Дифференциация пород крупного рогатого скота по гену BoLa-DRB3 главного комплекса гистосовместимости и ISSR-маркерам тема диссертации и автореферата по ВАК РФ 03.00.15, кандидат биологических наук Мохаммад Абади Мохаммадреза

• Мохаммад Абади Мохаммадреза
• кандидат биологических наук
• 2005

Оглавление диссертации кандидат биологических наук Мохаммад Абади Мохаммадреза

1.В ведение

2. Обзор литературы 5 2.1 .Структура, функции и полиморфизм главного комплекса гистосовместимости (гкг)

2.1.1.Главный комплекс гистосовместимости: история вопроса, функция, номенклатура

2.1.2.Структура главного комплекса гистосовместимости В 2.1.3 .Главный комплекс гистосовместимости крупного рогатого скота (BoLA) 11 2.1.4.Методы изучения главного комплекса гистосовместимости и полиморфизм генов класса II

2.2.Полиморфизм гена BoLA-DRB3 и его ассоциации с различными заболеваниями крупного рогатого скота 22 2.2.1 .Полиморфизм гена BoLA-DRB

2.2.2.Ассоциации BoLA-DRB3 с заболеваниями

2.3.Дифференциация пород крупного рогатого скота по ДНК-маркерам

3.Материалы и методы исследования

4.Результаты и их обсуждение 51 4.1.Дифференциация пород крупного рогатого скота по аллелям гена BoLA-DRB

4. 2.Распределение аллелей гена BoLA-DRB3, ассоциированных с болезнями, в исследованных породах крупного рогатого скота 59 4.3 .Дифференциация пород крупного рогатого скота с использованием молекулярного мультилокусного анализа 66 4.3.1.Спектры ISSR-полиморфизма у крупного рогатого скота 67 4.3 ^.Дифференциация пород крупного рогатого скота по GA-ISSR-маркеру

4.3.3. Дифференциация пород крупного рогатого скота по AG-ISSR-маркеру

4.3.4.Характеристика (GA)9C-ISSR- и (AG)9C-ISSR-MapKepoB и возможности их использования для дифференциации пород крупного рогатого скота

5. Выводы

Введение диссертации (часть автореферата) на тему «Дифференциация пород крупного рогатого скота по гену BoLa-DRB3 главного комплекса гистосовместимости и ISSR-маркерам»

Интенсивная селекция крупного рогатого скота привела к созданию специализированных пород. Хотя селекция на создание высокопродуктивных молочных пород крупного рогатого скота была успешной, однако она привела к серьезным проблемам, связанным с резким преобладанием во всем мире одной породы - голштино-фризской. Результатом этого явилось значительное сокращение численности других пород, а, следовательно, и сокращение общего генетического разнообразия генофонда крупного рогатого скота. Например, Россия в первой половине XX века потеряла более 30 местных пород и отродий крупного рогатого скота. Из 66 пород крупного рогатого скота, разводившихся в 80-90 годах XX века в бывшем СССР, в 2001 году в Российской Федерации осталось 33 породы. Из 33-х оставшихся пород только 16 имеют достаточную численность для нормального воспроизводства (Алтухов и др., 2004). Обеднение генофонда крупного рогатого скота в будущем может привести к отрицательным непредсказуемым последствиям, поскольку невозможно предсказать возникновение новых требований к продуктивности и резистентности крупного рогатого скота к заболеваниям. Важно поддерживать максимально возможное разнообразие генофонда крупного рогатого скота. Необходимым условием для проведения таких работ является проведение генетического мониторинга пород крупного рогатого скота на молекулярном уровне.

За рубежом большое внимание уделяется проблемам изучения биоразнообразия крупного рогатого скота. Многие ведущие зарубежные институты разрабатывают долгосрочные проекты, посвященные генетическому мониторингу и, в частности, ДНК-мониторингу генофонда крупного рогатого скота (например, проект Roslin Institute (Edinburg) - "Genetic Diversity in Cattle"). С использованием молекулярных методов анализа исследуется генетическая структура пород крупного рогатого скота (MacHugh et al., 1998), их происхождение (Troy et al., 2001; Hanotte et al., 2002); создана международная программа и база данных по картированию генома Bos taurus (http://www.ri.bbsrc.ac.uk/bovmap/bovmap.htm). Однако исследуются, в основном, европейские породы. Большая часть местных и аборигенных пород на молекулярно-генетическом уровне практически не исследована, что определило цель наших исследований, заключающуюся в изучении генетического разнообразия пород к.р.с. с использованием ДНК-технологий.

В качестве тест-систем для изучения генетического разнообразия и дифференциации пород крупного рогатого скота нами был использован анализ полиморфизма гена BoLA-DRB3 главного комплекса гистосовместимости, участвующего в формировании иммунного ответа организма на вирусные и бактериальные инфекции, и ISSR-фингерпринтинг, позволяющий оценивать уровень полиморфизма генома в целом. Высокий уровень полиморфизма гена BoLA-DRB3 (секвенировано более 90 аллелей) позволяет использовать его как высоко информативный маркер для изучения генетического разнообразия пород крупного рогатого скота. При этом генетическая дифференциация популяций (в том числе и пород сельскохозяйственных животных) по главному комплексу гистосовместимости актуальна не только для рассмотрения проблем сохранения видов и биоразнообразия, но и для рассмотрения проблем устойчивости к заболеваниям. В генетико-селекционных исследованиях сельскохозяйственных животных большое значение имеет анализ популяции, изучение их гетерогенности, дифференциация и идентификация пород. Использование молекулярных маркеров значительно расширяет возможности генетического анализа популяций, позволяет установить меж- и внутри-породную вариабельность отдельных участков генома и составить представление о генетической структуре породы. Одним из наиболее эффективных направлений исследований в этом плане является анализ межмикросателлитного полиморфизма - ISSR-анализ или, как его еще иногда называют, — ISSR-фингерпринтинг. Этот метод относится к методам молекулярного мультилокусного анализа, он позволяет одновременно оценивать полиморфизм десятков локусов (до 30 локусов и выше). Данный подход широко применяется для дифференциации видов и сортов растений, однако, крайне мало используется в исследованиях генофондов сельскохозяйственных животных.

