Новые штаммы Bacillus как основа биопрепаратов для птицеводства тема диссертации и автореферата по ВАК РФ 00.00.00, кандидат наук Лутфуллина Гузель Фанисовна

• Лутфуллина Гузель Фанисовна
• кандидат наук
• 2023

Оглавление диссертации кандидат наук Лутфуллина Гузель Фанисовна

СОДЕРЖАНИЕ

ВВЕДЕНИЕ

1 ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ

1.1 Кишечная микробиота сельскохозяйственных птиц

1.1.1 Факторы, влияющие на формирование микробиоты кишечника

1.1.2 Желудочно-кишечный тракт цыпленка и его комменсальная 18 микробиота

1.1.3 Влияние микробиоты на иммунитет и здоровье кишечника

1.1.4 Взаимосвязь между составом микробиоты и продуктивностью 24 сельскохозяйственных птиц

1.2 Антибиотикорезистентность и пробиотики как альтернатива 27 антибиотикам в птицеводстве

1.2.1 Проблема развития антибиотикорезистентности в птицеводстве

1.2.2 Характеристика пробиотиков, используемых в птицеводстве

1.2.3 Механизмы действия пробиотиков, используемых в птицеводстве

1.2.3.1 Конкурентное исключение и антагонизм

1.2.3.2 Здоровье и целостность кишечника хозяина

1.2.3.3 Пищеварение, всасывание питательных веществ

1.2.3.4 Параметры продуктивности

1.2.3.5 Иммуномодуляция

1.2.4 Пробиотики на основе бактерий рода Bacillus sp

1.2.5 Механизмы антимикробного действия пробиотических штаммов 38 бактерий рода Bacillus sp.

1.2.5.1 Рибосомно синтезированные пептидные антибиотики

1.2.5.2 Нерибосомно синтезированные пептиды

1.3 Применение штаммов Bacillus в качестве пробиотиков для бройлеров

1.3.1 Влияние Bacillus на колонизацию кишечника цыплят-бройлеров 49 полезными бактериями и иммунную систему

1.3.2 Влияние пробиотиков Bacillus на параметры роста, показатели 52 здоровья птиц

1.3.3 Способы введения пробиотиков

Заключение

ЭКСПЕРИМЕНТАЛЬНАЯ ЧАСТЬ

2 МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ

2.1 Объект исследования

2.2 Питательные среды и условия культивирования

2.3 Выделение, идентификация, исследование филогении и 58 морфологии бактерий

2.3.1 Выделение бактерий из ризосферы картофеля

2.3.2 Идентификация бактерий с помощью MALDI BюТyper (Braker 58 Daltonik)

2.3.3 Молекулярно-генетическая идентификация бактерий

2.3.4 Исследование морфологии бактерий с помощью сканирующей 60 электронной микроскопии

2.4 Характеристика пробиотических свойств бактерий

2.4.1 Исследование способности бактерий к росту при различных рН 60 среды, динамики роста бактерий и образования спор

2.4.2 Исследование устойчивости спор бактерий к рН и способности к 60 прорастанию in vitro

2.4.3 Исследование устойчивости спор бактерий к желчи

2.4.4 Исследование вирулентности, токсичности и токсигенности бактерий

2.5 Исследование способности бактерий к синтезу гидролитических 62 ферментов и других метаболитов

2.5.1 Исследование протеолитической активности

2.5.2 Исследование целлюлазной активности

2.5.3 Исследование амилазной и пектиназной активности

2.6 Исследование фунгистатической активности бактерий

2.7 ПЦР амплификация генов, ответственных за синтез антимикробных 64 пептидов

2.8 Секвенирование и анализ геномов Bacillus

2.8.1 Секвенирование и сборка генома, депонирование в базу данных

2.8.2 Филогенетический анализ бактерий

2.8.3 Полногеномная идентификация бактерий

2.8.4 Поиск и анализ геномных локусов, ответственных за синтез 66 антимикробных метаболитов

2.9 Оценка пробиотических свойств штаммов Bacillus в опыте на 67 цыплятах-бройлерах

2.9.1 Эксперимент in vivo на цыплятах-бройлерах

2.9.2 Определение параметров роста цыплят-бройлеров

2.9.3 Статистический анализ параметров роста цыплят-бройлеров

2.10 Накопление, выделение, концентрирование и характеристика 69 антимикробных свойств суммарной фракции липопептидов Bacillus

2.10.1 Подбор оптимальных условий и времени культивирования B. subtilis 69 GM5 для максимальной продукции липопептидов

2.10.2 Исследование динамики изменения поверхностного натяжения 69 среды

2.10.3 Выделение и концентрирование суммарной фракции липопептидов 70 B. subtilis GM5

2.10.4 Исследование фунгистатической активности фракций липопептидов 71 B. subtilis GM5

2.10.5 Исследование антибактериальной активности фракций 71 липопептидов B. subtilis GM5

2.11 Влияние спор B. subtilis GM5 на формирование бактериальной 72 микробиоты ЖКТ и экспрессию генов в тканях слепого кишечника

2.11.1 Отбор органов и проб содержимого слепого кишечника цыплят

2.11.2 Выделение ДНК и секвенирование по гену 16S рРНК

2.11.3 Биоинформатический анализ данных секвенирования

2.11.4 Оценка иммунного статуса цыплят-бройлеров

2.11.4.1 Отбор образцов ткани слепого кишечника

2.11.4.2 Анализ экспрессии генов в тканях слепого кишечника 74 3 РЕЗУЛЬТАТЫ

3.1 Выделение бактерий, их идентификация и исследование морфологии

3.1.1 Выделение и идентификация бактерий

3.1.2 Исследование морфологии B. subtilis GM2 и GM5

3.2 Характеристика пробиотических свойств бактерий

3.2.1 Динамика роста и спорообразования бактерий

3.2.2 Способность бактерий к росту при различных рН среды

3.2.3 Устойчивость спор к рН и способность к прорастанию in vitro

3.2.4 Устойчивость спор бактерий к желчи

3.2.5 Исследование вирулентности, токсичности и токсигенности бактерий

3.2.6 Исследование фунгистатической активности штаммов B. subtilis GМ2 83 и GМ5

3.2.7 Способность бактерий к синтезу гидролитических ферментов

3.2.8 ПЦР амплификация генов, ответственных за синтез антимикробных 88 пептидов, в геномах B. subtilis GM2 и GM5

3.3 Секвенирование и характеристика генома пробиотических бактерий

3.3.1 Секвенирование и аннотирование генома бактерий

3.3.2 Филогенетический анализ бактерий

3.3.3 Сравнительная характеристика геномов пробиотических штаммов

Bacillus GM2 и GM5 и идентификация локусов, детерминирующих синтез липопептидов

3.4 Накопление, выделение, концентрирование и характеристика 95 суммарной фракции липопептидов

3.4.1 Подбор оптимальных условий культивирования бактерии Bacillus 95 для максимальной продукции липопептидов

3.4.2 Исследование ингибирующей активности фракции липопептидов в 99 отношении патогенных и условно-патогенных бактерий, дрожжей и микромицетов

3.4.3 Устойчивость липопептидов к действию температуры, рН, соли и 103 желчи

3.5 Влияние бактерий Bacillus на параметры роста, иммунный статус и 102 формирование бактериальной микробиоты ЖКТ цыплят-бройлеров

3.5.1 Изменение показателей прироста и потребления корма у цыплят при 102 добавлении в их рацион пробиотиков B. intestinalis GM2 и B. subtilis GM5

3.5.2 Структура бактериального сообщества и разнообразие микробиоты 105 слепой кишки

3.5.3. Влияние спор B. subtilis GM5 на экспрессию генов в тканях слепого

кишечника

ОБСУЖДЕНИЕ РЕЗУЛЬТАТОВ

ЗАКЛЮЧЕНИЕ

СПИСОК СОКРАЩЕНИЙ

СПИСОК ЛИТЕРАТУРЫ

ПРИЛОЖЕНИЕ

Введение диссертации (часть автореферата) на тему «Новые штаммы Bacillus как основа биопрепаратов для птицеводства»

ВВЕДЕНИЕ

Актуальность темы исследования и степень ее изученности

Мясо и яйца птицы являются одними из наиболее ценных источников животного белка во всем мире, и спрос на продукты птицеводства продолжает расти [Hafez, Attia, 2020; Kolobe et al., 2022]. Быстрый рост производства связан с широким использованием антибиотиков - стимуляторов роста (АСР), направленных на повышение продуктивности животных и профилактику заболеваний, вызванных бактериями родов Salmonella, Escherichia и Campylobacter [Musa et al., 2019; Clavijo et al., 2022; Robinson et al., 2022]. Однако проблема развития антибиотикорезистентности патогенных бактерий и вредное действие АСР по отношению к кишечной микробиоте привело к общеевропейскому запрету использования этих препаратов в сельском хозяйстве начиная с 2006 года (Регламент (ЕС) № 1831/2003). В РФ принят закон, запрещающий добавлять антимикробные препараты в корма и реализовывать такие корма без рецепта ветеринарного врача (№ 463-ФЗ). В связи с этим актуальной задачей для производителей является снижение использования и последующий полный отказ от АСР при выращивании птицы, что обуславливает необходимость использования альтернативных препаратов, в качестве которых в настоящее время все более активно используются различные кормовые добавки: пребиотики, пробиотики, синбиотики и органические кислоты [Gul, Alsayeqh, 2022]. Наиболее перспективными кормовыми добавками являются пробиотики, представляющие собой живые бактерии, грибы и дрожжи, которые дополняют желудочно-кишечную флору и способствуют поддержанию здоровой пищеварительной системы. За последние годы на фоне снижения применения антибиотиков в производстве птицы происходит значительное увеличение использования пробиотиков [Abd El-Hack et al., 2020; Krysiak et al., 2021]. Традиционно в птицеводстве использовались пробиотики на основе бактерий родов Lactobacillus, Bifidobacterium и Streptococcus, активные штаммы которых способны к секреции антимикробных метаболитов в желудочно-кишечном тракте (ЖКТ), конкурентной адгезии к слизистой оболочке кишечника, а также улучшению эпителиального барьера кишечника и его целостности [Феоктистова с соавт., 2017; Jha et al., 2020; Larsberg et al., 2023]. Более того, пробиотики улучшают показатели роста,

усвояемость питательных веществ и модулируют иммунную систему хозяина [Larsberg et al., 2023].

В настоящее время все более широкое применение находят пробиотики на основе спорообразующих бактерий рода Bacillus, которые, как известно, являются продуцентами огромного количества метаболитов, активно ингибируют рост патогенных и условно-патогенных бактерий, влияют на морфологическую структуру и здоровье кишечника, улучшают усвояемость питательных веществ, модулируют кишечную микробиоту и повышают иммунный статус цыплят бройлеров [Агеев с соавт., 2022; Ogbuewu et al., 2022]. Важной характеристикой Bacillus является способность образовывать споры, высокая устойчивость к неблагоприятным условиям и быстрый рост в ЖКТ цыплят, что делает их удобными при производстве кормовых добавок [Mazanko et al., 2022]. Вследствие этого поиск новых пробиотических штаммов Bacillus с определенными специфическими характеристиками для их использования для конкретных целей в птицеводстве и исследование их влияния на формирование микробиоты слепого кишечника и иммунный статус цыплят бройлеров является актуальной задачей.

Микробиота кишечника представляет большой интерес для исследователей, пытающихся улучшить продуктивность и здоровье птиц, а также безопасность пищевых продуктов из домашней птицы [Richards et al., 2019]. Известно, что микробиом кишечника является вторым геномом хозяина, активно влияющим на его рост и развитие [Carrasco et al., 2019], а сбалансированная кишечная микробиота играет ключевую роль в метаболических и иммунных процессах организма птиц [Rychlik, 2020; Fathima et al., 2022]. Современные высокопроизводительные методы секвенирования следующего поколения позволяют проанализировать и исследовать динамику формирования микробных сообществ ЖКТ и их роль в обмене веществ и состоянии здоровья цыплят [Tang et al., 2020]. Метагеномный анализ позволяет найти подходы для улучшения роста и продуктивности цыплят путем введения диеты на основе полезных бактериальных штаммов c пробиотическими свойствами или их метаболитов [Memon et al., 2022]. Данные, полученные при анализе микробных сообществ ЖКТ цыплят, важны для оценки возможности использования новых пробиотических штаммов Bacillus в качестве кормовых добавок в птицеводстве.

Цель работы - выделение и характеристика штаммов Bacillus и оценка их пробиотического потенциала на цыплятах-бройлерах.

Для достижения этой цели решались следующие задачи:

1. Выделение, идентификация, изучение морфологии и характеристика пробиотических свойств новых штаммов Bacillus.

2. Полногеномный анализ штаммов Bacillus intestinalis GM2 и Bacillus subtilis GM5 и идентификация генетических локусов, ответственных за синтез антимикробных метаболитов.

3. Оптимизация условий биосинтеза, выделение и характеристика антимикробных свойств суммарной фракции липопептидов Bacillus subtilis GM5.

4. Изучение влияния штаммов Bacillus на параметры роста (прирост биомассы тела, коэффициент конверсии корма) цыплят-бройлеров.

5. Анализ динамики изменения структуры бактериальной микробиоты слепого кишечника в процессе роста цыплят-бройлеров и влияния пробиотического штамма Bacillus subtilis GM5 на ее формирование и экспрессию генов в тканях кишечника.

Научная новизна

В работе впервые исследованы и охарактеризованы пробиотические свойства бактерий Bacillus intestinalis GM2 и Bacillus subtilis GM5, выделенных из ризосферы картофеля. Показано, что штаммы Bacillus обладают устойчивостью к желчи, широкому диапазону рН среды, также ферментативной активностью и безопасны для модельных животных. На основе сравнительного полногеномного анализа двух пробиотических штаммов Bacillus GM2 и GM5 проведена идентификация геномных локусов, детерминирующих синтез антимикробных липопептидов. Установлен вклад липопептидов в антимикробный и пробиотический потенциал штамма B. subtilis GM5. Впервые, показано, что добавление спор B. intestinalis GM2 и B. subtilis GM5 повышает живую массу цыплят-бройлеров Кобб-500 и увеличивает индекс продуктивности. Впервые проведено исследование влияния штамма B. subtilis GM5 на формирование и динамику структуры бактериальной микробиоты слепого кишечника цыплят-бройлеров Кобб-500 в разных возрастных категориях, что позволило оценить вклад пробиотика в модуляцию микробиоты цыплят. Показано, что штамм B. subtilis

GM5 повышает разнообразие микробиоты и модулирует структуру бактерильного сообщества слепого кишечника цыплят-бройлеров. Установлено, что у цыплят, получавших споры B. subtilis GM5, в различной степени повышался уровень экспрессии генов белков плотного контакта (CLDN1, OCCLUDIN, JAM2) и генов, определяющих чувствительность к питательным веществам (FFAR2, GLUT1), что может быть важно как для повышения иммунного статуса цыплят, так и улучшения пищеварительной функции.

Теоретическая и практическая значимость

Выявленные пробиотические свойства бактерий B. intestinalis GM2 и B. subtilis GM5, такие как устойчивость к желчи, широкому диапазону рН среды, безопасность для модельных животных, продукция метаболитов с антимикробной активностью, гидролитических ферментов, также увеличение живой массы цыплят-бройлеров, делают данные штаммы перспективными агентами для использования в качестве кормовой добавки в птицеводстве. Анализ генома двух пробиотических штаммов Bacillus GM2 и GM5 позволил выявить геномные локусы, детерминирующие синтез антимикробных липопептидов и оценить вклад в пробиотический потенциал штаммов. Результаты метагеномных исследований будут способствовать более углубленному и детальному пониманию закономерностей формирования бактериальной микробиоты слепого кишечника цыплят-бройлеров Кобб-500 и влияния на нее кормовой добавки из спор B. subtilis GM5. Таким образом, практическая значимость работы связана с тем, что исследуемый штамм B. subtilis GM5 является перспективной основой для разработки пробиотического препарата для птицеводства.

Положения, выносимые на защиту:

1. Выделен и охарактеризован штамм Bacillus subtilis GM5 с высоким пробиотическим потенциалом: споры бактерий устойчивы к высокой концентрации желчи и широкому диапазону рН среды, бактерии обладают антимикробной активностью. Добавление спор штамма GM5 в корма цыплят-бройлеров приводит к повышению живой массы цыплят на 13.7% и снижению коэффициента конверсии корма на 5%.

2. В микробиоте слепого кишечника цыплят-бройлеров кросса Кобб-500 доминируют бактерии филумов Firmicutes, Proteobacteria и Bacteroidetes,

соотношение которых изменяется в зависимости от возраста. Споры пробиотического штамма Bacillus subtilis GM5 повышают разнообразие микробиоты и численность полезных групп бактерий.

Степень достоверности подтверждается значительным количеством лабораторных экспериментов, проведенных с использованием современного высокоточного оборудования и проанализированных с помощью соответствующих программных обеспечений, а также публикацией полученных данных в рецензируемых научных изданиях.

Апробация работы и публикации

По материалам работы опубликовано 11 статей в рецензируемых журналах, из которых 7 в журналах, индексируемых Web of Science и Scopus, 4 - в отечественных журналах, индексируемых в базе РИНЦ и рекомендованных ВАК РФ, 24 тезиса, получены 2 патента РФ.

Материалы диссертации представлены на Международной конференции студентов, аспирантов и молодых учёных «Ломоносов-2016», «Ломоносов-2018», «Ломоносов-2021» (Москва, 2016, 2018, 2021); на 69-ой и 74-ой Всероссийских с международным участием школах-конференциях молодых ученых «БИОСИСТЕМЫ: организация, поведение, управление» (Нижний Новгород, 2016; 2021); на Международной научно-практической конференции «БИОТЕХНОЛОГИИ МИКРООРГАНИЗМОВ» (Минск, 2019), на IV Международной научной конференции «Современное состояние, проблемы и перспективы развития аграрной науки» (Симферополь, 2019); на Всероссийской научно-практической конференции «Микробные биотехнологии в птицеводстве и животноводстве» (Казань, 2018); на V Международной конференции «ПОСТГЕНОМ». В поисках моделей персонализированной медицины (Казань, 2018); на II и III Международной школе-конференции студентов, аспирантов и молодых ученых «Материалы и Технологии XXI Века» (Казань, 2016, 2018); на V Международной научно-практической конференции «Биотехнология: наука и практика» (Ялта, 2017); на 10-м Всероссийском форуме студентов, аспирантов и молодых ученых «Наука и инновации в технических университетах» (Санкт-Петербург, 2016).

Место выполнения работы и личный вклад соискателя

Работа реализована на базе НИЛ Агробиоинженерии КФУ в рамках государственной программы повышения конкурентоспособности Казанского (Приволжского) федерального университета среди ведущих мировых научно-исследовательских центров и соответствует целям стратегического проекта 1 (Геномные и постгеномные технологии здоровьесбережения и повышение биологической грамотности для устойчивого развития общества) в рамках проекта Приоритет 2030. Определение вирулентности, токсичности и токсигенности бактерий было проведено на мышах линии ICR (CD-1) в лаборатории химико-биологических исследований ИОФХ им. А.Е. Арбузова КазНЦ РАН. Эксперименты на цыплятах-бройлерах были проведены в крестьянско-фермерском хозяйстве «Лачен» (Медведевский район, Республика Марий-Эль). Исследования проводились при поддержке грантов РФФИ № 20-34-90130, РНФ № 16-16-04062, Фонда содействия инновациям «УМНИК», «Студенческий стартап» № 868rCCC15-L/80959 и АН РТ № 10-35-юГ. Личный вклад автора работы заключается в анализе данных отечественной и зарубежной литературы по теме диссертации, разработке основной проблемы исследования, планировании, организации и реализации экспериментов, а также интерпретации полученных результатов.

