Ингибирование свободнорадикальных реакций и точечные мутации при радиационном повреждении сахарного фрагмента ДНК, компьютерное моделирование тема диссертации и автореферата по ВАК РФ 03.00.02, кандидат химических наук Кузурман, Петр Андреевич

• Кузурман, Петр Андреевич
• кандидат химических наук
• 2000

Оглавление диссертации кандидат химических наук Кузурман, Петр Андреевич

ВВЕДЕНИЕ.

Глава 1. Ингибирование превращений 2-дезоксирибозильных радикалов: радиозащита и точечные мутации (обзор литературы).

Глава 2. Метод исследования: компьютерное моделирование процесса взаимодействия радикалов 2-дезоксирибозила с 1пН.

§ 1. Особенности метода компьютерного моделирования.

§2. Метод окна доступа.

§3. Схема компьютерного эксперимента.

Глава 3. Разработка количественного метода оценки вероятности взаимодействия двух молекул.

§ 1. Метод окна доступа - метод количественной оценки стерической вероятности взаимодействия реагентов.

§2. Принципы оценки стерической вероятности межмолекулярных взаимодействий в виртуальном пространстве.

Метод окна доступа: прямая и обратная задачи.

§ 3. Моделирование образования химической связи.

Глава 4. Изменение положения азотистых оснований в макрорадикалах

2-дезоксирибозила относительно исходного нуклеотида.

§ 1. Радиационно-химическое образование радикалов

2-дезоксирибозила в составе нуклеотида.

§2. Построение моделей макрорадикалов в составе нуклеотида и полинуклеотидной цепочки.

§ 3. Моделирование процесса передачи первоначального повреждения неспаренного электрона) с сахара на основание.

Глава 5. Исследование методом окна доступа процесса взаимодействия радикалов 2-дезоксирибозила в ДНК с веществамиингибиторами — реакции замещения.

§ 1. Принципы моделирования реакции замещения методом окна доступа.

§ 2. Построение 3-мерных моделей веществ-ингибиторов.

§3. Модели С'г, С'з- и С'4-стереоизомеров 2-дезоксирибозы.

Глава 6. Принципы управления процессами радиозащиты ДНК и выхода стереоизомеров, основанные на методе окна доступа.

§ 1. Образование однонитевых разрывов и оценка вероятности взаимодействия С'з-, С'5-, С'4-радикалов 2-дезоксирибозила с 1пН.

§ 2. Иные типы повреждений сахарного фрагмента ДНК и оценка вклада реакции Ксах+1пН в конечный эффект радиозащиты.

§ 3. Стереоизомеры 2-дезоксирибозила как потенциальные сайты точечных мутаций и оценка выхода их образования по реакции ингибитора с радикалами сахарного фрагмента.

ВЫВОДЫ.

Введение диссертации (часть автореферата) на тему «Ингибирование свободнорадикальных реакций и точечные мутации при радиационном повреждении сахарного фрагмента ДНК, компьютерное моделирование»

Актуальность темы.

Радиозащита ДНК на первичных, физико-химических стадиях ее лучевого поражения в клетке по свободнорадикальному механизму, как принято считать, связана с реализацией двух процессов: а) конкуренции за радикалы - продукты радиолиза воды между веществом-радиопротектором и биополимером и б) ингибирования свободноради-кальных реакций, по Н.М.Эмануэлю, 1957. Реализация этих процессов при облучении живых организмов вызывает радиозащитный эффект (Эмануэль Н.М., Бурлакова Е.Б., Круглякова К.Е., Сапежинский И.И., 1966), а на молекулярном уровне - снижение выхода деструкции оснований и различных процессов деструкции сахарофосфатного остова ДНК.

