Тяжелые грибковые инфекции, вызванные редкими возбудителями тема диссертации и автореферата по ВАК РФ 00.00.00, доктор наук Хостелиди Софья Николаевна
- Специальность ВАК РФ00.00.00
- Количество страниц 314
Оглавление диссертации доктор наук Хостелиди Софья Николаевна
ВВЕДЕНИЕ
Актуальность темы исследования
Степень разработанности темы
Цель исследования
Задачи исследования
Научная новизна
Теоретическая и практическая значимости работы
Методология и методы исследования
Положения, выносимые на защиту
Степень достоверности и апробация результатов
Объем и структура работы
Личный вклад автора в проведенное исследование
ГЛАВА 1. ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ
1.1. Определение тяжелых грибковых инфекций, вызванных редкими возбудителями
1.2. Распространенность тяжелых грибковых инфекций, вызванных редкими возбудителями
1.3. Характеристика редких возбудителей тяжелых грибковых инфекций
1.4. Фоновые заболевания и состояния пациентов с тяжелыми редкими грибковыми инфекциями, вызванными редкими возбудителями
1.5. Факторы риска развития тяжелых грибковых инфекций, вызванных редкими возбудителями
1.6. Патогенетические механизмы тяжелых грибковых инфекций, вызванных редкими возбудителями
1.7. Клинические формы тяжелых грибковых инфекций, вызванных редкими возбудителями
1.8. Диагностика тяжелых грибковых инфекций, вызванных редкими возбудителями
1.9. Принципы лечения тяжелых грибковых инфекций, вызванных редкими
возбудителями
1.10 Выживаемость пациентов с тяжелыми грибковыми инфекциями, вызванными
редкими возбудителями
ГЛАВА 2. МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ ИССЛЕДОВАНИЯ
2.1 Общая характеристика исследования
2.2 Объект исследования
2.3 Методы обследования пациентов
2.3.1 Клинические методы исследования
2.3.2 Инструментальные методы исследования
2.3.3 Лабораторные микологические методы исследования
2.4 Критерии диагностики тяжелых грибковых инфекций, вызванных редкими возбудителями
2.5 Принципы лечения
2.6 Дизайн исследования
2.7 Статистические методы анализа результатов исследования
ГЛАВА 3. РЕЗУЛЬТАТЫ ОБСЛЕДОВАНИЯ И ЛЕЧЕНИЯ ПАЦИЕНТОВ С МУКОРМИКОЗОМ
3.1 Характеристика обследованных пациентов
3.2 Характеристика пациентов с мукормикозом и группы сравнения
3.3 Фоновые состояния и факторы риска развития мукормикоза
3.4 Клинические варианты мукормикоза у различных категорий пациентов
3.5 Клинические проявления мукормикоза у различных категорий пациентов
3.6 Результаты инструментального обследования пациентов с мукормикозом
3.7 Результаты лабораторного обследования и спектр возбудителей мукормикоза у различных категорий пациентов
3.8 Особенности лечения мукормикоза у различных категорий пациентов
3.9 Общая выживаемость пациентов с мукормикозом и прогностически значимые
факторы
ГЛАВА 4. РЕЗУЛЬТАТЫ ОБСЛЕДОВАНИЯ И ЛЕЧЕНИЯ ПАЦИЕНТОВ С ТЯЖЕЛЫМИ ГРИБКОВЫМИ ИНФЕКЦИЯМИ, ВЫЗВАННЫМИ ДРУГИМИ РЕДКИМИ МИЦЕЛИАЛЬНЫМИ ВОЗБУДИТЕЛЯМИ
4.1 Характеристика пациентов с тяжелыми грибковыми инфекциями, вызванными другими редкими мицелиальными возбудителями
4.2 Фоновые состояния пациентов и факторы риска тяжелых грибковых инфекций, вызванных другими редкими мицелиальными возбудителями
4.3 Клинические варианты и клинические проявления тяжелых грибковых инфекций, вызванных другими редкими мицелиальными возбудителями
4.4 Методы диагностики и спектр возбудителей тяжелых грибковых инфекций, вызванных другими редкими мицелиальными возбудителями
4.5 Особенности лечения пациентов с тяжелыми грибковыми инфекциями, вызванными другими редкими мицелиальными возбудителями
4.6 Общая выживаемость пациентов с тяжелыми грибковыми инфекциями, вызванными другими редкими мицелиальными возбудителями и прогностические
значимые факторы
ГЛАВА 5. РЕЗУЛЬТАТЫ ОБСЛЕДОВАНИЯ И ЛЕЧЕНИЯ ПАЦИЕНТОВ С ТЯЖЕЛЫМИ ГРИБКОВЫМИ ИНФЕКЦИЯМИ, ВЫЗВАННЫМИ РЕДКИМИ ДРОЖЖЕПОДОБНЫМИ ВОЗБУДИТЕЛЯМИ
5.1 Характеристика пациентов с тяжелыми грибковыми инфекциями, вызванными редкими дрожжеподобными возбудителями
5.2 Фоновые заболевания и факторы риска тяжелых грибковых инфекций, вызванных редкими дрожжеподобными возбудителями
5.3 Клинические варианты и клинические проявления тяжелых грибковых инфекций, вызванных редкими дрожжеподобными возбудителями
5.4 Лабораторная диагностика и спектр возбудителей тяжелых грибковых инфекций, вызванных редкими дрожжеподобными микромицетами
5.5 Особенности терапии тяжелых грибковых инфекций, вызванных редкими
дрожжеподобными возбудителями
5.6 Общая выживаемость пациентов с тяжелыми грибковыми инфекциями, вызванными редкими дрожжеподобными возбудителями и прогностически
значимые факторы
ГЛАВА 6. ЗАКЛЮЧЕНИЕ
ВЫВОДЫ
РЕКОМЕНДАЦИИ
ПЕРСПЕКТИВЫ ДАЛЬНЕЙШЕЙ РАЗРАБОТКИ ТЕМЫ
СПИСОК УСЛОВНЫХ СОКРАЩЕНИЙ И ОБОЗНАЧЕНИЙ
СПИСОК ЛИТЕРАТУРЫ
ПРИЛОЖЕНИЕ. АЛГОРИТМЫ ДИАГНОСТИКИ И ЛЕЧЕНИЯ ТЯЖЕЛЫХ ГРИБКОВЫХ ИНФЕКЦИЙ, ВЫЗВАННЫХ РЕДКИМИ ВОЗБУДИТЕЛЯМИ
ВВЕДЕНИЕ Актуальность темы исследования Грибковые инфекции, вызванные редкими возбудителями, становятся все более актуальной проблемой современного здравоохранения по причине тяжелого течения заболеваний, высокой частоты инвалидизации и смертности пациентов [2;257;264].
Новые методы лечения злокачественных и аутоиммунных заболеваний привели к увеличению когорты иммуноскомпрометированных пациентов. Широкое применение противогрибковых лекарственных средств для профилактики и эмпирической терапии у пациентов с онкогематологическими заболеваниями или реципиентов трансплантатов кроветворных стволовых клеток (ТКСК) и солидных органов, оказалось эффективным в отношении инвазивного аспергиллеза и кандидоза, но сместило спектр возбудителей в сторону микотических инфекций, вызванных редкими возбудителями, которые нередко устойчивы к стандартным антимикотикам [56].
Согласно международным данным «редкими» микотическими инфекциями считают микозы, заболеваемость которыми менее 1 на 100 000 человек [236]. Проведенные ранее исследования показали, что в эту группу заболеваний в России относят мукормикоз, а также другие микотические инфекции, еще более редко встречающиеся на территории нашей страны и не являющиеся эндемичными [531]. Анализ зарубежных публикаций, посвященных редким инвазивным микозам, продемонстрировал, что общее число описанных клинических случаев с 2010 по 2020 гг. превышает более чем в 2 раза число публикаций за предыдущее десятилетие [24].
Распространенность тяжелых грибковых инфекций (ТГИ), вызванных редкими возбудителями, варьирует в зависимости от основного заболевания и географического региона. Например, в США в период с 2008 г. по 2017 год диагностировали 6 случаев фузариоза на 1000 аутотрансплантаций кроветворных стволовых клеток, у реципиентов аллогенных ТКСК (НЬА-родственные) этот
показатель достигает 20 на 1000 трансплантаций, в Бразилии - 0,6% и 3,2% соответственно [307,184]. В Испании в многоцентровом исследовании Fusarium spp. были выделены у 1,2% всех обследованных пациентов с факторами риска инвазивных микозов, таким образом, фузариоз был более распространённой инфекцией у иммуноскомпрометированных пациентов [431]. На сегодняшний день в России отсутствуют программы систематического эпиднадзора за инвазивными грибковыми инфекциями, поэтому точные данные по распространенности тяжелых грибковых инфекций, вызванных редкими возбудителями, остаются неизвестными.
Согласно зарубежным исследованиям, редкие инфекции, вызываемые дрожжеподобными грибами, отличными от Candida spp. и Cryptococcus spp., составляют около 2% от всех инвазивных микозов [185;234;288]. К этой группе относятся инфекции, обусловленные базидиомицетами Rhodotorula spp., Sporobolomyces spp., Trichosporon spp., Malassezia spp., Pseudozyma (Moesziomyces) spp. и аскомицетами Geotrichum spp., Kodamaea spp., Saccharomyces spp. и Saprochaet spp
Общим для всех грибковых инфекций, вызванных редкими возбудителями, является трудность установления диагноза. Все микромицеты, широко распространены в природе, многие из них являются патогенами растений. Длительное время представителей этой группы микромицетов считали непатогенными для человека, но в последние годы отмечается рост заболеваний, связанных с этими грибами у различных категорий иммуноскомпрометированных пациентов. Так «не-кандидозные» дрожжи в многоцентровых исследованиях составляли 1,7% случаев, инвазивных микозов в Китае и составили 8.1% всех дрожжеподобных возбудителей инвазивных микозов, а в Испании 1,8% случаев всех фунгемий в течение года. Большее количество описанных случаев связаны с Trichosporon spp., реже c Rhodotorula spp., Malassezia spp. и другими дрожжеподобными грибами [234;541].
В то же время появляются новые группы риска развития инвазивных
грибковых инфекций. К таким пациентам относят больных с тяжелым острым респираторным синдромом, вызванным SARS-CoV-2 или вирусами гриппа А и гриппа В, которым требуется интенсивная терапия [101;272], а также пациентов, получающих биологическую терапию (например, ингибиторы фактора некроза опухоли альфа) и новые генно-биоинженерные препараты. Влияние данных факторов риска было доказано для развития инвазивного аспергиллеза [131], в отношении мукормикоза и других микозов, вызванных редкими возбудителями, проблема остается неизученной.
Клинические проявления инвазивных редких микозов разнообразны. Возможны изолированные локальные изменения кожи и глубоких тканей, придаточных пазух носа, легких, головного мозга, тканей орбиты и др. [201;266;270]. Описаны поражения практически всех органов и систем. Следует отметить, что даже поверхностные очаги инфекции кожи у иммуноскомпрометированных пациентов являются тяжело протекающими инфекциями с высокой летальностью. Летальность при мукормикозе кожи достигает 30% [138;244]. Летальность при поражении других органов значительно выше: при поражении легких до 57%, при диссеминированном мукормикозе или вовлечении центральной нервной системы (ЦНС) достигает 90-100% [244].
Дрожжеподобные микромицеты наиболее часто вызывают фунгемию и диссеминированный микоз, который даже на фоне адекватной терапии приводит к летальному исходу 15-83% пациентов в зависимости от фонового состояния, возбудителя и эффективности используемых антимикотиков [42;206;360].
Увеличение числа пациентов с микотическими инфекциями, вызванными редкими возбудителями, тяжесть течения заболеваний, высокая летальность, а также рост пациентов с факторами риска инвазивных микозов, послужили поводом для данного исследования.
Степень разработанности проблемы Анализ литературных данных продемонстрировал, что в Российской Федерации не проводили исследования, направленные на изучение факторов
риска, клинических проявлений, оценки лечения и выживаемости пациентов с тяжелыми микотическими инфекциями, вызванными редкими возбудителями у разных категорий пациентов. Следует отметить, что большинство зарубежных исследований проводили на основании анализа опубликованных случаев, а проспективные работы, осуществляли обработку данных в определенных группах пациентов и учитывали не весь спектр фоновых состояний, а так же факторов риска развития болезни [126;195;199; 235;308;452].
Единичные зарубежные исследования были направлены на изучение и оценку факторов риска редких инвазивных микотических инфекций в многопрофильных стационарах, оценку клинических проявлений и тактики ведения пациентов [201;204]. В последнее время появляются новые группы риска развития тяжелых микотических инфекций, вызванных редкими возбудителями. Влияние этих факторов на выживаемость пациентов, а также прогноз течения заболевания в зависимости от симптоматики и применяемой терапии, остаются неизвестными.
Многие авторы сообщают об увеличении числа пациентов с мукормикозом на фоне пандемии COVID-19 [196;537]. На первых этапах пандемии мукормикоз был трудно диагностируемым заболеванием, в связи с невозможностью проведения полноценного микологического обследования пациентов в регионах РФ и эти пациенты погибали в отделениях неврологии, нейрохирургии, реанимации и интенсивной терапии (ОРИТ). Из всего вышеперечисленного следует, что дальнейшая разработка диагностических критериев и внедрение новых принципов тактики лечения и профилактических мероприятий позволит повысить качество оказания помощи и улучшить показатели выживаемости пациентов с микотическими инфекциями, вызванными редкими возбудителями. В нашей стране остается неизвестным спектр возбудителей тяжелых инвазивных микозов, вызванных редкими микромицетами, что особенно важно с учетом низкой чувствительности этой группы возбудителей к большинству применяемых антимикотиков. Описаны случаи развития микозов, обусловленных
мукормицетами, редкими плесневыми микромицетами и дрожжеподобными грибами. Однако систематизация этих случаев, анализ фоновых заболеваний и состояний, факторов риска, клинических проявлений, диагностики, тактики и эффективности лечения не проводили.
Все приведенные факты определяют актуальность исследования распространенности, особенностей течения фоновых заболеваний, клинических проявлений и лечения редких инвазивных микотических инфекций в РФ.
Цель исследования
определить клинико-лабораторные особенности тяжелых грибковых инфекций, вызванных редкими возбудителями, для разработки и оптимизации алгоритмов диагностики и лечения.
Задачи исследования
1. Определить наиболее распространенные тяжелые грибковые инфекции, обусловленные редкими возбудителями, а также основные фоновые заболевания и состояния пациентов.
2. Установить факторы риска развития тяжелых микотических инфекций, вызванных редкими возбудителями, у различных категорий пациентов (онкогематологических, COVID-19 и «прочих»).
3. Выявить видовой спектр возбудителей мукормикоза, других тяжелых микозов, вызванных редкими мицелиальными и дрожжеподобными микромицетами.
4. Изучить клинико-лабораторные особенности тяжелых грибковых инфекций, обусловленных редкими возбудителями у различных категорий пациентов.
5. Оценить эффективность и безопасность терапии тяжелых грибковых инфекций, обусловленных редкими возбудителями.
6. Установить прогностические критерии тяжелых грибковых инфекций, обусловленных редкими возбудителями.
7. Разработать алгоритмы диагностики и лечения тяжелых грибковых инфекций, обусловленных редкими возбудителями (мукормицетами, нитчатыми и дрожжеподобными микромицетами).
Научная новизна
Впервые в России создан регистр пациентов тяжелыми грибковыми инфекциями, вызванными редкими возбудителями в России. Впервые в клинической практике РФ продемонстрировано увеличение числа пациентов тяжелыми грибковыми инфекциями на фоне пандемии COVID-19. Установлено, что основной инфекцией, вызванной редкими грибковыми возбудителями, является мукормикоз, реже развиваются инфекции, вызванные другими редкими мицелиальными и дрожжеподобными возбудителями. Показано, что мукормикоз наиболее распространен среди пациентов СОУГО-19 и гематологических; микотические инфекции, вызванные другими редкими мицелиальными возбудителями - у гематологических пациентов; инфекции, вызванные редкими дрожжеподобными возбудителями - у пациентов отделений реанимации и интенсивной терапии.
Установлено, что у пациентов с СОУГО-19 факторами риска являются неконтролируемый сахарный диабет, кетоацидоз, длительное применение высоких доз глюкокортикостероидов. У гематологических пациентов наибольший риск развития мукормикоза был на фоне алло-трансплантации кроветворный стволовых клеток, реакции «трансплантат против хозяина», а также при агранулоцитозе более 10 суток и лимфоцитопении более 14 суток. Риск развития мукормикоза у «прочих» пациентов повышается при длительном (более 7 дней) пребывании в отделениях реанимации и интенсивной терапии, применении искусственной вентиляции легких, центрального венозного катетера. Риск развития тяжелых микотических инфекций, вызванных другими редкими плесневыми возбудителями, повышается у реципиентов алло- трансплантации кроветворный стволовых клеток, на фоне реакции «трансплантат против хозяина», при агранулоцитозе более 14 суток, лимфоцитопении более 14 суток, использовании глюкокортикостероидов в дозе более 100 мг/сутки в течение 14 дней и длительном пребывании в отделений реанимации и интенсивной терапии. У «прочих» пациентов риск развития инвазивных микозов повышается при длительном пребывании в отделениях
реанимации и интенсивной терапии, а также применении искусственной вентиляции легких.
Установлено, что возбудителями тяжелых редких микотических инфекций являются: мукормицеты - Rhizopus spp., Rhizomucor spp. Lichtheimia spp. и Mucor spp.; другие редкие мицелиальные возбудители - Fusarium spp., Paecilomyces spp., Acremonium spp., Trichoderma spp., Scopulariopsis spp., Scedosporium spp., Aureobasidium spp., Exophiala spp., Alternaria spp. и Cladospurium spp.; редкие дрожжеподобные возбудители - Trichosporon spp., Rodotorula spp., Geotrichum spp., Sacharamyses spp. и Malassesia sp.. Выявлено, что наиболее часто клинические проявления тяжелых микотических инфекций, вызванных редкими возбудителями, неспецифичны и не зависят от вида возбудителя. Основными клиническими вариантами являются поражение придаточных пазух носа, поражение легких, центральной нервной системы и фунгемия. Клинический вариант зависит от фонового состояния: у пациентов COVID-19 преобладает поражение околоносовых придаточных пазух (96%), у гематологических пациентов - поражение легких (7281%), у «прочих» пациентов - поражение придаточных пазух носа и легких развиваются одинаково часто.
Показано, что без своевременного применения антимикотической терапии инфекции распространяются на близлежащие ткани или гематогенно, что приводит к более тяжелому течению заболевания и летальному исходу. Оценена роль влияния факторов риска, клинического варианта течения заболевания, антимикотической терапии и хирургического лечения на исход инвазивного микоза.
Разработана клиническая классификация тяжелых грибковых инфекций, вызванных редкими возбудителями, на основании которой определены рациональные диагностические алгоритмы, а также алгоритмы тактики ведения пациентов для эффективного лечения и снижения смертности.
Теоретическая и практическая значимость
Результаты исследования демонстрируют, что ранняя диагностика мукормикоза, а также других тяжелых грибковых инфекций вызванных редкими мицелиальными и дрожжеподобными возбудителями, улучшает показатели выживаемости пациентов. Применение разработанных алгоритмов диагностики и лечения улучшают прогноз заболевания, уменьшают риск инвалидизации и летального исхода.
Разработанные алгоритмы диагностики и лечения используются в работе врачей гематологов, онкологов, трансплантологов, реаниматологов, отоларингологов, хирургов, а также врачей лабораторной, инструментальной и лучевой диагностики, в период стационарного и амбулаторного наблюдения пациентов с тяжелыми грибковыми инфекциями.
Оптимизация диагностики и лечения тяжелых грибковых инфекций, вызванных редкими возбудителями, характеризующихся высокой летальностью и оказывающих негативное влияние на качество и продолжительность жизни пациентов, включая пациентов трудоспособного возраста, приводит к улучшению показателей выживаемости пациентов, уменьшению времени пребывания в стационаре, что имеет практическую значимость для здравоохранения Российской Федерации.
Теоретические положения отражены в методических рекомендациях и учебных пособиях, используемых в учебном процессе кафедры клинической микологии, аллергологии и иммунологии ФГБОУ ВО СЗГМУ им. И.И.Мечникова Минздрава России, кафедры медицинской микробиологии ФГБОУ ВО СЗГМУ им. И.И.Мечникова Минздрава России.
Методология и методы исследования
Поставленные в работе задачи решали с использованием методологии научного познания на основании последовательного набора данных. Применили методы: научного анализа (включающий обработку литературы по теме
исследования), эмпирический метод (распределение полученных данных по группам и дальнейшее сравнение) и прикладной метод научного познания.
