Условно-патогенные энтеробактерии: доминирующие популяции, биологические свойства, медико-экологическая значимость тема диссертации и автореферата по ВАК РФ 03.02.03, доктор биологических наук Анганова, Елена Витальевна

• Анганова, Елена Витальевна
• доктор биологических наук
• 2012

Оглавление диссертации доктор биологических наук Анганова, Елена Витальевна

Список сокращений

Введение

ГЛАВА 1. Обзор литературы

1.1. Условно-патогенные микроорганизмы и их патогенный потенциал

1.2. Условно-патогенные энтеробактерии в инфекционной патологии человека, в т.ч. в этиологической структуре острых кишечных инфекций

1.3. Условно-патогенные энтеробактерии в микробных сообществах водных экосистем и их биологические свойства

1.4. Молекулярно-генетическая характеристика условно патогенных энтеробактерий

1.5. Антибиотикоустойчивость как одно из важнейших свойств условно-патогенных микроорганизмов

1.6. Адаптационный потенциал условно-патогенных энтеробактерий

ГЛАВА 2 Материалы и методы исследования (эпидемиологические, микробиологические, молекулярно-генетические, статистические)

ГЛАВА 3. Эпидемиологический анализ заболеваемости острыми кишечными инфекциями, в.т.ч. вызванными условно-патогенными энтеробактериями, в Иркутской области и г. Иркутске. Спектр микроорганизмов, выделяемых при ОКИ.

ГЛАВА 4. Условно-патогенные энтеробактерии в микробных сообществах водных экосистем Восточной Сибири, доминирующие популяции, значимость в оценке трансформации микробных сообществ

ГЛАВА 5. Биологическая активность условно-патогенных энтеробактерий

5.1. Фенотипические проявления условно-патогенных представителей семейста Enterobacteriaceae, выделенных из фекалий больных острыми кишечными инфекциями

5.2. Биологическая активность УПЭ водных экосистем

ГЛАВА 6. Антибиотикорезистентность условно-патогенных микроорганизмов

6.1. Антибиотикорезистентность условно-патогенных энтеробактерий, выделенных из фекалий больных ОКИ

6.2. Антибиотикорезистентность водных изолятов условно-патогенных энтеробактерий

ГЛАВА 7. Результаты выявления у условно-патогенных энтеробактерий генетических маркеров «островов» патогенности

ГЛАВА 8. Клинико - эпидемиологические аспекты острых кишечных инфекций, сопровождающихся выделением условно-патогенных энтеробактерий

ГЛАВА 9. Адаптационный потенциал условно-патогенных энтеробактерий, выделенных от больных и из водных объектов (вариабельность ферментативной активности, способность к формированию биопленок).

ГЛАВА 10. Обсуждение результатов исследований 228 ВЫВОДЫ 263 ПРАКТИЧЕСКИЕ РЕКОМЕНДАЦИИ 265 СПИСОК ИСПОЛЬЗОВАННОЙ ЛИТЕРАТУРЫ

СПИСОК СОКРАЩЕНИЙ

АМП - антимикробные препараты

АБП - антибактериальные препараты

АЛА - антилизоцимная активность

АИА - антиинтерфероновая активность

АКА - антикомплементарная активность

АлфА - антилактоферриновая активность

БЛРС - бета-лактамазы расширенного спектра (Extended spectrum beta-lactamases - ESBL)

ГА - гемолитическая активность

ДДМ - диско-диффузионный метод

ЖКТ - желудочно-кишечный тракт

ИАР - индекс антибиотикорезистентности

ИЭС - индекс эпидемиологической ситуации

ИМС - инфекции мочевой системы

КА - кровяной агар

КОЕ - колониеобразующие единицы

MAP множественная антибиотикорезистентность

МИК - минимальная ингибирующая концентрация

МХА - агар Мюллера - Хинтон

НГОБ - неферментирующие бактерии

ОКИ - острые кишечные инфекции

ОКИУЭ - острые кишечные инфекции установленной этиологии

ОКИНУЭ - острые кишечные инфекции неустановленной этиологии

ОКБ - общие колиформные бактерии

ОП оптическая плотность

ПА - протеолитическая активность

ПЦР - полимеразная цепная реакция

УПМ - условно-патогенные микроорганизмы

УПЭ - условно-патогенные энтеробактерии

ТКБ - термотолерантные колиформные бактерии

ЭПКП - энтеропатогенная кишечная палочка

NCCLS - National Committee for Clinical Laboratory Standarts (Национальный комитет по клиническим лабораторным стандартам США)

CLSI - Institute of Clinical and Laboratory Standards (Институт клинических и лабораторных стандартов)

Введение диссертации (часть автореферата) на тему «Условно-патогенные энтеробактерии: доминирующие популяции, биологические свойства, медико-экологическая значимость»

Актуальность проблемы. В настоящее время во всех странах мира наблюдается активизация условно-патогенных микроорганизмов (УПМ) (Бондаренко В.М., 2011). Бактерии данной группы характеризуются выраженной неоднородностью, являясь, с одной стороны, представителями транзиторной нормальной микрофлоры человека, а с другой,- возбудителями инфекционных заболеваний (Марри П.Р. с соавт., 2006; Егорова С.А., 2007; Бондаренко В.М., 2011). В связи с этим, проблеме инфекций, обусловленных УПМ, особенно представителями семейства Enterobacteriaceae, уделяется пристальное внимание (Ахтариева A.A., 2010). К числу наиболее распространенных инфекционных заболеваний относятся острые кишечные инфекции (ОКИ), занимающие одно из ведущих мест в инфекционной патологии детского возраста (Воротынцева Н.В. соавт., 2001; Жеребцова Н.Ю. с соавт., 2007; Денисюк Н.Б., 2011; Хворостухина А.И., 2011; Калуцкий П.В., 2011). Доля ОКИ, вызванных условно-патогенными энтеробактериями (УПЭ), в общей структуре ОКИ установленной этиологии, по данным разных авторов, варьирует от 12,8-21,2% до 34,1% (Зуева Л.П., 2005; Жеребцова Н.Ю., 2006).

В связи с разноречивостью мнений относительно участия УПЭ в этиологии кишечных инфекций, А.Р. Мавзютов с соавт. (2001), С.А.Егорова (2008), В.М. Бондаренко (2011), JI.B. Михайлова (2011) отмечают, что для оценки этиологической значимости УПЭ при инфекционных процессах необходимо заключение об их патогенном потенциале, который недостаточно учитывается при верификации острых кишечных инфекций. Кроме того, масштабы изменения патогенности условно-патогенных энтеробактерий, являющиеся одной из причин увеличения их медицинской значимости, свидетельствуют о целесообразности изучения этого явления у данной группы бактерий, как на фенотипическом, так и на молекулярно-генетическом уровне (Мавзютов А.Р. с соавт., 2002; Фиалкина C.B., 2004; Жеребцова Н.Ю., 2006; Вершинин А.Е., 2008; Бондаренко В.М., 2011; Burgos

Y. et al., 2010). В то же время, патогенность и региональные особенности возбудителей острых кишечных инфекций, обусловленных УПЭ, до сих пор изучены недостаточно.

Одним из важнейших аспектов фенотипической характеристики условно-патогенных энтеробактерий является их резистентность к антимикробным препаратам (АМП) (Страчунский Л.С., 2002; Скала JI.3. с соавт., 2004; Бочков И.А. с соавт., 2009; Tenover F.С., 2005). При этом, как отмечает А.Е. Билев (2011), массовое распространение антибиотикорезистентных штаммов в популяциях условно-патогенных микроорганизмов стало важной проблемой клинической медицины, в связи с их более высокими адаптационными возможностями по сравнению с возбудителями классических инфекций.

На фоне информации о роли условно-патогенных микроорганизмов в инфекционной патологии человека недостаточно изученной остается проблема их циркуляции в природных, в частности, водных экосистемах. Между тем, адаптивные возможности бактерий данной группы и, соответственно, их потенциальные местообитания, экологические ниши, механизмы и формы существования в природе необычайно широки и многообразны (Бухарин О.В., 1997). Особое значение имеет изучение циркуляции бактерий данной группы в водных объектах, оказывающих существенное влияние на жизнедеятельность человеческой популяции (Мамонтова JIM. с соавт., 2000). Условно-патогенные микроорганизмы способны не только длительно обитать в субстратах внешней среды, в частности, в воде, но и накапливаться в ней. Выживанию и накоплению микроорганизмов в объектах внешней среды, в т.ч. в воде, способствуют факторы персистенции (Макаров В.Ю., 2007). Также у водных штаммов УПЭ выявлены адгезивная и гемолитическая активность, описаны ферменты ДНКаза, гиалуронидаза, некоторые протеиназы (Езепчук Ю.В., 1985; Кравченко О.С., 2009;), резистентность к антимикробным препаратам (Загайнова A.B., 2010). Усиливающееся антропогенное воздействие на водные экосистемы определяет необходимость изучения циркуляции и биологических свойств УПЭ с позиций оценки их потенциальной эпидемической опасности и влияния на экологическое состояние микробиоценозов природных водоемов. В рамках изучения биологической активности УПЭ важное значение имеет выявление их адаптационных возможностей, способствующих выживанию в различных условиях среды обитания, в частности, вариабельность ферментативного аппарата и способность к формированию биопленок. В связи с этим роли биопленок в окружающей среде и организме хозяина в последнее время уделяется особое внимание (Романова М.Ю. с соавт., 2011; СЬашЫеББ Л). е1 а1., 2006).

Исходя из вышеизложенного целью работы является: выявить доминирующие популяции, фенотипические и генотипические характеристики, адаптационный потенциал условно-патогенных энтеробактерий на моделях острых кишечных инфекций и водных экосистем для оценки их медико-экологической значимости.

Для выполнения указанной цели поставлены следующие задачи.

1. Изучить спектр условно-патогенных энтеробактерий, выделенных при острых кишечных инфекциях установленной этиологии, у детей Иркутской области.

2. Изучить циркуляцию бактерий данной группы в микробных сообществах водных экосистем на модели крупнейших водоемов Восточной Сибири, их таксономическую характеристику, выявить доминирующие и субдоминирующие популяции, видовое разнообразие.

3. Определить фенотипические характеристики условно-патогенных энтеробактерий, выделенных от больных ОКИ, а также из водных объектов.

4. Определить и оценить частоту встречаемости у микроорганизмов генетических детерминант патогенности.

5. Оценить резистентность к антимикробным препаратам условно-патогенных энтеробактерий, выделенных от больных ОКИ и из водных объектов.

6. Провести анализ клинических аспектов острых кишечных инфекций, обусловленных бактериями семейства Еп1егоЬас1епасеае, их сопряженность с наличием генетических детерминант патогенности микроорганизмов.

7. Изучить адаптационный потенциал клинических и водных штаммов энтеробактерий в различных условиях существования (количественная оценка ферментативной активности, способность к образованию биопленок).

Научная новизна и теоретическая значимость работы Определен таксономический спектр условно-патогенных энтеробактерий, выделяемых при ОКИ, у детей Иркутской области, его смена в многолетнем аспекте, выявлены субдоминирующие популяции, изучены патогенные свойства, дана оценка влияния факторов патогенности на клинико-эпидемиологические особенности острых кишечных инфекций.

Полученные данные о фенотипических маркерах условно-патогенных энтеробактерий вносят вклад в изучение патогенности бактерий данной группы, их участия на различных этапах инфекционного процесса.

Определены генетические маркеры УПЭ, информативные при оценке их этиологической значимости при ОКИ {ЫуА, МуВ, з/аА, я/аО, \тА, 1гр-2). Показаны различия в частоте встречаемости генов патогенности у различных видов представителей семейства Еп1егоЬас1епасеае.

Показана значимость условно-патогенных энтеробактерий, их биологической активности, персистентного потенциала, распространенности генетических маркеров патогенности среди водных изолятов для оценки экологического состояния микробиоценозов водных экосистем и потенциальной опасности водной среды

Получены данные об адаптационных возможностях УПЭ (вариабельность ферментативного аппарата УПЭ, способность к формированию биопленочных сообществ), что позволяет внести вклад в решение проблемы по изучению их адаптации к различным условиям обитания.

Практическая значимость

Определены основные виды условно-патогенных представителей семейства Еп1егоЬас1епасеае в структуре ОКИ и маркеры их патогенности, существенно важные с клинической точки зрения.

Данные, полученные при определении фенотипических и генотипических факторов патогенности бактерий указанной группы, вносят вклад в оценку их этиологической и эпидемиологической значимости.

Мониторинг антибиотикоустойчивости УПЭ позволяет создать паспорт резистентности возбудителей ОКИ для построения формуляра АМП и определения политики их применения

Разработанный способ определения гетерогенности микробных популяций по показателю антибиотикорезистентности УПЭ позволяет проводить оценку их потенциальной опасности и расширить возможности биотестирования водных экосистем.

