Оптимизация сьемки обратного пространства и оценки качества производных в белковой кристаллографии тема диссертации и автореферата по ВАК РФ 01.04.18, кандидат физико-математических наук Никонов, Станислав Владимирович

• Никонов, Станислав Владимирович
• кандидат физико-математических наук
• 1984

Оглавление диссертации кандидат физико-математических наук Никонов, Станислав Владимирович

В диссертации представлены результаты работ, выполненных автором в Институте белка АН СССР под руководством Ю.Н.Чиргад-зе. Автор приносит глубокую благодарность своему научному руководителю за постоянный интерес к работе, оказание всесторонней помощи и участие в обсуждении результатов. Автор благодарит сотрудников лаборатории структурного анализа Института белка АН СССР Сергеева Ю.В., Бражникова Е.В., Фоменкову Н.П. и Невскую H.A., с которыми он выполнял совместные работы по сбору и обработке дифракционных данных, и сотрудника лаборатории структурного анализа Института молекулярной биологии АН СССР Васильева Д.Г. за предоставление адаптированной к ЭВМ ЕС 1040 версии программ обработки данных, полученных методом вращения-качания, и обработку оптимизированного набора структурных амплитуд лейцинаминопептидазы. Автор выражает свою глубокую признательность Гороховой Т.Л. за большую помощь в оформлении данной работы.

ВВВДЕНИЕ.

ГЛАВА I. ОСОБЕННОСТИ ПОЛУЧЕНИЯ НАБОРОВ ДИФРАКЦИОННЫХ ДАННЫХ В БЕЛКОВОЙ КРИСТАЛЛОГРАФИИ (ЛИТЕРАТУРНЫЙ ОБЗОР)

1.1. Характерные особенности белковых кристаллов.

1.2. Объем и характер экспериментальных данных в белковой кристаллографии

1.3. Современные методы съемки обратного пространства

1.4. Формирование таблицы структурных амплитуд. Проблемы шкалирования

1.5. Характеристики качества наборов экспериментальных данных.

1.6. Постановка задачи оптимизации

ГЛАВА П. ОПТИМАЛЬНАЯ СТРАТЕГИЯ СЪЕМКИ ОБРАТНОГО

ПРОСТРАНСТВА

2.1. Принципы и количественные критерии оптимальной съемки.

2.2. Оптимизация съемки обратного пространства в методе экранной прецессии

2.3. Оптимизация съемки обратного пространства в методе вращения.

2.4. Оценка эффективности оптимизации съемки обратного пространства

2.5. Планирование эксперимента и сбор оптимизированных наборов данных от кристаллов ^-кристаллинов фракций П и Ш £ и лейцинаминопептидазы.

ГЛАВА Ш. ВЫЧИСЛЕНИЕ КОЭФФИЦИЕНТА ПРИВВДЕНШ СТРУКТУРНЫХ АМПЛИТУД ПРОИЗВОДНЫХ К ЖАЛЕ НАТИВНОГО БЕЖА НА БАЗЕ СТАТИСТИЧЕСКИХ КРИТЕРИЕВ. УЛУЧШЕНИЕ ОЦЕНОК КАЧЕСТВА ПРОИЗВОДНЫХ 3.1. Корректное определение коэффициента приведения данных от производных к шкале нативного белка. Критерии изоморфизма

3.2. Формула для вычисления коэффициента приведения.

3.3. Статистический критерий отбора шкалируемых отражений

3.4. Оценка точности вычислений. Формирование набора экспериментальных данных ^ р у-кристаллина Шьпри разрешении 3,0 А

Заключение диссертации по теме «Кристаллография, физика кристаллов», Никонов, Станислав Владимирович

ОСНОВНЫЕ ВЫВОДЫ

1. Проанализированы узловые проблемы, характеризующие сбор дифракционных данных в белковой кристаллографии. Показано, что съемка обратного пространства и отбор тяжелоатомных производных могут быть оптимизированы, и определены основные критерии процесса оптимизации.

2. Предложен обобщенный алгоритм оптимальной съемки обратного пространства. Рассмотрены его модификации применительно к методам экранной прецессии и вращения-качания и создано соответствующее программное обеспечение. Проведено сравнение оптимизированных наборов с литературными данными для ряда белков. Показано, что оптимизация существенно сокращает время съемки, выигрыш в экспозиции зависит от разрешения и симметрии кристалла и может в ряде случаев достигать 50%.

