Поиск новых биологически активных веществ на основе компьютерного анализа взаимосвязей "Структура-механизм-эффект" тема диссертации и автореферата по ВАК РФ 03.00.04, кандидат биологических наук Лагунин, Алексей Александрович
- Специальность ВАК РФ03.00.04
- Количество страниц 117
Оглавление диссертации кандидат биологических наук Лагунин, Алексей Александрович
1. ВВЕДЕНИЕ.
2. ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ.
2.1. Классификация видов биологической активности.
2.2. Компьютерные методы в поиске новых лекарственных веществ.
2.3. Артериальные гипертензии и препараты для их лечения.
3. ОБЪЕКТЫ И МЕТОДЫ.
3.1. Объекты.
3.2. Методы.
3.2.1. Прогноз спектра биологической активности химических веществ.
3.2.2. Биохимические методы анализа ингибирования ферментов (АПФ и НЭП).
4. РЕЗУЛЬТАТЫ И ОБСУЖДЕНИЕ.
4.1. Компьютерная система анализа взаимосвязей "механизм-эффект" "PharmaExpert".
4.1.1. База данных по видам биологической активности.
4.1.2. База знаний по взаимосвязям "механизм - эффект".
4.1.3. Методы анализа взаимосвязей "механизм -фармакологический эффект".
4.1.4. Оценка эффективности анализа взаимосвязей "механизм-эффект" для прогноза биологической активности.
4.2. Web-сервер для прогноза спектра биологической активности химических веществ.
4.3. Поиск антигипертензивных соединений с комбинированным механизмом действия.
Рекомендованный список диссертаций по специальности «Биохимия», 03.00.04 шифр ВАК
Компьютерная оценка плейотропного действия фармакологических веществ2012 год, доктор биологических наук Лагунин, Алексей Александрович
Информационная технология прогноза фармакологической активности химических соединений2009 год, доктор биологических наук Васильев, Павел Михайлович
Информационная технология прогноза фармакологической активности химических соединений2009 год, доктор биологических наук Васильев, Павел Михайлович
Компьютерный поиск новых ингибиторов интегразы ВИЧ-12006 год, кандидат биологических наук Акимов, Денис Владимирович
Исследование внеэкспериментальных подходов к оптимизации химических структур для создания новых лекарственных средств2004 год, доктор биологических наук Кабанкин, Анатолий Сергеевич
Заключение диссертации по теме «Биохимия», Лагунин, Алексей Александрович
6. выводы
1. Создана компьютерная система анализа взаимосвязей "механизм-эффект" PharmaExpert, обеспечивающая интерпретацию и коррекцию прогнозируемого программой PASS спектра биологической активности веществ.
2. Создан Web-cepBep (http://www.ibmh.msk.su/PASS/) для прогноза спектра биологической активности химических соединений, который позволяет получать результаты прогноза программы PASS в интерактивном режиме через Интернет.
3. Показана возможность компьютерного поиска соединений с комбинированными механизмами биологической активности. Выявлено несколько БАВ, которые с большой вероятностью могут проявить не описанные ранее в литературе комбинации механизмов антигипертензивного действия.
4. Поиск соединений с комбинированными механизмами антигипертензивного действия в базах данных ChemBridge и AsInEx выявил 4 соединения, являющиеся потенциальными ингибиторами АПФ и НЭП. Экспериментальная проверка подтвердила наличие у них ингибирующей активности, причем лучшие соединения имеют
1С50 порядка 10"7-10"9 М для АПФ и порядка 10"5 М для НЭП.
7. БЛАГОДАРНОСТИ
Автор выражает искреннюю признательность проф. О. А. Гомазкову за полезное обсуждение результатов работы, д.б.н. Н. И. Соловьевой и сотрудникам ее лаборатории за экспериментальное тестирование выявленных нами соединений, д.х.н. В. Ф. Поздневу за синтез субстрата АПФ, фирме MDL Information Systems, Inc. за предоставление возможности использования ISIS/Base и базы данных MDDR, фирме ChemBridge за предоставление образцов химических соединений.
