Биологические свойства возбудителя сосудистого бактериоза капусты и меры защиты тема диссертации и автореферата по ВАК РФ 06.01.07, кандидат наук Во Тхи Нгок Ха

• Во Тхи Нгок Ха
• кандидат наук
• 2015

Оглавление диссертации кандидат наук Во Тхи Нгок Ха

Оглавление

ВВЕДЕНИЕ

ГЛАВА 1. ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ

1.1. Вредоносность и распространенность сосудистого бактериоза капусты

1.2. Систематическое положение возбудителя

1.3. Симптомы

1.4. Расовый состав патогена

1.5. Методы защиты капусты от сосудистого бактериоза

1.6. Методы диагностики зараженности

1.7. Генетика Xanthomonas campestris pv. campestris

ГЛАВА 2. МАТЕРИАЛ И МЕТОДЫ

2.1. Выделение и хранение чистых культур возбудителя

2.2. Идентификация рас патогена и оценка устойчивости к сосудистому бактериозу селекционного материала капусты

2.3. Изучение методов защиты капусты от сосудистого бактериоза

2.4. Выделение ДНК и ПЦР анализ

ГЛАВА 3. РАСОВЫЙ СОСТАВ ВОЗБУДИТЕЛЯ И УСТОЙЧИВОСТЬ СОРТООБРАЗЦОВ КАПУСТЫ К СОСУДИСТОМУ БАКТЕРИОЗУ

3.1. Расовый состав популяции патогена

3.2. Оценка устойчивости различных гибридов капусты к сосудистому бактериозу

3.3. Проявление симптомов сосудистого бактериоза у капустных растений с различными генами устойчивости в зависимости от концентрации инокулюма X. campestris pv. campestris

ГЛАВА 4. ОЦЕНКА ЭФФЕКТИВНОСТИ СРЕДСТВ ЗАЩИТЫ КАПУСТЫ ОТ СОСУДИСТОГО БАКТЕРИОЗА

4.1. Оценка эффективности биопрепаратов на основе бактерий-антагонистов и антибиотиков

4.2. Антибактериальная активность эфирных масел и их использование для обеззараживания семян капусты от сосудистого бактериоза

4.3. Выделение и испытание эффективности бактериофагов против сосудистого бактериоза

ГЛАВА 5. ОЦЕНКА ГЕНЕТИЧЕСКОГО РАЗНООБРАЗИЯ ШТАММОВ XANTHOMONAS CAMPESTRIS И МОЛЕКУЛЯРНО-ГЕНЕТИЧЕСКИХ МАРКЕРОВ ПАТОВАРИАНТОВ ЭТОГО ВИДА

5.1. Оценка диагностических маркеров для патовариантов видаXanthomonas campes tris

5.2. Генетическое разнообразие возбудителя сосудистого бактериоза в России в 2006-2012 гг

5.3. Мультилокусный анализ последовательностей ДНК штаммов^ campestris

ЗАКЛЮЧЕНИЕ

СПИСОК ЛИТЕРАТУРЫ

ПРИЛОЖЕНИЕ

Введение диссертации (часть автореферата) на тему «Биологические свойства возбудителя сосудистого бактериоза капусты и меры защиты»

ВВЕДЕНИЕ

Актуальность. Капуста в России всегда была одной из основных овощных культур. В Советском Союзе в 1978 году площади под капустой занимали 271,5 тыс.га. В современной России произошло сокращение площадей по этой культурой, и в 2011 году они составляли 123,3 тыс. га.

Россия занимает третье место в мире по производству капусты после Индии и Китая, что составляет около 6% валового мирового сбора - 3,528 млн. т, но по урожайности лишь 47-е место с показателем 28,6 т/га (Пивоваров, Бондарева, 2013).

Во Вьетнаме общая площадь под овощными культурами составляет 635,8 тысяч га. Из них растения семейства капустных занимают 70 -80% от общего объема производства и площадей. В основном выращиваются листовые капусты (японские и китайские), а также белокочанная, цветная и кольраби (http://www.sonongnghiep.hochiminhcity.gov.vn/). Урожайность капусты составляет 20-25 т/га.

Капуста богата полезными веществами, среди которых следует в первую очередь отметить антиоксиданты, которые успешно предупреждают развитие ряда опасных заболеваний человека. Брюссельская и цветная капуста способствуют снижению риска онкологических заболеваний и заболеваний сердечно-сосудистой системы. В белокочанной капусте содержится индол-3-карбинол, ускоряющий выведение из организма веществ, вызывающих рак некоторых внутренних органов (Лизгунова, 1984; Бондарева, 2013).

Одной из причин низкой урожайности капусты является поражение болезнями, среди которых ведущее значение имеет сосудистый бактериоз, вызваемый ХапЖотопаБ сатреъ^'^ pv. сатреБЫя (Рашше1, 1895; Dowson, 1939). Это заболевание распространено всех странах мира и всех регионах Российской Федерации, где возделывают капусту, и приводит к снижению урожайности капусты, ее качества и ухудшению лежкости кочанов в период хранения. Особую

актуальность эта проблема имеет для Вьетнама, где сочетание высокой температуры, высокой влажности воздуха и обилие осадков приводит к частым эпифитотиям сосудистого бактериоза (http://trongraulamvuon.com).

В системе защиты капусты от этого заболевания большое значение имеют следующие элементы:

диагностика зараженности семян возбудителем молекулярно-генетическими методами;.

- использование биологических препаратов на основе антагонистических бактерий и антибиотиков;

- выведение и выращивание устойчивых к заболеванию сортов и гибридов.

Степень разработанности темы. Данной проблеме посвящены

многочисленные работы Schaad, Vicente, Матвеевой, Игнатова, Мазурина и др. Тем не менее, остаются нерешенными многие вопросы, касающиеся биологии патогена и мер защиты. Слабо изучена сравнительная эффективность многих биопрепаратов, рекомендованных для защиты капусты от бактериозов. Весьма перспективным представляется использование для этой цели растительных эфирных масел и бактериофагов. В отношении устойчивости гибридов капусты нет достоверных сведений о том, к каким расам патогена они устойчивы. А для правильного размещения этих гибридов необходимы сведения о расовом составе возбудителя. На семенах капусты могут встречаться различные патовары X. campestris. Для точной диагностики зараженности семян молекулярно-генетическими методами необходимы маркеры, способные различать эти патовары и выявлять X. campestris pv. campestris.

Цель и задачи. Целью работы являлось усовершенствование методов защиты от сосудистого бактериоза на основе использования экологически безопасных препаратов, устойчивых гибридов Fj капусты и разработки молекулярно-генетических методов диагностики возбудителя.

Для достижения этой цели планировалось решение следующих задач:

1. Выявить расовый состав коллекции изолятов патогена различного географического происхождения.

2. Изучить генетический полиморфизм коллекции штаммов X сатреБ^ ру. сатрея^я методом мультилокусного анализа для поиска специфичных для этого патовара молекулярных маркеров.

3. Провести оценку устойчивости к заболеванию ряда современных гибридов капусты.

4. Изучить эффективность биопрепаратов в защите капусты от сосудистого бактериоза.

5. Провести скрининг антибактериальной активности эфирных масел различных растений по отношению к X. сатреБМБ ру. сагаре^га.

6. Оценить эффективность бактериофагов в защите от сосудистого бактериоза.

Научная новизна. Уточнен расовый и генетический состав возбудителя сосудистого бактериоза капусты. Показано несовершенство существующего набора растений-дифференциаторов. Установлены степени связи между оценками нерасоспецифической устойчивости растений капусты к бактериозу при использовании различных методов инокуляции. Получены новые данные о сравнительной биологической эффективности биопрепаратов в защите капусты от сосудистого бактериоза. Выявлены видоспецифичные и патовар-специфичные праймеры для молекулярно-генетической диагностики возбудителя.

Теоретическая и практическая значимость работы. Уточнен период защитного действия ряда зарегистрированных биологических препаратов. Выявлены гибриды капусты, проявляющие расово-специфическую устойчивость к отдельным изолятам возбудителя. Определена оптимальная инфекционная нагрузка для создания искусственного инфекционного фона при оценке устойчивости селекционного материала. Установлена высокая биологическая эффективность эфирных масел тимьяна обыкновенного, душицы обыкновенной и чабера горного в борьбе с семенной инфекцией. Показана перспективность использования бактериофагов X. сатреьЫБ ру. сатрезМБ для обеззараживания семян.

Методология и методы диссертационного исследования. Работа выполнена с использованием современных фитопатологических, микробиологических и молекулярно-генетических методов, разработанных ведущими учеными в этой области (Schaad, Kamoun, Vicente, Игнатов и др.).

Положения, выносимые на защиту:

1. Возбудитель сосудистого бактериоза в Российской Федерации представлен расами 1, 3, 4 и 6. Это необходимо учитывать при районировании гибридов капусты с расоспецифической устойчивостью и при создании искусственных инфекционных фонов в селекции на устойчивость.

2. Нерасоспецифический тип устойчивости зависит от нескольких факторов, выявляемых разными методами инокуляции, использующих различные пути проникновения возбудителя в растение-хозяина.

3. Эфирные масла тимьяна обыкновенного, душицы обыкновенной, чабера горного, а также бактериофаги X. campestris pv. campestris показывают защитное действие, не уступающее лучшим из зарегистрированных биопрепаратов с бактерицидным действием.

Степень достоверности и апробация результатов. Работа выполнена с использованием современных методик и оборудования. Выводы подтверждены результатами статистической обработки экспериментальных данных методами, включающими дисперсионный, корреляционный и факторный анализы. Результаты исследования были представлены на Международной научной конференции молодых учёных и специалистов, посвященной 170-летию со дня рождения К. А. Тимирязева (Москва, РГАУ-МСХА, 5-6 июня 2013 г.), Международной научной конференции молодых учёных и специалистов, посвящённой созданию объединённого аграрного вуза в Москве (Москва, РГАУ-МСХА, 3-4 июня 2014 г.), Международной научно-практической конференции «Бактериальные и фитоплазменные болезни сельскохозяйственных культур: научные и практические аспекты» (Московская область, ВНИИФ, 15-18 октября 2014 г.). По результатам работы были опубликованы 8 печатных работ, в том числе 3 статьи в рецензируемых журналах, рекомендованных ВАК.

ГЛАВА 1. ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ

1.1. Вредоносность и распространенность сосудистого бактериоза

капусты

Сосудистый бактериоз как болезнь капусты впервые обнаружил Garman (1894) в конце 19-го века в Кентуки, США. Он выделил два рода бактерий из больного растения, но не смог определить, какой из них вызывал заболевание. В Айове, США Pammel (1895а; 1895b) нашел похожую болезнь на брюкве и турнепсе и показал, что болезнь вызывала бактерия, идентифицированная как Bacillus campestris с желто-пигментированными колониями на питательной среде. В штате Висконсин также была обнаружена болезнь турнепса и капусты, названная желтой (Russell, 1898; Smith, 1898). С того времени болезнь была обнаружена на всех континентах, где выращивали капустные (Bradbury, 1986), и она считается одной из самых опасных болезней капусты в мире (Williams, 1980).

В США возбудитель сосудистого бактериоза вызывал заражение более 70% рассады капусты в 1973 году (Williams, 1980), и с этого времени ущерб из-за болезни постоянно увеличивается. Развитие заболевания в нескольких штатах США причинило в 1976 году ущерб свыше миллиона долларов (Kennedy, Alhorn, 1980). В Канаде в период 1979-80 гг. потери брюквы, вызванные сосудистым бактериозом, достигали 60% (МсКееп, 1981).

В странах Африки в различные годы потери от болезни варьировали от 10 до 80% (Mguni, 1996). В Сербии возбудитель был обнаружен впервые в 1964 году. Болезнь вызывала около 80% потерь урожая при выращивании кормовой капусты в центральной Сербии (Perisic, Panic, 1964; Balaz cit., 2001). В Черногории сосудистый бактериоз был обнаружен летом 2009 года в Zeta Plain, где вызывал отмирание до 80%) выращиваемой капусты на некоторых участках (Dragana, Jelica, 2012). В Непале возбудитель появился с 1977 года и до сих пор является самым вредоносным заболеванием капусты (Shrestha, 1977; Tika, Ramchandra 1998;

Jensen et al., 2010). В Мозамбике сосудистый бактериоз вызывал потери урожая капусты до 70 % (Bila et al., 2008). В 2007 году произошла вспышка заболевания, которая нанесла серьезный ущерб на семенных участках и поразила 70% растений капусты на юге Мозамбика (Bila et al., 2013). Сильное поражение капустных культур наблюдается в Израиле в зимний период (Kritzman, Ben-Yephet, 1990).

В Таиланде выявлена встречаемость заболевания на 84% полей капусты (Schaad, Thaveechai, 1983). В Корее сосудистый бактериоз является основной болезнью капусты (Kim, 1986). В Японии выявлено заражение от 50 до 90% растений капусты, в основном, вследствие семенной инфекции (Shiomi, 1992; Ignatov et al., 1997). Особенно значительный ущерб сосудистый бактериоз наносит семеноводству цветной капусты (Shyam et al., 1994). В Индии потери урожая капусты от болезни достигали 50% (Gupta, 1991; Roohie, Umesha, 2012).

