Генетические маркеры атеросклероза тема диссертации и автореферата по ВАК РФ 00.00.00, кандидат наук Тимофеева Софья Владимировна

• Тимофеева Софья Владимировна
• кандидат наук
• 2025

Оглавление диссертации кандидат наук Тимофеева Софья Владимировна

ОГЛАВЛЕНИЕ

ОГЛАВЛЕНИЕ

СПИСОК СОКРАЩЕНИЙ

ВВЕДЕНИЕ

1. ОБЗOP ЛИТEPAТУРЫ

1.1 Современные представления молекулярно-генетических механизмов атеросклероза

1.2 Белок кодирующие гены, ассоциированные с атеросклерозом

1.3 Роль микроРНК в диагностике атеросклероза

1.4 Роль длинных некодирующихРНК в диагностике атеросклероза

1.5 Гены митохондриального генома, ассоциированные с атеросклерозом

МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ ИССЛЕДОВАНИЯ

2.1 Характеристика обследованных групп

2.2 Молекулярно-генетические методы исследования

2.3 Методы статистической обработки данных

2.4 Методы биоинформационного анализа

2.5 Контроль качества проводимых молекулярно-генетических исследований

3 РЕЗУЛЬТАТЫ И ОБСУЖДЕНИЕ

3.1 Распространение полиморфных локусов белок кодирующих генов

APOE, LIPC, LPL, IL4, IL10, TNFa, PPARGC1A, EDN, XRCC1 у

пациентов с атеросклерозом и в контрольной группе

3.2 Поиск сайтов связывания микроРНК в цис-регуляторных последовательностях и в полиморфных локусах генов липидного обмена, генов воспалительного ответа, гена коактиватора транскрипционных факторов, гена системы репарации ДНК, гена эндотелиального фактора

роста

3.3 Анализ ассоциаций полиморфных локусов генов микроРНК MIR758 (гб1885068), MIR96 (ге13231740), MЖ33a (^9620000) с риском развития атеросклероза

3.4 Генные сети взаимодействий белок кодирующих генов и генов некодирующей РНК

3.5 Анализ ассоциации полиморфного локуса гб2383207 днРНК CDKN2B-AS с риском развития атеросклероза

3.6 Анализ межгенных взаимодействий при атеросклерозе

3.7 Анализ митохондриальных мутаций ассоциированных с атеросклерозом

ЗАКЛЮЧЕНИЕ

ВЫВОДЫ

СПИСОК ИСПОЛЬЗОВАННЫХ ИСТОЧНИКОВ

АФК

днРНК

ИБС

ИИ

ИМ

ЛПВП

ЛПНП

Мито-микроРНК

нкРНК

ССЗ

цРНК

APOE

BAFF

BER

CDKN2B-AS

EDN1 GWAS

СПИСОК СОКРАЩЕНИЙ

- активные форы кислорода

- длинные некодирующие РНК

- ишемическая болезнь сердца

- ишемический инсульт

- инфаркт миокарда

- липопротеиды высокой плотности

- липопротеиды низкой плотности

- Митохондриальные микроРНК

- некодирующих РНК

- сердечно-сосудистые заболевания

- циркулирующие РНК

- apolipoprotein E - аполипротеин Е

- TNF superfamily member 13b - Член суперсемейства TNF 13b

- base excision repair - репарация эксцизии оснований

- сусНп-dependent kinase inhibitor 2B antisense RNA 1 -антисмысловая РНК ингибитора 2B циклин-зависимых киназ

- endothelin 1 - эндотелин

- genome-wide association scanning - полногеномный анализ ассоциаций

GenBank

IFNy

IgM

IL4

IL10

LIPC

LPL

M-CSF

MDR

MIR33 MIR96 MIR758 miRBase

MT-CYB

MT-ND1

- база данных аннотированных нуклеотидных последовательностей ДНК, РНК белков

- Интерферон гамма

- Иммуноглобулины M

- Interleukin 4 - интерлейкин

- Interleukin 10 - интерлейкин

- hepatic lipase - печеночная липаза

- lipoprotein lipase липопротеинлипаза

- macrophage colony-stimulating factor -колониестимулирующий фактор макрофагов

- multifactor dimensionality reduction - метод мультифакторного моделирования геномных взаимодействий

- microRNA 33 - ген микроРНК человека

- microRNA 96 - ген микроРНК

- microRNA 758 - ген микроРНК

- the microRNA database - база данных последовательностей предшественников и зрелых miRNA с аннотациями

- mitochondrially encoded cytochrome b - кодирование цитохрома Б

- mitochondrially encoded NADH dehydrogenase 1 -кодирование субъединицы 1 NADH дегидрогеназы

MT-ND2

MT-ND5

MT-RNR1

MT-TL2

NADH NCBI

NER

PCSK9

PDGF

PPARGC1A

ROS

SNP

SSBR TH1

mitochondrially encoded NADH dehydrogenase 2 кодирование субъединицы 2 NADH дегидрогеназы

mitochondrially encoded NADH dehydrogenase 5 митохондриально кодируемая НАДН-дегидрогеназа

mitochondrially encoded 12S RNA субъединицы 1 12S РНК

кодирование

- mitochondrially encoded tRNA leucine 2 - кодирование т-РНК лейцина, кодон узнавания UUR

- НАДН-дегидрогеназный комплекс

- National Center for Biotechnology Information -национальный центр биотехнологической информации

- nucleotide excision repair - репарация эксцизии нуклеотидов

- proprotein convertase subtilisin/kexin type 9 -пропротеинконвертазы субтилизин/кексин типа

- platelet-derived growth factor - фактор роста тромбоцитов

- peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-alpha - коактиватор пераксисом альфа

- reactive oxygen species - накопление активных форм кислорода

- single nucleotide polymorphism - однонуклеотидный полиморфизм

- single strand break repair - репарация разрывов одной цепи

- Т-хелперы

TNFa

- tumor necrosis factor - фактор некроза опухоли

Treg - regulatory T cells, suppressor T cells - регуляторные Т-

лимфоциты

XRCC1 - x-ray repair cross complementing 1 - ген системы

репарации ДНК

Введение диссертации (часть автореферата) на тему «Генетические маркеры атеросклероза»

ВВЕДЕНИЕ

Актуальность исследования. Сердечно-сосудистые заболевания (ССЗ) являются ведущей причиной заболеваемости и смертности во всем мире. В России по официальной статистике смертность от ССЗ за 2022 год составила 904 055 случаев, а в мире 17,8 млн смертей в год (Шиловская и др., 2022; Dattani et al., 2023; Gaidai et al., 2023).

ССЗ развиваются постепенно на протяжении всей жизни, начиная с повышения уровней факторов риска, наблюдаемого уже в детстве или подростковом возрасте, и появления субклинических заболеваний, которые могут возникать в молодом или в среднем возрасте, однако манифестируют ССЗ, как правило, в конце жизни (Li et al., 2023). За последнее десятилетие появление крупномасштабных технологий генотипирования и полногеномных ассоциативных исследований GWAS (Genome-Wide Association Studies-https://www.ebi.ac.uk/gwas/), предоставило мощные инструменты для выявления ассоциаций генотип-фенотип для мультфакторных заболеваний. По данным международного исследования GWAS с участием порядка 1 миллиона человек, выявлено более 300 локусов в белок-кодирующих генах, ассоциированных с проявлением сердечно-сосудистых заболеваний, включая коронарную болезнь, ишемический инсульт, аневризмы аорты, заболевания периферических сосудов, фибрилляцию предсердий, нарушения функционирования клапанов, развитие атеросклероза (Song et al., 2021; Aragam et al., 2022; Tcheandjieu et al., 2022). В работе рассмотрены локусы, ассоциированные с атеросклерозом в белок кодирющих генах и генах некодирующей РНК.

Заслуживает внимания факт, что более 95% полиморфных локусов генома человека, статистически ассоциированных с риском заболеваний, находятся за пределами генов, кодирующих белки (Fernandez-Ruiz et al., 2018; German et al., 2020; Maurano et al., 2012; Ma et al., 2023). Исследования в области некодирующего генома продемонстрировали важность микроРНК и длинных некодирующих РНК (днРНК) в качестве регуляторов сигнальных путей и липидного гомеостаза,

которые способны менять баланс прогрессирования и регрессии возникновения атеросклеротических бляшек.

Несмотря на значительный прогресс в статистических и экспериментальных инструментах, используемых для поиска областей генома, ассоциированных с риском заболевания, по-прежнему сложно идентифицировать гены, лежащие в основе генетических ассоциаций (Сильнягин и др., 2024). Определение маркеров генетической предрасположенности может расширить понимание патогенеза атеросклероза и послужить основой для поиска новых терапевтических мишеней для его лечения.

Цель работы - исследовать межгенные взаимодействия белок-кодирующих генов APOE, LIPC, LPL, IL4, IL10, TNFa, PPARGC1A, XRCC1, EDN1, микроРНК MIR758, MIR96, MIR33a и длинной некодирующей РНК CDKN2B-AS, принимающих участие в молекулярном патогенезе атеросклероза.

Задачи исследования:

1. Определить частоты аллелей и ассоциации генотипов девяти полиморфных локусов белок кодирующих генов rs769452 APOE, rs2070895 LIPC, rs328 LPL, rs224350 IL4, rs3024491 IL10, rs1800629 TNFa, rs1801282 PPARGC1A, rs25487 XRCC1, rs5370 EDN1 с риском развития атеросклероза среди жителей Ростовской области.

2. Изучить частоты аллелей и ассоциации генотипов полиморфных локусов генов микроРНК rs1885068 MIR758, rs13231740 MIR96, rs9620000 MIR33a, гена днРНК rs2383207 CDKN2B-AS с риском развития атеросклероза среди жителей Ростовской области.

3. Провести биоинформационный поиск сайтов связывания микроРНК в окрестности и внутри белок-кодирующих генов и генов микроРНК и днРНК с риском развития атеросклероза. Построить генную сеть их взаимодействия.

4. Исследовать межгенные взаимодействия полиморфных локусов белок-кодирующих-генов и генов некодирующей РНК в патогенезе атеросклероза.

Научная новизна. Впервые проведен комплексный анализ полиморфных локусов 8 генов кодирующих белок и 4 генов некодирующей РНК. Получены

новые данные о взаимодействии белок-кодирующих генов и генов некодирующей РНК при развитии атеросклероза у жителей Ростовской области.

Получены новые данные о частоте аллелей и генотипов генов липидного обмена, генов воспалительного ответа, гена коактиватора транскрипционных факторов, гена системы репарации ДНК, гена эндотелиального фактора роста, генов микроРНК и гена днРНК с риском развития атеросклероза среди жителей Ростовской области.

Впервые построена карта взаимодействия генов липидного обмена, воспалительного ответа и системы репарации с APOE, LIPC, LPL, ^10, Т^а, PPARGC1A, EDN1, XRCC1 с компонентами некодирующей РНК.

Впервые выявлены сайты связывания микроРНК в цис- регуляторных регионах генов липидного обмена, генов воспалительного ответа, гена коактиватора транскрипционных факторов, гена системы репарации ДНК, гена эндотелиального фактора роста, генов микроРНК и гена днРНК с риском развития атеросклероза.

Опираясь на результаты множественного анализа межгенных взаимодействий и стохастического моделирования, впервые получены новые данные о прогностической значимости межгенных взаимодействий, имеющих наибольшую значимость для персонифицированной диагностики риска атеросклероза: IL10хLIPCхEDN1 (р < 0,0001), IL10хLIPCхLPL (р < 0,0001), LIPCхEDN1хMIR33a (р < 0,0001).

Положения, выносимые на защиту:

1. В риск развития атеросклероза вносят вклад мутации генов липидного обмена, окислительного стресса, цитокинов, гена эндотелиального фактора, гена системы репарации ДНК, генов микроРНК и длинных некодирующих РНК.

2. Риск развития атеросклероза можно прогнозировать по трехлокусным моделям межгенных взаимодействий полиморфных локусов генов Ж10 О-1082А - LIPC -2500>А - ЕDN Ьув198Авп и LIPC -2500>А - ЕDN Ьув198Авп - МЯЗЗа с.2907 + 201Т>С.

3. В цис-регуляторных районах генов, ассоциированных с развитием атеросклероза локализованы сайты-связывания микроРНК Ьва-ш1г-758, Ива-ш1г-96, 118а-ш1г-33а, Ьва-ш1г-619, Ьва-ш1г-5096, Ьва-ш1г-1273, Ива-тк 5585, Ива-ш1г-548, Ива-ш1г-1285, Ива-ш1г-5095, Ива-ш1г-1303.

Теоретическая и практическая значимость работы. Теоретическая значимость данного исследования проявляется в раскрытии ролей межгенных взаимодействий полиморфных локусов генов, кодирующих белки и генов некодирующей РНК в патогенезе атеросклероза. Проведенные мета-анализы, суммирующие результаты многочисленных исследований, позволяют обобщить выводы предшествующих исследований и сформулировать заключения об ассоциации полиморфных локусов с атеросклерозом. Выявлены значимые персонифицированные генотипы для прогноза развития атеросклероза. Полученные данные могут быть использованы в разработке тест-систем для оценки уровня риска и предрасположенности к развитию атеросклероза.

Созданный банк образцов ДНК может быть использован в дальнейших исследованиях для анализа причин патогенеза атеросклероза.

Полученные в работе результаты внедрены в клинико-лабораторную и практическую деятельность медицинских центров ООО «Наука» (г.Ростов-на-Дону); ООО «Диагностиклаб» (г.Ростов-на-Дону) и АО «Врачъ» (г.Ростов-на-Дону). Новые научные данные, а также разработанные в ходе выполнения работы экспериментальные методики используются в учебном процессе на факультете биологических наук Академии биологии и биотехнологии Южного федерального университета, в частности при чтении лекций по курсам «Генетика человека», «Медико-генетическое консультирование», при проведении практических занятий по генетике.

