Выделение и характеристика новых изолятов актинобактерий - продуцентов биологически активных веществ тема диссертации и автореферата по ВАК РФ 03.02.03, кандидат наук Сапармырадов Керемли

• Сапармырадов Керемли
• кандидат наук
• 2019

Оглавление диссертации кандидат наук Сапармырадов Керемли

ГЛАВА 1. ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ

1 .Общая характеристика стрептомицетов

1.1 Морфология стрептомицетов

1.2. Среда обитания

1.3. Фитотоксичность

1.4. Антагонизм актинобактерий с фитопатогенами. Фитогормоны

1.5. Антибиотики 20 1.6 Деградация высокополимерных соединений, гербицидов, токсинов 30 ГЛАВА 2. МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ 38 2.1 Материалы и объекты исследования

2.2.Условия выращивания микроорганизмов

2.3. Методы исследования

2.3.1. Выделение актинобактерий

2.3.2. Определение биологических эффектов

2.3.2.1. Определения антибиотической активности

2.3.2.2. Определение фитотоксичности

2.3.3. Идентификация изолятов

2.3.3.1. Определение культурально-морфологических свойств

2.3.3.2. Метаболическое профилирование

2.3.4. Статистическая обработка данных

ГЛАВА 3. РЕЗУЛЬТАТЫ И ОБСУЖДЕНИЕ

3.0 Выделение и первичные культурально-морфологические признаки новых вариантов стрептомицетов

3.1 Биологические эффекты изолятов 50 3.1.1 Определение антагонистической активности 51 3.1.2. Определение фитотоксичности

3.2 Определение видовой принадлежности 64 ЗАКЛЮЧЕНИЕ 80 СПИСОК СОКРАЩЕНИЙ 82 СПИСОК ИСПОЛЬЗОВАННОЙ ЛИТЕРАТУРЫ

Введение диссертации (часть автореферата) на тему «Выделение и характеристика новых изолятов актинобактерий - продуцентов биологически активных веществ»

Актуальность темы исследования и степень ее разработанности

Изучение актинобактерий является важным аспектом не только в биодеградации почвы и разных соединений, но и в борьбе против вредителей, патогенных микроорганизмов (Ridhima et а1., 2017). Мировая тенденция неуклонно растущей резистентности к существующим антибиотикам диктует спрос на новые противомикробные препараты. Наиболее экономически и биотехнологически ценными продуцентами являются актинобактерии. Способность продуцировать широкий спектр вторичных метаболитов - разнородной по химическому строению группы веществ, включающей кроме многих ценных антибиотиков, витамины группы В, аминокислоты, ароматические вещества, ферменты, - является выдающейся отличительной чертой актинобактерий, что широко используется в медицине, ветеринарии, растениеводстве и других отраслях хозяйства феш1ап et а!., 1995; Звягинцев и др., 2001; Егоров, 2004; Яето et а!., 2008; Matsui et а!., 2009). Среди зарегистрированных 23000 биологически активных вторичных метаболитов, продуцируемых микроорганизмами, более 10000 производится актинобактериями, что составляет 45% от всех биологически активных метаболитов микробного происхождения (ЫапёЫт е1 а1., 2018).

Поскольку большинство известных в наши дни антибиотиков продуцируют представители рода ^гврХотусвя, принадлежащего к группе актинобактерий, этот род является наиболее изучаемым (Raghava et а!., 2012). Стрептомицеты представлены преимущественно почвенными бактериями, очень устойчивыми к экстремальным условиям, основная роль которых заключается в разложении сложных субстратов и участии в формировании почвенного плодородия (Орлов и др., 1996). В зависимости от механического и химического состава почвы: ее окультуренности, засоленности, характера

растительного покрова, - данные микроорганизмы синтезируют те или иные вещества. Например, недавно были получены эндофитные стрептомицеты для повышения эффективности фиторемедиации почв, загрязненных нефтью, и ее деградации (Baoune et al., 2018). Установлена возможность биодеградации гербицида- сульфосульфурона -стрептомицетом Streptomyces albogriseolus (Ridhima et al., 2016). Выделены Streptomyces lividans TK 24 и Streptomyces aureofaciens ATCC 10762, испытанные в качестве детоксикантов афлатоксина B1, который при поражении кормов микроскопическими грибами из рода Aspergillus вызывает аспергиллотоксикоз теплокровных животных с тяжелыми последствиями. Показано, что инкубация этих стрептомицетов в присутствии 20 мкг/мл афлотоксина B1 за сутки приводит к его снижению в 7-8 раз (Eshelli et al., 2015). Аналогично тяжелые микотоксикозы происходят при употреблении кормов, зараженных паразитирующими микроскопическими грибами из родов Penicillium и Fusarium. Однако еще в 1994 стало известно о перспективности применения в полевых условиях живых культур актинобактерий Streptomyces felleus, Streptomyces chrysmallus и Streptomyces globisporus для защиты растений от грибов из рода Fusarium (Новикова и др., 1994; Колоколова и др., 1994). Также известно, что представители актинобактерий из рода Strepromyces способны не только ограничивать инфекционный потенциал фитопатогенов, но и проявлять фитотоксичность, что могло бы лечь в основу создания фито-и биогербицидов. Использование микроорганизмов в качестве биогербицидов могло бы предотвращать или частично ингибировать рост сорных растений, препятствующих росту культурных растений. Таким образом, изучение актинобактерий является одним из самых важных аспектов не только в биодеградации почвы и разных соединений (Arya et al., 2017), но и в борьбе против вредителей, патогенных микроорганизмов.