В России заболевание было впервые обнаружено в 1905 г. в Смоленской и Харьковской губерниях., а затем в Петрограде, Курской и Московской губерниях (Ячевский, 1935). В последние годы происходит нарастание зараженности заболеванием, и возбудитель встречается на всей территории, где выращиваются капустные культуры, особенно в центральной и черноземной зоне (Рисунок 1.1.1.). Пораженность растений в эпифитотийные годы достигает 90-100% при развитии болезни 40-47% (Иванюк, Сильванович, 1990). В разных регионах России болезнь вызывает потери от 23 до 57% у восприимчивых сортов капусты (Игнатов, 1992; Джалилов и др. 1989). В Московской области потери урожая составляли 40-60% (Джалилов, Тивари, 1990) при пораженности выращиваемых растений 90 - 100%) (Рогачев, 1991). Снижение урожайности капусты в Западной Сибири составляло от 23,5 до 100% (Сухорукова, 1987). В Белоруссии прямые потери урожая капусты из-за сосудистого бактериоза достигали 56% (Иванюк, Сильванович, 1991).

Xaittkomonas campestris pv. campestris (Pommel) Dowson

Зоны вредоносности | J Сильной | |Зона распространения

40° 60° 100° 140°

Рисунок 1.1.1. Зоны распространения и вредоносности сосудистого бактериоза капусты Xanthomonas campestris pv. campestris в России (http://www.agroatlas.ru)

1.2. Систематическое положение возбудителя

Тип: Bacteria;

Группа: Proteobacteria;

Класс: Gammaproteobacteria;

Порядок: Xanthomonadales;

Семейство: Xanthomonadaceae;

Типовым представителем рода Xanthomonas является вид X campestris (Pammel, 1895) Dowson, 1939.

Синонимы: Bacillus campestris, Bacterium campestre (Pammel, 1895), Pseudomonas campestris (Pammel, 1895; Smith, 1897), Phytomonas campestris (Pammel 1895; Bergey's manual, 1984).

Бактерия Xanthomonas campestris pv. campestris - грамотрицательные, неспороносные палочки 0,6-0,7 x 1,2-1,7 мкм; с полярным жгутиком. Облигатные аэробы. Оптимальная температура размножения 25-30 "С, максимальная - 38-39 "С, минимальная - 5 °С. Растут в среде с лактатом кальция. Нуждаются в факторах роста: метионине, глутаминовой кислоте, никотиновой кислоте или их сочетании (Bergey's manual, 1984). На агаровой среде с углеводами колония бактерии круглая, выпуклая, гладкая, блестящая сначала светлая, затем желтоватая, край колонии ровный. На бульоне бактериальная колония образует муть, осадок и пленку в виде кольца, на картофеле колония выпуклая, гладкая, слизистая маслянисто-блестящая, желтая в виде тягучей массы. Морфологическая неоднородность клеток может быть следствием изменения режима культивирования бактерий. Образуют кислоту из дульцита, декстрозы, галактозы, арабинозы, ксилозы, аргинина, мальтозы, сорбита, глюкозы сахарозы, раффинозы, глицерина. Гидролизируют желатин, экскулин, выделяют леван при температуре 35 °С (Tatjana et al., 2013). Наблюдаются штаммовые различия в использовании инозита, маннита, трегалозы, лактозы, целлобиозы и рибозы (Dye, 1962; Tika, Ramchandra, 1999). Гидролизируют крахмал, образуют мукоидную колонию на питательном агаре с добавлением 5-% глюкозы (Джалилов, 1996). Образуют специфические пигменты, локализованные в мембране бактерии: бромзамещенные арильные полиены, или «ксантомонадины» (Starr et al., 1977; Bradbury, 1986), которые играют важную роль в устойчивости организма к ультрафиолетовому излучению. Не образуют люминесцентный пигмент на агаровой среде, растут при 1 % NaCl (Tika, Ramchandra, 1998). В Непале в 1998 году обнаружены штаммы, чувствительные к налидиксовой кислоте (30 мкг/мл) и тетрациклин (30 мкг/мл), а также устойчивые к антибиотикам (гентамицин, 10 мкг/мл; эритромицин, 15 мкг/мл; бацитрацин, 10 мкг/мл; ампициллин, 10 мкг/мл; клоксациллин, 30 мкг/мл; цефалексин, 30 мкг/мл; хлорамфеникол, 30 мкг/мл и нитрофурантоин, 30 мкг/мл) (Tika, Ramchandra, 1998). Некоторые штаммы из Сербии показывали положительную реакцию на каталазу, отрицательную - на

оксидазу, выделяют H2S, индол, не показывают толерантность к 0,1 и 0,02% TTC (triphenyl-tetrazolium chloride) (Tatjana et al., 2013).

Генетические свойства штаммов X. campestris pv. campestris изучались различными генетическими методами. Большинство штаммов были охарактеризованы генетическим фингерпринтингом с помощью REP-, ERIC-, ВОХ-ПЦР (Massomo et al, 2003; Tsygankova et al, 2004; López et al., 2006; Valverde et al, 2007; Zaccardelli et al, 2008; Jensen et al., 2010; Lema et al, 2011; Lizyben 2012; Roohie, Umesha, 2012; Tatjana et al, 2013), фрагментного анализа (AFLP) (Ignatov et al, 2007) или мультилокусного анализа (Ah-You et al, 2009).

Характерной особенностью X. campestris pv. campestris является синтез ксантана. Этот полисахарид образует слизистую капсулу, которая защищает клетку от высыхания и играет важную роль в прикреплении бактерии к клеточной стенке растения. Ксантан широко используются как стабилизирующая добавка в пищевой, косметической промышленности и как смазочный материал в других отраслях промышленности (Garcia-Ochoa et al, 2000; Джалилов, 1996; Federico et al, 1996; Morris, 1977; Silvina et al., 2011).

Возбудитель сосудистого бактериоза поражает большинство растений семейства Капустные (Brassicaceae). Культурные растения, поражаемые сосудистым бактериозом, относятся к родам Brassica или Raphanus. Показано, что на различных видах растений-хозяев разные расы возбудителя существенно различаются по агрессивности (Vicente et al, 1997; Vicente, Joana, Holub, 2012).

Среди дикорастущих растений развитие заболевания отмечено на Rorippa indica, В. rapa var. campestris (сурепица), Capsella bursa-pastoris (пастушья сумка), Raphanus raphanistrum (дикая редька), Crambe spp. , Lepidium sativum (садовый кресс), Lepidium virginicum, Sinapis arvensis (дикая горчица), Erysimum cheiri, Matthiola incana. Эти растения могут поражаются начиная со всходов до созревания семян (Schaad, Dianese, 1981; Ignatov et al, 1992; Nazir et al, 2010).

Патоген перезимовывает в почве преимущественно в растительных остатках (Джалилов, Тивари, 1995); на сорных растениях семейства Капустные (Schaad, Dianese, 1981) и в семенах (Schaad, 1982; Franken, 1992). Патоген может

сохраняться в семенах до трех лет (Bazzi, 1991), в почве - от 14 до 42 дней. В пораженных растительных остатках возбудитель сохраняется до 244 дней (Schaad, White, 1974). Этот период сохранения жизнеспособности зависит от климата и может варьировать от двух месяцев в тропиках до двух лет в сухом и прохладном регионе (Strandberg, 1973). При температуре почвы 5 °С патоген сохраняется дольше, чем при 20°С (Santiranjan et al., 1986; Джалилов, Тивари, 1995). Основным источником инокулюма при эпифитотиях сосудистого бактериоза часто служат инфицированные кочерыги (Kocks, Zadocks, 1996).

1.3. Симптомы

Поражение капустных растений проявляется на всех стадиях выращивания культуры: на всходах, рассаде, растущих в поле растениях первого года и семенниках (Джалилов, 1996). Симптомы сосудистого бактериоза варьируют в зависимости от сорта, вида и рода хозяина, его возраста и условий окружающей среды. Поражаются в основном надземные органы, хотя наблюдается и поражение корнеплодов у редиса и репы (Lambe, Lacy, 1982; Sherf, Macnab, 1986; Roberts et al., 1987), а у растений рапса поражаются корни, приводя к корневой гнили (Иванюк, Сильванович, 1990).

Зараженные семена, как правило, не проявляют каких-либо признаков инфекции, но затем на всходах появляется обесцвечивание, затем точечный некроз семядольных листьев, потом они чернеют и увядают (Matsumoto, 1975; Shiomi, 1991). Сильно пораженные семена рапса и горчицы могут выглядеть сморщенными и бесцветными (Sharma et al., 1992). Проникновение патогена в растение может происходить через механические повреждения, устьица и гидатоды.

На листьях появляются по краям хлоротичные пятна, которые затем принимают V-образную форму. У пораженного растения сосуды становятся темными - от коричневого до черного цвета (Goto, 1992). При системном

поражении наблюдаются увядание и опадение пораженных листьев (Matsumoto, 1975). К начальным симптомам можно отнести появление сетки потемневших сосудов (Schaad, Thaveechai, 1983).В некоторых случаях на листьях появляются округлые некротические пятна. Иногда увядание и некротизация сосудов ксилемы не приводит к пожелтению листьев. При высокой температуре симптомы у пораженных растений белокочанной и цветной капусты могут быть сходными с симптомами слизистого бактериоза (Ignatov et al., 1992). В связи с повышением вирулентности патогена X. с. pv. campestris, в последний годы отмечают новые виды симптомов, такие как появление на листьях темно-зеленых водянистых пятен, с последующим их хлорозом и опадением (Tatjana et al., 2013).

Многими исследователями отмечается, что ряд штаммов Хсс вызывают нетипичные для сосудистого бактериоза симптомы. Mguni с соавторами (1996), выделили три биологических типа штаммов (Хсс, ХссА и ХссВ) из капустных, культивируемых в Зимбабве. Штаммы типа ХссА вызывали гниль растения, типа ХссВ вызывали увядание и гниль стебля, а штаммами группы Хсс формировались типичные «У»-образные симптомы.

Системное поражение растений развивается в результате размножения бактерий в проводящей ткани. После заражения через гидатоды, бактерии передвигаются из межклеточного пространства паренхимы в сосуды ксилемы и затем распространяются по черешку, стеблю и корню. Размножение бактерий приводит к нарушению нормального развития растений. При раннем заражении больные растения не формируют кочан, что приводит к значительным потерям урожая.

В поле симптомы системного поражения сосудистым бактериозом сходно с фузариозным увяданием, вызываемым грибом Fusarium oxysporum. Для точной диагностики этих болезней необходимо разрезать кочерыгу в поперечном направлении. При этом в случае сосудистого бактериоза сосуды будут иметь черную окраску, а не буро-коричневую как при фузариозе (Защита овощных культур и картофеля от болезней, 2006). Сосудистый бактериоз с некрозом сосудов принято считать типичным проявлением болезни.

В местах механических повреждений при повышенной относительной влажности воздуха появляется экссудат. Он содержит клетки возбудителя и представляет маленькие капли желтой маслянистой жидкости.

На капусте могут встречаться и другие виды и патовары Xanthomonas. Эти виды не встречаются в сосудах капусты, а поражают паренхиму листьев, вызывая небольшие темно-серые некрозы. К ним относятся возбудители листовой пятнистости капусты X campestris pv. raphani и X. campestris pv. armoraciae. Патовары X. campestris pv. armoraciae и X campestris pv. raphani наиболее близки к возбудителю сосудистого бактериоза капусты по ряду свойств (McCuloch, 1929; Vaulerin et al, 1990; White, 1930; Alvarez et al., 1994; Ignatov et al., 1998a). Различия между ними заключаются, главным образом, в симптомах и набору поражаемых растений-хозяев. Патовар X. campestris pv. armoraciae вызывает симптомы на капустах, хрене, турнепсе и других растениях семейства Капустные. Патовар X. campestris pv. raphani вызывает симптомы на редисе, турнепсе, горчице, томате, табаке и перце, но не встречается на хрене (White, 1930). В отличие от X campestris pv. campestris, X campestris pv. armoraciae не вызывает системного поражения типичного для сосудистого бактериоза (Vauterin et al., 1990).

Первые симптомы заболевания обычно обусловлены посевом инфицированных семян (Hunter et al., 1975; Randhawa, Schaad, 1984; Schaad, White, 1974; Kohl, Wolf, 2005). При прорастании зараженного семени возбудитель проникает в мезофилл листа и сосудистую систему эпикотиля, а в дальнейшем - в гидатоды. Развитие заболевания при температуре +15...+20°С может носить латентный характер. Повышение температуры до 25-30°С может приводить к переходу от латентного состояния к проявлению симптомов (Kohl, Wolf, 2005).

При температуре свыше 30 "С симптомы могут проявляться в виде больших пятен в средней части листьев, а при 15 °С - 17 °С наблюдается только некроз листьев. При этом не было никаких видимых внешних изменений на инфицированных черешках и стеблях. Хотя, на их продольном разрезе из

некротизированных сосудов были изолированы на питательную среду желтые, мукоидные колонии (Dragana, Jelica, 2012).