3. Методом экранной прецессии получены оптимизированные трехмерные наборы структурных амплитуд нативного белка и пяти о производных Т-кристаллина П при разрешении 5 А, нативного

А- Р оо белка /-кристаллина Шь при разрешениях 5 А и 2,5 А, четырех о его производных при разрешении 5 А и пяти производных при о разрешении 3 А, нативного белка лейцинаминопептидазы при разре-о шении 6 А. Методом вращения-качания получены оптимизированные наборы одного из производных У" -кристаллина Ш§ при разрешении о 'о

2,5 А и лейцинаминопептидазы при разрешении 2,9 А.Трехмерные о наборы данных /"-кристаллина П при разрешении 5 А и производноо го ^-кристаллина Шь при разрешении 2,5 А измерены с одного монокристалла каждый. Полученные экспериментальные данные были использованы для определения структур -кристаллина П при о v о разрешении 5 А и Г -кристаллина Шь при разрешениях 5,0 А и

3,0 А.

4. Показано, что использование статистических критериев позволяет получить значение коэффициента приведения данных тяжелоатомных производных к жале нативного белка, свободное от вклада тяжелого атома. Получены расчетные формулы для вычисления коэффициента приведения и отбора отражений, пригодных для шкалирования.и создано соответствующее программное обеспечение.

5. Предложен дополнительный критерий изоморфизма, основанный на анализе зависимости коэффициента приведения данных тяжелоатомных производных к шкале нативного белка от разрешения, и исследована его связь с существующими критериями. Проанализировано качество производных -кристаллина Ш & при разрешении о и

3 А и показано, что корректно определенный коэффициент приведения повышает достоверность оценок качества производных и улучшает синтезы Паттерсона. Сформирован улучшенный набор экспери

I 0 ментальных данных / -кристаллина ШЬ при разрешении 3,0 А.

Список литературы диссертационного исследования кандидат физико-математических наук Никонов, Станислав Владимирович, 1984 год

1. Бланделл Т.J1.f Джонсон Л.Н. Кристаллография бежа. Перевод с англ., Мир, Москва, 1979.

2. Ленинджер А.Л. Биохимия. Перевод с англ., Мир, Москва,1974.

3. Bragg V/.L. X-Ray Analysis of Biological Molecules, in: Aspects of Protein Structure (ed. G.N.Ramac;hadran). Acad. Press, London, New York, 1963, p.p. 1-13.

4. Вайнштейн Б.К. Современная кристаллография, т. 2, Наука, Москва, 1979.

5. Dickerson R.E., Kendrew J.С., Strandberg В.Е. The Crystal Structure of Myoglobin: Phase Determination to a Resolutionоof 2 A by the Method of Isomorphous Replacement. Acta Cryst., 1961, v. 14, p.p. 1188-1195.

6. Blow D.M., Crick F.H.C. The Treatment of Errors in the Isomorphous Replacement Method. Acta Cryst., 1959» v. 12, p.p. 794—802.

7. Dickerson R.E., Kopka M.L., Varnum J.C., Weinzierl J.R., Bias, Feedback and Reliability in Isomorphous Phase Analysis. Acta Cryst., 1967, v. 23, p.p. 511-536.

8. Kartha G., Use of Isomorphous Series and Anomalous Scattering Data in Structure Determination of Large Molecules in: Crystallographic Computing (ed. Ahmed) Munksquard, Copenhagen, 1970, p.p. 132-145.

9. Matthews B.W. The Determination of Position of Anomalously Scattering Heavy Atom Groups in Protein Crystals. Acta Cryst., 1966, v. 20, p.p. 230-241.

10. Harker D. The Determination of the Phases of the Structure Factors of Non-Centrosymmetric Crystals by the Method of Double Isomorphous Replacement. Acta Cryst., 1956, v. 9, p.p.1-9«

11. Hendrickson W.A. Radiation Damage in Protein Crystallography. J. Mol. Biol., 1976, v. 106, p.p. 889-893.

12. Stammers D.K., Muirhead H. Three-dimensional Structureoof Cat Muscle Pyruvate Kinase at 3.1 A Resolution. J. Mol. Biol., 1977, v. 112, p.p. 309-316.