Разработанный способ определения гетерогенности микробных популяций по показателю антибиотикорезистентности УПЭ позволяет проводить оценку их экологического состояния и расширить возможности биотестирования водных экосистем.

Данные по изучению микробиоценозов крупнейших водоемов Восточной Сибири могут быть использованы в качестве базовой информации для мониторирования водных экосистем.

Внедрения. Материалы исследований используются в практике работы Управления Федеральной службы в сфере защиты прав потребителей и благополучия человека по Республике Саха (Якутия) для целей микробиологического мониторинга поверхностных водоемов; в практике работы Управления Федеральной службы по надзору в сфере защиты прав потребителей и благополучия человека по Иркутской области для целей эпидемиологического надзора за острыми кишечными инфекциями; внедрены в учебный процесс на кафедре эпидемиологии и микробиологии ГБОУ ДПО «Иркутская государственная медицинская академия последипломного образования» (акт внедрения №16 от 22.10.2011). Результаты исследований использованы при издании учебных пособий для врачей: «Микробиологический мониторинг водных экосистем» (2008); «Техногенное загрязнение окружающей среды и инфекционная патология (клинико-эпидемиологические обобщения)» (2008); «Проявление инфекционной патологии в условиях техногенного загрязнения окружающей среды» (учебное пособие для системы послевузовского профессионального образования врачей, утввержденный УМО по медицинскому и фармацевтическому образованию вузов России (УМО -17-28/78 от 26.02.2010), методических рекомендаций для врачей «Выявление факторов риска в эпидемиологическом анализе» (2011).

По результатам исследований получены Свидетельства Федеральной службы по интеллектуальной собственности, патентам и товарным знакам (РОСПАТЕНТ) о гос. регистр. БД № 2010620379 от 14.07.2010г. «Биопрофиль условно-патогенных энтеробактерий - возбудителей острых кишечных инфекций у детей»; № 2010620552 от 24.09.2010г. «Таксономическая характеристика и биологические свойства условно-патогенных микроорганизмов водных экосистем»; № 2011620192 от 11.03.2011г. «Клинико-эпидемиологические особенности острых кишечных инфекций, обусловленных условно-патогенными микроорганизмами»; № 2011620513 от 13.07.2011г. «Антибиотикоустойчивость аутохтонных и аллохтонных представителей микробного сообщества водных экосистем».

Положения, выносимые на защиту:

1. Основными представителями условно-патогенных энтеробактерий в структуре бактериальных ОКИ установленной этиологии являются бактерии родов Enterobacter, Proteus, Klebsiella и Citrobacter (класс субдоминант). Данные виды энтеробактерий (а также E.coli и Pantoea) присутствуют (с изменением степени доминирования) и в таксономическом спектре грамотрицательной составляющей микробиоценозов водных экосистем.

2. Условно-патогенные бактерии семейства Еп1егоЬас1епасеае характеризуются выраженной фенотипической и генотипической гетерогенностью, что необходимо учитывать при оценке их этиологической и эпидемиологической значимости.

3. Условно-патогенные энтеробактерии, выделенные от больных ОКИ, несут генетические маркеры патогенности, детерминирующие важные этапы взаимодействия возбудителя с клетками организма хозяина: адгезию, продукцию гемолизинов, размножение в тканях (ЫуА, МуВ, я/аА, я/аС, АтА, ггр-2). Наличие у клинических штаммов энтеробактерий генетических детерминант патогенности сопряжено с утяжелением клинической картины заболевания.

4. Распространенность условно-патогенных энтеробактерий, их таксономическая характеристика, степень доминирования, биологическая активность, персистентный потенциал, наличие генетических маркеров патогенности, антибиотикоустойчивость являются индикаторами степени потенциальной опасности водных микробиоценозов.

5. Условно-патогенные бактерии семейства Еп1егоЬас1епасеае (клинические и водные изоляты) характеризуются адаптационным потенциалом, отражающимся качественными и количественными проявлениями ферментативной активности, а также способностью к формированию биопленочных сообществ.

Апробация работы

Материалы диссертационной работы были представлены на: Российской научно-практ. конференции, посвящ. 100-летию профессора Е.В. Талалаева «Оценка современного состояния микробиологических исследований в Восточно-Сибирском регионе» (Иркутск, 2002); Межрегиональной научно-практ. конференции «Биология микроорганизмов и их научно-практическое использование» (Иркутск, 2004); научно-практической конференции «Здоровье населения Иркутской области: проблемы и пути решения» (Иркутск, 2003); I межрегиональном семинаре «Организация санитарноэпидемиологического мониторинга за острыми кишечными инфекциями» (Иркутск, 2006); научно-практ. конференции «Оценка эколого-экономической ситуации загрязнения водных экосистем в бассейне оз. Байкал и управление экологическим риском» (Иркутск, 2006); научно-практ. конференции «Среда обитания человека и санитарно-эпидемиологическое благополучие населения» (Улан-Удэ, 2006, Управление Федеральной службы по надзору в сфере защиты прав потребителей и благополучия человека по республике Бурятия); III Российской научной конференции с международным участием «Проблемы инфекционной патологии в регионах Сибири, Дальнего Востока и Крайнего Севера» (Новосибирск, 2006); Всероссийской научно-практ. конференции «Здоровая семья - здоровый ребенок», поев. 20-летию образования Института педиатрии и репродукции человека СО РАМН (Иркутск, 2009); Всероссийском пленуме Научного совета по экологии человека и гигиене окружающей среды РАМН и Минздравсоцразвития РФ (Москва, 2009, ГУ НИИ ЭЧ И ГОС им. А.Н.Сысина РАМН); научной конференции с международным участием «Этиологические, эпидемиологические и клинические аспекты инфекционных болезней» (к 90-летию кафедры микробиологии, вирусологии и иммунологии Иркутского государственного медицинского университета) (Иркутск, 2010); региональной научно-практ. конференции с международным участием «Актуальные вопросы инфекционной патологии» (Иркутск, 2010); III межрегиональном семинаре «Организация санитарно-эпидемиологического мониторинга за острыми кишечными инфекциями» (Иркутск, 2010); международной конференции «Проблемы экологии». Чтения памяти профессора М.М. Кожова (Иркутск, 2010); II Международной научно-практ. конференции «Экология, здоровье, спорт» (Чита, 2010); международной конференции «Экология и геохимическая деятельность микроорганизмов экстремальных местообитаний» (Улан-Удэ, 2011); всероссийской научно-практ. конференции с междунар. участием «Окружающая среда и здоровье населения» (г. Иркутск, 2011); всероссийской научно-практ. конференции с между нар. участием «Актуальные проблемы эпидемиологии на современном этапе» (Москва, 2011); Пленуме Научного совета по экологии человека и гигиене окружающей среды «Актуализированные проблемы здоровья человека и среды его обитания и пути их решения» (Москва, 2011).

Публикации

Основные положения диссертационной работы нашли отражение в 59 научных публикациях, в т. ч. в журналах, рекомендованных ВАК для публикации материалов докторских диссертаций - 22, монографиях - 2, пособиях для врачей - 3, из них утвержденных УМО по медицинскому и фармацевтическому образованию вузов России - 1, методических рекомендациях для врачей -1, базах данных, получивших Свидетельства РОСПАТЕНТа - 4.

Структура и объем диссертации

Диссертация состоит из введения, обзора литературы, описания материалов и методов, результатов собственных исследований, отраженных в 7 главах, главы обсуждения полученных материалов, выводов, списка использованных источников литературы. Работа изложена на 302 страницах, иллюстрирована 112 рисунками и 25 таблицами. Список литературы содержит 398 работ, из них 285 отечественных и 113 зарубежных авторов.

Заключение диссертации по теме «Микробиология», Анганова, Елена Витальевна

выводы

1. Основными представителями условно-патогенных энтеробактерий в структуре бактериальных ОКИ установленной этиологии являются бактерии родов Enterobacter, Proteus, Klebsiella и Citrobacter (класс субдоминант), характеризующиеся сменой вариантного и количественного состава в многолетнем аспекте. Данные виды энтеробактерий (а также E.col и Pantoea) присутствуют (с изменением степени доминирования) и в таксономическом спектре грамотрицательной составляющей микробиоценозов водных экосистем.

2. Патогенность УПЭ, характеризующихся выраженной фенотипической неоднородностью, определяется свойствами конкретного штамма, а не видовой или родовой принадлежностью. Среди клинических штаммов УПЭ преобладают (р<0,01) изоляты, которым свойственно наличие двух (32,9±1,5%) и более (39,4±1,6%) маркеров, коррелирующих с патогенностью.

3. Клинические штаммы условно-патогенных энтеробактерий обладают фенотипическими маркерами (антилизоцимной, адгезивной, фосфатазной (40-50%), гемолитической и протеолитической (около 30%>) активностью, а также продукцией ДНКазы (26,5±1,4%), способствующими реализации их патогенного потенциала и обеспечивающими их участие на различных этапах инфекционного процесса. При этом УПЭ, выделенные от больных ОКИ, значимо чаще (р<0,01) характеризовались наличием фенотипических признаков по сравнению со штаммами контрольной группы.

4. Условно-патогенные энтеробактерии, выделенные от больных ОКИ, несут генетические маркеры патогенности (23,4±3,2%), детерминирующие важные этапы взаимодействия возбудителя с клетками организма хозяина: адгезию, продукцию гемолизинов, размножение в тканях (hlyA, hlyB, sfaA, sfaG, fimA, irp-2), свидетельствующие об их этиопатогенетической значимости. Наиболее широкий набор генетических маркеров патогенности выявлен у бактерий рода Klebsiella, доля которых в структуре ОКИ у детей в последние годы значимо возрастает.

5. В большинстве случаев генетические детерминанты патогенности обнаружены у культур, выделенных от детей до 3-х лет, у которых отмечен и самый широкий набор генетических маркеров. У детей указанной возрастной группы риска отмечается и наиболее тяжелое клиническое течение ОКИ.

6. Популяция клинических штаммов УПЭ гетерогенна по отношению к антимикробным препаратам и характеризуется значительным распространением антибиотикорезистентых штаммов (свойством полирезистентности обладают 54,9±1,2%, более трети микроорганизмов резистентны к двум-пяти препаратам, монорезистентны лишь 6,3±0,6% штаммов). Клинические штаммы энтеробактерий обладают более высоким (р<0,05) уровнем резистентности к В-лактамным антибиотикам и низким - к фторхинолонам и аминогликозидам III поколения.

Энтеробактерии, выделенные от больных ОКИ, характеризуются более высокой частотой встречаемости антибиотикорезистентных штаммов по сравнению со штаммами контрольной группы, среди которых не было выявлено полирезирезистентных штаммов и отмечено значимое (р<0,01) преобладание чувствительных (58,5±4,7%) и монорезистеных (30,2±4,4%) УПЭ.

7. Условно-патогенные энтеробактерии, выделенные из водных объектов, характеризуются значимо более редкой (по сравнению с клиническими штаммами) частотой встречаемости исследованных фенотипических признаков, среди которых преобладают штаммы с одним маркером (41,3%). Биопрофиль водных штаммов УПЭ характеризуется преобладанием персистентных свойств, способствующих их выживанию в окружающей среде. В районах антропогенного загрязнения наблюдается усиление биологической активности УПЭ (адгезивная, антилизоцимная, фосфатазная, ДНКазная и гемолитическая активность), определяя экологическую значимость данной группы бактерий.

8. Водные штаммы УПЭ обладают генетическими маркерами патогенности, что свидетельствует об их потенциальной эпидемиологической опасности. Вместе с тем, частота обнаружения данных детерминант была ниже (р<0,05) по сравнению с клиническими штаммами, и характеризовалась встречаемостью только двух генов (ЫуА, з/аС) и минимальным набором генетических маркеров патогенности.

9. Условно-патогенные энтеробактерии, выделенные из водных объектов, в отличие от клинических, среди которых не обнаружены штаммы, чувствительные ко всем протестированным АМП, характеризовались принадлежностью (по индексам антибиотикорезистентности) к четырем кластерам (чувствительные, моно-, умеренно- и полирезистентные). Гетерогенность микробных популяций УПЭ по антибиотикорезистентности отражает экологическое состояние микробиоценозов водных экосистем и данный показатель может быть использован в качестве инструмента оценки при их биотестировании.

10. Содержание грамотрицательных условно-патогенных энтеробактерий в микробиоценозах водных экосистем определяет потенциальную опасность водного объекта, оказывая влияние на уровень антибиотикорезистентности штаммов. При повышении удельного веса УПЭ на 1% имеет место увеличение содержания антибиотикорезистентных штаммов на 1,6% (гх>у= 0,7381; тг = ±0,131; р<0,01).

11. Для условно-патогенных энтеробактерий, изолированных от больных ОКИ и водных объектов, характерен выраженный адаптационный потенциал, реализуемый путем перестройки их ферментативной активности и формирования биопленочных сообществ, определяя тем самым способность выживания бактерий как в организме хозяев, так и в окружающей внешней среде.

