Ассоциация полиморфных вариантов генов, влияющих на редокс-статус, с тяжестью течения COVID-19 тема диссертации и автореферата по ВАК РФ 00.00.00, кандидат наук Ид Муэз

• Ид Муэз
• кандидат наук
• 2025

Оглавление диссертации кандидат наук Ид Муэз

ОГЛАВЛЕНИЕ

СПИСОК СОКРАЩЕНИЙ

ВВЕДЕНИЕ

ГЛАВА 1 ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ

1.1. Механизмы окислительного стресса при вирусных инфекциях

1.2. Анализ генетических вариаций, ассоциированных с тяжестью течения СОУГО-19 в различных популяциях мира

1.3. Роль некодирующих РНК в тяжести течения COVID-19

ГЛАВА 2 МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ ИССЛЕДОВАНИЯ

2.1. Дизайн исследования

2.2. Анализ баз данных

2.3. Формирование групп пациентов

2.4. Характеристики генов и полиморфизмов исследования

2.5. Молекулярно-генетические методы

2.5.1. Выделение тотальной ДНК

2.5.2. Выявление БМР генов методом аллель-специфично полимеразной цепной реакциию

2.6. Биохимические методы исследования

2.6.1. Определение параметров гидропероксид-индуцированной люминол-активированной хемилюминесценции (ГЛХЛ)

2.6.2. Определение оксидазной активности церулоплазмина

2.6.3. Определение суммарной пероксидазной активности (СПА)

2.6.4. Определение активности супероксиддисмутазы / супероксидустраняющей активности (СОД/СУА)

2.6.5.Определение активности каталазы/скорости утилизации пероксида водорода

2.7. Статистическая обработка результатов

ГЛАВА 3 РЕЗУЛЬТАТЫ ИССЛЕДОВАНИЯ И ИХ ОБСУЖДЕНИЕ

3.1. Биохимические показатели окислительного стресса у пациентов с легкой и тяжелой формой COVID-19

3.2. Анализ роли полиморфных локусов генов супероксиддисмутазы SOD1 и SOD2 у пациентов с легкой и тяжелой формой COVID-19

3.2.1. Анализ распределения частот генотипов и аллелей полиморфных локусов генов супероксиддисмутазы SOD1 и SOD2 и их ассоциации с тяжестью течения COVID-19

3.2.2. Анализ межгенных взаймодействий и сочетанных аллелей полиморфных локусов генов супероксиддисмутазы SOD1 и SOD2 у пациентов с легкой и тяжелой формой COVID-19

3.3. Анализ роли полиморфных локусов генов антиоксидантных ферментов, связанных с глутатионом GSTP1 и GPX4 у пациентов с легкой и тяжелой формой COVID-19

3.3.1. Анализ распределения частот генотипов и аллелей полиморфных локусов генов антиоксидантных ферментов, связанных с глутатионом GSTP1 и GPX4 и их ассоциации с тяжестью течения COVID-19

3.3.2. Анализ межгенных взаймодействий и сочетанных аллелей полиморфных локусов генов антиоксидантных ферментов, связанных с глутатионом GSTP1 и GPX4 у пациентов с легкой и тяжелой формой COVID-19

3.4. Анализ роли полиморфных локусов других генов, влияющих на редокс-статус, CAT, PON1, NRF2, NOS3, MPO у пациентов с легкой и тяжелой формой COVID-19

3.4.1. Анализ распределения частот генотипов и аллелей полиморфного локуса гена CAT rslüül 179 (-262 С>Т) и его ассоциация с тяжестью течения COVID-19

3.4.2. Анализ распределения частот генотипов и аллелей полиморфного локуса гена PON1 rs662 (А5750) и его ассоциация с тяжестью течения COVID-19

3.4.3. Анализ распределения частот генотипов и аллелей полиморфного локуса гена NRF2 rs6721961 (-617 G>T) и его ассоциация с тяжестью течения COVID-19

3.4.4. Анализ распределения частот генотипов и аллелей полиморфного локуса гена NOS3 rs2070744 (-786 T> C) и его ассоциация с тяжестью течения COVID-19

3.4.5. Анализ распределения частот генотипов и аллелей полиморфного локуса гена MPO rs2333227 (-463 C> T) и его ассоциация с тяжестью течения COVID-19

3.4.6. Анализ межгенных взаймодействий полиморфных локусов генов CAT, PON1, NRF2, NOS3, и MPO у пациентов с легкой и тяжелой формой COVID-19

3.5. Анализ роли полиморфных локусов генов некодирующих РНК, регулирующих редокс-статус: микроРНК MIR125A и днРНК H19 у пациентов с легкой и тяжелой формой COVID-19

3.5.1. Анализ распределения частот генотипов и аллелей полиморфного

локуса гена микроРНК MIR125A rs12976445 (T>C) и его ассоциации с

тяжестью течения COVID-19

3.5.2. Анализ распределения частот генотипов и аллелей полиморфного локуса гена днРНК Н19 гб217727 (С>Т) и его ассоциации с тяжестью течения

COVID-19

3.5.3. Анализ межгенных взаймодействий полиморфных локусов генов MIR125A и H19 у пациентов с легкой и тяжелой формой COVID-19

3.6. Анализ межгенных взаймодействий всех изученных полиморфных локусов генов у пациентов с легкой и тяжелой формой COVID-19

3.7. Анализ неравновесия по сцеплению изученных полиморфных локусов гена GSTP1 у пациентов COVID-19 в Ростовской области

3.8. Анализ ассоциаций полиморфных локусов с биохимическими показателями окислительного стресса

ЗАКЛЮЧЕНИЕ

ВЫВОДЫ

СПИСОК ЛИТЕРАТУРЫ

СПИСОК СОКРАЩЕНИЙ

COVID-19 - Коронавирусное заболевание

SARS-CoV-2 - Тяжелый острый респираторный синдром коронавирус

ОС - Окислительный стресс

АФК - Активные формы кислорода

АФА - Активные формы азота

GWAS - Полногеномный исследование ассоциаций

GST - Глутатион S-трансферазы

SNP - Однонуклеотидный полиморфизм

АОС - Антиоксидантная система

СОД - Супероксиддисмутазы

GPx - Глутатионпероксидазы

ОРДС - Острый респираторный дистресс-синдром

ГЛХЛ - Гидропероксид-индуцированная люминол-активированная хемилюминесценция

СОД/СУА - Активность СОД / супероксидустраняющая активность VH202 - Активность каталазы/скорость утилизации перекиси водорода СПА - Суммарная пероксидазная активность КТ - Компьютерная томография ОШ - Отношения шансов

ДИ - Доверительный интервал ЦП - Церулоплазмина CAT - Каталаза

GSTP1 - Глутатион S-трансфераза Пи1 GPX4 - Глутатионпероксидаза 4 P0N1 - Параоксоназа

N0S3 - Эндотелиальная синтаза оксида азота MPO - Миелопероксидаза

NRF2 - Ядерный фактор, связанный с эритроидом 2 фактор

ВВЕДЕНИЕ

Введение диссертации (часть автореферата) на тему «Ассоциация полиморфных вариантов генов, влияющих на редокс-статус, с тяжестью течения COVID-19»

Актуальность избранной темы

Коронавирусное заболевание 2019 (COVID-19), вызванное коронавирусом (SARS-CoV-2), быстро распространилось по миру и привело к развитию пандемии (Sharma et al., 2020). По состоянию на 28 апреля 2024 г. во всем мире зарегистрировано более 775 миллионов подтвержденных случаев заболевания и более 7 миллионов смертей (https: //data.who .int/dashboards/covid 19/ - 28 апреля 2024 г.). Из них в Российской Федерации подтверждено более 24 миллионов случаев заболевания и 400 тысяч смертей. Пандемия нанесла серьезный удар по системе здравоохранения, экономическому прогрессу и социальной сплоченности во всем мире (Yuan et al., 2023). У пациентов с COVID-19 наблюдался широкий спектр симптомов: от бессимптомных случаев до тяжелой инфекции с серьезными осложнениями и смертью (Arjmand et al., 2023).

Окислительный стресс, представляющий собой дисбаланс между выработкой свободных радикалов и способностью системы антиоксидантной защиты к детоксикации образующихся активных формах кислорода и азота, рассматривается как ключевой фактор патогенеза инфекции COVID-19 (Черняк и др., 2020). Ткани повреждаются из-за перепроизводства активных форм кислорода (АФК) клетками иммунной системы. Прооксидантные цитокины, такие как TNF-a (фактор некроза опухоли-альфа), также высвобождаются активированными фагоцитами (Wieczfinska et al., 2022). Неконтролируемый воспалительный процесс усиливает окислительный стресс, который, в свою очередь, способствует выработке цитокинов воспалительными клетками (Wieczfinska et al., 2022).

Генетический полиморфизм хозяина играет важную роль в восприимчивости и/или тяжести различных вирусных инфекций, включая COVID-19 (Dieter et al., 2022a). Генетический полиморфизм может влиять на

8

многие процессы, такие как проникновение и репликация SARS-CoV-2, а также иммунный ответ хозяина. Таким образом, в патогенезе COVID-19 может участвовать комбинация нескольких генов (Dieter et al., 2022a), в том числе гены, кодирующие белки, так и гены некодирующих РНК (Gilyazova et al., 2023). На сегодняшний день проведено множество исследований ассоциации между генетическими полиморфизмами и COVID-19. Степень разработанности темы

В крупномасштабных исследованиях генетических ассоциаций, охватывающих как редкие, так и распространенные генетические локусы, использовались различные дизайны исследований и определения нескольких фенотипов заболеваний для идентификации нескольких геномных областей, ассоциированных с COVID-19. Наряду с множеством последующих исследований, эти результаты расширили понимание этиологии заболеваний и открыли пути лечения COVID-19 (Niemi et al., 2022). Например, крупное исследование «случай-контроль» было проведено путем сравнения данных последовательностей экзома от пациентов с опасным для жизни течением COVID-19, с данными от пациентов с легким или бессимптомным течением (Zhang et al., 2020). Они сосредоточились на 13 генах-кандидатах, ранее связанных с моногенными иммунологическими нарушениями или участвующих в этих путях, и пришли к выводу, что по меньшей мере 3,5% пациентов с опасной для жизни пневмонией, вызванной COVID-19, имели генетические дефекты в некоторых из этих генов, участвующих в пути 1го типа интерферона (Zhang et a!., 2020). Результаты полногеномного исследования ассоциаций (GWAS) оказались важной отправной точкой для различения генетических локусов, которые влияют на восприимчивость к инфекции SARS-CoV-2, и тех, которые повышают риск развития тяжелой формы заболевания COVID-19 (Niemi et al., 2022). По данным Каталога GWAS, было проведено 274 исследований, содержащих 4208

9

полиморфных локусов, ассоциированных с тяжестью течения COVID-19 (https://www.ebi.ac.uk/gwas/search?query=COVID-19 ; 8 июля 2024 г.).

В связи с тем, что окислительный стресс играет роль в патогенезе COVID-19, важно изучить генетические механизмы, связанные с окислительным стрессом, и их вклад в патологию COVID-19. На данный момент опубликовано несколько генетических исследований с участием пациентов с COVID-19, в которых основное внимание уделяется генетическому полиморфизму генов, ассоциированных с окислительным стрессом (Tsermpini et al., 2022, Kaidashev et al., 2021). Например, гены, кодирующие суперсемейство глутатион S-трансфераз (GST), были одними из наиболее изученных генов для оценки их потенциальной ассоциации с восприимчивостью и тяжестью заболевания COVID-19 (Coric et al., 2021). В целом полиморфные локусы генов, ассоциированные с окислительным стрессом, были изучены в различных популяциях с целью выявления их ассоциации с риском тяжёлого течения COVID-19. Однако полученные результаты оказались противоречивыми, что обуславливает важность проведения данных исследований ассоциации полиморфных локусов генов в каждой популяции.

Объект и предмет исследования

Объектами исследования послужили образцы крови больных COVID-19. 351 пациент с COVID-19 были разделены на 2 группы в зависимости от тяжести симптомов (208 пациентов с легкой и 143 пациента с тяжелой формой COVID-19). Группы исследования были классифицированы в соответствии с рекомендациями Министерства здравоохранения Российской Федерации (временные методические рекомендации - профилактика, диагностика и лечение новой коронавирусной инфекции (COVID-19)). Информированное согласие было

получено от всех участников исследования. Образцы крови были взяты в медицинском центре «Наука» (Ростов-на-Дону, Российская Федерация).

Предмет исследования - генетические характеристики больных COVID-19, в том числе генетические полиморфные локусы белок-кодирующих генов, включая: SOD1 rs4998557, SOD2 rs4880, CAT rs1001179, GSTP1 rs1695, GSTP1 rs1138272, GPX4 rs713041, NOS3 rs2070744, PON1 rs662, NRF2 rs6721961, MPO rs2333227, и генетические полиморфные локусы генов некодирующих РНК: MIR125A rs12976445 и H19 rs217727.

Цель исследования

Изучить ассоциацию полиморфных локусов генов ферментов антиоксидантной защиты, прооксидантов, генов микроРНК и длинной некодирующей РНК, принимающих участие в регуляции редокс-зависимых механизмов, с тяжестью течения COVID-19, и оценить их межгенные взаимодействия и ассоциации с биохимическими показателями окислительного статуса у пациентов Ростовской области.

Задачи исследования

1. Исследовать распределение частот аллелей и генотипов полиморфных локусов белок кодирующих генов, влияющих на редокс-статус: SOD1 rs4998557, SOD2 rs4880, CAT rs1001179, GSTP1 rs1695,GSTP1 rs1138272, GPX4 rs713041, NOS3 rs2070744, PON1 rs662,NRF2 rs6721961, MPO rs2333227 у жителей Ростовской области и изучить их ассоциации с тяжестью течения COVID-19.

2. Исследовать распределение частот аллелей и генотипов полиморфных локусов генов некодирующих РНК, регулирующих редокс-статус: микроРНК MIR125A rs12976445 и днРНК H19 rs217727 у жителей Ростовской области и изучить их ассоциации с тяжестью течения COVID-19.

3. Исследовать межгенные взаимодействия полиморфных локусов изученных генов и определить значимые модели для изменения риска тяжести течения СОУГО-19 у жителей Ростовской области.

