Генетические детерминанты патогенности клинических штаммов Klebsiella pneumoniae тема диссертации и автореферата по ВАК РФ 03.00.07, кандидат биологических наук Фиалкина, Светлана Владимировна

• Фиалкина, Светлана Владимировна
• кандидат биологических наук
• 2004

Оглавление диссертации кандидат биологических наук Фиалкина, Светлана Владимировна

ВВЕДЕНИЕ

ГЛАВА 1. ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ

1.1. Этиологическая роль Klebsiella pneumoniae в инфекционной патологии человека

1.2. Факторы патогенности энтеробактерий

1.2.1. Факторы патогенности Klebsiella pneumoniae

1.2.2. Факторы патогенности других условнопатогенных энтеробактерий

1.3. ПЦР в идентификации патогенных бактерий и диагностике инфекционных заболеваний

СОБСТВЕННЫЕ ИССЛЕДОВАНИЯ

ГЛАВА 2. МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ

2.1. Используемые штаммы, среды

2.2. Характеристика эталонных штаммов

2.3. Полимеразная цепная реакция

2.3.1. Подготовка проб

2.3.2. Амплификация ДНК

2.3.3. Детекция результатов ПЦР

2.4. Биологические методы исследования

2.4.1. Количественная оценка адгезивной активности

2.4.2. Определение гемолитической активности

2.4.3. Определение ДНК-азной и РНК-азной активности

2.4.4. Определение казеинолитической активности

2.4.5. Определение антилизоцимной активности 57 2.4.6 Определение энтерогемолитической активности

2.4.7. Изучение адгезии на модели культуры клеток RH

2.4.8. Изучение цитотоксического некротизирующего фактора на модели клеточных линий Vero и HeLa

2.4.9. Изучение гемаггютинирующей способности

2.4.10. Определение вирулентности штаммов K.pneumoniae при внутрибрюшинном заражении белых мышей

2.5. Серологическое типирование K.pneumoniae

2.6. Определение чувствительности к антибиотикам

2.7. Методы статистического анализа

ГЛАВА 3. РЕЗУЛЬТАТЫ ИССЛЕДОВАНИЙ

3.1. Коллекция клинических штаммов Klebsiella pneumoniae и их общая характеристика

3.2. Характеристика биологических свойств клинических изолятов Klebsiella pneumoniae

3.3. Изучение нуклеотидных последовательностей генов, обеспечивающих адгезию Klebsiella pneumoniae на эпителии

3.3.1. Определение нуклеотидных последовательностей генов, контролирующих синтез фимбрий S, Р и 1 типа у клинических штаммов Klebsiella pneumoniae

3.3.2. Определение нуклеотидных последовательностей еаеА гена у клинических штаммов K.pneumoniae

3.4. Изучение адгезии штаммов Klebsiella pneumoniae на клеточных линиях RH

3.5. Изучение генетических детерминант, обеспечивающих размножение возбудителя в тканях

3.6. Изучение генетических детерминант токсинообразования у клинических штаммов Klebsiella pneumoniae

3.6.1. Обнаружение нуклеотидных последовательностей cnf-1 гена у клинических штаммов Klebsiella pneumoniae

3.6.2. Обнаружение нуклеотидных последовательностей генов, контролирующих синтез шигаподобных энтеротоксинов 1 и 2 типа, у штаммов Klebsiella pneumoniae

3.6.3. Определение генетических детерминант, контролирующих синтез гемолизинов, у клинических штаммов Klebsiella pneumoniae

3.7. Частота встречаемости нуклеотидных последовательностей генов патогенности у клинических изолятов K.pneumoniae

3.8. Фенотипическая экспрессия факторов патогенности Klebsiella pneumoniae

3.8.1. Энтерогемолитическая активность клебсиелл

3.8.2. Гемолитическая активность клебсиелл

3.8.3. Фенотипическая экспрессия цитотоксического некротизирующего фактора

3.8.4. Гемагглютинирующая активность K.pneumoniae

3.9. Оценка патогенности клинических штаммов Klebsiella pneumoniae in vivo

ОБСУЖДЕНИЕ РЕЗУЛЬТАТОВ

ВЫВОДЫ

Введение диссертации (часть автореферата) на тему «Генетические детерминанты патогенности клинических штаммов Klebsiella pneumoniae»

Актуальность проблемы.

В настоящее время отмечается значительное изменение этиологической структуры инфекционной заболеваемости, связанной с активизацией условнопатогенных бактерий. Наше внимание привлекли капсульные энтеробактерии, в частности клебсиеллы. Клебсиеллы обнаруживаются как при острых кишечных, так и при ряде парентеральных инфекций: урологических, менингеальных, токсикосептических и др. (24).

Клинические проявления вызываемых клебсиеллами патологических процессов многообразны. Кдебсиеллез можно охарактеризовать как заболевание, протекающее в различных клинических формах, при которых клебсиеллы являются этиологическим агентом. Клебсиеллы, как и другие условнопатогенные микроорганизмы, поражают, как правило, людей со сниженной естественной резистентностью организма (первичные и вторичные иммунодефицита). Чаще всего это новорожденные и дети первого года жизни, беременные женщины, постоперационные, посттравматические и онкологические больные, пациенты, с повреждениями кожных покровов и слизистых оболочек. В результате развивается локальный или генерализованный инфекционный процесс. В некоторых случаях клебсиеллезная инфекция протекает крайне тяжело и заканчивается сепсисом с летальностью до 60%, особенно у новорожденных и детей первого года жизни (10).

Достаточно часто клебсиеллы выступают как возбудители внутрибольничных инфекций (ВБИ), которые регистрируются с частотой 100 -180 случаев на 100 тыс. новорожденных, 60-80 случаев на 100 тыс. госпитализированных (18). Причиной этого является применение антибиотиков, использование иммунодепрессантов, широкое применение внутривенных вливаний, хирургических вмешательств. Также возникновению внутрибольничных инфекций клебсиеллезной этиологии способствует циркуляция этих бактерий в родовспомогательных учреждениях, в отделениях для новорожденных, в отделениях соматических стационаров. Характерной особенностью ВБИ, обусловленных условнопатогенными микроорганизмами, является формирование и распространение штаммов с повышенной вирулентностью.

К настоящему времени у клебсиелл изучено небольшое число факторов патогенности. Известны фимбриальные структуры и белки наружной мембраны, сообщающие адгезивную активность Klebsiella pneumoniae. Многие штаммы обладают полисахаридной капсулой, которая защищает микробную клетку от лизирующего действия комплемента и фагоцитов хозяина, продуцируют токсины (термостабильный-ST и термолабильный-LT энтеротоксины, тиолзависимый гемолизин), вещества, инактивирующие лизоцим, бактерицидный компонент интерферона, секреторный иммуноглобулин А. Однако, информация неполная, многие патогенные свойства клебсиелл остаются малоизученными.