Анализ данных по радиолизу растворов ДНК в присутствии веществ - радиопротекторов показывает, что восстановление исходной структуры в полимере возможно лишь в том случае, если неспаренный электрон в первичном макрорадикале локализован на 2-дезоксирибозном звене. Как известно, при радиолизе углеводов в водных растворах образуются - стереоизомеры (эпимеры) исходных соединений: в результате реакций восстановления радикалов сахара, в частности, первичных радикалов дезоксирибозы (Кочетков Н. К., Кудряшов Л.И. и др., 1970-78). Если предположить, что такого типа процесс возможен и при облучении ДНК (образование эпимеров 2-дезоксирибозы), то тезис о восстановлении исходной (первоначальной) структуры 2-дезоксирибозила в реакциях его радикалов с веществом-ингибитором нуждается в корректировке, а именно: поскольку асимметрическими атомами в 2-дезоксирибозе являются Сь Сз и С4, следует ожидать образования продуктов радиолиза - эпимеров именно по этим атомам. Отсюда можно было бы прийти к выводу, что и по реакции ингибитора 1пН с первичными макрорадикалами С'ь С'з и С'4, имеющими планарную конфигурацию связей С-С и С-О, наряду с восстановлением исходной конфигурации связей - структуры фу-ранозного цикла (истинной репарацией повреждений ДНК) возможно образование и стереоизомеров (по крайней мере, с 50%-ной вероятностью, учитывая возможный под

6. ход молекулы InH с двух сторон к "сахарному" радикалу с планарной конфигурацией химических связей). Поскольку появление таких стереоизомеров должно изменить ориентацию оснований в пространстве, то модифицированные таким образом нуклео-тиды ( радиация + действие InH) могли бы стать в ДНК потенциальными сайтами точечных (транзиций и трансверсий) мутаций.

Представляется, что единственным методом, позволяющим решить эту проблему, является метод компьютерного моделирования (МКМ), которому присущи:

- возможность моделирования пространственных молекулярных структур и их фрагментов,

- возможность оперативных изменений в стереоструктурах биомакромолекул под воздействием различных факторов,

- возможность моделирования биохимического процесса по соответствующим элементарным актам.

Поэтому МКМ в сочетании с разработанной компьютерной технологией получения количественных параметров взаимодействующих молекулярных структур был избран для решения поставленной задачи. Предлагаемый в данной работе метод позволил, опираясь на литературные и полученные в лаборатории физической химии ДНК и других биополимеров ИБХФ РАН данные исследований по радиолизу ДНК и соединений, моделирующих ее фрагменты, проанализировать механизмы превращений каждого из 5 типов первичных радикалов 2-дезоксирибозила во всех 4-х дезоксинуклеотидах вплоть до образования конечных молекулярных продуктов деструкции сахарного фрагмента, в том числе и в присутствии вещества-ингибитора.

В отличие от существующих методик моделирования, например, рассматривающих взаимодействие поверхностей молекулярных структур по динамическому механизму (Woodcock et al., 1995), используемая оперирует с функциональными группами (активными центрами) реагентов и их промежуточным комплексом (в статическом режиме).

К радиационным процессам деструкции ДНК, вызванных первичным повреждением ее сахарного фрагмента, относят образование однонитевых разрывов (ОР), щелочно-лабильных связей (ЩЛС), выделение свободных азотистых оснований (САО), образование 5',8-циклических производных пуринов и т.п. (Амирагова М.И.и др., 1973; Рябченко Н.И., 1979; Fuciarelli A.F.et al., 1985; Swarts S.G., 1995). Эти повреждения можно связать с превращениями первичных 2-дезоксирибозильных радикалов C'i - С'5.

7.

Представлялось интересным определить, с превращениями какого именно радикала связано то или иное повреждение сахарофосфатного остова, количественно оценить вклад каждого из 2-дезоксирибозильных радикалов в эти повреждения ДНК и, наконец, оценить (прогнозировать) максимальный эффект влияния на эти процессы щения радикалов в облучаемой клетке вещества-ингибитора свободнорадикальных реакций (СРР).

Цель и задачи работы.

Цели данного исследования состояли в том, чтобы: а) разработать компьтерную методику моделирования процесса взаимодействия радикалов и молекул веществ-ингиби-тора; б) оценить стерическую вероятность взаимодействия радикалов нуклеотидов с радикальным центром в сахарном фрагменте и молекул веществ-ингибиторов по двум альтернативным направлениям: радиозащита (восстановление исходной структуры биополимера) и процесс образования стереоизомеров 2-дезоксирибозы в составе нулео-тида (потенциальных сайтов точечных мутаций).