4. Определить значимые сочетания генотипов полиморфных локусов изученных генов для прогноза риска тяжёлого течения СОУГО-19 в исследуемой популяции.

5. Изучить ассоциации полиморфных локусов, влияющих на редокс-статус, с биохимическими показателями окислительного стресса.

Научная новизна работы

Впервые проведен комплексный анализ ассоциации полиморфных локусов различных генов, влияющих на редокс-статус, с тяжестью течения СОУГО-19 у жителей Ростовской области. Среди исследованных полиморфных локусов генов установлены новые генетические маркеры тяжести течения СОУГО-19 в исследуемой прпуляции. Впервые выявлены значимые ассоциации полиморфных локусов белок кодирующих генов PON1 гб662, SOD2 гб4880, GPX4 гб713041, NOS3 ^2070744 и MPO гб2333227 с тяжестью течения СОУГО-19.

Впервые проведен анализ ассоциации полиморфных локусов генов некодирующих РНК, регулирующих экспрессию генов ферментов редокс-статуса, с тяжестью течения СОУГО-19 в исследуемых группах пациентов. Впервые выявлена ассоциация полиморфного локуса гена днРНК H19 с повышением риска тяжелого течения СОУГО-19.

Впервые выполнен всесторонний анализ межгенных взаимодействий исследованных полиморфных локусов генов в исследуемых группах больных СОУГО-19. В результате были получены данные о значимом вкладе межгенных взаимодействий в повышение риска тяжелого течения СОУГО-19. В ходе анализа была определена четырехлокусная модель межгенных взаимодействий генов SOD2, PON1, NRF2, и H19, которая показала значимый вклад в тяжесть течения

12

СОУГО-19 и может быть использована для прогнозирования риска тяжелой формы заболевания.

Впервые проведен анализ ассоциации полиморфных локусов, влияющих на редокс-статус, с биохимическими показателями окислительного стресса в исследуемых группах больных СОУГО-19 и выявлены ассоциации полиморфного локуса ге4880 БОБ2 со снижением активности СОД/СУА и с повышением светосуммы быстрой вспышки ГЛХЛ у пациентов с тяжелым течением заболевания.

Теоретическая значимость и практическая ценность работы

Теоретическая значимость данного исследования проявляется в выявлении роли полиморфных локусов генов-кандидатов и их межгенных взаимодействий в риске тяжести течения СОУГО-19 у жителей Ростовской области. Результаты исследования открывают перспективы для более детального изучения вклада генов антиоксидантных ферментов в тяжесть течения СОУГО-19.

Данные исследования распределения частот аллелей и генотипов полиморфных локусов, изученных в данной работы, были использованы для создания базы данных генотипирования. Получено свидетельство о государственной регистрации базы данных № 2024622849 под названием: «Полиморфные варианты генов антиоксидантных ферментов у пациентов с разной степенью тяжести СОУГО-19» : № 2024621583, предоставляющей ценный ресурс для статистического анализа на основе информации о больных СОУГО-19 в Ростовской области.

Генетические маркеры, показавшие статистически значимую ассоциацию с тяжестью течения инфекции, могут претендовать на включение в диагностические панели для оценки индивидуального генетического риска тяжелого состояния у пациентов с СОУГО-19. Полученные результаты предоставляют основу для дальнейших исследований, направленных на

13

выявление патологических механизмов участия белок-кодирующих и белок-некодирующих генов в тяжести течения COVID-19. Методология и методы исследования

Данное исследование было выполнено на выборке пациентов с COVID-19 среди жителей Ростовской области (n=351), которая включила 143 пациентов с тяжелым течением COVID-19 и 208 пациентов с легким течением заболевания. Молекулярно-генетические исследования, включая выделение ДНК и генотипирование полиморфных локусов генов методом аллель-специфичной полимеразной цепной реакции, проводились в лаборатории биологии развития и организации генома на кафедре генетики в Академии биологии и биотехнологии им. Д.И. Ивановского Южного федерального университета в г. Ростове-на-Дону. Тотальную геномную ДНК выделяли из лейкоцитов сорбентным методом. Генотипирование включенных SNP осуществлялось с помощью аллель-специфической ПЦР (АС-ПЦР). Обнаружение амплифицированной ДНК осуществлялось в реальном времени или с помощью электрофореза. Для проведения ПЦР использовали прибор QuantStudio™ 5 (Applied Biosystems, США). Биохимические исследования включали спектрофотометрические методы. Оптическую плотность измеряли с использованием спектрофотометра DU-800 (Beckman Coulter, США). Для биоинформатического анализа данных применяли ресурсы: NCBI, Ensembl, Genecards, SNPedia, miRTarBase, LncRNA2Target, и LncRNADisease. Программный комплекс IBM SPSS Statistics 27.0 (IBM, Армонк, США) был использован для обработки полученных результатов исследования. Для исключения эффекта небольшого размера выборки точный критерий Фишера был использован. Пост-хок анализ статистической мощности проводили для исключения возможности ошибок первого типа и подтверждения ассоциации. Алгоритм Multifactor Dimensionality Reduction MDR 3.0.2 использовался для изучения межгенных взаимодействий.

14

Применена поправка Бонферрони с целью исключения статистических ошибок при множественных сравнениях. Положения, выносимые на защиту

1. Полиморфные локусы белок-кодирующих генов, влияющих на редокс-статус, rs4880 SOD2, rs713041 GPX4, rs662 PON1, rs2070744 NOS3 и rs2333227 MPO ассоциированы с тяжестью течения COVID-19.

2. Полиморфный локус гена днРНК rs217727 H19 ассоциирован с тяжестью течения COVID-19.

3. Значимый вклад в тяжесть течения COVID-19 вносит взаимодействие полиморфных локусов генов SOD2, PON1, NRF2 и H19.

4. Сочетания генотипов полиморфных локусов генов SOD2, PON1, NRF2 и H19 можно использовать для прогнозирования риска тяжелого течения COVID-19.

5. Риск тяжелого течения COVID-19 повышается при сдвиге динамического равновесия прооксидантов - антиоксидантов, обусловленном гомозиготным генотипом по минорному аллелю полиморфного локуса rs4880 SOD2, который приводит к снижению активности СОД и повышению уровня АФК.

Степень достоверности и апробация результатов

Степень достоверности результатов подтверждается репрезентативностью выборок пациентов с COVID-19 для исследования, применением современных методов молекулярно-генетического анализа, методов генетико-статистического анализа данных. Результаты настоящего исследования были представлены на V Международной научной конференции «Генетика и биотехнология XXI века: проблемы, достижения, перспективы» в Государственном научном учреждении « Институт генетики и цитологии, Национальной академии наук Беларуси» (21 -25 ноября 2022 года, г. Минск, Республика Беларусь), Европейской конференции

генетики человека (European Society of Human Genetics - ESHG) (10-13 июня 2023 года, г. Глазго, Шотландия, Великобритания, Гибридная конференция), XI Международной научно-практической конференции «Молекулярная диагностика» (14 ноября 2023 года, г. Москва), Международной конференции студентов, аспирантов и молодых ученых «Ломоносов-2024» «Московский государственный университет имени М. В. Ломоносова» (12-26 апреля 2024 года, г. Москва), и Международном Конгрессе «VIII Съезд Вавиловского общества генетиков и селекционеров, посвященный 300-летию российской науки и высшей школы» (14-19 июня 2024 года, г. Саратов). Личный вклад автора

Диссертантом лично осуществлен поиск и комплексный анализ данных зарубежной и Российской литературы по теме диссертационной работы. Диссертант самостотельно провёл этапа молекулярно-генетические исследования (выделение геномной ДНК из образцов венозной крови, а также генотипирование полиморфных локусов генов, влияющих на редокс-статус). Диссертант проводил генетико-статистический анализ данных, и далее, -интерпретацию полученных результатов, сопоставление с отечественной и зарубежной литературой. Диссертантом лично подготовлены рукопись и автореферат диссертации. Публикации

По теме диссертационного исследования опубликовано 10 печатных работ, в том числе 4 статьи в журналах из перечня рецензируемых научных изданий, рекомендованных ВАК РФ, и 1 статья в научных изданиях, включенных в мировые базы научного цитирования (Web of Science, Scopus). Получено регистрационное удостоверение на базу данных. Структура и объем диссертации

Диссертация представлена на 180 страницах машинописного текста и имеет следующую структуру: оглавление, список сокращений, введение, обзор литературы, материалы и методы исследования, результаты и их обсуждение, заключение, выводы и список литературы. Диссертационная работа включает 44 рисунка и 23 таблицы. Библиографический список включает в себя 246 литературных источников.

Финансовая поддержка работы

Исследование выполнено при финансовой поддержке Министерства науки и высшего образования РФ в рамках государственного задания в сфере научной деятельности № FENW-2023-0018.

ГЛАВА 1 ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ 1.1. Механизмы окислительного стресса при вирусных инфекциях

Окислительный стресс и антиоксидантная система

Окислительный стресс (ОС) — дисбаланс окислительно-восстановительного гомеостаза, вызванный увеличением выработки активных форм кислорода (АФК) и/или снижением антиоксидантной защиты (Рисунок 1). АФК в основном производятся как побочные продукты клеточного метаболизма (Щулькин и Филимонова, 2020). Некоторыми из основных АФК являются гидроксильные радикалы (•OH), супероксид (O2^-) и перекись водорода (H2O2) (Цейликман и Лукин, 2022). Существуют также активные формы азота (АФА), образующиеся в результате ассоциации молекул азота с кислородом, такие как пероксинитрит (ONOO-), продукт реакции между оксидом азота (•NO) и супероксидом (O2^-).

Умеренные уровни АФК участвуют во многих важных клеточных процессах (Sies, 2019). Они играют роль во внутриклеточной передаче сигналов, выступая в качестве вторичных мессенджеров, тем самым опосредуя рост клеток, иммунную функцию, аутофагию и общую окислительно-восстановительную регуляцию (Даренская и др, 2020). Однако ОС, вызванная перепроизводством АФК, оказывает вредное воздействие на клеточные компоненты, такие как нуклеиновые кислоты, белки и липиды (Щулькин и Филимонова, 2020). Важными источниками АФК являются митохондрии, эндоплазматический ретикулум и пероксисомы, которые способствуют окислительному стрессу (García-Sánchez et al., 2020). Другие источники также включают семейство NOX, ксантиноксидазу/ксантиндегидрогеназу (XO/XDH), миелопероксидазу (MPO), цитохром P450, синтазу оксида азота (NOS) и фосфолипазу A2 (Patel, 2016).

Рисунок 1 - в нормальных физиологических условиях существует баланс между свободными радикалами и антиоксидантами, и любое отклонение от него может

вызвать окислительный стресс

Для поддержания гомеостаза и защиты клеток от вредного воздействия окислительного стресса, в живом организме есть комплексная антиоксидантная система (АОС) (Чанчаева и др., 2013). Защитные механизмы включают неферментные компоненты (например, глутатион, витамин С) и эндогенные антиоксидантные ферменты (например, каталаза, супероксиддисмутаза) (Рыбакова и др., 2022). Антиоксидантные ферменты представляют собой важный механизм защиты от окислительного стресса, вызванного АФК. К ним относятся супероксиддисмутаза, каталаза, глутатион-Б-трансфераза, глутатионпероксидаза

и другие важные ферменты, которые играют роль в балансировании окислительно-восстановительного статуса в организме (1ошоуае1 а1., 2023).

Супероксиддисмутазы (СОД), семейство ферментативных антиоксидантов, защищают клетки от окислительного стресса, нейтрализуя супероксидный радикал на перекись водорода и молекулярный кислород (Lewandowski et а1., 2020). Изоформы СОД у человека включают цитозольную Си-7п-зависимую (СОД1), митохондриальную Мп-зависимую (СОД2) и внеклеточную (СОД3) (ЕикшапёЦвЫо-Рикш, 2011).

Каталаза - один из важнейших антиоксидантных ферментов, встречающихся в аэробных организмах. Фермент расщепляет две молекулы перекиси водорода на две молекулы воды и одну молекулу кислорода (Кап&е! а1., 2019).

Глутатионпероксидазы (GPxs) представляют собой семейство ферментов, содержащих селеноцистеин в активном центре и обладающих пероксидазной активностью (ЬиЬоБ е1 а1., 2011). GPx восстанавливает гидроперекиси липидов до спиртов, а перекись водорода до воды (Lubos е1 а1., 2011). Глутатион-Б-трансферазы представляют собой многофункциональные ферменты, которые детоксицируют ксенобиотики и эндогенные метаболиты, катализируя их конъюгацию с восстановленным глутатионом (GSH) (Ыапеу1сИе1 а1., 2013). В нескольких исследованиях показаны их антиоксидантные и противовоспалительные роли, а также их участие в регуляции сигнальных путей (РЦева-Егсе§оуас е1 а1., 2018).

Параоксоназы (РОК) представляют собой семейство ферментов, состоящее из трёх членов— РОШ, РОШ и РО№ (Боровкова и др., 2017). Параоксоназа 1 (РОШ) — кальций-зависимый гидролитический фермент, наиболее популярный из семейства параоксоназ (Shunmoogam et а!., 2018). РОШ обладает

20

антиоксидантными свойствами за счет снижения окисленных липидов в липопротеинах низкой плотности (ЛПНП) и липопротеинах высокой плотности (ЛПВП), а также ингибирования перекисного окисления липопротеинов (Grzegorzewska et а1., 2021). Схема АФК представлена на рисунке 2, и их характеристики в таблице 1.

Рисунок 2 - АФК и окислительный стресс (Jiang et al., 2021). NOX - семейство НАДФН-оксидаз; АФК - активные формы кислорода; NOS - синтаза оксида азота; СОД - супероксиддисмутаза; PRX - пероксиредоксин; КАТ - каталаза; GPX — глутатионпероксидаза; H2O2 - перекись водорода; ОН - гидроксидные радикалы. Реакция Фентона —реакция, в которой перекись водорода превращается в свободный гидроксильный радикал посредством

каталитического процесса. 21

Таблица 1 - АФК и их характеристики (Das and Roychoudhury, 2014)

АФК Механизм действия Антиоксидантная система против АФК

Супероксид (O2^-) Реагирует с соединениями, содержащими двойную связь, такими как (Бе-Б) белки Супероксиддисмутазы (СОД)

Гидроксильные радикалы (•OH) Чрезвычайно реактивен со всеми биомолекулами. Флавоноиды и пролин

Перекись водорода (H2O2) Окисляет белки и образует •ОН через О2^- Каталаза (CAT), пероксидазы (POXs) и флавоноиды

Синглетный кислород (1O2) Окисляет белки и ДНК Каротиноиды и а-токоферол

Механизмы окислительного стресса

Существует два основных механизма, посредством которых окислительный стресс способствует развитию заболеваний. Первый предполагает образование реактивных форм во время окислительного стресса, которые непосредственно окисляют макромолекулы, включая мембранные липиды, структурные белки, ферменты и нуклеиновые кислоты, что приводит к нарушению функции клеток и их гибели (Forman and Zhang, 2021). Второй

механизм окислительного стресса - аберрантная окислительно-восстановительная передача сигналов (Forman and Zhang, 2021).