Данное исследование является многоцентровым проспективным когортным. Диссертационное исследование включало в себя этап формирования групп пациентов в ходе которого проводили дифференциально диагностические исследования для подтверждения диагноза инвазивного редкого микоза, либо уточнялось его отсутствие согласно критериям разработанным European Organization for Research and Treatment of Cancer and the Mycoses Study Group Education and Research Consortium (EORTC/MSGERC) адаптированными в 2020 году. Данный этап проводили в период с 2004 по 2022 год. В исследование включены пациенты с диагнозом мукормикоз или другими микотическими инфекциями, вызванными редкими возбудителями, старше 18 лет, а также пациенты, со сходными фоновыми состояниями без инвазивных микозов, которые были включены в группу контроля. Наряду с клиническими методами применили аналитический метод (анализ отечественной и зарубежной литературы по исследуемому вопросу), эмпирический (анализ, сравнение и наблюдение с использованием таблиц) и проводили статистическую обработку результатов (программа STATISTICA 12.1).
Положения, выносимые на защиту
1. Основными тяжелыми редкими микозами являются мукормикоз (67,7%), а также инфекции, вызванные мицелиальными (Fusarium spp. и др.) (22,5%) и дрожжеподобными (9,7%) грибами (Trichosporon spp. и др.). Мукормикоз чаще возникал у пациентов с COVID-19 (46%), мицелиальные микозы - у онкогематологических пациентов (74%), обусловленные дрожжеподобными грибами инфекции - у пациентов отделений реанимации и интенсивной терапии (93%).
2. Наиболее распространенный фактор риска развития мукормикоза -декомпенсированный сахарный диабет (ОШ=13,3), мицелиальных микозов
длительный агранулоцитоз (ОШ=12,3), обусловленных дрожжеподобными грибами инфекций - длительное применение ЦВК (ОШ=42,3).
3. Ведущая клиническая форма мукормикоза - деструктивный риносинусит (61%) с поражением глазниц и органов зрения (31%), мицелиальных микозов - пневмония (73%) с гематогенной диссеминацией (16%), обусловленных дрожжеподобными грибами инфекций - фунгемия (77%) с диссеминацией (30%). Клинические проявления зависят от фоновых заболеваний.
4. Возбудителей тяжелых редких грибковых инфекций, преимущественно относили к мукормицетам родов Rhizopus (46%), Lichtheimia (14%) и Rhizomucor (18%); гиалогифомицетам - Fusarium spp. (27%), Paecilomyces spp. (20%), Acremonium spp. (14%); редким дрожжеподобным микромицетам -Trichosporon spp. (40%), Rodotorula spp. (33%) и Geotrichum spp. (17%).
5. Наиболее высокую эффективность при лечении показали: у пациентов с мукормикозом - липидные формы амфотерицина В (р=0,035), позаконазол (р=0,000) и изавуконазол (100% vs. 58%) и хирургическое удаление пораженных тканей (р=0,000); у пациентов с другими редкими мицелиальными микозами - вориконазол (р=0,021) и хирургическое удаление пораженных тканей (р=0,036); у пациентов с обусловленными редкими дрожжеподобными грибами инфекций - применение липидных форм амфотерицина В (р=0,0457) и замена ЦВК (р= 0,004). Наибольшее число не желательных явлений определяли при использовании амфотерицина В дезоксихолата (75%).
6. Ухудшают прогноз заболевания длительное влияние факторов риска развития тяжелых грибковых инфекций, вызванных редкими возбудителями: агранулоцитоз (р=0,000), РТПХ (р=0,000), лимфоцитопения (р=0,019), сопутствующая бактериальная инфекция (р=0,000) и длительное пребывание в ОРИТ (р=0,000), а также распространение инфекционного процесса (р=0,000). Улучшают прогноз ранняя диагностика (в течение 7 дней от начала заболевания и раняя (в первые 24 часа) антимикотическая терапия (р=0,000).
7. На фоне проводимой терапии общая выживаемость пациентов с мукормикозом в течение 90 суток составила 72%, пациентов с мицелиальными микозами - 63%, а пациентов с обусловленными дрожжеподобными грибами инфекциями в течение 30 суток - 63%.
Степень достоверности и апробация результатов исследования
Данное исследование явилось проспективным динамическим. С 2004 года сформированы регистры пациентов редкими тяжелыми грибковыми инфекциями. Весь объем проведенных обследований соответствует цели исследования и позволяет ответить на поставленные задачи. Использованные методы статистической обработки демонстрируют высокую степень достоверности полученных результатов.
По материалам диссертационного исследования опубликованы 62 научные работы. В их числе 33 статьи: из них 23 в журналах, рекомендованных ВАК при Минобрнауки России, 17 статей в журналах, входящих в базы Scopus, Web of Science, Medline.
Результаты научной работы были изложены в виде докладов на международных и региональных конференциях, а также симпозиумах. Доклады были представлены в виде постерных и устных сообщений: на конференции по медицинской микологии (Москва, 2013), 6th Advances Against Aspergillosis and Mucormycosis (Мадрид, 2014), 24th Congress European Congress of Clinical Microbiology and Infectious Diseases (ECCMID) (Барселона, 2014), «3rd forum of Zygomycosis» (Афины, 2014), 55th Interscience Conference on Antimicrobial Agents and Chemotherapy (Сан-Диего, 2015), 26th Congress European Congress of Clinical Microbiology and Infectious Diseases (Амстердам, 2016), на Всероссийском конгрессе по медицинской микробиологии, эпидемиологии, клинической микологии и иммунологии (Санкт-Петербург, 2014, 2015, 2016, 2017, 2018, 2019, 2020, 2021, 2022); 27th European Congress of Clinical Microbiology and Infectious Diseases» (Вена, 2018), 8th Advances Against Aspergillosis and Mucormycosis
(Лиссабон, 2018), 9th Advances Against Aspergillosis and Mucormycosis (Лугано, 2020), 30th European Congress of Clinical Microbiology & Infectious Diseases (Париж, 2020), на VII Внеочередном онлайн Конгрессе Международной общественной организации «Евро-Азиатское общество по инфекционным болезням» (Санкт-Петербург, 2021), 31st European Congress of Clinical Microbiology and Infectious Diseases (Вена, 2021), 10th Trends in Medical Mycology (Аберден, 2021), на Юбилейной научно-практической конференции, посвященной 10-летию образования ФГБОУ ВО СЗГМУ им. И.И. Мечникова Минздрава России «Профилактическая и клиническая медицина 2021» (Санкт-Петербург, 2021), на Всероссийской научно-практической конференции с международным участием «Мечниковские чтения» (Санкт-Петербург, 2022), на XI Петербургском форуме оториноларингологов России (Санкт-Петербург, 2022), на Российской научно-практической конференции «Управляемые и другие социально значимые инфекции: диагностика, лечение и профилактика» (Санкт-Петербург, 2023).
Результаты работы внедрены в учебный процесс кафедры клинической микологии, аллергологии и иммунологии и медицинской микробиологии федерального государственного бюджетного образовательного учреждения высшего образования «Северо-Западный государственный медицинский университет имени И.И. Мечникова» Минздрава России, в лечебно-диагностический процесс микологической клиники федерального государственного бюджетного образовательного учреждения высшего образования «Северо-Западный государственный медицинский университет имени И.И. Мечникова», ГБУЗ Ленинградкой областной клинической больницы.
Рекомендованный список диссертаций по специальности «Другие cпециальности», 00.00.00 шифр ВАК
Бронхолегочные микозы у больных туберкулезом: состав и свойства возбудителей, лабораторная диагностика2020 год, доктор наук Кулько Александр Борисович
Сравнительный анализ факторов патогенности клинических и урбанистических изолятов Aspergillus niger2019 год, кандидат наук Баязитова Алина Ахметовна
Грибы Malassezia furfur у новорождённых отделений хирургии, реанимации и интенсивной терапии: оптимизация микробиологической диагностики2021 год, кандидат наук Родченко Юлия Валериевна
Совершенствование диагностики неинвазивных микозов околоносовых пазух2020 год, кандидат наук Банников Сергей Анатольевич
Эпидемиологическая и клинико-патогенетическая характеристика инвазивных микозов (криптококкоз, кандидоз) у ВИЧ - инфицированных пациентов2018 год, доктор наук Чарушина Ирина Петровна
Введение диссертации (часть автореферата) на тему «Тяжелые грибковые инфекции, вызванные редкими возбудителями»
Объем и структура работы
Диссертационная работа изложена на 314 страницах машинописного текста и состоит из введения и шести глав. В первой главе изложен обзор литературы по изучаемой проблеме, во второй главе описаны используемые материалы и методы обследования пациентов, в последующих главах - результаты, полученные в ходе собственных исследований и заключение. По результатам работы
сформулированны выводы. В приложении приводятся алгоритмы диагностики и лечения.
Диссертация, кроме печатного текста, содержит наглядную информацию, продемонстрированную 57 таблицами и проиллюстрированную 55 рисунками, дополнительная информация содержится в приложении. Указатель литературы, использованной для анализа, состоит из 567 публикаций, из них 24 — отечественных авторов и 543 — иностранных.
Личный вклад автора
Личный вклад автора состоит в определении цели исследования, разработке и выполнении поставленных задач. Автор самостоятельно проводила сбор и анализ опубликованной литературы по проблеме исследования, осуществляла статистическую обработку полученной информации и их дальнейшую интерпретацию. Соискатель самостоятельно консультировала пациентов в различных стационарах Санкт-Петербурга, а также из других городов РФ. Создан регистр пациентов редкими микотическими инфекциями, куда включено более 300 пациентов и оценено более 250 показателей. Также соискатель участвовала в сборе биологических субстратов от пациентов для проведения микологических исследований.
Автором выполнены анализы и разъяснение полученных данных, обобщены полученные выводы и опубликованы учебные пособия, содержащие рекомендации по диагностике и лечению тяжелых грибковых инфекций, вызванных редкими возбудителями, для их внедрения в деятельность практикующих врачей и учебный процесс. Полученные результаты были изложены в научных статьях периодических изданий (в том числе в журналах, включенных в перечень ВАК), а также в тезисах докладов, изложенных в рамках научно-практических конференций и конгрессов.
Этический комитет Проведение диссертационного исследования было одобрено Локальным этическим комитетом ФГБОУ ВО СЗГМУ им. И.И. Мечникова Минздрава России, протокол от 03.11.2021 г. №10, 01.03.2023 № 3.
ГЛАВА 1 ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ 1.1. Определение тяжелых редких грибковых инфекций, вызванных редкими возбудителями.
Инвазивные грибковые заболевания представляют собой все более актуальную угрозу для пациентов с наследственным или приобретенным иммунодефицитом, особенно для гематологических и реципиентов трансплантатов органов или кроветворных стволовых клеток [308;313;452]. Благодаря новым стратегиям лечения и использованию новейших достижений медицинской науки, врачам во всем мире удается сохранить жизни тяжелым пациентоам, в то же время пролонгированные периоды иммунодефицитного состояния, дают возможность развития у них инвазивных микозов. Наиболее частые возбудители инвазивных микозов у людей - представители грибов рода Aspergillus, Candida и Cryptococcus [194;540]. В Российской Федерации, как и во всем мире, увеличивается число других микотических инфекций, вызываемых более редкими возбудителями, такими как представители родов Mucorales, Fusarium, Paecilomyces, Scedosporium, Lomentospora, Alternaria, Bipolaris, Curvularia и т.д. [188;540].
Популяционные исследования показывают, что распространенность мукормикоза на сегодня колеблется от 0,43 до 1,2 случая на миллион жителей в Европе [188]. В России распространенность заболевания составила 0,162/100 000 человек в год [531], что позволило включить мукормикоз в список орфанных заболеваний в 2020 году [14]. Другие представители плесневых и дрожжеподобных микромицетов, становились возбудителями заболевания еще более редко.
В настоящее время в Российской Федерации принято считать заболевания редкими, если патологией страдает 1 из 20000 человек, что соответствует 5/100 000 [15]. В других странах данный показатель варьирует от 5/100 000 в Корее до 64/100 000 в США и 76/100 000 в Китае [462].
Участниками глобального проекта FungiScope, который включает в себя более 100 исследователей по всему миру, в том числе и из РФ, «редкими»
предложено считать инвазивные микозы, развивающиеся у 1 из 100 000 человек в год [236]. В эту группу отнесли микотические инфекции, вызванные не-Aspergillus зрр., не-Candida ярр., не-СгурЮсоссия spp. и не-РпеитосуяНя ]&оуеси, а также неэндемичные микозы (т.е. в группу не вошли бластомикоз, кокцидиоидомикоз, гистоплазмоз, эумицетома). В Российской Федерации по настоящее время не ведется глобальный учет всех случаев инвазивных микозов, вызванных редкими возбудителями.
1.2. Распространенность тяжелых грибковых инфекций, вызванных редкими возбудителями.
Все тяжелые грибковые инфекции (ТГИ), вызванные редкими возбудителями, можно разделить на две большие группы: микозы, вызванные редкими мицелиальными микромицетами и микозы, вызванные дрожжеподобными грибами. Наиболее часто встречаются среди них, согласно зарубежным данным, мукормикоз, фузариоз, пециломикоз, родоторулез.
Мукормикоз является одной из наиболее актуальных проблем, т.к. данное заболевание характеризуется высокой летальностью и инвалидизацией пациентов. Во всем мире отмечен рост частоты мукормикоза в последние десятилетия. Так Вйаг М. и соавторы в национальном многоцентровом 10-летнем исследовании мукормикоза во Франции продемонстрировали увеличение заболеваемости от 0,7/1000 000 в 1997 г. до 1,2/1000 000 в 2006 г. [293]. В США, по результатам аутопсий у пациентов со злокачественными гематологическими заболеваниями, мукормикоз выявляли 0,006 случаев на 100 вскрытий в 1989-1993 годах и 0,018 случаев/100 аутопсий в 2004-2008 годах [193]. Распространенность мукормикоза в США в 2014 году соответствовала 1,2/100 000 [442]. О росте распространенности мукормикоза сообщают исследователи и других стран. Так, по результатам многоцентрового исследования проведенного в Испании, число случаев мукормикоза увеличилось с 1,2 случаев на 100000 госпитализаций (с 1988 по 2006 г.) до 3,3 случаев на 100 000 госпитализаций (с 2007 по 2015 г.) [291]. В Бельгии
Saegeman V. et al. (2010 г.) сообщили об увеличении случаев мукормикоза до 1,48 случаев /100000 пациенто-дней в 2009 году [292].
Аналогичный рост распространенности мукормикоза был отмечен в нескольких исследованиях, проведенных в Азии. Исследователи из Ирана сообщили о росте заболеваемости мукормикозом с 9,7% в 2008 г. до 23,7% в 2014 г. [380]. Prakash H. и коллеги из Индии, продемонстрировали рост случаев мукормикоза с 24,7 случаев в год (1990-2007 гг.) до 89 случаев в год (2013-2015 гг.) [36].
Значимый рост случаев мукормикоза описан в период пандемии COVID-19. COVID-19 ассоциированный мукормикоз ^OVID-M) привлек внимание медиков всего мира в мае 2021 года, когда появились публикации о многочисленных случаях СOVID-M в Индии [130;537]. Менее чем за год в Индии было зарегистрировано более 47 000 случаев СOVID-M [438] и более 4000 летальных исходов. Многочисленные публикации свидетельствуют об увеличении числа случаев COVID-М в Германии, Чехии, Франции, Италии, Нидерландах, Великобритании и других странах [96;472].
Истинная распространенность мукормикоза остается неизвестной, так как многие случаи остаются недиагностированными из-за сложности взятия биообразцов из глубоких тканей и отсутствия серологической диагностики. Портал Leading International Fungal Education (LIFE) предложил схему расчета распространения микозов на основании известной частоты встречаемости заболеваний у определенных категорий пациентов. По этим оценкам, ежегодная распространенность мукормикоза может составлять около 10 000 случаев в год по всему миру [439]. В России распространенность мукормикоза определяли как 0,16 случаев на 100000 в год [531]. В нашей стране общее число случаев мукормикоза и распространенность среди различных категорий пациентов, оставались неизученными.
Другими, микотическими инфекциями, вызываемыми редкими возбудителями являются фузариоз, пециломикоз, акремониоз и т.д.
Распространенность этих микозов различается в зависимости от регионов и профиля стационаров, в которых их диагностируют. Рост заболеваемости фузариозом был отмечен в Бразилии сообщали о 14,8 /1000 пациентов с острым лимфобластным лейкозом и 13,1 /1000 пациентов с острым миелобластным лейкозом [184]. В Испании распространенность фузариоза составила 0,074 /10 000 госпитализаций у гематологических пациентов [179]. В этих и других странах был отмечен рост заболеваемости фузариозом в последние годы [178;184].
Следующим, по частоте встречаемости в зарубежных источниках микозом, является сцедоспориоз. Анализ опубликованных случаев, показал, что с 2000 года по 2020 год всего было выявлено 233 случая из 18 стран. В Австралии зарегистрировано 108 случаев, в США - 53, в Испании - 20, Германии - 15, Японии - 12. Распространённость сцедоспориоза в Австралии составила 0,1/100000 населения в год [449]. В другом исследовании, проведенном в США, сообщалось о 0,2 случаях сцедоспориоза на 100 000 гематологических пациентов в период с 1989 г. по 2006 г. [497].
Анализ опубликованных данных показал, что число инвазивных микозов, вызванных грибами рода РаесИотусея зарегистрированы всего в 22 странах мира с 1967 по 2021 год. Наибольшее число случаев в США (15), меньше в Австралии (5), Индии (5), в Китае (4), Турции (4). По три случая пециломикоза было описано в Испании и Чили, еще меньше в Канаде, Франции, Германии, Греции, единичные в Бразилии, Колумбии, Хорватии, Иране, Италии, Японии, Португалии, Словении, Тайване, Великобритании [104].
К редким микотическим инфекциям относят и акремониоз. Всего 177 публикаций клинических случаев было приведено в электронных базах данных на 2021 год. Больше половины из них посвящены поверхностным, локальным инфекциям. Клинические случаи инвазивных тяжелых инфекций описаны в Пакистане [71], Испании [395], Индии [44], Франции [46], Иране [43] и других странах. Практически не были описаны серии случаев, в связи с чем, можно считать, что распространенность заболеваний во всем мире остается неизвестной.
В настоящее время возбудители заболевания объединены в одну группу с другим родом грибов Scopulariopsis.
Распространенность инфекций, вызванных Scopulariopsis spp., остается также неизвестной. Всего в медицинской литературе до 2020 года насчитывалось 554 публикации, связанные с грибами рода Scopulariopsis. При этом было описано 86 случаев скопуляриоза из 24 стран. Большинство случаев было зарегистрировано в США, Франции и Испании [320]. В среднем число зарегистрированных случаев было менее 1/1000 000 населения в год в каждой из этих стран.
В одном из многоцентровых исследований в Китае было получено 29 изолятов Penicillium spp. Изоляты в основном были получены от пациентов с легочными заболеваниями (56,8%), аутоиммунными заболеваниями (12,6%) и СПИДом (5,4%) [514]. Всего за последние 20 лет был опубликован 41 клинический случай инвазивного микоза, связанный с этим возбудителем. Большинство из них зарегистрировано в США, Индии и Великобритании [108;312;562]. По одному в Мексике, Бразилии и Польше [161;368;412].
К микотическим инфекциям, вызываемыми редкими возбудителями, относят феогифомикозы. В эту группу заболеваний относят инвазивные инфекции, вызываемые Alternaria spp., Bipolaris spp., Aureobasidium spp., Cladophialophora spp., Exophiala spp., Cladosporium spp., Chaetomium spp., Curvularia spp. и пр. Наиболее часто, они вызывают поверхностные кератиты или поражения кожи. Так, например, в Индии на грибы рода Alternaria и Curvularia приходится 7% кератитов, связанных с плесенью [518]. Феогифомикозы являлись причиной инвазивных микозов почти у 10% реципиентов трансплантатов органов в наблюдаемом 10-летнем исследовании профильного стационара в США [402].
Возбудителями микотические инфекции, наиболее часто описывают грибы родов Malassezia, Pseudozyma (Moesziomyces), Rhodotorula, Sporobolomyces, Trichosporon, Geotrichum, Kodamaea, Saccharomyces и Saprochaete. При этом доля всех не-Candida микозов, составляет около 1-2 % инвазивных микотических инфекций. Так в Дании редкие инвазивные микозы вместе составили только 1,1%
из 4000 случаев грибковой инфекции за 8 лет [185], в то время как в Китае до 1,7% [288]. В Испании, в течение 2-х лет наблюдения, случаи инвазивных микозов, вызванных редкими возбудителями, составили 1,8% [234]. В другом крупном исследовании, анализирующем 2155 изолятов дрожжеподобных возбудителей, полученных из крови в течение года, показано, что причиной редких микозов в основном были: Trichosporon spp. (1,1%), Rhodotorula spp. (0,5%), Kodamaea ohmeri (0,3%) и Malassezia spp. (0,2%) [541].
