Комплексный подход к оценке микробиоценоза кишечника тема диссертации и автореферата по ВАК РФ 03.02.03, кандидат наук Щеглов, Владимир Сергеевич

• Щеглов, Владимир Сергеевич
• кандидат наук
• 2013

Оглавление диссертации кандидат наук Щеглов, Владимир Сергеевич

ОГЛАВЛЕНИЕ

ВВЕДЕНИЕ

ГЛАВА 1 ДИСБИОЗЫ И КИШЕЧНЫЕ ИНФЕКЦИИ

1.1 Роль кишечных инфекций в развитии дисбиоза

1.2 Роль условно-патогенных микроорганизмов в развитии и поддержании дисбиоза кишечника. Условно-патогенные микроорганизмы как этиологический фактор острых кишечных инфекций

1.3 Диагностика острых кишечных инфекций в РФ

1.4 Проблемы коррекции дисбиотических состояний. Пробиотикотерапия и антибиотикорезистентность

ГЛАВА 2 МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ

2.1 Объем исследований

2.2 Питательные среды

2.3 Методы микробиологических исследований

2.4 Статистическая обработка результатов

ГЛАВА 3 ВЫЯВЛЕНИЕ ВОЗБУДИТЕЛЕЙ КИШЕЧНЫХ ИНФЕКЦИЙ У ЛИЦ, ОБСЛЕДУЕМЫХ ПО ПОВОДУ ДИСБИОЗА КИШЕЧНИКА

3.1 Выявление возбудителей кишечных инфекций бактериальной этиологии у лиц, обследуемых по поводу дисбиоза кишечника

3.1.1 Выделение диареегенных эшерихий в ходе бактериологического исследования на дисбиоз кишечника

3.1.2 Выделение иерсиний в ходе бактериологического исследования на дисбиоз кишечника

3.1.3 Выделение сальмонелл в ходе бактериологического исследования на дисбиоз кишечника

3.2 Изменения микробиоценоза кишечника при ротавирусной инфекции

3.3 Расширенное исследование на дисбиоз кишечника и кишечные инфекции

3.4 Выявление токсина Clostridium difficile у пациентов, обследуемых по поводу дисбиоза кишечника

ГЛАВА 4 АНТИБИОТИКОРЕЗИСТЕНТНОСТЬ УСЛОВНО-ПАТОГЕННЫХ И ПАТОГЕННЫХ ЭНТЕРОБАКТЕРИЙ, ВЫДЕЛЯЕМЫХ ПРИ ИССЛЕДОВАНИИ НА ДИСБИОЗ КИШЕЧНИКА

4.1 Антибиотикорезистентность условно-патогенных энтеробактерий, выделенных при исследовании на дисбиоз кишечика. Фенотипическое выявление ферментов антибиотикорезистентности

4.2 Антибиотикорезистентность патогенных энтеробактерий

4.3 Сравнительная оценка антибиотикорезистентности условно-патогенных и патогенных микроорганизмов, выделенных от одного пациента при исследовании на дисбиоз кишечника

ГЛАВА 5 АНТИБИОТИКОРЕЗИСТЕНТНОСТЬ ПРЕДСТАВИТЕЛЕЙ МИКРОБИОЦЕНОЗА КИШЕЧНИКА И МИКРООРГАНИЗМОВ, ВЫДЕЛЕННЫХ ИЗ ПРОБИОТИЧЕСКИХ ПРЕПАРАТОВ

5.1 Антибиотикорезистентность лактобактерий, выделенных от людей и лакто- и бифидобактерий, используемых при производстве пробиотических препаратов

5.2 Антибиотикорезистентность энтерококков, выделенных от людей, и штаммов энтерококков, используемых при производстве пробиотических препаратов

ЗАКЛЮЧЕНИЕ

ВЫВОДЫ:

ПРАКТИЧЕСКИЕ РЕКОМЕНДАЦИИ:

ПЕРСПЕКТИВЫ ДАЛЬНЕЙШЕЙ РАЗРАБОТКИ ТЕМЫ

СПИСОК СОКРАЩЕНИЙ

СПИСОК ЛИТЕРАТУРЫ

СПИСОК ИЛЛЮСТРАТИВНОГО МАТЕРИАЛА

ПРИЛОЖЕНИЯ

Введение диссертации (часть автореферата) на тему «Комплексный подход к оценке микробиоценоза кишечника»

ВВЕДЕНИЕ

Актуальность проблемы

Заболевания, протекающие с синдромом диареи, продолжают оставаться актуальной проблемой в Российской Федерации. Частота эпизодов диареи у грудных детей колеблется от одного до трех в течение первого года жизни. В зависимости от степени нарушения самочувствия, тяжести диспепсического синдрома и данных анамнеза эти эпизоды расцениваются по-разному: часто как транзиторная ферментативная недостаточность либо дисбиоз, реже как инфекционная диарея (Гончар Н.В., и соавт. 2009).

Как первичное состояние дисбиоз, как правило, встречается только у детей до года при нарушении формирования кишечного микробиоценоза. Однако дисбиоз кишечника может маскировать острые кишечные инфекции (ОКИ), усиливаясь или появляясь на их фоне. В ходе исследования на дисбиоз кишечника иногда диагностируются кишечные инфекции, возбудители которых влекут изменения в составе микробиоты. При отсутствии расширенного микробиологического исследования терапия может быть безуспешной. Но при классическом бактериологическом исследовании на дисбиоз кишечника, без целенаправленного выявления прочих возможных возбудителей ОКИ -кампилобактеров, вирусов, простейших - патогенные микроорганизмы обнаруживаются у ничтожно малого количества пациентов. В последние годы вирусные агенты занимают ведущее место среди этиологических факторов острых кишечных инфекций у детей во всем мире (Горелов A.B., 2004). Доля бактериальных кишечных инфекций значительно снизилась и составляет 710%. Увеличилось число микст-инфекций (вирусно-бактериальных) до 15 -17% (Горелов A.B. и соавт., 2005). Вклад возбудителей вирусной этиологии в общую структуру кишечных инфекций детей раннего возраста составляет 57,9% (ротавирусы - 35%, норовирусы - 16,7%, астровирусы - 6,2%) (Боднев С.А. и соавт., 2010).

По данным ФГУН ЦНИИ эпидемиологии Роспотребнадзора структура заболеваемости ОКИ в РФ за 2012 г. выглядела следующим образом: сальмо-неллез - 6,5%, шигелез-1,8%, другие острые кишечные инфекции установленной этиологии - 27,4%, кишечные инфекции неустановленной этиологии -64,3% (Сведения об инфекционных заболеваниях, 2012).

Возможность использования полимеразной цепной реакции (ПЦР) для установления этиологической структуры ОКИ существенно увеличивает процент расшифровки. ПЦР для диагностики вирусных инфекций имеет ряд таких преимуществ перед другими методами диагностики (культуральным и серологическим), как универсальность методики для широкого спектра возбудителей, высокая чувствительность и специфичность, невысокая себестоимость. Разработанные системы для обнаружения кампилобактеров и иерси-ний также упрощают процесс диагностики инфекций, вызванных трудно-культивируемыми микроорганизмами, и позволяют своевременно начать антибактериальную терапию. Учитывая высокий уровень распространения острых кишечных инфекций у детей, данная возрастная группа особенно нуждается в комплексном микробиологическом обследовании с поиском наиболее вероятных возбудителей кишечных инфекций и оценкой микробиоценоза кишечника.

Проблемой заслуживающей особого внимания является антибиотико-резистентность микроорганизмов, используемых в составе пробиотических препаратов. Применение полирезистентных штаммов может способствовать распространению антибиотикорезистентности среди индигенных микроорганизмов кишечного биоценоза, условно-патогенных и патогенных микроорганизмов, попадающих в кишечный биотоп. Так, лактобактерии, выделяемые от детей грудного возраста, имеют от 8 до 15 маркеров резистентности (Николаева И.В. и соавт., 2010). Все чаще появляется информация о плазмидной природе устойчивости лактобактерий к антибиотикам (Gueimonde М. et al., 2006; Huys G. et al., 2006; Masco L. et al., 2006; Saarela M. et al., 2007). Учитывая важность данной проблемы, необходимо изучение антибиотикорези-

стентности пробиотических штаммов, индигенных микроорганизмов кишечного биоценоза, условно-патогенных и патогенных энтеробактерий для сопоставления спектров их резистентности и определения возможных рисков от использования препаратов, в отношении которых широко распространена устойчивость.

Степень разработанности темы исследования

Большинство работ, посвященных дисбиозам кишечника, касаются изучения количественно-качественного состава микробиоценоза кишечника, наличию условно-патогенных микроорганизмов (УПМ) и их ассоциаций (За-харенко С.М. и соавт., 2006; Катаева JI.B. и соавт., 2010). Данный подход к изучению регламентируется соответствующим отраслевым стандартом. При этом недооценена роль возбудителей ОКИ как бактериальной, так и вирусной этиологии, наличие которых влечет за собой дисбиотические изменения.

Так, в соответствии с требованиями ОСТ 91500.11.0004-2003, необходимо выделять 16 групп микроорганизмов, в перечень которых не входят вирусные возбудители и труднокультивируемые патогены (Campylobacter spp., Y.enterocolitica). Нельзя не отметить, что классическое бактериологическое исследование на дисбиоз не в полной мере отвечает современным потребностям клинической медицины и существующим возможностям диагностики. В связи с этим, необходима разработка алгоритма исследования на дисбиоз кишечника с формированием перечня выявляемых патогенов как бактериальной, так и вирусной этиологии.

Цель исследования: с помощью современных методов (ПЦР, иммуно-хроматография) определить частоту обнаружения вирусов и бактерий - этиологических агентов диарейного синдрома у детей, обследуемых по поводу дисбиоза кишечника, для оптимизации выбора средств противомикробной терапии.

Задачи исследования:

1. Оценить частоту выявления возбудителей кишечных инфекций у детей, обследованных на дисбиоз кишечника бактериологическим методом, сопоставить частоту выявления возбудителей кишечных инфекций с помощью ПЦР и классического бактериологического метода и оценить целесообразность включения генной диагностики в комплексную схему исследования на дисбиоз кишечника.

2. Оценить частоту выявления токсинов Clostridium difficile у детей, обследуемых на дисбиоз кишечника, и необходимость включения иммуно-хроматографического метода в комплексную схему исследования на дисбиоз кишечника.

