Геномный полиморфизм стрептококка группы В-возбудителя заболеваний человека и животных тема диссертации и автореферата по ВАК РФ 03.00.04, доктор биологических наук Дмитриев, Александр Валентинович
- Специальность ВАК РФ03.00.04
- Количество страниц 293
Оглавление диссертации доктор биологических наук Дмитриев, Александр Валентинович
СПИСОК СОКРАЩЕНИЙ стр.
ОГЛАВЛЕНИЕ
ВВЕДЕНИЕ
ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ
ОБЩИЕ СВЕДЕНИЯ О СТРЕПТОКОККАХ СЕРОЛОГИЧЕСКОЙ ГРУППЫ В И ВЫЗЫВАЕМЫХ ИМИ ЗАБОЛЕВАНИЯХ
Классификация стрептококков группы В
Стрептококки группы В - возбудителя заболеваний человека и животных
Лечение, профилактика и диагностика инфекций, вызванных СГВ 22 ХАРАКТЕРНЫЕ ОСОБЕННОСТИ ГЕНОМА И ОСНОВНЫЕ БИОЛОГИЧЕСКИЕ СВОЙСТВА СТРЕПТОКОККОВ ГРУППЫ В 24 Общая характеристика генома СГВ
Группоспецифический и капсульный полисахариды СГВ
Поверхностные и секретируемые белки СГВ - потенциальные факторы вирулентности
Особенности метаболизма СГВ
Адаптация СГВ к условиям стресса
Инсерционные последовательности ДНК СГВ
Острова" патогенности СГВ
ФАКТОРЫ ВИРУЛЕНТНОСТИ СТРЕПТОКОККОВ ГРУППЫ В 36 Полисахаридная капсула СГВ
Антиген |3, связывающий иммуноглобулины А человека
Семейство поверхностных белков СГВ, устойчивых к действию трипсина
С5а пептидаза СГВ
Другие потенциальные факторы вирулентности СГВ
МОЛЕКУЛЯРНАЯ ЭПИДЕМИОЛОГИЯ ЗАБОЛЕВАНИЙ,
ВЫЗВАННЫХ СТРЕПТОКОККАМИ ГРУППЫ В
Традиционные методы эпидемиологического анализа
Идентификация СГВ методом полимеразной цепной реакции
ПЦР-анализ с использованием "случайных" праймеров
Днализ рестрикционного полиморфизма хромосомной ДНК СГВ
1. Метод фингерпринтирования
2. Метод электрофореза в пульсирующем электрическом поле 53 Риботипирование СГВ 57 Дифференцировка СГВ по наличию инсерционных последовательностей ДНК 60 Набор генов вирулентности - потенциальный генетический маркер штаммов СГВ 62 Сравнительный анализ штаммов СГВ, выделенных от человека и животных 62 ЗАКЛЮЧЕНИЕ ОБЗОРА ЛИТЕРАТУРЫ 64 МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ ИССЛЕДОВАНИЯ 67 Бактерии, культуральные среды и условия роста 67 Иммуноблотинг бактериальных колоний 70 Выделение ДНК 70 Выделение хромосомной ДНК 70 Выделение препаратов ДНК для ПЦР 71 Выделение препаратов ДНК из клинических образцов сыворотки крови и мочи 71 Выделение плазмидной ДНК 71 Выделение ДНК из агарозного геля 72 Приготовление препаратов ДНК для электрофореза в пульсирующем электрическом поле 72 Электрофорез ДНК в агарозном геле
3.5. Гидролиз ДНК рестриктазами
3.6. Полимеразная цепная реакция
3.6.1. Multiplex-PCR
3.7. Гибридизационный анализ ДНК
3.7.1. Риботипирование
3.8. Клонирование ДНК
3.9. Секвенирование ДНК
3.10. Компьютерный анализ ДНК
4. РЕЗУЛЬТАТЫ СОБСТВЕННЫХ ИССЛЕДОВАНИЙ И
ОБСУЖДЕНИЕ
4.1. ГЕНЫ, ОБЕСПЕЧИВАЮЩИЕ ФОРМИРОВАНИЕ ВИРУЛЕНТНОГО ФЕНОТИПА СТРЕПТОКОККОВ ГРУППЫ В
4.1.1. Анализ наличия генов вирулентности у штаммов СГВ; полиморфизм длин рестрикционных фрагментов, содержащих гены вирулентности
4.1.2. Изучение взаимной локализации генов вирулентности в геноме СГВ
4.1.3. Клонирование и секвенирование гена alp
4.1.4. Устойчивость штаммов СГВ к эритромицину и ее генетические детерминаты
4.1.5. ОБСУЖДЕНИЕ РЕЗУЛЬТАТОВ
4.1.5.1. Различия в наборах генов вирулентности у штаммов СГВ
4.1.5.2. Размеры рестрикционных фрагментов ДНК, содержащих гены вирулентности, как критерии для дифференцировки штаммов СГВ
4.1.5.3. Использование а-подобных белков в молекулярной диагностике и профилактике инфекций, вызванных стрептококками группы В
4.2. ИНСЕРЦИОННЫЕ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТИ ДНК СТРЕПТОКОККОВ ГРУППЫ В
4.2.1. Распространенность инсерционных последовательностей ДНК у штаммов СГВ
Полиморфизм длин рестрикционных фрагментов ДНК, содержащих IS элементы
Локализация IS861 и IS1548 на хромосомной ДНК методом Southern гибридизации
Идентификация сайтов интеграции ISSa4 в геноме СГВ
ОБСУЖДЕНИЕ РЕЗУЛЬТАТОВ
Гетерогенность штаммов СГВ по наличию IS элементов
Генетическая характеристика штаммов СГВ, выделенных от человека и содержащих ISSa
Использование IS элементов СГВ в качестве эпидемиологических маркеров
Использование полиморфизма длин рестрикционных фрагментов ДНК, содержащих IS элементы, для сравнительного анализа штаммов СГВ
АНАЛИЗ ШТАММОВ СТРЕПТОКОККОВ ГРУППЫ В МЕТОДАМИ ПУЛЬС-ЭЛЕКТРОФОРЕЗА И
РИБОТИПИРОВАНИЯ
Характеристика генома штаммов СГВ методом пульсэлектрофореза
Риботипирование штаммов СГВ
ОБСУЖДЕНИЕ РЕЗУЛЬТАТОВ
Гетерогенность рибосомных типов СГВ
Гетерогенность Smal рестрикционных паттернов ДНК и размеров генома штаммов СГВ
Картирование генома и сравнительный анализ штаммов
СГВ, выделенных от человека и животных
Сравнительный анализ рестрикционных паттернов ДНК
СГВ и наличия генов вирулентности
4.3.3.4.1. Генетическая однородность штаммов СГВ, содержащих ген bac
4.3.3.4.2. Анализ штаммов СГВ, выделенных от животных
4.4. ДИАГНОСТИКА СТРЕПТОКОККОВ ГРУППЫ В
И ДИФФЕРЕНЦИРОВКА СТРЕПТОКОККОВ РАЗЛИЧНЫХ ВИДОВ МЕТОДОМ ПОЛИМЕРАЗНОЙ ЦЕПНОЙ РЕАКЦИИ
4.4.1. ПЦР-диагностика СГВ с использованием гена scpB в качестве
ДНК диагностического признака
4.4.2. ПЦР-диагностика СГВ с использованием гена српбО в качестве
ДНК диагностического признака
4.4.3. Использование multiplex-PCR для дифференцировки стрептококков
4.4.3.1. Multiplex-PCR с использованием праймеров на ген српбО
4.4.3.2. Multiplex-PCR с использованием праймеров на гены вирулентности СГВ
4.4.3.3. Multiplex-PCR с использованием праймеров на IS элементы СГВ
4.4.4. ОБСУЖДЕНИЕ РЕЗУЛЬТАТОВ
4.4.4.1. Преимущества предлагаемых в настоящем исследовании подходов для ПЦР-диагностики СГВ
4.4.4.2. Использование предлагаемой ПЦР-диагностики СГВ для анализа образцов биологических жидкостей
4.4.4.3. Использование предлагаемых подходов для ПЦР-дифференцировки штаммов стрептококков, вызывающих заболевания человека и животных
4.5. ОРГАНИЗАЦИЯ ФРАГМЕНТА ГЕНОМА СТРЕПТОКОККА ГРУППЫ В В ОБЛАСТИ ГЕНА bac
4.5.1. Клонирование и секвенирование гена bac
4.5.2. Клонирование и секвенирование гена консервативного гипотетического белка
4.5.3. Клонирование и секвенирование гена сенсорной гистидинкиназы
Рекомендованный список диссертаций по специальности «Биохимия», 03.00.04 шифр ВАК
Геномный полиморфизм Streptococcus pyogenes различных emm-генотипов2012 год, кандидат биологических наук Полякова, Екатерина Михайловна
Рецепторные белки стрептококков: Клонирование генов, характеристика и практ. использование белков, экспрессируемых в E. coli1998 год, доктор биологических наук Гупалова, Татьяна Витальевна
Изучение области связывания IgA на рекомбинантном белке Bac стрептококка группы B2000 год, кандидат биологических наук Устинович, Ирина Анатольевна
Молекулярно-генетическая характеристика белка ScaAB стрептококков группы B2006 год, кандидат биологических наук Воробьева, Екатерина Ивановна
Двухкомпонентная регуляторная система Sak188/Sak189 и ее влияние на свойства Streptococcus agalactiae2011 год, кандидат биологических наук Рождественская, Анастасия Сергеевна
Введение диссертации (часть автореферата) на тему «Геномный полиморфизм стрептококка группы В-возбудителя заболеваний человека и животных»
Актуальность работы
Изучение патогенных стрептококков и вызываемых ими заболеваний продолжает оставаться одной из актуальных задач медицинской науки и практического здравоохранения. Это объясняется распространенностью стрептококковых инфекций во всех странах мира и тяжелыми осложнениями, часто приводящими к летальным исходам.
За последние два десятилетия значительно возрос интерес к Streptococcus agalactiae (стрептококк группы В, СГВ), который ранее рассматривался лишь в качестве возбудителя мастита крупного рогатого скота (158). В настоящее время установлено, что этот микроб является также одним из ведущих патогенов человека при беременности и у новорожденных (238). Кроме того, СГВ оказались способными вызывать заболевания взрослых людей, такие как пиелонефрит, артриты, абсцессы, мастит, эндокардит, септицемию и др. Однако в России, до недавнего времени, инфекциям, вызываемым СГВ, не придавалось должного внимания. Причиной этого была и продолжает оставаться слабая лабораторно-диагностическая база, отсутствие нормативных документов по диагностике, профилактике и лечению инфекций, вызываемых СГВ, а также слабая информированность отечественных специалистов о патогенных свойствах СГВ. Как следствие, это привело к серьезной недооценке роли СГВ инфекции в акушеро-гинекологической практике и неонаталогии, где смертность от инфекций, вызванных СГВ, является крайне высокой (238, 255).