В России описаны случаи развития микозов, обусловленных мукормицетами, редкими плесневыми микромицетами и дрожжеподобными грибами. Однако систематизация этих случаев, анализ фоновых заболеваний и состояний, факторов риска, клинических проявлений, диагностики, тактики и эффективности лечения не проводили [5;7;9;11;12;18;19].
1.3. Характеристика возбудителей тяжелых редких грибковых инфекций. Характеристика возбудителей мукормикоза.
Мукормицеты - низшие грибы в царстве Fungi. Они являются представителями отдела Zygomycota и делятся на классы Trichomycetes и Zygomycetes.
Клинически значимыми для иммуноскомпрометированных пациентов являются грибы класса Zygomycetes, который, был разделен на три порядка: Mucorales, Mortierellales и Entomophthorales. Большинство возбудителей входят в порядок Mucorales и относятся к семействам Mucoraceae, реже Cunninghamellaceae, Saksenaeaceae, Thamnidiaceae, Syncephalastraceae. Представители родов Rhizopus, Mucor, Lichtheimia, Rhizomucor и Apophysomyces относят именно к первому семейству Mucoraceae (подсемейство Mucormycotina) (табл.1).
Мукормицеты в большом количестве обнаруживают в почве. Споры грибов обнаруживают в пищевых продуктах, компосте, в сырых помещениях, системах вентиляции. Мелкий размер спор (около 6,6 мкм) позволяет с циркулирующими
потоками воздуха перемещаться на значительные рассотяния. Концентрация спор меняется постоянно в пределах одного здания или помещения. В связи с чем, грибы Mucorales spp. часто выявляют в качестве контаминатов. Это обстоятельство обуславливает необходимость в многократном исследовании биосубстратов и соблюдение санитарных норм в помещениях лабораторий.
Таблица 1
Классификация мукормицетов
Подсемейство Род Виды, наиболее частых возбудителей мукормикоза
Mucormycotina Apophysomyces A. variabilis
Cunninghamella C. bertholletiae
Lichtheimia (Absidia) L. corymbifera L. Ramosa
Mucor M. circinelloides
Rhizopus R arrhizus (oryzae) R. microsporus
Rhizomucor R pusillus
Saksenaea S. vasiformis
Entomophthoromycotina Basidiobolus B. ranarum
Conidiobolus C. coronatus
Глобальный мета-анализ всех опубликованных с 2000 по 2017 года случаев мукормикоза показал, что наиболее частой причиной заболевания были грибы рода Rhizopus spp. (48% всех случаев), затем Mucor spp. (14%), Lichtheimia spp. - 13%, Apophysomyces spp. - 8%, Rhizomucor spp. - 6%, Cunninghamella spp. - 7%, Saksenaea complex - 3%, другие - 2%. Среди Rhizopus spp. наиболее частым этиологическим значимым патогеном был Rhizopus arrhizus (ранее Rhizopus oryzae) (33%) [539].
Грибы Mucorales обычно быстро растут, образуя широкие гифы, не имеющие перегородок на регулярном расстоянии и включающие большое количество ядер. Септы обычно образуются для разграничения репродуктивных структур или
набухших частей. При тканевой инфекции они могут образовывать перегородки, но не на одинаковых расстояниях, как у аскомицетообразных грибов.
Rhizopus spp. - цвет колонии имеют сероватый или белый, коричневый или желтовато-коричневый. Субстратный воздушный мицелий шерстистый и довольно обильный. Мицелий образуется путем скопления несептированных гиф, как правило, бесцветный. Спорангиофоры длиной около 100-200 мкм, могут раполагаться одиночно или группами; характерно наличие ризоидов. Спорангии с черной или коричневой апофизой, а сами споры - округлые и угловатые, размером 8,2-18,8 мкм [415].
Mucor spp. - колонии гладкие, бархатистые, серые. Субстратный мицелий тоже несептирован. Спорангиеносцы прямостоящие, длиной 180-400 мкм с одной или двумя ветвями, отходящими под прямым углом. Ризоиды отсутствуют. Спорангии имеют апофизу бурого или темно-серого цвета около 60 мкм в диаметре, а споры 3-5 мкм [415].
Lichtheimia spp. - колонии пушистые, цвет - белый, серый. Спорангиеносцы крупные, до 250 мкм длиной, ветвящиеся, растут из столона между ризоидами. Спорангии (25-35 мкм) гиалиновые, многоспоровые и грушевидные по форме, а колумелла (15-21 мкм) куполообразная с выступающим колбовидным апофизом. Внутри спорангиев формируются гиалиновые спорангиоспоры 2-3*3-4 мкм, шаровидные или эллиптические, бесцветные, гладкие или шероховатые. Мицелий несептирован (или редко септирован) [22;40].
Rhizomucor spp. - колонии белые, серо-коричневые. Воздушный мицелий незначительный. Спорангиеносцы вырастают из ветвящихся воздушных гиф или из столона. Ризоиды развиты слабо. Спорангии шарообразные, содержат мелкие круглые спорангиоспоры. Термоустойчив - растет при температуре свыше 55°С.
Наблюдения показывают, что таксоны, такие как Apophysomyces, Saksenaeaceae и Circinella simplex, распространены в тропических и субтропических регионах. Сообщения о Apophysomyces spp. и Saksenaeaceae ssp. в
более холодных регионах связаны с клиническими изолятами, которые были завезены из южных ареалов [563].
В настоящее время известно, что возбудители порядка Mucorales чувствительны к амфотерицину В, позаконазолу и изавуконазолу in vivo и in vitro. В то же время практически все полученные изоляты были не чувствительны к эхинокандинам, вориконазолу, итраконазолу, флуконазолу, тербинафину [287].
Характеристика возбудителей тяжелых микозов, вызванных редкими нитчатыми микромицетами.
Редкие мицелиальные микромицеты можно разделить на две большие группы гиалогифомицеты и феогифомицеты. Гиалогифомикозы это группа заболеваний, которые вызывают светлоокрашенные («гиалиновые») мицелиальные грибы (Fusarium spp., Scedosporium spp., Acremonium spp., Paecilomyces spp., Scopulariopsis spp. и Trichoderma spp.). Инфекции, обусловленные феогифомицетами, тоже относят к редким заболеваниям. Основные возбудители - это темноокрашенные грибы Alternaria spp., Bipolaris spp., Fonsecaea spp., Exophiala spp., Phialophora spp., Phoma spp., Wangiella spp. и пр. Все они распространены в окружающей среде и часто являются возбудителями заболеваний культурных растений.
Fusarium spp. - наиболее распространенные, клинически значимые, редкие плесневые микромицеты. Основные возбудители фузариоза - F. oxysporum, F. Solani (новое наименование Neocosmospora solani), F. verticillioides, F. proliferatum, F. subglutinans, F. equiseti и F. chlamydosporum. Распространены эти микромицеты повсеместно, наибольшее число их обнаруживают в почве, а также на различных частях растенияй, в том числе зернах злаков. Представители рода Fusarium могут образовывать биопленки на внутривенных катетерах, а также на мягких контактных линзах. Эти грибы могут колонизировать системы распределения воды в больницах и соответственно стать потенциальными источниками внутрибольничной инфекции.
Fusarium spp., образуют пушистые, плоские или раскидистые колонии. Цвет колонии сверху белый, кремовый, рыжевато-коричневый, лососевый, желтый, красный, розовый или фиолетовый. На нижней стороне цвет может быть рыжевато-коричневым, красным, темно-фиолетовым. Микромицеты обычно производят как макроконидии, так и микроконидии из тонких фиалидов. Макроконидии бесцветные, от двух до нескольких клеток, от веретенообразной до серповидной формы, в основном с удлиненной апикальной клеткой и базальной клеткой на ножке. Микроконидии от 1 до 2 клеток, гиалиновые, грушевидные, от веретенообразных до яйцевидных, прямые или изогнутые [401]. Проведенные исследования, показали, что грибы рода Fusarium чувствительны к амфотерицину В, вориконазолу, позаконазолу, изавуконазолу и не чувствительны к другим азолам, эхинокандинам [72].
Scedosporium spp. встречается повсеместно в качестве почвенного сапрофита, преимущественно в засушливых ареалах Австралии, Юго-западной части США и в Испании, в связи с чем в этих странах большее число зарегистрированных случаев заболевания. При образовании колоний мицелий микромицетов разделен перегородками, от гиалинового до бледно-коричневого цвета. Гифы шириной 1,32,9 мкм. Конидиофоры одиночные, часто редуцируются до конидиогенной клетки, возникающей из недифференцированной гифы (длиной 5-15 мкм) [500].
Paecilomyces spp. являются основными агентами загрязнения пищевых продуктов, прежде всего растительного происхождения. Их также можно найти в: маргарине, плавленых сырах, сухофруктах, крупах, злаках, фруктах, мясных продуктах, орехах, масле и семенах. Этот вид способен разлагать пищевые консерванты, например, бензойную и пропионовую кислоты, что приводит к изменению запаха пищевых продуктов. В недавнем исследовании было показано, что P. variotii был третьим наиболее частым термофильным таксоном, выделенным из испорченных оливок и оливкового жмыха. P. variotii также обнаруживали в пшеничной муке, кускусе, рисе и макаронах. Виды Byssochlamys были выделены из пищевых продуктов в разных странах: Франции, Швейцарии, Нидерландах, США,
Китае, Бельгии, Канаде и др. [429]. B. nivea (анаморфа Paecilomyces niveus), B. spectabilis (анаморфа Paecilomyces variotii) и B. fulva (анаморфа Paecilomices fulvus) часто связаны с порчей фруктовых соков [232]. Способность выдерживать термическую обработку обусловлена образованием аскоспор. Эти виды производят аскоспоры способные выживать 100 мин при 850C, а их термостойкость обычно увеличивается с повышением концентрации сахара [465]. Дополнительными факторами являются рН и органические кислоты, противодействующие термоустойчивости аскоспор, но только при рН ниже 4 [371]. Колонии грибов, обычно гладкие желтого или темно-бордового цвета, растут при температурах до 43-45°С. Конидиофоры грибов неравномерно разветвлены и содержат один или несколько фиалидов. Фиалиды колбовидной формы с широким основанием и узкой вершиной, размером в среднем 16,3 х 2,28 мкм. Конидии обычно в цепочках, цвет от лимонного до желтовато-бордового, эллипсоидной или цилиндрической формы с усеченными концами, размером 4,78 х2,75 мкм. Могут формировать хламидоспоры. Одной из особенностей культур является способность синтезировать кислоты [371].
Acremonium spp. относят к типу Ascomycota, подтипу Ascomycotina, семейству Hypocreaceae, роду Acremonium. Распространены они повсеместно; их часто выявляют в почве и на гниющих растениях. Acremonium spp. в свою очередь контаминируют различные компоненты зданий, особенно пострадавшие от воды. Acremonium spp. зачастую обнаруживают в системах кондиционирования воздуха, увлажнителях, сливных поддонах и оконных уплотнениях. Микромицеты данного рода включают около 150 видов. Большинство видов являются сапрофитами и не вызывают заболеваний при попадании в организм человека или животного. Однако, некоторые виды могут вызывать поверхностные микозы (например, кератит) у иммунокомпетентных пациентов или поражение внутренних органов у иммуноскомпрометированных пациентов.
Известно 9 видов Acremonium spp., вызывающих микозы у человека: A. falciforme, A. recifei, A. kiliense (новое название - Sarocladium kiliense), A. potronii, A.
roseogriseum (новое название - Gliomastix roseogrisea), A. strictum (новое название -Sarocladium strictum), A. alabmensis, A. blochi и A. astrogriseum. A. kiliense и A. falciforme чаще вызывают мицетому, Sarocladium strictum - пневмонию. Acremonium spp. могут колонизировать верхние дыхательные пути и вызывать микоаллергоз. Все Acremonium spp. устойчивы in vitro к амфотерицину В (АмВ), эхинокандинам, флуконазолу и итраконазолу. Чувствительны к вориконазолу [517]. Acremonium spp. легко растут при 30 °C на глюкозо-пептонном агаре, образуя колонии примерно 50 мм за 7 дней. Колонии плоские, с гладкой, влажной, бархатистой или хлопьевидной текстурой. Цвет мицелия варьирует от светло-розового до оранжевого, иногда желтого, белого или зеленого. Фиалиды длинные и тонкие, конидии имеют цилиндрическую или эллипсоидальную форму, образованные слизистыми пучками на кончиках [93]. Виды Acremonium морфологически очень похожи, что затрудняет их идентификацию.
Scopulariopsis spp. содержит как гиалиновые, так и дематиевые плесени, а их телеоморфы входят в род Microascus (отряд Microascales). Это сапрофиты, обычно выделяемые из почвы, воздуха, растительных остатков, бумаги и влажной среды помещений [222]. Основные возбудители - S. brevicaulis, S. acremonium, S. brumptii и S. candida. Наибольшую клиническую значимость имеет вид Scopulariopsis brevicaulis, который отличается низкой чувствительностью ко всем известным в настоящее время антимикотикам in vitro. Scopulariopsis spp. образуют колонии белого, бледно-серого, бледно-коричневого или коричневого цвета. Мицелий преимущественно гиалиновый. Фиалиды гиалиновые или бледно-коричневые, цилиндрические, с широким плоским конидиогенным отверстием и в основном образуются плотно на конидиеносцах. Конидии гиалиновые или бледно-коричневые, гладкие или отчетливо шероховатые, часто с выступающим основанием. Аскоспоры обычно почковидные или полулунные, гиалиновые или бледно-желтые [471].
Penicillium spp. широко распространены в природе. Виды Penicillium распознают по плотным щеткообразным спороносным структурам, называемыми
пенициллами. Конидиофоры простые или разветвленные и заканчиваются скоплениями колбовидных фиалид. Споры (конидии) образуются сухими цепочками из кончиков фиалид, с самой молодой спорой в основании цепочки, и почти всегда зеленые. Ветвление является важным признаком для идентификации Penicillium spp.. Грибы Penicillium — большой и сложный род, встречающийся почти повсеместно, и обычно самый многочисленный род грибов в почве [391]. Грибы рода Penicillium активно используют в фармацевтической и пищевой промышленности (например, P. chrysogenum используют для получения пенициллина, а P. camemberti и P. roqueforti применяют в изготовлении сыров). В современной классификации грибов некоторые Penicillium spp. отнесли к роду Talaromyces. Например, P. marneffei и P. purpurogenum теперь называются Talaromyces marneffei и T. purpurogenus. Основные возбудители инфекции у человека - P. chrysogenum, P. citrinum, P. decumbens, P. commune, P. oxalicum [110].
Trichoderma spp. распространены повсеместно, сапрофитируют в почве. Trichoderma spp. используют в агропромышленности в качестве фунгицидов. Виды Trichoderma образуют белые, зеленые или желтые колонии. Гифы оканчиваются конидиеносцами, которые дают боковые ответвления с завитками коротких фиалид. Одноклеточные споры (конидии) образуются последовательно из кончиков фиалид. Виды Trichoderma могут убивать другие грибы с помощью вырабатываемых ими токсинов и литических ферментов. Это свойство широко используют в сельском хозяйстве, для биологической борьбы с некоторыми грибами, вызывающими болезни растений. С другой стороны, Trichoderma spp. могут быть серьезными вредителями на культивируемых растениях. Виды Trichoderma сапрофитируют в почве (особенно во влажной), навозе и разлагающихся растительных остатках. Возбудители инвазивных микозов в основном относят к виду Trichoderma longibrachiatum, реже - T. harzianum, T. koningii, T. pseudokoningii, T. viride. Trichoderma spp. - полирезистентные патогены, устойчивы in vitro к эхинокандинам, флуконазолу, итраконазолу и флуцитозину.
Похожие диссертационные работы по специальности «Другие cпециальности», 00.00.00 шифр ВАК
Поверхностные микозы кожи у ВИЧ-инфицированных пациентов: этиология, клиника, диагностика и лечение2015 год, кандидат наук Райденко, Ольга Васильевна
Влияние микотического поражения кожи и ногтей на показатели тяжести течения бронхиальной астмы2017 год, кандидат наук Жучков, Михаил Валерьевич
Особенности диагностики и лечения онихомикоза, обусловленного недерматомицетами2015 год, кандидат наук Кубасова, Наталья Леонидовна
СОВЕРШЕНСТВОВАНИЕ ИДЕНТИФИКАЦИИ ВОЗБУДИТЕЛЕЙ ОСОБО ОПАСНЫХ МИКОЗОВ НА ОСНОВЕ МОЛЕКУЛЯРНО-ГЕНЕТИЧЕСКИХ МЕТОДОВ2016 год, кандидат наук Маркин Александр Михайлович
Инвазивные микозы у пациентов с острыми лейкозами на фоне цитостатической химиотерапии2017 год, кандидат наук Зюзгин, Илья Сергеевич
Список литературы диссертационного исследования доктор наук Хостелиди Софья Николаевна, 2023 год
СПИСОК ЛИТЕРАТУРЫ
1. Аравийский, Р. А. Диагностика микозов / Р. А. Аравийский, Н. Н. Климко, Н. В. Васильева. - Санкт-Петербург: СПбМАПО, 2004. - 186 с.
2. Диагностика и лечение микозов в отделениях реанимации и интенсивной терапии: Российские рекомендации / отв. ред. Н. Н. Климко. - 2-е изд., доп. и перераб. - Москва: Фармтек, 2015. - 96 с.
3. Диагностика и лечение микозов в отделениях реанимации и интенсивной терапии. Российские национальные рекомендации / под ред. Н. Н. Климко. Москва: Боргес, 2015. - 92 с.
4. Инвазивные микозы, обусловленные редкими возбудителями, у детей со злокачественными опухолями и незлокачественными заболеваниями кроветворной и лимфатической ткани на фоне трансплантации костного мозга и противоопухолевой химиотерапии / Ю. А. Рогачева, М. О. Попова, И. В. Маркова [и др.] // Педиатрия. Журнал им. Г. Н. Сперанского. - 2019. №1. - С. 28-35.
5. Инвазивные микозы, обусловленные редкими возбудителями, у онкогематологических больных на фоне трансплантации костного мозга и противоопухолевой химиотерапии / Ю. А. Рогачева, М. О. Попова, А. Г. Волкова [и др.] // Проблемы медицинской микологии. -2017. - №4. - С.10-14.
6. Инвазивный микоз, обусловленный Aureobasidium pullulons, у ребенка с острым миелобластным лейкозом (собственное клиническое наблюдение) / Н. С., Багирова, А. В. Попа, Т. С. Богомолова [и др.] // Клиническая онкогематология. -2018. - №3. - С.259-264.
7. Инфекции, вызванные редкими плесневыми грибами, в гематологии. / И. И. Калинина, У. Н. Петрова, О. В. Горонкова [и др.] // Онкогематология. - 2012. - № 4. - С. 35-42.
8. Климко, Н. Н. Микозы: диагностика и лечение. Руководство для врачей. / Н.Н. Климко. - 3-е изд., испр. и доп. - Москва: Ви Джи Групп, 2017. - 336 с.
9. Клинический случай легочной формы мукормикоза у ребенка с острым лимфобластным лейкозом. / Ю. Ю. Козель, О. Ю. Куцевалова, В. В. Дмитриева [и
др.] // Южно-Российский онкологический журнал: South Russian Journal of Cancer.
- 2021. - Т.2, №4. - С. 13-17.
10. Меледина, Т. В. Дрожжи Saccharomyces cerevisiae. Морфология, химический состав, метаболизм: учеб. пособие / Т. В. Меледина, С. Г. Давыденко. - Санкт-Петербург: Университет ИТМО; ИХиБТ, 2015. - 88 с.
11. Менингиты, обусловленные Rhodotorula mucilaginosa: клиническое наблюдение и обзор / Ю. В. Борзова, Т. С. Богомолова, М. Н. Артемьева [и др.] // Проблемы медицинской микологии. - 2017. - №3. - С.13-16.
12. Острый диссеминированный фузариоз (обзор). Описание клинического случая / С. Н. Хостелиди, С. М. Мошнина, А. А. Мясников [и др.] // Проблемы медицинской микологии. - 2012. - №4. - С.33-37.
13. Первое описание клинического случая мукормикоза околоносовых пазух в Пермском крае / А. О. Чарушин, С. Н. Хостелиди, Р. И. Боровинский [и др.] // Проблемы медицинской микологии. - 2022. -Т.24, №1. - С. 19-25.