Научная новизна работы.

1. Впервые предложен метод количественной оценки стерической вероятности взаимодействия любых двух молекул, фрагмента биополимера и молекулы, основанный на компьютерном моделировании (метод окна доступа). На его основе определена вероятность взаимодействия различных ингибиторов со всеми радикалами сахарного фрагмента в В-ДНК.

2. Этим методом впервые оценена эффективность радиозащиты сахарного фрагмента нуклеотида ДНК и вероятность образования стереоизомеров, исходя и^ превращений каждого из радикалов 2-дезоксирибозила в присутствии веществ-ингибиторов свободнорадикальных реакций.

3. Оценена (в первом приближении) возможность образования водородных связей между основанием в каноническом нуклеотиде в составе ДНК и основанием в эпиме ре - продукте радиационной модификации 2-дезоксирибозы; оценена вероятность максимального выхода потенциальных точечных мутаций при преврати)

8. образовании стереоизомеров 2-дезоксирибозы.

4. Представлена схема образования однонитевых разрывов и выделения свободных оснований, связывающая оба этих процесса с последовательностью превращений одного и того же типа радикалов.

Практическое и теоретическое значение работы.

Разработан метод количественной оценки вероятности взаимодействия любых двух молекул или фрагмента биополимера и молекулы, основанный на стерическом моделировании. Для использования метода необходимы сведения о структуре взаимодействующих молекул и (хотя бы приблизительное) знание механизма взаимодействия. Показана возможность применения метода окна доступа для оценки вероятности реализации взаимодействия всех радикалов 2-дезоксирибозила с различными ингибиторами для определения относительного выхода повреждений ДНК.

Положения, выносимые на защиту.

1. Конструирование 3-мерных моделей исходных нуклеотидов, их радикалов по сахарному фрагменту и их стереоизомеров.

2. Метод моделирования реакции замещения + 1пН, оценка вероятности взаимодействия двух молекул (метод окна доступа).

3. Результаты оценки эффективности радиозащиты от повреждений сахарного фрагмента нуклеотида в составе В-ДНК, исходя из превращений каждого из радикалов 2-дезоксирибозила для различных веществ-ингибиторов.

4. Оценка выхода потенциальных предмутационных повреждений при образовании эпимеров сахарного фрагмента в реакциях с различными ингибиторами.

5. Сведение материального баланса по промежуточным (радикалы С'п, п=1-5) и основным конечным продуктам радиолиза сахарного фрагмента в В-ДНК.

Заключение диссертации по теме «Биофизика», Кузурман, Петр Андреевич

ВЫВОДЫ

1. Разработан метод моделирования реакции замещения (11+1пН=1Ш+1п', где Я' и 1п -радикалы сахарного фрагмента ДНК и ингибитора) - метод окна доступа. Данный метод позволяет количественно оценивать стерическую вероятность (эффективность) взаимодействия любых двух молекул в различных средах и предоставляет возможность решать две основные задачи:

- прямая - определение вероятности взаимодействия при известных стереоструктурах реагентов и механизме реакции;

- обратная - уточнение или определение стереоструктур и механизма реакции при известной из эксперимента вероятности взаимодействия реагентов.

2. Построены 3-мерные структуры пяти алкильных радикалов, возникающих из канонических дезоксинуклеотидов в результате атаки ОН радикалами атомов углерода в дезоксирибозном фрагменте молекулы В-ДНК. В качестве исходной использовалась структура 2-дезоксирибозы в СУэндо-конформации, нуклеотиды рассматривались в анти-ориентации относительно N - гликозидной связи. Установлено, что при образовании алкильных радикалов сахарного звена в составе полинуклеотидной цепи(струк-турного аналога тяжа В-ДНК) основание отклоняется от первоначального положения в неповрежденном нуклеотиде: угол поворота Ы-гликозидной связи варьирует в пределах от -49° (для СО до -0° (для С'5).