ПРАКТИЧЕСКИЕ РЕКОМЕНДАЦИИ

В отношении условно-патогенных энтеробактерий, выделяемых при острых кишечных инфекциях:

- Для выявления смены таксономического и количественного состава условно-патогенных этиологических агентов острых кишечных инфекций и оценки их патогенности следует проводить анализ доминирования представителей данной группы с определением важнейших факторов патогенности.

Для подтверждения этиопатогенетической значимости УПЭ, выделяемых при острых кишечных инфекциях, рекомендуется определение генов «островов» патогенности (ЫуВ, ЫуА, я/аА, з/аС, /гтА, ¡.гр-2).

- Проводить мониторинг антибиотикоустойчивости УПЭ, что позволит создать паспорт резистентности возбудителей ОКИ для построения формуляра АМП и определения политики их применения.

Для расширения возможностей, повышения информативности биотестирования циркуляции УПЭ в водных экосистемах и выявления их потенциальной опасности целесообразен комплексный подход, отражающий следующие аспекты:

- Оценка структуры микробиоценоза водных экосистем (доля условно-патогенных микроорганизмов); таксономическая характеристика условно-патогенной составляющей микробиоценоза, структурированность степени доминирования различных представителей УПЭ и их оценка с использованием различных дополнительных показателей (видового разнообразия, индекс антибиотикорезистентности);

- Оценка уровня распространенности и выраженности биологической активности и персистентного потенциала УПЭ с анализом их популяционного биопрофиля;

- Выявление генетических детерминант патогенности, ответственных за адгезивную, инвазивную активность и другие свойства, для определения потенциальной опасности УПЭ водных микробиоценозов;

- Определение гетерогенности микробных популяций по показателю антибиотикорезистентности с позиции кластерной структурированности и оценка на ее основе состояния микробиоценозов водных экосистем.

Список литературы диссертационного исследования доктор биологических наук Анганова, Елена Витальевна, 2012 год

1. Абаев Ю.К. Проблема инфекции в педиатрии / Ю.К. Абаев // Медицинские новости. 2007. - №4. - С. 8-17.

2. Агаева P.A. Некоторые эпидемические данные об острых кишечных заболеваниях, сопровождающихся выделением бактерий рода Proteus / P.A. Агаева//Журн. микробиол.-1978.-№5,- С. 146-147.

3. Андреев В.А. Сравнительная оценка питательных сред Мюллер-Хинтон и АГВ / В.А. Андреев, A.M. Иванов /Тезисы IX съезда Всерос. научно-практического общества эпидемиологов, микробиологов и паразитологов, 2627 апреля 2007г.-М., 2007.-Т.З.-С.6-7.

4. Амшарин И.П. Статистические методы в микробиологических исследованиях /И.П. Амшарин, A.A. Воробьев,-1962.- 180с.

5. Астафьев В.А. Заболеваемость острыми кишечными инфекциями и биологическое загрязнение окружающей среды в Сибири : Автореф. дисс. докт. мед. наук. 14.00.30- эпидемиология,- НЦ МЭ ВСНЦ СО РАМН,-Иркутск,- 2007. 38с.

6. Баканов А.И. Количественная оценка доминирования в экологических сообществах / А. И. Баканов // ИБВВ АН СССР.- 1987,- 63 с. Деп. в ВИНИТИ. 08.12.1987, № 8593-В87.

7. Байковская Ю.В. Острые кишечные инфекции у детей в г. Томске //Ю.В. Байковская, С.Ю. Попадейкина, С.Я.Шишикина// Журнал инфектологии.-201 l.-T.3.-№ З.-С. 29.

8. Белобородова Н.В. Клиническое значение микробных биопленок /2011/ http://www.internist.ru / 25.12.2011/

9. Белова Е. Лечение острых кишечных инфекций: к детям нужен особый подход/ Фармацевтический вестник //http://medicina-online.ru/articles /2007/ 48047/2.03.2010/

10. Беляев Е.И. Пути усовершенствования препаратов, нормализующих микрофлору кишечника / Е.И. Беляев // Аутофлора человека в норме и патологии и ее коррекция.- Горький.-1988.- С.74-79.

11. Березин А.Г. Характеристика и клиническое значение бета-лактамаз расширенного спектра / А.Г. Березин, Ромашов О.М., Яковлев С.В., Сидоренко С.В. // Антибиотики и химиотерапия.- 2003.- Т.48.-№7.

12. Бернасовская Е.П. Острые кишечные инфекции, вызванные условно-патогенными микроорганизмами / Е.П. Бернасовская, В.Н. Бычковский, С.И. Бидненко. К.: Здоровье.- 1984,- 152с.

13. Бешлиев Д.А. Диагностика и лечение острого пиелонефрита / Д.А. Бешлиев, J1.A. Ходырева// Журн. Трудный пациент,- 2007.- №12-13.-С.5-9.

14. Биоценоз-сберегающая терапия кишечных инфекций у детей / А.А. Новокшонов, В.Ф. Учайкин, Н.В. Соколова, О.Н. Тихонова и др. //http://www.medgate.ru/article/2008/116358/ 15.03. 2010/

15. Билалов Ф.С. Особенности некоторых биологических свойств штаммов Escherichia coli, выделенных от онкологических больных с инфекционными осложнениями: Дисс. . канд. биол. наук.- 03.00.07- микробиология.-Челябинск, 2007.- 113 с.

16. Богданов М.Б., Черненькая Т.В. Алгоритмы и организация антибиотикотерапии / М.Б. Богданов, Т.В. Черненькая // Руководство для врачей.- М.: Издательский дом Видар-М, 2004.- 219с.

17. Боковой А.Г. Роль условно-патогенных микроорганизмов в этиологии острых кишечных инфекций и проблема дизбактериоза кишечника у детей: Дисс. . д-ра мед. наук.- Москва, 1991.- 255 с.

18. Бондаренко В.М. Антилизоцимная активность как генетически контролируемый фактор патогенности энтеробактерий / В.М. Бондаренко,

19. A.JI. Яблочков // в Сб.: Персистенция микроорганизмов,- Куйбышев.-1987.-С. 85-89.

20. Бондаренко В.М. Гемолизины энтеробактерий и их связь с вирулентностью возбудителя / В.М. Бондаренко, A.B. Голубев // Журн. микробиол., эпидемиологии, иммунологии.-1988.-№11.-С.102-109.

21. Бондаренко В.М. Проблема патогенности клебсиелл / В.М. Бондаренко,

22. B.Г.Петровская, Н.И.Нестерова. Ульяновск, 1996.-132с.

23. Бондаренко В.М. Адгезивная активность клинических штаммов клебсиелл/ В.М. Бондаренко, Wu Gang, М.М. Barcus // Журн. Микробиол. эпидемиологии, иммунологии.-1996. -№2.-С.104.-109.

24. Бондаренко В.М. Современные представления о молекулярно-биологических основах патогенеза шигеллезов / В.М. Бондаренко, М.З. Шахмарданов // Журн. микробиол., эпидемиологии, иммунологии.-1998.-№6.-С. 88-92.

25. Бондаренко В.М. Факторы патогенности бактерий и их роль в развитии инфекционного процесса / В.М. Бондаренко // Журн. микробиол., эпидемиологии, иммуноллогии.-1999.-№5.-С. 34-39.

26. Бондаренко В.М., Аганова О.В., Виноградов H.A. Роль бактериальной протеазы, деградирующий секреторный иммуноглобулин А, В персистенции клебсиелл // Журн. микробиол., эпидемиологии, иммунологии -2000.-№4. -Приложение С. 12-16.

27. Бондаренко В.М. «Острова» патогенности бактерий / В.М. Бондаренко // Журн. микробиол.-2001.-№4.-С.67-74.

28. Бондаренко В.М. Секретируемые факторы патогенности энтеробактерий / В.М. Бондаренко, А.Р. Мавзютов, Е.Golkocheva// Журн. Микробиол,- 2002, №1-С.84-90.

29. Бондаренко В.М. Клебсиеллы и клебсиеллезы /В.М. Бондаренко, С.В. Фиалкина, О.В. Агапова.- Тверь: Изд-во «Триада».- 2008. — 160 с.

30. Бондаренко В.М. Механизмы формирования патогенности оппортунистическими микроорганизмами / В.М. Бондаренко // Инфекционные болезни.- Матер. II Ежегодного Всерос. Конгресса по инфекционным болезням,- 2010.-т.8.-Прилож.№1.-С.42-43.

31. Бондаренко, В. М. Генетические маркеры вирулентности условно патогенных бактерий / В. М. Бондаренко // Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии. -2011-1.-N3.-C. 94-99.

32. Бондаренко В.М. Роль условно-патогенных бактерий при хронических воспалительных процессах различной локализации / В.М. Бондаренко.-Тверь: Изд-во «Триада».-2011-2.-88с.

33. Боковой А.Г. Роль условно-патогенных микроорганизмов в этиологии острых кишечных инфекций и проблема дизбактериоза кишечника у детей: Дисс. . д-ра мед. наук.- Москва, 1991.- 255 с.

34. Бочков И.А. Условно патогенные микроорганизмы, выделяемые у амбулаторных пациентов урологического профиля / И.А. Бочков, С.С. Саргсян // Материалы VIII съезда Всерос. об-ва эпидемиологов, микробиологов, паразитологов.-М,- 2002.- Т.З.- С. 138-139.

35. Бочков И.А. Влияние лечебных бактериофагов на условно-патогенную и симбиотическую микрофлору толстой кишки / И. А. Бочков, Э.С. Лавренева, Л.П. Юрков // Эпидемиология и инфекционные болезни,- 2009,-№2-С. 48-51.

36. Брилис В.И. Адгезивные свойства лактобацилл: Автореф.дис. канд. мед наук. М,-1983.-20с.

37. Брилис В.И., Брилене ТА., Ленцнер Х.П. Способ определения адгезивных свойств бактерий. А.с. 1076441 СССР, МКИ С12К1/00 #3421146/28-13. Заявл. 22.02.82; Опубл. 28.02.84.

38. Брода П. Плазмиды (перевод с англ.) / П. Брода. М,- 1982,- 224с.

39. Бухарин О.В. Антилизоцимный тест как маркер персистенции микроорганизмов / О.В. Бухарин, Б.Я. Усвяцов // Теоретическая и прикладная иммунология: Тез. докл. 1 всесоюзн. конф. -М., 1982. С.58-34.

40. Бухарин O.B. Метод определения антилизоцимной активности микроорганизмов /О.В. Бухарин // Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунологии,- 1984,- N 2,- С. 27-28.

41. Бухарин О.В. Персистенция бактерий / О.В. Бухарин,- Актовая речь. Оренбург,-1992,- 32с.

42. Бухарин О.В., Литвин В.Ю. Патогенные бактерии в природных экосистемах. Екатеринбург: УрО РАН.-1997.-277 с.

43. Бухарин О.В. Персистенция патогенных бактерий / О.В. Бухарин М,-Екатеринбург.-УрО РАН,- 1999.-368с.

44. Бухарин О.В. Значение персистенции бактериальных патогенов для клинической практики / О.В. Бухарин // Российские медицинские вести.-2000.-№3.-С. 18-26.

45. Бухарин О.В. Проблемы персистенции патогенов в инфектологии / О.В. Бухарин //Журн.микробиол. 2006. №4. - С.4 - 8.

46. Бушуева E.H. Факторы вирулентности условно-патогенной микрофлоры при урогенитальных инфекциях /E.H. Бушуева// Раздел: Материалы УШсъезда Всерос. об-ва эпидемиологов, микробиологов и паразитологов.- М., 2002.-Т. 1.- С. 146.

47. Васильев Б.Я. Острые кишечные заболевания. Ротавирусы и ротавирусная инфекция / Б.Я. Васильев, Р.И.Васильева, Ю.В,Лобзин.- Серия «Мир медицины».-СПб: Изд-во «Лань»-2000.-272 с.

48. Вершинин А.Е. Видовой состав микрофлоры и перспективы вакцинотерапии при хроническом простатите / А.Е. Вершинин : Автореф. дисс. канд.мед.наук, 03.00.07- микробиология, Москва, 2008.-21с.

49. Виноградова Л.А. Изучение биологического загрязнения воды в условиях антропогенной нагрузки /Л.А. Виноградова // Гигиенические аспекты изучения биологического загрязнения объектов окружающей среды: Мат. X Всесоюз. конф,- М:,1988.-С. 55-56.

50. Воробьев А.А. Возможности лабораторной диагностики инфекций, вызванных бактериями рода Campylobacter / А.А.Воробьев, Л.А.Сичинский, С.А. Дратвин // Журн. микробиологии, эпидемиологии, иммунологии.-2000. -№1.-С. 95-103.

51. Воротынцева Н.В. Острые кишечные инфекции у детей / Н.В. Воротынцева, Л.Н. Мазанкова. М.: Медицина, 2001.- 480 с.