Распространение патогена может происходить каплями воды, дождя, аэрозолями, сельскохозяйственными машинами и людьми (Vicente, 2012). В рассадном отделении патоген особенно сильно распространяется при использовании верхнего полива - дождевания (Shidaki et al, 2000). Изменение способа полива может снижать распространение патогена (Roberts et al, 2007). Эпифитотия заболевания в Белоруссии была связана с сочетанием температурой в поле +22...+28 С с частыми дождями и повышенной влажностью (Сильванович, 1989). Показано, что массовое развитие заболевания наблюдалось в годы с большим числом дождливых дней и высокой инфекционной нагрузкой (Kocks et al, 1999).

1.4. Расовый состав патогена

Создание устойчивых сортов капусты к сосудистому бактериозу -достаточно сложная задача, так как возбудитель обладает высокой степенью генетической, серологической и биологической изменчивости (Alvares et al, 1994; Tsygankova et al, 2004). Анализ расового состава дает информацию о генах вирулентности в популяциях патогенов, что играет важную роль в селекции устойчивых сортов и их районировании.

На основе изучения взаимодействия штаммов возбудителя сосудистого бактериоза X. campestris pv. campestris с различными сортами и гибридами Brassica rapa и Brassica juncea S. Kamun с соавторами (1992) впервые выделили пять рас патогена по способности заражать растения-дифференциаторы с тремя расово-специфическими генами устойчивости.). Установлено, что расу 1 можно разделить на две или три расы в зависимости от реакции патогена с некоторыми образцами В. oleracea и В. carinata (Vicente et al, 1998; Ignatov et al 1998b).

Раса 0 возбудителя сосудистого бактериоза капустных Xanthomonas campestris pv. campestris (Pamm.) Dow, способная преодолевать доминантный ген устойчивости Rb, встречающийся у растений с геномом ВВ, была выделена после инокуляции устойчивого амфитриплоидного растения с геномом ААВВСС авирулентным штаммом расы 1 (Игнатов и др., 2000). Vicente с сотрудниками (2001) проводили опыт с большой коллекцией штаммов возбудителя и использовали дополнительные растения-дифференциаторы. Ими была предложена новая классификация рас патогена. Три расы (1, 2 и 4) были сохранены из классификации Kamoun et al. (1992), однако не было найдено не одного изолята, который бы соответствовал расе 3, поэтому эта раса была исключена из новой классификации. Три варианта среди изолятов, относящиеся к предыдущей расе 1 были найдены на основе их реакций с В. oleracea и В. carinata: новая раса 1 считается наиболее часто встречаемой расой, новая раса 3 реже с представителями типовых штамм Хсс (АТСС33913; NCPPB 528), и к дополнительной расе 5 относились изоляты из Австралии, Канады и США, принадлежавшие раньше к X. campestris pv. aberrans. Раса 0 была переименована на расу 6 в новой модели. Единственным представителем расы 2 был изолят HRI 3849A (2D520), который был использован для поиска устойчивых растений у Arabidopsis thaliana. В работе Vicente с соавторами (2001) был разработан набор растений дифференциаторов, который используется по настоящее время для определения расового состава патогена. Совсем недавно были идентифицированы еще три расы: 7 (Brita et al., 2007, 2010) и 8, 9 (Fargier, Manceau, 2007).

К недостаткам этого набора растений дифференциаторов следует отнести то, что в него входят сорта и коммерческие Fi гибриды. У сортов реакция часто варьирует вследствие их гетерозиготности. Гибриды Fj не могут быть размножены исследователями самостоятельно, а фирмы-оригинаторы могут со временем снять их с производства. Лучшее решение этой проблемы - переход к использованию набору дифференциаторов на основе дигаплоидных линий (DH). Они включают в себя DH линии, которые заменяют Cobra, PI 199947, Florida Broad Leaf Mustard и Miracle F1.

Во всем мире расы 1 и 4 являются преобладающими, но их относительные частоты встречаемости меняются в зависимости от географических регионов. Раса 1 чаще встречается в Англии (Игнатов, 2006), в Мозамбике (Bila et al., 2013), в то время как раса 4 доминировала в Португалии (Vicente et al., 2004), на северо-западе Испании (Lema et al., 2011) и в некоторых восточно- и южно-африканских странах, таких как Танзания и Уганда (Mulema et al., 2012; Lizyben, 2012). Другие расы, как правило, встречаются редко, расы 2 и 6 отсутствовали в коллекции изолятов из Японии и России (Ignatov et al., 1998а), однако раса 6 является самой распространённой расой в Непале (Jensen et al., 2010). Раса 5 также встречается редко. Она недавно была найдена в Непале (Jensen et al., 2010) и в поле на северо-западе Испании (Lema et al., 2011). В Португалии и на северо-западе Испании на инфицированной репе была выявлена раса 6 (Vicente, 2004; Lema et al., 2011). Мониторинг частот встречаемости и географического распределения рас в различных странах имеет большое значение для разработки эффективных программ селекции сортов и гибридов капусты на устойчивость. При этом инокуляция селекционного материала должна проводиться преобладающими в регионе расами, в частности расами 1 и 4.

Список литературы диссертационного исследования кандидат наук Во Тхи Нгок Ха, 2015 год

СПИСОК ЛИТЕРАТУРЫ

1. Бактериофаги: биология и практическое применение / Под ред. Э. Каттер, А. Сулаквелидзе // пер. с английского, научн. ред. A.A. Летаров. - М.: Научный мир. - 2012. - 640 с.

2. Бондарева, Л.Л. Новые сорта и гетерозисные гибриды капусты селекции ВНИИССОК / Л.Л. Бондарева // Овощи России. - 2013. - № 3(20). - С. 32-33.

3. Гордиенко, Ф.И. Природа и пути инфекции главнейших бактериозов капусты и обоснование способов борьбы с ними: Библиография / Ф. И. Гордиенко; под ред. М. Д. Лясковского. - Харьков: НИИ соцземледелия, 1940. -50с.

4. Джалилов, Ф.С. Бактериальные болезни капусты (диагностика, патогенез, иммунитет, защитные мероприятия): автореф. дис. ... док. биол. наук: 06.01.11 / Джалилов Февзи Сеид-Умерович. - М., 1996. - 32 с.

5. Джалилов, Ф.С. Вредоносность сосудистого бактериоза капусты / Ф.С. Джалилов, Г.Ф. Монахос, Р.Д. Тивари // Известия ТСХА. - 1989. - вып.З. - С. 169-172.

6. Джалилов, Ф.С. Диагностика возбудителя сосудистого бактериоза капусты белокочанной иммунофлуоресцентным методом / Ф.С. Джалилов // Известия ТСХА. - 1986. - Вып. 2. - С. 139-140.

7. Джалилов, Ф.С. Диагностика зараженности семян капусты сосудистым бактериозом: Учебно-методическое пособие / Ф.С. Джалилов. - М.: Издательство МСХА., 1995. - 21с.

8. Джалилов, Ф.С. Иммуноферментная диагностика зараженности семян капусты возбудителем сосудистого бактериоза / Ф.С. Джалилов // Сельскохозяйственная биология. - 1987. -N 5. - С.48-50.

9. Джалилов, Ф.С. Источники инфекции при сосудистом бактериозе капусты / Ф.С. Джалилов, Р.Д. Тивари // Известия ТСХА. - 1990. - вып.2. - С. 101-105.

10. Джалилов, Ф.С. Методы изучения бактериальных болезней растений: Методические указания для научно-исследовательской работы студентов / Ф.С. Джалилов. -. M.: МСХА., 1989. - 26 С.

11. Джалилов, Ф.С. Почва и растительные остатки как источники инфекции при сосудистом бактериозе капусты / Ф.С. Джалилов, Р.Д. Тивари // Фитонциды. Бактериальные болезни растений. Материалы конференции. - Киев, Львов. - 1990. - Ч. 2. - С. 77-78.

12. Джалилов, Ф.С. Сравнение методов оценки устойчивости капусты к сосудистому бактериозу / Ф.С. Джалилов, И.В. Корсак, Г.Ф. Монахос // Известия ТСХА. - 1995. - вып.2. - С. 147-153.

13. Джалилов, Ф.С. Эффективность гидротермической обработки и протравливания семян капусты против сосудистого бактериоза /Ф.С. Джалилов, Р.Д. Тивари, Е.И. Андреева, C.B. Амосова, Н.И. Иванова // Известия ТСХА. -1989.-Т. 5. - С. 102-105.

14. Защита овощных культур и картофеля от болезней: Учебное пособие / А.К. Ахатов, Ф.С.Джалилов, О.О.Белошапкина и др.; под ред. А.К. Ахатова. - Москва, 2006. - 352с.

15. Иванюк В.Г.; Сильванович H.A. Сосудистый бактериоз белокочанной капусты в Белоруссии / В.Г. Иванюк; H.A. Сильванович // Овощеводство. - 1991. - Т. 8. с. 94-98.

16. Иванюк, В.Г. Эпифитотиология сосудистого бактериоза капусты / В.Г. Иванюк, H.A. Сильванович // Известия АН БССР. - 1990. - №4. - С. 58-63.

17. Игнатов А.Н. Распространение возбудителей опасных бактериозов растений в Российской Федерации / А.Н. Игнатов // Материалы международной научно-практической конференции «Бактериальные и фитоплазменные болезни сельскохозяйственных растений (Московская обл., Одинцовский р-н, п. Большие

Вяземы, ВНИИ фитопатологии, 15-18 октября 2014 г.) Защита картофеля. - 2014. -№ 2. - С. 53-57.

18. Игнатов, А.Н. Генетическое разнообразие фитопатогенных бактерий Xanthomonas campestris и устойчивость к ним растений семейства Brassicaceae: автореф. дис. ... док. биол. наук: 06.01.11 / Игнатов Александр Николаевич. - М., 2006. - 44 с.

19. Игнатов, А.Н. Количественный анализ серологических признаков Xanthomonas campestris / А.Н. Игнатов, К.Л Поляков, А.Н.Самохвалов // Сельскохозяйственная биология. - 1998. - №1. - С.106-115.

20. Игнатов, А.Н. Патоген крестоцветных Xanthomonas campestris. О создании устойчивых к ксантомонадам растений семейства Brassicacea / А.Н. Игнатов, Я. Кугунуки, К. Хида, Г.Ф. Монахос, Ф.С. Джалилов // Сельскохозяйственная биология. - 2002. - № 5. - С. 75-84.

21. Игнатов, А.Н. Появление расы 0 в результате спонтанной мутации изолята расы 1 Xanthomonas campestris pv. campestris — возбудителя сосудистого бактериоза крестоцветных / А.Н. Игнатов, Г.Ф. Монахос, Ф.С. Джалилов // Известия ТСХА. - 2000. - Вып. 4. - С. 71-75.

22. Лизгунова, Т.В. Капуста / Т.В.Лизгунова // Культурная флора СССР / Подред. Д.Д.Брежнева и О.Н.Коровина.- Л. Колос. Ленингр. отделение, 1984. -328с.

23. Мазурин, Е.С. Методы диагностики возбудителя сосудистого бактериоза капусты и меры защиты: автореф. дис. ... канд. биол. наук: 06.01.11 / Мазурин Евгений Сергеевич. - М., 2009. - 22 с.

24. Маланкина, ЕЛ. Лекарственные растения на приусадебном участке / ЕЛ.Маланкина. - М.: Фитон. - 2007. - 271 с.

25. Матвеева Е.В. Фитобактериомицин против бактериозов капусты / Е.В. Матвеева, А.П. Пивина, В.Д. Лободюк // Картофель и овощи. - 1984. - N 4. -С.32.

26. Методы общей бактериологии: Учебно-методическое пособие / Под ред. Ф. Герхарда. - М.: Мир. - 1983. - Т 1 - 536 с.

27. Монахос, Г.Ф. Источник моногенной устойчивости капусты к сосудистому бактериозу / Г.Ф. Монахос, Ф.С. Джалилов // Известия ТСХА. 1995. -Вып. 4.-С, - 147-152.

28. Петру шина, А. Д. Использование ингаляции эфирными маслами в комплексной терапии и для профилактики ОРВИ у детей / А. Д. Петрушина, A.C. Никогосян, И.Д. Кайб, JI.A. Мальченко, С.А. Ушакова // Вопросы педиатрии. -2012.-Т. 11.-№2.-С. 180-183.

29. Пивоваров, В.Ф. Основные направления и результаты селекции и семеноводства капустных культур во ВНИИССОК / В.Ф. Пивоваров, JI.JI. Бондарева // Овощи России. - 2013 - № 3(20). - С.4-9.

30. Лунина Н. В. Оценка генетического разнообразия фитопатогенных бактерий рода Xanthomonas и разработка молекулярных маркеров для их диагностики: автореф. дис. ... канд. биол. наук: 03.00.07 / Пунина Наталия Владимировна. - М., 2009. - 27 с.

31. Самохвалов, А.Н. Гидротермическая обработка семян капусты / А.Н. Самохвалов // Защита растений. - 1987. - №2. - С.38.

32. Самохвалов, А.Н. Против бактериозов капусты / А.Н. Самохвалов // Защита растений. - 1983. - Т. 3. - С.52-53.

33. Сигитов, А.О. Термохимический способ обработки семян капусты против сосудистого бактериоза / А.О. Сигитов, A.A. Джаймурзина, Р.Д. Карбозова // Материалы республиканской научно-практической конференции по картофелеводству и овощеводстве в Казахстане, пос. Кайнар. - 1997. - С.46-47.

