Дифференциация популяций человека и животных по генам главного комплекса гистосовместимости тема диссертации и автореферата по ВАК РФ 03.00.15, доктор биологических наук Удина, Ирина Геннадьевна

• Удина, Ирина Геннадьевна
• доктор биологических наук
• 2003

Оглавление диссертации доктор биологических наук Удина, Ирина Геннадьевна

1.ВВЕДЕНИЕ.

1.1. АКТУАЛЬНОСТЬ ПРОБЛЕМЫ.

1.2. ЦЕЛИ И ЗАДАЧИ ИССЛЕДОВАНИЯ.

1.3. НАУЧНАЯ НОВИЗНА РАБОТЫ.

1.4. ПРАКТИЧЕСКАЯ ЗНАЧИМОСТЬ.

1.5. ПОЛОЖЕНИЯ, ВЫДВИГАЕМЫЕ НА ЗАЩИТУ.

1.6. АПРОБАЦИЯ РАБОТЫ.

1.7. ПУБЛИКАЦИИ РЕЗУЛЬТАТОВ ИССЛЕДОВАНИЙ.

2. ОБЪЕКТЫ И МЕТОДЫ ИССЛЕДОВАНИЙ.

2.1. ОБЪЕКТЫ ИССЛЕДОВАНИЙ.

2.2. МЕТОДЫ ИССЛЕДОВАНИЙ.

3. РЕЗУЛЬТАТЫ И ИХ ОБСУЖДЕНИЕ. 28 3.1. ДИФФЕРЕНЦИАЦИЯ ПОПУЛЯЦИЙ ПО ГЕНАМ ГЛАВНОГО КОМПЛЕКСА ГИСТОСОВМЕСТИМОСТИ 28 3.1.1. дифференциация популяций человека по генам главного комплекса гистосовместимости

3.1.1.1. Введение в проблему.

3.1.1.2. Краткий обзор литературных данных о распределении генов системы HLA в популяциях мира.

3.1.1.3. Дифференциация народов России и сопредельных территорий по генам системы HLA. 37 3.1.1.3.1. Дифференциация популяций человека в Северной Азии по генам класса I HLA-A, -В, и -С. 37 3.1.1.3.2.Особенности генетической дифференциации финно-угорских народов по системе HLA.

3.1.1.3.3. Особенности дифференциации популяций человека в Северной Евразии по генам HLA-A и -В.

3.1.1.3.4. Особенности распределения гаплотипов HLA в популяциях Северной Евразии.

3.1.2. Дифференциация природных популяций по генам главного комплекса гистосовместимости

3.1.2.1. Введение в проблему.

3.1.2.2. Дифференциация популяций лося (Alces alces) по гену MhcAlal-DRBl.

3.1.3. Генетическая дифференциация искусственно разводимых популяций.

3.1.3.1. Введение в проблему.

3.1.3.2. Генетическая дифференциация редких видов. 77 3.1.3.2.1. Дифференциация популяций зубра (Bison bonasus) по MhcBibo-DRB3.

3.1.3.3. Генетическая диференциация домашних видов.

3.1.3.3.1. Изучение полиморфизма генов класса IBoLA (краткий литературный обзор).

3.1.3.3.2. Дифференциация отечественных пород КРС по антигенам BoLA-A класса I.

3.1.3.3.3. Изучение полиморфизма генов класса IIBoLA (краткий литературный обзор).

3.1.3.3.4. Дифференциация пород крупного рогатого скота отечественной селекции по аллелям гена класса IIBoLA-DRB3. 102 3.1.3.3.4. Изучение генетического разнообразия отечественных пород лошадей. 105 3.2. ИЗУЧЕНИЕ АССОЦИАЦИЙ АЛЛЕЛЕЙ ГЕНОВ ГЛАВНОГО КОМПЛЕКСА ГИСТОСОВМЕСТИМОСТИ (BoLA) И СЦЕПЛЕННЫХ ГЕНОВ С

ПРИЗНАКАМИ ЖИРНОМОЛОЧНОЙ ПРОДУКТИВНОСТИ В ПОРОДАХ КРУПНОГО РОГАТОГО СКОТА ОТЕЧЕСТВЕННОЙ СЕЛЕКЦИИ.

3.2.1. Введение в проблему.

3.2.2. Изучение ассоциаций аллелей BOLA-DRB3 с признаками жирномолочной продуктивности в породах крупного рогатого скота отечественной селекции.

3.2.3. Изучение ассоциаций маркеров гена пролактина (PRL) с признаками жирномолочной продуктивности

3.2.3.1. Введение в проблему.

3.2.3.2. Изучение ассоциаций маркеров гена пролактина (PRL) с признаками жирномолочной продуктивности у отечественных пород крупного рогатого скота 112 3.3. ВЫЯВЛЕНИЕ АССОЦИАЦИЙ С ЗАБОЛЕВАНИЯМИ МАРКЕРОВ ГЛАВНОГО КОМПЛЕКСА ГИСТОСОВМЕСТИМОСТИ У ЧЕЛОВЕКА И ЖИВОТНЫХ.

3.3.1. Введение в проблему.

3.3.2. Ассоциации с заболеваниями антигенов HLA.

3.3.3. Изучение ассоциаций антигенов HLA-A и В с чувствительностью и устойчивостью к туберкулезу в узбекской популяции.

3.3.4. молекулярно-генетические механизмы устойчивости и чувствительности к лейкозу, обусловленные маркерами главного комплекса гистосовместимости . 130 3.3.4,1. Введение в проблему. Краткие литературные сведения об ассоциациях маркеров главного комплекса гистосовместимости с лейкозом.

3.3.4.2. Молекулярно-генетические механизмы устойчивости и чувствительности к лейкозу у отечественных пород крупного рогатого скота, выявленные по особенностям распределения аллелей BoLA~DRB3.

3.3.4.2.1. Ассоциация аллелей гена BoLA-DRBS с чувствительностью к лейкозу в айрширской и черно-пестрой породах крупного рогатого скота.

3.3.4.2.2. Ассоциация аллелей гена BoLA-DRB3 с устойчивостью к лейкозу.

3.3.4.2.3. Анализ генотипов BoLA-DRB3 в связи с устойчивостью и чувствительностью к лейкозу.

3.3.4.2.4. Анализ распределения уровней гетерозиготности в изученных группах животных айрширской и черно-пестрой пород крупного рогатого скота.

3.3.4.2.5. Краткое заключение.

3.3.4.3. Параметры молочной продуктивности у отечественных пород КРС в связи с заболеванием лейкозом.

4.3АКЛЮЧЕНИЕ.

5. ВЫВОДЫ.

Введение диссертации (часть автореферата) на тему «Дифференциация популяций человека и животных по генам главного комплекса гистосовместимости»

1.1. АКТУАЛЬНОСТЬ ПРОБЛЕМЫ.

Проблемы генетической дифференциации и филогении популяций человека являются актуальными на протяжении последних десятилетий. В последнее время в связи с развитием ДНК технологий анализа полиморфизма геномов появились новые высоко информативные инструменты для решения этих проблем.

В работе для получения характеристики генетической дифференциации популяций Северной Евразии использовали маркеры чрезвычайно полиморфной системы HLA (HLA-A, -В и -С). По сравнению с другими аутосомными маркерами применение системы HLA занимает одно из лидирующих мест по информативности в популяционно-генетических исследованиях, а также при составлении геногеографических карт (Ammerman, Cavalli-Sforza, 1984, Cavalli-Sforza et al., 1996). За последние годы накоплен уникальный материал по типированию маркеров системы HLA в популяциях мира, в том числе, и наши данные. Данные о дифференциации популяций России и пограничных государств по системе HLA необходимы как недостающее звено для рассмотрения генетических связей коренных народов Северной Азии и Северной Америки, а также народов Сибири и Восточной Европы по маркерам системы HLA.

Чрезвычайный интерес представляют собой этнические группы коренного населения Сибири, их филогения и генетическая дифференциация, особенно в свете их исторических связей с коренным населением Америки. Многие проблемы генетики и истории дивергенции популяций человека могут быть освещены при изучении генофонда древних изолятов, например популяций Берингии.

Прогресс в области ДНК-технологий позволил внедрить в практику научных исследований разнообразные маркеры нового типа. Среди них наиболее широко используются маркеры, основанные на изучении нуклеотидной последовательности D-петли митохондриального генома, гаплотипов NRY (нерекомбинирующей части Y-хромосомы) и аутосомных микросателлитов. Аутосомные микросателлиты, традиционно рассматриваемые как селективно-нейтральные маркеры генома, предоставляют возможность сопоставления данных о дифференциации популяций человека с помощью различных ДНК-маркеров (Rosenberg et al., 2002).

Маркеры системы HLA имеют свои преимущества при изучении дифференциации популяций человека, которые обусловлены функциями генов главного комплекса гистосовместимости, связанными с обеспечением иммунного ответа на чужеродные антигены. Это способствует важности их рассмотрения в качестве маркеров иммунного ответа как на индивидуальном, так и на популяционном уровне. Данные о дифференциации популяций человека по системе HLA важны не только для интерпретаций особенностей дифференциации популяций по другим молекулярным маркерам, но и для выявления действия отбора на популяции человека, поскольку особенности распространения маркеров системы HLA отражают как исторические связи популяций, так и их взаимодействие с разнообразными возбудителями болезней.

Сохранение генетического разнообразия по генам главного комплекса гистосовместимости становится первоочередной задачей для сохранения отдельных популяций животных (включая породы сельскохозяйственных животных), а также видов в целом. Генетическая дифференциация природных популяций животных по главному комплексу гистосовместимости, а также популяций редких видов и искуственно разводимых популяций актуальна не только для рассмотрения проблем сохранения видов и биоразнообразия, но и для рассмотрения проблем устойчивости к заболеваниям. Изучение генофонда отечественных пород и природных популяций копытных по генам главного комплекса гистосовместимости актуально в связи с исчезновением пород домашних животных за последние десятилетия, вызванным социально-экономическими условиями в стране, и резким сокращением численности диких видов, обусловленным тотальным истреблением животных из-за нерегулируемой охоты.

Заключение диссертации по теме «Генетика», Удина, Ирина Геннадьевна

5. ВЫВОДЫ.

1. Экспериментально определены спектр и частота иммунологических маркеров системы HLA для восьми народов (коми, коми-пермяки, манси, узбеки, чукчи, эвенки, якуты и эскимосы) в 16 локальных популяциях. Методом многомерного шкалирования (с использованием собственнных и литературных данных) выявлена дифференциация 24 народов Евразии по системе HLA в главных координатах: РС1 и РС2, РС1 и РСЗ и объединение их в кластеры, в основном, соответствующие географическому положению народов (Северо-Восточная Сибирь, Южная Сибирь, Западная Сибирь и Таймыр, Средняя Азия и Казахстан, Европейская часть). Для 55 популяций России и сопредельных территорий определен уровень генетической дифференциации по системе HLA: минимальные значения Fst составили 0,012 (HLA-A11) и 0,006 (HLA-B22), максимальные значения - 0,085 (HLA-A9) и 0,167 (HLA-B40), средняя оценка значений Fst для локусов HLA-A и —В составила 0,043.

2. Полученные характеристики североазиатского генофонда по системе HLA (профиль частот антигенов, уровень генетической дифференциации и гетерозиготности по HLA-A и -В) выдвигают его на роль связующего звена между монголоидами Восточной Азии и Северной Америки, а также впервые предоставляют возможность объяснения специфических особенностей дифференциации коренного населения Северной Америки по системе HLA на основании гипотезы его происхождения из Северной Азии.