52. Владимиров Ю. А. Зачем нужна белковая кристаллография/ Ю.А. Владимиров//Журн.Природа.-2003.http://vivovoco.rsl.rU/VV/JOURNAL/NATURE/l 103/PROT.HTM /9.03.2010/

53. Влияние Протокола по антимикробной терапии на частоту и прогноз нозокомиальной пневмонии у больных с тяжелой травмой / Д.Н. Проценко, А.И. Ярощецкий, С.В. Яковлев, Б.Р. Гельфанд и др. // Инфекции и антимикробная терапия,- 2005.-т.7.-№2.

54. Гебеш В.В. Современные эффективные методы в лечении больных острыми кишечными инфекциями / В.В. Гебеш // Кишечные инфекции.-1991.- Вып.22.- С. 46-50.

55. Гемолитическая активность бактерий рода Enterobacter / А.А. Ахтариева, Т.А. Савченко, Р.З. Саляхов, А.А. Камалова// Журн. Успехи современного естествознания.-2003.-№8.- С. 72.

56. Генетические маркеры патогенности условно-патогенных энтеробактерий, выделенных у детей и подростков при острых кишечных инфекциях / Н.Ю. Жеребцова, А.Х.Баймиев,Д.А. Валишин, А.Р. Мавзютов // Журн. эпидем.,микробиологии и иммунобиол.-2007.-№2.-С.З-8.

57. Гизантулина С.С. Условно-патогенные энтеробактерии при ОКИ у детей раннего возраста и совершенствование их микробиологической диагностики: Автореф. . канд. мед. наук.- М.,1989.- 20с.

58. Гинцбург А.Л. Генодиагностика инфекционных заболеваний / А.Л. Гинцбург // Журн. Микробиол,- 1998.- №3.- С. 86-95.

59. Гинцбург А.Л. Современное состояние и перспективы молекулярно-генетических методов в решении задач медицинской микробиологии / А.Л.

60. Гинцбург, H.A. Зигангирова, Ю.М. Романова // Журн. Микробиол,- 1999.-№5.- С.22-26.

61. Голошва Е.В. Персистентные характеристики энтеробактерий, выделенных в динамике экспериментального дисбактериоза / Е.В.Голошва,

62. A.В.Алещукина, Л.Н.Терновская // Материалы VIII съезда Всерос. об-ва эпидемиологов, микробиологов, паразитологов,- М.- 2002.-С. 161-162.

63. Голубев В.А. Характеристика HIy-плазмид различного происхождения и их значение для вирулентности энтеробактерий: Автореф. дисс. канд. биол. наук,- М., 1984,- 22с.

64. Гланц С. Медико-биологическая статистика / С. Гланц.- Пер. с англ.-М., Практика,- 1999,- 459с.

65. Грачёв М. А. Метод выделения высокоочищенной ДНК для использования в полимеразной цепной реакции / М. А. Грачёв, С. Ю. Кузнецова, Т. А. Щербакова // Молекулярная биология. 2006. - №1. - С. 180183.

66. Григорьева Л.В. Состояние разработки проблемы биологических факторов окружающей среды в УССР / Л.В. Григорьева // Гигиенические аспекты биологического загрязнения объектов окружающей среды: Мат.Х Всесоюзн. конф,- М,- 1988.- С.62-64.

67. Гриценко В.А. Влияние абиотических факторов на антилизоцимную активность и другие биологические характеристики энтиробактерий / В.А. Гриценко // В сб. : Персистенция микроорганизмов.- Куйбышев.-1987,- С.110-116.

68. Громова Г.Г. Клинико-микробиологическая оценка эшерихиозной бактериурии у детей / Г.Г. Громова, A.A. Вялкова, Ю.А.Брудасов,

69. B.А.Гриценко: Материалы 1 съезда нефрологов,- 1996,- С. 267.

70. Давыдовский И.В. Учение об инфекции (биологический аспект проблемы) / И.В. Давыдовский.-М.: Медицина.-1956.- 107с.

71. Дубинина И.Г. Роль метода полимеразной цепной реакции в генодиагностике / И.Г. Дубинина, С.Н. Щербо// Новые генетические технологии,- М,- 1998,- Сб.1.- С. 20-43.

72. Дьяков С.И. Методы быстрого определения чувствительности микробов к антибиотикам / С.И. Дьяков, Н.Ю. Ильина, И.К. Лебедева // Антибиотики.-1983,- №7.-С.545-554.

73. Дьяков С.И. Современные методы и средства быстрого определения чувствительности возбудителей опасных инфекционных заболеваний к антибиотикам и химиопрепаратам / С.И. Дьяков, И.К. Лебедева, С.В. Сидоренко // Военно-мед. журнал,- 1996.-№3.- С. 44-47.

74. Евтодиенко В.Г. Этиологический фактор при острых кишечных инфекциях: Мат. УШсъезда ЭМИП,- М.: 2002,- Т.2.- С. 169.

75. Егорова С.А. Патогенный потенциал микроорганизмов рода Klebsiella, как возбудителей острых кишечных инфекций / С.А. Егорова, Л.А. Кафтырева, М.А.Макарова // Вестник Военно-мед. Академии, Приложение 2 (22).- 2008.- С.535-536.

76. Егорова С.А. Характеристика бактерий рода Klebsiella, выделенных при дисбиозах кишечника: Автореф.дис. канд. мед. наук,- 03.00.07-микробиология. С-Петербург,- 2007. 22с.

77. Езепчук Ю.В. Биомолекулярные основы патогенности бактерий / Ю.В. Езепчук.-М. Медицина,-1985 .-240с.

78. Ерастова Е.Н. Клебсиеллезная инфекция у онкологичечких больных. К-серовары, выдлеяемые при этом возбудителе / Е.Н. Ерастова, Б.С. Киселева, А.З. Смолянская //ЖМЭИ.- 1984,- №2.- С. 19-23.

79. Жеребцова Н.Ю. Генетические маркеры патогенности условно-патогенных энтеробактерий, выделенных у детей и подростков при острых кишечных инфекциях / Н.Ю. Жеребцова, А.Х. Маймиев, Д.А. Валишин, А.Р. Мавзютов// ЖМЭИ.- 2007,- №2,- С. 3-8.

80. Зайцева Е.А. Система анализа микробиологических и молекулярно-генетических маркеров для выявления высоковирулентных штаммов Listeria monocytogenes: Автореф. дисс.докт. мед. наук.-03.02.03.- микробиология.-НИИЭМ им. Н.Ф.Гамалеи РАМН.-Москва.-2010.-43с.

81. Захарова И.Н. Инфекции мочевой системы у детей: современные представления об этиологии / И.Н. Захарова // Журн. Нефрология и диализ.-2001.-Т.З.-№1 / http://www.nephro.ru/magazine/article/

82. Захарова Ю.В. Оптимизация принципов коррекции состояний микрофлоры толстой кишки у жителей Кемеровской области / Ю.В. Захарова, Л.А. Леванова // Журн. медицина в Кузбассе.- 2009.-№2,- С.30-35.

83. Зубков М.Н. Неферментирующие бактерии. Acinetobacter spp.: таксономия, классификация, характеристика, клиническое значение, идентификация, антибиотикорезистеность / М.Н.Зубков // Инфекции и антимикробная терапия,- 2003.-Т.5.- №2.

84. Зуев В.А. Литическая активность бактериальных вирусов / В.А. Зуев,-М.: Медицина,- 1969,- 184с.

85. Зуева Л.П. Эпидемиология / Л.П. Зуева, Р.Х. Яфаев //Учебник.-СПб: ООО «Издательство ФОЛИАНТ», 2005.-752с.

86. Зятикова Л.Е. Клинико-эпидемиологическая характеристика клебсиеллезного энтероколита у новорожденных детей / Л.Е. Зятикова, Л.А. Чурина, А.И. Шемонова // Всерос. съезд инфекционистов, 3-й,- М.-Смоленск.-1989.-С.130-132.

87. Иванова В.В. Заномерности взаимоотношений макроорганизма и возбудителей инфекционных болезней у детей / В.В. Иванова, Е.А. Корнева // Вестн. РАМН.-2000.-№ 11.- С. 7-11.

88. Инвестиции в здравоохранение: Отчет о мировом развитии.-1993.-Вашингтон, 1993 .-240с.

89. Инфекционная «агрессивность» окружающей среды: Концепция микробиологического мониторинга / JLM. Мамонтова, Е.Д. Савилов, А.П. Протодьяконов и др.- Н., Наука, 2000.-240с.

90. Информационное письмо МАКМАХ. Состояние антибиотикорезистентности грамотрицательных возбудителей нозокомиальных инфекций в отделениях интенсивной терапии,- М.-1997.- С.8.

91. Итоги и перспективы изучения проблемы острых кишечных, респираторных инфекций и гепатитов у детей / A.B. Горелов, JI.M. Милютина, А.Р. Рейзис, Д.В. Усенко и др. // Эпидемиология и инфекционные болезни.-2009.-№2.- С.51-57.

92. Калина Г.П. Методический подход к изучению условно-патогенных микроорганизмов в объектах окружающей среды /Г.П. Калина // Гигиена и санитария,-1982,- №1,- С.40.

93. Калина Г.П. Микроэволюция антропофильных прокариот как фактор изменения активности эпидемических процессов. Микроэволюция патогенности / Г.П. Калина // ЖМЭИ.- 1991,- №5-, С.71-74.

94. Калмыкова А.И. Пробиотики: терапия и профилактика заболеваний. Укрепление здоровья /А.И. Калмыкова.- НПФ «Био Веста», СибНИПТИП СО РАСХИ - Новосибирск,- 2001. - 208с.

95. Катосова Л.К. Микрофлора мочи у детей с хроническим обструктивным пиелонефритом: Автореф. дис. канд. мед.наук.- Москва.- 1993.-23с.

96. Клинические особенности энтеробактерной инфекции у детей / В.П. Молочный, И.И. Протасеня, Л.М. Тимохина, И.В. Лущекова и др. // Дальневосточный журнал инфекционной патологии,- 2005.-N 7.-С.75-76.

97. Клинико-лабораторная характеристика сальмонеллезно-ротавирусной микст-инфекции у детей / Г.М. Филиппова, И.В. Иванов, О.Е Ефименко, Е.Ю. Котубей и др. // Журнал инфектологии.-201 l.-T.3.-№ 3.-С.99.

98. Константинова Ю.А. Применение пробиотиков в лечении вирусно-баткериальных кишечных инфекций у детей раннего возраста// Ю.А. Константинова,С.Е. Чащина, Н.А. Петрова // Журнал инфектологии. -2011.-Т.3.-№3.-С. 58.

99. Коротяев А.И., Бабичев С.А. Медицинская микробиология, иммунология и вирусология. Учебник.-СПб: «Специальная литература».-1998.- 591с.

100. Косько В.Н. Клинико-адаптационные механизмы и возможности их коррекции у детей разного возраста, больных дизентерией: Автореф. дис. д-ра мед.наук.-К., 1995.-25с.

101. Кравченко О.С. Бактерии рода Enterococcus в озере Байкал: распределение, видовой состав, механизм адаптации: Диссертация . кандидата биологических наук: 03.00.16, 03.00.07.- Бурят, гос. ун-т,- Иркутск, 2009,- 143 с.

102. Краснов В.В. Острые кишечные инфекции у детей. Современные представления / В.В. Краснов // Ремедиум Приволжье.- 2011.-№ 5/ http://www.remedium.ru/public/journal/remvolga/2011/

103. Красноголовец В.Н. Клебсиеллезные инфекции / В.Н. Красноголовец, Б.С. Кисилев -М.: Медицина,-1996,- 256 с.

104. Крылов В.Н. Роль горизонтального переноса генов бактериофагами в возникновении патогенных бактерий / В.Н.Крылов // Журн. Генетика,- 2003.-Т.39.-№5,- С.595-620.

105. Кулаев И.С. Бактериолитические ферменты микробного происхождения в биологии и медицине / И.С.Кулаев // http://www.pereplet.ru/obrazovanie/stsoros/275. html/1997^

106. Лакин Г.Ф. Биометрия /Г.Ф. Лакин,- учебное пособие для биол. спец. вузов, 4-е изд., перераб. и доп.- М.: Высшая школа, 1990.- 352 с

107. Леви М.И. Быстрый метод определения чувствительности бактериальных культур к различным антибиотикам в жидкой среде / М.И. Леви, И.А.Горожанкина, Л.А. Сагатовская // Антибиотики.- 1967.- №1- С. 5765.

108. Леви М. И Ускоренный отбор предпочтительных антибиотиков для терапии больных с гнойными осложнениями / М.И. Леви, Ю.Г. Сучков // В кн.: Современные технологии диагностики и терапии инфекционных болезней,- С.-Петербург,- 1999,- С. 35-36. (1)

109. Леви М.И. Ускоренный отбор эффективных антибиотиков для лечения больных госпитальными инфекциями / М.И. Леви, Ю.Г. Сучков, В.Я. Прохоров, В.А. Терушкин // Дезинфекционное дело. №3. -1999.- С. 34-40.3)

110. Лобзин Ю.В. Клиника, диагностика и лечение актуальных кишечных инфекций / Ю.В. Лобзин, В.М. Волжанин, С.Н. Захаренко.- СПб.: ИКФ «Фолиант», 1999,- 122с.

