - V. 44. - P. 453-455.

105. Nicolas-Chanoine M. H. Inhibitor-resistant p-lactamases // J. Antimicrob. Chemother. 1997. - V. 40. - P. 1-3.

106. Nuesch-lnderbinen M. T., Kayser F. H, Hachler P. Survey and molecular genetics of SHV p-lactamases in Enterobacteriaceae in Switzerland: two novel enzymes, SHV-11 and SHV-12 // Antimicrob. Agents Chemother.- 1997. V. 41. - P. 943-949.

107. Orita M., Ivahana H, Kanazawa H., Hayashi K., Sekiya T. Detection of polymorphisms of human DNA by gel electrophoresis as single-strand conformation polymorphisms // Proc. Natl. Acad. Sci USA 1989.- V. 86. P. 2766-2770.

108. Ouellette M., Paul G. C., Philippon A. M., Roy P. H. Oligonucleotide probes (TEM-1, OXA-1) versus isoelectric focusing in p-lactamase characterization of 114 resistant strains // Antimicrob. Agents Chemother. 1988. - V. 32. - P. 397-399.

109. Ouellette M., Rossi J. J., Bazin R., Roy P. H. Oligonucleotide probes for the detection of TEM-1 and TEM-2 p-lactamase genes and their transposons // Can. J. Microbiol. 1987. - V. 33. - P. 205-211.

110. Palzkill T., Thomson K. S., Sanders C. C., Moland E. S., Huang W., Milligan T. W. New variant of TEM-10 p-lactamase gene produced by a clinical isolate of Proteus mirabilis 11 Antimicrob. Agents Chemother.- 1995. V. 39. - P. 1199-1200.

111. Paniara O., Platsouka E., Dimopoulou H., Tzelepi E., Miragou V., Tzouvelekis L. S. Diversity of beta-lactam resistance levels among related Klebsiella pneumoniae strains isolated in an intensive care unit // J. Chemother. 2000. - V. 12. - P. 204-207.

112. Payne D. J., Marriot M. S., Amyes S. G B. Characterisation of a unique ceftazidime hydrolysing p-lactamase, TEM-E2 // J. Med. Microbiol.- 1990. V. 32. - P. 131-134.

113. Payne D. J., Thomson C. J. Molecular Approaches for the Detection and Identification of p-lactamases // Molecular Bacteriology. Protocols and

114. Clinical Applications / Ed. Woodford N. and Johnson A. P. Totowa, New Jersey: Humana Press, 1998. P. 495-512.

115. PCR-SSCP analysis. PhastSystem separation technique file No. 131.- Uppsala: Pharmacia Biotech., 1993. 8 P.

116. Peduzzi J., Barthelemy M., Tiwari K., Mattioni D., Labia R. Structural features related to hydrolytic activity against ceftazidime of plasmid-mediated SHV-type CAZ-5 ß-lactamase // Antimicrob. Agents Chemother. 1989. - V. 33. - P. 2160-2163.

117. Peixe L. V., Sousa J. C., Perez-Diaz J. C., Baquero F. A bla(TEM-lb)-derived TEM-6 ß-lactamase: a case of convergent evolution // Antimicrob. Agents Chemother. 1997. - V. 41. - P. 1206.

118. Petit A., Gerbaud G., Sirot D., Courvalin P., Sirot J. Molecular epidemiology of TEM-3 (CTX-1) ß-lactamase // Antimicrob. Agents Chemother. 1990. - V. 34. - P.219-224.

119. Philippon A., ArletG., Lagrange P. H. Origin and impact of plasmid-mediated extended-spectrum beta-lactamases // Eur. J. Clin. Microbiol. Infect. Dis. 1994. - V. 13. - Suppl. 1. - P. 17-29.

120. Podbielski A., Melzer B. Nucleotide sequence of the gene encoding the SHV-2 ß-lactamase (blaSHV-2) of Klebsiella ozaenae // Nucleic Acids Res. 1990. - V. 18.- P. 4916.

121. Poupart M.-C., Chanal C., Sirot D., Labia R., Si rot J. Identification of CTX-2, a novel cefotaximase from a Salmonella mbandaka isolate // Antimicrob. Agents Chemother. 1991. - V. 35. - P. 1498-1500.

122. Prinarakis E. E., Miriagou V., Tzelepi N., Gazouli M., Tzouvelekis L. S. Emergence of an inhibitor-resistant ß-lactamase (SHV-10) derived from an SHV-5 variant // Antimicrob. Agents Chemother. 19974. -V. 1.- P. 838-840.