13. Lindquist Y., Br'änden K.I. Structure of Glycolate Oxiodase from Spinach at a Resolution of 5*5 A. J. Mol. Biol., 1980, v. 143, p.p. 201-211.

14. Wilson I.A., Skehel J.J., Wiley D.C. Structure of theo

15. Haemag-Glutamin Membrane Glycoprotein in Influenza Virus at 3.0 A Resolution. Nature, 1981, v. 289, p.p. 366-373.

16. Reshetnikova L.S., Garber M.B., Fomenkova N.P., Nikonov S.V., Chirgadze Yu.N. Crystallographic Study of the Large Trip-tic Fragments of Elongation Factor G from Escherichia coli. J. Mol. Biol., 1982, v. 160, p.p. 127-132.

17. Schmid M.F., Weaver L.H., Holmes M.A., Grütter M.G., Ohlendorf D.H., Reynolds R.A., Remington S.J., Matthews B.W.

18. An Oscillation Data Collection System for High-Resolution Protein Crystallography. Acta Cryst., 1981, v. A37, 701-770.

19. Zelwer С., Risler J.L., Brunic S. Crystal Structure of Eschericia coli Methionil-tRUA Synthetase. J. Mol. Biol., 1982, v. 155, P.P. 63-81.

20. Liljas L., Unge Т., Jones T.A., Pridborg K., Lovgren S., Skoglund U., Strandberg B. Structure of Satellite Tobacco Necroosis Virus at 3.0 A Resolution. J. Mol. Biol., 1982, v. 159» p.p. 93-108.

21. Hartmann H., Parak P., Steigemann W., Petsko G.A., Pon-zi D.R., Prauenfelder H. Conformational Substates in Protein: Structure and Dynamic of Metmyoglobin at 80 K. Proc. Hat. Acad. Sci. USA, 1982, v. 79, p.p. 4967-4971.

22. Leslie A.G.W., Wonacott A.J. Coenzyme Binding in Crystals of Glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase. J. Mol. Biol., 1983, v. 165, 375-391.

23. Irwin M.A., Nyborg J., Reid B.R., Blow D.M. The Crystalо

24. Structure of Tyrosyl-Transfer RITA Synthetase at 2.7 A Resolution. J. Mol. Biol., 1976, v. 105, p.p. 577-586.

25. Greenhough T.J., Helliwell J.R. The uses of sychrotron X-radiation in the Crystallography of Molecular Biology. Prog, in Bioph. and Mol. Biol., 1983, v. 41, p.p. 67-123.

26. Fourme R., Kahn R. Synchrotron Radiation as a Tool for Macromolecular Crystallography. Current Status and Trends at LURE. Biochemic, 1981, v. 63, p.p. 887-890.

27. Herriott J.R., Sieker L.C., Jensen L.N. Structure ofо

28. Rubredoxin an X-ray Study to 2.5 A Resolution. J, Mol. Biol., 1970, v. 50, p.p. 391-406.

29. Зайцев В.Л., Вагин A.A., Мошков К.А., Борисова О.П., Яковлев A.C., Нейфах С.А. Рентгеноструктурное исследование цер-рулоплазмина человека. Кристаллография, 1983, т. 28, с. 477-487.

30. Вайнштейн Б.К. Современная кристаллография, т. I, Наука, Москва, 1979.

31. Бокий Г.Б., Порай-Кошиц М.А. Рентгеноструктурный анализ, т. I, изд-во Московского университета, 1964.

32. International Tables for X-ray Crystallography, v. 1 (ed. Henry N.P.N., Lonsdale K.). The Kinoch Press Birmingham, 1952.

33. Matthews B.W. X-Ray Structure of Protein. In the Proteins, v. Ill, Acad. Press, New York, San Fransisko, London, 1977.

34. Rossmann M.G., Leslie A.G.W., Abdel Meguid S.S., Tsuki-hara T. Processing and Post-Refinement of Oscillation Camera Data. J. Appl. Cryst., 1979, v. 12, p.p. 570-581.

35. Schwager P., Bartels К., Jones A., Refinement of Setting Angles in Screenless Film Methods. J. Appl. Cryst., 1975, v.8,p.p. 275-281.

36. Arndt U.W., Champness J.H., Phizackerly R.P., Wonacott A.J. A Single-Crystal Oscillation Camera for Large unit Cells. J. Appl, Cryst., 1973, v. 6, p.p. 457-463.