Личный вклад автора. Диссертационная работа основана на оригинальном материале, полученном самостоятельно автором в результате экспериментальных исследований в период с 2015 по 2024 гг. Тема исследования, цель, задачи, объекты, методы определены автором совместно с научным руководителем. Все экспериментальные работы выполнены самостоятельно

автором на базе Академии биологии и биотехнологии им.Д.И. Ивановского, ЮФУ. Анализ полученных результатов, формулировка выводов и основных защищаемых положений выполнены самостоятельно автором работы.

Апробация работы. Материалы диссертации были представлены на 7-мом Конгрессе здоровья и биомедицины в Сингапуре (Сингапур, 2016); на Международной конференции молодых ученых «New trends in life science» (Ереван, 2016); на 85-м и 86 Европейском конгрессе по атеросклерозу «EAS» (Прага, 2017; Лиссабон 2018г.); на Европейской конференции по генетике человека «European Human Genetics Conference» (Копенгаген, 2017); на международной научной конференции студентов, аспирантов и молодых ученых «Ломоносов» (Москва, 2017; Москва, 2023) ); на научно-практической конференции с международным участием «Генетика-фундаментальная основа инноваций в медицине и селекции» (Ростов-на-Дону, 2017; 2019); на VII Съезде Вавиловского Общества Генетиков и Селекционеров (Санкт-Петербург, 2019); на Международной конференции IBIBM-LncRNA-2021 «Длинные некодирующие РНК: механизм, функция и вычислительный анализ» (Дубай, 2021); на международной конференции «Медицинская наука в эру цифровой трансформации» (Курск, 2021); на V Международной научной конференции "Генетика и биотехнология XXI века: проблемы, достижения, перспективы" (Минск, 2022).

Публикации. По теме диссертационного исследования опубликовано 17 работ, в том числе одна их них в журналах базы данных Scopus и Web of Science (К1), один патент, 3 в периодических изданиях из перечня ведущих рецензируемых научных журналов (К2), утвержденных ВАК Министерства образования и науки России и рекомендованных для публикации основных научных результатов диссертации на соискание искомой ученой степени.

Структура и объем работы. Диссертация состоит из введения, трех глав, заключения, списка литературы. Работа изложена на 171 странице, содержит 30 таблиц, 44 рисунок. Список использованной литературы включает 285 источников, в том числе 276 на иностранных языках.

Конкурсная поддержка работы.

Работа была проведена в рамках научно-исследовательских работ Академии биологии и биотехнологии им. Д.И. Ивановского Южного федерального университета.

Исследование поддержано грантом Российского научного фонда №. 151510022. Исследование проводилось при поддержке Фонда содействия развитию малых предприятий в научно-технической сфере №: 11675ГУ /2017, а также при поддержке ЦКП «Высокие технологии» Южного федерального университета.

Благодарности. Автор выражает глубокую благодарность за помощь, поддержку и ценные рекомендации своему научному руководителю д.б.н., профессору, заведующей кафедрой генетики Т.П. Шкурат. Автор благодарен лаборатории «Биологии организации и развития генома» АБиБ им. Д..И. Ивановского, ЮФУ за предоставленную возможность провести молекулярно-генетические исследования. Автор благодарен руководству КДЛ «Наука» за эффективное сотрудничество и любезно предоставленный ими материал для выполнения настоящего исследования. Автор выражает признательность научным сотрудникам кафедры генетики АБиБ им. Д..И. Ивановского, ЮФУ, всегда готовым поделиться своими знаниями и дать ценные практические рекомендации, а также создающим комфортную обстановку доверительных профессиональных отношений.

ГЛАВА 1 ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ

1.1 Современные представления молекулярно-генетических механизмов атеросклероза

Сердечно-сосудистые заболевания (ССЗ), в частности атеросклероз является основной причиной смертности во всем мире (Bjorkegren et al., 2022; Fan et al., 2022; Gill et al., 2021). Данные статистики всемирной организации здравоохранения (ВОЗ) свидетельствуют о том, что на протяжении 20 лет ССЗ остаются лидирующей причиной смертности во всем мире (Don et al., 2022). По оценкам каждый год умирает 17,9 млн человек во всем мире. ССЗ представляют собой группу болезней сердца и кровеносных сосудов, в которую входят ишемическая болезнь сердца, заболевания сосудов головного мозга, ревматическая болезнь сердца и другие патологии (https://www.who.int). Длительное время атеросклероз может протекать без клинических проявлений, пока не приведет к осложнениям в виде острых или хронических сосудистых событий (Aengevaeren et al., 2024; Banach et al., 2024). Таким образом, в связи с высокой медико-социальной значимостью ССЗ, изучение механизмов развития атеросклероза остается в фокусе внимания научного сообщества (Yang et al., 2023).

Патологические описания атеросклероза у человека впервые были опубликованы 500 лет назад (Hanke et al., 2001). Однако слово «атеросклероз» впервые было предложено Феликсом Маршаном в 1904 году, который предположил, что атеросклероз ответственен почти за все обструктивные процессы в артериях (Konstantinov et al., 2006). Хорошо известно, что атеросклероз является не системным, а скорее локальным сосудистым заболеванием. Это означает, что некоторые артерии подвержены атеросклерозу, такие как брюшная аорта, грудная аорта, коронарные артерии, мозговые артерии, сонные артерии и почечные артерии, тогда как такие артерии, как внутренняя грудная артерия, печеночные артерии и радиальные артерии, как правило, не подвержены атеросклерозу у одного и того же пациента. Неизвестно, какой механизм отвечает за

восприимчивость и резистентность артерий у людей. Однако внутренняя грудная артерия и радиальные артерии часто используются в качестве трансплантата при шунтировании, поскольку они устойчивы к атеросклерозу (Nigra et al., 2011).

Патогенез атеросклероза представляет собой многофакторный и динамичный процесс (Khan et al., 2021). Основным элементом атеросклеротического поражения является атеросклеротическая бляшка, которая возникает в местах отложения липопротеидов низкой плотности (ЛПНП), закупоривает просвет сосуда и вызывает его сужение, затрудняя работу кровотока (Reyes-Soffer et al., 2022; Zhang et al., 2024). На рисунке 1 представлено прогрессирование атеросклероза и взаимодействие факторов, способствующих его или смягчающих атерогенез.

Рисунок 1 — Прогрессирование атеросклероза отражает взаимодействие факторов, способствующих или смягчающих атерогенез (ЫЬЬу е1 а1., 2021)

На этом схематическом рисунке отражены результаты экспериментальных исследований на мышах и наблюдения за атеросклеротическими бляшками человека. Пути, которые, как считается, способствуют образованию поражений (факторы, выделенные красным), показаны слева, а механизмы, которые могут сдерживать атерогенез (факторы, выделенные синим), показаны справа. Гладкомышечные клетки и макрофаги могут пролиферировать по мере роста

интимального поражения. PDGF способствует миграции и репликации гладкомышечных клеток, а затем образованию внеклеточного матрикса. Все клетки в атероматозной бляшке могут секретировать цитокины, примерами которых являются IL-1, TNFa и M-CSF (также известный как CSF1). Активированные лимфоциты T-хелперов 1 (TH1) продуцируют IFNy, который может стимулировать мононуклеарные фагоциты и усугублять атеросклероз. Другие типы клеток продуцируют компенсирующие медиаторы. Лимфоциты B1 могут секретировать естественные антитела IgM; Т-хелперные лимфоциты 2 (ТН 2) продуцируют противовоспалительный цитокин IL-10; а регуляторные Т (Трег) клетки могут секретировать TGFß. Эти медиаторы могут противодействовать клеточной пролиферации, способствовать синтезу внеклеточного матрикса и подавлять воспаление. Мононуклеарные фагоциты могут поглощать умирающие или мертвые клетки, которые возникают в результате апоптоза, посредством процесса, известного как эффероцитоз. Неэффективный эффероцитоз способствует накоплению остатков мертвых или умирающих клеток и способствует формированию центрального липидного ядра атеросклеротической бляшки. В2-лимфоциты секретируют медиаторы (такие как BAFF, член семейства TNF), которые могут усугублять атерогенез. На этой диаграмме показана только часть медиаторов, которые были вовлечены в содействие или противодействие аспектам атерогенеза. Текущие исследования показывают, что борьба между пролиферацией и смертью продолжается с участием провоспалительных, противовоспалительных и способствующих разрешению медиаторов — как правило, на протяжении длительного многолетнего процесса эволюции атеросклеротической бляшки человека (Libby et al., 2021).

В процесс формирования бляшки участвуют тромбоциты, скопления внутриклеточных и внеклеточных липидов, фибрина, гладкомышечных клеток, соединительной ткани, промежуточного вещества (гликозаминогликанов и др.) и кальция (Gao et al., 2022; Alves de Oliveira et al., 2024) (Рис.2).

Адгезия Оксидация Инфильтрация Появление Пролиферация Создание Разрыв моноцитов ЛНП макрофагами пенистых гладкомышечных капсулы с тромбом

клеток клеток

Моноциты ЛНП оЛНП СРБ Пенистые Гладко- Тромбоциты Капсула

клетки мышечные клетки

Рисунок 2 — Развитие атеросклеротической бляшки (Kanenko et al., 2023)

Дискуссии об этиологии и патогенезе развития атеросклероза ведутся уже более 100 лет (Lu et al., 2022; Fan et al., 2024). На сегодняшний день выделяют две основные группы объединённых гипотез патогенеза атеросклероза. Одна из них включает в себя «инфильтрационные» гипотезы и исходит из того, что начальным процессом развития атеросклероза является накопление таких веществ, как липопротеиды, фибриноген плазмы крови и т.п. в сосудистой стенке (Kotlyarov et al., 2024). Сюда можно отнести липидно-инфильтрационную гипотезу Н.Н. Аничкова, тромбогенную гипотезу К.В. Рокитанского, нейроэндокринную, вирусную и бактериальную теории (Мельдеханов и др., 2021). Открытие участника гомеостаза холестерина, пропротеинконвертазы субтилизин/кексин типа 9 (PCSK9). Показано, что PCSK9 способствовует развитию атеросклеротических бляшек и тромбозов, активации тромбоцитов, рекрутированию лейкоцитов и образованию тромбов. Высокое содержание PCSK-9, вызванное мутациями в этом гене сопровождается избыточной доставкой холестерина в стенки сосудов и развитием атеросклероза (Morvaridzadeh et al., 2024).

Вторая группа объединяет гипотезы, которые в качестве первопричины развития атеросклероза рассматривают изменения в эндотелии и других

структурах сосудистой стенки в ответ на воздействие различных факторов (Bethel et al., 2023; Giannakopoulou et al., 2024; Mathew et al., 2024). Во вторую группу входят лизосомальнуая, аутоиммунновоспалительная, моноклональная, генетическая, эпигенетическая гипотезы, а также гипотеза «ответ на повреждение в артериальном русле» (Ross et al., 1976), где в качестве инициирующих факторов патогенеза рассматривают активное и пассивное курение, повышение артериального давления вследствие заболевания или эмоциональных и физических нагрузок, дислипидемию, в особенности гиперхолестеринемию, обусловленную либо генетической предрасположенностью, либо нарушением пищевых привычек (Воробьева и др., 2022).

Каждая из приведенных выше гипотез не может самостоятельно объяснить возникновение и развитие заболевания, но они существенно дополняют друг друга.

Таким образом, в своем исследовании мы рассматриваем в качестве прогностических биомаркеров полиморфизм генов, кодирующих белки и полиморфные локусы генов некодирующей РНК, вовлеченные в патогенез атеросклероза.

1.2 Белок кодирующие гены, ассоциированные с атеросклерозом

Анализ полиморфизмов генов играет важную роль в оценке предрасположенности к мультифакторным заболеваниям на популяционном и индивидуальном уровне (He et al., 2020; Полоников и др., 2021; Acharya et al., 2024). Согласно современным представлениям, полиморфные локусы генов - могут использоваться для прогнозирования риска и исходов заболевания с последующей оптимизацией и персонализацией его профилактики и лечения (He et al., 2020; Wu et al., 2024; Ma et al., 2024). Достижения в области геномных технологий позволили установить широкий спектр полиморфных локусов генов, которые могут стать биомакерами для предиктивной диагностики атеросклероза (Ord et al., 2021; Martínez López et al., 2024). В нашем исследовании мы изучили полиморфизмы генов, которые по данным современной литературы могут быть вовлечены в развитие атеросклероза на разных этапах:

• генов липидного обмена APOE (rs769452), LIPC (rs2070895), LPL (rs328);

• воспалительного ответа IL4 (rs224350), IL10 (rs3024491), TNFa (rs224350);

• коактиватора транскрипционных факторов пераксисом PPARGC1A (rs8192678);

• гена системы репарации ДНК XRCC1 (rs5370);

• гена эндотелиального фактора EDN1 (rs5370).

Ген АРОЕ локализуется на участке хромосомы 19q13.32 и кодирует белок аполипопротеин Е. Аполипопротеин Е синтезируется в печени и головном мозге, входит в состав хиломикронов и липопротеидов низкой плотности (ЛПНП), обладающих выраженным атерогенным действием, приводящим к атеросклерозу. АРОЕ инициирует захват и удаление ЛПНП посредством взаимодействия со специфическим рецептором на поверхности гепатоцитов; участвует в процессах: иммунорегуляции, нервной регенерации и активации липолитических ферментов -липазы печени, липопротеинлипазы и лецитин-холестеролацилтрансферазы (Marais et al., 2019; Chen et al., 2024). Мутации в гене АРОЕ изменяют структуру молекулы аполипопротеина, нарушая механизм липидного обмена. Генетический полиморфизм АРОЕ является важной предпосылкой возникновения гиперлипопротеинемии, снижающей функциональные возможности сердечнососудистой системы (Lumsden et al., 2020). Полиморфизм Leu28Pro гена АРОЕ (ApoE4Freiburg) был впервые описан Orth M. et.all (1999) и по данным HuGeNET является одним из наименее изученных среди мутаций аполипопротеина Е (Orth et al., 1999).