Целью данного исследования было изучение генетического разнообразия пород крупного рогатого скота и их дифференциация на основе ДНК-полиморфизма гена BoLA-DRB3 и ISSR-анализа. Для достижения указанной цели были поставлены следующие нижеперечисленные задачи:

1. Провести сравнительный анализ аллельного разнообразия гена BoLA-DRB3 у четырех пород крупного рогатого скота: у ярославской, монгольской, немецкой черно-пестрой пород и у иранской породы Систани.

2. Оценить характер распределения аллелей гена BoLA-DRB3, ассоциированных с болезнями, в исследованных породах крупного рогатого скота.

3. Провести сравнительный анализ спектров ISSR-полиморфизма у исследованных пород с использованием двух типов праймеров: (GA^C и (AG)9C.

4. Охарактеризовать генетическое разнообразие исследованных пород на основе ISSR-маркеров.

5. Изучить возможность использования (GA)9C-ISSR- и (AG^C-ISSR-MapKepoe для дифференциации исследуемых пород.

2. ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ 2.1. СТРУКТУРА, ФУНКЦИИ И ПОЛИМОРФИЗМ ГЛАВНОГО КОМПЛЕКСА

Заключение диссертации по теме «Генетика», Мохаммад Абади Мохаммадреза

5. ВЫВОДЫ

1. Сравнительный анализ аллельного разнообразия гена BoLA-DRB3 у четырех пород КРС (ярославской, монгольской, немецкой черно-пестрой и иранской породы Систани) показал, что исследованные породы различаются как по спектру аллелей, так и по их частотам. Высокое разнообразие спектра аллелей по данному локусу отмечено у российской ярославской (35 аллелей) и иранской породы Систани (33 аллеля) по сравнению с немецкой черно-пестрой (29 аллелей) и монгольской (17 аллелей) породами.

2. Показана генетическая устойчивость ярославской породы к лейкозу и маститу, обусловленная высоким содержанием BoLA-DRB3-anneneii, ассоциированных с устойчивостью к лейкозу и низким содержанием аллеля BoLA-DRB3.2*23, ассоциированного с высоким риском заболеваемости маститом. Суммарная частота аллелей устойчивости к лейзозу у ярославской породы (18,1%) в 3 раза выше, чем у иранской породы Систани (6,9%), ив 1,7 раза выше, чем у немецкого черно-пестрого (10,1%) и монгольского скота (11%).

3. Идентифицировано 43 полиморфных ДНК-фрагмента на основе ISSR-анализа 270 особей четырех пород КРС с использованием маркеров (GA)9C-ISSR и (AG)9C-ISSR. Сравнительный анализ геномного полиморфизма у четырех пород КРС показал, что исследованные породы различаются как по наличию/отсутствию отдельных фрагментов в ISSR-спектрах, так и по их частотам.

4. Отмечены высокие значения коэффициента внутригруппового сходства и низкий уровень гетерозиготности для всех исследованных пород (кроме монгольского скота). По уровню внутригруппового сходства достоверно отличается от всех остальных пород монгольский скот, приближающийся по этому показателю к природным популяциям (0,62 для GA-ISSR-маркера и 0,47 для AG-ISSR-маркера).

5. Выявлены достоверные различия (0,0<Р<0,02) по среднему числу фрагментов на особь для GA-ISSR-маркера между азиатскими (монгольская и иранская) и европейскими (черно-пестрая и ярославская) породами, причем внутри групп породы не отличались друг от друга по этому параметру.

6. Впервые на основе кластерного анализа и метода главных компонент показано, что GA- и AG-IS SR-маркеры имеют разный уровень разрешающей способности и должны использоваться для решения различных задач. Менее полиморфный GA-ISSR-маркер (11 фрагментов) пригоден для дифференциации пород КРС, в то время как более полиморфный AG-ISSR-маркер (32 фрагмента) информативен при изучении внутрипородного полиморфизма и дифференциации отдельных стад, семейств, линий.

Список литературы диссертационного исследования кандидат биологических наук Мохаммад Абади Мохаммадреза, 2005 год

1. Алтухов Ю. П. Генетические процессы в популяциях. / М.: Наука. 1989.

2. Городная А. В., Глазко В. И. ISSR-PCR в дифференциации генофондов пород крупного рогатого скота // Цитология и генетика. 2003. N. 1. С. 61-67.

3. Глазко В. И. Генетика изоферментов сельскохозяйственных животных // М: ВИНИТИ, 1988. 212 С.

4. Глазко В. И., Дымань Т. Н., Тарасюк С. И., Дубин А. В. Полиморфизм белков, RAPD-PCR и ISSR-PCR маркеров у зубров, бизонов и крупного рогатого скота // Цитология и генетика. 1999. Т.ЗЗ N. С. 30-39.

5. Гостимский С.А., Кокаева З.Г., Боброва В.К. Использование молекулярных маркеров для анализа генома растений // Генетика. 1999. Т.35. №11. С.1538-1549.

6. Карамышева Е.Е. Молекулярно-генетический анализ классов I и II главного комплекса гистосовместимости в связи с устойчивостью и восприимчивостью к гемобластозам крупного рогатого скота айрширской породы. / Диссертация на звание канд.биол.наук. М. 1998.