ОС связан с широким спектром патологий, включая сердечно-сосудистые заболевания, нейродегенеративные заболевания, сахарный диабет и рак (Ngo and Duennwald, 2022). На основании вклада ОС в этиологию этих патологий они были сгруппированы в две категории: ОС как основная причина патологии и ОС как вторичный фактор, способствующий прогрессированию заболевания (Forman and Zhang, 2021). Однако, поскольку роль окислительного стресса во многих заболеваниях до конца не изучена, эта классификация является предварительной (Forman and Zhang, 2021).

Схематическое изображение связи АФК с окислительным стрессом и их воздействием на организм человека представлено на рисунке 3.

Рисунок 3 - Схематическое изображение связи между АФК, окислительным стрессом и их воздействием на организм человека (Sharifi-Rad et al., 2020). Изменение химических реакций на клеточном уровне приводит к появлению свободных радикалов и перекисей, поражающих внутриклеточные структуры -белки, липиды, ДНК, с нарушением внутренних механизмов на этом уровне.

Свободные радикалы обычно образуются в организме под воздействием внешних факторов, таких как загрязнение окружающей среды, курение сигарет, или внутренних, когда снижается антиоксидантная активность

Роль окислительного стресса в патогенезе вирусов широко изучается в связи с появлением доказательств перепроизводства АФК во время вирусных инфекций (Camini et al., 2017). Образование АФК, вызванное инфекцией, может влиять на несколько клеточных процессов, включая воспалительные реакции, иммунные функции и апоптоз (Reshi et al., 2014). Патогенез некоторых вирусов включает нарушение баланса редокс-статуса и индукцию окислительного стресса, который, в свою очередь, облегчает определенные этапы жизненного цикла вируса и активирует воспалительную реакцию (Checconi et al., 2020). В этом контексте многие исследования подчеркнули важность редокс-чувствительных путей как новых клеточных мишеней для терапии, направленной на блокирование репликации вируса и вызванного вирусом воспаления (Checconi et al., 2020).

Оксиданты, индуцированные вирусной инфекцией, включают NO, O2-,OH и их побочные продукты, такие как H2O2 (Zhang et al., 2014). Оксиданты могут способствовать модуляции клеточных ответов, регуляции репликации и патогенеза вируса (Zhang et al., 2014). В основном, вирусы влияют на окислительно-восстановительный баланс клеток, увеличивая количество окислителей, таких как супероксид и оксид азота, и ингибируют синтез

антиоксидантных ферментов, таких как СОД, каталаза и глутатионпероксидазы (Camini et al., 2017).

Влияние окислительно-восстановительного статуса на патогенез заболеваний, в том числе вирусных инфекций, обусловила актуальность изучения вариаций оксидантно-антиоксидантной системы на всех уровнях, включая полиморфные локусы генов, кодирующих антиоксидантные ферменты (Eid et al., 2023).

В нескольких исследованиях была выявлена ассоциация однонуклеотидных полиморфизмов (SNP) генов, кодирующих антиоксидантные ферменты, с вирусными инфекциями (Birk, 2021). Особое внимание уделялось роли этих генетических полиморфизмов в патогенезе. Например, было продемонстрировано, что полиморфизм гена каталазы CAT rs1001179 (-262 C>T) может играть важную и защитную роль при инфекциях нижних дыхательных путей, связанных с респираторными вирусами, у детей, гетерозиготных или гомозиготных по минорному аллелю (Chamblisset al., 2020). Было обнаружено, что гомозиготность по дикому аллелю полиморфного локуса гена глутатионпероксидазы 1 GPxl SNP Pro198Leu (rs 1050450) значимо ассоциирована с тяжестью течения фиброза печени, вызванного вирусом гепатита С (ВГС) (Sousa et al., 2016).

Поскольку окислительный стресс является основным признаком вирусных инфекций, который вносит значимый вклад как в патофизиологию хозяина, так и в функцию и репликацию вируса (Birk, 2021), важность его изучения значимо возросла во время пандемии COVID-19, чтобы полностью понять патогенез этой новой инфекции. Биомаркеры окислительного стресса в развитии и тяжести COVID-19 представлены на рисунке 4.

Рисунок 4 - Биомаркеры окислительного стресса в развитии и тяжести COVID-19 (Tsermpini et al., 2022). Во время заражения SARS-CoV-2 уровни АФК повышаются, а дисбаланс между тиолами и дисульфидами приводит к перекисному окислению липидов. O2- преобразуется в H2O2 через SOD, который далее преобразуется в H2O и O2 через CAT. Образуются различные продукты перекисного окисления липидов (акролеин, 4-гидроксиноненаль (HNE), и малоновый диальдегид (MDA)). Гидропероксид липидов (LOOH) и перекись водорода (H2O2) восстанавливаются до липидных спиртов и воды соответственно с помощью глутатионпероксидаз (GPX). В этой ферментативной реакции восстановленный глутатион (GSH) превращается в дисульфид глутатиона, который затем регенерируется с помощью глутатионредуктазы (GR). Акролеин, HNE и MDA конъюгируются с глутатионом посредством

Список литературы диссертационного исследования кандидат наук Ид Муэз, 2025 год

СПИСОК ЛИТЕРАТУРЫ

1. Алексеев, А. В. Определение антиоксидантов методом активированной хемилюминесценции с использованием 2,2'-азо-бис(2-амидинопропана) / А. В. Алексеев, Е. В. Проскурнина, Ю. А. Владимиров // Вестник Московского университета. Серия 2: Химия. - 2012. - Т. 53, № 3. - С. 187193.

2. Боровкова, Н. В. Параоксоназа: универсальный фактор антиоксидантной защиты организма человека / Е. И. Боровкова, Н. В. Антипова, Т. В. Корнеенко [и др.] // Вестник Российской академии медицинских наук. -2017. - Т. 72, № 1. - С. 5-10. - DOI 10.15690/vramn764.

3. Бушуева, О. Ю. Генетические варианты rs1049255 CYBA и rs2333227 MPO ассоциированы с предрасположенностью к ишемической болезни сердца у русских жителей Центральной России / О. Ю. Бушуева // Кардиология. -2020. - Т. 60, № 10. - С. 47-54. - DOI 10.18087/cardio.2020.10.n1229.

4. Владимиров, Ю. А. Кинетическая хемилюминесценция как метод изучения реакций свободных радикалов / Ю. А. Владимиров, Е. В. Проскурнина, Д. Ю. Измайлов // Биофизика. - 2011. - Т. 56, № 6. - С. 1081-1090.

5. Владимиров, Ю. А. Свободные радикалы и клеточная хемилюминесценция / Ю. А. Владимиров, Е. В. Проскурнина // Успехи биологической химии. -2009. - Т. 49. - С. 341-388.

6. Гафарова, Л. М. Об особенностях применения критерия согласия Пирсона %2 / Л. М. Гафарова, И. Г. Завьялова, Н. Н. Мустафин // Экономические и социально-гуманитарные исследования. - 2015. - № 4(8). - С. 63-67.

7. Даренская, М. А. COVID-19: окислительный стресс и актуальность антиоксидантной терапии / М. А. Даренская, Л. И. Колесникова, С. И. Колесников // Вестник Российской академии медицинских наук. - 2020. -Т. 75, № 4. - С. 318-325. - DOI 10.15690/vramn1360.

8. Камышников, В. С. Справочник по клинико-биохимическим исследованиям и лабораторной диагностике / В. С. Камышников ; В. С. Камышников. - 3-е изд.. - Москва : МЕДпресс-информ, 2009. - 889 с.

9. Кантемирова, Б. И. Полиморфизм генов у больных новой коронавирусной инфекцией COVID-19 / Б. И. Кантемирова, В. В. Василькова // Инфекционные болезни: новости, мнения, обучение. - 2022. - Т. 11, № 3(42). - С. 130-137. - DOI 10.33029/2305-3496-2022-11-3-130-137.

10.Клебанов, Г. И. Антиоксидантные свойства производных 3-оксипиридина: мексидола, эмоксипина и проксипина / Г. И. Клебанов, О. Б. Любицкий, О.

B. Васильева [и др.] // Вопросы медицинской химии. - 2001. - Т. 47, № 3. -

C. 288-300.

11.Королюк, М. А. Метод определения активности каталазы / М. А. Королюк, Л. И. Иванова, И. Г. Майорова [и др.] // Лабораторное дело. - 1988. - № 1. - С. 16-19.

12.Лукаш, А.И. , Внуков В.В., Ананян А.А. и др. Металлосодержащие соединения плазмы крови при гипербарической оксигенации / А. И. Лукаш,

B. В. Внуков, А. А. Ананян [и др.] // Экспериментальные и клинические аспекты. - 1996. - C. 88.

13.Рыбакова, Л. П. Окислительно-антиокислительная система организма человека, роль в развитии патологического процесса и его коррекции (ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ) / Л. П. Рыбакова, Л. Р. Алексанян, С. И. Капустин,

C. С. Бессмельцев // Вестник гематологии. - 2022. - Т. 18, № 4. - С. 26-37.

14.Сирота, Т. В. Новый подход в исследовании процесса аутоокисления адреналина и использование его для измерения активности супероксиддисмутазы / Т. В. Сирота // Вопросы медицинской химии. -1999. - Т. 45, № 3. - С. 263-272.

15.Цейликман, В. Э. Влияние окислительного стресса на организм человека / В. Э. Цейликман, А. А. Лукин // Международный научно-исследовательский журнал. - 2022. - № 3-1(117). - С. 206-211. - DOI 10.23670/IRJ.2022.117.3.037.

16.Чанчаева, Е. А. Современное представление об антиоксидантной системе организма человека / Е. А. Чанчаева, Р. И. Айзман, А. Д. Герасев // Экология человека. - 2013. - № 7. - С. 50-58.

17. Черняк, Б. В. COVID-19 и окислительный стресс / Б. В. Черняк, Е. Н. Попова, А. С. Приходько [и др.] // Биохимия. - 2020. - Т. 85, № 12. - С. 1816-1828. - DOI 10.31857/S0320972520120064.

18.Шестаков, В. А. Хемилюминесценция плазмы крови в присутствии перекиси водорода / В. А. Шестаков, И. О. Бойчевская, М. П. Шерстнев // Вопросы медицинской химии. - 1979. - № 25. - С. 132-137.

19.Шкурат, Т. П. Генетическая эпидемиология полногеномных ассоциативных исследований с тяжестью течения COVID-19 (обзор GWAS исследований) / Т. П. Шкурат, М. Ид, А. А. Шкетик [и др.] // Живые и биокосные системы. - 2024. - № 48. - DOI 10.18522/2308-9709-2024-48-4.

20.Щулькин, А. В. Роль свободно-радикального окисления, гипоксии и их коррекции в патогенезе COVID-19 / А. В. Щулькин, А. А. Филимонова // Терапия. - 2020. - Т. 6, № 5(39). - С. 187-194. - DOI 10.18565/therapy.2020.5.187-194.

21.Abobaker, A. The impact of certain genetic variants (single nucleotide polymorphisms) on incidence and severity of COVID-19 / A. Abobaker, T. Nagib, A. Alsoufi // The Journal of Gene Medicine. - 2021. - Vol. 23, No. 2. -DOI 10.1002/jgm.3310.

22.Ali, R. M. Effect of polymorphisms CYP17 (rs743572), SOD2 (rs4880) and CAT (rs1001179) on hormonal profile and redox status of blood serum and follicular

147

fluid in patients with polycystic ovary syndrome / R. M. Ali, S. V. Lomteva, A. A. Aleksandrova [et al.] // Gene Reports. - 2023. - Vol. 33. - P. 101817. - DOI 10.1016/j.genrep.2023.101817.

23. Ali-Osman, F. Molecular cloning, characterization, and expression in Escherichia coli of full-length cDNAs of three human glutathione S-transferase Pi gene variants. Evidence for differential catalytic activity of the encoded proteins / F. Ali-Osman, O. Akande, G. Antoun [et al.] // The Journal of biological chemistry. - 1997. - Vol. 272, No. 15. - P. 10004-10012. - DOI 10.1074/jbc.272.15.10004.

24.Arjmand, B. Critical roles of cytokine storm and bacterial infection in patients with COVID-19: therapeutic potential of mesenchymal stem cells / B. Arjmand, S. Alavi-Moghadam, M. Sarvari [et al.] // Inflammopharmacology. - 2023. - Vol. 31, No. 1. - P. 171-206. - DOI 10.1007/s10787-022-01132-6.

25. Asano, T. X-linked recessive TLR7 deficiency in~ 1% of men under 60 years old with life-threatening COVID-19 / T. Asano, B. Boisson, F. Onodi [et al.] // Science immunology. - 2021. - Vol. 6, No. 62. - P. eabl4348. - DOI 10.1126/sciimmunol.abl4348.

26.Asselta, R. ACE2 and TMPRSS2 variants and expression as candidates to sex and country differences in COVID-19 severity in Italy / R. Asselta, E. M. Paraboschi, A. Mantovani [et al.] // Aging. - 2020. - Vol. 12, No. 11. - P. 1008710098. - DOI 10.18632/aging.103415.

27.Attur, M. Interleukin-1 Receptor Antagonist Gene (IL1RN) Variants Modulate the Cytokine Release Syndrome and Mortality of COVID-19 / M. Attur, Ch. Petrilli, S. Adhikari [et al.] // Journal of Infectious Diseases. - 2024. - Vol. 229, No. 6. - P. 1740-1749. - DOI 10.1093/infdis/jiae031.

