Научно-практические подходы получения производственных штаммов дрожжей Saccharomyces тема диссертации и автореферата по ВАК РФ 00.00.00, доктор наук Давыденко Светлана Геннадьевна

• Давыденко Светлана Геннадьевна
• доктор наук
• 2024

Оглавление диссертации доктор наук Давыденко Светлана Геннадьевна

РЕФЕРАТ

SYNOPSIS

ВВЕДЕНИЕ

ГЛАВА 1. ДРОЖЖИ КАК НАУЧНЫЙ И ПРОИЗВОДСТВЕННЫЙ ОБЪЕКТ (ЛИТЕРАТУРНЫЙ ОБЗОР)

1.1 Исторические данные об использовании дрожжей

1.1.1 Эволюция дрожжей - сахаромицетов. Эффект Кребтри, производство, накопление и потребление этанола

1.1.2 Конкурентные взаимоотношения между видами. Продукция антагонистических веществ

1.1.3 Антагонистическая активность дрожжей S. cerevisiae. Киллерная система дрожжей

1.1.4 Жизненный цикл дрожжей

1.2 Механизмы эволюции генома дрожжей

1.2.1 Роль спонтанных мутаций в эволюции

1.2.2 Межвидовые гибриды

1.2.3 Интрогрессия

1.2.4 Горизонтальный перенос генов

1.2.5 Полиплоидия

1.2.6 Генеалогия вида S. cerevisiae

1.2.7 Хромосомный полиморфизм

1.3 Метаболизм дрожжей

1.3.1 Эффективный транспорт и ассимиляция азот - содержащих соединений

1.3.2 Липиды и витамины

1.3.3 Эффективная секреция белков

1.3.4 Прикрепление белков к мембранам

1.3.5 Устойчивость к стрессам (этанольному, химическому, осмотическому, температурному)

1.4 Эволюция пивных, винных и хлебопекарных дрожжей

1.4.1 Эволюция пивных дрожжей. Возникновение новых свойств дрожжей, важных для пивоварения

1.4.2 Дрожжи для крафтового пивоварения

1.4.3 Дрожжи для производства пива с низким содержанием этанола

1.4.4 Микроорганизмы для производства пива с повышенной кислотностью

1.5 Эволюция винных дрожжей. Возникновение новых свойств дрожжей, важных для виноделия

1.6 Эволюция хлебопекарных дрожжей. Возникновение новых свойств дрожжей, важных для хлебопечения

1.6.1 Роль дрожжей в хлебопечении

1.7 Использование генной инженерии для улучшения свойств дрожжей

1.7.1 Общие цели направленного улучшения пивоваренных, винных и хлебопекарных дрожжей

1.7.2 Усиление и оптимизация поглощения сахаров, работы ферментов глюконеогенеза и гликолиза

1.7.3 Цели направленного улучшения пивоваренных и винных дрожжей

1.7.4 Цели направленного улучшения пивоваренных дрожжей

1.7.5 Цели направленного улучшения хлебопекарных дрожжей

1.7.6 Заключение

ГЛАВА 2. МЕТОДИЧЕСКАЯ ЧАСТЬ

1.8 Объекты исследований

1.9 Материалы исследований

1.10 Схема экспериментальных исследований

1.11 Методы исследований дрожжей

1.11.1 Состав питательных сред

1.11.2 Условия культивирования

1.11.3 Определение концентрации клеточной суспензии

1.11.4 Таксономическое изучение штамма с помощью Лр1 20 АиХ

системы

1.11.5 Витальная окраска клеток метиленовым синим

1.11.6 Окрашивание иодонитротетразолиум хлоридом

1.11.7 Тестирование на устойчивость к повышенной концентрации ионов меди и к температуре

1.11.8 Получение дыхательно - недостаточных мутантов

1.11.9 Электрофоретическое кариотипирование дрожжей

1.11.10 Анализ пивного сусла и пива

1.11.11 Лабораторный сравнительный тест по изучение бродильной активности штаммов

1.11.12 Испытание штаммов на минипивзаводе

1.11.13 Определение чувствительности к доксициклину

1.11.14 Разделение белков методом денатурирующего электрофореза по Лэммли

1.11.15 Детекция белка №р150р методом Вестерн-блоттинга

1.11.16 Сравнение генетических последовательностей

1.11.17 Трансформация дрожжей многокопийным вектором

1.11.18 Разделение белков в системе двумерного электрофореза

1.11.19 Пробоподготовка для масс-спектрометрии

1.11.20 Масс - спектрометрический анализ

1.11.21 Изучение хлебопекарных свойств дрожжей У-3194

1.11.22 Экспресс метод определения качества семенных дрожжей

1.11.23 Экспресс метод оценки пищевой безопасности напитков

1.11.24 Анализ антагонистической (киллерной) активности

1.11.25 Получение мутантов с повышенной АА

1.11.26 Определение секреции а- фактора

1.11.27 Определение устойчивости к актидиону

1.11.28 Определение осмотической резистентности

1.11.29 Определение содержания днРНК

1.11.30 Статистическая обработка результатов

ГЛАВА 3. ИСПОЛЬЗОВАНИЕ МЕТОДОВ ГЕНЕТИКИ, СЕЛЕКЦИИ, ГЕНОМИКИ И ПРОТЕОМИКИ ДЛЯ РЕШЕНИЯ БИОТЕХНОЛОГИЧЕСКИХ ЗАДАЧ

3.1 Новые аспекты создания производственных штаммов дрожжей

3.2 Анализ хромосомного полиморфизма для изучения генома

3.3 Общая схема создание нового штамма методами классической генетики и селекции

3.4 Создание нового штамма для пивоварения

3.4.1 Схема отбора перспективных штаммов для генетического конструирования нового штамма для пивоварения

3.4.2 Морфологические признаки штамма У-3194

3.4.3 Физиолого - биохимические признаки У-3194

3.4.4 Сравнение бродильной активности штаммов в лабораторных условиях

3.4.5 Испытания штамма У-3194 на минизаводе

3.4.6 Испытание штамма У-3194 на производстве

3.4.7 Сертификация

3.4.8 Итоги реализации проекта

3.5 Заключение

3.6 Использование протеомики в практике бродильных производств

3.7 Использование пивоваренных дрожжей в хлебопечении

3.7.1 Обоснование выбора технологии хлебопечения с использованием

остаточных пивных дрожжей

3.8 Технико - экономический расчет себестоимости производства хлеба пшеничного с использованием пивоваренных дрожжей У-3194

3.9 Заключение

ГЛАВА 4. РОЛЬ ПРОЦЕССА СЕКРЕЦИИ В ФОРМИРОВАНИИ

ОРГАНОЛЕПТИЧЕСКИХ СВОЙСТВ. ВЫЯВЛЕНИЕ НОВЫХ ГЕНОВ, УЧАСТВУЮЩИХ В ПРОЦЕССЕ СЕКРЕЦИИ

4.1 Заключение

ГЛАВА 5. ИСПОЛЬЗОВАНИЕ КЛАССИЧЕСКИХ МЕТОДОВ ГЕНЕТИКИ И СЕЛЕКЦИИ ДЛЯ СОЗДАНИЯ ПРОДУЦЕНТОВ ДЛЯ ФАРМАЦЕВТИЧЕСКОЙ ПРОМЫШЛЕННОСТИ

5.1 Роль генотипа представителей генетических линий дрожжей S. cerevisiae при создании продуцентов днРНК

5.2 Роль стабилизации генома при селекции продуцентов днРНК

5.3 Заключение

ГЛАВА 6. ТЕХНОЛОГИЧЕСКОЕ ПРОГНОЗИРОВАНИЕ КАЧЕСТВА И

БЕЗОПАСНОСТИ ПРОДУКТОВ

6.1 Создание и применение нового экспресс метода оценки качества семенных дрожжей для технологического прогнозирования

6.2 Прогнозирование пищевой безопасности

6.3 Практическое применение метода прогнозирования

6.4 Заключение

ЗАКЛЮЧЕНИЕ

СПИСОК СОКРАЩЕНИЙ

СПИСОК ЛИТЕРАТУРЫ

Приложения

Приложение А. Обязательное

Приложение Б. Обязательное

Приложение В1. Обязательное

Приложение В2. Обязательное

Приложение В3. Обязательное

Приложение В4. Обязательное

Приложение В5. Обязательное

Приложение В6. Обязательное

Приложение В7. Обязательное

Приложение В8. Обязательное

Приложение В9. Обязательное

Приложение В10. Обязательное

Приложение В11. Обязательное

Приложение Г. Обязательное

Приложение Д1. Обязательное

Приложение Д2. Обязательное

Приложение Д3. Обязательное

Приложение Д4. Обязательное

Приложение Е1. Обязательное

Приложение Е2. Обязательное

Приложение Е3. Обязательное

Приложение Е4. Обязательное

Приложение Е5. Обязательное

Приложение Е6. Обязательное

Приложение Е7. Обязательное

Приложение Е8. Обязательное

Приложение Ж. Обязательное

Приложение И. Обязательное

Приложение К1. Обязательное

Приложение К2. Обязательное

Реферат Общая характеристика работы

Основанием выбора направлений исследования является актуальная задача создания биотехнологических штаммов с улучшенными свойствами для отечественной промышленности с целью повышения эффективности работы предприятий, экономии и рециклинга ресурсов и импортозамещения.

Практическим результатом исследований явилось получение и внедрение в производство нового отечественного пивоваренного штамма дрожжей 8асскаготусв8 свгву181ав (8. свгеу181ав) У-3194 с целью импортозамещения, генетическое конструирование нового штамма 8. свгву181ав - продуцента интерфероногена (двунитевой РНК, днРНК), оптимизация и масштабирование соответствующих процессов, использование остаточных пивоваренных дрожжей для выпечки хлеба, уменьшения за счет этого объема сточных вод пивоварен и снижение затрат на сырье для хлебопекарных предприятий, а также создание нового экспресс - метода оценки физиологической активности биомассы бродильных производств и контроля безопасности напитков.

Важнейшая задача улучшения производственных продуцентов требует использования современных подходов к конструированию перспективных штаммов. Основными научными достижениями, полученными в данной работе, являются использование данных протеомики для выявления генов, специфичных для штаммов, используемых в хлебопечении и пивоварении, а также производстве биоэтанола. Полученные промышленно - специфичные гены могут стать основой для совершенствования производственных штаммов.

Оптимизация процессов, связанных с секрецией, является весьма актуальной при создании биологических продуцентов фармакологических препаратов. Благодаря научному подходу удалось выявить роль ряда генов с ранее неизвестной функцией в процессе секреции.

Введение диссертации (часть автореферата) на тему «Научно-практические подходы получения производственных штаммов дрожжей Saccharomyces»

Актуальность темы.

Задача создания перспективных штаммов - продуцентов является одной из ключевых в биотехнологии и имеет существенный практический и экономический эффект.

Для каждого производства используются специализированные штаммы, обладающие необходимыми технологическими свойствами. Существующие промышленные штаммы обладают некоторыми недостатками, например, наличием серных или фенольных запахов.

Основными проблемами современной биотехнологии бродильных производств являются: улучшение органолептического профиля готовой продукции, удовлетворяющего потребителей, повышение эффективности процесса секреции дрожжевых метаболитов, экологический мониторинг биотехнологических производств и рециклинг отходов, использование природных антагонистических активностей биотехнологических продуцентов для подавления посторонней микрофлоры и повышения качества продукции, отсутствие экспресс-методов оценки свойств биомассы и экспресс методов биобезопасности готовых продуктов.

Для решения этих проблем можно предложить следующие пути решения: использование классических методов генетики и селекции для создания новых биотехнологических продуцентов, изучение генетического контроля процесса секреции дрожжевых метаболитов, выявление генов, влияющих на антагонистическую активность (АА) дрожжей, создание экспресс-методов оценки свойств биомассы и биобезопасности готовых продуктов, использование современных методов молекулярной биологии, геномики и протеомики;

Для устранения этих недостатков можно применять как классические методы генетики и селекции, так и новые подходы молекулярной генетики и протеомики. Применение классических подходов к созданию биотехнологических продуцентов требует использование специализированных схем селекции.

Классические методы генетики и селекции, во многих случаях является результативным, но требует большого объема работы и времени, а иногда

применение этих методов сталкивается с непреодолимыми трудностями. В частности, использование этих методов осложнено отсутствием селективных маркеров, невозможностью их экспрессии после гибридизации рецессивных аллей интересующих генов, а также наследованием нежелательных признаков родителей.

Создание штаммов для различных технологических процессов требует использования данных геномного секвенирования и биоинформатики для выявления новых, ранее неизвестных функций генов.

Кроме элиминации серных и полифенольных вкусов в пивных напитках важно совершенствовать процесс секреции и других метаболитов дрожжевой клетки поскольку выделяемые дрожжами примерно 800 метаболитов (ацетат, ацетоин, диацетил, глицерин, полифенолы, эфиры, высшие спирты и т. д.), определяют органолептический профиль пива.

Изучение генетического контроля процесса секреции особенно важно для биотехнологии и фармацевтики, так как технологически значительно экономичнее использовать вещества, секретируемый клеткой в среду, чем осуществлять трудоемкий процесс разрушения биомассы с целью дальнейшей очистки целевого вещества.

Существует много методов оценки безопасности продуктов питания и их компонентов, однако большинство из них достаточно трудоемки или требуют проведения экспериментов на животных, что неоднозначно воспринимается обществом. В определенной степени дрожжи сахаромицеты могут внести вклад в решение этой проблемы в качестве тест - объектов, так как они относятся к эукариотическим организмам и многие процессы, протекающие в клетках животных и дрожжей идентичны (Mohamшadi et а1. 2015).

Вторичное использование отходов производства, является важной проблемой в области экологии и экономии ресурсов. Предлагаемое использование отработанных пивоваренных дрожжей для производства хлеба может во многом решить эту задачу. Практический эффект заключается в экономии ресурсов, затрачиваемых на производство хлебопекарных дрожжей. Использование живых организмов и биологических процессов в производстве с целью получения

полезных продуктов для народного хозяйства лежит в основе научных исследований по специальности 2.7.1 «Биотехнология пищевых продуктов, лекарственных и биологически активных веществ» (отрасль науки - технические).