111. Лопухов Л.В. Полимеразная цепная реакция в клинической микробиологической диагностике / Л. В. Лопухов, М. В. Эйделыитейн // Клиническая микробиология и антимикробная химиотерапия. 2004. - Т. 2. -№3. - С. 96-106.

112. Лубянова И.П. Современные представления о метаболизме железа с позиции профпатолога / И.П. Лубянова // Актуальные проблемы транспортной медицины. 2010. - №2 (20). - С. 47-57.

113. Мавзютов А.Р. Молекулярно-генетическая характеристика клинических штаммов E.coli внекишечного происхождения / А.Р. Мавзютов, В.А. Гриценко // Клиническая микробиология и антимикробная химиотерапия.-2001,- №3.- Приложение 1.- С.25-26.

114. Мавзютов А.Р. «Острова» патогенности условно-патогенных энтеробактерий / А.Р. Мавзютов, С.В.Фиалкина, В.М. Бондаренко // Журн. микробиол.-2002.- №6- С.5-9.

115. Макаров Ю.А. Микробиологическая оценка воды природных водоемов Зейско-Буреинской равнины / Ю.А. Макаров, Н.Е. Горковенко// Электронныйнаучный журнал «Исследовано в России»http://zhurnal.ape.relarn.ru/articles/2007/123pdf.

116. Малый В.П.Общая характеристика острых кишечных инфекций / В.П. Малый// Клиническая иммунология. Аллергология. Инфектология,- 2010.-№7. с. 14-30.

117. Малышкин А.П. Антилизоцимная активность сальмонелл / А.П. Малышкин // В сб.: Факторы естественного иммунитета.- Куйбышев,- 1983.-с.81-84.

118. Мальцев С.В. Что такое биопленка? / С.В. Мальцев, Г.Ш. Мансурова,-«Практика».- 2012.- http://mfvt.ru.

119. Мамонтова JI.M. Основы микробиологического мониторинга водных экосистем и контроля питьевой воды: Автореф. дисс. докт. биол. наук.-03.00.16.-НИИ биологии при ИГУ.- Иркутск,-1998,- 40с.

120. Марри П.Р. Клиническая микробиология. Краткое руководство / П.Р. Марри, И.Р. Шей.- Пер. с анг,- М.: Мир, 2006.- 425с.

121. Маслова Э.И. Ферменты патогенности бактерий рода клебсиелла-энтеробактер /Э.И. Маслова // Кишечные инфекции в Казахстане.- Алма-Ата,-1980.-Т.21.-С.36-40.

122. Марголина Г.Л. Санитарно-микробиологическая характеристика валдайстких озер / Г.Л. Марголина, И.Н. Цедрик //Гигиенические аспекты изучения биологического загрязнения объектов окружающей среды: Мат. X Всесоюз. конф.- М:,1988.-С. 93-94.

123. Марков А.В. Условно-патогенные микроорганизмы в крупнейших водоемах Восточной Сибири и их роль в гигиенической оценке качества вод: Автореф. дисс. канд. мед. наук.- М., 2004.- 23с.

124. Мартыненко Л.М. Факторы патогености Klebsiella pneumoniae и их роль в патогенезе острой кишечной инфекции у детей первого года жизни: Дисс.докт. биол. наук. 03.00-07- микробиология.-Ростов-на-Дону- 1996.-398с.

125. Медицинская микробиология. Под ред. В.И. Покровского, O.K. Поздеева. М.: ГЭОТАР-Медицина, 1998.- 1200с.

126. Мельников Н.И. Ферменты патогенности и токсины бактерий / Н.И. Мельников, В.Н. Мельников, М.Г. Гимранов .-М.:Изд-во «Медицина».- 1969.-251с.

127. Методические рекомендации по выявлению гемолитических, адгезивных и энтеротоксигенных энтеробактерий № 28-6/7 от 23.02.87.- 13с.

128. Методические рекомендации по проведению работ в диагностических лабораториях, использующих метод полимеразной цепной реакции. Основные положения, утв. зам. преде. Госкомсанэпиднадзора 22.06.1995.- М., 1995.- 7с.

129. Методические рекомендации по детекции оперона ctx AB у холерных вибрионов с помощью полимеразной цепной реакции, утв. зам. министра здравоохранения России.-Иркутск, 1998.- 10с.

130. Методический подход к оценке эпидемиологической ситуации по обобщенному критерию / Е,Д, Савилов, Г.И. Алексеева, М.В.Мальцева, В.А. Астафьев, А.Ф. Кравченко, Е.И.Бурцева // Эпидемиология и инфекционные болезни.-№ 1 .-2011.- С. 17-20.

131. Методические указания по бактериологической диагностике смешанной кишечной инфекции молодняка животных, вызываемой патогенными энтеробактериями № 13-7-2/1759 от 11 ,10.1999г.

132. Механизмы выживания бактерий / О.В. Бухарин, А.Л. Гинцбург, Ю.М. Романова, Г.И. Эль-Регистан. М.:Медицина.-2005.-367с.

133. Митрохин С.Д. Инфекции центральной нервной системы: современный алгоритм микробиологического исследования / С.Д. Митрохин // Инфекции и антимикробная терапия.-2002,- Т.4.-С.188-189.

134. Митрохин С.Д. Значение энтеробактерий в инфекционной патологии человека / С.Д. Митрохин // Инфекции и антимикробная терапия.- 2005.- Т. 7,- №2.// http://old.consilium-medicum.com/media/infektion/0502/69.shtml/

135. Михайлова Л.В. Биология условно-патогенных микроорганизмов, вызывающих острые кишечные инфекции: Диссер.канд. мед. наук.-03.02.03-микробиология.-Волгоград. 2011.-136с.

136. Навашин С.М. Рациональная антибиотикотерапия / С.В. Навашин, И.Л. Фомина,- М.:- 1982.

137. Нарушение нормального состава кишечных бактерий: клиническое значение и вопросы терапии / Э.П. Яковенко, А.В. Яковенко, Н.А. Агафонова, А.С. Прянишникова и др. // Болезни органов пищеварения.-2008.-N 2.-С.41-46.

138. Некоторые особенности острых кишечных инфекций у детей первых 2-х лет жизни в г. Шахты / Гревцев Ю.В., Кононенко Л.П., Шумских И.В. и др. : Мат. VIII съезда ЭМИП.-2002,- Т.2.- С.29.

139. Некоторые факторы патогенности Е. coli, выделенных от больных с инфекционными осложнениями / Ф. С. Билалов, 3. Г. Габидуллин, М.М.Туйгунов, Э. Ф. Мамбетова // Известия Челябинского научного центра. -2006. №2.-С. 123-126.

140. Немцева Н.В. Определение свежего фекального загрязнения воды поверхностных водоемов /Н.В. Немцева, И.А. Мисетов, Г.П. Алехина // ЖМЭИ,- 1994,- 44.- С.120-123.

141. Николаев Ю.А. Биопленка — «город микробов» или аналог многоклеточного организма?/ Ю. А. Николаев Ю.А., В. К. Плакунов // Микробиология.-76(2)- 2007.- С.149-163.

142. Ныркова О.И. Эффективность использования современного перорального антибиотика «Альфа Нормикс»в терапии бактериальных диарей /О.И. Ныркова, М.К. Бехтерева // Журнал инфектологии.-2009.-Т.1-№2-. С. 51.

143. Одум Ю. Основы экологии Ю. Одум.- 1975.-740с.

144. Ольховиков А.И. Клинико-эпидемиологичекие особенности кишечных инфекций, вызванных условно-патогенными возбудителями у детей первого месяца жизни/ А.И. Ольховиков, A.C. Соколова // Журнал инфектологии.-2011.-Т.3- №3.- С.83.

145. Особенности острых кишечных инфекций у детей в Мордовии / О.И. Петров, В.Ф. Павелкина, Н.П.Амплеева, Р.З.Альмяшева и др. // Журнал инфектологии.-2011.- Т.З.-№ 3,- С.85-86.

146. Определение чувствительности микроорганизмов к антибактериальным препаратам: МУК 4.2.1890-04 Методические указания.- М.: Федеральный центр Госсанэпиднадзора Минздрава России,- 2004.-91с.

147. Орлова К.А. Экспресс-детекция и выявление генов факторов патогенности бактериальных возбудителей острых кишечных инфекций: Дис. . канд. биол. наук : 03.00.07 : Москва, 2004.- 144 с.

148. Особенности ОКИ у детей раннего возраста /A.B. Доценко, О.Н. Черных, С.П. Кокарева, С.В. Никитина, Ю.А. Бутузов// Журнал инфектологии,- 2011-. Т.3.-№3.-С.45.

149. Павловский E.H. Курс паразитологии человека / E.H. Павловский.- М., Л., 1934,- 592с.

150. Падейская E.H. Фторхинолоны в клинике инфекционных заболеваний / E.H. Падейская // Инфекции и антимикробная терапия.- 2005.- Т.П.- №3.

151. Панасюк Е.Ю. Особенности биоразнообразия условно-патогенных бактерий озера Байкал и их значение при оценке качества воды: Автореф. дис.канд.мед.наук.- Иркутск.- 2002.-25с.

152. Пак С.Г. Стратегия совершенствования специфической лабораторной диагностики инфекционных заболеваний / С.Г. Пак, О.Ф Белая//

153. Инфекционные болезни,- Матер. II Ежегодного Всерос. Конгресса по инфекционным болезням 2010.-т.8.-Прилож.№1.-С.236-237.

154. Первушина JI.A. Антилизоцимный признак микроорганизмов в бактериологической диагностике и лечении воспалительных заболеваний внутренних женских половых органов: Автореф. дисс. канд. мед. наук. Челябинск. -1990.-23с.

155. Петровская В.Г. Общие принципы генетического контроля патогенности бактерий / В.Г.Петровская, В.М.Бондаренко // Журн. микробиологии, эпидемиологии, иммунологии.-1994.-№3.- С. 106-110.

156. Пехов А.П. Плазмиды бактерий/ А.П. Пехов. -М,- 1986.-223с.

157. Поздеев O.K. Медицинская микробиология / Под ред. акад. РАМН В.И.Покровского.- М.:ГЭОТАР-МЕД, 2002,- 768с.

158. Покровский В.И. Эпидемический процесс в эпоху научно-технического прогресса / В.И.Покровский, Б.Л.Черкасский, Ю.П. Солодовников // Руководство по эпидемиологии инфекционных болезней : Вопросы общей эпидемиологии,- М.: Медицина, 1993.- Т. 1.-С.62-66.

159. Покровский В. И. Сальмонеллезы / В.И. Покровский, Б.Л. Черкасский.-М.,1995.-224с.

160. Поляк М.С. Основы антибиотикотерапии / М.С.Поляк. СПб.: Издательство «Анатолия».-2003.-56с.

161. Практикум по микробиологии: учеб. Пособие для студ. ВУЗов / Под ред. А.И. Нетрусова. М.: Издательский центр «Академия». - 2005. - 608 с.

162. Принципы организации микробиологического мониторинга / Л.М. Мамонтова, A.M. Кондратьева, A.B. Марков,Е.В. Анганова и др. // Бюл.ВСНЦ СО РАМН.- 2001,- №4 (18).-С.50-55.

163. Приказ МЗ СССР «Об унификации микробиологических (бактериологических) методов исследования, применяемых в клинико-диагностических лабораториях лечебно-профилактических учреждений» № 535 от 22.04.85.

164. Применение статистических методов в эпидемиологическом анализе / Е.Д. Савилов, JI.M. Мамонтова, В. А. Астафьев, С.Н. Жданова.- М.: МЕДпресс-информ, 2004.- 112с.

165. Проблема острых кишечных инфекций у детей в Краснодарском крае / О.К.Александрова, Т.Н. Перепелкина, В.П. Клиндухов, Т.В. Шевырева и др.//Журнал инфектологии.-2011.-T.3.-C.23.

166. Прокопьева М.В. Оценка антропогенного загрязнения водной экосистемы р. Лены: Автореф. дисс.канд. мед. наук.- М., 2004.- 18с.

167. Прозоркина Н.В. Основы микробиологии, вирусологии и иммунологии. / Н.В. Прозоркина, П.А. Рубашкина.-2008.-384с.

168. Радциг М.А. Действие наночастиц серебра на бактерии: жизнеспособность, образование биопленок и Quorum Sensing регуляция / М.А. Радциг, О.А.Кокшарова, И.А. Хмель // http://rusnanotech08.rusnanoforum.ru/

169. Резник В.И. Роль вирусов в этиологии острых кишечных заболеваний/ В.И. Резник, E.H. Присяжнюк, Л.А. Лебедева //Дальневосточный журнал инфекционной патологии. -2009.- №16.- С. 37-42.