3. В Средней Сибири (у эвенков) и на Чукотке (у чукчей и азиатских эскимосов) выявлен обедненный спектр антигенов (HLA-A2, -А9, -А19, -В5, -В15, -В27, -В35 и -В40) (у эвенков еще и HLA-B17), неоднородное распределение частот и низкий уровень гетерозиготности (69,5%) по HLA-A и -В, которые сходны с аналогичными параметрами, характерными для коренного населения Северной Америки, что указывает на генетическое родство народов Сибири и Северной Америки.

4. У финно-угорских народов установлен уровень генетической дифференциации (Fst = 0,220) и гетерозиготности (85,4%) по HLA-A и -В. Выявлена выраженная дифференциация генофондов финно-угорских народов по уровню гетерозиготности (77,4-89,3%) и по представленности маркеров, характерных для европейских (HLA-AIB8 и HLA-A3B7) и сибирских (HLA-A9,- -В40) народов, а также маркеров, распространенных у финно-угров (HLA-A3B35, -А9В21, -А9В7, -А28В13, -А2В13 и другим). Отмечена выраженная неоднородность локальных популяций народов коми (Fst=0,188) и манси (Fst=0,0061) по маркерам системы HLA, обусловленная как генетическим дрейфом, так и вхождением в их состав разных этнических компонентов при формировании популяций.

5. Методом компьютерной геногеографии выявлено сходное распространение частот галлотипов и их значений неравновесия по сцеплению для HLA-A1B8, -АЗВ7 и -А9В7 в Северной Евразии и отсутствие сходства для этих параметров для HLA-A9B40, что предполагает значительную древность данного гаплотипа у сибирского коренного населения. Установлено формирование гаплотипа HLA-А9В7 в Западной Сибири.

6. В черно-пестрой и айрширской породах отечественной селекции обнаружены ранее не описанные аллели, обеспечивающие чувствительность (BoLA-DRB3.2*3, *10 и *18) и устойчивость к лейкозу: BoLA-DRB3.2*2 и *7. Показана универсальность влияния аминокислотных мотивов, кодируемых BoLA-DRB3, на чувствительность и устойчивость к лейкозу: VDTY в позициях 75-78 и ER (70-71) соответственно, установленных ранее (Хи et al., 1993). Выявлена чувствительность к лейкозу животных с генотипами, кодирующими соответствующие аминокислотные мотивы в позициях 75-78: VDTY/VDTV (RR*=11,7, 0,05<Р<0,001) в черно-пестрой и VDTY/X (.RR=7,74, Р=0,001), VDTY/VDTY (RR=4,71, 0,05<Р<0,001) в айрширской породах крупного рогатого скота. Продемонстрирована устойчивость к лейкозу животных с генотипами, кодирующими ER/X (RR=0,13 (черно-пестрая порода) и RR-0,32 (айрширская порода) с 0,05<Р<0,001) в позициях 70-71.

Установлено влияние повышенного уровня гетерозиготности в качестве неспецифического фактора на устойчивость к лейкозу.

7. Выявлено, что параметры жирномолочной продуктивности у крупного рогатого скота ассоциируются с маркерами главного комплекса гистосовместимости и сцепленных генов. Отмечена ассоциация между аллелем BoLA-DRB3.2*22 в черно-пестрой породе отечественной селекции и высокой молочной продуктивностью (Р=0,0099, %2^7,17, df=l). В породах с высокой жирностью молока продемонстрирован высокий уровень гетерозиготности по гену пролактина с использованием двух ДНК-маркеров (микросателлитного локуса (XI6641) в промоторной области и ftsaI-ПДРФ интрона III).

8. Для отечественных пород, в том числе для красной горбатовской породы крупного рогатого скота (с помощью маркеров BoLA-DRB3) и монгольской, тувинской, якутской и вятской пород лошадей (с помощью молекулярных маркеров ядерного и митохондриального генома), установлен более высокий уровень генетического разнообразия по сравнению с завезенными или заводскими породами.

9. Установлены обедненные спектры аллелей MhcBibo-DRB3 (2 аллеля) в популяции зубра и MhcAlal-DRBl (8 аллелей) в популяциях лося на территории России, что подтверждает свидетельства о прохождении этими видами через бутылочное горлышко". В дальневосточной популяции лося впервые выявлено существование комплекса генетических маркеров (включающего аллели Mhc-AlalDRBl *5, *7 и *10 и гаплотипы D-петли митохондриальной ДНК с делецией 75 п.н.), характерного для североамериканской популяции, что указывает на генетическую связь популяций лося Евразии и Америки.

4. ЗАКЛЮЧЕНИЕ.

Охарактеризован уровень генетической дифференциации популяций коренного населения Северной Евразии по антигенам HLA-A, В, и С (по литературным и собственным данным). Применение факторного анализа и многомерного шкалирования продемонстрировало высокую разрешающую способность системы HLA для характеристики народов Северной Евразии. Показан индивидуальный набор координат для изученных народов, а также выявлено, что на долю факторов 1, 2, 3 и 4 приходилось соответственно 28,0, 14,9, 11,1 и 8,3% суммарной дисперсии по HLA-A и —В у 24 народов (Udina, 2001). В главных координатах РС1 и РС2, РС1 и РСЗ выявлена кластеризация проекций генофондов 24 народов России и сопредельных территорий, в основном, соответствующая географическому положению народов, проживающих в регионах: Северо-Восточной Сибири, Западной Сибири и Таймыра, Средней Азии и Казахстана, Южной Сибири и Европейской части. В 55 популяциях России и сопредельных государств изучен уровень генетической дифференциации по системе HLA: оценки Fst для конкретных аллелей варьировали от 0,012 (HLA-A11) до 0,085 (HLA-A9) для HLA-A и от 0,006 (HLA-В22) до 0,167 (HLA-B40) - для HLA-B. Средняя оценка Fst составила 0,043 для HLA-A и В локусов.

Получена обобщенная характеристика народов Северной Азии по системе HLA, в целом свойственная монголоидным популяциям мира. Выявлены комплексы генетических особенностей по системе HLA, характерные для отдельных групп населения. В Средней Сибири (эвенки) и на Чукотке (азиатские эскимосы и береговые чукчи) прослежено обедненное разнообразие антигенов, включающее HLA-A2, А9, А28, Awl 9, В5, В15, В17, В27, В35 и В40 (в Средней Сибири еще и HLA-B17), неоднородное распределение частот с превалированием HLA-A2, А9 и В40, низкий уровень гетерозиготности. Проведен сравнительный анализ комплексов генетических особенностей системы HLA, характерных для населения Западной и Южной Сибири (Fst= 0,020), с более высоким разнообразием антигенов, включающим также антигены HLA-A3, А10, All, В7, В22, более однородным распределением частот, более высоким уровнем гетерозиготности. В генофонде народов, проживающих на границе сибирских и европейских народов (регион Урала и прилегающих территорий), показано накопление антигенов, характерных для европейского населения (HLA-A1, A3, В7, В8).

Характеристика дифференциации генофонда народов Северной Азии по системе HLA с Fst=0,425, включающая характерный спектр частот антигенов (HLA-A2, А10, А9, А19, В5, В13, В15, В17, В27, В35 и В40) и относительно низкий уровень гетерозиготности, выдвигает их генофонд на роль связующего звена между народами Восточной и Юго-Восточной Азии (Fst-0,377), с одной стороны, и Северной Америки (Fst=0,437) - с другой, что подтверждено также оценками угловых генетических расстояний между генофондом Северной Азии в целом и группами монголоидов мира.

Специфические черты комплекса HLA в Новом свете впервые рассмотрены в свете гипотезы североазиатского (сибирского) происхождения черт рассматриваемого комплекса. В Средней Сибири (эвенки) и на Чукотке (береговые чукчи, азиатские эскимосы) впервые выявлены комплексы системы HLA, сходные с таковыми в Северной Америке. В формировании современных комплексов HLA в Северной Азии и Северной Америке отмечена важная роль случайного дрейфа и отбора, приведшая к сходному уровню генетической дифференциации групп Сибири и Северной Америки (см. Рычков, Ящук, 1986).

В настоящее время проблема заселения Америки и Сибири чрезвычайно актуальна. Данные по типированию аллелей HLA-A, -В и -С у североамериканских индейцев с помощью полимеразной цепной реакции (Cao et al., 2001) и аллелей локусов HLA класса II методом SSCP (single strand conformation polymorphism - однонитевой конформационный полиморфизм) с последующим секвенированием у народов Сибири, Америки и других монголоидных групп мира (Uinuk-ool et al., 2002) в целом согласуются с нашими данными. По данным особенностей распространения аллелей HLA класса II выявлено, что сибирские коренные популяции кластеризуются на основе оценок генетических расстояний с популяциями коренного населения Америки, а другие монголоидные группы кластеризуются отдельно (Grahovac et al., 1998, Uinuk-ool et al., 2002). Данные о распространении тех или иных гаплотипов по этим маркерам, которые характерны для американских индейцев, показали, что отдельные гаплотипы присутствуют только на Дальнем Востоке, а другие - у народов Средней и Южной Сибири (Uinuk-ool et al., 2002). По нашим данным в Сибири у разных народов отмечены гаплотипы HLA-A9B2 7, HLA-A9B35 и другие отмеченные у американских индейцев, а у манси присутствует антиген HLA-B21, который ранее отмечен в Северной Америке у индейцев.

В Сибири были выявлены группы населения с гаплотипами Y-хромосомы и D-петли митохондриальной ДНК, предковые по отношению к распространенным у коренного населения Америки (Shields et al., 1993, 1996; Torroni et al., 1993; Merriwether et al., 1996; Bonato, Salzano, 1997; Lell et al., 1997, 2002; Karafet et al., 1997, 1999, 2001; Starikovskaya et al., 1998; Santos et al.,1999; Underhill et al, 2001; Derbeneva et al., 2002 и др.). В качестве районов, в которых присутствуют эти маркеры, были выявлены Дальний Восток (ульчи, нивхи и др.), Чукотка (эскимосы, чукчи, эвены, коряки), а также регион Сибири, прилегающий к Байкалу (захватывающий территорию проживания эвенков) (Karafet et al., 1999,

2002, Underhill et al, 2001). Варианты митохондриальных гаплотипов, характерные для коренного населения Америки, выявлены у алтайцев (Derenko et al., 2001). Таким образом, наши данные хорошо согласуются с данными по другим маркерам, так как мы выявили в качестве групп со сходными чертами по системе HLA с коренным населением Америки - эвенков и азиатских эскимосов и береговых чукчей. Современные данные позволяют сделать вывод о существовании не менее двух миграций в Америку. Одна из этих миграций предположительно шла из региона, прилегающего к Байкалу (включая Среднюю Сибирь) (20-25 тыс. лет назад), а другая - из Берингии (11300 тыс. лет назад) (Forester et al., 1996). Данные о маркерах системы HLA подтверждают вклад генофонда восточных монголоидных групп в генофонд коренного населения Америки, что предполагает возможность дополнительной миграции населения (Tokunaga et al., 2001).

В настоящее время активно ведутся исследования такого заболевания как анкилозирующий спондилит, которое ассоциируется с антигеном HLA-B27, проводится изучение этого заболевания параллельно на Чукотке (где по нашим данным этот антиген весьма частый) и на Аляске (где также отмечена высокая частота В27) (Erdesz et al., 1994, Boyer et al., 1996).

Впервые получены данные о распространении HLA-A, В и С финно-угорских народов в Уральском регионе: манси, коми-пермяков и удорской группы коми, а также у узбеков в Средней Азии. С использованием литературных и собственных данных получена обобщенная характеристика финно-угорских народов. Показан специфический спектр характерных антигенов: HLA-A2, -A3, -А9, -В7, -В13, -В35, -В27, -В40, а также оценен уровень генетической дифференциации Fst = 0,220. Выявлены группы с более высокой (манси, удмурты) и низкой (мордва) выраженностью " монголоидных " особенностей генетической дифференциации по системе HLA. У финно-угров отмечена выраженная неоднородность локальных популяций, включая характерные спектры галлотипов, у коми (Fst-0,187) и манси (Fst=0,0062) по маркерам системы HLA, которая обусловлена не только генетическим дрейфом, но и историей формирования групп (участие разных этнических пластов), а также контактами с пограничными народами. С помощью факторного анализа выявлены аллели, вносящие основной вклад в дифференциацию по основным компонентам, и дифференцированы отдельные финно-угорские народы.

