Разработка методов генетической паспортизации значимых для сельского хозяйства насекомых и клещей на основе штрих-кодирования ДНК тема диссертации и автореферата по ВАК РФ 03.02.07, кандидат наук Кокина Анастасия Васильевна

• Кокина Анастасия Васильевна
• кандидат наук
• 2021

Оглавление диссертации кандидат наук Кокина Анастасия Васильевна

ГЛАВА 1. ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ

1.1. Использование метода штрих-кодирования ДНК для выявления таксономической принадлежности организмов

1.1.1. Штрих-кодирование ДНК, его суть и основные подходы

1.1.2. Участок ДНК для «штрих-кодирования» организмов

1.1.2.1. Рибосомная ДНК (рДНК).................................................................1S

1.1.2.2. Хлоропластная ДНК (хлДНК)..........................................................1B

1.1.2.3. Митохондриальная ДНК (мтДНК)

1.1.3. Молекулярно-филогенетический анализ

1.1.4. Метабаркодирование ДНК

1.1.5. Материалы для штрих-кодирования ДНК

1.1.6. Ограничения штрих-кодирования ДНК

1.2. Методы молекулярно-генетической идентификации организмов

1.2.1. ПЦР в реальном времени с использованием зондов

1.2.1.1. Молекулярные маяки («molecular beacons»)

1.2.1.2 TaqMan зонды

1.2.2. Секвенирование следующего поколения (NGS)...................................3S

1.2.2.1. 454 (Roche) пиросеквенирование

1.2.2.2. Ion Torrent

1.2.2.3. Illumina (Solexa)

ГЛАВА 2. ЭКСПЕРИМЕНТАЛЬНАЯ ЧАСТЬ

2.1. ОБЪЕКТЫ И МЕТОДЫ ИССЛЕДОВАНИЯ

2.1.1. Объект исследования

2.1.2. Методы исследования

2.1.2.1. Выделение ДНК из биоматериала с помощью ЦТАБ - буфера

2.1.2.2. Выделение ДНК с помощью набора Quick - gDNA MiniPred (Zymo Research)

2.1.2.3. Проведение ПЦР

2.1.2.4. Проведение ПЦР в реальном времени

2.1.2.5. Гель - электрофорез в 2% агарозном геле

2.1.2.6. Экстракция ДНК из агарозного геля с помощью набора Cleanup Standard (Евроген, Россия)

2.1.2.7. Рестрикционный анализ (ПЦР - ПДРФ)

2.1.2.8. Разработка TaqMan зондов

2.1.2.9. ПЦР с TaqMan зондами

2.1.2.10. Секвенирование

2.1.2.11. Статистические алгоритмы и компьютерные программы, использованные для анализа полученных последовательностей

ГЛАВА 3. РЕЗУЛЬТАТЫ И ИХ ОБСУЖДЕНИЕ

3.1. Дифференциация видов клопов рода Eurygaster Laporte, 1833 (Hemiptera: Heteroptera: Scutelleridae), основных вредителей зерновых культур в европейской части России, на основе морфологических признаков и штрих-кодирования ДНК

3.1.1. Возможности дифференцировки видов клопов рода Eurygaster по морфологическим характеристикам

3.1.2. Идентификация клопов рода Eurygaster на основе секвенирования гена субъединицы 1 митохондриальной цитохромоксидазы

3.1.3. Разработка метода для экспресс - идентификации наиболее вредоносного вида для злаковых культур - Eu. integriceps

3.2. Дифференциация коммерчески доступных видов клещей родов Amblyseius и Neoseiulus (Acari: Phytoseiidae) с помощью молекулярно-генетических методов

3.2.1. Штрих-кодирование ДНК клещей родов Amblyseius и Neoseiulus

3.2.2. Разработка метода быстрой дифференциации коммерчески доступных видов клещей родов Amblyseius и Neoseiulus (Acari: Phytoseiidae) на основе рестрикционного анализа

3.3. Дифференциация подвидов медоносных пчел России на основе штрих-кодирования ДНК и с помощью мутагенной ПЦР-ПДРФ

3.3.1. Штрих-кодирование ДНК подвидов медоносных пчел России

3.3.1. Разработка метода дифференциации ключевых пород медоносных пчел в России на основе мутагенной ПЦР-ПДРФ

ЗАКЛЮЧЕНИЕ

ПЕРЕЧЕНЬ СОКРАЩЕНИЙ И УСЛОВНЫХ ОБОЗНАЧЕНИЙ

СПИСОК ЛИТЕРАТУРЫ

ПРИЛОЖЕНИЕ А

Введение диссертации (часть автореферата) на тему «Разработка методов генетической паспортизации значимых для сельского хозяйства насекомых и клещей на основе штрих-кодирования ДНК»

ВВЕДЕНИЕ

Актуальность работы. Разнообразие жизни является основой стабильности и устойчивости любой экосистемы и биосферы в целом. «Предполагается, что общее число существующих видов на Земле достигает 8,7 млн, из которых более 75 % не описаны (Mora et al., 2011). С огромным биоразнообразием связаны многие практические проблемы в сельском хозяйстве, возникающие при обеспечении защиты растений, при борьбе с вредителями и переносчиками болезней, при контроле над инвазивными видами животных и растений, а также мониторинге состояния окружающей среды» (Кокина, 2015).

К примеру, в мировой фауне в 2010 году насчитывалось 42 тысячи видов, входящих в отряд полужесткокрылых насекомых, или клопов (Heteroptera) (Винокуров и др., 2010). В настоящее время их еще больше. В 6 томов каталога полужесткокрылых Палеарктики (Catalogue..., 1995-2006, 2013) включено, в общей сложности, 9365 видов из 1632 родов и 66 семейств. В настоящее время палеарктических видов также значительно больше, поскольку ежегодно открываются и описываются новые для науки виды.

По характеру трофических связей в составе отряда полужесткокрылых большинство видов - фитофаги, но также достаточно много зоофагов и фитозоофагов, есть также и кровососущие эктопаразиты. Среди клопов-фитофагов, распространённых в России, насчитывается несколько десятков видов, вредных для сельскохозяйственных культур, лесных и парковых насаждений. Кроме того, 2 вида являются кровососами, причиняющими вред непосредственно организму человека (Cimex lectularius и C. hemipterus).

К видам, сильно вредящим сельскохозяйственным культурам, относятся, прежде всего, представители рода Eurygaster (вредная черепашка) из семейства щитников-черепашек (Scutelleridae), родов Eurydema (крестоцветные клопы) и Aelia (остроголовые клопы) из семейства щитников (Pentatomidae), ряд видов из семейства клопов-слепняков (Miridae) - хлебные клопики (Trigonotylus

caelestialium, T. rufworms), виды рода Polymerus conatus, P. vulneratus), странствующие слепняки (^^Ыт elongata и N. erratica), грушевая кружевница (Stephanitis pyri) из семейства клопов-кружевниц (Тт§1ёае) и ряд других.

И среди перечисленных выше, и среди других представителей отряда полужесткокрылых насекомых существуют не просто виды, повреждающие культурные и дикорастущие растения, а первостепенные вредители сельского хозяйства, лесных и культурных насаждений, такие как вредная черепашка (Eurygaster integiceps), инвазивные американские виды дубовая и платановая коритухи (Corythucha arcuata и C. cШata), инвазивный тропический мраморный клоп (Halyomorpha halys). Кроме того, как оказалось, инвазивный тропический постельный клоп (Cmex hemipterus), интенсивно осваивающий населенные пункты России, оказался гораздо более вредоносным, чем постельный клоп C. ^Ш^пт, распространенный по всему миру.

В составе родов, к которым относятся вредные виды полужесткокрылых, почти всегда представлены виды, которые вредят в меньшей степени или вообще не вредят. При этом вредные и не вредящие виды обычно морфологически очень близки к настоящим вредителям в составе этих же родов, что вызывает серьезные, а в ряде случаев неразрешимые, проблемы с точной идентификацией конкретных вредных видов.

Для определения видов полужесткокрылых, как и насекомых других отрядов, разработаны и опубликованы определители, включающие виды, распространенные на различных территориях России, других государств и природных территорий. К таким руководствам относится, например, серия определителей насекомых Европейской части СССР (1964-1987). Аналогичная серия определителей опубликована для идентификации насекомых Дальнего Востока СССР и России (1986 и др.). Кроме того, специалистами-систематиками разработан и опубликован ряд специальных определителей. Они включают только основные вредные виды или еще крайне близкие к ним виды, не вредящие или слабо вредящие, но живущие на тех же самых

сельскохозяйственных культурах и породах деревьев, что и вредители. К таким руководствам относится, в частности, серия определителей вредных и полезных насекомых сельскохозяйственных культур в СССР (1980-1984). Разработчиками таких специализированных определителей являются специалисты-систематики по отдельным таксономическим группам, в том числе и по отряду полужесткокрылых насекомых.

Кроме общих и специальных определителей опубликован ряд справочников, включающих основные вредные виды насекомых и сопутствующие им виды, относящиеся к категориям второстепенных и потенциальных вредителей. К ним относится, например, серия справочников «Насекомые и клещи - вредители сельскохозяйственных культур» (1972-1999).

В практике защиты растений всегда требуется оперативная идентификация вредителей, появляющихся на посевных культурах, посадках свеклы, картофеля, подсолнечника, на плодово-ягодных культурах, в лесных насаждениях. Требуется идентификация не только взрослых насекомых (имаго), но также их личинок и яйцекладок. Приведенные выше определители позволяют идентифицировать только имаго. Определителей по личинкам очень мало, а по яйцекладкам подобные справочники почти отсутствуют. Определение насекомых, в том числе вредных, по преимагинальным фазам развития значительно сложнее, чем по признакам имаго. Но даже оперативное определение взрослых насекомых и идентификация вредителей обычно оказываются очень трудной или даже непреодолимой преградой при планировании и проведении защитных мероприятий для работников сельскохозяйственных предприятий. Отличия в морфологических структурах (деталях строения, окраске, размерах и пропорциях частей тела) вредных видов от близких им видов, не являющихся вредителями, бывают настолько тонкими или незначительными, что неподготовленный в достаточной мере агроном не в состоянии их уловить и оценить. Специалисты-систематики при определении близких между собой видов обычно используют микропрепараты, в том числе препараты гениталий. Для их изготовления требуются серьезные навыки в этой

работе, которые достигаются в течение многих месяцев или даже лет. Работа по приготовлению микропрепаратов проводится только с использованием светооптических приборов и химических соединений. Она требует значительного времени даже для опытного специалиста-энтомолога. Использования для идентификации приведенных выше общих и специальных определителей требует длительной предварительной подготовки под руководством специалистов-энтомологов. Определение же личинок, особенно младших возрастов, и яйцекладок часто вообще представляет собой невыполнимую задачу. Кроме того, данная проблема осложняется нехваткой узконаправленных специалистов по таксономическому определению видов.

Ограничения, присущие системам идентификации на основе морфологии, указывают на необходимость нового подхода к распознаванию таксонов. В настоящее время отсутствует системный подход по генетическому определению видовой принадлежности тех или иных насекомых и клещей.

Ранее был разработан «способ идентификации видов неизвестного организма» Джона А. Вебстера (Патент РФ № 2011681 С1, 20.11.1984), предусматривающий выделение ДНК этого организма, обработку ДНК рестриктазой, гибридизацию на фильтрах фрагментов ДНК с меченым нуклеотидным зондом и детекцию гибридных последовательностей с последующим анализом ее результатов. Очевидно, что его метод является очень трудоемким и отнимает много времени. Кроме того, отсутствует международная база данных по рестрикционным полиморфизмам широких групп организмов. «Были разработаны системы по ЯДРО-РСЯ анализу, а также анализу микросаттелитных участков ДНК. Однако, данные методы являются трудоемкими и имеют низкую воспроизводимость, помимо этого, ЯДРО анализ имеет высокую погрешность вследствие контаминации исходных образцов ДНК. Методы идентификации таксонов по анализу смесей ДНК из разных видов организмов в настоящий момент не разработаны» (Кокина, 2015).

Микрогеномные идентификационные системы, позволяющие различать организмы с помощью анализа небольшого сегмента генома (штрих-кода),

представляют собой чрезвычайно перспективный подход в диагностике биологического разнообразия (Garrity et al., 2009). Эти «штрих-коды ДНК» представляют собой практический стандартизированный инструмент идентификации на уровне видов, который можно использовать для оценки биоразнообразия (Adamowicz and Steinke, 2015), изучения истории жизни и экологических исследований, для обеспечения подлинности и безопасности пищевых продуктов и лекарственных препаратов, а также для криминалистического анализа.

Цель исследования - разработать методы экспресс - идентификации сельскохозяйственно значимых насекомых и клещей на основе штрих-кодирования ДНК.

В соответствии с целью работы были поставлены следующие задачи:

1. Провести штрих-кодирование ДНК клопов рода Eurygaster, коммерчески значимых клещей родов Amblyseius и Neoseiulus, а также подвидов медоносных пчел России.

2. На основе секвенированных последовательностей выявить участки ДНК изучаемых видов (подвидов), которые позволят их дифференцировать друг.

3. Провести филогенетический анализ имеющихся последовательностей ДНК вредителей из рода Eurygaster, энтомофагов родов Amblyseius и Neoseiulus, ключевых подвидов медоносных пчел в международных базах данных.

4. Рассмотреть возможность применения ПЦР с TaqMan зондами для быстрой идентификации видов клопов рода Eurygaster.

5. Разработать схемы проведения ПЦР-ПДРФ, которые позволят быстро определять таксономическую принадлежность клопов рода Eurygaster, клещей родов Amblyseius и Neoseiulus, а также подвидов медоносных пчел.

Научная новизна. Штрих-кодирование ДНК Eu. integriceps (GenBank: KR105371.1), как самого опасного вредителя зерновых культур в составе рода Eurygaster, а также обитающего только в природных экосистемах Eu. dilaticollis (GenBank: KU726545.1) сделаны впервые нами. Разработан метод идентификации вредной черепашки (Eurygaster integriceps) на основе

рестрикционного анализа, который позволяет в течение нескольких часов идентифицировать вредителя на его ранних «стадиях развития (яйца, личинки) в независимости от пола насекомого, а также без привлечения узкоспециализированного специалиста-энтомолога» (патент РФ №2617935 C1).

Разработан метод быстрой дифференциации коммерчески доступных видов клещей родов Amblyseius и Neoseiulus (Acari: Phytoseiidae) «на основе рестрикционного анализа предварительно амплифицированного участка ДНК, включающего гены 185 рРНК, ITS1, 5.8S рРНК, ITS2, 28S рРНК» (патент РФ №2631933 C1).

Нами «был проведен анализ нуклеотидной последовательности участка гена цитохромоксидазы субъединицы 1 митохондриальной ДНК для разных пород медоносных пчел. Установлены отличия в нуклеотидной последовательности между 4 основными породами медоносной пчелы (Apis mellifera carpathica, Apis mellifera caucasica, Apis mellifera carnica и Apis mellifera mellifera), которые позволили нам разработать метод экспресс-идентификации перечисленных пород пчел на основе мутагенного рестрикционного анализа (ПЦР-ПДРФ). Было выявлено, что для среднерусской породы пчел характерно 2 гаплотипа» (патент РФ № 2653435 C1). Последовательность цитохромоксидазы субъединицы 1 для A. mellifera carpatica зарегистрирована впервые нами.

Теоретическая и практическая значимость. Внедрение предлагаемых методов идентификации насекомых и клещей на основе штрих-кодирования ДНК в сельское хозяйство позволит обеспечивать частных аграриев, для которых характерны низкие финансовые показатели, новыми и эффективными технологическими решениями. Данные решения направлены на экономию материалов и денежных средств, обеспечивают высокие показатели производительности сельскохозяйственной отрасли, с учётом текущих финансовых возможностей, а также безопасность предлагаемой продукции. Полученные в ходе исследования результаты и усовершенствованные методики идентификации могут быть в дальнейшем использованы для изучения

биоразнообразия, для проверки подлинности продуктов питания и контроля над инвазивными видами насекомых, а также для мониторинга состояния окружающей среды.