14. Перечень редких (орфанных) заболеваний (minzdrav.gov.ru)
15. Практическое руководство по антиинфекционной химиотерапии / под ред. Л. С. Страчунского, Ю. Б. Белоусова, С. Н. Козлова. - Смоленск: МАКМАХ, 2007. -586 с.
16. Профилактика, диагностика и лечение новой коронавирусной инфекции (COVID-19). Временные методические рекомендации. Версия 10 (08.02.2021) (утв. Минздравом России 8 февраля 2021 г.). https://static-0.minzdrav.gov.ru/.
17. Случай успешного лечения микотического менингита, обусловленного Candida albicans и Trichosporon asahii / Е. В. Шагдилеева, Е. Р. Рауш, Ю. А. Васильева [и др.] // Успехи медицинской микологии. - 2013. - Т. 11. - С. 245-247.
18. Случай успешного лечения редкого микоза лёгких, вызванного Acremonium spp. у пациента с острым миелобластным лейкозом (М4эо) / С. Н. Хостелиди, Ю. Э. Мелехина, Д. А. Горностаев [и др.] // Проблемы медицинской микологии. - 2014.
- №3. С. 33-37.
19. Успешная диагностика и лечение фузариоза у больной острым лейкозом. /Н.
A. Батманова, Н. С. Багирова, З. В. Григорьевская [и др.] // Гематология и трансфузиология. -2022;67(1): 139-149. URL: doi:10.35754/0234-5730-2022-67-1-139-149.
20. Хостелиди, С.Н. Диагностика и лечение инзазивных микозов, обусловленных редкими плесневыми микромицетами, в Санкт-Петербурге / С. Н. Хостелиди, Ю.
B. Борзова, О.В. Шадривова [и др.] // Проблемы медицинской микологии. - 2015. -Т.17. - № 2. - С. 146.
21. Хостелиди, С.Н. Диагностика и лечение микозов, обусловленных редкими дрожжеподобными грибами, в Санкт-Петербурге / С. Н. Хостелиди, Т. С. Богомолова, М. О. Попова [и др.] // Проблемы медицинской микологии. - 2015. -Т. 17. - № 2. - С.145.
22. Хостелиди, С. Н. Диагностика и лечение мукормикоза у иммуноскомпрометированых больных: учеб. пособие /. С. Н. Хостелиди, Н. Н. Климко. - Санкт-Петербург: Изд. дом ГБОУ ВПО СЗГМУ им. И.И. Мечникова, 2015. - 48 с.
23. Хостелиди, С. Н. Микозы, вызванные редкими мицелиальными грибами: учеб. пособие. / С. Н. Хостелиди, Н. Н. Климко. - Санкт-Петербург: Изд. дом ГБОУ ВПО СЗГМУ им. И.И. Мечникова, 2021. - 66 с.
24. Электронно - микроскопическое исследование Lichtheimia spp. In vivo и in vitro / А. А. Степанова, С. Н. Хостелиди, Р. А. Аравийский [и др.] // Проблемы медицинской микологии. - 2012. - №4. - С. 55-61.
25. А Sphenoid sinusitis with intracranial extension produced by an emergent fungus. / Y. Е. Carpintero, M. E. Soley, M. B. R. Cueto, M. P. Moreno // Acta Otorrinolaringol Esp. -2011. - Vol. 62. - №2. - P. 158-60.
26. A case of cerebral pheohyphomycosis in an immunocompetent patient: emphasis on intraoperative findings / A. Aggarwal, P. Salunke, S. Mohindra [et al.] // Neurol India. -2014. - Vol. 62. - №5. - P. 551-552.
27. A challenging complication following SARS-CoV-2 infection: a case of pulmonary mucormycosis / D. Pasero, S. Sanna, C. Liperi [et al.] // Infection. - 2020. - Vol. 17. - P. 1-6.
28. A cluster of Geotrichum clavatum (Saprochaete clavata) infection in haematological patients: a first Italian report and review of literature / M. I. Del Principe, L. Sarmati, M. Cefalo, [et al.] // Mycoses/ - Vol. 59. - №9. - P. 594-601.
29. A comparison of histomorphologic diagnosis with culture- and immunohistochemistry-based diagnosis of invasive aspergillosis and mucormycosis / H.-J. Son, J. S. Song, S. Choi [et al.] // Infect. Dis. - 2020. - Vol. 52. - P. 279-283.
30. A global analysis of mucormycosis in France: the RetroZygo Study (2005-2007) / F. Lanternier, E. Dannaoui, G. Morizot [et al.]. French Mycosis Study Group // Clin Infect Dis. - 2012. - Vol. 54. - Suppl 1. - P. 35-43.
31. A modified technique to fabricate a complete hollow obturator for bilateral maxillectomy in a patient with mucormycosis—A technical case report / U. M. Mani, K. Mohamed, A. Krishna Kumar, A. Inbarajan // Spec. Care Dent. - 2019. - Vol. 39. - P. 610-616.
32. A Mycoses Study Group International Prospective Study of Phaeohyphomycosis: An Analysis of 99 Proven/Probable Cases / S. G. Revankar, J. W. Baddley, S. C. Chen [et al.] // Open Forum Infect Dis. - 2017. - Vol. 4. - №4. - P.ofx200.
33. A new solid oral tablet formulation of posaconazole: a randomized clinical trial to investigate rising single- and multiple-dose pharmacokinetics and safety in healthy volunteers / G. Krishna, L. Ma, M. Martinho, R. A. Preston, E. O'Mara // J Antimicrob Chemother. - 2012. - Vol. 67. - №11. - P. 2725-2730.
34. A novel fungal pathogen under the spotlight--Acremonium spp. associated fungaemia in an immunocompetent host / T. Purnak, Y. Beyazit, G. O. Sahin [et al.] // Mycoses. - 2011. - Vol. 54. - №1. - P. 78-80.
35. A phylogenetic and taxonomic re-evaluation of the Bipolaris-Cochliobolus-Curvularia complex / D. S. Manamgoda, L. Cai, E. H. C. McKenzie [et al.] // Fungal Diversity. - 2012. - Vol. 56. - №1. - P. 131-144.
36. A prospective multicenter study on mucormycosis in India: Epidemiology, diagnosis, and treatment / H. Prakash, A. K. Ghosh, S. M. Rudramurthy [et al.] // Med Mycol. - 2019. - Vol. 57. - №4. - P. 395-402.
37. A rare case of hemorrhagic pneumonia due to Cladosporium cladosporioides / S. Grava, F. A. Lopes, R. S. Cavallazzi [et al.] // J Bras Pneumol. - 2016. - Vol. 42. - №№5. -P. 392-394.
38. A rationale for reduced-frequency dosing of anidulafungin for antifungal prophylaxis in immunocompromised patients / R J.Brüggemann, W. J. Van Der Velden, C. A. Knibbe [et al.] // J Antimicrob Chemother. - 2015. - Vol. 70. - №4. - P. 1166-1174.
39. A retrospective cohort of invasive fusariosis in the era of antimould prophylaxis / A. Fernández-Cruz, M. A. Semiglia, J. Guinea [et al.] // Medical mycology, - 2020. -Vol. 58. - №3. - P. 300-309.
40. A significant number of reported Absidia corymbifera (Lichtheimia corymbifera) infections are caused by Lichtheimia ramosa (syn. Lichtheimia hongkongensis): an emerging cause of mucormycosis / P. C. Woo, S. Y. Leung, A. H. Ngan [et al.] // Emerg Microbes Infect. - 2012. - Vol. 1. - №8. - P.e15.
41. Acremonium phylogenetic overveiw and revision of Gliomastix, Scarocladium and Trichothecium / R. C. Summerbell, C. Gueidan, H. J. Schroers [et al.] // Stud Mycol. -2011. - Vol. 68. - P. 139-162.
42. Acremonium pneumonia successfully treated in patient with acute myeloid leukemia: a case report / N. N. Klimko, S. N. Khostelidi, Y. E. Melekhina [et al.] // J Bacteriol Mycol Open Access. - 2016. - Vol. 2. - №5. - P. 116-119.
43. Acremonium Pneumonia: Case Report and Literature Review / A. Fakharian, A. Dorudinia, I. Alavi Darazam [et al.] // Tanaffos. - 2015. - Vol. 14. - №2. - P. 156-160.
44. Acremonium species: a review of the etiological agents of emerging hyalohyphomycosis / S. Das, R. Saha, S. A. Dar, V. G. Ramachandran // Mycopathologia. - 2010. - Vol. 170. - №6. - P. 361-375.
45. Acremonium strictum fungaemia in a paediatric patient with acute leukaemia / A. Warris, F. Wesenberg, P. Gaustad, [et al.] // Scand J Infect Dis. - 2000. - Vol. 32. - №4.
- p. 442-444.
46. Acremonium strictum pulmonary infection in a leukemic patient successfully treated with posaconazole after failure of amphotericin B / R. Herbrecht, V. Letscher-Bru, C. Fohrer [et al.] // Eur J Clin Microbiol Infect Dis. - 2002. - Vol. 21. - №11. - P. 814-817.
47. Acrophialophora fusispora brain abscess in a patient with acquired immunodeficiency syndrome: a case report and review of the literature / C-W. Li, H-C. Lee, T. C. Chang [et al.] // Diagn Microbiol Infect Dis. - 2013. - Vol. 76. - P. 368-371.
48. Activities of caspofungin, itraconazole, posaconazole, ravuconazole, voriconazole, and amphotericin B against 448 recent clinical isolates of filamentous fungi / D. J. Diekema, S. A. Messer, R. J. Hollis [et al.] // J Clin Microbiol. - 2003. - Vol. 41. - №8.
- P. 3623-3626.
49. Activity of Amphotericin B Formulations and Voriconazole, Alone or in Combination, against Biofilms of Scedosporium and Fusarium spp / K. Vikelouda, M. Simitsopoulou, L. Skoura [et al.] // Antimicrob Agents Chemother. - 2021. - Vol. 65. -№11. - P. e00638-21.
50. Acute invasive fungal rhinosinusitis: MR imaging features and their impact on prognosis / Y. R. Choi, J. H. Kim, H. S. Min, [et al.] // Neuroradiology. - 2018. -Vol. 60.
- №7. - P. 715-723.
51. Acute Invasive Rhino-Orbital Mucormycosis in a Patient With COVID-19-Associated Acute Respiratory Distress Syndrome / Z. K. Mekonnen, D. C. Ashraf, T. Jankowski [et al.] // Ophthalmic Plast Reconstr Surg. - 2021. - Vol. 37. - №2. - P. 40-80.
52. Acute ischemia of bilateral lower extremities as a presenting feature of disseminated mucormycosis endocarditis: A case report / N. Tachamo, P. Rajagopalan, S. Nazir [et al.] // J Community Hosp Intern Med Perspect. - 2016. - Vol. 6. - №6. - P. 33215.
53. Adler-Moore J. P. Amphotericin B lipid preparations: what are the differences?/ J. P. Adler-Moore, R. T. Proffitt // Clin Microbiol Infect. - 2008. - Vol. 14. - № 4. - P. 2536.
54. Ajith Kumar A. K. Rhino-orbital Cerebral Mucormycosis / AK AK, V.Gupta //StatPearls [Internet]. Treasure Island (FL): StatPearls Publishing. - 2022. - PMID: 32491361.
55. Alekseyev K. Rhinocerebral mucormycosis and COVID-19 pneumonia / K. Alekseyev, L. Didenko, B. Chaudhry // J Med Cases. - 2021. - Vol. 12. - №3. - P. 85-89.
56. All You Need to Know and More about the Diagnosis and Management of Rare Mold Infections / M. Hoenigl, S. M. Levitz, A. N. Schuetz [et al.] // mBio. - 2021. - Vol. 12. - №1. - e02920-20. - doi:10.1128/mBio.02920-20.
57. All You Need To Know and More about the Diagnosis and Management of Rare Yeast Infections / R. Sprute, C O. A.ornely, S. C. Chen [et al.] // mBio. - 2021. - Vol. 12.
- №4. - P. e0159421. doi:10.1128/mBio.01594-21.
58. Alper I. Ribosomal DNA polymorphisms in the yeast Geotrichum candidum / I. Alper, M. Frenette, S. Labrie // Fungal Biol. - 2011. - Vol. 115. - P. 1259-1269. - doi: 10.1016/j.funbio.2011.09.002.
59. Als3 is a Candida albicans invasin that binds to cadherins and induces endocytosis by host cells / Q. T. Phan, C. L. Myers, Y. Fu [et al.] // PLoS Biol. - 2007. - Vol. 5. - №3.
- P. 64. - doi: 10.1371/journal.pbio.0050064.
60. Alternaria redefined / J. H. Woudenberg, J. Z. Groenewald, M. Binder, P. W. Crous // Studies in mycology. - 2013. - Vol. 75. - №1. - P. 171-212. -https://doi.org/10.3114/sim0015.
61. Amphotericin B and Other Polyenes-Discovery, Clinical Use, Mode of Action and Drug Resistance / H. Carolus, S. Pierson, K. Lagrou, P. Van Dijck // J Fungi (Basel). -2020. - Vol. 6. - №4. - P. 321. -doi: 10.3390/jof6040321.
62. Amphotericin B-induced renal tubular cell injury is mediated by Na+ Influx through ion-permeable pores and subsequent activation of mitogen-activated protein kinases and elevation of intracellular Ca2+ concentration / T. Yano, Y. Itoh, E. Kawamura
[et al.] // Antimicrob Agents Chemother. - 2009. - Vol. 53. - №4. - P. 1420-1426. -doi: 10.1128/AAC.01137-08.
63. An Adult Zebrafish Model Reveals that Mucormycosis Induces Apoptosis of Infected Macrophages / A. Lopez-Munoz, F. E. Nicolas, D. Garcia-Moreno [et al.] // Sci Rep. - 2018. - Vol. 8. - №1. - P. 12802. - doi: 10.1038/s41598-018-30754-6.
64. An integrated genomic and transcriptomic survey of mucormycosis-causing fungi / M. C. Chibucos, S. Soliman, T. Gebremariam [et al.] // Nat. Commun. - 2016. - Vol. 7.
- P. 12218. - doi: 10.1038/ncomms12218.
65. An unusual cluster of Acremonium kiliense fungaemias in a haematopoietic cell transplantation unit / A. Ioakimidou, T. A. Vyzantiadis, I. Sakellari [et al.] // Diagn Microbiol Infect Dis. - 2013. - Vol. 75. - №3. - P. 313-316. -doi: 10.1016/j.diagmicrobio.2012.11.015.
66. An unusual infection, an unusual outcome-Fonsecaea pedrosoi cerebral granuloma / V. S. Madhugiri, I. D. Bhagavatula, A. Mahadevan, N. Siddaiah // J Neurosurg Pediatric.
- 2011. - Vol. 8. - P. 229-232. - doi:10.3171/2011.5.PEDS1112.
67. An update on the diversity, ecology and biogeography of the Saccharomyces genus / H. Alsammar, D. Delneri // FEMS Yeast Res. - 2020. - Vol. 1. - №20(3). - foaa013. -doi: 10.1093/femsyr/foaa013.
68. Analysis of a Food-Borne Fungal Pathogen Outbreak: Virulence and Genome of a Mucor circinelloides Isolate from Yogurt / S. C. Lee, R. B. Billmyre, A. Li [et al.] // mBio. - 2014. - Vol. 5. - №4. - e01390-14. - doi: 10.1128/mBio.01390-14.
69. Anhalt J. Identification of bacteria using mass spectrometry/ J.Anhalt, C. Fenselau // Analytical Chemistry. - 1975. - Vol. 47. - P. 219-225. - doi: 10.1021/ac60352a007.
70. Anidulafungin dosing in critically ill patients with continuous venovenous haemodiafiltration / G. Aguilar, J. R. Azanza, J. A. Carbonell [et al.] // J Antimicrob Chemother. - 2014. - Vol. 69. - №6. - P. 1620-1623. - doi: 10.1093/jac/dkt542.
71. Anis A. A Rare Case of Brain Abscesses Caused by Acremonium Species / A. Anis, F. Sameeullah, J. M. Bhatti // Cureus. - 2021. - Vol. 10. - № 13(4). -e14396. doi: org/10.7759/cureus.14396.
72. Antifungal Susceptibility Testing of Fusarium: A Practical Approach / A. M. S. Al-Hatmi, I. Curfs-Breuker, G. S. de Hoog [et al.] // J Fungi (Basel). -2017. - Vol. 3. - №2.
- P. 19. - doi:10.3390/jof3020019.
73. Arcobello J. T. Phaeohyphomycosis / J. T. Arcobello, S. G. Revankar // Seminars in respiratory and critical care medicine. - 2020. - Vol. 41. - №1. - P. 131-140. - doi: org/10.1055/s-0039-3400957.
74. Aribandi M. CT and MRI features in Bipolaris fungal sinusitis / M. Aribandi, C.. Bazan 3rd // Australasian radiology. -2007. - Vol. 51. - №2. - P. 127-132. -doi.org/10.1111/j.1440-1673.2007.01680.x.
75. Asif A. A. Paecilomyces Pneumonia Despite Voriconazole Prophylaxis: A Case Report and Literature Review / A. A. Asif, M. Roy, S. Ahmad // Eur J Case Rep Intern Med. -2021. - Vol. 8. - №7. - 002651. - doi: 10.12890/2021_002651. eCollection 2021.
76. Aspergillus fumigatus CalA binds to integrin alpha 5 beta1 and mediates host cell invasion / H. Liu, M. J. Lee, N. V. Solis [et al.] // Nat Microbiol. - 2016. - Vol. 14. - №2.
- P. 16211. - doi: 10.1038/nmicrobiol.2016.21.
77. Aspergillus galactosaminogalactan mediates adherence to host constituents and conceals hyphal beta-glucan from the immune system / F. N. Gravelat, A. Beauvais, H. Liu [et al.] // PLoS Pathog. - 2013. - Vol. 9. - № 8. - e1003575. - doi: 10.1371/journal.ppat.1003575.
78. Assessment of the safety and pharmacokinetics of anidulafungin when administered with cyclosporine / J. A. Dowell, M. Stogniew, D. Krause [et al.] // J Clin Pharmacol. - 2005. - Vol. 45. - P. 227-233. - doi: 10.1177/0091270004270146.
79. Atlas of Clinical Fungi, 4th edition / G. S. De Hoog, J. Guarro, J. Gene [et al.] // Hilversum. - 2020.- 1600 p.
80. Augustine H. F. Aggressive combined medical and surgical management of mucormycosis results in disease eradication in 2 pediatric patients / H. F. Augustine, C. White, J. Bain // Plast. Surg. - 2017. - Vol. 25. - P. 211-217. - doi: 10.1177/2292550317716119.
81. Baldin C. Molecular mechanisms of mucormycosis-The bitter and the sweet/ C. Baldin, A. S. Ibrahim // PLoS Pathog. - 2017. - Vol. 13. - №8. - e1006408. -doi:10.1371/journal.ppat.1006408.
82. Batt C. A. Encyclopedia of Food Microbiology/ C. A. Batt, R. K. Robinson //Elsevier Science. - 2014. - [Google Scholar].
83. B-D-glucan as a diagnostic adjunct for invasive fungal infections: validation, cutoff development, and performance in patients with acute myelogenous leukemia and myelodysplastic syndrome / Z. Odabasi, G. Mattiuzzi, E. Estey [et al.] // Clin Infect Dis.
- 2004. - Vol. 39. - №2. - P. 199-205. - doi: 10.1086/421944.
84. Bellmann R. Clinical pharmacokinetics of systemically administered antimycotics // Curr Clin Pharmacol. - 2007. - Vol. 2. - P. 37-58. - doi: 10.2174/157488407779422311.
85. Bellmann R. Pharmacokinetics of antifungal drugs: practical implications for optimized treatment of patients/ R. Bellmann, P. Smuszkiewicz // Infection. - 2017. -Vol. 45. - №6. - P. 737-779. - doi: 10.1007/s15010-017-1042-z.
86. Berkow E. L. Fluconazole resistance in Candida species: a current perspective / E. L. Berkow, S. R. Lockhart // Infect Drug Resist. - 2017. - Vol. 10. - P. 237-245. - doi: 10.2147/IDR.S118892.
87. Bhandari J. Crigler Najjar Syndrome / J. Bhandari, P. K. Thada, S. Nagalli // In: StatPearls [Internet]. Treasure Island (FL). - 2022. - PMID: 32965842.
88. Bicarbonate correction of ketoacidosis alters host-pathogen interactions and alleviates mucormycosis / T. Gebremariam, L. Lin, M. Liu [et al.] // J Clin Invest. 2016.
- Vol. 126. - №6. - P. 2280-2294. - doi: 10.1172/JCI82744.