На границе сибирских и европейских народов показано формирование гаплотипа HLA-A9B7, с входящими в него маркерами: HLA-A9, широко распространенным у монголоидов, и HLA-B7, происходящим из «европеоидного» гаплотипа HLA-A3B7, маркирующего древний европеоидный пласт в генофонде изученных популяций. Впервые особенности распространения этого гаплотипа рассмотрены с учетом сибирских популяций. У народов России и сопредельных территорий рассмотрены также геногеографические особенности распространения частот галлотипов и значений неравновесия по сцеплению галлотипов HLA-A1B8, HLA-A3B7, HLA-A3B7 и HLA-A9B40. Показано совпадение областей распространения высоких значений частот и неравновесия по сцеплению для трех первых галлотипов.

Отмечены вредные последствия инбридинга, приводящие к снижению разнообразия по главному комплексу гистосовместимости (на примере MhcBibo-DRB3), что создает угрозу для сохранения редкого вида (зубр) и к общему снижению устойчивости популяции вида к заболеваниям. Так, в популяциях зубра в Беловежской Пуще и других широкое распространение получило заболевание половых органов у самцов, вызываемое неспецифической микрофлорой. Такие заболевания могут представлять угрозу для выживания вида. Таким образом, для популяции чрезвычайно важно сохранять резерв изменчивости по антигенам гистосовместимости для адекватного иммунного ответа на чужеродные антигены. Последствия инбридинга отмечены в изученном стаде айрширской породы с низким уровнем ротации производителей, повлекшим снижение уровня гетерозиготности по гену BoLA-DRB3 в стаде и приведшим к сильной пораженности стада вируса лейкоза крупного рогатого скота. Доказана роль гетерозиготности как неспецифического фактора в устойчивости к лейкозу у КРС особенно выраженная при вертикальной передаче вируса лейкоза крупного рогатого скота до достижения реципиентом иммунной компетенции, т.е. когда обычные генетические механизмы устойчивости к заболеванию не работают. В двух породах показан наиболее низкий уровень гетерозиготности в группах коров, больных лейкозом, как по аллелям, так и в отношении мотивов, которые они кодируют, а также продемонстрирована большая чувствительность к лейкозу высокопродуктивных коров.

Установлен спектр конкретных антигенов, кодируемых аллелями генов главного комплекса гистосовместимости, в обеспечении устойчивости или чувствительности к лейкозу в айрширской и черно-пестрой породах КРС и ассоциация с туберкулезом у человека антигена HLA-B12. Подтверждена непосредственная роль маркеров BoLA-DRB3 на молекулярном уровне и кодируемых ими аминокислотных последовательностей (или мотивов) VDTY в позициях 75-78 в чувствительности и ER (70-71) в устойчивости к лейкозу у КРС, выявленных ранее (Xu et al., 1993). Показана универсальность влияния этих мотивов на чувствительность и устойчивость к лейкозу на примере двух пород отечественной селекции, выявлены новые аллели, обеспечивающие чувствительность (BoLA-DRB 3.2*3, *10 и *18) (кодирующие VDTY) и устойчивость к лейкозу: BoLA-DRB3.2*2 и *7, первый, вероятно, - за счет мотива

RK (70-71), второй - за счет изменения конформации молекулы антигена в связи с делецией 65 ко дона. Выявлен спектр генотипов, сформированных по принципу аминокислотных мотивов, которые они кодируют в позициях 75-78, которые достоверно обусловливали чувствительность к лейкозу в черно-пестрой (VDTY/VDTV, RR=11,7, 0,05<Р<0,001) и айрширской (VDTY/X, RP=7,74, Р=0,001, VDTY/VDTY, RR=4,71, 0,05<Р<0,001) породах крупного рогатого скота. В обеих породах продемонстрирована достоверная устойчивость животных с генотипами, кодирующими ER/X (RR=0,13 (в черно-пестрой) и RR=0,32 (в айрширской) с 0,05<Р<0,001) 70-71 (Удина и др., 2003).

У красной горбатовской, айрширской и черно-пестрой пород отечественной селекции проведен сравнительный анализ генетического разнообразия по аллелям гена BoLA-DRB3, изученного с помощью молекулярных методов. Продемонстрирован высокий уровень генетического разнообразия у отечественной красной горбатовской породы. Для отечественных (местных) пород лошадей также продемонстрирован более высокий уровень генетического разнообразия с применением молекулярных маркеров ядерного и митохондриального генома по сравнению с заводскими породами. Выявлен высокий уровень генетического разнообразия монгольской и тувинской пород лошадей, которые являются непосредственными потомками дикой лошади Пржевальского. Таким образом, генофонд отечественных (местных) пород характеризуется более высоким уровнем генетического разнообразия (по сравнению с завезенными или заводскими породами) и может служить источником генетических маркеров, обусловливающих ценные хозяйственно-полезные признаки.

Показано, что параметры жирномолочной продуктивности ассоциируются с маркерами главного комплекса гистосовместимости и сцепленных генов, что указывает на существование специфических генетических комплексов в генофонде отдельных пород. Выявлена связь между аллелем BoLA-DRB3.2*22 в черно-пестрой породе отечественной селекции и молочной продуктивностью. Ранее для отдельных пород также наблюдали ассоциации с маркерами ГКГ, например, для голштинской породы КРС отмечена корреляция с аллелем BoLA-DRB 3.2*8 повышенной продуктивности, показана также корреляция между повышенным содержанием белка в молоке для коров этой породы и аллелем BoLA-DRB3.2*7 (Sharif et al., 1999). Понятно, что выявляемые ассоциации вероятнее всего характерны для отдельных пород и не имеют универсального характера, так'как породы КРС содержат индивидуальные комплексы ценных адаптивно-хозяйственных признаков. Показан высокий уровень гетерозиготности по гену пролактина (PRL), сцепленному с BoLA, у молочных пород с высоким содержанием жира в молоке (немецкая черно-пестрая и айрширская породы, монгольский скот), что подтверждает присутствие в генофонде пород КРС устойчивых генетических комплексов, обусловливающих формирование хозяйственно-полезных признаков.

Показана эффективность изучения маркеров гистосовместимости при решении задач по дифференциации отдельных видов и локальных популяций. Применение гетерологичной полимеразной цепной реакции для исследования генетической изменчивости популяций по ГКГ позволило изучить генетическую дифференциацию популяций лося и зубра с помощью анализа ПЦР-ПДРФ (у зубра) и аллельного полиморфизма на уровне нуклеотидной последовательности исследуемого экзона 2 гена DRB3. Установлен спектр аллелей MhcBibo-DRB3 в современной популяции зубра и MhcAlal-DRBl в популяциях лося на территории России. Низкий уровень разнообразия соответствует прохождению этими популяциями через «бутылочное горлышко». Продемонстрирована возможность применения маркеров гистосовместимости MhcBibo-DRB3 для выявления межвидовой гибридизации между зубром и бизоном, что эффективно для выявления гибридных животных в зоне контакта чистокровных зубров с бизонами или их гибридами. В популяциях лося Евразии выявлено восемь из 10 ранее описанных у лося аллелей (Mikko, Andersen, 1995b). В генофонде лося в Евразии выявлены аллели Mhc-AlalDRBl *5,*7 и * 10 и гаплотип митохондриальной D-петли с делецией 75 п.н., ранее отмеченные только в генофонде лося в Северной Америке. Кроме того, особенности распространения аллелей Mhc-AlalDRBl, гаплотипов D-петли и полиморфных вариантов гена каппа-казеина позволяют охарактеризовать современную популяцию лося как принадлежащую к одному виду и выявить центр максимального разнообразия вида на Дальнем Востоке (включая Якутию), который может быть как центром происхождения вида, так и областью смешения ранее дифференцированных популяций. Этот же регион выявлен как наиболее вероятный источник миграций лося в Америку.

Список литературы диссертационного исследования доктор биологических наук Удина, Ирина Геннадьевна, 2003 год

1. Абрамов В.Ю., Зарецкая Ю.М., Кривцова Л.А., Оточева Л.В. Особенности полиморфизма генетической системы HLA в популяции хантов // Генетика. 1990. Т.26. N6. С.1087-1091.

2. Алексеев В.П., Гохман Ш.И. Антропология Азиатской части СССР.- М.: Наука, 1984. С.99-100.

3. Вожегова Н.П. Генетические маркеры клеток крови среди некоторых популяций населения Северо-Востока Европейской части РСФСР / Автореф. дис. канд. биол. наук. Ленинград, 1987. 24С.

4. Вожегова Н.П., Стражникова Г.А., Зайцева Г.А., Раппопорт А.И., Смирнов А.В. Генетические маркеры крови у лиц удмуртской национальности // Гематология и трансфузиология. 1986. N 9. С.50-53.

5. Дектярева Е.А., Пузырев В.П. Генетическая система HLA в популяции северных хантов в сравнении с другими финно-угорскими народами // Генетика. 1993. Т.29. N3. С.515-519.

6. Жеребцов Л.Н. Формирование этнографических групп коми (зырян). Финно-угорский сборник. М.:Наука, 1982. С.96-111.

7. Зайцева Г.А., Драверт Е.Д., Тананов А.Т. и др. Особенности антигенной структуры эритроцитов и лейкоцитов у лиц национальности коми // Проблемы гематологии и переливания крови. 1981. Т. XXI. N9. С.23-26.

8. Зарецкая Ю.М. Клиническая иммуногенетика. М.: Медицина. 1983. С. 38.

9. Калнина О.В., Калнин В.В. Полиморфизм малатдегидрогеназы у черноморского шпрота (Sprattus sprattus phalericus Risso) II. Закономерности изменчивости // Генетика. 1989. Т. 25. N2. С.351-359.

10. Ю.Коненков В.И. Иммуногенетика нарушений функций иммунитета при диффузных заболеваниях соединительной ткани / Дисс. На соиск. Уч. Ст. доктора биол. Наук. Новосибирск, 1985. 403С.

11. Костюченко М.В., Удина И.Г., Зайцев A.M., Храброва Л.Ф., Сулимова Г.Е. ДНК-технологии для оценки генетического разнообразия пород лошадей отечественной селекции // Сельскохозяйственная биология, 2001, N6, С.29-34.

12. Литвинов В.И., Чуканова В.П., Поспелов Л.Е. и др. Распределение антигенов HLA у больных туберкулезом и здоровых лиц молдавской национальности// Здравоохранение Молдавии. 1986. N8. С.125-131.

13. Проблемы наследственности при болезнях легких / Под ред. А.Г.Хоменко. Москва: "Медицина", 1990. 240С.

14. Рычков Ю.Г., Удина И.Г. Генетика популяций таежных охотников-оленеводов. Особенности распространения маркеров системы HLA в коренном населении Средней Сибири // Генетика. 1985. Т. XXI. N5.С. 861868.

15. Рычков Ю.Г., Ящук Е.В. Генетическая память об этногенез / Этнические связи народов севера Азии и Америки по данным антропологии. Под ред. М.С.Великановой и И.М.Золотаревой. М.:Наука, 1986. С.149-166.

16. Симонян Г. А., Хисамутдинов Ф.Ф. Ветеринарная гематология. М.: Колос, 1995. 256С.

