Формирование патогенного потенциала у аутоштаммов Escherichia coli в ассоциативном симбиозе толстой кишки у детей с функциональными нарушениями желудочно-кишечного тракта тема диссертации и автореферата по ВАК РФ 03.02.03, кандидат наук Иванова, Елена Иннокентьевна

• Иванова, Елена Иннокентьевна
• кандидат наук
• 2014

Оглавление диссертации кандидат наук Иванова, Елена Иннокентьевна

СОДЕРЖАНИЕ

Стр.

ПЕРЕЧЕНЬ СОКРАЩЕНИЙ И УСЛОВНЫХ ОБОЗНАЧЕНИЙ

ВВЕДЕНИЕ

ГЛАВА 1. ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ

1.1. Микробиота желудочно-кишечного тракта человека в норме и патологии

1.2. Функциональные ' нарушения желудочно-кишечного тракта

1.3. Кишечник и иммунитет

1.4. Роль кишечной палочки в норме и патологии у детей, характеристика ее антигенной структуры и основных факторов

патогенно сти

ГЛАВА 2. МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ ИССЛЕДОВАНИЙ

2.1. Объекты исследований

2.2. Методы исследований

2.2.1. Микробиологические исследования

2.2.2. Молекулярно-генетические исследования

2.2.3. Статистические методы

РЕЗУЛЬТАТЫ СОБСТВЕННЫХ ИССЛЕДОВАНИЙ

ГЛАВА 3. ХАРАКТЕРИСТИКА КИШЕЧНОГО МИКРОБИОЦЕНОЗА

У ДЕТЕЙ РАЗНОГО ВОЗРАСТА, ПРОЖИВАЮЩИХ В Г. ИРКУТСКЕ

3.1. Микроэкологическая характеристика интестинального биоценоза детей с функциональными нарушениями желудочно-кишечного

тракта

ГЛАВА 4. МОЛЕКУЛЯРНО-ГЕНЕТИЧЕСКАЯ ХАРАКТЕРИСТИКА ФАКТОРОВ ПАТОГЕННОСТИ ESCHERICHIA COLI, ВЫДЕЛЕННЫХ ИЗ КИШЕЧНИКА ЗДОРОВЫХ ДЕТЕЙ И ДЕТЕЙ С ФУНКЦИОНАЛЬНЫМИ НАРУШЕНИЯМИ ЖЕЛУДОЧНО-

КИШЕЧНОГО ТРАКТА

4.1. Обнаружение генетических детерминант токсинообразования у штаммов Escherichia coli, выделенных от детей с функциональными нарушениями желудочно-кишечного тракта

4.2. Определение частоты встречаемости генов, кодирующих способность к формированию связывания пилей и синтез адгезина интимина у аутоштаммов Escherichia coli

4.3. Характеристика комплекса генетических маркеров факторов патогенности в штаммах Escherichia coli, выделенных из кишечника детей с

функциональными нарушениями желудочно-кишечного тракта

ГЛАВА 5. ОБСУЖДЕНИЕ РЕЗУЛЬТАТОВ

ВЫВОДЫ

ПРАКТИЧЕСКИЕ РЕКОМЕНДАЦИИ И ПЕРСПЕКТИВЫ

ДАЛЬНЕЙШИХ ИССЛЕДОВАНИЙ

СПИСОК ИСПОЛЬЗОВАННЫХ ИСТОЧНИКОВ

СПИСОК СОКРАЩЕНИЙ

ГУС (HUS) - гемолитико-уремический синдром

ДАКП (DAEC) - диффузно-агрегативный тип Е. coli

ДНК — дезоксирибонуклеиновая кислота

КОЕ - колониеобразующие единицы

ЛПС — липополисахарид клеточной стенки

ОКИ - острые кишечные инфекции

ПЦР - полимеразная цепная реакция

РНК — рибонуклеиновая кислота

СРК - синдром раздраженного кишечника

УПМ - условно-патогенные микроорганизмы

ФН - функциональные нарушения

ЖКТ - желудочно-кишечный тракт

ЭАКП (ЕАЕС) - энтероагрегативный тип Е. coli

ЭГКП - энтерогемморагический тип Е. coli

ЭИКП (EIEC) - энтероинвазивный тип Е. coli

ЭПКП (ЕРЕС) - энтеропатогенный тип Е. coli

ЭТКП (ЕТЕС) - энтеротоксигенный тип E.coli

E.coli СФА - E.coli со слабой ферментативной активностью

E.coli ГА - E.coli с гемолитической активностью

ЕНЕС (VTEC) - шигатоксигенный тип Е. coli

IgA, IgM, IgG, IgE - иммуноглобулины классов А, М, G, Е

LT — термолабильные энтеротоксины

РАМР — патоген-ассоциированные молекулярные образы

PRR - образраспознающие рецепторы

slgA - секреторный иммуноглобулин А

ST - термостабильные энтеротоксины

E.coli (гем+) — E.coli с гемолитической активностью

Введение диссертации (часть автореферата) на тему «Формирование патогенного потенциала у аутоштаммов Escherichia coli в ассоциативном симбиозе толстой кишки у детей с функциональными нарушениями желудочно-кишечного тракта»

ВВЕДЕНИЕ

Актуальность проблемы

Международные исследования микробиома человека, проекты глобального масштаба последнего десятилетия (Human Microbiome Project и Meta-HIT project), позволили пролить свет на огромную роль микробиоты человека в сохранении физиологического здоровья и тесной взаимосвязи его дисбиотических состояний со множеством заболеваний макроорганизма (Arumugam М. et al., 2011; Qin J. et al., 2010). В микробиоме человека наиболее представительна микробиота желудочно-кишечного тракта, в структуре патологии которого значительное место в детском возрасте занимают функциональные нарушения (Хавкин А.И., 2001; Tyler A.D. et al., 2013). В настоящее время кишечная микробиота расценивается как отдельный орган в организме человека, который за счет метаболических процессов, обеспечивает многие физиологические и неврологические реакции (Umu О.С.О. et al., 2013). В нормальных физиологических условиях макроорганизм и его микробиота представляют собой сложный, многофункциональный, динамический, равноправный симбиоз (эубиоз) (Ефимов Б.А. и др., 2002; Войда Ю.В. и др., 2012). При превышении пороговой величины отрицательно воздействующих на организм экзогенных и эндогенных факторов микробиоценозы выходят из состояния равновесия, что проявляется не только микроэкологическими, или иммунными нарушениями, но и огромным спектром заболеваний, сопряженных с нарушением микроэкологического гомеостаза (Abbasian F. et al., 2013). Иммунная система детей играет решающую роль в этих процессах как мощный защитный барьер и регулятор патологических состояний организма, а возрастная структура детей характеризуется некоторыми особенностями развития иммунитета. Для понимания функциональных возможностей иммунитета растущего организма важно знать физиологию его становления, которая определяется наличием пяти критических периодов развития (Стефани Д.В. и др., 1977; Хаитов P.M., 2001; Леванова Л.А. и др., 2003; Никулин Б.А., 2007; Щеплягина Л.А. и др., 2009). Немногочисленные исследования свидетельствуют о том, что для каждого периода развития

иммунной системы детей характерен своеобразный состав микробиоты кишечника (Леванова Л.А. и др., 2003; Спирюкова У.А., 2010; Куандыкова А.К. и др., 2010). Поэтому вопросы профилактики дисбиотических расстройств вызывают возрастающий интерес, поскольку поддержание на физиологическом уровне нормальной микробиоты человека предупреждает как развитие дисбиозов, так и многих других заболеваний, развивающихся и углубляющихся на их фоне (Янковский Д.С. и др., 2010).

Любые нарушения приводят к доминированию в биотопе потенциально опасных микроорганизмов, усилению генетического обмена и формированию клонов, несущих геномные «острова» патогенности, а также множественную лекарственную устойчивость микроорганизмов. Избыточное заселение при дисбиозах биотопов человека полирезистентными, высоковирулентными штаммами условно-патогенной биоты таит в себе опасность повреждения нормальной биопленки и замены ее на «дефектную» биологическую структуру, отличающуюся патологической концентрацией внедрившихся в нее дисбиозных микроорганизмов (Янковский Д.С. и др., 2010).

Escherichia coli, являясь постоянным обитателем кишечника человека, входит в состав его микробиоценоза. В норме кишечная палочка выполняет ряд полезных для хозяина функций - синтезирует витамины и аминокислоты, поддерживает колонизационную резистентность кишечника, обеспечивает антигенную стимуляцию местного иммунитета (Тюрин Ю.А. и др., 2002). Между тем, при нарушениях микроэкологического характера E.coli способна резко наращивать не только свое количественное присутствие, но и проявлять патогенные свойства, что играет важную роль в патогенезе развития дисбиоза кишечника. Постоянный антигенный дрейф, наличие или приобретение различных факторов патогенности (токсины, гемолизины, некротизирующий и гемолитический факторы, сидерофоры) затрудняют проведение эффективной специфической профилактики эшерихиоза, что побуждает не только постоянно осуществлять мониторинг данной инфекции, но изучать и контролировать биологические свойства возбудителя (прежде всего его антибиотикорезистентность и наличие различных

маркеров патогенности) (Мамбетова Э.Ф., 2007; Лайман Е.Ф. и др., 2012). Наличие подобных свойств повышает патогенный потенциал микробов, придавая им высокую экологическую пластичность и способность активно участвовать в воспалительном процессе (Гриценко В.А. и др., 2000).

В конечном итоге характер формирующегося патологического процесса и клинические проявления заболевания непосредственно будут зависеть от тех факторов патогенности, которые экспрессирует возбудитель (Малов В.А. и др., 2005).

Особого внимания заслуживают кишечные (диарейные) заболевания, обусловленные штаммами Е.соН, продуцирующими 8Ы§а-подобный токсин. Вызываемые шигатоксигенным типом вспышки происходят все чаще, последняя из них (май-июнь 2011 г.) в Германии охватила свыше 4000 человек, у 25 % из которых диарея сопровождалась развитием гемолитико-уремического синдрома. Заболевание завершилось летальным исходом в 39 случаях (возбудитель серотип ОЮ4:Н4) (Кафтырева Л.А. и др., 2011; ВггизгЫешюг Е. е1 а1., 2011; Сого§еапи О. & а1., 2012).

Раскрытие механизмов межмикробных взаимодействий, определяющих формирование и поддержание ассоциативных симбиозов организма хозяина в норме и при патологических состояниях, открывает перспективы решения фундаментальных проблем микробиологии - выявления причинно-следственных связей формирования патогенных вариантов микросимбионтов.