7. Костюченко М.В., Удина И.Г., Зайцев A.M., Храброва JI.A., Сулимова Г.Е. Изучение генетического разнообразия пород лошадей отечественной селекции на основе RAPD-PCR и микросателлитных маркеров // Сельскохоз. биология. 2001. №6. С.29-34.

8. Ю.Рокицкий П.Ф. Основы вариационной стастистики для биологов // Минск. 1961. 220 С.

9. Сулимова Г.И. ДНК-маркеры в генетических исследованиях: типы маркеров, их свойства и области применения // Генетика. 1995. Т. 31. № 9. С.1294-1299.

10. Сулимова Г.И. ДНК-маркеры в генетических исследованиях: типы маркеров, их свойства и области применения // Успехи современной биологии. 2004. Т. 124. №3. С. 260-271.

11. Сулимова Г.И., Удина И.Г., Шайхаев Г.О., Захаров И.А. ДНК-полиморфизм гена BoLA-DRB3 у крупного рогатого скота в связи с устойчивостью и восприимчивостью к лейкозу//Генетика. 1995. Т. 31. № 9. С.1294-1299.

12. Удина И.Г. Гены главного комплекса гистосовместимости человека и животных // Успехи соврем, генетики 1994. Вып.19. С. 133 177.

13. Удина И.Г., Карамышева Е.Е., Сулимова Г.Е., Павленко С.П., Туркова С.О., Орлова А.Р., Эрнст Л .К. Сравнительный анализ айрширской и черно-пестрой пород крупного рогатого скота по маркерам гистосовместимости // Генетика.1998. Т.34. N12. С.1668-1674.

14. Удина И.Г., Сипко Т.П., Соколова С.С., Сулимова Г.Е. Сравнительная характеристика полимофизма ДНК локусов DQB и DRB главного комплекса гистосовместимости у представителей семейства Bovidae // Генетика. 1994. N3.T.30. С. 356-360.

15. Хатами С.Р., Лазебный О.Е., Максименко В.Ф., Сулимова Г.Е. ДНК-полиморфизм генов гормона роста и пролактина у ярославского и черно-пестрого скота в связи с молочной продуктивностью // Генетика . 2005. Т.41. №2.

16. Храпалова И. А., Рыжова Н. Н., Пухальский В. А., Кочиева Е. 3. Филогенетические отношения видов рода Lycopersicon (Tourn) Mill, и молекулярные данные RAPD- и ISSR-анализов // Генетические коллекции овощных растении. 2001. С. 244-251.

17. Alexander J.A., Bailey Е., Woodward J. Analysis of equine Iymphocyne antigen system by Southern blot hybridization // Immunogenetics.1987. V. 25 P. 47-54.

18. Alizadeh Z., Karrow N., Mallard B. N. Biological effect of varying peptide binding affinity to the BoLA-DRB3*2703 allele // Genet. Sel. Evol. 2003. V. 35. Suppl. 1. P. 51-65.

19. Amorena B. & Stone W.H. Serologically defined SD locus in cattle // Science. 1978.1. V.201. Р.159-160.

20. Andersson L. Organization of the bovine MHC class II region as revealed by genomic hibridizations // Animal Genetics. 1988a. Vol.19. P.32-34.

21. Andersson L. Genetic polymorphism of a bovine t-complex gene (TCP1) linkage to major histocompatibility genes//Journal of Heredity. 1988b. V.79, N1. P.l-5.

22. Andersson L., Bohme J., Rask L., Peterson P.A. Genomic hybridization of bovine class II major Histocompatibility genes: 1. Extensive polymorphism of DQa and DQb genes //Animal genetics. 1986a. V.17. P.95-112.

23. Andersson L., Bohme J., Peterson P.A. & Rask L. Genomic hybridization of bovine class II major histocompatibility genes: 2. Polymorphism of DR genes and linkage disequilibrium in the DQ-DR region // Animal Genetics. 1986b. V.l 17. P.295-304.

24. Andersson L., Lunden A., Sigurdottir S., Davies Ch.J. & Rask L. Linkage relationships in the bovine MHC region. High recombination frequency between class II subregions //Immunogenetics. 1988. V.27. P.273-280.

25. Andersson L. & Rask L. Characterization of the MHC Class II region in cattle. The number of DQ genes varies between haplotypes // Immunogenetics. 1988. V.27. P.l10-120.

26. Andersson L., Sigurdartottir S., Borsch C. & Gustafsson K. Evolution of MHC polymorphism: extensive sharing of polymorphic sequence motifs between human and bovine DRB alleles // Immunogenetics. 1991. V.33. P.l88-193.

27. Andersson M., Bohme J., Andersson G., MoIIer E. Thorsby E., Rask L. & Peterson P.A. Genomic hybridization with class II transplantation antigens cDNA probes as a complementary technique in tissue typing // Human immunology. 1984. V.l 1. P.57-67.

28. Auffray С., Strominger J.L. Molecular genetics of the human major histocompatibility complex // Adv. Hum. Genet. 1986. V. 15. P. 197-247.

29. Baker С. M. & Manwell C. Chemical classification of cattle. 1. Breed groups // Anim Blood Groups Biochem Genet. 1980. V. 11. N.3. P.127-50.

30. Bell J.I., Todd J.A., McDevitt H.O. The molecular basis of HLA-disease associations // In: Advances in human genetics (ed. by H. Harris, K. Hirschhorn). N.Y. and L: Plenum press. 1989. V. 18. Ch.l. P. 1-42.

31. Briles W.E., Briles R.W., Pollock D.L., Petrison M. Marker's disease resistance in chicken affected by complementation of В alloalleles in a cross of commercial parent stocks //Anim. Blood Grps. and Biochem. Genet. 1980. N. 11, Suppl.l. P. 14.