34. Сильванович, H.A. О методах определения устойчивости капусты к сосудистому бактериозу / H.A. Сильванович, В.Г. Иванюк // Селекция и семеноводство. - 1991. - №4. - С. 19-20.

35. Сильванович, H.A. Сосудистый бактериоз капусты и пути снижения его вредоносности: автореф. дис. ... канд. биол. наук. / Сильванович Николай Андреевич. - п. Самохваловичи, Минской области. - 1989. - 21с.

36. Студенцов, О.В. Устойчивость коллекционных сортов капусты к сосудистому бактериозу в предгорной зоне Северного Кавказа / О.В. Студенцов,

Н.Н. Петровская // Бюллетень ВНИИ растениеводства. - 1981. - вып. 111. - С.45-48.

37. Сухорукова, Н.С. Методика оценки и селекционного отбора белокочанной капусты на устойчивость к сосудистому бактериозу: автореф. дисс... канд. с.-х.наук. / Сухорукова Н.С. // Москва. - 1987. - 16с.

38. Тивари, Р.Д. Биологические обоснования приемов защиты капусты от сосудистого бактериоза: автореферат дисс... канд. биол.наук.: 06.01.11 / Тивари Рам Део. - Москва. - 1989. - 22с.

39. Ячевский, А.А. Бактериозы растений / А.А. Ячевский. - M.-JL: Сельхозгиз. - 1935. - 372 С.

40. Adriaenssens, Е. М. T4-related bacteriophage LIME stone isolates for the control of soft rot on potato caused by "Dickeya solanГ / E. M. Adriaenssens, J. V. Vaerenbergh, D. Vandenheuvel., V. Dunon, P. Ceyssens, M. D. Pro ft, A. M. Kropinski, J. P. Noben, M. Maes, R. Lavigne // PLoS ONE. - 2012. - Vol. 7. - № 3. - P. 1-10.

41. Agrios, N.G. Plant Pathology (Fifth Edition) / N.G. Agrios // Elsevier Academic Press, Burlington, USA, San Diego, California, USA, London, UK, 2005. -925p.

42. Ah-You, N. Polyphasic characterization of Xanthomonads pathogenic to Anacardiaceae and their relatedness to different Xanthomonas species / N. Ah-You, L. Gagnevin, P.A.D. Grimont, S. Brisse, X. Nesme, F. Chiroleu, L. Bui Thi Ngoc, E. Jouen, P. Lefeuvre // Int J Syst Evol Microbiol. - 2009. - V. 59. - P. 306-318.

43. Alexander, S. Bacteriophage Therapy /S. Alexander, A. Zemphira, M. J. Jr. Glenn // Antimicrob Agents Chemotherapy. - 2001. - № 45(3). - P. 649-659.

44. Alshia, J.L. Copper resistance in Xanthomonas campestris pv. campestris affecting crucifers in Trinidad / J.L. Alshia, E. Winston, B.J. Jeffrey, R. Adash // Eur J Plant Pathol.-2013.-V. 136.-P. 61-70.

45. Alvarez, A.M. Identification of Xanthomonads and grouping of strains of ч Xanthomonas campestris pv. campestris with monoclonal antibodies / A.M. Alvarez,

A.A. Benedict, C.Y. Mizumoto // Phytopathology. - 1985. - № 75. - P. 722-728.

46. Alvarez, A.M. Serological, pathological, and genetic diversity among strains of Xanthomonas campestris infecting crucifers / A.M. Alvarez, A.A. Benedict,

C.Y. Mizumoto, J. E. Hunter, D.W. Gabriel // Phytopathology. - 1994. - №.84. -P. 1449-1457.

47. Arias, R.S. Effect of soil-matric potential and phylloplanes of rotation-crops on the survival of a bioluminescent Xanthomonas campestris pv. campestris /R.S. Arias, S.C. Nelson, A.M. Alvarez // Eur J Plant Pathol. - 2000. - V. 106. - P. 109-116.

48. Arsenijevic, M. Bacterial diseases of plants (second amended and revised edition): Scientific Book / M. Arsenijevic. - Belgrade, 1988.

49. Bain, D. Resistance of cabbage to black rot / D. Bain // Phytopathology. -.1955. -V.45.- P. 35-37.

50. Bain, D.C. Disappearance of blackrot symptoms in cabbage seedlings /

D.C. Bain // Phytopathology. -1955. - V.45. - P. 55-56.

51. Bain, D.C. Reaction of brassica seedlings to blackrot / D.C. Bain // Phytopathology. - 1952. -V. 42. - P. 316-319.

52. Bajpai, V. K. Antibacterial activity of essential oil and extracts of Cleistocalyx operculatus buds against the bacteria of Xanthomonas spp. / V. K. Bajpai, N. T. Dung, H. J. Suh, S. C. Kang // Journal of the American Oil Chemists' Society. -2010a. - № 87. -P. 1341-1349.

53. Bajpai, V. K. Control of plant pathogenic bacteria of Xanthomonas spp. by the essential oil and extracts of Metasequoia glyptostroboides Miki ex Hu in vitro and in vivo / V. K. Bajpai, M. J. Cho, S. C. Kang // Journal of phytopathol. - 2010b. -V. 158. - P. 479-486.

54. Balaz, J. Bacterial diseases of brassicas / J. Balaz // Plant Protection. -2001.-V. 29. -№ 6.-P. 555-559.

55. Balaz, J. Seeds as a source of primary inoculum for Bacterial diseases of vegetables and integrated protection measures / Balaz J. // Pesticides and Phytomedicine. - 2005. - V. 20. - № 2. - P. 79-88.

56. Balaz, J. Some current problems of bacterial blight and vegetables their control. A summary of the seminar papers XIII plant protection Vojvodina, Arandelovac. - 1989. - P. 74-75.

57. Balogh, B. Characterization and use of bacteriophages associated with citrus bacterial pathogens for disease control. PhD Dissertation / Balogh Botond. -Gainesville, FL: University of Florida, 2006. - 112 p.

58. Balogh, B. Control of citrus canker and citrus bacterial spot with bacteriophages / B. Balogh, B. I. Canteros, R. E. Stall, J. B. Jones // Plant Disease. -2008. - V. 92. - № 7. - P. 1048-1052.

59. Balogh, B. Improved efficacy of newly formulated bacteriophages for management of bacterial spot on tomato / B. Balogh, J. B. Jones, M. T. Momol // Plant Disease. - 2003. - Vol. 87. - № 8. - P. 949-954.

60. Bazzi, C. Seed-transmission of phytopathogenic bacteria / C. Bazzi // Petria. - 1991. - V. 1 (Suppl.l). - P.19-30.

61. Bergey, D.H. Bergey's Manual of Systematic Bacteriology / D.H. Bergey, Noel R.K., John G.H. - Williams & Wilkins, 1984. - 2648p.

62. Bila, J. Status of Bacterial Black rot of Brassicas in Southern Region of Mozambique: Survey, Detection and Identification of the Causal Agent Xanthomonas campestris pv. campestris / J. Bila // M.Sc. thesis, University of Copenhagen, Denmark. -2008. - P. 102.

63. Bila, J. Xanthomonas campestris pv. campestris race 1 is the main causal agent of black rot of Brassicas in Southern Mozambique / J. Bila, C. N. Mortensen, M. Andresen, J. G. Vicente, E. G. Wulff// African Journal of Biotechnology. - 2013. - V. 12. -№ 6.-P. 602-610.

64. Boule, J. Isolation and characterization of eight bacteriophages infecting Erwinia amylovora and their potential as biological control agents in British Columbia, Canada / J. Boule, P. L. Sholberg, S. M. Lehman, D. T. Ogorman, A. M. Svircev // Canadian Journal of Plant Pathology. - 2011. - V. 33. - № 3. - P. 308-317.

65. Bradbury, J. F. Guide to plant pathogenic bacteria / J. F. Bradbury. -Wallingford: UK. - CAB International, 1986. - 332 p.

66. Brita, D.J. Occurrence and Diversity of Xanthomonas campestris pv. campestris in Vegetable Brassica Fields in Nepal / Brita D.J., J.G. Vicente, H.K. Manandhar, S.J. Roberts // Plant Dis. - 2010. - V. 94. - P. 298-305.

67. Camargo, L.E.A. Mapping of quantitative trait loci controlling resistance of Brassica oleracea to Xanthomonas campestris pv. campestris in field and greenhouse / L.E.A. Camargo, P.H. Williams, T.S. Osborn // Phytopathology. - 1995. - V. 85. - P. 1296-1300.

68. Castanieda, A. Mutagenesis of all eight avr genes in Xanthomonas campestris pv. campestris had no detected effect on pathogenicity but one avr gene affected race specificity / A. Castanieda, J.D. Reddy, B. El-Yacoubi, D.W. Gabriel // Mol. Plant Microbe Interact. - 2005. -V. 18. - P. 1306-1317.

69. Champoux, J.J. DNA topoisomerases: structure, function, and mechanism / J.J. Champoux // Annu. Rev. Biochem. - 2001. - V. 70. - P. 369-413.

70. Civerolo, E.L. Inhibition of bacterial spot of peach foliage by Xanthomonas pruni bacteriophage / E.L. Civerolo, H.L. Keil // Phytopathology. - 1969. -V. 59.-P. 1966-1967.

71. Clayton, E.E. Control of black-rot and black-leg of cruciferous crops by seed and seed bed treatments / E.E. Clayton // Phytopathology. -1924. - V. 14. - P.22-24.

72. Cook, A.A. Relation of the black rot pathogen to cabbage seed / A.A. Cook, R.H. Larson, J.C. Walker // Phytopathology. - 1952. - V. 42. - P.316-320.

73. Dickson, M. D. Juvenile black rot resistance in cabbage / M.D. Dickson, J.E. Hunter // C. Cruciferae Newsletter. - 1985. - V. 10. - P. 100.

74. Domen, H.Y. Detection of Xanthomonas campestris pv. campestris in soil using a direct immunofluorecence technique / H.Y. Domen, A.M. Alvarez // Conf. plant pathog. - 1978. - P. 301-305.

75. Dragana, R. Occurrence of Xanthomonas campestris pv. campestris (Pammel, 1895) Dowson 1939, on Brassicas in Montenegro / R. Dragana, B. Jelica // Pestic. Phytomed. Belgrade. - 2012. - V. 27. - № 2. - P. 131-140.

76. Dye, D.W. The inadequacy of the usual determinative tests for the identification of Xanthomonas spp. / D.W. Dye // New Zealand J Agric Sci. - 1962. -V. 5.-P. 393-416.

77. Fargier, E. Pathogenicity assays restrict the species Xanthomonas campestris into three pathovars and reveal nine races within X. campestris pv. campestris / E. Fargier, C. Manceau // Plant Pathology. - 2007. - V. 56. - P. 805-818.

78. Felsenstein, J. Confidence limits on phylogenies: An approach using the bootstrap / J. Felsenstein // Evolution. - 1985. - № 39. - P. 783-791.

79. Filomena, N. Effect of Essential Oils on Pathogenic Bacteria / N. Filomena F. Florinda, D. M. Laura, C. Raffaele, D. F. Vincenzo // Pharmaceuticals. -2013,-№6.-P. 1451-1474.

80. Flaherty, J. E. Control of bacterial spot on tomato in the greenhouse and field with H-mutant bacteriophages / J. E. Flaherty, J. B. Jones, B. K. Harbaugh, G. C. Somodi, L. E. Jackson // HortScience. - 2000. - V. 35. - № 5. - P. 882-884.

81. Franken, A. Application of polyclonal and monoclonal antibodies for the detection of Xanthomonas campestris pv. campestris in crucifer seeds using immunofluorescence microscopy / A. Franken // Netherlands Journal of Plant Pathology. - 1992. - V. 98. - P. 95-106.

82. Fujiwara, A. Biocontrol of Ralstonia solanacearum by treatment with lytic bacteriophages / A. Fujiwara, M. Fujisawa, R. Hamasaki, T. Kawasaki, M. Fujie, T. Yamada // Applied and Environmental Microbiology. - 2011. - Vol. 77. - № 12. - P. 4155 -4162.

83. Garcia-Ochoa, F. Xanthan gum: Production, recovery, and properties / F. Garcia-Ochoa, V.E. Santos, J.A. Casas, E. Gomez // Biotechnol Adv. - 2000. - V. 18. -P. 549-579.

84. Gasic, K. Isolation and characterization of Xanthomonas euvesicatoria bacteriophages / K. Gasic, M.M. Ivanovic, M. Ignjatov, A. Calic, A. Obradovic // Journal of Plant Pathology. - 2011. - Vol. 93 (2). - P. 415-423.

85. Gill, J. J. Bacteriophages of Erwinia amylovora / J. J. Gill, A. M. Svircev, R. Smith, A. J. Castle // Applied and Environmental Microbiology. - 2003. -Vol. 69. - № 4. - P. 2133-2138.

86. Goto, M. Fundamentals of bacterial plant pathology / M. Goto // San Diego, USA. Academic Press Inc. - 1992.

87. Guo, H. Brassica napus, Sources of resistance to black rot in crucifers and inheritance of resistance / H. Guo, M.H. Dickson, J.E. Hunter // Hortscience. -1991.-V. 26(12).-P. 1545-1547.