В работе представлены генетические и селекционные исследования в области прикладной микробиологии, технологии выращивания микроорганизмов -продуцентов, получения биологически активных соединений, метаболитов, изучение их состава, очистки техногенных отходов, создания стандартных биосистем для контроля качества и оценки безопасности пищевых продуктов.

Целью диссертационной работы было создание новых штаммов методами генетики и селекции для устранения существенных недостатков наряду с использованием новых методов для выявления генов, специфичных для пивоварения, хлебопечения и производства этанола, а также новых генов, влияющих на процесс секреции.

Для достижения поставленной цели были определены следующие задачи:

Задача 1 - создать схему конструирования штамма У-3194 для пивоваренной промышленности с высокой скоростью брожения и уникальными органолептическими свойствами на основе классических методов генетики и селекции;

Задача 2 - исследовать его морфофизиологические особенности и полиморфизм хромосом для доказательства гибридной природы нового штамма У-3194;

Задача 3 - разработать технологию и техническую документацию на новый штамм У-3194 и технологические процессы;

Задача 4 - внедрить штамм У-3194 в производство;

Задача 5 - выявить связь генов с ранее неизвестной функцией с процессом секреции для создания биотехнологических продуцентов;

Задача 6 - провести сравнительное изучение данных протеомики штаммов, используемых в пивоварении, хлебопечении и в производстве этанола; выявить гены;

Задача 7 - специфичные для технологий пивоварения, хлебопечения и

производства этанола для их последующей направленной модификации;

Задача S - создать методологические подходы для оценки физиологической активности биомассы и безопасности пищевых продуктов;

Задача 9 - использовать классические методы генетики и селекции для создания штаммов дрожжей с повышенной антагонистической активностью и высокопродуктивного штамма - продуцента интерфероногена Y-1047 и исследовать кариотипическую изменчивость высокогомозиготной линии продуцентов днРНК с повышенной антагонистической.

Методы исследования. В качестве материалов использовали реактивы фирм Sigma (для выделения хромосомной ДНК и кариотипирования), Fluka (для газовой и жидкостной хроматографии), Difco (для микробиологических сред). Для выделения хромосомной ДНК применяли Zymoliase 100T фирмы Seikagaki.

Анализ пива проводили с помощью автоматического анализатора пива Alcolyzer plus beer + DVA4500 (Anton Paar GmbH, Австрия) и мутномера VAS ROTA 90/25 («Haffmans B.V.», Нидерланды). Содержание сахаров и летучих компонентов пива определяли с применением высокоэффективной жидкостной хроматографии ВЭЖХ (LC -10ADVp, (Shimadzu, Германия) и газового хроматографа (HP 6890, Ajilent Technologies), соответственно.

Для анализа ДНК и белков использовали системы вертикального и горизонтального электрофореза (MGU-602T (C.B.S. Scientific, США и Mini-PROTEAN Tetra (BioRad)), соответственно. Документирование данных проводили на денситометрах Ultroscan 2202 (LKB, США) и GS-710 (BioRad, США), а также камере для документирования BioDoc-It® Imaging Systems, UVP® (США). Количественную оценку интенсивности полос белков после проведения Вестерн-блота осуществляли путем сканирования пленок на денситометре GS-710 (BioRad) с использованием программы One версии 4.0 (BioRad).

С помощью аппарата для пульс-фреза (ПФ) (ПИЯФ, Россия) изучали количество и размеры хромосомной ДНК дрожжей.

Для получения препаратов для протеомного анализа использовали систему

изоэлектрической фокусировки белков Ettan IPGPhor 3 (Healthcare, GE), электрофоретическое разделение белков по молекулярным массам проводили в 10 % полиакрил амидном геле (ПААГ) по методу Laemmle U. K., 1970 с модификациями. Использовали ротационный вакуумный концентратор RVC 2-33 IR (Christ, Германия), высокоэффективный жидкостной хроматограф Милихром-6, совмещенный с МАЛДИ-споттером (Группа компаний «ГРАНАТ», Россия) и МАЛДИ масс - спектрометр (МС) (AB Sciex TOF/TOF 5800 (AB Sciex, США). Масс-спектры получали с помощью программного обеспечения TOF/TOF Series Explorer. Анализ MC и MC/MC спектров проводили с использованием специализированного программного обеспечения ProteinPilot 4.0 (AB Sciex) в поисковой системе MASCOT (либо Protein Prospector) по международным белковым базам данных UniProtKB/Swiss-Prot/NCBL Для уточнения относительного обилия белков в пробах использовался индекс emPAI (Exponentially Modified Protein Abundance Index), рассчитываемый для анализа в поисковой системе Mascot (Ishihama et al., 2005).

Основные положения, выносимые на защиту:

- новая схема селекции для конструирования штамма дрожжей для пивоварения;

- скрининг штаммов для скрещивания;

- доказательство гибридной природы нового штамма путем изучения его хромосомного полиморфизма;

- данные по изучению биосинтетической активности нового штамма;

- результаты производственных испытаний штамма;

- применение генно - инженерных конструкций для выявления генов с ранее неизвестными функциями и их связи с процессом секреции белков;

- открытие нового гена GPI14, кодирующего гликозилфосфоинозитол-альфа 1,4 маннозилтрансферазу I;

- результаты по выявлению генов - мишеней с экспрессией, характерной для штаммов, используемых в пивоваренной, хлебопекарной и спиртовой

промышленности;

- обоснование использования отработанных пивоваренных дрожжей для производства хлеба;

- результаты по использованию дрожжей в качестве модельного объекта для оценки физиологической активности семенных дрожжей для бродильных производств и безопасности продуктов;

- результаты по полиморфизму хромосом и содержанию индуктора интерферона у штаммов - представителей высокогомозиготной линии продуцентов днРНК.

Научно-техническая задача, решаемая в диссертации, заключается в использования методов генетики, селекции, геномики и протеомики для выявления специфичных генов и их направленных изменений с целью формирования хозяйственно-ценных признаков производственных штаммов дрожжей S. cerevisiae с различной биосинтетической активностью.

Объекты и предметы исследования

В работе были использованы штаммы дрожжей S. cerevisiae из Всероссийской Коллекции Промышленных Микроорганизмов

ФГУПГосНИИГенетика (ВКПМ) http: //www. genetika.ru/vkpm, штаммы из коллекции Отдела Молекулярной и Радиационной Биофизики Петербургского Института Ядерной Физики им. Константинова Российской Академии наук (ПИЯФ), коллекции EUROSCAF, коллекции Carlsberg, Hefebank Weihenstephan и университета ИТМО.

Новизна, научная и практическая значимость

Проведенные исследования заложили основу для создания новых промышленных продуцентов для пивоварения и других бродильных производств и фармакологии.

Используя научный подход, основанный на базе классических методов

генетики и селекции создана схема получения нового пивоваренного штамма сегву181ав У-3194 и методом пульс-фореза доказана его гибридная природа, показано промежуточное наследование устойчивости к температуре, к концентрациям ионов меди.

Проведено таксономическое изучение штамма Y-3194 с использованием системы и программного обеспечения фирмы ВюМепеих, доказано, что штамм принадлежит виду 8асскаготусв8 свгву181ав.

Штамм пивных дрожжей свгву181ав депонирован в ВКПМ под регистрационным номером Y-3194, обеспечивающий улучшение технологических параметров производства и повышение потребительских свойств готового продукта.

Методом протеомного анализа найдены специфичные гены для штаммов, используемых в пивоварении, хлебопечении и производстве этанола.

Показано, что в протеоме пивоваренных дрожжей по сравнению с хлебопекарными увеличена экспрессия белков, связанных с метаболизмом аминокислот и белков, участвующих в реакциях дрожжевой клетки на стрессовые условия.

Установлено, что большинство генов спиртовых штаммов, характеризующихся повышенной экспрессией, оказывает регулирующее действие на окислительно-восстановительные реакции, процессы детоксикации и стресса.

С применением геномного анализа и условно-летальных конструкций было установлено, что из 63 генов с неизвестной функцией 5 генов влияют на секрецию маркерного белка №р150.

Выявлен ген ОР114, регулирующий секрецию белков у дрожжей, гомологичный гену РЮ-М млекопитающих.

На основании проведенных лабораторных и промышленных исследований разработан Стандарт организации, описывающий специфические особенности производства хлеба из остаточных пивоваренных дрожжей Y-3194 «Дрожжи хлебопекарные 5. свгву181в штамм Y-3194».

Регистрация и сертификация штамма Y-3194 отражена в документах:

Санитарно-эпидемиологическое заключение СЭЗ 78.12.8 000 М. 0000.14.01.08; Свидетельство о государственной регистрации RU.78.01.08.010 Е.006937.10.11; Декларация о соответствии ТС N RU Д^и.АЕ45 В.09103; выписки из ВКПМ о расширении области применения дрожжей Y-3194 в пивоварении, виноделии, хлебопечении и для производства сидра.

Разработан и утвержден пакет технологической документации для использования штамма Y-3194: Технологическая инструкция на производство пива светлого «Балтика Кулер», ТИ 9184-093 и Технические условия на производство пиво светлое «Балтика «Кулер» ТУ 9184-093-018249; утверждены Технологические условия на остаточные дрожжи «Дрожжи пивные свгву181ав Y-3194» ТУ 9184-118-2007.

По результатам лабораторных и промышленных испытаниях штамм Y-3194 внедрен в производство.

На основе генетически изолированного штамма свгву181ав Y-3194 разработан бренд пива «Кулер».

Штамм Y-3194 является в настоящее время единственным отечественным пивоваренным штаммом, который имеет практику промышленного использования. Ранее в России, в основном, применяли штаммы немецкой, датской, чешской и т.д. школ пивоварения.

Применение штамма Y-3194 позволило снизить длительность брожения на 24-36 ч, повысило производительность предприятия на 12,7 % за счет снижения расходов на охлаждение; увеличило вкусовую и коллоидную стабильность готового продукта, что позволяет продлить срок годности напитка с 6 до 9 мес.

Штамм Y-3194 внедрен на 8 филиалах ООО «Пивоваренная компания «Балтика». С 2007 по июнь 2019 было произведено 2 405 550 129 л пива, экономический эффект составляет 1,657 руб. на литр пива, что соответствует 994 млн. руб. / год для завода производительностью 6 млн гл / год, о чем свидетельствует Акт внедрения.

Использование собственного штамма для производства чистой культуры дрожжей позволяет снизить затраты пивоваренного завода на 240 тыс. руб. / год.

Проведены производственные испытания в Международном хлебопекарном центре ООО «Лейпуриен тукку» по выпечке хлебобулочных изделий с использованием штамма Y-3194. По результатам тестирования четырех технологий выпечки хлеба наиболее перспективным оказался ускоренный способ. Дегустационная оценка показала, что хлеб, произведенный с использованием дрожжей Y-3194, имел более выраженный аромат, окраска корки была интенсивнее по сравнению с коммерческими дрожжами «Люкс Экстра» ООО СФ-Нева. Экономический эффект составил 7,5 % от общей стоимости производства хлеба.

Разработаны экспресс-метод оценки физиологической активности семенного материала бродильных производств и экспресс - метод оценки биологической безопасности напитков и их ингредиентов.

Разработанные в результате исследований технологии способствуют повышению эффективности технологий бродильных производств, рециклингу отходов и оценки качества готовых продуктов и ингредиентов.

Разработанные экспресс-методы по оценке физиологической активности и оценки безопасности напитков и ингредиентов внедрены в учебный процесс на мегафакультете наук о жизни Университета ИТМО для подготовки студентов, обучающихся по направлениям 19.03.02 «Продукты питания из растительного сырья» и 19.04.01 «Биотехнология» на образовательной программе «Биотехнология напитков, хлеба и кондитерских изделий», о чем имеется Акт внедрения. Разработаны учебные пособия «Физиологическое состояние дрожжей», «Дрожжи Saccharomyces cerevisie. Морфология, химический состав, метаболизм», которые включены в состав учебно-методических комплексов по дисциплинам «Основы биотехнологии дрожжей», «Основы биотехнологии микроорганизмов», «Инновационные технологии пивоварения».

Степень достоверности и апробация

Достоверность результатов основывалась на статистической обработке данных с использованием стандартных программных продуктов, таких как Exell, Word, а также специализированных программ со встроенными инструментами

статистической обработки, например, Использовали базы данных SGD. Документирования данных проводили на денситометре Ultroscan 2202 (LKB, США) и GS-710 (BioRad, США), а также камеру для документирования BioDoc-It® Imaging Systems, UVP® (США). Количественную оценку интенсивности полос белка после проведения Вестерн-блота осуществляли путем сканирования пленок на денситометре GS-710 (BioRad) с использованием программы One версии 4.0 (BioRad). Масс-спектры получали с помощью программного обеспечения TOF/TOF Series Explorer.

Анализ МС и МС/МС спектров проводили с использованием специализированного программного обеспечения ProteinPilot 4.0 (AB Sciex) в поисковой системе MASCOT (либо Protein Prospector) по международным белковым базам данных UniProtKB/Swiss-Prot/NCBI. Для уточнения относительного обилия белков в пробах использовался индекс emPAI (Exponentially Modified Protein Abundance Index), рассчитываемый для анализа в поисковой системе Mascot.