32. Brown J.H., Jardetzky Th.S., Gorga J.C., Stern L.J., Urban R.G., Strominger J.L. and Wiley D.C. Three-dimensional structure of the human class II histocompatibility antigen HLA-DR1 //Nature. 1993. V.364. P. 33 39.

33. Burke M.G., Stone R.T., Muggli-Cockett E. Nucleotide sequence and Nothern analysis of a bovine major histocompatibility class II DRB-like cDNA // Animal Genetics. 199la. Vol.22. P.343-352.

34. Burke M.G., Stone R.T. & Muggli-Cockett N.E. The nucleotide sequence of bovine major histocompatibility class II DRB cDNA and hybridization to lymphocyte RNA // Animal genetics. 1991b. Vol. 22. Suppl .1. P.49-50.

35. Burny A., Bruck C., Chantrenne H. et al. Bovine leukemia virus: molecular biologyand epidemiology // In: Viral Oncology (ed. by G. Klein). New York: Raven Press, 1980. P.89-231.

36. Burny A., Cleuter Y., Kettmann R. et al. Bovine leukemia: facts and hypotheses derived from the study of an infectious cancer // Vet. Microbiol. 1988. V.17. P.197-218.

37. Caetano-Anolles G., Bassam B.J., Gresshoff P.M. DNA amplification fingerprinting using very short arbitrary oligonucleotides // Biotechnology. 1991. V.9. N.6. P.553-557.

38. Caldwell J., Brayan C.F., Cumferland P.A., Weseli D.F. Serologically detected limphocyte antigens in Holstein cattle // Anim. Blood. Grps. Biochem. Genet. 1977. V. 8. P. 197-207.

39. Caldwell J., Cumferland P.A., Weseli D.F., Willians J.D. Breed differencies in frequency of BoLA specificities // Anim. Blood Grps. and Biochem. Genet. 1979. V. 10. P. 93-98.

40. Cameron.P.U., Tabarais H.A., Pulendran В., Robinson W., Dawkins R.L. Consirvation of central MHC genome: PFGE mapping and RFLP analysis of complement, HSP70, and TNF genes in the goat // Immunogenetics 1990. V.31. P. 253-264.

41. Carrol C.L., Sommer F.G., McNeal J.E., Stamey T.A. The abnormal prostate: MR imaging at 1.5 T with histopathologic correlation // Radiology. 1987. V. 163. P. 521525.

42. Coppin H.L., Garmichael P., Lombardi G.L. et al. Position 71 in the a helix of the DRp domain is predicted to influence peptide binding and plays a central role in allorecognition // Eur. J. Immunol. 1993. V.23. P.343-349.

43. Crew M.D., Filipowsky M.E., Neshat M.S., Smith G.S., Walford R.L. Transmembrane domain length variation in the evolution of major histocompatibility complex class I genes. // Proc. Natl. Acad. Sci. U S A. 1991. V. 88. P. 4666-4670.

44. Crittenden L.B. Natural and artificially induced genetic resistance to viral diseases in poultry // Animal Genetics. 1991. V.22. Suppl.l. P.2-7.

45. Davies C.J., Andersson L., Ellis S.A. et al. Nomenclature for factors of the BoLA system, 1996: report of the IS AG BoLA Nomenclature Committee // Animal Genetics. 1997. V.28. P.159-168.

46. Davies C.J., Joosten I., Bernoco D., Arriens M.A., Bester J., Ceriotti G., Ellis S., Hensen E.J., Hines H.C., Horin P., et al. Polymorphism of bovine MHC class I genes // Eur J Immunogenet. 1994 V. 21(4). P. 239-258.

47. Deverson E.V., Wright H., Watson S., Ballingall K., Huskisson N., Diamond A.G., Howard J.C. Class II major histocompatibility complex genes of the sheep // Animal Genetics. 1991. V.22. P. 211-227.

48. Dietz A., Detilleux J., Freemann A. et al. Genetic association of bovine lymphocyte antigen DRB3 alleles with immonological traits of Holstein cattle // Journal of Dairy Science. 1997a. V.80. P.400-405.

49. Dietz А. В., Cohen N.D., Timms L. & Kehrli M.E., Bovine lymphocyte antigen class II alleles as risk factors for high somatic cell counts in milk of lactating dairy cows // Journal of Dairy Science. 1997b. V.80. P.406-412.

50. Dodol G.J., Bernoco D., Stormont C. Serological analysis for linked BoLA loci // Anim. Blood Grps. and Biochem. Genet. 1980. V. 11, Suppl.l. P.28-29.

51. Dyer P.A., Martin S. Techniques used to define human MHC antigens: serology // Immunol Lett. 1991 V. 29(1-2) P. 15-21.

52. Esteban E., Thorn R., Ferrer J. Characterization of the blood lymphocyte, population in cattle infected with the bovine leukemia virus // Cancer Res. 1985. V.45. P.3225-3230.

53. Fang D.Q., Federici C.T., Roose M.L. A high-resolution linkage map of the citrus tristeza virus resistance gene region in Poncirus trifoliata (L.) Raf. // Genetics. 1998. V.150.N.2. P.883.

54. Ferrer J., Marshak R., Abt D. et al. Persistent lymphocytosis in cattle; nature and relation to lymphosarcoma. Ann. Rech. Vet. 1978. V.9. P.851-857.

55. Figueroa F., Gutknecht J., Tyichy H., Klein J. Class II MHC genes in rodent evolution // Immunological reviews. 1990. V. 113. P. 27-46.

56. FIajnik M.F., Pasquier L.D. The major histocompatibility complex of frogs // Immunological Reviews. 1990. N. 113. P. 47-64.