3. Охарактеризовать устойчивость к антибактериальным препаратам возбудителей кишечных инфекций и условно-патогенных энтеробактерий, выделяемых при исследовании на дисбиоз кишечника.

4. Охарактеризовать устойчивость к антибактериальным препаратам индигенных представителей микробиоценоза кишечника и пробиотических штаммов.

Научная новизна:

1. Определена частота встречаемости возбудителей острых кишечных инфекций при проведении классического бактериологического исследования на дисбиоз кишечника и ПЦР, разработан алгоритм комплексного исследования, направленный на улучшение качества микробиологической диагностики кишечных инфекций в ходе исследования на дисбиоз кишечника.

2. Впервые на основании большой выборки определена частота встречаемости возбудителей острых кишечных инфекций в результате проведения классического бактериологического исследования на дисбиоз кишечника (8174 исследований).

3. У детей, обследующихся по поводу дисбиоза кишечника, впервые определена частота обнаружения токсина Clostridium difficile методом имму-нохроматографии.

4. Впервые сопоставлена устойчивость к антибактериальным препаратам пробиотических штаммов и микроорганизмов кишечного биотопа, выявленных в ходе исследования на дисбиоз кишечника.

Теоретическая и практическая значимость работы:

1. Предложен комплексный подход к диагностике дисбиоза кишечника, основанный на применении молекулярно-генетического и бактериологического методов исследования. Показана необходимость при проведении данного исследования целенаправленного поиска наиболее часто встречающихся возбудителей кишечных инфекций бактериальной и вирусной этиологии. Получено удостоверение на рационализаторское предложение № 1857, принятое ГОУВПО СПбГМА им. И.И. Мечникова 24.06.2011г. к использованию под наименованием «Уточнение диагностики дисбактериоза кишечника».

2. Сопоставлена устойчивость к антибактериальным препаратам микроорганизмов кишечного биоценоза и возбудителей кишечных инфекций, выявленных в ходе исследования на дисбиоз кишечника, являющейся важной информацией для дальнейшего изучения вероятности передачи генов резистентности в условиях кишечного биотопа.

3. Данные о минимальной ингибирующей концентрации антибактериальных препаратов для лакто- и бифидобактерий являются важной информацией для проведения дальнейших исследований с целью выяснения вероятности передачи генов резистентности в условиях кишечного биотопа и разработки критериев безопасности пробиотических штаммов.

Внедрение материалов диссертационного исследования

Материалы диссертационного исследования внедрены в работу бактериологической лаборатории Госпиталя ветеранов войн и бактериологическую лабораторию ЗАО «СИТИЛАБ» (Приложение 1, 2).

Результаты диссертационного исследования внедрены в лекционный курс кафедры микробиологии Военно-медицинской академии им. С.М. Кирова и курс практических занятий медицинского факультета СПбГУ (Приложение 3, 4).

Методология и методы исследования

Методологической основой диссертационного исследования явилось последовательное применение методов научного познания. Работа выполнена в дизайне сравнительного многоцентрового проспективного исследования с использованием бактериологических, молекулярно-генетических, аналитических, статистических методов.

Основные положения, выносимые на защиту:

1. Применение комплексного подхода к исследованию на дисбиоз кишечника с использованием полимеразной цепной реакции для выявления возбудителей кишечных инфекций повышает расшифровку причин дисбио-тических состояний.

2. Выявление токсинов С.сИШсИе в рамках комплексного исследования на дисбиоз кишечника целесообразно.

3. Среди штаммов патогенных и условно-патогенных энтеробакте-рий, выделяемых при исследовании на дисбиоз кишечника, выявляются штаммы с множественной лекарственной устойчивостью.

4. Имеет место множественная лекарственная устойчивость лактобак-терий, входящих в состав пробиотических препаратов и лактобактерий кишечного микробиоценоза.

Степень достоверности и апробация результатов

Степень достоверности полученных результатов проведённых исследований определяется достаточным и репрезентативным объёмом выборок исследований и обследованных пациентов с использованием современных методов исследования. Статистическая обработка полученных результатов осуществлена методами параметрической и непараметрической статистики с использованием компьютерных программ Excel. Достоверность различий определяли, рассчитывая Хи квадрат при р<0,05 и ошибку доли. Методы статистической обработки полученных результатов адекватны поставленным задачам. Сформулированные в диссертации выводы, положения и рекомендации аргументированы и логически вытекают из системного анализа значительного объёма выборок обследованных пациентов и результатов выполненных исследований. Достоверность работы подтверждается публикацией её результатов в рецензируемых научных изданиях. По материалам диссертационного исследования опубликовано 20 печатных работ, в том числе 4 статьи в рецензируемых научных изданиях, рекомендуемых ВАК РФ.

Основные положения диссертации представлены и обсуждены на отчетных научно-практических конференциях сотрудников и молодых ученых СПбГМА им. И.И. Мечникова (Санкт-Петербург, 2010, 2011), на Всероссийских научно-практических конференциях по медицинской микробиологии и клинической микологии с международным участием «XV Кашкинские чтения» (Санкт-Петербург, 27 - 28 июня 2012г.) и «XVI Кашкинские чтения» (Санкт-Петербург, 19-21 июня 2013 г.) и Европейском конгрессе по клинической микробиологии и инфекционным заболеваниям (ECCMID-2013, Берлин, 27-30 апреля 2013 г.).

Диссертация апробирована на расширенном заседании кафедры медицинской микробиологии ГБОУ ВПО СЗГМУ им. И.И.Мечникова Минздрава России, протокол № 12/13 от «31» октября 2013 г.; на заседании научной

проблемной комиссии «Эпидемиология, профилактика, диагностика и лечение инфекционных (бактериальных, вирусных, микотических, паразитарных и связанных с оказанием медицинской помощи) и некоторых неинфекционных заболеваний» ГБОУ ВПО СЗГМУ им. И.И.Мечникова Минздрава России, протокол № 3 от 12.11.13.

Личное участие автора в получении результатов исследования

Автором обоснованы цель, задачи и схемы исследования, осуществлены сбор и анализ литературных источников. Выполнены основные микробиологические исследования. Предложен комплексный подход к исследованию на дисбиоз кишечника. Проанализированы полученные данные, осуществлено обобщение и статистическая обработка результатов исследования, сформулированы выводы и основные положения, выносимые на защиту.

Структура и объем диссертации

Диссертация изложена на 128 страницах машинописного текста и состоит из введения, 5 глав, заключения, выводов, практических рекомендаций, списка литературы. Иллюстративный материал представлен 8 рисунками и 24 таблицами. Указатель литературы содержит 156 источников, из них 87 отечественных и 69 зарубежных авторов.

12

ГЛАВА 1

ДИСБИОЗЫ И КИШЕЧНЫЕ ИНФЕКЦИИ 1.1 Роль кишечных инфекций в развитии дисбиоза

Исследование микробиоты и разработка методов её коррекции - важное направление во многих сферах медицины, в фармацевтической и пищевой промышленности. Интерес к проблемам изучения микробиоценоза кишечника перешагнул рамки рутинной лабораторной диагностики дисбактериоза, заключающейся в выделении нескольких групп наиболее изученных микроорганизмов, а использование пробиотических штаммов в настоящее время рассматривается не только в контексте заместительной пробиотической терапии. Всё чаще пробиотики используются как альтернатива антимикробным химиопрепаратам. Открываются научные и практические перспективы для разработки принципиально новых препаратов на основе экзометаболитов нормальной микробиоты (Вахитов Т.Я., Петров Л.Н., 2006; Ткаченко Е.И., Суворов А.Н., 2009). Однако бактериологический анализ фекалий, проводимый с целью охарактеризовать микробиоценоз кишечника и подобрать препараты для его коррекции, как правило, не подразумевает использования возможностей новых методов исследования, поэтому описание микробиоценоза кишечника остается неполным, а подбор пробиотиков - эмпирическим. В то же время «анализ на дисбиоз» востребован в клинической практике, особенно у детей, несмотря на узость проводимого исследования и неоднозначность трактовки результатов (Булатова Е.М., Богданова И.М., 2009). У детей раннего возраста кишечный микробиоценоз находится в процессе формирования и является неустойчивой экосистемой, состав которой легко изменяется под действием различных факторов (перевод на искусственное вскармливание, введение прикорма, антибиотикотерапия, ОКИ и др.) (Николаева И.В. и соавт., 2010). При изучении микробиоценоза кишечника людей из различных возрастных групп показано, что наибольшие изменения неизменно выявляются у детей первого года жизни (Чернуха М.Ю. и соавт.,

2005). Причинами для направления на исследование микробиоценоза, особенно часто назначаемого детям младшего возраста, являются нарушения стула, которые могут быть обусловлены как избыточным размножением условно-патогенных микроорганизмов, так и кишечными инфекциями различной этиологии (Бойцов А.Г. и соавт., 2008). Диарея у грудных детей часто рассматривается как нарушенный микробиоценоз кишечника или ферментативная недостаточность (Самсыгина Г.А., 2003; Farano S. et al., 2003; Хавкин А.И., Жихарева Н.С., 2006). Нередко при этом имеет место формализованный подход к исключению кишечных инфекций, которые также могут быть причинами диареи. Наиболее сложно в порядке дифференциального диагноза с дисбактериозом определить острую кишечную инфекцию, вызванную условно-патогенным возбудителем (клебсиеллой, протеем, синегнойной палочкой и др.). Однако, несмотря на известную роль условно-патогенных микроорганизмов в развитии диареи, обязательно следует провести скрининг кишечных инфекций, вызванных патогенными возбудителями. (Учайкин В.Ф., 2002). Нельзя не отметить, что классическое бактериологическое исследование на дисбиоз кишечника не в полной мере отвечает данным потребностям. Так, в соответствии с требованиями отраслевого стандарта ОСТ 91500.11.0004-2003 «Протокол ведения больных. Дисбактериоз кишечника», необходимо выделять 16 групп микроорганизмов: бифидобактерии, лактобактерии, бактероиды, энтерококки, фузобактерии, эубактерии, пептострептококки, клостридии, типичные E.coli, лактозонегативные E.coli, E.coli с гемолитической активностью, другие условно-патогенные энтеробактерии (Klebsiella, Enterobacter, Hafnia, Serratia, Proteus, Morganella, Providencia, Citrobacter и др.), стафилококк золотистый, стафилококки сапрофитный и эпидермальный, дрожжепо-добные грибы рода Candida, неферментирующие бактерии (Pseudomonas, Acinetobacter и др.) (ОСТ 91500.11.0004-2003). Большинство из них является условно-патогенными микроорганизмами, способными при изменении биотопа обитания оказывать локальное или системное повреждающее действие. Большое значение в этиологии эндогенного инфицирования из кишечника