Исходя из того, что клинические проявления клебсиеллезов многообразны, а спектр изученных факторов патогенности клебсиелл остается узким, актуальной является проблема поиска новых патогенетических свойств у клинических штаммов K.pneumoniae, в частности факторов патогенности, известных для других энтеробактерий. Установлено, что родственные виды могут обладать сходными свойствами. Так, доказано, что энтеротоксины, продуцируемые штаммами K.pneumoniae, высоко гомологичны энтеротоксинам E.coli. Показана гомология фимбриальных адгезинов клебсиелл и эшерихий (10).

В свете достижений современной молекулярной биологии и генетики, которые привели к возникновению новых методов изучения генома и диагностики инфекционных заболеваний, представляет интерес использование этих методов для исследования факторов патогенности K.pneumoniae. Одним из таких методов является метод ГТЦР. Уже имеются работы, посвященные применению молекулярно-генетических методов, в частности гибридизационных зондов, для определения термолабильного энтеротоксина (LT) у штаммов клебсиелл, выделенных при острых кишечных инфекциях (6).

Возможность появления сходных генетических структур у разных видов энтеробактерий обусловлена современными представлениями о мобильных генетических элементах, к числу которых принадлежат «острова» патогенности.

Под островами патогенности принято понимать фрагменты ДНК, размерами от 1 до 10 kb («островки») или от 10-20 до 200 kb («острова»), включающие дискретные гены вирулентности и обнаруживаемые только у патогенных микроорганизмов. Указанные фрагменты ДНК отличаются от «core genome» по содержанию % G+C, как правило, фланкированы малыми прямыми нуклеотидными повторами (DR-directly repead) и часто ассоциированы с 3' областью локусов различных транспортных РНК (тРНК). Детерминанты ОП способны распространяться среди родственных видов бактерий при конъюгации, трансдукции или трансформации. Такая мобильность ОП связана с тем, что они могут входить в состав бактериофагов, транспозонов или плазмид. Именно интеграция, стабилизация и экспрессия генов вирулентности, входящих в состав ОП, и лежит в основе формирования новых свойств, в том числе вирулентных у родственных непатогенных видов бактерий различных таксономических групп (3, 107, 129).

У условнопатогенных, в частности некоторых серотипов E.coli известны ОП, несущие гены, контролирующие синтез адгезинов, инвазинов, токсинов (гемолизина, цитотоксического некротизирующего фактора-1 (CNF-1), шигаподобного энтеротоксина и др.), системы поглощения ионов железа, важной для размножения возбудителя в тканях.

Учитывая вышеизложенное, определение нуклеотидных последовательностей генов, контролирующих синтез факторов патогенности различных энтеробактерий, у клинических штаммов К. pneumoniae методом полимеразной цепной реакции является актуальным.

Цель и задачи исследования.

Цель работы: исследовать наличие нуклеотидных последовательностей генов, контролирующих синтез факторов патогенности энтеробактерий, у штаммов K.pneumoniae, изолированных при урологических и острых кишечных инфекциях, токсикосептицемиях, дисбиотических состояниях.

Задачи исследования:

1. Выделить штаммы Klebsiella pneumoniae от больных с уроинфекциями, острыми кишечными инфекциями, токсикосептицемиями, дисбиотическими состояниями.

2. Подобрать праймеры, специфичные в отношении факторов патогенности различных энтеробактерий и оптимизировать условия амплификации этих праймеров.

3. С помощью набора праймеров, амплифицирующих, нуклеотидные последовательности генов, обеспечивающих адгезию: возбудителя (фимбрии Р типа (рарС и рарН), S типа (sfaA и sfaG) и 1 типа (fimA), бактериальный адгезии интимин - еаеА), размножение в тканях (железорегулируемый белок -irp2), продукцию токсических веществ (цитотоксический некротизирующий фактор - cnfl, энтерогемолизин - ehxA, а-гемолизин - hlyB, шигаподобные энтеротоксины 1 и 2 типа - stxl и stx2), определить наличие указанных детерминант у штаммов K.pneumoniae.

4. Дать сравнительную характеристику частоты встречаемости нуклеотидных последовательностей некоторых генов патогенности у штаммов клебсиелл и других энтеробактерий.

5. Оценить возможность экспрессии некоторых генетических детерминант патогенности, нуклеотидные последовательности которых были выявлены у клинических штаммов K.pneumoniae методом ГТЦР с использованием различных биологических моделей.

Научная новизна и практическая значимость работы.

У клинических изолятов Klebsiella pneumoniae впервые обнаружены нуклеотидные последовательности генов, обеспечивающих адгезию возбудителя (рарС, рарН, sfaG, sfaA, eaeA, fimA гены), размножение в тканях • (irp2 ген) и продукцию токсинов (cnfl, ehx, hly, stx2).

Частота встречаемости нуклеотидных последовательностей генов, контролирующих синтез факторов патогенности, у клинических штаммов Klebsiella pneumoniae составила 31,8%.

Подобраны праймеры, амплифицирующие консервативные участки генов, контролирующих синтез факторов патогенности энтеробактерий, и оптимизированы условия их амплификации.

Показана корреляция между присутствием в геноме штаммов клебсиелл нуклеотидных последовательностей генов, детерминирующих синтез факторов патогенности, и экспрессией адгезинов, а-гемолизина, энтерогемолизина, < цитотоксического некротизирующего фактора 1.

Предложен набор из трех пар праймеров, для выявления нуклеотидных последовательностей генов, контролирующих синтез факторов патогенности, ассоциированных с адгезивной, цитотоксической активностью и способностью к размножению in vivo как у бактерий рода Klebsiella, так и других представителей семейства Enterobacteriaceae. Праймеры могут быть использованы для типирования внутрибольничных штаммов клебсиелл с целью установления источника происхождения изолятов.

За неоценимую помощь при выполнении работы автор выражает искреннюю благодарность научному руководителю - заведующему лабораторией генетики вирулентности бактерий ГУ НИИЭМ им. Н.Ф. Гамалеи РАМН, проф., д.м.н. В.М. Бондаренко и всем сотрудникам лаборатории. Автор благодарит в.н.с. НИИ им. Д.И. Ивановского, к.б.н. Михайлову Г.Р. за консультации и помощь при выполнении экспериментов на клеточных линиях.

Заключение диссертации по теме «Микробиология», Фиалкина, Светлана Владимировна

ВЫВОДЫ

1. Впервые обнаружено, что клинические изоляты Klebsiella pneumoniae могут содержать нуклеотидные последовательности генов, контролирующих синтез адгезинов, токсинов, белков, обеспечивающих размножение возбудителя в тканях.

2. При изучении 255 штаммов K.pneumoniae нуклеотидные последовательности генов, контролирующих синтез факторов патогенности, выявлены у 81 изолята, что составляет 31,8%. Среди штаммов, выделенных при острых кишечных инфекциях, частота встречаемости нуклеотидных последовательностей генов патогенности составила 24(31,2%), при токсикосептицеческих состояниях -26(29,9%), уроинфекциях - 22(47,8%), дисбактериозах - 9(20,0%).