Изложенное выше обосновывает актуальность исследования, целью которого было выделить, идентифицировать и охарактеризовать актинобактерии из природных и антропогенных источников.

В соответствии с поставленной целью решали следующие задачи:

1. На основании морфологических признаков выделить актинобактерии из различных почв России и Монголии, а также сточных вод МУП «Водоканал» г. Казани.

2. Определить антагонистическую активность изолятов по отношению к прокариотам, низшим и высшим эукариотам.

3. Провести метаболическое профилирование изолятов по способности к утилизации различных источников углерода и хемочувствительности.

4. С использованием анализа нуклеотидных последовательностей 16S рРНК определить таксономическую принадлежность выделенных актинобактерий.

Научная новизна работы

Из образцов почв, отобранных в различных районах России и Монголии, были выделены новые изоляты актинобактерий, отнесенные на основании результатов генотипического и фенотипического анализов к видам Streptomyces odorifer, Streptomyces sampsonii, Streptomyces albidoflavus и Streptomyces sundarbansensis. Впервые показано, что актинобактерии вида Streptomyces odorifer проявляют антагонистическую активность, подавляя рост грамположительных и грамотрицательных бактерий Bacillus megaterium DSM319, Salmonella typhimurium и Pseudomonas putida PCL1760 и микроскопических грибов Trichoderma asperellum T.50, Fusarium oxysporum A.1, Penicillum sp и Aspergillum niger, Saccharomyces cerevisiae. Впервые установлено, что актинобактерии вида Streptomyces albidoflavus подавляют

рост микроскопического гриба Trichoderma asperellum T.50 и не оказывают

6

влияния на рост Saccharomyces cerevisiae. Впервые показано, что актинобактерии вида Streptomyces sampsonii угнетают рост грамположительных и грамотрицательных бактерий Bacillus megaterium DSM319 и Salmonella typhimurium, а также микроскопических грибов Trichoderma asperellum T.50, Fusarium oxysporum A.1, Penicillum sp и Saccharomyces cerevisiae. Впервые показано, что актинобактерии Streptomyces odorifer, Streptomyces albidoflavus, Streptomyces sundarbansensis проявляют фитотоксичность, угнетая рост корней сорняковых растений ширицы (Amaranthus retroflexus) и лебеды (Atriplex nudicaulis), а также одноклеточной водоросли Chlorella vulgaris.

Теоретическая и практическая значимость работы.

Сведения, полученные в ходе исследования новых изолятов актинобактерий Streptomyces sampsonii, Streptomyces odorifer, Streptomyces albidoflavus, Streptomyces sundarbansensis имеют теоретическое значение, так как дополняют и расширяют сформировавшиеся представления о физиолого-биохимических свойствах представителей перечисленных видов. Практическая значимость выполненного исследования заключается в том, что все выделенные изоляты проявляют фунгицидную активность, угнетая рост токсигенных микроскопических грибов Trichoderma asperellum T.50, Fusarium oxysporum A.1, Penicillum sp и Aspergillum niger и могут играть роль биофунгицидов при оздоровлении почвы. Обладая фитотоксической активностью, они также могут выступать в роли биогербицидов, подавляющих всхожесть или рост сорняковых растений. Подавляя рост токсигенных микроскопических грибов, они могут служить консервантами при заготовке кормов.

Методология диссертационной работы заключалась в комплексном подходе к выделению новых вариантов актинобактерий из различных почв России и Монголии, и их идентификации и характеристике. Анализ литературы, посвященной тематике исследования, проведен формальнологическими методами. Исследования, направленные на решение поставленных задач, осуществляли общенаучными и специфическими методами. В работе использованы методы классической микробиологии, а также современные методы биохимии и молекулярной биологии, и статистического анализа.

Основные положения, выносимые на защиту

1. Из 1 8 новых изолятов 1 0 проявляли вариабельную антагонистическую активность, а 4 - активность широкого спектра действия.

2. Изоляты с широкой антагонистической активностью отнесены к видам Streptomyces sampsonii, Streptomyces alЫdoflavш, Streptomyces odorifer, Streptomyces sundarbansensis на основе биохимических и генотипических признаков.

3. Streptomyces sampsonii (изолят А.8) стимулирует развитие растений и может быть рекомендован в качестве биопестицида для закрытого грунта; Streptomyces alЫdoflavш (изолят М.32), Streptomyces odorifer (изолят М.77), Streptomyces sundarbansensis (изолят М.43) в качестве биофунгицидов.