принадлежит бактериям родов Escherichia, Klebsiella, Proteus, Pseudomonas, Enterococcus, Acinetobacter, Bacteroides, Clostridium. Они могут служить причиной внекишечной или генерализованной инфекции у иммунокомпромети-рованных лиц, у новорожденных. (Бондаренко В.М. и соавт., 2006). Однако микробиологические исследования в целом затрагивают не более 4% известных вирусов и не более 12% известных бактерий (Захаренко С.М., Сафонова Н.В., 2006). В структуру классического бактериологического исследования на дисбиоз кишечника включение новых групп микроорганизмов происходит достаточно болезненно. Так, несмотря на включение в ОСТ 91500.11.0004— 2003 таких нормируемых показателей, как бактероиды, фузобактерии, эубак-терии, пептострептококки, немногие лаборатории идут на подобные дополнительные исследования. Встречаются работы, авторы которых в качестве признаков нарушенного микробиоценоза принимают не наличие условно-патогенных энтеробактерий и прочих тривиальных микроорганизмов, а, например, присутствие Coprococcus, Collinsella, Coprobacillis, что дополнительно указывает на недостаточный диапазон рутинного исследования на дисбиоз и неоднозначность критериев, выбираемых в качестве оценочных при описании микробиоценоза (Kassinen А. et al., 2007). Это не снимает необходимости выявления патогенных микроорганизмов. Острые кишечные инфекции и до настоящего времени не теряют своей актуальности в связи с частотой распространения, неуправляемостью, тяжестью течения, количеством неблагоприятных исходов. Патогенные энтеробактерии могут быть обнаружены не менее чем у 0,7% лиц, обследованных по поводу дисбиоза (Войтенкова Е.В. и соавт., 2008). При дополнительном исследовании на кампилобактеры, вирусы, простейшие частота обнаружения возбудителей кишечных инфекций при исследовании на дисбиоз кишечника, очевидно, могла бы быть выше.

Кишечные инфекции - группа заболеваний вирусной и бактериальной природы, для которых характерен фекально-оральный механизм передачи, синдром общей интоксикации, диарейный синдром и склонность к развитию дегидратации различной степени выраженности. Кишечные инфекции в РФ

продолжают оставаться актуальной проблемой, заболеваемость кишечными инфекциями неустановленной этиологии в РФ стабильно превышает показатель 100 на 100 тыс. населения (Сологуб Т.В., 2006). Так, в 2012 году этот показатель составил 364,3 на 100 тыс. населения (Сведения об инфекционных заболеваниях, 2012). Распространенность ОКИ у детей грудного возраста точно не установлена (Гончар Н.В. и соавт., 2003). Однако даже с учетом этого фактора можно констатировать, что кишечные инфекции наблюдаются преимущественно у детей первых 5 лет жизни - до 70% случаев всех острых кишечных инфекций. (Романцов М.Г., Тихомирова О.В., 2010). В настоящее время доказано, что подавляющее большинство острых кишечных инфекций у детей обусловлено вирусами, среди которых ротавирусы занимают первое место (Glass R.I., 2000). Доля ротавирусов в этиологической структуре кишечных инфекций у детей составляет 35%, норовирусов - 16,7%, астровирусов - 6,2% (Боднев С.А. и соавт., 2010).

Считается, что ОКИ у взрослых обусловлены преимущественно бактериальными патогенами, тогда как у детей - вирусными. Однако у взрослых роль вирусов в развитии кишечных инфекций также очень велика. Наиболее частой причиной вспышек острых гастроэнтеритов у взрослых в лечебных и гериартрических учреждениях являются норовирусы, рота- и астровирусы. (Glass R.I., et al.,1996; Васильев Б.Я., Васильева Р.И., 2000). Показано, что у 22,6% пациентов инфекционного стационара вирусы - единственная причина диареи, а в структуре острых кишечных инфекций расшифрованной этиологии сальмонеллы и норовирусы заняли первое место (по 19,8%) (Сагалова О.И. и соавт., 2007). Авторами доказано, что наиболее значимыми возбудителями кишечных инфекий, сопоставимыми по частоте выявления с сальмонеллами и шигеллами, являются норовирусы второго генотипа и ротавирусы группы А, которые выявляются соответственно у 10,4 и 8,9% обследованных больных. Высокий уровень спорадической заболеваемости норовирусной инфекцией среди взрослых и детей. Наличие бессимптомного вирусоносительства и субклинических форм инфекции в сочетании с высокой контагиозностью но-

ровирусов являются предпосылками, которые определяют лидирующую роль норовирусов в эпидемической заболеваемости острыми кишечными инфекциями во многих регионах. Отмечена сезонная смена доминирующих возбудителей диарейных заболеваний вирусной природы: преобладание ротавирусов группы А в зимне-весенний период, норовирусов - в весенне-летние месяцы, астровирусов - осенью и в начале зимы (Сагалова О.И. и соавт., 2008). Астровирусы выделяются у детей в 1,3%, а у взрослых- 5,9% случаев острых кишечных инфекций уточненной этиологии (Подколзин А.Т. и соавт., 2004).

Отдельного рассмотрения требуют сочетанные кишечные инфекции. Так, установлено, что частота микст-инфекций, как бактериально-бактериальных, так и вирусно-бактериальных, составляет не менее 11%. У трети детей с бактериологически подтвержденным сальмонеллезом и обследованных на ротавирусы, выявляется сальмонеллезно-ротавирусная микст-инфекция (Милютина Л.Н и соавт., 2007). А сочетание ротавирусной инфекции с шигеллезами составляет от 0,5 до 6,5%. На примере сальмонеллеза и ротавирусной инфекции доказано, что сочетанное течение кишечных инфекций у детей раннего возраста влияет на удлинение сроков реконвалесценции (Романцов М.Г., Тихомирова О.В., 2010).

Диагностика ОКИ остается одной из актуальных проблем инфекционной патологии. От быстроты верификации диагноза во многом зависят противоэпидемические мероприятия, лечебная тактика в остром периоде заболевания, реабилитационные мероприятия в период реконвалесценции. При острых кишечных инфекциях вирусной этиологии антибактериальная терапия не оказывает положительного лечебного эффекта, и, напротив, может удлинить период реконвалесценции. Раннее выявление кишечной инфекции, в том числе при исследовании на дисбиоз - залог быстрой и эффективной элиминации возбудителя. Значимость ранней расшифровки кишечных инфекций аргументируется ещё и тем, что в случае длительной персистенции возбудителя и неадекватной антибиотикотерапии формируется лекарственная рези-

стентность, что показано на примере сальмонеллезной инфекции у детей (Горелов Л.Н. и соавт., 2009).

Но целенаправленное выделение этиологически значимых патогенов, таких, как вирусы и кампилобактеры, не нормируется в структуре исследования микробиоценоза кишечника. Это приводит к неполной этиологической расшифровке кишечных инфекций и, как следствие, к неадекватной этио-тропной терапии в начальном периоде болезни и затягиванию санации от возбудителя. Требуется ориентация врача на одновременное обследование пациентов раннего возраста на дисбиоз и патогены - вирусы и бактерии.

Большой интерес представляют работы, обосновывающие взаимосвязь неинфекционной патологии с перенесенными ранее кишечными инфекциями. Нередко кишечные инфекции протекают под маской обострения основного неинфекционного заболевания или под маской дисбиоза, как, например, СРК (Симаненков В.И. и соавт., 2009). Установлено, что риск развития СРК выше после перенесенного кампилобактериоза, сальмонеллеза, шигеллеза (Парфенов А.И., Ручкина И.Н., 2006; Ruigomez А. et al., 2007). Остается всё меньше заболеваний, в развитии которых не подтверждена роль микробных агентов (Суворов А.Н., Успенский Ю.П., 2009).

1.2 Роль условно-патогенных микроорганизмов в развитии и поддержании дисбиоза кишечника. Условно-патогенные микроорганизмы как этиологический фактор острых кишечных инфекций

Согласно современным представлениям микробиоценозы организма человека представляет собой единую экосистему биоценозов различных органов и систем, отличающихся многокомпонентностью и количественным разнообразием у лиц разного возраста. Ключевым элементом экосистемы является микробиота желудочно-кишечного тракта, представляющего собой резервуар микроорганизмов, которые при определенных условиях способны выходить за пределы кишечного биотопа, контаминируя слизистые смежных органов и приводя к развитию патологических процессов (Михайленко E.JI. и

Заключение диссертации по теме «Микробиология», Щеглов, Владимир Сергеевич

ВЫВОДЫ:

1. Применение бактериологического метода диагностики в комплексе с ПЦР статистически достоверно (р<0,05) увеличивает частоту обнаружения у детей, обследуемых по поводу дисбиоза кишечника, этиологических агентов ОКИ по сравнению с классическим подходом в 9,6 раз с (2,4±0,3)% до (23,3±6,9)%. Классический бактериологический метод и поли-меразная цепная реакция являются взаимодополняющими методами и должны использоваться параллельно.

2. Частота обнаружения токсина Clostridium difficile иммунохрома-тографическим методом у детей, обследуемых на дисбиоз кишечника, составила (1,8±0,9)%, в связи с чем включение иммунохроматографического метода выявления токсина С.difficile в комплексную схему исследования на дисбиоз кишечника целесообразно по клиническим показаниям и эпидемиологическому анамнезу.

3. Доля патогенных энтеробактерий, выделенных при исследовании на дисбиоз кишечника, устойчивых хотя бы к одному антибактериальному препарату, среди иерсиний составила (65,2±4,8)% штаммов, диареегенных эшерихий - (43,1±5,0)% штаммов, сальмонелл - (40,0±4,9)% штаммов.

4. Среди условно-патогенных энтеробактерий резистентность хотя бы к одному препарату выявлена от (24,3±4,3)% для штаммов E.coli с типичными свойствами до 100% для штаммов Citrobacter spp., Klebsiella spp., Enterobacter spp. Фенотипически автоматизированным методом пограничных концентраций установлено, что у штаммов Е. coli, Klebsiella spp., Enterobacter spp. резистентность к бета- лактамам была обусловлена продукцией бета-лактамаз ESBL, а к аминогликозидам - синтезом аминогликозидмодифици-рующих ферментов ААС(б') -1 и ААС(б') - II.