Уже более 70 лет иммунологический подход продолжает оставаться основным для идентификации и классификации патогенных стрептококков группы В (172), среди которых выявляются девять различных серологических типов (Ia, Ib, II-VIII). Использование методов молекулярной генетики позволяет более подробно охарактеризовать стрептококки группы Вив пределах одного
11 и того же серологического типа СГВ обнаружить различные генетические линии (131). Совершенно очевидно, что реальное количество эпидемиологически значимых штаммов существенно превышает число известных серологических типов СГВ. Поэтому, использование методов молекулярной генетики с целью выявления генетических маркеров отдельных штаммов (клонов) СГВ, имеющих эпидемиологическое значение, может существенно повысить эффективность дифференцировки изолятов и изучения эпидемиологии заболеваний, вызываемых СГВ.
Несмотря на то, что молекулярно-генетические методы позволяют детально охарактеризовывать штаммы СГВ, они все еще крайне редко используются при изучении эпидемиологии заболеваний, вызванных СГВ. Одной из основных причин редкого использования молекулярных методов является то, что сам выбор метода анализа не регламентирован, полностью зависит от опыта и возможностей экспериментатора, а условия проведения исследований до сих пор не стандартизованы. Все это отрицательно сказывается на результатах анализов и точности диагностического заключения.
Очевидно, что изучение особенностей организации генома штаммов СГВ и разработка на этой основе комплекса стандартизованных молекулярных методов для изучения эпидемиологии стрептококковых инфекций, актуальны не только для медицинской науки, но и для практического здравоохранения. Новые знания о генетике и особенностях строения генома различных штаммов СГВ должны оказаться полезными для выявления эпидемиологически значимых клонов-возбудителей заболеваний и эпидемиологического надзора за распространением инфекций, вызванных стрептококками группы В.
Изложенное выше определило цель и задачи исследования.
12
Цель исследования:
Изучение геномного полиморфизма штаммов Streptococcus agalactiae и разработка на этой основе методов диагностики и дифференцировки стрептококков группы В - возбудителей заболеваний человека и животных.
Задачи работы:
1. Сравнительный анализ штаммов СГВ методами молекулярной генетики и определение критериев для дифференцировки штаммов, выделенных от человека и животных;
2. Изучение распространенности определенного набора генов вирулентности (Ъса, Ъас, scpB, Imb, cyl, hylB, cfb, scaB, glnA) и возможности существования "островов" патогенности у штаммов СГВ различных серотипов;
3. Изучение распространенности инсерционных последовательностей ДНК IS1548, IS861, lSSa4, IS 1381 и локализация сайтов их инсерции в хромосомную ДНК штаммов СГВ;
4. Определение организации фрагмента генома СГВ в области локализации гена вирулентности Ьас, кодирующего IgA связывающий белок;
5. Разработка и апробирование на клиническом материале методов ПЦР-диагностики стрептококков различных видов, вызывающих заболевания человека и животных.
Научная новизна:
Научная новизна работы заключается в комплексном сравнительном молекулярно-генетическом анализе СГВ, выделенных от человека и животных, и выявлении генетических маркеров для эффективной дифференцировки штаммов:
13 впервые научно обосновано положение о существовании у стрептококков группы В "острова" патогенности, содержащего гены вирулентности scpB и Imb, кодирующие С5а пептидазу и белок, связывающий ламинин, соответственно;
- впервые установлена точная локализация гена вирулентности bac на хромосоме и обнаружен "остров" патогенности, содержащий ген bac и гены новой двухкомпонентной регуляторной системы, предположительно позволяющей стрептококкам группы В адаптироваться и выживать в неблагоприятных условиях;
- впервые показано, что штаммы СГВ, выделенные от человека, отличаются от штаммов, выделенных от животных, наборами генов вирулентности и IS элементов;
- установлено, что "горячими точками" для инсерции в геном СГВ являются участки ДНК с высоким содержанием аденина и тимина, а число копий IS элементов и их взаимное расположение в геноме СГВ может быть использовано в качестве эпидемиологического маркера штаммов;
- выявлены значительные различия в размерах геномов различных штаммов СГВ, при этом минимальный размер генома составил 2029 т.н.п., а максимальный - 2465 т.н.п., и впервые установлено значение Smal рестрикционных фрагментов генома СГВ размерами от 42 т.н.п. до 100 т.н.п. для дифференцировки штаммов;
- обнаружена область геномной ДНК, содержащая варьирующее количество прямых повторов размерами 44 н.п. и спейсерных участков размерами 16 н.п. у различных штаммов СГВ; обнаружен новый ген alp5, кодирующий белок семейства поверхностных а-подобных белков, участвующих в формировании вирулентности СГВ;
14
- обоснована целесообразность использования особенностей структуры генов $срВ и српбО для ПЦР-дифференцировки штаммов различных видов стрептококков, вызывающих заболевания человека и животных.
Практическая значимость исследования:
В целом, исследование носит теоретический характер. Тем не менее, многие из полученных данных являются перспективными для дифференцировки штаммов СГВ с целью характеристики клона-возбудителя заболевания и для мониторинга инфекций, в частности, внутрибольничных инфекций, вызванных СГВ. В настоящее время метод ПЦР-диагностики СГВ в биологических жидкостях человека апробирован на клиническом материале и используется в Научно-исследовательской лаборатории "Диагностика" (Санкт-Петербург) и Пекинском детском госпитале (Китай), а на основании предложенного подхода разрабатываются методические рекомендации МЗ и СР РФ по диагностике СГВ (Центр по молекулярной медицине МЗ и СР РФ, Санкт-Петербург). Предложенный экспресс-метод дифференцировки стрептококков различных видов, вызывающих мастит у крупного рогатого скота, используется в ветеринарной практике в Университете ветеринарной медицины (Кошице, Словакия).
Фрагменты ДНК, секвенированные в настоящем исследовании, были депонированы в базе данных ОепВапк под следующими номерами: АУ445916, АУ449757, АУ449758, АУ449759, АУ455996, АУ455997, АУ459524, АУ461799, АУ461800, АУ461801, АУ487423, АУ487424, АУ464086, АУ464087, АУ464088, АУ508648, АУ496926, АУ598359, АУ587557, АУ587556, АУ587555, АУ691895, АУ691897, АУ691898, АУ707990, АУ707991, АУ707993 (Приложения 1-27).
15
Положения, выносимые на защиту:
1. Анализ Sma\ рестрикционных фрагментов хромосомной ДНК от 42 т.н.п. до 100 т.н.п. и анализ длин рестрикционных фрагментов, содержащих гены вирулентности и IS элементы стрептококков группы В, необходим для оценки степени генетического родства штаммов и является эффективным средством генетической дифференцировки штаммов;
2. Стрептококки группы В, содержащие ген вирулентности bac, кодирующий IgA связывающий белок, являются близкородственными и составляют отдельную генетическую линию. Ген вирулентности bac и гены двухкомпонентной регуляторной системы входят в состав "острова" патогенности СГВ;
3. Ген вирулентности scpB, кодирующий С5а пептидазу, и ген Imb, кодирующий белок, связывающий ламинин, входят в состав "острова" патогенности СГВ;
4. Штаммы СГВ, выделенные от человека, значительно отличаются от штаммов СГВ, выделенных от животных, распространенностью генов вирулентности scpB, Imb, bac и сочетаниями IS элементов IS1548, IS861, IS 1381 и lSSa4;
5. Полиморфизм нуклеотидных последовательностей и различия в количестве прямых повторов размерами 44 н.п. и спейсерных областей размерами 16 н.п. являются критерием для дифференцировки штаммов;
6. Белок, кодируемый геном alp5, относится к семейству а-подобных поверхностных белков СГВ, которые участвуют в формировании вирулентного фенотипа микроба;
7. ПЦР анализ с использованием праймеров на специфические области генов scpB и српбО является перспективным подходом для дифференцировки патогенных стрептококков различных видов.
16
Достоверность полученных результатов подтверждается следующим:
1) Высокой чувствительностью и специфичностью использованных молекулярно-генетических методов исследования (ПЦР, секвенирование, Southern гибридизация, рестрикционный анализ и др.), которые в совокупности позволяют однозначно трактовать полученные данные;
2) Использованием современных компьютерных программ ("SEQAID", "OLIGO", "BLAST", "Multalin" и др.), электронных баз данных PubMed и Medline, а также базы данных GenBank для анализа ДНК.
Апробация работы. Материалы диссертации опубликованы в 49 научных работах (из них 24 статьи и 25 тезисов) и доложены на 20 симпозиумах и конференциях: 5-ой Международной Конференции по стрептококковой генетике, Виши (Франция) в 1998 г.; 1-ом Центрально-Европейском Конгрессе по ветеринарии, Будапешт (Венгрия) в 1999 г.; XIV Международном Симпозиуме по стрептококкам и стрептококковым заболеваниям, Окленд (Новая Зеландия), в 1999 г.; Международной Конференции Чехословацкого Микробиологического общества "Актуальные проблемы микробиологии и иммунологии", Кошице (Словакия) в 1999 г.; 9-ом и Съезде Чешского и Словацкого Иммунологических обществ, Либерец (Чехия) в 2000 г.; Научной конференции «Актуальные проблемы фундаментальных исследований в области биологии и медицины», Санкт-Петербург (Россия) в 2000 г.; 3-ем Международном Симпозиуме по антимикробным препаратам, Сеул (Южная Корея) в 2001 г.; 4-ой Всероссийской медико-биологической конференции молодых исследователей «Человек и его здоровье», Санкт-Петербург (Россия) в 2001 г.; 22-ом Конгрессе Чехословацкого Микробиологического Общества, Кошице (Словакия) в 2001 г.; 23-ем Международном Педиатрическом Когрессе, Пекин (Китай) в 2001 г.; VIII Съезде Всероссийского научно-практического общества эпидемиологов,
17 микробиологов и паразитологов, Москва (Россия) в 2002 г.; 6-ой Международной Конференции по стрептококковой генетике, Эшвилл (США) в 2002 г.; Российско-Американском семинаре "Экология инфекционных заболеваний", Новосибирск (Россия) в 2002 г.; XV Международном Симпозиуме по стрептококкам и стрептококковым заболеваниям, Гоа (Индия) в 2002 г.; Международной конференции по функциональной геномике грамположительных микроорганизмов, Бавено (Италия) в 2003 г.; 13-ом Европейском Конгрессе по клинической микробиологии и инфекционным заболеваниям, Глазго (Шотландия) в 2003 г.; 10-ом Съезде Чешского и Словацкого Иммунологических обществ, Банска Быстрица (Словакия) в 2003 г.; Научно-практическом семинаре "Особенности идентификации, выделения и определения чувствительности пиогенных стрептококков", Санкт-Петербург (Россия) в 2004; 14-ом Европейском Конгрессе по клинической микробиологии и инфекционным заболеваниям, Прага (Чехия) в 2004 г.; 23-ем Конгрессе Чехословацкого Микробиологического Общества, Брно (Чехия) в 2004 г.