Обобщая высказанные положения, следует признать высокую актуальность исследований, посвященных одновременному изучению инфекционного, иммунного и морфологического факторов в патогенезе заболеваний кишечника.

Цель исследования — изучить динамику формирования патогенного потенциала микроорганизмов-симбионтов кишечного микробиоценоза для оценки риска развития воспалительных процессов у детей с функциональными нарушениями желудочно-кишечного тракта.

Для достижения указанной цели исследования были поставлены следующие задачи:

1. Дать микробиологическую характеристику кишечного биоценоза и изучить ассоциативные взаимоотношения симбионтов толстой кишки у детей разного возраста с функциональными нарушениями желудочно-кишечного тракта.

2. Установить наличие и частоту встречаемости фрагментов генов «островов» патогенности у аутоштаммов Escherichia coli, выделенных при функциональных нарушениях желудочно-кишечного тракта у детей разных возрастных групп.

3. Определить характер взаимосвязи между наличием патогенного потенциала изученных культур индигенной Escherichia coli с сопутствующей кишечной микробиотой.

Научная новизна

Впервые показано, что аутоштаммы E.coli с нормальной ферментативной активностью, выделенные от детей с функциональными нарушениями желудочно-кишечного тракта, несут фрагменты ДНК «островов» патогенности, гомологичные известным генам кластеров патогенности Escherichia coli и характерным для диареегенных штаммов (энтеропатогенных, энтерогемморагических E.coli).

Регистрация генетических детерминант патогенности в аутоштаммах индигенных эшерихий в сочетании с сопутствующей потенциально-патогенной микробиотой дают основание для дальнейшего изучения вопросов, связанных с внутривидовой пластичностью и эволюцией E.coli.

Практическая значимость работы обоснована научной новизной проведенных исследований.

Полученные в работе данные расширяют и углубляют представления о характере межмикробных взаимодействий, определяющих формирование и поддержание микросимбиоценозов кишечника, что позволит оптимизировать диагностику, профилактику и коррекцию патомикробиоценозов.

Использование метода ПЦР для детекции факторов патогенности в аутоштаммах индигенной E.coli целесообразно для получения объективной информации о локальной циркуляции аутоштаммов E.coli с наличием детерминант патогенности.

Полученные новые данные используются в учебном процессе на кафедре эпидемиологии и микробиологии ГБОУ ДПО ИГМАПО МЗ РФ, физико-химической биологии ФГБОУ ВПО ИГУ. Положения, выносимые на защиту

1. Развитие микроэкологических нарушений в кишечном биотопе у детей с функциональными нарушениями желудочно-кишечного тракта характеризуются снижением доминирования и значимости индигенной симбиотической биоты, что сопровождается нарушением контроля за составом условно-патогенных видов.

2. Штаммы E.coli разных фенотипических групп (вариантов), выделенные от детей с функциональными нарушениями желудочно-кишечного тракта, являются резервуаром генетических детерминант факторов патогенности, обеспечивающих главным образом колонизацию (закрепление) микроорганизмов и синтез шига-подобных токсинов.

3. Потенциал факторов патогенности в составе популяций E.coli формируется у детей с функциональными нарушениями желудочно-кишечного тракта чаще при дисбиотических нарушениях, нежели при эубиозе.

Апробация работы

Результаты проведенных исследований были доложены и обсуждены на:

• Ежегодной научно-теоретической конференции аспирантов и студентов Иркутского государственного университета (г. Иркутск, 2009).

• Научно-практической конференции «Экспериментальные подходы в решении медико-биологических проблем» (г. Иркутск, 2011).

• II Межрегиональной научно-практической конференции молодых ученых «Человек: здоровье и экология» (г. Иркутск, 2011).

• IX Научно-практической конференции молодых ученых, посвященной 35-летнему юбилею Научно-исследовательского института медицинских проблем Севера СО РАМН «Актуальные вопросы охраны здоровья населения регионов Сибири» (г. Красноярск, 2011).

• Межрегиональной научно-практической конференции молодых ученых «Экологические и медицинские проблемы Сибири» (г. Ангарск, 2012).

• Научно-практической конференции молодых ученых «Диагностика, профилактика и надзор за природно-очаговыми и другими инфекционными болезнями» (г. Иркутск, 2013).

• 80-ой Юбилейной Всероссийской Байкальской научно-практической конференции молодых ученых и студентов с международным участием «Актуальные вопросы современной медицины» (г. Иркутск, 2013).

• Международной конференции «Молекулярная эпидемиология актуальных инфекций» (г. Санкт-Петербург, 2013).

• Юбилейной научно-практической конференции с международным участием, посвященной 90-летию организации кафедры инфекционных болезней «Актуальные проблемы современной инфектологии» (г. Иркутск, 2013).

• Научно-практической конференции педиатров «Актуальные проблемы детской инфектологии (г. Иркутск, 2013).

• III Межрегиональной научно-практической конференции молодых ученых «Человек: здоровье и экология» (г. Иркутск, 2013).

Публикации: По теме диссертации опубликовано 20 научных работ, из них 8 в изданиях, рекомендованных ВАК Минобразования и науки РФ для публикаций материалов диссертационных работ.

Личный вклад соискателя. Автору принадлежит ведущая роль в проведении экспериментов, анализе и обобщении полученных результатов. В работах вклад автора является определяющим и заключается в непосредственном участии на всех этапах исследования: от постановки задач, их экспериментально-теоретической реализации до обсуждения результатов в научных публикациях и докладах. Лабораторные, клинические, молекулярно-генетические исследования проведены непосредственно автором настоящей работы на базе лаборатории микроэкологии и клиники ФГБУ «Научного центра проблем здоровья семьи и репродукции человека» СО РАМН.

Автор выражает искреннюю признательность за консультативную, практическую и организационную помощь в работе над диссертационной работой к.б.н. Ю.П. Джиоеву, к.б.н. Е.Б. Раковой.

Объем и структура диссертации. Диссертация состоит из введения, обзора литературы, описания материалов и методов исследования, глав собственных исследований и обсуждения результатов, выводов и списка использованных литературных источников. Работа изложена на 125 страницах машинописного текста, иллюстрирована 7 таблицами, 20 рисунками. Библиографический указатель включает 147 наименований отечественных и 77 зарубежных источников литературы.

ГЛАВА 1. ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ

1.1. Мнкробпота желудочно-кишечного тракта человека в норме и патологии

Микробиоценоз кишечника является центром микроэкологической системы человека, для которой характерно наличие сложного динамического равновесия между гомеостазом макроорганизма и микробными ассоциациями, заселяющими его (Бондаренко В.М. и др., 2007; Щербаков П.Л. и др., 2007; Бурковская В.А. и др., 2009). В настоящее время взаимодействие человека и микроорганизмов рассматривается с позиции ассоциативного симбиоза, представляющего собой многокомпонентную интегральную систему, включающую организм человека в качестве макропартнера, стабильный доминантный микросимбионт и минорные, ассоциированные микросимбионты с разнонаправленными воздействиями, определяющими формирование, стабильность существования и продуктивность симбиоза в целом (Перунова Н.Б. и др., 2010; Бухарин О.В. и др., 2012).

Состав кишечной микробиоты достаточно индивидуален и формируется в первые дни жизни ребенка, состав которой остается стабильным (Хавкин А.И., 2003; Юлиш Е.И. и др., 2011; Джантасова А.Д., 2013). В отличие от взрослых кишечная микробиота младенцев вариабельна по составу и может легко изменяться в течение времени. Основным источником бактерий для новорожденного ребенка является вагинальная, кишечная и кожная микробиота матери, которые попадают в организм ребенка при прохождении родовых путей и первых контактах. В условиях современного родильного дома источником бактерий является также внутренняя среда родильного отделения, руки персонала и окружающие дети. Первыми кишечник младенца колонизируют аэробные бактерии, так как ранний постнатальный период характеризуется высоким уровнем кислорода в тканях, далее с 3-го дня жизни происходит постепенная колонизация анаэробных бактерий. Нарушения процессов нормальной колонизации кишечника младенца могут быть связаны с оперативным родоразрешением, использованием антибиотиков в раннем постнатальном

периоде, отсутствием грудного вскармливания (Булатова Е.М. и др., 2011; Nutten S. et al., 2007).

Видовой и количественный состав микробных популяций в разных биотопах желудочно-кишечного тракта (ЖКТ) неоднороден, но каждый из биотопов представляет собой микроэкологическую саморегулирующуюся систему, все компоненты которой (макроорганизм + микробиота) выполняют взаимополезные функции и находятся в состоянии симбиоза, поддерживая в этой системе динамическое равновесие - эубиоз (Янковский Д.С. и др., 2010).

Качественный и количественный состав микробиоты разных отделов пищеварительного тракта имеет существенные различия (Николаева И.В., 2010). По последним данным, в составе кишечной микробиоты обнаружено 395 филогенетических групп микроорганизмов, из которых 244 (62 %) являются абсолютно новыми. Общее количество видов приближается к 1500 и требует уточнения (Eckburg P.B. et al., 2005). В верхних отделах тонкой кишки

2 3

микроорганизмы определяются в небольшом количестве (не более 10 - 10

КОЕ/мл содержимого), в подвздошной кишке совокупное количество

микроорганизмов составляет до 10б КОЕ/мл химуса (Николаева И.В., 2010). В

тонкой кишке микроорганизмы локализуются преимущественно пристеночно

(Яковенко Э.П. и др., 2008). Самая высокая плотность микробного обсеменения в

11 12

толстой кишке - около 400 различных видов (10м - 101Z КОЕ/г фекалий) (Белоусова Е.А. и др., 2005; Zoetendal E.G. et al., 2004). Главная (резидентная) биота толстой кишки представлена бифидобактериями, бактероидами и лактобациллами, которые составляют до 90 % всей толстокишечной микробиоты. Эти представители относятся к анаэробным микроорганизмам. К резидентной микробиоте относятся также фекальный энтерококк и пропионовокислые бактерии, однако их доля в общем пуле микробных популяций незначительна (Тец В.В., 1994; Бондаренко В.М. и др., 2003). Сопутствующую (факультативную) биоту представляют главным образом аэробные микроорганизмы: эшерихии, эубактерии, фузобактерии, различные кокки - в общей сложности около 10%. Менее 1 % приходится на долю многочисленных представителей остаточной

биоты, включая аэробов и анаэробов. Таким образом, 90 % кишечной микробиоты составляют анаэробные бактерии, соотношение анаэробы : аэробы = 10:1 (Шендеров Б.А. , 1998; Бондаренко В.М. и др., 2003; Ардатская М.Д. и др., 2004). Именно толстая кишка в силу такой высокой микробной контаминации несет самую большую функциональную нагрузку по сравнению с другими биотопами (Белоусова Е.А. и др., 2005).