Объём и структура диссертации

Материалы диссертации изложены на 184 страницах машинописного текста. Работа содержит 23 рисунка и 16 таблиц. Диссертационная работа состоит из введения, обзора литературы, материалов и методов, результатов исследований, обсуждения результатов, заключения, выводов и списка литературы. Библиография включает 386 источника, среди которых 11 российских и 375 зарубежных источников. Приложение включает данные по составу комбикормов для цыплят-бройлеров (таблицы П1-П3), выписку из протокола №22 П4.

Благодарности

Автор выражает благодарность научному руководителю д.б.н., профессору кафедры микробиологии КФУ А.М. Мардановой за душевное руководство и полную поддержку; д.б.н., профессору кафедры микробиологии КФУ М.Р. Шариповой за замечания и важные комментарии при обсуждении работы;

заведующему отделом сельскохозяйственной биотехнологии (ТатНИИСХ), к.б.н. З. Сташевски и заведующему лабораторией селекции картофеля, к.б.н., с.н.с. С.Г. Вологину за предоставленные образцы ризосферы картофеля; к.б.н., доценту директору МДЦ АМ КФУ В.Г. Евтюгину за проведение СЭМ; м.н.с. ИОФХ им. А.Е. Арбузова - обособленное структурное подразделение ФИЦ КазНЦ РАН О.А. Лениной за помощь в проведении опытов на мышах; д.б.н., профессору кафедры технологии производства продукции животноводства МарГУ С.Ю. Смоленцеву и З. Алимчуевой за помощь в проведении экспериментов на цыплятах-бройлерах; в.н.с, к.б.н. НИЛ Молекулярная вирусология Е.И. Шагимардановой и в.н.с., к.б.н. НИЛ Экологическая метагеномика Н.Е. Гоголевой за помощь в проведении секвенирования геномов бактерий и за проведение метагеномного секвенирования образцов кишечника; к.б.н Й.А. Акосах, м.н.с. Д.С. Пудовой за помощь в биоинформатическом анализе полученных данных; ассистенту, м.н.с. М.Т. Лутфуллину, аспиранту, м.н.с. А.А. Николаевой, инженеру кафедры микробиологии КФУ Н.К. Мочаловой за помощь в организации экспериментов. Автор выражает признательность всем сотрудникам кафедры микробиологии и НИЛ Агробиоинженерии КФУ за полезные советы и благожелательную атмосферу.

1 ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ

1.1 Кишечная микробиота сельскохозяйственных птиц

Микробиота желудочно-кишечного тракта (ЖКТ) играет ключевую роль в сохранении здоровья сельскохозяйственных птиц благодаря своей способности модулировать физиологические функции хозяина, необходимые для поддержания гомеостаза кишечника за счет укрепления иммунитета, переваривания питательных веществ, сохранения целостности кишечного барьера. В основном, это происходит за счет конкурентного исключения и предотвращения колонизации ЖКТ патогенными микроорганизмами. При этом снижается расход энергии, которая тратится у птиц для поддержания иммунной системы в активном состоянии. Таким образом, «здоровая» кишечная микробиота подразумевает экономию энергии для хозяина, что выражается в повышении продуктивности птицы.

Спрос на продукты птицеводства в последние десятилетия вырос в геометрической прогрессии: предполагается, что в 2023 году объем производства куриного мяса достигнет 130 миллионов тонн, что сделает его самым потребляемым источником животного белка в мире [Fathima et al., 2022]. В то же время в секторе птицеводства существует серьезная проблема, связанная со вспышками эпидемий инфекционных заболеваний, особенно в географических районах с изменяющимися климатическими условиями [Kers et al., 2018]. В связи с этим особое внимание исследователей привлекают вопросы, связанные с поддержанием здоровья птицы и ролью в этом процессе разнообразия кишечной микробиоты и её функциональности. В многочисленных исследованиях установлено, что кишечная микробиота оказывает сильное влияние на развитие кишечного эпителия и модуляцию физиологических показателей на протяжении всех стадий роста птиц, что обуславливает важность формирования оптимальных микробных сообществ в разных отделах кишечника [Popov et al., 2021; Luise et al., 2022].

1.1.1 Факторы, влияющие на формирование микробиоты кишечника

По мнению некоторых авторов, кишечную микробиоту стоит рассматривать в качестве самостоятельного органа, который играет важную роль в сохранении здоровья хозяина, модулируя физиологические функции организма, включая обмен

веществ и иммунитет. С микробиотой кишечника тесно связан процесс пищеварения. Так, поглощение питательных веществ, усвояемость корма, получение энергии и продуктивность зависят от состава и разнообразия микробиоты [Stanley et al., 2013; Mancabelli et al., 2016].

Микробиота ЖКТ птиц включает сотни видов бактерий. На уровне филумов в основном преобладают Firmicutes, Bacteroidetes, Proteobacteria и Actinobacteria [Oakley et al., 2014; Clavijo, Flórez, 2017]. Однако надо отметить, что микробные сообщества, обнаруженные в различных отделах ЖКТ (зобе, желудке, подвздошном, слепом и толстом кишечнике) цыплят-бройлеров, различаются по количественным и качественным показателям [Stanley et al., 2014; Yan et al., 2017; Popov et al., 2021]. В настоящее время в качестве инструментов для изучения микробных сообществ используются омиксные технологии, которые позволяют быстро и надежно охарактеризовать состав кишечной микробиоты птиц в стандартных условиях и в зависимости от различных стрессовых факторов инфекционной, экологической и генетической природы [Borda-Molina et al., 2018].

Начальная колонизация ЖКТ птиц происходит естественным путем с момента вылупления или может начаться раньше, путем прохождения микроорганизмов через поры яичной скорлупы [Lee et al., 2017]. В птицеводческих фермах применяются строгие правила гигиены, которые значительно снижают микробную нагрузку в среде инкубирования, чтобы избежать колонизации патогенными бактериями [Donaldson et al., 2017]. Только что вылупившиеся на ферме цыплята приобретают первоначальную микробиоту из искусственной среды вместо естественного материнского источника. Однако имеются данные, подтверждающие гипотезу о том, что часть микроорганизмов, колонизирующих эмбрионы на ранних стадиях, может быть унаследована от материнских кур. Колонизация ЖКТ молодняка также регулируется факторами окружающей среды, включая влияние иммунной системы на разных стадиях роста птиц [Ding et al., 2017].

Установлено, что после вылупления в первые дни ЖКТ цыплят последовательно заселяется бактериями семейства Enterobacteriaceae, а затем примерно с 7-дневного возраста - бактериями филума Firmicutes [Ballou et al., 2016]. Вместе с тем показано, что колонизация ЖКТ молодых цыплят

определенными видами бактерий семейств Enterobacteriaceae или Firmicutes, вероятно, является случайным процессом, обусловленным контактом с определенными бактериями, поступающими из окружающей цыплят среды, а также присутствующими в пище и воде [Kubasova et al., 2019]. В научном сообществе существует консенсус в отношении того, что раннее заселение кишечника имеет большое значение для здоровья и продуктивности цыплят при дальнейшем их развитии, поскольку оно может изменить морфологию и физиологию кишечника, а также восприимчивость к инфекционным заболеваниям [Kers et al., 2018]. Инокуляция пребиотиками, пробиотиками и консорциумами микроорганизмов, наносимых непосредственно на яйцо или внутрь него, рассматривается как стратегия, способствующая ранней колонизации кишечника птиц «здоровой» микробиотой с момента вылупления [Baldwin et al., 2018; Rubio, 2019].

После начальной колонизации кишечника наблюдается сукцессия микроорганизмов, в которой видовое разнообразие микробиоты ЖКТ цыплят увеличивается и стабилизируется по мере роста птиц. Этот процесс обычно происходит у цыплят-бройлеров в возрасте около 3 недель [Shang et al., 2018; Jurburg et al., 2019]. Установлено, что на развитие и формирование кишечной микробиоты кур влияют генетический фон птиц и факторы управления фермой [Zou et al., 2022]. Например, у кур-несушек было описано четыре различных этапа развития микробиоты слепого кишечника в течение первого года жизни [Videnska et al., 2014]. Так показано, что видовое изменение микробиоты кишечника коррелирует с изменениями профиля цитокинов, экспрессируемых клетками кишечника хозяина в ответ на увеличение или уменьшение количества различных групп бактерий [Oakley, Kogut, 2016]. Увеличение количества бактерий филума Proteobacteria, в состав которых также входят и патогенные бактерии, коррелировало с действием провоспалительных цитокинов, в то время как увеличение представителей филума Firmicutes связано с противовоспалительными цитокинами. Следовательно, кишечная микробиота участвует в иммунном гомеостазе ЖКТ птиц, поэтому количественные и качественные изменения в составе микробиоты могут привести к иммунному дисбалансу.

Показано, что на формирование микробиоты ЖКТ птиц также влияет множество факторов и внутренних правил ферм и птицефабрик, такие как мероприятия гигиены и биобезопасности, протоколы и критерии, используемые для определения времени доступа к корму, программы кормления [Metzler-Zebeli et al., 2019], протоколы схем вакцинации, приема терапевтических препаратов, факторы, связанные со стрессом и благополучием цыплят, например, плотностью посадки [Guardia et al., 2011]. Также продемонстрировано влияние качества подстилки, продолжительности фотопериода [Wang et al., 2018b], вентиляции, концентрации аммиака в воздухе и теплового стресса [Shi et al., 2019]. Влияние некоторых из этих факторов на продуктивность цыплят-бройлеров широко изучено, но до сих пор мало исследований, которые анализируют взаимосвязь этих факторов с составом и разнообразием кишечной микробиоты [Averós, Estevez, 2018]. Например, подстилка, на которой выращиваются цыплята, обычно состоит из сосновой стружки, рисовой шелухи и других растительных материалов, а также остатков корма, воды и куриных экскрементов, которые смешиваются и компостируются с подстилочными материалами. Показано, что материалы, используемые в качестве субстрата для подстилки, могут изменять состав кишечной микробиоты и влиять на морфологию и физиологию кишечника [Wang et al., 2018]. На протяжении всего цикла роста цыплята непрерывно клюют и глотают частицы подстилки и, таким образом, приобретают значительную часть микроорганизмов, входящих в кишечную микробиоту. Кроме того, подстилка накапливает фекалии и представляет собой резервуар микроорганизмов со своим собственным разнообразием и составом [Pan, Yu, 2014]. В работе Diaz Carrasco с соавторами [2019] была показана тесная корреляция между микробиотой слепого кишечника и подстилочным материалом. Например, несмотря на различия в структуре популяций некоторые группы бактерий являются общими и показывают одинаковый характер изменчивости, как в кишечнике цыплят, так и в подстилке. Показано, что сезонные изменения микробного разнообразия подстилочных материалов коррелируют с сезонными изменениями продуктивности цыплят и увеличением видового богатства в образцах содержимого слепого кишечника [Diaz Carrasco et al., 2019].

Таким образом, между микробиотой закрытых птичников или птицефабрик, и в первую очередь подстилочного материала, и микробиотой кишечника цыплят-бройлеров происходит постоянный обмен микроорганизмами, что подчеркивает роль подстилки как резервуара микробного разнообразия и необходимости создания оптимальных зоогигиенических условий для формирования оптимальной микробиоты ЖКТ цыплят.

1.1.2 Желудочно-кишечный тракт цыпленка и его комменсальная микробиота

Известно, что у птиц по сравнению с другими позвоночными более высокая скорость прохождения пищи по ЖКТ и повышенная активность пищеварительных ферментов [Popov et al., 2021]. В отличие от млекопитающих ротовая полость птиц не содержат зубов, поэтому пища там не задерживается, сразу спускаясь по пищеводу в зоб. Однако в ротовой полости происходит выработка слюны, смачивающей пищу, что обеспечивает влажную и благоприятную среду для развития микроорганизмов в зобе [Scanes, 2014]. Зоб - это расширение пищевода, в котором пища накапливается до попадания в желудок. Если птица голодна, пища может попасть в желудок, минуя зоб; если пищи достаточно, то она будет задерживаться в зобе и поступать в желудок небольшими порциями. Также в зобе вырабатывается слизистый секрет, содержащий муцин, который создает идеальные условия для размягчения пищи и развития микробиоты, в том числе для микробного брожения пищи [Feye et al., 2020].

У кур микробиота зоба, в основном, представлена бактериями, попавшими в организм с пищей. Их численность может достигать 109 КОЕ/г. В первую очередь это виды Lactobacillus, Clostridiaceae, Bifidobacterium, Enterobacteriaceae и Enterococcus [Stanley et al., 2014]. Показано, что в зобе доминировали бактерии типа Firmicutes (60%), также присутствовали Bacteroidetes (14%), Cyanobacteria (13%) и Proteobacteria (8%). Среди Firmicutes наиболее распространенными родами были Lactobacillus (28%), Bacillus (4%) и Bacteroides (4%) [Han et al., 2016]. В другой работе также показали, что в зобе кур чаще всего были представлены Lactobacillus, Bifidobacterium и Enterobacter [Feye et al., 2020]. Пища может оставаться в зобе до 14 ч; однако чаще всего это происходит в течение 1-3 часов.

Далее пища попадает в желудок, унося с собой часть микробиоты, остальная часть которой остается на стенках зоба [Popov et al., 2021].

Желудок у птиц состоит из двух отделов: железистого и мышечного. Железистый желудок перерабатывает химус, используя ферменты при кислом рН, который может составлять 2.3-4.8. Время нахождения пищи в железистом желудке у кур составляет 10-30 мин [Scanes, 2014]. В мышечном желудке пища измельчается с помощью мелких камней или песка, которые заглатываются птицей, и также происходит первая часть ферментативного переваривания пищи. Затем содержимое мышечного желудка небольшими порциями транспортируется в тонкий кишечник [Oakley et al., 2014]. Из-за низкого рН количество и разнообразие

Список литературы диссертационного исследования кандидат наук Лутфуллина Гузель Фанисовна, 2023 год

СПИСОК ЛИТЕРАТУРЫ

1. Агеев, Б. В. Влияние пробиотика Bacillus subtilis на продуктивность кур-несушек кросса Браун Ник в летний период времени [Текст] / Б. В. Агеев, А. А. Кистина, Ю. Н. Прытков, Э. Н. Алиева // Аграрный научный журнал ВЕТЕРИНАРИЯ И ЗООТЕХНИЯ. - 2022. - № 6. - С. 47-50.

2. Байдалинов, А. И. Оценка биобезопасности штамма Bacillus amyloliquefaciens мв40, перспективного в качестве основы биопрепарата против бактериального ожога плодовых культур [Текст] / А. И. Байдалинов, О. Н. Шемшура, Э. Т. Исмаилова, Г. Т. Джакибаева, Д. А. Тлеубекова, Г. Б. Баймаханова, Ш. Т. Кенжеев // МИКРОБИОЛОГИЯ ЖЭНЕ ВИРУСОЛОГИЯ. - 2021. - T. 4, №. 35. - С. 38-42.

3. Балабан, Н. П. Практическое применение бациллярных протеаз [Текст] / Н. П. Балабан, М. Р. Шарипова // Учен. зап. Казан. ун-та. Сер. Естеств. науки. - 2011. - Т. 153. - кн. 2. - С. 29-40.

4. ГОСТ Р 50003-92. Вещества поверхностно-активные. Определение поверхностного натяжения путем вытягивания жидких пленок = Surface active agents. Determination of surface tension by drawing up liquid films: государственный стандарт Российской Федерации: издание официальное : утвержден и введен в действие Постановлением Госстандарта России от 15.07.92 № 693: введен впервые: дата введения 1993-07-01. - Москва: Издательство Стандартов, 1992. - 15 с. - Текст: непосредственный.

5. Максимов, И. В. Перспективы применения бактерий - продуцентов липопептидов для защиты растений (Обзор) [Текст] / И. В. Максимов, Б. П. Сингх, Е. А. Черепанова, Г. Ф. Бурханова, Р. М. Хайруллин // Прикладная биохимия и микробиология. - 2020. - T. 56, № 1. - С. 19-34.

6. Празднова, Е. В. Нерибосомально синтезируемые метаболиты и генетические механизмы их синтеза в реализации фунгицидного эффекта бактерий р. Bacillus и Paenibacillus (обзор) [Текст] / Е. В. Празднова, А. И. Андриянов, Н. Г. Васильченко // «Живые и биокосные системы». - 2018. - № 25. - Статья 6.

7. Российская Федерация. Законы. О внесении изменений в Закон Российской Федерации «О ветеринарии» и Федеральный закон Об обращении лекарственных средств: Федеральный закон РФ № 463 от 30.12.2021: [принят Государственной

думой 17 декабря 2021 года : одобрен Советом Федерации 24 декабря 2021 года]. -Москва, 2021. - 7 с. - Текст: непосредственный.

8. Рудакова, Н. Л. Секретируемая металлопротеиназа Bacillus intermedius: получение гомогенного препарата фермента и исследование физико-химических свойств [Текст] / Н. Л. Рудакова, А. Р. Сабирова, А. Р. Каюмов, А. М. Марданова, Н. П. Балабан, М. Р. Шарипова // Учен. зап. Казан. ун-та. Сер. Естеств. науки. -2010. - Т. 152. - кн. 2. - С. 145-154.

9. Феоктистова, Н. В. Биопрепараты микробного происхождения в птицеводстве [Текст] / Н. В. Феоктистова, А. М. Марданова, М. Т. Лутфуллин, Л. М. Богомольная, М. Р. Шарипова // Учен. зап. Казан. ун-та. Сер. Естеств. науки. -2018. - Т. 160. - кн. 3. - С. 395-418.

10. Феоктистова, Н. В. Пробиотики на основе бактерий рода Bacillus в птицеводстве [Текст] / Н. В. Феоктистова, А. М. Марданова, Г. Ф. Хадиева, М. Р. Шарипова // Учен. зап. Казан. ун-та. Сер. Естеств. науки. - 2017. - Т. 159. - кн. 1. -С. 85-107.

11. Хадиева, Г.Ф. Влияние пробиотиков Bacillus subtilis GM2 и GM5 на рост и усвояемость кормов у цыплят-бройлеров [Текст] / Г. Ф. Хадиева, М. Т. Лутфуллин, А. А. Николаева, Н. К. Мочалова, С. Ю. Смоленцев, А. М. Марданова, М. Р. Шарипова // Учен. зап. Казан. ун-та. Сер. Естеств. науки. - 2019. - Т. 161. - кн. 3. -С. 472-489.

12. Abd El-Hack, M.E. Probiotics in poultry feed: A comprehensive review [Text] / M. E. Abd El-Hack, M. T. El-Saadony, M. E. Shafi, et al. // J. Anim. Physiol. Anim. Nutr. - 2020. - V. 104. - P. 1835-1850.