Методология и методы научного исследования. Исследование было выполнено с использованием усовершенствованных методов молекулярной биологии, а также современных методов биоинформатики и филогенетического анализа. Подробное описание использованных в ходе работы методов представлено в главе «Материалы и методы».

Положения, выносимые на защиту.

1. Три вида клопа: Eurygaster maura, Eurygaster testudinarius, Eurygaster dUaticoШs невозможно дифференцировать на основе классического штрих-кодирования ДНК насекомых. В то же время Eurygaster integriceps (наиболее вредоносный) легко идентифицируется по гену цитохромоксидазы, отличающему данный вид от других видов того же рода.

2. Использование TaqMan зондов для дифференциации основных вредителей зерновых культур (клопов рода Eurygaster) не является подходящим методом для видовой идентификации.

3. Проведение ПЦР — ПДРФ с помощью рестриктаз AccB1 I, AspLE, Ssp I позволяет быстро и точно идентифицировать коммерчески используемые виды клещей родов Amblyseius и Neoseiulus без секвенирования ДНК.

4. Обнаружены специфичные для конкретных подвидов пчел, которые позволили разработать молекулярно-генетический метод для быстрой идентификации подвидов медоносных пчел на основе полиморфизма длины рестрикционных фрагментов.

Апробация результатов работы. Основные результаты диссертационной работы были представлены на XXIII и XXIV Международной научной конференции студентов, аспирантов и молодых ученых «Ломоносов» (Москва, 2016 и 2017), на региональной научной конференции студентов, аспирантов и молодых ученых «Инновационные технологии на базе фундаментальных научных разработок - прорыв в будущее» от Фонда

содействия развитию малых форм предприятий в научно-технической сфере по программе «У.М.Н.И.К.» (Воронеж, 2015).

Публикации. Основные результаты диссертационной работы изложены в 13 публикациях, из них 2 - в журналах, рекомендованных ВАК РФ и 4 - в журналах, индексируемых в Web of Science и Scopus; имеется 3 патента РФ.

Структура и объём диссертации. Диссертация изложена на 145 страницах. Состоит из введения, основной части, содержащей 13 таблиц и 17 рисунков, заключения, списка литературы (включает 295 наименования, в том числе 259 - на иностранном языке), перечня сокращений и условных обозначений, и приложения.

Благодарность. Работа выполнена при поддержке гранта РНФ № 1614-00176, гранта Президента Российской Федерации для государственной поддержки молодых российских ученых и ведущих научных школ (НШ-2535.2020.11). Автор искренне признателен и выражает благодарность сотрудникам кафедры зоологии и паразитологии Воронежского государственного университета В. Б. Голубу и В. А. Соболевой за предоставление материала для исследования и помощь в идентификации видов насекомых отряда полужесткокрылых по морфологическим характеристикам, М. Ю. Сыромятникову за помощь в освоении методик проведения лабораторных исследований.

ГЛАВА 1. ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ 1.1. Использование метода штрих-кодирования ДНК для выявления таксономической принадлежности организмов 1.1.1. Штрих-кодирование ДНК, его суть и основные подходы

Штрих-кодирование («barcoding») ДНК - это новая система, разработанная для обеспечения быстрой, точной и автоматизированной идентификации видов с использованием коротких стандартизованных участков генов в качестве внутренних видовых меток (Frezal and Leblois, 2008; Kress and Erickson, 2012). В качестве исследовательского инструмента для таксономистов штрих-кодирование ДНК помогает в идентификации, расширяя возможности диагностики видов за счет включения всех этапов жизненного цикла организма без его повреждения. Традиционные систематики используют несколько морфологических признаков для определения видов. Сегодня такие черты все чаще дополняются информацией на основе ДНК. Первоначальные тесты генетического штрих-кодирования с использованием митохондриальных маркеров на животных показали точность, близкую к 100%, что указывает на высокую валидность метода при определенных условиях (Ward et al., 2003; Hebert et al., 2004; Barrett and Hebert, 2005). Точная идентификация видов, отнесение неизвестного к известному, требует всеобъемлющей сравнительной молекулярной базы данных, с которой можно сравнивать неизвестные. Однако очевидно, что большая часть биологического разнообразия в мире не задокументирована (May, 1997; Wilson, 2003). Следовательно, заявленная вторая цель штрих-кодирования ДНК - облегчить процесс открытия новых видов (Stoeckle, 2003; Hebert et al., 2004; Janzen, 2004).

В настоящее время исследователи во всем мире используют штрих-кодирования ДНК для изучения биоразнообразия (Ward et al., 2005; Shander and Willassen, 2005; Ajmal et al., 2014; Rosas et al., 2018), дифференцируя загадочные виды, при проверке подлинности продуктов питания (Ceruso et al., 2020), при контроле над инвазивными видами насекомых (Armstrong and Ball, 2005) и для надзора за переносчиками болезней (Besansky et al., 2003)

выявлении паразитов, насекомых-вредителей (Oba et al., 2015; Sow et al., 2019; Kunprom and Pramual, 2019; Twinkle et al., 2020; Marullo et al., 2020) и хищников, мониторинге незаконной торговли животными и их продукцией. Кроме того, этот метод потенциально может использоваться для мониторинга качества питьевой воды, а также для быстрой идентификации индикаторных видов озер, рек и ручьев, контролировать виды исчезающих растений и животных (Lambert et al., 2005).

1.1.2. Участок ДНК для «штрих-кодирования» организмов

Размер генома растений варьируется от 8,8 х 106 до более 300 х 109п.н., однако ДНК можно получить из небольшого количества ткани листа (0,1 г), что весьма удобно для идентификации. Для изучения генетической изменчивости доступен широкий спектр молекулярных методов, включая анализ сайтов рестрикции, анализ перестроек ДНК, а также наиболее часто используемые методы на основе ПЦР с последующим секвенированием ДНК (Martins and Hellwig, 2005; Mitchell and Wen, 2005).

Использование последовательностей ДНК или белков для идентификации организмов было предложено как более эффективный подход, чем традиционные методы для определения видовой принадлежности (Tautz et al., 2003; Blaxter, Elsworth, Daub, 2004).

Ген хлоропласта, такой как matK (maturase K), или ядерный ген, такой как ITS (внутренний транскрибируемый спейсер), могут быть эффективной мишенью для штрих-кодирования у растений. Kress et al. (2005) продемонстрировали эффективность штрих-кодирования ДНК у покрытосеменных растений (Kress et al., 2005). Рибосомная ДНК может быть использована для дополнения результатов, основанных на пластидных генах, что может обеспечить более сложный многокомпонентный штрих-код для диагностики и определения границ видов (Chase et al., 2005). Последовательности, используемые для молекулярного штрих-кодирования,

включают ген ядерной малой субъединицы рРНК (SSU, также известный как 16S у прокариот и 18S у большинства эукариот), ген ядерной большой субъединицы рРНК (LSU, также известный как 23S и 28S), сильно вариабельный внутренний транскрибируемый спейсерный участок цистрона рРНК (ITS, разделенный геном 5S рРНК на области ITS1 и ITS2), ген митохондриальной цитохром с оксидазы 1 (CO1 или cox1) и большая субъединица рибулозобифосфаткарбоксилазы хлоропласта (rbc L) (Chase et al., 2005).

1.1.2.1. Рибосомная ДНК (рДНК)

Рибосома является важной единицей всех живых организмов, которая управляет синтезом белка, в конечном итоге подпитывая рост клеток (накопление клеточной массы) и пролиферацию клеток (увеличение числа клеток) (Fonseca et al., 2018).

Анализ последовательностей генов многокопийной ядерной рибосомной ДНК (рДНК), кодирующих структурные РНК рибосом (рРНК), широко используется в филогенетике растений (Braukmann et al., 2017). Рибосомная ДНК расположена в виде тандемных повторов в одном или нескольких хромосомных локусах с тысячами повторов. В целом рДНК может составлять до 10% всего генома растения. Размер повторяющейся единицы рДНК человека (18S рРНК; 28S рРНК; 5,8S рРНК; 5'ETS; 3'ETS; ITS1; ITS2; межгенный спейсер (Matyasek et al., 2019); псевдоген cdc27; сайт связывания p53) составляет 42 999 п.н.

Большинство размеров генома покрытосеменных имеют узкий диапазон от 135 до 160 т.п.н. В геномах растений цистрон рДНК кодирует 18S, 26S и 5.8S рРНК, которые разделены двумя внутренними транскрибируемыми спейсерами (ITS1 и ITS2), а цистрон фланкирован внешними транскрибируемыми спейсерами: 5'- ETS и 3'- ETS (рис. 1).

Рисунок 1 - Домены последовательности рДНК тандемных кластеров генов (каждый примерно по 10 т.п.н.) ядерных и органелларных рДНК различных организмов и органелл. (а) пре-рДНК в геноме и (б) транслированные рибосомные субъединицы. Сокращения: ETS - внешний транскрибируемый спейсер, ITS - внутренний транскрибируемый спейсер, NTS - нетранскрибируемый спейсер, 5.8S - 28S - рибосомные субъединицы нуклеопротеидов рРНК (по: Ali et al., 2014)

Эти области представляют собой относительно короткие последовательности, ITS1 200-300 п.н., ITS2 180-240 п.н. и 5,8S 160 п.н. у цветковых растений. Рибосомы эукариот состоят из двух субъединиц: большой (LSU), которая примерно в два раза больше, чем малая субъединица и малой (SSU). Ген 18S кодирует SSU, а LSU кодируется 26S и 5.8S. Область ITS включает ген 5.8S, который является наиболее широко используемым молекулярным маркером на межвидовом и межродовом уровнях (Feliner et al., 2004). Из-за влияния согласованной эволюции, полиморфизмы обусловлены не внутригеномной изменчивостью в этих локусах, а, скорее, более частым

слиянием различных копий ITS в одном геноме (Feliner et al., 2004). Ген 18S является медленно эволюционирующим маркером и также подходит для определения филогении покрытосеменных растений и близкородственных семейств, таких как Caryophyllales (Cuenoud, 2002). Однако наиболее частым ограничением использования 18S рДНК для филогенетического анализа является низкий уровень изменчивости среди покрытосеменных растений.

Филогенетическая полезность последовательностей 26S широко не изучена. У растений ген 26S имеет длину около 3,4 т.п.н. и включает 12 сегментов экспансии, которые являются вариабельными. Общая скорость нуклеотидных замен 26S в 1,6-2,2 раза выше, чем у 18S. Последовательности 26S использовались для дифференциации близкородственных семейств, таких как Apiales (Chandler and Plunkett, 2004) и для определения филогенетического положения семейств растений (Simmons, 2001; Neyland, 2002).

Область внешнего транскрибируемого спейсера (ETS) (особенно 3'-конец последовательности 5'-ETS, смежной с 18S) также использовалась для филогенетических анализов. Частота полиморфизма ETS еще недостаточно изучена. Более того, внутренняя повторяющаяся структура области ETS может затруднять амплификацию и выравнивание последовательностей (Linder et al., 2000). Для сравнения всех локусов рДНК, ITS является наиболее часто секвенированным локусом, используемым в филогенетических исследованиях растений (Pandey and Ali, 2006; 2012; Choudhary et al., 2011; Subramaniam et al., 2013; Lee et al., 2013). Преимущество области ITS состоит в том, что она может быть амплифицирована двумя меньшими фрагментами (ITS1 и ITS2) с присоединяющимся локусом 5.8S. Достаточно консервативная область 5.8S на самом деле содержит достаточно филогенетических сигналов для различения на уровнях порядков и типов, однако этот локус не является предметом штрих-кодирования. ITS-области часто различаются вставками и делециями внутри индивидуума, а не заменами, что затрудняет секвенирование, поскольку несколько типов ITS-последовательностей анализируются одновременно (Lee et al., 2013).

Таксономия - это синтетическая наука, основанная на данных из таких различных областей, как морфология, анатомия, эмбриология, цитология и химия. В последние годы развитие методов молекулярной биологии, включая методы молекулярной гибридизации, клонирования, расщепления рестрикционными эндонуклеазами и секвенирования нуклеиновых кислот, предоставило множество новых инструментов для исследования филогенетических взаимоотношений. Реконструкции филогении покрытосеменных в значительной степени опирались на пластидные и митохондриальные гены (Qiu et al., 2010; Sun et al., 2019), а иногда и целые пластидные геномы (Moore et al., 2007; 2010) и ядерные гены (Li et al., 2011). Развитие молекулярно-систематических методов изучения ДНК и филогенетической теории привело к созданию классификации семейств цветковых растений (Haston et al., 2009).

1.1.2.2. Хлоропластная ДНК (хлДНК)

Обманчиво простая задача выбора подходящего локуса для использования в качестве штрих-кода растения оказалась гораздо более сложной, чем ожидалось, и вызвала серьезные споры. Несмотря на отсутствие консенсуса по универсальному штрих-коду растений, таксономисты, экологи, биологи-эволюционисты и специалисты по охране окружающей среды уже предполагают применение генетического идентификатора для широкого круга исследований и прикладных программ (Mace, 2004). Широкомасштабное стандартизированное секвенирование митохондриального гена СО1 сделало ДНК-штрих-кодирование эффективным инструментом идентификации видов во многих группах животных (Gustafsson et al., 2016; Camargo et al., 2016; Katugin et al., 2017; Gandolfi et al., 2017; Wang et al., 2018). У растений, однако, низкие показатели замещения мтДНК привели к поиску альтернативных областей штрих-кодирования.

Хлоропласты - характерные органеллы растительных клеток. В них проходят многочисленные важные метаболические пути, включая фотосинтез,

который делает хлоропласты основным источником химической энергии на Земле (Zoschke and Bock, 2018). ХлДНК очень часто использовалась в систематических и филогенетических исследованиях растений (Yang et al., 2015; Meng et al., 2019; Li et al., 2019; Chen et al., 2020). Это круглая молекула размером 120-217 т.п.н., за исключением зеленой водоросли Floydiella terrestris с огромной хлДНК размером 521 168 п.н. (Gyulai et al., 2012).

Список литературы диссертационного исследования кандидат наук Кокина Анастасия Васильевна, 2021 год

- 18 с.

37.A development strategy to fast establish the Taqman qPCR based method to detect SNP mutations / X. Jiang, J. Xiang, R. Wang, Q. Wan // Hum Cell. -2020. - Vol. 33. - No. 4. - P. 1331-1333.

38.A minimalist barcode can identify a specimen whose DNA is degraded / Hajibabaei M., Smith M. A., Janzen D. H. [et al.] // Mol. Ecol. Notes. - 2006.

- Vol. 6. - P. 959-964.

39.A Molecular Method for the Identification of Honey Bee Subspecies Used by Beekeepers in Russia / M. Y. Syromyatnikov, A. V. Borodachev, A. V. Kokina, V. N. Popov // Insects. - 2018. - Vol. 9. - No. 1. - е10.

40.A morphological and molecular phylogenetic analysis of relationships between genera of the nematode sub-family Cloacininae (Stossich) (Strongyloidea: Chabertiidae) parasitic in kangaroos, wallabies and rat-kangaroos (Marsupialia: Macropodoidea) / I. Beveridge, A. Jabbar, A. Koehler, T. Sukee // Zootaxa. -2020. - Vol. 4851, No. 2.

41.A new multiplex RT-qPCR method for the simultaneous detection and discrimination of Zika and chikungunya viruses / Broeders S., Garlant L., Fraiture M. A. [et al.] // Int J Infect Dis. - 2020. - Vol. 92. - P. 160-170.

42.A plea for DNA taxonomy / Tautz D., Arctander P., Minelli A. [et al.] // Trends Ecol. Evol. - 2003. - Vol. 18. - No. 2. - P. 70-74.

43.A proposal for a standardised protocol to barcode all land plants / Chase M. W., Cowan R. S., Hollingsworth P. M. [et al.] // Taxon. - 2007. - Vol. 56. -No. 2. - P. 295-299.

44.A Rapid Method for the Identification of Fresh and Processed Pagellus erythrinus Species against Frauds / Ceruso M., Mascolo C., Luca P. [et al.] // Foods. - 2020. - Vol. 9. - No. 10. - P. 1397.