5. Устойчивость к 5 и более группам антибактериальных препаратов выявлена у (98,0±2,8)% штаммов Lactobacillus, выделенных из кишечника, у (81,5±7,8)% штаммов Lactobacillus и (82,6±7,6)% штаммов Bifidobacterium, входящих в состав пробиотических препаратов.

ПРАКТИЧЕСКИЕ РЕКОМЕНДАЦИИ:

1. Рекомендуется комплексный характер диагностики дисбиотиче-ских состояний у детей с использованием бактериологического метода и современных методов диагностики ОКИ бактериальной и вирусной этиологии (ПЦР и иммунохроматографии).

2. При назначении антибактериальных препаратов для лечения кишечных инфекций, либо коррекции дисбиотических состояний рекомендуется учитывать чувствительность лактобактерий к ампициллину и гентамици-ну.

3. Рекомендуется элиминация выделенных в диагностически значимом количестве условно-патогенных микроорганизмов, устойчивых к антибактериальным препаратам.

4. Выявление токсина С. difficile рекомендуется проводить при наличии клинических показаний (диарея) и эпидемиологического анамнеза (ан-тибиотикотерапия или пребывание в стационаре).

ПЕРСПЕКТИВЫ ДАЛЬНЕЙШЕЙ РАЗРАБОТКИ ТЕМЫ

Перспективы дальнейшей разработки темы лежат в совершенствовании подходов к лабораторной диагностике дисбиотических состояний, пересмотре перечня групп микроорганизмов, определяемых при изучении кишечного микробиоценоза и разработке стратегии исследования на дисбиоз кишечника с целью предоставления клиницистам достоверной информации о состоянии мик-робиоты, а также в изучении вероятности передачи генов резистентности среди микроорганизмов, являющихся представителями микробиоценоза кишечника и входящих в состав пробиотических препаратов, с целью разработки критериев коррекции дисбиотических состояний и индивидуального подбора пробиотических препаратов, а также с целью изучения генетической безопасности стартовых пробиотических культур.

Список литературы диссертационного исследования кандидат наук Щеглов, Владимир Сергеевич, 2013 год

СПИСОК ЛИТЕРАТУРЫ

1. Аветисян, Л.Р. Эпидемиологические и микробиологические аспекты колонизации кишечника детей первого года жизни условно-патогенными микроорганизмами: автореф. дис... канд. мед. наук: / Л.Р. Аветисян - М., 2008-35 с.

2. Азнабаева, Л.М. Модификация антибиотикорезистентности в условиях микробного симбиоза / Л.М. Азнабаева, Б.Я. Усвяцов, О.В. Бухарин // Антибиотики и химиотерапия. - 2010. - Т. 55. - № 5 - 6. - С. 14-17.

3. Ананьева, Н.В. Влияние экзополисахаридов на стрессоустойчи-вость пробиотических культур / Н.В. Ананьева, В.И. Ганина // Клиническое питание. - 2007. - № 1 - 2. - С. А 20.

4. Баженов, Л.Г. Изучение антагонистического действия лактобацилл на Helicobacter pylori / Л.Г. Баженов, В.М. Бондаренко, Е.А. Лыкова, Д.К. Огай // Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунологии. - 1997. - № 3. - С. 89-91.

5. Боднев, С.А. Нововирусы как этиологический фактор острых кишечных инфекций у детей раннего возраста в Новосибирске / С.А. Боднев, В.В. Малеев, Е.В. Жираковская, Т.Э. Юн, А.Ю. Тикунов, Н.А. Никифорова, Т.Г. Корсакова, В.В. Клемешева, А.В. Качко, А.Т. Подколзин, Н.В. Тикунова // Эпидемиология и инфекционные болезни. - 2010. - №1. - С. 40-45.

6. Бойцов, А.Г. Дисбиотические нарушения микрофлоры толстого кишечника: проблемы диагностики и коррекции / А.Г. Бойцов, Л.Ю. Нилова, Е.А. Оришак // Вестник СПбГМА им. И.И. Мечникова. - 2008. - №3. - С. 120-123.

7. Бондаренко, В.М. «Острова» патогенности бактерий / В.М. Бондаренко // Журнал микробиологии. - 2001. - № 4. - С. 67-74.

8. Бондаренко, В.М. Гемагглютинирующая и адгезивная способность штаммов клебсиелл и энтеробактерий / В.М. Бондаренко, С.С. Барку, В.И. Брилис, А.А. Ленцнер // Журнал микробиологии. -1987. - № 7. - С. 3-6.

9. Бондаренко, В.М. Дисбактериоз кишечника как клинико-лабораторный синдром: современное состояние проблемы / В.М. Бондаренко, Т.В. Мацулевич. - М.: ГЭОТАР - Медиа, 2006. - 304 с.

10. Бондаренко, В.М. Дисбиозы и препараты с пробиотической функцией /

B.М. Бондаренко, А.А. Воробьев // Журнал микробиологии. - 2004. - № 1. - С. 84-92.

11. Бондаренко, В.М. Клебсиеллы и клебсиеллезы / В.М. Бондаренко,

C.В. Фиалкина, О.В.Агапова. - Тверь: ООО «Издательство «Триада», 2008. - 160 с.

12. Бондаренко, В.М. Молекулярно-биологический метод типирова-ния детерминант термолабильного энтеротоксина у штаммов протеев, изолированных при острых кишечных инфекциях / В.М. Бондаренко, З.С. Габиду-лин, С.А. Колесников // Лабораторное дело. - 1987. - № 4. - С. 289-291.

13. Бондаренко, В.М. Общий анализ представлений о патогенных и условно-патогенных бактериях / В.М. Бондаренко // Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунологии. - 1997. - № 4. - С. 20-26.

14. Бондаренко, В.М. Прикладные аспекты молекулярной биологии бифидобактерий и лактобацилл / В.М. Бондаренко // Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунологии. - 2006. - № 2. - С. 89-96.

15. Бондаренко, В.М. Секретируемые факторы патогенности энтеро-бактерий / В.М. Бондаренко, А.Р. Мавзютов, E.Golkocheva // Журнал микробиологии. - 2002. - № 1. - С. 84-89.

16. Бондаренко, В.М. Синдром избыточного бактериального роста в тонкой кишке в аспекте дисбактериоза кишечника / В.М. Бондаренко, Е. А. Лыкова, Т.В. Мацулевич // Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунологии. - 2006. - № 6. - С. 57-63.

17. Бондаренко, В.М. Факторы патогенности бактерий и их роль в развитии инфекционного процесса / В.М. Бондаренко // Журнал Микробиологии. - 1999. - № 5. - С. 34-39.

18. Ботина, С.Г. Классификация отечественных пробиотических культур рода Lactobacillus / С.Г. Ботина, К.М. Климина, Н.В. Коробан, В.В Зинченко, В.Н. Даниленко // Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунологии. - 2010. - № 5. - С. 3-7.

19. Бочков, И.А. Влияние лечебных бактериофагов на условно-патогенную и симбиотическую микрофлору толстой кишки / И.А. Бочков,

Э.С. Лаврентьева, Л.П. Юрко // Эпидемиология и инфекционные болезни. -2009. - №2.-С. 48-51.

20. Булатова Е.М. Становление и роль микробиоты у детей. Современные подходы к диагностике и лечению дисбиоза кишечника в педиатрической практике / Е.М. Булатова, И.М. Богданова //Дисбиоз кишечника, руководство по диагностике и лечению. Под редакцией Е.И. Ткаченко, А.Н. Суворова. - СПб.: ИнформМед, 2009 - Гл. 14 - С. 175-218.

21. Васильев, Б.Я. Острые кишечные заболевания. Ротавирусы и ротавирус-ная инфекция / Б .Я. Васильев, Р.И. Васильева, Ю.В. Лобзин. - СПб: лань, 2000.-296 с.

22. Вахитов, Т.Я. Регуляторные функции экзометаболитов бактерий / Т.Я. Вахитов, Л.Н. Петров // Микробиология. - 2006. -Т.75, № 4. - С. 483-488.

23. Войтенкова, Е.В. Находки возбудителей острых кишечных инфекций при исследовании на дисбиоз кишечника / Е.В. Войтенкова, З.Н. Матвеева, Л.А. Кафтырева // В кн.: Идеи Пастера в борьбе с инфекциями. - СПб.: НИИЭМ, 2008. - С. 113.

24. Гизатуллина, С.С. Некоторые биологические свойства энтеробакте-рий, выделенных от больных с диареей / С.С. Гизатуллина, М.О. Биргер, H.A. Ко-лышкина // Журнал микробиологии. - 1988. - № 2. - С. 13-17.

25. Гончар, Н.В. Выбор пробиотика для рациональной терапии клеб-сиеллезной инфекции у детей / Н.В. Гончар, Л.В. Березина, О.В. Тихомирова, О.В. Добролеж, Н.Б. Вербицкая, Л.Н. Петров, В.М. Бондаренко // Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунологии. - 2009. - № 2. - С. 85-89.

26. Горелов, A.B. Терапия острых кишечных инфекций у детей в современных условиях / A.B. Горелов // Вопросы современной педиатрии.-2004. - №4. - С. 72-78.

27. Горелов, A.B. Практическое руководство по диагностике и комплексной терапии острых кишечных инфекций у детей / A.B. Горелов. - Астрахань, 2005. - 116 с.

28. Горелов, A.B. Пробиотики: механизмы действия и эффективность при инфекциях желудочно-кишечного тракта / A.B. Горелов, Д.В. Усенко // Эпидемиология и инфекционные болезни. - 2006. - № 4. - С. 53-56.

29. Горелов, A.B. Пути и перспективы изучения проблемы острых кишечных, респираторных инфекций и гепатитов у детей / A.B. Горелов, JI.H. Милютина, А.Р. Рейз, Д.В. Усенко, Т.С. Никитина, А.К. Дронина, A.A. Плоскирева, Т.А. Руженцова // Эпидемиология и инфекционные болезни. - 2009. - № 2. - С. 51-57.

30. ГОСТ Р ИСО 20776-1-2010 Клинические лабораторные исследования и диагностические тест- системы in vitro. Исследование чувствительности инфекционных агентов и оценка функциональных характеристик изделий для исследования чувствительности к антимикробным средствам. - М. : Стандартинформ, 2010. -24 с.

31. Грачева, Н.М. Клинико-микробиологические особенности острой кишечной инфекции, вызванной бактериями Hafnia alvei и ротавирусом / Н.М. Грачева, Н.И. Леонтьева, В.М. Бондаренко, C.B. Фиалкина, Г.Н. Коновалова // Журнал микробиологии. - 2003. - № 2. - С. 62-65.