13. Abdel-Mawgoud, A. M. Optimization of surfactin production by Bacillus subtilis isolate BS5 [Text] / A. M. Abdel-Mawgoud, M.M. Aboulwafa, N. A. H. Hassouna // Applied Biochemistry and Biotechnology. - 2008. - V. 150. - P. 305-325.

14. Abdel-Moneim, M. Effect of dietary supplementation of Bacillus subtilis spores on growth performance, oxidative status and digestive enzyme activities in Japanese quail birds [Text] / M. Е. Abdel-Moneim, D. A. Selim, H. A. Basuony, E. M. Sabic, A. A. Saleh, T. A. Ebeid // Trop Anim Health Prod. - 2020. - V. 52. - P. 671-680.

15. Abdelqader, A. Effects of dietary probiotic inclusion on performance, eggshell quality, cecal microflora composition, and tibia traits of laying hens in the late phase of

production [Text] / A. Abdelqader, R. Irshaid, A. R. Al-Fataftah // Trop. Anim. Health Prod. - 2013. - V. 45. - P. 1017-1024.

16. Abriouel, H. Diversity and applications of Bacillus bacteriocins [Text] / H. Abriouel, C. M. Franz, N. B. Omar, A. Galvez // FEMS Microbiol. Rev. - 2011. - V. 35. - P. 201-232.

17. Adhikari, B. Characterization of the Culturable Subpopulations of Lactobacillus in the Chicken Intestinal Tract as a Resource for Probiotic Development [Text] / B. Adhikari, Y. M. Kwon // Front. Microbiol. - 2017. - V. 8. - P. 1389.

18. Ahire, J. J. Survival and Germination of Bacillus clausii UBBC07 Spores in vitro Human Gastrointestinal Tract Simulation Model and Evaluation of Clausin Production [Text] / J. J. Ahire, M. S. Kashikar, R. S. Madempudi // Front. Microbiol. - 2020. - V. 11. - E. 1010.

19. Ahuja, K. Poultry Probiotic Ingredients Market Size by Product (Lactobacilli, Bifidobacterium, Streptococcus, Bacillus), by Application (Broilers, Layers, Turkeys, Breeders, Chicks & Poults): Regional Outlook, Application Potential, Price Trends, Competitive Market Share & Forecast, 2019-2025/ K. Ahuja, K. Mamtani, 2019. - 220 p. - Report ID: GMI318. - URL: https://www.gminsights.com/industry-analysis/poultry-probiotics-market (accessed on 2 October 2020). - Available online: Global Market Insights. - Text: online.

20. Aidara-Kane, A. World Health Organization (WHO) guidelines on use of medically important antimicrobials in food-producing animals [Text] / A. Aidara-Kane, F. J. Angulo, J. M. Conly, Y. Minato, E. K. Silbergeld, S. A. McEwen, et al. // Antimicrob. Resist. Infect. Control. - 2018. - V. 7. - P. 1-8.

21. Akbari, M. R. Expression of antimicrobial peptides in cecal tonsils of chickens treated with probiotics and infected with Salmonella enterica serovar typhimurium [Text] / M. R. Akbari, H. R. Haghighi, J. R. Chambers, J. Brisbin, et al. // Clin. Vaccine Immunol. - 2008. - V.15. - P.1689-1693.

22. Alam, S. Effect of Bacillus cereus and Phytase on the Expression of Musculoskeletal Strength and Gut Health in Japanese Quail (Coturnix japonica) [Text] / S. Alam, S. Masood, H. Zaneb, I. Rabbani, R. U. Khan, M. Shah, S. Ashraf, I. A. Alhidaryn // J. Poult. Sci. - 2020. - V. 57. - P. 200-204.

23. Aleti, G. Genome mining: Prediction of lipopeptides and polyketides from Bacillus and related Firmicutes [Text] / G. Aleti, A. Sessitsch, G. Brader // Comput Struct Biotechnol J. - 2015. - V. 13. - P. 192-203.

24. Algammal, A. M. Emerging MDR-Mycobacterium avium subsp. avium in house-reared domestic birds as the first report in Egypt [Text] / A. M. Algammal, H. R. Hashem, A. S. Al-otaibi, K. J. Alfifi, E. M. El-dawody, E. Mahrous, et al. BMC Microbiol. - 2021b. - V. 21, № 1. - E. 237.

25. Algammal, A. M. Virulence-determinants and antibiotic-resistance genes of MDR-Escherichia coli isolated from secondary infections following FD-outbreak in cattle [Text] / A. M. Algammal, H. F Hetta, G. E. Batiha, W. N. Hozzein, W. M. El Kazzaz, H. R. Hashem, et al. // Sci. Rep. - 2020. - V. 10. - E. 19779.

26. Aljazzar, A. Prevalence and Antimicrobial Susceptibility of Campylobacter Species with Particular Focus on the Growth Promoting, Immunostimulant and Anti-Campylobacter jejuni Activities of Eugenol and Trans-Cinnamaldehyde Mixture in Broiler Chickens [Text] / A. Aljazzar, M. I. Abd El-Hamid, R. M. S. El-Malt, W.R. El-Gharreb, S.M. Abdel-Raheem, A. M. Ibrahim, A. M. Abdelaziz, D. Ibrahim // Animals. - 2022. - V. 12. - № 7. - E. 905.

27. Al-Wahaibi, Y. Biosurfactant production by Bacillus subtilis B30 and its application in enhancing oil recovery Y. Al-Wahaibi, S. Joshi, S. Al-Bahry, A. Elshafie, A. Al-Bamani, B. Shibulal // Colloids Surf. B. - 2014. - V. 114. - P. 324-333.

28. Amuguni, H. Bacillus subtilis: a temperature resistant and needle free delivery system of immunogens [Text ]/ H. Amuguni, S. Tzipori // Hum Vaccin Immunother. -2012. - V. 8. - P. 979-986.

29. An, J. Purification and characterization of a novel bacteriocin CAMT2 produced by Bacillus amyloliquefaciens isolated from marine fish Epinephelus areolatus [Text] / J. An, W. Zhu, Y. Liu, X. Zhang, L. Sun, P. Hong // Food Control. - 2015. - V. 51. - P. 278-282.

30. Anand, S. Comparative in silico analysis of butyrate production pathways in gut commensals and pathogens [Text] / S. Anand, H. Kaur, S. S. Mande // Front Microbiol -2016. - V. 7. - E. 1945.

31. Angiuoli, S. V. Toward an online repository of standard operating procedures (SOPs) for (meta)genomic annotation / S.V. Angiuoli, A. Gussman, W. Klimke, G. Cochrane, D. Field, G. Garrity, et al. // OMICS. - 2008. - V. 12. - P. 137-141.

32. Aranda, F. J. Further aspects on the hemolytic activity of the antibiotic lipopeptide iturin A [Text] / F. J. Aranda, J. A. Teruel, A. Ortiz // Biochim Biophys Acta

- 2005. - V. 17. - P. 51-56.

33. Arnaouteli, S. Bacillus subtilis biofilm formation and social interactions S. Arnaouteli, N. C. Bamford, N. R. Stanley-Wall, Ä. T. Kovacs // Nat. Rev. Microbiol. -2021. - V. 19. - P. 600-614.

34. Aruwa, C. E. Poultry gut health - microbiome functions, environmental impacts, microbiome engineering and advancements in characterization technologies [Text] / C. E. Aruwa, C. Pillay, M. M. Nyaga, S. Sabiu // J Anim Sci Biotechnol. - 2021. - V. 12, № 1.

- E. 119.

35. Averos, X. Meta-analysis of the effects of intensive rearing environments on the performance and welfare of broiler chickens [Text] / X. Averos, I. Estevez // Poultry Sci.

- 2018. - V. 97. - P. 3767-3785.

36. Awad, W. A. Campylobacter infection in chickens modulates the intestinal epithelial barrier function [Text] / W. A. Awad, A. Molnar, J. R. Aschenbach, K. Ghareeb, B. Khayal, C. Hess, D. Liebhart, K. Dublecz, M. Hess // Innate Immun. - 2015.

- V. 21. - P. 151-160.

37. Aziz, R. K. The RAST server: rapid annotations using subsystems technology / R.K. Aziz, D. Bartels, A.A. Best, M. DeJongh, T. Disz, R.A. Edwards, et al. // BMC Genomics. - 2008. - V. 9. - E. 75.

38. Bai, K. Supplemental effects of probiotic Bacillus subtilis fmbJ on growth performance, antioxidant capacity, and meat quality of broiler chickens [Text] / K. Bai, Q. Huang, J. Zhang, J. He, L. Zhang, T. Wang // Poult. Sci. - 2017. - V. 96. - P. 74-82.

39. Baindara, P. Characterization of two antimicrobial peptides produced by a halotolerant Bacillus subtilis strain SK.DU.4 isolated from a rhizosphere soil sample [Text] / P. Baindara, S. M. Mandal, N. Chawla, P. K. Singh, A.K. Pinnaka, S. Korpole // AMB Express. - 2013. - V. 3, № 1. - E. 2.

40. Bajagai, Y. S. Probiotics in animal nutrition: production, impact and regulation [Text] / Y. S. Bajagai, A. V. Klieve, P. J. Dart, W. L. Bryden; FAO Animal Production and Health Paper No. 179. - Rome: FAO, 2016. - 108 p. - ISBN 978-92-5-109333-7.

41. Balandin, S. V. Pediocin-Like Antimicrobial Peptides of Bacteria [Text] / S. V. Balandin, E. V. Sheremeteva, T. V. Ovchinnikova // Biochemistry (Mosc). - 2019. - V. 84, № 5. - P. 464-478.

42. Balasingham, K. Probiotic characterization of lactic acid bacteria isolated from swine intestine [Text]/ K. Balasingham, C. Valli, L. Radhakrishnan, D. Balasuramanyam // Veterinary World. - 2017. -V. 10, № 7. - P. 825-829.

43. Baldan, E. Beneficial Bacteria Isolated from Grapevine Inner Tissues Shape Arabidopsis thaliana Roots [Text] / E. Baldan, S. Nigris, C. Romualdi, S. D'Alessandro, A. Clocchiatti, M. Zottini, P. Stevanato, A. Squartini, B. Baldan // PLoS One. - 2015. -V. 10, № 10. - E. 0140252.

44. Baldwin, S. At-hatch administration of probiotic to chickens can introduce beneficial changes in gut microbiota [Text] / S. Baldwin, R. J. Hughes, T. T. Hao Van, R. J. Moore, D. Stanley // PLoS One. - 2018. - V. 13. - E.0194825.

45. Ballou, A. L. Development of the chick microbiome: how early exposure influences future microbial diversity [Text] / A. L. Ballou, R. A. Ali, M. A. Mendoza, J. C. Ellis, H. M. Hassan, W. J. Croom, M. D. Koci // Front. Vet. Sci. -2016. - V. 3, № 2. -E. 00002

46. Bankevich, A. SPAdes: A New Genome Assembly Algorithm and Its Applications to Single-Cell Sequencing [Text] / A. Bankevich, S. Nurk, D. Antipov, A. A. Gurevich, M. Dvorkin, A. S. Kulikov, V. M Lesin, S. I. Nikolenko, S. Pham, A. D. Prjibelski, A. V. Pyshkin, A. V. Sirotkin, N. Vyahhi, G. Tesler, M. A. Alekseyev, P. A. Pevzner // J Comput Biol. - 2012. - V. 19, № 5. - P. 455-477.

47. Bartal, A. Effects of Different Cultivation Parameters on the Production of Surfactin Variants by a Bacillus subtilis strain [Text] / A. Bartal, A. Vigneshwari, B. Boka, M. Vörös, I. Takacs, L. Kredics, L. Manczinger, M. Varga, C. Vagvölgyi, A. Szekeres // Molecules. - 2018. - V. 18. - E. 2675.

48. Berg, G. Plant-dependent genotypic and phenotypic diversity of antagonistic rhizobacteria isolated from different Verticillium host plants [Text] / G. Berg, N. Roskot,

A. Steidle, L. Eberl, A. Zock, K. Smalla // Appl. Environ. Microbiol. - 2002. - V.68, № 7. - P. 3328-3338.

49. Bernardeau, M. Importance of the gastrointestinal life cycle of Bacillus for probiotic functionality [Text] / M. Bernardeau, M. J. Lehtinen, S. D. Forssten, P. Nurminen // J. Food Sci. Technol. - 2017. - V. 54. - P. 2570-2584.

50. Bernardeau, M. Overview of differences between microbial feed additives and probiotics for food regarding regulation, growth promotion effects and health properties and consequences for extrapolation of farm animal results to humans [Text] / M. Bernardeau, J.-P. Vernoux // Clin. Microbiol. Infect. - 2013. - V. 19. - P. 321-330.

51. Blajman, J. E. Probiotics and broiler growth performance: A meta-analysis of randomised controlled trials [Text] / J. E. Blajman, L. S. Frizzo, M. V. Zbrun, D. M. Astesana, M. L. Fusari, L. P. Soto, M. R. Rosmini, M. L. Signorini // Br. Poult. Sci. -2014. - V. 55. - P. 483-494.

52. Blin, K. antiSMASH 5.0: updates to the secondary metabolite genome mining pipeline [Text] / K. Blin, S. Shaw, K. Steinke, R. Villebro, N. Ziemert, S.Y. Lee // Nucleic Acids Res. - 2019. - V. 47. - P. 1-7.

53. Bodinga, B. M. Effects of Bacillus subtilis DSM 32315 on Immunity, Nutrient Transporters and Functional Diversity of Cecal Microbiome of Broiler Chickens in Necrotic Enteritis Challenge [Text] / B. M. Bodinga, K. Hayat, X. Liu, J. Zhou, X. Yang, A. Ismaila, R. N. Soomro, Z. Ren, W. Zhang, X. J. Yang // World Poult. Res. - 2020. -V. 10. - P. 527-544.

54. Boeckel, Van T. P Global antibiotic consumption 2000 to 2010: an analysis of national pharmaceutical sales data [Text] / T. P. Van Boeckel, M. D. S. Gandra, M. P. P. A. Ashok, Q. Caudron, B. T Grenfell, S. A Levin, R. Laxminarayan // The Lancet Infectious Diseases. - 2014. - V. 14. - P. 742-750.

55. Bolger, A. M. Trimmomatic: a flexible trimmer for Illumina sequence data / A. M. Bolger, M. Lohse, B. Usadel // Bioinformatics. - 2014. - V. 30. - P. 2114-2120.

56. Borda-Molina, D. Current perspectives of the chicken gastrointestinal tract and its microbiome [Text] / D. Borda-Molina, J. Seifert, A. Camarinha-Silva // Comput.Struct. Biotechnol. J. - 2018. - V. 16. - P. 131-139.

57. Broom, L. J. The role of the gut microbiome in shaping the immune system of chickens [Text] / L. J. Broom, M. H. Kogut // Vet. Immunol. Immunopathol. - 2018. - V. 204. - P. 44-51.

58. Browne, K. A. New Era of Antibiotics: The Clinical Potential of Antimicrobial Peptides [Text] / K. Browne, S. Chakraborty, R. Chen, M. D. P. Willcox, D. StClair Black, W. R. Walsh, N. Kumar // Int J Mol Sci. - 2020. - V. 21. - E. 7047.

59. Cao, G. Positive effects of a: Clostridium butyricum-based compound probiotic on growth performance, immune responses, intestinal morphology, hypothalamic neurotransmitters, and colonic microbiota in weaned piglets [Text] / G. Cao, F. Tao, Y. Hu, Z. Li, Y. Zhang, B. Deng, et al. // Food Funct. - 2019. - V. 10. - P. 2926-2934.

60. Caporaso, J. G. Ultra-high-throughput microbial community analysis on the Illumina HiSeq and MiSeq platforms [Text] / J. G. Caporaso, C. L. Lauber, W. A. Walters, D. Berg-Lyons, J. Huntley, N. Fierer, et al. // ISME J. - 2012. - V. 6. - P. 16211624.

61. Casula, G. Bacillus probiotics: spore germination in the gastrointestinal tract [Text] / G. Casula, S. Cutting // M. Appl. Environ. Microbiol. - 2002. - V. 68. - P. 23442352.

62. Caulier, S. Overview of the Antimicrobial Compounds Produced by Members of the Bacillus subtilis Group [Text] / S. Caulier, C. Nannan, A. Gillis, F. Licciardi, C. Bragard, J. Mahillon // Front. Microbiol. - 2019. - V. 10. - E. 302.

63. Cenci, G. Tolerance to challenges miming gastrointestinal transit by spores and vegetative cells of Bacillus clausii / G. Cenci, F. Trotta, G. Caldini // J. Appl. Microbiol. - 2006. - V. 101. - P. 1208-1215.

64. Chaloner, G. Dynamics of dual infection with Campylobacter jejuni strains in chickens reveals distinct strain-to-strain variation in infection ecology [Text] / G. Chaloner, P. Wigley, S. Humphrey, K. Kemmett, L. Lacharme-Lora, T. Humphrey, et al. // Applied Environmental Microbiology. - 2014. - V. 80, № 20. - P. 6366-6372.

65. Chalvon-Demersay, T. Supplementing functional amino acids and polyphenols at low dose can restore performance and amino acid digestibility in broilers challenged with coccidiosis [Text] / T. Chalvon-Demersay, T. Yamphet, S. Srinongkote, H. Ohara, W. Lambert // Livestock Science. - 2021. - V. 254. - E. 104769.

66. Charteris, W. P. Effect of conjugated bile salts on antibiotic susceptibility of bile salt-tolerant Lactobacillus and Bifidobacterium Isolates [Text] / W. P. Charteris, P. M. Kelly, L. Morelli, J. K. Collins // J. Food Protection. - 2000. - V. 63. - P. 1369-1376.

67. Checcucci, A. Editorial: Optimizing probiotic applications in agriculture: Exploring the role of growth and health promoter's microorganisms in plants and livestock animals [Text] / A. Checcucci, D. Luise, F. Pini // Front. Microbiol. - 2022. -V. 13. - E. 993075.

68. Checcucci, A. Exploring the Animal Waste Resistome: The Spread of Antimicrobial Resistance Genes Through the Use of Livestock Manure [Text] / A. Checcucci, P. Trevisi, D. Luise, M. Modesto, S. Blasioli, I. Braschi, P. Mattarelli // Front. Microbiol. - 2020. - V. 11. - E. 1416.

69. Cheled-Shoval, S. L. Differences in intestinal mucin dynamics between germ-free and conventionally reared chickens after mannan-oligosaccharide supplementation [Text] / S. L. Cheled-Shoval, N. S. Gamage, E. Amit-Romach, et al. // Poult Sci. - 2014. - V. 93, № 3. - P.636-644.

70. Chen, J. N. Extracts containing CLPs of Bacillus amyloliquefaciens JN68 isolated from chicken intestines exert antimicrobial effects, particularly on methicillin-resistant Staphylococcus aureus and Listeria monocytogenes [Text] / J. N. Chen, C. W. Wei, H. C. Liu, S. Y. Chen, C. Chen, Y. M. Juang, C. C. Lai, G. T. Yiang // Mol Med Rep. - 2016. -V. 14, № 6. - P.5155-5163.

71. Chen, P. Effects of Probiotics and Gut Microbiota on Bone Metabolism in Chickens: A Review [Text] / P. Chen, T. Xu, C. Zhang, X. Tong, A. Shaukat, Y. He, K. Liu, S. Huang // Metabolites. - 2022. - V. 12, № 10. - E. 1000.