28.Bach, H. A. Genetic variations of antioxidant genes and their association with male infertility in Vietnamese men / H. A. Bach, P. N. Vu, T. H. T. Ma [et al.] //

Journal of clinical laboratory analysis. - 2023. - Vol. 37, No. 2. - P. e24829. -DOI 10.1002/jcla.24829.

29.Barbosa, P. The Role of rs713041 Glutathione Peroxidase 4 (GPX4) Single Nucleotide Polymorphism on Disease Susceptibility in Humans: A Systematic Review and Meta-Analysis / P. Barbosa, N. F. Abo El-Magd, J. Hesketh [et al.] // International Journal of Molecular Sciences. - 2022. - Vol. 23, No. 24. - P. 15762. - DOI 10.3390/ijms232415762.

30.Bastard, P. Autoantibodies neutralizing type I IFNs are present in~ 4% of uninfected individuals over 70 years old and account for~ 20% of COVID-19 deaths / P. Bastard, A. Gervais, T. Le Voyer [et al.] // Science immunology. -2021. - Vol. 6, No. 62. - P. eabl4340. - DOI 10.1126/sciimmunol.abl4340.

31.Beltrán-García, J. Oxidative Stress and Inflammation in COVID-19-Associated Sepsis: The Potential Role of Anti-Oxidant Therapy in Avoiding Disease Progression / J. Beltrán-García, R. Osca-Verdegal, F. V. Pallardó [et al.] // Antioxidants (Basel, Switzerland). - 2020. - Vol. 9, No. 10. - P. 936. - DOI 10.3390/antiox9100936.

32.Bergara-Muguruza, L. lncRNA involvement in immune-related diseases - from SNP association to implication in pathogenesis and therapeutic potential / L. Bergara-Muguruza, A. Castellanos-Rubio, I. Santin [et al.] // Journal of Translational Genetics and Genomics. - 2023. - Vol. 7, No. 4. - P. 213-229. -DOI 10.20517/j tgg.2023.14.

33.Bermano, G. Evidence that a polymorphism within the 3'UTR of glutathione peroxidase 4 is functional and is associated with susceptibility to colorectal cancer / G. Bermano, V. Pagmantidis, N. Holloway [et al.] // Genes & nutrition. - 2007. - Vol. 2, No. 2. - P. 225-232. - DOI 10.1007/s12263-007-0052-3.

34.Birk, R. Nutrigenetics of antioxidant enzymes and micronutrient needs in the context of viral infections / R. Birk // Nutrition Research Reviews. - 2021. - Vol. 34, No. 2. - P. 174-184. - DOI 10.1017/S0954422420000244.

35.Boldin, M. P. miR-146a is a significant brake on autoimmunity, myeloproliferation, and cancer in mice / M. P. Boldin, K. D. Taganov, D. S. Rao [et al.] // The Journal of experimental medicine. - 2011. - Vol. 208, No. 6. - P. 1189. - DOI 10.1084/jem.20101823.

36.Booth, A. Population risk factors for severe disease and mortality in COVID-19: A global systematic review and meta-analysis / A. Booth, A. B. Reed, S. Ponzo [et al.] // PloS one. - 2021. - Vol. 16, No. 3. - P. e0247461. - DOI 10.1371/journal.pone.0247461.

37.Bouligand, J. Effect of NFE2L2 genetic polymorphism on the association between oral estrogen therapy and the risk of venous thromboembolism in postmenopausal women / J. Bouligand, O. Cabaret, M. Canonico [et al.] // Clinical pharmacology and therapeutics. - 2011. - Vol. 89, No. 1. - P. 60-64. -DOI 10.1038/clpt.2010.241.

38.Buraczynska, K. Genetic determination of TNF and myeloperoxidase production in dialyzed patients with diabetic nephropathy / K. Buraczynska, M. Koziol-Montewka, M. Majdan [et al.] // Renal failure. - 2004. - Vol. 26, No. 6. - P. 633639. - DOI 10.1081/jdi-200037165.

39.Cai, T. Polymorphisms in MIR499A and MIR125A gene are associated with autoimmune thyroid diseases / T. Cai, J. Li, X. An [et al.] // Molecular and cellular endocrinology. - 2017. - Vol. 440. - P. 106-115. - DOI 10.1016/j.mce.2016.11.017.

40.Camini, F. C. Implications of oxidative stress on viral pathogenesis / F. C. Camini, C. C. Da Silva Caetano, L. T. Almeida, C. L. De Brito Magalhaes //

Archives of Virology. - 2017. - Vol. 162, No. 4. - P. 907-917. - DOI 10.1007/s00705-016-3187-y.

41.Campochiaro, C. The conundrum of interleukin-6 blockade in COVID-19 / C. Campochiaro, L. Dagna // The Lancet Rheumatology. - 2020. - Vol. 2, No. 10.

- P. e579-e580. - DOI 10.1016/S2665-9913(20)30287-3.

42.Castellani, L. W. Transgenic mice express human MPO -463G/A alleles at atherosclerotic lesions, developing hyperlipidemia and obesity in -463G males / L. W. Castellani, J. J. Chang, X. Wang [et al.] // Journal of lipid research. - 2006.

- Vol. 47, No. 7. - P. 1366-1377. - DOI 10.1194/jlr.M600005-JLR200.

43.Castillo-Tong, D. C. Association of myeloperoxidase with ovarian cancer / D. C. Castillo-Tong, A. Reinthaller, E. Schuster [et al.] // Tumor Biology. - 2014. - Vol. 35, No. 1. - P. 141-148. - DOI 10.1007/s13277-013-1017-3.

44.Chambliss, J. M. A polymorphism in the catalase gene promoter confers protection against severe RSV bronchiolitis / J. M. Chambliss, M. Ansar, J. P. Kelley [et al.] // viruses. - 2020. - Vol. 12, No. 1. - P. 57. - DOI 10.3390/v12010057.

45.Checconi, P. Redox-modulating agents in the treatment of viral infections / P. Checconi, A. T. Palamara, M. De Angelis [et al.] // International Journal of Molecular Sciences. - 2020. - Vol. 21, No. 11. - P. 1-21. - DOI 10.3390/ijms21114084.

46. Chen, F. miR-125a Suppresses TrxR1 Expression and Is Involved in H2O2-Induced Oxidative Stress in Endothelial Cells / F. Chen, H. Liu, J. Wu, [et al.] // Journal of immunology research. - 2018. - Vol. 6140320. - DOI 10.1155/2018/6140320.

47. Cheng, J. Risk stratification by long non-coding RNAs profiling in COVID-19 patients / J. Cheng, X. Zhou, W. Feng [et al.] // Journal of cellular and molecular

medicine. - 2021. - Vol. 25, No. 10. - P. 4753-4764. - DOI 10.1111/jcmm.16444.

48. Choi, J. Y Iron intake, oxidative stress-related genes (MnSOD and MPO) and prostate cancer risk in CARET cohort / J. Y. Choi, C. C. Hong, C. B. Ambrosone [et al.] // Carcinogenesis. - 2008. - Vol. 29, No. 5. - P. 964-970. - DOI 10.1093/carcin/bgn056.

49.Chu, J. Superoxide dismutase alterations in COVID-19: implications for disease severity and mortality prediction in the context of omicron variant infection / J. Chu, L. Hua, X. Liu [et al.] // Frontiers in Immunology. - 2024. - Vol. 15. - DOI 10.3389/fimmu.2024.1362102.

50.Coric, V. GSTP1 and GSTM3 Variant Alleles Affect Susceptibility and Severity of COVID-19 / V. Coric, I. Milosevic, T. Djukic [et al.] // Frontiers in Molecular Biosciences. - 2021. - Vol. 8, No. APR. - P. 747493. - DOI 10.3389/fmolb.2021.747493.

51.Costa-Urrutia, P. Antioxidant Enzymes Haplotypes and Polymorphisms Associated with Obesity in Mexican Children / P. Costa-Urrutia, A. M. Flores-Buendia, I. Ascencio-Montiel [et al.] // Antioxidants (Basel, Switzerland). -2020. - Vol. 9, No. 8. - P. 684. - DOI 10.3390/antiox9080684.

52.COVID-19 Host Genetics Initiative. A second update on mapping the human genetic architecture of COVID-19 / COVID-19 Host Genetics Initiative // Nature. - 2023. - Vol. 621, No. 7977. - P. 7-26. - DOI 10.1038/s41586-023-06355-3.

53.COVID-19 Host Genetics Initiative. Mapping the human genetic architecture of COVID-19 / COVID-19 Host Genetics Initiative // Nature. - 2021. - Vol. 600, No. 7889. - P. 472-477. - DOI 10.1038/s41586-021-03767-x.

54. Crawford, A. Relationships between single nucleotide polymorphisms of antioxidant enzymes and disease / A. Crawford, D. P. Geraghty, D. A. Kunde [et

al.] // Gene. - 2012. - Vol. 501, No. 2. - P. 89-103. - DOI 10.1016/j.gene.2012.04.011.

55. Das, K. Reactive oxygen species (ROS) and response of antioxidants as ROS-scavengers during environmental stress in plants / K. Das, A. Roychoudhury // Frontiers in environmental science. - 2014. - Vol. 2. - P. 53. - DOI 10.3389/fenvs.2014.00053.

56.De la Monte, S. M. Nitric oxide synthase-3 overexpression causes apoptosis and impairs neuronal mitochondrial function: relevance to Alzheimer's-type neurodegeneration / S. M. de la Monte, J. Chiche, A. von dem Bussche [et al.] // Laboratory investigation; a journal of technical methods and pathology. - 2003. - Vol. 83, No. 2. - P. 287-298. - DOI 10.1097/01.lab.0000056995.07053.c0

57.Deng, Y Associations of lncRNA H19 Polymorphisms at MicroRNA Binding Sites with Glioma Susceptibility and Prognosis / Y. Deng, L. Zhou, J. Yao [et al.] // Molecular therapy. Nucleic acids. - 2020. - Vol. 20. - P. 86-96. - DOI 10.1016/j.omtn.2020.02.003.

58.Dieter, C. Genetic polymorphisms associated with susceptibility to COVID-19 disease and severity: A systematic review and meta-analysis / C. Dieter, L. A. Brondani, C. B. Leitao // PLoS One. - 2022. - Vol. 17, No. 7. - P. e0270627. -DOI 10.1371/journal.pone.0270627. (A).

59.Dieter, C. Polymorphisms in ACE1, TMPRSS2, IFIH1, IFNAR2, and TYK2 genes are associated with worse clinical outcomes in COVID-19 / C. Dieter, L. de Almeida Brondani, N. E. Lemos [et al.] // Genes. - 2022. - Vol. 14, No. 1. -P. 29. - DOI 10.3390/genes14010029. (B)

60.Ding, J. Current understanding on long non-coding RNAs in immune response to COVID-19 / J. Ding, J. Chen, X. Yin, J. Zhou // Virus Research. - 2023. - Vol. 323. - P. 198956. - DOI 10.1016/j.virusres.2022.198956.

61.Diniz, L. R. L. Natural Antioxidants: A Review of Studies on Human and Animal Coronavirus / L. R. L. Diniz, C. D. S. M. Bezerra Filho, B. C. Fielding [et al.] // Oxidative medicine and cellular longevity. - 2020. - Vol. 2020. - DOI 10.1155/2020/3173281.

62.Downes, D. J. Identification of LZTFL1 as a candidate effector gene at a COVID-19 risk locus / D. J. Downes, P. Hua, N. Roberts [et al.] // Nature Genetics. -2021. - Vol. 53, No. 11. - P. 1606-1615. - DOI 10.1038/s41588-021-00955-3.

63.Eid, M. A. The association of PON1 and NOS3 genetic variants with the severity of COVID-19 / M. A. Eid, A. A. Aleksandrova, M. A. Shkurat [et al.] // Gene Reports. - 2023 - Vol. 33. - DOI 10.1016/j.genrep.2023.101814.

64.Eid, M.A. Association of superoxide dismutase and catalase genetic variants and their gene-gene interactions with the severity of COVID-19 / Eid M.A, Aleksandrova A.A, Kosenko P.O [et al.] // Ecological genetics. - 2024. - Vol. 22, No. 3. - P. 255-264. - DOI 10.17816/ecogen632736. (a)

65.Eid, M. A. Effects of GSTP1 and GPX4 genetic variants and their gene-gene interaction on the severity of COVID-19 / M. A. Eid, A. A. Aleksandrova, S. A. Zatonsky [et al.] // Медицинская генетика. - 2024. - Vol. 23, No. 4. - P. 45-53. - DOI 10.25557/2073-7998.2024.04.45-53. (b)

66.Eid, M. Association of MIR125A and H19 genetic variants with the severity of COVID-19 / M. Eid, T. P. Shkurat // Live and Bio-abiotic Systems. - 2024. - No. 48. - DOI 10.18522/2308-9709-2024-48-3.

67.Ellinghaus, D. Genome wide association study of severe Covid-19 with respiratory failure / D. Ellinghaus, F. Degenhardt, L. Bujanda [et al.] // The New England journal of medicine. - 2020. - Vol. 383, No. 16. - P. 1522-1534. - DOI 10.1056/NEJMoa2020283.

68.Fadista, J. Shared genetic etiology between idiopathic pulmonary fibrosis and COVID-19 severity / J. Fadista, F. Geller, B. Feenstra [et al.] // EBioMedicine. -2021. - Vol. 65. - P. 103277. - DOI 10.1016/j.ebiom.2021.103277.

69.Fang, Zh. Ch. No association between myeloperoxidase gene rs2333227 G>A polymorphism and Alzheimer's disease risk: a meta-analysis and trial sequential analysis / Zh. Ch. Fang, Ch. Ch. Mao, Ya. Ju. Hu [et al.] // Journal of Integrative Neuroscience. - 2022. - Vol. 21, No. 1. - P. 032. - DOI 10.31083/j .jin2101032.

70.Farmohammadi, A. Association analysis of rs1695 and rs1138272 variations in GSTP1 gene and breast cancer susceptibility / A. Farmohammadi, V. Arab-Yarmohammadi, R. Ramzanpour // Asian Pacific journal of cancer prevention : APJCP. - 2020. - Vol. 21, No. 4. - P. 1167-1172. - DOI 10.31557/APJCP.2020.21.4.1167.