88. Gupta, D.K. Studies on black rot of cabbage in Manipur / D.K. Gupta. // Indian Journal of Mycology and Plant Pathology. - 1991. - V. 21. - C. 203-204.

89. Hauben, L. Comparison of 16s ribosomal DNA sequences of all Xanthomonas species / L. Hauben, L. Vauterin, J. Swing, E.R.B. Moore // Int. J. Syst. Bacteriol. - 1997.- V. 47. - P.328-335.

90. Heiander, I.M. Characterization of the action of selected essential oil components on Gram-negative bacteria / I.M. Heiander, H.L. Alakomi, K. Latva, T. Mattila-Sandholm, I. Pol, E.J. Smid, L.G.M. Gorris, A. Von-Wright // J. Agric. Food Chem. - 1998. - № 46. - P. 3590-3595.

91. Hetz, G.P. Evaluation of methods inoculating Xanthomonas campestris pv campestris for detecting sorses of resistans in brassicas / G.P. Hetz, A. Takatzu, F.J. Reifscheider // Fitobacteriologia Brasileira. - 1998. - V.13. - P.207-210.

92. Huang, W.M. Bacterial diversity based on type II DNA topoisomerase genes / Huang W.M. // Annu. Rev. Genet. - 1996. - V. 30. - P. 79-107.

93. Hunter, J.E. Observations on the source and spread of Xanthomonas campestris in an epidemic of black rot in New York / J.E. Hunter, G.S. Abawi, R.F. Becker // Plant Disease Reporter. - 1975. - V. 59. - № 5. - P. 384-387.

94. Hunter, J.E. Source of resistance to black rot of cabbage expressed in seedlings and adult plants / J.E. Hunter, M.H. Dickson, J.W. Ludwig // Plant Disease. -1987. - V. 71. - № 3. - P. 263-266.

95. Ignatov, A. Black rot of crucifers and sources of resistance in brassicas / A. Ignatov, Y. Kuginuki, K. Hida // Japanese Agricultural Research Quarterly. - 1998a. -V. 32.-P. 167-172.

96. Ignatov, A. Distribution and inheritance of race-specific resistance to Xanthomonas campestris pv. campestris in Brassica rapa and B. napus / A. Ignatov, Y. Kuginuki, K. J. Hidam // Russ. Phytopathol. Soc. - 2000. - № 1. - P. 89-94.

97. Ignatov, A. Genetic diversity in populations of Xanthomonas campestris pv. campestris in cruciferous weeds in central Coastal California / A. Ignatov, A. Sechler, E.L. Schuenzel, I. Agarkova, B. Oliver, A.K. Vidaver, N.W. Schaad // Phytopathology. - 2007. - V. 97. - P.803-812.

98. Ignatov, A. Race-specific reaction of resistance to black rot in Brassica oleracea / A. Ignatov, Y. Kuginuki, K. Hida // European J. Plant Pathol. - 1998b. -V. 104. - P. 821-827.

99. Ignatov, A. Variation of pathogenicity in Xanthomonas campestris pv. campestris in Japan / A. Ignatov, Y. Kuginuki, I. Kobayashi, H. Masuda, K. Yamada, K. Hida // J. J. Hort. Society. - 1997. - B.4 (Suppl.l). - C. 67-68.

100. Jensen, B. D. Occurrence and diversity of Xanthomonas campestris pv. campestris in vegetable Brassica fields in Nepal / B. D. Jensen, J. G. Vicente, H. K. Manandhar, S. J. Roberts // Plant Dis. - 2010. - V. 94. - P. 298-305.

101. Joel, F.P. MALDI-TOF mass spectrometry subspecies-level rapid resolution of the complete genus of phytopathogenic Xanthomonas / F.P. Joel, V. Pfltiger, M. Tonolla, G. Vogel, B. Duffy - Switzerland, 2009.

102. Johnson, J.R. Development of polymerase chain reaction- based assays for bacterial gene detection / J.R. Johnson // J. Microbiol.Methods. - 2000. - V. 41. - P. 201-209.

103. Kamoun, S. Incompatible interactions between crucifers and Xanthomonas campestris involve a vascular hypersensitive response: Role of the hrpX locus / S. Kamoun, H. V. Kamdar, E. Tola, C. I. Kado // Mol. Plant Microbe Interact. -1992. - V.5.-P. 22-23.

104. Keary, R. Bacteriophages and their endolysins for control of pathogenic bacteria Microbial pathogens and strategies for combating them: science, technology and education / R. Keary, O. McAuliffe, R.P. Ross, C. Hill, J. O'Mahony, A. Coffey // A. Mendez-Vilas, Ed. - P. 1208 - 1240.

105. Kennedy, B. W. Estimates of U.S. crop losses to procaryote plant pathogens / B.W. Kennedy, S.M. Alcorn // Plant Disease. - 1980. - V. 64. - № 7. - C. 674-676.

106. Kim, B. S. Testing for detection for Xanthomonas campestris pv. campestris in crucifer seeds and seed disifection / Kim B. S. // Korean J. Plant Pathology - 1986. - V.2. - № 2. - P. 96-101.

107. Knobloch, K. Action of terpenoids on energy metabolism / K. Knobloch, H. Weigand, N. Weis, H. M. Schwarm, H. Vigenschow // In: Brunke, E.J., Editor. Progress in Essential Oil Research: 16th International Symposium on Essential Oils, De Gruyter, Berlin. - 1986. - P. 429-445.

108. Kocks, C.G. Cabbage refuse piles as sources of inoculum in black rot epidemics / C.G. Kocks, J.C. Zadocks // Plant Disease. - 1996. - № 80. - P. 789-792.

109. Kocks, C.G. Spatiotemporal development of black rot (X. campestris pv. campestris) in cabbage in relation to initial inoculum levels in field plots in The Netherlands / C.G. Kocks, J.C. Zadoks, M.A. Ruissen // Plant Pathology. - 1999. - V. 48.-P. 176-188.

110. Kohl, J. Alternaria brassicicola and Xanthomonas campestris pv. campestris in organic seed production of Brassicae: Epidemiology and seed infection / J. Kohl, J. Wolf // Plant Research International. Wageningen, September, 2005. - 363 p.

111. Kotan, R. Antibacterial activity of essential oils extracted from some medicinal plants, carvacrol and thymol on Xanthomonas axonopodis pv. vesicatoria (Doidge) Dye causes bacterial spot disease on pepper and tomato / R. Kotan, F. Dadasoglu, S. Kordali, A. Cakir, N. Dikbas, R. Cakmakci // Journal of Agricultural Technology. - 2007. - Vol. 3. - № 2. - P. 299-306.

112. Kotila, J. E. Investigations on the blackleg disease of potato / J. E. Kotila, G. H. Coons // Michigan Agricultural Experimental Station Technical Bulletin. - 1925. -V. 67.-№3.-29 p.

113. Krauthausen, H. J. Methods to reduce the spread of the black rot pathogen, Xanthomonas campestris pv. campestris, in brassica transplants / H. J. Krauthausen, N. Laun, W. Wohanka // Journal of Plant Diseases and Protection. - 2011. -Vol. 118. -№ 1. - P. 7-16.

114. Kritzman, G. Control by metham-sodium of Xanthomonas campestris pv. campestris and the pathogen's survival in soil / G. Kritzman, Y. Ben-Yephet // Phytoparasitica. - 1996. - V. 18. - № 3. - P. 217-227.

«

115. Lambe, R.C. Controls for two important diseases: black rot and black leg of cabbage / R.C. Lambe, G.H. Lacy // American Vegetable Grower. - 1982. - V.30. -P. 10-12.

116. Lambert, R.J.W. A study of the minimum inhibitory concentration and mode of action of oregano essential oil, thymol and carvacrol / R.J.W. Lambert, P.N. Skandamis, P.J. Coote, G.J.E. Nychas // J. Appl. Microbiol. - 2001. - Vol. 9. - P. 453462.

117. Lang J. M. Management of Xanthomonas leaf blight of onion with bacteriophages and a plant activator / J. M Lang, D. H. Gent, H. F. Schwartz // Plant Disease. - 2007. - Vol. 91. - № 7. - P. 871-878.

118. Lehman, S. M. Development of a bacteriophage-based biopesticide for fire blight: Ph.D. biology thesis / Susan M. Lehman, B.Sc. - Brock University, St. Catharines, Canada, 2007. - 310 p.

119. Leite, R.M.V.B.C.,. Characterization of Xanthomonas campestris pv. campestris isolated from canola / R.M.V.B.C. Leite, O. Ruano, N. Komori // Summa Phytopathologica. - 1994. - V.20. - P. 35-38.

120. Lelliot, R.A. Methods for the diagnosis of bacterial diseases of plants / R.A. Lellio t, D.E. Stead // Oxford etc.: Blackweell sci. publ. - 1987. - 216 P.

121. Lema, M. Discrimination of Xanthomonas campestris pv. campestris races among strains from northwestern Spain by Brassica spp. genotypes and rep-PCR /

M. Lema, M.E. Cartea, T. Sotelo, P. Velasco, P. Soengas // European Journal of Plant Pathology. - 2012. - V. 133. - P. 159-169.

122. Lema, M. Identification of Sources of Resistance to Xanthomonas campestris pv. campestris in Brassica napus Crops / M. Lema, P. Soengas, P. Velasco, M. Francisco, M. E. Cartea // Plant Dis. - 2011. - V. 95. - P. 292-297.

123. Lenka, S. A note on the efficacy in vivo of various antibiotics and fungicide chemicals against Xanthomonas campestris pv. campestris causing black rot of cauliflower / S. Lenka, S. Ram // Orissa Journal of Horticulture. - 1997. - Vol. 25. -№ l.-P. 90-92.

124. Leu, Y.S. Multiplex polymerase chain reaction for simultaneous detection of Xanthomonas campestris pv. campestris and X. campestris pv. raphani / Leu, Y. S. W.L. Deng, W.S.Yang, Y.F. Wu, A.S. Cheng, S.T. Hsu, K.C. Tzeng // Plant Pathology Bulletin. - 2010. - V. 19. - P. 137-147.

125. Liew, K.W. Biological and morphological characterization of Xanthomonas campestris bacteriophages / K.W. Liew, A.M. Alvarez // Phythopathology. - 1981. - V. 71. - P. 269-273.

126. Lindeberg, M. Roadmap to new virulence determinants in Pseudomonas syringae: insights from comparative genomics and genome organization / M. Lindeberg, C. Myers, A. Collmer, D. Schneider // Mol PlantMicrobe Interact. - 2008. -V. 21.-P. 685-700.

127. Lizyben, C. Characterisation of Xanthomonas campestris pv. campestris isolates from South Africa using genomic DNA fingerprinting and pathogenicity tests / C. Lizyben, Cornelius C.B. // Eur J Plant Pathol. - 2012. - V. 133. - P. 811-818.

128. Lopez, M.M. Innovative tools for detection of plant pathogenic viruses and bacteria / M.M. Lopez, E. Bertolini, A. Olmos, P. Caruso, M.T. Gorris, P. Llop, R. Penyalver, M. Cambra // Int. Microbiol. - 2003. - V. 6. - P. 233-243.

129. Lopez, R. Phenotypic and genetic diversity in strains of common blight bacteria {Xanthomonas campestris pv. phaseoli and X. campestris pv. phaseoli var. fuscans) in a secondary center of diversity of the common bean host suggests multiple

introduction events / R. Lopez, C. Asensio, R.L. Gilbertson //. Phytopathology. - 2006. -V. 96.-P. 1204-1213.

130. Mallmann, W.L. Isolation of an inhibitory substance from plants / W.L. Mallmann, C.J. Hemstreet // Agricultural Research. - 1924. - V. 28. - № 6599. - P. 602.

131. Massomo, S.M.S. Identification and characterisation of Xanthomonas campestris pv. campestris strains from Tanzania by pathogenicity tests, Biolog, rep-PCR and fatty acid methyl ester analysis / S.M.S. Massomo, H. Nielsen, R.B. Mabagala, K. Mansfeld-Giese, J. Hockenhull, C.N. Mortensen // European Journal of Plant Pathology. - 2003. - V. 109. - P. 775-789.

132. Matsumoto, T.T. Crucifers. Seed field phytosanitary certification training aid and plant pathological study notes for significant seed-borne diseases / T.T. Matsumoto // State of California, Department of Food and Agriculture. Division of Plant Industry Exclusion and Detection. CRR-C-1-2. 1975.

133. McCuloch, L.A. A bacterial leaf spot of horse-radish caused by Bacterium campestris var. Armoraciae / L.A. McCuloch // N.Var J.Agr. Res. - 1929. -V. 38. - P. 269-287.

134. Mckeen W.E. Black rot of rutabaga in Ontario and its control / W.E. Mckeen // Canadian Journal of Plant Pathology. - 1981. - V. 3. - P.244-246.

135. McKenna, F. Novel in vivo use of a polyvalent Streptomyces phage to disinfest Streptomyces scabies-infected seed potatoes / F. McKenna, K. A. El-Tarabily, G. E. S. T. J. Hardy, B. Dell // Plant Pathology. - 2001. - Vol. 50. - № 6. - P. 666-675.