72. Choct, M. Enzymes for the feed industry: past, present and future [Text] / M. Choct // World's Poult. Sci. J. - 2006. - V. 62. - P. 5-16.

73. Chomczynski, P. Single-Step Method Of RNA Isolation By Acid Guanidinium Thiocyanate-Phenol-Chlorform Extraction [Text] / P. Chomczynski, N. Sacchi // Analytical Biochemistry - 1987. - V. 162. - P. 156-159.

74. Ciszewski, A. Influence of Effective Microorganisms and Clinoptilolite on Gut Barrier Function, Intestinal Health and Performance of Broiler Chickens during Induced Eimeria tenella Infection A. Ciszewski, L. S. Jarosz, M. Kalinowski, A. Marek, Z.

Gr^dzki, S. Grabowski, M. Hejdysz, S. Nowaczewski, A. Rysiak // Agriculture. - 2022. -V. 12. - E. 2176.

75. Ciurescu, G. Effect of Bacillus subtilis on growth performance, bone mineralization, and bacterial population of broilers fed with different protein sources [Text] / G. Ciurescu, M. Dumitru, A. Gheorghe, A. E. Untea, R. Dräghici // Poult. Sci. -2020. - V. 99. - P. 5960-5971.

76. Clavijo, V. The gastrointestinal microbiome and its association with the control of pathogens in broiler chicken production: A review [Text] / V. Clavijo, M. J. V. Flórez // Poult. Sci. - 2017. - V. 97. - P. 1006-1021.

77. Clavijo, V. The gut microbiota of chickens in a commercial farm treated with a Salmonella phage cocktail [Text] / V. Clavijo, T. Morales, M. J. Vives-Flores, et al. // Sci Rep. - 2022. - V. 12, №. 1. - E. 991.

78. Connerton, P. L. The effect of the timing of exposure to Campylobacter jejuni on the gut microbiome and inflammatory responses of broiler chickens [Text] / P. L. Connerton, P. J. Richards, G. M. Lafontaine, P. M. O'Kane, N. Ghaffar, N. J. Cummings, D. L. Smith, N. M. Fish, I. F. Connerton // Microbiome. - 2018. - V. 6, № 1. - E. 88.

79. Contesini, J. An overview of Bacillus proteases: from production to application [Text] / Contesini J., R. De Melo, H. Sato // Critical Reviews in Biotechnology. - 2017. -V. 38. - P. 321-334.

80. Cutting, S. M. Bacillus probiotics [Text] / S. M. Cutting // Food Microbiol. -2011. - V. 28. - P. 214-220.

81. Dang, Y. Enhanced production of antifungal lipopeptide iturin A by Bacillus amyloliquefaciens LL3 through metabolic engineering and culture conditions optimization [Text] / Y. Dang, F. Zhao, X. Liu, et al. // Microb Cell Fact. - 2019. - V. 18, № 1. - E. 68.

82. Darsi, E. Effects of Bacillus subtilis PB6 supplementation on productive performance, egg quality and hatchability in broiler breeder hens under commercial farm condition [Text] / E. Darsi, M. Zhaghari // Journal of Applied Animal Research. - 2021. - V. 49, № 1. - P. 109-117.

83. DeFilippi, S. Fungal competitors affect production of antimicrobial lipopeptides in Bacillus subtilis Strain B9-5 J [Text] / S. DeFilippi, E. Groulx, M. Megalla, R. Mohamed, T. J. Avis // Chem. Ecol. - 2018. - V. 44, № 4. - P. 374-383.

84. Deleu, M. Effect of Fengycin, a Lipopeptide Produced by Bacillus subtilis, on Model Biomembranes [Text] / M. Deleu, M. Paquot, T. Nylander // Biophys J. - 2008. -V. 94, №. 7. - P. 2667-2679.

85. Demidyuk, I.V. Cloning, sequencing, expression, and characterization of protealysin, a novel neutral proteinase from Serratia proteamaculans representing a new group of thermolysin-like proteases with short N-terminal region of precursor [Text] / I. V. Demidyuk, A. E. Kalashnikov, T. Y. Gromova, E. V. Gasanov, D. R. Safina, M. V. Zabolotskaya, G. N. Rudenskaya, S. V. Kostrov // Protein. Expr. Purif. - 2006. - V. 47. -P. 551-561.

86. Demin, K. A. Mechanisms of Candida Resistance to Antimycotics and Promising Ways to Overcome It: The Role of Probiotics [Text] / K. A. Demin, A. G. Refeld, A. A. Bogdanova, E. V. Prazdnova, I. V. Popov, O. Y. Kutsevalova, A. M. Ermakov, A. B. Bren, D. V. Rudoy, V. A. Chistyakov, et al. // Probiotics Antimicrob. Proteins. - 2021. -V. 13, № 4. - P. 926-948.

87. Deng, W. The probiotic Bacillus licheniformis ameliorates heat stress-induced impairment of egg production, gut morphology, and intestinal mucosal immunity in laying hens [Text] / W. Deng, X. F. Dong, J. M. Tong, Q. Zhang // Poult. Sci. - 2012. -V. 91. - P. 575-582.

88. Diaz Carrasco, J. M. Microbiota, gut health and chicken productivity: what is the connection? [Text] / J. M. Diaz Carrasco, N. A. Casanova, M. E. Fernández Miyakawa // Microorganisms. - 2019. - V. 7. - P. 374-389.

89. Dibner, J. J. Theeffect of dietary ingredients and age on the microscopic structureof the gastrointestinal tract in poultry [Text] / J. J. Dibner, M. L. Kitchell, C. A. Atwell, F. J. Ivey // J. Appl. Poult. Res. - 1996. - V. 5. - P. 70-77.

90. Dimkic, I. The profile and antimicrobial activity of Bacillus lipopeptide extracts of five potential biocontrol strains [Text]/ I. Dimkic, S. Stankovic, M. Nisavic, M. Petkovic, P. Ristivojevic, D. Fira, et al. // Front. Microbiol. - 2017. - V. 8. - E. 925.

91. Ding, H. Dietary supplementation with Bacillus subtilis DSM 32315 alters the intestinal microbiota and metabolites in weaned piglets [Text] / H. Ding, X. Zhao, C. Ma, Q. Gao, Y. Yin, X. Kong, et al. // J. Appl. Microbiol. - 2021. - V. 130. - P. 217-232.

92. Ding, J. Inheritance and establishment of gut microbiota in chickens [Text] / J. Ding, R. Dai, L. Yang, C. He, K. Xu, S. Liu, W. Zhao, L. Xiao, L. Luo, Y. Zhang, H. Meng // Front. Microbiol. - 2017. - V. 8. - E. 1967.

93. Ding, J. Heritable Gut Microbiome Associated with Salmonella enterica Serovar Pullorum Infection in Chickens [Text] / J. Ding , H. Zhou, L. Luo , L. Xiao , K. Yang , L. Yang , Y. Zheng , K. Xu , C. He , C. Han , H. Luo , C. Qin , F. T. Akinyemi , C. Gu , Z. Zhou , Q. Huang , H. Meng // ASM Journals mSystems. - 2021. - V. 6, № 1. - E. 0119220.

94. Donaldson, E. E. The time-course of broiler intestinal microbiota development after administration of cecal contents to incubating eggs [Text] / E. E. Donaldson, D. Stanley, R. J. Hughes, R. J. Moore // PeerJ 5. - 2017. - V. 5. - E. 3587.

95. Duangnumsawang, Y. Development and Functional Properties of Intestinal Mucus Layer in Poultry [Text] / Y. Duangnumsawang, J. Zentek, F. Goodarzi Boroojeni // Front Immunol. - 2021. - V. 12. - E.745849.

96. Duc, L. H. Bacterial spores as vaccine vehicles [Text] / L. H. Duc, H. A. Hong, N. Fairweather, E. Ricca, S. M. Cutting // Infect. Immun. - 2003. - V. 71. - P. 2810-2818.

97. Dunlap, C. A. Iturinic Lipopeptide Diversity in the Bacillus subtilis Species Group - Important Antifungals for Plant Disease Biocontrol Applications [Text] / C. A. Dunlap, M. J. Bowman, A. P. Rooney // Front. Microbiol. - 2019. - V. 10. - E.1794.

98. Duskaev, G. Effects of Bacillus cereus and coumarin on growth performance, blood biochemical parameters, and meat quality in broilers [Text] / G. Duskaev, S. Rakhmatullin, O. Kvan // Vet. World. - 2020. - V. 13. - P. 2484-2492.

99. Edens, F.W. An alternative for antibiotic use in poultry: Probiotics [Text] / F.W. Edens // Braz. J. Poult. Sci. - 2003. - V. 5. - P. 75-97.

100. Edwards, J. Structure, variation, and assembly of the root-associated microbiomes of rice [Text] / J. Edwards, C. Johnson, C. Santos-Medelli'n, E. Lurie, N. K. Podishetty, S. Bhatnagar, et al. // Proc Natl Acad Sci USA. - 2015. - V.112, № 8. - P. 11-20.

101. Elisashvili, V. Recent Advances in the Physiology of Spore Formation for Bacillus Probiotic Production [Text] / V. Elisashvili, E. Kachlishvili, M. L. Chikindas // Probiotics Antimicrob. Proteins. - 2019. - V. 11. - P. 731-747.

102. Elleithy, E. M. M. Influence of dietary Bacillus coagulans and/or Bacillus licheniformis-based probiotics on performance, gut health, gene expression, and litter quality of broiler chickens [Text] / E. M. M. Elleithy, B. M. Bawish, S. Kamel, et al. // Trop Anim Health Prod. - 2023. - V. 55, № 1. - E. 38.

103. Elshaghabee, F. M. F. Bacillus As Potential Probiotics: Status, Concerns, and Future Perspectives [Text] / F. M. F. Elshaghabee, N. Rokana, R. D. Gulhane, C. Sharma, H. Panwar // Front Microbiol. - 2017. - V. 8. - E. 1490.

104. Ermakova, L.P. Effects of a probiotic containing Bacillus subtilis on the gut microflora, yolk quality and blood lipid concentrations of laying Pharaon quails [Text] / L. P. Ermakova, G. A. Nozdrin, S. N. Tishkov, Y. V. Novik, N. A. Gotovchikov, I. K. Mensh // Vet. Stanica. - 2021. - V. 52. - P. 297-306.

105. European Commission. Ban on Antibiotics as Growth Promoters in Animal Feed Enters into Effect. European Commision; Brussels, Belgium: 2005. [(accessed on 1 April 2023)]. Press Release Database. Available online: http://europa.eu/rapid/press-release_IP-05-1687_en.htm

106. European Food Safety Authority (EFSA). Annual Report on surveillance for avian influenza in poultry and wild birds in Member States of the European Union in 2020 [Text] / European Food Safety Authority (EFSA), I. Aznar, F. Baldinelli, A. Papanikolaou, A. Stoicescu, Y. Van der Stede // EFSA Journal 19.12. - 2021. - E. 06953.

107. Faderl, M. Keeping bugs in check: The mucus layer as a critical component in maintaining intestinal homeostasis [Text] / M. Faderl, M. Noti, N. Corazza, C. Mueller // IUBMB Life. - 2015. - V. 67. - P. 275-285.

108. Faille, C. Occurrence of Bacillus cereus spores with a damaged exosporium: Consequences on the spore adhesion on surfaces of food processing lines [Text] / C. Faille, G. Tauveron, C. Le Gentil-Lelievre, C. Slomianny // J. Food Prot. - 2007. - V. 70. - P. 2346-2353.

109. Falardeau, J. Ecological and mechanistic insights into the direct and indirect antimicrobial properties of Bacillus subtilis lipopeptides on plant pathogens [Text] / J. Falardeau, C. Wise, L. Novitsky, T. J. Avis // J Chem Ecol. - 2013. - V. 39, №. 7. - P. 869-878.

110. Fan, L. DRAMP: A comprehensive data repository of antimicrobial peptides [Text] / L. Fan, J. Sun, M. Zhou, J. Zhou, X. Lao, H. Zheng, H. Xu // Sci. Rep. - 2016. -V. 6. - E. 24482.

111. FAO Food and Nutrition Paper. Probiotics in Food: Health and Nutritional Properties and Guidelines for Evaluation. Food and Agriculture Organization of the United Nations; Rome, Italy: World Health Organization; Geneva, Switzerland. - 2006.

112. Fathima, S. Gastrointestinal Microbiota and Their Manipulation for Improved Growth and Performance in Chickens [Text] / S. Fathima, R. Shanmugasundaram, D. Adams, R. K. Selvaraj // Foods. - 2022. - V. 11, № 10. - E. 1401.

113. Feye, K. M. Influential factors on the composition of the conventionally raised broiler gastrointestinal microbiomes [Text] / K. M. Feye, M. F. A. Baxter, G. Tellez-Isaias, M. H. Kogut, S. C. Ricke // Poult. Sci. - 2020. - V. 99. - P. 653-659.

114. Fira, D. Biological control of plant pathogens by Bacillus species [Text] / D. Fira, I. Dimkic, T. Beric, J. Lozo, S. Stankovic // J Biotechnol. - 2018. - V. 285. - P. 44-55.

115. Forte, C. Effects of two different probiotics on microflora, morphology, and morphometry of gut in organic laying hens [Text] / C. Forte, G. Acuti, E. Manuali, P. C. Proietti, S. Pavone, M. Trabalza-Marinucci, et al. // Poult. Sci. - 2016. - V. 95. - P. 2528-2535.

116. Fu, R. Effects of dietary Bacillus coagulans and yeast hydrolysate supplementation on growth performance, immune response and intestinal barrier function in weaned piglets [Text] / R. Fu, C. Liang, D. Chen, H. Yan, G. Tian, P. Zheng, et al. // J. Anim. Physiol. Anim. Nutr. (Berl). - 2021. - V. 105. - P. 898-907.

117. Gabriel, I. Microflora of the digestive tract: critical factors and consequences for poultry [Text] / I. Gabriel, M. Lessire, S. Mallet, J. Guillot // World's poultry science journal. - 2006. - V. 62, № 3. - P. 499-511.

118. Gadde, U. D. Alternatives to antibiotics for maximizing growth performance and feed efficiency in poultry: A review [Text] / U. D. Gadde, W. H. Kim, S. T. Oh, H. S. Lillehoj // Anim. Health Res. Rev. - 2017. - V. 18. - P. 26-45.

119. Gao, Z. Study of Bacillus subtilis on growth performance, nutrition metabolism and intestinal microfora of 1 to 42 d broiler chickens [Text] / Z. Gao, H. Wu, L. Shi, X. Zhang, R. Sheng, F. Yin, et al. // Anim. Nutr. - 2017. - V. 3. - P. 109-113.

120. Gewirtz, A. T. Cutting edge: Bacterial flagellin activates basolaterally expressed TLR5 to induce epithelial proinflammatory gene expression [Text] / A. T. Gewirtz, T. A. Navas, S. Lyons, P. J. Godowski, J. L. Madara // J. Immunol. - 2001. - V. 167. - P. 1882-1885.

121. Gharib-Naseri, K. Modulations of genes related to gut integrity, apoptosis, and immunity underlie the beneficial effects of Bacillus amyloliquefaciens CECT 5940 in broilers fed diets with different protein levels in a necrotic enteritis challenge model [Text] / K. Gharib-Naseri, J. C. D. de Paula, K. Doranalli, S. Kheravii, R. A. Swick, M. Choct, S. Wu // J. Anim. Sci. Biotechnol. - 2020. - V. 11. - P. 1-13.

122. Glendinning, L. Assembly of hundreds of novel bacterial genomes from the chicken caecum [Text] / L. Glendinning, R. D. Stewart, M. J. Pallen, K. A. Watson, M. Watson // Genome Biol. - 2020. - V. 21, № 1. - E. 34.

123. Gong, A. D. Antagonistic mechanism of iturin A and plipastatin A from Bacillus amyloliquefaciens S76-3 from wheat spikes against Fusarium graminearum [Text] / A. D. Gong, H. P. Li, Q. S. Yuan, X. S. Song, W. Yao, W. J. He, et al // PLoS One - 2015. -V. 10. - E 0116871.

124. Gong, L. Effects of three probiotic Bacillus on growth performance, digestive enzyme activities, antioxidative capacity, serum immunity, and biochemical parameters in broilers [Text] / L. Gong, B. K. Wang, X. Q. Mei, H. Xu, Y. Qin, W. F. Li, Y. S. Zhou // J. Anim. Sci. - 2018. - V. 89. - P. 1561-1571.

125. Gong, M. Study of the Antifungal Ability of Bacillus subtilis Strain PY-1 in Vitro and Identification of its Antifungal Substance (Iturin A) [Text] / M. Gong, J.D. Wang, J. Zhang, H. Yang, X.F. Lu, Y. Pel, J.Q. Cheng // Acta Biochimica et Biophysica Sinica. -2006. - V. 38, № 4. - P. 233-240.

126. Gonzalez-Jaramillo, L. M. Antimycotic activity of fengycin C biosurfactant and its interaction with phosphatidylcholine model membranes [Text] / L. M. Gonzalez-Jaramillo, F. J. Aranda, J. A. Teruel, V. Villegas-Escobar, A. Ortiz // Colloid Surf. B -2017. - V. 156. - P. 14-22.

127. Grant, A. Bacillus spp. as direct-fed microbial antibiotic alternatives to enhance growth, immunity, and gut health in poultry [Text] / A. Grant, C. G. Gay, H. S. Lillehoj // Avian Pathol. - 2018. - V. 47, № 4. - P. 339-351.

128. Gresse, R. Gut microbiota dysbiosis in postweaning piglets: understanding the keys to health [Text] / R. Gresse, F. Chaucheyras-durand, M. A. Fleury, T. Van de Wiele, E. Forano, S. Blanquet-diot // Trends Microbiol. - 2017. - V. 25. - P. 851-873.

129. Guardia, S. Effects of stocking density on the growth performance and digestive microbiota of broiler chickens [Text] / S. Guardia, B. Konsak, S. Combes, F. Levenez, L. Cauquil, J. F. Guillot, et al. // Poult. Sci. - 2011. - V. 90. - P. 1878-1889.

130. Gul, S. T. Probiotics as an alternative approach to antibiotics for safe poultry meat production [Text] / S. T. Gul, A. F. Alsayeqh // Pak Vet J. - 2022. - V. 42, № 3. - P. 285-291.

131. Gurevich, A. QUAST: Quality Assessment Tool for Genome Assemblies [Text] / A. Gurevich, V. Saveliev, N. Vyahhi, G. Tesler // Bioinformatics. - 2013. - V.15, № 29. - P. 1072-1075.

132. Gurjar, J. Production of surfactin from rice mill polishing residue by submerged fermentation using MTCC 2423 [Text] / J. Gurjar, B. Sengupta // Bioresource Technology. - 2015. - V. 189. - P. 243-249.

133. Hafez, H. M. Challenges to the Poultry Industry: Current Perspectives and Strategic Future After the COVID-19 Outbreak [Text] / H. M. Hafez, Y. A. Attia // Front. Vet. Sci. - 2020. - V. 7. - E. 516.