Работа выполнена при частичной поддержке ФЦНТП «Исследования и разработки по приоритетным направлениям развития науки и техники гражданского назначения», подпрограмма «Перспективные информационные технологии» приоритетного направления «Информационные технологии и электроника», проект «Разработка программного комплекса для компьютерного конструирования новых эффективных химических соединений с заданными свойствами» 0201.07.201 и направления «Технология живых систем», подпрограмма «Создание новых лекарственных средств методами химического и биологического синтеза», проект 3 «Разработка фармакологических средств, регулирующих процессы иммуногенеза», подпроект «Компьютерное конструирование лекарственных средств» (509-3.2(00)-П).
5. ЗАКЛЮЧЕНИЕ
В результате выполненной работы была разработана компьютерная система PharmaExpert для интерпретации и коррекции результатов прогноза спектра биологической активности соединений. Система открыта для пополнения новой информацией о наименованиях биологических активностей и взаимосвязях "механизм-эффект". Анализ взаимосвязей "механизм-эффект" с помощью компьютерной системы PharmaExpert дает возможность выдвигать обоснованные предположения о вероятных механизмах действия и фармакологических эффектах новых химических веществ и отбирать наиболее перспективные биологически активные соединения для экспериментального исследования. Создание Интернет-ресурса (PASS Inet) по прогнозу спектра биологической активности не только предоставляет возможность многим исследователям использовать данный метод для оценки новых БАВ, но и является основой для создания базы данных образцов синтезированных химических веществ для выявления соединений с требуемыми биологическими свойствами. Показана возможность поиска новых соединений с комбинированными механизмами действия на основе прогноза их биологической активности. Найдены новые соединения, одновременно являющиеся ингибиторами АПФ и НЭП - ферментов, причастных к патогенезу артериальной гипертензии и некоторых других патологий (например, сердечной недостаточности).
Список литературы диссертационного исследования кандидат биологических наук Лагунин, Алексей Александрович, 2001 год
1. Авидон В.В. Критерии сравнения химических структур и принципы построения информационного языка для информационно-логической системы по биологически активным соединениям. // Химико-фармацевтический журнал. —1974. —Т.8. —С. 22-25.
2. Веселовский А.В., Медведев А.Е., Тихонова О.В., Скворцов B.C., Иванов А. С. Моделирование субстрат-связывающего участка активного центра моноаминооксидазы А. // Биохимия, 2000. —Т.65. —№8.—С. 1072-1080.
3. Гогин Е.Е. Гипертоническая болезнь и симптоматические гипертензии. // Диагностика и лечение внутренних болезней. М. Медицина, 1991. — Т.1. — С. 21-110.
4. Голендер В.Е., Розенблит А.Б. Вычислительные методы конструирования лекарств. // Рига, Зинатне, 1983.
5. Голендер В.Е., Розенблит А.Б. Логико-комбинаторные методы в конструировании лекарств. // Рига, Зинатне, 1983.
6. Гомазков О.А. Пептиды в кардиологии. Биохимия. Физиология. Патология. Информация. Анализ. // М. Материк Альфа, 2000. — 143С.
7. Кадыров Ч.Ш., Тюрина Л.А., Симонов В.Д., Семенов В.А. Машинный поиск химических препаратов с заданными свойствами. //Ташкент, "ФАН", 1989. — С. 17.
8. Каркищенко Н.Н. Фармакологические основы терапии. // М. IMP-Медицина, 1996. — С.142-145.
9. Комиссарова Н.В., Симе В.Е., Гомазков О.А., Оэме Р. Подавлением веществом Р активности ангиотензин-превращающего фермента из сыворотки крови человека. // Бюллетень экспериментальной биологии и медицины, 1982. —№6. —С.3-5.
10. Ланг Г.Ф. Гипертоническая болезнь. // JL: Медгиз, 1950. —496 С.
11. Машковский М.Д. Лекарственные средства. Издание четырнадцатое. // М. «Новая Волна». 1997. — 2Т. —1357 С.