По характеру метаболизма микробиота толстой кишки разделяется на две основные группы: протеолитические и сахаролитические бактерии. Протеолитические виды (бактероиды, протей, эшерихии, клостридии и др.) используют в качестве питательного и энергетического субстрата продукты белкового гидролиза и как конечные метаболиты своей жизнедеятельности образуют токсичные вещества, в том числе аммиак, ароматические аминокислоты, эндогенные канцерогены, сульфиды и др., вызывают гнилостные процессы. Эти субстанции способствуют развитию воспаления, диареи, неоплазий. Большинство протеолитических микроорганизмов являются условно-патогенами (Белоусова Е.А. и -др., 2005; Костюкевич О.И., 2007; Яковенко Э.П. и др., 2008; Приходько В.Ю., 2012). Сахаролитическая биота (бифидобактерии, лактобактерии, некоторые кокки, пропионовокислые бактерии) используют для жизнедеятельности углеводные субстраты, поступающие в толстую кишку, и полисахариды кишечной слизи. Метаболические функции, выполняемые сахаролитическими микробами, являются полезными для организма хозяина, поддерживают гомеостаз и нейтрализуют негативные влияния протеолитической микробиоты (Бондаренко В.М. и др., 2003; Яковенко Э.П. и др., 2008).

Нормальная микробиота человека рассматривается как качественное и количественное соотношение популяций микробов отдельных органов и систем, поддерживающих биохимическое, метаболическое и иммунологическое равновесие организма хозяина (Бондаренко В.М. и др., 2003). С современных позиций нормальную микробиоту следует так же рассматривать как интегральную часть организма хозяина, своеобразный экстракорпоральный орган, вовлекаемый в синтез и деградацию собственных и чужеродных субстанций,

структуру, через которую идет транслокация как полезных, так и потенциально вредных агентов (Коршунов В.М. и др., 1997; Крамарь B.C. и др., 2010).

Роль нарушений состава микробиоты ЖКТ в детском возрасте определяется ее неспособностью выполнять в полном объеме физиологические функции, и прежде всего - противостоять колонизации кишечника экзогенными патогенными микроорганизмами. В результате снижения уровня бифидобактерий нарушаются процессы пищеварения: всасывания питательных веществ, синтез витаминов, утрачивается способность к активации различных ферментов и их субстратов в кишечном содержимом. Элиминация лактобактерий приводит к изменению pH кала и снижению уровня ферментативной активности. При наличии кишечных расстройств изменяется большинство биохимических показателей кала: повышается содержание общих липидов, триглицеридов, углеводов, общего белка (Воронцов И.М., 1997). Многими авторами описано развитие мальабсорбции углеводов в патогенезе кишечных инфекций, как фактор, отягощающий их течение (Воронцов И.М., 1997; Никитенко В.М. и др., 2004; Постникова Е.А. и др., 2004). На фоне снижения резистентности организма и угнетения иммунологических сил при нарушении питания, гиповитаминозах или интеркурентных инфекциях и прочего создаются условия для реализации патогенного действия условно-патогенных микроорганизмов (УПМ). Чаще всего в результате элиминации индигенных микроорганизмов экологические ниши заселяются представителями условно-патогенной аэробной биоты - бактериями родов Klebsiella, Enterobacter, Proteus, Staphylococcus, Clostridium (С. difficile), Acinetobacter, Pseudomonas и грибов рода Candida, которые высокорезистентны к антибиотикам и менее требовательны к условиям размножения. Среди всех изученных культур условно-патогенных энтеробактерий, по данным исследований О.Г. Крамаря, самым высоким уровнем устойчивости к антибиотикам отличались Proteus spp. (89%), затем Klebsiella spp. (51-94%), Enterobacter spp. (56-98 %), Staphylococcus spp. (67-90 %) (Крамарь О.Г., 1997).

Нарушение видового и количественного состава микробных популяций и рост УПМ в определенном биотопе, приводящие к нарушению динамического

равновесия (эубиоза) в экосистеме данного биотопа, называют дисбиозом. Процесс может, однако, на этом не закончиться. Изменение биоценоза одного биотопа влечет за собой транслокацию микроорганизмов в нехарактерные биотопы и снижение колонизационной резистентности как отдельных биотопов, так и всей микроэкологической системы «человек - микробиота» (Коршунов В.М. и др., 1996; Маев И.В. и др., 2008; Савастеева A.B. и др., 2013). С нарушением микробной экологии кишечного тракта в настоящее время связывается развитие различных заболеваний человека: атопического дерматита, бронхиальной астмы, кишечных дисфункций, антибиотикоассоциированной диареи, частых респираторных инфекций и др. (Парфёнов А.И. и др., 2007; Schmidt W.P., 2004; Högenauer С. et al., 2006). Кроме того, наличие УПМ в тонкой и толстой кишке может приводить к развитию воспалительных процессов (Григорьев П.Я. и др., 2000).

Таким образом, как только в организме происходят патологические изменения, меняются состав и свойства кишечной микробиоты (Ардатская М.Д., 2010). Нарушения микробиоценоза, как правило, являются следствием функциональной или органической патологии ЖКТ микробиоты. Подводя итог вышеизложенному, хотелось бы отметить, что на настоящем этапе кишечную микробиоту следует рассматривать с позиции одной из функциональных систем макроорганизма, которая находится в тесной взаимосвязи с другими функциональными системами; при этом конечный результат их взаимодействия направлен на выравнивание нарушенного равновесия. Кишечная микробиота, неся большую функциональную нагрузку, не может не участвовать в возникновении и поддержании функциональных и патологических расстройств, поэтому выбор терапии должен быть корректным и направлен на то звено нарушенной регуляции, которое утратило возможность самовосстановления.

1.2. Функциональные нарушения желудочно-кншечного тракта

Функциональные нарушения (ФН) желудочно-кишечного тракта (ЖКТ) занимают одно из ведущих мест в структуре патологии органов пищеварения

(Хавкин А.И. и др., 2006). В клинической практике врача-гастроэнтеролога данные нарушения функции кишечника встречаются часто (Сергиенко Е.И., 2009), особенно у детей. Но наиболее часто они встречаются в первый год жизни ребенка (Самсыгина Г.А., 2000; Беляева И.А. и др., 2006; Белоусов Ю.В., 2007; Анастасевич JI.A., 2008).

Учитывая анатомо-физиологические особенности ребенка, можно с уверенностью утверждать, что в той или иной степени кишечные дисфункции возникают практически у всех детей раннего возраста и являются функциональным, в какой-то мере «условно» физиологическим состоянием периода адаптации и созревания ЖКТ грудного ребенка (Хавкин А.И., 2001). Однако проблема нарушения функции кишечника, как это ни странно, вызывает особый интерес педиатров, неонатологов, гастроэнтерологов и даже невропатологов. Ведение таких детей связано с определенными сложностями, так как мало учитывается тот факт, что пищеварительная система ребенка наиболее сложно адаптируется к внеутробному существованию и очень многие факторы влияют на это (Бердникова Е.К. и др., 2006; Leung А.К. et al., 2004).

Функциональными заболеваниями (или нарушениями) принято считать ситуации, когда в ходе обследования не удается обнаружить анатомических, морфологических, метаболических или иных нарушений, которые могли бы объяснить имеющиеся у ребенка симптомы. Причины функциональных расстройств часто лежат вне пораженного органа и обусловлены нарушением нервной и гуморальной регуляции деятельности пищеварительного тракта. Функциональные нарушения ЖКТ, как правило, связаны именно с расстройствами систем саморегуляции желудка, кишечника, билиарного тракта и др. (Приворотский В.Ф. и др., 2012).

Основными физиологическими функциями ЖКТ являются секреция, переваривание, всасывание и моторика; он является средой обитания симбионтной микробиоты, влияет на становление функций иммунной системы. Перечисленные функции связаны между собой, вначале заболевания может иметь место нарушение только одной из функций, по мере развития болезни могут

изменяться и другие. В настоящее время, если о функциональных нарушениях ЖКТ, то говорят как о нозологической форме, подразумеваются нарушения моторной функции и соматической чувствительности, однако к ним часто присоединяются изменения секреторной, всасывающей функций, микробиоты пищеварительной системы и иммунного ответа (Мухина Ю.Г. и др., 2003).

Согласно широко распространенному определению функциональных нарушений по D.A. Drossman (1994), они представляют собой «разнообразную комбинацию гастроинтестинальных симптомов без структурных или биохимических нарушений». Близким по смыслу является определение ФН, представленное в «Римских критериях II», международном консенсусе по функциональным заболевания органов пищеварения 1999 года (Drossman D.A., 1994; Drossman D.A., 1999). Уязвимость такого определения функциональных нарушений заключается в его зависимости от текущего уровня наших знаний и возможностей методов исследования, которые не позволяют выявить те или иные структурные нарушения, подвергая сомнению сам факт существования этой группы заболеваний. С другой стороны, ФН являются «нарушениями функций органа, причины которых лежат вне пораженного органа и связаны с измененной регуляцией нарушенной функции». Именно это определение представляется наиболее приемлемым как для практической деятельности, так и для теоретического осмысления многообразия патологических процессов в человеческом (да и не только человеческом) организме (Бельмер C.B. и др., 2005).

Список литературы диссертационного исследования кандидат наук Иванова, Елена Иннокентьевна, 2014 год

СПИСОК ИСПОЛЬЗОВАННЫХ ИСТОЧНИКОВ

1. Александров В.А. Основы иммунной системы желудочно-кишечного тракта / В.А. Александров // Методическое пособие. - Санкт-Петербург: МАЛО, 2006. -44 с.

2. Анастасевич Л.А. Кишечные колики у детей раннего возраста: причины, диагностика, лечение / Л.А. Анастасевич // РМЖ. - 2008. - Т. 16. - № 3. - С. 154.

3. Ардатская М.Д. Микробиоценоз кишечника и его роль в развитии и поддержании заболеваний желудочно-кишечного тракта / М.Д. Ардатская // Нов. медицины и фармации. -2010. -№ 313. - С. 55-69.

