Оценка генетического разнообразия фитопатогенных бактерий рода Xanthomonas и разработка молекулярных маркеров для их диагностики тема диссертации и автореферата по ВАК РФ 03.00.07, кандидат биологических наук Пунина, Наталия Владимировна

• Пунина, Наталия Владимировна
• кандидат биологических наук
• 2009

Оглавление диссертации кандидат биологических наук Пунина, Наталия Владимировна

ВВЕДЕНИЕ.

СПИСОК СОКРАЩЕНИЙ, ИСПОЛЬЗОВАННЫХ В РАБОТЕ.

ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ

Глава 1.1. Фитопатогенные бактерии рода Xanthomonas.

1.1.1. Бактерии рода Xanthomonas.

1.1.2. Систематика бактерий рода Xanthomonas.

1.1.3. Генетическая изменчивость бактерий рода Xanthomonas.

1.1.4. Патоварианты видов X. campestris,X. vesicatoria и X. arboricola как примеры разного состава таксонов и изменчивости бактерий.

Глава 1.2. Методы диагностики фитопатогенных бактерий.

1.2.1. Фенотипические методы.

1.2.1.1. Тесты на патогенность.

1.2.1.2. Биохимические методы исследования.38 >

1.2.1.3. Методы серотипирования и изоферментного анализа.

1.2.2. Генотипические (биомолекулярные) методы диагностики.

1.2.2.1. Определение содержания гуанина и цитозина в молекуле ДНК.

1.2.2.2. ДНК-ДНК и РНК-ДНК гибридизация нуклеиновых кислот.

1.2.2.3. Методы ДНК фингерпринтинга.

1.2.2.4. ПЦР со специфичными праймерами.

1.2.4.5. Методы, основанные на анализе первичных последовательностей нуклеиновых кислот.

1.2.3. Интегральная диагностика.

1.2.4. Ген субъединицы Б фермента ДНК гиразы.

1.2.5. Цитохром Р450 редуктазы бактерий.

1.2.6. Посттрансляционная модификация у патогенных бактерий.

Регион Хсс000б-0007.

1.2.6.1. Посттрансляционная модификация и модификаторы.

1.2.6.2. Регион Хсс000б-0007 бактерий рода Xanthomonas.

ЭКСПЕРИМЕНТАЛЬНАЯ ЧАСТЬ.

Глава 2. Материалы и методы исследования.

2.1. Объекты исследования.

2.2. Изучение физиологических признаков бактерий рода Xanthomonas.

2.2.1. Проверка вирулентности бактерий.

2.2.2. Изучение биохимических свойств бактерий.

2.2.3. Статистическая обработка данных.

2.3. Условия культивирования бактерий и выделения препаратов ДНК из биомассы

2.4. Генетический анализ.

2.4.1. ПЦР с использованием праймеров к гену 16S рРНК и межгенному региону 16S- 23S рРНК ITS.

2.4.2. ПЦР с использованием праймеров к гену gyrB.

2.4.3. ПЦР с использованием праймеров к гену cytP-450 семейства 133B3/B

2.4.4. ПЦР с использованием праймеров к региону Хсс0006-0007.

2.5. ПЦР с использованием праймеров к гену avrXccC.

2.6. Очистка ПЦР-продуктов в агарозе.

2.7. Клонирование ПЦР-фрагментов.

2.7.1. Приготовление компетентных клеток.

2.7.2. Лигирование.

2.7.3. Трансформация клеток плазмидной ДНК.

2.7.4. Выделение плазмидной ДНК.

2.7.5. Рестрикционный анализ плазмидной ДНК.

2.8. Секвенирование фрагментов генов.

2.9. Биоинформационный анализ данных.

РЕЗУЛЬТАТЫ И ОБСУЖДЕНИЯ.

Глава 3. Оценка фенотипического (физиологического) разнообразия бактерий рода Xanthomonas.

3.1. Биохимические свойства изучаемых штаммов Xanthomonas spp.

3.2. Исследование штаммов на патогенность.

Глава 4. Оценка генетического разнообразия исследуемой коллекции Xanthomonas spp. и нуклеотидных последовательностей генов, выбранных в качестве молекулярных маркеров.

4.1. Генетическое разнообразие последовательностей гена рРНК.

4.2. Генетическое разнообразие последовательностей idS^iSpPHK ITS.

4.3. Модель вероятной вторичной структуры оперона 16S-23S-5S рРНК ITS.

4.4. Генетическое разнообразие последовательностей гена gyrB.

4.5. Генетическое разнообразие нуклеотидных последовательностей З'-конца гена gyrB бактерий рода Xanthomonas.

4.6. Генетическое разнообразие последовательностей гена gyrB для бактерий рода Xanthomonas spp. в Российской Федерации.

4.7. Генетическое разнообразие последовательностей регионаХсс000б-0007.

4.8. Генетическое разнообразие последовательностей гена cytP-450 сем.

CYP133B3/B4.

Глава 5. Изучение изменения бактериального фенотипа.

Делеция гена авирулентности avrXccC.

5.1. Появление расы 6 в результате индуцированной мутации изолята расы 1 X. campesrtis pv. campestris.

5.2. Генетическое изучение индуцированной мутации/делеции гена avrXccC.

5.3. Вероятные механизмы встраивания и делеции гена avrXccC

X. campestris pv. campestris.

Глава 6. Создание молекулярных маркеров для диагностики Xanthomonas spp.

6.1. Создание молекулярных маркеров для диагностики бактерий рода Xanthomonas на различных таксономических уровнях.

6.2. Проверка специфичности системы праймсров XarF-XarR для представителей вида X arboricola.

ВЫВОДЫ.

Введение диссертации (часть автореферата) на тему «Оценка генетического разнообразия фитопатогенных бактерий рода Xanthomonas и разработка молекулярных маркеров для их диагностики»

По данным FAO доля бактериальных болезней в среднегодовых потерях урожая сельскохозяйственных растений составляет около 30% (FAO, 2005). Бактерии рода Xanthomonas поражают более 400 видов растений (Leyns et al, 1984), что приводит к серьезным экономическим потерям. Род Xanthomonas включает более 27 видов (Vauterin et al, 1997), обладающих сходными физиологическими и генетическими признаками. Из-за отсутствия эффективных химических и агротехнических мер борьбы с бактериозами и недостатка устойчивых сортов и гибридов, ранняя диагностика бактериального заражения семян и посадочного материала является ключевым способом снижения вредоносности заболеваний. В большинстве случаев бактерии рода Xanthomonas специализируются на определенном виде/роде растений, но некоторые растения поражаются сразу несколькими видами патогена, а некоторые виды бактерии заражают растения различных семейств и классов. В последние годы наблюдается повсеместное усиление вредоносности бактериозов, что является результатом нескольких факторов: 1) появления новых агрессивных штаммов фитопатогенных бактерий, которые поражают более широкий круг сельскохозяйственных культур; 2) глобального потепления климата; 3) глобального распространения наиболее вирулентных штаммов из-за расширяющихся международной торговли и туризма; 4) внедрения индустриальной технологии растениеводства, включающей применение гибридных семян от международных производителей, распространения однородных генотипов сельскохозяйственных культур в различных странах, централизованного-выращивания рассады и механизированной обработки полей (Ежегодник ГЭП, 2006, www.unep.org/GC/GCSS-IX/Documents/K0584231 .r.doc). В связи с этим проблема идентификации фитопатогенов становится все более актуальной при диагностике зараженности материала.

Недостатком применяемой диагностики является тестирование штаммов на одном таксономическом уровне, часто только для узкой клональной группы штаммов фитопатогенных бактерий. К тому же, диагностика фитопатогенных бактерий затруднена присутствием на растении эпифитных бактерий родственных видов со сходными физиологическими и генетическими признаками (Vauterin et al, 1997). Применение интегрального анализа, куда входят фенотипические и молекулярные методы для разных таксономических уровней, позволит диагностировать штаммы не только ожидаемых групп бактерий, но и новых, потенциально вирулентных.

СПИСОК СОКРАЩЕНИЙ, ИСПОЛЬЗОВАННЫХ В РАБОТЕ а/к - аминокислоты

АТФ, АДФ — аденозинтрифосфорная/аденозиндифосфорная кислота

ГЦ — молярное содержание суммы гуанина и цитозина в процентах от общего количества оснований ДНК

ГП - горизонтальный перенос

ДНК — дезоксирибонуклеиновая кислота

ЖК — жирные кислоты иРНК, рРНК, тРНК - информационная/рибосомальная/транспортная рибонуклеиновая кислота

ЛПС — липополисахариды

МДМ - молекулярно-генетический маркер

ПААГ — полиакриламидный гель

ПААГ-ДСН — полиакриламидный гель с додецилсульфатом натрия

ПААГ-PFGE - гель-электрофорез в пульсирующем поле п.о. - пара оснований

ПЦР - полимеразная цепная реакция

ЭПС — экзоплисахариды

СТАВ - цетилтриметиламмонийбромид, цетавлон ТАЕ-буфер - буфер, содержащий Трис, ацетат и ЭДТА Трис — триоксиметиламинометан ЭДТА — этилендиаминтетраацетат

AFLP - анализ полиморфизма длины амплификационных фрагментов ARDRA - анализ рестрикции амплифицированной рибосомальной ДНК ВОХ-ПЦР - амплификация поторяющихся BOX последовательностей DAF — фингерпринтинг на основе амплификации ДНК dNTP - дезоксинуклеозидтрифосфат

FAME - анализ профилей метиловых эфиров жирных кислот FAO — продовольственная и сельскохозяйственная организация ООН IPTG — изопропил-p-D-l -тиогалактопиранозид MLST - мультилокусное секвенирование

NBS-LRR — нуклеотид-связывающий сайти область лейцин-обогащенного повторяющегося мотива

PR(s) - белки, связанные с патогенезом

RAPD-ПЦР - случайная амплификация полиморфной ДНК

RFLP - анализ полиморфизма длины фрагментов рестрикции

SCAR-ПЦР — амплификация с применением геном-специфичных маркеров

SDS - додецилсульфат натрия

SNP — полиморфизм одного нуклеотида

T-RFLP - анализ полиморфизма длин терминальных фрагментов рестрикции X-Gal — 5-бром-4-хлор-3-индолил-бета-0-галактопиранозид

ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ

Заключение диссертации по теме «Микробиология», Пунина, Наталия Владимировна

выводы

1. Впервые проведен анализ генетического разнообразия последовательностей генов gyrB, cyt-P450 сем. CYP133B3/B4 и регионаХсс0006-0007 для 113 штаммов^ campestris pv. campestris и родственных видов Xanthomonas, представляющих популяции патогенных бактерий в РФ. Установлены нуклеотидные замены, характерные для видов X arboricola, X. campestris, X vesicatoria и внутривидовых групп X. campestris, пригодные для создания специфичных ПЦР-маркеров.