Ген LIPC содержит 9 экзонов и расположен на участке хромосомы 15q21-23. Он принимает участие в гидролизе триацилглицеридов и фосфолипидов ЛПВП. Zago et al., (2020) в своем исследовании показали статистическки значимую корреляцию между мужчинами-носителями полиморфизма LIPC и более высоким риском ишемической болезни сердца (ИБС) (Zago et al., 2020). Кроме того, в последние годы исследования GWAS выявили значимую ассоциацию полиморфизма гена LIPC (-250 G/A) с более высоким уровнем триглицеридов и более низким уровнем ЛПВП (Hoogeveen et al., 2021). Исследования показали

ассоциацию распространенных и редких вариантов последовательностей гена LIPC на развитие коронарного атеросклероза с особым акцентом на роль липидов крови (Karam et al., 2024).

Ген LPL содержит 10 экзонов и находится на участке хромосомы 8p22. LPL влияет на взаимодействие атерогенных липопротеинов с клеточной поверхностью и с рецепторами на сосудистой стенке (Zhu et al., 2018). По данным результатов исследования GTEx на рисунке 3 показана выраженная экспрессия белка гена LPL в тканях аорты и сердца (Zhang et al., 2022; Yu et al., 2023; Yao et al., 2024).

Рисунок 3 — Экспрессия белка гена ЬРЬ в 54 тканях из 17382 образцов, 948

доноров (Aguet et al., 2019) Полиморфизм Ser447Ter гена ЬРЬ является следствием трансверсии C в G в экзоне 9, которая превращает кондон серина 447 (TCA) в кодон преждевременной терминации (TGA). Предыдущие исследования продемонстрировали связь полиморфизма Ser447Ter с низким риском ишемической болезни сердца (Kumari et al., 2021), однако его влияние на атеросклероз недостаточно изучено. Shimo-Nakanishi et al. впервые предположили, что полиморфизм ЬРЬ Ser447Ter был связан со снижением риска развития атеросклероза. Тем не менее последующие исследования показали противоречивые результаты: некоторые исследования подтвердили протективный эффект этого полиморфизма (Salazar-Toetosa et al.,

2020), другие сообщали об отрицательной ассоциации минорных аллелей гена LPL с атеросклерозом, в частности у афроамериканской популяции (Tabikhanova et al., 2019).

Ген IL4 содержит 4 экзона и находится на участке хромосомы 5q31.1. IL-4 индуцирует активацию и дифференцировку В-клеток и развитие субпопуляции Т-хелперов-2 (Th2) лимфоцитов. Кроме того, IL-4 также участвует в хемотаксисе макрофагов, В-клеток и Т-клеток, образовании молекул адгезии эндотелиальных клеток и гемопоэзе (Taleb et al., 2016; Takenoshita et al., 2024).

Ген IL10 кодирует белок, состоит из 5 экзонов и располагается участке хромосомы 1q31-32. Эксперименты in vivo показали противовоспалительный эффект IL-10, в частности, избыточная экспрессия этого цитокина ингибирует накопление ЛПНП в сосудистых стенках артерий (Volpatti et al., 2024). Результаты исследований in vitro показали, что IL-10 подавляет образование молекул адгезии на иммунокомпетентных клетках, а также синтез и функции металлопротеиназы (Posadas-Sanchez et al., 2018).

Ген TNFa представляет собой плейотропный цитокин, оказывающий мощное провоспалительное действие при атеросклерозе и других метаболических и воспалительных нарушениях, таких как ожирение и резистентность к инсулину, которые также являются факторами риска сердечно-сосудистых заболеваний. TNF-а в основном продуцируется моноцитами и макрофагами (Muñoz-Barrera et al., 2024). Участие TNFa в патогенезе атеросклероза подтверждается его присутствием в атеросклеротических бляшках человека. Кроме того, уровни циркулирующего TNFa связаны с повышенным риском повторного инфаркта миокарда, атеросклеротическим утолщением интима-медиа сонных артерий, нарушением гомеостаза триглицеридов и глюкозы и возрастным атеросклерозом (Yupeng et al., 2019). Показано, что повышенный уровень TNFa и носители полиморфизмных локусов гена TNF-a ассоциированы с риском развития инфаркта миокарда особенно если они курильщики, что имеет важное значение для разработки мер по профилактике сердечно-сосудистых заболеваний.

Белок рецептора у, активируемого пролифератором пероксисом (PPAR-y), кодируется геном PPARGC1A и классифицируется как одна из его изоформ. PPARy преимущественно экспрессируется в адипоцитах, гладкомышечных клетках сосудов, эндотелиальных клетках, макрофагах, а также модулирует различные аспекты метаболизма и воспаления (Wang et al., 2022) (Рис.4).

Рисунок 4 — Экспрессия гена PPARG в 54 тканях из 17382 образцов, 948 доноров

(Aguet et al., 2019)

PPAR-y отвечает за гидролиз триглицеридов в адипоцитах, воздействуя на липопротеиновую липазу (Mirza et al., 2019). По данным литературы агонисты PPARy обладают потенциалом для лечения атеросклероза, улучшая эндотелиальную функцию, тем самым замедляя прогрессирование образования атеросклеротических бляшек и уменьшая хроническое воспаление и тромбоз, что приводит к снижению риска сердечно-сосудистых заболеваний (Song et al., 2022). Результаты исследований утверждают, что полиморфизм rs1801282 гена PPARG может влиять на индивидуальную предрасположенность к метаболическим заболеваниям, в частности на атеросклероз. Замена AC / G в экзоне приводит к обмену пролина на аланин в положении 12 аминокислоты (P12A) (rs1801282; Ex4-49C>G) (Oniki et al., 2024). Данное положение находится в домене PPARG,

Список литературы диссертационного исследования кандидат наук Тимофеева Софья Владимировна, 2025 год

СПИСОК ИСПОЛЬЗОВАННЫХ ИСТОЧНИКОВ

1. Воробьева ЕН., Симонова ГИ., Воробьев РИ., Лещенко ИЖ. Свободно-радикальное окисление и атеросклероз. Атеросклероз. 2010;6(2):20-27.

2. Мельдеханов ТТ., Есиргепова СР., Пиржанов БТ., и др., Патогенез атеросклероза. Актуальные проблемы теоретической и клинической медицины. 34;(4):21-28. ёо1: 10.24412/2790-1289-2021-42128

3. Нескубина ОМ., Амелина СС., Шкурат ТП., Романов ДЕ. Поиск сайтов связывания микро РНК в цис-регуляторных последовательностях и в в генах липидного, углеводного обмена, окислительного и противовоспалительного гомеостаза. Научные результаты биомедицинских исследований. 2019;5(3):24-33.

4. Полоников АВ., Клёсова ЕЮ., Азарова ЮЭ. Биоинформатические инструменты и интернет-ресурсы для оценки регуляторного потенциала полиморфных локусов, установленных полногеномными ассоциативными исследованиями мультифакториальных заболеваний (обзор). Научные результаты биомедицинских исследований. 2021;7(1): 15-31.

5. Сильнягин ДЕ., Горбунов НЕ., Макшанова ГП. Значение наследственного фактора в возникновении атеросклероза. ПРОГРАММА V Международная научно-практическая конференция «Интеграция теории и практики в медицине: достижения и перспективы». 2024:451.

6. Тимофеева СВ., Нескубина ОМ., Бутенко ЕВ., Шкурат ТП. Анализ межгенных взаимосвязей при раннем и позднем атеросклерозе в популяции Ростовской области. VII съезд Вавиловского общества генетиков и селекционеров, посвященный 100-летию кафедры генетики СПБГУ, и ассоциированные симпозиумы. Сборник тезисов. ООО «Издательство ВВМ» (Санкт-Петербург). 2019:767.

7. Тимофеева С.В., Шерчкова Т.А., Шкурат Т.П. Полиморфизм гена ANRIL и предрасположенность к атеросклерозу. Медицинская генетика. 2023;22(4):32-37. https://doi.org/10.25557/2073-7998.2023.04.32-37

8. Тимофеева СВ., Шкурат ТП., Ассоциация полиморфизма rs1801282 гена PPARG с риском развития атеросклероза: Мета - анализ. «Живые и биокосные системы». 2022;40. doi: 10.18522/2308-9709-2022-40-1

9. Шиловская А. А., Таранец О. П. Анализ факторов риска развития облитерирующего атеросклероза //Медицина и молодёжь-2022. - С. 31.

10. Abaj F., Sotoudeh G., Karimi E., et al. Interaction between the dietary indices and PPAR-y Pro12Ala gene variants on cardiovascular risk factors in patients with type 2 diabetes mellitus.. Int J Clin Pract. 2021;75(8):e14307. doi: 10.1111/ijcp.14307

11. Aengevaeren VL., Claessen G., Eijsvogels TM. Coronary atherosclerosis in athletes: recent insights and clinical considerations. Br J Sports Med. 2024;58(11):574-576. doi: 10.1136/bjsports-2023-107938

12. Acharya S., Liao S., Jung WJ., et al. Multi-omics Integration Identifies Genes Influencing Traits Associated with Cardiovascular Risks: The Long Life Family Study. Preprint. medRxiv. 2024;2024.03.04.24303657. doi:10.1101/2024.03.04.24303657

13. Aguet F. et al. The GTEx Consortium atlas of genetic regulatory effects across human tissues. Science. 2020;369(6509):1318-1330. doi: 10.1126/science.aaz1776

14. Aguilo F., Di Cecilia S., Walsh MJ. Long Non-coding RNA ANRIL and Polycomb in Human Cancers and Cardiovascular Disease. Curr Top Microbiol Immunol. 2016;394:29-39. doi:10.1007/82_2015_455

15. Ahmadi A., Behmanesh M., Boroumand MA., Tavallaei M. Up-regulation of MSH2, XRCC1 and ATM genes in patients with type 2 diabetes and coronary artery disease. Diabetes Res Clin Pract. 2015;109(3):500-506. doi:10.1016/j.diabres.2015.05.049

16. Akinyemi R, Arnett DK., Tiwari HK., et al. Interleukin-6 (IL-6) rs1800796 and cyclin dependent kinase inhibitor (CDKN2A/CDKN2B) rs2383207 are associated with ischemic stroke in indigenous West African Men. J Neurol Sci. 2017;379:229-235. doi:10.1016/j.jns.2017.05.046

17. Alves de Oliveira H Junior., de Menezes Neves PDM., de Figueiredo Oliveira GB., et al. Impact of genetic background as a risk factor for atherosclerotic cardiovascular disease: A protocol for a nationwide genetic case-control (CV-GENES) study in Brazil. PLoS One. 2024;19(3):e0289439. doi:10.1371/journal.pone.0289439

18. Alsagaby S., Ahmed AA., Rasheed Z., et al. Association of genetic polymorphisms in DNA repair genes ERCC2 Asp312Asn (rs1799793), ERCC2 Lys 751 Gln (rs13181), XRCC1 Arg399 Gln (rs25487) and XRCC3 Thr 241Met (rs861539) with the susceptibility of lung cancer in Saudi population. Nucleosides Nucleotides Nucleic Acids. 2022;41(5-6):530-554. doi:10.1080/15257770.2022.2052317

19. Andreou I., Sun X., Stone PH., Edelman ER., Feinberg MW. miRNAs in atherosclerotic plaque initiation, progression, and rupture. Trends Mol Med. 2015;21(5):307-318. doi:10.1016/j.molmed.2015.02.003

20. Aragam KG., Jiang T., Goel A., et al. Discovery and systematic characterization of risk variants and genes for coronary artery disease in over a million participants. Nat Genet. 2022;54(12):1803-1815. doi:10.1038/s41588-022-01233-6

21. Aschrafi A., Schwechter AD., Mameza MG., et al. MicroRNA-338 regulates local cytochrome c oxidase IV mRNA levels and oxidative phosphorylation in the axons of sympathetic neurons. J Neurosci. 2008;28(47):12581-12590. doi: 10.1523/JNEUR0SCI.3338-08.2008

22. Bazo AP., Salvadori D Jr., Salvadori RA., et al. DNA repair gene polymorphism is associated with the genetic basis of atherosclerotic coronary artery disease. Cardiovasc Pathol. 2011;20(1):e9-e15. doi:10.1016/j.carpath.2009.12.004

23. Banach M., Surma S. Monitoring of traditional atherosclerosis cardiovascular disease risk factors - is it enough to prevent premature acute coronary syndrome?. Lancet Reg Health Eur. 2024;38:100866. doi: 10.1016/j.lanepe.2024.100866

24. Bandiera S., Matégot R., Girard M., et al. MitomiRs delineating the intracellular localization of microRNAs at mitochondria. Free Radic Biol Med. 2013;64:12-19. doi:10.1016/j.freeradbiomed.2013.06.013

25. Baranyi R. et al. Analysis, design, and prototypical implementation of a serious game reha@ stroke to support rehabilitation of stroke patients with the help of a mobile phone //IEEE Transactions on Games. 2020;12( 4): 341-350.