134. Haller, D. Metabolic and functional properties of lactic acid bacteria in the gastrointestinal ecosystem: a comparative in vitro study between bacteria of intestinal and fermented food origin / D. Haller, H. Colbus, M. G. Gänzle, P. Scherenbacher, C. Bode, W. P. Hammes// Syst. Appl. Microbiol. - 2001. - V. 24. - P. 218-226.

135. Han, G. G. Relationship between the microbiota in different sections of the gastrointestinal tract, and the body weight of broiler chickens [Text] / G. G. Han, E. B. Kim, J. Lee, J. Y. Lee, G. Jin, J. Park, C. S. Huh, I. K. Kwon, D. Y. Kil, Y. J. Choi, et al. // Springerplus. - 2016. - V. 5. - E. 911.

136. Hanif, A. Fengycin Produced by Bacillus amyloliquefaciens FZB42 Inhibits Fusarium graminearum Growth and Mycotoxins Biosynthesis [Text] / A. Hanif, F. Zhang, P. Li, C. Li, Y. Xu, M. Zubair, M. Zhang, D. Jia, X. Zhao, J. Liang, T. Majid, J. Yan, A. Farzand, H. Wu, Q. Gu, X. Gao // Toxins. - 2019. - V. 11, № 5. - E. 295.

137. Hankel, J. Luminal and mucosa-associated caecal microbiota of chickens after experimental Campylobacter jejuni infection in the absence of Campylobacter-specific

phages of group II and III [Text] / J. Hankel, S. Kittler, B. Chuppava, E. Galvez, T. Strowig, A. Becker, M. von K. Blickwede, M. Plötz, C. Visscher // Microbial Genomics. - 2022. - V. 8. - E. 000874.

138. Harwood, C. R. Secondary metabolite production and the safety of industrially important members of the Bacillus subtilis group [Text] / C. R. Harwood, J. M. Mouillon, S. Pohl, J. Arnau // FEMS Microbiol. Rev. - 2018. - V. 42. - P. 721-738.

139. Hassan, M. Natural antimicrobial peptides from bacteria: Characteristics and potential applications to fight against antibiotic resistance [Text] / M. Hassan, M. Kjos, I. F. Nes, D. B. Diep, F. Lotfipour // J. Appl. Microbiol. - 2012. - V. 113. - P. 723-736.

140. Hazarika, D. J. Lipopeptide mediated biocontrol activity of endophytic Bacillus subtilis against fungal phytopathogens [Text] / D. J. Hazarika, G. Goswami, T. Gautom,

A. Parveen, P. Das, M. Barooah, R. Boro // BMC Microbiology. - 2019. - V. 19, № 1. -E. 71.

141. He, T. Effects of Probiotics as Antibiotics Substitutes on Growth Performance, Serum Biochemical Parameters, Intestinal Morphology, and Barrier Function of Broilers [Text] / T. He, S. Long, S. Mahfuz, D. Wu, X. Wang, X. Wei, X. Piao // Animals. -2019. - V. 9, № 11. - E. 985.

142. Herlemann, D. P. Transitions in bacterial communities along the 2000 km salinitygradient of the Baltic Sea [Text] / D. P. Herlemann, M. Labrenz, K. Jurgens, S. Bertilsson, J. J. Waniek, A. F. Andersson // ISME J. - 2011. - V. 5. - P. 1571-1579.

143. Hernández-González, J. C. Bacteriocins from Lactic Acid Bacteria. A Powerful Alternative as Antimicrobials, Probiotics, and Immunomodulators in Veterinary Medicine [Text] / J. C. Hernández-González, A. Martínez-Tapia, G. Lazcano-Hernández,

B. E. García-Pérez, N. S. Castrejón-Jiménez // Animals (Basel). - 2021. - V. 11, № 4. -E. 979.

144. Hernandez-Patlan, D. Impact of a Bacillus Direct-Fed Microbial on Growth Performance, Intestinal Barrier Integrity, Necrotic Enteritis Lesions, and Ileal Microbiota in Broiler Chickens Using a Laboratory Challenge Model [Text] / D. Hernandez-Patlan, B. Solis-Cruz, K. P. Pontin, X. Hernandez-Velasco, R. Merino-Guzman, B. Adhikari, R. López-Arellano, Y. M. Kwon, B. M. Hargis, M. A. Arreguin-Nava, et al. // Front. Vet. Sci. - 2019. - V. 6. - E. 108.

145. Hisanga, S. Studies on the germination of genus Bacillus spores in rabbit and canine intestines [Text] / S. Hisanga // J. Nagoya City Med. Assoc. - 1980. - V. 30 - P. 456-469.

146. Hoa, T. Fate and dissemination of Bacillus subtilis spores in a murine model [Text] / T. T. Hoa, L. H. Duc, R. Isticato, L. Baccigalupi, E. Ricca, P. H. Van, et al. // Appl. Environ. Microbiol. - 2001. - V. 67. - P. 3819-3823.

147. Hong, Y. Preliminary study on the efect of Bacillus amyloliquefaciens TL on cecal bacterial community structure of broiler chickens [Text] / Y. Hong, Y. Cheng, Y. Li, X. Li, Z. Zhou, D. Shi, et al. // Biomed Res Int. - 2019. - E. 5431354.

148. Huang, P. The chicken gut metagenome and the modulatory effects of plant-derived benzylisoquinoline alkaloids [Text] / P. Huang, Y. Zhang, K. Xiao, F. Jiang, H. Wang, D. Tang, D. Liu, B. Liu, et al. // Microbiome. - 2018. - V. 6, № 1. - E. 211.

149. Huang, Q. Effects of Bacillus subtilis B10 spores on viability and biological functions of murine macrophages [Text] / Q. Huang, X. Xu, Y. L. Mao, Y. Huang, I. R. Rajput, W. F. Li // Anim. Sci. J. - 2013. - V. 84. - P. 47-52.

150. Iwase, N. Production of iturin A homologues under different culture conditions [Text] / N. Iwase, M. S. Rahman, T. Ano // J. Environ. Sci. - 2009. - V. 21. - P. 28-32.

151. Jansen, E. F. Subtilin-An antibacterial product of Bacillus subtilis. Culturing conditions and properties [Text] / E. F. Jansen, D. J. Hirschmann // Arch. Biochem. -1944. - V. 4. - P. 297-309.

152. Jayaraman, S. Use of Bacillus subtilis PB6 as a potential antibiotic growth promoter replacement in improving performance of broiler birds [Text] / S. Jayaraman, P. P. Das, P. C. Saini, B. Roy, P. N. Chatterjee // Poult. Sci. - 2017. - V. 96. - P. 26142622.

153. Jerzsele, A. Efficacy of protected sodium butyrate, a protected blend of essential oils, their combination, and Bacillus amyloliquefaciens spore suspension against artificially induced necrotic enteritis in broilers [Text] / A. Jerzsele, K. Szeker, R. Csizinszky, E. Gere, C. Jakab, J. J. Mallo, P. Galfi // Poult. Sci. - 2012. - V. 91. - P. 837843.

154. Jha, R. Probiotics (Direct-Fed Microbials) in Poultry Nutrition and Their Effects on Nutrient Utilization, Growth and Laying Performance, and Gut Health: A Systematic

Review. [Text] / R. Jha, R. Das, S. Oak, P. Mishra // Animals (Basel). - 2020. - V. 10. -E. 1863.

155. Jha, S. S. Lipopeptide production by Bacillus subtilis R1 and its possible applications [Text] / S. S. Jha, S. J. Joshi // G. Braz J Microbiol. - 2016. - V. 4. - P. 955964.

156. Jia, R. Protective effects of Bacillus subtilis ASAG 216 on growth performance, antioxidant capacity, gut microbiota and tissues residues of weaned piglets fed deoxynivalenol contaminated diets [Text] / R. Jia, F. A. Sadiq, W. Liu, L. Cao, Z. Shen // Food Chem. Toxicol. - 2021. - V. 148. - E. 111962.

157. Jiang, S. Bacillus subtilis-based probiotic improves skeletal health and immunity in broiler chickens exposed to heat stress [Text] / S. Jiang, F. Yan, J. Hu, A. Mohammed, H. Cheng // Animals. - 2021. - V. 11, № 6. - E. 1494.

158. Jordan, S. Regulation of LiaRS-dependent gene expression in Bacillus subtilis: identification of inhibitor proteins, regulator binding sites, and target genes of a conserved cell envelope stress-sensing two-component system [Text] / S. Jordan, A. Junker, J. D. Helmann, T. Mascher // J. Bacteriol. - 2006. - V. 188. - P. 5153-5166.

159. Jozefiak, D. Carbohydrate fermentation in the avian ceca: a review [Text] / D. Jozefiak, A. Rutkowski, S. A. Martin // Anim. Feed. Sci. Technol. - 2004. - V. 113. - P. 1-15.

160. Jurburg, S. D. Patterns of community assembly in the developing chicken microbiome reveal rapid primary succession [Text] / S. D. Jurburg // Microbiol. Open. -2019. - V. 8, № 9. - E. 00821.

161. Kaspar, F. Bioactive secondary metabolites from Bacillus subtilis: A comprehensive review [Text] / F. Kaspar, P. Neubauer, M. Gimpel // J. Nat. Prod. -2019. - V. 82. - P. 2038-2053.

162. Kazemi, S. A. Evaluating two multistrain probiotics on growth performance, intestinal morphology, lipid oxidation and ileal microflora in chickens [Text] / S. A. Kazemi, H. Ahmadi, M. A. Karimi Torshizi // J. Anim. Physiol. Anim. Nutr. - 2019. - V. 103. - P. 1399-1407.

163. Keerqin, C. Probiotic Bacillus subtilis 29,784 improved weight gain and enhanced gut health status of broilers under necrotic enteritis condition [Text] / C.

Keerqin, L. Rhayat, Z. H. Zhang, K. Gharib-Naseri, S. K. Kheravii, E. Devillard, T. M. Crowley, S. B. Wu // Poult. Sci. - 2021. - V. 100. - E100981.

164. Keller, D. Spores of Bacillus coagulans GBI-30, 6086 show high germination, survival and enzyme activity in a dynamic, computer-controlled in vitro model of the gastrointestinal tract [Text] / D. Keller, S. Verbruggen, H. Cash, S. Farmer, K. Venema // Benef. Microbes. - 2019. - V. 10. - P. 77-87.

165. Kelly, J. Composition and diversity of mucosa-associated microbiota along the entire length of the pig gastrointestinal tract; dietary influences [Text] / J. Kelly, K. Daly, A. W. Moran, S. Ryan, D. Bravo, S. P. Shirazi-Beechey // Environ. Microbiol. - 2017. -V. 19. - P. 1425-1438.

166. Kers, J. G. Host and environmental factors affecting the intestinal microbiota in chickens [Text] / J. G. Kers, F. C. Velkers, E. A. Fischer, G. D. A. Hermes, J. A. Stegeman, H. Smidt // Front. Microbiol. - 2018. - V. 16, № 9. - E. 235.

167. Kim, K. Dietary supplementation of Bacillus subtilis influenced intestinal health of weaned pigs experimentally infected with a pathogenic E. coli [Text] / K. Kim, Y. He, X. Xiong, A. Ehrlich, X. Li, H. Raybould, et al. // J. Anim. Sci. Biotechnol - 2019. - V. 10. - E. 52.

168. Kim, M. Status of the phylogenetic diversity census of ruminal microbiomes [Text] / M. Kim, M. Morrison, Z. Yu // FEMS Microbiol. Ecol. - 2011. - V. 76. - P. 4963.

169. Kimera, Z. I. Multidrug-Resistant, Including Extended-Spectrum Beta Lactamase-Producing and Quinolone-Resistant, Escherichia coli Isolated from Poultry and Domestic Pigs in Dar es Salaam, Tanzania [Text] / Z. I. Kimera, F. X. Mgaya, G. Misinzo, S. E. Mshana, N. Moremi, M. I. N. Matee // Antibiotics. - 2021. - V. 10, № 4. -E. 406.

170. Klaenhammer, T. R. Genetics of bacteriocins produced by lactic acid bacteria [Text] / T. R. Klaenhammer // FEMS Microbiology Reviews. - 1993. - V. 12. - P. 39-86.

171. Kolobe, S. D. Potential use of acacia leaf meal as protein feed source for poultry diets: a review. [Text] / S. D. Kolobe, T. G. Manyelo, J. W. Ng'ambi, E. Malematja, T. Chitura, M. F. D. Nemauluma // JAPS: Journal of Animal & Plant Sciences. - 2022. - V. 32, № 6. - P. 1491-1500.

172. Konieczka, P. Effects of pea extrusion and enzyme and probiotic supplementation on performance, microbiota activity and biofilm formation in the broiler gastrointestinal tract [Text] / P. Konieczka, K. Nowicka, M. Madar, M. Taciak, S. Smulikowska // Br. Poult. Sci. - 2018. - V. 59. - P. 654-662.

173. Kordel, M. Interaction of the pore forming-peptide antibiotics pep 5, nisin and subtilin with non-energized liposomes [Text] / M. Kordel, F. Schuller, H. G. Sahl // FEBS Lett. -1989. - V. 244. - P. 99-102.

174. Korenblum, E. Purification and characterization of a surfactin-like molecule produced by Bacillus sp. H2O-1 and its antagonistic effect against sulfate reducing bacteri [Text] / E. Korenblum, L.V. de Araujo, C.R. Guimaräes, et al. // BMC Microbiol. - 2012. - V. 12. - E. 252.

175. Kourmentza, K. Antimicrobial activity of lipopeptide biosurfactants against foodborne pathogen and food spoilage microorganisms and their cytotoxicity [Text] / K. Kourmentza, X. Gromada, N. Michael, C. Degraeve, G. Vanier, R. Ravallec, F. Coutte, K. A. Karatzas P. Jauregi // Front. Microbiol. - 2021. - V. 11. - E. 561060.

176. Krysiak, K. Overview of the Use of Probiotics in Poultry Production [Text] / K. Krysiak, D. Konkol, M. Korczynski // Animals. - 2021. - V. 11, № 6. - E.1620.

177. Kubasova, T. Contact with adult hen affects development of caecal microbiota in newly hatched chicks [Text] / T. Kubasova, M. Kollarcikova, M. Crhanova, D. Karasova, D. Cejkova, A. Sebkova, et al. // PLoS One. - 2019. - V. 14. - E. 0212446

178. Kumar, M. Cancer-preventing attributes of probiotics: An update [Text] / M. Kumar, A. Kumar, R. Nagpal, D. Mohania, P. Behare, V. Verma, P. Kumar, D. Poddar, P. K. Aggarwal, C. Henry // Int. J. Food Sci. Nutr. - 2010. - V. 61. - P. 473-496.

179. Kumar, S. MEGA7: Molecular Evolutionary Genetics Analysis version 7.0 for bigger datasets / S. Kumar, G. Stecher, K. Tamura // Molecular Biology and Evolution. -2016. - V. 33. - P. 1870-1874.

180. Larsberg, F. Probiotic Bacillus Strains Enhance T Cell Responses in Chicken [Text] / F. Larsberg, M. Sprechert, D. Hesse, G. Loh, G. A. Brockmann, S. Kreuzer-Redmer // Microorganisms. - 2023. - V. 11, № 2. - E. 269.

181. Latorre, J. D. Evaluation of germination, distribution, and persistence of Bacillus subtilis spores through the gastrointestinal tract of chickens [Text] / J. D. Latorre, X. Hernandez-Velasco, G. Kallapura, A. Menconi, N. R. Pumford, M. J. Morgan, S. L.

Layton, L. R. Bielke, B. M. Hargis, G. Tellez // Poult. Sci. - 2014. - V. 93. - P. 17931800.

182. Lavoie, B. Regulation of Bone Metabolism by Serotonin; Understanding the Gut-Bone Signaling Axis [Text] / B. Lavoie, J. B. Lian, G. M. Mawe // Springer: Cham, Switzerland. - 2017. - V. 1033. - P. 35-46.

183. Lee, D. H. Microbial ecology of Bacillus thuringiensis: Fecal populations recovered from wildlife in Korea [Text] / D. H. Lee, I. H. Cha, D. S. Woo, M. Ohba // Can. J. Microbiol. - 2003. - V. 49. - P. 465-471.

184. Lee, K. W. An update on direct-fed microbials in broiler chickens in postantibiotic era [Text] / K.-W. Lee, H. S. Lillehoj // Anim. Prod. Sci. - 2017. - V. 57. - P. 1575.

185. Lee, K. W. Effects of direct-fed microbials on growth performance, gut morphometry, and immune characteristics in broiler chickens [Text] / K. W. Lee, S. H. Lee, H. S. Lillehoj, G. X. Li, S. I. Jang, U. S. Babu, et al. // Poult. Sci. - 2010. - V. 89. -P. 203-216.

186. Lefevre, M. Probiotic strain Bacillus subtilis CU1 stimulates immune system of elderly during common infectious disease period: a randomized, double-blind placebo-controlled study [Text] / M. Lefevre, S.M. Racedo, G. Ripert, et al. // Immun Ageing. -2015. - V. 12. - E. 24.

187. Lei, K. Influence of dietary inclusion of Bacillus licheniformis on laying performance, egg quality, antioxidant enzyme activities, and intestinal barrier function of laying hens [Text] / K. Lei, Y. L. Li, D. Y. Yu, I. R. Rajput, W. F. Li // Poult. Sci. -2013. - V. 92. - P. 2389-2395.

188. Li, C. Intestinal morphologic and microbiota responses to dietary Bacillus spp. in a broiler chicken model [Text] / C. L. Li, J. Wang, H. J. Zhang, S. G. Wu, Q. R. Hui, C. B. Yang, et al. // Front. Physiol. - 2019. - V. 9. - E. 1968.

189. Li, C. Intestinal morphologic and microbiota responses to dietary Bacillus spp. in a broiler chicken model [Text] / C. Li, J. Wang, H. Zhang, S. Wu, Q. Hui, et al.// - Front Physiol. - 2019. - V. 9. - E. 1968.

190. Li, G. Layer pullet preferences for light colors of light-emitting diodes [Text] / G. Li, B. Li, Y. Zhao, Z. Shi, Y. Liu, W. Zheng // Animal. - 2019. - V. 13. - P. 1245-1251.

191. Li, G. Novel activity evaluation and subsequent partial purification of antimicrobial peptides produced by Bacillus subtilis LFB112 [Text] / G. Li, B. Liu, Y. Shang, Z. Yu, R. Zhang // Ann. Microbiol. - 2012. - V. 62. - P. 667-674.

192. Li, S. Global spread of Salmonella enteritidis via centralized sourcing and international trade of poultry breeding stocks [Text] / S. Li, Y. He, D. A. Mann, et al. // Nat Commun. - 2021. - V. 12. - E. 5109.

193. Li, T. Effects of in ovo probiotic administration on the incidence of avian pathogenic Escherichia coli in broilers and an evaluation on its virulence and antimicrobial resistance properties [Text] / T. Li, C. D. Castañeda, J. Miotto, C. McDaniel, A. S. Kiess, L. Zhang // Poult. Sci. - 2021. - V. 100. - E.100903.