4. Ардатская М.Д. Дисбактериоз кишечника: понятие, диагностические подходы и пути коррекции. Возможности и преимущества биохимического исследования кала: пособие для врачей / М.Д. Ардатская, О.Н. Минушкин, Н.С. Иконников. - М., 2004. - 57 с.

5. Ассоциации видов и генов патогенности бактерий рода Enterococcus, выделенных из разных биотопов у жителей г. Иркутска / С.М. Попкова, A.C. Волокитина, Ю.П. Джиоев и др. // Известия Иркутск, гос.унив-та Серия «Биология. Экология». - 2011. - Т.4. - №1 (9). - С. 14-25.

6. Атлас по медицинской микробиологии, вирусологии и иммунологии / Под ред. А.А.Воробьева, А.С.Быкова.- М.: Мед. информ. агентство, 2003. - 232 с.

7. Ахваткина Н.Б. Особенности иммунитета детского возраста / Н.Б. Ахваткина, A.A. Махалова // Вестник КазНМУ. - 2012. - №3 - С. 117-120.

8. Бабаян М.Л. Коррекция функциональных запоров в педиатрии: современный взгляд и проверенные веками истины [Электронный ресурс] / М.Л. Бабаян, А.И. Хавкин // РМЖ, Человек и лекарство. - 2011. - Т. 19. - № 5. - Режим доступа: http://www.rmj.ru/articles_7587.htm.

9. Байко C.B. Гемолитико-уремический синдром: эпидемиология, классификация, клиника, диагностика, лечение (Обзор литературы. Часть 1) / C.B. Байко // Нефрология и диализ. - 2007. - Т. 9. - № 4. - С. 370-377.

10. Байко C.B. Гемолитико-уремический синдром: эпидемиология, классификация, клиника, диагностика, лечение (Обзор литературы. Часть 2) / C.B. Байко // Нефрология и диализ. - 2007. - Т. 9. - № 4. - С. 377-386.

11. Баранов A.A. Заболевания органов пищеварения у детей (тонкая и толстая кишка) / A.A. Баранов, Е.В. Климанская - М., 1999. - 210 с.

12. Белая О.Ф. Клиническое значение выявления маркера шига-токсина у больных острыми кишечными инфекционными заболеваниями / О.Ф. Белая, И.Е. Герасимова, В.А. Малов // Кремлевская медицина. Клинический вестник. - 2004.

- № 2. - С. 67-71.

13. Белоусов Ю.М. Гастроэнтерология детского возраста / Ю.М. Белоусов, О.П. Коляда // Учебник. - К.: СПД, 2007. - С. 169-282.

14. Белоусова Е.А. Возможности лактулозы в коррекции нарушений кишечной микрофлоры [Электронный ресурс] / Е.А. Белоусова, H.A. Морозова // Фарматека.

- 2005. - № 1 (97). - Режим доступа: http://www.pharmateca.ru/ru/archive/article/5870.

15. Бердникова Е.К. Функциональные нарушения желудочно-кишечного тракта у детей раннего возраста / Е.К. Бердникова, Е.С. Кешишян // Рус. мед. журнал. -2006. -№ 14 (19). -С. 1397-1400.

16. Блудова Н.Г. Лактобактерии, пробиотики и иммунная система кишечника / Н.Г. Блудова // Современная гастроэнтерология. - 2005. - № 4 (24). - С. 115-120.

17. Бондаренко В.М. Дисбактериоз кишечника как клинико-лабораторный синдром: современное состояние проблемы / В.М. Бондаренко, Т.В. Мацулевич. -М: Гэотар-Медиа, 2007. - 304 с.

18. Бондаренко В.М. Дисбактериозы кишечника у взрослых / В.М. Бондаренко, Н.М. Грачева, Т.В. Мацулевич. - М., 2003. - 206 с.

19. Бондаренко В.М. Симбиотические энтерококки и проблемы энтерококковой оппортунистической инфекции / В.М. Бондаренко, А.Н. Суворов. - М., 2007. - 30 с.

20. Борисов Л.Б. Медицинская микробиология, вирусология, иммунология / Л.Б. Борисов. - Учебник. М.: ООО «Медицинское информационное агентство», 2005.-736 е.: ил.

21. Бухарин О.В. Роль ассоциативных микросимбионтов в функционировании ассоциативного симбиоза / О.В. Бухарин, Е.А. Кремлева, A.B. Сгибнев // Журн. микробиол. - 2012. - № 6. - С. 89-95.

22. Бухарин О.В. Симбиотические взаимоотношения человека и микроорганизмов / О.В. Бухарин , Н.Б. Перунова // Журн. физиология человека. -2012. - Т. 38. -№ 1.-С. 108-115.

23. Видовая характеристика и факторы персистенции облигатно-анаэробных микроорганизмов кишечной микробиоты человека / A.B. Савастеева, Е.В. Иванова, Н.Б. Перунова, Т.А. Бондаренко // Бюллетень Оренбургского научного центра УрО РАН (электронный журнал). - 2013. - №3. - С. 1—11.

24. Вовк Е.И. Острая диарея во внегоспитальной медицинской практике / Е.И. Вовк // Лечащий врач. - 2006. - № 5. - С. 77-84.

25. Возрастные особенности иммунитета у детей / Л.А. Щеплягина, В.М. Чернов, И.В. Круглова, В.М. Делягин // Лекция для врачей. - М., 2008. - С. 36.

26. Возрастные особенности микробиоценоза кишечника у жителей г. Кемерово / Л.А. Леванова, В.А. Алешкин, A.A. Воробьев и др. // ЖМЭИ. - 2001. - № 3. - С. 72-75.

27. Войда Ю.В. Микроэкология человека и роль пробиотических препаратов в терапии гнойно-воспалительных заболеваний в акушерстве и гинекологии / Ю.В. Войда, Н.Л. Солонина // Annals of Mechnikov Institute. - 2012. - № 2. - С. 27-37.

28. Воронцов И.М. Диетология развития - важнейший компонент профилактической педиатрии и валеологии детства / И.М. Воронцов // Педиатрия. - 1997. -№3. - С. 57-61.

29. Вспышки острой кишечной инфекции, вызванные Escherichia coli ОЮ4:Н4, зарегистрированные в странах Европы, и биологические особенности возбудителя / Л.А. Кафтырева, С.А. Егорова, М.А. Макарова и др. // Вестник Санкт-Петербургского университета. - 2011. - Сер. 11. - Вып. 4. - С. 119-126.

30. Гайдышев И.В. Анализ и обработка данных. Специальный справочник / И.В. Гайдышев. - Спб: Питер, 2001. - 750 с.

31. Глебова Н.С. Изменения микробиоценоза кишечника под влиянием дестабилизирующего действия бластоцистной инвазии / Н.С. Глебова // Вестник ОГУ. - 2007. - № 5. - С. 155-160.

32. ГОСТ Р ИСО 5725-2-2002.

33. Григорьев П.Я. Нарушение нормального состава кишечной микрофлоры, клиническое значение и вопросы терапии / П.Я. Григорьев, Я.П. Яковенко // Методическое пособие. - Москва, 2000. - 16 с.

34. Гриценко В.А. Экологические и медицинские аспекты симбиоза Escherichia coli и человека / В.А. Гриценко, О.В. Бухарин // Журн. микробиол. - 2000. - № 3.

- С. 92-99.

35. Джантасова А.Д. Микробиоценоз кишечника у детей с частыми острыми респираторными заболеваниями / А.Д. Джантасова // Вестник Карагандинского университета. Серия «Биология. Медицина. География». - 2013. - № 2 (70). - С. 78-81.

36. Дисбактериоз кишечника: вопросы биологической терапии / А.И. Парфёнов, И.Н. Ручкина, Г.А. Осипов, Ю.К. Калоев // Трудный пациент. - 2007. - Т. 5. - № 5.

- С. 23-28.

37. Дисбактериозы желудочно-кишечного тракта / В.М. Бондаренко, Б.В. Боев, Е.А. Лыкова, А.А. Воробьев // Рос. журнал гастроэнтерологии, гематологии и колопроктологии. - 1998. - № 1. — С. 66-70.

38. Дисбактериозы у детей / А.А. Воробьев, К.И. Савицкая, В.М. Бондаренко и др. // Учебное пособие. - Москва: КМК Лтд, 1998. - 64 с.

39. Дисбиозы и современные подходы к их профилактике / Д.С. Янковский, В.П. Широбоков, Р.А. Моисеенко и др. // Современная педиатрия. - 2010. - № 3 (31).-С. 143-151.

40. Ефимов Б.А. Современные методы оценки качественных и количественных показателей микрофлоры кишечника и влагалища / Б.А. Ефимов, Л.И. Кафарская, В.М. Коршунов // Журн. микробиол. - 2002. - № 4. - С. 72-78.

41. Захарова Е.А. Микроэкологическая характеристика кишечного микробиоценоза часто болеющих детей / Е.А. Захарова, И.С. Азизов // Журн. микробиол. - 2012. - № 2. - С. 63-68.

42. Захарова И.Н. Запоры у детей / И.Н. Захарова, Н.Е. Малова, И.М. Колбашкина // Русский медицинский журнал. - 2005. - № 1. - С. 56-64.

43. Захарова Ю.В. Биологические свойства бифидобактерий в ассоциативном симбиозе толстой кишки / Ю.В. Захарова // Медицина в Кузбассе. - 2010. - № 1. -С. 14-16.

44. Изучение качественного и количественного состава микрофлоры кишечника у клинически здоровых детей в раннем возрасте / Е.А. Постникова, А.П. Пикина, Л.И. Кафарская, Б.А. Ефимов // Журн. микробиол. - 2004. - №1. - С. 67-69.

45. Ильина H.A. E.coli как условно-патогенные бактерии кишечника человека / H.A. Ильина, Е.А. Карпеева, И.Т. Гусева // Современные наукоемкие технологии. -2008.-№9.-С. 60-62.

46. Йоргенсен Дж.Х. Микробиологический справочник для клиницистов / Дж.Х. Йоргенсен // М: Мир, 2006. - 242 с.

47. Капустин В.А. Функциональные заболевания органов пищеварения у детей. Опыт альтернативного чтения / В.А. Капустин, А.И. Хавкин, Ю.А. Изачик. -Алматы, 1994. - 191 с.

48. Карпищенко А.И. Медицинские лабораторные диагностики. Справочник / А.И. Карпищенко. - Санкт-Петербург: Интермедика. - 2002. - 600 с.