3. Построены 3-мерные структуры стереоизомеров канонических нуклеотидов по СУ, С'з- и СУ атомам сахарного фрагмента В-ДНК. В образовавшихся стереоизомерах угол поворота Ы-гликозидной связи изменяется от ~55° (для С'О до ~2° (для С'з).

4. На моделях полинуклеотидных цепей показана принципиальная возможность образования водородных связей между одним из канонических нуклеотидов и нуклеоти-дом с образовавшимся стереоизомером. Предполагается, что образование Н-связей между неканоническими (по Уотсону-Крику) основаниями может служить основой появления точечных мутаций (по сахару).

5. По превращениям всех макрорадикалов 2-дезоксирибозила в присутствии ингибиторов-радиопротекторов (антиоксидантов) в облученной клетке методом окна доступа определены максимально достижимые величины выходов радиозащиты и потенциаль

75. ного мутагенного эффекта. В случае 4-окси-3,5-ди-трет.-бутил-а-метилбензил амина максимальный выход радиозащиты не превышает -13 % (для радикала С'4 ), а минимальный - -0 % (для радикала С'О; вероятность выхода потенциальных точечных мутаций при образовании стереоизомеров достигает: 10,7% (С'0,12,2% (С'з), 10,7%(С'4).

6. Использование набора ингибиторов с различными размерами масок открывает прин ципиальную возможность управления процессами избирательных превращений радикалов для достижения целевого эффекта: радиозащиты ДНК или образования стерео-изомеров сахарного фрагмента-потенциальных сайтов точечных мутаций. Например, при переходе от упомянутого экранированного фенола к меркаптоэтанолу в случае С'1-центрированного радикала выход стереоизомера возрастает в - 11 раз, а для С'4 -в -27 раз.

7. На основе анализа результатов исследований (эксперименты лаборатории физической химии ДНК и других биополимеров ИБХФ РАН и литературные данные) в первом приближении достигнут материальный баланс по свободнорадикальным и основным молекулярным продуктам (процессам) радиолиза сахарного фрагмента ДНК. Представлена схема превращений радикалов 2-дезоксирибозила, включающая элемен тарные акты гидролиза фосфоэфирных связей в радикалах С'з,С'5 и (в присутствии Ог) С'4 и образования аллильных радикалов, что впервые позволило объяснить возникновение однонитевых разрывов, сопровождающееся выделением свободных оснований при у-облучении биополимера. Максимальные величины выхода процессов образования однонитевых разрывов, свободных азотистых оснований в В-ДНК при облучении клетки в присутствии 1пН, например, 4-окси-3,5-ди-трет-бутил-а-метилбензиламина, согласно оценке методом окна доступа, в результате превращения указанных алкиль-ных радикалов не превышают 40-45% общего выхода образования радикалов сахарно го фрагмента, а с учетом образования эпимеров по атомам углерода С'з и С'4 в фура-нозном цикле этот эффект достигает величины - 65%.

76.

Список литературы диссертационного исследования кандидат химических наук Кузурман, Петр Андреевич, 2000 год

1. Эмануэль Н.М. Роль свободных радикалов в радиобиологических процессах. Труды МОИП. Т.7. М.: Изд-во АН СССР, 1963. С.73-83.

2. Эмануэль Н.М., Бурлакова Е.Б., Круглякова К.Е., Сапежинский И.И. Изучение свободно радикальных процессов при действии излучения на модельные системы и роль радикалов в лучевом поражении. // Изв. АН СССР, сер. биологич., 1966. N2. С. 183-187.

3. Шарпатый В.А. Радиационная химия биополимеров. М.: Энергоиздат. 1981. 158 с.

4. Шарпатый В.А. Радиационная модификация сахарного фрагмента в ДНК: образование разрывов, изменение конформации полимера, передача повреждения на основание. //Радиобиология, 1992. Т.32. В.2. С.180-193.

5. Шарпатый В.А., Султанходжаева М.Н О роли положительно заряженных парамагнитных частиц в радиолитическом разложении глюкозы. // Изв. АН СССР, сер. химич., 1969. N5. С.1183-1185.