71.Farr, R. J. Altered microRNA expression in COVID-19 patients enables identification of SARS-CoV-2 infection / R. J. Farr, C. L. Rootes, G. G. Au [et al.] // PLoS Pathogens. - 2021. - Vol. 17, No. 7. - P. e1009759. - DOI 10.1371/journal.ppat.1009759.

72.Fernández-Pato, A. Plasma miRNA profile at COVID-19 onset predicts severity status and mortality / A. Fernández-Pato, A. Virseda-Berdices, S. Resino [et al.] // Emerging Microbes and Infections. - 2022. - Vol. 11, No. 1. - P. 676-688. -DOI 10.1080/22221751.2022.203 8021.

73.Flynn, J. M. SOD2 in mitochondrial dysfunction and neurodegeneration / J. M. Flynn, S. Melov // Free radical biology & medicine. - 2013. - Vol. 62. - P. 4-12.

- DOI 10.1016/j.freeradbiomed.2013.05.027.

74.Forman H. J. Targeting oxidative stress in disease: Promise and limitations of antioxidant therapy / H. J. Forman, H. Zhang // Nature Reviews Drug Discovery.

- 2021. - Vol. 20, No. 9. - P. 689-709. - DOI 10.1038/s41573-021-00233-1.

75.Fricke-Galindo, I. Genetics Insight for COVID-19 Susceptibility and Severity: A Review / I. Fricke-Galindo, R. Falfan-Valencia // Frontiers in Immunology. -

2021. - Vol. 12. - P. 622176. - DOI 10.3389/fimmu.2021.622176.

76.Fukai, T. Superoxide dismutases: Role in redox signaling, vascular function, and diseases / T. Fukai, M. Ushio-Fukai // Antioxidants and Redox Signaling. - 2011. - Vol. 15, No. 6. - P. 1583-1606. - DOI 10.1089/ars.2011.3999.

77.Fukui, M. Mitochondrial superoxide dismutase SOD2, but not cytosolic SOD1, plays a critical role in protection against glutamate-induced oxidative stress and cell death in HT22 neuronal cells / M. Fukui, B. T. Zhu // Free radical biology & medicine. - 2010. - Vol. 48, No. 6. - P. 821-830. - DOI 10.1016/j.freeradbiomed.2009.12.024.

78.Galasso, M. Browsing the oldest antioxidant enzyme: catalase and its multiple regulation in cancer / M. Galasso, S. Gambino, M. G. Romanelli [et al.] // Free radical biology & medicine. - 2021. - Vol. 172. - P. 264-272. - DOI 10.1016/j.freeradbiomed.2021.06.010.

79.Galasso, M. The rs1001179 SNP and CpG methylation regulate catalase expression in chronic lymphocytic leukemia / M. Galasso, E. Dalla Pozza, R. Chignola [et al.] // Cellular and Molecular Life Sciences. - 2022. - Vol. 79, No. 10. - P. 1-15. - DOI 10.1007/s00018-022-04540-7.

80.Gallagher, P. M. Association of IL-10 polymorphism with severity of illness in community acquired pneumonia / P. M. Gallagher, G. Lowe, T. Fitzgerald [et al.] // Thorax. - 2003. - Vol. 58, No. 2. - P. 154-156. - DOI 10.1136/thorax.58.2.154.

81. Gallegos-Arreola, M. P. SOD2 Gene Variants (rs4880 and rs5746136) and Their Association with Breast Cancer Risk / M. P. Gallegos-Arreola, R. Ramirez-Patino, J. Y. Sanchez-Lopez [et al.] // Current Issues in Molecular Biology. -

2022. - Vol. 44, No. 11. - P. 5221-5233. - DOI 10.3390/cimb44110355.

82.García-Sánchez, A. The Role of Oxidative Stress in Physiopathology and Pharmacological Treatment with Pro- And Antioxidant Properties in Chronic Diseases / A. García-Sánchez, A. G. Miranda-Díaz, E. G. Cardona-Muñoz // Oxidative Medicine and Cellular Longevity. - 2020. - Vol. 2020. - P. 2082145. - DOI 10.1155/2020/2082145.

83.Garg, A. Circulating cardiovascular microRNAs in critically ill COVID-19 patients / A. Garg, A. A. Derda, K. Xiao [et al.] // European Journal of Heart Failure. - 2021. - Vol. 23, No. 3. - P. 468-475. - DOI 10.1002/ejhf.2096.

84.Gautrey, H. A T/C polymorphism in the GPX4 3'UTR affects the selenoprotein expression pattern and cell viability in transfected Caco-2 cells / H. Gautrey, F. Nicol, A. A. Sneddon [et al.] // Biochimica et biophysica acta. - 2011. - Vol. 1810, No. 6. - P. 584-591. - DOI 10.1016/j.bbagen.2011.03.016.

85.Gems, D. Interpreting interactions between treatments that slow aging / D. Gems, S. Pletcher, L. Partridge // Aging cell. - 2002. - Vol. 1, No. 1. - P. 1-9. - DOI 10.1046/j.1474-9728.2002.00003.x.

86.Ghapanchi, J. The LncRNA H19 rs217727 Polymorphism Is Associated with Oral Squamous Cell Carcinoma Susceptibility in Iranian Population / J. Ghapanchi, Z. Ranjbar, M. J. Mokhtari [et al.] // BioMed research international. - 2020. - Vol. 1634252. - DOI 10.1155/2020/1634252.

87.Gilyazova, I. COVID-19: Mechanisms, risk factors, genetics, non-coding RNAs and neurologic impairments / I. Gilyazova, Ya. R. Timasheva, A. Karunas [et al.] // Non-Coding RNA Research. - 2023. - Vol. 8, No. 2. - P. 240-254. - DOI 10.1016/j.ncrna.2023.02.007.

88.Glotov, O. S. Genetic risk factors for the development of COVID-19 coronavirus infection / O. S. Glotov, A. N. Chernov, S. G. Scherbak [et al.] // Russian Journal of Genetics. - 2021. - Vol. 57, No. 8. - P. 878-892. - DOI 10.1134/S1022795421080056.

89.Gnasso, A. The Arg allele in position 192 of PON1 is associated with carotid atherosclerosis in subjects with elevated HDLs / A. Gnasso, C. Motti, C. Irace [et al.] // Atherosclerosis. - 2002. - Vol. 164, No. 2. - P. 289-295. - DOI 10.1016/s0021 -9150(02)00070-9.

90.Golabi, S. Oxidative Stress and Inflammatory Status in COVID-19 Outpatients: A Health Center-Based Analytical Cross-Sectional Study / S. Golabi, S. Ghasemi, M. Adelipour [et al.] // Antioxidants. - 2022. - Vol. 11, No. 4. - DOI 10.3390/antiox11040606.

91.Goud, P. T. A multiple-hit hypothesis involving reactive oxygen species and myeloperoxidase explains clinical deterioration and fatality in covid-19 / P. T. Goud, D. Bai, H. M. Abu-Soud // International Journal of Biological Sciences. -2020. - Vol. 17, No. 1. - P. 62-72. - DOI 10.7150/ijbs.51811.

92.Green, P. S. Neuronal expression of myeloperoxidase is increased in Alzheimer's disease /P. S. Green, A. J. Mendez, J. S. Jacob [et al.] // Journal of neurochemistry. - 2004. - Vol. 90, No. 3. - P. 724-733. - DOI 10.1111/j.1471-4159.2004.02527.x.

93.Grundler, F. Interplay between oxidative damage, the redox status, and metabolic biomarkers during long-term fasting / F. Grundler, F. Wilhelmi De Toledo, R. Mesnage [et al.] // Food and Chemical Toxicology. - 2020. - Vol. 145. - P. 111701. - DOI 10.1016/j.fct.2020.111701.

94.Grzegorzewska, A. E. Paraoxonase 1 concerning dyslipidaemia, cardiovascular diseases, and mortality in haemodialysis patients / A. E. Grzegorzewska, P. Adamska, E. Iwanczyk-Skalska [et al.] // Scientific Reports. - 2021. - Vol. 11, No. 1. - DOI 10.1038/s41598-021-86231-0.

95.Guimaraes, L. M. F. Implications of SARS-Cov-2 infection on eNOS and iNOS activity: Consequences for the respiratory and vascular systems / L. M. F.

Guimaraes, C. V. T. Rossini, C. Lameu [et al.] // Nitric oxide : biology and chemistry. - 2021. - Vol. 111-112. P. 64-71. - DOI 10.1016/j.niox.2021.04.003.

96.Gümü§, H. Oxidative stress and decreased Nrf2 level in pediatric patients with COVID-19 / H. Gümü§, T. Erat, I. Öztürk [et al.] // Journal of Medical Virology. - 2022. - Vol. 94, No. 5. - P. 2259-2264. - DOI 10.1002/jmv.27640.

97.Guo, Q. Y LncRNA H19 polymorphisms associated with the risk of OSCC in Chinese population / Q. Y. Guo, H. Wang, Y Wang // European review for medical and pharmacological sciences. - 2017. - Vol. 21, No. 17. - P. 3770-3774.

98.Hancock, L. A. Muc5b overexpression causes mucociliary dysfunction and enhances lung fibrosis in mice / L. A. Hancock, C. E. Hennessy, G. M. Solomon [et al.] // Nature Communications. - 2018. - Vol. 9, No. 1. - P. 1-10. - DOI 10.1038/s41467-018-07768-9.

99.Hayakawa, K. MicroRNA-766-3p contributes to anti-inflammatory responses through the indirect inhibition of NF-kB signaling / K. Hayakawa, M. Kawasaki, T. Hirai [et al.] // International journal of molecular sciences. - 2019. - Vol. 20, No. 4. - P. 809. - DOI 10.3390/ijms20040809.

100. Hekimi, S. Why only time will tell / S. Hekimi, C. Benard, R. Branicky [et al.] // Mechanisms of ageing and development. - 2001. - Vol. 122, No. 7. - P. 571-594. - DOI 10.1016/s0047-6374(01 )00218-4.

101. Henderson, L. A. On the alert for cytokine storm: immunopathology in COVID-19 / L. A. Henderson, S. W. Canna, G. S. Schulert [et al.] // Arthritis & rheumatology. - 2020. - Vol. 72, No. 7. - P. 1059-1063. - DOI 10.1002/art.41285.

102. Herengt, A. Nrf2 in viral infection / A. Herengt, J. Thyrsted, C. K. Holm // Antioxidants. - 2021. - Vol. 10, No. 9. - DOI 10.3390/antiox10091491.

103. Hoffmann, M. SARS-CoV-2 Cell Entry Depends on ACE2 and TMPRSS2 and Is Blocked by a Clinically Proven Protease Inhibitor / M. Hoffmann, H.

159

Kleine-Weber, S. Pöhlmann [et al.] // Cell. - 2020. - Vol. 181, No. 2. - P. 271-280.e8. - DOI 10.1016/j.cell.2020.02.052.

104. Hornung, V. OAS proteins and cGAS: unifying concepts in sensing and responding to cytosolic nucleic acids / V. Hornung, R. Hartmann, A. Ablasser [et al.] // Nature Reviews Immunology. - 2014. - Vol. 14, No. 8. - P. 521-528. - DOI 10.1038/nri3719.

105. Horowitz, J. E. Genome-wide analysis provides genetic evidence that ACE2 influences COVID-19 risk and yields risk scores associated with severe disease / J. E. Horowitz, J. A. Kosmicki, A. Damask [et al.] // Nature Genetics. -2022. - Vol. 54, No. 4. - P. 382-392. - DOI 10.1038/s41588-021-01006-7.

106. Hu, Y. Two common SNPs in pri-miR-125a alter the mature miRNA expression and associate with recurrent pregnancy loss in a Han-Chinese population / Y. Hu, C. M. Liu, L. Qi [et al.] // RNA biology. - 2011. - Vol. 8, No. 5. - P. 861-872. - DOI 10.4161/rna.8.5.16034.

107. Huang, G. Z. The GSTP1 A1578G polymorphism and the risk of childhood acute lymphoblastic leukemia: results from an updated meta-analysis / G. Z. Huang, W. Shan, L. Zeng [et al.] // Genetics and molecular research : GMR. -2013. - Vol. 12, No. 3. - P. 2481-2491. - DOI 10.4238/2013.July.24.3.

108. Huang, Y Y. Association between the Genetic Variants of Glutathione Peroxidase 4 and Severity of Endometriosis / Y. Y. Huang, C. H. Wu, C. H. Liu [et al.] // International journal of environmental research and public health. -2020. - Vol. 17, No. 14. - P. 5089. - DOI 10.3390/ijerph17145089.

109. Huckriede, J. Histone H3 Cleavage in Severe COVID-19 ICU Patients / J. Huckriede, F. de Vries, M. Hultström [et al.] // Frontiers in cellular and infection microbiology. - 2021. - Vol. 11. - P. 694186. - DOI 10.3389/fcimb.2021.694186.

110. Huffman, J. E. Multi-ancestry fine mapping implicates OAS1 splicing in risk of severe COVID-19 / J. E. Huffman, G. M. Peloso, G. Butler-Laporte [et

160

al.] // Nature Genetics. - 2022. - Vol. 54, No. 2. - P. 125-127. - DOI 10.1038/s41588-021-00996-8.

111. Hussain, M. Structural variations in human ACE2 may influence its binding with SARS-CoV-2 spike protein / M. Hussain, N. Jabeen, F. Raza [et al.] // Journal of medical virology. - 2020. - Vol. 92, No. 9. - P. 1580-1586. - DOI 10.1002/jmv.25832.

112. Hyndman, M. E. The T-786-->C mutation in endothelial nitric oxide synthase is associated with hypertension / M. E. Hyndman, H. G. Parsons, S. Verma [et al.] // Hypertension. - 2002. - Vol. 39, No. 4. - P. 919-922. - DOI 10.1161/01.hyp.0000013703.07316.7f.

113. Inoue, Y Associations of single nucleotide polymorphisms in precursor-microRNA (miR)-125a and the expression of mature miR-125a with the development and prognosis of autoimmune thyroid diseases / Y. Inoue, M. Watanabe, N. Inoue [et al.] // Clinical and experimental immunology. - 2014. -Vol. 178, No. 2. - P. 229-235. - DOI 10.1111/cei.12410.

114. Iorio, M. V. MicroRNA gene expression deregulation in human breast cancer / M. V. Iorio, M. Ferracin, C. G. Liu [et al.] // Cancer research. - 2005. -Vol. 65, No. 16. - P. 7065-7070. - DOI 10.1158/0008-5472.CAN-05-1783.