Материалы работы докладывались на заседаниях отдела молекулярной микробиологии НИИЭМ РАМН (1998, 1999, 2000, 2002, 2003, 2004 гг.), лаборатории микробиологии и иммунологии Пекинского детского госпиталя (1998, 2000, 2001, 2002, 2004), кафедре микробиологии и иммунологии Университета ветеринарной медицины, Кошице (1999, 2003).
Объем и структура диссертации. Материалы диссертации изложены на 293 страницах машинописного текста, включающего в себя введение, 4 главы обзора литературы, описание материалов и методов исследования, 5 глав собственных исследований, обсуждение полученных результатов, выводы, список литературы и приложения. Работа проиллюстрирована 28 таблицами и 32 рисунками, указатель литературы содержит 319 источников, в том числе 9 отечественных и 310 иностранных.
Похожие диссертационные работы по специальности «Биохимия», 03.00.04 шифр ВАК
Молекулярно-генетический анализ штаммов Vibrio cholerae O1392004 год, доктор биологических наук Ерошенко, Галина Александровна
АНАЛИЗ МОЛЕКУЛЯРНО-ГЕНЕТИЧЕСКИХ ОСОБЕННОСТЕЙ ШТАММОВ VIBRIO CHOLERAE О1 КЛАССИЧЕСКОГО И ЭЛЬ ТОР БИОВАРОВ2013 год, кандидат медицинских наук Кульшань, Татьяна Алексеевна
Молекулярно-генетические особенности структуры генов патогенности возбудителей коклюша и дифтерии; совершенствование лабораторной диагностики при этих инфекциях.2009 год, доктор медицинских наук Борисова, Ольга Юрьевна
Молекулярно-генетические свойства штаммов холерного вибриона эльтор с различной эпидемической значимостью2004 год, кандидат медицинских наук Костромитина, Елена Александровна
Сравнительный анализ фенотипических и молекулярно-генетических свойств холерных вибрионов эльтор, выделенных до начала и в период седьмой пандемии холеры2009 год, кандидат медицинских наук Нефедов, Константин Сергеевич
Заключение диссертации по теме «Биохимия», Дмитриев, Александр Валентинович
ВЫВОДЫ
1) У проанализированных штаммов СГВ впервые обнаружены два "острова" патогенности. В состав одного из них входят ген вирулентности bac, кодирующий IgA связывающий белок, и гены двухкомпонентной регуляторной системы, состоящей из сенсорной гистидинкиназы и ДНК-связывающего белка регулятора ответа. В состав другого "острова" патогенности входят ген вирулентности scpB, кодирующий С5а пептидазу, и ген вирулентности Imb, кодирующий белок, связывающий ламинин;
2) Штаммы СГВ, содержащие ген вирулентности bac, имеют сходные рестрикционные паттерны, риботипы, серотипы, сходство в наличии IS элементов и генов вирулентности и принадлежат к отдельной генетической линии;
3) Построены генетические карты СГВ различных серотипов. Размеры геномов изученных штаммов СГВ варьируют от 2029 до 2465 т.н.п. Большинство штаммов СГВ, выделенных от людей, отличаются от штаммов, выделенных от животных, наборами генов вирулентности и IS элементов;
4) Рестрикционный анализ ДНК СГВ и анализ полиморфизма длин рестрикционных фрагментов, содержащих гены вирулентности и IS элементы, позволяют оценить степень генетического родства штаммов и идентифицировать различные генетические линии СГВ;
5) В геноме СГВ обнаружен участок ДНК, содержащий прямые повторы размерами 44 н.п. и спейсерные области размерами 16 н.п. Полиморфизм нуклеотидных последовательностей и различия в количестве прямых повторов и спейсерных областей могут быть использованы в качестве критерия для генетической дифференцировки штаммов;
6) Новый ген alp5 стрептококков группы В кодирует синтез белка, сходного по структуре с семейством а-подобных белков, участвующих в формировании вирулентного фенотипа СГВ;
БЛАГОДАРНОСТИ
Выражаю глубокую благодарность академику РАМН Тотоляну A.A. и профессору Суворову А.Н. за помощь в организации исследовательского процесса и в приобретении необходимых реактивов и оборудования, а также за ценные замечания при обсуждении результатов диссертационной работы.
Благодарю своих иностранных коллег Prof. Yonghong Yang, Dr. Adong Shen (Пекинский детский госпиталь, Китайская Народная Республика), Prof. Ivan Mikula, Doc. Ludmila Tkacikova (Университет Ветеринарной Медицины, Кошице, Словакия) за многолетние плодотворные совместные исследования.
Выражаю благодарность всем коллегам отдела молекулярной микробиологии Научно-исследовательского института экспериментальной медицины РАМН за доброжелательное отношение и создание в коллективе творческой атмосферы.
Настоящее исследование было поддержано грантами 00-04-493 60а, 01-0406043, 02-04-06927 и 03-04-49760 Российского Фонда Фундаментальных Исследований, а также грантами Президента Российской Федерации МК-2782.2003.04 и НШ-2206.2003.4.
225
5. ОБЩЕЕ ЗАКЛЮЧЕНИЕ
Настоящее исследование посвящено изучению особенностей организации генома и геномного полиморфизма S. agalactiae (стрептококки группы В, СГВ), а также разработке на основании полученных результатов методов диагностики и дифференцировки стрептококков - возбудителей заболеваний человека и животных. Актуальность исследования обусловлена недостатком знаний о геномных различиях между штаммами СГВ различных серотипов, патогенных для человека, крайне малой информацией о генетике СГВ, патогенных для животных, а также отсутствием стандартизованных методов диагностики и генотипирования штаммов СГВ.
Список литературы диссертационного исследования доктор биологических наук Дмитриев, Александр Валентинович, 2004 год
1. Берджи.: Краткий определитель бактерий Берджи. М.: Мир, 1980, 269280.
2. Боидаренко В.М.: Факторы патогеиности бактерий и их роль в развитии инфекционного процесса. ЖМЭИ. 1999, 5, 34-39.
3. Бондаренко В.М.: "Острова" патогенности бактерий. ЖМЭИ. 2001, 4, 6774.
4. Булгакова Т.Н., Грабовская К.Б., Тотолян A.A.: Стрептококки группы В в патологии человека. ЖМЭИ. 1983, 8, 7-17.
5. Гинцбург А.Л.: 1998. Генодиагностика инфекционных заболеваний. ЖМЭИ. 3, 86-95.
6. Романова Ю.М., Гинцбург А.Л.: Участие мобильных элементов в формировании свойств патогенных бактерий. ЖМЭИ. 1999,2, 22-29.
7. Устинович И.А., Гупалова Т.В., Тотолян A.A., Суворов А.Н.: Изучение IgA-рецепторного белка стрептококка группы В. Биотехнология. 2002, 1, 3-10.
8. Adams W.G., Kinney J.C., Schuchat A., Collier C.L., Papasian C.J., Kilbride H.W., Riedo F.X., Broome C.V.: Outbreak of early-onset group В streptococcal sepsis. Pediatr. Infect. Dis. J. 1993, 12, 565-570.226
9. Allardice J.G., Baskett T.F., Seshia M.M.K., Bowman N, Malazdrewicz R.: Perinatal group B streptococcal colonization and infection. Am. J. Obstet. Gynecol. 1982, 142,617-620.
10. Anderson B.E., McDonald G.A., Jones D.C., Regnery R.L.: A protective protein antigen of Rickettsia rickettsii has tandemly repeated, near-identical sequences. Infect. Immun., 1990, 58, 2760-2769.
11. Areschoug T., Stalhammar-Carlemalm M., Larsson C., Lindahl G.: Group B streptococcal surface ptoteins as targets for protective antibodies: identification of two novel proteins in strains of serotype V. Infect. Immun. 1999, 67, 6350-6357.
12. Arpin C., Daube H., Tessier F., Quentin C.: Presence of me/A and mefE genes in Streptococcus agalactiae. Antimicrob. Agents Chemother. 1999, 43, 944-946.
13. Backman A., Lantz P., Radstrom P., Oleen P.: Evaluation of an extended diagnostic PCR assay for detection and verification of the common causes of bacterial meningitis in CSF and other biological samples. Mol. Cell. Probes. 1999, 13,49-60.
14. Baker C.J.: Group B streptococcal infections. Clin. Perinatol. 1997, 24, 59-70.227
15. Baker C.J., Barrett F.F.: Transmission of group B streptococci among parturient women and their neonates. J. Pediatr. 1973, 83, 919-925.
16. Baker C.J., Barett F.F.: Group B streptococcal infections in infants. JAMA. 1974, 230, 1158-1160.
17. Baker C.J., Barrett F.F., Gordon R.C., Yow M.D.: Suppurative meningitis due to streptococci of Lancefield group B: a study of 33 infants. J. Pediatr. 1973, 82, 724729.
18. Baker C.J., Edwards M.S., Kasper D.L.: Role of antibody to native type III polysaccharide of group B streptococcus in infant infection. Pediatrics. 1981, 68, 544-549.
19. Baker C.J., Kasper D.L.: Correlation of maternal antibody deficiency with susceptibility to neonatal group B streptococcal infection. N. Engl. J. Med. 1976, 294, 753-756.
20. Baker C.J., Paoletti L.C., Rench M.A., Guttormsen H.-K., Carey V.J., Hickman M.E., Kasper D.L.: Use of capsular polysaccharide-tetanus toxoid conjugate vaccine for type II group B Streptococcus in healthy women. J. Infect. Dis. 2000, 182, 11291138.
21. Baker C.J., Paoletti L.C., Guttormsen H.-K., Rench M.A., Hickman M.E., Kasper D.L.: Safety and immunogenicity of capsular polysaccharide-tetanus toxoid conjugate vaccines for group B streptocccal types la and lb. J.Infect. Dis. 1999, 179, 142-150.