2. Впервые обнаружены штаммы вида X arboricola, поражающие сельскохозяйственные злаки, крестоцветные растения и подсолнечник. Создана система ПЦР-праймеров для их диагностики.

3. Впервые в России обнаружены штаммы X. campestris pv. raphani, поражающие пасленовые растения, и проведен комплексный анализ их физиологических и генетических свойств.

4. Впервые установлен факт делеции гена авирулентности avrXccC у X campestris pv. campestris, индуцированной заражением растений с комплементарным геном устойчивости Rxccl.

Список литературы диссертационного исследования кандидат биологических наук Пунина, Наталия Владимировна, 2009 год

1. Авезджанова Г.П. Внутривидовое разнообразие возбудителя черной бактериальной пятнистости томатов Xanthomonas vesicatoria (Doidge) Dowson и оценка коллекции томатов на устойчивость к заболеванию // Автореф. канд. биол. наук — Ленинград. -1967.

2. Бельтюкова К.И., Матышевская М.С., Куликовская М.Д., Сидоренко С.С. Методы исследования возбудителей бактериальных болезней растений. // Киев: Наукова думка. -1968.-С. 316.

3. Биргер М.О. (ред.). Справочник по микробиологическим и вирусологическим методам исследования. // Медицина. -1982. -С. 229.

4. Булыгина Е.С. Систематика Грамотрицательных метилотрофных бактерий на основе анализа нуклеотидных последовательностей 5S рибосомных РНК // Кандидатская дисс.-1991.

5. Головлев Е.Л. О старых проблемах новой,систематики бактерий // Микробиология. -1998. -Т. 67. № 2. -С. 281-286.

6. Горленко М.В., Воронкевич И.В. Возбудители бактериальных пятнистостей томата и мака: // Микробиология. -1949. -№18 -С. 258-262.

7. Гусева Л;И., Атлуханов A.M. Черная бактериальная пятнистость томатов в Молдавии // Сб. «Фитонциды. Фитопатогенные бактерии». Тезисы докладов. -Ч. 2. Киев. Наукова Думка. -1985. -С. 62-63.

8. Игнатов А.Н. Генетическое разнообразие фитопатогенных ксантомонад вида Xanthomonas campestris и устойчивость к ним растений семейства Brassicaceae. // Кандидатская дисс. на соискание уч. ст. д.б.н. -2006.

9. Игнатов А.Н., Кугинуки Я. Хида К. Возбудитель бактериозов капустных Xanthomonas campestri s. О создании устойчивых к ксантомонадам растений семейства Brassiceae. // Сельскохозяйственная биология. -2002. -№5. -С. 75-84.

10. Игнатов А.Н., Монахос Г.Ф., Джалилов Ф.С. Появление расы 0 в результате спонтанной мутации изолята расы 1 Xanthomonas campestris pv. campestris возбудителя сосудистого бактериоза крестоцветных. // Известия ТСХА. -2000. -№4. -С. 71-75.

11. Игнатов А.Н., Поляков К. Л., Самохвалов А.Н. Количественный анализ серологических признаков Xanthomonas campestris. // Сельскохозяйственная биология. -1998. -№1. -С. 106-115.

12. Инге-Вечтомов С.В. Генетика с основами селекции. // М., Высшая школа, -1989.

13. Князева З.В. Бактериальные болезни томатов и меры борьбы с ними (рекомендации). // Воронеж. -1981.

14. Матвеева Е.В., Быкова Г.А., Лазарев A.M. Бактериальные болезни томата и картофеля и меры борьбы с ними. // СПб. Методические рекомендации. Пушкин. -1999.

15. Меликова С.А. Этиология бурой и черной пятнистости плодов перца в Краснодарском крае // М.: Автореф. канд. биол. наук. -1961.

16. Мокрякова М.В., Абдеева И.А., Пирузян Э.С., Шаад Н.В., Игнатов А.Н. Разнообразие генов-эффекторов у бактерий рода Xanthomonas. II Микробиология. -2010. -№1. (в печати).

17. Петрикеева Е.В. Бактериальные болезни помидоров. Распространение болезней сельскохозяйственных культур в 1968 1972 гг. // Ленинград. ВИЗР. -1973.

18. Пономаренко Е.А., Лисица А.В., Карузина И.И., Гусев С.А. База знаний по цитохромам Р450. // М.: Сборник материалов Сессии ИВТН-2006. -2006. -С. 32.

19. Северцов А.Н. Морфологические закономерности эволюции. //М.: изд-во АН СССР. -1939. -С.610.

20. Сидоренко С.С., Айзенберг С.З. Бактериозы томатов в условиях Киевской области // Сб. «Фитопатогенные бактерии» Киев. Наукова Думка. -1975. -С. 219—220.

21. Цыганкова С.В. Использование нового метода ПЦР-фингерпринтинга для дифференциации микроорганизмов на низших таксономических уровнях. // Кандидатская дисс. -2004.

22. Шестаков С.В. Роль горизонтального переноса генов в эволюции. Доклад, прочитанный на теоретическом семинаре геологов и биологов "Происхождение живых систем". 15-20 августа 2003 г., Горный Алтай, стационар "Денисова Пещера". Электронная публикация.

23. Шмальгаузен И.И. Проблемы дарвинизма. // Л.: Наука, -1969. -С. 493.

24. Alay К., Altinyay N., Hancioglu О., Dundar F., Unal A. Studies on desiccation of hazelnut branches in the Black Sea region. // Bitiki Koruma Bulteni. -1973. -V.13. -P. 202-213.

25. Aim E.J., Huang K.H., Price M.N., Koche R.P:, Keller K., Dubchak I.L., Arkin A.P. The MicrobesOnline Website for Comparative Genomics. // Genome Research, -2005. —V. 15 (7). — P. 1015-1022.

26. Alvarez A.M., Benedict A.A., Mizumoto C.Y. Identification of xanthomonads and grouping of strains of Xanthomonas campestris pv. campestris with monoclonal antibodies. // Phytopathology. -1985. -V. 75 (6). -P. 722-728.

27. Alvarez A.M., Benedict A.A., Mizumoto C.Y., Hunter J.E., Gabriel D.W. Serological, pathological, and genetic diversity among strains of Xanthomonas campestris infecting crucifers. // Phytopathology. -1994. -V. 84. -P. 1449-1457.

28. Alvarez A.M. and Lou K. Rapid identification of Xanthomonas campestris pv. campestris by ELISA. // Plant Disease. -1985. -P. 69. -C. 1082-1086.

29. Aravind'L., Leipe D.D. and Koonin E.V. Toprim: a conserved catalytic domain in type IA and II topoisomerases, DnaG-type primases, OLD- family nucleases and RecR proteins. // Nucleic Acids Res. -1998. -V. 26. -P. 4205^1213.

30. Barss H.P.'. A new filbert disease in Oregon. // Oregon Agricultural Experiment Station Biennial Crop Pest and Horticulture Report. -1913. -V. 14. -P. 213-223.

31. Battilani P., Rossi V. and Saccardi A. Development of xanthomonas arboricola pv. pruni epidemics on peaches. // J. of Plant Pathology. -1999. -V. 81 (3). -P. 161-171.

32. Becker A. and Vorholter. Xanthan'Biosynthesis by Xanthomonas Bacteria: An Overview of the Current-Biochemical, and" Genomic Data. // Microbial Production of Biopolymers and Polymer Precursors. Caister Academic Press. -2009? ISBN 978-1-904455-36-3.

33. Becker A., Katzen F., Puhler A., and Ielpi L. Xanthamgum biosynthesis and application: a biochemical/genetic perspective. // Appl. Microbiol. Biotechnol. -1998. -V. 50. -P. 145-152.

34. Benedict A.A., Alvarez A.M. and Pollard L.W. Pathovar-specific antigens of Xanthomonas campestris pv. begoniae and X.campestris pv. pelargonii detected with monoclonal antibodies. //Appl. Env. Microbiol. -1990, -V. 56. -P. 572-574.

35. Bergey's manual of Systematic Bacteriology. -1984. Baltimore: The Williams & Wilkins Co. (Co-edetor: Peter H.A. SneathNoel R.Krieg), Ed. VHIth, 2, -P. 965-1599.