49. Кишечная микробиота: современные представления / Е.М. Булатова, Н.М. Богданова, Е.А. Лобанова, Т.В. Габрусская // Педиатрия. - 2009. - № 3. - Т. 87. -С. 104-110.

50. Клинико-эпидемиологическая характеристика и современные аспекты лечения острых инфекционных диарей у детей / В.А. Петров, A.A. Арова, Т.В. Цопа, Н.В. Родионова // Лекарственный вестник. - 2007. - № 3. - С. 12-15.

51. Козлов И.Г. Лекарственные воздействия через рецепторы врожденного иммунитета / И.Г. Козлов, Т.М. Андронова // Современные представления о

молекулярном механизме действия глюкозаминилмурамилдипептида (ГМДП). -2006. - С. 27-37.

52. Комплексные подходы к реабилитации детей с дисфункциями желудочно-кишечного тракта / И.А. Беляева, Г.В. Яцык, Т.Э. Боровик, В.А. Скворцова // Вопросы современной педиатрии. - 2006. - № 5 (3). - С. 109-113.

53. Конь И.Я. Диетотерапия функциональных нарушений органов ЖКТ у детей первого года жизни / И.Я. Конь, Т.Н. Сорвачева // Лечащий Врач. - 2004. - № 2. -С. 55-59.

54. Копанев Ю.А. Взаимосвязь функции местного иммунитета и микробиоценоза кишечника, возможности иммунокоррекции дисбактериоза / Ю.А. Копанев // Лечащий врач. - 2009. - № 9. - С. 66-69.

55. Корниенко Е.А. Актуальные вопросы коррекции кишечной микрофлоры у детей / Е.А. Корниенко. - Учебно-методическое пособие. М.: ГОУ ВУНМЦ МЗ и CP РФ, 2006. - 48 с.

56. Корниенко Е.А. Младенческие кишечные колики: современные представления о механизмах развития и новые возможности терапии / Е.А. Корниенко, Н.В. Вагеманс, O.K. Нетребенко // Вопросы современной педиатрии. -2010. -№5(33). -С. 176-183.

57. Корниенко Е.А. Роль кишечной микрофлоры и пробиотиков в развитии иммунитета у грудных детей / Е.А. Корниенко, O.K. Нетребенко, С.Е. Украинцев // Педиатрия. - 2009. - Т. 87. - № 1. - С. 77-83.

58. Коршунов В.М. Нормальная микрофлора кишечника. Диагностика, профилактика и лечение дисбактериозов кишечника: пособие для врачей и студентов / В.М. Коршунов, H.H. Володин, Б.А. Ефимов. - М., 1997. - 39 с.

59. Коршунов В.М. Рациональные подходы к проблеме коррекции микрофлоры кишечника / В.М. Коршунов, В.В. Смеянов, Б.А. Ефимов // Вестник РАМН. -1996.-№2.-С. 60-65.

60. Костюкевич О.И. Современные представления о микробиоценозе кишечника. Дисбактериоз и его коррекция / О.И. Костюкевич // Русский медицинский журнал. - 2007. - Т. 15. - № 28. - С. 2-7.

61. Крамарь О.Г. Микробные популяции и биоценозы при острых кишечных инфекциях, вызванных условно-патогенными микроорганизмами: автореф. дисс. ... канд. мед. наук. / Крамарь Олег Григорьевич. - Москва, 1997. - 24 с.

62. Куандыкова А.К. Состояние микробиоценоза кишечника у детей с резко ограниченной двигательной активностью / А.К. Куандыкова, Е.К. Куандыков // Гигиена труда и медицинская экология. - 2010. - №4 (29). - С. 112-115.

63. Кулачев А.П. Методы и средства анализа по данным в среде Windows Stadia / А.П. Кулачев. - М.: Информатика и компьютеры, 1999. - 252 с.

64. Лазарева Т.С. Желудочно-кишечный тракт, микрофлора и иммунитет / Т.С. Лазарева, Ф.Ф. Жвания // Педиатрическая фармакология. - 2009. - Т. 6. - № 1. -С. 46-50.

65. Леванова Л.А. Микроэкология кишечника жителей Западной Сибири, коррекция дисбиотических состояний : дис. ... д-ра мед. наук: 03.00.07 / Леванова Людмила Александровна. - Москва, 2003. - 289 е.: ил.

66. Легонькова Т.И. Функциональные расстройства пищеварения и состояние микрофлоры у детей первого года жизни при различных видах вскармливания / Т.И. Легонькова, Е.В. Матвеева // Педиатрия. - 2011. - Т. 90. - № 4. - С. 78-84.

67. Маев И.В. Терапевтическая тактика при синдроме избыточного бактериального роста в тонкой кишке / И.В. Маев, A.A. Самсонов // Consilium medicum. - 2008. - Т. 9. - № 7 - С. 44-50.

68. Малов В.А. Антибактериальные препараты в лечении острых кишечных (диарейных) заболеваний / В.А. Малов, А.Н. Горобченко // Лечащий врач. - 2006. -№ 5. - С. 85-89.

69. Малов В.А. Острые инфекционные диарейные заболевания / В.А. Малов, А.Н. Горобченко // Лечащий Врач. - 2005. - № 2. - С. 6-8.

70. Малый В.П. Эшерихиозы /В.П. Малый //Журн. клиническая иммунология. Аллергология. Инфектология. - 2011 - № 5. - С. 5-18.

71. Мамбетова Э.Ф. Сравнительная характеристика некоторых биологических свойств монокультур и сокультивируемых вариаций бактерий рода Serratia и

Staphylococcus aureus: автореф. дис. ... канд. мед. наук: 03.00.07 / Мамбетова Эльмира Факиловна. - Челябинск, 2007. - 21 с.

72. Маркеры вирулентности у штаммов Escherichia coli Ol / М.А. Макарова, Л.А. Кафтырева, Н.С. Григорьева и др. // Журн. микробиол. - 2011 - № 1. - С. 7173.

73. Маянский А.Н. Дисбактериозы: иллюзии и реальность / А.Н. Маянский // Педиатрия. - 2000. - № 4. - С.80-88.

74. Медицинская микробиология / гл. ред. В.И. Покровский, O.K. Поздеев. -М.: Гэотар Медицина, 1998. - 1200 е.: ил.

75. Методики клинических лабораторных исследований: Справочное пособие. Том 3. Клиническая микробиология. Бактериологические исследования. Микологические исследования. Паразитологические исследования. Инфекционная иммунодиагностика. Молекулярные исследования в диагностике инфекционных заболевангий / Под ред. В.В. Меньшикова. - М.: Лабора, 2009. -С. 71-141.

76. Микробиология / A.B. Воробьев, A.C. Быков, Е.П. Пашков, A.M. Рыбакова. - Учебник - 2-е изд., перераб. и доп. - М.: Медицина, 2003. - 336 с: ил.

77. Микробиоценоз кишечника в критические периоды развития ребенка / Л.А. Леванова, В.А. Алешкин, A.A. Воробьев и др. // Журн. микробиол. - 2001. - № 6. -С. 69-73.

78. Микрофлора кишечника и механизмы иммунорегуляции / С.С. Хромова, А.Н. Шкопоров, Б.А. Ефимов и др. // Вопросы детской диетологии. - 2005. - Т. 3. -№ 1.-С 92-96.

79. Микроэкология кишечника у детей и ее нарушения / П.Л. Щербаков, A.A. Нижевич, В.В. Логиновская и др. // Фарматека. - 2007. - № 14. - С. 28-34.

80. Микроэкологический пейзаж различных биотопов у детей Иркутской области / С.М. Попкова, Е.Б. Ракова, Е.Л. Кичигина и др. // Бюллетень ВСНЦ СО РАМН. - 2012. - № 5 (87). - Ч. 1. - С. 288-292.

81. Микроэкология человека, коррекция дисбактериоза / B.C. Крамарь, Т.Н. Савченко, В.О. Крамарь и др. // Вестник ВолГМУ. - 2010. - Выпуск 4 (36). - С. 73-76.

82. Минушкин О.Н. Функциональные расстройства ЖКТ / О.Н. Минушкин // Consilium medicum. - 2004. - Т. 6. - № 6. - С. 376-381.

83. Минушкин О.Н. Лечение функциональных расстройств кишечника и желчевыводящей системы, протекающих с абдоминальными болями и метеоризмом / О.Н. Минушкин, Г.А. Елизаветина, М.Д. Ардатская // Клиническая фармакология и терапия. - 2002. - Т. 11. - № 1. - С. 25-29.

84. Молекулярно-генетическая характеристика факторов патогенности E.coli, выделенных из операционных ран различных классов / Е.Ф. Лайман, В.А. Шаркова, М.Е. Мазур, М.Н. Просянникова // Международный журнал экспериментального образования. - 2012. - № 5. - С. 84-85.

85. Мухина Ю.Г. Иммунная система и микрофлора кишечника у детей. Обоснование функционального питания / Ю.Г. Мухина, М.И. Дубровская, Л.И. Кафарская // Фарматека. - 2006. - № 2. - С. 22-28.

86. Мюллер П. Таблицы по математической статистике / П. Мюллер, П. Нойман, Р. Шторм. - М: Финансы и статистика, 1982. - 278 с.

87. Нарушение микробиоценоза кишечника при хронических воспалительных заболеваниях кишечника и абсорбционная функция тонкой кишки / В.А. Бурковская, Э.И. Белобородова, Л.А. Акимова и др. // Сибирский медицинский журнал. - 2009. - № 4 (2). - С. 40-45.

88. Нарушение нормального состава кишечных бактерий: клиническое значение и вопросы терапии / Э.П. Яковенко, А.Н. Иванов, А.В. Казарина и др. // РМЖ. - 2008. - № 10 (2). - С. 41^16.

89. Николаева И.В. Клинические аспекты и коррекция дисбактериоза кишечника у детей раннего возраста / И.В. Николаева // Педиатрия. - 2010. - №1. -С. 96-100.

90. Никулин Б.А. Оценка и коррекция иммунного статуса / Б.А. Никулин. - М.: Гэотар-Медиа, 2007. - 375 с.

91. Осипенко М.Ф. Пробиотики в лечении диарейного синдрома / М.Ф. Осипенко, Е.А. Бикбулатова, С.И. Холин // Фарматека. - 2008. - № 13. - С. 36-40.

92. Отраслевой Стандарт «Протокол ведения больных. Дисбактериоз кишечника» / ОСТ 91500.11.0004-2003. Приказ МЗ РФ № 231 от 09.06.2003. - 70 с.