115. Jablonska, E. Lipid peroxidation and glutathione peroxidase activity relationship in breast cancer depends on functional polymorphism of GPX1 / E. Jablonska, J. Gromadzinska, B. Peplonska [et al.] // BMC Cancer. - 2015. - Vol. 15, No. 1. - P. 1-12. - DOI 10.1186/s12885-015-1680-4.

116. Jaworska, K. A low selenium level is associated with lung and laryngeal cancers / K. Jaworska, S. Gupta, K. Durda [et al.] // PloS one. - 2013. - Vol. 8, No. 3. - P. e59051. - DOI 10.1371/journal.pone.0059051.

117. Jerotic, D. SOD2 rs4880 and GPX1 rs1050450 polymorphisms do not confer risk of COVID-19, but influence inflammation or coagulation parameters

161

in Serbian cohort / D. Jerotic, J. Ranin, Z. Bukumiric [et al.] // Redox Report. -2022. - Vol. 27, No. 1. - P. 85-91. - DOI 10.1080/13510002.2022.2057707.

118. Jiang S. Dietary regulation of oxidative stress in chronic metabolic diseases / S. Jiang, H. Liu, C. Li // Foods. - 2021. - Vol. 10, No. 8. - P. 1854. -DOI 10.3390/foods10081854.

119. Jiao, L. Association between miR-125a rs12976445 and survival in breast cancer patients / L. Jiao, J. Zhang, Y. Dong [et al.] // American journal of translational research. - 2014. - Vol. 6, No. 6. - P. 869-875.

120. Jomova, K. Reactive oxygen species, toxicity, oxidative stress, and antioxidants: Chronic diseases and aging / K. Jomova, R Raptova, S. Y. Alomar [et al.] // Archives of toxicology. - 2023. - Vol. 97, No. 10. - P. 2499-2574. -DOI 10.1007/s00204-023-03562-9.

121. Josephy, P. D. Oxidative activation of benzidine and its derivatives by peroxidases / P. D. Josephy // Environmental health perspectives. - 1985. - Vol. 64. - P. 171-178. - DOI 10.1289/ehp.8564171.

122. Juni, R. Dysregulation of cardiac endothelial lncRNA H19 in COVID19 patients induces endothelial dysfunction, which impairs cardiomyocyte function / R. Juni, P. Phelp, D. Bink [et al.] // Journal of Molecular and Cellular Cardiology. - 2022. - Vol. 173. - P. 121. - DOI 10.1016/j.yjmcc.2022.08.238.

123. Kaidashev, I. Host gene variability and SARS-CoV-2 infection: A review article / I. Kaidashev, O. Shlykova, O. Izmailova [et al.] // Heliyon. - 2021. - Vol. 7, No. 8. - P. e07863. - DOI 10.1016/j.heliyon.2021.e07863.

124. Kargapolova, Y. The enzymatic and non-enzymatic function of myeloperoxidase (Mpo) in inflammatory communication / Y. Kargapolova, S. Geißen, R. Zheng [et al.] // Antioxidants. - 2021. - Vol. 10, No. 4. - DOI 10.3390/antiox10040562.

125. Karkhanei, B. Evaluation of oxidative stress level: total antioxidant capacity, total oxidant status and glutathione activity in patients with COVID-19 / B. Karkhanei, E. Talebi Ghane, F. Mehri // New Microbes and New Infections. - 2021. - Vol. 42. - P. 100897. - DOI 10.1016/j.nmni.2021.100897.

126. Kasela, S. Integrative approach identifies SLC6A20 and CXCR6 as putative causal genes for the COVID-19 GWAS signal in the 3p21.31 locus / S. Kasela, Z. Daniloski, S. Bollepalli [et al.] // Genome Biology. - 2021. - Vol. 22, No. 1. - DOI 10.1186/s 13059-021 -02454-4.

127. Kellner, M. ROS Signaling in the Pathogenesis of Acute Lung Injury (ALI) and Acute Respiratory Distress Syndrome (ARDS) / M. Kellner, S. Noonepalle, Q. Lu [et al.] // Advances in experimental medicine and biology. - 2017. - Vol. 967. - P. 105-137. - DOI 10.1007/978-3-319-63245-2_8.

128. Kitoh, R. SOD1 gene polymorphisms in sudden sensorineural hearing loss / R. Kitoh, S. Y Nishio, K. Ogawa [et al.] // Acta oto-laryngologica. - 2016. -Vol. 136, No. 5. - P. 465-469. - DOI 10.3109/00016489.2015.1116047.

129. Kobayashi, E. H. Nrf2 suppresses macrophage inflammatory response by blocking proinflammatory cytokine transcription / E. H. Kobayashi, T. Suzuki, R. Funayama [et al.] // Nature communications. - 2016. - Vol. 7. - P. 11624. -DOI 10.1038/ncomms 11624.

130. Krueger, J. G. Tyrosine kinase 2 and Janus kinase-signal transducer and activator of transcription signaling and inhibition in plaque psoriasis / J. G. Krueger, I. B. Mcinnes, A. Blauvelt // Journal of the American Academy of Dermatology. - 2021. - DOI 10.1016/j.jaad.2021.06.869.

131. Laforge, M. Tissue damage from neutrophil-induced oxidative stress in COVID-19 / M. Laforge, C. Elbim, C. Frère [et al.] // Nature reviews. Immunology. - 2020. - Vol. 20, No. 9. - P. 515-6. - DOI 10.1038/s41577-020-0407-1.

132. Laha, S. In silico analysis of altered expression of long non-coding RNA in SARS-CoV-2 infected cells and their possible regulation by STAT1, STAT3 and interferon regulatory factors / S. Laha, C. Saha, S. Dutta [et al.] // Heliyon. -2021. - Vol. 7, No. 3. - DOI 10.1016/j.heliyon.2021.e06395.

133. Lee, J. S. Longitudinal proteomic profiling provides insights into host response and proteome dynamics in COVID-19 progression / J. S. Lee, D. Han, S. Y. Kim [et al.] // Proteomics. - 2021. - Vol. 21, No. 11-12. - P. e2000278. -DOI 10.1002/pmic.202000278.

134. Lehmann, T. P. rs12976445 variant in the pri-miR-125a correlates with a lower level of hsa-miR-125a and ERBB2 overexpression in breast cancer patients / T. P. Lehmann, K. Korski, M. Ibbs [et al.] // Oncology letters. - 2013. - Vol. 5, No. 2. - P. 569-573. - DOI 10.3892/ol.2012.1040.

135. Lewandowski, L. Alterations in concentration/activity of superoxide dismutases in context of obesity and selected single nucleotide polymorphisms in genes: SOD1, SOD2, SOD3 / L. Lewandowski, M. Kepinska, H. Milnerowicz // International Journal of Molecular Sciences. - 2020. - Vol. 21, No. 14. - P. 5069. - DOI 10.3390/ijms21145069.

136. Li, Z. A partition-ligation-combination-subdivision EM algorithm for haplotype inference with multiallelic markers: update of the SHEsis (http://analysis. bio-x. cn) / Z. Li, Z. Zhang, Z. He [et al.] // Cell research. - 2009. - Vol. 19, No. 4. - P. 519-523. - DOI 10.1038/cr.2009.33.

137. Liu, N. The impact of ABO blood group on COVID-19 infection risk and mortality: A systematic review and meta-analysis / N. Liu, T. Zhang, L. Ma [et al.] // Blood Reviews. - 2021. - Vol. 48. - P. 100785. - DOI 10.1016/j.blre.2020.100785.

138. Liu, T. Association between PON1 rs662 polymorphism and coronary artery disease / T. Liu, X. Zhang, J. Zhang [et al.] // European journal of clinical nutrition. - 2014. - Vol. 68, No. 9. - P. 1029-1035. - DOI 10.1038/ejcn.2014.105.

139. Lubos, E. Glutathione peroxidase-1 in health and disease: from molecular mechanisms to therapeutic opportunities / E. Lubos, J. Loscalzo, D. E. Handy // Antioxidants & Redox Signaling. - 2011. - Vol. 15, No. 7. - P.1957-199. - DOI 10.1089/ars.2010.3586.

140. Mahesh, G. MicroRNA-155: a master regulator of inflammation / G. Mahesh, R. Biswas // Journal of Interferon & Cytokine Research. - 2019. - Vol. 39, No. 6. - P. 321-330. - DOI 10.1089/jir.2018.0155.

141. Maki, R. A. Aberrant expression of myeloperoxidase in astrocytes promotes phospholipid oxidation and memory deficits in a mouse model of Alzheimer disease / R. A. Maki, R. C. Lyon, W. F. Reynolds [et al.] // Journal of Biological Chemistry. - 2009. - Vol. 284, No. 5. - P. 3158-3169. - DOI 10.1074/jbc.M807731200.

142. Manevich, Y. Allelic variants of glutathione S-transferase P1-1 differentially mediate the peroxidase function of peroxiredoxin VI and alter membrane lipid peroxidation / Y. Manevich, S.Hutchens, K.Tew [et al.] // Free radical biology & medicine. - 2013. - Vol. 54. - P. 62-70. - DOI 10.1016/j.freeradbiomed.2012.10.556.

143. Mann, M. An NF-KB-microRNA regulatory network tunes macrophage inflammatory responses / M. Mann, A. Mehta, J. L. Zhao // Nature communications. - 2017. - Vol. 8, No. 1. - P. 851. - DOI 10.1038/s41467-017-00972-z.

144. Marczak, E. D. Polymorphisms in the transcription factor NRF2 and forearm vasodilator responses in humans / E. D. Marczak, J. Marzec, D. C. Zeldin

[et al.] // Pharmacogenetics and genomics. - 2012. - Vol. 22, No. 8. - P. 620628. - DOI 10.1097/FPC.0b013e32835516e5.

145. Markovic, M. GPX3 Variant Genotype Affects the Risk of Developing Severe Forms of COVID-19 / M. Markovic, J. Ranin, Z. Bukumiric [et al.] // International Journal of Molecular Sciences. - 2023. - Vol. 24, No. 22. - P. 16151. - DOI 10.3390/ijms242216151.

146. Marzec, J. M. Functional polymorphisms in the transcription factor NRF2 in humans increase the risk of acute lung injury / J. M. Marzec, H. Y. Cho, S. R. Kleeberger [et al.] // FASEB Journal. - 2007. - Vol. 21, No. 9. - P. 2237-2246. -DOI 10.1096/fj.06-7759com.

147. Mashkina, E. V. The association of early pregnancy loss with polymorphism in xenobiotics detoxification genes / E. V. Mashkina, K. N. Saraev, E. V. Butenko [et al.] // American Journal of Applied Sciences. - 2015. - Vol. 12, No. 3. - P. 185-190. - DOI 10.3844/ajassp.2015.185.190.

148. Mehri, F. Changes in oxidative markers in COVID-19 patients / F. Mehri, A. H. Rahbar, E. T. Ghane [et al.] // Archives of medical research. - 2021. - Vol. 52, No. 8. - P. 843-849. - DOI 10.1016/j.arcmed.2021.06.004.

149. Meng, Q. MPO Promoter Polymorphism rs2333227 Enhances Malignant Phenotypes of Colorectal Cancer by Altering the Binding Affinity of AP-2a / Q. Meng, S. Wu, Y Wang [et al.] // Cancer research. - 2018. - Vol. 78, No. 10. - P. 2760-2769. - DOI 10.1158/0008-5472.CAN-17-2538.

150. Meydan, C. The Neat Dance of COVID-19: NEAT1, DANCR, and Co-Modulated Cholinergic RNAs Link to Inflammation / C. Meydan, N. Madrer, H. Soreq // Frontiers in Immunology. - 2020. - Vol. 11. - P. 590870. - DOI 10.3389/fimmu.2020.590870.

151. Meyer, N. J. A functional synonymous coding variant in the IL1RN gene is associated with survival in septic shock / N. J. Meyer, J. F. Ferguson, R. Feng

166

[et al.] // American journal of respiratory and critical care medicine. - 2014. -Vol. 190, No. 6. - P. 656-664. - DOI 10.1164/rccm.201403-05860c.

152. Mi, B. High miR-31-5p expression promotes colon adenocarcinoma progression by targeting TNS1 / B. Mi, Q. Li, T. Li [et al.] // Aging (Albany NY). - 2020. - Vol. 12, No. 8. - P. 7480. - DOI 10.18632/aging.103096.

153. Mira, J. P. Association of TNF2, a TNF-a promoter polymorphism, with septic shock susceptibility and mortality: A multicenter study / J. P. Mira, A. Cariou, M. Monchi [et al.] // JAMA. - 1999. - Vol. 282, No. 6. - P. 561-568. -DOI 10.1001/jama.282.6.561.

154. Moazzam-Jazi, M. Interplay between SARS-CoV-2 and human long non-coding RNAs / M. Moazzam-Jazi, H. Lanjanian, S. Maleknia [et al.] // Journal of cellular and molecular medicine. - 2021. - Vol. 25, No. 12. - P. 5823-5827. -DOI 10.1111/jcmm.16596.

155. Nakayama, M. T(-786)--> C mutation in the 5'-flanking region of the endothelial nitric oxide synthase gene is associated with myocardial infarction, especially without coronary organic stenosis / M. Nakayama, H. Yasue, M. Yoshimura [et al.] // The American journal of cardiology. - 2000. - Vol. 86, No. 6. - P. 628-634. - DOI 10.1016/s0002-9149(00)01041-9.

156. Nandi, A. Role of Catalase in Oxidative Stress- And Age-Associated Degenerative Diseases / A. Nandi, N. Das, L. J. Yan, C. K. Jana // Oxidative Medicine and Cellular Longevity. - 2019. - Vol. 2019. - P. 9613090. - DOI 10.1155/2019/9613090.

157. Natarelli, L. MicroRNAs and long non-coding RNAs as potential candidates to target specific motifs of SARS-CoV-2 / L. Natarelli, L. Parca, T. Mazza [et al.] // Non-coding RNA. - 2021. - Vol. 7, No. 1. - P. 14. - DOI 10.3390/ncrna7010014.