36. Bikandi J., San Millan R., Rementeria A. and Garaizar J. In silico analysis of complete bacterial genomes: PCR, AFLP-PCR, and endonuclease restriction. // Bioinformatics -2004. -V. 20 (5). -P. 798-799.

37. Birnboim H.C., Doly J. A rapid alkaline extraction procedure for screening recombinant plasmid DNA//Nucl. Acids Res. -1979. -V. 7. P. -1513-1523.

38. Bossio D.A., Scow K.M. Impacts of Carbon * and Flooding on Soil Microbial Communities: Phospholipid Fatty Acid Profiles and Substrate Utilization Patterns // Microb. Ecol. 1998. -V. 35. -P. 265-278.

39. Boudon S., Manceau C. and Notteghem J.-L„ Structure and origin of Xanthomonas arboricola pv. pruni populations causing bacterial spot of stone fruit trees in Western Europe. // Phytopathology. -2005. -V. 95. -P. 1081-1088.

40. Bradbury J.F. Guide to plant pathogenic bacteria. // Wallingford, UK. -C. CAB International. -1986.

41. Braun V. Energy-coupled transport and signal transduction through the gram-negative outer membrane via TonB-ExbB-ExbD-dependent receptor proteins. // FEMS Microbiol Rev -1995.-V. 16.-P. 295-307.

42. Brinkerhoff L.A. Variation in Xanthomonas malvacearum and its relation to control. //Annu. Rev. Phytopathol. -1970. -V. 8. -P. 85-110.

43. Brosius J., Dull T.J., Sleeter D.D. and Noller H.F. Gene organization and primary structure of a ribosomal RNA operonfrom Escherichia coli. // J Mol Biol. -1981. -V. 148. -P. 107-127.

44. Burgmann H., Widmer F., von Sigler W., Zeyer J. New Molecular Screening Tools for Analysis of Free-Living Diazotrophs in Soil // Appl. Environ. Microbiol. -2004. -V. 70. -№ 1. -P. 240-247.

45. Btittner D, Nennstiel D, Kliisener В, Bonas U. Functional analysis of HrpF, a putative type III translocon protein from Xanthomonas campestris pv. vesicatoria. // J Bacterid. -2002. -V. 184.-P. 2389-2398.

46. Canchaya С., Proux C., Fournous G., Bruttin A. and Briis H. Prophage Genomics. // Microbiol, and Molec. Biol. Rev. -2003. -V. 67 (2). -P. 238-276.

47. Caron P. R. Appendix: compendium of DNA topoisomerase sequences. In M.-A. Bjornsti, and N. Osheroff (ed.), DNA topoisomerase protocols. DNA topology and enzymes, // Humana Press, Totowa, N.J. -1999. -V. 94. -P. 279-316.

48. Champoux J.J. DNA topoisomerases: structure, function, and mechanism. // Annu. Rev. Biochem. -2001.V. 70. -P: 369-413.

49. Chase A.R., Stall R.E., Hodge N.C. and Jones J.B. Characterization of Xanthomonas campestris strains from aroids using physiological, pathological, and fatty acid analyses. // Phytopathology. -1992. -V. 82. -P. 754-759.

50. Chen J., Roberts P. and Gabriel D.W. Effects of a virulence locus from Xanthomonas campestris 528T on pathovar status and ability to elicit blight symptoms on crucifers. // Phytopatology, -1994.-V. 84. -P. 1458-1464.

51. Cho H.S., Lee S.S., Kim K.D, Hwang I., Lim J.-S., Park Y.-I., Pai H.-S. DNA Gyrase Is Involved in Chloroplast Nucleoid Partitioning. // Plant Cell. -2004. -V. 16 (10). -P. 2665-2682.

52. Church M.J., Short C.M., Jenkins B.D., Karl D.M., Zehr J.P. Temporal Patterns of Nitrogenase Gene (niffl) Expression in the Oligotrophic North Pacific Ocean. // Appl. Environ. Microbiol. -2005. -V. 71. -№ 9. p. 5362-5370.

53. Cobb B.D. and Clarkson J.M. A simple procedure for optimizing the polymerase chain reaction (PCR) using modified Taguchi methods. // Nucleic Acids Res. -1994. -V. 22. -P. 38013805.

54. Collins M.D. and Jones D. Distribution of isoprenoid quinone structural types in bacteria and their taxonomic implications // Microbiol. Rev. -1981. -V. 45. -P. 316-354.

55. Col well R.R. Polyphasic taxonomy of the genus Vibrio: numerical taxonomy of Vibrio cholerae, Vibrio parahaemolyticus, and related Vibrio species. // J.Bacteriol. -1970. -V. 104. -P. 410-433.

56. Condon С., Squires С., Squires С. L. Control of rRNA transcription in Escherichia coli. // Microbiol Rev. -1995. -V. 59. -P. 623-645.

57. Cooper J.E. and Feil E.J. Multilocus sequence typing what is resolved. // TRENDS in Microbiol. -2004. -V. 12. -P. 373-377.

58. Costenaro L., Grossmann J.G., Ebel C., Maxwell A. Modular structure of the full-length DNA gyrase В subunit revealed by small-angle X-ray scattering. // Structure. -2007. —V. 15 (3). -P. 329-339.

59. Creighton Т.Е. Disulphide bonds and protein stability. // Bioessays. -1988. -V. 8. -P. 57-63.

60. Cubero J. and Graham» J.H. The leucine-responsive regulatory protein (lrp) gene for characterization of the relationship among Xanthomonas species. // Int. J. Syst. Evol. Microbiol. -2004. -V. 54. -P. 429-437.

61. Cubero J. and Graham J.H. Genetic relationship among worldwide strains of Xanthomonas causing canker in citrus species and design of new primers for their identification by PCR. // Appl. and Environmental Micr. -2002. -V. 68. -P. 1257-1264.

62. Day W.A. and Maurelli A.T. Black holes and antivirulence genes: selection for gene loss as part of the evolution of bacterial pathogens. In Evolution of Microbial Pathogens. Edited by: Seifert H.S., Dirita V.J. // Washington, D.C.: ASM Press; -2006.

63. DeFranco A.L. and Koshland D.E.Jr. Multiple methylation in processing of sensory signals during bacterial chemotaxis. // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. -1980. -V. 77. -P. 24292433.

64. Degtyarenko K.N. Structural domains of P450-containing monooxygenase systems. // Protein Engineering. -1995. -V. 8. -P. 737-747.

65. Dekio S., Yamasaki R., Jidoi J., Hori H. and Osawa S. Secondary structure and phylogeny of Staphylococcus and Micrococcus 5s rRNA. // J. Bacterial. -1984. -V. 159. -P. 233-237.

66. Delucca R. and McCracken M.D. Observations on interactions between naturally-collected bacteria and several species of algae. // Hydrobiologia. -1977.-V. 55. -P. 71-75.

67. Devereux J., Haeberli P. And Smithies O. A comprehensive set of sequence analysis programs for the vax. //Nucl. Acid. Res. -1984. -V. 12. -P. 387-395.

68. Dewick P.M. and Haslam E. Phenol Biosynthesis in Higher Plants. // Biochem. J. -1969. -V. 113.-P. 537-542.

69. Dobrindt U. and Hacker J„ Whole genome plasticity in pathogenic bacteria. // Curr. Opin. Microbiol. -2001. -V. 4. -P. 550-557.

70. Dobrindt U., Hochhut В., Hentschel U. and Hacker J. Genomic islands in pathogenic and environmental microorganisms. // Nat. Rev. Micro. -2004. -V. 2. -P. 414-424.

71. Doidge E.A. A tomato cancer. // J. Dep. Agr. Unions. Afr. -1920.N.1. -P. 718—721.

72. Dubiley S., Kirillov E., Mirzabekov A. Polymorphism analysis and gene detection by minisequencing on an array of gel-immobilized primers // Nucleic Acids Res. -1999. -V. 27. -P. 19.

73. Dye D.W., Bradbury J.F., Diskey R.S., Goto M., Hayward A.C. International standards for naming pathovars of phytopathogenic bacteria and a list of pathovar names and pathotype strains. // Rev. Plant Pathol. -1980. -V. 59. -P. 153-168.

74. Dye D.W. and Lettiot R.A. Genus Xanthomonas. Ed. Bushanan. 8th. ed. -1968. -P. 339345.

75. Edmilson R., Goncalves E.R., Rosato Y.B. Phylogenetic analysis of Xanthomonas species based upon 16S-23S rDNA intergenic spacer sequences. // IJSEM. -2002. -V. 52. -P. 355-361.

76. EPPO/CABI. Xanthomonas arboricola pv. pruni. In: Quarantine Pests for Europe, 2nd edn. // CAB International, Wallingford (GB). -1997. -P. 1096-1100.

77. Feil E.J. Small change: keeping pace with microevolution. // Nat. Rev. Microbiol. -2004. -V. 2. -P. 483-495.

78. Fleming S.B., Block J., Fraser K.M., Mercer A. A. and Robinson A. J. Conservation of gene structure and arrangement between vaccinia virus and orf virus. // Virology. -1993. —V. 195.-P. 175-184.

79. Flor H. Current status of the gene-for-gene concept. // Annu. Rev. Phytopathol.-1971. -V. 9. -P. 275-296.

80. Fox G.E., Wisotzkey J.D. and Jurtshuk P. Jr. How close is close: 16s rRNA sequence identity may not be sufficient to guarantee species identity. // Int J Syst Bacterid. -1992. -V. 42, -P. 166-170.