Основные результаты работы докладывались и обсуждались на российских и межународных научно-технических конференциях и симпозиумах и конгрессах: XXI st International Conference on Yeast Genetics and Molecular Biology (Goteborg Sweeden, 2003); XX International Conference on Yeast Genetics and Molecular Biology (Prague Czech Republic, 2001); VI International Symposium and Exhibition on Environmental Contamination in Central and Eastern Europe and the Commonwealth of Independent States (Czech Republic Prague, 2003); 1st Biotechnology World Congress (Emerates, Dubai, 2012); IV Международной научно-практической конференции Современное состояние и перспективы развития пищевой промышленности и общественного питания (Челябинск, 2010); II международной Интернет-конференции (Казань, 2012); III международной Интернет-конференции (Казань, 2012); VIII Международная научно-техническая конференция «Низкотемпературные и пищевые технологии в XXI веке» (Санкт-Петербург, 2017 г.); 2nd B-fost 2018 Congress (Yerevan, Armenia, 2018); The Third ASRTU Sino-Russian Bilateral Symposium on Innovation Food Science and Equipment (Harbin,

China, 2018); Х Евразийского научного форума (СПб, 2018), Functional Food Center's 31st International Conference (2023), XII международная научно-практическая конференция «Биотехнология: наука и практика» (Воронеж 2024), XII Международный Балтийский морской форум (Калининград, 2024), FFC32 Satellite Conference Discovery, Research and Utilization of Bioactive Compounds: Development of Healthy and Functional Food Products (Калифорния 2024), LXIII Международная научно-практическая конференция "Eurasiascience" (Москва 2024).

Степень разработанности темы

Дрожжи S. cerevisiae можно считать идеальным модельным организмом вследствие короткого времени репликации ДНК, эффективной споруляции, отсутствия патогенности и небольшого размера генома (около 6000 генов). Большое значение имеет использование дрожжей в качестве модели для исследований в области медицины (Mager and Winderickx, 2005), эволюции (Voordeckers and Verstrepen, 2015; Snoek, T. et al., 2014; Steensels J. et al., 2014) и популяционной геномики (Liti et al., 2009). Штаммы дрожжей широко используются в производстве фармацевтических препаратов и других важных химических веществ (Бородина и Нильсен, 2014).

Дрожжи - сахаромицеты широко используются в фармацевтической промышленности для синтеза рекомбинантного инсулина, альбумина, эритропоэтина, глюкагона, человеческого гормона роста, вакцин против гриппа, гепатитов А и В, дифтерии и папиллома вируса (Türker, 2014).

В 1990 г. генетически модифицированный штамм (ГМО) S. cerevisiae стал одним из первых ГМО, одобренных для пищевой промышленности Великобритании. Он использовался в хлебопечении для усиленного производства углекислого газа. Многие гены, кодирующие желательные свойства, были введены в геном штаммов пивных и винных дрожжей.

Использование современных технологий модификации экспрессии генов предлагает новый инструмент целенаправленной коррекции фенотипа дрожжей

Saccharomyces и позволяет исключить нежелательные свойства промышленных штаммов (Sander, 2014).

Внедрение результатов исследования Штамм внедрен на 8 Российских заводах ООО «Пивоваренная компания «Балтика», находящихся в Санкт-Петербурге, Самаре, Ярославле, Туле, Ростове, Воронеже, Хабаровске и Новосибирске.

Новый бренд пива «Кулер» создан на основе полученного штамма Y-3194.

В Международном хлебопекарном центре ООО «Лейпуриен тукку» получили хлеб с использованием штамма Y-3194. По результатам тестирования четырех технологий выпечки хлеба, наиболее перспективным оказался ускоренный способ. Дегустационная оценка показала, что хлеб, произведенный с использованием дрожжей Y-3194, имел более выраженный аромат, окраска корки была интенсивнее по сравнению с коммерческими дрожжами «Люкс Экстра» ООО СФ-Нева. Экономический эффект составил 7,5 %. Разработанные методы оценки физиологической активности дрожжей и безопасности пищевой продукции внедрены в учебном процессе Университета ИТМО для подготовки студентов, обучающихся по направлениям 19.03.02, 19.04.01 «Биотехнология напитков, хлеба и кондитерских изделий». Методические указания включены в состав учебно -методических комплексов по дисциплинам «Основы биотехнологии дрожжей», «Основы биотехнологии микроорганизмов», «Инновационные технологии пивоварения». Получен Акт об использовании результатов диссертационной работы в учебном процессе мегафакультета наук о жизни Университета ИТМО.

Рассматриваемые проблемы решались в соответствии с

Межведомственной инновационной программой «Биотехнология для медицины и агропромышленного комплекса»; программы «Научные исследования высшей школы по приоритетным направлениям науки и техники»; программы Министерства образования РФ «Университеты России»; Федеральной целевой программы «Интеграция науки и высшего образования России», а также Прогноз научно-технологического развития России: 2030 в области обеспечения

безопасности пищевых продуктов.

Вклад автора в проведенные исследования

Личный вклад автора состоит в постановке и разработке путей решения задач, проведении исследований, суммировании, обработке и интерпретации результатов, а также в подготовке публикаций по теме диссертации. Разработанные автором методические и практические рекомендации и интеллектуальная собственность в виде патента на создание нового штамма дрожжей для пивоварения, являются результатом самостоятельного исследования и формируют новый подход в создании продуцентов для различных направлений биотехнологии.

Диссертация написана автором самостоятельно, содержит новые научные результаты и положения, выдвигаемые для публичной защиты, и свидетельствуют о личном вкладе автора в научную и производственную деятельность.

Теоретически обосновано направление исследований, сформулированы цель и задачи, разработана методология. Автор лично планировала, организовывала проведение всех испытаний и внедрений, а также обобщала полученные результаты. Под ее руководством и при непосредственном участии определены критерии отбора дрожжей-сахаромицетов для пивоварения, установлены морфолого-физиологические, молекулярно-биологические, биохимические и технологические особенности изучаемых штаммов дрожжей. Автором теоретически обоснованы и экспериментально подтверждены направления и метода селекции промышленных продуцентов и рециклинга семенных дрожжей; под ее непосредственным руководством и участии разработаны способы оценки биобезопасности напитков и ингредиентов.

Структура и объем работы

Диссертация состоит из введения, 7 глав, заключения, списка литературы и приложений. Работа изложена на 488 страницах, содержит: 45 рисунков, 32 таблицы, 31 приложение. Список литературных источников включает 341 источников.

Публикации

Основное содержание диссертации опубликовано в 30 печатных работах, из них 19 публикаций в изданиях, рецензируемых Web of Science или Scopus, 10 статей в журналах из перечня ВАК, 1 публикация в иных изданиях и 1 патент Российской Федерации (приложение К1).

Основное содержание работы

Дрожжи как научный и производственный объект

Аналитический обзор посвящен научным и историческим данным использования и изучения дрожжей. Проанализированы этапы эволюции формирования геномов пивоваренных, винных и хлебопекарных дрожжей, а также рассмотрены специфичные для них гены.

Отдельно рассмотрены генетические последствия трех направлений использования для нужд человека - доместикации («одомашнивания») дрожжей для пивоварения, виноделия и хлебопечения и выявлены генетические изменения, специфичные для этих производств.

Использование методов генетики, селекции, геномики и протеомики для решения биотехнологических задач

Наряду с классическими методами изучения и изменения генома современная наука предоставляет новые пути и инструменты для более направленного и эффективного решения задач, формируя новую концепцию, определяющую стратегию действий и систему путей решения практических задач. Полученные знания подтверждаются практикой. Научный подход - совокупность методов решения задач с целью получения новых знаний. В таблице 1 приведены использованные в работе методы решения практических задач для создания новых производственных штаммов.

Список литературы диссертационного исследования доктор наук Давыденко Светлана Геннадьевна, 2024 год

СПИСОК ЛИТЕРАТУРЫ

1. Афонин Д. В., Дедегкаев А. Т., Давыденко C. Г. Влияние процессов, протекающих при сбраживании сусла, на инициальную мутность пива // Пиво и напитки . 2012. № 1. C. 26-29.

2. Ермолаева Г. А. Справочник работника лаборатории пивоваренного предприятия / Г. А. Ермолаева, 2004.

3. Захаров И. А., Кожин С. А., Кожина Т. Н. Сборник методик по генетике дрожжей-сахаромицетов // Наука. 1984. C. 144.

4. Межевая Е. В. Изучение интеграции плазмиды pYF91 в дрожжевые хромосомы методом пульс-фореза // Биополимеры и клетка. 1990. № 3 (6). C. 90.

5. Меледина Т. В. [и др.]. Маннопротеины и их выделение из дрожжевых клеток // Вестник Международной академии холода. 2023. № 2. C. 75-81.

6. Aguilar Uscanga M. G., Délia M.-L., Strehaiano P. Brettanomyces bruxellensis: effect of oxygen on growth and acetic acid production // Applied Microbiology and Biotechnology. 2003. № 2 (61). C. 157-162.

7. AGUILERA J., ANTONIOPRIETO J. Yeast cells display a regulatory mechanism in response to methylglyoxal // FEMS Yeast Research. 2004. № 6 (4). C. 633-641.

8. Ait-El-Mkadem S. [и др.]. Mutations in MDH2, Encoding a Krebs Cycle Enzyme, Cause Early-Onset Severe Encephalopathy // The American Journal of Human Genetics. 2017. № 1 (100). C. 151-159.

9. ALBERTIN W. [и др.]. Evidence for autotetraploidy associated with reproductive isolation in Saccharomyces cerevisiae : towards a new domesticated species // Journal of Evolutionary Biology. 2009. № 11 (22). C. 2157-2170.

10. Alexander M. A., Jeffries T. W. Respiratory efficiency and metabolite partitioning as regulatory phenomena in yeasts // Enzyme and Microbial Technology. 1990. № 1 (12). C. 2-19.

11. Alexandre H. Flor yeasts of Saccharomyces cerevisiae—Their ecology, genetics and metabolism // International Journal of Food Microbiology. 2013. № 2 (167). C. 269-

12. Almeida P. [h gp.]. A Gondwanan imprint on global diversity and domestication of wine and cider yeast Saccharomyces uvarum // Nature Communications. 2014. № 1 (5). C. 4044.

13. Alves-Araujo C. [h gp.]. Sugar utilization patterns and respiro-fermentative metabolism in the baker's yeast Torulaspora delbrueckii // Microbiology. 2007. № 3 (153). C. 898-904.

14. Alves-Jr S. L. [h gp.]. Maltose and Maltotriose Active Transport and Fermentation by Saccharomyces Cerevisiaes // Journal of the American Society of Brewing Chemists. 2007. № 2 (65). C. 99-104.

15. Anderson J. D., Widom J. Sequence and position-dependence of the equilibrium accessibility of nucleosomal DNA target sites 1 1Edited by T. Richmond // Journal of Molecular Biology. 2000. № 4 (296). C. 979-987.

16. ANTUNOVICS Z. [h gp.]. Gradual genome stabilisation by progressive reduction of the genome in an interspecific hybrid with // FEMS Yeast Research. 2005. № 12 (5). C. 1141-1150.

17. Aouizerat T. [h gp.]. Isolation and Characterization of Live Yeast Cells from Ancient Vessels as a Tool in Bio-Archaeology // mBio. 2019. № 2 (10).

18. Baker E. [h gp.]. The Genome Sequence of Saccharomyces eubayanus and the Domestication of Lager-Brewing Yeasts // Molecular Biology and Evolution. 2015. № 11 (32). C. 2818-2831.

19. Barrales R. R. [h gp.]. Chromatin Modulation at the FLO11 Promoter of Saccharomyces cerevisiae by HDAC and Swi/Snf Complexes // Genetics. 2012. № 3 (191). C. 791-803.

20. Bataillon M. [h gp.]. Early thiamin assimilation by yeasts under enological conditions: Impact on alcoholic fermentation kinetics // Journal of Fermentation and Bioengineering. 1996. № 2 (82). C. 145-150.

21. Bergin S. A. [h gp.]. Identification of European isolates of the lager yeast parent Saccharomyces eubayanus // FEMS Yeast Research. 2022. № 1 (22).

22. Bidard F. [h gp.]. The Saccharomyces cerevisiae FLO1 flocculation gene

encodes for a cell surface protein // Yeast. 1995. № 9 (11). C. 809-822.

23. Biden T. J., Prugue M. L., Davison A. G. M. Evidence for phosphatidylinositol hydrolysis in pancreatic islets stimulated with carbamoylcholine. Kinetic analysis of inositol polyphosphate metabolism // Biochemical Journal. 1992. №2 2 (285). C. 541-549.

24. Bing J. [h gp.]. Evidence for a Far East Asian origin of lager beer yeast // Current Biology. 2014. № 10 (24). C. R380-R381.

25. Birch A. N. [h gp.]. Influence of commercial baker's yeasts on bread aroma profiles // Food Research International. 2013. № 1 (52). C. 160-166.

26. Birch A. N., Petersen M. A., Hansen Â. S. The aroma profile of wheat bread crumb influenced by yeast concentration and fermentation temperature // LWT - Food Science and Technology. 2013. № 2 (50). C. 480-488.

27. Bisson L. F. Stuck and Sluggish Fermentations // American Journal of Enology and Viticulture. 1999. № 1 (50). C. 107-119.

28. Bizaj E. [h gp.]. A breeding strategy to harness flavor diversity of Saccharomyces interspecific hybrids and minimize hydrogen sulfide production // FEMS Yeast Research. 2012. № 4 (12). C. 456-465.

29. Blieck L. [h gp.]. Isolation and Characterization of Brewer's Yeast Variants with Improved Fermentation Performance under High-Gravity Conditions // Applied and Environmental Microbiology. 2007. № 3 (73). C. 815-824.

30. Blomqvist K. [h gp.]. Chromosomal Integration and Expression of Two Bacterial a-Acetolactate Decarboxylase Genes in Brewer's Yeast // Applied and Environmental Microbiology. 1991. № 10 (57). C. 2796-2803.

31. Bonanomi M. [h gp.]. The Toxic Effects of Pathogenic Ataxin-3 Variants in a Yeast Cellular Model // PLOS ONE. 2015. № 6 (10). C. e0129727.

32. Borneman A. R. [h gp.]. Comparative genome analysis of a Saccharomyces cerevisiae wine strain // FEMS Yeast Research. 2008. № 7 (8). C. 1185-1195.

33. Borneman A. R. [h gp.]. Whole-Genome Comparison Reveals Novel Genetic Elements That Characterize the Genome of Industrial Strains of Saccharomyces cerevisiae // PLoS Genetics. 2011. № 2 (7). C. e1001287.