32. Григорьев, П.Я. Синдром раздраженной кишки, ассоциированный с дисбактериозом / П.Я. Григорьев, Э.П. Яковенко // Consilium Medicum. -2003.-Т.2,№ 7.-С. 305-307.

33. Гуревич, P.A. Микрофлора кишечника у больных инфарктом миокарда. / P.A. Гуревич, A.A. Крылов, Я.С. Циммерман, П.П. Эппггейн // Лабораторное дело. - 1986. - № 1. - С. 44-45.

34. Денисенко, ВБ. Рост молочнокислых бактерий на средах, содержащих желчь /В.В. Денисенко, ИА Найденко //Клиническое питание. - 2007. - № 1 - 2. - С. А37.

35. Дисбиоз кишечника. Руководство по диагностике и лечению / под ред. Е.И Ткаченко. А.Н. Суворова. - СПб.: издательство: ИнформМед. 2009. - 276 с.

36. Жеребцова, Н.Ю. Генетические маркеры патогенности условно патогенных энтеробактерий, выделенных у детей и подростков при острых кишечных инфекциях / Н.Ю. Жеребцова, А.Х. Баймиев, Д.А. Валишин, А.Р. Мавзутов // Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунологии. - 2007. - № 2. - С. 3-8.

37. Жихарева, Н.С. Использование пребиотиков в терапии синдрома раздраженного кишечника / Н.С. Жихарева, А.И. Хавкин // Русский медицинский журнал. - 2006. -Т.14, № 19. - С. 1384-1386.

38. Завгородняя, Е.Ф. Некоторые биологические свойства условно-патогенных бактерий в структуре кишечных микробиоценозов у детей с нарушениями кишечной микроэкологии / Е.Ф. Завгородняя, JI.A. Сташкевич // Клиническое питание. - 2007. - № 1 - 2. - С. А42.

39. Захаренко, С.М. Дисбиоз кишечника: от науки первого уровня к науке взаимоотношений / С.М. Захаренко, Н.В. Сафонова // Гастроэнтерология Санкт-Петербурга. - 2006. - № 1 - 2. - С. 5-10.

40. Ильина, Т.С. Биопленки как способ существования бактерий в окружающей среде и организме хозяина: феномен, генетический контроль и системы регуляции их развития / Т.С Ильина, Ю.М. Романова, A.JI. Гинцбург // Генетика. - 2004. - Т. 40, №11.- С. 1445-1456.

41. Катаева, JI.B. Возрастные особенности дисбиоза толстой кишки / JI.B. Катаева, К.Б. Степанова, Т.Ф. Степанова, Н.Ф. Нижегородцева, В.В. Ташланова // Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунологии. - 2010. - № 1. - С. 76-80.

42. Каширская, Н.Ю. Значение пробиотиков и пребиотиков в регуляции кишечной микрофлоры / Н.Ю. Каширская // Русский медицинский журнал. - 2000. - Т 8, № 13-14. - С. 572-576.

43. Кветная, A.C. Диагностика, прогнозирование течения и лечение острых кишечных инфекций условно-патогенной и смешанной этиологии / Кветная A.C. [и др.] // Методические рекомендации, Л., 1990. - 27 с.

44. Козлова, Е.В. Устойчивость к антибиотикам штаммов лактобацилл / Е.В. Козлова // Журнал антибиотики и химиотерапия. - 1992. - Т.37, №6, С. 12-15.

45. Козлова, Н.С. Плазмиды антибиотикрезистентных штаммов ши-гелл, выделенных в Ленинградской области / Н.С. Козлова // Антибиотики и химиотерапия.-1993. - Т. 38. - № 4-5. - С. 9 -13.

46. Корниенко, Е.А. Современные принципы выбора пробиотиков / // Детские инфекции.- 2007, № 3 - с. 64-69.

47. Коссович, Л.В. Внутривидовой и межвидовой перенос плазмид-ной и хромосомной ДНК при естественной трансформации у Bacillus subtilis

и Escherichia coli / JI.В. Коссович, A.A. Прозоров // Микробиология. - 1990. -Т.59, №6. - С. 1046-1049.

48. Лопухов, Л.В. Полимеразиая цепная реакция в клинической микробиологической диагностике / Л.В. Лопухов, М.В. Эйделынтейн // Клиническая микробиология и антимикробная химиотерапия. - 2000. - Т.2,- № 3. - С. 96-104.

49. Мавзютов, А.Р. «Острова» патогенности условно-патогенных эн-теробактерий / А.Р. Мавзютов, C.B. Фиалкина, В.М. Бондаренко // Журнал микробиологии. - 2002. - № 6. - С. 5-9.

50. Малеев, В.В. Резистентность шигелл и современные возможности антибактериальной терапии шигеллезов / В.В. Млеев, A.C. Иванов, Л.С. Страчунский // Клиническая микробиология и антимикробная химиотера-пия.-2005.- Т. 7, № 4.- С. 350-368.

51. Милютина, Л.Н. Актуальные проблемы смешанных инфекций у детей / Л.Н. Милютина, Ю.А. Зотова, О.Б. Мурзина // Материалы Юбилейной Всероссийской научно-практической конференции. - СПб., 2007. - С. 69.

52. Михайленко, Е.Л. Микроэкологические нарушения желудочно-кишечного тракта и репродуктивной системы при острых кишечных инфекциях у детей / Е.Л. Михайленко, A.B. Горелов, М.Д. Ардатская, Д.В. Усенко, О.Б. Мурзина//Гастроэнтерология Санкт-Петербурга. - 2009. - №2-3. - С. 17-19.

53. MP «Псевдотуберкулез и иерсиниоз (эпидемиология, клиника, диагностика, терапия)» Утвержден Департаментом Госсанэпиднадзора Минздрава РФ от 11 мая 2004г. N 11-3/8-09. - 22с.

54. Николаева, И.В. Видовой состав и антибиотикорезистентность лактобацилл у детей грудного возраста / И.В. Николаева, H.A. Шабанова, В.М. Бондаренко, Г.Н. Коновалова, В.А. Анохин // Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунологии. - 2010. - № 6. - С. 70-75.

55. Оришак, Е.А. Лабораторные методы индивидуального подбора пробиотиков / Е.А. Оришак, Л.Ю. Нилова, А.Г. Бойцов //Лабораторная диагностика России. Ежегодный справочник. - 2010-2011. Мир медицины, изд-во «человек». - С 121.

56. Оришак, Е.А. Выявление бактерий и вирусов - возбудителей кишечных инфекций у лиц с дисбактериозом кишечника /Е.А. Оришак, А.Г. Бойцов, B.C. Щеглов, Л.Ю. Нилова // Лаборатория.- 2011. - № 4. - С. 21-22.

57. ОСТ 91500.11.004 2003. Протокол ведения больных. Дисбактериоз кишечника. Утвержден приказом Минздрава РФ от 9 июня 2003. - №231. - 82с.

58. Парфенов, А.И. Синдром раздраженного кишечника / А.И. Парфенов, И.Н. Ручкина // Медицинский вестник. - 2006. -№ 16. - С. 359.

59. Перунова, Н.Б. Микробная регуляция биологических свойств бактерий кишечного микросимбиоза человека / Н.Б. Перунова, Е.В. Иванова, О.В. Бухарин // Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунологии. - 2006. - №6. - С. 76-79.

60. Петровская, В.Г. Адгезины энтеротоксигенных кишечных палочек: роль в патогенезе диарей и генетический контроль / В.Г. Петровская, В.М. Бонда-ренко // Журнал микробиологии. - 1990. - № 5. - С. 110-117.

61. Подколзин, А.Т. Изучение этиологии острых кишечных инфекций у детей, госпитализированных в инфекционные отделения стационаров Москвы / А.Т. Подколзин, A.A. Мухина, Г.А. Шипулин, В.Н. Кузьмина, С.И. Браславская, В.В. Малеев, A.B. Горелов, Н.В. Белова, А.Г. Боковой, Н.Б. Танина, A.A. Новокшонов, Н.В. Соколова, Л.Н. Мазанкова, Н.О. Ильина, С.В. Шишкина, Г.Ю. Яковлева // Инфекционные болезни. - 2004. - № 2(4). - С. 85-91.

62. Постникова, Е.А. Изучение качественного и количественного состава микрофлоры кишечника у клинически здоровых детей в раннем возрасте / Е.А. Постникова, А.П. Пикина, Л.И. Кафарская, Б.А. Ефимов // Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунологии. - 2004. - № 1. - С. 62-67.

63. Решедько, Г.К. Значение ферментативной модификации аминоглико-зидов в развитии резистентности у бактерий / Г.К. Решедько // Клиническая микробиология и антимикробная химиотерапия. -1999.- Т.1, № 1.- С. 40-50.

64. Романцов, М.Г. Коррекция иммунных нарушений, терапия кишечных инфекций и дисбиоза у детей (клинический обзор) / М.Г. Романцов, О.В. Тихомирова// Антибиотики и химиотерапия. - 2010. - Т.55, №5-6. - С. 41-49.

65. Рыбальченко, О.В. Проявление антагонистического действия бакгерио-циногенных Lactobacillus acidophilus на клетки Klebsiella pneumonia, Citrobacter freundii и Proteus mirabilis / O.B. Рыбальченко, B.M. Бондаренко, Н.Б. Вербицкая // Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунологии. - 2006. - № 7. - С. 8-11.

66. Саблин, O.A. Проблема резистентности Helicobacter pylori к кларитро-мицину / O.A. Саблин, Т.А. Ильчишина// Гастроэнтерология. - 2009. - №2. С. 4-8.

67. Сагалова, О.И. Астровирусная инфекция / О.И. Сагалова // Актуальные вопросы вирусных инфекций в современный период : сб. науч.-практ. работ - Екатеринбург, 2008. - С. 228-236.

68. Сагалова, О.И. Вирусные гастроэнтериты у взрослых (обзор) / О.И. Сагалова // Актуальные вопросы практической и теоретической медицины : сб. науч.-практ. работ. - Челябинск, 2007. - С. 117-119.

69. Сагалова, О.И. Значение вирусов в этиологии острых кишечных кишечных инфекций у взрослых / О.И. Сагалова, А.Т. Подколзин, Е.Б. Фенске, Н.Ю. Абрамычева, В.В. Малеев // Актуальные проблемы охраны здоровья населения Челябинской области: материалы VI съезда врачей Челяб. обл. - Челябинск, 2008.-С. 248-251.