57. Fraga S., San-Fabian E., Thornton S., Singh Bh. Prediction of secondary structure and functional sites of major histocompatibility complex molecules // J. Mol. Recognition.1990. V.3.N.2. P. 65-73.

58. Fries R., Hedige R.R. & Strazinger G. Tentative chromosomal localization of the bovine major histocompatibility complex by in situ hybridization // Animal Genetics. 1986. V.17. P.287-294.

59. Germain R.N., Hendrix L.R. MHC class II structure, occupancy and surface expression determined by post-endoplasmic reticulum antigen binding. // Nature.1991. V. 12. N.6340. P. 134-139.

60. Gilliespie B.E., Jayarao B.M., Dowlen H.H. & Oliver S.P. Analysis and frequency of bovine lymphocyte antigen DRB3.2 alleles in Jersey cows // Journal of Dairy Science. 1999. V.82. P.2049-2053.

61. Giovambattista G., Golij ow C.D., Dulout F.N. & Lojo M.M. Gene frequencies of DRB3.2 locus of Argentine Creole cattle //Animal Genetics. 1996. V.27. P.55-56.

62. Giovambattista G, Ripoli MV, Peral-Garcia P, Bouzat JL. Indigenous domestic breeds as reservoirs of genetic diversity: the Argentinean Creole cattle // Anim Genet. 2001. V.32. N.5. P.240-247.

63. Gorer P.A. The detection of antigenetic differences in mouse eritrocytes by the employment of the immune sera//British. Exp. Pathol. 1936. Vol.17. P. 42-50.

64. Groenen M.A.M., van der Poel J.J., Dijkhof R.J.M. & Giphart M.J. Cloning of thebovine major histocompatibility comlex class II genes // Animal genetics. 1989. V.20. P.267-268.

65. Groenen M.A.M., van der Poel J.J., Dijkhof R.J.M. & Giphart M.J. The nucleotide sequence of bovine MHC class II DQB and DRB genes // Immunogenetics. 1990. V.31. P.37-44.

66. Grosclaude F., Mahe M.F., Voglino G.F. The beta E variant and the phosphorylation code of bovine caseins // FEBS Lett. 1974. V. 1.45. P. 3-5.

67. Gupta M., Chyi Y.S., Romero-Severson J., Owen J.L. Amplification of DNA markers from evolutionarily diverse genomes using single primers of simple-sequence repeats // Theoret. Appl. Genet. 1994. V.89. P.998-1006.

68. Hanotte O., Bradley D.G., Ochieng J.W., Verjee Y., Hill E.W., Rege J.E. African pastoralism: genetic imprints of origins and migrations // Science. 2002. V.12. N.296 (5566). P.336-9.

69. Hedrick Ph. W., Whittam Th.S. & Parham P. Heterozygosity at individual amino acid sites: extremely high levels for HLA-A and B-genes // Proceedings of the National academy of sciences USA. 1991. V.88. P.5897-5901.

70. Hines H.C., Bailey E. & Park C.A. Relationship of the bovine major histocompatibility complex with aspects of persistent lymphocytosis/leukaemia // Animal Genetics. 1991. V.22. Suppl.l. P.93.

71. Hirsch F., Sachs D., Gustafsson K.et al. Ch. Class II genes of miniature svine.III. Characterisation of an expressed pig class II gene homologous to HLA-DQA II Immunogenetics. 1990. V.31. P.52-56.

72. Horin P., Matiasovic J, Trtkova K, Pavlik I. BoLA DYA polymorphism in Czech cattle // Exp. Clin. Immunogenet. 1998. V.15. N.l. P.56-60.

73. Hughes A.L. and Nei M., Nucleotide substitutions at major histocompatibility complex class II loci: evidence for overdominant selection // Proc. Natl. Acad Sci. USA. 1989. V.86. P.958 -962.

74. Irzikovska L., Wolko В., Swi^cicki W.K. The genetic linkage map of pea (Pisum sativum L.) based on molecular, biochemical and morphological markers // Pisum Genetics. 2001. V.33. N.l. P. 13.

75. Joosten I., Hensen E.J., Sanders M.F. & Andersson L. Bovine MHC class II restriction fragment length polymorphism linked to expressed polymorphism // Immunogenetics. 1990. V. 31. P.123-126.

76. Joosten I., Oliver R.A., Spooner R.L., Willams J.L., Hepkema G., Sanders M.F., Hensen E.J. Characterisation of class I bovine lymphocyte antigens (BoLA) by one-dimensional isoelectric focussing // Animal Genetics. 1988. V.19. P.103-113.

77. Joosten I., Sanders M.F. & Hensen E. J. MHC class I compatibility between dam and calf increases the risk of bovine retained placenta//Animal genetics. 1991. V.22. Suppl.l. P.114.

78. Joosten I., Sanders M.F., van der Poel A., Williams J.L., Hepkema B.G. & Hensen E.J. Biochemically defined polymorphism of bovine MHC class II // Immunogenetics.1989. V.29. P.213-216.

79. Kaufman J., Skjoedt K., Salmonsen J. The MHC molecules of nonmammalian vertebrates//Immunological reviews. 1990. N113. P. 83-118;

80. Klein J., Bontrop R.E., Dawkins R.L., Erlich H.A.,Gyllensten U.B., Heise E.R., Jones P.P., Parham P., WakelandE., Watkins D.,I. Nomenclature for major histocompatibility complexes of different species: a proposal // Immunogenetics.1990. V.31.P.405-409.

81. Krieger J.I, Karr R.W., Grey H.M. et al. Single amino acid changes in DR and antigen define residues critical for peptide-МНС binding and T cell recognition // J. Immunol.1991. V.146. P.2331 2340.