3. Предложен алгоритм последовательного использования 3х пар праймеров для выявления консервативных участков генов патогенности, ассоциированных с адгезивной, цитотоксической активностью и способностью к размножения in vivo как у бактерий рода Klebsiella, так и других представителей семейства Enterobacteriaceae.

4. Выявлена корреляция между присутствием в геноме штаммов клебсиелл нуклеотидных последовательностей генов, детерминирующих синтез факторов патогенности, и экспрессией адгезинов, а-гемолизина, энтерогемолизина, цитотоксического некротизирующего фактора 1.

5. Показана эффективность применения предложенных праймеров, амплифицирующих нуклеотидные последовательности генов, ассоциированных с вирулентностью клебсиелл, для типирования внутрибольничных изолятов.

Список литературы диссертационного исследования кандидат биологических наук Фиалкина, Светлана Владимировна, 2004 год

1. Агапова О.В., Бондаренко В.М., Поликарпов Н.А. Ферменты патогенности клинических штаммов Klebsiella pneumoniae. Журн. микробиол. 1999, 2: 5-8.

2. Агапова О.В., Бондаренко В.М., Мигунов В.М. Частота встречаемости клинических штаммов Klebsiella pneumoniae, инактивирующих секреторный Iga. Журн. микробиол. 1998, 6: 80-81.

3. Бондаренко В.М. «Острова» патогенности бактерий. Журн. микробиол. 2001, 4: 67-74.

4. Бондаренко В.М., Gang Wu, Barkus М.М. Адгезивная активность клинических штаммов клебсиелл. Журн. микробиол. 1996, 2: 104-109.

5. Бондаренко В.М., Мавзютов А.Р., Голкочева Е.Н. Секретируемые факторы патогенности энтеробактерий. Журн. микробиол. 2002, 1: 67-71.

6. Бондаренко В.М., Тимофеева И.Т., Бондаренко Вл.М. и др. О значимости высеваемости клебсиелл, энтеробактер, цитробактер и кишечных иерсиний при бактериологических исследованиях. Журн. микробиол. 1987,6: 74-78.

7. Бондаренко В.М. Факторы патогенности бактерий и их роль в развитии инфекционного процесса. Журн. микробиол. 1999, 5: 34-39.

8. Бондаренко В.М., Ценева Г.Я., Березина JI.A. и др. Адгезивная активность Klebsiella pneumoniae, контролируемая плазмидой 55 МД. Журн. микробиол., 1996, 4: 3-6.

9. Бондаренко В.М. Общий анализ представлений о патогенных и условно патогенных бактериях. Журн. микробиол., 1997, 4: 20-26.

10. Бондаренко В.М., Петровская В.Г., Потатуркина-Нестерова Н.И. Проблема патогенности клебсиелл. Ульяновск. 1996. 132с.

11. Боев Б.В., Бондаренко В.М., Valencia С.Р. Математическая модель оперативного анализа и прогноза вспышек госпитальных инфекций среди новорожденных (на примере клебсиеллезной инфекции). Журн. микробиол., 1996, 3: с. 106-109.

12. Брилис В.И., Брилене Т.А.,Ленцнер Х.П. и др. Методика изучения адгезивного процесса микроорганизмов. Лаб. дело, 1986, 4: 210-212.

13. З.Бухарин О.В., Усвяцов Б.Я., Малышкин А.Г. и др. Метод определения антилизоцимной активности микроогранизмов. Журн. микробиол., 1984, 2: 27-28.

14. Воробьев А.А., Гинцбург А.Л., Бондаренко В.М. Мир микробов. Вестник РАМН. 2000, 1: 11-14.

15. Воробьев А. А., Борисова Е.В., Борисов В. А. Липополисахариды грамотрицательных вирулентных бактерий и их роль в инфекции и иммунитете. Вестник РАМН, 1997, 3: 10-13.

16. Гинцбург А.Л. Генодиагностика инфекционных заболеваний. Журн. микробиол. 1998, 3: 86-95.

17. Гинцбург А.Л., Зигангирова Н.А., Романова Ю.М. Современное состояние и перспективы молекулярно-генетических методов в решении задач медицинской микробиологии. Журн. микробиол. 1999, 5: 22-26.

18. Генчиков Л. А. Распространение внутрибольничных инфекций. Профилактика внутрибольничных инфекций. Под ред. Е.П.Ковалевой.1. М.-1993.и

19. Горская Е.М., Бондаренко В.М., Шогенова Ю.С. и др. Протеолитическая активность содержимого толстой кишки в норме и при микроэкологических нарушениях. Журн. микробиол. 1995, 3: 116-120.

20. Грецев Ю.В., Кононенко Л.П., Шумских И.В. и др. Некоторые особенности острых кишечных инфекций у детей первых 2-х лет жизни в г. Шахты. Материалы VIII съезда ЭМИП. М. 2002, т.2, с.29.

21. Егорова Т.Н., БондаренкоВ.М., Зверев Д.В. и др. Роль бактериальных токсинов в патогенезе гемолитико-уремического синдрома, вызываемого энтерогеморрагическими эшерихиями. Журн. микробиол.2001, 1: 82-89.

22. Евтодиенко В.Г., Котец О.Н., Халаку А.Г. Этиологический фактор при острых кишечных инфекциях. Материалы VIII съезда ЭМИП. М. 2002, т.2, с. 169.

23. Камачкова И.М., Журавлева Л.А., Мухамеджанова С.А. Этиологическая значимость условно патогенных бактерий в развитии инфекций мочевыделительной системы. Материалы VIII съезда ЭМИП. М. 2002, т.1, с.182-183.

24. Красноголовец В.Н., Киселева Б.Г. Клебсиеллезные инфекции. Москва «Медицина». 1996.

25. Лакин Г.Ф. Биометрия. МЛ 990.

26. Маматкулов И.Х., Бондаренко В.М. Этиологическая структура летальных токсикосептицемий новорожденных. Журн.микробиол. 1997, 2: 84-5.

27. Маккреди Б.Дж., Чимера, Д.А. Обнаружение и идентификация патогенных микроорганизмов молекулярными методами. Молекулярная клиническая диагностика. Методы. М.: Мир; 1999. с.496 506.

28. Набока Ю.Л., Васильева Л.И., Брагина Л.Е. и др. Этиологическая структура и персистентные характеристики возбудителей хронического пиелонефрита у детей. Материалы VIII съезда ЭМИП. М. 2002, т.1, с.208-209.

29. Поликарпов Н.А., Шилов В.М., Зубков М.Н. и др. Биологические свойства условнопатогенных энтеробактерий, выделенных из крови больных. Журн. микробиол.1986, 2: 34-38.

30. Руднев И.А., Бондаренко В.М. Тиолзависимые гемолизины как факторы патогенности клебсиелл. Журн. микробиол.1993, 6: 31-32.