136. McNeil, D. L. Bacteriophages: a potential biocontrol agent against walnut blight (Xanthomonas campestris pv. juglandis) / D. L. McNeil, S. Romero, J. Kandula, C. Stark, A. Stewart, S. Larsen // New Zealand Plant Protection. - 2001. - Vol. 54. - P. 220-224.

137. Mguni, C.M. Bacterial black rot (Xanthomonas campestris pv. campestris) of vegetable brassicas in Zimbabwe: Ph.D. Thesis / C.M. Mguni. - The Royal Veterinary and Agricultural University, Copenhagen, Denmark. -1996. - 144 p.

138. Mguni, C.M. Biological control of bacteria black rot of cabbage. -C. isolation and screening of antagonists to the pathogen, Xanthomonas campestris pv. campestris / C.M. Mguni, J. Hockenhull, C.N. Mortensen, C.L. Keswani // IX International Conference on Plant Pathogenic Bacteria, August 26-29, 1996. Centre for Advanced Study in Botany, University of Madras, Guindy Campus, Madras, India.

139. Mijuskovic, M. Plant diseases in the People's Republic of Montenegro in 1949 year. Contributions to the study of plant diseases in Montenegro / M. Mijuskovic // Montenegrin Academy of Sciences and Arts, Podgorica, 2002.

140. Miyazawa, M. Composition of the essential oil from the leaves of Eruca sativa / M. Miyazawa, T. Maehara, K. Kurose // Flavour and Fragrance Journal. - 2002. -V. 17.-P. 187-190.

141. Moore, E.R. 16S rRNA gene sequence analyses and inter- and intrageneric relationships of Xanthomonas species and Stenotrophomomas maltophilia / E.R. Moore, A.S. Kruger, I. Hauben, S.E. Seal, M.J. Dainiels, D.R. Baere, D.R. Wachter, K.N. Timmis, Swings // FEMS Microbiol. Lett. - 1997. - V. 151. - P. 145-153.

142. Morris, E.R. Molecular origin of Xanthan solution properties / E.R. Morris // In. -C. Sandford PAS, Lankins A, eds. Extracellular Microbial Polysaccarides Symposium 45, Washington, D.C., USA. - 1977. - P.81-83.

143. Mulema, J.K. Characterisation of isolates that cause black rot of crucifers in East Africa / J.K. Mulema, J.G. Vicente, D.A.C. Pink, A. Jackson, D.O. Chacha, L. Wasilwa, Z.M. Kinyua, D.K. Karanja, E.B. Holub, P. Hand. // European Journal of Plant Pathology.-2012.-V. 133. -№2.-P. 427-438.

144. Napoles, P. The use of different treatments to control Xanthomonas campestris pv. campestris in cabbage seeds / P. Napoles, Z. Amat, P. Ramirez // Proteccion de Plantas. - 1991. - Vol. 1. - № 34. - P. 33-41.

145. Nazir, A.B. Pathogenicity and host range of Xanthomonas campestris pv. campestris - incitant of black rot of crucifers / A. B. Nazir, S. Nusrath, K. A. Bhat, S.A. Mir // Journal of Phytology. -2010.-V.2.-№10.-P.01-05.

146. Neergaard, P. Seed Pathology / Neergaard, P. The MacMillan Press Ltd., London, 1979. - Vol. 1-2. - 1191p.

147. Nei, M. Molecular Evolution and Phylogenetics / M. Ne, S. Kumar // Oxford University Press, New York. - 2000.

148. Nemeth, J. Bacterial black rot (Xanthomonas campestris (Pammel) Dowson 1939) of Brassica species / J. Nemeth, E.M. Laszlo // Novenyvedelem. - 1983. -V. 19.-№.-9.-C. 391-397.

149. Nguefack, J. Evaluation of five essential oils from aromatic plants of Cameroon for controlling seed borne bacteria of rice (Oryza sativa L.) / J. Nguefack, I. Somda, C.N. Mortensen, A. Zollo // Seed science and technology. - 2005. - V. 33. - P. 397-407.

150. Oboo, H. Effect of selected essential oil plants on bacterial wilt disease development in potatoes / H. Oboo, A.W. Muia, Z.M. Kinyua // Journal of Applied Biosciences. - 2014. - Vol. 78. - P. 6666 - 6674.

151. Obradovic, A. Bacterial diseases of brassicas / A. Obradovic // The vegetable Contemporary. - 2010. - V. 9. - № 36. - P. 27-30.

152. Obradovic, A. First report of black rot of cauliflower and cale caused by Xanthomonas campestris pv campestris in Yugoslavia / A. Obradovic, M. Arsenijevic, T. Draizera // Plant Disease. - 1999. - V.83. - P. 109-165.

153. Obradovic, A. Integration of biological control agents and systemic acquired resistance inducers against bacterial spot on tomato / A. Obradovic, J.B. Jones, M.T. Momol // Plant Disease. - 2005. - Vol.89. - № 7. - P. 712-716.

154. Obradovic, A. Management of tomato bacterial spot in the field by foliar applications of bacteriophages and SAR inducers / A. Obradovic, J.B. Jones, M. T. Momol, B. Balogh, S.M. Olson // Plant Disease. - 2004. - Vol. 88. - № 7. - P. 736-740.

155. Obradovic, A. Xanthomonas campestris pv. campestris pathogen of brassicas in Serbia / A. Obradovic, M. Arsenijevic, M. Ivanovic // Plant Protection. -2000. - V. 51 (233-234). - P. 255-267.

156. Pammel, L.H. Bacteriosis of rutabaga (Bacillus campestris n sp.) / L.H. Pammel // Am Mon Microscopical J. - 1895a. -V. 16. - P. 145-151.

157. Pammel, L.H. Bacteriosis of rutabaga (Bacillus campestris n. sp.) / L.H. Pammel // Iowa State Coll Agric Exp Stn Bull. - 1895b. - V. 27. - P. 130-134.

158. Parkinson, N. Phylogenetic analysis of Xanthomonas species by comparison of partial gyrase B gene sequences / N. Parkinson, V. Aritua, J. Heeney, C. Cowie, J.D. Bew, D. Stead // Int. J. of Syst. and Evol. Microbiology. - 2007. - V. 57. -P. 2881-2887.

159. Pietro, I.C. Antibacterial activity of essential oil components and their potential use in seed disinfection / I.C. Pietro, S. Vellasamy, S.I. Nicola // J. Agric. Food Chem. - 2009. - V. 57. - P. 9454-9461.

160. Pradhanang, P.M. Effects of plant essential oils on Ralstonia solanacearum population density and bacterial wilt incidence in Tomato / P. M. Pradhanang, M.T. Momol, S.M. Olson, J. B. Jones // Plant Dis. - 2003. - V. 87. - P. 423-427.

161. Qian, W. Comparative and functional genomic analyses of the pathogenicity of phytopathogen Xanthomonas campestris pv. campestris / W. Qian, Y. Jia, S.X. Ren, Y.Q. He, J.X. Feng, L.F. Lu, Q. Sun, G. Ying, D.J. Tang, H. Tang, W. Wu, P. Hao, L. Wang, B.L. Jiang, S. Zeng, W.Y. Gu, G. Lu, L. Rong, Y. Tian, Z. Yao, G. Fu, B. Chen, R. Fang, B. Qiang, Z. Chen, G.P. Zhao, J.L. Tang, C. He // Genome Res.-2005.-V. 15.-P. 757-767.

162. Randhawa, P. Selective isolation of Xanthomonas campestris pv. campestris from crucifer seeds / P. Randhawa, N.W. Schaad // Phytopathology. - 1984. - V. 68. - P. 249-252.

163. Ravensdale, M. Bacteriophages and the control of Erwinia carotovora subsp. carotovora / M. Ravensdale, T. J. Blom, J. A. Gracia-Garza, A. M. Svircev, R. J. Smith // Canadian Journal of Plant Pathology. - 2007. - Vol. 29. - № 2. - P. 121-130.

164. Robert, C. Isolation and characterization of novel soil-borne lytic bacteriophages infecting Dickeya spp. biovar 3 (D. solani) / C. Robert, O. Zofia, L. Ewa // Pathology Section Meeting. Jerusalem, Israel. - 2013. - 17-24 november.

165. Roberts, I.N. Antiserum against Xanthomonas phytopathogen inhibits host-pathogen interaction in seedlings of Brassica campestris / I.N. Roberts, J.M. Dow, K.Y. Lum, G. Scofield, C.E. Barber, M.J. Daniels // FEMS Microbiology Letters. -1987. - V. 44. - № 3. - P. 383-387.

166. Roberts, S.J. Detection of Xanthomonas campestris pv. campestris on Brassica spp. In International Rules for Seed Testing / S.J. Roberts, H. Koenraadt // Bassersdorf, Switzerland, International Seed Testing Association (ISTA). - 2006. - P. 1-16.

167. Roberts, S.J. Modelling the spread of Xanthomonas campestris pv. campestris in module-raised brassica transplants / S.J. Roberts, J. Brough, P.J. Hunter // Plant Pathology. - 2007. - V. 56. - P. 391-401.

168. Rondon, M.R. Cloning the soil metagenome: a strategy for accessing the genetic and functional diversity of uncultured microorganisms / M.R. Rondon, P.R. August, A.D. Bettermann // Appl. Environ. Microbiol. - 2000. - V. 66. -P. 2541-2547.

169. Roohie, R.K. Development of multiplex PCR for the specific detection of Xanthomonas campestris pv. campestris in Cabbage and correlation with disease incidence / R.K. Roohie, S. Umesha // J Plant Pathol Microb. -2012. - V. 3. - № 4. - P. 1-9.

170. Russell, H.L. A bacterial rot of cabbage and allied plants / H.L. Russell // Wis. Agric. Exp. Stn. Bull. - 1898. - V. 65. - P. 1-39.

171. Russo, N.L. Isolation of streptomycin-resistant isolates of Erwinia amylovora in New York / N.L. Russo, T.J. Burr, D.I. Breth, H.S. Aldwinckle // Plant Disease. - 2008. - V.92. - P. 714-718.

172. Rzhetsky, A. A simple method for estimating and testing minimum evolution trees / A. Rzhetsky, M.Nei // Molecular Biology and Evolution. - 1992. - № 9.-P. 945-967.

173. Saccardi, A. Xanthomonas campestris pv. pruni control trials with phage treatments on peaches in the orchard / A. Saccardi, E. Gambin, M. Zaccardelli, G. Barone, U. Mazzucchi // Phytopathologia Mediterranea. - 1993. - Vol. 32. - P. 206210.

174. Saitou, N. The neighbor-joining method: A new method for reconstructing phylogenetic trees / N. Saitou, M. Nei // Molecular Biology and Evolution. - 1987. - № 4. - P. 406-425.

175. Santiranjan, B. Survival of Xanthomonas campestris pv. campestris in soil / B. Santiranjan, S.B. Chattopadhyay // Indian Journal of Mycological Research. -1986.-V. 24. -№2. -P. 97-101.

176. Schaad, N.W. A qualitative method for detecting Xanthomonas campestris in crucifer seed / N.W. Schaad, R. Kendrick // Phytopathology. -1975. - V. 65. - № 9. - P.1034-1036.

177. Schaad, N.W. Black rot of crucifers in Thailand / N.W. Schaad, N. Thaveechai//Plant Disease. - 1983. -V. 67. - № 11. - P.1231-1234.

178. Schaad, N.W. Cruciferous weeds as sources of inoculum of Xanthomonas campestris in black rot of crucifers / N.W. Schaad, J.C. Dianese // Phytopathology. - 1981. - V. 71. - № 11. - P.1215-1220.

179. Schaad, N.W. Survival of Xanthomonas campestris in soil / N.W. Schaad, W.C. White // Phytopathology. - 1974. - V. 64. - №12. - P. 1518-1520.

180. Schaad, N.W. Xanthomonas campestris pv. campestris: cause of black rot of crucifers. In Xanthomonas Swings, J.G., and Civerolo, E.L., eds / N.W. Schaad, A. Alvarez // London: Chapman & Hall. - 1993. - P. 51-55.

181. Schaad, N.W., 1989. Detection of Xanthomonas campestris pv. campestris in crucifers / Schaad N.W., Roth D.A.// Detection of Plant Pathogenic Bacteria in Seeds and Other Planting Materials. St. Paul, MN, USA. -C. APS Press. -1989.-P. 68-75.

182. Schnabel, E.L. Isolation and characterization of five Erwinia amylovora bacteriophages and assessment of phage resistance in strains of Erwinia amylovora / E.L. Schnabel, A. L. Jones // Applied and Environmental Microbiology. - 2001. - Vol. 67. -№ 1. - P. 59-64.

183. Schultz, T. Control of Xcc in Crucifer seed with slurry treatments of calcium hypochlorite / T. Schultz, R.L. Gabrielson // Plant disease. - 1986. - V. 70. - P. 1027-1030.

184. Sharma, J. Detection of Xanthomonas campestris pv. campestris (Pammel) Dowson infection in rape and mustard seeds / J. Sharma, K. Agrawal, D. Singh // Seed Research. - 1992. - V. 20. - P. 128-133.

185. Sherf, A.F. Vegetable diseases and their control / A.F. Sherf, A.A. MacNab // Vegetable diseases and their control. - 1986. - Ed. 2. - 728 p.