45.A review of methods for discrimination of honey bee populations as applied to European beekeeping / Bouga M., Alaux C., Bienkowska M. [et al.] // J. Apic. Res. - 2011. - Vol. 50. - P. 51-84.

46.A simple molecular method for rapid identification of commercially used Amblyseius and Neoseiulus species (Acari: Phytoseiidae) / Syromyatnikov M. Y., Kokina A. V., Belyakova N. A. [et al.] // Zootaxa. - 2018. - Vol. 4394. -No. 2. - P. 270-278.

47.A tale of three next generation sequencing platforms: comparison of Ion Torrent, Pacific Biosciences and Illumina MiSeq sequencers / Quail M. A., Smith M., Coupland P. [et al.] // BMC Genomics. - 2012. - Vol. 13. - P. 341.

48.A triplex probe-based TaqMan qPCR assay for Calreticulin type I and II mutation detection / Tang Y., Shi C., Wu Z. [et al.] // Hematology. - 2019. -Vol. 24. - No. 1. - P. 26-31.

49.Accurate whole human genome sequencing using reversible terminator chemistry / D. R. Bentley, S. Balasubramanian, H. P. Swerdlow, G. P. Smith // Nature. - 2008. - Vol. 456. - No. 7218. - P. 53-59.

50.Ackerfield, J. R. Evolution of Hedera (the ivy genus, Araliaceae): insights from chloroplast DNA data / J. R. Ackerfield, J. Wen // Int. J. Plant Sci. -2003. - Vol. 164. - P. 593-602.

51.Ajmal, Ali M. The changing epitome of species identification - DNA barcoding / Ajmal Ali M., Gyulai G., Hidvegi N. // Saudi J Biol Sci. - 2014. -Vol. 21. - No. 3. - P. 204-231.

52.Ali, M. A. Molecular phylogenetic study of Cardamine amaraeformis Nakai using nuclear and chloroplast DNA markers / M. A. Ali, J. Lee, S. Y. Kim, F. M. Al-Hemaid // Genet. Mol. Res. - 2012. - Vol. 11. - No. 3. - P. 3086-3090.

53.Amblyseius swirskii: what made this predatory mite such a successful biocontrol agent? / Calvo F. J., Knapp M., van Houten Y. M. [et al.] // Exp Appl Acarol. - 2015. - Vol. 65. - No. 4. - P. 419-433.

54.Analysis of gluten-hydrolyzing proteinase polymorphism in wheat grains damaged by Sunn Pest Eurygaster integriceps Put. and related bugs / Konarev Al. V., Konarev A.V., Nefedova L. I. [et al.] // Russian Agricultural Sciences. - 2013. - Vol. 39. - No. 5. - P. 390-395.

55.Angiosperm phylogeny inferred from sequences of four mitochondrial genes / Qiu Y. L., Li L., Wang B. [et al.] // J. Syst. Evol. - 2010. - Vol. 48. - P. 391425.

56.Antony, T. Molecular beacons: nucleic acid hybridization and emerging applications / T. Antony, V. Subramaniam // J Biomol Struct Dyn. - 2001. -Vol. 19. - No. 3. - P. 497-504.

57.Armstrong, K. F. DNA barcodes for biosecurity: invasive species identification / K. F. Armstrong, S. L. Ball // Philos. Trans. R. Soc. Lond. B Biol. Sci. -2005. - Vol. 360. - P. 1813-1823.

58. Assessing environmental DNA detection in controlled lentic systems / G. R. Moyer, E. Díaz-Ferguson, J. E. Hill, C. Shea // PLoS One. - 2014. - Vol. 31. -No. 7. - e103767.

59.Assessment of the mitochondrial origin of honey bees from Argentina / A. H. Abrahamovich, O. Atela, P. De la Rúa, J. Galián // J. Apic. Res. Bee World. -2007. - Vol. 46. - P. 191-194.

60.Authoritative subspecies diagnosis tool for European honey bees based on ancestry informative SNPs / Momeni J., Parejo M., Nielsen R. O. [et al.] // BMC Genomics. — 2021. — Vol. 22. - No. 1. — e101.

61.Barrett, R. D. Identifying spiders through DNA barcodes / R. D. Barrett, P. D. Hebert // Can J Zool. - 2005. - Vol. 83. - P. 481-491.

62.Batzakis, B. D. Morphological characters of the Greek species of Eurygaster Laporte, 1832 (Heteroptera: Pentatomidae) / B. D. Batzakis // Annales d' Institut Phytopathologique Benaki (N.S.). - 1972. - Vol. 10. - P. 267-279.

63.Besansky, N. J. DNA barcoding of parasites and invertebrate disease vectors: what you don't know can hurt you / N. J. Besansky, D. W. Severson, M. T. Ferdig // Trends Parasitol. - 2003. - Vol. 19. - P. 545-546.

64.Better Resolution for Cytochrome b than Cytochrome c Oxidase Subunit I to Identify Schizothorax Species (Teleostei: Cyprinidae) from the Tibetan Plateau and Its Adjacent Area / Ma Q., He K., Wang X. [et al.] // DNA Cell Biol. -2020. - Vol. 39. - No. 4. - P. 579-598.

65.Beyond DNA barcoding: The unrealized potential of genome skim data in sample identification / K. Bohmann, S. Mirarab, V. Bafna, M.T. Gilbert // Mol Ecol. - 2020. - Vol. 29. - No. 14. - P. 2521-2534.

66.Biodiversity, conservation and current threats to European honeybees / De la Rúa P., Jaffé R., Dall'Olio R. [et al.] // Apidologie. - 2009. - Vol. 40. - P. 263-284.

67.Biological control of thrips and whiteflies by a shared predator: two pests are better than one / G.J. Messelink, R. van Maanen, S.F. van Steenpaal, A. Janssen // Biol Control. - 2008. - Vol. 42. - P. 372-379.

68.Biological identifications through DNA barcodes / P. Ward, A. Cywinska, S. Ball, J. Waard // Proc Biol Sci. - 2003. - Vol. 270. - P. 313-321.

69.Blaxter, M. DNA taxonomy of a neglected animal phylum: an unexpected diversity of tardigrades / M. Blaxter, B. Elsworth, J. Daub // Proc. R. Soc. B. -2004. - Vol. 271. - P. 189-192.

70.Carrion fly-derived DNA as a tool for comprehensive and cost-effective assessment of mammalian biodiversity / Calvignac-Spencer S., Merkel K., Kutzner N. [et al.] // Molecular Ecology. - 2013. - Vol. 22. - P. 915-924.

71.Catalogue of the Heteroptera of the Palaearctic Region / Aukema B., Rieger Chr. Rabitsh W. eds (2013). Vol. 6. Supplement. Amsterdam: The Netherlands Entomological Society. - 639 p.

72.Catalogue of the Heteroptera of the Palaearctic Region / B. Aukema, Rieger Chr. eds (1995-2006). Amsterdam: The Netherlands Entomological Society. (Vol. 1, 1995, 222 p.; Vol. 2, 1996, 361 p.; Vol. 3, 1999, 577 p.; Vol. 4, 2001, 346 p.; Vol. 5, 2006, 550 p.).

73.Chandler, G. T. Evolution in Apiales: nuclear and chloroplast markers together in (almost) perfect harmony / G. T. Chandler, G. M. Plunkett // Bot. J. Linn. Soc. - 2004. - Vol. 144. - P. 123-147.

74.Characterization of a prolyl endoprotease from Eurygaster integriceps Puton (Sunn pest) infested wheat / C. Darkoh, M. El-Bouhssini, M. Baum, B. Clack // Arch Insect Biochem Physiol. - 2010. - Vol. 74. - No. 3. - P. 163-178.

75.Characterization of the native honey bee subspecies in Saudi Arabia using the mtDNA COI-COII intergenic region and morphometric characteristics / Alattal Y., Alsharhi M., Al-Ghamdi A. [et al.] // Bull. Insectol. - 2014. - Vol. 67. - P. 31-37.

76.Chen, C. C. Exploring phylogeny of the microsoroid ferns (Polypodiaceae) based on six plastid DNA markers / C. C. Chen, J. Hyvonen, H. Schneider // Mol Phylogenet Evol. - 2020. - Vol. 143. - P. 106665.

77.Choudhary, R. K. Studies on genetic diversity among population of Persicaria barbata (L.) Hara from India based on internal transcribed spacer sequences of

nuclear ribosomal DNA / R. K. Choudhary, M. A. Ali, J. Lee // Saudi. J. Biol. Sci. - 2011. - Vol. 18. - No. 2. - P. 123-127.

78.COI barcoding as a molecular assay for the identification of phytoseiid mites / Li J. B., Li Y.X., Sun J.T. [et al.] // Systematic and Applied Acarology. - 2012.

- Vol. 17. - P. 397-406.

79.Comparison of sequencing by hybridization and cycle sequencing for genotyping of human immunodeficiency virus type 1 reverse transcriptase / Hanna G. J., Johnson V. A., Kuritzkes D. R. [et al.] // J Clin Microbiol. - 2000.

- Vol. 38. - No. 7. - P. 2715-2721.

80.Comparison of Seven Commercial TaqMan Master Mixes and Two Real-Time PCR Platforms Regarding the Rapid Detection of Porcine DNA / S. J. Kang, C. S. Jang, J. M. Son, K. W. Hong // Food Sci Anim Resour. - 2021. - Vol. 41. -No. 1. - P. 85-94.

81.Complete chloroplast genome of Camellia japonica genome structures, comparative and phylogenetic analysis / Li W., Zhang C., Guo X. [et al.] // PLoS One. - 2019. - Vol. 14. - No. 5. - e0216645.

82.Conservation genetics - Heat Map analysis of nuSSRs of a DNA of archaeological watermelons (Cucurbitaceae, Citrullus l. lanatus) compared to current varieties / Gyulai G., Szabo Z., Wichmann B. [et al.] // Genes Genom. Genom. - 2012. - Vol. 6. - No. 1. - P. 86-96.

83.Conserving diversity and vitality for honey bee breeding / Meixner M. D., Costa C., Kryger P. [et al.] // Journal of Apicultural Research. — 2010. — Vol. 49. - No. 1. — P. 85—92.

84.Cornuet, J. M. Putative origin and function of the intergenic region between COI and COII of Apis mellifera L. mitochondrial DNA / J. M. Cornuet, L. Garnery, M. Solignac // Genetics. - 1991. - Vol. 128. - P. 393-403.

85.Correction: Environmental DNA as a 'Snapshot' of Fish Distribution: A Case Study of Japanese Jack Mackerel in Maizuru Bay, Sea of Japan / Yamamoto S., Minami K., Fukaya K. [et al.] // PLoS One. . - 2016. - Vol. 11. - No. 4. -e0153291.

86.Critchley, B. R. Literature review of sunn pest Eurygaster integriceps Put. (Hemiptera: Scutelleridae) / B. R. Critchley // Crop Protection. - 1998. - Vol. 17. - No. 4. - P. 271-287.

87.Cytochrome c oxidase: evolution of control via nuclear subunit addition / Pierron D., Wildman D. E., Hüttemann M. [et al.] // Biochim Biophys Acta. -2012. - Vol. 1817. - No .4. - P. 590-597.

88.Dabert, M. DNA markers in the phylogenetics of the Acari / M. Dabert // Biology Letters. - 2006. - Vol. 43. - No. 2. - P. 97-107.

89.Dasmahapatra, K. Taxonomy: DNA barcodes: recent successes and future prospects / K. Dasmahapatra, J. Mallet // Heredity. - 2006. - Vol. 97. - P. 254-255.

90.Deciphering host-parasitoid interactions and parasitism rates of crop pests using DNA metabarcoding / Sow A., Brevault T., Benoit L., Chapuis M. P. [et al.] // Sci Rep. - 2019 - Vol. 9. - No. 1. - P. 3646.

91.Desmyter, S. COI sequence variability between Chrysomyinae of forensic interest / S. Desmyter, M. Gosselin // Forensic Sci Int Genet. - 2009. - Vol. 3.

- No.2. - P. 89-95.

92.Detecting useful genetic markers and reconstructing the phylogeny of an important medicinal resource plant, Artemisia selengensis, based on chloroplast genomics / D. Meng, Z. Xiaomei, K. Wenzhen, Z. Xu // PLoS One.

- 2019. - Vol. 14. - No. 2. - e0211340.

93.Detection of Extracellular Vesicle RNA Using Molecular Beacons / Oliveira G. P., Zigon E., Rogers G. [et al.] // iScience. - 2020. - Vol. 23. - No. 1. - P. 100782.

94.Determination of human platelet antigen typing by molecular methods: Importance in diagnosis and early treatment of neonatal alloimmune thrombocytopenia / S. A. Arinsburg, B. H. Shaz, C. Westhoff, M. M. Cushing // Am J Hematol. - 2012. - Vol. 87. - No. 5. - P. 525-528.

95.Development of primer pairs from diverse chloroplast genomes for use in plant phylogenetic research / Y. C. Yang, T. L. Kung, C. Y. Hu, S. F. Lin // Genet Mol Res. - 2015. - Vol. 14. - No. 4. - P. 14857-14870.

96.Dispersal of Amblyseius swirskii (Acari: Phytoseiidae) on High-Tunnel Bell Peppers in Presence or Absence of Polyphagotarsonemus latus (Acari: Tarsonemidae) / Lopez L., Smith H. A., Hoy M. A. [et al.] // J Insect Sci. -2017. - Vol. 17. - No. 1. - P. 6.

97.Dizkirici, A. Molecularphylogeny of Triticum and Aegilops genera basedon its and MatK sequence data / A. Dizkirici, C. Kansu, S. Onde // Pakistan Journal of Botany. - 2016. - Vol. 48. - P. 143 - 153.

98.DNA barcoding and minibarcoding as a powerful tool for feather mite studies / Doña J., Diaz-Real J., Mironov S. [et al.] // Mol Ecol Resour. - 2015. - Vol. 15. - No. 5. - P. 1216-1225.

99.DNA barcoding and morphological analysis for rapid identification of most economically important crop-infesting Sunn pests belonging to Eurygaster Laporte, 1833 (Hemiptera, Scutelleridae) / Syromyatnikov M. Y., Golub V. B., Kokina A. V. [et al.] //Zookeys. - 2017. - Vol. 706. - P. 51-71.

100. DNA barcoding Australia's fish species / Ward R. D., Zemlak T. S., Innes B. [et al.] // Philos. Trans. R. Soc. B. - 2005. - Vol. 360. - P. 18471857.

101. DNA barcoding cannot reliably identify species of the blowfly genus Protocalliphora (Diptera: Calliphoridae) / Whitworth T. L., Dawson R. D., Magalon H., Baudry E. // Proc Biol Sci. - 2007. - Vol. 274. - No. 1619. - P. 1731-1739.

102. DNA Barcoding for Identification of Sugarcane Borers in China / Wang J. D., Wang W. Z., Lin Z. L. [et al.] // Neotrop Entomol. - 2018. - Vol. 47. -No. 3. - P. 362-368.

103. DNA barcoding for squids of the family Gonatidae (Cephalopoda: Teuthida) from the boreal North Pacific / O. N. Katugin, O. V. Chichvarkhina,

A. O. Zolotova, A. Y. Chichvarkhin // Mitochondrial DNA. - 2017. - Vol. 28.

- No. 1. - P. 41-49.

104. DNA barcoding in land plants: Developing standards to quantify and maximize success / Erickson D. L., Spouge J., Resch A. [et al.] // Taxon. -2008. - Vol. 57. - P. 1304-1316.

105. DNA barcoding of Japanese click beetles (Coleoptera, Elateridae) / Oba Y., Ohira H., Murase Y. [et al.] // PLoS One. - 2015. - Vol. 10. - No. 1. -e0116612.

106. DNA Data Bank of Japan: 30th anniversary / Kodama Y., Mashima J., Kosuge T. [et al.] // Nucleic Acids Res. - 2018. - Vol. 46. - P. 30-35.

107. DNA from soil mirrors plant taxonomic and growth form diversity / Yoccoz N., Bräthen K., Gielly L. [et al.] // Molecular Ecology. - 2012. - Vol. 21. - P. 3647-3655.