89. Biodiversity of the genus Cladophialophora/ H. Badali, C. Gueidan, M. J. Najafzadeh [et al.] // Stud Mycol. - 2008. - Vol. 61. - P. 175-91. doi: 10.3114/sim.2008.61.18.
90. Blood culture procedures and diagnosis of Malassezia furfur bloodstream infections: Strength and weakness / R. Iatta, M. Battista, G. Miragliotta [et al.] // Medical mycology. - 2018. - Vol. 56. - №7. - P. 828-833. - doi.org/10.1093/mmy/myx122.
91. Brain abscesses caused by Cladophialophora bantiana in lung transplant patient: A case report and review of the literature / A. Gschwend, T. Degot, J. Denis [et al.] // Transpl Infect Dis. -2017. - Vol. 19. - №6. - doi: 10.1111/tid.12787.
92. Calcineurin plays key roles in the dimorphic transition and virulence of the human pathogenic zygomycete Mucor circinelloides / S. C. Lee, A. Li, S. Calo, J. Heitman // PLoS Pathog. - 2013. - Vol. 9. - №9. - e1003625. - doi:10.1371/journal.ppat.1003625.
93. Campbell C. K. Identification of Pathogenic Fungi / C. K. Campbell, E. M. Johnson. - John Wiley & Sons. - 2013. - P. 178-179. ISBN 978-1118520048.
94. Candida albicans-epithelial interactions: dissecting the roles of active penetration, induced endocytosis and host factors on the infection process / B B. Wachtler, F. Citiulo, N. Jablonowski [et al.] // PLoS One. - 2012. - Vol. 7. - №5. - P. e36952. - doi: 10.1371/journal.pone.0036952.
95. Cappelletty D. The echinocandins / D. Cappelletty, K. Eiselstein-McKitrick // Pharmacotherapy. - 2007. - Vol. 27. - P. 369-388. - doi: 10.1592/phco.27.3.369.
96. Case series of four secondary mucormycosis infections in COVID-19 patients, the Netherlands, December 2020 to May 2021 / J. B. Buil, A. R. H. van Zanten, R. G. Bentvelsen [et al.] //Euro Surveill. - 2021. - Vol. 26. - №23. - P. 2100510. - doi: 10.2807/1560-7917.ES.2021.26.23.2100510.
97. Caspofungin susceptibility in Aspergillus and non-Aspergillus molds: inhibition of glucan synthase and reduction of beta-D-1,3 glucan levels in culture / J. N. Kahn, M. J. Hsu, F. Racine [et al.] // Antimicrob Agents Chemother. - 2006. - Vol. 50. - №6. - P. 2214-2216. - doi:10.1128/AAC.01610-05.
98. Castano G. Trichosporonosis / G. Castano, S. N. S. Yarrarapu, P. K. Mada // In: StatPearls [Internet]. Treasure Island (FL): StatPearls Publishing. - 2022. -. PMID: 29494084.
99. Causes of death in hyper-IgE syndrome / A. F. Freeman, D. E. Kleiner, H. Nadiminti [et al.] // J Allergy Clin Immunol. -2007. - Vol. 119. - №5. - P. 1234-1240. -doi: 10.1016/j.jaci.2006.12.666.
100. Cerebral phaeohyphomycosis caused by Alternaria spp.: A case report / S. Cardona, S. Yusef, E. Silva [et al.] // Med Mycol Case Rep. - 2019.- Vol. 27.- P. 11-13. -doi:10.1016/j.mmcr.2019.12.001.
101. Chamilos G. Call for action: invasive fungal infections associated with ibrutinib and other small molecule kinase inhibitors targeting immune signaling pathways / G. Chamilos, M. S. Lionakis, D. P. Kontoyiannis // Clin Infect Dis. - 2018. - Vol. 66. - P. 140-148. - doi:10.1093/cid/cix687.
102. Characteristics and risk factors for mortality of invasive non-Aspergillus mould infections in patients with haematologic diseases: A single-centre 7-year cohort study / H. J. Lee, S. Y. Cho, D. G. Lee [et al.] // Mycoses. - 2020. - Vol. 63. - №3. P. 257-264. - doi: 10.1111/myc.13038.
103. Characteristics of Mucormycosis in Hematological Patients and a Death Prediction Model / X. Ma, A. Li, W. Cao [et al.] // Frontiers in microbiology.- 2021. - Vol. 12. -784974. - doi:10.3389/fmicb.2021.784974.
104. Characterization and outcome of invasive infections due to Paecilomyces variotii: analysis of patients from the FungiScope® registry and literature reports / R. Sprute, J. Salmanton-Garcia, E. Sal [et al.] // J Antimicrob Chemother.- 2021. - Vol. 76. - №3. - P. 765-774. - https://doi.org/10.1093/jac/dkaa481.
105. Chen S. C. Echinocandin antifungal drugs in fungal infections: a comparison / S. C. Chen, M. A. Slavin, T. C. Sorrell // Drugs. -2011. - Vol. 71. - P. 11-41. - doi: 10.2165/11585270-000000000-00000.
106. Chikley A. Mucormycosis of the Central Nervous System / A. Chikley, R. BenAmi, D. P. Kontoyiannis // J Fungi (Basel). -2019. - Vol. 5. - №3. - P. 59. - doi: 10.3390/jof5030059.
107. Chronic fungal meningitis caused by Aureobasidium proteae / M. Kutlesa, E. Mlinaric-Missoni, L. Hatvani [et al.] // Diagn Microbiol Infect Dis. - 2012. - Vol. 73. -№3. - P. 271-272. - doi: 10.1016/j.diagmicrobio.2012.03.007.
108. Chronic postoperative fungal endophthalmitis caused by Penicillium citrinum after cataract surgery / A. Garg, A. Stuart, M. Fajgenbaum [et al.] // J Cataract Refract Surg. -2016. - Vol. 42. - №9. - P. 1380-1382. - doi: 10.1016/j.jcrs.2016.07.025.
109. Cladophialophora abundans, a novel species of Chaetothyriales isolated from the natural environment / P. Y. Feng, G. S. de Hoog, M. J. Najafzadeh [et al.] // Mycol. Prog.
- 2013. - doi: 10.1007/s11557-013-0924-4.
110. Classification of Aspergillus, Penicillium, Talaromyces and related genera (Eurotiales): An overview of families, genera, subgenera, sections, series and species / J. Houbraken, S. Kocsube, C. M. Visagie [et al.] // Stud Mycol. - 2020. - Vol. 95. - P. 5169. - doi:10.1016/j.simyco.2020.05.002.
111. Clinical and epidemiological aspects of infections caused by fusarium species: a collaborative study from Israel / R. Nir-Paz, J. Strahilevitz, M. Shapiro [et al.] // J Clin Microbiol. - 2004. - Vol. 42. - №8. - P. 3456-3461. - doi: 10.1128/JCM.42.8.3456-3461.2004.
112. Clinical and microbiological characteristics of Rhodotorula mucilaginosa infections in a tertiary-care facility / M. R. Capoor, S. Aggarwal, C. Raghvan [et al.] //Indian J Med Microbiol. - 2014. - Vol. 32. - №3. - P. 304-309. - doi: 10.4103/02550857.136576.
113. Clinical evaluation of a Mucorales-specific real-time PCR assay in tissue and serum samples / J. Springer, M. Lackner, C. Ensinger [et al.] // J. Med. Microbiol. - 2016.
- Vol. 65. - P. 1414-1421. - doi: 10.1099/jmm.0.000375.
114. Clinical manifestations, treatment and outcome of ocular infections caused by Paecilomyces species / H. Kawakami, H. Inuzuka, K. Mochizuki [et al.] // Nippon Ganka Gakkai Zasshi. -2012. - Vol. 116. - №7. - P. 613-622. - PMID: 22844780.
115. Clinical Pharmacokinetics and Pharmacodynamics of Micafungin / R. E. Wasmann, E. W. Muilwijk, D. M. Burger [et al.] // Clin Pharmacokinet. - 2018. - Vol. 57. - №3. - P. 267-286. - doi: 10.1007/s40262-017-0578-5.
116. Clinical Pharmacokinetics, Pharmacodynamics, Safety and Efficacy of Liposomal Amphotericin B / A. H. Groll, B. J. A. Rijnders, T. J. Walsh [et al.] // Clin Infect Dis. -2019.- Vol. 68. - Suppl 4. - P. 260-274. -doi: 10.1093/cid/ciz076.
117. Clinical practice guidelines for the management of candidiasis: 2016 update by the Infectious Diseases Society of America / P. G. Pappas, C. A. Kauffman, D. Andes [et al.] // Clin Infect Dis. 2015. - Vol. 62. - P. 1-50. - doi: 10.1093/cid/civ933.
118. Clinical Spectrum, Diagnosis and Outcome of Rare Fungal Infections in Patients with Hematological Malignancies: Experience of 15-Year Period from a Single Tertiary Medical Center / E. Hardak, E. Fuchs, Y. Geffen [et al.] // Mycopathologia . - 2020. -Vol. 185. - №2. - P. 347-355. - doi: 10.1007/s11046-020-00436-x.
119. Clinical study of chronic invasive sinusitis caused by dematiaceous fungi / G. Fang, Q. Zhang, L. Zhu, D. Li // Lin Chung Er Bi Yan Hou Tou Jing Wai Ke Za Zhi. -2011. - Vol. 25. - №20. - P. 916-919. PMID: 22239050.
120. Combination therapy of murine mucormycosis or aspergillosis with iron chelation, polyenes, and echinocandins / A. S.Ibrahim, T. Gebremariam, G. Luo [et al.] // Antimicrob Agents Chemother. - 2011. - Vol. 55. - P. 1768-1770. -doi:10.1128/AAC.01577-10.
121. Comparative efficacies of conventional amphotericin b, liposomal amphotericin B (AmBisome), caspofungin, micafungin, and voriconazole alone and in combination against experimental murine central nervous system aspergillosis. / K.V. Clemons, M. Espiritu, R. Parmar, D.A. Stevens // Antimicrob Agents Chemother. - 2005. - Vol. 49. -№12. - P. 4867-4875. - doi: 10.1128/AAC.49.12.4867-4875.2005.
122. Comparison of computed tomographic findings in pulmonary mucormycosis and invasive pulmonary aspergillosis / J. Jung, M. Y. Kim, H. J. Lee [et al.] // Clin Microbiol Infect. - 2015. - Vol. 21. - №7. - 684.e11-8. - doi: 10.1016/j.cmi.2015.03.019.
123. Comparison of EUCAST and CLSI broth microdilution methods for the susceptibility testing of 10 Systemically active antifungal agents when tested against Candida spp / M. A. Pfaller, M. Castanheira, S. A. Messer [et al.]. // Diagn Microbiol
Infect Dis. - 2014. - Vol. 79. - №2. - P. 198-204. - doi: 10.1016/j.diagmicrobio.2014.03.004.
124. Comparison of the Vitek 2 yeast susceptibility system with CLSI microdilution for antifungal susceptibility testing of fluconazole and voriconazole against Candida spp., using new clinical breakpoints and epidemiological cutoff values / M. A. Pfaller, D. J. Diekema, G. W. Procop, M. G. Rinaldi // Diagn Microbiol Infect Dis. 20132013. - Vol. 77. - №1. - P. 37-40. https://doi.org/10.1016/j.diagmicrobio. 2013.05.019.
125. Connecting the Dots: Interplay of Pathogenic Mechanisms between COVID-19 Disease and Mucormycosis / H. Prakash, A. Skiada, R. A. Paul [et al.] // J Fungi (Basel).
- 2021. - Vol. 7. - №8. - P. 616. - doi: 10.3390/jof7080616.
126. Consensus guidelines for the treatment of invasive mould infections in haematological malignancy and haemopoietic stem cell transplantation / C. C. Blyth, N. M. Gilroy, S. D. Guy [et al.] // Intern Med J. - 2014. - Vol. 44(12b). - P. 1333-1349. -doi: 10.1111/imj.12598.
127. Conventional Amphotericin B Associated Nephrotoxicity in Patients With Hematologic Malignancies / V. Gursoy, F. Ozkalemkas, V. Ozkocaman [et al.] // Cureus.
- 2021. - Vol. 13. - №7. - e16445. - doi:10.7759/cureus.16445.
128. Corrigendum: Malassezia ecology, pathophysiology, and treatment / B. Theelen, C. Cafarchia, G. Gaitanis [et al.] // Med Mycol. - 2019. - Vol. 57. - №3. - P. e2. -doi: 10.1093/mmy/myy046.
129. CotH3 mediates fungal invasion of host cells during mucormycosis / T. Gebremariam, M. Liu, G. Luo [et al.] // J Clin Invest. -2014. - Vol. 124. - №1. - P. 237250. - doi: 10.1172/JCI71349.
130. COVID-19 and mucormycosis syndemic: double health threat to a collapsing healthcare system in India / I. C. N. Rocha, M. M. Hasan, S. Goyal [et al.] // Trop Med Int Health. - 2021. - Vol. 26. - №9. - P. 1016-1018. - doi: 10.1111/tmi.13641.
131. COVID-19 associated pulmonary aspergillosis (CAPA) - from immunology to treatment / A. Arastehfar, A. Carvalho, F. L. van de Veerdonk [et al.] //J Fungi (Basel). -2020. - Vol. 6. - №2. - P. 91. - doi: 10.3390/jof6020091.
132. COVID-19-Associated Mucormycosis (CAM): Case-Series and Global Analysis of Mortality Risk Factors / A. Riad, A. A. Shabaan, J. Issa [et al.] // Journal of fungi (Basel, Switzerland). - 2021. - Vol. 7. - №10. - P. 837. -https://doi.org/10.3390/jof7100837.
133. COVID-19-associated mucormycosis: Case report and systematic review. / A. Dilek, R. Ozaras, S. Ozkaya [et al.] // Travel Med Infect Dis. - 2021. - Vol. 44. - 102148.
- doi:10.1016/j.tmaid.2021.102148.
134. Cross-reactivity of Fusarium spp. in the Aspergillus galactomannan enzyme-linked immunosorbent assay / A. M. Tortorano, M. C. Esposto, A. Prigitano [et al.] // J Clin Microbiol. - 2012. - Vol. 50. - №3. - P. 1051-1053. - doi: 10.1128/JCM.05946-11.
135. Curvularia brain abscess / N. Gadgil, M. Kupferman, S. Smitherman [et al.] // J Clin Neurosci. -2013. - Vol. 20. - №1. - P. 173-175. - doi: 10.1016/j.jocn.2012.05.012.
136. Cutaneous alternariosis-- a case series of an increasing phaeohyphomycosis / I. Coutinho, V. Teixeira, A. Gameiro [et al.] // J Eur Acad Dermatol Venereol. - 2015. -Vol. 29. - №10. - P. 2053-2054. - doi: 10.1111/jdv.12589.
137. Cutaneous infection by Alternaria infectoria in a liver transplant recipient: a case report / E. Coussens, S. Rogge, M. Haspeslagh [et al.] // Acta Gastroenterol Belg. - 2014.
- Vol. 77. - №2. - P. 256-258. PMID: 25090825.
138. Cutaneous mucormycosis / A. D. Castrejon-Perez, E. C. Welsh, I. Miranda [et al.] // An Bras Dermatol. - 2017. - Vol. 92. - №3. - P. 304-311. -doi: 10.1590/abd1806-4841.20176614.
139. Cutaneous mucormycosis complicating methotrexate, prednisone, and infliximab therapy / H. Gadadhar, S. Hawkins, J. E. Huffstutter, M. Panda // J Clin Rheumatol. -2007. - Vol. 13. - №6. - P. 361-2. - doi: 10.1097/RHU.0b013e31815d3ddd.
140. Cutaneous mucormycosis in a young, immunocompetent girl / M. P. De Oliveira-Neto, M. Da Silva, P. C. Fialho Monteiro [et al.] // Med Mycol. - 2006. - Vol. 44. - №6.
- P. 567-570. - doi: 10.1080/13693780600622411.
141. Cutaneous mucormycosis: report of five cases and review of the literature / M. E. Amáiz-García, D. Alonso-Peña, M del Carmen González-Vela [et al.] // J Plast Reconstr Aesthet Surg. - 2009. - Vol. 62. - №11. - P. 434-41. - doi: 10.1016/j.bjps.2008.04.040.
142. Cutaneous zygomycosis / A. Bonifaz, D. Vázquez-González, A. Tirado-Sánchez, R. M. Ponce-Olivera // Clin Dermatol. - 2012. - Vol. 30. - №4. - P. 413-419. doi: 10.1016/j.clindermatol.2011.09.013.
143. Cytokine responses and regulation of interferon-gamma release by human mononuclear cells to Aspergillus fumigatus and other filamentous fungi / A. Warris, M. G. Netea, P. E. Verweij [et al.] // Med Mycol. - 2005. - Vol. 43. - №7. - P. 613-21. - doi: 10.1080/13693780500088333..
144. DALI Study authors. Pharmacokinetic variability and exposures of fluconazole, anidulafungin, and caspofungin in intensive care unit patients: Data from multinational Defining Antibiotic Levels in Intensive care unit (DALI) patients Study / M. G. Sinnollareddy, J. A. Roberts, J. Lipman [et al.] // Crit Care. - 2015. - Vol. 19. - №1. - P. 33. - doi: 10.1186/s13054-015-0758-3.
145. De Almeida Júnior J. N. Invasive Trichosporon Infection: a Systematic Review on a Re-emerging Fungal Pathogen / J. N. De Almeida Júnior, C. Hennequin // Front Microbiol. -2016. - Vol. 7. - P. 1629. - doi: 10.3389/fmicb.2016.01629.
146. De Hoog G. S. The Yeasts, a-Taxonomic- Study. Fifth Edition / G. S. De Hoog, M. Th. Smith // 2011. - Vol. 1. - P. 565. - The-yeasts-a-taxonomic-study-5th-edition-by-cletus-kurtzman.pdf.
147. Deep cutaneous mycosis due to Alternaria infectoria after liver transplantation: successful treatment with fluconazole / N. Alhmali, P. Lindenlaub, B. Ghebremedhin [et al.] // Eur J Dermatol. - 2013. - Vol. 23. - №1. - P. 100-102. - doi: 10.1684/ejd.2012.1885.
148. Deferasirox, an iron-chelating agent, as salvage therapy for rhinocerebral mucormycosis / C. Reed, A. Ibrahim, J. E. Jr. Edwards [et al.]. // Antimicrob Agents Chemother. - 2006. - Vol. 50. - P. 3968-3969. - doi:10.1128/AAC.01065-06.
149. Defining breakthrough invasive fungal infection-Position paper of the mycoses study group education and research consortium and the European Confederation of Medical Mycology / O. A. Cornely, M. Hoenigl, C. Lass-Flörl [et al.] // Mycoses. -2019.
- Vol. 62. - №9. - P. 716-729. - doi: 10.1111/myc.12960.
150. Defining opportunistic invasive fungal infections in immunocompromised patients with cancer and hematopoietic stem cell transplants: an international consensus / S. Ascioglu, J. H.Rex, B. de Pauw [et al.]. Mycoses Study Group of the National Institute of Allergy and Infectious Diseases // Clin Infect Dis. - 2002. - Vol. 34. - №1. - P. 7-14.
- doi: 10.1086/323335.
151. Defining Responses to Therapy and Study Outcomes in Clinical Trials of Invasive Fungal Diseases: Mycoses Study Group and European Organization for Research and Treatment of Cancer Consensus Criteria / B. H. Segal, R. Herbrecht, D. A. Stevens [et al.] // Clin Infect Dis. - 2008. - Vol. 47. - №5. - P. 674-83. - doi: 10.1086/590566.
152. Definition, diagnosis, and management of COVID-19-associated pulmonary mucormycosis: Delphi consensus statement from the Fungal Infection Study Forum and Academy of Pulmonary Sciences, India / V. Muthu, R. Agarwal, A. Patel [et al.]. // Lancet Infect Dis. - 2022. - Vol. 22. - №9. - P. 240-253. - doi: 10.1016/S1473-3099(22)00124-4.
153. Dental and Oral Manifestations of COVID-19 Related Mucormycosis: Diagnoses, Management Strategies and Outcomes / O. S. Janjua, M. S. Shaikh, M. A. Fareed [et al.] // J Fungi (Basel). - 2021. - Vol. 8. - №4. - P. 44. - doi: 10.3390/jof8010044.
154. Detection of Circulating Mucorales DNA in Critically Ill Burn Patients: Preliminary Report of a Screening Strategy for Early Diagnosis and Treatment / M. Legrand, M. Gits-Muselli, L. Boutin [et al.] // Clin. Infect. Dis. - 2016. - Vol. 63. - P. 1312-1317. - doi: 10.1093/cid/ciw563.