93. Патогенез дисфункций желудочно-кишечного тракта у детей грудного возраста / И.А. Беляева, Г.В. Яцык, И.В. Дворяковский и др. // Российский педиатрический журнал. - 2007. - № 4. - С. 4-7.

94. Перунова Н.Б. Микробная регуляция биологических свойств бактерий кишечного микросимбиоценоза человека / Н.Б. Перунова, Е.В. Иванова, О.В. Бухарин //Журн. микробиол. - 2010. - № 6. - С. 76-80.

95. Показатели местного иммунитета и микробиоценоза кишечника больных сальмонеллезной инфекцией / О.В. Бухарин, И.Н. Чайникова, А.И. Смолягин и др. // Вестник ОГУ (Приложение биология и медицина). - 2005. - №5. - С. 4-8.

96. Приворотский В.Ф. Младенческие кишечные колики: проблема и пути решения / В.Ф. Приворотский, Н.Е. Луппова // Педиатрия. - 2012. - Том 91. - № 4. -С. 98-105.

97. Приходько В.Ю. Хронические запоры у больных пожилого возраста. Оптимизация лечения / В.Ю. Приходько // Семейная медицина. - 2012. - № 1. — С. 79-84.

98. Пушкарева В.И. Растения как резервуар и источник возбудителей пищевых инфекций / В.И. Пушкарева, В.Ю. Литвин, С.А. Ермолаева // Ж. эпидем. и вакцинопроф. - 2012 - № 2. - С. 10-20.

99. Роль бактериальных токсинов в патогенезе гемолитико-уремического синдрома, вызываемого энтерогеморрагическими эшерихиозами / Т.Н. Егорова, В.М. Бондаренко, Д.В. Зверев, Э.А. Светоч //Журн. микробиол., эпидемиол. и иммунобиол. - 2001. - № 1. - С. 82-89.

100. Романцов М.Г. Часто болеющие дети: современная фармакотерапия / М.Г. Романцов, Ф.И. Ершов // Руководство для врачей. - Москва: Издательская группа «Гэотар-Медиа», 2006. - 191 с.

101. Руководство по инфекционному контролю в стационаре // Под ред. Р. Венцеля, Т. Бревера, Ж - П. Бутцлера / МАКМАХ, 2003. - 131 с.

102. Руководство по медицинской микробиологии. Общая и санитарная микробиология. Книга I / Колл. Авторов // Под редакцией А.С. Лабинской, Е.Г. Волиной. - М.: Изд-во БИНОМ, 2008. - 1080 е.: ил.

103. Руководство по медицинской микробиологии. Частная медицинская микробиология и этиологическая диагностика инфекций. Книга II / Колл. авторов // Под ред. А.С. Лабинской, Н.Н. Костюковой, С.М. Ивановой - М.: Изд-во БИНОМ, 2012. - 1152 е.: ил.

104. Ручкина И.Н. Постинфекционный синдром раздраженного кишечника -новое в этиологии и патогенезе функциональных заболеваний / И.Н. Ручкина, А.И. Парфенов, А.Г. Осипов // Consilium medicum. - 2006. - Экстравыпуск. - С. 812.

105. Самсыгина Г.А. Кишечная колика у детей / Г.А. Самсыгина. - Москва. -2000. - 165 с.

106. Сергиенко Е.И. Функциональные расстройства кишечника: диагностика с позиций III Римского консенсуса / Е.И. Сергиенко // Гастроэнтерология (тематический номер) / Практикующему гастроэнтерологу. — 2009. — 294 с.

107. Сидоренко С.В. Инфекционный процесс как «диалог» между хозяином и паразитом / С.В. Сидоренко //КМАХ. -№ 4 (3). - 2001. - С. 301-315.

108. Синдром избыточного газообразования в кишечнике: клиническое значение и принципы терапии [Электронный ресурс] / Л.И. Буторова, А.Н. Коломоец, Е.С. Тарасова и др. // Трудный пациент. - 2005. - № 6. - Режим доступа: http://t-pacient.ru/articles/6178.

109. Современные подходы к лечению острой кишечной инфекции у детей [Электронный ресурс] / Л.В. Закордонец, С.А. Крамарев, Т.В. Береговая и др. // Здоровье ребенка. - 2013. - № 4 (48). - Режим доступа: http://www.mif-ua.com/archive/article_print/36714.

110. Современные представления о механизмах формирования иммунного ответа слизистой оболочки кишечника у детей раннего возраста / М.И.

Дубровская, Ю.Г. Мухина, Л.И. Кафарская, П.В. Шумилов // Трудный пациент. -2006. - Т. 4. - № 6. - С. 9-14.

111. Спирюкова У.А. Возрастные изменения микрофлоры кишечника у детей в критические периоды развития / У.А. Спирюкова // Естествознание и гуманизм. Раздел 2. Актуальные проблемы микробиологии, паразитологии и инфектологии. -2010.-С. 28-29.

112. Становление и динамика кишечной микробиоты в младенчестве: факторы влияния и риски нарушений / Е.М. Булатова, O.K. Нетребенко, И.С. Волкова, Е.А. Лобанова-Дейн // Педиатрия. - 2011. - Т. 90. - № 5. - С. 112-118.

113. Стефани Д.В. Иммунология и иммунопатология детского возраста / Д.В. Стефани, Ю.Е. Вельтищев. - М.: Медицина, 1996. - 364 с.

114. Стефани Д.В. Клиническая иммунология детского возраста / Д.В. Стефани, Ю.Е. Вельтищев. - М.: Медицина, 1977. - 280 с.

115. Супотницкий М.В. Бактериальные токсины. Их природа, механизмы действия, возможности конструирования гибридных и модифицированных токсинов / М.В. Супотницкий // Биопрепараты. - 2011. - № 1. - С. 6-15.

116. Сытник С.И. Экологический подход к оценке кожной микрофлоры / С.И. Сытник // Антибиотики и химиотерапия - 1989. - Т. 34. - № 6. - С. 466-472.

117. Тактика педиатра при младенческих кишечных коликах / И.Н. Захарова, Н.Г. Сугян, E.H. Андрюхина, Ю.А. Дмитриева // Российский медицинский журнал.- 2010. -№ 18 (1).-С. 11-15.

118. Тец В.В. Справочник по клинической микробиологии / В.В. Тец. - СПб., 1994.-223 с.

119. Транслокация бактерий из желудочно-кишечного тракта - естественный защитный механизм / В.М. Никитенко, Е.И. Ткаченко, A.A. Стадников и др. // Экспериментальная и клиническая гастроэнтерология. - 2004. - №1. - С. 48.

120. Тюрин Ю.А. Роль кишечной палочки в норме и патологии у ребенка / Ю.А. Тюрин, В.А. Анохин // Казанский мед. журн. - 2002. - Т. 83. - № 1. - С. 49-52.

121. Уголев A.M. Теория адекватного питания и трофология / A.M. Уголев. — Санкт-Петербург: Наука, 1991. -271 с.

122. Улиско И.Н. Характеристика эшерихиозной микрофлоры кишечника больных острыми кишечными инфекциями / И.Н. Улиско, А.П. Батуро, Э.И. Романенко // Журн. микробиол. - 1993. - № 3. - С. 17-21.

123. Урсова Н.И. Дисбактериозы кишечника у детей. Руководство для практикующих врачей / Н.И. Урсова; под ред. проф. Г.В. Римарчук. - М., 2006. -240 с.

124. Факторы патогенности бактерий семейства Enterobacteriaceae, обеспечивающие выживание в организме хозяина / З.Г. Габидуллин, A.A. Ахтариева, М.М. Туйгунов и др. // Медицинский Вестник Башкортостана. - 2009. -№ 5. - Т. 4.-С. 86-94.

125. Функциональные заболевания пищеварительного тракта у детей. Принципы рациональной терапии / А.И. Хавкин, C.B. Бельмер, Г. Волынец, Н.С. Жихарева // Справочник педиатра: ежемесячный научно-практич. журнал. - 2006. - № 2. - С. 17-32.

126. Функциональные нарушения желудочно-кишечного тракта у детей грудного возраста: роль диетотерапии [Электронный ресурс] / В.А. Скворцова, Г.В. Яцык, Н.Г. Звонкова и др. // Лечащий врач. - 2011. - Режим доступа: http://www.lvrach.ru/2011/06/15435215.

127. Функциональные нарушения желудочно-кишечного тракта, проявляющиеся синдромом рвоты и срыгивания у детей грудного возраста / Ю.Г. Мухина, А.И. Чубарова, С.Г. Грибакин, М.В. Кыштымов // Вопросы современной педиатрии. -2003.-Т. 2. -№ 1. - С. 62-66.

128. Функциональные нарушения органов пищеварения у детей / C.B. Бельмер, Т.В. Гасилина, А.И. Хавкин., A.C. Эйберман // М., 2005. - 36 с.

129. Хавкин А.И. Микробиоценоз кишечника и иммунитет / А.И. Хавкин // РМЖ. - 2003. - Т. 11. - № 3. - С. 3-7.

130. Хавкин А.И. Микроэкология кишечника и аллергия / А.И. Хавкин // Лечащий врач. - 2003. - № 2. - С. 10-15.

131. Хавкин А.И. Функциональные заболевания кишечника у детей / А.И. Хавкин, Н.С. Жихарева // РМЖ. - 2002. - № 10 (2). - С. 78-81.

132. Хавкин А.И. Функциональные нарушения желудочно-кишечного тракта у детей раннего возраста / А.И. Хавкин // Пособие для врачей. - Москва, 2001. - С. 16-17.

133. Хазенсон Л.Б. Иммунологические основы диагностики и эпидемиологического анализа кишечных инфекций / Л.Б. Хазенсон, Н.А. Чайка — СПб.: Медицина, 1987. - 112 с.

134. Хаитов P.M. Иммунная система желудочно-кишечного тракта: особенности строения и функционирования в норме и патологии / P.M. Хаитов, Б.В. Пинегин // Иммунология. - 1997. - №5. - С. 4-7.

135. Хаитов P.M. Физиология иммунной системы / P.M. Хаитов. - М., 2001. -224 с.

136. Хромова С.С. Иммунитет у детей: от рождения к колонизации кишечника / С.С. Хромова, Л.И. Кафарская, Б.А. Ефимов // Вопросы детской диетологии. -2006.- Т. 4. — № 1.-С. 15-19.