26. Bartel DP. MicroRNAs: genomics, biogenesis, mechanism, and function. Cell. 2004;116(2):281-297. doi:10.1016/s0092-8674(04)00045-5

27. Barrey E., Saint-Auret G., Bonnamy B., et al. Pre-microRNA and mature microRNA in human mitochondria. PLoS One. 2011;6(5):e20220. doi:10.1371/journal.pone.0020220

28. Barshad G., Marom S., Cohen T., Mishmar D. Mitochondrial DNA Transcription and Its Regulation: An Evolutionary Perspective. Trends Genet. 2018;34(9):682-692. doi:10.1016/j.tig.2018.05.009

29. Bejerano T., Etzion S., Elyagon S., et al. Nanoparticle Delivery of miRNA-21 Mimic to Cardiac Macrophages Improves Myocardial Remodeling after Myocardial Infarction. Nano Lett. 2018;18(9):5885-5891. doi:10.1021/acs.nanolett.8b02578

30. Bethel M., Annex BH. Peripheral arterial disease: A small and large vessel problem. Am Heart J Plus. 2023;28:100291. doi:10.1016/j.ahjo.2023.100291

31. Beylerli O., Gareev I., Sufianov A., et al. The role of microRNA in the pathogenesis of glial brain tumors. Noncoding RNA Res. 2022;7(2):71-76. doi:10.1016/j.ncrna.2022.02.005

32. Beylerli O., Gareev I., Sufianov A., et al. Long noncoding RNAs as promising biomarkers in cancer. Noncoding RNA Res. 2022;7(2):66-70. doi: 10.1016/j. ncrna.2022.02.004

33. Bian Z., Li LM., Tang R., et al. Identification of mouse liver mitochondria-associated miRNAs and their potential biological functions. Cell Res. 2010;20(9): 1076-1078. doi: 10.1038/cr.2010.119

34. Biros E., Cooper M., Palmer LJ., et al. Association of an allele on chromosome 9 and abdominal aortic aneurysm. Atherosclerosis. 2010;212(2):539-542. doi:10.1016/j.atherosclerosis.2010.06.015

35. Brem R., Hall J. XRCC1 is required for DNA single-strand break repair in human cells. Nucleic Acids Res. 2005;33(8):2512-2520. doi:10.1093/nar/gki543

36. Björkegren JLM., Lusis AJ. Atherosclerosis: Recent developments. Cell. 2022;185(10):1630-1645. doi:10.1016/j.cell.2022.04.004

37. Carninci P., Kasukawa T., Katayama S., et al. The transcriptional landscape of the mammalian genome. Science. 2005;309(5740):1559-1563. doi: 10.1126/science.1112014

38. Canale P., Borghini A. Mitochondrial microRNAs: New Emerging Players in Vascular Senescence and Atherosclerotic Cardiovascular Disease. Int J Mol Sci. 2024;25(12):6620. doi: 10.3390/ijms25126620.

39. Chan DC. Mitochondria: dynamic organelles in disease, aging, and development. Cell. 2006;125(7):1241-1252. doi:10.1016/j.cell.2006.06.010

40. Chen C., Liu Q., Li Y., et al. Circulating microRNA-33b levels are associated with the presence and severity of coronary heart disease. Scand J Clin Lab Invest. 2024;84(2): 133-137. doi: 10.1080/00365513.2024.2340751

41. Chen JX., Liu J., Hu F., et al. Genetic variants on chromosome 9p21 confer risks of cerebral infarction in the Chinese population: a meta-analysis. Int J Immunopathol Pharmacol. 2019;33:2058738419847852. doi: 10.1177/2058738419847852

42. Chen T., Huang Z., Wang L., et al. MicroRNA-125a-5p partly regulates the inflammatory response, lipid uptake, and ORP9 expression in oxLDL-stimulated monocyte/macrophages. Cardiovasc Res. 2009;83(1): 131-139. doi: 10.1093/cvr/cvp121

43. Chen X., Bao Y., Zhao J., et al. Associations of Triglycerides and Atherogenic Index of Plasma with Brain Structure in the Middle-Aged and Elderly Adults. Nutrients. 2024;16(5):672. doi:10.3390/nu16050672

44. Chen X., Cao Y., Guo Y., et al. microRNA-125b-1-3p mediates autophagy via the RRAGD/mTOR/ULK1 signaling pathway and mitigates atherosclerosis progression. Cell Signal. 2024;118:111136. doi: 10.1016/j.cellsig.2024.111136

45. Chen Z., Schunkert H. Genetics of coronary artery disease in the post-GWAS era. J Intern Med. 2021;290(5):980-992. doi:10.1111/joim.13362

46. Cheng M., An S., Li J. CDKN2B-AS may indirectly regulate coronary artery disease-associated genes via targeting miR-92a. Gene. 2017;629:101-107. doi:10.1016/j.gene.2017.07.070

47. Chistiakov DA., Shkurat TP., Melnichenko AA., et al. The role of mitochondrial dysfunction in cardiovascular disease: a brief review. Ann Med. 2018;50(2): 121-127. doi: 10.1080/07853890.2017.1417631

48. Chong M., Mohammadi-Shemirani P., Perrot N, et al. GWAS and ExWAS of blood mitochondrial DNA copy number identifies 71 loci and highlights a potential causal role in dementia. Elife. 2022;11:e70382. doi:10.7554/eLife.70382

49. Christiansen MK., Nissen L., Winther S., et al. Genetic Risk of Coronary Artery Disease, Features of Atherosclerosis, and Coronary Plaque Burden. J Am Heart Assoc. 2020;9(3):e014795. doi:10.1161/JAHA.119.014795

50. Citrin KM., Fernández-Hernando C., Suárez Y. MicroRNA regulation of cholesterol metabolism. Ann N Y Acad Sci. 2021;1495(1):55-77. doi: 10.1111/nyas.14566

51. Congrains A., Kamide K., Ohishi M., Rakugi H. ANRIL: molecular mechanisms and implications in human health. Int J Mol Sci. 2013;14(1): 1278-1292. doi: 10.3390/ijms14011278.

52. Cui XY., Zhan JK., Liu YS. Roles and functions of antisense lncRNA in vascular aging. Ageing Res Rev. 2021;72:101480. doi:10.1016/j.arr.2021.101480

53. Davignon J., Ganz P. Role of endothelial dysfunction in atherosclerosis. Circulation. 2004;109(23 Suppl 1):III27-III32. doi:10.1161/01.CIR.0000131515.03336.f8

54. Dattani S., Spooner F., Ritchie H., Roser M. Causes of Death. OurWorldinData.org. 2023. https://ourworldindata.org/causes-of-death

55. Dehghan A., Bis JC., White CC., et al. Genome-Wide Association Study for Incident Myocardial Infarction and Coronary Heart Disease in Prospective Cohort Studies: The CHARGE Consortium. PLoS One. 2016;11(3):e0144997. doi:10.1371/journal.pone.0144997

56. Dekkers KF., Slieker RC., Ioan-Facsinay A., et al. Lipid-induced transcriptomic changes in blood link to lipid metabolism and allergic response. Nat Commun. 2023;14(1):544. doi:10.1038/s41467-022-35663-x

57. de Lima-Reis SR., Silva TA., Costa LSA., et al. Serum levels of vitamin A, selenium, and better dietary total antioxidant capacity are related to lower oxidative DNA damage: A cross-sectional study of individuals at cardiovascular risk. J Nutr Biochem. 2022;107:109070. doi:10.1016/j.jnutbio.2022.109070

58. Dichgans M., Malik R., König IR., et al. Shared genetic susceptibility to ischemic stroke and coronary artery disease: a genome-wide analysis of common variants. Stroke. 2014;45(1):24-36. doi:10.1161/STR0KEAHA.113.002707

59. Clarke MC., Figg N., Maguire JJ., et al. Apoptosis of vascular smooth muscle cells induces features of plaque vulnerability in atherosclerosis. Nat Med. 2006;12(9): 1075-1080. doi: 10.1038/nm1459

60. Devaux Y., Zangrando J., Schroen B., et al. Long noncoding RNAs in cardiac development and ageing. Nat Rev Cardiol. 2015;12(7):415-425. doi: 10.1038/nrcardio.2015.55

61. Ding K., Liao Y., Gong D., Zhao X., Ji W. Effect of long non-coding RNA H19 on oxidative stress and chemotherapy resistance of CD133+ cancer stem cells via the MAPK/ERK signaling pathway in hepatocellular carcinoma. Biochem Biophys Res Commun. 2018;502(2):194-201. doi:10.1016/j.bbrc.2018.05.143

62. Doliner B., Dong C., Blanton SH., et al. Apolipoprotein E Gene Polymorphism and Subclinical Carotid Atherosclerosis: The Northern Manhattan Study. J Stroke Cerebrovasc Dis. 2018;27(3):645-652. doi: 10.1016/j.j strokecerebrovasdis.2017.09.053

63. Don AN., Kakharov ZA., Artykov DD. Atherosclerosis: Socio-economic Challenge of the Present and Ways to Improve Public Health. Re-health journal.-2022. 2022;3(15):31-3.

64. Dong Y., Han LL., Xu ZX. Suppressed microRNA-96 inhibits iNOS expression and dopaminergic neuron apoptosis through inactivating the MAPK signaling pathway by targeting CACNG5 in mice with Parkinson's disease. Mol Med. 2018;24(1):61. doi: 10.1186/s10020-018-0059-9

65. Dubovyk YI., Oleshko TB., Harbuzova VY., Ataman AV. Positive Association between EDN1 rs5370 (Lys198Asn) Polymorphism and Large Artery Stroke in a Ukrainian Population. Dis Markers. 2018;2018:1695782. doi:10.1155/2018/1695782

66. Dumont A., Lee M., Barouillet T., et al. Mitochondria orchestrate macrophage effector functions in atherosclerosis. Mol Aspects Med. 2021;77:100922. doi:10.1016/j.mam.2020.100922

67. Ebuehi OAT. A polymorphism in the hepatic lipase gene promoter influences plasma lipid profile and lipoprotein ratio in patients with ischemic stroke. Journal of Acute Disease.2021. doi: 10.4103/2221-6189.307388

68. Ellman N., Keswell D., Collins M., et al. Ethnic differences in the association between lipid metabolism genes and lipid levels in black and white South African women. Atherosclerosis. 2015;240(2):311-317. doi: 10.1016/j. athero sclerosis.2015.03.027

69. ENCODE Project Consortium. An integrated encyclopedia of DNA elements in the human genome. Nature. 2012;489(7414):57-74. doi:10.1038/nature 11247

70. Escate R., Padró T., Pérez de Isla L., et al. Circulating miR-6821-5p levels and coronary calcification in asymptomatic familial hypercholesterolemia patients. Atherosclerosis. 2024;392:117502. doi:10.1016/j.atherosclerosis.2024.117502

71. Ettehad D., Emdin CA., Kiran A., et al. Blood pressure lowering for prevention of cardiovascular disease and death: a systematic review and meta-analysis. Lancet. 2016;387(10022):957-967. doi:10.1016/S0140-6736(15)01225-8

72. Fan J., Watanabe T. Atherosclerosis: Known and unknown. Pathol Int. 2022;72(3): 151-160. doi: 10.1111/pin.13202

73. Fan L., Liu J., Hu W., et al. Targeting pro-inflammatory T cells as a novel therapeutic approach to potentially resolve atherosclerosis in humans. Cell Res. 2024;34(6):407-427. doi: 10.1038/s41422-024-00945-0

74. Fan S., Tian T., Chen W., et al. Mitochondrial miRNA Determines Chemoresistance by Reprogramming Metabolism and Regulating Mitochondrial Transcription. Cancer Res. 2019;79(6):1069-1084. doi:10.1158/0008-5472.CAN-18-2505

75. Feinberg MW., Moore KJ. MicroRNA Regulation of Atherosclerosis. Circ Res. 2016;118(4):703-720. doi:10.1161/CIRCRESAHA.115.306300

76. Fernandez-Ruiz, I. (2018). Atherosclerosis: a new role for lncRNAs in atherosclerosis. Nature Reviews Cardiology, 15(4), 195-196.

77. Fernandez-Ruiz I. Atherosclerosis: A new role for lncRNAs in atherosclerosis. Nat Rev Cardiol. 2018;15(4):195. doi:10.1038/nrcardio.2018.18

78. Fica SM., Tuttle N., Novak T., et al. RNA catalyses nuclear pre-mRNA splicing. Nature. 2013;503(7475):229-234. doi:10.1038/nature12734

79. Fish JE., Santoro MM., Morton SU., et al. miR-126 regulates angiogenic signaling and vascular integrity. Dev Cell. 2008;15(2):272-284. doi: 10.1016/j. devcel .2008.07.008

80. Forrester SJ, Griendling KK. Mitochondrial Respiration and Atherosclerosis: R-E-S-P-I-R-E. Find Out What it Means to M^ (and VSMC). Arterioscler Thromb Vasc Biol. 2017;37(12):2229-2230. doi:10.1161/ATVBAHA.117.310298

81. Gadde S., Rayner KJ. Nanomedicine Meets microRNA: Current Advances in RNA-Based Nanotherapies for Atherosclerosis. Arterioscler Thromb Vasc Biol. 2016;36(9):e73-e79. doi: 10.1161/ATVBAHA. 116.307481

82. : Gaidai O, Yakimov V, Wang K. Cardio-Cancer Risks Cross-Validation by Gaidai-Yakimov Reliability Method. SciBase 0ncol.2023; 1(2): 1007.

83. Gammage PA., Frezza C. Mitochondrial DNA: the overlooked oncogenome?. BMC Biol. 2019;17(1):53. doi:10.1186/s12915-019-0668-y

84. Gao S., Wang X., Meng LB., et al. Recent Progress of Chronic Stress in the Development of Atherosclerosis. Oxid Med Cell Longev. 2022;2022:4121173. doi: 10.1155/2022/4121173

85. Gareev I., Beylerli O., Liang Y., et al. The Role of MicroRNAs in Therapeutic Resistance of Malignant Primary Brain Tumors. Front Cell Dev Biol. 2021;9:740303. doi: 10.3389/fcell.2021.740303

86. Gareev I., Gileva Y., Dzidzaria A., et al. Long non-coding RNAs in oncourology. Noncoding RNA Res. 2021;6(3):139-145. doi:10.1016/j.ncrna.2021.08.001

87. German CA., Shapiro MD. Small Interfering RNA Therapeutic Inclisiran: A New Approach to Targeting PCSK9. BioDrugs. 2020;34(1):1-9. doi: 10.1007/s40259-019-00399-6

88. Giannakopoulou SP., Antonopoulos A., Panagiotakos D. Serum Inflammatory Markers Used in Cardiovascular Disease Risk Prediction Models: A Systematic Review. Angiology. doi:10.1177/00033197241239691

89. Gill PK., Dron JS., Hegele RA. Genetics of hypertriglyceridemia and atherosclerosis. Curr Opin Cardiol. 2021;36(3):264-271. doi: 10.1097/HC0.0000000000000839

90. Goina CA., Goina DM., Farcas SS., Andreescu NI. The Role of Circular RNA for Early Diagnosis and Improved Management of Patients with Cardiovascular Diseases. Int J Mol Sci. 2024;25(5):2986. doi:10.3390/ijms25052986

91. Golchin Mafi M., Ghaderian SMH., Akhavan-Niaki H., et al. Analysis of Two CDKN2B-AS Polymorphisms in Relation to Coronary Artery Disease Patients in North of Iran. Int J Mol Cell Med. 2017;6(1):31-37.