22. Barton L.L., Feigin R.D., Lins R.: Group B beta hemolytic streptococcal meningitis in infants. J. Pediatr. 1973, 82, 719-721.
23. Bateman A., Eddy S.R., Chothia C.: Members of the immunoglobulin superfamily in bacteria. Protein Science. 1996, 5, 1939-1941.
24. Bayer A.S., Chow A.W., Anthony B.F., Guze L.B.: Serious infections in adults due to group B streptococci. Am. J. Med. 1976, 61, 498-501.228
25. Becker, I.D., Robinson, O.M., Bazan, T.S., Lopez-Osuna, M., Kretschmer, R.R.: Bactericidal capacity of newborn phagocytes against group B beta-hemolytic streptococci. Infect. Immun. 1981, 34, 535-539.
26. Beckmann C., Waggoner J.D., Harris T.O., Tamura G.S., Rubens C.E.: Identification of novel adhesins from group B streptococci by use of phage display reveals that C5a peptidase mediates fibronectin binding. Infect. Immun. 2002, 70, 2869-2876.
27. Benson J.A., Ferrieri P.: Rapid pulsed-field gel electrophoresis method for group B streptococcus isolates. J. Clin. Microb. 2001, 39, 3006-3008.
28. Benson K.D., Luchansky J.B., Elliott J.A., Degnan A.J., Willenberg H.J., Thornbery J.M., Kay H.H.: Pulsed-field fingerprinting of vaginal group B streptococcus in pregnancy. Obstet. Gynecol. 2002, 100, 545-551.
29. Bentley R. W., Leigh J. A.: Determination of 16S ribosomal RNA gene copy number in Streptococcus uberis, S. agalactiae, S. dysgalactiae and S. parauberis. FEMS Immunol. Med. Microbiol. 1996, 12, 1-7.
30. Betriu C., Culebras E., Gomez M., Rodriguez-A vial I., Sanchez B.A., Agreda M.C., Picazo J.J.: Erythromycin and clindamycin resistance and telithromycin susceptibility in Streptococcus agalactiae. Antimicrob. Agents Chemother. 2003, 47, 1112-1114.
31. Bevanger L.: Ibc proteins as serotype markers of group B streptococci. Acta Path. Microb. Immunol. Scand. Sect. B, 1991, 231-234.229
32. Bevanger L., Brakstad O.G., Maeland J.A, Kvam A.I., Iversen G., Lyng R.V.: Aberrations in expression of the ß antigen of Streptococcus agalactiae. Adv. Exp. Med. Biol. 1997, 418, 999 1001.
33. Bevanger L., Naess A.I.: Mouse protective antibodies against the Ibc proteins in group B streptococci. Acta Pathol. Microbiol. Immunol. Scand. Sect. B. 1985, 93, 121 124.
34. Bik E.M., Gouw R.D., Mooi F.R.: DNA fingerprinting of Vibrio cholerae strains with a novel insertion sequence element: a tool to identity epidemic strains. J. Clin. Microbiol. 1996, 34, 1453-1461.
35. Bingen E., Lambert-Zechovsky N., Mariani-Kurkdjian P., Doit C, Aujard Y., Fournerie F., Mathieu H.: Bacterial counts in cerebrospinal fluid of children with meningitis. Eur. J. Clin. Microbiol. Infect.Dis. 1990, 9, 278-281.
36. Birnboim H.C., Daly J.: A rapid alkaline extraction procedure for screening recombinant plasmid DNA. Nucleic Acid. Res. 1979, 7, 1513-1523.
37. Blake M.S., Donets M., Carr D., Qi H., Tai J.Y.: Identification of the IgA binding domain on group B streptococcal ß antigen. Abstracts of XIII Lancefield International Symposium on Streptococci and Streptococcal Diseases, Paris, France, 1996.
38. Bolotin A., Wincker P., Mauger S., Jaillon O., Malarme K., Weissenbach J., Ehrlich S.D., Sorokin A.: The complete genome sequence of the lactic acid bacterium Lactococcus lactis ssp. Lactis IL1403. Genome Res. 2001, 11, 731-753.
39. Boyer K.M.: Neonatal group B streptococcal infections. Curr. Opin. Pediatr. 1995,7, 13-18.
40. Boyer K.M., Gadzala C.A., Burd L.I., Fischer D.E., Paton J.B., Gotoff S.P.: Selective intrapartum chemoprophylaxis of neonatal group B streptococcal early-onset disease. I. Epidemiologic rationale. J. Infect. Dis. 1983, 148, 795-801.
41. Brady L.J., Boyle M.D.: Identification of non-immunoglobulin A-Fc-binding forms and low-molecular-weight secreted forms of the group B streptococcal beta antigen. Infect. Immun. 1989, 57, 1573-1581.
42. Brady L.J., Hosana A., Askeland D., Tai J.: Cloning of non-IgA Fc binding forms of the group B streptococcal bata antigen. Abstracts of 4th International ASM Conference on Streptococcal Genetics, Santa Fe, USA. 1994, 33.
43. Brodeur B.R., Boyer M., Charlebois I., Hamel J., Couture F., Rioux C.R., Martin D.: Identification of group B streptococcal Sip protein, which elicits cross-protective immunity. Infect. Immun. 2000, 68, 5610-5618.
44. Brousseau R., Hill J.E., Prefontaine G., Goh S.H., Harel J., Hemmingsen S.M.: Streptococcus suis characterized by analysis of chaperonin 60 gene sequence. Appl. Envir. Microbiol. 2001, 67, 4828-4833.
45. Carstensen H., Christensen K.K., Grennert L., Persson K., Polberger S.: Early-onset neonatal group B streptococcal septicaemia in siblings. J. Infect. 1988, 17, 201204.
46. Chaffin D.O., Beres S.B., Yim H.H., Rubens C.E.: The serotype of type la and III group B streptococci is determined by the polymerase gene within the polycistronic capsule operon. J. Bacteriol. 2000, 182, 4466-4477.231
47. Chatellier S., Ramanantsoa C., Harriau P., Rolland K., Rosenau A., Quentin R.: Characterization of Streptococcus agalactiae strains by randomly amplified polymorphic DNA analysis. J. Clin. Microbiol. 1997, 35, 2573-2579.
48. Cheng Q., Finkel D., Hostetter M.K.: Novel purification scheme and functions for a C3-binding protein from Streptococcus pneumoniae. Biochemistry. 2000, 39, 5450-5457.
49. Christensen K.K., Svennigsen N., Pahlader K., Ingermasson E., Linden V., Christensen P.: Relation between neonatal pneumoniae and maternal carriage of B streptococci. Scand. J. Infect. Dis. 1982, 14, 261-266.
50. Chmouryguina I.I., Suvorov A.N., Ferrieri P., Cleary P.P.: Conservation of C5a peptidase genes in group A and B streptococci. Infect. Immun. 1996, 64, 2387-2390.
51. Cimolai N., Roscoe D.L.: Contemporary context for early-oneset group B streptococcal sepsis of the newborn. Am. J. Perinatol. 1995, 12, 46-49.
52. Clancy J., Dib-Hajj F., Petitpas J.W., Yuan W.: Cloning and characterization of a novel macrolide efflux gene, mreA, from Streptococcus agalactiae. Antimicrob. Agents Chemother. 1997, 41, 2719-2723.
53. Cleat P.H., Timmis K.N.: Cloning and expression in Escherichia coli of the Ibc protein genes of group B streptococci: binding of human immunoglobulin A to the beta antigen. Infect. Immun. 1987, 55,1151-1155.
54. Cochi S.L., Feldman R.A.: Estimating national incidence of group B streptococcal disease: the effect of adjusting for birth weight. Pediatr. Infect. Dis. J. 1983,2,414-415.
55. Colman G.: Typing of Streptococcus agalactiae (Lancefield group B). Eur. J. Clin. Microbiol. Infect. Dis. 1988, 7, 226-231.
56. Courvalin P., Goldstein F., Philippon A., Sirot J. (eds.). 1985. L'antibiogramme. MPC-VIDEOM, Brussels, Belgium.
57. Mc Cracken G.H.Jr.: Group B streptococci: the new challenge in neonatal infections. J. Pediatr. 1973, 82, 703-705.
58. Cumming C.G.: Group B streptococcal cell surfaces. J. Med. Microbiol. 1984, 18, 151-155.
59. Dave S., Carmicle S., Hammerschmidt S., Pangburn M.K., McDaniel L.S.: Dual roles of PspC, a surface protein of Streptococcus pneumoniae, in binding human secretory IgA and factor H. J. Immunol. 2004, 173, 471-477.
60. Davin-Regli A., Abed Y., Charrel R.N., Bollet C., de Micco P.: Variations in DNA concentrations significantly affects the reproducibility of RAPD fingerprint patterns. Res. Microbiol. 1995, 146, 561-568.
61. Denning D.V., Bacer C.J., Troup N.J., Tompkins L.S.: Restriction endonucleases analysis of human and bovine group B streptococcus for epidemiologic study. J. Clin. Microb. 1989, 27, 1352-1356.
62. Dillon H.C., Khare S., Gray B.M.: Group B streptococcal carriage and disease: a 6-year prospective study. J. Pediatr. 1987, 110, 31-36.233
63. Dinger J., Muller D., Pargac N., Schwarze R.: Breast milk transmission of group B streptococcal infection. Pediatr. Infect. Dis. J. 2002, 21, 567-568.
64. Dmitriev A.V., Pak J.V., Suvorov A.N., Totolian A.A.: Analysis of pathogenic group B streptococci by pulsed field gel electrophoresis. Adv. Exp. Med. Biol. 1997, 418,351-353.
65. Düben J., Jelinkova J., Neubauer M.: Group B streptococci in the female genital tract and nosocomial colonization of newborn. Infect. Immun. 1978, 23, 8994.
66. Duma R.J., Weinberg A.N., Medrek T.F., Kunz L.J.: Streptococcal infections: a bacteriologic and clinical study of streptococcal bacteremia. Medicine. 1969, 48, 87-127.
67. Edwards M.S., Kasper D.L., Jennings H.J., Baker C.J., Nicholson-Weiler A.: Capsular sialic acid prevents activation of the alternative complement pathway by type III, group B streptococci. J. Immunol. 1982, 128, 1278-1283.
68. Elliot J.A., Farmer K.D., Facklam R.R.: Sudden increase in isolation of group B streptococci, serotype V, is not due to emergence of a new pulsed-field gel electrophoresis type. J. Clin. Microbiol. 1998, 36, 2115-2116.