155. Diabetes mellitus as the major risk factor for mucormycosis in Mexico: Epidemiology, diagnosis, and outcomes of reported cases / D. E. Corzo-León, L. D. Chora-Hernández, A. P Rodríguez-Zulueta., T. J. Walsh // Med. Mycol. -2018. - Vol. 56.
- P. 29-43. - doi: 10.1093/mmy/myx017.
156. Diagnosis and treatment of mucormycosis in patients with hematological malignancies: guidelines from the 3rd European Conference on Infections in Leukemia (ECIL 3). European Conference on Infections in Leukemia. / A. Skiada, F. Lanternier, A. H. Groll [et al.] // Haematologica. - 2013. - Vol. 98. - №4. - P. 492-504. - doi: 10.3324/haematol.2012.065110.
157. Díaz-Couselo F. A. Catheter-Related Acremonium kiliense Fungemia in a Patient with Ulcerative Colitis under Treatment with Infliximab / F. A. Díaz-Couselo, M. Zylberman // Case Rep Infect Dis. - 2011. - 2011. - 710740. - doi: 10.1155/2011/710740.
158. Dignani M. C. Human fusariosis / M. C. Dignani, E. Anaissie // Clin Microbiol Infect. - 2004. - Vol. 10. - Suppl 1. - P. 67-75. - doi: 10.1111/j.1470-9465.2004.00845.x.
159. Disseminated Cutaneous Trichosporonosis in an Adult Bone Marrow Transplant Patient / A. M. Y. Yong, S. S. Yang, K. B. Tan, S. A. Ho // Indian Dermatol Online J. -2017. - Vol. 8. - №3. - P. 192-194. - doi:10.4103/idoj.ID0J_92_16.
160. Disseminated fusariosis in immunocompromised patients / E. M. Gutiérrez Paredes, L. Gámez Pérez, A. J. González Rodríguez [et al.] // Eur J Dermatol. - 2011. -Vol. 21. - №5. - P. 753-755. - doi: 10.1684/ejd.2011.1429.
161. Disseminated penicilliosis due to Penicillium chrysogenum in a pediatric patient with Henoch-Schonlein syndrome / M. Aviles-Robles, C. Gomez-Ponce, J. Resendiz-Sanchez [et al.] // Int J Infect Dis. - 2016. -Vol. 51. -P. 78-80. - doi: 10.1016/j.ijid.2016.08.026.
162. Disseminated Phaeohyphomycosis with Brain Abscess and Biliary Invasion Due to Bipolaris spp. in an Immunocompetent Patient / T. Frank, Y. Esquenazi, M. Nigo [et al.] / Ann Clin Lab Sci. - 2016. - Vol. 46. - №4. - P. 439-42. - PMID: 27466308.
163. Disseminated Phaeohyphomycosis: Review of an Emerging Mycosis / S. G. Revankar, J. E. Patterson, D. A. Sutton [et al.] // Clin Infect Dis. - Vol. 34. - № 4. - P. 467-476. - https://doi.org/10.1086/338636.
164. Disseminated zygomycosis with involvement of the central nervous system / A. Skiada, L. Vrana, H. Polychronopoulou [et al.] // Clin Microbiol Infect. - 2009. - Vol. 15. - Suppl 5. - P. 46-49. - https://doi.org/10.1111/j.1469-0691.2009.02980.x.
165. Diversity of Bipolaris species in clinical samples in the United States and their antifungal susceptibility profiles / K. C. Da Cunha, D. A. Sutton, A. W. Fothergill [et al.] // J Clin Microbiol. - 2012. - Vol. 50. - №12. - P. 4061-4066. -doi: 10.1128/JCM.01965-12.
166. Diversity of coelomycetous fungi in human infections: A 10-y experience of two European reference centres/ D. Garcia-Hermoso, N. Valenzuela-Lopez, O. Rivero-Menendez [et al.] // Fungal Biol. - 2019. - Vol. 123. - №4. - P. 341-349. doi:10.1016/j.funbio.2019.02.001.
167. Does weight impact anidulafungin pharmacokinetics? / V. J. Lempers, A. van Rongen, E. P. van Dongen [et al.] // Clin Pharmacokinet. - 2016. - Vol. 55. - P. 12891294. - doi: 10.1007/s40262-016-0401 -8.
168. Donnelly J. P. Deferasirox as adjunctive therapy for mucormycosis / J. P. Donnelly, M. Lahav // J. Antimicrob. Chemother. - 2012. - Vol. 67. - P. 519-520. - doi: 10.1093/jac/dkr540.
169. Drosophila melanogaster as a model host to dissect the immunopathogenesis of zygomycosis / G. Chamilos, R. E. Lewis, J. Hu [et al.] // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. -2008. - Vol. 105. - P. 9367-9372. - doi: 10.1073/pnas.0709578105.
170. Drug interactions between micafungin at high doses and cyclosporine A in febrile neutropenia patients after allogeneic hematopoietic stem cell transplantation / Y. Inoue, T. Saito, K. Ogawa [et al.] // Int J Clin Pharmacol Ther. -2012. - Vol. 50. - P. 831-837. - doi: 10.5414/CP201738.
171. Early diagnosis and monitoring of mucormycosis by detection of circulating DNA in serum: Retrospective analysis of 44 cases collected through the French Surveillance Network of Invasive Fungal Infections (RESSIF) / L. Millon, R. Herbrecht, F. Grenouillet [et al.] // Clin. Microbiol. Infect. 2016. - Vol. 22. - P. 810.e1-810.e8. - doi: 10.1016/j.cmi.2015.12.006.
172. ECIL-6 guidelines for the treatment of invasive candidiasis, aspergillosis and mucormycosis in leukemia and hematopoietic stem cell transplant patients / F. Tissot, S.
Agrawal, L. Pagano [et al.] // Haematologica. - 2017. - Vol. 102. - №3. - P. 433-444. -doi: 10.3324/haematol.2016.152900.
173. ECMM and ISHAM collaborators. The emergence of COVID-19 associated mucormycosis: a review of cases from 18 countries / M. Hoenigl, D. Seidel, A. Carvalho [et al.] // Lancet Microbe. - 2022. - Vol. 3. - №7. - P. 543-552. - doi: 10.1016/S2666-5247(21)00237-8.
174. Effect of a high-fat meal on the pharmacokinetics of 300-milligram posaconazole in a solid oral tablet formulation / W. M. Kersemaekers, P. Dogterom, J. Xu [et al.] // Antimicrob Agents Chemother. - 2015. - Vol. 59. - P. 3385-3389. - doi: 10.1128/AAC.05000-14.
175. Effects of Letermovir and/or Methylprednisolone Coadministration on Voriconazole Pharmacokinetics in Hematopoietic Stem Cell Transplantation: A Population Pharmacokinetic Study / K. Suetsugu, S. Muraki, J. Fukumoto [et al.] // Drugs R D. - 2021. - Vol. 21. - №4. - P. 419-429. - doi:10.1007/s40268-021-00365-0.
176. EGFR and HER2 receptor kinase signaling mediate epithelial cell invasion by Candida albicans during oropharyngeal infection / W. Zhu, Q. T. Phan, P. Boontheung [et al.] // Proc Natl Acad Sci U S A. - 2012. - Vol. 109. - №35. - P. 14194-14199. - doi: 10.1073/pnas.1117676109.
177. Ellis D. Amphotericin B: spectrum and resistance / D. Ellis // J Antimicrob Chemother. - 2002. - Vol. 49. - Suppl 1. - P. 7-10. - doi: 10.1093/jac/49.suppl_1.7.
178. Emergence of fusarioses in a university hospital in Turkey during a 20-year period / B. Dalyan Cilo, A. M. Al-Hatmi, S. Seyedmousavi [et al.] // Eur J Clin Microbiol Infect Dis. -2015. - Vol. 34. - №8. - P. 1683-1691. - doi: 10.1007/s10096-015-2405-y.
179. Emerging invasive zygomycosis in a tertiary care center: epidemiology and associated risk factors / J. Ambrosioni, K. Bouchuiguir-Wafa, J. Garbino //Int J Infect Dis. - 2010. - Vol. 14. - Suppl 3. - P. 100-103. - doi: 10.1016/j.ijid.2009.11.024.
180. Enache-Angoulvant A. Invasive Saccharomyces infection: a comprehensive review / A. Enache-Angoulvant, C. Hennequin // Clin Infect Dis. - 2005. - Vol. 41. - P. 1559-1568. - doi: 10.1086/497832.
181. Endocarditis due to Rhodotorula mucilaginosa in a kidney transplanted patient: case report and review of medical literature / A. M. Cabral, S. da Siveira Rioja, F. Brito-Santos [et al.] // JMM Case Rep. -2017. - Vol. 4. - №11. - e005119. - doi: 10.1099/jmmcr.0.005119.
182. Endocarditis verrucosa secundaria a Saccharomyces cerevisiae. Caso clínico [Verrucous endocarditis secondary to Saccharomyces cerevisiae. A case report] / F. Ruiz-Esquide, M. C. Díaz, E. Wu, V. Silva // Revista medica de Chile. - 2002. - Vol. 130. -№10. - P. 1165-1169. - PMID: 12491835.
183. Endoscopic nasal lateral wall dissection approach to maxillary sinus / B. Zhou, D. Han, S. Cui [et al.] // Zhonghua Er Bi Yan Hou Tou Jing Wai Ke Za Zhi. - 2007. - Vol. 42. - №10. - P. 743-748. - PMID: 18229584.
184. Epidemiological aspects and characterization of the resistance profile of Fusarium spp. in patients with invasive fusariosis / P. D. D. Rosa, M. Ramirez-Castrillon, R. Borges [et al.] // J Med Microbiol. - 2019. - Vol. 68. - №10. - P. 1489-1496. - doi: 10.1099/jmm.0.001059.
185. Epidemiological changes with potential implication for antifungal prescription recommendations for fungaemia: data from a nationwide fungaemia surveillance programme / M. C. Arendrup, E. Dzajic, R. H. Jensen [et al.] / Clin Microbiol Infect. -2013. - Vol. 19. - №8. - P. 343-353. - doi: 10.1111/1469-0691.12212.
186. Epidemiological study of Trichosporon asahii infections over the past 23 years / H. Li, M. Guo, C. Wang [et al.] // Epidemiol Infect. - 2020. - Vol. 148. - P. 169. -doi: 10.1017/S0950268820001624.
187. Epidemiology and Antifungal Susceptibility of Infections Caused by Trichosporon Species: An Emerging Non-Candida and Non-Cryptococcus Yeast Worldwide / S. Singh, M. R. Capoor, S. Varshney [et al.] // Indian J Med Microbiol. - 2019. - Vol. 37. - №4. -P. 536-541. - doi.org/10.4103/ijmm.IJMM_19_146.
188. Epidemiology and clinical manifestations of mucormycosis / G. Petrikkos, A. Skiada, O. Lortholary [et al.] // Clin Infect Dis. - 2012. - Vol. 54 Suppl 1. - P. 23-34. -https://doi.org/10.1093/cid/cir866.
189. Epidemiology and outcome of Rhodotorula infection in haematological patients / J. Garcia-Suarez, P. Gomez-Herruz, J. A. Cuadros, C. Burgaleta // Mycoses. - 2011. -Vol. 54. - №4. - P. 318-324. - doi: 10.1111/j.1439-0507.2010.01868.x.
190. Epidemiology and outcome of zygomycosis: A review of 929 reported cases / M. M. Roden, T. E. Zaoutis, W. L. Buchanan [et al.] // Clin. Infect. Dis. - 2005. - Vol. 41. -P. 634-653. - doi: 10.1086/432579.
191. Epidemiology and outcomes of invasive fungal infections in allogeneic haematopoietic stem cell transplant recipients in the era of antifungal prophylaxis: a single-centre study with focus on emerging pathogens / D. E. Corzo-Leon, M. J. Satlin, R. Soave [et al.] // Mycoses. - 2015. - Vol. 58. - №6. - P. 325-36. - doi: 10.1111/myc.12318.
192. Epidemiology and Pathophysiology of COVID-19-Associated Mucormycosis: India Versus the Rest of the World / V. Muthu, S. M. Rudramurthy, A. Chakrabarti, R. Agarwal // Mycopathologia. - 2021. - Vol. 186. - №6. - P. 739-754. -doi: 10.1007/s11046-021-00584-8.
193. Epidemiology and sites of involvement of invasive fungal infections in patients with haematological malignancies: A 20-year autopsy study / R. E. Lewis, L.Cahyame-Zuniga, K. Leventakos [et al.] // Mycoses. - 2013. - Vol. 56. - P. 638-645. - doi: 10.1111/myc.12081.
194. Epidemiology of invasive aspergillosis in critically ill patients: clinical presentation, underlying conditions, and outcomes / F. S. Taccone, A. M. Van den Abeele, P. Bulpa [et al.] // Crit Care. - 2015. - Vol. 19. - №1. - P. 7. - doi: 10.1186/s13054-014-0722-7.
195. Epidemiology of invasive fungal infections in the intensive care unit: results of a multicenter Italian survey (AURORA Project) / M. T. Montagna, G. Caggiano, G. Lovero [et al.] // Infection. - 2013. - Vol. 41. - №3. - P. 645-653. - doi: 10.1007/s15010-013-0432-0.
196. Epidemiology of systemic mycoses in the COVID-19 pandemic / M.G. Frias-De-Leon, R. Pinto-Almazan, R. Hernandez-Castro [et al.] // J Fungi (Basel). - 2021. - Vol. 7. - №7. - P. 556. - doi: 10.3390/jof7070556.
197. Epidemiology, clinical presentation and management of COVID-19 associated mucormycosis: A single centre experience from Pune, Western India / A. Dravid, R. Kashiva, Z. Khan, [et al.] // Mycoses. -2022. - Vol. 65. - №5. - P. 526-540. - doi: 10.1111/myc.13435.
198. Epidemiology, clinical profile, management, and outcome of COVID-19-associated rhino-orbital-cerebral mucormycosis in 2826 patients in India - Collaborative OPAI-IJO Study on Mucormycosis in COVID-19 (COSMIC), Report 1 / M. Sen, S. G. Honavar, R. Bansal [et al.] // Indian J Ophthalmol. - 2021. - Vol. 69. - №7. - P. 16701692. - https://doi.org/10.4103/ijo.IJO_1565_21.
199. Epidemiology, outcomes, and mortality predictors of invasive mold infections among transplant recipients: a 10-year, single-center experience / D. Neofytos, S. Treadway, D. Ostrander [et al.] // Transpl Infect Dis. - 2013. - Vol. 15. - №3. - P. 233242. - doi: 10.1111/tid.12060.
200. EQUAL Score Scedosporiosis/Lomentosporiosis 2021: a European Confederation of Medical Mycology (ECMM) tool to quantify guideline adherence / J. Stemler, M. Lackner, S. C. Chen [et al.] // J Antimicrob Chemother. - 2021. - Vol. 77. - №1. - P. 253258. - doi: 10.1093/jac/dkab355.
201. ESCMID and ECMM joint clinical guidelines for the diagnosis and management of rare invasive yeast infections / M. C. Arendrup, T. Boekhout, M. Akova [et al.]. European Society of Clinical Microbiology and Infectious Diseases Fungal Infection Study Group; European Confederation of Medical Mycology. //Clin Microbiol Infect. -2014. - Vol. 20. - Suppl 3. - P. 76-98. - doi: 10.1111/1469-0691.12360.
202. ESCMID and ECMM joint clinical guidelines for the diagnosis and management of systemic phaeohyphomycosis: diseases caused by black fungi / A. Chowdhary, J. F. Meis, J. Guarro [et al.] // Clin Microbiol Infect. -2014. - Suppl 3. - P. 47-75. - doi: 10.1111/1469-0691.12515.
203. ESCMID and ECMM joint clinical guidelines for the diagnosis and management of mucormycosis 2013 / O. A. Cornely, S. Arikan-Akdagli, E. Dannaoui [et al.]. European Confederation of Medical Mycology // Clin Microbiol Infect. - 2014. - Suppl 3. - P. 526. - doi.org/10.1111/1469-0691.12371.
204. ESCMID and ECMM joint guidelines on diagnosis and management of hyalohyphomycosis: Fusarium spp., Scedosporium spp. and others / A. M. Tortorano, M. Richardson, E. Roilides [et al.] // Clin Microbiol Infect. - 2014. - Vol. 20 Suppl 3. - P. 27-46. - doi: 10.1111/1469-0691.12465.
205. Eswaran S. Acute Fulminant Mucormycosis Triggered by Covid 19 Infection in a Young Patient / S. Eswaran, S. K. Balan, P. K. Saravanam // Indian J Otolaryngol Head Neck Surg. - 2022. - Vol. 74. - Suppl 2. - P. 3442-3446. - doi: 10.1007/s12070-021-02689-4.
206. European Medicines Agency. Assessment report for mycamine. 24 Aug 2008. http : //www.ema.europa.eu/docs/en_GB/document_library/EPAR_-_Public_assessment_report/human/000734/WC500031079.pdf. Accessed 22 May 2017. [Ref list].
207. European Medicines Agency. Ecalta. EPAR-Product Information. 2014. http://www.ema.europa.eu. Accessed 3 Mar 2017. [Ref list].
208. European Medicines Agency. Posaconazole injection assessment report: EPAR -assessment report - Variation. 2014. https://www.ema.europa.eu/en/documents/variation-report/noxafil-h-c-610-x-0033-epar-assessment-report-variation_en.pdf. Accessed 15 Apr 2020. [Ref list].
209. European Medicines Agency. Summary of product characteristics: mycamine. 20 Dec 2012. http://www.ema.europa.eu/docs/en_GB/document_library/EPAR_-_Product_Information/human/000734/WC500031075.pdf. Accessed 22 May 2017. [Ref list].
210. European Society of Clinical Microbiology and Infectious Diseases (ESCMID) Fungal Infection Study Group (EFISG) and European Confederation of Medical Mycology (ECMM) 2013 joint guidelines on diagnosis and management of rare and
emerging fungal diseases / O A Comely, M Cuenca-Estrella, J F Meis, A J Ullmann // Clin Microbiol Infect. -2014. - Suppl 3. - P. 1-4. - doi: 10.1111/1469-0691.12569.
211. Exophiala phaeomuriformis Fungal Keratitis: Case Report and In Vivo Confocal Microscopy Findings / S. Aggarwal, T. Yamaguchi, R. Dana, P. Hamrah // Eye Contact Lens. - 2017. - Vol. 43. - № 2. - P. 4- 6. - doi: 10.1097/ICL.0000000000000193.
212. Exophiala spinifera as a cause of cutaneous phaeohyphomycosis: case study and review of the literature / J. E. Harris, D. A. Sutton, A. Rubin [et al.] // Med Mycol. -2009. - Vol. 47. - №1. - P. 87-93. - doi: 10.1080/13693780802412611.
213. Factors affecting surgical resection and treatment outcomes in patients with pulmonary mucormycosis / H Choi., H. Lee, K. Jeon [et al.] // J Thorac Dis. - 2019. -Vol. 11. - №3. - P. 892-900. - doi: 10.21037/jtd.2019.01.75.
214. Fatal fungemia with Scedosporium prolificans in a patient with acute myeloid leukemia / M. Nishimori, T. Takahashi, E. Suzuki [et al.] // Medical mycology journal. -2014. - Vol. 55. - №4. - P. 63-70. - https://doi.org/10.3314/mmj.55.E63.
215. Fatal Trichosporon fungemia in patients with hematologic malignancies / K. Suzuki, K. Nakase, T. Kyo [et al.] // Eur J Haematol. - 2010. - Vol. 84. - №5. - P. 441447. - doi: 10.1111/j.1600-0609.2010.01410.x.
216. Feng J. Characteristics of pulmonary mucormycosis and predictive risk factors for the outcome / J. Feng, X. Sun // Infection. - 2018. - Vol. 46. - P. 503-512. - doi: 10.1007/s 15010-018-1149-x.
217. First case of phaeohyphomycosis due to Pleurostoma ootheca in a kidney transplant recipient in Martinique (French West Indies) / E. Amazan, N. Desbois, G. Fidelin [et al.] // Med Sante Trop. - 2014. - Vol. 24. №3. - P. 323-325. - doi:10.1684/mst.2014.0342
218. First report of rhinosinusitis caused by Neoscytalidium dimidiatum in Iran/ M. Bakhshizadeh, H. R. Hashemian, M. J. Najafzadeh [et al.] //J Med Microbiol . - 2014. -Vol. 63(Pt 7). - P. 1017-1019. - doi: 10.1099/jmm.0.065292-0.
219. Five-year evaluation of bloodstream yeast infections in a tertiary hospital: the predominance of non-C. albicans Candida species / G. H. Pereira, P. R. Müller, M. W.
Szeszs [et al.] // Med Mycol. - 2010. - Vol. 48. - P. 839-842. - doi: 10.3109/13693780903580121.