108. DNA marker technology for wildlife conservation / Arif I. A., Khan H. A., Bahkali A. H. [et al.] // Saudi J Biol Sci. - 2011. - Vol. 18. - No. 3. - P. 219-225.

109. Dubey, B. DNA mini-barcoding: An approach for forensic identification of some endangered Indian snake species / B. Dubey, P. Meganathan, I. Haque // Forensic Sci Int Genet. - 2011. - Vol. 5. - No. 3. - P. 181-184.

110. Efficient and sensitive identification and quantification of airborne pollen using next-generation DNA sequencing / Kraaijeveld K., Weger L. A., Ventayol Garcia M. [et al.] // Molecular Ecology Resources. - 2015. - Vol. 15.

- P. 8-16.

111. Environmental barcoding: A next-generation sequencing approach for biomonitoring applications using river benthos / Hajibabaei M., Shokralla S., Zhou X. [et al.] // PLoS ONE. - 2011. - Vol. 6. - e17497.

112. Environmental DNA / P. Taberlet, E. Coissac, M. Hajibabaei, L. H. Rieseberg // Mol. Ecol. - 2012. - Vol. 21. - P. 1789-1793.

113. Environmental DNA analysis for estimating the abundance and biomass of stream fish / Doi H., Inui R., Akamatsu Y. // Freshwater Biology. - 2017. -Vol. 62. - P. 30-39.

114. Environmental DNA metabarcoding of lake fish communities reflects long-term data from established survey methods / Hänfling B., Lawson Handley L., Read D. S. [et al.] // Mol Ecol. - 2016. - Vol. 25. - No. 13. - P. 3101-3119.

115. Environmental DNA metabarcoding: Transforming how we survey animal and plant communities / Deiner K., Bik H. M., Mächler E. [et al.] // Mol Ecol. - 2017. - Vol. 26. - No. 21. - P. 5872-5895.

116. Factors Associated with Honey Bee Colony Losses: A Mini-Review / P. Hristov, R. Shumkova, N. Palova, B. Neov // Vet Sci. - 2020. - Vol. 7. - No. 4. - P. 166.

117. Fang, S. G. Formalin removal from archival tissue by critical point drying. / S. G. Fang, Q. H. Wan, N. Fijihara // Biotechniques. - 2002. - Vol. 33. - No. 3. - P. 604, 606, 608-610.

118. Feliner, G. N. Fine scale geographic structure, intra-individual polymorphism and recombination in nuclear ribosomal internal transcribed spacers in Armeria (Plumbaginaceae) / G. N. Feliner, B. G. Larena, J. F. Aguilar // Ann. Bot. - 2004. - Vol. 93. - No. 2. - P. 189-200.

119. Fish DNA barcoding around large marine infrastructure for improved biodiversity assessment and monitoring / Rosas U., Menendez F., Cornejo R. [et al.] // Mitochondrial DNA. - 2018. - Vol. 29. - No. 8. - P. 1174-1179.

120. Frezal, L. Four years of DNA barcoding: current advances and prospects / L. Frezal, R. Leblois // Infect Genet Evol. - 2008. - Vol. 8. - No. 5. - P. 727736.

121. Fundamentals of pyrosequencing / C. T. Harrington, E. I. Lin, M. T. Olson, J. R. Eshleman // Arch Pathol Lab Med. - 2013. - Vol. 137. - No. 9. -P. 1296-1303.

122. GenBank / Sayers E. W., Cavanaugh M., Clark K. [et al.] // Nucleic Acids Res. - 2020. - Vol. 8. - No. 48. - P. 84-86.

123. GenBank / Sayers E. W., Cavanaugh M., Clark K. [et al.] // Nucleic Acids Res. - 2019. - Vol. 47. - P. 94-99.

124. Gene flow in admixed populations and implications for the conservation of the Western honeybee, Apis mellifera / Soland-Reckeweg G., Heckel G., Neumann P. [et al.] // Journal of Insect Conservation. — 2009. — Vol. 13. — P. 317-328.

125. Genetic diversity and its conservation implications of Vitex rotundifolia (Lamiaceae) populations in East Asia / Sun Y, Yang H, Zhang Q. [et al.] // PeerJ. - 2019. - Vol.7. - e6194.

126. Genetic diversity of the locus COI-COII of mitochondrial DNA in honeybee populations (Apis mellifera L.) from the Tomsk region / Ostroverkhova N. V., Konusova O. L., Kucher A. N. [et al.] // Genetika. -2015. - Vol. 51. - P. 89-100.

127. Genetic integrity of the Dark European honey bee (Apis mellifera mellifera) from protected populations: A genome-wide assessment using SNPs and mtDNA sequence data / Pinto M. A., Henriques D., Chavez-Galarza J. [et al.] // J. Apic. Res. - 2014. - Vol. 53. - P. 269-278.

128. Genetic variation in the predacious phytoseiid mite, Amblyseius swirskii (Acari: Phytoseiidae): Analysis of specific mitochondrial and nuclear sequences / H. A. I. Ramadan, E. M. El-Banhawy, A. A. Hassan, S. I. Afia // Arab Journal of Biotechnology. - 2004. - Vol. 7. - P. 189-196.

129. Genetic variation of melon (C. melo) compared to an extinct landrace from the Middle Ages (Hungary) I. rDNA, SSR and SNP analysis of 47 cultivars / Szabo Z., Gyulai G., Humphreys M. [et al.] // Euphytica. - 2005. -Vol. 146. - P. 87-94.

130. Gerson, U. Mites for the control of pests in protected cultivation / U. Gerson, P. G. Weintraub // Pest Manag Sci. - 2007. - Vol. 63. - No. 7. - P. 658-676.

131. Ghasemzadeh, S. Biological control of Echinothrips americanus by phytoseiid predatory mites and the effect of pollen as supplemental food / S. Ghasemzadeh, A. Leman, G. J. Messelink // Exp Appl Acarol. - 2017. - Vol. 73. - No. 2. - P. 209-221.

132. Global pollinator declines: trends, impacts and drivers / Potts S. G., Biesmeijer J. C., Kremen C. [et al.] // Trends Ecol Evol. - 2010. - Vol. 25. -No. 6. - P. 345-353.

133. Gul, A. Sunn pest control policies and effect of Sunn pest damage on wheat quality and price in Turkey / A. Gul, A. Cuma, D. Mithat // Quality and Quanity. - 2006. - Vol. 40. - P. 469-480.

134. Gustafsson, C. M. Maintenance and Expression of Mammalian Mitochondrial DNA / C. M. Gustafsson, M. Falkenberg, N. G. Larsson // Annu Rev Biochem. - 2016. - Vol. 85. - P. 133-160.

135. Hall, B. G. Building phylogenetic trees from molecular data with MEGA / B. G. Hall // Mol Biol Evol. - 2013. - Vol. 30. - No. 5. - P. 1229-1235.

136. Hall, B. G. Evolution and biochemistry of family 4 glycosidases: implications for assigning enzyme function in sequence annotations / B. G. Hall, J. Thompson // Mol Biol Evol. - 2009. - Vol. 26. - No. 11. - P. 24872497.

137. Hall, B. G. Phylogenetic analysis as a tool in molecular epidemiology of infectious diseases / B. G. Hall, M. Barlow // Ann Epidemiol. - 2006. - Vol. 16. - No. 3. - P. 157-169.

138. Heat Map analysis of nuSSRs of a DNA of archaeological watermelons (Cucurbitaceae, Citrullus l. lanatus) compared to current varieties / Gyulai G., Szabo Z., Wichmann B. // Genes Genom. Genom. - 2012. - Vol. 6. - No. 2. -P. 86-96.

139. New DNA barcodes for identification of Korean birds / H. Y. Park, G. Jung, C. B. Kim, H. S. Yoo // Genes & Genomics. - 2011. - Vol. 33. - No 2. -P. 91-95.

140. High Throughput Sequencing: An Overview of Sequencing Chemistry / Ambardar S., Gupta R., Trakroo D. [et al.] // Indian J Microbiol. - 2016. - Vol. 56. - No. 4. - P. 394-404.

141. Honey bee genotypes and the environment / Meixner M., Buchler R., Costa C. [et al.] // Journal of Apicultural Research. — 2014. — Vol. 53. — P. 183-187.

142. How many species are there on Earth and in the ocean? / Mora C., Tittensor D. P., Adl S. // PLoS Biol. - 2011. - Vol. 9. - No. 8. - e1001127.

143. Hui, P. Next generation sequencing: chemistry, technology and applications / P. Hui // Top Curr Chem. - 2014. - Vol. 336. - P. 1-18.

144. Hurst, G. D. Problems with mitochondrial DNA as a marker in population, phylogeographic and phylogenetic studies: the effects of inherited symbionts / G. D. Hurst, F. M. Jiggins // Proc Biol Sci. - 2005. - Vol. 272. -No. 1572. - P. 1525-1534.

145. Hybridization kinetics and thermodynamics of molecular beacons / A. Tsourkas, M. A. Behlke, S. D. Rose, G. Bao // Nucleic Acids Res. - 2003. -Vol. 31. - No. 4. - P. 1319-1330.

146. Hybridization of DNA and PNA molecular beacons to single-stranded and double-stranded DNA targets / Kuhn H., Demidov V. V., Coull J. M. [et al.] // J Am Chem Soc. - 2002. - Vol. 124. - No. 6. - P. 1097-1103.

147. Identification of birds through DNA barcodes / P. D. Hebert, M. Y. Stoeckle, T. S. Zemlak, C. M. Francis // PLoS Biol. - 2004. - Vol. 2. - No. 10.

- P. 1657-1663.

148. Identification of Birds through DNA Barcodes / P. D. Hebert, M. Y. Stoeckle, T. S. Zemlak, C. M. Francis // PLoS Biol. - 2004. - Vol. 2. - No. 10.

- e312.

149. Identification of herbal medicinal materials using DNA barcodes / M. Li, H. Cao, P. P. But, P. C. Shaw // J. Syst. Evol. - 2011. - Vol. 49. - No. 3. - P. 271-283.

150. iDNA from terrestrial haematophagous leeches as a wildlife surveying and monitoring tool-prospects, pitfalls and avenues to be developed / Schnell I. B., Sollmann R., Calvignac-Spencer S. [et al.] // Frontiers in Zoology. -2015. - Vol. 12. - No. 1.

151. International Nucleotide Sequence Database Collaboration The international nucleotide sequence database collaboration / Karsch-Mizrachi I., Takagi T., Cochrane G. [et al.] // Nucleic Acids Res. - 2018. - Vol. 46. - P. 48-51.

152. Intragenomic heterogeneity of intergenic ribosomal DNA spacers in Cucurbita moschata is determined by DNA minisatellites with variable potential to form non-canonical DNA conformations / Matyásek R., Kuderová A., Kutílková E. [et al.] // DNA Res. - 2019. - Vol. 26. - No. 3. - P. 273-286.

153. Intraspecific variation in Radopholus similis solates assessed with restriction fragment length polymorphism and DNA sequencing of the internal transcribed spacer region of the ribosomal RNA cistron / Elbadri G. A., De Ley P., Waeyenberge L. [et al.] // Int. J. Parasitol. - 2002. - Vol. 32. - P. 199-205.

154. Is a large-scale DNA-based inventory of ancient life possible? / Lambert D. M., Baker A., Huynen L. [et al.] // J. Hered. - 2005. - Vol. 96. - No. 3. - P. 279-284.

155. Jackson, A. S. DNA barcoding of primates and the selection of molecular markers using African Great Apes as a model / A. S. Jackson, V. Nijman // J Anthropol Sci. - 2020. - Vol. 98.

156. Janssen, A. Alternative food and biological control by generalist predatory mites: the case of Amblyseius swirskii / A. Janssen, M. W. Sabelis // Exp Appl Acarol. - 2015. - Vol. 65. - No. 4. - P. 413-418.

157. Janzen, D. H. Now is the time / D. H. Janzen // Philos Biol Sci. - 2004. - Vol. 359. - P. 731-732.

158. John, K. St. Review Paper: The Shape of Phylogenetic Treespace / K. St. John // Syst Biol. - 2017. - Vol. 66. - No. 1. - P. 83-94.

159. Kadenbach, B. The subunit composition and function of mammalian cytochrome c oxidase / B. Kadenbach, M. Hüttemann // Mitochondrion. -2015. - Vol. 24. - P. 64-76.

160. Kapli, P. Phylogenetic tree building in the genomic age / P. Kapli, Z. Yang, M. J. Telford // Nat Rev Genet. - 2020. - Vol. 21. - No. 7. - P. 428-444.

161. Kimura, M. A simple method for estimating evolutionary rate of base substitutions through comparative studies of nucleotide sequences / M. Kimura // Journal of Molecular Evolution. - 1980. - Vol. 16. - P. 111-120.

162. Kress, W. J. A two-locus global DNA barcode for land plants: The coding rbcL gene complements the non-coding trnH-psbA spacer region / W. J. Kress, D. L. Erickson // PLoS ONE. - 2007. - Vol. 2. - No. 6. - e508.

163. Kress, W. J. DNA barcodes: methods and protocols / W. J. Kress, D. L. Erickson. - Totowa; N J: Humana Press. - 2012. - Vol. 858. - pp. 3-8.

164. Kunprom, C. DNA barcoding of fruit flies (Diptera: Tephritidae) in Thailand: ambiguity, misidentification and cryptic diversity / C. Kunprom, P. Pramual // Mitochondrial DNA. - 2019. - Vol. 30. - No. 8. - P. 861-873.

165. Ladoukakis, E. Evolution and inheritance of animal mitochondrial DNA: rules and exceptions / E. Ladoukakis, E. Zouros // Journal of Biological Research-Thessaloniki. - 2017. - Vol. 24. - No. 1. - P. 2.

166. Land plants and DNA barcodes: short-term and long term goals / Chase M.W., Salamin N., Wilkinson M. [et al.] // Philos. Trans. R. Soc. B. - 2005. -Vol. 360. - P. 1889-1895.

167. Landscape-scale distribution patterns of earthworms inferred from soil DNA / Pansu J., De Danieli S., Puissant J. [et al.] // Soil Biology and Biochemistry. - 2015. - Vol. 83. - P. 100-105.

168. LARP1 on TOP of ribosome production / Fonseca B. D., Lahr R. M., Damgaard C. K. [et al.] // Wiley Interdiscip Rev RNA. - 2018. - e1480.

169. Late Endosomes Act as mRNA Translation Platforms and Sustain Mitochondria in Axons / Cioni J. M., Lin J. Q., Holtermann A.V. [et al.] // Cell. - 2019. - Vol. 176. - No. 1-2. - P. 56-72, 15.

170. Mace, G. M. The role of taxonomy in species conservation / G. M. Mace // Philos Trans R Soc Lond B Biol Sci. - 2004. - Vol. 359. - No. 1444. - P. 711-719.

171. Marcus, J. M. Our love-hate relationship with DNA barcodes, the Y2K problem, and the search for next generation barcodes / J. M. Marcus // AIMS Genetics. - 2018. - Vol. 5. - P. 1-23.

172. Mardis, E. R. Next-generation DNA sequencing methods / E. R. Mardis // Annu Rev Genomics Hum Genet. - 2008. - Vol. 9. - P. 387-402.

173. Martins, L. Systematic position of the genera Serratula and Klasea Centaureinae (Cardueae, Asteraceae) inferred from ETS and ITS sequence data and new combination in Klasea / L. Martins, F. H. Hellwig // Taxon. - 2005. -Vol. 54. - No. 3. - P. 632-638.

174. Marullo, R. Barcoding: A Reliable Method for the Identification of Thrips Species (Thysanoptera, Thripidae) Collected on Sticky Traps in Onion Fields DNA / R. Marullo, F. Mercati, G. Vono // Insects. - 2020. - Vol. 11. -No. 8. - P. 489.

175. May, R. M. The dimensions of life of earth / R. M. May. - Washington: National Academy Press. - 1997. - pp. 30-45.

176. McCombie, W. R. Next-Generation Sequencing Technologies / W. R. McCombie, J. D. McPherson, E. R. Mardis // Cold Spring Harb Perspect Med. - 2019. - Vol. 9. - No. 11. - e036798.