92. Hahn A., Zuryn S. The Cellular Mitochondrial Genome Landscape in Disease. Trends Cell Biol. 2019;29(3):227-240. doi:10.1016/j.tcb.2018.11.004

93. Hajibabaie F., Kouhpayeh S., Mirian M., et al. MicroRNAs as the actors in the atherosclerosis scenario. J Physiol Biochem. 2020;76(1):1-12. doi:10.1007/s13105-019-00710-7

94. Hall DP., Cost NG., Hegde S., et al. TRPM3 and miR-204 establish a regulatory circuit that controls oncogenic autophagy in clear cell renal cell carcinoma. Cancer Cell. 2014;26(5):738-753. doi:10.1016/j.ccell.2014.09.015

95. Hameed H., Faryal M., Aslam MA., et al. Association of Polymorphisms (rs 1799782, rs25489 and rs25487) in XRCC1 and (rs 13181) XPD genes with Acute Coronary Artery Syndrome in Subjects from Multan, Pakistan. Pak J Pharm Sci. 2016;29(3):869-876.

96. Hanke H., Lenz C., Finking G. The discovery of the pathophysiological aspects of atherosclerosis--a review. Acta Chir Belg. 2001;101(4): 162-169.

97. Hasan NS., Kamel SA., Hamed M., et al. Peroxisome proliferator-activated receptor-y polymorphism (rs1801282) is associated with obesity in Egyptian patients with coronary artery disease and type 2 diabetes mellitus. J Genet Eng Biotechnol. 2017;15(2):409-414. doi:10.1016/j.jgeb.2017.08.002

98. He H., Li R., Choi S., et al. Increased cardiovascular and atherosclerosis markers in blood of older patients with atopic dermatitis. Ann Allergy Asthma Immunol. 2020;124(1):70-78. doi:10.1016/j.anai.2019.10.013

99. He M., Dong J., Wen J., et al. Epitranscriptomic Modification of MicroRNA Increases Atherosclerosis Susceptibility. Circulation. 2023;148(22):1819-1822. doi: 10.1161/CIRCULATI0NAHA.123.065455

100. He W, Huang P, Liu D, et al. Polymorphism of the XRCC1 Gene Is Associated with Susceptibility and Short-Term Recovery of Ischemic Stroke. Int J Environ Res Public Health. 2016;13(10):1016. doi:10.3390/ijerph13101016.

101. Heiskanen M., Kähönen M., Hurme M., et al. Polymorphism in the IL10 promoter region and early markers of atherosclerosis: the Cardiovascular Risk in Young Finns Study. Atherosclerosis. 2010;208(1):190-196. doi:10.1016/j.atherosclerosis.2009.06.032

102. Hennessy EJ., van Solingen C., Scacalossi KR., et al. The long noncoding RNA CHROME regulates cholesterol homeostasis in primate. Nat Metab. 2019;1(1):98-110. doi:10.1038/s42255-018-0004-9

103. Holdt LM., Teupser D. Long Noncoding RNA ANRIL: Lnc-ing Genetic Variation at the Chromosome 9p21 Locus to Molecular Mechanisms of Atherosclerosis. Front Cardiovasc Med. 2018;5:145. doi:10.3389/fcvm.2018.00145

104. Holvoet, P. Non-coding RNAs Related to Atherosclerosis. In: Non-coding RNAs at the Cross-Road of Cardiometabolic Diseases and Cancer . Springer, Cham. 2021. https://doi.org/10.1007/978-3-030-68844-8_5

105. Hong T., Wei Y., Xue X., et al. A Novel Anti-Coagulative Nanocomplex in Delivering miRNA-1 Inhibitor Against Microvascular Obstruction of Myocardial Infarction. Adv Healthc Mater. 2020;9(11):e1901783. doi:10.1002/adhm.201901783

106. Hoogeveen RC., Ballantyne CM. Residual Cardiovascular Risk at Low LDL: Remnants, Lipoprotein(a), and Inflammation. Clin Chem. 2021;67(1):143-153. doi: 10.1093/clinchem/hvaa252

107. Hosen MR., Goody PR., Zietzer A., et al. MicroRNAs As Master Regulators of Atherosclerosis: From Pathogenesis to Novel Therapeutic Options. Antioxid Redox Signal. 2020;33(9):621-644. doi:10.1089/ars.2020.8107

108. Hoseini SM., Bijanzadeh M., Seyedian SM. A DNA Repair Pathway Polymorphism (rs25487) and Angiographically Proven Coronary Artery Patients in a Population of Southern Iran. Cardiovasc Hematol Agents Med Chem. 2021;19(1):76-82. doi:10.2174/1871525718666200805113813

109. Hsu PY., Lin WY., Lin RT., Juo SH. MicroRNA let-7g inhibits angiotensin II-induced endothelial senescence via the LOX-1-independent mechanism. Int J Mol Med. 2018;41(4):2243-2251. doi:10.3892/ijmm.2018.3416

110. Hu L, Su G, Wang X. The roles of ANRIL polymorphisms in coronary artery disease: a meta-analysis. Biosci Rep. 2019;39(12):BSR20181559. doi:10.1042/BSR20181559

111. Huang J, Zhao L, Fan Y, et al. The microRNAs miR-204 and miR-211 maintain joint homeostasis and protect against osteoarthritis progression. Nat Commun. 2019;10(1):2876. doi:10.1038/s41467-019-10753-5

112. Huang T., Zhao HY., Zhang XB., et al. LncRNA ANRIL regulates cell proliferation and migration via sponging miR-339-5p and regulating FRS2

expression in atherosclerosis. Eur Rev Med Pharmacol Sci. 2020;24(4):1956-1969. doi:10.26355/eurrev_202002_20373

113. Huang W, Li H, Yu Q, Xiao W, Wang DO. LncRNA-mediated DNA methylation: an emerging mechanism in cancer and beyond. J Exp Clin Cancer Res. 2022;41(1):262. doi: 10.1186/s13046-022-02468-1

114. Hudson G, Gomez-Duran A, Wilson IJ, Chinnery PF. Recent mitochondrial DNA mutations increase the risk of developing common late-onset human diseases. PLoS Genet. 2014;10(5):e1004369. doi:10.1371/journal.pgen.1004369

115. Hussain MM., Goldberg IJ. Human MicroRNA-33b Promotes Atherosclerosis in Apoe-/- Mice. Arterioscler Thromb Vasc Biol. 2018;38(10):2272-2275. doi:10.1161/ATVBAHA.118.311617

116. Ibi D., Blauw LL., Noordam R., et al. Triglyceride-lowering LPL alleles combined with LDL-C-lowering alleles are associated with an additively improved lipoprotein profile. Atherosclerosis. 2021;328:144-152. doi: 10.1016/j. athero sclerosis.2021.04.015

117. Jaé N., Dimmeler S. Noncoding RNAs in Vascular Diseases. Circ Res. 2020; 126(9): 1127-1145. doi: 10.1161/CIRCRESAHA. 119.315938

118. Jebari-Benslaiman S., Galicia-García U., Larrea-Sebal A., et al. Pathophysiology of Atherosclerosis. Int J Mol Sci. 2022;23(6):3346. doi: 10.3390/ijms23063346

119. Jiang Q., Li Y., Wu Q., et al. Pathogenic role of microRNAs in atherosclerotic ischemic stroke: Implications for diagnosis and therapy. Genes Dis. 2021;9(3):682-696. doi:10.1016/j.gendis.2021.01.001

120. Josefs T., Boon RA. The Long Non-coding Road to Atherosclerosis. Curr Atheroscler Rep. 2020;22(10):55. doi:10.1007/s11883-020-00872-6

121. Kablak-Ziembicka A., Badacz R., Przewlocki T. Clinical Application of Serum microRNAs in Atherosclerotic Coronary Artery Disease. J Clin Med. 2022; 11(22):6849. doi:10.3390/jcm11226849

122. Kaneko H., Yano Y., Okada A., et al. Age-Dependent Association Between Modifiable Risk Factors and Incident Cardiovascular Disease. J Am Heart Assoc. 2023;12(2):e027684. doi: 10.1161/JAHA.122.027684

123. Karam ZM., Yari A., Najmadini A., et al. Association of the ESR1 (rs9340799), OLR1 (rs3736234), LIPC (rs2070895), VDR (rs2228570), and CETP (rs708272) Polymorphisms With Risk of Coronary Artery Disease in Iranian Patients. J Clin Lab Anal. 2024;38(6):e25026. doi:10.1002/jcla.25026

124. Khan AW., Paneni F., Jandeleit-Dahm KAM. Cell-specific epigenetic changes in atherosclerosis. Clin Sci (Lond). 2021;135(9): 1165-1187. doi: 10.1042/CS20201066

125. Kirichenko TV, Sobenin IA, Khasanova ZB, et al. Data on association of mitochondrial heteroplasmy and cardiovascular risk factors: Comparison of samples from Russian and Mexican populations. Data Brief. 2018;18:16-21. doi:10.1016/j.dib.2018.02.068

126. Kong H., Sun ML., Zhang XA., Wang XQ. Crosstalk Among circRNA/lncRNA, miRNA, and mRNA in Osteoarthritis. Front Cell Dev Biol. 2021;9:774370. doi:10.3389/fcell.2021.774370

127. Kong P., Cui ZY., Huang XF., et al. Inflammation and atherosclerosis: signaling pathways and therapeutic intervention. Signal Transduct Target Ther. 2022;7(1): 131. doi: 10.1038/s41392-022-00955-7

128. Konstantinov IE., Mejevoi N., Anichkov NM. Nikolai N. Anichkov and his theory of atherosclerosis. Tex Heart Inst J. 2006;33(4):417-423.

129. Koohdani F., Sotoudeh G., Kalantar Z., Mansoori A. PPARy Pro12Ala Polymorphism Influences the Relationship between Dietary Fat Intake, Adiposity and Lipid Profile in Patients with Type 2 Diabetes. Int J Vitam Nutr Res. 2018;88(5-6):263-269. doi: 10.1024/0300-9831/a000595

130. Kotlyarov S. Involvement of Lipids and Lipid Mediators in Inflammation and Atherogenesis. Curr Med Chem. doi: 10.2174/0109298673303369240312092913

131. Kucher AN., Nazarenko MS., Markov AV., et al. Variability of Methylation Profiles of CpG Sites in microrNA Genes in Leukocytes and Vascular Tissues of

Patients with Atherosclerosis. Biochemistry (Mosc). 2017;82(6):698-706. doi: 10.1134/S0006297917060062

132. Kumari A., Kristensen KK., Ploug M., Winther AL. The Importance of Lipoprotein Lipase Regulation in Atherosclerosis. Biomedicines. 2021;9(7):782. doi: 10.3390/biomedicines9070782

133. Lamerdin JE., Montgomery MA., Stilwagen SA., et al. Genomic sequence comparison of the human and mouse XRCC1 DNA repair gene regions. Genomics. 1995;25(2):547-554. doi: 10.1016/0888-7543(95)80056-r

134. Lee DY., Yang TL., Huang YH., et al. Induction of microRNA-10a using retinoic acid receptor-a and retinoid x receptor-a agonists inhibits atherosclerotic lesion formation. Atherosclerosis. 2018;271:36-44. doi:10.1016/j.atherosclerosis.2018.02.010

135. Lee SR., Han J. Mitochondrial Nucleoid: Shield and Switch of the Mitochondrial Genome. Oxid Med Cell Longev. 2017;2017:8060949. doi: 10.1155/2017/8060949

136. Levine M., Ensom MH. Post hoc power analysis: an idea whose time has passed?. Pharmacotherapy. 2001;21(4):405-409. doi:10.1592/phco.21.5.405.34503

137. Li BR., Xia LQ., Liu J., et al. miR-758-5p regulates cholesterol uptake via targeting the CD36 3'UTR. Biochem Biophys Res Commun. 2017;494(1-2):384-389. doi:10.1016/j.bbrc.2017.09.150

138. Li C., Pan Y., Zhang R., et al. Genomic Innovation in Early Life Cardiovascular Disease Prevention and Treatment. Circ Res. 2023;132(12):1628-1647. doi:10.1161/CIRCRESAHA.123.321999

139. Li J., Cai SX., He Q., et al. Intravenous miR-144 reduces left ventricular remodeling after myocardial infarction. Basic Res Cardiol. 2018;113(5):36. doi: 10.1007/s00395-018-0694-x

140. Li Z., Huang C., Bao C., et al. Exon-intron circular RNAs regulate transcription in the nucleus. Nat Struct Mol Biol. 2015;22(3):256-264. doi: 10.1038/nsmb.2959

141. Libby P. The changing landscape of atherosclerosis. Nature. 2021;592(7855):524-533. doi:10.1038/s41586-021-03392-8

142. Lightbody RJ., Taylor JMW., Dempsie Y., Graham A. MicroRNA sequences modulating inflammation and lipid accumulation in macrophage "foam" cells: Implications for atherosclerosis. World J Cardiol. 2020;12(7):303-333. doi: 10.4330/wjc.v12.i7.303

143. Lilevska A., Sierkova V., Savytska., et al. Polymorphism LYS198ASN endothelin-1 gene as a predictor of the development coronary heart disease in patients with chronic obstructive pulmonary disease. Atherosclerosis. 2021;331:77. doi: 10.1016/j. athero sclerosis.2021.06.224.