12. МКБ-10. Международная статистическая классификация болезней и проблем, связанных со здоровьем. Десятый пересмотр. // ВОЗ, Женева, 1995.
13. Мясников А.Л. Гипертоническая болезнь и атеросклероз. // М. Медицина, 1965. — 615 С.
14. Постнов Ю.В., Орлов С.Н. Первичная гипертензия как патология клеточных мембран. // М. Медицина, 1987. — 190 С.
15. Раевский О.А. Введение в конструирование биологически активных веществ. // М. МХТИ, — 1984.
16. Регистр Лекарственных Средств России, Энциклопедия лекарств. Ред. Ю.Ф. Крылов. // М. «РЛС-2000». 1999. —820 С.
17. ТЕЗАУРУС информационно-поисковый по биологической активности химических соединений. // М. ЦБНТИмедпром. 1982. — 216 С.
18. Ту Д., Гонсалес Р. Принципы распознавания образов.// М. Мир, 1978.—411 С.
19. Харкевич Д.А. Фармакология. // М. Геотар Медицина, 2001. — 664 С.
20. Харрисон Т.Р. Внутренние болезни. // М. Медицина, 1995. —Т.5. — С.387.
21. Шашкова Г.В., Лепахин В.К., Колесникова Г.Н. Справочник синонимов лекарственных средств. // М. «ФАРМЕДИНФО». 1998. —447 С.
22. Шулутко Б.И., Перов Ю.Л. Артериальная гипертензия. // СПб., 1993, —304 С.
23. Шустов С.Б., Яковлев В.А., Баранов В.Л., Карлов В.А. Артериальные гипертензии. // СПб. Специальная Литература, 1997.320 С.
24. Al-Lazikani В., Jung J., Xiang Z., Honig В. Protein structure prediction. // Curr. Opin. Chem. Biol. — 2001, —V.5. —№1. —P.51-56.
25. Aoyama Т., Suzuki Y., Ichikawa H. Neural Networks Applied to Quantitative Structure-Activity Relationships. // J. Med. Chem. — 1990.1. V.33. —P. 905-908.
26. Aoyama Т., Suzuki Y., Ichikawa H. Neural Networks Applied to Quantitative Structure-Activity Relationships (QSAR) Analysis. // J. Med. Chem. — 1990. — V.33. — P. 2583-2590.
27. Asher J.R., Naftilan A.J. Vasopeptidase inhibition: a new direction in cardiovascular treatment. // Curr. Hypertens. Rep., 2000. —V.2. —№4. —P.384-391.
28. Baskin I.I., Palyulin V.A., Zefirov N.S. A neural device for searching direct correlations between structures and properties of organic compounds. // J. Chem. Inf. Comput. Sci. — 1997. —V.37. — №4. —P. 715-721.
29. Berman H.M., Westbrook J., Feng Z., Gilliland G., Bhat T.N., Weissig H., Shindyalov I.N., Bourne P.E. The Protein Data Bank. // Nucleic Acids Research. —2000. —V. 28. — №1. —P. 235-242.
30. Blundell Т., Carney D., Gardner S., Hayes F., Howlin В., Hubbard Т., Overington J., Singh D.A., Sibanda B.L., Sutcliffe M. 18th Sir Hans
31. Krebs lecture. Knowledge-based protein modelling and design. 11 Eur. J. Biochem., 1988. —V.172. —№3. — P.513-520.
32. Borodina Yu., Filimonov D., Poroikov V. Computer-aided estimation of synthetic compounds similarity with endogenous bioregulators. // Quant. Struct.-Activ. Relationships, 1998. —V.17. —№5. —P.459-464.
33. Burger A. Classification of drugs. // In Hansch C., Sammes P.G., and Taylor J.B. (eds) Comprehensive Medicinal Chemistry. Pergamon Press, Oxford, 1990. — V.I. — P.249-260.
34. Cambridge Crystallographic Data Center (CCDC) http://www.ccdc.cam.ac.uk/
35. Chemical Abstracts Service (CAS) http://www.cas.org/
36. Claessens M., Van Cutsem E., Lasters I., Wodak S. Modelling the polypeptide backbone with 'spare parts' from known protein structures. // Protein Eng., 1989. —V.2. —№5. —P.335-345.