70. Сагалова, О.И. Характеристика этиологической структуры острых кишечных инфекций у взрослых по данным инфекционного стационара / О.И. Сагалова, O.A. Пищулова, В.А. Нечет, А.Т. Подколозин, В.В. Малеев, Е.Ю. Абрамычева, Е.Б. Фенске // Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунологии. - 2007. - № 5. - С. 7-12.

71. Самсыгина, Г.А. Особенности становления биоценоза кишечника и кишечный дисбактериоз / Г.А. Самсыгина // Педиатрия. Consilium medicum. -2003.-№ 2.-С. 31-33.

72. Сведения об инфекционных и паразитарных заболеваниях в РФ за январь-декабрь 2012 / ФГУЗ «Федеральный центр гигиены и эпидемиологии» Роспот-ребнадзора [Электронный ресурс] - Режим доступа: http://www.fcgsen.ru/5/arhiv.htm, свободный. - Загл. с экрана.

73. Сереброва, С.Ю. Ятрогенный дисбиоз кишечника у гастроэнтерологических больных / С.Ю. Сереброва // Рус.ский медицинский журнал. -2006. - Т. 14, №29. - С. 2110-2116.

74. Сидоренко, С.В. Этиология тяжелых госпитальных инфекций в отделениях реанимации и антибиотикорезистентность среди их возбудителей / С.В. Сидоренко, С.П. Резван, JI.B. Еремина // Антибиотики и химиотерапия. - 2005. - Т. 50, № 2 - 3. - С. 33- 41.

75. Симаненков, В.И. Пробиотиотики в терапии постинфекционного синдрома раздраженного кишечника / В.И. Симаненков, А.Н. Суворов, С.М. Захаренко, А.Н. Бочкарева, З.Р. Сундукова // Гастроэнтерология Санкт-Петербурга. - 2009. - № 4. - С. 25-28.

76. Сологуб, Т.В. Заболевания, протекающие с диарейным синдромом: учебно-метод. пособие / под ред. Т.В. Сологуб. Санкт-Петербург. - 2006. - 46 с.

77. Тец, В.В. Бактериальные биопленки. Антимикробная терапия / В.В. Тец // Consilium Medicum. - 2007. - Экстравыпуск. - С. 13-15.

78. Ткаченко, Е.И. Клинические возможности пробиотической терапии в коррекции нарушений липидного обмена у больных ишемической болезнью сердца / Е.И. Ткаченко, Ю.П. Успенский, Г.А. Баскович, В.М. Льнявина, Н.В. Барышникова, В.В. Петренко // Клиническое питание. 2006. - № 1-2. - С. 25-30.

79. Тюрин, В.П. Инфекционные эндокардиты / В.П. Тюрин. - М.: ГЭОТАР - Медиа, 2012. - 368 с.

80. Учайкин, В.Ф. Руководство по инфекционным заболеваниям у детей. - М.: Гэотар Медицина, 1999. - С. 492-494.

81. Учайкин, В.Ф. Руководство по инфекционным болезням у детей / Под ред. В.Ф. Учайкина - Гэотар Медицина, 2002. - 824 с.

82. Филиппова, Е.С. Изучение антибиотикорезистентности некоторых пробиотических штаммов. / Е.С. Филиппова, Н.А. Забокрицкий, А.В. Молдованов // Биомедицина.- 2010, № 5.- С. 142-144.

83. Хавкин, А.И. Коррекция дисбиотических изменений кишечника у детей на современном этапе / А.И. Хавкин, Н.С. Жихарева // Русский медицинский журнал. - 2006. - № 12(16). - С. 3-6.

84. Червинец, Ю.В. Бактериоциногенные высокоантагонистическиее штаммы лактобацилл / Ю.В. Червинец, В.М. Бондаренко, Н.А. Шабанова, A.M. Самоукина, В.М. Червинец // Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунологии. - 2006. - № 7. - С. 78-82.

85. Чернуха, М. Ю. Изучение состава микрофлоры толстого кишечника различных возрастных групп, проживающих в г. Москве / М. Ю. Чернуха, Г.В. Алексеева, JI.P. Аветисян, О. В. Кузнецова, К. Р. Толовская, И. А. Шагинян // Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунологии. - 2005. - № 4. - С. 69-73.

86. Чернуха, М.Ю. Антибиотикорезистентность и возможное происхождение штаммов Staphylococcus aureus и Klebsiella, выделенных от детей с дисбактериозом кишечника / М.Ю. Чернуха, JI.P. Аветисян, Г.В. Алексеева, О.В. Кузнецова, И.А. Шагинян // Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунологии. - 2005. - № 5. - С. 66-70.

87. Шульпекова, Ю.О. Кишечные бактерии, пробиотики и перспективы их применения для лечения заболеваний желудочно-кишечного тракта / Ю.О. Шульпекова // Фарматека. - 2008. - № 2. - С. 46-51.

88. Armand-Lefever, L. Imipenem resistance in Salmonella enterica serovar wein related to porin loss and CMV-4 b-lactamase production / L. Armand-Lefever // Antimicrobial Agents and Chemotherapy - 2000. - Vol.47. - P. 1165-1168.

89. Bratoeva, M.P. In vivo R-plasmid transfer in a patient with a mixed infection of Shigella dysentery / M.P. Bratoeva, J. F. John // Epidemiology & Infection. - 1994. - Vol.112. - P. 247-252.

90. Chang, Y. Ciprofloxacin and tetracycline susceptibility of lactobacilli isolated from indigenous children's feces / Y. Chang, Y.Wang, I. Wang, C. Lin, H. Chuang,Y. Wu, T.Chung, T. Chen // African Journal of Microbiology. - 2012. - Vol. 6(2)-P. 245-250.

91. Cheikhyoussef, A. Antimicrobial proteinaceous compounds obtained from bifidobacteria: from production to their application / A. Cheikhyoussef, N. Pogori, W. Chen, H. Zhang // International Journal of food microbiology. -2008. - Vol.125, №3 - P. 215-222.

92. Chow, A. W. Comparative In Vitro Activity of Newer Cephalosporins Against Anaerobic Bacteria / A. W. Chow, D. Bednorz // Antimicrobial Agents and Chemotherapy. - 1978. - Vol. 14, №. 5 P. - 668-671.

93. Chui, C.H. Isolation of Salmonella enterica serotype choleraesuis resistant to ceftriaxone and ciprofloxacin / C.H. Chui, L.H. Su, C. Chu, J.H. Chia, T.L. Wu, T.Y. Lin, Y.S. Lee, J.T. Ou // The Lancet. - 2004. - Vol. 363. - P. 1285-1286.

94. Citron, D. M., Tyrrell K. L., Merriam C.V., Goldstein E.J.C. Comparative In Vitro Activities of LFF571 against Clostridium difficile and 630 Other Intestinal Strains of Aerobic and Anaerobic Bacteria // Antimicrobial Agents and Chemotherapy.-2012.- Vol. 56, №. 5-P.2493-2503.

95. Collado, M.C. Antimicrobial peptides are among the antagonistic metabolites produced by Bifidobacterium against Helicobacter pylori / M.C. Collado,

A. González, R. González, M. Hernández, M.A. Ferrús, Y. Sanz // International Journal of Antimicrobial Agents - 2005. - № 5. - P. 385-391.

96. Conway, P. L. Selection criteria for probiotic microorganisms / P.L. Conway // Asia Pacific Journal of Clinical Nutrition. - 1996. - № 5. - P. 10-14.

97. Costerton, J. W. Bacterial biofilms: a common cause of persistent infections / J.W. Costerton, P.S. Stewart, E.P. Greenberg // Science. -1999. - Vol.284. - P. 1318 - 1322.

98. Cummings, J.H. Probiotics, prebiotics and antibiotics in inflammatory bowel disease / J.H. Cummings, S.C. Kong // Novartis Foundation symposium. -2004.-Vol. 263.-P. 99-111.

99. D'Aimmo, M.R. Antibiotic resistance of lactic acid bacteria and Bifidobacterium spp. isolated from dairy and pharmaceutical products / M.R. D'Aimmo, M. Modesto,

B. Biavati //International Journal of Food Microbiology. - 2007. - Vol. 115 - P. 35-42.

100. Davis, M.A. Multiresistant clones of Salmonella enterica: the importance of dissemination / M.A. Davis, D.D. Hancock, Т.Е. Besser // Journal of Laboratory and Clinical Medicine. - 2002. - Vol. 140. - P. 135-141.

101. Delgado, S. Antibiotic susceptibility of Lactobacillus and Bifidobacterium species from the human gastrointestinal tract / S. Delgado, A.B. Florez, B. Mayo // Current Microbiology. - 2005. - № 50(4). - P. 202-207.

102. Donohue, D.C. Safety of probiotics / D.C. Donohue // Asia Pacific Journal Clinical Nutrition. - 2006. - № 15(4). - P. 563-569.

103. Dunne, E.E. Emergence of domestically-acquired ceftriaxone-resistant Salmonella infections associated with AmpC b-lactamase / E.E. Dunne, P.D. Fey, P. Kludt, R. Reporter, F. Mostashari, P. Shillam, J. Wicklund, C. Miller, B. Holland, K. Stamey, T.J. Barrett, J.K. Rasheed, F.C. Tenover, E.M. Ribot, F.J. Angulo // Journal of the American Medical Association. - 2000. - Vol.284. - P. 3151-3156.

104. Egervârn, M. Identification and characterization of antibiotic resistance genes in Lactobacillus reuteri and Lactobacillus plantarum / M. Egervârn, S. Roos, H. Lindmark // Journal of Applied Microbiology. - 2009. - №5. - P.1658-1668.

105. European Committee on Antimicrobial Susceptibility Testing: Breakpoint tables for interpretation of MICs and zone diameters, Version 3.1, valid from 2013-02-11 [Электронный ресурс] - Электрон.дан. - Режим доступа: http://www.eucast.org/clinical_breakpoints/, свободный. - Загл. с экрана.

106. Farano, S. Intestinal microflora in early infancy: composition and development / S. Farano, R Chierici, P. Guerrini, V. Vigi // Acta Pediatr. - 2003. - Vol. 91. - P. 48-55.

107. Finlay, B. Common themes in microbial pathogenicity / B. Finlay, S. Falkow // Microbiology and Molecular Biology Reviews. - 1989. - Vol.53, № 2. - P. 210-230.