Материалы диссертации представлены на международных и всероссийских конгрессах и конференциях: IV Всероссийской конференции c международным участием, посвященной 80-летию со дня рождения В.В. Базыльчика «Современные проблемы химической науки и фармации» (Чебоксары, 2015 г); IV международной научно-практической конференции «Трансграничное сотрудничество в области экологической безопасности и охраны окружающей среды» (Гомель, 2018); Международной научной конференции «Наука, техника и инновационные технологии в эпоху могущества и счастья» (Ашхабад, 2018).

Место выполнения работы и личный вклад диссертанта

Основные экспериментальные данные получены непосредственно автором исследования за время работы в Институте фундаментальной медицины и биологии Казанского (Приволжского) федерального университета (2015-2019). Автором был проведен анализ данных отечественной и зарубежной литературы по теме диссертации. Автор принимал участие в планировании и осуществил экспериментальную и аналитическую часть работы. Большинство этапов работы выполнены автором лично. Автором проведен анализ полученных результатов, обсуждены результаты и сформулированы выводы. Работа по выделению изолятов проведена в соавторстве с Б. Чулуун, секвенирование ампликонов 16S РНК выполнялось компанией «Евроген» г.Москва.

Связь работы с базовыми научными программами

Представленная работа была финансирована Российским Министерством Науки и образования ФСП №14.А18.21.1930, ФСП

№16.552.11.7083. Работа выполнена за счет средств субсидии, выделенной в рамках государственной поддержки Казанскому (Приволжскому) федеральному университету в целях повышения его конкурентоспособности среди ведущих мировых научно-образовательных центров (5-ТОП-100).

Публикация результатов исследования

По материалам диссертации опубликовано 6 статей в научных журналах, в том числе 3 публикации в рецензируемых журналах из списка ВАК или индексируемых в базах данных Scopus и Web of Science, также 5 тезисов докладов Международных и Всероссийских конференций и конгрессов.

Структура и объем диссертационной работы

Материалы диссертационный работы изложены на 95 страницах машинописного текста. Работа содержит 10 рисунка и 13 таблиц. Диссертация состоит из введения, обзора литературы, материалов и методов, результатов и обсуждения, заключения, и списка литературы. Библиография включает 90 источников, среди которых 24 отечественных- и 66 зарубежных источников.

Благодарности. За внимательное отношение к работе и помощь автор выражает признательность научному руководителю- ведущему научному сотруднику Института фундаментальной медицины и биологии д.б.н. М.Н. Филимоновой; бывшему научному руководителю д.б.н., профессору Ф.К. Алимовой, за участие в постановке эксперимента и анализе полученных результатов к.б.н. Н.И. Акберовой, Ph.D. Ш.З. Валидову, Ph.D. Э.Р. Булатову, к.х.н. А.З. Миндубаеву и Б. Чулуун. За поддержку и помощь всем сотрудникам кафедры микробиологии ИФМиБ, в особенности д.б.н., профессору О.Н Ильинской, к.б.н. доценту П.В. Зеленихину, инженеру кафедры Н. К. Мочаловой.

Заключение диссертации по теме «Микробиология», Сапармырадов Керемли

ЗАКЛЮЧЕНИЕ

С целью получения перспективных для дальнейшего применения стрептомицетов выделяли новые изоляты из природных и антропогенных источников. Так как стрептомицеты широко распространены в экосистемах, особенно в почве, выделение проводили из образцов почв, отобранных в различных районах России и Монголии. В результате было выделено 18 изолятов, по фенотипическим признакам соответствующих представителям рода стрептомицетов. Исследование биологических эффектов позволило отобрать 4 изолята, подавляющих рост грамположительных и грамотрицательных бактерий Bacillus megaterium DSM319 и Salmonella typhimurium, Pseudomonas putida PCL1760, одноклеточной зеленой водоросли Chlorella vulgaris, а также микроскопических токсигенных грибов Aspergillus niger, Trichoderma asperellum T.50, Fusarium oxysporum A.1, Penicillium sp. и влияющих на скорость роста корней сорняковых растений Atriplex nudicaulis, Amaranthus retroflexus и горчицы белой (Sinapis alba), которую применяют как удобрение и для обезараживания почвы. На основании результатов генотипирования и определения фенотипических свойств была определена видовая принадлежность изолятов. Полученные результаты в сочетании со сведениями, представленными в литературе, позволили заключить следующее:

1. Из различных почв районов России и Монголии, а также из антропогенного источника - осадка сточных вод - выделили 18 изолятов обладающих комплексом морфологических свойств актинобактерий.

2. Из 18 изолятов 1 0 обладали отдельными антагонистическими активностями; 4 изолята (А.8, М.32, М.43 и М.77) проявили широкий спектр антагонистических активностей к про- и эукариотам.

3. Генотипирование в сочетании с метаболическим профилированием и хемофенотириванием позволило отнести изоляты А.8, М.32, М.43 и М.77 к видам Streptomyces sampsonii, Streptomyces albidoflavus, Streptomyces

sundarbansensis и Streptomyces odorifer.