177. McGee, K. M. A comparison of the wet and dry season DNA-based soil invertebrate community characteristics in large patches of the bromeliad Bromelia pinguin in a primary forest in Costa Rica / K. M. McGee, W. D. Eaton // Applied Soil Ecology. - 2015. - Vol. 87. - P. 99-107.

178. MEGA5: molecular evolutionary genetics analysis using maximum likelihood, evolutionary distance, and maximum parsimony methods / Tamura K., Peterson D., Peterson N. [et al.] // Mol Biol Evol. - 2011. - Vol. 28. - No. 10. - P. 2731-2739.

179. MEGA6: Molecular Evolutionary Genetics Analysis version 6.0 / Tamura K., Stecher G., Peterson D. [et al.] // Molecular Biology and Evolution. - 2013. - Vol. 30. - P. 2725-2729.

180. Messelink, G. J. Evaluation of phytoseiid predators for control of Western flower thrips on greenhouse cucumber / G. J. Messelink, S. F. van Steenpaal, P. J. Ramakers // Biocontrol. - 2006. - Vol. 51. - P. 753-768.

181. Meta-barcoding of 'dirt'DNA from soil reflects vertebrate biodiversity / Andersen K., Bird K. L., Rasmussen M. [et al.] // Molecular Ecology. - 2012. - Vol. 21. - P. 1966-1979.

182. Metzker, M. L. Sequencing technologies - the next generation / M. L. Metzker // Nat Rev Genet. - 2010. - Vol. 11. - No. 3. - P. 31-46.

183. Meyer, C. P. DNA Barcoding: Error Rates Based on Comprehensive Sampling / C. P. Meyer, G. Paulay // PLoS Biol. - 2005. - Vol. 3. - No. 12. -e422.

184. Microsatellite genetic diversity of Apis mellifera meda skorikov / Rahimi A., Mirmoayedi A., Kahrizi D. [et al.] // Mol Biol Rep. - 2014. - Vol. 41. -No. 12. - P. 7755-7761.

185. Mikhailov, K. V. Lack of reproducibility of molecular phylogenetic analysis of Cyclopoida / K. V. Mikhailov, V. N. Ivanenko // Mol Phylogenet Evol. - 2019. - Vol. 139. - P. 106574.

186. Mitchell, A. Phylogeny of Brassaiopsis (Araliaceae) in Asia based on nuclear ITS and 5S-NTS DNA sequences / A. Mitchell, J. Wen // Systematic Botany. - 2005. - Vol. 30. - No. 4. - P. 872-886.

187. Mitochondrial cytochrome c oxidase deficiency / Rak M., Bénit .P, Chrétien D. [et al.] // Clin Sci (Lond). - 2016. - Vol. 130. - No. 6. - P. 393407.

188. Mitochondrial DNA variation of Apis mellifera iberiensis: further insights from a large-scale study using sequence data of the tRNAleu-cox2 intergenic region / Chavez-Galarza J., Garnery L., Henriques D. [et al.] // Apidologie. - 2017. - Vol. 48. - P. 533-544.

189. Molecular beacons for protein-DNA interaction studies / Li J., Cao Z. C., Tang Z. [et al.] // Methods Mol Biol. - 2008. - Vol. 429. - P. 209-224.

190. Molecular markers in plant systematics I: nuclear sequences / Pandey A. K., Ali M. A. - Dehradun, India: Plant Sciences Research in India: Challenges and Prospects. Botanical Survey of India, -2006. - pp. 21-34.

191. Molecular phylogenetic relationships among members of the family Phytolaccaceae sensu lato inferred from internal transcribed spacer sequences of nuclear ribosomal DNA / J. Lee, S. Y. Kim, S. H. Park, M. A. Ali // Genet. Mol. Res. - 2013. - Vol. 12. - No. 4. - P. 4515-4525.

192. Molecular phylogenetics of Caryophyllales based on nuclear 18S rDNA and plastid rbcL, atpB, and matK DNA sequences / Cuenoud P., Savolainen V., Chatrou L. W. [et al.] // Am. J. Bot. - 2002. - Vol. 89. - P. 132-144.

193. Molecular phylogeny of genus Triticum L. / Golovnina K. A., Glushkov S. A., Blinov A. G. [et al.] // PlantSyst Evol. - 2007. - Vol. 264. - P. 195 -216.

194. Monitoring endangered freshwater biodiversity using environmental DNA / Thomsen P., Kielgast J., Iversen L. L. [et al.] // Molecular Ecology. -2012. - Vol. 21. - P. 2565-2573.

195. Multiple Multilocus DNA Barcodes from the Plastid Genome Discriminate Plant Species Equally Well / Fazekas A.J., Burgess K.S., Kesanakurti P.R. [et al.] // PLoS One. - 2008. - Vol. 3. - No. 7. - e2802.

196. Multiplex TaqMan locked nucleic acid real-time PCR for the differential identification of various meat and meat products / Xu R., Wei S., Zhou G. [et al.] // Meat Sci. - 2018. - Vol. 137. - P. 41-46.

197. Murray, D. C. From benchtop to desktop: Important considerations when designing amplicon sequencing workflows / D. C. Murray, M. L. Coghlan, M. Bunce // PLoS ONE. - 2015. - Vol. 10. - e0124671.

198. Narihiro, T. Oligonucleotide primers, probes and molecular methods for the environmental monitoring of methanogenic archaea / T. Narihiro, Y. Sekiguchi // Microb Biotechnol. - 2011. - Vol. 4. - No. 5. - P. 585-602.

199. Neimorovets, V. Review of the genus Eurygaster (Hemiptera: Heteroptera: Scutelleridae) of Russia. Zootaxa / V. Neimorovets // zootaxa. -2020. - Vol. 4722. - No. 6. - P. 501-539.

200. Neonicotinoids in the agroecosystem: In-field long-term assessment on honeybee colony strength and microbiome / Alberoni D., Favaro R., Baffoni L. [et al.] // Sci Total Environ. - 2021. - Vol. 762. - e144116.

201. New Evidences of Mitochondrial DNA Heteroplasmy by Putative Paternal Leakage between the Rock Partridge (Alectoris graeca) and the Chukar Partridge (Alectoris chukar) / Gandolfi A., Crestanello B., Fagotti A. [et al.] // PLoS One. - 2017. - Vol. 12. - No. 1. - e0170507.

202. Next-generation freshwater bioassessment: eDNA metabarcoding with a conserved metazoan primer reveals species-rich and reservoir-specific communities / Lim N. K., Tay Y. C., Srivathsan A. [et al.] // Royal Society Open Science. - 2016. - Vol. 3. - No. 11. - P. 160635.

203. Next-generation monitoring of aquatic biodiversity using environmental DNA metabarcoding / Valentini A., Taberlet P., Miaud C. [et al.] // Molecular Ecology. - 2016. - Vol. 25. - P. 929-942.

204. Next-Generation Sequencing in Oncology: Genetic Diagnosis, Risk Prediction and Cancer Classification / Kamps R., Brandao R. D., Bosch B. J. [et al.] // Int J Mol Sci. - 2017. - Vol. 18. - No. 2. - P. 308.

205. Neyland, R. A phylogeny inferred from large-subunit (265) ribosomal DNA sequences suggests the family Dasypogonaceae is closely aligned with Restionaceae allies / R. Neyland // Aust. Syst. Bot. - 2002. - Vol. 15. - P. 749-754.

206. Oleksa, A. Wing geometric morphometrics and microsatellite analysis provide similar discrimination of honey bee subspecies / A. Oleksa, A. Tolski // Apidologie. - 2015. - Vol. 46. - P. 49-60.

207. One-tube real-time isothermal amplification assay to identify and distinguish human immunodeficiency virus type 1 subtypes A, B, and C and circulating recombinant forms AE and AG / de Baar M. P., Timmermans E. C.,

Bakker M. [et al.] // J Clin Microbiol. - 2001. - Vol. 39. - No. 5. - P. 18951902.

208. Oya, Y. Molecular Phylogenetic Analysis of Acotylea (Platyhelminthes: Polycladida) / Y. Oya, H. Kajihara // Zoolog Sci. - 2020. - Vol. 37. - No. 3. -P. 271-279.

209. Palmer S. A. The blossoming of plant archaeogenetics / S. A. Palmer, O. Smith, R. G. Allaby // Ann. Anat. - 2012. - Vol. 194. - No. 1. - P. 146-156.

210. Pandey, A. K. Intraspecific variation in Panax assamicus Ban. (Araliaceae) populations based on internal transcribed spacer (ITS1-5.8S-ITS2) sequences of nrDNA / A. K. Pandey, M. A. Ali // Ind. J. Biotechnol. - 2012. -Vol. 11. - P. 30-38.

211. Parallel loss of plastid introns and their maturase in the genus Cuscuta / McNeal J. R., Kuehl J. V., Boore J. L. [et al.] // PLoS One. - 2009. - Vol. 4. -No. 6. - e5982.

212. PCR to predict risk of airborne disease / J. S. West, S. D. Atkins, J. Emberlin, B. D. Fitt // Trends in Microbiology. - 2008. - Vol. 16. - P. 380387.

213. Pennisi, E. Taxonomy. Wanted: A barcode for plants / E. Pennisi // Science. - 2007. - Vol. 318. - P. 190-191.

214. Pettersson, E. Generations of sequencing technologies / E. Pettersson, J. Lundeberg, A. Ahmadian // Genomics. - 2009. - Vol. 93. - No. 2. - P. 105111.

215. Phylogenetic analysis of 83 plastid genes further resolves the early diversification of eudicots / Moore M. J., Soltis P. S., Bell C. D. [et al.] // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. - 2010. - Vol. 107. - P. 4623-4628.

216. Phylogeneticanalysis of the acetyl-CoA carboxylase and 3-phosphoglycerate kinase loci in wheat and other grasses / Huang S., Sirikhachornkit A., Faris J. D. [et al.] // Plant Mol Biol. - 2002. - Vol. 48. - P. 805- 820.

217. Phylogeny of the Celastraceae inferred from 26S nuclear ribosomal DNA, phytochrome B, rbcL, atpB, and morphology / Simmons M. P., Savolainen V., Clevinger C. C. [et al.] // Mol. Phylogenet. Evol. - 2001. - Vol. 19. - P. 353-366.

218. Phytoseiid predators as potential biological control agents for Bemisia tabaci / M. Nomikou, A. Janssen, R. Schraag, M. W. Sabelis // Exp Appl Acarol. - 2001. - Vol. 25. - No. 4. - P. 271-291.

219. Phytoseiid predators suppress populations of Bemisia tabaci on cucumber plants with alternative food / M. Nomikou, A. Janssen, R. Schraag, M. W. Sabelis // Exp Appl Acarol. - 2002. - Vol. 27. - No. 1-2. - P. 57-68.

220. Pilliod, D. S. Estimating occupancy and abundance of stream amphibians using environmental DNA from filtered water samples / C. S. Goldberg, R. S. Arkle, L. P. Waits // Canadian Journal of Fisheries and Aquatic Sciences. - 2013. - Vol. 70. - P. 1123-1130.

221. Practical considerations in design of internal amplification controls for diagnostic PCR assays / Hoorfar J., Malorny B., Abdulmawjood A. [et al.] // J Clin Microbiol. - 2004. - Vol. 42. - No. 5. - P. 1863-1868.

222. Prevalence and characteristics of hepatitis C virus infection in Shenyang City, Northeast China, and prediction of HCV RNA positivity according to serum anti-HCV level: retrospective review of hospital data / Li Y., Zhao L., Geng N. [et al.] // Virol J. - 2020. - Vol. 17. - No. 1. - P. 36.

223. Protein analysis based on molecular beacon probes and biofunctionalized nanoparticles / Shi H., He X., Yang X. [et al.] // Sci China Chem. - 2010. -Vol. 53. - No. 4. - P. 704-719.

224. Pyrosequencing analysis of the oral microflora of healthy adults / Keijser B. J., Zaura E., Huse S. M. [et al.] // J Dent Res. - 2008. - Vol. 87, No. 11. - P. 1016-1020.

225. Pyrosequencing-principles and applications / Fakruddin M., Chowdhury A., Hossain M. [et al.] // Life. - 2012. - Vol. 50. - P. 65.

226. Qin, Y. Sequencing by hybridization of long targets / Y. Qin, T. M. Schneider, M. P. Brenner // PLoS One. - 2012. - Vol. 7. - No. 5. - e35819.

227. QTrim: a novel tool for the quality trimming of sequence reads generated using the Roche/454 sequencing platform / Shrestha R. K., Lubinsky B., Bansode V. B. [et al.] // BMC Bioinformatics. - 2014. - Vol. 15. - P. 33.

228. Quantifying relative fish abundance with eDNA: A promising tool for fisheries management / A. Lacoursière-Roussel, G. Côté, V. Leclerc, L. Bernatchez // Journal of Applied Ecology. - 2016. - Vol. 53. - P. 1148-1157.

229. Quantitative detection of pork in commercial meat products by TaqMan real-time PCR assay targeting the mitochondrial D-loop region / Kim M., Yoo I., Lee S. Y. [et al.] // Food Chem. - 2016. - Vol. 210. - P. 102-106.

230. Rapid degradation of longer DNA fragments enables the improved estimation of distribution and biomass using environmental DNA / Jo T., Murakami H., Masuda R. [et al.] // Molecular Ecology Resources. - 2017. -Vol. 17. - No. 6. - P. 25-33.

231. Real-time DNA sequencing from single polymerase molecules. Science / Eid J., Fehr A., Gray J. // Science. - 2009. - Vol. 323, No. 5910. - P. 133-138.

232. Recent Advances in the Molecular Beacon Technology for Live-Cell Single-Molecule Imaging / S. Mao, Y. Ying, R. Wu, A. K. Chen // Science. -2020. - Vol. 23. - No. 12. - P. 101801.

233. Redesign of PCR primers for mitochondrial cytochrome c oxidase subunit I for marine invertebrates and application in all-taxa biotic surveys / J. Geller, C. Meyer, M. Parker, H. Hawk // Mol Ecol Resour. - 2013. - Vol. 13. -No. 5. - P. 851-861.

234. Reproductive compatibility and genetic and morphometric variability among populations of the predatory mite, Amblyseius largoensis (Acari: Phytoseiidae), from Indian Ocean Islands and the Americas / Navia D., Domingos C. A., Mendonça R. S. [et al.] //. Biological Control. - 2014. - Vol. 72. - P. 17-29.

235. Review and future prospects for DNA barcoding methods in forensic palynology / Bell K. L., Burgess K. S., Okamoto K. C. [et al.] // Forensic Sci Int Genet. - 2016. - Vol. 21. - P. 110-116.

236. Saitou, N. The neighbor-joining method: A new method for reconstructing phylogenetic trees / N. Saitou, M. Nei // Molecular Biology and Evolution. - 1987. - Vol. 4. - P. 406-425.

237. Screening mammal biodiversity using DNA from leeches / Schnell I. B., Thomsen P. F., Wilkinson N. [et al.] // Current Biology. - 2012. - Vol. 22. - P. 262-263.

238. Seberg, O. How many loci does it take to DNA barcode a crocus? / O. Seberg, G. Petersen // PLoS ONE. - 2009. - Vol. 4. - e4598.

239. Seed remains of common millet from the 4th (Mongolia) and 15th (Hungary) centuries: AFLP, SSR and mtDNA sequence recoveries / Gyulai G., Humphreys M., Lagler R. [et al.] // Seed Sci. Res. - 2006. - Vol. 16. - P. 179191.

240. Selecting barcoding loci for plants: Evaluation of seven candidate loci with species-level sampling in three divergent groups of land plants / Hollingsworth M. L., Andra Clark A., Forrest L. L. [et al.] // Mol Ecol Res. -2009. - Vol. 9. - No. 2. - P. 439-457.

241. Selection of candidate DNA barcoding regions for use on land plants / Ford C. S., Ayres K. L, Toomey N. [et al.] // Bot J Linn Soc. - 2009. - Vol. 159. - P. 1-11.