186. Shiomi, T. Dry heat sterilization for seed stain of cabbage black rot disease / T. Shiomi // Agriculture and Horticulture. - 1991. - V. 66. № 10. - P. 11771180.

187. Shrestha, K.A. List of seed-borne organisms in Nepal / K. Shrestha // Nepalese J Agrie. - 1997. - V. 12. - P. 217-224.

188. Shy am, K.R. Prevalence of different types of curd rots and extent of yield loss due to plant mortlity in cauliflower seed crop / K.R. Shy am, S.K. Gupta, R.K. Mandraia // Indian Journal of Mycology and Plant Pathology. - 1994. - V. 24. - C. 172175.

189. Sikkema, J. Mechanisms of membrane toxicity of hydrocarbons / J. Sikkema, J. A. M. De Bont, B. Poolman // Microbiol. Rev. - 1995. - V. 59. - P. 201-222.

190. Silvina, R.S. Expression, purification and biochemical characterization of GumI, a monotopic membrane GDP-mannose:glycolipid 4-p-D-mannosyltransferase from Xanthomonas campestris pv.campestris / R.S. Silvina, I.B. María, B. Máximo, I. Luis // Glycobiologyvol. - 2011. - V. 21. - № 7. - P. 903-913.

191. Smith, E.F. The black rot of the cabbage / E.F. Smith //US Dep. Agrie. Farmer's Bull. - 1898,-V. 68.-P. 1-21.

192. Starr, M.P. Chemotaxonomic significance of the Xanthomonadins, novel brominated aryl-polyene pigments produced by bacteria of the genus Xanthomonas / M.P. Starr, C.L. Jenkins, L.B. Bussey, A.G. Andrewes // Archives of Microbiology. -1977.-V. 113. - № 1/2.-C. 1-9.

193. Stéphanie, B. Genome sequence of Xanthomonas campestris pv. campestris strain Xca5 / B. Stéphanie, G. Endrick, C. Sébastien, B. Valérie, A. Matthieu, D.N. Laurent // Genome Announc. - 2013. - Volume 1 Issue 1. - P. 1-2

194. Stonier, T. Agrobacterium tumefaciens Conn. IV. Bacteriophage PB21 and its inhibitory effect on tumor induction / T. Stonier, J. McSharry, T. Speitel // Journal of Virology. - 1967. - Vol. 1. - № 2 - P. 268-273.

195. Strandberg, J. Spatial distribution of cabbage black rot and the estimation of diseased plant populations / J. Strandberg // Phytopathology. - 1973. - V. 63. - № 8. -P.998-1003.

196. Summers, W.C. Bacteriophage research: early history / W.C. Summers // In: Kutter E, SulakvelidzeA, ed(s). Bacteriophages: Biology and Applications. Boca Raton, FL: CRC Press, 2005. - P. 5-28.

197. Svircev, A.M. Control of the fire blight pathogen with bacteriophages / A.M. Svircev, S.M. Lehman, W.S. Kim, E. Barszcz, K.E. Schneider, A.J. Castle // In: Zeller W, Ullrich C, eds. Proc 1st Int Symp Biol Control Bact Plant Dis, Berlin, Germany: Die Deutsche Bibliothek - CIP-Einheitsaufnahme. - 2005. - October 23-26.

- P.259-261.

198. Taguchi, G. Introduction to off-line quality control / G. Taguchi, Y. Wu // Japan Quality Control Organisation. Nagoya. Japan. - 1980. - 111 p.

199. Tamura, K. MEGA6: Molecular evolutionary genetics analysis version 6.0 / K. Tamura, G. Stecher, D. Peterson, A. Filipski, S. Kumar // Molecular Biology and Evolution. - 2013. - № 30. - P. 2725-2729.

200. Tamura, K. Prospects for inferring very large phylogenies by using the neighbor-joining method / K. Tamura, M. Nei, S. Kumar // Proceedings of the National Academy of Sciences (USA). - 2004. - № 101. - P. 11030-11035.

201. Tanaka, H. N. Control of tobacco bacterial wilt by an avirulent strain of Pseudomonas solanacearum M4S and its bacteriophage / H. N. Tanaka, H. Maeda // Annals of the Phytopathological Society of Japan. - 1990. - Vol. 56. - № 2. - P. 243246.

202. Tatjana, P. Phenotypic and genotypic characterization of Xanthomonas campestris strains isolated from cabbage, kale and broccoli / P. Tatjana, J. Dragana, S. Mira P. Milovanovic, N. Dolovac, D. Postic, S. Stankovic // Arch. Biol. Sci., Belgrade.

- 2013. - V 65. - № 2. - P. 585-593.

203. Tatusova, T. Update on RefSeq microbial genomes resources / Tatusova T., S. Ciufo, S. Federhen, B. Fedorov, R. McVeigh, K. O'Neill, I. Tolstoy, L. Zaslavsky // Nucleic Acids Research. - 2014. - P 1-7.

204. Taylor, J.D. Sources and origin of resistance to Xanthomonas campestris pv. campestris in Brassica genomes / J.D. Taylor, J. Conway, S.J. Roberts, D. Astley, J.G. Vicente // Phytopathology. - 2002. - V. 92. - P. 105-111.

205. Thomas, R.C. A bacteriophage in relation to Stewart's disease of corn / R.C. Thomas // Phytopathology. - 1935. - № 25. - P. 371-372.

206. Tika, B. A. Phenotypic characteristics of Xanthomonas campestris pv. campestris from Nepal / B. A. Tika, B. Ramchandra // European Journal of Plant Pathology. - 1999. - V. 105. - P. 303-305.

207. Tsygankova, S.V. Genetic intraspecies relationships in Xanthomonas campestris pv. campestris revealed by novel rep-PCR primers / S.V. Tsygankova, A.N. Ignatov, E.S. Boulygina, B.B. Kuznetsov, E.V. Korotkov // European J. Plant Pathol. -2004.-V.110.-P. 845-853.

208. Twort, F.W. An investigation on the nature of the ultramicroscopic viruses / F.W. Twort // Lancet. - 1915. - V. 189. - P. 241-243.

209. Ultee, A. The phenolic hydroxyl group of carvacrol is essential for action against the food-borne pathogen Bacillus cereus / A. Ultee, M.H. Bennik, R. Moezelaar // Appl. Environ. Microbiol. - 2002. - V. 68. - P. 1561-1568.

210. Valverde, A. Assessment of genetic diversity of Xanthomonas campestris pv. campestris isolates from Israel by various DNA fingerprinting techniques / A. Valverde, T. Hubert, A. Stolov, A. Dagar, J. Kopelowitz, S. Burdman // Plant Pathology. - 2007. - V. 56. - P. 17-25.

211. Vauterin, L. Towards an improved taxonomy of Xanthomonas / L. Vauterin, J. Swings, K. Kersters, M. Gillis, T.W. Mew, M.N. Schroth, N.J. Palleroni, D.C. Hildebrand, D.E. Stead, E.L. Civerolo, A.C. Hayward, H. Maraite, R.E. Stall, A.K. Vidaver, J.F. Bradbury // International Journal of Systematic Bacteriology. - 1990. - V. 40.-P. 312-316.

212. Vicente, J. G. Development of an improved Brassica differential series for the identification of races of Xanthomonas campestris pv. campestris / J. G. Vicente, A. Ignatov, J. Conway, S. J. Roberts, J. D. Taylor // 7th Int. Cong. Plant Pathol., Edinburgh, UK. - 1998. - P.2.2.71.

213. Vicente, J. G. Identification and origin of Xanthomonas campestris pv. campestris races and related pathovars / J. G. Vicente, J. Conway, S. J. Roberts, J. D. Taylor //Phytopathology. - 2001. - V. 91. - P. 492-499.

214. Vicente, J.G. Occurrence and distribution of Xanthomonas campestris races in Portugal / J.G. Vicente, J.S. Dias, J.D. Taylor // ISHS Symposium on brassicas. 10thCrucifer Genetics Workshop. - 1997. - 23-27 September. Rennes France. - P.214.

215. Vicente, J.G. The black rot of crucifers / J.G. Vicente // Operations Center and National Horticultural Technology, Portugal. - 2004

216. Vicente, J.G. Xanthomonas campestris pv. campestris (cause of black rot of crucifers) in the genomic era is still a worldwide threat to brassica crops / J.G. Vicente, E.B. Holub // Molecular Plant Pathology. - 2012. - V. 14. - № 1. - P. 2-18.

217. Vorholter, F.J. The genome of Xanthomonas campestris pv. campestris B100 and its use for the reconstruction of metabolic pathways involved in xanthan biosynthesis / F.J. Vorholter, S. Schneiker, A. Goesmann, L. Krause, T. Bekel, O. Kaiser, B. Linke, T. Patschkowski, C. Riickert, J. Schmid, V.K. Sidhu, V. Sieber, A. Tauch, S.A. Watt, B. Weisshaar, A. Becker, K. Niehaus, A. Piihler // J Biotechnol. -2008.-V. 134.-P. 33-45.

218. Walker, J.C. Diseases of Vegetable Crops / J.C. Walker // New York, USA. McGraw-Hill Book Company, Inc. - 1952. - 592 p.

219. Wang, J.C. The role of DNA topoisomerases in recombination and genome stability: a double-edged sword / J.C. Wang, R.Caron, R.A. Kim // Cell. -1990. - V. 62. - P. 403-406.

220. Wang, P.W. Convergent evolution of phytopathogenic pseudomonads onto hazelnut / P.W. Wang, R.L. Morgan, M. Scortichini, D.S. Guttman // Microbiology. - 2007. - V. 153. - P. 2067-2073.

221. Weiss, B.D. Isolation and Characterization Phage for Xanthomonas campestris pv. campestris / B. D. Weiss, M.A. Ca page, M. Kessel, S.A. Benson // J Bacterid. - 1994.-V. 176. -№ 11.-P. 3354-3359.

222. Wells, J.M. In vitro inhibition of soft-rotting bacteria by EDTA and nisin and in vivo response on inoculated fresh cut carrots / J.M. Wells, C. Liao, A.T. Hotchkiss // Plant Dis. - 1998. - V. 82. - P. 491-495.

223. White, H. Bacterial spot of radish and turnip / H. White // Phytopathology. -1930. -V. 20. - P. 653-662.

224. Williams, P.H. Black rot: A continuing threat to world crucifers / P.H. Williams // Plant Dis. - 1980. - V. 64. - P. 736-742.

225. Williams, P.H. Inheritance of resistance in cabbage to black rot / P.H. Williams, T. Staub, J.C. Sutton // Phytopathology. - 1972. - V.62. - P. 247-252.

226. Wolf V.D. J.M. Disinfection of vegetable seed by treatment with essential oils, organic acids and plant extracts / V.D.J.M. Wolf, Y. Birnbaum, P.S. Van Der Zouwen, S.P.C. Groot // Seed Sei. & Technol. - 2008. - V. 36. - P. 76-88.

227. Yamamoto, S. Phylogenetic analysis of Acinetobacter strains based on the nucleotide sequences of gyrB genes and on the amino acid sequences of their products / S. Yamamoto, S. Harayama // Int. J. Syst. Bacteriol. - 1996. - V.46. - P. 506511.

228. Yamamoto, S. Phylogenetic structures of the genus Acinetobacter based on gyrB sequences: comparison with the grouping by DNA-DNA hybridization / S. Yamamoto, P.J. Bouvet, S. Harayama // Int. J. Syst. Bacteriol. - 1999. - V. 49. - P. 8795.

229. Yi-Hsiung, T. Characterization of filamentous bacteriophage phi Lf from Xanthomonas campestris pv. campestris / T. Yi-Hsiung, L. Mun-Ching, L. Kuo-Chih, LP. Chao-Chi, C. Ruey-Yi // Journal of General Virology. - 1990. - V. 71. - P. 1881: 1884.

230. Young, J.M. A multilocus sequence analysis of the genus Xanthomonas / J.M. Young, D.C. Park, H.M. Shearman, E.A. Fargier // Syst. Appl. Microbiol. - 2008. -V. 31.-№5.-P. 366-377.

231. Yucel, I. Avirulence gene avrPphC from Pseudomonas syringae pv. phaseolicola 3121: A plasmid-borne homologue of avrC closely linked to an avrD

allele / I. Yucel, D. Slaymaker, C. Boyd, J. Murillo, R. I. Buzzell, N. T. Keen //Mol. Plant- Microbe Interact. - 1994. - V. 7. - P. 677-679.

232. Zaccardelli, M. Characterization of Italian populations of Xanthomonas campestris pv. campestris using primers based on DNA repetitive sequences / M. Zaccardelli, F. Campanile, C. Moretti, R. Buonaurio // Journal of Plant Pathology. -2008. - V. 90. - № 2. - P. 375-381.

233. Zaccardelli, M. Xanthomonas campestris pv. pruni bacteriophages on peach trees and their potential use for biological control / M. Zaccardelli, A. Saccardi, E. Gambin, U. Mazzucchi // Phytopathol Mediterr. - 1992. - V. 31. - P. 133-40.

234. http://www.agroatlas.ru

235. http://www.megasoftware.net/

236. http ://www. sonongnghiep .hochiminhcity. gov. vnJ

237. http://trongraulamvuon.com

Приложение 1. Штаммы, использованные в работе.