81. Franco A.A., Rodney K., Cheng R.K., Chung G.T., Wu C., Oh H.-B. and Sears C.L. Molecular Evolution of the Pathogenicity Island of Enterotoxigenic Bacteroides fragilis Strains. //J. of Bacteriology. -1999. -V. 181 (21). -P. 6623-6633.

82. Frapolli M., Defago G., Moenne-Loccoz Y. Multilocus sequence analysis of biocontrol fluorescent Pseudomonas spp. producing the antifungal compound 2,4-diacetylphloroglucinol. // Env. Microbiology. -2007. -V. 9 (8). -P. 1939-1955.

83. Frost G.E., Rosenberg H. Relationship between the tonB locus and iron transport in Escherichia coli. // J Bacteriol. -1975 -V. 124 (2). -P. 704-712.

84. Fuglsang A. Distribution of' potential type II restriction' sites (palindromes) in prokaryotes. // Biochem. Biophys. Res. Commun. -2003. -V. 310 (2). -P. 280-285.

85. Fujimura-Kamada K., Nouvet F.J. and Michaelis S. A Novel Membrane-associated Metalloprotease, Ste24p, Is Required for the First Step of NH2-terminal Processing of the Yeast a-Factor Precursor. // J. Cell Biol. -1997. -V. 136. -P. 271-285.

86. Funk D.J. and Omland K.E. Species-level paraphyly and polyphyly: Frequency, causes, and consequences, with insights from animal mitochondrial DNA. // Annual Review of Ecology Evolution and Systematics, -2004. -V. 34 (1). -P. 397-423.

87. Gabriel D.W. Why do pathogens carry avirulence genes? // Physiol. Mol. Plant Pathol. 1999. .-V. 55. -P. 205-214.

88. Gabriel D.W., Kingsley M.T., Yang Y., Chen J. and Roberts P. Host-specific virulence genes of Xanthomonas in: Molecular Mechanisms of Bacterial Virulence. Eds. Kado C.I. and Crosa J. // Kluwer Academic Publishers, Dordrecht. -1993. -PP. 141-158.

89. Gardan L. Bacterial blight of hazel-nut caused by Xanthomonas corylina. // Convegno Internazionale sul Nocciulo Avellino. -1983. -P. 443-450.

90. Gardner M.W. and Kendriek I.B. Bacterial spot of tomato and pepper. // Phytopathology. -1923.-V. 13.-P. 307-315.

91. Gardner M.W and Kendriek I.B. Bacterial spot of tomato. // J. Agr. Res. (Washington,

92. D.C.), -1921. -V. 21. -P. 123-156.

93. Garfinkel D. Studies on pig liver microsomes.Enzymes and pigment composition of different microsomal fractions. // Arch.Biochem.Biophys. -1958. —V. 77. —P. 493-509.

94. Gevers D., Dawyndt P., Vandamme P., Willems A., Vancanneyt M., Swings J., De Vos P. Stepping stones towards a new prokaryotic taxonomy. // Phil. Trans. R. Soc. B. -2006. -V. 361.-P. 1911-1916.

95. Gevers D., Cohan F.M., Lawrence J.G., Spratt B.G., Coenye Т., Feil E.J., Stackebrandt

96. E., Van de Peer Y., Vandamme P., Thompson F.L. and Swings J. Opinion paper: Reevaluating prokaryotic species. //Nature Rev. Microbiol. -2005. —V. 3. -P. 733-739.

97. Gilson E., Clement J.-M., Perrin S. and Hifnung M. Palindromic units a case of highly repetitive DNA sequences in bacteria. // Trends Genet. -1987. -V. 3. -P. 226-230.

98. Goode M.J., Sasser M. Prevention the key to controlling bacterial speck and bacterial speck of tomato. // Plant Disease. -1980. -V. 64. -P: 831-834.

99. Goebl M. and Yanagida M. The TPR snap helix: a novel protein repeat motif from mitosis to transcription. //Trends Biochem Sci. -1990. -V. 16. -P. 173-177.

100. Goncalves E.R. and Rosato Y.B. Phylogenetic analysis of Xanthomonas species based upon 16S-23S rDNA intergenic spacer sequences // Int. J. Syst. Bacteriology. -2002. -V.52. -P. 355-361.

101. Gonzalez R. and Hanna B.A. Evaluation of Gen-Probe DNA hybridization systems for the identification of Mycobacterium tuberculosis and Mycobacterium avium-intracellulare. // Diagn. Microbiol. Infect. Dis. -1987. -V. 8 (2). -P. 69-77.

102. Goto M. Fundamentals of bacterial plant pathology. // San Diego, USA. -C. Academic Press Inc. -1992.

103. Guengerich F.P., Gillam E.M.J. and Shimada T. New applications of bacterial systems to problems in toxicology. // Crit. Rev. Toxicol. -1996. -V. 26. -P. 551-583.

104. Guengerich F.P. Cytochrome P450 enzymes. // Am. Sci. -1993. -V. 81. -P. 440—448.

105. Guerrero C.J. and Lobos A.W. Xanthomonas campestris pv. corylina, causal agent of bacterial blight of hazel in region IX, Chile. //Agricultura Tecnica Santiago. -1987. -V. 47. -P. 422-426.

106. Gurtler Y., Mayall B.C. Genetic transfer and genome evolution in MRS A // Microbiology. -2001. -V. 147. -P. 3195-3197.

107. Gurtler V. and Stanisich V.M. New approaches to typing and identification of bacteria using the 16S-23S rDNA spacer region. // Microbiology. -1996. -V. 142. -P. 3-16.

108. Gurtler Y., Wilson V.A., Mayall B.C. Classification of medically important Clostridia using restiction endonuclease site differences of PCR-amplified 16S rRNA // J. Gen. Microbiol. -1991.-V. 137. -P. 2673-2679.

109. Hall Т. BioEdit: a user-friendly biological sequence alignment editor and analysis program for Windows 95/98/NT//Nucl. Acids Symp. -1999. -Ser. 41. -P. 95-98.

110. Hantke K. and Braun V. Membrane receptor dependent iron transport in Escherichia coli. // FEBS Lett. -1975. -V. 49 (3). -P. 301-305.

111. Hartung J.S., Daniel J.F. and Pruvost O.P. Detection of Xanthomonas campestris pv. citri by the polymerase chain reaction. // Appl. and Env. Microbiology. -1993. -V. 59. -P. 1143— 1148.

112. Hauben L., Vauterin L., Swing J, Moore ERB. Comparison of 16s ribosomal DNA sequences of all Xanthomonas species. // Int. J. Syst. Bacteriol. -1997.-V. 47. -P.328-335.

113. Heath M.C. The role of gene-for-gene interactions in the determination of host species specificity. // Phytopathology. -1991. -V. 81. -P. 127-130.

114. Hennig W. Phylogenetic systematics. // Urbana: Illinois Univ. Press, -1966. -P. 263.

115. Henriksen S.D. Serotyping of bacteria. // Methods Microbiol. -1978. -V. 12. -P. 1-13.

116. Higgins B.B. The bacterial spot of pepper. // Phytopathology. -1922. -V. 12. -P. 501516.

117. Hirokazu О. Phylogenetic Analysis of Genus Xanthomonas. // Plant Protection. -2006.-V. 60 (9). -P. 448-451.

118. Huang H.C., Hsieh T.F., Erickson R.S. Biology and epidemiology of Erwinia rhapontici, causal agent of pink seed and crown rot of plants. // Plant pathol. Bull. -2003. -V. 12. -P. 69-76.

119. Huang W.M. Bacterial diversity based on type II DNA topoisomerase genes. // Annu. Rev. Genet. -1996. -V. 30. -P. 79-107.

120. Hueck C.J. Type III Protein Secretion Systems in Bacterial Pathogens of Animals and Plants. // Microbiol. Mol. Biol. Rev. -1998. -V. 62. -P. 379-433.

121. Hugh R., Leifson E. The taxonomic significance of fermentative versus oxidative metabolism of carbohydrates by various gram-negative bacteria // J. Bact. -1953. -V. 66. -P. 2426.

122. Hung C.H., Yang C.F., Yang C.Y. Involvement of tonB-exbBDlD2 operon in infection of Xanthomonas campestris phage phi L7. // Biochem and Biophys Res Commun. -2003. -V. 302. -P.878-884.

123. Hunter J.E., Abawi G.S., Becker R.F. Observations on the source and spread of Xanthomonas campestris in an epidemic of black rot in New York. // Plant Disease Reporter. -1975.-V. 59 (5). -P. 384-387.

124. Hunter R.E., Brinkerhoff L.A. and Bird L.S. The development of a set of upland cotton lines for differentiating races of Xanthomonas malvacearum. // Phytopathology. -1968. -V. 58. — P. 830-832.

125. Hurt E.G. and Loon A.P.G.M. How proteins find mitochondria and intramitochon- drial compartments. // Trends in Biochem. Sci. -1986. -V. 11. -№ 5. p. 204-207.

126. Ignatov A., Kuginuki Y, Kobayashi I, Masuda H, Yamada K, Hida K. Variation of pathogenicity in Xanthomonas campestris pv. campestris in Japan. // J. J. Hort. Society. -1997a. -V.4 (Suppl.l). -P. 67-68.

127. Ignatov A., Monakhos G., Jalilov F. Shift of Xanthomonas campesrtis pv. campesrtis race 1 to race 0 in planta. // J. Rus. Soc. Plant Pathol. -2001. -V. 2. -P. 68-70.

128. Innes R.W. Plant-parasite interactions: has the gene-for-gene model become outdated? // Trends in Microbiology. -1995. -V. 3. -P. 483-485.