31. ЗЬСинякова Л.А., Белобородов В.Б. Эмпирическая антибактериальная терапия гнойного пиелонефрита. Антибиотики и химиотер. 2002; 4 (1): 21-6.

32. Сергевнин В.И. Этиологическая структура и экологическая классификация острых кишечных инфекций. Эпидемиол. и инфекцион. Болезни, 1997, 6: 8-9.

33. Титов Л.П., Шабан Ж.Г., Картель А.И. Использование продигиозана и тактивина в лечении больных хроническими клебсиеллезами. Журн. микробиол., 2001, 5: 46-49.

34. Турчанинов Д.В., Стасенко В.Л., Николаев С.В. Гнойно-септические инфекции новорожденных в перинатальном центре. Материалы VIII съезда ЭМИП. М. 2002, т.З, с. 172-173.

35. Abe Н., Tatsuno I., Tobe Т. et al. Bicarbonate ion stimulates the expression of locus of enterocyte effacement-encoded genes in enterohemorrhagic Escherichia coli 0157:H7. Infect Immun 2002;70(7): 3500-9.

36. Abul-Milh M., Wu Y., Lau B. Induction of epithelial cell death includingapoptosis by enteropathogenic Escherichia coli expressing bundle-forming pili. Infect Immun 2001; 69(12): 7356-64.

37. Akopyants N.S., Clifton S.W., Kersulyte D. et al. Analyses of the cag pathogenicity island of Helicobacter pylori. Mol.Microbiol.1998, 28:37-53.

38. Albano F., Thompson M.R, Orru S. et al. Structural and functional features of modified heat-stable toxins produced by enteropathogenic Klebsiella cells. Pediatr Res 2000; 48(5): 685-90.

39. Alessio M., Albano F., Tarallo L. et al. Interspecific plasmid transfer and modification of heat-stable enterotoxin expression by Klebsiella pneumoniae from infants with diarrhea. Pediatr Res 1993; 33(2): 205-8.

40. A1-Hasani K., Rajakumar K., Bulach D. et al. Genetic organization of the she pathogenicity island in Shigella flexneri 2a. Microb Pathog 2001; 30(1): 1-8.

41. Andreu A., Stapleton A.E., Fennell C. et al. Urovirulence determinants in Escherichia coli strains causing prostatitis. J Infect Dis 1997; 176(5): 1416.

42. Blanc-Potard A.B., Kayser J., Groisman E.A. The SPI-3 pathogenicity island of Salmonella enterica. J.Bacteriol.1999, 181: 998-1004.

43. Buchrieser C., Brosch R., Bach S. et al. The high-pathogenicity island of

44. Yersinia pseudotuberculosis can be inserted into any of the three chromosomal asn tRNA genes. Mol Microbiol 1998; 30(5): 965-78.

45. Buchrieser C., Prentice M., Carniel E. The 102-kilobase unstable region of Yersinia pestis comprises a high-pathogenicity island linked to a pigmentation segment which undergoes internal rearrangement. J Bacteriol 1998; 180(9): 2321-9.

46. Bach S., de Almeida A., Carniel E. The Yersinia high-pathogenicity island is present in different members of the family Enterobacteriaceae. FEMS Microbiol Lett 2000 15; 183(2): 289-94.

47. BauerM.E., Welch. Characterization of an RTX toxin from enterohemorrhagic Escherichia coli 0157:H7. Infect. Immun. 1996; 64: 167-175.

48. Bernabe A., Contreras A., Gomez MA. et. al. Polyarthritis in kids associated with Klebsiella pneumoniae. Vet Rec 1998 Jan 17; 142(3): 64-6.

49. Beutin L., Stroeher U.H., Manning P.A. Isolation of enterohemolysin (Ehly2)-associated sequences encoded on temperate phages of Escherichia coli. Gene 1993; 132(1): 95-9.

50. Bingen-Bidois M., Clermont O, Bonacorsi S. et. al. Phylogenetic analysis and prevalence of urosepsis strains of Escherichia coli bearing pathogenicity island-like domains. Infect Immun 2002; 70(6): 3216-26.

51. Brouqui P, Raoult D. Endocarditis due to rare and fastidious bacteria. Clin Microbiol Rev 2000; 14(1): 177-207.

52. Boom R., Sal C.J., Salimans M.M., et. al. Rapid and simple method for purification of nucleic acids. J.Clin. Microbiol. 1988; 28(3): 495-503.

53. Boutiba-Ben Boubaker I., Ben Salah D, Besbes M. et. al. Multidrug resistance in Klebsiella pneumoniae: multicenter study. Tunis Med 2002; 80(1): 26-8.

54. Bonnet R., Souweine В., Gauthier G. et. al. Non-0157:H7 Stx2-producing Escherichia coli strains associated with sporadic cases of hemolytic-uremic syndrome in adults. J Clin Microbiol 1998; 36(6): 1777-80.

55. Boerlin P. Evolution of virulence factors in Shiga-toxin-producing Escherichia coli. Cell Mol Life Sci 1999,30; 56(9-10): 735-41.

56. Boquet P. The cytotoxic necrotizing factor 1 (CNF1) from Escherichia coli. Toxicon 2001; 39(11): 1673-80.

57. Boyd E.F., Hartl D.L. Chromosomal regions specific to the pathogenic isolates of Escherichia coli have a phylogenetically clustered distribution. J.Bacteriol. 1998, 180: 1159-1165.

58. Basu S., Mukherjee K.K., Poddar B. et. al. An unusual case of neonatal brain abscess following Klebsiella pneumoniae septicemia. Infection 2001; 29(5): 283-5.

59. Brian B.P., Frosolono M., Murray B.E. Polymmerase chain reaction for diagnosis of enterohemrragic E.coli infection and hemolytic uremic syndrom. J. Clin. Microbiol. 1992; 30: 1801-1806.

60. BrunderW., Karch H. Genome plasticity in Enterobacteriaceae. Int.J.Med.Microbiol. 2000, 290: 153-165.

61. Carniel E. The Yersinia high-pathogenicity island. Int Microbiol 1999; 2(3): 161-7.

62. Carniel E. The Yersinia high-pathogenicity island: an iron-uptake island. Microbes Infect 2001; 3(7): 561-9.

63. Carniel E., Guilvout I., Prentice M. Characterization of a large chromosomal "high-pathogenicity island" in biotype IB Yersinia enterocolitica. J Bacteriol 1996; 178(23): 6743-51.

64. Capo C., Meconi S., Sanguedolce M.V. et. al. Effect of cytotoxic necrotizing factor-1 on actin cytoskeleton in human monocytes: role in the regulation of integrin-dependent phagocytosis. J Immunol 1998; 161(8): 4301-8.

65. Clermont O., Bonacorsi S., Bingen E. The Yersinia high-pathogenicity island is highly predominant in virulence-associated phylogenetic groups of Escherichia coli. FEMS Microbiology Letters. 2001, 196 (2): 153-157.