37. Jeffery J.W. Methods in X-ray Crystallography. Acad. Press, London and New York, 1971.

38. Singh A.K., Ramaseshan S. The Determination of a Heavy Atom Positions in Protein Derivatives. Acta Cryst., 1966, v. 21, p.p. 279-284.

39. Blow D.N., RoesmarfcM.g. Single Isomorphous Replacement Method. Acta Cryst., 1961, v. 14, p.p. 1195-1203.

40. North A.C.T. The Combination of Isomorphous Replacement and Anomalous Scattering Data in Phase Determination of Non-Centrosymmetric Reflections. Acta Cryst., 1965, v. 18, p.p. 212217.

41. Плетнев B.3., Цыганник И.Н., Попович В.А. Определение положения тяжелых атомов в изоморфных производных лейцин-специфичного белка прямыми рентгеновскими методами. Кристаллография, 1983, т. 28, с. 708-712.

42. Amirthalingam V. The Effect of Errors in the Intensities on the Phase Angles Determined by the Isomorphous Replacement Method. Acta Cryst., 1967, v. 23, p.p. 522-523.

43. Бару С.Е., Провоз Г.И., Савинов Г.А., Сидоров В.А., Фельдман И.Г., Хабахпашев А.Г., Шувалов Б.Н. Детекторы рентгеновского излучения для рентгеноструктурных исследований. Кристаллография, 1980, т. 25, с. 371-379.

44. Arndt U.W. The optimum Strategy in Measuring Structure Factors. Acta Cryst., 1968, v. B24, p.p. 1355-1357.

45. Arndt U.V/. Television Area Detectors. In: The Rotation Method in Crystallography (ed. Arndt U.W., Wonacott A.J.), North Holland Pub. Co., .Amsterdam, Hew York, Oxford, 1977» p.p. 245263.

46. Arndt U.V/., Gilmore D.J., Yionacott A.J. X-Ray Film. In: The Rotation Method in Crystallography. North Holland Pub. Co., Amsterdam, New York, Oxford, 1977, p.p. 207-219.

47. Morimoto H., Uyeda R. A Second Comparision of Various Commercially Available X-ray Films. Acta Cryst., 1963» v. 16, p.p. 1107-1119.

48. Xuong N., Freer S.T., Hamlin R., Nielsen C., Vernon V., The Electronic Stationary Picture Method for High-Speed Measurement of Reflection Intensities from Crystals with barge Unit Cells. Acta Cryst., 1978, v. A34, p.p. 289-296.

49. Blake C.C.F., Geisow M.J., Swan I.D.A. , Rerat C. Strucoture of Human Plasma Prealbumin at 2.5 A Resolution. J. Mol. Biol., 1974, v. 88, p.p. 1-12.

50. Агеев О.И., Арутюнян Э.Г., Гоганов Д.А., Попов A.H., Хейкер Д.М., Шульмейстер В.М. Методика исследования белков в 512-канальном дифрактометре ДАЕК-20. Кристаллография, 1981, т. 26, вып. 3, с. 451-457.

51. Buerger M.J. The Precession Method in X-ray Crystallography. John Wiley, New York, London, Sydney, 1964.

52. Subramanian E., Cook W.J. Crystallization and Preliminary X-ray Investigation of Acid Protease from Cladosporium,

53. J. Biol. Chem., 1984, v. 259, p.p. 1251-1252.

54. Coraarmond M.-B., Tougard P. Preliminary Crystallographic Study of the Fc Fragment of a Monoclonal IgG2b murine immunoglobulin. J. Mol. Biol., 1983, v. 168, p.p. 907-908.

55. Slingsby C., Miller R.L., Berbers G.A.N., Preliminary X-ray Crystallographic Study of the Principal Subunit of the Lens Structural Protein, Bovine jS -Crystallin, J. Mol. Biol., 1982, v. 157, p.p. 191-194.

56. Rosen L.S., Magdoff-Fairchild B., Molecular Packing in a Second Monoclinic Crystal of Deoxygenated Sickle Haemoglobin. J. Mol. Biol., 1982, v. 157, p.p. 181-189.