129. Ioannides C. Cytochrome P450: Role in the Metabolism and Toxicity of Drugs and Other Xenobiotics (Issues in Toxicology). // Royal Society of Chemistry Cambridge, UK. -2008. -Ps. 400.

130. Iteman I., Rippka R, Tandeau de Marsac, Herdman M. Comparison of conserved structural and regulatory domains within divergent 16S rRNA-23S rRNA spacer sequences of cyanobacteria. // Microbiology. -2000. -V. 146. -P. 1275-1286.

131. Jackson R.W. Plant pathogenic bacteria: genomics and molecular biology. //Horizon Scientific Press. -2009. -Ps. 330.

132. Janga S.C., Collado-Vides J., Moreno-Hagelsieb G. Nebulon: a system for the inference of functional relationships of gene products from the rearrangement of predicted operons. // Nucleic Acids Res. -2005. -V. 33 (8). -P. 2521-2530.

133. Janse J.D. Standartization, validation and approval of test methods for quarantine bacteria: examples of harmonizations in plant health laboratories in Europe. // Phytopathol. Polonica. -2005."-V. 35. -P. 19-27.

134. Jensen M.A., Webster J.A., Straus N. Rapid identification of bacteria on the basis of Polymerase Chain Reaction-Amplified ribosomal DNA spacer polymorphism. // Appl. Environ. Microbiol. -1993. -V. 59. -P. 945-952.

135. Johnson J.R. Development of polymerase chain reaction- based assays for bacterial gene detection. // J. Microbiol.Methods. -2000. -V. 41. -P. 201-209.

136. Jones J.D.G. and Dangi J.L. The plant immune system. // Nature. -2006. -V. 444, -P. 323-329.

137. Jones J.B., Bouzar H., Somodi G.C., Stall R.E., Pernezny K., Morsy G., Scott J.W. Evidence for the preemptive nature of tomato race 3 of Xanthomonas campestris pv. vesicatoria in Florida. // Phytopathology. -1998. -V. 88. -P. 33-38.

138. Kamoun S., Kado C.I. Phenotypic switching affecting chemotaxis, xanthan production, and virulence in Xanthomonas campestris. // Appl. Environm. Microbiol., -1990: -V. 56. —P. 3855-3860.

139. Kamoun S., Kadmar H.V., Tola E., Kado C.I. Incompatible interaction between crucifers and Xanthomonas campestris involve a vascular hypersensitive response. -C. role of the hrpX locus. // Molec. Plant Micr. Interact. -1992. -V.5. -P. 2233-2236.

140. Kampranis S.C., Maxwell A. Conformational Changes in DNA Gyrase Revealed by Limited Proteolysis. //J. Biol. Chem. -1998. -V. 273. -P. 22606-22614.

141. Kasai H., Ezaki T. and Harayama S. Differentiation of phylogenetically related slowly growing mycobacteria by their gyrB sequences. // J. Clin. Microbiol: -2000. -V. 38. -P. 301308.

142. Kay S., Hahn S., Marois E., Hause G., Bonas U. A Bacterial Effector Acts as a Plant Transcription Factor and Induces a Cell Size Regulator. // Science. -2007. -V. 318. -№ 5850. -P. 648-651.

143. Kjemtrup S., Nimchuk Z., Dangi J.L. Effector proteins of phytopathogenie bacteria: bifunctional signals in virulence and host recognition. // Curr. Opin. Microbiol. -2000. -V. 3. -P. 73-78.

144. Kim B.S. Testing for detection of Xanthomonas campestris pv. campestris in crucifer seeds and seed disinfection. // Korean Journal of Plant Pathology, -1986. -V.2 (2). -P. 96-101.

145. Kim J., Nietfeld J., Benson A.K. Octamer-based genome scanning distinguishes a unique subpopulation of E. coli 0157:H7 strains in cattle // PNAS. -1999. -V. 96. -P. 13288-13293.

146. Kimura M.A. simple method for estimating evolutionary rate at base substitudions through comparative studies of nucleotide sequences // J. Mol. Evol. -1980. -V. 16. -P. 111-120.

147. Kirk J.L., Beaudette L.A., Hart M., Moutoglis P., Klironomos J.N., Lee H., Trevors J.T. Methods of studying soil microbial diversity // J. Microbiol. Methods. -2004. -V. 58. -P. 169188.

148. Klingenberg M. Pigments of liver microsomes. // Arch.Biochem.Biophys. -1958. -V. 75. -P. 376-386.

149. Kocks C.G., Zadocks J.C. Cabbage refuse piles as sources of inoculum in black rot epidemics. // Plant Disease. -1996. -V. 80. -P. 789-792.

150. Kolb S., Knief C., Stubner S., Conrad R. Quantitative Detection of Methanotrophs in Soil by Novel pmoA-Targeted Real-Time PCR Assays // Appl: Environ. Microbiol. -2003. —V. 69. -№ 5. -P. 2423-2429.

151. Kolbert C.P. and Persing D.H. Ribosomal DNA sequencing as a tool for identification of bacterial pathogens. // Curr. Opin. Microbiol. -1999. -V. 2. -P. 299-305.

152. Konstantinidis K.T. and Tiedje J.M. Genomic insights that advance the species definition for prokaryotes. // PNAS. -2005. -V. 102 -P. 2567-2572.

153. Kornitzer D., Teff D., Altuvia S , Oppenheim A.B. Isolation, characterization, and sequence of an Escherichia coli heat shock gene, htpx. // J. Bacteriol. -1991. -V. 173. -P. 2944— 2953.

154. Kostman J.R., Edlind T.D., LiPuma J.J., Stull T.L. Molecular epidemiology of Pseudomonas cepacia determined by polymerase chain reaction ribotyping // J. Clin. Microbiol. -1992. -V. 30. -P. 2084-2087.

155. Kovacs N. Identification of Pseudomonas pyocyanea by the oxidase reaction. // Nature (London). -1956. -V. 178. -P. 703.

156. Koval G.K. Diseases of hazel. // Zashchita Rastenii. -1978. -V. 8. -P. 44-45.

157. Kuflu K.M. and Cuppels D.A. Development of a diagnostic DNA. probe for xanthomonads causing bacterial spot of peppers and tomatoes. // App: and env. Microbiology. -1997. -V. 63(11). -P. 4462-4470.

158. Lamb J.R., Tugendreich S. and Hieter P. Tetratrico peptide repeat interactions: to TPR or not to TPR? // Trends in Biochemical Sciences. -1995. -V. 20 (7). P. 257-259.

159. Lamb ^ C.J., Lawton M.A., Dron M. and Dixon R.A. Signals and transudation mechanisms for activation of plant defense against microbial attack. // Cell. -1989. -V. 56. -P. 215-224.

160. Lane D.J. 16S/23S rRNA sequencing. Nucleic acid techniques in bacterial systematics. // New York, NY, John Wiley and Sons. E. Stackebrandt and M. Goodfellow, eds. -1991. -P. 115175.

161. Lazo G.R., Roffey R. and Gabriel D. W. Path ovars of Xanthomonas campestris are distinguishable by restriction fragment length polymorphism. // Int. J. Syst. Bacterid. -1987. —V. 37.-P. 214-221.

162. Leach J. E. and White F. F. Bacterial avirulence genes. // Annu. Rev. Phytopathol. -1996. -V. 34. -P. 153-179.

163. Lee Y.-A. and Chou S.-L. Quinate metabolism and utilization as phenotypic propeties to identify Erwinia cypripedii and E. rhapontici. // Plant pathol. Bull. -2003. -V. 12. -P. 242-246.

164. Lee Y.-A., Hildebrand D.C., Schroth M.N. Use of quinate metabolism as a phenotypic property to identify members of Xanthomonas campestris DNA homology group 6. // Phytopathology. -1992. -V. 82. -P. 971-973.

165. Leite R.M.V.B.C., Ruano O. and Komori N. Characterization of Xanthomonas campestris pv. campestris isolated from canola. // Summa Phytopathologica, -1994, -V.20. -P. 35-38.

166. Lengeler J.W., Drews G., Schlegel H.G. Biology of the prokaryotes. // Georg Thieme Verlag. -1999. -PP. 955.

167. Lerat E., Daubin V., Ochman H., Moran N.A. Evolutionary origins of genomic repertoires in bacteria. // PLoS Biol. -2005. -V. 5. -E.130.

168. Leyns F., Cleene M.D., Swings J.-G. and Ley J.D. The host range of the genus Xanthomonas. // Botanical review. -1984, -V. 50. -P. 308-356.

169. Li H. and Poulos T.L. Modeling protein-substrate interactions in the heme domain of cytochrome P450(BM-3). //Acta Crystallogr. D. Biol. Crystallogr. -1995. -V. 51 (Pt 1). -P. 2132.

170. Liao C.-H. and Wells J.M. Association of pectolitic starins of Xanthomonas campestris with soft rot of fruits and vegetables at retail markets. // Phytopatology. -1987. -V. 77. -P. 418422.

171. Librado P. and Rozas J. DnaSP v5: A software for comprehensive analysis of DNA polymorphism data. // Bioinformatics. -2009. -V. 25. -P. 1451-1452.

172. Lindeberg M., Myers C., Collmer A., Schneider D. Roadmap to new virulence determinants in Pseudomonas syringae: insights from comparative genomics and genome organization. // Mol PlantMicrobe Interact. -2008. -V. 21. -P. 685-700.

173. Locke T. and Barnes D. New or unusual records of plant diseases and pests. Xanthomonas corylina on cob-nuts and filberts. // Plant Pathology. -1979. —V. 28. -P. 53.