34. Borneman A. R. [h gp.]. The genome sequence of the wine yeast VIN7 reveals

an allotriploid hybrid genome with Saccharomyces cerevisiae and Saccharomyces kudriavzevii origins // FEMS Yeast Research. 2012. № 1 (12). C. 88-96.

35. Borodina I., Nielsen J. Advances in metabolic engineering of yeast Saccharomyces cerevisiae for production of chemicals // Biotechnology Journal. 2014. № 5 (9). C. 609-620.

36. Broek M. van den [h gp.]. Chromosomal Copy Number Variation in Saccharomyces pastorianus Is Evidence for Extensive Genome Dynamics in Industrial Lager Brewing Strains // Applied and Environmental Microbiology. 2015. № 18 (81). C. 6253-6267.

37. Brown C. A., Murray A. W., Verstrepen K. J. Rapid Expansion and Functional Divergence of Subtelomeric Gene Families in Yeasts // Current Biology. 2010. № 10 (20). C. 895-903.

38. Brown S. L. [h gp.]. Reducing haziness in white wine by overexpression of Saccharomyces cerevisiae genes YOL155c and YDR055w // Applied Microbiology and Biotechnology. 2007. № 6 (73). C. 1363-1376.

39. Cabranes C., Mangas J. J., Blanco D. CONTROLLED PRODUCTION OF CIDER BY INDUCTION OF ALCOHOLIC FERMENTATION AND MALOLACTIC CONVERSION // Journal of the Institute of Brewing. 1996. № 2 (102). C. 103-109.

40. Canonico L. [h gp.]. Torulaspora delbrueckii in the brewing process: A new approach to enhance bioflavour and to reduce ethanol content // Food Microbiology. 2016. (56). C. 45-51.

41. Cantor C. R., Smith C. L., Mathew M. K. Pulsed-Field Gel Electrophoresis of Very Large DNA Molecules // Annual Review of Biophysics and Biophysical Chemistry. 1988. № 1 (17). C. 287-304.

42. Carbonetto B. [h gp.]. Bakery yeasts, a new model for studies in ecology and evolution // Yeast. 2018. № 11 (35). C. 591-603.

43. Carle G. F., Olson M. V An electrophoretic karyotype for yeast. // Proceedings of the National Academy of Sciences. 1985. № 11 (82). C. 3756-3760.

44. Carlquist M. [h gp.]. Process engineering for bioflavour production with metabolically active yeasts - a mini-review. // Yeast (Chichester, England). 2015. № 1

(32). C. 123-43.

45. Cavalieri D. [h gp.]. Evidence for S. cerevisiae Fermentation in Ancient Wine // Journal of Molecular Evolution. 2003. № 0 (57). C. S226-S232.

46. Chan C. T. Y. [h gp.]. Reprogramming of tRNA modifications controls the oxidative stress response by codon-biased translation of proteins // Nature Communications. 2012. № 1 (3). C. 937.

47. Charizanis C. [h gp.]. The mitochondrial cytochrome c peroxidase Ccp1 of Saccharomyces cerevisiae is involved in conveying an oxidative stress signal to the transcription factor Pos9 (Skn7) // Molecular and General Genetics MGG. 1999. № 3 (262). C. 437-447.

48. Charron M. J. [h gp.]. Molecular evolution of the telomere-associated MAL loci of Saccharomyces. // Genetics. 1989. № 2 (122). C. 307-316.

49. Ciani M. [h gp.]. Controlled mixed culture fermentation: a new perspective on the use of non- Saccharomyces yeasts in winemaking // FEMS Yeast Research. 2010. № 2 (10). C. 123-133.

50. Codon A. C., Benitez T., Korhola M. Chromosomal polymorphism and adaptation to specific industrial environments of Saccharomyces strains // Applied Microbiology and Biotechnology. 1998. № 2 (49). C. 154-163.

51. Corsetti A. [h gp.]. Combined Effect of Sourdough Lactic Acid Bacteria and Additives on Bread Firmness and Staling // Journal of Agricultural and Food Chemistry. 2000. № 7 (48). C. 3044-3051.

52. Cousseau F. E. M. [h gp.]. Characterization of maltotriose transporters from the Saccharomyces eubayanus subgenome of the hybrid Saccharomyces pastorianus lager brewing yeast strain Weihenstephan 34/70 // Letters in Applied Microbiology. 2013. № 1 (56). C. 21-29.

53. Cubillos F. A. [h gp.]. Self-fertilization is the main sexual reproduction mechanism in native wine yeast populations // FEMS Microbiology Ecology. 2009. № 1 (67). C. 162-170.

54. Curwin A. J., Blume J. von, Malhotra V. Cofilin-mediated sorting and export of specific cargo from the Golgi apparatus in yeast // Molecular Biology of the Cell. 2012.

№ 12 (23). C. 2327-2338.

55. Damon C. [h gp.]. A novel fungal family of oligopeptide transporters identified by functional metatranscriptomics of soil eukaryotes // The ISME Journal. 2011. № 12 (5). C. 1871-1880.

56. Dashko S. [h gp.]. Why, when, and how did yeast evolve alcoholic fermentation? // FEMS Yeast Research. 2014. № 6 (14). C. 826-832.

57. Davydenko S. [h gp.]. Proteomics Answers Which Yeast Genes Are Specific for Baking, Brewing, and Ethanol Production // Bioengineering. 2020. № 4 (7). C. 147.

58. Davydenko S. G. [h gp.]. Determination of the level of plasmid dual-stranded RNA in killer strains of the yeast Saccharomyces cerevisiae. // Molekuliarnaia genetika, mikrobiologiia i virusologiia. 1990. № 11. C. 10-1.

59. Davydenko S. G. [h gp.]. [Chromosome polymorphism in the yeast Saccharomyces]. // Genetika. 1990. № 12 (26). C. 2135-46.

60. Davydenko S. G. [h gp.]. Screening for novel essential genes of Saccharomyces cerevisiae involved in protein secretion // Yeast. 2004. № 6 (21). C. 463-471.

61. Davydenko S. G. [h gp.]. Characterization of GPI14/YJR013w mutation that induces the cell wall integrity signalling pathway and results in increased protein production in Saccharomyces cerevisiae // Yeast. 2005. № 12 (22). C. 993-1009.

62. Davydenko S. G. [h gp.]. A new yeast strain for brewery: Properties and advantages // Russian Journal of Genetics. 2010. № 11 (46). C. 1295-1305.

63. Davydenko S. G., Meledina T. V., Ivanova V. A. New Foresight Methodology for Toxicity Assessment // Scientific Study and Research: Chemistry and Chemical Engineering, Biotechnology, Food Industry. 2020. № 3 (21). C. 333-342.

64. Day R. E. [h gp.]. Characterization of the putative maltose transporters encoded by YDL247w and YJR160c // Yeast. 2002. № 12 (19). C. 1015-1027.

65. DeLuna A. [h gp.]. NADP-Glutamate Dehydrogenase Isoenzymes of Saccharomyces cerevisiae // Journal of Biological Chemistry. 2001. № 47 (276). C. 43775-43783.

66. Demeshkina N. [h gp.]. A new understanding of the decoding principle on the ribosome // Nature. 2012. № 7393 (484). C. 256-259.

67. Denby C. M. [h gp.]. Industrial brewing yeast engineered for the production of primary flavor determinants in hopped beer // Nature Communications. 2018. № 1 (9). C. 965.

68. Dequin S. The potential of genetic engineering for improving brewing, wine-making and baking yeasts // Applied Microbiology and Biotechnology. 2001. № 5-6 (56). C. 577-588.

69. Dequin S., Barre P. Mixed Lactic Acid-Alcoholic Fermentation by Saccharomyes cerevisiae Expressing the Lactobacillus casei L(+)-LDH // Nature Biotechnology. 1994. № 2 (12). C. 173-177.

70. Dickinson J. R., Salgado L. E. J., Hewlins M. J. E. The Catabolism of Amino Acids to Long Chain and Complex Alcohols in Saccharomyces cerevisiae // Journal of Biological Chemistry. 2003. № 10 (278). C. 8028-8034.

71. Domizio P. [h gp.]. Lachancea thermotolerans as an alternative yeast for the production of beer // Journal of the Institute of Brewing. 2016. № 4 (122). C. 599-604.

72. Donalies U. E. B. [h gp.]. Improvement of Saccharomyces Yeast Strains Used in Brewing, Wine Making and Baking Berlin, Heidelberg: Springer Berlin Heidelberg, C. 67-98.

73. Drewke C., Ciriacy M. Overexpression, purification and properties of alcohol dehydrogenase IV from Saccharomyces cerevisiae // Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Gene Structure and Expression. 1988. № 1 (950). C. 54-60.

74. Dujon B. Yeast evolutionary genomics // Nature Reviews Genetics. 2010. № 7 (11). C. 512-524.

75. Dunayevich P. [h gp.]. Heat-stress triggers MAPK crosstalk to turn on the hyperosmotic response pathway // Scientific Reports. 2018. № 1 (8). C. 15168.

76. Dunn B. [h gp.]. Recurrent Rearrangement during Adaptive Evolution in an Interspecific Yeast Hybrid Suggests a Model for Rapid Introgression // PLoS Genetics. 2013. № 3 (9). C. e1003366.

77. Dunn B., Levine R. P., Sherlock G. Microarray karyotyping of commercial wine yeast strains reveals shared, as well as unique, genomic signatures // BMC Genomics. 2005. № 1 (6). C. 53.

78. Dunn B., Sherlock G. Reconstruction of the genome origins and evolution of the hybrid lager yeast Saccharomycespastorianus // Genome Research. 2008. № 10 (18). C. 1610-1623.

79. Edward D. Kerr Capturing and Characterising Wild Yeast for Beer Brewing // bioRxiv. 2024.

80. Erny C. [и др.]. Ecological Success of a Group of Saccharomyces cerevisiae/Saccharomyces kudriavzevii Hybrids in the Northern European Wine-Making Environment // Applied and Environmental Microbiology. 2012. № 9 (78). C. 32563265.

81. Fay J. C. [и др.]. Population genetic variation in gene expression is associated with phenotypic variation in Saccharomyces cerevisiae // Genome Biology. 2004. № 4 (5). C. R26.

82. Fay J. C. [и др.]. A polyploid admixed origin of beer yeasts derived from European and Asian wine populations // PLOS Biology. 2019. № 3 (17). C. e3000147.

83. Fiaux J. [и др.]. Metabolic-Flux Profiling of the Yeasts Saccharomyces cerevisiae and Pichia stipitis // Eukaryotic Cell. 2003. № 1 (2). C. 170-180.

84. Fidalgo M. [и др.]. Adaptive evolution by mutations in the FLO11 gene // Proceedings of the National Academy of Sciences. 2006. № 30 (103). C. 11228-11233.

85. Flavio M. F. G. [и др.]. Anthelmintic and antioxidant potential of Fagopyrum esculentum Moench in vitro // African Journal of Agricultural Research. 2016. № 44 (11). C. 4454-4460.

86. Fogel S., Welch J. W., Maloney D. H. The molecular genetics of copper resistance in Saccharomyces cerevisiae — a paradigm for non-conventional yeasts // Journal of Basic Microbiology. 1988. № 3 (28). C. 147-160.

87. Foury F. [и др.]. The complete sequence of the mitochondrial genome of Saccharomyces cerevisiae // FEBS Letters. 1998. № 3 (440). C. 325-331.

88. Francesco G. De [и др.]. Screening of new strains of Saccharomycodes ludwigii and Zygosaccharomyces rouxii to produce low-alcohol beer // Journal of the Institute of Brewing. 2015. № 1 (121). C. 113-121.

89. Frasse P. [и др.]. The Influence of Fermentation on Volatile Compounds in

French Bread Dough // LWT - Food Science and Technology. 1993. № 2 (26). C. 126132.

90. Frederick D. L., Tatchell K. The REG2 Gene of Saccharomyces cerevisiae Encodes a Type 1 Protein Phosphatase-Binding Protein That Functions with Reglp and the Snf1 Protein Kinase to Regulate Growth // Molecular and Cellular Biology. 1996. № 6 (16). C. 2922-2931.

91. Fujii T. [и др.]. Application of a ribosomal DNA integration vector in the construction of a brewer's yeast having alpha-acetolactate decarboxylase activity // Applied and Environmental Microbiology. 1990. № 4 (56). C. 997-1003.

92. Fukuda K. [и др.]. Brewing properties of sake yeast whose EST2 gene encoding isoamyl acetate-hydrolyzing esterase was disrupted // Journal of Fermentation and Bioengineering. 1998. № 1 (85). C. 101-106.

93. Galeote V. [и др.]. Amplification of a Zygosaccharomyces bailii DNA Segment in Wine Yeast Genomes by Extrachromosomal Circular DNA Formation // PLoS ONE. 2011. № 3 (6). C. e17872.

94. Gallone B. [и др.]. Domestication and Divergence of Saccharomyces cerevisiae Beer Yeasts // Cell. 2016. № 6 (166). C. 1397-1410.e16.

95. Gari E. [и др.]. A set of vectors with a tetracycline-regulatable promoter system for modulated gene expression in Saccharomyces cerevisiae. // Yeast (Chichester, England). 1997. № 9 (13). C. 837-48.

96. Gélinas P. Mapping Early Patents on Baker's Yeast Manufacture // Comprehensive Reviews in Food Science and Food Safety. 2010. № 5 (9). C. 483-497.

97. Gibson B., Liti G. Saccharomyces pastorianus : genomic insights inspiring innovation for industry // Yeast. 2014. C. n/a-n/a.

98. Gjermansen C. [и др.]. Towards diacetyl-less brewers' yeast. Influence of ilv2 and ilv5 mutations // Journal of Basic Microbiology. 1988. № 3 (28). C. 175-183.