220. Fluconazole Resistance in Isolates of Uncommon Pathogenic Yeast Species from the United Kingdom / A. M. Borman, J. Muller, J. Walsh-Quantick [et al.] // Antimicrob Agents Chemother. - 2019. - Vol. 63. - №8. - e00211-19. - doi: 10.1128/AAC.00211-19.
221. Fogarty C. Invasive fungal infection of the maxilla following dental extractions in a patient with chronic obstructive pulmonary disease / C. Fogarty, F. Regennitter, C. F. Viozzi // J Can Dent Assoc. -2006. - Vol. 72. - №2. - P. 149-52. PMID: 16545177.
222. Food and indoor fungi / R. A. Samson, J. Houbraken, U. Thrane [et al.]; CBS-KNAW Fungal Biodiversity Centre. - Utrecht, The Netherlands. - 2010. - Vol. 2. - P. 390. - (CBS Laboratory Manual Series).
223. Fourth European Conference on Infections in Leukaemia (ECIL-4): guidelines for diagnosis, prevention, and treatment of invasive fungal diseases in paediatric patients with cancer or allogeneic haemopoietic stem-cell transplantation / A. H. Groll, E. Castagnola, S. Cesaro [et al.] // Lancet Oncol. - 2014. - Vol. 15. - №8. - P. 327-340. doi: 10.1016/S1470-2045(14)70017-8.
224. French Mycosis Study Group Prospective pilot study of high-dose (10 mg/kg/day) liposomal amphotericin B (L-AMB) for the initial treatment of mucormycosis / F. Lanternier, S. Poiree, C. Elie, [et al.] // The Journal of antimicrobial chemotherapy. -2015. - Vol. 70. - №11. - P. 3116-3123. - https://doi.org/10.1093/jac/dkv236.
225. Functional surface proteomic profiling reveals the host heat-shock protein A8 as a mediator of Lichtheimia corymbifera recognition by murine alveolar macrophages / M. I. Abdelwahab Hassan, J. M. Kruse, T. Kruger [et al.] // Environmental Microbiologi. -2020. - Vol. 22. - Suppl 9. - P. 3722-3740 - doi.:10.1111/1462-2920.15140.
226. Functions of natural killer cells / E. Vivier, E. Tomasello, M. Baratin [et al.] // Nat Immunol. - 2008. - Vol. 9. - №5. - P. 503-510. - doi: 10.1038/ni1582.
227. Fungaemia due to rare yeasts in a tertiary care university centre within 18 years/ S. Alp, D. Gulmez, C. M. Ayaz [ et al.] // Mycoses. - 2020. - Vol. 63. - №5. - P. 488-493. - doi: 10.1111/myc.13072.
228. Fungal brain abscess caused by "Black Mold" (Cladophialophora bantiana) - A case report of successful treatment with an emphasis on how fungal brain abscess may be different from bacterial brain abscess / Z. Aljuboori, R. Hruska, A. Yaseen [et al.] // Surg Neurol Int. - 2017. - Vol. 5. - №8. - P. 46. - doi: 10.4103/sni.sni_448_16.
229. Fungal Infection Caused by Geotrichum capitatum in a Severe Aplastic Anemia Patient: a Case Report and Review of the Literature / W. Shan, C. Dai, J. Kan [et al.] // Clinical laboratory. - 2018. - Vol. 64. - №5. - P. 867-869. -https://doi.org/10.7754/Clin.Lab.2017.171127.
230. Fungal infections in mechanically ventilated patients with COVID-19 during the first wave: the French multicentre MYCOVID study / J. P. Gangneux, E. Dannaoui, A. Fekkar [et al.] // Lancet Respiratory medicine. - 2022. - Vol. 10. - №2. - P. 180-190. -doi.org/ 10.1016/S2213-2600(21 )00442-2.
231. Fungal rhinosinusitis and imaging modalities / I. R. Gorovoy, M. Kazanjian, R. C. Kersten [et al.] // Saudi journal of ophthalmology. - 2012. - Vol. 26. - №4. - P. 419-426.
- doi.org/10.1016/j.sjopt.2012.08.009.
232. Fungal spoilage of crops and food. In Agricultural Applications / J. Dijksterhuis, J. Houbraken, R. A. Samson // Springer-Verlag: Berlin/Heidelberg, Germany. - 2013. - Vol. 11. - P. 35-56. - ISBN 978-3-642-36821-9.
233. Fungemia and interstitial lung compromise caused by Malassezia sympodialis in a pediatric patient / C. Aguirre, C. Euliartea, J. Finquelievich [et al.] // Rev Iberoam Micol.
- 2015. - Vol. 32. - №2. - P. 118-121. - doi: 10.1016/j.riam.2014.01.002.
234. Fungemia due to rare opportunistic yeasts: data from a population-based surveillance in Spain / M. Fernandez-Ruiz, J. Guinea, M. Puig-Asensio [et al.] // Med Mycol. - 2017. - Vol. 55. - №2. - P. 125-136. - doi.org/10.1093/mmy/myw055.
235. Fungemia due to Rhodotorula mucilaginosa after allogeneic hematopoietic stem cell transplantation / T. Mori, Y. Nakamura, J. Kato [et al.] // Transpl Infect Dis. 2012. -Vol. 14. - №1. - P. 91-94. - doi: 10.1111/j.1399-3062.2011.00647.x.
236. FungiScope™ - Global Emerging Fungal Infection Registry / D. Seidel, D. L. A. Graeff, M. J. G. T. Vehreschild [et al.] // Mycoses. - 2017. - Vol. 60. - №8. - P. 508-516. - doi: 10.1111/myc.12631.
237. Fusariosis / F. Nucci, S. A. Nouér, D. Capone [et al.] // Semin Respir Crit Care Med. - 2015. - Vol. 36. - №5. - P. 706-714. - doi: 10.1055/s-0035-1562897.
238. Fusariosis in a Patient with Acute Myeloid Leukemia: A Case Report and Review of the Literature / M. Delia, R. Monno, G. Giannelli [et al.] / Mycopathologia. - 2016. -Vol. 181. - №5-6. - P. 457-463. - doi.org/10.1007/s11046-016-9987-5.
239. Fusarium Brain Abscess in a Patient with Diabetes Mellitus and Liver Cirrhosis / cY. J. Chen, C. L. Chou, K. J. Lai, Y. L. Lin // Acta Neurol Taiwan. - 2017. - Vol. 26. -№3. - P. 128-132. - PMID: 29468621.
240. Fusarium brain abscess: case report and literature 2334 review / R. R. Garcia, Z. Min, S. Narasimhan, N. Bhanot // Mycoses. -2015. - Vol. 58. - №1. - P. 22-26. -doi: 10.1111/myc.12271.
241. Fusarium infection: report of 26 cases and review of 97 cases from the literature / M. Muhammed, T. Anagnostou, A. Desalermos [et al.] // Medicine. - 2013. - Vol. 92. -№6. - P. 305-316. - https://doi.org/10.1097/MD.0000000000000008.
242. Fusarium Molds and Mycotoxins: Potential Species3003 Specific Effects / A. Bertero, A. Moretti, L. J. Spicer, F. Caloni // Toxins (Basel). - 2018. - Vol. 10. - №6. -P. 244. - doi: 10.3390/toxins10060244.
243. Fusarium species causing invasive fungal pneumonia in an immunocompetent patient: a case report / S. Y. Chae, H. M. Park, T. H. Oh [et al.] // The Journal of international medical research. - 2020. - Vol. 48. - №12. - 300060520976475. -doi.org/10.1177/0300060520976475.
244. Garnica M. Difficult mycoses of the skin: advances in the epidemiology and management of eumycetoma, phaeohyphomycosis and chromoblastomycosis / M. Garnica, M. Nucci, F. Queiroz-Telles // Curr Opin Infect Dis. -2009. - Vol. 22. - №6. -P. 559-563. - doi: 10.1097/Qœ.0b013e328332bbc5.
245. Gastric angioinvasive mucormycosis in immunocompetent adult, a rare occurrence / M. Nasa, Z. Sharma, L. Lipi, R. Sud // J Assoc Physicians India. - 2017. - Vol. 65. -№12. - P. 103-104. - PMID: 29327534.
246. Gastrointestinal mucormycosis in apparently immunocompetent hosts - A review / H. Kaur, A. Ghosh, S. M. Rudramurthy, A. Chakrabarti // Mycoses. - 2018. - Vol. 61. -P. 898-908. - doi: 10.1111/myc.12798.
247. Gastrointestinal mucormycosis in immunocompromised hosts / M. V. Dioverti, K. A. Cawcutt, M. Abidi [et al.] // Mycoses. - 2015. - Vol. 58. - P. 714-718. -doi: 10.1111/myc.12419.
248. Genetic and Metabolic Aspects of Primary and Secondary Metabolism of the Zygomycetes / K. Voigt, T. Wolf, K. Ochsenreiter [et al.] // The Mycota. Biochemistry and Molecular Biology / Editors: Hoffmeister D. - Springer Verlag, Berlin; 2016. - Vol. 3. - P. 361-85. doi: 10.1007/978-3-319-27790-5_15.
249. Genus-wide comparative genomics of Malassezia delineates its phylogeny, physiology, and niche adaptation on human skin / G.Wu, H. Zhao, C. Li [et al.] // PLoS Genet. - 2015. - Vol. 11. - №11. - P. e1005614. - doi: 10.1371/journal.pgen.1005614.
250. George J. Anidulafungin: when and how? The clinician's view / J. George, A. C. Reboli // Mycoses. - 2012. - Vol. 55. - №1. - P. 36-44. - doi.org/10.1111/j.1439-0507.2011.02052.x.
251. Geotrichum candidum in Infective Endocarditis / S. Meena, G. Singh, Y. Dabas [et al.] // J Glob Infect Dis. 2017. - Vol. 9. - №3. - P. 127-128. -doi: 10.4103/j gid.j gid_112_16.
252. Geotrichum capitatum fungemia in patients treated for acute leukemia / H. Ben Neji, M. Bchir, M. Hamdoun [et al.] // Med Mal Infect. - 2019. - Vol. 49. - №4. - P. 284286. - doi: 10.1016/j.medmal.2018.09.005.
253. Geotrichum capitatum septicemia: case report and review of the literature / H. Trabelsi, S. Néji, L. Gargouri [et al.] // Mycopathologia. - 2015. - Vol. 179. - №5-6. - P. 465-469. - https://doi.org/10.1007/s11046-015-9869-2.
254. Global Antifungal Surveillance Study Results from the ARTEMIS DISK Global Antifungal Surveillance study, 1997 to 2005: an 8.5-year analysis of susceptibilities of Candida species and other yeast species to fluconazole and voriconazole determined by CLSI standardized disk diffusion testing / M. A. Pfaller, D. J. Diekema, D. L. Gibbs [et al.] // J Clin Microbiol. 2007. - Vol. 45. - №6. - P. 1735-1745. -https://doi.org/10.1128/JCM.00409-07.
255. Global Cutaneous Mucormycosis: A Systematic Review / A. Skiada, M. Drogari-Apiranthitou, I. Pavleas [et al.] // J Fungi (Basel). - 2022. - Vol. 8. - №2. - P. 194. -doi: 10.3390/jof8020194.
256. Global epidemiology of cutaneous zygomycosis / A. Skiada, D. Rigopoulos, G. Larios [et al.] // Clin Dermatol. - 2012. - Vol. 30. - №6. - P. 628-632. - doi: 10.1016/j.clindermatol.2012.01.010.
257. Global guideline for the diagnosis and management of mucormycosis: an initiative of the European Confederation of Medical Mycology in cooperation with the Mycoses Study Group Education and Research Consortium / O. A. Cornely, A. Alastruey-Izquierdo, D. Arenz [et al.]. Mucormycosis ECMM MSG Global Guideline Writing Group // Lancet Infect Dis. - 2019. - Vol. 19. - №12. - P. 405-421. - doi: 10.1016/S1473-3099(19)30312-3.
258. Global guideline for the diagnosis and management of rare yeast infections: an initiative of the ECMM in cooperation with ISHAM and ASM / S. C Chen., J Perfect, A. L. Colombo [et al.] // Lancet Infect Dis. - 2021. - Vol. 21. - Sup.12. - P. e375-e386. doi:10.1016/S1473-3099(21)00203-6.
259. Gobernado M. Anidulafungina [Anidulafungin] / M. Gobernado, E. Cantón // Rev Esp. Quimioter. - 2008. - Vol. 21. - №2. - P. 99-114. - PMID: 18509769.
260. Goebel S. C. Infección por Saccharomyces cerevisiae [Saccharomyces cerevisiae infections] / S. C. Goebel, M. F. Oliveira de, L. C. Severo // Revista iberoamericana de micologia. - 2013. - Vol. 30. - №3. - P. 205-208. - doi.org/10.1016/j.riam.2013.03.001.
261. Golubev W. I. Rhodotorula rosulata sp. nov. Rhodotorula silvestris sp. nov. and Rhodotorula straminea sp. nov., novel myo-inositol-assimilating yeast species in the
Microbotryomycetes / W. I. Golubev, G. Scorzetti // Int J Syst Evol Microbiol. -2010. -Vol. 60(Pt 10). - P. 2501-2506. - doi: 10.1099/ijs.0.016303-0.
262. Góralska K. Neuroinfections caused by fungi / K. Góralska, J. Blaszkowska, M. Dzikowiec // Infection. - 2018. - Vol. 46. - P. 443-459. - doi.org/10.1007/s15010-018-1152-2.
263. Guarner J. Histopathologic Diagnosis of Fungal Infections in the 21st Century / J. Guarner, M. E. Brandt // Clin. Microbiol. Rev. - 2011. - Vol. 24. - P. 247-280. -doi:10.1128/CMR.00053-10.
264. Guideline for the Management of Fever and Neutropenia in Children With Cancer and Hematopoietic Stem-Cell Transplantation Recipients: 2017 Update / T. Lehrnbecher, P. Robinson, B. Fisher [et al.] // J Clin Oncol. - 2017. - Vol. 35. - №18. - P. 2082-2094.
- doi: 10.1200/JC0.2016.71.7017.
265. Guillot J. Malassezia Yeasts in Veterinary Dermatology: An Updated Overview / J. Guillot, R. Bond // Front Cell Infect Microbiol. - 2020. - Vol. 28. - №10. - P. 79. - doi: 10.3389/fcimb.2020.00079.
266. Gülmez D. [Mycoses due to Rare Moulds in Our Country: A Systematic Review] / D. Gülmez // Mikrobiyol Bul. Turkish. - 2022. - Vol. 56. - №1. - P. 143-189. -doi: 10.5578/mb.20229914.
267. Hammer M. M. Pulmonary Mucormy-cosis: Radiologic Features at Presentation and Over Time / M. M. Hammer, R. Madan, H. Hatabu // AJR Am J Roentgenol. - 2018. -Vol. 210. - №4. - P. 742-747. -doi: 10.2214/AJR.17.18792.
268. Hamoud S. Recurrent Saccharomyces cerevisiae fungemia in an otherwise healthy patient / S. Hamoud, Z. Keidar, T. Hayek // Isr Med Assoc J. - 2011. - Vol. 13. - №9. -P. 575-576. - PMID: 21991722.
269. Head-to-head comparison of the activities of currently available antifungal agents against 3,378 Spanish clinical isolates of yeasts and filamentous fungi / M. Cuenca-Estrella, A. Gomez-Lopez, E. Mellado [et al.] // Antimicrobial agents and chemotherapy.
- 2006. - Vol. 50. - №3. - P. - 917-921. -doi.org/10.1128/AAC.50.3.917-921.2006.
270. Healthcare-associated mucormycosis / B. Rammaert, F. Lanternier, J. R. Zahar, [et al.] // Clin Infect Dis. - 2012. - Vol. 54. - Suppl 1. - P. 44-54. - doi:10.1093/cid/cir867.
271. Hens B., Brouwers J., Corsetti M., Augustijns P. Supersaturation and precipitation of posaconazole upon entry in the upper small intestine in humans / // J Pharm Sci. -2016. - Vol. 105. - №9. - P. 2677-2684. - doi:10.1002/jps.24690.
272. Hoenigl M. Invasive fungal disease complicating COVID-19: When It Rains, It Spores / M. Hoenigl // Clin Infect Dis. - 2021. - Vol. 73. - №7. - P. 1645-1648. - doi: 10.1093/cid/ciaa1342.
273. Honavar S. G. Code Mucor: Guidelines for the Diagnosis, Staging and Management of Rhino-Orbito-Cerebral Mucormycosis in the Setting of COVID-19 / S. G. Honavar // Indian J. Ophthalmol. - 2021. - Vol. 69. - P. 1361-1365. -doi: 10.4103/ijo.IJO_1165_21.
274. Hosseini S. M. S. Rhinocerebral mucormycosis: Pathways of spread / S. M. Hosseini, P. Borghei // Eur Arch Otorhinolaryngol. - 2005. - Vol. 262. - №11. - P. 932938. - doi: 10.1007/s00405-005-0919-0.
275. How does antifungal pharmacology differ for mucormycosis versus aspergillosis? / R. E.Lewis, O. Lortholary, B. Spellberg [et al.] // Clin Infect Dis. - 2012. - Vol. 54. -Suppl 1. - P. 67-72. - doi: 10.1093/cid/cir884.
276. Howlett S., Sullivan T., Abdolrasouli A., [et al.] A black mould death: A case of fatal cerebral phaeohyphomycosis caused by Cladophialophora bantiana / // Med Mycol Case Rep. -2019. - Vol. 24. - P. 23-26. - doi: 10.1016/j.mmcr.2019.02.004.
277. Human Tissue Distribution of Anidulafungin and Micafungin / J. Marx, R. Welte, T. Gasperetti [et al.] // Antimicrobial agents and chemotherapy. - 2021. - Vol. 65. - №7. - e0016921. - https://doi.org/10.1128/AAC.00169-21.
278. Hyperbaric Oxygen Reduces Aspergillus fumigatus Proliferation in Vitro and Influences in Vivo Disease Outcomes / S. Dhingra, J.C. Buckey, R.A. Cramer // Antimicrob. Agents Chemother. - 2018. - Vol. 62. - e01953-17. - doi: 10.1128/AAC.01953-17.
279. Ibrahim A. S. Update on mucormycosis pathogenesis / A. S. Ibrahim, D. P. Kontoyiannis // Curr Opin Infect Dis. - 2013. -Vol. 26. - №6. - P. 508-515. -doi: 10.1097/QCO.0000000000000008.
280. Identification and characterization of a laminin-binding protein of Aspergillus fumigatus: extracellular thaumatin domain protein (AfCalAp) / S. K. Upadhyay, L. Mahajan, S. Ramjee [et al.] // J Med Microbiol. - 2009. - Vol. 58(Pt 6). - P. 714-722. -doi: 10.1099/jmm.0.005991-0.
281. Impact of CYP2C19, CYP3A4, ABCB1, and FMO3 genotypes on plasma voriconazole in Thai patients with invasive fungal infections / S. Chuwongwattana, T. Jantararoungtong, S. Prommas [et al.] // Pharmacol Res Perspect. - 2020. -Vol. 8. - №6. - e00665. - doi: 10.1002/prp2.665.
282. Impact of Loading Dose of Caspofungin in Pharmacokinetic-Pharmacodynamic Target Attainment for Severe Candidiasis Infections in Patients in Intensive Care Units: the CASPOLOAD Study / S. Bailly, E. Gautier-Veyret, M. P. Lê [et al.] //Antimicrob Agents Chemother. - 2020. - Vol. 64. - №12. - e01545-20. - doi: 10.1128/AAC.01545-20.
283. Improvement in the outcome of invasive fusariosis in the last decade / M. Nucci, K. Marr, M. Vehreschild [et al.] // Clin Microbiol Infect. - 2014. - Vol. 20. - №6. - P. 580-585. - doi: 10.1111/1469-0691.12409.
284. In vitro activities of posaconazole, fluconazole, itraconazole, voriconazole, and amphotericin B against a large collection of clinically important molds and yeasts / F. Sabatelli, R. Patel, P. A. Mann [et al.] // Antimicrob Agents Chemother. - 2006. - Vol. 50. - №6. - P. 2009-15. - doi: 10.1128/AAC.00163-06.
285. In vitro and in vivo studies to characterize the clearance mechanism and potential cytochrome P450 interactions of anidulafungin / B. D. Damle, J. A. Dowell, R. L. Walsky [et al.] // Antimicrob Agents Chemother. -2009. - Vol. 53. - P. 1149-1156. - doi: 10.1128/AAC.01279-08.