174. Lopez M.M., Bertolini E., Olmos A., Caruso P., Gorris M.T., Llop P., Penyalver R., Cambra M. Innovative tools for detection of plant pathogenic viruses and bacteria. // Int. Microbiol. -2003. -V. 6. -P. 233-243.

175. Loreti S., Gallelli A., Belisario A., Wajnberg E., Corazza L. Investigation of genomic variability of Xanthomonas arboricola pv.Juglandis by AFLP analysis. // Eur. J. of plant pathology. -2000. -V. 107, -P. 583-591.

176. Louws F.J., Rademaker J.L.W. and de Bruijn F.J. The three Ds of PCR-based genomic analysis of phytobacteria: diversity, detection, and disease diagnosis. // Annu. Rev. Phytopathol. -1999. ~y'. 37. -P. 81-125.

177. Louws F.J., Fulbright D.W., Stephens C.T., de Bruijn F.J. Differentiation of genomic structure by rep-PCR fingerprinting to rapidly classify Xanthomonas campestris pv. vesicatoria. // Phytopathology, -1994, -V. 85. -P. 528-536.

178. Lupski J.R., and Weinstock G.M. Short, interspersed repetitive DNA sequences. // J. Bacteriol. -1992. -V. 174. -P. 4525-4529.

179. Maiden M.C. Multilocus sequence typing of bacteria. // Annu Rev Microbiol. -2006. -V. 60.-P. 561-588.

180. Maiden M.C., Bygraves J.A., Feil E. Multilocus sequence typing: a portable approach to the identification of clones within populations of pathogenic microorganisms. // Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. -1998. -V. 95. -P. 3140-3145.

181. Matheson V.G., Munakata-Marr J., Hopkins G.D., McCarty P.L., Tiedje J.M. and Forney L.J. A Novel Means To Develop Strain-Specific DNA Probes for Detecting Bacteria in the Environment. // Appl. and env. Microbiol. -1997. -V. 63 (7). -P. 2863-2869.

182. Matzura O. and Wennborg A. "RNAdraw: an integrated program for RNA secondary structure calculation and analysis under 32-bit Microsoft Windows". // Computer App. in the Biosciences (CABIOS). -1996. -V. 12. -P. 247-249.

183. McCuloch L.A. A bacterial leaf spot of horse-radish caused by Bacterium campestris var. armoraciae. //N.Var. J.Agr. Res. -1929, .-V. 38. -P. 269-287.

184. McDonell M.T. and Colwell R.R. Phylogeny of Vibrionaceae, and recommendation for two new genera, Listonella and Shewanella. // Syst. Appl. Microbial. -1985. -V. 6. -P. 171-182.

185. McFadden L.A., Morey H.R. Bacterial leaf spot disease of poinsettia in Florida. // Plant Disease Reporter. -1962. -V. 46. -P. 551-554.

186. Mew T.W., Alvarez A.M., Leach J.E. and Swings J. Focus on bacterial blight of rice. // Plant Dis. -1993. -V. 77. -P. 5-12.

187. Mihail J.D., Taylor S.J., Verslues P.E., Hodge N.C. Bacterial blight of Crambe abyssinica in Missouri caused by Xanthomonas campestris. // Plant Disease. -1993. -77 (6). -P. 569-574.

188. Minsavage G.V., Schaad N.W. Characterization of membrane proteins of Xanthomonas campestris pv. campestris. // Phytopathology. -1983. -V. 73. -P.747-755.

189. Mizukami T. and Wakimoto S. Epidemiology and control of bacterial leaf blight of rice. // Annu. Rev. Phytopathol. -V. 7. -P. 51-72.

190. Mobarry B.K., Wagner M., Urbain V., Rittmann В and Stahl D.A. Phylogenetic probes for analyzing abundance and spatial organization of nitrifying bacteria. // Appl. Environ. Microbiol. -1996. -V. 62. -P. 2156-2162.

191. Morris C.E., Georgakopoulos D.G. and Sands D.C. Ice nucleation active bacteria andi their.potentialirole in precipitation. // J. Phys. IV France.-2004: -V. 121. -P: 87-103.

192. Mortazavi; R ■, Hayes C.T. and; Ariya P;A;. Ice nucleation activity of bacteria isolated from snow comparediwith'organic and inorganic substrates: // Biogeosciences Discussions. -2008.-V. 5.-P. 1469-1510. • .

193. Nag D: К. and Petes T. D;. S even-base-pair, inverted: repeats; imDN A' form stable hairpins in vivo in Saccharomyces cerevisiae: //Genetics^-1991'.-V! 129 (3):-P: 669-673: •

194. NeuMLand'Kumar S:.Molecular Evolutiomand Phylogenetics;// Oxford^University Press. New York. -2000.

195. Noviello C. Infectiousdiseasesof hazeLV/AnnalideHaFacoltadi Scienze Agrarie della

196. Universita degli Studi dilNapoli'Portici: -1969; -V. 3: -P; 11-39;228: Nyvall R.F. Field crop diseases. // Ames, Iowa: State University Press. -1999:

197. Ochman H., Lawrence J.G., Groisman E.A. Lateral gene transfer and the nature of bacterial innovation. //Nature. -2000. -V. 405. -P. 299-304.

198. OEPP/EPPO. Data sheets on quarantine organisms No. 134, Xanthomonas campestris pv. corylina. // Bulletin OEPP/EPPO Bulletin. -1986. -V. 16. -P. 13-16.

199. OEPP/EPPO. Specific quarantine requirements. // EPPO Technical Documents. -1990. -V. 1008.-P. 10-14.

200. OEPP/EPPO. EPPO Standards. // Bulletin OEPP/EPPO Bulletin. -2005. -V. 35. -P. 543597.

201. Omura T. and Sato R. A new cytochrome in liver microsomes. // J. Biol. Chem. -1962. -V. 237.-P. 375-1376.

202. Opio A.F., Allen D.J., Teri J.M. Pathogenic variation in Xanthomonas campestris pv. phaseoli, the causal agent of common bacterial blight in Phaseolus beans. // Plant pathology. -1996.-V. 45.-P. 1126-1133.

203. Parge H.E., Forest K.T., Hickey M.J., Christensen D.A., Getzoff E.D. and Tainer J.A. Structure of the fibre-forming protein pilin at 2-6 resolution. // Nature. -1995. -V. 378. -P. 3238.

204. Parkinson N., Aritua V., Heeney J., Cowie C., Bew J.D., Stead D. Phylogenetic analysis of Xanthomonas species by comparison of partial gyrase В gene sequences.// Int. J. of Syst. and Evol. Microbiology. -2007. -V. 57. -P. 2881-2887.

205. Patel M.K., Bhatt V.V., Kulkarni Y.S. Three new bacterial diseases of plants from Bombay. // Indian Phytopathology. -1951. -V. 4. -P. 142-151.

206. Pohronezny K. and Volin R.B. The effect of bacterial spot on yield and quality of fresh market tomatoes. //HortScience. -1983. -V. 18. -P. 69-70.

207. Pohronezny K., Stall R.E., Canteros B.I., Kegley M., Datnoff L.E. Sudden shift in the prevalent race of Xanthomonas campestris pv. vesicatoria in peper fields in Southern Florida. // Plant disease. -1992. -V. 76. -P. 118—120.

208. Poplawsky A.R., Chun W. Strains of Xanthomonas campestris pv. campestris with atypical pigmentation isolated from commercial crucifer seeds. // Plant Disease. -1995. -V. 79 (10). -P. 1021-1024.

209. Postle K. TonB and the gram-negative dilemma. // Mol Microbiol. -1990. -V. 4. -P. 2019-2025.

210. Poulsen G.B., Kahl G., Weising K. Differential abundance of simple repetitive sequences in species of Brassica and related Brassicaceae. // Plant Syst. Evol. -1994. -V. 190. -P. 21-30.

211. PQS (Plant Quarantine Service) of Indonesia. 2008. (http://karantina-lampung.deptan. go .id/)

212. Preston C.D., Pearman D.A., Dines T.D. New Atlas of British and Irish Flora. // Oxford University Press, Oxford, UK. -2002.

213. Prunier J.P., Luisetti J., Gardan L., Germain E., Sarraquigne J. La bacteriose du noisetier (Xanthomonas corylina). // Revue Horticole. -1976. -V. 170. -P. 31, 40.

214. Raetz C.R.H. and Whitfield C. Lipopolysaccharide endotoxins. // Annu. Rev. Biochem. -2002.-V. 71.-P. 635-700.

215. Ramirez M.E., Fucikousky L.; Garcia-Jimenez F., Quintero R., Galindo E. Xanthan gum production by altered pathogenicity variants of Xanthomonas campestris. // Appl. Microbiol. Biotechnol., -1988. -V. 29. -P. 5-10.

216. Randhawa P., Schaad N.W. Selective isolation of Xanthomonas campestris pv. campestris from crucifer seeds. // Phytopathology, -1984.-V. 68. -P. 249-252.

217. Ranjard L., Poly F., Nazaret S. Monitoring complex bacterial communities using culture-independent molecular techniques: application to soil environment // Res. Microbiol. -2000. —V. 151.-P. 167-177.

218. Rao J.R., Fleming C.C., Moore J.E. Molecular diagnostics: current technology and applications. // Horizon Scientific Press. -2006. -PP. 379.

219. Roberts S.J. and Koenraadt H. Proposal for a revised method for detection of Xanthomonas campestris pv. campestris in Brassica seed. // Seed Science and Technology -2002. -V. 30. Cited from http. -C.//www.worldseed.org/pdf7WS-xcc-brassica-cabbage.pdf

220. Rocha Eduardo P.C. DNA repeats lead to the accelerated loss of gene order in bacteria. // Trends in Genetics. -2003. -V. 19. -P. 600-603.