108. Fuller, R Probiotics and prebiotics: microflora management for improved gut health / R. Fuller, G.R Gibson // Clinical Microbiology and Infection. - 1998. - № 4. -P. 477-480.

109. Gfeller, K.Y. Molecular analysis of antimicrobial resistance determinants of commensal lactobacilli [Электронный ресурс] / K.Y. Gfeller - Режим

доступа: http://e-collection.library.ethz.ch/eserv/eth:26303/eth-26303-02.pdf, свободный. - Загл. с экрана. >

110. Ghigo, J.M. Natural conjugative plasmids induce bacterial biofilm development / J.M. Ghigo // Nature. - 2001. - Vol. 412.-P. 442-445.

111. Glass, R.I. The changing epidemiology of astrovirus-associated gastroenteritis / R.I. Glass, J. Noel, D. Mitchell; J.E. Herrmann, N.R. Blacklow, L.K. Pickering, P. Dennehy, G. Ruiz-Palacios, M.L. Guerrero, S.S. Monroe // Arch virol. - 1996. - № 12. - P. 287-300.

112. Glass, R.I. The epidemiology of enteric caliciviruses from humans: a reassessment using new diagnostics / R.I. Glass, J. Noel, T. Ando, R. Fankhauser, G. Belliot, A. Mounts, U.D. Parashar, J.S. Bresee, S.S. Monroe // Journal of Infectious Diseases. - 2000. - Vol. 181, №2. - P. 254-261.

113. Goldstein, E. J. C. Comparative In Vitro Activities of Ertapenem (MK-0826) against 1,001 Anaerobes Isolated from Human Intra-Abdominal Infections / E.J. C. Goldstein, D.M. Citron, C.V. Merriam, Y.A. Warren, K.L. Tyrrell // Antimicrobial Agents and Chemotherapy. - 2000. - Vol. 44, №. 9 - P. 2389-2394.

114. Goldstein, E.J.C. Comparative In Vitro Activities of XRP 2868, Pristina-mycin, Quinupristin-Dalfopristin, Vancomycin, Daptomycin, Linezolid, Clarithromycin, Telithromycin, Clindamycin, and Ampicillin against Anaerobic Gram-Positive Species, Actinomycetes, and Lactobacilli // E.J.C. Goldstein, D.M. Citron, C.V. Merriam, Y.A. Warren, K.L. Tyrrell, H.T. Fernandez, A. Bryskier // Antimicrobial Agents and Chemotherapy. - 2005. - Vol. 49, №. 1 - P. 408-513.

115. Gueimonde, M. Presence of specific antibiotic resistance genes in infant faecal microbiota / M. Gueimonde, S. Salminen, E. Isolauri // Fems Immunology and Medical Microbiology. - 2006. - № 48. - P. 21-25.

116. Hanson, N.D. Unusual Salmonella enterica serotype typhimurium isolate producing CMY-7, SHV-9 and ОХА-ЗО b-lactamases / N.D. Hanson, E.S. Moland, A. Hossain, S.A. Neville, I.B. Gosbell, K.S. Thomson // Journal of Antimicrobial Chemotherapy. - 2002. - Vol.49. - P. 1011-1014.

117. Haunsver, V. High rates of conjugation in bacterial biofilms as enter-mined by quantitave in situ analisis / V. Haunsver, S. Wuertz // Applied and Environmental Microbiology - 1999. - Vol.65. - P. 3710-3713.

118. Huys, G. Genetic Basis of Tetracycline and Minocycline Resistance in Potentially Probiotic Lactobacillus plantarum Strain CCUG 43738 / G. Huys, K. D'Haene, J. Swings // Antimicrobial Agents and Chemotherapy. - 2006. - № 50(4). -P. 1550-1551.

119. Isolauri, E. Probiotics: a role in the treatment of intestinal infection and inflammation / E. Isolauri, PV. Kiijavainen, S. Salminen // Gut. - 2002. - Vol. 50, №3. - P. 54-59.

120. Jacoby, G.A. Properties of plasmids responsible for production of extended-spectrum b -lactamases / G.A. Jacoby, L. Sutton // Antimicrobial Agents and Chemotherapy. - 1991. - Vol.35 - P. 164-169.

121. Kassinen, A. The fecal microbiota of irritable bowel syndrome patientas differs significantly from that of healthy subjects / A. Kassinen, L. Krogius-Kurikka,

H. Mäkivuokko, T. Rinttilä, L. Paulin, J. Corander, E. Malinen, J. Apajalahti, A. Pal-va // Gastroenterology. - 2007. - Vol. 133, №1. - P. 24-33.

122. Khalil, K. Occurrence and susceptibility to antibiotics of Shigella species in stools of hospitalized children with bloody diarrhea in Pakistan / K. Khalil, S.R. Khan, K. Mazhar, B. Kaijser, G.B. Lindblom // American Journal of Tropical Medicine and Hygiene. -1998. - Vol. 58. - P. 800-803.

123. Klare, I. Antimicrobial susceptibilities of Lactobacillus, Pediococcus and Lactococcus human isolates and cultures intended for probiotic or nutritional use /

I. Klare, C. Konstabel, G. Werner, G. Huys, V. Vankerckhoven, G. Kahlmeter, B. Hildebrandt, S. Muller-Bertling, W. Witte, H. Goossens // Journal of Antimicrobial Chemotherapy. - 2007. - Vol. 59(5) - P. 900-912.

124. Lanes, C. Propagation of Tem- and PSE-type b-lactamases among amoxicil-lin-resistant Salmonella spp. isolated in France / C. Lanes, V. Kirchgesner, P. Plesiat // Antimicrobial Agents and Chemotherapy. 1999. - Vol. 43. - P. 2430-2436.

125. Livermore, D.M. b-lactamases in laboratory and clinical resistance / D.M. Livermore // Clinical Microbiology Reviews.-1995.- Vol. 8- P. 557-84.

126. Lonkar, P. Isolation, In vitro Antibacterial Activity, Bacterial Sensitivity and Plasmid Profile of Lactobacilli / P. Lonkar, S.D. Harne, D.R. Kalorey, N.V. Kurkure // Asian-Australasian Journal of Animal Sciences. - 2005. - Vol 18, №. 9 - P. 1336-1342.

127. Luh, K. Quinupristin-Dalfopristin Resistance among Gram-Positive Bacteria in Taiwan / K. Luh, P. Hsueh, L. Teng, H. Pan, Y. Chen, J. Lu, J. Wu, S. Ho // Antimicrobial Agents and Chemotherapy. - 2000. - Vol. 44, №. 12 - P. 3374-3380.

128. Martiny, D. Comparison of the Microflex LT and Vitek MS systems for routine identification of bacteria by matrix-assisted laser desorption ionization-time of flight mass spectrometry / D. Martiny, L. Busson, I. Wybo, H. R. El, A. Dediste, O. Vandenberg // Journal of Clinical Microbiology. -2012. - № 50(4). -P. 1313-1325

129. Masco, L. Antimicrobial susceptibility of Bifidobacterium strains from humans, animals and probiotic products / L. Masco, K. Van Hoorde, E. De Brandt, J. Swings, G. Huys//Journal of Antimicrobial Chemotherapy. - 2006. - Vol. 58, № 1. - P. 85-94.

130. Matagne, A. Catalytic properties of class A b-lactamases: efficiency and diversity / A. Matagne, J. Lamotte-Brasseur, J.M. Frere // Biochemical Journal - 1998.- Vol. 1-P. 581-98.

131. Miendje Deyi, V.Y. Diagnostic value of five commercial tests for the rapid diagnosis of Clostridium difficile-associated disease / V.Y. Miendje Deyi, O. Vandenberg, G. Mascart, S. Gning, P. Retore, N. Douat, A. Dediste // Clinical Laboratory- 2008. Vol.54 (1-2).-p. 9-13.

132. Moubareck, C., Gavini F., Vaugien L., Butel M.J., Doucet-Populaire F. Antimicrobial susceptibility of bifidobacteria // Journal of Antimicrobial Chemotherapy." 2005.-Vol. 55, № 1-P. 38^14.

133. Nawaz, M. E. Characterization and transfer of antibiotic resistance in lactic acid bacteria from fermented food products / M.E. Nawaz, J. Wang, A. Zhou, C. Ma, X. Wu, J.E. Moore, B.C. Millar, J. Xu / Cuirent Microbiology. - 2011. - Vol. 62 (3) - P. 1081 -1089.

134. Neuwirth, С. Outbreak of TEM-24-producing Enterobacter aerogenes in an intensive care unit and dissemination of the extended-spectrum beta-lactamase to other members of the family Enterobacteriaceae / C. Neuwirth, E. Siebor, J. Lopez, A. Pechinot, A. Kazmierczak // Journal of Clinical Microbiology. - 1996. - № 34. - P. 76-79.

135. Oh, J.Y. Changes in patterns of antimicrobial susceptibility and inte-gron carriage among Shigella sonnei isolates from Southwestern Korea during epidemic periods / J.Y. Oh, H.S. Yu, S.K. Kim, S.Y. Seol, D.T. Cho, J.C. Lee // Journal of Clinical Microbiology. - 2003. - № 41. - P. 421-423.

136. Parkhill, J. Complete genome sequence of a multiple drug resistant Salmonella enterica serovar Typhi CT18 / J. Parkhill, G. Dougan, K.D. James, N.R. Thomson, DPickard, J. Wain, C. Churcher, K.L. Mungall, S.D. Bentley, M.T.Holden, M. Sebaihia, S.Baker, D. Basham, K. Brooks, T. Chillingworth, P.Connerton, A. Cronin, P. Davis, R.M. Davies, L. Dowd, N. White, J. Farrar, T. Feltwell, N. Hamlin, A. Haque, T.T. Hien, S. Holroyd, K. Jagels, A. Krogh, T.S. Larsen, S. Leather, S. Moule, P. O'Gaora, С. Рапу, M. Quail, K. Rutherford, M. Simmonds , J Skelton, K. Stevens , S. Whitehead, B.G. Barrell // Nature. - 2001. - Vol.413. - P. 848-852.

137. Parry, C.M. Typhoid fever / C.M. Рапу, T.T Hien, G. Dougan, N.J. White, J. J. Farrar//New England Journal of Medicine. 2002. - Vol. 347.-P. 1770-1782.

138. Performance Standards for Antimicrobial Disk Susceptibility Tests; Approved Standard - Eleventh Edition & Performance Standards for Antimicrobial Susceptibility Testing; Twenty Second Informational Supplement STANDARD published 01/01/2012 by Clinical and Laboratory Standards Institute [Электронный ресурс] - Электрон.дан. - Режим доступа: http://issuu.com/joellibro/docs/libro, свободный. - Загл. с экрана.