170. Решедько Т.К. Особенности определения чувствительности микроорганизмов диско-диффузионным методом / К.Г.Решедько, О.У. Стецюк // Лабораторная диагностика,- КМАХ.- 2001.-Т.З,- №4.

171. Речкин А.И. Поиск новых резервуаров для персистенции и участников циркуляции энтеробактерий в естественных экосистемах / А.И. Речкин, Н.И. Евтеева // Вестник Нижегородского университета им. Н.И. Лобачевского.-2007,- №6,- С. 99-103.

172. Рожнова С.Ш. Сальмонеллезы в России: затишье перед бурей / С.Ш. Рожнова, Акулова Н.К., Христюхина O.A. // Эпидемиология и инфекционные болезни,-2011.-№2,-С. 9-12.

173. Романова Ю.М. Участие мобильных элементов в формировании свойств патогенных бактерий / Ю.М. Романова, A.JI. Гинцбрук // Мол .генетика.-1999.- С.22-29.

174. Романова Ю.М. Мобильные генетические элементы и их роль в эволюции патогенных бактерий / Ю.М. Романова, Т.С. Ильина, A.JI. Гинцбрук // Вестник РАМН.-2001.- №4.-С. 15-19.

175. Романова Ю.М. Бактериальные биопленки как естественная форма существования бактерий в окружающей среде и организме хозяина / Ю.М. Романова, А.Л. Гинцбург // ЖМЭИ,- 2011,- №3.- С. 99-109.

176. Роль иммуномодулятора гепон в комплексной терапии острых кишечных инфекций у детей /A.A. Новокшонов, В.Ф. Учайкин, Н.В.Соколова, Г.М. Курбанова и др./ http://www.medlinks.ru/article.phpsid/ 2009 (15 марта 2010)

177. Руднев И.А. Тиолзависимые гемолизины как факторы патогенности клебсиелл / И.А. Руднев// Журн. Микробиол.-1993.-№6.-С. 31-32.

178. Руднов В.А. Современное клиническое значение синегнойной инфекции и возможности ее терапии у пациентов отделений реанимации / В.А. Руднов // Инфекции и антимикробная терапия.-2002.-Т.4.- с. 170-177.

179. Руководство к лабораторным занятиям по микробиологии / Под ред. Л.Б. Борисова.-2-e изд., перераб. и доп.-М.: Медицина. 1984.-256с.

180. Сазыкин Ю.О. Антибиотики и оболочка микробной клетки / Ю.О. Сазыкин, П.С. Навашин.- Изд. ВИНИТИ.- Итоги науки и техники.- М.: 1991,-185с.

181. Сазыкин Ю.О. Современные пути поиска новых антибактериальных агентов: предложения и дискуссии / Ю.О. Сазыкин // Антибиотики и химиотерапия,- 1998.- №12.- С. 4-7.

182. Саляхов Р.З. Гемолитическая активность клинических штаммов бактерий рода Serratia / Р.З. Саляхов, З.Г. Гибидуллина, A.A. Ахтариева// Журн. Успехи современного естествознания,- 2003.-№8,- С. 73.

183. Сергевнин В.И. Этиологическая структура и экологическая классификация острых кишечных инфекций / В.И. Сергевнин // Эпидемиол. и инфекционные болезни,- 1997,- №6,- С.8-9.

184. Сергевнин В.И. Эпидемиология острых кишечных инфекций / В.И. Сергевнин.-Пермь: ГОУ ВПО ПГМА им. ак. Е.А.Вагнера Росздава, 2008.-280с.

185. Сергиев В.П. Инфекционные болезни и цивилизация: прошлое, настоящее, будущее / В. П. Сергиев,H.A. Малышев, И.Д. Дронов.-М., 2000.-207с.

186. Сергиев В.П. Инфекционные болезни на рубеже веков: осознание биологической угрозы/ В.П. Сергиев, H.H. Филатов; отв. ред.В.Л.Шульц.; Центр исследования проблем безопасности РАН.- М.: Наука, 2006.- 572с.

187. Сидоренко C.B. Клиническое значение резистентности микроорганизмов к антимикробным препаратам / С.В.Сидоренко // Рос. мед. вести,- 1998,-№1,-С. 28-34.

188. Сидоренко C.B. Есть ли будущее у антибактериальной терапии / С.В.Сидоренко // Антибиотики и химиотерапия.- 1999,- №1. С. 3-5.

189. Сидоренко C.B. Антибиотикограмма: диско-диффузионный метод. Интерпретация результатов / C.B. Сидоренко, В.Е. Колупаев,- Смоленск, 2000,- 28с.

190. Сидоренко C.B. Инфекционный процесс как "диалог" между хозяином и паразитом /С.В.Сидоренко // Клиническая микробиология и антимикробная химиотерапия. 2001.-Том 3,- № 4.- С. 301-315.

191. Сидоренко C.B. Бета-лактамазы расширенного спектра: клиническое значение и методы детекции / C.B. Сидоренко // Инфекции и антимикробная терапия,- 2002.-Т4. -№6. С. 164-170.

192. Сингер М. Гены и геномы / М. Сингер, П. Берг (Перевод, с англ. Т. С. Ильиной, Ю. М. Романовой). М.: Мир, 1998. - 373 с.

193. Скала JI.3., Сидоренко C.B., Нехорошева А.Г. Практические аспекты современной клинической микробиологии / Л.З. Скала, С.В.Сидоренко, А.Г.Нехорошева М.: Лабинформ.-1997.- С.52-102.

194. Скала Л.З. Практические аспекты современной клинической микробиологии /Л.З.Скала, С.В.Сидоренко, А.Г.Нехорошева, И.Н.Лукин, С.А.Грудинина Тверь: ООО «Издательство «Триада», 2004.- 312 с.

195. Смолянская А.З. Условно-патогенные бактерии кишечника -возбудители инфекций кишечной и внекишечной локализации/ А.З. Смолянская.- Всерос. съезд микробиологов и эпидемиологов, 5-й: Тез.докл,-М., 1985.-С.280-282.

196. Совершенствование нормативной и методической базы бактериологического мониторинга качества питьевой воды / Л.В. Иванова, А.Е. Недачин, H.H. Буторина, A.B. Загайнова и др. // Гигиена и санитария.-2007.-N 5.-С.36-39.

197. Соколов В.Ю. К вопросу о механизме антилизоцимной активности бактерий / В.Ю. Соколов, А.П. Луда В сб. : Персистенция микроорганизмов.-Куйбышев.-1987,- С.120-125.

198. Соловых Г.Н. Система «лизоцим антилизоцим» микроорганизмов в формировании водных сообществ пресноводных водоемов: Дисс.докт. биол. наук. 03.00.07 — Оренбург, 1995. —226 с.

199. Способ оценки состояния микрофлоры кишечника человека по количеству адгезивно-активных бактерий и типу адгезинов / Гизатулинга С.С., Биргер М.О., Кулинич Л.И., Фиш Н.Г. и др. // Клиническая микробиология.- 1991.-С.21-23.

200. Стент Г. Молекулярная биология вирусов бактерий / Г. С тент.- М.: Мир,-1965,- 467с.

201. Страчунский Л.С. Состояние антибиотикорезистентности в России / Л.С.Страчунский //Клиническая фармакология,- 2000.-№2.- С.6-9.

202. Страчунский Л.С. Практическое руководство по антиинфекционной химиотерапии / Л.С.Страчунский, Ю.Б.Белоусов, С.Н. Козлов,- 2002,- 382с.

203. Строганов В.П. Феномен резистентности / В.П. Строганов // Микробиолог и клиницист,- 1998.- №5 (11).

204. Супотницкий М.В. Микроорганизмы, токсины и эпидемии. М., 2000.-376с.

205. Тец В.В. Бактериальные сообщества. В кн.: Клеточные сообщества / Под ред. В. Теца. -Санкт-Петербург: Изд-во СП6ГМУ.-1998. С. 15-73.

206. Тимаков В.Д. Ферментативная активность бактерий в связи с их вирулентностью / В.Д. Тимаков, Д.Г. Кудлай, В.Г. Петровская // ЖМЭИ.-1968, вып. 3,- с. 3-16.

207. Титов Л.П. Стратегии контроля резистентности микроорганизмов к антибиотикам: международный и национальный опыт / Л.П. Титов, В.И.Ключенович// В кн. Резистентность микроорганизмов к антимикробным препаратам,- Минск,- 2003.- С. 4-13.

208. Титов Л.П. Классификация, номеклатура и эволюция значимых для медицины бактерий. -http://www.itlab.anitex.by/msmi/bmm/01.2006/4.html /13.03.2010/.

209. Тотолян А.А. Генетика патогенности микроорганизмов / А.А. Тотолян // Вестник РАМН. 2000. - № 11. - С. 29-32.

210. Урсова Н.И. Базовые функции кишечной микрофлоры и формирование микробиоценоза у детей /Н.И.Урсова // Практика педиатра. http://medi.ru/doc/jO 10603 30.htm /2006.

211. Файзуллина Р.А. Об опыте применения препарата Энтерофурил в детской практике / Р.А. Файзуллина // http://www.medvestnik.rU/archive/2008/5/1077.html /29.03.2010/.

212. Фиалкина С.В. Генетические детерминанты патогенности клинических штаммов Klebsiella pneumoniae : Автореф. дисс.канд. биол.наук, 03.00.07-микробиология, Москва, 2004. 24с.

213. Фомина И.П. Современное значение орального цефалоспорина III поколения цефиксима в терапии бактериальных инфекций/ И.П.Фомина, Л.Б.Смирнова //Журн. Инфекции и антимикробная терапия/- 2002/-Т.4, №3.

214. Формирование биопленок клиническими штаммами бактерий комплекса Burkholderia cepacia в зависимости от их фенотипических и генотипических характеристик / И.А.Шагинян, Г.А.Данилина, М.Ю.Чернуха, Г.В.Алексеева, А.Б. Батов // ЖМЭИ.-2007.-№1, С.3-9.

215. Фролов А.Ф., Зарицкий A.M., Фельдман Ю.А. Еще раз об условной патогенности микроорганизмов (ответ оппоненту) // Журн. микробиологии, эпидемиологии, иммунологии.-1989.- №5.- С.96-98.

216. Фролов В.М. Клинико-иммунологические особенности и лечение кишечной инфекции клебсиеллезной этиологии / В.М.Фролов, Н.Д. Ющук, H.A. Пересадин // Журн. Инфекционные болезни.- 1994.- С. 67-70.

217. Хазиев Ф.Х. Методы почвенной энзимологии / Ф.Х. Хазиев,- М.: Наука. 1990. - 189 с.

218. Ходырева Л.А. Клинико-лабораторные аспекты диагностики, течения и прогноза мочевой инфекции: Автореф. дисс. . док. мед.наук: 14.00.40/ ФГУ «НИИ урологии Росмедтехнологий».- Москва.-2007.-39с.

219. Худяк Э.И. Частота обнаружения условно-патогенных баткерий семейства кишечных у больных острыми кишечными заболеваниями и у здоровых детей / Э.И. Худяк, Л.А. Савицкая, У.А. Бахадырова // Мед.журн. Узбекистана,- 1983,- №2,- С.28-30.

220. Цинзерлинг А. В. Современные инфекции / А. В. Цинзерлинг. СПб.: Сотис, 1993. - 363с.

221. Частная медицинская микробиология с техникой микробиологических исследований: Учебное пособие / Под. Ред. A.C. Лабинской, Л.П. Блинковой, A.C. Ещиной.-М.:ОАО «Издательство «Медицина», 2005.-600 с.

222. Чакветадзе С.С. Острые нарушения пищеварения у детей 1-го года жизни/ С.С. Чакветадзе // Медицинский научный и научно-методический журнал .-2005,- №27,- С.3-23.

223. Чистович Г.Н. Патогенез стафилококковой инфекции / Г.Н. Чистович.-Г.Н. Чистович. 1961. Л.: Медгиз, 1961,- 216 с.

224. Шагинян И.А. Роль и место молекулярно-генетических методов в эпидемиологическом анализе внутрибольничных инфекций.- .- 2000. -Т 2,-№3.

225. Шеенков Н.В. Роль антилизоцимной активности бактерий в развитии инфекционного процесса и пути ее регуляции: Автореф. дисс. канд. мед.наук.-Челябинск.-1993.

226. Шеенков Н.В. Антилизоцимная активность бактерий рода Brucella / H.B. Шеенков, M.B.Скачков, А.Г. Яковлев, М.Б. Шерстнева // Журн. микробиол.-2000.-№4.-Приложение.- С.99-100.

227. Шорникова Е.А. Диагностика состояния экосистем водотоков по гидрохимическим и микробиологическим показателям: Автореф. дисс.канд. биол. наук.-03-00-16.- Петрозаводск- 2007.-23с.

228. Щелкунов С. Н. Генетическая инженерия / С. Н. Щелкунов. -Новосибирск: Сибирское университетское изд-во, 2004. 496 с.