37. Cohen N.C. Guidebook on Molecular Modeling in Drug Design. // Academic Press, 1996. — P.219-230.
38. Cohen N.C. Guidebook on Molecular Modeling in Drug Design. // Academic Press, 1996. — 361 P.
39. Cole G.M., Vayer E.F., Swanson S.M., White W.G. In Olson E.C., Christoffersen R.E. (Eds). Computer-Assisted Drug Design. // ACS
40. Symposium series 112, American Chemical Society. Washington. — 1979.—P. 189-204.
41. Cotran R.S., Kumar V., Collins T. Robbins Pathologic Basis of disease. // W.B. Saunders Company, 1999. —P.510-514.
42. Cramer 3rd R.D., Patterson D.E., Bunce J.D. Recent advances in comparative molecular field analysis (CoMFA). // Prog. Clin. Biol. Res. —1989—V.291.—P.161-165.
43. Cuchman M., Zhu H., Geahlen L.R., Kraker J.A. Synthesis and Biochemical Evaluation of a Series of Aminoflavones as Potential Inhibitors of Protein-Tyrosine Kinases p56. // J. Med. Chem. — 1994. — V.37. —P.3353-3362.
44. Deane C.M., Kaas Q., Blundell T.L. SCORE: predicting the core of protein models. // Bioinformatics, 2001. —V. 17 —№6. —P.541-550.
45. Doucet J., Weber J. Computer-Aided Molecular Design: Theory and Application. //Academic Press, London, 1996. —487p.
46. ENZYME database http://www.genome.ad.jp/dbget/.
47. Enzyme Nomenclature. Recommendations (1972) of the International Union of Pure and Applied Chemistry and the International Union of Biochemistry. // Elsevier Publishing Company. —1972.
48. Ewing T.J., Makino S., Skillman A.G., Kuntz I.D. DOCK 4.0: search strategies for automated molecular docking of flexible molecule databases. // J. Comput. Aided Mol. Des., 2001. —V.15. —№5. — P.411-428.-л
49. Filimonov D., Poroikov V., Borodina Yu., Gloriozova T. Chemical Similarity Assessment Through Multilevel Neighborhoods of Atoms: Definition and Comparison with the Other Descriptors. // J.Chem.Inf.Comput. Sci., 1999. — V.39. —№4. —P.666-670.
50. Free S.M., Wilson J.W. A mathematical contribution to structure-activity studies. // Journal of Medicinal Chemistry. 1964. —V.4. — P.395-399.
51. Folkow В. How hypertension develops: the last theory. // Am. in Midlife Male, 1990. — V. 11. —P.3-4.
52. Gasteiger J., Rudolph C., Sadowski J. Automatic Generation of 3D-Atomic Coordinates for Organic Molecules. // Tetrahedron Сотр. Method., 1990.—V.3.—P.537-547.
53. Gonzalez J.E., Oades K., Leychkis Y., Harootunian A., Negulescu P.A. Cell-based assays and instrumentation for screening ion-channel targets. // Drug Discov Today, 1999. —V.4 —P.431-439.
54. Gilman A.G., Rail T.W., Nies A.S., Taylor P. Goodman and Gilman's The Pharmacological Basis of Therapeutics. // New York, Pergamon Press, 1990.—P.784.
55. Gundertofte K., Flemming S.J. Molecular Modeling and prediction of bioactivity. // Kluwer Academic/Plenium Publishers, 2000. —502 P.
56. Jaen-Oltra J., Salabert-Salvador M.T., Garcia-March F.J., Perez-Gimenez F., Tomas-Vert F. Artificial neural network applied to prediction of fluorquinolone antibacterial activity by topological methods. // J. Med. Chem., 2000. —V.43 —№6. —P. 1143-1148.
57. Jalali-Heravi M., Parastar F. Use of artificial neural networks in a QSAR study of anti-HIV activity for a large group of HEPT derivatives. // J. Chem. Inf. Comput. Sci., 2000. —V.40. —№1. —P. 147-154.