57. Le Brun E., van Rapenbusch R., Structure of Bacilluso

58. Subtilis Levansucrase at 3.8 A Resolution. J. of Biol. Chem., 1980, v. 255, No. 24, p.p. 12034-12036.

59. Harrison S.C., Jack A., Structure of Tomato Bushy Stunto

60. Virus III. Three-dimensional X-ray Diffraction Analysis at 16 A Resolution. J. Mol. Biol., 1975, v. 97, p.p. 173-191.

61. Remington S.J., Anderson W.F., Owen J., Ten Eyck L.F., Grainger C.T., Matthews B.W. Structure of the Lysozyme fromo

62. Bacteriophase T4: An Electron Density Map at 2.4 A Resolution. J. Mol. Biol., 1978, v. 118, p.p. 81-98.

63. Donald W., Musich L., Rossmann M.G. The Structure ofo

64. Mouse Testicular Lactate Dehydrogenase Isoenzyme C^ at 2.9 A Resolution. J. of Biol, chem., 1979, v. 254, No. 16, p.p. 7611-7620,

65. Deatherape J.F., Moffat K., Structure of Nitric Oxide Hemoglobin. J. Mol. Biol., 1979, v. 134, p.p. 401-417.

66. McPherson A. The Three-dimensional Structure of Canavaolin at 3»0 A Resolution by X-ray Diffraction Analysis. J. Biol. Chem., 1980, v. 255, No. 21, p.p. 10472-10480.

67. Colman P.M., Jansonius J.N., Matthews B.W. The StrucDture of Thermolysin: An Electron Density Map at 2.3 A Resolution. J. Mol. Biol., 1972, v. 70, p.p. 701-724.

68. Matthews B.W., Penna R.E., Bolognesi M.C., Schmid M.P., Olson J.M. Structure of a Bacteriochlorophyll a-Protein from the Green Photоsynthetic Bacterium Prosthecochloris acstuarii. J. Mol. Biol., 1979, v. 131, p.p. 259-285.

69. Wing R., Drew H., Takano Т., Broka C., Tanaka S., Ita-kura K., Dickerson R.E. Crystal Structure Analysis of a Complete Turn of В DNA. Nature, 1980, v. 287, p.p. 755-758.

70. Rayment I., Backer T.S., Caspar D.L.D., Murakami W.T.о

71. Polyoma Virus Capsid Structure at 22.5 A Resolution. Nature, 1982, v. 295, p.p. 110-115.

72. Чиргадзе Ю.Н., Сергеев Ю.В., Фоменкова Н.П., Орешин

73. B.Д., Никонов С.В. Структура /-кристаллина Шь из глазнойа олинзы теленка при разрешении 3 А. ДАН СССР, 1981, т. 259, с. 1502-1505.

74. Чиргадзе Ю.Н., Сергеев Ю.В., Фоменкова Н.П., Никонов

75. C.В., Лунин В.Ю. Определение структуры У'-кристаллина П изо "глазной линзы теленка с разрешением 5 А. ДАН СССР, 1979, т. 250, с. 762-765.

76. Chirgadze Yu.N., Oreshin V.D., Sergeev Yu*V., Nikonov S.V., Lunin V.Yu. Structure of ^-crystallin Illb from Calf Lens at 5 A Resolution, PEBS Lett., 1980, v. 118, p.p. 296-298.

77. Xuong N.-H., Freer S.T. Reflection Intensity Measurementby Screenless Precession Photography. Acta Cryst., 1971» v.B27, p.p. 2380-2387.

78. Ladenstein R., Epp 0., Bartels K., Jones A., Huber R. Structure Analysis and Molecular Model of the Selenoenzyme Gluotatione Peroxidase at 2.8 A Resolution. J. Mol. Biol., 1979» v. 134, p.p. 199-218.

79. Вайнштейн Б.К., Мелик-Адамян В.P., Барынин В.В., Вагин

80. А.А., Некрасов Ю.В., Малинина Л.В., Гулый М.Ф., Гудкова I.B.,

81. Дегтярь Р.Г. Рентгенографическое исследование структуры каталазыогриба Pinicilium Vitale Pidopl et Bilai с разрешением 6 A. ДАН, 1979, т. 246, Ш I, с. 220-227.

82. Arndt U.W. Introduction in: The Rotation Method,in Crystallography (ed. Arndt U.W., Y/onakott A.J.) Horth Holland Pub. Co., Amsterdam, Few York, Oxford, 1977, p.p. 1-5.