221. Rondon M.R., August P.R., Bettermann A.D. Cloning the soil metagenome: a strategy for accessing the genetic and functional diversity of uncultured microorganisms. // Appl. Environ. Microbiol. -2000. -V. 66. -P. 2541-2547.

222. Rutherford K. Artemis: sequence visualisation and annotation. Bioinformatics. -2000. -V. 16. -P. 944-945.

223. Ruissen M.A., Gielink A.J. The development of black rot in cabbage as a result of difference in guttation between cultivars. // Proceedings of the Eight International Conference on Plant Pathogenic Bacteria, 9-12 June, Versailles, France. -1993.

224. Russel H.L. A bacterial rot of cabbage and allied plants.// Wise. Agric. Sta. Bull. -1898. -Ps65.

225. Ryhlik W. OLIGO 7 primer analysis software. // Methods Mol. Biol. -2007. -V. 402. -P. 35-60.

226. Saitou N. and Nei M. The neighbor-joining method: a new method for reconstructing phylogenetic trees // Mol. Biol. Evol. -1987. -V. 4. -P.406-425.

227. Salzberg S.L., Salzberg A.J., Kerlavage A.R. and Tomb J.-F. Skewed Oligomers and Origins of Replication. // Gene. -1998. -V. 217 (1-2). -P. 57-67.

228. Sanger F., Nicklen S., Coulson A.R. DNA sequencing with chain-terminating inhibitors // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. -1977. -V. 84. -P. 5463-5467.

229. Sambrook J., Fritsch E.F. and Maniatis Т. Molecular cloning: -C. a laboratory manual, 2nd ed. Cold Spring Harbor Laboratory Press, Cold Spring Harbor, N.Y. -1989.

230. Santiranjan Bandyopadhyay, Chattopadhyay S.B. Survival of Xanthomonas campestris pv. campestris in soil. // Indian J.f of Mycological Res. -1986. -V. 24 (2). -P. 97-101.

231. Sarkar S.F. and Guttman D.S. The evolution of the core genome of Pseudomonas syringae, a highly clonal, endemic plant pathogen. // Appl. Environ. Microbiol. -2004. -V. 70. -P. 1999-2012.

232. Schaad N.W. (Ed.) Laboratory guide for identification of plant pathogenic bacteria. // St. Paul, Minnesota, USA, APS Press. -1988. -Ed. 2. -P. 164.

233. Schaad N.W. Detection of seedborne bacterial plant pathogens. // Plant Disease. -1982.-V. 66 (10).-P. 885-890.

234. Schaad N.W. and Dianese J.C. Cruciferous weeds as sources of inoculum of Xanthomonas campestris in black rot of crucifers. // Phytopathology. -1981. -V. 71 (11). -P. 1215-1220.

235. Schaad N.W., Franken A.A.J.M. Xanthomonas campestris pv. campestris. Working Sheet 68.// ISTA Handbook On Seed Health Testing. Zurich, Switzerland. -C. International Seed Testing Association. -1997.

236. Schaad N.W., White W.C. Survival of Xanthomonas campestris in soil. // Phytopathology. -1974. -V. 64 (12). -P. 1518-1520.

237. Schaad N.W., Jones J.B. and Lacy G. Xanthomonas. In: Laboratory guide for identification of plant pathogenic bacteria, 3rd edition. Schaad N.W., Jones J.B. and Chun W. (eds.). //APS Press, St. Paul, MN. -2001.

238. Schleifer K.H. and Kandler O. Peptidoglycan types of bacterial cell walls and their taxonomic implications. // Bacteriol Rev. -1972. -V. 36. -P. 407-477.

239. Schuenzel E.L., Sechler A., Ignatov A., Schaad N.W. Multi-locus sequence typing as a tool for taxonomic identification and classification for Xanthomonas campestris pv campestris and related pathovars. // не опубликовано.

240. Schultz Т., Gabrielson R.L. Xanthomonas campestris pv. campestris in Western Washington crucifer seed fields. -C. occurrence and survival. // Phytopathology. -1986. -V. 76 (12). -P. 1306-1309.

241. Scortichini M., Rossi M.P., Marchesi U. Genetic, phenotypic and pathogenic diversity of Xanthomonas arboricola pv. corylina strains question the representative nature of the type strain. // Plant Pathology. -2002. -V. 51. -P. 374-381.

242. Scortichini M. and Rossi M.P. Genetic diversity of Xanthomonas arboricola pv. fragariae strains and comparison with some other X. arboricola pathovars using repetitive PCR genomic fingerprinting. // J. of Phytopathology. -2003. -V. 151. -P. 113-119.

243. Scortichini M. and Simeone A.M. Review of the bacterial diseases of apricot. // Rivista di Frutticoltura e di Ortofloricoltura. -1997. -V. 59. -P. 51-57.

244. Selander R.K., Caugant D.A., Ochman H., Musser J.M., Gilmour M.N. and Whittam T.S. Methods in multilocus enzyme electrophoresis for bacterial population genetics and systematics. //Appl. Environ. Microbiol. -1986. -V. 51. -P. 873-884.

245. Sharpies G.J., Lloyd R.G. A novel repeated DNA sequence located in the intergenic regions of bacterial chromosomes. //Nucleic acids research. -1990. -V. 18 (22). -P. 6503-6508.

246. Sikorski R.S., Boguski M.S., Goebl M. and Hieter P. A repeating amino acid motif in CDC23 defines a new family of proteins and a new relationship among genes required for mitosis and RNA synthesis. // Cell. -1990. -V. 26. -P. 307-317.

247. Smith C.W.J. RNA-protein interactions: a practical approach. // Oxford University Press. -1998.-T. 192. —PP.341.

248. Spratt B.G., Maiden M.C. Bacterial population'genetics, evolution and epidemiology // Phil. Trans. R. Soc. Lond. B. -1999. -V. 354. -P. 701-710.

249. Srivastava A.K. and Schlessinger D„ Mechanism and regulation of bacterial ribosomal RNA processing. // Annu. Rev. Microbiol. -1990.-V. 44. -P. 105-129.

250. Srivastava A.K. and Schiessinger D. Structure and organization of ribosomal DNA. // Biochimie. -1991. -V. 73. -P. 631-638.

251. Stahl D.A., Lane D.J., Olsen G.J. and Pace N.R. Characterization of Yellowstone hot spring microbial community by 5S rRNA sequences // Appl. Environ. Microbiol. -1985. -V. 49. -P. 1379-1384.

252. Stall R.E., Gottwald T.R., Koizum M., Schaad N.W. Ecology or plant pathogenic xanthomonads. // In. -C. Swings J.G., Civerolo E.L., eds. Xanthomonas, 1st ed. London, UK. -C. Chapman and Hall. -1993. -P. 265-299.

253. Starr M.P., Jenkins C.L., Bussey L.B., Andrewes A.G. Chemotaxonomic significance of the xanthomonadins, novel brominated aryl-polyene pigments produced by bacteria of the genus Xanthomonas. // Archives of Microbiology. -1977. -V. 113 (1/2). -P. 1-9.

254. Starr M.P., Jenkins C.L., Bussey L.B., Andrewes A.G. Chemotaxonomic significance of the xanthomonadins. novel brominated aryl-polyene pigments produced by bacteria of the genus Xanthomonas. // Archives of Microbiology. -1977. -V. 113. -P. 1-9.

255. Starr M.P. and Stephens W.L. Pigmentation and taxonomy of the genusXanthomonas. // J. of Bacteriology. -1964. -V. 87. -P. 293-302.

256. Staskawicz B.J., Ausubel F.M.', Bakeij B.J., Ellis G. and Jones J.D.G. Molecular genetics of plant disease resistance. // Science. -1995. -V. 268. -P. 661-667.

257. Stead D.E., Sellwood J.E., Wilson J., Viney J. Evaluation of a commercial microbial identification system based on fatty acid profiles for rapid, accurate identification of plant pathogenic bacteria. // J.Appl.Bacteriol. -1992. -V. 72. -P. 315-321.

258. Stefani E., Bazzi C., Mazzucchi U. and Colussi A. Xanthomonas campestris pv. pruni in Friuli peach orchards. // Informatore Fitopatologico. -1989. -V. 39. -P. 60-63.

259. Strandberg J„ Spatial distribution of cabbage black rot and the estimation of diseased plant populations. //Phytopathology. -1973. -V. 63 (8). -P. 998-1003.

260. Stravato V.M., Carannante G., Scortichini M. Occurrence of Xanthomonas arboricola pv. poinsetticola on Euphorbia pulcherrima in Italy. // J. of Plant Pathology. -2004. -V. 86. -P. 177.

261. Sutic D. Bacterioze Crvenog Patlidzana (Tomato bacteriosis). // Posebna Izd. Inst. Zasht. Bilja, Beograd (Spec. Edit. Inst. Plant Prot., Beograd). -1957. -V. 6. -P. 1-65.

262. Swings J.G. and Civerolo E.L. Xanthomonas. // Chapman and Hall, London. -1993.

263. Taguchi G. and Wu Y. Introduction to off-line quality control // Japan Quality Control Organisation. Nagoya. Japan. -1980.

264. Tang В., Boisvert P., Higgs P.G. Comparison of tRNA and rRNA phylogenies in proteobacteria: implications for the frequency of horizontal gene transfer. // arXiv:q-bio.PE/0404030. -2004.