99. Goffeau A. [и др.]. Life with 6000 Genes // Science. 1996. № 5287 (274). C. 546-567.

100. GonzÄilez S. S. [и др.]. Natural hybrids from Saccharomyces cerevisiae , Saccharomyces bayanus and Saccharomyces kudriavzevii in wine fermentations // FEMS

Yeast Research. 2006. № 8 (6). C. 1221-1234.

101. Gorter de Vries A. R. [h gp.]. CRISPR-Cas9 mediated gene deletions in lager yeast Saccharomycespastorianus // Microbial Cell Factories. 2017. № 1 (16). C. 222.

102. Gueldener U. A second set of loxP marker cassettes for Cre-mediated multiple gene knockouts in budding yeast // Nucleic Acids Research. 2002. №2 6 (30). C. 23e-223.

103. Guillaume C. [h gp.]. Molecular Basis of Fructose Utilization by the Wine Yeast Saccharomyces cerevisiae: a Mutated HXT3 Allele Enhances Fructose Fermentation // Applied and Environmental Microbiology. 2007. № 8 (73). C. 24322439.

104. Hagman A., Piskur J. A Study on the Fundamental Mechanism and the Evolutionary Driving Forces behind Aerobic Fermentation in Yeast // PLOS ONE. 2015. № 1 (10). C. e0116942.

105. Hammond J. R. M., Eckersley K. W. Fermentation properties of brewing yeast with killer character // Journal of the Institute of Brewing. 1984. № 3 (90). C. 167-177.

106. Hansen A., Schieberle P. Generation of aroma compounds during sourdough fermentation: applied and fundamental aspects // Trends in Food Science & Technology. 2005. № 1-3 (16). C. 85-94.

107. Hansen J. Inactivation of MXR1 Abolishes Formation of Dimethyl Sulfide from Dimethyl Sulfoxide in Saccharomyces cerevisiae // Applied and Environmental Microbiology. 1999. № 9 (65). C. 3915-3919.

108. Hansen J., Kielland-brandt M. C. Inactivation of MET2 in brewer's yeast increases the level of sulfite in beer // Journal of Biotechnology. 1996. № 1 (50). C. 7587.

109. Hansen J., Kielland-Brandt M. C. Inactivation of MET10 in brewer's yeast specifically increases SO2 formation during beer production // Nature Biotechnology. 1996. № 11 (14). C. 1587-1591.

110. Hatoum R., Labrie S., Fliss I. Antimicrobial and Probiotic Properties of Yeasts: From Fundamental to Novel Applications // Frontiers in Microbiology. 2012. (3).

111. Haukeli A. D., Lie S. The influence of 2-acetohydroxy acids on the determination of vicinal diketones in beer and during fermentation // Journal of the

Institute of Brewing. 1971. № 6 (77). C. 538-543.

112. Hazelwood L. A. [и др.]. The Ehrlich Pathway for Fusel Alcohol Production: a Century of Research on Saccharomyces cerevisiae Metabolism // Applied and Environmental Microbiology. 2008. № 8 (74). C. 2259-2266.

113. Hebly M. [и др.]. S. cerevisiae x S. eubayanus interspecific hybrid, the best of both worlds and beyond // FEMS Yeast Research. 2015. № 3 (15).

114. Heinicke S. [и др.]. The Princeton Protein Orthology Database (P-POD): A Comparative Genomics Analysis Tool for Biologists // PLoS ONE. 2007. № 8 (2). C. e766.

115. Herrmann K. M., Weaver L. M. The shikimate pathway // Annual Review of Plant Physiology and Plant Molecular Biology. 1999. № 1 (50). C. 473-503.

116. Heux S., Cachon R., Dequin S. Cofactor engineering in Saccharomyces cerevisiae: Expression of a H2O-forming NADH oxidase and impact on redox metabolism // Metabolic Engineering. 2006. № 4 (8). C. 303-314.

117. Higgins V. J. [и др.]. Leu343Phe substitution in the Malx3 protein of Saccharomyces cerevisiae increases the constitutivity and glucose insensitivity of MAL gene expression // Current Genetics. 1999. № 5 (35). C. 491-498.

118. Hinnebusch A. G., Fink G. R. Positive regulation in the general amino acid control of Saccharomyces cerevisiae. // Proceedings of the National Academy of Sciences. 1983. № 17 (80). C. 5374-5378.

119. Hirata D. [и др.]. Stable Overproduction of Isoamyl Alcohol by Saccharomyces cerevisiae with Chromosome-integrated Multicopy LEU4 Genes // Bioscience, Biotechnology, and Biochemistry. 1992. № 10 (56). C. 1682-1683.

120. Ihmels J. [и др.]. Rewiring of the Yeast Transcriptional Network Through the Evolution of Motif Usage // Science. 2005. № 5736 (309). C. 938-940.

121. Inoue Y., Tsujimoto Y., Kimura A. Expression of the Glyoxalase I Gene of Saccharomyces cerevisiae Is Regulated by High Osmolarity Glycerol Mitogen-activated Protein Kinase Pathway in Osmotic Stress Response // Journal of Biological Chemistry. 1998. № 5 (273). C. 2977-2983.

122. Ishihama Y. [и др.]. Exponentially Modified Protein Abundance Index

(emPAI) for Estimation of Absolute Protein Amount in Proteomics by the Number of Sequenced Peptides per Protein // Molecular & Cellular Proteomics. 2005. № 9 (4 ). C. 1265-1272.

123. Ishino Y. [h gp.]. Nucleotide sequence of the iap gene, responsible for alkaline phosphatase isozyme conversion in Escherichia coli, and identification of the gene product // Journal of Bacteriology. 1987. № 12 (169). C. 5429-5433.

124. Jakovljevic J. [h gp.]. Ribosomal proteins L7 and L8 function in concert with six A3 assembly factors to propagate assembly of domains I and II of 25 S rRNA in yeast 60S ribosomal subunits // RNA. 2012. № 10 (18). C. 1805-1822.

125. Jantti J. [h gp.]. Characterization of temperature-sensitive mutations in the yeast syntaxin 1 homologues Sso1p and Sso2p, and evidence of a distinct function for Ssolp in sporulation // Journal of Cell Science. 2002. № 2 (115). C. 409-420.

126. Jensen R., Sprague G. F., Herskowitz I. Regulation of yeast mating-type interconversion: feedback control of HO gene expression by the mating-type locus. // Proceedings of the National Academy of Sciences. 1983. № 10 (80). C. 3035-3039.

127. Johnston J. R., Baccari C., Mortimer R. K. Genotypic characterization of strains of commercial wine yeastsby tetrad analysis // Research in Microbiology. 2000. № 7 (151). C. 583-590.

128. Johnston J. R., Mortimer R. K. Electrophoretic Karyotyping of Laboratory and Commercial Strains of Saccharomyces and Other Yeasts // International Journal of Systematic Bacteriology. 1986. № 4 (36). C. 569-572.

129. Johnston J. R., Mortimer R. K. Electrophoretic Karyotyping of Laboratory and Commercial Strains of Saccharomyces and Other Yeasts // International Journal of Systematic Bacteriology. 1986. № 4 (36). C. 569-572.

130. Jolly N. P., Varela C., Pretorius I. S. Not your ordinary yeast: non-Saccharomyces yeasts in wine production uncovered // FEMS Yeast Research. 2014. № 2 (14). C. 215-237.

131. Kachroo A. H. [h gp.]. Systematic humanization of yeast genes reveals conserved functions and genetic modularity // Science. 2015. №2 6237 (348). C. 921-925.

132. Kambacheld M. [h gp.]. Role of the Novel Metallopeptidase MoP112 and

Saccharolysin for the Complete Degradation of Proteins Residing in Different Subcompartments of Mitochondria // Journal of Biological Chemistry. 2005. № 20 (280). C. 20132-20139.

133. Kellis M., Birren B. W., Lander E. S. Proof and evolutionary analysis of ancient genome duplication in the yeast Saccharomyces cerevisiae // Nature. 2004. № 6983 (428). C. 617-624.

134. Kelly J. M., Hynes M. J. Transformation of Aspergillus niger by the amdS gene of Aspergillus nidulans. // The EMBO Journal. 1985. № 2 (4). C. 475-479.

135. Kennedy M. A., Barbuch R., Bard M. Transcriptional regulation of the squalene synthase gene (ERG9) in the yeast Saccharomyces cerevisiae // Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Gene Structure and Expression. 1999. № 1 (1445). C. 110-122.

136. Komath S. S. [h gp.]. Generating anchors only to lose them: The unusual story of glycosylphosphatidylinositol anchor biosynthesis and remodeling in yeast and fungi // IUBMB Life. 2018. № 5 (70). C. 355-383.

137. Krogerus K. [h gp.]. New lager yeast strains generated by interspecific hybridization // Journal of Industrial Microbiology and Biotechnology. 2015. № 5 (42). C. 769-778.

138. Krogerus K. [h gp.]. Ploidy influences the functional attributes of de novo lager yeast hybrids // Applied Microbiology and Biotechnology. 2016. № 16 (100). C. 72037222.

139. Krogerus K. [h gp.]. Novel brewing yeast hybrids: creation and application // Applied Microbiology and Biotechnology. 2017. № 1 (101). C. 65-78.

140. Kumaran R., Yang S.-Y., Leu J.-Y. Characterization of Chromosome Stability in Diploid, Polyploid and Hybrid Yeast Cells // PLoS ONE. 2013. № 7 (8). C. e68094.

141. LAEMMLI U. K. Cleavage of Structural Proteins during the Assembly of the Head of Bacteriophage T4 // Nature. 1970. № 5259 (227). C. 680-685.

142. Larkin J. C., Woolford J. L. Molecular cloning and analysis of the CRYI gene: a yeast ribosomal protein gene // Nucleic Acids Research. 1983. № 2 (11). C. 403-420.

143. Lee M. B. [h gp.]. Defining the impact of mutation accumulation on replicative lifespan in yeast using cancer-associated mutator phenotypes // Proceedings of the

National Academy of Sciences. 2019. № 8 (116). C. 3062-3071.

144. Lee M. C. S., Miller E. A. Molecular mechanisms of COPII vesicle formation // Seminars in Cell & Developmental Biology. 2007. № 4 (18). C. 424-434.

145. Léger-Silvestre I. [h gp.]. Specific Role for Yeast Homologs of the Diamond Blackfan Anemia-associated Rps19 Protein in Ribosome Synthesis // Journal of Biological Chemistry. 2005. № 46 (280). C. 38177-38185.

146. LEGRAS J. [h gp.]. Bread, beer and wine: Saccharomyces cerevisiae diversity reflects human history // Molecular Ecology. 2007. № 10 (16). C. 2091-2102.

147. Legras J.-L. [h gp.]. Adaptation of S. cerevisiae to Fermented Food Environments Reveals Remarkable Genome Plasticity and the Footprints of Domestication // Molecular Biology and Evolution. 2018. № 7 (35). C. 1712-1727.

148. Leskovac V., TriviÄ| S., PeriÄDin D. The three zinc-containing alcohol dehydrogenases from baker's yeast, Saccharomyces cerevisiae // FEMS Yeast Research. 2002. № 4 (2). C. 481-494.

149. Levin D. E. Cell Wall Integrity Signaling in Saccharomyces cerevisiae // Microbiology and Molecular Biology Reviews. 2005. № 2 (69). C. 262-291.

150. Libkind D. [h gp.]. Microbe domestication and the identification of the wild genetic stock of lager-brewing yeast // Proceedings of the National Academy of Sciences. 2011. № 35 (108). C. 14539-14544.

151. Lilly M., Lambrechts M. G., Pretorius I. S. Effect of Increased Yeast Alcohol Acetyltransferase Activity on Flavor Profiles of Wine and Distillates // Applied and Environmental Microbiology. 2000. № 2 (66). C. 744-753.

152. Lim C. R. [h gp.]. The Saccharomyces cerevisiae RuvB-like Protein, Tih2p, Is Required for Cell Cycle Progression and RNA Polymerase II-directed Transcription // Journal of Biological Chemistry. 2000. № 29 (275). C. 22409-22417.

153. Lin Y. Formulation and testing of cupric sulphate medium for wild yeast detection // Journal of the Institute of Brewing. 1981. № 3 (87). C. 151-154.

154. Liti G. [h gp.]. Population genomics of domestic and wild yeasts // Nature. 2009. № 7236 (458). C. 337-341.

155. Liu T. [h gp.]. Predominant yeasts in Chinese traditional sourdough and their

influence on aroma formation in Chinese steamed bread // Food Chemistry. 2018. (242). C. 404-411.

156. Lobov A. A. [h gp.]. Proteomic Profiling of the Human Fetal Multipotent Mesenchymal Stromal Cells Secretome // Molecules. 2020. № 22 (25). C. 5283.

157. Lott T. J., Boiron P., Reiss E. An electrophoretic karyotype for Candida albicans reveals large chromosomes in multiples // Molecular and General Genetics MGG. 1987. № 1 (209). C. 170-174.

158. Luparia V. [h gp.]. Assimilation of grape phytosterols by Saccharomyces cerevisiae and their impact on enological fermentations // Applied Microbiology and Biotechnology. 2004. № 1 (65).

159. Maga J. A., Pomeranz Y. Bread flavor // C R C Critical Reviews in Food Technology. 1974. № 1 (5). C. 55-142.

160. Magalhaes F. [h gp.]. Exploring the potential of Saccharomyces eubayanus as a parent for new interspecies hybrid strains in winemaking // FEMS Yeast Research. 2017. № 5 (17).

161. Mager W. H., Winderickx J. Yeast as a model for medical and medicinal research // Trends in Pharmacological Sciences. 2005. № 5 (26). C. 265-273.

162. Magliani W. [h gp.]. Yeast killer systems // Clinical Microbiology Reviews. 1997. № 3 (10). C. 369-400.

163. Magwene P. M. Revisiting Mortimer's Genome Renewal Hypothesis: Heterozygosity, Homothallism, and the Potential for Adaptation in Yeast 2014.C. 37-48.

164. Magwene P. M., Willis J. H., Kelly J. K. The Statistics of Bulk Segregant Analysis Using Next Generation Sequencing // PLoS Computational Biology. 2011. № 11 (7). C. e1002255.