4. Изолят Streptomyces sapmsonii по совокупности антагонистических эффектов может быть рекомендован в качестве биогербицида для закрытого грунта, изоляты Streptomyces albidoflavus, Streptomyces odorifer, Streptomyces sundarbansensis - на основании профиля антагонистических активностей в качестве биофунгицидов.

Список литературы диссертационного исследования кандидат наук Сапармырадов Керемли, 2019 год

1. Авакян A.A. Атлас анатомии бактерий, патогенных для человека и животных / А. А. Авакян, Л. Н. Кац, И. Б. Павлова // Акад. мед. наук СССР. -Москва : Медицина. - 1972.

2. Алимова Ф.К. Методические указания к выполнению лабораторных работ по теме: экология микроорганизмов / Ф.К. Алимова, Н.Г. Захарова, С.Ю. Егоров //. Казань: Изд-во КГУ. - 1993.

3. Бурцева, С. А. Стрептомицеты почв Молдовы как источник регуляторов роста растений / С. А. Бурцева // Материалы межд. науч. практич. конф. «Селекция и семеноводство овощных культур в ХХ1 в».М. -2000. - V.l.

4. Гаузе Г. Ф. Лекции по антибиотикам. 3-е изд./ Г. Ф. Гаузе // М.: Изд-во АН СССР, - 1958.

5. Егоров Н.С. Основы учения об антибиотиках / Н.С. Егоров // Москва: Издательство «Высшая школа». - 1986

6. Егоров Н.С. Основы учения об антибиотиках. Определение антибиотической активности микроорганизмов / Н.С. Егоров // Москва: Наука. - 2004

7. Звягинцев Д.Г. Экология актиномицетов / Д.Г. Звягинцев, Г.М. Зенова // М.: ГЕОС. - 2001. - P.257.

8. Звягинцев, Д. Г. Разнообразие почвенных актиномицетных комплексов, обусловленное температурными адаптациями мицелиальных актинобактерий / Д. Г. Звягинцев, Г. М. Зенова, Т. А. Грачева, А. И. Курапова, М. С. Дуброва // Теоретическая и прикладная экология. - 2011. - № 1

9. Ильина А.В. Внеклеточные протеиназа и хитиназа, продуцируемые культурой Streptomyces kurssanovii II / А.В Ильина, Н.Ю.Татаринова, Е В.

10. Калакуцкий, Л. В. Актиномицеты и высшие растения / Л. В. Калакуцкий, Л. С. Шарая // Успехи микробиологии, М. Наука,1990. - V. 2

11. Колоколова Н.Н. Антибиотики против фитопатогенных микроорганизмов, выделенные из актиномицетов почв Казахстана / Н.Н. Колоколова // Алматы. - 1994.

12. Красильников, Н. А. Микроорганизмы почвы и высшие растения / Н. А. Красильников // М.: Изд-во АН СССР. - 1958.

13. Манучарова Н.А. Хитинолитический актиномицетный комплекс чернозема / Н.А. Манучарова, Э.В. Белова, Л.М. Полянская, Г.М. Зенова // Наука (М.), Микробиология. - 2004. - V.73. - № 1. - P.68-72.

14. Миндубаев А.З. Сравнение фитотоксичности, фунгицидных и бактерицидных свойств streptomyces из разных биотопов. Определение видовой принадлежности штамма А8 / А.З. Миндубаев, Ф.К. Алимова, Д.Г. Яхваров, Ч. Болормаа, К.А. Сапармырадов // Экологический Вестник Северного Кавказа. - 2015. - V.11. - № 1. - P.51-58

15. Миндубаев А.З. Сравнение антагонистических свойств стрептомицетов из различных биотопов / А.З. Миндубаев, К.А. Сапармырадов, Ф.К. Алимова // Российский журнал прикладной экологии. - 2016. - P.28-32.

16. Новикова И И. Испытание новых биопрепаратов в борьбе с фузариозом колоса / И.И. Новикова, В.Г. Иващенко, Г.В. Калько, И.В. Бойкова, Л.А. Назаровская, А.И. Литвиненко // Микология и фитопатология. - 1994. - V.28

17. Орлов, Д.С. Органическое вещество почв Российской Федерации / Д. С. Орлов, О. Н. Бирюкова, Н.И. Суханова // М.: Наука. - 1996

18. Прокофьева-Бельговская Л.Л. Строение и развитие актиномицетов / Л.Л. Прокофьева-Бельговская // М.:Изд-во Лкадемии наук СССР. - 1963. -P.275.

19. Растимешина И.О. Стимуляция прорастания семян огурцов метаболитами актиномицетов / И.О. Растимешина // Междунар. науч.-практ. конф. «Селекция и семеноводство овощных культур в XXI веке». -2000.

20. Татаринова Н.Ю. Хитинолитический комплекс ферментов Streptomyces kurssanovii и его использование против возбудителя фузариоза пшеницы Fusarium culmorum / Н.Ю.Татаринова, О.С. Гринченко, В.П. Варламов, Г.В. Поспехов, И.С. Васикова, В.Г. Джавахия // Прикладная биохимия и микробиология. Наука (М.). - 1996. - V.32. - № 2. - P.242-246.