17. Сипко Т.П., Удина И.Г., Бадагуева Ю.Н., Сулимова Г.Е., Сравнительная характеристика полиморфизма ДНК гена каппа-казеина у представителей семейства Bovidae // Генетика. 1994. Т30. N2.C. 225-229.

18. Сипко Т.П., Раутиан Г.С., Удина И.Г., Уханов С.В., Берендяева З.И. Изучение полиморфизма групп крови у зубров // Генетика. 1995. Т.31. N1. С.93-100.

19. Слепченко А.Р., Павленко С.П., Иткин Б.З. Серологические методы получения BoLA-типирующих реагентов / Методические рекомендации (Лабораторное руководство). Москва: Всес. Акад. С.-Х. Наук, 1988.

20. Сулимова Г.Е., Бадагуева Ю.Н., Удина И.Г. Полиморфизм гена каппа-казеина в популяциях подсемейства Bovinae // Генетика. 1996. Т.32. N.ll. С.1576-1582.

21. Сулимова Г.И., Удина И.Г., Шайхаев Г.О., Захаров И.А. ДНК-полиморфизм гена BoLA-DRB3 у крупного рогатого скота в связи с устойчивостью и восприимчивостью к лейкозу // Генетика. 1995. Т. 31. № 9. С.1294-1299.

22. Удина И.Г. Сравнительная характеристика генетических особенностей распространения антигенов системы HLA у коренного населения Средней Сибири / Стабильность и изменчивость генома, под ред. Ю.Ф. Богданова. М.: Наука, 1985. С.133-142.

23. Удина И.Г. Особенности распространения антигенов гистосовместимости HLA у представителей мансийской национальности / Тезисы докладов V съезда ВОГиС им. Н.И. Вавилова. Москва, 1987а.-Т.2.- С.117.

24. Удина И.Г. Особенности распространения антигенов главной системы гистосовместимости человека /HLAУ у трех финно-угорских народов / Тезисы докладов XVII Всесоюзной финно-угорской конференции- Устинов, 1987b.-Ч.2.-С.134-135

25. Удина И.Г. Гены главного комплекса гистосовместимости человека и животных / Успехи современной генетики. Под ред. И.А.Захарова. Москва: Наука, 1994. С. 133- 177.

26. Удина И. Г., Бадагуева Ю.Н., Сулимова Г.Е., Захаров И.А. Распределение аллелей гена каппа-казеина в популяции зубра (Bison bonasus) 11 Генетика. 1995. T.31. N12. С. 1704 -1706.

27. Удина И.Г., Данилкин А.А., Боескоров Г.Г. Генетическое разнообразие лося (Alces alces L.) в Евразии // Генетика, 2002, Т.38. N8, С.1125-1132.

28. Удина И.Г., Карамышева Е.Е., Сулимова Г.Е., Павленко С.П., Туркова С.О., Орлова А.Р., Эрнст JI.K. Сравнительный анализ айрширской и черно-пестрой пород крупного рогатого скота по маркерам гистосовместимости // Генетика. 1998. Т.34. N12. С.1668-1674.

29. Удина И.Г., Раутиан Г.С. Генетический полиморфизм системы HLA у коми и коми-пермяков // Генетика. 1994. T.30.N7. С.982-991.

30. Удина И.Г., Сипко Т.П., Соколова С.С., Сулимова Т.Е. Сравнительная характеристика полимофизма ДНК локусов DQB и DRB главного комплекса гистосовместимости у представителей семейства Bovidae // Генетика. 1994. N3. Т.ЗО. С. 356-360.

31. Удина И.Г., Туркова С.О., Костюченко М.В., Лебедева Л.А., Сулимова Г.Е. Полиморфизм гена пролактина (микросателлиты, ПЦР-ПДРФ) у крупного рогатого скота // Генетика, 2001,Т.37, N.4. С.511-516.

32. Удина И.Г., Шкурко В.Н., Братин В.Б. Особенности распространения антигенов гистосовместимости /HLA/ у коренного населения побережья Чукотки / Проблемы молекулярной и популяционной генетики. Под ред. Ю.Ф.Богданова. М.: Наука, 1988. С. 90-93.

33. Фефелова В.В., Высоцкая Г.С. Изучение распределения антигенов системы HLA у коренных народностей Сибири как основа для анализа этногенеза популяций / Препринт N12 АН СССР СО ВЦ. Красноярск, 1987. 18С.

34. Фефелова В.В. Генетические маркеры системы HLA у коренных народностей Дальнего Востока как основа для анализа этногенеза популяций / Автореф. Дис. .докт. биол. наук. Новосибирск, 1991. 25С.

35. Хаитов P.M., Алексеев Л.П. Геномика HLA: новые возможности молекулярной генетики человека в диагностике и терапии // Молекулярная медицина. 2003. N1. С.17-31.

36. Хоменко А.Г., Литвинов В.И., Чуканова В.П. и др. Антигены комплекса HLAу больных туберкулезом и здоровых лиц в различных популяциях. Иммунология. 1985. N1. С.22-25.

37. Эрнст Л.Н., Сулимова Г.Е., Орлова А.Р., Удина И.Г., Павленко С.П. Особенности распространения антигенов BoLA-A и аллелей BoLA-DRB3 у черно-пестрого скота в связи с ассоциацией с лейкозом // Генетика. 1997. Т.ЗЗ. N1.С.87-95.

38. Abdulsalem М., Gony J., Schmid М. Et al. HLA phenotyping in an Indonesian population // Tissue Antigens. 1975. V.5. N.6. P.80-84.

39. Akers R.M., Bauman D.E., Capuco A.V., Goodman G.T. & Tucker H.A. Prolactin regulation of milk secretion and biochemical differentiation of mammary epithelial cells in periparturient cows // Endocrinology. 1981. V.109. P.23-30.

40. Aldridge, B.M., McGuirk, S.M., Clark, R.J., Knapp, L.A., Watkins, D.I. & Lunn, D.P. Denaturing gradient gel electrophoresis: a rapid method for differentiating BoLA-DRB3 alleles // Animal Genetics. 1998. V.29. P.389-396.

41. Alexander L/J., Stewart A.F., Mackinlay A.G. et al. Isolation and characterization of the bovine к-casein gene I I Eur. J. Biochem. 1988. V.178. P.395-401.

42. Ambresin A., Tran Т., Spertini F., Herbort C. Behcet's disease in Western Switzerland: Epidemiology and analysis of ocular involvement // Ocul. Immunol. Inflamm. 2002. V.10. N1. P.53-63.

43. Ammerman A.J., Cavalli-Sforza L.L. The neolitic transition and the genetics of populations in Europe. New Jersey, Princeton: Princeton Univ. Press. 1984. 176P.

44. Amorena В. & Stone W.H. Serologically defined SD locus in cattle // Science. 1978. V.201 P. 159-160.

45. Andersson L. Organization of the bovine MHC class II region as revealed by genomic hibridizations // Animal Genetics. 1988a. Vol.19. P.32-34.

46. Andersson L. Genetic polymorphism of a bovine t-complex gene (TCP1) linkage to major histocompatibility genes//Journal of Heredity. 1988b. V.79, NL P.1-5.

47. Andersson L., Bohme J., Rask L., Peterson P. A. Genomic hybridization of bovine class II major Histocompatibility genes: 1. Extensive polymorphism of DQa and DQb genes //Animal genetics. 1986a. V.17. P.95-112.

48. Andersson L., Bohme J., Peterson P.A. & Rask L. Genomic hybridization of bovine class II major histocompatibility genes: 2. Polymorphism of DR genes and linkage disequilibrium in the DQ-DR region // Animal Genetics. 1986b. V.l 17. P.295-304.

49. Andersson L., Lunden A., Sigurdottir S., Davies Ch.J. & Rask L. Linkage relationships in the bovine MHC region. High recombination frequency between class II subregions // Immunogenetics. 1988. V.27. P.273-280.

50. Andersson L. & Rask L. Characterization of the MHC Class II region, in cattle. The number of DQ genes varies between haplotypes // Immunogenetics. 1988. V.27. P.110-120.

51. Andersson L., Sigurdartottir S., Borsch C. & Gustafsson K. Evolution of MHC polymorphism: extensive sharing of polymorphic sequence motifs between human and bovine DRB alleles // Immunogenetics. 1991. V.33. P.188-193.

52. Andersson M., Bohme J., Andersson G., Moller E. Thorsby E., Rask L. & Peterson P.A. Genomic hybridization with class II transplantation antigens cDNA probes as a complementary technique in tissue typing // Human immunology. 1984. V.l 1. P.57-67.

53. Arnaiz-Villena A., Dimitroski K., Pacho A. et al. HLA genes in Macedonians andthe sub-Saharan origin of the Greeks // Tissue Antigens. 2001a. V.57. P.118-127.

54. Arnaiz-Villena A., Elaiwa N., Silvers C. et al. The origin of Palestinians and their genetic relatedness with other Mediterranean populations // Human Immunology. 2001b. V.62. P.889-900.

55. Arnaiz-Villena A., Karin M., Bendikuze N. et al. HLA alleles and haplotypes in the Turkish population: relatedness to Kurds, Armenians and other Mediterraneans // Tissue Antigens. 2001c. V.57. P.308-317.

56. Ballingall K.T., Luyai A., McKeever D.J. Analysis of genetic diversity at the DQA locus in African cattle: evidence for a DQA3 locus. Immunogenetics. 1997. V.46. P.237- 243.

57. Batra T.R., Lee A.J., Stear M.J. Class I alleles of the bovine major histocompatibility system and their association with economic traits // J. Daily Sci. 1989a. V.72. N.8. P.2115-2124.

58. Barta T.R., Stear M.J., Lee A.J. & Gavora J.S. Association of BoLA antigens with production traits in cows // Animal genetics. 1989b. V. 20. Suppl.l. P.32.

59. Bell J.I., Todd J.A., McDevitt H.O. The molecular basis of HLA-disease association / Advances in human genetics. Eds. H.Harris & K.Hirschhorn. N.Y. & L.: Plenum press, 1989.V.18. Ch.l. P. 1-42.

60. Bensaid A., Naessens J., Kemp S.J., Black S.J., Shapiro S.Z. & Teale AJ. An immunochemical analysis of class I (BoLA) molecules on the surface of bovine cells // Immunogenetics. 1988. V. 27. P.139-144.

61. Black F.L. Interrelationships between Amerindian tribes of Lower Amazonia asmanifest by HLA haplotype disequilibria 11 Am. J. Hum. Genet. 1984. V.36. N6. P.l 318-1331.

62. Bodmer J., Bodmer W. Population genetics of the HL-A system. A summary from the Fifth International Histocompatibility Testing Workshop// Israel J. Med. Sci. 1973. V9. N.9-10. P.1257-1268.

63. Bodmer W.F. Population studies and the measurement of natural selection with special reference to the HLA system// Israel J. Med. Sci. 1973. V.9. N9-10. P. 15031518.

64. Bodmer W.F.Evolution of HL-A and other major histocompatibility systems // Genetics. 1975. V.79. P. 293-304.

65. Bodmer J. & Bodmer W. Population genetics of the HL-A system. A summary from the Fifth International Histocompatibility Testing Workshop// Israel J. Med Sci. 1973. V.9. N9-10. P.1257-1268.

66. Bonatto S.L., Salzano F.M. A single and early migration for the peopling of the Americas supported by mitochondrial DNA sequence data // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 1997. V.94. N.5. P.1866-1871.

67. Boom R., Sol C.J.A. and Salimans M.M.M. Rapid and simple method for purification of nucleic acids II J. Clin. Microbiol. 1990. V. 28. P. 495 503.

68. Botstein D., White R.L., Skolnik M., and Davis R.W. Construction of genetic linkage map in man using restriction fragment length polymorphism // Am. J. Genet. 1980. V. 32. P. 314-331.