58. Johnson M.S., Overington J.P. A structural basis for sequence comparisons. An evaluation of scoring methodologies. // J. Mol. Biol., 1993. — V.233. —№4. —P.716-738.
59. Jones ТА, Thirup S. Using known substructures in protein model building and crystallography. // EMBO J., 1986. —V.5. —№4. —P.819-822.
60. Hansch C. and Fujita. Т., J. [rho.]-[[sigma]]-[[pi]] Analysis. A Method for the Correlation of Biological Activity and Chemical Structure. // Amer. Chem. Soc., — 1964. —V.86. —P.1616-1626.
61. Hathaway В., Hansch C. Inhibition of human dihydrofolate reductase by 4,6-diamino-1,2-dihydro-2,2-dimethyl-1 -(substituted-phenyl)-s-triazine s. A quantitative structure-activity relationship analysis. // J. Med. Chem., 1984.—V.27.—№2.—P.144-149.
62. Hertzberg R.P. and Pope A.J. High-throughput screening: new technology for the 21st century. // Curr. Opin. Chem. Biol., 2000. —V.4. —P.445-451.
63. Holtje H., Sippl W. Rational Approaches to Drug Design. Proceedings of the 13th European Symposium on Quantitative Structure-Activity Relationships. // Prous Science., 2001. —521 P.
64. Horn F., Weare J., Beukers M., Horsch S., Bairoch A., Chen W., et all. GPCRDB: an information system for G protein-coupled receptors. // Nucleic Acids Res., 1998. —426. —№1. —P.275-279.
65. Itai A., Kato Y., Iitaka Y. In Y. Itaka, A. Itai (Eds.). Proceedings of Symposium on Three-Dimensional Structures and Drag Action.// Univ. Tokyo Press. Tokyo., 1986. —P.195-205.
66. Katzung B.G. Basic & Clinical Pharmacology. //Lange Medical Books/McGraw-Hill, 2001. —P.245-264.
67. Kikuchi O. // Quantitative Structure-Activity Relationships, 1987. — Y.6. — P.179-184.
68. Knight J.L., Weaver D.F. A computational quantitative structure-activity relationship study of carbamate anticonvulsants using quantum pharmacological methods. // Seizure., 1998. —V.7. —№5. —P.347-354.
69. Ksander G.M. Benzofused macrocyclic lactams as triple inhibitors of endothelin-converting enzyme, neutral endopeptidase 24.11, and angiotensin-converting enzyme. // J. Cardiovasc. Pharmacol., 1998. — V.31.—Suppl.l.—S71.
70. Kubinyi H. // Quantitative Structure-Activity Relationships, 1993. — V.7. —P.121-133.
71. Kubinyi H. 3D QSAR in Drug Design. Theory, Methods and Applications. // ESCOM, London, 1993. —758 P.
72. Li Z., Mehdi S., Patel I., Kaooya J., Judkins M., Zhang W., Diener K., Lzada A., Dunnington D. An ultra-high throughput screening approach for an adenine transferase using fluorescence polarization. // J. Biomol. Screen., 2000. —V.5. — P. 31-38.
73. Levitt M. Accurate modeling of protein conformation by automatic segment matching. // J. Mol. Biol., 1992. —V.226. —№2. —P.507-533.
74. Lew M.J., Angus J.A. Analysis of competitive agonist-antagonist interactions by nonlinear regression. // Trends Pharmacol. Sci., 1995. — V.16.—№10.—P.328-337.
75. Lucic В., Amic D., Trinajstic N. Nonlinear multivariate regression outperforms several concisely designed neural networks on three QSPR data sets. // J. Chem. Inf. Comput. Sci., 2000. —V.40. —№2. —P.403-413.