6. Gregoli S., Olast M., Bertinchamps A. Charge migration phenomena in y-irradiated costacking complexex of DNA nucleotides. I. A computer-assisted ESR analysis of dAMP-dTMP complexex in frozen solution. // Radiat. Res., 1977. V. 70. N 2.1. P. 255-274.

7. Добряков C.H., Ильясова В.Б., Минхаджидинова ДР., Шарпатый В.А. Машинный анализ анизотропных спектров ЭПР и структура радикальных Н- и ОН-ад-дуктов компонентов нуклеиновых кислот в водных замороженных растворах. // Биофизика, 1986. Т.31. N6. С. 933-935.

8. Teoule R. Review: Radiation-induced DNA damage and its repair. // Int. J. Radiat. Biol., 1987. V.51. N4. P.573-589.

9. Наджимиддинова M.T., Шарпатый В.А. Образование и превращение радикалов в замороженных водных растворах моносахаридов. // Докл. АН СССР, 1968.1. Т. 180. N4. С. 909-912.

10. Кочетков Н.К., Кудряшов Л.И., Членов М.А., Шарпатый В.А., Наджимиддино-ваМ.Т., Никитин И.В., Эмануэль Н.М. О механизме радиолиза водных растворов рибозы. //Докл. АН СССР, 1968. Т. 183. N2. С. 376-378.

11. Кочетков Н.К., Кудряшов Л.И., Членов М. А. Радиационная химия углеводов. М.: Наука. 1978. 288 с.

12. ЗенгерВ. Принципы структурной организации нуклеиновых кислот. М.:Мир.1987. 584 с.

13. Амирагова М.И., Дуженкова Н.А., Крушинская Н.П., Мочалина А.С., СавичА.В., Шальнов М.И. Первичные радиобиологические процессы. М.: Атомиздат. 1973. 336 с.

14. Тарасов В.А. Молекулярные механизмы репарации и мутагенеза. М.: Наука. 1982. 226 с.

15. Алиханян С.И., Акифьев А.П., ЧернинЛ.С. Общая генетика. М.: Высшая школа. 1985. 448 с.

16. Моссэ И.Б. Проблемы химической защиты в радиационной генетике. Минск: Наука и техника. 1974. 152 с.

17. Моссэ И.Б. Радиация и наследственность: генетические аспекты противорадиационной защиты. Минск: Университетское. 1990. 210 с.

18. Скалацкая С.И. Возможная роль молекулярных продуктов радиолиза ДНК в мутагенезе. //Радиац. биология. Радиоэкология, 1995. Т.35. В.2. С.205-224.

19. Ward J.F. Radiation mutagenesis: The initial DNA lesions responsible. // Radiat. Res., 1995. V. 142. N 3. P. 362-368.

20. Ward J.F. DNA damage produced by ionizing radiation in mammalian cells: Identities, mechanisms of formation, and reparability. // Prog. Nucl. Acid Res. & Mol. Biol.,1988. V. 35. P. 95-125.

21. Гоникберг Э.М., Одинцова С.П., Андреев В.М., Круглякова К.Е. Кинетика возникновения одноцепочечных разрывов и щелочелабильных связей при облучении суперспиральной ДНК фага РМ2. // Радиобиология, 1981. Т. 21.78.1. В. 1. С. 51-57.

22. Гоникберг Э.М., Андреев В.М., Одинцова С.П. Использование псоралена для обнаружения сопряженных повреждений двух цепей в облученной ДНК фага РМ2. //Радиобиология, 1984. Т. 24. В. 1. С. 13-16.

23. Edington C.W. The effect of 5,2-aminoethylisothiuronium bromide hydrobromide (AET) on the induction of dominant and sex-linked recessive lethals in Dros. mel. // Amer. Naturalist, 1958. Y. 92. N 867. P. 371-373.

24. HenkeH., Höhne G., Künkel A. Über die Wirkung von Aminoaethylisothiuronium (AET) auf die Strahleninduzierte Mutationstrate bei Drosophila melanogaster. // Strahlentherapie, 1963. Bd. 122. N 2. S. 279-282.

25. Künkel H.A., Rosener A. Experiments with chemical compounds which reduce or increase mutagenic effects of ionizing radiation. // Genetics Today: Proc. 2nd Intern. Congr. Genetics. Hague. 1963. V. 154. N4. P. 67.