69. Breen M., Downs P., Irvin Z., Bell K. An equine tetranucleotide repeat: microsatellite MPZ001. Animal. Genetics, 1994,25, 123.

70. Brown J.H., Jardetzky Th.S., Gorga J.C., Stern L.J., Urban R.G., Strominger J.L. and Wiley D.C. Three-dimensional structure of the human class II histocompatibility antigen HLA-DR1 // Nature. 1993.V.364. P. 33 39.

71. Bunce M, O'Neill CM, Barnardo MCNM et al. Phototyping: comprehensive DNA typing for HLA-A, В, C, DRB1, DRB3, DRB4, DRB5 & DQB1 by PCR with 144 primer mixes utilizing sequence specific primers (PCR-SSP) // Tissue Antigens. 1995. V.46. P.355-367.

72. Burke M.G., Stone R.T., Muggli-Cockett E. Nucleotide sequence and Nothern analysis of a bovine major histocompatibility class II DRB-like cDNA // Animal Genetics. 199la. Vol.22. P.343-352.

73. Burke M.G., Stone R.T. & Muggli-Cockett N.E. The nucleotide sequence of bovine major histocompatibility class II DRB cDNA and hybridization to lymphocyte RNA // Animal genetics. 1991b. Vol. 22. Suppl .1. P.49-50.

74. Burny A., Bruck C., Chantrenne H. et al. Bovine leukemia virus: molecular biologyand epidemiology // In: Viral Oncology (ed. by G. Klein). New York: Raven Press, 1980. P.89-231.

75. Bumy A., Cleuter Y., Kettmann R. et al. Bovine leukemia: facts and hypotheses derived from the study of an infectious cancer // Vet. Microbiol. 1988. V.17. P. 197218.

76. Busson M., Vu Trieu A., Labelle P., Pham-Van K., Ho-Quang H., Bouteiller A.M., Bleux H., Charron D., Hors J. HLA-DRB1 and DQB1 allele distribution exposed to malaria in Vietnam // Tissue Antigens. 20.02. V.59. Iss. 6. P.470-474.

77. Cameron P.U., Cobain T.J., Zhang W.J., Kay P.H., Dawkins R.F. Influence of C4 null genes on infection with human immunodeficiency virus // British Medical J. 1988. V.296. P.1627-1628.

78. Cameron P.U., Mallal S.A., French M.A.H. & Dawkins R.L Major histocompatibility complex genes influence the outcome of HIV infection. Ancestral haplotypes with C4 null alleles explain diverse HLA associations // Human immunology. 1990. V.29. P.282-296.

79. Camper S.A., Lyck D.N., Yao Y., Woychik R.P., Goodwin R.G., Lyons R.H., Rottman F.M. Characterization of the bovine prolactin gene // DNA. 1984. V.3. N.3. P.237-249.

80. Cavalli-Sforza L.L., Menozzi P., Piazza A. The history and geography of human genes. Princeton, New Jersey: Princeton University Press, 1996. 413P.

81. Chang H.K., Kim J.W. The Clinical Features of Behcet's Disease in Yongdong

82. Districts: Analysis of a Cohort Followed from 1997 to 2001 // J. Korean Med. Sci. 2002. V.17. N6. P.784-789.

83. Chan S.H., Wee G.B., Srinivasan N. et al. HLA antigens in three common populations in South East Asia Chinese, Malay and Filipino // Tissue Antigens. 1979. V.13. P.361-368.

84. Chernajovsky Y., Winyard P.G., Kabouridis P.S. Advances in understanding the genetic basis of rheumatoid arthritis and osteoarthritis: implications for therapy // Am J. Pharmacogenomics. 2002. V.2. N4. P.223-234.

85. Chiewsilp P., Chanarat P. The HLA system in Thais // Vox. Sang. 1976. V.30. N1. P.74-80.

86. Chikuni K., Mori Ya., Tabata Т., Saito M., Monma M., Kosugiyama M. Molecular plylogeny based on the к-Casein and cytochrome b sequences in mammalian suborder ruminantia // J. Molecular Evolution. 1995. V.41. P.859- 866.

87. Chimge N-O., Tanaka H., Kashiwase K. et al. The HLA system in the population of Mongolia. Tissue Antigens. 1996. V.49. P.477-483.

88. Chrenek P., Vasicek D., Bauerovf M., and Bulla J. Simultaneous analysis of bovine growth hormone and prolactin alleles by multiplex PCR and RFLP // Czech J. Anim. Sci. 1998. V.43. P.53-55.

89. Colonna M., Mantovani W., Corazza R., Barboni P.,Gasbarrini G., Ferrara G.B., Tosi R. & Tanigaki N. Reassessment of HLA association with Celiac Disease in special reference to DP association // Human Immunology. 1990. V.29. P.263-274.

90. Comas D., Mateu E., Calafell F. et al. HLA class I and class II DNA typing and the origin of Basques // Tissue Antigens. 1998. V.51. P.30-40.

91. Coppin H.L., Garmichael P., Lombardi G.L. et al. Position 71 in the a helix of the DR(3 domain is predicted to influence peptide binding and plays a central role in allorecognition // Eur. J. Immunol. 1993.V.23. P.343-349.

92. Cox S.T., Marsh S.G.E., Scott I. et al. HLA-A-B-C polymorphism in a UK Ashkenazi Jewish potential bone marrow donor population // Tissue Antigens. 1999. V.53. P.41-50.

93. Crawford M.H., Reddy B.M., Martinez-Laso J., Mack S.J., Erlich H.A. Genetic variation among the Golla Pastoral caste subdivisions of Andhra Pradesh, India, according to the HLA system // Hum. Immunol 2001. V.62. P.1031-1041.

94. O.Crittenden L.B. Natural and artificially induced genetic resistance to viral diseases in poultry // Animal Genetics. 1991. V.22. Suppl. 1. P.2-7.

95. Davies C.J., Andersson L., Ellis S.A. et al. Nomenclature for factors of the BoLA system, 1996: report of the IS AG BoLA Nomenclature Committee // Animal Genetics. 1997. V.28. P.159-168.

96. Dawkins R.L., Laver A., Cameron P.U., Martin E., Kay P.H. & Christiansen F.T. Some disease-associated ancestral haplotypes carry a polymorphism of TNF // Human Immunology. 1989. V.26. P.l 18-121.

97. Degos L., Chaventre A., Jacquard A. Migration, selection and histocompatibility // J. of Human Evolution. 1979 V.8. P.795-797.

98. Degos L.& Dausset J. Human migration and linkage disequilibrium of the HL-A system // Immunogenetics. 1974. N3. P. 195-210.

99. Derenko M.V., Grzybowski Т., Malyarchuk B.A., Czamy J., Miscicka-Sliwka D., Zakharov I.A. The presence of mitochondrial haplogroup x in Altaians from South Siberia //Am. J. Hum. Genet. 2001. V.69. N1. P.237-241.

100. Dietz A., Detilleux J., Freemann A. et al. Genetic association of bovine lymphocyte antigen DRB3 alleles with immonological traits of Holstein cattle // Journal of Dairy Science. 1997a. V.80. P.400-405.

101. Dietz А. В., Cohen N.D., Timms L. & Kehrli M.E., Bovine lymphocyte antigen class II alleles as risk factors for high somatic cell counts in milk of lactating dairy cows // Journal of Dairy Science. 1997b. V.80. P.406-412.

102. Dossetor J.B., Howson W.T., Schleut J. et al. Study of the HL-A system in two Canadian Eskimo populations// Histocompatibility Testing 1972. Eds. J.Dausset & J.Colombani. Copenhagen: Munksgaard, 1973. P.3225-3331.

103. Dunckley H., Jawinska E.C., Gatenby P.A. & Seijeantson S.W. DNA-DR typing shows HLA-DRwl 1 RFLPs are increased in frequency in both progressive systemic sclerosis and CREST variants of scleroderma // Tissue antigens.l989.V.33. P.418-420.

104. Edwards A.W.F. & Cavalli-Sforza L.L. Reconstruction of evolutionary trees // Pubis. Syst. Ass. 1964. V.6. P.67-76.

105. Ellis S.A., Staines K.A., Stear M.J., Hensen E.J., Morrison W.I. DNA typing for BoLA class I using sequence-specific primers (PCR-SSP). European Journal of Immunogenetics. 1998. V.43. P.156- 159.

106. Ellis S.A., Holmes E.C., Staines K.A., Smith K.B., Stear M.J., McKeever D.J., MacHugh N.D., Morrison W.I. Variation in the number of expressed MHC genes in different cattle class I haplotypes. Immunogenetics. 1999. V.50. P.319-328.

107. Elo K.T., Vilkki J., de Koning D.J., Velmala R.J., Tanila A.V.A quantitative trait locus for live weight maps to bovine chromosome 23 // Mamm. Genome. 1999. V.10.N.8.P.831-835.

108. Esteban E., Thorn R., Ferrer J. Characterization of the blood lymphocyte, population in cattle infected with the bovine leukemia virus // Cancer Res. 1985.1. V.45. Р.3225-3230.

109. Ewen K.R., Matthews M.E. VIAS-H39, an equine tetranucleotide microsatellite repeat polymorphism. Animal. Genetics. 1994. V.25. P.433.

110. Ferrer J., Marshak R., Abt D. et al. Persistent lymphocytosis in cattle; nature and relation to lymphosarcoma. Ann. Rech. Vet. 1978. V.9. P.851-857.

111. Fries R., Hedige R.R. & Strazinger G. Tentative chromosomal localization of the bovine major histocompatibility complex by in situ hybridization // Animal Genetics. 1986. V.17. P.287-294.

112. Forster P., Harding R., Torroni A., Bandelt H.J. Origin and evolution of Native American mdDNA variation: a reappraisal //Am. J. Hum. Genet. 1996. V.59. N4. P.935-945.

113. Garrote J.A., Arranz E., Telleria J.J., Castro J., Calvo C., Blanco-Quiros A. TNF alpha and LT alpha gene polymorphisms as additional markers of celiac disease susceptibility in a DQ2-positive population // Immunogenetics. 2002. V.54. N8. P.551-555.

114. Gautschi C. & Gaillaxd C. Influence of major histocompatibility complex on reproduction and production traits in swine // Animal genetics. 1990. V.21. P.161-170.

115. Gelhaus L., Schnittger L., Mehlitz D., Horstmann R.D. & Meyer C.G. Sequence and PCR-RFLP analysis of 14 novel BoLA-DRB3 alleles // Animal Genetics. 1995. V.26. P.147-157.

116. Gelhaus A., Forster B. Cattle MHC genes DOA and DOB: sequence polymorphisms and assignments to the class lib region // Eur J Immunogenet. 2001. V.28. N.3. P.429-433.

117. Gilliespie B.E., Jayarao B.M., Dowlen H.H. & Oliver S.P. Analysis and frequency of bovine lymphocyte antigen DRB3.2 alleles in Jersey cows // Journal of Dairy Science. 1999. V.82. P.2049-2053.

118. Giovambattista G., Golijow C.D., Dulout F.N. & Lojo M.M. Gene frequencies of DRB3.2 locus of Argentine Creole cattle // Animal Genetics. 1996. V.21. P.55-59.

119. Giovambattista G, Ripoli MV, Peral-Garcia P, Bouzat JL. Indigenous domestic breeds as reservoirs of genetic diversity: the Argentinean Creole cattle // Anim Genet. 2001. V.32. N.5. P.240-247.

120. Gomez-Casado E-, del Moral P., Martinez-Laso J. et al. HLA genes in Arabic-speaking Moroccans: close relatedness to Berbers and Iberians // Tissue Antigens. 2000. V.55. P.239-249.

121. Gorodezky С., Castro-Escobar L.E., Escobar-Gutierrez A. The HLA system in prevalent Mexican Indian group the Nahuas // Tissue Antigens. 1985. V.25. N.I-P.38-46.