21. Терехова Л.П. Использование селективных сред для выделения актиномицетов. Поиск продуцентов антибиотиков среди актиномицетов редких родов / Л.П. Терехова, O.A. Галатенко, И.В. Ллферова, Т.П Преображенская // Ллма-Лта: Гылым. - 1990.

22. Федоров Л.Л. Жизнь растений. Т. 1. Бактерии и актиномицеты / Л.Л. Федоров // - М.: Просвещение, - 1974. - P.528

23. Цавкелова Е.Л. Образование ауксинов бактериями, ассоциированными с корнями орхидей / Е.Л. Цавкелова, Т.Л. Чердынцева, Л.И. Нетрусов // Микробиология - 2005. - V.74. - №1. - P.55-62.

24. Широких И.Г. Лнтифунгальный потенциал актиномицетов из ризосферы ячменя на дерново-подзолистых почвах / И.Г. Широких // Почвоведение. - 2003. - №4. - P.458-464.

25. Alharbi S.A. Antibacterial activity of Actinobacteria isolated from terrestrial soil of Saudi Arabia / S.A. Alharbi, C. Arunachalam, A.M. Murugan, M. Wainwright // J. Food Agric. Environ. - 2012. - V.10. - №2. - P.1093-1097.

26. Arumugam M. Streptomyces sundarbansensissp. nov., an actinomycete that produces 2-allyloxyphenol / M. Arumugam, A. Mitra, A. Pramanik, M. Saha, R. Gachhui, J. Mukherjee // International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology . - 2011. - V.61. - P.2664-2669.

27. Augustine S.K. A non-polyene antifungal antibiotic from Streptomyces albidoflavusPU 23 / S.K. Augustine, S.P. Bhavsar, B.P. Kapadnis // J. Biosci. -2005. - V.30. - P.201-211.

28. Bakker M.E. Development of oil and mucilage cells in Cinnamomum burmanni. An ultrastructural study / M.E. Bakker, A.F. Gerritsen, J.P. van der Schaaf // Acta Bot. Neerl. - 1991. -V.40. - P.339-356.

29. Balows, E. A. The Prokaryotes. A Handbook on the Biology of Bacteria. Ecophysiology, Isolation, Identification, Applications / E. A. Balows, H. G. Truper, M. Dworkin // Springer-Verlag.N.Y., Berlin ets. - 1991

30. Baoune H. Petroleum degradation by endophytic Streptomyces spp. isolated from plants grown in contaminated soil of southern Algeria / H. Baoune, A. O. El Hadj-Khelil, G. Pucci, P. Sineli, L. Loucif, M. A. Polti // Ecotoxicology and Environmental Safety. - 2018. - V.147. - P.602-609.

31. Bignell D.R.D. Phytotoxins produced by plant pathogenic Streptomyces species / D.R.D. Bignell, J.K. Fyans and Z. Cheng // Journal of Applied Microbiology. - 2013. - V.116. - P.223-235.

32. Blanquez A. Decolorization and detoxification of textile dyes using a versatile Streptomyces laccase-natural mediator system / A. Blanquez, J. Rodriguez, V. Brissos, S. Mendes, L. O. Martins, A. S. Ball, M. E. Ariasa, M. Hernandez // Saudi Journal of Biological Sciences. - 2018.

33. Bressollier P. Purification and Characterization of a Keratinolytic Serine Proteinase fromStreptomyces albidoflavus / P. Bressollier,F.O. Letourneau, M.

34. Brzezinska M. S. Purification and Characterization of Streptomyces albidoflavus Antifungal Components / M. S. Brzezinska, U. Jankiewicz, A. Burkowska // Applied Biochemistry and Microbiology. - 2013. - V.49. - №5. -P.451-457.

35. Colquhoun D. Binding, gating, affinity and efficacy: the interpretation of structure-activity relationships for agonists and of the effects of mutating receptors / D. Colquhoun // Br J Pharmacol. - 1998. - V.125.

36. Chen C. Streptomyces nigra sp. nov. is a Novel Actinobacterium Isolated From Mangrove Soil and Exerts a Potent Antitumor Activity in Vitro / C. Chen, Y. Ye, R. Wang, Y. Zhang, C. Wu, S. C. Debnath, Z. Ma, J. Wang, M. Wu // Frontiers in Microbiology. - 2018. - V.9.

37. Chen M. Anti-glioma Natural Products Downregulating Tumor Glycolytic Enzymes from Marine Actinomycete Streptomyces sp. ZZ406 / M. Chen, W. Chai, T. Song, M. Ma, X. Lian, Z. Zhang // SCientifiC REPORTS. - 2018. - V.8. -№72.

38. Dehne H.W. and Lennartz B. Biologishe Bekampfung von Blattkrankheiten des Getreides durch Einschrankung der epidemischen Entwicklung des Erregers / H.W. Dehne and B Lennartz // Bonn: Inst. Fur Pflanzenkrankheiten. - 2000.