194. Li, X. Overexpression of specific proton motive force-dependent transporters facilitate the export of surfactin in Bacillus subtilis [Text] / X. Li, H. Yang, D. Zhang, X. Li, H. Yu, Z. Shen // J. Ind. Microbiol. Biotechnol. - 2015. - V. 42. - P. 93-103. 10.1007/s10295-014-1527-z

195. Li, X. Overexpression of specific proton motive force-dependent transporters facilitate the export of surfactin in Bacillus subtilis [Text] / X. Li, H. Yang, D. Zhang, H. Yu, Z. Shen // J. Ind. Microbiol. Biotechnol. - 2015. -V. 42. - P. 93-103.

196. Li, Y. Effect of Bacillus subtilis CGMCC 1.1086 on the growth performance and intestinal microbiota of broilers. [Text]/ Y. Li, Q. Xu, Z. Huang, et al. // J Appl Microbiol. - 2016. - V. 120, № 1. - P. 195-204.

197. Li, Y. F. Beneficial Effects of Probiotic Treatment on Gut Microbiota in Very Low Birth Weight Infants [Text] / Y. F. Li, C. R. Zhu, X. L. Gong, et al. // Gastroenterol Res Pract. - 2019. - E. 3682836.

198. Li, Y. The manifold roles of microbial ribosomal peptide-based natural products in physiology and ecology [Text] / Y. Li, S. Rebuffat // J. Biol. Chem. - 2020. - V. 295. -P. 34-54.

199. Li, Y. The manifold roles of microbial ribosomal peptide-based natural products in physiology and ecology [Text] / Y. Li, S. Rebuffat // J Biol Chem. - 2020. - V. 295, № 1. - P. 34-54.

200. Li, Y.C. Associations of dietary phytosterols with blood lipid profiles and prevalence of obesity in Chinese adults, a cross-sectional study [Text] / Y. C. Li, C. L. Li,

R. Li, Y. Chen, M. Zhang, P. P. Guo, D. Shi, X. N. Ji, R. N. Feng, C. H. Sun // Lipids Health Dis. - 2018. - V. 17. - E. 54.

201. Lin, L-Z. Isolation and Characterization of Fengycins Produced by Bacillus amyloliquefaciens JFL21 and Its Broad-Spectrum Antimicrobial Potential Against Multidrug-Resistant Foodborne Pathogens [Text] / L-Z. Lin, Q-W. Zheng, T. Wei, Z-Q. Zhang, C-F. Zhao, H. Zhong, Q-Y. Xu, J-F. Lin, L-Q. Guo // Front. Microbiol. - 2020. -V. 11. - E. 579621.

202. Liu, J. Surfactin effectively inhibits Staphylococcus aureus adhesion and biofilm formation on surfaces [Text] / J. Liu, W. Li, X. Zhu, H. Zhao, Y. Lu, C. Zhang, Z. Lu // Appl. Microbiol. Biotechnol. - 2019. - V. 103. - P. 4565-4574.

203. Loiseau, C. Surfactin from Bacillus subtilis displays an unexpected anti-Legionella activity [Text] / C. Loiseau, M. Schlusselhuber, R. Bigot, J. Bertaux, J.-M. Berjeaud, J. Verdon // Appl. Microbiol. Biotechnol. - 2015. - V. 99. - P. 5083-5093.

204. Lu, H. Transcriptome Analysis of Bacillus amyloliquefaciens Reveals Fructose Addition Effects on Fengycin Synthesis [Text] / H. Lu, H. Xu, P. Yang, M. Bilal, S. Zhu, M. Zhong, L. Zhao, C. Gu, S. Liu, Y. Zhao, C. Geng // Genes. - 2022. - V. 13. - E. 984.

205. Lu, J. Diversity and succession of the intestinal bacterial community of the maturing broiler chicken Appl [Text]/ J. Lu, U. Idris, B. Harmon, J. J. Maurer, M. D. Lee, C. Hofacre // Environ Microbiol. - 2003. - V. 69. - P. 6816-6824.

206. Luise, D. Bacillus spp. Probiotic Strains as a Potential Tool for Limiting the Use of Antibiotics, and Improving the Growth and Health of Pigs and Chickens [Text] / D. Luise, P. Bosi, L. Raff, L. Amatucci, S. Virdis, P. Trevisi // Front Microbiol. - 2022. - V. 13. - E.801827.

207. Luo, C. Nonribosomal peptide synthase gene clusters for lipopeptide biosynthesis in Bacillus subtilis 916 and their phenotypic functions [Text] / C. Luo, X. Liu, H. Zhou, X. Wang, Z. Chen // Appl. Environ. Microbiol. - 2015. - V. 81, №.1. - P. 422-431.

208. Ma, L. Characterization of an acidic cellulase produced by Bacillus subtilis BY-4 isolated from gastrointestinal tract of Tibetan pig [Text] / L. Ma, W. P. Yang, F. X. Meng, et al. // J Taiwan Inst Chem Eng. - 2015. - V. 56. - P. 67-72.

209. Ma, Y. Identification of lipopeptides in Bacillus megaterium by two-step ultrafiltration and LC-ESI-MS/MS [Text] / Y. Ma, Q. Kong, C. Qin, et al. // AMB Expr. - 2016. - V. 6. - E. 79.

210. Maget-Dana, R. Interactions of surfactin with membrane models [Text] / R. Maget-Dana, M. Ptak // Biophys J. - 1995. - V. 68. - P. 1937-1943.

211. Magnusdottir, S. Generation of genome-scale metabolic reconstructions for 773 members of the human gut microbiota [Text] / S. Magnusdottir, A. Heinken, L. Kutt, D. A. Ravcheev, E. Bauer, A. Noronha, et al. // Nat Biotechnol. - 2017. - V. 35. - P. 81-89.

212. Mancabelli, L. Insights into the biodiversity of the gut microbiota of broiler chickens [Text] / L. Mancabelli, C. Ferrario, C. Milani, M. Mangifesta, F. Turroni, S. Duranti, G. A. Lugli, A. Viappiani, M. C. Ossiprandi, D. van Sinderen, M. Ventura // Environ. Microbiol. - 2016. - V.18. - P. 4727-4738.

213. Markowiak-Kopec, P. The Effect of Probiotics on the Production of Short-Chain Fatty Acids by Human Intestinal Microbiome [Text] / P. Markowiak-Kopec, K. Slizewska // Nutrients. - 2020. - V. 12, № 4. - E. 1107.

214. Martirani, L. Purification and partial characterization of bacillocin 490, a novel bacteriocin produced by a thermophilic strain of Bacillus licheniformis [Text] / L. Martirani, M. Varcamonti, G. Naclerio, M. D. Felice // Microb. Cell Fact. - 2002. - V. 1. - E. 1.

215. Marx, R. Structure of the Bacillus subtilis peptide antibiotic subtilosin A determined by 1H-NMR and matrix assisted laser desorption/ionization time-of-flight mass spectrometry [Text] / R. Marx, T. Stein, K. D. Entian, S. J. Glaser // J. Protein Chem. - 2001. - V. 20. - P. 501-506.

216. Mazanko, M. S. Beneficial Effects of Spore-Forming Bacillus Probiotic Bacteria Isolated From Poultry Microbiota on Broilers' Health, Growth Performance, and Immune [Text] / M. S. Mazanko, I. V. Popov, E. V. Prazdnova, A. G. Refeld, A. B. Bren, G. A. Zelenkova, V. A. Chistyakov, A. Algburi, R. M. Weeks, A. M. Ermakov, Chikindas M. L. // System. Front. Vet. Sci. - 2022. - V. 9. - E. 877360.

217. Mazanko, M.S. Bacillus Probiotic Supplementations Improve Laying Performance, Egg Quality, Hatching of Laying Hens, and Sperm Quality of Roosters [Text] / M. S. Mazanko, I. F. Gorlov, E. V. Prazdnova, M. S. Makarenko, A. V. Usatov, A. B. Bren, V. A. Chistyakov, A. V. Tutelyan, Z. B. Komarova, N. I. Mosolova, et al. // Probiotics Antimicrob. Proteins. - 2018. - V. 10. - P. 367-373.

218. Medeot, D. B. Fengycins From Bacillus amyloliquefaciens MEP218 Exhibit Antibacterial Activity by Producing Alterations on the Cell Surface of the

Pathogens Xanthomonas axonopodis pv. vesicatoria and Pseudomonas aeruginosa PA01. [Text] / D. B. Medeot, M. Fernandez, G. M. Morales, E. Jofre // Front. Microbiol. -2020. - V. 10. - E. 3107.

219. Medvecky, M. Whole genome sequencing and function prediction of 133 gut anaerobes isolated from chicken cecum in pure cultures [Text] / M. Medvecky, D. Cejkova, O. Polansky, D. Karasova, T. Kubasova, A. Cizek, et al. // BMC Genom. -2018. - V. 19, № 1. - E. 561.

220. Medzhitov, R. Toll-like receptors and innate immunity [Text] / R. Medzhitov // Nat. Rev. Immunol. - 2001. - V. 1. - P. 135-145.

221. Memon, F. U. Chicken Gut Microbiota Responses to Dietary Bacillus subtilis Probiotic in the Presence and Absence of Eimeria Infection [Text] / F. U. Memon, Y. Yang, G. Zhang, I. H. Leghari, F. Lv, Y. Wang, F. Laghari, F. A. Khushk, H. Si // Microorganisms. - 2022. - V. 10. - E. 1548.

222. Menconi, A. Immuno-modulation and anti-inflammatory effects of antibiotic growth promoters versus probiotics in the intestinal tract [Text] / A. Menconi, L. R. Bielke, B. M. Hargis, G. Tellez // J. Microbiol. Res. Rev. - 2014. - V. 2. - P. 62-67.

223. Metzler-Zebeli, B. U. Feed restriction modifies intestinal microbiota-host mucosal networking in chickens divergent in residual feed intake [Text] / B. U. Metzler-Zebeli, S.-C. Siegerstetter, E. Magowan, P. G. Lawlor, R. M. Petri, N. E. O'Connell, et al. // mSystems. - 2019. - V. 4. - E.00261-E.00218.

224. Mingmongkolchai, S. Bacillus probiotics: An alternative to antibiotics for livestock production [Text] / S. Mingmongkolchai, W. Panbangred // J. Appl. Microbiol. -2018. - V. 124. - P. 1334-1346.

225. Mohammed, A. A. Effects of dietary supplementation of a probiotic (Bacillus subtilis) on bone mass and meat quality of broiler chickens [Text] / A. A. Mohammed, R. S. Zaki, E. A. Negm, M. A. Mahmoud, H. W. Cheng // Poult. Sci. - 2021. - V. 100. - E. 100906.

226. Mohsin, M. Effect of Probiotics on the Performance and Intestinal Health of Broiler Chickens Infected with Eimeria tenella [Text] / M. Mohsin, Z. Zhang, G. Yin // Vaccines. - 2022. - V. 10, № 1. - E. 97.

227. Mora, I. Cyclic lipopeptide biosynthetic genes and products, and inhibitory activity of plant-associated Bacillus against phytopathogenic bacteria [Text] / I. Mora, J. Cabrefiga, E. Montesinos // PLoS ONE. - 2015. - V. 10. - E. 0127738.

228. Motta, A. S. Antibacterial activity of a bacteriocin-like substance produced by Bacillus sp. P34 that targets the bacterial cell envelope [Text] / A. S. Motta, F. S. Flores, A. A. Souto, A. Brandelli // Antonie Van Leeuwenhoek. - 2008. - V. 93. - P. 275-284.

229. Mountzouris, K. C. Evaluation of the efficacy of a probiotic containing Lactobacillus, Bifidobacterium, Enterococcus, and Pediococcus strains in promoting broiler performance and modulating cecal microflora composition and metabolic activities [Text] / K. C. Mountzouris, P. Tsitrsikos, E. Kalamara, S. Nitsch, G. Schatzmayr, K. Fegeros // Poult. Sci. - 2007. - V. 86. - P. 309-317.

230. Mukherjee, A. Potential probiotics from Indian major carp, Cirrhinus mrigala. Characterization, pathogen inhibitory activity, partial characterization of bacteriocin and production of exoenzymes [Text] / A. Mukherjee, D. Dutta, S. Banerjee // Res. Vet. Sci. -2016. - V. 108. - P. 76-84.

231. Mullis, K. B. Specific synthesis of DNA in vitro via a polymerase-catalyzed chain reaction [Text] / K. B. Mullis, F. A. Faloona // Methods Enzymol. - 1987. - V. 155. - P. 335-350.

232. Musa, B. B. Bacillus subtilis B21 and Bacillus licheniformis B26 improve intestinal health and performance of broiler chickens with clostridium perfringens-induced necrotic enteritis [Text] / B. B. Musa, Y. Duan, H. Khawar, Q. Sun, Z. Ren, M. A. Elsiddig Mohamed, et al. // J. Anim. Physiol. Anim. Nutr. - 2019. - V. 103. - P. 1039-1049.

233. Neijat, M. Effect of dietary supplementation of Bacillus subtilis DSM29784 on hen performance, egg quality indices, and apparent retention of dietary components in laying hens from 19 to 48 weeks of age [Text] / M. Neijat, R. B. Shirley, J. Barton, P. Thiery, A. Welsher, E. Kiarie // Poult. Sci. - 2019. - V. 98. - P. 5622-5635.

234. Neveling, D. P. Probiotics: An Antibiotic Replacement Strategy for Healthy Broilers and Productive Rearing [Text] / D. P. Neveling, L. M. T. Dicks // Probiotics Antimicrob. Proteins. - 2021. - V. 13. - P. 1-11.

235. Ngunjiri, J. M. Farm stage, bird age, and body site dominantly afect the quantity, taxonomic composition, and dynamics of respiratory and gut microbiota of commercial

layer chickens [Text] / J. M. Ngunjiri, K. J. M. Taylor, M. C. Abundo, H. Jang, M. Elaish, K. C. Mahesh, et al. // Appl Environ Microbiol. - 2019. - V. 85, № 9. - E. 0313718.

236. Nguyen, A.T.V. Isolation and characterization of Bacillus subtilis CH16 strain from chicken gastrointestinal tracts for use as a feed supplement to promote weight gain in broilers [Text] / A.T.V. Nguyen, D.V. Nguyen, M.T. Tran // Lett Appl Microbiol. -2015. - V. 60. - P. 580-588.

237. Nicholson, W. L. Roles of Bacillus endospores in the environment [Text] / W. L. Nicholson // Cell Mol. Life Sci. - 2002. - V. 59. - P. 410-416.

238. Noreen, A. Investigating the Role of Antibiotics on Induction, Inhibition and Eradication of Biofilms of Poultry Associated Escherichia coli Isolated from Retail Chicken Meat [Text] / A. Noreen, H. Masood, J. Zaib, Z. Rafaque, A. Fatima, H. Shabbir, J. Alam, A. Habib, S. Noor, K. Dil, J. I. Dasti // Antibiotics (Basel). - 2022. - V. 19, № 11. - E. 1663.

239. Oakley, B. B. Spatial and temporal changes in the broiler chicken cecal and fecal microbiomes and correlations of bacterial taxa with cytokine gene expression [Text] / B. B. Oakley, M. H. Kogut // Front. Vet. Sci. - 2016. - V. 3, № 11. - E. 00011.

240. Oakley, B. B. The chicken gastrointestinal microbiome [Text] / B. B. Oakley, H. S. Lillehoj, M. H. Kogut, W. K. Kim, J. J. Maurer, A. Pedroso, M. D. Lee, S. R. Collett, T. J. Johnson, N. A. Cox // FEMS Microbiol. Lett. - 2014. - V. 360. - P. 100-112.

241. OECD; Food, Agriculture Organization of the United Nations. OECD-FAO Agricultural Outlook 2022-2031; OECD: Paris, France, 2022.

242. Ogbuewu, I. P. Bacillus Probiotics as Alternatives to In-feed Antibiotics and Its Influence on Growth, Serum Chemistry, Antioxidant Status, Intestinal Histomorphology, and Lesion Scores in Disease-Challenged Broiler Chickens [Text] / I. P. Ogbuewu, M. Mabelebele, N. A. Sebola, C. Mbajiorgu // Front. Vet. Sci. - 2022. - V. 9. - E. 876725.

243. Ohimain, E. I. The effect of probiotic and prebiotic feed supplementation on chicken health and gut microflora [Text] / E. I. Ohimain, R. T.Ofongo // J. Anim. Vet. Adv. - 2012. - V. 4. - P.135-143.

244. Oliveira, J. E. In ovo inoculation of chicken embryos with probiotic bacteria and its effect on posthatch Salmonella susceptibility [Text] / J. E. Oliveira, E. Van der

Hoeven-Hangoor, I. B. Van de Linde, R. C. Montijn, J. Van der Vossen // Poult. Sci. -2014. - V. 93. - P. 818-829.

245. Ongena, M. Bacillus lipopeptides: Versatile Weapons for Plant Disease Biocontrol [Text] / M. Ongena, P. Jacques // Trends in Microbiology. - 2008. - V. 16. -P. 115-125.

246. Paik, H. D. Identification and partial characterization of tochicin, a bacteriocin produced by Bacillus thuringiensis subsp. tochigiensis [Text] / H. D. Paik, S. S. Bae, S. H. Park, J. G. Pan // J. Ind. Microbiol. Biotechnol. - 1997. - V. 19. - P. 294-298.

247. Pan, D. Intestinal microbiome of poultry and its interaction with host and diet [Text] / D. Pan, Z. Yu // Gut Microbes. - 2014. - V. 5. - P. 108-119.

248. Pan, X. Probiotic Effects of Bacillus licheniformis DSM5749 on Growth Performance and Intestinal Microecological Balance of Laying Hens [Text] / X. Pan, Y. Cai, L. Kong, C. Xiao, Q. Zhu, Z. Song // Front Nutr. - 2022. - V. 9. - E. 868093.

249. Pandit, R. J. Microbial diversity and community composition of cecal microbiota in commercial and indigenous indian chickens determined using 16s rDNA amplicon sequencing [Text] / R. J. Pandit, A. T. Hinsu, N. V. Patel, P. G. Koringa, S. J. Jakhesara, J. R. Thakkar, et al. // Microbiome . - 2018. - V. 6, № 1. - E. 115.

250. Park, J. H. Supplemental effect of probiotic Bacillus subtilis B2A on productivity, organ weight, intestinal Salmonella microflora, and breast meat quality of growing broiler chicks [Text] / J. H. Park, I. H. Kim // Poult. Sci. - 2014. - V. 93, № 8. -P. 2054-2059.

251. Pathak, K. V. Identification of surfactins and iturins produced by potent fungal antagonist, Bacillus subtilis K1 isolated from aerial roots of banyan (Ficus benghalensis) tree using mass spectrometry [Text] / K.V. Pathak, H. Keharia // 3Biotech. - 2014. - V. 4. - P. 283-295.

252. Pathak, K. V. Lipopeptides from the banyan endophyte, Bacillus subtilis K1: Mass spectrometric characterization of a library of fengycins [Text] / K. V. Pathak, H. Keharia, K. Gupta, S. S. Thakur, P. J. Balaram // Am. Soc. Mass Spectrom. - 2012. - V. 23. - P.1716-1728.

253. Pedroso, A. A. Efect of in ovo administration of an adult-derived microbiota on establishment of the intestinal microbiome in chickens [Text] / A. A. Pedroso, A. B. Batal, M. D. Lee // Am. J. Vet. Res. - 2016. - V. 77. - P. 514-526.