137. Цветкова Л.Н. Хронические запоры в практике врача педиатра [Электронный ресурс] / Л.Н. Цветкова // Практика педиатра. - 2005. - Режим доступа: http://medi.ru/doc/j01050329.htm.

138. Шабанова Н.А. Различия по набору генов патогенности у штаммов Escherichia coli, продуцирующих шига-подобные токсины / Н.А. Шабанова, В.М. Бондаренко // Журн. микробиол. - 2009. - № 5. - С. 4-8.

139. Шендеров Б.А. Медицинская микробная экология и функциональное питание. Микрофлора человека и животных / Б.А. Шендеров. - М.: Грантъ, 1998. -Т. 1.-288 с.

140. Шендеров Б.А. Социально-экологические и клинические последствия дисбаланса микробной экологии человека и животных. Микрофлора человека и животных / Б.А. Шендеров. -М.: Грантъ, 1998. - Т. 2.-416 с.

141. Шульпекова Ю.О. Применение пробиотиков в клинической практике / Ю.О. Шульпекова // РМЖ. - 2003. - Т. 5. - № 1. - С. 28-32.

142. Шуляк Б.Ф. Энтерогемморагичнские штаммы E.coli. Обзор / Б.Ф. Шуляк // Альманах клинической медицины. - 2011. - № 25. - С. 72-76.

143. Щеплягина JI.А. Возрастные особенности иммунитета у детей / Л.А. Щеплягина, И.В. Круглова // Русский медицинский журнал. - 2009. - № 17 (23). -С. 1564—1569.

144. Энтерококки как возбудители инфекционных послеоперационных осложнений / И.Н. Габриелян, Е.М. Горская, Т.С. Спирина, Т.Б. Преображенская // Журн. микробиол. - 2007. - № 4. - С. 50-53.

145. Эпидемиологический анализ: Методы статистической обработки материала / Е.Д. Савилов, В.А. Астафьев, С.Н. Жданова, Е.А. Заруднев. - Новосибирск: Наука-Центр, 2011. - 156 с.

146. Юлиш Е.И. Проблемы дисбактериоза кишечника и методы его коррекции / Е.И. Юлиш, Б.И. Кривушев // Здоровье ребенка. - 2011. - № 7 (34). - С. 1-4.

147. Янковский Д.С. Место дисбиоза в патологии человека / Д.С. Янковский, Р.А. Моисеенко, Г.С. Дымент // Современная педиатрия. - 2010. - № 1 (29) - С. 154-167.

148. Abbasian F., Saberbaghi Т. Metagenomic study of human gastrointestinal tracts in health and diseases // Journal of Gastroenterology and Hepatology Research. - 2013. -№2(12).-P. 885-896.

149. A human gut microbial gene catalogue established by metagenomic sequencing // J. Qin, R. Li, J. Raes et al. // Nature. - 2010. - №464 (7285). - P. 59-65.

150. Analysis of incidence of infection with enterotoxigenic Escherichia coli in a prospective cohort study of infant diarrhea in Nicaragua / M. Paniagua, F. Espinoza, M. Ringman et al. // J. Clin. Microbiol. - 1997. - № 35. - P. 1404-1410.

151. Antagonistic effect of Lactobacillus strains against gasproducing coliforms isolated from colicky infants / F. Savino, L. Cordisco, V. Tarasco et al. // BMC Microbiol.- 2011.-№ 11.-P. 157.

152. Antibiotic administration early in life impaires specific humoral responses to an oral antigen and increases intestinal mast cell numbers and mediators concentrations / S. Nutten, A. Schumann, D. Donnicola et al. // Clin, and Vaccine Immunol. - 2007. - № 2. -P. 190-197.

153. Applying case definition criteria to irritable bowel syndrome / S.H. Yale, A.K. Musana, A. Kieke et al. // Clin. Med. Res. - 2008. - Vol. 6. - № 1. - P. 9-16.

154. Bacterial counts of intestinal Lactobacillus species in infants with colic / F. Savino, E. Bailo, R. Oggero et al. // Pediatr. Allergy Immunol. - 2005. - Vol. 16. - P. 72-75.

155. Bae W.K. A case of hemolytic uremic syndrome caused by Escherichia coli 0104:H4 / W.K. Bae, Y.K. Lee, M.S. Cho // Yonsei Med J. - 2006. - № 47 (3). - P. 437-439.

156. Beutin L. Outbreak of Shiga toxin-producing Escherichia coli (STEC) 0104:H4 infection in Germany causes a paradigm shift with regard to human pathogenicity of STEC strains / L. Beutin, A. Martin // J. Food Prot. - 2012. - № 75 (2). - P. 408-418.

157. Bouguenec C.L. Diffusely adherent Escherichia coli strains expressing Afa/Dr adhesins (Afa/Dr DAEC): hitherto unrecognized pathogens / C.Le Bouguenec, A.L. Servin // FEMS Microbiology Letters. - 2006. - Vol. 256. - Issue 2. - P. 185-194.

158. Characterization of the gut-associated microbiome in inflammatory pouch complications following ileal pouch-anal anastomosis / A.D. Tyler, N. Knox, B. Kabakchiev et al. // PLoS ONE. - 2013. - № 8 (9). - URL: e66934. doi: 10.1371 /journal. pone.0066934.

159. Cheasty T. Antigenic relationships between the enteroinvasive Escherichia coli O antigens 028ac, 0112ac, 0124, 0136, 0143, 0144, 0152, and 0164 and Shigella O antigens / T. Cheasty, B. Rowe // J. Clin. Microbiol. - 1983 - Vol. 17. - № 4. - P. 681684.

160. Critch J. Infantile colic: Is there a role for dietary interventions? / J. Critch // Paediatr. Child. Health - 2011. - № 16 (1). - P. 47-49.

161. Cumulative effect of prophage burden on Shiga toxin production in Escherichia coli / P.C. Fogg, J.R. Saunders, A J. McCarthy, H.E. Allison // Microbiology. - 2012. -Vol. 58 (Pt2).-P. 488^197.

162. Detection and characterization of diarrheagenic Escherichia coli from young children in Hanoi, Vietnam / T.V. Nguyen, P.L. Van, C.L. Huy et al. // J. Clin. Microbiol. - 2005. - Vol. 43. - № 2. - P. 755-760.

163. Detection of Enterotoxigenic Escherichia coli in stool samples by using nonradioactively labeled oligonucleotide DNA probes and PCR / C. Schultsz, G.J. Pool, R. Ketel et al. // J. Clin. Microbiol. - 1994. - Vol. 32. - № 10. - P. 2393-2397.

164. Development of PCR for screening of Enteroaggregative Escherichia coli / H. Schmidt, C. Knop, S. Franke et al. // J. Clin.Microbiol. - 1995. - Vol. 33. - № 3. - P. 701-705.

165. Differentiation of pathogenic Escherichia coli strains in Brazilian children by PCR / N.G. Tornieporth, J. John, K. Saigado et al. // J. Clin.Microbiol. - 1995. - Vol. 33.-№5.-P. 1371-1374.

166. Diversity of the human intestinal microbial flora / P.B. Eckburg, E.M. Bik, C.N. Bernstein et al. // Science. - 2005. - Vol. 308 (5728). - P. 1635-1638.

167. Drossman D.A. The functional gastrointestinal disorders and the rome II process / D.A. Drossman // Gut. - 1999. - № 45 (Suppl. 2). - P. Ill—115.

168. Drossman D.A. The functional gastrointestinal disorders and the Rome III process / D.A. Drossman // Gastroenterology. - 2006. - Vol. 130. - № 5. - P. 13771390.

169. Drossman D.A. The Functional Gastrointestinal Disorders. Diagnosis, Pathophysiology,and treatment / D.A. Drossman // A Multinational Consensus (Boston, New York, Toronto, London). - 1994. - P. 370.

170. Enterotypes of the human gut microbiome / M. Arumugam, J. Raes, E. Pelletier et al. // Nature. - 2011. - № 473 (7346). - P. 174-180.

171. Evaluation of the premier EHEC Assay for Detection of shiga toxin-producing Escherichia coli / S.K. Kehl, P. Havens, C.E. Behnke, D.W. Acheson // J. of clinical microbiology. - 1997. - Vol. 35. -№ 8. - P. 2051-2054.

172. Finlay Enteropathogenic E.coli (EPEC) transfers its receptor for intimate adherence into mammalian cells / B. Kenn, R. DeVinney, M. Stein et al. // Cell. - 1997. -Vol. 91. -№ 14.-P. 511-520.

173. Frank C. Epidemic profile of shiga-toxin producing E.coli 0104:H4 outbreak in Germany - Preliminary Report / C. Frank, D. Werber, J.P. Cramer // N. Engl. J. Med. -2011.-№ 6.-P. 1-11.

174. Functional bowel disorders / G.F. Longstreth, W.G. Thompson, W.D. Chey et al. // Gastroenterology. - 2006. - Vol. 130. - Issue 5. - P. 1480-1491.

175. Genome sequence analyses of two isolates from the recent Escherichia coli outbreak in Germany reveal the emergence of a new pathotype: Entero-Aggregative-Haemorrhagic Escherichia coli (EAHEC) / E. Brzuszkiewicz, A. Thürmer, J. Schuldes et al.//Arch. Microbiol.-2011.-Vol. 193.-P. 883-891.

176. Gunzburg S.T. Identification of Enteropathogenic Escherichia coli by PCR-based detection of the bundle-forming pilus gene / S.T. Gunzburg, N.G. Tornieporth, L.W. Riley // J. Clin.Microbiol. - 1995. - Vol. 33. - № 5. - P. 1375-1377.

177. Gyles C.L. Shiga toxin-producing Escherichia coli: an overview / C.L. Gyles. // J.Anim.Sci. - 2007. - Vol. 85. - P. E45-E62.

178. Hartland E.L. Enteropathogenic and enterohemorrhagic E.coli: ecology, pathogenesis, and evolution / E.L. Hartland, J.M. Leong // Front Cell Infect Microbiol. -2013.-Vol.3.-Article 15.-P. 1-3.

179. Hemolytic uremic syndrome in children in northern India / R.N. Srivastava, A. Moudgil, A. Bagga, A.S. Vasudev // Pediatr. nephrol. - 1991. - Vol. 5. - № 3. - P. 284-288.

180. Herold S. Shiga toxin-encoding bacteriophages - genomes in motion / S. Herold, H. Karch, H. Schmidt // Int J.Med.Microbiol. - 2004. - № 2-3 (294). - P. 115-121.