39. Demain A.L. Emerging concepts of secondary metabolism in actinomycetes. / A.L. Demain, A. Fang // Actinomycetol - 1995. - V.9. - P.98-117.

40. Diraviyam T. Antioxidant activity of melanin pigment from Streptomyces species D5 isolated from Desert soil / T. Diraviyam, M. Radhakrishnan, R. Balagurunathan // Rajasthan, India. Drug Invention Today. - 2011. - V.3.

41. Eshelli M. Metabolomics of the Bio-Degradation Process of Aflatoxin B1 by Actinomycetes at an Initial pH of 6.0 / M. Eshelli , L. Harvey, R. Edrada-Ebel, B. McNeil // Toxins. - 2015. - V.7. - P.439-456.

42. Fernandez Chimeno R.I. FlB-96212, a novel cytotoxic macrolide produced by a marine Micromonosora (I) Taxonomy, fermentation, isolation and biological activities / R.I. Fernandez Chimeno, L. Canedo, D. Espliego, F.D.L. Gravalos, J.L. Calle, F. Romero // J.Antibiot. - 2000. - V.53. - P.474-478.

43. Frandberg Emma and Schnurer Johan. Antifungal activity of chitinolytic bacteria isolated from airtight stored cereal grain / Emma Frandberg and Johan Schnurer // Canadian Journal of Microbiology. - 1998. - V.44. - № 2. - P.121-127.

44. Goudjal Y. Biocontrol of Rhizoctonia solani damping-off and promotion of tomato plant growth by endophytic actinomycetes isolated from native plants of Algerian Sahara / Y. Goudjala, O. Toumatia, A. Yekkour, N. Sabaou, F. Mathieuc, A. Zitouni // Microbiological Research. - 2013.

45. Haggag W.M. Application of Broad-Spectrum of Marine Streptomyces albidoflavus as biofungicide and Plant Growth Promoting of tomato diseases / W.M. Haggag, S.M. Singer, M. D. Aly // RJPBCS. - 2014. - V.5. - №6. - P.142-148.

46. Hardt P.D. Pancreatic exocrine function in patients with type 1 and type 2 diabetes mellitus / P.D. Hardt, A. Krauss, L. Bretz, M. Porsch-Ozcurumez, H. Schnell-Kretschmer, E. Maser, R.G. Bretzel, T. Zekhorn, H.U. Klor // Acta Diabetol. - 2000. - V.37. - P.105-110.

47. Hemashenpagam N. Purification of secondary metabolites from soil actinomycetes / N. Hemashenpagam // International Journal of Microbiology Research. - 2011. - V.3. - №3. - P.148-156.

48. Hernandez L. 4'-N-Methyl-5'-199 hydroxystaurosporine and 5'-hydroxystaurosporine, new indolocarbazole alkaloids from a marine Micromonospora sp. Strain / L. M. C. Hernandez, J. A. F. Blanco, J. P. Baz, J. L. F. Puentes, F. R. Millan, F. E. Vasquez, R. I. F. Chimeno, D. G. Gravalos // J Antibiot. - 2000. - V.53. - P.895-902.

49. Ilangumaran G. Microbial Degradation of Lobster Shells to Extract Chitin Derivatives for Plant Disease Management / G. Ilangumaran, G. Stratton, S. Ravichandran, P. S. Shukla, P. Potin, S. Asiedu, B. Prithiviraj // Frontiers in Microbiology. - 2017. - V.8

50. Jain P.K. Isolation, characterization and antifugal activity of Streptomyces sampsonii GS 1322 / P.K. Jain, P.C. Jain // Indian journal of experimental Biology. - 2007. - V.45. - P.203-206.

51. Jain R. Feather hydrolysate fromStreptomyces sampsoniiGS 1322: A potential low cost soil amendment / R. Jain, A. Jain, N. Rawat, M. Nair, R. Gumashta // Journal of Bioscience and Bioengineering. - 2015. - V.121. - №6. -P.672-677.

52. James TY. Reconstructing the early evolution of the fungi using a six gene phylogeny / T.Y. James, F. Kauff , C.L. Schoch, P.B. Matheny, V. Hofstetter, C. Cox, G. Celio, C. Gueidan, E. Fraker, J. Miadlikowska, H.T. Lumbsch, A. Rauhut, V. Reeb, E.A. Arnold, A. Amtoft, J.E. Stajich, K. Hosaka, G.H. Sung, D. Johnson, B. O'Rourke, M. Crockett, M. Binder, J.M. Curtis, J.C. Slot, Z. Wang , A.W. Wilson, A. Schubler, J.E. Longcore, K. O'Donnell, S. Mozley-Standridge, D. Porter, P.M. Letcher, M.J. Powell, J.W. Taylor, M.M. White, G.W. Griffith, D.R. Davies, R.A. Humber, J. Morton, J. Sugiyama, A.Y. Rossman, J.D. Rogers, D.H. Pfister, D. Hewitt, K. Hansen, S. Hambleton, R.A. Shoemaker, J. Kohlmeyer, B. Volkmann-Kohlmeyer, R.A. Spotts, M. Serdani, P.W. Crous, K.W. Hughes, K. Matsuura, E. Langer, G. Langer, W.A. Untereiner, R. Lucking, B. Budel, D.M. Geiser, A. Aptroot, P. Diederich, I. Schmitt, M. Schultz, R. Yahr, D.S. Hibbett, F.