165. Marbaix A. Y. [h gp.]. Extremely Conserved ATP- or ADP-dependent Enzymatic System for Nicotinamide Nucleotide Repair // Journal of Biological Chemistry. 2011. № 48 (286). C. 41246-41252.

166. Marinoni G. [h gp.]. Horizontal Transfer of Genetic Material among Saccharomyces Yeasts // Journal of Bacteriology. 1999. № 20 (181). C. 6488-6496.

167. Marsit S. [h gp.]. Evolutionary Advantage Conferred by an Eukaryote-to-

Eukaryote Gene Transfer Event in Wine Yeasts // Molecular Biology and Evolution. 2015. № 7 (32). C. 1695-1707.

168. Marsit S., Dequin S. Diversity and adaptive evolution of Saccharomyces wine yeast: a review // FEMS Yeast Research. 2015. № 7 (15). C. fov067.

169. Martorell P. [h gp.]. Physiological characterization of spoilage strains of Zygosaccharomyces bailii and Zygosaccharomyces rouxii isolated from high sugar environments // International Journal of Food Microbiology. 2007. № 2 (114). C. 234242.

170. Masneuf I. [h gp.]. New Hybrids between Saccharomyces Sensu Stricto Yeast Species Found among Wine and Cider Production Strains // Applied and Environmental Microbiology. 1998. № 10 (64). C. 3887-3892.

171. Masneuf-Pomarède I. [h gp.]. Hybrids Saccharomyces cerevisiae x Saccharomyces bayanus var. uvarum having a high liberating ability of some sulfur varietal aromas of Vitis vinifera Sauvignon blanc wines // OENO One. 2002. № 4 (36). C. 205.

172. McGovern P. E. [h gp.]. Fermented beverages of pre- and proto-historic China // Proceedings of the National Academy of Sciences. 2004. № 51 (101). C. 17593-17598.

173. Meilgaard M. C. Prediction of flavor differences between beers from their chemical composition // Journal of Agricultural and Food Chemistry. 1982. № 6 (30). C. 1009-1017.

174. Mertens S. [h gp.]. A Large Set of Newly Created Interspecific Saccharomyces Hybrids Increases Aromatic Diversity in Lager Beers // Applied and Environmental Microbiology. 2015. № 23 (81). C. 8202-8214.

175. Mertens S. [h gp.]. Reducing phenolic off-flavors through CRISPR-based gene editing of the FDC1 gene in Saccharomyces cerevisiae x Saccharomyces eubayanus hybrid lager beer yeasts // PLOS ONE. 2019. № 1 (14). C. e0209124.

176. Miller E. [h gp.]. Cargo selection into COPII vesicles is driven by the Sec24p subunit // The EMBO Journal. 2002. № 22 (21). C. 6105-6113.

177. Miller S. M., Magasanik B. Role of NAD-linked glutamate dehydrogenase in nitrogen metabolism in Saccharomyces cerevisiae // Journal of Bacteriology. 1990. № 9

(172). C. 4927-4935.

178. Miller-Fleming L., Giorgini F., Outeiro T. F. Yeast as a model for studying human neurodegenerative disorders // Biotechnology Journal. 2008. №2 3 (3). C. 325-338.

179. Mithieux S. M., Weiss A. S. Tandem integration of multiple ILV5 copies and elevated transcription in polyploid yeast // Yeast. 1995. № 4 (11). C. 311-316.

180. Miyashita K. [h gp.]. Cloning and analysis of the AWA1 gene of a nonfoaming mutant of a sake yeast // Journal of Bioscience and Bioengineering. 2004. № 1 (97). C. 14-18.

181. Mohammadi S. [h gp.]. Scope and limitations of yeast as a model organism for studying human tissue-specific pathways // BMC Systems Biology. 2015. №2 1 (9). C. 96.

182. Morales L., Dujon B. Evolutionary Role of Interspecies Hybridization and Genetic Exchanges in Yeasts // Microbiology and Molecular Biology Reviews. 2012. №

4 (76). C. 721-739.

183. Mortimer R. K. [h gp.]. Genome renewal: A new phenomenon revealed from a genetic study of 43 strains of Saccharomyces cerevisiae derived from natural fermentation of grape musts // Yeast. 1994. № 12 (10). C. 1543-1552.

184. Mortimer R. K. Evolution and Variation of the Yeast (Saccharomyces) Genome // Genome Research. 2000. № 4 (10). C. 403-409.

185. Munujos P. [h gp.]. Assay of Succinate Dehydrogenase Activity by a Colorimetric-Continuous Method Using Iodonitrotetrazolium Chloride as Electron Acceptor // Analytical Biochemistry. 1993. № 2 (212). C. 506-509.

186. Nasuti C., Solieri L. Yeast Bioflavoring in Beer: Complexity Decoded and Built up Again // Fermentation. 2024. № 4 (10). C. 183.

187. Natarajan K. [h gp.]. Transcriptional Profiling Shows that Gcn4p Is a Master Regulator of Gene Expression during Amino Acid Starvation in Yeast // Molecular and Cellular Biology. 2001. № 13 (21). C. 4347-4368.

188. Naumov G. I. [h gp.]. Three new species in the Saccharomyces sensu stricto complex: Saccharomyces cariocanus, Saccharomyces kudriavzevii and Saccharomyces mikatae. // International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology. 2000. №

5 (50). C. 1931-1942.

189. Navas M. A., Cerdan S., Gancedo J. M. Futile cycles in Saccharomyces cerevisiae strains expressing the gluconeogenic enzymes during growth on glucose. // Proceedings of the National Academy of Sciences. 1993. № 4 (90). C. 1290-1294.

190. Needleman R. Control of maltase synthesis in yeast // Molecular Microbiology. 1991. № 9 (5). C. 2079-2084.

191. Nespolo R. F. [и др.]. An Out-of-Patagonia migration explains the worldwide diversity and distribution of Saccharomyces eubayanus lineages // PLOS Genetics. 2020. № 5 (16). C. e1008777.

192. Nevoigt E., Stahl U. Reduced pyruvate decarboxylase and increased glycerol-3-phosphate dehydrogenase [NAD+] levels enhance glycerol production in Saccharomyces cerevisiae. // Yeast (Chichester, England). 1996. № 13 (12). C. 1331-7.

193. Novick P., Field C., Schekman R. Identification of 23 complementation groups required for post-translational events in the yeast secretory pathway // Cell. 1980. № 1 (21). C. 205-215.

194. Novo M. [и др.]. Eukaryote-to-eukaryote gene transfer events revealed by the genome sequence of the wine yeast Saccharomyces cerevisiae EC1118 // Proceedings of the National Academy of Sciences. 2009. № 38 (106). C. 16333-16338.

195. Nussbaum R. L., Caskey C. T. Purification and characterization of hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase from Saccharomyces cerevisiae // Biochemistry. 1981. № 16 (20). C. 4584-4590.

196. Omura F. [и др.]. Reduction of Hydrogen Sulfide Production in Brewing Yeast by Constitutive Expression of MET25 Gene // Journal of the American Society of Brewing Chemists. 1995. № 2 (53). C. 58-62.

197. Ono B., Ishino-Arao Y. Inheritance of chromosome length polymorphisms in Saccharomyces cerevisiae // Current Genetics. 1988. № 5 (14). C. 413-418.

198. Özcan S., Johnston M. Function and Regulation of Yeast Hexose Transporters // Microbiology and Molecular Biology Reviews. 1999. № 3 (63). C. 554-569.

199. Paget C. M., Schwartz J., Delneri D. Environmental systems biology of cold-tolerant phenotype in Saccharomyces species adapted to grow at different temperatures // Molecular Ecology. 2014. № 21 (23). C. 5241-5257.

200. Panttilä M. E. [и др.]. Expression of two Trichoderma reesei endoglucanases in the yeast Saccharomyces cerevisiae // Yeast. 1987. № 3 (3). C. 175-185.

201. Park H., Bakalinsky A. T. SSU1 mediates sulphite efflux in Saccharomyces cerevisiae. // Yeast (Chichester, England). 2000. № 10 (16). C. 881-8.

202. Pérez-Ortin J. E. [и др.]. Molecular Characterization of a Chromosomal Rearrangement Involved in the Adaptive Evolution of Yeast Strains // Genome Research. 2002. № 10 (12). C. 1533-1539.

203. Pérez-Través L. [и др.]. Evaluation of different genetic procedures for the generation of artificial hybrids in Saccharomyces genus for winemaking // International Journal of Food Microbiology. 2012. № 2 (156). C. 102-111.

204. Peris D. [и др.]. Population structure and reticulate evolution of Saccharomyces eubayanus and its lager-brewing hybrids // Molecular Ecology. 2014. № 8 (23). C. 20312045.

205. Peris D. [и др.]. Complex Ancestries of Lager-Brewing Hybrids Were Shaped by Standing Variation in the Wild Yeast Saccharomyces eubayanus // PLOS Genetics.

2016. № 7 (12). C. e1006155.

206. Peris D. [и др.]. Hybridization and adaptive evolution of diverse Saccharomyces species for cellulosic biofuel production // Biotechnology for Biofuels.

2017. № 1 (10). C. 78.

207. Peter J. [и др.]. Genome evolution across 1,011 Saccharomyces cerevisiae isolates // Nature. 2018. № 7701 (556). C. 339-344.

208. Peth A., Nathan J. A., Goldberg A. L. The ATP Costs and Time Required to Degrade Ubiquitinated Proteins by the 26 S Proteasome // Journal of Biological Chemistry. 2013. № 40 (288). C. 29215-29222.

209. Pittet M., Conzelmann A. Biosynthesis and function of GPI proteins in the yeast Saccharomyces cerevisiae // Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Molecular and Cell Biology of Lipids. 2007. № 3 (1771). C. 405-420.

210. Postma E. [и др.]. Enzymic analysis of the crabtree effect in glucose-limited chemostat cultures of Saccharomyces cerevisiae // Applied and Environmental Microbiology. 1989. № 2 (55). C. 468-477.

211. Procopio S., Qian F., Becker T. Function and regulation of yeast genes involved in higher alcohol and ester metabolism during beverage fermentation // European Food Research and Technology. 2011. № 5 (233). C. 721-729.

212. Pronk J. T., Yde Steensma H., Dijken J. P. Van Pyruvate metabolism in Saccharomyces cerevisiae. // Yeast (Chichester, England). 1996. № 16 (12). C. 1607-33.

213. Purlis E., Salvadori V. O. A moving boundary problem in a food material undergoing volume change - Simulation of bread baking // Food Research International. 2010. № 4 (43). C. 949-958.

214. Rachidi N., Barre P., Blondin B. Multiple Ty-mediated chromosomal translocations lead to karyotype changes in a wine strain of Saccharomyces cerevisiae // Molecular and General Genetics MGG. 1999. № 4-5 (261). C. 841-850.

215. Rautio J., Londesborough J. Maltose Transport by Brewer's Yeasts in Brewer's Wort // Journal of the Institute of Brewing. 2003. № 3 (109). C. 251-261.

216. Remize F. [и др.]. Glycerol Overproduction by Engineered Saccharomyces cerevisiae Wine Yeast Strains Leads to Substantial Changes in By-Product Formation and to a Stimulation of Fermentation Rate in Stationary Phase // Applied and Environmental Microbiology. 1999. № 1 (65). C. 143-149.

217. Remize F., Andrieu E., Dequin S. Engineering of the Pyruvate Dehydrogenase Bypass in Saccharomyces cerevisiae : Role of the Cytosolic Mg 2+ and Mitochondrial K + Acetaldehyde Dehydrogenases Ald6p and Ald4p in Acetate Formation during Alcoholic Fermentation // Applied and Environmental Microbiology. 2000. № 8 (66). C. 31513159.

218. Replansky T. [и др.]. Saccharomyces sensu stricto as a model system for evolution and ecology // Trends in Ecology & Evolution. 2008. № 9 (23). C. 494-501.

219. Ribas J. C., Wickner R. B. The Gag Domain of the Gag-Pol Fusion Protein Directs Incorporation into the L-A Double-stranded RNA Viral Particles in Saccharomyces cerevisiae // Journal of Biological Chemistry. 1998. № 15 (273). C. 9306-9311.

220. Richard Preiss European Farmhouse Brewing Yeasts Form a Distinct Genetic Group // bioRxiv. 2024.

221. Riou C. [h gp.]. Purification, Characterization, and Substrate Specificity of a Novel Highly Glucose-Tolerant P-Glucosidase from Aspergillus oryzae // Applied and Environmental Microbiology. 1998. № 10 (64). C. 3607-3614.

222. Rozp^dowska E. [h gp.]. Parallel evolution of the make-accumulate-consume strategy in Saccharomyces and Dekkera yeasts // Nature Communications. 2011. № 1 (2). C. 302.

223. Ruderfer D. M. [h gp.]. Population genomic analysis of outcrossing and recombination in yeast // Nature Genetics. 2006. № 9 (38). C. 1077-1081.

224. Russell I., Hancock I. F., Stewart G. G. Construction of Dextrin Fermentative Yeast Strains That Do Not Produce Phenolic Off-Flavors in Beer // Journal of the American Society of Brewing Chemists. 1983. № 2 (41). C. 45-51.

225. Saha B. C., Bothast R. J. Production, purification, and characterization of a highly glucose-tolerant novel beta-glucosidase from Candida peltata // Applied and Environmental Microbiology. 1996. № 9 (62). C. 3165-3170.

226. Sahlstrom S., Park W., Shelton D. R. Factors Influencing Yeast Fermentation and the Effect of LMW Sugars and Yeast Fermentation on Hearth Bread Quality // Cereal Chemistry. 2004. № 3 (81). C. 328-335.

227. Saison D. [h gp.]. Decrease of Aged Beer Aroma by the Reducing Activity of Brewing Yeast // Journal of Agricultural and Food Chemistry. 2010. № 5 (58). C. 31073115.