26. Mittler S. The failure of sulphhydryl compounds AET, MEA and glutathione to protect against X-ray induced chromosome aberrations in male Drosophila. // Int. J. Radiat. Biol., 1964. V. 8. N 5. P. 405-407.

27. Künkel H.A. Gibt es einer genetischen Strahlenschutz? //Atompraxis, 1964. V. 10. N7. P. 301-309.

28. Померанцева М.Д., Вилкина Г.А. Влияние цистамина на частоту индуцированных радиацией генетических повреждений в половых клетках самцов мыши.

29. Инф. бюлл. Научн. совета по пробл. радиобиологии, 1975. В. 18. С. 36-37.

30. Künkel H.A., Trams А., Henke Н. Über den Einfluss von S-Hydroxytryptamin (serotonin) auf die Strahleninduzierte Mutationsrate bei Drosophila melanogaster. // Naturwissenschaften, 1965. Bd. 52. N. 23. S. 650-652.

31. Sobels F.H., Tates A.D. Recovery from premutational damage of X-irradiation in Drosophila spermatogenesis. //J. Cell and Compar. Physiol., 1961. V. 58. N 3. P. 189-192.

32. Proust J. Action d'un pre-traitment des femelles Drosophila melanogaster avec de

33. Г Actinomycine D sur la frequence de letaux dominants induits par les rayons dans les spermatozoides murs. //C. r. Acad. Sei., 1969. V. D269. N1. P. 86-88.

34. Ehling U.H. Modification of premutational radiation damage in male mice.(Summary). //Stud. Biophys., 1971. N29. P. 151-152.79.

35. Mandai S.K., RahsmanR., Mukherjee A.S. Fractional and whole body mutations in Drosophila melanogaster: effect // Proc. Symp. Mutagen. Carcinogen, and Teratogen, of Chem. Baroda; New Delhi, 1975. P. 129.

36. Scholes G., Taylor W., Weiss J. Action of X-rays (200 kV) on a- and ß-Glycerophosphate in aqueous solution. //J. Chem. Soc., 1957. N1. P. 235-246.

37. Weiss J. Organic Peroxides in Radiobiology. L.-N.Y.: 1958. P. 52.

38. ЖижинаГ.П., ЗыбинаД.Л., Круглякова K.E., Эмануэль H.M. Кинетические характеристики распада перекисных соединений в облученных растворах ДНК. //Докл. АН СССР, 1964. Т. 158. N4. С. 935-938.

39. ЖижинаГ.П. Кинетика образования и распада гидроперекисей ДНК. Дисс.канд. хим. наук. М.: ИХФ АН СССР, 1967. 120 с.

40. Закатова Н.В., Шарпатый В.А. О механизме радиолиза водных растворов ДНК. //Докл. АН СССР, 1971. Т. 200. N6. С. 1378-1381.

41. Шарпатый В. А. Первичные механизмы лучевого поражения биологически важных макромолекул: ДНК, белка, ДНП, полисахаридов. Дисс. . до кг. хим. наук. М.: ИХФ АН СССР, 1972. 419 с.

42. Скворцов В.Г., МилинчукВ.К. Реакции свободных радикалов в 7-облученной

43. ДНК в присутствии кислорода. //Радиобиология, 1975. Т. 15. В. 4. С.483-489.

44. Sharpatyi V.A., ZakatovaN.V. Formation and conversion of radicals in irradiated aqueous DNP solutions. // Proc. of IV Symp. on Radiat. Chem., Budapest. 1976. P. 923-930.

45. Закатова H.B., Шарпатый B.A. О реакциях радикалов, образующихся при облучении ДНП в водных растворах. //Радиобиология, 1977. Т. 17. В. 1. С. 3-7.

46. Шарпатый В. А., ГолубеваН.П. О первоначальном месте локализации свободной валентности в нуклеопротеидном комплексе при облучении его водных замороженных растворов. //Там же, 1977. Т. 17. В. 2. С. 200-204.