144. Liu J., Liu Y., Wang F., Liang M. miR-204: Molecular Regulation and Role in Cardiovascular and Renal Diseases. Hypertension. 2021;78(2):270-281. doi:10.1161/HYPERTENSIONAHA.121.14536

145. Liu L., Shi Z., Ji X., et al. Adipokines, adiposity, and atherosclerosis. Cell Mol Life Sci. 2022;79(5):272. doi:10.1007/s00018-022-04286-2

146. Liu X., Li S., Yang Y., et al. The lncRNA ANRIL regulates endothelial dysfunction by targeting the let-7b/TGF-ßR1 signalling pathway. J Cell Physiol. 2021;236(3):2058-2069. doi:10.1002/jcp.29993

147. Loyer X., Potteaux S., Vion AC., et al. Inhibition of microRNA-92a prevents endothelial dysfunction and atherosclerosis in mice. Circ Res. 2014;114(3):434-443. doi: 10.1161 /CIRCRE SAHA. 114.302213

148. Lu TX, Rothenberg ME. MicroRNA. J Allergy Clin Immunol. 2018;141(4):1202-1207. doi:10.1016/j.jaci.2017.08.034

149. Lu X., Yang B., Yang H., et al. MicroRNA-320b Modulates Cholesterol Efflux and Atherosclerosis. J Atheroscler Thromb. 2022;29(2):200-220. doi:10.5551/jat.57125

150. Lumsden AL., Mulugeta A., Zhou A., Hyppönen E. Apolipoprotein E (APOE) genotype-associated disease risks: a phenome-wide, registry-based, case-control study utilising the UK Biobank. EBioMedicine. 2020;59:102954. doi: 10.1016/j.ebiom.2020.102954

151. Ma S, Xie X, Yuan R, et al. Vascular Aging and Atherosclerosis: A Perspective on Aging. Aging Dis. doi:10.14336/AD.2024.0201-1

152. Ma WQ., Han XQ., Wang X., et al. Associations between XRCC1 Gene Polymorphisms and Coronary Artery Disease: A Meta-Analysis. PLoS One. 2016;11(11):e0166961. doi:10.1371/journal.pone.0166961

153. Ma Y., He S., Xie Q., et al. LncRNA: An Important Regulator of Atherosclerosis. Curr Med Chem. 2023;30(38):4340-4354. doi: 10.2174/0929867330666230111125141

154. Mao Y., Yue H., Dong F. LncRNA CDKN2B-AS1 in atherosclerosis: Friend or foe?. Int J Cardiol. 2021;343:106. doi:10.1016/j.ijcard.2021.09.006

155. Mathew DT., Peigh G., Lima JAC., et al. Associations of Circulating Vascular Cell Adhesion Molecule-1 and Intercellular Adhesion Molecule-1 With Long-Term Cardiac Function. J Am Heart Assoc. 2024;13(6):e032213. doi:10.1161/JAHA.123.032213

156. Martinet W., Knaapen MW., De Meyer GR., et al. Elevated levels of oxidative DNA damage and DNA repair enzymes in human atherosclerotic plaques. Circulation. 2002;106(8):927-932. doi:10.1161/01.cir.0000026393.47805.21

157. Martinez Lopez I., Gomez Cerezo JF., Gamez JM., et al. Post-event follow-up costs in patients with atherosclerotic cardiovascular disease in Spain. Front Cardiovasc Med. 2024;11:1324537. doi:10.3389/fcvm.2024.1324537

158. Maurano MT., Humbert R., Rynes E., et al. Systematic localization of common disease-associated variation in regulatory DNA. Science. 2012;337(6099): 1190-1195. doi: 10.1126/science.1222794

159. Mandolini C., Santovito D., Marcantonio P., et al. Identification of microRNAs 758 and 33b as potential modulators of ABCA1 expression in human atherosclerotic plaques. Nutr Metab Cardiovasc Dis. 2015;25(2):202-209. doi:10.1016/j.numecd.2014.09.005

160. Marais AD. Apolipoprotein E in lipoprotein metabolism, health and cardiovascular disease. Pathology. 2019;51(2):165-176. doi: 10.1016/j.pathol.2018.11.002

161. Meng Q., Pu L., Luo X., et al. Regulatory Roles of Related Long Non-coding RNAs in the Process of Atherosclerosis. Front Physiol. 2020;11:564604. doi: 10.3389/fphys.2020.564604

162. Mercer TR., Neph S., Dinger ME., et al. The human mitochondrial transcriptome. Cell. 2011;146(4):645-658. doi:10.1016/j.cell.2011.06.051

163. Mirza AZ., Althagafi II., Shamshad H. Role of PPAR receptor in different diseases and their ligands: Physiological importance and clinical implications. Eur J Med Chem. 2019;166:502-513. doi:10.1016/j.ejmech.2019.01.067

164. Muñoz-Barrera L, Perez-Sanchez C, Ortega-Castro R, et al. Personalized cardiovascular risk assessment in Rheumatoid Arthritis patients using circulating molecular profiles and their modulation by TNFi, IL6Ri, and JAKinibs. Biomed Pharmacother. 2024;173:116357. doi:10.1016/j.biopha.2024.116357

165. Moher D, Shamseer L, Clarke M, et al. Preferred reporting items for systematic review and meta-analysis protocols (PRISMA-P) 2015 statement. Syst Rev. 2015;4(1):1. doi:10.1186/2046-4053-4-1

166. Motsinger AA., Ritchie MD. The effect of reduction in cross-validation intervals on the performance of multifactor dimensionality reduction. Genet Epidemiol. 2006;30(6):546-555. doi:10.1002/gepi.20166

167. Morvaridzadeh M., Zoubdane N., Heshmati J., et al. High-Density Lipoprotein Metabolism and Function in Cardiovascular Diseases: What about Aging and Diet Effects?. Nutrients. 2024;16(5):653. doi:10.3390/nu16050653

168. Nawaz S. Endothelin 1 gene variant rs5370 and risk of coronary artery disease in the local population of Pakistan, a case-control study. Pure and Applied Biology (PAB). 2021;10(4):1427-1435. doi:10.19045/bspab.2021-100148

169. Nie P., Yang F., Wan F., et al. Analysis of MicroRNAs Associated With Carotid Atherosclerotic Plaque Rupture With Thrombosis. Front Genet. 2021;12:599350. doi:10.3389/fgene.2021.599350

170. Nigro P., Abe J., Berk BC. Flow shear stress and atherosclerosis: a matter of site specificity. Antioxid Redox Signal. 2011;15(5):1405-1414. doi: 10.1089/ars.2010.3679

171. Nojima T., Proudfoot NJ. Mechanisms of lncRNA biogenesis as revealed by nascent transcriptomics. Nat Rev Mol Cell Biol. 2022;23(6):389-406. doi: 10.1038/s41580-021-00447-6

172. Oniki K., Ohura K., Endo M., et al. The Association of the Cholesterol Efflux Capacity with the Paraoxonase 1 Q192R Genotype and the Paraoxonase Activity. J Atheroscler Thromb. 2024;31(9):1263-1276. doi:10.5551/jat.64711

173. Orekhov AN., Poznyak AV., Sobenin IA., et al. Mitochondrion as a Selective Target for the Treatment of Atherosclerosis: Role of Mitochondrial DNA Mutations and Defective Mitophagy in the Pathogenesis of Atherosclerosis and Chronic Inflammation. Curr Neuropharmacol. 2020;18(11):1064-1075. doi: 10.2174/1570159X17666191118125018

174. Orekhov AN., Ivanova EA., Markin AM., et al. Genetics of Arterial-Wall-Specific Mechanisms in Atherosclerosis: Focus on Mitochondrial Mutations. Curr Atheroscler Rep. 2020;22(10):54. doi:10.1007/s11883-020-00873-5

175. Orekhov AN., Nikiforov NN., Ivanova EA., Sobenin IA. Possible Role of Mitochondrial DNA Mutations in Chronification of Inflammation: Focus on Atherosclerosis. J Clin Med. 2020;9(4):978. doi:10.3390/jcm9040978

176. Örd T., Öunap K., Stolze LK., et al. Single-Cell Epigenomics and Functional Fine-Mapping of Atherosclerosis GWAS Loci. Circ Res. 2021;129(2):240-258. doi: 10.1161 /CIRCRESAHA. 121.318971

177. Ortega R., Liu B., Persaud SJ. Effects of miR-33 Deficiency on Metabolic and Cardiovascular Diseases: Implications for Therapeutic Intervention. Int J Mol Sci. 2023;24(13):10777. doi:10.3390/ijms241310777

178. Orth M., Weng W., Funke H., et al. Effects of a frequent apolipoprotein E isoform, ApoE4Freiburg (Leu28-->Pro), on lipoproteins and the prevalence of coronary artery disease in whites. Arterioscler Thromb Vasc Biol. 1999;19(5):1306-1315. doi:10.1161/01.atv.19.5.1306

179. Pahlavanneshan S., Ahmadi A., Boroumand M., et al. Association of -77T>C and Arg194trp polymorphisms of XRCC1 with risk of coronary artery diseases in Iranian population. Iran J Basic Med Sci. 2016;19(2): 194-200.

180. Paramasivam A., Vijayashree Priyadharsini J. MitomiRs: new emerging microRNAs in mitochondrial dysfunction and cardiovascular disease. Hypertens Res. 2020;43(8):851-853. doi: 10.1038/s41440-020-0423-3

181. Pasmant E., Sabbagh A., Vidaud M., Bieche I. ANRIL, a long, noncoding RNA, is an unexpected major hotspot in GWAS. FASEB J. 2011;25(2):444-448. doi:10.1096/fj .10-172452

182. Posadas-Sánchez R., Angeles-Martínez J., Pérez-Hernández N., et al. The IL-10-1082 (rs1800896) G allele is associated with a decreased risk of developing premature coronary artery disease and some IL-10 polymorphisms were associated with clinical and metabolic parameters. The GEA study. Cytokine. 2018;106:12-18. doi:10.1016/j.cyto.2018.02.028

183. Pordzik J., Pisarz K., De Rosa S., et al. The Potential Role of Platelet-Related microRNAs in the Development of Cardiovascular Events in High-Risk Populations, Including Diabetic Patients: A Review. Front Endocrinol (Lausanne). 2018;9:74. doi: 10.3389/fendo.2018.00074

184. Price NL., Rotllan N., Canfrán-Duque A., et al. Genetic Dissection of the Impact of miR-33a and miR-33b during the Progression of Atherosclerosis. Cell Rep. 2017;21(5): 1317-1330. doi:10.1016/j.celrep.2017.10.023

185. Price NL., Zhang X., Fernández-Tussy P., et al. Loss of hepatic miR-33 improves metabolic homeostasis and liver function without altering body weight or atherosclerosis. Proc Natl Acad Sci USA. 2021;118(5):e2006478118. doi: 10.1073/pnas.2006478118

186. Qi P., Du X. The long non-coding RNAs, a new cancer diagnostic and therapeutic gold mine. Mod Pathol. 2013;26(2):155-165. doi:10.1038/modpathol.2012.160

187. Qu H., Fang X. A brief review on the Human Encyclopedia of DNA Elements (ENCODE) project. Genomics Proteomics Bioinformatics. 2013;11(3): 135-141. doi:10.1016/j.gpb.2013.05.001

188. Rai PK., Craven L., Hoogewijs K., Russell OM, Lightowlers RN. Advances in methods for reducing mitochondrial DNA disease by replacing or manipulating the

mitochondrial genome. Essays Biochem. 2018;62(3):455-465. doi: 10.1042/EBC20170113

189. Ramirez CM., Davalos A., Goedeke L., et al. MicroRNA-758 regulates cholesterol efflux through posttranscriptional repression of ATP-binding cassette transporter A1. Arterioscler Thromb Vasc Biol. 2011;31(11):2707-2714. doi:10.1161/ATVBAHA.111.232066

190. Raskurazhev AA., Kuznetsova PI., Shabalina AA., Tanashyan MM. MicroRNA and Hemostasis Profile of Carotid Atherosclerosis. Int J Mol Sci. 2022;23(18):10974. doi:10.3390/ijms231810974

191. Rayner KJ., Esau CC., Hussain FN., et al. Inhibition of miR-33a/b in nonhuman primates raises plasma HDL and lowers VLDL triglycerides. Nature. 2011;478(7369):404-407. doi:10.1038/nature10486

192. Razeghian-Jahromi I., Karimi Akhormeh A., Zibaeenezhad MJ. The Role of ANRIL in Atherosclerosis. Dis Markers. 2022;2022:8859677. doi: 10.1155/2022/8859677

193. Reyes-Soffer G., Ginsberg HN., Berglund L., et al. Lipoprotein(a): A Genetically Determined, Causal, and Prevalent Risk Factor for Atherosclerotic Cardiovascular Disease: A Scientific Statement From the American Heart Association. Arterioscler Thromb Vasc Biol. 2022;42(1):e48-e60. doi:10.1161/ATV.0000000000000147

194. Rodriguez S., Gaunt TR., Day IN. Hardy-Weinberg equilibrium testing of biological ascertainment for Mendelian randomization studies. Am J Epidemiol. 2009;169(4):505-514. doi:10.1093/aje/kwn359

195. Roiz-Valle D., Caravia XM., Lopez-Otin C. Mechanisms of mitochondrial microRNA regulation in cardiovascular diseases. Mech Ageing Dev. 2023;212:111822. doi:10.1016/j.mad.2023.111822

196. Ross R, Glomset JA. The pathogenesis of atherosclerosis (first of two parts). N Engl J Med. 1976;295(7):369-377. doi:10.1056/NEJM197608122950707

197. Roth GA., Mensah GA., Johnson CO., et al. Global Burden of Cardiovascular Diseases and Risk Factors, 1990-2019: Update From the GBD 2019 Study. J Am Coll Cardiol. 2020;76(25):2982-3021. doi:10.1016/j.jacc.2020.11.010

198. Saglietto A., Manfredi R., Elia E., et al. Cardiovascular disease burden: Italian and global perspectives. Minerva Cardiol Angiol. 2021;69(3):231-240. doi:10.23736/S2724-5683.21.05538-9