123. Prinarakis E. E., Tzelepi E., Gazouli M., Mentis A. F., Tzouvelekis L. S. Characterization of a novel SHV ß-lactamase variant that resembles the SHV-5 enzyme // FEMS Microbiol. Lett. 1996. - V. 139. - P. 229-234.

124. Rasmussen B. A., Bush K. Carbapenem-hydrolyzing ß-lactamases // Antimicrob. Agents Chemother. 1997. - V. 41. - P. 223-232.

125. Reshedko G., Stetsuk 0., Bogdanovich T. Klebsiella pneumoniae: problem of resistance 11 Alpe Adria Microbiol. J. 1996. - V. 5. - P. 6972.

126. Rice L. B., Marshall S. H., Carias L. L., Sutton L. L., Jacoby J. A., Sequences of MGH-1, YOU-1, YOU-2 extended spectrum ß-lactamase genes //Antimicrob. Agents Chemother. 1993. - V. 37. - P. 2760-2761.

127. Richmond M. H., Sykes R. B. The ß-lactamases of gram-negative bacteria and their possible physiological role // Adv. Microb. Physiol.1973. V. 9. - P. 31-88.

128. Ridley A. M. Genomic Fingerprinting by Application of rep-PCR // Molecular Bacteriology. Protocols and Clinical Applications / Ed. Woodford N. and Johnson A. P. Totowa, New Jersey: Humana Press, 1998. P. 103-115.

129. Roy C., SeguraC., Tirado M., Reig R., Hermida M., Tervel D. et al. Frequency of plasmid determined beta-lactamases in 680 consecutively isolated strains of Enterobacteriaceae // Eur. J. Clin. Microbiol. Infect. Dis. 1986. - V. 4. - P. 146-147.

130. Saunders N. A., Clewley J. P. DNA amplification: general concepts and methods // Molecular Bacteriology. Protocols and Clinical Applications / Ed. Woodford N. and Johnson A. P. Totowa, New Jersey: Humana Press, 1998. P. 63-82.

131. Scanvic A. M., Soilleux M. J., Chaibi E. B., Labia R., Scavizzi M. R. TEM-8: a paradoxical ceftazidimase that owes its uniqueness to the presence of serine residues at positions 164 and 238 // J. Antimicrob. Chemother. 1997. - V. 40. - P. 303-304.

132. Shlaes D. M., Currie-McCumber C., Hull A., Behlare I., Kron M. OHIO-1 p-lactamase is part of the SHV-1 family 11 Antimicrob. Agents Chemother. 1990. - V. 34. - P. 1570-1576.

133. Simard J.-L., Roy P. H. PCR detection of penicillinase-producing Neisseria gonorrhoeae // Diagnostic Molecular Microbiology. Principles and Aplications / Ed. Persing D., Smith T. Washington: ASM, 1993, P. 543-546.

134. Simpson I. N., Harper P. B., O'Callaghan C. H. Principal p-lactamases responsible for resistance to p-lactam antibiotics in urinary tract infections // Antimicrob. Agents Chemother. 1980. - V. 17. - P. 929936.

135. SirotD. Extended-spectrum plasmid-mediated p-lactamases // J. Antimicrob. Chemother. 1995. - V. 36. - P. 19-34.

136. SirotD., Chanal C., Henquell C., Labia R., SirotJ., Cluzel R. Clinical isolates of Escherichia coli producing multiple TEM mutants resistant to p-lactamase inhibitors // J. Antimicrob. Chemother. 1994. - V. 33.- P. 1117-1126.

137. Siu L. K., Ho P. L., Yuen K. Y., Wong S. S., Chau P. Y. Transferable hyperproduction of TEM-1 p-lactamase in Shigella flexneri due to a point mutation in the pribnow box // Antimicrob. Agents Chemother. 1997.- V. 41. P. 468-470.

138. Sougakoff W.( Goussard S., Courvalin P. The TEM-3 ß-lactamase, which hydrolyzes broad-spectrum cephalosporins, is derived from the TEM-2 penicillinase by two amino acid substitutions // FEMS Microbiol. Lett.- 1988. V. 56. - P. 343-348.

139. Sougakoff W., Petit A., Goussard S., Sirot D., Bure A., Courvalin P. Characterization of the plasmid genes blaT-4 and blaT-5 which encode the broad-spectrum ß-lactamases TEM-4 and TEM-5 in Enterobacteriaceae // Gene. 1989. - V. 78. - P. 339-348.

140. Speldooren V., Heym B., Labia R., Nicolas-Chanoine M.-H. Discriminatory detection of inhibitor-resistant ß-lactamases in Escherichia coli by single-strand conformation polymorphism-PCR // Antimicrob. Agents Chemother. 1998. - V. 42. - P. 879-884

141. Spencer R. C., Wheat P. F., Winstanley T. G., Cox D. M., Plested S. J. Novel ß-lactamase in a clinical isolate of Klebsiella pneumoniae conferring unusual resistance to ß-lactam antibiotics // J. Antimicrob. Chemother.- 1987. V. 20. - P. 919-921.