66. Cockerill III F.R. Genetic Methods for Assessing Antimicrobial Resistance. Antimicrob Agents Chemother 1999; 43: 199-212.

67. Coletti M., Passamonti F., Del Rossi E. et. al. Klebsiella pneumoniae infection in Italian rabbits. Vet Rec 2001; 149(20): 626-7.

68. Ching J.C., Jones N.L., Ceponis P.J. et. al. Escherichia coli Shiga-Like Toxins Induce Apoptosis and Cleavage of Poly(ADP-Ribose) Polymerase via In Vitro Activation of Caspases. Infect Immun 2002; 70(8): 4669-77.

69. Chinen I., Rivas M., Soriano V. et. al. Escherichia coli ehll gene-positive serotype 018ac:H31 associated with an outbreak of diarrhea in a neonatal nursery in Neuquen City, Argentina. J Clin Microbiol 2002; 40(4): 1225-9.

70. Changyun Y., Jianguo X. Prevalence of Iron Transport Gene on Pathogenicity-Associated Island of Uropathogenic Escherichia coli in E.coli 0157:H7 Containing Shiga Toxin Gene. Journal of Clinical Microbiology. 2001, 39(6): 2300-2305.

71. De Rycke J., Gonzalez E.A., Blanco J. et. al. Evidence for two types of cytotoxic necrotizing factor in human and animal clinical isolates of Escherichia coli. J Clin Microbiol 1990; 28(4): 694-9.

72. De Rycke J., Nougayrede J.P., Oswald E. et. al. Interaction of Escherichia coli producing cytotoxic necrotizing factor with HeLa epithelial cells. Adv Exp Med Biol 1997;412:363-6.

73. DeVinney R., Stein M., Reinscheid D. Enterohemorrhagic Escherichia coli produces tir, which is translocated to the host cell membrane but is tyrosine phosphorylated. Infect. Immun.1999, 67(5): 2389-2398.

74. Dobrindt U., Reidl J. Pathogenicity islands and phage conversion: evolutionary aspects of bacterial pathogenesis. Int J Med Microbiol, 2000; 290(6): 519-27.

75. Deng W., Li Y., Vallance B.A. et. al. Locus of enterocyte effacement from Citrobacter rodentium: sequence analysis and evidence for horizontal transfer among attaching and effacing pathogens. Infect Immun 2001; 69(10): 632335.

76. Drolet R.J., Fairbrother M., Harel J. et. al. Attaching and effacing and enterotoxigenic Escherichia coli associated with enteric colibacillosis in the dog. Can. J. Vet. Res. 1994; 58: 87-92.

77. Economou A. Following leader: bacterial protein export through the Sec pathway. Trends Microbiol. 1999, 7: 315-320.

78. Eklund M., Scheutz F., Siitonen A. Clinical isolates of non-0157 Shiga toxin-producing Escherichia coli: serotypes, virulence characteristics, and molecular profiles of strains of the same serotype. J Clin Microbiol 2001; 39(8): 282934.

79. Elliott E.J., Robins-Browne R.M., O'Loughlin E.V. et al. Nationwide study of haemolytic uraemic syndrome: clinical, microbiological, and epidemiological features. Arch Dis Child 2001;85(2): 125-31.

80. Elliot S.J., Wainwright L. The complete sequence of the locus of enterocyte effacement (LEE) from enteropathogenic Escherichia coli E2348/69. Mol. Microbiol. 1998,28: 1-4.

81. Favre-Bonte S., Darfeuille-Michaud A, Forestier C. Aggregative adherence of Klebsiella pneumoniae to human intestine-407 cells. Infect Immun. 1995; 63(4): 1318-28.

82. Fabbri A., Falzano L., Travaglione S. et al. Rho-activating Escherichia coli cytotoxic necrotizing factor 1: macropinocytosis of apoptotic bodies in human epithelial cells. Int J Med Microbiol. 2002; 291(6-7): 551-4.

83. Fader R.C., Houston C.W., Davis Ch.P. Evidence that in vitro adherence of Klebsiella pneumoniae to ciliated hamster tracheal cells is mediated by type 1 fimbriae. Curr. Microbiol. 1984;10:29-34.

84. Falbo V., Pace Т., Picci L. et al. Isolation and nucleotide sequence of the gene encoding cytotoxic necrotizing factor 1 of Escherichia coli. Infect Immun. 1993; 61(11): 4909-14.

85. Flatau G., Lemichez E., Gauthier M. et al. Toxin-induced activation of the G protein p21 Rho by deamidation of glutamine. Nature. 1997; 387(6634): 72933.

86. Flatau G., Landraud L., Boquet P. et al. Deamidation of RhoA glutamine 63 by the Escherichia coli CNF1 toxin requires a short sequence of the GTPase switch 2 domain. Biochem Biophys Res Commun. 2000; 267(2): 588-92.

87. Fiorentini C., Falzano L., Fabbri A. et al. Activation of Rho GTPases by Cytotoxic Necrotizing Factor 1 Induces Macropinocytosis and Scavenging Activity in Epithelial Cells. Mol. Biol. Cell. 2001; 12: 2061 2073.

88. Finlay B.B., Falkow S. Common themes in microbial pathogenicity revisited. Microbiol. Mol. Biol. Rev.1997, 61: 136-169.

89. Fischer J., Maddox C., Moxley D. et al. Pathogenicity of a dovine attaching effacing Escherichia coli isolate lacking Shiga-like toxing. Am. J. Vet. Rev. 1994;55:991-999.

90. Fiorentini C., Fabbri A., Flatau G. et al. Escherichia coli cytotoxic necrotizing factor 1 (CNF1), a toxin that activates the Rho GTPase. J Biol Chem. 1997; 272(31): 19532-7.

91. Feng P., Weagant S.D., Monday S.R. Genetic analysis for .virulence factors in Escherichia coli 0104:H21 that was implicated in an outbreak of hemorrhagic colitis. J Clin Microbiol. 2001; 39(1): 24-8.

92. French G.L., Sannom K.P., Simmons N. Hospital outbreak of Klebsiella pneumoniae resistant to broad-spectrum cephalosporins and (-lactam (-lactomase inhibitor combinations by hyperproduction of SHV-5 (-lactamase. J. Clin. Microbiol. 1996, 34: 358-363.

93. Fredericks D.N., Relman D.A. Application of Polymerase Chain Reaction to the Diagnosis of Infectious Diseases. Clin Infect Dis 1999; 29: 457-88.

94. Goffaux F., China В., Mainil J. Organisation and in vitro expression of esp genes of the LEE (locus of enterocyte effacement) of bovine enteropathogenicand enterohemorrhagic Escherichia coli. Vet Microbiol. 2001, 26;83(3):275-86.

95. Goffaux F., China В., Janssen L. et al. Genotypic characterization of enteropathogenic Escherichia coli (EPEC) isolated in Belgium from dogs and cats. Res Microbiol. 2000;151(10):865-71.