83. Weber P.C., Howard A., Xuong N.-H., Salemme F.R. Crys-tallographic Structure of Rhodospirillum molischianum Perricyto-chrome С' at 2.3 A Resolution. J. Mol. Biol., 1981, v. 133, p.p. 399-424.

84. Matthews D.A., Alden R.A., Bolin J.T., Freer S.T., Haw-lin R., Xuong N-H., Krout J., Рое M., Williams M., Hoogsteen K. Dihydrofolate Reductase: X-ray Structure of the Binary Complex with Methotrexate. Science, 1977, v. 197, p.p. 452-455.

85. Rogers D. The Scaling of Intensities. In: Computing Methods in Crystallography (ed. Rollett J.S.) Pergamon Press. Oxford, London, Edinburg, Hew York, Paris, Frankfurt, 1965«

86. Сриниваоан P., Партасарати С. Применение статистических методов в рентгеновской кристаллографии.Перевод с англ., Мир, Москва, 1979.

87. Kraut J. Scaling a set of Intersecting Reciprocal planes. Acta Cryst., 1958, v. 11, p.p. 895-897.

88. Dickerson R.E. Л general Method for Determining Film-to-Film Scaling Constant. Acta Cryst., 1959, v. 12, p.p. 610-612.

89. Hamilton W.C. Rollett J.S., Sparks R.A. On the Relative Scaling of X-ray Photographs. Acta Cryst., 1965, v. 18, p.p. 129130.

90. Fox G.C., Holmes K.C. An Alternative Method of Solving the Layer Scaling Equations of Hamilton, Rollett and Sparks. Acta Cryst., 1966, v. 20, p.p. 886-893.

91. Rollett J.S., Sparks R.A. The Correlation of Intersecting Layers of X-ray Intensity Data. Acta Cryst., 1960, v. 13, p.p. 273-274.

92. Wilson A.J.C. The probability Distribution of X-ray Intensities. Acta Cryst., 194-9, v* 2» P*P* 318-327.

93. Blow D.M. The Structure of Haemoglobin.VII.Determonati-on of Phase Angles in the blon-Centrosymmetric /ЮО/Zone. Proc. Roy. Soc., 1958, v. A24-7, p.p. 302-335.

94. Green D.W., Ingram V.M., Perutz M.F. The Structure of Haemoglobin. IV Sign Determination by the Isomorphous Replacement Method. Proc. Roy Soc., 1954-, v. A225, p.p. 287-318.

95. Kraut J., Sieker L.C., High D.F., Freer S.T. С Hymotryposinogen: a Three Dimensional Fourier Synthesis at 5 A Resolution. Proc. Nat. Acad. Sci. USA, 1962, v. 48, p.p. 1417-1432.

96. Matthews ВД7. Local scaling: a Method to Reduce Systematic Errors in Isomorphous Replacement and Anomalous Scattering Measurements. Acta Cryst., 1975, v. A31, p.p. 480-487.

97. Eklund H. , Samama J-P., V/allen L. , Branden K-I. Structure of a Triclinic Complex of Hourse Liver Alcohol Dehydrogenase at 2.9 A Resolution. J. Mol. Biol., 1981, v. 146, p.p.561-587.

98. Parkes A. S., Hughes R.E. Irradiation Volume in Weissenberg and Precession Techniques. Acta Cryst., 1963, v. 16, p.p. 1185-1187.

99. Wonakott A.J. Geometry of the Rotation Method. In: The Rotation Method in Crystallography (ed. Arndt U.W., Wonakott A.J.) North-Holland Pub. Co., Amsterdam, New York, Oxford, 1977, p.p. 75-Ю5.

100. Keith C., Peldman D.S., Deganello S., Glick J., Ward K.B., Jones E.O., Sigler P.B. The 2.5 A Crystal Structure of a Dimeric Phosphorilase A from the Venom of Crotalus

101. The J. of Biol. Chem., 1981, v. 256, p.p. 8602-8607.

102. Weber E., Paramokos E., Bode W., Huber R., Kato I., Laskowski M., Jr. Crystallization, Crystal Structure Analysis and Molecular Model of the Third Domain of Japanese quail Ovomucoid, a Kazal Type Inhibitor. J. Mol. Biol., 1981, v. 149, p.p. 109-123.