199. Salazar-Tortosa DF., Pascual-Gamarra JM., Labayen I., et al. Association between lipoprotein lipase gene polymorphisms and cardiovascular disease risk factors in European adolescents: The Healthy Lifestyle in Europe by Nutrition in Adolescence study. Pediatr Diabetes. 2020;21(5):747-757. doi:10.1111/pedi.13035

200. Sarkar D, Oghabian A, Bodiyabadu PK, et al. Multiple Isoforms of ANRIL in Melanoma Cells: Structural Complexity Suggests Variations in Processing. Int J Mol Sci. 2017;18(7):1378. doi:10.3390/ijms18071378

201. Sazonova MA., Sinyov VV., Ryzhkova AI., et al. Role of Mitochondrial Genome Mutations in Pathogenesis of Carotid Atherosclerosis. Oxid Med Cell Longev. 2017;2017:6934394. doi:10.1155/2017/6934394

202. Sazonova MA., Zhelankin AV., Barinova VA., et al. Dataset of mitochondrial genome variants associated with asymptomatic atherosclerosis. Data Brief. 2016;7:1570-1575. doi:10.1016/j.dib.2016.04.055

203. Sharma P., Sampath H. Mitochondrial DNA Integrity: Role in Health and Disease. Cells. 2019;8(2):100. doi:10.3390/cells8020100

204. Shemiakova T., Ivanova E., Grechko AV., et al. Mitochondrial Dysfunction and DNA Damage in the Context of Pathogenesis of Atherosclerosis. Biomedicines. 2020;8(6): 166. doi: 10.3390/biomedicines8060166

205. Shen MR., Zdzienicka MZ., Mohrenweiser H., et al. Mutations in hamster single-strand break repair gene XRCC1 causing defective DNA repair. Nucleic Acids Res. 1998;26(4): 1032-1037. doi:10.1093/nar/26.4.1032

206. Shimo-Nakanishi Y., Urabe T., Hattori N., et al. Polymorphism of the lipoprotein lipase gene and risk of atherothrombotic cerebral infarction in the Japanese. Stroke. 2001;32(7):1481-1486. doi:10.1161/01.str.32.7.1481

207. Shkurat T., Romanov D., Pshenichnyy E., et al. Prevalence of mirnas in introns and cis-regulatory regions of genes of the somatotropic axis in mammals. American Journal of Applied Sciences. 2015;12(1): 1-7. https://doi.org/10.3844/ajassp.2015.L7

208. Shoeibi S. Diagnostic and theranostic microRNAs in the pathogenesis of atherosclerosis. Acta Physiol (Oxf). 2020;228(1):e13353. doi:10.1111/apha.13353

209. Sidorkiewicz M. Is microRNA-33 an Appropriate Target in the Treatment of Atherosclerosis?. Nutrients. 2023;15(4):902. doi:10.3390/nu15040902

210. Smith JG., Melander O., Lövkvist H., et al. Common genetic variants on chromosome 9p21 confers risk of ischemic stroke: a large-scale genetic association study. Circ Cardiovasc Genet. 2009;2(2):159-164. doi:10.1161/CIRCGENETICS.108.835173

211. Sobenin IA., Sazonova MA., Postnov AY., et al. Mitochondrial mutations are associated with atherosclerotic lesions in the human aorta. Clin Dev Immunol. 2012;2012:832464. doi:10.1155/2012/832464

212. Sobenin IA., Sazonova MA., Postnov AY., et al. Changes of mitochondria in atherosclerosis: possible determinant in the pathogenesis of the disease. Atherosclerosis. 2013;227(2):283-288. doi:10.1016/j.atherosclerosis.2013.01.006

213. Sobenin IA., Sazonova MA., Postnov AY., et al. Association of mitochondrial genetic variation with carotid atherosclerosis. PLoS One. 2013;8(7):e68070. doi:10.1371/journal.pone.0068070

214. Soehnlein O., Libby P. Targeting inflammation in atherosclerosis - from experimental insights to the clinic. Nat Rev Drug Discov. 2021;20(8):589-610. doi:10.1038/s41573-021-00198-1

215. Son DJ., Kumar S., Takabe W., et al. The atypical mechanosensitive microRNA-712 derived from pre-ribosomal RNA induces endothelial inflammation and atherosclerosis. Nat Commun. 2013;4:3000. doi:10.1038/ncomms4000

216. Song Y., Choi JE., Kwon YJ., et al. Identification of susceptibility loci for cardiovascular disease in adults with hypertension, diabetes, and dyslipidemia. J Transl Med. 2021;19(1):85. doi:10.1186/s12967-021-02751-3

217. Song Y., Li S., He C. PPARy Gene Polymorphisms, Metabolic Disorders, and Coronary Artery Disease. Front Cardiovasc Med. 2022;9:808929. doi: 10.3389/fcvm.2022. 808929

218. Spizzo R., Almeida MI., Colombatti A., Calin GA. Long non-coding RNAs and cancer: a new frontier of translational research?. Oncogene. 2012;31(43):4577-4587. doi:10.1038/onc.2011.621

219. Strassheim D., Karoor V., Stenmark K., Verin A, Gerasimovskaya E. A current view of G protein-coupled receptor - mediated signaling in pulmonary hypertension: finding opportunities for therapeutic intervention. Vessel Plus. 2018;2:29. doi:10.20517/2574-1209.2018.44

220. Suarez Y., Wang C., Manes TD., Pober JS. Cutting edge: TNF-induced microRNAs regulate TNF-induced expression of E-selectin and intercellular adhesion molecule-1 on human endothelial cells: feedback control of inflammation. J Immunol. 2010;184(1):21-25. doi:10.4049/jimmunol.0902369

221. Sufianov A., Begliarzade S., Ilyasova T., et al. MicroRNAs as prognostic markers and therapeutic targets in gliomas. Noncoding RNA Res. 2022;7(3): 171-177. doi:10.1016/j.ncrna.2022.07.001

222. Sun J, Sun Z, Gareev I, et al. Exosomal miR-2276-5p in Plasma Is a Potential Diagnostic and Prognostic Biomarker in Glioma. Front Cell Dev Biol. 2021;9:671202. doi:10.3389/fcell.2021.671202

223. Sun X., Icli B., Wara AK., et al. MicroRNA-181b regulates NF-KB-mediated vascular inflammation. J Clin Invest. 2012;122(6):1973-1990. doi:10.1172/JCI61495

224. Sweta S., Dudnakova T., Sudheer S., et al. Importance of Long Non-coding RNAs in the Development and Disease of Skeletal Muscle and Cardiovascular Lineages. Front Cell Dev Biol. 2019;7:228. doi:10.3389/fcell.2019.00228

225. Tabas I., Garcia-Cardena G., Owens GK. Recent insights into the cellular biology of atherosclerosis. J Cell Biol. 2015;209(1):13-22. doi: 10.1083/jcb.201412052

226. Tabaei S., Tabaee SS. Implications for MicroRNA involvement in the prognosis and treatment of atherosclerosis. Mol Cell Biochem. 2021;476(3):1327-1336. doi:10.1007/s11010-020-03992-4

227. Tabikhanova LE., Osipova LP., Voronina EN., et al. Polymorphism of lipid exchange genes in some populations of South and East Siberia. Vavilov Journal of Genetics and Breeding. 2019;23(8): 1011-1019. doi.org/10.18699/VJ19.578

228. Takenoshita Y., Tokito A., Jougasaki M. Inhibitory Effects of Eicosapentaenoic Acid on Vascular Endothelial Growth Factor-Induced Monocyte Chemoattractant Protein-1, Interleukin-6, and Interleukin-8 in Human Vascular Endothelial Cells. Int J Mol Sci. 2024;25(5):2749. doi:10.3390/ijms25052749

229. Tanashyan MM., Shabalina AA., Kuznetsova PI., Raskurazhev AA. miR-33a and Its Association with Lipid Profile in Patients with Carotid Atherosclerosis. Int J Mol Sci. 2023;24(7):6376. doi:10.3390/ijms24076376

230. Tao J., Xia L., Cai Z., et al. Interaction Between microRNA and DNA Methylation in Atherosclerosis. DNA Cell Biol. 2021;40(1):101-115. doi: 10.1089/dna.2020.6138

231. Taleb S. Inflammation in atherosclerosis. Arch Cardiovasc Dis. 2016;109(12):708-715. doi:10.1016/j.acvd.2016.04.002

232. Tang J., Fang X., Chen J., et al. Long Non-Coding RNA (lncRNA) in Oral Squamous Cell Carcinoma: Biological Function and Clinical Application. Cancers (Basel). 2021;13(23):5944. doi:10.3390/cancers13235944

233. Tang X., Luo YX., Chen HZ., Liu DP. Mitochondria, endothelial cell function, and vascular diseases. Front Physiol. 2014;5:175. doi: 10.3389/fphys.2014.00175

234. Tcheandjieu C., Zhu X., Hilliard AT., et al. Large-scale genome-wide association study of coronary artery disease in genetically diverse populations. Nat Med. 2022;28(8): 1679-1692. doi:10.1038/s41591-022-01891-3

235. Thomas AA., Feng B., Chakrabarti S. ANRIL: A Regulator of VEGF in Diabetic Retinopathy. Invest Ophthalmol Vis Sci. 2017;58(1):470-480. doi: 10.1167/iovs.16-20569

236. Timofeeva SV., Sherchkova TA., Shkurat TP. Associations between XRCC1 gene polymorphisms and atherosclerosis-induced diseases: a meta-analysis. Medical Genetics. 2022;21(6):49-58. (In Russ.) https://doi.org/10.25557/2073-7998.2022.06.49-58

237. Timofeeva SV., Sherchkova TA., Shkurat TP. Polymorphism rs2383207 of CDKN2B-AS and Susceptibility to Atherosclerosis: A Mini Review. Noncoding RNA. 2022;8(6):78. doi:10.3390/ncrna8060078

238. Titov BV., Osmak GJ., Matveeva NA., et al. Genetic risk factors for myocardial infarction more clearly manifest for early age of first onset. Mol Biol Rep. 2017;44(4):315-321. doi:10.1007/s 11033-017-4112-5

239. Turner AW, Wong D, Khan MD, et al. Multi-Omics Approaches to Study Long Non-coding RNA Function in Atherosclerosis. Front Cardiovasc Med. 2019;6:9. doi:10.3389/fcvm.2019.00009

240. Valverde-Hernandez JC., Flores-Cruz A., Chavarria-Soley G., et al. Frequencies of variants in genes associated with dyslipidemias identified in Costa Rican genomes. Front Genet. 2023;14:1114774. doi: 10.3389/fgene.2023.1114774

241. Vargas JN., Kar AN., Kowalak JA., et al. Axonal localization and mitochondrial association of precursor microRNA 338. Cell Mol Life Sci. 2016;73(22):4327-4340. doi: 10.1007/s00018-016-2270-6

242. Vartak T., Kumaresan S., Brennan E. Decoding microRNA drivers in atherosclerosis. Biosci Rep. 2022;42(7):BSR20212355. doi:10.1042/BSR20212355

243. Volobueva A., Grechko A., Yet SF., et al. Changes in Mitochondrial Genome Associated with Predisposition to Atherosclerosis and Related Disease. Biomolecules. 2019;9(8):377. doi:10.3390/biom9080377

244. Volpatti LR., de Matos SN., Borjas G., et al. LDL-Binding IL-10 Reduces Vascular Inflammation in Atherosclerotic Mice. Preprint. bioRxiv. 2024;2024.03.04.582839. doi:10.1101/2024.03.04.582839

245. Wang F., Su X., Liu C., et al. Prognostic Value of Plasma Long Noncoding RNA ANRIL for In-Stent Restenosis. Med Sci Monit. 2017;23:4733-4739. doi: 10.12659/msm.904352

246. Wang H., Tian Q., Zhang R., et al. Nobiletin alleviates atherosclerosis by inhibiting lipid uptake via the PPARG/CD36 pathway. Lipids Health Dis. 2024;23(1):76. doi: 10.1186/s12944-024-02049-5

247. Wang LP., Zhao LR., Cui HW., et al. Association between PPARy2 Pro12Ala polymorphism and myocardial infarction and obesity in Han Chinese in Hohhot, China. Genet Mol Res. 2012;11(3):2929-2938. doi: 10.4238/2012.May.18.13

248. Wang M., Cui B., Gong M., et al. Arctium lappa leaves based on network pharmacology and experimental validation attenuate atherosclerosis by targeting the AMPK-mediated PPARG/LXRa pathway. Biomed Pharmacother. 2022; 153:113 503. doi: 10.1016/j. biopha.2022.113503

249. Wang M., Gu J., Shen C., et al. Association of MicroRNA Biogenesis Genes Polymorphisms with Risk of Large Artery Atherosclerosis Stroke. Cell Mol Neurobiol. 2022;42(6): 1801-1807. doi:10.1007/s10571-021-01057-8

250. Wang S., Li K. MicroRNA-96 regulates RGC-5 cell growth through caspase-dependent apoptosis. Int J Clin Exp Med. 2014;7(10):3694-3702

251. Wang C., Sun T., Li H., et al. Lipoprotein lipase Ser447Ter polymorphism associated with the risk of ischemic stroke: a meta-analysis. Thromb Res. 2011;128(5):e107-e112. doi: 10.1016/j.thromres.2011.07.016

252. Wang H., Liu F., Zhao W., et al. High glucose promotes atherosclerosis by regulating miRNA let7d-5p level. J Diabetes Investig. 2024;15(6):711-724. doi: 10.1111/jdi.14180

253. Wang X., Baksh SS., Pratt RE., et al. Modifying miRs for effective reprogramming of fibroblasts to cardiomyocytes. Mol Ther Nucleic Acids. 2024;35(2):102160. doi:10.1016/j.omtn.2024.102160

254. Wang Y., Chen X., Lu Z., Lai C. Circ_0093887 regulated ox-LDL induced human aortic endothelial cells viability, apoptosis, and inflammation through modulating miR-758-3p/BAMBI axis in atherosclerosis. Clin Hemorheol Microcirc. 2022;81(4):343-358. doi: 10.3233/CH-221445