242. Sequence dependent rigidity of single stranded DNA / N. L. Goddard, G. Bonnet, O. Krichevsky, A. Libchaber // Phys Rev Lett. - 2000. - Vol. 85. -No. 11. - P. 2400-2403.

243. Sequencing by hybridization (SBH): advantages, achievements, and opportunities / Drmanac R., Drmanac S., Chui G. [et al.] // Adv Biochem Eng Biotechnol. - 2002. - Vol. 77. - P. 75-101.

244. Shander, C. What can biological barcoding do for marine biology / C. Shander, E. Willassen // Mar. Biol. Resour. - 2005. - Vol. 1. - P. 79-83.

245. Shearer, T. L. DNA BARCODING: Barcoding corals: Limited by interspecific divergence, not intraspecific variation / T. L. Shearer, M. A. Coffroth // Molecular Ecology Resources. - 2008. - Vol. 8. - No. 2. - P. 247255.

246. Shendure, J. Next-generation DNA sequencing / J. Shendure, H. Ji. // Nat Biotechnol. - 2008. - Vol. 26. - No. 10. - P. 1135-1145.

247. Slatko, B. E. Overview of Next-Generation Sequencing Technologies / B. E. Slatko, A. F. Gardner // Ausubel. Curr Protoc Mol Biol. - 2018. - Vol. 122. - No. 1. - e59.

248. Soil sampling and isolation of extracellular DNA from large amount of starting material suitable for metabarcoding studies / Taberlet P., Prud'Homme S. M., Campione E. [et al.] // Molecular Ecology. - 2012. - Vol. 21. - P. 18161820.

249. Song, L. Phylogenetic Analysis of Protein Family / L. Song, S. Wu, A. Tsang // Methods Mol Biol. - 2018. - Vol. 1775. - P. 267-275.

250. Spooner, D. M. DNA barcoding will frequently fail in complicated groups: An example in wild potatoes / D. M. Spooner // Am J Bot. - 2009. -Vol. 96. - No. 6. - P. 1177-1189.

251. Status of Reseda pentagyna (Resedaceae) inferred from analysis of combined nuclear ribosomal and chloroplast sequence data / Ali M. A., Al-Hemaid F. M. A., Choudhary R. K. // Bangladesh J. Plant Taxon. - 2013. -Vol. 20. - No. 2. - P. 233-238.

252. Stichel, W. lllustrierte Bestimmungstabellen der Wanzen. II, Europa. (Hemiptera Heteroptera Europae) / W. Stichel. // Berlin-Hermsdorf. - 19591962. - Vol. 4. - P. 225-838.

253. Stoeckle, M. Taxonomy, DNA, and the bar code of life / M. Stoeckle // Bioscience. - 2003. - Vol. 53. - No. 4. - P. 796-797.

254. Structure and Genetic Variability of the Oceanic Whitetip Shark, Carcharhinus longimanus, Determined Using Mitochondrial DNA / Camargo

S. M., Coelho R., Chapman D. [et al.] // PLoS One. - 2016. - Vol. 11. - No. 5.

- e0155623.

255. Structure and genetic variation of the mitochondrial control region in the honey bee Apis melHfera / Gonçalves R., Freitas A.I., Jesus J. [et al.] // Apidologie. - 2015. - Vol. 46. - P. 515-526.

256. Studies on monitoring and tracking genetic resources: an executive summary / Garrity G. M., Thompson L. M., Ussery D. W. [et al.] // Stand Genomic Sci. - 2009. - Vol.1. - No. 1. - P. 78-86.

257. Study of the microbiological composition of dairy products and Mayonnaise using dna barcoding and metabarcoding / Syromyatnikov M. Yu., Kokina A. V., Savinkova O. V. [et al.] // Foods and Raw materials. — 2018.

— №1. URL: https://cyberleninka.ru/article/n7study-of-the-microbiological-composition-of-dairy-products-and-mayonnaise-using-dna-barcoding-and-metabarcoding (дата обращения: 12.04.2021).

258. Subramaniam, S. Molecular systematics of Indian Crotalaria (Fabaceae) based on ITS sequences of nuclear ribosomal DNA / S. Subramaniam, A. Pandey, R. Geeta, M. Mort // Plant Systematics and Evolution. - 2013. - Vol. 299. - P. 1089-1106.

259. Sukhikh, I. Molecular phylogenetic analysis of subfamilial placement of Haplotropis Saussure, 1888 (Orthoptera: Pamphagidae) based on mitochondrial and nuclear DNA markers / I. Sukhikh, A. Blinov, A. Bugrov // Zootaxa. - 2019. - Vol. 4551. - No. 5. - P. 530-540.

260. Surveillance of fish species composition using environmental DNA / Minamoto T., Yamanaka H., Takahara T. [et al.] // Limnology. - 2012. - Vol. 13. - P. 193-197.

261. Sushi barcoding in the UK: another kettle of fish / Vandamme S. G., Griffiths A. M., Taylor S. A. [et al.] // PeerJ. - 2016. - Vol. 4. - e1891.

262. Syromyatnikov, M. Y. A Molecular Method for the Identification of Honey Bee Subspecies Used by Beekeepers in Russia / M. Y. Syromyatnikov,

A. V. Borodachev, A. V. Kokina, V. N. Popov // Insects. — 2018. — Vol. 9, No. 1. — e10.

263. Tamura, K. Prospects for inferring very large phylogenies by using the neighbor-joining method / K. Tamura, M. Nei, S. Kumar // PNAS. - 2004. -Vol. 101. - P. 11030-11035.

264. Ten species in one: DNA barcoding reveals cryptic species in the neotropical skipper butterfly Astraptes fulgerator / Hebert P. D., Penton E. H., Burns J. M. [et al.] // Proc Natl Acad Sci U S A. - 2004. - Vol. 101. - No. 41. - P. 14812- 14817.

265. Ten years of next-generation sequencing technology / E. L. van Dijk, H. Auger, Y. Jaszczyszyn, C. Thermes // Trends Genet. - 2014. - Vol. 30. - No. 9. - p. 418-426.

266. Testing the Efficacy of DNA Barcodes for Identifying the Vascular Plants of Canada / Braukmann T. W, Kuzmina M. L, Sills J. [et al.] // PLoS One. - 2017. - Vol. 12. - No. 1. - e0169515.

267. The challenges of sequencing by synthesis / Fuller C. W., Middendorf L. R., Benner S. A. [et al.] // Nat Biotechnol. - 2009. - Vol. 27. - No. 11. -P.1013-1023.

268. The changing epitome of species identification - DNA barcoding / Ajmal A. M., Gyulai G., Hidvegi N. [et al.] // Saudi J Biol Sci. - 2014. - Vol. 21. -No. 3. - P. 204-231.

269. The complete external transcribed spacer of 185-265' rDNA: amplification and phylogenetic utility at low taxonomic levels in Asteraceae and closely allied families / Linder C. R., Goertzen L. R., Heuval B. V. [et al.] // Mol. Phylogenet. Evol. - 2000. - Vol. 14. - P. 285-303.

270. The Complexity of Mitochondrial Complex IV: An Update of Cytochrome c Oxidase Biogenesis in Plants / Mansilla N., Racca S., Gras D. E. [et al.] // Int J Mol Sci. - 2018. - Vol. 19. - No. 3. - P. 662.

271. The ecologist's field guide to sequence-based identification of biodiversity / Creer S., Deiner K., Frey S. [et al.] // Methods in Ecology and Evolution. - 2016. - Vol. 7. - P. 1008-1018.

272. The efficiency of universal mitochondrial DNA barcodes for species discrimination of Pomacea canaliculata and Pomacea maculate / A. Kannan, S. Rama Rao, S. Ratnayeke, Y. Y. Yow // Peer J. - 2020. - Vol. 8. - e8755.

273. The European Nucleotide Archive in 2017 / Silvester N., Alako B., Amid C. [et al.] // Nucleic Acids Res. - 2018. - Vol. 46. - P. 36-40.

274. The Linear Angiosperm Phylogeny Group (LAPG) III: a linear sequence of the families in APG II / Haston E., Richardson J. E., Stevens P. F. [et al.] // Bot. J. Linn. Soc. - 2009. - Vol. 161. - P. 128-131.

275. The phylogenetic approach for viral infectious disease evolution and epidemiology: An updating review // Ciccozzi M., Lai A., Zehender G. [et al.] // J Med Virol. - 2019. - Vol. 91. - No. 10. - P. 1707-1724.

276. The puzzle of DNA sequences of Phytoseiidae (Acari: Mesostigmata) in the public GenBank database / Tixier M. S., Hernandes F. A., Guichou S., Kreiter S. // Invertebrate Systematics. - 2011. - Vol. 25. - P. 389-406.

277. The real-time polymerase chain reaction / Kubista M., Andrade J. M., Bengtsson M. [et al.] // Mol Aspects Med. - 2006. - Vol. 27. - No. 2-3. - P. 95-125.

278. The screening and identification of DNA barcode sequences for Rehmannia / Duan H., Wang W., Zeng Y. [et al.] // Sci Rep. - 2019. - Vol. 9. - No. 1. - P. 17295.

279. Thiacloprid exposure perturbs the gut microbiota and reduces the survival status in honeybees / Liu Y. J., Qiao N. H., Diao Q. Y. [et al.] // J Hazard Mater. - 2020. - Vol. 389. - е121818.

280. Tixier, M. S. Morphological variation in the biological control agent Neoseiulus californicus (Acari: Phytoseiidae): Consequences for diagnostic reliability and synonymies / M. S. Tixier, S. Guichou, S. Kreiter // Invertebrate Systematics. - 2008. - Vol. 22. - P. 453-469.

281. Tracking earthworm communities from soil DNA / Bienert F., De Danieli S., Miquel C. [et al.] // Mol Ecol. - 2012. - Vol. 21. - No. 8. - P. 20172030.

282. Tsourkas, A. Structure-function relationships of shared-stem and conventional molecular beacons / A. Tsourkas, M. A. Behlke, G. Bao // Nucleic Acids Res. - 2002. - Vol. 30. - No. 19. - P. 4208-4215.

283. Turner, C. R. Fish environmental DNA is more concentrated in aquatic sediments than surface water / C. R. Turner, K. L. Uy, R. C. Everhart // Biological Conservation. - 2015. - Vol. 183. - P. 93-102.

284. Twinkle, T. DNA barcoding and Taxonomic account on some selected species of subfamily Plusiinae (Lepidoptera: Noctuidae) from India / T. Twinkle, P. R Shashank, P. C. Chattopadhyay // Zootaxa. - 2020 - Vol. 8. -No. 4. - P. 269-275.

285. Use of DNA barcodes to identify flowering plants / Kress J. W., Wurdack J. K., Zimmer E. A. [et al.] // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. - 2005. -Vol. 102. - P. 8369-8374.

286. Using DNA metabarcoding to identify the floral composition of honey: A new tool for investigating honey bee foraging preferences / Hawkins J., de Vere N., Griffith A. [et al.] // PLoS ONE. - 2015. - Vol. 10. - e0134735.

287. Using DNA metabarcoding to investigate honey bee foraging reveals limited flower use despite high floral availability / De Vere N., Jones L. E., Gilmore T. [et al.] // Scientific Reports. - 2017. - Vol. 7. - P. 42838.

288. Using plastid genome-scale data to resolve enigmatic relationships among basal angiosperms / M. J. Moore, C. D. Bell, P. S. Soltis, D. E. Soltis // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. - 2007. - Vol. 104. - P. 19363-19368/

289. Wallace, D. C. Why do we still have a maternally inherited mitochondrial DNA? Insights from evolutionary medicine / D. C. Wallace // Annu Rev Biochem. - 2007. - Vol. 76. - P. 781-821.

290. Weintraub, P. G. Integrated control of pests in tropical and subtropical sweet pepper production / P. G. Weintraub // Pest Manag Sci. - 2007. - Vol. 63. - P. 753-760.

291. Wiemers, M. Does the DNA barcoding gap exist? - a case study in blue butterflies (Lepidoptera: Lycaenidae) / M. Wiemers, K. Fiedler // Front Zool. -2007. - Vol. 4. - e8.

292. Will, K. W. Myth of the molecule: DNA barcodes for species cannot replace morphology for identification and classification / K. W. Will, D. Rubinoff // Cladistics. - 2004. - Vol. 20. - No. 1. - P. 47-55.

293. Wilson, E. O. The encyclopedia of life / E. O. Wilson // Trends Ecol Evol. - 2003. - Vol. 18. - P. 77-80.

294. Young, N. D. Purifying selection detected in the plastid gene matK and flanking ribozyme regions within a group II intron of nonphotosynthetic plants / N. D. Young, C. W. DePamphilis // Molecular biology and evolution. - 2000. - Vol. 17. - No. 12. - P. 1933-1940.

295. Zoschke, R. Chloroplast Translation: Structural and Functional Organization, Operational Control, and Regulation / R. Zoschke, R. Bock // Plant Cell. - 2018. - Vol. 30. - No. 4. - P. 745-770.

ПРИЛОЖЕНИЕ А 1. Eurygaster integriceps Puton, 1881 - Вредная черепашка

Класс: Insecta - Насекомые

Отряд: Hemiptera - Полужесткокрылые

Подотряд: Heteroptera - Клопы

Семейство: Scutelleridae - Щитники-черепашки

Используемые генетические маркеры

Цитохромоскидаза субъединица 1

Наиболее оптимальные праймеры для проведения баркодинга

Обратный LepRl - TAAACTTCTGGATGTCCAAAAAATCA Прямой mHemF - GCATTYCCACGAATAAATAAYATAAG Последовательность генов Genbank

AACGCTATATTTCCTATTCGGAATATGAGCCGGAATAGTAGGAACCGCCATAAGATGAA

TCATCCGAATTGAATTAGGACAGCCCGGAACATTTATTGGAGATGACCAAATTTACAAT

GTTATTGTCACTGCCCACGCATTCGTAATAATTTTCTTCATAGTTATACCTATTATAAT KR105371 1

TGGAGGATTTGGAAACTGACTCGTACCTTTAATAATTGGAGCACCAGACATAGCATTCC '

CTCGAATAAATAATATAAGATTCTGATTATTACCCCCTTCACTAACCCTACTACTAGTA

AGTAGTATAGTAGAAACAGGGGTAGGAACTGGATGAACAGTATACCCCCCTCTATCGAG

AAATTTAGCCCATAGAGGGGCATCTGTAGACCTGGCTATCTTTTCATTACATTTAGCAG

GTGTTTCATCAATCTTAGGAGCTGTAAACTTTATCTCTACAATCATTAACATACGACCC

GTTGGTATAACACCTGAACGGATCCCACTATTCGTCTGATCAGTTGGAATTACTGCATT

ATTACTGCTACTATCACTACCAGTACTAGCAGGAGCTATTACTATACTACTTACTGACC

GTAACTTCAACACATCATTCTTTGACCCTTCAGGAGGGGGAGATCCTATTCTTTACCAA

CATTTATTC

Выровненная последовательность

AACGCTATATTTCCTATTCGGAATATGAGCCGGAATAGTAGGAACCGCCATAAGATGAA TCATCCGAATTGAATTAGGACAGCCCGGAACATTTATTGGAGATGACCAAATTTACAAT GTTATTGTCACTGCCCACGCATTCGTAATAATTTTCTTCATAGTTATACCTATTATAAT TGGAGGATTTGGAAACTGACTCGTACCTTTAATAATTGGAGCACCAGACATAGCATTCC CTCGAATAAATAATATAAGATTCTGATTATTACCCCCTTCACTAACCCTACTACTAGTA AGTAGTATAGTAGAAACAGGGGTAGGAACTGGATGAACAGTATACCCCCCTCTATCGAG AAATTTAGCCCATAGAGGGGCATCTGTAGACCTGGCTATCTTTTCATTACATTTAGCAG GTGTTTCAT CAATCTTAGGAGC TGTAAACTTTATCTCTACAAT CATTAACATACGACCC GTTGGTATAACACCTGAACGGATCCCACTATTCGTCTGATCAGTTGGAATTACTGCATT ATTACTGCTACTATCACTACCAGTACTAGCAGGAGCTATTACTATACTACTTACTGACC GTAACTTCAACACATCATTCTTTGACCCTTCAGGAGGGGGAGATCCTATTCTTTACCAA CATTTATTC