158. Ngo, Vy. Nrf2 and Oxidative Stress: A General Overview of Mechanisms and Implications in Human Disease / Vy. Ngo, M. L. Duennwald // Antioxidants. - 2022. - Vol. 11, No. 12. - P. 2345. - DOI 10.3390/antiox11122345.

159. Niemi, M. E. K. The human genetic epidemiology of COVID-19 / M. E. K. Niemi, M. J. Daly, A. Ganna // Nature Reviews Genetics. - 2022. - DOI 10.1038/s41576-022-00478-5.

160. Nishida, N. MicroRNA-125a-5p is an independent prognostic factor in gastric cancer and inhibits the proliferation of human gastric cancer cells in combination with trastuzumab / N. Nishida, K. Mimori, T. Yokobori [et al.] // Clinical Cancer Research. - 2011. - Vol. 17, No. 9. - P. 2725-2733. - DOI 10.1158/1078-0432.CCR-10-2132.

161. Novikova, I. A. Maternal energy metabolism and angiogenesis genes polymorphisms in fetal growth restriction / I. A. Novikova, D. Alset, T. P. Shkurat [et al.] // Gene Reports. - 2021. - Vol. 23. - P. 101170. - DOI 10.1016/j.genrep.2021.101170.

162. Pairo-Castineira, E. Genetic mechanisms of critical illness in COVID-19 / E. Pairo-Castineira, S. Clohisey, K. Rawlik [et al.] // Nature. - 2021. - Vol. 591, No. 7848. - P. 92-98. - DOI 10.1038/s41586-020-03065-y.

163. Pan, X. The Association between PON1 (Q192R and L55M) Gene Polymorphisms and Risk of Cancer: A Meta-Analysis Based on 43 Studies / X. Pan, L. Huang, M. Li [et al.] // BioMed research international. - 2019. - Vol. 2019. - DOI 10.1155/2019/5897505.

164. Pansarasa, O. SOD1 in Amyotrophic Lateral Sclerosis: "Ambivalent" Behavior Connected to the Disease / O. Pansarasa, M. Bordoni, L. Diamanti [et al.] // International journal of molecular sciences. - 2018. - Vol. 19, No. 5. - P. 1345. - DOI 10.3390/ijms19051345.

165. Patel, M. Targeting Oxidative Stress in Central Nervous System Disorders / M. Patel // Trends in Pharmacological Sciences. - 2016. - Vol. 37, No. 9. - P. 768-778. - DOI 10.1016/j.tips.2016.06.007.

166. Pehlivan, S. Investigation of MBL2 and NOS3 functional gene variants in suspected COVID-19 PCR (-) patients / S. Pehlivan, M. Kose, S. Mese [et al.] // Pathogens and global health. - 2022. - Vol. 116, No. 3. - P. 178-184. - DOI 10.1080/20477724.2021.1984726.

167. Pérez-Pérez, J. M. Understanding synergy in genetic interactions / J. M. Pérez-Pérez, H. Candela, J. L. Micol // Trends in genetics : TIG. - 2009. - Vol. 25, No. 8. - P. 368-376. - DOI 10.1016/j.tig.2009.06.004.

168. Piedrafita, F. J. An Alu element in the myeloperoxidase promoter contains a composite SPl-thyroid hormone-retinoic acid response element / F. J. Piedrafita, R. B. Molander, G. Vansant [et al.] // The Journal of biological chemistry. - 1996. - Vol. 271, No. 24. - P. 14412-14420. - DOI 10.1074/jbc.271.24.14412.

169. Pieri, M. Alterations in Circulating miRNA Levels after Infection with SARS-CoV-2 Could Contribute to the Development of Cardiovascular Diseases: What We Know So Far / M. Pieri, P. Vayianos, V. Nicolaidou [et al.] // International Journal of Molecular Sciences. - 2023. - Vol. 24, No. 3. - P. 2380. - DOI 10.3390/ijms24032380.

170. Pljesa-Ercegovac, M. Glutathione transferases: Potential targets to overcome chemoresistance in solid tumors / M. Pljesa-Ercegovac, A. Savic-Radojevic, M. Matic [et al.] // International Journal of Molecular Sciences. -2018. - Vol. 19, No. 12. - P. 3785. - DOI 10.3390/ijms19123785.

171. Plowman, T. Non-coding RNAs in COVID-19: emerging insights and current questions / T. Plowman, D. Lagos // Non-coding RNA. - 2021. - Vol. 7, No. 3. - P. 54. - DOI 10.3390/ncrna7030054.

172. Rai, H. Association of endothelial nitric oxide synthase gene polymorphisms with coronary artery disease: An updated meta-analysis and systematic review / H. Rai, S. Kumar, A. Kapoor [et al.] // PLoS ONE. - 2014. -Vol. 9, No. 11. - P. e113363. - DOI 10.1371/journal.pone.0113363.

173. Rashedi, J. Risk Factors for COVID-19 / J. Rashedi, B. Mahdavi Poor, V. Asgharzadeh [et al.] // Le infezioni in medicina. - 2020. Vol. 28, No. 4. - P. 469474.

174. Reshi, M. L. RNA viruses: ROS-mediated cell death / M. L. Reshi, Y. C. Su, J. R. Hong // International Journal of Cell Biology. - 2014. - P. 467452. -DOI 10.1155/2014/467452.

175. Reynolds, W. F. The human myeloperoxidase gene is regulated by LXR and PPARalpha ligands / W. F. Reynolds, A. P. Kumar, F. J. Piedrafita // Biochemical and biophysical research communications. - 2006. - Vol. 349, No. 2. - P. 846-854. - DOI 10.1016/j.bbrc.2006.08.119.

176. Rezaei, M. Long non-coding RNA H19 expression and functional polymorphism rs217727 are linked to increased ischemic stroke risk / M. Rezaei, M. J. Mokhtari, M. Bayat [et al.] // BMC neurology. - 2021. - Vol. 21, No. 1. -P. 54. - DOI 10.1186/s12883-021-02081-3.

177. Rink, L. Recent progress in the tumor necrosis factor-a field / L. Rink, H. Kirchner // International Archives of Allergy and Immunology. - 1996. - Vol. 111, No. 3. - P. 199-209. - DOI 10.1159/000237369.

178. Rodriguez, S. Hardy-Weinberg equilibrium testing of biological ascertainment for Mendelian randomization studies / S. Rodriguez, T. R. Gaunt, I. N. M. Day // American journal of epidemiology. - 2009. - Vol. 169, No. 4. - P. 505-514. - DOI 10.1093/aj e/kwn359.

179. Roszak, A. Involvement of myeloperoxidase gene polymorphism 463G>A in development of cervical squamous cell carcinoma / A. Roszak, A. Lutkowska,

170

M. Lianeri [et al.] // International Journal of Biological Markers. - 2017. - Vol. 31, No. 4. - P. e440-e445. - DOI 10.5301/jbm.5000212.

180. Saadat, M. Evaluation of association between Q192R and L55M genetic polymorphisms of PON1 and serum paraoxonase-1 activity in healthy individuals, a meta-analysis / M. Saadat // Romanian Journal of Diabetes Nutrition & Metabolic Diseases. - 2018. - Vol. 25, No. 2. - P. 171-180. - DOI 10.2478/rj dnmd-2018-0020.

181. Saadat, M. Prevalence and mortality of COVID-19 are associated with the L55M functional polymorphism of Paraoxonase 1 / M. Saadat // Proceedings of Singapore Healthcare. - 2021. - DOI 10.1177/20101058211040582.

182. Sabater Molina, M. Polymorphisms in ACE, ACE2, AGTR1 genes and severity of COVID-19 disease / M. Sabater Molina, E. Nicolás Rocamora, A. I. Bendicho [et al.] // PloS one. - 2022. - Vol. 17, No. 2. - P. e0263140. - DOI 10.1371/journal.pone.0263140.

183. Sabbatinelli, J. Decreased serum levels of the inflammaging marker miR-146a are associated with clinical non-response to tocilizumab in COVID-19 patients / J. Sabbatinelli, A. Giuliani, G. Matacchione [et al.] // Mechanisms of ageing and development. - 2021. - Vol. 193. - P. 111413. - DOI 10.1016/j.mad.2020.111413.

184. Salama, C. Tocilizumab in patients hospitalized with Covid-19 pneumonia / C. Salama, J. Han, L. Yau [et al.] // New England Journal of Medicine. - 2021.

- Vol. 384, No 1. - P. 20-30. - DOI 10.1056/NEJMoa2030340.

185. Saleh, A. Association of TNF-a G-308 a Promoter Polymorphism with the Course and Outcome of COVID-19 Patients / A. Saleh, A. Sultan, M. A. Elashry [et al.] // Immunological investigations. - 2022. - Vol. 51, No. 3. - P. 546-557.

- DOI 10.1080/08820139.2020.1851709.

186. Sanders, J. M. Pharmacologic Treatments for Coronavirus Disease 2019 (COVID-19): A Review / J. M. Sanders, M. L. Monogue, J. B. Cutrell [et al.] // JAMA. - 2020. - Vol. 323, No. 18. - P. 1824-1836. - DOI 10.1001/jama.2020.6019.

187. Santric, V. GSTP1 RS1138272 polymorphism affects prostate cancer risk / V. Santric, M. Acimovic, U. Bumbasirevic [et al.] // Medicina (Kaunas, Lithuania). - 2020. - Vol. 56, No. 3. - P. 128. - DOI 10.3390/medicina56030128.

188. Savikina, K. G. Association of CAT C262T (rs1001179) polymorphism with male infertility: Meta-analysis / K. G. Savikina, S. V. Lomteva, A. H. Abd Ali [et al.] // Meta Gene. - 2021. - Vol. 30. - P. 100974. - DOI 10.1016/j.mgene.2021.100974.

189. Schatzman, S. S. Chemical Warfare at the Microorganismal Level: A Closer Look at the Superoxide Dismutase Enzymes of Pathogens / S. S. Schatzman, V. C. Culotta // ACS Infectious Diseases. - 2018. - Vol. 4, No. 6. -P. 893-903. - DOI 10.1021/acsinfecdis.8b00026.

190. Semenova, N. V. Superoxide Dismutase Activity in Male and Female Patients of Different Age with Moderate COVID-19 / N. V. Semenova, L. V. Rychkova, M. A. Darenskaya [et al.] // Bulletin of Experimental Biology and Medicine. - 2022. - Vol. 173, No. 1. - P. 51-53. - DOI 10.1007/s10517-022-05491-6.

191. Sharifi-Rad, M. Lifestyle, Oxidative Stress, and Antioxidants: Back and Forth in the Pathophysiology of Chronic Diseases / M. Sharifi-Rad, N. V. Anil Kumar, P. Zucca [et al.] // Frontiers in Physiology. - 2020. - Vol. 11, No. MAR. - P. 694. - DOI 10.3389/fphys.2020.00694.

192. Sharma, A. Severe acute respiratory syndrome coronavirus-2 (SARS-CoV-2): a global pandemic and treatment strategies / A. Sharma, S. Tiwari, M. K. Deb

[et al.] // International Journal of Antimicrobial Agents. - 2020. - Vol. 56, No. 2.

- P. 106054. - DOI 10.1016/j.ijantimicag.2020.106054.

193. Shelton, J. F. Trans-ancestry analysis reveals genetic and nongenetic associations with COVID-19 susceptibility and severity / J. F. Shelton, A. J. Shastri, C. Ye [et al.] // Nature Genetics. - 2021. - Vol. 53, No. 6. - P. 801-808.

- DOI 10.1038/s41588-021-00854-7.

194. Shi, X. The possible association between the presence of an MPO -463 G > A (rs2333227) polymorphism and cervical cancer risk / X. Shi, B. Li, Y. Yuan [et al.] // Pathology, research and practice. - 2018. - Vol. 214, No. 8. - P. 11421148. - DOI 10.1016/j.prp.2018.05.018.

195. Shi, Y. Y. SHEsis, a powerful software platform for analyses of linkage disequilibrium, haplotype construction, and genetic association at polymorphism loci / Y. Y. Shi, L. He // Cell research. - 2005. - Vol. 15, No. 2. - P. 97-98. - DOI 10.1038/sj.cr.7290272.

196. Shiravi, A. A. Vitamin D can be effective on the prevention of COVID-19 complications: A narrative review on molecular aspects / A. A. Shiravi, Z. Abdollahi, P. Miar [et al.] // International Journal for Vitamin and Nutrition Research. - 2020. - DOI 10.1024/0300-9831/a000676.

197. Shunmoogam, N. Paraoxonase (PON)-1: A brief overview on genetics, structure, polymorphisms and clinical relevance / N. Shunmoogam, P. Naidoo, R. Chilton // Vascular Health and Risk Management. - 2018. - Vol. 14. - P. 137143. - DOI 10.2147/VHRM.S165173.

198. Sies, H. Oxidative eustress and oxidative distress: Introductory remarks / H. Sies // Oxidative Stress: Eustress and Distress, 2019. - P. 3-12. - DOI 10.1016/B978-0-12-818606-0.00001 -8.

199. Sikora, M. Genetic Attenuation of Paraoxonase 1 Activity Induces Proatherogenic Changes in Plasma Proteomes of Mice and Humans / M. Sikora,

173

E. Bretes, J. Perla-Kajan [et al.] // Antioxidants (Basel, Switzerland). - 2020. -Vol. 9, No. 12. - P. 1198. - DOI 10.3390/antiox9121198.

200. Siokas, V. Analysis of SOD2 rs4880 Genetic Variant in Patients with Alzheimer's Disease / V. Siokas, P. Stamati, G. Pateraki [et al.] // Current Issues in Molecular Biology. - 2022. - Vol. 44, No. 10. - P. 4406-4414. - DOI 10.3390/cimb44100302.

201. Sole, X. SNPStats: a web tool for the analysis of association studies / X. Sole, E. Guino, J. Valls [et al.] // Bioinformatics. - 2006. - Vol. 22, No. 15. - P. 1928. - DOI 10.1093/bioinformatics/btl268.

202. Sousa, V. C. S. D. Association of Catalase and Glutathione Peroxidase 1 Polymorphisms with Chronic Hepatitis C Outcome / V. C. S. D. Sousa, P. Moura, M. S. M. Cavalcanti [et al.] // Annals of Human Genetics. - 2016. - Vol. 80, No. 3. - P. 145-153. - DOI 10.1111/ahg.12152.