96. Goffaux F., China В., Janssen L. et al. The locus for enterocyte effacement (LEE) of enteropathogenic Escherichia coli (EPEC) from dogs and cats. Adv Exp Med Biol. 1999; 473: 129-36.

97. Gophna U., Oelschlaeger T.A., Hacker J. et al. Yersinia HPI in septicemic Escherichia coli strains isolated from diverse hosts. FEMS Microbiol Lett; 196(1): 57-60.

98. Griffin P.M. Escherichia coli 0157:H7 and other enteropathogenic Escherichia coli. In BlaserM.J., Smith P.D.,Ravdin H.B. et al. Infection of gastrointestinal tract. Raven Press. New York. N.Y. 1995:739-761.

99. Germani Y., Begaud E., Le Bouguenec C. Detection of the Escherichia coli attaching and effacing gene (eaeA) in enteropathogenic strains by polymerase chain reaction. Res. Microbiol. 1997; 148: 177-181.

100. Guerin F., Le Bouguenec C., Gilquin J. et al. Bloody diarrhea caused by Klebsiella pneumoniae: a new mechanism of bacterial virulence? Clin Infect Dis. 1998; 27(3): 648-9.

101. Gupta A. Hospital-acquired infections in the neonatal intensive care unit—Klebsiella pneumoniae. Semin Perinatol. 2002;26(5):340-5.

102. Goldberg S., Cardash H., Browning H. et. al. Isolation of Enterobacteriaceae from the mouth and potential association with malodor. J Dent Res. 1997; 76(11): 1770-5.

103. Hacker J., Blum-Oehler G., Muhldorfer I. et al. Pathogenicity islands of virulent bacteria: structure, function and impact on microbial evolution. Mol.Microbiol. 1997, 23:1089-1097.

104. Hacker J., Bender L., Ott M. et. al. Deletions of chromosomal region coding for fimbriae and haemolysins occur in vivo and in vitro in various extraintestinal Escherichia coli isolates. Microb Pathog. 1990; 8:213-225.

105. Hansen-Wester I., Hensel M. Salmonella pathogenicity islands encoding type III secretion systems. Microb Infect. 2001; 3:549-59.

106. Heid C.A. Real-time quantitative PCR. Genome Res. 1996; 6: 986-994.

107. Hentschel U., Hacker J. Pathogenicity islands: the tip of the iceberg. Microb Infect. 2001; 3: 545-8.

108. Horiguchi Y. Escherichia coli cytotoxic necrotizing factors and Bordetella dermonecrotic toxin: the dermonecrosis-inducing toxins activating Rho small GTPases. Toxicon. 2001; 39(11): 1619-27.

109. Hostacka A. Klebsiella species from the viewpoint of nosocomial infections and virulence factors. Epidemiol Mikrobiol Imunol. 2001; 50(2): 92-6.

110. Hueck C.J. Type III secretion systems in bacterial pathogens of animals and plants. Microbiol. Mol. Biol. Rev. 1998, 62: 379-433.

111. Inoue M. Hospital outbreak of MEN-1-derived extended spectrum beta-lactamase-producing Klebsiella pneumoniae. J Infect Chemother. 2001; 7(2): 124.

112. Ingersoll M., Groisman E.A., Zychlinsky A. Pathogenicity islands of Shigella. CurrTop Microbiol Immunol. 2002; 264(1): 49-65.

113. Island M.D, Cui X., Warren J.W. Effect of Escherichia coli cytotoxic necrotizing factor 1 on repair of human bladder cell monolayers in vitro. Infect Immun. 1999; 67(7): 3657-61.

114. Jacob-Dubuisson F., Locht c., Antoine R. Two-pertner secreyion in gram-negative bacteria: a thrifty, specific pathway for large virulence-proteine. Mol. Microbiol. 2001, 40 (2): 306-313.

115. Jurgens D., Ozel M., Takaisi-Kikuni N.B. Production and characterization of Escherichia coli enterohemolysin and its effects on the structure of erythrocyte membranes. Cell Biol Int. 2002; 26(2): 175-86.

116. Johnson D.E., Drachenberg C., Lockatell C.V. et. al. The role of cytotoxic necrotizing factor-1 in colonization and tissue injury in a murine model of urinary tract infection. FEMS Immunol Med Microbiol. 2000; 28(1): 37-41.

117. Johnson J.R., O'Bryan T.T., Kuskowski M. et. al. Ongoing horizontal and vertical transmission of virulence genes and papA alleles among Escherichia coli blood isolates from patients with diverse-source bacteremia. Infect Immun 2001; 69(9): 5363-74.

118. Jolivet-Gougeon A., Tamanai-Shacoori Т., Sauvager F. et. al. Production of Escherichia coli group I-like heat-labile enterotoxin by Enterobacteriaceae isolated from environmental water. Microbios 1997; 90(364-365):209-l 8.

119. Jores J., Rumer L., Kiessling S. A novel locus of enterocyte effacement (LEE) pathogenicity island inserted at pheV in bovine Shiga toxin-producing Escherichia coli strain 0103:H2. FEMS Microbiol Lett 2001,16; 204(1): 75-9.

120. Jothikumar N., Griffiths M.W. Rapid detection of Escherichia coli 0157:H7 with multiplex real-time PCR assays. Appl Environ Microbiol 2002;68(6): 3169-71.

121. Jackson M.P., Neill R.J., O'Brien A.D. et al. Nucleotide sequence analysis and comparison of the structural genes for shiga-like toxin I and shiga-like toxin II encoded by bacteriophages E.coli EDL933. FEMS Microbiol.Lett. 1987, 44:109-114.

122. Kabha K., Nissimov L., Athamna A. et.al. Relationships among capsular structure, phagocytosis, and mouse virulence in Klebsiella pneumoniae. Infect Immun. 1995;63(3):847-52.

123. Karch H., Schubert S., Zhang D. et al. A genomic island, termed high-pathogenicity island, is present in certain non-0157 Shiga toxin-producing Escherichia coli clonal lineages. Infect Immun. 1999; 67(11):5994-6001.

124. Kaper J.B., Hacker J. Pathogenicity islands and other mobile virulence elements.-AMS.-Washington D.C.-1999.

125. Kaper J.B. The locus of enterocyte effacement pathogenicity island of Shiga toxin-producing Escherichia coli 0157:H7 and other attaching and effacing E. coli. Jpn J Med Sci Biol. 1998; 51 Supp IS: 101-7.

126. Kaper J.B., McDaniel Т.К., Jarvis K.G. et al. Genetics of virulence of enteropathogenic E. coli. Adv Exp Med Biol. 1997; 412: 279-87.

127. Kenny B. Mechanism of action of EPEC type III effector molecules. Int J Med Microbiol. 2002; 291(6-7): 469-77.

128. Kenny В., Lai L.C., Finlay B.B., Donnenberg M.S. EspA, a protein secreted by enteropathogenic Escherichia coli, is required to induce signals in epithelial cells. Mol.Microbiol.1996, 20: 313-323.