№ Название штамма Год Координаты Место происхождения, культура

1-3 DK-1, DK-2, DK-3 10.2012 54°55'00" с. ш. 37°24'00" в. д. Серпуховский.р-н МО, капуста б/к

4-15 Ram 1-1, Ram 1-2, Ram 1-3, Ram 2-1, Ram 2-2, Ram 2-3, Ram 3-1, Ram 3-2, Ram 3-3, Ram 4-1, Ram 4-2, Ram 4-3 10.2012 55°34'00" с. ш. 38°13'00" в. д. Раменский р-н МО, капуста б/к

16-18 B-l, B-2, B-3 09.2012 55°37'54" с. ш. 38°05'26" в. д. ОПХ Быково МО, кольраби

19-21 Tirl, Tir2, Tir3 11.2012 46°50'25" с. ш. 29°38'36" в. д. Г. Тирасполь Молдова, капуста б/к

22-25 ХУ-1-1, ХУ 1-2, ХУ 2-1, ХУ 2-2 10.2012 46.63333 N 32.60000001 Е Г. Херсон Украина, капуста к/к

26-28 DB-1, DB-2, DB-3 10.2012 54°55'00" с. ш. 37°24'00" в. д. Серпуховский.р-н МО, капуста б/к

29-33 177NZ, 276NZ, NZ276, 306NZ, NZ306 - 51.710863,4.839478 Nickerson Zwaan, капуста

34 Eruca 2005 - США, руккола

35-37 Xok-1, Xok-2, Xok-3 09.2006 45°02'00" с. ш. 38°59'00" в. д. Краснодарский край, капуста б/к

38-43 Tri, Tr2, Tr3, Tr4, Tr5, Tr6 - 46°50'25" с. ш. 29°38'36" в. д. Тирасполь, Молдова, капуста б/к

44 L, - 59°57'00" с. ш. 30°19'00" в. д. Ленинградская обл., капуста

45 A5 2001 55°45'06" с. ш. 37°37'04" в. д. Московская обл, капуста

46 ex 528=NCPPB528T 1957 - Великобритания, капуста

47-51 Tlo-1, Tlo-2, Tlo-3, Tlo-4, Tlo-5 08.2007 54°12'00" с. ш. 37°37'00" в. д. Тульская обл., капуста

52 AF-2 2001 55°45'06" с. ш. 37°37'04" в. д. Москва,, капуста

53 11390 - - Бразилия, капуста

54 11392 - - pv. aberrans, капуста

55 04-29-B1 2004 - США, Калифорния, капуста

56 33437 - - pv. raphani США, Wisconsin, редис

57 11386 - - Бразилия, капуста

58 53-4 03.2005 - США, Калифорния, горчица

59 Bul-K 1999 - Германия, капуста

60 T5 2007 54°12'00" с. ш. 37°37'00" в. д. Тульская область, капуста

61 Lixl6 09.2006 55°05'00" с. ш. 38°47'00" в. д. Коломенск. р-н МО, капуста

62 Xn-13 1997 - Япония, капуста

63 P4110 1998 - Германия, капуста

64-65 Bun-1, Bun-2 09.2006 56°21'00" с. ш. 37°32'00" в. д. Дмитровский р-н МО, капуста

66-76 Bel2, Bel-, Bel-4, Bel 4-1, Bel 4-2, Bel4-3 Bel-4, Bel-5, Bel-6, Bel-7, Bel-8, Bel-9 10.2006 53°55'00" с. ш. 27°33'00" в. д. Белоруссия, капуста

77-86 Daschl-1, Daschl-2, Dasch-2, Dasch-4, Dasch4 белый, Dasch4 желтый, Dasch-5, Dasch-8, Dasch-9, Dasch-10 09.2006 54°55'00" с. ш. 37°24'00" в. д Серпухов.р-н МО, капуста

Приложение 2. Реакция гибридов белокочанной капусты к штаммам возбудителя сосудистого бактериоза.

Штамм патогена Раса Гарантия Церокс Тайфун Синтекс Браксан Таурус Циркон Агрессор Зенон Бронко

ДК-1 1 + + + + + + + + + +

ДК-2 1 + + + + + + + + + +

ДК-3 1 + + + + + + + + + +

ДВ-1 1 + + - + + + + - + -

ДВ-2 1 + + + + + + + + + -

ДВ-3 1 + + - - + + + - + -

Яам- 1-1 3 + + + + + + + + + +

Яам- 1-2 3 + + + + + + + + + +

Лам- 1-3 3 + + + + + + + + + +

Лам - 2-1 3 + - + - - + + - + +

Яам - 2-2 3 + + + + + + + + + +

Яам - 2-3 3 + + + + + + + + + +

Яам-3-1 1 + + + + + + + + + +

Ыам - 3-2 1 + + + + + + + + + +

Яам - 3-3 1 + - + + + + + - + +

Лам-4-1 1 + + + - + + + + + +

Лам - 4-2 1 + + + + - + + - + +

Яам - 4-3 3 + + + + - + + + + -

В-1 3 + + + - + + + + + +

В-2 3 + + + + + + + + + +

В-3 3 + + + + + + + + + +

ТЫ 1 + + + + + + + + + +

Тп2 1 + + + + + + + + + +

ТпЗ 3 + + + + + + + + + +

ХУ-1-1 6 + + + + + + + + +

ХУ 1-2 6 + + + + + + + + + +

ХУ 2-1 6 + + + + + + + + + +

ХУ 2-2 6 + + + + + + + + + +

277Ш 4 + + + + + + + + + +

276Ш 1 + + + + + + + + + +

306Ш 3 + + + + - + + + + -

Егиса 3 + + - + + + + + + +

Хок-1 3 + + + + - - + + + +

А А

Тг1 3 + + + + + - - + + +

Тг2 3 + + + + + + - + + -

ТгЗ 3 + + + + + - + + + +

Тг4 3 + + + - + - + + + +

Тг5 3 + + + + + + + - + -

Тгб 3 + + + + - - + + + +

л, 3 + + - + + - + + + -

А5 3 + - + - - + + + + -

ех 528 1 + - - - - + + + + +

Т1о-1 3 + + - - - - - - + -

Т1о-2 3 + + + + - - + + + +

Т1о-3 3 + + + + - + + - + +

Т1о-4 3 + + + + - - + + + +

Т1о-5 3 + + - + - - + + + -

АР-2 6 + + + + + + + + + +

11390 3 + - + + - - - + + +

11392 3 + - + + - - - + + +

0429В1 3 + - - - + + - - + -

33437 6 + - + + + + + + + +

11386 3 + + + + + + + - + +

Ви1-К 4 + - - - - - + + + +

1лх16 4 + - - - - - - - + -

Хп-13 4 + + + + + + + + + +

Вип-1 4 + - - - - + + + + +

Вип-2 3 + + - + + + + + + -

Ве1-2 3 + + - - - + + - + +

Ве1-3 3 + + + - + + + - + -

Ве1-8 3 + - - - - + + - + -

Ве1-9 3 + + + - + - + - + -

Вазс11-2 3 + + + + + + + + + +

ВазсЬ-4 3 + + - - - - + - + +

ОазсЬ-9 4 + - - - + - - - + -

Оа$сЬ-8 3 + - - - - - - - + -

Всего вирулентная реакция, % 100 82 74 71 67 73 86 74 100 71

Примечание: «+» - наличие симптомов; «-» - отсутствие симптомов

Приложение 3. Последовательность праймеров, использованных в работе

Название праймера Прямой Обратный

Хсс0007 - ТопВ 804//1443 5' -CGC MGS SGT GAT GGA CAA GC- 3'

Cyml33F2/R2 5' -CGCATTGCAGATCATGTTGG- 3' 5' -TTCCAGGGCATGAGCCGCAT- 3'

xopAD3453 /4134 5' -CTG CGG CTC AAG GAC АТС GT- 3' 5' -CCK GCA YAC CGG GTA GTT GTC- 3'

wxcOFl 76/R652 5' -TGAGCAGCCTCTGGCTGACG- 3' 5' -CCGTGTAGTAAACGCCGAAACAGC- 3'

Xcc2f/2r 5' -TGGGTTTTCGCCTATCAAAC-3 ' 5' -TGCAACTATTCCTAGCACCG- 3'

Xcrl4f/14r 5' -CGTTAGCCAGGTAGAAAGCG- 3' 5' -TCGCTATTTCCATCTACCCG- 3'

BOXA IS 5' -CTACGGCAAGGCGACGCTGACG- 3'

ERIC 5' -ATGTAAGCTCCTGGGGATTCAC- 3' 5' -AAGTAAGTGACTGGGGTGAGCG- 3'

JEL1 5'CTCAGGTCAGGTCGCC3'

rpoD 5' -TGGAACAGGGCTATCTGACC- 3' 5' -CATTCAAGGTTGGTCTGCTT- 3'

gyrB 5' -ACGAGTACAACCCGGACAA- 3' 5' -CCCATCARGGTGCTGAAGAT- 3'

'cytP-450F2/ R2(186) 5' -TGAGGCGCGCGATCAGATC- 3' 5' -CTGCTGCTCAATCCGCCG- 3'

Xcc2109Fl/Rl 5' -CAGGTGTCGGGCAAGATTCGGC- 3' 5' -CACCCGGGCTTAACATTTCTAAC- 3'

Xcc2109F2/R2 5' -AGCGTCACGGGTAGCGATGTC- 3' 5' -GAAGCGCGGGAGCGGCCGAGTTCG- 3'

Xcc2109F3/R3 5' -GTCCAAGGAAAACAAGCGCTC- 3' 5' -CGTGGGACCTGTTCCGAATGCT- 3'

Приложение 4. Температурно-временной профиль для ПЦР амплификации

Праймер Стадия амплификации Число

1 2 3 4 5 6 повторений

Начальная Денатурация Отжиг Элонгация Окончательная Хранение цикла 2,3,4

денатурация праймеров элонгация стадии

Темп., Время, Темп., Время, Темп., Время, Темп., Время, Темп., Время, С

С мин. С мин. С мин. С мин. С мин.

Хсс0007 - ТопВ 94 7 94 0,5 65 0,5 72 1 72 7 4 35

804//1443г

сут1Ш2т 95 1 95 0,5 65 0,5 72 0,5 72 3 4 30

хорАй3453 /4134 95 7 95 0,5 60 0,5 72 0,5 72 10 4 35

\vxcOFl 76/Я652 95 5 95 0,5 64 0,5 72 0,5 72 10 4 35

Хсс2//2г 95 5 95 0,5 60 0,5 72 0,5 72 10 4 35

Хсг14//14г 95 5 95 0,5 60 0,5 72 0,5 72 10 4 35

ВОХА 18 96 5 95 0,5 54 0,5 72 1 72 10 4 39

ЕЫС 96 5 95 0,5 60 0,5 72 1 72 5 4 35

МЫ 95 2 95 0,5 66 0,5 72 0,5 72 10 4 35

ИаН 95 2 95 0,5 55 0,5 72 0,5 72 10 4 35

гроИ 95 1 95 0,5 65 0,5 72 0,5 72 3 4 30

%угВ 95 1 95 0,5 65 0,5 72 0,5 72 3 4 30

Хсс2109Р1/К1 95 1 95 0,5 65 0,5 72 0,5 72 3 4 30

Хсс2109Р2№ 95 1 95 0,5 65 0,5 72 0,5 72 3 4 30

Хсс2109РЗ/ЯЗ 95 1 95 0,5 65 0,5 72 0,5 72 3 4 30

Приложение 5. Выравнивание фрагмента последовательности гена avrXccC типового штамма Хсс АТСС 33913 (нуклеотиды 501 - 1560) и последовательности гомологичного гена штамма Tir2 с инверсией фрагмента в районе 517840 п.о.

510 520 530 540 550 560 570 580 590 600

i i i i i ii i i i i i i i i i i i ii

АТСС33913 AATTGAAGTCAAGGTGTATCGGCAGTGTGGAGCGATTTCAGGAGAAACTATCCCGATGACGACAGTCAGTGCGGCCGTGGATGATAATGCCATTAGTGCG Tir 2 AATTGAAGTCAAGGTGTGAGCGAAAAGATTGCACGTTTTTGCATCTCTACAGCCCGGTTGGGCAGGTGGGCTGGCCAGACG-CGTGATTCTGCGACGGCG

область инверсии

АТСС33913 AGGCTGCGGAACCTTCCGAAGGATAAACGCCAACAGGCAAGACAGAGTATGGCATCTTCACATCCTAACATGATCACTCATACTAGCGCTGAATATATTA Tir 2 AAAAGCGAATATAATCCTCACTTTTGGTGTCGGCATCAGGT—CGGCAAGATCGCTATCTTTTT-AGAATCCCTACCGATCCTAAAT-GGGGGCGCTC

Consensus AAACTATAAGAGATCATCTGGAGTCTCTGTACTTGCAAGCGATTGATCCATCGCTTGAGAAGCATGAGGCCTTTGAGCTAATAGCGCGACTGCACTGGTG Tir 2 AAAAAA--TTAGATAATCAG-CCACAAATTG-CTCTCAG-ATCTAAGCATTGCCTCGATATCGAGAGATTTTTCCCATGTGCAGATATGGGCACATTTC

810 820 830 840 850 860 870 880 890 900

ii i ii ii ii i i i i i i ii i i i