69. Ellis S., Kotiw M., Garland S.M.: Restriction endonuclease analysis of group B streptococcal isolates from two distinct geographical regions. J. Hosp. Infect. 1996, 33, 279-287.
70. Estuningsih S., Soedarmanto I., Fink K., Lammler C., Wibavan I.W.T.: Studies on Streptococcus agalactiae isolated from bovine masitis in Indonesia. J. Vet. Med. 2002, 49, 185-187.
71. DiFabrio J.L., Michon F., Brisson J.-R., Jennings H.J., Wessels M.R., Benedi V.-J., Kasper D.L.: Structure of the capsular polysaccharide antigen of type IV group B Streptococcus. Can. J. Chem. 1989, 67, 877-882.
72. Facklam R.R., Washington J.A.: Streptococcus and related catalase-negative gram-positive cocci. In: Manual of Clinical Microbiology, edited by Balows A., Hausler W.Jr. and Herrman K.L. Washington, DC: American Society for Microbiology, 1991, 238-239.
73. Faxelius G., Bremme K., Christensen K.K., Christensen P., Ringertz S.: Neonatal septicemia due to group B streptococci perinatal risk factors and outcome of subsequent pregnancies. J. Perinat. Med. 1988, 16, 423-430.
74. Fasola E., Livdahl C., Ferrieri P.: Molecular analysis of multiple isolates of the major serotypes of group B streptococci. J.Clin.Microbiol. 1993, 31, 2616-2620.
75. Ferretti J.J., Suvorov A.N.: Islands of genetic novelity. Heredity. 2002, 89, 407-408.
76. Ferrieri P.: Surface-localized protein antigens of Group B Streptococci. Rev. Infect. Dis. 1988, 10, 363-366.
77. Ferrieri P.: GBS infections in the newborn infant: diagnosis and treatment. Antibiot. Chemoter., 1985, 35, 211-215.
78. Ferrieri P., Cleary P.P., Seeds A.E.: Epidemiology of group B streptococcal carriage in pregnant women and newborn infants. J. Med. Microb. 1977, 10, 103-114.235
79. Ferrieri P., Cho D.S., Livdahl C., Rubens C.E., Flores A.E.: DNA restriction profiles of nontypable group B streptococcal clinical isolates. Adv. Exp. Med. Biol. 1997,418,343-346.
80. Ferrieri P., Flores A.: Surface protein expression in group B streptococcal invasive isolates. Adv. Exp. Med. Biol. 1997, 418, 635 637.
81. Ferrieri P., Gray E.D., Wannamaker L.W.: Biochemical and immunological characterization of the extracellular nucleases of GBS. J. Exp. Med. 1980, 51, 56 -58.
82. Flores A.E., Ferrieri P.: Molecular species of R-protein antigens produced by clinical isolates of group B streptococci. J. Clin. Microbiol. 1989, 27, 1050 1054.
83. Flores A.E., Ferrieri P.: Characterization of trypsin resistant proteins of group B streptococci (GBS). In: Pathogenic streptococci: present and future, edited by A.Totolian. St.Petersburg, Russia: Lancer Publications, 1994, 333-334.
84. Forsman P., Tilsala-Timisjarvi A., Alatossava T.: Identification of staphylococcal and streptococcal causes of bovine mastitis using 16S-23S rRNA spacer regions. Microb. Reading. 1997, 143, 3491-3500.
85. Franciosi R.A., Knostman J.D., Zimmerman R.A.: Group B streptococcal neonatal and infant infections. J. Pediatr. 1973, 82, 707-710.
86. Fung J.C., Wicher K.: Comparison of slide agglutination test (Phadebact) with counterimmunoelectrophoresis for detection of streptococcal group antigens. Am. J. Clin. Pathol. 1982, 77, 608-610.
87. Gaillot O., Bregenholt S., Jaubert F., Di Santo J.P., Berche P.: Stress-induced ClpP serine protease of Listeria monocytogenes is essential for induction of listeriolysin O-dependent protective immunity. Infect. Immun. 2001, 69, 4938-4943.236
88. Gaillot O., Poyart C., Berche P., Trieu-Cuot P.: Molecular characterization and expression analysis of the superoxide dismutase gene from Streptococcus agalactiae. Gene. 1997, 204,213-218.
89. Gallagher P.G., Watanakunakorn C.: Group B streptococcal endocarditis: report of seven cases and review of the literature, 1962- 1985. Rev. Infect. Dis. 1986, 8, 175-188.
90. Ganapathy M.E., Rissing J.R.: Group B streptococcal vertebral osteomyelitis bacteremia. South. Med. J. 1995, 88, 350-351.
91. Gardam M.A., Low D.E., Saginur R., Miller M.A.: Group B streptococcal necrotizing fascitis and streptococcal toxic-shock-like syndrome in adults. Arch. Intern. Med. 1998, 158, 1704-1708.
92. Garland S.M., Kelli N.: Early-onse neonatal group B streptococcal sepsis: economics of various prevention strategies. Med. J. Aust. 1995, 162, 413-417.
93. Gase K., Ferretti J.J., Primeaux C., McShan W.M.: Identification, cloning, and expression of the CAMP factor gene (cfa) of group A streptococci. Infect. Immun. 1999, 67, 4725-4731.
94. Gase K., Ozegowski J., Malke H.: The Streptococcus agalactiae hylB gene encoding hyaluronate lyase: completion of the sequence and expression analysis. Biochim. Biophys. Acta. 1998,1398, 86-98.
95. Gordillo M.E., Singh K.V., Baker C.J., Murray B.E.: Typing of group B streptococci: comparison of pulsed-field gel electrophoresis and conventional electrophoresis. J. Clin. Microbiol. 1993, 31, 1430-1434.
96. Granlund M., Michel F., Norgren M.: Mutually exclusive distribution of IS1548 and GBSil, an active group II intron identified in human isolates of group B streptococci. J. Bacteriol. 2001, 183, 2560-2569.
97. Granlund M., Oberg L., Sellin M., Norgren M.: Identification of a novel insertion element, IS1548, in group B streptococci, predominantly in strains causing endocarditis. J. Infect. Dis. 1998, 177, 967-976.
98. Gravekamp C., Horensky D.S., Michel J.L., Madoff L.: Variation in repeat number within the alpha C protein of group B streptococci alters antigenicity and protective epitopes. Infect. Immun. 1996, 64, 3576-3583.
99. Greisen K., Loeffelholz M., Purohit A., Leong D.: PCR primers and probes for the 16S rRNA gene of most species of pathogenic bacteria, inclusing bacteria found in cerebrospinal fluid. J. Clin. Microbiol. 1994, 32, 335-351.
100. Groisman E.A., Ochman H.: Pathogenicity islands: bacterial evolution in quantum leaps. Cell. 1996, 87, 791-794.
101. Gupta, R. S.: Evolution of the chaperonin families (Hsp60, HsplO and Tcp-1) of proteins and the origin of eukaryotic cells. Mol. Microbiol. 1995, 15, 1-11.
102. Gurtler V., Stanisich V.A.: New approaches to typing and identification of bacteria using the 16S-23S rDNA spacer region. Microbiology. 1996, 142, 3-16.
103. Hacker J.: Pathogenicity islands and the evolution of microbes. Annu. Rev. Microbiol. 2000, 54, 641-679.238
104. Hacker J., Blum-Oehler G., Muhldorfer I., Tschape H.: Pathogenicity islands of virulent bacteria: structure, function and impact on microbial evolution. Mol. Microbiol. 1997, 23, 1089-1097.
105. Hall L.M., Duke B., Urwin G.: An approach to the identification of the pathogens of bacterial meningitis by the polymerase chain reaction. Eur. J. Clin. Microbiol. Infect. Dis. 1995, 14, 1090-1094.
106. Hassan A., Abdulmawjood A., Yildirim A.O., Fink K., Lammler C., Schlenstedt R.: Identification of streptococci isolated from various sources by determination of cfb gene and other CAMP-factor genes. Can J. Microbiol. 2000, 46, 946-951.
107. Haug R.H., Hoiby E.A., Lermark G.: Serotyping and bacteriophage typing of group B streptococci. NIPH Ann. (Norway). 1983, 6, 119-123.
108. Hauge M., Jespersgaard C., Poulsen K., Kilian, M.: Population structure of Streptococcus agalactiae reveals an association between specific evolutionary lineages and putative virulence factors but not disease. Infect. Immun. 1996, 64, 919925.
109. Hoe N., Nakashima K., Grigsby D., Pan X., Dou S.J., Naidich S., Garcia M., Kahn E., Bergmire-Sweat D., Musser J.M.: Rapid molecular genetic subtyping of serotype Ml group A Streptococcus strains. Emerg. Infect. Dis. 1999, 5, 254-263.
110. Hollingshead S.K., Fischetti V.A., Scott J.R.: Size variation in group A streptococcal M protein is generated by homologous recombination between intragenic repeats. Mol. Gen. Genet., 1987, 207, 196-203.
111. Holmstrom B., Grimsley E.W.: Necrotizing fasciitis and toxic shock-like syndrome caused by group B streptococcus. South. Med. J. 2000, 93, 1096-1098.
112. Horaud T., de Cespedes G., Trieu-Cuot P.: Chromosomal gentamicin resistance transposon Tn3706 in Streptococcus agalactiae B128. Antimicrob. Agents Chemother. 1996, 40, 1085-1090.
113. Hunter P.R., Gaston M.A.: Numerical index of the discriminatory ability of typing systems: an application of Simpson's index of diversity. J. Clin. Microbiol. 1988, 26,361-362.
114. Hynes W.L., Ferretti J.J.: Sequence analysis and expression in Escherichia coli of the hyaluronidase gene of Streptococcus pyogenes. Infect. Immun. 1989, 57, 533539.
115. Iannelli F., Oggioni M.R., Pozzi G.: Allelic variation in the highly polymorphic locus pspC of Streptococcus pneumonaie. Gene. 2002, 284, 63-71.
116. Jackson P.J., Dao M.L., Lim D.V.: Cell-associated collagenolytic activity by group B streptococci. Infect. Immun. 1994, 62, 5647 5651.
117. Jennings HJ., Katzenellenbogen C., Lugowski C., Kasper D.L.: Structure of the native polysaccharide antigens of type la and lb group B Streptococcus. Biochemistry. 1983,22, 1258-1263.
118. Jennings HJ., Rossell K.-G., Katzenellenbogen C., Kasper D.L.: Structural determination of the capsular polysaccharide antigen of type II group B Streptococcus. J. Biol. Chem. 1983, 258, 1793-1798.