254. Pelicia, K. Use of prebiotics and probiotics of bacterial and yeast origin for freerange broiler chickens [Text] / K. Pelicia, A. A. Mendes, E. S. P. B. Saldanha, C. C. Pizzolante, S. E. Takahashi, J. Moreira, R. G. Garcia, R. R. Quinteiro, I. C. L. A. Paz, C. M. Komiyama // Braz. J. Poult. Sci. - 2004. - V. 6, № 3. - P. 163-169.

255. Pender, C. M. In ovo supplementation of probiotics and its effects on performance and immune-related gene expression in broiler chicks [Text] / C. M. Pender, S. Kim, T. D. Potter, M. M. Ritzi, M. Young, R. A. Dalloul // Poult. Sci. - 2017. - V. 96. - P. 1052-1062.

256. Percie Du Sert, N. The ARRIVE guidelines 2.0: Updated guidelines for reporting animal research [Text] / N. Percie Du Sert, V. Hurst, A. Ahluwalia, S. Alam, M. T. Avey, M. Baker, W. J. Browne, A. Clark, I. C. Cuthill, U. Dirnagl, et al. // PLoS Biol. - 2020. -V. 18. - E. 3000410.

257. Pinkas, D. Bacillus subtilis cardiolipin protects its own membrane against surfactin-induced permeabilization [Text] / D. Pinkas, R. Fiser, P. Kozlik, T. Dolejsova, K. Hryzakova, I. Konopasek, G. Mikusova // Biochimica et Biophysica Acta (BBA) -Biomembranes. - 2020. - V. 1862. - E. 183405.

258. Popov, I. V. A Review of the Effects and Production of Spore-Forming Probiotics for Poultry [Text] / I. V. Popov, A. Algburi, E. V. Prazdnova, M. S. Mazanko, V. Elisashvili, A. B. Bren, V. A. Chistyakov, E. V. Tkacheva, V. I. Trukhachev, I. M. Donnik, Y. A. Ivanov, D. Rudoy, A. M. Ermakov, R. M. Weeks, M. L. Chikindas // Animals. - 2021. - V. 11, № 7. - E. 1941.

259. Poulsen, A. S. R. Impact of Bacillus spp. spores and gentamicin on the gastrointestinal microbiota of suckling and newly weaned piglets [Text] / A. S .Poulsen, R., N. de Jonge, J. L. Nielsen, O. H0jberg, C. Lauridsen, S. M. Cutting, et al. // PLoS One - 2018. - V. 13. - E. 0207382.

260. Raaijmakers, J. M. Natural Functions of Lipopeptides from Bacillus and Pseudomonas: More Than Surfactants and Antibiotics [Text] / J. M. Raaijmakers, I. De Bruijn, O. Nybroe, M. Ongena // FEMS Microbiol. Rev. - 2010. - V. 34. - P. 1037-1062.

261. Rachmilewitz, D. Toll-like receptor 9 signaling mediates the anti-inflammatory effects of probiotics in murine experimental colitis [Text] / D. Rachmilewitz, K. Katakura, F. Karmeli, T. Hayashi, C. Reinus, B. Rudensky, S. Akira, K. Takeda, J. Lee, K. Takabayashi // Gastroenterology. - 2004. - V. 126. - P. 520-528.

262. Raeth-Knight, M. L. Effect of Direct-Fed Microbials on Performance, Diet Digestibility, and Rumen Characteristics of Holstein Dairy Cows [Text] / M. L. Raeth-Knight, J. G. Linn, H. G. Jung // J. Dairy Sci. - 2007. - V. 90. - P. 1802-1809.

263. Rahman, F. B. Molecular genetics of surfactin and its effects on different subpopulations of Bacillus subtilis [Text] / F. B. Rahman, B. Sarkar, R. Moni, M. S.Rahman // Biotechnol Rep (Amst). - 2021. - V. 32. - E. 00686.

264. Rahman, M. Effects of probiotics and enzymes on growth performance and haematobiochemical parameters in broilers [Text] / M. Rahman, A. Mustari, M. Salauddin, M. J. Rahman // Bangladesh Agric. Univ. - 2014. - V. 11. - P. 111-118.

265. Raho, R. In-situ photo-assisted deposition of silver particles on hydrogel fibers for antibacterial applications [Text] / R. Raho, F. Paladini, F.A. Lombardi, S. Boccarella, B. Zunino, M. Pollini // Mater. Sci. Eng. C. Mater. Biol. Appl. - 2015. - V. 55. - P. 42-49.

266. Rakoff-Nahoum, S. Recognition of commensal microflora by toll-like receptors is required for intestinal homeostasis [Text] / S. Rakoff-Nahoum, J. Paglino, F. Eslami-Varzaneh, S. Edberg, R. Medzhitov // Cell. - 2004. - V. 118. - P. 229-241.

267. Reddyvari, R. Evaluating the Immune Response and Performance Parameters of Broilers to Bacillus subtilis and Mannan Oligosaccharides and Assessing Their Efficacy in Reducing Necrotic Enteritis in Broilers [Text] / R. Reddyvari // University of Georgia ProQuest Dissertations Publishing, USA. -2020. - E. 28154601.

268. Rehman, A. Dietary effect of probiotics and prebiotics on broiler performance, carcass, and immunity [Text] / A. Rehman, M. Arif, N. Sajjad, M. Q. Al-Ghadi, M. Alagawany, M. E. Abd El-Hack, A. R. Alhimaidi, S. S. Elnesr, B. O. Almutairi, R. A. Amran, E. O. S. Hussein, A. A. Swelum // Poult Sci. - 2020. - V. 99, № 12. - P. 69466953.

269. Rehman, MS-u. The Potential of Toll-Like Receptors to Modulate Avian Immune System: Exploring the Effects of Genetic Variants and Phytonutrients [Text] / MS-u. Rehman, Su. Rehman, W. Yousaf, F-u. Hassan, W. Ahmad, Q. Liu, H. Pan // Front. Genet. - 2021. - V. 12. - E. 671235.

270. Reid, W. D. K. Cytokine responses in birds challenged with the human food-borne pathogen Campylobacter jejuni implies a Th17 response [Text] / W. D. K. Reid, A. J. Close, S. Humphrey, G. Chaloner, L. Lacharme-Lora, L. Rothwell, et al. // R. Soc. Open Sci. - 2016. - V. 3. - E. 150541.

271. Rhayat, L. Effect of Bacillus subtilis Strains on Intestinal Barrier Function and Inflammatory Response [Text] / L. Rhayat, M. Maresca, C. Nicoletti, J. Perrier, K. S. Brinch, S. Christian, E. Devillard, E. Eckhardt // Front. Immunol. - 2019. - V. 10. - E. 564.

272. Rishi, P. Protective efficacy of probiotic alone or in conjunction with a prebiotic in Salmonella-induced liver damage [Text] / P. Rishi, S. K. Mavi, S. Bharrhan, G. Shukla, R. Tewari // FEMS Microbiol. Ecol. - 2009. - V. 69. - P. 222-230.

273. Roberfroid, M. B. Global view on functional foods: European perspectives [Text] / M. B. Roberfroid // Br. J. Nutr. - 2002. - V. 88. - P. 133-138.

274. Robinson, K. Effect of Salmonella Typhimurium Colonization on Microbiota Maturation and Blood Leukocyte Populations in Broiler Chickens [Text] / K. Robinson, A.L.F.V. Assumpcao, K. Arsi, G. F. Erf, A. Donoghue, P. R. R. Jesudhasan // Animals. -2022. - V. 12. - P. 2867.

275. Rodriguez-Sorrento, A. Assessment of the Effects of the Synbiotic Combination of Bifidobacterium longum subsp. infantis CECT 7210 and Oligofructose-Enriched Inulin Against Digestive Bacterial Infections in a Piglet Model [Text]/ A. Rodriguez-Sorrento, L. Castillejos, P. López-Colom, G. Cifuentes-Orjuela, J. A. Moreno-Muñoz, S. M. Martín-Orúe // Front. Microbiol. - 2022. - V. 13. - E. 831737.

276. Rohith, H. S. In vitro validation studies for adhesion factor and adhesion efficiency of probiotic Bacillus licheniformis MCC 2514 and Bifidobacterium breve NCIM 5671 on HT-29 cell lines [Text] / H. S. Rohith, P. M. Halami // Arch. Microbiol. -2021. - V. 203, № 6. - P. 2989-2998.

277. Romero, D. The iturin and fengycin families of lipopeptides are key factors in antagonism of Bacillus subtilis toward Podosphaera fusca [Text] / D. Romero, A. de Vicente, R. H. Rakotoaly, S. Dufour, J. W. Veening, E. Arrebola, F. M. Cazorla, O. P. Kuipers, M. Paquot, A. Pérez-García // Molecular plant-microbe interactions: MPMI 20 4. - 2007. - P. 30-40.

278. Roncevic, T. Antimicrobial Peptides as Anti-Infective Agents in Pre-Post-Antibiotic Era? [Text] / T. Roncevic, J. Puizina, A. Tossi // Int. J. Mol. Sci. - 2019. - V. 20, № 22. - E. 5713.

279. Roselli, M. Immunomodulating effects of probiotics for microbiota modulation, gut health and disease resistance in pigs [Text] / M. Roselli, R. Pieper, C. Rogel-Gaillard,

H. de Vries, M. Bailey, H. Smidt, et al. // Anim. Feed Sci. Technol. - 2017. - V. 233. -P. 104-119.

280. Roth, N. The application of antibiotics in broiler production and the resulting antibiotic resistance in Escherichia coli: A global overview [Text] / N. Roth, A. Käsbohrer, S. Mayrhofer, U. Zitz, C. Hofacre, K. J. Domig // Poult. Sci. - 2019. - V. 98. - P. 1791-1804.

281. Roto, S. M. Applications of in ovo technique for the optimal development of the gastrointestinal tract and the potential influence on the establishment of its microbiome in poultry [Text] / S. M. Roto, Y. M. Kwon, S. C. Ricke // Front. Vet. Sci. - 2016. - V. 3. -E. 63.

282. Rozhkova, A. Improving the Competitiveness of Poultry Farms in the Krasnoyarsk Region of Russia [Text] / A. Rozhkova, E. Stepanova // In E3S Web of Conferences. EDP Sciences. - 2021. - V. 247. - E. 01026.

283. Rubio, L. A. Correlations between changes in intestinal microbiota composition and performance parameters in broiler chickens [Text] / L. A. Rubio, R. Ruiz, M. J. Peinado, A. Echávarri, C. Ortiz Mellet, J. M. García-Fernández // J. Anim. Physiol. Anim. Nutr. - 2015. - V. 99. - P. 418-423.

284. Rubio, L. A. Possibilities of early life programming in broiler chickens via intestinal microbiota modulation [Text] / L. A Rubio // Poultry Science. - 2019. - V. 98, № 2. - P. 695-706.

285. Ruiz Sella, S. R. B. Bacillus subtilis natto as a potential probiotic in animal nutrition [Text] / S. R. B. Ruiz Sella; T. Bueno, A. A. B. de Oliveira, S. G. Karp, C. R. Soccol // Crit. Rev. Biotechnol. - 2021. - V. 41. - P. 355-369.

286. Rychlik, I. Composition and function of chicken gut microbiota [Text] / I. Rychlik // Animals (Basel). - 2020. - V. 10, № 1. - E. 103.

287. Sabaté, D. C. Biocontrol of Sclerotinia sclerotiorum (Lib.) de Bary on common bean by native lipopeptide-producer Bacillus strains [Text] / D. C. Sabaté, C. P. Brandan, G. Petroselli, R. Erra-Balsells, M. C. Audisio // Microbiological Research. - 2018. - V. 211. - P. 21-30.

288. Sabaté, D. C. Inhibitory activity of surfactin, produced by different Bacillus subtilis subsp. subtilis strains, against Listeria monocytogenes sensitive and bacteriocin-

resistant strains [Text] / D.C. Sabate, M.C. Audisio // Microbiol. Res. - 2013. - V. 168. -P. 125-129.

289. Saggese, A. An antimicrobial peptide specifically active against Listeria monocytogenes is secreted by Bacillus pumilus SF214 [Text] / A. Saggese, Y. De Luca, L. Baccigalupi, et al. // BMC Microbiol. - 2022. - V. 22, № 1. - Е. 3.

290. Salaheen, S. Alternative growth promoters modulate broiler gut microbiome and enhance body weight gain [Text] / S. Salaheen, S. W. Kim, B. J. Haley, J. A. S Van Kessel, D. Biswas // Front Microbiol. - 2017. - V. 8. - E. 2088.

291. Salter, A. M. Improving the sustainability of global meat and milk production [Text] / A. M. Salter // Proc Nutr Soc. - 2017. - V. 76. - P. 22-27.

292. Sambrook, J. Molecular cloning: a laboratory manual [Text] / J. Sambrook, D.W. Russel // Cold Spring Harbor Laboratory Press. - 2001. - P. 2100.

293. Sambrook, J. Molecular cloning: a laboratory manual [Text] / J. Sambrook, E. F. Fritsch, T. Maniatis // Cold Spring Harbor Laboratory Press. - 1989. - P. 2222.

294. Sandvang, D. Effects of feed supplementation with 3 different probiotic Bacillus strains and their combination on the performance of broiler chickens challenged with Clostridium perfringens [Text] / D. Sandvang, L. Skjoet-Rasmussen, M. D. Cantor, G. F. Mathis, B. S. Lumpkins, A. Blanch // Poult Sci. - 2021. - V. 100, № 4. - E. 100982

295. Sarwar, A. Qualitative analysis of biosurfactants from Bacillus species exhibiting antifungal activity [Text] / A. Sarwar, G. Brader, E. Corretto, G. Aleti, M. A. Ullah, A. Sessitsch, et al. // PLoS ONE. - 2018. - V. 13, № 6. - E. 0198107.

296. Savitri, L. P. Probiotics for human health in Advances in Probiotics for Sustainable Food and Medicine [Text] / L. P. Savitri, G. Goel, A. Kumar // Microorganisms for Sustainability. - 2021. - V. 21. - P. 181-212.

297. Scanes, C. G. Sturkie's Avian Physiology, 6th ed. [Text] / C. G. Scanes // Elsevier: Amsterdam, The Netherlands. - 2014. - P. 1056.

298. Schieber, M. ROS function in redox signaling and oxidative stress [Text] / M. Schieber, N. S. Chandel // Curr. Biol. - 2014. - V. 24. - P. 453-462.

299. Sevane, N. Dietary inulin supplementation modifies significantly the liver transcriptomic profile of broiler chickens [Text] / N. Sevane, F. Bialade, S. Velasco, A. Rebole, M. L. Rodriguez, L. T. Ortiz, et al. // PLoS One - 2014. - V. 9, № 6. - E. 98942.

300. Seydlova, G. Surfactin production enhances the level of cardiolipin in the cytoplasmic membrane of Bacillus subtilis [Text] / G. Seydlova, R. Fiser, R. Cabala, P. Kozlik, J. Svobodova, M. Patek // Biochimica Et Biophysica Acta-Biomembranes. - 2013. - V. 1828, № 11. - P. 2370-2378.

301. Shabat, S. K. B. Specific microbiome-dependent mechanisms underlie the energy harvest efficiency of ruminants [Text] / S. K. B. Shabat, G. Sasson, A. Doron-Faigenboim, T. Durman, S. Yaacoby, M. E. Berg Miller, et al. // ISME J. - 2016. - V. 10. - P. 2958-2972.

302. Shanahan, F. Nutrient tasting and signaling mechanisms in the gut V. Mechanisms of immunologic sensation of intestinal contents [Text] / F. Shanahan // Am. J. Physiol. - 2000. - V. 278. - P. 191-196.

303. Shang, Y. Chicken Gut Microbiota: Importance and Detection Technology [Text] / Y. Shang, S. Kumar, B. Oakley, W. K. Kim // Front. Vet. Sci. - 2018. - V. 5. - E. 00254.

304. Shanmugasundaram, R. Effect of Bacillus subtilis and Bacillus licheniformis probiotic supplementation on cecal Salmonella load in broilers challenged with salmonella [Text] / R. Shanmugasundaram, T. J. Applegate, R. K. Selvaraj // J. Appl. Poult. Res. - 2020. - V. 29. - P. 808-816.

305. Shehata, M.G. Youssef Screening of isolated potential probiotic lactic acid bacteria for cholesterol lowering property and bile salt hydrolase activity [Text] / M. G. Shehata, S. A. Sohaimy, A. Malak, M. M. El-Sahn // Annals of Agricultural Sciences. -2016. - V. 61. - P. 65-75.

306. Shelburne, C. E. The spectrum of antimicrobial activity of the bacteriocin subtilosin A [Text] / C. E. Shelburne, F. Y. An, V. Dholpe, A. Ramamoorthy, D. E. Lopatin, M. S. Lantz // J. Antimicrob. Chemother. - 2007. - V. 59. - P. 297-300.

307. Shi, D. Impact of gut microbiota structure in heat-stressed broilers [Text] / D. Shi, L. Bai, Q. Qu, S. Zhou, M. Yang, S. Guo, et al. // Poult. Sci. - 2019. - V. 98. - P. 24052413.

308. Shimizu T. Complete genome sequence of Clostridium perfringens, an anaerobic flesh-eater [Text] / T. Shimizu, K. Ohtani, H. Hirakawa, K. Ohshima, A. Yamashita, T. Shiba, N. Ogasawara, M. Hattori, S. Kuhara, H. Hayashi // PNAS. - 2002. - V. 99. - P 996-1001.

309. Shini, S. Avian intestinal ultrastructure changes provide insight into the pathogenesis of enteric diseases and probiotic mode of action [Text] / S. Shini, R. C. Aland, W. L. Bryden // Sci Rep. - 2021. - V. 11. - № 1. - E. 167.

310. Siahmoshteh, F. Unraveling the mode of antifungal action of Bacillus subtilis and Bacillus amyloliquefaciens as potential biocontrol agents against aflatoxigenic Aspergillus parasiticus [Text] / F. Siahmoshteh, Z. Hamidi-Esfahani, D. Spadaro, M. Shams-Ghahfarokhi, M. Razzaghi-Abyaneh // Food Control. - 2018. - V. 89. - P. 300307. 10.1016/j.foodcont.2017.11.010

311. Siedler, S. Competitive Exclusion Is a Major Bioprotective Mechanism of Lactobacilli against Fungal Spoilage in Fermented Milk Products [Text] / S. Siedler, M. H. Rau, S. Bidstrup, et al. // Appl Environ Microbiol. - 2020. - V. 86, № 7. - E. 0231219.

312. Siegerstetter, S.-C. Fecal microbiota transplant from highly feed efficient donors shows little effects on age-related changes in feed efficiency-associated fecal microbiota in chickens [Text] / S.-C. Siegerstetter, R. M. Petri, E. Magowan, P. G. Lawlor, Q. Zebeli, N. E. O'Connell, et al. // Appl. Environ. Microbiol. - 2018. - V. 84. - E. 0233002317.

313. Siegerstetter, S.-C. Intestinal microbiota profiles associated with low and high residual feed intake in chickens across two geographical locations [Text] / S.-C. Siegerstetter, S. Schmitz-Esser, E. Magowan, S. U. Wetzels, Q. Zebeli, P. G. Lawlor, et al. // PLoS ONE. - 2017. - V. 12. - E. 0187766.