90

53. Jaouadi B. Production, purification, and characterization of a highly thermostable and humic acid biodegrading peroxidase from a decolorizing Streptomyces albidoflavusstrain TN644 isolated from a Tunisian off-shore oilfield / B. Jaouadi, H. Rekik, A Badis,N. Z. Jaouadi, M. Belhoula, M. Hmidi, S. Kourdali, D. Fodil, S. Bejar // International Biodeterioration & Biodegradation. -2014. - V.90. - P.36-44.

54. Kalpana V.N. Production of Xylanase from Various Lignocellulosic Waste Materials by Streptomyces sp. and its Potential Role in Deinking of Newsprint / V.N. Kalpana, V. Devi Rajeswari // Asian Journal of Biochemistry. - 2015. -V.10. - №5. - P.222-229.

55. Kini A.R. Increased bone marrow angiogenesis in B-cell chronic lymphocytic leukemia. Leukemia / A.R. Kini, N.E. Kay, L.C.Peterson // - 2000. -V.14. - P.1414-1418.

56. Kristufek V. Accumulation of mineral elements in tuber periderm of potato cultivars differing in susceptibility to common scab / V. Kristufek, J. Divis, I. Dostalkova, J. Kalcik // Potato Res. - 2000. - V.43. - P.107-114.

57. Krol M. and Kobus J. Bakterie halofilne wiazace wolny azot wyizolowane z endoryzosfery roslin jednolisciennych. Drobnoustroje w Srodowisku / M. Krol and J. Kobus // Akademia Rolnicza Ed. W. Barabasz. Krakow. - 1997. - P.291-305.

58. Mahon, C.R. Text Book of Diagnostic Microbiology. 3th Edition / C.R. Mahon, G. Manuselis, D.C. Lehman // Saunders, USA. - 2007.

59. Matsui H. A chemical neurotoxin, MPTP induces Parkinson's disease like phenotype, movement disorders and persistent loss of dopamine neurons in medaka fish / H. Matsui, Y. Taniguchi, H. Inoue, K. Uemura, S. Takeda, R. Takahashi // Neurosci. Res. - 2009. - V.65. - P.263-271.

91

61. Moncheva P. Characteristics of soil Actinomycetes from Antarctica / P. Moncheva, S. Tishkov, N. Dimitrova, V. Chipeva, S.A. Chipeva, N. Bogatzevska // Journal of CultureCollections. - 2002. - V.3. - P.3-14.

62. Olano C. Antitumor compounds from actinomycetes: from gene clusters to new derivatives by combinatorial biosynthesis / C. Olano; C. Mendez; J.A. Salas // Nat. Prod. Rep. - 2009. - V.26. - P.628-660.

63. Raghava Rao K.V. Antagonistic activitiesof actinobacteria from mangrove sediment / K.V. Raghava Rao, Ch. Ravikiran, D. Bhaskara Rao, Y. Madhavi, P. Koteswara Rao, T. Raghava Rao // Int J Pharm PharmSci. - 2012. - V.4. - № 1. -P.364-367.

64. Raja A. and Prabakarana P. Actinomycetes and Drug-An Overview / A. Raja and P. Prabakarana // American Journal of Drug Discovery and Development. -2011. - V.1. - P.75-84.

65. Rajan B.M. and Kannabiran K. Extraction and Identification of Antibacterial Secondary Metabolites from Marine Streptomyces sp. VITBRK2 / B.M. Rajan, K Kannabiran // IJMCM. - 2014. - V.3. - № 3.

66. Rajesh R.O. Screening of Antibiotic Producing Actinomycetes from Coconut Husk Retting Sample / R.O. Rajesh, P.A. Mary Helen, S. Jaya Sree // International Journal of Research in Pharmaceutical and Biomedical. - 2013. -V.4. - №1. - P.67-74.

67. Reino J.L. Secondary metabolites from species of the biocontrol agent Trichoderma / J.L. Reino, R.F. Guerrero, R. Hernandez-Galan, I.G. Collado // Phytochemistry. - 2008. - V.7. - P.89-123.

68. Ridhima A. Brevibacillus borstelensis and Streptomyces albogriseolus have roles to play in degradation of herbicide, sulfosulfuron / A. Ridhima, N. K. Mishra, A. K. Sharma // Biotech. - 2016. - V.3.

69. Roy R.N. Dibutyl phthalate, the bioactive compound produced by Streptomyces albidoflavus 321.2 / R.N. Roy, S. Laskar, S.K. Sen // Microbiological Research. - 2006. - V.161. - P.121-126.