122. Grahovac В., Sukernik R.I., O'hUigin C., Zaleska-Rutczynska Z., Blagitko N., Raldugina O., Kosutic Т., Satta Y., Figueroa F., Takahata N., Klein J. Polymorphism of the HLA class II loci in Siberian populations // Hum. Genet. 1998. V.102. N1. P.27-43.

123. Greiner J., Schleirmacher E., Lenhard V. et al. HLA antigene, gene and haplotype frequinces in Thailand // Human Genetics. 1978. V.41. N1. P.73-87.

124. Groenen M.A.M., van der Poel J.J., Dijkhof R.J.M. & Giphart M.J. Cloning of the bovine major histocompatibility comlex class II genes // Animal genetics. 1989. V.20. P.267-268.

125. Groenen M.A.M., van der Poel J.J., Dijkhof R.J.M. & Giphart M.J. The nucleotide sequence of bovine MHC class II DQB and DRB genes // Immunogenetics. 1990. V.31. P.37-44.

126. Good M.F., Kaslow D.C., Miller L.H. Pathways and strategies for developing a Malaria blood stage vaccine / Annu. Rev. Immunol. 1998. V.16. P.57-87.

127. Hall M.A., Lanchbury J.S.S., Bolsover W.J., Welsh K.I. & Ciclitira P.J. Celiac disease is associated with anextended HLA-DR3 haplotype which includes HLA-DPwl 11 Human Immunology. 1990. V.27. P.220-229.

128. Hart G.L., Bastiaansen J., Dentine M.R., Kirkpatrick B.W. Detection of a four-allele single strand conformation polymorphism (SSCP) in the bovine prolactin gene5' flank //Animal Genetics. 1993. V.24. P.149.

129. Hawkins B.R., Ho A.Y., Cho E.K. & Osmund I.F. HLA antigens, glyoxalase I, and esterase D in Hong Kong Chinese // Human Genetics. 1984. V.66. N.4. P.371-375.

130. Hedrick Ph. W., Whittam Th.S. & Parham P. Heterozygosity at individual amino acid sites: extremely high levels for HLA-A and B-genes // Proceedings of the National academy of sciences USA. 1991. V.88. P.5897-5901.

131. Hildesheim A, Wang SS. Host and viral genetics and risk of cervical cancer: a review // Virus. Res. 2002. V.89. N2. P.229-234.

132. НШ A.V.S. The immunogenetics of resistance to Malaria I I Proc. Assoc. Am. Physicians. 1999. V.lll. P.272-277.

133. Hill A.V., Aidoo M., Allsopp C.E., Davenport M., Yates S.N.Interactions between Plasmodium falciparum and HLA molecules // Biochem Soc Trans. 1994. N2. P.282-285.

134. Hines H.C., Bailey E.& Park C.A. Relationship of the bovine major histocompatibility complex with aspects of persistent lymphocytosis/leukaemia // Animal Genetics. 1991.V.22. Suppl.l. P.93.

135. Hoj S., Fredholm M., Larsen N.J., Nielsen V.H. Growth hormone gene polymorphism associated with selection for milk fat production in lines of cattle // Animal Genetics. 1993. V.24. N.2. P.91-96.

136. Horin P., Matiasovic J, Trtkova K, Pavlik I. BoLA DYA polymorphism in Czech cattle // Exp. Clin. Immunogenet. 1998. V.15. N.l. P.56-60.

137. Horn G.T., Bugawan T.L., Long Ch.M., Manos M.M. & Erlich H.A. Sequence analysis of HLA class II genes from insulin-dependent diabetic individuals // Human Immunology. 1988. V.21. P.249-263.

138. Hughes A.L. and Nei M., Nucleotide substitutions at major histocompatibility complex class II loci: evidence for overdominant selection // Proc. Natl. Acad Sci. USA. 1989. V.86. P.958 -962.

139. Jaraquemada D., Oilier W., Doyle P. et al. HLA polymorphisms in Shanhai Chinese population // Tissue Antigens. 1984. V.23. N1. P.23-32.

140. Jeannet M., Schapira M., Gervasoni C. et al. Study of the HL-A system and other polymorphisms in the Tibetan population / Histocompatibility Testing 1972, Eds. J.Dausset& J.Colombani. Copenhagen: Munksgaard, 1973. P.241-250.

141. Jobim L.F., Moura N.C., Persolli L.B. et al. HLA antigens in Tikuna Indians // Am.

142. J. of Physical Anthropol. 1981. V.56. N3. P.285-290.

143. Joysey M., Roger J.H., Abbas A. et al. Study of a Malay population / Histocompatibility Testing 1972, Eds. J.Dausset & J.Colombani. Copenhagen: Munksgaard, 1973. P. 251-260.

144. Joosten I., Hensen E.J., Sanders M.F. & Andersson L. Bovine MHC class II restriction fragment length polymorphism linked to expressed polymorphism // Immunogenetics. 1990. V. 31. P. 123-126.

145. Joosten I., Oliver R.A., Spooner R.L., Willams J.L., Hepkema G., Sanders M.F., Hensen E.J. Characterisation of class I bovine lymphocyte antigens (BoLA) by one-dimensional isoelectric focussing // Animal Genetics. 1988. V.19. P.103-113.

146. Joosten I., Sanders M.F. & Hensen E.J. MHC class I compatibility between dam and calf increases the risk of bovine retained placenta//Animal genetics. 1991. V.22. Suppl.l. P.l 14.

147. Joosten I., Sanders M.F., van der Poel A., Williams J.L., Hepkema B.G. & Hensen E.J. Biochemically defined polymorphism of bovine MHC class II // Immunogenetics. 1989. V.29. P.213-216.

148. Karafet T.M., Zegura S.L., Posukh O., Osipova L., Bergen A., Long J., Goldman D., Klitz, W., Harihara S., de Knijff P., Wiebe V., Griffiths R.C., Templeton A.R. &

149. Hammer F. Ancestral Asian source(s) of New World Y-chromosome founder haplotypes // Am. J. Hum. Genet. 1999. V.64. P.817-831.

150. Karafet T.M., Xu L., Du R., Wang W., Feng Sh., Wells R.S., Redd A.J., Zegura L.& Hammer F. Paternal population history of East Asia: sources, patterns, and microevolutionary processes // Am. J. Hum. Genet. 2001. V.69. P.615-628.

151. Karp D.R., Teletski Ch. I., Jaraquemada D., Maloy W.L., Coligan J.E. & Long E.O. Structural requirements for paring of a and b chains and HLA-DR and HLA-DP molecules I I The J. of Experimental Medicine. 1990. V.171. N3. P.615-628.

152. Kemp S.J., Spooner R.L., Teale A.J. A Comparative-study of major histocompatibility complex antigens in East African and European Cattle breeds // Animal Genetics. 1988. V.19. P. 17- 29.

153. Kemp S.J., Tucker E.M. & Teale A.J. A bovine monoclonal antibody detecting a class I BoLA antigen // Animal Genetics. 1990. V.21. P. 153-160.

154. Khan M.A., Ball E.J. Genetic aspects of ankylosing spondylitis // Best. Pract. Res. Clin. Rheumatol. 2002. V. 16. N4. P.675-690.

155. Kim K.I., Yang Y.H., Lee S.S., Park C., Ma R., Bouzat J.L., Lewin H.A. Phylogenetic relationships of Cheju horses to other horse breeds as determined by mtDNA D-loop sequence polymorphism. Animal. Genetics. 1999. V.30. P.102-108.

156. Kissmeyer-Nielson F., Thorsby E. Lymphocytotoxic Microtechnique / Manual of Tissue Typing Techniques. Bethesda, 1970. P.31.

157. Kissmeyer-Nielsen F., Andersen H., Hange M. et al. HL-A types in Danish Eskimos from Greenland // Tissue Antigens. 1971. V. 1. P.74-80.

158. Kissmeyer-Nielsen F., Kjerbye K.E., Lamm L.U. et al. Study of HL-A system in Eskimos / Histocompatibility Testing 1972. Eds. J.Dausset & J.Colombani. Copenhagen: Munksgaard, 1973. P.317-324.

159. Krieger J.I, Karr R.W., Grey H.M. et al. Single amino acid changes in DR and antigen define residues critical for peptide-МНС binding and T cell recognition // J. Immunol. 1991. V.146. P.2331 -2340.

160. Kostyu D.D. & Amos D.B. Mysteries of Amerindians // Tissue Antigens. 1981. V.16. P.111-123.

161. Kumar S., Tamura K., Nei M. Molecular evolutionary genetic analysis. Version 1.0. The Pennsylvania State University. University Park. PA 16802.1993.

162. Layrisse Z., Layrisse M., Malave I. et al. Histocompatibility Antigens in a genetically isolated American Indian tribe // American J. of Human Genetics. 1973. V.25.N7. P.493-509.

163. Lagziel A., DeNise S., Hanotte O., Dhara S., Glazko V., Broadhead A., Davoli R. Geographic and breed distribution of an Mspl PCR-RFLP in the bovine growth hormone (bGH) gene // Animal Genetics. 2000. V.31. N3. P.210 213.

164. Lagziel A., Lipkin E., Ezra E., Soller M., Veller J.I. An Mspl polymorphism at the bovine growth hormone (bGH) gene is linked to a locus affecting milk protein percentage // Animal Genetics. 1999. V.30. N4. P.296-299.

165. Lee T.D., Zhao T.M., Bu К J. et al. Association of the HLA-DR-4 with myastenia Gravis in Chinese // Tissue Antigens. 1984. V.23. N2. P.127-129.

166. Lee T.D. Marrow donor registry and cord blood bank in Taiwan // Int. J. Hematol. 2002. V.76. Suppl.l. P.312-314.

167. Ledwidge S.A., Mallard B.A., Gibson J.P., Jansen G.B., Jiang Z.H. Multi-primer target PCR for rapid identification of bovine DRB3 alleles. Animal Genetics. 2001.V.32. N.4. P.219-221.

168. Lewin H.A. Disease resistance and immune response genes in cattle: strategies for their detection and evidence of their existence// J. Dairy Sci. 1989. V.72. P.334-1338.

169. Lewin H., Bernoco D. Evidence for BoLA-linked resistance and susceptibility to subclinical progression of bovine leukaemia virus infection // Animal Genetics. 1986. V. 17. P. 197-207.

170. Lewin H. A.; Russell G. C.; Glass E. J. Genomic Organisation Of The Mhc: Structure, Origin And Function // Immunol. Rev., V.167. 1999. P.145-158.

171. Lewin H.A., Ming-Che Wu, Steawart J.A., Nolan TJ. Association between BoLA and subclinical bovine leukemia virus infection in a herd of Holstein-Friesian cows // Immunogenetics. 1988a. V.25. P.338-334.

172. Lewin H., Wu M., Nolan T. et al. Peripheral В lymphocyte percentage as an indicator of subclinical progression to bovine leukemia virus infection // J. Dairy Sci. 1988b. V.71. P. 2526-2534.

173. Lewontin R.C On measures of genetic disequilibrium // Genetics. 1988. V.1120. N3. P.849-852.

174. Lewontin R.C.& Krakouer J. Distribution of gene frequency as a test of the theory of the selective neutrality of polymorphisms // Genetics. 1973. V.74. N1. P.l 75-195.

175. Lindberg P.G. & Andersson L. Close association between DNA polymorphism of bovine major histocompatibility complex class I genes and serological BoLA-A specificities // Animal Genetics. 1988. V. 19. P.245-255.

176. Lorenz R. Straub O. The epidemiology of enzootic bovine leukosis. / In: Enzootic Bovine Leukosis and Bovine Leukemia Virus. A. Burny and M. Mammerickx, eds. Martinus Nijhoff, Boston, 1987. P. 51-67.