286. In vitro antifungal activities of isavuconazole (BAL4815), voriconazole, and fluconazole against 1,007 isolates of zygomycete, Candida, Aspergillus, Fusarium, and
Scedosporium species / J. Guinea, T. Pelaez, S. Recio [et al.] // Antimicrob Agents Chemother. - 2008. - Vol. 52. - №4. - P. 1396-1400. - doi: 10.1128/AAC.01512-07.
287. In Vitro Antifungal Drug Resistance Profiles of Clinically Relevant Members of the Mucorales (Mucoromycota) Especially with the Newer Triazoles / A. M. Borman, M. Fraser, Z. Patterson [et al.] // Journal of fungi (Basel, Switzerland). - 2021. - Vol. 7. -№4. - P. 271. - doi.org/10.3390/jof7040271.
288. In vitro susceptibilities of yeast species to fluconazole and voriconazole as determined by the 2010 National China Hospital Invasive Fungal Surveillance Net (CHIF-NET) study / H. Wang, M. Xiao, S. C-A. Chen [et al.] // Clin Microbiol. - 2012.
- Vol. 50. - №12. - P. 3952-3959. - doi: 10.1128/JCM.01130-12.
289. Increased inhibition of cytochrome P450 3A4 with the tablet formulation of posaconazole / A. Petitcollin, R. Crochette, C. Tron [et al.] // Drug Metab Pharmacokinet.
- 2016. - Vol. 31. - P. 389-393. - doi: 10.1016/j.dmpk.2016.05.001.
290. Increased species-assignment of filamentous fungi using MALDI-TOF MS coupled with a simplified sample processing and an in-house library / M. E. Zvezdanova, P. Escribano, A. Ruiz [et al.] // Med Mycol. - 2019. -Vol. 57. - №1. - P. 63-70. - doi: 10.1093/mmy/myx154.
291. Increasing incidence of mucormycosis in a large Spanish hospital from 2007 to 2015: Epidemiology and microbiological characterization of the isolates / J. Guinea, P. Escribano, A. Vena [et al.] // PLoS ONE. - 2017. - Vol. 12. - e0179136. doi:10.1371/journal.pone.0179136.
292. Increasing incidence of Mucormycosis in university hospital, Belgium / V. Saegeman, J. Maertens, W. Meersseman [et al.] // Emerg. Infect. Dis. - 2010. - Vol. 16.
- P. 1456-1458. - doi:10.3201/eid1609.100276.
293. Increasing incidence of zygomycosis (mucormycosis), France, 1997-2006 / D. Bitar, D. Van Cauteren, F. Lanternier [et al.] // Emerg Infect Dis. - 2009. - Vol. 15. - №9.
- P. 1395-1401. - doi: 10.3201/eid1509.090334.
294. Infections caused by Scedosporium spp / K. J. Cortez, E. Roilides, F. Quiroz-Telles [et al.] // Clin Microbiol Rev. - 2008. - Vol. 21. - №1. - P. 157-197. - doi: 10.1128/CMR.00039-07.
295. Infections due to emerging and uncommon medically important fungal pathogens. / T. J. Walsh, A. Groll, J. Hiemenz [et al.] // Clin Microbiol Infect. - 2004. - Vol. 10 Suppl 1. - P. 48-66. - https://doi.org/10.1111/j.1470-9465.2004.00839.x.
296. Infections due to Scedosporium apiospermum and Scedosporium prolificans in transplant recipients: clinical characteristics and impact of antifungal agent therapy on outcome / S. Husain, P. Muñoz, G. Forrest [et al.] // Clinical infectious diseases. - 2005.
- Vol. 40. - №1. - P. 89-99. - doi.org/10.1086/426445.
297. Infectious Disease Group of the EORTC. An EORTC Phase II study of caspofungin as first-line therapy of invasive aspergillosis in haematological patients / C. Viscoli, R. Herbrecht, H. Akan [et al.] // J Antimicrob Chemother. - 2009. - Vol. 64. - №26. - P. 12741281. - doi: 10.1093/jac/dkp355.
298. Inhibition of EGFR signaling protects from mucormycosis / T. Watkins, T. Gebremariam, M. Swidergall [et al.] // MBio. - 2018. - Vol. 9. - №4. - P. e01384-18. -doi:10.1128/mBio.01384-18.
299. Inhibitory potential of antifungal drugs on ATP-binding cassette transporters P-glycoprotein, MRP1 to MRP5, BCRP, and BSEP / V. J. Lempers, J. J. van den Heuvel, F. G. Russel [et al.] // Antimicrob Agents Chemother. - 2016. - Vol. 60. - P. 3372-3379.
- doi:10.1128/AAC.02931-15.
300. Initial use of combination treatment does not impact survival of 106 patients with haematologic malignancies and mucormycosis: A propensity score analysis / A. Kyvernitakis, H. A. Torres, Y. Jiang [et al.] // Clin. Microbiol. Infect. - 2016. -Vol. 22. -811.e1-811.e8. - doi:10.1016/j.cmi.2016.03.029.
301. Intensive care medicine research agenda on invasive fungal infection in critically ill patients / M. Bassetti, J. Garnacho-Montero, T. Calandra [et al.] // Intensive Care Med.
- 2017. - Vol. 43. - №9. - P. 1225-1238. - doi: 10.1007/s00134-017-4731-2.
302. Interferon-gamma and granulocyte-macrophage colonystimulating factor augment the activity of polymorphonuclear leukocytes against medically important zygomycetes. / C. Gil-Lamaignere, M. Simitsopoulou, E. Roilides [et al.] // J Infect Dis. - 2005. - Vol. 191. - №7. - P. 1180-1187. - doi: 10.1086/428503.
303. Interpersonal Factors in the Pharmacokinetics and Pharmacodynamics of Voriconazole: Are CYP2C19 Genotypes Enough for Us to Make a Clinical Decision? / X. Zhong, X. Tong, Y. Ju [et al.] // Curr Drug Metab. - 2018. - Vol. 19. - .№14. - P. 11521158. - doi:10.2174/1389200219666171227200547.
304. Intra-articular injection of voriconazole for Fusarium solani arthritis after bone marrow transplantation / N. Kawashima, N. Yoshida, N. Matsushita [et al.] // J Infect. -2012. - Vol. 65. - №4. - P. 366-367. - doi: 10.1016/j.jinf.2012.06.001.
305. Intracellular concentrations of anidulafungin in different compartments of the peripheral blood / F. Farowski, O. A. Cornely, J. J. Vehreschild [et al.] // Int J Antimicrob Agents. - 2013. - Vol. 41. - P. 379-382. - doi: 10.1016/j.ijantimicag.2012.12.002.
306. Invasive Acremonium strictum infection in a bone marrow transplant recipient / S. Miyakis, A. Velegraki, S. Delikou [et al.] // Pediatr Infect Dis J. 2006. - Vol. 25. - №3. -P. 273-275. - doi: 10.1097/01.inf.0000202107.73095.ad.
307. Invasive fungal diseases in haematopoietic cell transplant recipients and in patients with acute myeloid leukaemia or myelodysplasia in Brazil / M. Nucci, M. Garnica, A. B. Gloria [et al.] // Clin Microbiol Infect. - 2013. - Vol. 19. - №8. - P. 745-51. - doi: 10.1111/1469-0691.12002.
308. Invasive fungal infections among organ transplant recipients: results of the Transplant-Associated Infection Surveillance Network (TRANSNET) / P. G. Pappas, B. D. Alexander, D. R. Andes [et al.] // Clin Infect Dis. - 2010. - Vol. 50. - №8. - P. 11011111. - doi: 10.1086/651262.
309. Invasive Fungal Sinusitis: Risk Factors for Visual Acuity Outcomes and Mortality / K. E. Hirabayashi, O. O. Idowu, E. Kalin-Hajdu [et al.] // Ophthalmic Plast Reconstr Surg. - 2019. - Vol. 35. - №6. - P. 535-542. - doi: 10.1097/IOP.0000000000001357.
310. Invasive Fusariosis in Patients with Hematologic Diseases / Nucci M., Engelhardt M., Hamed K. [et al.] // J Fungi (Basel). 2021. - Vol. 7. - №10. - P. 815. - doi: 10.3390/jof7100815.
311. Invasive Fusariosis in Pediatric Hematology/Oncology and Stem Cell Transplant Patients: A Report from the Israeli Society of Pediatric Hematology-Oncology / M. Benish, S. Elitzur, N. Arad-Cohen [et al.] // J Fungi (Basel). - 2022. - Vol. 8. - №4. - P. 387. - doi: 10.3390/jof8040387.
312. Invasive infection due to penicillium species 6511 other than P. marneffei / G. Lyratzopoulos, M. Ellis, R. Nerringer, D. W. Denning // J Infect. - 2002. -Vol. 45. - №3.
- P. 184-95. - doi:10.1053/jinf.2002.1056.
313. Invasive infections due to filamentous fungi other than Aspergillus: epidemiology and determinants of mortality / M. Slavin, S. van Hal, T. C. Sorrell [et al.] // Clin Microbiol Infect. - 2015. - Vol. 21. - №5. - P. 490.e1-10. - doi: 10.1016/j.cmi.2014.12.021.
314. Invasive infections due to Saprochaete and Geotrichum species: Report of 23 cases from the FungiScope Registry / G. L. Duran, D. Seidel, M. J. Vehreschild [et al.]. FungiScope Group // Mycoses. - 2017. - Vol. 60. - №4. - P. 273-279. -doi.org/10.1111/myc. 12595.
315. Invasive mold infections in cancer patients: 5 years' experience with Aspergillus, Mucor, Fusarium and Acremonium infections / V. Jr. Krcmery, E. Kunova, Z. Jesenska [et al.] // Support Care Cancer. - 1996. - Vol. 4. - №1. - P. 39-45. - doi: 10.1007/BF01769874.
316. Invasive mould sinusitis in patients with haematological malignancies: a 10 year single-centre study / S. Davoudi, V. A. Kumar, Y. Jiang [et al.] // The Journal of antimicrobial chemotherapy. - 2015. - Vol. 70. - №10. - P. 2899-2905. -doi.org/10.1093/jac/dkv198.
317. Invasive mucormycosis in chronic granulomatous disease/ A. M. Al-Otaibi, D. A. Al-Shahrani, E. M. Al-Idrissi, H. M. Al-Abdely // Saudi Med J. - 2016. - Vol. 37. - №5.
- P. 567-569. - doi:10.15537/smj.2016.5.14239.
318. Invasive non-Aspergillus mold infections in transplant recipients, United States, 2001-2006 / B. J. Park, P. G. Pappas, K. A. Wannemuehler [et al.] // Emerg Infect Dis. 2011. - Vol. 17. - №10. - P. 1855-1864. - doi: 10.3201/eid1710.110087.
319. Invasive rhino-orbital fungal sinusitis following dental manipulation / H. Chopra, K. Dua, S. Bhatia [et al.] // Mycoses. - 2009. - Vol. 52. - №4. - P. 368-71. - doi: 10.1111/j.1439-0507.2008.01600.x.
320. Invasive Scopulariopsis alboflavescens infection in patient with acute myeloid leukemia / K. Kurata, S. Nishimura, H., Ichikawa [et al.] // Int J Hematol. - 2018. - Vol. 108. - №6. - P. 658-664. - doi: 10.1007/s12185-018-2496-1.
321. Iosifidis E. Advances in the Treatment of Mycoses in Pediatric Patients / E. Iosifidis, S. Papachristou, E. Roilides // Journal of fungi (Basel, Switzerland). - 2018. -Vol. 4. - №4. - P. 115. - doi.org/10.3390/jof4040115.
322. Iron loading and erythrophagocytosis increase ferroportin 1 (FPN1) expression in J774 macrophages / M. D. Knutson, M. R. Vafa, D. J. Haile, M. Wessling-Resnick // Blood. - 2003. - Vol. 102. - №12. - P. 4191-4197. - doi: 10.1182/blood-2003-04-1250.
323. Iron restriction inside macrophages regulates pulmonary host defense against Rhizopus species / A. M Andrianaki., I. Kyrmizi, K. Thanopoulou [et al.] //Nat Commun. - 2018. - Vol. 20. - № 9. - №1. - P.3333. - doi: 10.1038/s41467-018-05820-2.
324. Isavuconazole versus voriconazole for primary treatment of invasive mould disease caused by Aspergillus and other filamentous fungi (SECURE): a phase 3, randomised-controlled, non-inferiority trial / J. A. Maertens, II. Raad, K. A. Marr [et al.] // Lancet. -2016. - Vol. 387. - P. 760-769. - doi: 10.1016/S0140-6736(15)01159-9.
325. Isavuconazonium sulfate: a triazole prodrug for invasive fungal infections / D. Murrell, J. B. Bossaer, R. Carico [et al.] // Int J Pharm Pract. - 2016. - Vol. 25. - P. 1830. - doi: 10.1111/ijpp.12302.
326. Isolated bilateral renal mucormycosis in apparently immunocompetent patients— a case series from India and review of the literature / D. Bhadauria, P. Etta, A. Chelappan [et al.] // Clin. Kidney J. - 2018. - Vol. 11. - P. 769-776. -doi: 10.1093/ckj/sfy034.
327. Izumi K. A rare case of infective endocarditis complicated by Trichosporon asahii fungemia treated by surgery / K. Izumi, Y. Hisata, S. Hazama // Ann Thorac Cardiovasc Surg . - 2009. - Vol. 15. - №5. - P. 350-3. - PMID: 19901894.
328. Jacobs S. E. Non-Aspergillus Hyaline Molds: Emerging Causes of Sino-Pulmonary Fungal Infections and Other Invasive Mycoses / S. E. Jacobs, N. L. Wengenack, T. J. Walsh // Seminars in respiratory and critical care medicine. - 2020. - Vol. 41. - №1. - P. 115-130. - doi.org/10.1055/s-0039-3401989.
329. Jain S. Unusual fungal sepsis of Alternaria alternata in acute lymphoblastic leukaemia in an adult patient / S. Jain, B. Tarai, P. Tuli, P. Das // Indian J Med Microbiol.
- 2015. - Vol. 33. - №4. - P. 599-600. - doi: 10.4103/0255-0857.167324.
330. Jayamohan Y. Pseudallescheriasis: a summary of patients from 1980-2003 in a tertiary care center / Y. Jayamohan, J. A. Ribes // Arch Pathol Lab Med. -2006. - Vol. 130. - №12. - P. 1843-1846. - doi: 10.5858/2006-130-1843-PAS0PF.
331. Jennings Z, Kable K, Halliday CL Verruconis gallopava cardiac and endovascular infection with dissemination after renal transplantation: Case report and lessons learned // Med Mycol Case Rep. - 2016. - Vol. 13. - №15. - P. 5-8. - doi: 10.1016/j.mmcr.2016.12.006.
332. Jianhong L. Isolated renal mucormycosis in children / L. Jianhong, H. Xianliang, J. Xuewu // J. Urol. - 2004. - Vol. 171. - P. 387-388. -doi:10.1097/01.ju.0000100842.96636.a0.
333. John B. V. Hyperbaric oxygen as an adjunctive treatment for zygomycosis / B. V. John, G. Chamilos, D. P. Kontoyiannis // Clin. Microbiol. Infect. -2005. - Vol. 11. - P. 515-517. - doi: 10.1111/j.1469-0691.2005.01170.x.
334. Kanafani Z.A. Antimicrobial resistance: resistance to antifungal agents: mechanisms and clinical impact / Z. A. Kanafani, J. R. Perfect // Clin Infect Dis. - 2008.
- Vol. 46. - №1. - P. 120-128. - doi: 10.1086/524071.
335. Karas M. Laser desorption ionization of proteins with molecular masses exceeding 10,000 Daltons / M. Karas, F. Hillenkamp // Anal. Chem. - 1988. - Vol. 60. - P. 22992301. - doi: 10.1021/ac00171a028.
336. Kauffman C. A. Update on echinocandin antifungals. / C. A. Kauffman, P. L. Carver // Semin Respir Crit Care Med. - 2008. - Vol, 29. - №2. - P. 211-219. - doi: 10.1055/s-2008-1063859.
337. Kelesidis T. Efficacy and safety of the probiotic Saccharomyces boulardii for the prevention and therapy of gastrointestinal disorders / T. Kelesidis, C. Pothoulakis // Therap Adv Gastroenterol. - 2012. - Vol. 5. - №2. - P. 111-125. -doi: 10.1177/1756283X11428502.
338. Kleinschmidt-Demasters B. K. Disseminated Fusarium infection with brain abscesses in a lung transplant recipient / B. K. Kleinschmidt-Demasters // Clin Neuropathol. - 2009. - Vol. 28. - №6. - P. 417-421. - doi: 10.5414/npp28417.
339. Klimko N. N. Mucormycosis in haematological patients: Case report and results of prospective study in Saint Petersburg, Russia / N. N. Klimko, S. N. Khostelidi, T. S. Bogomolova [et al.] // Mycoses. - 2014. - Vol. 57. - Sup.3. - P. 91-96. - doi: 10.1111/myc.12247. - EDN GZBROX.
340. Kodamaea ohmeri fungaemia successfully treated with caspofungin / C.-H. Chiu, Y.-C. Wang, S.-T. Shanget [et al.] // Int J Antimicrob Agents. - 2010. - Vol. 35. - №1. -P. 98-99. -doi: 10.1016/j.ijantimicag.2009.09.010.
341. Koehler P. Bone and joint infections by Mucorales, Scedosporium, Fusarium and even rarer fungi / P. Koehler, D. Tacke, O. Cornely // Crit Rev Microbiol. - 2016. - Vol. 42. - №1. - P. 158-71. - doi: 10.3109/1040841X.2014.910749.
342. Kolar S. S. M. Role of pattern recognition receptors in the modulation of antimicrobial peptide expression in the corneal epithelial innate response to F. solani / S. S. Kolar, H. Baidouri, A. M. Mcdermott // Invest Ophthalmol Vis Sci. - 2017. - Vol. 58. - №5. - P. 2463-2472. - doi: 10.1167/iovs.16-20658.
343. Kontoyiannis D. P. How I treat mucormycosis / D. P. Kontoyiannis, R. E. Lewis // Blood J. Am. Soc. Hematol. - 2011. - Vol. 118. - P. 1216-1224. - doi: 10.1182/blood-2011-03-316430.
344. Lack of pharmacokinetic interaction between anidulafungin and tacrolimus / J. A. Dowell, M. Stogniew, D. Krause [et al.] // J Clin Pharmacol. -2007. - Vol. 47. - P. 305314. - doi: 10.1177/0091270006296764.
345. Lackner M. Laboratory diagnosis of mucormycosis: current status and future perspectives / M. Lackner, R. Caramalho, C. Lass-Florl // Future microbiology. - 2014. - Vol. 9. - №5. - P. 683-695. - doi.org/10.2217/fmb.14.23.
346. Lakhani P. Challenges in the Polyene- and Azole-Based Pharmacotherapy of Ocular Fungal Infections / P.Lakhani, A. Patil, S. Majumdar // J Ocul Pharmacol Ther. -2019. -Vol. 35. - №1. - P. 6-22. - doi:10.1089/jop.2018.0089.
347. Lazarus J. E., Branda J. A., Gandhi R. G., et al. Disseminated Intravascular Infection Caused by Paecilomyces variotii: Case Report and Review of the Literature. Open Forum Infect Dis. - 2020. - Vol. 15. - №7(6). - ofaa166. doi: 10.1093/ofid/ofaa166.
348. Leal Jr. S. M. The role of cytokines and pathogen recognition molecules in fungal keratitis - Insights from human disease and animal models / Jr. S. M. Leal, E. Pearlman // Cytokine. - 2012. - Vol. 58. - №1. - P. 107-111. - doi: 10.1016/j.cyto.2011.12.022.
349. Lewis R. E. P. Invasive aspergillosis in glucocorticoid-treated patients / R. E. Lewis, D. P. Kontoyiannis // Med Mycol. - 2009. - Vol. 47. - Suppl 1. - P. 271-281. -doi: 10.1080/13693780802227159.
350. Li M. D. [Advance study of rhinocerebralmucormycosis] / M. D. Li, J. J. Ye // Zhonghua Yan Ke Za Zhi. Chinese. - 2019. - Vol. 55. - №8. - P. 629-633. - doi: 10.3760/cma.j.issn.0412-4081.2019.08.017..
351. Lionakis M. S. Glucocorticoids finad invasive fungal infections / M. S. Lionakis, D. P. Kontoyiannis // Lancet. - 2003. - Vol. 362. - № 9398. - P. 1828-1838. - doi: 10.1016/S0140-6736(03)14904-5.
Обратите внимание, представленные выше научные тексты размещены для ознакомления и получены посредством распознавания оригинальных текстов диссертаций (OCR). В связи с чем, в них могут содержаться ошибки, связанные с несовершенством алгоритмов распознавания. В PDF файлах диссертаций и авторефератов, которые мы доставляем, подобных ошибок нет.