139. Qin, X. Ciprofloxacin-resistant gram-negative bacilli in the fecal microflora of children / X. Qin, Y. Razia, J.R. Johnson, J.R. Stapp, D.R. Boster, T. Tsosie, D.L. Smith, C.R. Braden, K. Gay, F.J. Angulo, P.I. Tarr // Antimicrobial Agents and Chemotherapy.- 2006. - Vol.50. - P. 3325-3329.

140. Quigley, E. Small Intestinal Bacterial Overgrowth: Roles of Antibiotics, Prebiotics, and Probiotics / E. Quigley, R. Quera // Journal Gastroenterology. -2006. - Vol. 130, Issue 2. - P. 78-90.

141. Roberts, M.C. Mechanisms of antibiotic resistance in oral bacteria [Электронный ресурс] / M.C. Roberts - Режим доступа: http://www.tufts.edu/med/apua/news/15_2b.html, свободный. - Загл. с экрана.

142. Roberts, А. P. Transfer of TN916-like elements in microcosm dental plaques / A. P. Roberts, G. Cheah, D. Ready, J. Pratten, M. Wilson, P. Mullany // Antimicrobial Agents and Chemotherapy. - 2001. - Vol.45 - P. 2943-2946.

143. Ruigomez, A. Risk of irritable bowel syndrome after an episode of bacterial gastroenteritis in general practice: influence of comorbidities / A. Ruigomez, L.A. Garcia Rodriguez, J. Paris // Clinical Gastroenterology and Hepatology. - 2007. - Vol. 5, №4. - P. 465-469.

144. Rodríguez-Pardo, D. Infections caused by Clostridium difficile / D. Pardo -Rodriguez, B. Mirelis, F. Navarro // Enfermedases Infecciosas y Microbiologia Clínica. -2013.-№4.- P254-263.

145. Sanders, M.E. Probiotics: considerations for human health / M.E. Sanders // Nutrition Reviews. - 2003. - Vol. 61, № 3. - P. 9-19.

146. Shanahan, P.M.A. Characterization of multi-drag resistant Salmonella typhi isolated from Pakistan / P.M.A. Shanahan, K.A. Karamat, C.J. Thomson, S.G. Amyes // Epidemiology and Infection - 2000. - Vol. 124. - P. 9-16.

147. Speldooren, V. Discriminatory detection of inhibitor-resistant b-lactamases in Escherichia coli by single-strand conformation polymorphism-PCR / V. Speldooren, B. Heym, R. Labia, M.-H. Nicolas-Chanoine // Antimicrobial Agents and Chemotherapy. - 1998. - Vol.42. - P. 879-884.

148. Swenson, J.M. Antimicrobial Susceptibility of Vancomycin-Resistant Leuconostoc, Pediococcus, and Lactobacillus Species / J.M. Swenson, R.R. Facklam, C. Thornsberry // Antimicrobial Agents and Chemotherapy. - 1990. - Vol. 34, №. 4 - P. 543-549.

149. Temmerman, R. Identification and antibiotic susceptibility of bacterial isolates from probiotic products / R. Temmerman // International Journal of Food Microbiology - 2003. - Vol. 25. - P. 1-10.

150. Thomas, C.M. Mechanisms of, and barriers to, horizontal gene transfer between bacteria / C.M. Thomas, K.M. Nielsen // Nature Reviews Microbiology. -2005.-Vol.3.-P. 711-721.

151. Topisirovic, L. Potential of lactic acid bacteria isolated from specific natural niches in food production and preservation / L. Topisirovic, M. Kojic, D. Fira, N. Golic, I. Strahinic, J. Lozo // International Journal of Food Microbiology. - 2006. - Vol 112(3). - P. 230-235.

152. Vanderhoof, J. A. The role of probiotics in the treatment of intestinal infections and inflammation / J.A. Vanderhoof, R.J. Young // Current Opinion in Gastroenterology. - 2001. - Vol. 17:1. - P. 58-62.

153. Verdet, C. A novel integron in Salmonella enterica serovar enteritidis, carryng the bla (DHA-1) gene and its regulator gene ampR, originated from Morganella morganii / C. Verdet, G. Arlet, G. Barnaud, P.H. Lagrange, A. Philippon // Antimicrob Agents Chemother. - 2000. - Vol.44. - P. 222-225.

154. Watnick P. Biofilm, city of microbes / P. Watnick, R.Kolter // Journal of Bacteriology. - 2000. - Vol.182. - P. 2675-2679.

155. Zarazaga, M. In Vitro Activities of Ketolide HMR3647, Macrolides, and Other Antibiotics against Lactobacillus, Leuconostoc, and Pediococcus Isolates / M. Zarazaga, Y. Saenz, A. Portillo, C. Tenorio, F. Ruiz-Larrea, R. Del Campo, F. Baquero, C. Torres // Antimicrobial Agents and Chemotherapy. - 1999. - Vol. 43, №. 12 - P. 3039-3041.

156. Zhou, J.S. Antibiotic susceptibility profiles of new probiotic Lactobacillus and Bifidobacterium strains /J.S. Zhou // International Journal of food microbiology. - 2005. - Vol. 98. - P. 211-217.

СПИСОК ИЛЛЮСТРАТИВНОГО МАТЕРИАЛА

Таблицы

1. Таблица 2.1 Объем проведенных исследований - с. 34.

2. Таблица 2.2 Питательные среды, применяемые в исследованиях - с. 35.

3. Таблица 2.3 Качественный и количественный состав микроорганиз-мовкишечника у здоровых людей (КОЕ/г фекалий) согласно ОСТ 91500.11.0004- 2003-с. 36.

4. Таблица 3.1.1 Диареегенные эшерихии, выделенные бактериологическим методом при диагностике дисбиоза кишечника в разных возрастных группах - с. 43

6. Таблица 3.1.2 Встречаемость условно-патогенных микроорганизмов при выделении диареегенных эшерихий в ходе бактериологического исследования на дисбиз кишечника - с. 44.

6. Таблица 3.1.3 Иерсинии, выделенные при диагностике дисбиоза кишечника в разных возрастных группах - с.45.

7. Таблица 3.1.4 Встречаемость условно-патогенных микроорганизмов при выделении иерсиний в ходе исследования на дисбиз кишечника - с.45.

8. Таблица 3.1.5 Сальмонеллы, выделенные бактериологическим методом при диагностике дисбиоза кишечника в разных возрастных группах - с. 46.

9. Таблица 3.1.6 Встречаемость условно-патогенных микроорганизмов при выделении сальмонелл в ходе исследования на дисбиз кишечника - с.47.

10. Таблица 3.3.1. Возбудители ОКИ, выявленные методом ПЦР при обследовании на дисбиоз кишечника - с. 49.

11. Таблица 4.1.1 Антибиотикорезистентность условно-патогенных микроорганизмов, выделенных при диагностике дисбиоза кишечника - с. 55.

12. Таблица 4.1.2 Случаи множественной лекарственной резистентности условно-патогенных энтеробактерий, выделенных при исследовании на дисбиоз кишечника - с. 57.

13. Таблица 4.1.3 Частота встречаемости ферментов резистентности у условно-патогенных энтеробактерий - с. 59-60.

14. Таблица 4.2.1 Штаммы резистентных к АБП патогенных энтеробак-терий, выделенные при исследовании на дисбиоз кишечника — с. 62.

15. Таблица 4.3.1 Ранжирование патогенных и условно-патогенных эн-теробактерий по устойчивости к антибактериальным препаратам — с.68.

16. Таблица 5.1.1 Происхождение штаммов, отобранных для тестирование на антибиотикорезистентность - с. 70.

17. Таблица 5.1.2 Литературные данные о резистентности бифидобакте-рий, выделенных из пищевых продуктов и пробиотических препаратов - с. 72.

18. Таблица 5.1.3 Литературные данные о резистентности лактобакте-рий, выделенных из пробиотических препаратов - с. 73.

19. Таблица 5.1.4 Литературные данные о резистентности лактобакте-рий, выделенных из кишечника, а также являющихся клиническими изолята-ми и вызывающими различные инфекционные процессы - с. 74-75.

20. Таблица 5.1.5 Интерпретация результатов тестирования штаммов Lactobacillus к антибактериальным препаратам — с. 77.

21. Таблица 5.1.6 МИК для штаммов лактобактерий, выделенных при диагностике дисбиоза кишечника и пробиотических лакто- и бифидобакте-рий - с. 78-79.

22. Таблица 5.1.7 Множественная лекарственная устойчивость лакто- и би-фидобактерий - с. 83.

23. Таблица 5.2.1 МИК для штаммов Enterococcus faecium, выделенных при обследовании на дисбиоз кишечника и из пробиотиков - с. 88.

24. Таблица 5.2.2 Резистентность штаммов Enterococcus faecium, выделенных при обследовании на дисбиоз кишечника, из мочи и из пробиотиков — с. 89.

Рисунки

1. Рисунок 3.3.1 - с. 50. Возбудители кишечных инфекций, выявленные при расширенном исследовании на дисбиоз кишечника с использованием метода ПЦР

2. Рисунок 4.2.1 Случаи МЛУ патогенных энтеробактерий, выделенных при обследовании на дисбиоз кишечника - с. 64.

3. Рисунок 4.3.1 Совпадение антибиотикорезистентности патогенных и условно-патогенных энтеробактерий, выделенных от одного обследуемого — с. 66.

4. Рисунок 5.1.1 Доля изолятов лактобактерий, выделенных от пациентов при исследовании на дисбиоз кишечника, устойчивых и высокоустойчивых к антибактериальным препаратам - с. 84.

5. Рисунок 5.1.2 Доля изолятов лактобактерий, выделенных из пробио-тиков, устойчивых и высокоустойчивых к антибактериальным препаратам -с. 84.

6. Рисунок 5.1.3 Доля изолятов бифидобактерий, выделенных из про-биотиков, устойчивых и высокоустойчивых к антибактериальным препаратам - с. 85.

7. Рисунок 6.1 Возбудители ОКИ, выделенные при бактериологическом исследовании на дисбиоз кишечника по стандартной методике - с. 90.

8. Рисунок 6.2 Возбудители ОКИ, выделенные при расширенном исследовании на дисбиоз кишечника с использованием ПЦР - с. 91.

Г«Ш£Ж> ДШ