82. Kroemer G., Bernot A., Behar G., Chausse A.M., Gastinel L.N., Guillemot F., Park I., Thorava 1.Р., Zoorob R., Auffray C. Molecular genetics of the chicken MHC: current status and evolutionary aspects. // Immunol. Review. 1990 V. 113. P. 119-145.

83. Lanchbury J.S. Techniques used to define human MHC antigens: monoclonals, class I and class II biochemistry. // Immunol. Lett. 1991 V. 29. P. 23-29.

84. Ledwidge S.A., Mallard B.A., Gibson J.P., Jansen G.B., Jiang Z.H. Multi-primer target PCR for rapid identification of bovine DRB3 alleles. Animal Genetics. 2001. V. 32. N.4. P.219-221.

85. Leveziel. J. Basedow's disease// Soins. 1983. V.404. P. 41-42.

86. Lewin H.A. Disease resistance and immune response genes in cattle: strategies for their detection and evidence of their existence// J. Dairy Sci. 1989. V.72. P.334-1338.

87. Lewin H., Bernoco D. Evidence for BoLA-linked resistance and susceptibility to subclinical progression of bovine leukaemia virus infection // Animal Genetics. 1986. V.17. P. 197-207.

88. Lewin H. A.; Russell G. C.; Glass E. J. Genomic Organisation Of The Mhc: Structure, Origin and Function // Immunol. Rev., V.167. 1999. P. 145-158.

89. Lewin H.A., Ming-Che Wu, Steawart J.A., Nolan T.J. Association between BoLA and subclinical bovine leukemia virus infection in a herd of Holstein-Friesian cows // Immunogenetics. 1988a. V.25. P.338-334.

90. Lewin H., Wu M., Nolan T. et al. Peripheral В lymphocyte percentage as an indicator of subclinical progression to bovine leukemia virus infection // J. Dairy Sci. 1988b. V.71. P. 2526-2534.

91. Lindberg P.G. & Andersson L. Close association between DNA polymorphism of bovine major histocompatibility complex class I genes and serological BoLA-A specificities // Animal Genetics. 1988. V.19. P.245-255.

92. Litt M. & Luty J. A. A hypervariable microsatellite revealed by in vitro amplification of a dinucleotide repeat within the cardiac muscle actin gene // Am J Hum Genet. 1989 V. 44. N. 3. P. 397-401.

93. Lorenz R. Straub O. The epidemiology of enzootic bovine leukosis. / In: Enzootic Bovine Leukosis and Bovine Leukemia Virus. A. Burny and M. Mammerickx, eds. Martinus Nijhoff, Boston, 1987. P. 51-67.

94. Lunden A., Edfors-Lilja I., Simonsen M. & Liljedahl L.E.The influence of chicken major histocompatibility complex on production traits in egg-laying hens // Animal Genetics. 1991. V. 22. Suppl.l. P. 103-104.

95. MacHugh D.E, Loftus R.T., Cunningham P., Bradley D.G. Genetic structure of seven European cattle breeds assessed using 20 microsatellite markers // Anim Genet. 1998. V.29. N.5. P.333-40.

96. Maillard J.C., Renard C., Chardon P., Chantal I. & Bensaid A. Characterization of 18 new BoLA-DRB3 alleles // Animal Genetics. 1999. V. 30. P. 200-205.

97. Miltiadou D., Law A.S., Russell G. C. Establishment of a sequence-based typing system for BoLA-DRB3 exon 2 // Tissue Antigens 2003. V. 62. P. 55-65.

98. Mirsky M.L., Olmstead C.Da., Lewin H.A. Reduced bovine leukaemia virus proviral load in genetically resistant cattle // Animal Genetics. 1998. V.29. P.245-252.

99. Moazami-Goudarzi K., Laloe D., Furet J.P., Grosclaude F. Analysis of genetic relationships between 10 cattle breeds with 17 microsatellites // Anim. Genet.1997. N28. P. 338-345.

100. Mueller U.G., Wolfenbarger L. AFLP genotyping and fingerprinting // Trends Ecol. Evol. 1999. V.14.N.10. P.389.

101. Muggli-Cockett N.E. & Stone R.T. Identification of genetic variatrion in the bovine major histocompatibility complex DRb-like genes using sequenced bovine genomic probes // Animal Genetics. 1988. V.19. P.213-225.

102. Muggli-Cockett N.E. & Stone R.T. Partial nucleotide sequence of a bovine major histocompatibility class II DRb-like gene //Animal Genetics. 1989. V.20. P.361-370.

103. Muggli-Cockett N.E., Stone R.T. Restriction fragment length polymorphisms in bovine major histocompatibility complex class II b-chain genes using bovine exon-containing hybridization probes // Animal Genetics. 1991. V.22. P. 123-136.

104. Naqvi N1, Chattoo B.B. Development of a sequence characterized amplified region (SCAR) based indirect selection method for a dominant blast-resistance gene in rice // Genome. 1996. V.39. N.l. P.26.

105. Nei. M. Variation and covariation of gene frequences in subdivided populations // Evolution. 1965. V.19. №2. P.256-258.

106. Nei M., Miller J.C. A simple method for estimating average number of nucleotide substitutions within and between populations from restriction data // Genetics. 1990. V.125. P.873 879.

107. Nei M. & Tajima F. DNA polymorphism detectable by restriction endonucleases // Genetics. 1981. V.97. P.145 163.

108. Park C.A., Hines H.C. & Monke D.R. Association between the bovine major histocompatibility complex and posterior spinal paresis in Holstein bulls // Animal Genetics. 1991. V.22. Suppl.l. P.94-95.