129. Khan N.A., Wang Y., Kim K.J. et al. Cytotoxic necrotizing factor-1 contributes to Escherichia coli K1 invasion of the central nervous system. J

130. Biol Chem. 2002; 277(18): 15607-12.

131. Koga H. Klebsiella sepsis. Ryoikibetsu Shokogun Shirizu. 1999;(23 Pt 1): 262-5.

132. Kobayashi H., Shimada J., Nakazawa M. et al. Prevalence and characteristics of shiga toxin-producing Escherichia coli from healthy cattle in Japan. Appl Environ Microbiol. 2001; 67(1): 484-9.

133. Kuhar I., Grabnar M., Zgur-Bertok D. Virulence determinants of uropathogenic Escherichia coli in fecal strains from intestinal infections and healthy individuals. FEMS Microbiol Lett. 1998; 164(2): 243-8.

134. Krawies S., Riley M. Organization of the bacterial chromosome. Microbiol. Rev. 1990; 54:502-539.

135. Kreft J., Vazquez-Boland J.A., Altrock S. et al. Pathogenicity islands and other virulence elements in Listeria. Curr Top Microbiol Immunol. 2002; 264(2): 109-25.

136. Lai Y.C., Yang S.L., Peng H.L. et al. Identification of genes present specifically in a virulent strain of Klebsiella pneumoniae. Infect Immun. 2000; 68(12): 7149-51.

137. Landraud L., Gauthier M., Fosse T. et al. Frequency of Escherichia coli strains producing the cytotoxic necrotizing factor (CNF1) in nosocomial urinary tract infections. Lett Appl Microbiol. 2000; 30(3): 213-6.

138. Lee C.A. Pathogenicity islands and the evolution of bacterial pathogens.1.fect. Agents Dis.1996, 5:1-7.

139. Lockman H.A., Gillespie R.A., Baker B.D. et al. Yersinia pseudotuberculosis produces a cytotoxic necrotizing factor. Infect Immun. 2002; 70(5): 2708-14.

140. Li L., Zhu Q., Xu J. Identification of high-pathogenicity island-harboring Escherichia coli from children with diarrhea disease. Zhonghua Yi Xue Za Zhi. 2001; 81(23): 1427-9.

141. Liliang P.C., Lin Y.C., Su T.M. et. al. Klebsiella brain abscess in adults. Infection. 2001; 29(2): 81-6.

142. Livrelli V., De Champs C., Di Martino P. et. al. Adhesive properties and antibiotic resistance of Klebsiella, Enterobacter, and Serratia clinical isolates involved in nosocomial infections. J Clin Microbiol. 1996; 34(8): 1963-9.

143. Marches O., Nougayrede J.P., Boullier S. et. al. Role of tir and intimin in the virulence of rabbit enteropathogenic Escherichia coli serotype 0103:H2. Infect Immun. 2000; 68(4): 2171-82.

144. Maroncle N., Balestrino D., Rich C. et.al. Identification of Klebsiella pneumoniae Genes Involved in Intestinal Colonization and Adhesion Using Signature-Tagged Mutagenesis. Infect Immun. 2002, 70 (8): 4729-4734.

145. Mills M., Meysick K.C., O'Brien A. D. Cytotoxic Necrotizing Factor Type 1 of Uropathogenic Escherichia coli Kills Cultured Human Uroepithelial 5637 Cells by an Apoptotic Mechanism. Infect. Immun. 2000; 68: 5869-5880.

146. Mitsumori K., Terai A., Yamamoto S. et. al. Virulence characteristics of Escherichia coli in acute bacterial prostatitis. J Infect Dis. 1999; 180(4): 137881.

147. Mecsas J., Strauss E.J. Molecular mechanisms of bacterial virulence:type III secretion and pathogenicity islands. Emerg.Infect.Dis. 1996, 2:271 -288.

148. Merino S., Altarriba M., Izquierdo L. et. al. Cloning and sequencing of the Klebsiella pneumoniae 05 wb gene cluster and its role in pathogenesis. Infect Immun. 2000; 68(5):2435-40.

149. Meng J., Zhao S., Doyle M.P. et. al. Polymmerase chain reaction for detecting E.coli 0157:H7. Int. J. Food Microbiol. 1996; 32:103-113.

150. Nakao H. Shiga toxin producing Escherichia coli infection. Nippon Rinsho. 2002; 60(3): 545-50.

151. Nassif X., Fournier J.M., Arondel J. et.al. Mucoid phenotype of Klebsiella pneumoniae is a plasmid-encoded virulence factor. Infect Immun. 1989;57(2):546-52.

152. Niyogi S.K., Pal A, Mitra U. et. al. Enteroaggregative Klebsiella pneumoniae in association with childhood diarrhoea. Indian J Med Res. 2000; 112:133-4.

153. Nataro J.P., Kaper J.B. Diarrheagenic Escherichia coli. Clin.Microbiol.Rev. 1998, 11:142-201.

154. Newton C.R., Graham A. PCR. Oxford: Bios Scientific Publishers. 1996: 18-29.

155. Nowrouzian F., Adlerberth I., Wold A.E. P fimbria, capsule and aerobactin characterize colonic resident Escherchia coli. Epidemiol. Infect. 2001; 126: 11-18.

156. Oelschlaeger T.A., Dobrindt U., Hacker J. Pathogenicity islands of uropathogenic E. coli and the evolution of virulence. Int J Antimicrob Agents. 2002; 19(6): 517-21.

157. Oelschlaeger Т. A., Tall B.D. Invasion of cultured human epithelial cells by Klebsiella pneumoniae isolated from the urinary tract. Infect Immun. 1997; 65(7): 2950-8.

158. Podschun R., Sievers D., Fischer A, . et. al. Serotypes, hemagglutinins, siderophore synthesis, and serum resistance of Klebsiella isolates causing human urinary tract infections. J Infect Dis 1993; 168(6): 1415-21.

159. Pass M. A., Odedra R. Batt R. M. Multiplex PCRs for Identification of Escherichia coli Virulence Genes. Journal of Clinical Microbiology. 2000; 38(5): 2001-2004.

160. Paton A. W., Paton J.C. Detection and Characterization of Shiga Toxigenic Escherichia coli by Using Multiplex PCR Assays for stxl, stx2, eaeA, Enterohemorrhagic E.coli hlyA, rfbOlll, and rfb0157. Journal of Clinical Microbiology. 1998; 36(2): 598-602.

161. Persing D.H., Cimino G.D. Amplification Product Inactivation Methods. Diagnostic Molecular Microbiology. Principles and Applications. Washington: ASM Press. 1993: 105-21.

162. Podschun R., Fischer A., Ullmann U. Characterization of Klebsiella terrigena strains from humans: haemagglutinins, serum resistance, siderophore synthesis, and serotypes. Epidemiol Infec.t 2000; 125(1 ):71-8.