2. Eurygaster testudinaria (Geoffroy, 1785) - Влаголюбивая черепашка Класс: Insecta - Насекомые Отряд: Hemiptera - Полужесткокрылые Подотряд: Heteroptera - Клопы Семейство: Scutelleridae - Щитники-черепашки Используемые генетические маркеры Цитохромоскидаза субъединица 1

Наиболее оптимальные праймеры для проведения баркодинга

Прямой LepFl - GCATTYCCACGAATAAATAAYATAAG Обратный LepRl - TAAACTTCTGGATGTCCAAAAAATCA Последовательность генов Genbank

AACACTATACTTCCTATTCGGAATATGAGCCGGAATAGTAGGGACCGCCATAAGATGAA TCATCCGAATTGAACTAGGACAACCCGGAACATTTATTGGAGATGACCAAATTTATAAT GTTATTGTCACTGCCCACGCATTCGTAATAATTTTCTTTATAGTCATACCTATTATAAT TGGAGGATTTGGGAACTGACTAGTACCTTTAATAATTGGAGCACCAGACATAGCATTCC CTCGAATAAATAACATAAGATTCTGATTATTACCACCCTCACTAACCCTGTTACTAGTA AGTAGTATAGTAGAAACAGGGGTAGGAACTGGATGAACAGTATACCCTCCTCTATCGAG AAATTTAGCCCATAGAGGAGCATCTGTAGACTTAGCTATCTTTTCATTACATTTAGCAG GTGTTTCCTCAATCTTAGGAGCCGTAAACTTTATCTCTACAATCATTAACATACGACCC ATTGGTATAACACCTGAACGAATCCCACTATTCGTCTGATCAGTTGGAATTACCGCATT ATTACTACTACTATCATTGCCAGTACTAGCCGGAGCTATTACTATATTACTTACTGACC GTAACTTCAACACATCATTCTTCGACCCTTCAGGAGGAGGAGATCCCATTCTTTACCAA CATCTATTT

присвоен

Номер в системе Genbank NCBI пока ещё не

Выровненная последовательность

AACACTATACTTCCTATTCGGAATATGAGCCGGAATAGTAGGGACCGCCATAAGATGAA TCATCCGAATTGAACTAGGACAACCCGGAACATTTATTGGAGATGACCAAATTTATAAT GTTATTGTCACTGCCCACGCATTCGTAATAATTTTCTTTATAGTCATACCTATTATAAT TGGAGGATTTGGGAACTGACTAGTACCTTTAATAATTGGAGCACCAGACATAGCATTCC CTCGAATAAATAACATAAGATTCTGATTATTACCACCCTCACTAACCCTGTTACTAGTA AGTAGTATAGTAGAAACAGGGGTAGGAACTGGATGAACAGTATACCCTCCTCTATCGAG AAATTTAGCCCATAGAGGAGCATCTGTAGACTTAGCTATCTTTTCATTACATTTAGCAG GTGTTTCCTCAATCTTAGGAGCCGTAAACTTTATCTCTACAATCATTAACATACGACCC ATTGGTATAACACCTGAACGAATCCCACTATTCGTCTGATCAGTTGGAATTACCGCATT ATTACTACTACTATCATTGCCAGTACTAGCCGGAGCTATTACTATATTACTTACTGACC GTAACTTCAACACATCATTCTTCGACCCTTCAGGAGGAGGAGATCCCATTCTTTACCAA CATCTATTT

3. Eurygaster maura (Linnaeus, 1758) - Черепашка маврская Класс: Insecta - Насекомые Отряд: Hemiptera - Полужесткокрылые Подотряд: Heteroptera - Клопы Семейство: Scutelleridae - Щитники-черепашки Используемые генетические маркеры Цитохромоскидаза субъединица 1

Наиболее оптимальные праймеры для проведения баркодинга

Прямой LepFl - GCATTYCCACGAATAAATAAYATAAG Обратный LepRl - TAAACTTCTGGATGTCCAAAAAATCA Последовательность генов Genbank

AACACTATACTTCCTATTCGGAATATGAGCCGGAATAGTAGGGACCGCCATAAGATGAA TCATCCGAATTGAACTAGGACAACCCGGAACATTTATTGGAGATGACCAAATTTATAAT GTTATTGTCACTGCCCACGCATTCGTAATAATTTTCTTTATAGTCATACCTATTATAAT TGGAGGATTTGGGAACTGACTAGTACCTTTAATAATTGGAGCACCAGACATAGCATTCC CTCGAATAAATAACATAAGATTCTGATTATTACCACCCTCACTAACCCTGTTACTAGTA AGTAGTATAGTAGAAACAGGGGTAGGAACTGGATGAACAGTATACCCTCCTCTATCGAG AAATTTAGCCCATAGAGGAGCATCTGTAGACTTAGCTATCTTTTCATTACATTTAGCAG GTGTTTCCTCAATCTTAGGAGCCGTAAACTTTATCTCTACAATCATTAACATACGACCC ATTGGTATAACACCTGAACGAATCCCACTATTCGTCTGATCAGTTGGAATTACCGCATT ATTACTACTACTATCATTGCCAGTACTAGCCGGAGCTATTACTATATTACTTACTGACC GTAACTTCAACACATCATTCTTCGACCCTTCAGGAGGAGGAGATCCCATTCTTTACCAA CATCTATTT

присвоен

Выровненная последовательность

AACACTATACTTCCTATTCGGAATATGAGCCGGAATAGTAGGGACCGCCATAAGATGAA TCATCCGAATTGAACTAGGACAACCCGGAACATTTATTGGAGATGACCAAATTTATAAT GTTATTGTCACTGCCCACGCATTCGTAATAATTTTCTTTATAGTCATACCTATTATAAT TGGAGGATTTGGGAACTGACTAGTACCTTTAATAATTGGAGCACCAGACATAGCATTCC CTCGAATAAATAACATAAGATTCTGATTATTACCACCCTCACTAACCCTGTTACTAGTA AGTAGTATAGTAGAAACAGGGGTAGGAACTGGATGAACAGTATACCCTCCTCTATCGAG AAATTTAGCCCATAGAGGAGCATCTGTAGACTTAGCTATCTTTTCATTACATTTAGCAG GTGTTTCCTCAATCTTAGGAGCCGTAAACTTTATCTCTACAATCATTAACATACGACCC ATTGGTATAACACCTGAACGAATCCCACTATTCGTCTGATCAGTTGGAATTACCGCATT ATTACTACTACTATCATTGCCAGTACTAGCCGGAGCTATTACTATATTACTTACTGACC GTAACTTCAACACATCATTCTTCGACCCTTCAGGAGGAGGAGATCCCATTCTTTACCAA CATCTATTT

Номер в системе Genbank NCBI пока ещё не

4. Eurygaster dUaticoШs (БоИги, 1860) - Черепашка широкоспинная Класс: 1пвеС:а - Насекомые Отряд: Иеш1р1ега - Полужесткокрылые Подотряд: Ие1егор1ега - Клопы Семейство: Бс^еПепёае - Щитники-черепашки Используемые генетические маркеры Цитохромоскидаза субъединица 1

Наиболее оптимальные праймеры для проведения баркодинга

Прямой LepF2_t - татАлллсалсаасслатАлтслтллкалтлтуаа

Обратный LepR1 - TAAACTTCTGGATGTCCAAAAAATCA Последовательность генов СепЬапк

ОССАТААОАТОААТСАТССОААТТОААСТАООАСААСССООААСАТТТАТТООАОАТОА ССАААТТТАТААТОТТАТТОТСАСТОСССАСОСАТТСОТААТААТТТТСТТТАТАОТСА ТАССТАТТАТААТТООАООАТТТОООААСТОАСТАОТАССТТТААТААТТООАОСАССА ОАСАТАОСАТТСССТСОААТАААТААСАТААОАТТСТОАТТАТТАССАСССТСАСТААС ССТОТТАСТАОТААОТАОТАТАОТАОАААСАООООТАООААСТООАТОААСАОТАТАСС СТССТСТАТСОАОАААТТТАОСССАТАОАООАОСАТСТОТАОАСТТАОСТАТСТТТТСА ТТАСАТТТООСАООТОТТТССТСААТСТТАООАОССОТАААСТТТАТСТСТАСААТСАТ ТААСАТАСОАСССАТТООТАТААСАССТОААСОААТСССАСТАТТСОТСТОАТСАОТТО ОААТТАССОСАТТАТТАСТАСТАСТАТСАТ

присвоен

Номер в системе Genbank NCBI пока ещё не

Выровненная последовательность

ОССАТААОАТОААТСАТССОААТТОААСТАООАСААСССООААСАТТТАТТООАОАТОА ССАААТТТАТААТОТТАТТОТСАСТОСССАСОСАТТСОТААТААТТТТСТТТАТАОТСА ТАССТАТТАТААТТООАООАТТТОООААСТОАСТАОТАССТТТААТААТТООАОСАССА ОАСАТАОСАТТСССТСОААТАААТААСАТААОАТТСТОАТТАТТАССАСССТСАСТААС ССТОТТАСТАОТААОТАОТАТАОТАОАААСАООООТАООААСТООАТОААСАОТАТАСС СТССТСТАТСОАОАААТТТАОСССАТАОАООАОСАТСТОТАОАСТТАОСТАТСТТТТСА ТТАСАТТТООСАООТОТТТССТСААТСТТАООАОССОТАААСТТТАТСТСТАСААТСАТ ТААСАТАСОАСССАТТООТАТААСАССТОААСОААТСССАСТАТТСОТСТОАТСАОТТО ОААТТАССОСАТТАТТАСТАСТАСТАТСАТ

5. Amblyseius swirskii (Athias-Henriot, 1962) Класс: Arachnida - Паукообразные Отряд: Mesostigmata Семейство: Phytoseiidae Используемые генетические маркеры

Внутренний транскрибируемый спейсер; 28S, 5.8S и 18S рибосомальная РНК Наиболее оптимальные праймеры для проведения баркодинга

Прямой ITS1 - TCCGTAGGTGAACCTGCGG Обратный ITS4 - TCCTCCGCTTATTGATATGC

Последовательность генов Genbank

AACCTGCGGAAGGATCATTACTGATTTGAGCCACTATCTACTCCCTCTCATAGTGGTGT

TGTCTGATGTTCTATCTTAGACTCTTACATGCCAGCGTGCTGGCTGTTTGCTGTCTTCG

AGAGACATGAAAAACAACCTGTATTAGTTTACGTGGTACGTCTCCTCCGTCCTTTGGCA KX348008 1

CACCGCTCGATTGTGGTGTTACCGTCCTTTGGTTACGGGAAGGCGTATGCGCGTAAGTC '

GGTAACCATTCCGACAACCTTTTCACTTCCTTTGGAAGTAAGTTGTGCTATCGAGAAGA

AAAAAACCAAGACTCAATATGGGGGATCACTTAGTCCTTAAATCGATGAAAAACATAGT

AATTTGTGGAAATTGATGTGAGTTGTGAAATTTTGTGAGCATTGTGTTTTTGAATGAAA

ATTTCAGCACGGACACTTCTGTATCTGTGCTACATTTGTTTCAGTATATAAACCGTATC

ATACGTATTTACCTTTGCTGCAGCCCTCGTCGGTATCGCCATGCAATGGTATAAATTCT

CTTTGGTCACAAGAGTGATACCAAAACAAACCATTATGACGTGTATCTGAAATCAAGTG

TGACGACCCGCTGAACTTAA

Выровненная последовательность

AACCTGCGGAAGGATCATTACTGATTTGAGCCACTATCTACTCCCTCTCATAGTGGTGT TGTCTGATGTTCTATCTTAGACTCTTACATGCCAGCGTGCTGGCTGTTTGCTGTCTTCG AGAGACATGAAAAACAACCTGTATTAGTTTACGTGGTACGTCTCCTCCGTCCTTTGGCA CACCGCTCGATTGTGGTGTTACCGTCCTTTGGTTACGGGAAGGCGTATGCGCGTAAGTC GGTAACCATTCCGACAACCTTTTCACTTCCTTTGGAAGTAAGTTGTGCTATCGAGAAGA AAAAAACCAAGACTCAATATGGGGGATCACTTAGTCCTTAAATCGATGAAAAACATAGT AATTTGTGGAAATTGATGTGAGTTGTGAAATTTTGTGAGCATTGTGTTTTTGAATGAAA ATTTCAGCACGGACACTTCTGTATCTGTGCTACATTTGTTTCAGTATATAAACCGTATC ATACGTATTTACCTTTGCTGCAGCCCTCGTCGGTATCGCCATGCAATGGTATAAATTCT CTTTGGTCACAAGAGTGATACCAAAACAAACCATTATGACGTGTATCTGAAATCAAGTG TGACGACCCGCTGAACTTAA

6. Amblyseius cucumeris (О^ешапэ, 1930) Класс: лгасЬшёа - Паукообразные Отряд: Мевов1:1§ша1а Семейство: РИ^оБеШае Используемые генетические маркеры

Внутренний транскрибируемый спейсер; 28S, 5.8S и 18S рибосомальная РНК Наиболее оптимальные праймеры для проведения баркодинга

Прямой ITS1 - TCCGTAGGTGAACCTGCGG Обратный ITS4 - TCCTCCGCTTATTGATATGC

Последовательность генов СепЬапк

ТСТОТАОТОТОААССТОСООААООАТСАТТАСТОАТТААААТССАТТСССТАСТТСТОТ КХ348006 1

АООТОАОТООТСОАТОТАТОАТОСАСТАТСТТАОАСТСССАСАОСССАТТТСОСТОАСТ '

ОТТТОТТОТСТТС ОАОАООСАТ ОТ ОАСАААСТТОТАТТТСАААТАСОТАОТ ОС ОАСТСО

ТТТООТССОТООСАСАСТОСТСААТТОТООТОТТТССОТССАСАООААСОООСОАООСО

ТОАОТСООТААССАТТССОАСААСАССТТСАСТТСТОТААОААОТСОТТТОТОСТАТТО

АОААОАААААААТСААОАСТСААТАТОООООАТСАСТТАОТССТТАААТСОАТОААААА

САТААТААТТТОТООАААТТОАТОТОАОТТОТОАААТТТТОТОАОСАТТОТОТТТТТОА

АТОААААТТТСАОСАТООАСАСТТСТОТАТСТОТОСТАСАТТТОТТТСАОТАТАТАААС

СОТАТСАТАСОТАТТТАССТТТОСТОСАОСССТСОТСООСАССОСТАТОСААТООТАТА

ААТТСТСТТТООТСАСААОАОТОАТАССААААССАААССАТТАТОАСОТОТАТСТОААА

ТСААОТОТОАСОАСССОСТОААСТТААОСАТАТ

Выровненная последовательность

ТСТОТАОТОТОААССТОСООААООАТСАТТАСТОАТТААААТССАТТСССТАСТТСТОТ АООТОАОТООТСОАТОТАТОАТОСАСТАТСТТАОАСТСССАСАОСССАТТТСОСТОАСТ ОТТТОТТОТСТТСОАОАООСАТОТ ОАСАААСТ ТОТАТТ ТСАААТАСОТАОТОС ОАСТСО ТТТООТССОТООСАСАСТОСТСААТТОТООТОТТТССОТССАСАООААСОООСОАООСО ТОАОТСООТААССАТТССОАСААСАССТТСАСТТСТОТААОААОТСОТТТОТОСТАТТО АОААОАААААААТСААОАСТСААТАТОООООАТСАСТТАОТССТТАААТСОАТОААААА САТААТААТ ТТОТ ООАААТ ТОАТОТОАОТТОТ ОАААТТТТОТОАОСАТТОТОТТТТТОА АТОААААТТТСАОСАТООАСАСТТСТОТАТСТОТОСТАСАТТТОТТТСАОТАТАТАААС СОТАТСАТАСОТАТТТАССТТТОСТОСАОСССТСОТСООСАССОСТАТОСААТООТАТА ААТТСТСТТТООТСАСААОАОТ ОАТАССААААССАААССАТ ТАТОАСОТОТАТСТ ОААА ТСААОТОТОАСОАСССОСТОААСТТААОСАТАТ