109. Paterson S., Wilson K., Pemberton J.M. Major histocompatibility complex variation associated with juvenile survival and parasite resistance in a large unmanaged ungulate population // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 1998. V.95. N7. P.3714-3719.

110. Pelikan S., Rogstad S. GELSTATS version 2.6 // University of Cincinnati, Cincinnati, Ohio. 1996.

111. Perry M. D., Davey M.R., Power J.B., Love K.C., Bligh H.F.J., Roach P.S., Jones C. // Plant Molecular Biology Reporter. 1998. V. 16. N.l. P.49.

112. Rask L., Andersson L., Gustafsson K., Jonsson A.K. Parsimony analysis of mammalian class II histocompatibility genes // Immunol. Rev. 1990. V. 113. P. 187206.

113. Ripoli M. V., Liron J. P., De Luca J. C., Rojas F., Dulout F. N., Giovambattista G. Gene Frequency Distribution of the BoLA-DRB3 Locus in Saavedreno Creole Dairy Cattle // Biochemical Genetics 2004.Vol. 42, N. 7/8. P. 231-240.

114. Rothel J.S., Dufty J.H. & Wood P.R. Studies on the bovine major histocompatibility class I and class II antigens using homozygous typing cells and antigen-specific BoT4+ blast cells // Animal Genetics. 1990. V.21. P. 141-148.

115. Sagata N., Yasunaga Т., Tsuzuku Kawamura J. et al. Complete nucleotide sequenceof the genome of bovine leukemia virus: its evolutionary relationship to other retroviruses // Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 1985. V.82. P.677-681.

116. Sarmiento U.M., DeRose S., Sarmiento J.I., Storb R. Allelic variation in the DQ subregion of the canine major histocompatibility complex: I. DQA. II Immunogenetics. 1992. V. 35(6). P. 416-20.

117. Sarmiento U.M., Sarmiento J.I., Storb R. Allelic variation in the DR subregion of the canine major histocompatibility complex.// Immunogenetics. 1990. V. 32. P. 1319.

118. Sarmiento U.M., Storb R. Nucleotide sequence of a dog class I cDNA clone. // Immunogenetics. 1990a. V. 31. P. 400-404.

119. Sarmiento U.M., Storb R. Nucleotide sequence of a dog DRB cDNA clone // Immunogenetics. 1990b. V. 31. P.396-399.

120. Scott P.C., Gogolin-Ewens KJ, Adams ТЕ, Brandon MR. Nucleotide sequence, polymorphism, and evolution of ovine MHC class II DQA genes // Immunogenetics. 1991a. V.34. P. 69-79.

121. Scott P.C., Madox J.F., Cogolin-Ewens K.J., Brandon M.R. The nucleotide sequence and evolution of ovine MHC class II В genes: DQB and DRB // Immunogenetics. 1991b. V. 34. P. 80-87.

122. Sell S., Hunt J.M., Knoll B.J., Dunsford H.A. Cellular events during hepatocarcinogenesis in rats and the question of premalignancy // Adv. Cancer Res. 1987. V. 48. P. 37-111.

123. Sher A., Gazzinelli R.T., Oswald LP. et al. Role of T-cell derived cytokines in the downregulation of immune responses in parasitic and retroviral infection // Immunological Reviews. 1992. V.127. P. 183-204.

124. Sigurdardottir S., Borsch C., Gustafsson K. & Andersson L. Cloning and sequence analysis of 14 DRB alleles of the bovine major histocompatibility complex by using the polymerase chain reaction // Animal Genetics. 1991a. V.22. P. 199-211.

125. Sigurdardottir S., Borsch C., Gustafsson K. & Andersson L. Conserved polymorphism at major histocompatibility DRB loci in man and cattle // Animal Genetics. 1991b. V.22. Suppl.l. P.59-60.

126. Sigurdardottir S., Lunden A. & Andersson L. Restriction fragment length polymorphism of DQ and DR class II genes of the bovine major histocompatibility complex // Animal Genetics. 1988. V.19. P.133-150.

127. Spies Т., Morton C.C., Nedospasov S.A., Fiers W., Pious D., Strominger J.L. Genesfor the tumor necrosis factors alpha and beta are linked to the human major histocompatibility complex. // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 1986. V. 83. P. 86998702.

128. Spooner R.L., Leveziel H., Grosclaude F., Oliver R.A., Vaiman M. Evidence for a possible major histocompatibility complex (BoLA) in cattle // Journal of Immunogenetics. 1978. V.5. P.335-346.

129. Stear M.J., Dimmock C.K., Newman M.J., Nicholas F.W. BoLA antigens are associated with increased frequency of persistent lymphocytosis in bovine leukaemia virus // Animal Genetics. 1988a. V.19. P.151-158.

130. Stear M.J., Рокоту T.S., Muggli N.E. & Stone R.T. Breed differences in the distribution of BoLA-A locus antigens in American cattle // Animal Genetics. 1988b. V.19. P.171-176.

131. Stern L.J., Brown J.H., Jardetzky T.S. et al. Crystal structure of the human class II MHC protein HLA-DR1 complexed with an influenza virus peptide// Nature. 1994. V.368. P.215-221.

132. Stone R.T. & Muggli-Cockett N. E. Partial nucleotide sequence of a novel bovinemajor histocompatibility complex class II b-Chain gene, BoLA-DIB // Animal Genetics.1990. V.21. P.353-360.

133. Strominger I.L. Human Major Histocompatibility Complex Genes: class I antigens and Tumor Necrosis Factor// Cold Spring Harbor Symposia on Quantitative Biology. 1986. V. 11. P. 63-66.

134. Sutton V.R., Knowles R.W. An aberrant DRBA null gene transcript is found that could encode a novel HLA-DR beta chain // Immunogenetics. 1990. V. 31. P. 112117.