47. Gregoli S., OlastN., Bertinchamps A. Radiolitic pathways in y-irradiated DNA: influence of chemical and conformational factors. // Radiat. Res., 1982. V. 89. N 2. P. 238.

48. Шарпатый B.A. Микродозиметрия. Л.: Изд-во ЛИЯФ, 1986. С. 163-180.

49. Бунина Е.Ф., ЖижинаГ.П., Шарпатый В. А. Образование радикалов перекисно-го типа при низкотемпературном облучении клеток и тканей. // Изв. АН СССР, сер. биолог., 1987. N3. С. 465-468.

50. Бунина Е.Ф., Шарпатый В. А. Поражение ДНК в составе клеток и тканей. //Там же, 1988. N 1. С. 137-139. х

51. Miyamoto Т., Nakao J. The frequency pattern of dumpy mutations induced by X-rays in the successive stages of oocytes ofDrosophila. // Jap. J. Genet., 1978. V. 53. N. 3. P. 175-181.

52. Sobels F.H. Repair and differential radio sensitivity in developping germ cells of Drosophila males. // Repair from Genetic Radiation Damage. Oxf.; L.; N.Y.; Paris, 1963. P. 179-185.

53. Miyamoto T. Dumpy mutations following X-irradiation ofDrosophila melanogaster mature sperm in oxygen or in nitrogen. //Genetics, 1982. V. 102. N4. P. 783-794.

54. InagakiE., Sobels F.H. Post-radiation repair of specific loci in Drosophila spermatids. //Mutat. Res., 1972. V. 15. N2. P. 229-232.

55. Fujikawa K. Pilot experiments involving visible mutations induced in immature Drosophila oocytes by X-rays at low dose rate. // DJS, 1981. V. 56. P. 39-40.

56. Fujikawa K., Inagaki E. Mutagenic effectiveness of 14 MeV neutrons and 200 kV X-rays at the dumpy complex locus of Dros. mel. // Mutat. Res., 1979. V. 63. N 1.81.1. P. 139-146.

57. Woodcock S., Henrissat В., Sugiyama J. Docking of congo red to the surface of crystalline cellulose using molecular mechanics. //Biopolymers, 1995. V. 36. N2.1. P. 201-210.

58. Кларк Т. Компьютерная химия. ML: Мир. 1990. 384 c.

59. Кантор Ч., ШиммелП. Биофизическая химия. М.:Мир. 1984. Т.2 . 496 с.

60. Современные методы биофизических исследований: Практикум по биофизике. М.: Высшая школа. 1988. 359 с.

61. Ландау М. А. О геометрии сахарных остатков нуклеиновых кислот. // Изв. АН СССР, сер. биол., 1990. N 5. С. 649-656.

62. Colson А.-О, Besler В., SevillaM.D. Ab initio molecular orbital calculations on DNA radical ions. 3. Ionization potentials and ionization sites in components of the DNA sugar phosphate backbone. //J. Phys. Chem., 1993. V. 97. N30. P. 8092-8097.

63. Эмануэль H.M., Кнорре Д.Г. Курс химической кинетики. М.: Высшая школа. 1974. 400 с.

64. ШарпатыйВ.А. Проблемы радиационной химии полисахаридов (обзор). // Радиац. биология. Радиоэкология, 1999. Т. 39. N1. С. 156-161.

65. Садыхова С.Х., Брагинская Ф.И. Изучение гидратации нуклеиновых кислот (ДНК и РНК) и их производных ультразвуковым методом. //Биофизика, 1975. Т. 20: N 1. С. 20-22.

66. Шадыро О.И., Ильясова В.Б., Юркова И. Л., ЕдимичеваИЛ, ШарпатыйВ.А. О механизме образования разрывов в полинуклеотиде. // Тр. IX конф. "Магнитный резонанс в химии и биологии", Звенигород: Тез. докл. М.: Изд.-во ИХФ, 1996. С. 67-68.

67. BonicelA., MariaggiN., Hughes Е., TeouleR. In vitro y-irradiation of DNA: Identification of radioinduced chemical modifications of the adenine moiety. // Radiat. Res., 1980. V. 83. N 1. P. 19-26.