181. Inhibition of neutrohil apoptosis by verotoxin 2 derived from Escherichia coli 0157:H7 / J. Liu, T. Akahoshi, T. Sasahana et al. // Infect. Immun. - 1999. - Vol. 67. -P. 6203-6205.

182. Immunobiology and immunopathology of human gut mucosa: humoral immunity and intraepithelial lymphocytes / P. Brandtzaeg, T.S. Halstesten, K. Kett et al. // Gastroenterology. - 1989. - Vol. 97. - P. 1562-1584.

183. Impact of irritable bowel syndrome (IBS) on health-related quality of life / M. Amouretti, C. Le Pen, A.F. Gaudin et al. // Gastroenterol. Clin. Biol. - 2006. - Vol. 30. - № 2. - P. 241-246.

184. Intestinal microflora in colicky and non colicky infants / F. Savino, F. Cresi, S. Pautasso et al. // Acta Pediatrica - 2004. - Vol. 93. - P. 825-829.

185. Johnson J.R. Virulence factors in Escherichia coli / J.R. Johnson // J. Clin. Microbiol. - 2005. - № 43 (12). - P. 6221-6222.

186. Klebsiella oxytoca as a causative organism of antibiotic-associated hemorrhagic colitis / C. Hogenauer, C. Langner, E. Beubler et al. // The New Engl. J. Med. - 2006. -Vol. 355.-P. 2418-2426.

187. Lamm M.E. Current concepts in mucosal immunity. How epithelial transport of IgA antibodies relates to host defense / M.E. Lamm // Am J Physiol. - 1998. - Vol. 274. -P. G614-G617.

188. Lamm M.E. Interaction of antigens and antibodies at mucosal surfaces / M.E. Lamm // Ann. rev microbiol. - 1997. - Vol. 51. - P. 311-340.

189. Lehtonen L. Intestinal microflora in colicky and noncolicky infants: bacterial cultures and gasliquid chromatography / L. Lehtonen, H. Korvenranta, E. Eerola // J. Ped. Gasroenterol. Nutr. - 1994. - № 19. - P. 310-314.

190. Leung A.K. Infantile colik: a review / A.K. Leung, J.F. Lemau // J. R Soc. Health. -2004.-Vol. 124.-P. 162-166.

191. Lockman H. Nukleonide sequence analisis of the A2 and B subunits of the Vibrio cholera tnterotoxin / H. Lockman, J.B. Kaper // J. Biol.Chem. - 1983. - Vol. 258. - P. 13722-13726.

192. Mayer L. Oral tolerance: new approaches, new problems / L. Mayer // Clin. Immunol. - 2000. - Vol. 94. - P. 1-8.

193. McDaniel T.K. A cloned pathogenicity island from enteropathogenic Escherichia coli confers the attaching and effacing phenotype on E. coli K-12 / T.K. McDaniel, J.B. Kaper // Mol. microbiol. - 1997 - Vol. 23. - P. 399^107.

194. Mellmann A. Analysis of collection of hemolytic uremic syndrome - associated enterohemorrhagic Escherichia coli / A. Mellmann, M. Bielaszewska, R. Kock // Emerging In fectious Diseases. - 2008. - № 14 (8). - P. 1287-1290.

195. Mestecky J. Passive and active protection against disorders of the gut / J. Mestecky, M.W. Russell // Vet. Quart. - 1998. - Vol. 20 (Suppl. 3). - P. 83-87.

196. Microbiology of bacterial translocation in humans / C.J. O'Boyle, J. MacFie, C.J. Mitchell et al. // Gut. - 1998. - Vol. 42. - P. 29-35.

197. Molecular microbial ecology of the gastrointestinal tract from phytogeny to function / E.G. Zoetendal, B. Cheng, S. Koike, R.L. Mackie // Curr Issues Intest Microbiol. - 2004. - № 5. - P. 31-45.

198. Monoclonal antibodies specific for the bundle-forming pilus of Enteropathogenic Escherichia coli / J.A. Giron, F. Qadri, T. Azim et al. // Infection and immunity. - 1995. - Vol. 63. - № 12 - P. 4949-4952.

199. Moons P. Lysogenic conversion and phage resistance development in phage exposed Escherichia coli biofilms / P. Moons, D. Faster, A. Aertsen // Viruses. - 2013. -№5(1). _p. 150-161.

200. Nagura H. Mucosal immune system and mucosal inflammation / H. Nagura, H. Ohtani // Bioregulation and its disorders in the gastrointestinal tract. - Tokyo: Blackwell Science, 1998.-P. 95-104.

201. Noris M. Hemolytic uremic syndrome / M. Noris, G. Remuzzi // J. Am. Soc. Nephrol.-2005.-№ 16 (4).-P. 1035-1050.

202. Origins of the E.coli strain causing an outbreak of hemolytic-uremic syndrome in Germany / D.A. Rasko, D.R. Webster, J.W. Sahl et al. // Engl J Med. - 2011. - Vol. 365.-P. 709-717.

203. Outbreak of haemolytic uraemic syndrome and bloody diarrhoea due to Escherichia coli 0104:H4, south-west France, June 2011 / G. Gault, F.X. Weill, P. Mariani-Kurkdjian et al. // Eurosurveillance. - 2011. - Vol. 16, Issue 26. - P. 1-3.

204. Pathogenesis of shiga-toxin producing Escherichia coli / A. Melton-Celsa, K. Mohawk, L. Teel, A. O'Brien // Curr Top Microbiol. Immunol. - 2012. - Vol. 357. - P. 67-103.

205. Potential applications of gut microbiota to control human physiology / O.C.O. Umu, M. Oostindjer, P.B. Pope et al. // Antonie van Leeuwenhoek. - 2013. - Vol. 104. -Issue 5.-P. 609-618.

206. Quinolone antibiotics induce shiga toxin-encoding bacteriophages, toxin production, and death in mice / X. Zhang, A.D. McDaniel, L.E. Wolf et al. // J. Infect. Dis. - 2000. - Vol. 181 (2). - P. 664-670.

207. Riley L.W. Hemorrhagic colitic associated with a rare E.coli serotype / L.W. Riley, R.S. Remis, S.D. Helgerson //N. Engl. J. Med. - 1983. - Vol. 308. - P. 681-685.

208. Robins-Browne R. M. Escherichia coli as a cause of diarrhea / R.M. Robins-Browne, E.L. Hartland // J. Gastroenterol. Hepatol. - 2002. - № 17. - P. 467-475.

209. Rothkotter H. J. Lymphocyte migration in the intestinal mucosa: entry, transit and emigration of lymphoid cells and the influence of antigen / H.J. Rothkotter, R. Pabst, M. Bailey // Vet. Immunol. Immunopathol. - 1999. - Vol. 72. - P. 157-165.

210. Sadler J.E. Idiopathic thrombotic thrombocytopenic purpura / J.E. Sadler, M. Poncz // Ch. 124. Antibody-mediated thrombotic disorders: idiopathic thrombotic thrombocytopenic purpura and heparin-induced thrombocytopenia. Williams Hematology, Seventh Edition, McGraw-Hill Medical, 2007. - P. 2031-2054.

211. Savage D.C. Mucosal microbiota // Mucosal Immunology / Ed. by P.L. Ogra, J. Mestecky, M.E. Lamm, W. Strober, J.R. McGhee, J. Bienestock. - San Diego: Academic Press, 2000. - P. 216-238.

212. Savino F. Focus on infantile colic / F. Savino // Acta Paediatrica - 2007. - № 96 (9).-P. 1259-1264.

213. Schmidt W.P. Model of the epidemic of childhood atopy / W.P. Schmidt // Med Sci Monit. - 2004. - № 10 (2). - P. HY5-9.

214. Schmitt C.K. Bacterial toxins: friends or foes? / C.K. Schmitt, K.C. Meysick, A.D. Brien // Emerg. Infect. Dis. - 1999. - Vol. 5. - № 2. - P. 224-234.

215. Serotypes, virulence genes, and intimin types of shiga toxin (verotoxin)-producing Escherichia coli isolates from healthy sheep in Spain / M. Blanco, J.E. Blanco, A. Mora et al. // J. Clin.Microbiol. - 2003. - Vol. 41. - № 4. - P. 1351-1356.

216. Shiga toxin-producing Escherichia coli 0104:H4: a new challenge for microbiology / M. Muniesa, J.A. Hammerl, S. Hertwig et al. // Appl Environ Microbiol. -2012. - Vol. 78 (12). - P. 4065-4073.

217. Sporadic cases of haemolytic-uraemic syndrome associated with faecal cytotoxin and cytotoxin-producing Escherichia coli in stools / M.A. Karmali, M. Petric, B.T. Steele, C. Lim//The Lancet. - 1983 - Vol. 321. - P. 619-620.

218. Structure of the bundle-forming pilus from Enteropathogenicpscherichia coli / S. Ramboarina, P.J. Fernandes, S. Daniell et al. // The J. of biolpgical chemistry. - 2005. -Vol. 280. - № 48. - P. 40252-40260.

219. Talley N.J. Irritable bowel syndrome / N.J. Talley // Intern. Med. J. - 2006. - Vol. 36.-№ 11.-P. 724-728.

220. Tarr Ph. Shiga toxin-associated hemolytic uremic syndrome and thrombotic thrombocytopenic purpura: distinct mechanisms of pathogenesis / Ph. Tarr // Kidney International. - 2009. - № 75. - P. 29-32.

221. Therapeutic concentrations of antibiotics inhibit Shiga toxin release from enterohemorrhagic E.coli 0104:H4 from the 2011 German outbreak / D. Corogeanu, R. Willmes, M. Wolke et al. // BMC Microbiology. - 2012. - Vol. 12. - P. 160-170.

222. The Escherichia coli common pilus and the bundle-forming pilus acin concert during the formation of localized adherence by Enteropathogenic E. coli / Z. Saldana, A.L. Erdem, S. Schüller et al. // J. of bacteriology. - 2009. - Vol. 191. - № 11. - P. 3451-3461.

223. The role of mucosal microbiota in the development and maintenance of the mucosal immune system / J.J. Cebra, H.Q. Jiang, J. Sterzl, H. Tlaskalova-Hogenova // Mucosal Immunology. Academic Press, New York, 1999. - P. 267-280.

224. Tobe T. Role of bundle-forming pilus of enteropathogenic Escherichia coli in host cell adherence and in microcolony development / T. Tobe, C. Sasakawa // Cellular Microbiology. - 2001. - № 3 (9). - P. 579-585.