V

314. Sikic Pogacar, M. Effect of Lactobacillus spp. on adhesion, invasion, and translocation of Campylobacter jejuni in chicken and pig small-intestinal epithelial cell lines [Text] / M. Sikic Pogacar, T. Langerholc, D. Micetic-Turk, S. S. Mozina, A. Klancnik // BMC Vet. Res. - 2020. - V. 16, №. 1. - E. 34.

315. Singh, K.M. High through put 16S rRNA gene-based pyrosequencing analysis of the fecal microbiota of high FCR and low FCR broiler growers [Text] / K. M. Singh, T. Shah, S. Deshpande, S. J. Jakhesara, P. G. Koringa, D. N. Rank, C. G. Joshi // Mol. Biol. Rep. - 2012. - V. 39. - P. 10595-10602.

316. Siwek, M. Prebiotics and synbiotics-in ovo delivery for improved lifespan condition in chicken [Text] / M. Siwek, A. Slawinska, K. Stadnicka, J. Bogucka, A. Dunislawska, M. Bednarczyk // BMC Vet. Res. - 2018. - V. 14. - P. 1-17.

317. Slawinska, A. Influence of synbiotics delivered in ovo on immune organs development and structure [Text] / A. Slawinska, M. Siwek, J. Zylinska, J. Bardowski, J. Brzezinska, K. A. Gulewicz, M. Nowak, M. Urbanowski, A. Plowiec, M. Bednarczyk // Folia Biol. - 2014. - V. 62. - P. 277-285.

318. Slawinska, A. Long-Term Transcriptomic Effects of Prebiotics and Synbiotics Delivered In Ovo in Broiler Chickens [Text] / A. Slawinska, A. Plowiec, M. Siwek, M. Jaroszewski, M. Bednarczyk // PLoS One - 2016. - V. 11, № 12. - E. 0168899.

319. Slawinska, A. Modulation of microbial communities and mucosal gene expression in chicken intestines after galactooligosaccharides delivery In Ovo [Text] / A. Slawinska, A. Dunislawska, A. Plowiec, et al. // PLoS One. - 2019. - V.14, № 2. - E. e0212318.

320. Smitha, S. Thermostable Bacteriocin BL8 from Bacillus licheniformis isolated from marine sediment [Text] / S. Smitha, S. G. Bhat // J. Appl. Microbiol. - 2013. - V. 114. - P. 688-694.

321. Sögaard, H. Microbials for feed: Beyond lactic acid bacteria [Text] / H. Sögaard, T. Suhr-Jessen // Feed. Int. Ernational. - 1990. - V. 11. - P. 32-38.

322. Song, B. Effects of age on immune function in broiler chickens [Text] / B. Song,

D. Tang, S. Yan, et al. // J. Animal. Sci. Biotechnol. - 2021. - V. 12, № 1. - E. 42.

323. Stanley, D. Bacteria within the gastrointestinal tract microbiota correlated with improved growth and feed conversion: challenges presented for the identification of performance enhancing probiotic bacteria [Text] / D. Stanley, R. J. Hughes, M. S. Geier, R. J. Moore // Front. Microbiol. - 2016. - V. 7. - E. 187.

324. Stanley, D. Changes in the caecal microflora of chickens following Clostridium perfringens challenge to induce necrotic enteritis [Text] / D. Stanley, A. L. Keyburn, S.

E. Denman, R. J. Moore // Vet. Microbiol. - 2012. - V. 159. - P. 155-162.

325. Stanley, D. Comparison of fecal and cecal microbiotas reveals qualitative similarities but quantitative differences [Text] / D. Stanley, M. S. Geier, H. Chen, R. J. Hughes, R. J. Moore // BMC Microbiology - 2015. - V. 15. - P. 1-11.

326. Stanley, D. Identification of chicken intestinal microbiota correlated with the efficiency of energy extraction from feed [Text] / D. Stanley, M. S. Geier, S. E. Denman, V. R. Haring, T. M. Crowley, R. J. Hughes, R. J. Moore // Vet. Microbiol. - 2013. - V. 164. - P. 85-92.

327. Stanley, D. Microbiota of the chicken gastrointestinal tract: Influence on health, productivity and disease [Text] / D. Stanley, R. J. Hughes, R. J. Moore // Appl. Microbiol. Biotechnol. - 2014. - V. 98. - P. 4301-4310.

328. Sudan, S. Potential Probiotic Bacillus subtilis Isolated from a Novel Niche Exhibits Broad Range Antibacterial Activity and Causes Virulence and Metabolic Dysregulation in Enterotoxic E. coli [Text] / S. Sudan, R. Flick, L. Nong, J. Li // Microorganisms. - 2021. - V. 9, № 7. - E. 1483.

329. Sumi, C. Antimicrobial peptides of the genus Bacillus: a new era for antibiotics [Text] / C. D. Sumi, B. W. Yang, I. C. Yeo, Y. T. Hahm // Can J Microbiol. - 2015. - V. 61. - P. 93-103.

330. Sutyak, K. E. Isolation of the Bacillus subtilis antimicrobial peptide subtilosin from the dairy product-derived Bacillus amyloliquefaciens [Text] / R. E. Wirawan, A. A. Aroutcheva, M. L. Chikindas // J. Appl. Microbiol. - 2008. - V. 104. - P. 1067-1074.

331. Talapko, J. Antimicrobial Peptides - Mechanisms of Action, Antimicrobial Effects and Clinical Applications [Text] / J. Talapko, T. Mestrovi'c, M. Juzbasi'c, M. Tomas, S. Eri'c, L. Horvat Aleksijevi'c, S. Beki'c, D. Schwarz, S. Mati'c, M. Neuberg, et al. // Antibiotics. - 2022. - V. 11, № 10. - E. 1417.

332. Tallentire, C. W. Artificial selection for improved energy efficiency is reaching its limits in broiler chickens [Text] / C. W. Tallentire, I. Leinonen, I. Kyriazakis // Scientific Reports. - 2018. - V. 8, № 1. - E. 1168.

333. Tam, N. K. The intestinal life cycle of Bacillus subtilis and close relatives [Text] / N. K. Tam, N. Q. Uyen, H. A. Hong, L. H. Duc, T. T. Hoa, C. R. Serra, A. O. Henriques, S. M. Cutting // J. Bacteriol. - 2006. - V. 188. - P. 2692-2700.

334. Teo, A. Effect of Bacillus subtilis PB6 (CloSTAT) on Broilers Infected with a Pathogenic Strain of Escherichia coli [Text] / A. Y. L. Teo, H. M. Tan // Journal of Applied Poultry Research. - 2006. - V. 15. - P. 229-235.

335. Th0fner, I. Recovery of probiotic bacteria from the intestinal tract of broilers after noninvasive pre-hatch application [Text] / I. Th0fner, D. Sandvang, K. Aagaard, L. L. Poulsen // Benef Microbes. - 2021. - V. 12, № 5. - P. 467-477.

336. Torok, V. A. Identification and characterization of potential performance-related gut microbiotas in broiler chickens across various feeding trials [Text] / V. A. Torok, R.

J. Hughes, L. L. Mikkelsen, R. Perez-Maldonado, K. Balding, R. MacAlpine, et al. // Appl. Environ. Microbiol. - 2011. - V. 77. - P. 5868-5878.

337. Torok, V.A. Application of methods for identifying broiler chicken gut bacterial species linked with increased energy metabolism [Text] / V. A. Torok, K. Ophel-Keller, M. Loo, R. J. Hughes // Appl. Environ. Microbiol. - 2008. - V. 74. - P. 783-791.

338. Tran, C. Antimicrobial Bacillus: Metabolites and Their Mode of Action. Antibiotics (Basel) [Text] / C. Tran, I. E. Cock, X. Chen, Y. Feng. - 2022. - V. 11, № 1. - E. 88.

339. Tsuge, K. Gene yerP, involved in surfactin self-resistance in Bacillus subtilis [Text] / K. Tsuge, Y. Ohata, M. Shoda // Antimicrob. Agents Chemother. - 2001. - V. 45. - P. 3566-3573.

340. Tyagi, A. K. Commentary: Probiotic and technological properties of Lactobacillus spp. strains from the human stomach in the search for potential candidates against gastric microbial dysbiosis [Text] / A. K. Tyagi, S. Prasad // Front. Microbiol. -2015. - V. 19. - E. 00433.

341. Tyagi, A. M. The Microbial Metabolite Butyrate Stimulates Bone Formation via T Regulatory Cell-Mediated Regulation of WNT10B Expression [Text] / A. M. Tyagi, M. Yu, T. M. Darby, et al. // Immunity. - 2018. - V. 49. - P. 1116-1131.

342. Uttlova, P. Bacillus subtilis alters the proportion of major membrane phospholipids in response to surfactin exposure [Text] / P. Uttlova, D. Pinkas, O. Bechynkova, R. Fiser, J. Svobodova, G. Seydlova // Biochimica et Biophysica Acta (BBA)-Biomembranes. - 2016. - V. 1858. - P. 2965-2971.

343. Vasilchenko, N. Regulation of nonribosomal peptide synthesis as a mechanism of antifungal activity of probiotics based on the bacteria genera Bacillus and Paenibacillus in XIV International Scientific Conference "INTERAGROMASH 2021" [Text] / N. Vasilchenko, M. Kulikov, V. Stacenko, V. Pakhomov, N. Kulikova, N. Gordeeva // Lecture Notes in Networks and Systems. - 2022. - V. 246. - P. 111-121.

344. Vazquez, A. P. Bacillus species are superior probiotic feed-additives for poultry [Text] / A.P. Vazquez // J Bacteriol Mycol Open Access. - 2016. - V. 2. - P. 57-59.

345. Velho, R. V. Real-time PCR investigation on the expression of sboA and ituD genes in Bacillus spp. [Text]/ R. V. Velho, D. G. Caldas, L. F. Medina, S. M. Tsai, A. Brandelli // Lett Appl Microbiol. - 2011. - V. 52, № 6. - P. 660-666.

346. Videnska, P. Characterization of egg laying hen and broiler fecal microbiota in poultry farms in Croatia, Czech Republic, Hungary and Slovenia [Text] / P. Videnska, M. M. Rahman, M. Faldynova, V. Babak, M. E. Matulova, E. Prukner-Radovcic, et al. // PLoS One - 2014. - V. 9. - E. 110076.

347. Videvall, E. Cornwallis Measuring the gut microbiome in birds: Comparison of faecal and cloacal sampling [Text] / E. Videvall, M. Strandh, A. Engelbrecht, S. Cloete // Charlie K. - 2018. - V. 18. - P. 424-434.

348. Vieco-Saiz, N. Benefits and Inputs From Lactic Acid Bacteria and Their Bacteriocins as Alternatives to Antibiotic Growth Promoters During Food-Animal Production [Text] / N. Vieco-Saiz, Y. Belguesmia, R. Raspoet, E. Auclair, F. Gancel, I. Kempf, D. Drider // Front. Microbiol. - 2019. - V. 10. - E. 00057.

349. Waghu, F. H. CAMPR3: A database on sequences, structures and signatures of antimicrobial peptides [Text] / F. H. Waghu, R. S. Barai, P. Gurung, S. Idicula-Thomas // Nucleic Acids Res. - 2016. - V. 44. - P. 1094-1097.

350. Waite, D. W. Exploring the avian gut microbiota: Current trends and future directions [Text] / D. W. Waite, M. W. Taylor // Front Microbiol. - 2015. - V. 6. - E. 00673.

351. Wang, G. Development of a homologous expression system development and the systematic site-directed mutagenesis analysis of thurincin H, a bacteriocin produced by Bacillus thuringiensis SF361 [Text] / G. Wang, D. C. Manns, J. J. Churey, R. W. Worobo // Appl. Environ. Microbiol. - 2014a. - V. 80. - P. 3576-3584.

352. Wang, J. Identification of Lipopeptide Iturin A Produced by Bacillus amyloliquefaciens NCPSJ7 and Its Antifungal Activities against Fusarium oxysporum f. sp. Niveum [Text] / J. Wang, J. Qiu, X. Yang, J. Yang, S. Zhao, Q. Zhou, L. Chen // Foods. - 2022. - V. 11. - E. 11192996

353. Wang, Q. Isolation, characterization and evolution of a new thermophilic Bacillus licheniformis for lactic acid production in mineral salts medium [Text] / Q. Wang, X. Zhao, J. Chamu, K. T. Shanmugam // Bioresour. Technol. - 2011. - V. 102. - P. 81528158.

354. Wang, W. Bacillus Metabolites: Compounds, Identification and Anti-Candida albicans Mechanisms [Text] / W. Wang, J. Zhao, Z. Zhang // Microbiol. Res. - 2022. -V. 13. - P. 972-984.

355. Wang, X. Effect of lactylate and Bacillus subtilis on growth performance, peripheral blood cell profile, and gut microbiota of nursery pigs [Text] / X. Wang, T. Tsai, X. Wei, B. Zuo, E. Davis, T. Rehberger, et al. // Microorganisms. - 2021. - V. 9. -E. 803.

356. Wang, X. J. Effects of high ambient temperature on the community structure and composition of ileal microbiome of broilers [Text] / X. J. Wang, J. H. Feng, M. H. Zhang, X. M. Li, D. D. Ma, S. S. Chang, et al. // Poult. Sci. - 2018b. - V. 97. - P. 21532158.

357. Weber, T. AntiSMASH4.0-a comprehensive resource for the genome mining of biosynthetic gene clusters / T. Weber, K. Blin, S. Duddela, D. Krug, H.U. Kim, R. Bruccoleri, S.Y. Lee, M.A. Fischbach, R. Müller, W. Wohlleben, R. Breitling, E. Takano, M.H. Medema // Nucleic Acids Res. - 2015. - V. 43. - P. 237-243.

358. Wei, Y-H. Production and Characterization of Fengycin by Indigenous Bacillus subtilis F29-3 Originating from a Potato Farm [Text] / Y-H. Wei, L-C. Wang, W-C. Chen, S-Y. Chen // Int. J. Mol. Sci. - 2010. - V. 11. - P. 4526-4538.

359. Whelan, R. The impact of Bacillus subtilis DSM 32315 on the pathology, performance, and intestinal microbiome of broiler chickens in a necrotic enteritis challenge [Text] / R. A. Whelan, K. Doranalli, T. Rinttilä, K. Vienola, G. Jurgens, J. Apajalahti // Poult Sci. - 2019. - V. 98. - P. 3450-3463.

360. Wise, C. Cellular lipid composition affects sensitivity of plant pathogens to fengycin, an antifungal compound produced by Bacillus subtilis strain CU12 [Text] / C. Wise, J. Falardeau, I. Hagberg, T. Avis // Biochem. and Cell Biol. - 2014. - V. 104, № 10. - P. 1036-1041.

361. Wise, M. G. Quantitative analysis of the intestinal bacterial community in one- to three-week-old commercially reared broiler chickens fed conventional or antibiotic-free vegetable-based diets [Text] / M. G. Wise, G. R. Siragusa // J. Appl. Microbiol. - 2007. -V. 102. - P. 1138-1149.

362. Withanage, G. S. Rapid expression of chemokines and proinflammatory cytokines in newly hatched chickens infected with Salmonella enterica serovar Typhimurium [Text] / G.S. Withanage, P. Kaiser, P. Wigley, C. Powers, P. Mastroeni, H. Brooks, P. Barrow, A. Smith, D. Maskell, I. McConnell // Infect. Immun. - 2004. - V. 72. - P. 2152-2159.

363. Xiang, F. The development of lactic acid bacillus in animal husbandry [Text] / F. Xiang, C. H. Xu // J. Anim. Sci. Vet. Med. - 2009. - V. 1, № 42. - E. 44.

364. Xiao, Y. Microbial community mapping in intestinal tract of broiler chicken [Text] / Y. Xiao, Y. Xiang, W. Zhou, J. Chen, K. Li, H. Yang // Poult. Sci. - 2017. - V. 96. - P. 1387-1393.

365. Xu, L. Bacillus coagulans enhance the immune function of the intestinal mucosa of yellow broilers [Text] / L. Xu, Q. Fan, Y. Zhuang, Q. Wang, Y. Gao, C. Wang // Revista brasileira de ciencia avícola. - 2017. - V. 19. - P. 115-122.

366. Xu, X. Immunomodulatory effects of Bacillus subtilis (natto) B4 spores on murine macrophages [Text] / X. Xu, Q. Huang, Y. Mao, Z. Cui, Y. Li, Y. Huang, et al. // Microbiol. Immunol. - 2012. - V. 56. - P. 817-824.

367. Xu, Y. Effects of Bacillus subtilis and Bacillus licheniformis on growth performance, immunity, short-chain fatty acid production, antioxidant capacity, and cecal microflora in broilers [Text] / Y. Xu, Y. Yu, Y. Shen, Q. Li, J. Lan, Y. Wu, et al. // Poult Sci. - 2021. - V. 100. - E. 101358.

368. Yan, W. Gut metagenomic analysis reveals prominent roles of Lactobacillus and cecal microbiota in chicken feed efficiency [Text] / W. Yan, C. Sun, J. Yuan, N. Yang // Scientific Reports. - 2017. - V. 7. - E. 45308.

369. Yan, X. X. Structural and functional analysis of the pore-forming toxin NetB from Clostridium perfringens [Text] / X. X. Yan, C. J. Porter, S. P. Hardy, D. Steer, A. Ian Smith, N. S. Quinsey, V. Hughes, J. K. Cheung, A. L. Keyburn, et al. // Mbio. - 2013. -V. 4, № 1. - E. 00019-13.

370. Yan, Y. Y. Effects of dietary live or heat-inactivated autochthonous Bacillus pumilus SE5 on growth performance, immune responses and immune gene expression in grouper Epinephelus coioides [Text] / Y. Y. Yan, H. Q. Xia, H. L. Yang et al. // Aquac Nutr. - 2016. - V. 22. - P. 698-707.

371. Yi, X. Rapid improvement in the macrolactins production of Bacillus sp. combining atmospheric room temperature plasma with the specific growth rate index [Text] / X. Yi, Y. Gan, L. Jiang, L. Yu, Y. Liu, C. Gao // J. Biosci. Bioeng. - 2020. - V. 130, № 1. - P. 48-53.

372. Zhang, G. Modulatory Effects of Bacillus subtilis on the Performance, Morphology, Cecal Microbiota and Gut Barrier Function of Laying Hens [Text] / G.

Zhang, H. Wang, J. Zhang, X. Tang, A. Raheem, M. Wang, W. Lin, L. Liang, Y. Qi, Y. Zhu, et al. // Animals (Basel). - 2021. - V. 11, № 6. - E. 1523.

373. Zhang, J. L. Different combinations of probiotics improve the production performance, egg quality and immune response of layer hens [Text]/ J. L. Zhang, Q. M. Xie, J. Ji, W. H. Yang, Y. B. Wu, C. Li, J. Y. Ma, Y. Z. Bi // Poultry Science. - 2012. -V. 91. - P. 2755-2760.

374. Zhang, L. Fengycins, cyclic lipopeptides from marine Bacillus subtilis strains, kill the plant-pathogenic fungus Magnaporthe grisea by inducing reactive oxygen species production and chromatin condensation [Text] / L. Zhang, C. Sun // Appl. Environ. Microb. - 2018. - V. 84. - E. 445-418.