177. Lunden A., Edfors-Lilja I., Simonsen M. & Liljedahl L.E.The influence of chicken major histocompatibility complex on production traits in egg-laying hens // Animal Genetics. 1991. V. 22. Suppl.l. P. 103-104.

178. Lunney J.K. & Madden K.B. Assessment of the genetic control of swine immune responses to the nematode parasite, Trichinella spiralis /I Animal Genetics. 1991. V. 22. Suppl.l. P. 93-94.

179. MacHugh D.E., Shriver MD., Loftus R.T., Cunningham P., Bradley D. Microsatellite DNA variation and the evolution, domestication and phylogeography of Taurine and Zebu cattle (Bos taurus and Bos indicus)// Genetics. 1997. V.146. P.1071 1086.

180. Maeda H., Takeuchi F., Juji T. et al. HLA-DRw3 in juvenile onset diabetes mellitus in Chinese // Tissue Antigens. 1980. V. 15. P. 173-176.

181. Maillard J.C., Renard C., Chardon P., Chantal I. & Bensaid A. Characterization of 18 new BoLA-DRB3 alleles // Animal Genetics. 1999. V. 30. P. 200-205.

182. Mattiuz P.L., Ihde D., Piazza A. et al. New approaches to the population genetics and segregation analysis of the HL-A system / Histocompatibility Testing 1970. Ed. P.Terasaki. Copenhagen: Munksgaard, 1970. P. 193-201.

183. Mejdell C.M., Stear M.J., Lingaas F. & Lie O.Genetic analysis on BoLA-A antigens and serum Transferrins in Norwegian cattle // Animal Genetics. 1991. V.22. Suppl. 1. P.42.

184. Merriwether D.A., Hall W.W., Vahlne A., Ferrell R.E. mtDNA variation indicates Mongolia may have been the source for the founding population for the New World // Am. J. Hum. Genet. 1996. V.59. N1. P.204-212.

185. Merel P.A., Dorman J.S., Todd J.A., McDevitt H.O. & Trucco M. Aspartic acid at position 57 of the HLA DQ b chain protects against type I diabetes: a family study // Proceedings of the National Academy of Sciences USA. 1988. V.85. P.8111-8115.

186. Mikko S., Andersson L. Extensive MHC class II Drb3 diversity in African and European cattle // Immunogenetics. 1995a. V.45. P.408-413.

187. Mikko S., Andersson L. Low major histocompatibility complex class II diversity in European and North American moose // Proc. Natl. Acad. Sci., U.S.A. 1995b. V.92. P.4259-4263.

188. Mikko S., Lewin H.A., Anderson L. A phylogenetic analysis of cattle DRB3 alleles with a deletion of codon 65 // Immunogenetics. 1997a. V.47. P.23 -29.

189. Mikko S., Roed K., Schmutz Sh., Anderson L Monomorphism and polymorphism at Mhc DRB loci in domestic and wild ruminants / Immunological Revies. 1999. V.167. P.169-178.

190. Mikko S., Spencer M., Morris, Stabile S., Basu Т., Stormont C. & Anderson L. A comparative analysis of Mhc DRB3 polymorphism in the American bison (Bison bison) //J. Heredity. 1997b. V.88. P.499-503.

191. Miniter P., Chan K.W., Pollack M.S. et al. HLA linked genetic markers in Chineseand other Oriental populations // Tissue Antigens. 1981. V. 18. N5. P.285-298.

192. Miretti M.M., Ferro J.A., Lara M.A., Contel E.P. Restriction fragment length polymorphism (RFLP) in exon 2 of the BoLA-DRB3 gene in South American cattle // Biochem Genet. 2001. V.39. N.9-10. P.311-324.

193. Mirsky M.L., Olmstead C.Da., Lewin H.A. Reduced bovine leukaemia virus proviral load in genetically resistant cattle // Animal Genetics. 1998. V.29. P.245-252.

194. Mitra A., Schlee P., Balakrishnan C.R., Pirchner F. Polymorphism at growth -hormone and prolactin loci in Indian cattle and buffalo // J. Anim. Breed. Genet. 1995. V.112. P.71-74.

195. Mittal K.K., Hasegawa Т., Ting A. et al. Genetic variation in the HL-A system between Ainus, Japanese, and Caucasians / Histocompatibility Testing 1972. Eds. J.Dausset&. J.Colombani. Copenhagen: Munksgaard, 1973. P.187-195.

196. Мок S.C., Lo K.W. & Tsao S.W. Direct cycle sequencing of mutated alleles detected by PCR single-strand conformation polymorphism analysis // Biotechniques. 1993. V.14. P.790-796.

197. Moris B.G., Spencer M.C., Stabile S. and Dodd J.N. Restriction fragment length polymorphism (RFLP) of exon 2 of the MhcBibi-DRB3 gene in American bison (Bison bison) //Animal Genetics, Suppl.l. 1994. P.91-93.

198. Muggli-Cockett N.E. & Stone R.T. Identification of genetic variatrion in the bovine major histocompatibility complex DRb-like genes using sequenced bovine genomic probes//Animal Genetics. 1988. V.19. P.213-225.

199. Muggli-Cockett N.E. & Stone R.T. Partial nucleotide sequence of a bovine major histocompatibility class II DRb-like gene // Animal Genetics. 1989. V.20. P.361-370.

200. Nagaoka Y., Kabeya H., Onuma M. et al. Ovine MHC class II DRB1 alleles associated with resistance or susceptibility to development of bovine leukemia virus-induced ovine lymphoma // Cancer Res. 1999. V.59. N4. P.975-981.

201. Nei. M. Variation and covariation of gene frequences in subdivided populations // Evolution. 1965. V.19. №2. P.256-258.

202. Nei M., Miller J.C. A simple method for estimating average number of nucleotide substitutions within and between populations from restriction data // Genetics. 1990. V.125.P.873-879.

203. Nei M. & Tajima F. DNA polymorphism detectable by restriction endonucleases // Genetics. 1981. V.97. P. 145 163.

204. Parham P., Ohta T. Population biology of antigen presentation by MHC class I molecules // Science. 1996. N272. P.67-74.

205. Park M.H., Kim H.S., Kang S.J. HLA-A-B and -DRB1 allele and haplotype frequencies in 510 Koreans // Tissue Antigens. 1999. V.53. P.386-390.

206. Park C.A., Hines H.C. & Monke D.R. Association between the bovine major histocompatibility complex and posterior spinal paresis in Holstein bulls // Animal Genetics. 1991. V.22. Suppl.l. P.94-95.

207. Pascual M., Mataran L., Jones G., Shing D., van der Slik A.R., Giphart M.J., Schreuder G.M., de Vries R.R., Breedveld F.C., Roovers E., Zanelli E., Martin J. HLA haplotypes and susceptibility to rheumatoid arthritis. More than class II genes

208. Scand. J. Rheumatol. 2002. V.31. N5. P.275-278.

209. Pastemack A., Tiilikainen A. HLA-B27 in Rheumatoid arthritis and amyloidosis // Tissue Antigens. 1977. V.9. N2. P.80-89.

210. Paterson S., Wilson K., Pemberton J.M. Major histocompatibility complex variation associated with juvenile survival and parasite resistance in a large unmanaged ungulate population // Proc. Natl. Acad. Sci. U S A. 1998. V.95. N7. P.3714-3719.

211. Payne R., Kidd K.K., Radvany R & Perkins H.A. HLA and other polymorphisms of the Chinese of the Canton area/ Histocompatibility Testing 1972. Eds. J.Dausset & J.Colombani. Copenhagen: Munksgaard, 1973. P.197-201.

212. Pei J., Tokunaga K., Araki C. et al. HLA polymorphism in Han Chinese population of Sihuan // Tissue Antigens. 1985. V.26. N5. P.323-331.

213. Piazza A, Lonjou C. HLA in Europe and the Mediterranean countries / In: Charron D, ed. HLA Genetic Diversity of HLA Functional and Medical Implications. Paris: EDK Medical and Scientific International Publishers, 1997. P.374-384.

214. Population and Habitat viability assessment for the European bison (Bison bonasus). Ed. Z. Pucek, I. Udina, U.S.Seal & P. Miller, Poland, Wolinski National Park, Miedzyzdroje, 1995.

215. Pospelov L.E., Matrakshin A.G., Erdynieva L.S., Malenko A.F., Afanasiev K.I., Rubtsova G.A., Egorov I.K., Yeremeyev V.V., Apt A.S. Genetic markers in the Tuvan population of Todja, Siberia // Tissue Antigens. 1997. V49. N6. P.629-634.

216. Pudovkin A.I., Zaykin D.V., Hedgecock D. On the potential for estimating the effective number of breeders from heterozygote-excess in progeny // Genetics. 1996. 144. P. 383-187.

217. Ritz L.R., Glowatzki-Mullis M.-L., MacHugh D.E., Gaillard C. Phylogenetic analysis of the tribe Bovini using microsatellites // Animal Genetics. 2000. V.31. N3. P.178- 185.

218. Riezebos A.Y.D., Molenaar B.A.J., Nieuw-Dalland B.V. & Renard C. Association between MHC and litter size traits in a commercial pig line // Animal Genetics. 1991. V.22. Suppl.l. P.l05.

219. Roitberg-Tambur A., Witt C.S., Friedmann A. et al. Comparative analysis of HLA polymorphism at the serologic and molecular level in Moroccan and Ashkenazi Jews // Tissue Antigens. 1995. V.46. P.104-110.

220. Rothel J.S., Dufty J.H. & Wood P.R. Studies on the bovine major histocompatibility class I and class II antigens using homozygous typing cells and antigen-specific BoT4+blast cells //Animal Genetics. 1990. V.21. P.141-148.

221. Rosenberg N.A., Pritchard К., Weber J.L., Cann H.M., Kidd K.K., Zhivotovsky L.A., Feldman M.W. 2002. Genetic structure of human populations. Science. V.298. P. 2381-2385.

222. Sawhney S.M.S., Taylor D.W., Russell. G.C. Polymorphism of bovine major histocompatibility complex (MHC) class I genes revealed by polymerase chain reaction (PCR) and restriction enzyme analysis // Animal Genetics. 2001. V.27. P.31-36.

223. Scharf S.J., Long Ch. M. & Erlich H.A. Sequence analysis of the HLA-DRb and HLA-DQb loci from three Pemphigus vulgaris patients // Human Immunology. 1988. V.22. P.61-69.

224. Schmutz S.M., Plante Y. & Berryere T. Comparison of RFLP patterns between Holstein and Simmental cattle with DRB // Animal Genetics. 1991.V.22. Suppl. 1. P.53.

225. Shaw C-K., Chen L-L., Lee A, Lee T.D. Distribution of HLA gene and haplotype frequencies in Taiwan: a comparative study among Min-nan, Hakka, Aborigine and Mainland Chinese //Tissue Antigens. 1999. V.53. P.51-64.

226. Sher A., Gazzinelli R.T., Oswald I.P. et al. Role of T-cell derived cytokines in the downregulation of immune responses in parasitic and retroviral infection // Immunological Reviews. 1992. V.127. P.l83-204.

227. Shields G.F., Schmiechen A.M., Frazier B.L., Redd A., Voevoda M.I., Reed J.K., Ward R.H. mtDNA sequences suggest a recent evolutionary divergence for Beringian and northern North American populations // Am. J. Hum. Genet. 1993. V.53. N3. P. 549-562.

228. Shiroishi Т., Hanzawa N., Sagai Т., Ishiura M., Gojobori Т., Steinmetz M. & Moriwaki K. Recombinational hotspot specific to female meiosis in the mouse major histocompatibility complex // Immunogenetics. 1990. V.31. P.79-88

229. Shmid D.O., Curk S. On leukocyte serology in the pig and cattle / 13th Eur. Congr. On Animal Blood Group Biochem. Polymorphisms. Wien, 1972. P. 13.