7. Amblyseius barkeri (Hughes, 1948) Класс: Arachnida - Паукообразные Отряд: Mesostigmata Семейство: Phytoseiidae Используемые генетические маркеры

Внутренний транскрибируемый спейсер; 28S, 5.8S и 18S рибосомальная РНК Наиболее оптимальные праймеры для проведения баркодинга

Прямой ITS1 - TCCGTAGGTGAACCTGCGG Обратный ITS4 - TCCTCCGCTTATTGATATGC

Последовательность генов Genbank

TCCGTAGGGTGAACCTGCGGAAGGATCATTACTGATTAAAAATCCATTCACTCCATCAC KX348007 1

ATGGAAGAATGGTGCAAGTATGATGTTCTAACTTGGATTCAAGCATTTCGGTTCGCTGA '

AATCTTGCTATCTGGGAGAGACATGTAAAATATATGTATTTGAAATACGTAGTGCGACT

CACTTGTTCTGTGGCACACCGCTTGATTGCGGTGTTACCGTCCACGGGGTACGGGTGAG

GCGTGAGTCGGTAATCATTCCGACAATATTTCCACTTCAACTTGAAGTTGTTTTGTGCT

ATAGAGAAGAAAAAAATCAAGACTCAATATGGGGGATCACTTAGTCCTTAAATCGATGA

AAAACATAGTAATTTGTGGAAATTGATGTGAGTTGTGAAATTTTGTGAGCATTGTGTTT

TTGAATGAAAATTTCAGCATGGACACTTCTGTATCTGTGCTACATTTGTTTCAGTATAT

AAACCGTATCATAAGTATTTACCTTTGCTGCAGCCCTCGTCGGCAACGCTATGCAATGG

TATAAATTCTCTTTGGTCACAGGTGTGATACCAATCCAAACCATTATGACGTGTATCTG

AAATCAAGTGTGACGACCCGCTGAACTTAAGCATATCAATAAGCGGAGG

Выровненная последовательность

TCCGTAGGGTGAACCTGCGGAAGGATCATTACTGATTAAAAATCCATTCACTCCATCAC ATGGAAGAATGGTGCAAGTATGATGTTCTAACTTGGATTCAAGCATTTCGGTTCGCTGA AATCTTGCTATCTGGGAGAGACATGTAAAATATATGTATTTGAAATACGTAGTGCGACT CACTTGTTCTGTGGCACACCGCTTGATTGCGGTGTTACCGTCCACGGGGTACGGGTGAG GCGTGAGTCGGTAATCATTCCGACAATATTTCCACTTCAACTTGAAGTTGTTTTGTGCT ATAGAGAAGAAAAAAATCAAGACTCAATATGGGGGATCACTTAGTCCTTAAATCGATGA AAAACATAGTAAT TTGT GGAAATT GATGTGAGTTGT GAAAT TTTGTGAGCATTGTGTTT TTGAATGAAAATTTCAGCATGGACACTTCTGTATCTGTGCTACATTTGTTTCAGTATAT AAACCGTATCATAAGTATTTACCTTTGCTGCAGCCCTCGTCGGCAACGCTATGCAATGG TATAAATTCTCTTTGGTCACAGGTGTGATACCAATCCAAACCATTATGACGTGTATCTG AAATCAAGTGTGACGACCCGCTGAACTTAAGCATATCAATAAGCGGAGG

г

8. Apis mellifera mellifera (Linnaeus, 1758) - Пчела среднерусская Класс: Insecta - Насекомые Отряд: Hymenoptera - Перепончатокрылые Семейство: Apidae - Пчелы настоящие Используемые генетические маркеры Цитохромоскидаза субъединица 1

Наиболее оптимальные праймеры для проведения баркодинга

Прямой LepFl - GCATTYCCACGAATAAATAAYATAAG Обратный LepRl - TAAACTTCTGGATGTCCAAAAAATCA

№ Последовательность генов

1 ATTATTCGAATAGAATTAAGATCCCCAGGATCATGAAT TAACAATGATCAAATTTATAAT ACAATTGTTACTAGTCATGCATTCCTAATAATTTTTTTTATAGTTATACCATTTTTAATT GGAGGATTTGGAAATTGGCTTATTCCTTTAATACTAGGATCACCTGATATAGCATTCCCC CGAATAAATAATATTAGATTTTGATTACTTCCTCCCTCATTATTTATACTTTTATTAAGA AATTTATTTTATCCAAGACCAGGAACTGGATGAACAGTATATCCACCATTATCAGCATAT TTATATCATTCTTCACCTTCAGTAGATTTTGCAATTTTTTCTCTTCATATATCAGGAATT TCATCAATTATAGGATCATTAAACTTAATAGTTACAATTATAATAATAAAAAATTTTTCT AT AAATT AT GACCAAATT

2 AT TAT TC GAATAGAATTAAGAT CCCCAGGATCAT GAATTAACAAT GATCAAAT TTATAAT KY271938 ACAATTGTTACTAGTCATGCATTCCTAATAATTTTTTTTATAGTTATACCATTTTTAATT GGAGGATTTGGAAATTGGCTTATTCCTTTAATACTAGGATCACCTGATATAGCATTCCCC CGAATAAATAATATTAGATTTTGATTACTTCCTCCCTCATTATTTATACTTTTATTAAGA

AATTTATTTTATCCAAGACCAGGAAC TGGATGAACAGTATATCCACCATTATCAGCATAT TTATATCATTCTTCACCTTCAGTAGATTTTGCAATTTTTTCTCTTCATATATCAGGAATT TCATCAATTATAGGATCATTAAACTTAATAGTTACAATTATAATAATAAAAAATTTTTCT AT AAATT AT GACCAAATT

3 AT TAT TC GAATAGAATTAAGAT CCCCAGGATCAT GAATTAACAAT GATCAAAT TTATAAT KY271937 ACAATTGTTACTAGTCATGCATTCCTAATAATTTTTTTTATAGTTATACCATTTTTAATT GGAGGATTTGGAAATTGGCTTATTCCTTTAATACTAGGATCACCTGATATAGCATTCCCC CGAATAAATAATATTAGATTTTGATTACTTCCTCCCTCATTATTTATACTTTTATTAAGA AAT TTATTTTATCCAAGAC CAGGAAC TGGATGAACAGTATATCCACCATTATCAGCATAT TTATATCATTCTTCACCTTCAGTAGATTTTGCAATTTTTTCTCTTCATATATCAGGAATT TCATCAATTATAGGATCATTAAACTTAATAGTTACAATTATAATAATAAAAAATTTTTCT AT AAATT AT GACCAAATT

4 AT TAT TC GAATAGAATTAAGAT CCCCAGGATCAT GAATTAACAAT GATCAAAT TTATAAT KY271936 ACAATTGTTACTAGTCATGCATTCCTAATAATTTTTTTTATAGTTATACCATTTTTAATT GGAGGATTTGGAAATTGGCTTATTCCTTTAATACTAGGATCACCTGATATAGCATTCCCC CGAATAAATAATATTAGATTTTGATTACTTCCTCCCTCATTATTTATACTTTTATTAAGA AAT TTATTTTATCCAAGAC CAGGAAC TGGATGAACAGTATATCCACCATTATCAGCATAT TTATATCATTCTTCACCTTCAGTAGATTTTGCAATTTTTTCTCTTCATATATCAGGAATT TCATCAATTATAGGATCATTAAACTTAATAGTTACAATTATAATAATAAAAAATTTTTCT AT AAATT AT GACCAAATT

Genbank

KY271939

5 ATTATTAGAATAGAATTAAGATCCCCAGGATCATGAATTAACAATGATCAAATTTATAAT KY271935 ACAATTGTTACTAGTCATGCATTCCTAATAATTTTTTTTATAGTTATACCATTTTTAATT GGAGGATTTGGAAATTGGCTTATTCCTTTAATACTAGGATCACCTGATATAGCATTCCCC CGAATAAATAATATTAGATTTTGATTACTTCCTCCCTCATTATTTATACTTTTATTAAGA AATTTATTTTATCCAAGACCAGGAAC TGGATGAACAGTATATCCACCATTATCAGCATAT TTATATCATTCTTCACCTTCAGTAGATTTTGCAATTTTTTCTCTTCATATATCAGGAATT TCATCAATTATAGGATCATTAAACTTAATAGTTACTTTTATAATAATAAAAAATTTTTCT AT AAATT AT GACCAAATT

б AT TAT TC GAATAGAATTAAGAT CCCCAGGATCAT GAATTAACAAT GATCAAAT TTATAAT KY271934 ACAATTGTTACTAGTCATGCATTCCTAATAATTTTTTTTATAGTTATACCATTTTTAATT GGAGGATTTGGAAATTGGCTTATTCCTTTAATACTAGGATCACCTGATATAGCATTCCCC CGAATAAATAATATTAGATTTTGATTACTTCCTCCCTCATTATTTATACTTTTATTAAGA AAT TTATTTTATCCAAGAC CAGGAAC TGGATGAACAGTATATCCACCATTATCAGCATAT TTATATCATTCTTCACCTTCAGTAGATTTTGCAATTTTTTCTCTTCATATATCAGGAATT TCATCAATTATAGGATCATTAAACTTAATAGTTACAATTATAATAATAAAAAATTTTTCT AT AAATT AT GACCAAATT

7 AT TAT TC GAATAGAATTAAGAT CTCCAGGATCAT GAATTAATAAC GATCAAAT TTATAAT KY271933 ACAATTGTTACTAGCCACGCATTTCTAATAATCTTTTTTATAGTTATACCATTTCTAATT GGAGGATTTGGAAATTGGCTTATTCCTTTAATACTAGGATCACCTGATATAGCATTTCCC CGAATAAATAATGTTAGATTTTGATTACTTCCTCCCTCATTATTAATACTTTTATTAAGA AATTTATTTTACCCAAGACCAGGAACTGGATGAACAGTATATCCACCATTATCAGCATAT TTATATCACTCTTCACCTTCAGTAGATTTTGCAATTTTTTCTCTTCATATATCAGGAATT TCCTCAATTATAGGATCATTAAATTTAATAGTTACAATTATAATAATAAAAAATTTTTCT AT AAATT AT GACCAAATT

8 AT TAT TC GAATAGAATTAAGAT CCCCAGGATCAT GAATTAACAAT GATCAAAT TTATAAT KY271932 ACAATTGTTACTAGTCATGCATTCCTAATAATTTTTTTTATAGTTATACCATTTTTAATT GGAGGATTTGGAAATTGGCTTATTCCTTTAATACTAGGATCACCTGATATAGCATTCCCC CGAATAAATAATATTAGATTTTGATTACTTCCTCCCTCATTATTTATACTTTTATTAAGA AAT TTATTTTATCCAAGAC CAGGAAC TGGATGAACAGTATATCCACCATTATCAGCATAT TTATATCATTCTTCACCTTCAGTAGATTTTGCAATTTTTTCTCTTCATATATCAGGAATT TCATCAATTATAGGATCATTAAACTTAATAGTTACAATTATAATAATAAAAAATTTTTCT AT AAATT AT GACCAAATT

9 AT TAT TC GAATAGAATTAAGAT CCCCAGGATCAT GAATTAACAAT GATCAAAT TTATAAT KY271931 ACAATTGTTACTAGTCATGCATTCCTAATAATTTTTTTTATAGTTATACCATTTTTAATT GGAGGATTTGGAAATTGGCTTATTCCTTTAATACTAGGATCACCTGATATAGCATTCCCC CGAATAAATAATATTAGATTTTGATTACTTCCTCCCTCATTATTTATACTTTTATTAAGA AAT TTATTTTATCCAAGAC CAGGAAC TGGATGAACAGTATATCCACCATTATCAGCATAT TTATATCATTCTTCACCTTCAGTAGATTTTGCAATTTTTTCTCTTCATATATCAGGAATT TCATCAATTATAGGATCATTAAACTTAATAGTTACAATTATAATAATAAAAAATTTTTCT AT AAATT AT GACCAAATT

10 AT TAT TC GAATAGAATTAAGAT CTCCAGGATCAT GAATTAATAAC GATCAAAT TTATAAT KY271930 ACAATTGTTACTAGCCACGCATTTCTAATAATCTTTTTTATAGTTATACCATTTCTAATT GGAGGATTTGGAAATTGGCTTATTCCTTTAATACTAGGATCACCTGATATAGCATTTCCC CGAATAAATAATGTTAGATTTTGATTACTTCCTCCCTCATTATTAATACTTTTATTAAGA AATTTATTTTACCCAAGACCAGGAACTGGATGAACAGTATATCCACCATTATCAGCATAT TTATATCACTCTTCACCTTCAGTAGATTTTGCAATTTTTTCTCTTCATATATCAGGAATT TCCTCAATTATAGGATCATTAAATTTAATAGTTACAATTATAATAATAAAAAATTTTTCT AT AAATT AT GACCAAATT

11 ATTATTCGAATAGAATTAAGAT CCCCAGGATCAT GAATTAACAAT GATCAAAT TTATAAT KY271929 ACAATTGTTACTAGTCAYGCATTYCTAATAATYTTTTTTATAGTTATACCATTTYTAATT GGAGGATTTGGAAATTGGCTTATTCCTTTAATACTAGGATCACCTGATATAGCATTCCCC CGAATAAATAATATTAGATTTTGATTACTTCCTCCCTCATTATTTATACTTTTATTAAGA

AATTTATTTTATCCAAGACCAGGAACTGGATGAACAGTATATCCACCATTATCAGCATAT TTATATCATTCTTCACCTTCAGTAGATTTTGCAATTTTTTCTCTTCATATATCAGGAATT TCATCAATTATAGGATCATTAAACTTAATAGTTACAATTATAATAATAAAAAATTTTTCT AT AAATT AT GACCAAATT

12 ATTATTT GAATAGAATTAAGAT CTCCAGGATCATGAAT TAATAACGATCAAATTTATAAT KY271928 ACAATTGTTACTAGCCACGCATTTCTAATAATCTTTTTTATAGTTATACCATTTCTAATT GGAGGATTTGGAAATTGGCTTATTCCTTTAATACTAGGATCACCTGATATAGCATTTCCC CGAATAAATAATGTTAGATTTTGATTACTTCCTCCCTCATTATTAATACTTTTATTAAGA AATTTATTTTACCCAAGACCAGGAACTGGATGAACAGTATATCCACCATTATCAGCATAT TTATATCACTCTTCACCTTCAGTAGATTTTGCAATTTTTTCTCTTCATATATCAGGAATT TCCTCAATTATAGGATCATTAAATTTAATAGTTACAATTATAATAATAAAAAATTTTTCT AT AAATT AT GACCAAATT

Выровненная последовательность

ATTATTH GAATAGAATTAAGAT CYCCAGGATCATGAATTAAYAAYGATCAAATTTATAAT ACAATTGTTACTAGYCAYGCATTYCTAATAATYTTTTTTATAGTTATACCATTTYTAATT GGAGGATTTGGAAATTGGCTTATTCCTTTAATACTAGGATCACCTGATATAGCATTYCCC CGAATAAATAATRTTAGATTTTGATTACTTCCTCCCTCATTATTWATACTTTTATTAAGA AATTTATTTTAYCCAAGACCAGGAACTGGATGAACAGTATATCCACCATTATCAGCATAT TTATATCAYTCTTCACCTTCAGTAGATTTTGCAATTTTTTCTCTTCATATATCAGGAATT TCMTCAATTATAGGATCATTAAAYTTAATAGTTACWWTTATAATAATAAAAAATTTTTCT AT AAATT AT GACCAAATT

Г

9. Apis mellifera carpatica (Foti, 1965) - Пчела карпатская Класс: Insecta - Насекомые Отряд: Hymenoptera - Перепончатокрылые Семейство: Apidae - Пчелы настоящие Используемые генетические маркеры Цитохромоскидаза субъединица 1