163. Podschun R., Pietsch S., Holler C. et. al. Incidence of Klebsiella species in surface waters and their expression of virulence factors. Appl Environ Microbiol. 2001; 67(7): 3325-7.

164. Podschun R., Ullmann U. Klebsiella spp. as nosocomial pathogens: epidemiology, taxonomy, typing methods, and pathogenicity factors. Clin Microbiol Rev. 1998; 11(4): 589-603.

165. Pollard D.R., Johnson WM., Lior H. et.al. Rapid and specific detection of verotoxin genes in Escherichia coli by the polymerase chain reaction. J Clin Microbiol. 1990; 28(3):540-5.

166. Rakin A., Noelting C., Schubert S. Common and specific characteristics of the high-pathogenicity island of Yersinia enterocolitica. Infect Immun. 1999; 67(10): 5265-74.

167. Recktenwald J., Schmidt H. The nucleotide sequence of Shiga toxin (Stx) 2e-encoding phage phiP27 is not related to other Stx phage genomes, but the modular genetic structure is conserved. Infect Immun. 2002; 70(4): 1896908.

168. Reischl U., Youssef M.T., Kilwinski J. et al. Real-time fluorescence PCR assays for detection and characterization of Shiga toxin, intimin, and enterohemolysin genes from Shiga toxin-producing Escherichia coli. J Clin Microbiol. 2002; 40(7): 2555-65.

169. Ronald A. The etiology of urinary tract infection: traditional and emerging pathogens. Am J Med. 2002 8; 113 Suppl 1 A: 14-19.

170. Sandner L., Eguiarte L.E., Navarro A. et al. The elements of the locus of enterocyte effacement in human and wild mammal isolates of Escherichia coli: evolution by assemblage or disruption? Microbiology. 2001; 147(Pt 11): 314958.

171. Schauer D.B., Falkow S. Attaching and effacing locus of a Citrobacter freundii biotype that causes transmissible murin colonic hiperplasia. Infect Immun. 1993; 61: 2486-24-92.

172. Schmidt H., Montag M., Bockemuhl J. et al. Shiga-like toxin II-related cytotoxins in Citrobacter freundii strans from humans and beef samples. Infect Immun. 1993,61: 534-543.

173. Schmidt G., Aktories K. Rho GTPase-activating toxins: cytotoxic necrotizing factors and dermonecrotic toxin. Methods Enzymol. 2000; 325: 125-36.

174. Schmitt C.K., Meysick K.C., O'Brien A.D. Bacterial toxins: friends or foes? Emerg Infect Dis. 1999; 5(2): 224-34.

175. Schmidt G., Sehr P., Wilm M. et al. Gin 63 of Rho is deamidated by Escherichia coli cytotoxic necrotizing factor-1. Nature. 1997; 387(6634): 7259.

176. Schmidt H., Beutin L., Karch H. Molecular analysis of the plasmid-encoded hemolysin of Escherichia coli 0157:H7 stain EDL933. Infect Immun. 1995; 63: 1055-1061.

177. Schubert S., Rakin A., Fischer D. et al. Characterization of the integration site of Yersinia high-pathogenicity island in Escherichia coli. FEMS Microbiol Lett. 1999; 179(2): 409-14.

178. Schubert S., Rakin A., Karch H. et al. Prevalence of the "high-pathogenicity island" of Yersinia species among Escherichia coli strains that are pathogenic to humans. Infect Immun. 1998, 66(2): 480-5.

179. Schubert S., Cuenca S., Fischer D. et al. High-pathogenicity island of Yersinia pestis in enterobacteriaceae isolated from blood cultures and urine samples: prevalence and functional expression. J Infect Dis. 2000; 182(4): 1268-71.

180. Sen K., Asher D.M. Multiplex PCR for detection of Enterobacteriaceae in blood. Transfusion. 2001; 41(11): 1356-64.

181. Shea J.E., Beuzon C.R., Gleeson C. et al. Influence of the Salmonella typhimurium pathogenicity island 2 type III secretion system on bacterial growth in the mouse. Infect.Immun. 1999, 67: 213-219.

182. Silveira W.D., Benetti F., Lancellotti M. et al. Biological and genetic characteristics of uropathogenic Escherichia coli strains. Rev Inst Med Trop Sao Paulo. 2001; 43(6): 303-10.

183. Stroeher U.N., Bode L., Beutin L. et al. Characterization and sequence of a 33-kDa enterohemolysin (Ehly 1 )-associated protein in Escherichia coli. Gene. 1993; 132(1): 89-94.

184. Sugiyama H., Ono Y. Klebsiella pneumoniae pneumonia. Ryoikibetsu Shokogun Shirizu. 1999; (23 Pt 1): 366-8.

185. Sebghati Т.A., Korhonen Т.К., Hornick D.B. et al. Characterization of the type 3 fimbrial adhesins of Klebsiella strains. Infect Immun. 1998; 66(6): 2887-94.

186. Taneike I., Zhang H.M., Wakisaka-Saito N. et al. Enterohemolysin operon of Shiga toxin-producing Escherichia coli: a virulence function of inflammatory cytokine production from human monocytes. FEBS Lett. 2002; 524(1-3): 219-24.

187. Terai A., Yamamoto S., Mitsumori K. et al. Escherichia coli virulence factors and serotypes in acute bacterial prostatitis. Int J Urol. 1997; 4(3): 28994.

188. Torres A.G., Kaper J.B. Pathogenicity islands of intestinal E. coli. Сип-Тор Microbiol Immunol. 2002; 264(1): 31-48.

189. Vernet V., Philippon A., Madoulet C. et al. Virulence factors (aerobactin and mucoid phenotype) in Klebsiella pneumoniae and Escherichia coli blood culture isolates. FEMS Microbiol Lett. 1995; 130(1): 51-7.

190. Winstanley C., Hart C.A. Type III secretion systems and pathogenicity islands. J Med Microbiol. 2001; 50(2): 116-26.

191. White T.J. Amplification Product Detection Methods. Diagnostic Molecular Microbiology. Principles and Applications. Washington: ASM Press; 1993: 138-48.

192. Yamamoto S., Terai A., Yuri K. et. al. Detection of urovirulence factorsin Escherichia coli by multiplex polymerase chain reaction. FEMS Immunol Med Microbiol. 1995; 12(2): 85-90.

193. Yinnon A.M., Burtaru A., Raveh D., et.al. Klebsiella bacteriamia: community versus nosocomial infection.Q J Med. 1996;.89:933-941.

194. Yoshida K., Matsumoto Т., Tateda K. et.al. Role of bacterial capsule in local and systemic inflammatory responses of mice during pulmonary infection with Klebsiella pneumoniae. J Med Microbiol. 2000; 49(11): 1003-10.

195. Zhu C., Harel J., Jacquec M. et. al. Virulence properties and attaching-effacing activiti of Escherichia coli 045 from swine postweaning diarrhea. Infect.Immun. 1994; 62: 4153-4159.