68. Fuciarelli A.F., Miller C.G., Ralleigh J. A. An immunochemical probe for 8,5'-cyclo-adenosine-5'-monophosphate and its deoxy analog in irradiated nucleic acids. // Radiat. Res., 1985. V. 104. N2. P. 272-283.

69. Cadet J., BergerM. Radiation-induced decomposition of the purine bases within DNA and related model compounds. //Int. J. Radiat. Biol., 1985. V. 47. N2. P. 127-143.82.

70. DirksenML., BlakelyW.F., HolwittE., DizdarogluM. Effect ofDNA conformation on hydroxyl radical-induced formation of 8,5'-cyclopurine 2'-deoxyribonucleoside residues in DNA. //Int. J. Radiat. Biol., 1988. V. 54. N2. P. 195-204.

71. МисуркинИ.А., Тихомиров В.А. Частное сообщение.

72. DewarM.J.S., Zoebisch E.G., EamonnF.H., Stewart J.J.P. AMI: A new general purpose quantum mechanical molecular model. //J. Amer. Chem. Soc., 1985.

73. V. 107. N 13. P. 3902-3909.

74. Stewart J. J.P. Applications of "MNDO"-type semiempirical methods. //J. Сотр. Chem., 1989. V. 10. N2. P. 209-220.

75. Ершов В.В., Никифоров Г.А., Володькин А.А. Пространственно-затрудненные фенолы. М.: Химия. 1972. 351 с.

76. Корицкий А.Т., Шарпатый В. А. О превращениях свободных радикалов сахарного фрагмента ДНК при радиолизе. //Химия высоких энергий, 1991. Т. 25. N4. С. 354-356.

77. Roots R., Okada S. Protection of DNA molecules of cultured mammalian cells from radiation-induced single-strand scissions by various alcohols and SH compounds. // Int. J. Radiat. Biol., 1972. V. 21. N4. P. 329-342.

78. БяковВ.М., Ничипоров Ф.Г. Внутритрековые химические процессы. М.: Энер-гоатомиздат. 1985. 152 с.

79. Пикаев А.К. Современная радиационная химия. Радиолиз газов и жидкостей. Т. 2. М.: Наука. 1986. 440 с.

80. Бугаенко Л.Т., Кузьмин М.Г., ПолакЛ.С. Химия высоких энергий. М.: Химия. 1988. 366 с.

81. Пикаев А.К., Кабакчи С. А. Реакционная способность первичных продуктов радиолиза воды. Справочник. М.: Энергоатомиздат. 1982. 200 с.

82. Рябченко Н И. Радиация и ДНК. М.: Атомиздат. 1979. 192 с.

83. Swarts S.G. Importance of hole and electron transfer processes to end-product formation in y-irradiated dry and hydrated DNA. // Proc. of Congress "Radiation Research 1895-1995", Aug. 27-Sept. 1, 1995, Wurzburg. V. 2. P. 208-211.

84. Шарпатый В. А. О свободнорадикальных механизмах радиационной модификации сахарного фрагмента ДНК. // Радиац. биология. Радиоэкология, 1997. Т. 37. В. 4. С.508-511.83

85. ПряхинЕ.А. Динамика изменения репарации ДНК клеток костного мозга у мышей при облучении Sr90. Дисс. канд. биол. наук. М.: МГУ им. М.В. Ломоносова, 1997. 135 с.

86. Dizdaroglu М., DirksenM.-L., Jiang Н., RobbinsJ. Н. Ionizing-radiation-induced damage in the DNA of cultured human cells. //Biochem. J., 1987. V. 241. N3.1. P. 929-932.

87. ЖижинаГ.П., Бунина Е.Ф., Скалацкая С.И., Шарпатый В. А. Сравнительное изучение накопления свободных радикалов и разрывов ДНК при у-облучении ее растворов и клеток. //Докл. АН СССР, 1985. Т. 281. N6. С. 1466-1470.

88. Пулатова М.К., РихиреваГ.Т., Куроптева З.В. Электронный парамагнитный резонанс в молекулярной радиобиологии. М.: Энергоатомиздат. 1989. 232 с.