203. Suzuki, T. Regulatory nexus of synthesis and degradation deciphers cellular Nrf2 expression levels / T. Suzuki, K. Takaya, M. Yamamoto [et al.] // Molecular and Cellular Biology. - 2013. - Vol. 33, No. 12. - P. 2402-2412. - DOI 10.1128/MCB.00065-13.

204. Tan, X. Association between glutathione S-transferases P1 Ile105Val polymorphism and susceptibility to esophageal cancer: evidence from 20 case-control studies / X. Tan, M. Chen // Molecular biology reports. - 2015. - Vol. 42, No. 2. - P. 399-408. - DOI 10.1007/s11033-014-3781-6.

205. Tavassolifar, M. Ja. New insights into extracellular and intracellular redox status in COVID-19 patients / M. Ja. Tavassolifar, H. A. Aghdaei, O. Sadatpour [et al.] // Redox Biology. - 2023. - Vol. 59. - P. 102563. - DOI 10.1016/j.redox.2022.102563.

206. Teimoori, B. The effect of GPx-1 rs1050450 and MnSOD rs4880 polymorphisms on PE susceptibility: a case- control study / B. Teimoori, M.

174

Moradi-Shahrebabak, M. Razavi [et al.] // Molecular Biology Reports. - 2019. -Vol. 46, No. 6. - P. 6099-6104. - DOI 10.1007/s11033-019-05045-6.

207. Teo, A. Myeloperoxidase inhibition may protect against endothelial glycocalyx shedding induced by COVID-19 plasma / A. Teo, L. L. Y. Chan, Ch. Cheung [et al.] // Communications Medicine. - 2023. - Vol. 3, No. 1. - P. 62. -DOI 10.1038/s43856-023-00293-x.

208. Tsermpini, E. E. Molecular Mechanisms Related to Responses to Oxidative Stress and Antioxidative Therapies in COVID-19: A Systematic Review / E. E. Tsermpini, U. Glamoclija, F. Ulucan-Karnak [et al.] // Antioxidants. - 2022. - Vol. 11, No. 8. - DOI 10.3390/antiox11081609.

209. Tsermpini, E. E. Molecular Mechanisms Related to Responses to Oxidative Stress and Antioxidative Therapies in COVID-19: A Systematic Review / E. E. Tsermpini, U. Glamoclija, F. Ulucan-Karnak [et al.] // Antioxidants. - 2022. - Vol. 11, No. 8. - DOI 10.3390/antiox11081609.

210. Uffelmann, E. Genome-wide association studies / E. Uffelmann, Q. Q. Huang, N. S. Munung [et al.] // Nature Reviews Methods Primers. - 2021. - Vol. 1, No. 59. - DOI 10.1038/s43586-021-00056-9.

211. Ulhaq, Z. S. Anti-IL-6 receptor antibody treatment for severe COVID-19 and the potential implication of IL-6 gene polymorphisms in novel coronavirus pneumonia / Z. S. Ulhaq, G. V. Soraya // Medicina Clínica. - 2020. - Vol. 155, No. 12. - P. 548. - DOI 10.1016/j.medcli.2020.07.002. (a)

212. Ulhaq, Z. S. Interleukin-6 as a potential biomarker of COVID-19 progression / Z. S. Ulhaq, G. V. Soraya // Medecine et maladies infectieuses. -2020. - Vol. 50, No. 4. - P. 382. - DOI 10.1016/j.medmal.2020.04.002. (b)

213. Van Der Made, C. I. Presence of genetic variants among young men with severe COVID-19 / C. I. Van Der Made, A. Simons, J. Schuurs-Hoeijmakers [et

al.] // Jama. - 2020. - Vol. 324, No. 7. - P. 663-673. - DOI 10.1001/jama.2020.13719.

214. Van Schooten, F. J. Myeloperoxidase (MPO) -463G->A reduces MPO activity and DNA adduct levels in bronchoalveolar lavages of smokers / F. J. Van Schooten, A. W. Boots, A. M. Knaapen [et al.] // Cancer epidemiology, biomarkers & prevention. - 2004. - Vol. 13, No. 5. - P. 828-833.

215. Vijayan, A. Modifiable risk factors, oxidative stress markers, and SOD2 rs4880 SNP in coronary artery disease: an association study / A. Vijayan, V. Chithra, C. Sandhya // Molecular Biology Reports. - 2024. - Vol. 51, No. 1. - P. 805. - DOI 10.1007/s11033-024-09727-8.

216. Vishnubalaji, R. Protein coding and long noncoding RNA (lncRNA)) transcriptional landscape in SARS-CoV-2 infected bronchial epithelial cells highlight a role for interferon and inflammatory response / R. Vishnubalaji, H. Shaath, N. M. Alajez // Genes. - 2020. - Vol. 11, No. 7. - P. 1-19. - DOI 10.3390/genes11070760.

217. Wang, M. GSTM1 Null Genotype and GSTP1 Ile105Val Polymorphism Are Associated with Alzheimer's Disease: a Meta-Analysis / M. Wang, Y. Li, L. Lin [et al.] // Molecular neurobiology. - 2016. - Vol. 53, No. 2. - P. 1355-1364.

- DOI 10.1007/s12035-015-9092-7.

218. Wang, P. The Opening of Pandora's Box: An emerging role of long noncoding RNA in viral infections / P. Wang // Frontiers in immunology. - 2019.

- Vol. 9. - P. 430795. - DOI 10.3389/fimmu.2018.03138.

219. Wang, W. SOD2 Facilitates the Antiviral Innate Immune Response by Scavenging Reactive Oxygen Species / W. Wang, Y. Jin, N. Zeng [et al] // Viral immunology. - 2017. - Vol. 30, No. 8. - P. 582-589. - DOI 10.1089/vim.2017.0043.

220. Wheeler, A. P. Treating patients with severe sepsis / A. P. Wheeler, G. R. Bernard // The New England journal of medicine. - 1999. - Vol. 340, No. 3. - P. 207-214. DOI 10.1056/NEJM199901213400307.

221. Wickenhagen, A. A prenylated dsRNA sensor protects against severe COVID-19 / A. Wickenhagen, E. Sugrue, S. Lytras [et al.] // Science. - 2021. -Vol. 374, No. 6567. - P. eabj3624. - DOI 10.1126/science.abj3624.

222. Wieczfinska, J. Oxidative Stress-Related Mechanisms in SARS-CoV-2 Infections / J. Wieczfinska, P. Kleniewska, R. Pawliczak // Oxidative Medicine and Cellular Longevity. - 2022. - Vol. 2022. - P. 5589089. - DOI 10.1155/2022/5589089.

223. Wigner, P., Variation of genes involved in oxidative and nitrosative stresses in depression / P. Wigner, E. Synowiec, K. Bialek [et al.] // European Psychiatry. - 2018. - Vol. 48, No. S1. - P. 38-48. - DOI 10.1016/j.eurpsy.2017.10.012.

224. Wilson, A. G. An allelic polymorphism within the human tumor necrosis factor a promoter region is strongly associated with HLA A1, B8, and DR3 alleles / A. G. Wilson, F. S. Di Giovine, G. W. Duff [et al.] // Journal of Experimental Medicine. - 1993. - Vol. 177, No. 2. - P. 557-560. - DOI 10.1084/jem.177.2.557.

225. Wink, D. A. Mechanisms of the antioxidant effects of nitric oxide / D. A. Wink, K. M. Miranda, M. G. Espey [et al.] // Antioxidants & redox signaling. -2001. - Vol. 3, No. 2. - P. 203-213. - DOI 10.1089/152308601300185179.

226. Wu, Ch. Prognostic role of microRNA polymorphisms in patients with advanced esophageal squamous cell carcinoma receiving platinum-based chemotherapy / Ch. Wu, M. Li, Ch. Hu, H. Duan // Cancer Chemotherapy and Pharmacology. - 2014. - Vol. 73, No. 2. - P. 335-341. - DOI 10.1007/s00280-013-2364-x.

227. Wu, Y. A study of differential circRNA and lncRNA expressions in COVID- 19-infected peripheral blood / Y. Wu, X. Xia, B. Li [et al.] // Scientific Reports. - 2021. - Vol. 11, No. 1. - DOI 10.1038/s41598-021-86134-0.

228. Xiao, L. A case-control study of selenoprotein genes polymorphisms and autoimmune thyroid diseases in a Chinese population / L. Xiao, Q. Yao, N. Yan [et al.] // BMC Medical Genetics. - 2017. - Vol. 18, No. 1. - P. 54. - DOI 10.1186/s12881-017-0415-6.

229. Xie, P. Association between GSTP1 Ile 105Val polymorphism and glioma risk: A systematic review and meta-analysis / P. Xie, Y. Liang, G. Liang, B. Liu // Tumor Biology. - 2014. - Vol. 35, No. 1. - P. 493-499. - DOI 10.1007/s13277-013-1069-4.

230. Xu, B. SOD1 is a Possible Predictor of COVID-19 Progression as Revealed by Plasma Proteomics / B. Xu, Y Lei, X. Ren [et al.] // ACS Omega. -2021. - Vol. 6, No. 26. - P. 16826-16836. - DOI 10.1021/acsomega.1c01375.

231. Yamamoto, T. Identification of polymorphisms in the promoter region of the human NRF2 gene / T. Yamamoto, K. Yoh, A. Kobayashi [et al.] // Biochemical and biophysical research communications. - 2004. - Vol. 321, No. 1. - P. 72-79. - DOI 10.1016/j.bbrc.2004.06.112.

232. Yao, Ya. Genome and epigenome editing identify CCR9 and SLC6A20 as target genes at the 3p21.31 locus associated with severe COVID-19 / Ya. Yao, F. Ye, K. Li [et al.] // Signal Transduction and Targeted Therapy. - 2021. - Vol. 6, No. 1. - P. 1-3. - DOI 10.1038/s41392-021-00519-1.

233. Ye, E. A. miR-146a suppresses STAT3/VEGF pathways and reduces apoptosis through IL-6 signaling in primary human retinal microvascular endothelial cells in high glucose conditions / E. A. Ye, J. J. Steinle // Vision Research. - 2017. - Vol. 139. - P. 15-22. - DOI 10.1016/j.visres.2017.03.009.

234. Yi, J. F. Mn-SOD and CuZn-SOD polymorphisms and interactions with risk factors in gastric cancer / J. F. Yi, Y. M. Li, T. Liu [et al.] // World journal of

178

gastroenterology. - 2010. - Vol. 16, No. 37. - P. 4738-4746. - DOI 10.3748/wjg.v16.i37.4738.

235. Yi, K. Long noncoding RNA and its role in virus infection and pathogenesis / K. Yi, Y. Zhang, Y. Wang [et al.] // Frontiers in Bioscience-Landmark. - 2019. - Vol. 24, No. 4. - P. 777-789. - DOI 10.2741/4750.

236. Yildirim, Z. Genetic and epigenetic factors associated with increased severity of Covid-19 / Z. Yildirim, O. S. Sahin, V. Bozok Cetintas, S. Yazar // Cell Biology International. - 2021. - Vol. 45, No. 6. - P. 1158-1174. - DOI 10.1002/cbin.11572.

237. Yuan, Y. The development of COVID-19 treatment / Y. Yuan, B. Jiao, L. Qu [et al.] // Frontiers in immunology. - 2023. - Vol. 14. - P. 1125246. - DOI 10.3389/fimmu.2023.1125246.

238. Zarkovic, N. Post-mortem Findings of Inflammatory Cells and the Association of 4-Hydroxynonenal with Systemic Vascular and Oxidative Stress in Lethal COVID-19 / N. Zarkovic, A. Jakovcevic, A. Mataic [et al.] // Cells. -2022. - Vol. 11, No. 3. - P. 444. - DOI 10.3390/cells11030444.

239. Zhang Y. Antioxidants: potential antiviral agents for Japanese encephalitis virus infection / Y. Zhang, Z.Wang, H.Chen [et al.] // International Journal of Infectious Diseases. - 2014. - Vol. 24. - P. 30-36. - DOI 10.1016/j.ijid.2014.02.011.

240. Zhang, J. Understanding the Role of SARS-CoV-2 ORF3a in Viral Pathogenesis and COVID-19 / J. Zhang, A. Ejikemeuwa, J. M. Simard [et al.] // Frontiers in Microbiology. - 2022. - Vol. 13. - P. 854567. - DOI 10.3389/fmicb.2022.854567.

241. Zhang, L. The G894t, T-786c and 4b/a polymorphisms in Enos gene and cancer risk: a meta-analysis / L. Zhang, L. M. Chen, M. N. Wang [et al.] // Journal

of evidence-based medicine. - 2014. - Vol. 7, No. 4. - P. 263-269. - DOI 10.1111/jebm.12126.

242. Zhang, Q. Inborn errors of type I IFN immunity in patients with life-threatening COVID-19 / Q. Zhang, Z. Liu, M. Moncada-Velez [et al.] // Science.

- 2020. - Vol. 370, No. 6515. - P. eabd4570. - DOI 10.1126/science.abd4570.

243. Zhou, C. F. Association of glutathione S-transferase pi (GSTP1) Ile105Val polymorphism with the risk of skin cancer: a meta-analysis / C. F. Zhou, T. Ma, D. C. Zhou [et al.] // Archives of dermatological research. - 2015. - Vol. 307, No. 6. - P. 505-513. - DOI 10.1007/s00403-015-1576-9.

244. Zhou, Y. F. Tumor necrosis factor-a and interleukin-6 suppress microRNA-1275 transcription in human adipocytes through nuclear factor-KB / Y. F. Zhou, Z. Y. Fu, X. H. Chen [et al.] // Molecular Medicine Reports. - 2017.

- Vol. 16, No. 5. - P. 5965-5971. - DOI 10.3892/mmr.2017.7392.

245. Zienolddiny, S. A comprehensive analysis of phase I and phase II metabolism gene polymorphisms and risk of non-small cell lung cancer in smokers / S. Zienolddiny, H. Lind, D. Ryberg [et al.] // Carcinogenesis. - 2008.

- Vol. 29, No. 6. - P. 1164-1169. - DOI 10.1093/carcin/bgn020.

246. Zuo, Y. Neutrophil extracellular traps in COVID-19 / Y. Zuo, S. Yalavarthi, H. Shi [et al.] // JCI insight. - 2020. - Vol. 5, No. 11. - P. e138999. - DOI 10.1172/jci.insight.138999.