228. Salazar A. N. [h gp.]. Chromosome level assembly and comparative genome analysis confirm lager-brewing yeasts originated from a single hybridization // BMC Genomics. 2019. № 1 (20). C. 916.

229. Sambuk E. V. [h gp.]. Saccharomyces cerevisiae killer toxins: synthesis, mechanisms of action and practical use // Ecological genetics. 2019. № 3 (17). C. 59-73.

230. Sampaio J. P., Gonfalves P. Natural Populations of Saccharomyces kudriavzevii in Portugal Are Associated with Oak Bark and Are Sympatric with S. cerevisiae and S. paradoxus // Applied and Environmental Microbiology. 2008. № 7 (74). C. 2144-2152.

231. Samuel D. Investigation of Ancient Egyptian Baking and Brewing Methods by

Correlative Microscopy // Science. 1996. № 5274 (273). C. 488-490.

232. Sanchez R. G., Solodovnikova N., Wendland J. Breeding of lager yeast with Saccharomyces cerevisiae improves stress resistance and fermentation performance // Yeast. 2012. № 8 (29). C. 343-355.

233. Sandberg A. -S., svanberg U. Phytate Hydrolysis by Phytase in Cereals; Effects on In Vitro Estimation of Iron Availability // Journal of Food Science. 1991. № 5 (56). C. 1330-1333.

234. Sander J. D., Joung J. K. CRISPR-Cas systems for editing, regulating and targeting genomes // Nature Biotechnology. 2014. № 4 (32). C. 347-355.

235. Sasaki T. [и др.]. Breeding of a Brewer's Yeast Possessing Anticontaminant Properties // Journal of the American Society of Brewing Chemists. 1984. № 4 (42). C. 164-166.

236. Schaaff I., Heinisch J., Zimmermann F. K. Overproduction of glycolytic enzymes in yeast // Yeast. 1989. № 4 (5). C. 285-290.

237. Schmitt M. J., Breinig F. The viral killer system in yeast: from molecular biology to application // FEMS Microbiology Reviews. 2002. № 3 (26). C. 257-276.

238. Schwartz D. C., Cantor C. R. Separation of yeast chromosome-sized DNAs by pulsed field gradient gel electrophoresis // Cell. 1984. № 1 (37). C. 67-75.

239. Selmecki A. M. [и др.]. Polyploidy can drive rapid adaptation in yeast // Nature. 2015. № 7543 (519). C. 349-352.

240. Seung-lim R., Yoshikatsu M., Yoshinobu K. Genomic Reorganization Between Two Sibling Yeast Species, Saccharomyces bayanus and Saccharomyces cerevisiae // Yeast. 1996.

241. Sharp D. C., Steensels J., Shellhammer T. H. The effect of hopping regime, cultivar and ß -glucosidase activity on monoterpene alcohol concentrations in wort and beer // Journal of the Institute of Brewing. 2017. № 2 (123). C. 185-191.

242. Sherman F. Getting started with yeast 2002.C. 3-41.

243. Shibasaki S., Ueda M. Progress of Molecular Display Technology Using Saccharomyces cerevisiae to Achieve Sustainable Development Goals // Microorganisms. 2023. № 1 (11). C. 125.

244. Shnyreva M. G. [h gp.]. Biochemical properties and excretion behavior of repressible acid phosphatases with altered subunit composition // Microbiological Research. 1996. № 3 (151). C. 291-300.

245. Sicard D., Legras J.-L. Bread, beer and wine: Yeast domestication in the Saccharomyces sensu stricto complex // Comptes Rendus Biologies. 2011. № 3 (334). C. 229-236.

246. Smith D. J. [h gp.]. PMI40 , an Intron-Containing Gene Required for Early Steps in Yeast Mannosylation // Molecular and Cellular Biology. 1992. № 7 (12). C. 2924-2930.

247. Somers J. M., Bevan E. A. The inheritance of the killer character in yeast // Genetical Research. 1969. № 1 (13). C. 71-83.

248. Sone H. [h gp.]. Nucleotide sequence and expression of the Enterobacter aerogenes alpha-acetolactate decarboxylase gene in brewer's yeast // Applied and Environmental Microbiology. 1988. № 1 (54). C. 38-42.

249. Sor F., Fukuhara H. Analysis of chromosomal DNA patterns of the genus Kluyveromyces // Yeast. 1989. № 1 (5). C. 1-10.

250. Soukaina Timouma Development of a genome scale metabolic model for the lager hybrid yeast S. pastorianus to understand evolution of metabolic pathways in industrial settings // bioRxiv. 2023.

251. Steensels J. [h gp.]. Improving industrial yeast strains: exploiting natural and artificial diversity // FEMS Microbiology Reviews. 2014. № 5 (38). C. 947-995.

252. Steensels J. [h gp.]. Brettanomyces yeasts — From spoilage organisms to valuable contributors to industrial fermentations // International Journal of Food Microbiology. 2015. (206). C. 24-38.

253. Steensels J. [h gp.]. Domestication of Industrial Microbes // Current Biology. 2019. № 10 (29). C. R381-R393.

254. Stefanuto P.-H. [h gp.]. Advanced method optimization for volatile aroma profiling of beer using two-dimensional gas chromatography time-of-flight mass spectrometry // Journal of Chromatography A. 2017. (1507). C. 45-52.

255. Steffan J. S., McAlister-Henn L. Isolation and characterization of the yeast gene

encoding the MDH3 isozyme of malate dehydrogenase. // Journal of Biological Chemistry. 1992. № 34 (267). C. 24708-24715.

256. Stepchenkova E. I. [h gp.]. Practical Approaches for the Yeast Saccharomyces cerevisiae Genome Modification // International Journal of Molecular Sciences. 2023. № 15 (24). C. 11960.

257. Steyn A. J. C., Pretorius I. S. Co-expression of a Saccharomyces diastaticus glucoamylase-encoding gene and a Bacillus amyloliquefaciens a-amylase-encoding gene in Saccharomyces cerevisiae // Gene. 1991. (100). C. 85-93.

258. Stratford M. Yeast flocculation: Reconciliation of physiological and genetic viewpoints // Yeast. 1992. № 1 (8). C. 25-38.

259. Suarez-Lepe J. A., Morata A. New trends in yeast selection for winemaking // Trends in Food Science & Technology. 2012. № 1 (23). C. 39-50.

260. Suihko M.-L. [h gp.]. Construction and analysis of recombinant glucanolytic brewer's yeast strains // Applied Microbiology and Biotechnology. 1991. № 6 (35).

261. SWIEGERS J. H. [h gp.]. Yeast and bacterial modulation of wine aroma and flavour // Australian Journal of Grape and Wine Research. 2005. № 2 (11). C. 139-173.

262. Szkopinska A. [h gp.]. Polyprenol formation in the yeast Saccharomyces cerevisiae: effect of farnesyl diphosphate synthase overexpression // Journal of Lipid Research. 1997. № 5 (38). C. 962-968.

263. Takahashi K., Inuzuka M., Ingi T. Cellular signaling mediated by calphoglin-induced activation of IPP and PGM // Biochemical and Biophysical Research Communications. 2004. № 1 (325). C. 203-214.

264. Tanghe A. [h gp.]. Aquaporin Expression Correlates with Freeze Tolerance in Baker's Yeast, and Overexpression Improves Freeze Tolerance in Industrial Strains // Applied and Environmental Microbiology. 2002. № 12 (68). C. 5981-5989.

265. Tataridis P. [h gp.]. Use of non-saccharomyces Torulaspora delbrueckii yeast strains in winemaking and brewing // Zbornik Matice srpske za prirodne nauke. 2013. № 124. C. 415-426.

266. Taylor G. T., Marsh A. S. Mygp + copper, a medium that detects both Saccharomyces and non-Saccharomyces wild yeast in the presence of culture yeast //

Journal of the Institute of Brewing. 1984. № 3 (90). C. 134-145.

267. Tesnière C. [h gp.]. Impact of Nutrient Imbalance on Wine Alcoholic Fermentations: Nitrogen Excess Enhances Yeast Cell Death in Lipid-Limited Must // PLoS ONE. 2013. № 4 (8). C. e61645.

268. Teste M.-A., François J. M., Parrou J.-L. Characterization of a New Multigene Family Encoding Isomaltases in the Yeast Saccharomyces cerevisiae, the IMA Family // Journal of Biological Chemistry. 2010. № 35 (285). C. 26815-26824.

269. Tezuka H. [h gp.]. Cloning of a Gene Suppressing Hydrogen Sulfide Production by Saccharomyces Cerevisiae and its Expression in a Brewing Yeast // Journal of the American Society of Brewing Chemists. 1992. № 4 (50). C. 130-133.

270. Thomson J. M. [h gp.]. Resurrecting ancestral alcohol dehydrogenases from yeast // Nature Genetics. 2005. № 6 (37). C. 630-635.

271. Thurston P. A., Quain D. E., Tubb R. S. Lipid metabolism and the regulation of volatile ester synthesis in Saccharomyces cerevisiae // Journal of the Institute of Brewing. 1982. № 2 (88). C. 90-94.

272. Tipper D. J., Bostian K. A. Double-stranded ribonucleic acid killer systems in yeasts // Microbiological Reviews. 1984. № 2 (48). C. 125-156.

273. Tkach J. M. [h gp.]. Dissecting DNA damage response pathways by analysing protein localization and abundance changes during DNA replication stress // Nature Cell Biology. 2012. № 9 (14). C. 966-976.

274. Tubb R. S. [h gp.]. Development of new techniques for the genetic manipulation of brewing yeasts Elsevier, 1981.C. 75-79.

275. Turker M. Yeast Biotechnology: Diversity and Applications // 27th VH Yeast Conference, Advances in Science and Industrial Productionss of Baker's Yeast, Istanbul. 2014.

276. Urano N. [h gp.]. Conversion of a non-flocculent brewer's yeast to flocculent ones by electrofusion // Journal of Biotechnology. 1993. № 2-3 (28). C. 249-261.

277. Vakeria D. [h gp.]. Characterisation of amylolytic brewing yeast // Journal of the Institute of Brewing. 1996. № 1 (102). C. 27-32.

278. Vanbeneden N. [h gp.]. Formation of 4-vinyl and 4-ethyl derivatives from

hydroxycinnamic acids: Occurrence of volatile phenolic flavour compounds in beer and distribution of Padl-activity among brewing yeasts // Food Chemistry. 2008. № 1 (107). C. 221-230.

279. Verheyen C. [h gp.]. The contribution of glutathione to the destabilizing effect of yeast on wheat dough // Food Chemistry. 2015. (173). C. 243-249.

280. Verheyen C., Jekle M., Becker T. Effects of Saccharomyces cerevisiae on the structural kinetics of wheat dough during fermentation // LWT - Food Science and Technology. 2014. № 1 (58). C. 194-202.

281. Verschoor A. [h gp.]. Three-dimensional structure of the yeast ribosome // Nucleic Acids Research. 1998. № 2 (26). C. 655-661.

282. Verstrepen K. J. [h gp.]. Yeast flocculation: what brewers should know // Applied Microbiology and Biotechnology. 2003. № 3 (61). C. 197-205.

283. Vezinhet F., Blondin B., Hallet J.-N. Chromosomal DNA patterns and mitochondrial DNA polymorphism as tools for identification of enological strains of Saccharomyces cerevisiae // Applied Microbiology and Biotechnology. 1990. № 5 (32).

284. Vidgren V., Londesborough J. 125th Anniversary Review: Yeast Flocculation and Sedimentation in Brewing // Journal of the Institute of Brewing. 2011. № 4 (117). C. 475-487.

285. Vidgren V., Londesborough J. Characterization of the Saccharomyces bayanus-type AGT1 transporter of lager yeast // Journal of the Institute of Brewing. 2012. № 2 (118). C. 148-151.

286. Vidgren V., Ruohonen L., Londesborough J. Characterization and Functional Analysis of the MAL and MPH Loci for Maltose Utilization in Some Ale and Lager Yeast Strains // Applied and Environmental Microbiology. 2005. № 12 (71). C. 7846-7857.

287. Vigentini I. [h gp.]. CRISPR/Cas9 System as a Valuable Genome Editing Tool for Wine Yeasts with Application to Decrease Urea Production // Frontiers in Microbiology. 2017. (8).

288. Vincent S. F. [h gp.]. Comparison of melibiose utilizing baker's yeast strains produced by genetic engineering and classical breeding // Letters in Applied Microbiology. 1999. № 2 (28). C. 148-152.

289. Vodkin M., Katterman F., Fink G. R. Yeast Killer Mutants with Altered Double-Stranded Ribonucleic Acid // Journal of Bacteriology. 1974. № 2 (117). C. 681— 686.

290. Voordeckers K., Verstrepen K. J. Experimental evolution of the model eukaryote Saccharomyces cerevisiae yields insight into the molecular mechanisms underlying adaptation // Current Opinion in Microbiology. 2015. (28). C. 1-9.

291. Walker G. M. Pichia anomala: cell physiology and biotechnology relative to other yeasts // Antonie van Leeuwenhoek. 2011. № 1 (99). C. 25-34.

292. Walkey C. J. [и др.]. The Saccharomyces cerevisiae fermentation stress response protein Igd1p/Yfr017p regulates glycogen levels by inhibiting the glycogen debranching enzyme // FEMS Yeast Research. 2011. № 6 (11). C. 499-508.

293. Walther A., Hesselbart A., Wendland J. Genome Sequence of Saccharomyces carlsbergensis, the World's First Pure Culture Lager Yeast // G3 Genes|Genomes|Genetics. 2014. № 5 (4). C. 783-793.

294. Wang D. [и др.]. Genetic modification of industrial yeast strains to obtain controllable NewFlo flocculation property and lower diacetyl production // Biotechnology Letters. 2008. № 11 (30). C. 2013-2018.

295. Warner J. R. The economics of ribosome biosynthesis in yeast // Trends in Biochemical Sciences. 1999. № 11 (24). C. 437-440.