255. Weakley SM., Jiang J., Kougias P., et al. Role of somatic mutations in vascular disease formation. Expert Rev Mol Diagn. 2010;10(2): 173-185. doi: 10.1586/erm.10.1

256. Wei Y., Nazari-Jahantigh M., Neth P., et al. MicroRNA-126, -145, and -155: a therapeutic triad in atherosclerosis?. Arterioscler Thromb Vasc Biol. 2013;33(3):449-454. doi: 10.1161/ATVBAHA. 112.300279

257. Wojtasinska A., Fr^k W., Lisinska W., et al. Novel Insights into the Molecular Mechanisms of Atherosclerosis. Int J Mol Sci. 2023;24(17):13434. doi: 10.3390/ijms241713434

258. Wu J., Al-Zahrani A., Beylerli O., et al. Circulating miRNAs as Diagnostic and Prognostic Biomarkers in High-Grade Gliomas. Front Oncol. 2022;12:898537. doi: 10.3389/fonc.2022.898537

259. Wu W., Xiao H., Laguna-Fernandez A., et al. Flow-Dependent Regulation of Kruppel-Like Factor 2 Is Mediated by MicroRNA-92a. Circulation. 2011;124(5):633-641. doi: 10.1161/CIRCULATIONAHA. 110.005108

260. Wu X., Pan X., Zhou Y., et al. Identification of key genes for atherosclerosis in different arterial beds. Sci Rep. 2024;14(1):6543. doi:10.1038/s41598-024-55575-8

261. Xie L., Huang G., Gao M., et al. Identification of Atrial Fibrillation-Related lncRNA Based on Bioinformatic Analysis. Dis Markers. 2022;2022:8307975. doi: 10.1155/2022/8307975

262. Xu J., Murphy SL., Kockanek KD., Arias E. Mortality in the United States, 2018. NCHS Data Brief. 2020;(355):1-8.

263. Xu K., Saaoud F., Shao Y., et al. Early hyperlipidemia triggers metabolomic reprogramming with increased SAH, increased acetyl-CoA-cholesterol synthesis, and decreased glycolysis. Redox Biol. 2023;64:102771. doi: 10.1016/j.redox.2023.102771

264. Yamaguchi S., Yamada Y., Metoki N., et al. Genetic risk for atherothrombotic cerebral infarction in individuals stratified by sex or conventional risk factors for atherosclerosis. Int J Mol Med. 2006;18(5):871-883.

265. Yang C, Offen S, Saw J. What Is New in Spontaneous Coronary Artery Dissection?. CJC Open. 2023;6(2Part B):417-424. doi:10.1016/j.cjco.2023.10.007

266. Yang K., He YS., Wang XQ., et al. MiR-146a inhibits oxidized low-density lipoprotein-induced lipid accumulation and inflammatory response via targeting tolllike receptor 4. FEBS Lett. 2011;585(6):854-860. doi:10.1016/j.febslet.2011.02.009

267. Yang L., Li LP., Yi HC. DeepWalk based method to predict lncRNA-miRNA associations via lncRNA-miRNA-disease-protein-drug graph. BMC Bioinformatics. 2022;22(Suppl 12):621. doi:10.1186/s12859-022-04579-0

268. Yang S., Mi X., Chen Y., et al. MicroRNA-216a induces endothelial senescence and inflammation via Smad3/lKBa pathway. J Cell Mol Med. 2018;22(5):2739-2749. doi: 10.1111/jcmm.13567

269. Yang X., Li Y., Li Y., et al. Oxidative Stress-Mediated Atherosclerosis: Mechanisms and Therapies. Front Physiol. 2017;8:600. doi: 10.3389/fphys.2017.00600

270. Yang X., Liu H., Zhang Q., et al. MiR-96 promotes apoptosis of nucleus pulpous cells by targeting FRS2. Hum Cell. 2020;33(4):1017-1025. doi: 10.1007/s13577-020-00389-9

271. Yao J., Chen Y., Huang Y., et al. The role of cardiac microenvironment in cardiovascular diseases: implications for therapy. Hum Cell. 2024;37(3):607-624. doi:10.1007/s13577-024-01052-3

272. Yao X., Yan C., Zhang L., et al. LncRNA ENST00113 promotes proliferation, survival, and migration by activating PI3K/Akt/mTOR signaling pathway in atherosclerosis. Medicine (Baltimore). 2018;97(16):e0473. doi: 10.1097/MD.0000000000010473

273. Yu H., Cao H., Yu H. MicroRNA-98 inhibition accelerates the development of atherosclerosis via regulation of dysfunction of endothelial cell. Clin Exp Hypertens. 2023;45(1):2206068. doi:10.1080/10641963.2023.2206068

274. Yuepeng J., Zhao X., Zhao Y., Li L. Gene polymorphism associated with TNF-a (G308A) IL-6 (C174G) and susceptibility to coronary atherosclerotic heart

disease: A meta-analysis. Medicine (Baltimore). 2019;98(2):e13813. doi: 10.1097/MD.0000000000013813

275. Zago VHS., Parra ES., Virginio VWM., et al. Lipase C, Hepatic Type -250A/G (rs2070895) Variant Enhances Carotid Atherosclerosis in Normolipidemic and Asymptomatic Individuals from Brazil. Lipids. 2020;55(3):225-237. doi: 10.1002/lipd. 12232

276. Zhang J., Li S., Wu L., et al. Application of Dual-Layer Spectral-Detector Computed Tomography Angiography in Identifying Symptomatic Carotid Atherosclerosis: A Prospective Observational Study. J Am Heart Assoc. 2024;13(6):e032665. doi: 10.1161/JAHA.123.032665

277. Zhang L., Sui R.. Effect of SNP polymorphisms of EDN1, EDNRA, and EDNRB gene on ischemic stroke. Cell Biochem Biophys. 2014;70(1):233-239. doi:10.1007/s12013-014-9887-6

278. Zhang M., Yu Z., Zhao L., Luo H. Long non-coding RNA PVT1 regulates atherosclerosis progression via the microRNA-106b-5p/ACSL4 axis. Biochem Biophys Res Commun. 2023;667:170-179. doi:10.1016/j.bbrc.2023.05.037

279. Zhang RN., Shen F., Pan Q., et al. PPARGC1A rs8192678 G>A polymorphism affects the severity of hepatic histological features and nonalcoholic steatohepatitis in patients with nonalcoholic fatty liver disease. World J Gastroenterol. 2021;27(25):3863-3876. doi: 10.3748/wjg.v27.i25.3863

280. Zhang X., Rotllan N., Canfran-Duque A., et al. Targeted Suppression of miRNA-33 Using pHLIP Improves Atherosclerosis Regression. Circ Res. 2022;131(1):77-90. doi:10.1161/CIRCRESAHA.121.320296

281. Zhang X., Lv S., Guo C., et al. Gene-gene interaction between PPARG and CYP1A1 gene on coronary artery disease in the Chinese Han Population. Oncotarget. 2017;8(21):34398-34404. doi:10.18632/oncotarget. 16186

282. Zhou Y., Magi R., Milani L., Lauschke VM. Global genetic diversity of human apolipoproteins and effects on cardiovascular disease risk. J Lipid Res. 2018;59(10): 1987-2000. doi: 10.1194/jlr.P086710

283. Zhu N., Zhang D., Chen S., et al. Endothelial enriched microRNAs regulate angiotensin II-induced endothelial inflammation and migration. Atherosclerosis. 2011;215(2):286-293. doi:10.1016/j.atherosclerosis.2010.12.024

284. Zhu Y., Xian X., Wang Z., et al. Research Progress on the Relationship between Atherosclerosis and Inflammation. Biomolecules. 2018;8(3):80. Published 2018 Aug 23. doi:10.3390/biom8030080

285. Zorov DB, Juhaszova M, Sollott SJ. Mitochondrial reactive oxygen species (ROS) and ROS-induced ROS release. Physiol Rev. 2014;94(3):909-950. doi:10.1152/physrev.00026.2013

Статьи в журналах:

1. Timofeeva S.V. Polymorphism rs2383207 of CDKN2B-AS and susceptibility to atherosclerosis: a mini review. / Timofeeva S.V., Sherchkova T.A., Shkurat T.P. // Non Coding. — 2022. — Vol. 8. — №6. — P. 49-58.

2. Timofeeva S.V. Associations between XRCC1 gene polymorphisms and atherosclerosis-induced diseases: a meta-analysis / Timofeeva S.V., Sherchkova T.A., Shkurat T.P. // Medical Genetics. — 2022. — Vol. 21. — №6. — P. 4958.

3. Тимофеева С.В. Ассоциация полиморфизма rs1801282 гена PPARG с риском развития атеросклероза: Мета - анализ / Тимофеева С.В., Шкурат Т.П.// Живые и биокосные системы. — 2022. — Vol. 3. С. — 1-13.

4. Тимофеева С.В. Ассоциация полиморфизмов генов микроРНК MIR96, MIR758, MIR33a с атеросклерозом / Тимофеева С.В., Бутенко Е.В., Санникова Т.В., Шкурат Т.П // Медицинская генетика. - 2023.

5. Тимофеева С.В., Шерчкова Т.А., Шкурат Т.П. Полиморфизм гена ANRIL и предрасположенность к атеросклерозу. Медицинская генетика. 2023;22(4):32-37. https://doi.org/10.25557/2073-7998.2023.04.32-37

Тезисы конференций:

6. Shkurat T.P. MicroRNA binding sites in mitochondrial genes are associated with the progression of atherosclerosis / Shkurat T.P., Timofeeva S.V., Romanov D.E., Butenko E.V. // Annals Of The Academy Of Medicine, Singapore. — 2016. — T. 45 (suppl), № 9. — С. 174.

7. Тимофеева С.В. Изучение распределения микроРНК вокруг митохондриальных генов, ассоциированных с развитием атеросклероза / Тимофеева С.В. // XXIII Международная научная конференция студентов, аспирантов и молодых ученых "Ломоносов" (Москва, 11-15 апреля 2016г)

8. Butenko E.V. Lipid metabolism genes polymorphisms are assosiated with atherosclerotic status / Butenko E.V., Timofeeva S.V., Neskubina O., Shkurat

T.P. // International Young Scientists Conference "New trends in life science", Erevan, Armenia, 26-28 September 2016. - С. 40-41.

9. Timofeeva S.V. Inflammatory response and oxidative stress genes polymorphisms are assosiated with atherosclerotic status / Timofeeva S.V., Butenko E.V., Neskubina O., Potemkin D., Mashkina E.V. // International Young Scientists Conference "New trends in life science", Erevan, Armenia, 26-28 September 2016. - С. 69.

10. Timofeeva S.V. Oxidative stress and inflammation response genes in mirna-mediated mitochondrial and nuclear genome crosstalk associated with cardiovascular diseases / Timofeeva S.V., Butenko E.V., Romanov D.E., Shkurat T.P. // Atherosclerosis. - 2017 - V. 263 - P. - e202.

11. Тимофеева С.В. Оценка вклада полиморфных вариантов генов PON1 и EDN1 в развитие сердечно-сосудистых заболеваний. Тимофеева С.В., Бутенко Е.В. Международная научная конференция студентов, аспирантов и молодых ученых "Ломоносов" (Москва, 10-14 апреля 2017г)

12. Тимофеева С.В. Биоинформационное исследование микроРНК -регуляторов генов атеросклероза / Тимофеева С.В. // Генетика -фундаментальная основа инноваций в медицине и селекции, Ростов-на-Дону, 2-4 ноября 2017

13. Butenko E.V. The contribution of genetic variants to plasma lipid composition related to the atherosclerotic status / Butenko E.V., Timofeeva S.V., Derevyanchuk E.G., Shkurat T.P. // The 50th European Society of Human Genetics Conference, Copenhagen, Denmark, 27-30 May 2017. - P.E-P05.03.

14. Timofeeva S.V. Genetic effects of PPARG1C and TNF1 gene variants related to cardiovascular disorders / Timofeeva S.V., Butenko E.V., Derevyanchuk E.G., Neskubina O.M., Shkurat T.P. // The 50th European Society of Human Genetics Conference, Copenhagen, Denmark, 27-30 May 2017. - P. E-P05.24.

15. Timofeeva S.V. Association of heteroplasmy level of mitohondrial mutation m.13513g> in gene MT-ND5 with carotid atherosclerosis in russian population. / Timofeeva S.V., Butenko E.V., Derevyanchuk E.G., Shkurat T.P. // Atherosclerosis. - 2018 - V. 275 - P. - e186-e187.

16. Тимофеева С.В. Анализ межгенных взаимосвязей при раннем и позднем атеросклерозе в популяции ростовской области. Тимофеева С.В., Нескубина О.М., Бутенко Е.В., Шкурат Т.П. // VII Съезд Вавиловского Общества Генетиков И Селекционеров, Посвященный 100-Летию Кафедры Генетики СПБГУ, и Ассоциированные Симпозиумы, Санкт-Петербург, 18-22 июня 2019 года

17. Timofeeva S. Long coding RNA interaction with gene LDLR associated with atherosclerosis / Timofeeva S., Sherchkova T. // Материалы V Международной научной конференции "Генетика и биотехнология XXI века: проблемы, достижения, перспективы", Минск, 21-25 ноября 2022. - С. 158.

18. Timofeeva S.V. LNCRNA-HOXA-AS3 - MiRNA networkin atherosclerosis. Timofeeva S. V., Shkurat T.P. // Медицинская наука в эру цифровой трансформации Курск, 10 декабря 2022.

19. Тимофеева С.В. Ассоциация полиморфизмов генов микроРНК MIR96, MIR758 с атеросклерозом / Тимофеева С.В. // Материалы Международная научная конференции «Ломоносов-2023», Москва, 10-21 апреля 2023.

Патенты:

20. Патент на изобретение №2752363 C2, 26.07.2021. Способ прогнозирования высокого риска развития раннего атеросклероза. Тимофеева С.В., Нескубина О.М., Амелина М.А., Бутенко Е.В., Шкурат Т.П. Заявка № 2019145642 от 30.12.2019.