229. Эпидемиологические особенности острой кишечной инфекции (ОКИ) в г. Новочеркасске / З.Д. Макагонова, Г.Т. Календжян, С.Ф. Аксенова, О.А.Стрижак и др.- Материалы VIII съезда Всерос. об-ва ЭМП.- М., 2002.-Т.1.- С. 73.

230. Эпидемиологический мониторинг антибиотикорезистентности микроорганизмов с использованием компьбтерной программы WHONET: методические рекомендации / Зуева Л.П., Поляк М.С., Кафтырева Л.А., Колосовская Е.Н. и др.- Спб.- 2004,- 69с.

231. Эколого-эпидемиологическая оценка качества вод реки Лены / Е.Д. Савилов, Ю.А. Долженко, А.П. Протодьяконов и др. Новосибирск : Наука,2006,- 136с.

232. Энделыитейн М.В. Разработка молекулярно-генетических методов для исследования В-лактамаз ТЕМ и SHV у клинических штаммов энтеробактерий : Автореф. дисс. канд.биол.наук.- 14.00.31- Москва.-2000.- 21с.

233. Эшерихиозы у детей в современных условиях / Т.С. Хорошева, М.К. Бехтерева, А.С. Кветная, О.И. Ныркова // Журнал инфектологии.- 2011.- Т.З.-№ 3.-С.102.

234. Ющук Н.Д. Клинико-иммунологическая характеристика кишечной клебсиеллезной инфекции / Н.Д. Ющук, В.М. Фролов // Сов. мед.- 1990.-№9.-С.79-83.

235. Яковлев В.П. Клинико-лабораторное обоснование назначения цефоперазон/ сульбактама больным с тяжелыми госпитальными инфекциями / В.П.Яковлев, Д.Л. Щавелев, С.В.Яковлев // Инфекции и антимикробная терапия.-2002,- Т.4.-№5.-С. 132-138.

236. Яковлев С.В. Амоксициллин/сульбактам новые возможности преодоления антибиотикорезистентности / С.В. Яковлев // Журн. Русский медицинский журнал. -2005.- т. 13.-№ 21. - С. 1418-1422.

237. Ярков А.И. Клинические проявления синдрома интоксикации при заболеваниях клебсиеллезной этиологии / А.И. Ярков, Л.С.Павлова, О.Н.Добромыслова// Всерос. съезд инфекционистов.- Смоленск.-1989.- С 128130.

238. Abbo A. Impact of multi-drug resistant Acinetobacter baumannii (MDR -AB) on patients clinical outcomes / A. Abbo, S.Navon-Venezia, Y. Siegman-Igra, Y. Carmeli // 45 th ICAAC. Abstract К-1302.-2006,- P. 336.

239. Abraham E. An enzyme from bacteria able to destroy penicillin / E Abraham, E Clain.- Natura.- 1940,- V.146.- P.837-839.

240. Adrews J.M. Determination of minimum inhibitory concentrations / J.M. Adrews // J. Antimicrib. Chemother.-2001,- 48 (SI).- P. 5-16.

241. Ambler R.P. The structure of b-lactamases / R.P. Ambler.- Pbilos. Trans. R.Soc. London Ser.- 1980.-289,- P.321-331.

242. Analyses of the cag pathogenicity island of Helicobacter pylori / N.S. Akopyants, S.W.Clifton, D. Kersulyte et al. // J.Mol.Microbiol.-1998.-V.28.-P.37-53.

243. Arthur M. Distribution of erythromycin esterase and rRNA methylase genes in members of the family Enterobacteriaceae highly resistant to erythromycin / M. Arthur, A. Andremont, P. Courvalin // Antimicrob. Agents Chemother.-1987.-N.31.-P. 404-409.

244. Asada Y. NADH-oxidazing peroxidase produced by lignin-degrading basidiomycete Phanerochaete chrysosporium / Y.Asada, M.Miyabe, M.Kikkawa, H. Kuwakara // J. Ferment. Technol. 1987. - V. 65. - № 4. - P. 483-487.

245. Bauer A.W. Antibiotic susceptibility testing by a standardized singl disk method / A.W. Bauer, W.M. Kirby, J.C Sherris, M. Turck // Amer J Clin Pathol.-1966,-N. 45,- P. 493-496/

246. Bauer M.E. Characterization of an RTX toxin from enterohemorrhagic Escherichia coli О 157:Н7/ M.E. Bauer, Welch // J. Infect. Immun.-1996.- V.64.- P. 167-175.

247. Bates P. R. Comparative epidemiology of rotavirus, subgenus F (types 40 and 41) adenovirus and astrovirus gastroenteritis in children / P. R. Bates et al. // J Med Virol. 1993 .-39(3):224-228.

248. Bender J. Lipases as Pathogenicity Factors of Bacterial Pathogens of Humans / J. Bender and A. Flieger // Handbook of Hydrocarbon and Lipid Microbiology.-2010, Part 29, 3241-3258p.

249. Bergogne-Berezin E. Opportunistic nosocomial multiply resistant bacterial infections their treatment and prevention./ E. Bergogne-Berezin, D. Deere, M.-L. Guillou // J. Antimicrob. Chemother.- 1993,- Vol.32.- Suppl. A.- P. 39-47.

250. Blanc-Potard A.B. The SPI-3 pathogenicity island of Salmonella enterica/ A.B. Blanc-Potard, J. Kayser, E.A. Groisman // J. Bacteriol.-1999, 181 : 998-1004.

251. Bloody diarrhea caused by Klebsiella pneumoniae : a new mechanism of bacterial virulence? / F. Guerin, C. Bouguenec, J. Gilquin et al. // Clin Infect Dis.-1998; 27(3).-P. 649-649.

252. Bobo L. D. PCR detection of Chlamydia trachomatis / L. D. Bobo. -Washington: ASM Press, 1993.- 235 p.

253. Brunder W. Genome plasticity in Enterobactericeae / W. Brunder, H. Karch // Int. J. Med. Microbiol.-2000,- V.290.- P. 1530165.

254. Burgos Y. Common origin of plasmid encoded alpha-hemolysin genes in Escherichia coli /Y.Burgos., L.Beu // BMC Microbiology.- 2010, 10:193 doi:10.1186/1471-2180-10-193.

255. Chambless J.D. A three-dimensional computer model of four hypothetical mechanisms protecting biofilms from antimicrobials / J.D. Chambless, S.M.Hunt, S.S. Philip //Appl. and Environmental Microbiology.-V.2006.-V.72.-P.2005-2013.

256. Characterization of the type 3 fimbrial adhesions of Klebsiella strains / T.A. Sebghati, T.K. Korhonen, D.B. Hornick et al. // Infect Immun. 1998; 66(6).- P. 2887-2894.

257. Cockerill F.R. Genetic Methods for Assessing Antimicrobial Resistance / F.R. Cockeril //Antimicrob Agents Chemother.- 1999.-V.43.- P. 199-212.

258. Cole S.T. Bacterial genomes-all shapes and sizes/ S.T Cole, I.Saint-Girons //In book Organization of the Prokariotic Genome. Edited by R.L.Charlebois. -1999,- P.35-57.

259. Comité de Antibiogramme de la Société Française de Microbiologie. Technical recommendations for in vitro susceptibility testing // Clin. Microbiol. Infect.-1996.-2 (Suppl. 1 ). S 11 -25.

260. Complete genome sequence of Salmonella enterica serovar typhimurium LT2/ M. Mcclelland, K.Sanderson, J.Speith at al.// Nature.- 2001.-Vol.413,- P.852-856.

261. Costerton J.W. Microbial Biofilms / J.W Costerton, Z. Lewandowski, D.E. Caldwell // Ann Rev Microbiol.-1995.-V.- 49.-P.711-745.

262. Costerton J.W. Bacterial biofilms: a common cause of persistent infections / J.W. Costerton, P.S Stewart, E.P. Greenberg // Science.-1999.-V.284.-P. 13181322.

263. Daigle F. Expression and detection of pap, sfa, afa encoded fimbrial adhesin systems among uropatogenic E. coli / F. Daigle, J. Harel, J. Fairbrother, P. Lebel // J. Microbiol. Infect. Dis.- 1990.- №9 (4).- P.281-283.

264. Davies D. Understanding biofilm resistance to antibacterial agents / D. Davies // Nat. Rev. Drug. Discov. 2003.-V.2.-P.114-22.

265. DeFlaun M.F. Genes and their varied hosts. In: Levy S.B., Miller R.V. Gene transfer in the environment / M.F. DeFlaun, S.B Levy // New York : McGraw №11 Publishing.-1991 .-N1 .-P.32.

266. Dobrindt U. Pathogenicity islands and phage conversion:evolutionary aspects of bacterial pathogenesis / U. Dobrindt, J. Reidl // J. Med. Microbiol.-2000.- V. 290(6).-P. 519-527.

267. Doolittle W.F. Lateral genomic/ W.F Doolittle // Trends.Genet.-1999.-V.15,-P.5-8.

268. Dubos R.J. Biochemical determinants of microbial diseases.-Cambridge.-1954.-152 p.

269. Ediin B.R. An outbreak of multidrug resistant tuberculosis among hospitalized patients with acquired immunodeficiency syndrome / B.R.Ediin, J.I.Tokars, M.H. Grieco, J.T. Crawford. // N. Engl. J.Med. 1992,- V.326.-P. 15141521.

270. Ericsson H.M. Antibiotic sensitivity testing. Report of an international collaborative study / H.M. Ericsson, J.C. Sherris.- Acta Pathol Microbiol Scand Sect B.-1971.- 217 (Suppl.)-P. 1-90.

271. European Committee for Clinical Laboratory Standards. Standard for quality assurance. Part I: Terminology and general principles. ECCLS Document. 1985; 2 (1).

272. European Committee for Antimicrobial Susceptibility Testing (RUCAST) of the European Society of Clinical Microbiology and Infectious Diseases (ESCMID) // Clin. Microbiol. Infect.-2003.- №9,- P. 1-7.

273. Escherichia coli ehll gene-positive serotype 018ac:H31 associated with an outbreak of diarrhea in a neonatal nursery in Neuquen City, Argentina/ I. Chinen, M. Rivas, V. Soriano et al. // J. Clin. Microbiol. -2002,- V.40(4).- P. 1225-9.

274. Fath M.J. ABC Transporters: Bacterial Exporters / M. J. Fath, R. Kolter // Microbiological reviews. -1993. Vol. 57. №4. - P. 995-1017.

275. Finlay B.B. Common themes in microbial pathogenecity revisited / B.B. Finlay, S. Falkow // Microbial Mol Biol.- 1997.- N.6.-P. 36-69.

276. Genetics of virulence of enteropathogenic E.coli / J.B. Karper,T.K.McDaniel, K.G.Jarvis et al. // Adv Exp Med Biol.-1997-412:279-87.

277. Genetic organization of the she pathogenicity island in Shigella flexneri 2a / K. Al-Hasani, K. Rajakumar, D. Bulach et al. // Microb. Pathog.-2001.- V.30(l).-P.l-8.

278. Goodgame R. W. Viral causes of diarrhea / R. W. Goodgame // Gastroenterol Clin North Am. 2001. V. 30. P. 779-795.

279. Gottesman M. Bacteriophage lambda the untold story / M. Gottesman // J. Mol. Biol.-1999.- V.293.- P.177-180.

280. Hacker J. Influence of cloned Escherichia coli haemolisin henes, S.fimbria and serum resistance on pathogenicity in ditterent animal models / J. Hacker, H.Hof //Microbiol. Patogenesis.-1986.-N. 1.- P. 1533-1547.

281. Hacker J. Pathogenecity island of virulent bacteria: structure, funcrion and impact on microbial evolution / J. Hacker, G.Blum-Oehler, I. Muhldorfer // J.Mol.microbiol.-l 997.-V.23.-P. 1089-1097.

282. Hancock V. Biofilm formation by asymptomatic and virulent urinary tract infectious Escherichia coli strains / V.Hancock, L. Ferrieres, P. Klemm // FEMS Immunol. Med. Microbiol.- 2007.-V.51 .-P.212-219.

283. Hendrix R.W. Evolutionary relationships among diverse bacteriophages and prophages All the World,s a phage / R.W Hendrix, C.M. Magraret, R. Smith // Proc. Natl. Acad. Sci. USA.-1999.- V. 96. Issue 5.-P. 2192-2197.

284. Hentschel U. Pathogenecity islands: the tip of the iceberg /U.Hentschel, J. Hacker//J. Microb. Infect.-2001.- V. 3. P. 545-548.

285. Huang Qing-Chunj. Physiological characters of the resistance mutant of Xanthomonas citri to amicarthiazol / Huang Qing-Chunj, Zhou Ming-Guoj, Ye ZhongYin // Acta Phytopathologica Sinica. 2003. - V. 33. - No. 1. c. 1-11.

286. Ingersoll M. Pathogenicity island of Shigella / M. Ingersoll, E.A. Groisman, A. Zychlisky // Curr Top Microbiol Immunol.-2002.-V.264(l).- P. 49-65.