119. Jensen N.E., Aarestrup F.M.: Epidemiological aspects of group B streptococci of bovine and human origin. Epidemiol. Infect. 1996,117, 417-422.241
120. Jerlstrom P.J., Chhatwal G.S., Timmis K.N.: The IgA binding (3 antigen of the c protein complex of group B streptococci: sequence determination of its gene and detection of two binding regions. Molec. Microb. 1991, 5, 843-849.
121. Jerlstrom P.G., Talay S.R., Valentin-Weigland P., Timmis K.N., Chhatwal G.S.: Identification of an immunoglobulin A binding motif located in the b-antigen of the c protein complex of group B streptococci. Infect. Immun. 1996, 64, 2787-2793.
122. Jiang M., Babiuk L.A., Potter A.A., Jiang M.: Cloning, sequencing and expression of the CAMP factor gene of Streptococcus uberis. Microbial Pathogenesis. 1996, 20, 297-307.
123. Johnson D.R., Ferrieri P.: Group B streptococcal Ibc protein antigen: distribution of two determinants in wild-type strains of common serotypes. J.Clin. Microbiol. 1984, 19, 506-510.
124. Jones A.L., Knoll K.M., Rubens C.E.: Identification of Streptococcus agalactiae virulence genes in the neonatal rat sepsis model using signature-tagged mutagenesis. Molec. Microb. 2000, 37, 1444-1455.
125. Kasper D.L., Baker C.J., Jennings H.J.: Cell structure and antigenic composition of GBS. Antibiot. Chemoter. 1985, 35, 90-100.
126. Kawasaki E.: Amplification of genomic DNA. In: PCR protocols, edited by Innis M., Geland D., Sninsky J. and White T. San Diego: Academic Press, 1990, 1328.
127. Keefe G.P.: Streptococcus agalactiae mastitis: a review. Can. Vet. J. 1997, 38, 429-437.
128. Kiel J.A., Boels J.M., Ten Berge A.M., Venema G.: Two putative insertion sequences flank a truncated glycogen branching enzyme gene in the thermophile Bacillus stearothermophilus. DNA Seq. 1993, 4, 1-9.242
129. Kogan G., Uhrin D., Brisson J.R., Paoletti L.C., Blodgett A.E., Kasper D.L., Jennings H.J.: Structural and immunochemical characterization of the type VIII group B Streptococcus capsular polysaccharide. J. Biol. Chem. 1996, 271, 87868790.
130. Kong F., Gowan S., Martin D., James G., Gilbert G.L.: Molecular profiles of group B streptococcal surface protein antigen genes: relationship to molecular serotypes. J. Clin. Microbiol. 2002, 40, 620-626.
131. Lachenauer C.S., Creti R., Michel J.L., Madoff L.C.: Mosaicism in the alphalike protein genes of group B streptococci. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 2000, 97, 9630-9635.
132. Lachenauer C.S., Madoff L.C.: Cloning and expression in Escherichia coli of a protecive surface protein from type V group B streptococci. Adv. Exp. Med. Biol. 1997,418,615-618.
133. Lagergard T., Shiloach J., Robbins J.B., Schneerson R.: Synthesis and immunological properties of conjugates composed of group B Streptococcus type III capsular polysaccharide covalently bound to tetanus toxoid. Infect. Immun. 1990, 58, 687-694.
134. Lammler C., Schwarz S., Wibawan I.W., Ott E., Bopp V., Martinez-Tagle A.: Comparison of streptococci of serological group B isolated from healthy carriers and active disease in Chile. J. Med. Microb. 1995, 42, 161-164.
135. Lancefield R.C.: A serological identification of human and other groups of hemolytic streptococci. J. Exp. Med. 1933, 57, 571-595.
136. Lancefield R.C.: A serological differentiation of specific types of bovine hemolytic streptococci (group B). J. Exp. Med. 1934, 59, 441-458.
137. Lancefield R.C., Freimer E.H.: Type-specific polysaccharide antigens of group B streptococci. J. Hyg. (Lond). 1966, 64, 191-203.
138. Lars B., Brakstad O.G., Maeland J.A., Kvam A.I., Iversen G., Lyng R.V.: Aberrations in expression of the beta antigen of Streptococcus agalactiae. Adv. Exp. Med. Biol. 1997, 418, 999-1001.
139. Larsson C., Stalhammar-Carlemalm M., Lindahl G.: Experimental vaccination against group B streptococcus, as encapsulated bacterium, with highly purified preparations of cell surface proteins Rib and a. Infect. Immun. 1996, 64, 3518 3523.
140. Larsson C., Stalhammar-Carlemalm M., Lindahl G.: Protection against experimental infection with group B streptococcus by immunization with a bivalent protein vaccine. Vaccine. 1999, 17, 454-458.
141. Li Y.H., Lau P.C., Tang N., Svensater G., Ellen R.P., Cvitkovitch D.G.: Novel two-component regulatory system involved in biofilm formation and acid resistance in Streptococcus mutans. J. Bacteriol. 2002, 184, 6333-6342.
142. Lee C.A.: Pathogenicity islands and the evolution of bacterial pathogens. Infect. Agents Dis., 1996, 5, 1-7.
143. Lin B., Averett W.F., Novak J., Chatham W.W., Hollingshead S.K., Coligan J.E., Egan M.L., Pritchard D.G.: Characterization of PepB, a group B streptococcal oligopeptidase. Infect. Immun. 1996. 64: 3401-3406.
144. Lindahl G., Akerstrom B.: Receptor for IgA in group A streptococci: cloning of the gene and characterization of the protein expressed in Escherichia coli. Mol. Microbiol. 1989, 3, 239-247.
145. Lindahl G., Akerstrom B., Vaerman J.-P., Stenberg L.: Characterization of an IgA receptor from group B streptococci: specificity for serum IgA. Eur. J. Immunol. 1990, 20, 2241-2247.
146. Limansky A.S., Sutich E.G., Guardati M.C., Toresani I.E., Viale A.M.: Genomic diversity among Streptococcus agalactiae isolates detected by a degenerate oligonucleotide-primed amplification assay. J. Infect. Dis. 1998, 177, 1308-1313.245
147. Madoff L.C., Hori S., Michel J.L., Baker C.J., Kasper D.L.: Phenotypic diversity in the alpha C protein of group B streptococci. Infect. Immun. 1991, 59, 2638-2644.
148. Madoff L.C., Michel J.L., Gong E.W., Rodewald A.K., Kasper D.L.: Protection of neonatal mice from group B streptococcal infection by maternal immunization with beta C protein. Infect. Immun. 1992, 60, 4989-4994.
149. Madoff L.C., Paoletti L.C., Tai J.Y., Kasper D.L.: Maternal immunization of mice with group B streptococcal type III polysaccharide-beta C protein conjugate elicits protective antibody to multiple serotypes. J. Clin. Invest. 1994, 94, 286-292.
150. Maeland J.A., Brakstad O.G., Bevanger L., Kwam A.I.: Streptococcus agalactiae |3 gene and gene product variations. J. Med. Microbiol. 1997, 46, 9991005.
151. Mahillon J., Chandler M.: Insertion sequences. Microbiol. Mol. Biol. Rev. 1998, 62, 725-774.
152. Maniatis T., Fritsch E.F., Sambrook J.: Molecular Cloning: A Laboratory Manual. Cold Spring Harbor Laboratory Press, Cold Spring Harbor, NY, 1982.
153. Martin D., Rioux S., Gagnon E., Boyer M., Hamel J., Charland N., Brodeur B.R.: Protection from group B streptococcal infection in neonatal mice by maternal immunization with recombinant Sip protein. Infect. Immun. 2002, 70, 4897-4901.
154. Martinez G., Harel J., Gottschalk M.: Specific detection by PCR of Streptococcus agalactiae in milk. Can. J. Vet. Res. 2001, 65, 68-72.
155. Martinez G., Harel J., Higgins R., Lacouture S., Daignault D., Gottschalk M.: Characterization of Streptococcus agalactiae isolates of bovine and human origin by randomly amplified polymorphic DNA analysis. J.Clin.Microbiol. 2000, 38, 71-78.
156. Mawn J.A., Heard S.R., Simpson A.J.: Detection of the C protein gene among group B streptococci using PCR. J. Clin. Pathol. 1993, 46, 633-636.
157. Mecsas J., Strauss E.J.: Molecular mechanisms of bacterial virulence: type III secretion and pathogenicity islands. Emerg. Infect. Dis. 1996, 2, 271-288.246
158. Melchers W.J., Bakkers J.M., Toonen M., van Kuppeveld F.J., Trijbels M., Hoogkamp-Korstanje J.A.: Genetic analysis of Streptococcus agalactiae strains isolated from neonates and their mothers. FEMS Immunol. Med. Microbiol. 2003, 36, 111-113.
159. Meyer, J., Iida, S., Arber, W.: Does the insertion element IS1 transpose preferentially into A+T- rich DNA segments? Mol. Gen. Genet. 1980, 178, 471-473.
160. Michel J.L., Madoff L.C., Olson K., Kling D.E., Kasper D.L.: Large, identical, tandem repeating units in the C protein alpha antigen gene, bca, of group B streptococci. Proc.Natl.Acad.Sci.USA, 1993, 89, 10060-10064.
161. Mickelson, M.N.: Glucose degradation, molar growth yields, and evidence for oxidative phosporylation in Streptococcus agalactiae. J. Bacteriol. 1972, 109, 96105.
162. Mileham A.J.: Identification of microorganisms using random primed PCR. Mol. Biotechnol. 1997, 8, 139-145.
163. Milligan, T.W., Doran, T.I., Straus, D.C., Mattingly, S.J.: Growth and amino acid requirements of various strains of group B streptococci. J. Clin. Microbiol. 1978, 7, 28-33.
164. Morales W.J., Dickey S.S., Bornick P., Lim D.V.: Change in antibiotic resistance of group B streptococcus: impact on intrapartum management. Am. J. Obstet. Gynecol. 1999, 181, 310-314.
165. Moyo S.R., Maeland J.A., Lyng R.V.: The putative R1 protein of Streptococcus agalactiae as serotype marker and target of protective antibodies. APMIS. 2001, 109, 842-848.
166. Murphy J., Sukes G., Gardiner M., Hannan A.: Group B Streptococcus carrier rate in pregnant women and their newborn infants. J. Infect. Dis. 1982, 5, 165-199.247
167. Musser J.M., Mattingly S.J., Quentin R., Goudeau A., Selander R.K.: Identification of a high-virulence clone of Streptococcus agalactiae (group B streptococcus). Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 1989, 86, 4731-4735.