135. Takeshima S., Nakai Y., Ohta M., Aida Y. Short communication: characterization of DRB3 alleles in the MHC of Japanese shorthorn cattle by polymerase chain reaction-sequence-based typing //J. Dairy Sci. 2002. V.85. N6. P. 1630-1632.

136. Tautz D. Hypervariability of simple sequences as a general source for polymorphic DNA markers //Nucleic Acids Res. 1989 V. 17. N. 16. P. 6463-71.

137. TeaIe A.J., Kaushal A.Q., MacHugh N., Toye P. & Bensaid A. Bovine MHC class I cDNA clones: evidence for expression of two loci // Animal Genetics. 1991. V.22. Suppl.l. P.59.

138. Teale A.J., Watnbugu J., Gwakisa P.S., Stranzinger G., Bradley D., Kemp S.J. A polymorphism in randomly amplified DNA that differentiates the Y chromosomes of Bos indicus and Bos taurus // Anim. Genet. 1995. V.26. N.4. P. 243-248.

139. Todd J.A., Acha-Orbea H., Bell J.I., Chao N., Fronek Zd., Jacob Ch.O., McDermott

140. M., Sinha А.А., Timmerman L., Steinman L., McDevitt H.O. A molecular basis for MHC class II associated autoimmunity // Science.1988. V.240. N4855. P.1003-1009.

141. Trowsdale J. Molecular organization of the MHC molecules // Immunological letters. 1991. V. 29. P. 178.

142. Troy C.S., MacHugh D.E., Bailey G.F. et al. Genetic evidence for Near Eastern origins of European cattle //Nature. 2001. V.410. P.1088-1091.

143. Usuki K., Nishizawa M., Matsuki K., Tokunaga K. et al. Association of a particular amino acid sequence of the HLA-DR pi chain with HTLV-I-associated myelopathy. Eur. J.Immunol. 1990. V.20. P. 1603 1608.

144. Vos P., Hogers R., Bleeker M., Rejans M., van de Lee Т., Homes M., Fritjers A., Pot J., Peleman J., Kuiper M., Zabeau M. AFLP: a new technique for DNA fingerprinting // Nucl. Acids Res. 1995. V.23. N.21. P.4407-14.

145. Waugh R., Powell W. Using RAPD marker for crop improvement //Trends Biotechnol. 1992. V.10. P.186-191.

146. Weber J. L. & May P. E. Abundant class of human DNA polymorphisms which can be typed using the polymerase chain reaction // Am J Hum Genet. 1989 V. 44. N. 3. P. 388-96.

147. Welsh J., McClelland M. Fingerprinting genomes using PCR with arbitrary primers //Nucleic Acids Res. 1990. V.18.N.24. P.7213-7218.

148. Williams I., Kubelik A.R., Livak K.I., Rafalski I.A., Tongey S.N. DNA polymorphisms amplified by arbitrary primers are useful as genetics markers // Nucleic Acids Res. 1990. V. 18. N.22. P.6531-6535.

149. Williams J.L., Oliver R.A. & Spooner R.L. Variation in BoLA class I antigens on bovine lymphocytes following infection with Theileria annulata // Animal Genetics. 1991. V.22. Suppl.l. P.43.

150. Winkler Ch., Schults A., Cevario St., O'Brien St. Genetic characterisation of FLA the cat major histocompatibility complex // Proc.NatI Acad. Sci. USA. 1989. V.86. P.943-947.

151. Xu A. & Lewin H.A. Characterization of bovine major histocompatibility complex class II genes using the polymerase chain reaction //Animal Genetics. 1991. V.22. Suppl.l. P.61-62.

152. Xu A., Van Eijk M.J.T., Park Ch. and Lewin H.A. Polymorphism in BoLA-DRB3 Exon 2 Correlates with Resistance to Persistent Lymphocytosis Caused by Bovine1.ukemia Virus // J. Immunol. 1993. V.151. P.6977 6985.

153. Yuhki N., Heideeker G.F., O'Brien S.J. Characterization of MHC cDNA clones in the domestic cat. Diversity and evolution of class I genes.// J. Immunol. 1989. V. 15; 142. P. 3676-3682.

154. Yuhki N., O'Brien S.J. Molecular characterization and genetic mapping of class I and class II genes for the domestic cat // Immunogenetics. 1988. V. 27. P. 414-425.

155. Yuhki N., O'Brien S.J. DNA variation of the mammalian major histocompatibility complex reflects genomic diversity and population history. //Proc. Natl. Acad. Sci. U SA. 1990. V. 87. P. 836-40.

156. Zanotti M., Poli G., Poli W. et al. Association of the BoLA class II haplotypes with subclinical progression of bovine leukaemia virus infection in Holstein-Friesian cattle //Animal genetics. 1996. V.27. P.337-341.

157. Zhivotovsky LA, Underhill PA, Cinnioglu C, Kayser M, Morar B, Kivisild T, Scozzari R, Cruciani F, Destro-Bisol G, Spedini G, Chambers GK, Herrera RJ, Yong KK, Gresham D, Tournev I, Feldman MW, Kalaydjieva L. // Am. J. Hum. Genet. 2004. V.74.N.1.P.50.

158. Zoorob R., Behar G., Kroemer G., Auffray Ch. Polymorphism of class II MHC genes in the domestic fowl//Animal Genetics. 1991. V.22. S.l. P.62

159. Я благодарю О.Е. Лазебного за неоценимую помощь в статистической обработке результатов, Г.Н. Полухину за помощь и внимание в течение 3 лет аспирантуры.

160. Выражаю искреннюю благодарность своей супруге Ш. Мораднасаб за постоянное внимание, помощь и терпение.