296. Warren M. J., Scott A. I. Tetrapyrrole assembly and modification into the ligands of biologically functional cofactors // Trends in Biochemical Sciences. 1990. № 12 (15). C. 486-491.

297. Warringer J., Liti G., Blomberg A. Yeast Reciprocal Hemizygosity to Confirm the Causality of a Quantitative Trait Loci-Associated Gene // Cold Spring Harbor Protocols. 2017. № 8 (2017). C. pdb.prot089078.

298. Watari J. [и др.]. Construction of flocculent brewer's yeast by chromosomal integration of the yeast flocculation gene flol // Journal of the Institute of Brewing. 1994. № 2 (100). C. 73-77.

299. Wenger J. W., Schwartz K., Sherlock G. Bulk Segregant Analysis by High-Throughput Sequencing Reveals a Novel Xylose Utilization Gene from Saccharomyces

cerevisiae // PLoS Genetics. 2010. № 5 (6). C. e1000942.

300. Whiting G. C. Organic acid metabolism of yeasts during fermentation of alcoholic beverages-a review // Journal of the Institute of Brewing. 1976. № 2 (82). C. 84-92.

301. Will J. L. [h gp.]. Incipient Balancing Selection through Adaptive Loss of Aquaporins in Natural Saccharomyces cerevisiae Populations // PLoS Genetics. 2010. № 4 (6). C. e1000893.

302. Wolfe K. H., Shields D. C. Molecular evidence for an ancient duplication of the entire yeast genome // Nature. 1997. № 6634 (387). C. 708-713.

303. Xu T., Forgac M. Subunit D (Vma8p) of the Yeast Vacuolar H+-ATPase Plays a Role in Coupling of Proton Transport and ATP Hydrolysis // Journal of Biological Chemistry. 2000. № 29 (275). C. 22075-22081.

304. Yamano S. [h gp.]. Brewing performance of a brewer's yeast having a-acetolactate decarboxylase from Acetobacter aceti subsp. xylinum // Journal of Biotechnology. 1995. № 1 (39). C. 21-26.

305. YeastMine SGD data base // https://www.yeastgenome.org.

306. Young E. T. [h gp.]. Multiple Pathways Are Co-regulated by the Protein Kinase Snf1 and the Transcription Factors Adrl and Cat8 // Journal of Biological Chemistry. 2003. № 28 (278). C. 26146-26158.

307. Yuan D. S. Zinc-Regulated Genes in Saccharomyces cerevisiae Revealed by Transposon Tagging // Genetics. 2000. № 1 (156). C. 45-58.

308. Yuan G.-C. [h gp.]. Genome-Scale Identification of Nucleosome Positions in S. cerevisiae // Science. 2005. № 5734 (309). C. 626-630.

309. Zhao H., Eide D. The Gene Encodes the Low Affinity Zinc Transporter in // Journal of Biological Chemistry. 1996. № 38 (271). C. 23203-23210.

310. Zhou N. [h gp.]. Kazachstania gamospora and Wickerhamomyces subpelliculosus: Two alternative baker's yeasts in the modern bakery // International Journal of Food Microbiology. 2017. (250). C. 45-58.

311. Zimmer A. [h gp.]. QTL Dissection of Lag Phase in Wine Fermentation Reveals a New Translocation Responsible for Saccharomyces cerevisiae Adaptation to

Sulfite // PLoS ONE. 2014. № 1 (9). C. e86298.

312. Analytica EBC. Fermentable Carbohydrates in Beer by HPLC. Brussels Method 9.27/ URL: https://brewup.eu/ebc-analytica/beer/real-degree-of-fermentation-of-beer/9.27 // Belgium: European Brewery Convention.

313. Analytica EBC method 9.5. Real degree of fermentation of beer // Brussels, Belgium: European Brewery Convention // URL: https://brewup.eu/ebc-analytica/beer/real-degree-of-fermentation-of-beer/9.5. 2010.

314. Analytica EBC method 9.24. Vicinal Diketones in Beer: Gas Chromatographic URL: https://brewup.eu/ebc-analytica/beer/real-degree-of-fermentation-of-beer/9.24 // Brussels, Belgium: European Brewery Convention. 2010.

315. Analytica EBC method 9.39. Dimethyl Sulfate in Beer: Gas Chromatographic URL: https://brewup.eu/ebc-analytica/beer/real-degree-of-fermentation-of-beer/9.39 // Brussels, Belgium: European Brewery Convention. 2010.

316. Давыденко, С. Г. Применение методов окраски дрожжей для оценки их физиологического состояния. / С. Г. Давыденко, Л. М. Васильева, Б. Э. Баташов [и др.] //Пиво и напитки - 2011. - №. 5. - С. 8-11. .

317. Национальный Биоресурсный Центр, Всероссийская коллекция промышленных микроорганизмов НИЦ «Курчатовский институт» // Текст : электронный - URL: https://vkpm.genetika.ru.

318. Biomerieux. Официальный сайт компании Biomerieux // URL: https://biomerieuxdirect.com/industry/Bacteriology/ID-AST-Manual/ID-AST-API/ID-Manual/Api-galleries-Yeasts/API%26reg-20-C-AUX-%2825-STRIPS%2B25MEDIA%29/p/20210.

319. Saccharomyces Genome Database (SGD) URL: https://www.yeastgenome.org/blast-sgd.

320. ГОСТ Р 54731-2011. Дрожжи хлебопекарные прессованные. Технические условия = Pressed bakery yeast. Specifications: национальный стандарт Российской Федерации: издание официальное: утвержден и введен в действие Приказом Федерального агентства по техническому регулированию и метрологии от 13 декабря 2011 г. №900-ст : введен впервые : дата введения 2013-01-01 / разработан

ГНУ ВНИИПБТ Россельхозакадемии. - Москва: Стандартинформ, 2013. - III, 11.

321. ГОСТ 210094 -75. Хлеб и хлебобулочные изделия. Метод определения влажности = Bread and bakery products. Method for the determination of moisture : межгосударственный стандарт: издание официальное: утвержден и введен в действие Постановлением Государственного комитета стандартов Совета Министров СССР от 19.08.75 №2175 : взамен ОСТ ВКС 5540 в части п. III: дата введения 1976-07-01 / разработан Министерством пищевой промышленности СССР. - Москва: Стандартинформ, 2006. - I, 3 с.

322. ГОСТ 5670-96. Хлебобулочные изделия. Методы определения кислотности = Bread, rolls and buns. Methods for determination of acidity: межгосударственный стандарт: издание официальное: утвержден и введен в действие Постановлением Комета российской Федерации по стандартизации, метрологии и сертификации от 10.09.96 №569 : взамен ГОСТ 5670-51, ГОСТ 712891 (в части 3.7) переиздание Август 2006 : дата введения 1997-08-01 // разработан Государственным научно-исследовательским институтом хлебопекарной промышленности - Москва: Стандартинформ, 2006. - I, 3 с.

323. ГОСТ 5669-96. Хлебобулочные изделия. Методы определения пористости = Bakey products Bread, rolls and buns. Methods for determination of porosity: межгосударственный стандарт: издание официальное: утвержден и введен в действие Постановлением Комета российской Федерации по стандартизации метрологии и сертификации от 1996-11-05 №608 : взамен ГОСТ 5669-51 переиздание Июнь 2001: дата введения 1997-08-01 // разработан Государственным научно-исследовательским институтом хлебопекарной промышленности - Москва: Стандартинформ, 2006. - I, 3 с.

324. ГОСТ 5667-65. Хлеб и хлебобулочные изделия. Правила приемки, методы отбора образцов, методы определения органолептических показателей и массы изделий = Bread and bakery products. Rules of acceptance, methods of sampling, methods for determination of organoleptic characteristics and mass: государственный стандарт Союза ССР: издание официальное: утвержден и введен в действие Государственным Комитетом стандартов, мер и измерительных приборов СССР

28.05.65 : взамен ГОСТ 5669-51 // дата введения 1997-08-01 разработан ГосНИИХП. - Москва : Стандартинформ, 2006. - I, 4 с.

325. Давыденко, С. Г. Создание и применение нового экспресс-метода оценки качества семенных дрожжей / С. Г. Давыденко // Пиво и напитки. - 2012. - №. 5. -С. 20-23.

326. Давыденко, С. Г. Разработка нового экспресс-метода оценки физиологического влияния пива / С. Г. Давыденко, А. Т. Дедегкаев, Т. В. Меледина //Пиво и напитки. - 2014. - №. 6- С. 26-30.

327. Давыденко, С. Г. Новый экспресс-метод оценки физиологического влияния слабоалкогольных и безалкогольных напитков Меледина / С. Г. Давыденко, А. Т. Дедегкаев, Т. В. Меледина //Пиво и напитки - 2014. - №. 5. -С. 58-61. .

328. Меледина, А. Т. Дедегкаев, Д. В. Афонин Качество пива: стабильность вкуса аромата, коллоидная стойкость, дегустация СПб.: ИД «Профессия», 2011. -220 с. .

329. Давыденко, С.Г. Методологический подход к разработке нового сорта пива с использованием модели "дома качества". Проектирование процесса / С. Г. Давыденко, А. Т. Дедегкаев, Т. В. Меледина [и др.] //Пиво и напитки - 2012. - №.5. - С. 6-9.

330. Белявская, И. Г. Пищевая ценность хлебобулочных изделий из полбяной муки, обогащённых витаминами, железом и кальцием / И. Г. Белявская, О. А. Вржесинская, В. М. Коденцова [и др.] //Хлебопродукты. - 2020. - №. 2. - С. 5457. .

331. Меледина, Т. В. Использование нового штамма дрожжей в хлебопечении / Т. В. Меледина, С. Г. Давыденко, О. В. Головинская [и др.] // Техника и технология пищевых производств. - 2018. - Т. 48. - №. 4. - С. 59-65.

332. Давыденко С.Г. Мутанты с повышенной убивающей активностью как модель для создания штаммов дрожжей Saccharomyces cerevisiae - продуцентов днРНК: дис. канд. биол. наук: 03.00.15/Давыденко Светлана Геннадьевна. - М., 1996 - 131 с. .

333. Davydenko, S. Genetic control and physiological characteristics of ski mutants of killer K2 Saccharomyces cerivisiae strains / S. Davydenko, G. Nesterova, A. Stolova [et al.] //Genetika. - 1992. - Т. 28. - №. 2. - С. 72-88.

334. Nesterova, G. F. Mutants of Saccharomyces cerevisiae K-2 with increased killer activty / G. F. Nesterova, L. V. Semykina, E. V. Kalashnikova [et al.] //Genetika. -1981. - Т. 17. - №. 11. - С. 1957-1966.

335. Нестерова, Г. Ф. Фундаментальные и прикладные аспекты изучения вирусоподобных плазмид дрожжей сахаромицетов / Г. Ф. Нестерова // Генетика. -1993. - Т. 29. - №. 4. - С. 581-603.

336. Nesterova, G. F. Dominant nonsense suppressors, which inhibit the killer activity in yeast Saccharomyces cerevisiae / G. F. Nesterova, A. M. Zekhnov, S. G. Inge-Vechtomov //Genetika. - 1975. - Т. 11 - №.8. - С.96-103.

337. Нарцисс, Л. Краткий курс пивоварения/ при участии Бака В.; перевод с нем. А. А. Куреленкова. - СПб.: Профессия, 2007. - 640 с.

338. Меледина, Т. В. Применение цветов кудзу для снижения токсичности пива / Т. В. Меледина, С. Г. Давыденко, К. И Аравина [и др.] // Вестник Воронежского государственного университета инженерных технологий. - 2019. -Т. 81. - №. 2 (80). .

339 Приложения

Таблица А1 - Штаммы, использованные в работе

Штамм Генотип Вид Коллекция

W34/70 прототроф S. cerevisiae Hefebank Weihenstephan

Т-П-8а прототроф S. cerevisiae ВКПМ

ВКПМ 268 прототроф S. cerevisiae var vini ВКПМ

NCYC74 прототроф S. carlsbergensis ВКПМ

VKPM 2478 прототроф S. paradoxus ВКПМ

Y-57 прототроф S. cerevisiae (inusitatus) ВКПМ

Y-443 прототроф S. cerevisiae (carlsbergensis) ВКПМ

Y-518 прототроф S. cerevisiae (carlsbergensis) ВКПМ

Y-730 прототроф S. cerevisiae (carlsbergensis) ВКПМ

Y-1173 прототроф S. cerevisiae (carlsbergensis) ВКПМ

Y-1213 прототроф S. cerevisiae (diastaticus) ВКПМ

Y-28 прототроф S. cerevisiae (carlsbergensis) ВКПМ

Y-29 прототроф S. cerevisiae (carlsbergensis) ВКПМ

Y-198 прототроф S. cerevisiae (carlsbergensis) ВКПМ

Y-243 прототроф S. cerevisiae (carlsbergensis) ВКПМ

Y-300 прототроф S. cerevisiae (carlsbergensis) ВКПМ

Y-334 прототроф S. cerevisiae (carlsbergensis) ВКПМ

Y-1172 прототроф S. cerevisiae ВКПМ

Y-1240 прототроф S. cerevisiae ВКПМ

Y-1241 прототроф S. cerevisiae ВКПМ

Y-2945 прототроф S. cerevisiae ВКПМ

B1 прототроф, POF+ S. cerevisiae ПИЯФ

B2 прототроф, POF+ S. cerevisiae ПИЯФ

B3 прототроф, POF+ S. cerevisiae ПИЯФ

B4 прототроф, POF+ S. cerevisiae ПИЯФ

B5 прототроф, POF+ S. cerevisiae ПИЯФ

B6 прототроф, POF+ S. cerevisiae ПИЯФ

B7 прототроф, POF- S. cerevisiae ПИЯФ

B10 прототроф, POF+ S. cerevisiae ПИЯФ

B15 прототроф, POF+ S. cerevisiae ПИЯФ

B16 прототроф, POF+ S. cerevisiae ПИЯФ

B20 прототроф, POF+ S. cerevisiae ПИЯФ

B30 прототроф, POF+ S. cerevisiae ПИЯФ