76. Luco J.M., Ferretti F.H. QSAR based on multiple linear regression and PLS methods for the anti-HIV activity of a large group of HEPTderivatives. // J. Chem. Inf. Comput. Sci., 1997. —V. 37. —№ 2 — P.392-401
77. Main B. W., Cardiovascular effects of YM-16151-4, a novel dihydropyridine derivative which possesses calcium entry blocking and selective beta 1-adrenoceptor blocking activities, in dogs. // FASEB J., 1988. —V.2. —№4. —Abst. 1797.
78. Mumford R.A., Strauss A.W., Powers J.C., Pierzchala P.A., Nishino N., Zimmerman M. A zinc metalloendopeptidase associated with dog pancreatic membranes. // J. Biol. Chem., 1980. — V.255. —№6. — P.2227-2230.
79. McFarland J.W., Cooper C.B., Newcomb D.M. Linear discriminant and multiple regression analyses of anticoccidial triazines. // J. Med. Chem., 1991. —V.34. —№6. —P. 1908-1911.
80. McKittrick B.A. Design and synthesis of phosphinic acids that triply inhibit endothelin converting enzyme, angiotensin converting enzyme and neutral endopeptidase 24.11. // Bioorg. Med. Chem. Lett., 1996. — V.6.—№14,—P. 1629.
81. Metge C, Black C, Kozyrskyj A. The Population's Use of Pharmaceuticals. // Med. Care, 1999. —'V.37. —№6. — Suppl. JS42-JS59.
82. MDL Inc., http://www.mdli.com
83. Molchanova M.S., Shcherbukhin V.V., Zefirov N.S. Computer generation of molecular structures by SMOG program. // Journal of
84. Chemical Information and Computer Science, 1996. —V.36. —№4. — P.888-899.
85. Moriguchi I.I, Hirano H., Hirono S. Prediction of the Rodent Carcinogenicity of Organic Compounds from Their Chemical Structures Using the FALS Method.//Environ. Health. Perspect., 1996. —V.104S. —№5 —P. 1051-1058.
86. National Cancer Institute (NCI), http://cactus.cit.nih.gov/ncidb2/
87. Negwer M., Scharnow H.G. Organic-Chemical Drugs and Their Synonyms. // Wiley-VCH, Weinheim, 2001. —4680p.
88. Novic M., Nikolovska-Coleska, Solmajer T. Quantitative Structure-Activity Ralatiomship of Flavonoid p561ck Protein Tyrosine Kinase Inhibitors. A Neural Network Approach.// J. Chem. Inf. Comput. Sci., 1997.—V.37.—P.990-998.
89. Panzenbeck M. J. BMY-20014 is a combined Ca++/alphal-adrenergic antagonist with prolonged effects on coronary blood flow. // FASEB J., 1989. —V.3. —№4. —Abst. 4607.
90. Parker G.J., Law T.L., Lenoch F.J., Bolger R.E. Development of high throughput screening assays using fluorescence polarization: nuclear receptor-ligand-binding and kinase/phosphatase assays. // J. Biomol. Screen, 2000. —V.5. —P.77-88.
91. Peitsch M.C. Protein modeling by E-mail. // Biotechnology, 1995. — V.13.—P.658-660.
92. Pope A.J, Haupts U, Moore K.J. Homogeneous fluorescence readouts for miniaturized high-throughput screening; theory and practice. // Drug Discov Today, 1999. —V.4. —P.350-362.
93. Poroikov V.V, Filimonov D.A, Borodina Y.V, Lagunin A.A, Kos A. Robustness of biological activity spectra predicting by computer program PASS for noncongeneric sets of chemical compounds. // J. Chem. Inf. Comput. Sci, 2000. —P.40. —№6. —P. 1349-1355.
94. Pradal H. Les Grands Medicaments. // Editions du Seuil, Paris, 1975.
95. Roques B. P., Noble F., Daugee V., Fournie-Zaluski M.C., Beaumont A. Neutral endopeptidase 24.11: structure, inhibition, and experimental and clinical pharmacology. // Pharmacol. Rev., 1993. —V.45. —P.87-146.