168. Nagano N., Nagano Y., Taguchi F.: High expression of a C protein beta antigen gene among invasive strains from certain clonally related groups of type la and lb group B streptococci. Infect. Immun. 2002, 70, 4643-4649.
169. Nagano Y., Nagano N., Takahashi S., Murono K., Fujita K., Taguchi F., Okuwaki Y.: Restriction endonuclease digest patterns of chromosomal DNA from group B p-haemolytic streptococci. J. Med. Microbiol., 1991, 35, P. 297-303.
170. Nair S., Frehel C., Nguyen L., Escuyer V., Berche P.: ClpE, a novel member of the HSP100 family, is involved in cell division and virulence of Listeria monocytogenes. Mol. Microbiol. 1999, 31, 185-196.
171. Nair S., Milohanic E., Berche P.: ClpC ATPase is required for cell adhesion and invasion of Listeria monocytogenes. Infect. Immun. 2000, 68, 7061-7068.
172. Naredo-Sanchez E., Pozo F., Campos C., Uson J., Garcia-Perea A. and Martin-Mola M.: Streptococcus agalactiae septic arthritis associated with chondrocalcinosis in patient without predisposing systhemic disease. Clin. Exp. Reumatol. 1995, 12, 578-579.
173. Navarre W.W., Schneewind O.: Surface proteins of gram-positive bacteria and mechanisms of their targeting to the cell wall envelope. Microbiol. Mol. Biol. Rev. 1999, 63, 174-229.
174. Noel G.J., Katz S.L., Edelson P.J.: The role of C3 in mediating binding and ingestion of group B Streptococcus serotype III by murine macrophages. Pediatr. Res. 1991,30, 118-123.
175. Oguro H.: A study of group B streptococcus with special reference to the relationship between serological type and virulence. J. Jap. Assoc. Infect. Dis. 1983, 58, 376-384.
176. Olcen P., Lantz P.G., Backman A., Radstrom P.: Rapid diagnosis of bacterial meningitis by a seminested PCR strategy. Scand. J. Infect. Dis. 1995, 27, 537-539.
177. Panthel K., Dietz P., Haas R., Beier D.: Two-component systems of Helicobacter pylori contribute to virulence in a mouse infection model. Infect. Immun. 2003, 71, 5381-5385.
178. Paoletti L.C.: Potency of clinical group B streptococcal conjugate vaccines. Vaccine. 2001, 19, 2118-2126.
179. Paoletti L.C., Kasper D.L.: Conjugate vaccines against group B Streptococcus types IV and VII. J. Infect. Dis. 2002, 186, 123-126.
180. Paoletti L.C., Pinel J., Kennedy R.C., Kasper D.L.: Maternal antibody transfer in Baboons and mice vaccinated with a group B streptococcal polysaccharide conjugate. J. Infect. Dis. 2000, 181, 653-658.
181. Paoletti L.C., Wessels M.R., Michon F., DiFabrio J., Jennings H.J., Kasper D.L.: Group B streptococcus type II polysaccharide-tetanus toxoid conjugate vaccine. Infect. Immun. 1992, 60, 4009-4014.
182. Pattison I.H., Matthews P.R.J., Howell D.G.: The type classification of group B streptococci, with special reference to bovine strains apparently lacking in type polysaccharide. J. Pathol. Bacteriol. 1955, 69, 51-60.
183. Phuektes P, Mansell PD, Browning GF.: Multiplex polymerase chain reaction assay for simultaneous detection of Staphylococcus aureus and streptococcal causes of bovine mastitis. J. Dairy. Sci. 2001, 84, 1140-1148.
184. Podbielski A., Blankenstein O., Lutticken,R.: Molecular characterization of the cfb gene encoding group B streptococcal CAMP-factor. Med. Microbiol. Immunol. (Berl.). 1994, 183,239-256.
185. Portillo A., Ruiz-Larrea F., Zarazaga M., Alonso A., Martinez J.L., Torres C.: Macrolide resistance genes in Enterococcus spp. Antimicrob. Agents Chemother. 2000, 44, 967-971.
186. Portnoy D.A., Chakraborty T., Goebel W., Cossart P.: Molecular determinants of Listeria monocytogenes pathogenesis. Infect. Immun. 1992, 60, 1263-1267.
187. Poyart C., Pellegrini E., Gaillot O., Boumalia C., Baptista M., Trieu-Cuot P.: Contribution of Mn-cofactored superoxide dismutase (SodA) to the virulence of Streptococcus agalactiae. Infect. Immun. 2001, 69, 5098-5106.
188. Pridmore D., Stefanova T., Mollet B.: Cryptic plasmids from Lactobacillus helveticus and their evolutionary relationship. FEMS Microbiol. Lett. 1994, 124, 301305.
189. Pritzlaff C.A., Chang J.C., Kuo S.P., Tamura G.S., Rubens C.E., Nizet V.: Genetic basis for the beta-haemolytic/cytolytic activity of group B streptococcus. Mol. Microbiol. 2001, 39, 236-248.
190. Rainard P., Poutrel B.: Generation of complement fragment C5a in milk is variable among cows. J. Dairy Sci. 2000, 83, 945-951.
191. Rakonjac J.V., Robbins J.C., Fischetti V.A.: DNA sequence of the serum opacity of group A streptococci: identification of a fibronectin-binding repeat domain. Infect. Immun., 1995, 63, 622-631.
192. Riordan F.A., Thomson A.P., Sills J.A., Hart C.A.: Bacterial meningitis in the first three months of life. Postgrad. Med. J. 1995, 71, 36-38.
193. Rioux S., Martin D., Ackermann H.-W., Dumont J., Hamel J., Brodeur B.R.: Localization of surface immunogenic protein on group B streptococcus. Infect. Immun. 2001, 69, 5162-5165.
194. Riffon R., Sayasith K., Khalil H., Dubreuil P., Drolet M., Lagace J.: Development of a rapid and sensitive test for identification of major pathogens in bovine mastitis by PCR. J. Clin. Microbiol. 2001, 39, 2584-2589.
195. Rubens C.E., Heggen L.M., Haft R.F., Wessels M.R.: Identification of cpsD, a gene essential for type III capsule expression in group B streptococci. Mol. Microbiol. 1993, 8, 843-855.251
196. Rubens C.E., Heggen L.M., Kuypers J.M.: 1S861, a group B streptococcal insertion sequence related to IS 150 and IS3 of Escherichia coli. J. Bacteriol. 1989, 171, 5531-5535.
197. Rubens C.E., Wessels M.R., Heggen L.M., Kasper D.L.: Transposon mutagenesis of type III group B Streptococcus: correlation of capsule expression with virulence. Proc. Natl. Acad. Sei. USA. 1987, 84, 7208 7212.
198. Rüssel H., Norcross N.L., Kahn D.E.: Isolation and characterization of Streptococcus agalactiae bacteriophage. J. Gen. Virol. 1969, 5, 315-317.
199. Russell-Jones G.J., Gotsclich E.C., Blake M.S.: A surface receptor specific for human IgA on group B streptococci possessing the Ibc protein antigen. J. Exp. Med. 1984, 160, 1467-1475.
200. Saiki R.K., Gelfand D.H., Stoffel S., Scharf S.J., Higuchi R, Horn G.T., Mullis K.B., Erlich H.A.: Primer-directed enzymatic amplification of DNA with a thermostable DNA polymerase. Science, 1988, 239, P. 487-491.
201. Sanchez-Beato A.R., Garcia E., Lopez R., Garcia J.L.: Identification and characterization of IS 1381, a new insertion sequence in Streptococcus pneumoniae. J. Bacteriol. 1997, 179, 2459-2463.
202. Schalen C.: Prevalence of IgA receptors in clinical isolates of Streptococcus pyogenes and Streptococcus agalactiae: serological distinction between the receptors by blocking antibodies. FEMS Immunol. Med. Microbiol. 1993, 7, 39 46.
203. Schlivert P.M., Gocke J.L., Deringer J.R.: Group B streptococcal toxic shocklike syndrome: report of a case and purification of the associated pyrogenic toxin. Clin. Infect. Dis. 1993, 17, 26-31.
204. Schnitzler N., Haase G., Podbielski A., Kaufhold A., Lammler C., Lutticken R.: Human isolates of large-coloni-forming ß hemolytic group G streptococci form a252distinct clade upon 16S rRNA gene analysis. Adv. Exp. Med. Biol. 1997, 418, 363365.
205. Schrag S.J., Zywicki S., Farley M.M., Reingold A.L., Harrison L.H., Lefkowitz L.B., Hadler J.L., Cieslak P.R., Schuchat A.: Group B streptococcal disease in the era of intrapartum antibiotic prophylaxis. N. Engl. J. Med. 2000, 342, 15-20.
206. Schuchat A.: Epidemiology of group B streptococcal disease in the United States: shifting paradigms. Clin. Microbiol. Rev. 1998, 11, 497-513.
207. Schuchat A., Deaver-Robinson K., Plikaytis B.D., Zangwill K., Mohle-Boetani J., Wenger J.D.: Multistate case-control study of maternal risk factors for neonatal group B streptococcal disease. Pediatr. Infect. Dis. J. 1994, 13, 623-629.
208. Schuchat A., Oxtoby M., Cochi S., Sikes R.K., Hightower A.W., Plikaytis B., Broome C.V.: Population-based risk factors for neonatal group B streptococcal disease: results of a cohort study in Metropolitan Atlanta. I. Infect. Dis. 1990, 162, 672-677.
209. Sechi L., L.Daneo-Moore.: Characterization of intergenic spacers in two rrn operons. J. Bacteriol. 1993, 175, 3213-3219.
210. Sechter I., Mestre F., Hansen D.S.: Twenty-three years of Klebsiella phage typing: a review of phage typing of 12 clusters of nosocomial infections, and a comparison of phage typing with K serotyping. Clin. Microbiol. Infect. 2000, 6, 233238.
211. Seppala H., Skurnik M., Soini H., Roberts M.C., Huovinen P.: A novel erythromycin resistance methylase gene (ermTR) in Streptococcus pyogenes. Antimicrob. Agents Chemother. 1998, 42, 257-262.253
212. Shea J.E., Beuzon C.R., Gleeson C., Mundy R., Holden D.W.: Influence of the S.typhimurium pathogenicity island 2 type III secretion system on bacterial growth in the mouse. Infect. Immun. 1999, 67, 213-219.
213. Shankar V., Gilmore M.: Characterization of the Enterococcus faecalis alpha C protein homolog. Adv. Exp. Med. Biol. 1997, 418, 1045 1048.