70. Saha M. Production and purification of a bioactive substance inhibiting multiple drug resistant bacteria and human leukemia cells from a salt-tolerant marine actinobacterium isolated from the Bay of Bengal / M. Saha, P. Jaisankar, S. Das, K.K. Sarkar, S. Roy, S.E. Besra, J.R. Vedasiromani, D. Ghosh, B. Sana, and J. Mukherjee // Biotechnol. Lett. - 2006. - V.28. - P.1083-1088.

71. Salla T.D. Streptomyces rhizobacteria modulate the secondary metabolism of Eucalyptus plants / T.D. Salla, T. R. da Silva, L. V. Astarita, E. R. Santarem // Plant Physiology and Biochemistry. - 2014. - V.85. - P.14-20.

72. 32) Sambrook J. Molecular cloning: A laboratory manual / J. Sambrook, P. Maccallum, D. Russel //. Cold Springs Harbour Press, NY. - 2001.

73. Sanchez T. Evaluation of the productive indicators of Holstein cows in pedestals / T. Sanchez, L. Lamela, R. Valdes, O. Lopez // Pastos y Forrajes. -2006. - V.29. - №1. - P.51-60.

74. Sawaguchi A. Chitosan degradation and associated changes in bacterial community structures in two contrasting soils / A. Sawaguchi, S. Ono, M. Oomura, K. Inami, Y. Kumeta, K. Honda, R. Sameshima-Saito, K. Sakamoto, A. Ando, A. Saito // Soil Science and Plant Nutrition. - 2015. - V.61. - 471-480.

75. Shen B. Biosynthesis of aromatic polyketides / B. Shen // Top. Curr. Chem. - 2000.

76. Sprusansky O. The bkdR gene of Streptomyces coelicolor is required for

morphogenesis and antibiotic production and encodes a transcriptional regulator of

93

77. Stackebrandt E. Proposal for a new hierarchic classification system, Actinobacteria classis nov. / E. Stackebrandt, F.A. Rainey, N.L. Ward-Rainey // Int. J. Syst. Bacteriol. - 1997. - V.47. - P.479-491.

78. Sundaramoorthy P. Effect of fertilizer factory effluent on germination and seedling growth of groundnut varieties / P. Sundaramoorthy, J. Kunchithapatam, P. Thamizhiniyan, V. Venkateslu // J. Ecobiol. - 2001. - V.13. - №1. - P.03-08.

79. Taira T. Antifungal activity of rye (Secale cereale) seed chitinases: The different binding manner of class I and class II chitinases to the fungal cell walls / T. Taira, T. Ohnuma, T. Yamagami, Y. Aso, M. Ishiguro, M. Ishihara // Biosci Biotechnol Biochem. - 2002. - V.66. - P.970-977.

80. Takami, S. Induction of macrophage inflammatory protein MIP-1a mRNA on glial cells after focal cerebral ischemia in the rat / S. Takami, H. Nishikawa, M. Minami, A. Nishiyori, M. Sato, A. Akaike, M. Satoh // Neurosci Lett. - 1997. -V.227. - P.173-176.

81. Takahashi Y.O. and Omura S. Isolation of new actinomycete strains for the screening of new bioactive compounds / Y.O. Takahashi and S. Omura // J Gen Applied Microbiol. - 2003. - V.49. - P.141-154.

82. Van Loon L. C. Systemic resistance induced by rhizosphere bacteria / L. C. Van Loon, P. A. H. M. Bakker, C. M. J. Pieterse // Annual Review of Phytopathology. - 1998. - V.36. - P.453-483.

83. Waksman S.A. A rapid method for demonstrating the identity of streptomycin-producing strains of Streptomyces griseus / S.A. Waksman, H.C. Reilly, D.A. Harris // Proc. Soc. Exptl. Biol. Med. - 1947. - V.66. - P.617-619.

84. Walker J. D. and Colwell R. R. Factors affecting enumeration and isolation of actinomycetes from Chesapeake Bay and Southeastern Atlantic Ocean / Walker J. D. and Colwell R. R. // Mar. Biol. - 1975.

85. Weisburg W.G. 16S ribosomal DNA amplification for phylogenetic study. / W.G. Weisburg, S.M. Barns, D.A. Pelletier, D.J. Lane // Journal of Bacteriology. -1991. - V.173. - P.697-703.

86. Wu Z. Antibacterial and Cytotoxic New Napyradiomycins from the Marine-Derived Streptomyces sp. SCSIO 10428 / Z. Wu. S. Li, J. Li, Y. Chen, K. Saurav, Q. Zhang, H. Zhang, W. Zhang, S. Zhang, C. Zhang // Mar. Drugs. - 2013. - V.11. - P. 2113-2125.

87. http//www.ncbi.nlm.nih.gov/BLAST

88. http://h-sw-h.com/landscape-design/flowergarden/gorchica-belaya-sostav-i-poleznye.html

89. https : //en.wikipedia. org/wiki/Pseudomonas_putida

90. https://www.argo-shop.com.ua/article-7861 .html