265. Taylor J.D., Conway J., Roberts S.J., Astley D., Vicente J.G. Sources and origin of resistance to Xanthomonas campestris pv. campestris in Brassica genomes. // Phytopathology. 2002. -V.92. -P. 105-111.

266. Theodorou^ M.C., Panagiotidis C.A. Panagiotidis C.H. Involvement of the AtoS-AtoC signal transduction system in poly-(R)-3-hydroxybutyrate biosynthesis in Escherichia coli. // Biochimica et Biophysica Acta. -2006. -V. 1760. -P. 896-906.

267. Theron J. and Cloete Т.Е. Molecular techniques for determining microbial diversity and community structure in natural environments. // Critical Rev. in Microbiology. -2000. -V. 26. -P. 37-57.

268. Thomas C.M. and Nielsen K.M. Mechanisms of, and barriers to, horizontal gene transfer between bacteria. //Nature Reviews in Microbiology. -2005. -V. 3. -P. 711-721.

269. Tsygankova S.V., Ignatov A.N., Boulygina E.S., Kuznetsov B.B., Korotkov E.V. Genetic intraspecies relationships in Xanthomonas campestris pv. campestris revealed by novel rep-PCR primers. // European J. Plant Pathol. -2004. -V.l 10. -P. 845-853.

270. Urwin R. and Maiden M.C.J. Multi-locus sequence typing: a tool for global epidemiology. // TRENDS in Microbiol. -2003. -V. 11. -P. 479-487.

271. Van den Mooter M. and Swings J. Numerical analysis of 295 phenotypic features of 266 Xanthomonas strains and related strains and an improved taxonomy of the genus. // Int. J. of Syst. Bacteriology. -1990. -V. 40. -P. 348-369.

272. Vauterin1 L., Rademaker J. and Swings J. Synopsis on the Taxonomy of the Genus Xanthomonas. // The American Phytopathological Society. -2000. -V. 90. -P. 677-682.

273. Vauterin L. and Swings J. Are classification and phytopathological diversity compatible in Xanthomonas? //J. of Industrial Microbiol, and Biotech. -1997. -V. 19 (2). -P. 77-82.

274. Vauterin L., Swings J., Kersters K., Gillis M., Mew T.W., Schroth M.N., Palleroni N.J., Hildebrand D.C., Stead D.E., Civerolo E.L., Hayward A.C., Maraite H., Stall R.E., Vidaver

275. A.K., Bradbury J.F. Towards an improved taxonomy of Xanthomonas. // Int. J. of Syst. Bacteriology. -1990. -V. 40. -P. 312-316.

276. Vauterin L., Hoste В., Kersters K., Swings, J. Rectification of Xanthomonas. // Int. J. Syst. Bacteriology. -1995. -V. 45. -P. 472-489.

277. Vicente J.C., Roberts S.J. and Taylor J.D. Identification and Origin of Xanthomonas campestris pv. campestris Races and Related Pathovars.// Phytopathology. -2001. -V. 91. -P. 492-499.

278. Vicente J.G., Dias J.S., Taylor J.D. Occurrence and distribution of Xanthomonas campestris races in Portugal. // ISHS Symposium on brassicas. 10th Crucifer Genetics Workshop. -1997. 23-27 September. RennesFrance. -P. 214.

279. Vorholter F.J., Schneiker S., Goesmann A., Krause L., Bekel Т., Kaiser O., Linke В., Patschkowski Т., Ruckert C., Schmid J., Sidhu V.K., Sieber V., Tauch A., Watt S.A., Weisshaar

280. B., Becker A., Niehaus K., Ptihler A. The genome of Xanthomonas campestris pv. campestris

281. В100 and its use for the reconstruction of metabolic pathways involved in xanthan biosynthesis. // J Biotechnol. -2008. -V. 134. -P. 33-45.

282. Vos P., Hogers R., Bleeker M., Reijans M., van de Lee Т., Homes M., Frijters A., Pot J., Peleman J., Muiper M., Zabeau M. AFLP: a new concept for DNA fingerprinting // Nucleic Acids Res. -1995. -V. 21. -P. 4407-4414.

283. Wakabayashi S., Kimura Т., Fukuyama K., Matsubara H. and Rogers L.J. The amino acid sequence of a flavodoxin from the eukaryotic red alga Chondrus crispus. // Biochem. J. -1989. — V. 263.-P. 981-984.

284. Wall M.K., Mitchenall L.A., Maxwell A. Arabidopsis thaliana DNA gyrase is targeted to chloroplasts and mitochondria. // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. -2004. -V. 101. -P. 7821-7826.

285. Walker J.C. Diseas of vegetable crops. // McGraw-Hill, New York. -1952.

286. Wang J.C., Caron P.R. and Kim R A. The role of DNA topoisomerases in recombination and genome stability: a double-edged sword? // Cell. -1990. -V. 62. -P. 403-406.

287. Wang P.W., Morgan R.L., Scortichini M. and Guttman D.S. Convergent evolution of phytopathogenic pseudomonads onto hazelnut. // Microbiology. -2007. -V. 153, -P. 2067-2073.

288. Watanabe K., Nelson J., Harayama S. and Kasai H. ICB database: the gyrB database for identification and classification of bacteria. //Nucleic Acids Res. -2001. -V. 29. -P. 344- 345.

289. Wertz J.E., Goldstone C., Gordon D.M., Riley M.A. A molecular phylogeny of enteric bacteria and implications for a bacterial species concept. // J. of Evol. Biology. -2003. -V. 16 (6). -P. 1236-1248.

290. White H. Bacterial spot of radish and turnip. // Phytopathology. 1930. -V. 20. -P. 653662.

291. Wigley D.B., Davies G.J., Dodson E.J., Maxwell A. and Dodson G. Crystal structure of an N-terminal fragment of the DNA gyrase В protein. //Nature. -1991. -V. 351. -P. 624-629.

292. Williams P.H. Black rot. a continuing threat to world crucifers. // Plant Disease. -1980. -V. 64. -P. 736-742.

293. Wimalajeewa D.L.S., Washington W.S. Bacterial blight of hazel-nut. Australasian. // Plant Pathology. -1980. -V. 9. -P. 113-114.

294. Wookey P. The tonB gene product in Escherichia coli. Energy-coupling or molecular processing of permeases? // FEBS Lett. -1982. -V. 139 (2). -P. 145-154.

295. Yamamoto S., Bouvet P. J. and Harayama. S. Phylogenetic structures of the genus Acinetobacter based on gyrB sequences: comparison with- the grouping by DNA-DNA hybridization. // Int. J. Syst. Bacteriol. -1999. -V. 49. -P. 87-95.

296. Yamamoto S. and Harayama S. Phylogenetic analysis of Acinetobacter strains based on the nucleotide sequences of gyrB genes and on the amino acid sequences of their products // Int. J. Syst. Bacteriol. 1996. V.46. P: 506-511.

297. Yamamoto S. and Harayama- S. Phylogenetic relationships of Pseudomonas putida strains deduced from the nucleoude sequences of gyrB, rpoD and 16S rRNA genes // Int. J. Syst. Bacterial. -1998: -V. 48. -P. 813-819:

298. Yang P., Vauterin L., VanCanneyt M., Swings J. and Kersters K. Application of fatty acid- methyl esters for the taxonomic analysis of the genus Xanthomonas. // Syst. Appl. Microbiol. -1993. -V. 16. -P. 47-71.

299. Yang Y., Gabriel- D. W. Xanthomonas avirulence/pathogenicity gene family encodes functional plant nuclear targeting signals. // MPMI. 1995. -V.8. -P.627-631.

300. Young J.M., Park D.C., Shearman H.M., Fargier E. A multilocus sequence analysis of the genus Xanthomonas. // Syst. Appl. Microbioh -2008. -V. 31 (5). -P. 366-377.

301. Zaccardelli M., Del Galdo A., Caglioti C., Buonaurio R. Genetic variability of Xanthomonas campestris pv. campestris populations: first results. // J. of Plant Pathology. -2002. -V. 84.-P. 199.

302. Zaccardelli M. Molecular characterization of Xanthomonas campestris pv. campestris isolates. // J. of Plant Pathology. -2001. -V. 83. -P. 245.

303. Zaccardelli M., Ceroni P. and Mazzucchi U. Amplified fragment length polymorphism fingerprinting of Xanthomonas arboricola pv. pruni. // J. of Plant Pathology, -1999. —V. 81. —P. 173-179.

304. Zelles L. Fatty acid patterns of phospholipids and lipopolysaccharides in the characterisation of microbial communities in soil: a review // Biol. Fertil. Soils. -1999. —V. 29. -P. 111-129.

305. Zhao Y.-F., Damicone J.P., Demezas D.H., Bender C.L., Zhao Y.F. Bacterial leaf spot diseases of leafy crucifers in Oklahoma caused by pathovars of Xanthomonas campestris. // Plant Disease. -2000. -V. 84. -P. 1008-1014.

306. Zhang W., Jayarao B.M. and Knabel S.J. Multi-virulence-locus sequence typing of Listeria monocytogenes. // Appl. Environ. Microbiol. -2004. -V. 70. -P. 913-920.

307. Zhu W., MaGbanua M. M., and White F. F. Identification of two novel hrp-associated genes in the hrp gene cluster of Xanthomonas oryzae pv. oryzae. // J. Bacteriol. -2000. —V. 182. -P. 1844-1853.

308. Zipfel C. and Felix G. Plants and animals: a different taste for microbes? Curr. Opin. // Plant Biol. -2005. -V. 8. -P. 353-360.