96. RBI Research biochemicals international. 1999 Catalog/Handbook. // Research biochemicals L.P., 1999. —552 P.
97. Reuben B.G., Wittkoff H.A. Pharmaceutical Chemicals in Perspective. // Wiley, New York, 1989.
98. Ruskoaho H. Atrial natriuretic peptide: synthesis, release, and metabolism. // Pharmacol. Rev., 1992. —V.44. —№4. —P.479-602.
99. Sadowski J., Schwab C.H., Gasteiger J. Evaluation of 3D Structure Generators Revisited. // 1996, http://www2.chemie.uni-erlangen.de/software/corina/xrayeval.html
100. Sali A., Blundell T.L. Comparative protein modelling by satisfaction of spatial restraints. // J. Mol. Biol., 1993. —V.234. —№3. —P.779-815.
101. Sippl W., Contreras J.M, Parrot I., Rival Y.M., Wermuth C.G. Structure-based 3D QSAR and design of novel acetylcholinesterase inhibitors. // J. Comput. Aided Mol. Des., 2001. —V. 15.—№5. —P.395-410.
102. Srinivasan N., Blundell T.L. An evaluation of the performance of an automated procedure for comparative modelling of protein tertiary structure. //ProteinEng., 1993. —V.6. —№5. —P.501-512.
103. Taylor D. P. BMS-181102: Neuroprotection with 5-HT2 antagonism and L-type Ca++ channel blockade. // Soc. Neurosci. Abst., 1994. —V.20 — Part 1.—Abst. 81.12.
104. Taylor J.B., Kenewell H.A. Modern Medicinal Chemistry. // Ellis Horwood, London, 1993.
105. Tripos, Inc. http://www.tripos.com/index.html.
106. Turner A.J., Tanzawa K. Mammalian membrane metallopeptidases: NEP, ECE, KELL, and PEX. // FASEB J., 1997. —V.ll. —№5. — P.355-364.
107. Unger R., Harel D., Wherland S., Sussman J.L. A 3D building blocks approach to analyzing and predicting structure of proteins. // Proteins, 1989. —V.5. —№4. —P.355-373.
108. Veretennicova N., Skorova A. etc. SAR Investigation of biologically Active Compounds Using OREX Expert System. // In Quantitative Structure-Activity Relationships in Environmental Sciences-VII. SETAC PRESS., 1996. —Chapter 8.
109. Walsh T.F. Potent dual antagonists of endothelin and angiotensin II receptors derived from alpha-phenoxyphenylacetic acids (Part III). // Bioorg. Med. Chem. Lett, 1995. —V.5. —№11. —P.l 155.
110. Watling K.J, Kebabian J.W, Neumeyer J.L. (Eds.) The RBI Handbook of Receptor Classification and Signal Transduction. // Research Biochemicals International, Natick, MA 01760-2447 USA, 1995.
111. Weber H.P. Screening Three-Dimensional Databases for Lead Finding. // In "Computer-Aided Drug Design Industrial Research", Ed. by Herrmann E.C, Franke R. Springer Verlag. Berlin, 1995. —P.l 11-128.
112. Wermuth C.G. The Practice Medicinal Chemistry. // Academic Press, London, 1996. —P.6-85.
113. Wlodawer A, Vondrasek J. Inhibitors of HIV-l protease: a major success of structure-assisted drug design. // Annu. Rev. Biophys. Biomol. Struct, 1998.—V.27. —P.249-284.
114. WHO Collaborating Centre for Drug Statistics Methodology: "Guidelines for АТС classification and DDD assignment". Oslo, 1996.
115. Zupan J, Gastaiger J. Neural Networks in Chemistry and Drug Design.//Wiley-VCH, 1999.—380 P.116
116. Yu L., White J.V., Smith T.F. A homology identification method that combines protein sequence and structure information. // Protein Sci., 1998. —V.7. —№12. —P.2499-2510.
Обратите внимание, представленные выше научные тексты размещены для ознакомления и получены посредством распознавания оригинальных текстов диссертаций (OCR). В связи с чем, в них могут содержаться ошибки, связанные с несовершенством алгоритмов распознавания. В PDF файлах диссертаций и авторефератов, которые мы доставляем, подобных ошибок нет.