214. Shigeoka A.O., Rote N.S., Santos J.I. and Hill H.R.: Assessment of the virulence factors of group B streptococci: correlation with sialic acid content. J. Infect. Dis. 1983, 147, 857-863.
215. Southern E.M.: Detection of specific sequences among DNA fragments separated by gel electrophoresis. J. Mol. Biol. 1975, 98, 503-517.
216. Spellerberg B., Martin S., Franken C., Berner, C., Lutticken, R.: Identification of a novel insertion sequence element in Streptococcus agalactiae. Gene. 2000, 241, 51-56.
217. Spellerberg B., Pohl B., Haase G., Martin S., Weber-Heynemann J., Lutticken R.: Identification of genetic determinants for the hemolytic activity of Streptococcus agalactiae by ISS7 transposition. J. Bacteriol. 1999, 181, 3212-3219.
218. Spellerberg B., Rozdzinski E., Martin S., Weber-Heynemann J., Lutticken R.: rgf encodes a novel two-component signal transduction system of Streptococcus agalactiae. Infect. Immun. 2002, 70, 2434-2440.254
219. Squires C., Squires C.L.: The Clp proteins: proteolysis regulators or molecular chaperones? J. Bacteriol. 1992, 174, 1081-1085.
220. Sriprakash K.S., Hartas J.: Genetic mosaic upstream of scpG in human group G streptococci contains sequences from group A streptococcal virulence region. Adv. Exp. Med. Biol. 1997, 418, 749-751.
221. Stalhammar-Carlemalm M., Areschoug T., Larsson C., Lindahl G.: Cross-protection between group A and group B streptococci due to cross-reacting surface proteins. J. Infect. Dis. 2000, 182, 142-149.
222. Stalhammar-Carlemalm M., Stenberg L., Lindahl G.: Protein Rib: A novel group B streptococcal cell surface protein that confers protective immunity and is expressed by most strains causing invasive infections. J. Exp. Med. 1993, 177, 15931603.
223. Stanley J., Baquar N., Threlfall E.J.: Genotypes and phylogenetic relationships of Salmonella typhimurium are defined by molecular fingerprinting of IS200 and 16S rrn loci. J. Gen. Microbiol. 1993, 139, 1133-1140.
224. Stewardson-Krieger P.B., Gotoff S.P.: Risk factors in early-onset neonatal group B streptococcal infections. Infection. 1978, 6, 50-53.
225. Stringer J.: The development of a phage-typing system for group-B streptococci. J. Med. Microbiol. (England). 1980, 13,133-143.
226. Suvorov A.N., Cleary P.P., Ferrieri P.: C5a peptidase gene from group B streptococci. In: Genetics and Molecular Biology of Streptococci, Lactococci and Enterococci, 1991,230-232.
227. Suvorov A., Dmitriev A., Ustinovich I., Schalen C., Totolian A.: Molecular analysis of clinical group B streptococcal strains by use of a and P gene probes. FEMS Immunol. Med. Microbiol. 1997, 17, 149-154.255
228. Suvorov A.N., Ferretti J.J. Heterogeneity of group A pathogenic streptococci. In: Pathogenic streptococci: Present and future. (Totolian, A.A., Ed.) Lancer Publ., St. Petersburg, Russia, 1994, P. 21-24.
229. Suvorov A.N., Ferretti, J.J.: Comparative analysis of chromosomal organization of group A streptococcal strains. In: Proceedings of XIV Lancefield International Symposium on Streptococci and Streptococcal Diseases. 2000, 381-384.
230. Suvorov A. N., Flores A. E., Ferrieri P.: Cloning of the glutamine synthetase gene from group B streptococci. Infect. Immun. 1997, 65, 191-196.
231. Tamura G.S., Herndon M., Przekwas J., Rubens, C.E., Ferrieri, P., Hillier, S.L.: Analysis of restriction fragment length polymorphisms of the insertion sequence IS/357 in group B streptococci. J. Infect. Dis. 2000, 181, 364-368.
232. Tanaka D., Gyobu Y., Kodama H.: Typing of group B streptococci by pulsed-field gel electrophoresis. Kansenshogaku-Zasshi. 1995, 69, 455-460.
233. Tang W.M., Ho P.L., Yau W.P., Wong J.W., Yip D.K.: Report of 2 fatal cases of adult necrotizing fasciitis and toxic shock syndrome caused by Streptococcus agalactiae. Clin. Infect. Dis. 2000, 31, El5-17.
234. Teng L.J., Hsueh P.R., Tsai J.C., Chen P.W., Hsu J.C., Lai H.C., Lee C.N., Ho S.W.: GroESL sequence determination, phylogenetic analysis, and species differentiation for viridans group streptococci. J. Clin. Microbiol. 2002, 40, 31723178.256
235. Thomas-Bories I., Fitoussi F., Mariani-Kurkdjian P., Raymond J., Brahimi N., Bidet P., Lefranc V., Bingen E.: Clonal relationship between U.S. and French serotype V group B streptococcal isolates. J. Clin. Microb. 2001, 39, 4526-4528.
236. Timoney J.F., Walker J., Zhou M., Ding J.: Cloning and sequence analysis of a protective M-like protein gene from Streptococcus equi subsp. zooepidemicus. Infect. Immun., 1995,63, 1440-1445.257
237. Toresani I., Limansky A., Bogado I., Guardati M.C., Viale A., Sutich E.G.: Phenotypic and genotypic study of Streptococcus agalactiae in vagina of pregnant women in Argentina // Medicina (B Aires). 2001, 61, 295-300.
238. Uh Y., Jang I.H., Hwang G.Y., Yoon K.J., Song W.: Emerging erythromycin resistance among group B streptococci in Korea. Eur. J. Clin. Microbiol. Infect. Dis. 2001,20,52-54.
239. Uhiara J.E.: Group B streptococcal carriage among parturiens and their neonates in Zaria, Nigeria. Afr. J. Med. Sci. 1993, 22, 831-879.
240. Wakhle (Joshi) L, Saigal SR.: Rapid and specific diagnosis of group B streptococcal infection by the polymerase chain reaction (PCR). Adv. Exp. Med. Biol. 1997,418, 347-349.
241. Whiley R.A., Hall L.M.C., Hardie J.M., Beighton D.: Intra-specific diversity within Streptococcus anginosus. Adv. Exp. Med. Biol. 1997, 418, 367-369.
242. Watts J.L.: Etiological agents of bovine mastitis. Vet. Microbiol. 1988, 16, 4166.
243. Wibavan I.W., Lammler C., Smola J.: Properties and type antigen patterns of group B streptococcal isolates from pigs and nutrias. J.Clin.Microbiol. 1993, 31, 762764.
244. Wastfelt M., Stalhammar-Carlemalm M., Delisse A.M., Cabezon T., Lindahl G.: Identification of a family of streptococcal surface proteins with extremely repetitive structure. J. Biol. Chem. 1996, 271, 18892-18897.
245. Wastfelt M., Stalhammar-Carlemalm M., Delisse A-M., Cabezon T., Lindahl G.: The Rib and a proteins define a family of group B streptococcal surface proteins that confer protecive immunity. Adv. Exp. Med. Biol. 1997, 418, 619 622.258
246. Wessels M.R., Paoletti L.C., Kasper D.L., DiFabio J.L., Michon F., Holme K., Jennings H.J.: Immunogenicity in animals of a polysaccharide-protein conjugate vaccine against type III group B Streptococcus. J. Clin. Invest. 1990, 86, 1428-1433.
247. Wessels M.R., Paoletti L.C., Pinel J., Kasper D.L.: Immunogenicity and protective activity of a type V streptococcal polysaccharide-tetanus toxoid conjugate vaccine. J. Infect. Dis. 1995, 171, 879-884.
248. Wessels M.R., Rubens C.E., Benedi V.J., Kasper D.L.: Definition of a bacterial virulence factor: sialylation of the group B streptococcal capsule. Proc. Natl. Acad. Sei. USA. 1989, 86, 8983-8987.
249. Yagupsky P., Menegus M.S., Powell K.R.: The changing spectrum of group B streptococcal disease in infants: an eleven-year experience in a tertiary care hospital. Pediatr. Infect. Dis. J. 1991, 10, 801-808.
250. Yamamoto S., Miyake K., Koike Y., Watanabe M., Machida Y., Ohta M., Iijima S.: Molecular characterization of type-specific capsular polysaccharide biosynthesis genes of Streptococcus agalactiae type la. J. Bacteriol. 1999, 181, 51765184.
251. Yildirim A.O., Lammler Ch., Weiss R.: Identification and characterization of Streptococcus agalactiae isolated from horses. Vet. Microbiol. 2002, 85, 31-35.
252. Yildirim A.O., Lammler C., Weiss R., Kopp P.: Pheno- and genotypic properties of streptococci of serological group B of canine and feline origin. FEMS Microbiol. Lett. 2002, 212,187-192.259
253. Yother J., Briles D.E.: Structural properties and evolutionary relationship of PspA, a surface protein of Streptococcus pneumoniae, as revealed by sequence analysis. J. Bacterid., 1992, 174, 601-609.
254. Yu W., Mireau I., Mars A., Johnson E., Dunny G., McKay L.L.: Novel insertion sequence-like element IS982 in lactococci. Plasmid. 1995, 33, 218-225.
255. Zaleznik D.F., Rench M.A., Hiller S., Krohn M.A., Platt R., Lee M.L., Flores A.E., Ferrieri P., Baker C.J.: Invasive disease due to group B Streptococcus in pregnant women and neonates from diverse population groups. J. Infect. Dis. 2000, 30, 276-281.
256. Zerbib D., Gamas P., Chandler M., Prentki P., Bass S., Galas D.: Specificity of insetion of IS 1. J. Mol. Biol. 1985, 185, 517-524.
257. Zhang Y., Isaacman D.J., Wadowsky R.M., Rydquist-White J., Post J.C., Ehrlich G.D.: Detection of Streptococcus pneumoniae in whole blood by PCR. J. Clin. Microb. 1995, 33, 596-601.
258. Zhang Y., Lei Y., Khammanivong A., Herzberg M.C.: Identification of a novel two-component system in Streptococcus gordonii V288 involved in biofilm formation. Infect. Immun. 2004, 72, 3489-3494.
Обратите внимание, представленные выше научные тексты размещены для ознакомления и получены посредством распознавания оригинальных текстов диссертаций (OCR). В связи с чем, в них могут содержаться ошибки, связанные с несовершенством алгоритмов распознавания. В PDF файлах диссертаций и авторефератов, которые мы доставляем, подобных ошибок нет.