230. Sigurdardottir S., Borsch C., Gustafsson K. & Andersson L. Cloning and sequence analysis of 14 DRB alleles of the bovine major histocompatibility complex by using the polymerase chain reaction // Animal Genetics. 1991a. V.22. P.l99-211.

231. Sigurdardottir S., Borsch C., Gustafsson K. & Andersson L. Conserved polymorphism at major histocompatibility DRB loci in man and cattle // Animal Genetics. 1991b . V.22. Suppl.I. P.59-60.

232. Sigurdardottir S., Lunden A. & Andersson L. Restriction fragment length polymorphism of DQ and DR class II genes of the bovine major histocompatibility complex // Animal Genetics. 1988. V.19. P.133-150.

233. Sinnott P.J., Costigan C., Dyer Ph.A., Harris R. & Strachan T. Extended MHC haplotypes and CYP21/C4 gene organization in Irish 21-hydroxylase deficiency families // Human Genetics. 1991. V.87. N.3. P.361-366.

234. Sitte K., Brinkworth R., East I.J., Jazwinska E.C.A single amino acid deletion in the antigen binding site of BoLA-DRB3 is predicted to affect peptide binding // Vet. Immunol. Immunopathol. 2002. V. 85. N3-4. P.129-135.

235. Skow L.C. A hypervariable, locus-specific BoLA class I marker // Animal genetics. 1991.V.22. Suppl.I. P.51.

236. So A.K.L., Fielder A.H.L., Warner C.A., Isenberg D.A., Batchelor J.R., Walport M.J. DNA polymorphism of major histocompatibility complex class II and class III genes in systemic lupus erythematosus // Tissue antigens. 1990. V.35. P.144-147.

237. Song E.Y., Park M.H., Kang S.J., Park H.J., Kim B.C., Tokunaga K., Akaza Т., Juji

238. Т. HLA class II allele and haplotype frequencies in Koreans based on 107 families // Tissue Antigens. 2002. V.59. N6. P.475-486.

239. Spooner R.L., Leveziel H., Grosclaude F., Oliver R.A., Vaiman M. Evidence for a possible major histocompatibility complex (BoLA) in cattle // Journal of Immunogenetics. 1978. V.5. P.335-346.

240. Spuhler J.N., Genetic, linguistic and geographical distances in native Northern America / In: The Assessment of population affinities in man/ Ed/ J/S.Weiner, J.Huizinga. Oxford: Gladeron Press, 1972. P.73-135.

241. Stear M.J., Dimmock C.K., Newman M.J., Nicholas F.W. BoLA antigens are associated with increased frequency of persistent lymphocytosis in bovine leukaemia virus // Animal Genetics. 1988a. V.19. P.151-158.

242. Stear M.J., Pokorny T.S., Muggli N.E. & Stone R.T. Breed differences in the distribution of BoLA-A locus antigens in American cattle // Animal Genetics. 1988b. V.19. P.171-176.

243. Stern L.J., Brown J.H., Jardetzky T.S. et al. Crystal structure of the human class II MHC protein HLA-DR1 complexed with an influenza virus peptide// Nature. 1994. V.368. P.215-221.

244. Stone R.T. & Muggli-Cockett N.E. Partial nucleotide sequence of a novel bovine major histocompatibility complex class II b-Chain gene, BoLA-DIB // Animal Genetics.1990. V.21. P.353-360.

245. Stone A.C., Stoneking M. mtDNA analysis of a prehistoric Oneota population: implications for the peopling of the world // Am. J. Hum. Genet. 1998. V.62. P.1153-1170.

246. Takeshima S., Nakai Y., Ohta M., Aida Y. Short communication: characterization of DRB3 alleles in the MHC of Japanese shorthorn cattle by polymerase chain reaction-sequence-based typing // J. Dairy Sci. 2002. V.85. N6. P.1630-1632.

247. Teale A.J., Kaushal A.Q., MacHugh N., Toye P. & Bensaid A. Bovine MHC class IcDNA clones: evidence for expression of two loci // Animal Genetics. 1991. V.22. Suppl.l. P.59.

248. Terasaki P.I., McCleland J.D. Microdroplet assay of human serum cytotoxins // Nature. 1964. V.204. P.998-1000.

249. Teutsch M.R., Stewart-Havnes J.A., Beever J.E. & Lewin H.A.Haplotype of the bovine major histocompatibility complex genes in Angus cattle // Animal Genetics. 1991. V. 22. Suppl.l. P.78-79.

250. The MHC sequencing consortium. Complete sequence and gene map of a human histocompatibility complex // Nature. 1999. V.401. P.921-923.

251. Todd J.A., Acha-Orbea H., Bell J.I., Chao N., Fronek Zd., Jacob Ch.O., McDermott M., Sinha A.A., Timmerman L., Steinman L., McDevitt H.O. A molecular basis for MHC class II associated autoimmunity // Science.1988. V.240. N4855. P.1003-1009.

252. Tokunaga K., Kay P.H., Christianssen F.T., Saueracker G. & Dawkins R.L. Comparative mapping of the human major histocompatibility complex in different racial groups by pulsed gel electrophoresis // Human Immunology. 1989. V.26. P.99-106.

253. Tokunaga K., Sideltseva E.W., Tanaka H. et al. Distribution of HLA antigens and haplotypes in the Buryat population of Siberia //Tissue Antigens. 1995. V.45. P.98-102.

254. Tokunaga K., Ohashi J., Bannai M., Juji T. Genetic link between Asians and native Americans: evidence from HLA genes and haplotypes // Human Immunology. 2001.1. V.62.N9. P.1001-1008.

255. Tonks S., Marsh S.G.E., Bunce M. et al. HLA class I typing study. / In: Charron D, ed. HLA Genetic Diversity of HLA Functional and Medical Implications. Paris: EDK Medical and Scientific. International Publishers, 1997. P. 199-215.

256. Torroni A., Schurr T.G., Cabell M.F., Brown M.D., Neel J.V., Larsen M., Smith D.G., Vullo C.M., Wallace D.C. Asian affinities and continental radiation of the four founding Native American mtDNAs //Am. J. Hum. Genet. 1993. V.53. N3. P.563-590.

257. Torroni A., Neel J.V., Barrantes R., Schurr T.G., Wallace D.C. Mitochondrial DNA «clock» for the Amerinds and its implications for timing their entry into North America// Proc. Natl Acad Sci USA. 1994 V.91. P.l 158-1162.

258. Tren M.H., Hors J., Busson M. & Degos L. HL-A markers in the Vietnamese population // Tissue Antigens. 1978. V.ll. P.139-143.

259. Troup G.M., Schanfield M.S., Singaraji C.H. et al. Study of HLA alloantigens of the Navajo Indians in the North America // Tissue Antigens. 1982. V.20. N5. P.339-351.

260. Udina I.G. Computer analysis of D-loop of mitochondrial DNA variation in Asian horse breeds / Proceedings of the third international conference on bioinformatics of genome regulation. BGRS* 2002, V.4, Novosibirsk, Russia, 2002. P.69-71.

261. Udina I.G., The genetic differentiation of human populations in Northern Eurasia by HLA system. In: Proceedings of the 3rd International workshop on Computer

262. Science and Information Technologies. Ufa, Yangutau, Russia, 2001 USATU Publications V.2. P.66-70.

263. Udina I.G. and Shaikhaev G.O. Restriction fragment length polymorphism (RFLP) of exon 2 of the MHCBi£>o-DRB3 gene in European bison (Bison bonasus) // Acta Theriologica, 1998. Suppl.5. P.75-82.

264. Uinuk-Ool T.S., Takezaki N., Sukernik R.I., Nagl S., Klein J. Origin and affinities of indigenous Siberian populations as revealed by HLA class II gene frequencies // Hum. Genet. 2002. V.110. N3. P.209-226.

265. Usuki K., Nishizawa M., Matsuki K., Tokunaga K. et al. Association of a particular amino acid sequence of the HLA-DR (31 chain with HTLV-I-associated myelopathy. Eur. J.Immunol. 1990. V.20. P. 1603 1608.

266. Usinger W.R., Curie-Cohen M., Stone W.H. Lymphocyte-defined loci in cattle // Science. 1977. V.196. N.4293. P.1017-1018.

267. Vage D.I., Olsaker I., Sorensen A., Arnet E.F. & Lie O. Current status of BoLA A-DQ linkage disequilibrium in Norwegian cattle // Animal Genetics. 1991. V.22. Suppl.l. P.54.

268. Williams R.C., Morse H.G., Bonnell M.D. et al. The HLA loci of the Hopi and Navajo // American J. Physical Anthropology. 1981. V.56. P.291-296.

269. Williams J.L., Oliver R.A. & Spooner R.L. Variation in BoLA class I antigens on bovine lymphocytes following infection with Theileria annulata H Animal Genetics. 1991. V.22. Suppl.I. P.43.

270. Wolf J.B., David V.A. and Deutch A.H. Identification of a distal regulatory element in the 5' flanking region of the bovine prolactin gene // Nucleic Acids Res. 1990. VI8 (16). P.4905-4912.

271. Хи A. & Lewin H.A. Characterization of bovine major histocompatibility complex class II genes using the polymerase chain reaction //Animal Genetics. 1991. V.22. Suppl.I. P.61-62.

272. Xu A-, Van Eijk M.J.T., Park Ch. and Lewin H.A. Polymorphism in BoLA-DRB3 Exon 2 Correlates with Resistance to Persistent Lymphocytosis Caused by Bovine Leukemia Virus // J. Immunol. 1993. V.151. P.6977 6985.

273. Yasuda N., Komori K. & Tsuji K. Workshop report in genetics / Proceedings of the First Asia and Oceania histocompatibility workshop and conference (AOHWS). Eds/ K.Tsuji & K.Komori. Hakone, 1979. P.l 13-115.

274. Yiping S. & Changxind S. The HLA polymorphism in the Beijing Chinese, America // Tissue Antigens. 1985. V.20. N5. P.339-351.

275. Yuhki N. & O'Brien St.J. DNA variation of the mammalian major histocompatibility complex reflects genomic diversity and population history // Proceedings of the National Academy of Sciences USA. 1990. V.87. P.836-840.

276. Zanotti M., Poli G., Poli W. et al. Association of the BoLA class II haplotypes with subclinical progression of bovine leukaemia virus infection in Holstein-Friesian cattle // Animal genetics. 1996. V.27. P.337-341.

277. Zemmour J., Ennis P.D., Parham P. & Dupont B. Comparison of the structure of HLA Bw47 to HLA-B13 and its relationship to 21-hydroxylase deficiency // Immunogenetics. 1988. V.27. P.281-287.

278. Zhang H.M., DeNise S.K., Ax R.L. Rapid communication: Diallelic single-stranded conformational polymorphism detected in the bovine prolactin gene // J. Anim. Sci. 1994. V.72. P.256.

279. Zharkikh A.A., Rzhetsky A.Yu., Morosov, P.S., Sitnikova,T.L., Krushkal J.S. VOSTORG: a package of microcomputer programs for sequence analysis and construction of phylogenetic trees. Gene. 1991. V.101. P.251-254.

280. Wolf D.V.A., and Deutch A.U. Identification of distal regulatory element in 5' flanking region of bovine prolactin gene // Nucleic Acids Res. 1990. V.18. N16. P.4905 -4912.

281. Xu A., Van Eijk M.J.T., Park C., Lewin H.A. Polymorphism in BoLA-DRB3 exon 2 correlates with resistance to persistent lymphocytosis by bovine leukemia virus // J. Immunol. 1993. V.151. P.6977 6985.10. БЛАГОДАРНОСТИ.

282. Г.Е. Сулимовой, д.б.н., проф