103. Wierenga R.K., Dejong R.J., Kalk K.H., Hoi W.G.J., Drenth J. Crystal Structure of p-Hydroxybenzoate Hydroxylase. J. Mol. Biol., 1979, v. 131, p.p. 55-73.

104. Murthy M.R.N., Reid III T.J., Sicignano A., Tonaka N., RossmamM.G. Structure of beef Liver Catalase. J. Mol. Biol., 1981, v. 152, p.p. 465-499.

105. Varghese J.N., Laver W.G., Colman P.M. Structure ofоthe Influenza Virus Glycoprotein Neuraminidase at 2.9 A Resolution. Hature, 1983, v. 303, p.p. 35-44.

106. Gilland. G.L., Quiocho P.A. Structure of L-arabinoseobinding protein from Escherichia coli at 2.4 A Resolution. J. Mol. Biol., 1981, v. 146, p.p. 341-362.

107. Weber I.Т., Johnson L.N., Wilson K.S., Yeates D.G.R., Wild. D.L., Jenkins J.S. Crystallographic Studies of the Activity of Glycogen Phosphorylase b. Nature, 1978, v. 274, p.p. 433-437.

108. Braver G.D., Delbaere L.T.J., James M.N.G. Molecularо

109. Structure of Crystalline Streptomyces Griseus Protease A at 2.8 A Resolution. J. Mol. Biol., 1978, v. 124, p.p. 243-259.

110. Heinemann U., Pal G.P., Hilgenfeld R., Saenger W. Crystal and Molecular Structure of the Sulfhydryl Protease Calo-tropin D1 at 3.2 A Resolution. J. Mol. Biol., 1982, v. 161, p.p. 591-606.

111. Crick F.H.C., Magdoff B.S. The theory of the Method of Isomorphous Replacement for Protein Crystals. Acta Cryst., 1956, v. 9, p.p. 901-910.

112. Shutt C., Winkler P.K., The Oscillation Method for very Large Unit Cells, in: The Rotation Method in Crystallography (ed.: U.Y/. Arndt and A.J.Wonacott) North Holland Publishing Company, Amsterdam, New York, Oxford, 1977, p.p. 173-187.

113. Azaroff L.V. Crystal Settings for Upper Level Photography precession Method. Rev. Sei. Instr., 1954, v. 25, p.p. 928-929.

114. Понтрягин Л.С., Болтянский В.Г., Гамкридзе Р.В., Мищенко Е.Ф. Математическая теория оптимальных процессов. Наука, Москва, 1961.

115. Никонов С.В., Чиргадзе Ю.Н. Оптимизация съемки обратного пространства в методе прецессии и ее применение в белковой кристаллографии. Кристаллография, 1981, т. 26, вып. 4,с. 687-694.

116. Murthy M.R.N., Garavito R.M., Johnson J.E., Rossmann

117. M.G. Structure of Lobster apo-D-glyceraldehyde-3-phosphate deohydrogenase at 3 A Resolution. J. Mol. Biol., 1980, v. 138, p.p. 859-872.

118. Johnson L.N. , Stura E.A., Wilson K.S., Sansom M.S.P., Weber I.T. Nucleotide Binding to Glycogen Phosphorilase b in the Crystal. J. Mol. Biol., 1979, v. 134-, p.p. 639-653.

119. Holmes M.A., Matthews B.W. Structure of Thermolysin Refined at 1.6 A Resolution. J. Mol. Biol., 1982, v. 160, p.p. 623-639.

120. Dickerson R.E., Kopka M.L., Borders C.L., JR., Varnumо

121. J., Weinzierl J.E. A Gentrosymmetric Projection at 4 A of Hourse Heart Oxidized Cytochrome C. J. Mol. Biol., 1967, v. 29, p.p.77-95.

122. Nikonov S.V. .Correct Calculation of Scale Factor Between Diffraction Data Sets of Isomorphous Crystals and its Application to Protein Crystallography. Acta Cryst., 1983, v. A39, p.p. 693-697.

123. Cruikshank D.W.J. General Theory of Statistics. In: Computing Methods in Crystallography (ed. Rollett J.S.) Pergamon press. Oxford, London, Edinburg, New York, Paris, Frankfurt, 1965, p.p. 99-107.

124. Лунин В.Ю. Фазовая программа Тен-Эйка. Препринт. НЦБИ АН СССР, Пущино, 1979.