142. Stapleton P., Wu P.-J., King A., Shannon K., French G., Phillips I. Incidence and mechanisms of resistance to the combination of amoxicillin and clavulanic acid in Escherichia coli // Antimicrob. Agents Chemother. 1995. - V. 39. - P. 2478-2483.

143. Stratchounsky L., Reshedko G., Kretchikova O. The survey of resistance in Klebsiella pneumoniae. // 19th International Congress of Chemotherapy: Abstracts. Canada, 1995. Abstr. 4223.

144. Sutcliffe J. G., Nucleotide sequence of the ampicillin resistance gene of Escherichia coli plasmid pBR322 11 Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 1978.- V. 75. P. 3737-3741.

145. Sykes R. B., Matthew M. The p-lactamases of gram-negative bacteria and their role in resistance to p-lactam antibiotics // J. Antimicrob. Chemother. 1976. - V. 2. - P. 115-157.

146. Taylor G. R. (ed.) Laboratory methods for the detection of mutations and polymorphisms in DNA Boca Raton: CRC Press., 1997. P. 37-39.

147. Tenover F. C., Huang M. B., Rasheed J. K., Persing D. H. Development of PCR assays to detect ampicillin resistance genes in cerebrospinal fluid samples containing Haemophilus influenzae // J. Clin. Microbiol. 1994.- V. 32. P. 2729-2737.

148. Tessier F., Arpin C., Allery A., Quentin C. Molecular characterization of a TEM-21 p-lactamase in a clinical isolate of Morganella morganii // Antimicrob. Agents Chemother. 1998. - V. 42. - P. 2125-2127.

149. Thomson C. J., Amyes S. G. Molecular epidemiology of the plasmid-encoded TEM-1 p-lactamase in Scotland // Epidemiol. Infect. 1993.- V. 110. P. 117-125.

150. Thomson C. J., Shanahan P. M., Amyes S. G Nucleotide sequences ofinhibitor-resistant TEM ß-lactamases // J. Antimicrob. Chemother.- 1998. V. 41. - P. 572-573.

151. Thomson K. S., Weber D. A., Sanders C. C., Sanders W. E. Jr ß-lactamase production in members of the family Enterobacteriaceae and resistance to ß-lactam-enzyme inhibitor combinations // Antimicrob. Agents Chemother. 1990. - V. 34. - P. 622-627.

152. Tsakris A., Tzouvelekis L. S., Douboyas J., Panagea T., Tzelepi E. Diversity of ß-lactamases among Klebsiella pneumoniae strains isolated in a university hospital in Greece // Eur. J. Epidemiol. 1997. - V. 13.- P. 103-107.

153. VuyeA., Verschraegen G.( Claeys G. Plasmid-mediated p-lactamases in clinical isolates of Klebsiella pneumoniae and Escherichia coli resistant to ceftazidime // Antimicrob. Agents Chemother. 1989.- V. 33. - P. 757761.

154. Webb E. C. (ed.) Enzyme nomenclature. London: Academic Press Inc. (London) Ltd., 1984. - V. 1. P. 366-374.

155. Webber D. A., Sanders C. C., Bakken J. S., Quinn J. P. A novel chromosomal TEM derivative and alterations in outer membrane proteins together mediate selective ceftazidime resistance in Escherichia coli // J. Infect. Dis. 1990. - V. 162. - P. 460-465.

156. Weber D. A., Sanders C. C., Bakken J. S., Quinn G. P. A novel chromosomal TEM derivative and alterations in outer membrane proteins together mediate selective ceftazidime resistance in Escherichia coli // J. Infect. Dis. 1990. - V. 162. - P. 460-465.

157. Widjojoatmojo M. N., Fluit A. C., Verhoef J. Rapid Identification of Bacteria by PCR-Single-Strand Conformation Polymorphism // J. Clin. Microbiol. 1994. - V. 32. - P. 3002-3007.

158. Wiedemann B., Kliebe C., Kresken M. The epidemiology of p-lactamases // J. Antimicrob. Chemother. 1989. - V. 24. - Suppl. B. - P. 1-22.

159. Wu P. J., Shannon K., Phillips I. Mechanisms of hyperproduction of TEM-1 p-lactamase by clinical isolates of Escherichia coli // J. Antimicrob. Chemother. 1995.- V. 36. - P. 927-939.

160. Yang Y., Bhachech N., Bradford P. A., Jett B. D., Sahm D. F., Bush K.