287. Jacoby G. More extended spectrum beta-lactamases / G.Jacoby, A. Medeiros // Antimicrob. Agents Chemother.- 1991.- V.35.- P. 1697-1704.

288. Jaeger K.-3. Lipases of Bacterial / K.-3. Jaeger, RANSAC, S. et al. // FEMS of microbiology. 063opbi-nepeBecTH.-1994.-V. 15.- P. 29-63.

289. Karper J.B. The LEE Pathogenicity island of enteropathogenic and enterohaemorrhagic Escheerichia coli. Nova Actra Leopoldina. 2004.-V.88. N.-333,-P. 147-150.

290. Kelly T.M., Brenner D.J., Farmer J.J. Enterobacteriaceae // Mannual jf Clinical Microbiology / Ed. E.H. Lennette.- Washington, 1985.- P. 263-277.

291. Kirby W. Extraction of a highly potent penicillin inactivator from penicillin resistant staphylococci / W. Kirby.- Science.-1944,- V.99.- P. 452-455.

292. Kreft J. Evolution of pathogenic Listeria spesies. Nova Actra Leopoldina. 2004,- V.88. No 333. P. 173-183.

293. Krumperman P.H. Multiple antibiotic resistance indexing of Escherichia coli to identify high-risk sources of fecal contamination of foods/ P.H. Krumperman // Applied and Environmental Microiology. 1983,- Vol.46.- N.l. -P. 165-170.

294. Lee C.A. Pathogenicity islands and the evolution of bacterial pathogens / C.A. Lee // Infect. Agents Dis.-1996.-V.5.- P. 1-7.

295. Lopman B. Viral Gastroenteritis Outbreaks in Europe, 1995-2000 / B. Lopman et al. // Emerg Infect Dis, 2003. V. 9, № 1. P. 90-96.

296. Life in the 21 st Century: A Vision for All. The World Health Report- 1998, Geneva, WHO.-1998-24lp.

297. Livermore D.M. Beta-lactamases in laboratory and clinical resistence / D.M. Livermore // Clin. Microbiol. Rev. -1995,- Vol.8.- P. 557-584.

298. Maroncle N. Identification of Klebsiella pneumoniae Genes Involved in Intestinal Colonization and Adhesion Using Signature-Tagged Mutagenesis / N. Maroncle, D. Balestrino, C.Rich et.al. // Infect Immun. 2002. - Vol. 70 (8). - P. 4729-4734.

299. Margalef R. Information theory in ecology/ R. Margalef //Trans. Soc. Gen. Syst. Res. 1958. Vol. 3. P. 36-71.

300. Mathews C.K. An overview of the T4 development program / C.K.Mathews // Molecular Biology of Bacteriophage T4. Ed. Karam J.D. Washington, DC: Am.Soc.Microbiol.-1994.- P. 1-8.

301. Mattoes H.M. Optimizing antimicrobial pharmacodynamics dosage strategies for meropenem / H.M. Mattoes, J.L.Kuti, G.L.Drusano, D.P.Nicolau // Clin.Ther.-2004.-26(8).-P. 1187-1198.

302. Meyer K.S., Urban C., Eagan J.A., Berger B.J., Rahal J.J. Nosocomial outbreak of Klebsiella infection resistant to late-generation cephalosporins. Ann. Intern. Med. 1993,- V.19.-P. 353-358.

303. Mecsas J. Molecular Mechanisms of Bacterial Virulence: Type III Secretion and Pathogenicity Islands / Mecsas J., Strauss E.J. // Emerging Infectious Diseases. 1996. - Vol. 2, № 4. - P. 271 -290.

304. Millis K. B. Specific synthesis of DNA in vitro via a polymerase-catalyzed chain reaction / K. B. Millis, F. A. Faloona // Methods in Enzymology. 2007. -№155. - P. 335-350.

305. Murray B.E. In vitro studies of plasmidmediated penicillinase from Streptococcus faecalis suggest a staphylococcal origin. / B.M. Murray, B. Mederski-Samoraj, S.K. Foster, J.L. Brunton, P. Harford // J. Clin.Invest.-1986.-N.77.- P. 289-293.

306. Murray B.M. New aspects of antimicrobial resistance and the resulting therapeutic dilemmas / B.M. Murray // J.Infect. Dis. -1991.- V.163.-P. 1185-1194.

307. National Committee for Clinical Laboratory Standarts. Development of in vitro susceptibility testing criteria and quality control parameters. Approved quideline. NCCLS Document M-23A.- 1994.-12 (16).

308. Neu H.C. The crisis in antibiotic resistance / H.C. Neu // Science.-1992,-V.257.- P.1064-1073.

309. Noble W.C. Co- transfer of vancomycin and resistance genes from Enterococcus faecalis NCTC 12201 to Staphylococcus aureus / W.C.Noble, Z.Virane, RGA. Gree // FEMS Microbiol. Lett.-1992.-N.93.-P.-195-198.

310. Niyogi S.K. Enteroaggregative Klebsiella pneumoniae in association with childhood diarrhea/ S.K. Niyogi, A. Pal, U. Mitra et. al. // Indian J Med Res. -2000. Vol. 112. - P. 133-134

311. O" Brien T.F. Resistance to antibiotics at medical centres in different parts of the world and the International survey of antibiotic resistance group / T.F.O' Brien // J. Antimicrob. Cbemotber. .-1986,- Suppl.- P.-243-253.

312. Ochman H. Lateral gene transfer and the nature of bacterial innovation // H. Ochman, J.G. Lawrence, E.A. Groisman //Nature 2004.-405.-P. 299-304.

313. Olson M.E. Biofilm bacteria: formation and compararive susceptibility of antibiotics / Olson M.E. et al. // Can. J. Vet. Res.- 2002,- V.66(2).-P.86-92.

314. O'Toole G.A. Flagellar and twitching motility are necessary for Pseudomonas aeruginosa biofilm development / G.A. O'Toole , R. Kolter // Mol. Microbiol.-1998,- V. 30,- P. 295-304.

315. O'Toole G.A. Biofilm formation as microbial development / G.A. O'Toole, H.B Kaplan, R.Kolter // Ann. Rev. Microbiol.- 2000.-V.54.-P. 49-79.

316. Pathogenicity islands and other virulence elements in Listeria / J. Kreft, J.A. Vazquez-Boland, S. Altrock et al. // Curr Top Microbiol Immunol.-2002.- V. 264(2).-P. 109-125.

317. Parashar U.D. Rotavirus and Severe Childhood Diarrhea / U.D. Parashar, C.J.Gibson, J.S.Bresee, R.I. Glass // Emerg Infect Dis .- 2006.-V. 12(2).- P.304-306.

318. Pass M.A. Multiplex PCRs for Identification of Escherichia coli Virulence Genes / M.A. Pass, R. Odedra, R.M. Batt // J. Clinical Microbiology.- 2000,-V.38(5).-P. 2001-2004.

319. Phillipon A., Labia R., Jacoby G. Extendedspectrum I lactomases. Antimicrob. Agents Chemother.- 1989,- V.33.- P. 1131-1136.

320. Primer-directed enzymatic amplification of DNA with a thermostable DNA polymerase / R. J. Saiki, D. H. Gelfan, S. Stoffel, S. J. Scharff, R. Higuchi // Science. 2006. - №239. - P. 487-491

321. Quinolone antibiotic in the treatment of Salmonella infections / M.O Asperilla, A. Raymond, R.A. Smego, L.K.Scott // Rev. Infect. Dis.-1990.-V.12,- P. 873-889/

322. Role of intraspecies recombination in the spread of pathogenicity islands within the Escherichia coli species/ S. Schubert, P.Darlu, O.Clermont et.al/PloS Pathog.-2009.-V.5(1).-P.257-265.

323. Roy C. Frequency of plasmid-determined betalactamases in 680 consecutively isolated strains of Enterobacteriaceae. / C. Roy, C.Segura, M.Tirado, R.Reig, M.Hermida, D.Teruel // Eur. J. Clin. Microbiol.-1985,- №4,- P. 146-147.

324. Ryder M.A. Catheter-Related Infections: It's All About Biofilm. Topics in Advanced/ M.A. Ryder // Practice Nursing Journal.- 2005.-V.5(3).

325. Sambrook J. Molecular cloning. A laboratory manual / J. Sambrook, E. F. Fritsch, T. Maniatis. New York: Cold Spring Harbor Laboratory Press.- 1989. - V. 2,- 345 p.

326. Schauer D.B. Attacching and effacing locus of a Citrobacter freundii biotypethat causes transmissible murin colonic hyperplasia/ D.B. Schauer, S.Falkov // Infect.Immun.- 1993.-V.61,- P.2486-2492.

327. Sen K. Multiplex PCR for detection of Enterobacteriaceae in blood / K. Sen, D.M. Asher // Transfusoin.- 2001.- V. 41(11).-P. 1356-1364.

328. Sougakoff W. Plasmidmediated resistance to third generation cephalosporins caused by point mutations in TEM -type penicillinase genes / W. Sougakoff, S. Goussard, G. Gerbaud, P. Courvalin // Rev. Infect. Dis.-1988.- V.10.-P. 879-884.

329. Schmidt H. Pathogenicity Islands in Bacterial Pathogenesis / H. Schmidt, M. Hensel // Clinical Microbiology reviews.-2004.- V.17.-N1.- P. 14-56.

330. Short-course norfloxacin and trimethoprim-sulfamethoxazol treatment of sigellosis and salmonellosis in Egypt / Bassily S., Hyams K.C., N.A. El Masry et al. // Am. J. Trop. Med. Hyg.-1994.-V.51-32.- P. 219-223.

331. Smith H.W. The toxic role of Alphahaemolisin in the pathogenesis of experimental E.coli infection in mice/ H.W. Smith, H.B. Huggins // J.of Gen Microb.-1985.- N.131. p. 395-403.

332. Tenover F.C. Novel and emerging mechanisms of antimicrobial resistance in nosocomial pathogens / F.C. Tenover // Am. J. Med.-1991.-V.91 (suppl B).-P. 7681.

333. Tenover F.C. Global problem of antimicrobial resistance / F.C. Tenover // Russ. Med.J.-2005.- P.1-6.

334. Tetz V.V. The effect of antimicrobial agents and mutagen on bacterial cells in colonies / V.V. Tetz // Med. Microbiol. Lett. 1996.-V.5.- P.426-436.

335. Thanassi D. G. Multiple pathways allow protein secretion across the bacterial outer membrane / D. G. Thanassi, S. J Hultgren// Current Opinion in Cell Biology. 2000. - Vol. 12. - P. 420-430.

336. The application of biofilm science to the study and control of chronic bacterial infections / Costerton J. W., Veeh R., Shirtliff M. et. al. // Clin. Invest.-2003.-V. 112.-P.1466-1477.

337. Torres A.G. Pathogenicity island of intestinal E.coli / A.G. Torres, J.B. Kaper // Curr Top Microbiol Immunol.- 2002.-V. 264 (1).- P. 31-48.

338. Vandepitte J. Basic laboratory procedures in clinical bacteriology / J.Vandepitte, K. Engbaek, P. Piot, C.C. Heuck.-Geneva: World Health Organization. -1991.

339. Virulence factors (aerobactin and mucoid phenotype) in Klebsiella pneumoniae and Escherichia coli blood culture isolates / V. Vernet, A. Philippon, C. Madoulet et al. // FEMS Microbiol Lett. 1995;130 (1).- P. 51-57.

340. Wang C.Y. Pandrug-resistant Pseudomonas aeruginosa among hospitalized patients clinical features, risk-factors and outcomes / C.Y. Wang, J.S. Jerng, K.Y. Cheng // Clin. Microbiol. Infect.- 2006.- V.12.- P. 63-68.

341. Watnick P. Biofilm, city of microbes / P.Watnick, R.Kolter // J. Bacteriol.-2000.- V.182.- P.2675-2679.

342. Weyant S.R., Moss W., Weaver R., Hollis D., Jordan J., Cook E., Daneshvar M. Identification of Unusual Pathogenic Gram-Negative Aerobic Bacteria (second edition). Atlanta, Georgia, 1999,- 791p.

343. Wiener J. Multiple antibiotic-resistant Klebsiella and Escherihia coli in nursing homes / J.Wiener, J.P.Quinn, P.A.Bradford et.al.- JAMA.-1999.- N 281,-P.517-523.

344. Wilhelmi I. Viruses causing gastroenteritis / I. Wilhelmi, E. Roman, A. Sanchez-Fauquier // Clin. Microbiol. Infect. 2003. V. 9. P. 247-262.

345. Wisplinghoff H. Molecular epidemiology of clinical Acinetobacter baumannii isolates from Europe and the U.S. using a new MLST scheme / H.Wisplinghoff, C. Hippler, S. Bartual, F. Rodriguez-Valera et al. // 45 th ICAAC. Abstract C2- 2006.-1428.- P. 126.